extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "Several", "mechanisms", "of", "CTM", "are", "studied", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effects", "of", "the", "length", "of", "live", "polymer", "chains", "and", "the", "type", "of", "monoradical", "that", "initiated", "the", "live", "polymer", "chains", "on", "the", "energy", "barriers", "and", "rate", "constants", "of", "the", "invol...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "calculations", "are", "carried", "out", "using", "density", "functional", "theory", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Three", "types", "of", "hybrid", "functionals", "(", "B3LYP", ",", "X3LYP", ",", "and", "M06", "-", "2X", ")", "and", "four", "basis", "sets", "(", "6", "-", "31G", "(", "d", ")", ",", "6", "-", "31G", "(", "d", ",", "p", ")", ",", "6", "-",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Transition", "state", "theory", "is", "used", "to", "estimate", "rate", "constants", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "indicate", "that", "abstraction", "of", "a", "hydrogen", "atom", "(", "by", "live", "polymer", "chains", ")", "from", "the", "methyl", "group", "in", "methyl", "acrylate", ",", "the", "methylene", "group", "in", "ethyl", "acrylate", ",", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHE...
[ "Also", ",", "the", "rate", "constants", "of", "CTM", "reactions", "calculated", "using", "M06", "-", "2X", "are", "in", "good", "agreement", "with", "those", "estimated", "from", "polymer", "sample", "measurements", "using", "macroscopic", "mechanistic", "model...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "rate", "constant", "values", "do", "not", "change", "significantly", "with", "the", "length", "of", "live", "polymer", "chains", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Abstraction", "of", "a", "hydrogen", "atom", "by", "a", "tertiary", "radical", "has", "a", "higher", "energy", "barrier", "than", "abstraction", "by", "a", "secondary", "radical", ",", "which", "agrees", "with", "experimental", "findings", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "calculated", "and", "experimental", "NMR", "spectra", "of", "dead", "polymer", "chains", "produced", "by", "CTM", "reactions", "are", "comparable", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "theoretical", "/", "computational", "study", "reveals", "that", "CTM", "occurs", "most", "likely", "via", "hydrogen", "abstraction", "by", "live", "polymer", "chains", "from", "the", "methyl", "group", "of", "methyl", "acrylate", "and", "methylene", "gr...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", ...
[ "Novel", "triaryl", "sulfonamide", "derivatives", "as", "selective", "cannabinoid", "receptor", "2", "inverse", "agonists", "and", "osteoclast", "inhibitors", ":", "discovery", ",", "optimization", ",", "and", "biological", "evaluation", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cannabinoid", "receptors", "have", "gained", "increasing", "attention", "as", "drug", "targets", "for", "developing", "potential", "therapeutic", "ligands", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "report", "the", "discovery", "and", "optimization", "of", "triaryl", "sulfonamides", "as", "a", "novel", "series", "possessing", "significant", "CB2", "receptor", "affinity", "and", "selectivity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Four", "sets", "of", "triaryl", "ligands", "were", "designed", "and", "synthesized", "for", "further", "structural", "modifications", "and", "led", "to", "the", "identification", "of", "eight", "compounds", "as", "potent", "and", "selective", "CB2", "inverse", ...	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Especially", ",", "compound", "57", "exhibited", "the", "strongest", "binding", "affinity", "on", "the", "CB2", "receptor", "(", "CB2K", "(", "i", ")", "of", "0", ".", "5", "nM", ")", "and", "the", "best", "selectivity", "over", "the", "CB1", "receptor"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Importantly", ",", "57", "also", "showed", "potent", "inhibitory", "activity", "on", "osteoclast", "formation", ",", "and", "it", "was", "confirmed", "by", "a", "cell", "viability", "assay", "that", "the", "inhibition", "effects", "were", "not", "derived", "f...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "3D", "QSAR", "studies", "confirmed", "our", "SAR", "findings", "that", "three", "bulky", "groups", "play", "an", "important", "role", "for", "CB2", "receptor", "binding", "affinity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cell", "type", "determines", "the", "light", "-", "induced", "endosomal", "escape", "kinetics", "of", "multifunctional", "mesoporous", "silica", "nanoparticles", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "We", "investigated", "uptake", "and", "individual", "endosome", "lysis", "events", "in", "fibroblast", ",", "normal", ",", "and", "carcinoma", "cell", "lines", "using", "a", "colloidal", "mesoporous", "silica", "(", "CMS", ")", "nanoparticle", "(", "NP", ")",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Endosome", "lysis", "was", "induced", "through", "the", "activation", "of", "protoporphyrin", "IX", "(", "PpIX", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Surprisingly", ",", "this", "release", "-", "on", "-", "demand", "system", "resulted", "in", "more", "broadly", "distributed", "lysis", "times", "than", "expected", ",", "particularly", "for", "Renca", ",", "a", "renal", "carcinoma", "cell", "line", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "analysis", "of", "the", "NP", "load", "per", "endosome", ",", "endosome", "size", ",", "and", "uptake", "characteristics", "indicate", "that", "Renca", "cells", "not", "only", "take", "up", "a", "lower", "amount", "of", "NPs", "in", "comparison", "w...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "We", "then", "created", "a", "stochastic", "model", "detailing", "steps", "downstream", "of", "uptake", "to", "understand", "how", "much", "factors", "that", "cannot", "be", "directly", "measured", ",", "such", "as", "variations", "in", "the", "PpIX", "load",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Model", "results", "indicate", "that", "the", "distributions", "are", "primarily", "determined", "by", "the", "endosome", "properties", ",", "rather", "than", "variations", "across", "NPs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Visualizing", "RNA", "base", "-", "pairing", "probabilities", "with", "RNAbow", "diagrams", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "are", "many", "effective", "ways", "to", "represent", "a", "minimum", "free", "energy", "RNA", "secondary", "structure", "that", "make", "it", "easy", "to", "locate", "its", "helices", "and", "loops", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "a", "greater", "challenge", "to", "visualize", "the", "thermal", "average", "probabilities", "of", "all", "folds", "in", "a", "partition", "function", "sum", ";", "dot", "plot", "representations", "are", "often", "puzzling", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "we", "introduce", "the", "RNAbows", "visualization", "tool", "for", "RNA", "base", "pair", "probabilities", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RNAbows", "represent", "base", "pair", "probabilities", "with", "line", "thickness", "and", "shading", ",", "yielding", "intuitive", "diagrams", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RNAbows", "aid", "in", "disentangling", "incompatible", "structures", ",", "allow", "comparisons", "between", "clusters", "of", "folds", ",", "highlight", "differences", "between", "wild", "-", "type", "and", "mutant", "folds", ",", "and", "are", "also", "rathe...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Imogolite", "-", "like", "nanotubes", ":", "structure", ",", "stability", ",", "electronic", "and", "mechanical", "properties", "of", "the", "phosphorous", "and", "arsenic", "derivatives", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Imogolite", "is", "a", "single", "-", "walled", "aluminosilicate", "nanotube", "(", "NT", ")", "found", "in", "nature", "that", "can", "be", "easily", "synthesized", ",", "as", "well", "as", "its", "analogue", "aluminogermanate", "NT", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Based", "on", "geometrical", "assumptions", "and", "pKa", "values", ",", "species", "such", "as", "H3PO4", ",", "H3PO3", ",", "H3AsO3", ",", "H3AsO4", "could", "also", "be", "candidates", "to", "form", "imogolite", "-", "like", "structures", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "work", ",", "we", "provide", "insights", "about", "the", "stability", ",", "electronic", ",", "structural", "and", "mechanical", "properties", "of", "possible", "imogolite", "like", "NTs", "by", "means", "of", "self", "-", "consistent"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Similarly", "to", "aluminogermanate", ",", "where", "the", "tetrahedral", "silicate", "groups", "are", "replaced", "by", "germanate", ",", "in", "this", "work", "tetrahedral", "silicate", "groups", "are", "substituted", "by", "phosphate", ",", "phosphite", ",", ...	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL",...
[ "Detailed", "analysis", "is", "focused", "on", "structural", "properties", ",", "strain", "energy", ",", "band", "gap", "and", "Mulliken", "charges", "distribution", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "calculated", "strain", "energy", "curves", "for", "all", "studied", "zigzag", "imogolite", "-", "like", "NTs", "present", "well", "-", "defined", "minima", ",", "which", "change", "as", "a", "consequence", "of", "composition", "variation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "the", "strain", "energy", "curves", "of", "armchair", "imogolite", "-", "like", "NTs", "also", "present", "minima", ",", "although", "in", "all", "cases", "less", "stable", "than", "zigzags", "by", "at", "least", "2", ".", "2", "meV", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "insulating", "NT", "behaviour", "changes", "after", "internal", "modification", "from", "silicate", "to", "phosphate", ",", "phosphite", ",", "arsenate", "and", "arsenite", ",", "as", "well", "as", "the", "charge", "distribution", "inside", "and", "outsi...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "UDP", "-", "Glucuronosyltransferase", "(", "UGT", ")", "1A", "Polymorphism", "c", ".", "2042C", ">", "G", "(", "rs8330", ")", "Is", "Associated", "with", "Increased", "Human", "Liver", "Acetaminophen", "Glucuronidation", ",", "Increased", "UGT1A", "Exo...	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-C...
[ "Acetaminophen", "is", "cleared", "primarily", "by", "hepatic", "glucuronidation", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Polymorphisms", "in", "genes", "encoding", "the", "acetaminophen", "UDP", "-", "glucuronosyltransferase", "(", "UGT", ")", "enzymes", "could", "explain", "interindividual", "variability", "in", "acetaminophen", "glucuronidation", "and", "variable", "risk", "for", "li...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "human", "liver", "bank", "samples", "were", "phenotyped", "for", "acetaminophen", "glucuronidation", "activity", "and", "genotyped", "for", "the", "major", "acetaminophen", "-", "glucuronidating", "enzymes", "(", "UGTs", "1A1", ",", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "these", ",", "only", "three", "linked", "single", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "SNPs", ")", "located", "in", "the", "shared", "UGT1A", "-", "3", "'", "UTR", "region", "(", "rs10929303", ",", "rs1042640", ",", "rs8330", ")", "were", "associate...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O",...
[ "Mechanistic", "studies", "using", "luciferase", "-", "UGT1A", "-", "3", "'", "UTR", "reporters", "indicated", "that", "these", "SNPs", "do", "not", "alter", "mRNA", "stability", "or", "translation", "efficiency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "there", "was", "evidence", "for", "allelic", "imbalance", "and", "a", "gene", "-", "dose", "proportional", "increase", "in", "the", "amount", "of", "exon", "5a", "versus", "exon", "5b", "containing", "UGT1A", "mRNA", "spliced", "transcripts", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cotransfection", "studies", "demonstrated", "an", "inhibitory", "effect", "of", "exon", "5b", "containing", "cDNAs", "on", "acetaminophen", "glucuronidation", "by", "UGT1A1", "and", "UGT1A6", "cDNAs", "containing", "exon", "5a", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "silico", "analysis", "predicted", "that", "rs8330", "creates", "an", "exon", "splice", "enhancer", "site", "that", "could", "favor", "exon", "5a", "(", "over", "exon", "5b", ")", "utilization", "during", "splicing", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "the", "prevalence", "of", "rs8330", "was", "significantly", "lower", "(", "P", "=", "0", ".", "027", ",", "chi", "(", "2", ")", "test", ")", "in", "patients", "who", "had", "acute", "liver", "failure", "from", "unintentional", "acetamino...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "Together", ",", "these", "findings", "suggest", "that", "rs8330", "is", "an", "important", "determinant", "of", "acetaminophen", "glucuronidation", "and", "could", "affect", "an", "individual", "'", "s", "risk", "for", "acetaminophen", "-", "induced", "liver", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Anthelmintic", "activity", "of", "the", "natural", "compound", "(", "+", ")", "-", "limonene", "epoxide", "against", "Schistosoma", "mansoni", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Blood", "fluke", "of", "the", "genus", "Schistosoma", "are", "the", "etiological", "agents", "of", "human", "schistosomiasis", ",", "an", "important", "neglected", "tropical", "disease", "that", "afflicts", "over", "200", "million", "people", "worldwide", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "treatment", "for", "this", "disease", "relies", "heavily", "on", "a", "single", "drug", ",", "praziquantel", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Recent", "reports", "of", "praziquantel", "resistance", "raise", "concerns", "about", "future", "control", "of", "the", "disease", "and", "show", "the", "importance", "of", "developing", "new", "antischistosomal", "drugs", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Currently", ",", "natural", "products", "have", "been", "a", "good", "source", "for", "drug", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "(", "+", ")", "-", "Limonene", "epoxide", "is", "a", "mixture", "of", "cis", "and", "trans", "isomers", "found", "in", "many", "plants", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "report", "the", "in", "vitro", "effect", "of", "this", "natural", "compound", "on", "the", "survival", "time", "of", "Schistosoma", "mansoni", "adult", "worms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "we", "examined", "alterations", "on", "the", "tegumental", "surface", "of", "adult", "schistosomes", "by", "means", "of", "confocal", "laser", "scanning", "microscopy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effects", "of", "(", "+", ")", "-", "limonene", "epoxide", "at", "25", "micro", "g", "/", "mL", "on", "S", ".", "mansoni", "adult", "worms", "were", "similar", "to", "those", "of", "the", "positive", "control", "(", "praziquantel", ")", ",", ...	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Confocal", "laser", "scanning", "microscopy", "revealed", "that", "(", "+", ")", "-", "limonene", "epoxide", "-", "mediated", "worm", "killing", "was", "associated", "with", "tegumental", "destruction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", ",", "along", "with", "the", "low", "toxicity", "of", "the", "(", "+", ")", "-", "limonene", "epoxide", ",", "suggest", "that", "this", "natural", "compound", "might", "be", "promising", "for", "the", "development", "of", "new", "schistos...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Neuronatin", "-", "mediated", "aberrant", "calcium", "signaling", "and", "endoplasmic", "reticulum", "stress", "underlie", "neuropathology", "in", "Lafora", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Lafora", "disease", "(", "LD", ")", "is", "a", "teenage", "-", "onset", "inherited", "progressive", "myoclonus", "epilepsy", "characterized", "by", "the", "accumulations", "of", "intracellular", "inclusions", "called", "Lafora", "bodies", "and", "caused", "by", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "But", "how", "the", "loss", "of", "function", "of", "either", "laforin", "or", "malin", "causes", "disease", "pathogenesis", "is", "poorly", "understood", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", ",", "neuronatin", "was", "identified", "as", "a", "novel", "substrate", "of", "malin", "that", "regulates", "glycogen", "synthesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "demonstrate", "that", "the", "level", "of", "neuronatin", "is", "significantly", "up", "-", "regulated", "in", "the", "skin", "biopsy", "sample", "of", "LD", "patients", "having", "mutations", "in", "both", "malin", "and", "laforin", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Neuronatin", "is", "highly", "expressed", "in", "human", "fetal", "brain", "with", "gradual", "decrease", "in", "expression", "in", "developing", "and", "adult", "brain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "in", "adult", "brain", ",", "neuronatin", "is", "predominantly", "expressed", "in", "parvalbumin", "-", "positive", "GABAergic", "interneurons", "and", "localized", "in", "their", "processes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "level", "of", "neuronatin", "is", "increased", "and", "accumulated", "as", "insoluble", "aggregates", "in", "the", "cortical", "area", "of", "LD", "brain", "biopsy", "samples", ",", "and", "there", "is", "also", "a", "dramatic", "loss", "of", "parval...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ectopic", "expression", "of", "neuronatin", "in", "cultured", "neuronal", "cells", "results", "in", "increased", "intracellular", "Ca", "(", "2", "+", ")", ",", "endoplasmic", "reticulum", "stress", ",", "proteasomal", "dysfunction", ",", "and", "cell", "death"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "suggest", "that", "the", "neuronatin", "-", "induced", "aberrant", "Ca", "(", "2", "+", ")", "signaling", "and", "endoplasmic", "reticulum", "stress", "might", "underlie", "LD", "pathogenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Quantitative", "analysis", "of", "TALE", "-", "DNA", "interactions", "suggests", "polarity", "effects", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transcription", "activator", "-", "like", "effectors", "(", "TALEs", ")", "have", "revolutionized", "the", "field", "of", "genome", "engineering", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "present", "here", "a", "systematic", "assessment", "of", "TALE", "DNA", "recognition", ",", "using", "quantitative", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "and", "reporter", "gene", "activation", "assays", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Within", "TALE", "proteins", ",", "tandem", "34", "-", "amino", "acid", "repeats", "recognize", "one", "base", "pair", "each", "and", "direct", "sequence", "-", "specific", "DNA", "binding", "through", "repeat", "variable", "di", "-", "residues", "(", "RVDs...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "that", "RVD", "choice", "can", "affect", "affinity", "by", "four", "orders", "of", "magnitude", ",", "with", "the", "relative", "RVD", "contribution", "in", "the", "order", "NG", ">", "HD", "~", "NN", ">>", "NI", ">", "NK", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "NN", "repeat", "preferred", "the", "base", "G", "over", "A", ",", "whereas", "the", "NK", "repeat", "bound", "G", "with", "10", "(", "3", ")", "-", "fold", "lower", "affinity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "compared", "AvrBs3", ",", "a", "naturally", "occurring", "TALE", "that", "recognizes", "its", "target", "using", "some", "atypical", "RVD", "-", "base", "combinations", ",", "with", "a", "designed", "TALE", "that", "precisely", "matches", "'", "standard...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "comparison", "revealed", "unexpected", "differences", "in", "sensitivity", "to", "substitutions", "of", "the", "invariant", "5", "'", "-", "T", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Another", "surprising", "observation", "was", "that", "base", "mismatches", "at", "the", "5", "'", "end", "of", "the", "target", "site", "had", "more", "disruptive", "effects", "on", "affinity", "than", "those", "at", "the", "3", "'", "end", ",", "particu...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "provide", "evidence", "that", "TALE", "-", "DNA", "recognition", "exhibits", "a", "hitherto", "un", "-", "described", "polarity", "effect", ",", "in", "which", "the", "N", "-", "terminal", "repeats", "contribute", "more", "to", "affinity",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transient", "receptor", "potential", "channels", "-", "emerging", "novel", "drug", "targets", "for", "the", "treatment", "of", "pain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "mammals", "several", "members", "of", "the", "Transient", "Receptor", "Potential", "channel", "family", "(", "TRPs", ")", ",", "expressed", "mainly", "in", "the", "sensory", "neurons", "and", "skin", "keratinocytes", ",", "are", "implicated", "in", "rel...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Since", "the", "TRPV1", "-", "4", ",", "TRPA1", "and", "TRPM8", "channels", "from", "this", "family", "play", "a", "pivotal", "role", "in", "both", "the", "detection", "and", "possibly", "modulation", "of", "painful", "stimuli", ",", "they", "are", "regar...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "few", "agents", "acting", "at", "TRPs", ",", "such", "as", "capsaicin", "or", "menthol", ",", "have", "a", "long", "history", "of", "their", "application", "as", "analgesics", ",", "whereas", "others", "(", "e", ".", "g", ".", "SB705498", ",", "J...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O"...
[ "In", "this", "review", "we", "discuss", "pain", "physiology", ",", "as", "well", "as", "the", "pharmacological", "properties", "of", "the", "TRPs", "involved", "in", "pain", "detection", "as", "potential", "critical", "peripheral", "analgesic", "targets", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "present", "one", "of", "the", "most", "relevant", "strategies", "in", "the", "search", "for", "novel", "analgesic", "drugs", ",", "namely", "the", "TRP", "channels", "and", "their", "ligands", ",", "both", "agonists", "and", "antagonists", "as", "pote...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "safety", "profile", "of", "these", "agents", ",", "in", "particular", "their", "impact", "on", "thermosensation", ",", "is", "also", "discussed", "below", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Photoactive", "analogs", "of", "farnesyl", "diphosphate", "and", "related", "isoprenoids", ":", "design", "and", "applications", "in", "studies", "of", "medicinally", "important", "isoprenoid", "-", "utilizing", "enzymes", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Farnesyl", "diphosphate", "(", "FPP", ")", "is", "an", "important", "metabolic", "intermediate", "in", "the", "biosynthesis", "of", "a", "variety", "of", "molecules", "including", "sesquiterpenes", "and", "the", "side", "chains", "of", "a", "number", "of", "c...	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "FPP", "is", "also", "the", "source", "of", "isoprenoid", "side", "chains", "found", "attached", "to", "proteins", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Enzymes", "that", "employ", "FPP", "as", "a", "substrate", "are", "of", "interest", "because", "they", "are", "involved", "in", "the", "semisynthesis", "of", "drugs", "as", "well", "as", "targets", "for", "drug", "design", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Photoactive", "analogs", "of", "FPP", "have", "been", "useful", "for", "identifying", "enzymes", "that", "use", "this", "molecule", "as", "a", "substrate", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "variety", "of", "photocrosslinking", "groups", "have", "been", "employed", "to", "prepare", "FPP", "analogs", "for", "use", "in", "such", "experiments", "including", "aryl", "azides", ",", "diazotrifluoropropionates", "and", "benzophenones", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "In", "this", "review", ",", "the", "design", "of", "these", "probes", "is", "described", "along", "with", "an", "examination", "of", "how", "they", "have", "been", "used", "in", "crosslinking", "experiments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Impact", "of", "quaternary", "structure", "dynamics", "on", "allosteric", "drug", "discovery", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "morpheein", "model", "of", "allosteric", "regulation", "draws", "attention", "to", "proteins", "that", "can", "exist", "as", "an", "equilibrium", "of", "functionally", "distinct", "assemblies", "where", ":", "one", "subunit", "conformation", "assembles", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "The", "case", "study", "of", "porphobilinogen", "synthase", "(", "PBGS", ")", "illustrates", "how", "such", "an", "equilibrium", "holds", "lessons", "for", "disease", "mechanisms", ",", "drug", "discovery", ",", "understanding", "drug", "side", "effects", ",", ...	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "morpheein", "model", "of", "allostery", "has", "been", "proposed", "as", "applicable", "for", "a", "wide", "assortment", "of", "disease", "-", "associated", "proteins", "(", "Selwood", ",", "T", ".", ",", "Jaffe", ",", "E", ".", ",", "(", "2012",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Several", "mechanisms", "of", "CTM", "are", "studied", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effects", "of", "the", "length", "of", "live", "polymer", "chains", "and", "the", "type", "of", "monoradical", "that", "initiated", "the", "live", "polymer", "chains", "on", "the", "energy", "barriers", "and", "rate", "constants", "of", "the", "invol...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "calculations", "are", "carried", "out", "using", "density", "functional", "theory", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Three", "types", "of", "hybrid", "functionals", "(", "B3LYP", ",", "X3LYP", ",", "and", "M06", "-", "2X", ")", "and", "four", "basis", "sets", "(", "6", "-", "31G", "(", "d", ")", ",", "6", "-", "31G", "(", "d", ",", "p", ")", ",", "6", "-",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Transition", "state", "theory", "is", "used", "to", "estimate", "rate", "constants", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "indicate", "that", "abstraction", "of", "a", "hydrogen", "atom", "(", "by", "live", "polymer", "chains", ")", "from", "the", "methyl", "group", "in", "methyl", "acrylate", ",", "the", "methylene", "group", "in", "ethyl", "acrylate", ",", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHE...

[ "Also", ",", "the", "rate", "constants", "of", "CTM", "reactions", "calculated", "using", "M06", "-", "2X", "are", "in", "good", "agreement", "with", "those", "estimated", "from", "polymer", "sample", "measurements", "using", "macroscopic", "mechanistic", "model...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "rate", "constant", "values", "do", "not", "change", "significantly", "with", "the", "length", "of", "live", "polymer", "chains", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Abstraction", "of", "a", "hydrogen", "atom", "by", "a", "tertiary", "radical", "has", "a", "higher", "energy", "barrier", "than", "abstraction", "by", "a", "secondary", "radical", ",", "which", "agrees", "with", "experimental", "findings", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "calculated", "and", "experimental", "NMR", "spectra", "of", "dead", "polymer", "chains", "produced", "by", "CTM", "reactions", "are", "comparable", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "theoretical", "/", "computational", "study", "reveals", "that", "CTM", "occurs", "most", "likely", "via", "hydrogen", "abstraction", "by", "live", "polymer", "chains", "from", "the", "methyl", "group", "of", "methyl", "acrylate", "and", "methylene", "gr...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", ...

[ "Novel", "triaryl", "sulfonamide", "derivatives", "as", "selective", "cannabinoid", "receptor", "2", "inverse", "agonists", "and", "osteoclast", "inhibitors", ":", "discovery", ",", "optimization", ",", "and", "biological", "evaluation", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cannabinoid", "receptors", "have", "gained", "increasing", "attention", "as", "drug", "targets", "for", "developing", "potential", "therapeutic", "ligands", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "report", "the", "discovery", "and", "optimization", "of", "triaryl", "sulfonamides", "as", "a", "novel", "series", "possessing", "significant", "CB2", "receptor", "affinity", "and", "selectivity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Four", "sets", "of", "triaryl", "ligands", "were", "designed", "and", "synthesized", "for", "further", "structural", "modifications", "and", "led", "to", "the", "identification", "of", "eight", "compounds", "as", "potent", "and", "selective", "CB2", "inverse", ...

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Especially", ",", "compound", "57", "exhibited", "the", "strongest", "binding", "affinity", "on", "the", "CB2", "receptor", "(", "CB2K", "(", "i", ")", "of", "0", ".", "5", "nM", ")", "and", "the", "best", "selectivity", "over", "the", "CB1", "receptor"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Importantly", ",", "57", "also", "showed", "potent", "inhibitory", "activity", "on", "osteoclast", "formation", ",", "and", "it", "was", "confirmed", "by", "a", "cell", "viability", "assay", "that", "the", "inhibition", "effects", "were", "not", "derived", "f...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "3D", "QSAR", "studies", "confirmed", "our", "SAR", "findings", "that", "three", "bulky", "groups", "play", "an", "important", "role", "for", "CB2", "receptor", "binding", "affinity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cell", "type", "determines", "the", "light", "-", "induced", "endosomal", "escape", "kinetics", "of", "multifunctional", "mesoporous", "silica", "nanoparticles", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "We", "investigated", "uptake", "and", "individual", "endosome", "lysis", "events", "in", "fibroblast", ",", "normal", ",", "and", "carcinoma", "cell", "lines", "using", "a", "colloidal", "mesoporous", "silica", "(", "CMS", ")", "nanoparticle", "(", "NP", ")",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Endosome", "lysis", "was", "induced", "through", "the", "activation", "of", "protoporphyrin", "IX", "(", "PpIX", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Surprisingly", ",", "this", "release", "-", "on", "-", "demand", "system", "resulted", "in", "more", "broadly", "distributed", "lysis", "times", "than", "expected", ",", "particularly", "for", "Renca", ",", "a", "renal", "carcinoma", "cell", "line", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "analysis", "of", "the", "NP", "load", "per", "endosome", ",", "endosome", "size", ",", "and", "uptake", "characteristics", "indicate", "that", "Renca", "cells", "not", "only", "take", "up", "a", "lower", "amount", "of", "NPs", "in", "comparison", "w...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "We", "then", "created", "a", "stochastic", "model", "detailing", "steps", "downstream", "of", "uptake", "to", "understand", "how", "much", "factors", "that", "cannot", "be", "directly", "measured", ",", "such", "as", "variations", "in", "the", "PpIX", "load",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Model", "results", "indicate", "that", "the", "distributions", "are", "primarily", "determined", "by", "the", "endosome", "properties", ",", "rather", "than", "variations", "across", "NPs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Visualizing", "RNA", "base", "-", "pairing", "probabilities", "with", "RNAbow", "diagrams", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "are", "many", "effective", "ways", "to", "represent", "a", "minimum", "free", "energy", "RNA", "secondary", "structure", "that", "make", "it", "easy", "to", "locate", "its", "helices", "and", "loops", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "a", "greater", "challenge", "to", "visualize", "the", "thermal", "average", "probabilities", "of", "all", "folds", "in", "a", "partition", "function", "sum", ";", "dot", "plot", "representations", "are", "often", "puzzling", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "we", "introduce", "the", "RNAbows", "visualization", "tool", "for", "RNA", "base", "pair", "probabilities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RNAbows", "represent", "base", "pair", "probabilities", "with", "line", "thickness", "and", "shading", ",", "yielding", "intuitive", "diagrams", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RNAbows", "aid", "in", "disentangling", "incompatible", "structures", ",", "allow", "comparisons", "between", "clusters", "of", "folds", ",", "highlight", "differences", "between", "wild", "-", "type", "and", "mutant", "folds", ",", "and", "are", "also", "rathe...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Imogolite", "-", "like", "nanotubes", ":", "structure", ",", "stability", ",", "electronic", "and", "mechanical", "properties", "of", "the", "phosphorous", "and", "arsenic", "derivatives", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Imogolite", "is", "a", "single", "-", "walled", "aluminosilicate", "nanotube", "(", "NT", ")", "found", "in", "nature", "that", "can", "be", "easily", "synthesized", ",", "as", "well", "as", "its", "analogue", "aluminogermanate", "NT", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Based", "on", "geometrical", "assumptions", "and", "pKa", "values", ",", "species", "such", "as", "H3PO4", ",", "H3PO3", ",", "H3AsO3", ",", "H3AsO4", "could", "also", "be", "candidates", "to", "form", "imogolite", "-", "like", "structures", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "work", ",", "we", "provide", "insights", "about", "the", "stability", ",", "electronic", ",", "structural", "and", "mechanical", "properties", "of", "possible", "imogolite", "like", "NTs", "by", "means", "of", "self", "-", "consistent"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Similarly", "to", "aluminogermanate", ",", "where", "the", "tetrahedral", "silicate", "groups", "are", "replaced", "by", "germanate", ",", "in", "this", "work", "tetrahedral", "silicate", "groups", "are", "substituted", "by", "phosphate", ",", "phosphite", ",", ...

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL",...

[ "Detailed", "analysis", "is", "focused", "on", "structural", "properties", ",", "strain", "energy", ",", "band", "gap", "and", "Mulliken", "charges", "distribution", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "calculated", "strain", "energy", "curves", "for", "all", "studied", "zigzag", "imogolite", "-", "like", "NTs", "present", "well", "-", "defined", "minima", ",", "which", "change", "as", "a", "consequence", "of", "composition", "variation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "the", "strain", "energy", "curves", "of", "armchair", "imogolite", "-", "like", "NTs", "also", "present", "minima", ",", "although", "in", "all", "cases", "less", "stable", "than", "zigzags", "by", "at", "least", "2", ".", "2", "meV", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "insulating", "NT", "behaviour", "changes", "after", "internal", "modification", "from", "silicate", "to", "phosphate", ",", "phosphite", ",", "arsenate", "and", "arsenite", ",", "as", "well", "as", "the", "charge", "distribution", "inside", "and", "outsi...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "UDP", "-", "Glucuronosyltransferase", "(", "UGT", ")", "1A", "Polymorphism", "c", ".", "2042C", ">", "G", "(", "rs8330", ")", "Is", "Associated", "with", "Increased", "Human", "Liver", "Acetaminophen", "Glucuronidation", ",", "Increased", "UGT1A", "Exo...

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-C...

[ "Acetaminophen", "is", "cleared", "primarily", "by", "hepatic", "glucuronidation", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Polymorphisms", "in", "genes", "encoding", "the", "acetaminophen", "UDP", "-", "glucuronosyltransferase", "(", "UGT", ")", "enzymes", "could", "explain", "interindividual", "variability", "in", "acetaminophen", "glucuronidation", "and", "variable", "risk", "for", "li...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "human", "liver", "bank", "samples", "were", "phenotyped", "for", "acetaminophen", "glucuronidation", "activity", "and", "genotyped", "for", "the", "major", "acetaminophen", "-", "glucuronidating", "enzymes", "(", "UGTs", "1A1", ",", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "these", ",", "only", "three", "linked", "single", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "SNPs", ")", "located", "in", "the", "shared", "UGT1A", "-", "3", "'", "UTR", "region", "(", "rs10929303", ",", "rs1042640", ",", "rs8330", ")", "were", "associate...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O",...

[ "Mechanistic", "studies", "using", "luciferase", "-", "UGT1A", "-", "3", "'", "UTR", "reporters", "indicated", "that", "these", "SNPs", "do", "not", "alter", "mRNA", "stability", "or", "translation", "efficiency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "there", "was", "evidence", "for", "allelic", "imbalance", "and", "a", "gene", "-", "dose", "proportional", "increase", "in", "the", "amount", "of", "exon", "5a", "versus", "exon", "5b", "containing", "UGT1A", "mRNA", "spliced", "transcripts", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cotransfection", "studies", "demonstrated", "an", "inhibitory", "effect", "of", "exon", "5b", "containing", "cDNAs", "on", "acetaminophen", "glucuronidation", "by", "UGT1A1", "and", "UGT1A6", "cDNAs", "containing", "exon", "5a", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "silico", "analysis", "predicted", "that", "rs8330", "creates", "an", "exon", "splice", "enhancer", "site", "that", "could", "favor", "exon", "5a", "(", "over", "exon", "5b", ")", "utilization", "during", "splicing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "the", "prevalence", "of", "rs8330", "was", "significantly", "lower", "(", "P", "=", "0", ".", "027", ",", "chi", "(", "2", ")", "test", ")", "in", "patients", "who", "had", "acute", "liver", "failure", "from", "unintentional", "acetamino...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "Together", ",", "these", "findings", "suggest", "that", "rs8330", "is", "an", "important", "determinant", "of", "acetaminophen", "glucuronidation", "and", "could", "affect", "an", "individual", "'", "s", "risk", "for", "acetaminophen", "-", "induced", "liver", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Anthelmintic", "activity", "of", "the", "natural", "compound", "(", "+", ")", "-", "limonene", "epoxide", "against", "Schistosoma", "mansoni", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Blood", "fluke", "of", "the", "genus", "Schistosoma", "are", "the", "etiological", "agents", "of", "human", "schistosomiasis", ",", "an", "important", "neglected", "tropical", "disease", "that", "afflicts", "over", "200", "million", "people", "worldwide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "treatment", "for", "this", "disease", "relies", "heavily", "on", "a", "single", "drug", ",", "praziquantel", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Recent", "reports", "of", "praziquantel", "resistance", "raise", "concerns", "about", "future", "control", "of", "the", "disease", "and", "show", "the", "importance", "of", "developing", "new", "antischistosomal", "drugs", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Currently", ",", "natural", "products", "have", "been", "a", "good", "source", "for", "drug", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "(", "+", ")", "-", "Limonene", "epoxide", "is", "a", "mixture", "of", "cis", "and", "trans", "isomers", "found", "in", "many", "plants", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "report", "the", "in", "vitro", "effect", "of", "this", "natural", "compound", "on", "the", "survival", "time", "of", "Schistosoma", "mansoni", "adult", "worms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "we", "examined", "alterations", "on", "the", "tegumental", "surface", "of", "adult", "schistosomes", "by", "means", "of", "confocal", "laser", "scanning", "microscopy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effects", "of", "(", "+", ")", "-", "limonene", "epoxide", "at", "25", "micro", "g", "/", "mL", "on", "S", ".", "mansoni", "adult", "worms", "were", "similar", "to", "those", "of", "the", "positive", "control", "(", "praziquantel", ")", ",", ...

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Confocal", "laser", "scanning", "microscopy", "revealed", "that", "(", "+", ")", "-", "limonene", "epoxide", "-", "mediated", "worm", "killing", "was", "associated", "with", "tegumental", "destruction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", ",", "along", "with", "the", "low", "toxicity", "of", "the", "(", "+", ")", "-", "limonene", "epoxide", ",", "suggest", "that", "this", "natural", "compound", "might", "be", "promising", "for", "the", "development", "of", "new", "schistos...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Neuronatin", "-", "mediated", "aberrant", "calcium", "signaling", "and", "endoplasmic", "reticulum", "stress", "underlie", "neuropathology", "in", "Lafora", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Lafora", "disease", "(", "LD", ")", "is", "a", "teenage", "-", "onset", "inherited", "progressive", "myoclonus", "epilepsy", "characterized", "by", "the", "accumulations", "of", "intracellular", "inclusions", "called", "Lafora", "bodies", "and", "caused", "by", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "But", "how", "the", "loss", "of", "function", "of", "either", "laforin", "or", "malin", "causes", "disease", "pathogenesis", "is", "poorly", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recently", ",", "neuronatin", "was", "identified", "as", "a", "novel", "substrate", "of", "malin", "that", "regulates", "glycogen", "synthesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "demonstrate", "that", "the", "level", "of", "neuronatin", "is", "significantly", "up", "-", "regulated", "in", "the", "skin", "biopsy", "sample", "of", "LD", "patients", "having", "mutations", "in", "both", "malin", "and", "laforin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Neuronatin", "is", "highly", "expressed", "in", "human", "fetal", "brain", "with", "gradual", "decrease", "in", "expression", "in", "developing", "and", "adult", "brain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "in", "adult", "brain", ",", "neuronatin", "is", "predominantly", "expressed", "in", "parvalbumin", "-", "positive", "GABAergic", "interneurons", "and", "localized", "in", "their", "processes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "level", "of", "neuronatin", "is", "increased", "and", "accumulated", "as", "insoluble", "aggregates", "in", "the", "cortical", "area", "of", "LD", "brain", "biopsy", "samples", ",", "and", "there", "is", "also", "a", "dramatic", "loss", "of", "parval...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ectopic", "expression", "of", "neuronatin", "in", "cultured", "neuronal", "cells", "results", "in", "increased", "intracellular", "Ca", "(", "2", "+", ")", ",", "endoplasmic", "reticulum", "stress", ",", "proteasomal", "dysfunction", ",", "and", "cell", "death"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "suggest", "that", "the", "neuronatin", "-", "induced", "aberrant", "Ca", "(", "2", "+", ")", "signaling", "and", "endoplasmic", "reticulum", "stress", "might", "underlie", "LD", "pathogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Quantitative", "analysis", "of", "TALE", "-", "DNA", "interactions", "suggests", "polarity", "effects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transcription", "activator", "-", "like", "effectors", "(", "TALEs", ")", "have", "revolutionized", "the", "field", "of", "genome", "engineering", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "present", "here", "a", "systematic", "assessment", "of", "TALE", "DNA", "recognition", ",", "using", "quantitative", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "and", "reporter", "gene", "activation", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Within", "TALE", "proteins", ",", "tandem", "34", "-", "amino", "acid", "repeats", "recognize", "one", "base", "pair", "each", "and", "direct", "sequence", "-", "specific", "DNA", "binding", "through", "repeat", "variable", "di", "-", "residues", "(", "RVDs...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "that", "RVD", "choice", "can", "affect", "affinity", "by", "four", "orders", "of", "magnitude", ",", "with", "the", "relative", "RVD", "contribution", "in", "the", "order", "NG", ">", "HD", "~", "NN", ">>", "NI", ">", "NK", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "NN", "repeat", "preferred", "the", "base", "G", "over", "A", ",", "whereas", "the", "NK", "repeat", "bound", "G", "with", "10", "(", "3", ")", "-", "fold", "lower", "affinity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "compared", "AvrBs3", ",", "a", "naturally", "occurring", "TALE", "that", "recognizes", "its", "target", "using", "some", "atypical", "RVD", "-", "base", "combinations", ",", "with", "a", "designed", "TALE", "that", "precisely", "matches", "'", "standard...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "comparison", "revealed", "unexpected", "differences", "in", "sensitivity", "to", "substitutions", "of", "the", "invariant", "5", "'", "-", "T", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Another", "surprising", "observation", "was", "that", "base", "mismatches", "at", "the", "5", "'", "end", "of", "the", "target", "site", "had", "more", "disruptive", "effects", "on", "affinity", "than", "those", "at", "the", "3", "'", "end", ",", "particu...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "provide", "evidence", "that", "TALE", "-", "DNA", "recognition", "exhibits", "a", "hitherto", "un", "-", "described", "polarity", "effect", ",", "in", "which", "the", "N", "-", "terminal", "repeats", "contribute", "more", "to", "affinity",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transient", "receptor", "potential", "channels", "-", "emerging", "novel", "drug", "targets", "for", "the", "treatment", "of", "pain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "mammals", "several", "members", "of", "the", "Transient", "Receptor", "Potential", "channel", "family", "(", "TRPs", ")", ",", "expressed", "mainly", "in", "the", "sensory", "neurons", "and", "skin", "keratinocytes", ",", "are", "implicated", "in", "rel...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Since", "the", "TRPV1", "-", "4", ",", "TRPA1", "and", "TRPM8", "channels", "from", "this", "family", "play", "a", "pivotal", "role", "in", "both", "the", "detection", "and", "possibly", "modulation", "of", "painful", "stimuli", ",", "they", "are", "regar...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "few", "agents", "acting", "at", "TRPs", ",", "such", "as", "capsaicin", "or", "menthol", ",", "have", "a", "long", "history", "of", "their", "application", "as", "analgesics", ",", "whereas", "others", "(", "e", ".", "g", ".", "SB705498", ",", "J...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O"...

[ "In", "this", "review", "we", "discuss", "pain", "physiology", ",", "as", "well", "as", "the", "pharmacological", "properties", "of", "the", "TRPs", "involved", "in", "pain", "detection", "as", "potential", "critical", "peripheral", "analgesic", "targets", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "present", "one", "of", "the", "most", "relevant", "strategies", "in", "the", "search", "for", "novel", "analgesic", "drugs", ",", "namely", "the", "TRP", "channels", "and", "their", "ligands", ",", "both", "agonists", "and", "antagonists", "as", "pote...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "safety", "profile", "of", "these", "agents", ",", "in", "particular", "their", "impact", "on", "thermosensation", ",", "is", "also", "discussed", "below", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Photoactive", "analogs", "of", "farnesyl", "diphosphate", "and", "related", "isoprenoids", ":", "design", "and", "applications", "in", "studies", "of", "medicinally", "important", "isoprenoid", "-", "utilizing", "enzymes", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Farnesyl", "diphosphate", "(", "FPP", ")", "is", "an", "important", "metabolic", "intermediate", "in", "the", "biosynthesis", "of", "a", "variety", "of", "molecules", "including", "sesquiterpenes", "and", "the", "side", "chains", "of", "a", "number", "of", "c...

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "FPP", "is", "also", "the", "source", "of", "isoprenoid", "side", "chains", "found", "attached", "to", "proteins", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Enzymes", "that", "employ", "FPP", "as", "a", "substrate", "are", "of", "interest", "because", "they", "are", "involved", "in", "the", "semisynthesis", "of", "drugs", "as", "well", "as", "targets", "for", "drug", "design", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Photoactive", "analogs", "of", "FPP", "have", "been", "useful", "for", "identifying", "enzymes", "that", "use", "this", "molecule", "as", "a", "substrate", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "variety", "of", "photocrosslinking", "groups", "have", "been", "employed", "to", "prepare", "FPP", "analogs", "for", "use", "in", "such", "experiments", "including", "aryl", "azides", ",", "diazotrifluoropropionates", "and", "benzophenones", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "In", "this", "review", ",", "the", "design", "of", "these", "probes", "is", "described", "along", "with", "an", "examination", "of", "how", "they", "have", "been", "used", "in", "crosslinking", "experiments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Impact", "of", "quaternary", "structure", "dynamics", "on", "allosteric", "drug", "discovery", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "morpheein", "model", "of", "allosteric", "regulation", "draws", "attention", "to", "proteins", "that", "can", "exist", "as", "an", "equilibrium", "of", "functionally", "distinct", "assemblies", "where", ":", "one", "subunit", "conformation", "assembles", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "The", "case", "study", "of", "porphobilinogen", "synthase", "(", "PBGS", ")", "illustrates", "how", "such", "an", "equilibrium", "holds", "lessons", "for", "disease", "mechanisms", ",", "drug", "discovery", ",", "understanding", "drug", "side", "effects", ",", ...

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "morpheein", "model", "of", "allostery", "has", "been", "proposed", "as", "applicable", "for", "a", "wide", "assortment", "of", "disease", "-", "associated", "proteins", "(", "Selwood", ",", "T", ".", ",", "Jaffe", ",", "E", ".", ",", "(", "2012",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...