extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "CONCLUSION", ":", "The", "study", "clearly", "reveals", "the", "antimutagenic", "and", "antigenotoxic", "properties", "of", "SAE", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "<", "/", "abstract", ">" ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "Azidoacetylene", "-", "interpretation", "of", "gas", "phase", "infrared", "spectra", "based", "on", "high", "-", "level", "vibrational", "configuration", "interaction", "calculations", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Azidoacetylene", "is", "a", "highly", "explosive", "substance", ",", "which", "has", "been", "synthesized", "and", "characterized", "for", "the", "first", "time", "quite", "recently", "[", "Banert", "et", "al", ".", ",", "Angew", ".", "Chem", ".", ",", "I...	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "outlined", "in", "this", "work", ",", "the", "vibrational", "spectrum", "of", "azidoacetylene", "is", "dominated", "by", "strong", "couplings", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "that", "reason", ",", "we", "have", "studied", "the", "vibrational", "spectrum", "of", "the", "title", "compound", "by", "gas", "phase", "measurements", "and", "high", "-", "level", "vibrational", "structure", "calculations", "beyond", "the", "harmonic",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Based", "on", "the", "interplay", "of", "theory", "and", "experiment", ",", "we", "were", "able", "to", "identify", "all", "fundamentals", ",", "strong", "Fermi", "resonances", "and", "intense", "overtones", ",", "which", "contribute", "to", "the", "spectrum"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "5", "'", "flanking", "region", "of", "Gonadotropin", "Regulated", "Testicular", "RNA", "Helicase", "(", "GRTH", "/", "DDX25", ")", "gene", "directs", "its", "cell", "specific", "androgen", "regulated", "gene", "expression", "in", "testicular", "germ", "c...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gonadotropin", "Regulated", "Testicular", "RNA", "Helicase", "(", "GRTH", "/", "Ddx25", ")", "is", "a", "post", "-", "transcriptional", "regulator", "of", "genes", "that", "are", "essential", "for", "spermatid", "elongation", "and", "completion", "of", "spermat...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "also", "prevents", "Leydig", "cells", "(", "LC", ")", "from", "gonadotropin", "overstimulation", "of", "androgen", "production", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "In", "transgenic", "(", "Tg", ")", "mice", "carrying", "deletions", "of", "the", "GRTH", "5", "'", "flanking", "regions", "we", "previously", "demonstrated", "that", "the", "-", "1085", "bp", "to", "ATG", "contains", "the", "elements", "for", "basal", "an...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "No", "expression", "in", "germ", "cells", "(", "GC", ")", "was", "found", "with", "sequences", "extended", "up", "to", "-", "3", ".", "6", "Kb", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "define", "regulatory", "regions", "of", "GRTH", "required", "for", "expression", "in", "GC", ",", "Tg", "mice", "were", "generated", "with", "5", "'", "flanking", "sequence", "6", ".", "4", "Kb", "(", "6", ".", "4", "Kb", "-", "Tg", ")", "and"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "GFP", "was", "expressed", "in", "all", "lines", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Immuno", "-", "histochemistry", "analysis", "showed", "that", "6", ".", "4Kb", "-", "Tg", "directed", "GFP", "expression", "in", "both", "GC", "and", "LC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Deletion", "of", "the", "sequence", "-", "205", "bp", "to", "-", "3", ".", "6", "Kb", "(", "6", ".", "4Kb", "/", "del", "-", "Tg", ")", "directs", "GFP", "expression", "only", "in", "meiotic", "and", "haploid", "GCs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "indicated", "that", "the", "distal", "region", "-", "6", ".", "4", "Kb", "/", "-", "3", ".", "6", "Kb", "is", "required", "for", "GRTH", "cell", "specific", "expression", "in", "GC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Also", ",", "it", "inhibits", "the", "expression", "of", "GRTH", "in", "LC", "directed", "by", "the", "205", "bp", "promoter", ",", "an", "effect", "that", "is", "neutralized", "by", "the", "-", "3", ".", "6Kb", "/", "-", "205bp", "sequence", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Flutamide", "treatment", "prevents", "GFP", "/", "GRTH", "expression", "in", "Tg", "lines", "demonstrating", "in", "vivo", "direct", "and", "indirect", "effects", "of", "endogenous", "androgen", "on", "GC", "and", "LC", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "studies", "have", "generated", "and", "characterized", "transgenic", "lines", "that", "can", "be", "utilized", "to", "define", "requirements", "for", "cell", "specific", "expression", "of", "the", "GRTH", "gene", "and", "to", "further", "advance", "our",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Estrogen", "Receptor", "-", "alpha", "Variant", ",", "ER", "-", "alpha", "36", ",", "is", "Involved", "in", "Tamoxifen", "Resistance", "and", "Estrogen", "Hypersensitivity", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Antiestrogens", "such", "as", "tamoxifen", "provided", "a", "successful", "treatment", "for", "ER", "-", "positive", "breast", "cancer", "for", "the", "past", "two", "decades", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "most", "breast", "tumors", "are", "eventually", "resistant", "to", "tamoxifen", "therapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "molecular", "mechanisms", "underlying", "tamoxifen", "resistance", "have", "not", "been", "well", "established", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", ",", "we", "reported", "that", "breast", "cancer", "patients", "with", "tumors", "expressing", "high", "concentrations", "of", "ER", "-", "alpha", "36", ",", "a", "variant", "of", "ER", "-", "alpha", ",", "benefited", "less", "from", "tamoxifen",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "Here", ",", "we", "investigated", "the", "function", "and", "underlying", "mechanism", "of", "ER", "-", "alpha", "36", "in", "tamoxifen", "resistance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "We", "found", "that", "tamoxifen", "increased", "ER", "-", "alpha", "36", "concentrations", "and", "tamoxifen", "-", "resistant", "MCF7", "cells", "expressed", "high", "concentrations", "of", "ER", "-", "alpha", "36", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "MCF7", "cells", "with", "forced", "expression", "of", "recombinant", "ER", "-", "alpha", "36", "and", "H3396", "cells", "expressing", "high", "concentrations", "of", "endogenous", "ER", "-", "alpha", "36", "were", "resistant", "to", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "ER", "-", "alpha", "36", "downregulation", "in", "tamoxifen", "-", "resistant", "cells", "with", "the", "shRNA", "method", "restored", "tamoxifen", "sensitivity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "We", "also", "found", "tamoxifen", "acted", "as", "a", "potent", "agonist", "by", "activating", "phosphorylation", "of", "the", "AKT", "kinase", "in", "ER", "-", "alpha", "36", "expressing", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "we", "found", "that", "cells", "with", "high", "concentration", "of", "ER", "-", "alpha", "36", "protein", "were", "hypersensitive", "to", "estrogen", ";", "activating", "ERK", "phosphorylation", "at", "pM", "range", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "thus", "demonstrated", "that", "elevated", "ER", "-", "alpha", "36", "concentration", "is", "one", "of", "the", "mechanisms", "by", "which", "ER", "-", "positive", "breast", "cancer", "cells", "escape", "tamoxifen", "therapy", "and", "provid...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ "Ovarian", "Expression", "of", "Insulin", "-", "Like", "Peptide", "3", "(", "INSL3", ")", "and", "Its", "Receptor", "(", "RXFP2", ")", "During", "Development", "of", "Bovine", "Antral", "Follicles", "and", "Corpora", "Lutea", "and", "Measurement", "of", "Cir...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Insulin", "-", "like", "peptide", "3", "(", "INSL3", ")", ",", "a", "major", "product", "of", "testicular", "Leydig", "cells", ",", "is", "also", "expressed", "by", "the", "ovary", ",", "but", "its", "functional", "role", "remains", "poorly", "understood"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "quantified", "expression", "of", "INSL3", "and", "its", "receptor", "RXFP2", "in", "theca", "interna", "cell", "(", "TIC", ")", "and", "granulosa", "cell", "compartments", "of", "developing", "bovine", "antral", "follicles", "and", "in", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "INSL3", "and", "RXFP2", "mRNA", "levels", "were", "much", "higher", "in", "TIC", "than", "granulosa", "cell", "and", "increased", "progressively", "during", "follicle", "maturation", "with", "INSL3", "peaking", "in", "large", "(", "11", "-", "18", "mm", ")"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "Expression", "of", "both", "INSL3", "and", "RXFP2", "in", "CL", "was", "much", "lower", "than", "in", "TIC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "situ", "hybridization", "and", "immunohistochemistry", "confirmed", "abundant", "expression", "of", "INSL3", "mRNA", "and", "protein", "in", "TIC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "observations", "indicate", "follicular", "TIC", "rather", "than", "CL", "as", "the", "primary", "site", "of", "both", "INSL3", "production", "and", "action", ",", "implying", "a", "predominantly", "autocrine", "/", "paracrine", "role", "in", "TIC", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "corroborate", "the", "above", "findings", ",", "we", "showed", "that", "in", "vitro", "exposure", "of", "TIC", "to", "a", "luteinizing", "concentration", "of", "LH", "greatly", "attenuated", "expression", "of", "both", "INSL3", "and", "its", "receptor",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "in", "vivo", ",", "a", "significant", "cyclic", "variation", "in", "plasma", "INSL3", "was", "observed", "during", "synchronized", "estrous", "cycles", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "INSL3", "and", "estradiol", "-", "17", "beta", "followed", "a", "similar", "pattern", ",", "both", "increasing", "after", "luteolysis", ",", "before", "falling", "sharply", "after", "the", "LH", "surge", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "theca", "-", "derived", "INSL3", ",", "likely", "from", "the", "dominant", "preovulatory", "follicle", ",", "is", "detectable", "in", "peripheral", "blood", "of", "cattle", ",", "and", "expression", "is", "down", "-", "regulated", "during", "lu...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Collectively", ",", "these", "findings", "underscore", "the", "likely", "role", "of", "INSL3", "as", "an", "important", "intrafollicular", "modulator", "of", "TIC", "function", "/", "steroidogenesis", ",", "while", "raising", "doubts", "about", "its", "potential"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ionizing", "radiation", "-", "inducible", "microRNA", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "induces", "apoptosis", "by", "directly", "targeting", "Mcl", "-", "1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "functions", "of", "microRNAs", "(", "miRNAs", ")", "as", "either", "oncogenes", "or", "tumor", "suppressors", "in", "regulating", "cancer", "-", "related", "events", "have", "been", "established", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "analyzed", "the", "alterations", "in", "the", "miRNA", "expression", "profile", "of", "the", "glioma", "cell", "line", "U", "-", "251", "caused", "by", "ionizing", "radiation", "(", "IR", ")", "by", "using", "an", "miRNA", "array", "and", "identifie...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Among", "the", "IR", "-", "responsive", "miRNAs", ",", "we", "further", "examined", "the", "function", "of", "miR", "-", "193a", "-", "3p", ",", "which", "exhibited", "the", "most", "significant", "growth", "-", "inhibiting", "effect", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "miR", "-", "193a", "-", "3p", "was", "observed", "to", "induce", "apoptosis", "in", "both", "U", "-", "251", "and", "HeLa", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "also", "demonstrated", "that", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "induces", "the", "accumulation", "of", "intracellular", "reactive", "oxygen", "species", "(", "ROS", ")", "and", "DNA", "damage", "as", "determined", "by", "the", "level", "of", "gamma", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "induction", "of", "both", "apoptosis", "and", "DNA", "damage", "by", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "was", "blocked", "by", "antioxidant", "treatment", ",", "indicating", "the", "crucial", "role", "of", "ROS", "in", "the", "action", "of", "miR", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Among", "the", "putative", "target", "proteins", ",", "the", "expression", "of", "Mcl", "-", "1", ",", "an", "anti", "-", "apoptotic", "Bcl", "-", "2", "family", "member", ",", "decreased", "because", "of", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "transfection",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "reporter", "assay", "using", "a", "luciferase", "construct", "containing", "the", "3", "'", "-", "untranslated", "region", "of", "Mcl", "-", "1", "confirmed", "that", "Mcl", "-", "1", "is", "a", "direct", "target", "of", "miR", "-", "193a", "-", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Down", "-", "regulation", "of", "Mcl", "-", "1", "by", "siRNA", "transfection", "closely", "mimicked", "the", "outcome", "of", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "transfection", "showing", "increased", "ROS", ",", "DNA", "damage", ",", "cytochrome", "c", "rel...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ectopic", "expression", "of", "Mcl", "-", "1", "suppressed", "the", "pro", "-", "apoptotic", "action", "of", "miR", "-", "193a", "-", "3p", ",", "suggesting", "that", "Mcl", "-", "1", "depletion", "is", "critical", "for", "miR", "-", "193a", "-", "3p"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Collectively", ",", "our", "results", "suggest", "a", "novel", "function", "for", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "and", "its", "potential", "application", "in", "cancer", "therapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Site", "-", "specific", "O", "-", "glycosylation", "on", "the", "MUC2", "mucin", "inhibits", "cleavage", "by", "the", "Porphyromonas", "gingivalis", "secreted", "cysteine", "protease", "(", "RgpB", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "colonic", "epithelial", "surface", "is", "protected", "by", "an", "inner", "mucus", "layer", "which", "the", "commensal", "microflora", "cannot", "penetrate", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "previously", "demonstrated", "that", "Entamoeba", "histolytica", "(", "E", ".", "h", ".", ")", "secretes", "a", "protease", "capable", "of", "dissolving", "this", "layer", "that", "is", "required", "for", "parasite", "penetration", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "asked", "if", "there", "are", "bacteria", "that", "can", "secrete", "similar", "proteases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "screened", "bacterial", "culture", "supernatants", "for", "such", "activity", "using", "recombinant", "fragments", "of", "the", "MUC2", "mucin", ",", "the", "major", "structural", "component", "and", "the", "only", "gel", "-", "forming", "mucin", "in", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MUC2", "has", "two", "central", "heavily", "O", "-", "glycosylated", "mucin", "domains", "that", "are", "protease", "-", "resistant", "and", "has", "cysteine", "rich", "N", "-", "and", "C", "-", "termini", "responsible", "for", "polymerization", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Culture", "supernatants", "of", "Porphyromonas", "gingivalis", "(", "P", ".", "g", ".", ")", ",", "a", "bacterium", "that", "secretes", "proteases", "responsible", "for", "periodontitis", ",", "cleaved", "the", "MUC2", "-", "C", "terminal", "region", ",", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "active", "enzyme", "was", "isolated", "and", "identified", "as", "Arg", "-", "gingipain", "B", "(", "RgpB", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Two", "cleavage", "sites", "were", "localized", "to", "IR", "v", "TT", "and", "NR", "v", "QA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IR", "v", "TT", "cleavage", "will", "disrupt", "the", "MUC2", "polymers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "this", "site", "has", "two", "potential", "O", "-", "glycosylation", "sites", "we", "tested", "whether", "recombinant", "GalNAc", "-", "transferases", "(", "GalNAc", "-", "Ts", ")", "could", "glycosylate", "a", "synthetic", "peptide", "covering", "the",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Only", "GalNAc", "-", "T3", "was", "able", "to", "glycosylate", "the", "second", "Thr", "in", "IRTT", ",", "rendering", "the", "sequence", "resistant", "to", "cleavage", "by", "RgpB", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "when", "GalNAc", "-", "T3", "was", "expressed", "in", "CHO", "-", "cells", "expressing", "the", "MUC2", "C", "-", "terminal", ",", "the", "second", "threonine", "was", "glycosylated", "and", "the", "protein", "became", "resistant", "to",...	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "suggest", "that", "bacteria", "can", "produce", "proteases", "capable", "of", "dissolving", "the", "inner", "protective", "mucus", "layer", "by", "specific", "cleavages", "in", "the", "MUC2", "mucin", "and", "that", "this", "cleavage", "can...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "Biological", "Active", "Analogues", "of", "the", "Opioid", "Peptide", "Biphalin", ":", "Mixed", "alpha", "/", "beta", "(", "3", ")", "-", "Peptides", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Natural", "residues", "of", "the", "dimeric", "opioid", "peptide", "Biphalin", "were", "replaced", "by", "the", "corresponding", "homo", "-", "beta", "(", "3", ")", "amino", "acids", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "derivative", "1", "containing", "h", "beta", "(", "3", ")", "Phe", "in", "place", "of", "Phe", "showed", "good", "mu", "-", "and", "delta", "-", "receptor", "affinities", "(", "Ki", "(", "delta", ")", "=", "0", ".", "72", "nM", ";", "Ki", ...	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "3", "-", "Hydroxypyridin", "-", "2", "-", "thione", "as", "Novel", "Zinc", "Binding", "Group", "for", "Selective", "Histone", "Deacetylase", "Inhibition", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Small", "molecules", "bearing", "hydroxamic", "acid", "as", "the", "zinc", "binding", "group", "(", "ZBG", ")", "have", "been", "the", "most", "effective", "histone", "deacetylase", "inhibitors", "(", "HDACi", ")", "to", "date", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "concerns", "about", "the", "pharmacokinetic", "liabilities", "of", "the", "hydroxamic", "acid", "moiety", "have", "stimulated", "research", "efforts", "aimed", "at", "finding", "alternative", "nonhydroxamate", "ZBGs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "identified", "3", "-", "hydroxypyridin", "-", "2", "-", "thione", "(", "3", "-", "HPT", ")", "as", "a", "novel", "ZBG", "that", "is", "compatible", "with", "HDAC", "inhibition", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "3", "-", "HPT", "inhibits", "HDAC", "6", "and", "HDAC", "8", "with", "an", "IC50", "of", "681", "and", "3675", "nM", ",", "respectively", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Remarkably", ",", "3", "-", "HPT", "gives", "no", "inhibition", "of", "HDAC", "1", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Subsequent", "optimization", "led", "to", "several", "novel", "3HPT", "-", "based", "HDACi", "that", "are", "selective", "for", "HDAC", "6", "and", "HDAC", "8", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "a", "subset", "of", "these", "inhibitors", "induces", "apoptosis", "in", "various", "cancer", "cell", "lines", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Oxadiazole", "-", "isopropylamides", "as", "potent", "and", "non", "-", "covalent", "proteasome", "inhibitors", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Abstract", "Screening", "of", "the", "50", ",", "000", "ChemBridge", "compound", "library", "led", "to", "the", "identification", "of", "the", "oxadiazole", "-", "isopropylamide", "1", "(", "PI", "-", "1833", ")", "which", "inhibited", "CT", "-", "L", "ac...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"...
[ "LC", "/", "MS", "-", "MS", "and", "dialysis", "show", "that", "1", "is", "a", "non", "-", "covalent", "and", "rapidly", "reversible", "CT", "-", "L", "inhibitor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Focused", "library", "synthesis", "provided", "11ad", "(", "PI", "-", "1840", ")", "with", "CT", "-", "L", "activity", "(", "IC50", "27", "nM", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Detailed", "SAR", "studies", "indicate", "that", "the", "amide", "moiety", "and", "the", "2", "phenyl", "rings", "are", "sensitive", "toward", "modifications", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hydrophobic", "residues", ",", "such", "as", "propyl", "or", "butyl", ",", "in", "the", "para", "-", "position", "(", "not", "ortho", "or", "meta", ")", "of", "the", "A", "-", "ring", "and", "a", "meta", "-", "pyridyl", "group", "as", "B", "-", "r...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Compound", "11ad", "(", "IC50", "0", ".", "37", "micro", "M", ")", "is", "more", "potent", "than", "1", "(", "IC50", "3", ".", "5", "micro", "M", ")", "at", "inhibiting", "CT", "-", "L", "activity", "in", "intact", "MDA", "-", "MB", "-", "468", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "activity", "of", "11ad", "warrants", "further", "pre", "-", "clinical", "investigation", "of", "this", "class", "as", "non", "-", "covalent", "proteasome", "inhibitors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Potent", "Proteasome", "Inhibitors", "Derived", "from", "the", "Unnatural", "Cis", "-", "Cyclopropane", "Isomer", "of", "Belactosin", "A", ":", "Synthesis", ",", "Biological", "Activity", ",", "and", "Mode", "of", "Action", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "natural", "product", "belactosin", "A", "(", "1", ")", "with", "a", "trans", "-", "cyclopropane", "structure", "is", "a", "useful", "prototype", "compound", "for", "developing", "potent", "proteasome", "(", "core", "particle", ",", "CP", ")", "inhibi...	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "date", ",", "1", "and", "its", "analogs", "are", "the", "only", "CP", "ligands", "bind", "to", "both", "the", "non", "-", "primed", "S1", "pocket", "as", "well", "as", "the", "primed", "substrate", "binding", "channel", ",", "however", ",", "the...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "We", "have", "performed", "structure", "activity", "relationship", "studies", ",", "hereby", "elucidating", "unnatural", "cis", "-", "cyclopropane", "derivatives", "of", "1", "that", "exhibit", "high", "potency", "to", "primarily", "block", "the", "chymotrypsin", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...
[ "The", "most", "active", "compound", "3e", "reversibly", "inhibits", "cCP", "and", "iCP", "similarly", "with", "an", "IC50", "of", "5", ".", "7", "nM", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "X", "-", "ray", "crystallographic", "analysis", "of", "the", "yeast", "proteasome", "in", "complex", "with", "3e", "revealed", "that", "the", "ligand", "accommodates", "predominantly", "to", "the", "primed", "substrate", "binding", "channel", "and", "covalently",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", ...
[ "Development", "of", "an", "ALK2", "-", "Biased", "BMP", "Type", "I", "Receptor", "Kinase", "Inhibitor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "bone", "morphogenetic", "protein", "(", "BMP", ")", "signaling", "pathway", "has", "essential", "functions", "in", "development", ",", "homeostasis", ",", "and", "the", "normal", "and", "pathophysiologic", "remodeling", "of", "tissues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Small", "molecule", "inhibitors", "of", "the", "BMP", "receptor", "kinase", "family", "have", "been", "useful", "for", "probing", "physiologic", "functions", "of", "BMP", "signaling", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "and", "may", "have", "roles", "in", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "describe", "the", "development", "of", "a", "selective", "and", "potent", "inhibitor", "of", "the", "BMP", "type", "I", "receptor", "kinases", ",", "LDN", "-", "212854", ",", "which", "in", "contrast", "to", "previously", "described", "BMP", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...
[ "In", "vitro", ",", "LDN", "-", "212854", "exhibits", "some", "selectivity", "for", "ALK2", "in", "preference", "to", "other", "BMP", "type", "I", "receptors", ",", "ALK1", "and", "ALK3", ",", "which", "may", "permit", "the", "interrogation", "of", "ALK2",...	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CONCLUSION", ":", "The", "study", "clearly", "reveals", "the", "antimutagenic", "and", "antigenotoxic", "properties", "of", "SAE", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "<", "/", "abstract", ">" ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "Azidoacetylene", "-", "interpretation", "of", "gas", "phase", "infrared", "spectra", "based", "on", "high", "-", "level", "vibrational", "configuration", "interaction", "calculations", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Azidoacetylene", "is", "a", "highly", "explosive", "substance", ",", "which", "has", "been", "synthesized", "and", "characterized", "for", "the", "first", "time", "quite", "recently", "[", "Banert", "et", "al", ".", ",", "Angew", ".", "Chem", ".", ",", "I...

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "outlined", "in", "this", "work", ",", "the", "vibrational", "spectrum", "of", "azidoacetylene", "is", "dominated", "by", "strong", "couplings", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "that", "reason", ",", "we", "have", "studied", "the", "vibrational", "spectrum", "of", "the", "title", "compound", "by", "gas", "phase", "measurements", "and", "high", "-", "level", "vibrational", "structure", "calculations", "beyond", "the", "harmonic",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Based", "on", "the", "interplay", "of", "theory", "and", "experiment", ",", "we", "were", "able", "to", "identify", "all", "fundamentals", ",", "strong", "Fermi", "resonances", "and", "intense", "overtones", ",", "which", "contribute", "to", "the", "spectrum"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "5", "'", "flanking", "region", "of", "Gonadotropin", "Regulated", "Testicular", "RNA", "Helicase", "(", "GRTH", "/", "DDX25", ")", "gene", "directs", "its", "cell", "specific", "androgen", "regulated", "gene", "expression", "in", "testicular", "germ", "c...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Gonadotropin", "Regulated", "Testicular", "RNA", "Helicase", "(", "GRTH", "/", "Ddx25", ")", "is", "a", "post", "-", "transcriptional", "regulator", "of", "genes", "that", "are", "essential", "for", "spermatid", "elongation", "and", "completion", "of", "spermat...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "also", "prevents", "Leydig", "cells", "(", "LC", ")", "from", "gonadotropin", "overstimulation", "of", "androgen", "production", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "In", "transgenic", "(", "Tg", ")", "mice", "carrying", "deletions", "of", "the", "GRTH", "5", "'", "flanking", "regions", "we", "previously", "demonstrated", "that", "the", "-", "1085", "bp", "to", "ATG", "contains", "the", "elements", "for", "basal", "an...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "No", "expression", "in", "germ", "cells", "(", "GC", ")", "was", "found", "with", "sequences", "extended", "up", "to", "-", "3", ".", "6", "Kb", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "define", "regulatory", "regions", "of", "GRTH", "required", "for", "expression", "in", "GC", ",", "Tg", "mice", "were", "generated", "with", "5", "'", "flanking", "sequence", "6", ".", "4", "Kb", "(", "6", ".", "4", "Kb", "-", "Tg", ")", "and"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "GFP", "was", "expressed", "in", "all", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immuno", "-", "histochemistry", "analysis", "showed", "that", "6", ".", "4Kb", "-", "Tg", "directed", "GFP", "expression", "in", "both", "GC", "and", "LC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Deletion", "of", "the", "sequence", "-", "205", "bp", "to", "-", "3", ".", "6", "Kb", "(", "6", ".", "4Kb", "/", "del", "-", "Tg", ")", "directs", "GFP", "expression", "only", "in", "meiotic", "and", "haploid", "GCs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "indicated", "that", "the", "distal", "region", "-", "6", ".", "4", "Kb", "/", "-", "3", ".", "6", "Kb", "is", "required", "for", "GRTH", "cell", "specific", "expression", "in", "GC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Also", ",", "it", "inhibits", "the", "expression", "of", "GRTH", "in", "LC", "directed", "by", "the", "205", "bp", "promoter", ",", "an", "effect", "that", "is", "neutralized", "by", "the", "-", "3", ".", "6Kb", "/", "-", "205bp", "sequence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Flutamide", "treatment", "prevents", "GFP", "/", "GRTH", "expression", "in", "Tg", "lines", "demonstrating", "in", "vivo", "direct", "and", "indirect", "effects", "of", "endogenous", "androgen", "on", "GC", "and", "LC", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "studies", "have", "generated", "and", "characterized", "transgenic", "lines", "that", "can", "be", "utilized", "to", "define", "requirements", "for", "cell", "specific", "expression", "of", "the", "GRTH", "gene", "and", "to", "further", "advance", "our",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Estrogen", "Receptor", "-", "alpha", "Variant", ",", "ER", "-", "alpha", "36", ",", "is", "Involved", "in", "Tamoxifen", "Resistance", "and", "Estrogen", "Hypersensitivity", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Antiestrogens", "such", "as", "tamoxifen", "provided", "a", "successful", "treatment", "for", "ER", "-", "positive", "breast", "cancer", "for", "the", "past", "two", "decades", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "most", "breast", "tumors", "are", "eventually", "resistant", "to", "tamoxifen", "therapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "The", "molecular", "mechanisms", "underlying", "tamoxifen", "resistance", "have", "not", "been", "well", "established", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recently", ",", "we", "reported", "that", "breast", "cancer", "patients", "with", "tumors", "expressing", "high", "concentrations", "of", "ER", "-", "alpha", "36", ",", "a", "variant", "of", "ER", "-", "alpha", ",", "benefited", "less", "from", "tamoxifen",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "Here", ",", "we", "investigated", "the", "function", "and", "underlying", "mechanism", "of", "ER", "-", "alpha", "36", "in", "tamoxifen", "resistance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "We", "found", "that", "tamoxifen", "increased", "ER", "-", "alpha", "36", "concentrations", "and", "tamoxifen", "-", "resistant", "MCF7", "cells", "expressed", "high", "concentrations", "of", "ER", "-", "alpha", "36", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "MCF7", "cells", "with", "forced", "expression", "of", "recombinant", "ER", "-", "alpha", "36", "and", "H3396", "cells", "expressing", "high", "concentrations", "of", "endogenous", "ER", "-", "alpha", "36", "were", "resistant", "to", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "ER", "-", "alpha", "36", "downregulation", "in", "tamoxifen", "-", "resistant", "cells", "with", "the", "shRNA", "method", "restored", "tamoxifen", "sensitivity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "We", "also", "found", "tamoxifen", "acted", "as", "a", "potent", "agonist", "by", "activating", "phosphorylation", "of", "the", "AKT", "kinase", "in", "ER", "-", "alpha", "36", "expressing", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "we", "found", "that", "cells", "with", "high", "concentration", "of", "ER", "-", "alpha", "36", "protein", "were", "hypersensitive", "to", "estrogen", ";", "activating", "ERK", "phosphorylation", "at", "pM", "range", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "thus", "demonstrated", "that", "elevated", "ER", "-", "alpha", "36", "concentration", "is", "one", "of", "the", "mechanisms", "by", "which", "ER", "-", "positive", "breast", "cancer", "cells", "escape", "tamoxifen", "therapy", "and", "provid...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ "Ovarian", "Expression", "of", "Insulin", "-", "Like", "Peptide", "3", "(", "INSL3", ")", "and", "Its", "Receptor", "(", "RXFP2", ")", "During", "Development", "of", "Bovine", "Antral", "Follicles", "and", "Corpora", "Lutea", "and", "Measurement", "of", "Cir...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Insulin", "-", "like", "peptide", "3", "(", "INSL3", ")", ",", "a", "major", "product", "of", "testicular", "Leydig", "cells", ",", "is", "also", "expressed", "by", "the", "ovary", ",", "but", "its", "functional", "role", "remains", "poorly", "understood"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "quantified", "expression", "of", "INSL3", "and", "its", "receptor", "RXFP2", "in", "theca", "interna", "cell", "(", "TIC", ")", "and", "granulosa", "cell", "compartments", "of", "developing", "bovine", "antral", "follicles", "and", "in", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "INSL3", "and", "RXFP2", "mRNA", "levels", "were", "much", "higher", "in", "TIC", "than", "granulosa", "cell", "and", "increased", "progressively", "during", "follicle", "maturation", "with", "INSL3", "peaking", "in", "large", "(", "11", "-", "18", "mm", ")"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "Expression", "of", "both", "INSL3", "and", "RXFP2", "in", "CL", "was", "much", "lower", "than", "in", "TIC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "situ", "hybridization", "and", "immunohistochemistry", "confirmed", "abundant", "expression", "of", "INSL3", "mRNA", "and", "protein", "in", "TIC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "observations", "indicate", "follicular", "TIC", "rather", "than", "CL", "as", "the", "primary", "site", "of", "both", "INSL3", "production", "and", "action", ",", "implying", "a", "predominantly", "autocrine", "/", "paracrine", "role", "in", "TIC", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "corroborate", "the", "above", "findings", ",", "we", "showed", "that", "in", "vitro", "exposure", "of", "TIC", "to", "a", "luteinizing", "concentration", "of", "LH", "greatly", "attenuated", "expression", "of", "both", "INSL3", "and", "its", "receptor",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "in", "vivo", ",", "a", "significant", "cyclic", "variation", "in", "plasma", "INSL3", "was", "observed", "during", "synchronized", "estrous", "cycles", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "INSL3", "and", "estradiol", "-", "17", "beta", "followed", "a", "similar", "pattern", ",", "both", "increasing", "after", "luteolysis", ",", "before", "falling", "sharply", "after", "the", "LH", "surge", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "theca", "-", "derived", "INSL3", ",", "likely", "from", "the", "dominant", "preovulatory", "follicle", ",", "is", "detectable", "in", "peripheral", "blood", "of", "cattle", ",", "and", "expression", "is", "down", "-", "regulated", "during", "lu...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Collectively", ",", "these", "findings", "underscore", "the", "likely", "role", "of", "INSL3", "as", "an", "important", "intrafollicular", "modulator", "of", "TIC", "function", "/", "steroidogenesis", ",", "while", "raising", "doubts", "about", "its", "potential"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ionizing", "radiation", "-", "inducible", "microRNA", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "induces", "apoptosis", "by", "directly", "targeting", "Mcl", "-", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "functions", "of", "microRNAs", "(", "miRNAs", ")", "as", "either", "oncogenes", "or", "tumor", "suppressors", "in", "regulating", "cancer", "-", "related", "events", "have", "been", "established", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "analyzed", "the", "alterations", "in", "the", "miRNA", "expression", "profile", "of", "the", "glioma", "cell", "line", "U", "-", "251", "caused", "by", "ionizing", "radiation", "(", "IR", ")", "by", "using", "an", "miRNA", "array", "and", "identifie...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Among", "the", "IR", "-", "responsive", "miRNAs", ",", "we", "further", "examined", "the", "function", "of", "miR", "-", "193a", "-", "3p", ",", "which", "exhibited", "the", "most", "significant", "growth", "-", "inhibiting", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "miR", "-", "193a", "-", "3p", "was", "observed", "to", "induce", "apoptosis", "in", "both", "U", "-", "251", "and", "HeLa", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "demonstrated", "that", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "induces", "the", "accumulation", "of", "intracellular", "reactive", "oxygen", "species", "(", "ROS", ")", "and", "DNA", "damage", "as", "determined", "by", "the", "level", "of", "gamma", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "induction", "of", "both", "apoptosis", "and", "DNA", "damage", "by", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "was", "blocked", "by", "antioxidant", "treatment", ",", "indicating", "the", "crucial", "role", "of", "ROS", "in", "the", "action", "of", "miR", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Among", "the", "putative", "target", "proteins", ",", "the", "expression", "of", "Mcl", "-", "1", ",", "an", "anti", "-", "apoptotic", "Bcl", "-", "2", "family", "member", ",", "decreased", "because", "of", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "transfection",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "reporter", "assay", "using", "a", "luciferase", "construct", "containing", "the", "3", "'", "-", "untranslated", "region", "of", "Mcl", "-", "1", "confirmed", "that", "Mcl", "-", "1", "is", "a", "direct", "target", "of", "miR", "-", "193a", "-", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Down", "-", "regulation", "of", "Mcl", "-", "1", "by", "siRNA", "transfection", "closely", "mimicked", "the", "outcome", "of", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "transfection", "showing", "increased", "ROS", ",", "DNA", "damage", ",", "cytochrome", "c", "rel...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ectopic", "expression", "of", "Mcl", "-", "1", "suppressed", "the", "pro", "-", "apoptotic", "action", "of", "miR", "-", "193a", "-", "3p", ",", "suggesting", "that", "Mcl", "-", "1", "depletion", "is", "critical", "for", "miR", "-", "193a", "-", "3p"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Collectively", ",", "our", "results", "suggest", "a", "novel", "function", "for", "miR", "-", "193a", "-", "3p", "and", "its", "potential", "application", "in", "cancer", "therapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Site", "-", "specific", "O", "-", "glycosylation", "on", "the", "MUC2", "mucin", "inhibits", "cleavage", "by", "the", "Porphyromonas", "gingivalis", "secreted", "cysteine", "protease", "(", "RgpB", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "colonic", "epithelial", "surface", "is", "protected", "by", "an", "inner", "mucus", "layer", "which", "the", "commensal", "microflora", "cannot", "penetrate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "previously", "demonstrated", "that", "Entamoeba", "histolytica", "(", "E", ".", "h", ".", ")", "secretes", "a", "protease", "capable", "of", "dissolving", "this", "layer", "that", "is", "required", "for", "parasite", "penetration", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "asked", "if", "there", "are", "bacteria", "that", "can", "secrete", "similar", "proteases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "screened", "bacterial", "culture", "supernatants", "for", "such", "activity", "using", "recombinant", "fragments", "of", "the", "MUC2", "mucin", ",", "the", "major", "structural", "component", "and", "the", "only", "gel", "-", "forming", "mucin", "in", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MUC2", "has", "two", "central", "heavily", "O", "-", "glycosylated", "mucin", "domains", "that", "are", "protease", "-", "resistant", "and", "has", "cysteine", "rich", "N", "-", "and", "C", "-", "termini", "responsible", "for", "polymerization", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Culture", "supernatants", "of", "Porphyromonas", "gingivalis", "(", "P", ".", "g", ".", ")", ",", "a", "bacterium", "that", "secretes", "proteases", "responsible", "for", "periodontitis", ",", "cleaved", "the", "MUC2", "-", "C", "terminal", "region", ",", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "active", "enzyme", "was", "isolated", "and", "identified", "as", "Arg", "-", "gingipain", "B", "(", "RgpB", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "cleavage", "sites", "were", "localized", "to", "IR", "v", "TT", "and", "NR", "v", "QA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IR", "v", "TT", "cleavage", "will", "disrupt", "the", "MUC2", "polymers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "this", "site", "has", "two", "potential", "O", "-", "glycosylation", "sites", "we", "tested", "whether", "recombinant", "GalNAc", "-", "transferases", "(", "GalNAc", "-", "Ts", ")", "could", "glycosylate", "a", "synthetic", "peptide", "covering", "the",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Only", "GalNAc", "-", "T3", "was", "able", "to", "glycosylate", "the", "second", "Thr", "in", "IRTT", ",", "rendering", "the", "sequence", "resistant", "to", "cleavage", "by", "RgpB", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "when", "GalNAc", "-", "T3", "was", "expressed", "in", "CHO", "-", "cells", "expressing", "the", "MUC2", "C", "-", "terminal", ",", "the", "second", "threonine", "was", "glycosylated", "and", "the", "protein", "became", "resistant", "to",...

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "suggest", "that", "bacteria", "can", "produce", "proteases", "capable", "of", "dissolving", "the", "inner", "protective", "mucus", "layer", "by", "specific", "cleavages", "in", "the", "MUC2", "mucin", "and", "that", "this", "cleavage", "can...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "Biological", "Active", "Analogues", "of", "the", "Opioid", "Peptide", "Biphalin", ":", "Mixed", "alpha", "/", "beta", "(", "3", ")", "-", "Peptides", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Natural", "residues", "of", "the", "dimeric", "opioid", "peptide", "Biphalin", "were", "replaced", "by", "the", "corresponding", "homo", "-", "beta", "(", "3", ")", "amino", "acids", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "derivative", "1", "containing", "h", "beta", "(", "3", ")", "Phe", "in", "place", "of", "Phe", "showed", "good", "mu", "-", "and", "delta", "-", "receptor", "affinities", "(", "Ki", "(", "delta", ")", "=", "0", ".", "72", "nM", ";", "Ki", ...

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "3", "-", "Hydroxypyridin", "-", "2", "-", "thione", "as", "Novel", "Zinc", "Binding", "Group", "for", "Selective", "Histone", "Deacetylase", "Inhibition", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Small", "molecules", "bearing", "hydroxamic", "acid", "as", "the", "zinc", "binding", "group", "(", "ZBG", ")", "have", "been", "the", "most", "effective", "histone", "deacetylase", "inhibitors", "(", "HDACi", ")", "to", "date", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "concerns", "about", "the", "pharmacokinetic", "liabilities", "of", "the", "hydroxamic", "acid", "moiety", "have", "stimulated", "research", "efforts", "aimed", "at", "finding", "alternative", "nonhydroxamate", "ZBGs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "identified", "3", "-", "hydroxypyridin", "-", "2", "-", "thione", "(", "3", "-", "HPT", ")", "as", "a", "novel", "ZBG", "that", "is", "compatible", "with", "HDAC", "inhibition", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "3", "-", "HPT", "inhibits", "HDAC", "6", "and", "HDAC", "8", "with", "an", "IC50", "of", "681", "and", "3675", "nM", ",", "respectively", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Remarkably", ",", "3", "-", "HPT", "gives", "no", "inhibition", "of", "HDAC", "1", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Subsequent", "optimization", "led", "to", "several", "novel", "3HPT", "-", "based", "HDACi", "that", "are", "selective", "for", "HDAC", "6", "and", "HDAC", "8", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "a", "subset", "of", "these", "inhibitors", "induces", "apoptosis", "in", "various", "cancer", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Oxadiazole", "-", "isopropylamides", "as", "potent", "and", "non", "-", "covalent", "proteasome", "inhibitors", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Abstract", "Screening", "of", "the", "50", ",", "000", "ChemBridge", "compound", "library", "led", "to", "the", "identification", "of", "the", "oxadiazole", "-", "isopropylamide", "1", "(", "PI", "-", "1833", ")", "which", "inhibited", "CT", "-", "L", "ac...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"...

[ "LC", "/", "MS", "-", "MS", "and", "dialysis", "show", "that", "1", "is", "a", "non", "-", "covalent", "and", "rapidly", "reversible", "CT", "-", "L", "inhibitor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Focused", "library", "synthesis", "provided", "11ad", "(", "PI", "-", "1840", ")", "with", "CT", "-", "L", "activity", "(", "IC50", "27", "nM", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Detailed", "SAR", "studies", "indicate", "that", "the", "amide", "moiety", "and", "the", "2", "phenyl", "rings", "are", "sensitive", "toward", "modifications", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hydrophobic", "residues", ",", "such", "as", "propyl", "or", "butyl", ",", "in", "the", "para", "-", "position", "(", "not", "ortho", "or", "meta", ")", "of", "the", "A", "-", "ring", "and", "a", "meta", "-", "pyridyl", "group", "as", "B", "-", "r...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Compound", "11ad", "(", "IC50", "0", ".", "37", "micro", "M", ")", "is", "more", "potent", "than", "1", "(", "IC50", "3", ".", "5", "micro", "M", ")", "at", "inhibiting", "CT", "-", "L", "activity", "in", "intact", "MDA", "-", "MB", "-", "468", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "activity", "of", "11ad", "warrants", "further", "pre", "-", "clinical", "investigation", "of", "this", "class", "as", "non", "-", "covalent", "proteasome", "inhibitors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Potent", "Proteasome", "Inhibitors", "Derived", "from", "the", "Unnatural", "Cis", "-", "Cyclopropane", "Isomer", "of", "Belactosin", "A", ":", "Synthesis", ",", "Biological", "Activity", ",", "and", "Mode", "of", "Action", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "natural", "product", "belactosin", "A", "(", "1", ")", "with", "a", "trans", "-", "cyclopropane", "structure", "is", "a", "useful", "prototype", "compound", "for", "developing", "potent", "proteasome", "(", "core", "particle", ",", "CP", ")", "inhibi...

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "date", ",", "1", "and", "its", "analogs", "are", "the", "only", "CP", "ligands", "bind", "to", "both", "the", "non", "-", "primed", "S1", "pocket", "as", "well", "as", "the", "primed", "substrate", "binding", "channel", ",", "however", ",", "the...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "We", "have", "performed", "structure", "activity", "relationship", "studies", ",", "hereby", "elucidating", "unnatural", "cis", "-", "cyclopropane", "derivatives", "of", "1", "that", "exhibit", "high", "potency", "to", "primarily", "block", "the", "chymotrypsin", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...

[ "The", "most", "active", "compound", "3e", "reversibly", "inhibits", "cCP", "and", "iCP", "similarly", "with", "an", "IC50", "of", "5", ".", "7", "nM", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "X", "-", "ray", "crystallographic", "analysis", "of", "the", "yeast", "proteasome", "in", "complex", "with", "3e", "revealed", "that", "the", "ligand", "accommodates", "predominantly", "to", "the", "primed", "substrate", "binding", "channel", "and", "covalently",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", ...

[ "Development", "of", "an", "ALK2", "-", "Biased", "BMP", "Type", "I", "Receptor", "Kinase", "Inhibitor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "bone", "morphogenetic", "protein", "(", "BMP", ")", "signaling", "pathway", "has", "essential", "functions", "in", "development", ",", "homeostasis", ",", "and", "the", "normal", "and", "pathophysiologic", "remodeling", "of", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Small", "molecule", "inhibitors", "of", "the", "BMP", "receptor", "kinase", "family", "have", "been", "useful", "for", "probing", "physiologic", "functions", "of", "BMP", "signaling", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "and", "may", "have", "roles", "in", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "describe", "the", "development", "of", "a", "selective", "and", "potent", "inhibitor", "of", "the", "BMP", "type", "I", "receptor", "kinases", ",", "LDN", "-", "212854", ",", "which", "in", "contrast", "to", "previously", "described", "BMP", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...

[ "In", "vitro", ",", "LDN", "-", "212854", "exhibits", "some", "selectivity", "for", "ALK2", "in", "preference", "to", "other", "BMP", "type", "I", "receptors", ",", "ALK1", "and", "ALK3", ",", "which", "may", "permit", "the", "interrogation", "of", "ALK2",...

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]