text
stringlengths
0
1.95k
данных из внешних файлов различных форматов (.txt, .xls, .dbf, mdb и т.д.) или экспорта
результатов в файлы .pdf, .doc и др.
311
При работе с использованием командного окна R Console мы рекомендуем во всех
случаях создавать файл со скриптом (т.е. последовательностью операторов языка R,
выполняющей определенные действия). Если этот файл существует, его лучше всего
поместить в рабочий каталог, а если нет – создать там же новый текстовый файл с любым
именем (но, для определенности, лучше с расширением *.r). Если после запуска R выбрать
пункт меню "Файл > Открыть скрипт", то этот файл откроется в окне "Редактор R". Далее
выделяется любой осмысленный фрагмент подготовленного скрипта (от имени одной
переменной до всего содержимого) и осуществляется запуск этого блока на выполнение.
Это можно сделать четырьмя возможными способами: (из основного и контекстного
меню, кнопкой на панели инструментов и комбинацией клавиш Ctrl+R). Результаты,
появившиеся в окне "Консоль", можно скопировать через буфер обмена в любой
текстовый файл.
vegan, labdsv,
simboot и FD
Установка используемых пакетов (package)
Стандартная инсталляция
базовую
статистической
комплектацию из 17 пакетов (base, graphics, datasets, stats, splines, spatial, MASS, tcltk и
др.), содержащих более 1600 различных функций. Этот список может быть существенно
расширен в зависимости от профиля выполняемых работ: количество доступных пакетов
уже превысило 2000 и их число неуклонно растет. Приведем неполный список пакетов,
которые мы активно использовали в своих скриптах:
Пакеты R
среды R
содержит
Назначение
выполнение расчетов по экологии сообществ (меры сходства,
разнообразия и вложенности, ординация и другие методы многомерного
анализа)
нуль-модели и анализ показателей в экологии и эволюции сообществ
анализ данных мониторинга окружающей среды
функции геометрической морфометрии
выбор переменных в регрессионных моделях
статистические критерии в биометрии
процедуры, связанные с прикладным регрессионным анализом
специальные виды регрессии (RMA, LARS, Lasso и др.)
построение моделей со смешанными эффектами
picante
ade4
shapes
boot, bootstrap функции различных процедур бутстрепа и «складного ножа»
lawstat
car
FWDselect,
packfor,glmulti
lmodel2, lars
lme4
tree, rpart,
randomForest,
party, mvpart
Hotelling
cluster
pvclust
klaR, kknn,
e1071
nnet, kohonen
pastecs
forecast
spatstat
сравнение многомерных выборок
процедуры кластерного анализа
бутстрепинг деревьев классификации
построение иерархических деревьев регрессии
методы распознавания и классификации
использование нейронных сетей и карт Кохонена
анализ тренда временных рядов в экологии
прогнозирование временных рядов и модели сезонной динамики
пространственное размещение точек, подбор моделей
пространственные зависимости: геостатистические методы и
моделирование
связь c программой JAGS для получения марковских цепей Монте-Карло
чтение и запись в файлы Excel
усовершенствованный графический пакет
spdep
rjags
xlsReadWrite
lattice