extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "LDN", "-", "212854", "potently", "inhibits", "heterotopic", "ossification", "in", "an", "inducible", "transgenic", "mutant", "ALK2", "mouse", "model", "of", "fibrodysplasia", "ossificans", "progressiva", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "represent", "a", "significant", "step", "toward", "developing", "selective", "inhibitors", "targeting", "individual", "members", "of", "the", "highly", "homologous", "BMP", "type", "I", "receptor", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Such", "inhibitors", "would", "provide", "greater", "resolution", "as", "probes", "of", "physiologic", "function", "and", "improved", "selectivity", "against", "therapeutic", "targets", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Bacteria", "-", "adsorbed", "palygorskite", "stabilizes", "the", "quaternary", "phosphonium", "salt", "with", "specific", "-", "targeting", "capability", ",", "long", "-", "term", "antibacterial", "activity", ",", "and", "lower", "cytotoxicity", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "order", "to", "extend", "the", "antibacterial", "time", "of", "quaternary", "phosphonium", "salt", "in", "bacteria", ",", "palygorskite", "(", "PGS", ")", "is", "used", "as", "the", "carrier", "of", "dodecyl", "triphenyl", "phosphonium", "bromide", "(", "DTP", ")", ",", "and", "a", "DTP", "-", "PGS", "hybrid", "is", "prepared", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Antibacterial", "performance", "of", "this", "novel", "hybrid", "is", "investigated", "for", "both", "Gram", "-", "positive", "and", "Gram", "-", "negative", "bacteria", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "show", "that", "the", "DTP", "could", "be", "absorbed", "on", "the", "surface", "of", "PGS", "which", "had", "bacteria", "-", "adsorbed", "capability", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "DTP", "-", "PGS", "hybrid", ",", "combining", "the", "advantages", "of", "PGS", "and", "DTP", ",", "display", "specific", "-", "targeting", "capability", ",", "long", "-", "term", "antibacterial", "activity", ",", "and", "lower", "cytotoxicity", ",", "suggesting", "the", "great", "potential", "application", "as", "PGS", "-", "based", "antibacterial", "powder", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Artificial", "Neural", "Networks", "for", "Efficient", "Clustering", "of", "Conformational", "Ensembles", "and", "their", "Potential", "for", "Medicinal", "Chemistry", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "biological", "function", "of", "proteins", "is", "strictly", "related", "to", "their", "molecular", "flexibility", "and", "dynamics", ":", "enzymatic", "activity", ",", "protein", "-", "protein", "interactions", ",", "ligand", "binding", "and", "allosteric", "regulation", "are", "important", "mechanisms", "involving", "protein", "motions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Computational", "approaches", ",", "such", "as", "Molecular", "Dynamics", "(", "MD", ")", "simulations", ",", "are", "now", "routinely", "used", "to", "study", "the", "intrinsic", "dynamics", "of", "target", "proteins", "as", "well", "as", "to", "complement", "molecular", "docking", "approaches", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "methods", "have", "also", "successfully", "supported", "the", "process", "of", "rational", "design", "and", "discovery", "of", "new", "drugs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Identification", "of", "functionally", "relevant", "conformations", "is", "a", "key", "step", "in", "these", "studies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "generally", "done", "by", "cluster", "analysis", "of", "the", "ensemble", "of", "structures", "in", "the", "MD", "trajectory", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", "Artificial", "Neural", "Network", "(", "ANN", ")", "approaches", ",", "in", "particular", "methods", "based", "on", "Self", "-", "Organising", "Maps", "(", "SOMs", ")", ",", "have", "been", "reported", "performing", "more", "accurately", "and", "providing", "more", "consistent", "results", "than", "traditional", "clustering", "algorithms", "in", "various", "data", "-", "mining", "problems", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "specific", "case", "of", "conformational", "analysis", ",", "SOMs", "have", "been", "successfully", "used", "to", "compare", "multiple", "ensembles", "of", "protein", "conformations", "demonstrating", "a", "potential", "in", "efficiently", "detecting", "the", "dynamic", "signatures", "central", "to", "biological", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "examples", "of", "the", "use", "of", "SOMs", "to", "address", "problems", "relevant", "to", "other", "stages", "of", "the", "drug", "-", "design", "process", ",", "including", "clustering", "of", "docking", "poses", ",", "have", "been", "reported", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "contribution", "we", "review", "recent", "applications", "of", "ANN", "algorithms", "in", "analysing", "conformational", "and", "structural", "ensembles", "and", "we", "discuss", "their", "potential", "in", "computer", "-", "based", "approaches", "for", "medicinal", "chemistry", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PFKFB3", "activation", "in", "cancer", "cells", "by", "the", "p38", "/", "MK2", "pathway", "in", "response", "to", "stress", "stimuli", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PFK", "-", "2", "/", "FBPase", "-", "2", "(", "6", "-", "phosphofructo", "-", "2", "-", "kinase", "/", "fructose", "-", "2", ",", "6", "-", "bisphosphatase", ")", "catalyses", "the", "synthesis", "and", "degradation", "of", "Fru", "-", "2", ",", "6", "-", "P2", "(", "fructose", "-", "2", ",", "6", "-", "bisphosphate", ")", ",", "a", "key", "modulator", "of", "glycolysis", "and", "gluconeogenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "PFKFB3", "gene", "is", "involved", "in", "cell", "proliferation", "owing", "to", "its", "role", "in", "carbohydrate", "metabolism", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "analyze", "its", "mechanism", "of", "regulation", "as", "an", "immediately", "early", "gene", "controlled", "by", "stress", "stimuli", "that", "activate", "p38", "/", "MK2", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "report", "that", "exposure", "of", "HeLa", "and", "T98G", "cells", "to", "different", "stress", "stimuli", "(", "NaCl", ",", "H2O2", ",", "UV", "radiation", "and", "anisomycin", ")", "leads", "to", "a", "rapid", "increase", "(", "15", "-", "30", "minutes", ")", "in", "PFKFB3", "mRNA", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "use", "of", "specific", "inhibitors", "in", "combination", "with", "MK2", "-", "deficient", "cells", "implicate", "control", "by", "MK2", "protein", "kinase", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transient", "transfection", "of", "HeLa", "cells", "with", "deleted", "gene", "promoter", "constructs", "allowed", "us", "to", "identify", "a", "Serum", "Response", "Element", "(", "SRE", ")", "to", "which", "Serum", "Response", "Factor", "(", "SRF", ")", "binds", "and", "thus", "transactivates", "PFKFB3", "gene", "transcription", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Direct", "Binding", "of", "phospho", "-", "SRF", "to", "the", "SRE", "sequence", "(", "-", "918", "nt", ")", "was", "confirmed", "by", "ChIP", "(", "chromatin", "immunoprecipiation", ")", "assays", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "PFKFB3", "isoenzyme", "phosphorylation", "at", "Ser461", "by", "MK2", "increases", "PFK", "-", "2", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Together", ",", "the", "results", "suggest", "a", "multimodal", "mechanism", "of", "stress", "stimuli", "affecting", "PFKFB3", "transcriptional", "regulation", "and", "kinase", "activation", "by", "protein", "phosphorylation", ",", "resulting", "in", "an", "increase", "in", "Fru", "-", "2", ",", "6", "-", "P2", "concentration", "and", "stimulation", "of", "glycolysis", "in", "cancer", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Identification", "of", "a", "new", "interaction", "mode", "between", "the", "Src", "homology", "2", "(", "SH2", ")", "domain", "of", "C", "-", "terminal", "Src", "kinase", "(", "Csk", ")", "and", "Csk", "-", "binding", "protein", "(", "Cbp", ")", "/", "phosphoprotein", "associated", "with", "glycosphingolipid", "microdomains", "(", "PAG", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Proteins", "with", "Src", "homology", "2", "(", "SH2", ")", "domains", "play", "major", "roles", "in", "tyrosine", "kinase", "signaling", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "Structures", "of", "many", "SH2", "domains", "have", "been", "studied", ",", "and", "the", "regions", "involved", "in", "their", "interactions", "with", "ligands", "have", "been", "elucidated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "these", "analyses", "have", "been", "performed", "using", "short", "peptides", "comprising", "phosphotyrosine", "followed", "by", "a", "few", "amino", "acids", ",", "which", "are", "described", "as", "the", "canonical", "recognition", "sites", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "report", "the", "solution", "structure", "of", "the", "SH2", "domain", "of", "C", "-", "terminal", "Src", "kinase", "(", "Csk", ")", "in", "complex", "with", "a", "longer", "phosphopeptide", "from", "Csk", "-", "binding", "protein", "(", "Cbp", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "structure", ",", "together", "with", "biochemical", "experiments", ",", "revealed", "the", "existence", "of", "a", "novel", "binding", "region", "in", "addition", "to", "the", "canonical", "phosphotyrosine", "-", "314", "binding", "site", "of", "Cbp", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutational", "analysis", "of", "this", "second", "region", "in", "cells", "showed", "that", "both", "canonical", "and", "novel", "binding", "sites", "are", "required", "for", "tumor", "suppression", "through", "the", "Cbp", "-", "Csk", "interaction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "the", "data", "indicate", "an", "allosteric", "connection", "between", "Cbp", "binding", "and", "Csk", "activation", "that", "arises", "from", "residues", "in", "the", "beta", "B", "/", "beta", "C", "loop", "of", "the", "SH2", "domain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "G", "-", "protein", "coupled", "receptor", "agonist", "BV8", "/", "prokineticin", "-", "2", "and", "STAT3", "form", "a", "feed", "-", "forward", "loop", "in", "both", "normal", "and", "malignant", "myeloid", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "important", "role", "of", "Bv8", "in", "mobilization", "of", "myeloid", "cells", "and", "myeloid", "cell", "-", "dependent", "angiogenesis", "has", "been", "established", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", ",", "it", "has", "also", "been", "shown", "that", "granulocyte", "colony", "stimulating", "factor", "(", "G", "-", "CSF", ")", "-", "induced", "Bv8", "expression", "is", "Stat3", "dependent", "in", "CD11b", "+", "Gr1", "+", "myeloid", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "Bv8", "downstream", "signaling", "pathway", "(", "s", ")", "intrinsic", "to", "myeloid", "cells", "crucial", "for", "angiogenesis", ",", "and", "potentially", "also", "for", "development", "of", "cancers", "of", "myeloid", "origin", ",", "remains", "largely", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "show", "that", "BV8", "activates", "STAT3", ",", "which", "is", "critical", "for", "regulating", "genes", "important", "for", "both", "tumor", "cell", "proliferation", "/", "survival", "and", "tumor", "angiogenesis", ",", "in", "both", "normal", "and", "malignant", "myeloid", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Further", ",", "BV8", "-", "induced", "STAT3", "activation", "requires", "Janus", "activated", "kinase", "2", "(", "JAK2", ")", "activity", "as", "shown", "by", "both", "genetic", "and", "pharmacologic", "inhibition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Knocking", "down", "BV8", "in", "human", "myeloid", "leukemia", "cells", "inhibits", "STAT3", "activity", "and", "expression", "of", "STAT3", "-", "downstream", "angiogenic", "and", "pro", "-", "proliferation", "/", "survival", "genes", ",", "leading", "to", "a", "decrease", "in", "tumor", "cell", "viability", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "BV8", "shRNA", "expressing", "leukemia", "cells", "exhibit", "reduced", "STAT3", "activity", "and", "tumor", "growth", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Taken", "together", ",", "we", "have", "delineated", "a", "signaling", "pathway", "downstream", "of", "BV8", "that", "plays", "critical", "roles", "in", "both", "the", "tumor", "microenvironment", "and", "malignant", "myeloid", "cells", "for", "angiogenesis", "and", "tumor", "cell", "proliferation", "/", "survival", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Visual", "evoked", "potentials", "in", "children", "prenatally", "exposed", "to", "methylmercury", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Prenatal", "exposure", "to", "methylmercury", "can", "cause", "both", "neurobehavioral", "deficits", "and", "neurophysiological", "changes", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "evidence", "of", "neurotoxic", "effects", "within", "the", "visual", "nervous", "system", "is", "inconsistent", ",", "possibly", "due", "to", "incomplete", "statistical", "adjustment", "for", "beneficial", "nutritional", "factors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "evaluated", "the", "effect", "of", "prenatal", "methylmercury", "exposure", "on", "visual", "evoked", "potential", "(", "VEP", ")", "latencies", "in", "Faroese", "children", "with", "elevated", "prenatal", "methylmercury", "exposure", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "A", "cohort", "of", "182", "singleton", "term", "births", "was", "assembled", "in", "the", "Faroe", "Islands", "during", "1994", "-", "1995", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "At", "age", "7", "years", ",", "VEP", "tracings", "were", "obtained", "from", "139", "cohort", "subjects", "after", "exclusion", "of", "subjects", "with", "abnormal", "vision", "conditions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "used", "multiple", "regression", "analysis", "to", "evaluate", "the", "association", "of", "mercury", "concentrations", "in", "cord", "blood", "and", "maternal", "hair", "at", "parturition", "with", "VEP", "latencies", "after", "adjustment", "for", "potential", "confounders", "that", "included", "the", "cord", "-", "serum", "phospholipid", "concentration", "of", "n", "-", "3", "polyunsaturated", "fatty", "acids", "(", "PUFAs", ")", "and", "the", "duration", "of", "breastfeeding", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Unadjusted", "correlations", "between", "mercury", "exposure", "and", "VEP", "latencies", "were", "equivocal", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Multiple", "regression", "models", "showed", "that", "increased", "mercury", "concentrations", ",", "especially", "in", "maternal", "hair", ",", "were", "associated", "with", "delayed", "latencies", "for", "VEP", "peak", "N145", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "covariate", "adjustment", ",", "a", "delay", "of", "2", ".", "22ms", "(", "p", "=", "0", ".", "02", ")", "was", "seen", "for", "each", "doubling", "of", "the", "mercury", "concentration", "in", "maternal", "hair", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "agreement", "with", "neuropsychological", "findings", ",", "the", "present", "study", "suggests", "that", "prenatal", "methylmercury", "exposure", "may", "have", "an", "adverse", "effect", "on", "VEP", "findings", "despite", "the", "absence", "of", "clinical", "toxicity", "to", "the", "visual", "system", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "this", "association", "was", "apparent", "only", "after", "adjustment", "for", "n", "-", "3", "PUFA", "status", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Spongiatriol", "inhibits", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "activation", "and", "induces", "apoptosis", "in", "pancreatic", "cancer", "cells", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pancreatic", "cancer", ",", "the", "fourth", "leading", "cause", "of", "cancer", "death", "in", "the", "US", ",", "is", "highly", "resistant", "to", "all", "current", "chemotherapies", ",", "and", "its", "growth", "is", "facilitated", "by", "chronic", "inflammation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "majority", "of", "pro", "-", "inflammatory", "cytokines", "initiate", "signaling", "cascades", "that", "converge", "at", "the", "activation", "of", "the", "Nuclear", "Factor", "Kappa", "B", "(", "NF", "kappa", "B", ")", ",", "a", "signal", "transduction", "molecule", "that", "promotes", "cell", "survival", ",", "proliferation", "and", "angiogenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "an", "effort", "to", "identify", "novel", "inhibitors", "of", "NF", "kappa", "B", ",", "the", "HBOI", "library", "of", "pure", "compounds", "was", "screened", "using", "a", "reporter", "cell", "line", "that", "produces", "luciferin", "under", "the", "transcriptional", "control", "of", "NF", "kappa", "B", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Seven", "compounds", "were", "identified", "through", "this", "screen", ",", "but", "in", "the", "case", "of", "five", "of", "them", ",", "their", "reported", "mechanism", "of", "action", "made", "them", "unlikely", "to", "be", "specific", "NF", "kappa", "B", "inhibitors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Spongiatriol", ",", "a", "marine", "furanoditerpenoid", "that", "was", "first", "isolated", "in", "the", "1970s", ",", "is", "shown", "here", "to", "inhibit", "NF", "kappa", "B", "transcriptional", "activity", "in", "a", "reporter", "cell", "line", ",", "to", "reduce", "levels", "of", "phosphorylated", "(", "active", ")", "NF", "kappa", "B", "in", "the", "AsPC", "-", "1", "cell", "line", ",", "to", "have", "an", "IC50", "for", "cytotoxicity", "in", "the", "low", "micromolar", "range", "against", "the", "AsPC", "-", "1", ",", "BxPC", "-", "3", ",", "MiaPaCa", "-", "2", "and", "Panc", "-", "1", "pancreatic", "cancer", "cell", "lines", ",", "and", "to", "induce", "moderate", "but", "significant", "apoptosis", "in", "both", "the", "AsPC", "-", "1", "and", "the", "Panc", "-", "1", "cell", "lines", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Is", "There", "Visceral", "Adipose", "Tissue", "(", "VAT", ")", "Intracellular", "Hypercortisolism", "in", "Human", "Obesity", "?" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "fact", "that", "obesity", "is", "a", "prominent", "feature", "of", "Cushing", "'", "s", "syndrome", "(", "systemic", "hypercortisolism", "of", "adrenocortical", "origin", ")", "stimulated", "a", "40", "-", "year", "search", "for", "evidence", "of", "systemic", "hypercortisolism", "in", "human", "obesity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "That", "search", "has", "failed", "to", "find", "such", "evidence", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "the", "past", "15", "years", ",", "however", ",", "studies", "have", "been", "done", "to", "evaluate", "a", "possible", "alternative", "type", "of", "hypercortisolism", "in", "obesity", ",", "namely", "visceral", "adipose", "tissue", "(", "VAT", ")", "intracellular", "hypercortisolism", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "current", "review", "summarizes", "the", "evidence", "published", "so", "far", "about", "this", "possibility", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "have", "been", "three", "types", "of", "evidence", "studied", ":", "direct", "measurement", "of", "the", "VAT", "levels", "of", "11", "beta", "-", "hydroxysteroid", "dehydrogenase", "type", "I", "(", "11", "-", "HSD", "-", "1", ")", ",", "which", "converts", "biologically", "inactive", "cortisone", "to", "biologically", "active", "cortisol", ";", "direct", "measurement", "of", "splanchnic", "cortisol", "production", ";", "and", "evaluation", "of", "the", "effect", "of", "a", "specific", "inhibitor", "of", "11", "-", "HSD", "-", "1", "on", "metabolic", "abnormalities", "associated", "with", "obesity", ",", "particularly", "diabetes", "mellitus", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "are", "complex", "and", "difficult", "to", "interpret", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "conclusion", "is", "that", "the", "presence", "of", "VAT", "intracellular", "hypercortisolism", "in", "human", "obesity", "is", "possible", "but", "unlikely", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Long", "-", "term", "Effects", "of", "Perinatal", "Androgenization", "on", "Reproductive", "Parameters", "of", "Male", "Rat", "Offspring", "Androgenization", "and", "Male", "Rat", "Reproduction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "known", "that", "during", "sex", "differentiation", ",", "fetal", "androgens", "are", "critical", "determinants", "of", "the", "male", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "testosterone", "is", "necessary", "for", "normal", "development", "of", "male", "sexual", "behavior", ",", "perinatal", "androgen", "treatment", "can", "result", "in", "disruption", "of", "normal", "male", "sexual", "reproduction", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pregnant", "Wistar", "rats", "were", "administered", "either", "corn", "oil", "(", "vehicle", ")", "or", "testosterone", "propionate", "at", "0", ".", "2", "mg", "/", "kg", "from", "gestational", "day", "12", "until", "the", "end", "of", "lactation", "and", "the", "reproductive", "function", "of", "male", "offspring", "was", "evaluated", "at", "90", "(", "adulthood", ")", "and", "270", "(", "middle", "age", ")", "days", "of", "age", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Perinatal", "androgenization", "in", "the", "rat", "provoked", "a", "reduction", "in", "sperm", "production", "and", "reserves", "in", "adulthood", "that", "did", "not", "affect", "fertility", "and", "did", "not", "persist", "at", "more", "advanced", "ages", ",", "as", "shown", "by", "the", "results", "at", "post", "-", "natal", "day", "270", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "If", "perinatal", "androgenization", "promotes", "similar", "effects", "in", "humans", "of", "reproductive", "age", ",", "the", "results", "of", "the", "present", "work", "can", "impact", "male", "reproduction", "health", ",", "given", "the", "less", "efficient", "spermatogenesis", "and", "lower", "sperm", "reserves", "in", "the", "human", "epididymis", ",", "compared", "to", "rodents", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "CYP2B6", "*", "6", "Allele", "Significantly", "Alters", "the", "N", "-", "demethylation", "of", "Ketamine", "Enantiomers", "In", "Vitro", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ketamine", "is", "primarily", "metabolized", "to", "norketamine", "by", "hepatic", "cytochrome", "P450", "(", "CYP", ")", "2B6", "and", "CYP3A4", "-", "mediated", "N", "-", "demethylation", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "relative", "contribution", "from", "each", "enzyme", "remains", "controversial", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "CYP2B6", "*", "6", "allele", "is", "associated", "with", "reduced", "enzyme", "expression", "and", "activity", "that", "may", "lead", "to", "interindividual", "variability", "in", "ketamine", "metabolism", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "We", "examined", "the", "N", "-", "demethylation", "of", "individual", "ketamine", "enantiomers", "using", "human", "liver", "microsomes", "(", "HLMs", ")", "genotyped", "for", "the", "CYP2B6", "*", "6", "allele", ",", "insect", "cell", "expressed", "recombinant", "CYP2B6", "and", "CYP3A4", "enzymes", "and", "COS", "-", "1", "cell", "expressed", "recombinant", "CYP2B6", ".", "1", "and", "CYP2B6", ".", "6", "protein", "variant", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Effects", "of", "CYP", "-", "selective", "inhibitors", "on", "norketamine", "formation", "were", "also", "determined", "in", "HLMs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "two", "-", "enzyme", "Michaelis", "-", "Menten", "model", "best", "fitted", "the", "HLM", "kinetic", "data", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Km", "value", "for", "the", "high", "affinity", "enzyme", "and", "the", "low", "affinity", "enzyme", "were", "similar", "to", "those", "for", "the", "expressed", "CYP2B6", "and", "CYP3A4", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "intrinsic", "clearance", "for", "both", "ketamine", "enantiomers", "by", "the", "high", "affinity", "enzyme", "in", "HLMs", "with", "CYP2B6", "", "1", "/", "", "1", "genotype", "were", "at", "least", "2", "-", "fold", "and", "6", "-", "fold", "higher", ",", "respectively", ",", "than", "those", "for", "CYP2B6", "", "1", "/", "", "6", "genotype", "and", "CYP2B6", "", "6", "/", "", "6", "genotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Vmax", "and", "Km", "values", "for", "CYP2B6", ".", "1", "were", "approximately", "160", "%", "and", "70", "%", "of", "those", "for", "CYP2B6", ".", "6", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ThioTEPA", "(", "CYP2B6", "inhibitor", ",", "25", "mu", "M", ")", "and", "the", "monoclonal", "antibody", "against", "CYP2B6", "but", "not", "troleandomycin", "(", "CYP3A4", "inhibitor", ",", "25", "mu", "M", ")", "or", "the", "monoclonal", "antibody", "against", "CYP3A4", "inhibited", "ketamine", "N", "-", "demethylation", "at", "clinically", "relevant", "concentrations", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "degree", "of", "inhibition", "was", "significantly", "reduced", "in", "HLMs", "with", "the", "CYP2B6", "*", "6", "allele", "(", "gene", "-", "dose", "P", "<", "0", ".", "05", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "indicate", "a", "major", "role", "of", "CYP2B6", "in", "ketamine", "N", "-", "demethylation", "in", "vitro", "and", "a", "significant", "impact", "of", "the", "CYP2B6", "*", "6", "allele", "on", "enzyme", "-", "ketamine", "binding", "and", "catalytic", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Molecular", "Dynamics", "Simulations", "of", "CO2", "Formation", "in", "Interstellar", "Ices", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CO2", "ice", "is", "one", "of", "the", "most", "abundant", "components", "in", "ice", "-", "coated", "interstellar", "ices", "besides", "H2O", "and", "CO", ",", "but", "the", "most", "favorable", "path", "to", "CO2", "ice", "is", "still", "unclear", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Molecular", "dynamics", "calculations", "on", "the", "ultraviolet", "photodissociation", "of", "different", "kinds", "of", "CO", "-", "H2O", "ice", "systems", "have", "been", "performed", "at", "10", "K", "in", "order", "to", "demonstrate", "that", "the", "reaction", "between", "CO", "and", "an", "OH", "molecule", "resulting", "from", "H2O", "photodissociation", "through", "the", "first", "excited", "state", "is", "a", "possible", "route", "to", "form", "CO2", "ice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "However", ",", "our", "calculations", ",", "which", "take", "into", "account", "different", "ice", "surface", "models", ",", "suggest", "that", "there", "is", "another", "product", "with", "a", "higher", "formation", "probability", "(", "(", "3", ".", "00", "+/-", "0", ".", "07", ")", "x", "10", "(", "-", "2", ")", ")", ",", "which", "is", "the", "HOCO", "complex", ",", "whereas", "the", "formation", "of", "CO2", "has", "a", "probability", "of", "only", "(", "3", ".", "6", "+/-", "0", ".", "7", ")", "x", "10", "(", "-", "4", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "initial", "location", "of", "the", "CO", "is", "key", "to", "obtain", "reaction", "and", "form", "CO2", ":", "the", "CO", "needs", "to", "be", "located", "deep", "into", "the", "ice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "HOCO", "complex", "becomes", "trapped", "in", "the", "cold", "ice", "surface", "in", "the", "trans", "-", "HOCO", "minimum", "because", "it", "quickly", "loses", "its", "internal", "energy", "to", "the", "surrounding", "ice", ",", "preventing", "further", "reaction", "to", "H", "+", "CO2", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Several", "laboratory", "experiments", "have", "been", "carried", "out", "recently", ",", "and", "they", "confirm", "that", "CO2", "can", "also", "be", "formed", "through", "other", ",", "different", "routes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "compare", "our", "theoretical", "results", "with", "the", "data", "available", "from", "experiments", "studying", "the", "formation", "of", "CO2", "through", "a", "similar", "pathway", "as", "ours", ",", "even", "though", "the", "initial", "conditions", "were", "not", "exactly", "the", "same", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "also", "show", "that", "the", "HCO", "van", "der", "Waals", "complex", "can", "be", "formed", "through", "the", "interaction", "of", "CO", "with", "the", "H", "atom", "that", "is", "formed", "as", "a", "product", "of", "H2O", "photodissociation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "the", "reaction", "of", "the", "H", "atom", "photofragment", "following", "H2O", "photodissociation", "with", "CO", "can", "be", "a", "possible", "route", "to", "form", "HCO", "ice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "LDN", "-", "212854", "potently", "inhibits", "heterotopic", "ossification", "in", "an", "inducible", "transgenic", "mutant", "ALK2", "mouse", "model", "of", "fibrodysplasia", "ossificans", "progressiva", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "represent", "a", "significant", "step", "toward", "developing", "selective", "inhibitors", "targeting", "individual", "members", "of", "the", "highly", "homologous", "BMP", "type", "I", "receptor", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Such", "inhibitors", "would", "provide", "greater", "resolution", "as", "probes", "of", "physiologic", "function", "and", "improved", "selectivity", "against", "therapeutic", "targets", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Bacteria", "-", "adsorbed", "palygorskite", "stabilizes", "the", "quaternary", "phosphonium", "salt", "with", "specific", "-", "targeting", "capability", ",", "long", "-", "term", "antibacterial", "activity", ",", "and", "lower", "cytotoxicity", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "order", "to", "extend", "the", "antibacterial", "time", "of", "quaternary", "phosphonium", "salt", "in", "bacteria", ",", "palygorskite", "(", "PGS", ")", "is", "used", "as", "the", "carrier", "of", "dodecyl", "triphenyl", "phosphonium", "bromide", "(", "DTP", ")", ",", "and", "a", "DTP", "-", "PGS", "hybrid", "is", "prepared", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Antibacterial", "performance", "of", "this", "novel", "hybrid", "is", "investigated", "for", "both", "Gram", "-", "positive", "and", "Gram", "-", "negative", "bacteria", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "show", "that", "the", "DTP", "could", "be", "absorbed", "on", "the", "surface", "of", "PGS", "which", "had", "bacteria", "-", "adsorbed", "capability", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "DTP", "-", "PGS", "hybrid", ",", "combining", "the", "advantages", "of", "PGS", "and", "DTP", ",", "display", "specific", "-", "targeting", "capability", ",", "long", "-", "term", "antibacterial", "activity", ",", "and", "lower", "cytotoxicity", ",", "suggesting", "the", "great", "potential", "application", "as", "PGS", "-", "based", "antibacterial", "powder", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Artificial", "Neural", "Networks", "for", "Efficient", "Clustering", "of", "Conformational", "Ensembles", "and", "their", "Potential", "for", "Medicinal", "Chemistry", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "biological", "function", "of", "proteins", "is", "strictly", "related", "to", "their", "molecular", "flexibility", "and", "dynamics", ":", "enzymatic", "activity", ",", "protein", "-", "protein", "interactions", ",", "ligand", "binding", "and", "allosteric", "regulation", "are", "important", "mechanisms", "involving", "protein", "motions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Computational", "approaches", ",", "such", "as", "Molecular", "Dynamics", "(", "MD", ")", "simulations", ",", "are", "now", "routinely", "used", "to", "study", "the", "intrinsic", "dynamics", "of", "target", "proteins", "as", "well", "as", "to", "complement", "molecular", "docking", "approaches", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "methods", "have", "also", "successfully", "supported", "the", "process", "of", "rational", "design", "and", "discovery", "of", "new", "drugs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identification", "of", "functionally", "relevant", "conformations", "is", "a", "key", "step", "in", "these", "studies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "generally", "done", "by", "cluster", "analysis", "of", "the", "ensemble", "of", "structures", "in", "the", "MD", "trajectory", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recently", "Artificial", "Neural", "Network", "(", "ANN", ")", "approaches", ",", "in", "particular", "methods", "based", "on", "Self", "-", "Organising", "Maps", "(", "SOMs", ")", ",", "have", "been", "reported", "performing", "more", "accurately", "and", "providing", "more", "consistent", "results", "than", "traditional", "clustering", "algorithms", "in", "various", "data", "-", "mining", "problems", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "specific", "case", "of", "conformational", "analysis", ",", "SOMs", "have", "been", "successfully", "used", "to", "compare", "multiple", "ensembles", "of", "protein", "conformations", "demonstrating", "a", "potential", "in", "efficiently", "detecting", "the", "dynamic", "signatures", "central", "to", "biological", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "examples", "of", "the", "use", "of", "SOMs", "to", "address", "problems", "relevant", "to", "other", "stages", "of", "the", "drug", "-", "design", "process", ",", "including", "clustering", "of", "docking", "poses", ",", "have", "been", "reported", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "contribution", "we", "review", "recent", "applications", "of", "ANN", "algorithms", "in", "analysing", "conformational", "and", "structural", "ensembles", "and", "we", "discuss", "their", "potential", "in", "computer", "-", "based", "approaches", "for", "medicinal", "chemistry", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PFKFB3", "activation", "in", "cancer", "cells", "by", "the", "p38", "/", "MK2", "pathway", "in", "response", "to", "stress", "stimuli", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PFK", "-", "2", "/", "FBPase", "-", "2", "(", "6", "-", "phosphofructo", "-", "2", "-", "kinase", "/", "fructose", "-", "2", ",", "6", "-", "bisphosphatase", ")", "catalyses", "the", "synthesis", "and", "degradation", "of", "Fru", "-", "2", ",", "6", "-", "P2", "(", "fructose", "-", "2", ",", "6", "-", "bisphosphate", ")", ",", "a", "key", "modulator", "of", "glycolysis", "and", "gluconeogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "PFKFB3", "gene", "is", "involved", "in", "cell", "proliferation", "owing", "to", "its", "role", "in", "carbohydrate", "metabolism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "analyze", "its", "mechanism", "of", "regulation", "as", "an", "immediately", "early", "gene", "controlled", "by", "stress", "stimuli", "that", "activate", "p38", "/", "MK2", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "report", "that", "exposure", "of", "HeLa", "and", "T98G", "cells", "to", "different", "stress", "stimuli", "(", "NaCl", ",", "H2O2", ",", "UV", "radiation", "and", "anisomycin", ")", "leads", "to", "a", "rapid", "increase", "(", "15", "-", "30", "minutes", ")", "in", "PFKFB3", "mRNA", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "use", "of", "specific", "inhibitors", "in", "combination", "with", "MK2", "-", "deficient", "cells", "implicate", "control", "by", "MK2", "protein", "kinase", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transient", "transfection", "of", "HeLa", "cells", "with", "deleted", "gene", "promoter", "constructs", "allowed", "us", "to", "identify", "a", "Serum", "Response", "Element", "(", "SRE", ")", "to", "which", "Serum", "Response", "Factor", "(", "SRF", ")", "binds", "and", "thus", "transactivates", "PFKFB3", "gene", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Direct", "Binding", "of", "phospho", "-", "SRF", "to", "the", "SRE", "sequence", "(", "-", "918", "nt", ")", "was", "confirmed", "by", "ChIP", "(", "chromatin", "immunoprecipiation", ")", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "PFKFB3", "isoenzyme", "phosphorylation", "at", "Ser461", "by", "MK2", "increases", "PFK", "-", "2", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Together", ",", "the", "results", "suggest", "a", "multimodal", "mechanism", "of", "stress", "stimuli", "affecting", "PFKFB3", "transcriptional", "regulation", "and", "kinase", "activation", "by", "protein", "phosphorylation", ",", "resulting", "in", "an", "increase", "in", "Fru", "-", "2", ",", "6", "-", "P2", "concentration", "and", "stimulation", "of", "glycolysis", "in", "cancer", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identification", "of", "a", "new", "interaction", "mode", "between", "the", "Src", "homology", "2", "(", "SH2", ")", "domain", "of", "C", "-", "terminal", "Src", "kinase", "(", "Csk", ")", "and", "Csk", "-", "binding", "protein", "(", "Cbp", ")", "/", "phosphoprotein", "associated", "with", "glycosphingolipid", "microdomains", "(", "PAG", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Proteins", "with", "Src", "homology", "2", "(", "SH2", ")", "domains", "play", "major", "roles", "in", "tyrosine", "kinase", "signaling", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "Structures", "of", "many", "SH2", "domains", "have", "been", "studied", ",", "and", "the", "regions", "involved", "in", "their", "interactions", "with", "ligands", "have", "been", "elucidated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "these", "analyses", "have", "been", "performed", "using", "short", "peptides", "comprising", "phosphotyrosine", "followed", "by", "a", "few", "amino", "acids", ",", "which", "are", "described", "as", "the", "canonical", "recognition", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "report", "the", "solution", "structure", "of", "the", "SH2", "domain", "of", "C", "-", "terminal", "Src", "kinase", "(", "Csk", ")", "in", "complex", "with", "a", "longer", "phosphopeptide", "from", "Csk", "-", "binding", "protein", "(", "Cbp", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "structure", ",", "together", "with", "biochemical", "experiments", ",", "revealed", "the", "existence", "of", "a", "novel", "binding", "region", "in", "addition", "to", "the", "canonical", "phosphotyrosine", "-", "314", "binding", "site", "of", "Cbp", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutational", "analysis", "of", "this", "second", "region", "in", "cells", "showed", "that", "both", "canonical", "and", "novel", "binding", "sites", "are", "required", "for", "tumor", "suppression", "through", "the", "Cbp", "-", "Csk", "interaction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "the", "data", "indicate", "an", "allosteric", "connection", "between", "Cbp", "binding", "and", "Csk", "activation", "that", "arises", "from", "residues", "in", "the", "beta", "B", "/", "beta", "C", "loop", "of", "the", "SH2", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "G", "-", "protein", "coupled", "receptor", "agonist", "BV8", "/", "prokineticin", "-", "2", "and", "STAT3", "form", "a", "feed", "-", "forward", "loop", "in", "both", "normal", "and", "malignant", "myeloid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "important", "role", "of", "Bv8", "in", "mobilization", "of", "myeloid", "cells", "and", "myeloid", "cell", "-", "dependent", "angiogenesis", "has", "been", "established", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recently", ",", "it", "has", "also", "been", "shown", "that", "granulocyte", "colony", "stimulating", "factor", "(", "G", "-", "CSF", ")", "-", "induced", "Bv8", "expression", "is", "Stat3", "dependent", "in", "CD11b", "+", "Gr1", "+", "myeloid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "Bv8", "downstream", "signaling", "pathway", "(", "s", ")", "intrinsic", "to", "myeloid", "cells", "crucial", "for", "angiogenesis", ",", "and", "potentially", "also", "for", "development", "of", "cancers", "of", "myeloid", "origin", ",", "remains", "largely", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "show", "that", "BV8", "activates", "STAT3", ",", "which", "is", "critical", "for", "regulating", "genes", "important", "for", "both", "tumor", "cell", "proliferation", "/", "survival", "and", "tumor", "angiogenesis", ",", "in", "both", "normal", "and", "malignant", "myeloid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Further", ",", "BV8", "-", "induced", "STAT3", "activation", "requires", "Janus", "activated", "kinase", "2", "(", "JAK2", ")", "activity", "as", "shown", "by", "both", "genetic", "and", "pharmacologic", "inhibition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Knocking", "down", "BV8", "in", "human", "myeloid", "leukemia", "cells", "inhibits", "STAT3", "activity", "and", "expression", "of", "STAT3", "-", "downstream", "angiogenic", "and", "pro", "-", "proliferation", "/", "survival", "genes", ",", "leading", "to", "a", "decrease", "in", "tumor", "cell", "viability", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "BV8", "shRNA", "expressing", "leukemia", "cells", "exhibit", "reduced", "STAT3", "activity", "and", "tumor", "growth", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Taken", "together", ",", "we", "have", "delineated", "a", "signaling", "pathway", "downstream", "of", "BV8", "that", "plays", "critical", "roles", "in", "both", "the", "tumor", "microenvironment", "and", "malignant", "myeloid", "cells", "for", "angiogenesis", "and", "tumor", "cell", "proliferation", "/", "survival", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Visual", "evoked", "potentials", "in", "children", "prenatally", "exposed", "to", "methylmercury", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Prenatal", "exposure", "to", "methylmercury", "can", "cause", "both", "neurobehavioral", "deficits", "and", "neurophysiological", "changes", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "evidence", "of", "neurotoxic", "effects", "within", "the", "visual", "nervous", "system", "is", "inconsistent", ",", "possibly", "due", "to", "incomplete", "statistical", "adjustment", "for", "beneficial", "nutritional", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "evaluated", "the", "effect", "of", "prenatal", "methylmercury", "exposure", "on", "visual", "evoked", "potential", "(", "VEP", ")", "latencies", "in", "Faroese", "children", "with", "elevated", "prenatal", "methylmercury", "exposure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "A", "cohort", "of", "182", "singleton", "term", "births", "was", "assembled", "in", "the", "Faroe", "Islands", "during", "1994", "-", "1995", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "At", "age", "7", "years", ",", "VEP", "tracings", "were", "obtained", "from", "139", "cohort", "subjects", "after", "exclusion", "of", "subjects", "with", "abnormal", "vision", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "used", "multiple", "regression", "analysis", "to", "evaluate", "the", "association", "of", "mercury", "concentrations", "in", "cord", "blood", "and", "maternal", "hair", "at", "parturition", "with", "VEP", "latencies", "after", "adjustment", "for", "potential", "confounders", "that", "included", "the", "cord", "-", "serum", "phospholipid", "concentration", "of", "n", "-", "3", "polyunsaturated", "fatty", "acids", "(", "PUFAs", ")", "and", "the", "duration", "of", "breastfeeding", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Unadjusted", "correlations", "between", "mercury", "exposure", "and", "VEP", "latencies", "were", "equivocal", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Multiple", "regression", "models", "showed", "that", "increased", "mercury", "concentrations", ",", "especially", "in", "maternal", "hair", ",", "were", "associated", "with", "delayed", "latencies", "for", "VEP", "peak", "N145", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "covariate", "adjustment", ",", "a", "delay", "of", "2", ".", "22ms", "(", "p", "=", "0", ".", "02", ")", "was", "seen", "for", "each", "doubling", "of", "the", "mercury", "concentration", "in", "maternal", "hair", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "agreement", "with", "neuropsychological", "findings", ",", "the", "present", "study", "suggests", "that", "prenatal", "methylmercury", "exposure", "may", "have", "an", "adverse", "effect", "on", "VEP", "findings", "despite", "the", "absence", "of", "clinical", "toxicity", "to", "the", "visual", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "this", "association", "was", "apparent", "only", "after", "adjustment", "for", "n", "-", "3", "PUFA", "status", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Spongiatriol", "inhibits", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "activation", "and", "induces", "apoptosis", "in", "pancreatic", "cancer", "cells", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pancreatic", "cancer", ",", "the", "fourth", "leading", "cause", "of", "cancer", "death", "in", "the", "US", ",", "is", "highly", "resistant", "to", "all", "current", "chemotherapies", ",", "and", "its", "growth", "is", "facilitated", "by", "chronic", "inflammation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "majority", "of", "pro", "-", "inflammatory", "cytokines", "initiate", "signaling", "cascades", "that", "converge", "at", "the", "activation", "of", "the", "Nuclear", "Factor", "Kappa", "B", "(", "NF", "kappa", "B", ")", ",", "a", "signal", "transduction", "molecule", "that", "promotes", "cell", "survival", ",", "proliferation", "and", "angiogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "an", "effort", "to", "identify", "novel", "inhibitors", "of", "NF", "kappa", "B", ",", "the", "HBOI", "library", "of", "pure", "compounds", "was", "screened", "using", "a", "reporter", "cell", "line", "that", "produces", "luciferin", "under", "the", "transcriptional", "control", "of", "NF", "kappa", "B", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Seven", "compounds", "were", "identified", "through", "this", "screen", ",", "but", "in", "the", "case", "of", "five", "of", "them", ",", "their", "reported", "mechanism", "of", "action", "made", "them", "unlikely", "to", "be", "specific", "NF", "kappa", "B", "inhibitors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Spongiatriol", ",", "a", "marine", "furanoditerpenoid", "that", "was", "first", "isolated", "in", "the", "1970s", ",", "is", "shown", "here", "to", "inhibit", "NF", "kappa", "B", "transcriptional", "activity", "in", "a", "reporter", "cell", "line", ",", "to", "reduce", "levels", "of", "phosphorylated", "(", "active", ")", "NF", "kappa", "B", "in", "the", "AsPC", "-", "1", "cell", "line", ",", "to", "have", "an", "IC50", "for", "cytotoxicity", "in", "the", "low", "micromolar", "range", "against", "the", "AsPC", "-", "1", ",", "BxPC", "-", "3", ",", "MiaPaCa", "-", "2", "and", "Panc", "-", "1", "pancreatic", "cancer", "cell", "lines", ",", "and", "to", "induce", "moderate", "but", "significant", "apoptosis", "in", "both", "the", "AsPC", "-", "1", "and", "the", "Panc", "-", "1", "cell", "lines", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Is", "There", "Visceral", "Adipose", "Tissue", "(", "VAT", ")", "Intracellular", "Hypercortisolism", "in", "Human", "Obesity", "?" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "fact", "that", "obesity", "is", "a", "prominent", "feature", "of", "Cushing", "'", "s", "syndrome", "(", "systemic", "hypercortisolism", "of", "adrenocortical", "origin", ")", "stimulated", "a", "40", "-", "year", "search", "for", "evidence", "of", "systemic", "hypercortisolism", "in", "human", "obesity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "That", "search", "has", "failed", "to", "find", "such", "evidence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "the", "past", "15", "years", ",", "however", ",", "studies", "have", "been", "done", "to", "evaluate", "a", "possible", "alternative", "type", "of", "hypercortisolism", "in", "obesity", ",", "namely", "visceral", "adipose", "tissue", "(", "VAT", ")", "intracellular", "hypercortisolism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "current", "review", "summarizes", "the", "evidence", "published", "so", "far", "about", "this", "possibility", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "have", "been", "three", "types", "of", "evidence", "studied", ":", "direct", "measurement", "of", "the", "VAT", "levels", "of", "11", "beta", "-", "hydroxysteroid", "dehydrogenase", "type", "I", "(", "11", "-", "HSD", "-", "1", ")", ",", "which", "converts", "biologically", "inactive", "cortisone", "to", "biologically", "active", "cortisol", ";", "direct", "measurement", "of", "splanchnic", "cortisol", "production", ";", "and", "evaluation", "of", "the", "effect", "of", "a", "specific", "inhibitor", "of", "11", "-", "HSD", "-", "1", "on", "metabolic", "abnormalities", "associated", "with", "obesity", ",", "particularly", "diabetes", "mellitus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "are", "complex", "and", "difficult", "to", "interpret", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "conclusion", "is", "that", "the", "presence", "of", "VAT", "intracellular", "hypercortisolism", "in", "human", "obesity", "is", "possible", "but", "unlikely", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Long", "-", "term", "Effects", "of", "Perinatal", "Androgenization", "on", "Reproductive", "Parameters", "of", "Male", "Rat", "Offspring", "Androgenization", "and", "Male", "Rat", "Reproduction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "known", "that", "during", "sex", "differentiation", ",", "fetal", "androgens", "are", "critical", "determinants", "of", "the", "male", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "testosterone", "is", "necessary", "for", "normal", "development", "of", "male", "sexual", "behavior", ",", "perinatal", "androgen", "treatment", "can", "result", "in", "disruption", "of", "normal", "male", "sexual", "reproduction", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pregnant", "Wistar", "rats", "were", "administered", "either", "corn", "oil", "(", "vehicle", ")", "or", "testosterone", "propionate", "at", "0", ".", "2", "mg", "/", "kg", "from", "gestational", "day", "12", "until", "the", "end", "of", "lactation", "and", "the", "reproductive", "function", "of", "male", "offspring", "was", "evaluated", "at", "90", "(", "adulthood", ")", "and", "270", "(", "middle", "age", ")", "days", "of", "age", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Perinatal", "androgenization", "in", "the", "rat", "provoked", "a", "reduction", "in", "sperm", "production", "and", "reserves", "in", "adulthood", "that", "did", "not", "affect", "fertility", "and", "did", "not", "persist", "at", "more", "advanced", "ages", ",", "as", "shown", "by", "the", "results", "at", "post", "-", "natal", "day", "270", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "If", "perinatal", "androgenization", "promotes", "similar", "effects", "in", "humans", "of", "reproductive", "age", ",", "the", "results", "of", "the", "present", "work", "can", "impact", "male", "reproduction", "health", ",", "given", "the", "less", "efficient", "spermatogenesis", "and", "lower", "sperm", "reserves", "in", "the", "human", "epididymis", ",", "compared", "to", "rodents", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "CYP2B6", "*", "6", "Allele", "Significantly", "Alters", "the", "N", "-", "demethylation", "of", "Ketamine", "Enantiomers", "In", "Vitro", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ketamine", "is", "primarily", "metabolized", "to", "norketamine", "by", "hepatic", "cytochrome", "P450", "(", "CYP", ")", "2B6", "and", "CYP3A4", "-", "mediated", "N", "-", "demethylation", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "relative", "contribution", "from", "each", "enzyme", "remains", "controversial", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "CYP2B6", "*", "6", "allele", "is", "associated", "with", "reduced", "enzyme", "expression", "and", "activity", "that", "may", "lead", "to", "interindividual", "variability", "in", "ketamine", "metabolism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "We", "examined", "the", "N", "-", "demethylation", "of", "individual", "ketamine", "enantiomers", "using", "human", "liver", "microsomes", "(", "HLMs", ")", "genotyped", "for", "the", "CYP2B6", "*", "6", "allele", ",", "insect", "cell", "expressed", "recombinant", "CYP2B6", "and", "CYP3A4", "enzymes", "and", "COS", "-", "1", "cell", "expressed", "recombinant", "CYP2B6", ".", "1", "and", "CYP2B6", ".", "6", "protein", "variant", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Effects", "of", "CYP", "-", "selective", "inhibitors", "on", "norketamine", "formation", "were", "also", "determined", "in", "HLMs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "two", "-", "enzyme", "Michaelis", "-", "Menten", "model", "best", "fitted", "the", "HLM", "kinetic", "data", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "Km", "value", "for", "the", "high", "affinity", "enzyme", "and", "the", "low", "affinity", "enzyme", "were", "similar", "to", "those", "for", "the", "expressed", "CYP2B6", "and", "CYP3A4", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "intrinsic", "clearance", "for", "both", "ketamine", "enantiomers", "by", "the", "high", "affinity", "enzyme", "in", "HLMs", "with", "CYP2B6", "*", "1", "/", "*", "1", "genotype", "were", "at", "least", "2", "-", "fold", "and", "6", "-", "fold", "higher", ",", "respectively", ",", "than", "those", "for", "CYP2B6", "*", "1", "/", "*", "6", "genotype", "and", "CYP2B6", "*", "6", "/", "*", "6", "genotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "Vmax", "and", "Km", "values", "for", "CYP2B6", ".", "1", "were", "approximately", "160", "%", "and", "70", "%", "of", "those", "for", "CYP2B6", ".", "6", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "ThioTEPA", "(", "CYP2B6", "inhibitor", ",", "25", "mu", "M", ")", "and", "the", "monoclonal", "antibody", "against", "CYP2B6", "but", "not", "troleandomycin", "(", "CYP3A4", "inhibitor", ",", "25", "mu", "M", ")", "or", "the", "monoclonal", "antibody", "against", "CYP3A4", "inhibited", "ketamine", "N", "-", "demethylation", "at", "clinically", "relevant", "concentrations", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "degree", "of", "inhibition", "was", "significantly", "reduced", "in", "HLMs", "with", "the", "CYP2B6", "*", "6", "allele", "(", "gene", "-", "dose", "P", "<", "0", ".", "05", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "indicate", "a", "major", "role", "of", "CYP2B6", "in", "ketamine", "N", "-", "demethylation", "in", "vitro", "and", "a", "significant", "impact", "of", "the", "CYP2B6", "*", "6", "allele", "on", "enzyme", "-", "ketamine", "binding", "and", "catalytic", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Molecular", "Dynamics", "Simulations", "of", "CO2", "Formation", "in", "Interstellar", "Ices", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CO2", "ice", "is", "one", "of", "the", "most", "abundant", "components", "in", "ice", "-", "coated", "interstellar", "ices", "besides", "H2O", "and", "CO", ",", "but", "the", "most", "favorable", "path", "to", "CO2", "ice", "is", "still", "unclear", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Molecular", "dynamics", "calculations", "on", "the", "ultraviolet", "photodissociation", "of", "different", "kinds", "of", "CO", "-", "H2O", "ice", "systems", "have", "been", "performed", "at", "10", "K", "in", "order", "to", "demonstrate", "that", "the", "reaction", "between", "CO", "and", "an", "OH", "molecule", "resulting", "from", "H2O", "photodissociation", "through", "the", "first", "excited", "state", "is", "a", "possible", "route", "to", "form", "CO2", "ice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "However", ",", "our", "calculations", ",", "which", "take", "into", "account", "different", "ice", "surface", "models", ",", "suggest", "that", "there", "is", "another", "product", "with", "a", "higher", "formation", "probability", "(", "(", "3", ".", "00", "+/-", "0", ".", "07", ")", "x", "10", "(", "-", "2", ")", ")", ",", "which", "is", "the", "HOCO", "complex", ",", "whereas", "the", "formation", "of", "CO2", "has", "a", "probability", "of", "only", "(", "3", ".", "6", "+/-", "0", ".", "7", ")", "x", "10", "(", "-", "4", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "initial", "location", "of", "the", "CO", "is", "key", "to", "obtain", "reaction", "and", "form", "CO2", ":", "the", "CO", "needs", "to", "be", "located", "deep", "into", "the", "ice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "HOCO", "complex", "becomes", "trapped", "in", "the", "cold", "ice", "surface", "in", "the", "trans", "-", "HOCO", "minimum", "because", "it", "quickly", "loses", "its", "internal", "energy", "to", "the", "surrounding", "ice", ",", "preventing", "further", "reaction", "to", "H", "+", "CO2", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Several", "laboratory", "experiments", "have", "been", "carried", "out", "recently", ",", "and", "they", "confirm", "that", "CO2", "can", "also", "be", "formed", "through", "other", ",", "different", "routes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "compare", "our", "theoretical", "results", "with", "the", "data", "available", "from", "experiments", "studying", "the", "formation", "of", "CO2", "through", "a", "similar", "pathway", "as", "ours", ",", "even", "though", "the", "initial", "conditions", "were", "not", "exactly", "the", "same", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "also", "show", "that", "the", "HCO", "van", "der", "Waals", "complex", "can", "be", "formed", "through", "the", "interaction", "of", "CO", "with", "the", "H", "atom", "that", "is", "formed", "as", "a", "product", "of", "H2O", "photodissociation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "the", "reaction", "of", "the", "H", "atom", "photofragment", "following", "H2O", "photodissociation", "with", "CO", "can", "be", "a", "possible", "route", "to", "form", "HCO", "ice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]