extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "The", "water", "solvation", "shell", "was", "less", "tight", "for", "the", "bulk", "-", "absorbed", "NO", "(", "2", ")", "than", "for", "the", "surface", "-", "adsorbed", "NO", "(", "2", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Adsorbed", "NO", "(", "2", ")", "demonstrated", "a", "marked", "orientational", "preference", ",", "with", "the", "oxygens", "pointing", "into", "the", "vacuum", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Such", "behavior", "is", "expected", "for", "a", "mildly", "hydrophobic", "and", "surfactant", "molecule", "like", "NO", "(", "2", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Estimates", "based", "on", "our", "results", "suggest", "that", "at", "high", "NO", "(", "2", ")", "concentrations", "encountered", ",", "for", "example", ",", "in", "some", "sampling", "systems", ",", "adsorption", "and", "reaction", "of", "NO", "(", "2", ")", "at", "the", "surface", "may", "contribute", "to", "the", "formation", "of", "gas", "-", "phase", "HONO", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Liver", "-", "specific", "disruption", "of", "the", "murine", "glucagon", "receptor", "produces", "alpha", "-", "cell", "hyperplasia", ":", "evidence", "for", "a", "circulating", "alpha", "-", "cell", "growth", "factor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Glucagon", "is", "a", "critical", "regulator", "of", "glucose", "homeostasis", ";", "however", ",", "mechanisms", "regulating", "glucagon", "action", "and", "alpha", "-", "cell", "function", "and", "number", "are", "incompletely", "understood", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "elucidate", "the", "role", "of", "the", "hepatic", "glucagon", "receptor", "(", "Gcgr", ")", "in", "glucagon", "action", ",", "we", "generated", "mice", "with", "hepatocyte", "-", "specific", "deletion", "of", "the", "glucagon", "receptor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "exhibited", "reductions", "in", "fasting", "blood", "glucose", "and", "improvements", "in", "insulin", "sensitivity", "and", "glucose", "tolerance", "compared", "with", "wild", "-", "type", "controls", ",", "similar", "in", "magnitude", "to", "changes", "observed", "in", "Gcgr", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "preservation", "of", "islet", "Gcgr", "signaling", ",", "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "developed", "hyperglucagonemia", "and", "alpha", "-", "cell", "hyperplasia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "investigate", "mechanisms", "by", "which", "signaling", "through", "the", "Gcgr", "regulates", "alpha", "-", "cell", "mass", ",", "wild", "-", "type", "islets", "were", "transplanted", "into", "Gcgr", "(", "-", "/", "-", ")", "or", "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Wild", "-", "type", "islets", "beneath", "the", "renal", "capsule", "of", "Gcgr", "(", "-", "/", "-", ")", "or", "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "exhibited", "an", "increased", "rate", "of", "alpha", "-", "cell", "proliferation", "and", "expansion", "of", "alpha", "-", "cell", "area", ",", "consistent", "with", "changes", "exhibited", "by", "endogenous", "alpha", "-", "cells", "in", "Gcgr", "(", "-", "/", "-", ")", "and", "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "pancreata", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "that", "a", "circulating", "factor", "generated", "after", "disruption", "of", "hepatic", "Gcgr", "signaling", "can", "increase", "alpha", "-", "cell", "proliferation", "independent", "of", "direct", "pancreatic", "input", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Identification", "of", "novel", "factors", "regulating", "alpha", "-", "cell", "proliferation", "and", "mass", "may", "facilitate", "the", "generation", "and", "expansion", "of", "alpha", "-", "cells", "for", "transdifferentiation", "into", "beta", "-", "cells", "and", "the", "treatment", "of", "diabetes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "HLA", "-", "A", "*", "24", "is", "an", "independent", "predictor", "of", "5", "-", "year", "progression", "to", "diabetes", "in", "autoantibody", "-", "positive", "first", "-", "degree", "relatives", "of", "type", "1", "diabetic", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "investigated", "whether", "HLA", "-", "A", "*", "24", "typing", "complements", "screening", "for", "HLA", "-", "DQ", "and", "for", "antibodies", "(", "Abs", ")", "against", "insulin", ",", "GAD", ",", "IA", "-", "2", "(", "IA", "-", "2A", ")", ",", "and", "zinc", "transporter", "-", "8", "(", "ZnT8A", ")", "for", "prediction", "of", "rapid", "progression", "to", "type", "1", "diabetes", "(", "T1D", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Persistently", "Ab", "(", "+", ")", "siblings", "/", "offspring", "(", "n", "=", "288", ";", "aged", "0", "-", "39", "years", ")", "of", "T1D", "patients", "were", "genotyped", "for", "HLA", "-", "DQA1", "-", "DQB1", "and", "HLA", "-", "A", "*", "24", "and", "monitored", "for", "development", "of", "diabetes", "within", "5", "years", "of", "first", "Ab", "(", "+", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "HLA", "-", "A", "*", "24", "(", "P", "=", "0", ".", "009", ")", ",", "HLA", "-", "DQ2", "/", "DQ8", "(", "P", "=", "0", ".", "001", ")", ",", "and", "positivity", "for", "IA", "-", "2A", "+/-", "ZnT8A", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", "were", "associated", "with", "development", "of", "T1D", "in", "multivariate", "analysis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "5", "-", "year", "risk", "increased", "with", "the", "number", "of", "the", "above", "three", "markers", "present", "(", "n", "=", "0", ":", "6", "%", ";", "n", "=", "1", ":", "18", "%", ";", "n", "=", "2", ":", "46", "%", ";", "n", "=", "3", ":", "100", "%", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Positivity", "for", "one", "or", "more", "markers", "identified", "a", "subgroup", "of", "171", "(", "59", "%", ")", "containing", "88", "%", "of", "rapid", "progressors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "combined", "presence", "of", "HLA", "-", "A", "*", "24", "and", "IA", "-", "2A", "(", "+", ")", "+/-", "ZnT8A", "(", "+", ")", "defined", "a", "subgroup", "of", "18", "(", "6", "%", ")", "with", "an", "82", "%", "diabetes", "risk", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Among", "IA", "-", "2A", "(", "+", ")", "+/-", "ZnT8A", "(", "+", ")", "relatives", ",", "identification", "of", "HLA", "-", "A", "*", "24", "carriers", "in", "addition", "to", "HLA", "-", "DQ2", "/", "DQ8", "carriers", "increased", "screening", "sensitivity", "for", "relatives", "at", "high", "Ab", "-", "and", "HLA", "-", "inferred", "risk", "(", "64", "%", "progression", ";", "P", "=", "0", ".", "002", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "HLA", "-", "A", "*", "24", "independently", "predicts", "rapid", "progression", "to", "T1D", "in", "Ab", "(", "+", ")", "relatives", "and", "complements", "IA", "-", "2A", ",", "ZnT8A", ",", "and", "HLA", "-", "DQ2", "/", "DQ8", "for", "identifying", "participants", "in", "immunointervention", "trials", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Comparison", "of", "the", "structural", "characteristics", "of", "Cu", "(", "2", "+", ")", "-", "bound", "and", "unbound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "obtained", "in", "simulations", "using", "different", "force", "fields", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effects", "of", "Cu", "(", "2", "+", ")", "binding", "and", "the", "utilization", "of", "different", "force", "fields", "when", "modeling", "the", "structural", "characteristics", "of", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "were", "investigated", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "To", "this", "end", ",", "we", "performed", "extensive", "temperature", "replica", "exchange", "molecular", "dynamics", "(", "T", "-", "REMD", ")", "simulations", "on", "Cu", "(", "2", "+", ")", "-", "bound", "and", "unbound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "using", "the", "GROMOS", "43A1", ",", "OPLS", "-", "AA", ",", "and", "AMBER03", "force", "fields", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Each", "replica", "was", "run", "for", "300", "ns", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "structural", "characteristics", "of", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "were", "studied", "based", "on", "backbone", "dihedral", "angle", "distributions", ",", "free", "-", "energy", "surfaces", "obtained", "with", "different", "reaction", "coordinates", ",", "favored", "conformations", ",", "the", "formation", "of", "different", "Turn", "structures", ",", "and", "the", "solvent", "exposure", "of", "the", "hydrophobic", "residues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "findings", "show", "that", "AMBER03", "prefers", "to", "sample", "helical", "structures", "for", "the", "unbound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "and", "does", "not", "sample", "any", "beta", "-", "hairpin", "structure", "for", "the", "Cu", "(", "2", "+", ")", "-", "bound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "the", "central", "structure", "of", "the", "major", "conformational", "clusters", "for", "the", "Cu", "(", "2", "+", ")", "-", "bound", "and", "unbound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "according", "to", "simulations", "performed", "using", "the", "GROMOS", "43A1", "and", "OPLS", "-", "AA", "force", "fields", "is", "a", "beta", "-", "hairpin", "with", "Turn", "(", "9", "-", "6", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cu", "(", "2", "+", ")", "can", "also", "promote", "the", "formation", "of", "the", "beta", "-", "hairpin", "and", "increase", "the", "solvent", "exposure", "of", "hydrophobic", "residues", ",", "which", "promotes", "the", "aggregation", "of", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "This", "study", "can", "help", "us", "to", "understand", "the", "mechanisms", "through", "which", "Cu", "(", "2", "+", ")", "participates", "in", "the", "fibrillation", "of", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "at", "the", "atomic", "level", ",", "which", "in", "turn", "represents", "a", "step", "towards", "elucidating", "the", "nosogenesis", "of", "Parkinson", "'", "s", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CB", "(", "1", ")", "receptor", "allosteric", "modulators", "display", "both", "agonist", "and", "signaling", "pathway", "specificity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "previously", "identified", "allosteric", "modulators", "of", "the", "cannabinoid", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "(", "Org", "27569", ",", "PSNCBAM", "-", "1", ")", "that", "display", "a", "contradictory", "pharmacological", "profile", ":", "increasing", "the", "specific", "binding", "of", "the", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "agonist", "[", "(", "3", ")", "H", "]", "CP55940", "but", "producing", "a", "decrease", "in", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "agonist", "efficacy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "investigated", "the", "effect", "one", "or", "both", "compounds", "in", "a", "broad", "range", "of", "signaling", "endpoints", "linked", "to", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "activation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "assessed", "the", "effect", "of", "these", "compounds", "on", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "agonist", "-", "induced", "[", "(", "35", ")", "S", "]", "GTP", "gamma", "S", "binding", ",", "inhibition", ",", "and", "stimulation", "of", "forskolin", "-", "stimulated", "cAMP", "production", ",", "phosphorylation", "of", "extracellular", "signal", "-", "regulated", "kinases", "(", "ERK", ")", ",", "and", "beta", "-", "arrestin", "recruitment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "also", "investigated", "the", "effect", "of", "these", "allosteric", "modulators", "on", "CB", "(", "1", ")", "agonist", "binding", "kinetics", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "compounds", "display", "ligand", "dependence", ",", "being", "significantly", "more", "potent", "as", "modulators", "of", "CP55940", "signaling", "as", "compared", "with", "WIN55212", "and", "having", "little", "effect", "on", "[", "(", "3", ")", "H", "]", "WIN55212", "binding", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Org", "27569", "displays", "biased", "antagonism", "whereby", "it", "inhibits", ":", "agonist", "-", "induced", "guanosine", "5", "'", "-", "O", "-", "(", "3", "-", "[", "(", "35", ")", "S", "]", "thio", ")", "triphosphate", "(", "[", "(", "35", ")", "S", "]", "GTP", "gamma", "S", ")", "binding", ",", "simulation", "(", "G", "alpha", "(", "s", ")", "-", "mediated", ")", ",", "and", "inhibition", "(", "G", "alpha", "(", "i", ")", "-", "mediated", ")", "of", "cAMP", "production", "and", "beta", "-", "arrestin", "recruitment", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "it", "acts", "as", "an", "enhancer", "of", "agonist", "-", "induced", "ERK", "phosphorylation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Alone", ",", "the", "compound", "can", "act", "also", "as", "an", "allosteric", "agonist", ",", "increasing", "cAMP", "production", "and", "ERK", "phosphorylation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "find", "that", "in", "both", "saturation", "and", "kinetic", "-", "binding", "experiments", ",", "the", "Org", "27569", "and", "PSNCBAM", "-", "1", "appeared", "to", "influence", "only", "orthosteric", "ligand", "maximum", "occupancy", "rather", "than", "affinity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "data", "indicate", "that", "the", "allosteric", "modulators", "share", "a", "common", "mechanism", "whereby", "they", "increase", "available", "high", "-", "affinity", "CB", "(", "1", ")", "agonist", "binding", "sites", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "receptor", "conformation", "stabilized", "by", "the", "allosterics", "appears", "to", "induce", "signaling", "and", "also", "selectively", "traffics", "orthosteric", "agonist", "signaling", "via", "the", "ERK", "phosphorylation", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Plasma", "ghrelin", "is", "positively", "associated", "with", "body", "fat", ",", "liver", "fat", "and", "milk", "fat", "content", "but", "not", "with", "feed", "intake", "of", "dairy", "cows", "after", "parturition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ghrelin", "is", "a", "gastrointestinal", "peptide", "hormone", "that", "is", "present", "in", "blood", "mostly", "in", "a", "non", "-", "posttranslationally", "modified", "form", ",", "with", "a", "minor", "proportion", "acylated", "at", "Ser", "(", "3", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "ghrelin", "forms", "were", "initially", "assigned", "a", "role", "in", "the", "control", "of", "food", "intake", "but", "there", "is", "accumulating", "evidence", "for", "their", "involvement", "in", "fat", "allocation", "and", "utilization", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "investigated", "changes", "in", "the", "ghrelin", "system", "in", "dairy", "cows", ",", "exhibiting", "differences", "in", "body", "fat", "mobilization", "and", "fatty", "liver", ",", "from", "late", "pregnancy", "to", "early", "lactation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Sixteen", "dairy", "cows", "underwent", "liver", "biopsy", "and", "were", "retrospectively", "grouped", "based", "on", "high", "(", "H", ")", "or", "low", "(", "L", ")", "liver", "fat", "content", "post", "-", "partum", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "groups", "had", "a", "comparable", "feed", "intake", "in", "week", "-", "6", "(", "before", "parturition", ")", "and", "week", "2", "(", "after", "parturition", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Only", "before", "parturition", "was", "preprandial", "total", "ghrelin", "concentration", "higher", "in", "L", "than", "in", "H", "cows", "and", "only", "after", "parturition", "was", "the", "basal", "plasma", "concentration", "of", "non", "-", "esterified", "fatty", "acids", "higher", "in", "H", "than", "in", "L", "cows", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "before", "and", "after", "parturition", ",", "H", "cows", "had", "higher", "preprandial", "plasma", "concentrations", "of", "acyl", "ghrelin", ",", "a", "higher", "acyl", ":", "total", "ghrelin", "ratio", ",", "lower", "plasma", "triacylglyceride", "concentrations", "and", "a", "lower", "respiratory", "quotient", "compared", "with", "L", "cows", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "group", "differences", "could", "not", "be", "attributed", "to", "an", "allelic", "variant", "of", "the", "acyl", "ghrelin", "receptor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "Rather", ",", "the", "ratio", "of", "acyl", ":", "total", "ghrelin", "correlated", "with", "several", "aspects", "of", "fat", "metabolism", "and", "with", "respiratory", "quotient", "but", "not", "with", "feed", "intake", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "show", "that", "endogenous", "ghrelin", "forms", "are", "associated", "with", "fat", "allocation", ",", "fatty", "liver", ",", "and", "utilization", "of", "fat", "during", "the", "periparturient", "period", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "1", ",", "25", "-", "Dihydroxyvitamin", "D3", "upregulates", "leptin", "expression", "in", "mouse", "adipose", "tissue", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Leptin", "is", "an", "adipose", "tissue", "-", "derived", "hormone", "that", "plays", "a", "critical", "role", "in", "energy", "homeostasis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Vitamin", "D", "has", "been", "shown", "to", "regulate", "energy", "metabolism", ",", "but", "the", "relationship", "between", "vitamin", "D", "and", "leptin", "is", "unclear", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Leptin", "expression", "and", "secretion", "was", "reduced", "in", "vitamin", "D", "receptor", "(", "VDR", ")", "-", "null", "mice", "and", "increased", "in", "transgenic", "(", "Tg", ")", "mice", "overexpressing", "the", "VDR", "in", "adipocytes", ";", "however", ",", "as", "leptin", "is", "mainly", "determined", "by", "fat", "mass", ",", "it", "is", "unclear", "whether", "the", "vitamin", "D", "hormone", "directly", "regulates", "leptin", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "address", "this", "question", ",", "we", "determined", "the", "effect", "of", "vitamin", "D", "on", "leptin", "expression", "in", "vivo", "and", "ex", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "-", "week", "treatment", "of", "WT", "mice", "with", "the", "vitamin", "D", "analog", "RO", "-", "27", "-", "5646", "led", "to", "a", "significant", "increase", "in", "adipose", "leptin", "mRNA", "transcript", "and", "serum", "leptin", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "in", "adipose", "tissue", "cultures", ",", "1", ",", "25", "-", "dihydroxyvitamin", "D", "markedly", "stimulated", "mRNA", "expression", "and", "secretion", "of", "leptin", ",", "but", "not", "resistin", ",", "in", "adipose", "tissues", "obtained", "from", "WT", "mice", ",", "but", "not", "from", "VDR", "-", "null", "mice", ",", "and", "leptin", "upregulation", "induced", "by", "1", ",", "25", "-", "dihydroxyvitamin", "D", "was", "more", "robust", "in", "adipose", "tissues", "obtained", "from", "VDR", "Tg", "mice", "compared", "with", "WT", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "demonstrate", "that", "1", ",", "25", "-", "dihydroxyvitamin", "D", "stimulates", "adipose", "leptin", "production", "in", "a", "VDR", "-", "dependent", "manner", ",", "suggesting", "that", "vitamin", "D", "may", "affect", "energy", "homeostasis", "through", "direct", "regulation", "of", "leptin", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Suramin", "decreases", "injury", "and", "improves", "regeneration", "of", "ethanol", "-", "induced", "steatotic", "partial", "liver", "grafts", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Steatotic", "grafts", "are", "excluded", "for", "use", "in", "partial", "liver", "transplantation", "(", "LT", ")", "because", "of", "the", "increased", "risk", "of", "primary", "nonfunction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "investigated", "the", "effects", "of", "suramin", ",", "a", "polysulfonated", "naphthylurea", ",", "on", "the", "outcome", "of", "steatotic", "partial", "LT", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Rat", "livers", "were", "harvested", "after", "acute", "ethanol", "treatment", "(", "6", "g", "/", "kg", ",", "intragastric", "administration", ")", ",", "reduced", "in", "size", "to", "=~", "1", "/", "3", ",", "and", "transplanted", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Serum", "alanine", "aminotransferase", "(", "ALT", ")", "and", "total", "bilirubin", "levels", "as", "well", "as", "hepatic", "necrosis", "and", "apoptosis", "were", "significantly", "higher", "after", "transplantation", "of", "fatty", "partial", "grafts", "(", "FPG", ")", "than", "lean", "partial", "grafts", "(", "LPG", ")", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Suramin", "(", "5", "mg", "/", "kg", ",", "i", ".", "p", ".", ")", "decreased", "ALT", "by", "=~", "60", "%", ",", "hyperbilirubinemia", "by", "75", "%", ",", "necrosis", "by", "83", "%", ",", "and", "apoptosis", "by", "70", "%", "after", "FPG", "transplantation", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hepatic", "cellular", "5", "-", "bromo", "-", "2", "'", "-", "deoxyuridine", "(", "BrdU", ")", "incorporation", "increased", "to", "28", "%", "in", "LPG", "but", "was", "only", "2", "%", "in", "FPG", "at", "48", "hours", ",", "and", "the", "mitotic", "index", "increased", "to", "7", "%", "in", "LPG", "but", "was", "only", "0", ".", "2", "%", "in", "FPG", ",", "indicating", "suppressed", "regeneration", "in", "FPG", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Suramin", "increased", "BrdU", "incorporation", "and", "the", "mitotic", "index", "to", "43", "%", "and", "9", "%", ",", "respectively", ",", "in", "FPG", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "FPG", "recipients", "died", "within", "5", "days", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Suramin", "recovered", "survival", "of", "FPG", "to", "62", "%", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "mRNA", "was", "2", ".", "2", "-", "fold", "higher", "in", "FPG", "than", "in", "LPG", "and", "was", "associated", "with", "activation", "of", "caspase", "-", "8", "and", "caspase", "-", "3", "in", "FPG", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Suramin", "decreased", "TNF", "-", "alpha", "and", "caspase", "activation", "in", "FPG", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transforming", "growth", "factor", "-", "beta", "(", "TGF", "-", "beta", ")", ",", "phospho", "-", "Smad2", "/", "3", "and", "p21Cip1", "were", "significantly", "higher", "in", "FPG", "than", "in", "LPG", "and", "suramin", "blocked", "TGF", "-", "beta", "formation", "and", "its", "down", "-", "stream", "signaling", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Taken", "together", ",", "suramin", "improves", "the", "outcome", "of", "FPG", "transplantation", ",", "most", "likely", "by", "inhibition", "of", "TNF", "-", "alpha", "and", "TGF", "-", "beta", "formation", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ecological", "risk", "assessment", "in", "the", "context", "of", "global", "climate", "change", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Changes", "to", "sources", ",", "stressors", ",", "habitats", ",", "and", "geographic", "ranges", ";", "toxicological", "effects", ";", "end", "points", ";", "and", "uncertainty", "estimation", "require", "significant", "changes", "in", "the", "implementation", "of", "ecological", "risk", "assessment", "(", "ERA", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Because", "of", "the", "lack", "of", "analog", "systems", "and", "circumstances", "in", "historically", "studied", "sites", ",", "there", "is", "a", "likelihood", "of", "type", "III", "error", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "a", "first", "step", ",", "the", "authors", "propose", "a", "decision", "key", "to", "aid", "managers", "and", "risk", "assessors", "in", "determining", "when", "and", "to", "what", "extent", "climate", "change", "should", "be", "incorporated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Next", ",", "when", "global", "climate", "change", "is", "an", "important", "factor", ",", "the", "authors", "recommend", "seven", "critical", "changes", "to", "ERA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "First", ",", "develop", "conceptual", "cause", "-", "effect", "diagrams", "that", "consider", "relevant", "management", "decisions", "as", "well", "as", "appropriate", "spatial", "and", "temporal", "scales", "to", "include", "both", "direct", "and", "indirect", "effects", "of", "climate", "change", "and", "the", "stressor", "of", "management", "interest", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Second", ",", "develop", "assessment", "end", "points", "that", "are", "expressed", "as", "ecosystem", "services", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Third", ",", "evaluate", "multiple", "stressors", "and", "nonlinear", "responses", "-", "include", "the", "chemicals", "and", "the", "stressors", "related", "to", "climate", "change", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fourth", ",", "estimate", "how", "climate", "change", "will", "affect", "or", "modify", "management", "options", "as", "the", "impacts", "become", "manifest", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fifth", ",", "consider", "the", "direction", "and", "rate", "of", "change", "relative", "to", "management", "objectives", ",", "recognizing", "that", "both", "positive", "and", "negative", "outcomes", "can", "occur", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Sixth", ",", "determine", "the", "major", "drivers", "of", "uncertainty", ",", "estimating", "and", "bounding", "stochastic", "uncertainty", "spatially", ",", "temporally", ",", "and", "progressively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Seventh", ",", "plan", "for", "adaptive", "management", "to", "account", "for", "changing", "environmental", "conditions", "and", "consequent", "changes", "to", "ecosystem", "services", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Good", "communication", "is", "essential", "for", "making", "risk", "-", "related", "information", "understandable", "and", "useful", "for", "managers", "and", "stakeholders", "to", "implement", "a", "successful", "risk", "-", "assessment", "and", "decision", "-", "making", "process", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Topoisomerase", "I", "inhibitor", "evodiamine", "acts", "as", "an", "antibacterial", "agent", "against", "drug", "-", "resistant", "Klebsiella", "pneumoniae", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Topoisomerase", "inhibitors", "have", "been", "developed", "in", "a", "variety", "of", "clinical", "applications", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "investigated", "the", "inhibitory", "effect", "of", "evodiamine", "on", "E", ".", "coli", "topoisomerase", "I", ",", "which", "may", "lead", "to", "an", "anti", "-", "bacterial", "effect", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Evodiamine", "inhibits", "the", "supercoiled", "plasmid", "DNA", "relaxation", "that", "is", "catalyzed", "by", "E", ".", "coli", "topoisomerase", "I", ",", "and", "computer", "-", "aided", "docking", "has", "shown", "that", "the", "Arg161", "and", "Asp551", "residues", "of", "topoisomerase", "I", "interact", "with", "evodiamine", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "We", "investigated", "the", "bactericidal", "effect", "of", "evodiamine", "against", "multidrug", "-", "resistant", "Klebsiella", "pneumoniae", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Evodiamine", "showed", "a", "significantly", "lower", "minimal", "inhibitory", "concentration", "value", "(", "MIC", "128", "micro", "g", "/", "mL", ")", "compared", "with", "antibiotics", "(", ">", "512", "micro", "g", "/", "mL", ")", "against", "the", "clinical", "isolate", "of", "K", ".", "pneumoniae", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "suggested", "that", "evodiamine", "is", "a", "potential", "agent", "against", "drug", "-", "resistant", "bacteria", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Derivation", "of", "a", "benchmark", "for", "freshwater", "ionic", "strength", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Because", "increased", "ionic", "strength", "has", "caused", "deleterious", "ecological", "changes", "in", "freshwater", "streams", ",", "thresholds", "for", "effects", "are", "needed", "to", "inform", "resource", "-", "management", "decisions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "particular", ",", "effluents", "from", "surface", "coal", "mining", "raise", "the", "ionic", "strength", "of", "receiving", "streams", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "authors", "developed", "an", "aquatic", "life", "benchmark", "for", "specific", "conductance", "as", "a", "measure", "of", "ionic", "strength", "that", "is", "expected", "to", "prevent", "the", "local", "extirpation", "of", "95", "%", "of", "species", "from", "neutral", "to", "alkaline", "waters", "containing", "a", "mixture", "of", "dissolved", "ions", "in", "which", "the", "mass", "of", "SO", "(", "4", ")", "2", "-", "+", "HCO", "(", "3", ")", "-", ">=", "Cl", "(", "-", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "water", "solvation", "shell", "was", "less", "tight", "for", "the", "bulk", "-", "absorbed", "NO", "(", "2", ")", "than", "for", "the", "surface", "-", "adsorbed", "NO", "(", "2", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Adsorbed", "NO", "(", "2", ")", "demonstrated", "a", "marked", "orientational", "preference", ",", "with", "the", "oxygens", "pointing", "into", "the", "vacuum", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Such", "behavior", "is", "expected", "for", "a", "mildly", "hydrophobic", "and", "surfactant", "molecule", "like", "NO", "(", "2", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Estimates", "based", "on", "our", "results", "suggest", "that", "at", "high", "NO", "(", "2", ")", "concentrations", "encountered", ",", "for", "example", ",", "in", "some", "sampling", "systems", ",", "adsorption", "and", "reaction", "of", "NO", "(", "2", ")", "at", "the", "surface", "may", "contribute", "to", "the", "formation", "of", "gas", "-", "phase", "HONO", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Liver", "-", "specific", "disruption", "of", "the", "murine", "glucagon", "receptor", "produces", "alpha", "-", "cell", "hyperplasia", ":", "evidence", "for", "a", "circulating", "alpha", "-", "cell", "growth", "factor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Glucagon", "is", "a", "critical", "regulator", "of", "glucose", "homeostasis", ";", "however", ",", "mechanisms", "regulating", "glucagon", "action", "and", "alpha", "-", "cell", "function", "and", "number", "are", "incompletely", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "elucidate", "the", "role", "of", "the", "hepatic", "glucagon", "receptor", "(", "Gcgr", ")", "in", "glucagon", "action", ",", "we", "generated", "mice", "with", "hepatocyte", "-", "specific", "deletion", "of", "the", "glucagon", "receptor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "exhibited", "reductions", "in", "fasting", "blood", "glucose", "and", "improvements", "in", "insulin", "sensitivity", "and", "glucose", "tolerance", "compared", "with", "wild", "-", "type", "controls", ",", "similar", "in", "magnitude", "to", "changes", "observed", "in", "Gcgr", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Despite", "preservation", "of", "islet", "Gcgr", "signaling", ",", "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "developed", "hyperglucagonemia", "and", "alpha", "-", "cell", "hyperplasia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "investigate", "mechanisms", "by", "which", "signaling", "through", "the", "Gcgr", "regulates", "alpha", "-", "cell", "mass", ",", "wild", "-", "type", "islets", "were", "transplanted", "into", "Gcgr", "(", "-", "/", "-", ")", "or", "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Wild", "-", "type", "islets", "beneath", "the", "renal", "capsule", "of", "Gcgr", "(", "-", "/", "-", ")", "or", "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "mice", "exhibited", "an", "increased", "rate", "of", "alpha", "-", "cell", "proliferation", "and", "expansion", "of", "alpha", "-", "cell", "area", ",", "consistent", "with", "changes", "exhibited", "by", "endogenous", "alpha", "-", "cells", "in", "Gcgr", "(", "-", "/", "-", ")", "and", "Gcgr", "(", "Hep", ")", "(", "-", "/", "-", ")", "pancreata", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "a", "circulating", "factor", "generated", "after", "disruption", "of", "hepatic", "Gcgr", "signaling", "can", "increase", "alpha", "-", "cell", "proliferation", "independent", "of", "direct", "pancreatic", "input", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identification", "of", "novel", "factors", "regulating", "alpha", "-", "cell", "proliferation", "and", "mass", "may", "facilitate", "the", "generation", "and", "expansion", "of", "alpha", "-", "cells", "for", "transdifferentiation", "into", "beta", "-", "cells", "and", "the", "treatment", "of", "diabetes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "HLA", "-", "A", "*", "24", "is", "an", "independent", "predictor", "of", "5", "-", "year", "progression", "to", "diabetes", "in", "autoantibody", "-", "positive", "first", "-", "degree", "relatives", "of", "type", "1", "diabetic", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "investigated", "whether", "HLA", "-", "A", "*", "24", "typing", "complements", "screening", "for", "HLA", "-", "DQ", "and", "for", "antibodies", "(", "Abs", ")", "against", "insulin", ",", "GAD", ",", "IA", "-", "2", "(", "IA", "-", "2A", ")", ",", "and", "zinc", "transporter", "-", "8", "(", "ZnT8A", ")", "for", "prediction", "of", "rapid", "progression", "to", "type", "1", "diabetes", "(", "T1D", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Persistently", "Ab", "(", "+", ")", "siblings", "/", "offspring", "(", "n", "=", "288", ";", "aged", "0", "-", "39", "years", ")", "of", "T1D", "patients", "were", "genotyped", "for", "HLA", "-", "DQA1", "-", "DQB1", "and", "HLA", "-", "A", "*", "24", "and", "monitored", "for", "development", "of", "diabetes", "within", "5", "years", "of", "first", "Ab", "(", "+", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "HLA", "-", "A", "*", "24", "(", "P", "=", "0", ".", "009", ")", ",", "HLA", "-", "DQ2", "/", "DQ8", "(", "P", "=", "0", ".", "001", ")", ",", "and", "positivity", "for", "IA", "-", "2A", "+/-", "ZnT8A", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", "were", "associated", "with", "development", "of", "T1D", "in", "multivariate", "analysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "5", "-", "year", "risk", "increased", "with", "the", "number", "of", "the", "above", "three", "markers", "present", "(", "n", "=", "0", ":", "6", "%", ";", "n", "=", "1", ":", "18", "%", ";", "n", "=", "2", ":", "46", "%", ";", "n", "=", "3", ":", "100", "%", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Positivity", "for", "one", "or", "more", "markers", "identified", "a", "subgroup", "of", "171", "(", "59", "%", ")", "containing", "88", "%", "of", "rapid", "progressors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "combined", "presence", "of", "HLA", "-", "A", "*", "24", "and", "IA", "-", "2A", "(", "+", ")", "+/-", "ZnT8A", "(", "+", ")", "defined", "a", "subgroup", "of", "18", "(", "6", "%", ")", "with", "an", "82", "%", "diabetes", "risk", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Among", "IA", "-", "2A", "(", "+", ")", "+/-", "ZnT8A", "(", "+", ")", "relatives", ",", "identification", "of", "HLA", "-", "A", "*", "24", "carriers", "in", "addition", "to", "HLA", "-", "DQ2", "/", "DQ8", "carriers", "increased", "screening", "sensitivity", "for", "relatives", "at", "high", "Ab", "-", "and", "HLA", "-", "inferred", "risk", "(", "64", "%", "progression", ";", "P", "=", "0", ".", "002", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "HLA", "-", "A", "*", "24", "independently", "predicts", "rapid", "progression", "to", "T1D", "in", "Ab", "(", "+", ")", "relatives", "and", "complements", "IA", "-", "2A", ",", "ZnT8A", ",", "and", "HLA", "-", "DQ2", "/", "DQ8", "for", "identifying", "participants", "in", "immunointervention", "trials", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Comparison", "of", "the", "structural", "characteristics", "of", "Cu", "(", "2", "+", ")", "-", "bound", "and", "unbound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "obtained", "in", "simulations", "using", "different", "force", "fields", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effects", "of", "Cu", "(", "2", "+", ")", "binding", "and", "the", "utilization", "of", "different", "force", "fields", "when", "modeling", "the", "structural", "characteristics", "of", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "were", "investigated", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "To", "this", "end", ",", "we", "performed", "extensive", "temperature", "replica", "exchange", "molecular", "dynamics", "(", "T", "-", "REMD", ")", "simulations", "on", "Cu", "(", "2", "+", ")", "-", "bound", "and", "unbound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "using", "the", "GROMOS", "43A1", ",", "OPLS", "-", "AA", ",", "and", "AMBER03", "force", "fields", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Each", "replica", "was", "run", "for", "300", "ns", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "structural", "characteristics", "of", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "were", "studied", "based", "on", "backbone", "dihedral", "angle", "distributions", ",", "free", "-", "energy", "surfaces", "obtained", "with", "different", "reaction", "coordinates", ",", "favored", "conformations", ",", "the", "formation", "of", "different", "Turn", "structures", ",", "and", "the", "solvent", "exposure", "of", "the", "hydrophobic", "residues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "findings", "show", "that", "AMBER03", "prefers", "to", "sample", "helical", "structures", "for", "the", "unbound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "and", "does", "not", "sample", "any", "beta", "-", "hairpin", "structure", "for", "the", "Cu", "(", "2", "+", ")", "-", "bound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "the", "central", "structure", "of", "the", "major", "conformational", "clusters", "for", "the", "Cu", "(", "2", "+", ")", "-", "bound", "and", "unbound", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "according", "to", "simulations", "performed", "using", "the", "GROMOS", "43A1", "and", "OPLS", "-", "AA", "force", "fields", "is", "a", "beta", "-", "hairpin", "with", "Turn", "(", "9", "-", "6", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cu", "(", "2", "+", ")", "can", "also", "promote", "the", "formation", "of", "the", "beta", "-", "hairpin", "and", "increase", "the", "solvent", "exposure", "of", "hydrophobic", "residues", ",", "which", "promotes", "the", "aggregation", "of", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "This", "study", "can", "help", "us", "to", "understand", "the", "mechanisms", "through", "which", "Cu", "(", "2", "+", ")", "participates", "in", "the", "fibrillation", "of", "alpha", "-", "syn12", "peptide", "at", "the", "atomic", "level", ",", "which", "in", "turn", "represents", "a", "step", "towards", "elucidating", "the", "nosogenesis", "of", "Parkinson", "'", "s", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CB", "(", "1", ")", "receptor", "allosteric", "modulators", "display", "both", "agonist", "and", "signaling", "pathway", "specificity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "previously", "identified", "allosteric", "modulators", "of", "the", "cannabinoid", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "(", "Org", "27569", ",", "PSNCBAM", "-", "1", ")", "that", "display", "a", "contradictory", "pharmacological", "profile", ":", "increasing", "the", "specific", "binding", "of", "the", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "agonist", "[", "(", "3", ")", "H", "]", "CP55940", "but", "producing", "a", "decrease", "in", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "agonist", "efficacy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "investigated", "the", "effect", "one", "or", "both", "compounds", "in", "a", "broad", "range", "of", "signaling", "endpoints", "linked", "to", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "assessed", "the", "effect", "of", "these", "compounds", "on", "CB", "(", "1", ")", "receptor", "agonist", "-", "induced", "[", "(", "35", ")", "S", "]", "GTP", "gamma", "S", "binding", ",", "inhibition", ",", "and", "stimulation", "of", "forskolin", "-", "stimulated", "cAMP", "production", ",", "phosphorylation", "of", "extracellular", "signal", "-", "regulated", "kinases", "(", "ERK", ")", ",", "and", "beta", "-", "arrestin", "recruitment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "investigated", "the", "effect", "of", "these", "allosteric", "modulators", "on", "CB", "(", "1", ")", "agonist", "binding", "kinetics", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "compounds", "display", "ligand", "dependence", ",", "being", "significantly", "more", "potent", "as", "modulators", "of", "CP55940", "signaling", "as", "compared", "with", "WIN55212", "and", "having", "little", "effect", "on", "[", "(", "3", ")", "H", "]", "WIN55212", "binding", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Org", "27569", "displays", "biased", "antagonism", "whereby", "it", "inhibits", ":", "agonist", "-", "induced", "guanosine", "5", "'", "-", "O", "-", "(", "3", "-", "[", "(", "35", ")", "S", "]", "thio", ")", "triphosphate", "(", "[", "(", "35", ")", "S", "]", "GTP", "gamma", "S", ")", "binding", ",", "simulation", "(", "G", "alpha", "(", "s", ")", "-", "mediated", ")", ",", "and", "inhibition", "(", "G", "alpha", "(", "i", ")", "-", "mediated", ")", "of", "cAMP", "production", "and", "beta", "-", "arrestin", "recruitment", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "it", "acts", "as", "an", "enhancer", "of", "agonist", "-", "induced", "ERK", "phosphorylation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Alone", ",", "the", "compound", "can", "act", "also", "as", "an", "allosteric", "agonist", ",", "increasing", "cAMP", "production", "and", "ERK", "phosphorylation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "find", "that", "in", "both", "saturation", "and", "kinetic", "-", "binding", "experiments", ",", "the", "Org", "27569", "and", "PSNCBAM", "-", "1", "appeared", "to", "influence", "only", "orthosteric", "ligand", "maximum", "occupancy", "rather", "than", "affinity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "data", "indicate", "that", "the", "allosteric", "modulators", "share", "a", "common", "mechanism", "whereby", "they", "increase", "available", "high", "-", "affinity", "CB", "(", "1", ")", "agonist", "binding", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "receptor", "conformation", "stabilized", "by", "the", "allosterics", "appears", "to", "induce", "signaling", "and", "also", "selectively", "traffics", "orthosteric", "agonist", "signaling", "via", "the", "ERK", "phosphorylation", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Plasma", "ghrelin", "is", "positively", "associated", "with", "body", "fat", ",", "liver", "fat", "and", "milk", "fat", "content", "but", "not", "with", "feed", "intake", "of", "dairy", "cows", "after", "parturition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ghrelin", "is", "a", "gastrointestinal", "peptide", "hormone", "that", "is", "present", "in", "blood", "mostly", "in", "a", "non", "-", "posttranslationally", "modified", "form", ",", "with", "a", "minor", "proportion", "acylated", "at", "Ser", "(", "3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "ghrelin", "forms", "were", "initially", "assigned", "a", "role", "in", "the", "control", "of", "food", "intake", "but", "there", "is", "accumulating", "evidence", "for", "their", "involvement", "in", "fat", "allocation", "and", "utilization", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "investigated", "changes", "in", "the", "ghrelin", "system", "in", "dairy", "cows", ",", "exhibiting", "differences", "in", "body", "fat", "mobilization", "and", "fatty", "liver", ",", "from", "late", "pregnancy", "to", "early", "lactation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Sixteen", "dairy", "cows", "underwent", "liver", "biopsy", "and", "were", "retrospectively", "grouped", "based", "on", "high", "(", "H", ")", "or", "low", "(", "L", ")", "liver", "fat", "content", "post", "-", "partum", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "groups", "had", "a", "comparable", "feed", "intake", "in", "week", "-", "6", "(", "before", "parturition", ")", "and", "week", "2", "(", "after", "parturition", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Only", "before", "parturition", "was", "preprandial", "total", "ghrelin", "concentration", "higher", "in", "L", "than", "in", "H", "cows", "and", "only", "after", "parturition", "was", "the", "basal", "plasma", "concentration", "of", "non", "-", "esterified", "fatty", "acids", "higher", "in", "H", "than", "in", "L", "cows", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "before", "and", "after", "parturition", ",", "H", "cows", "had", "higher", "preprandial", "plasma", "concentrations", "of", "acyl", "ghrelin", ",", "a", "higher", "acyl", ":", "total", "ghrelin", "ratio", ",", "lower", "plasma", "triacylglyceride", "concentrations", "and", "a", "lower", "respiratory", "quotient", "compared", "with", "L", "cows", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "group", "differences", "could", "not", "be", "attributed", "to", "an", "allelic", "variant", "of", "the", "acyl", "ghrelin", "receptor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "Rather", ",", "the", "ratio", "of", "acyl", ":", "total", "ghrelin", "correlated", "with", "several", "aspects", "of", "fat", "metabolism", "and", "with", "respiratory", "quotient", "but", "not", "with", "feed", "intake", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "show", "that", "endogenous", "ghrelin", "forms", "are", "associated", "with", "fat", "allocation", ",", "fatty", "liver", ",", "and", "utilization", "of", "fat", "during", "the", "periparturient", "period", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "1", ",", "25", "-", "Dihydroxyvitamin", "D3", "upregulates", "leptin", "expression", "in", "mouse", "adipose", "tissue", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Leptin", "is", "an", "adipose", "tissue", "-", "derived", "hormone", "that", "plays", "a", "critical", "role", "in", "energy", "homeostasis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Vitamin", "D", "has", "been", "shown", "to", "regulate", "energy", "metabolism", ",", "but", "the", "relationship", "between", "vitamin", "D", "and", "leptin", "is", "unclear", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Leptin", "expression", "and", "secretion", "was", "reduced", "in", "vitamin", "D", "receptor", "(", "VDR", ")", "-", "null", "mice", "and", "increased", "in", "transgenic", "(", "Tg", ")", "mice", "overexpressing", "the", "VDR", "in", "adipocytes", ";", "however", ",", "as", "leptin", "is", "mainly", "determined", "by", "fat", "mass", ",", "it", "is", "unclear", "whether", "the", "vitamin", "D", "hormone", "directly", "regulates", "leptin", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "address", "this", "question", ",", "we", "determined", "the", "effect", "of", "vitamin", "D", "on", "leptin", "expression", "in", "vivo", "and", "ex", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "-", "week", "treatment", "of", "WT", "mice", "with", "the", "vitamin", "D", "analog", "RO", "-", "27", "-", "5646", "led", "to", "a", "significant", "increase", "in", "adipose", "leptin", "mRNA", "transcript", "and", "serum", "leptin", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "in", "adipose", "tissue", "cultures", ",", "1", ",", "25", "-", "dihydroxyvitamin", "D", "markedly", "stimulated", "mRNA", "expression", "and", "secretion", "of", "leptin", ",", "but", "not", "resistin", ",", "in", "adipose", "tissues", "obtained", "from", "WT", "mice", ",", "but", "not", "from", "VDR", "-", "null", "mice", ",", "and", "leptin", "upregulation", "induced", "by", "1", ",", "25", "-", "dihydroxyvitamin", "D", "was", "more", "robust", "in", "adipose", "tissues", "obtained", "from", "VDR", "Tg", "mice", "compared", "with", "WT", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "demonstrate", "that", "1", ",", "25", "-", "dihydroxyvitamin", "D", "stimulates", "adipose", "leptin", "production", "in", "a", "VDR", "-", "dependent", "manner", ",", "suggesting", "that", "vitamin", "D", "may", "affect", "energy", "homeostasis", "through", "direct", "regulation", "of", "leptin", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Suramin", "decreases", "injury", "and", "improves", "regeneration", "of", "ethanol", "-", "induced", "steatotic", "partial", "liver", "grafts", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Steatotic", "grafts", "are", "excluded", "for", "use", "in", "partial", "liver", "transplantation", "(", "LT", ")", "because", "of", "the", "increased", "risk", "of", "primary", "nonfunction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "investigated", "the", "effects", "of", "suramin", ",", "a", "polysulfonated", "naphthylurea", ",", "on", "the", "outcome", "of", "steatotic", "partial", "LT", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Rat", "livers", "were", "harvested", "after", "acute", "ethanol", "treatment", "(", "6", "g", "/", "kg", ",", "intragastric", "administration", ")", ",", "reduced", "in", "size", "to", "=~", "1", "/", "3", ",", "and", "transplanted", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Serum", "alanine", "aminotransferase", "(", "ALT", ")", "and", "total", "bilirubin", "levels", "as", "well", "as", "hepatic", "necrosis", "and", "apoptosis", "were", "significantly", "higher", "after", "transplantation", "of", "fatty", "partial", "grafts", "(", "FPG", ")", "than", "lean", "partial", "grafts", "(", "LPG", ")", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Suramin", "(", "5", "mg", "/", "kg", ",", "i", ".", "p", ".", ")", "decreased", "ALT", "by", "=~", "60", "%", ",", "hyperbilirubinemia", "by", "75", "%", ",", "necrosis", "by", "83", "%", ",", "and", "apoptosis", "by", "70", "%", "after", "FPG", "transplantation", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hepatic", "cellular", "5", "-", "bromo", "-", "2", "'", "-", "deoxyuridine", "(", "BrdU", ")", "incorporation", "increased", "to", "28", "%", "in", "LPG", "but", "was", "only", "2", "%", "in", "FPG", "at", "48", "hours", ",", "and", "the", "mitotic", "index", "increased", "to", "7", "%", "in", "LPG", "but", "was", "only", "0", ".", "2", "%", "in", "FPG", ",", "indicating", "suppressed", "regeneration", "in", "FPG", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Suramin", "increased", "BrdU", "incorporation", "and", "the", "mitotic", "index", "to", "43", "%", "and", "9", "%", ",", "respectively", ",", "in", "FPG", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "FPG", "recipients", "died", "within", "5", "days", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Suramin", "recovered", "survival", "of", "FPG", "to", "62", "%", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "mRNA", "was", "2", ".", "2", "-", "fold", "higher", "in", "FPG", "than", "in", "LPG", "and", "was", "associated", "with", "activation", "of", "caspase", "-", "8", "and", "caspase", "-", "3", "in", "FPG", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Suramin", "decreased", "TNF", "-", "alpha", "and", "caspase", "activation", "in", "FPG", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transforming", "growth", "factor", "-", "beta", "(", "TGF", "-", "beta", ")", ",", "phospho", "-", "Smad2", "/", "3", "and", "p21Cip1", "were", "significantly", "higher", "in", "FPG", "than", "in", "LPG", "and", "suramin", "blocked", "TGF", "-", "beta", "formation", "and", "its", "down", "-", "stream", "signaling", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Taken", "together", ",", "suramin", "improves", "the", "outcome", "of", "FPG", "transplantation", ",", "most", "likely", "by", "inhibition", "of", "TNF", "-", "alpha", "and", "TGF", "-", "beta", "formation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ecological", "risk", "assessment", "in", "the", "context", "of", "global", "climate", "change", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Changes", "to", "sources", ",", "stressors", ",", "habitats", ",", "and", "geographic", "ranges", ";", "toxicological", "effects", ";", "end", "points", ";", "and", "uncertainty", "estimation", "require", "significant", "changes", "in", "the", "implementation", "of", "ecological", "risk", "assessment", "(", "ERA", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Because", "of", "the", "lack", "of", "analog", "systems", "and", "circumstances", "in", "historically", "studied", "sites", ",", "there", "is", "a", "likelihood", "of", "type", "III", "error", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "a", "first", "step", ",", "the", "authors", "propose", "a", "decision", "key", "to", "aid", "managers", "and", "risk", "assessors", "in", "determining", "when", "and", "to", "what", "extent", "climate", "change", "should", "be", "incorporated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Next", ",", "when", "global", "climate", "change", "is", "an", "important", "factor", ",", "the", "authors", "recommend", "seven", "critical", "changes", "to", "ERA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "First", ",", "develop", "conceptual", "cause", "-", "effect", "diagrams", "that", "consider", "relevant", "management", "decisions", "as", "well", "as", "appropriate", "spatial", "and", "temporal", "scales", "to", "include", "both", "direct", "and", "indirect", "effects", "of", "climate", "change", "and", "the", "stressor", "of", "management", "interest", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Second", ",", "develop", "assessment", "end", "points", "that", "are", "expressed", "as", "ecosystem", "services", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Third", ",", "evaluate", "multiple", "stressors", "and", "nonlinear", "responses", "-", "include", "the", "chemicals", "and", "the", "stressors", "related", "to", "climate", "change", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fourth", ",", "estimate", "how", "climate", "change", "will", "affect", "or", "modify", "management", "options", "as", "the", "impacts", "become", "manifest", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fifth", ",", "consider", "the", "direction", "and", "rate", "of", "change", "relative", "to", "management", "objectives", ",", "recognizing", "that", "both", "positive", "and", "negative", "outcomes", "can", "occur", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Sixth", ",", "determine", "the", "major", "drivers", "of", "uncertainty", ",", "estimating", "and", "bounding", "stochastic", "uncertainty", "spatially", ",", "temporally", ",", "and", "progressively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Seventh", ",", "plan", "for", "adaptive", "management", "to", "account", "for", "changing", "environmental", "conditions", "and", "consequent", "changes", "to", "ecosystem", "services", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Good", "communication", "is", "essential", "for", "making", "risk", "-", "related", "information", "understandable", "and", "useful", "for", "managers", "and", "stakeholders", "to", "implement", "a", "successful", "risk", "-", "assessment", "and", "decision", "-", "making", "process", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Topoisomerase", "I", "inhibitor", "evodiamine", "acts", "as", "an", "antibacterial", "agent", "against", "drug", "-", "resistant", "Klebsiella", "pneumoniae", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Topoisomerase", "inhibitors", "have", "been", "developed", "in", "a", "variety", "of", "clinical", "applications", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "investigated", "the", "inhibitory", "effect", "of", "evodiamine", "on", "E", ".", "coli", "topoisomerase", "I", ",", "which", "may", "lead", "to", "an", "anti", "-", "bacterial", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Evodiamine", "inhibits", "the", "supercoiled", "plasmid", "DNA", "relaxation", "that", "is", "catalyzed", "by", "E", ".", "coli", "topoisomerase", "I", ",", "and", "computer", "-", "aided", "docking", "has", "shown", "that", "the", "Arg161", "and", "Asp551", "residues", "of", "topoisomerase", "I", "interact", "with", "evodiamine", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "We", "investigated", "the", "bactericidal", "effect", "of", "evodiamine", "against", "multidrug", "-", "resistant", "Klebsiella", "pneumoniae", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Evodiamine", "showed", "a", "significantly", "lower", "minimal", "inhibitory", "concentration", "value", "(", "MIC", "128", "micro", "g", "/", "mL", ")", "compared", "with", "antibiotics", "(", ">", "512", "micro", "g", "/", "mL", ")", "against", "the", "clinical", "isolate", "of", "K", ".", "pneumoniae", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "suggested", "that", "evodiamine", "is", "a", "potential", "agent", "against", "drug", "-", "resistant", "bacteria", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Derivation", "of", "a", "benchmark", "for", "freshwater", "ionic", "strength", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Because", "increased", "ionic", "strength", "has", "caused", "deleterious", "ecological", "changes", "in", "freshwater", "streams", ",", "thresholds", "for", "effects", "are", "needed", "to", "inform", "resource", "-", "management", "decisions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "particular", ",", "effluents", "from", "surface", "coal", "mining", "raise", "the", "ionic", "strength", "of", "receiving", "streams", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "authors", "developed", "an", "aquatic", "life", "benchmark", "for", "specific", "conductance", "as", "a", "measure", "of", "ionic", "strength", "that", "is", "expected", "to", "prevent", "the", "local", "extirpation", "of", "95", "%", "of", "species", "from", "neutral", "to", "alkaline", "waters", "containing", "a", "mixture", "of", "dissolved", "ions", "in", "which", "the", "mass", "of", "SO", "(", "4", ")", "2", "-", "+", "HCO", "(", "3", ")", "-", ">=", "Cl", "(", "-", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]