extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "Extirpation", "concentrations", "of", "specific", "conductance", "were", "estimated", "from", "the", "presence", "and", "absence", "of", "benthic", "invertebrate", "genera", "from", "2", ",", "210", "stream", "samples", "in", "West", "Virginia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "extirpation", "concentration", "is", "the", "95th", "percentile", "of", "the", "distribution", "of", "the", "probability", "of", "occurrence", "of", "a", "genus", "with", "respect", "to", "specific", "conductance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "a", "region", "with", "a", "background", "of", "116", "micro", "S", "/", "cm", ",", "the", "5th", "percentile", "of", "the", "species", "sensitivity", "distribution", "of", "extirpation", "concentrations", "for", "163", "genera", "is", "300", "micro", "S", "/", "cm", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Because", "the", "benchmark", "is", "not", "protective", "of", "all", "genera", "and", "protects", "against", "extirpation", "rather", "than", "reduction", "in", "abundance", ",", "this", "level", "may", "not", "fully", "protect", "sensitive", "species", "or", "higher", "-", "quality", ",", "exceptional", "waters", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hypoxia", "-", "response", "element", "(", "HRE", ")", "-", "directed", "transcriptional", "regulation", "of", "the", "rat", "lysyl", "oxidase", "gene", "in", "response", "to", "cobalt", "and", "cadmium", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Lysyl", "oxidase", "(", "LO", ")", "catalyzes", "crosslink", "of", "collagen", ",", "elastin", ",", "and", "histone", "H1", ",", "stabilizing", "the", "extracellular", "matrix", "and", "cell", "nucleus", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "enzyme", "displays", "dual", "functions", "for", "tumorigenesis", ",", "i", ".", "e", ".", ",", "as", "a", "tumor", "suppressor", "inactivating", "the", "ras", "oncogene", "and", "as", "a", "tumor", "promoter", "enhancing", "malignant", "cell", "metastasis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "elucidate", "LO", "transcriptional", "regulation", ",", "we", "have", "cloned", "the", "804", "base", "pair", "region", "upstream", "of", "the", "translation", "start", "site", "(", "ATG", ")", "of", "the", "rat", "LO", "gene", "with", "the", "maximal", "promoter", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Computer", "analysis", "indicated", "that", "at", "least", "four", "hypoxia", "-", "response", "element", "(", "HRE", ")", "consensuses", "(", "5", "'", "-", "ACGTG", "-", "3", "'", ")", "exist", "in", "the", "cloned", "LO", "promoter", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Treatment", "of", "rat", "lung", "fibroblasts", "(", "RFL6", ")", "with", "CoCl2", "(", "Co", ",", "10", "-", "100", "mu", "M", ")", ",", "a", "chemical", "hypoxia", "reagent", ",", "enhanced", "LO", "mRNA", "expression", "and", "promoter", "activities", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Overexpression", "of", "LO", "was", "associated", "with", "upregulation", "of", "hypoxia", "-", "inducible", "factor", "(", "HIF", ")", "-", "1", "alpha", "at", "mRNA", "levels", "in", "cobalt", "(", "Co", ")", "-", "treated", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "LO", "is", "a", "hypoxia", "-", "responsive", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dominant", "negative", "-", "HIF", "-", "1", "alpha", "inhibited", "LO", "promoter", "activities", "stimulated", "by", "Co", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Electrophoretic", "mobility", "shift", ",", "oligonucleotide", "competition", ",", "and", "in", "vitro", "translated", "HIF", "-", "1", "alpha", "binding", "assays", "indicated", "that", "only", "one", "HRE", "mapped", "at", "-", "387", "/", "-", "383", "relative", "to", "ATG", "was", "functionally", "active", "among", "four", "consensuses", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Site", "-", "directed", "mutation", "of", "this", "HRE", "significantly", "diminished", "the", "Co", "-", "induced", "and", "LO", "promoter", "-", "directed", "expression", "of", "the", "reporter", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cadmium", "(", "Cd", ")", ",", "an", "inducer", "of", "reactive", "oxygen", "species", ",", "inhibited", "HIF", "-", "1", "alpha", "mRNA", "expression", "and", "HIF", "-", "1", "alpha", "binding", "to", "the", "LO", "gene", "in", "Co", "-", "treated", "cells", "as", "revealed", "by", "RT", "-", "PCR", "and", "ChIP", "assays", ",", "respectively", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "modulation", "of", "the", "HRE", "activity", "by", "Co", "and", "Cd", "plays", "a", "critical", "role", "in", "LO", "gene", "transactivation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Identifying", "protein", "interaction", "subnetworks", "by", "a", "bagging", "Markov", "random", "field", "-", "based", "method", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Identification", "of", "differentially", "expressed", "subnetworks", "from", "protein", "-", "protein", "interaction", "(", "PPI", ")", "networks", "has", "become", "increasingly", "important", "to", "our", "global", "understanding", "of", "the", "molecular", "mechanisms", "that", "drive", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Several", "methods", "have", "been", "proposed", "for", "PPI", "subnetwork", "identification", ",", "but", "the", "dependency", "among", "network", "member", "genes", "is", "not", "explicitly", "considered", ",", "leaving", "many", "important", "hub", "genes", "largely", "unidentified", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "present", "a", "new", "method", ",", "based", "on", "a", "bagging", "Markov", "random", "field", "(", "BMRF", ")", "framework", ",", "to", "improve", "subnetwork", "identification", "for", "mechanistic", "studies", "of", "breast", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "method", "follows", "a", "maximum", "a", "posteriori", "principle", "to", "form", "a", "novel", "network", "score", "that", "explicitly", "considers", "pairwise", "gene", "interactions", "in", "PPI", "networks", ",", "and", "it", "searches", "for", "subnetworks", "with", "maximal", "network", "scores", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "improve", "their", "robustness", "across", "data", "sets", ",", "a", "bagging", "scheme", "based", "on", "bootstrapping", "samples", "is", "implemented", "to", "statistically", "select", "high", "confidence", "subnetworks", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "first", "compared", "the", "BMRF", "-", "based", "method", "with", "existing", "methods", "on", "simulation", "data", "to", "demonstrate", "its", "improved", "performance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "then", "applied", "our", "method", "to", "breast", "cancer", "data", "to", "identify", "PPI", "subnetworks", "associated", "with", "breast", "cancer", "progression", "and", "/", "or", "tamoxifen", "resistance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "experimental", "results", "show", "that", "not", "only", "an", "improved", "prediction", "performance", "can", "be", "achieved", "by", "the", "BMRF", "approach", "when", "tested", "on", "independent", "data", "sets", ",", "but", "biologically", "meaningful", "subnetworks", "can", "also", "be", "revealed", "that", "are", "relevant", "to", "breast", "cancer", "and", "tamoxifen", "resistance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "G4LDB", ":", "a", "database", "for", "discovering", "and", "studying", "G", "-", "quadruplex", "ligands", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "G", "-", "quadruplex", "ligands", "database", "(", "G4LDB", ",", "http", ":", "/", "/", "www", ".", "g4ldb", ".", "org", ")", "provides", "a", "unique", "collection", "of", "reported", "G", "-", "quadruplex", "ligands", "to", "streamline", "ligand", "/", "drug", "discovery", "targeting", "G", "-", "quadruplexes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "G", "-", "quadruplexes", "are", "guanine", "-", "rich", "nucleic", "acid", "sequences", "in", "human", "telomeres", "and", "gene", "promoter", "regions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "is", "a", "growing", "recognition", "for", "their", "profound", "roles", "in", "a", "wide", "spectrum", "of", "diseases", ",", "such", "as", "cancer", ",", "diabetes", "and", "cardiovascular", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ligands", "that", "affect", "the", "structure", "and", "activity", "of", "G", "-", "quadruplexes", "can", "shed", "light", "on", "the", "search", "for", "G", "-", "quadruplex", "-", "targeting", "drugs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "we", "built", "the", "G4LDB", "to", "(", "i", ")", "compile", "a", "data", "set", "covering", "various", "physical", "properties", "and", "3D", "structure", "of", "G", "-", "quadruplex", "ligands", ";", "(", "ii", ")", "provide", "Web", "-", "based", "tools", "for", "G", "-", "quadruplex", "ligand", "design", ";", "and", "(", "iii", ")", "to", "facilitate", "the", "discovery", "of", "novel", "therapeutic", "and", "diagnostic", "agents", "targeting", "G", "-", "quadruplexes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "G4LDB", "currently", "contains", ">", "800", "G", "-", "quadruplex", "ligands", "with", "~", "4000", "activity", "records", ",", "which", ",", "to", "our", "knowledge", ",", "is", "the", "most", "extensive", "collection", "of", "its", "kind", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "offers", "a", "user", "friendly", "interface", "that", "can", "meet", "a", "variety", "of", "data", "inquiries", "from", "researchers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "example", ",", "ligands", "can", "be", "searched", "for", "by", "name", ",", "molecular", "properties", ",", "structures", ",", "ligand", "activities", "and", "so", "on", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Building", "on", "the", "reported", "data", ",", "the", "database", "also", "provides", "an", "online", "ligand", "design", "module", "that", "can", "predict", "ligand", "binding", "affinity", "in", "real", "time", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Laminar", "silk", "scaffolds", "for", "aligned", "tissue", "fabrication", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "3D", "-", "biomaterial", "scaffolds", "with", "aligned", "architecture", "are", "of", "vital", "importance", "in", "tissue", "regeneration", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "generic", "method", "is", "demonstrated", "to", "produce", "aligned", "biomaterial", "scaffolds", "using", "the", "physics", "of", "directional", "ice", "freezing", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Homogeneously", "aligned", "3D", "silk", "scaffolds", "with", "high", "porosity", "and", "alignment", "are", "prepared", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "method", "can", "be", "adapted", "to", "a", "wide", "range", "of", "polymers", "and", "is", "devoid", "of", "any", "chemical", "reactions", ",", "thus", "avoiding", "potential", "complications", "associated", "with", "by", "-", "products", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mechanical", "properties", "and", "cellular", "responses", "with", "chondrocytes", "and", "bone", "-", "marrow", "-", "derived", "hMSCs", "are", "studied", ",", "assessing", "survival", ",", "proliferation", ",", "and", "differentiation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "vivo", "tests", "suggest", "biocompatibility", "of", "the", "matrices", "for", "future", "tissue", "engineering", "applications", ",", "specifically", "in", "areas", "where", "high", "cellular", "alignment", "is", "needed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Enantiomeric", "discrimination", "of", "isoxazoline", "fused", "beta", "-", "amino", "acid", "derivatives", "using", "(", "18", "-", "crown", "-", "6", ")", "-", "2", ",", "3", ",", "11", ",", "12", "-", "tetracarboxylic", "acid", "as", "a", "chiral", "NMR", "solvating", "agent", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "(", "18", "-", "Crown", "-", "6", ")", "-", "2", ",", "3", ",", "11", ",", "12", "-", "tetracarboxylic", "acid", "is", "a", "useful", "chiral", "NMR", "solvating", "agent", "for", "isoxazoline", "-", "fused", "beta", "-", "amino", "acid", "derivatives", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Isoxazoline", "substrates", "are", "analyzed", "as", "their", "hydrochloride", "salts", "in", "methanol", "-", "d", "(", "4", ")", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "crown", "ether", "and", "substrate", "associate", "through", "the", "formation", "of", "three", "hydrogen", "bonds", "between", "the", "protonated", "amine", "and", "crown", "ether", "oxygen", "atoms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Enantiomeric", "discrimination", "is", "observed", "for", "two", "or", "more", "resonances", "of", "every", "substrate", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "At", "least", "one", "of", "these", "resonances", "is", "free", "of", "overlap", "with", "other", "resonances", "in", "the", "spectrum", "and", "has", "large", "enough", "enantiomeric", "discrimination", "to", "enable", "the", "determination", "of", "enantiomeric", "purity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "2D", "COSY", "methods", "can", "be", "used", "to", "identify", "additional", "resonances", "that", "exhibit", "enantiomeric", "discrimination", "in", "the", "NMR", "spectrum", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Effects", "of", "mutated", "pregnancy", "-", "associated", "plasma", "protein", "-", "a", "on", "atherosclerotic", "lesion", "development", "in", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pregnancy", "-", "associated", "plasma", "protein", "-", "A", "(", "PAPP", "-", "A", ")", "is", "a", "large", "multidomain", "metalloprotease", "involved", "in", "cleavage", "of", "IGF", "binding", "protein", "(", "IGFBP", ")", "-", "4", "and", "-", "5", "thereby", "causing", "release", "of", "bioactive", "IGF", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Individual", "domains", "of", "PAPP", "-", "A", "have", "been", "characterized", "in", "vitro", ",", "including", "the", "metzincin", "proteolytic", "domain", "important", "for", "IGFBP", "proteolytic", "activity", ",", "short", "consensus", "repeats", "critical", "for", "cell", "surface", "association", ",", "and", "Lin", "-", "12", "/", "Notch", "repeat", "module", "demonstrated", "to", "determine", "IGFBP", "substrate", "specificity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "test", "the", "hypothesis", "that", "specific", "cleavage", "of", "IGFBP", "-", "4", "by", "PAPP", "-", "A", "in", "close", "proximity", "to", "the", "cell", "surface", "is", "required", "for", "development", "of", "lesions", "in", "a", "murine", "model", "of", "atherosclerosis", ",", "the", "following", "PAPP", "-", "A", "transgenic", "(", "Tg", ")", "mice", "were", "generated", ":", "Tg", "(", "E483A", ")", ",", "which", "lacks", "all", "PAPP", "-", "A", "proteolytic", "activity", ";", "Tg", "(", "D1499A", ")", ",", "which", "selectively", "lacks", "proteolytic", "activity", "against", "IGFBP", "-", "4", ";", "and", "Tg", "(", "K1296A", "/", "K1316A", ")", ",", "in", "which", "cell", "surface", "binding", "is", "compromised", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Following", "cross", "-", "breeding", "with", "apolipoprotein", "E", "(", "ApoE", ")", "knockout", "(", "KO", ")", "mice", ",", "ApoE", "KO", "/", "Tg", "mice", "were", "fed", "a", "high", "-", "fat", "diet", "to", "promote", "aortic", "lesion", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Lesion", "area", "was", "increased", "2", "-", "fold", "in", "aortas", "from", "ApoE", "KO", "/", "Tg", "wild", "-", "type", "compared", "with", "ApoE", "KO", "mice", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "there", "was", "no", "significant", "increase", "in", "the", "lesion", "area", "in", "any", "of", "the", "ApoE", "KO", "/", "Tg", "mutant", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "conclude", "that", "PAPP", "-", "A", "proteolytic", "activity", "is", "required", "for", "the", "lesion", "-", "promoting", "effect", "of", "PAPP", "-", "A", "and", "that", "its", "specificity", "must", "be", "directed", "against", "IGFBP", "-", "4", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "our", "data", "demonstrate", "that", "cleavage", "of", "IGFBP", "-", "4", "at", "a", "distance", "from", "the", "cell", "surface", ",", "and", "hence", "from", "the", "IGF", "receptor", ",", "is", "not", "effective", "in", "promoting", "the", "development", "of", "the", "atherosclerotic", "lesions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "PAPP", "-", "A", "exerts", "its", "effect", "while", "bound", "to", "the", "cell", "surface", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Does", "catch", "and", "release", "affect", "the", "mating", "system", "and", "individual", "reproductive", "success", "of", "wild", "Atlantic", "salmon", "(", "Salmo", "salar", "L", ".", ")", "?" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "documented", "the", "breeding", "system", "of", "a", "wild", "population", "of", "Atlantic", "salmon", "(", "Salmo", "salar", "L", ".", ")", "by", "genetically", "sampling", "every", "returning", "adult", "and", "assessed", "the", "determinants", "of", "individual", "fitness", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "then", "quantified", "the", "impacts", "of", "catch", "and", "release", "(", "C", "&", "R", ")", "on", "mating", "and", "reproductive", "success", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "sexes", "showed", "high", "variance", "in", "individual", "reproductive", "success", ",", "and", "the", "estimated", "standardized", "variance", "was", "higher", "for", "males", "(", "2", ".", "86", ")", "than", "for", "females", "(", "0", ".", "73", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "a", "weak", "positive", "relationship", "between", "body", "size", "and", "fitness", "and", "observed", "that", "fitness", "was", "positively", "correlated", "with", "the", "number", "of", "mates", ",", "especially", "in", "males", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mature", "male", "parr", "sired", "44", "%", "of", "the", "analysed", "offspring", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "impact", "of", "C", "&", "R", "on", "the", "number", "of", "offspring", "was", "size", "dependent", ",", "as", "the", "reproductive", "success", "of", "larger", "fish", "was", "more", "impaired", "than", "smaller", "ones", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Also", ",", "there", "was", "an", "interactive", "negative", "effect", "of", "water", "temperature", "and", "air", "exposure", "time", "on", "reproductive", "success", "of", "C", "&", "R", "salmon", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "improves", "our", "understanding", "of", "the", "complex", "reproductive", "biology", "of", "the", "Atlantic", "salmon", "and", "is", "the", "first", "to", "investigate", "the", "impact", "of", "C", "&", "R", "on", "reproductive", "success", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "study", "expands", "the", "management", "toolbox", "of", "appropriate", "C", "&", "R", "practices", "that", "promote", "conservation", "of", "salmon", "populations", "and", "limit", "negative", "impacts", "on", "mating", "and", "reproductive", "success", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Effective", "targeting", "of", "A", "beta", "to", "macrophages", "by", "sonochemically", "prepared", "surface", "-", "modified", "protein", "microspheres", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Imbalanced", "homeostasis", "and", "oligomerization", "of", "the", "amyloid", "-", "beta", "(", "A", "beta", ")", "peptide", "in", "the", "brain", "are", "hallmarks", "of", "Alzheimer", "'", "s", "disease", "(", "AD", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Microglia", "and", "macrophages", "play", "a", "critical", "role", "in", "the", "etiology", "of", "AD", "either", "by", "clearing", "A", "beta", "from", "the", "brain", "or", "inducing", "inflammation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recent", "evidence", "suggests", "that", "clearance", "of", "A", "beta", "by", "microglia", "/", "macrophages", "via", "the", "phagocytic", "pathway", "is", "defective", "in", "AD", ",", "which", "can", "contribute", "to", "the", "accumulation", "of", "A", "beta", "in", "the", "brain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "recently", "demonstrated", "that", "protein", "microspheres", "modified", "at", "their", "surface", "with", "multiple", "copies", "of", "an", "A", "beta", "-", "recognition", "motif", "can", "strongly", "bind", "A", "beta", ",", "inhibit", "its", "aggregation", ",", "and", "directly", "reduce", "its", "toxicity", "by", "sequestering", "it", "from", "the", "medium", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "describe", "how", "microsphere", "-", "bound", "A", "beta", "can", "stimulate", "microglial", "cells", "and", "be", "phagocytosed", "through", "a", "mechanism", "that", "is", "distinct", "from", "that", "of", "A", "beta", "removal", "and", ",", "thus", ",", "contribute", "to", "the", "clearance", "of", "A", "beta", ",", "even", "by", "defective", "microglial", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "phagocytosis", "was", "most", "effective", ",", "with", "microspheres", "having", "a", "diameter", "of", "<", "1", "mu", "m", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "introduction", "of", "polyethylene", "glycol", "to", "the", "surface", "of", "the", "microspheres", "changed", "the", "kinetics", "of", "the", "phagocytosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "while", "aggregated", "A", "beta", "induced", "a", "significant", "inflammatory", "response", "that", "was", "manifested", "by", "the", "release", "of", "TNF", "-", "alpha", ",", "the", "microsphere", "-", "bound", "A", "beta", "dramatically", "reduced", "the", "amount", "of", "cytokine", "released", "from", "microglial", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Diversity", "patterns", "of", "uncultured", "Haptophytes", "unravelled", "by", "pyrosequencing", "in", "Naples", "Bay", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Haptophytes", "are", "a", "key", "phylum", "of", "marine", "protists", ",", "including", "~", "300", "described", "morphospecies", "and", "80", "morphogenera", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "used", "454", "pyrosequencing", "on", "large", "subunit", "ribosomal", "DNA", "(", "LSU", "rDNA", ")", "fragments", "to", "assess", "the", "diversity", "from", "size", "-", "fractioned", "plankton", "samples", "collected", "in", "the", "Bay", "of", "Naples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "group", "-", "specific", "primer", "set", "targeting", "the", "LSU", "rDNA", "D1", "/", "D2", "region", "was", "designed", "to", "amplify", "Haptophyte", "sequences", "from", "nucleic", "acid", "extracts", "(", "total", "DNA", "or", "RNA", ")", "of", "two", "size", "fractions", "(", "0", ".", "8", "-", "3", "or", "3", "-", "20", "mu", "m", ")", "and", "two", "sampling", "depths", "[", "subsurface", ",", "at", "1", "m", ",", "or", "deep", "chlorophyll", "maximum", "(", "DCM", ")", "at", "23", "m", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "454", "reads", "were", "identified", "using", "a", "database", "covering", "the", "entire", "Haptophyta", "diversity", "currently", "sequenced", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "data", "set", "revealed", "several", "hundreds", "of", "Haptophyte", "clusters", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "most", "of", "these", "clusters", "could", "not", "be", "linked", "to", "taxonomically", "known", "sequences", ":", "considering", "OTUs", "(", "97", "%", ")", "(", "clusters", "build", "at", "a", "sequence", "identity", "level", "of", "97", "%", ")", "on", "our", "global", "data", "set", ",", "less", "than", "1", "%", "of", "the", "reads", "clustered", "with", "sequences", "from", "cultures", ",", "and", "less", "than", "12", "%", "clustered", "with", "reference", "sequences", "obtained", "previously", "from", "cloning", "and", "Sanger", "sequencing", "of", "environmental", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "we", "highlighted", "a", "large", "uncharacterized", "environmental", "genetic", "diversity", ",", "which", "clearly", "shows", "that", "currently", "cultivated", "species", "poorly", "reflect", "the", "actual", "diversity", "present", "in", "the", "natural", "environment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Haptophyte", "community", "appeared", "to", "be", "significantly", "structured", "according", "to", "the", "depth", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "highest", "diversity", "and", "evenness", "were", "obtained", "in", "samples", "from", "the", "DCM", ",", "and", "samples", "from", "the", "large", "size", "fraction", "(", "3", "-", "20", "mu", "m", ")", "taken", "at", "the", "DCM", "shared", "a", "lower", "proportion", "of", "common", "OTUs", "(", "97", "%", ")", "with", "the", "other", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Reads", "from", "the", "species", "Chrysoculter", "romboideus", "were", "notably", "found", "at", "the", "DCM", ",", "while", "they", "could", "be", "detected", "at", "the", "subsurface", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "highest", "proportion", "of", "totally", "unknown", "OTUs", "(", "97", "%", ")", "was", "collected", "at", "the", "DCM", "in", "the", "smallest", "size", "fraction", "(", "0", ".", "8", "-", "3", "mu", "m", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Overall", ",", "this", "study", "emphasized", "several", "technical", "and", "theoretical", "barriers", "inherent", "to", "the", "exploration", "of", "the", "large", "and", "largely", "unknown", "diversity", "of", "unicellular", "eukaryotes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "octadecaneuropeptide", "stimulates", "somatolactin", "release", "from", "cultured", "goldfish", "pituitary", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "study", "aimed", "to", "investigate", "the", "distribution", "of", "the", "octadecaneuropeptide", "(", "ODN", ")", "in", "the", "goldfish", "brain", "and", "to", "look", "for", "a", "possible", "effect", "of", "ODN", "on", "somatolactin", "(", "SL", ")", "release", "from", "pituitary", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "discrete", "population", "of", "ODN", "-", "immunoreactive", "neurones", "was", "localised", "in", "the", "lateral", "part", "of", "the", "nucleus", "lateralis", "tuberis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "neurones", "sent", "projections", "through", "the", "neurohypophyseal", "tract", "towards", "the", "neurohypophysis", ",", "and", "nerve", "fibres", "were", "seen", "in", "the", "close", "vicinity", "of", "SL", "-", "producing", "cells", "in", "the", "pars", "intermedia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Incubation", "of", "cultured", "goldfish", "pituitary", "cells", "with", "graded", "concentrations", "of", "ODN", "(", "10", "(", "-", "9", ")", "-", "10", "(", "-", "5", ")", "m", ")", "induced", "a", "dose", "-", "dependent", "stimulation", "of", "SL", "-", "beta", ",", "but", "not", "SL", "-", "alpha", ",", "release", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ODN", "-", "evoked", "SL", "release", "was", "blocked", "by", "the", "metabotrophic", "endozepine", "receptor", "antagonist", "cyclo", "(", "1", "-", "8", ")", "[", "DLeu", "(", "5", ")", "]", "OP", "but", "was", "not", "affected", "by", "the", "central", "-", "type", "benzodiazepine", "receptor", "antagonist", "flumazenil", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "ODN", "-", "induced", "SL", "release", "was", "suppressed", "by", "treatment", "with", "the", "phospholipase", "C", "(", "PLC", ")", "inhibitor", "U", "-", "73122", "but", "not", "with", "the", "protein", "kinase", "A", "(", "PKA", ")", "inhibitor", "H", "-", "89", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "These", "results", "indicate", "that", ",", "in", "fish", ",", "ODN", "produced", "by", "hypothalamic", "neurones", "acts", "as", "a", "hypophysiotrophic", "neuropeptide", "stimulating", "SL", "release", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Extirpation", "concentrations", "of", "specific", "conductance", "were", "estimated", "from", "the", "presence", "and", "absence", "of", "benthic", "invertebrate", "genera", "from", "2", ",", "210", "stream", "samples", "in", "West", "Virginia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "extirpation", "concentration", "is", "the", "95th", "percentile", "of", "the", "distribution", "of", "the", "probability", "of", "occurrence", "of", "a", "genus", "with", "respect", "to", "specific", "conductance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "a", "region", "with", "a", "background", "of", "116", "micro", "S", "/", "cm", ",", "the", "5th", "percentile", "of", "the", "species", "sensitivity", "distribution", "of", "extirpation", "concentrations", "for", "163", "genera", "is", "300", "micro", "S", "/", "cm", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Because", "the", "benchmark", "is", "not", "protective", "of", "all", "genera", "and", "protects", "against", "extirpation", "rather", "than", "reduction", "in", "abundance", ",", "this", "level", "may", "not", "fully", "protect", "sensitive", "species", "or", "higher", "-", "quality", ",", "exceptional", "waters", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hypoxia", "-", "response", "element", "(", "HRE", ")", "-", "directed", "transcriptional", "regulation", "of", "the", "rat", "lysyl", "oxidase", "gene", "in", "response", "to", "cobalt", "and", "cadmium", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Lysyl", "oxidase", "(", "LO", ")", "catalyzes", "crosslink", "of", "collagen", ",", "elastin", ",", "and", "histone", "H1", ",", "stabilizing", "the", "extracellular", "matrix", "and", "cell", "nucleus", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "enzyme", "displays", "dual", "functions", "for", "tumorigenesis", ",", "i", ".", "e", ".", ",", "as", "a", "tumor", "suppressor", "inactivating", "the", "ras", "oncogene", "and", "as", "a", "tumor", "promoter", "enhancing", "malignant", "cell", "metastasis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "elucidate", "LO", "transcriptional", "regulation", ",", "we", "have", "cloned", "the", "804", "base", "pair", "region", "upstream", "of", "the", "translation", "start", "site", "(", "ATG", ")", "of", "the", "rat", "LO", "gene", "with", "the", "maximal", "promoter", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Computer", "analysis", "indicated", "that", "at", "least", "four", "hypoxia", "-", "response", "element", "(", "HRE", ")", "consensuses", "(", "5", "'", "-", "ACGTG", "-", "3", "'", ")", "exist", "in", "the", "cloned", "LO", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Treatment", "of", "rat", "lung", "fibroblasts", "(", "RFL6", ")", "with", "CoCl2", "(", "Co", ",", "10", "-", "100", "mu", "M", ")", ",", "a", "chemical", "hypoxia", "reagent", ",", "enhanced", "LO", "mRNA", "expression", "and", "promoter", "activities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Overexpression", "of", "LO", "was", "associated", "with", "upregulation", "of", "hypoxia", "-", "inducible", "factor", "(", "HIF", ")", "-", "1", "alpha", "at", "mRNA", "levels", "in", "cobalt", "(", "Co", ")", "-", "treated", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "LO", "is", "a", "hypoxia", "-", "responsive", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dominant", "negative", "-", "HIF", "-", "1", "alpha", "inhibited", "LO", "promoter", "activities", "stimulated", "by", "Co", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Electrophoretic", "mobility", "shift", ",", "oligonucleotide", "competition", ",", "and", "in", "vitro", "translated", "HIF", "-", "1", "alpha", "binding", "assays", "indicated", "that", "only", "one", "HRE", "mapped", "at", "-", "387", "/", "-", "383", "relative", "to", "ATG", "was", "functionally", "active", "among", "four", "consensuses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Site", "-", "directed", "mutation", "of", "this", "HRE", "significantly", "diminished", "the", "Co", "-", "induced", "and", "LO", "promoter", "-", "directed", "expression", "of", "the", "reporter", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cadmium", "(", "Cd", ")", ",", "an", "inducer", "of", "reactive", "oxygen", "species", ",", "inhibited", "HIF", "-", "1", "alpha", "mRNA", "expression", "and", "HIF", "-", "1", "alpha", "binding", "to", "the", "LO", "gene", "in", "Co", "-", "treated", "cells", "as", "revealed", "by", "RT", "-", "PCR", "and", "ChIP", "assays", ",", "respectively", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "modulation", "of", "the", "HRE", "activity", "by", "Co", "and", "Cd", "plays", "a", "critical", "role", "in", "LO", "gene", "transactivation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identifying", "protein", "interaction", "subnetworks", "by", "a", "bagging", "Markov", "random", "field", "-", "based", "method", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identification", "of", "differentially", "expressed", "subnetworks", "from", "protein", "-", "protein", "interaction", "(", "PPI", ")", "networks", "has", "become", "increasingly", "important", "to", "our", "global", "understanding", "of", "the", "molecular", "mechanisms", "that", "drive", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "methods", "have", "been", "proposed", "for", "PPI", "subnetwork", "identification", ",", "but", "the", "dependency", "among", "network", "member", "genes", "is", "not", "explicitly", "considered", ",", "leaving", "many", "important", "hub", "genes", "largely", "unidentified", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "present", "a", "new", "method", ",", "based", "on", "a", "bagging", "Markov", "random", "field", "(", "BMRF", ")", "framework", ",", "to", "improve", "subnetwork", "identification", "for", "mechanistic", "studies", "of", "breast", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "method", "follows", "a", "maximum", "a", "posteriori", "principle", "to", "form", "a", "novel", "network", "score", "that", "explicitly", "considers", "pairwise", "gene", "interactions", "in", "PPI", "networks", ",", "and", "it", "searches", "for", "subnetworks", "with", "maximal", "network", "scores", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "improve", "their", "robustness", "across", "data", "sets", ",", "a", "bagging", "scheme", "based", "on", "bootstrapping", "samples", "is", "implemented", "to", "statistically", "select", "high", "confidence", "subnetworks", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "first", "compared", "the", "BMRF", "-", "based", "method", "with", "existing", "methods", "on", "simulation", "data", "to", "demonstrate", "its", "improved", "performance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "then", "applied", "our", "method", "to", "breast", "cancer", "data", "to", "identify", "PPI", "subnetworks", "associated", "with", "breast", "cancer", "progression", "and", "/", "or", "tamoxifen", "resistance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "The", "experimental", "results", "show", "that", "not", "only", "an", "improved", "prediction", "performance", "can", "be", "achieved", "by", "the", "BMRF", "approach", "when", "tested", "on", "independent", "data", "sets", ",", "but", "biologically", "meaningful", "subnetworks", "can", "also", "be", "revealed", "that", "are", "relevant", "to", "breast", "cancer", "and", "tamoxifen", "resistance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "G4LDB", ":", "a", "database", "for", "discovering", "and", "studying", "G", "-", "quadruplex", "ligands", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "G", "-", "quadruplex", "ligands", "database", "(", "G4LDB", ",", "http", ":", "/", "/", "www", ".", "g4ldb", ".", "org", ")", "provides", "a", "unique", "collection", "of", "reported", "G", "-", "quadruplex", "ligands", "to", "streamline", "ligand", "/", "drug", "discovery", "targeting", "G", "-", "quadruplexes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "G", "-", "quadruplexes", "are", "guanine", "-", "rich", "nucleic", "acid", "sequences", "in", "human", "telomeres", "and", "gene", "promoter", "regions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "is", "a", "growing", "recognition", "for", "their", "profound", "roles", "in", "a", "wide", "spectrum", "of", "diseases", ",", "such", "as", "cancer", ",", "diabetes", "and", "cardiovascular", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ligands", "that", "affect", "the", "structure", "and", "activity", "of", "G", "-", "quadruplexes", "can", "shed", "light", "on", "the", "search", "for", "G", "-", "quadruplex", "-", "targeting", "drugs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "we", "built", "the", "G4LDB", "to", "(", "i", ")", "compile", "a", "data", "set", "covering", "various", "physical", "properties", "and", "3D", "structure", "of", "G", "-", "quadruplex", "ligands", ";", "(", "ii", ")", "provide", "Web", "-", "based", "tools", "for", "G", "-", "quadruplex", "ligand", "design", ";", "and", "(", "iii", ")", "to", "facilitate", "the", "discovery", "of", "novel", "therapeutic", "and", "diagnostic", "agents", "targeting", "G", "-", "quadruplexes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "G4LDB", "currently", "contains", ">", "800", "G", "-", "quadruplex", "ligands", "with", "~", "4000", "activity", "records", ",", "which", ",", "to", "our", "knowledge", ",", "is", "the", "most", "extensive", "collection", "of", "its", "kind", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "offers", "a", "user", "friendly", "interface", "that", "can", "meet", "a", "variety", "of", "data", "inquiries", "from", "researchers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "example", ",", "ligands", "can", "be", "searched", "for", "by", "name", ",", "molecular", "properties", ",", "structures", ",", "ligand", "activities", "and", "so", "on", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Building", "on", "the", "reported", "data", ",", "the", "database", "also", "provides", "an", "online", "ligand", "design", "module", "that", "can", "predict", "ligand", "binding", "affinity", "in", "real", "time", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Laminar", "silk", "scaffolds", "for", "aligned", "tissue", "fabrication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "3D", "-", "biomaterial", "scaffolds", "with", "aligned", "architecture", "are", "of", "vital", "importance", "in", "tissue", "regeneration", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "generic", "method", "is", "demonstrated", "to", "produce", "aligned", "biomaterial", "scaffolds", "using", "the", "physics", "of", "directional", "ice", "freezing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Homogeneously", "aligned", "3D", "silk", "scaffolds", "with", "high", "porosity", "and", "alignment", "are", "prepared", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "method", "can", "be", "adapted", "to", "a", "wide", "range", "of", "polymers", "and", "is", "devoid", "of", "any", "chemical", "reactions", ",", "thus", "avoiding", "potential", "complications", "associated", "with", "by", "-", "products", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mechanical", "properties", "and", "cellular", "responses", "with", "chondrocytes", "and", "bone", "-", "marrow", "-", "derived", "hMSCs", "are", "studied", ",", "assessing", "survival", ",", "proliferation", ",", "and", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vivo", "tests", "suggest", "biocompatibility", "of", "the", "matrices", "for", "future", "tissue", "engineering", "applications", ",", "specifically", "in", "areas", "where", "high", "cellular", "alignment", "is", "needed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Enantiomeric", "discrimination", "of", "isoxazoline", "fused", "beta", "-", "amino", "acid", "derivatives", "using", "(", "18", "-", "crown", "-", "6", ")", "-", "2", ",", "3", ",", "11", ",", "12", "-", "tetracarboxylic", "acid", "as", "a", "chiral", "NMR", "solvating", "agent", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "(", "18", "-", "Crown", "-", "6", ")", "-", "2", ",", "3", ",", "11", ",", "12", "-", "tetracarboxylic", "acid", "is", "a", "useful", "chiral", "NMR", "solvating", "agent", "for", "isoxazoline", "-", "fused", "beta", "-", "amino", "acid", "derivatives", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Isoxazoline", "substrates", "are", "analyzed", "as", "their", "hydrochloride", "salts", "in", "methanol", "-", "d", "(", "4", ")", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "crown", "ether", "and", "substrate", "associate", "through", "the", "formation", "of", "three", "hydrogen", "bonds", "between", "the", "protonated", "amine", "and", "crown", "ether", "oxygen", "atoms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Enantiomeric", "discrimination", "is", "observed", "for", "two", "or", "more", "resonances", "of", "every", "substrate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "At", "least", "one", "of", "these", "resonances", "is", "free", "of", "overlap", "with", "other", "resonances", "in", "the", "spectrum", "and", "has", "large", "enough", "enantiomeric", "discrimination", "to", "enable", "the", "determination", "of", "enantiomeric", "purity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "2D", "COSY", "methods", "can", "be", "used", "to", "identify", "additional", "resonances", "that", "exhibit", "enantiomeric", "discrimination", "in", "the", "NMR", "spectrum", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Effects", "of", "mutated", "pregnancy", "-", "associated", "plasma", "protein", "-", "a", "on", "atherosclerotic", "lesion", "development", "in", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pregnancy", "-", "associated", "plasma", "protein", "-", "A", "(", "PAPP", "-", "A", ")", "is", "a", "large", "multidomain", "metalloprotease", "involved", "in", "cleavage", "of", "IGF", "binding", "protein", "(", "IGFBP", ")", "-", "4", "and", "-", "5", "thereby", "causing", "release", "of", "bioactive", "IGF", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Individual", "domains", "of", "PAPP", "-", "A", "have", "been", "characterized", "in", "vitro", ",", "including", "the", "metzincin", "proteolytic", "domain", "important", "for", "IGFBP", "proteolytic", "activity", ",", "short", "consensus", "repeats", "critical", "for", "cell", "surface", "association", ",", "and", "Lin", "-", "12", "/", "Notch", "repeat", "module", "demonstrated", "to", "determine", "IGFBP", "substrate", "specificity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "test", "the", "hypothesis", "that", "specific", "cleavage", "of", "IGFBP", "-", "4", "by", "PAPP", "-", "A", "in", "close", "proximity", "to", "the", "cell", "surface", "is", "required", "for", "development", "of", "lesions", "in", "a", "murine", "model", "of", "atherosclerosis", ",", "the", "following", "PAPP", "-", "A", "transgenic", "(", "Tg", ")", "mice", "were", "generated", ":", "Tg", "(", "E483A", ")", ",", "which", "lacks", "all", "PAPP", "-", "A", "proteolytic", "activity", ";", "Tg", "(", "D1499A", ")", ",", "which", "selectively", "lacks", "proteolytic", "activity", "against", "IGFBP", "-", "4", ";", "and", "Tg", "(", "K1296A", "/", "K1316A", ")", ",", "in", "which", "cell", "surface", "binding", "is", "compromised", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Following", "cross", "-", "breeding", "with", "apolipoprotein", "E", "(", "ApoE", ")", "knockout", "(", "KO", ")", "mice", ",", "ApoE", "KO", "/", "Tg", "mice", "were", "fed", "a", "high", "-", "fat", "diet", "to", "promote", "aortic", "lesion", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Lesion", "area", "was", "increased", "2", "-", "fold", "in", "aortas", "from", "ApoE", "KO", "/", "Tg", "wild", "-", "type", "compared", "with", "ApoE", "KO", "mice", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "there", "was", "no", "significant", "increase", "in", "the", "lesion", "area", "in", "any", "of", "the", "ApoE", "KO", "/", "Tg", "mutant", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "conclude", "that", "PAPP", "-", "A", "proteolytic", "activity", "is", "required", "for", "the", "lesion", "-", "promoting", "effect", "of", "PAPP", "-", "A", "and", "that", "its", "specificity", "must", "be", "directed", "against", "IGFBP", "-", "4", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "our", "data", "demonstrate", "that", "cleavage", "of", "IGFBP", "-", "4", "at", "a", "distance", "from", "the", "cell", "surface", ",", "and", "hence", "from", "the", "IGF", "receptor", ",", "is", "not", "effective", "in", "promoting", "the", "development", "of", "the", "atherosclerotic", "lesions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "PAPP", "-", "A", "exerts", "its", "effect", "while", "bound", "to", "the", "cell", "surface", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Does", "catch", "and", "release", "affect", "the", "mating", "system", "and", "individual", "reproductive", "success", "of", "wild", "Atlantic", "salmon", "(", "Salmo", "salar", "L", ".", ")", "?" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "documented", "the", "breeding", "system", "of", "a", "wild", "population", "of", "Atlantic", "salmon", "(", "Salmo", "salar", "L", ".", ")", "by", "genetically", "sampling", "every", "returning", "adult", "and", "assessed", "the", "determinants", "of", "individual", "fitness", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "then", "quantified", "the", "impacts", "of", "catch", "and", "release", "(", "C", "&", "R", ")", "on", "mating", "and", "reproductive", "success", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "sexes", "showed", "high", "variance", "in", "individual", "reproductive", "success", ",", "and", "the", "estimated", "standardized", "variance", "was", "higher", "for", "males", "(", "2", ".", "86", ")", "than", "for", "females", "(", "0", ".", "73", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "a", "weak", "positive", "relationship", "between", "body", "size", "and", "fitness", "and", "observed", "that", "fitness", "was", "positively", "correlated", "with", "the", "number", "of", "mates", ",", "especially", "in", "males", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mature", "male", "parr", "sired", "44", "%", "of", "the", "analysed", "offspring", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "impact", "of", "C", "&", "R", "on", "the", "number", "of", "offspring", "was", "size", "dependent", ",", "as", "the", "reproductive", "success", "of", "larger", "fish", "was", "more", "impaired", "than", "smaller", "ones", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Also", ",", "there", "was", "an", "interactive", "negative", "effect", "of", "water", "temperature", "and", "air", "exposure", "time", "on", "reproductive", "success", "of", "C", "&", "R", "salmon", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "improves", "our", "understanding", "of", "the", "complex", "reproductive", "biology", "of", "the", "Atlantic", "salmon", "and", "is", "the", "first", "to", "investigate", "the", "impact", "of", "C", "&", "R", "on", "reproductive", "success", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "study", "expands", "the", "management", "toolbox", "of", "appropriate", "C", "&", "R", "practices", "that", "promote", "conservation", "of", "salmon", "populations", "and", "limit", "negative", "impacts", "on", "mating", "and", "reproductive", "success", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Effective", "targeting", "of", "A", "beta", "to", "macrophages", "by", "sonochemically", "prepared", "surface", "-", "modified", "protein", "microspheres", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Imbalanced", "homeostasis", "and", "oligomerization", "of", "the", "amyloid", "-", "beta", "(", "A", "beta", ")", "peptide", "in", "the", "brain", "are", "hallmarks", "of", "Alzheimer", "'", "s", "disease", "(", "AD", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Microglia", "and", "macrophages", "play", "a", "critical", "role", "in", "the", "etiology", "of", "AD", "either", "by", "clearing", "A", "beta", "from", "the", "brain", "or", "inducing", "inflammation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recent", "evidence", "suggests", "that", "clearance", "of", "A", "beta", "by", "microglia", "/", "macrophages", "via", "the", "phagocytic", "pathway", "is", "defective", "in", "AD", ",", "which", "can", "contribute", "to", "the", "accumulation", "of", "A", "beta", "in", "the", "brain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "recently", "demonstrated", "that", "protein", "microspheres", "modified", "at", "their", "surface", "with", "multiple", "copies", "of", "an", "A", "beta", "-", "recognition", "motif", "can", "strongly", "bind", "A", "beta", ",", "inhibit", "its", "aggregation", ",", "and", "directly", "reduce", "its", "toxicity", "by", "sequestering", "it", "from", "the", "medium", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "describe", "how", "microsphere", "-", "bound", "A", "beta", "can", "stimulate", "microglial", "cells", "and", "be", "phagocytosed", "through", "a", "mechanism", "that", "is", "distinct", "from", "that", "of", "A", "beta", "removal", "and", ",", "thus", ",", "contribute", "to", "the", "clearance", "of", "A", "beta", ",", "even", "by", "defective", "microglial", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "phagocytosis", "was", "most", "effective", ",", "with", "microspheres", "having", "a", "diameter", "of", "<", "1", "mu", "m", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "introduction", "of", "polyethylene", "glycol", "to", "the", "surface", "of", "the", "microspheres", "changed", "the", "kinetics", "of", "the", "phagocytosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "while", "aggregated", "A", "beta", "induced", "a", "significant", "inflammatory", "response", "that", "was", "manifested", "by", "the", "release", "of", "TNF", "-", "alpha", ",", "the", "microsphere", "-", "bound", "A", "beta", "dramatically", "reduced", "the", "amount", "of", "cytokine", "released", "from", "microglial", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Diversity", "patterns", "of", "uncultured", "Haptophytes", "unravelled", "by", "pyrosequencing", "in", "Naples", "Bay", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Haptophytes", "are", "a", "key", "phylum", "of", "marine", "protists", ",", "including", "~", "300", "described", "morphospecies", "and", "80", "morphogenera", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "used", "454", "pyrosequencing", "on", "large", "subunit", "ribosomal", "DNA", "(", "LSU", "rDNA", ")", "fragments", "to", "assess", "the", "diversity", "from", "size", "-", "fractioned", "plankton", "samples", "collected", "in", "the", "Bay", "of", "Naples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "group", "-", "specific", "primer", "set", "targeting", "the", "LSU", "rDNA", "D1", "/", "D2", "region", "was", "designed", "to", "amplify", "Haptophyte", "sequences", "from", "nucleic", "acid", "extracts", "(", "total", "DNA", "or", "RNA", ")", "of", "two", "size", "fractions", "(", "0", ".", "8", "-", "3", "or", "3", "-", "20", "mu", "m", ")", "and", "two", "sampling", "depths", "[", "subsurface", ",", "at", "1", "m", ",", "or", "deep", "chlorophyll", "maximum", "(", "DCM", ")", "at", "23", "m", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "454", "reads", "were", "identified", "using", "a", "database", "covering", "the", "entire", "Haptophyta", "diversity", "currently", "sequenced", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "set", "revealed", "several", "hundreds", "of", "Haptophyte", "clusters", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "most", "of", "these", "clusters", "could", "not", "be", "linked", "to", "taxonomically", "known", "sequences", ":", "considering", "OTUs", "(", "97", "%", ")", "(", "clusters", "build", "at", "a", "sequence", "identity", "level", "of", "97", "%", ")", "on", "our", "global", "data", "set", ",", "less", "than", "1", "%", "of", "the", "reads", "clustered", "with", "sequences", "from", "cultures", ",", "and", "less", "than", "12", "%", "clustered", "with", "reference", "sequences", "obtained", "previously", "from", "cloning", "and", "Sanger", "sequencing", "of", "environmental", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "we", "highlighted", "a", "large", "uncharacterized", "environmental", "genetic", "diversity", ",", "which", "clearly", "shows", "that", "currently", "cultivated", "species", "poorly", "reflect", "the", "actual", "diversity", "present", "in", "the", "natural", "environment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Haptophyte", "community", "appeared", "to", "be", "significantly", "structured", "according", "to", "the", "depth", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "highest", "diversity", "and", "evenness", "were", "obtained", "in", "samples", "from", "the", "DCM", ",", "and", "samples", "from", "the", "large", "size", "fraction", "(", "3", "-", "20", "mu", "m", ")", "taken", "at", "the", "DCM", "shared", "a", "lower", "proportion", "of", "common", "OTUs", "(", "97", "%", ")", "with", "the", "other", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Reads", "from", "the", "species", "Chrysoculter", "romboideus", "were", "notably", "found", "at", "the", "DCM", ",", "while", "they", "could", "be", "detected", "at", "the", "subsurface", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "highest", "proportion", "of", "totally", "unknown", "OTUs", "(", "97", "%", ")", "was", "collected", "at", "the", "DCM", "in", "the", "smallest", "size", "fraction", "(", "0", ".", "8", "-", "3", "mu", "m", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Overall", ",", "this", "study", "emphasized", "several", "technical", "and", "theoretical", "barriers", "inherent", "to", "the", "exploration", "of", "the", "large", "and", "largely", "unknown", "diversity", "of", "unicellular", "eukaryotes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "octadecaneuropeptide", "stimulates", "somatolactin", "release", "from", "cultured", "goldfish", "pituitary", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "present", "study", "aimed", "to", "investigate", "the", "distribution", "of", "the", "octadecaneuropeptide", "(", "ODN", ")", "in", "the", "goldfish", "brain", "and", "to", "look", "for", "a", "possible", "effect", "of", "ODN", "on", "somatolactin", "(", "SL", ")", "release", "from", "pituitary", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "discrete", "population", "of", "ODN", "-", "immunoreactive", "neurones", "was", "localised", "in", "the", "lateral", "part", "of", "the", "nucleus", "lateralis", "tuberis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "neurones", "sent", "projections", "through", "the", "neurohypophyseal", "tract", "towards", "the", "neurohypophysis", ",", "and", "nerve", "fibres", "were", "seen", "in", "the", "close", "vicinity", "of", "SL", "-", "producing", "cells", "in", "the", "pars", "intermedia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Incubation", "of", "cultured", "goldfish", "pituitary", "cells", "with", "graded", "concentrations", "of", "ODN", "(", "10", "(", "-", "9", ")", "-", "10", "(", "-", "5", ")", "m", ")", "induced", "a", "dose", "-", "dependent", "stimulation", "of", "SL", "-", "beta", ",", "but", "not", "SL", "-", "alpha", ",", "release", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "ODN", "-", "evoked", "SL", "release", "was", "blocked", "by", "the", "metabotrophic", "endozepine", "receptor", "antagonist", "cyclo", "(", "1", "-", "8", ")", "[", "DLeu", "(", "5", ")", "]", "OP", "but", "was", "not", "affected", "by", "the", "central", "-", "type", "benzodiazepine", "receptor", "antagonist", "flumazenil", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "ODN", "-", "induced", "SL", "release", "was", "suppressed", "by", "treatment", "with", "the", "phospholipase", "C", "(", "PLC", ")", "inhibitor", "U", "-", "73122", "but", "not", "with", "the", "protein", "kinase", "A", "(", "PKA", ")", "inhibitor", "H", "-", "89", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "These", "results", "indicate", "that", ",", "in", "fish", ",", "ODN", "produced", "by", "hypothalamic", "neurones", "acts", "as", "a", "hypophysiotrophic", "neuropeptide", "stimulating", "SL", "release", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]