extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "Recent", "findings", "from", "the", "Women", "'", "s", "Health", "Initiative", "(", "WHI", ")", "and", "other", "studies", "suggest", "that", "a", "woman", "'", "s", "clinical", "and", "biological", "characteristics", "may", "modify", "her", "health", "outcomes", "on", "hormone", "therapy", "(", "HT", ")", "and", "that", "some", "women", "may", "be", "more", "appropriate", "candidates", "for", "therapy", "than", "others", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "emerging", "body", "of", "evidence", "suggests", "that", "it", "may", "be", "possible", "to", "identify", "women", "who", "are", "more", "likely", "to", "have", "favorable", "outcomes", "and", "less", "likely", "to", "have", "adverse", "events", "on", "HT", ",", "as", "well", "as", "to", "tailor", "the", "optimal", "dose", ",", "formulation", ",", "and", "route", "of", "delivery", "of", "treatment", ",", "by", "the", "use", "of", "individual", "risk", "stratification", "and", "a", "personalized", "approach", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Several", "clinical", "characteristics", "that", "have", "been", "proposed", "for", "this", "purpose", "include", "a", "woman", "'", "s", "age", ",", "time", "since", "menopause", ",", "symptom", "severity", ",", "baseline", "vascular", "health", ",", "risk", "for", "breast", "cancer", ",", "biomarker", "levels", ",", "and", "genetic", "predisposition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "underlying", "rationale", "for", "personalized", "medicine", ",", "that", "each", "person", "has", "a", "unique", "biologic", "profile", "that", "can", "help", "to", "guide", "the", "choice", "of", "therapy", ",", "applies", "well", "to", "HT", "decision", "making", "and", "holds", "promise", "for", "improved", "treatment", "efficacy", "and", "safety", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "report", ",", "which", "focuses", "on", "vascular", "health", ",", "reviews", "the", "evidence", "on", "the", "role", "of", "such", "markers", "in", "tailoring", "the", "use", "of", "hormone", "therapy", "to", "appropriate", "candidates", ",", "with", "the", "ultimate", "goal", "of", "developing", "a", "personalized", "risk", ":", "benefit", "prediction", "model", "that", "takes", "into", "account", "clinical", "and", "genetic", "factors", ",", "\"", "patient", "-", "centered", "\"", "outcomes", "including", "sense", "of", "well", "being", "and", "quality", "of", "life", ",", "and", "other", "variables", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "proposed", "personalized", "approach", "to", "HT", "decision", "making", "has", "the", "potential", "to", "improve", "the", "quality", "of", "health", "care", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Reversal", "of", "dopamine", "D2", "agonist", "-", "induced", "inhibition", "of", "ventral", "tegmental", "area", "neurons", "by", "Gq", "-", "linked", "neurotransmitters", "is", "dependent", "on", "protein", "kinase", "C", ",", "G", "protein", "-", "coupled", "receptor", "kinase", ",", "and", "dynamin", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dopaminergic", "neurons", "of", "the", "ventral", "tegmental", "area", "are", "important", "components", "of", "brain", "pathways", "related", "to", "addiction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Prolonged", "exposure", "of", "these", "neurons", "to", "moderate", "concentrations", "of", "dopamine", "(", "DA", ")", "decreases", "their", "sensitivity", "to", "inhibition", "by", "DA", ",", "a", "process", "called", "DA", "-", "inhibition", "reversal", "(", "DIR", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DIR", "is", "mediated", "by", "phospholipase", "C", "and", "conventional", "subtype", "of", "protein", "kinase", "C", "(", "cPKC", ")", "through", "concurrent", "stimulation", "of", "D2", "and", "D1", "-", "like", "DA", "receptors", ",", "or", "by", "D2", "stimulation", "concurrent", "with", "activation", "of", "5", "-", "HT", "(", "2", ")", "or", "neurotensin", "receptors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "study", ",", "we", "further", "characterized", "this", "phenomenon", "by", "use", "of", "extracellular", "recordings", "in", "brain", "slices", "to", "examine", "whether", "DIR", "is", "linked", "to", "G", "protein", "-", "coupled", "receptor", "kinase", "-", "2", "(", "GRK2", ")", "or", "dynamin", "by", "assessing", "DIR", "in", "the", "presence", "of", "antagonists", "of", "these", "enzymes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DIR", "was", "blocked", "by", "beta", "-", "ARK1", "inhibitor", ",", "which", "inhibits", "GRK2", ",", "and", "by", "dynasore", ",", "which", "blocks", "dynamin", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Reversal", "of", "inhibition", "by", "D2", "agonist", "quinpirole", "was", "produced", "by", "serotonin", "(", "50", "micro", "M", ")", "and", "by", "neurotensin", "(", "5", "-", "10", "nM", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Serotonin", "-", "induced", "or", "neurotensin", "-", "induced", "reversal", "was", "blocked", "by", "beta", "-", "ARK1", "inhibitor", ",", "dynasore", ",", "or", "cPKC", "antagonist", "5", ",", "6", ",", "7", ",", "13", "-", "tetrahydro", "-", "13", "-", "methyl", "-", "5", "-", "oxo", "-", "12H", "-", "indolo", "[", "2", ",", "3", "-", "a", "]", "pyrrolo", "[", "3", ",", "4c", "]", "carbazole", "-", "12", "-", "propanenitrile", "(", "G", "o", "6976", ")", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "This", "further", "characterization", "of", "DIR", "indicates", "that", "cPKC", ",", "GRK2", ",", "and", "dynamin", "play", "important", "roles", "in", "the", "desensitization", "of", "D2", "receptors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "drugs", "of", "abuse", "produce", "persistent", "increases", "in", "DA", "concentration", "in", "the", "ventral", "tegmental", "area", ",", "reduction", "of", "D2", "receptor", "sensitivity", "as", "a", "result", "of", "drug", "abuse", "may", "be", "a", "critical", "factor", "in", "the", "processes", "of", "addiction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "comparative", "analysis", "of", "computational", "approaches", "to", "relative", "protein", "quantification", "using", "peptide", "peak", "intensities", "in", "label", "-", "free", "LC", "-", "MS", "proteomics", "experiments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Liquid", "chromatography", "coupled", "with", "mass", "spectrometry", "(", "LC", "-", "MS", ")", "is", "widely", "used", "to", "identify", "and", "quantify", "peptides", "in", "complex", "biological", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "particular", ",", "label", "-", "free", "shotgun", "proteomics", "is", "highly", "effective", "for", "the", "identification", "of", "peptides", "and", "subsequently", "obtaining", "a", "global", "protein", "profile", "of", "a", "sample", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "a", "result", ",", "this", "approach", "is", "widely", "used", "for", "discovery", "studies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Typically", ",", "the", "objective", "of", "these", "discovery", "studies", "is", "to", "identify", "proteins", "that", "are", "affected", "by", "some", "condition", "of", "interest", "(", "e", ".", "g", ".", "disease", ",", "exposure", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "for", "complex", "biological", "samples", ",", "label", "-", "free", "LC", "-", "MS", "proteomics", "experiments", "measure", "peptides", "and", "do", "not", "directly", "yield", "protein", "quantities", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "protein", "quantification", "must", "be", "inferred", "from", "one", "or", "more", "measured", "peptides", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "recent", "years", ",", "many", "computational", "approaches", "to", "relative", "protein", "quantification", "of", "label", "-", "free", "LC", "-", "MS", "data", "have", "been", "published", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "review", ",", "we", "examine", "the", "most", "commonly", "employed", "quantification", "approaches", "to", "relative", "protein", "abundance", "from", "peak", "intensity", "values", ",", "evaluate", "their", "individual", "merits", ",", "and", "discuss", "challenges", "in", "the", "use", "of", "the", "various", "computational", "approaches", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mithramycin", "A", "inhibits", "myeloid", "cell", "leukemia", "-", "1", "to", "induce", "apoptosis", "in", "oral", "squamous", "cell", "carcinomas", "and", "tumor", "xenograft", "through", "activation", "of", "Bax", "and", "oligomerization", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "several", "human", "malignancies", ",", "overexpression", "of", "myeloid", "cell", "leukemia", "-", "1", "(", "Mcl", "-", "1", ")", "confers", "resistance", "to", "induction", "of", "apoptosis", ";", "however", ",", "Mcl", "-", "1", "-", "mediated", "inhibition", "of", "apoptosis", "in", "oral", "squamous", "cell", "carcinoma", "(", "OSCC", ")", "is", "not", "fully", "understood", "and", "has", "been", "investigated", "in", "this", "study", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Mcl", "-", "1", "promoter", "activators", "(", "TPA", ")", "and", "epidermal", "growth", "factor", "(", "EGF", ")", "enhanced", "neoplastic", "transformation", "of", "JB6", "cells", "and", "this", "response", "was", "accompanied", "by", "enhanced", "expression", "of", "Mcl", "-", "1", ",", "and", "knockdown", "of", "Mcl", "-", "1", "by", "RNA", "interference", "(", "RNAi", ")", "decreased", "JB6", "cell", "transformation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "same", "cell", "line", ",", "we", "also", "demonstrated", "that", "mithramycin", "A", "(", "Mith", ")", "decreased", "TPA", "-", "induced", "JB6", "cell", "transformation", "and", "Mcl", "-", "1", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mcl", "-", "1", "was", "overexpressed", "in", "human", "oral", "tumors", "compared", "with", "normal", "oral", "mucosa", "and", "also", "in", "several", "OSCC", "cell", "lines", "including", "HN22", "and", "HSC", "-", "4", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Treatment", "of", "these", "cells", "with", "Mith", "also", "decreased", "Mcl", "-", "1", "expression", "and", "neoplastic", "cell", "transformation", ",", "and", "this", "was", "accompanied", "by", "induction", "of", "several", "markers", "of", "apoptosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Knockdown", "of", "Mcl", "-", "1", "by", "RNAi", "also", "induced", "apoptotic", "cell", "death", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "downregulation", "of", "Mcl", "-", "1", "by", "Mith", "and", "RNAi", "increased", "pro", "-", "apoptotic", "protein", "Bax", ",", "resulting", "in", "the", "Bax", "translocation", "into", "mitochondria", "and", "its", "oligomerization", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mith", "also", "suppressed", "tumor", "growth", "in", "vivo", "and", "induced", "apoptosis", "in", "tumor", "by", "also", "regulating", "expression", "of", "Mcl", "-", "1", "and", "Bax", "proteins", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "indicate", "a", "critical", "role", "for", "Mcl", "-", "1", "in", "the", "growth", "and", "survival", "of", "OSCC", "and", "demonstrate", "that", "Mith", "may", "be", "a", "potential", "anticancer", "drug", "candidate", "for", "clinical", "treatment", "of", "OSCC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Novel", "assays", "for", "detection", "of", "urinary", "KIM", "-", "1", "in", "mouse", "models", "of", "kidney", "injury", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Kidney", "injury", "molecule", "-", "1", "(", "KIM", "-", "1", ")", "has", "been", "qualified", "by", "the", "Food", "and", "Drug", "Administration", "and", "European", "Medicines", "Agency", "as", "a", "urinary", "biomarker", "to", "monitor", "preclinical", "nephrotoxicity", "in", "rats", "and", "on", "a", "case", "-", "by", "-", "case", "basis", "for", "the", "translation", "of", "potentially", "nephrotoxic", "drugs", "into", "first", "-", "in", "human", "studies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "mouse", "models", "are", "widely", "employed", "in", "preclinical", "studies", ",", "few", "urinary", "biomarker", "studies", "have", "been", "performed", "in", "mice", "due", "to", "limited", "urine", "availability", "and", "lack", "of", "sensitive", "assays", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "report", "the", "development", "and", "validation", "of", "two", "different", "assays", "for", "quantitative", "assessment", "of", "mouse", "urinary", "KIM", "-", "1", "(", "uKIM", "-", "1", ")", "and", "compare", "the", "sensitivity", "of", "KIM", "-", "1", "relative", "to", "other", "standard", "markers", "in", "ischemia", "reperfusion", "and", "aristolochic", "acid", "(", "AA", ")", "-", "induced", "kidney", "injury", "in", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "sensitive", ",", "reproducible", ",", "and", "quantitative", "microbead", "-", "based", "KIM", "-", "1", "ELISA", "was", "established", ",", "which", "requires", "only", "10", "mu", "l", "urine", "for", "triplicate", "determination", "with", "an", "assay", "range", "of", "12", ".", "21", "pg", "/", "ml", "to", "50", "ng", "/", "ml", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "second", "assay", "is", "a", "laminar", "flow", "dipstick", "assay", ",", "which", "has", "an", "assay", "range", "of", "195", "pg", "/", "ml", "to", "50", "ng", "/", "ml", "and", "provides", "quantitative", "assessment", "of", "KIM", "-", "1", "in", "15", "min", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "uKIM", "-", "1", "levels", "increased", "with", "increasing", "time", "of", "ischemia", "or", "time", "after", "AA", "administration", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "only", "10", "-", "min", "ischemia", "followed", "by", "24", "-", "h", "reperfusion", ",", "uKIM", "-", "1", "was", "significantly", "elevated", "by", "13", "-", "fold", ",", "whereas", "serum", "creatinine", "(", "sCr", ")", ",", "blood", "urea", "nitrogen", ",", "N", "-", "acetyl", "-", "beta", "-", "glucosaminidase", "(", "NAG", ")", ",", "and", "proteinuria", "levels", "did", "not", "change", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "AA", "administration", ",", "uKIM", "-", "1", "levels", "were", "significantly", "upregulated", "by", "greater", "than", "threefold", "within", "12", "h", ",", "whereas", "sCr", "and", "NAG", "levels", "were", "unchanged", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mouse", "KIM", "-", "1", "was", "stable", "for", "multiple", "freeze", "-", "thaw", "cycles", ",", "for", "up", "to", "5", "days", "at", "room", "temperature", "and", "up", "to", "at", "least", "an", "year", "when", "stored", "at", "-", "80", "degrees", "C", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Performance", "of", "urinary", "and", "gene", "expression", "biomarkers", "in", "detecting", "the", "nephrotoxic", "effects", "of", "melamine", "and", "cyanuric", "acid", "following", "diverse", "scenarios", "of", "co", "-", "exposure", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "standard", "nephrotoxicity", "assessments", "primarily", "detect", "impaired", "renal", "function", ",", "KIM", "-", "1", ",", "clusterin", ",", "NGAL", ",", "osteopontin", "and", "TIMP", "-", "1", "were", "recently", "identified", "biomarkers", "proposed", "to", "indicate", "earlier", "perturbations", "in", "renal", "integrity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "recent", "adulteration", "of", "infant", "and", "pet", "food", "with", "melamine", "(", "MEL", ")", "and", "structurally", "-", "related", "compounds", "revealed", "that", "co", "-", "ingestion", "of", "MEL", "and", "cyanuric", "acid", "(", "CYA", ")", "could", "form", "melamine", "-", "cyanurate", "crystals", "which", "obstruct", "renal", "tubules", "and", "induce", "acute", "renal", "failure", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "concurrently", "evaluated", "the", "ability", "of", "multiplexed", "urinary", "biomarker", "immunoassays", "and", "biomarker", "gene", "expression", "analysis", "to", "detect", "nephrotoxicity", "in", "F344", "rats", "co", "-", "administered", "60ppm", "each", "of", "MEL", "and", "CYA", "in", "feed", "or", "via", "gavage", "for", "28days", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "biomarkers", "were", "also", "evaluated", "for", "the", "ability", "to", "differentiate", "the", "effects", "of", "the", "compounds", "when", "co", "-", "administered", "using", "diverse", "dosing", "schedules", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "consecutive", "vs", ".", "staggered", "gavage", ")", "and", "dosing", "matrixes", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "feed", "vs", ".", "gavage", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "illustrate", "the", "ability", "of", "both", "methods", "to", "detect", "and", "differentiate", "the", "severity", "of", "adverse", "effects", "in", "the", "staggered", "and", "consecutive", "gavage", "groups", "at", "much", "lower", "doses", "than", "previously", "observed", "in", "animals", "co", "-", "exposed", "to", "the", "compounds", "in", "feed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "also", "demonstrate", "that", "these", "urinary", "biomarkers", "outperform", "traditional", "diagnostic", "methods", "and", "represent", "a", "powerful", ",", "non", "-", "invasive", "indicator", "of", "chemical", "-", "induced", "nephrotoxicity", "prior", "to", "the", "onset", "of", "renal", "dysfunction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "NMDA", "receptor", "blockade", "impairs", "the", "muscarinic", "conversion", "of", "sub", "-", "threshold", "transient", "depression", "into", "long", "-", "lasting", "LTD", "in", "the", "hippocampus", "-", "prefrontal", "cortex", "pathway", "in", "vivo", ":", "correlation", "with", "gamma", "oscillations", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cholinergic", "fibers", "from", "the", "brainstem", "and", "basal", "forebrain", "innervate", "the", "medial", "prefrontal", "cortex", "(", "mPFC", ")", "modulating", "neuronal", "activity", "and", "synaptic", "plasticity", "responses", "to", "hippocampal", "inputs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "investigated", "the", "muscarinic", "and", "glutamatergic", "modulation", "of", "long", "-", "term", "depression", "(", "LTD", ")", "in", "the", "intact", "projections", "from", "CA1", "to", "mPFC", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cortical", "-", "evoked", "responses", "were", "recorded", "in", "urethane", "-", "anesthetized", "rats", "for", "30", "min", "during", "baseline", "and", "4", "h", "following", "LTD", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "order", "to", "test", "the", "potentiating", "effects", "of", "pilocarpine", "(", "PILO", ")", ",", "independent", "groups", "of", "rats", "received", "either", "a", "microinjection", "of", "PILO", "(", "40", "nmol", ";", "i", ".", "c", ".", "v", ".", ")", "or", "vehicle", ",", "immediately", "before", "or", "20", "min", "after", "a", "sub", "-", "threshold", "LTD", "protocol", "(", "600", "pulses", ",", "1", "Hz", ";", "LFS600", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Other", "groups", "received", "either", "an", "infusion", "of", "the", "selective", "NMDA", "receptor", "antagonist", "(", "AP7", ";", "10", "nmol", ";", "intra", "-", "mPFC", ")", "or", "vehicle", ",", "10", "min", "prior", "to", "PILO", "preceding", "LFS600", ",", "or", "prior", "to", "a", "supra", "-", "threshold", "LTD", "protocol", "(", "900", "pulses", ",", "1", "Hz", ";", "LFS900", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "show", "that", "PILO", "converts", "a", "transient", "cortical", "depression", "induced", "by", "LFS600", "into", "a", "robust", "LTD", ",", "stable", "for", "at", "least", "4", "h", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "applied", "after", "LFS600", ",", "PILO", "does", "not", "change", "either", "mPFC", "basal", "neurotransmission", "or", "late", "LTD", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "data", "also", "indicate", "that", "NMDA", "receptor", "pre", "-", "activation", "is", "essential", "to", "the", "muscarinic", "enhancement", "of", "mPFC", "synaptic", "depression", ",", "since", "AP7", "microinjection", "into", "the", "mPFC", "blocked", "the", "conversion", "of", "transient", "depression", "into", "long", "-", "lasting", "LTD", "produced", "by", "PILO", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "AP7", "effectively", "blocked", "the", "long", "-", "lasting", "LTD", "induced", "by", "LFS900", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "our", "findings", "suggest", "that", "the", "glutamatergic", "co", "-", "activation", "of", "prefrontal", "neurons", "is", "important", "for", "the", "effects", "of", "PILO", "on", "mPFC", "synaptic", "depression", ",", "which", "could", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "control", "of", "executive", "and", "emotional", "functions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effects", "of", "alpha", "-", "tocopherol", "on", "oxidative", "damage", "and", "serum", "levels", "of", "Clara", "cell", "protein", "16", "in", "aspiration", "pneumonitis", "induced", "by", "bile", "acids", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "aim", "in", "this", "study", "is", "to", "examine", "the", "effects", "of", "alpha", "-", "tocopherol", "(", "AT", ")", "on", "rats", "with", "aspiration", "pneumonitis", "induced", "with", "bile", "acids", "(", "BAs", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "animals", "were", "divided", "in", "to", "four", "groups", ",", "namely", "saline", "group", "(", "n", "=", "7", ")", ",", "saline", "+", "AT", "group", "(", "n", "=", "7", ")", ",", "BA", "group", "(", "n", "=", "7", ")", ",", "and", "BA", "+", "AT", "group", "(", "n", "=", "7", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Saline", "and", "BA", "groups", "aspirated", "intratracheally", "with", "1", "ml", "/", "kg", "saline", "and", "1", "ml", "/", "kg", "bile", "acids", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "AT", "was", "given", "at", "20", "mg", "/", "kg", "/", "day", "dosage", "for", "7", "days", "to", "the", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "AT", "group", "was", "given", "20", "mg", "/", "kg", "/", "day", "AT", "for", "7", "days", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Malondialdehyde", "(", "MDA", ")", ",", "Clara", "cell", "protein", "16", "(", "CC", "-", "16", ")", ",", "catalase", "(", "CAT", ")", ",", "superoxide", "dismutase", "(", "SOD", ")", ",", "as", "well", "as", "peribronchial", "inflammatory", "cell", "infiltration", ",", "alveolar", "septal", "infiltration", ",", "alveolar", "edema", ",", "alveolar", "exudate", ",", "alveolar", "histiocytes", ",", "and", "necrosis", "were", "evaluated", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "CAT", "activity", "of", "the", "BA", "group", "was", "significantly", "lower", "than", "the", "saline", "group", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "BA", "+", "AT", "group", ",", "there", "was", "a", "significant", "increase", "in", "SOD", "and", "CAT", "activities", "when", "compared", "with", "that", "of", "the", "BA", "group", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "CC", "-", "16", "and", "MDA", "contents", "in", "the", "BA", "group", "were", "significantly", "higher", "than", "in", "the", "saline", "group", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "CC", "-", "16", "and", "MDA", "levels", "of", "the", "BA", "+", "AT", "group", "were", "significantly", "lower", "than", "BA", "group", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Histopathologic", "changes", "were", "seen", "in", "BA", "group", ",", "and", "there", "was", "a", "significant", "decrease", "in", "the", "BA", "+", "AT", "group", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "AT", "might", "be", "beneficial", "in", "the", "treatment", "of", "aspiration", "pneumonitis", "induced", "by", "BAs", "because", "AT", "decreased", "oxidative", "damage", "and", "resulted", "in", "a", "decrease", "in", "CC", "-", "16", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Resveratrol", "attenuates", "hepatotoxicity", "of", "rats", "exposed", "to", "arsenic", "trioxide", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Arsenic", "trioxide", "(", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", ")", "is", "an", "environmental", "pollutant", "and", "potent", "toxicant", "to", "humans", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "it", "also", "shows", "substantial", "anti", "-", "cancer", "activity", "in", "individuals", "with", "acute", "promyelocytic", "leukemia", "(", "APL", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Unfortunately", ",", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "-", "treated", "leukemia", "patients", "suffer", "hepatotoxicity", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Resveratrol", "has", "been", "demonstrated", "to", "have", "efficient", "antioxidant", "and", "antineoplastic", "activities", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "study", "that", "how", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "in", "combination", "with", "resveratrol", "affects", "hepatotoxicity", "and", "arsenic", "accumulation", "in", "the", "liver", "is", "lacking", ",", "and", "the", "present", "study", "tackles", "this", "question", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Wistar", "rats", "were", "injected", "with", "3mg", "/", "kg", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "on", "alternate", "days", ";", "resveratrol", "(", "8mg", "/", "kg", ")", "was", "administered", "1h", "before", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Rats", "were", "killed", "on", "the", "8th", "day", "to", "determine", "histological", "liver", "damage", ",", "the", "antioxidant", "enzymes", "in", "serum", ",", "the", "ratio", "of", "reduced", "glutathione", "(", "GSH", ")", "to", "oxidized", "glutathione", "(", "GSSG", ")", ",", "and", "arsenic", "accumulation", "in", "the", "liver", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "resveratrol", "+", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "group", ",", "activities", "of", "superoxide", "dismutase", ",", "catalase", "in", "serum", "and", "GSH", "/", "GSSG", "were", "significantly", "increased", ",", "histopathological", "effects", "were", "reduced", ",", "and", "arsenic", "accumulation", "markedly", "decreased", "in", "the", "liver", ",", "compared", "with", "the", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "-", "treated", "group", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "resveratrol", "attenuated", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "-", "induced", "hepatotoxicity", "by", "decreasing", "oxidative", "stress", "and", "arsenic", "accumulation", "in", "the", "liver", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "suggest", "that", "use", "of", "resveratrol", "as", "post", "-", "remission", "therapy", "of", "APL", "and", "adjunctive", "therapy", "in", "patients", "with", "chronic", "exposure", "to", "arsenic", "may", "decrease", "arsenic", "hepatotoxicity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Development", "and", "evaluation", "of", "a", "mechanistic", "bioconcentration", "model", "for", "ionogenic", "organic", "chemicals", "in", "fish", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "mechanistic", "mass", "balance", "bioconcentration", "model", "is", "developed", "and", "parameterized", "for", "ionogenic", "organic", "chemicals", "(", "IOCs", ")", "in", "fish", "and", "evaluated", "against", "a", "compilation", "of", "empirical", "bioconcentration", "factors", "(", "BCFs", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "model", "is", "subsequently", "applied", "to", "a", "set", "of", "perfluoroalkyl", "acids", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Key", "aspects", "of", "model", "development", "include", "revised", "methods", "to", "estimate", "the", "chemical", "absorption", "efficiency", "of", "IOCs", "at", "the", "respiratory", "surface", "(", "E", "(", "W", ")", ")", "and", "the", "use", "of", "distribution", "ratios", "to", "characterize", "the", "overall", "sorption", "capacity", "of", "the", "organism", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Membrane", "-", "water", "distribution", "ratios", "(", "D", "(", "MW", ")", ")", "are", "used", "to", "characterize", "sorption", "to", "phospholipids", "instead", "of", "only", "considering", "the", "octanol", "-", "water", "distribution", "ratio", "(", "D", "(", "OW", ")", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Modeled", "BCFs", "are", "well", "correlated", "with", "the", "observations", "(", "e", ".", "g", ".", ",", "r", "(", "2", ")", "=", "0", ".", "68", "and", "0", ".", "75", "for", "organic", "acids", "and", "bases", ",", "respectively", ")", "and", "accurate", "to", "within", "a", "factor", "of", "three", "on", "average", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Model", "prediction", "errors", "appear", "to", "be", "largely", "the", "result", "of", "uncertainties", "in", "the", "biotransformation", "rate", "constant", "(", "k", "(", "M", ")", ")", "estimates", "and", "the", "generic", "approaches", "for", "estimating", "sorption", "capacity", "(", "e", ".", "g", ".", ",", "D", "(", "MW", ")", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Model", "performance", "for", "the", "set", "of", "perfluoroalkyl", "acids", "considered", "is", "highly", "dependent", "on", "the", "input", "parameters", "describing", "hydrophobicity", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "log", "K", "(", "OW", ")", "of", "the", "neutral", "form", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "model", "applications", "broadly", "support", "the", "hypothesis", "that", "phospholipids", "contribute", "substantially", "to", "the", "sorption", "capacity", "of", "fish", ",", "particularly", "for", "compounds", "that", "exhibit", "a", "high", "degree", "of", "ionization", "at", "biologically", "relevant", "pH", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Additional", "empirical", "data", "on", "biotransformation", "and", "sorption", "to", "phospholipids", "and", "subsequent", "incorporation", "into", "property", "estimation", "approaches", "(", "e", ".", "g", ".", ",", "k", "(", "M", ")", ",", "D", "(", "MW", ")", ")", "are", "priorities", "with", "respect", "to", "improving", "model", "performance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "vitro", "perturbations", "of", "targets", "in", "cancer", "hallmark", "processes", "predict", "rodent", "chemical", "carcinogenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thousands", "of", "untested", "chemicals", "in", "the", "environment", "require", "efficient", "characterization", "of", "carcinogenic", "potential", "in", "humans", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "proposed", "solution", "is", "rapid", "testing", "of", "chemicals", "using", "in", "vitro", "high", "-", "throughput", "screening", "(", "HTS", ")", "assays", "for", "targets", "in", "pathways", "linked", "to", "disease", "processes", "to", "build", "models", "for", "priority", "setting", "and", "further", "testing", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recent", "findings", "from", "the", "Women", "'", "s", "Health", "Initiative", "(", "WHI", ")", "and", "other", "studies", "suggest", "that", "a", "woman", "'", "s", "clinical", "and", "biological", "characteristics", "may", "modify", "her", "health", "outcomes", "on", "hormone", "therapy", "(", "HT", ")", "and", "that", "some", "women", "may", "be", "more", "appropriate", "candidates", "for", "therapy", "than", "others", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "emerging", "body", "of", "evidence", "suggests", "that", "it", "may", "be", "possible", "to", "identify", "women", "who", "are", "more", "likely", "to", "have", "favorable", "outcomes", "and", "less", "likely", "to", "have", "adverse", "events", "on", "HT", ",", "as", "well", "as", "to", "tailor", "the", "optimal", "dose", ",", "formulation", ",", "and", "route", "of", "delivery", "of", "treatment", ",", "by", "the", "use", "of", "individual", "risk", "stratification", "and", "a", "personalized", "approach", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "clinical", "characteristics", "that", "have", "been", "proposed", "for", "this", "purpose", "include", "a", "woman", "'", "s", "age", ",", "time", "since", "menopause", ",", "symptom", "severity", ",", "baseline", "vascular", "health", ",", "risk", "for", "breast", "cancer", ",", "biomarker", "levels", ",", "and", "genetic", "predisposition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "underlying", "rationale", "for", "personalized", "medicine", ",", "that", "each", "person", "has", "a", "unique", "biologic", "profile", "that", "can", "help", "to", "guide", "the", "choice", "of", "therapy", ",", "applies", "well", "to", "HT", "decision", "making", "and", "holds", "promise", "for", "improved", "treatment", "efficacy", "and", "safety", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "report", ",", "which", "focuses", "on", "vascular", "health", ",", "reviews", "the", "evidence", "on", "the", "role", "of", "such", "markers", "in", "tailoring", "the", "use", "of", "hormone", "therapy", "to", "appropriate", "candidates", ",", "with", "the", "ultimate", "goal", "of", "developing", "a", "personalized", "risk", ":", "benefit", "prediction", "model", "that", "takes", "into", "account", "clinical", "and", "genetic", "factors", ",", "\"", "patient", "-", "centered", "\"", "outcomes", "including", "sense", "of", "well", "being", "and", "quality", "of", "life", ",", "and", "other", "variables", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "proposed", "personalized", "approach", "to", "HT", "decision", "making", "has", "the", "potential", "to", "improve", "the", "quality", "of", "health", "care", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Reversal", "of", "dopamine", "D2", "agonist", "-", "induced", "inhibition", "of", "ventral", "tegmental", "area", "neurons", "by", "Gq", "-", "linked", "neurotransmitters", "is", "dependent", "on", "protein", "kinase", "C", ",", "G", "protein", "-", "coupled", "receptor", "kinase", ",", "and", "dynamin", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dopaminergic", "neurons", "of", "the", "ventral", "tegmental", "area", "are", "important", "components", "of", "brain", "pathways", "related", "to", "addiction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Prolonged", "exposure", "of", "these", "neurons", "to", "moderate", "concentrations", "of", "dopamine", "(", "DA", ")", "decreases", "their", "sensitivity", "to", "inhibition", "by", "DA", ",", "a", "process", "called", "DA", "-", "inhibition", "reversal", "(", "DIR", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DIR", "is", "mediated", "by", "phospholipase", "C", "and", "conventional", "subtype", "of", "protein", "kinase", "C", "(", "cPKC", ")", "through", "concurrent", "stimulation", "of", "D2", "and", "D1", "-", "like", "DA", "receptors", ",", "or", "by", "D2", "stimulation", "concurrent", "with", "activation", "of", "5", "-", "HT", "(", "2", ")", "or", "neurotensin", "receptors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", ",", "we", "further", "characterized", "this", "phenomenon", "by", "use", "of", "extracellular", "recordings", "in", "brain", "slices", "to", "examine", "whether", "DIR", "is", "linked", "to", "G", "protein", "-", "coupled", "receptor", "kinase", "-", "2", "(", "GRK2", ")", "or", "dynamin", "by", "assessing", "DIR", "in", "the", "presence", "of", "antagonists", "of", "these", "enzymes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DIR", "was", "blocked", "by", "beta", "-", "ARK1", "inhibitor", ",", "which", "inhibits", "GRK2", ",", "and", "by", "dynasore", ",", "which", "blocks", "dynamin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Reversal", "of", "inhibition", "by", "D2", "agonist", "quinpirole", "was", "produced", "by", "serotonin", "(", "50", "micro", "M", ")", "and", "by", "neurotensin", "(", "5", "-", "10", "nM", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Serotonin", "-", "induced", "or", "neurotensin", "-", "induced", "reversal", "was", "blocked", "by", "beta", "-", "ARK1", "inhibitor", ",", "dynasore", ",", "or", "cPKC", "antagonist", "5", ",", "6", ",", "7", ",", "13", "-", "tetrahydro", "-", "13", "-", "methyl", "-", "5", "-", "oxo", "-", "12H", "-", "indolo", "[", "2", ",", "3", "-", "a", "]", "pyrrolo", "[", "3", ",", "4c", "]", "carbazole", "-", "12", "-", "propanenitrile", "(", "G", "o", "6976", ")", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "This", "further", "characterization", "of", "DIR", "indicates", "that", "cPKC", ",", "GRK2", ",", "and", "dynamin", "play", "important", "roles", "in", "the", "desensitization", "of", "D2", "receptors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "drugs", "of", "abuse", "produce", "persistent", "increases", "in", "DA", "concentration", "in", "the", "ventral", "tegmental", "area", ",", "reduction", "of", "D2", "receptor", "sensitivity", "as", "a", "result", "of", "drug", "abuse", "may", "be", "a", "critical", "factor", "in", "the", "processes", "of", "addiction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "comparative", "analysis", "of", "computational", "approaches", "to", "relative", "protein", "quantification", "using", "peptide", "peak", "intensities", "in", "label", "-", "free", "LC", "-", "MS", "proteomics", "experiments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Liquid", "chromatography", "coupled", "with", "mass", "spectrometry", "(", "LC", "-", "MS", ")", "is", "widely", "used", "to", "identify", "and", "quantify", "peptides", "in", "complex", "biological", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "particular", ",", "label", "-", "free", "shotgun", "proteomics", "is", "highly", "effective", "for", "the", "identification", "of", "peptides", "and", "subsequently", "obtaining", "a", "global", "protein", "profile", "of", "a", "sample", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "a", "result", ",", "this", "approach", "is", "widely", "used", "for", "discovery", "studies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Typically", ",", "the", "objective", "of", "these", "discovery", "studies", "is", "to", "identify", "proteins", "that", "are", "affected", "by", "some", "condition", "of", "interest", "(", "e", ".", "g", ".", "disease", ",", "exposure", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "for", "complex", "biological", "samples", ",", "label", "-", "free", "LC", "-", "MS", "proteomics", "experiments", "measure", "peptides", "and", "do", "not", "directly", "yield", "protein", "quantities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "protein", "quantification", "must", "be", "inferred", "from", "one", "or", "more", "measured", "peptides", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "recent", "years", ",", "many", "computational", "approaches", "to", "relative", "protein", "quantification", "of", "label", "-", "free", "LC", "-", "MS", "data", "have", "been", "published", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "review", ",", "we", "examine", "the", "most", "commonly", "employed", "quantification", "approaches", "to", "relative", "protein", "abundance", "from", "peak", "intensity", "values", ",", "evaluate", "their", "individual", "merits", ",", "and", "discuss", "challenges", "in", "the", "use", "of", "the", "various", "computational", "approaches", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mithramycin", "A", "inhibits", "myeloid", "cell", "leukemia", "-", "1", "to", "induce", "apoptosis", "in", "oral", "squamous", "cell", "carcinomas", "and", "tumor", "xenograft", "through", "activation", "of", "Bax", "and", "oligomerization", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "several", "human", "malignancies", ",", "overexpression", "of", "myeloid", "cell", "leukemia", "-", "1", "(", "Mcl", "-", "1", ")", "confers", "resistance", "to", "induction", "of", "apoptosis", ";", "however", ",", "Mcl", "-", "1", "-", "mediated", "inhibition", "of", "apoptosis", "in", "oral", "squamous", "cell", "carcinoma", "(", "OSCC", ")", "is", "not", "fully", "understood", "and", "has", "been", "investigated", "in", "this", "study", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "Mcl", "-", "1", "promoter", "activators", "(", "TPA", ")", "and", "epidermal", "growth", "factor", "(", "EGF", ")", "enhanced", "neoplastic", "transformation", "of", "JB6", "cells", "and", "this", "response", "was", "accompanied", "by", "enhanced", "expression", "of", "Mcl", "-", "1", ",", "and", "knockdown", "of", "Mcl", "-", "1", "by", "RNA", "interference", "(", "RNAi", ")", "decreased", "JB6", "cell", "transformation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "same", "cell", "line", ",", "we", "also", "demonstrated", "that", "mithramycin", "A", "(", "Mith", ")", "decreased", "TPA", "-", "induced", "JB6", "cell", "transformation", "and", "Mcl", "-", "1", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mcl", "-", "1", "was", "overexpressed", "in", "human", "oral", "tumors", "compared", "with", "normal", "oral", "mucosa", "and", "also", "in", "several", "OSCC", "cell", "lines", "including", "HN22", "and", "HSC", "-", "4", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Treatment", "of", "these", "cells", "with", "Mith", "also", "decreased", "Mcl", "-", "1", "expression", "and", "neoplastic", "cell", "transformation", ",", "and", "this", "was", "accompanied", "by", "induction", "of", "several", "markers", "of", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Knockdown", "of", "Mcl", "-", "1", "by", "RNAi", "also", "induced", "apoptotic", "cell", "death", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "downregulation", "of", "Mcl", "-", "1", "by", "Mith", "and", "RNAi", "increased", "pro", "-", "apoptotic", "protein", "Bax", ",", "resulting", "in", "the", "Bax", "translocation", "into", "mitochondria", "and", "its", "oligomerization", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mith", "also", "suppressed", "tumor", "growth", "in", "vivo", "and", "induced", "apoptosis", "in", "tumor", "by", "also", "regulating", "expression", "of", "Mcl", "-", "1", "and", "Bax", "proteins", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "indicate", "a", "critical", "role", "for", "Mcl", "-", "1", "in", "the", "growth", "and", "survival", "of", "OSCC", "and", "demonstrate", "that", "Mith", "may", "be", "a", "potential", "anticancer", "drug", "candidate", "for", "clinical", "treatment", "of", "OSCC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Novel", "assays", "for", "detection", "of", "urinary", "KIM", "-", "1", "in", "mouse", "models", "of", "kidney", "injury", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Kidney", "injury", "molecule", "-", "1", "(", "KIM", "-", "1", ")", "has", "been", "qualified", "by", "the", "Food", "and", "Drug", "Administration", "and", "European", "Medicines", "Agency", "as", "a", "urinary", "biomarker", "to", "monitor", "preclinical", "nephrotoxicity", "in", "rats", "and", "on", "a", "case", "-", "by", "-", "case", "basis", "for", "the", "translation", "of", "potentially", "nephrotoxic", "drugs", "into", "first", "-", "in", "human", "studies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "mouse", "models", "are", "widely", "employed", "in", "preclinical", "studies", ",", "few", "urinary", "biomarker", "studies", "have", "been", "performed", "in", "mice", "due", "to", "limited", "urine", "availability", "and", "lack", "of", "sensitive", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "report", "the", "development", "and", "validation", "of", "two", "different", "assays", "for", "quantitative", "assessment", "of", "mouse", "urinary", "KIM", "-", "1", "(", "uKIM", "-", "1", ")", "and", "compare", "the", "sensitivity", "of", "KIM", "-", "1", "relative", "to", "other", "standard", "markers", "in", "ischemia", "reperfusion", "and", "aristolochic", "acid", "(", "AA", ")", "-", "induced", "kidney", "injury", "in", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "sensitive", ",", "reproducible", ",", "and", "quantitative", "microbead", "-", "based", "KIM", "-", "1", "ELISA", "was", "established", ",", "which", "requires", "only", "10", "mu", "l", "urine", "for", "triplicate", "determination", "with", "an", "assay", "range", "of", "12", ".", "21", "pg", "/", "ml", "to", "50", "ng", "/", "ml", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "second", "assay", "is", "a", "laminar", "flow", "dipstick", "assay", ",", "which", "has", "an", "assay", "range", "of", "195", "pg", "/", "ml", "to", "50", "ng", "/", "ml", "and", "provides", "quantitative", "assessment", "of", "KIM", "-", "1", "in", "15", "min", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "uKIM", "-", "1", "levels", "increased", "with", "increasing", "time", "of", "ischemia", "or", "time", "after", "AA", "administration", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "only", "10", "-", "min", "ischemia", "followed", "by", "24", "-", "h", "reperfusion", ",", "uKIM", "-", "1", "was", "significantly", "elevated", "by", "13", "-", "fold", ",", "whereas", "serum", "creatinine", "(", "sCr", ")", ",", "blood", "urea", "nitrogen", ",", "N", "-", "acetyl", "-", "beta", "-", "glucosaminidase", "(", "NAG", ")", ",", "and", "proteinuria", "levels", "did", "not", "change", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "AA", "administration", ",", "uKIM", "-", "1", "levels", "were", "significantly", "upregulated", "by", "greater", "than", "threefold", "within", "12", "h", ",", "whereas", "sCr", "and", "NAG", "levels", "were", "unchanged", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mouse", "KIM", "-", "1", "was", "stable", "for", "multiple", "freeze", "-", "thaw", "cycles", ",", "for", "up", "to", "5", "days", "at", "room", "temperature", "and", "up", "to", "at", "least", "an", "year", "when", "stored", "at", "-", "80", "degrees", "C", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Performance", "of", "urinary", "and", "gene", "expression", "biomarkers", "in", "detecting", "the", "nephrotoxic", "effects", "of", "melamine", "and", "cyanuric", "acid", "following", "diverse", "scenarios", "of", "co", "-", "exposure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "standard", "nephrotoxicity", "assessments", "primarily", "detect", "impaired", "renal", "function", ",", "KIM", "-", "1", ",", "clusterin", ",", "NGAL", ",", "osteopontin", "and", "TIMP", "-", "1", "were", "recently", "identified", "biomarkers", "proposed", "to", "indicate", "earlier", "perturbations", "in", "renal", "integrity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "recent", "adulteration", "of", "infant", "and", "pet", "food", "with", "melamine", "(", "MEL", ")", "and", "structurally", "-", "related", "compounds", "revealed", "that", "co", "-", "ingestion", "of", "MEL", "and", "cyanuric", "acid", "(", "CYA", ")", "could", "form", "melamine", "-", "cyanurate", "crystals", "which", "obstruct", "renal", "tubules", "and", "induce", "acute", "renal", "failure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "concurrently", "evaluated", "the", "ability", "of", "multiplexed", "urinary", "biomarker", "immunoassays", "and", "biomarker", "gene", "expression", "analysis", "to", "detect", "nephrotoxicity", "in", "F344", "rats", "co", "-", "administered", "60ppm", "each", "of", "MEL", "and", "CYA", "in", "feed", "or", "via", "gavage", "for", "28days", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "biomarkers", "were", "also", "evaluated", "for", "the", "ability", "to", "differentiate", "the", "effects", "of", "the", "compounds", "when", "co", "-", "administered", "using", "diverse", "dosing", "schedules", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "consecutive", "vs", ".", "staggered", "gavage", ")", "and", "dosing", "matrixes", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "feed", "vs", ".", "gavage", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "illustrate", "the", "ability", "of", "both", "methods", "to", "detect", "and", "differentiate", "the", "severity", "of", "adverse", "effects", "in", "the", "staggered", "and", "consecutive", "gavage", "groups", "at", "much", "lower", "doses", "than", "previously", "observed", "in", "animals", "co", "-", "exposed", "to", "the", "compounds", "in", "feed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "demonstrate", "that", "these", "urinary", "biomarkers", "outperform", "traditional", "diagnostic", "methods", "and", "represent", "a", "powerful", ",", "non", "-", "invasive", "indicator", "of", "chemical", "-", "induced", "nephrotoxicity", "prior", "to", "the", "onset", "of", "renal", "dysfunction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "NMDA", "receptor", "blockade", "impairs", "the", "muscarinic", "conversion", "of", "sub", "-", "threshold", "transient", "depression", "into", "long", "-", "lasting", "LTD", "in", "the", "hippocampus", "-", "prefrontal", "cortex", "pathway", "in", "vivo", ":", "correlation", "with", "gamma", "oscillations", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cholinergic", "fibers", "from", "the", "brainstem", "and", "basal", "forebrain", "innervate", "the", "medial", "prefrontal", "cortex", "(", "mPFC", ")", "modulating", "neuronal", "activity", "and", "synaptic", "plasticity", "responses", "to", "hippocampal", "inputs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "investigated", "the", "muscarinic", "and", "glutamatergic", "modulation", "of", "long", "-", "term", "depression", "(", "LTD", ")", "in", "the", "intact", "projections", "from", "CA1", "to", "mPFC", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cortical", "-", "evoked", "responses", "were", "recorded", "in", "urethane", "-", "anesthetized", "rats", "for", "30", "min", "during", "baseline", "and", "4", "h", "following", "LTD", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "order", "to", "test", "the", "potentiating", "effects", "of", "pilocarpine", "(", "PILO", ")", ",", "independent", "groups", "of", "rats", "received", "either", "a", "microinjection", "of", "PILO", "(", "40", "nmol", ";", "i", ".", "c", ".", "v", ".", ")", "or", "vehicle", ",", "immediately", "before", "or", "20", "min", "after", "a", "sub", "-", "threshold", "LTD", "protocol", "(", "600", "pulses", ",", "1", "Hz", ";", "LFS600", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Other", "groups", "received", "either", "an", "infusion", "of", "the", "selective", "NMDA", "receptor", "antagonist", "(", "AP7", ";", "10", "nmol", ";", "intra", "-", "mPFC", ")", "or", "vehicle", ",", "10", "min", "prior", "to", "PILO", "preceding", "LFS600", ",", "or", "prior", "to", "a", "supra", "-", "threshold", "LTD", "protocol", "(", "900", "pulses", ",", "1", "Hz", ";", "LFS900", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "show", "that", "PILO", "converts", "a", "transient", "cortical", "depression", "induced", "by", "LFS600", "into", "a", "robust", "LTD", ",", "stable", "for", "at", "least", "4", "h", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "applied", "after", "LFS600", ",", "PILO", "does", "not", "change", "either", "mPFC", "basal", "neurotransmission", "or", "late", "LTD", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "also", "indicate", "that", "NMDA", "receptor", "pre", "-", "activation", "is", "essential", "to", "the", "muscarinic", "enhancement", "of", "mPFC", "synaptic", "depression", ",", "since", "AP7", "microinjection", "into", "the", "mPFC", "blocked", "the", "conversion", "of", "transient", "depression", "into", "long", "-", "lasting", "LTD", "produced", "by", "PILO", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "AP7", "effectively", "blocked", "the", "long", "-", "lasting", "LTD", "induced", "by", "LFS900", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "our", "findings", "suggest", "that", "the", "glutamatergic", "co", "-", "activation", "of", "prefrontal", "neurons", "is", "important", "for", "the", "effects", "of", "PILO", "on", "mPFC", "synaptic", "depression", ",", "which", "could", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "control", "of", "executive", "and", "emotional", "functions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effects", "of", "alpha", "-", "tocopherol", "on", "oxidative", "damage", "and", "serum", "levels", "of", "Clara", "cell", "protein", "16", "in", "aspiration", "pneumonitis", "induced", "by", "bile", "acids", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "aim", "in", "this", "study", "is", "to", "examine", "the", "effects", "of", "alpha", "-", "tocopherol", "(", "AT", ")", "on", "rats", "with", "aspiration", "pneumonitis", "induced", "with", "bile", "acids", "(", "BAs", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "The", "animals", "were", "divided", "in", "to", "four", "groups", ",", "namely", "saline", "group", "(", "n", "=", "7", ")", ",", "saline", "+", "AT", "group", "(", "n", "=", "7", ")", ",", "BA", "group", "(", "n", "=", "7", ")", ",", "and", "BA", "+", "AT", "group", "(", "n", "=", "7", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Saline", "and", "BA", "groups", "aspirated", "intratracheally", "with", "1", "ml", "/", "kg", "saline", "and", "1", "ml", "/", "kg", "bile", "acids", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "AT", "was", "given", "at", "20", "mg", "/", "kg", "/", "day", "dosage", "for", "7", "days", "to", "the", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "AT", "group", "was", "given", "20", "mg", "/", "kg", "/", "day", "AT", "for", "7", "days", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Malondialdehyde", "(", "MDA", ")", ",", "Clara", "cell", "protein", "16", "(", "CC", "-", "16", ")", ",", "catalase", "(", "CAT", ")", ",", "superoxide", "dismutase", "(", "SOD", ")", ",", "as", "well", "as", "peribronchial", "inflammatory", "cell", "infiltration", ",", "alveolar", "septal", "infiltration", ",", "alveolar", "edema", ",", "alveolar", "exudate", ",", "alveolar", "histiocytes", ",", "and", "necrosis", "were", "evaluated", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "CAT", "activity", "of", "the", "BA", "group", "was", "significantly", "lower", "than", "the", "saline", "group", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "BA", "+", "AT", "group", ",", "there", "was", "a", "significant", "increase", "in", "SOD", "and", "CAT", "activities", "when", "compared", "with", "that", "of", "the", "BA", "group", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "CC", "-", "16", "and", "MDA", "contents", "in", "the", "BA", "group", "were", "significantly", "higher", "than", "in", "the", "saline", "group", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "CC", "-", "16", "and", "MDA", "levels", "of", "the", "BA", "+", "AT", "group", "were", "significantly", "lower", "than", "BA", "group", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Histopathologic", "changes", "were", "seen", "in", "BA", "group", ",", "and", "there", "was", "a", "significant", "decrease", "in", "the", "BA", "+", "AT", "group", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "AT", "might", "be", "beneficial", "in", "the", "treatment", "of", "aspiration", "pneumonitis", "induced", "by", "BAs", "because", "AT", "decreased", "oxidative", "damage", "and", "resulted", "in", "a", "decrease", "in", "CC", "-", "16", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Resveratrol", "attenuates", "hepatotoxicity", "of", "rats", "exposed", "to", "arsenic", "trioxide", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Arsenic", "trioxide", "(", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", ")", "is", "an", "environmental", "pollutant", "and", "potent", "toxicant", "to", "humans", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "it", "also", "shows", "substantial", "anti", "-", "cancer", "activity", "in", "individuals", "with", "acute", "promyelocytic", "leukemia", "(", "APL", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Unfortunately", ",", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "-", "treated", "leukemia", "patients", "suffer", "hepatotoxicity", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Resveratrol", "has", "been", "demonstrated", "to", "have", "efficient", "antioxidant", "and", "antineoplastic", "activities", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "study", "that", "how", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "in", "combination", "with", "resveratrol", "affects", "hepatotoxicity", "and", "arsenic", "accumulation", "in", "the", "liver", "is", "lacking", ",", "and", "the", "present", "study", "tackles", "this", "question", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Wistar", "rats", "were", "injected", "with", "3mg", "/", "kg", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "on", "alternate", "days", ";", "resveratrol", "(", "8mg", "/", "kg", ")", "was", "administered", "1h", "before", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Rats", "were", "killed", "on", "the", "8th", "day", "to", "determine", "histological", "liver", "damage", ",", "the", "antioxidant", "enzymes", "in", "serum", ",", "the", "ratio", "of", "reduced", "glutathione", "(", "GSH", ")", "to", "oxidized", "glutathione", "(", "GSSG", ")", ",", "and", "arsenic", "accumulation", "in", "the", "liver", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "resveratrol", "+", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "group", ",", "activities", "of", "superoxide", "dismutase", ",", "catalase", "in", "serum", "and", "GSH", "/", "GSSG", "were", "significantly", "increased", ",", "histopathological", "effects", "were", "reduced", ",", "and", "arsenic", "accumulation", "markedly", "decreased", "in", "the", "liver", ",", "compared", "with", "the", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "-", "treated", "group", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "resveratrol", "attenuated", "As", "(", "2", ")", "O", "(", "3", ")", "-", "induced", "hepatotoxicity", "by", "decreasing", "oxidative", "stress", "and", "arsenic", "accumulation", "in", "the", "liver", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "suggest", "that", "use", "of", "resveratrol", "as", "post", "-", "remission", "therapy", "of", "APL", "and", "adjunctive", "therapy", "in", "patients", "with", "chronic", "exposure", "to", "arsenic", "may", "decrease", "arsenic", "hepatotoxicity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Development", "and", "evaluation", "of", "a", "mechanistic", "bioconcentration", "model", "for", "ionogenic", "organic", "chemicals", "in", "fish", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "mechanistic", "mass", "balance", "bioconcentration", "model", "is", "developed", "and", "parameterized", "for", "ionogenic", "organic", "chemicals", "(", "IOCs", ")", "in", "fish", "and", "evaluated", "against", "a", "compilation", "of", "empirical", "bioconcentration", "factors", "(", "BCFs", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "model", "is", "subsequently", "applied", "to", "a", "set", "of", "perfluoroalkyl", "acids", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Key", "aspects", "of", "model", "development", "include", "revised", "methods", "to", "estimate", "the", "chemical", "absorption", "efficiency", "of", "IOCs", "at", "the", "respiratory", "surface", "(", "E", "(", "W", ")", ")", "and", "the", "use", "of", "distribution", "ratios", "to", "characterize", "the", "overall", "sorption", "capacity", "of", "the", "organism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Membrane", "-", "water", "distribution", "ratios", "(", "D", "(", "MW", ")", ")", "are", "used", "to", "characterize", "sorption", "to", "phospholipids", "instead", "of", "only", "considering", "the", "octanol", "-", "water", "distribution", "ratio", "(", "D", "(", "OW", ")", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Modeled", "BCFs", "are", "well", "correlated", "with", "the", "observations", "(", "e", ".", "g", ".", ",", "r", "(", "2", ")", "=", "0", ".", "68", "and", "0", ".", "75", "for", "organic", "acids", "and", "bases", ",", "respectively", ")", "and", "accurate", "to", "within", "a", "factor", "of", "three", "on", "average", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Model", "prediction", "errors", "appear", "to", "be", "largely", "the", "result", "of", "uncertainties", "in", "the", "biotransformation", "rate", "constant", "(", "k", "(", "M", ")", ")", "estimates", "and", "the", "generic", "approaches", "for", "estimating", "sorption", "capacity", "(", "e", ".", "g", ".", ",", "D", "(", "MW", ")", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Model", "performance", "for", "the", "set", "of", "perfluoroalkyl", "acids", "considered", "is", "highly", "dependent", "on", "the", "input", "parameters", "describing", "hydrophobicity", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "log", "K", "(", "OW", ")", "of", "the", "neutral", "form", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "model", "applications", "broadly", "support", "the", "hypothesis", "that", "phospholipids", "contribute", "substantially", "to", "the", "sorption", "capacity", "of", "fish", ",", "particularly", "for", "compounds", "that", "exhibit", "a", "high", "degree", "of", "ionization", "at", "biologically", "relevant", "pH", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Additional", "empirical", "data", "on", "biotransformation", "and", "sorption", "to", "phospholipids", "and", "subsequent", "incorporation", "into", "property", "estimation", "approaches", "(", "e", ".", "g", ".", ",", "k", "(", "M", ")", ",", "D", "(", "MW", ")", ")", "are", "priorities", "with", "respect", "to", "improving", "model", "performance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vitro", "perturbations", "of", "targets", "in", "cancer", "hallmark", "processes", "predict", "rodent", "chemical", "carcinogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thousands", "of", "untested", "chemicals", "in", "the", "environment", "require", "efficient", "characterization", "of", "carcinogenic", "potential", "in", "humans", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "proposed", "solution", "is", "rapid", "testing", "of", "chemicals", "using", "in", "vitro", "high", "-", "throughput", "screening", "(", "HTS", ")", "assays", "for", "targets", "in", "pathways", "linked", "to", "disease", "processes", "to", "build", "models", "for", "priority", "setting", "and", "further", "testing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]