tokens listlengths 2 298 | ner_tags listlengths 2 298 |
|---|---|
[
"The",
"long",
"road",
"of",
"research",
"on",
"snake",
"venom",
"serine",
"proteinases",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"has",
"long",
"been",
"recognized",
"that",
"snake",
"venom",
"serine",
"proteinases",
"(",
"SVSPs",
")",
"affect",
"various",
"physiological",
"functions",
"including",
"blood",
"coagulation",
",",
"fibrinolysis",
",",
"blood",
"pressure",
"and",
"platelet",
"aggregation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"SVSPs",
"have",
"been",
"used",
"as",
"refined",
"tools",
"to",
"study",
"molecular",
"mechanisms",
"involved",
"in",
"the",
"activation",
"of",
"key",
"factors",
"that",
"control",
"hemostasis",
"and",
"as",
"therapeutic",
"agents",
"in",
"various",
"thrombotic",
"and",
"hemostatic",
"conditions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"aim",
"of",
"this",
"review",
"is",
"to",
"highlight",
"the",
"state",
"of",
"our",
"knowledge",
"on",
"the",
"advances",
"made",
"in",
"SVSP",
"research",
"since",
"the",
"18th",
"century",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"includes",
"the",
"personal",
"accounts",
"of",
"some",
"distinguished",
"scientists",
"that",
"addressed",
"specific",
"problems",
"and",
"contributed",
"to",
"advance",
"the",
"field",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"brief",
"review",
"of",
"the",
"scientific",
"history",
"of",
"several",
"lesser",
"-",
"known",
"snake",
"venom",
"proteins",
":",
"l",
"-",
"amino",
"acid",
"oxidases",
",",
"hyaluronidases",
"and",
"phosphodiesterases",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"considering",
"the",
"proteins",
"and",
"toxins",
"in",
"snake",
"venom",
"one",
"'",
"s",
"thoughts",
"generally",
"migrate",
"to",
"the",
"proteinases",
",",
"neurotoxins",
"and",
"phospholipases",
"since",
"these",
"families",
"of",
"proteins",
"are",
"comprised",
"by",
"many",
"of",
"the",
"toxins",
"found",
"in",
"venom",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
"as",
"modern",
"proteomic",
"and",
"transcriptomic",
"venom",
"research",
"has",
"abundantly",
"shown",
"snake",
"venoms",
"are",
"complex",
"and",
"containing",
"numerous",
"families",
"of",
"protein",
"beyond",
"the",
"\"",
"big",
"three",
"\"",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"brief",
"review",
"we",
"will",
"discuss",
"three",
"of",
"the",
"lesser",
"discussed",
"proteins",
"typically",
"found",
"in",
"snake",
"venoms",
":",
"l",
"-",
"amino",
"acid",
"oxidases",
"(",
"LAAO",
")",
";",
"hyaluronidases",
"and",
"phosphodiesterases",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"proteins",
"have",
"long",
"been",
"known",
"to",
"be",
"part",
"of",
"many",
"venoms",
"'",
"proteomes",
"with",
"reports",
"appearing",
"in",
"the",
"literature",
"as",
"early",
"as",
"1944",
"for",
"LAAO",
",",
"1947",
"for",
"hyaluronidase",
"(",
"spreading",
"factor",
")",
",",
"and",
"1932",
"for",
"venom",
"phosphodiesterase",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"are",
"more",
"or",
"less",
"contemporary",
"with",
"the",
"first",
"reports",
"(",
"circa",
"1950",
")",
"on",
"snake",
"venom",
"proteases",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"the",
"relatively",
"modest",
"literature",
"on",
"these",
"snake",
"venom",
"proteins",
"stems",
"not",
"from",
"lack",
"of",
"early",
"discovery",
"but",
"rather",
"more",
"likely",
"to",
"their",
"ostensibly",
"minor",
"role",
"in",
"snake",
"venom",
"pathophysiology",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"review",
"we",
"will",
"provide",
"an",
"overview",
"of",
"the",
"experimental",
"history",
"of",
"these",
"venom",
"proteins",
",",
"their",
"biochemical",
"and",
"structural",
"features",
"and",
"their",
"role",
"in",
"snake",
"venom",
"toxinology",
"with",
"the",
"aim",
"of",
"bringing",
"a",
"fuller",
",",
"more",
"comprehensive",
",",
"understanding",
"of",
"the",
"history",
"of",
"laboratory",
"research",
"on",
"snake",
"venoms",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"there",
"are",
"some",
"comments",
"on",
"these",
"proteins",
"from",
"investigators",
"who",
"were",
"actively",
"engaged",
"in",
"their",
"investigation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Functional",
"and",
"structural",
"interaction",
"of",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"with",
"the",
"human",
"alpha",
"4",
"beta",
"2",
"nicotinic",
"acetylcholine",
"receptor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"interaction",
"of",
"the",
"selective",
"norepinephrine",
"reuptake",
"inhibitor",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"with",
"the",
"human",
"alpha",
"4",
"beta",
"2",
"nicotinic",
"acetylcholine",
"receptor",
"(",
"nAChR",
")",
"in",
"different",
"conformational",
"states",
"was",
"studied",
"by",
"several",
"functional",
"and",
"structural",
"approaches",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Patch",
"-",
"clamp",
"and",
"Ca",
"(",
"2",
"+",
")",
"-",
"influx",
"results",
"indicate",
"that",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"does",
"not",
"activate",
"h",
"alpha",
"4",
"beta",
"2",
"nAChRs",
"via",
"interaction",
"with",
"the",
"orthosteric",
"sites",
",",
"but",
"inhibits",
"agonist",
"-",
"induced",
"h",
"alpha",
"4",
"beta",
"2",
"activation",
"by",
"a",
"noncompetitive",
"mechanism",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Consistently",
",",
"the",
"results",
"from",
"the",
"electrophysiology",
"-",
"based",
"functional",
"approach",
"suggest",
"that",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"may",
"act",
"via",
"open",
"channel",
"block",
";",
"therefore",
",",
"it",
"is",
"capable",
"of",
"producing",
"a",
"use",
"-",
"dependent",
"type",
"of",
"inhibition",
"of",
"the",
"h",
"alpha",
"4",
"beta",
"2",
"nAChR",
"function",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"tested",
"whether",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"binds",
"to",
"the",
"luminal",
"[",
"(",
"3",
")",
"H",
"]",
"imipramine",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"results",
"indicate",
"that",
",",
"although",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"binds",
"with",
"low",
"affinity",
"to",
"this",
"site",
",",
"it",
"discriminates",
"between",
"the",
"resting",
"and",
"desensitized",
"h",
"alpha",
"4",
"beta",
"2",
"nAChR",
"ion",
"channels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Patch",
"-",
"clamp",
"results",
"also",
"indicate",
"that",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"progressively",
"inhibits",
"the",
"h",
"alpha",
"4",
"beta",
"2",
"nAChR",
"with",
"two",
"-",
"fold",
"higher",
"potency",
"at",
"the",
"end",
"of",
"one",
"-",
"second",
"application",
"of",
"agonist",
",",
"compared",
"with",
"the",
"peak",
"current",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"molecular",
"docking",
"studies",
"show",
"that",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"blocks",
"the",
"ion",
"channel",
"at",
"the",
"level",
"of",
"the",
"imipramine",
"locus",
",",
"between",
"M2",
"rings",
"6",
"'",
"and",
"14",
"'",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"we",
"found",
"a",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"conformer",
"that",
"docks",
"in",
"the",
"helix",
"bundle",
"of",
"the",
"alpha",
"4",
"subunit",
",",
"near",
"the",
"middle",
"region",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"According",
"to",
"molecular",
"dynamics",
"simulations",
",",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"binding",
"is",
"stable",
"for",
"both",
"sites",
",",
"albeit",
"less",
"stable",
"than",
"imipramine",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"The",
"interaction",
"of",
"these",
"drugs",
"with",
"the",
"helix",
"bundle",
"might",
"alter",
"allostericaly",
"the",
"functionality",
"of",
"the",
"channel",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"conclusion",
",",
"the",
"clinical",
"action",
"of",
"(",
"-",
")",
"-",
"reboxetine",
"may",
"be",
"produced",
"(",
"at",
"least",
"partially",
")",
"by",
"its",
"inhibitory",
"action",
"on",
"h",
"alpha",
"4",
"beta",
"2",
"nAChRs",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Proteins",
"with",
"an",
"alpha",
"/",
"beta",
"hydrolase",
"fold",
":",
"Relationships",
"between",
"subfamilies",
"in",
"an",
"ever",
"-",
"growing",
"superfamily",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Alpha",
"/",
"beta",
"hydrolases",
"function",
"as",
"hydrolases",
",",
"lyases",
",",
"transferases",
",",
"hormone",
"precursors",
"or",
"transporters",
",",
"chaperones",
"or",
"routers",
"of",
"other",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"amount",
"of",
"structural",
"and",
"functional",
"available",
"data",
"related",
"to",
"this",
"protein",
"superfamily",
"expands",
"exponentially",
",",
"as",
"does",
"the",
"number",
"of",
"proteins",
"classified",
"as",
"alpha",
"/",
"beta",
"hydrolases",
"despite",
"poor",
"sequence",
"similarity",
"and",
"lack",
"of",
"experimental",
"data",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
"the",
"superfamily",
"can",
"be",
"rationally",
"divided",
"according",
"to",
"sequence",
"or",
"structural",
"homologies",
",",
"leading",
"to",
"subfamilies",
"of",
"proteins",
"with",
"potentially",
"similar",
"functions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Since",
"the",
"discovery",
"of",
"proteins",
"homologous",
"to",
"cholinesterases",
"but",
"devoid",
"of",
"enzymatic",
"activity",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
",",
"the",
"neuroligins",
")",
",",
"divergent",
"functions",
"have",
"been",
"ascribed",
"to",
"members",
"of",
"other",
"subfamilies",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
",",
"lipases",
",",
"dipeptidylaminopeptidase",
"IV",
",",
"etc",
".",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"study",
"the",
"potentially",
"moonlighting",
"properties",
"of",
"alpha",
"/",
"beta",
"hydrolases",
",",
"the",
"ESTHER",
"database",
"(",
"for",
"ESTerase",
"and",
"alpha",
"/",
"beta",
"Hydrolase",
"Enzymes",
"and",
"Relatives",
";",
"http",
":",
"/",
"/",
"bioweb",
".",
"ensam",
".",
"inra",
".",
"fr",
"/",
"esther",
")",
",",
"which",
"collects",
",",
"organizes",
"and",
"disseminates",
"structural",
"and",
"functional",
"information",
"related",
"to",
"alpha",
"/",
"beta",
"hydrolases",
",",
"has",
"been",
"updated",
"with",
"new",
"tools",
"and",
"the",
"web",
"server",
"interface",
"has",
"been",
"upgraded",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"new",
"Overall",
"Table",
"along",
"with",
"a",
"new",
"Tree",
"based",
"on",
"HMM",
"models",
"has",
"been",
"included",
"to",
"tentatively",
"group",
"subfamilies",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"tools",
"provide",
"starting",
"points",
"for",
"phylogenetic",
"studies",
"aimed",
"at",
"pinpointing",
"the",
"origin",
"of",
"duplications",
"leading",
"to",
"paralogous",
"genes",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
",",
"acetylcholinesterase",
"versus",
"butyrylcholinesterase",
",",
"or",
"neuroligin",
"versus",
"carboxylesterase",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Another",
"of",
"our",
"goals",
"is",
"to",
"implement",
"new",
"tools",
"to",
"distinguish",
"catalytically",
"active",
"enzymes",
"from",
"non",
"-",
"catalytic",
"proteins",
"in",
"poorly",
"studied",
"or",
"annotated",
"subfamilies",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Enantioselective",
"apoptosis",
"induction",
"in",
"histiocytic",
"lymphoma",
"cells",
"and",
"acute",
"promyelocytic",
"leukemia",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"aim",
"of",
"this",
"study",
"was",
"to",
"identify",
"valproic",
"acid",
"(",
"VPA",
")",
"analogs",
"with",
"a",
"broad",
"spectrum",
"of",
"anti",
"-",
"cancer",
"activities",
"and",
"an",
"increased",
"apoptosis",
"-",
"inducing",
"potential",
"compared",
"with",
"the",
"parent",
"VPA",
",",
"which",
"is",
"enrolled",
"as",
"histone",
"deacetylase",
"(",
"HDAC",
")",
"inhibitor",
"in",
"a",
"large",
"number",
"of",
"clinical",
"trials",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"identified",
"a",
"chiral",
"VPA",
"derivative",
",",
"(",
"S",
")",
"-",
"2",
"-",
"pentyl",
"-",
"4",
"-",
"pentynoic",
"acid",
",",
"previously",
"characterized",
"as",
"HDAC",
"inhibitor",
"that",
"induced",
"massive",
"programmed",
"cell",
"death",
"in",
"a",
"strongly",
"enantioselective",
"manner",
"in",
"U937",
"histiocytic",
"lymphoma",
"cells",
"and",
"NB4",
"acute",
"promyelocytic",
"leukemia",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"By",
"performing",
"fluorescence",
"-",
"activated",
"cell",
"sorting",
"and",
"Western",
"blotting",
"analyses",
",",
"we",
"established",
"that",
"enantiomer",
"(",
"S",
")",
"-",
"2",
"-",
"pentyl",
"-",
"4",
"-",
"pentynoic",
"acid",
"has",
"higher",
"apoptosis",
"-",
"inducing",
"potential",
"than",
"VPA",
"itself",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"optic",
"antipode",
"(",
"R",
")",
"-",
"2",
"-",
"pentyl",
"-",
"4",
"-",
"pentynoic",
"acid",
"and",
"VPA",
"caused",
"under",
"the",
"same",
"conditions",
"only",
"a",
"weak",
"growth",
"inhibition",
"without",
"inducing",
"cell",
"differentiation",
"and",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"(",
"S",
")",
"-",
"2",
"-",
"pentyl",
"-",
"4",
"-",
"pentynoic",
"acid",
"is",
"more",
"apoptogenic",
"than",
"VPA",
"and",
"displays",
"enantioselective",
"anti",
"-",
"cancer",
"properties",
"that",
"warrant",
"further",
"research",
"regarding",
"the",
"mechanistic",
"basis",
"of",
"its",
"activity",
"and",
"its",
"potential",
"use",
"in",
"cancer",
"therapy",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Influence",
"of",
"pH",
",",
"light",
"cycle",
",",
"and",
"temperature",
"on",
"ecotoxicity",
"of",
"four",
"sulfonylurea",
"herbicides",
"towards",
"Lemna",
"gibba",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"chemical",
"regulation",
",",
"e",
".",
"g",
".",
"the",
"EU",
"Water",
"Framework",
"Directive",
",",
"REACH",
",",
"or",
"the",
"Pesticide",
"Directive",
",",
"standardized",
"ecotoxicological",
"tests",
"are",
"applied",
"to",
"evaluate",
"and",
"rank",
"the",
"hazard",
"of",
"compounds",
"and",
"for",
"deriving",
"environmental",
"quality",
"standards",
"(",
"EQS",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Standardized",
"test",
"methods",
"prescribe",
"fixed",
"testing",
"conditions",
"e",
".",
"g",
".",
"specific",
"temperature",
",",
"pH",
",",
"light",
"intensity",
"etc",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"environmental",
"conditions",
"under",
"which",
"the",
"organisms",
"live",
"are",
"rarely",
"identical",
"to",
"the",
"standard",
"conditions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"the",
"ecotoxicity",
"of",
"compounds",
"found",
"in",
"standard",
"test",
"is",
"not",
"only",
"a",
"function",
"of",
"the",
"compounds",
"inherent",
"physico",
"-",
"chemical",
"properties",
"but",
"is",
"also",
"affected",
"by",
"test",
"conditions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"therefore",
"important",
"to",
"study",
"the",
"effect",
"of",
"changes",
"in",
"test",
"conditions",
"in",
"order",
"to",
"get",
"reliable",
"input",
"ecotoxicity",
"data",
"for",
"assessing",
"the",
"potential",
"risk",
"posed",
"by",
"a",
"compound",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"objective",
"of",
"this",
"study",
"was",
"to",
"investigate",
"the",
"implications",
"of",
"changing",
"test",
"conditions",
"on",
"the",
"toxicity",
"of",
"four",
"sulfonylurea",
"herbicides",
"(",
"SUs",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"toxicity",
"of",
"the",
"four",
"SUs",
"towards",
"Lemna",
"gibba",
"was",
"investigated",
"at",
"three",
"pH",
"levels",
"(",
"6",
",",
"7",
".",
"5",
"and",
"9",
")",
",",
"at",
"two",
"temperatures",
"(",
"15",
"and",
"24",
"degrees",
"C",
")",
"and",
"two",
"light",
"regimes",
"(",
"continuous",
"and",
"12",
":",
"12",
"h",
"light",
":",
"dark",
"cycle",
")",
"The",
"EC50",
"increased",
"twofold",
"to",
"tenfold",
"for",
"the",
"four",
"SUs",
"when",
"pH",
"was",
"increased",
"from",
"6",
"to",
"9",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Decreasing",
"the",
"temperature",
"from",
"24",
"to",
"15",
"degrees",
"C",
"or",
"introducing",
"a",
"dark",
":",
"light",
"cycle",
"did",
"not",
"cause",
"any",
"trends",
"in",
"changes",
"in",
"toxicity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"results",
"show",
"that",
"test",
"conditions",
"can",
"have",
"an",
"effect",
"on",
"the",
"toxicity",
"and",
"this",
"should",
"be",
"considered",
"when",
"the",
"standard",
"test",
"results",
"are",
"used",
"for",
"derivation",
"of",
"EQS",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Nondestructive",
"indices",
"of",
"mercury",
"exposure",
"in",
"three",
"species",
"of",
"turtles",
"occupying",
"different",
"trophic",
"niches",
"downstream",
"from",
"a",
"former",
"chloralkali",
"facility",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Turtles",
"are",
"useful",
"for",
"studying",
"bioaccumulative",
"pollutants",
"such",
"as",
"mercury",
"(",
"Hg",
")",
"because",
"they",
"have",
"long",
"life",
"spans",
"and",
"feed",
"at",
"trophic",
"levels",
"that",
"result",
"in",
"high",
"exposure",
"to",
"anthropogenic",
"chemicals",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"compared",
"total",
"Hg",
"concentrations",
"in",
"blood",
"and",
"toenails",
"of",
"three",
"species",
"of",
"turtles",
"(",
"Chelydra",
"serpentina",
",",
"Sternotherus",
"odoratus",
",",
"and",
"Graptemys",
"geographica",
")",
"with",
"different",
"feeding",
"ecologies",
"from",
"locations",
"up",
"-",
"and",
"downstream",
"of",
"a",
"superfund",
"site",
"in",
"Virginia",
",",
"USA",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mercury",
"concentrations",
"in",
"turtle",
"tissues",
"were",
"low",
"at",
"the",
"reference",
"site",
"(",
"average",
"+/-",
"1SE",
":",
"blood",
"=",
"48",
"+/-",
"6",
"ng",
"g",
"(",
"-",
"1",
")",
";",
"nail",
"=",
"2",
",",
"464",
"+/-",
"339",
"ng",
"g",
"(",
"-",
"1",
")",
"FW",
")",
"but",
"rose",
"near",
"the",
"contamination",
"source",
"to",
"concentrations",
"among",
"the",
"highest",
"ever",
"reported",
"in",
"turtles",
"[",
"up",
"to",
"1",
",",
"800",
"ng",
"g",
"(",
"-",
"1",
")",
"(",
"blood",
")",
"and",
"42",
",",
"250",
"ng",
"g",
"(",
"-",
"1",
")",
"(",
"nail",
")",
"FW",
"]",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Tissue",
"concentrations",
"remained",
"elevated",
"~",
"130",
"km",
"downstream",
"from",
"the",
"source",
"compared",
"to",
"reference",
"concentrations",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Tissue",
"Hg",
"concentrations",
"were",
"higher",
"for",
"C",
".",
"serpentina",
"and",
"S",
".",
"odoratus",
"than",
"G",
".",
"geographica",
",",
"consistent",
"with",
"the",
"feeding",
"ecology",
"and",
"our",
"stable",
"isotope",
"(",
"delta",
"(",
"13",
")",
"C",
"and",
"delta",
"(",
"15",
")",
"N",
")",
"analyses",
"of",
"these",
"species",
"."
] | [
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"we",
"suggest",
"that",
"toenails",
"were",
"a",
"better",
"indication",
"of",
"Hg",
"exposure",
"than",
"blood",
",",
"probably",
"because",
"this",
"keratinized",
"tissue",
"represents",
"integrated",
"exposure",
"over",
"time",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"demonstrate",
"that",
"downstream",
"transport",
"of",
"Hg",
"from",
"point",
"sources",
"can",
"persist",
"over",
"vast",
"expanses",
"of",
"river",
"thereby",
"posing",
"potential",
"exposure",
"risks",
"to",
"turtles",
",",
"but",
"relative",
"exposure",
"varies",
"with",
"trophic",
"level",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"our",
"study",
"identifies",
"turtle",
"toenails",
"as",
"a",
"simple",
",",
"cost",
"-",
"efficient",
",",
"and",
"minimally",
"invasive",
"tissue",
"for",
"conservation",
"-",
"minded",
"sampling",
"of",
"these",
"long",
"-",
"lived",
"vertebrates",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Comparative",
"analysis",
"of",
"the",
"protective",
"effects",
"of",
"caffeic",
"acid",
"phenethyl",
"ester",
"(",
"CAPE",
")",
"on",
"pulmonary",
"contusion",
"lung",
"oxidative",
"stress",
"and",
"serum",
"copper",
"and",
"zinc",
"levels",
"in",
"experimental",
"rat",
"model",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"aim",
"of",
"this",
"study",
"was",
"to",
"investigate",
"the",
"effects",
"of",
"caffeic",
"acid",
"phenethyl",
"ester",
"(",
"CAPE",
")",
"in",
"the",
"lungs",
"by",
"biochemical",
"and",
"histopathological",
"analyses",
"in",
"an",
"experimental",
"isolated",
"lung",
"contusion",
"model",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Eighty",
"-",
"one",
"male",
"Sprague",
"-",
"Dawley",
"rats",
"were",
"used",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"animals",
"were",
"divided",
"randomly",
"into",
"four",
"groups",
":",
"group",
"1",
"(",
"n",
"=",
"9",
")",
"was",
"defined",
"as",
"without",
"contusion",
"and",
"without",
"CAPE",
"injection",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"Group",
"2",
"(",
"n",
"=",
"9",
")",
"was",
"defined",
"as",
"CAPE",
"10",
"mu",
"mol",
"/",
"kg",
"injection",
"without",
"lung",
"contusion",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Group",
"3",
"(",
"n",
"=",
"36",
")",
"was",
"defined",
"as",
"contusion",
"without",
"CAPE",
"-",
"administrated",
"group",
"which",
"consisted",
"of",
"four",
"subgroups",
"that",
"were",
"created",
"according",
"to",
"analysis",
"between",
"days",
"0",
",",
"1",
",",
"2",
",",
"and",
"3",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Group",
"4",
"(",
"n",
"=",
"27",
")",
"was",
"defined",
"as",
"CAPE",
"10",
"mu",
"mol",
"/",
"kg",
"administrated",
"after",
"contusion",
"group",
"divided",
"into",
"three",
"subgroups",
"according",
"to",
"analysis",
"on",
"days",
"1",
",",
"2",
",",
"and",
"3",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CAPE",
"10",
"mu",
"mol",
"/",
"kg",
"was",
"injected",
"intraperitoneally",
"30",
"min",
"after",
"trauma",
"and",
"on",
"days",
"1",
"and",
"2",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Blood",
"samples",
"were",
"obtained",
"to",
"measure",
"catalase",
"(",
"CAT",
")",
"and",
"superoxide",
"dismutase",
"(",
"SOD",
")",
"activities",
"and",
"level",
"of",
"malondialdehyde",
"(",
"MDA",
")",
"and",
"for",
"blood",
"gas",
"analysis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Trace",
"elements",
"such",
"as",
"zinc",
"and",
"copper",
"were",
"measured",
"in",
"serum",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"lung",
"tissue",
"was",
"also",
"removed",
"for",
"histopathological",
"examination",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Isolated",
"lung",
"contusion",
"increased",
"serum",
"and",
"tissue",
"SOD",
"and",
"CAT",
"activities",
"and",
"MDA",
"levels",
"(",
"p",
"<",
"0",
".",
"05",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"serum",
"and",
"tissue",
"SOD",
",",
"MDA",
",",
"and",
"CAT",
"levels",
"on",
"day",
"3",
"were",
"lower",
"in",
"group",
"4",
"compared",
"to",
"group",
"3",
"(",
"p",
"<",
"0",
".",
"05",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Further",
",",
"the",
"levels",
"of",
"SOD",
",",
"MDA",
",",
"and",
"CAT",
"in",
"group",
"4",
"were",
"similar",
"compared",
"to",
"group",
"1",
"(",
"p",
">",
"0",
".",
"05",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CAPE",
"also",
"had",
"a",
"significant",
"beneficial",
"effect",
"on",
"blood",
"gases",
"(",
"p",
"<",
"0",
".",
"05",
")",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"serum",
"zinc",
"and",
"copper",
"levels",
"were",
"(",
"p",
"<",
"0",
".",
"05",
")",
"influenced",
"by",
"the",
"administration",
"of",
"CAPE",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"Histopathological",
"examination",
"revealed",
"lower",
"scores",
"in",
"group",
"4",
"compared",
"to",
"group",
"3",
"(",
"p",
"<",
"0",
".",
"05",
")",
"and",
"no",
"significant",
"differences",
"compared",
"to",
"group",
"1",
"(",
"p",
">",
"0",
".",
"05",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CAPE",
"appears",
"to",
"be",
"effective",
"in",
"protecting",
"against",
"severe",
"oxidative",
"stress",
"and",
"tissue",
"damage",
"caused",
"by",
"pulmonary",
"contusion",
"in",
"an",
"experimental",
"setting",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"we",
"conclude",
"that",
"administration",
"of",
"CAPE",
"may",
"be",
"used",
"for",
"a",
"variety",
"of",
"conditions",
"associated",
"with",
"pulmonary",
"contusion",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Clinical",
"use",
"of",
"CAPE",
"may",
"have",
"the",
"advantage",
"of",
"prevention",
"of",
"pulmonary",
"contusion",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Carboxylesterases",
"are",
"uniquely",
"expressed",
"among",
"tissues",
"and",
"regulated",
"by",
"nuclear",
"hormone",
"receptors",
"in",
"the",
"mouse",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Carboxylesterases",
"(",
"CES",
")",
"are",
"a",
"well",
"recognized",
",",
"yet",
"incompletely",
"characterized",
"family",
"of",
"proteins",
"that",
"catalyze",
"neutral",
"lipid",
"hydrolysis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Some",
"CES",
"have",
"well",
"-",
"defined",
"roles",
"in",
"xenobiotic",
"clearance",
",",
"pharmacologic",
"prodrug",
"activation",
",",
"and",
"narcotic",
"detoxification",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"emerging",
"evidence",
"suggests",
"other",
"CES",
"may",
"have",
"roles",
"in",
"lipid",
"metabolism",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Humans",
"have",
"six",
"CES",
"genes",
",",
"whereas",
"mice",
"have",
"20",
"Ces",
"genes",
"grouped",
"into",
"five",
"isoenzyme",
"classes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Perhaps",
"due",
"to",
"the",
"high",
"sequence",
"similarity",
"shared",
"by",
"the",
"mouse",
"Ces",
"genes",
",",
"the",
"tissue",
"-",
"specific",
"distribution",
"of",
"expression",
"for",
"these",
"enzymes",
"has",
"not",
"been",
"fully",
"addressed",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"we",
"performed",
"studies",
"to",
"provide",
"a",
"comprehensive",
"tissue",
"distribution",
"analysis",
"of",
"mouse",
"Ces",
"mRNAs",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"demonstrated",
"that",
"while",
"the",
"mouse",
"Ces",
"family",
"1",
"is",
"highly",
"expressed",
"in",
"liver",
"and",
"family",
"2",
"in",
"intestine",
",",
"many",
"Ces",
"genes",
"have",
"a",
"wide",
"and",
"unique",
"tissue",
"distribution",
"defined",
"by",
"relative",
"mRNA",
"levels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"evaluating",
"Ces",
"gene",
"expression",
"in",
"response",
"to",
"pharmacologic",
"activation",
"of",
"lipid",
"-",
"and",
"xenobiotic",
"-",
"sensing",
"nuclear",
"hormone",
"receptors",
"showed",
"differential",
"regulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"specific",
"shifts",
"in",
"Ces",
"gene",
"expression",
"were",
"seen",
"in",
"peritoneal",
"macrophages",
"following",
"lipopolysaccharide",
"treatment",
"and",
"in",
"a",
"steatotic",
"liver",
"model",
"induced",
"by",
"high",
"-",
"fat",
"feeding",
",",
"two",
"model",
"systems",
"relevant",
"to",
"disease",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Overall",
"these",
"data",
"show",
"that",
"each",
"mouse",
"Ces",
"gene",
"has",
"its",
"own",
"distinctive",
"tissue",
"expression",
"pattern",
"and",
"suggest",
"that",
"some",
"CES",
"may",
"have",
"tissue",
"-",
"specific",
"roles",
"in",
"lipid",
"metabolism",
"and",
"xenobiotic",
"clearance",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"DCPIB",
",",
"the",
"proposed",
"selective",
"blocker",
"of",
"volume",
"-",
"regulated",
"anion",
"channels",
",",
"inhibits",
"several",
"glutamate",
"transport",
"pathways",
"in",
"glial",
"cells",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"4",
"-",
"(",
"2",
"-",
"Butyl",
"-",
"6",
",",
"7",
"-",
"dichloro",
"-",
"2",
"-",
"cyclopentyl",
"-",
"indan",
"-",
"1",
"-",
"on",
"-",
"5",
"-",
"yl",
")",
"oxobutyric",
"acid",
"(",
"DCPIB",
")",
"was",
"identified",
"as",
"the",
"selective",
"blocker",
"of",
"volume",
"-",
"regulated",
"anion",
"channels",
"(",
"VRAC",
")",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"VRAC",
"are",
"permeable",
"to",
"small",
"inorganic",
"and",
"organic",
"anions",
",",
"including",
"the",
"excitatory",
"neurotransmitter",
"glutamate",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"recent",
"years",
"DCPIB",
"has",
"been",
"increasingly",
"used",
"for",
"probing",
"the",
"physiologic",
"and",
"pathologic",
"roles",
"of",
"VRAC",
"and",
"was",
"found",
"to",
"potently",
"suppress",
"pathologic",
"glutamate",
"release",
"in",
"cerebral",
"ischemia",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Because",
"ischemic",
"glutamate",
"release",
"can",
"be",
"mediated",
"by",
"a",
"plethora",
"of",
"mechanisms",
",",
"in",
"this",
"study",
"we",
"explored",
"the",
"selectivity",
"of",
"DCPIB",
"toward",
"the",
"majority",
"of",
"previously",
"identified",
"glutamate",
"transporters",
"and",
"permeability",
"pathways",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"l",
"-",
"[",
"(",
"3",
")",
"H",
"]",
"glutamate",
",",
"d",
"-",
"[",
"(",
"3",
")",
"H",
"]",
"aspartate",
",",
"and",
"l",
"-",
"[",
"(",
"14",
")",
"C",
"]",
"cystine",
"were",
"used",
"to",
"trace",
"amino",
"acid",
"release",
"and",
"uptake",
"."
] | [
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"found",
"that",
"in",
"addition",
"to",
"its",
"well",
"-",
"characterized",
"effect",
"on",
"VRAC",
",",
"DCPIB",
"potently",
"inhibited",
"glutamate",
"release",
"via",
"connexin",
"hemichannels",
"and",
"glutamate",
"uptake",
"via",
"the",
"glutamate",
"transporter",
"GLT",
"-",
"1",
"in",
"rat",
"glial",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"DCPIB",
"had",
"no",
"direct",
"effect",
"on",
"vesicular",
"glutamate",
"release",
"from",
"rat",
"brain",
"synaptosomes",
"or",
"the",
"cystine",
"/",
"glutamate",
"exchange",
"in",
"astrocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"compound",
"did",
"not",
"affect",
"the",
"astrocytic",
"glutamate",
"transporter",
"GLAST",
",",
"nor",
"did",
"it",
"block",
"glutamate",
"release",
"via",
"the",
"P2X",
"(",
"7",
")",
"/",
"pannexin",
"permeability",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.