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bioRxiv 论文元数据集

此数据集收录了 bioRxiv 从 2013 年 11 月 16 日至 2025 年 3 月 17 日期间的所有论文的元数据信息(297,902篇)。要获取全文,请根据论文标题或 DOI 前往官方网站查找:https://www.biorxiv.org/ ,或使用官方 API 获取文献:https://api.biorxiv.org/

数据集字段

  • doi: 数字对象标识符。
  • title: 论文标题。
  • authors: 作者列表。
  • author_corresponding: 通讯作者。
  • author_corresponding_institution: 通讯作者所属机构。
  • date: 发表日期。
  • version: 版本信息。
  • type: 论文类型。
  • license: 许可信息。
  • category: 学科分类。
  • jatsxml: JATS XML 格式内容。
  • abstract: 摘要。
  • published: 发表状态。
  • server: 服务器信息。
  • index_level_0: 索引。

使用方法

您可以使用以下代码加载数据集:

import pandas as pd

# 使用 huggingface-cli 登录以访问此数据集
df = pd.read_parquet("hf://datasets/jackkuo/bioRxiv_meta/combined_biorxiv_data.parquet")

更新日志

  • 2025-03-16: 数据集更新,未来将每月更新一次。