tokens
listlengths
2
298
ner_tags
listlengths
2
298
[ "In", "this", "study", ",", "we", "have", "employed", "photochemical", "internalization", "(", "PCI", ")", ",", "a", "minimally", "invasive", "method", "for", "light", "-", "controlled", ",", "specific", "delivery", "of", "membrane", "-", "impermeable", "macromolecules", "from", "endocytic", "vesicles", "to", "the", "cytosol", ",", "to", "specifically", "target", "CD133", "-", "positive", "cancer", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "demonstrate", "that", "PCI", "increases", "the", "cytotoxic", "effect", "of", "an", "immunotoxin", "(", "IT", ")", "targeting", "CD133", "-", "expressing", "cancer", "cells", "of", "colon", "(", "WiDr", "and", "HCT116", ")", "and", "pancreas", "(", "BxPC", "-", "3", ")", "origin", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "IT", "consisted", "of", "the", "mAb", "CD133", "/", "1", "(", "AC133", ")", "bound", "to", "the", "ribosome", "inactivating", "plant", "toxin", "saporin", "(", "anti", "-", "CD133", "/", "1", "-", "sap", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "TPCS2a", "-", "PCI", "of", "anti", "-", "CD133", "/", "1", "-", "sap", "is", "specific", ",", "and", "highly", "cytotoxic", "at", "femto", "-", "molar", "concentrations", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Specific", "binding", "and", "uptake", "of", "CD133", "/", "1", ",", "was", "shown", "by", "fluorescence", "microscopy", "and", "co", "-", "localization", "with", "TPCS2a", "in", "endosomes", "/", "lysosomes", "was", "determined", "by", "confocal", "microscopy", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CD133", "(", "high", ")", "WiDr", "cells", ",", "isolated", "by", "fluorescence", "activated", "cell", "sorting", ",", "had", "a", "7", "-", "fold", "higher", "capacity", "to", "initiate", "spheroids", "than", "CD133", "(", "low", ")", "cells", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", "and", "were", "resistant", "to", "photodynamic", "therapy", "(", "PDT", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "PDT", "-", "resistance", "was", "bypassed", "by", "the", "PCI", "strategy", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Tumor", "initiation", "and", "aggressive", "growth", "in", "athymic", "nude", "mice", "was", "obtained", "with", "only", "10", "CD133", "(", "high", ")", "cells", "in", "contrast", "to", "CD133", "(", "low", ")", "cells", "where", "substantially", "higher", "cell", "numbers", "were", "needed", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "excellent", "high", "efficacy", "and", "selectivity", "of", "eliminating", "CD133", "-", "expressing", "cells", "by", "PCI", "warrant", "further", "pre", "-", "clinical", "evaluations", "of", "this", "novel", "therapeutic", "approach", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Evidence", "for", "a", "new", "mechanism", "behind", "HIFU", "-", "triggered", "release", "from", "liposomes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "promising", "approach", "for", "local", "drug", "delivery", "is", "high", "-", "intensity", "focused", "ultrasound", "(", "HIFU", ")", "-", "triggered", "release", "of", "drugs", "from", "stimuli", "-", "responsive", "nanoparticles", "such", "as", "liposomes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "aim", "of", "this", "study", "was", "to", "investigate", "whether", "another", "release", "mechanism", "is", "involved", "with", "HIFU", "-", "triggered", "release", "from", "liposomes", "beside", "cavitation", "and", "temperature", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "it", "was", "studied", "whether", "this", "new", "release", "mechanism", "allows", "the", "release", "of", "lipophilic", "compounds", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "both", "a", "lipophilic", "(", "Nile", "red", ")", "and", "a", "hydrophilic", "(", "fluorescein", ")", "compound", "were", "loaded", "into", "thermosensitive", "(", "TSL", ")", "or", "non", "-", "thermosensitive", "liposomes", "(", "NTSL", ")", "and", "the", "liposomes", "were", "subjected", "both", "to", "continuous", "wave", "-", "(", "CW", ")", "and", "pulsed", "wave", "(", "PW", ")", "-", "HIFU", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mean", "liposome", "size", "varied", "from", "97", "to", "139nm", "with", "a", "polydispersity", "index", "(", "PDI", ")", "<=", "0", ".", "06", "for", "the", "different", "formulations", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Tm", "of", "the", "phospholipid", "bilayer", "of", "the", "TSL", "was", "around", "42", "degrees", "C", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Approximately", "80", "%", "of", "fluorescein", "was", "released", "within", "15min", "from", "TSL", "at", "temperatures", ">=", "42", "degrees", "C", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "no", "fluorescein", "release", "from", "NTSL", "and", "NR", "release", "from", "both", "TSL", "and", "NTSL", "was", "observed", "at", "temperatures", "up", "to", "60", "degrees", "C", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CW", "-", "HIFU", "exposure", "of", "TSL", "resulted", "in", "rapid", "temperature", "elevation", "up", "to", "52", "degrees", "C", "and", "subsequently", "almost", "quantitative", "fluorescein", "release", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Fluorescein", "release", "from", "NTSL", "was", "also", "substantial", "(", "~", "64", "%", "after", "16min", "at", "20W", ")", "." ]
[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Surprisingly", ",", "CW", "-", "HIFU", "exposure", "(", "20W", "for", "16min", ")", "resulted", "in", "the", "release", "of", "NR", "from", "TSL", "(", "~", "66", "%", "of", "the", "loaded", "amount", ")", ",", "and", "this", "was", "even", "higher", "from", "NTSL", "(", "~", "78", "%", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PW", "-", "HIFU", "exposure", "did", "not", "result", "in", "temperatures", "above", "the", "Tm", "of", "TSL", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "nearly", "85", "%", "of", "fluorescein", "was", "released", "from", "TSL", "after", "32min", "at", "20W", "of", "PW", "-", "HIFU", "exposure", ",", "whereas", "the", "release", "from", "NTSL", "was", "around", "27", "%", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interestingly", ",", "NR", "release", "from", "NTSL", "was", "~", "30", "%", "after", "2min", "PW", "-", "HIFU", "exposure", "and", "increased", "to", "~", "70", "%", "after", "32min", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "addition", "of", "microbubbles", "to", "the", "liposomes", "prior", "to", "PW", "-", "HIFU", "exposure", "did", "not", "result", "in", "more", "release", ",", "which", "suggests", "that", "cavitation", "can", "be", "excluded", "as", "the", "main", "mechanism", "responsible", "for", "the", "triggered", "release", "of", "both", "a", "hydrophilic", "and", "a", "lipophilic", "model", "compound", "from", "liposomes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dynamic", "light", "scattering", "analysis", "showed", "that", "the", "mean", "size", "and", "PDI", "of", "the", "liposomes", "did", "not", "significantly", "change", "after", "CW", "-", "and", "PW", "-", "HIFU", "exposure", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Taken", "together", ",", "it", "is", "therefore", "concluded", "that", "neither", "temperature", "elevation", "nor", "inertial", "cavitation", "is", "essential", "for", "the", "release", "of", "both", "hydrophilic", "and", "lipophilic", "compounds", "from", "liposomes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "assumed", "that", "the", "release", "originates", "from", "radiation", "force", "-", "induced", "acoustic", "streaming", ",", "causing", "the", "liposomes", "to", "collide", "at", "the", "walls", "of", "the", "exposure", "chamber", "leading", "to", "shear", "forces", "which", "in", "turn", "results", "in", "reversible", "liposome", "destabilization", "and", "release", "of", "both", "hydrophilic", "and", "lipophilic", "compounds", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Lactosylated", "gramicidin", "-", "based", "lipid", "nanoparticles", "(", "Lac", "-", "GLN", ")", "for", "targeted", "delivery", "of", "anti", "-", "miR", "-", "155", "to", "hepatocellular", "carcinoma", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Lactosylated", "gramicidin", "-", "containing", "lipid", "nanoparticles", "(", "Lac", "-", "GLN", ")", "were", "developed", "for", "delivery", "of", "anti", "-", "microRNA", "-", "155", "(", "anti", "-", "miR", "-", "155", ")", "to", "hepatocellular", "carcinoma", "(", "HCC", ")", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MiR", "-", "155", "is", "an", "oncomiR", "frequently", "elevated", "in", "HCC", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Lac", "-", "GLN", "formulation", "contained", "N", "-", "lactobionyl", "-", "dioleoyl", "phosphatidylethanolamine", "(", "Lac", "-", "DOPE", ")", ",", "a", "ligand", "for", "the", "asialoglycoprotein", "receptor", "(", "ASGR", ")", ",", "and", "an", "antibiotic", "peptide", "gramicidin", "A", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "nanoparticles", "exhibited", "a", "mean", "particle", "diameter", "of", "73nm", ",", "zeta", "potential", "of", "+", "3", ".", "5mV", ",", "anti", "-", "miR", "encapsulation", "efficiency", "of", "88", "%", ",", "and", "excellent", "colloidal", "stability", "at", "4", "degrees", "C", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Lac", "-", "GLN", "effectively", "delivered", "anti", "-", "miR", "-", "155", "to", "HCC", "cells", "with", "a", "16", ".", "1", "-", "and", "4", ".", "1", "-", "fold", "up", "-", "regulation", "of", "miR", "-", "155", "targets", "C", "/", "EBP", "beta", "and", "FOXP3", "genes", ",", "respectively", ",", "and", "exhibited", "significant", "greater", "efficiency", "over", "Lipofectamine", "2000", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "mice", ",", "intravenous", "injection", "of", "Lac", "-", "GLN", "containing", "Cy3", "-", "anti", "-", "miR", "-", "155", "led", "to", "preferential", "accumulation", "of", "the", "anti", "-", "miR", "-", "155", "in", "hepatocytes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Intravenous", "administration", "of", "1", ".", "5mg", "/", "kg", "anti", "-", "miR", "-", "155", "loaded", "Lac", "-", "GLN", "resulted", "in", "up", "-", "regulation", "of", "C", "/", "EBP", "beta", "and", "FOXP3", "by", "6", ".", "9", "-", "and", "2", ".", "2", "-", "fold", ",", "respectively", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "potential", "application", "of", "Lac", "-", "GLN", "as", "a", "liver", "-", "specific", "delivery", "vehicle", "for", "anti", "-", "miR", "therapy", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recent", "advances", "in", "theranostic", "nanocarriers", "of", "doxorubicin", "based", "on", "iron", "oxide", "and", "gold", "nanoparticles", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hybrid", "(", "organic", "/", "inorganic", ")", "nanoparticles", "emerged", "as", "a", "simple", "solution", "to", "build", "\"", "theranostic", "\"", "systems", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Due", "to", "their", "physical", "properties", ",", "superparamagnetic", "iron", "oxide", "nanoparticles", "(", "SPIONs", ")", "and", "plasmonic", "gold", "nanoparticles", "(", "Au", "-", "NPs", ")", "are", "extensively", "studied", "as", "a", "part", "of", "diagnostic", "and", "therapeutic", "strategies", "in", "cancer", "treatments", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "They", "can", "be", "used", "as", "agents", "for", "in", "vitro", "or", "in", "vivo", "imaging", ",", "for", "magnetic", "drug", "targeting", "and", "/", "or", "thermal", "therapy", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Their", "functionalization", "with", "organic", "shells", "enhances", "their", "potential", "performance", "in", "tumor", "targeting", "and", "drug", "delivery", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "advances", "in", "such", "hybrid", "nanocarriers", "are", "well", "illustrated", "with", "the", "example", "of", "the", "anticancer", "drug", "doxorubicin", "(", "DOX", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "aim", "of", "this", "review", "is", "to", "give", "a", "multidisciplinary", "overview", "of", "such", "smart", "nanosystems", "loaded", "with", "DOX", ",", "based", "on", "examples", "taken", "from", "recent", "publications", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "From", "a", "physico", "-", "chemical", "point", "of", "view", ",", "we", "discuss", "the", "choices", "for", "the", "strategies", "for", "loading", "DOX", "and", "the", "consequences", "on", "drug", "release", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "From", "a", "biological", "point", "of", "view", ",", "we", "analyze", "the", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "assays", "concerning", "tumor", "imaging", ",", "targeted", "drug", "delivery", "and", "anticancer", "efficiency", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Future", "opportunities", "and", "challenges", "are", "also", "addressed", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Bisphenol", "A", ":", "Update", "on", "newly", "developed", "data", "and", "how", "they", "address", "NTP", "'", "s", "2008", "finding", "of", "\"", "Some", "Concern", "\"" ]
[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Bisphenol", "A", "(", "BPA", ")", "is", "a", "component", "of", "polycarbonate", "plastics", "and", "epoxy", "resins", "used", "in", "many", "commercial", "products", "including", "coatings", "and", "liners", "of", "food", "containers", "." ]
[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Low", "levels", "of", "BPA", "can", "be", "detected", "in", "over", "90", "%", "of", "human", "urine", "samples", "in", "the", "US", ",", "indicating", "that", "exposure", "to", "BPA", "is", "widespread", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "In", "2008", ",", "the", "US", "National", "Toxicology", "Program", "'", "s", "Center", "for", "the", "Evaluation", "of", "Risks", "to", "Human", "Reproduction", "(", "NTP", "-", "CERHR", ")", "expressed", "concerns", "regarding", "BPA", "'", "s", "potential", "health", "effects", ",", "and", "suggested", "improved", "study", "designs", "and", "methodologies", "that", "they", "believed", "would", "address", "those", "concerns", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "paper", "discusses", "some", "of", "the", "controversial", "issues", "surrounding", "BPA", ",", "summarizes", "the", "current", "regulatory", "status", "of", "BPA", ",", "reviews", "recent", "pharmacokinetic", "studies", ",", "and", "describes", "ongoing", "and", "planned", "research", "on", "the", "effects", "of", "BPA", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "we", "evaluate", "two", "papers", "studying", "BPA", "neurobehavioral", "effects", ",", "identified", "by", "the", "European", "Food", "Safety", "Authority", "and", "the", "German", "Federal", "Institute", "for", "Risk", "Assessment", "as", "being", "valid", "for", "use", "in", "risk", "assessment", ",", "to", "determine", "whether", "they", "address", "the", "NTP", "-", "CERHR", "methodological", "concerns", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "data", "from", "these", "studies", "would", "likely", "be", "sufficient", "for", "NTP", "to", "lower", "its", "concern", "level", "for", "neurobehavioral", "effects", "of", "BPA", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "At", "this", "time", ",", "many", "regulatory", "agencies", "from", "around", "the", "world", "support", "the", "use", "of", "BPA", "in", "food", "contact", "materials", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "Review", "of", "the", "\"", "Omics", "\"", "Approach", "to", "Biomarkers", "of", "Oxidative", "Stress", "in", "Oryza", "sativa", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Physiological", "and", "ecological", "constraints", "that", "cause", "the", "slow", "growth", "and", "depleted", "production", "of", "crops", "have", "raised", "a", "major", "concern", "in", "the", "agriculture", "industry", "as", "they", "represent", "a", "possible", "threat", "of", "short", "food", "supply", "in", "the", "future", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "key", "feature", "that", "regulates", "the", "stress", "signaling", "pathway", "is", "always", "related", "to", "the", "reactive", "oxygen", "species", "(", "ROS", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "accumulation", "of", "ROS", "in", "plant", "cells", "would", "leave", "traces", "of", "biomarkers", "at", "the", "genome", ",", "proteome", ",", "and", "metabolome", "levels", ",", "which", "could", "be", "identified", "with", "the", "recent", "technological", "breakthrough", "coupled", "with", "improved", "performance", "of", "bioinformatics", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "review", "highlights", "the", "recent", "breakthrough", "in", "molecular", "strategies", "(", "comprising", "transcriptomics", ",", "proteomics", ",", "and", "metabolomics", ")", "in", "identifying", "oxidative", "stress", "biomarkers", "and", "the", "arising", "opportunities", "and", "obstacles", "observed", "in", "research", "on", "biomarkers", "in", "rice", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "major", "issue", "in", "incorporating", "bioinformatics", "to", "validate", "the", "biomarkers", "from", "different", "omic", "platforms", "for", "the", "use", "of", "rice", "-", "breeding", "programs", "is", "also", "discussed", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "development", "of", "powerful", "techniques", "for", "identification", "of", "oxidative", "stress", "-", "related", "biomarkers", "and", "the", "integration", "of", "data", "from", "different", "disciplines", "shed", "light", "on", "the", "oxidative", "response", "pathways", "in", "plants", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Inhibition", "of", "proteases", "as", "a", "novel", "therapeutic", "strategy", "in", "the", "treatment", "of", "metabolic", ",", "inflammatory", "and", "functional", "diseases", "of", "the", "gastrointestinal", "tract", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Proteases", "are", "widely", "distributed", "in", "the", "human", "body", "and", "are", "crucially", "involved", "in", "the", "modulation", "of", "physiological", "processes", "in", "the", "gastrointestinal", "(", "GI", ")", "tract", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "They", "also", "have", "a", "major", "role", "in", "the", "etiology", "and", "the", "course", "of", "GI", "diseases", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "review", "discusses", "the", "pharmacology", "of", "proteases", "and", "medical", "application", "of", "their", "inhibitors", "in", "the", "GI", "tract", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "particular", ",", "we", "focus", "on", "metabolic", "disorders", ",", "such", "as", "diabetes", "type", "2", ",", "inflammatory", "bowel", "diseases", "(", "IBD", ")", ",", "irritable", "bowel", "syndrome", "(", "IBS", ")", "and", "abdominal", "pain", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Based", "on", "recent", "papers", "in", "the", "field", "of", "pharmacology", "and", "documented", "clinical", "trials", ",", "we", "suggest", "future", "treatment", "options", "employing", "protease", "inhibitors", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Evaluation", "of", "perfluoroalkyl", "acid", "activity", "using", "primary", "mouse", "and", "human", "hepatocytes", "." ]
[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "perfluorooctanoic", "acid", "(", "PFOA", ")", "and", "perfluorooctane", "sulfonate", "(", "PFOS", ")", "have", "been", "studied", "at", "length", ",", "less", "is", "known", "about", "the", "biological", "activity", "of", "other", "perfluoroalkyl", "acids", "(", "PFAAs", ")", "detected", "in", "the", "environment", "." ]
[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "a", "transient", "transfection", "assay", "developed", "in", "COS", "-", "1", "cells", ",", "our", "group", "has", "previously", "evaluated", "a", "variety", "of", "PFAAs", "for", "activity", "associated", "with", "activation", "of", "peroxisome", "proliferator", "-", "activated", "receptor", "alpha", "(", "PPAR", "alpha", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "use", "primary", "heptatocytes", "to", "further", "assess", "the", "biological", "activity", "of", "a", "similar", "group", "of", "PFAAs", "using", "custom", "designed", "Taqman", "Low", "Density", "Arrays", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Primary", "mouse", "and", "human", "hepatoyctes", "were", "cultured", "for", "48h", "in", "the", "presence", "of", "varying", "concentrations", "of", "12", "different", "PFAAs", "or", "Wy14", ",", "643", ",", "a", "known", "activator", "of", "PPAR", "alpha", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Total", "RNA", "was", "collected", "and", "the", "expression", "of", "48", "mouse", "or", "human", "genes", "evaluated", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gene", "selection", "was", "based", "on", "either", "in", "-", "house", "liver", "microarray", "data", "(", "mouse", ")", "or", "published", "data", "using", "primary", "hepatocytes", "(", "human", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gene", "expression", "in", "primary", "mouse", "hepatocytes", "was", "more", "restricted", "than", "expected", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Genes", "typically", "regulated", "in", "whole", "tissue", "by", "PPAR", "alpha", "agonists", "were", "not", "altered", "in", "mouse", "cells", "including", "Acox1", ",", "Me1", ",", "Acaa1a", ",", "Hmgcs1", ",", "and", "Slc27a1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cyp2b10", ",", "a", "gene", "regulated", "by", "the", "constitutive", "androstane", "receptor", "and", "a", "transcript", "normally", "up", "-", "regulated", "by", "in", "vivo", "exposure", "to", "PFAAs", ",", "was", "also", "unchanged", "in", "cultured", "mouse", "hepatocytes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cyp4a14", ",", "Ehhadh", ",", "Pdk4", ",", "Cpt1b", ",", "and", "Fabp1", "were", "regulated", "as", "expected", "in", "mouse", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "larger", "group", "of", "genes", "were", "differentially", "expressed", "in", "human", "primary", "hepatocytes", ",", "however", ",", "little", "consistency", "was", "observed", "across", "compounds", "with", "respect", "to", "which", "genes", "produced", "a", "significant", "dose", "response", "making", "the", "determination", "of", "relative", "biological", "activity", "difficult", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "likely", "reflects", "weaker", "activation", "of", "PPAR", "alpha", "in", "human", "versus", "rodent", "cells", "as", "well", "as", "variation", "among", "individual", "cell", "donors", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Unlike", "mouse", "cells", ",", "CYP2B6", "was", "up", "-", "regulated", "in", "human", "hepatocytes", "by", "a", "number", "of", "PFAAs", "as", "was", "PPAR", "delta", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Rankings", "were", "conducted", "on", "the", "limited", "dataset", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "mouse", "hepatocytes", ",", "the", "pattern", "was", "similar", "to", "that", "previously", "observed", "in", "the", "COS", "-", "1", "reporter", "cell", "assay", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "With", "the", "exception", "of", "PFHxA", ",", "longer", "chain", "PFAA", "carboxylates", "were", "the", "most", "active", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "pattern", "was", "similar", "in", "human", "hepatocytes", ",", "although", "PFDA", "and", "PFOS", "showed", "higher", "activity", "than", "previously", "observed", "while", "PFOA", "showed", "somewhat", "less", "activity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "reflect", "inherent", "challenges", "in", "using", "primary", "hepatocytes", "to", "predict", "toxicological", "response", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gene", "Cloning", ",", "Expression", "and", "Characterization", "of", "a", "Novel", "Xylanase", "from", "the", "Marine", "Bacterium", ",", "Glaciecola", "mesophila", "KMM241", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Marine", "xylanases", "are", "rather", "less", "studied", "compared", "to", "terrestrial", "xylanases", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "a", "new", "xylanase", "gene", ",", "xynB", ",", "was", "cloned", "from", "the", "marine", "bacterium", ",", "Glaciecola", "mesophila", "KMM241", ",", "and", "expressed", "in", "Escherichia", "coli", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "xynB", "encodes", "a", "multi", "-", "domain", "xylanase", "XynB", "of", "glycoside", "hydrolase", "(", "GH", ")", "family", "8", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "recombinant", "XynB", "comprises", "an", "N", "-", "terminal", "domain", "(", "NTD", ")", "with", "unknown", "function", "and", "a", "catalytic", "domain", ",", "which", "is", "structurally", "novel", "among", "the", "characterized", "xylanases", "of", "GH", "family", "8", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "XynB", "has", "the", "highest", "identity", "(", "38", "%", ")", "to", "rXyn8", "among", "the", "characterized", "xylanases", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "recombinant", "XynB", "showed", "maximal", "activity", "at", "pH", "6", "-", "7", "and", "35", "degrees", "C", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "thermolabile", "and", "salt", "-", "tolerant", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "XynB", "is", "an", "endo", "-", "xylanase", "that", "demands", "at", "least", "five", "sugar", "moieties", "for", "effective", "cleavage", "and", "to", "hydrolyze", "xylohexaose", "and", "xylopentaose", "into", "xylotetraose", ",", "xylotriose", "and", "xylobiose", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "NTD", "was", "expressed", "in", "Escherichia", "coli", "to", "analyze", "its", "function", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "recombinant", "NTD", "exhibited", "a", "high", "binding", "ability", "to", "insoluble", "xylan", "and", "avicel", "and", "little", "binding", "ability", "to", "chitosan", "and", "chitin", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Since", "the", "NTD", "shows", "no", "obvious", "homology", "to", "any", "known", "carbohydrate", "-", "binding", "module", "(", "CBM", ")", "sequence", "in", "public", "databases", ",", "XynB", "may", "contain", "a", "new", "type", "of", "CBM", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Variations", "in", "polyethylene", "glycol", "brands", "and", "their", "influence", "on", "the", "preparation", "process", "of", "hydrogel", "microspheres", "." ]
[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]