Accession
stringlengths 8
11
| Organism_Name
stringlengths 10
53
| Submitters
stringlengths 4
2.42k
⌀ | Organization
stringlengths 3
234
⌀ | Org_location
stringlengths 3
24
⌀ | Release_Date
stringlengths 10
10
| Isolate
stringlengths 1
75
⌀ | Species
stringlengths 10
53
⌀ | Genus
stringlengths 7
22
⌀ | Family
stringlengths 10
19
⌀ | Molecule_type
stringclasses 14
values | Length
int64 5k
95.4k
| Sequence_Type
stringclasses 2
values | Publications
float64 1
134
⌀ | Geo_Location
stringlengths 3
88
⌀ | Country
stringlengths 3
32
⌀ | Host
stringlengths 3
64
⌀ | Isolation_Source
stringlengths 3
31
⌀ | Collection_Date
stringlengths 4
10
⌀ | BioSample
stringlengths 12
14
⌀ | BioProject
stringlengths 9
23
⌀ | GenBank_Title
stringlengths 22
320
| Sequence
stringlengths 5k
95.4k
| __index_level_0__
int64 39
112k
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AF079456.1
|
Onyong-nyong virus
|
Lanciotti,R.S., Ludwig,M.L., Rwaguma,E.B., Lutwama,J.J., Kram,T.M., Karabatsos,N., Cropp,B.C., Miller,B.R., Rwanuma,E.B.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-Borne Diseases
|
USA
|
1998-08-06
| null |
Onyong-nyong virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,822
|
GenBank
| 1
|
Uganda
|
Uganda
| null | null | null | null | null |
O'nyong-nyong virus strain SG650, complete genome
|
ATGGCTGCGTGACACACACACGCAGCTTACGGGTTTCATACTGCTCTACTCTGCATTGCAAGAGATTAAAGTACCCATCATGGATTCAGTGTATGTAGACATAGATGCTGACAGCGCGTTTCTGAAGGCGTTGCAGCGAGCATACCCCATGTTTGAGGTGGAACCAAAGCAGGTCACGCCAAATGACCATGCAAACGCTAGAGCATTTTCGCATCTAGCAATAAAACTGATAGAGCAGGAAATTGATCCAGACTCAACCATTCTAGACATTGGTCCTGCACCAGCTAGGAGGATGATGTCTGATAGAAAATACCACTGCGTCTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGACCCTGAGAGGCTCGCGAATTACGCGAGAAAACTTGCATCAGCCGCTGGAAAGGTGACAGATAAAAACATCTCCGGAAAAATTAATGATCTACAGGCTGTGATGGCCGTACCGAATATGGAAACATCCACATTCTGCCTACACACTGATGCTACATGCAAACAAAGAGGAGACGTCGCCATTTATCAAGACGTCTACGCCGTCCATGCACCTACCTCGCTGTACCACCAGGCGATCAAAGGAGTCCGCGTGGCATATTGGATAGGGTTCGATACGACACCTTTCATGTACAATGCAATGGCTGGCGCATACCCATCATATTCAACAAACTGGGCTGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAATATAGGGCTGTGTTCAACAGACCTATCTGAGGGTAGACGAGGCAAATTATCTATCATGAGAGGCAAAAAATTGAAGCCATGCGACCGAGTGTTATTCTCGGTCGGCTCAACACTCTACCCTGAAAGTCGCAAACTTTTACAAAGCTGGCATTTACCATCGGTATTCCACCTGAAGGGTAAACTCAGCTTCACCTGCCGCTGTGACACGATTGTCTCATGCGAAGGATACGTCGTCAAGAGAGTGACGATGAGTCCAGGCATCTACGGAAAGACATCGGGGTATGCTGTAACTCATCATGCCGACGGCTTCCTGATGTGCAAGACGACAGATACAGTAGACGGTGAAAGGGTATCCTTCTCCGTGTGTACTTACGTACCAGCTACTATCTGCGATCAGATGACTGGAATCCTTGCCACTGAGGTAACCCCAGAAGACGCACAGAAACTACTGGTTGGGCTAAACCAACGGATAGTGGTCAATGGCAGGACGCAACGCAATACAAACACCATGAAAAATTACTTGCTCCCAATAGTTGCTCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCCAAAGAATGTCGAAAGGACATGGAGGACGAAAAACTCTTGGGTGTCCGAGAGAGGACCTTAACATGCTGTTGCCTATGGGCATTCAGAAAGCATAAGACGCATACGGTGTACAAAAGACCGGATACCCAGTCAATCCAAAAGGTCCCTGCTGAATTTGACAGCTTCGTGATACCAAGCCTGTGGTCGTCAGGTTTATCAATCCCGCTGAGAACCAGAATCAAGTGGCTTTTGAGCAAAGCTCCAAAACACGAGCAACTACCACACAGCGGAAACGCAGAGGAAGCAGCTCAGGCTGAAATGGATGCAGCGGAAGAACGGGAGGCTGAGCTAACCCGAGAAGCTATGCCACCATTGCAAGCGACACAGGATGACGTTCAGGTAGAAATTGATGTAGAGCAACTTGAAGACCGAGCAGGAGCGGGCATAGTCGAAACACCAAGGGGAGCAATTAAAGTCACAGCCCAACCGTCAGACCGTGTTGTCGGAGAGTACTTAGTACTGACACCGCAGGCGGTCCTGCGCAGCCAAAAACTCAGTCTGATTCATGCGCTTGCGGAGCAGGTAAAAACGTGCACACATAGTGGGCGAGCAGGCAGGTACGCGGTTGAAGCATACGACGGGCGTGTTCTAGTGCCCTCGGGCTACGCGATACCCCAGGAAGATTTCCAGAGCTTAAGCGAAAGCGCCACTATGGTATTTAATGAGCGAGAGTTTGTGAACCGGAAGTTGCACCACATCGCCATGCACGGCCCAGCGCTGAACACCGATGAAGAGTCATACGAACTGGTAAGGGTTGAGAAAACAGAACACGAGTACGTCTATGACGTCGATCAGAAGAAATGCTGCAAGAGAGAGGAAGCAACAGGACTAGTGCTAGTAGGCGACTTAACTAGCCCACCATATCATGAGTTCGCCTACGAAGGACTAAAAATCCGCCCAGCATGTCCATACAAAACGGCGGTTATAGGTGTCTTCGGAGTACCGGGTTCCGGCAAGTCGGCTATAATCAAAAACCTGGTAACCAGGCAAGACTTGGTGACTAGTGGAAAAAAAGAAAACTGCCAAGAAATCTCCAATGATGTAATGCGGCAAAGGAAATTGGAGATATCTGCACGTACAGTCGACTCACTACTCCTGAATGGATGTAACAAGCCAGTGGAAGTACTGTACGTGGATGAGGCATTTGCTTGTCATTCGGGAACCCTGTTGGCACTGATAGCCATGGTTAGACCGCGTCAGAAGGTCGTACTTTGTGGCGACCCAAAGCAGTGCGGATTCTTCAATATGATGCAAATGAAGGTTAACTATAATCACAATATCTGCACACAGGTGTATCATAAAAGCATATCAAGGCGGTGTACACTGCCTGTAACAGCCATCGTGTCCTCGTTGCATTACGAGAGCAAGATGCGCACTACAAATGAGTACAACCAGCCAATCGTAGTGGATACTACGGGCATAACAAAACCAGAACCCGGGGACTTAGTGTTAACGTGTTTCCGGGGATGGGTTAAGCAGTTGCAAATAGACTACCGTGGAAACGAAGTCATGACAGCAGCTGCCTCTCAGGGGCTGACTAGAAAAGGTGTTTATGCAGTAAGGCAGAAAGTCAACGAAAACCCTCTGTATGCATCAACTTCAGAGCACGTTAACGTGTTATTGACACGCACAGAGGGCAAGTTGATATGGAAAACACTCTCGGGCGATCCATGGATAAAGATACTGCAGAACCCCCCAAAAGGGAACTTTAAGGCAACAATCAAGGAGTGGGAAGCGGAACACGCCTCCATTATGGCAGGAATATGCAATCACCAGATGGCTTTTGACACATTTCAGAACAAAGCTAATGTATGCTGGGCTAAATGCCTGGTCCCTATTCTTGACACCGCTGGAATCAAACTAAGTGACAGGCAGTGGTCTCAGATAGTGCAAGCTTTTAAAGAAGATAGGGCCTACTCTCCAGAAGTTGCACTGAATGAAATATGTACCCGCATATATGGGGTAGATCTGGACAGCGGACTATTTTCAAAGCCGCTGATATCCGTCTACTATGCAGACAACCACTGGGACAATAGACCAGGAGGAAAAATGTTCGGGTTCAACCCTGAGGTGGCACTTATGCTTGAAAAGAAATATCCCTTTACAAAAGGTAAGTGGAACATCAACAAGCAGATATGTATAACTACCAGAAAGGTTGACGAATTTAACCCCGAAACCAACATAATACCGGCCAACCGAAGACTGCCGCACTCACTCGTGGCTGAACACCATACAGTGAGAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTAAACAAAATCAACGGTCACCACATGTTGTTGGTTAGTGGTTATAATCTTATATTACCAACAAAAAGAGTCACCTGGGTAGCACCGTTAGGCACCAGAGGTGCAGACTACACATATAACCTGGAACTTGGTCTACCAGCCACACTAGGCAGATATGACCTGGTAGTTATCAATATCCATACTCCATTCCGCATACATCATTACCAGCAGTGTGTAGATCACGCAATGAAGCTCCAGATGCTAGGGGGGGACTCTCTACGGCTGTTAAAGCCAGGAGGTTCACTTCTGATTAGAGCTTACGGGTACGCCGACCGAACCAGTGAAAGGGTCATTAGCGTATTGGGACGCAAGTTCAGATCGTCCAGGGCTCTAAAACCTCAGTGCATCACGAGCAATACAGAAATGTTCTTCCTATTTAGCCGATTCGACAACGGAAGAAGGAACTTCACCACACATGTTATGAACAACCAGCTGAATGCAGTGTATGCAGGACTGGCCACTAGAGCGGGCTGTGCTCCGTCATACCGTGTGAAACGGATGGACATCGCGAAAAACACTGAGGAATGCGTGGTAAACGCCGCCAATCCACGCGGAGTACCAGGCGATGGAGTATGTAAAGCCGTGTATAGAAAATGGCCAGAATCATTCAGAAACAGTGCAACGCCAGTGGGTACTGCAAAGACAATCATGTGCGGTCAATACCCCGTCATCCACGCGGTAGGCCCAAACTTCTCAAACTATTCTGAGGCTGAAGGGGATAGGGAATTGGCTTCAGTGTATAGAGAAGTGGCGAAAGAAGTGTCTAGGCTAGGAGTGAGCAGTGTAGCCATCCCTTTGCTTTCAACCGGTGTGTACTCAGGAGGCAAAGATAGACTGCTGCAATCACTAAACCATCTTTTCACAGCGATGGATTCGACAGATGCAGATGTTGTCATCTATTGCAGGGATAAGGAATGGGAGAAGAAGATCACTGAAGCCATATCATTAAGATCCCAGGTAGAACTACTAGATGATCACATCTCAGTGGATTGCGACATTGTACGCGTTCATCCAGACAGCAGCTTGGCAGGCCGAAAGGGGTACAGCACAGTAGAGGGAGCACTCTACTCGTACCTAGAGGGAACAAGATTCCACCAAACTGCTGTAGATATGGCAGAAATATATACCATGTGGCCAAAACAAACTGAAGCCAATGAACAGGTCTGCCTATATGCTCTGGGGGAGAGCATAGAGTCAGTCAGGCAAAAATGTCCTGTAGACGACGCCGACGCCTCATTCCCTCCGAAAACAGTCCCGTGCCTATGCCGTTATGCCATGACGCCTGAACGAGTTGCACGCCTACGCATGAATCATACTACTAGCATCATAGTGTGCTCGTCTTTTCCACTGCCGAAGTACAAAATCGAGGGCGTGCAAAAAGTAAAATGTTCAAAAGCACTCTTGTTTGATCACAACGTACCGTCTCGAGTGAGCCCGAGAACGTACAGGCCTGCGGACGAAATCATACAGACACCTCAAATACCAACTGAAGCGTGCCAGGACGCACAATTCGTGCAGTCAATAACTGATGAAGCAGTGCCAGTTCCGTCAGACTTAGAGGCTTGTGACGCAACTATGGACTGGCCCTCTATCGACATCGTACCAACAAGACAAAGAAGCGACTCATTTGACAGCGAGTATAGTTCCAGAAGTAACATACAGCTGGTGACAGCGGACGTGCATGCACCAATGTACGCAAATTCGCTGGCGTCCAGCGGAGGTTCAGTGCTGTCGCTGTCCAGTGAACAAGCTCAGAACGGCATAATGATACTACCTGATTCAGAAGACACAGATAGTATAAGCAGAGTAAGCACACCGATCGCCCCACCCAGGAGACGTTTGGGAAGGACTATAAATGTGACTTGTGACGAGCGGGAAGGGAAAATACTCCCTATGGCCAGCGACAGGCTCTTCACTGCTAAGCCATACACTGTCGCACTGGGCGTATCAACAGCAGACATAACTGCGTACCCCATCCAGGCACCGCTAGGATCGACACAACCGCCTGCCCTCGAACAGATCACTTTCGGAGATTTCGCCGAAGGTGAAATAGACAACCTCCTGACAGGGGCATTGACATTTGGAGACTTCGAGCCAGGTGAAGTGGAAGAGCTGACGGATAGCGAGTGGTCAACATGCTCGGACACAGATGAAGAGTTATGACTAGACAGAGCAGGGGGTTACATATTCTCCTCTGACACTGGTCAAGGTCATCTACAGCAAAAATCAGTACGTCAAACGACGCTACCGGTAAACATTGTTGAAGAGGTCCACGAAGAGAAATGCTACCCACCTAAATTGGATGAGATCAAAGAGCAACTCTTACTTAAGAGACTCCAGGAGAGTGCTTCCACGGCTAACCGGAGTAGGTACCAATCTAGAAAAGTGGAAAACATGAAAGCCACGATTATCCACAGACTGAAAGAGGGTTGCAGGCTCTACTTGGCGTCAGATACACCGAGGGTCCCATCTTACCGAATCACATACCCGGCGCCGGTCTACTCGCCTTCAATCAGTATCAAATTGAATAACCCAGAGACCGCAGTAGCAGTGTGTAATGAGTTTTTGGCCAGAAACTATCCAACTGTGGCATCCTACCAAGTTACTGACGAGTACGACGCGTACTTGGACATGGTAGACGGGTCCGAAAGCTGCCTAGACAGAGCTACATTTAACCCGTCTAAACTCAGGAGTTACCCAAAACAACACTCTTACCACGCACCCACCATCAGAAGTGCAGTGCCATCACCATTCCAAAATACGTTGCAGAATGTCTTGGCAGCGGCCACAAAAAGAAACTGCAACGTAACGCAGATGAGGGAATTGCCCACTATGGACTCCGCAGTGTTTAACGTGGAGTGTTTTAAGAAGTACGCATGCAACCAAGAGTACTGGAGAGAGTTCGCCTCAAGCCCTATAAGGGTAACGACAGAGAATCTGACAATGTATGTGACAAAACTAAAGGGGCCTAAAGCGGCGGCACTCTTCGCAAAAACACACAACTTGCTGCCGCTACAAGAGGTACCAATGGACAGGTTTACAATGGACATGAAACGTGATGTAAAAGTGACACCAGGTACAAAGCACACCGAGGAAAGGCCGAAAGTACAGGTCATACAGGCAGCAGAACCGCTGGCAACAGCATATCTGTGTGGCATACACAGAGAGTTGGTAAGAAGACTAAATGCAGTTCTGCTACCAAATGTCCACACACTGTTCGATATGTCAGCCGAAGATTTCGATGCAATCATATCTACACATTTCAAACCGGGCGATGCTGTACTAGAAACCGATATAGCCTCATTTGACAAGAGTCAAGACGATTCGCTTGCGCTGACCGCCATGATGCTGCTAGAAGACCTTGGGGTAGACCAACCTATCCTGGACCTGATAGAAGCAGCATTCGGCGAAATATCCAGTTGCCATCTACCGACGGGCACGCGGTTTAAGTTCGGCGCAATGATGAAATCAGGCATGTTTCTAACCCTGTTTGTCAATACCCTCCTGAACATCACCATTGCTAGTCGGGTGCTAGAGGAGCGATTGACTACTTCAGCCTGTGCAGCATTCATTGGGGACGACAACATAATACATGGAGTTGTCTCTGACGCACTAATGGCTGCACGTTGTGCTACGTGGATGAACATGGAAGTGAAAATCATCGATGCAGTAGTGTCAGAGAAGGCGCCATACTTCTGCGGGGGATTTATCTTACACGACACGGTGACAGGCACGTCGTGCAGAGTAGCAGACCCTTTAAAGAGACTGTTCAAGTTAGGCAAACCTCTGGCAGCTGGAGACGAACAGGATGAGGACAGAAGACGTGCTCTGGCAGATGAGGTTACTAGATGGCAAAGAACCGGCTTAATCACAGAATTAGAAAAAGCAGTATACTCCAGGTATGAAGTACAAGGAATAACAGCCGTAATAACATCAATGGCTACCTTTGCGAGTAGCAAAGAAAACTTTAAAAAACTAAGAGGGCCCGTCGTAACCTTGTACGGTGGACCTAAATAGGTACGCACTACAGCTACCTACTTTGAGACAAACATCGCTAATAGCCATGGAGTTCATACCAGCACAAACTTATTATAACAGAAGATACCAGCCTAGACCTTGGACCCAACGCCCTACTATCCAGGTGATCAGGCCAAAACCACGCCGGAGCAGGCCTGCAGGACAACTCGCACAACTGATATCCGCAGTCAGCAGACTAGCACTGCGTACAGTTCCTCAGAAACCACGCCGGACCCGAAAAACTAAGAAGCAAAAACAAGTGAAGCAAGAACAACAGAGCACTAGGAACCAGAAGAAAAAGGCGCCGAAACAAAAGCAGACTCAAAAGAAAAAGAGACCAGGACGCAGGGAAAGGATGTGCATGAAGATTGAAAATGACTGCATCTTCGAAGTCAAACATGAAGGAAAAATAACGGGGTATGCATGCCTAGTAGGTGATAAGGTAATGAAACCAGCACACGTGAAAGGGACTATTGACAATGCAGACCTAGCGAAGTTGGCGTTCAAAAGATCATCCAAGTATGATCTAGAATGCGCACAGATACCAGTGCACATGAAATCGGACGCCTCAAAGTTCACCCATGAAAAACCAGAAGGCTACTATAACTGGCATCACGGAGCGGTACAGTATTCTGGAGGGAGGTTTACAATCCCTACAGGCGCGGGAAAGCCTGGGGACAGCGGAAGACCAATCTTTGACAACAAGGGGCGCGTCGTGGCTATTGTCCTAGGCGGGGCAAACGAAGGAACCAGGACAGCACTATCTGTAGTGACTTGGAATAAAGACATAGTCACGAAAATCACACCGGAGGGGTCAGTTGAATGGAGCCTTGCCCTCCCTGTCATGTGCCTGTTGGCAAACACAACCTTCCCATGCTCCCAACCGCCTTGCGCGCCGTGCTGCTACGAAAAGAAACCGGAAGAAACCTTGAGGATGCTGGAGGACAACGTCATGCAACCAGGGTACTACCAGTTACTCGATTCAGCATTGGCCTGCTCACAACATCGTCAAAGACGCAATGCAAGAGAAAACTTCAATGTCTACAAAGTCACTAGGCCGTACTTAGCCCACTGCCCTGACTGCGGGGAGGGACACTCATGTCACAGCCCAATAGCATTAGAACGGATCAGAAGTGAGGCAACAGATGGTACCTTGAAAATCCAGGTATCTCTGCAAATCGGAATAAAGACAGACGACAGCCACGATTGGACGAAGCTGCGGTATATGGATAGCCATACACCTGTGGATGCAGACCGATCTGGTTTGTTTGTCAGAACGTCAGCACCGTGCACCATCACGGGAACGATGGGACATTTTATACTAGCACGCTGTCCGAAAGGAGAGACGCTGACGGTAGGATTTGTAGACAGTAGAAGGATCAGTCACACATGCATGCACCCGTTCCACCACGAGCCGCCGCTGATAGGGAGAGAGAAGTTTCACTCCCGCCCACAGCATGGCAAAGAACTACCTTGCAGTACGTACGTCCATACCACAGCGGCCACTACTGAGGAAATAGAAGTGCATATGCCGCCAGATACCCCTGACTACACGCTAATGACACAGCAAGCGGGAAACGTTAAGATCACAGTTGACGGCCAGACAGTACGATACAAGTGCAAATGTGACGGCTCCAATGAAGGATTAATAACCACTGACAAAGTCATAAATAACTGCAAAGTAGACCAATGCCACACAGCAGTTACAAACCACAAGAAATGGCAATACAACTCACCGTTGACCCCGCGGAACTCCGAACAAGGAGATAGGAAAGGTAAAATCCACATCCCATTTCCACTGGTAAACACAACCTGCAGGGTACCAAAAGCAAGAAATCCGACCATCACATACGGTAAAAACAGAGTCACTCTGCTGTTGTATCCAGACCATCCAACACTCCTTTCGTATCGCTCCATGGGAAGGATCCCGGATTACCATGAAGAGTGGATAACAAGTAAGAAGGAAATAAGTATCACAGTACCAGCAGAAGGCTTAGAGGTCACATGGGGTAATAATGACCCATACAAATATTGGCCCCAACTGTCTACAAATGGTACCGCGCACGGGCACCCACATGAAATAATCCTCTATTACTATGAGCTGTACCCAACTACCACAATTGCTGTACTGGCTGCTGCATCTATCGTAGTGGCATCTTTGGTAAGTCTATCATTAGGCATGTGCATATGCGCGAGACGCAGGTGCATCACGCCGTATGAGCTAACTCCGGGAGCTACCATCCCGTTCCTCCTAGGTGTACTATGCTGTGTCAAGACTGCAAAAGCAGCATCGTACTACGAAGCTGCAACATACCTCTGGAATGAGCAACAACCATTATTTTGGTTACAGCTTTTAATCCCTCTGTCAGCTGCAATTGTTGCGTGTAATTGCCTAAAACTTTTACCATGCTGCTGCAAAACATTGACTTTTTTAGCCGTTATGAGCATCGGTGCCCGCACTGTGTCCGCGTACGAGCACGCAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTTGTTAGCAGACCAGGGTATAGCCCTATGGTCTTAGAAATGGAGCTACAGTCGGTCACTCTGGAACCAACATTGTTCTTGGACTACATCACGTGTGAGTATAAAACAATCACACCGTCCCCGTACGTAAAATGCTGTGGTACAGCTGAATGTAAGGCCAAGAACCTACCAGATTATAACTGCAAAGTATTCACAGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGAGGAGCATATTGCTTCTGTGACGCAGAGAACACACAACTCAGTGAGGCACACGTTGAGAAATCAGAATCATGCAAAACTGAGTTTGCATCAGCCTACAGAGCCCACACAGCTTCAGTATCAGCTAAACTACGTGTCTTTTACCAAGGGAATAATATCACTGTGTCTGCATACGCTAATGGTGATCACGCAGTCACGGTAAAGGACGCGAAGTTTGTCATCGGTCCACTATCGTCCGCCTGGTCACCATTTGATAATAAGATCGTGGTGTACAAAGGCGAAGTCTACAACATGGACTATCCACCTTTTGGCGCAGGGAGGCCAGGACAGTTCGGTGACATCCAGAGCCGCACGCCAGACAGCAAGGATGTCTATGCGAATACGCAGTTAATACTGCAAAGACCAGCGGCAGGAGCAATACACGTGCCTTACTCCCAGGCACCCTCGGGCTTTAAGTACTGGCTCAAAGAAAAAGGGGCATCATTGCAGCATACGGCACCATTTGGCTGTCAGATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCAGTGAACTGTGCAGTGGGCAACATACCAGTCTCCATTGACATTCCAGATGCAGCTTTCACCAGGGTCACTGACGCTCCTTCCGTCACAGACATGTCCTGTGAAGTGGCTTCGTGTACCCATTCATCTGATTTTGGAGGTGCCGCAGTTGTAAAGTACACAGCTAGTAAAAAGGGGAAATGCGCTGTGCACTCTTTAACAAACGCGGTCACTATCCGCGAACCTAACGTAGATGTCGAGGGAACAGCACAACTACAGATTGCCTTCTCGACCGCACTAGCTAGTGCTGAATTTAAGGTGCAGATCTGCTCCACACAGGTACACTGCTCAGCGACATGCCATCCTCCTAAAGATCACATAGTCAACTACCCGTCACCGCACACCACACTGGGAGTGCAGGACATCTCAACGACAGCTATGTCTTGGGTCCAGAAGATTACAGGAGGAGTGGGACTCGTGGTTGCTATAGCTGCTTTGATCTTAATCATAGTTCTCTGCGTATCGTTTAGCAGACACTAAAGCATACATGCCCCAAAGTAACATACTATACAGGTATACGTGCTCCCTGAGCAGCACAATATATGTATTATCTATAAAAGAAAAACAAAAACATAAAAATTATAAAATACAAAAGTATAAAAACAGGTATCAGTACCCCCTTAGAGGTACATCACTTAACCAGGTATTAGTGCCCCCTTAGAGGCACATCATATAACCAGGTATAGGTGCCCCCTTAGAGGCACACTAACAATAGGTATAAGTGCCCCCTTAGTGGCACACTAACCACCACAATTGGTAATATGAAGAGACGTAGGTATGAAGCTTCATAAAAGCTGCCGAACTTACTTTAAGATGTAGGCGTACCGAACTCTTCGACAATTCTCCGAACCCGCAGGGACGTAGGAGAAGTTATTTTGTTTTTAATATTTC
| 111,626
|
M20303.1
|
Onyong-nyong virus
|
Strauss,E.G., Levinson,R., Rice,C.M., Dalrymple,J., Strauss,J.H., Levinson,R.S.
| null | null |
1993-08-02
| null |
Onyong-nyong virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,835
|
GenBank
| 2
| null | null | null | null | null | null | null |
O'Nyong-nyong virus (Gulu strain) complete genome
|
ATAGCTGCGTGATACACACACGCAGCTTACGGGTTTCATACTGCTCTACTCTGCATTGCAAGAGATTAAAGTACCCATCATGGATTCAGTGTATGTAGACATAGATGCTGACAGCGCGTTTCTGAAGGCGTTGCAGCAAGCATACCCCATGTTTGAGGTGGAACCAAAGCAGGTCACGCCAAATGACCATGCAAACGCTAGAGCATTTTCGCATCTAGCAATAAAACTGATAGAGCAGGAAATTGATCCAGACTCAACCATTCTAGACATTGGTAGCGCACCAGCTAGGAGGATGATGTCTGATAGAAAATACCACTGCGTCTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGACCCTGAGAGGCTCGCGAATTACGCGAGAAAACTTGCGTCAGCCGCTGGAAAGGTGACAGATAAAAACATCTCCGGAAAAATTAATGATCTACAAGCTGTGATGGCCGTACCGAATATGGAAACATCCACATTCTGCCTACACACTGATGCTACATGCAAACAAAGAGGAGACGTCGCCATTTATCAAGACGTCTACGCCGTCCATGCACCTACCTCGCTGTACCATCAGGCGATTAAAGGAGTCCGCGTGGCATACTGGATAGGGTTCGATACGACACCTTTCATGTACAATGCAATGGCTGGCGCATACCCATCATATTCAACAAACTGGGCTGATGAGCAGGTACTGAAAGCTAAGAACATAGGGCTGTGTTCAACAGACCTATCTGAGGGTAGACGAGGCAAACTATCCATCATGAGAGGCAAAAAATTGAAGCCATGCGACCGAGTGCTATTCTCGGTCGGCTCAACACTCTACCCTGAAAGTCGTAAACTTCTACAAAGCTGGCATTTACCATCGGTATTTCATCTGAAGGGTAAACTCAGCTTCACCTGCCGCTGTGACACGATCGTCTCATGCGAAGGATACGTTGTCAAGAGAGTGACCATGAGTCCAGGCATCTACGGAAAGACATCGGGGTATGCTGTAACTCATCATGCCGGCGGCTTCCTGATGTGCAAGACGACAGATACAGTAGACGGCGAAAGGGTATCATTCTCCGTGTGTACTTACGTACCAGCTACTATCTGCGACCAGATGACTGGAATCCTTGCCACTGAGGTAACCCCAGAAGACGCACAGAAACTACTGGTTGGGCTAAACCAACGGATAGTGGTCAATGGCAGGACGCAACGTAATACAAACACCATGAAAAACTACCTGCTCCCAATAGTTGCTCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCCAAAGAATGTCGAAAGGACATGGAGGACGAAAAACTCTTGGGTGTCCGAGAGAGGACCTTAACGTGCTGTTGCCTATGGGCATTTAGAAAGCACAAGACGCATACGGTGTACAAAAGACCGGATACCCAGTCAATCCAAAAGGTCCCTGCCGAATTTGACAGCTTTGTGATACCAAGTCTGTGGTCGTCAGGTTTATCAATTCCGCTGAGAACCAGAATCAAGTGGCTCTTGAGCAAAGCTCCAAAATACGAGCAACTACCGCACAGCGGAAACGCCGAGGAAGCAGCCCAGGCTGAAACAGATGCGGTAGAAGAACAGGAGGCAGAGCTAACCCGAGAAGCTATGCCACCATTGCAGGCGACACAGGATGACATTCAGGTAGAAATTGATGTAGAGCAACTTGAAGACCGAGCAGGAGCGGGCATAGTCGAAACACCAAGAGGAGCAATCAAAGTCACAGCCCAACCGTCAGACCTTGTTGTCGGAGAGTACTTAGTACTGACACCGCAGGCGGTCCTGCGCAGCCAAAAACTCAGTCTGATTCACGCGCTTGCAGAGCAGGTAAAAACGTGCACACATAGTGGGCGAGCAGGCAGGTACGCGGTTGAAGCATACGATGGGCGTGTTCTAGTGCCCTCGGGCTACGCGATACCCCAGGAAGACTTCCAGAGCTTAAGCGAAAGTGCCACCATGGTATTTAACGAGCGAGAGTTTGTGAACCGGAAGTTACACCACATCGCCATGCACGGCCCAGCGCTGAACACTGATGAAGAGTCATATGAACTGGTAAGGGTAGAGAAAACAGAACACGAGTACGTCTATGACGTTGATCAGAAGAAATGTTGTAAGAGGGAGGAAGCAACAGGACTAGTGCTAGTAGGCGACTTAACTAGCCCACCATACCATGAGTTCGCCTACGAAGGACTAAAAATCCGCCCAGCATGTCCATACAAAACGGCAGTTATAGGTGTCTTCGGAGTACCGGGTTCTGGCAAGTCGGCTATAATCAAAAACCTGGTAACCAGGCAAGACTTGGTGACTAGTGGAAAAAAAGAAAACTGCCAAGAAATCTCCAATGACGTAATGCGGCAAAGGAAATTGGAGATATCTGCACGTACAGTCGACTCACTACTCCTGAATGGATGTAACAAGCCAGTGGAAGTACTGTACGTGGACGAGGCATTCGCTTGTCATTCGGGAACCCTGTTGGCACTGATAGCCATGGTTAGACCGCGTCAGAAGGTCGTACTTTGTGGCGACCCAAAGCAGTGCGGATTCTTCAATATGATGCAAATGAAGGTCAACTATAATCACAACATCTGCACACAGGTGTACCATAAAAGCATATCAAGGCGGTGTACACTGCCTGTAACAGCCATCGTGTCCTCGTTGCATTACGAGAGCAAGATGCGCACTACAAATGAGTACAACCAGCCAATCGTAGTGGATACTACGGGCATAACAAAACCAGAACCCGGGGACTTAGTGTTAACGTGTTTCCGGGGATGGGTTAAGCAGCTGCAAATAGACTACCGTGGAAACGAAGTCATGACAGCAGCTGCTTCTCAGGGGCTGACCAGAAAAGGTGTTTATGCAGTAAGGCAGAAAGTCAACGAAAACCCTCTGTATGCACCAACATCAGAACACGTTAACGTGCTATTGACACGCACAGAGGGCAAGTTGACATGGAAGACACTCTCAGGCGACCCATGGATAAAGATACTGCAGAACCCCCCAAAAGGGGACTTTAAGGCAACAATCAAGGAGTGGGAAGCAGAACACGCCTCCATCATGGCAGGAATATGCAATCACCAGATGGCTTTTGACACATTTCAGAACAAAGCTAATGTATGCTGGGCTAAATGCCTGGTCCCTATTCTTGACACTGCTGGAATCAAATTAAGTGACAGGCAGTGGTCTCAGATAGTGCAAGCTTTTAAAGAAGATAGGGCCTACTCTCCAGAAGTTGCACTGAATGAAATATGCACTCGCATATATGGGGTAGACCTGGACAGCGGACTATTCTCAAAGCCACTGATATCCGTCTACTATGCAGACAACCACTGGGACAATAGACCAGGAGGAAAAATGTTCGGGTTCAACCCTGAGGTGGCACTTATGCTTGAAAAGAAATATCCCTTTACAAAAGGTAAGTGGAACATTAACAAGCAGATATGTATAACTACCAGAAAGGTTGACGAATTTAACCCCGAAACCAACATAATACCGGCCAACCGCAGACTGCCGCACTCACTCGTGGCTGAACACCACTCAGTGAGAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTAAACAAAATCAGCGGTCACCACATGTTGTTGGTTAGCGGTCATAATCTTATATTACCAACAAAAAGAGTCACCTGGGTAGCACCGTTAGGCACCCGAGGTGCAGACTACACATATAACCTGGAACTTGGTCTACCAGCCACACTAGGCAGATATGACCTGGTAGTTATCAATATCCATACTCCATTCCGCATACATCATTACCAGCAGTGTGTAGATCACGCAATGAAGCTCCAGATGCTAGGGGGGGACTCTCTACGGCTGTTAAAGCCGGGAGGTTCACTTCTGATTAGAGCTTACGGGTACGCCGACCGAACCAGTGAAAGGGTCATTAGCGTATTGGGACGCAAGTTCAGATCGTCCAGGGCTCTGAAACCTCAGTGCATCACGAGCAATACAGAAATGTTCTTCCTATTTAGCCGATTCGACAATGGAAGAAGGAACTTCACCACACATGTTATGAACAACCAGCTGAACGCAGTGTATGCAGGACTGGCCACTAGAGCGGGCTGTGCCCCGTCATACCGAGTGAAACGGATGGACATCGCAAAGAACACTGAGGAATGCGTGGTAAACGCCGCCAATCCGCGCGGAGTACCAGGCGATGGAGTATGTAAAGCCGTGTATAGAAAATGGCCAGAATCATTCAGAAACAGTGCAACACCAGTGGGGACTGCAAAGACAATCATGTGCGGTCAATACCCCGTCATCCACGCAGTAGGCCCTAACTTCTCAAACTATTCTGAGGCTGAAGGGGATAGGGAATTGGCTTCAGTGTATAGAGAAGTGGCGAAAGAAGTGTCTAGGCTAGGAGTGAGCAGTGTAGCCATCCCTTTGCTCTCAACCGGTGTGTACTCAGGAGGCAAAGACAGACTGCTGCAATCACTAAACCATCTTTTCGCAGCGATGGATTCGACAGATGCAGACGTTGTCATCTACTGCAGGGACAAGGAATGGGAGAAGAAGATCACTGAAGCCATATCACTAAGATCCCAGGTAGAATTACTAGATGATCACATCTCAGTGGATTGCGACATTGTACGCGTTCATCCAGACAGCAGCTTGGCAGGCCGAAAGGGGTACAGCACAGTAGAGGGAGCACTCTACTCGTACCTAGAGGGAACAAGATTCCACCAAACTGCAGTAGATATGGCAGAGATATATACCATGTGGCCGAAACAAACTGAAGCCAACGAACAGGTCTGCCTATATGCTCTGGGGGAGAGTATAGAGTCCGTCAGGCAAAAATGTCCCGTAGACGACGCCGACGCCTCATTCCCTCCGAAAACAGTCCCGTGCCTATGCCGTTATGCTATGACGCCTGAACGAGTTGCACGTCTACGCATGAATCATACCACCAGCATCATAGTGTGCTCGTCTTTTCCGCTGCCGAAATACAAAATCGAGGGCGTGCAAAAAGTAAAATGTTCGAAAGCACTCTTGTTTGATCACAACGTACCGTCTCGAGTGAGCCCGAGAACGTACAGGCCTGCGGACGAAATCATACAGACACCTCAAACACCAACTGAAGCGTGTCAGGACGCACAACTCGTGCAGTCAATAAATGATGAAGCAGTGCCAGTTCCCTCAGACTTAGAGGCTTGTGACGCAACTATGGACTGGCCCTCTATCGGCACCGTATCAACAAGACAAAGACACGACTCATCTGACAGCGAGTATAGTGGCTCCAGAAGTAACATACAACTAGTGACGGCGGACGTGCATGCACCAATGTACGCACATTCGCTGGCGTCCAGCGGAGGTTCAATGCTGTCGCTGTCCAGTGAACCAGCTCAGAACGGCACAATGATACTACTTGACTCAGAAGACACAGACAGTATAAGCAGAGTAAGCACACCGATCGCCCCGCCCAGAAGACGTTTGGGAAGGACCATAAATGTGACCTGCGACGAGCGGGAAGGGAAAATACTCCCTATGGCCAGCGACAGGTTCTTCACTGCTAAGCCATACACTGTCGCACTGAGCGTATCAACAGCAGATATGACTGTGTATCCCATCCAGGCACCGCTAGGATTGATACCACCACCTACCCTCGAACCGATCACTTTCGGAGACTTCGCCGAAGGTGAAATAGACAACCTCCTGACAGGGGCATTGACATTTGGGGACTTCGAGCCAGGTGAAGTGGAAGAGCTGACGGATAGCGAGTGGTCAACGTGCTCGGACACAGACGAAGAGTTACGACTAGACAGAGCAGGGGGTTACATATTCTCCTCTGACACTGGTCAAGGTCATCTACAGCAAAAATCAGTACGTCAAACGACGCTACCGGTAAACATTGTTGAAGAGGTCCACGAAGAGAAATGCTATCCACCTAAATTGGATGAGATCAAAGAGCAACTACTACTTAAGAGACTTCAGGAGAGTGCTTCCACGGCTAACCGGAGTAGGTACCAATCTAGAAAAGTGGAAAACATGAAAGCCACGATTATCCACAGACTGAAAGAGGGTTGCAGACTCTATTTGGCGTCAGAAACACCGAGGGTCCCATCTTACCGAGTCACATACCCGGCGCCCATCTACTCGCCTTCAATCAATATCAAACTGACTAACCCAGAGACTGCAGTAGCAGTGTGTAACGAGTTTTTGGCCAGAAACTATCCAACTGTGGCATCCTACCAAGTCACTGACGAGTACGACGCGTACTTGGATATGGTAGACGGGTCCGAAAGTTGCCTAGACAGAGCTACATTCAACCCGTCTAAACTCAGGAGTTACCCAAAACAACACTCTTACCACGCACCCACCATCAGAAGTGCAGTGCCATCACCATTCCAAAATACGTTGCAGAATGTCTTGGCAGCGGCCACAAAAAGAAACTGCAACGTAACGCAGATGAGGGAACTACCCACTATGGACTCCGCAGTGTTTAACGTGGAGTGTTTTAAGAAGTACGCTTGCAACCAAGAGTACTGGAGAGAGTTCGCCTCAAGCCCTATAAGGGTAACGACAGAGAATCTGACAATGTATGTGACGAAACTAAAGGGGCCTAAAGCGGCGGCACTCTTCGCAAAAACACACAACTTGCTGCCGCTACAAGAGGTACCGATGGACAGGTTCACAATGGACATGAAACGTGATGTGAAAGTGACACCAGGTACAAAGCACACCGAGGAAAGGCCGAAAGTACAGGTCATACAGGCGGCAGAACCACTGGCAACAGCATACCTGTGTGGCATACACAGAGAGTTGGTGAGAAGACTAAATGCAGTTCTGCTACCGAATGTCCACACACTGTTCGATATGTCAGCCGAAGACTTCGATGCAATTATAGCCACCCATTTCAAACCGGGCGATGCTGTACTAGAAACTGACATAGCCTCATTTGATAAGAGTCAAGACGACTCGCTTGCGTCGACCGCCATGATGTTGCTAGAAGACCTTGGGGTAGATCAACCTATCCTGGATCTGATAGAAGCAGCATTCGGCGAAATATCCAGTTGTCATCTACCGACGGGTACGCGGTTCAAGTTCGGCGCAATGATGAAATCAGGCATGTTTCTAACCCTGTTTGTCAATACCCTCCTGAACATCACCATTGCCAGTCGGGTGTTAGAGGAGCGATTGACTACTTCAGCCTGTGCAGCTTTCATTGGGGACGACAACATAATACATGGGGTTGTCTCTGACGCACTAATGGCTGCACGTTGTGCTACGTGGATGAACATGGAAGTGAAAATCATCGATGCAGTAGTGTCAGAGAAGGCGCCATACTTCTGTGGGGGATTTATTTTACACGACACGGTGACAGGCACGTCGTGCAGAGTAGCAGACCCTTTAAAGAGACTGTTCAAGCTAGGCAAACCTCTGGCAGCTGGAGACGAACAGGATGAGGACAGAAGACGTGCTCTGGCAGATGAGGTTACTAGATGGCAAAGAACCGGCTTAGTCACAGAATTGGAAAAAGCAGTATATTCAAGGTATGAAGTACAAGGAATAACAGCCGTAATAACATCAATGGCTACCTTTGCGAATAGCAAAGAAAACTTTAAGAAACTAAGAGGGCCCGTCGTAACCTTGTACGGCGGACCTAAATAGGTACGCACTACAGCTACCTACTTAGAGCATACATCGCTAATAGCCATGGAGTTCATACCAGCACAAACTTACTACAATAGAAGATACCAGCCTAGACCCTGGACTCAACGCCCTACTATCCAGGTGATCAGGCCAAAACCACGCCGAAGAAGGCCTGCAGGACAACTCGCACAACTGATATCCGCAGTCAGCAGACTAGCACTGCGTACAGTTCCCCAGAAACCACGCCGGACCCGAAAAATTAAGAAGCAAAAGCAAGTAAAGCAAGAACAACAGAGTACTACGAACCAGAAGAAAAAGGCGCCGAAACAAAAGCAGACCCAAAAGAAAAAGAGACCAGGACGAAGGGAAAGGATGTGCATGAAGATTGAAAATGACTGCATCTTCGAAGTCAGACATGAAGGAAAAGTAACGGGGTATGCATGCCTAGTAGGTGATAAGGTAATGAAACCAGCACACGTGAAAGGAACTATTGACAACGCAGACCTAGCGAAGTTGGCGTTCAAAAGATCATCCAAATATGATCTAGAGTGCGCACAGATACCAGTGCACATGAAATCGGACGCCTCAAAGTTCACCCATGAAAAACCAGAAGGCTATTACAACTGGCATCACGGAGCAGTACAGTATTCTGGAGGGAGGTTCACGATCCCTACAGGCGCAGGAAAGCCTGGGGACAGCGGAAGACCAATCTTTGACAACAAGGGGCGTGTCGTGGCTATTGTTCTAGGCGGAGCAAACGAAGGAACCAGGACAGCACTATCTGTAGTGACTTGGAATAAAGACATAGTCACAAAAATCACACCAGAGGGGTCAGTTGAATGGAGCCTTGCCCTCCCTGTCATGTGCCTGTTGGCAAATACAACCTTCCCATGTTCCCAACCGCCTTGCGCGCCGTGCTGCTACGAAAAGAAACCGGAAGAAACCTTGAGAATGCTGGAGGACAACGTCATGCAACCAGGATATTACCAGTTACTCGATTCAGCATTGGCCTGCTCACAACGTCGTCAAAAACGTAATGCAAGAGAAAACTTCAATGTCTACAAAGTCACTAGGCCGTACTTAGCCCACTGTCCTGACTGCGGGGAGGGACACTCATGCCACAGCCCAATAGCATTAGAACGGATCAGAAGTGAGGCAACAGATGGTACCTTGAAAATCCAGGTATCTCTGCAAATCGGAATAAAGACAGACGACAGCCACGATTGGACGAAGCTACGGTATATGGATAGCCATACACCTGTGGATGCAGACCGATCCGGGTTGTTTGTCAGAACGTCAGCACCGTGCACCATCACGGGAACGATGGGACATTTCATACTAGCACGCTGTCCGAAAGGAGAGACGCTGACGGTAGGATTTGTAGACAGTAGAAGGATCAGTCACACGTGCATGCACCCGTTCCGCCACGAGCCACCGCTGATAGGGAGAGAGAAGTTTCACTCCCGCCCGCAGCATGGCAAAGAACTACCTTGCAGTACATACGTCCATACCACAGCGGCAACTGCTGAGGAAATAGAAGTGCATATGCCGCCAGATACCCCTGACTACACGCTGATGACACAGCAAGCGGGAAACGTTAAGATCACAGTTGACGGCCAGACGGTACGATACAAGTGCAAATGTGACGGCTCCAATGAAGGATTAATAACCGCTGACAAAGTCATAAATAACTGCAAAGTAGACCAATGCCACACAGCGGTTACAAACCACAAGAAATGGCAATACAATTCACCGCTGACCCCGCGGAACTCCGAACAAGGAGATAGAAAAGGTAAGATCCATATCCCATTTCCACTGGTGAACACAACCTGCAGGGTACCAAAAGCAAGAAATCCGACTGTCACATACGGTAAAAACAGAGTCACTCTGCTGTTACATCCAGACCACCCAACACTCCTTTCGTACCGCGCCATGGGAAGGATCCCGGATTACCATGAAGAGTGGATAACAAACAAGAAGGAAATAAGTATCACAGTACCAGCAGAAGGCTTAGAGGTTACGTGGGGTAATAATGACCCATACAAATATTGGCCCCAACTGTCTACAAATGGTACTGCGCACGGGCACCCACATGAAATAATCCTCTATTACTATGAGCTGTACCCAACTACCACAATTGCTGTACTAGCTGCTGCTTCTATCGTAATAACATCTTTGGTAGGTCTATCATTAGGCATGTGCATATGCGCGAGACGCAGGTGCATCACGCCATATGAGCTGACTCCAGGAGCTACCATCCCATTCCTCCTAGGTGTACTATGCTGTGCCAGGACTGCAAAAGCAGCATCGTACTACGAAGCTGCAACATACCTCTGGAATGAGCAACAACCATTATTTTGGTTACAGCTTCTAATCCCTCTGTCAGCTGCAATTGTTGTGTGTAATTGCCTAAAACTTTTACCATGCTGCTGCAAAACATTGACTTTTTTAGCCGTCATGAGCATCGGTGCCCGCACTGTGACCGCGTACGAGCACGCAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTGTAAGACTCTTGTTAGCAGACCAGGGTACAGCCCTATGGTCTTAGAAATGGAGCTACAGTCGGTCACTCTGGAACCAGCATTATCCTTGGATTACATTACGTGTGAGTATAAAACAATCACACCGTCCCCGTACGTAAAATGCTGTGGTACAGCTGAATGTAAGGCCAAGAACCTGCCAGATTATAACTGCAAAGTATTCACAGGCGTCTACCCATTTATGTGGGGAGGAGCATACTGCTTCTGTGACGCAGAGAACACACAGCTCAGCGAGGCACACGTTGAGAAATCAGAATCATGCAAAACTGAGTTTGCATCAGCCTACAGAGCCCACACAGCTTCAGTATCAGCTAAACTACGTGTCTTTTACCAAGGGAATAATATCACCGTGTCTGCATACGCCAATGGTGATCATGCAGTTACGGTGGAAGACGCGAAGTTTGTCATCGGTCCACTATCGTCCGCCTGGTCACCATTTGATAATAAGATCGTGGTGTACAAAGGCGAAGTCTACAATATGGACTATCCACCTTTCGGCGCAGGGAGGCCAGGACAGTTCGGTGACATCCAGAGCCGCACGCCAGACAGCAAGGACGTCTATGCGAATACGCAGTTAATACTGCAAAGACCAGCGGCAGGAGCAATACACGTGCCTTACTCCCAGGCACCTTCGGGCTTTAAGTACTGGCTCAAGGAAAAAGGGGCATCATTGCAGCATACTGCACCATTTGGCTGTCAGATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCAGTGAACTGTGCAGTGGGCAACATACCAGTCTCCATTGACATCCCAGATGCAGCTTTCACCAGGGTCACTGACGCTCCTTCCATCACAGACATGTCCTGCGAAGTAGCTTCGTGTACCCATTCATCTGATTTTGGAGGTGCCGCAGTCATAAAGTACACAGCTAGTAAAAAAGGAAAATGCGCCGTGCACTCTGTAACAAATGCGGTCACTATCCGCGAACCTAACGTAGATGTCAAGGGAACAGCACAATTGCAAATTGCCTTCTCGACCGCACTAGCTAGTGCGGAATTCAAGGTGCAGATCTGCTCCACACTGGTACACTGCTCAGCGACGTGCCATCCTCCTAAAGACCATATAGTCAATTACCCGTCACCTCACACCACACTAGGAGTGCAGGACATTTCAACGACAGCTATGTCTTGGGTCCAGAAGATTACAGGAGGAGTGGGACTCGTGGTTGCTATAGCTGCTTTGATCTTAATTATAGTTCTCTGCGTATCATTTAGCAGACACTAAAGTACACATGCCCCAAAGTAATATACTGTACAGGTATACGTGCTCCCTGAGCAGCACGATATATGTATTATCCATAAAAGAAAAACAAAACAAAAATATAAAAATTATAAAATACAAAAGTATAAAAACAGGTATTGGTACCCCCTTAGAGGTACATTATTTAACCAGTGAAAATAGGTATTGGTGCCCCCTTAGAGGCACATTATAGAACCAGGTATAGGTGCCCCCTTAGAGGTACACCAACAATAGGTATAAGTGCCCCCTTAGTGGCACACTAACCACCACAATCGGTAATATGAAGAGACGTAGGTATGAAGCTTCGTAAAAGCTGCCGAACTTACTTTAAGATGTAGGCGTACCGAACTCTTCGACAATTCTCCGACGCAGGGACGTAGGAGAAGTTATTTTGTTTTTAATATTTC
| 112,050
|
OL472195.1
|
Ophiovirus ranunculi
|
Rivarez,M.P.S., Pecman,A., Bacnik,K., Maksimovic Carvalho Ferreira,O., Vucurovic,A., Seljak,G., Mehle,N., Gutierrez-Aguirre,I., Ravnikar,M., Kutnjak,D., Kogej,Z., Lengar,Z.
|
National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-07-23
|
PLE20ST2
|
Ophiovirus ranunculi
|
Ophiovirus
|
Aspiviridae
|
ssRNA(-)
| 7,585
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Solanum lycopersicum
| null |
2020-09
|
SAMN22357975
|
PRJNA772045
|
MAG: Ophiovirus ranunculi isolate PLE20ST2 segment RNA1, complete sequence
|
AAAAATTCACACATTAAAAGTTAATATCTTCAAAAGACACCAGGAGAGCAATAACAGGATGACTACTGAGATTAGAATGACTGGAATAAAGGGCTTTGTTCTCAAGGAAGTGACACATCTTGATCAAGAGATAAAAGAAAGAAATGAGAGAATCCTTTCTGATTTTGTTGAGTATAAAACTAGTTATAATGAAGAAACTAGGTTTCTTTATGGTTCATGGTTATTGACACTTGAGGAAGACGAAGACCCTTTTTGTAAGAAAGGAATAATCATCATCAAAACAAATGGCAAAATTGTGGATTGTGACATTCACAAGGGAATTGAGATTACTTTGGCAAACTCCTTTAAGGAAGCATGGGGCTCATTCTACAACCGGGTTTATAAATCTGACTTAATCTTGCTTATGAAAGACAAAAGGGTTTTCATTATAATGAACGAAATTCCACCCCCCAAATATAGTTTGAAATTAACTTCGGAAGAAACAAAAATAAAGGAGAGCAGAGACAAGAAATATAAGGAAATTAAGAAGAAACAGATCTTGGCCTGAATTTGGTTTTAGATTGTTTTAAATAAAAAGAAATTCTGAACCAATAACATTAGGAGAAATTGTACAGATCAAATGGAATCATATCTTAGAGAGAAAAATATCAATCATTGTGACACACCATGGACGAGAGAAGTGATGAGTAAATTTGTCAATGACTTTGATGTGCTCACTCAGACAATTAAAAACGAGAAAGAAAAAGAAGCAGATGAAGTGAAAATTGATTTTGAACATAAACTTGTTGATCTGAAAAACTGCAGCAAGGATTTTTTCTTGAGTATGAATAAGATAGGGACACCGTGCATTCTAGTAAAGCTAGATAGTCCTTACAAGGAAATCACTCAACACAATGCTTCCATTGTTTTGGGTTCACAATTTCCGAAAAAATGGTCAGAAAAGAATATGCTAGAACTGTTTTTGTTCAGAGAAACTTTTCTCAAGGAAGCAAGAGACGACTGTATTCCTCTTATCAACCCTGAGCTTGGACAGAAAGGTTCTATAGATCTTATCAAGCGATTGAAGAAACTTAGCCTTGCTTCAAGTGAGTCAGGAGTGTTTCTGAAATTTTCCGGAAATCTAATAAACCATGAAATCTCCCTCTTGGAAAAACAACTTCTAGGAACAAAGAAAAGGCAGAAAGTGACTTATGAAATTAGTGAAGATGCTGCAAAGAACTACTGGGTCTTAGATATTTTTGAGCACCTAAACAAGAACATATTGAGGAGTGCCAGTGCCAAACATAACAATCGTGAGTTGGACACAAGCATTGAATATTATGAAGGAAAGAGGTTGAACACTAGGTACTTCCCTATAGGAGCCTCAATCTCAAAAATCGAGTTTGAAAAGGAAGGAAGATATCTGATCATCTTTTTGTCATCGACAATTTGTGCTTATTATTGGGATGATGGTTTTCAGGTGTACTTGGGAAGGCCTGATATGCTACAGTACAGTTTGTATTTGGCAGACAATCTATTGTCGCTTAGCATCATTCGGACCCAAATGTCAGAATCTGAGAAAAAGTTTTTGGATTACTACACTAATCTATTATATGAACCAGAAGACATCAGGATAGGAATGGGAGGTCTTTATGAAACAACATGTCTTCTTCTTTCTGACATGAAGACTCTTTCAGCGAGTATGCCAATCCTTGATAATGTTGTGGAATCGATTAATGTTTCTCTTAGCCATACAGAAAAACTTATTGAGATCTGTCAAGAATCAGAGCCCGAAATTTGTATCAGAATGTCCTCTATAGGTAAAACGCTAATCATTGCAAGCACAAAACCAGGAAAAGGGATCAGTAGATATACACAACGGACAAATCGAGACAACACAGTTAATGAAAACACTGTAAGAAGGTTAAGATCTTTATTCAAACAAAGAGTTATTTCTGCCTACATAAAGAAACATGGAAGAGTCCCAAACTTAGTAAGTGTTCCTGAAGATTTAGGTGCTCAGTTAGAAATGAAAGCAGCAGGAGGCAATTATATAAATCAGATGATATCTGAGACTAGCAGATATGATGAAGTAAAGTTAGGAAAGTTCCTAGAGCCTGGTGAAGAAATGAATCTACAATCAAGAATAATCGATAAGGCTTGCTCAAAAGACAGTTATTCTCAAGAAAGTAACTCTGAGAAAGAAATTCATTATTATATCACTCATAACATGGAAGATGTCTTCTCTGAACCAATGGGGATCAAAAAGGAAGCATACAGGTCATCCTCCAGAGTCGCTGAAGTAATCCACAGGTCTGAAGGTCTGCAGAAAAACATAGAAAAATATATGTTGGTCAAACTCTCAGAAAAGGAACGTGAGCAAAAGATTGCTGCTAGATTCTATGGCATTGCTTCCTTCAAATTGAAGCTTTGGATTAGTTCAACAATGGAGATGGTCAAAAGAGCAATGAAACTATTACCTGGACAGATGATGACCATGACAGATGATGAAAGAAGAGAAATCATGTTTAAAATGTCAGAGAAGTTACTAGAAGAGGATACATATTCTCTCTTTTTGGATTATTCTGGTCATAATACGTCTCAAAGGCCTGAAAATACAAATTTTATAATGGAAGAAATAGCTAACATGTATGGTTATTTTGAGGGATCGCGTGAATATGAAGAATTTACTTCATTGCCTTATGTCTTTAGTAATATCCATTTAATAGTGGAAGACACATGGAGTGACATGATCTACTACTCAAAAGGGCAGCTGGGTGCAATTGAAGGATGGTTAGGGGGTTTATGGGGAATTCAATCCCAATTGATGCTGGAGGACATGTTCATGCAATTAGGTGTGAGAGATTTTATTGGAACAACCTATTCTGATGATTCATGTGGTGTGTTCACTCAGAAGTCTATGGATGTACAGAAACTAAATGGAATAATTAAGAATGTTCAGAGATGTGGTGAGGATATGGGACTCATTGTTAAGCTTTCACAAACTCAGGTCACAAATGGGAGATGTTCTATGCTGAAGGAACACTATTACAAGGGTGTGCCTATTGAGATGACATTGAAAAAGATCATGTCAATAAGCCCCAATGGCCCCAAGATTCTTTGTGATGAACTAGAATCTAGTGCCTTGATTGATTCAGGTTTTACATCAAGTTGCACTAGATCTTCAACCATATGGACACAGGCACTAATTAGAAATTTTCGCATCATAAAATTGCTTTCAAGTTCTTTAAGAAAGATGACAGAAGAAATACTCCAAGATAACCTTGATGAAAGATATCTTTCCAGCAAACATAATTATGAAATTAGCATGAAATCAGCATTGAGAGGACTAAATAAGAACGTAAATAGCAAAGTGTTTATACCTGCACCTCGATCAAGGAACATTGAGTTTTTCCAGTTCCACCAAAATGATCAGGATGTTTTGGACATTGTTCTTATGTTTCTATACTCTCCGTACACAATGTATGGGTTTGCTCTAACACCTTTGCCTGACGTATTGATCTCAGGCTATAGTTTGTCTAATGTGAAAAGAATAAGTTATCTCCAAGGAATATTGAAAGTTGAAAACGTCAAGAAGATGGGTTCCTTGATAAATCTTTCACAAAATGCTATCAGTTACCTGGACAATCCGTTTCCTATGATTGGGGGAAGAAAAGATACATCACTTTTTGTAAGGCCAGAGATCGAAAGAATATTATCAAAAGTTGTTACAAACAAGGAACTATTGGACTTCTTATCACTTTATACTCGAGAAGATGAATTGGAATTTAAAGGACAACTAGTTTTAGCATTCAAGAATTGTTTTTCATCCAGAATCACAGGCAAGTTCTTAGAATCAAGTTTATATGCATATGTGCAGGAAATCCTGTCAAAAATAGACAATGCAGCAACAATGAAGATGATTCTTGGTGGAAGAAAGATGATGATGTTGATAGACAAGGCATGGCAAGCGAATTTCAGAATGAAGATAAGACTCAATACTAACACAATCATAAATTATGACGATTTGATGTTTGCTAGAGGTAACAAAGCATTGATATTGCCAAACAAGGAATCAGTGTCACTGAAATTCTTAGAAATAGAAGAAATACCAATCATGGGAAAAGTTCTACACTCAAATCTTAAAAGTATGATCCAACCGATATTCAAAGGCACAACTAAACTAACAGAAGAAGGAAGAAAAGCAAGGCCGCCACAAAGAACTTTCCTTAACTCTGCTAAGTTTGATAGAGAATTAGGAGTAGATGGAATGTTTGAACATAAGTTAATCTTCAAGGCATATGATTTAGTGAGGTATGTAAAATGGCTCATGATGGAACAAGAGAAATTTTCATCTGGAATGTCGGAAATTGATAAGACAACTTTAATTTCCATTTGTGATACAGTGTTGAACACATTTACTGATGCCAAGTATAGTGATATAGAAGAGAATGTTGTGTGTCCTAAAAGTGGAAGATATTTTCATAGGGCATTAACAGGAGGATTCAATCCAAAAACTGGTGATCTTTCCTCCAATCTATTGAGCGGAAATTATGATATAACAGGGGTAGATCAACTTATTGCAAAAACAGGAGGAGTGGATAACAATCTAAACCTCCAATATTTAATGATTTATATCAGGATAGGACTGGCTTTCTTGGGACCAAATGCTTGGGAGTTAGTTCCTTTGACTTTGACTAATGACATTCTCGAACATATCAGAGATGTGTCATTTGTTATCAAAGGATTAAACGAAATAAACATCAGCAAGAAATTATATAAGATGGCCTCAAAGAAGAAAATCAAAGAAAGAGGAAAAATGTATTACAATTATTCCACTTTTGTCGAAAAGAATGAAGATATAGCAGACAAATTCATAAATCATGTTTCTACAACTAAAGAATACTTTGTAAATCAGGAAAGTGCATTTAGGTCTGTTCATTCTTACATGGTAGACCAAATGATAGTTAGTCCAGAATTAGTATCAGATGATATCTTGAAAGGACTAATAGGAGATGAAATCTTTAAAGAAGGTAGGATGACATTCTTTGATAAATTCTACAGGTACTATAAGTCTTTGAATGTCATTGGCAATGAAACTCCCTCACGATCGGTTATTAGAGGACTTCTTTATGAAGAAATGTTCAGTGTTAACGAAAATTCAATAGGCAAACAACTATGGGCTGATGAAATGACAAGATTTGGTTATTCTAGTGGATTCAAGAAGGCCTTAATGAGATTGTTCATTTTATCTACTTCACTATCATACAGGATGGTAGATCAAGAGAACAACACTGTTAGACTGCAAGTAAACAAACACAGAACGATAGTTAACAGCAAAAACAATTTTGAGAAAATGAGGAAAGGTGTCTGTCAATTTTACATTAAAGACAAAAGAATTACGGAAATGATTGTGAATTCATTCCCTACTTTGGGTTACACGTACTCAGACATTCATTCAGGAGCAAGTATTCTTTGTGATGAGATTAGCAATATTGAGTTTGAACAAATGAGGTTGGGTTCTTATTACCTTAAACTGCACAAGTCCTATACTGAGAAGAAAGAAAACGTGTGTTATGGCCAAGTGGAATTTACTGAGATTAATATTTCAGAGGAAGATTTTAGAGACACCAGAGGCATAGATTCTGCACTGAAGGGATTTGAAACAGCATGTTCATTAATGGTGAGCCCAGAAAAGATATCTTCACCAACGATGTCATCAGTTTATCCAAGTGCAAAAGGTCTATTATCATTATTGAAAGGAAATGGGTTCATTAAAGAGGATGAAAGTGTCATTGAACTTTGCGGTGGAAGAGGTGATTTTCATTTAGCAATGATGGAAAGTAACATAAAACACACAACAATTTCAAGAGAAGATGGTTACAACCTAGTCATGAGAATACCAGGAATGACATCAAAGAAGGTTAGTTTCAACTGTTTCAAACAACAAGACTATATAGGCTATTTTGATCACAACATCATACTGCTTGATATTTCTCACATTACAAGCAAACATGATTGTTTGAGCGGAATCATAGGAGATGCAAGAATTGCTAAGAAGAAGATGATATTGAGATTAAATGGATTAAACAAGTTCTTAAATGAGAAAGTGCTGGATGAAATGAGAGGAGCTGAGTTGAAAGTCTGCTTACCTGCATTGGAGTCTCCTGGTTATGTCTATCTACTAATAGACTTCACAAAACAAAGTGATATGATAAGCACATCTAGTATCAGTGAGAAAAAGGGCTACAATAGATCTATTATATCTTCATCTTTGATTAATGCCGTGTCCAAAGTTGATTTGAAAAATGTGATAACAGTCCCACCCAAGCAAGTTCAAGATCCAACAATGGAAATTATTAATGATGATAAACTAATAGAAATGTTGGTAGAAGAAGACCCTGATTATGTTCATGTAAGTCAAGAAATTAAGAATAAAATAACTTCTTTGAATCAATTTAGAGATAACATGCTCGTGTATGTGTCAAACAAGTACTATGAAAGAAATAGGGGAAAATTGAAAGGATTAGGCAGAAGACTCATCTGCAACGGGAACTGGAGAGATGATAAGAGGTTGCCTGAGAATTTGATCGAACTAGGAAGAAAAATTAGAGAAGATGACCGTGATACAATAGAAGTTGGGAATAAAGTGCTCAGAGACCATCTTATGATTGTCAAGGGAGTAACAAGTATGAACAATGATGAATTGATTAAATTTATGGAAGAGATCTTAAATGTTAAAGACAACAAGAAGAATTCCATAGAATGCTGGAAACTGATCCTTAATCTGTCAGGAAACGAAGAGGTTATCGACTCTAGTGCTATAACAGATATGATTAACATTAAAAAGTTCAAGAAAACAATAGATAGAACCATAAATTCCTCATATGAAATAGCATCAAAAGCAATACTATCTTTCAAAACAGGAAGAATAATAGAAGGTTTGTTAGTAGTTGCGAATATGGGAAATCTTAAAAGAAAAGCAATCTTAGACCATAAGGACAAAACCACACGAACAAACATCTTACATTATAAACTTTACATGAATAGGATAATGCTAGCTTCCAGATCCATGTATACCGAACCGTACTTTTTAGGGATAGATAACAGAAAATTCGAAGAGCTATGGGCAAAAATAGGCACCGAGGAGATATCATTAGATCTAAGAGGATTATCGCAATCTATGAATGATGAAAAGATGCTAGAAAAATTCTTCCAGGAAATAAATAGTGAATACTTCTCATTTGTAGGGCATTTCAATGGAGCAATATCGGATCTATCTCGAAGACTAGACGAAAGCATAACAGACATACCAGAAATAACTGCATTAGATATAGGGCTAGGGGCTACAGAAGAAGATATAGAAATTAACAAAAGCATAGACACTTTTGAGAAATTAACGGAGTTTATGGGAGAAAGTGCAATCATTGGTGCATGGGCAGATATTGAAGAAGATTTCTCTGATTAAGGATAATGGGTTTTAAGACAATGATCAAGAATACTAACATAGTTAATTATATCTCTGACTATTAAAATTCAGGTGACAAGTGACAGGATTCAAAAATTTGCGACTACAGTCATTGCGACTCGCCAGGTTCTAAGGTTC
| 27,834
|
OL472199.1
|
Ophiovirus ranunculi
|
Rivarez,M.P.S., Pecman,A., Bacnik,K., Maksimovic Carvalho Ferreira,O., Vucurovic,A., Seljak,G., Mehle,N., Gutierrez-Aguirre,I., Ravnikar,M., Kutnjak,D., Kogej,Z., Lengar,Z.
|
National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-07-23
|
KOP19ST
|
Ophiovirus ranunculi
|
Ophiovirus
|
Aspiviridae
|
ssRNA(-)
| 7,587
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Solanum lycopersicum
| null |
2019-08
|
SAMN22357975
|
PRJNA772045
|
MAG: Ophiovirus ranunculi isolate KOP19ST segment RNA1, complete sequence
|
CTAAAGATCCACACATTAAAAGTTAATCCCTTCAAAAGACACCAGGAGAGTAATAACAGGATGACTACTGAGATTCGAATGACCGGGATAAAAGGCTTTGTTCTCAAGGAAGTGACACATCTTGATCAAGAGATAAAAGAAAGAAATGAGAGAATCCTTTCTGATTTTGTTGAGTATAAAACTAGTTATAATGAGGAAACTAGGTTTCTTTATGGTTCATGGTTATTGACACTTGAGGAAGATGAAGACCCTTTTTGTAAGAAAGGAATAATCATCATAAAAACAAATGGCAAAATTGTGGATTGTGACATTCACAAGGGAATTGAGATTACTTTGGCAAACTCCTTTAAGGAAGCATGGGGCTCATTTTACAACCGAGTTTATAAATCTGACTTAATCTTGCTTATGAAAGACAAAAGGGTTTTCATTATAATGAATGAGATTCCACCGCCAAAATATAGTTTGAAATTAACTTCGGAAGAAACAAAAATAAAGGAGAGCAGGGACAAGAAATACAAAGAAATTAAGAAGAAACAGATCTTGGCCTGAATTTGGTTTTAGATTGTTTTAAATAAAAAGAAATTCTGAACCAATAACATAAGGAGAAATTGTACAGATCAAATGGAATCATATCTTAGGGAGAAAAATATCAATCATTGTGATACACCATGGACGAGAGAAGTAATGAGTAAATTTGTTAATGACTTTGATGTGCTCACTCAGACAATTAAAAACGAGAAAGAAAAAGAAGCAGATGAAGTGAAAATTGATTTTGAACATAAACTTGTTGATCTGAAAAACTGCAGCAAGGATTTTTTCTTGAGTATGAATAAGATAGGGACACCGTGCATTCTAGTGAAGCTAGATAGTCCTTACAAGGAAATCACCCAACACAATGCTTCCATTGTTTTGGGTTCACAATTTCCAAAAAAATGGTCAGAAAAGAATATGCTTGAACTGTTTTTGTTCAGAGAAACTTTTCTCAAAGAAGCAAGAGACGACTGTATCCCTCTTACCAACCCTGAGCTTGGACAGAAAGGTTCTATAGATCTTATCAAACGACTGAAGAAACTCAGCCTTGCTTCAAGTGAATCAGGAGTGTTTCTGAAATTTTCCGGAAATCTAATAAACCATGAAATCTCCCTCTTGGAAAAACAACTTCTAGGAACAAAGAAAAGACAGAAAATGGCTTATGAAATTAGTGAAGATGCTGCAAAGAATTACTGGGTCTTAGATATTTTTGAGCACCTAAACAAGAACATATTGAGGAGTGCCAGTGCGAAACATAACAATCGTGAGTTGGACACAAGCATTGAATATTATGAAGGAAAGAGGTTGAACACTAGGTACTTCCCTATAGGAGCCTCAATCTCAAAAATCGAGTTTGAAAAGGAAGGAAGATATCTGATCATCTTTTTGTCATCGACAATTTGTGCTTATTATTGGGATGATGGTTCTCAGGTGTACTTGGGAAGGCCTGATATGCTGCAGTACAGTTTGTATTTGGCAGACAATCTATTGTCGCTTAGCATCATTCGAACCCAAATGTCAGAATCTGAGAAAAAGTTTTTGGATTACTACACTAATCTGTTATATGAACCAGAAGACATCAGGATAGGAATGGGAGGTCTTTATGAAACAACATGTCTTCTTCTTTCTGACATGAAAACTCTTTCAGCGAGTATGCCAATCCTTGATAATGTTGTGGAATCGATTAATGTTTCTCTTAGCCATACAGAAAAACTTATTGAGATCTGTCAAGAATCAGAGCCCGAAATTTGTATCAGAATGTCCTCTATAGGTAAAACGCTAATCATTGCAAGCACAAAACCAGGAAAAGGGATCAGTAGATATACACAACGGACAAATCGAGACAACACAGTTAATGAAAACACTGTAAGAAGATTAAGATCCCTATTCAAACAAAGAGTTATTTCTGCTTACATAAAGAAACATGGGAGAGTCCCAAACTTAGTAAGTGTTCCTGAAGATTTAGGTGCTCAGTTGGAAATGAAAGCAGCAGGAGGCAATTATATAAATCAGATGATATCTGAAACTAGCAGATATGATGAAGTAAAGTTAGGAAAGTTCCTAGAGCCTGGTGAAGAAATGAATCTGCAATCAAGAATAATCGATAAGGCTTGCTCAAAAGACAATTATTCTCAAGAAAGTAACTCTGAGAAGGAAATTCATTATTATATCACTCATAACATGGAAGATGTCTTCTCTGAACCAATGGGGATCAAAAAGGATGCATACAGGTCATCCTCCAGAGTCGCTGAAGTGATCCATAGGTCTGAAGGTCTGCAGAAAAACATAGAAAAATATATGTTGGTCAAACTCTCAGAAAAGGAACGTGAACAAAAGATTGCTGCTAGATTCTATGGTATTGCTTCCTTCAAATTAAAGCTTTGGATTAGTTCAACAATGGAGATGGTCAAAAGAGCAATGAAGCTGTTACCTGGACAGATGATGACCATGACGGATGATGAGAGAAGAGAAATCATGTTTAAAATGTCAGAGAAGTTACTAGAAGAGGATACATATTCTCTCTTTTTAGATTATTCTGGTCATAATACGTCTCAAAGGCCTGAAAATACAAATTTTATAATGGAAGAGATAGCTAACATGTATGGTTATTTTGAGGGATCGCGTGAATATGAAGAATTTACTTCATTGCCTTACGTCTTTAGTAATATCCATTTAATAGTAGAAGACACATGGAGTGACATGATCTACTACTCAAAAGGGCAACTGGGTGCAATTGAAGGATGGTTAGGGGGTTTATGGGGAATTCAATCCCAATTGATGCTGGAAGACATGTTCATGCAATTAGGTGTGAGAGATTTTATTGGAACAACCTATTCTGATGATTCATGTGGTGTGTTCACTCAGAAGTCTATGGATGTACAGAAACTAAATGGAATAATTAAGAATGTTCAGAGATGTGGTGAGGATATGGGACTCATTGTTAAGCTTTCACAAACTCAGGTCACAAATGGGAGATGTTCTATGCTGAAGGAACACTATTACAAGGGTGTGCCTATTGAGATGACATTGAAAAAGATCATGTCAATAAGCCCCAATGGCCCCAAGGTTCTTTGTGATGAACTAGAATCTAGTGCTTTGATTGATTCAGGTTTCACATCAAGTTGCACTAGATCTTCAACCATATGGACACAGGCACTAATTAGAAATTTTCGCATCATAAAATTGCTTTCAAGTTCTTTGAGAAAGATGACAGAAGAAATGCTCCAGGATAACCTTGATGAAAGATATCTTTCCAGCAAACATAATTATGAAATTAGCATGAAATCAGCATTGAGAGGACTAAATAAGAACGTAAATAACAGAGTGTTTATACCTGCACCTCGATCAAGGAACATTGAGTTTTTCCAGTTCCACCAAAATGATCAGGATGTTTTGGACATTGTTCTTATGTTTCTATACTCTCCATACACAATGTATGGGTTTGCTCTAACACCTTTGCCTGACGTATTGATTTCAGGCTATAGTTTGTCCAATGTAAAAAGAATAAGTTATCTCCAAGGAATATTGAAAGTTGAAAACGTCAAGAAGATGGGTTCTTTGATAAATCTTTCACAAAATGCTATCAGTTACCTGGACAATCCGTTTCCTATGATTGGGGGAAGAAAAGATACATCACTTTTTGTAAGGCCAGAGATCGAAAGAATATTATCAAAAGTTGTTACCAACAAGGAACTATTGGACTTCTTATCACTTTATACTCGAGAAGATGAATTGGAATTTAAAGGACAATTAGTTTTAGCATTCAAGAATTGTTTCTCGTCCAGAATCACAGGCAAGTTCTTGGAATCAAGTTTATATGCATATGTGCAGGAAATTTTGTCAAAAATAGACAATGCAGCAACAATGAAGATGATTCTTGGTGGAAGAAAGATGATGATGTTGATAGACAAGGCATGGCAAGCGAATTTCAGAATGAAGATAAGATTCAATACTAACACAATCATAAATTATGACGATTTGATGTTTGCCAGAGGTAACAAAGCATTGATATTGCCAAACAAAGAATCAGTATCACTGAAGTTCTTGGAAATAGAAGAAATACCAATCATGGGAAAAGTTCTACACTCAAATCTTAAAAGTATGATCCAACCGATATTCAAAGGCACAACTAAACTAACAGAAGAAGGAAGAAAAGCAAGGCCGCCACAAAGAACTTTCCTTAACTCTGCTAAGTTTGATAGAGAATTAGGAGTAGATGGAATGTTTGAACATAAGTTAATCTTCAAGGCATATGATTTAGTGAGGTATGTAAAATGGCTCATGATGGAACAAGAGAAATTTTCATCAGGAATGTCGGAAATTGATAAGACAACTTTAATCTCCATTTGTGATACAGTGTTGAACACATTTACTGATGCCAAGTATAGTGATATAGAAGAGAATGTTGTGTGTCCTAAAAGTGGAAGATATTTCCATAGAGCATTAACAGGAGGATTCAACCCAAAGACTGGCGATCTTTCCTCCAATCTATTGAGCGGAAATTATGATATAACAGGGGTAGATCAACTTATTGCAAAAACAGGAGGAGTAGATAACAATCTAAACCTTCAATATTTGATGATTTATGTCAGGATAGGACTGGCTTTTTTGGAACCAAATGCTTGGGAGTTAGTTCCTTTGACTTTGACTAATGACATTCTCGAACATGTCAGAGATGTGTCATTTGTCATCAAAGGATTAAACGAAATAAACATCAGCAAGAAATTATATAAGATGGCCTCAAAGAAGAAAATCAAAGAAAGAGGAAAAATGTATTACAATTATTCTACCTTTGTTGAAAAGAATGAAGATATAGCGGACAAATTCATAAACCATGTTTCTACAACTAAAGAATACTTTGTAAATCAGGAAAGTGCATTTAGGTCTGTTCATTCTTACATGGTAGACCAAATGATAGTTAGTCCAGAATTGGTATCAGATGATATCTTGAGAGGACTGATAGGAGATGAAATCTTTAAAGAGGGTAGGATGACATTCTTTGATAAATTCTACAGGTACTATAAGTCTTTGAATGTCATTGGCAATGAAACTCCCTCACGATCGGTTATTAGAGGGCTCCTTTATGAAGAAATGTTCAGTGTTAACGAAAATTCAATAGGCAAACAACTATGGGCTGATGAAATGACAAGATTTGGTTATTCTAGTGGATTCAAGAAGGCCTTAATGAGATTGTTCATTTTGTCTACTTCACTATCATACAGGATGGTAGATCAAGAGAACAACACTGTTAGACTGCAAGTAAACAAACACAGGACGATAGTCAACAGCAAAAACAATTTTGAGAAAATGAGGAAAGGTGTCTGTCAATTTTACATTAAAGATAAAAGAATTACGGAAATGATTGTGAATTCATTTCCTACTTTGGGTTACACGTACTCAGACATTCATTCAGGAGCAAGTATTCTTTGTGATGAGATCAGCAATATTGAGTTTGAACAAATGAGGTTGGGTTCTTATTACCTTAAACTCCACAAGTCCTATACTGAGAAAAAAGAAAACGTGTGTTATGGCCAGGTGGAATTTACTGAGATTAATGTTTCAGAGGAAGATTTTAGAGACACCAGAGGCATAGATTCTGCACTGAAGGGATTTGAAACAGCATGTTCATTAATGGTGAGCCCAGAGAAGATATCTTCACCGACGATGTCATCAGTTTATCCAAGTGCAAAAGGTCTATTATCATTATTGAAAGGAAATGGGTTCATTAAAGAGAATGAAAGTGTCATTGAACTTTGCGGTGGAAGAGGTGATTTTCATTTAGCAATGATGGAAAGTAACATAAAACACATAACAATTTCAAGAGAAGATGGTTACAACCTAGTCATGAGAATACCAGGAATGACATCAAAGAAGGTTAGTTTCAACTGTTTCAAACAACAAGACTATATAGGCTATTTTGATCACAACATCATACTGCTTGATATTTCTCACATTACAAGCAAACATGATTGTTTGAGCGGGATCATAGGAGATGCAAGAATTGCCAAGAAGAAGATGATATTGAGATTAAATGGATTAAACAAGTTCCTAAATGAGAAAGTGCTGGATGAAATGAGAGGAGCTGAGTTGAAAGTCTGTTTACCCGCATTGGAATCTCCTGGTTATGTCTATCTACTAATGGACTTCGCAAAACAAAGTGATATGATAAGCACATCTAGTATCAGTGAGAAAAAAGGCTACAATAGATCTATTATATCTTCATCTTTGATTAATGCGGTATCCAAAGTTGATTTGAAAAATGTGATAACAGTCCCACCCAAGCAAGTTCAAGATCCAACAATGGAGATTATTAATGATGATAAACTAATAGAAATGTTGGTAGAAGAAGACCCTGATTATGTTCATGTAAGTCAAGAAATTAAGAATAAAATAACTTCTTTGAATCAATTTAGAGATAACATGCTCGTGTATGTATCAAACAAGTACTATGAAAGAAATCGAGAAAAATTGAAAGGATTAGACAGGAGACTCATCTGCAACGGGAACTGGAGAGAAGATAAGAGGTTGCCTGAAAATTTGATCGAACTAGGAAGAAAAATTAGAGAAGATGACCGTGATACAATAGAAGTTGGGAATAAAGTGCTCAGAGACCATCTTATGATTGTCAAGGGAGTAACAGGTATGAATAATGATGAATTGATTAAATTCATGGAAGAGATCTTAAATGTTAAAGACAACAAGAAGAATTCTATAGAATGCTGGAAACTGATCCTCAATTTGTCAGGAAACGAAGAGGTTATTGACTCTAGTGCTATAACAGATATGATTAACATTAAAAAGTTCAAGAAAACAATAGATAGAACCATAAATTCCTCATATGAAATAGCATCAAAAGCAATACTATCTTTTAAAACAGGAAGAATTATAGAAGGTTTGTTAGTAGTTGCGAATATGGGAAATCTTAAAAGAAAAGCAATTTTAGACCATAAGGACAAAACCACACGAACAAACATCTTACATTACAAACTTTACATGAATAGGATAATGCTAGCTTCCAGATCTATGTATACCGAACCGTACTTCTTAGGGATAGATAACAGAAAATTCGAAGAGCTATGGGCAAAAATAGGCACTGAGGAGATATCATTAGATCTAAGAGGATTATCGCAATCTATGAATGATGAAAAGATGCTAGAAAAATTCTTCCAGGAAATAAATAGTGAATACTTCTCATTTGTAGGGCATTTCAATGGAGCAATATCGGATCTATCTCGAAGACTAGACGAAAGCATAACAGACATACCAGAAATAACTGCGTTGGATATAGGACTAGGGGCTACAGAAGAAGACATAGAAATTAACAAAAGCATAGACACTTTTGAGAAATTGACGGAGTTTATGGGAGAAAGTGCAATCATTGGTGCATGGGCAGATATTGAAGAAGATTTCTCTGATTAAGGATAATGAGTTTTGAGATAATGATTAAGAATACTAACATAGTTAACTATATCTTTGACTATCAAAATCCAGGTGATAAGTGATAGGATTCAAAAATTTGCGACTACAGTCATTGCGACTCGCCAGGTTCGAAGGTTC
| 27,835
|
OL472203.1
|
Ophiovirus ranunculi
|
Rivarez,M.P.S., Pecman,A., Bacnik,K., Maksimovic Carvalho Ferreira,O., Vucurovic,A., Seljak,G., Mehle,N., Gutierrez-Aguirre,I., Ravnikar,M., Kutnjak,D., Kogej,Z., Lengar,Z.
|
National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-07-23
|
KOP20SW1
|
Ophiovirus ranunculi
|
Ophiovirus
|
Aspiviridae
|
ssRNA(-)
| 7,523
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Solanum nigrum
| null |
2020-08
|
SAMN22357975
|
PRJNA772045
|
MAG: Ophiovirus ranunculi isolate KOP20SW1 segment RNA1, complete sequence
|
CACACATTAAAAGTTAATATCTTCAAAAGACACCAGGAGACCAATAACAGGATGACTACTGAGATTAGAATGACTGGAATAAAGGGCTTTGTTCTCAAGGAAGTGACACATCTCGATCAAGAGATAAAAGAAAGAAATGAGAGAATCCTTTCTGATTTTGTTGAGTATAAAACTAGTTATAATGAAGAAACTAGGTTTCTTTATGGTTCATGGTTATTGACACTTGAGGAAGACGAAGACCCTTTTTGTAAGAAAGGAATAATCATCATCAAAACAAATGGCAAAATTGTGGATTGTGACATTCACAAGGGAATTGAGATTACTTTGGCAAACTCCTTTAAGGAAGCATGGGGCTCATTCTACAACCGAGTTTATAAATCTGACTTAATCTTGCTTATGAAAGACAAAAGGGTTTTCATTATAATGAACGAAATTCCACCCCCCAAATATAGTTTGAAATTAACTTCGGAAGAAACAAAAATAAAGGAGAGCAGAGACAAGAAATATAAGGAAATTAAGAAGAAACAGATCTTGGCCTGAATTTGGTTTTGGATTGTTTTAAATAAAAAGAAATTCTGAACCAATAACATTAGGAGAAATTGTACAGATCAAATGGAATCATATCTTAGAGAGAAAAATATCAATCATTGTGATACACCATGGACGAGAGAAGTGATGAGTAAATTTGTCAATGACTTTGATGTGCTCACTCAGACAATTAAAAATGAGAAAGAAAAAGAAGCAGATGAAGTGAAAATTGATTTTGAACATAAACTTGTTGATCTAAAAAACTGCAGCAAGGATTTTTTCTTGAGTATGAATAAGATAGGGACACCGTGCATTCTAGTAAAGCTAGATAGTCCTTACAAGGAAATCACTCAACACAATGCTTCCATTGTTTTGGGTTCACAATTTCCGAAAAAATGGTCAGAAAAGAATATGCTTGAACTGTTTTTGTTCAGAGAAACTTTTCTCAAGGAAGCAAGAGACGACTGTATTCCTCTTATCAACCCTGAGCTTGGACAGAAAGGTTCTATAGATCTTATCAAGCGATTGAAGAAACTTAGCCTTGCTTCAAGTGAGTCAGGAGTGTTTCTGAAATTTTCTGGAAATCTAATAAACCATGAAATCTCTCTCTTGGAAAAACAACTTCTAGGAACAAAGAAAAGGCAGAAAGTGACTTATGAAATTAGTGAAGATGCTGCAAAGAACTACTGGGTCTTAGATATTTTTGAGCACCTAAACAAGAACATATTGAGGAGTGCCAGTGCCAAACATAACAATCGTGAGTTGGACACAAGCATTGAATATTATGAAGGAAAGAGGTTGAACACTAGGTACTTCCCTATAGGAGCCTCAATCTCAAAAATCGAGTTTGAAAAGGAAGGAAGATATCTGATCATCTTTTTGTCATCGACAATTTGTGCTTATTATTGGGATGATGGTTTTCAGGTGTACTTGGGAAGGCCTGATATGCTACAGTACAGTTTGTATTTGGCAGACAATCTATTGTCGCTTAGCATCATTCGGACCCAAATGTCAGAATCTGAGAAAAAGTTTTTGGATTACTACACTAATCTATTATATGAACCAGAAGACATCAGGATAGGAATGGGAGGTCTTTATGAAACAACATGTCTTCTTCTTTCTGACATGAAGACTCTTTCAGCGAGTATGCCAATCCTTGATAATGTTGTGGAATCGATTAATGTTTCTCTTAGCCACACAGAAAAACTTATTGAGATCTGTCAAGAATCAGAGCCCGAAATTTGTATCAGAATGTCCTCTATAGGTAAAACGCTAATCATTGCAAGCACAAAACCAGGAAAAGGGATCAGTAGATATACACAACGGACAAATCGAGACAACACAGTTAATGAAAACACTGTAAGAAGGTTAAGATCTCTATTCAAACAAAGAGTTATTTCTGCCTACATAAAAAAACATGGAAGAGTCCCAAACTTAGTAAGTGTTCCTGAGGATTTAGGTGCTCAGTTAGAAATGAAAGCAGCAGGAGGCAATTATATAAATCAGATGATATCTGAGACTAGCAGATATGATGAAGTAAAGTTAGGAAAGTTCCTAGAGCCTGGTGAAGAAATGAATCTACAATCAAGAATAATCGATAAGGCTTGCTCAAAAGACAGTTATTCTCAAGAAAGTAACTCTGAGAAAGAAATTCATTATTATATCACTCATAACATGGAAGATGTCTTCTCTGAACCAATGGGGATCAAAAAGGAAGCATACAGGTCATCTTCCAGAGTCGCTGAAGTAATCCACAGGTCTGAAGGTCTGCAGAAAAACATAGAAAAATATATGTTGGTCAAACTCTCAGAAAAGGAACGTGAGCAAAAGATTGCTGCTAGGTTCTATGGCATTGCTTCCTTCAAATTGAAGCTTTGGATTAGTTCAACAATGGAGATGGTCAAAAGAGCAATGAAACTATTACCTGGACAGATGATGACCATGACGGATGATGAGAGAAGAGAAATCATGTTCAAAATGTCAGAGAAGTTACTAGAAGAGGATACATATTCTCTCTTTTTGGATTATTCTGGTCATAATACGTCTCAAAGGCCTGAAAATACAAATTTTATAATGGAAGAAATAGCTAACATGTATGGTTATTTTGAGGGATCGCGTGAATATGAAGAATTTACTTCATTGCCTTATGTCTTTAGTAATATCCATTTAATAGTGGAAGACACATGGAGTGACATGATCTACTACTCAAAAGGGCAGCTGGGTGCAATTGAAGGATGGTTAGGGGGTTTATGGGGAATTCAATCCCAATTGATGCTGGAGGACATGTTCATGCAATTAGGTGTGAGAGATTTTATTGGAACAACCTATTCTGATGATTCATGTGGTGTGTTCACTCAGAAGTCTATGGATGTACAGAAACTAAATGGAATAATTAAGAATGTTCAGAGATGTGGTGAGGATATGGGACTCATTGTGAAGCTTTCACAAACTCAGGTCACAAATGGGAGATGTTCTATGCTGAAGGAACACTATTACAAGGGTGTGCCTATTGAGATGACATTGAAAAAGATCATGTCAATAAGCCCCAATGGCCCCAAGATTCTTTGTGATGAACTAGAATCTAGTGCCTTGATTGATTCAGGTTTTACATCAAGTTGCACTAGATCTTCAACCATATGGACACAAGCACTAATTAGAAATTTTCGCATCATAAAATTGCTTTCAAGTTCTTTAAGAAAGATGACAGAAGAAATGCTCCAAGATAACCTTGATGAAAGATATCTTTCCAGCAAACATAATTATGAAATTAGCATGAAATCAGCATTGAGAGGACTAAATAAGAACGTAAATAGCAAAGTGTTTATACCTGCACCTCGATCAAGGAACATTGAGTTTTTCCAGTTCCACCAAAATGATCAGGATGTTTTGGACATTGTTCTTATGTTTCTATACTCTCCATACACAATGTATGGGTTTGCTCTAACACCTTTGCCTGACGTATTGATTTCAGGCTATAGTTTGTCTAATGTGAAAAGAATAAGTTATCTCCAAGGAATATTGAAAGTTGAAAACGTCAAGAAGATGGGTTCCTTGATAAATCTTTCACAAAATGCTATCAGTTACCTGGACAATCCGTTTCCTATGATTGGGGGAAGAAAAGATACATCACTTTTTGTAAGGCCAGAGATCGAAAGAATATTATCAAAAGTTGTTACAAACAAGGAACTATTGGACTTCTTATCACTTTATACTCGAGAAGATGAATTGGAATTTAAAGGACAACTAGTTTTAGCATTCAAGAATTGTTTCTCATCCAGAATCACAGGCAAGTTCTTAGAATCAAGTTTATACGCATATGTGCAGGAAATCCTGTCAAAAATAGACAATGCAGCAACAATGAAGATGATTCTTGGTGGAAGAAAGATGATGATGTTGATAGACAAGGCATGGCAAGCGAATTTCAGAATGAAGATAAGACTCAATACTAACACAATCATAAATTATGACGATTTGATGTTTGCTAGAGGTAACAAAGCATTGATATTGCCAAACAAAGAATCAGTGTCACTGAAATTCTTAGAAATAGAAGAAATACCAATCATGGGAAAAGTTCTACACTCAAATCTTAAAAGTATGATCCAACCGATATTCAAAGGCACAACTAAACTAACAGAAGAAGGAAGAAAAGCAAGGCCGCCACAAAGAACTTTCCTTAACTCTGCTAAGTTTGATAGAGAATTAGGAGTAGATGGAATGTTTGAACATAAGTTAATCTTCAAAGCATATGATTTAGTGAGGTATGTAAAATGGCTCATGATGGAACAAGAGAAATTTTCATCTGGAATGTCGGAAATTGATAAGACAACTTTAATCTCCATTTGTGATACAGTATTGAACACATTTACTGATGCCAAGTATAGTGATATAGAAGAGAATGTTGTGTGTCCTAAAAGTGGAAGATATTTTCATAGGGCACTAACAGGAGGATTCAATCCAAAAACTGGCGATCTTTCCTCCAATCTATTGAGCGGAAATTATGATATAACAGGGGTAGATCAACTTATTGCAAAAACAGGAGGAGTGGATAACAATCTAAACCTCCAATATTTAATGATTTATATCAGGATAGGACTGGCTTTCTTGGAACCAAATGCTTGGGAGTTAGTTCCTTTGACTTTGACTAATGACATTCTCGAACATATCAGAGATGTGTCATTTGTTATCAAAGGATTAAACGAAATAAACATCAGCAAGAAATTATATAAGATGGCCTCAAAGAAGAAAATCAAAGAAAGAGGAAAAATGTATTACAATTATTCCACTTTTGTTGAAAAGAATGAAGATATAGCAGACAAATTCATAAATCATGTTTCTACAACTAAAGAATACTTTGTAAATCAGGAAAGTGCATTTAGGTCTGTTCATTCTTACATGGTAGACCAAATGATAGTTAGTCCAGAATTAGTATCAGATGATATCTTGAAGGGACTAATAGGAGATGAAATCTTTAAAGAAGGTAGGATGACATTCTTTGATAAATTCTACAGGTACTATAAGTCTTTAAATGTCATTGGCAATGAAACTCCCTCACGATCGGTTATTAGAGGACTTCTTTATGAAGAAATGTTCAGTGTTAACGAAAATTCAATAGGCAAACAACTATGGGCTGATGAAATGACAAGGTTTGGTTATTCTAGTGGATTCAAGAAGGCCTTAATGAGATTGTTCATTTTGTCTACTTCACTATCATACAGGATGGTAGATCAAGAGAACAACACTGTTAGACTGCAAGTAAACAAACACAGAACGATAGTTAACAGCAAAAACAATTTTGAGAAAATGAGGAAAGGTGTCTGTCAATTTTACATTAAGGACAAAAGAATTACGGAAATGATTATGAATTCATTCCCTACTTTGGGTTACACGTACTCAGACATTCATTCAGGAGCAAGTATTCTTTGTGATGAGATTAGCAATATTGAGTTTGAACAAATGAGGTTGGGTTCTTATTACCTTAAACTGCACAAGTCCTATACTGAGAAGAAAGAAAACGTGTGTTATGGCCAAGTGGAATTTACTGAGATTAATATTTCAGAGGAAGATTTTAGAGACACCAGAGGCATAGATTCTGCACTGAAGGGATTTGAAACAGCATGTTCATTAATGGTGAGCCCAGAAAAGATATCTTCACCAACGATGTCATCAGTTTATCCAAGTGCAAAAGGTCTATTATCATTATTGAAAGGAAATGGGTTCATTAAAGAGGATGAAAGTGTCATTGAACTTTGCGGTGGAAGAGGTGATTTTCATTTAGCAATGATGGAAAGTAACATAAAACACACAACAATTTCAAGAGAAGATGGTTACAACCTAGTCATGAGAATACCAGGAATGACATCAAAGAAGGTTAGTTTCAACTGTTTCAAACAACAAGACTATATAGCCTATTTTGATCACAACATCATACTGCTTGATATTTCTCACATTACAAGTAAACATGATTGTTTGAGCGGAATCATAGGAGATGCAAGAATTGCTAAGAAGAAGATGATATTGAGATTAAATGGATTAAACAAGTTCTTAAATGAGAAAGTGCTGGATGAAATGAGAGGAGCTGAGTTGAAAGTCTGCTTACCCGCATTGGAGTCTCCTGGTTATGTCTATCTACTAATAGACTTCACAAAACAAAGTGATATGATGAGCACATCTAGTATCAGTGAGAAAAAGGGCTACAATAGATCTATTATATCTTCATCTTTGATTAATGCCGTGTCCAAAGTTGATTTGAAAAATGTGATAACAGTCCCACCCAAGCAAGTTCAAGATCCAACAATGGAAATTATTAATGATGATAAACTAATAGAAATGTTGGTAGAAGAAGACCCTGATTATGTTCATGTAAGTCAAGAAATTAAGAATAAAATAACTTCTTTGAATCAATTTAGAGATAACATGCTCGTGTATGTGTCAAACAAGTACTATGAAAGAAATAGGGGAAAATTGAAAGGATTAGGCAGGAGACTCATCTGCAACGGGAACTGGAGAGATGATAAGAGGTTGCCCGAGAATTTAATCGAACTAGGAAGAAAAATTAGAGAAGATGACCGTGATACAATAGAAGTTGGGAATAAAGTGCTCAGAGACCATCTTATGATTGTCAAGGGGGTAACAGGTATGAACAATGATGAATTGATTAAATTTATGGAAGAGATCTTAAATGTTAAAGACAACAAGAAGAATTCCATAGAATGCTGGAAACTGATCCTTAATTTGTCAGGAAACGAAGAAGTTATCGACTCTAGTGCTATAACAGATATGATTAACATTAAAAAGTTCAAGAAAACAATAGATCGAACCATAAATTCCTCATATGAAATAGCATCAAAAGCAATACTATCTTTCAAAACAGGAAGAATAATAGAAGGTTTGTTAGTAGTTGCGAATATGGGAAATCTTAAAAGAAAAGCAATCTTAGACCATAAGGACAAAACCACACGAACAAACATCTTACATTATAAACTTTACATGAATAGGATAATGCTAGCTTCCAGATCCATGTATACCGAACCGTACTTTTTAGGGATAGATAACAGAAAATTCGAAGAGCTATGGGCAAAAATAGGCACCGAGGAGATATCATTAGATCTAAGAGGATTATCGCAATCTATGAATGATGAAAAGATGCTAGAAAAATTCTTCCAGGAAATAAATAGTGAATACTTCTCATTTGTAGGGCATTTCAATGGAGCAATATCGGATCTATCTCGAAGACTAGACGAAAGCATAACAGACATACCAGAAATAACTGCATTAGATATAGGGCTAGGGGCTACAGAAGAAGATATAGAAATTAACAAAAGCATAGACACTTTTGAGAAATTAACGGAGTTTATGGGAGAAAGTGCAATCATTGGTGCATGGGCAGATATTGAAGAAGATTTCTCTGATTAAGGGTAATGAGTTTTGAGACAATGATCAAGAATACTAACATAGTTAATTATATCTCTGACTATCAAAATTCAGGTGACAAGTGA
| 27,836
|
OL472207.1
|
Ophiovirus ranunculi
|
Rivarez,M.P.S., Pecman,A., Bacnik,K., Maksimovic Carvalho Ferreira,O., Vucurovic,A., Seljak,G., Mehle,N., Gutierrez-Aguirre,I., Ravnikar,M., Kutnjak,D., Kogej,Z., Lengar,Z.
|
National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-07-23
|
NGO19AT
|
Ophiovirus ranunculi
|
Ophiovirus
|
Aspiviridae
|
ssRNA(-)
| 7,611
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Solanum lycopersicum
| null |
2019-08
|
SAMN22357975
|
PRJNA772045
|
MAG: Ophiovirus ranunculi isolate NGO19AT segment RNA1, complete sequence
|
CTTTTCTAAAAATTCACACATTAAAAGTTAATATCTTCAAAAGACACCAGGAGAGTAATAACAGGATGACTACTGAGATTAGAATGACTGGAATAAAGGGCTTTGTTCTCAAGGAAGTGACACATCTTGATCAAGAGATAAAAGAAAGAAATGAGAGAATCCTTTCTGATTTTGTTGAGTATAAAACTAGTTATAATGAAGAAACTAGGTTTCTTTATGGTTCATGGTTATTGACACTTGAGGAAGACGAAGACCCTTTTTGTAAGAAAGGAATAATCATCATCAAAACAAATGGCAAAATTGTGGATTGTGACATTCACAAGGGAATTGAGATTACTTTGGCAAACTCCTTTAAGGAAGCATGGGGCTCATTCTACAACCGAGTTTATAAATCTGACTTAATCTTGCTTATGAAAGACAAAAGGGTTTTCATTATAATGAACGAAATTCCACCCCCCAAATATAGTTTGAAATTAACTTTGGAAGAAACAAAAATAAAGGAGAGCAGAGACAAGAAATATAAGGAAATTAAGAAGAAACAAATCTTGGCCTGAATTTGGTTTTAGATTGTTTTAAATAAAAAGAAATTCTGAACCAATAACATTAGGAGAAATTGTACAGATCAAATGGAATCATATCTTAGAGAGAAAAATATCAATCATTGTGATACACCATGGACGAGAGAAGTGATGAGTAAATTTGTCAATGACTTTGATGTGCTCACTCAGACAATTAAAAACGAGAAAGAAAAAGAAGCAGATGAAGTGAAAATTGATTTTGAACATAAACTTGTTGATCTGAAAAACTGCAGCAAGGATTTTTTCTTGAGTATGAATAAGATAGGGACACCGTGCATTCTAGTAAAGCTAGATAGTCCTTACAAGGAAATCACTCAACACAATGCTTCCATTGTTTTGGGTTCACAATTTCCGAAAAAATGGTCAGAAAAGAATATGCTTGAACTGTTTTTGTTCAGAGAAACTTTTCTCAAGGAAGCAAGAGACGACTGTATTCCTCTTATCAACCCGGAGCTTGGACAGAAAGGTTCTATAGATCTTATCAAGCGATTGAAGAAACTTAGCCTTGCTTCAAGTGAGTCAGGAGTGTTTCTGAAATTTTCTGGAAATCTAATAAACCATGAAATCTCCCTCTTGGAAAAACAACTTCTAGGAACAAAGAAAAGGCAGAAAGTGACTTATGAAATTAGTGAAGATGCTGCAAAGAACTACTGGGTCTTAGATATTTTTGAGCACCTAAACAAGAACATATTGAGGAGTGCCAGTGCCAAACATAACAATCGTGAGTTGGACACAAGCATTGAATATTATGAAGGAAAGAGGTTGAACACTAGGTACTTCCCTATAGGAGCCTCAATCTCAAAAATCGAGTTTGAAAAGGAAGGAAGATATCTGATCATCTTTTTGTCATCGACAATTTGTGCTTATTATTGGGATGATGGTTTTCAGGTGTACTTGGGAAGGCCTGATATGCTACAGTACAGTTTGTATTTGGCAGACAATCTATTGTCGCTTAGCATCATTCGGACCCAAATGTCAGAATCTGAGAAAAAGTTTTTGGATTACTACACTAATCTATTATATGAACCAGAAGACATCAGGATAGGAATGGGAGGTCTTTATGAAACAACATGTCTTCTTCTTTCTGACATGAAGACTCTTTCAGCGAGTATGCCAATCCTTGATAATGTTGTGGAATCGATTAATGTTTCTCTTAGCCATACAGAAAAACTTATTGAGATCTGTCAAGAATCAGAGCCCGAAATTTGTATCAGAATGTCCTCTATAGGTAAAACGCTAATCATTGCAAGCACAAAACCAGGAAAAGGAATCAGTAGATATACACAACGGACAAATCGAGACAACACAGTTAATGAAAACACTGTAAGAAGGTTAAGATCCTTATTCAAACAAAGAGTTATTTCTGCCTACATAAAGAAACATGGAAGAGTCCCAAACTTAGTAAGTGTTCCTGAGGATTTAGGTGCTCAGTTAGAAATGAAAGCAGCAGGAGGCAATTATATAAATCAGATGATATCTGAGACTAGCAGATATGATGAAGTAAAGTTAGGAAAGTTCCTAGAGCCTGGTGAAGAAATGAATCTACAATCAAGAATAATCGATAAGGCTTGCTCAAAAGACAGTTATTCCCAAGAAAGTAACTCTGAGAAAGAAATTCATTATTATATCACTCATAACATGGAAGATGTCTTCTCTGAACCAATGGGGATCAAAAAGGAAGCATACAGGTCATCCTCCAGAGTCGCTGAAGTAATCCACAGGTCTGAAGGTCTGCAGAAAAACATAGAAAAATATATGTTGGTCAAACTCTCAGAAAAGGAACGTGAGCAAAAGATTGCTGCTAGATTCTATGGCATTGCTTCCTTCAAATTGAAGCTTTGGATTAGTTCAACAATGGAGATGGTCAAAAGAGCAATGAAACTATTACCTGGACAGATGATGACCATGACGGATGATGAGAGAAGAGAAATCATGTTTAAAATGTCAGAGAAGTTACTAGAAGAGGATACATATTCTCTCTTTTTGGATTATTCTGGTCATAATACGTCTCAAAGGCCTGAAAATACAAATTTTATAATGGAAGAAATAGCTAACATGTATGGTTATTTTGAGGGATCGCGTGAATATGAAGAATTTACTTCATTGCCTTATGTCTTTAGTAATATCCATTTAATAGTGGAAGACACATGGAGTGACATGATCTACTACTCAAAAGGGCAGCTGGGTGCAATTGAAGGATGGTTAGGGGGTTTATGGGGAATTCAATCCCAATTGATGCTGGAGGACATGTTCATGCAATTAGGTGTGAGAGATTTTATTGGAACAACCTATTCTGATGATTCATGTGGTGTGTTCACTCAGAAGTCTATGGATGTACAGAAACTAAATGGAATAATTAAGAATGTTCAGAGATGTGGTGAGGATATGGGACTCATTGTTAAGCTTTCACAAACTCAGGTCACAAATGGGAGATGTTCTATGCTGAAGGAACACTATTACAAGGGTGTGCCTATTGAGATGACATTGAAAAAGATCATGTCAATAAGCCCCAATGGCCCCAAGATTCTTTGTGATGAACTAGAATCTAGTGCCTTGATTGATTCAGGTTTTACATCAAGTTGCACTAGATCTTCAACCATATGGACACAGGCACTAATTAGAAATTTTCGCATCATAAAATTGCTTTCAAGTTCTTTAAGAAAGATGACAGAAGAAATGCTCCAAGATAACCTTGATGAAAGATATCTTTCCAGCAAACATAATTATGAAATTAGCATGAAATCAGCATTGAGAGGACTAAATAAGAACGTAAATAGCAAAGTGTTTATACCTGCACCTCGATCAAGGAACATTGAGTTTTTCCAGTTCCACCAAAATGATCAGGATGTTTTGGACATTGTTCTTATGTTTCTATACTCTCCATACACAATGTATGGGTTTGCTCTAACACCTTTGCCTGACGTATTGATTTCAGGCTATAGTTTGTCTAATGTGAAAAGAATAAGTTATCTCCAAGGAATATTGAAAGTTGAAAACGTCAAGAAGATGGGTTCCTTGATAAATCTTTCACAAAATGCTATCAGTTACCTGGACAATCCGTTTCCTATGATTGGGGGAAGAAAAGATACATCACTTTTTGTAAGGCCAGAGATCGAAAGAATATTATCAAAAGTTGTTACAAACAAGGAACTATTGGACTTCTTATCACTTTATACTCGAGAAGATGAATTGGAATTTAAAGGACAACTAGTTTTAGCATTCAAGAATTGTTTCTCATCCAGAATCACAGGCAAATTCTTAGAGTCAAGTTTATATGCATATGTGCAGGAAATCCTGTCAAAAATAGACAATGCAGCAACAATGAAGATGATTCTTGGTGGAAGGAAGATGATGATGTTGATAGACAAGGCATGGCAAGCGAATTTCAGAATGAAGATAAGACTCAATACTAACACAATCATAAATTATGACGATTTGATGTTTGCTAGAGGTAACAAAGCATTGATATTGCCAAACAAAGAATCAGTGTCACTAAAATTCTTAGAAATAGAAGAAATACCAATCATGGGAAAAGTTCTACACTCAAATCTTAAAAGTATGATCCAACCGATATTCAAAGGCACAACTAAACTAACAGAAGAAGGAAGAAAAGCAAGGCCGCCACAAAGAACTTTCCTTAACTCTGCTAAGTTTGATAGAGAATTAGGAGTAGATGGAATGTTTGAACATAAGTTAATCTTCAAGGCATATGATTTAGTGAGGTATGTAAAATGGCTCATGATGGAACAAGAGAAATTTTCATCTGGAATGTCGGAAATTGATAAGACAACTTTAATCTCCATTTGTGATACAGTGTTGAACACATTTACTGATGCCAAGTATAGTGATATAGAAGAGAATGTTGTGTGTCCTAAAAGTGGAAGATATTTTCATAGGGCATTAACAGGAGGATTCAATCCAAAAACTGGCGATCTTTCCTCCAATCTATTGAGCGGAAATTATGATATAACAGGGGTAGATCAACTTATTGCAAAAACAGGAGGAGTGGATAACAATCTAAACCTCCAATATTTAATGATTTATATCAGGATAGGACTGGCTTTCTTGGAACCAAATGCTTGGGAGTTAGTTCCTTTGACTTTGACTAATGACATTCTCGAACATATCAGAGATGTGTCATTTGTTATCAAAGGATTAAACGAAATAAACATCAGCAAGAAATTATATAAGATGGCCTCAAAGAAGAAAATCAAAGAAAGAGGAAAAATGTATTACAATTATTCCACTTTTGTTGAAAAGAATGAAGATATAGCAGACAAATTCATAAATCATGTTTCTACAACTAAAGAATACTTTGTAAATCAGGAAAGTGCATTTAGGTCTGTTCATTCTTACATGGTAGACCAAATGATAGTTAGTCCAGAATTAGTATCAGATGATATCTTGAAAGGACTAATAGGAGATGAAATCTTTAAAGAAGGTAGGATGACATTCTTTGATAAATTCTACAGGTACTATAAGTCTTTGAATGTCATTGGCAATGAAACTCCCTCACGATCGGTTATTAGAGGACTTCTTTATGAAGAAATGTTCAGTGTTAACGAAAATTCAATAGGCAAACAACTATGGGCTGATGAAATGACAAGATTTGGTTATTCTAGTGGATTCAAGAAGGCCTTAATGAGATTGTTCATTTTGTCTACTTCACTATCATACAGGATGGTAGATCAAGAGAACAACACTGTTAGACTGCAAGTAAACAAACACAGAACGATAGTTAACAGCAAAAACAATTTTGAGAAAATGAGGAAAGGTGTCTGTCAATTTTACATTAAAGACAAAAGAATTACGGAAATGATTGTGAATTCATTCCCTACTTTGGGTTACACGTACTCAGACATTCATTCAGGAGCAAGTATTCTTTGTGATGAGATTAGCAATATTGAGTTTGAACAAATGAGGTTGGGTTCTTATTACCTTAAACTGCACAAGTCCTATACTGAGAAGAAAGAAAACGTGTGTTATGGCCAAGTGGAATTTACTGAGATTAATATTTCAGAGGAAGATTTTAGAGACACCAGAGGCATAGATTCTGCACTGAAGGGATTTGAAACAGCATGTTCATTAATGGTGAGCCCTGAAAAGATATCTTCACCAACGATGTCATCAGTTTATCCAAGTGCAAAAGGTCTATTATCATTATTGAAAGGAAATGGGTTCATTAAAGAGGATGAAAGTGTCATTGAACTTTGCGGTGGAAGAGGTGATTTTCATTTAGCAATGATGGAAAGTAACATAAAACACACAACAATTTCAAGAGAAGATGGTTACAACCTAGTCATGAGAATACCAGGAATGACATCAAAGAAGGTTAGTTTCAACTGTTTCAAACAACAAGACTATATAGGCTATTTTGATCACAACATCATACTGCTTGATATTTCTCACATTACAAGCAAACATGATTGTTTGAGCGGAATCATAGGAGATGCAAGAATTGCTAAGAAGAAGATGATATTGAGATTAAATGGATTAAACAAGTTCTTAAATGAGAAAGTGCTGGATGAAATGAGAGGAGCTGAGTTGAAAGTCTGCTTACCTGCATTGGAGTCTCCTGGTTATGTTTATCTACTAATAGACTTCACAAAACAAAGTGATATGATAAGCACATCTAGTATCAGTGAGAAAAAGGGCTACAATAGATCTATTATATCTTCATCTTTGATTAATGCCGTGTCCAAAGTTGATTTGAAAAATGTGATAACAGTCCCACCCAAGCAAGTTCAAGATCCAACAATGGAAATTATTAATGATGATAAACTAATAGAAATGTTGGTAGAAGAAGACCCTGATTATGTTCATGTAAGTCAAGAAATTAAGAATAAAATAACTTCTTTGAATCAATTTAGAGATAACATGCTCGTGTATGTGTCAAACAAGTACTATGAAAGAAATAGGGGAAAATTGAAAGGATTAGGCAGGAGACTCATCTGCAATGGGAACTGGAGAGATGATAAGAGGTTGCCTGAGAATTTGATCGAACTAGGAAGAAAAATTAGAGAAGATGACCGTGATACAATAGAAGTTGGGAATAAAGTGCTCAGAGACCATCTTATGATTGTCAAGGGAGTAACAGGTATGAACAATGATGAATTGATTAAATTTATGGAAGAGATCTTAAATGTTAAAGACAACAAGAAGAATTCCATAGAATGCTGGAAACTGATCCTTAATTTGTCAGGAAACGAAGAGGTTATCGACTCTAGTGCTATAACAGATATGATTAACATTAAAAAGTTCAAGAAAACAATAGATAGAACCATAAATTCCTCATATGAAATAGCATCAAAAGCAATACTATCTTTCAAAACAGGAAGAATAATAGAAGGTTTGTTAGTAGTTGCGAATATGGGAAATCTTAAAAGAAAAGCAATCTTAGACCATAAGGACAAAACCACACGAACAAACATCTTACATTATAAACTTTACATGAATAGGATAATGCTAGCTTCCAGATCCATGTATACCGAACCGTACTTTTTAGGGATAGATAACAGAAAATTCGAAGAGCTATGGGCAAAAATAGGCACCGAAGAGATATCATTAGATCTAAGAGGATTATCGCAATCTATGAATGATGAAAAGATGCTAGAAAAATTCTTCCAGGAAATAAATAGTGAATACTTCTCATTTGTAGGGCATTTCAATGGAGCAATATCGGATCTATCTCGAAGACTAGACGAAAGCATAACAGACATACCAGAAATAACTGCATTAGATATAGGGCTAGGGGCTACAGAAGAAGATATAGAAATTAACAAAAGCATAGACACTTTTGAGAAATTAACGGAGTTTATGGGAGAAAGTGCAATCATTGGTGCATGGGCAGATATTGAAGAAGATTTCTCTGATTAAGGATAATGAGTTTTGAGACAATGATCAAGAATACTAACATAGTTAATTATATCTCTGACTATCAAAATTCAGGTGACAAGTGACAGGATTCAAAAATTTGCGACTACAGTCATTGCGACTCGCCAGGTTCGAAGGTTCAAAAATAGATCTTTATACA
| 27,837
|
OL472211.1
|
Ophiovirus ranunculi
|
Rivarez,M.P.S., Pecman,A., Bacnik,K., Maksimovic Carvalho Ferreira,O., Vucurovic,A., Seljak,G., Mehle,N., Gutierrez-Aguirre,I., Ravnikar,M., Kutnjak,D., Kogej,Z., Lengar,Z.
|
National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-07-23
|
NGO19ST
|
Ophiovirus ranunculi
|
Ophiovirus
|
Aspiviridae
|
ssRNA(-)
| 7,590
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Solanum lycopersicum
| null |
2019-08
|
SAMN22357975
|
PRJNA772045
|
MAG: Ophiovirus ranunculi isolate NGO19ST segment RNA1, complete sequence
|
CTAAAAATTCACACATTAAAAGTTAATATCTTCAAAAGACACCAGGAGAGTAATAACAGGATGACTACTGAGATTAGAATGACTGGAATAAAGGGCTTTGTTCTCAAGGAAGTGACACATCTTGATCAAGAGATAAAAGAAAGAAATGAGAGAATCCTTTCTGATTTTGTTGAGTATAAAACTAGTTATAATGAAGAAACTAGGTTTCTTTATGGTTCATGGTTATTGACACTTGAGGAAGACGAAGACCCTTTTTGTAAGAAAGGAATAATCATCATCAAAACAAATGGCAAAATTGTGGATTGTGACATTCACAAGGGAATTGAGATTACTTTGGCAAACTCCTTTAAGGAAGCATGGGGCTCATTCTACAACCGAGTTTATAAATCTGACTTAATCTTGCTTATGAAAGACAAAAGGGTTTTCATTATAATGAACGAAATTCCACCCCCCAAATATAGTTTGAAATTAACTTTGGAAGAAACAAAAATAAAGGAGAGCAGAGACAAGAAATATAAGGAAATTAAGAAGAAACAAATCTTGGCCTGAATTTGGTTTTAGATTGTTTTAAATAAAAAGAAATTCTGAACCAATAACATTAGGAGAAATTGTACAGATCAAATGGAATCATATCTTAGAGAGAAAAATATCAATCATTGTGATACACCATGGACGAGAGAAGTGATGAGTAAATTTGTCAATGACTTTGATGTGCTCACTCAGACAATTAAAAACGAGAAAGAAAAAGAAGCAGATGAAGTGAAAATTGATTTTGAACATAAACTTGTTGATCTGAAAAACTGCAGCAAGGATTTTTTCTTGAGTATGAATAAGATAGGGACACCGTGCATTCTAGTAAAGCTAGATAGTCCTTACAAGGAAATCACTCAACACAATGCTTCCATTGTTTTGGGTTCACAATTTCCGAAAAAATGGTCAGAAAAGAATATGCTTGAACTGTTTTTGTTCAGAGAAACTTTTCTCAAGGAAGCAAGAGACGACTGTATTCCTCTTATCAACCCTGAGCTTGGACAGAAAGGTTCTATAGATCTTATCAAGCGATTGAAGAAACTTAGCCTTGCTTCAAGTGAGTCAGGAGTGTTTCTGAAATTTTCTGGAAATCTAATAAACCATGAAATCTCCCTCTTGGAAAAACAACTTCTAGGAACAAAGAAAAGGCAGAAAGTGACTTATGAAATTAGTGAAGATGCTGCAAAGAACTACTGGGTCTTAGATATTTTTGAGCACCTAAACAAGAACATATTGAGGAGTGCCAGTGCCAAACATAACAATCGTGAGTTGGACACAAGCATTGAATATTATGAAGGAAAGAGGTTGAACACTAGGTACTTCCCTATAGGAGCCTCAATCTCAAAAATCGAGTTTGAAAAGGAAGGAAGATATCTGATCATCTTTTTGTCATCGACAATTTGTGCTTATTATTGGGATGATGGTTTTCAGGTGTACTTGGGAAGGCCTGATATGCTACAGTACAGTTTGTATTTGGCAGACAATCTATTGTCGCTTAGCATCATTCGGACCCAAATGTCAGAATCTGAGAAAAAGTTTTTGGATTACTACACTAATCTATTATATGAACCAGAAGACATCAGGATAGGAATGGGAGGTCTTTATGAAACAACATGTCTTCTTCTTTCTGACATGAAGACTCTTTCAGCGAGTATGCCAATCCTTGATAATGTTGTGGAATCGATTAATGTTTCTCTTAGCCATACAGAAAAACTTATTGAGATCTGTCAAGAATCAGAGCCCGAAATTTGTATCAGAATGTCCTCTATAGGTAAAACGCTAATCATTGCAAGCACAAAACCAGGAAAAGGGATCAGTAGATATACACAACGGACAAATCGAGACAACACAGTTAATGAAAACACTGTAAGAAGGTTAAGATCTTTATTCAAACAAAGAGTTATTTCTGCCTACATAAAGAAACATGGAAGAGTCCCAAACTTAGTAAGTGTTCCTGAGGATTTAGGTGCTCAGTTAGAAATGAAAGCAGCAGGAGGCAATTATATAAATCAGATGATATCTGAGACTAGCAGATATGATGAAGTAAAGTTAGGAAAGTTCCTAGAGCCTGGTGAAGAAATGAATCTACAATCAAGAATAATCGATAAGGCTTGCTCAAAAGACAGTTATTCCCAAGAAAGTAACTCTGAGAAAGAAATTCATTATTATATCACTCATAACATGGAAGATGTCTTCTCTGAACCAATGGGGATCAAAAAGGAAGCATACAGGTCATCCTCCAGAGTCGCTGAAGTAATCCACAGGTCTGAAGGTCTGCAGAAAAACATAGAAAAATATATGTTGGTCAAACTCTCAGAAAAGGAACGTGAGCAAAAGATTGCTGCTAGATTCTATGGCATTGCTTCCTTCAAATTGAAGCTTTGGATTAGTTCAACAATGGAGATGGTCAAAAGAGCAATGAAACTATTACCTGGACAGATGATGACCATGACGGATGATGAGAGAAGAGAAATCATGTTTAAAATGTCAGAGAAGTTACTAGAAGAGGATACATATTCTCTCTTTTTGGATTATTCTGGTCATAATACGTCTCAAAGGCCTGAAAATACAAATTTTATAATGGAAGAAATAGCTAACATGTATGGTTATTTTGAGGGATCGCGTGAATATGAAGAATTTACTTCATTGCCTTATGTCTTTAGTAATATCCATTTAATAGTGGAAGACACATGGAGTGACATGATCTACTACTCAAAAGGGCAGCTGGGTGCAATTGAAGGATGGTTAGGGGGTTTATGGGGAATTCAATCCCAATTGATGCTGGAGGACATGTTCATGCAATTAGGTGTGAGAGATTTTATTGGAACAACCTATTCTGATGATTCATGTGGTGTGTTCACTCAGAAGTCTATGGATGTACAGAAACTAAATGGAATAATTAAGAATGTTCAGAGATGTGGTGAGGATATGGGACTCATTGTTAAGCTTTCACAAACTCAGGTCACAAATGGGAGATGTTCTATGCTGAAGGAACACTATTACAAGGGTGTGCCTATTGAGATGACATTGAAAAAGATCATGTCAATAAGCCCCAATGGCCCCAAGATTCTTTGTGATGAACTAGAATCTAGTGCCTTGATTGATTCAGGTTTTACATCAAGTTGCACTAGATCTTCAACCATATGGACACAGGCACTAATTAGAAATTTTCGCATCATAAAATTGCTTTCAAGTTCTTTAAGAAAGATGACAGAAGAAATGCTCCAAGATAACCTTGATGAAAGATATCTTTCCAGCAAACATAATTATGAAATTAGCATGAAATCAGCATTGAGAGGACTAAATAAGAACGTAAATAGCAAAGTGTTTATACCTGCACCTCGATCAAGGAACATTGAGTTTTTCCAGTTCCACCAAAATGATCAGGATGTTTTGGACATTGTTCTTATGTTTCTATACTCTCCATACACAATGTATGGGTTTGCTCTAACACCTTTGCCTGACGTATTGATTTCAGGCTATAGTTTGTCTAATGTGAAAAGAATAAGTTATCTCCAAGGAATATTGAAAGTTGAAAACGTCAAGAAGATGGGTTCCTTGATAAATCTTTCACAAAATGCTATCAGTTACCTGGACAATCCGTTTCCTATGATTGGGGGAAGAAAAGATACATCACTTTTTGTAAGGCCAGAGATCGAAAGAATATTATCAAAAGTTGTTACAAACAAGGAACTATTGGACTTCTTATCACTTTATACTCGAGAAGATGAATTGGAATTTAAAGGACAACTAGTTTTAGCATTCAAGAATTGTTTCTCATCCAGAATCACAGGCAAATTCTTAGAGTCAAGTTTATATGCATATGTGCAGGAAATCCTGTCAAAAATAGACAATGCAGCAACAATGAAGATGATTCTTGGTGGAAGGAAGATGATGATGTTGATAGACAAGGCATGGCAAGCGAATTTCAGAATGAAGATAAGACTCAATACTAACACAATCATAAATTATGACGATTTGATGTTTGCTAGAGGTAACAAAGCATTGATATTGCCAAACAAAGAATCAGTGTCACTAAAATTCTTAGAAATAGAAGAAATACCAATCATGGGAAAAGTTCTACACTCAAATCTTAAAAGTATGATCCAACCGATATTCAAAGGCACAACTAAACTAACAGAAGAAGGAAGAAAAGCAAGGCCGCCACAAAGAACTTTCCTTAACTCTGCTAAGTTTGATAGAGAATTAGGAGTAGATGGAATGTTTGAACATAAGTTAATCTTCAAGGCATATGATTTAGTGAGGTATGTAAAATGGCTCATGATGGAACAAGAGAAATTTTCATCTGGAATGTCGGAAATTGATAAGACAACTTTAATCTCCATTTGTGATACAGTGTTGAACACATTTACTGATGCCAAGTATAGTGATATAGAAGAGAATGTTGTGTGTCCTAAAAGTGGAAGATATTTTCATAGGGCATTAACAGGAGGATTCAATCCAAAAACTGGCGATCTTTCCTCCAATCTATTGAGCGGAAATTATGATATAACAGGGGTAGATCAACTTATTGCAAAAACAGGAGGAGTGGATAACAATCTAAACCTCCAATATTTAATGATTTATATCAGGATAGGACTGGCTTTCTTGGAACCAAATGCTTGGGAGTTAGTTCCTTTGACTTTGACTAATGACATTCTCGAACATATCAGAGATGTGTCATTTGTTATCAAAGGATTAAACGAAATAAACATCAGCAAGAAATTATATAAGATGGCCTCAAAGAAGAAAATCAAAGAAAGAGGAAAAATGTATTACAATTATTCCACTTTTGTTGAAAAGAATGAAGATATAGCAGACAAATTCATAAATCATGTTTCTACAACTAAAGAATACTTTGTAAATCAGGAAAGTGCATTTAGGTCTGTTCATTCTTACATGGTAGACCAAATGATAGTTAGTCCAGAATTAGTATCAGATGATATCTTGAAAGGACTAATAGGAGATGAAATCTTTAAAGAAGGTAGGATGACATTCTTTGATAAATTCTACAGGTACTATAAGTCTTTGAATGTCATTGGCAATGAAACTCCCTCACGATCGGTTATTAGAGGACTTCTTTATGAAGAAATGTTCAGTGTTAACGAAAATTCAATAGGCAAACAACTATGGGCTGATGAAATGACAAGATTTGGTTATTCTAGTGGATTCAAGAAGGCCTTAATGAGATTGTTCATTTTGTCTACTTCACTATCATACAGGATGGTAGATCAAGAGAACAACACTGTTAGACTGCAAGTAAACAAACACAGAACGATAGTTAACAGCAAAAACAATTTTGAGAAAATGAGGAAAGGTGTCTGTCAATTTTACATTAAAGACAAAAGAATTACGGAAATGATTGTGAATTCATTCCCTACTTTGGGTTACACGTACTCAGACATTCATTCAGGAGCAAGTATTCTTTGTGATGAGATTAGCAATATTGAGTTTGAACAAATGAGGTTGGGTTCTTATTACCTTAAACTGCACAAGTCCTATACTGAGAAGAAAGAAAACGTGTGTTATGGCCAAGTGGAATTTACTGAGATTAATATTTCAGAGGAAGATTTTAGAGACACCAGAGGCATAGATTCTGCACTGAAGGGATTTGAAACAGCATGTTCATTAATGGTGAGCCCTGAAAAGATATCTTCACCAACGATGTCATCAGTTTATCCAAGTGCAAAAGGTCTATTATCATTATTGAAAGGAAATGGGTTCATTAAAGAGGATGAAAGTGTCATTGAACTTTGCGGTGGAAGAGGTGATTTTCATTTAGCAATGATGGAAAGTAACATAAAACACACAACAATTTCAAGAGAAGATGGTTACAACCTAGTCATGAGAATACCAGGAATGACATCAAAGAAGGTTAGTTTCAACTGTTTCAAACAACAAGACTATATAGGCTATTTTGATCACAACATCATACTGCTTGATATTTCTCACATTACAAGCAAACATGATTGTTTGAGCGGAATCATAGGAGATGCAAGAATTGCTAAGAAGAAGATGATATTGAGATTAAATGGATTAAACAAGTTCTTAAATGAGAAAGTGCTGGATGAAATGAGAGGAGCTGAGTTGAAAGTCTGCTTACCTGCATTGGAGTCTCCTGGTTATGTTTATCTACTAATAGACTTCACAAAACAAAGTGATATGATAAGCACATCTAGTATCAGTGAGAAAAAGGGCTACAATAGATCTATTATATCTTCATCTTTGATTAATGCCGTGTCCAAAGTTGATTTGAAAAATGTGATAACAGTCCCACCCAAGCAAGTTCAAGATCCAACAATGGAAATTATTAATGATGATAAACTAATAGAAATGTTGGTAGAAGAAGACCCTGATTATGTTCATGTAAGTCAAGAAATTAAGAATAAAATAACTTCTTTGAATCAATTTAGAGATAACATGCTCGTGTATGTGTCAAACAAGTACTATGAAAGAAATAGGGGAAAATTGAAAGGATTAGGCAGGAGACTCATCTGCAATGGGAACTGGAGAGATGATAAGAGGTTGCCTGAGAATTTGATCGAACTAGGAAGAAAAATTAGAGAAGATGACCGTGATACAATAGAAGTTGGGAATAAAGTGCTCAGAGACCATCTTATGATTGTCAAGGGAGTAACAGGTATGAACAATGATGAATTGATTAAATTTATGGAAGAGATCTTAAATGTTAAAGACAACAAGAAGAATTCCATAGAATGCTGGAAACTGATCCTTAATTTGTCAGGAAACGAAGAGGTTATCGACTCTAGTGCTATAACAGATATGATTAACATTAAAAAGTTCAAGAAAACAATAGATAGAACCATAAATTCCTCATATGAAATAGCATCAAAAGCAATACTATCTTTCAAAACAGGAAGAATAATAGAAGGTTTGTTAGTAGTTGCGAATATGGGAAATCTTAAAAGAAAAGCAATCTTAGACCATAAGGACAAAACCACACGAACAAACATCTTACATTATAAACTTTACATGAATAGGATAATGCTAGCTTCCAGATCCATGTATACCGAACCGTACTTTTTAGGGATAGATAACAGAAAATTCGAAGAGCTATGGGCAAAAATAGGCACCGAAGAGATATCATTAGATCTAAGAGGATTATCGCAATCTATGAATGATGAAAAGATGCTAGAAAAATTCTTCCAGGAAATAAATAGTGAATACTTCTCATTTGTAGGGCATTTCAATGGAGCAATATCGGATCTATCTCGAAGACTAGACGAAAGCATAACAGACATACCAGAAATAACTGCATTAGATATAGGGCTAGGGGCTACAGAAGAAGATATAGAAATTAACAAAAGCATAGACACTTTTGAGAAATTAACGGAGTTTATGGGAGAAAGTGCAATCATTGGTGCATGGGCAGATATTGAAGAAGATTTCTCTGATTAAGGATAATGAGTTTTGAGACAATGATCAAGAATACTAACATAGTTAATTATATCTCTGACTATCAAAATTCAGGTGACAAGTGACAGGATTCAAAAATTTGCGACTACAGTCATTGCGACTCGCCAGGTTCGAAGGTTCAAA
| 27,838
|
NC_076997.1
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Cho,S.-Y., Lim,S., Kim,H., Soh,E.H., Moon,J.S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
Taean
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,475
|
RefSeq
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Gladiolus
| null |
2011-06-23
| null |
PRJNA485481
|
Ornithogalum mosaic virus isolate Taean, complete genome
|
AAAAATATAAACTCTCAACAACACAACGAACGAATCAAAACATTCAAGCTTTCAAACTCTCAAACAACTCTTACAATCTAGTCTCCTTGGAACTCACACAAGTTTTTCAGAAGACTCTCTCTTGAACTCCGTCTTTACAAGTTTAATTCATCAACCACTCAATGGCTCTCAGTTTCACCACTCAGATGGCATCGGACTTCACCGGTTTGGCCGGGTTGTCATTTGGTTCCTTTGAACCAAGCATCAAGCCTTTAAGGATGGGTCAGTTTCTCGTGCAGCAAGCCGAGAAACTAACAGAAAAAGCCTTCGCACTGTACAAAGTGGACGTTAGTCCAATTCCATCAAAGGTCAAGCCTGTGAAGGAGGCAGAGCAAAAGAAAACAGTGGAAGACTACACAATTCCACAGCAACTCGTCACAAAAATAGACGTCCCTGAGGTTGTTCTGAAGCCAGAAACACTGGCTACTGGGATAAAACGGGCAACATCTGTCAAACGACCCAGCAAGAAACCGCGTGCACCAATCATAAAGAGCACAGCACAGATTAACTCATTATTTGATCAACTGGTCATTATAATGAAAAAGAAGCTGGGTACTGTTGAGGTCGCTGGGAGCAGTGGGCTCATCAAGTTTAAGAGGACTGAGTACGGCACACTACCCGTCGCTATGGTCAAACATATGCGGCACAAACTCAGTGCAATAGACCTCAATGTTACTGGGTGGGCGTCGAAGGTGCTACAGCGGATAGCGAACATTGCGCGACCACGGACAAATATCGAAACATGTTTCTTAGCGAAGGGGGATAGCGGACTTCTTGTGAATAAGTCGCATCTTCTTGGGGCTATGGTTTCGGATGCTAAGCGAGGATTTCTGGTTGTGCGCGGACGTTGTGTGCACGGAATTGTGGACGCAGTGAGTAAGGCTACAAAGAAACTATTGTCTATGACGGTCCACTATTCTCTGGGAACTCAATACTTTGAAGCTTTCAGCATTGAGTTCCTGAAACATCGAGTGGTCACCCACGAGGGGCCGTGCAATAGAGACATACCCTTAACGGATATAGCAAGGGTCCATGCACAACTTCACCAACTTTTCTTTGGTTGTGGAAAGATCACCTGTCTCAAGTGCATGCAGGAAGTTGCAACTCGTGGTGAACAAAACTTTCTCGAACCAGTACTTAATGGAGTGGCTAGCCTGGAAAATGAACTTCGAGAGGTGAGTTTACCACACATCGCAGCCTTGATGAAATTTATAACCGTGGAACGTGAGAAGAGAAACATTGATATCAATCTACATGCCGATGTCTTAAAAATCACGAACGGCAAGGAGGGCGAAATATTCAAAATGATATCACGGCTCAATGATGCACTGAGCAAATCTGGTTTTGGAGATTCGCAAGCCTTGCGAACTGCACATGTGGAACTTTTACAGATCGCACGTTGGTGCAAAAATCGAACGGATATAAATCAGTCAGGGAATCTCCAAAATTTCAGGAATAAGATTTCTGGTAAAGCACACATTAACACAGCTTTGATGTGTGATAACCAGTTGGACACTAATGGGAATTTCCTCTGGGGTAAGAGAGGGTATCACGCGAAACGATTCTTCGCAAATTATTTTGAGAAGATAAACCCCAAGGATGGATACGCACAACATCGCCTTAGAAAGAATCCAAATGGCGCGCGAGAGTTGGCGATTGGCAATCTATTAATGTCGACAAACTTCGAGGTTTTAAGACAGCAGCTGAAAGGTCACGCTATTGAGTCAGTTGGAATAACGGAAGCGTGTGTTAGTAGATTGAACAATAATTTCTTGTACAGCTGTTGTTGCGCAACTTTAGACGATGGAAAACCCGTATTATCCGATCTCAAGATTCCAACTAAGAACCATCTGGTAATAGGGAATACTGGTGATGCCAAATATGTAGACCTTCCAACAAACGATGACGAATACTTATATATAGCAAAGGAAGGGTACTGTTATGTGAATATATTCTTGGCAATGCTGGTTAATGTTAGTGAAAAAGACGCAAAAGAGTTCACCAAAACGATGGTTCGAGATTTAGTGGTTCCTAAGTTGGGACAATGGCCAAAACTCATTGATGTAGCTACGGCATGCCATTTGCTCAGTGTGTTTTTCCCAGATACAAGAAATGCTGAATTGCCACGAATTTTGGTTGACCATGGAAATAAGACGATGCATGTCGTAGACTCGTACGGATCGTTAACAACAGGGTACCATGTACTTAAAGCAACGACTGTTAACCAACTCATTGGTTTTGCTAGTGATGAGCTCCACAGCGATATGAAGGAATACTATGTCGGTGGTTCACAGAAGCCAGCAACGGCATGGGATTTGAGTAAAACCCTAATAAAAGGGGTCTACAGGCCCAACGTGATGCGAGAAGTTTTGGAGCTTGAGCCATGTCTACTTGCGCTGGGGATATTGTCACCAAGGTTGCTCATAGCTTTGTTCAACAGCGGATCTCTCGATAAAGCAGCATCATACTGGATGGGAAAAGATGATTCTATTGTGCGAATGGTTGCAATTCTCGAAATGTTGGCAAAGAAAGTTTCTATGGCACGCTTGTTAGTCGAGCAAAAACAGATTTTGGATCAGCATGCGCAACACGTGTTTAACGAGGTTTTTACTGGTTTTAGACAACAAATGTCGTATCACACTGTGTGTGAAACACTTTTGGTTATGAAAGCACGTTGTGATTCGGATGAACAACTTGGAAACCTTGGATTCTTGCTTCATGATACGCAAGTTGTCGAACTGTTTGAAAAAAATTATCAAAACGAGTTAGAAGCAGCATGGAACGACTTAACTTGGCGGGAAAAATTATATGCAAGTTGGCATTGGTCAAAATCGCAGCGAAAACTGCAAGAGTTTTACGTTCTTCAAGATACGGGAGGTTCGAAAGACGCATGTTGCAAATCAGTGCAGCAATTTGCGGCATCCACCACAGAGAGTTACAGAAGTGTCCGGGCTGGTTGTTATAAATATGCAATAAGTTTGCGTAATAGAATCAGGCGCAGGTTTGTACAGTCTATCTTCTCTATTATATATATTAGCTTGCAAGATTTAATGAAATTCGCGAATGTATTAGCAATAATAGCGCTTTTGATGAGTATCATAAGCCAAGCACATGATTGGTTACGCATCCACCAAAAATACAAAATGCAAAAGAACCTCGAATTCCAGAGCAAAATGGATTTAGTGATACAACACGCTTATGCCTCTGCATACGTACAGGATGTCAGACCAACCACTGAGGAATTTGAGGCAAAGTTGAAGGAGCTGGGAGAAGACGTGTGGTCATATTACGAAACTTATTGGCTGGGTGCTGCTGGCGTAAAGCATCAAGCAAAGAATCCACAAGAACATCAGCTTGAACAAGTCATTGCATTTATGACTCTACTATCTATGATGTACAGCCCTGAGAGAAGTGACGGTCTTTTCAAAATTCTAAACAAGGTAAAAGGGGTGTTAGGCACAATTGAAGGTGGAGTCTACCATCAACTGGATGAGATTCAAGATGTCTTCTCAGAGAAGAACTTGACGATAGATTTCGAGCTGGACGGCGAGAACCAAATTGACCACACGACATTTGACGTGACCTTTGGGAATTGGTGGCAACAACAACTTGATTCGAATAGAGTTGTACCTCATTACCGAAACGGAGGGCACTTCTTGGAGTTTACTCGAAATACATGTGTAGAAGTGTGCAACCGGATACACACAACAGCACAGCAGGAATTTCTCATTCGAGGAGGCGTTGGATCGGGAAAGTCAACTGGGCTTCCATTCCATCTATCGGGTCGCGGTCAAGTTCTAATTATCGAACCAACAAGGCCATTGGCGGAAAACGTGTGTAAACAATTGCGTGGAGAACCATTTCTCACATTTCCTACGCTCCGAATGCGTGGATTAGTTTCATGTGGATCAGCTCCAATCGATATTATGACTAGCGGATATGCCTTACATTATCTAGCTAACACGCGAACAATGCTCAATGCATACTCTTTCATAATTTTTGACGAGTGCCATGTTTTGGATAGCGCTGCAATGGCTTTCTACAGCCTCCTCAAAGAGTCACAATTTCAAGGAAAAATACTCAAAGTCTCAGCGACACCACCTGGACGAGAAACTGAGTTCTCTACAATGAGAACTGTGACATTGGCCACAGAGGAGAGTATCTCATTTGACGCTTTCGTTAAGCAGCAAGGAACGGGTAGTAACGTTGATGTTGTTTCAAAAGGAGATAACATTCTTGTATATGTAGCTAGCTATAATGAGGTGGATAGTTTAAGTAAATTGCTAACAGATAAGGGTTATATTGTAACTAAGGTCGATGGGCGTACAATGAAAGTTGGTAGTGTCGAGATTCAAACACGTGGCAGCCCAAGTCATAAGCATTTCATTGTAGCCACTAACATCATCGAGAACGGAGTAACCTTAGACATAGATGTTGTAGTAGATTTTGGAACCAAGGTTATTGCCGACATTGACATAGATAATAGAATGATGTCTTTCAAGAAGATTCCAGTCTCATATGGCGAAAGAATTCAACGACTTGGACGGGTCGGAAGAGTTAAAGATGGCCATGCACTACGGATCGGTTCTACTGAAAAAGGTGTATTGGAAATTCCAACCGCGGTGGCAAACGATGCAGCATTCCTCTGTTTCGTGTACGGCTTGCCCGTGATGACTCACAACGTGACAACCAGCCTTCTGGCGAATTGCACGAGAAAGCAAGCTACGACTATGATGCAGTTTGAGCTCTCGCCATATTTCACTGTAGGACTTGTCCGTTTCAACGGAACAATGCATCCTATAATTCACGATATGCTCAAATCATACAAGCTGAGGGATAGCGAGATCCATTTAAGCACTCTAGCAGTACCCTTTAAACAGACAGGCTCTTGGATCACGGTCTCACAGTATAGAGCGATGGGTGCGAAGTTAGAACTTCCTGATACAACTCGACTGCCTTTTTACCTCAAGGACATTCCTGATCGCTTATACGAGAAAATCTGGAAATGTGTAATCGAGCACAGAGGTGACGCAGGTTTTGGTAGGCTAACAACCCACTGCGCAGCTAAAGTGGCTTACACGCTTAGCACCGATCCTGTGGCGATACCGAGAACTGTAACAATCATAGATGCATTGATTAAACAAGAACAAGAAAAGCAAGCATATTTCAGAACGCTGCAAATGCAGAACTGCTCAGTTGGCTCTTTCTCCCTCGCTTCAATTGCTAACGCTTTGCGCTCTAGGTATTCCGTTGATCATACAAGCGACAATATCGAAATCTTGCAGCGCGCAAAAGCCCAGCTCATGGATTACTCGACCACGAATCCCACGGTTCAAAGCGCAGAAATGCTCACGAATTATGGGGTCCTCAATGTTGTGCAACACCAGAGCGCACCAGGCGTGGTAAAAGCATTGCAACTCAAGGGTAAATGGAAGGGAGAATTACTGACACGAGATATCTTTATCAGTGGATGTGTTTTTGTTGGTGGAATTTGGATGATATGGAAATATTTCAAGAGCAAAAGCCTGGAAAGTGTTATTCATCAAGGTATGGGTAAGCGGCAGAGGCAAAAACTCAAGTTTAGGAACACAGCGCTCGGAAAGTTGGGGAGAGAGGTGTATGGAGATGACGACACGATCGAACACCACTTTGGTTCAGCATATACTGCAAAGGGAAAGACAAAAGGACGCCACACCACTAGAGGAATGGGAACAAAAACGAGACATTTCATGAACATCTATGGATTCGATCCATCCGAGTACACAATCGTCCGTTATGTTGATCCGCTCACAGGGGCGACACAAGATGAGAATCCTCTTATGGCAATTGACCTTGTGCAAGAGCATTTTGCAAAAATTCGAAGTCAATTGATATCGGAAGATAAGTTGGAAGCTCAACATGTGATTTCACAACCAGGAATACAAGCCTATTACATGAAGAACAAAAATGATGCCGCGCTGAAGGTGGACCTTACCCCACACAATCCTCTGTTAGTTACAAGAACAGGCAACATTGCGGGCTTTCCCGAGAATGAGTTTATTCTAAGACAAACTGGTAAGGCGACTAGCATCAAATTCTCAGACGTTCCGGAGGAGAATGAATTGGTTGAGGTGGAACATGAAGGGAAGAATCTGAACCGAGGACTTCGAGATTACAACGTTGTTTCAAATGTGATATGTCGTTTGACGAATGAGTCCGATGGCCATACAGCTTCGTTATTCGGTTTGGGCTACGGAGGTTACATCATAACAAACCGGCACTTGTTCAAGAATAATAATGGTGTTCTGAAGGTTCAATCACAGCATGGGGATTTCATTGTGAAGAACACCACACAGCTCAGGATGGTACCTGTTGGCAAGACAGACATACTCATCATTCGAATGCCGAAGGATTTTCCGGTTCTACCTCAAAAGCTTCGATTTCGGGCACCCGCGAACGAGGATAAAGTTTGTTTAATAGCTTCCAATTTCCAAGAGAGATATGTCTCAAGTCTTGTGTCTGAAACAAGTTCAGTGTATCCAGTTGGTAACGGAGAATTTTGGCAGCATTGGATTTCAACAAAAGATGGGCATTGTGGACTCCCCTTGACTTCTACAAAAGACGGATTTGTTATTGGAATACACAGTTTGTCTACCATAACGAATTCGAAGAACTTCTTTGCGTCCATACCTGCGAACTTTGAAGAGCAATATCTTTCCAAGTTGGAACAACAGAATTGGACCGCAAATTGGAAGTATAATCCAAATGAGGTTAGTTGGAACGGTTTAAAATTGCAGGAGAACAAGCCAGATAAGATATTTCGAGCTATAAAAGAAGTTTCATCTTTGTTCTCAGACACTGTCTATGAGCAAGGACAGGAATCAGGTTGGCTGTTCCGCGAACTGAAGGATAACCTCAAGGCAGTGGCTATACTCCCAAATCAACTGGTCACAAAACATGTTGTGAAAGGTCCCTGCCAATGCTTCATTCGGTACTTAAATGAGACACCAGACGCCTCTAAGTTCTTCAGACCATTAATGGGACACTACGGGAAAAGTGTGTTGAATAAAGAAGCGTTTGTCAAAGACATAATGAAGTATAGCAAACCAATTGTGTTGGGAGAAGTTGACTTTCAAAAGTTTGAAGAGGGTTTCGACAACGTGATCAGAATGCTCCATGACATTGGTTTTGGAAAGTGCGACTATGTCACAGATGGCATGGAAGTGTACAAGAGTCTCAACTTGAAGGCAGCTGTTGGCGCTATGTACACAGGAAAGAAGCAACAATACTTCGATGGGATGAGCGAAGAAGAAGTTAACCAGCTGGTTACCGCAAGTTGTTTTAGACTCTGGTCTGGCAAATTTGGAGTATGGAATGGTTCATTGAAAGCTGAACTTCGACCGATGGAAAAAGTGCAAGCTTGCAAAACGCGTACATTCACGGCTGCTCCACTGGACACATTACTCGGTGCGAAAGTGTGTGTTGATGATTTCAACGCGCAATTTTACGACAAGCATCTCTTAGCACCTTGGACTGTAGGAATTTGCAAATACTACAAAGGGTGGGACGCATTCATGGGTAAACTTCCTGACGGGTGGTTATACTGCGACGCTGATGGATCGCAATTTGACAGCTCGTTAACACCTTTCCTCATTAATAGTGTCTTAAGACTTAGACTTGAGTTCATGGAGGAATGGGATGTTGGTTCACGCATGCTATCAAATTTGTATACGGAGATTATTTACACACCTATAGCCACACCTGATGGAACAATTGTAAAGAAGTTTCGCGGAAACAACAGTGGGCAGCCTTCAACTGTTGTTGACAACACTTTGATGGTCGTGTTGGCTATGAACTATGCATTAGCAAAACTGTCGATTCCATATGAGGAAATGGAGTCACGGATTCGCTACTTTGCAAATGGTGACGACCTTCTGATAGCGGTTGAACCCACACGAGGGGGTGAAATTCTCGATTCACTTCAAGCATCATTCTCTGAACTGGGACTCAACTATGATTTCAACGACAGAACTTTCGACAAGACGCAGCTCAGCTTCATGTCTCACCAGGCTTTGTGGGATGGAGACATGTATATACCAAAGATCAAACAGGAGCGAGTGGTGTCGATTTTGGAATGGGACAGAAGCGTTTTACCAGAGCACAGAATTGAAGCTGTATGTGCAGCTATGATCGAGGCGTGGGGTTATCCTGAACTGCTTCAGGAAATACGAAAGTTCTATGCGTATATGGTTACACAGGAACCATATAGTGCAATACATGCTCAAGGCAAAACTCGCTACATTTCCGAGCGAGCACTGGTGACACTCTACAAGGACGAAAAGGTGGTGTTGAGCGACATTGAACCCTACCTTCAAAAGTTGGCCGAAATGAGCTTGGATTGCTTTGATGAAATTGTTTCGCATCAAGCAGAATCTATGGATGCAGGAGGATCAAGCAGACCACCAGCGCCGTTGGTGAGACAACAAGATCAAGATGTTAACGTTGGAACGTTTTCTGTTGCGCGAGTGAAAGCGTTGAGTGACAAGATGATGTTACCAAAGGTGCGAGGTAGAACAGTGCTTAACTTACAGCATTTGGTACAATACAACCCTGAGCAAGTCGAGATTTCAAACACTCGCGCCACAAGAACACAGTTCAATAACTGGTACGACAAGGTGAGAGATAATTATGGGGTTACAGATGACCAAATGACCGTCATTCTAAATGGCTTGATGGTGTGGTGCATTGAAAATGGTACTTCACCAAACTTGAACGGTAATTGGACGATGATGGATGGTGACGAACAAGTCGAATATCCTCTACAACCAATCCTTGAGAATGCGCAGCCAACGTTCAGACAGATTATGGCGCATTTCTCAAACGCAGCCGAGGCGTATATCGAAAAGAGAAACTCGGAACAAAGGTACATGCCAAGGTATGGCAGCCAACGAAATCTGAACGACTACAGCTTAGCCCGCTATGCATTTGATTTTTATGAACTGACGTCCCGAACGCCTAACAGGGCTAGGGAAGCACATATACAAATGAAAGCAGCAGCTCTTCGAAACACCAAAACGAAGTTGTTTGGTTTGGATGGGAAAGTGGGTACCGAGGAAGAGGACACAGAACGGCATGTTGCAAGCGATGTTAATCGTAACATGCATTCACTACTTGGTGTTAATATGTGATTTAGTGAAGGTGAGCTTGATCTACACATGGATTAGTTTACTCTGTTAGCATCCTTTCCTTTGAATTATGCGAGGTATCATTTATCTTAGTGACCAACACAGTCAAGTATTGGGTTGGGTGATAAGGTAAGTGAATATTATAGTGTGATTTCGAACTTATTATTGTTGTATTGTACTTGCTAGGTTAGGTGACTGTTCTAGTTTGCAATGAATTACAACAGGTGACTAATCTAGCACATATTATAATATTTCAATAGTGTGTAAGAGAC
| 736
|
NC_019409.1
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Wylie,S.J., Li,H., Dixon,K.W., Richards,H., Jones,M.G., Jones,M.G.K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2012-11-13
|
KP
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,445
|
RefSeq
| 1
|
Australia
|
Australia
| null | null |
2011-08
| null |
PRJNA485481
|
Ornithogalum mosaic virus, complete genome
|
CAACAACACTCATAAACGCTTAAAACTTCGACTCACGAACTTTCAAGCTTTTAAATCTTCGAATTTTCCGATTTCTTTGAATCCCGACCAAAACATCGTTTATTACTACTCCCACACCTTCACACAATGGCTGTCACATTCTCTTGTAACTTGAACAGCGACATCAGCATTTTCCGAAACATTAGTTTTGGAACGTTCCCCGCCGAACCGACGCCCATTAGGATGGGCCAGCTGCTTGTTAAGCAAGCAGAGAGCCAGATTGAAGCAGCTTTCGCAGGAATCAAAACTTTTCCTGTTGTGCTTTTGGAAAGAGGAAAACCAGCAATTAAAAGCACACGTCGAAACCTGGCGAAGGAAGATTTTACAATTGAACCTCAAATTGTAGATCGAATGATTGCACCGGCAGCGAAACAGGATGCAGCACCACTGGCAAAAGGTGTTAAACGAGCAACTTCTGTCAAGCAGCGGAAGATCCGTATGAAAAGACCTGTAATTAAAAACGAAAACCAAATCCAGCTGATTATTGATCAGGTTATCCACATTATGAAGAAGAAATGCGGAGCAATTGAAATTGCAGGAAGCAGCGGCAGCGTGCGCTTCAAGAGAACCGAGTATGGGACCTTACCATTAGTGAAGGTTCGACACATGGAACGCAAAATACGCGCTGTTGATCTTGGCACAAATGCAGGAGCCAAGAAAATTCTACAACGAATCTCTGACATTGCGCAGCCCAGATACAATATAGAAACATGCTTTCTTAAGAGAGGGGATAGTGGTCTCCTTATAAAGAAGTCACGACTTGTTGGATCATTCTTATCTGATAACGCTCATGATTTCATTGTTGTTCGCGGACGTAGCAAACACGGTATTGTGGATGCAGTGAGCAAAGTGTCTCATGAAGTTCTCACTTCTACTGTTCATTATTCACTTAGTGCACAGTATTTTGACGCCTTCAGTACAGAATTCCTCAGGCATCAGGTCGTCACTCATGAAGGACCGTGCGAGCGAGACATACCATTACCAACAATTGGTAAATTGCACGCCCAACTGTACCAGTTGTTTTTCACCAGTGGGAAAATAACGTGTTTAAAGTGCATGAATGAAATCGCGCAGCGGAGTGGTGAAAATTTTATTGAACCATTATTGGGAGACGTGACAGATCTTGAAAAGGAAATACGCGAAACAAGTTTGCCACATGTGCAAGCGTTAATGCGCACTATCGCCATCGAACGAGAGAAGCGGCAAATTGATATAAGTGTGCATGCGGACATTTTACGCATAACTAATGGCAGAGAAGGGGAAATTTTCAAGATGATATCTCGACTGAATGATGCGCTTAGCAAGTCAGGATTTGGGGATCAATCCGCACTCAAATCCGCACATTCAGAACTATTGCAAATTGCGCGCTGGTGTAAAAATAGGTCAGATATAAATCAGTCAGGTAGCCTTCAAAACTTTCGGAATAAGATATCTGGCAAGGCGCATGTGAACACAGCTCTTATGTGTGACAACCAACTTGATACAAACGGAAACTTTCTGTGGGGAAAGAGGGGTTATCATGCAAAGAGATTCTTTGCAAATTACTTTGAGAAGATCAATCCTAAGGATGGATACGCGCAGCATAGAGTTAGAAAGAATCCGAATGGAGAACGTGAGCTTGCAATCGGTAATTTACTCATGTCCACAAACTTTGAAGTGTTAAGGCAACAACTCAAGGGTAATGCCATTGAATCCGTAGGATTAACAGAGGCGTGTATTAGTAGACTTAATAATAATTTTATGTATAGTTGTTGTTGCGCAACGTTGGATGATGGTAAGCCAGTGCTATCGGACTTGAAAATTCCCACGAAGAATCATTTGGTGATCGGGAATACAGGAGATGCAAAGTACGTCGACTTACCAACAAATGATGATGAGCATTTGTATATATCGAAGGACGGTTATTGTTATGTAAATATATTTCTAGCTATGTTGGTGAATATCAGTGAAAAGGACGCGAAGGAATTTACAAAGACAATGGTGCGAGATCTTGTAGTACCAAAACTTGGCAAATGGCCGAAACTGATTGATGTAGCAACGGCATGCCATCTTCTTAGCGTTTTCTTTCCTGACACACGAAATGCAGAACTTCCGCGAATCCTTGTTGATCACACGAATAAAACAATGCATGTGGTGGACTCGTATGGCTCCCTCACAACCGGATATCATGTGTTAAAAGCTACTACGGTCAACCAACTCATTGGTTTTGCTAGTGACGAACTGCAAAGCGAAATGAAGGACTATTTTGTTGGAGGTAGTAGACAAGGAGTTACAGCATGGGATCTAACAAAAGTCCTTATTAAAAGCATTTACAGACCCACACGCATGCGAGAAGTAATTGAACAAGAACCTTGTTTACTAGCATTAGCGATTCTATCACCACACTTGCTTATGACTTTGTTTAATAGTGGATCCTTCGACCAAGCAGCAGAGTACTGGATAGGAAAGGATGAGTCTATTATTAGACTCGTCGCCATCCTGGAGATGCTTACAAAGAAAGTGTCTATGGCAAGATTGCTAGTAGAGCAACATCAAATCCTTGAGCAACATGCGCAGAATGTTTTCAATGAGGTATTCACTGGTTTTCGTACACAAATGTCATATAACATAGTCACCCAAACTTTGTTGGTACTAAAGTCGCGTTGTGAATCCAATGAACAGCTTGGAAATCTCGGATTTTTCATTCATGACAAAAGAACGCTCGAAATCTTTGAAAAAAATTATTGCAACGAATTGGAAGCGTCATGGAACGAGCTGTCTTGGTCGGAAAAATTTTATGCAAGTTGGCAATGGTCAAAAGCACAGCGAAAGTTGAAAGAATCTTTCGTCCCACTCGACACAGCAGATTCGAGCGGCGTATGCAGAAAGTCACTGCAGCAATTTGCGGAATGCGCGAAGAACAAGTGCAAAGAAGTACGCACTGGTTGTTGTAGACATGTCAAGGAAATGTGTAAAAGCGTGAGACGGAAGTGCATCAGATCGGTTCTCTCCTTGGTTAATGCAAGCATCCCAGATTTAATTAAGGTGGCAAATCTGTTAGCTATCATAACATTGTTGATGGGAATCATAAATCAAGCTCAAGCCTGGCTACACGTTCATCAGAAATATAAAATGCAGAAGAAGCGAGAGAAACAAGATCAAATGGATCAAGCGATTTATCATGCATATCTCTCACTGAAACAAAACGACCAACTGCCAACAGTTGAACAGTTTGAGGACGTTGTTAGGAGACTTGGCGACGAAATTTGGGAGCATTATGAGACATTCTGGAAAGGTTTTGATGTCGTCAAATTCCAAGTAAAGAATCAACAAGAGCAAAACCTTGAAAAGATAATTGCGTTTGTTACACTTCTTTCTATGCTATATAGTCCGGAGCGAAGTGATAGTCTTTTTAAAATTCTCAACAAAGTGAAAGGAGTTCTTGGAACGATTGAAGGTGGGGTTTATCATCAGCTAGATGACATCCAAGACATCATAAGTGAAAAGAACCTGACAATCGATTTCTCGTTAGACAACGAAAAACAAATTGACCATACAACTTTTGATGTTACATTTGGAGATTGGTGGCAGCAACAACTCAATACCAATAGAGTGGTGTCGCATTACAGAACGGGCGGTTACTTCATGGAATTTACACGCGCAACGTGTTTGGAAGTTTGCAACAAAATCCATACGACATCACAACATGAATTCCTCATACGCGGTGGAGTTGGATCGGGTAAGTCAACTGGTTTACCATTCAACTTGTCCAGCAAAGGCCAAGTATTGATCATTGAACCGACGAGACCTTTGGCTGAAAATGTTTGCAAACAACTGAGAAATGAACCATTCCTCGTAAACCCAACTTTGAGGATGCGAGGATTGGTTACTTGTGGTTCAGATGCAATTGATGTAATGACCAGCGGATATGCTTTACACTATCTAGCAAACGCACGCAACCTTCTGAATTCTTATATGTACATAATTTTTGATGAGTGCCATGTGTTAGATAGTTCTGCCATGGCTTTCTATAGCCTCCTCAAGGAGATGCAGTTTTCAGGAAAGATTCTGAAAGTGTCAGCCACACCACCTGGACGTGAGACAGAGTTTACGACTATGAAGACAGTCTCATTAGCAACAGAAGAAAGCATTTCTTTCGAGGCCTTCGTGCGGCAGCAAGGAACTGGTAGTAATGTAGATGTAGTTTCGAAAGGCGATAATATTCTAGTATATGTAGCAAGTTATAATGACGTAGATAATTTAAGTAAATTATTAACAGATAAGGGATACTCCGTAACAAAGGTCGATGGCAGAACCATGAAAGTGGGGAGTGTCGAAATTAGAACACGAGGGAGTCCTTTAAATAAACATTTTGTGGTCGCAACTAACATTATAGAAAACGGTGTAACGCTAGACATAGATGTAGTTGTTGATTTTGGTGTTAAAGTTTGTGCAGATATTGACATAGATAATAGAATGATGGTTTTCAAAAAGATGGCTGTATCATATGGAGAGAGAATTCAGCGATTGGGGCGAGTTGGTCGCGTGAAAGAAGGACATGCCCTTAGAATCGGTCACACTGAGAAGGGTATCACAGAGATTCCAACAGCTGTAGCAACTGATGCAGCTTTCTTGTGCTTTGTCTATGGACTGCCGGTTATGACACACAATGTCACAACTAGTCTTCTTAGCAATTGTACTAGAAAGCAAGCAACAACGATGATGCAGTTTGAACTTTCACCATACTTCACTGTTGGACTCGTTCGTTTTAACGGCACCATGCATCCTATAGTTCATGACATATTGAAACAATACAAACTTAGGGATAGTGAGATACACTTGAGCACATTAGCAGTTCCTTACAAGCATACGGGTTCATGGATAACAGTTTCACAATATAGATCTATGGGCGCTAAACTGGAATTACCAGAAGAAACGCGACTACCGTTTTATCTTAAGGACGTTCCAGATAAGGTGTATGAGAAACTGTGGAAGTGTGTTATCGAACATAGAGGGGATGCTGGATTTGGGAGGCTCACGACACATTGCGCGGCCAAAGTTGCATATACTTTGAGTACGGATCCAATTGCCATCCCTCGAACTGTAACAATAATAAACGCCTTGATTGCTCAAGAGCAAGAAAAACAAGCATACTTCAAAACACTTCAGATGCAGAATTGCTCGGTTGGTTCTTTCTCACTAGCATCAATTGCGAATGCACTACGATCCAGATATGCTGTTGATCACACAAGCGACAACATCGAGCTATTACAGCGAGCGAAAGCTCAGTTGTTGGATTTCGCAGCCTCATCTAACACAGCCCAAGATAGTGAAGTGCTCTCAAATTATGGAGTGTTGCATGTGGTCCAACATCAAGACACTAAATCTATCTCTCGTGCACTAGGATTGAGAGGTAAATGGAATGGAGAACTACTAACTCGTGATATATTTGTGAATGGTTGTGTTCTGAGTGGAGGAATTTGGATGATATGGCAGTTTTTCAAAGGTAAGTTTGGTGAAGAAGTTTCCCATCAAGGGATGGGGAAAAGACAGAGACAGAAACTTAAGTTTCGAAATACTGCATTGGGCAAACTTGGTCGAGAAGTGCATGGCGACGATGGAACAATTGAGCATCATTTTGGAGAAGCGTACACATCAAAAGGAAAGGCAAAAGGGAAGCATGGCACCCGTGGAATGGGTACTAAGACAAGACACTTCATGAATATATATGGCTTTGATCCGTCAGAGTACACGATTGTTCGTTATCTTGATCCATTAACTGGAGCAACACAAGATGAGAATCCCCTGATGGCAATAGATTTGGTTCAAGAACGCTTTGCAGAAATTAGATCACAACTTATTTGTGAGGATAAACTTGAGAAGCAAGCTATTATATCAAATCCAGGTATTCAGGCATTCTACATGAAGAATAAAAGCGACGCAGCTTTGAAAGTTGATCTCACACCGCATAACCCTTTGTTGTTAACACGAACGGGCACCATAGCTGGGTTTCCAGAGAATGAGTTTGTGCTGAGACAAACTGGAAAAGCACAAAATATTAGAGCATCCGATGTACCAGAATCGAATTGTCTTGATGACGTGGAACACGAAGGAAAGAATCTCAACAGGGGTCTCAGGGATTACAACGTGATCTCAAGTGTTGTTTGTCGCTTGACTAATGAGTCTGATGGTCATTCCGCTTCGCTGTATGGTTTGGGCTACGGTGGATACATAATCACAAATCGTCACTTATTCAAGAATAACAATGGCATCCTGAAGGTCCAGTCACAACATGGAGACTTTGTCGTAAAGAATACAACGCAACTTAAAATGACACCGGTCGGTAAGACAGATATTCTAATCATTCGCATGCCGAAAGATTTTCCTGTCTTACCGAGGAGATTACGATTTCGAGCGCCATCCAGCGACGACAAAGTGTGCCTCATCGCATCAAACTTTCAGGAGCGATATGTCTCGAGTCTAGTTTCTGAAACAAGTTCGGTTTACCCTGTTGGAAATGGGGAATTTTGGCAACATTGGATTTCTACGAAGGATGGGCATTGTGGGTTGCCTTTGACGTCAACAAAAGATGGGTTTATAATTGGTATTCATAGTTTGTCAACGATCACAAACTCGAAAAACTTCTTCGCTTCGATACCAAGTAATTTCGAGGAATTATACCTTGATAAGTTAGAACAACAAGCATGGACATCCAACTGGAAGTACAACCCAAATGAAGTAAGCTGGAATGGACTCAAATTGCAGGAGAATAAGCCGGACAACATTTTTAAGGCAATGAAAGAAGTGTCCTCACTCTTTTCAGATCCAGTTTATGAGCAAGGTCAAGAATCTGGATGGCTATTTCGAGAGCTCAAGGATAATCTGAAGGCTGTTGCCATTTTACCAAATCAACTGGTTACAAAACACGTTGTTAAAGGACCGTGCCAATGTTTCATGAAATATCTTAATGAAACACCTGAAGCTGAGACTTTCTTTCGACCTCTCATGGGGCACTATTCAAAAAGCATACTCAGTAAAGAAGCTTTCGTTAGAGACATCATGAAATACAGCAAACCTATAGTTTTGGGGGAAGTCAATTTCTTGAAATTTGAAGAAGGGTACAACAATGTTGTTCGCATGTTTCGGGACTTGGGATTTGAAACTTGCCAGTATGTAACGGACGGAATAGAAATTTACAAGAGCCTGAATCTTAAAGCAGCAGTCGGAGCCTTGTATACTGGGAAGAAGCAGCAATATTTTGAAGGTATGAGCGAAGAAGCAATACAAAAATTGGTGGAGGCCAGTTGTTTTCGTTTGTGGAGCGGGAAGTTTGGGTTGTGGAACGGATCGCTTAAGGCTGAGTTGCGACCAATTGAAAAAGTTCGAGCTGGCAAGACAAGAACTTTCACAGCAGCACCCTTGGACACGTTGTTAGGTGCAAAAGTTTGTGTTGATGACTTCAATGCACAATTTTATGCAAAGCACTTACAAGCGCCTTGGACTGTTGGAATATGCAAGTATTACAGAGGATGGGATGAGTTTATGGCCAAGCTTCCGACTGGTTGGTTGTATTGTGACGCAGATGGTTCGCAATTTGATAGCTCACTAACACCTTTTCTTATCAACAGTGTTTTGAGGTTACGCCTAGAATTCATGGAGGAGTGGGATATTGGTGAACAAATGTTGTCGAATCTTTACACTGAGATTATATATACTCCGATTGCCACACCTGACGGAACAGTTGTTAAGAAGTTTCGTGGCAATAATAGTGGGCAACCGTCGACAGTTGTTGACAACACACTGATGGTGGTTTTGGCAATGAACTATTCTCTCGCGAAACTGGACATCCCATTCGAAGCGATGGATAGCAGGATACGCTACTTTGCTAATGGTGACGATTTGATAATTGCAGTCAATCCGATTGGAGGAGAACACATTTTGGATTCCTTACAAGATTCATTTTCGGAGCTAGGGTTGAACTACGACTTTAACGATCGTACATATAGTAAGGAACAATTGAGCTTTATGTCCCATCAAGCTCTGTGGGATAGGGATATGTACATACCCAAAATAAAAGCAGAGCGAGTGGTTTCTATTTTGGAATGGGACAGAAGTATACTTCCTGAACATCGAATTGAGGCAGTCTGCGCTGCCATGATTGAAGCATGGGGCTTTCCTAACTTGCTGCAAGAGATTAGGAAGTTTTACGCTTATATGGTGACACAGGAACCATATAGTGCCCTACATGCACAGGGGCAAACGAGATATATTTCTGAGCAAGCCCTGATAACGCTTTACAAGGACAGAAAGGTAATTCTTAATGATATAGAACCTTATCTTCAAAAATTGGCAGAGATATCATTAGAATCGGATGAAGAGGAAGTTTGGCATCAGGCGGAATCCATGGACGCTGGCGGTTCTGGTCGACAACAGGATAGTGTTGCGCGACAACAAGACAAGGACGTTAATGTTGGAACGTTCTCTGTAGCACGAGTGAAGCAAATCAGCGACAAGATGATGCTACCAAAAGTGCGAGGAAAGGCAGTCCTCAATCTGCAGCACCTTATCCAATATAGCCCTGAGCAAACAGAAATTTCAAACACAAGGGCGACTCGCACACAATTTGATCATTGGTATGATAAGGTAAGAGAAAGTTATGGTGTAACTGATGAGCAGATGTCAGTTATACTAAACGGCTTAATGGTTTGGTGCATCGAAAATGGGACATCACCAAATTTACAAGGCAATTGGACTATGATGGATGGAGAGGAACAGGTTGAATATCCATTGCAGCCAGTACTTGAGAATGCGCAACCAACTTTTCGACAAATTATGGCGCATTTCTCAAACGCAGCCGAGGCGTATATTGAGAAAAGAAACTCGGAACAAAGGTACATGCCAAGGTATGGCAGTCAACGAAATCTGAACGACTACAGTTTAGCTCGCTATGCATTTGACTTTTATGAGATGACATCTCGAACTCCTAACAGGGCGCGAGAAACACATATACAAATGAAAGCGGCGGCTCTTCGAAACACCAAGACGAAGTTGTTTGGTTTGGATGGAAAAGTGGGTACCGAAGAAGAGGACACGGAACGGCACACGGCAAGCGATGTTCGTCGTGACATGCATTCACTGCTAGGTGTTAGTATGTGATTTAGTGAAGGTGGATTAGTTTAATAATAGAATAATCTACTCCGTTAGCATCCTTTCTTTTGAATTATGCGTAGTAATTGTTCATGTCAGTGACCAACACAGTCAAGTATTGGGTTGGGTGATGACGCGAGCAAGTATTAGTGTGTGATTTCGAACTTATTATTGTTGTATTGTGATTGCTAAATAGGGTGATTGTTTTAGTTTTATGAACTACAACAAGTGACCTATTTAGCAAATATCTATAATATTTCAATAGTGTGTAAGAGACAAA
| 7,178
|
JQ807995.1
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Wylie,S.J., Li,H., Dixon,K.W., Richards,H., Jones,M.G., Jones,M.G.K.
|
Murdoch University, Plant Virology, WA State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2012-11-04
|
SW3.1
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,445
|
GenBank
| 1
|
Australia
|
Australia
| null | null |
2011-08
| null | null |
Ornithogalum mosaic virus isolate SW3.1, complete genome
|
CAACAACACTCATAAACGCTTAAAACTTCGACTCACGAACTTTCAAGCTATTAAATCTTCGAATTTTCCGATTTCTTTGAATCCCGACCAAAACATCGCTTATTACTACTCCCACACCTTCACACAATGGCTGTCACATTCTCTTGTAACTTGAACAGCGACATCAACAATTTCCGAAACATTAGTTTCGGAACGTTCCCCGCCGAATCGACGCCCATTAGGATGGGCCAGCTGCTTGTTAAGCAAGCAGAGAGCCAGATTGAAGCAGCTTTCGCAGGAATCAAAACTTTTCCTGTTGTGCTTCCGGAAAGAGGAAAACCAACAATTAAACGCACACGTCAAAACCTGGCGAAGGAAGATACTACAATTGAACCTCAAATTGTAGATCGAATAATTGCACCGGCAGCGAAACAGGATGCAGCACCACTGGCAAAAGGTGTTAAACGAGCAACTTCTGTCAAGCAGCGGAAGATCCGAATGAAACGACCTGTTATTAAAAACGAAAACCAAATCCAGCTGATTATCGATCAGGTTATTCACATTATGAAGAAGAAATGCGGAGCAATTGAAATTGCAGGAAGCAGCGGCAGCGTGCACTTCAAGAGAACTGAGTATGGGACCTTGCCACTAGTGAAGGTTCGACACATGGAACGCAAAATACGCGCTGTTGATCTTGGCACAAATGCAGGAGCCAAGAAAATTCTACAACGAATCTCTGACATTGCGCAGCCCAGATACAATATAGAAACATGCTTTCTCAAGAGAGGGGATAGTGGTCTCCTGATAAAGAAGTCACGACTTGTTGGATTATTCTTATCTGATAACGCTCATGATTTCATTGTTGTCCGCGGACGTAGCAAACACGGTATTGTGGATGCAGTGAGCAAAGTGTCTCATGAAGTTCTCACTTCTACTGTTCATTATTCACTTAGTGCACAGTATTTTGACGCCTTCAGTACAGAATTCCTCAAGCATCGGGTCGTCACTCATGAAGGACCGTGCGAGCGAGACATACCATTACCAACAATTGGTAAATTGCACGCCCAACTGTACCAGTTGTTTTTCACTAGTGGGAAAATAACATGTTTAAAGTGCATGAATGAAATCGCGCAGCGGAGTGGTGAAAATTTTATTGAACCATTATTGGGAGACGTGAAAGACCTTGAAAAGGAAATACGCGAAACAAGTTTGCCACATGTGCAAGCGTTAATGCGCACTATCGCCATCGAACGAGAGAAGCGGCAAATTGATATAAGTGTGCATGCGGACATTTTACGCATAACTAATGGAAGAGAAGGGGAAATTTTCAAGATGGTATCTCGACTGAATGATGCGCTTAGCAAGTCAGGATTTGGTGATCAATCCGCACTCAAATCCGCACATTTAGAACTATTGCAAATTGCGCGCTGGTGTAAAAATAGGTCAGATATAAATCAGTCAGGTAGCCTTCAAAACTTTCGGAATAAGATATCTGGCAAGGCGCATGTAAACACAGCTCTTATGTGTGATAATCAACTTGATACAAACGGAAACTTTCTGTGGGGAAAGAGGGGTTACCACGCAAAGAGATTCTTTGCAAATTACTTTGAGAAGATCAATCCTAAGGATGGATACGCGCAGCATAGAGTTAGAAAGAATCCGAATGGAGAACGTGAGCTTGCAATCGGTAATTTACTCATGTCCACAAACTTTGAAGTGTTAAGGCAACAACTCAAGGGTAATGCCATTGAATCCGTAGGATTAACAGAGGCATGTGTTAGTAGACTCAATAATAACTTTATGTATAGTTGTTGTTGCGCAACGTTGGATGATGGTAAGCCAGTGCTATCGGACTTGAAAATTCCCACGAAGAATCATTTGGTGATCGGGAATACAGGAGATGCAAAGTACGTCGACTTACCAACAAATGATGATGAGCATTTGTATATATCGAAGGACGGTTATTGTTATGTAAATATATTTCTAGCTATGTTGGTGAATATCAGTGAAAAGGACGCGAAGGAATTTACAAAGACAATGGTGCGAGATCTTGTAATACCAAAACTTGGCAAATGGCCGAAACTGATTGATGTAGCAACGGCATGCCATCTTCTTAGCGTTTTCTTTCCTGACACACGAAATGCAGAACTTCCGCGAATCCTTGTTGATCACACGAATAAAACAATGCATGTGGTAGACTCGTATGGCTCCCTCACAACTGGATATCATGTTTTAAAAGCTACTACGGTCAACCAACTCATTGGTTTTGCTAGTGACGAACTGCAAAGCGAGATGAAGGACTATTTTGTTGGAGGTGGTAGACAAGGAGTTACAGCATGGGATCTAACAAAAGTCCTTATTAAAGGCATTTACAGACCCACCCACATGCGAGAAGTAATTGAACAAGAACCTTGTTTACTAGCATTAGCGATTCTATCACCACACTTGCTTATGGCTTTGTTTAATAGTGGATCTTTCGACCAAGCAGCAGAGTACTGGATGGGAAAGGATGAGTCTATTATTAGACTCGTCGCCATTCTGGAGATGCTTACAAAGAAAGTGTCTATGGCAAGATTGCTGGTAGAGCAACATCAAATCCTTGAGCAACATGCGCAGAATGTTTTCAATGAGGTATTCACTGGTTTTCGTACACAAATGTCATATCACATAGTCACCCAAACTTTGTTGGTACTGAAGTCGCGGTGTGAATCCAATGAACAGCTTGGAAATCTCGGATTTTTCATTCATGACAAAAGAACGCTCGAAATCTTTGAAAAAAATTATTGCAACGAATTGGAAGCGTCATGGAACGAGCTGTCTTGGTCGGAAAAATTTTATGCAAGTTGGCAATGGTCAAAAGCACAGCGAAAGTTGAAAGAGTCTTTCGTCCCACTCGACACAGCAGGTTCGAGCGGCGTATGCAGAAAGTCATTGCAGCAATTTGCGGAATGCGCGAAGAACAAGTGCAAAGAAGTGCGCACTGGTTGTTGTAGACATGTCAAGGAAATGTGTAAAAGCGTGAGACGGAAGTGCATCAGATCGGTTTTCTCTTTGGTTAATGCAAGCATCCCAGATTTAATCAAGGTGGCAAATCTGTTAGCTATCATAACGTTGTTGATGGGAATCATAAATCAAGCTCAAGCCTGGCTACACGTCCATCAGAAATATAAAATGCAGAAGAAGCGAGAGAAACAAGATCAACTGGACCAAGCGATTTATCATGCATATCTCTCACTGAAACAAAATGACCAACTGCCAACAGTTGAACAGTTTGAGGACGTTGTCAGGAAACTTGGCGACGAAATTTGGGAGCATTATGAGACATTCTGGAAAGGTTTTGATGTCGTTAAATTCCAAGTAAAGAATCAACAAGAGCAAAACCTTGAAAAGATAATTGCGTTTGTTACACTTCTTTCTATGCTATATAGTCCGGAGCGAAGTGATAGTCTTTTCAAAATTCTCAACAAAGTGAAAGGAGTTCTTGGAACGATTGAAGGTGGGGTTTATCATCAGCTGGATGACATCCAAGACATCATAAGTGAAAAGAACTTGACAATCGATTTCTCGTTAGACAACGAGAAACAAATTGACCATACAACTTTTGATGTTACATTTGGAGATTGGTGGCAGCAACAACTCAATACCAATAGAGTGGTGTCGCATTACAGAACGGGCGGTTACTTCATGGAATTTACACGCGCAACGTGTTTGGAAGTTTGCAACAAAATCCATACGACATCACAACATGAATTCCTCATACGCGGTGGAGTTGGATCGGGTAAGTCAACTGGTTTACCATTCCACTTGTCCAGCAAAGGCCAAGTATTGATCATTGAACCGACGAGACCTTTGGCTGAAAATGTTTGTAAACAACTGAGAAATGAACCATTCCTCGTAAACCCAACTTTGAGGATGCGAGGATTGGTGACTTGTGGTTCAGATGCAATTGATGTAATGACCAGCGGATATGCTTTACACTATCTAGCTAACGCACGCAACCTTCTGAATTCTTATATGTACATAATTTTTGATGAGTGTCATGTGTTAGATAGTTCTGCCATGGCTTTCTATAGCCTTCTCAAGGAGATGCAGTTTTCAGGGAAGATTTTGAAAGTGTCAGCTACACCACCTGGACGTGAGACAGAGTTTACGACTATGAAGACAGTCTCATTAGCAACAGAAGAAAGCATTTCTTTCGAGGCCTTCGTGCGGCAGCAAGGAACTGGTAGTAATGTAGATGTAATTTCGAAAGGCGATAATATTCTAGTATATGTAGCAAGTTATAATGAAGTAGATAATTTAAGTAAATTATTAACAGATAAGGGATACTCCGTAACAAAGGTCGATGGCAGAACCATGAAAGTGGGGAGTGTCGAAATTAGAACACGAGGGAGTCCTTTAAATAAACATTTTGTGGTCGCAACTAACATTATAGAAAACGGTGTAACGCTAGACATAGATGTAGTTGTTGATTTTGGTGTTAAAGTTTGTGCAGATATTGACATAGATAATAGAATGATGGTTTTCAAAAAGATGGCTGTATCATATGGAGAGAGAATTCAGCGATTGGGGCGAGTTGGTCGCGTGAAAGAAGGACATGCCCTTAGAATCGGTCACACTGAGAAGGGTATCACAGAGATTCCAACAGCTGTAGCAACTGATGCAGCTTTCTTGTGCTTTGTCTATGGACTGCCGGTTATGACACACAATGTCACAACTAGTCTTCTTAGCAATTGTACTAGAAAGCAAGCAACAACGATGATGCAGTTTGAACTTTCACCATACTTCACTGTTGGACTCGTTCGTTTTAACGGCACCATGCATCCTATAATTCATGACATATTGAAACAATACAAACTTAGGGATAGTGAGATACACTTGAGCACATTAGCAATCCCCTACAAGCAGACGGGTTCATGGATAACAGTTTCACAATATAGATCTATGGGCGCTAAACTGGAATTACCAGAAGAAACGCGACTACCGTTTTATCTTAAAGACGTTCCAGATAAGGTGTATGAGAAACTGTGGAAGTGTGTTATCGAACACAGAGGGGATGCTGGATTTGGGAGGCTCACGACACATTGCGCGGCCAAAGTTGCATATACTTTGAGTACGGATCCAATTGCCATCCCTCGAACTGTAACAATAATAAACGCCTTGATTGCTCAAGAGCAAGAAAAACAAGCATATTTCAAAACGCTTCAGATGCAGAATTGCTCGGTTGGTTCTTTCTCACTAGCATCAATTGCGAATGCACTACGATCCAGATATGCTGTTGATCACACAAGCGACAACATCGAGATATTACAGCGAGCGAAAGCTCAGTTGTTGGATTTCGCAGCCTCATCTAACACAGCCCAAGATAGTGAAGTGCTCTCAAATTATGGAGTGTTGCATGTGGTCCAACATCAAGACACTGGAGCTATCTCTCGTGCACTAGGATTGAGAGGTAAATGGAATGGAGAACTACTAACTCGTGATTTATTTGTGAATGGTTGTGTTCTGAGTGGAGGAATTTGGATGATATGGCAGTATTTCAAAGGTAAGTTTGGTGAAGAAGTTTCCCACCAAGGGATGGGGAAAAGACAGAGACAGAAACTTAAGTTTCGAAATACTGCATTGGGCAAACTTGGTCGAGAAGTGCACGGCGACGATGGAACAATTGAGCATTATTTTGGAGAAGCGTACACATTAAAAGGAAAGGCAAAAGGGAAGCATGGCACCCGTGGAATGGGTACTAAGACAAGACACTTCATGAATATATATGGCTTTGATCCGTCAGAGTACACGATTGTTCGTTATCTTGATCCATTAACTGGAGCAACACAAGATGAGAATCCCCTGATGGCAATAGATTTGGTTCAAGAACGCTTTGCAGAAATTAGATTACAACTTATTTCTGAAGATAAACTTGAGAGGCAAGCTGTTACATCAAATCCAGGTATTCAAGCATTCTACATGAAGAATAAAAGCGACGCAGCTTTGAAAGTTGATCTCACACCGCATAACCCTTTGTTGGTAACACGAATAGGCACCATAGCTGGGTTTCCAGAGAATGAGTTTGTGCTGAGACAAACTGGAAAAGCACAAAATATTAAAGCATCCGATGTACCAGAATCGAATTGTCTTGATGACGTGGAACACGAAGGAAAGAATCTCAACAGGGGTCTCAGGGATTACAACGTGATCTCAAGTGTTGTTTGTCGCTTGACTAATGAGTCTGATGGTCATTCCGCTTCGCTATATGGTTTGGGCTACGGTGGATACATAATCACAAATCGTCACTTATTCAAGAATAACAATGGCATCCTGAAGGTTCAGTCACAACACGGAGACTTTGTCGTAAAGAATACAACGCAACTTAAAATGACACCGGTCGGTAAGACAGATATTCTAATCATTCGCATGCCGAAAGATTTTCCTGTCTTACCGAGGAGATTACGATTTCGAGCACCATCCAGCGACGACAAAGTGTGCCTCATCGCATCAAACTTTCAGGAGCGATATGTCTCGAGTCTAGTTTCTGAAACAAGTTCGGTTTACCCTGTTGGAAATGGGGAATTTTGGCAACATTGGATTTCTACGAAGGATGGGCATTGTGGGTTGCCTTTGACGTCAACAAAAGATGGGTTTATAATTGGCATTCATAGTTTGTCAACGATCACAAACTCGAAAAACTTCTTCGCTTCAATACCAAGTGATTTCGAGGAATCATACCTTGATAAGTTAGAACAACAAGCATGGACGTCCAACTGGAAGTACAACCCAAATGAAGTAAGCTGGAATGGACTCAAATTGCAGGAGAATAAGCCGGACAACATTTTTAAGGCAATGAAAGAAGTGTCCTCACTCTTTTCAGATTCAGTTTATGAGCAAGGTCAAGAATCTGGATGGCTATTTCGAGAACTCAAGGATAATCTGAAGGCTGTTGCCATTTTACCAAATCAACTGGTCACAAAACACGTTGTTAAAGGACCGTGCCAGTGTTTCATGAAATATCTTAATGAAACACCTGAAGCTGAGACTTTCTTTCGACCTCTCATGGGGCACTATTCAAAAAGCATACTCAGTAAAGAAGCTTTCGTTAGAGACATCATGAAATACAGCAAACCTATAGTTTTGGGAGAAGTCAATTTCTTGAAATTTGAAGAAGGGTACAACAATGTCGTTCGCATGTTTCGGGACTTGGGATTTGAAACTTGCCAGTATGTAACGGACGGAATGGAAATTTACAAGAGCCTGAATCTTAAAGCAGCAGTCGGAGCCTTGTACACTGGTAAGAAGCAGCAATATTTTGAAGGTATGAGCGAAGAAGCAATACAAAAATTGGTGGAGGCCAGTTGTTTTCGTTTGTGGAGCGGGAAGTTTGGGTTGTGGAACGGATCGCTTAAGGCTGAGTTGCGACCAATTGAAAAAGTTCGAGCTGGCAAAACAAGAACTTTCACAGCAGCACCCTTGGACACGTTGTTAGGTGCAAAAGTTTGTGTAGATGACTTCAATGCACAATTTTATGCAAAGCACTTACAAGCGCCTTGGACTGTTGGGATATGCAAGTATTATAGAGGATGGAATGAGTTTATGGCCAAGCTTCCGACTGGTTGGTTGTATTGTGACGCAGATGGTTCGCAATTTGATAGCTCACTAACACCTTTTCTTATCAACAGTGTTTTGAGGTTACGCCTAGAATTCATGGAGGAGTGGGATATTGGTGAACAAATGTTGTCGAATCTCTACACTGAGATTATATATACTCCGATTGCCACACCTGACGGAACAGTTGTTAAGAAGTTTCGTGGCAATAATAGTGGGCAACCGTCGACAGTTGTTGACAACACATTGATGGTGGTTTTGGCAATGAACTATTCTCTCGCGAAACTGGACATCCCATTCGAAGCGATGGATAGTAGGATACGTTACTTTGCTAATGGTGACGATTTGATAATTGCAGTCAATCCGATTGGAGGAGAACACATTTTGGATTCTTTACAAGATTCATTTTCGGAGCTAGGGTTGAACTACGACTTTAACGATCGTACATACAGTAAGGAACAATTGAGCTTTATGTCTCATCAAGCTCTGTGGGATAGAGACATGTACATACCCAAAATAAAGGCAGAGCGAGTGGTATCTATTTTGGAGTGGGACAGAAGTATACTTCCTGAACATCGAATTGAGGCAGTATGCGCTGCCATGATTGAAGCATGGGGCTTTCCTAACTTGCTGCAAGAGATTAGGAAGTTTTACGCTTATATGGTGACACAGGAACCATATAGTGCCTTACATGCACAGGGGCAAACGAGATATATTTCTGAGCAAGCCCTGATAACGCTTTACAAGGACCGAAAGGTAATTCTTAATGATATAGAACCTTATCTTCAAAAATTGGCAGAGATATCATTAGAATCGGATGAAGAGGAAGTTTGGCATCAGGCGGAATCTATGGACGCTGGCGGTTCTGGTCGACAACAGGATAGTGTTGTGCGACAACAAGACAAGGACGTTAATGTTGGAACGTTCTCTGTAGCACGAGTGAAGCAAATCAGCGACAAGATGATGCTACCAAAAGTGCGAGGAAAGGCAGTCCTCAATCTGCAGCACCTTATCCAATATAGCCCTGAGCAAACAGAAATTTCAAACACAAGGGCGACTCGCACACAATTTGATCATTGGTATGATAAGGTAAGAGAAAGTTATGGTGTAACTGATGAGCAGATGTCAGTTATACTAAACGGCTTAATGGTTTGGTGCATCGAAAACGGGACATCACCAAATTTACAAGGCAATTGGACTATGATGGATGGAGAGGAACAGGTTGAATATCCATTGCAGCCAGTACTTGAGAATGCGCAACCAACTTTTCGACAAATTATGGCGCATTTCTCAAACGCAGCCGAGGCGTATATTGAGAAAAGAAACTCGGAACAAAGGTACATGCCAAGGTATGGCAGTCAACGAAATCTGAACGACTACAGTTTAGCTCGCTATGCATTTGACTTTTATGAGATGACGTCTCGAACTCCTAACAGGGCGCGAGAAGCACATATACAAATGAAAGCGGCGGCTCTTCGAAACACCAAAACGAAGTTGTTTGGTTTGGATGGAAAAGTGGGTACCGAAGAAGAGGACACGGAACGGCACACGGCAAGCGATGTTCGTCGTGACATGCATTCACTGCTAGGTGTTAGTATGTGATTTAGTGAAGGTGGATTAGTTTAATAATAAGATAATCTACTCCGTTAGCATCCTTTCTTTTGAATTATGCGTAGTAATTGTTCATGTCAGTGACCAACACAGTCAAGTATTGGGTTGGGTGATGATGCGAGCGAGTATTAGTGTGTGATTTCGAACTTATTATTGTTGTATTGTGATTGCTAAATAGGGTGATTGTTTTAGTTTTATGAACTACAACAAGTGACCTATTTAGCAAATATCTATAATATTTCAATAGTGTGTAAGAGACAAA
| 95,845
|
JQ807996.1
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Wylie,S.J., Li,H., Dixon,K.W., Richards,H., Jones,M.G., Jones,M.G.K.
|
Murdoch University, Plant Virology, WA State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2012-11-04
|
SW3.3
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,447
|
GenBank
| 1
|
Australia
|
Australia
| null | null |
2011-08
| null | null |
Ornithogalum mosaic virus isolate SW3.3, complete genome
|
CAACAACACTCATAAACGCTTAAAACTTCAACTCACGAACTTTCAAGCTTTTAAATCTTCGAATTCTCCGATTTCTTTGAATCCCGACCAAAACATCGCTTATTACTACTCCCACACCTTCACAATGGTTGTCACATTCTCTTGTAACTTGAACAACGACATCAGCATGTTCCGAAACATTAATTTTGGAACGTTCCCCGCCGAATCGACGCCCATTAGGATGGGCCAGCTGCTTGTTAAGCAATCAGAGAGCCAGATTGAAGCAGCTTTCGCAGGAATCAAAACTTTTCCTGTTGTACTTTTGGAAAGAGGAAAACCAGCAATTAAACGCACACGTCAAAACCTGGCGAAGGAAGATATTACAATTGAACCTCAAATTGTAGATCGAATGATTGCACCGGCAGCGAAACAGGATGCAGCACCACTGGCGAAAGGTGTTAAACGAGCAACTTCTGTCAAGCAGCGGAAGATCCGTATGAAAAGACCTGTAATTAAAAACGAAAACCAAATCCAGCTAATTATCGATCAGGTTATCCACATTATGAAGAAGAAATGTGGAGCAATTGAAATTGCAGGAAGCAGTGGCAGCGTGCACTTTAAGAGAACCGAGTATGGGACTTTGCCACTAGTGAAGGTTCGACACATGGAACGCAAAATACGCGCTGTTGATCTTGGCACAAATGCAGGAGCCAAGAAAATTCTACAACGAATCTCTGACATTGCTCAGCCCAGATATAATATAGAAACATGCTTTCTTAAGAGAGGGGATAGTGGTCTCCTTATAAAGAAATCACGACTTGTTGGATCATTCTTATCTGACAACGCTCAGGATTTCATTGTTGTCCGCGGACGTAGCAAACACGGTATTGTGGATGCAGTGAGCAAAGTGTCTCATGAAGTTCTCACTTCTACTGTTCATTATTCACTTAGTGCACAGTATTTTGACGCCTTCAGTACAGAATTCCTCAGGCATCGGGTCGTCACTCATGAAGGACCGTGCGAGCGAGACATACCATTACCAACAATTGGTAAATTGCACGCCCAACTGTACCAGTTGTTTTTCACCAGTGGGAAAATAACGTGTTTAAAGTGCATGAATGAAATCGCGCAGCGGAGTGGTGAAAATTTTATTGAACCATTATTGGGAGACGTGACAGACCTTGAAAAGGAAATACGCGAAACAAGTTTGCCACATGTGCAAGCGTTAATGCGCACTATCGCCATCGAACGAGAGAAGCGGCAAATTGATATAAGTGTGCATGCGGACATTTTACGCATAACTAATGGAAGAGAAGGAGAAATTTTCAAGATGGTATCTCGACTGAATGATGCGCTTAGCAAGTCAGGATTTGGGGATCAATCCGCACTCAAATCCGCACATTTAGAACTATTGCAAATTGCGCGCTGGTGTAAAAATAGGTCAGATATAAATCAGTCAGGTAGCCTCCAAAACTTTCGGAATAAGATATCTGGCAAGGCGCATGTGAACACAGCTCTTATGTGTGATAATCAACTTGATACAAACGGAAACTTTCTGTGGGGAAAGAGGGGTTATCACGCAAAAAGATTCTTTGCAAATTATTTTGAGAAGATCAATCCTAAGGATGGATACGCGCAGCATAGAGTTAGAAAGAATCCGAATGGAGAACGTGAACTTGCAATCGGTAATTTACTCATGTCCACAAACTTTGAAGTGTTAAGGCAACAACTCAAGGGTAATGCCATTGAATCCGTAGGATTAACAGAGGCGTGTGTTAGTAGACTTAATAATAATTTTATGTATAGTTGTTGTTGCGCAACGTTGGATGATGGTAAGCCAGTGCTATCGGACTTGAAAATTCCCACGAAGAATCATTTGGTGATCGGGAATACAGGAGATGCAAAGTACGTCGACTTACCAACAAATGATGATGAGCATTTGTATATATCGAAGGACGGTTATTGTTATGTAAATATATTTCTAGCTATGTTGGTGAATATCAGTGAAAAGGACGCGAAGGAATTCACAAAGACAATGGTGCGAGATCTTGTAGTACCAAAACTTGGCAAATGGCCGAAACTGATTGATGTAGCAACGGCATGCCATCTTCTTAGTGTTTTCTTTCCTGACACACGAAATGCAGAACTTCCGCGAATCCTTGTTGATCACACGAATAAAACAATGCATGTAGTGGACTCGTATGGCTCCCTCACAACTGGATATCATGTTTTAAAAGCTACTACGGTCAACCAACTCATTGGTTTTGCTAGCGACGAACTGCAAAGCGAGATGAAGGACTATTTTGTTGGAGGTGGACAAGGAGTTACAGCATGGGATCTAACAAAAGTCCTTATTAAAGGCATTTACAGACCCACACACATGCGAGAAGTAATTGAACAAGAACCTTGTTTACTAGCATTAGCGATTCTATCACCACGTTTGCTTATGGCTTTGTTTAATAGTGGATCTTTCGACCAAGCAGCAGAGTACTGGATGGGAAAGGATGAGTCTATTATTAGACTCGTCGCCATTCTGGAGATGCTTACAAAGAAAGTGTCTATGGCAAGATTGCTGGTAGAGCAACAACAAATCCTTGAGCAACATGCGCAGAATGTTTTCAATGAGGTATTCACTGGTTTTCGTACACAGATGTCATATCACATAGTTACCCAAACTTTGTTGGTACTGAAGTCGCGTTGTGAATCTAATGAACAGCTTGGAAATCTCGGATTTTTCGTTCATGACAAAAGAACGCTCGAAATCTTTGAAAAAAATTATTGCAACGAATTGGAAGCGTCATGGAACGAGCTGTCTTGGTCGGAAAAATTTTATGCAAGTTGGCATTGGTCAAAAGCACAGCGAAAGTTGAAAGAGTCTTTCGTCCCACTCGACACAGCAGGTTCGAGCGGCGTATGCAGAAAGTCATTGCAGCAATTTGCGGAATGCGCGAAGAACAAGTACAAAGAAGTACGCACTGGTTGTTGTAGACATGTCAAGGAAATGTGTAAAAGCGTGAGACGGAAGTGCATCAGATCGGTTTTCTCCTTGGTTAATGCAAGCATCCCAGATTTAATCAAGGTGGCAAATCTGTTAGCTATCATAACGTTGTTGATGGGAATCATAAATCAAGCTCAAGTCTGGCTACACGTCCATCAGAAATATAAAATGCAGAAGAAGCAAGAGAAACAAGATCAAATGGACCAAGCGATTTATCATGCATATCTCTCACTGAAACAAAATGACCAACTGCCAACAGTTGAACAGTTTGAGGACGTTGTTAGGAAACTTGGCGACGAAATTTTGGAGCATTATGAGACATTCTGGAAAGGTTTTGATGTCGTCAAATTCCAAGTAAAGAATCAACAAGAGCAAAACCTTGAAAAGATAATTGCGTTTGTTACACTTCTTTCTATGCTATATAGTCCGGAGCGAAGTGATAGTCTTTTCAAAATTCTCAACAAAGTGAAAGGAGTTCTTGGAACGATTGAAGGTGGGGTTTATCATCAGCTAGATGACATCCAAGACATCATAAGTGAAAAGAACTTGACAATCGATTTCTCGTTAGACAACGAGAAACAAATTGACCATACCACTTTTGATGTTACATTTGGAGATTGGTGGCAGCAACAACTCAATACCAATAGAGTGGTGTCGCATTACAGAACGGGCGGTCACTTCATGGAATTTACACGCGCAACGTGTTTGGAAGTTTGCAACAAAATCCATACGACATCACAACATGAGTTCCTCATACGCGGTGGAGTTGGATCGGGTAAGTCAACTGGTTTACCATTCCACTTGTCCAGCAAAGGCCAAGTATTGATCATTGAACCGACGAGACCTTTGGCTGAGAATGTTTGCAAACAACTGAGAAATGAACCATTCCTCATAAGCCCAACTTTGAGGATGCGAGGATTGGTGACTTGTGGTTCAGATGCAATTGATGTAATGACCAGCGGATATGCTTTACACTATCTAGCAAACGCACGCAACCTTCTGAATTCTTATATGTACATAATTTTTGATGAGTGTCATGTGTTAGATAGTTCTGCCATGGCTTTCTATAGCCTCCTCAAGGAGATGCAGTTTTCGGGAAAGATTCTGAAAGTGTCAGCCACACCACCTGGACGTGAGACAGAGTTCACGACTATGAAGACAGTCTCATTAGCAACAGAAGAAAGCATTTCTTTCGAGGCCTTCGTGCGGCAGCAAGGAACTGGTAGTAATGTAGATGTAGTTTCGAAAGGCGATAATATTCTAGTATATGTAGCAAGTTATAATGAAGTAGATAGTTTAAGTAAATTATTAACAGATAAGGGATACTCCGTAACAAAGGTCGATGGCAGAACCATGAAAGTGGGGAGTGTCGAAATTAGAACACGAGGGAGTCCTTTAAATAAACATTTTGTGGTCGCAACTAACATCATAGAAAACGGTGTAACGCTAGACATAGATGTAGTTGTTGATTTTGGTGTTAAAGTTTGTGCAGATATTGACATAGATAATAGAATGATGGTTTTCAAAAAGATGGCTGTATCATATGGAGAGAGAATTCAGCGATTGGGGCGAGTTGGTCGCGTGAAAGAAGGACATGCCCTTAGAATCGGTCACACTGAGAAGGGTATTACAGAGATTCCAACAGCTGTAGCAACTGATGCAGCTTTCTTGTGCTTTGTCTATGGACTGCCGGTTATGACACACAATGTCACAACTAGTCTTCTTAGCAATTGTACTAGAAAGCAAGCAACAACGATGATGCAGTTTGAACTTTCACCATACTTCACTGTTGGACTCGTTCGTTTTAACGGCACCATGCATCCTATAATTCATGACATATTGAAACAATACAAACTTAGGGATAGTGAGATACACTTGAGCACATTAGCAGTCCCTTACAAGCATACGGGTTCATGGATAACAGTTTCACAATATAGATCTATGGGCGCTAAACTGGAATTACCAGAAGAAACGCGACTACCGTTTTATCTTAAAGACGTTCCAGATAAGGTGTATGAGAAACTGTGGAAGTGTGTTATCGAACACAGAGGGGATGCTGGATTTGGGAGGCTCACGACACATTGCGCGGCCAAAGTTGCATATACTTTGAGTACGGATCCAATTGCCATCCCTCGAACTGTAACAATAATAAACGCCTTGATTGCTCAAGAGCAAGAAAAACAAGCATACTTCAAAACGCTTCAGATGCAGAATTGCTCGGTTGGTTCTTTCTCACTAGCATCAATTGCAAATGCACTACGATCCAGATATGCTGTTGATCACACAAGTGACAACATCGAGATATTACAGCGAGCGAAAGCTCAGTTGTTGGATTTCGCAGCCTCATCTAACACAGCCCAAGATAGTGAAGTGCTCTCAAATTATGGAGTGTTGCATGTGGTCCAACATCAAGACACTGGCGCTATCTCTCGTGCACTAGGATTGAGAGGTAAATGGAATGGAGAACTACTAACTCGTGATTTATTTGTGAATGGTTGTGTTCTGAGTGGAGGAATTTGGATGATATGGCAGTATTTCAAAGGTAAGTTTGGTGAAGAAGTTTCCCACCAAGGGATGGGGAAAAGACAGAGACAGAAACTTAAGTTTCGAAATACTGCATTGGGCAAACTTGGTCGAGAAGTGCACGGCGACGATGGAACAATTGAGCATCATTTTGGAGAAGCGTACACATCAAAAGGAAAGGCAAAAGGGAAGCATGGCACCCGTGGAATGGGTACTAAGACAAGACACTTCATGAATATATATGGCTTTGATCCGTCAGAGTACACGATTGTTCGTTATCTTGATCCATTAACTGGAGCAACACAAGATGAGAATCCCCTGATGGCAATAGATTTAGTTCAAGAACGCTTTGCAGAAATTAGATCACAACTTATTTCTGAGGACAAACTTGAGAGGCAAGCTATTATATCACATCCAGGTATTCAGGCATTCTACATGAAGAATAAAAGCGACGCAGCTTTGAAAGTTGATCTCACACCGCATAATCCTTTGTTGGTAACACGAATGGGCACCATAGCTGGGTTTCCAGAGAATGAGTTTGTGCTGAGACAAACTGGAAAAGCACAAAATATTAAAGCATCTGATGTACCAGAATCGAATTGTCTTGATGACGTGGAACACGAAGGAAAGAATCTCAACAGGGGTCTCAGAGATTACAACGTGATCTCAAGTGTTGTTTGTCGCTTGACTAATGAGTCTGATGGTCATTCCGCTTCGCTGTATGGTTTGGGCTACGGTGGATACATAATCACAAATCGTCACCTATTCAAGAATAACAATGGCATCCTGAAGGTTCAGTCACAACACGGAGACTTTGTCGTAAAGAACACAACGCAACTTAAAATGACACCGGTCGGTAATACAGATATTCTAATCATTCGCATGCCGAAAGATTTTCCTGTCTTACCGAGGAGATTACGATTTCGAGCGCCATCCAGCGACGACAAAGTGTGTCTCATCGCATCAAACTTTCAGGAGCGATATGTCTCGAGTCTAGTCTCTGAAACAAGTTCGGTTTACCCTGTTGGAAATGGGGAATTTTGGCAACATTGGATTTCTACGAAGGATGGGCATTGTGGGTTGCCTTTGACGTCAACAAAAGATGGGTTTATAATTGGCATTCATAGTTTGTCAACGATCACAAACTCGAAAAACTTCTTCGCTTCAATACCAAGTAATTTTGAGGAATCATACCTTGATAAGTTAGAACAACAAGCATGGACATCCAACTGGAAGTACAACCCAAATGAAGTAAGCTGGAATGGACTCAAATTGCAGGAGAATAAGCCGGACAACATTTTTAAGGCAATGAAAGAAGTGTCCTCACTCTTTTCAGATTCAGTTTATGAGCAAGGTCAAGAATCTGGATGGCTATTTCGAGAGCTCAAGGATAATCTGAAGGCTGTTGCCATTTTACCAAATCAACTGGTTACAAAACATGTTGTTAAAGGACCGTGCCAATGTTTCATGAAATATCTTAATGAAACACCTGAAGCTGAGACTTTCTTTCGACCTCTCATGGGGCACTATTCAAAAAGTATACTCAGTAAAGAAGCTTTCGTTAGAGACATCATGAAATACAGCAAACCTATAGTTTTGGGAGAAGTCAATTTCTCGAAATTTGAAGAAGGGTACAACAATGTTGTTCGCATGTTTCAGGACTTGGGATTTGAAACTTGCCAGTATGTAACGGACGGAATGGAAATTTACAAGAGCCTGAATCTTAAAGCAGCAGTCGGAGCCTTGTATACTGGGAAGAAGCAGCAATATTTTGAAGGTATGAGCGAAGAAGCAATACAAAAATTGGTGGAGGCCAGTTGTTTTCGTTTGTGGAGCGGGAAGTTTGGGTTGTGGAACGGATCGCTTAAGGCTGAGTTGCGACCAATTGAAAAAGTTCGAGCTGGCAAGACAAGAACTTTCACAGCAGCACCCTTGGACACGTTGCTAGGTGCAAAAGTTTGTGTTGATGACTTCAATGCACAATTTTATGCAAAGCACTTACAAGCACCTTGGACTGTTGGAATATGCAAGTATTACAGAGGATGGGATGAGTTTATGGCCAAGCTTCCGACTGGTTGGTTGTATTGTGACGCAGATGGTTCGCAATTTGATAGCTCACTAACACCTTTTCTTATCAACAGTGTTTTGAGGTTACGCCTAGAATTCATGGAGGAGTGGGATATTGGTGAGCAAATGTTGTCGAATCTTTACACTGAGATCATATATACTCCGATTGCCACACCTGACGGAACAGTTGTTAAGAAGTTTCGTGGCAATAATAGTGGGCAACCGTCGACAGTTGTTGACAACACATTGATGGTGGTTTTGGCAATGAACTATTCTCTCGCGAAACTGGACATCCCATTCGAAGCGATGGATAGTAGGATACGTTACTTTGCTAATGGTGACGATTTAATAATTGCAGTCAATCCGATTGGAGGAGAACACATTTTGGATTCCTTACAAGATTCATTTTCGGAGCTAGGGTTGAATTACGACTTTAACGATCGTACATACAGTAAGGAACAATTGAGTTTTATGTCCCATCAAGCTCTGTGGGATAGGGACATGTACATACCTAAAATAAAGGCAGAGCGAGTGGTATCTATTTTGGAATGGGACAGAAGTGTACTTCCTGAACATCGAATTGAGGCAGTCTGCGCTGCCATGATTGAAGCATGGGGCTTTCCTAACTTGCTGCAAGAGATTAGGAAGTTTTACGCTTATATGGTGACACAGGAGCCATATAGTGCCCTACATGCACAGGGGCAAACGAGATATATTTCTGAGCAAGCCCTGATAACGCTTTACAAGGACCGAAAGGTAATTCTTAATGATATAGAACCTTATCTTCAAAAATTGGCAGAGATATCATTAGAATCGGATGAAGAGGAAGTTTGGCATCAGGCGGAATCCATGGACGCTGGCGGTTCTGGTCGACAACAGGATAGTGTTGCGCGACAACAAGACAAGGACGTTAATGTTGGAACGTTCTCTGTAGCACGAGTGAAGCAAATCAGCGACAAGATGATGCTACCAAAAGTGCGAGGAAAGGCAGTTCTCAATCTGCAGCACCTTATCCAATATAGCCCTGAGCAAACAGAAATTTCAAACACAAGGGCGACTCGCACACAATTTGATCATTGGTATGATAAGGTTAGAGAAAGTTATGGTGTAACTGATGAGCAGATGTCAGTTGTACTAAACGGCTTAATGGTTTGGTGCATCGAAAATGGGACATCACCAAATTTACAAGGCAATTGGACTATGATGGATGGAGAGGAACAGGTTGAATATCCATTGCAGCCAGTACTTGAGAATGCGCAACCAACTTTTCGACAAATTATGGCGCATTTCTCAAACGCAGCCGAGGCGTATATTGAGAAAAGAAACTCGGAACAAAGGTACATGCCAAGGTATGGCAGTCAACGAAATCTGAACGACTACAGTTTAGCTCGCTATGCATTTGACTTTTATGAGATGACATCTCGAACTCCTAACAGGGCGCGAGAAGCACATATACAAATGAAAGCGGCGGCTCTTCGAAACACCAAAACGAAGTTGTTTGGTTTGGATGGAAAAGTGGGTACCGAAGAAGAGGACACGGAACGGCACACGGCAAGCGATGTTCGTCGTGACATGCATTCACTGCTAGGTGTTAGTATGTGATTTAGTGAAGGTGGATTAGTTTAATAATGAGATAATCTACTCCGTTAGCATCCTTTCTTTTGAATTATGCGTAGTAATTGTTCATGTCAGTGACCAACACAGTCAAGTATTGGGTTGGGTGATGATGCGAGCGAATATTAGTGTGTGATTTCGAACTTATTATTGTTATATTGTGATTGCTAAATAGGGTGATTGTTTTAGTTTCATGAACTACAACAAGTGACCTATTTAGCAAATATCTATAGTATTTCAATAGTAAGTTCGAAATCACACACTAA
| 95,846
|
JQ807997.1
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Wylie,S.J., Li,H., Dixon,K.W., Richards,H., Jones,M.G., Jones,M.G.K.
|
Murdoch University, Plant Virology, WA State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2012-11-04
|
KP
|
Ornithogalum mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,445
|
GenBank
| 1
|
Australia
|
Australia
| null | null |
2011-08
| null | null |
Ornithogalum mosaic virus isolate KP, complete genome
|
CAACAACACTCATAAACGCTTAAAACTTCGACTCACGAACTTTCAAGCTTTTAAATCTTCGAATTTTCCGATTTCTTTGAATCCCGACCAAAACATCGTTTATTACTACTCCCACACCTTCACACAATGGCTGTCACATTCTCTTGTAACTTGAACAGCGACATCAGCATTTTCCGAAACATTAGTTTTGGAACGTTCCCCGCCGAACCGACGCCCATTAGGATGGGCCAGCTGCTTGTTAAGCAAGCAGAGAGCCAGATTGAAGCAGCTTTCGCAGGAATCAAAACTTTTCCTGTTGTGCTTTTGGAAAGAGGAAAACCAGCAATTAAAAGCACACGTCGAAACCTGGCGAAGGAAGATTTTACAATTGAACCTCAAATTGTAGATCGAATGATTGCACCGGCAGCGAAACAGGATGCAGCACCACTGGCAAAAGGTGTTAAACGAGCAACTTCTGTCAAGCAGCGGAAGATCCGTATGAAAAGACCTGTAATTAAAAACGAAAACCAAATCCAGCTGATTATTGATCAGGTTATCCACATTATGAAGAAGAAATGCGGAGCAATTGAAATTGCAGGAAGCAGCGGCAGCGTGCGCTTCAAGAGAACCGAGTATGGGACCTTACCATTAGTGAAGGTTCGACACATGGAACGCAAAATACGCGCTGTTGATCTTGGCACAAATGCAGGAGCCAAGAAAATTCTACAACGAATCTCTGACATTGCGCAGCCCAGATACAATATAGAAACATGCTTTCTTAAGAGAGGGGATAGTGGTCTCCTTATAAAGAAGTCACGACTTGTTGGATCATTCTTATCTGATAACGCTCATGATTTCATTGTTGTTCGCGGACGTAGCAAACACGGTATTGTGGATGCAGTGAGCAAAGTGTCTCATGAAGTTCTCACTTCTACTGTTCATTATTCACTTAGTGCACAGTATTTTGACGCCTTCAGTACAGAATTCCTCAGGCATCAGGTCGTCACTCATGAAGGACCGTGCGAGCGAGACATACCATTACCAACAATTGGTAAATTGCACGCCCAACTGTACCAGTTGTTTTTCACCAGTGGGAAAATAACGTGTTTAAAGTGCATGAATGAAATCGCGCAGCGGAGTGGTGAAAATTTTATTGAACCATTATTGGGAGACGTGACAGATCTTGAAAAGGAAATACGCGAAACAAGTTTGCCACATGTGCAAGCGTTAATGCGCACTATCGCCATCGAACGAGAGAAGCGGCAAATTGATATAAGTGTGCATGCGGACATTTTACGCATAACTAATGGCAGAGAAGGGGAAATTTTCAAGATGATATCTCGACTGAATGATGCGCTTAGCAAGTCAGGATTTGGGGATCAATCCGCACTCAAATCCGCACATTCAGAACTATTGCAAATTGCGCGCTGGTGTAAAAATAGGTCAGATATAAATCAGTCAGGTAGCCTTCAAAACTTTCGGAATAAGATATCTGGCAAGGCGCATGTGAACACAGCTCTTATGTGTGACAACCAACTTGATACAAACGGAAACTTTCTGTGGGGAAAGAGGGGTTATCATGCAAAGAGATTCTTTGCAAATTACTTTGAGAAGATCAATCCTAAGGATGGATACGCGCAGCATAGAGTTAGAAAGAATCCGAATGGAGAACGTGAGCTTGCAATCGGTAATTTACTCATGTCCACAAACTTTGAAGTGTTAAGGCAACAACTCAAGGGTAATGCCATTGAATCCGTAGGATTAACAGAGGCGTGTATTAGTAGACTTAATAATAATTTTATGTATAGTTGTTGTTGCGCAACGTTGGATGATGGTAAGCCAGTGCTATCGGACTTGAAAATTCCCACGAAGAATCATTTGGTGATCGGGAATACAGGAGATGCAAAGTACGTCGACTTACCAACAAATGATGATGAGCATTTGTATATATCGAAGGACGGTTATTGTTATGTAAATATATTTCTAGCTATGTTGGTGAATATCAGTGAAAAGGACGCGAAGGAATTTACAAAGACAATGGTGCGAGATCTTGTAGTACCAAAACTTGGCAAATGGCCGAAACTGATTGATGTAGCAACGGCATGCCATCTTCTTAGCGTTTTCTTTCCTGACACACGAAATGCAGAACTTCCGCGAATCCTTGTTGATCACACGAATAAAACAATGCATGTGGTGGACTCGTATGGCTCCCTCACAACCGGATATCATGTGTTAAAAGCTACTACGGTCAACCAACTCATTGGTTTTGCTAGTGACGAACTGCAAAGCGAAATGAAGGACTATTTTGTTGGAGGTAGTAGACAAGGAGTTACAGCATGGGATCTAACAAAAGTCCTTATTAAAAGCATTTACAGACCCACACGCATGCGAGAAGTAATTGAACAAGAACCTTGTTTACTAGCATTAGCGATTCTATCACCACACTTGCTTATGACTTTGTTTAATAGTGGATCCTTCGACCAAGCAGCAGAGTACTGGATAGGAAAGGATGAGTCTATTATTAGACTCGTCGCCATCCTGGAGATGCTTACAAAGAAAGTGTCTATGGCAAGATTGCTAGTAGAGCAACATCAAATCCTTGAGCAACATGCGCAGAATGTTTTCAATGAGGTATTCACTGGTTTTCGTACACAAATGTCATATAACATAGTCACCCAAACTTTGTTGGTACTAAAGTCGCGTTGTGAATCCAATGAACAGCTTGGAAATCTCGGATTTTTCATTCATGACAAAAGAACGCTCGAAATCTTTGAAAAAAATTATTGCAACGAATTGGAAGCGTCATGGAACGAGCTGTCTTGGTCGGAAAAATTTTATGCAAGTTGGCAATGGTCAAAAGCACAGCGAAAGTTGAAAGAATCTTTCGTCCCACTCGACACAGCAGATTCGAGCGGCGTATGCAGAAAGTCACTGCAGCAATTTGCGGAATGCGCGAAGAACAAGTGCAAAGAAGTACGCACTGGTTGTTGTAGACATGTCAAGGAAATGTGTAAAAGCGTGAGACGGAAGTGCATCAGATCGGTTCTCTCCTTGGTTAATGCAAGCATCCCAGATTTAATTAAGGTGGCAAATCTGTTAGCTATCATAACATTGTTGATGGGAATCATAAATCAAGCTCAAGCCTGGCTACACGTTCATCAGAAATATAAAATGCAGAAGAAGCGAGAGAAACAAGATCAAATGGATCAAGCGATTTATCATGCATATCTCTCACTGAAACAAAACGACCAACTGCCAACAGTTGAACAGTTTGAGGACGTTGTTAGGAGACTTGGCGACGAAATTTGGGAGCATTATGAGACATTCTGGAAAGGTTTTGATGTCGTCAAATTCCAAGTAAAGAATCAACAAGAGCAAAACCTTGAAAAGATAATTGCGTTTGTTACACTTCTTTCTATGCTATATAGTCCGGAGCGAAGTGATAGTCTTTTTAAAATTCTCAACAAAGTGAAAGGAGTTCTTGGAACGATTGAAGGTGGGGTTTATCATCAGCTAGATGACATCCAAGACATCATAAGTGAAAAGAACCTGACAATCGATTTCTCGTTAGACAACGAAAAACAAATTGACCATACAACTTTTGATGTTACATTTGGAGATTGGTGGCAGCAACAACTCAATACCAATAGAGTGGTGTCGCATTACAGAACGGGCGGTTACTTCATGGAATTTACACGCGCAACGTGTTTGGAAGTTTGCAACAAAATCCATACGACATCACAACATGAATTCCTCATACGCGGTGGAGTTGGATCGGGTAAGTCAACTGGTTTACCATTCAACTTGTCCAGCAAAGGCCAAGTATTGATCATTGAACCGACGAGACCTTTGGCTGAAAATGTTTGCAAACAACTGAGAAATGAACCATTCCTCGTAAACCCAACTTTGAGGATGCGAGGATTGGTTACTTGTGGTTCAGATGCAATTGATGTAATGACCAGCGGATATGCTTTACACTATCTAGCAAACGCACGCAACCTTCTGAATTCTTATATGTACATAATTTTTGATGAGTGCCATGTGTTAGATAGTTCTGCCATGGCTTTCTATAGCCTCCTCAAGGAGATGCAGTTTTCAGGAAAGATTCTGAAAGTGTCAGCCACACCACCTGGACGTGAGACAGAGTTTACGACTATGAAGACAGTCTCATTAGCAACAGAAGAAAGCATTTCTTTCGAGGCCTTCGTGCGGCAGCAAGGAACTGGTAGTAATGTAGATGTAGTTTCGAAAGGCGATAATATTCTAGTATATGTAGCAAGTTATAATGACGTAGATAATTTAAGTAAATTATTAACAGATAAGGGATACTCCGTAACAAAGGTCGATGGCAGAACCATGAAAGTGGGGAGTGTCGAAATTAGAACACGAGGGAGTCCTTTAAATAAACATTTTGTGGTCGCAACTAACATTATAGAAAACGGTGTAACGCTAGACATAGATGTAGTTGTTGATTTTGGTGTTAAAGTTTGTGCAGATATTGACATAGATAATAGAATGATGGTTTTCAAAAAGATGGCTGTATCATATGGAGAGAGAATTCAGCGATTGGGGCGAGTTGGTCGCGTGAAAGAAGGACATGCCCTTAGAATCGGTCACACTGAGAAGGGTATCACAGAGATTCCAACAGCTGTAGCAACTGATGCAGCTTTCTTGTGCTTTGTCTATGGACTGCCGGTTATGACACACAATGTCACAACTAGTCTTCTTAGCAATTGTACTAGAAAGCAAGCAACAACGATGATGCAGTTTGAACTTTCACCATACTTCACTGTTGGACTCGTTCGTTTTAACGGCACCATGCATCCTATAGTTCATGACATATTGAAACAATACAAACTTAGGGATAGTGAGATACACTTGAGCACATTAGCAGTTCCTTACAAGCATACGGGTTCATGGATAACAGTTTCACAATATAGATCTATGGGCGCTAAACTGGAATTACCAGAAGAAACGCGACTACCGTTTTATCTTAAGGACGTTCCAGATAAGGTGTATGAGAAACTGTGGAAGTGTGTTATCGAACATAGAGGGGATGCTGGATTTGGGAGGCTCACGACACATTGCGCGGCCAAAGTTGCATATACTTTGAGTACGGATCCAATTGCCATCCCTCGAACTGTAACAATAATAAACGCCTTGATTGCTCAAGAGCAAGAAAAACAAGCATACTTCAAAACACTTCAGATGCAGAATTGCTCGGTTGGTTCTTTCTCACTAGCATCAATTGCGAATGCACTACGATCCAGATATGCTGTTGATCACACAAGCGACAACATCGAGCTATTACAGCGAGCGAAAGCTCAGTTGTTGGATTTCGCAGCCTCATCTAACACAGCCCAAGATAGTGAAGTGCTCTCAAATTATGGAGTGTTGCATGTGGTCCAACATCAAGACACTAAATCTATCTCTCGTGCACTAGGATTGAGAGGTAAATGGAATGGAGAACTACTAACTCGTGATATATTTGTGAATGGTTGTGTTCTGAGTGGAGGAATTTGGATGATATGGCAGTTTTTCAAAGGTAAGTTTGGTGAAGAAGTTTCCCATCAAGGGATGGGGAAAAGACAGAGACAGAAACTTAAGTTTCGAAATACTGCATTGGGCAAACTTGGTCGAGAAGTGCATGGCGACGATGGAACAATTGAGCATCATTTTGGAGAAGCGTACACATCAAAAGGAAAGGCAAAAGGGAAGCATGGCACCCGTGGAATGGGTACTAAGACAAGACACTTCATGAATATATATGGCTTTGATCCGTCAGAGTACACGATTGTTCGTTATCTTGATCCATTAACTGGAGCAACACAAGATGAGAATCCCCTGATGGCAATAGATTTGGTTCAAGAACGCTTTGCAGAAATTAGATCACAACTTATTTGTGAGGATAAACTTGAGAAGCAAGCTATTATATCAAATCCAGGTATTCAGGCATTCTACATGAAGAATAAAAGCGACGCAGCTTTGAAAGTTGATCTCACACCGCATAACCCTTTGTTGTTAACACGAACGGGCACCATAGCTGGGTTTCCAGAGAATGAGTTTGTGCTGAGACAAACTGGAAAAGCACAAAATATTAGAGCATCCGATGTACCAGAATCGAATTGTCTTGATGACGTGGAACACGAAGGAAAGAATCTCAACAGGGGTCTCAGGGATTACAACGTGATCTCAAGTGTTGTTTGTCGCTTGACTAATGAGTCTGATGGTCATTCCGCTTCGCTGTATGGTTTGGGCTACGGTGGATACATAATCACAAATCGTCACTTATTCAAGAATAACAATGGCATCCTGAAGGTCCAGTCACAACATGGAGACTTTGTCGTAAAGAATACAACGCAACTTAAAATGACACCGGTCGGTAAGACAGATATTCTAATCATTCGCATGCCGAAAGATTTTCCTGTCTTACCGAGGAGATTACGATTTCGAGCGCCATCCAGCGACGACAAAGTGTGCCTCATCGCATCAAACTTTCAGGAGCGATATGTCTCGAGTCTAGTTTCTGAAACAAGTTCGGTTTACCCTGTTGGAAATGGGGAATTTTGGCAACATTGGATTTCTACGAAGGATGGGCATTGTGGGTTGCCTTTGACGTCAACAAAAGATGGGTTTATAATTGGTATTCATAGTTTGTCAACGATCACAAACTCGAAAAACTTCTTCGCTTCGATACCAAGTAATTTCGAGGAATTATACCTTGATAAGTTAGAACAACAAGCATGGACATCCAACTGGAAGTACAACCCAAATGAAGTAAGCTGGAATGGACTCAAATTGCAGGAGAATAAGCCGGACAACATTTTTAAGGCAATGAAAGAAGTGTCCTCACTCTTTTCAGATCCAGTTTATGAGCAAGGTCAAGAATCTGGATGGCTATTTCGAGAGCTCAAGGATAATCTGAAGGCTGTTGCCATTTTACCAAATCAACTGGTTACAAAACACGTTGTTAAAGGACCGTGCCAATGTTTCATGAAATATCTTAATGAAACACCTGAAGCTGAGACTTTCTTTCGACCTCTCATGGGGCACTATTCAAAAAGCATACTCAGTAAAGAAGCTTTCGTTAGAGACATCATGAAATACAGCAAACCTATAGTTTTGGGGGAAGTCAATTTCTTGAAATTTGAAGAAGGGTACAACAATGTTGTTCGCATGTTTCGGGACTTGGGATTTGAAACTTGCCAGTATGTAACGGACGGAATAGAAATTTACAAGAGCCTGAATCTTAAAGCAGCAGTCGGAGCCTTGTATACTGGGAAGAAGCAGCAATATTTTGAAGGTATGAGCGAAGAAGCAATACAAAAATTGGTGGAGGCCAGTTGTTTTCGTTTGTGGAGCGGGAAGTTTGGGTTGTGGAACGGATCGCTTAAGGCTGAGTTGCGACCAATTGAAAAAGTTCGAGCTGGCAAGACAAGAACTTTCACAGCAGCACCCTTGGACACGTTGTTAGGTGCAAAAGTTTGTGTTGATGACTTCAATGCACAATTTTATGCAAAGCACTTACAAGCGCCTTGGACTGTTGGAATATGCAAGTATTACAGAGGATGGGATGAGTTTATGGCCAAGCTTCCGACTGGTTGGTTGTATTGTGACGCAGATGGTTCGCAATTTGATAGCTCACTAACACCTTTTCTTATCAACAGTGTTTTGAGGTTACGCCTAGAATTCATGGAGGAGTGGGATATTGGTGAACAAATGTTGTCGAATCTTTACACTGAGATTATATATACTCCGATTGCCACACCTGACGGAACAGTTGTTAAGAAGTTTCGTGGCAATAATAGTGGGCAACCGTCGACAGTTGTTGACAACACACTGATGGTGGTTTTGGCAATGAACTATTCTCTCGCGAAACTGGACATCCCATTCGAAGCGATGGATAGCAGGATACGCTACTTTGCTAATGGTGACGATTTGATAATTGCAGTCAATCCGATTGGAGGAGAACACATTTTGGATTCCTTACAAGATTCATTTTCGGAGCTAGGGTTGAACTACGACTTTAACGATCGTACATATAGTAAGGAACAATTGAGCTTTATGTCCCATCAAGCTCTGTGGGATAGGGATATGTACATACCCAAAATAAAAGCAGAGCGAGTGGTTTCTATTTTGGAATGGGACAGAAGTATACTTCCTGAACATCGAATTGAGGCAGTCTGCGCTGCCATGATTGAAGCATGGGGCTTTCCTAACTTGCTGCAAGAGATTAGGAAGTTTTACGCTTATATGGTGACACAGGAACCATATAGTGCCCTACATGCACAGGGGCAAACGAGATATATTTCTGAGCAAGCCCTGATAACGCTTTACAAGGACAGAAAGGTAATTCTTAATGATATAGAACCTTATCTTCAAAAATTGGCAGAGATATCATTAGAATCGGATGAAGAGGAAGTTTGGCATCAGGCGGAATCCATGGACGCTGGCGGTTCTGGTCGACAACAGGATAGTGTTGCGCGACAACAAGACAAGGACGTTAATGTTGGAACGTTCTCTGTAGCACGAGTGAAGCAAATCAGCGACAAGATGATGCTACCAAAAGTGCGAGGAAAGGCAGTCCTCAATCTGCAGCACCTTATCCAATATAGCCCTGAGCAAACAGAAATTTCAAACACAAGGGCGACTCGCACACAATTTGATCATTGGTATGATAAGGTAAGAGAAAGTTATGGTGTAACTGATGAGCAGATGTCAGTTATACTAAACGGCTTAATGGTTTGGTGCATCGAAAATGGGACATCACCAAATTTACAAGGCAATTGGACTATGATGGATGGAGAGGAACAGGTTGAATATCCATTGCAGCCAGTACTTGAGAATGCGCAACCAACTTTTCGACAAATTATGGCGCATTTCTCAAACGCAGCCGAGGCGTATATTGAGAAAAGAAACTCGGAACAAAGGTACATGCCAAGGTATGGCAGTCAACGAAATCTGAACGACTACAGTTTAGCTCGCTATGCATTTGACTTTTATGAGATGACATCTCGAACTCCTAACAGGGCGCGAGAAACACATATACAAATGAAAGCGGCGGCTCTTCGAAACACCAAGACGAAGTTGTTTGGTTTGGATGGAAAAGTGGGTACCGAAGAAGAGGACACGGAACGGCACACGGCAAGCGATGTTCGTCGTGACATGCATTCACTGCTAGGTGTTAGTATGTGATTTAGTGAAGGTGGATTAGTTTAATAATAGAATAATCTACTCCGTTAGCATCCTTTCTTTTGAATTATGCGTAGTAATTGTTCATGTCAGTGACCAACACAGTCAAGTATTGGGTTGGGTGATGACGCGAGCAAGTATTAGTGTGTGATTTCGAACTTATTATTGTTGTATTGTGATTGCTAAATAGGGTGATTGTTTTAGTTTTATGAACTACAACAAGTGACCTATTTAGCAAATATCTATAATATTTCAATAGTGTGTAAGAGACAAA
| 95,847
|
NC_005776.1
|
Oropouche virus
|
Aquino,V.H., Moreli,M.L., Moraes Figueiredo,L.T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2004-03-04
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,846
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Oropouche virus segment L, complete genome
|
AGTAGTGTGCTCCTATTCCGAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCACAACTGTTGCTCAACCAATATCGGAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAGATAGCAAAGGATATATGGCGAGATCTATTAAATGATCGACACAATTACTTTTCTCGGGAATTTTGCAGAGCTGCAAATCTTGAGTACAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTTCTTGATGGTTATAAAGCAAGGAAAGTTCGCTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTACATGATGGAAAGATGTATATAATAGACTTCAAAGTGTCTGTAGACGACCGATCTTCTAGAATCACAAGGGAGAAATATAATGAGATTTTTGGAGAGGTATTCAATCCAGAAGGTGTAGATTTTGAAATTGTTATTATTAGATTAGATCCTTCAAATATGACGATACATGTGGACTCTCGAGATTTCGTGAATACAATTGGGCCGATTACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTGTTCGGGAAATTTCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGACACCCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAATTCATGAGTTCAATGCCAGAGGCAGAACAGGCCCTATTCAAGGAAGCATTGGAATTCAAATCATTTGGGGCAGAAAAATGGAATATCTTTTTGAAGGGGGTGATGTCAAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACTAAAGGACATGCTCATTCTATATTTCTGACAACAGGGGACTACCCCAAGCCAGACAAAGACCAAATTTCAGCAGGTTGGAGAGAAATGGTAAACAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCAAAGAATGATTCAAATAGCAACAATAATATACAAAAGCTAATCAAACTATCTAAATCACTGCAAGCTATGAGCGGGACAGGGAGCTATGTAAATGCTTTCAAGTCATTAGGGAGATTAATGGATATATCATCAGATGTTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGGAAATTGAAATCTCTGGCAAGGTCTAGTATAAAAAAACTTGACAGGAAAATAGAGCCAATACAAATTGGGACTGCAACTGTCTTATGGGAACAGCAATTTAAACTAGATACAGATGTTATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATCTTGGGATCGGTAAGCACAAATCATTTTCAAAGAAATTAAACAACGACATAAATACTGATAAGCCTAAAATATTAAATTTCAACAATGATGATATAGTCAGGAAATGCAAAGATAAATATAATCAAGTCATACATAACCTATCCCAAATCAATGAATTAGATAAGATTGGAAACTACCTAGAGCACTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGATTTTATATATAATACAACCAAAACTAAATACTGGCAATGCATCAATGACTATTCCACCCTAATGAAAAACATGTTAGCTGTCTCTCAATATAATAGACACAATACGTTTAGAATTGTCTCATGTGCAAACAATAATGTATTTGGTCTAGTAATGCCAAGCTCAGATATAAAGACAAAAAAAGCAACTTTAGTCTATGCAATAATGGCTCTCCATAATGAGGAGGCAGAAATAGCAGAACTTGGCTCACTCTACTCAACTTTTAAGACAGCAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGGCTGGATAAAGAAAGATGCCAACGCATAGTATCCTCTCCAGGCTTGTTCCTCATGACAAGCTGCCTATTATTCAACGGTAACAAGAGTTTAGAATTTGATAAATTACTAGGATTTTCATTTTTTACGTCAATATCAATTACGAAAGCTATGCTCTCCCTTACTGAGCCTTCACGTTATATGATCATGAACTCGTTAGCAGTTTCCAGCCATGTAAGAGAGTATATATCTGAAAAATTCTCCCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGACTTAATCAAGAAGGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGAAAAAAAGTACAAATAAGAGACATAAAATTAACAGATTATGATATAACACAAAAGGGAGTGGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCTATTTGGTTCCCAGGAAAGGTAAACCTGAAAGAATATTTAAACCAAATTTATCTACCATTTTATTTTAACTCTAAAGGATTACATGAAAAACATCATGTCTTGATAGATTTGGCTAAAACAGTACTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGGGAGTCATTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCTAAGCGACTGTCACTTAATGTTTTAATTTACTCATTGCAGGAACTGAATTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTAAGAAGCCGGGTGGAAAACGCAAATAATTTCAACAGATCTATAACGACAATATCTACTTTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGTGATTTTGAAGAAGAAAAAAGAGAAAAACTAAGAATGATACAAAAGAAACTTGCAAAGGATATTTCTAAATTAACCATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAGATCACAAACGAACATGAGATAAGGCATTCAACTTATGAGGACTTAAAACAATCTATCCCAGATTACACAGATTATATGTCTGTGAAAGTTTTTGACAGATTGTACGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAATGATAAGGAAACAGTCAAGCTGATTCTAGAGACCATGAAAAAACATAAAATATTTCATTTTGGATTCTTCAATAAAGGACAAAAAACAGCCAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGTCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGGTGCAAATTAAACCCTGAAGAAATGATAAGTGAACCAGGCGACTCGAAACTAAGGGTATTAGAGAAGCAATCAGAAGACGAAATCAGGTATATTAGCAATACAATAAAGACATTAGGGAATGCCATAGAGAACTTGCAATCTGGATCTTTAAATTGGGCAGATATATGCGAAAACAAAGCAAGAGGACTTAAGATAGAAATAAATGCTGATATGTCCAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTTAAATATTTTTGGTTGATAGTGCTTGATCCCATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAAAGGATAATTTATTTCCTCTGTAATTATATGCAGAAAAGGCTTATAATGCCCGATGAATTGCTCACTACTATATTGGATCAAAGAGTTCCTTATTCAAATGACATAATTGGATTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAGCGTAACTGGCTTCAAGGCAACTTAAATTATACAAGCAGTTACTTACACAGCTGTAGTATGTCTGTGTACAAAGATATAATAAGAGAAGCAGCAATATTATTAGAAGGAGAAGCCCTTGTGAACTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCTATATGTATGGTGCAGAATAAATTACCAGATGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGCTTAACTTTTGGCAATCAGGCAAATATGAAGAAGACATATCTAACTAACTTCATCAAAGAGTTTGTTTCTTTATTTAATATACATGGAGAACCATTTTCTATATATGGGAGATTTCTACTCACAGCAGTAGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCATGGTTGCCCACCATCACTTGCATGGGTATCTATCGCTCTAAATCACTGGATAACCCACACTACATATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAATGACCCGTTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAGTGAAATACCAGTAGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGTGATTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCAGGGAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGGAAGTTATCATCCCCAATCTTACAAAGAGAAAGTATTCAAGATCAATACAATTCTATAGAAAAGTGGGATCTGAGCAAATTATCACAGATCGACATTCTAAGGCTTAAAATGCTCAGGTATATATCTCTTGATAGTTCAGTCACATCTGATGATGGTATGGGGGAGACTAGTGAAATGAGATCTCGATCACTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACAAGTGGGTCACTTAATAGGTTGAAATCATATAAAGACTTTCAAGATATAATAGCAGATGAGGACAAGACAAACGAACTATTTGAGAATTTCATTAGACACCCAGAGTTACTGGTTACAAAAGGCGAAACATTTGAAGAATTTGTTAATACGATATTATTTAGGTACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTGTCAATACAAAACCCAGCACAGCTTTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAGTAATTGACTACACTAGCATACATGACAAGATTTTTGGATTACAAGACATGCCAGGAATTGAAGAACTAGATACAATTATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAGAGTTATGTTCAAATCGTAGATGACTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAACGATGTCAAGACTATATTTGCCTTTTGTCTTATGAATGACCCACTACTGATCACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAGGGACATAGTCAAGAAAGAATAGGTCAATCAGCATGCAAAATGCCAGAGGTCCGAAGTCTAAAACTCATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTACCGAATGTAGATATAGATGAACTTGCAAGGGATCTATCTCATTTAGAAGACTTCATACAAAGTACAAAACTCAGAGAAAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAGCGGCACTTAGGAAGGGATTTCAAATTTGAAATCAAAGAACTAACTAGATTTTACCAAGTGTGTTATGATTACATAAAGTCTACAGAACATAAAGTCAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGCGGGGCACTGACAGGTAACTTGATAAATGACAAATTATGGTACATAACGCATTATCTGAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAGGCACAAATTTCTTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATTGCTGATGAGGCACTAAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTCTTGGCATCAGAATCAAGAATACAATTTCTGAAGAAAATTATTGAAGAATTCACATACAAAGGGATACCTGTAAAACATTTATACTCAAAAATAAAGAACTCCAAGTTGAGGGTTAAATTTCTAGGGATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACACAGAATGATCTGGATAAATTTGATGCAGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTGTCAAGAGATATGAATACTGGACCAATAGACTTAATGATAAGCGGTTACTCTAGACAGCTGCGGATCACTGGGGAAGATGACAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAGGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTAATTTATAGACACGGTCAGGCAATGTTGAATAAGCCACACGGCTTAAAGCTTGAAAAAATGCAACCTGTGACTGAGATGTCTAAACGATTACATTATATCGTTTTCCAGCAAAGATCACGGAAACGATACTTCTATTCTATATTACCCACCCAAGTAATTGAGGACCATAATTCTAGAGTTGAATCATCTAGGCTAAGCAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGCCCTGTTGCAATATCAAAACTCTACCAACAAGGACGGCCTATACTTTCCAAAGTTAGAAATCTGAATATGCAGACTCATTCGCTTTCCAGAATACAAGTTAATGTAGATGAATATGCCATCACGAGAAGAGCACATTTTCAGAAAATGCCTTTCTTCGAAGGACCATCAATCCCTTCTGGTGGTATGGATTTGTCTGAGTTGATGAAATCTACATCCCTATTAAGCTTGAATTATGATAACATAAAAAATGCATCCTTATTGGACATGTCTAGGGTATTTAAGTGCAATGGCAGTGGAGATGACCAAATGGCTTTCGAATTTCTATCGGACGAAATTTTGGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATTAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCCTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTTGACTTCCTCGACATGGGATTTTGCTCGAATGAAAATCTTAGTATTCTGGAGGAAATACATTGGATAATCAGTTATTTAAAAACAAATCAATGGTCTACGGAACTAGACAATTGTATTCACATGTGCATGTACAGGAATGGATATGATGCAGAATATCATAAATTTGATATACCCTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGAACAATAAATTGGACTGAAGTCATTGAATTTATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAAATTGAGCCATGGTCTAGTATGAAGTCACACTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCACTAGAGTGTATGAAAAATGAGAAAAGATCATTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGCAAATCCAAATTTGACTTCTAAGGTATACACATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 8,411
|
PP154172.1
|
Oropouche virus
|
Almeida,T., Silva,D., Nascimento,F., Mejia,M., Nascimento,V., Souza,V., Oliveira,Y., Casseb,L., Chiang,J., Cruz,A.C., Rodrigues,J.T., Morais,M.A., Silva,C., Vieira,D., Meneses,C., Maito,R., Arcanjo,A.R., Araujo,G., Amorim,T., Barros,D., Delatorre,E., Graf,T., Wallau,G., Bello,G., Naveca,F.
|
Instituto Leonidas e Maria Deane - Fiocruz Amazonia, Laboratorio de Ecologia de Doencas Transmissiveis na Amazonia
|
Brazil
|
2024-02-04
|
ILMD_TF29
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,814
|
GenBank
| null |
Brazil: Amazonas_Tefe
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2015-04-13
| null | null |
Oropouche virus isolate ILMD_TF29 segment L, complete sequence
|
ACTCCTATTTCGAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAACTGTTACTCAACCAATATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCAAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTCCTCGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACACGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTGTCTGTGGACGATCGGTCTTCCAGAATTACAAGAGAGAAATACAATGAAATTTTTGGAGAAGTGTTCAACCCAGAAGGTGTGGACTTTGAAATCGTTATTATCAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTTGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATCGGACCAATCACGCTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTCCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGACCGAAGAAGATACTCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAGTTCATGAATTCAATGCCAGAGTCAGAACAGGCCCTGTTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCAGAAAAATGGAATATTTTCTTAAAGGGAGTGATGTCTAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACCAAAGGACATGCCCAATCCATATTCTTGGCAACAGGGGACTACCCCAAACCAGATAAGGACCAAATTTCAGCTGGCTGGCGAGAGATGGTAAGTAGAGTGAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGCATACATTTTATATGGGCACAAAATGACTCAAGTAGCAATAATAACATACAGAAATTAATCAAACTATCCAAATCATTGCAAGCCATGAGTGGAACAGGAAGCTATGTAAGTGCTTTTAAATCATTAGGAAGATTGATGGATATATCATCAGACATCAAAAAGTATGAGTCGTTCTGCGGAAAATTAAAATCTTTGGCAAGGTCTAGCGTAAAGAAACTCGACAGGAAAATAGAACCGGTACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTTAAATTAGATACGGATGTCATAAAAAGAGAGGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTCGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAATGACATAAATACCGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGACGATATAGTTAGGAAATGCAAAGATAAATATAACCAAGTCACACATAACTTGTCTCAAGTTAATGAATTAGACAAGATTGGAAATTATCTAGAGCATTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACCAAGTACTGGCAATGCATCAACGACTACTCTACCCTAATGAAAAACATGCTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACCTTTAGGATTGTCTCGTGTGCGAATAACAATGTATTTGGCCTAGTGATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGACAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCCACTTTCAAGACAACAACAGGCTATATTTCAATATCAAAAGCTTTTAGGCTAGATAAAGAAAGGTGCCAGCGCATAGTGTCCTCTCCAGGCTTATTTCTTATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAGTTTGATAAGTTACTAGGCTTTTCATTTTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGCTATATGATCATGAATTCATTGGCAGTTTCTAGCCATGTAAAAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTATACAAAAACAGCATTTTCTGTAGTGATGACAGATTTGATTAAAAAAGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGGAAAAAGGTCCAAATAAGGGATATAAAGTTAACAGACTACGATATAACACAGAAAGGGGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATTTGGTTCCCGGGAAAGGTAAATTTAAAAGAATACTTGAACCAGATTTATTTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGATTGCATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGAGAATCATTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCTAAGCAGACTGTCAACTTAAATATTTTGATTTACTCAATTGCAAGGAATTTGAACTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTGAGGAGCCGGGTGGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCCACCTTTACCAGCTCGAAATCATGCATTAAAATTGGTGATTTTGAGGAGGAGAAAAAGAAGAAAACTAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAAGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAACATGAGATAAGACACTCAACTTATGAGGATTTGAAACAATCTATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACTAACGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGTTGATTCTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTTACTTCGGATTCTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTCGAGGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTTGAAAGAATAGCCAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAAATGATAAGCGAACCAGGCGACTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAGCAATCAGAAGATGAAATTAGGTATATCAGCAACACAATAAAGACATTGGGAAATGCCATAGAAAACCTGCAATCCGGGTCTTTAAATTGGGCAGATATATGTGAAAGTAAGGCACGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTCAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTTGATCCTATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAGAGAATAATTTATTTTCTATGTAATTATATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACAATATTGGACCAGAGGGTTCCTTATTCAAATGATATAATTGGGTTGATGACAAACAATTACAGATCCAACACAGTAGAAATAAAGCGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAATTATACAAGTAGTTACTTGCACAGCTGTAGTATGTCTGTATATAAAGACATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAAGGGGAAGCCCTTGTGAATTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCCATATGTATGGTGCAAAACAAGTTGCCAGATGACAATGTAATTGAATTTTGCATCAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGAAATCAGGCAAACATGAAAAAGACATACCTAACCAACTTCATCAAGGAATTTGTTTCTTTATTTAATATACACGGGGAGCCATTCTCTATATACGGGAGGTTTTTGCTTACAGCAGTAGGGGACTGTGCCTATCTGGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCATGGCTGCCCACCATCACTGGCATGGGTATCCATTGCTTTGAATCACTGGATAACTCACACCACGTATAATATGTTACCTGGCCAAAATAATGACCCATTACCATTCTTCCCTACCAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGTGGAATACTAGAAAGTGACTTATCAACAATTGCACTAACCGGTTTAGAAGCGGGAAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGAAAACTATCATCTCCAATCTTGCAAAGAGAAAGTATCCAAGACCAATACAATTCTATAGAAAAATGGGACCTAAGTAGGTTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTCACATCTGATGACGGTATGGGGGAGACCAGTGAAATGAGGTCGCGATCGCTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACGAGTGGGTCACTCAATAGACTTAAATCGTATAAAGATTTTCAAAATATAATAACAGATGAGGATAAGACAAACGAGCTATTTGAGAATTTCATTAGGCATCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTTGAAGAATTTGTCAATACAATATTATTTAGGTATAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTCTGTCAATACAAAATCCAGCACAACTCTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATTTTTGGATTGCAAGATATGCCAGGAATCGAAGAACTAGATACAATCATAGGCCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGATGATTTAAGCAACTTAACACTGGATATTAATGATGTCAAGACTATATTCGCCTTCTGTCTCATGAATGATCCACTACTAATTACATCCGCTAATAACATAATAATGTCTGTTAAAGGGCATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAGGTCAGGAGTCTGAAGCTTATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGCAGATATAGACGAGCTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGATTTCATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATTTAGGAAGAGATTTCAAGTTTGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTGTGTTATGATTATATAAAATCTACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATTGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGGAACTTAATAAATGACAAATTGTGGTATATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACACAAGGCACAAATTTCGTCCTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGGCTAATAGCACATTTTGCCGATACTTTCTTGGCACCTGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAAAAGGTTATCGAAGAATTCACATACAAAGGGATACCTGTAAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTCAAATTCTTAGGGATCCTTTTGTGGTTGGATGACCTAACACAAAATGATTTGGATAAGTTTGATGCAGATAAATCAGACGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAACACCGGACCAATAGATTTAATGATAAGTGGCTATTCCAGGCAACTGCGGATCACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTCACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTACAGACACGGCCAGGCAATGTTAAATAAACCGCACGGATTGAAGCTTGAAAAGATGCAGCCTGTAACTGAGATGTCTAAACAACTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGGTCAAGAAAGCGGTATTTCTATTCTATATTGCCCACCCAAATAATTGAAGATCATAATTCTAGAATCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTGTGTCCTGTTGCAGTATCAAAACTCTATCAGCAAGGACGACCTATACTTTCCAAGGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCATTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGATGAATATGCCATTACAAGAAGAGCGCATTTCCAGAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTATCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCTAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAAAATGACCAAATGGCTTTTGAGTTCCTGTCAGATGAAATTCTAGAGCAAGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCTTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCGAACGAGAACCTTAGTATTTTAGAGGAAATACATTGGATTATCAGTTATTTGAAGACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTATCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCGATAAACCGAACAGTAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTTATACTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAGCCATGGTCGAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCGTTAGAGTGCATGAAAAGCGAGAAAAGATCACTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGGAAATCCAAGTTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTA
| 9,113
|
MK506828.1
|
Oropouche virus
|
Wise,E.L., Logue,C.H., Mellors,J., Atkinson,B., Marquez,S., Zapata,S., Paz,V., Trueba,G., Gutierrez,B., Pybus,O.G., Jackson,S.K., Fejer,G., Pullan,S.T.
|
Public Health England, NIS, Research
|
United Kingdom
|
2019-11-08
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| null |
Ecuador
|
Ecuador
|
Homo sapiens
|
blood
|
2016-04
| null | null |
Oropouche virus strain OROV/EC/Esmeraldas/057/2016 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAACTGTTACTCAACCAATATCGAAATAGGATATTGCATTGCCGTGAACCTGAAATAGCAAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTCCTCGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACACGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTGTCTGTGGATGATCGGTCTTCCAGAATTACAAGAGAGAAATACAATGAAATTTTTGGAGAAGTGTTCAATCCAGAAGGTGTGGACTTTGAAATCGTTATTATCAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTTGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATCGGGCCAATCACGCTAAACATTAGCATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTCCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATCGAAGAAGATACTCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAGTTCATGAATTCAATGCCAGAGTCAGAACAGGCCTTGTTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCAGAAAAATGGAATATTTTCTTAAAGGGAGTGATGTCTAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACCAAAGGACATGCCCAATCCATATTTTTGGCAACAGGGGACTATCCCAAACCAGATAAGGACCAAATTTCAGCTGGCTGGCGAGAGATGGTAAGTAGGGTGAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGTATACATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAATAATAACATACAGAAATTAATCAAACTATCCAAATCATTGCAAGCCATGAGTGGAACAGGAAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGATTGATGGATATATCGTCAGACATCAAAAAGTATGAATCGTTCTGCGGAAAATTAAAATCTTTGGCAAGGTCTAGTGTAAAGAAACTCGACAGGAAAATAGAACCGGTGCAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAGCAATTTAAATTGGATACGGATGTCATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTCGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAATGACATAAATACCGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGACGATATAGTTAGGAAATGCAAAGATAAATATAACCAAGTCACACATAACTTGTCTCAAGTTAATAATTTAGACAAGATTGGAAATTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACCAAGTACTGGCAATGCATCAACGACTACTCTACCCTAATGAAAAACATGCTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACCTTTAGGATTGTCTCATGTGCAAATAACAATGTATTTGGCTTAGTGATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCCACTTTCAAGACAACAACAGGCTATATTTCAATATCGAAAGCTTTTAGGCTAGATAAAGAAAGGTGTCAGCGCATAGTGTCTTCTCCAGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAGTTTGATAAGTTACTAGGCTTTTCATTTTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGCTATATGATCATGAACTCATTGGCAGTTTCTAGCCATGTAAAAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTAGTGATGACAGATTTGATTAAAAAAGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGGAAAAAGGTCCAAATAAGGGATATAAAGTTAACAGACTACGATATAACACAGAAAGGGGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATTTGGTTCCCGGGAAAGGTAAATTTAAAAGAATACTTGAATCAGATTTATTTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGATTGCATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGAGAATCACTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATATTTTAATTTACTCAATTGCAAGGAATTTGAACTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTGAGGAGCCGGGTGGAAAATGCAAATAACTTTAACAGGTCTATAACAACAATATCCACCTTTACCAGCTCGAAATCATGCATTAAAATTGGTGATTTTGAAGAGGAGAAAAAGAAGAAAACTAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAAGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAACATGAGATAAGACACTCAACTTATGAGGATTTGAAACAATCTATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACTAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAATCAAGTTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTTACTTCGGGTTCTTCAACAAAGGACAGAAAACAGCTAAAGATAGGGAAATATTTTTAGGTGAATTCGAGGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTTGAAAGAATAGCCAAAGAGAGATGCAAATTAAATCCAGAAGAAATGATAAGCGAACCAGGTGACTCTAAATTAAGAGTATTGGAAAAGCAATCAGAAGATGAAATTAGGTATATCAGCAACACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACCTGCAATCCGGGTCTTTAAATTGGGCAGATATATGTGAAAGTAAGGCACGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTCAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTTGATCCTATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAGAGAATAATTTATTTTCTATGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACGATATTGGACCAGAGGGTTCCTTATTCAAATGATATAATTGGGTTGATGACAAACAATTATAGATCCAACACAGTAGAAATAAAGCGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAATTATACAAGTAGTTACTTGCACAGCTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTGGAGGGGGAAGCCCTTGTGAATTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCCATATGTATGGTGCAAAACAAGTTGCCAGATGACAATGTAATTGAATTTTGCATCAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGAAATCAGGCAAACATGAAAAAGACATACTTAACCAACTTCATCAAGGAATTTGTTTCTTTATTTAATATACACGGGGAGCCATTCTCTATATACGGGAGGTTTTTGCTTACTGCAGTAGGGGACTGTGCCTATCTGGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACCGCTATAAAGCATGGCTGCCCACCGTCACTGGCATGGGTATCCATTGCTTTGAATCACTGGATAACTCACACCACGTATAATATGTTACCTGGCCAAAATAATGACCCATTACCATTCTTCCCTACCAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGCGACTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCGGGAAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGGAAACTATCATCTCCAATCTTGCAAAGAGAAAGTATCCAAGACCAATACAATGCTATAGAAAAATGGGACCTAAGTAGGTTATCGCAGATCGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTCACATCTGACGATGGTATGGGGGAGACCAGTGAAATGAGGTCGCGATCACTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACGAGTGGGTCACTCAATAGGCTTAAATCGTATAAAGATTTTCAAAATATAATAACAGATGAGGATAAGACAAACGAGCTATTTGAGAATTTCATTAGGCATCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGTGAAACATTTGAAGAATTTGTCAATACAATATTATTTAGGTATAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTCTGTCAATACAAAATCCAGCACAACTCTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAATAATCGACTACACTAGCATACATGATAAGATTTTTGGATTGCAAGATATGCCGGGAATCGAAGAACTAGATACAATCATAGGCCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGATGATTTAAGCAACTTAACACTGAATATTAATGATGTCAAGACTATATTCGCCTTCTGTCTCATGAATGATCCACTACTAATTACATCTGCTAATAACATAATAATGTCTGTTAAAGGGCATAGCCAAGAGAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCAGGAGTCTGAAGCTTATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGACGAGCTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGATTTCATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAAAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATTTAGGAAGAGATTTCAAGTTTGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTGTGTTACGATTATATAAAATCTACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGCGGCGCACTGACAGGGAACTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTGAAAAATATAGTGTCTACTACACACAAGGCACAAATCTCGTCCTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAATAGCACATTTTGCCGATACTTTCTTGGCATCTGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAAAAGGTTATCGAAGAATTCACATACAAAGGGATACCTGTAAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTCAAATTCCTAGGGATCCTTTTATGGTTGGATGACCTAACACAAAATGATTTGGATAAGTTTGATGCAGATAAATCAGACGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGACATGAACACCGGACCAATAGATTTAATGATAAGTGGCTATTCCAGGCAGCTGCGGATCACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTCACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTACAGACACGGCCAGGCAATGTTAAATAAACCGCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTAACTGAGATGTCTAAACAACTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGGTCAAGAAAACGGTACTTCTATTCTATATTGCCCACCCAAATAATTGAAGATCATAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTGTGTCCTGTTGCAGTATCAAAACTCTATCAGCAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCATTCACTTTCCAGAATACAGGTTAATGTAGATGAATATGCCATTACAAGAAGAGCGCATTTCCAGAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATTCCTTCTGGTGGCATGGATCTATCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAGAATGCTTCTTTATTGGATATGTCTAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAAAATGACCAAATGGCTTTTGAGTTCCTGTCAGATGAAATTCTAGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCTTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCGAACGAGAACCTTAGTATTTTAGAGGAAATACATTGGATTATCAGTTATTTGAAGACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTATCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCGATAAACCGAACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTTATACTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAGCCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCATTAGAGTGCATGAAAAGCGAGAAAAGATCACTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGGAAATCCAAGTTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 58,394
|
MK506829.1
|
Oropouche virus
|
Wise,E.L., Logue,C.H., Mellors,J., Atkinson,B., Marquez,S., Zapata,S., Paz,V., Trueba,G., Gutierrez,B., Pybus,O.G., Jackson,S.K., Fejer,G., Pullan,S.T.
|
Public Health England, NIS, Research
|
United Kingdom
|
2019-11-08
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| null |
Ecuador
|
Ecuador
|
Homo sapiens
|
blood
|
2016-04
| null | null |
Oropouche virus strain OROV/EC/Esmeraldas/155/2016 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAACTGTTACTCAACCAATATCGAAATAGGATATTGCATTGCCGTGAACCTGAAATAGCAAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTCCTCGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACACGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTGTCTGTGGATGATCGGTCTTCCAGAATTACAAGAGAGAAATACAATGAAATTTTTGGAGAAGTGTTCAATCCAGAAGGTGTGGACTTTGAAATCGTTATTATCAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTTGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATCGGGCCAATCACGCTAAACATTAGCATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTCCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATCGAAGAAGATACTCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAGTTCATGAATTCAATGCCAGAGTCAGAACAGGCCTTGTTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCAGAAAAATGGAATATTTTCTTAAAGGGAGTGATGTCTAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACCAAAGGACATGCCCAATCCATATTTTTGGCAACAGGGGACTATCCCAAACCAGATAAGGACCAAATTTCAGCTGGCTGGCGAGAGATGGTAAGTAGGGTGAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGTATACATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAATAATAACATACAGAAATTAATCAAACTATCCAAATCATTGCAAGCCATGAGTGGAACAGGAAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGATTGATGGATATATCGTCAGACATCAAAAAGTATGAATCGTTCTGCGGAAAATTAAAATCTTTGGCAAGGTCTAGTGTAAAGAAACTCGACAGGAAAATAGAACCGGTGCAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAGCAATTTAAATTGGATACGGATGTCATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTCGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAATGACATAAATACCGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGACGATATAGTTAGGAAATGCAAAGATAAATATAACCAAGTCACACATAACTTGTCTCAAGTTAATAATTTAGACAAGATTGGAAATTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACCAAGTACTGGCAATGCATCAACGACTACTCTACCCTAATGAAAAACATGCTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACCTTTAGGATTGTCTCATGTGCAAATAACAATGTATTTGGCTTAGTGATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCCACTTTCAAGACAACAACAGGCTATATTTCAATATCGAAAGCTTTTAGGCTAGATAAAGAAAGGTGTCAGCGCATAGTGTCTTCTCCAGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAGTTTGATAAGTTACTAGGCTTTTCATTTTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGCTATATGATCATGAACTCATTGGCAGTTTCTAGCCATGTAAAAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTAGTGATGACAGATTTGATTAAAAAAGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGGAAAAAGGTCCAAATAAGGGATATAAAGTTAACAGACTACGATATAACACAGAAAGGGGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATTTGGTTCCCGGGAAAGGTAAATTTAAAAGAATACTTGAACCAGATTTATTTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGATTGCATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGAGAATCACTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATATTTTAATTTACTCAATTGCAAGGAATTTGAACTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTGAGGAGCCGGGTGGAAAATGCAAATAACTTTAACAGGTCTATAACAACAATATCCACCTTTACCAGCTCGAAATCATGCATTAAAATTGGTGATTTTGAAGAGGAGAAAAAGAAGAAAACTAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAAGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAACATGAGATAAGACACTCAACTTATGAGGATTTGAAACAATCTATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACTAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAATCAAGTTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTTACTTCGGGTTCTTCAACAAAGGACAGAAAACAGCTAAAGATAGGGAAATATTTTTAGGTGAATTCGAGGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTTGAAAGAATAGCCAAAGAGAGATGCAAATTAAATCCAGAAGAAATGATAAGCGAACCAGGTGACTCTAAATTAAGAGTATTGGAAAAGCAATCAGAAGATGAAATTAGGTATATCAGCAACACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACCTGCAATCCGGGTCTTTAAATTGGGCAGATATATGTGAAAGTAAGGCACGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTCAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTTGATCCTATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAGAGAATAATTTATTTTCTATGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACGATATTGGACCAGAGGGTTCCTTATTCAAATGATATAATTGGGTTGATGACAAACAATTATAGATCCAACACAGTAGAAATAAAGCGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAATTATACAAGTAGTTACTTGCACAGCTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTTGTGAATTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCCATATGTATGGTGCAAAACAAGTTGCCAGATGACAATGTAATTGAATTTTGCATCAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGAAATCAGGCAAACATGAAAAAGACATACTTAACCAACTTCATCAAGGAATTTGTTTCTTTATTTAATATACACGGGGAGCCATTCTCTATATACGGGAGGTTTTTGCTTACTGCAGTAGGGGACTGTGCCTATCTGGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACCGCTATAAAGCATGGCTGCCCACCGTCACTGGCATGGGTATCCATTGCTTTGAATCACTGGATAACTCACACCACGTATAATATGTTACCTGGCCAAAATAATGACCCATTACCATTCTTCCCTACCAACAATAGAAATGAAATACCAGTAGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGCGACTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCGGGAAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGGAAACTATCATCTCCAATCTTGCAAAGAGAAAGTATCCAAGACCAATACAATGCTATAGAAAAATGGGACCTAAGTAGGTTATCGCAGATCGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTCGCATCTGACGATGGTATGGGGGAGACCAGTGAAATGAGGTCGCGATCACTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACGAGTGGGTCACTCAATAGGCTTAAATCGTATAAAGATTTTCAAAATATAATAACAGATGAGGATAAGACAAACGAGCTATTTGAGAATTTCATTAGGCATCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGTGAAACATTTGAAGAATTTGTCAATACAATATTATTTAGGTATAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTCTGTCAATACAAAATCCAGCACAACTCTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAATAATCGACTACACTAGCATACATGATAAGATTTTTGGATTGCAAGATATGCCGGGAATCGAAGAACTAGATACAATCATAGGCCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGATGATTTAAGCAACTTAACACTGGATATTAATGATGTCAAGACTATATTCGCCTTCTGTCTCATGAATGATCCACTACTAATTACATCTGCTAATAACATAATAATGTCTGTTAAAGGGCATAGCCAAGAGAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCAGGAGTCTGAAGCTTATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGACGAGCTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGATTTCATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAAAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATTTAGGAAGAGATTTCAAGTTTGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTGTGTTACGATTATATAAAATCTACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGCGGCGCACTGACAGGGAACTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTGAAAAATATAGTGTCTACTACACACAAGGCACAAATCTCGTCCTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAATAGCACATTTTGCCGATACTTTCTTGGCATCTGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAAAAGGTTATCGAAGAATTCACATACAAAGGGATACCTGTAAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTCAAATTCCTAGGGATCCTTTTATGGTTGGATGACCTAACACAAAATGATTTGGATAAGTTTGATGCAGATAAATCAGACGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGACATGAACACCGGACCAATAGATTTAATGATAAGTGGCTATTCCAGGCAGCTGCGGATCACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTCACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTACAGACACGGCCAGGCAATGTTAAATAAACCGCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTAACTGAGATGTCTAAACAACTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGGTCAAGAAAACGGTACTTCTATTCTATATTGCCCACCCAAATAATTGAAGATCATAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTGTGTCCTGTTGCAGTATCAAAACTCTATCAGCAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCATTCACTTTCCAGAATACAGGTTAATGTAGATGAATATGCCATTACAAGAAGAGCGCATTTCCAGAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATTCCTTCTGGTGGCATGGATCTATCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAGAATGCTTCTTTATTGGATATGTCTAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAAAATGACCAAATGGCTTTTGAGTTCCTGTCAGATGAAATTCTAGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCTTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCGAACGAGAACCTTAGTATTTTAGAGGAAATACATTGGATTATCAGTTATTTGAAGACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTATCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCGATAAACCGAACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTTATACTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAGCCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCATTAGAGTGCATGAAAAGCGAGAAAAGATCACTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGGAAATCCAAGTTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 58,395
|
MK506830.1
|
Oropouche virus
|
Wise,E.L., Logue,C.H., Mellors,J., Atkinson,B., Marquez,S., Zapata,S., Paz,V., Trueba,G., Gutierrez,B., Pybus,O.G., Jackson,S.K., Fejer,G., Pullan,S.T.
|
Public Health England, NIS, Research
|
United Kingdom
|
2019-11-08
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| null |
Ecuador
|
Ecuador
|
Homo sapiens
|
blood
|
2016-04
| null | null |
Oropouche virus strain OROV/EC/Esmeraldas/171/2016 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAACTGTTACTCAACCAATATCGAAATAGGATATTGCATTGCCGTGAACCTGAAATAGCAAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTCCTCGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACACGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTGTCTGTGGATGATCGGTCTTCCAGAATTACAAGAGAGAAATACAATGAAATTTTTGGAGAAGTGTTCAATCCAGAAGGTGTGGACTTTGAAATCGTTATTATCAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTTGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATCGGGCCAATCACGCTAAACATTAGCATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTCCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATCGAAGAAGATACTCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAGTTCATGAATTCAATGCCAGAGTCAGAACAGGCCTTGTTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCAGAAAAATGGAATATTTTCTTAAAGGGAGTGATGTCTAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACCAAAGGACATGCCCAATCCATATTTTTGGCAACAGGGGACTATCCCAAACCAGATAAGGACCAAATTTCAGCTGGCTGGCGAGAGATGGTAAGTAGGGTGAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGTATACATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAATAATAACATACAGAAATTAATCAAACTATCCAAATCATTGCAAGCCATGAGTGGAACAGGAAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGATTGATGGATATATCGTCAGACATCAAAAAGTATGAATCGTTCTGCGGAAAATTAAAATCTTTGGCAAGGTCTAGTGTAAAGAAACTCGACAGGAAAATAGAACCGGTGCAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAGCAATTTAAATTGGATACGGATGTCATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTCGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAATGACATAAATACCGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGACGATATAGTTAGGAAATGCAAAGATAAATATAACCAAGTCACACATAACTTGTCTCAAGTTAATAATTTAGACAAGATTGGAAATTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACCAAGTACTGGCAATGCATCAACGACTACTCTACCCTAATGAAAAACATGCTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACCTTTAGGATTGTCTCATGTGCAAATAACAATGTATTTGGCTTAGTGATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCCACTTTCAAGACAACAACAGGCTATATTTCAATATCGAAAGCTTTTAGGCTAGATAAAGAAAGGTGTCAGCGCATAGTGTCTTCTCCAGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAGTTTGATAAGTTACTAGGCTTTTCATTTTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGCTATATGATCATGAACTCATTGGCAGTTTCTAGCCATGTAAAAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTAGTGATGACAGATTTGATTAAAAAAGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGGAAAAAGGTCCAAATAAGGGATATAAAGTTAACAGACTACGATATAACACAGAAAGGGGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATTTGGTTCCCGGGAAAGGTAAATTTAAAAGAATACTTGAACCAGATTTATTTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGATTGCATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGAGAATCACTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATATTTTAATTTACTCAATTGCAAGGAATTTGAACTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTGAGGAGCCGGGTGGAAAATGCAAATAACTTTAACAGGTCTATAACAACAATATCCACCTTTACCAGCTCGAAATCATGCATTAAAATTGGTGATTTTGAAGAGGAGAAAAAGAAGAAAACTAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAAGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAACATGAGATAAGACACTCAACTTATGAGGATTTGAAACAATCTATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACTAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAATCAAGTTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTTACTTCGGGTTCTTCAACAAAGGACAGAAAACAGCTAAAGATAGGGAAATATTTTTAGGTGAATTCGAGGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTTGAAAGAATAGCCAAAGAGAGATGCAAATTAAATCCAGAAGAAATGATAAGCGAACCAGGTGACTCTAAATTAAGAGTATTGGAAAAGCAATCAGAAGATGAAATTAGGTATATCAGCAACACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACCTGCAATCCGGGTCTTTAAATTGGGCAGATATATGTGAAAGTAAGGCACGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTCAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTTGATCCTATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAGAGAATAATTTATTTTCTATGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACGATATTGGACCAGAGGGTTCCTTATTCAAATGATATAATTGGGTTGATGACAAACAATTATAGATCCAACACAGTAGAAATAAAGCGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAATTATACAAGTAGTTACTTGCACAGCTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTTGTGAATTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCCATATGTATGGTGCAAAACAAGTTGCCAGATGACAATGTAATTGAATTTTGCATCAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGAAATCAGGCAAACATGAAAAAGACATACTTAACCAACTTCATCAAGGAATTTGTTTCTTTATTTAATATACACGGGGAGCCATTCTCTATATACGGGAGGTTTTTGCTTACTGCAGTAGGGGACTGTGCCTATCTGGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACCGCTATAAAGCATGGCTGCCCACCGTCACTGGCATGGGTATCCATTGCTTTGAATCACTGGATAACTCACACCACGTATAATATGTTACCTGGCCAAAATAATGACCCATTACCATTCTTCCCTACCAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGCGACTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCGGGAAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGGAAACTATCATCTCCAATCTTGCAAAGAGAAAGTATCCAAGACCAATACAATGCTATAGAAAAATGGGACCTAAGTAGGTTATCGCAGATCGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTCACATCTGACGATGGTATGGGGGAGACCAGTGAAATGAGGTCGCGATCACTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACGAGTGGGTCACTCAATAGGCTTAAATCGTATAAAGATTTTCAAAATATAATAACAGATGAGGATAAGACAAACGAGCTATTTGAGAATTTCATTAGGCATCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGTGAAACATTTGAAGAATTTGTCAATACAATATTATTTAGGTATAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTCTGTCAATACAAAATCCAGCACAACTCTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAATAATCGACTACACTAGCATACATGATAAGATTTTTGGATTGCAAGATATGCCGGGAATCGAAGAACTAGATACAATCATAGGCCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGATGATTTAAGCAACTTAACACTGGATATTAATGATGTCAAGACTATATTCGCCTTCTGTCTCATGAATGATCCACTACTAATTACATCTGCTAATAACATAATAATGTCTGTTAAAGGGCATAGCCAAGAGAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCAGGAGTCTGAAGCTTATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGACGAGCTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGATTTCATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAAAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATTTAGGAAGAGATTTCAAGTTTGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTGTGTTACGATTATATAAAATCTACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGCGGCGCACTGACAGGGAACTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTGAAAAATATAGTGTCTACTACACACAAGGCACAAATCTCGTCCTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAATAGCACATTTTGCCGATACTTTCTTGGCATCTGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAAAAGGTTATCGAAGAATTCACATACAAGGGGATACCTGTAAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTCAAATTCCTAGGGATCCTTTTATGGTTGGATGACCTAACACAAAATGATTTGGATAAGTTTGATGCAGATAAATCAGACGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGACATGAACACCGGACCAATAGATTTAATGATAAGTGGCTATTCCAGGCAGCTGCGGATCACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTCACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTACAGACACGGCCAGGCAATGTTAAATAAACCGCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTAACTGAGATGTCTAAACAACTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGGTCAAGAAAACGGTACTTCTATTCTATATTGCCCACCCAAATAATTGAAGATCATAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTGTGTCCTGTTGCAGTATCAAAACTCTATCAGCAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCATTCACTTTCCAGAATACAGGTTAATGTAGATGAATATGCCATTACAAGAAGAGCGCATTTCCAGAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATTCCTTCTGGTGGCATGGATCTATCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAGAATGCTTCTTTATTGGATATGTCTAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAAAATGACCAAATGGCTTTTGAGTTCCTGTCAGATGAAATTCTAGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCTTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCGAACGAGAACCTTAGTATTTTAGAGGAAATACATTGGATTATCAGTTATTTGAAGACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTATCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCGATAAACCGAACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTTATACTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAGCCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCATTAGAGTGCATGAAAAGCGAGAAAAGATCACTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGGAAATCCAAGTTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 58,396
|
MK506831.1
|
Oropouche virus
|
Wise,E.L., Logue,C.H., Mellors,J., Atkinson,B., Marquez,S., Zapata,S., Paz,V., Trueba,G., Gutierrez,B., Pybus,O.G., Jackson,S.K., Fejer,G., Pullan,S.T.
|
Public Health England, NIS, Research
|
United Kingdom
|
2019-11-08
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| null |
Ecuador
|
Ecuador
|
Homo sapiens
|
blood
|
2016-04
| null | null |
Oropouche virus strain OROV/EC/Esmeraldas/206/2016 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAACTGTTACTCAACCAATATCGAAATAGGATATTGCATTGCCGTGAACCTGAAATAGCAAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTCCTCGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACACGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTGTCTGTGGATGATCGGTCTTCCAGAATTACAAGAGAGAAATACAATGAAATTTTTGGAGAAGTGTTCAATCCAGAAGGTGTGGACTTTGAAATCGTTATTATCAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTTGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATCGGGCCAATCACGCTAAACATTAGCATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTCCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATCGAAGAAGATACTCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAGTTCATGAATTCAATGCCAGAGTCAGAACAGGCCTTGTTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCAGAAAAATGGAATATTTTCTTAAAGGGAGTGATGTCTAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACCAAAGGACATGCCCAATCCATATTTTTGGCAACGGGGGACTATCCCAAACCAGATAAGGACCAAATTTCAGCTGGCTGGCGAGAGATGGTAAGTAGGGTGAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGTATACATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAATAATAACATACAGAAATTAATCAAACTATCCAAATCATTGCAAGCCATGAGTGGAACAGGAAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGATTGATGGATATATCGTCAGACATCAAAAAGTATGAATCGTTCTGCGGAAAATTAAAATCTTTGGCAAGGTCTAGTGTAAAGAAACTCGACAGGAAAATAGAACCGGTGCAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAGCAATTTAAATTGGATACAGATGTCATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTCGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAATGACATAAATACCGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGACGATATAGTTAGGAAATGCAAAGATAAATATAACCAAGTCACACATAACTTGTCTCAAGTTAATAATTTAGACAAGATTGGAAATTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACCAAGTACTGGCAATGCATCAACGACTACTCTACCCTAATGAAAAACATGCTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACCTTTAGGATTGTCTCATGTGCAAATAACAATGTATTTGGCTTAGTGATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCCACTTTCAAGACAACAACAGGCTATATTTCAATATCGAAAGCTTTTAGGCTAGATAAAGAAAGGTGTCAGCGCATAGTGTCTTCTCCAGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAGTTTGATAAGTTACTAGGCTTTTCATTTTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGCTATATGATCATGAACTCATTGGCAGTTTCTAGCCATGTAAAAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTAGTGATGACAGATTTGATTAAAAAAGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGGAAAAAGGTCCAAATAAGGGATATAAAGTTAACAGACTACGATATAACACAGAAAGGGGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATTTGGTTCCCGGGAAAGGTAAATTTAAAAGAATACTTGAACCAGATTTATTTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGATTGCATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGAGAATCACTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATATTTTAATTTACTCAATTGCAAGGAATTTGAACTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTGAGGAGCCGGGTGGAAAATGCAAATAACTTTAACAGGTCTATAACAACAATATCCACCTTTACCAGCTCGAAATCATGCATTAAAATTGGTGATTTTGAAGAGGAGAAAAAGAAGAAAACTAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAAGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAACATGAGATAAGACACTCAACTTATGAGGATTTGAAACAATCTATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACTAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAATCAAGTTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTTACTTCGGGTTCTTCAACAAAGGACAGAAAACAGCTAAAGATAGGGAAATATTTTTAGGTGAATTCGAGGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTTGAAAGAATAGCCAAAGAGAGATGCAAATTAAATCCAGAAGAAATGATAAGCGAACCAGGTGACTCTAAATTAAGAGTATTGGAAAAGCAATCAGAAGATGAAATTAGGTATATCAGCAACACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACCTGCAATCCGGGTCTTTAAATTGGGCAGATATATGTGAAAGTAAGGCACGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTCAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTTGATCCTATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAGAGAATAATTTATTTTCTATGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACGATATTGGACCAGAGGGTTCCTTATTCAAATGATATAATTGGGTTGATGACAAACAATTATAGATCCAACACAGTAGAAATAAAGCGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAATTATACAAGTAGTTACTTGCACAGCTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTTGTGAATTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCCATATGTATGGTGCAAAACAAGTTGCCAGATGACAATGTAATTGAATTTTGCATCAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGAAATCAGGCAAACATGAAAAAGACATACTTAACCAACTTCATCAAGGAATTTGTTTCTTTATTTAATATACACGGGGAGCCATTCTCTATATACGGGAGGTTTTTGCTTACTGCAGTAGGGGACTGTGCCTATCTGGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACCGCTATAAAGCATGGCTGCCCACCGTCACTGGCATGGGTATCCATTGCTTTGAATCACTGGATAACTCACACCACGTATAATATGTTACCTGGCCAAAATAATGACCCATTACCATTCTTCCCTACCAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGCGACTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCGGGAAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGGAAACTATCATCTCCAATCTTGCAAAGAGAAAGTATCCAAGACCAATACAATGCTATAGAAAAATGGGACCTAAGTAGGTTATCGCAGATCGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTCACATCTGACGATGGTATGGGGGAGACCAGTGAAATGAGGTCGCGATCACTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACGAGTGGGTCACTCAATAGGCTTAAATCGTATAAAGATTTTCAAAATATAATAACAGATGAGGATAAGACAAACGAGCTATTTGAGAATTTCATTAGGCATCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGTGAAACATTTGAAGAATTTGTCAATACAATATTATTTAGGTATAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTCTGTCAATACAAAATCCAGCACAACTCTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAATAATCGACTACACTAGCATACATGATAAGATTTTTGGATTGCAAGATATGCCGGGAATCGAAGAACTAGATACAATCATAGGCCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGATGATTTAAGCAACTTAACACTGGATATTAATGATGTCAAGACTATATTCGCCTTCTGTCTCATGAATGATCCACTACTAATTACATCTGCTAATAACATAATAATGTCTGTTAAAGGGCATAGCCAAGAGAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCAGGAGTCTGAAGCTTATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGACGAGCTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGATTTCATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAAAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATTTAGGAAGAGATTTCAAGTTTGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTGTGTTACGATTATATAAAATCTACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGCGGCGCACTGACAGGGAACTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTGAAAAATATAGTGTCTACTACACACAAGGCACAAATCTCGTCCTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAATAGCACATTTTGCCGATACTTTCTTGGCATCTGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAAAAGGTTATCGAAGAATTCACATACAAAGGGATACCTGTAAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTCAAATTCCTAGGGATCCTTTTATGGTTGGATGACCTAACACAAAATGATTTGGATAAGTTTGATGCAGATAAATCAGACGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGACATGAACACCGGACCAATAGATTTAATGATAAGTGGCTATTCCAGGCAGCTGCGGATCACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTCACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTACAGACACGGCCAGGCAATGTTAAATAAACCGCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTAACTGAGATGTCTAAACAACTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGGTCAAGAAAACGGTACTTCTATTCTATATTGCCCACCCAAATAATTGAAGATCATAATTCTAGAGTAGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTGTGTCCTGTTGCAGTATCAAAACTCTATCAGCAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCATTCACTTTCCAGAATACAGGTTAATGTAGATGAATATGCCATTACAAGAAGAGCGCATTTCCAGAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATTCCTTCTGGTGGCATGGATCTATCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAGAATGCTTCTTTATTGGATATGTCTAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAAAATGACCAAATGGCTTTTGAGTTCCTGTCAGATGAAATTCTAGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCTTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTTGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCGAACGAGAACCTTAGTATTTTAGAGGAAATACATTGGATTATCAGTTATTTGAAGACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTATCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCGATAAACCGAACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTTATACTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAGCCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCATTAGAGTGCATGAAAAGCGAGAAAAGATCACTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGGAAATCCAAGTTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 58,397
|
MK506832.1
|
Oropouche virus
|
Wise,E.L., Logue,C.H., Mellors,J., Atkinson,B., Marquez,S., Zapata,S., Paz,V., Trueba,G., Gutierrez,B., Pybus,O.G., Jackson,S.K., Fejer,G., Pullan,S.T.
|
Public Health England, NIS, Research
|
United Kingdom
|
2019-11-08
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| null |
Ecuador
|
Ecuador
|
Homo sapiens
|
blood
|
2016-04
| null | null |
Oropouche virus strain OROV/EC/Esmeraldas/210/2016 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAACTGTTACTCAACCAATATCGAAATAGGATATTGCATTGCCGTGAACCTGAAATAGCAAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTCCTCGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACACGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTGTCTGTGGATGATCGGTCTTCCAGAATTACAAGAGAGAAATACAATGAAATTTTTGGAGAAGTGTTCAATCCAGAAGGTGTGGACTTTGAAATCGTTATTATCAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTTGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATCGGGCCAATCACGCTAAACATTAGCATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTCCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATCGAAGAAGATACTCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAGTTCATGAATTCAATGCCAGAGTCAGAACAGGCCTTGTTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCAGAAAAATGGAATATTTTCTTAAAGGGAGTGATGTCTAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACCAAAGGACATGCCCAATCCATATTTTTGGCAACAGGGGACTATCCCAAACCAGATAAGGGCCAAATTTCAGCTGGCTGGCGAGAGATGGTAAGTAGGGTGAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGTATACATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAATAATAACATACAGAAATTAATCAAACTATCCAAATCATTGCAAGCCATGAGTGGAACAGGAAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGATTGATGGATATATCGTCAGACATCAAAAAGTATGAATCGTTCTGCGGAAAATTAAAATCTTTGGCAAGGTCTAGTGTAAAGAAACTCGACAGGAAAATAGAACCGGTGCAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAGCAATTTAAATTGGATACGGATGTCATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTCGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAATGACATAAATACCGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGACGATATAGTTAGGAAATGCAAAGATAAATATAACCAAGTCACACATAACTTGTCTCAAGTTAATAATTTAGACAAGATTGGAAATTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACCAAGTACTGGCAATGCATCAACGACTACTCTACCCTAATGAAAAACATGCTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACCTTTAGGATTGTCTCATGTGCAAATAACAATGTATTTGGCTTAGTGATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCCACTTTCAAGACAACAACAGGCTATATTTCAATATCGAAAGCTTTTAGGCTAGATAAAGAAAGGTGTCAGCGCATAGTGTCTTCTCCAGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAGTTTGATAAGTTACTAGGCTTTTCATTTTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGCTATATGATCATGAACTCATTGGCAGTTTCTAGCCATGTAAAAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTAGTGATGACAGATTTGATTAAAAAAGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGGAAAAAGGTCCAAATAAGGGATATAAAGTTAACAGACTACGATATAACACAGAAAGGGGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATTTGGTTCCCGGGAAAGGTAAATTTAAAAGAATACTTGAACCAGATTTATTTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGATTGCATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGAGAATCACTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATATTTTAATTTACTCAATTGCAAGGAATTTGAACTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTGAGGAGCCGGGTGGAAAATGCAAATAACTTTAACAGGTCTATAACAACAATATCCACCTTTACCAGCTCGAAATCATGCATTAAAATTGGTGATTTTGAAGAGGAGAAAAAGAAGAAAACTAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAAGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAACATGAGATAAGACACTCAACTTATGAGGATTTGAAACAATCTATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACTAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAATCAAGTTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTTACTTCGGGTTCTTCAACAAAGGACAGAAAACAGCTAAAGATAGGGAAATATTTTTAGGTGAATTCGAGGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTTGAAAGAATAGCCAAAGAGAGATGCAAATTAAATCCAGAAGAAATGATAAGCGAACCAGGTGACTCTAAATTAAGAGTATTGGAAAAGCAATCAGAAGATGAAATTAGGTATATCAGCAACACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACCTGCAATCCGGGTCTTTAAATTGGGCAGATATATGTGAAAGTAAGGCACGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTCAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTTGATCCTATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAGAGAATAATTTATTTTCTATGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACGATATTGGACCAGAGGGTTCCTTATTCAAATGATATAATTGGGTTGATGACAAACAATTATAGATCCAACACAGTAGAAATAAAGCGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAATTATACAAGTAGTTACTTGCACAGCTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTTGTGAATTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCCATATGTATGGTGCAAAACAAGTTGCCAGATGACAATGTAATTGAATTTTGCATCAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGAAATCAGGCAAACATGAAAAAGACATACTTAACCAACTTCATCAAGGAATTTGTTTCTTTATTTAATATACACGGGGAGCCATTCTCTATATACGGGAGGTTTTTGCTTACTGCAGTAGGGGACTGTGCCTATCTGGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACCGCTATAAAGCATGGCTGCCCACCGTCACTGGCATGGGTATCCATTGCTCTGAATCACTGGATAACTCACACCACGTATAATATGTTACCTGGCCAAAATAATGACCCATTACCATTCTTCCCTACCAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGCGACTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCGGGAAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGGAAACTATCATCTCCAATCTTGCAAAGAGAAAGTATCCAAGACCAATACAATGCTATAGAAAAATGGGACCTAAGTAGGTTATCGCAGATCGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTCACATCTGACGATGGTATGGGGGAGACCAGTGAAATGAGGTCGCGATCACTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACGAGTGGGTCACTCAATAGGCTTAAATCGTATAAAGATTTTCAAAATATAATAACAGATGAGGATAAGACAAACGAGCTATTTGAGAATTTCATTAGGCATCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGTGAAACATTTGAAGAATTTGTCAATACAATATTATTTAGGTATAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTCTGTCAATACAAAATCCAGCACAACTCTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAATAATCGACTACACTAGCATACATGATAAGATTTTTGGATTGCAAGATATGCCGGGAATCGAAGAACTAGATACAATCATAGGCCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGATGATTTAAGCAACTTAACACTGGATATTAATGATGTCAAGACTATATTCGCCTTCTGTCTCATGAATGATCCACTACTAATTACATCTGCTAATAACATAATAATGTCTGTTAAAGGGCATAGCCAAGAGAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCAGGAGTCTGAAGCTTATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGACGAGCTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGATTTCATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAAAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATTTAGGAAGAGATTTCAAGTTTGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTGTGTTACGATTATATAAAATCTACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGCGGCGCACTGACAGGGAACTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTGAAAAATATAGTGTCTACTACACACAAGGCACAAATCTCGTCCTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAATAGCACATTTTGCCGATACTTTCTTGGCATCTGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAAAAGGTTATCGAAGAATTCACATACAAAGGGATACCTGTAAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTTAAATTCCTAGGGATCCTTTTATGGTTGGATGACCTAACACAAAATGATTTGGATAAGTTTGATGCAGATAAATCAGACGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGACATGAACACCGGACCAATAGATTTAATGATAAGTGGCTATTCCAGGCAGCTGCGGATCACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTCACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTACAGACACGGCCAGGCAATGTTAAATAAACCGCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTAACTGAGATGTCTAAACAACTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGGTCAAGAAAACGGTACTTCTATTCTATATTGCCCACCCAAATAATTGAAGATCATAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTGTGTCCTGTTGCAGTATCAAAACTCTATCAGCAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCATTCACTTTCCAGAATACAGGTTAATGTAGATGAATATGCCATTACAAGAAGAGCGCATTTCCAGAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATTCCTTCTGGTGGCATGGATCTATCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAGAATGCTTCTTTATTGGATATGTCTAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAAAATGACCAAATGGCTTTTGAGTTCCTGTCAGATGAAATTCTAGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCTTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCGAACGAGAACCTTAGTATTTTAGAGGAAATACATTGGATTATCAGTTATTTGAAGACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTATCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCGATAAACCGAACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTTATACTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAGCCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCATTAGAGTGCATGAAAAGCGAGAAAAGATCACTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGGAAATCCAAGTTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 58,398
|
MF620129.1
|
Oropouche virus
|
Wise,E.L., Lewandowski,K.S., Liberty,L., Alexander,S., Baker,N.P., Russell,J.E., Pullan,S.T., Logue,C.H.
|
Public Health England, NIS
| null |
2017-09-16
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| null | null | null | null | null |
1961-01-13
| null | null |
Oropouche virus culture NCPV:1409261v segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCGAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCACAACTGTTGCTCAACCAATATCGGAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAGATAGCAAAGGATATATGGCGAGATCTATTAAATGATCGACACAATTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAATCTTGAGTACAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTTCTTGATGGTTATAAAGCAAGGAAAGTTCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACATGATGGAAAGATGTATATAATAGACTTCAAAGTGTCTGTAGACGACCGATCTTCTAGAATCACAAGGGAAAAATATAATGAGATTTTTGGAGAAGTATTCAATCCAGAAGGTGTAGATTTTGAAATTGTTATTATTAGATTAGATCCCTCAAATATGGCTATACATGTGGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATTGGGCCGATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTGTTCGGAAAATTCCGGGATGATGATAAATTTCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGACACCCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAATTCATGAATTCAATGCCAGAGGCAGAACAGGCCCTATTCAAGGAAGCATTAGAATTCAAATCATTCGGGGCAGAAAAATGGAATATCTTCTTGAAGGGTGTGATGTCAAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACTAAAGGACATGCTCATTCTATATTTCTGACAACAGGGGACTACCCCAAGCCAGATAAAAACCAAATTTCAGCAGGTTGGAGAGAAATGGTAAATAGAGTGAGCTCCGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAATAATAATATACAAAAGCTAATCAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGCGGGACAGGGAGCTATGTAAATGCTTTCAAGTCATTAGGAAGATTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGGAAGTTAAAATCTCTGGCAAGGTCTAGTATAAAAAAACTTGACAGGAAAATAGAGCCAATTCAAATTGGGACTGCAACTGTCTTATGGGAACAGCAATTTAAACTAGATACAGATGTTATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTTGGGATCGGTAAGCACAAATCATTTTCAAAGAAATTAAACAATGACATAAATACTGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGATGATATAGTTAGGAAATGCAAAGATAAATATAATCAAGTCATACATAACCTATCCCAAATCAATGAATTAGATAAGATTGGAAACTACCTAGAGCATTTTTCAACTAAGATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGATTTTATATATAATACAACTAAAACTAAGTACTGGCAATGCATCAATGACTATTCCACCCTAATGAAAAACATGTTAGCTGTCTCTCAATATAATAGACACAATACGTTTAGAATTGTCTCATGTGCAAACAATAATGTATTCGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAGACAAAAAAAGCAACTTTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCATAATGAGGAGGCAGAAATAGCAGAACTTGGCTCACTCTACTCAACTTTTAAGACAGCAACAGGATATATTTCAATATCCAAGGCTTTTAGGCTGGATAAAGAAAGATGCCAACGCATAGTATCCTCTCCAGGCTTGTTCCTCATGACAAGCTGCCTATTATTCAACGGTAACAAGAGTTTAGAATTTGATAAATTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCAATTACGAAAACTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGTTATATGATCATGAACTCGTTAGCAGTTTCCAGCCATGTAAGAGAGTATATATCTGAAAAATTCTCCCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGACTTAATCAAAAAGGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGAAAAAAAGTACAAATAAGAGACATAAAATTAACAGATTATGATATAACACAAAAGGGAGTGGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCTATTTGGTTCCCAGGAAAGGTAAACCTAAAAGAATATTTAAACCAAATCTATCTGCCATTTTATTTTAACTCTAAAGGATTACATGAAAAACATCATGTCTTGATAGATTTGGCTAAAACAGTACTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGGGAGTCACTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCTAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTATTCAATTGCAAGGAATTTGAATTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTAAGAAGCCGGGTAGAAAATGCAAATAATTTCAACAGATCTATAACGACAATATCTACTTTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGTGATTTTGAAGAAGAAAAAAAGAGAAAAACTAAGAATGATACAAAGAAACTTGCAAAGGATATTTCTAAATTAACCATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAACGAACATGAGATAAGGCATTCAACTTATGAGGACTTAAAACAATCTATCCCAGATTACACAGATTATATGTCTGTGAAAGTTTTTGACAGATTGTACGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGCGATAAGGAAACAGTCAAACTGATTCTAGAGACCATGAAAAAACATAAAATATTTCATTTTGGGTTCTTCAATAAAGGACAAAAAACAGCCAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGTCTGTACCTTGTCGAAAGGCTAGCCAAAGAGAGGTGCAAATTAAACCCTGAAGAAATGATAAGTGAACCAGGCGACTCGAAATTAAGGGTATTAGAGAAGCAATCAGAAGACGAAATCAGGTATATTAGCAATACGATAAAAACACTAGGGAATGCCATAGAAAGTTTGCAATCTGGATCTTTAAATTGGGCAGATATATGCGAAAATAAAGCAAGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGACATGTCCAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTTTGGTTGATAGTACTTGATCCCATCTTGTATCCTGCTGAGAGGAAAAGGATAATTTATTTCCTCTGTAATTATATGCAGAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACTATATTGGATCAAAGAGTTCCTTATTCAAATGACATAATTGGATTAATGACAAACAATTATAGGTCCAATACAGTAGAAATAAAGCGTAACTGGCTTCAAGGCAACTTGAATTATACAAGCAGTTACTTACACAGCTGTAGTATGTCTGTATACAAAGATATAATAAGAGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGAGAAGCCCTTGTGAACTCAATGGTGCATTCTGATGATAATCAAACATCTATATGTATGGTGCAGAATAAATTACCAGATGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGCTTAACTTTTGGCAATCAGGCGAATATGAAGAAGACATATCTAACTAATTTCATCAAAGAGTTTGTTTCTTTATTTAATATACATGGAGAACCATTTTCTATATATGGGAGATTTCTACTCACAGCAGTAGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCATGGTTGTCCACCGTCACTTGCATGGGTATCTATCGCTCTAAATCACTGGATAACCCACACTACATATAATATGCTGCCTGGCCAAAATAATGACCCGTTGCCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAGTGAAATACCAGTAGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGCGATTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACGTTCCTAACAAATATAGCAAGGAAGTTATCAWCCCCAATCTTACAAAGAGAAAGTATTCAAGATCAATATAATTCTATAGAAAAGTGGGATCTGAGTAAATTATCACAGATCGACATTCTAAGGCTTAAAATGCTCAGGTATATATCTCTTGATAGTTCAGTCACATCTGATGACGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCTCGATCACTTTTAACGCCTCGTAAATTCACAACAAGTGGGTCACTTAATAGGTTGAAATCATACAAAGATTTTCAAGATATAATAGCAGATGAGGACAAGACAAACGAACTATTTGAGAATTTCATTAGACACCCAGAGTTACTGGTTACAAAAGGCGAAACATTTGAAGAATTTGTTAATACGATATTATTTAGGTACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTGTCAATACAAAACCCGGCACAGCTTTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAGTAATTGACTACACTAGCATACATGACAAGATTTTTGGATTACAAGACATGCCAGGAATTGAAGAACTAGATACAATTATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAGAGTTATGTCCAGATCGTAGATGACTTAAGCAATCTAACATTGGATATAAACGATGTCAAGACTATATTTGCCTTTTGTCTTATGAATGACCCACTACTGATCACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTCAAGGGACATAGTCAAAAAAGAATAGGTCAATCAGCATGCAAAATGCCAGAGGTCCGAAGTCTAAAACTCATACATTACTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCAAGGGATCTATCTCATTTAGAAGACTTCATACAAAGTACAAAACTCAGAGAAAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAGCGGCACTTAGGGAGGGATTTCAAATTTGAAATCAAAGAACTAACTAGATTTTACCAAGTGTGTTATGATTACATAAAGTCTACAGAACATAAAGTCAAGGTGTTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAACTTGATAAATGACAAATTATGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAGGCACAAATTTCTTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAGGCACTAAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTCTTGGCATCAGAATCAAGGATACAATTTCTGAAGAAAATTATTGAAGAATTCACATACAAAGGAATACCTGTAAAACATTTATACTCAAAAATAAAGAACTCCAAATTGAGGGTTAAATTTCTAGGGATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACACAGAATGATCTGGATAAATTTGATGCAGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTGTCAAGAGATATGAATACTGGACCAATAGACTTAATGATAAGCGGTTACTCTAGGCAGCTGCGGATTACTGGGGAAGATGACAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAGGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTAATTTATAGACACGGTCAGGCAATGTTGAATAAGCCACATGGCTTAAAGCTTGAAAAAATGCAACCTGTGACTGAGATGTCTAAACGATTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGATCACGGAAACGATACTTCTATTCTATATTACCTACCCAAGTAATTGAGGACCATAATTCTAGAGTTGAATCATCTAGGCTAAGCAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGCCCTGTTGCAATATCAAAACTCTACCAACAAGGACGGCCTATACTTTCCAAAGTTAGAAATCTGAATATGCAGACTCATTCGCTTTCCAGAATACAAGTTAATGTAGATGAATATGCCATTACAAGAAGAGCACATTTTCAGAAAATGCCTTTCTTCGAAGGACCGTCAATCCCTTCTGGTGGTATGGATTTATCAGAGCTAATGAAATCCACATCCCTATTAAGCTTGAACTATGATAACATTAAAAATGCATCTTTATTGGACATGTCTAGGGTATTTAAGTGCAATGGCAGTGAAGATGACCAAATGGCTTTCGAATTTCTATCGGACGAAATTTTGGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCCTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTTGACTTCCTTGACATGGGATTTTGCTCGAATGAAAATCTTAGCATTCTGGAGGAAATACATTGGATAATCAGTTATTTGAAAACAAATCAATGGTCTACGGAACTAGATAATTGTATTCACATGTGCATGTACAGGAATGGGTATGATGCAGAATATCATAAATTTGATATACCCTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGAACAATAAATTGGACAGAGGTCATTGAATTTATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAAATTGAGCCATGGTCTAGTATGAAGTCACACTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCACTAGAGTGTATGAAAAATGAGAAAAGATCATTGGCAGAATTTGTAGACAGAAGTAAGAAAACTGGCAAATCTAAATTTGACTTCTAAGGTATACACATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 74,627
|
KP691603.1
|
Oropouche virus
|
Tilston-Lunel,N.L., Hughes,J., Acrani,G.O., da Silva,D.E., Azevedo,R.S., Rodrigues,S.G., Vasconcelos,P.F., Nunes,M.R., Elliott,R.M., da Silva,D.E.A., Azevedo,R.S.S., Rodrigues,S., Vasconcelos,P.F.C., Nunes,M.R.T.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-03-15
|
BeH759024
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
2009-07-24
| null | null |
Oropouche virus isolate BeH759024 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAGCTGTTGCTCAACCAGTATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCGAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTCCCTGCTGAGGATATTTGCGCTGAAGTCCTTGATAGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGTTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTGCATGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTATCTGTAGATGATCGATCTTCCAGGATTACAAGGGAGAAATACAATGAGATTTTTGGAGAGGTGTTCAATCCAGAAGGTGTAGACTTTGAAATTGTTATTATTAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTGGATTCTCGAGATTTCATGAATACGATTGGACCAATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTTCGAGATGATGATAAATTCCATGCCATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGATACCCCAGAATTGCTTACTCATCCAATATACAATGAATTTATGAATTCAATGCCAGAAGCAGAACAGGCTTTATTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCGGAGAAATGGAATATTTTTTTAAAAGGGGTAATGTCCAGGTATGGTGAATATTATAAAGAGTTTACTAAAGGGCATGCACAATCTATATTCTTGACAACAGGAGATTACCCCAGGCCAGATAAGGACCAAATTTCGGCCGGCTGGCGAGAAATGGTGAGTAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGATATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAACAATAACATACAGAAACTAATTAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGTGGGACAGGGAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGACTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGAAAGTTAAAATCTCTAGCAAGATCTAGTGTGAAGAAACTTGACAGGAAAATAGAACCAATACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTCAAATTAGATACGGATGTTATAAAAAGGGAAGATAGAATACACTTAATGAAAGACTATTTTGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAGTGACATAAATACTGATAAGCCTAAGATATTGAATTTTGATAATGACGACATAGTTAGGAAATGCAAAGACAAATATAATCAAGTCACACATAACTTATCTCAAGTCAATGAATTGGACAAGATTGGGAACTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAGATTAGTGCCTGTAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACAACTAAAACTAAGTATTGGCAGTGTATCAATGACTACTCTACCTTGATGAAAAACATGTTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACTTTTAGAGTTGTCTCATGTGCAAATAATAATGTATTTGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTACGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCTACTTTTAAGACAACAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGACTAGATAAGGAAAGATGCCAACGTATAGTGTCCTCTCCGGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAATTTGATAAGTTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCCATGCTATCTCTCACGGAGCCTTCGCGCTATATGATCATGAATTCGCTGGCAGTCTCTAGCCATGTGAGAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTACACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGATTTGATTAAAAAGGGCTGCTATTCAGCATACGAGCAGAGGAAAAAGGTGCAAATAAGGGATATAAAATTAACAGACTACGATATAACACAAAAGGGAGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATCTGGTTCCCAGGGAAGGTAAATTTAAAGGAGTACTTGAGCCAGATTTATCTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGACTACATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATTGAAAAAGAACAAAGGGAGTCACTACCTGAACCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGAAATTTGAACTTAGATACTTCGAGACATAATTTTGTGAGAAGTCGAGTAGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCTACTTTCACCAGCTCAAAATCGTGTATTAAGATTGGTGATTTCGAGGAGGAGAAAAAGAGAAAAACCAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAGGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAATCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAGCATGAGATAAGACACTCAACTTACGAGGATTTAAAACAATCCATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGCTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTCACTTCGGATTTTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAGATGATAAGTGAACCAGGTGATTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAACAGTCAGAAGACGAAATCAGGTATATCAGTAATACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACTTGCAATCCGGGTCTTTAGATTGGGCAGATATATGTGAAAATAAGGCAAGAGGGCTCAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTCGATCCTATCTTGTATCCTGCTGAGAGAAAGAGAATAATTTATTTCCTCTGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTTACTACTATATTGGACCAGAGGGTTCCCTATTCAAATGATATAATTGGGTTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAACGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAACTATACAAGCAGCTACTTGCACAGTTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTCGTGAATTCAATGGTACACTCTGATGACAATCAAACATCCATATGTATGGTACAGAACAAGTTGCCAGACGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGGAATCAAGCTAACATGAAGAAGACATACCTAACCAATTTCATCAAGGAGTTTGTTTCTTTATTCAATATACATGGAGAGCCATTCTCTATATATGGGCGATTTTTGCTTACGGCAGTGGGCGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCACGGTTGCCCACCATCACTAGCATGGGTATCCATTGCCTTAAATCACTGGATAACCCACACCACGTATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAACGACCCACTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATATTAGAAAGCGACCTATCGACAATTGCACTGACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACATTTTTGACAAATATAGCAAGAAAATTATCATCTCCGATCTTGCAAAGAGAGAGTATTCAAGACCAATATAATTCTATAGAAAAATGGGATCTAAGTAGATTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTTACATCTGATGATGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCCCGATCACTTTTAACACCTCGTAAGTTTACAACAAGTGGATCGCTCAATAGACTGAAATCATATAAGGATTTTCAAAATATAATAGCAGATGAAGACAAGACAAATGAGCTATTCGAGAATTTCATCAGGCACCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTCGAAGAGTTTGTTAATACAATATTATTTAGATACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTATCAATACAAAATCCAGCACAGCTATTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATCTTCGGATTGCAAGATATGCCAGGGATTGAAGAACTAGATACAATCATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGACGATTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAATGATGTCAAGACTATATTTGCCTTCTGCCTCATGAATGACCCACTACTAATTACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAAGGACATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCCGAAGTCTGAAGCTTATACATTATTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTACGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGACTTTATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATCTAGGAAGGGATTTCAAGTTCGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTATGTTATGATTATATAAAATCCACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAATTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAAGCACAAATTTCGTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTTTTAGCGTCCGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAGAAGGTTATCGAAGAGTTCACATACAAGGGAATACCTGTGAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTTAAATTCTTAGGAATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACGCAAAATGATCTAGATAAATTTGATGCGGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAATACTGGGCCAATAGATTTAATGATAAGTGGTTATTCTAGGCAGTTGCGAATTACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAGTCGCAAGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTATAGACACGGTCAGGCGATGTTAAATAAGCCTCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTGACTGAGATGTCTAAACAATTACATTATATTGTTTTCCAACAGAGATCAAGAAAGCGATACTTCTATTCTATACTACCCACCCAAATAATTGAAGACCACAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGTCCCGTTGCAGTATCAAAACTTTATCAACAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCACTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGACGAATATGCCATTACAAGGAGAGCACACTTCCAAAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTGTCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCCAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAGAATGACCAAATGGCTTTCGAATTCCTATCAGATGAAATTCTAGAGCAGGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAGAACGCCTTCCATAAAGCCTTAATCTCAGAGTGTGATAAATTTGAAGAGGTATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCAAATGAAAATCTTAGCATTTTAGAAGAAATACACTGGATTATCAGTTATTTAAAAACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTACCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGGACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTCATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAACCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTGGCATTAGAGTGTATAAAGAACGAGAAAAGATCACTGGCAGAGTTTGTAGATAGAAGCAAGAAAACTGGAAAATCCAAATTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,466
|
KP691606.1
|
Oropouche virus
|
Tilston-Lunel,N.L., Hughes,J., Acrani,G.O., da Silva,D.E., Azevedo,R.S., Rodrigues,S.G., Vasconcelos,P.F., Nunes,M.R., Elliott,R.M., da Silva,D.E.A., Azevedo,R.S.S., Vasconcelos,P.F.C., Nunes,M.R.T.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-03-15
|
BeH759021
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
2009-07-23
| null | null |
Oropouche virus isolate BeH759021 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAGCTGTTACTCAACCAGTATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCGAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTCCCTGCTGAGGATATTTGCGCTGAAGTCCTTGATAGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGTTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTGCATGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTATCTGTAGATGATCGATCTTCCAGGATTACAAGGGAGAAATACAATGAGATTTTTGGAGAGGTGTTCAATCCAGAAGGTGTAGACTTTGAAATTGTTATTATTAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTGGATTCTCGAGATTTCATGAATACGATTGGACCAATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTTCGAGATGATGATAAATTCCATGCCATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGATACCCCAGAATTGCTTACTCATCCAATATACAATGAATTTATGAATTCAATGCCAGAAGCAGAACAGGCTTTATTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCGGAGAAATGGAATATTTTTTTAAAAGGGGTAATGTCCAGGTATGGTGAATATTATAAAGAGTTTACTAAAGGGCATGCACAATCTATATTCTTGACAACAGGAGATTACCCCAGGCCAGATAAGGACCAAATTTCGGCCGGCTGGCGAGAAATGGTGAGTAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGATATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAACAATAACATACAGAAACTAATTAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGTGGGACAGGGAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGACTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGAAAGTTAAAATCTCTAGCAAGATCTAGTGTGAAGAAACTTGACAGGAAAATAGAACCAATACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTCAAATTAGATACGGATGTTATAAAAAGGGAAGATAGAATACACTTAATGAAAGACTATTTTGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAGTGACATAAATACTGATAAGCCTAAGATATTGAATTTTGATAATGACGACATAGTTAGGAAATGCAAAGACAAATATAATCAAGTCACACATAACTTATCTCAAGTCAATGAATTGGACAAGATTGGGAACTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAGATTAGTGCCTGTAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACAACTAAAACTAAGTATTGGCAGTGTATCAATGACTACTCTACCTTGATGAAAAACATGTTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACTTTTAGAGTTGTCTCATGTGCAAATAATAATGTATTTGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTACGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCTACTTTTAAGACAACAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGACTAGATAAGGAAAGATGCCAACGTATAGTGTCCTCTCCGGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAATTTGATAAGTTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCCATGCTATCTCTCACGGAGCCTTCGCGCTATATGATCATGAATTCGCTGGCAGTCTCTAGCCATGTGAGAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTACACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGATTTGATTAAAAAGGGCTGCTATTCAGCATACGAGCAGAGGAAAAAGGTGCAAATAAGGGATATAAAATTAACAGACTACGATATAACACAAAAGGGAGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATCTGGTTCCCAGGGAAGGTAAATTTAAAGGAGTACTTGAGCCAGATTTATCTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGACTACATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATTGAAAAAGAACAAAGGGAGTCACTACCTGAACCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGAAATTTGAACTTAGATACTTCGAGACATAATTTTGTGAGAAGTCGAGTAGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCTACTTTCACCAGCTCAAAATCGTGTATTAAGATTGGTGATTTCGAGGAGGAGAAAAAGAGAAAAACCAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAGGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAATCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAGCATGAGATAAGACACTCAACTTACGAGGATTTAAAACAATCCATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGCTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTCACTTCGGATTTTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAGATGATAAGTGAACCAGGTGATTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAACAGTCAGAAGACGAAATCAGGTATATCAGTAATACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACTTGCAATCCGGGTCTTTAGATTGGGCAGATATATGTGAAAATAAGGCAAGAGGGCTCAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTCGATCCTATCTTGTATCCTGCTGAGAGAAAGAGAATAATTTATTTCCTCTGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTTACTACTATATTGGACCAGAGGGTTCCCTATTCAAATGATATAATTGGGTTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAACGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAACTATACAAGCAGCTACTTGCACAGTTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTCGTGAATTCAATGGTACACTCTGATGACAATCAAACATCCATATGTATGGTACAGAACAAGTTGCCAGACGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGGAATCAAGCTAACATGAAGAAGACATACCTAACCAATTTCATCAAGGAGTTTGTTTCTTTATTCAATATACATGGAGAGCCATTCTCTATATATGGGCGATTTTTGCTTACGGCAGTGGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCACGGTTGCCCACCATCACTAGCATGGGTATCCATTGCCTTAAATCACTGGATAACCCACACCACGTATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAACGACCCACTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATATTAGAAAGCGACCTATCGACAATTGCACTGACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACATTTTTGACAAATATAGCAAGAAAATTATCATCTCCGATCTTGCAAAGAGAGAGTATTCAAGACCAATATAATTCTATAGAAAAATGGGATCTAAGTAGATTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTTACATCTGATGATGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCCCGATCACTTTTAACACCTCGTAAGTTTACAACAAGTGGATCGCTCAATAGACTGAAATCATATAAGGATTTTCAAAATATAATAGCAGATGAAGACAAGACAAATGAGCTATTCGAGAATTTCATCAGGCACCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTCGAAGAGTTTGTTAATACAATATTATTTAGATACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTATCAATACAAAATCCAGCACAGCTATTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATCTTCGGATTGCAAGATATGCCAGGGATTGAAGAACTAGATACAATCATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGACGATTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAATGATGTCAAGACTATATTTGCCTTCTGCCTCATGAATGACCCACTACTAATTACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAAGGACATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCCGAAGTCTGAAGCTTATACATTATTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTACGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGACTTTATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATCTAGGAAGGGATTTCAAGTTCGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTATGTTATGATTATATAAAATCCACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAATTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAAGCACAAATTTCGTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTTTTAGCGTCCGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAGAAGGTTATCGAAGAGTTCACATACAAGGGAATACCTGTGAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTTAAATTCTTAGGAATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACGCAAAATGATCTAGATAAATTTGATGCGGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAATACTGGGCCAATAGATTTAATGATAAGTGGTTATTCTAGGCAGTTGCGAATTACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTATAGACACGGTCAGGCGATGTTAAATAAGCCTCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTGACTGAGATGTCTAAACAATTACATTATATTGTTTTCCAACAGAGATCAAGAAAGCGATACTTCTATTCTATACTACCCACCCAAATAATTGAAGACCACAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGTCCCGTTGCAGTATCAAAACTTTATCAACAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCACTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGACGAATATGCCATTACAAGGAGAGCACACTTCCAAAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTGTCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCCAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAGAATGACCAAATGGCTTTCGAATTCCTATCAGATGAAATTCTAGAGCAGGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAGAACGCCTTCCATAAAGCCTTAATCTCAGAGTGTGATAAATTTGAAGAGGTATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCAAATGAAAATCTTAGCATTTTAGAAGAAATACACTGGATTATCAGTTATTTAAAAACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTACCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGGACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTCATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAACCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTGGCATTAGAGTGTATAAAGAACGAGAAAAGATCACTGGCAGAGTTTGTAGATAGAAGCAAGAAAACTGGAAAATCCAAATTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,467
|
KP691609.1
|
Oropouche virus
|
Tilston-Lunel,N.L., Hughes,J., Acrani,G.O., da Silva,D.E., Azevedo,R.S., Rodrigues,S.G., Vasconcelos,P.F., Nunes,M.R., Elliott,R.M., da Silva,D.E.A., Azevedo,R.S.S., Vasconcelos,P.F.C., Nunes,M.R.T.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-03-15
|
BeH759022
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
2009-07-24
| null | null |
Oropouche virus isolate BeH759022 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAGCTGTTACTCAACCAGTATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCGAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTCCCTGCTGAGGATATTTGCGCTGAAGTCCTTGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGTTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTGCATGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTATCTGTAGATGATCGATCTTCCAGGATTACAAGGGAGAAATACAATGAGATTTTTGGAGAGGTGTTCAATCCAGAAGGTGTAGACTTTGAAATTGTTATTATTAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTGGATTCTCGAGATTTCATGAATACGATTGGACCAATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTTCGAGATGATGATAAATTCCATGCCATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGATACCCCAGAATTGCTTACTCATCCAATATACAATGAATTTATGAATTCAATGCCAGAAGCAGAACAGGCTTTATTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCGGAGAAATGGAATATTTTTTTAAAAGGGGTAATGTCCAGGTATGGTGAATATTATAAAGAGTTTACTAAAGGGCATGCACAATCTATATTCTTGACAACAGGAGATTACCCCAGGCCAGATAAGGACCAAATTTCGGCCGGCTGGCGAGAAATGGTGAGTAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGATATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAACAATAACATACAGAAACTAATTAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGTGGGACAGGGAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGACTAATGGATATATCATCAGATATTAAGAAATATGAATCATTTTGTGGAAAGTTAAAATCTCTAGCAAGATCTAGTGTGAAGAAACTTGACAGGAAAATAGAACCAATACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTCAAATTAGATACGGATGTTATAAAAAGGGAAGATAGAATACACTTAATGAAAGACTATTTTGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAGTGACATAAATACTGATAAGCCTAAGATATTGAATTTTGATAATGACGACATAGTTAGGAAATGCAAAGACAAATATAATCAAGTCACACATAACTTATCTCAAGTCAATGAATTGGACAAGATTGGGAACTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAGATTAGTGCCTGTAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACTAAGTATTGGCAGTGTATCAATGACTACTCTACCTTGATGAAAAACATGTTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACTTTTAGAGTTGTCTCATGTGCAAATAATAATGTATTTGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTACGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCTACTTTTAAGACAACAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGACTAGATAAGGAAAGATGCCAACGTATAGTGTCCTCTCCGGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAATTTGATAAGTTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCCATGCTATCTCTCACGGAGCCTTCGCGCTATATGATCATGAATTCGCTGGCAGTCTCTAGCCATGTGAGAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTACACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGATTTGATTAAAAAGGGCTGCTATTCAGCATACGAGCAGAGGAAAAAGGTGCAAATAAGGGATATAAAATTAACAGACTACGATATAACACAAAAGGGAGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATCTGGTTCCCAGGGAAGGTAAATTTAAAGGAGTACTTGAGCCAGATTTATCTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGACTACATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATTGAAAAAGAACAAAGGGAGTCACTACCTGAACCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGAAATTTGAACTTAGATACTTCGAGACATAATTTTGTGAGAAGTCGAGTAGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCTACTTTCACCAGCTCAAAATCGTGTATTAAGATTGGTGATTTCGAGGAGGAGAAAAAGAGAAAAACCAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAGGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAATCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAGCATGAGATAAGACACTCAACTTACGAGGATTTAAAACAATCCATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGCTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTCACTTCGGATTTTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAGATGATAAGTGAACCAGGTGATTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAACAGTCAGAAGACGAAATCAGGTATATCAGTAATACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACTTGCAATCCGGGTCTTTAGATTGGGCAGATATATGTGAAAATAAGGCAAGAGGGCTCAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTCGATCCTATCTTGTATCCTGCTGAGAGAAAGAGAATAATTTATTTCCTCTGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTTACTACTATATTGGACCAGAGGGTTCCCTATTCAAATGATATAATTGGGTTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAACGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAACTATACAAGCAGCTACTTGCACAGTTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTCGTGAATTCAATGGTACACTCTGATGACAATCAAACATCCATATGTATGGTACAGAACAAGTTGCCAGACGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGGAATCAAGCTAACATGAAGAAGACATACCTAACCAATTTCATCAAGGAGTTTGTTTCTTTATTCAATATACATGGAGAGCCATTCTCTATATATGGGCGATTTTTGCTTACGGCAGTGGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCACGGTTGCCCACCATCACTAGCATGGGTATCCATTGCCTTAAATCACTGGATAACCCACACCACGTATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAACGACCCACTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATATTAGAAAGCGACCTATCGACAATTGCACTGACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACATTTTTGACAAATATAGCAAGAAAATTATCATCTCCGATCTTGCAGAGAGAGAGTATTCAAGACCAATATAATTCTATAGAAAAATGGGATCTAAGTAGATTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTTACATCTGATGATGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCCCGATCACTTTTAACACCTCGTAAGTTTACAACAAGTGGATCGCTCAATAGACTGAAATCATATAAGGATTTTCAAAATATAATAGCAGATGAAGACAAGACAAATGAGCTATTCGAGAATTTCATCAGGCACCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTCGAAGAGTTTGTTAATACAATATTATTTAGATACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTATCAATACAAAATCCAGCACAGCTATTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATCTTCGGATTGCAAGATATGCCAGGGATTGAAGAACTAGATACAATCATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGACGATTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAATGATGTCAAGACTATATTTGCCTTCTGCCTCATGAATGACCCACTACTAATTACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAAGGACATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCCGAAGTCTGAAGCTTATACATTATTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTACGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGACTTTATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATCTAGGAAGGGATTTCAAGTTCGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTATGTTATGATTATATAAAATCCACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAATTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAAGCACAAATTTCGTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTTTTAGCGTCCGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAGAAGGTTATCGAAGAGTTCACATACAAGGGAATACCTGTGAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGAGTTAAATTCTTAGGAATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACGCAAAATGATCTAGATAAATTTGATGCGGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAATACTGGGCCAATAGATTTAATGATAAGTGGTTATTCTAGGCAGTTGCGAATTACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTATAGACACGGTCAGGCGATGTTAAATAAGCCTCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTGACTGAGATGTCTAAACAATTACATTATATTGTTTTCCAACAGAGATCAAGAAAGCGATACTTCTATTCTATACTACCCACCCAAATAATTGAAGACCACAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGTCCCGTTGCAGTATCAAAACTTTATCAACAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCACTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGACGAATATGCCATTACAAGGAGAGCACACTTCCAAAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTGTCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCCAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAGAATGACCAAATGGCTTTCGAATTCCTATCAGATGAAATTCTAGAGCAGGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAGAACGCCTTCCATAAAGCCTTAATCTCAGAGTGTGATAAATTTGAAGAGGTATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCAAATGAAAATCTTAGCATTTTAGAAGAAATACACTGGATTATCAGTTATTTAAAAACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTACCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGGACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTCATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAACCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTGGCATTAGAGTGTATAAAGAACGAGAAAAGATCACTGGCAGAGTTTGTAGATAGAAGCAAGAAAACTGGAAAATCCAAATTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,468
|
KP691612.1
|
Oropouche virus
|
Tilston-Lunel,N.L., Hughes,J., Acrani,G.O., da Silva,D.E., Azevedo,R.S., Rodrigues,S.G., Vasconcelos,P.F., Nunes,M.R., Elliott,R.M., da Silva,D.E.A., Azevedo,R.S.S., Vasconcelos,P.F.C., Nunes,M.R.T.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-03-15
|
BeH759025
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
2009-07-24
| null | null |
Oropouche virus isolate BeH759025 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAGCTGTTACTCAACCAGTATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCGAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTCCCTGCTGAGGATATTTGCGCTGAAGTCCTTGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGTTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTGCATGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTATCTGTAGATGATCGATCTTCCAGGATTACAAGGGAGAAATACAATGAGATTTTTGGAGAGGTGTTCAATCCAGAAGGTGTAGACTTTGAAATTGTTATTATTAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTGGATTCTCGAGATTTCATGAATACGATTGGACCAATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTTCGAGATGATGATAAATTCCATGCCATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGATACCCCAGAATTGCTTACTCATCCAATATACAATGAATTTATGAATTCAATGCCAGAAGCAGAACAGGCTTTATTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCGGAGAAATGGAATATTTTTTTAAAAGGGGTAATGTCCAGGTATGGTGAATATTATAAAGAGTTTACTAAAGGGCATGCACAATCTATATTCTTGACAACAGGAGATTACCCCAGGCCAGATAAGGACCAAATTTCGGCCGGCTGGCGAGAAATGGTGAGTAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGATATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAACAATAACATACAGAAACTAATTAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGTGGGACAGGGAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGACTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGAAAGTTAAAATCTCTAGCAAGATCTAGTGTGAAGAAACTTGACAGGAAAATAGAACCAATACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTCAAATTAGATACGGATGTTATAAAAAGGGAAGATAGAATACACTTAATGAAAGACTATTTTGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAGTGACATAAATACTGATAAGCCTAAGATATTGAATTTTGATAATGACGACATAGTTAGGAAATGCAAAGACAAATATAATCAAGTCACACATAACTTATCTCAAGTCAATGAATTGGACAAGATTGGGAACTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAGATTAGTGCCTGTAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACTAAGTATTGGCAGTGTATCAATGACTACTCTACCTTGATGAAAAACATGTTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACTTTTAGAGTTGTCTCATGTGCAAATAATAATGTATTTGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTACGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCTACTTTTAAGACAACAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGACTAGATAAGGAAAGATGCCAACGTATAGTGTCCTCTCCGGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAATTTGATAAGTTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCCATGCTATCTCTCACGGAGCCTTCGCGCTATATGATCATGAATTCGCTGGCAGTCTCTAGCCATGTGAGAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTACACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGATTTGATTAAAAAGGGCTGCTATTCAGCATACGAGCAGAGGAAAAAGGTGCAAATAAGGGATATAAAATTAACAGACTACGATATAACACAAAAGGGAGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATCTGGTTCCCAGGGAAGGTAAATTTAAAGGAGTACTTGAGCCAGATTTATCTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGACTACATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATTGAAAAAGAACAAAGGGAGTCACTACCTGAACCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGAAATTTGAACTTAGATACTTCGAGACATAATTTTGTGAGAAGTCGAGTAGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCTACTTTCACCAGCTCAAAATCGTGTATTAAGATTGGTGATTTCGAGGAGGAGAAAAAGAGAAAAACCAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAGGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAATCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAGCATGAGATAAGACACTCAACTTACGAGGATTTAAAACAATCCATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGCTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTCACTTCGGATTTTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAGATGATAAGTGAACCAGGTGATTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAACAGTCAGAAGACGAAATCAGGTATATCAGTAATACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACTTGCAATCCGGGTCTTTAGATTGGGCAGATATATGTGAAAATAAGGCAAGAGGGCTCAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTCGATCCTATCTTGTATCCTGCTGAGAGAAAGAGAATAATTTATTTCCTCTGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTTACTACTATATTGGACCAGAGGGTTCCCTATTCAAATGATATAATTGGGTTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAACGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAACTATACAAGCAGCTACTTGCACAGTTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTCGTGAATTCAATGGTACACTCTGATGACAATCAAACATCCATATGTATGGTACAGAACAAGTTGCCAGACGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGGAATCAAGCTAACATGAAGAAGACATACCTAACCAATTTCATCAAGGAGTTTGTTTCTTTATTCAATATACATGGAGAGCCATTCTCTATATATGGGCGATTTTTGCTTACGGCAGTGGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCACGGTTGCCCACCATCACTAGCATGGGTATCCATTGCCTTAAATCACTGGATAACCCACACCACGTATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAACGACCCACTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAAATGTGCGGAATATTAGAAAGCGACCTATCGACAATTGCACTGACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACATTTTTGACAAATATAGCAAGAAAATTATCATCTCCGATCTTGCAAAGAGAGAGTATTCAAGACCAATATAATTCTATAGAAAAATGGGATCTAAGTAGATTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTTACATCTGATGATGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCCCGATCACTTTTAACACCTCGTAAGTTTACAACAAGTGGATCGCTCAATAGACTGAAATCATATAAGGATTTTCAAAATATAATAGCAGATGAAGACAAGACAAATGAGCTATTCGAGAATTTCATCAGGCACCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTCGAAGAGTTTGTTAATACAATATTATTTAGATACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTATCAATACAAAATCCAGCACAGCTATTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATCTTCGGATTGCAAGATATGCCAGGGATTGAAGAACTAGATACAATCATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGACGATTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAATGATGTCAAGACTATATTTGCCTTCTGCCTCATGAATGACCCACTACTAATTACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAAGGACATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCCGAAGTCTGAAGCTTATACATTATTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTACGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGACTTTATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATCTAGGAAGGGATTTCAAGTTCGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTATGTTATGATTATATAAAATCCACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAATTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAAGCACAAATTTCGTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTTTTAGCGTCCGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAGAAGGTTATCGAAGAGTTCACATACAAGGGAATACCTGTGAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTTAAATTCTTAGGAATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACGCAAAATGATCTAGATAAATTTGATGCGGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAATACTGGGCCAATAGATTTAATGATAAGTGGTTATTCTAGGCAGTTGCGAATTACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTATAGACACGGTCAGGCGATGTTAAATAAGCCTCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTGACTGAGATGTCTAAACAATTACATTATATTGTTTTCCAACAGAGATCAAGAAAGCGATACTTCTATTCTATACTACCCACCCAAATAATTGAAGACCACAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGTCCCGTTGCAGTATCAAAACTTTATCAACAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCACTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGACGAATATGCCATTACAAGGAGAGCACACTTCCAAAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTGTCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCCAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAGAATGACCAAATGGCTTTCGAATTCCTATCAGATGAAATTCTAGAGCAGGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAGAACGCCTTCCATAAAGCCTTAATCTCAGAGTGTGATAAATTTGAAGAGGTATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCAAATGAAAATCTTAGCATTTTAGAAGAAATACACTGGATTATCAGTTATTTAAAAACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTACCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGGACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTCATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAACCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTGGCATTAGAGTGTATAAAGAACGAGAAAAGATCACTGGCAGAGTTTGTAGATAGAAGCAAGAAAACTGGAAAATCCAAATTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,469
|
KP691615.1
|
Oropouche virus
|
Tilston-Lunel,N.L., Hughes,J., Acrani,G.O., da Silva,D.E., Azevedo,R.S., Rodrigues,S.G., Vasconcelos,P.F., Nunes,M.R., Elliott,R.M., da Silva,D.E.A., Azevedo,R.S.S., Vasconcelos,P.F.C., Nunes,M.R.T.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-03-15
|
BeH759040
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
2009-07-23
| null | null |
Oropouche virus isolate BeH759040 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAGCTGTTACTCAACCAGTATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCGAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTCCCTGCTGAGGATATTTGCGCTGAAGTCCTTGATAGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGTTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTGCATGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTATCTGTAGATGATCGATCTTCCAGGATTACAAGGGAGAAATACAATGAGATTTTTGGAGAGGTGTTCAATCCAGAAGGTGTAGACTTTGAAATTGTTATTATTAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTGGATTCTCGAGATTTCATGAATACGATTGGACCAATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTTCGAGATGATGATAAATTCCATGCCATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGATACCCCAGAATTGCTTACTCATCCAATATACAATGAATTTATGAATTCAATGCCAGAAGCAGAACAGGCTTTATTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCGGAGAAATGGAATATTTTTTTAAAAGGGGTAATGTCCAGGTATGGTGAATATTATAAAGAGTTTACTAAAGGGCATGCACAATCTATATTCTTGACAACAGGAGATTACCCCAGGCCAGATAAGGACCAAATTTCGGCCGGCTGGCGAGAAATGGTGAGTAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGATATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAACAATAACATACAGAAACTAATTAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGTGGGACAGGGAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGACTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGAAAGTTAAAATCTCTAGCAAGATCTAGTGTGAAGAAACTTGACAGGAAAATAGAACCAATACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTCAAATTAGATACGGATGTTATAAAAAGGGAAGATAGAATACACTTAATGAAAGACTATTTTGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAGTGACATAAATACTGATAAGCCTAAGATATTGAATTTTGATAATGACGACATAGTTAGGAAATGCAAAGACAAATATAATCAAGTCACACATAACTTATCTCAAGTCAATGAATTGGACAAGATTGGGAACTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAGATTAGTGCCTGTAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACAACTAAAACTAAGTATTGGCAGTGTATCAATGACTACTCTACCTTGATGAAAAACATGTTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACTTTTAGAGTTGTCTCATGTGCAAATAATAATGTATTTGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTACGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCTACTTTTAAGACAACAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGACTAGATAAGGAAAGATGCCAACGTATAGTGTCCTCTCCGGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAATTTGATAAGTTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCCATGCTATCTCTCACGGAGCCTTCGCGCTATATGATCATGAATTCGCTGGCAGTCTCTAGCCATGTGAGAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTACACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGATTTGATTAAAAAGGGCTGCTATTCAGCATACGAGCAGAGGAAAAAGGTGCAAATAAGGGATATAAAATTAACAGACTACGATATAACACAAAAGGGAGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATCTGGTTCCCAGGGAAGGTAAATTTAAAGGAGTACTTGAGCCAGATTTATCTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGACTACATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATTGAAAAAGAACAAAGGGAGTCACTACCTGAACCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGAAATTTGAACTTAGATACTTCGAGACATAATTTTGTGAGAAGTCGAGTAGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCTACTTTCACCAGCTCAAAATCGTGTATTAAGATTGGTGATTTCGAGGAGGAGAAAAAGAGAAAAACCAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAGGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAATCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAGCATGAGATAAGACACTCAACTTACGAGGATTTAAAACAATCCATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGCTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTCACTTCGGATTTTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAGATGATAAGTGAACCAGGTGATTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAACAGTCAGAAGACGAAATCAGGTATATCAGTAATACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACTTGCAATCCGGGTCTTTAGATTGGGCAGATATATGTGAAAATAAGGCAAGAGGGCTCAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTCGATCCTATCTTGTATCCTGCTGAGAGAAAGAGAATAATTTATTTCCTCTGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTTACTACTATATTGGACCAGAGGGTTCCCTATTCAAATGATATAATTGGGTTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAACGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAACTATACAAGCAGCTACTTGCACAGTTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTCGTGAATTCAATGGTACACTCTGATGACAATCAAACATCCATATGTATGGTACAGAACAAGTTGCCAGACGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGGAATCAAGCTAACATGAAGAAGACATACCTAACCAATTTCATCAAGGAGTTTGTTTCTTTATTCAATATACATGGAGAGCCATTCTCTATATATGGGCGATTTTTGCTTACGGCAGTGGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCACGGTTGCCCACCATCACTAGCATGGGTATCCATTGCCTTAAATCACTGGATAACCCACACCACGTATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAACGACCCACTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATATTAGAAAGCGACCTATCGACAATTGCACTGACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACATTTTTGACAAATATAGCAAGAAAATTATCATCTCCGATCTTGCAAAGAGAGAGTATTCAAGACCAATATAATTCTATAGAAAAATGGGATCTAAGTAGATTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTTACATCTGATGATGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCCCGATCACTTTTAACACCTCGTAAGTTTACAACAAGTGGATCGCTCAATAGACTGAAATCATATAAGGATTTTCAAAATATAATAGCAGATGAAGACAAGACAAATGAGCTATTCGAGAATTTCATCAGGCACCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTCGAAGAGTTTGTTAATACAATATTATTTAGATACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTATCAATACAAAATCCAGCACAGCTATTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATCTTCGGATTGCAAGATATGCCAGGGATTGAAGAACTAGATACAATCATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGACGATTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAATGATGTCAAGACTATATTTGCCTTCTGCCTCATGAATGACCCACTACTAATTACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAAGGACATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCCGAAGTCTGAAGCTTATACATTATTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTACGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGACTTTATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATCTAGGAAGGGATTTCAAGTTCGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTATGTTATGATTATATAAAATCCACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAATTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAAGCACAAATTTCGTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTTTTAGCGTCCGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAGAAGGTTATCGAAGAGTTCACATACAAGGGAATACCTGTGAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTTAAATTCTTAGGAATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACGCAAAATGATCTAGATAAATTTGATGCGGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAATACTGGGCCAATAGATTTAATGATAAGTGGTTATTCTAGGCAGTTGCGAATTACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTATAGACACGGTCAGGCGATGTTAAATAAGCCTCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTGACTGAGATGTCTAAACAATTACATTATATTGTTTTCCAACAGAGATCAAGAAAGCGATACTTCTATTCTATACTACCCACCCAAATAATTGAAGACCACAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGTCCCGTTGCAGTATCAAAACTTTATCAACAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCACTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGACGAATATGCCATTACAAGGAGAGCACACTTCCAAAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTGTCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCCAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAGAATGACCAAATGGCTTTCGAATTCCTATCAGATGAAATTCTAGAGCAGGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAGAACGCCTTCCATAAAGCCTTAATCTCAGAGTGTGATAAATTTGAAGAGGTATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCAAATGAAAATCTTAGCATTTTAGAAGAAATACACTGGATTATCAGTTATTTAAAAACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTACCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGGACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTCATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAACCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTGGCATTAGAGTGTATAAAGAACGAGAAAAGATCACTGGCAGAGTTTGTAGATAGAAGCAAGAAAACTGGAAAATCCAAATTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,470
|
KP691618.1
|
Oropouche virus
|
Tilston-Lunel,N.L., Hughes,J., Acrani,G.O., da Silva,D.E., Azevedo,R.S., Rodrigues,S.G., Vasconcelos,P.F., Nunes,M.R., Elliott,R.M., da Silva,D.E.A., Azevedo,R.S.S., Vasconcelos,P.F.C., Nunes,M.R.T.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-03-15
|
BeH759529
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
2009-06-17
| null | null |
Oropouche virus isolate BeH759529 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAGCTGTTACTCAACCAGTATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCGAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTCCCTGCTGAGGATATTTGCGCTGAAGTCCTTGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGTTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTGCATGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTATCTGTAGATGATCGATCTTCCAGGATTACAAGGGAGAAATACAATGAGATTTTTGGAGAGGTGTTCAATCCAGAAGGTGTAGACTTTGAAATTGTTATTATTAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTGGATTCTCGAGATTTCATGAATACGATTGGACCAATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTTCGAGATGATGATAAATTCCATGCCATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGATACCCCAGAATTGCTTACTCATCCAATATACAATGAATTTATGAATTCAATGCCAGAAGCAGAACAGGCTTTATTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCGGAGAAATGGAATATTTTTTTAAAAGGGGTAATGTCCAGGTATGGTGAATATTATAAAGAGTTTACTAAAGGGCATGCACAATCTATATTCTTGACAACAGGAGATTACCCCAGGCCAGATAAGGACCAAATTTCGGCCGGCTGGCGAGAAATGGTGAGTAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGATATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAACAATAACATACAGAAACTAATTAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGTGGGACAGGGAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGACTAATGGATATATCATCAGATATTAAGAAATATGAATCATTTTGTGGAAAGTTAAAATCTCTAGCAAGATCTAGTGTGAAGAAACTTGACAGGAAAATAGAACCAATACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTCAAATTAGATACGGATGTTATAAAAAGGGAAGATAGAATACACTTAATGAAAGACTATTTTGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAGTGACATAAATACTGATAAGCCTAAGATATTGAATTTTGATAATGACGACATAGTTAGGAAATGCAAAGACAAATATAATCAAGTCACACATAACTTATCTCAAGTCAATGAATTGGACAAGATTGGGAACTACCTAGAGCACTTTTCAGCTAAGATTAGTGCCTGTAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACTAAGTATTGGCAGTGTATCAATGACTACTCTACCTTGATGAAAAACATGTTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACTTTTAGAGTTGTCTCATGTGCAAATAATAATGTATTTGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTACGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCTACTTTTAAGACAACAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGACTAGATAAGGAAAGATGCCAACGTATAGTGTCCTCTCCGGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAATTTGATAAGTTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCCATGCTATCTCTCACGGAGCCTTCGCGCTATATGATCATGAATTCGCTGGCAGTCTCTAGCCATGTGAGAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTACACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGATTTGATTAAAAAGGGCTGCTATTCAGCATACGAGCAGAGGAAAAAGGTGCAAATAAGGGATATAAAATTAACAGACTACGATATAACACAAAAGGGAGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATCTGGTTCCCAGGGAAGGTAAATTTAAAGGAGTACTTGAGCCAGATTTATCTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGACTACATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATTGAAAAAGAACAAAGGGAGTCACTACCTGAACCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGAAATTTGAACTTAGATACTTCGAGACATAATTTTGTGAGAAGTCGAGTAGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCTACTTTCACCAGCTCAAAATCGTGTATTAAGATTGGTGATTTCGAGGAGGAGAAAAAGAGAAAAACCAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAGGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAATCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAGCATGAGATAAGACACTCAACTTACGAGGATTTAAAACAATCCATCTCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGCTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTCACTTCGGATTTTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAGATGATAAGTGAACCAGGTGATTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAACAGTCAGAAGACGAAATCAGGTATATCAGTAATACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACTTGCAATCCGGGTCTTTAGATTGGGCAGATATATGTGAAAATAAGGCAAGAGGGCTCAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTCGATCCTATCTTGTATCCTGCTGAGAGAAAGAGAATAATTTATTTCCTCTGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTTACTACTATATTGGACCAGAGGGTTCCCTATTCAAATGATATAATTGGGTTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAACGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAACTATACAAGCAGCTACTTGCACAGTTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTCGTGAATTCAATGGTACACTCTGATGACAATCAAACATCCATATGTATGGTACAGAACAAGTTGCCAGACGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGGAATCAAGCTAACATGAAGAAGACATACCTAACCAATTTCATCAAGGAGTTTGTTTCTTTATTCAATATACATGGAGAGCCATTCTCTATATATGGGCGATTTTTGCTTACGGCAGTGGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCACGGTTGCCCACCATCACTAGCATGGGTATCCATTGCCTTAAATCACTGGATAACCCACACCACGTATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAACGACCCACTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATATTAGAAAGCGACCTATCGACAATTGCACTGACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACATTTTTGACAAATATAGCAAGAAAATTATCATCTCCGATCTTGCAGAGAGAGAGTATTCAAGACCAATATAATTCTATAGAAAAATGGGATCTAAGTAGATTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTTACATCTGATGATGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCCCGATCACTTTTAACACCTCGTAAGTTTACAACAAGTGGATCGCTCAATAGACTGAAATCATATAAGGATTTTCAAAATATAATAGCAGATGAAGACAAGACAAATGAGCTATTCGAGAATTTCATCAGGCACCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTCGAAGAGTTTGTTAATACAATATTATTTAGATACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTATCAATACAAAATCCAGCACAGCTATTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATCTTCGGATTGCAAGATATGCCAGGGATTGAAGAACTAGATACAATCATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGACGATTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAATGATGTCAAGACTATATTTGCCTTCTGCCTCATGAATGACCCACTACTAATTACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAAGGACATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCCGAAGTCTGAAGCTTATACATTATTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTACGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGACTTTATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATCTAGGAAGGGATTTCAAGTTCGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTATGTTATGATTATATAAAATCCACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAATTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAAGCACAAATTTCGTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTTTTAGCGTCCGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAGAAGGTTATCGAAGAGTTCACATACAAGGGAATACCTGTGAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGAGTTAAATTCTTAGGAATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACGCAAAATGATCTAGATAAATTTGATGCGGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAATACTGGGCCAATAGATTTAATGATAAGTGGTTATTCTAGGCAGTTGCGAATTACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTATAGACACGGTCAGGCGATGTTAAATAAGCCTCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTGACTGAGATGTCTAAACAATTACATTATATTGTTTTCCAACAGAGATCAAGAAAGCGATACTTCTATTCTATACTACCCACCCAAATAATTGAAGACCACAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGTCCCGTTGCAGTATCAAAACTTTATCAACAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCACTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGACGAATATGCCATTACAAGGAGAGCACACTTCCAAAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTGTCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCCAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAGAATGACCAAATGGCTTTCGAATTCCTATCAGATGAAATTCTAGAGCAGGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAGAACGCCTTCCATAAAGCCTTAATCTCAGAGTGTGATAAATTTGAAGAGGTATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCAAATGAAAATCTTAGCATTTTAGAAGAAATACACTGGATTATCAGTTATTTAAAAACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTACCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGGACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTCATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAACCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTGGCATTAGAGTGTATAAAGAACGAGAAAAGATCACTGGCAGAGTTTGTAGATAGAAGCAAGAAAACTGGAAAATCCAAATTTGATTTCTAAGGTATATGCATATAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,471
|
KP691621.1
|
Oropouche virus
|
Tilston-Lunel,N.L., Hughes,J., Acrani,G.O., da Silva,D.E., Azevedo,R.S., Rodrigues,S.G., Vasconcelos,P.F., Nunes,M.R., Elliott,R.M., da Silva,D.E.A., Azevedo,R.S.S., Vasconcelos,P.F.C., Nunes,M.R.T.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-03-15
|
BeH759620
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
2009-06-23
| null | null |
Oropouche virus isolate BeH759620 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAGCTGTTACTCAACCAGTATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCGAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTCCCTGCTGAGGATATTTGCGCTGAAGTCCTTGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGTTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTGCATGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTATCTGTAGATGATCGATCTTCCAGGATTACAAGGGAGAAATACAATGAGATTTTTGGAGAGGTGTTCAATCCAGAAGGTGTAGACTTTGAAATTGTTATTATTAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTGGATTCTCGAGATTTCATGAATACGATTGGACCAATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTTCGAGATGATGATAAATTCCATGCCATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGATACCCCAGAATTGCTTACTCATCCAATATACAATGAATTTATGAATTCAATGCCAGAAGCAGAACAGGCTTTATTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCGGAGAAATGGAATATTTTTTTAAAAGGGGTAATGTCCAGGTATGGTGAATATTATAAAGAGTTTACTAAAGGGCATGCACAATCTATATTCTTGACAACAGGAGATTACCCCAGGCCAGATAAGGACCAAATTTCGGCCGGCTGGCGAGAAATGGTGAGTAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGATATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAACAATAACATACAGAAACTAATTAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGTGGGACAGGGAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGACTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGAAAGTTAAAATCTCTAGCAAGATCTAGTGTGAAGAAACTTGACAGGAAAATAGAACCAATACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTCAAATTAGATACGGATGTTATAAAAAGGGAAGATAGAATACACTTAATGAAAGACTATTTTGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAGTGACATAAATACTGATAAGCCTAAGATATTGAATTTTGATAATGACGACATAGTTAGGAAATGCAAAGACAAATATAATCAAGTCACACATAACTTATCTCAAGTCAATGAATTGGACAAGATTGGGAACTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAGATTAGTGCCTGTAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACTAAGTATTGGCAGTGTATCAATGACTACTCTACCTTGATGAAAAACATGTTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACTTTTAGAGTTGTCTCATGTGCAAATAATAATGTATTTGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTACGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCTACTTTTAAGACAACAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGACTAGATAAGGAAAGATGCCAACGTATAGTGTCCTCTCCGGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAATTTGATAAGTTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCCATGCTATCTCTCACGGAGCCTTCGCGCTATATGATCATGAATTCGCTGGCAGTCTCTAGCCATGTGAGAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTACACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGATTTGATTAAAAAGGGCTGCTATTCAGCATACGAGCAGAGGAAAAAGGTGCAAATAAGGGATATAAAATTAACAGACTACGATATAACACAAAAGGGAGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATCTGGTTCCCAGGGAAGGTAAATTTAAAGGAGTACTTGAGCCAGATTTATCTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGACTACATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATTGAAAAAGAACAAAGGGAGTCACTACCTGAACCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACCGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGAAATTTGAACTTAGATACTTCGAGACATAATTTTGTGAGAAGTCGAGTAGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCTACTTTCACCAGCTCAAAATCGTGTATTAAGATTGGTGATTTCGAGGAGGAGAAAAAGAGAAAAACCAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAGGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAATCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAGCATGAGATAAGACACTCAACTTACGAGGATTTAAAACAATCCATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGCTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTCACTTCGGATTTTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAGATGATAAGTGAACCAGGTGATTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAACAGTCAGAAGACGAAATCAGGTATATCAGTAATACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACTTGCAATCCGGGTCTTTAGATTGGGCAGATATATGTGAAAATAAGGCAAGAGGGCTCAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTCTGGCTGATAGTACTCGATCCTATCTTGTATCCTGCTGAGAGAAAGAGAATAATTTATTTCCTCTGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTTACTACTATATTGGACCAGAGGGTTCCCTATTCAAATGATATAATTGGGTTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAACGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAACTATACAAGCAGCTACTTGCACAGTTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTCGTGAATTCAATGGTACACTCTGATGACAATCAAACATCCATATGTATGGTACAGAACAAGTTGCCAGACGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGGAATCAAGCTAACATGAAGAAGACATACCTAACCAATTTCATCAAGGAGTTTGTTTCTTTATTCAATATACATGGAGAGCCATTCTCTATATATGGGCGATTTTTGCTTACGGCAGTGGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCACGGTTGCCCACCATCACTAGCATGGGTATCCATTGCCTTAAATCACTGGATAACCCACACCACGTATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAACGACCCACTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATATTAGAAAGCGACCTATCGACAATTGCACTGACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACATTTTTGACAAATATAGCAAGAAAATTATCATCTCCGATCTTGCAAAGAGAGAGTATTCAAGACCAATATAATTCTATAGAAAAATGGGATCTAAGTAGATTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAGTTCGGTTACATCTGATGATGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCCCGATCACTTTTAACACCTCGTAAGTTTACAACAAGTGGATCGCTCAATAGACTGAAATCATATAAGGATTTTCAAAATATAATAGCAGATGAAGACAAGACAAATGAGCTATTCGAGAATTTCATCAGGCACCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTCGAAGAGTTTGTTAATACAATATTATTTAGATACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTATCAATACAAAATCCAGCACAGCTATTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATCTTCGGATTGCAAGATATGCCAGGGATTGAAGAACTAGATACAATCATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGACGATTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAATGATGTCAAGACTATATTTGCCTTCTGCCTCATGAATGACCCACTACTAATTACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAAGGACATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCCGAAGTCTGAAGCTTATACATTATTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTACGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGACTTTATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATCTAGGAAGGGATTTCAAGTTCGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTATGTTATGATTATATAAAATCCACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAATTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAAGCACAAATTTCGTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTTTTAGCGTCCGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAGAAGGTTATCGAAGAGTTCACATACAAGGGAATACCTGTGAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTTAAATTCTTAGGAATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACGCAAAATGATCTAGATAAATTTGATGCGGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAATACTGGGCCAATAGATTTAATGATAAGTGGTTATTCTAGGCAGTTGCGAATTACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTATAGACACGGTCAGGCGATGTTAAATAAGCCTCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTGACTGAGATGTCTAAACAATTACATTATATTGTTTTCCAACAGAGATCAAGAAAGCGATACTTCTATTCTATACTACCCACCCAAATAATTGAAGACCACAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGTCCCGTTGCAGTATCAAAACTTTATCAACAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCACTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGACGAATATGCCATTACAAGGAGAGCACACTTCCAAAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTGTCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCCAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAGAATGACCAAATGGCTTTCGAATTCCTATCAGATGAAATTCTAGAGCAGGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAGAACGCCTTCCATAAAGCCTTAATCTCAGAGTGTGATAAATTTGAAGAGGTATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCAAATGAAAATCTTAGCATTTTAGAAGAAATACACTGGATTATCAGTTATTTAAAAACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTACCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGGACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTCATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAACCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTGGCATTAGAGTGTATAAAGAACGAGAAAAGATCACTGGCAGAGTTTGTAGATAGAAGCAAGAAAACTGGAAAATCCAAATTTGATTTCTAAGGTATATGCATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,472
|
KP691630.1
|
Oropouche virus
|
Tilston-Lunel,N.L., Hughes,J., Acrani,G.O., da Silva,D.E., Azevedo,R.S., Rodrigues,S.G., Vasconcelos,P.F., Nunes,M.R., Elliott,R.M., da Silva,D.E.A., Azevedo,R.S.S., Vasconcelos,P.F.C., Nunes,M.R.T.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-03-15
|
BeH759146
|
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
2009-08-20
| null | null |
Oropouche virus isolate BeH759146 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCAAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCGCAGCTGTTACTCAACCAGTATCGAAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAAATAGCGAAGGATATATGGCGTGATCTATTGAATGATCGACACAACTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAACCTTGAGTATAGAAATGATGTCCCTGCTGAGGATATTTGCGCTGAAGTCCTTGATGGTTACAAAGCAAGGAAAGTGCGTTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTGCATGACGGGAAAATGTATATAATAGATTTCAAAGTATCTGTAGATGATCGATCTTCCAGGATTACAAGGGAGAAATACAATGAGATTTTTGGAGAGGTGTTCAATCCAGAAGGTGTAGACTTTGAAATTGTTATTATTAGGTTGGATCCTTCAAATATGGCTATACATGTGGATTCTCGAGATTTCATGAATACGATTGGACCAATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTATTTGGCAAATTTCGAGATGATGATAAATTCCATGCCATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGATACCCCAGAATTGCTTACTCATCCAATATACAATGAATTTATGAATTCAATGCCAGAAGCAGAACAGGCTTTATTCAAAGAAGCATTGGAATTCAAATCATTCGGAGCGGAGAAATGGAATATTTTTTTAAAAGGGGTAATGTCCAGGTATGGTGAATATTATAAAGAGTTTACTAAAGGGCATGCACAATCTATATTCTTGACAACAGGAGATTACCCCAGGCCAGATAAGGACCAAATTTCGGCCGGCTGGCGAGAAATGGTGAGTAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGATATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAACAATAACATACAGAAACTAATTAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGTGGGACAGGGAGCTATGTAAGTGCTTTCAAATCATTAGGAAGACTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGAAAGTTAAAATCTCTAGCAAGATCTAGTGTGAAGAAACTTGACAGGAAAATAGAACCAATACAAATTGGAACAGCAACTGTCTTATGGGAGCAACAATTCAAATTAGATACGGATGTTATAAAAAGGGAAGATAGAATACACTTAATGAAAGACTATTTTGGAATTGGTAAACACAAGTCTTTTTCAAAAAAGCTAAACAGTGACATAAATACTGATAAGCCTAAGATATTGAATTTTGATAATGACGACATAGTTAGGAAATGCAAAGACAAATATAATCAAGTCACACATAACTTATCTCAAGTCAATGAATTGGACAAGATTGGGAACTACCTAGAGCATTTTTCAGCTAAGATTAGTGCCTGTAGTGTAGAAATGTGGGACTTTATATATAATACGACTAAAACTAAGTATTGGCAGTGTATCAATGACTACTCTACCTTGATGAAAAACATGTTAGCTGTTTCCCAATATAATAGGCACAATACTTTTAGAGTTGTCTCATGTGCAAATAATAATGTATTTGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAAACAAAAAAAGCAACATTAGTCTACGCAATAATAGCTCTCCACAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGTTCACTCTATTCTACTTTTAAGACAACAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGACTAGATAAGGAAAGATGCCAACGTATAGTGTCCTCTCCGGGCTTATTTCTCATGACAAGCTGTCTATTATTCAATGGTAATAAGAGTCTAGAATTTGATAAGTTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCGATTACAAAAGCCATGCTATCTCTCACGGAGCCTTCGCGCTATATGATCATGAATTCGCTGGCAGTCTCTAGCCATGTGAGAGAGTATATATCTGAAAAATTTTCTCCTTACACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGATTTGATTAAAAAGGGCTGCTATTCAGCATACGAGCAGAGGAAAAAGGTGCAAATAAGGGATATAAAATTAACAGACTACGATATAACACAAAAGGGAGTAGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCCATCTGGTTCCCAGGGAAGGTAAATTTAAAGGAGTACTTGAGCCAGATTTATCTACCATTTTATTTTAATTCCAAAGGACTACATGAAAAGCATCATGTTTTAATAGATTTGGCTAAAACAGTGCTAGAAATTGAAAAAGAACAAAGGGAGTCACTACCTGAACCATGGTCAGAGATACCTGCCAAGCAGACCGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGAAATTTGAACTTAGATACTTCGAGACATAATTTTGTGAGAAGTCGAGTAGAAAATGCAAATAACTTTAACAGATCTATAACAACAATATCTACTTTCACCAGCTCAAAATCGTGTATTAAGATTGGTGATTTCGAGGAGGAGAAAAAGAGAAAAACCAAAAATGATGCAAAGAAACTAGCAAAGGATATTTCTAAATTAACTATAGCCAATCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAATGAGCATGAGATAAGACACTCAACTTACGAGGATTTAAAACAATCCATCCCAGATTACACAGACTATATGTCTGTAAAAGTTTTTGACAGACTATATGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGTGATAAAGAAACAGTCAAGCTGATTTTAGAGACTATGAAGAAGCATAAAATATTTCACTTCGGATTTTTCAACAAAGGACAAAAAACAGCTAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGCCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGATGCAAATTAAACCCAGAAGAGATGATAAGTGAACCAGGTGATTCTAAGTTAAGAGTATTAGAAAAACAGTCAGAAGACGAAATCAGGTATATCAGTAATACAATAAAGACATTGGGGAATGCCATAGAAAACTTGCAATCCGGGTCTTTAGATTGGGCAGATATATGTGAAAATAAGGCAAGAGGGCTCAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTCTGGCTGATAGTGCTCGATCCTATCTTGTATCCTGCTGAGAGAAAGAGAATAATTTATTTCCTCTGTAATTACATGCAAAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTTACTACTATATTGGACCAGAGGGTTCCCTATTCAAATGATATAATTGGGTTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAACGCAACTGGCTTCAAGGCAATTTAAACTATACAAGCAGCTACTTGCACAGTTGTAGTATGTCTGTATATAAAGATATAATAAGGGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGGGAAGCCCTCGTGAATTCAATGGTACACTCTGATGACAATCAAACATCCATATGTATGGTACAGAACAAGTTGCCAGACGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGTTTAACTTTTGGGAATCAAGCTAACATGAAGAAGACATACCTAACCAATTTCATCAAGGAGTTTGTTTCTTTATTCAATATACATGGAGAGCCATTCTCTATATATGGGCGATTTTTGCTTACGGCAGTGGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCACGGTTGCCCACCATCACTAGCATGGGTATCCATTGCCTTAAATCACTGGATAACCCACACCACGTATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAACGACCCACTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAATGAAATACCAGTGGAGATGTGCGGAATATTAGAAAGCGACCTATCGACAATTGCACTGACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACATTTTTGACAAATATAGCAAGAAAATTATCATCTCCGATCTTGCAAAGAGAGAGTATTCAAGACCAATATAATTCTATAGAAAAATGGGATCTAAGTAGATTATCGCAGATTGACATTCTGAGGCTTAAAATGCTTAGGTACATATCTCTTGATAATTCGGTTACATCTGATGATGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCCCGATCACTTTTAACACCTCGTAAGTTTACAACAAGTGGATCGCTCAATAGACTGAAATCATATAAGGATTTTCAAAATATAATAGCAGATGAAGACAAGACAAATGAGCTATTCGAGAATTTCATCAGGCACCCAGAGTTATTGGTCACAAAAGGCGAAACATTCGAAGAGTTTGTTAATACAATATTATTTAGATACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTATCAATACAAAATCCAGCACAGCTATTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAACAAACCAATAATTGACTACACTAGCATACATGATAAGATCTTCGGATTGCAAGATATGCCAGGGATTGAAGAACTAGATACAATCATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAAAGTTATGTCCAGATTGTAGACGATTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAATGATGTCAAGACTATATTTGCCTTCTGCCTCATGAATGACCCACTACTAATTACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAAGGACATAGCCAAGAAAGAATAGGACAATCAGCATGCAAAATGCCAGAAGTCCGAAGTCTGAAGCTTATACATTATTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTACGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCGAGGGATCTATCTCATCTGGAAGACTTTATACAAAGCACAAAACTCAGAGAGAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAACGGCATCTAGGAAGGGATTTCAAGTTCGAAATCAAAGAATTGACTAGATTTTACCAAGTATGTTATGATTATATAAAATCCACAGAACATAAAATTAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAATTTAATAAATGACAAATTGTGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAAGCACAAATTTCGTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAAGCACTGAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTTTTAGCGTCCGAATCAAGAATTCAATTTCTGAAGAAGGTTATCGAAGAGTTCACATACAAGGGAATACCTGTGAAACATTTATATTCCAAAATAAAGAATTCCAAGTTGAGGGTTAAATTCTTAGGAATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACGCAAAATGATCTAGATAAATTTGATGCGGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTATCAAGAGATATGAATACTGGGCCAATAGATTTAATGATAAGTGGTTATTCTAGGCAGTTGCGAATTACAGGGGAAGATGATAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAAGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTGATTTATAGACACGGTCAGGCGATGTTAAATAAGCCTCACGGATTGAAGCTTGAAAAAATGCAGCCTGTGACTGAGATGTCTAAACAATTACATTATATTGTTTTCCAACAGAGATCAAGAAAGCGATACTTCTATTCTATACTACCCACCCAAATAATTGAAGACCACAATTCTAGAGTCGAATCATCTAGGTTAAACAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGTCCCGTTGCAGTATCAAAACTTTATCAACAAGGACGACCTATACTTTCCAAAGTTAAGAATCTGAATATGCAGACTCACTCACTTTCTAGAATACAGGTTAATGTAGACGAATATGCCATTACAAGGAGAGCACACTTCCAAAAGATGCCTTTCTTTGAAGGACCATCCATCCCTTCTGGTGGCATGGATCTGTCAGAGTTAATGAAATCCACATCCTTATTGAGCTTAAATTATGACAATATAAAAAATGCTTCTTTATTGGATATGTCCAGAGTATTCAAGTGCAATGGCAGTGAGAATGACCAAATGGCTTTCGAATTCCTATCAGATGAAATTCTAGAGCAGGACGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAGAACGCCTTCCATAAAGCCTTAATCTCAGAGTGTGATAAATTTGAAGAGGTATTCGACTTTCTTGACATGGGGTTTTGCTCAAATGAAAATCTTAGCATTTTAGAAGAAATACACTGGATTATCAGTTATTTAAAAACGAATCAGTGGTCCACAGAACTAGACAATTGTATTCATATGTGTATGTATAGGAATGGGTATGATGCAGAGTACCATAGATTTGATATACCTTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGGACAATAAATTGGACAGAGGTTATTGAGTTCATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAGATTGAACCATGGTCAAGTATGAAGTCACATTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTGGCATTAGAGTGTATAAAGAACGAGAAAAGATCACTGGCAGAGTTTGTAGATAGAAGCAAGAAAACTGGAAAATCCAAATTTGATTTCTAAGGTATATGCATATAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,475
|
KP026179.1
|
Oropouche virus
|
Acrani,G.O., Tilston-Lunel,N.L., Spiegel,M., Weidmann,M., Dilcher,M., Andrade da Silva,D.E., Nunes,M.R., Elliott,R.M., Olszanski Acrani,G., Nunes,M.R.T.
|
University Medical Center Goettingen, Department of Virology
|
Germany
|
2015-03-10
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Trinidad and Tobago: Trinidad, Sangre Grande
|
Trinidad and Tobago
| null | null |
1955
| null | null |
Oropouche virus strain TRVL9760 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCGAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCACAACTGTTGCTCAACCAATATCGGAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAGATAGCAAAGGATATATGGCGAGATCTATTAAATGATCGACACAATTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAATCTTGAGTACAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTTCTTGATGGTTATAAAGCAAGGAAAGTTCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACATGATGGAAAGATGTATATAATAGACTTCAAAGTGTCTGTAGACGACCGATCTTCTAGAATCACAAGGGAAAAATATAATGAGATTTTTGGAGAAGTATTCAATCCAGAAGGTGTAGATTTTGAAATTGTTATTATTAGATTAGATCCCTCAAATATGGCTATACATGTGGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATTGGGCCGATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTGTTCGGGAAATTCCGGGATGATGATAAATTTCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGACACCCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAATTCATGAATTCAATGCCAGAGGCAGAACAGGCCCTATTCAAGGAAGCATTAGAATTCAAATCATTCGGGGCAGAAAAATGGAATATCTTCTTGAAGAGTGTGATGTCAAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACTAAAGGACATGCTCATTCTATATTTCTGACAACAGGGGACTACCCCAAGCCAGATAAAAACCAAATTTCAGCAGGTTGGAGAGAAATGGTAAATAGAGTGAGCTCCGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAATAATAATATACAAAAGCTAATCAAACTATCTAAATCACTGCAAGCTATGAGCGGGACAGGGAGCTATGTAAATGCTTTCAAGTCATTAGGGAGATTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGGAAGTTAAAATCTCTGGCAAGGTCTAGTATAAAAAAACTTGACAGGAAAATAGAGCCAATTCAAATTGGGACTGCAACTGTCTTATGGGAACAGCAATTTAAACTAGATACAGATGTTATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTTGGGATCGGTAAGCACAAATCATTTTCAAAGAAATTAAACAATGACATAAATACTGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGATGATATAGTCAGGAGATGCAAAGATAAATATAATCAAGTCATACATAACCTATCCCAAATCAATGAATTAGATAAGATTGGAAACTACCTAGAGCATTTTTCAACTAAGATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGATTTTATATATAATACAACTAAAACTAAGTACTGGCAATGCATCAATGACTATTCCACCCTAATGAAAAACATGTTAGCTGTCTCTCAATATAATAGACACAATACGTTTAGAATTGTCTCATGTGCAAACAATAATGTATTCGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAGACAAAAAAAGCAACTTTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCATAATGAGGAGGCAGAAATAGCAGAACTTGGCTCACTCTACTCAACTTTTAAGACAGCAACAGGATATATTTCAATATCCAAGGCTTTTAGGCTGGATAAAGAAAGATGCCAACGCATAGTATCCTCTCCAGGCTTGTTCCTCATGACAAGCTGCCTATTATTCAACGGTAACAAGAGTTTAGAATTTGATAAATTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCAATTACGAAAACTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGTTATATGATCATGAACTCGTTAGCAGTTTCCAGCCATGTAAGAGAGTATATATCTGAAAAATTCTCCCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGACTTAATCAAAAAGGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGAAAAAAAGTACAAATAAGAGACATAAAATTAACAGATTATGATATAACACAAAAGGGAGTGGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCTATTTGGTTCCCAGGAAAGGTAAACCTAAAAGAATATTTAAACCAAATCTATCTGCCATTTTATTTTAACTCTAAAGGATTACATGAAAAACATCATGTCTTGATAGATTTGGCTAAAACAGTACTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGGGAGTCACTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCTAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGGAATTTGAATTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTAAGAAGCCGGGTAGAAAATGCAAATAATTTCAACAGATCTATAACGACAATATCTACTTTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGTGATTTTGAAGAAGAAAAAAAGAGAAAAACTAAGAATGATACAAAGAAACTTGCAAAGGATATTTCTAAATTAACCATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAACGAACATGAGATAAGGCATTCAACTTATGAGGACTTAAAACAATCTATCCCAGATTACACAGATTATATGTCTGTGAAAGTTTTTGACAGATTGTACGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGCGATAAGGAAACAGTCAAACTGATTCTAGAGACCATGAAAAAACATAAAATATTTCATTTTGGGTTCTTCAATAAAGGACAAAAAACAGCCAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGTCTGTACCTTGTCGAAAGGCTAGCCAAAGAGAGGTGCAAATTAAACCCTGAAGAAATGATAAGTGAACCAGGTGACTCGAAATTAAGGGTATTAGAGAAGCAATCAGAAGACGAAATCAGGTATATTAGCAATACGATAAAAACACTAGGGAATGCCATAGAAAGTTTGCAATCTGGATCTTTAAATTGGGCAGATATATGCGAAAATAAAGCAAGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGACATGTCCAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTTTGGTTGATAGTACTTGATCCCATCTTGTATCCTGCTGAGAGGAAAAGGATAATTTATTTCCTCTGTAATTATATGCAGAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACTATATTGGATCAAAGAGTTCCTTATTCAAATGACATAATTGGATTAATGACAAACAATTATAGGTCCAATACAGTAGAAATAAAGCGTAACTGGCTTCAAGGCAACTTGAATTATACAAGCAGTTACTTACACAGCTGTAGTATGTCTGTATACAAAGATATAATAAGAGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGAGAAGCCCTTGTGAACTCAATGGTGCATTCTGATGATAATCAAACATCTATATGTATGGTGCAGAATAAATTACCAGATGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGCTTAACTTTTGGCAATCAGGCGAATATGAAGAAGACATATCTAACTAATTTCATCAAAGAGTTTGTTTCTTTATTTAATATACATGGAGAACCATTTTCTATATATGGGAGATTTCTACTCACAGCAGTAGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCATGGTTGTCCACCGTCACTTGCATGGGTATCTATCGCTCTAAATCACTGGATAACCCACACTACATATAATATGCTGCCTGGCCAAAATAATGACCCGTTGCCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAGTGAAATACCAGTAGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGTGATTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACGTTCCTAACAAATATAGCAAGGAAGTTATCATCCCCAATCTTACAAAGAGAAAGTATTCAAGATCAATATAATTCTATAGAAAAGTGGGATCTGAGTAAATTATCACAGATCGACATTCTAAGGCTTAAAATGCTCAGGTATATATCTCTTGATAGTTCAGTCACATCTGATGACGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCTCGATCACTTTTAACGCCTCGTAAATTCACAACAAGTGGGTCACTTAATAGGTTGAAATCATACAAAGATTTTCAAGATATAATAGCAGATGAGGACAAGACAAACGAACTATTTGAGAATTTCATTAGACACCCAGAGCTACTGGTTACAAAAGGCGAAACATTTGGAGAATTTGTTAATACGATATTATTTAGGTACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTGTCAATACAAAACCCGGCACAGCTTTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAGTAATTGACTACACTAGCATACATGACAAGATTTTTGGATTACAAGACATGCCAGGAATTGAAGAACTAGATACAATTATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAGAGTTATGTCCAGATCGTAGATGACTTAAGCAATCTAACATTGGATATAAACGATGTCAAGACTATATTTGCCTTTTGTCTTATGAATGACCCACTACTGATCACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTCAAGGGACATAGTCAAGAAAGAATAGGTCAATCAGCATGCAAAATGCCAGAGGTCCGAAGTCTAAAACTCATACATTACTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCAAGGGATCTATCTCATTTAGAAGACTCCATACAAAGTACAAAACTCAGAGAAAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAGCGGCACTTAGGGAGGGATTTCAAATTTGAAATCAAAGAACTAACTAGATTTTACCAAGTGTGTTATGATTACATAAAGTCTACAGAACATAAAGTCAAGGTGTTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAACTTGATAAATGACAAATTATGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAGGCACAAATTTCTTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAGGCACTAAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTCTTGGCATCAGAATCAAGGATACAATTTCTGAAGAAAATTATTGAAGAATTCACATACAAAGGAATACCTGTAAAACATTTATACTCAAAAATAAAGAACTCCAAATTGAGGGTTAAATTTCTAGGGATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACACAGAATGATCTGGATAAATTTGATGCAGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTGTCAAGAGATATGAATACTGGACCAATAGACTTAATGATAAGCGGTTACTCTAGGCAGCTGCGGATTACTGGGGAAGATGACAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAGGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTAATTTATAGACACGGTCAGGCAATGTTAAATAAGCCACACGGCTTAAAGCTTGAAAAAATGCAACCTGTGACTGAGATGTCTAAACGATTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGATCACGGAAACGATACTTCTATTCTATATTACCTACCCAAGTAATTGAGGACCATAATTCTAGAGTTGAATCATCTAGGCTAAGCAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGCCCTGTTGCAATATCAAAACTCTACCAACAAGGACGGCCTATACTTTCCAAAGTTAGAAATCTGAATATGCAGACTCATTCGCTTTCCAGAATACAAGTTAATGTAGATGAATATGCCATCACGAGACGAGCACATTTTCAGAAAATGCCTTTCTTCGAAGGACCGTCAATCCCTTCTGGTGGTATGGATTTATCAGAGCTAATGAAATCCACATCCCTATTAAGCTTGAACTATGATAACATTAAAAATGCATCCTTATTGGACATGTCTAGGGTATTTAAGTGCAATGGCAGTGAAGATGACCAAATGGCTTTCGAATTTCTATCGGACGAAATTTTGGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCCTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTTGACTTCCTTGACATGGGATTTTGCTCGAATGAAAATCTTAGCATTCTGGAGGAAATACATTGGATAATCAGTTATTTGAAAACAAATCAATGGTCTACGGAACTAGATAATTGTATTCACATGTGCATGTACAGGAATGGGTATGATGCAGAATATCATAAATTTGATATACCCTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGAACAATAAATTGGACAGAGGTCATTGAATTTATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAAATTGAGCCATGGTCTAGTATGAAGTCACACTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCACTAGAGTGTATGAAAAATGAGAAAAGATCATTGGCAGAATTTGTAGACAGAAGTAAGAAAACTGGCAAATCTAAATTTGACTTCTAAGGTATACACATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 87,549
|
KP052850.1
|
Oropouche virus
|
Acrani,G.O., Tilston-Lunel,N.L., Spiegel,M., Weidmann,M., Dilcher,M., Andrade da Silva,D.E., Nunes,M.R., Elliott,R.M.
|
University of Glasgow, MRC-Centre for Virus Research
| null |
2015-01-19
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,852
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Bradypus tridactylus
| null |
1960
| null | null |
Oropouche virus strain BeAn19991 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTCGAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCACAACTGTTGCTCAACCAATATCGGAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAGATAGCAAAGGATATATGGCGAGATCTATTAAATGATCGACACAATTACTTTTCTCGGGAATTTTGCAGAGCTGCAAATCTTGAGTACAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTTCTTGATGGTTATAAAGCAAGGAAAGTTCGCTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTACATGATGGAAAGATGTATATAATAGACTTCAAAGTGTCTGTAGACGACCGATCTTCTAGAATCACAAGGGAGAAATATAATGAGATTTTTGGAGAGGTATTCAATCCAGAAGGTGTAGATTTTGAAATTGTTATTATTAGATTAGATCCTTCAAATATGACTATACATGTGGACTCTCGAGATTTCGTGAATACAATTGGGCCGATTACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTGTTCGGGAAATTTCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGACACCCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAATTCATGAGTTCAATGCCAGAGGCAGAACAGGCCCTATTCAAGGAAGCATTGGAATTCAAATCATTTGGGGCAGAAAAATGGAATATCTTTTTGAAGGGGGTGATGTCAAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACTAAAGGACATGCTCATTCTATATTTCTGACAACAGGGGACTACCCCAAGCCAGACAAAGACCAAATTTCAGCAGGTTGGAGAGAAATGGTAAACAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCAAAGAATGATTCAAATAGCAACAATAATATACAAAAGCTAATCAAACTATCTAAATCACTGCAAGCTATGAGCGGGACAGGGAGCTATGTAAATGCTTTCAAGTCATTAGGGAGATTAATGGATATATCATCAGATGTTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGGAAATTGAAATCTCTGGCAAGGTCTAGTATAAAAAAACTTGACAGGAAAATAGAGCCAATACAAATTGGGACTGCAACTGTCTTATGGGAACAGCAATTTAAACTAGATACAGATGTTATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTTGGGATCGGTAAGCACAAATCATTTTCAAAGAAATTAAACAACGACATAAATACTGATAAGCCTAAAATATTAAATTTCAACAATGATGATATAGTCAGGAAATGCAAAGATAAATATAATCAAGTCATACATAACCTATCCCAAATCAATGAATTAGATAAGATTGGAAACTACCTAGAGCACTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGATTTTATATATAATACAACCAAAACTAAATACTGGCAATGCATCAATGACTATTCCACCCTAATGAAAAACATGTTAGCTGTCTCTCAATATAATAGACACAATACGTTTAGAATTGTCTCATGTGCAAACAATAATGTATTTGGTCTAGTAATGCCAAGCTCAGATATAAAGACAAAAAAAGCAACTTTAGTCTATGCAATAATGGCTCTCCATAATGAGGAGGCAGAGATAGCAGAACTTGGCTCACTCTACTCAACTTTTAAGACAGCAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGGCTGGATAAAGAAAGATGCCAACGCATAGTATCCTCTCCAGGCTTGTTCCTCATGACAAGCTGCCTATTATTCAACGGTAACAAGAGTTTAGAATTTGATAAATTACTAGGATTTTCATTTTTTACGTCAATATCAATTACGAAAGCTATGCTCTCCCTTACTGAGCCTTCACGTTATATGATCATGAACTCGTTAGCAGTTTCCAGCCATGTAAGAGAGTATATATCTGAAAAATTCTCCCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGACTTAATCAAGAAGGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGAAAAAAAGTACAAATAAGAGACATAAAATTAACAGATTATGATATAACACAAAAGGGAGTGGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCTATTTGGTTCCCAGGAAAGGTAAACCTGAAAGAATATTTAAACCAAATTTATCTACCATTTTATTTTAACTCTAAAGGATTACATGAAAAACATCATGTCTTGATAGATTTGGCTAAAACAGTACTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGGGAGTCATTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCTAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTACTCAATTGCAAGGAACTTGAATTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTAAGAAGCCGGGTGGAAAACGCAAATAATTTCAACAGATCTATAACGACAATATCTACTTTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGTGATTTTGAAGAAGAAAAAAAGAGAAAAACTAAGAATGATACAAAGAAACTTGCAAAGGATATTTCTAAATTAACCATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAGATCACAAACGAACATGAGATAAGGCATTCAACTTATGAGGACTTAAAACAATCTATCCCAGATTACACAGATTATATGTCTGTGAAAGTTTTTGACAGATTGTACGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAATGATAAGGAAACAGTCAAGCTGATTCTAGAGACCATGAAAAAACATAAAATATTTCATTTTGGATTCTTCAATAAAGGACAAAAAACAGCCAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGTCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGGTGCAAATTAAACCCTGAAGAAATGATAAGTGAACCAGGCGACTCGAAACTAAGGGTATTAGAGAAGCAATCAGAAGACGAAATCAGGTATATTAGCAATACAATAAAGACATTAGGGAATGCCATAGAGGACTTGCAATCTGGATCTTTAAATTGGGCAGATATATGCGAAAACAAAGCAAGAGGACTTAAGATAGAAATAAATGCTGATATGTCCAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTTAAATATTTTTGGTTGATAGTGCTTGATCCCATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAAAGGATAATTTATTTCCTCTGTAATTATATGCAGAAAAGGCTTATAATGCCCGATGAATTGCTCACTACTATATTGGATCAAAGAGTTCCTTATTCAAATGACATAATTGGATTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAGCGTAACTGGCTTCAAGGCAACTTAAATTATACAAGCAGTTACTTACACAGCTGTAGTATGTCTGTGTACAAAGATATAATAAGAGAAGCAGCAATATTATTAGAAGGAGAAGCCCTTGTGAACTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCTATATGTATGGTGCAGAATAAATTACCAGATGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGCTTAACTTTTGGCAATCAGGCAAATATGAAGAAGACATATCTAACTAACTTCATCAAAGAGTTTGTTTCTTTATTTAATATACATGGAGAACCATTTTCTATATATGGGAGATTTCTACTCACAGCAGTAGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCATGGTTGCCCACCATCACTTGCATGGGTATCTATCGCTCTAAATCACTGGATAACCCACACTACATATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAATGACCCGTTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAGTGAAATACCAGTAGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGTGATTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCAGGGAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGGAAGTTATCATCCCCAATCTTACAAAGAGAAAGTATTCAAGATCAATACAATTCTATAGAAAAGTGGGATCTGAGCAAATTATCACAGATCGACATTCTAAGGCTTAAAATGCTCAGGTATATATCTCTTGATAGTTCAGTCACATCTGATGATGGTATGGGGGAGACTAGTGAAATGAGATCTCGATCACTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACAAGTGGGTCACTTAATAGGTTGAAATCATATAAAGACTTTCAAGATATAATAGCAGATGAGGACAAGACAAACGAACTATTTGAGAATTTCATTAGACACCCAGAGTTACTGGTTACAAAAGGCGAAACATTTGAAGAATTTGTTAATACGATATTATTTAGGTACAATTCAAAGAAATTTAAAGAATCTTTGTCAATACAAAACCCAGCACAGCTTTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAGTAATTGACTACACTAGCATACATGACAAGATTTTTGGATTACAAGACATGCCAGGAATTGAAGAACTAGATACAATTATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAGAGTTATGTTCAAATCGTAGATGACTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAACGATGTCAAGACTATATTTGCCTTTTGTCTTATGAATGACCCACTACTGATCACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAGGGACATAGTCAAGAAAGAATAGGTCAATCAGCATGCAAAATGCCAGAGGTCCGAAGTCTAAAACTCATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTACCGAATGTAGATATAGATGAACTTGCAAGGGATCTATCTCATTTAGAAGACTTCATACAAAGTACAAAACTCAGAGAAAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAGCGGCACTTAGGAAGGGATTTCAAATTTGAAATCAAAGAACTAACTAGATTTTACCAAGTGTGTTATGATTACATAAAGTCTACAGAACATAAAGTCAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGCGGGGCACTGACAGGTAACTTGATAAATGACAAATTATGGTACATAACGCATTATTTGAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAGGCACAAATTTCTTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAGGCACTAAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTCTTGGCATCAGAATCAAGAATACAATTTCTGAAGAAAATTATTGAAGAATTCACATACAAAGGGATACCTGTAAAACATTTATACTCAAAAATAAAGAACTCCAAGTTGAGGGTTAAATTTCTAGGGATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACACAGAATGATCTGGATAAATTTGATGCAGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTGTCAAGAGATATGAATACTGGACCAATAGACTTAATGATAAGCGGTTACTCTAGACAGCTGCGGATCACTGGGGAAGATGACAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAGGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTAATTTATAGACACGGTCAGGCAATGTTGAATAAGCCACACGGCTTAAAGCTTGAAAAAATGCAACCTGTGACTGAGATGTCTAAACGATTACATTATATCGTTTTCCAGCAAAGATCACGGAAACGATACTTCTATTCTATATTACCCACCCAAGTAATTGAGGACCATAATTCTAGAGTTGAATCATCTAGGCTAAGCAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGCCCTGTTGCAATATCAAAACTCTACCAACAAGGACGGCCTATACTTTCCAAAGTTAGAAATCTGAATATGCAGACTCATTCGCTTTCCAGAATACAAGTTAATGTAGATGAATATGCCATCACGAGAAGAGCACATTTTCAGAAAATGCCTTTCTTCGAAGGACCATCAATCCCTTCTGGTGGTATGGATTTGTCTGAGTTGATGAAATCTACATCCCTATTAAGCTTGAATTATGATAACATAAAAAATGCATCCTTATTGGACATGTCTAGGGTATTTAAGTGCAATGGCAGTGAAGATGACCAAATGGCTTTCGAATTTCTATCGGACGAAATTTTGGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATTAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCCTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTTGACTTCCTCGACATGGGATTTTGCTCGAATGAAAATCTTAGTATTCTGGAGGAAATACATTGGATAATCAGTTATTTAAAAACAAATCAATGGTCTACGGAACTAGACAATTGTATTCACATGTGCATGTACAGGAATGGATATGATGCAGAATATCATAAATTTGATATACCCTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGAACAATAAATTGGACTGAAGTCATTGAATTTATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAAATTGAGCCATGGTCTAGTATGAAGTCACACTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCACTAGAGTGTATGAAAAATGAGAAAAGATCATTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGCAAATCCAAATTTGACTTCTAAGGTATACACATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 88,108
|
KC759122.1
|
Oropouche virus
|
Dugan,V.G., Halpin,R.A., Ghedin,E., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Gorchakov,R., Forrester,N., Weaver,S., Wentworth,D.E., Tesh,R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-03-17
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,811
|
GenBank
| null |
Trinidad and Tobago: Trinidad
|
Trinidad and Tobago
|
Homo sapiens
| null | null | null | null |
Oropouche virus strain TRVL-9760 segment L putative RNA polymerase L (L) gene, partial cds
|
CTATTTCGAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCACAACTGTTGCTCAACCAATATCGGAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAGATAGCAAAGGATATATGGCGAGATCTATTAAATGATCGACACAATTACTTTTCTCGAGAATTTTGCAGAGCTGCAAATCTTGAGTACAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTTCTTGATGGTTATAAAGCAAGGAAAGTTCGCTTTTGCACACCTGATAATTACTTACTACATGATGGAAAGATGTATATAATAGACTTCAAAGTGTCTGTAGACGACCGATCTTCTAGAATCACAAGGGAAAAATATAATGAGATTTTTGGAGAAGTATTCAATCCAGAAGGTGTAGATTTTGAAATTGTTATTATTAGATTAGATCCCTCAAATATGGCTATACATGTGGACTCTCGAGATTTCATGAATACAATTGGGCCGATCACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGACATGAAAGACTTCTTGTTCGGAAAATTCCGGGATGATGATAAATTTCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGACACCCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAATTCATGAATTCAATGCCAGAGGCAGAACAGGCCCTATTCAAGGAAGCATTAGAATTCAAATCATTCGGGGCAGAAAAATGGAATATCTTCTTGAAGGGTGTGATGTCAAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACTAAAGGACATGCTCATTCTATATTTCTGACAACAGGGGACTACCCCAAGCCAGATAAAAACCAAATTTCAGCAGGTTGGAGAGAAATGGTAAATAGAGTGAGCTCCGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCACAAAATGATTCAAGTAGCAATAATAATATACAAAAGCTAATCAAACTATCCAAATCACTGCAAGCTATGAGCGGGACAGGGAGCTATGTAAATGCTTTCAAGTCATTAGGAAGATTAATGGATATATCATCAGATATTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGGAAGTTAAAATCTCTGGCAAGGTCTAGTATAAAAAAACTTGACAGGAAAATAGAGCCAATTCAAATTGGGACTGCAACTGTCTTATGGGAACAGCAATTTAAACTAGATACAGATGTTATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATTTTGGGATCGGTAAGCACAAATCATTTTCAAAGAAATTAAACAATGACATAAATACTGATAAGCCTAAAATATTGAATTTTGACAATGATGATATAGTCAGGAAATGCAAAGATAAATATAATCAAGTCATACATAACCTATCCCAAATCAATGAATTAGATAAGATTGGAAACTACCTAGAGCATTTTTCAACTAAGATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGATTTTATATATAATACAACTAAAACTAAGTACTGGCAATGCATCAATGACTATTCCACCCTAATGAAAAACATGTTAGCTGTCTCTCAATATAATAGACACAATACGTTTAGAATTGTCTCATGTGCAAACAATAATGTATTCGGTTTAGTAATGCCAAGCTCAGACATAAAGACAAAAAAAGCAACTTTAGTCTATGCAATAATAGCTCTCCATAATGAGGAGGCAGAAATAGCAGAACTTGGCTCACTCTACTCAACTTTTAAGACAGCAACAGGATATATTTCAATATCCAAGGCTTTTAGGCTGGATAAAGAAAGATGCCAACGCATAGTATCCTCTCCAGGCTTGTTCCTCATGACAAGCTGCCTATTATTCAACGGTAACAAGAGTTTAGAATTTGATAAATTACTAGGATTTTCATTCTTTACATCAATATCAATTACGAAAACTATGCTCTCTCTTACTGAGCCTTCACGTTATATGATCATGAACTCGTTAGCAGTTTCCAGCCATGTAAGAGAGTATATATCTGAAAAATTCTCCCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGACTTAATCAAAAAGGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGAAAAAAAGTACAAATAAGAGACATAAAATTAACAGATTATGATATAACACAAAAGGGAGTGGATTCCAAAAGAGATCTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAATCTATCTGCCATTTTATTTTAACTCTAAAGGATTACATGAAAAACATCATGTCTTGATAGATTTGGCTAAAACAGTACTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGGGAGTCACTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCTAAGCAGACTGTCAACTTAAATGTTTTAATTTATTCAATTGCAAGGAATTTGAATTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTAAGAAGCCGGGTAGAAAATGCAAATAATTTCAACAGATCTATAACGACAATATCTACTTTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGTGATTTTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNAAACTAAGAATGATACAAAGAAACTTGCAAAGGATATTTCTAAATTAACCATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAAATCACAAACGAACATGAGATAAGGCATTCAACTTATGAGGACTTAAAACAATCTATCCCAGATTACACAGATTATATGTCTGTGAAAGTTTTTGACAGATTGTACGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAGCGATAAGGAAACAGTCAAACTGATTCTAGAGACCATGAAAAAACATAAAATATTTCATTTTGGGTTCTTCAATAAAGGACAAAAAACAGCCAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGTCTGTACCTTGTCGAAAGGCTAGCCAAAGAGAGGTGCAAATTAAACCCTGAAGAAATGATAAGTGAACCAGGCGACTCGAAATTAAGGGTATTAGAGAAGCAATCAGAAGACGAAATCAGGTATATTAGCAATACGATAAAAACACTAGGGAATGCCATAGAAAGTTTGCAATCTGGATCTTTAAATTGGGCAGATATATGCGAAAATAAAGCAAGAGGGCTTAAAATAGAAATAAATGCTGACATGTCCAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTTAAGTATTTTTGGTTGATAGTACTTGATCCCATCTTGTATCCTGCTGAGAGGAAAAGGATAATTTATTTCCTCTGTAATTATATGCAGAAAAGGCTTATAATGCCTGATGAATTGCTCACTACTATATTGGATCAAAGAGTTCCTTATTCAAATGACATAATTGGATTAATGACAAACAATTATAGGTCCAATACAGTAGAAATAAAGCGTAACTGGCTTCAAGGCAACTTGAATTATACAAGCAGTTACTTACACAGCTGTAGTATGTCTGTATACAAAGATATAATAAGAGAAGCAGCAACATTATTAGAGGGAGAAGCCCTTGTGAACTCAATGGTGCATTCTGATGATAATCAAACATCTATATGTATGGTGCAGAATAAATTACCAGATGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGCTTAACTTTTGGCAATCAGGCGAATATGAAGAAGACATATCTAACTAATTTCATCAAAGAGTTTGTTTCTTTATTTAATATACATGGAGAACCATTTTCTATATATGGGAGATTTCTACTCACAGCAGTAGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCATGGTTGTCCACCGTCACTTGCATGGGTATCTATCGCTCTAAATCACTGGATAACCCACACTACATATAATATGCTGCCTGGCCAAAATAATGACCCGTTGCCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAGTGAAATACCAGTAGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGCGATTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCAGGAAATGTCACGTTCCTAACAAATATAGCAAGGAAGTTATCATCCCCAATCTTACAAAGAGAAAGTATTCAAGATCAATATAATTCTATAGAAAAGTGGGATCTGAGTAAATTATCACAGATCGACATTCTAAGGCTTAAAATGCTCAGGTATATATCTCTTGATAGTTCAGTCACATCTGATGACGGTATGGGAGAGACTAGTGAAATGAGATCTCGATCACTTTTAACGCCTCGTAAATTCACAACAAGTGGGTCACTTAATAGGTTGAAATCATACAAAGATTTTCAAGATATAATAGCAGATGAGGACAAGACAAACGAACTATTTGAGAATTTCATTAGACACCCAGAGTTACTGGTTACAAAAGGCGAAACATTTGAAGAATTTGTTAATACGATATTATTTAGGTACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTGTCAATACAAAACCCGGCACAGCTTTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAGTAATTGACTACACTAGCATACATGACAAGATTTTTGGATTACAAGACATGCCAGGAATTGAAGAACTAGATACAATTATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAGAGTTATGTCCAGATCGTAGATGACTTAAGCAATCTAACATTGGATATAAACGATGTCAAGACTATATTTGCCTTTTGTCTTATGAATGACCCACTACTGATCACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTCAAGGGACATAGTCAAGAAAGAATAGGTCAATCAGCATGCAAAATGCCAGAGGTCCGAAGTCTAAAACTCATACATTACTCGCCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTGCCAAATGTAGATATAGATGAACTTGCAAGGGATCTATCTCATTTAGAAGACTTCATACAAAGTACAAAACTCAGAGAAAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAGCGGCACTTAGGGAGGGATTTCAAATTTGAAATCAAAGAACTAACTAGATTTTACCAAGTGTGTTATGATTACATAAAGTCTACAGAACATAAAGTCAAGGTGTTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGTGGCGCACTGACAGGTAACTTGATAAATGACAAATTATGGTACATAACACATTACTTAAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAGGCACAAATTTCTTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATAGCTGATGAGGCACTAAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTCTTGGCATCAGAATCAAGGATACAATTTCTGAAGAAAATTATTGAAGAATTCACATACAAAGGAATACCTGTAAAACATTTATACTCAAAAATAAAGAACTCCAAATTGAGGGTTAAATTTCTAGGGATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACACAGAATGATCTGGATAAATTTGATGCAGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTGTCAAGAGATATGAATACTGGACCAATAGACTTAATGATAAGCGGTTACTCTAGGCAGCTGCGGATTACTGGGGAAGATGACAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAGGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTAATTTATAGACACGGTCAGGCAATGTTGAATAAGCCACATGGCTTAAAGCTTGAAAAAATGCAACCTGTGACTGAGATGTCTAAACGATTACATTATATCGTTTTCCAGCAGAGATCACGGAAACGATACTTCTATTCTATATTACCTACCCAAGTAATTGAGGACCATAATTCTAGAGTTGAATCATCTAGGCTAAGCAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGCCCTGTTGCAATATCAAAACTCTACCAACAAGGACGGCCTATACTTTCCAAAGTTAGAAATCTGAATATGCAGACTCATTCGCTTTCCAGAATACAAGTTAATGTAGATGAATATGCCATTACAAGAAGAGCACATTTTCAGAAAATGCCTTTCTTCGAAGGACCGTCAATCCCTTCTGGTGGTATGGATTTATCAGAGCTAATGAAATCCACATCCCTATTAAGCTTGAACTATGATAACATTAAAAATGCATCTTTATTGGACATGTCTAGGGTATTTAAGTGCAATGGCAGTGAAGATGACCAAATGGCTTTCGAATTTCTATCGGACGAAATTTTGGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATCAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCCTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTTGACTTCCTTGACATGGGATTTTGCTCGAATGAAAATCTTAGCATTCTGGAGGAAATACATTGGATAATCAGTTATTTGAAAACAAATCAATGGTCTACGGAACTAGATAATTGTATTCACATGTGCATGTACAGGAATGGGTATGATGCAGAATATCATAAATTTGATATACCCTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGAACAATAAATTGGACAGAGGTCATTGAATTTATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAAATTGAGCCATGGTCTAGTATGAAGTCACACTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCACTAGAGTGTATGAAAAATGAGAAAAGATCATTGGCAGAATTTGTAGACAGAAGTAAGAAAACTGGCAAATCTAAATTTGACTTCTAAGGTATACACATGTAAAAGTAG
| 94,468
|
AF484424.1
|
Oropouche virus
|
Aquino,V.H., Moreli,M.L., Moraes Figueiredo,L.T.
|
Faculdade de Medicina de Ribeirao Preto, Virologia
|
Brazil
|
2002-12-24
| null |
Orthobunyavirus oropoucheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,846
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Oropouche virus segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTGCTCCTATTCCGAAACAAACAAAAACAATCTCAAAATGTCACAACTGTTGCTCAACCAATATCGGAATAGGATATTGCACTGCCGTGAACCTGAGATAGCAAAGGATATATGGCGAGATCTATTAAATGATCGACACAATTACTTTTCTCGGGAATTTTGCAGAGCTGCAAATCTTGAGTACAGAAATGATGTTCCTGCTGAGGATATTTGTGCTGAAGTTCTTGATGGTTATAAAGCAAGGAAAGTTCGCTTTTGTACACCTGATAATTACTTACTACATGATGGAAAGATGTATATAATAGACTTCAAAGTGTCTGTAGACGACCGATCTTCTAGAATCACAAGGGAGAAATATAATGAGATTTTTGGAGAGGTATTCAATCCAGAAGGTGTAGATTTTGAAATTGTTATTATTAGATTAGATCCTTCAAATATGACGATACATGTGGACTCTCGAGATTTCGTGAATACAATTGGGCCGATTACATTAAACATTAGTATGCAATGGTTTTTTGATATGAAAGACTTCTTGTTCGGGAAATTTCGGGATGATGATAAATTCCATGCTATAATAAGTCAAGGAGAATTCACAATGACATTGCCATGGATTGAAGAAGACACCCCAGAATTGCTTACTCATCCTATATACAATGAATTCATGAGTTCAATGCCAGAGGCAGAACAGGCCCTATTCAAGGAAGCATTGGAATTCAAATCATTTGGGGCAGAAAAATGGAATATCTTTTTGAAGGGGGTGATGTCAAAGTATGGTGAATATTATAAAGAATTTACTAAAGGACATGCTCATTCTATATTTCTGACAACAGGGGACTACCCCAAGCCAGACAAAGACCAAATTTCAGCAGGTTGGAGAGAAATGGTAAACAGAGTAAGCTCTGAACGTGACATGTCAAATGACATAAATCAGGAAAAACCAAGCATGCATTTTATATGGGCAAAGAATGATTCAAATAGCAACAATAATATACAAAAGCTAATCAAACTATCTAAATCACTGCAAGCTATGAGCGGGACAGGGAGCTATGTAAATGCTTTCAAGTCATTAGGGAGATTAATGGATATATCATCAGATGTTAAAAAATATGAATCATTTTGTGGGAAATTGAAATCTCTGGCAAGGTCTAGTATAAAAAAACTTGACAGGAAAATAGAGCCAATACAAATTGGGACTGCAACTGTCTTATGGGAACAGCAATTTAAACTAGATACAGATGTTATAAAAAGAGAAGACAGAATACATTTAATGAAAGATTATCTTGGGATCGGTAAGCACAAATCATTTTCAAAGAAATTAAACAACGACATAAATACTGATAAGCCTAAAATATTAAATTTCAACAATGATGATATAGTCAGGAAATGCAAAGATAAATATAATCAAGTCATACATAACCTATCCCAAATCAATGAATTAGATAAGATTGGAAACTACCTAGAGCACTTTTCAGCTAAAATTAGTGCCTGCAGTGTAGAAATGTGGGATTTTATATATAATACAACCAAAACTAAATACTGGCAATGCATCAATGACTATTCCACCCTAATGAAAAACATGTTAGCTGTCTCTCAATATAATAGACACAATACGTTTAGAATTGTCTCATGTGCAAACAATAATGTATTTGGTCTAGTAATGCCAAGCTCAGATATAAAGACAAAAAAAGCAACTTTAGTCTATGCAATAATGGCTCTCCATAATGAGGAGGCAGAAATAGCAGAACTTGGCTCACTCTACTCAACTTTTAAGACAGCAACAGGATATATTTCAATATCAAAGGCTTTTAGGCTGGATAAAGAAAGATGCCAACGCATAGTATCCTCTCCAGGCTTGTTCCTCATGACAAGCTGCCTATTATTCAACGGTAACAAGAGTTTAGAATTTGATAAATTACTAGGATTTTCATTTTTTACGTCAATATCAATTACGAAAGCTATGCTCTCCCTTACTGAGCCTTCACGTTATATGATCATGAACTCGTTAGCAGTTTCCAGCCATGTAAGAGAGTATATATCTGAAAAATTCTCCCCTTATACAAAAACATCATTTTCTGTGGTAATGACAGACTTAATCAAGAAGGGTTGCTATTCAGCATATGAACAGAGAAAAAAAGTACAAATAAGAGACATAAAATTAACAGATTATGATATAACACAAAAGGGAGTGGATTCCAAAAGAGATCTTAAATCTATTTGGTTCCCAGGAAAGGTAAACCTGAAAGAATATTTAAACCAAATTTATCTACCATTTTATTTTAACTCTAAAGGATTACATGAAAAACATCATGTCTTGATAGATTTGGCTAAAACAGTACTAGAAATCGAAAAAGAGCAAAGGGAGTCATTACCTGAGCCATGGTCAGAGATACCTGCTAAGCGACTGTCACTTAATGTTTTAATTTACTCATTGCAGGAACTGAATTTAGATACTTCAAGACATAATTTTGTAAGAAGCCGGGTGGAAAACGCAAATAATTTCAACAGATCTATAACGACAATATCTACTTTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGTGATTTTGAAGAAGAAAAAAGAGAAAAACTAAGAATGATACAAAAGAAACTTGCAAAGGATATTTCTAAATTAACCATAGCCAACCCAGCATTCTTAGATGAGATCACAAACGAACATGAGATAAGGCATTCAACTTATGAGGACTTAAAACAATCTATCCCAGATTACACAGATTATATGTCTGTGAAAGTTTTTGACAGATTGTACGAGAAGATTACTACCAATGAAATAAATGATAAGGAAACAGTCAAGCTGATTCTAGAGACCATGAAAAAACATAAAATATTTCATTTTGGATTCTTCAATAAAGGACAAAAAACAGCCAAAGATAGAGAAATATTTTTAGGTGAATTTGAAGCAAAAATGTGTCTGTACCTTGTCGAAAGAATAGCTAAAGAGAGGTGCAAATTAAACCCTGAAGAAATGATAAGTGAACCAGGCGACTCGAAACTAAGGGTATTAGAGAAGCAATCAGAAGACGAAATCAGGTATATTAGCAATACAATAAAGACATTAGGGAATGCCATAGAGAACTTGCAATCTGGATCTTTAAATTGGGCAGATATATGCGAAAACAAAGCAAGAGGACTTAAGATAGAAATAAATGCTGATATGTCCAAATGGAGTGCCCAAGATGTACTTTTTAAATATTTTTGGTTGATAGTGCTTGATCCCATCTTATATCCTGCTGAGAGGAAAAGGATAATTTATTTCCTCTGTAATTATATGCAGAAAAGGCTTATAATGCCCGATGAATTGCTCACTACTATATTGGATCAAAGAGTTCCTTATTCAAATGACATAATTGGATTAATGACAAACAATTATAGGTCTAATACAGTAGAAATAAAGCGTAACTGGCTTCAAGGCAACTTAAATTATACAAGCAGTTACTTACACAGCTGTAGTATGTCTGTGTACAAAGATATAATAAGAGAAGCAGCAATATTATTAGAAGGAGAAGCCCTTGTGAACTCAATGGTACATTCTGATGATAATCAAACATCTATATGTATGGTGCAGAATAAATTACCAGATGACAATATAATTGAATTTTGCATTAAGATATTCGAGAAGATATGCTTAACTTTTGGCAATCAGGCAAATATGAAGAAGACATATCTAACTAACTTCATCAAAGAGTTTGTTTCTTTATTTAATATACATGGAGAACCATTTTCTATATATGGGAGATTTCTACTCACAGCAGTAGGAGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTTAGCAAGTAGGCTATCTGCAACACAAACTGCTATAAAGCATGGTTGCCCACCATCACTTGCATGGGTATCTATCGCTCTAAATCACTGGATAACCCACACTACATATAATATGTTGCCTGGCCAAAATAATGACCCGTTACCATTCTTCCCTACTAACAATAGAAGTGAAATACCAGTAGAGATGTGCGGAATACTAGAAAGTGATTTATCAACAATTGCACTAACTGGTTTAGAAGCAGGGAATGTCACGTTTCTAACAAATATAGCAAGGAAGTTATCATCCCCAATCTTACAAAGAGAAAGTATTCAAGATCAATACAATTCTATAGAAAAGTGGGATCTGAGCAAATTATCACAGATCGACATTCTAAGGCTTAAAATGCTCAGGTATATATCTCTTGATAGTTCAGTCACATCTGATGATGGTATGGGGGAGACTAGTGAAATGAGATCTCGATCACTTTTAACACCTCGTAAATTCACAACAAGTGGGTCACTTAATAGGTTGAAATCATATAAAGACTTTCAAGATATAATAGCAGATGAGGACAAGACAAACGAACTATTTGAGAATTTCATTAGACACCCAGAGTTACTGGTTACAAAAGGCGAAACATTTGAAGAATTTGTTAATACGATATTATTTAGGTACAATTCAAAGAAATTCAAAGAATCTTTGTCAATACAAAACCCAGCACAGCTTTTTATTGAGCAAATATTATTTTCCAATAAACCAGTAATTGACTACACTAGCATACATGACAAGATTTTTGGATTACAAGACATGCCAGGAATTGAAGAACTAGATACAATTATAGGTCGCAAAACATTTGTTGAGAGTTATGTTCAAATCGTAGATGACTTAAGCAATTTAACATTGGATATAAACGATGTCAAGACTATATTTGCCTTTTGTCTTATGAATGACCCACTACTGATCACATCTGCTAACAATATAATAATGTCTGTTAAGGGACATAGTCAAGAAAGAATAGGTCAATCAGCATGCAAAATGCCAGAGGTCCGAAGTCTAAAACTCATACATTATTCACCAGCAGTTGTTTTGAGAGCCTATGTGAGAGGGCCAACAAATGTACCGAATGTAGATATAGATGAACTTGCAAGGGATCTATCTCATTTAGAAGACTTCATACAAAGTACAAAACTCAGAGAAAATATGAGAGAGAGAATAGAAATAAATGAGAAGCGGCACTTAGGAAGGGATTTCAAATTTGAAATCAAAGAACTAACTAGATTTTACCAAGTGTGTTATGATTACATAAAGTCTACAGAACATAAAGTCAAGGTATTCATATTGCCATACAAAGTTTTCACATCAATAGAATTCTGCGGGGCACTGACAGGTAACTTGATAAATGACAAATTATGGTACATAACGCATTATCTGAAAAATATAGTGTCTACTACACATAAGGCACAAATTTCTTCTTCACCTGAATTGGAATTGCAAATTGCTGATGAGGCACTAAGACTAGTAGCACATTTTGCTGATACTTTCTTGGCATCAGAATCAAGAATACAATTTCTGAAGAAAATTATTGAAGAATTCACATACAAAGGGATACCTGTAAAACATTTATACTCAAAAATAAAGAACTCCAAGTTGAGGGTTAAATTTCTAGGGATTCTTTTATGGTTAGATGATCTAACACAGAATGATCTGGATAAATTTGATGCAGATAAATCAGATGAAAAGATTATATGGAATAACTGGCAAGTGTCAAGAGATATGAATACTGGACCAATAGACTTAATGATAAGCGGTTACTCTAGACAGCTGCGGATCACTGGGGAAGATGACAAATTGATTGCTGCTGAATTGCAGGTTACTAGATTGTCAGAAGATTTAATTTATAGACACGGTCAGGCAATGTTGAATAAGCCACACGGCTTAAAGCTTGAAAAAATGCAACCTGTGACTGAGATGTCTAAACGATTACATTATATCGTTTTCCAGCAAAGATCACGGAAACGATACTTCTATTCTATATTACCCACCCAAGTAATTGAGGACCATAATTCTAGAGTTGAATCATCTAGGCTAAGCAGAGATTCAAAATGGGTTCCTGTATGCCCTGTTGCAATATCAAAACTCTACCAACAAGGACGGCCTATACTTTCCAAAGTTAGAAATCTGAATATGCAGACTCATTCGCTTTCCAGAATACAAGTTAATGTAGATGAATATGCCATCACGAGAAGAGCACATTTTCAGAAAATGCCTTTCTTCGAAGGACCATCAATCCCTTCTGGTGGTATGGATTTGTCTGAGTTGATGAAATCTACATCCCTATTAAGCTTGAATTATGATAACATAAAAAATGCATCCTTATTGGACATGTCTAGGGTATTTAAGTGCAATGGCAGTGGAGATGACCAAATGGCTTTCGAATTTCTATCGGACGAAATTTTGGAGCAAGATGTAGTTGAAGAAATAGAATGCAACCCTATATTTTCTATTAGTTATACAAAAAGAGGAGAATCCAATATGACTTATAAAAATGCTTTCCACAAAGCCTTAATCTCAGAATGTGACAAATTTGAAGAAGCATTTGACTTCCTCGACATGGGATTTTGCTCGAATGAAAATCTTAGTATTCTGGAGGAAATACATTGGATAATCAGTTATTTAAAAACAAATCAATGGTCTACGGAACTAGACAATTGTATTCACATGTGCATGTACAGGAATGGATATGATGCAGAATATCATAAATTTGATATACCCTCTAAATTCCTCAAAGACCCAATAAACCGAACAATAAATTGGACTGAAGTCATTGAATTTATATTATTAATTGAAGATTTCCAAACAAAAATTGAGCCATGGTCTAGTATGAAGTCACACTTCTGTTCAAAAGCACACAGTGTAGCACTAGAGTGTATGAAAAATGAGAAAAGATCATTGGCAGAATTTGTAGACAAAAGTAAGAAAACTGGCAAATCCAAATTTGACTTCTAAGGTATACACATGTAAAAGTAGTGTTTGTTTCTAAATAGGAGCACACTACT
| 110,526
|
NC_043699.1
|
Orthobunyavirus shuniense
|
van Eeden,C., Harders,F., Kortekaas,J., Bossers,A., Venter,M., Wichgers Schreur,P.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-06-28
| null |
Orthobunyavirus shuniense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,910
|
RefSeq
| 1
|
South Africa
|
South Africa
|
Equus caballus
| null |
2009-01-16
| null |
PRJNA485481
|
Shuni virus strain SAE1809 RNA-dependent RNA polymerase gene, complete cds
|
AGTAGTGTACCCCTAGAGAAAACAATTCAAAATGGATCCTTACCGTATCGATATGTTCCGCAATAGAATCCTTGCATCCAACGATCCTGAAGATGCAAAGGATATTATGTCAGATCTATTGATGGAACGCCATAACTACTTTGGCAGAGAAGTGTGTCAATACCTAGACATCGAATTTAGAAATGATACACCTGCTCAAGATATACTTCTTGAATTCCTGCCTCCAGGGACTGTTTTCAATGTGAGAAACTGCAGCCCGGATAATTATGTTATCTTAAATGGAAAATTATATATCATAGACTATAAAGTCTCTGTTGATGCTGGCTATGGATTGTCAACAAAGACAAAATATGAGGAAATATTTGGTGATGCTTTGTCTCCCTTTGGTCTCGATTTTGAGGTTGTTATAATCAGAGCAGATCCTATTCGAGAAATGGTGCATATTGACAGTCAAGACTTCATAAATGCTTTTGGAAACATCTACATTGATCTAGATTTTACATGGTTCTTCAATCTGCGTGCGTTACTTTATGATAAATTTAAAGATAATGACCGATTTTTAGAAATTGTCAACCAAGGCGAATTTACAATGACTTCACCATGGATAGAAGAAAATACACCAGAGTTATATACTCATCCTATATTCAAAGAGTTTTACAACTCACTTAATGATGAAGAAAAAAATACATTTAATACCAGCTTAGAATTTGACGCTACTAAATCTGAGAAATGGAATCAAAACCTGATTGCAGTAATCCAAAAGTATGAGCCATTTTACAAGAAATTTTGCAACATTGCAGCATCAGGAGTTTTTAAATGCACAGGTGATTATCCAGCACCTAGTAAGGATCAAATATCAAAGGGATGGGAAGATATGTATGAGAGAGTCAAGCTTGAGAGAGATTTAACTGATGACTTATCTAAACAGAAGCCAAGTTTCCACTTCATATGGTCGCCTCCTGATGCTGAGAGACCAAATGAAAATATTTCAAAGATATTGACATTGGCAAAGGCGCTTCAGAAGATACAAGGTGACTCCACTTTCATTAATGGGTTTAGATCATTGGGTTTGTTAATGGATTTCTCATCTAATATCGGCTTGTATGAATCGCATGTTAGCAAGCTTAAAAATACAGCACGGCAGACTTCTAAAAAAATAGACCAAAAGTTAGAAGAAGTAGAAATTGGGAGTGCAACTGTCTTATGGGAGCAGCAATTCAAATTTAATACAAAAATAATGAATGCTCAAGACAAGTCACATCTATTTAAAGATTTCCTTGGAATTGGTGGCCACAAATCATTTGGGAAAAAATCAATTGATGACTTGGATATAGAGAAGCCTAAGATATTGGATTTCAATTCAAAAAACGTCCAAGATGCGTGTAATAGAATTTATCGACAAGTCAAAAATGTCCTATCTAACACTAATTCCTTGAAAAAAATGGGCTGTTATTTAGAAGAATACGGATATAATATATCAAACGCTTCCCCAGACATATGGGAGAGAGTCCAAGAAGTATGTTCTACAAATTATTGGGCTGCAATCTTAGATTATTCAACTCTGATGAAAAATATGTTAGCTGCATCCCAATATAATCGCCATAATACATTTAGGGTTGTCACATGTGCAAACAACAACCTCTACGGGATAGTTATGCCTTCCTCAGATATCAAGACAAAAAGATCAACTCTTTGCTATTTTGTAATAGCTCTACATGACGGGAAAGAGGACGTTGTGCATTCTGGATCAATACATTCAACTTTCCAATCAGGATCTAAGTTTGTATCAATCTCAAAGGGTTTTAGACTAGATAAAGAGCGATGTCAAAGGATTGTATCATCACCAGGCTTATTCTTAATGACATCTTGCTTATTCTTATCCGACAACAAATCATTGAATACAAATGATGTCTTAAACTTTAGTTTCCACACATCTGTTTCAATAACAAAGGCAATGTTATCGCTAACTGAGCCTTCTAGATATATGATTATGAATTCACTTGCAATCTCAAGTCATGTGCGTGAGTATATGGCTGAAAAGTTTAGCCCATACACAAAGACTGCATTTTCTGTTGTTATGACACAGATCATTAAGCGTGCATGTTATGAGGCATTTGACCAGAAAGAAAAGATAGAGCTAAAAAATATACATCTGACAGATTATGAGATAACACAAAAAGGTGTGAAACCACAGAGAGACCTTAAATCTATATGGTTCCCAGGGCGTGTAAATTTGAAGGAATATATCAATCAGGTATACATGCCATTTTATTTCAACTCTAAAGGTTTGCATGAAAAACACCATGTTATGATTGACCTAGCTAAAACTATATTAGAAATTGAGAAAGATCAACGGTTGAACATACCTGGGATCTGGTCAGATATTCCAAAGAAGCAAACAGTCAACATTAGGGTTTTGATTTATTCACTTGCTAAAACATTGAACATGGACACATCGAGACATAATTATATACGTTCTCGTATAGAAAACAACAACAACTTAAAACGATCCATAACAACTATATCTACATTCACCAGTTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTTAGCGAATTTAAAAATCGTAAAGAAAAAAAGATAATAGGTAATATAAAAAAAGAAATAAGCAAGTATACAGTTGCAAATCCAGAGTTTGCAGAAGATTTAGATGTGTCTTGTGCTATACACCATGCCGATTATGCAGATGTGCGTAAGGCTATACCAAATTATTCAGATTGCATATCAACAAAGGTCTTTGATGCATTATATGAAAAGATAAAAAATGGAGAAATTGATGATAAACCAACAGTATCACATATATTTGAAGTAATGAGGAAACATAAACAATTTTACTTCAGTTTCTTTAACAAAGGTCAAAAAACAGCAAAAGACAGAGAGATTTTTGTTGGAGAATTTGAAGCAAAGATGTGCTTATATTTAGTTGAAAGGATCTCCAAAGAGCGTTGCCGCCTTAATCCAGAAGAGATGATCAGTGAACCAGGAGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAGGATTTGGCAGAAGCAGAAATTCGATACACAGCCCAAACACTAAAGAATTTGAACCGTAAAATACAAAAAGATATGTTTGGATCAGAGATTGATGTTGATATGAAGTTGCATGCACTGAAAATAGAAATAAATGCTGATATGTCAAAATGGAGTGCTCAGGATGTTTTATACAAGTATTTTTGGCTTTTTGCTTTAGATCCTGTTTTGTACAAATGCGAAAAAGAGAGGATCTTGTATTTCTTATGTAACTATATGCAAAAAAGACTTATCCTACCAGACGATTTAATTGCAAATATTCTAGATCAGAGAGTTCAGCGCCAAGATGACATCATATATGAAATGAGTAATGGTCTTACTCAAAATTGGGTTGAAATCAAGAGAAACTGGCTCCAAGGGAATTTAAACTACACTAGTAGTTATCTACACACATGCTCAATGAATGTTTATAAAGATGTAATTAAAAGATCTATTGATTTGCTTGAAGGAGAGACACTTGTCAACTCAATGGTGCATTCAGATGACAACCATACATCATTAGTCATAGTGCAGAATAAATTAAATGATAATATTTTAATTGAATTTTCTATAAAGTTGTTTGAAAAGATATGCTTAACATTTGGCAACCAAGCAAACATGAAGAAAACATATCTAACAAATTTTATTAAAGAATTTGTATCGTTATTTAATATATACGGTGAACCCTTTTCAGTATATGGTCGCTTTCTGCTGACAGCTGTCGGTGACTGTGCCTATCTAGGGCCTTATGAAGATTGTGCTAGTAGATTGTCAGCAACACAAACTGCAATAAAACATGGCTGCCCGCCATCACTTGCATGGATCAGTATAGCATTAAACCAATGGATCACACACAACACTTATAACATGCTTCCAGGCCAAAACAATGACCCATGTAACATATTGCCTTGCTACAATAGATTCGAGGTCCCTATTGAATTGTGTGGGCTATTAAATTGTTCCTTACCGAGCATTGCAATAGCAGGTTTAGAAGCAGATAATCTCGAATTTTTAGTCAGGACATCACGAAAGCTATCTCCCATAATGTATCAACGAGAGCCAATACAATCGCAGTATGATCACATTTTAGACTGGGATTTGAACCAATTAACCGAAATAGAAGCAATTAGATTCAAAATGCTGAGGTTTATGGCCTTGGACTCTTCTATGTCATCAGATGACGGAATGGGTGAGACAAGCGATATGCGATCAAGATCTTTGCTCACCCCAAGGAAATTCACAACACAAGCATCACTATCAAGATTAACATCTTACAATGACTATCAACAAATTATACAGGATCAGACTAAAGTTGACGAGTTGTTAGGCTATTTCATACAATATCCCCAACTGTTGGTCACAAAGGGAGAAAATGTAGAGGAATTTTGCCAGTCTATAAGATTCAGATATACTAGCCGGAAGTTTAAAGAATCACTATCAATACAAAATCCTGCACAATTATTTATAGAACAGATATTATTTGCAAACAAGCCAATGATTGATTATACTAGTATTCATGATAAATTATTTGGCATTCAAGATGATCCTAACATATCAGATACTACATGCATTATTGGAAAGAAAACCTTCCCAGAAACCTATAATCAGATTAAATGCGATTTAGAAAGATTCACATTAACAAATGCTGATATCAAGACAGTTTATAGTTATTGCTTGATGAATGATCCTATATTGATAGCATGTGCAAATAATATAATATTATCCATGAAAGGCATGACTATAGATAGGTCAGCTATGACATGTGCACAAATGCCTGAGATTAAAAGCCTTAAAGTAATTTACCATAGTCCAGCTTTAGTTTTGAGGGCATATGTAACTGGTGACATGACCATACGAGGAGCAGAGCCTGATGAAATGAGGAGAGATATATATCATCTTGAGGACTTTATAGAAAAGACAAACATACGGAATAAGATGAGAGAAAGAATTAACAAGAATGAAATAAGGTCTAATGGAAGAAATATTAAATTTGAGATCAAAGAGCTAACTAAGTATTATCAAATATGCTACGATTATATTAAATCTACTGAGCATAAAATAAAAATATTCATTTTGCCAAAAAGACCAGCTACCCCTTCTGACTTCTGCTCTATAGTAGCTGGTAATCTAATGCTAGACAACAAATGGGTTACAATACACCATCTAAAACAGATAACTTCACAAACAAAAAAAGCAGAAATAGCAACTTCAACAGATTTAGAGCTGCAACTGTCGTATGAATGTTTGCGCCTGGTAGCACATTTTGCTGATTCTTTTCTGGCAGATAATTCTAGAAAACAGTTCCTAAAGAGGGTAATTGAAGAATTCTCTTATAAAGGAGTTCCTGTCAAAGAGTTGTATGGTAAAATAAAACATTCAAGATTAAGGTCAAAGATAGTTCCTATACTATATTATATGGACGATTTAGATCAATTAGATTTGGATAGATATGATGCTGAAAAAGCAGAAGAGCAGATTACATGGAATAATTGGCAGACATCAAGAGAATTTCAGACTGGACCAATAGATTTATCAATTAAAGGCTATGGACGTAGCATCCGAATCATTGGGAATAATTCTAGGTTGACTGCAGCAGAACTTCAAATAAGTAGGATACGTGATGACATAATTTCTAGACACAGTCAAGCATTGCTAAATAAGAATCATGGGTTGAAATTTGAACTTATGGAAGAATACAAAGACCTTGATCCTAGGTTGTTTTATATATGTTACCAACTTAGGGCTAAGAAAAGATATCACTACAACATACTGTCGGTCTCACATATACTAGACCACAATAGACGCATACAGGAGTCTAAAATAAGATCTACCAATTATTGGGTGCCAGTCTGCCCAGTAGCAATTTCTAAGCTAACATATAATGACAAACCTCAATTAGGATTGATCAAGAGGTTAAATATGGATAATACAAAATTGACATCAATACAGGTAGCAGTTGAAGACTATGCAATGGTTAGAAAATGCAACTTTGCTAAGATGCAATTCTTTGACGGACCAGAATTACCATGTGGTGGAATAGATATTTCAAAGATGATGAAATCCCAGAATATTCTGAACTTACAAGTAGATACTTTACAAAGTATATCCCTTATTGAATTGTGTCGGATCTTTAACTGTAAAGGTACTAAGGATGATAATAATGCTTTTGAATTCTTGTCTGATGAAATTCTTGATGAGGAAGTAGATGAAGAGCTTGATTCCTCCCCAGCTTTGAAGATAACATACACAAAAAAGTCAATAAAAAATAATACATACAAAAACACAATAGTAAAAGCACTAATACGTGAATGCGACAAATTTGAGGAATGCTTTGACATAACTGACGAAGGCTTTACATCAGATAGCAATCTGGAAATTTTGGAATCTTTAGTCTGGATTTTGAGAGAGTTACATACTAATCAATGGTCGACAGAATTAATGCAATGCATTCATATGACACTGTATAGAAACGAGATGGATCATCTGTTCCATAGATTTTCCATTCCTGAACAATTTGTAGATAACCCAATATCATTGAATTATAAGTGGTCAAATGTGATAGAATTCTTGGTGACATTAATGCAGATAGATTATAAGCAAGAACCGTGGGTTTCAATTATGGCACATTCATTAAACAAAGCTGTTGAATATGCAACTGAAAGGAAGATACAGGAATCAACCAAAGAGAACAAATTGCAGAAGTTTATCAAAGGGAAGAAAATGGGTGGGAGGTCTAAGTTTGATTTCTAATGTAAGATTTAGCACTTAGTCTAAGCAACATACTATACTTCTAAAATCACGCTTCTTAATATACAATTAATCATTTAAATATCTTTAAATAAATTGTGTCTCTAGGGGCACACTACT
| 3,491
|
ON920928.1
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Golender,N.
|
Kimron Veterinary Institute, Devision of Virology
|
Israel
|
2022-09-26
| null |
Orthobunyavirus shuniense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,860
|
GenBank
| null |
Israel
|
Israel
|
Bos taurus
|
brain
|
2020-11-19
| null | null |
Shuni orthobunyavirus strain ISR-222/20 segment L, complete sequence
|
TCAAAATGGATCCTTACCGTATCGATATGTTCCGCAATAGGATCTTTGCATCAACTGATCCAGAAGATGCAAAGGATATTATGTCGGATCTGTTGATGGAACGTCATAACTACTTTGGCAGGGAAGTGTGTCAATACCTAGATATTGAGTTTAGAAATGACACACCTGCTCAGGACATACTTCTTGAGTTCTTGCCTCCAGGGACTGCTTTCAATGTGAGAAACTGCAGCCCGGACAATTATGTTATCTTTAATGGAAAATTGTACATTATAGATTATAAAGTCTCTGTCGATGCTAGCTATGGGCTGTCAACAAAGACAAAATATGAGGAAATATTCGGTGATGCTTTGTCTCCCTTTGGTCTTGATTTTGAGGTTGTTATAATCAGAGCTGATCCTATCCGAGAAATGGTTCATGTTGACAGTCAGGATTTTATAAATGCATTTGGGAACATCTACATCGATCTAGATTTCACATGGTTTTTCAATCTGCGTGCATTGTTGTATGATAAATTCAAAGATAATGACCGATTTTTAGAAATTGTCAATCAAGGCGAATTTACAATGACTTCACCATGGATAGAAGAAAATACACCAGAATTATACACTCATCCTATATTCAAAGAATTTTACAACTCACTTAATGATGAAGAAAAAAACACATTTAATACTAGCTTAGAATTTGATGCTACTAAATCTGAGAAATGGAATCAAAACTTGATTGCAGTCATCCAAAAATATGAACCATTCTACAAGAAATTTTGCAACATTGCGGCATCAGGAGTTTTTAAATGCACAGGTGATTATCCAGCGCCTAGTAAAGATCAAATATCAAAAGGATGGGAAGATATGTATGAGAGAGTCAAACTTGAGAGAGATTTAACTGATGACTTATCTAAGCAGAAGCCAAGTTTCCATTTTATATGGTCACCTCCCGATACTGAGCGGCCAAATGAAAATATTTCAAAGATATTGACATTATCAAAGGCGCTCCAAAAAATACAAGGTGACTCCACATTCATTAATGGGTTTAAATCACTAGGGTTGTTGATGGATTTCTCATCTAATATCGGCTTGTATGAATCGCATGTTAGCAAGCTTAAAAACACAGCACGGCAAACTTCTAAAAAAATAGACCAGAAATTAGAAGAAGTAGAAATTGGGAGTGCAACTGTTTTGTGGGAGCAGCAATTCAAATTTAATACAAAAATAATGAATGCTCAAGACAAGTCACATCTATTTAAAGATTTCCTTGGAATTGGTGGCCACAAGTCGTTTGCAAAAAAATCAATTGATGACTTGGATCTAGAGAAGCCTAAAATACTGGATTTCAATTCAAAAAATGTCCAAGATGCCTGTAATAGAATTTATCGCCAAGTCAAGAGTGTCCTATCTAATACTAATTCTTTGAAAAAAATGGGCTGTTATTTAGAAGAATATGGGTATAATATATCAAATGCTTCCCCTGATATGTGGGAGAGAGTCAAAGAAGTTTGTTCTACAAATTATTGGGCTGCAATCCTAGATTATTCAACTCTAATGAAAAATATGTTGGCTGCATCTCAATATAATCGTCACAATACATTTAGGGTTGTCACATGCGCAAATAACAACCTTTATGGAATAGTTATGCCTTCTTCAGATATCAAGACAAAACGATCAACTCTCTGCTATTTTGTAATAGCTCTACATGATGGGAAAGAAGATGTTGTACATTCTGGTTCAATACATTCAACTTTCCAGTCAGGATCTAAATTTGTATCGATTTCAAAGGGGTTTAGACTAGATAAAGAGAGATGTCAAAGGATTGTATCGTCACCAGGTTTGTTCTTAATGACATCTTGCTTATTCTTATCTGATAACAAATCATTAAATACAAGTGATGTCTTAAATTTTAGTTTTCACACATCTGTTTCAATAACAAAAGCAATGTTATCACTAACTGAGCCTTCTAGATATATGATTATGAACTCGCTTGCAATTTCAAGTCATGTCCGTGATTATATGGCTGAAAAATTTAGTCCATACACAAAAACTGCATTCTCTGTTGTTATGACACAGATCATTAAACGTGCATGCTATGAAGCATTTGACCAGAAAGAGAAGATAGAACTAAAAAGCATACATTTGACAGATTATGAGATAACACAAAAAGGTGTGAAACCACAGAGAGATCTCAAGTCCATATGGTTTCCAGGGCACGTGAATTTAAAGGAATATATCAATCAGGTATACATGCCATTTTATTTCAACTCTAAAGGTTTACATGAAAAACACCATGTTATGATCGACTTAGCTAAAACTATATTAGAAATTGAAAAAGATCAACGGTTGAATATACCTGGAATCTGGTCAGATGTTCCAAAGAAACAAACAGTTAACATCAGGGTTTTAATCTATTCGCTTGCTAAAACATTAAACATGGACACATCGAGACATAATTATATACGTTCTCGTATAGAAAACAGCAACAATTTGAAACGGTCCATCACAACTATTTCTACATTCACTAGTTCTAAATCATGCATTAAAATTGGAGACTTTAGTGAGTTTAAAAGTCGCAAAGAAAAAAAGATAATAGGTAATATAAAAAAAGAAATAAGCAAGTATACAGTTGCAAACCCAGAATTTGCAGAGGATTTAGATGTATCTTGTGCTATACATCATGCCGACTATGCAGATGTACGTAAGGCTATACCAAATTATGCAGATTGCATATCAACAAAAGTTTTTGATGCATTATATGAAAAGATAAAAAATGGAGAAATTGATGACAAACCAACAGTATCACATATATTTGAGGTAATGAGAAAACATAAGCAATTTTACTTCAGTTTCTTTAATAAAGGTCAAAAGACAGCAAAAGACAGAGAGATTTTTGTTGGTGAATTTGAAGCCAAGATGTGCTTATATTTAGTTGAAAGAATCTCCAAAGAACGCTGCCGCCTTAATCCAGAAGAAATGATCAGTGAACCAGGGGATTCTAAACTGAAAAAGTTAGAGGATTTAGCAGAAGCAGAAATTCGATACACAGCCCAAACACTGAAAAACTTAAATCGTAAATTACAAAAAGATATGTTTGGATCAGAAATTGATGTTGACATGAAATTGCATGCATTAAAGATAGAAATAAATGCCGACATGTCAAAATGGAGCGCTCAGGATGTTTTATACAAATACTTCTGGCTTTTTGCTTTGGATCCTGTTTTATACAAGTGTGAAAAGGAGAGAATCTTGTATTTCTTATGCAATTATATGCAAAAACGACTTATCTTGCCAGACGATTTAATTGCAAATATTCTAGACCAAAGGGTTCAACGCCAAGATGACATCATATATGAAATGAGTAATGGTCTTACTCAGAATTGGGTTGAAATCAAGCGAAACTGGCTCCAAGGGAATTTAAACTACACTAGCAGTTATCTACACACATGCTCAATGAACGTTTATAAAGACGTAATTAAAAGATCTATTGATTTGCTCGAGGGAGAGACACTTGTCAACTCAATGGTGCACTCAGATGACAACCACACATCATTAGTTATAGTGCAGAATAAACTAAATGATAATATTTTAATTGAGTTTTCTATAAAGTTATTTGAGAAAATATGCTTAACATTTGGCAACCAAGCAAATATGAAGAAAACTTATCTAACAAACTTCATTAAAGAATTTGTATCACTATTTAATATATATGGTGAACCATTTTCAGTATACGGCCGCTTTCTGCTGACAGCTGTCGGTGACTGTGCTTATTTAGGGCCTTATGAAGACTGCGCTAGTAGATTGTCAGCAACGCAAACTGCAATAAAACATGGATGCCCACCATCACTTGCATGGATCAGTATAGCATTAAATCAATGGATCACACATAACACTTATAATATGCTTCCAGGCCAAAACAATGACCCATGCAATATATTGCCCTGTTACAATAGGTTTGAAATTCCTATTGAATTGTGCGGGCTATTAAATTGTTCTTTACCAAGCATTGCGATAGCAGGTTTAGAAGCAGACAATCTTGAATTTTTAGTCAGGACATCACGAAAGCTATCTCCTGTAATGTATCAACGAGAACCGATACAGGTGCAGTATGATCACATTTTAGATTGGGATTTGAACCAACTAACTGAGATAGAAGCAATTAGATTCAAGATGCTAAGGTTTATGACCTTAGACTCTTCTATGTCATCAGATGACGGAATGGGTGAGACAAGCGATATGCGATCAAGGTCTTTACTTACTCCAAGGAAGTTTACAACACAAGCATCACTATCAAGATTAACATCTTATAATGATTACCAACAAATTATACAGGATCAGACTAAAATTGATGAGTTGTTGGGCTATTTTATACAATATCCTCAGCTGTTGGTTACAAAGGGAGAAAATGTAGAAGAATTTTGCCAGTCTATAAGATTCAGATATACTAGCAGAAAGTTTAAAGAATCACTATCAATACAGAATCCTGCACAGCTATTTATAGAGCAAATATTATTTGCAAACAAGCCAATGATTGATTACACTAGTATTCATGATAAATTATTTGGTATTCAAGATGATCCTAACATATCAGATACTACATGCATTATTGGGAAGAAAACCTTCCCAGAAACCTATAATCAGATTAAATGCGATTTAGAAAGATTCACATTAACAAACGCTGACATCAAAACAGTTTATAGTTATTGTTTAATGAATGACCCCATATTGATAGCATGTGCAAATAATATAATATTATCCATGAAAGGCATGGCTATAGACAGGTCAGCTATGACATGTGCACAGATGCCTGAGATTAAAAGCCTTAAAGTAATTTATCACAGTCCAGCTTTAGTTTTAAGGGCATATGTAACCGGTGATATGGCCATAAGAGGAGCAGAGCCTGATGAAATGAGGAGAGATATATACCATCTTGAGGACTTTATAGAAAAAACAAACATACGGAATAAGATGAGAGAAAGAATTAACAAGAATGAAATAAGGTCCAATGGGAGAGATATTAAGTTTGAGATCAAAGAGCTAACCAAGTATTATCAAATATGTTATGATTATATTAAATCTACTGAGCATAAGATAAAAATATTCATTTTGCCCAAAAGACCAGCCACCCCTTCTGACTTCTGCTCTATAGTAGCTGGCAATTTAATGTTAGACAACAGATGGGTTACAATACACCATCTAAAACAGATAACCTCACAAACAAAAAAGGCAGAAATAGCAACTTCAACTGATTTGGAACTGCAGCTGTCATACGAATGCCTGCGCCTGGTAGCACATTTTGCTGATTCCTTTTTGGCGGATAATTCTAGAAAACAATTCCTAAAGAGAGTGATTGAAGAGTTCTCTTATAAAGGAGTTCCAGTTAAAGAGTTATATGGTAAAATAAAGCATTCAAGATTAAGATCAAAGATAGTTCCCATACTGTATTACATGAATGATTTAGATCAATTAGACTTGGATAGATATGATGCCGAAAAAGCAGAAGAACAAATTACGTGGAATAACTGGCAGACATCAAGAGAATTCCAAACTGGACCAATAGATCTGTCAATTAAAGGCTATGGACGTAGCATCCGGATTATTGGGAGCAATTCTAGATTGACTGCAGCAGAACTTCAAATAAGTAGAATACGTGATGATATAATTTCCAGACATAGCCAAGCATTGTTAAATAAGAATCATGGGTTGAAATTTGAACTTATGGAAGAGTACAAAGACCTTGATCCTAGGCTATTTTATATATGCTATCAACTTAGGGCTAAGAAGAGATACCACTATAATATACTGTCAGTCTCACATATATTAGATCACAACAGACGTATACAAGAGTCTAAAATACGATCTACCAATTATTGGGTACCAGTCTGCCCAGTAGCAATTTCTAAGCTAACGTATAATGACAAACCTCAATTAGGATTGATCAAGAGGTTAAATATGGATAATACAAAGCTGACCTCAATACAGGTGGCAGTTGAAGACTATGCAATGGTTAGAAAATGTAATTTTGCTAAGATGCAATTCTTTGATGGACCAGAGTTACCATGTGGTGGAATAGACATTTCAAAGATGATGAAATCCCAAAACATTCTGAACTTACAAGTAGATACTTTACAGAGTATATCGCTCATTGAACTATGCCGGATCTTTAATTGTAAAGGCACTAAAGATGATAATAATGCTTTTGAATTTTTGTCTGATGAAATTCTTGATGAGGAGATAGATGAAGAGCTTGATTCCTCGCCAGCTCTGAAGATAACATACACAAAAAAATCAAAAAGAAACAACACATATAAAAATACAATAGTGAAAGCACTAATACGCGAATGTGACAAATTCGAGGAATGCTTTGATATAACTGATGAAGGCTTTACATCAGATAGCAATCTTGAAATTTTAGAATCTTTAGTCTGGATTTTGAAAGAATTGCATACAAATCAGTGGTCAACAGAACTAATGCAATGTATTCATATGGCACTGTATAGAAATGAAATGGATCATCTATTTCACAGATTTTCCATTCCTGAGCAATTTGTAGATAACCCAATATCATTGAATTACAAATGGTCAAATGTGATAGAATTCTTAATGACACTAATGCAGATAGATTATAAACAAGAACCATGGGTTTCAATTATGGCACATTCATTGAACAAGGCTGTTGAATATGCTACTGAAAGGAAGATACAGGAATCGACTAAAGAAAACAAATTGCAGAAATTTATCAAAGGGAAAAAAATGGGTGGGAGGTCTAAATTTGATTTCTAACGTAAAATTTAATACTTGGTCTAGGCAACATACTGTACTTCTAGAATCACACTTTTTAACATACAATTAATCATTTAAATATCTTTATATAAA
| 24,232
|
MF361844.1
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Golender,N., Bumbarov,V., Panshin,A., Khinich,Y., Eldar,A.
|
Kimron Veterinary Institute, Virology
|
Israel
|
2018-05-31
|
ISR-129/16
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,908
|
GenBank
| null |
Israel
|
Israel
|
Ovis aries
|
placenta
|
2016-02-10
| null | null |
Orthobunyavirus shuniense isolate ISR-129/16 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTGTACCCCTAGAGAAAACAATTCAAAATGGATCCTTACCGTATCGATATGTTCCGCAACAGGATCCTTGCATCAAATGATCCTGAAGATGCAAAGGATATTATGTCGGATCTGTTGATGGAACGCCATAACTACTTTGGCAGGGAAGTGTGTCAATACCTAGATATTGAGTTTAGAAATGACACACCTGCTCAAGATATACTTCTTGAATTCTTGCCTCCAGGGACTGTTTTCAATGTGAGAAACTGCAGCCCGGACAATTATGTTATCTTTAATGGAAAATTGTACATTATCGACTATAAAGTTTCAGTCGATGCTAGCTATGGGCTGTCGACAAAGACAAAATATGAGGAAATATTTGGTGATGCTTTGTCTCCCTTTGGTCTTGATTTTGAGGTTGTTATAATCAGAGCTGATCCTATCCGAGAAATGGTTCATGTTGACAGTCAGGATTTCATAAATGCATTTGGGAACATCTACATTGATCTAGATTTCACGTGGTTCTTCAATCTGCGTGCATTGCTGTATGACAAATTCAAAGATAATGACCGATTTTTAGAAATTGTCAATCAAGGCGAATTTACAATGACTTCACCATGGATAGAAGAAAATACACCAGAATTATACACTCACCCTATATTCAAAGAATTTTACAACTCACTTAATGATGAAGAAAAAAACACATTTAATACTAGCTTAGAATTTGATGCTACTAAATCTGAGAAATGGAATCAAAACTTGATTGCAGTCATCCAAAAATATGAACCATTCTACAAGAAATTTTGCAACATTGCGGCATCAGGAGTTTTTAAATGCACAGGTGATTATCCAGCGCCTAGTAAGGATCAAATATCAAAAGGGTGGGAAGATATGTATGAGAGAGTCAAACTTGAGAGAGATTTAACTGATGACTTATCTAAGCAGAAGCCAAGCTTCCACTTCATATGGTCACCTCCCGATGCTGAGCGGCCAAATGAAAATATTTCAAAGATATTGACATTATCAAAGGCGCTCCAAAAAATACAAGGTGACTCTACATTCATTAATGGGTTTAGATCATTAGGATTGCTGATGGATTTCTCATCTAATATTGGCTTGTATGAATCGCATGTTAGCAAACTTAAAAATACAGCACGGCAAACTTCTAAAAAAATAGACCAAAAATTAGAGGAAGTAGAAATCGGGAGTGCAACTGTTCTGTGGGAGCAGCAGTTCAAATTTAATACAAAAATAATGAATGCTCAAGACAAGTCACATCTATTTAAAGATTTCCTTGGAATTGGTGGCCACAAGTCGTTTGCAAAAAAATCAATTGATGACTTGGATCTAGAGAAGCCTAAAATACTGGATTTCAATTCAAAAAATGTCCAAGATGCCTGTAATAGAATTTATCGCCAAGTCAAGAATGTCCTATCTAATACTAATTCTTTGAAAAAAATGGGCTGTTATTTAGAAGAATACGGATATAATATATCAAATGCTTCCCCTGATATGTGGGAGAGAGTCAAAGAAGTATGTTCTACAAATTATTGGGCTGCAATCTTAGATTATTCAACTCTAATGAAAAATATGTTAGCTGCATCTCAATATAATCGTCATAATACATTTAGGGTTGTCACATGCGCAAATAATAATCTTTATGGAATAGTTATGCCTTCTTCAGATATCAAGACAAAACGATCAACTCTTTGCTATTTTGTAATAGCTCTACATGATGGGAAAGAAGACGTTGTACATTCTGGTTCAATACATTCAACTTTCCAGTCAGGATCTAAATTTGTATCGATCTCAAAGGGGTTTAGACTAGATAAAGAGCGATGTCAAAGGATTGTATCATCACCAGGTTTGTTCTTAATGACATCTTGCTTATTCTTATCTGATAACAAATCATTAAATACAAGTGATGTCTTAAACTTTAGTTTTCACACATCTGTTTCAATAACAAAGGCGATGTTATCACTAACTGAGCCTTCTAGATATATGATTATGAACTCGCTTGCAATTTCAAGTCATGTGCGTGAGTATATGGCTGAAAAGTTTAGCCCATACACAAAGACTGCATTCTCTGTTGTTATGACACAGATCATTAAGCGTGCATGCTATGAAGCATTTGACCAAAAAGAGAAGATAGAATTAAAAAACATACATTTGACAGATTATGAAATAACACAAAAAGGTGTGAAGCCACAGAGAGATCTTAAGTCCATATGGTTCCCAGGGCGTGTGAATTTAAAAGAATACATCAATCAGGTATACATGCCATTTTATTTTAACTCTAAAGGCTTACATGAAAAACACCATGTTATGATTGACTTAGCTAAAACTATATTAGAAATTGAAAAAGATCAACGGTTGAATATACCTGGGATCTGGTCAGATATACCAAAGAAACAAACAGTTAACATTAGGGTTTTGATCTATTCGCTTGCTAAAACATTGAACATGGACACATCGAGACATAATTATATACGTTCTCGCATAGAAAACAGTAACAATTTGAAACGATCCATTACAACTATATCTACATTCACTAGTTCTAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTTAGCGAGTTTAAAAGTCGTAAAGAAAAAAAGATAATAGGTAATATAAAAAAAGAAATAAGCAAGTATACAGTTGCAAACCCAGAATTTGCAGAGGATTTAGATGTATCTTGTGCTATACATCATGCCGACTATACAGATGTGCGTAAGGCTATACCAAATTATGCAGATTGCATATCAACAAAAGTATTTGATGCATTATATGAAAAGATAAAAAATGGAGAAATTGATGACAAACCAACAGTATCACATATATTTGAAGTAATGAAAAAACATAAGCAATTTTACTTCAGTTTCTTTAACAAGGGTCAAAAGACAGCAAAAGACAGAGAGATTTTTGTTGGTGAATTTGAAGCAAAGATGTGCTTATATTTAATTGAAAGAATCTCCAAAGAGCGTTGCCGCCTTAATCCAGAAGAAATGATCAGTGAACCAGGGGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAGGATTTAGCAGAAGCAGAAATTCGATACACAGCCCAAACACTAAAAAACTTAAATCGTAAACTACAAAAAGATATGTTTGGATCAGAAATTGATGTTGACATGAAATTGCATGCATTAAAAATAGAAATAAATGCTGACATGTCAAAATGGAGCGCTCAGGATGTCTTATACAAGTACTTCTGGCTTTTTGCTTTGGATCCTGTTTTATACAAGTGTGAAAAAGAGAGAATCCTGTACTTCTTATGTAACTATATGCAAAAAAGACTCATCTTGCCAGATGATTTAATCGCAAATATTCTAGACCAAAGGGTTCAGCGCCAAGATGACATCATATATGAAATGAGTAATGGTCTTACTCAGAATTGGGTTGAAATCAAGCGGAACTGGCTCCAAGGAAATTTAAACTACACTAGTAGTTATCTACACACATGCTCAATGAACGTTTATAAAGACGTAATTAAAAGATCTATTGATTTGCTTGAGGGAGAGACACTTGTCAACTCAATGGTGCACTCAGATGACAACCATACATCATTAGTTATAGTGCAGAATAAACTAAATGATAATATTTTAATTGAGTTTTCTATAAAGTTATTTGAGAAAATATGCTTAACATTTGGCAACCAAGCAAATATGAAGAAAACTTATCTAACAAACTTTATTAAAGAATTTGTATCACTATTTAATATATATGGTGAACCCTTTTCAGTATATGGTCGCTTTCTGCTGACAGCTGTCGGTGACTGTGCTTATTTAGGGCCTTATGAAGATTGCGCTAGTAGATTGTCAGCAACGCAAACTGCAATAAAACATGGATGCCCACCATCACTTGCATGGATCAGTATAGCATTAAATCAATGGATCACACACAACACTTATAATATGCTTCCAGGCCAGAACAATGATCCATGTAATGTACTGCCCTGCTACAATAGGTTCGAAATTCCTATTGAATTGTGCGGGCTATTAAATTGCTCTTTACCAAGCATTGCAATAGCAGGTTTGGAAGCAGACAATCTTGAATTTTTAGTCAGGACATCACGAAAGCTATCTCCTATAATGTATCAACGGGAACCAATACAAGTGCAGTATGATCACATTTTAGATTGGGATTTGAACCAACTAACCGAGATAGAGGCAGTTAGATTCAAGATGCTAAGGTTTATGACCTTGGACTCTTCTATGTCATCAGATGACGGAATGGGTGAGACAAGCGATATGCGATCAAGGTCTTTACTTACTCCAAGAAAGTTTACAACACAAGCATCACTATCAAGATTAACATCTTACAACGATTACCAACAAATTATACAGGATCAGACTAAAATTGATGAATTGTTGGGCTATTTTATACAGTATCCTCAGCTGTTGGTCACAAAGGGAGAAAATGTAGAAGAATTTTGCCAGTCTATAAGATTCAGATATACTAGCAGAAAGTTTAAAGAATCACTATCAATACAGAATCCTGCACAGCTATTTATAGAGCAAATATTATTTGCAAACAAGCCGATGATTGATTACACTAGTATTCATGATAAATTATTTGGTATTCAAGATGATCCTAACATATCAGATGCTACATGCATTATTGGGAAGAAAACTTTCCCTGAAACCTATAACCAGATTAAATGCGATTTAGAAAGATTCACATTAACAAATGCTGACATCAAAACAGTTTATAGTTATTGCTTAATGAATGACCCCATACTGATAGCATGTGCGAATAATATAATATTATCCATGAAAGGCATGGTTATAGACAGGTCAGCTATGACATGTGCACAGATGCCTGAAATTAAAAGCCTTAAGGTAATTTATCATAGTCCGGCTTTAGTTTTAAGGGCATATGTAAATGGTGACATGGCCATACGAGGAGCAGAGCCTGATGAAATGAGGAGAGATATATACCATCTTGAAGATTTTATAGAAAAAACAAACATACGGAATAAGATGAGAGAAAGAATCAACAAGAATGAAATAAGGTCTAATGGGAGAGATATTAAGTTTGAAATCAAGGAGCTAACCAAGTATTATCAAATATGCTATGATTATATTAAATCTACTGAGCATAAGATAAAAATATTCATTTTGCCCAAAAGACCAGCCACCCCTTCTGACTTTTGCTCTATAGTAGCTGGTAATTTAATGTTAGACAACAAATGGGTTACAATACACCATCTAAAACAGATAACCTCACAAACAAAAAAGGCAGAAATAGCAACTTCAACTGATCTGGAGCTGCAGCTGTCATATGAATGCTTGCGTTTGGTAGCACATTTTGCTGACTCCTTTTTGGCGGATAATTCTAGAAAACAATTCCTAAAGAGAGTGATTGAAGAGTTCTCTTATAAAGGAGTTCCAGTTAAAGAATTATATGGTAAAATAAAACATTCAAGATTAAGATCAAAGATAGTTCCTATACTGTATTATATGAATGATTTAGATCAACTAGACTTGGATAGGTATGATGCCGAAAAAGCAGAAGAACAAATTACGTGGAATAACTGGCAGACATCAAGAGAATTCCAAACTGGACCAATAGATTTATCAATTAAAGGCTATGGACGTAGCATCCGGATCATTGGAAGCAATTCTAGATTGACTGCAGCAGAACTTCAAATAAGTAGAATACGTGATGACATAATTTCCAGACATAGCCAAGCATTGTTAAATAAGAATCATGGGTTGAAATTTGAACTTATGGAAGAGTACAAAGACCTTGATCCTAGGCTATTTTATATATGCTATCAACTTAGGGCTAAGAAGAGATACCACTATAATATACTGTCAGTCTCACATATATTAGATCACAACAGACGCATACAAGAGTCTAAAATACGATCTACCAATTATTGGATACCAGTCTGCCCAGTAGCAATTTCTAAGCTAACGTATAATGACAAACCTCAATTAGGATTGATCAAGAGGTTAAATATGGATAGTACAAAGCTGACCTCAATACAGGTAGCAGTCGAAGACTATGCAATGGTTAGAAAATGCAATTTTGCTAAGATGCAATTCTTTGATGGACCAGAGTTACCATGTGGTGGAATAGACATTTCAAAGATGATGAAATCCCAAAATATCCTGAATTTACAAGTAGATACTTTACAGAGTATATCGCTCATTGAACTATGCCGAATCTTTAATTGTAAAGGCACTAAGGATGATAATAATGCTTTTGAATTTTTGTCTGATGAAATTCTTGATGAAGAAGTAGATGAAGAGCTTGATTCCTCGCCAGCTTTAAAGATAACATACACAAAAAAGTCAATAAAAAACAATACATACAAAAATACAATAGTGAAAGCACTAATACGCGAATGTGACAAATTCGAGGACTGCTTTGATATAACTGATGAAGGCTTTACATCAGATAGCAATCTGGAAATTTTAGAATCTTTAGTCTGGATTTTGAAAGAATTACATACAAATCAGTGGTCAACAGAATTAATGCAATGCATTCATATGGCACTGTATAGAAATGAAATGGATCATCTATTTCACAGATTTTCCATCCCTGAGCAATTTGTAGATAATCCAATATCATTGAATTACAAATGGTCAAATGTGATAGAATTCTTGATGACACTAATGCAGATAGATTATAAACAAGAACCGTGGGTTTCAATTATGGCACATTCATTGAACAAGGCTGTTGAATATGCGACTGAAAGGAAGATACAGGAATCGACTAAAGAAAACAAATTACAGAAATTTATCAAAGGGAAGAAAATGGGTGGGAGGTCCAAGTTTGATTTCTAACGTAAAATTTAATACTTAGTCTAGGCAACATACTGTACTTCTAGAATTACACTTCTTAACATACAATTAATCATTTAAATATCTTTATTTAAATTGTGTCTCTAGGGGCACACA
| 70,501
|
MF361847.1
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Golender,N., Bumbarov,V., Panshin,A., Khinich,Y., Eldar,A.
|
Kimron Veterinary Institute, Virology
|
Israel
|
2018-05-31
|
ISR-242/16
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,903
|
GenBank
| null |
Israel
|
Israel
|
Bos taurus
|
brain
|
2016-11-16
| null | null |
Orthobunyavirus shuniense isolate ISR-242/16 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTACCCCTAGAGAAAACAATTCAAAATGGATCCTTACCGTATCGATATGTTCCGCAACAGGATCCTTGCATCAAATGATCCTGAAGATGCAAAGGATATTATGTCGGATCTGTTGATGGAACGCCATAACTACTTTGGCAGGGAAGTGTGTCAATACCTAGATATTGAGTTTAGAAATGACACACCTGCTCAAGATATACTTCTTGAATTCTTGCCTCCAGGGACTGTTTTCAATGTGAGAAACTGCAGCCCGGACAATTATGTTATCTTTAATGGAAAATTGTACATTATTGACTATAAAGTTTCAGTCGATGCTAGCTATGGGCTGTCGACAAAGACAAAATATGAGGAAATATTTGGTGATGCTTTGTCTCCCTTTGGTCTTGATTTTGAGGTTGTTATAATCAGAGCTGATCCTATCCGAGAAATGGTTCATGTTGACAGTCAGGATTTCATAAATGCATTTGGGAACATCTATATTGATCTAAATTTCACGTGGTTCTTCAATCTGCGTGCATTGCTGTATGACAAATTCAAAGATAATGACCGATTTTTAGAAATTGTCAATCAAGGCGAATTTACAATGACTTCACCATGGATAGAAGAAAATACACCAGAATTATACACTCACCCTATATTCAAAGAATTTTACAACTCACTTAATGATGAAGAAAAAAACACATTTAATACTAGCTTAGAATTTGATGCTACCAAATCTGAGAAATGGAATCAAAACTTGATTGCAGTCATCCAAAAATATGAACCATTCTACAAGAAATTTTGCAACATAGCGGCATCAGGAGTTTTTAAATGCACAGGTGATTATCCAGCGCCTAGTAAGGATCAAATATCAAAAGGGTGGGAAGATATGTATGAGAGAGTCAAACTTGAGAGAGATTTAACTGATGACTTATCTAAGCAGAAGCCAAGTTTCCACTTCATATGGTCACCTCCCGATGCTGAGCGGCCAAATGAAAATATTTCAAAGATATTGACATTATCAAAGGCGCTCCAAAAAATACAAGGTGACTCTACATTCATTAATGGGTTTAGATCATTAGGATTGCTGATGGATTTCTCATCTAATATTGGCTTGTATGAATCGCATGTTAGCAAGCTTAAAAATACAGCACGGCAAACTTCTAAAAAAATAGACCAAAAATTAGAGGAAGTAGAAATCGGGAGTGCAACTGTTCTGTGGGAGCAGCAGTTCAAATTTAATACAAAAATAATGAATGCTCAAGACAAGTCACATCTATTTAAAGATTTCCTTGGAATTGGTGGCCACAAGTCATTTGCAAAAAAATCAATTGATGACTTGGATCTAGAGAAGCCTAAAATACTGGATTTCAATTCAAAAAATGTCCAAGATGCCTGTAATAGAATTTATCGCCAAGTCAAGAATGTCCTATCTAATACTAATTCTTTGAAAAAAATGGGCTGTTATTTAGAAGAATACGGATATAATATATCAAATGCTTCCCCTGATATGTGGGAGAGAGTCAAAGAAGTATGTTCTACAAATTATTGGGCTGCAATCTTAGATTATTCAACTCTAATGAAAAATATGTTAGCTGCATCTCAATATAATCGTCATAATACATTTAGGGTTGTCACATGCGCAAATAATAATCTTTATGGAATAGTTATGCCTTCTTCAGATATCAAGACAAAACGATCAACTCTTTGCTATTTTGTAATAGCTCTACATGATGGGAAAGAAGACGTTGTACATTCTGGTTCAATACATTCAACTTTCCAGTCAGGATCTAGATTTGTATCGATCTCAAAGGGGTTTAGACTAGATAAAGAGCGATGTCAAAGGATTGTATCATCACCAGGTTTGTTCTTAATGACATCTTGCTTATTCTTATCTGATAACAAATCATTAAATACAAGTGATGTCTTAAACTTTAGTTTTCACACATCTGTTTCAATAACAAAGGCGATGTTATCACTAACTGAGCCTTCTAGATATATGATTATGAACTCGCTTGCAATTTCAAGTCATGTGCGTGAGTATATGGCTGAAAAGTTTAGCCCATACACAAAGACTGCATTCTCTGTTGTTATGACACAGATTATTAAGCGTGCATGCTATGAAGCATTTGACCAAAAAGAGAAGATAGAATTAAAAAACATACATTTGACAGATTATGAAATAACACAAAAAGGTGTGAAGCCACAGAGAGATCTTAAGTCCATATGGTTCCCAGGGCGTGTGAATTTAAAAGAATACATCAATCAGGTATACATGCCATTTTATTTTAACTCTAAAGGCTTACATGAAAAACACCATGTTATGATTGACTTAGCTAAAACTATATTAGAAATTGAAAAAGATCAACGGTTGAATATACCTGGGATCTGGTCAGATATACCAAAGAAACAAACAGTTAACATTAGGGTTTTGATCTATTCGCTTGCTAAAACATTGAACATGGATACATCGAGACATAATTATATACGTTCTCGTATAGAAAACAGTAACAATTTGAAACGATCCATTACAACTATATCTACATTCACTAGTTCTAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTTAGCGAGTTTAAAAGTCGTAAAGAAAAAAAGATAATAGGTAATATAAAAAAAGAAATAAGCAAGTATACAGTTGCAAACCCAGAATTTGCAGAGGATTTAGATGTATCTTGTGCTATACATCATGCCGACTATACAGATGTGCGTAAGGCTATACCAAATTATGCAGATTGCATATCAACAAAAGTATTTGATGCATTATATGAAAAGATAAAAAATGGAGAAATTGATGACAAACCAACAGTATCACATATATTTGAAATAATGAAAAAACATAAGCAATTTTACTTCAGTTTCTTTAACAAGGGTCAAAAGACAGCAAAAGACAGAGAGATTTTTGTTGGTGAATTTGAAGCAAAGATGTGCTTATATTTAGTTGAAAGAATCTCCAAAGAGCGTTGCCGCCTTAATCCAGAAGAAATGATCAGTGAACCAGGGGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAGGATTTAGCAGAAGCAGAAATTCGATACACAGCCCAAACACTAAAAAACTTAAATCGTAAACTACAAAAAGATATGTTTGGATCAGAAATTGATGTTGACATGAAATTGCATGCATTAAAAATAGAAATAAATGCTGACATGTCAAAATGGAGCGCTCAGGATGTCTTATACAAGTACTTCTGGCTTTTTGCTTTGGATCCTGTTTTATACAAGTGTGAAAAAGAGAGAATCCTGTACTTCTTATGTAACTATATGCAAAAAAGACTCATCTTGCCAGATGATTTAATCGCAAATATTCTAGACCAAAGGGTTCAGCGCCAAGATGACATCATATATGAAATGAGTAATGGTCTTACTCAGAATTGGGTTGAAATCAAGCGGAACTGGCTCCAAGGAAATTTAAACTACACTAGTAGTTATCTACACACATGCTCAATGAACGTTTATAAAGACGTAATCAAAAGATCTATTGATTTGCTTGAGGGAGAGACACTTGTCAACTCAATGGTGCACTCAGATGACAACCATACATCATTAGTTATAGTGCAGAATAAACTAAATGATAATATTTTAATTGAGTTTTCTATAAAGTTATTTGAGAAAATATGCTTAACATTTGGCAACCAAGCAAATATGAAGAAAACTTATCTAACAAACTTTATTAAAGAATTTGTGTCACTATTTAATATATATGGTGAACCCTTTTCAGTATATGGTCGCTTTCTGCTGACAGCTGTCGGTGACTGTGCTTATTTAGGGCCTTATGAAGATTGCGCTAGTAGATTGTCAGCAACGCAAACTGCAATAAAACATGGATGCCCACCATCACTTGCATGGATCAGTATAGCATTAAATCAATGGATCACACACAACACTTATAATATGCTTCCAGGCCAGAACAATGATCCATGTAATGTACTGCCCTGCTACAATAGGTTCGAAATTCCTATTGAATTGTGCGGGCTATTAAATTGCTCTTTACCAAGCATTGCAATAGCAGGTTTGGAAGCAGACAATCTTGAATTTTTAGTCAGGACATCACGAAAGCTATCTCCTATAATGTATCAACGGGAACCAATACAAGTGCAGTATGATCACATTTTAGATTGGGATTTGAACCAACTAACCGAGATAGAGGCAGTTAGATTCAAGATGCTAAGGTTTATGACCTTGGACTCTTCTATGTCATCAGATGACGGAATGGGTGAGACAAGCGATATGCGGTCAAGGTCTTTACTTACTCCAAGAAAGTTTACAACACAAGCATCACTATCAAGATTAACATCTTACAACGATTACCAACAAATTATACAGGATCAGACTAAAGTTGATGAATTGTTGGGCTATTTTATACAGTATCCCCAACTGTTGGTCACAAAGGGAGAAAATGTAGAAGAATTTTGCCAGTCTATAAGATTCAGATATACTAGCAGAAAGTTTAAAGAATCACTATCAATACAGAATCCTGCACAGCTATTTATAGAGCAAATATTATTTGCAAACAAGCCGATGATTGATTACACTAGTATTCATGATAAATTATTTGGTATTCAAGATGATCCTAACATATCAGATGCTACATGCATTATTGGGAAGAAAACTTTCCCTGAAACCTATAACCAGATTAAATGCGATTTAGAAAGATTCACATTAACAAATGCTGACATCAAAACAGTTTATAGTTATTGCTTAATGAATGACCCCATACTGATAGCATGTGCGAATAATATAATATTATCCATGAAAGGCATGGTTATAGACAGGTCAGCTATGACATGTGCACAGATGCCTGAGATTAAAAGCCTTAAGGTAATTTATCATAGTCCGGCTTTAGTTTTAAGGGCATATGTAAATGGTGACATGGCCATACGAGGAGCAGAGCCTGATGAAATGAGGAGAGATATATACCATCTTGAAGATTTTATAGAAAAAACAAACATACGGAATAAGATGAGAGAAAGAATCAACAAGAATGAAATAAGGTCTAATGGGAGAGATATTAAGTTTGAAATCAAGGAGCTAACCAAGTATTATCAAATATGCTATGATTATATTAAATCTACTGAGCATAAGATAAAAATATTCATTTTGCCCAAAAGACCAGCCACCCCTTCTGACTTTTGCTCTATAGTAGCTGGTAATTTAATGTTAGACAACAAATGGGTTACAATACACCATCTAAAACAGATAACCTCACAAACAAAAAAGGCAGAAATAGCAACTTCAACTGATTTGGAGCTGCAGCTGTCATATGAATGCTTGCGCTTGGTAGCACATTTTGCTGACTCCTTTTTGGCGGATAATTCTAGAAAACAATTCCTAAAGAGAGTGATTGAAGAGTTCTCTTATAAAGGAGTTCCAGTTAAAGAATTATATGGTAAAATAAAACATTCAAGATTAAGATCAAAGATAGTTCCTATACTGTATTATATGAATGATTTAGATCAACTAGACTTAGATAGGTATGATGCCGAAAAAGCAGAAGAACAAATTACGTGGAATAACTGGCAGACATCAAGGGAATTCCAAACTGGACCAATAGATTTATCAATTAAAGGCTATGGACGTAGCATCCGGATCATTGGAAGCAATTCTAGATTGACTGCAGCAGAACTTCAAATAAGTAGAATACGTGATGATATAATTTCCAGACATAGCCAAGCATTGTTAAATAAGAATCATGGGTTGAAATTTGAACTTATGGAAGAGTACAAAGACCTTGATCCTAGGCTATTTTATATATGCTATCAACTTAGGGCTAAGAAGAGATACCACTATAACATACTGTCAGTCTCACATATATTAGATCACAACAGACGCATACAAGAGTCTAAAATACGATCTACCAATTATTGGATACCAGTCTGCCCAGTAGCAATTTCTAAGCTAACGTATAATGACAAACCTCAATTAGGATTGATCAAGAGGTTAAATATGGATAGTACAAAGCTGACCTCAATACAGGTAGCAGTCGAAGATTATGCAATGGTTAGAAAATGCAATTTTGCTAAGATGCAATTCTTTGATGGACCAGAGTTACCATGTGGTGGAATAGACATTTCAAAGATGATGAAATCCCAAAATATCCTGAATTTACAAGTAGATACTTTACAGAGTATATCGCTCATTGAACTATGCCGGATCTTTAATTGTAAAGGCACTAAGGATGATAATAATGCTTTTGAATTTTTGTCTGATGAAATTCTTGATGAAGAAGTAGATGAAGAGCTTGATTCCTCGCCAGCTTTAAAGATAACATACACAAAAAAGTCAATAAAAAACAACACATATAAAAATACAATAGTGAAAGCACTAATACGCGAATGTGACAAATTCGAGGACTGCTTTGATATAACTGATGAAGGCTTCACATCAGATAGCAATCTGGAAATTTTAGAATCTTTGGTCTGGATTTTGAAAGAATTACATACAAATCAGTGGTCAACAGAATTAATGCAATGCATTCATATGGCATTGTATAGAAATGAAATGGATCATCTATTTCACAGATTTTCCATCCCTGAGCAATTTGTAGATAATCCAATATCATTGAATTACAAATGGTCAAATGTGATAGAATTCTTGATGACACTAATGCAGATAGATTATAAACAAGAACCGTGGGTTTCAATTATGGCACATTCATTGAACAAGGCTGTTGAATATGCGACTGAAAGGAAGATACAGGAATCGGCTAAAGAAAACAAATTACAGAAATTTATCAAAGGGAAGAAAATGGGTGGGAGGTCCAAGTTTGATTTCTAACGTAAAATTTAATACTTAATCTAGGCAACATACTGTACTTCTAGAATTACACTTCTTAACATACAATTAATCATTTAAATATCTTTATATAAATTGTGTCTCTAGGGGCAA
| 70,502
|
MF361850.1
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Golender,N., Bumbarov,V., Panshin,A., Khinich,Y., Eldar,A.
|
Kimron Veterinary Institute, Virology
|
Israel
|
2018-05-31
|
ISR-2067/16
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,907
|
GenBank
| null |
Israel
|
Israel
|
Bos taurus
|
brain
|
2016-09-14
| null | null |
Orthobunyavirus shuniense isolate ISR-2067/16 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTGTACCCCTAGAGAAAACAATTCAAAATGGATCCTTACCGTATCGATATGTTCCGCAACAGGATCCTTGCATCAAATGATCCTGAAGATGCAAAGGATATTATGTCGGATCTGTTGATGGAACGCCATAACTACTTTGGCAGGGAAGTGTGTCAATACCTAGATATTGAGTTTAGAAATGACACACCTGCTCAAGATATACTTCTTGAATTCTTGCCTCCAGGGACTGTTTTCAATGTGAGAAACTGCAGCCCGGACAATTATGTTATCTTTAATGGAAAATTGTACATTATCGACTATAAAGTTTCAGTCGATGCTAGCTATGGGCTGTCGACAAAGACAAAATATGAGGAAATATTTGGTGATGCTTTGTCTCCCTTTGGTCTTGATTTTGAGGTTGTTATAATCAGAGCTGATCCTATCCGAGAAATGGTTCATGTTGACAGTCAGGATTTCATAAATGTATTTGGGAACATCTACATTGATCTAGATTTCACGTGGTTCTTCAATCTGCGTGCATTGCTGTATGACAAATTCAAAGATAATGACCGATTTTTAGAAATTGTCAATCAAGGCGAATTTACAATGACTTCACCATGGATAGAAGAAAATACACCAGAATTATACACTCACCCTATATTCAAAGAATTTTACAACTCACTTAATGATGAAGAAAAAAACACATTTAATACTAGCTTAGAATTTGATGCTACTAAATCTGAGAAATGGAATCAAAACTTGATTGCAGTCATCCAAAAATATGAACCATTCTACAAGAAATTTTGCAACATTGCGGCATCAGGAGTTTTTAAATGCACAGGTGATTATCCAGCGCCTAGTAAGGATCAAATATCAAAAGGGTGGGAAGATATGTATGAGAGAGTCAAACTTGAGAGAGATTTAACTGATGACTTATATAAGCAGAAGCCAAGTTTCCACTTCATATGGTCACCTCCCGATGTTGAGCGGCCAAATGAAAATATTTCAAAGATATTGACATTATCAAAGGCGCTCCAAAAAATACAAGGTGACTCTACATTCATTAATGGGTTTAGATCATTAGGATTGATGATGGATTTCTCATGTAATATTGGCTTGTATGAATCGCATGTTAGCAAGCTTAAAAATACAGCACGGCAAACTTCTAAAAAAATAGACCAAAAATTAGAGGAAGTAGAAATCGGGAGTGCAACTGTTCTGTGGGAGCAGCAGTTCAAATTTAATACAAAAATAATGAATGCTCAAGACAAGTCACATCTATTTAAAGATTTCCTTGGAATTGGTGGCCACAAGTCGTTTGCAAAAAAATCAATTGATGACTTGGATCTAGAGAAGCCTAAAATACTGGATTTCAATTCAAAAAATGTCCAAGATGCCTGTAATAGAATTTATCGCCAAGTCAAGAATGTCCTATCTAATACTAATTCTTTGAAAAAAATGGGCTGTTATTTAGAAGAATACGGATATAATATATCAAATGCTTCCCCTGATATGTGGGAGAGAGTCAAAGAAGTATGTTCTACAAATTATTGGGCTGCAATCTTGGATTATTCAACTCTAATGAAAAATATGTTAGCTGCATCTCAATATAATCGTCATAATACATTTAGGGTTGTCACATGCGCAAATAATAATCTTTATGGAATAGTCATGCCTTCTTCAGATATCAAGACAAAACGATCAACTCTTTGCTATTTTGTAATAGCTCTACATGATGGGAAAGAAGACGTTGTACATTCTGGTTCAATACATTCAACTTTCCAGTCAGGATCTAAATTTGTATCGATCTCAAAGGGGTTTAGACTAGATAAAGAGCGATGTCAAAGGATTGTATCATCACCAGGTTTGTTCTTAATGACATCTTGCTTATTCTTATCTGATAACAAATCATTAAATACAAGTGATGTCTTAAACTTTAGTTTTCACACATCTGTTTCAATAACAAAGGCGATGTTATCACTAACTGAGCCTTCTAGATATATGATTATGAACTCGCTTGCAATTTCAAGTCATGTGCGTGAGTATATGGCTGAAAAGTTTAGTCCATACACAAAGACTGCATTCTCTGTTGTTATGACACAGATCATTAAGCGTGCATGCTATGAAGCATTTGACCAAAAGGAGAAGATAGAATTAAAAAACATACATTTGACAGATTATGAAATAACACAAAAAGGTGTGAAGCCACAGAGAGATCTTAAGTCCATATGGTTCCCAGGGCGTGTGAATTTAAAAGAATACATCAATCAGGTATACATGCCATTTTATTTTAACTCTAAAGGCTTACATGAAAAACACCATGTTATGATTGACTTAGCTAAAACTATATTAGAAATTGAAAAAGATCAACGGTTGAATATACCTGGGATCTGGTCAGATATACCAAAGAAACAAACAGTTAACATTAGGGTTTTGATCTATTCGCTTGCTAAAACATTGAACATGGACACATCGAGACATAATTATATACGTTCTCGTATAGAAAACAGTAACAATTTGAAACGATCCATTACAACTATATCTACATTCACTAGTTCTAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTTAGTGAGTTTAAAAGTCGTAAAGAAAAAAAGATAATAGGTAATATAAAAAAAGAAATAAGCAAGTATACAGTTGCAAACCCAGAATTTGCAGAGGATTTAGATGTATCTTGTGCTATACATCATGCCGACTATACAGATGTGCGTAAGGCTATACCAAATTATGCAGATTGCGTATCAACAAAAGTATTTGATGCATTATATGAAAAGATAAAAAATGGAGAAATTGATGACAAACCAACAGTATCACATATATTTGAAGTAATGAAAAAACATAAGCAATTTTACTTCAGTTTCTTTAACAAGGGTCAAAAGACAGCAAAAGACAGAGAGATTTTTGTTGGTGAATTTGAAGCAAAGATGTGCTTATATTTAGTTGAAAGAATCTCCAAAGAGCGTTGCCGCCTTAATCCAGAAGAAATGATCAGTGAACCAGGGGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAGGATTTAGCAGAAGCAGAAATTCGATACACAGCCCAAACACTAAAAAACTTAAATCGTAAACTACAAAAAGATATGTTTGGATCAGAAATTGATGTTGACATGAAATTGCATGCATTAAAAATAGAAATAAATGCTGACATGTCAAAATGGAGCGCTCAGGATGTCTTATACAAGTACTTCTGGCTTTTTGCTTTGGACCCTGTTTTATACAAGTGTGAAAAAGAGAGAATCCTGTACTTCTTATGTAACTATATGCAAAAAAGACTCATCTTGCCAGATGATTTAATCGCAAATATTCTAGACCAAAGGGTTCAGCGCCAAGATGACATCATATATGAAATGAGTAATGGTCTTACTCAGAATTGGGTTGAAATCAAGCGGAACTGGCTCCAAGGAAATTTAAACTACACTAGTAGTTATCTACACACATGCTCAATGAACGTTTATAAAGACGTAATTAAAAGATCTATTGATTTGCTTGAGGGAGAGACACTTGTCAACTCAATGGTGCACTCAGATGACAACCATACATCATTAGTCATAGTGCAGAATAAACTAAATGATAATATTTTAATTGAGTTTTCTATAAAGTTATTTGAGAAAATATGCTTAACATTTGGCAACCAAGCAAATATGAAGAAAACTTATCTAACAAACTTTATTAAAGAATTTGTATCACTATTTAATATATATGGTGAACCCTTTTCAGTATATGGTCGCTTTCTGCTGACAGCTGTCGGTGACTGTTCTTATTTAGGGCCTTATGAAGATTGCGCTAGTAGATTGTCAGCAACGCAAACTGCAATAAAACATGGATGCCCACCATCACTTGCATGGATCAGTATAGCATTAAATCAATGGATCACACACAACACTTACAATATGCTTCCAGGCCAGAACAATGATCCATGTAATGTACTGCCCTGCTACAATAGATTCGAAATTCCTATTGAATTGTGCGGGCTATTAAATTGCTCTTTACCAAGCATTGCAATAGCAGGTTTGGAAGCAGACAATCTTGAATTTTTAGTCAGGACATCACGAAAGCTATCTCCTATAATGTATCAACGGGAACCAATACAAGTGCAGTATGATCACATTTTAGATTGGGATTTGAACCAACTAACCGAGATAGAGGCAGTTAGATTCAAGATGCTAAGGTTTATGACCTTGGACTCTTCTATGTCATCAGATGACGGAATGGGTGAGACAAGCGATATGCGATCAAGGTCTTTACTTACTCCAAGAAAGTTTACAACACAAGCATCACTATCAAGATTAACATCTTATAACGATTACCAACAAATTATACAGGATCAGACTAAAATTGATGAATTGTTGGGCTATTTTATACAGTATCCTCAGCTGTTGGTCACAAAGGGAGAAAATGTAGAAGAATTTTGCCAGTCTATAAGATTCAGATATACTAGCAGAAAGTTTAAAGAATCACTATCAATACAGAATCCTGCACAGCTATTTATAGAGCAAATATTATTTGCAAACAAGCCGATGATTGATTACACTAGTATTCATGATAAATTATTTGGTATTCAAGATGATCCTAACATATCAGATGCTACATGCATTATTGGGAAAAAAACTTTCCCTGAAACCTATAACCAGATTAAATGCGATTTAGAAAGATTCACATTAACAAATGCTGACATCAAAACAGTTTATAGTTATTGCTTAATGAATGACCCCATACTGATAGCATGTGCGAATAATATAATATTATCCATGAAAGGCATGGTTATAGACAGGTCAGCTATGACATGTGCACAGATGCCTGAGATTAAAAGCCTTAAGGTAATTTATCATAGTCCGGCTTTAGTTTTAAGGGCATATGTAAATGGTGACATGGCCATACGAGGAGCAGAGCCTGATGAAATGAGGAGAGATATATACCATCTTGAAGATTTTATAGAAAAAACAAACATACGGAATAAGATGAGAGAAAGAATCAACAAGAATGAAATAAGGTCTAATGGGAGAGATATTAAGTTTGAAATCAAGGAGCTAACCAAGTATTATCAAATATGCTATGATTATATTAAATCTACTGAGCATAAGATAAAAATATTCATTTTGCCCAAAAGACCAGCCACCCCTTCTGACTTTTGCTCTATAGTAGCTGGTAATTTAATGTTAGACAACAAATGGGTTACAATACACCATCTAAAACAGATAACCTCACAAACAAAAAAGGCAGAAATAGCAACTTCAACTGATTTGGAGCTGCAGCTGTCATATGAATGCTTGCGCTTGGTAGCACATTTTGCTGACTCCTTTTTGGCGGATAATTCTAGAAAACAATTCCTAAAGAGAGTGATTGAAGAGTTCTCTTATAAAGGAGTTCCAGTTAAAGAATTATATGGTAAAATAAAACATTCAAGATTAAGATCAAAGATAGTTCCTATACTGTATTATATGAATGATTTAGATCAACTAGACTTAGATAGGTATGATGCCGAAAAAGCAGAAGAACAAATTACGTGGAATAACTGGCAGACATCAAGGGAATTCCAAACTGGACCAATAGATTTATCAATTAAAGGCTATGGACGTAGCATCCGGATCATTGGAAGCAATTCTAGATTGACTGCAGCAGAACTTCAAATAAGTAGAATACGTGATGACATAATTTCCAGACATAGCCAAGCATTGTTAAATAAGAATCATGGGTTGAAATTTGAACTTATGGAAGAGTACAAAGACCTTGATCCTAGGCTATTTTATATATGCTATCAACTTAGGGCTAAGAAGAGATACCACTATAATATACTGTCAGTCTCACATATATTAGATCACAACAGACGCATACAAGAGTCTAAAATACGATCTACCAATTATTGGATACCAGTCTGCCCAGTAGCAATTTCTAAACTAACGTATAATGACAAACCTCAATTAGGATTGATCAAGAGGTTAAATATGGATAGTACAAAGCTGACCTCAATACAGGTAGCAGTCGAAGACTATGCAATGGTTAGAAAATGCAATTTTGCTAAGATGCAATTCTTTGATGGACCAGAGTTACCATGTGGTGGAATAGACATCTCAAAGATGATGAAATCCCAAAATATCCTGAATTTACAAGTAGATACTTTACAGAGTATATCGCTCATTGAACTATGCCGGATCTTTAATTGTAAAGGCACTAAGGATGATAATAATGCTTTTGAATTTTTGTCTGATGAAATTCTTGATGAAGAAGTAGATGAAGAGCTTGATTCCTCGCCAGCTTTAAAGATAACATACACAAAAAAGTCAATAAAAAACAACACATATAAAAATACAATAGTGAAAGCACTAATACGCGAATGTGACAAATTCGAGGACTGCTTTGATATAACTGATGAAGGCTTTACATCAGATAGCAATCTGGAAATTTTAGAATCTTTAGTCTGGATTTTGAAAGAATTACATACAAATCAGTGGTCAACAGAATTAATGCAATGCATTCATATGGCACTGTATAGAAATGAAATGGATCATCTATTTCACAGATTTGCCATCCCTGAGCAATTTGTAGATAATCCAATATCATTGAATTACAAATGGTCAAATGTGATAGAATTCTTGATGACACTAATGCAGATAGATTATAAACAAGAACCGTGGGTTTCAATTATGGCACATTCATTGAACAAGGCTGTTGAATATGCGACTGAAAGGAAGATACAGGAATCGACTAAAGAAAACAAATTACAGAAATTTATCAAAGGGAAGAAAATGGGTGGGAGGTCCAAGTTTGATTTCTAACGTAAAATTTAATACTTAGTCTAGGCAACATACTGTACTTCTAGAATTACACTTCTTAACATACAATTAATCATTTAAATATCTTTATATAAATTGTGTCTCTAGGGGCACAC
| 70,503
|
MF361853.1
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Golender,N., Bumbarov,V., Panshin,A., Khinich,Y., Eldar,A.
|
Kimron Veterinary Institute, Virology
|
Israel
|
2018-05-31
|
ISR-2162/16
|
Orthobunyavirus shuniense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,905
|
GenBank
| null |
Israel
|
Israel
|
Bos taurus
|
brain
|
2016-10-02
| null | null |
Orthobunyavirus shuniense isolate ISR-2162/16 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTGTACCCCTAGAGAAAACAATTCAAAATGGATCCTTACCGTATCGATATGTTCCGCAACAGGATCCTTGCATCAAATGATCCTGAAGATGCAAAGGATATTATGTCGGATCTGTTGATGGAACGCCATAACTACTTTGGCAGGGAAGTGTGTCAATACCTAGATATTGAGTTTAGAAATGACACACCTGCTCAAGATATACTTCTTGAATTCTTGCCTCCAGGGACTGTTTTCAATGTGAGAAACTGCAGCCCGGACAATTATGTTATCTTTAATGGAAAATTGTACATTATTGACTATAAAGTTTCAGTCGATGCTAGCTATGGGCTGTCGACAAAGACAAAATATGAGGAAATATTTGGTGATGCTTTGTCTCCCTTTGGTCTTGATTTTGAGGTTGTTATAATCAGAGCTGATCCTATCCGAGAAATGGTTCATGTTGACAGTCAGGATTTCATAAATGCATTTGGGAACATCTACATTGATCTAGATTTCACGTGGTTCTTCAATCTGCGTGCATTGCTGTATGACAAATTCAAAGATAATGACCGATTTTTAGAAATTGTCAATCAAGGCGAATTTACAATGACTTCACCATGGATAGAAGAAAATACACCAGAATTATACACTCACCCTATATTCAAAGAATTTTACAACTCACTTAATGATGAAGAAAAAAACACATTTAATACTAGCTTAGAATTTGATGCTACCAAATCTGAGAAATGGAATCAAAACTTGATTGCAGTCATCCAAAAATATGAACCATTCTACAAGAAATTTTGCAACATTGCGGCATCAGGAGTTTTTAAATGCACAGGTGATTATCCAGCGCCTAGTAAGGATCAAATATCAAAAGGGTGGGAAGATATGTATGAGAGAGTCAAACTTGAGAGAGATTTAACTGATGACTTATCTAAGCAGAAGCCAAGTTTCCACTTCATATGGTCACCTCCCGATGCTGAGCGGCCAAATGAAAATATTTCAAAGATATTGACATTATCAAAGGCGCTCCAAAAAATACAAGGTGACTCTACATTCATTAATGGGTTTAGATCATTAGGATTGCTGATGGATTTCTCATCTAATATTGGCTTGTATGAATCGCATGTTAGCAAGCTTAAAAATACAGCACGGCAAACTTCTAAAAAAATAGACCAAAAATTAGAGGAAGTAGAAATCGGGAGTGCAACTGTTCTGTGGGAGCAGCAGTTCAAATTTAATACAAAAATAATGAATGCTCAAGACAAGTCACATCTATTTAAAGATTTCCTTGGAATTGGTGGCCACAAGTCGTTTGCAAAAAAATCAATTGATGACTTGGATCTAGAGAAGCCTAAAATACTGGATTTCAATTCAAAAAATGTCCAAGATGCCTGTAATAGAATTTATCGCCAAGTCAAGAATGTCCTATCTAATACTAATTCTTTGAAAAAAATGGGCTGTTATTTGGAAGAATACGGATATAATATATCAAATGCTTCCCCTGATATGTGGGAGAGAGTCAAAGAAGTATGTTCTACAAATTATTGGGCTGCAATCTTAGATTATTCAACTCTAATGAAAAATATGTTAGCTGCATCTCAATATAATCGTCATAATACGTTTAGGGTTGTCACATGCGCAAATAATAATCTTTATGGAATAGTTATGCCTTCTTCAGATATCAAGACAAAACGATCAACTCTTTGCTATTTTGTAATAGCTCTACATGATGGGAAAGAAGACGTTGTACATTCTGGTTCAATACATTCAACTTTCCAGTCAGGATCTAAATTTGTATCGATCTCAAAGGGGTTTAGACTAGATAAAGAGCGATGTCAAAGGATTGTATCATCACCAGGTTTGTTCTTAATGACATCTTGCTTATTCTTATCTGATAACAAATCATTAAATACAAGTGATGTCTTAAACTTTAGTTTTCACACATCTGTTTCAATAACAAAGGCGATGTTATCACTAACTGAGCCTTCTAGATATATGATTATGAACTCGCTTGCAATTTCAAGTCATGTGCGTGAGTATATGGCTGAAAAGTTTAGCCCATACACAAAGACTGCATTCTCTGTTGTTATGACACAGATTATTAAGCGTGCATGCTATGAAGCATTTGACCAAAAAGAAAAGATAGAATTAAAAAACATACATTTGACAGATTATGAAATAACACAAAAAGGTGTGAAGCCACAGAGAGATCTTAAGTCCATATGGTTCCCAGGGCGTGTGAATTTAAAAGAATACATCAATCAGGTATACATGCCATTTTATTTTAACTCTAAAGGCTTACATGAAAAACACCATGTTATGATTGACTTAGCTAAAACTATATTAGAAATTGAAAAAGATCAACGGTTGAATATACCTGGGATCTGGTCAGATATACCAAAGAAACAAACAGTTAACATTAGGGTTTTGATCTATTCGCTTGCTAAAACATTGAACATGGATACATCAAGACATAATTATATACGTTCTCGTATAGAAAACAGTAACAATTTGAAACGATCCATTACAACTATATCTACATTCACTAGTTCTAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTTAGCGAGTTTAAAAGTCGTAAAGAAAAAAAGATAATAGGTAATATAAAAAAAGAAATAAGCAAGTATACAGTTGCAAACCCAGAATTTGCAGAGGATTTAGATGTATCTTGTGCTATACATCATGCCGACTATACAGATGTGCGTAAGGCTATACCAAATTATGCAGATTGCATATCAACAAAAGTATTTGATGCATTATATGAAAAGATAAAAAATGGAGAAATTGATGACAAACCAACAGTATCACATATATTTGAAATAATGAAAAAACATAAGCAATTTTACTTCAGTTTCTTTAACAAGGGTCAAAAGACAGCAAAAGACAGAGAGATTTTTGTTGGTGAATTTGAAGCAAAGATGTGCTTATATTTAGTTGAAAGAATCTCCAAAGAGCGTTGCCGCCTTAATCCAGAAGAAATGATCAGTGAACCAGGGGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAGGATTTAGCAGAAGCAGAAATTCGATACACAGCCCAAACACTAAAAAACTTAAATCGTAAACTACAAAAAGATATGTTTGGATCAGAAATTGATGTTGACATGAAATTGCATGCATTAAAAATAGAAATAAATGCTGACATGTCAAAATGGAGCGCTCAGGATGTCTTATACAAGTACTTCTGGCTTTTTGCTTTGGATCCTGTTTTATACAAGTGTGAAAAAGAGAGAATCCTGTACTTCTTATGTAACTATATGCAAAAAAGACTCATCTTGCCAGATGATTTAATCGCAAATATTCTAGACCAAAGGGTTCAGCGCCAAGATGACATCATATATGAAATGAGTAATGGTCTTACTCAGAATTGGGTTGAAATCAAGCGGAACTGGCTCCAAGGAAATTTAAACTACACTAGTAGTTATCTACACACATGCTCAATGAACGTTTATAAAGACGTAATCAAAAGATCTATTGATTTGCTTGAGGGAGAGACACTTGTCAACTCAATGGTGCACTCAGATGACAACCATACATCATTAGTTATAGTGCAGAATAAACTAAATGATAATATTTTAATTGAGTTTTCTATAAAGTTATTTGAGAAAATATGCTTAACATTTGGCAACCAAGCAAATATGAAGAAAACTTATCTAACAAACTTTATTAAAGAATTTGTATCACTATTTAATATATATGGTGAACCCTTTTCAGTATATGGTCGCTTTCTGCTGACAGCTGTCGGTGACTGTGCTTATTTAGGGCCTTATGAAGATTGCGCTAGTAGATTGTCAGCAACGCAAACTGCAATAAAACATGGATGCCCACCATCACTTGCATGGATCAGTATAGCATTAAATCAATGGATCACACACAACACTTATAATATGCTTCCAGGCCAGAACAATGATCCATGTAATGTACTGCCCTGCTACAATAGGTTCGAAATTCCTATTGAATTGTGCGGGCTATTAAATTGCTCTTTACCAAGCATTGCAATAGCAGGTTTGGAAGCAGACAATCTTGAATTTTTAGTCAGGACATCACGAAAGCTATCTCCTATAATGTATCAACGGGAACCAATACAAGTGCAGTATGATCACATTTTAGATTGGGATTTGAACCAACTAACCGAGATAGAGGCAGTTAGATTCAAGATGCTAAGGTTTATGACCTTGGACTCTTCTATGTCATCAGATGACGGAATGGGTGAGACAAGCGATATGCGGTCAAGGTCTTTACTTACTCCAAGAAAGTTTACAACACAAGCATCACTATCAAGATTAACATCTTACAACGATTACCAACAAATTATACAGGATCAGACTAAAATTGATGAATTGTTGGGCTATTTTATACAGTATCCCCAACTGTTGGTCACAAAGGGAGAAAATGTAGAAGAATTTTGCCAGTCTATAAGATTCAGATATACTAGCAGAAAGTTTAAAGAATCACTATCAATACAGAATCCTGCACAGCTATTTATAGAGCAAATATTATTTGCAAACAAGCCGATGATTGATTACACTAGTATTCATGATAAATTATTTGGTATTCAAGATGATCCTAACATATCAGATGCTACATGCATTATTGGGAAGAAAACTTTCCCTGAAACCTATAACCAGATTAAATGCGATTTAGAAAGATTCACATTAACAAATGCTGACATCAAAACAGTTTATAGTTATTGCTTAATGAATGACCCCATACTGATAGCATGTGCGAATAATATAATATTATCCATGAAAGGCATGGTTATAGACAGGTCAGCTATGACATGTGCACAGATGCCTGAGATTAAAAGCCTTAAGGTAATTTATCATAGTCCGGCTTTAGTTTTAAGGGCATATGTAAATGGTGACATGGCCATACGAGGAGCAGAGCCTGATGAAATGAGGAGAGATATATACCATCTTGAAGATTTTATAGAAAAAACAAACATACGGAATAAGATGAGAGAAAGAATCAACAAGAATGAAATAAGGTCTAATGGGAGAGATATTAAGTTTGAAATCAAGGAGCTAACCAAGTATTATCAAATATGCTATGATTATATTAAATCTACTGAGCATAAGATAAAAATATTCATTTTGCCCAAAAGACCAGCCACCCCTTCTGACTTTTGCTCTATAGTAGCTGGTAATTTAATGTTAGACAACAAATGGGTTACAATACACCATCTAAAACAAATAACCTCACAAACAAAAAAGGCAGAAATAGCAACTTCAACTGATTTGGAGCTGCAGCTGTCATATGAATGCTTGCGCTTGGTAGCACATTTTGCTGACTCCTTTTTGGCGGATAATTCTAGAAAACAATTCCTAAAGAGAGTGATTGAAGAGTTCTCTTATAAAGGAGTTCCAGTTAAAGAATTATATGGTAAAATAAAACATTCAAGATTAAGATCAAAGATAGTTCCTATACTGTATTATATGAATGATTTAGATCAACTAGACTTAGATAGGTATGATGCCGAAAAAGCAGAAGAACAAATTACGTGGAATAACTGGCAGACATCAAGGGAATTCCAAACTGGACCAATAGATTTATCAATTAAAGGCTATGGACGTAGCATCCGGATCATTGGAAGCAATTCTAGATTGACTGCAGCAGAACTTCAAATAAGTAGAATACGTGATGATATAATTTCCAGACATAGCCAAGCATTGTTAAATAAGAATCATGGGTTGAAATTTGAACTTATGGAAGAGTACAAAGACCTTGATCCTAGGCTATTTTATATATGCTATCAACTTAGGGCTAAGAAGAGATACCACTATAACATACTGTCAGTCTCACATATATTAGATCACAACAGACGCATACAAGAGTCTAAAATACGATCTACCAATTATTGGATACCAGTCTGCCCAGTAGCAATTTCTAAGCTAACGTATAATGACAAACCTCAATTAGGATTGATCAAGAGGTTAAATATGGATAGTACAAAGCTGACCTCAATACAGGTAGCAGTCGAAGATTATGCAATGGTTAGAAAATGCAATTTTGCTAAGATGCAATTCTTTGATGGACCAGAGTTACCATGTGGTGGAATAGACATTTCAAAGATGATGAAATCCCAAAATATCCTGAATTTACAAGTAGATACTTTACAGAGTATATCGCTCATTGAACTATGCCGGATCTTTAATTGTAAAGGCACTAAGGATGATAATAATGCTTTTGAATTTTTGTCTGATGAAATTCTTGATGAAGAAGTAGATGAAGAGCTTGATTCCTCGCCAGCTTTAAAGATAACATACACAAAAAAGTCAATAAAAAACAACACATATAAAAATACAATAGTGAAAGCACTAATACGCGAATGTGACAAATTCGAGGACTGCTTTGATATAACTGATGAAGGCTTTACATCAGATAGCAATCTGGAAATTTTAGAATCTTTGGTCTGGATTTTGAAAGAATTACATACAAATCAATGGTCAACAGAATTAATGCAATGCATTCATATGGCATTGTATAGAAATGAAATGGATCATCTATTTCACAGATTTTCCATCCCTGAGCAATTTGTAGATAATCCAATATCATTGAATTACAAATGGTCAAATGTGATAGAATTCTTGATGACACTAATGCAGATAGATTATAAACAAGAACCGTGGGTTTCAATTATGGCACATTCATTGAACAAGGCTGTTGAATATGCGACTGAAAGGAAGATACAGGAATCGACTAAAGAAAACAAATTACAGAAATTTATCAAAGGGAAGAAAATGGGTGGGAGGTCCAAGTTTGATTTCTAACGTAAAATTTAATACTTAATCTAGGCAACATACTGTACTTCTAGAATTACACTTCTTAACATACAATTAATCATTTAAATATCTTTATATAAATTGTGTCTCTAGGGGCAA
| 70,504
|
NC_003468.2
|
Orthohantavirus andesense
|
Meissner,J.D., Rowe,J.E., Borucki,M.K., St Jeor,S.C., St. Jeor,S.C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2000-10-10
| null |
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,562
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Andes virus segment L, complete genome
|
TAGTAGTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTATAGAGAGATTCATCAGAGAGTTAGGGACCTTGCACCTGGAACGGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTACGCTGTCAGACATGACCTGGTTGACCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGATAATAAAGATGTAGAAAGACCTATAGGTCAAGTTTTACTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTATTGAAAAGCTTTTTCCGAATGACACCAGATAATTATAAAATTACAGGTAACTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTGTCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGAGGCCTCCAATTTGTTGAGCACTTACTGGAAACTGAATCAAGGAAGGGTAATATACCGCAACCTTATAAAATAACATTCTCAGTGGTTGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCGACTCAGTGGCCCAGTCGGAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATAAATTATGTCAGAGAGCATTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCTTTGGAGGCAATGTTTAACTTAAAGTTCCATGTATCAGGCCCTAAACTGAGATACTTTAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGACAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAAGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAACAGTTACATTTACAGAAATACAACGAATCACGAAAACCAAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTACCATCAACAATCAGTTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCAAAAAACCAACCAGAAACACCAGTACAGATGCTTGCATTGGATATATCTTATAAGTATCTGAGTCTTACAAGGGATGAGTTGATCAATTATTATAGCCCTAGAGTGCACTTTCAATCGAGCCCTAATGTGAAGGAACCAGGGACACTGAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTCTCTAAATCAATTCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAAGGATTATTTGGTGAGATCATAGATAGCATAAATGTGGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCAAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCTCCTAATAAGACAACAGGTGTAGATGACCTGTTAAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGTAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATCTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCTGGGCTGCGCCGTTCTAAATATTGGTCAGTACATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATCTTGCCATCAAAGTCACTAGAGGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTTAAAGATGGTATAGGGTTGATAGACGCAGATAATATTGATTCTAAGGCCGAAATTGATGGTGTCACCTGGTGTTATTCTAAGGTCATGAGTATTGATTTAAACAGGTTATTGGCTTTGAACATAGCTTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACGGCTACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTCCACTTTTTACTCTGTGTGTCACAAAAGATGAAGCTATGTGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTACTCTGGGTACGAGTTGTTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGACCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATCATAAAATCTCTATTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGTTTGTTAGGATTGACAGTTGATCACTCCACGGTCGGAGCAAGTGGTGTTTACCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTTTACAAACATTACAGAAGTTTAATCTCTGAAGCTACAACTTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATTTACCAGAAGAGGCTAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGGAAGTTCCAGGAGAAAGAAAAACAATATGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTGATGTAGAACAACAGCTTTTTTGTCAGGAGGTCTCAGAGCTAAGTGCACAAGAGCTCAACAAATATTTACAGGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCTAATATCATGAATAAACACTGGGACAAACCATATTTCAGTCAAACACGCAATATCAGTCTCAAGGGAATGTCTGGGGCATTGCAAGAGGATGGACATTTAGCTGCTAGTGTGACACTGATTGAAGCAATTAGGTTTTTAAATAGATCACAAACCAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAGACTAAACAATCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTTAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATCACAACATTACCAACTAGGGTGCGATTAGAAATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATATATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAAGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGAGTATCAGAAATTACAACAAGCACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCCACAAAATGGTCACCAGGAGATAATTCTGCTAAGTTTAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGCTTATCAGACAACAAACTGAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGTAACATTTATGAGACTGAATTTTTTATGTCCAGGAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAAATCATTCAGATGCGGTTGAAGATTTCTTGGCATTTTTCTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTAAAGGGAAACTGGCTTCAAGGGAACTTAAATAAATGCTCATCATTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTGTTTCCAGAATTAGAGTGTTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTGTTCATTTATGGCTATCTGGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAGGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGCATGTTTAATCTACATGAGCACTTACTATTAATGGGTTCTATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTATCACCTACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTTTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATCCCTTTTGTTAAAATCTTACTGGGTTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTAAAGTCACTAGATTTGGGTGCTTGCCCACAATTAGCTCAACTAGCTATAGTATTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTAAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTGAATAAAGCACACGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCAATGTCTATTATGGAGCTTGCAACAGCTGGTTTTGGGATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGATGGTGATAGGTACGTATTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCACGACCGATTGGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAAGTGTTCACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCACATAATTATTTATTAGAGTGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGAGATAATTTGCTTGTATACCTTGTAAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATTACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTACAACTTCGTTTCCGTATGCAAGCAAAGCAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCTACGAGTTACCAACCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGACTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGACATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGAGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAATTCGGTGATTGGCTATAAGTATGCTCTTACAGTGGATGAAGTCAGTGATGTTCTTGATAGTGCATTCTTCCCAGAGTCTCTATCTGCAGACTTACAGGTTATGAAAGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGATATAAGTTCTCCTGAAGTCCTAAAACGCATAGCACCACTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTGGAAGGAAATGTAGAAGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTCAAGACAATGTCACTGATTAAAACAATCAGAGTAAGACCTAAGAAGGAGGTACTGAAAGCTATGTCTTTATATAGTGTTAAAGAAAATATTGGATTGCAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTATGCATAGAAATCTGGAGATGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTTAAAGAATGGCTAACATCTCTGTACTTTGAAAAACAGACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTTCCTATTGATCCTGAAATACAATGTATTGGCCTACTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTGTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGTGTGCAAACATATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTTCGTGTTACTTTTAATTTTGGTTTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAAAGAGTATATCTTAGAGACATCTATCACCCAACGACATGTGTTGCGGTTACTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTAATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAGCAAGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGTAAGCCTAATGTGCCATGTATTGTATATAAACACTGTGTCTTGAGAACTGGGCTTCGTACGAAACAGCCAATTAATAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGATGGTTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAGAGTCCACGGTTCTTGTTAGCACATGCATATCATACACTGCGTGATATTAGATATCAAGCAGTGCAGGCAGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTTATTAACCCAATTATATCATCAGGGCTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCCCTCATAATGAACAAGGCTAAGATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAGCTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATCCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCAGTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATTGATGATATGGAGGACTTTACTATAGCACTGGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAGGATATACAACACTTTCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTGATTCAGACAGAAGACATTGAGGTTAAAAAGATACGTGGGGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTCAAGCTATTAAAAAGCTGGGTTTCTAAAGGCCTTGCTATAGACAAAGTATACAATCCTATCGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGACTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAGGGATGGGGAGAAACTGTAAATGATCGATTCAAAGATTTAGATATTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAAAAGGGTGTACAGCCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTCAGGCATGTTGATGTTTTGCTGCGAAGGTTGTTCCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTATTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTCCCGGAGCATACTACTA
| 8,681
|
OQ092243.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Amgarten,D., Dorlass,E., dos Santos Soares,A.C., Moreira Salles,A.P., Takara,A., da Silva Santos,A., Oliveira Sartori,B.S., Petroni,R.C., Sallum Filho,C.F.C., Hidal,J.T., Camargo,L.F.A., Doi,A., Rebello Pinho,J.R.
|
Hospital Israelita Albert Einstein, Varsomics
|
Brazil
|
2023-01-18
| null |
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,538
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2022-12-09
| null | null |
Andes orthohantavirus strain VARS/22-01 segment L, complete sequence
|
AGTTTAGAAAAATGGAAAAATATAGAGAGATTCATCAGAGAGTTAGGGAACTTGCTCCTGGAAGTGCATCAGCATTAGAGTGTATGGATTTGCTTGATAGACTTTATGCTGTAAGACATGACTTGGTTGATCAGATGATAAAGCATGATTGGTCAGACAATAAGGATATTGAACGCCCTATAGGCCAGGTTCTTCTTATGGCAGGCATACCAAATGACATTATACAAGGCATGGAAAAAAAGATAATACCAAATAGTCCCACAGGCCAGGTTCTAAAGAGCTTTTTTAGGATGACACCTGACAATTTCAAAATAACAGGAAATTTAATTGAGTTCATAGAGGTCACCGTTACAGCAGATGTATCTCGGGGGATTAGAGAAAAGAAGATAAAGTATGAAGAAGGTCTCAAATTTGTTGAAAGTCTACTTGAAACTGAAGCACGGAAAGGTAACCTAACACAAGTATACAGGATAACTTTCTCTGTGGTGGCAGTCAAGACTGATGGATCAAATATTTCCACACAATGGCCCAGTCGAAGAAATGATGGTGTTGTACAGCACATGCGCTTAGTCCAGGCTGACATAAACTATGTTCGAGAACACCTAATTAGAGTTGATGAGAGGGCATCCCTTGAGGCAATGTTCAACTTGAAATTTCATGTCTCTGGACCAAAGTTGAGGTATTTTAATGTTCCTGATTATAGGCCACAACAACTTTGTAATCCTAGGATAGACAACCTTATACATTATTGCAAGAATTGGTTAACAGAAGAACATAAATTTGTATTCAGGGAGGTTACAGGGGCTGCTGTGATCCATACATTTGAAGAGCATGAGCAGGTGCATTTGAATAAGTATAATGAGTCGAGGAAGCCTCGAAATTTTTTACTAATTCAATTAACAGTACAAGGGGCCTACCTCCCTTCTACAATAAGTTCTGACCAGTGTGATACAAGGATAGGTTGTTTAGAGATATCAAAAAACCAACCTGAGACACCTATTCAGATGCTTGCTTTAGATATAGCATTTAAATATTTAAGTCTTACAAAGGATGAACTCATAAATTTTTATAGTCCTAGGGTGCACTTTCAAGCAAGTTCAAATGTAAAAGAACCAGGAACAATAAAATTAGGCCTGTCTCAATTGAATCCGTTATCTAAATCAGTATTAGATAATGTTGGTAAACATAAAAAAGATAAGGGCCTATTTGGTGAAGTCATTGAAAGCATCAATATTGCTAGTCAAATACAAGTTAATGCTTGTGCTAAAGTTGTGGAGCAGATTCTTTCAAATTTAGAAATTAACATCGGGGAAACAAACACAGGTATGCCATCCCCACATAAAACCACAGGTGTAGATGAGTTGCTCAATAAGTTCTATGATAATGAAATCGGTAAGTATATGTTATCCATTCTCAGAAAAACAGCAGCCTGGCATATTGGTCATCTTGTTAGGGACATCACAGAAAGTCTTATTGCTCATTCAGGGTTGCGTAGATCTAAATACTGGTCGGTTCATGCATATGATCATGGAAATGTTATCTTATTTATCTTACCATCAAAGTCATTGGAGGTGGTAGGTTCATACATAAGATATTTTACTGTCTTTAAGGATGGTATAGGTCTAGTTGATTCAGACAATATTGACTCTAGAGTAGATATTGATGGGGTTGTATGGTGTTATTCAAAAGTAATGAGTATTGATTTAAACCGATTATTGGCCCTTAATATAGCATTTGAAAAATCTCTCCTAGCGACAGCAACATGGTTTCAGTATTATACAGAGGATCAAGGACACTTTCCCCTACAGCATGCATTGAGATCCGTGTTTTCTTTTCATCTTCTACTATGTATGTCTCAAAAGATGAAACTGTGTGCGATATTTGATAACTTAAGGTACTTAATACCATCTGTGACATCTTTGTATTCAGGTTACGAATTACTAATTGAGAAGTTTTTTGAAAGACCATTTAAGAGCTCATTAGATGTATACCTATATTCAATAATAAAGTCTTTGCTAATAAGCCTTGCACAAAACAATAAAGTCCGGTTCTATTCTAAAGTGAGACTGCTGGGTCTAACAGTTGATCATTCTACTGTTGGTGCAAGTGGAGTGTATCCCTCTTTAATGTCCAGAGTTGTTTATAAGCATTATAGGAGTCTGATATCAGAAGCCACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAAGGGCTTCATGGAAATCTCCCGGAGGAAGCAAAAATACACTTGGAGACTATTGAATGGGCAAGAAAGTTTCAGGCCAAAGAAGCAAAATATGGGGATATCCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATAGAGTCAGTAATAAATGGAGAAGTGATAGTAGAACAACAGCTATTTTGTCAAGAGGTGTCAGAATTAAGTGCACAGGAGCTTAATAAATATTTGCAGGCTAAATCACAAGTCTTATGTGCCAACATCATGAACAAACATTGGGACAAGCCTTATTTTAGTCAAACCCGTAATATCAGTCTAAAAGGCATGTCTGGTGCCCAGCAAGAAGATGGTCATCTAGCTGCTAGTGTCACTTTAATAGAGGCAATACGGTTCTTGAATAGGTCACAGACTAACCCAAATGTTATTGATATGTATGAACAGACAAAACATAGCAAGGCTCAAGCTAGGATAGTTAGGAAATATCAAAGGACAGAAGCAGATAGAGGGTTTTTTATAACAACACTACCAACAAGGGTAAGGTTGGAGATAATTGAAGATTATTTTGATGCAATAGCAAAGGTTGTCCCTGAAGAATATATATCTTATGGTGGGGATAAAAAAATATTAAATATACAGAATGCTCTAGAAAAGGCACTTAGGTGGGCATCAGGTATGTCTGAAATAACCACTAGTACAGGCAAAGTGATCAAATTTAAGCGTAAACTAATGTATGTTAGTGCTGATGCTACAAAATGGTCACCTGGGGATAATTCGGCAAAGTTTAGGAGATTCACACAGGCAATTTATGATGGTTTGTCTGACAATAAACTAAAGTGTTGTGTTGTTGATGCTATAAGAAATATATATGAAACAGAGTTTTTTATGTCCCGGAAGCTACATCGATATATTGATAGCATGGATGAGCATTCAGATGCTGTTAACGATTTTTTAGCATTCTTTTCTGGTGGCGTTTCTGCTGCTGTTAAAGGTAATTGGTTGCAGGGTAATCTAAATAAATGTTCATCACTATATGGTGCTGCAATATCTCTCCTGTTTAGAGAGGTGTGGAAGCAGCTGTTTCCAGAATTAGAATGCTTTTTCGAATTTGCTCACCACTCAGATGATGCATTATTTATATATGGTTATCTGGAACCTGAGGATGATGGAACAGATTGGTTTCTCTATGTATCTCAACAAATACAGGCAGGAAATTATCACTGGCATGCAATTAACCAAGAAATGTGGAAAAGTATGTTTAACCTACACGAGCATCTTCTTCTAATGGGTTCCATTAAAGTTTCACCTAAGAAAACAACTGTTTCACCAACAAATGCTGAATTTTTATCCACATTCTTCGAAGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATTTTGCTAGGTTCATTATCAGATTTGCCTGGTTTAGGTTTTTTTGATGATCTAGCTGCTGCACAAAGTAGGTGTGTAAAGGCATTAGACTTAGGAGCATGCCCTCAGCTTGCTCAATTAGCCATAGTGCTTTGTACAAGTAAAGTAGAGAGATTGTATGGGACTGCTGATGGTATGGTTAACTCACCTACAGCCTTTTTAAAAGTACAGAAGTCACATGTCCCAATACCACTTGGGGGTGATGGATCCATGTCTATAATGGAACTAGCTACAGCGGGTTTCGGTATGGCTGATAAGAACATATTAAAGAATGCATTTATCTCATATAAACACACTCGTCGAGATGGTGATAGGTACATTTTAGGTCTTTTTAAGTTCTTAATGTCATTAAGTGAAGATGTGTTTCAACATGATAGGCTTGGTGAATTCAGCTTTGTAGGTAAAGTCCAATGGAAGGTGTTTACTCCCAAAGCAGAGTTTGAGTTCCATGATCAATTTTCACATAGTTACTTAGGGGACTGGACAAAACAACACCCAGTATATGACTATATAATCCCAAGAAATAGGGATAATTTACTTGTTTATCTTGTGAGGAAGTTAAATGATCCTAGCATTATTACAGCAATGACAATGCAGTCTCCACTACAACTTCGATTCCGTATGCAGGCGAAACAGCACATGAAAGTATGTAGGTATGAAGGTGAATGGGTCACGTTTAGGGAAATACTGGCAGCAGCTGACAGCTTTGCCACAGTTTATCAACCAAGTGAGAGAGATATGGATTTGTTCAATACACTGGTGAGCTGTACATTCTCAAAGGAATATGCATGGAAGGACTTTCTAAATGAAGTACGATGCGAGGTATTAACAACAAGGCATGTGCATAGGCCGAAAATTGCAAGAACATTCACTGTCAGGGAAAAAGATCAGGCAATCCAAAATCCCATTAATTCAGTGATAGGCTATAAGTATGCGATGACTGTTGATGAAATCAGTGATGTTCTAGATAGTGCATTCTTCCCTGAATCCTTGTCAGCTGACTTGCAGGTTATGAAAGATGGGGTTTATCGAGAGCTTGGATTGGATATAAGCTCTCCAGAGGTCTTAAAGCGCATAGCTCCATTACTATATAAAGCTGGGCGATCACGTGTGGTAATAGTTGAAGGAAATGTTGAAGGCACAGCCGAGTCAATTTGCAGTTACTGGCTAAAGGCCATGTCATTAATTAAGACAATTAGGGTTCGACCAAAGAAAGAGGTTTTGAAAGCTATGTCTTTGTATAGCGTTAAAGAAAATATAGGCCTACAAGATGATATTGCGGCTACACGATTGTGTATAGAGATTTGGCGATGGTGTAAGGCTAATGACCAAGATGTTAGAGAGTGGTTAACATCGCTGTATTTTGAGAAACAAACACTCATGGATTGGGTTGAAAGGTTCAGGAGAAAGGGGGTTGTTCCTATTGACCCTGAAATTCAATGCATTGGCTTATTGTTATATGATGTTCTAGGATATAAGAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGTAGAGCTTATTCCGGCAAACAATATGATGCATATTGTGTTCAAACATATAATGAAGAAACAAAGTTGTATGAAGGTGACCTCCGTGTAACCTTTAACTTTGGTTTGGATTGTGCACGACTTGAGGTGTTTTGGGATAAGAAGGAATACATCCTAGAAACTTCTATTACCCAAAGACATGTCTTGAGGCTTCTGATGGAAGAAGTATCTCAGGAGTTAGTTCGATGTGGTATGAGATTCAAAACAGAGCAAGTCAATCAAACAAGAAGTTTAGTGTTATTTAAAACAGAATCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATGTCCCCTGCATTGTGTATAAGCATTGTGTATTACGGACAGGTCTACGCACGAAACAGCCAATTAATAAAGAGTTCATGATTAATGTCCAATCTGATGGATTCCGAGCAATAGCTCAAATGGATATCGAAAGTCCTAGATTTTTATTAGCCCATGCATATCATACGTTGCGTGACATTCGCTATCAAGCTGTTCAGGCAGTGGGAAATGTTTGGTTCAGGACGGAGCAGCATAAACTTTTTATTAATCCAATAATTTCTACAGGCTTATTAGAAAACTTTATGAAGGGCTTGCCTGCAGCTATACCTCCTGCAGCATACTCATTAATAATGAATAAGGCTAAAATATCTGTAGATTTATTCATGTTTAATGAACTATTAGCTCTTATTAATAAAAATAACATCCTCAATTTAGATGGGATCGAAGAAACATCTGAGGGTTATAGTACAGTTACATCCATGTCAAGTAAACAATGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCAGAAGATGATATAGATGACATGGAAGATTTCACAATAGCACTGGATGATATTGACTTTGAACAGATTAATCTTGAGGAGGACATACAGCACTTTCTCCAGGATGAATCAGCTTATGTTGGTGATTTGCTAATTCAAACTGAAGATATTGAGGTTAAAAGGATACGTGGGGTCACTAGGGTTTTAGAACCTGTGCGGTTATTAAAAAGTTGGGTGTCAAAGGGCTTAGCGATTGATAAAGTCTACAACCCTGTTGGGATAATTCTTATGGCTAGATATATGTCAAAAACATATAACTTTAACTCAACACCCTTAGCATTATTAAATCCTTATGATCTCACAGAGTTAGAAAGTGTAGTTAAGGGCTGGGGTGAGACAGTCAATGATAGATTTAAAGAATTAGATACTGAGGCACAAACAGTTGTAAAAGAGAAAGGTGTCCAACCTGAGGATGTCCTTCCTGACTCTTTATTTTCATTTAGGCATGTAGATGTTCTCTTGCGTAGGCTTTTTCCACGTGATCCTGTGTCTAAGTTTTATTGAACAGAATTCTTATCTTGTTTATCCATTATGTAATGTTTAGTGTTCTTTTCCCGGAGCGGGTCGCA
| 19,252
|
MN258156.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epilink/96_2/6/19
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,546
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epilink/96_2/6/19 segment L, complete sequence
|
TAGTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGAACGGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATCTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATCATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACAGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGACGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTTCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAACAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCAACAATCAGTTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCAAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTACACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCAGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTATCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCACAAAAAGGATAAAGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTGGCAAGCCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCAAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAAACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATCTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCCAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGTGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTTATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACAGTCGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAACACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGCGCATTGCAAGAAGATGGGCACTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAAAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCCGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAATAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCGTTCCTTAAGGTGAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCAATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAATTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGACTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGACATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTGATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTTAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGGGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTCACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTATTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGTAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGATGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAATAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCACTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCTTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGACAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAGCCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTGCGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTCCCG
| 46,795
|
MN258157.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
NRC-2/97_06/01/1996
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,542
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate NRC-2/97_06/01/1996 segment L, complete sequence
|
GTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAGATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGAACGGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGACAGGCTCTATGCTGTCAGACATGATCTAGTTGATCAGATGATAAAGCATGATTGGTCTGATAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTACTGATGGCTGGTATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAGGTGCTGAAGAGCTTTTTTCGAATGACACCAGACAATTATAAAATTACAGGCAACTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTGACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGAGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAAATTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTGGTTGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAATGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCATTTAATAAAGTTGGATGAGAGAGCATCATTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTTCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCGCGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAACTTGTGTTCAAGGAAGTTAGTGGAGCTAATGTAATTCAAGCATTTGAAAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCAAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGAGCATATCTGCCATCAACAATCAGTTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTGGAAATATCAAAAAACCAACCAGAAACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTGATTAATTATTATAGCCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCTAATGTAAAGGAACCAGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTGAATCCACTTTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCACAAAAAGGATAAAGGGTTGTTTGGTGAGGTCATAGATAGCATAAATGTGGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCAAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCTCCTAATAAGACAACAGGTGTAGATGACTTGCTGAATAAGTTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCTATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGTCATCTAGTTAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGCCGTTCTAAATACTGGTCAGTACATGCATATGACCATGGGAATGTAATTCTGTTTGTTTTGCCATCAAAGTCATTAGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGATATTTTANNGTATTTAAGGATGGTATAGGATTAATAGATGCAGACNNNNNNNNNNNNNNNGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCCAAAGTCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGCATTAAATATAGCCTTTGAAAAATCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTACACTGAAGACCAAGGTCATTTCCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGTGCAATATTCGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTACTCTGGGTATGAGTTGTTAATAGAGAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTCGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACATTATAGAAGTTTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATTTACCAGAAGAAGCTAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAGGAAAAACAATATGGTGATATTCTTCTAAAAGAAGGCTATACGATTGAATCTGTAATCAATGGTGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAGGAACTTAATAAATATCTACAAGCGAAGTCTCAAGTTTTATGTGCTAATATTATGAATAAGCACTGGGATAAACCATATTTTAGTCAAACACGCAATATCAGTCTTAAAGGAATGTCCGGCGCACTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTCTTAAATAGATCACAGACCAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAGACCAAACAATCAAAGGCACAGGCTAGGATTGTCAGGAAGTACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAAAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGAGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGAAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAACTCTGCCAAATTTAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGCTGAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTGCGCAACATTTATGAGACTGAATTTTTTATGTCTAGGAAATTACATCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCATTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTAAAGGGAAATTGGCTTCAAGGAAATTTGAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTCCGGGAGGTCTGGAAACAACTATTTCCAGAATTAGAATGTTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATTTAGAGCCTGAAGATGATGGGACAGATTGGTTCTTGTATGTATCACATCAGATACAGGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTGTTAATGGGTTCCATTAAAGTATCACCTAAGAAGACAACAGTATCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATCCCTTTTGTTAAAATACTACTAGGTTCATTATCAGATCTTCCCGNNNNNNGTTTCTTTGATGATTTAGCTGCAGCACAAAGTAGATGTGTAAAGTCATTAGATTTAGGTGCTTGCCCACAATTAGCTCAGCTAGCTATAGTATTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGATTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTAAACTCTCCAACAGCATTTCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCAATGTCCATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTCGGGATGGCAGATAAAAATATTTTGAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTATTGGGTTTATTCAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCACGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTCGTAGGTAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATCGAGATAATTTGCTTGTGTACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCGCCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTGTGTCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAGTTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAGGAGTACGCTTGGAAAGACTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTTTTAACAACAAGACATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTTACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAATTCTGTGATTGGCTATAAGTATGCCCTCACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTAGATAGTGCATTCTTTCCAGAATCTTTATCTGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGGGTTTACAGGGAACTAGGGCTTGATATAAGTTCTCCTGAAGTTTTAAAACGCATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTGGAAGGGAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCATTGATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTACTGAAAGCTATGTCTTTATATAGTGTTAAAGAAAATATTGGATTGCAGGACGATATTGCAGCAACTCGATTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAAGAATGGCTAACATCCTTGTATTTTGAAAAGCAAACATTGATGGATTGGATAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAGATACAATGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTGTTAGGTTATAAAAGTGTTTTGCAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTACAAACATATAACGAAGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTCACTTTTAATTTTGGCCTAGACTGTGCAAGGTTAGAAGTCTTTTGGGACAAAAGAGAGTATATCTTAGAGACATCTATTACCCAGCGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTAATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAAGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTTAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGTAAGCCTAATGTGCCATGTATCGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTTCGTACAAAACAGCCAATTAATAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGATGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGATTCTTGCTGGCACATGCGTATCATACATTGCGTGATATCAGATATCAAGCAGTACAAGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTTATCAACCCAATTGTATCATCAGGACTCTTAGAAAATTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCTATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAATAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTCATAAATAGAAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCAGTGGTCTGAAGAAATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATCGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCACTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAGGATATACAGCATTTTCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATACAGACAGAGGACATTGAAGTTAAGAAGATACGTGGGGTGACAAGGGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGCTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGACAAAGTATACAATCCCATTGGGATAATCCTAATGGCACGATATATGTCAAAAACATACAACTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTACTAAACCCATATGATTTGACAGAGCTTGAAAGTGTTGTAAAGGGATGGGGAGAAACTGTAAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAGCAGTCGTTAAAGAGAAAGGTGTACAGCCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTCAGGCATGTTGATGTCTTGCTACGAAGGTTGTTCCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTNCC
| 46,796
|
MN258158.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
NRC-3/18_06/01/1997
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,540
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate NRC-3/18_06/01/1997 segment L, complete sequence
|
AGTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAGATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGAACGGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACATGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGATTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGACCTATAGGTCAAGTCTTGCTGATGGCTGGCATCCCTAATGATGTTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAACAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAACTATAAAATTACAGGCAATTTGATTGAGTTCATTGAAGTGACCGTGACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAAAAGAAAATAAAGTATGAAGGAGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAAATCGAATCAAAGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTGGTTGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGCCGGAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCCGAGAGCATTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCATTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTTCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCGCGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACGGTGCAAGGAGCATATCTGCCATCAACAATCAGTTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCAAAAAACCAACCAGAAACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTAAGCCTTACAAAGGATGAGTTGATTAATTATTACAGCCCTAGAGTGCACTTTCAATCGAGCCCTAATGTAAAGGAACCAGGAACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTGAATCCACTCTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGGAAGCACAAAAAGGATAAAGGGTTGTTTGGTGAGGTCATAGATAGCATAAATGTGGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCAAATCTTGAAATAAATATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGTGTGGACGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATCTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTTTGCGTCGTTCTAAGTACTGGTCAGTACATGCATATGACCATGGGAATGTGATTCTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTAGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGATATTTTACAGTATTTAAGGATGGTATAGGATTAATAGATGTGGATAATATTGATTCTAAGGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCCAAAGTCATGAGTATTGATTTAAACAGATTATTGGCCTTAAATATAGCCTTTGAGAAATCACTTCTTGCCACGGCAACATGGTTTCAATATTATACTGAAGACCAAGGTCATTTTCCCCTCCAACATGCATTGAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGTGCAATATTCGACAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAGTTGTTGATAGAGAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACTGTCGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTTTATAAACATTATAGAAGTTTAATCTCCGAAGCTACTACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATTTACCAGAAGAGGCTAAGATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATATGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACGATTGAATCTGTAATTAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCGGAGCTAAGTGCACAGGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCTAATATTATGAATAAGCACTGGGATAAACCATATTTTAGTCAAACACGCAATATCAGTCTTAAGGGAATGTCCGGCGCACTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACATTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACCAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAGACTAAACAATCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGGACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATCACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTAGAGATCATAGAGGATTATTTTGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAAAATGCACTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGAGTATCAGAAATCACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTTAGGAGATTTACACAGGCAATATATGATGGTTTATCAGATAACAAGTTGAAATGTTGTGTCGTTGATGCATTGCGCAACATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGGAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGATTTCTTGGCATTCTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAACGTAAAGGGAAATTGGCTTCAAGGAAATTTGAATAAATGCTCATCATTATTCGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAGCAATTATTTCCAGAATTAGAATGTTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGACGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAGGCAGGAAATTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTGTTAATGGGTTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTTTCACCTACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTTTTTGAGGGTTGTGCTGTGTCAATCCCTTTTGTTAAAATATTACTAGGTTCATTATCAGATCTTCCCGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTAGCAGCAGCACAGAGTAGATGTGTAAAGTCATTAGATTTAGGTGCTTGCCCGCAATTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGTTCAATGTCTATTATGGAACTCGCAACAGCTGGTTTCGGGATGGCAGATAAAAATATTCTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTATTGGGCTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCACGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAGTGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGAGATAATTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGTATCATCACGGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAAGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAGTTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTTTTTAACACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGACTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTTTTAACAACGAGACATGTACATAGACCTAAAATTGCTAGGACATTTACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCGATAAATTCTGTGATTGGCTATAAGTATGCTCTCACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCAGAATCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGGGTTTACAGGGAATTAGGGCTTGATATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCACTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTGGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTGATTAAAACAATCAGAGTAAGGCCTAAGAAGGAAGTACTGAAAGCTATGTCTTTATATAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTGCAGGATGATATTGCAGCAACTCGATTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTTAAAGAATGGCTAACGTCCTTGTATTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGATAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAGATACAATGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTGTTAGGTTATAAAAGTGTGTTGCAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAAACGTATAACGAGGAAACCAAACTATATGAAGGTGACCTTCGTGTTACTTTTAATTTTGGCCTAGACTGTGCAAGGTTAGAAGTCTTTTGGGATAAAAGAGAGTATATCTTAGAGACATCTATTACCCAGCGACATGTATTACGGTTGTTGATGGAAGAGGTGTCACAAGAATTAATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAAGTCAATCAAACTAGGAGCTTAGTGTTATTTAAAACAGAGGCTGGTTTCGAATGGGGTAAGCCTAATGTGCCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTTCGTACAAAACAGCCAATTAATAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGATGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTACGTGATATTAGGTATCAAGCAGTACAGGCAGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAGCTATTTATTAACCCAATCATATCATCAGGACTCTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAATAAGGCTAAAATCTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTTAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCAGAAGGTTACAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCAGTGGTCTGAAGAGATGAGCTTAATGTCTGATGATGATATCGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCACTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTAGAAGAGGATATACAGCATTTTCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAAGATATTGAAGTTAAAAAGATACGTGGGGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGCCTTGCTATAGACAAAGTATACAATCCCATTGGGATAATCCTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTACTAAACCCGTATGACTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAGGGATGGGGAGAAACTGTAAATGATCGATTTAAAGATTTAGATATTGAGGCACAAGCAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTGCGAAGGTTGTTCCCGCGTGATCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTATAGTGTTCTTT
| 46,797
|
MN258159.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
NRC-4/18_06/01/2018
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,545
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate NRC-4/18_06/01/2018 segment L, complete sequence
|
GTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAGATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGAACGGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACATGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGATTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGACCTATAGGTCAAGTCTTGCTGATGGCTGGCATCCCTAATGATGTTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAACAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAACTATAAAATTACAGGCAATTTGATTGAGTTCATTGAAGTGACCGTGACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAAAAGAAAATAAAGTATGAAGGAGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAAATCGAATCAAAGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTGGTTGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGCCGGAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCCGAGAGCATTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCATTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTTCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCGCGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACGGTGCAAGGAGCATATCTGCCATCAACAATCAGTTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCAAAAAACCAACCAGAAACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTAAGCCTTACAAAGGATGAGTTGATTAATTATTACAGCCCTAGAGTGCACTTTCAATCGAGCCCTAATGTAAAGGAACCAGGAACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTGAATCCACTCTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGGAAGCACAAAAAGGATAAAGGGTTGTTTGGTGAGGTCATAGATAGCATAAATGTGGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCAAATCTTGAAATAAATATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGTGTGGACGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATCTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTTTGCGTCGTTCTAAGTACTGGTCAGTACATGCATATGACCATGGGAATGTGATTCTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTAGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGATATTTTACAGTATTTAAGGNTGGTATAGGATTAATAGATGTGGATAATATTGATTCTAAGGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCCAAAGTCATGAGTATTGATTTAAACAGATTATTGGCCTTAAATATAGCCTTTGAGAAATCACTTCTTGCCACGGCAACATGGTTTCAATATTATACTGAAGACCAAGGTCATTTTCCCCTCCAACATGCATTGAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGTGCAATATTCGACAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAGTTGTTGATAGAGAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACTGTCGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTTTATAAACATTATAGAAGTTTAATCTCCGAAGCTACTACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATTTACCAGAAGAGGCTAAGATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATATGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACGATTGAATCTGTAATTAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCGGAGCTAAGTGCACAGGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCTAATATTATGAATAAGCACTGGGATAAACCATATTTTAGTCAAACACGCAATATCAGTCTTAAGGGAATGTCCGGCGCACTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACATTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACCAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAGACTAAACAATCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGGACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATCACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTAGAGATCATAGAGGATTATTTTGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAAAATGCACTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGAGTATCAGAAATCACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTTAGGAGATTTACACAGGCAATATATGATGGTTTATCAGATAACAAGTTGAAATGTTGTGTCGTTGATGCATTGCGCAACATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGGAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGATTTCTTGGCATTCTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAACGTAAAGGGAAATTGGCTTCAAGGAAATTTGAATAAATGCTCATCATTATTCGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAGCAATTATTTCCAGAATTAGAATGTTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGACGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAGGCAGGAAATTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTGTTAATGGGTTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTTTCACCTACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTTTTTGAGGGTTGTGCTGTGTCAATCCCTTTTGTTAAAATATTACTAGGTTCATTATCAGATCTTCCCGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTAGCAGCAGCACAGAGTAGATGTGTAAAGTCATTAGATTTAGGTGCTTGCCCGCAATTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGTTCAATGTCTATTATGGAACTCGCAACAGCTGGTTTCGGGATGGCAGATAAAAATATTCTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTATTGGGCTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCACGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAGTGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGAGATAATTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGTATCATCACGGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAAGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAGTTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTTTTTAACACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGACTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTTTTAACAACGAGACATGTACATAGACCTAAAATTGCTAGGACATTTACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCGATAAATTCTGTGATTGGCTATAAGTATGCTCTCACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCAGAATCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGGGTTTACAGGGAATTAGGGCTTGATATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCACTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTGGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTGATTAAAACAATCAGAGTAAGGCCTAAGAAGGAAGTACTGAAAGCTATGTCTTTATATAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTGCAGGATGATATTGCAGCAACTCGATTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTTAAAGAATGGCTAACGTCCTTGTATTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGATAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAGATACAATGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTGTTAGGTTATAAAAGTGTGTTGCAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAAACGTATAACGAGGAAACCAAACTATATGAAGGTGACCTTCGTGTTACTTTTAATTTTGGCCTAGACTGTGCAAGGTTAGAAGTCTTTTGGGATAAAAGAGAGTATATCTTAGAGACATCTATTACCCAGCGACATGTATTACGGTTGTTGATGGAAGAGGTGTCACAAGAATTAATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAAGTCAATCAAACTAGGAGCTTAGTGTTATTTAAAACAGAGGCTGGTTTCGAATGGGGTAAGCCTAATGTGCCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTTCGTACAAAACAGCCAATTAATAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGATGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTACGTGATATTAGGTATCAAGCAGTACAGGCAGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAGCTATTTATTAACCCAATCATATCATCAGGACTCTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAATAAGGCTAAAATCTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTTAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCAGAAGGTTACAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCAGTGGTCTGAAGAGATGAGCTTAATGTCTGATGATGATATCGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCACTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTAGAAGAGGATATACAGCATTTTCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAAGATATTGAAGTTAAAAAGATACGTGGGGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGCCTTGCTATAGACAAAGTATACAATCCCATTGGGATAATCCTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTACTAAACCCGTATGACTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAGGGATGGGGAGAAACTGTAAATGATCGATTTAAAGATTTAGATATTGAGGCACAAGCAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTGCGAAGGTTGTTCCCGCGTGATCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTATAGTGTTCTTTTCCCGG
| 46,798
|
MN258160.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
NRC-5/18_06/01/2018
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,539
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate NRC-5/18_06/01/2018 segment L, complete sequence
|
GTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAGATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGAACGGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTTAGACATGATCTAGTTGATCAGATGATAAAACATGATTGGTCTGATAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTCTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGTTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAACTATAAAATTACAGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTCACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGAGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAAATTGAATCGAGAAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTGGTTGCCGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAATGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTTTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCATTTAATAAAGTTAGATGAAAGAGCATCATTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTAAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGTTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAGATTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTAATTCAAGCATTTGAAAATCATGAGCAGTCGCACTTACAAAAATACAATGAATCACGAAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACGGTACAAGGAGCATATCTTCCATCAACAATCAGTTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAGATATCAAAAAACCAGCCAGAAACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTACCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTGATTAATTATTATAGCCCTAGGGTGCACTTTCAATCAAGCCCTAATGTAAAGGAACCAGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTGAATCCACTCTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCACAAAAAGGATAAAGGGTTGTTTGGTGAGGTCATAGATAGCATAAATGTGGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCGAAAATAATTGAGCAGATCTTATCAAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATACTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGTGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGTCATCTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCTGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTACATGCATATGACCATGGGAATGTAATTCTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTAGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGATATTTTACAGTATTTAAGGATGGTATAGGATTGATAGATGCAGACAATATTGATTCTAAGGCCGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATTGATTTAAACAGGTTATTGGCATTAAATATAGCTTTTGAGAAATCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGTCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGTGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTACTCTGGGTATGAGTTGTTAATAGAGAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAACAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTCCGTTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTCGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACATTATAGAAGTTTGATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATTTACCAGAAGAAGCTAAGATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAAAAACAATATGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACGATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTTTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGTTAAGTGCACAGGAACTTAACAAATATTTACAAGCGAAATCCCAAGTTTTATGTGCGAATATCATGAATAAACACTGGGATAAACCATATTTTAGTCAAACACGCAATATCAGTCTTAAAGGAATGTCCGGTGCACTGCAAGAAGATGGGCATTTATCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACCAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAGACTAAACAATCAAAGGCACAGGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATCACAACATTACCAACTAGGGTACGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTTGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAAGTTCTAAATATTCAAAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGAGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGAAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGTGACAACTCTGCCAAATTTAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAATAAGCTGAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTGCGCAACATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGGAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCATTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTAAAGGGAAATTGGCTTCAAGGAAACTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCGTTACTTTTCCGAGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAATGTTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATTTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAGGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAACCTACATGAACATTTACTGTTAATGGGTTCCATTAAAGTATCACCTAAGAAGACAACAGTATCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTTTTTGAGGGTTGTGCTGTGTCAATCCCTTTTGTTAAAATATTACTAGGTTCATTATCAGATCTTCCCGGGTTGGGTTTCTTTGATGATTTAGCAGCAGCACAAAGTAGATGTGTAAAGTCATTAGATTTAGGTGCTTGCCCACAATTAGCTCAACTAGCTATAGTATTGTGCACAAGTAAAGTTGAGAGATTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTAAATTCCCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCGCATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCAATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTCGGGATGGCAGATAAAAATATTCTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAACATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTACTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCACGACCGATTAGGTGAGTTCAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAGTGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGAGATAATTTGCTTGTGTATCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGTATTATCACAGCTATGACTATGCAATCACCATTACAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTCGCCACAAGTTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGACTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTTTTAACAACAAGACATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTTACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTGATTGGTTATAAGTATGCTCTCACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAATCTTTATCTGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGGGTTTACAGGGAATTAGGGCTTGATATAAGTTCTCCTGAAGTTTTAAAACGCATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTGGAAGGGAATATAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCATTGATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTACTGAAAGCTATGTCTTTATATAGTGTTAAAGAAAATATTGGATTGCAGGACGATATTGCAGCAACTCGACTATGCATAGAAATCTGGAGATGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAAGAATGGCTAACATCTTTGTATTTTGAAAAGCAAACATTGATGGATTGGATAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCCGAGATACAATGCATTGGCCTGCTCTTATATGATGTGTTAGGTTATAAAAGTGTGTTGCAAATGCAAGCAAACCGGAGAGCCTATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGTGTGCAAACATATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGATCTCCGTGTTACTTTTAATTTTGGCTTAGACTGTGCNNNNNNNNNAGTCTTTTGGGANAAAAGAGAGTATNTCTTAGAGANATCTATTACCCAGCGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTAATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACGGAACAAGTCAATCAAACTCGGAGTTTGGTGTTATTTAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGTAAGCCTAATGTGCCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTTCGTACAAAACAGCCAATTAATAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGATGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAGAGTCCACGATTTTTGTTGGCACATGCGTATCATACATTGCGTGATATCAGGTATCAAGCAGTACAGGCAGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCATAAACTATTTATCAACCCAATTATATCATCAGGACTCTTAGAAAATTTTATGAAAGGTTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAATAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTATTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGAAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGTAAGCAGTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATCGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCACTGGATGATATTGACTTTGAACAGATAAATTTGGAAGAGGATATACAGCATTTTTTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTTAAGAAAATACGTGGGGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCCATAGACAAAGTATACAATCCCATTGGAATAATCCTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAACTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTACTAAACCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAGGGATGGGGAGAAACTGTAAATGATCGATTTAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAGCAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTTTCTTTCAGGCATGTCGATGTCTTGCTACGAAGGTTGTTCCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTT
| 46,799
|
MN258161.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
NRC-6/18_05/21/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,548
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate NRC-6/18_05/21/18 segment L, complete sequence
|
TAGTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGAACGGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATCTAGTTGATCAGATGATAAAGCATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTAATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATCATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGTAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACAGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGACGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTTCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAACAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCAAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAATGTAAANGAACCAGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTATCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACAGTCGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTCTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATATTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGCGCATTGCAAGAAGATGGGCATCTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGAGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAAAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGACGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTGAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCAATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAGCATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAATTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTTAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGGGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACACGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAGTGGTTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGATGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAGCTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTCAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGACAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAGCCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTCTGCTGCGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTTTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTCCCGGA
| 46,800
|
MN258162.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_10_12/10/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,528
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_10_12/10/18 segment L, complete sequence
|
CTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCANTGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTG
| 46,801
|
MN258163.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_11_12/15/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,529
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_11_12/15/18 segment L, complete sequence
|
CCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCANNGACGGNANNGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTANGGTGNGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTC
| 46,802
|
MN258164.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_12_12/19/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,542
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_12_12/19/18 segment L, complete sequence
|
GTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTCC
| 46,803
|
MN258165.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_13_12/24/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,541
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_13_12/24/18 segment L, complete sequence
|
GTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTC
| 46,804
|
MN258166.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_14_12/26/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,543
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_14_12/26/18 segment L, complete sequence
|
GTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTCCC
| 46,805
|
MN258167.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_15_12/26/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,531
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_15_12/26/18 segment L, complete sequence
|
CTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTC
| 46,806
|
MN258168.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_16_12/28/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,541
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_16_12/28/18 segment L, complete sequence
|
GTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTC
| 46,807
|
MN258169.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_17_12/31/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,543
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_17_12/31/18 segment L, complete sequence
|
AGTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTCC
| 46,808
|
MN258170.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_18_12/31/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,531
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_18_12/31/18 segment L, complete sequence
|
TCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCANTATCAGCNTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCT
| 46,809
|
MN258171.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_19_1/2/19
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,547
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_19_1/2/19 segment L, complete sequence
|
AGTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTCCCGGA
| 46,810
|
MN258172.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_1_11/3/18
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,541
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_1_11/3/18 segment L, complete sequence
|
GTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTTTTC
| 46,811
|
MN258173.1
|
Orthohantavirus andesense
|
Martinez,V.P., Perez-Sautu,U., Alonso,D.O., Di Paola,N., Bellomo,C.M., Iglesias,A.A., Coelho,R.M., Periolo,N., Nagle,E.R., Chitty,J.A., Pratt,C.B., Wiley,M.R., Diaz,J., Biondo,E., Lewis,L., Anselmo,C., Pontoriero,F., Lavarra,E., Kuhn,J.H., Sanchez-Lockhart,M., Edelstein,A., Cisterna,D., Campos,J., Kaler,M., Rubinstein,A., Perandones,C., Palacios,G., Iglesias,A., Pratt,C.
|
United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases USAMRIID, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2020-09-30
|
Epuyen/18-19_Patient_20_1/1/19
|
Orthohantavirus andesense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,539
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Orthohantavirus andesense isolate Epuyen/18-19_Patient_20_1/1/19 segment L, complete sequence
|
AGTAGACTCCGGGATAGAAAAAGTTAGAAAAATGGAAAAGTACAGAGAAATTCATCAGAGAGTTAGGGATCTTGCACCTGGGACAGTATCAGCATTAGAATGCATAGATCTACTGGATAGGCTCTATGCTGTCAGACACGATTTAGTTGATCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATGTAGAAAGGCCTATAGGTCAAGTTTTGCTGATGGCTGGCATACCTAATGATATTATACAAGGCATGGAGAAGAAGATTATACCAAATAGCCCTTCTGGACAAGTGCTGAAGAGCTTTTTCCGAATGACACCAGACAATTATAAAATCACCGGCAATTTGATTGAGTTTATTGAAGTGACTGTAACAGCTGATGTATCACGAGGTATTAGGGAGAAGAAAATAAAGTATGAAGGTGGCCTTCAATTTGTTGAGCACTTACTTGAGGTTGAATCAAGGAAGGGTAACATACCGCAACCCTATAAAATAACATTCTCAGTAGTGGCAGTTAAAACAGATGGATCAAACATCTCAACTCAATGGCCTAGTCGAAGGAACGATGGGGTAGTTCAGCACATGCGTCTAGTCCAAGCTGATATTAATTATGTCAGAGAGCACTTAATAAAGTTAGATGAGAGAGCATCACTGGAAGCAATGTTCAACTTAAAATTCCATGTGTCAGGCCCTAAATTGAGATACTTCAACATCCCTGATTATAGACCACAGCAGCTATGTGAACCACGGATTGATAACTTAATACAATATTGCAAGAATTGGTTGACAAAAGAACATAAGTTTGTATTCAAGGAAGTCAGTGGAGCTAATGTGATTCAAGCATTTGAGAGTCATGAGCAGTCACACTTACAGAAATACAATGAATCACGGAAACCGAGAAATTTTTTACTCTTGCAGCTTACAGTGCAAGGGGCATATCTGCCATCGACAATCAGCTCTGACCAGTGCAATACTAGGATTGGGTGTCTAGAAATATCCAAAAACCAACCAGAGACACCAGTACAGATGCTTGCATTAGATATAGCTTATAAGTATCTGAGCCTTACAAAGGATGAGTTAATTAACTATTATAGTCCTAGAGTGCACTTTCAATCAAGCCCCAGTGTAAAGGAACCGGGGACATTAAAGTTAGGATTATCACAATTAAATCCACTGTCTAAATCAATCCTTGACAATGTTGGAAAGCATAAAAAGGATAAGGGATTGTTTGGTGAGATTATAGATAGTATAAATGTAGCAAGTCAAATACAGATCAATGCATGTGCAAAAATAATTGAGCAGATCTTATCTAATCTTGAAATAAACATTGGAGAAATAAATGCTAGTATGCCTTCCCCTAATAAGACAACAGGCGTAGATGACTTGTTGAATAAATTTTATGATAATGAGCTTGGGAAATATATGTTATCCATTCTGAGGAAAACAGCAGCATGGCATATAGGCCATTTAGTCAGAGATATCACAGAAAGTTTAATTGCACATGCCGGTCTGCGTCGTTCTAAATACTGGTCAGTGCATGCATATGACCATGGGAATGTAATTTTGTTTATTTTGCCATCAAAGTCATTGGAAGTAGTAGGTTCTTATATAAGGTATTTCACAGTATTCAAGGACGGTATAGGATTGATTGATGCGGACAATATTGATTCTAAAGCTGAAATTGATGGTGTTACTTGGTGTTATTCTAAAGTCATGAGTATCGATTTAAACAGGCTATTAGCCTTGAATATAGCCTTTGAGAAGTCACTTCTTGCCACAGCAACATGGTTCCAATATTATACTGAAGACCAAGGCCATTTTCCCCTTCAACATGCATTAAGGTCAATCTTTTCTTTTCACTTTTTACTATGTGTGTCACAGAAGATGAAACTATGCGCAATATTTGATAACCTTCGTTATCTGATACCATCAGTAACATCTTTGTATTCTGGGTATGAATTGCTAATAGAAAAATTCTTTGAGAGGCCATTTAAGAGTTCACTGGATGTATACCTTTATTCTATTATAAAGTCTCTGTTAATTAGTTTGGCACAAAATAATAAAGTTCGATTTTACTCAAGAGTTCGCTTGTTAGGATTGACAGTTGATCATTCTACGGTTGGAGCAAGTGGTGTTTATCCCTCTTTAATGTCCCGTGTTGTCTATAAACACTACAGAAGTCTAATCTCTGAAGCTACAACCTGTTTTTTCTTATTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATCTACCAGAAGAGGCCAAAATACATCTTGAAACCATTGAATGGGCTCGAAAGTTTCAGGAGAAAGAGAAACAATACGGTGATATTCTTCTAAAGGAAGGCTATACAATTGAATCTGTAATCAATGGAGAAGTTAATGTAGAACAACAGCTCTTTTGTCAAGAGGTTTCAGAGCTAAGTGCACAAGAACTTAACAAATATCTACAAGCAAAATCTCAAGTTTTATGTGCCAATATCATGAATAAGCACTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACACGCAATATCAGCCTTAAGGGAATGTCCGGTGCATTGCAAGAAGATGGGCATTTAGCTGCTAGTGTAACACTAATTGAAGCAATTAGATTTTTAAATAGATCACAGACTAATCCAAATGTTATTGATATGTATGAGCAAACTAAACAAGCAAAGGCACAAGCTAGGATTGTCAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGATTTTTTATTACAACATTACCAACTAGGGTGCGACTGGAGATAATAGAAGATTATTTCGATGCAATTGCAAAGGTTGTGCCTGAAGAATACATTTCTTATGGTGGGGATAAAAAGGTTCTAAATATTCAGAATGCACTAGAGAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGGGTATCAGAAATTACAACAAGTACTGGTAAAAGCATCAAGTTTAAGCGGAAATTAATGTATGTTAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCACCAGGAGACAATTCTGCCAAATTCAGGAGATTTACACAAGCAATATATGATGGTTTATCAGACAACAAGTTAAAATGTTGTGTTGTTGATGCATTACGCAATATTTATGAGACTGAATTCTTTATGTCTAGAAAATTACACCGATATATTGATAGTATGGAAGATCATTCAGATGCAGTTGAAGACTTCTTGGCGTTTTTTTCAAATGGAGTCTCAGCCAATGTGAAGGGAAATTGGCTTCAAGGGAATTTAAATAAATGCTCATCGTTATTTGGTGCTGCTGTCTCATTACTTTTTCGGGAGGTCTGGAAACAATTATTTCCAGAATTAGAGTGCTTTTTTGAATTTGCACATCATTCAGATGATGCATTATTTATTTATGGCTATCTAGAGCCTGAAGATGATGGAACAGATTGGTTTTTGTATGTATCACAGCAGATACAAGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTATAAATCAAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATTTACTATTAATGGGCTCCATTAAAGTGTCACCTAAGAAGACAACAGTGTCACCCACTAATGCAGAATTTCTTTCTACTTTCTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATTCCCTTTGTTAAAATATTACTAGGCTCATTATCAGATCTTCCTGGGTTAGGTTTCTTTGATGATTTGGCAGCAGCACAGAGCAGATGTGTAAAGTCATTGGATTTAGGTGCTTGCCCACAGTTAGCTCAACTAGCTATAGTGTTATGCACAAGCAAAGTTGAGAGGTTGTATGGTACTGCTGATGGAATGGTGAACTCTCCAACAGCATTCCTTAAGGTAAATAAAGCACATGTACCAGTACCACTTGGTGGTGATGGCTCGATGTCTATTATGGAACTTGCAACAGCTGGTTTTGGAATGGCAGATAAGAATATTTTAAAAAATGCATTCATATCTTATAAGCATACTCGTAGAGAAGGTGATAGATATGTCTTGGGTTTATTTAAATTTTTGATGTCATTAAGTGAGGATGTATTCCAGCATGACCGATTAGGTGAGTTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAGCTGAATTTGAATTTCATGATCAATTTTCGCATAATTATTTATTAGAATGGACACGTCAACATCCTGTGTATGACTATATTATTCCTAGAAATAGGGATAACTTGCTTGTATACCTTGTGAGAAAGTTGAATGATCCTAGCATCATCACAGCTATGACTATGCAGTCACCATTGCAACTCCGTTTTCGTATGCAGGCGAAACAACATATGAAAGTATGCCGGTATGAAGGTGAATGGGTCACATTCAGGGAGGTACTTGCTGCAGCTGATAGTTTTGCCACAAATTACCAGCCTACTGAAAGGGACATGGATCTCTTTAATACACTTGTAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTTTTAAATGAAGTAAGGTGTGAGGTCTTAACAACAAGGCATGTACATAGGCCTAAAATTGCTAGGACATTCACTGTTAGGGAAAAGGACCAGGCTATACAAAATCCAATAAACTCTGTAATTGGTTATAAGTATGCTCTTACAGTAGATGAAGTCAGTGATGTCCTTGATAGTGCATTCTTCCCGGAGTCTTTATCCGCAGACTTACAGGTTATGAAGGATGGAGTTTACAGAGAATTAGGACTTGACATAAGTTCTCCTGAGGTTTTAAAACGTATAGCACCGCTATTATATAAGGCAGGAAGGTCACGTGTTGTTATTGTTGAAGGAAATGTAGAGGGGACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTTAAGACAATGTCACTAATTAAAACAATTAGAGTAAGACCTAAGAAGGAAGTATTGAAAGCTATGTCTTTATACAGTGTTAAGGAAAATATTGGATTACAGGATGATATTGCAGCAACTCGACTGTGCATAGAAATCTGGAGGTGGTGTAAGGCAAATGAACAGGATGTCAAGGAATGGCTAACATCTTTATACTTTGAAAAACAAACATTGATGGATTGGGTAGAAAGGTTTAGAAGGAAAGGAGTTGTGCCTATTGATCCTGAAATACAGTGTATTGGCCTGCTCTTATATGATGTATTAGGTTATAAAAGTGTTTTACAAATGCAAGCAAACCGAAGAGCCTATTCAGGTAAGCAGTATGATGCATACTGTGTGCAGACGTATAACGAGGAAACAAAACTATATGAAGGTGACCTCCGTGTTACTTTCAATTTTGGTCTAGATTGTGCAAGGTTAGAAGTTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATCTTAGAGACATCGATCACCCAACGACATGTATTGCGGTTGTTGATGGAAGAAGTGTCACAAGAATTGATTAGATGTGGAATGAGATTCAAAACAGAACAGGTCAATCAAACTCGGAGCTTAGTGTTATTCAAAACAGAGGCTGGTTTTGAATGGGGCAAGCCTAATGTACCATGTATTGTATATAAACACTGTGTTTTGAGAACTGGACTCCGTACAAAACAGCCAATTAACAAAGAGTTCATGATAAATGTACAAAGTGACGGGTTCCGTGCAATAGCACAGATGGATATTGAAAGTCCACGGTTCTTGTTGGCACATGCATATCATACATTGCGTGATATTAGGTATCAGGCAGTACAGGCGGTAGGGAATGTATGGTTTAAAACAGAACAGCACAAACTATTCATCAACCCAATCATATCATCAGGACTTTTAGAAAACTTTATGAAAGGCTTACCTGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCTCTAATAATGAACAAGGCTAAAATTTCTGTGGATTTGTTTATGTTCAATGAACTATTAGCACTTATAAATAGGAATAATATTCTCAACCTTGATGGGATTGAAGAAACATCTGAAGGTTATAGTACTGTGACATCAATGTCTAGCAAGCACTGGTCTGAAGAGATGAGTTTAATGTCTGATGATGATATAGATGACATGGAGGATTTCACTATAGCGCTAGATGATATTGACTTTGAACAAATAAATTTGGAAGAAGATATACAGCATTTCCTGCAGGATGAATCAGCATATGTTGGTGATTTATTAATTCAGACAGAGGACATTGAAGTCAAGAAGATACGGGGAGTGACAAGAGTATTAGAGCCAGTTAAGCTATTAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTCTTGCTATAGATAAAGTATACAATCCTATTGGGATAATCTTAATGGCAAGATACATGTCAAAAACATACAATTTCAGTTCAACACCTCTTGCACTATTAAATCCATATGATTTGACAGAACTTGAAAGTGTTGTAAAAGGATGGGGAGAAACTGTGAATGATCGATTCAAAGATTTAGATGTTGAGGCACAAACAGTTGTTAAAGAGAAAGGTGTACAACCAGAAGATGTACTCCCTGATTCATTATTCTCTTTTAGGCATGTTGATGTTTTGCTACGAAGGTTGTTTCCGCGTGACCCTGTATCAACATTCTATTAGTGGATTTTATACCTTGTTCATACAGTATGTATATTGTAGTGTTCTT
| 46,812
|
NC_005235.1
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Nemirov,K., Vapalahti,O., Papa,A., Plyusnina,A., Lundkvist,A., Antoniadis,A., Vaheri,A., Plyusnin,A., Henttonen,H.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-11-25
| null |
Orthohantavirus dobravaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,532
|
RefSeq
| 2
|
Greece:Ano-Poroia
|
Greece
|
Apodemus flavicollis
| null | null |
SAMEA3283064
|
PRJNA485481
|
Dobrava virus complete L segment gene for polymerase protein, strain DOBV/Ano-Poroia/Afl9/1999)
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGAGACAAACTACTATAAAGATGGAAAAATACAGAGAAATTCATAGGGATCTACAATCCTTTCCAGTTGGGTCACTGACAGCAGTAGAGTGTATAGACTACCTGGATCGTCTCTATGCAATAAGGCATGACATTGTTGATCAGATGATAAAGCATGACTGGTCAGATAACAAGGATTCAGAGGAATCTATAGGAAAGGTTTTGCTGTTTGCTGGGGTGCCTAATAATGTTATAACTGCAATGGAAAAAAAGATCATTCCTGACCACCCAAGTGGTAAAACACTTCGTTCCTTCTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAGATTACAGGGTCAACGATTGAGTTTGTAGAAGTAACAGTTACTGTTGATGTTGACAAAGGAATCAGAGAGAAAAGGCTCAAGTATGAGGCAGGGCTAAAGTACATTGAACAAGAACTGCATAATCATTTTCTTAGAGGAGATATTCCACAACCTTATAAGATAACATTTCAGGTTGTCTCCGTTAGAACAGATGGTTCTAATATCTCTACACAATGGCCTAGCCGGAGGAATGATGGTGTTGTTCAATACATGAGGCTTGTACAAGCTGAAATTAGTTATGTTCGAGAGCACTTGATACGGCAGGAGGAAAGGGCTGCTCTAGAAGCAATGTTCAATCTAAAATTCAATATAAGCAACATAAAAAATCAACCATATTATATTCCTGATTACAGAGGAATCCCATTAATACATCCAAATATTAATGACTTAGTTGTATACATGAGGGATTGGTTATCAAAAAGCCATAAATTTTCATTTCATGAGGGAAAGGTCCCTGCTGTGTTTGACTGTTTTAATGAGAATGAACTTGAGCATGCTGTTAAATATCCTATTTCAAGGCATCCAAGGAACTTTTTATTGATCCAGTGCTCACTACTGTCATCCTACAACCCAGCTACAATCCTTTCTGATCAGGTCGACAGCAGACGGGCATGTAACTCTGTGTTGAACTTGATCCCTGAAACACCAACCTCCTTCTTAATACATGATATGGCATATAGGTATATCAATTTGACAAGAGAAGATATGGTTTCATTTTATGCACCCAAAACCCAATTCATACCCACACAGAATGTAAAAGAACCTGGAACTTTTAAGCTGACTGCTAACTCGATGAGGCCTGAGTCAAAGGCAATGTTAGACATGTTGGGTAGCCATGAGCCTGGTGAAAAGAAAGGTGCCCTAATTGAGAGTTTAAACCTAAGCAGCCATATAGTACAGTCTGAATGCGTCAGCCTGATTACTAAAATACTTTCTGACCTTGAGCTCAACATAAGTGAACCCACAAGTCATGGCTCCTTTACAACTAAACATACATATGTAGATAATGTTCTTGAGAAGTTTTTTCAAAATGAAATTCAAAGATATTTATTAGATGTTCTAAAAAAGACAACTGCATGGCATATTGGGCATCTCATTCGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGTCTCAAAAGATCAAAGTACTGGTCAGTACATGCATACAACAATGGGAATGTCATTTTATTCATACTCCCATCTAAATCATTGGAGGTAGCAGGGTCTTACATAAGGTTTGTGACAGTTTTTCGAATGGGTCCAGGGCTAGTCGATAAAGACAATCTGGATACAATTCTGACTGATCAGGATGTTACCTGGGGGGTTTCAAAGGTTATGAGTATTGATTTGAACAGGTTACTAGCGCTCAATATTGCATTTGAAAAGGCATTAATTGCTACAGCCACATGGTTTCAATACTATACAGAGGATCAAGGCCAGTTCCCCCTACAACATGCAATAAGGTCAGTTTTTGCTTACCATTTGTTGTTAGCTGTGTGCCAGAAGATGAAGTTGTGTGCCATTTTTGACAACTTACGATATTTAATACCTGCTGTTACATCACTTTACTCTGGATTCCCCTCTCTTATAAATAAGTTATTCGAGCGCCCCTTTAAGAGTGCTCTGGAAGTATATGTTTATTATAATATTAAGAGTCTACTTGTGGCCCTTGCACAAAATAACAAGGCTAGATTTTATTCAAAAGTAAAACTTTTAGGTCTAACAGTAGATCAATCAACTGTTGGAGCAAGTGGAATCTACCCGTCATTCATGTCCCGTGTCATTTACAAGCACTACCGTAGCTTAATATCAGAAGTAACAACTTGTTTCTTTCTGTTTGAAAAGGGTTTACATGGTAACATGAATGAGGAAGCAAAGATTCACCTTGAAACTGTGGAGTGGGCCCTAAAATTTAGGCAAAAAGAAGACCAATATGGAGAATCCATGGTTGAAAATGGTTACACAATAGGTGAACTCAATGATAATCAAGATTTAGTTGAACAACAACTATATTGTCAAGATGCTGTAGAACTTGCTGCTGTAGAACTTAATAAGATTTTATCAACAAAATCTCAGGTTGTTGCCAATAGCATTCTTAATAAATATTGGGAGGTTCCGTATTTTAGTCAGACTAGGAATATAAGTTTAAAGGGGATGTCAGGCCAAGTTCAAGAAGATGGACATCTTGCTGCATCTGTTACAATCATAGAGGCAATACGTTATCTCTCATCTTCACAGAACAATCCAAGTGTTCTACAACTTTATGAAGAGACTAGAAAAGTGAAAGCTCAAGCACGAATTGTTAGAAAATATCAGAGAACAGAGGCTGATAGAGGTTTTTTTATTACAACACTCCCAACACGATGTAGGTTAGAAATAATTGAAGATTATTACGATGCCATCTCAAAAAATGTGGCTGAAGAGTACATCTCCTATGGTGGTGAAAGGAAAATTTTATGTATTCAATCAGCTTTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCTTCTGGAGAGAGCTTTATTGAACTTAGCAACGGAAAGTTTATAAGGATGAAAAGAAAATTGATGTATGTGAGTGCTGATGCAACGAAATGGTCTCCTGGAGATAACTCAGCTAAATTCAGAAGATTCACAGCAGCTCTACATAATGGACTACCTGATGACCGTTTAAAAAATTGTGTAATTGATGCATTAAGGAATGTTTACAAAACTGACTTCTATATGTCCAGGAAATTAAGGGCTTATATAGATAACATGAATGGGCATGAGCCAGCTGTTAAGAATTTCCTGGAATTCTTCCCTGATGGTCATTGTGGAGAAGTGCGGGGCAATTGGTTGCAGGGAAATCTAAATAAGTGTTCATCTCTTTTTGGTGTAGGAATGTCGTTGCTATTTAAGCAACTTTGGAATGAATTATTCCCTGAATTAGACTGCTTCTTTGAATTTGCTCACCACTCAGATGATGCGCTCTTTATATATGGTTACCTTGAACCAATTGATGATGGAACTGATTGGTTTCTATATGTGTCTCAACAGATCCAAGCAGGTCATTTACACTGGTTTAGTGTGAACACAGAAATGTGGAAAAGTATGTTCAATCTGCATGAACACGTACTTCTCCTAGGTTCCATAAAGATATCCCCCAAGAAGACAACACTATCACCAACTAATGCGGAATTCCTCTCTACGTTCTTTGAAAGCTGTGCTGTGTCAATACCCTTTATCAAAATATTGTTAGGTTCTCTATCAGATTTGCCTGGTTTAGGTTACTTTGATGACCTTGCTGCTGCTCAAAGTAGATGTGTCAAAGCAATGGACCTTGGTGCATCACCACAAGTTGCCCAACTTGCTGTTGCACTATGCACAAATAAGGTTGAAAGATTATATGGGACAGCTGTTGGTATGATAAAACATCCATCAACATATCTTCAAGTCAAGCATGGTGATACACCTATTCCTCTAGGTGGAAGTGGTGCCATGTCAATAATGGAGCTAGCAACTGCTGGTATTGGTATGTCTGATAAAAATCTCTTAAAAAGGGCACTTTTAGGCTACATACATAAAAGGCAAAAAAATATGGCATATATTCTTGGCCTTTTTAAATTCTTAATGAACTTATCAAAAGATACATTCCAGCATGAAAGATTGGGTGAGTTTTCATTCATAGGGAAAGTGCAATGGAAAATATTTATACCGAAATCAGAGTTTGAGTTTTTTGACATGTACACACCAAAATTCTTAAAGCTATGGAGTGAACAACATGTTACTTATGATTACATTATTCCAAAGGGTAGAGATAATCTATTAATCTATCTTGTTAGGAAAATAAATGATCCAAGCATAGTCACTGCTATGACAATGCAATCACCACTCCAGTTAAGATTCAGAATGCAAGCAAAGCAACACATGAAAGTTTGCAAATTGGATGATGACTGGGTTACATTTAGGGAGATCTTAGCTGCAGCAAATAGTTTTGCACAATTGTATGAGGTAACTCAAGAAGATCTTGATCTTTTTCAGACACTAACAAGTTGTACATTTTCAAAGGAATATGCATGGAAAGATTTCTTGAATGGGGTGCAGTGTGATGTTATTCCTACGAAGCAGATCCAGAGGGCAAAAGTGGCCAGAACATTCACTGTGAGAGAAAAAGATCAGATCATTCAAAATAGTATCCCAGCTGTGATTGGGTATAAATTTGCAGTAACAGTTGATGAAATGTCAGATGTTTTGGATTCTGCAAAGTTCCCTGACTCTCTAGCTGTAGATCTGAAGACAATGAAAGATGGGGTTTATAGGGAACTTGGGTTGGATATCTCACAGGCTGAAGTAATGAAGAAGGTTGCACCTATGCTATATAAGAGCTCAAAGTCAAGGGTTGTTATTGTTCAAGGAAATGTGGAGGGCACAGCAGAGGCTATCTGTGGTTACTGGTTACGTACCATGTCCCTTGTGAAAACTATTAGGGTTAAACCGCATAAAGAAGTATTGAAAGCTGTATCCATCTTTAACAGAAAAGAGGATATTGGGCAACAAAAAGACCTTGCTGCATTGCGATTGTGCATAGAAGTTTGGCGCTGGTGTAAAGCAAATAATGCACCCTATCAAGAATGGTTTCATGCTCTGTGGTTTGAAGACAAAACATTTTCTGAGTGGCTTGATAGATTCATCCGTGTCGGTGTCCCTCCAGTGGACCCAGAGATCCAGTGTGCTGCACTAATGATTGCAGATATCAGAGGTGATCTATCTGTCCTACAAGTACAGGCAAATAGAAGAGCTTATTCAGGTAAACAATATGATGCCTATTGTGTTCAGACATATAACGAAGAAACAAAGCTCTATGAAGGTGACCTTCGAGTCACATTCAATTTTGGACTAGACTGTGCCCGCCTTGAAATATTCTGGGACAAACAAACATACATCCTTGAGACTTCAATAACACAAAAACATGTTTTGAAGATCATGATGGATGAAGTAACAAAAGAGTTGTTAAGGTGTGGAATGAGGTTTAAAACTGAACAAGTGTCTAATGTGAAACACCTAGTTTTGTTCAAGACAGAGGCAGGTTTTGAGTGGGGAAAGCCTAATATTCCTTGCATTGTATATAAAAACTGTGCACTACGTACAGGTTTAAGAGCAAACCAAACTGTTAACCACAAATTCATGATATCAATTAAGGATAACGGCCTTAGAGCTATTGCACAATATGATGATGAAAGTCCTCGGTTTTTACTTGCACATGCATTTCATACAATAAGGGATATTAGATACCAGGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTGTGGTTTATCCATAAGGGGATAAAACTATTCCTTAACCCAATTATTTCATCAGGTTTATTAGAAAATTTCATGAAAAATTTACCAGCAGCAATACCTCCTGCTGCATACTCATTAATCATGAATAGAGCTAAGATATCTGTTGATCTATTCATGTTCAATGATTTACTTAGGCTCATCAACCCATCAAATACGCTTGACCTATCCGGTTTGCAGCCAACTGAAGATGGGTTTAGCACTGTAAGCAGTATGTCAAGCAGATTATGGTCTGAAGAGGTTAGTTTTGTTGATGAAGATGAAGAGATTGATGATGAGTTCACAATAGACTTGCAGGATGTGGATTTTGAAAACATTGATGTGGAAGCTGATATTGAACATTTCTTACAAGATGAAAGTTCATATACAGGTGACTTACTCATTATGTCAGAAGAAACTGAAGTCAAGAAGATGAGAGGAATTATAAAACTGCTAGAGCCTGTTAGACTTATAAAAAGCTGGGTTTCCAAAGGTTTATGTATTGAGAAGGTATATAGCCCAACCAATATTATATTGATGACTAGATATCTTTCAAAAAATTTCAATTTTTCTGGTAGACAAGTTTCCCTTTTAGACCCATATGACTTGACTGAGTTTGAAAGCATTGTTAAAGGTTGGGGAGAATGTGTTGTTGATCAGTTCAGTACATTTGATCAGGAGACACAGCTTTTGGTATCTCAGAAAGGCATCTGCCCAGAGGATGTGGTACCTGATTCCCTTTTTTCATTTAGGCATACTATAGTTCTCTTACGTAGACTTTTTCCTCAGGACTCTGTTTCAACTTTCTACTAATTGTTTATATTTATTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 8,442
|
OK422869.1
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Jeske,K., Schulz,J., Tekemen,D., Balciauskas,L., Balciauskiene,L., Hiltbrunner,M., Drewes,S., Mayer-Scholl,A., Heckel,G., Ulrich,R.G.
|
Institute for Novel and Emerging Infectious Diseases, Friedrich-Loeffler-Institut
|
Germany
|
2022-08-22
|
LT16/Br_42
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,456
|
GenBank
| 1
|
Lithuania: Birzai
|
Lithuania
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016
| null | null |
Dobrava-Belgrade orthohantavirus isolate LT16/Br_42 segment L, complete sequence
|
ATGGAGAAATACAGAGAAATTCACAGGGATTTGCAATCCTTTCCAGTTGGGTCATTGACAGCAGTGGAGTGTATAGATTACCTCGATCGTCTCTATGCAATAAGACATGACATTGTTGACCAGATGATAAAGCATGACTGGTCAGATAATAAAGATTCAGAGGAACCTATAGGGAAGGTTCTATTATTTGCTGGGGTACCTAATAATGTCATAACTGCAATGGAAAAGAAAATCATCCCTGACCACCCAAGCGGTAAGACACTCCGATCCTTCTTCAAGATGACACCCGACAATTATAAGATAACCGGGTTAACAATTGAGTTTGTTGAGGTGACAGTTACTGCTGATGTCGATAAAGGGATTAGGGAAAAGAAGTTGAAATATGAAGCAGGATTAAAGTACATTGAAAAGGAGCTGAACAACCATTTTCTTAAAGGAGATATCCCACAACCTTACAAAATAGCATTTCAGGTTGTCTCAGTTAGAACAGATGGGTCTAATATCTCTACACAATGGCCTAGCAGAAGAAATGATGGTGTTGTTCAGTATATGAGATTAGTACAGGCTGAAATCAGTTATGTTAGGGAACATCTAATACGACAAGAAGAAAGGGCTGCATTGGAGGCAATGTTTAATTTAAAATTTAACATAAGTAATGTAAAAAATCAACCGTACTACATCCCTGATTATCGAGGAATTGCACTAATTCATCCAAACATTAATGACTTGGTTGTGTACATGAAAAGCTGGCTGTCAAAAAGTCATAAATTTTCATTTCATGAAGTAAAAGGACCTGCTGTGTTTGATTGTTTCAATGAAAATGAGCTTGAACATGCTGTAAAGTACCCCATTTCAAGGCACCCAAGAAACTTTTTATTAATACAGTGTTCACTGTTGTCTTCATATAGCCCGGCTACGATCCTCTCTGATCAAGTTGATAGCAGAAGAGCATGTAATTTTGTGTTAAACTTAATTCCTGAAACACCAACCTCATTCTTGATACATGATATGGCTTATAGGTATATCAATCTGACAAGAGAAGATATGGTTTCGTTTTATGCACCTAAGACCCAGTTCATTCCTACACAAAATGTGAAAGAACCTGGGACCTTTAAATTGACTGCTAATTCCATGAGGCCAGAGTCTAAAGCAATGTTGGATATGTTAGGTAGCCATGAACCAGGTGAGAAAAAAGGTGCTTTAATAGAGAGTTTAAATCTAAGTAGTCATATAGTCCAGTCTGAGTGTGTGAGCCTAATCACCAAAATACTTTCTGACCTTGAGCTTAATATTAGTGAGCCTACAAGCCATGGATCCTTTACTACAAAACATACATATGTTGACAATGTTTTAGATAAGTTTTTCCAAAATGAAATTCAAAAATACTTGTTGGATGTTTTGAAAAAGACAACTGCATGGCATATCGGCCACCTCATCCGGGATATAACAGAGAGTCTGATAGCTCATTCAGGTCTCAAAAGGTCGAAGTATTGGTCAATACATGCATATAATAATGGAAATGTCATTCTGTTCATACTTCCATCTAAGTCATTGGAGGTTGCTGGTTCATATATTAGGTTTGTGACAGTTTTCCGGATGGGCCCAGGTTTAGTTGATAAAGATAACTTAGATACAATATTAACTGACCAAGATGTCACTTGGGGAGTTTCAAAAGTCATGAGCATTGACCTAAATAGACTGCTAGCACTCAATATTGCGTTTGAAAAGGCATTGATTGCTACAGCTACATGGTTCCAATACTATACAGAAGATCAAGGTCAATTTCCCTTACAACATGCTGTAAGGTCAATCTTTGCATATCACTTATTATTGGCTGTGTGCCAGAAGATGAAATTATGTGCTATTTTTGACAATCTACGTTATTTAATACCTGCTGTTACATCTCTCTATTCTGGCTTTCCCTCACTTATAAATAAGTTATTTGAACGTCCTTTCAAGAGTGCCTTAGAAGTATATGTTTATTATAATATTAAAAGCCTACTTGTAGCATTGGCACAAAACAATAAGGCTCGATTCTACTCAAAAGTAAAGCTTTTAGGTCTGACAGTGGATCAATCAACAGTTGGTGCAAGCGGGATATACCCATCATTCATGTCTCGTGTGATCTATAAGCACTATCGTAGTCTTATATCAGAGGTAACTACATGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGGCTACATGGTAATATGAATGAGGAAGCAAAGATACACCTTGAGACTGTAGAATGGGCCCTTAAATTTAGACAGAAAGAAAACCAGTATGGGGAGTCTATGGTTGAGAATGGTTATACAATAGGCGAACTCAATGATAATCAGGATTTAGTTGAACAGCAGCTCTATTGTCAAGATGCTGTAGAGCTTGCTGCTGTGGAACTCAATAAAATCTTGTCAACAAAGTCCCAAGTTGTGGCTAATAGTATTCTCAGTAAGTACTGGGAAGTTCCATATTTCAGTCAGACTAGAAACATAAGCTTAAAAGGCATGTCAGGACAAGTTCAGGAAGATGGACATCTTGCTGCATCTGTTACAATTATAGAGGCAATACGTTATCTCTCATCCTCACAGAATAATCCTACTGTGCTACAACTTTATGAAGAAACTAGAAAGGTAAAGGCCCAAGCTCGCATTGTTAGAAAGTACCAAAGAACAGAGGCTGACAGAGGCTTTTTCATCACAACTCTTCCGACAAGGTGTAGATTAGAAATAATTGAAGACTATTACGATGCTATCTCAAAAAATGTAGCTGAAGAATACATCTCTTATGGTGGTGAACGCAAAATCTTATGTATTCAGTCAGCACTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCTTCTGGAGAGAGCTTTATTGAGCTTAGCAATGGGAAGTTTATAAGGATGAAAAGAAAATTAATGTATGTAAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCTCCTGGAGACAATTCAGCTAAATTTAGAAGATTTACTGCAGCTTTGCACAATGGATTGCCAGATGATCGTTTAAGGAATTGCGTGATTGATGCGCTCAGGAACGTTTACAAGACAGATTTTTATATGTCTAGAAAGTTGAGAGCATATATAGATAATATGAATGGGCATGAACCTGCTGTCAAGAATTTTCTGGAATTCTTTCCTGACGGTCATTGTGGAGAAGTCCGGGGTAATTGGCTGCAGGGAAATTTGAATAAGTGCTCATCTCTTTTTGGTGTGGGAATGTCCTTGCTCTTTAAGCAATTGTGGAACGAGTTGTTTCCTGAGCTAGATTGCTTTTTTGAATTTGCTCACCATTCAGATGATGCATTATTTATATATGGTTACCTTGAGCCAATTGATGATGGAACTGACTGGTTCCTCTACGTATCTCAACAGATCCAAGCAGGCCACTTGCACTGGTTTAGTGTGAACACTGAAATGTGGAAATGCATGTTTAATCTGCATGAGCATGTCTTGCTTCTTGGTTCCATCAAAATATCTCCCAAGAAAACAACACTATCTCCTACCAATGCAGAATTTCTTTCCACGTTCTTCGAGGGTTGTGCTGTGTCAATACCCTTTATAAAAATTTTATTGGGTTCTTTATCAGATCTACCAGGTTTAGGGTACTTTGATGATCTTGCAGCAGCCCAGAGTAGGTGTGTTAAGGCAATGGATCTCGGTGCATCACCACAGGTTGCACAGCTTGCAGTTGCACTTTGTACAAATAAAGTTGAGAGATTATATGGTACAGCTGTCGGTATGATAAATCACCCATCAACATATCTTCAGGTTAAGCATGGTGATACACCTATCCCTTTAGGTGGAAGTGGTGCTATGTCGATAATGGAATTAGCAACTGCTGGTATTGGCATGTCTGATAAAAATCTTTTAAAAAGGGCACTGTTAGGTTACATACATAAAAGGCAAAAAAACATGGCATACATTCTTGGCCTCTTTAAGTTTCTAATGAATCTGTCAAAGGACACTTTTCAACATGAAAGATTAGGTGAATTCTCATTTGTCGGGAAAGTACAGTGGAAAATATTCATTCCTAAGTCAGAATTTGAGTTTTTCGATATGTACACACCTAAGTTCTTAAAGCTCTGGAGTGAGCAACATGTTACCTATGATTATATTATCCCTAAAGGTAGAGACAATTTATTAATTTATCTTGTCAGAAAATTAAATGATCCAAGCATAGTCACTGCTATGACAATGCAATCACCACTTCAATTGAGGTTCAGGATGCAAGCAAAGCAACATATGAAAGTGTGTAAACTTGATGACAATTGGGTGACATTCAGGGAGGTCTTGGCTGCAGCAAATAGTTATGCACAATCATATGAAGTAACTCAAGAAGATCTTGACCTCTTCCAAACCTTAACAAGTTGCACATTTTCAAAGGAATATGCCTGGAAAGATTTCCTGAATGGGGTACAGTGTGATGTCATTCCAACTAAACAGATTCAAAGAGCAAAAGTAGCTAGGACTTTCACCGTGAGAGAAAAAGATCAGATCATTCAGAATAGTATCCCAGCTGTGATCGGTTACAAATTTGCGGTGACAGTTGATGAGATGTCAGATGTCTTAGACTCTGCAAAATTTCCTGACTCTTTAGCAGTAGATTTGAAGACAATGAAAGATGGGGTTTACAGAGAACTCGGACTAGATATCTCACAAGCTGAGGTAATGAAGAAGGTTGCACCAATGCTTTATAAGAGTTCAAAATCAAGGGTTGTTATTGTCCAAGGAAATGTAGAAGGCACTGCAGAGGCTATCTGTGGTTACTGGCTGCGTACCATGTCTCTTGTGAAAACAATCAGAGTTAAGCCACACAAGGAAGTATTAAAAGCAGTTTCTATTTTCAATAGGAAAGAAGACATTGGTCAACAGAAAGATCTTGCTGCATTAAGACTATGCATTGAGGTCTGGCGCTGGTGTAAAGCAAACAATGCACCCTATCAAGAGTGGTTTCATGCTTTATGGTTTGAAGATAAGACATTCTCTGAATGGTTAGATAGATTTATTCGTATAGGTGTCCCTCCGGTTGACCCTGAGATTCAGTGTGCTGCATTAATGATTGCAGATATCAGAGGTGACTTGTCCGTGCTACAAGTACAGGCTAATAGAAGAGCTTATTCAGGCAAACAATATGATGCTTACTGTGTTCAAACATATAATGAGGAGACAAAGCTCTATGAAGGTGACCTTAGAGTCACCTTTAATTTTGGGTTAGACTGTGCCAGGTTGGAAATCTTTTGGGACAAACAAACATATATTCTTGAGACTTCAATAACACAAAAACATGTCTTAAAAATTATGATGGATGAAGTGACAAAAGAGCTTTTAAAGTGTGGTATGCGATTTAAAACTGAGCAAGTTTCTAATGTCAAACACCTTGTATTGTTCAAGACAGAGGCAGGTTTTGAGTGGGGAAAACCCAATATCCCATGTATTGTGTACAAGAATTGTGCATTGCGCACAGGACTCAGGACAAATCAGACTGTTAATCATAAATTCATGATATCAATTAAAGACAATGGTCTCAGGGCTATTGCTCAATATGATGATGAAAGCCCTAGGTTTTTGCTTGCACATGCATTTCATACAATAAGGGATATTAGGTATCAGGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTGTGGTTTATCCATAAAGGGATAAAACTCTTTCTTAACCCAATTATCTCATCAGGTTTGTTAGAAAATTTCATGAAAAATCTGCCAGCTGCTATACCTCCTGCTGCATACTCACTAATCATGAATAGAGCAAAAATATCTGTTGACCTGTTTATGTTCAATGACTTACTTAGGCTCATTAATCCTTCGAATACATTAGATTTGTCTGGTCTGCAGCCAACTGAAGATGGGTTCAGTACTGTAAGCAGCTTATCGAGTAGGTTGTGGTCAGAGGAAGTTAGTTTTGTTGATGAGGATGAGGAGATTGATGATGAGTTTACGATAGATCTACAGGATGTAGATTTTGAGAATATTGATGTGGAAGCTGATATTGAACACTTTTTGCAAGATGAAAGCTCATATACAGGTGATTTGCTTATTATGTCTGAAGAGACTGAGGTTAAAAAAATGAGAGGCATTATAAAATTATTGGAACCTGTCCGACTTATAAAGAGCTGGGTTTCTAAAGGTCTATGCATCGAAAAGGTTTATAGCCCAACCAATATAATATTGATGACTAGGTACTTATCAAAGAATTTCAACTTTTCTGGAAGGCAAGTTTCCCTCTTAGATCCATATGATCTGACAGAGTTTGAAAGTATTGTTAAGGGATGGGGAGAGTGTGTTGTAGATCAGTTTAGCACATTTGATCAAGAGGCACAGCTATTAGTATCTCAGAAAGGCATCTGCCCAGAAGATGTGGTACCTGATTCTCTGTTTTCATTTAGACATACTATAGTCCTCCTGCGTAGACTTTTTCCCCAGGATTCTGTCTCAACTTTCTACTAA
| 26,698
|
OK422870.1
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Jeske,K., Schulz,J., Tekemen,D., Balciauskas,L., Balciauskiene,L., Hiltbrunner,M., Drewes,S., Mayer-Scholl,A., Heckel,G., Ulrich,R.G.
|
Institute for Novel and Emerging Infectious Diseases, Friedrich-Loeffler-Institut
|
Germany
|
2022-08-22
|
LT18/TYT_44
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,456
|
GenBank
| 1
|
Lithuania: Tytuvenai
|
Lithuania
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2018
| null | null |
Dobrava-Belgrade orthohantavirus isolate LT18/TYT_44 segment L, complete sequence
|
ATGGAGAAATACAGAGAAATTCACAGGGATTTGCAATCCTTTCCAGTTGGGTCATTAACAGCAGTGGAGTGTATAGACTACCTGGATCGTCTCTATGCAATAAGGCATGACATTGTTGACCAGATGATAAAGCATGACTGGTCAGATAATAAAGATTCAGAGGAACCTATAGGAAAAGTTCTATTATTTGCTGGGGTGCCTAATAATGTAATAACTGCAATGGAAAAGAAAATTATCCCTGACCATCCAAGTGGTAAGACACTCCGATCCTTTTTCAAGATGACACCTGACAATTATAAGATAACTGGGCTAACAATTGAGTTTGTTGAGGTGACAGTTACTGCTGATGTTGATAAAGGGATTAGGGAAAAAAAGTTGAAATATGAAGCAGGATTAAAATACATTGAACAAGAGTTGAACAACCATTTTCTCAGAGGAGATATCCCACAACCTTATAAAATAGCATTTCAGGTTGTCTCAGTTAGAACAGATGGATCTAATATCTCTACACAATGGCCTAGCAGAAGAAATGATGGTGTTGTTCAGTATATGAGATTAGTACAGGCTGAAATCAGTTATGTTAGGGAACATCTAATACGACAAGAAGAAAGAGCTGCGTTGGAGGCAATGTTTAATTTAAAGTTTAACATAAGTAATGTAAAAAATCAACCATACTACATCCCTGATTATCGAGGAATTGCACTAATTCATCCAAACATTAATGACTTAGTTGTATACATGAAAAGCTGGCTGTCGAAGAGTCATAAATTTTCATTTCATGAAGTAAAGGGACCTGCTGTGTTTGATTGTTTCAATGAAAATGAGCTTGAACATGCTGTAAAGTACCCTATTTCAAGGCACCCAAGAAACTTTTTATTAATACAGTGTTCACTGTTATCTTCATATAGCCCGGCTACAATCCTCTCTGATCAAGTTGATAGCAGAAGAGCATGTAATTTTGTATTGAACTTAATTCCTGAAACACCAACCTCATTCTTAATACATGATATGGCTTACAGGTATATCAATCTAACAAGAGAAGATATGGTTTCATTTTATGCACCTAAGACCCAGTTCATTCCTACACAAAATGTGAAAGAACCTGGGACTTTTAAATTGACTGCTAATTCTATGAGGCCAGAGTCTAAAGCAATGTTGGATATGTTAGGTAGTCATGAACCAGGTGAGAAAAAAGGTGCTTTAATTGAGAGTTTAAATTTAAGTAGCCATATAGTCCAGTCGGAGTGTGTGAGCCTAATCACCAAAATACTTTCTGACCTTGAGCTTAATATTAGTGAGCCAACAAGCCACGGATGCTTTACTACGAAACATACATATGTCGACAATGTTTTGGATAAGTTTTTTCAAAATGAAATTCAAAGATACTTATTAGATGTTTTGAAAAAGACAACTGCATGGCATATCGGCCACCTCATTCGAGATATAACAGAGAGTTTGATAGCTCATTCGGGTCTCAAAAGGTCAAAGTATTGGTCAGTACATGCATATAACAATGGAAATGTCATTTTGTTCATACTTCCATCTAAGTCATTGGAGGTCGCAGGTTCATATATTAGGTTTGTGACAGTTTTCAGGATGGGCCCAGGTTTAGTTGATAAAGATAATCTGGATACAATCTTGACTGACCAGGATGTCACTTGGGGAGTTTCAAAAGTCATGAGCATTGACTTAAATAGATTGCTAGCACTCAATATTGCATTTGAAAAGGCATTAATTGCTACAGCTACATGGTTCCAATATTATACAGAAGATCAAGGCCAATTCCCCTTACAACATGCTGTAAGGTCAATCTTTGCTTATCACTTACTATTGGCTGTGTGCCAGAAGATGAAATTATGTGCTATTTTTGACAATTTACGTTATTTAATACCTGCTGTTACATCCCTTTATTCTGGTTTTCCCTCACTTATAAATAAGTTATTTGAACGTCCTTTCAAGAGTGCTTTAGAAGTATATGTTTATTATAATATTAAAAGCTTACTTGTAGCATTGGCACAAAACAATAAGGCTCGATTCTACTCAAAAGTAAAGCTTTTAGGTCTGACAGTGGATCAATCAACAGTCGGTGCAAGTGGGATATACCCATCATTCATGTCTCGTGTCATCTATAAGCACTATCGTAGCCTTATATCAGAAGTAACTACATGTTTCTTTTTATTTGAGAAGGGGCTACATGGTAATATGAATGAGGAAGCGAAGATACATCTAGAGACTGTAGAATGGGCCCTTAAGTTTAGACAGAAAGAAAACCAGTATGGGGAGTCTATGGTTGAGAATGGTTACACAATAGGCGAACTCAATGATAATCAGGATTTAGTTGAACAACAGCTTTATTGTCAAGATGCTGTAGAGCTTGCTGCTGTAGAACTCAATAAAATATTGTCAACAAAGTCCCAAGTTGTGGCTAATAGTATTCTCAATAAGTATTGGGAAGTTCCATATTTCAGTCAGACTAGAAACATAAGCCTAAAAGGCATGTCAGGACAAGTTCAAGAAGATGGACATCTTGCTGCATCTGTTACAATTATAGAGGCAATACGGTACCTCTCGTCCTCACAGAACAATCCTAATGTGCTACAACTGTATGAGGAAACTAGAAAGGTAAAGGCCCAAGCTCGCATTGTTAGAAAGTATCAAAGAACAGAGGCTGACAGAGGCTTTTTCATCACAACTCTTCCGACAAGGTGTAGATTAGAAATAATTGAAGACTATTACGATGCCATCTCAAAAAATGTAGCTGAAGAATACATCTCTTATGGTGGTGAACGGAAAATCCTATGTATCCAGTCAGCACTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCATCTGGAGAGAGCTTTATTGAGCTTAGCAATGGGAAGTTTATAAGGATGAAAAGAAAATTAATGTATGTAAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCTCCTGGAGATAACTCAGCTAAATTTAGAAGATTTACTGCAGCTTTGCACAATGGACTGCCAGATGACCGTCTAAAGAATTGCGTGATTGATGCTCTCAGGAACGTTTATAAAACAGATTTTTATATGTCTAGAAAGTTGAGGGCATATATAGACAACATGAATGGGCATGAACCTGCTGTCAAGAATTTTCTGGAATTCTTTCCTGATGGTCATTGTGGAGAGGTCCGGGGTAATTGGCTGCAGGGAAATTTGAATAAGTGCTCATCTCTTTTTGGTGTGGGAATGTCATTGCTCTTTAAGCAATTGTGGAACGAGTTATTTCCTGAACTGGATTGCTTCTTTGAATTTGCTCACCATTCAGATGATGCATTATTTATATATGGTTACCTTGAACCAATTGATGATGGAACTGACTGGTTCCTCTATGTATCTCAACAGATCCAAGCAGGCCACTTGCACTGGTTTAGTGTGAACACTGAAATGTGGAAATGTATGTTTAATCTGCATGAGCATGTTTTGCTTCTTGGTTCCATCAAAATATCTCCCAAGAAAACAACACTATCTCCTACCAATGCAGAGTTTCTTTCCACGTTCTTCGAGGGTTGTGCTGTGTCAATACCCTTTATAAAAATCTTGTTGGGTTCTTTATCAGATCTACCAGGCTTAGGGTACTTTGATGATCTTGCAGCAGCCCAGAGTAGGTGTGTTAAGGCAATGGATCTTGGTGCATCACCGCAAGTTGCACAGCTTGCAGTTGCACTTTGTACGAATAAAGTTGAGAGATTATACGGTACAGCTGTTGGTATGATAAATCACCCATCAACATATCTCCAAGTTAAGCATGGTGATACACCTATCCCTTTAGGCGGAAGTGGTGCTATGTCAATAATGGAGTTAGCAACTGCTGGTATTGGTATGTCCGATAAAAATCTTTTAAAAAGGGCACTTTTAGGTTACGTACATAAAAGGCAGAAAAACATGGCATACATTCTTGGTCTCTTTAAGTTTTTAATGAATCTGTCAAAGGATACTTTTCAGCATGAAAGATTAGGTGAATTCTCATTTGTCGGGAAAGTACAATGGAAAATTTTCATTCCTAAGTCGGAATTTGAGTTCTTTGATATGTACACACCTAAGTTCTTGAAGCTTTGGAGTGAACAACATGTTACTTATGATTATATTATCCCTAAAGGTAGAGACAATTTGTTGATTTATCTTGTCAGAAAATTAAATGACCCAAGCATAGTCACTGCTATGACAATGCAATCACCACTTCAATTAAGGTTCAGGATGCAAGCAAAGCAACATATGAAAGTGTGTAAACTTGATGACAATTGGGTGACATTCAGGGAAGTTTTGGCTGCAGCAAATAGTTATGCACAATCATATGAAGTAACTCAAGAGGATCTTGACCTTTTCCAAACCTTAACAAGTTGCACATTTTCAAAAGAATATGCCTGGAAAGATTTCCTGAATGGGGTACAGTGTGATGTCATTCCAACTAAACAGATCCAAAGGGCAAAAGTAGCCAGGACTTTCACCGTGAGAGAAAAGGATCAGATCATTCAAAATAGTATCCCAGCTGTGATCGGCTATAAATTTGCAGTAACAGTTGATGAGATGTCAGATGTCTTAGACTCTGCAAAATTTCCTGACTCTTTAGCAGTAGATTTGAAAACAATGAAAGATGGGGTCTACAGAGAACTCGGACTAGATATCTCACAGGCTGAAGTAATGAAGAAGGTTGCACCAATGCTTTATAAGAGTTCAAAATCAAGGGTTGTTATTGTCCAAGGAAATGTGGAAGGCACCGCAGAAGCTATCTGTGGTTACTGGCTGCGTACCATGTCTCTTGTGAAAACAATTAGAGTTAAACCTCACAAGGAAGTATTAAAAGCAGTTTCTATTTTCAATAGGAAAGAAGACATTGGTCAACAGAAAGATCTTGCTGCACTAAGACTATGCATTGAGGTCTGGCGTTGGTGTAAAGCAAACAGTGCACCCTATCAAGAGTGGTTTCATGCTTTATGGTTTGAAGATAAAACATTCTCTGAATGGTTAGATAGGTTTATTCGTATAGGTGTTCCTCCAGTTGACCCAGAAATTCAGTGTGCTGCATTAATGATTGCAGATATCAGAGGTGACTTGTCTGTGCTACAAGTACAGGCTAATAGGAGGGCTTATTCAGGTAAACAATATGATGCTTATTGCGTTCAAACATATAATGAGGAAACAAAGCTCTATGAAGGTGACCTTAGAGTCACCTTTAATTTTGGGTTAGACTGTGCCCGGCTAGAAATCTTTTGGGACAAACAAACATATGTTCTTGAGACATCAATAACACAAAAACATGTCTTAAAAATTATGATGGATGAAGTGACGAAAGAGCTTTTAAAGTGTGGTATGCGATTTAAGACTGAGCAGGTTTCTAATGTCAAACACCTTGTCTTGTTCAAGACAGAGGCAGGTTTTGAGTGGGGAAAGCCCAATATCCCATGTATTGTGTACAAGAACTGTGCATTGCGCACAGGACTCAGGACAAATCAAACTGTTAACCATAAATTCATGATATCAATTAAAGACAATGGTCTCAGGGCTATTGCCCAATATGATGATGAAAGCCCTAGATTTTTGCTTGCACATGCATTTCATACAATAAGGGATATTAGGTACCAGGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTGTGGTTTATCCATAAAGGGATAAAACTCTTTCTTAACCCAATTATCTCATCAGGGTTGTTAGAAAATTTCATGAAAAACCTGCCAGCTGCCATACCTCCTGCTGCATATTCACTAATCATGAATAGAGCAAAGATATCTGTGGACCTGTTTATGTTTAATGACTTACTTAGGCTCATTAATCCTTCAAATACACTGGATCTGTCTGGTTTGCAGCCAACTGAAGATGGGTTCAGTACTGTGAGCAGCTTATCAAGTAGGTTGTGGTCAGAGGAAGTTAGTTTTGTTGATGAGGATGAGGAGATCGATGATGAGTTTACAATAGATCTACAGGATGTAGATTTTGAGAATATTGATGTGGAGGCTGATATTGAACACTTCTTGCAGGATGAGAGTTCATATACAGGTGATCTGCTTATTATGTCCGAAGAGACTGAGGTTAAAAAAATGAGAGGCATTATAAAATTATTGGAACCTGTCCGACTTATAAAGAGCTGGGTTTCTAAGGGTCTATGCATTGAAAAGGTTTATAGCCCAACCAATATAATATTGATGACTAGATATTTATCAAAGAATTTCAACTTTTCTGGAAAGCAAGTTTCCCTCTTAGATCCGTATGATCTGACAGAGTTTGAAAGTATTGTTAAAGGATGGGGAGAGTGTGTTGTAGATCAGTTTAGCACATTTGATCAAGAGGCACAGCTATTAGTATCTCAGAAAGGCATCTGCCCAGAAGATGTGGTACCTGATTCTCTGTTTTCATTTAGACATACTATAGTTCTCTTGCGTAGACTTTTTCCCCAGGATTCTGTCTCAACTTTCTACTAA
| 26,699
|
OK422871.1
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Jeske,K., Schulz,J., Tekemen,D., Balciauskas,L., Balciauskiene,L., Hiltbrunner,M., Drewes,S., Mayer-Scholl,A., Heckel,G., Ulrich,R.G.
|
Institute for Novel and Emerging Infectious Diseases, Friedrich-Loeffler-Institut
|
Germany
|
2022-08-22
|
LT18/LK_11
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,456
|
GenBank
| 1
|
Lithuania: Lukstas
|
Lithuania
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2018
| null | null |
Dobrava-Belgrade orthohantavirus isolate LT18/LK_11 segment L, complete sequence
|
ATGGAGAAATACAGAGAAATTCACAGGGATTTGCAATCCTTTCCAGTTGGGTCATTAACAGCAGTGGAATGTATAGATTACCTGGACCGTCTCTATGCAATAAGACATGACATTGTTGACCAGATGATAAAGCATGACTGGTCAGATAATAAAGATTCAGAGGAACCTATAGGGAAAGTTCTATTATTTGCTGGGGTACCCAATAATGTCATAACTGCGATGGAAAAGAAAATCATCCCTGACCATCCAAGTGGTAAGACACTCCGATCCTTCTTCAAGATGACACCTGACAATTATAAGATAACAGGGTTAACAATTGAGTTCGTTGAGGTGACAGTTACTGCTGATGTTGATAAAGGGATTAGGGAAAAGAAGTTGAAATATGAAGCAGGATTGAAGTATATTGAACAAGAGTTGAACAACCATTTTCTCAAAGGAGATATCCCACAGCCTTATAAAATAGCATTTCAGGTTGTCTCAGTTAGAACAGATGGATCTAATATCTCTACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTTCAGTATATGAGATTAGTACAGGCAGAAATCAGTTACGTTAGAGAACATCTAATACGGCAAGAAGAAAGAGCTGCTTTGGAGGCAATGTTTAATTTGAAATTTAATATAAGTAATGTAAAAAATCAACCATATTATATCCCTGATTATCGAGGAATTGCACTAATTCATCCAAACATTAATGACCTGGTTGTATACATGAAAAGCTGGCTATCAAAGAGTCATAAATTTTCATTTCATGAAGTAAAAGGACCTGCTGTGTTTGATTGTTTCAATGAAAATGAGCTTGAACATGCTGTAAAGTACCCTATTTCAAGGCACCCAAGAAACTTTTTATTAATACAGTGTTCACTGTTATCTTCATATAGTCCGGCTACGATCCTCTCTGATCAAGTTGATAGCAGAAGAGCATGTAATTTTGTGTTGAATTTAATCCCTGAAACACCAACCTCATTCTTAATACATGATATGGCTTACAGATATATCAATCTGACAAGAGAAGATATGGTTTCATTTTATGCACCTAAGACCCAGTTCATTCCCACACAAAATGTGAAAGAACCTGGGACTTTTAAATTGACTGCTAACTCTATGAGGCCAGAGTCTAAAGCAATGTTGGACATGTTGAGTAGCCATGAACCAGGTGAGAAAAAAGGTGCTTTAATTGAGAGTTTAAATCTGAGTAGCCATATAGTCCAGTCTGAGTGTGTGAGCCTAATCACCAAAATACTTTCTGACCTTGAGCTTAATATTAGTGAACCAACAAGTCACGGATCCTTTACTACGAAACATACATATGTTGACAACGTTTTAGATAAGTTTTTTCAAAATGAAATTCAAAGATACTTATTAGATGTTTTGAAAAAGACAACTGCATGGCATATTGGTCATCTCATCCGGGATATAACAGAGAGCTTGATAGCTCATTCGGGTCTCAAAAGATCAAAGTATTGGTCAATACATGCATATAACAATGGAAATGTCATTCTGTTCATACTTCCATCTAAGTCATTGGAGGTTGCAGGTTCATATATTAGGTTTGTGACAGTTTTCCGGATGGGCCCAGGTTTAGTTGATAAAGATAATTTGGATACAATATTGACTGACCAAGATGTCACTTGGGGAGTTTCAAAAGTTATGAGCATCGACTTAAATAGATTGCTAGCACTCAATATTGCATTTGAAAAGGCATTAATTGCTACAGCAACATGGTTCCAATATTATACAGAAGACCAAGGCCAATTTCCCTTACAACATGCTGTGAGGTCAATATTTGCTTATCACTTATTATTAGCCGTATGCCAAAAGATGAAGTTATGTGCTATTTTTGACAACTTGCGTTATTTAATACCTGCCGTCACATCTCTCTATTCTGGCTTTCCCTCACTTATAAATAAGTTATTTGAGCGTCCTTTCAAGAGTGCTTTAGAAGTATATGTTTATTATAATATTAAAAGCTTGCTTGTAGCATTGGCACAAAACAATAAGGCTCGATTTTACTCAAAAGTAAAACTTTTAGGTCTGACAGTGGATCAATCAACAGTTGGTGCAAGCGGGATATACCCATCATTCATGTCTCGTGTCATCTATAAGCACTATCGTAGTCTTATATCAGAGGTAACTACATGTTTCTTTTTATTTGAGAAGGGGCTACATGGTAATATGAATGAGGAAGCAAAGATACACCTTGAGACTGTAGAATGGGCCCTTAAATTTAGACAGAAAGAAAACCAGTATGGAGAGTCTATGGTTGAGAATGGCTATACAATAGGCGAACTCAATGATAATCAGGATTTAGTTGAACAACAGCTTTATTGTCAAGATGCTGTAGAGCTTGCTGCTATAGAACTCAATAAAATATTGTCAACAAAGTCCCAAGTTGTGGCTAATAGTATTCTCAATAAGTATTGGGAAGTTCCATATTTCAGTCAGACTAGAAATATAAGCTTAAAAGGCATGTCAGGACAAGTTCAGGAAGATGGACACCTTGCTGCATCTGTTACAATCATAGAGGCAATACGTTATCTCTCATCCTCACAGAACAATCCTAATGTGCTACAACTTTATGAGGAAACTAGAAAGATAAAGGCCCAAGCTCGCATTGTTAGAAAGTACCAAAGAACAGAGGCTGACAGGGGCTTCTTCATCACAACTCTTCCGACAAGATGTAGATTAGAAATAATTGAAGACTATTATGATGCCATCTCAAAAAATGTGGCTGAAGAATACATCTCTTATGGTGGTGAACGGAAAATCCTATGTATCCAGTCAGCACTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCTTCTGGAGAGAGCTTTATTGAGCTTAGCAATGGGAAATTTATAAGAATGAAAAGAAAATTAATGTATGTAAGTGCTGATGCAACGAAATGGTCTCCTGGAGACAACTCAGCTAAATTTAGAAGATTTACTGCAGCTTTGCACAATGGACTTCCAGATGACCGTCTAAGGAATTGCGTGATTGATGCTCTTAGGAATGTTTATAAAACAGATTTTTATATGTCTAGAAAATTGAGGGCATATATAGACAATATGAATGGGCATGAACCTGCTGTCAAGAATTTTCTGGAATTCTTTCCTGATGGTCATTGTGGAGAGGTCCGGGGTAATTGGCTGCAGGGAAATTTGAATAAGTGCTCATCTCTCTTCGGTGTGGGAATGTCATTGCTCTTTAAGCAATTATGGAATGAGTTATTTCCTGAGCTGGATTGCTTTTTTGAATTTGCTCACCATTCAGATGATGCATTATTTATATATGGTTACCTTGAGCCAATTGACGATGGAACTGACTGGTTCCTCTACGTATCTCAGCAGATCCAAGCAGGCCACTTGCACTGGTTTAGTGTGAATACTGAAATGTGGAAATGCATGTTTAATCTGCATGAGCATGTTTTGCTTCTCGGTTCCATCAAAATATCTCCCAAGAAAACAACACTATCTCCTACTAATGCAGAGTTTCTCTCCACGTTCTTCGAGGGTTGTGCTGTGTCAATACCCTTTATAAAAATCTTATTGGGTTCTTTATCAGATCTACCAGGCTTAGGGTACTTTGATGATCTTGCAGCAGCCCAGAGTAGGTGTGTTAAGGCAATGGACCTCGGTGCATCACCACAAGTTGCACAGCTTGCAGTTGCACTCTGTACGAATAAAGTTGAGAGACTATATGGTACAGCTGTTGGTATGATAAATCACCCATCAACATATCTTCAAGTTAAGCATGGTGATACACCTATCCCTTTAGGTGGAAGTGGTGCTATGTCAATAATGGAGTTAGCAACTGCTGGTATTGGCATGTCTGATAAAAATCTTTTAAAAAGGGCACTTTTAGGTTACATACATAAAAGGCAGAAAAACATGACATACATTCTTGGACTCTTTAAGTTTCTAATGAATCTGTCGAAGGACACTTTTCAGCATGAAAGATTAGGTGAATTCTCATTTGTCGGAAAAGTACAATGGAAAATCTTCATTCCTAAGTCAGAATTTGAGTTCTTCGACATGTACACACCTAAGTTTTTAAAGCTCTGGAGTGAGCAACATGTTACCTATGATTATATTATCCCTAAAGGTAGAGACAATTTATTGATTTATCTTGTCAGAAAACTAAATGACCCAAGCATAGTCACTGCTATGACAATGCAATCACCACTTCAATTAAGGTTCAGGATGCAAGCAAAGCAACATATGAAAGTATGTAAACTTGATGACAATTGGGTTACATTCAGGGAGGTATTGGCTGCAGCAAACAGTTATGCACAATCATATGAAGTAACTCAAGAGGATCTTGACCTCTTCCAAACCTTAACAAGTTGCACATTTTCAAAAGAATATGCCTGGAAAGATTTCTTGAATGGGGTACAGTGTGATGTCATTCCAACTAAACAGATTCAAAGAGCAAAAGTAGCCAGGACTTTTACTGTAAGAGAAAAGGATCAAATCATCCAAAATAGTATCCCAGCTGTGATCGGTTATAAATTCGCAGTAACAGTCGATGAGATGTCTGACGTTTTAGACTCTGCAAAATTCCCTGACTCTTTAGCAGTAGATTTGAAAACAATGAAAGATGGGGTCTACAGAGAACTCGGACTAGATATCTCACAAGCTGAGGTAATGAAGAAGGTTGCACCAATGCTTTATAAGAGTTCCAAATCAAGGGTTGTTATTGTTCAAGGAAATGTTGAAGGCACTGCAGAGGCTATCTGTGGTTACTGGCTGCGTACCATGTCTCTTGTGAAAACAATTAGAGTCAAGCCACACAAGGAAGTGTTAAAGGCAGTTTCTATTTTCAATAGGAAAGAAGATATTGGTCAACAGAAAGATCTTGCTGCATTAAGACTATGCATTGAGGTCTGGCGCTGGTGTAAAGCAAACAGTGCACCCTATCAAGAGTGGTTCCATGCTTTATGGTTTGAAGATAAGACATTCTCTGAATGGTTAGATAGGTTTATTCGTATAGGTGTTCCTCCGGTTGATCCAGAGATTCAGTGTGCTGCATTAATGATTGCAGATATCAGAGGTGACTTGTCTGTGCTACAAGTACAGGCTAACAGAAGAGCTTATTCAGGTAAACAATATGATGCTTATTGTGTTCAAACATATAATGAGGAAACAAAGCTCTATGAAGGTGATCTTAGAGTCACCTTCAATTTTGGGTTAGACTGTGCCCGGCTAGAAATCTTTTGGGACAAACAAACATATATTCTTGAGACTTCAATAACACAAAAACATGTCTTAAAAATTATGATGGATGAAGTGACAAAAGAGCTTTTGAAGTGTGGCATGCGATTTAAAACTGAGCAAGTTTCTAATGTCAAGCACCTTGTGTTGTTCAAGACAGAGGCAGGTTTTGAATGGGGAAAGCCCAACATCCCATGTATTGTGTATAAAAACTGTGCATTGCGTACAGGGCTCAGGACAAATCAGACTGTTAATCATAAATTCATGATATCAATCAAAGACAATGGTCTCAGGGCTATTGCCCAATATGATGATGAAAGCCCTAGGTTTTTGCTTGCACATGCATTTCATACAATAAGGGATATTAGGTATCAGGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTGTGGTTCATCCACAAAGGGATAAAACTCTTTCTTAACCCAATTATCTCATCAGGTTTGTTAGAAAATTTCATGAAAAATCTACCAGCTGCTATACCTCCTGCTGCATATTCACTAATTATGAATAGAGCAAAAATATCTGTTGACCTGTTCATGTTCAATGACTTACTTAGGCTCATTAATCCTTCGAATACGTTGGATCTGTCTGGCTTGCAGCCAACTGAAGATGGGTTCAGTACCGTAAGCAGCTTATCAAGTAGGTTGTGGTCAGAGGAAGTTAGTTTTGTTGATGAAGATGAGGAGATTGATGATGAGTTTACAATAGATCTACAGGATGTAGATTTTGAGAATATTGATGTGGAAGCTGATATTGAACACTTCTTGCAAGATGAAAGCTCATATACAGGTGATTTGCTTATCATGTCTGAAGAGACTGAAGTTAAAAAAATGAGAGGCATTATAAAATTGTTGGAACCTGTCCGACTTATAAAGAGCTGGGTTTCTAAAGGTCTATGCATCGAAAAGGTTTATAGCCCAACCAATATAATATTGATGACTAGATATTTATCAAAGAATTTTAACTTTTCTGGAAGGCAGGTTTCCCTCTTAGATCCGTATGATTTGACAGAATTTGAAAGTATTGTTAAAGGATGGGGAGAGTGTGTTGTGGATCAGTTTAGCACATTTGATCAAGAGGCACAGCTATTAGTATCTCAAAAAGGCATCTGCCCAGAAGATGTGGTACCTGATTCTCTGTTTTCATTTAGACACACCATAGTCCTCTTGCGTAGACTTTTCCCCCAGGATTCTGTCTCAACTTTCTACTAA
| 26,700
|
OM677634.1
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Leopardi,S., Drzewniokova,P., Baggieri,M., Marchi,A., Bucci,P., Bregoli,M., De Benedictis,P., Gobbo,F., Bellinati,L., Citterio,C., Monne,I., Pastori,A., Zamperin,G., Palumbo,E., Festa,F., Castellan,M., Zorzan,M., D'Ugo,E., Zucca,P., Terregino,C., Magurano,F., Schivo,A., Salviato,A., Fusaro,A., Milani,A.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie, Genomics and viral transcriptomics laboratory
|
Italy
|
2022-07-19
|
21RS2853-23
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,456
|
GenBank
| 1
|
Italy
|
Italy
|
Apodemus flavicollis
| null |
2021-07-20
| null | null |
Dobrava-Belgrade orthohantavirus isolate 21RS2853-23 segment L, complete sequence
|
ATGGAAAAATACAGAGAAATTCACAGGGATCTACAATCTTTTCCAGTTGGGTCACTGACAGCAGTAGAGTGTATAGACTACCTGGATCGTCTCTATGCAATAAGGCATGACATTGTTGATCAGATGATAAAGCATGACTGGTCAGATAATAAGGACTCAGAAGAATCCATAGGAAAGGTTTTGCTGTTTGCTGGGGTGCCTAATAATGTTATAACTGCAATGGAAAAAAAGATCATTCCTGACCACCCGAGTGGTAAGACACTCCGCTCTTTCTTTAAGATGACACCTGATAATTACAAGATTACAGGGTCAACAATTGAATTTGTAGAAGTAACAGTTACTGTCGATGTCGACAAAGGAATTAGAGAGAAAAGGCTCAAATATGAGGCAGGACTAAAGTACATTGAACAGGAACTGCATAATCACTTTCTTAAAGGAGATATCCCACAACCTTATAAGATAACATTTCAGGTTGTCTCAGTTAGAACAGACGGGTCTAATATTTCTACACAATGGCCTAGCAGAAGAAATGATGGTGTTGTTCAATACATGAGGCTTGTACAAGCTGAAATTAGCTATGTTCGAGAACACCTGATACGGCAAGAGGAAAGGGCTGCCTTGGAAGCAATGTTCAATCTAAAATTCAACATAAGTAATATAAAAAATCAACCATATTATATTCCTGATTACCGAGGAATTCCGTTAATACATCCCAATATTAATGACTTAGTTGTGTACATGAGGGATTGGTTATCAAAGAGTCATAAATTTTCATTTCATGAGGTGAAAGGTCCTGCTGTCTTTGACTGTTTTAACGAGAATGAACTCGAACATGCTGTTAAGTATCCCATCTCAAGGCATCCAAGGAATTTTTTATTGATCCAGTGCTCACTACTGTCATCCTACAATCCAGCTACAATCCTTTCTGATCAGGTTGACAGCAGAAGAGCATGTAACTCTGTGTTGAATCTAATCCCTGAAACACCAACCTCCTTCTTAATACATGATATGGCATATAGGTATATCAATTTGACAAGAGAAGATATGGTTTCATTCTATGCACCAAAAACCCAATTCATACCAACACAGAATGTAAAGGAACCTGGAACTTTTAAGCTGACTGCTAATTCTATGAGGCCTGAGTCAAAGGCAATGTTAGATATGCTGGGTAGCCATGATCCTGGTGAAAAGAAAGGTGCTCTAATTGAAAGTTTAAACCTAGGTAGTCATATAGTACAGTCTGAATGTGTCAGCCTGATTACTAAAATACTTTCTGACCTTGAACTCAATATAAGTGAACCCACAAGTCATGGCTCATTTACAACTAAACATACATATGTAGATAATGTCCTTGAGAAGTTCTTTCAGAATGAAATACAAAGATATTTATTAGATGTCCTCAAAAAGACAACTGCATGGCATCTTGGGCACCTCATTAGGGATATAACAGAAAGTTTGATTGCTCACTCAGGTCTCAAAAGATCAAAGTATTGGTCAGTGCATGCATACAACAATGGGAATGTCATTTTATTCATACTTCCATCTAAATCATTAGAGGTAGCAGGGTCTTATATAAGGTTTGTGACAGTTTTTCGAATGGGTCCAGGGTTAGTTGACAAAGACAATCTGGACACAATCTTGACTGATCAGGATGTTACCTGGGGGGTTTCAAAGGTTATGAGTATTGATTTAAACAGGTTATTAGCACTCAATATTGCATTTGAAAAGGCATTAATTGCTACAGCTACGTGGTTCCAATACTATACAGAGGATCAAGGCCAGTTTCCTCTACAACATGCAATAAGGTCAGTTTTTGCTTACCATCTATTGTTAGCTGTATGTCAGAAGATGAAGTTATGTGCTATTTTTGACAACTTACGATATCTAATACCTGCTGTTACATCTCTTTACTCTGGCTTCCCCTCTCTTATAAATAAATTATTCGAACGCCCTTTTAAGAGTGCTTTAGAAGTATATGTTTATTATAATATCAAGAGTCTACTTGTGGCTCTTGCACAGAATAACAAGGCTAGGTTTTATTCAAAAGTAAAACTTTTAGGTCTAACAGTAGATCAATCAACTGTCGGTGCAAGTGGGATTTACCCATCATTTATGTCTCGTGTTATTTACAAGCACTATCGTAGCTTGATATCAGAGGTAACAACATGTTTCTTTCTGTTTGAAAAAGGCTTACATGGTAATATGAATGAGGAAGCAAAAATACATCTTGAAACTGTAGAGTGGGCCCTTAAATTTAGGCAAAAGGAAGATCAATATGGAGAATCCATGGTTGAAAATGGTTACACAATAGGTGAACTTAGTGATAATCAAGATTTGGTTGAACAACAACTATATTGTCAGGATGCTGTAGAACTTGCTGCTATAGAACTCAATAAAATTTTATCAACAAAGTCTCAGGTTGTGGCCAATAGTATTCTTAATAAATATTGGGAGGTCCCTTATTTTAGTCAGACTAGGAACATAAGTCTAAAGGGGATGTCAGGCCAAGTTCAAGAAGATGGACATCTTGCTGCATCTGTGACAATCATAGAGGCAATACGTTATCTATCATCTTCACAGAACAATCCAAGTGTTTTACAACTTTATGAAGAAACTAGAAAAGTTAAAGCTCAAGCACGAATTGTTAGAAAGTATCAAAGAACAGAAGCTGATAGAGGTTTTTTTATCACAACACTCCCAACACGATGTAGGTTAGAAATAATTGAGGATTACTACGATGCTATCTCAAAAAATGTAGCTGAAGAGTACATCTCCTATGGTGGTGAAAGGAAAATTTTATGTATTCAATCAGCTTTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCTTCTGGAGAGAGCTTTATTGAACTCAGCAATGGGAAGTTCATAAGGATGAAAAGAAAATTGATGTATGTAAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCTCCTGGAGATAACTCAGCTAAGTTCAGAAGGTTCACAGCAGCTTTACATAACGGACTACCTGATGACCGTTTGAAAAATTGTGTAATTGATGCATTAAGGAATGTTTACAAAACTGACTTTTATATGTCCAGGAAATTAAGGGCTTATATAGATAACATGAACGGACATGAGCCTGCTGTTAAGAATTTCTTAGAATTTTTCCCTGATGGTCATTGTGGAGAAGTACGGGGTAATTGGTTGCAGGGAAATCTGAATAAGTGTTCATCTCTTTTTGGTGTAGGGATGTCACTGCTTTTTAAGCAACTTTGGAATGAGTTATTCCCTGAATTAGATTGCTTCTTTGAATTTGCTCACCATTCAGATGATGCACTCTTTATATACGGTTATCTTGAGCCAATTGATGATGGAACTGATTGGTTTCTATATGTGTCACAGCAGATTCAAGCAGGTCATTTACACTGGTTTAGTGTGAATACAGAAATGTGGAAGAGTATGTTCAATCTCCATGAGCACGTACTTCTCCTAGGCTCAATAAAGATATCCCCAAAGAAAACAACATTATCACCAACTAATGCGGAATTCCTTTCTACATTTTTTGAAGGCTGTGCTGTATCAATACCATTTATCAAAATACTGTTAGGTTCTTTATCAGATTTGCCAGGTCTAGGTTATTTTGATGACCTTGCTGCTGCCCAAAGTAGATGTGTCAAAGCAATGGACCTTGGAGCATCACCACAAGTTGCCCAGCTTGCAGTTGCATTATGCACAAATAAGGTTGAGAGATTATATGGAACAGCCGTTGGTATGATAAATCATCCATCAACATATCTCCAAGTCAAACATGGTGATACACCTATTCCTCTGGGCGGAAGTGGTGCTATGTCTATAATGGAACTAGCAACTGCTGGTATTGGTATGTCTGATAAAAATCTTTTGAAAAGAGCACTTCTAGGTTACATACATAAAAGGCAAAAAAATATGGCATATATTCTTGGTCTTTTTAAATTTTTGATGAACTTATCAAAAGATACATTCCAGCATGAAAGATTGGGTGAGTTCTCATTCATAGGGAAAGTGCAATGGAAAATATTCATACCTAAATCAGAATTTGAGTTTTTTGACATGTACACACCTAAATTTTTAAAACTTTGGAGTGAACAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCCAAAGGTAGGGACAATCTATTAATCTATCTTGTTAGAAAAATAAATGATCCAAGCATAGTCACTGCTATGACAATGCAATCACCACTCCAGTTAAGATTCAGAATGCAAGCAAAGCAGCACATGAAAGTTTGTAAATTGGATGATGACTGGGTTACATTTAGGGAGATCTTAGCTGCAGCAAACAGTTTTGCACAATCGTACGAAGTAACTCAAGAGGATCTTGACCTTTTTCAGACACTAACAAGTTGTACATTTTCAAAGGAATATGCCTGGAAAGACTTTTTGAATGGTGTACAGTGTGATGTTATTCCCACGAAGCAAATCCAGAGGGCAAAAGTGGCCAGAACATTCACTGTAAGAGAAAAGGATCAGATCATTCAAAACAGTATCCCAGCTGTAATTGGGTATAAATTTGCAGTCACAGTTGATGAAATGTCAGATGTTTTGGATTCTGCAAAATTCCCTGACTCTCTAGCTGTAGATTTAAAAACAATGAAAGATGGGGTTTATAGGGAGCTTGGGCTAGATATCTCACAAGCTGAAGTAATGAAAAAAGTTGCACCAATGTTATATAAGAGCTCAAAGTCAAGGGTTGTTATTGTTCAAGGAAATGTGGAGGGCACAGCAGAGGCTATCTGTGGTTACTGGTTACGTACCATGTCCCTCGTGAAAACTATTAGGGTCAAACCGCATAAAGAAGTACTAAAGGCTGTGTCCATTTTCAACAGAAAAGAGGATATTGGCCAACAAAAAGACCTTGCTGCATTGAGATTATGTATAGAAGTTTGGCGCTGGTGTAAAGCGAACAATGCTCCCTATCAAGAGTGGTTTCATGCTTTGTGGTTTGAAGACAAAACATTTTCTGAGTGGCTTGATAGATTCATCCGTGTTGGTGTCCCTCCAGTAGATCCAGAAATCCAGTGTGCTGCACTGATGATTGCAGATATCAGAGGTGATCTATCTGTCTTACAAGTACAGGCAAACAGAAGAGCTTATTCAGGTAAACAATATGATGCCTATTGTGTTCAAACATACAATGAAGAAACAAAGCTCTATGAAGGTGATCTTAGAGTCACGTTTAATTTCGGACTAGACTGTGCCCGTCTTGAAATATTCTGGGACAAACAAACATATATCCTTGAGACTTCAATAACACAGAAACATGTTTTGAAGATCATGATGGATGAAGTAACAAAAGAGTTGTTGAGATGCGGCATGAGGTTTAAAACTGAACAAGTGTCTAATGTGAAGCACCTAGTTCTGTTCAAGACAGAGGCAGGTTTTGAGTGGGGAAAGCCTAATATTCCTTGCATTGTGTATAAAAATTGTGCACTACGTACAGGGTTAAGGACAAATCAAACTGTTAACCATAAATTTATGATATCAATTAAAGATAATGGCCTTAGAGCTATTGCACAATATGATGATGAGAGTCCTAGGTTCTTACTTGCACATGCATTTCATACGATAAGGGATATTAGATACCAGGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTGTGGTTTATTCATAAGGGAATAAAACTCTTCCTTAACCCGATCATTTCATCAGGTCTATTGGAAAATTTCATGAAGAATTTGCCAGCAGCAATACCTCCTGCTGCATACTCATTAATTATGAATAGAGCCAAAATATCTGTTGATCTATTCATGTTCAATGACTTACTTAGGCTTATTAACCCGTCAAATACATTAGACCTATCTGGCCTGCAACCGACTGAAGATGGATTTAGCACTGTAAGTAGCATGTCAAGCAGATTATGGTCAGAAGAGGTTAGTTTTGTTGATGAAGATGAAGAGATTGATGATGAGTTTACAATAGACTTGCAGGATGTAGACTTTGAAAACATTGATGTGGAAGCTGATATTGAACATTTCTTACAGGACGAAAGCTCATATACAGGCGACTTACTCATTATGTCAGAAGAAACTGAAGTCAAAAAAATGAGAGGCATTATAAAGCTGTTAGAGCCTGTTCGACTTATAAAAAGTTGGGTCTCCAAGGGTTTATGTATTGAGAAGGTGTACAGCCCAACCAATATTATATTAATGACTAGATATCTTTCAAAAAATTTCAATTTCTCCGGTAGACAGGTTTCTCTCTTAGACCCATACGATTTAACTGAGTTTGAAAGCATCGTTAAAGGCTGGGGAGAATGTGTTGTTGATCAGTTCAGCACATTTGATCAGGAGGCACAGCTGTTGGTATCTCAGAAAGGCATTTGCCCAGAGGATGTGGTACCTGATTCTCTTTTTTCATTTAGGCATACTATAGTTCTCTTACGTAGACTTTTTCCTCAGGATTCTGTCTCAACTTTCTACTAA
| 27,983
|
OM677637.1
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Leopardi,S., Drzewniokova,P., Baggieri,M., Marchi,A., Bucci,P., Bregoli,M., De Benedictis,P., Gobbo,F., Bellinati,L., Citterio,C., Monne,I., Pastori,A., Zamperin,G., Palumbo,E., Festa,F., Castellan,M., Zorzan,M., D'Ugo,E., Zucca,P., Terregino,C., Magurano,F., Schivo,A., Salviato,A., Fusaro,A., Milani,A.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie, Genomics and viral transcriptomics laboratory
|
Italy
|
2022-07-19
|
21RS2853-24
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,456
|
GenBank
| 1
|
Italy
|
Italy
|
Apodemus flavicollis
| null |
2021-07-20
| null | null |
Dobrava-Belgrade orthohantavirus isolate 21RS2853-24 segment L, complete sequence
|
ATGGAAAAATACAGAGAAATTCACAGGGATCTACAATCTTTTCCAGTTGGGTCACTGACAGCAGTAGAGTGTATAGACTACCTGGATCGTCTCTATGCAATAAGGCATGACATTGTTGATCAGATGATAAAGCATGACTGGTCAGATAATAAGGACTCAGAAGAATCCATAGGAAAGGTTTTGCTGTTTGCTGGGGTGCCTAATAATGTTATAACTGCAATGGAAAAAAAGATCATTCCTGACCACCCGAGTGGTAAGACACTCCGCTCTTTCTTTAAGATGACACCTGATAATTACAAGATTACAGGGTCAACAATTGAATTTGTAGAAGTAACAGTTACTGTCGATGTCGACAAAGGAATTAGAGAGAAAAGGCTCAAATATGAGGCAGGACTAAAGTACATTGAACAGGAACTGCATAATCACTTTCTTAAAGGAGATATCCCACAACCTTATAAGATAACATTTCAGGTTGTCTCAGTTAGAACAGACGGGTCTAATATTTCTACACAATGGCCTAGCAGAAGAAATGATGGTGTTGTTCAATACATGAGGCTTGTACAAGCTGAAATTAGCTATGTTCGAGAACACCTGATACGGCAAGAGGAAAGGGCTGCCTTGGAAGCAATGTTCAATCTAAAATTCAACATAAGTAATATAAAAAATCAACCATATTATATTCCTGATTACCGAGGAATTCCGTTAATACATCCCAATATTAATGACTTAGTTGTGTACATGAGGGATTGGTTATCAAAGAGTCATAAATTTTCATTTCATGAGGTGAAAGGTCCTGCTGTCTTTGACTGTTTTAACGAGAATGAACTCGAACATGCTGTTAAGTATCCCATCTCAAGGCATCCAAGGAATTTTTTATTGATCCAGTGCTCACTACTGTCATCCTACAATCCAGCTACAATCCTTTCTGATCAGGTTGACAGCAGAAGAGCATGTAACTCTGTGTTGAATCTAATCCCTGAAACACCAACCTCCTTCTTAATACATGATATGGCATATAGGTATATCAATTTGACAAGAGAAGATATGGTTTCATTCTATGCACCAAAAACCCAATTCATACCAACACAGAATGTAAAGGAACCTGGAACTTTTAAGCTGACTGCTAATTCTATGAGGCCTGAGTCAAAGGCAATGTTAGATATGCTGGGTAGCCATGATCCTGGTGAAAAGAAAGGTGCTCTAATTGAAAGTTTAAACCTAAGTAGTCATATAGTACAGTCTGAATGTGTCAGCCTGATTACTAAAATACTTTCTGACCTTGAACTCAATATAAGTGAACCCACAAGTCATGGCTCATTTACAACTAAACATACATATGTAGATAATGTCCTTGAGAAGTTCTTTCAGAATGAAATACAAAGATATTTATTAGATGTCCTCAAAAAGACAACTGCATGGCATCTTGGGCACCTCATTAGGGATATAACAGAAAGTTTGATTGCTCACTCAGGTCTCAAAAGATCAAAGTATTGGTCAGTACATGCATACAACAATGGGAATGTCATTTTATTCATACTTCCATCTAAATCATTAGAGGTAGCAGGGTCTTATATAAGGTTTGTGACAGTTTTTCGAATGGGTCCAGGGTTAGTTGACAAAGACAATCTGGACACAATCTTGACTGATCAGGATGTTACCTGGGGGGTTTCAAAGGTTATGAGTATTGATTTAAACAGGTTATTAGCACTCAATATTGCATTTGAAAAGGCATTAATTGCTACAGCTACGTGGTTCCAATACTATACAGAGGATCAAGGCCAGTTTCCTCTACAACATGCAATAAGGTCAGTTTTTGCTTACCATCTATTGTTAGCTGTATGTCAGAAGATGAAGTTATGTGCTATTTTTGACAACTTACGATATCTAATACCTGCTGTTACATCTCTTTACTCTGGCTTCCCCTCTCTTATAAATAAATTATTCGAACGCCCTTTTAAGAGTGCTTTAGAAGTATATGTTTATTATAATATCAAGAGTCTACTTGTGGCTCTTGCACAGAATAACAAGGCTAGGTTTTATTCAAAAGTAAAACTTTTAGGTCTAACAGTAGATCAATCAACTGTCGGTGCAAGTGGGATTTACCCATCATTTATGTCTCGTGTTATTTACAAGCACTATCGTAGCTTGATATCAGAGGTAACAACATGTTTCTTTCTGTTTGAAAAAGGCTTACATGGTAATATGAATGAGGAAGCAAAAATACATCTTGAAACTGTAGAGTGGGCCCTTAAATTTAGGCAAAAGGAAGATCAATATGGAGAATCCATGGTTGAAAATGGTTACACAATAGGTGAACTTAGTGATAATCAAGATTTGGTTGAACAACAACTATATTGTCAGGATGCTGTAGAACTTGCTGCTATAGAACTCAATAAAATTTTATCAACAAAGTCTCAGGTTGTGGCCAATAGTATTCTTAATAAATATTGGGAGGTCCCTTATTTTAGTCAGACTAGGAACATAAGTCTAAAGGGGATGTCAGGCCAAGTTCAAGAAGATGGACATCTTGCTGCATCTGTGACAATCATAGAGGCAATACGTTATCTATCATCTTCACAGAACAATCCAAGTGTTTTACAACTTTATGAAGAAACTAGAAAAGTTAAAGCTCAAGCACGAATTGTTAGAAAGTATCAAAGAACAGAAGCTGATAGAGGTTTTTTTATCACAACACTCCCAACACGATGTAGGTTAGAAATAATTGAGGATTACTACGATGCTATCTCAAAAAATGTAGCTGAAGAGTACATCTCCTATGGTGGTGAAAGGAAAATTTTATGTATTCAATCAGCTTTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCTTCTGGAGAGAGCTTTATTGAACTCAGCAATGGGAAGTTCATAAGGATGAAAAGAAAATTGATGTATGTAAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCTCCTGGAGATAACTCAGCTAAGTTCAGAAGGTTCACAGCAGCTTTACATAACGGACTACCTGATGACCGTTTGAAAAATTGTGTAATTGATGCATTAAGGAATGTTTACAAAACTGACTTTTATATGTCCAGGAAATTAAGGGCTTATATAGATAACATGAACGGACATGAGCCTGCTGTTAAGAATTTCTTAGAATTTTTCCCTGATGGTCATTGTGGAGAAGTACGGGGTAATTGGTTGCAGGGAAATCTGAATAAGTGTTCATCTCTTTTTGGTGTAGGGATGTCACTGCTTTTTAAGCAACTTTGGAATGAATTATTCCCTGAATTAGATTGCTTCTTTGAATTTGCTCACCATTCAGATGATGCACTCTTTATATACGGTTATCTTGAGCCAATTGATGATGGAACTGATTGGTTTCTATATGTGTCACAGCAGATTCAAGCAGGTCATTTACACTGGTTTAGTGTGAATACAGAAATGTGGAAGAGTATGTTCAATCTCCATGAGCACGTACTTCTCCTAGGCTCAATAAAGATATCCCCAAAGAAAACAACATTATCACCAACTAATGCGGAATTCCTTTCTACATTTTTTGAAGGCTGTGCTGTATCAATACCATTTATCAAAATACTGTTAGGTTCTTTATCAGATTTGCCAGGTCTAGGTTATTTTGATGACCTTGCTGCTGCCCAAAGTAGATGTGTCAAAGCAATGGACCTTGGAGCATCACCACAAGTTGCCCAGCTTGCAGTTGCATTATGCACAAATAAGGTTGAGAGATTATATGGAACAGCCGTTGGTATGATAAATCATCCATCAACATATCTCCAAGTCAAACATGGTGATACACCTATTCCTCTGGGCGGAAGTGGTGCTATGTCTATAATGGAACTAGCAACTGCTGGTATTGGTATGTCTGATAAAAATCTTTTGAAAAGAGCACTTCTAGGTTACATACATAAAAGGCAAAAAAATATGGCATATATTCTTGGTCTTTTTAAATTTTTGATGAACTTATCAAAAGATACATTCCAGCATGAAAGATTGGGTGAGTTCTCATTCATAGGGAAAGTGCAATGGAAAATATTCATACCTAAATCAGAATTTGAGTTTTTTGACATGTACACACCTAAATTTTTAAAACTTTGGAGTGAACAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCCAAAGGTAGGGACAATCTATTAATCTATCTTGTTAGAAAAATAAATGATCCAAGCATAGTCACTGCTATGACAATGCAATCACCACTCCAGTTAAGATTCAGAATGCAAGCAAAGCAGCACATGAAAGTTTGTAAATTGGATGATGACTGGGTTACATTTAGGGAGATCTTAGCTGCAGCAAACAGTTTTGCACAATCGTACGAAGTAACTCAAGAGGATCTTGACCTTTTTCAGACACTAACAAGTTGTACATTTTCAAAGGAATATGCCTGGAAAGACTTCTTGAATGGTGTACAGTGTGATGTTATTCCCACGAAGCAAATCCAGAGGGCAAAAGTGGCCAGAACATTCACTGTAAGAGAAAAGGATCAGATCATTCAAAACAGTATCCCAGCTGTAATTGGGTATAAATTTGCAGTCACAGTTGATGAAATGTCAGATGTTTTGGATTCTGCAAAATTCCCTGACTCTCTAGCTGTAGATTTAAAAACAATGAAAGATGGGGTTTATAGGGAGCTTGGGCTAGATATCTCACAAGCTGAAGTAATGAAAAAAGTTGCACCAATGTTATATAAGAGCTCAAAGTCAAGGGTTGTTATTGTTCAAGGAAATGTGGAGGGCACAGCAGAGGCTATCTGTGGTTACTGGTTACGTACCATGTCCCTCGTGAAAACTATTAGGGTCAAACCGCATAAAGAAGTACTAAAGGCTGTGTCCATTTTCAACAGAAAAGAGGATATTGGCCAACAAAAAGACCTTGCTGCATTGAGATTATGTATAGAAGTTTGGCGCTGGTGTAAAGCGAACAATGCTCCCTATCAAGAGTGGTTTCATGCTTTGTGGTTTGAAGACAAAACATTTTCTGAGTGGCTTGATAGATTCATCCGTGTTGGTGTCCCTCCAGTAGATCCAGAAATCCAGTGTGCTGCACTGATGATTGCAGATATCAGAGGTGATCTATCTGTCTTACAAGTACAGGCAAACAGAAGAGCTTATTCAGGTAAACAATATGATGCCTATTGTGTTCAAACATACAATGAAGAAACAAAGCTCTATGAAGGTGATCTTCGAGTCACGTTTAATTTCGGACTAGACTGTGCCCGTCTTGAAATATTCTGGGACAAACAAACATATATCCTTGAGACTTCAATAACACAGAAACATGTTTTGAAGATCATGATGGATGAAGTAACAAAAGAGTTGTTGAGATGCGGCATGAGGTTTAAAACTGAACAAGTGTCTAATGTGAAGCACCTAGTTCTGTTCAAGACAGAGGCAGGTTTTGAGTGGGGAAAGCCTAATATTCCTTGCATTGTGTATAAAAATTGTGCACTACGTACAGGGTTAAGGACAAATCAAACTGTTAACCATAAATTTATGATATCAATTAAAGATAATGGCCTTAGAGCTATTGCACAATATGATGATGAGAGTCCTAGGTTCTTACTTGCACATGCATTTCATACGATAAGGGATATTAGATACCAGGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTGTGGTTTATTCATAAGGGAATAAAACTCTTCCTTAACCCGATCATTTCATCAGGTCTATTGGAAAATTTCATGAAGAATTTGCCAGCAGCAATACCTCCTGCTGCATACTCATTAATTATGAATAGAGCCAAAATATCTGTTGATCTATTCATGTTCAATGACTTACTTAGGCTTATTAACCCGTCAAATACATTAGACCTATCTGGCCTGCAACCGACTGAAGATGGATTTAGCACTGTAAGTAGCATGTCAAGCAGATTATGGTCAGAAGAGGTTAGTTTTGTTGATGAAGATGAAGAGATTGATGATGAGTTTACAATAGACTTGCAGGATGTAGACTTTGAAAACATTGATGTGGAAGCTGATATTGAACATTTCTTACAGGACGAAAGCTCATATACAGGCGACTTACTCATTATGTCAGAAGAAACTGAAGTCAAAAAAATGAGAGGCATTATAAAGCTGTTAGAGCCTGTTCGACTTATAAAAAGTTGGGTCTCCAAGGGTTTATGTATTGAGAAGGTGTACAGCCCAACCAATATTATATTAATGACTAGATATCTTTCAAAAAATTTCAATTTCTCCGGTAGACAGGTTTCTCTCTTAGACCCATACGATTTAACTGAGTTTGAAAGCATTGTTAAAGGCTGGGGAGAATGTGTTGTTGATCAGTTCAGCACATTTGATCAGGAGGCACAGCTGTTGGTATCTCAGAAAGGCATTTGCCCAGAGGATGTGGTACCTGATTCTCTTTTTTCATTTAGGCATACTATAGTTCTCTTACGTAGACTTTTTCCTCAGGATTCTGTCTCAACTTTCTACTAA
| 27,984
|
KT885041.1
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Miles,R.W., Lewandowski,K.
|
Public Health England, Diagnostic Support
| null |
2015-10-13
| null |
Orthohantavirus dobravaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,456
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Apodemus flavicollis
| null |
2015
| null | null |
Orthohantavirus dobravaense strain Stamforrad/POR segment L, complete sequence
|
ATGGAGAAATACAGAGAAATTCACAGGGATCTACAATCCTTTCCAGTTGGGTCACTGACAGCAGTAGAGTGTATAGACTACCTGGATCGTCTCTATGCAATAAGGCATGACATTGTTGACCAGATGATAAAGCATGACTGGTCAGATAATAAGGATTCAGAAGAATCCATAGGAAAGGTCTTGCTGTTTGCTGGGGTGCCTAATAATGTTATAACTGCAATGGAAAAAAAGATCATTCCTGACCACCCGAGTGGTAAGACACTCCGCTCTTTCTTTAAGATGACACCTGATAATTACAAGATTACAGGGTCAACAATTGAATTTGTAGAAGTAACAGTTACTGTCGATGTTGACAAAGGAATTAGAGAGAAAAGGCTTAAGTATGAGGCAGGACTAAAGTACATTGAACAGGAACTGCATAATCATTTCCTTAAAGGAGATATCCCACAACCTTATAAGATAACATTTCAGGTTGTCTCAGTTAGAACAGATGGGTCTAATATTTCTACACAATGGTCTAGCAGAAGGAATGATGGTGTTGTTCAATACATGAGGCTTGTACAAGCTGAAATTAGCTATGTTCGAGAACACCTGATACGGCAAGAGGAGAGGGCTGCCTTAGAAGCAATGTTCAATCTAAAATTCAACATAAGCAATATAAAAAATCAACCATATTATATTCCTGATTACCGAGGAACCCCGTTAATACATCCAAATATTAATGACTTAGTTGTGTACATGAGGGATTGGTTATCAAAGAGCCATAAATTTTCATTTCATGAGGTGAAAGGTCCTGCTGTCTTTGACTGTTTTAACGAGAATGAACTTGAACATGCTGTTAAATATCCTATCTCAAGGCATCCAAGGAATTTTTTATTGATCCAGTGCTCACTACTGTCATCCTACAATCCAGCTACAATCCTTTCTGATCAGGTTGACAGCAGAAGAGCATGTAACTCTGTGTTAAATCTAATCCCTGAAACACCAACCTCCTTCTTAATACATGATATGGCATATAGGTATATCAATTTGACAAGAGAAGATATGGTTTCATTCTATGCACCCAAAACCCAATTCATACCAACACAGAATGTAAAGGAACCTGGAACTTTCAAGCTGACTGCTAATTCTATGAGGCCTGAGTCAAAGGCAATGTTAGATATGCTAGGTAGCCATGAGCCCGGTGAAAAGAAAGGTGCTCTAATTGAAAGTTTAAACCTAAGCAGTCATATAGTACAGTCTGAATGTGTCAGCCTGATTACTAAAATACTTTCTGATCTTGAACTCAATATAAGTGAACCCACAAGTCACGGCACATTCACAACTAAACATACATATGTGGATAATGTCCTTGAGAAGTTCTTTCAGAATGAAATTCAAAGATATTTATTAGATGTCCTCAAAAAGACAACTGCATGGCATCTTGGGCACCTCATTAGGGATATAACAGAAAGTTTAATTGCTCACTCAGGTCTTAAAAGATCAAAGTATTGGTCAATACATGCATACAATAATGGGAATGTCATTTTATTCATACTTCCATCCAAATCACTGGAGGTAGCAGGGTCTTATATAAGGTTTGTGACAGTTTTCCGAATGGGTCCAGGGCTAGTTGACAAAGACAATCTGGACACAATCTTGACTGATCAGGATGTTACCTGGGGGGTTTCAAAGGTTATGAGTATTGATTTAAACAGGTTACTAGCACTCAATATTGCATTTGAAAAGGCATTAATTGCTACAGCTACGTGGTTCCAATACTATACAGAGGATCAAGGCCAGTTTCCTCTACAACATGCAATAAGGTCAGTTTTTGCTTACCATCTATTGTTAGCTGTATGCCAGAAGATGAAATTGTGTGCTATTTTTGACAACTTACGATATTTAATACCTGCTGTTACATCTCTTTACTCTGGCTTCCCTTCTCTTATAAATAAATTATTCGAGCGCCCTTTTAAGAGTGCTTTAGAAGTATATGTTTATCATAATATCAAGAGTCTACTTGTGGCTCTTGCACAGAATAACAAGGCTAGGTTTTATTCAAAAGTAAAACTTTTAGGTCTAACAGTAGATCAATCAACTGTCGGAGCAAGTGGGATTTACCCGTCCTTTATGTCTCGTGTTATTTACAAACACTATCGTAGCTTAATATCAGAGGTAACAACATGTTTTTTTCTGTTTGAAAAGGGCTTACATGGTAATATGAATGAGGAAGCCAAAATACATCTTGAAACTGTTGAGTGGGCCCTTAAATTTAGGCAAAAGGAAGACCAATATGGAGAATCCATGGTTGAAAATGGTTACACAATAGGTGAACTCAATGATAATCAAGATTTGGTTGAACAACAACTATATTGTCAGGATGCTGTAGAACTTGCTGCTGTAGAACTCAATAAAATCTTATCAACAAAGTCTCAGGTTGTAGCCAATAGTATTCTTAATAAATATTGGGAGGTCCCTTATTTTAGTCAGACTAGGAATATAAGTCTAAAGGGGATGTCAGGCCAAGTTCAGGAAGATGGACATCTTGCTGCATCTGTGACAATCATAGAGGCAATACGTTATTTATCATCTTCACAGAACAATCCAAGTGTTTTACAGCTTTATGAAGAAACTAGAAAAGTTAAAGCTCAAGCACGAATTGTTAGAAAGTATCAAAGAACAGAAGCTGATAGAGGTTTTTTTATTACAACACTCCCAACACGATGTAGGTTAGAAATAATTGAGGATTACTACGATGCTATCTCAAAAAATGTAGCTGAAGAGTACATCTCCTATGGTGGTGAAAGGAAAATTTTATGTATTCAATCAGCTTTAGAAAAAGCACTTAGATGGGCTTCTGGAGAGAGCTTTATTGAACTCAGCAATGGGAAGTTTATAAGGATGAAAAGAAAATTGATGTATGTAAGCGCTGATGCAACAAAATGGTCTCCTGGAGATAACTCAGCTAAGTTCAGAAGGTTCACAGCAGCTTTACATAACGGACTACCTGATGACTGTCTGAAAAACTGTGTAATTGATGCACTAAGGAATGTTTACAAAACTGACTTTTATATGTCCAGGAAATTAAGGGCTTATATAGATAACATGAACGGACATGAGCCTGCTGTTAAGAGTTTCTTAGAATTTTTCCCTGATGGTCATTGTGGAGAAGTACGGGGCAATTGGTTGCAGGGAAATCTGAATAAGTGTTCATCTCTTTTCGGTGTCGGGATGTCATTGCTTTTTAAGCAACTTTGGAATGAATTATTCCCTGAATTAGATTGCTTCTTTGAATTTGCTCACCATTCAGACGATGCACTCTTTATATACGGTTACCTTGAGCCAATTGATGATGGAACTGATTGGTTTTTATATGTGTCACAGCAGATTCAAGCAGGTCATTTACACTGGTTTAGTGTAAATACAGAAATGTGGAAAAGTATGTTTAATCTCCATGAGCACGTACTTCTCCTAGGCTCAATAAAGATATCCCCGAAGAAAACAACATTATCACCAACTAATGCGGAATTCCTTTCTACATTCTTTGAAGGCTGTGCTGTATCAATACCATTTATCAAAATACTGTTAGGTTCTTTATCAGATTTGCCAGGTCTAGGTTATTTTGATGACCTTGCTGCTGCCCAAAGTAGATGTGTCAAAGCAATGGATCTTGGAGCATCACCACAAGTTGCCCAGCTTGCGGTTGCACTATGCACAAATAAGGTTGAGAGATTATATGGAACAGCCGTTGGTATGATAAATCATCCATCAACATATCTCCAAGTCAAACATGGTGATACACCTATTCCTCTGGGTGGAAGTGGTGCTATGTCTATAATGGAACTAGCAACCGCTGGTATTGGTATGTCTGATAAAAATCTCTTGAAAAGGGCACTTCTAGGTTACATACATAAAAGGCAAAAGAATATGGCATATATTCTTGGTCTTTTTAAATTTTTGATGAACTTATCAAAAGATACATTCCAGCATGAAAGATTGGGTGAGTTCTCATTCATAGGGAAAGTGCAATGGAAAATATTTATACCTAAATCAGAATTTGAGTTTTTTGACATGTACACACCTAAATTTTTAAAACTTTGGAGTGAACAACATGTAACTTATGATTACATTATTCCAAAGGGTAGAGACAATCTATTAATTTATCTTGTTAGGAAAATAAATGATCCAAGCATAGTCACTGCTATGACAATGCAATCACCCCTCCAGTTAAGATTCAGAATGCAAGCAAAGCAACACATGAAAGTTTGCAAATTGGATGATGACTGGGTCACATTTAGGGAGATCTTAGCTGCAGCAAACAGTTTTGCACAATCGTACGAAGTAACTCAAGAGGATCTTGACCTTTTTCAGACACTAACAAGCTGTACATTCTCAAAGGAATATGCCTGGAAAGACTTCCTGAATGGTGTACAGTGTGACGTTATTCCCACGAAGCAAATCCAAAGGGCAAAAGTGGCCAGAACATTCACTGTAAGAGAAAAGGATCAGATCATTCAAAACAGTATTCCAGCTGTAATTGGGTATAAATTTGCAGTCACAGTTGATGAAATGTCAGATGTTTTGGATTCTGCAAAATTCCCTGACTCTCTAGCTGTAGATTTAAAAACAATGAAAGATGGGGTTTATAGGGAGCTTGGGCTAGATATCTCACAAGCTGAAGTAATGAAAAAGGTTGCACCAATGCTATATAAGAGCTCAAAATCAAGGGTTGTTATTGTTCAAGGAAATGTAGAGGGCACAGCAGAGGCTATCTGTGGTTACTGGTTACGTACCATGTCCCTTGTGAAAACTATTAGGGTTAAACCGCATAAAGAAGTACTAAAGGCTGTGTCCATTTTCAACAGAAAAGAGGATATTGGCCAACAAAAAGATCTTGCTGCATTGAGATTATGCATAGAAGTTTGGCGCTGGTGTAAAGCAAACAATGCCCCCTATCAAGAGTGGTTTCATGCTTTGTGGTTTGAAGACAAAACATTTTCTGAGTGGCTTGATAGATTCATCCGTGTCGGTGTCCCTCCAGTAGATCCAGAAATCCAGTGTGCTGCACTAATGATTGCAGATATCAGAGGTGATCTATCTGTCTTACAAGTACAGGCAAACAGAAGAGCTTATTCAGGTAAACAATATGATGCCTATTGTGTTCAAACATACAATGAAGAAACAAAGCTTTATGAAGGTGATCTTCGAGTCACATTTAATTTTGGACTAGACTGTGCTCGTCTTGAAATATTCTGGGACAAACAAACATATATCCTTGAGACTTCAATAACACAAAAACATGTTTTAAAGATCATGATGGATGAAGTAACAAAAGAGTTGTTAAGATGCGGCATGAGGTTTAAAACTGAACAAGTGTCCAATGTAAAGCACCTAGTTCTGTTCAAGACAGAGGCGGGTTTTGAGTGGGGAAAGCCTAATATTCCTTGTATTGTGTATAAAAATTGTGCACTACGTACAGGGTTGAGAACAAATCAAACTGTTAACCATAAATTCATGATATCAATTAAAGATAATGGCCTTAGAGCTATTGCACAATATGATGATGAAAGTCCTAGGTTCTTACTTGCACATGCATTTCATACAATAAGGGATATTAGATACCAGGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTGTGGTTTATTCATAAGGGAATAAAACTCTTCCTTAACCCGATTATTTCATCAGGCCTATTAGAAAATTTCATGAAGAATTTACCAGCAGCAATACCTCCTGCTGCATACTCATTAATTATGAATAGAGCCAAAATATCTGTTGATCTATTCATGTTCAATGACTTACTTAGGCTCATTAACCCGTCAAATACATTAGACCTATCTGGCTTGCAACCAACTGAAGATGGATTTAGCACTGTAAGTAGCATGTCAAGCAGATTATGGTCAGAAGAGGTTAGTTTTGTTGATGAAGATGAAGAGGTTGATGATGAGTTTACAATAGACTTGCAGGATGTGGACTTTGAAAACATTGATGTGGAAGCTGATATTGAACATTTCTTACAGGACGAAAGCTCATATACAGGTGACTTACTCATTATGTCAGAAGAAACTGAAGTCAAAAAAATGAGAGGCATTATAAAGCTGTTAGAGCCTGTTCGACTCATAAAAAGTTGGGTCTCCAAGGGTTTATGTATCGAGAAGGTATACAGCCCAACCAATATTATATTAATGACTAGATATCTTTCAAAAAATTTCAATTTCTCTGGTAAACAGGTTTCTCTCTTAGACCCATATGATTTAACTGAGTTTGAAAGCATTGTTAAAGGCTGGGGAGAATGTGTTGTTGATCAGTTCAGTACATTTGATCAGGAGGCACAGCTGTTGGTATCTCAGAAAGGCATTTGCCCAGAGGATGTGGTACCTGATTCTCTTTTTTCATTTAGGCATACTATAGTTCTCTTACGTAGACTTTTTCCTCAGGATTCTGTCTCAACTTTCTACTAA
| 85,232
|
JQ026206.1
|
Orthohantavirus dobravaense
|
Popugaeva,E., Witkowski,P.T., Schlegel,M., Ulrich,R.G., Auste,B., Rang,A., Kruger,D.H., Klempa,B.
|
Institute of Virology, Helmut-Ruska-Haus, Charite Medical School
|
Germany
|
2012-05-07
| null |
Orthohantavirus dobravaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,532
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
| null |
lung
|
2008
| null | null |
Dobrava-Belgrade virus strain GRW/Aa segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGAGACAAACTACTATAAAAATGGAGAAATACAGAGAAATTCACAGGGATTTACAATCCTTTCCAGTTGGGTCATTGACAGCAGTAGAGTGCATAGACTACCTGGATCGTCTCTATGCAATAAGGCATGATATTGTTGACCAAATGATAAAGCATGACTGGGCAGATAACAAGGATTCAGAAGAATCTATAGGAAAGGTTTTATTGTTTGCTGGGGTACCTAATAATGTCATAACTGCAATGGAAAAGAAAATCATCCCTGACCACCCAAGTGGTAAGACACTCCGATCCTTTTTTAAGATGACACCTGATAATTATAAGATAACAGGTTCAACAATTGAATTTGTTGAGGTGACGGTCACTGTTGATGTTGATAAGGGGATTAGGGAAAAGAAGTTGAAGTATGAAGCAGGCTTAAAGTACCTTGAACAAGAATTGCATAACCATTTTCTAAAAGGAGATATTCCACAGCCTTATAAAATAACATTCCAGGTTGTTTCAGTTAGGACAGACGGATCTAACATCTCTACACAGTGGCCCAGCAGGAGAAATGACGGGGTTGTTCAATACATGAGGCTGGTGCAGGCTGAGATTAGTTATGTCAGAGAACACTTAATACGGCAAGAGGAAAGAGCTGCATTAGAAGCAATGTTCAATTTAAAATTTAATATAAGCAATGTAAAAAATCAACCGTACTATATTCCTGATTATCGTGGAATTGCATTAATTCACCCAAACATTGATGACTTAGTTACCTATATGAAGAACTGGTTGTCAAAAAGTCATAAATTCTCATTCCATGAAGTAAAGGGTCCTGCTGTATTTGACTGTTTCAATGAAAATGAGATCGAACATGCTATAAAATATCCCATTTCGCGGCACCCGAGAAACTTTTTATTGATACAGTGCTCGCTACTATCTTCGTATAGTCCAGCTACAATTCTTTCTGATCAGGTTGATAGTAGAAGGGCATGTAATTCTGTACTAAACTTGATCCCTGAAACACCAACTTCATTTCTTATACATGATATGGCTTATCGGTATATTAATCTAACCAGAGAAGACATGGTTTCATTCTATGCACCCAAGACCCAGTTCATACCTACACAAAATGTAAAAGAGCCTGGGACTTTTAAGCTGACAGCCAATTCCATGAGGCCAGAGTCTAAAGCAATGTTTGACATGTTAGGTAGTCATGAACCAGGTGAAAAGAAAGGTGCTTTAATTGAGAGCTTGAATTTAAGCAGCCATATAGTTCAATCTGAATGTGTAAGCCTGATCACTAAAATACTTTCTGATCTTGAACTCAATATAAGTGAACCGACAAGCCACAGTTCTTTTACTACTAAACATACATATGTTGATAACGTCTTAGAAAAGTTTTTTCAAAATGAAATTCAGAGGTACTTGTTAGATGTTCTAAAGAAGACAACTGCATGGCATATCGGGCATCTTGTTCGGGATATAACAGAAAGTTTAATTGCTCATTCAGGTCTTAAAAGATCAAAGTATTGGTCAATACATGCGTATAATAACGGGAATGTGATCTTATTCATACTCCCGTCTAAATCATTAGAGGTTGCAGGGTCATATATAAGGTTTGTAACAGTTTTTCGGATGGGACCGGGTCTAGTTGATAAAGATAATCTGGATACAATATTGACTGATCAAGATATTACTTGGGGAGTCTCAAAGGTTATGAGTATTGACTTGAATAGATTATTAGCACTTAATATCGCATTTGAGAAGGCACTAATTGCCACAGCTACGTGGTTTCAGTACTATACAGAAGATCAAGGTCAGTTCCCTTTGCAGCATGCTATAAGGTCAATCTTTGCTTATCATTTGTTATTAGCTGTGTGTCAAAAGATGAAATTGTGTGCTATTTTTGATAATTTACGTTATTTAATACCTGCTGTCACATCTCTCTACTCTGGTTTCCCCTCTCTGGTAAATAAGTTATTTGAACGCCCTTTCAAAAGTGCCTTAGAGGTGTATGTCTATTACAATATTAAGAGTTTACTTGTTGCCCTTGCACAGAACAACAAGGCAAGGTTTTATTCCAAAGTGAAACTTTTAGGCTTAACAGTAGACCAATCTACTGTTGGTGCAAGTGGTATTTACCCYTCATTTATGTCTCGTGTCATTTATAAACATTATCGTAGTCTTATATCAGAAGTAACAACATGTTTTTTCTTATTTGAGAAGGGGCTGCATGGCAACATGAATGAGGAGGCAAAAATACACCTTGAGACCGTAGAATGGGCCCTCAAGTTTAGACAGAAAGAAGATCAATATGGAGAATCTATGGTTGAGAATGGTTATACAATAGGTGAACTTAATGACAACCCAGATTTGGTTGAACAGCAGCTCTACTGTCAAGATGCCGTAGAACTTGCGGCTGTAGAACTTAACAAGATACTATCAACAAAGTCCCAGGTTGTAGCCAATAGTATCCTCAATAAATATTGGGAAGTCCCTTATTTTAGCCAAACCAGGAATATAAGTTTGAAAGGGATGTCAGGGCAAGTCCAAGARGATGGGCATCTTGCTGCATCTGTTACAATTATAGAGGCAATACGTTACTTGTCATCCTCACAGCACAACCCTAGTGTACYACAACTTTATGAAGAGACTAGAAAGGTCAAAGCCCAAGCCCGCATTGTTCGAAAATACCAAAGAACAGAGGCTGATCGAGGTTTTTTCATCACAACACTTCCAACAAGGTGTAGATTAGAAATAATTGAAGATTATTATGATGCCATATCAAAAAATGTGGCTGAGGAGTACATTTCTTATGGTGGTGAACGGAAAATTCTATGTATTCAGTCAGCACTGGAAAAGGCACTTAGATGGGCCTCTGGAGAAAGTTTCATTGAGCTGAGTAATGGGAAGTTTATACGAATGAAGAGAAAGTTAATGTATGTAAGTGCTGATGCAACAAAATGGTCCCCTGGAGATAACTCAGCTAAATTCAGAAGATTCACTGCAGCTTTACATAATGGGCTGCCTGATGATCGTTTAAAAAATTGCGTAATTGATGCTCTCAGAAATGTTTACAAAACAGACTTCTATATGTCTAGAAAGCTGAGGGCTTATATAGATAATATGAATGGACTTGAGCCTGCTGTCAAAAGTTTTTTAGAATTCTTTCCTGATGGTCACTGTGGAGAAGTCCGGGGTAACTGGCTACAGGGGAACCTAAATAAGTGTTCATCTCTCTTTGGTGTGGGAATGTCATTACTTTTCAAGCAGTTGTGGAGTGAATTATTTCCAGAGTTAGATTGCTTTTTTGAATTTGCTCATCATTCAGATGATGCACTGTTCATATATGGTTACCTCGAACCGATTGATGATGGGACTGACTGGTTTCTTTATGTTTCTCAGCAAATTCAAGCAGGCCATTTACACTGGTTTAGTGTAAATACTGAAATGTGGAAAAGCATGTTTAATCTTCATGAACATGTACTACTGTTAGGCTCCATTAAGATATCCCCTAAGAAAACAACATTGTCTCCTACCAATGCAGAATTTCTTTCTACATTTTTTGAAGGTTGTGCTGTGTCAATACCCTTTGTTAAGATCTTATTGGGTTCTTTATCAGATCTACCAGGCCTGGGTTATTTTGATGATCTTGCAGCAGCCCAAAGTAGGTGTGTTAAGGCAATGGATCTTGGCGCATCGCCACAAGTTGCTCAGCTTGCAGTTGCACTATGCACAAATAAAGTTGAGAGGTTGTACGGTACAGCTGTTGGTATGGTAAATCATCCATCAACATATCTTCAGGTCAAACATGGTGATACACCTATTCCCCTAGGTGGGAGTGGTGCTATGTCAATAATGGAACTAGCAACGGCTGGAATAGGTATGTCCGATAAGAACCTTCTTAAAAGGGCTCTTCTAGGTTACATACACAAAAGGCAAAAGAACATGGCATATATCCTTGGCCTTTTTAAGTTTTTGATGAATTTATCAAAGGACACTTTTCAACATGAGAGGCTGGGTGAGTTTTCATTTATTGGAAAAGTACAATGGAAAATATTCATACCTAAATCAGAATTTGAGTTTTTTGACATGTATACACCTAAATTTTTAAAGCTCTGGAGTGAGCAACATGTAACATATGATTACATTATCCCTAAGGGCAGAGACAATTTACTAATTTACCTTGTTAGGAAAATAAATGATCCAAGTATAGTTACTGCTATGACAATGCAGTCACCACTTCAGTTAAGGTTTAGAATGCAAGCAAAACAACACATGAAAGTRTGTAAGCTTGATGATAACTGGGTTACATTTAGGGAGGTTTTAGCTGCAGCGAATAGCTTTGCACAATCKTATGAGGTGACTCAGGAAGATCTTGACCTTTTCCAAACCTTAACAAGCTGTACATTCTCAAAAGAATATGCCTGGAAGGACTTCCTAAATGGTGTACAATGTGATGTCATTCCAACAAAACAGATTCAAAGAGCAAAGGTAGCTAGGACTTTCACTGTAAGGGAGAAGGACCAAATCATTCAGAATAGCATTCCAGCCGTCATCGGTTACAAGTTTGCAGTGACAGTTGACGAAATGTCAGATGTCTTAGACTCAGCAAAATTCCCTGACTCACTAGCTGTAGACTTAAAAACTATGAAAGATGGGGTCTACAGAGAACTTGGATTAGATATCTCACAGGCTGAGGCAATGAAAAAGGTTGCACCAATGCTTTATAAAAGTTCAAAGTCAAGGGTGGTTATTGTGCAAGGAAATGTAGAAGGTACAGCTGAGGCTATCTGTGGCTACTGGTTGCGCACAATGTCCCTCGTGAAAACAATTAGAGTGAAGCCGCACAAAGAAGTATTGAAAGCTGTATCTATTTTTAATAGAAAGGAAGATATTGGTCAGCAGAAAGACCTTGCTGCACTGAGATTATGTATAGAAGTTTGGCGCTGGTGTAAAGCAAATAATGCACCTTATCAAGAATGGTTTCATGCTTTGTGGTTTGAAGATAAGACATTCTCTGAATGGTTGGATAGGTTCATCCGTATAGGTGTCCCTCCAGTGGATCCAGAGATTCAATGTGCCGCATTGATGATTGCAGATATCAGAGGTGATCTGTCTGTTTTACAGATACAGGCAAATAGGAGAGCTTATTCGGGTAAACAGTATGATGCATATTGTATTCAAACATACAATGAAGAAACAAAGCTATATGAGGGTGACCTCCGAGTCACCTTCAATTTTGGATTGGACTGTGCCCGTCTTGAAATCTTTTGGGACAAGCAAACATATATCCTGGAAACTTCAATAACACAAAAACATGTACTTAAGATCATGATGGATGAAGTGACAAAAGAATTATTGAGATGTGGTATGAGATTTAAAACTGAACAAGTTTCTAGTGTGAAACACCTTGTATTGTTTAAAACAGAGGCAGGTTTTGAATGGGGAAAACCTAACATCCCATGTATTGTATATAAAAATTGTGCATTGCGTACAGGGCTTAGAACAACTCAGACTGTCAATCATAAATTTATGATATCAATTAAAGACAATGGTCTTAGGGCCATTGCTCAATATGATGATGAAAGTCCTAGGTTTTTACTTGCACATGCATTTCATACAATAAGAGACATCAGGTACCAAGCAGTTGATGCTGTGAGTAATGTATGGTTTGTCCATAAAGGGATAAAACTCTTTCTTAATCCGATCATATCATCAGGCTTATTAGAGAATTTCATGAAAAATCTACCGGCAGCAATACCCCCTGCTGCATACTCACTAATTATGAATAGAGCAAAAATATCTGTTGATTTGTTTATGTTTAATGATTTGCTCAGGCTTATTAACCCAGCAAATACATTGGACCTATCTGGTTTGCAGCCAACTGAGGACGGATTTAGTACTGTGAGCAGTATGTCAAGTAGACTATGGTCAGAAGAAGTTAGCTTTGTTGATGAGGATGAGGAGGTTGATGATGAATTTACAATAGATTTACAGGATGTGGATTTTGAGAATATTGATGTAGAAGCTGATATTGAACATTTTTTACAAGATGAGAGCTCACATACAGGTGACTTACTTATTATGTCAGAAGAAACTGAAGTTAAAAAGATGAGAGGCATTATAAAACTATTAGAACCTGTCAGGCTCATAAAGAGTTGGGTATCTAAAGGCTTATGTATTGAAAAGGTTTATAGCCCAACTAATATTATATTAATGACTAGATATTTATCAAAGAATTTTAGTTTTTCTGGTAGACAGGTTTCCCTTCTAGACCCATATGATTTGACAGAATTTGAAAGCGTTGTCAAAGGATGGGGAGAGTGTGTTGTTGATCAGTTTAGCACATTTGATCAGGAGGCACAGCTTCTAGTATCTCAGAAAGGTATTTGTCCAGAAGATGTGGTACCTGATTCTCTRTTTTCATTCAGACATACTATAGTTCTCCTGCGTAGACTTTTCCCTCAGGATTCTGTTTCAACATTCTATTAATTGTTTATATTCATTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 97,148
|
NC_005222.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Schmaljohn,C.S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-11-18
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,533
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Hantaan virus segment L, complete genome
|
TAGTAGTAGACTCCCTAAATAACAAACTCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGTTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACATTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTATCTTGATAGACTTTACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCAGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAGAAAATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTAAAGGCCTTCTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAGAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACCTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTCCTAAAGGGTGAGATCCCACAACCCTATAAAATAACATTTAATGTAGTTGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTATGTTAGAGAGCACTTGATCAAAACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTAAAATTCAACATAAGTACACACAAAAGCCAGCCCTATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCAATAGGAGCAAATATTGAAGACTTAGTGGACTATTCGAAAGACTGGTTGTCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGATATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAATTTCCTACTCATACAATGTTCTTTAATCACATCTTATAAACCTGCTACCACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATACATTCTAAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCCTATCTGATCCATGATATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAAGATATGATTAATTATTATGCCCCGCGGATACAGTTTAAACAGACACAAAATGTAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGTTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTTAATAATCATAAAAGTGGTGAAAAGCATGGTGCACAAATAGAGAGCCTAAATATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCTGATTTAGAATTGAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTCGATACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAAAATGAAACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAAACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGTTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTATTTATTCTCCCATCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTCAGAATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAACTTGGATACAATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTTATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTTGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTCTGTTAGCTATATGCCAAAAGATGAAACTCTGTGCCATCTTTGACAATTTACGTTATCTTATACCTGCAGTAACATCATTATACTCTGGGTTTCCATCACTGATAGAAAAATTATTTGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAGAGCCTGTTAGTTGCACTTGCTCAAAATAATAAAGCCAGATTCTATTCTAAGGTAAAGTTACTAGGCTTAACAGTTGACCAATCAACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTCATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTAACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTTCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATTCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCAGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTCTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTGCGAGCAAATGCAGAGTTGGCAGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCTATTGAGTTGGCAGCAATAGAATTAAATAAAGTCTTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGTATATTGAGTAAGAACTGGGAAGAACCATATTTTAGTCAAACAAGAAATATCAGCCTGAAAGGCATGTCAGGGCAGGTTCAGGAAGATGGCCATTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAGGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCCTAAAATTATATGAGGAAACAAGGGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTGAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTTGAAATTATTGAGGACTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAGTACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATTCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATCGAACTTAGTAACCACAAATTTATTAGGATGAAGCGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGAGATAATTCAGCAAAGTTCCGTAGGTTCACCTCCATGCTACATAACGGACTTCCCAATAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGGAATTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTTTAGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAAGTGAAGGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTGAACAAGTGTTCTTCACTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTACTATTTAAACAGGTATGGACTAACTTATTCCCTGAGCTTGATTGTTTCTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTCATTTATGGATACTTGGAACCAGTAGATGATGGGACTGACTGGTTTTTGTTTGTCTCACAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAGCATATACTTCTTCTAGGCTCCATCAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAAATACTCTTAGGTTCTCTATCAGACTTACCAGGATTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCCGCACAAAGTAGGTGTGTTAAGGCTCTGGACCTTGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCGCCAGGCATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAGGTTAAGCATACTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTGGGATACTCACACAAGAGACAAAAATCAATGCTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTCTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATCGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCGAAGGGCAGAGACAATCTTCTCATTTATTTAGTCCGAAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCTTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCTAAGCAGCACATGAAGGTGTGTAGATTGGATGGAGAATGGGTTACTTTCAGGGAAGTTCTGGCAGCTGCAAACAGTTTTGCGGAGAATTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATCTATTTCAAACGTTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCCTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCGACAAAACAGGTTCAAAGGGCCAAAGTTGCACGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTACTGGACACAGCCAAGTTCCCAGACTCTCTATCTGTTGACCTAAAGACAATGAAAGACGGAGTTTATCGTGAGTTAGGGTTGGACATATCCTTACCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGGAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTCGCTACTGGCTAAAATCAATGTCATTGGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAAGAAGTCCTTCAAGCAGTTTCTATTTTTAATCGCAAAGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCTCTTAAACTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCTCTATGGTTCGAGGATAAAACCTTTTCAGAGTGGTTAGATAGGTTTTGTAGGGTTGGAGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATAGCTGATATAAAGGGTGATTACTCAGTCTTGCAGTTACAAGCGAATAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATATTGTGTACAAACATATAATGAAGTGACAAAGCTTTATGAGGGAGACCTAAGGGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCGATTACACAAAAGCATGTATTGAAGATCATGATGGATGAGGTTTCGAAAGAGTTGATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAACAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTGTTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCATGTATTGTTTATAAGAACTGTGTCCTAAGGACAAGCCTTAGGACTACGCAAGCAATTAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGCCCAAGATTCCTATTAGCTCATGCATTTCACACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCGGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAACTGTATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCATATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGACCTCTTTATGTTTAACGATTTACTTAAGCTAATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGGGATGAATTCAGTACTGTAAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTAGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTCACAATTGACTTGCAAGATGTGGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTGCAGGATGAAAGTTCATACACAGGAGACCTATTAATCAGCACAGAGGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATAGTGAAAATACTTGAGCCTGTTAGATTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGGTTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGGTATATCTCCAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTAGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGACCAGTTCGAAAGTCTCGATAGAGAGGCTCAGAATATGGTTGTTAATAAAGGAATATGCCCTGAGGATGTTATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCACACCATGGTACTGTTGAGGAGGTTATTCCCGCAGGATTCTATTTCCTCTTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTACTA
| 8,447
|
MK548664.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2020-03-01
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-06-21
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-19-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTACCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAAATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAACATTACTACACAATGGCCCAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGGGAGCACTTGATCAAAACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGTGCAAATATTGAAGATTTAGTGAACTATTCTAAGGAATGGTTATCAAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGGTATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGCTCTTTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGCAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCGCAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTTCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGCTTAGTGGATAAAGATAATTTGGACACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAGAAATTATTTGAACGCCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTTTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTCTACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGCCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTGAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTGTACTGCCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATTCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGACAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGATTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTTATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGAAATTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTCTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATATTTAGAACCAGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTGTTGGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGGTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTCAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTACAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAAAAATCAATGTTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGACCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGGTTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAATTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTGCTGGATACAGCCAAATTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGATGGAGTGTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTGAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTAAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCGAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTCGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAATGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCGAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCGTTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGTTGATTAACCCTAGGAATACACTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTGAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATCTCCTCTTTTTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 53,732
|
MK548667.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2020-03-01
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-10-12
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-50-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAAGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAGATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCCAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTATGTTAGAGAGCACTTGATCAAAGCTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTATTTGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGGTATTCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGCTCTTTAATCACATCTTACAAACCTGCCACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTAATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAAGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCGCAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAGCTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTCCCATCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAATTTGGATACTATATTAATTGACGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTTATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCCATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAAAAATTATTTGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTCGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACCTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTGAAATTGTATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGACTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTTATTAGGATGAGACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGGCTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTGAGGAACTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTCTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAGGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATATTTAGAACCAGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTCTTGGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTATCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAAATACTATTAGGTTCCCTGTCAGATTTACCCGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTTGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAGAAATCAATGCTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGGTTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAGTGCTACTAGGCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATCCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTACTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGACTTAAAGACAATGAAAGATGGAGTTTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCCATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGGAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTAAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAAGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATGTATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGTGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGGAAACCAAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTCAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTTTATTAGCTCATGCATTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAGAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGTTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTCGAAACGACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAGGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTTAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGTTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCGTTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCACACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTCCCACAGGATTCTATTTCCTCTTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 53,733
|
MK548668.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2020-03-01
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-11-25
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-181-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAAAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTAACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAGATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGAGAGCACTTGATTAAGACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTCAATCTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCAATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAAGCCAATCATTGTCAGAAGTATCCTATGTCCAGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGTTCTTTAATCACATCATACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATCGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCACAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATCCTCCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAGTAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAATTTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTGAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACGTGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAGTTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTTTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTCCCTTCACTGATAGAAAAATTATTTGAACGTCCATTTAAATCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCACAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAGGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAGTCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTAGCTGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTCGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTAAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGACTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTCATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTGATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGGAACTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAGACAGTTTTTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTCGCACATCACTCTGATGATGCATTATTCATTTATGGATACTTGGAACCTGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTATTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCTGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTTTTGGGTTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGTACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAGAAATCAATGCTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAAATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAATCAACATGTAACTTATGATTATATTATCCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAATGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAGTTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTACTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGACTTAAAGACAATGAAAGACGGGGTTTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTAGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCTATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTCAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTCCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAACAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGGTTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGGAAACCTAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCATTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCCTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAGATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACGACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAGGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGATATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACGGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTAAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAACTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCCTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 53,734
|
MK548669.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2020-03-01
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-11-25
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-185-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAAAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTAACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAGATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGAGAGCACTTGATTAAGACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTCAATCTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCAATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAAGCCAATCATTGTCAGAAGTATCCTATGTCCAGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGTTCTTTAATCACATCATACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATCGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCACAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATCCTCCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAGTAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAATTTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTGAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACGTGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAGTTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTTTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTCCCTTCACTGATAGAAAAATTATTTGAACGTCCATTTAAATCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCACAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAGGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAGTCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTAGCTGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTCGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTAAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGACTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTCATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTGATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGGAACTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAGACAGTTTTTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTCGCACATCACTCTGATGATGCATTATTCATTTATGGATACTTGGAACCTGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTATTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCTGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTTTTGGGTTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGTACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAGAAATCAATGCTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAAATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAATCAACATGTAACTTATGATTATATTATCCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAATGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAGTTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTACTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGACTTAAAGACAATGAAAGACGGGGTTTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTAGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCTATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTCAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTCCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAACAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGGTTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGGAAACCTAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCATTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCCTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAGATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACGACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAGGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGATATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACGGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTAAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAACTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCACACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCCTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 53,735
|
MK548691.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2020-03-01
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,510
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-06-21
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-19-R segment L, complete sequence
|
GACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTACCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAAATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAACATTACTACACAATGGCCCAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGGGAGCACTTGATCAAAACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGTGCAAATATTGAAGATTTAGTGAACTATTCTAAGGAATGGTTATCAAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGGTATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGCTCTTTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGCAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCGCAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTTCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGCTTAGTGGATAAAGATAATTTGGACACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAGAAATTATTTGAACGCCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTTTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTCTACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGCCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTGAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTGTACTGCCAAGACGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATTCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGACAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGATTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGAGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTTATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGTTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGAAATTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTCTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATATTTAGAACCAGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTGTTGGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCTCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGGTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTCAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTACAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAAAAATCAATGTTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGGTTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAATTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTGCTGGATACAGCCAAATTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGATGGAGTGTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTAAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCGAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTCGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAATGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCGTTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGTTGATTAACCCTAGGAATACACTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGGGATGGATTCAGTACTGTAAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTGAAAATACTTGAGCCTGTTAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCACACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATCTCCTCTTTTTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 53,736
|
MK548692.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2020-03-01
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-10-12
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-50-R segment L, complete sequence
|
TACTACTACACTCCCGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAAGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAGATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCCAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTATGTTAGAGAGCACTTGATCAAAGCTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTATTTGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGGTATTCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGCTCTTTAATCACATCTTACAAACCTGCCACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTAATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAAGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCGCAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAGCTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTCCCATCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAATTTGGATACTATATTAATTGACGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTTATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCCATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAAAAATTATTTGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTCGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACCTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTGAAATTGTATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGACTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTTATTAGGATGAGACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGGCTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTGAGGAACTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTCTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAGGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATATTTAGAACCAGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTCTTGGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTATCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAAATACTATTAGGTTCCCTGTCAGATTTACCCGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTTGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAGAAATCAATGCTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGGTTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAGTGCTACTAGGCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATCCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTACTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGACTTAAAGACAATGAAAGATGGAGTTTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCCATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGGAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTAAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAAGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATGTATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGTGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGGAAACCAAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTCAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTTTATTAGCTCATGCATTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAGAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGTTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTCGAAACGACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAGGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTTAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGTTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCGTTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCACACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTCCCACAGGATTCTATTTCCTCTTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 53,737
|
MK548693.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2020-03-01
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,486
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-11-25
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-181-R segment L, complete sequence
|
CAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAAAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTAACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAGATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGAGAGCACTTGATTAAGACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTCAATCTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCAATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAAGCCAATCATTGTCAGAAGTATCCTATGTCCAGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGTTCTTTAATCACATCATACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATCGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCACAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATCCTCCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAGTAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAATTTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTGAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACGTGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAGTTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTTTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTCCCTTCACTGATAGAAAAATTATTTGAACGTCCATTTAAATCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCACAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAGGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAGTCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTAGCTGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTCGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTAAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGACTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTCATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTGATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGGAACTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAGACAGTTTTTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTCGCACATCACTCTGATGATGCATTATTCATTTATGGATACTTGGAACCTGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTATTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCTGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTTTTGGGTTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGTACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAGAAATCAATGCTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAAATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAATCAACATGTAACTTATGATTATATTATCCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAATGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAGTTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTACTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGACTTAAAGACAATGAAAGACGGGGTTTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTAGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCTATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTCAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTCCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAACAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGGTTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGGAAACCTAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCATTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCCTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAGATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACGACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAGGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGATATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACGGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTAAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAACTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCACACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCCTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTT
| 53,738
|
MK548694.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2020-03-01
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-11-25
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-185-R segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCCGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAAAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTAACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAGATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGAGAGCACTTGATTAAGACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTCAATCTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCAATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAAGCCAATCATTGTCAGAAGTATCCTATGTCCAGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGTTCTTTAATCACATCATACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATCGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCACAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATCCTCCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAGTAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAATTTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTGAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACGTGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAGTTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTTTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTCCCTTCACTGATAGAAAAATTATTTGAACGTCCATTTAAATCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCACAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAGGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAGTCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTAGCTGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTCGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTAAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGACTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTCATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTGATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGGAACTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAGACAGTTTTTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTCGCACATCACTCTGATGATGCATTATTCATTTATGGATACTTGGAACCTGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTATTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCTGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTTTTGGGTTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGTACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAGAAATCAATGCTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAAATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAATCAACATGTAACTTATGATTATATTATCCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAATGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAGTTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTACTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGACTTAAAGACAATGAAAGACGGGGTTTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTAGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCTATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTCAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTCCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAACAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGGTTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGGAAACCTAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCATTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCCTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAGATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACGACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAGGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGATATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACGGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTAAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAACTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCACACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCCTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 53,739
|
MK548665.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-06-21
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-21-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTACCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAAATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAACATTACTACACAATGGCCCAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGGGAGCACTTGATCAAAACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGTGCAAATATTGAAGATTTAGTGAACTATTCTAAGGAATGGTTATCAAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGGTATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGCTCTTTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGCAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCGCAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTTCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGCTTAGTGGATAAAGATAATTTGGACACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAGAAATTATTTGAACGCCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTTTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTACCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTAACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGCCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTGAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTGTACTGCCAAGACGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATTCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGACAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGATTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTTATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGAAATTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTCTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATATTTAGAACCAGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTGTTGGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGGTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTCAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTACAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAAAAATCAATGTTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGACCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGGTTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAATTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTGCTGGATACAGCCAAATTCCCAGATTCTCTATCTGTTGACTTAAAGACAATGAAAGATGGAGTGTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTAAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCGAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTCGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAATGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCGTTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGTTGATTAACCCTAGGAATACACTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGGGATGGATTCAGTACTGTAAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTGAAAATACTTGAGCCTGTTAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATCTCCTCTTTTTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,429
|
MK548666.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2016-06-21
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa16-22-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTACCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAAATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAACATTACTACACAATGGCCCAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGGGAGCACTTGATCAAAACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGTGCAAATATTGAAGATTTAGTGAACTATTCTAAGGAATGGTTATCAAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGGTATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGCTCTTTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGCAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAAGATATGATTAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCGCAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTTCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGCTTAGTGGATAAAGATAATTTGGACACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAGAAATTATTTGAACGCCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCTCAAAATAATAAAGCCAGATTCTATTCTAAGGTAAAGTTACTAGGCTTAACAGTTGACCAATCAACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTCATGTCACGTATAGTCTACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGCCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTGAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTGTACTGCCAAGACGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATTCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGACAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGATTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTTATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGTTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGAAATTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTCTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATATTTAGAACCAGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTGTTGGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGGTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTCAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTACAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAAAAATCAATGTTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGACCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGGTTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAATTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTGCTGGATACAGCCAAATTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGATGGAGTGTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTAAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCGAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTCGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAATGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCATGTATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCGTTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGTTGATTAACCCTAGGAATACACTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGGGATGGATTCAGTACTGTAAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTGAAAATACTTGAGCCTGTTAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATCTCCTCTTTTTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,430
|
MK548670.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2017-04-18
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa17-52-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACTCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAATGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCTGTAAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCGATAGGGAAAGTACTATTATTTGCAGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCCACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGACAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAGAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGTTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTAAAGGGTGAGATCCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCCAGTAGGAGAAATGACGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGAGAGCACTTGATCAAAACTGAAGAGAGAGCAGCACTAGAAGCAATGTTTAACTTGAAGTTCAATATAAGTACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCTGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAAGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACGGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAAATATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAATTTCTTACTAATACAATGTTCATTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATACATTCTAAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTATTTGATCCATGATATGGCATATAGATACATAAACCTAACACGAGAAGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAAAATATAAGAGAGCCAGGAACATTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAGGCAATGTTAGATTTACTTAATAATCATAAAAGTGGTGAGAAACATGGTGCACAAATAGAAAGCCTAAATATTGCTAGTCATATTGTGCAGTCTGAATCCGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCCGATTTAGAACTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGATACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAAACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGTTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGTAACGTCATATTGTTTATTCTTCCATCAAAGTCACTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGGATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAACCTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATCTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTTGAAAAGGCTTTGATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGATCAGGGGCAATTCCCATTACAGTATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTCTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAAAAATTATTCGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTGAAGTTACTGGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGCGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAATAACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCAGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTGGAAAATGGATATATGATGTGGGAACTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTATACTGTCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAACTGAATAAGGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGTATATTGAGCAAAAATTGGGAGGAACCATATTTTAGTCAAACAAGAAATATCAGCTTGAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTGTCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAACCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGGGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTTGAAATTATTGAGGACTACTACGATGCCATAGCCAAGAATATCTCTGAAGAATATATATCGTATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCACAAATTTATTAGGATGAAGCGTAAGCTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGAGATAATTCAGCAAAGTTCCGTAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCCAATAATAAGCTAAAAAATTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTCATGTCAAGGAAACTAAGGAATTATATTGACAGCATGGGGAGCCTTGACCCACACATCAAACAATTTCTTGATTTTTTTCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAGAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAAGTATGGACTAATTTATTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATACTTGGAACCGGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATCTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTCCTAGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACCACAGTATCCCCGACAAATGCTGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGATGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTTTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTAGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCAGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCGATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACGGCTGGGATTGGGATGTCAGACAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAAAGACAAAAATCAATGCTATATATATTAGGTTTATTTAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGACGAAACATTTCAACATGAGAGGCTAGGACAATTTTCCTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATTTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTATACATCAAAATTTCTAGAGCTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGGGACAATCTTCTCATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGACCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAGGGTGTGTAGATTGGATGGGGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTTTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAATTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCCAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGACCAGATCATACAAAATAGCATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGACGTATTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGACGGAGTTTATCGTGAGCTAGGGTTAGACATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGGATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGAGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTGAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAAGTTCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAAGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAACTGTGCATAGAAATTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATAGGTTCTGTAGGGTTGGAGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGCGCAGCATTAATGATAGCTGATATAAAGGGTGATTACTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACTTAAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTCTGGGATAAAAAGGCATATATACTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTACTTAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGTTGATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAACAGGTCCAGGGAGTACGGCACATGGTGTTGTTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCTTGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATTAACCATAAATTTATGATCACAATAAAGGATGATGGGCTCCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCGAGATTTTTATTAGCTCATGCATTTCACACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTGGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAACTGTATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCCGCAATCCCTCCCGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCAGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGAGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTAGATGATGATGAAGAGCTTGATGACGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTGGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTATTGATCAGCACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATAGTGAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTGTCGATTGAGAAAGTATATAGCCCTGTTAATATCATCTTAATGTCACGGTATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTGTTAGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTCGAAAGTCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTTAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTTATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCTTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,431
|
MK548671.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2017-04-27
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa17-66-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAATTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTACCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAAATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAACATTACTACACAATGGCCCAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGGGAGCACTTGATCAGAACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTGAAGTTCAACATAGGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGAACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGGTATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGCTCTTTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCGCAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTCCCGTCAAAGTCACTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGCTTAGTGGATAAAGATAATTTGGACACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTTGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAGAAATTATTTGAACGCCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTTTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTACCCTTCATTTATGTCACGTATAGTCTACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGCCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTGTACTGCCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATTCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGACAGGGGATTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGATTACTATGATGCCATTGCTAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTTATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGAAATTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTCTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAGATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATATTTAGAACCAGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTGTTGGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGGTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTCAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTACAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCGATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAAAAATCAATGTTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAAGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGACCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGGTTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAATTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTGCTGGATACAGCCAAATTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGATGGAGTGTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTGAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTAAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAATCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAGTTGTGCATAGAAGTCTGGAGATGGTGTAAAGCGAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAATGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCGTTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGTTGATTAACCCTAGGAATACACTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTGAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATCTCCTCTTTTTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,432
|
MK548672.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2017-04-27
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa17-76-P segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGTGACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAATTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTACCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAAATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAACATTACTACACAATGGCCCAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGGGAGCACTTGATCAGAACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTTAATTTGAAGTTCAACATAGGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGAACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAGGTATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAACTTCTTACTAATACAATGCTCTTTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCGCAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTCCCGTCAAAGTCACTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGCTTAGTGGATAAAGATAATTTGGACACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTTGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAATTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAGAAATTATTTGAACGCCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTTTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCTTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTCTACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGCCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTGTACTGCCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATTCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGACAGGGGATTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGATTACTATGATGCCATTGCTAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTTATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGAAATTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAAACAGTTTCTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAGATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATATTTAGAACCAGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTGTTGGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGGTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTCAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTACAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAAAAATCAATGTTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAAGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGACCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGGTTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTCAGGGAAATTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTGCTGGATACAGCCAAATTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGATGGAGTGTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTGAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTAAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAATCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAGTTGTGCATAGAAGTCTGGAGATGGTGTAAAGCGAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAATGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAGGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCGTTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGTTGATTAACCCTAGGAATACACTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTGAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAGACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATCTCCTCTTTTTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,433
|
MK548695.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2017-03-09
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa17-8-R segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCCTAAATAACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGGACACTAACTGCAGTAGAGTGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCCGTGAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTACTATTATTTGCGGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAAAAAAAGATAATACCAAATCATCCTACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTAACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAAAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGCTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTGAAGGGTGAGATTCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTGGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGATGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTACGTTAGAGAGCACTTGATTAAGACTGAGGAGAGAGCTGCACTAGAAGCCATGTTCAATCTGAAGTTCAACATAAGCACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCAGATTATAAGGGGATGGAACCAATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAGGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACAGCAGTGTTCGAGTGCTTCAATTCAAATGAAGCCAATCATTGTCAGAAGTATCCTATGTCCAGAAAGCCTAGGAACTTCTTACTAATACAATGTTCTTTAATCACATCATACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATATATTCTGAACTTAATTCCAGATACACCAGCATCTTACCTGATCCATGACATGGCATATAGATACATAAACCTAACAAGAGAGGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAATTTAAACAGACACAGAATATAAGAGAGCCAGGAACGTTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAAGCAATGCTAGATTTACTCAATAATCATAAAAGTGGAGAGAAGCATGGTGCACAAATAGAGAGCCTAAACATTGCTAGTCATATTGTACAGTCTGAATCTGTTAGCCTGATTACAAAAATATTGTCTGATTTAGAATTAAATATAACTGAGCCATCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGACACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAGACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGCTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGCAATGTCATATTGTTTATTCTCCCGTCAAAGTCGCTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAATTTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATTTAAATAGGCTGCTAGCATTAAATATAGCTTTCGAAAAGGCTTTAATTGCAACAGCCACGTGGTTCCAATACTATACAGAAGACCAAGGGCAGTTCCCATTACAATATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTTTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTTTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTGACATCATTATACTCTGGGTTCCCTTCACTGATAGAAAAATTATTTGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCACAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTAAAGCTACTAGGCCTAACAGTGGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGTGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAGTGACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAGGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCCGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAGTCTTTAGTAGAAAATGGATATATGATGTGGGAGCTACGGGAGAATGCTGAGTTAGCTGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCTGTTGAGTTGGCAGCAATAGAATTGAATAAAGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGCATATTGAGCAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGCCAAACAAGAAATATTAGCTTAAAAGGTATGTCAGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTATCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAATCCTAGCCTCTTAAAATTATATGAGGAGACAAGAGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTCGAAATTATTGAGGACTACTATGATGCCATTGCCAAGAATATTTCTGAAGAATACATATCATATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATCCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCATAAATTCATTAGGATGAAACGTAAACTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGGGATAATTCAGCAAAGTTCCGAAGGTTTACCTCCATGCTACATAATGGACTCCCTAACAATAAGCTAAAAAACTGTGTGATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTTATGTCAAGGAAACTAAGGAACTATATTGACAGCATGGAAAGCCTTGACCCACACATCAGACAGTTTTTGGATTTTTTCCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAAAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCGCTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAGGTATGGACAAATTTGTTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTCGCACATCACTCTGATGATGCATTATTCATTTATGGATACTTGGAACCTGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTATTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGCCATTTGCACTGGTTTAGTGTTAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTTTTGGGTTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACTACAGTGTCCCCGACAAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATATTATTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTCGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGTACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCGGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCAATTCCATTGGGAGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATTGGGATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGCGCACTTCTAGGATACTCACACAAGAGACAGAAATCAATGCTATATATATTAGGTCTATTCAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGATGAAACATTTCAACATGAGAGGTTAGGGCAATTTTCTTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAAATCTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTACACATCAAAATTTTTAGAGTTATGGAGTAATCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGAGACAATCTTCTTATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCCTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAAAGTGTGTAGACTAGATGGAGAATGGGTTACCTTTAGGGAAGTTCTGGCTGCTGCTAACAGTTTTGCAGAAAGTTATAATGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTTTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCTAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGATCAGATCATACAAAATAGTATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGATGTACTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGACTTAAAGACAATGAAAGATGGGGTTTATCGTGAGCTAGGGTTGGATATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGAATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGGGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTAGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAGGTCCTTCAAGCAGTTTCTATTTTCAACCGTAAGGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTCAAGTTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATCGGTTCTGTAGGGTTGGGGTCCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGTGCAGCATTAATGATTGCTGATATAAAGGGTGATTATTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGAGCATATTCAGGTAAACAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACCTGAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTTTGGGATAAAAAAGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAGAAGCATGTATTAAAGATCATGATGGATGAGGTTTCGAAAGAGCTAATTAAGTGTGGGATGAGGTTTAATACAGAGCAGGTCCAAGGAGTACGGCACATGGTATTATTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGGAAACCTAATATTCCATGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAGGCAATCAACCATAAATTTATGATTACAATAAAAGATGATGGGCTTCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCAAGATTTCTATTAGCTCATGCATTTCATACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTAGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAATTATATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCTGCAATCCCTCCTGCTGCCTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAGATATCTGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACGACAGGGGATGGATTCAGTACTGTGAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAGGAAATGAGCTTAGTGGATGATGATGAAGAGCTTGATGATGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTAGATTTTGAGAATATAGATATAGAAGCAGATATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTACTGATCAGTACGGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATTGTGAAAATACTTGAGCCTGTCAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTATCTATTGAAAAAGTATATAGTCCTGTTAATATTATCTTAATGTCACGATATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTATTGGATCCATATGATTTAACGGAACTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTTGAAAATCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTCAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTCATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCACACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCCTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,434
|
MK548696.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,511
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2017-04-18
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa17-48-R segment L, complete sequence
|
TAACAAACTCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAATGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCTGTAAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCGATAGGGAAAGTACTATTATTTGCAGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCCACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTCTTCAAGATGACACCTGACAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAGAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGTTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTAAAGGGTGAGATCCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTAGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCCAGTAGGAGAAATGACGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTATGTTAGAGAGCACTTGATCAAAACTGAAGAGAGAGCAGCACTAGAAGCAATGTTTAACTTGAAGTTCAATATAAGTACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCTGATTATAAGGGGATGGAGCCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAAGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACGGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAAATATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAATTTCTTACTAATACAATGTTCATTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATACATTCTAAACTTAATCCCAGATACACCAGCATCTTATTTGATCCATGATATGGCATATAGATACATAAACCTAACACGAGAAGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAGTTTAAACAGACACAAAATATAAGAGAGCCAGGAACATTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAGGCAATGTTAGATTTACTTAATAATCATAAAAGTGGTGAGAAACATGGTGCACAAATAGAAAGCCTAAATATTGCTAGTCATATTGTGCAGTCTGAATCCGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCCGATTTAGAACTAAATATAACTGAGCCCTCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGATACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAAACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGTTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGTAACGTCATATTGTTTATTCTTCCATCAAAGTCACTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAACCTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATCTAAATAGGCTGCTAGCACTAAATATAGCTTTTGAAAAGGCTTTGATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGATCAGGGGCAATTCCCATTACAGTATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTCTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTAACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAAAAATTATTCGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTGAAGTTACTGGGCTTAACAGTTGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGCGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAATAACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCAGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTGGAAAATGGATATATGATGTGGGAACTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTATACTGTCAAGATGCCGTTGAGTTGGCAGCAATAGAACTGAATAAGGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGTATATTGAGCAAAAATTGGGAGGAACCATATTTTAGTCAAACAAGAAATATCAGCTTGAAAGGTATGTCTGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTGTCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAACCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGGGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTTGAAATTATTGAGGACTACTACGATGCCATAGCCAAGAATATCTCTGAAGAATATATATCGTATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATTCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCACAAATTTATTAGGATGAAGCGTAAGCTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGAGATAATTCAGCAAAGTTCCGTAGGTTTACCTCCATGCTGCATAATGGACTCCCCAATAATAAGCTAAAAAATTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTCATGTCAAGGAAACTAAGGAATTATATTGACAGCATGGGGAGCCTTGACCCACACATCAAACAATTTCTTGATTTTTTTCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAGAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCACTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAAGTATGGACTAATTTATTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATACTTGGAACCGGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGTCATCTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTCCTAGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACCACAGTATCCCCGACAAATGCTGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGATGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTTTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTAGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCAGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCGATTCCATTGGGGGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACGGCTGGGATTGGGATGTCAGACAAAAATCTATTAAAGCGTGCACTTCTAGGATACTCACACAAAAGACAAAAATCAATGCTATATATATTAGGTTTATTTAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGACGAAACATTTCAACATGAGAGGCTAGGACAATTTTCCTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATTTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTATACATCAAAATTTCTAGAGCTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGGGACAATCTTCTCATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCTTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAGGGTGTGTAGATTGGATGGGGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTTTGGCTGCAGCTAACAGTTTTGCGGAAAATTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCCAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGACCAGATCATACAAAATAGCATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGACGTATTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGACGGAGTTTATCGTGAGCTAGGGTTAGACATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGGATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGAGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAAGTTCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAAGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAACTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATAGGTTCTGTAGGGTTGGAGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGCGCAGCATTAATGATAGCTGATATAAAGGGTGATTACTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGGGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACTTAAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTCTGGGATAAAAAGGCATATATACTAGAAACATCAATCACACAGAAGCATGTACTTAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGTTGATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAACAGGTCCAGGGAGTACGGCACATGGTGTTGTTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCTTGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAAGCAATTAACCATAAATTTATGATCACAATAAAGGATGATGGGCTCCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCGAGATTTTTATTAGCTCATGCATTTCACACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTGGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAACTGTATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCCGCAATCCCTCCCGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCAGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGAGATGGATTCAGTACTGTAAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTAGATGATGATGAAGAGCTTGATGACGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTGGATTTCGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTATTGATCAGCACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATAGTGAAAATACTTGAGCCTGTGAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTGTCGATTGAGAAAGTATATAGCCCTGTTAATATCATCTTAATGTCACGGTATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTGTTAGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTCGAAAGTCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTTAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTTATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCTTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,435
|
MK548697.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2017-04-18
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa17-49-R segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCCTAAATGACAAACTCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAATGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCTGTAAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCGATAGGGAAAGTACTATTATTTGCAGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCCACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTCTTCAAGATGACACCTGACAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAGAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGTTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTAAAGGGTGAGATCCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTAGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCCAGTAGGAGAAATGACGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTATGTTAGAGAGCACTTGATCAAAACTGAAGAGAGAGCAGCACTAGAAGCAATGTTTAACTTGAAGTTCAATATAAGTACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCTGATTATAAGGGGATGGAGCCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAAGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACGGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAAATATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAATTTCTTACTAATACAATGTTCATTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATACATTCTAAACTTAATCCCAGATACACCAGCATCTTATTTGATCCATGATATGGCATATAGATACATAAACCTAACACGAGAAGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAGTTTAAACAGACACAAAATATAAGAGAGCCAGGAACATTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAGGCAATGTTAGATTTACTTAATAATCATAAAAGTGGTGAGAAACATGGTGCACAAATAGAAAGCCTAAATATTGCTAGTCATATTGTGCAGTCTGAATCCGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCCGATTTAGAACTAAATATAACTGAGCCCTCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGATACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAAACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGTTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGTAACGTCATATTGTTTATTCTTCCATCAAAGTCACTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAACCTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATCTAAATAGGCTGCTAGCACTAAATATAGCTTTTGAAAAGGCTTTGATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGATCAGGGGCAATTCCCATTACAGTATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTCTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTAACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAAAAATTATTCGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTGAAGTTACTGGGCTTAACAGTTGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGCGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAATAACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCAGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTGGAAAATGGATATATGATGTGGGAACTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCAGAACAACAATTGTACTGTCAAGATGCCATTGAGTTGGCAGCAATAGAACTGAATAAGGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGTATATTGAGCAAAAATTGGGAGGAACCATATTTTAGTCAAACAAGAAATATCAGCTTGAAAGGTATGTCTGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTGTCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAACCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGGGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTTGAAATTATTGAGGACTACTACGATGCCATAGCCAAGAATATCTCTGAAGAATATATATCGTATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATTCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCACAAATTTATTAGGATGAAGCGTAAGCTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGAGATAATTCAGCAAAGTTCCGTAGGTTTACCTCCATGCTGCATAATGGACTCCCCAATAATAAGCTAAAAAATTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTCATGTCAAGGAAACTAAGGAATTATATTGACAGCATGGGGAGCCTTGACCCACACATCAAACAATTTCTTGATTTTTTTCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAGAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCACTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAAGTATGGACTAATTTATTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATACTTGGAACCGGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGTCATCTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTCCTAGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACCACAGTATCCCCGACAAATGCTGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGATGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTTTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTAGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCAGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCGATTCCATTGGGGGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACGGCTGGGATTGGGATGTCAGACAAAAATCTATTAAAGCGTGCACTTCTAGGATACTCACACAAAAGACAAAAATCAATGCTATATATATTAGGTTTATTTAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGACGAAACATTTCAACATGAGAGGCTAGGACAATTTTCCTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATTTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTATACATCAAAATTTCTAGAGCTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGGGACAATCTTCTCATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCTTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAGGGTGTGTAGATTGGATGGGGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTTTGGCTGCAGCTAACAGTTTTGCGGAAAATTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCCAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGACCAGATCATACAAAATAGCATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGACGTATTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGACGGAGTTTATCGTGAGCTAGGGTTAGACATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGGATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGAGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAAGTTCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAAGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAACTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATAGGTTCTGTAGGGTTGGAGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGCGCAGCATTAATGATAGCTGATATAAAGGGTGATTACTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGGGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACTTAAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTCTGGGATAAAAAGGCATATATACTAGAAACATCAATCACACAGAAGCATGTACTTAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGTTGATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAACAGGTCCAGGGAGTACGGCACATGGTGTTGTTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCTTGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAAGCAATTAACCATAAATTTATGATCACAATAAAGGATGATGGGCTCCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCGAGATTTTTATTAGCTCATGCATTTCACACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTGGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAACTGTATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCCGCAATCCCTCCCGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCAGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGAGATGGATTCAGTACTGTAAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTAGATGATGATGAAGAGCTTGATGACGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTGGATTTCGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTATTGATCAGCACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATAGTGAAAATACTTGAGCCTGTGAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTGTCGATTGAGAAAGTATATAGCCCTGTTAATATCATCTTAATGTCACGGTATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTGTTAGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTCGAAAGTCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTTAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTTATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCACGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCTTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,436
|
MK548698.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,487
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2017-04-18
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa17-52-R segment L, complete sequence
|
GACAAACCCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAATGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCTGTAAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCGATAGGGAAAGTACTATTATTTGCAGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCCACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTCTTCAAGATGACACCTGACAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAGAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGTTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTAAAGGGTGAGATCCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTAGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCCAGTAGGAGAAATGACGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTATGTTAGAGAGCACTTGATCAAAACTGAAGAGAGAGCAGCACTAGAAGCAATGTTTAACTTGAAGTTCAATATAAGTACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCTGATTATAAGGGGATGGAGCCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAAGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACGGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAAATATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAATTTCTTACTAATACAATGTTCATTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATACATTCTAAACTTAATCCCAGATACACCAGCATCTTATTTGATCCATGATATGGCATATAGATACATAAACCTAACACGAGAAGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAGTTTAAACAGACACAAAATATAAGAGAGCCAGGAACATTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAGGCAATGTTAGATTTACTTAATAATCATAAAAGTGGTGAGAAACATGGTGCACAAATAGAAAGCCTAAATATTGCTAGTCATATTGTGCAGTCTGAATCCGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCCGATTTAGAACTAAATATAACTGAGCCCTCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGATACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAAACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGTTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGTAACGTCATATTGTTTATTCTTCCATCAAAGTCACTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAACCTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATCTAAATAGGCTGCTAGCACTAAATATAGCTTTTGAAAAGGCTTTGATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGATCAGGGGCAATTCCCATTACAGTATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTCTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTAACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAAAAATTATTCGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCTAGATTCTATTCTAAGGTGAAGTTACTGGGCTTAACAGTTGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGCGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAATAACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCAGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTGGAAAATGGATATATGATGTGGGAACTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTATACTGTCAAGATGCCGTTGAGTTGGCAGCAATAGAACTGAATAAGGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGTATATTGAGCAAAAATTGGGAGGAACCATATTTTAGTCAAACAAGAAATATCAGCTTGAAAGGTATGTCTGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTGTCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAACCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGGGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTTGAAATTATTGAGGACTACTACGATGCCATAGCCAAGAATATCTCTGAAGAATATATATCGTATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATTCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCACAAATTTATTAGGATGAAGCGTAAGCTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGAGATAATTCAGCAAAGTTCCGTAGGTTTACCTCCATGCTGCATAATGGACTCCCCAATAATAAGCTAAAAAATTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTCATGTCAAGGAAACTAAGGAATTATATTGACAGCATGGGGAGCCTTGACCCACACATCAAACAATTTCTTGATTTTTTTCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAGAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCACTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAAGTATGGACTAATTTATTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATACTTGGAACCGGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGTCATCTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTCCTAGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACCACAGTATCCCCGACAAATGCTGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGATGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTTTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTAGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCAGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCGATTCCATTGGGGGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACGGCTGGGATTGGGATGTCAGACAAAAATCTATTAAAGCGTGCACTTCTAGGATACTCACACAAAAGACAAAAATCAATGCTATATATATTAGGTTTATTTAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGACGAAACATTTCAACATGAGAGGCTAGGACAATTTTCCTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATTTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTATACATCAAAATTTCTAGAGCTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGGGACAATCTTCTCATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCTTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAGGGTGTGTAGATTGGATGGGGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTTTGGCTGCAGCTAACAGTTTTGCGGAAAATTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCCAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGACCAGATCATACAAAATAGCATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGACGTATTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGACGGAGTTTATCGTGAGCTAGGGTTAGACATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGGATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGAGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAAGTTCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAAGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAACTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATAGGTTCTGTAGGGTTGGAGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGCGCAGCATTAATGATAGCTGATATAAAGGGTGATTACTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGGGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACTTAAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTCTGGGATAAAAAGGCATATATACTAGAAACATCAATCACACAGAAGCATGTACTTAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGTTGATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAACAGGTCCAGGGAGTACGGCACATGGTGTTGTTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCTTGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAAGCAATTAACCATAAATTTATGATCACAATAAAGGATGATGGGCTCCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCGAGATTTTTATTAGCTCATGCATTTCACACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTGGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAACTGTATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCCGCAATCCCTCCCGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCAGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGAGATGGATTCAGTACTGTAAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTAGATGATGATGAAGAGCTTGATGACGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTGGATTTCGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTATTGATCAGCACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATAGTGAAAATACTTGAGCCTGTGAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTGTCGATTGAGAAAGTATATAGCCCTGTTAATATCATCTTAATGTCACGGTATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTGTTAGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTCGAAAGTCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTTAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTTATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCTTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTT
| 57,437
|
MK548699.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
No,J.S., Kim,W.K., Cho,S., Lee,S.H., Kim,J.A., Lee,D., Song,D.H., Gu,S.H., Jeong,S.T., Wiley,M.R., Palacios,G., Song,J.W., Song,J.-W.
|
School of Medicine, Korea University, Microbiology
| null |
2019-12-16
| null |
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Apodemus agrarius
|
lung
|
2017-04-18
| null | null |
Orthohantavirus hantanense strain Aa17-53-R segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCCTAAATAACAAACTCTGAAAAGAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAGCTGAAGGAGTTTTCTCCTGGTACACTAACTGCAGTAGAATGTATAGATTATCTTGATAGACTATACGCTGTAAGACATGACATTGTAGACCAAATGATTAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATTCAGAAGAAGCGATAGGGAAAGTACTATTATTTGCAGGGGTCCCTTCAAACATTATAACAGCACTAGAGAAAAAGATAATACCAAATCATCCCACAGGAAAGAGTCTCAAGGCCTTCTTCAAGATGACACCTGACAATTATAAAATTAGTGGAACAACAATTGAGTTTGTTGAGGTTACTGTCACGGCAGATGTTGACAAGGGAATAAGAGAGAAGAAGCTTAAATATGAGGCAGGTTTAACTTATATTGAACAAGAGTTGCATAAGTTCTTTCTAAAGGGTGAGATCCCACAACCTTATAAAATAACATTTAATGTAGTAGCAGTTCGCACAGATGGCTCCAATATTACTACACAATGGCCCAGTAGGAGAAATGACGGTGTTGTCCAGTATATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATAAGTTATGTTAGAGAGCACTTGATCAAAACTGAAGAGAGAGCAGCACTAGAAGCAATGTTTAACTTGAAGTTCAATATAAGTACACACAAAAGCCAGCCATATTACATACCTGATTATAAGGGGATGGAGCCGATAGGAGCAAATATTGAAGATTTAGTGGACTATTCTAAAGAATGGTTATCTAGAGCTAGAAATTTTTCATTTTTTGAAGTTAAAGGTACGGCAGTGTTCGAGTGCTTTAATTCAAATGAGGCCAATCATTGTCAAAAATATCCTATGTCCCGAAAGCCTAGAAATTTCTTACTAATACAATGTTCATTAATCACATCTTACAAACCTGCTACTACATTGTCAGATCAAATTGATAGTAGAAGGGCCTGTTCATACATTCTAAACTTAATCCCAGATACACCAGCATCTTATTTGATCCATGATATGGCATATAGATACATAAACCTAACACGAGAAGATATGATCAATTACTATGCCCCACGAATACAGTTTAAACAGACACAAAATATAAGAGAGCCAGGAACATTTAAGTTGACATCAAGTATGCTGAGAGCAGAATCAAAGGCAATGTTAGATTTACTTAATAATCATAAAAGTGGTGAGAAACATGGTGCACAAATAGAAAGCCTAAATATTGCTAGTCATATTGTGCAGTCTGAATCCGTTAGCCTGATTACAAAAATATTATCCGATTTAGAACTAAATATAACTGAGCCCTCAACTCAAGAATATTCCACAACTAAGCATACTTATGTTGATACAGTGTTAGACAAGTTTTTTCAGAATGAGACCCAGAAGTACCTGATAGATGTGTTGAAAAAAACAACAGCATGGCACATAGGTCATCTCATAAGGGATATAACAGAAAGTTTAATTGCTCATTCAGGATTAAAAAGATCAAAGTATTGGTCCTTACACTCATACAATAACGGTAACGTCATATTGTTTATTCTTCCATCAAAGTCACTTGAAGTAGCAGGTTCCTTTATTAGGTTCATTACAGTTTTTAGAATAGGACCTGGTTTAGTAGATAAAGATAACCTGGATACTATATTAATTGATGGTGACTCTCAGTGGGGGGTATCCAAAGTCATGAGCATTGATCTAAATAGGCTGCTAGCACTAAATATAGCTTTTGAAAAGGCTTTGATTGCAACAGCCACATGGTTCCAATACTATACAGAAGATCAGGGGCAATTCCCATTACAGTATGCAATTAGATCTGTGTTTGCAAATCATTTTCTGTTAGCTATATGTCAAAAAATGAAGCTCTGTGCCATTTTTGACAATCTACGTTATCTTATACCTGCAGTAACATCATTATACTCTGGGTTTCCTTCACTGATAGAAAAATTATTCGAACGTCCATTTAAGTCTTCATTAGAGGTATATATATATTATAATATTAAAAGCTTGTTAGTTGCACTTGCGCAAAATAATAAAGCCAGATTCTATTCTAAGGTGAAGTTACTGGGCTTAACAGTTGACCAGTCGACTGTTGGTGCAAGCGGAGTTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTATACAAACATTACAGGAGCTTAATATCTGAAATAACAACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAGGGTCTCCATGGAAATATGAATGAAGAAGCAAAAATCCATCTTGAGACAGTTGAATGGGCACTTAAATTCAGAGAGAAGGAAGAAAAGTATGGGGAATCTTTAGTGGAAAATGGATATATGATGTGGGAACTACGGGAGAATGCTGAGTTGGCTGAACAACAATTATACTGTCAAGATGCCGTTGAGTTGGCAGCAATAGAACTGAATAAGGTCCTGGCTACAAAGTCTAGTGTTGTTGCTAATAGTATATTGAGCAAAAATTGGGAGGAACCATATTTTAGTCAAACAAGAAATATCAGCTTGAAAGGTATGTCTGGACAGGTTCAGGAAGATGGCCACTTGTCATCATCTGTAACAATTATAGAAGCCATCCGCTATTTATCAAATTCAAGACATAACCCTAGCCTCTTGAAATTATATGAGGAGACAAGGGAGCAGAAAGCAATGGCAAGAATTGTAAGAAAATATCAAAGGACAGAGGCAGATAGGGGCTTTTTTATCACAACACTTCCTACTAGATGCAGGCTTGAAATTATTGAGGACTACTACGATGCCATAGCCAAGAATATCTCTGAAGAATATATATCGTATGGAGGTGAAAAAAAGATTCTTGCAATTCAAGGGGCACTTGAGAAGGCCTTGAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATTGAACTTAGTAATCACAAATTTATTAGGATGAAGCGTAAGCTCATGTATGTTAGTGCAGATGCTACAAAGTGGTCACCAGGAGATAATTCAGCAAAGTTCCGTAGGTTTACCTCCATGCTGCATAATGGACTCCCCAATAATAAGCTAAAAAATTGTGTAATTGATGCACTTAAACAAGTTTATAAGACAGATTTTTTCATGTCAAGGAAACTAAGGAATTATATTGACAGCATGGGGAGCCTTGACCCACACATCAAACAATTTCTTGATTTTTTTCCTGATGGGCACCATGGGGAGGTGAGAGGAAACTGGCTGCAGGGTAACTTAAATAAGTGTTCTTCACTTTTCGGTGTTGCAATGTCATTATTATTTAAACAAGTATGGACTAATTTATTCCCTGAGCTTGATTGCTTTTTTGAGTTTGCACATCACTCTGATGATGCATTATTTATTTATGGATACTTGGAACCGGTAGATGATGGGACTGATTGGTTCTTGTTTGTTTCTCAACAGATTCAAGCAGGTCATCTGCACTGGTTTAGTGTAAATACAGAGATGTGGAAGAGTATGTTTAATCTACATGAACATATACTTCTCCTAGGCTCCATTAAGATCTCACCAAAGAAAACCACAGTATCCCCGACAAATGCTGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGATGTGCTGTATCAATACCATTTGTTAAGATACTATTAGGTTCTCTTTCAGATTTACCAGGTTTAGGTTATTTTGACGATTTAGCAGCAGCACAAAGCAGATGTGTTAAGGCTCTGGATCTAGGAGCATCACCTCAGGTTGCACAACTAGCTGTAGCATTGTGCACCAGTAAAGTTGAAAGATTATATGGTACAGCACCAGGTATGGTAAACCACCCTGCAGCATACTTGCAAGTTAAGCATGCTGATACACCGATTCCATTGGGGGGAAATGGTGCAATGTCAATAATGGAGTTAGCAACGGCTGGGATTGGGATGTCAGACAAAAATCTATTAAAGCGTGCACTTCTAGGATACTCACACAAAAGACAAAAATCAATGCTATATATATTAGGTTTATTTAAGTTTTTGATGAAGTTATCTGACGAAACATTTCAACATGAGAGGCTAGGACAATTTTCCTTTATTGGGAAAGTACAGTGGAAGATTTTCACTCCAAAATCTGAATTCGAGTTTGCTGATATGTATACATCAAAATTTCTAGAGCTATGGAGTAGTCAACATGTAACTTATGATTATATTATTCCAAAGGGCAGGGACAATCTTCTCATTTATTTAGTCCGGAAGCTCAATGATCCAAGTATTGTTACAGCAATGACCATGCAGTCACCTTTGCAGCTCCGATTTAGAATGCAAGCCAAGCAGCACATGAGGGTGTGTAGATTGGATGGGGAATGGGTTACCTTCAGGGAAGTTTTGGCTGCAGCTAACAGTTTTGCGGAAAATTATAGTGCTACTAGCCAAGATATGGATTTATTTCAAACATTAACAAGTTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCTTGGAAAGATTTCTTGAATGGAATTCACTGTGATGTTATCCCAACAAAACAGGTTCAAAGGGCCAAAGTTGCCCGAACATTCACAGTCAGAGAAAAGGACCAGATCATACAAAATAGCATTCCTGCTGTCATTGGGTACAAATTTGCTGTAACTGTAGAGGAAATGTCAGACGTATTGGATACAGCCAAGTTCCCAGATTCTCTATCTGTTGATTTAAAGACAATGAAAGACGGAGTTTATCGTGAGCTAGGGTTAGACATATCCTTGCCTGATGTTATGAAAAGGATTGCACCTATGCTCTATAAATCTTCTAAATCAAGAGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTTGAAGGGACAGCTGAGGCTATATGTGCTTACTGGCTAAAATCAATGTCACTGGTAAAGACTATAAGAGTGAAGCCTCATAAGGAAGTTCTTCAAGCAGTTTCAATTTTCAACCGTAAAGAAGATATAGGACAACAGAAAGACTTAGCTGCCCTTAAACTGTGCATAGAAGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAGTGCTCCATATAGAGATTGGTTCCAGGCCTTATGGTTTGAGGATAAGACCTTTTCAGAGTGGTTAGATAGGTTCTGTAGGGTTGGAGTTCCACCAATTGATCCAGAGATCCAGTGCGCAGCATTAATGATAGCTGATATAAAGGGTGATTACTCAGTTTTGCAGTTACAAGCCAACAGGCGGGCATATTCAGGTAAGCAATATGATGCATACTGCGTACAGACATATAACGAAGTGACAAAGCTTTATGAAGGAGACTTAAGAGTAACATTTAATTTTGGTCTTGACTGTGCAAGGCTTGAGATCTTCTGGGATAAAAAGGCATATATACTAGAAACATCAATCACACAGAAGCATGTACTTAAGATCATGATGGATGAGGTTTCAAAAGAGTTGATTAAGTGTGGGATGAGATTTAATACAGAACAGGTCCAGGGAGTACGGCACATGGTGTTGTTTAAGACAGAGTCTGGATTTGAATGGGGAAAACCAAATATTCCTTGCATTGTTTATAAGAACTGTGTCTTAAGGACAAGCCTTAGAACCACACAAGCAATTAACCATAAATTTATGATCACAATAAAGGATGATGGGCTCCGTGCTATTGCACAACATGATGAAGATAGTCCGAGATTTTTATTAGCTCATGCATTTCACACAATAAGAGATATTAGGTATCAAGCAGTGGATGCTGTAAGTAATGTATGGTTCATCCACAAAGGAGTAAAACTGTATTTAAATCCCATCATTTCATCTGGTTTACTTGAGAATTTTATGAAGAATCTTCCAGCCGCAATCCCTCCCGCTGCTTATTCACTGATCATGAACCGTGCAAAAATATCAGTTGATCTCTTTATGTTTAATGATTTACTTAAGCTGATTAACCCTAGGAATACATTGGATCTATCAGGCCTTGAAACAACAGGAGATGGATTCAGTACTGTAAGTTCAATGTCAAGCCGATTATGGTCTGAAGAAATGAGCTTAGTAGATGATGATGAAGAGCTTGATGACGAGTTTACAATTGACTTGCAAGATGTGGATTTCGAGAATATAGATATAGAAGCAGACATTGAACATTTCCTACAAGATGAGAGTTCATACACAGGAGATCTATTGATCAGCACAGAAGAAACTGAATCAAAGAAAATGAGGGGCATAGTGAAAATACTTGAGCCTGTGAGACTGATTAAAAGCTGGGTATCACGTGGATTGTCGATTGAGAAAGTATATAGCCCTGTTAATATCATCTTAATGTCACGGTATATCTCTAAAACATTTAATTTGAGTACCAAACAGGTCTCATTGTTAGATCCATATGATTTAACAGAATTAGAGAGCATTGTCCGAGGATGGGGAGAATGTGTTATTGATCAGTTCGAAAGTCTTGATAGAGAGGCTCAAAGTATGGTTGTTAATAAAGGGATATGTCCTGAGGATGTTATTCCTGATTCATTATTTTCATTTAGGCATACCATGGTACTGTTAAGGAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCCTCTTTCTATTAGGCTTTCTTTCTTTTTCATTTTCCGGAGCATACTACTA
| 57,438
|
KY978757.1
|
Orthohantavirus hantanense
|
Liu,S., Gang,X., Xiong,Y., Gong,T.
|
Jiangxi Center for Disease Control and Prevention
|
China
|
2018-04-11
|
AYW89-15
|
Orthohantavirus hantanense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,533
|
GenBank
| null |
China: Anyi, Jiangxi
|
China
|
Apodemus agrarius
| null |
2015
| null | null |
Orthohantavirus hantanense isolate AYW89-15 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCCTAAGTGACAAACTCAGAAAGAAATGGATAAATATAGAGAAATTCACAATAAACTGAAGGAGTTCTCTCCTGGTACACTAACTGCGGTAGAGTGTATAGATTACTTGGATAGACTCTATGCAGTGAGGCATGACATCGTGGACCAGATGATAAAGCATGACTGGTCTGACAATAAAGACTCAGAAGAAGCAATAGGGAAAGTGCTACTGTTTGCAGGGGTTCCATCTAACATCATTACAGCATTAGAGAAGAAAGTCATACCAACTCACCCAACAGACAAGAATCTCAAGGCATTCTTTAAGATGACACCTGATAATTACAAAATTAATGGAACGACTATCGACTTTTTAGAAGTTACTGTAACAGCTGATGTTGATAAAGGCATAAGGGAGAAAAAAATGAAATATGAAGCAGGTTTGGCATATATTGAACAGGAACTACACAAGTTTTTCCTAAAGGGTGAGATTCCGCAACCGTATAAGATAACATTTAATGTAGTTGCAGTCCGGACAGATGGTTCAAACATCACTACACAGTGGCCCAGTAGAAGGAATGATGGCGTTGTACAATACATGAGGCTAGTTCAAGCTGAGATTAGTTATGTAAGGGAGCACCTTATTAAAACTGATGAAAGAGCTGCACTAGAGGCCATGTTCAATTTAAAGTTTAATATTAGTACACATAAGAGTCAACCATACTACATACCTGACTACAAGGGTATAGATCCAATAGGGGCAAATATTGAGGACTTGGTGGATTATTCCAGGGAGTGGTTATCTAGGGCTAGAAATTTTTCATTCTTCGAGGTCAAAGGCACAGCAGTTTTTGATTGTTTTAATTCAAATGAAGCAACCCATTGTCAAAAGTACCCTATGTCCCGCAAGCCTAGAAATTTCTTGCTGATACAATGCTCTTTAATCACATCATACAAACCTGCCACAACATTATCAGATCAAATCGACAGTAGAAGGGCTTGTTCATACATCTTAAATCTTATACCAGATACCCCTGCATCACATTTGATTCATGATATTGCGTATAGATATATAAACCTTACAAGGGAAGATATGATAAACTACTATGCACCAAGAATACAGTTCAAGCAGACACAAAACATAAGAGAGCCTGGTACATTCAAGCTGACATCAAGCATGTTAAGGGCAGAATCAAAGGCAATGCTGGATCTGCTCAACAATCATAAGAGTGGTGAAAAACATGGTGAACAGATAGAAAGCTTGAATATTGCGAGCCATATAGTACAGTCTGAGTCAGTTAGCCTGGTAACAAAAATTCTATCTGACCTAGAATTGAATATAACTGAGCCATCAACCCAAGAGTATTCTACTACAAAACACACCTATGTGGACACTGTGCTTGACAAGTTTTTCCAAAATGAGACTCAAAAATATCTGATAGATGTGCTGAAGAAAACAACAGCATGGCACATAGGTCATTTAGTAAGAGATATAACAGAAAGCTTGATTGCTCATTCTGGGTTAAAAAGGTCAAAATATTGGTCTCTTCATTCTTATAATAATGGTAATGTCATATTATTTATTCTTCCTTCAAAATCATTAGAAGTAGCCGGCTCTTTTATCAGGTTTATCACAGTTTTTAGGATAGGGCCTGGTTTAGTGGATAAAGACAATTTGGATACAGTTCTGCTTGATGGTGAATCTCAGTGGGGTGTCTCAAAGGTTATGAGTATTGATCTAAATAGATTACTTGCATTAAATATTGCCTTTGAGAAGGCATTGATTGCAACAGCCACATGGTTCCAGTATTACACCGAAGACCAAGGACAGTTTCCATTGCAGTATGCCATCAGATCTGTATTTGCAAATCACTTTTTACTGGCTATTTGCCAAAAAATGAAACTTTGTGCAATTTTTGATAATCTACGGTATTTAATACCTGCTGTTACTTCTCTATATTCTGGGTTTCCTTCATTGATTGAGAAATTATTTGAACGTCCTTTCAAATCTGCACTAGAAGTGTATACATATTATAATATTAAGAGTCTGTTAGTAGCACTTGCCCAAAATAATAAAGCCAGGTTTTACTCTAAAGTCAAGCTCTTGGGCTTAACAGTTGACCAATCAACTGTTGGTGCAAGTGGTATTTATCCTTCATTTATGTCACGTATAGTCTATAAGCACTATAGAAGTTTGATATCTGAGGTAACTACCTGTTTCTTTTTATTTGAAAAAGGGCTCCATGGAAACATGAATGAGGAAGCAAAGATACACCTTGAGACAGTAGAGTGGGCACTTAAATTCAGAGAAAAGGAAGAAAGGTATGGGGAATCATTGGTAGAAAACGGCTATATGATGTGGGAGCTTCGAGAAAATGCAGAATTGGCTGAGCAGCAATTATATTGTCAAGATGCTGTAGAATTAGCAGCCATTGAATTGAATAAAGTTTTATCCACCAAGTCTAGTGTAGTAGCAAATAGTATATTGAATAAAAATTGGGAAGAACCATATTTTAGTCAGACAAGAAATATTAGTCTTAAAGGCATGTCAGGGCAAGTCCAGGAGGATGGTCACCTCTCATCATCTGTAACAATTATCGAAGCTATCCGCTATTTGTCCAATTCACGACACAACCCTAGCTTATTAAAGCTGTACGAAGAAACAAGAGAGCAGAAGGCAATGGCCAGGATTGTAAGGAAATACCAGAGAACAGAAGCAGATAGAGGTTTCTTCATCACAACACTCCCGACTCGGTGCCGGCTAGAAATTATTGAGGACTATTATGATGCCATTGCTAAGAATATAACAGAAGAGTACATTTCTTATGGGGGTGAAAAGAAAATCCTTGCTATTCAAGGGGCCTTGGAGAAGGCCTTAAGATGGGCATCAGGTGAAAGCTTTATAGAGCTTAGCAACAATAAATTCATTAGGATGAAACGTAAATTAATGTATGTTAGTGCCGATGCCACCAAATGGTCACCTGGAGACAACTCAGCAAAATTCCGAAGATTCACTTCAATGTTACATAACGGTCTTCCAAACAATAAACTAAAGAACTGTGTAATCGATGCGCTCAAACAAGTTTATAAAACGGATTTCTTTATGTCAAGAAAGCTGAGAAACTATATTGATAGCATGGAAAGTCATGACCCACATATCAAACAGTTCTTAGAATTCTTTCCTGATGGGCATCATGGAGAAGTAAAAGGGAACTGGCTACAAGGCAACTTAAACAAGTGCTCATCTCTATTTGGTGTAGCAATGCCATTGTTGTTTAAGCAAGTGTGGAATAATCTGTTTCCTGAGCTTGATTGCTTCTTTGAATTTGCTCACCACTCAGATGATGCCCTGTTTATTTATGGATATTTAGAACCTGTTGATGATGGGACTGACTGGTTCTTATTTGTATCTCAACAGATTCAGGCTGGTCACTTACATTGGTTTAGTGTAAATACTGAAATGTGGAAAAGTATGTTTAACCTTCATGAGCATATACTCCTTCTAGGATCAATAAAGATATCACCCAAGAAAACAACAGTATCTCCAACTAATGCTGAATTTCTATCAACATTCTTTGAAGGTTGTGCTGTATCTATACCATTTGTTAAAATATTACTAGGTTCTCTGTCAGATTTACCAGGTTTAGGATACTTTGATGACTTGGCAGCAGCACAGAGCCGATGTGTTAAGGCATTAGACTTGGGAGCTTCACCTCAGGTTGCACAGCTAGCTGTGGCTTTATGCACCAGTAAAGTTGAAAGACTATATGGTACAGCACCAGGTATGGTGAATCACCCTGCTGCATACTTGCATGTTAAACACGGCGATACACCTATCCCGTTAGGGGGAAATGGTGCAATGTCCATTATGGAATTAGCAACAGCTGGGATAGGTATGTCAGATAAAAATCTATTAAAGCGTGCACTCATAGGTTATTCACACAAAAGACAGAAGTCAATGTTATATATTCTTGGCCTGTTTAAGTTTTTGATGAATTTATCGAATGAAACATTTCAGCATGAGAGATTAGGACAATTTTCTTTTATCGGAAAAGTACAATGGAAAATTTTCACACCTAAGTCTGAATTCGAGTTTGCTGACATGTATACATCCAAATTTCTGGAATTATGGAGCAACCAGCATGTAACATATGATTATATCATCCCAAAGGGTAGAGATAACCTTCTTATTTATTTAGTTAGAAAATTAAATGATCCTAGTATAGTAACAGCCATGACTATGCAGTCACCTTTACAATTGAGGTTCCGAATGCAGGCTAAGCAACATATGAAGGTATGTAGATTAGAGGGAGAATGGGTAACCTTTAGAGAAGTCCTAGCTGCTGCAAATAGTTTTGCAGAGAATTATAATCTTAGTAGCCAGGATATGGACTTATTCCAGACACTAACAAGTTGTACATTCTCTAAGGAGTATGCCTGGAAAGACTTCCTAAATGGGATTCATTGTGATGTTATACCAACAAAGCAAGTGCAGAGAGCCAAGGTTGCAAGAACCTTTACAGTCAGGGAGAAAGATCAAATTATACAGAATAGTATACCTGCTGTTATTGGCTATAAGTTTGCTGTGACCGTGGATGAAATGTCCGATGTATTGGATACTGCAAAGTTCCCTGACTCCTTATCTGTTGACCTGAAGACTATGAAAGATGGGGTCTATAGGGAATTAGGGTTAGACATATCATTACCTGATGTCATGAAAAGGATTGCACCTATGCTCTATAAGTCTTCCAAATCACGAGTAGTCATTGTCCAAGGAAATGTAGAAGGAACAGCTGAGGCTATATGTGCTTATTGGTTGAAGTCAATGTCATTAGTGAAAACAATAAGGGTAAAGCCCCATAAGGAAGTTCTTCAAGCTGTATCAATTTTTAACCGGAAAGAAGACATTGGCCAGCAAAAGGATCTGGCTGCCCTAAAGTTATGTATAGAAGTCTGGAGATGGTGTAAAGCAAATAATGCACCATATAGGGATTGGTTTCAGGCCCTCTGGTTTGAAGATAAAACTTTTTCAGAGTGGTTAGACAGATTTTGTAGAGTAGGAGTACCGCCCATTGACCCAGAAATTCAGTGTGCAGCACTTATGATAGCTGATATAAAGGGAGATTATTCAATTTTACAGTTGCAAGCCAACAGGAGAGCATATTCAGGCAAACAATATGATGCATACTGTGTGCAGACATACAATGAGATTACAAAACTCTATGAAGGGGATCTAAGAGTCACCTTCAATTTTGGTCTTGACTGTGCTAGGCTTGAAATCTTTTGGGATAAGAAAGCATATATATTAGAAACATCAATTACACAAAAACATGTGTTAAAGATCATGATGGATGAAGTTTCAAAGGAGTTATTAAAGTGTGGGATGAGGTTTAATACAGAGCAAGTTCAAGGTGTAAGACACATGGTGTTGTTTAAAACAGAATCAGGATTTGAATGGGGCAAACCTAACATTCCCTGTATTGTTTATAAGAATTGTGTTCTTAGAACCAGTTTAAGGACCACACAGGCAATTAACCACAAATTTATGATCACAGTAAAGGATGATGGACTACGTGCAATTGCACAGCATGATGAAGATAGCCCTAGATTTCTATTGGCTCATGCTTTCCATACAATAAGGGATATCAGATATCAAGCAGTGGATGCAGTGAGTAATGTATGGTTTATACACAAGGGGGTGAAGCTATATTTGAATCCTATTATATCATCTGGGCTACTTGAAAATTTCATGAAAAATCTTCCTGCTGCCATTCCGCCTGCTGCATATTCTTTAGTCATGAATCGAGCAAAAATCTCTGTGGATCTTTTCATGTTTAATGACCTTTTAAAGCTTATTAACCCTAATAACACGTTAGACCTTTCTGGTCTAGAGACAGCAGGAGATGGGTTTAGTACTGTTAGCTCCATGTCAAGCAGACTATGGTCTGAAGAAATGAGCCTGGTCGATGATGATGAAGAACTTGATGATGAGTTCACAATTGACCTACAGGATGTGGACTTTGAAAATATAGATATGGAGGCAGATATTGAGCACTTCTTACAAGATGAGAGTTCCTATACAGGGGACTTATTGATAAGTACAGAGGAGACTGAGTCTAAAAAAATGAGAGGTATTGTAAAGATACTTGAGCCTGTTAGATTAATTAAGAGCTGGGTATCACGAGGTTTATCTATTGAGAAAGTATATAGTCCTGTTAATATAATCCTAATGTCAAGGTATATCTCAAAAACTTTTAATCTAAGTACAAAGCAGGTTTCGCTGTTGGACCCATATGATTTGACTGAATTAGAAAGTATCGTTCGAGGTTGGGGAGAATGTGTAATTGATCAATTTGAAAGTCTCGATAGGGAGGCTCAAAGCATGGTGGTTAATAAAGGAATATGTCCTGAGGATGTTATTCCTGACTCATTATTTTCATTTAGACATACCATGGTGCTATTAAGAAGGTTATTTCCACAGGATTCTATTTCATCTTTCTACTAGGCTTTCTTTCTTCTTCATTTTCCGGAGCGTACTACTACTA
| 71,248
|
NC_077667.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Stohwasser,R., Raab,K., Darai,G., Bautz,E.K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-06
| null |
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Puumala virus CG1820 RNA-dependent RNA polymerase gene in L RNA segment
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAGTTTACTACAAATGGAGAAATACAGAGAGATCCATGAGAGAGTAAAGGAAGCAGTCCCAGGGGAGACTTCAGCAGTAGAATGCTTAGACTTATTAGATCGACTATATGCAGTTAGACATGATGTTGTAGATCAGATGATAAAGCATGACTGGTCAGACAATAAAGATAAGGAACAACCCATTGGACTAGTCCTACTAATGGCTGGTGTTCCCAATGATGTGATACAGAGTATGGAGAAAAGAATCATCCCAGGGAGTCCTAGTGGCCAGATTCTTAGGTCATTCTTCAAAATGACTCCTGATAATTACAAAATTACAGGGAATCTAATAGAGTTCATTGAGGTAACAGTAACTGCTGATGTAGCAAGGGGTGTTAGAGAAAAAATACTAAAGTATCAAGGAGGGTTAGAATTCATTGAGCAATTACTACAGATAGAAGCCCAAAAGGGTAATTGTCAATCTGGATTTAGGATAAAGTTTGATGTGGTGGCTATTAGAACTGATGGATCAAATATCTCAACACAATGGCCTAGTAGGAGGAATGAGGGTGTGGTACAGGCAATGAGGCTGATACAGGCAGATATCAATTTTGTTAGAGAACACTTAATAAAAAATGATGAAAGGGGAGCACTTGAAGCAATGTTCAATTTAAAGTTCCATGTCACAGGCCCAAAAGTACGAACATTTGACATCCCAAATTATAGACCTCAACAATTGTGTCAGCCTGTATTAGAAAATTTAGTTGAGTACTGTAAAAATTGGCTTGGGACTGATCATGCTTTTGCATTTAAAGAAGTGACTGGGCAACGTGTCTTTAATGTATTCAGGGATGAAGAAGAACTACATGCATCAAAATACGGACACTCTAGAAAGCCTAGGAACTTCCTCTTGTGTCAAATAAGCTTACAAGTACCATATTTACCATCAACAATAGCTTCAGACCAATATGACACAAGGTTAGCCTGTAGTGAAATTTTAAAAAATTACCCAGAAACACCACTGCAACTTTTAGCTAGGGATATGGCCTATAAATACATTACATTAGACAATGAAGATATCATTAATTATTATAATCCGCGAGTATACTTCAAACCTACACAGAATATCAAAGAACCAGGAACTTTCAAACTAAATTTATCTAACATGGATCCTAAATCAAAGGCATTAATTGATGTAATATCCAAAGATTCAAAGAAAGGGGTTTTTGGTGAGTTGATTGATAGTATAGATGTAGCAAGTCAAGTTCAACAGAATGAATGTGCAAAAACTATCGAGAAGATTCTGTCTGATCTTGAAGTTAATTTAGGTGATTCTACTGCTGGGTTAGATCAGCCGAAAAGAACAACTGGAGTAGATGATATATTAAGAAAATTTTATGACAATGAACTTGTCAAGTATCTGATTTCAGTCATACGGAAAACAACTGCAAGGCATTTAGGTCATTTATTACGTGATATCACTGAGTCTTTAATTGCACATGCAGGGCTTAAGCGATCTAAGTATTGGTCTGCCCATGGATATGCTTATGGTAGTGTGTTATTATGTATTTTGCCGTCTAAATCACTTGAAGTTGCAGGTTCATTTATTAGATTTTTTACTGTATTCAAAGAAGGATTGGGTCTTATTGATGCAGACAACCTTGATTCAAAAGTAGAGATAGATGGTGTTACATGGTGTTTTAGTAAAATAATTAGTTTGGACCTAAATCGATTGTTAGCTTTAAATATTGCCTTTGAGAAATCTCTTCTTGCTACGGCCACGTGGTTCCAATACTACACGGAGGACCAAGGGCACTTTCCTCTTCAGCATGCTTTACGGTCTGTTTTTGCATTTCACTTTCTGTTAGCTACATCCCAAAAAATGAAATTATGTGCAATATTTGATAACTTGCGCTACCTCATCCCAGCAGTTACATCCACATATTCTGGGTTTGAGCCATTGATTAGAAAGTTCTTTGAGCGACCGTTTAAAAGTGCACTAGAAGTATACCTGTACAACATCATAAAAACATTATTGGTGAGTCTTGCTCAAAATAATAAAATAAGATTTTATTCTAGGGTTAGGCTTTTAGGATTAACTGTTGATCAATCATCAATAGGAGCAAGTGGAGTGTACCCTTCACTAATGTCAAGGGTTGTCTATAAACATTATCGCAGTCTAATCTCAGAAGCAACAACTTGTTTTTTCTTATTTGAGAAAGGTTTACATGGTAATCTTACTGAAGAAGCTAAAATTCATCTTGAAACAGTTGAGTGGGCTAGAAAATTTAGAGAAAAAGAAAGAAAACTGGGTAGTTACATAATGGAAGAAGGTTATCATATACAGGATGTCTTAAACAATCAAGTGGTTGTTGAGCAACAACTTTTTTGCCAGGAGGTGGTTGAACTTGCTGCTCAAGAGTTAAATACTTATCTACATGCAAAGTCTCAAGTTATGGCAAGTAATATAATGAACAAACATTGGGATAAGCCATACTTTAGTCAAACCAGAAATATAAGCCTTAAGGGTATGTCAGGGGCATTACAAGAAGATGGTCATTTAGCTGCAAGTGTTACCCTTATTGAGGCAATTCGCTTTTTGAATCATTCACAAAATAACCCTACAGTGCTAGAACTTTATGAACAGACAAAAAAACAAAAGGCACAAGCAAGGATTGTCAGAAAATACCAGAGAACTGAAGCAGACCGTGGTTTTTTTATTACCACACTACCAACTAGAGTGAGATTAGAGATTATTGAGGATTACTATGATGCTATAGCTAGAGTTGTCCCAGAAGAATACATATCATATGGGGGAGAAACCAAAATATTAAACATTCAGCAGGCCCTGGAAAAGGCACTCAGGTGGGCCTCAGGAGAAAGTGAAATTCAGTCTTCAATAGGCCATTCTATAAAACTTAAGAGGAAACTAATGTATGTTAGTGCAGATGCAACTAAATGGTCACCTGGTGACAATTCTGCAAAATTTAGGAGGTTTACCCAATCCTTATATGATGGTTTACGTGATGATAAACTTAAAAATTGTGTGGTTGATGCACTAAGGAATATCTATGAAACTGACTTTTTTATATCTAGAAAGCTACATAGGTATATTGATAATATGGGTGAATTATCTGATGAGGTCTTGGACTTTTTATCTTTTTTTCCTAATAAAGTATCTGCTTCAATTAAAGGTAATTGGCTGCAAGGTAACTTGAATAAATGCTCTTCATTATTTGGTGCAGCAGTGTCATTGTTATTTAAACGTGTATGGGCCAAATTATACCCAGAGTTAGAGTGTTTCTTTGAATTTGCACATCATTCTGATGATGCTTTATTCATTTATGGTTATTTAGAGCCAGTAGATGATGGAACAGAATGGTTTCAATACGTGACTCAGCAGATACAAGCAGGAAACTTCCACTGGCATGCTGTAAATCAAGAGATGTGGAAAAGTATGTTTAATCTCCATGAGCATATTTTGTTAATGGGTTCAATAAAAATATCACCTAAGAAAACAACAGTATCCCCTACAAATGCTGAGTTTCTATCTACATTCTTTGAAGGTTGTGCAGTCTCAATTCCATTTATAAAAATTTTATTAGGTTCTTTATCAGATTTACCTGGATTAGGTTACTTTGATGACCTTGCTGCAGCCCAGAGTAGATGTGTTAAAGCATTAGACATGGGTGCTTGCCCCCAACTTGCACAATTAGGAATAGTATTATGTACGAGTAAAGTTGAGAGATTATATGGTACTGCTCCTGGGATGGTAAATAACCCAACTGCATACTTGAAAGTAGATAGGAGTTTAATCCCTATACCTTTAGGTGGTGATGGATCTATGTCAATTATGGAGCTTGCAACAGCAGGTATAGGGATGGCAGATAAGAATATATTGAAAAATGCATTCATAACTTATAAACATGCAAAAAAGGATAATGATCGATATGTATTAGGGTTATTTAAATTTTTAATGTCATTATCAGATGATATATTTCAGCATGACCGTTTAGGAGAATTTAGTTTTGTAGGGAAGGTTCAATGGAAAGTATTCACCCCTAAGAGCGAATTTGAATTCTATGATCAGTATTCAAGAAAATATTTAGAACTCTGGAGCGAACAGCATCCAGTTTATGATTATATTATACCAAGAGGTAGGGATAATTTATTGGTATATTTAGTTAGGAAACTAAATGATCCCAGCATAGTCACTGCAATGACAATGCAATCACCACTTCAATTAAGATTTCGAATGCAGGCAAAGCAACACATGAAAGTATGCAAGCTAGATGGTGAATGGGTGACATTTAGAGAGGTTCTTGCTGCTGCAGATGCATTTGCATCAGAATACCGACCTACTTTACAAGATATGGAACTCTTCCAGACACTAGTAAATTGTACATTCTCTAAAGAGTATGCCTGGAGAGATTTTTTAAATGAGGTGCAATGTGATGTATTGACAACAAGACAAATTCATAGACCAAAAGTGGCTCGTACTTTTACAGTTAAAGAAAAAGACCAAACAATACAGAATCCAATTACAGCTGTAATTGGCTACAAGTATGCAAGTAAAGTGGATGAGATTAGTGATGTGCTGGACAGTGCTATCCATCCTGATTCATTGTCTACTGACCTACAACTCATGAGGGAGGGTGTGTATAGAGAATTAGGCCTGGATATCAGTCAACCAAATGTACTAAAAAAAGTTGCACCATTACTATACAAATCTGGGAAATCAAGAATTGTAATTGTACAAGGAAACGTTGAGGGTACGGCAGAATCAATTTGTAGTTACTGGCTAAAGACAATGTCCCTTGTGAAGACTATAAAAGTAAAACCAAAGAAAGAGGTATTAAAAGCTGTATCTCTATATGGAAAGAAAGAGAAAGCTGGTGACCTAACACATTTAGCTGCAATGAGGTTATGTATTGAAGTATGGAGATGGTGTAAGGCAAATGAACAAGACTCAGTATCTTGGTTAAAGTACTTAATGTTTGAGAACAAGACATTAGAGCAGTGGATTGACTCGTTCTGCTCAAGAGGGGTTTTGCCAGTTGATCCTGAGATTCAATGTTTGGGTCTTCTTGTATATGATCTGAAAGGGCAAAAGGGTTTGTTGCAGATACAAGCTAATAGGCGGGCATATTCAGGAAAACAATATGATGCATATTGTGTGCAGACATATAATGAGGAGACAAAGCTTTATGAAGGAGACTTGAGGGTAACATTCAACTTTGGTATAGATTGTGCACGACTGGAGATTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATTTTAGAAACATCCATAACTCAACGGAATGTTTTGAAAATTCTTATGGAGGAAGTGACCAAGGAGTTACTACGCTGTGGTATGAGATTCAAAACAGAGCAAGTTAACTCTTCACGTAGTGTAGTATTGTTTAAAACAGAAAGTGGTTTTGAGTGGGGTAAACCTAATGTCCCATGTATTGTCTACAGAAATTGTACTCTTAGAACAGGCTTGAGAGTGCGGCAGCCTACAAACAAAGCATTCTCAATTACTATTCAAGCCAATGGTTTCCGAGCCATGGCTCAACTTGATGAAGAAAATCCCAGATTTCTACTTGCTCATGCATACCATAATTTAAAGGATGTAAGATATCAGGCATTACAGGCAGTTGGGAATGTTTGGTTCAAAATGACTCAACATAAGTTGTTTATAAATCCAATTATATCTGCTGGATTATTGGAAAATTTTATGAAGGGTCTACCTGCAGCAATTCCCCCTGCAGCCTATTCTCTTATTATGAATAAAGCGAAAATTTCTGTTGATTTATTCATGTTTAACGAGTTGTTAGCATTGATAAACCCACAAAATGTTCTTAATTTAGATGGGATCGAGGAAACATCTGAAGGTTATACAACAGTTAGTACAATTTCAAGTACGCAATGGTCAGAAGAAGTGAGCCTGACTATGGATGACAGTGATGATGACGGTGATGCTTCCCAGCTTGATTATACTATTGACCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGATTTGAAAGAAGATATTGAACATTTTTTACAGGATGAGTCAGCCTATACTGGAGACCTTTTAATTCAAACTGAGGAAACTGAGATAAGAAAGTTAAGAGGTATGATTAAGATTCTTGAGCCTGTAAAACTTATTAAGAGTTGGGTCTCCAAAGGTTTATCTATAGATAAAATATATAATCCAGTTAATATTATCCTCATGACTCGGTATATGTCCAAACATTATAATTTCCATGCAAAGCAGTTATCTCTCATGGACCCGTATGACTTAACTGAATTTGAGAGTATTGTCAAAGGATGGGGAGAGTGTGTCAAGGATCGATTTATTGAACTTGATCAAGAAGCCCAGAGAAAGGTCACTGAAGAGAGAGTGCTACCGGAAGATGTATTACCTGACTCTCTTTTTTCATTTAGACATGCTGATATCTTATTGAAGAGATTGTTTCCTAGGGACTCAGCCTCTTCTTTTTATTAACAGATTATACTTCTTATTGCTCTTATCTCGGAGTCTACTACTA
| 41
|
NC_005225.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Piiparinen,H., Vapalahti,O., Plyusnin,A., Vaheri,A., Lankinen,H.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-11-18
| null |
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
RefSeq
| null | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Puumala virus segment L, complete genome
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAATTTACTACAAATGGAGAAATACAGAGATATTCATGAGAGAGTCAAGGAGGCAGTCCCAGGGGAAACATCAGCAGTAGAATGTTTAGATTTATTGGATAGATTGTATGCAGTGAGGCATGATGTTGTAGACCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATAGAGAACAGCCTATAGGCCTTGTCTTACTAATGGCAGGTGTTCCAAATGATGTAATTCAGAGTATGGAGAAAAGAGTCATCCCAGGAAGTCCCAGTGGTCAGATCCTTAGATCATTTTTTAAAATGACACCTGACAATTATAAAATAACAGGGAACCTTATAGAGTTCATTGAGGTCACAGTGACAGCTGATGTGGCAAGGGGAGTTAGAGAGAAGATATTAAAGTATCAAGGGGGTTTAGAATTTATTGAACAATTGTTACAGATAGAAGCTCAGAAAGGTAATTGTCAATCTGGTTTTAAGATAAAGTTTAATGTGGTAGCAGTTAGGACTGATGGTTCAAACATATCAACACAGTGGCCTAGTAGAAGGAATGAAGGCGTTGTTCAAGCAATGAGATTAATACAAGCAGACATTAATTTTGTCAGAGAACACCTGATAAAGAATGATGAGAGAGGAGCACTTGAGGCAATGTTTAATCTAAAATTTCATGTAACAGGTCCTAAGGTTCGTACATTTGATATTCCGAATTATAGACCTCAGCCATTATGCCAACCTATATTAGAAAATCTAGTAGATTATTGTAAAAATTGGCTTGGAACAGATCATGCATTTGCATTTAAGGAAGTGACTGGTCAACGTGTTTTCAATGTCTTTAGGGAGGAGGAAGAAATACATGCATCCAAATATGGACACTCTAGAAAGCCTAGGAATTTTCTTTTATGTCAAATTAGCTTGCAGTCACCATATTTACCATCAACAATTGCATCTGATCAGTATGATACACGATTAGCTTGTAGTGAAATTTTAAAAAACTATCCTGAGACACCATTACAGCTATTGGCTAGAGATATGGCCTATAAATACATCACATTAGATCATGATGACATTATCAATTATTATAATCCAAGGGTTTACTTTAAGCCAACACAGAATATTAAAGAACCAGGTACCTTCAAATTGAATCTATCTAACATGGATCCAAAATCAAAAGCATTAATTGATGTCATATCAAAGGATTCAAAAAAAGGAGTGTTCGGTGAGTTGATTGATAGTGTTGATGTAGCAAGTCAAGTACAGCATAATGAATGCTCAAAAACTATTGAGAAAATTTTGTCAGATTTAGAAGTTAATCTAGGTGATGTGGCAAATGGATTAGATCAACCTAAGAAAACAACTGGTGTGGATGATATTTTAAGAAAATTTTATGATAATGAGCTTGTTAAGTACTTGATATCTGTTATACGGAAAACAACAGCCTGGCATCTAGGACATTTATTACGAGATATTACTGAGTCCTTAATTGCACATGCAGGGCTTAAAAGATCTAAATACTGGTCTGCTCACGGTTATGCATGTGGTAGTGTCTTATTATGCATATTACCATCTAAATCACTTGAAGTTGCTGGATCATTTATAAGGTTCTTTACTGTATTTAAGGAAGGTCTAGGTTTAATTGATACAGATAATCTTGACTCTAAAGCAGAAATTGATGGCGTTTCATGGTGCTTTAGTAAGATAATTAGTTTAGATTTAAATAGATTACTGGCCTTGAATATTGCATTTGAAAAATCCCTTCTTGCCACAGCAACATGGTTTCAGTATTATACTGAAGATCAAGGACATTTTCCTCTTCAACATGCACTTCGGTCCGTATTTGCATTCCATTTCCTTCTTTCTGTATCCCAGAAGATGAAATTGTGCGCAATCTTTGATAATCTCCGATATTTGATTCCAGCTGTCACATCTACCTACTCTGGCTTTGAACCTTTAATCAGAAAATTCTTTGAGCGGCCTTTTAAAAGTGCACTTGAAGTCTACTTATATGGTATTATAAAAGTATTACTAGTGAGCTTGGCTCAGAATAACAAAATAAGGTTTTATTCCAGGGTTAGACTTTTAGGGTTAACTGTTGACCAATCAACGATTGGAGCAAGCGGAGTGTATCCCTCTCTTATGTCAAGGGTTGTTTATAAGCATTATCGCAGTTTAATATCAGAGGCAACTACTTGTTTCTTTCTTTTTGAGAAGGGATTGCATGGCAATCTTACAGAAGAAGCTAAAATCCACCTAGAAACAGTTGAATGGGCTAGAAAATTTAGAGAGAAAGAAAGAGAATTGGGGAGTTATATAATGGAAGAAGGTTATCATATACAAGATGTTCTAAATAACCAAGTAGCTGTTGAACAGCAACTTTTTTGTCAAGAAGTTGTCGAACTAGCTGCTCAAGAACTAAACACTTACTTACATGCCAAATCCCAAGTCATGGCAAGCAACATTATGAACAAACACTGGGATAAACCTTATTTTAGCCAAACCAGAAATATAAGTCTTAAAGGTATGTCAGGTGCATTACAGGAAGATGGTCATTTAGCAGCAAGTGTGACATTAATTGAAGCAATTCGGTTCTTAAACCATTCACAAAATAATCCTACAGTACTTGAACTTTATGAGCAGACAAAAAAACAAAGGGCACAAGCAAGAATTGTTAGGAAATATCAAAGAACTGAGGCTGATAGAGGTTTTTTTATTACCACACTACCTACTAGAGTAAGATTAGAAATTATAGAAGATTATTATGATGCTATTGCCAAAGTTGTCCCAGAGGAATACATATCATATGGGGGTGAAAGGAAAATACTTAATATTCAGCAAGCCCTTGAAAAGGCACTTCGATGGGCCTCAGGTGAAAGTGAAATACAGTCTTCACTAGGTCATTCCATAAAATTGAAAAGAAAATTAATGTATGTTAGTGCAGATGCAACTAAGTGGTCACCTGGTGATAACTCTGCTAAATTTAGACGATTTACTCAATCTTTATATGATGGACTACGTGATGATAAATTAAAAAATTGTGTAGTTGATGCCTTAAGAAACATATATGAGACTGACTTTTTTATATCTAGAAAATTACACAGATATATTGATAATATGGGTGAATTATCTGATGAAGTGTTAGATTTCTTGTCATTTTTTCCGAATAAAGTATCTGCATCTATTAAAGGCAATTGGTTGCAAGGCAATCTAAACAAGTGTTCTTCATTATTTGGGGCAGCAATATCATTATTGTTTAAACGTGTGTGGGCTAAATTGTACCCAGAGTTAGAATGTTTTTTTGAATTTGCCCATCATTCTGATGATGCTTTATTTATTTATGGTTATCTGGAGCCTATAGATGATGGTACTGAGTGGTTTCAATATGTGACCCAACAAATTCAAGCAGGCAACTTTCATTGGCATGCTGTGAATCAGGAGATGTGGAAAAGTATGTTTAACCTCCATGAACACATTTTATTGATGGGTTCAATAAAGATTTCACCTAAAAAGACAACAGTATCACCTACAAATGCTGAATTCTTGTCTACATTTTTTGAAGGCTGTGCAGTCTCTATTCCCTTTATAAAAATCCTTTTAGGTTCTCTATCAGATTTACCTGGTTTAGGTTACTTTGATGATCTTGCAGCTGCTCAAAGCAGATGTGTCAAAGCACTAGATATGGGTGCATGTCCACAGCTTGCACAGTTAGGAATAGTGCTATGTACAAGTAAAGTTGAAAGGTTATATGGCACTGCCCCGGGTATGGTAAATAACCCTACTGCATACTTAAAAGTGGATAGAAACTTAATACCTATTCCTTTAGGTGGTGATGGTTCTATGTCAATCATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATAGGAATGGCAGATAAGAACATCTTAAAAAATGCATTTATAACTTATAAGCATGCTAAGAAGGATAACGATAGATACGTTCTGGGTTTATTTAAGTTTTTAATGTCACTATCTGATGATATTTTTCAACATGATCGTTTAGGAGAGTTCAGCTTTGTTGGGAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACCCCTAAAAGTGAGTTTGAATTTTATGATCAATATTCTAGAAAATATCTAGAGCTTTGGAGTGAACAGCACCCAGTTTATGACTATATCATACCAAGAGGTAGAGATAACCTTTTAGTGTACCTGGTAAGAAAATTGAATGATCCCAGCATAGTTACTGCAATGACAATGCAATCACCATTGCAATTAAGGTTCAGAATGCAGGCGAAACAGCATATGAAGGTATGTAAACTAGGTGGTGAATGGGTGACATTTAGAGAGGTTCTTGCTGCTGCAGATGCATTTGCGTCTGAATATCGGCCTACATTACAAGATATGGAGCTATTTCAAACATTAGTTAATTGTACATTTTCTAAAGAATACGCATGGAGAGACTTTTTAAATGAAGTACAGTGTGATGTACTAACAACAAGACAAATCCATAGACCAAAAGTTGCTCGTACATTCACAGTGAAAGAACGGGATCAAACAATTCAGAATCCTATTACAGCTGTAATAGGTTATAAATATGCAAGTAAAGTAGATGAGATAAGTGATGTATTGGATAGTGCCTTACATCCAGACTCCTTATCCACTGATTTGCAACTCATGAGAGAAGGTGTATATAGAGAATTGGGACTTGACATTAGTCAACCAAATGTTTTAAAGAAAGTTGCACCTCTATTATATAAATCAGGGAAATCTAGGATAGTGATAGTGCAAGGAAATGTTGAGGGTACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTGAAAACTATGTCTCTTGTTAAAACTATTAAAGTGAAGCCTAAAAAGGAGGTATTAAAGGCTGTATCACTTTATGGTAAGAAAGAGAAGGTGGGTGATCTGACACATTTAGCTGCAATGAGACTATGTATCGAGGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATGAACAAGATTCAGTAACATGGTTGAAATACTTGGTGTTTGAGAATAAAACACTAGAGCAGTGGGTAGACTTATTTTGTTCAAGAGGGGTATTGCCTATTGACCCAGAAATTCAGTGTTTAGGTCTTCTGGTATATGATCTTAAAGGGCAAAAGGGTTTATTGCAAATACAAGCCAATAGACGAGCATATTCAGGAAAGCAATATGATGCATATTGTGTGCAAACTTACAATGAGGAAACAAAACTTTATGAAGGAGATTTAAGGGTAACTTTTAATTTTGGTATAGACTGTGCACGTCTTGAAATTTTTTGGGATAAAAAAGAGTATATTTTAGAAACATCTATAACTCAACGGAATGTTTTGAAAATCTTGATGGAAGAAGTAACTAAAGAGTTGTTGCGCTGCGGTATGAGATTTAAAACAGAACAAGTTAATTCATCAAGAAGTGTTGTGTTGTTTAAGACAGAGAGTGGCTTTGAGTGGGGTAAGCCTAATGTGCCCTGTATAGTTTATAGGAATTGTACTCTCCGAACAGGCCTTAGGGTAAGACACCCGACAAATAAAGCATTCTCAATTACAATTCAGGCTAATGGCTTTAGGGCTATGGCACAGCTTGATGAAGAAAATCCTAGATTTCTTCTTGCACATGCTTATCATAATTTAAAGGATGTGAGATATCAGGCATTACAGGCAGTAGGAAATGTGTGGTTTAAAATGACACAGCATAAGTTGTTTATAAACCCGATCATATCAGCTGGATTACTAGAAAATTTTATGAAAGGGTTGCCTGCAGCAATTCCCCCAGCAGCTTATTCTCTTATTATGAATAAAGCAAAAATTTCTGTTGATTTATTTATGTTTAATGAACTATTAGCTTTGATAAATCCACAAAATGTTTTGAACTTGGATGGGATTGAGGAGACATCTGAAGGTTTTACAACAGTGAGCACAATCTCTAGCACACAGTGGTCAGAAGAAGTAAGTTTGACACTAGATGATAGTGATGATGATGATGATGCTTCAAACCTAGATTATACTATTGACCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGATCTAAAGGAGGATATTGAGCATTTTTTACAAGATGAATCTGCTTATACTGGAGATCTGTTAATTCAGACTGAGGAAACAGAAGTAAGAAAGTTGAGGGGTATGATAAAAATTCTTGAGCCTGTAAAGCTGATAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTTTGTCTATTGATAAAATATACAATCCTGTAAATATTATCCTAATGACTCGGTATATGTCTAAACATTATAATTTCCAGGCAAAGCAGTTATCTCTAATGGATCCATATGATCTGACTGAATTTGAGAGTGTTGTTAAAGGCTGGGGAGAGTGTGTCAAGGATCGATTTATTGAACTTGATCAAGAAGCTCAACGAAAAGTTACTGAAGAGAGAGTACTGCCTGAGGATGTACTCCCAGACTCCTTCTTTTCATTTAGACATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTGTTCCCTAGGGATTCAGCCTCTTCTTTTTATTAACAGATTATACTTCTTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 8,448
|
MZ014471.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Yashina,L.N., Tregubchak,T.V., Malyshev,B.S., Smetannikova,N.A., Grishchenko,I.V., Dol'sky,A.A., Shvalov,A.N., Zaykovskaya,A.V., Kazantsev,A.V., Chekashov,V.N., Krasovskaya,T.Y.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology 'Vector', Genomic Research
|
Russia
|
2022-03-04
|
Saratov-MG120/Russia/2019
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
GenBank
| null |
Russia: Saratov
|
Russia
|
Myodes glareolus
|
lung
|
2019-05
| null | null |
Puumala orthohantavirus isolate Saratov-MG120/Russia/2019 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAGTTTACTACAAATGGAGAAATACAGAGAGATCCACGAGAGAGTGAAGGAGGCAGTCCCAGGGGAAACGTCCGCAGTAGAGTGTTTAGACTTATTAGATCGGCTGTATGCAGTTAGGCATGATGTTGTAGATCAGATGATAAAGCATGATTGGTCTGACAATAAAGATAAAGAACAACCAATTGGTCTGGTCTTATTAATGGCTGGTGTCCCAAATGATGTGATACAAAGCATGGAGAAAAGAATTATCCCAGGGAGTCCAAGTGGCCAAATTCTTAGATCATTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATAACAGGAAATCTAATAGAGTTTATTGAGGTAACAGTGACTGCTGATGTGGCAAGAGGTGTTAGAGAAAAAATATTAAAATACCAAGGGGGTTTAGAGTTTATTGAGCAACAACTACAGGTAGAAGCACAAAAAGGTAATTGTCAATCTGGCTTTAGGATAAAGTTTGACGTGGTGGCTATAAGAACAGATGGATCAAATATTTCAACACAATGGCCCAGCAGGAGGAATGAAGGTGTTGTACAGGCAATGAGATTAATACAGGCAGACATTAATTTCGTTAGAGAACATTTGATAAAAAATGACGAGAGAGGTGCACTTGAAGCAATGTTTAATTTAAAATTTCATGTCACTGGCCCTAAAGTGCGAACATTTGATATTCCGAATTACAGGCCTCAGCAATTATGTCAACCTGTATTAGAAAATCTGGTAGATTATTGTAAGAATTGGCTCGGAACTGATCATGCTTTTGCATTTAAAGAAGTAACTGGGCAACGTGTCTTTAATGTGTTTAGAGATGAAGAAGAACTACATGCATCTAAGTATGGACACTCAAGAAAGCCTAGAAATTTTCTTTTATGTCAAATAAGCCTTCAAGCACCATATCTACCATCAACCATAGCCTCTGATCAATATGATACAAGGTTAGCTTGCAGTGAAATTCTGAAAAATTATCCTGAGACACCTTTACAACTTTTAGCCAGGGATATGGCTTACAAATACATTACACTAGATAATGAGGATATTATCAATTATTATAATCCGAGAGTTTACTTTAAACCCACACAAAATATCAAAGAACCAGGGACTTTTAAGTTAAATTTGTCTAGTATGGATCCTAAGTCGAAGGCATTGATTGATATAATCTCAAAGGATTCAAAGAAAGGGGTTTTTGGTGAATTAATTGATAGTATTGATGTAGCAAGTCAGGTTCAGCAGAATGAATGTGCAAAAACTATTGAAAAAATCCTTTCTGATCTTGAAGTTAATATAGGTGATTCTACTGCTGGATTAGAACAACCAAAAAGAACTACCGGAGTGGATGATATCTTAAGGAAGTTTTATGACAATGAACTTGTTAAGTACTTAATCTCAGTTATACGGAAAACAACTGCTTGGCATTTAGGACATCTATTACGTGATATTACTGAATCTCTTATTGCACATGCAGGGCTTAAAAGATCTAAATATTGGTCTGCTCATGGCTATGCCTATGGTAGTGTCCTGTTGTGTATCCTGCCATCTAAATCACTTGAAGTTGCAGGCTCATTCATTAGATTTTTTACTATATTTAAGGAGGGACTAGGCCTTATTGATGTAGATAATCTTGACTCTAAAGTAGAGATTGATGGTGTTTCATGGTGTTTCAGCAAAATTATTAGCCTGGATTTAAATCGATTATTAGCATTGAATATTGCATTTGAAAAGTCCCTTCTTGCTACAGCTACATGGTTTCAATATTATACAGAGGATCAAGGGCATTTCCCTCTCCAACATGCATTACGATCTGTCTTTGCATTCCATTTCCTTCTTTCCACATCTCAAAAGATGAAACTATGTGCCATATTTGATAATCTACGGTACCTTATTCCAGCAGTTACATCAACATATTCTGGCTTTGAGCCATTAATTAGGAAGTTCTTTGAACGACCCTTCAAAAGTGCATTGGAGGTATACTTGTATAACATTATAAAGACACTATTAGTTAGCTTAGCCCAAAATAATAAAATAAGATTTTATTCAAGAGTTAGACTTTTGGGGCTAACTGTTGATCAATCAACAATTGGGGCAAGTGGAGTTTATCCATCATTAATGTCACGGGTCGTGTATAAGCATTATCGTAGTTTAATTTCAGAAGCAACAACTTGTTTCTTTCTATTTGAGAAAGGACTACATGGTAATCTCACAGAAGAAGCTAAAATTCACCTTGAGACAGTTGAATGGGCCAGAAAATTTAGAGAAAAAGAAAGAGAGTTAGGTAGTTATATAATGGAAGAAGGTTATCATATACAAGATGTCTTAAACAATCAGGTAGTTGTTGAACAGCAACTCTTTTGCCAAGAAGTTGTCGAATTAGCTGCCCAAGAATTAAATACTTACTTGCATGCAAAGTCTCAAGTAATGGCAAGTAATATAATGAATAAACATTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACCAGGAATATCAGTCTTAAGGGGATGTCAGGAGCATTACAAGAAGATGGTCATCTGGCTGCAAGTGTTACTCTCATTGAGGCAATTCGTTTTTTAAATCATTCACAAAATAACCCTACAGTATTAGAACTTTATGAACAGACAAAAAAACAAAGGGCACAAGCAAGAATTGTTAGGAAATACCAAAGGACTGAAGCTGATAGAGGTTTCTTCATAACCACATTACCAACTAGAGTAAGGTTAGAAATTATTGAAGATTATTATGATGCTATAGCTAGGGTTGTTCCAGAAGAATATATATCCTATGGAGGTGAAAGAAAGATACTGAACATTCAACAGGCTTTAGAGAAGGCATTGAGGTGGGCTTCCGGAGAAAGTGAAATCCAGTCCTCGTTGGGTCACTCCATAAAATTGAAAAGAAAGCTGATGTATGTAAGTGCAGATGCAACTAAATGGTCACCAGGTGATAATTCAGCAAAGTTTAGAAGATTTACTCAATCCTTATATGATGGTTTACGTGATGACAAGCTAAAAAATTGTGTAGTTGATGCTCTAAGAAATATTTATGAAACTGACTTTTTTATATCCAGAAAACTGCATAGGTATATTGATAATATGGGTGAATTGTCTGATGAAGTACTAGATTTCTTATCTTTTTTTCCTAATAAAGTGTCTGCTTCAATAAAAGGCAACTGGCTGCAAGGTAATTTAAACAAATGTTCTTCATTATTTGGGGCGGCGGTATCATTATTGTTTAAACGTGTGTGGGCCAAATTATATCCAGAGTTAGAGTGTTTTTTTGAGTTTGCTCATCACTCTGATGATGCTTTATTCATTTATGGTTATTTAGAACCAGTAGATGATGGAACAGAATGGTTTCAGTACGTGACTCAACAAATACAGGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTGTAAATCAAGAAATGTGGAAAAGCATGTTTAATCTCCATGAGCATATTTTATTAATGGGTTCTATAAAAATATCACCTAAAAAGACAACAGTATCTCCTACAAATGCGGAGTTTCTATCTACATTCTTTGAGGGTTGTGCAGTCTCTATCCCCTTTATAAAGATTTTATTAGGTTCACTCTCTGATCTGCCTGGCTTGGGTTATTTCGATGATCTTGCTGCAGCTCAAAGTAGGTGTGTTAAGGCATTAGATATGGGTGCATGCCCTCAGCTTGCACAACTAGGAATAGTATTATGTACTAGTAAGGTTGAAAGATTATATGGTACTGCTCCTGGTATGGTCAATAATCCTACTGCATACTTAAAGGTGGACAGAAGTCTGATTCCTATACCGTTAGGTGGTGATGGTTCTATGTCAATCATGGAACTTGCCACAGCAGGTATAGGGATGGCAGACAAAAATATATTAAAAAATGCATTCATAACTTACAAACATGCAAAAAAAGATAATGATAGATATGTGTTAGGATTGTTTAAATTCTTAATGTCATTGTCAGATGATATATTCCAGCATGATCGCTTAGGGGAATTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAGTGGAAAGTTTTCACCCCTAAAAGTGAGTTTGAATTTTATGACCAATATTCAAGAAAATATCTTGAGCTTTGGAGTGAACAACATCCTGTCTATGATTATATTATACCAAGAGGTAGGGATAACCTATTAGTATACTTGGTAAGGAAGTTAAATGACCCTAGTATAGTTACTGCAATGACAATGCAATCACCACTTCAATTGAGGTTTCGGATGCAGGCAAAGCAACATATGAAAGTATGTAAGTTAGGTGGTGAATGGGTGACATTTAGGGAAGTTCTTGCCGCTGCAGATGCATTTGCATCAGAGTACCGACCAACATCACAGGATATGGAGCTCTTTCAAACACTTGTTAATTGTACATTTTCTAAAGAATATGCCTGGAGGGATTTCTTAAATGAAGTGCAATGTGATGTTTTAACAACAAGACAAATTCATAGACCAAAAGTTGCCCGTACTTTTACAGTTAAAGAAAGAGATCAAACAATACAAAATCCTATTACGGCTGTGATTGGCTACAAGTATGCTAGTAAAGTAGATGAAATAAGTGATGTATTAGATAGTGCTATTCATCCAGACTCATTGTCTACCGACTTGCAGCTTATGAGGGAAGGTGTCTACAGAGAATTAGGTCTTGATATCAGCCAACCGAATGTATTGAAGAAAGTTGCACCATTGTTGTATAAGTCTGGAAAGTCGAGGATTGTAATTGTGCAAGGAAATGTAGAGGGTACAGCTGAATCAATTTGTAGTTATTGGTTGAAGACTATGTCTCTTGTTAAGACTATTAAAGTAAAACCAAAAAAGGAGGTCCTAAAAGCTGTATCTCTTTATGGAAAAAAAGAAAAAGCTGGTGATTTAACACATTTAGCTGCAATGAGATTATGCATTGAAGTTTGGAGATGGTGCAAAGCTAATGAGCAAGATTCTGTATCTTGGTTAAAGTATCTAATGTTTGAAAACAAAACATTGGAACAATGGATAGATTCATTTTGTTCAAGAGGAGTTTTACCTGTGGATCCTGAGATCCAATGTTTAGGCCTTCTTGTATATGATCTTAAGGGACAAAAGGGTTTATTGCAAATACAAGCTAACAGGAGAGCATATTCAGGGAAGCAGTATGATGCCTATTGTGTGCAAACTTATAATGAAGAGACAAAACTTTATGAAGGAGATTTGAGGGTAACATTTAATTTTGGTATAGACTGTGCAAGACTAGAAATCTTTTGGGACAAAAAAGAGTATATTCTGGAAACATCCATAACCCAACGAAATGTATTAAAGATTCTCATGGAAGAAGTAACTAAAGAATTACTACRTTGTGGTATGAGATTTAAGACAGAGCAAGTCAACTCCTCACGTAGTGTAGTATTGTTTAAAACAGAAAGTGGTTTTGAATGGGGTAAACCCAATGTACCATGTATTGTTTATAGAAATTGCACCCTTAGGACAGGATTGAGAGTACGACAGCCTACAAACAAAGCATTTTCAATTACTATTCAGGCTAATGGATTTAGGGCTATGGCCCAGCTTGATGAAGAAAATCCTAGATTTTTACTCGCCCATGCATATCATAATTTAAAAGATGTTAGGTATCAGGCACTACAAGCAGTCGGAAATGTGTGGTTTAAGATGACTCAACATAAACTGTTTATAAATCCGATAATATCTGCTGGGCTGCTTGAGAATTTTATGAAAGGTTTGCCTGCAGCAATTCCTCCAGCAGCTTACTCTCTAATTATGAACAAGGCAAAAATATCTGTTGATTTATTCATGTTTAATGAACTGTTAGCTTTAATTAACCCACAGAATGTTTTAAACTTAGATGGAATAGAAGAAACATCAGAAGGTTTTACAACAGTTAGCACAATCTCTAGTACTCAATGGTCAGAAGAGGTGAGTTTAACAATGGATGATAGTGATGATGATGATAATGCTTCACAGCTTGATTACACTATTGACCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGATCTAAAAGAGGATATCGAGCATTTTTTACAGGATGAATCAGCATATACTGGAGATCTCTTAATTCAAACTGAGGAAACTGAAATAAGAAAGCTGAGAGGTATGATCAAAATTCTTGAGCCTGTAAAGCTTATTAAAAGTTGGGTTTCCAAAGGTTTATCCATAGACAAGATATATAACCCTGTTAATATTGTTCTCATGACTCGATACATGTCCAAGCATTACAATTTCCATACAAAGCAGTTATCTCTTATGGATCCGTATGATTTAACAGAGTTCGAAAGTATTGTTAAAGGTTGGGGAGAGTGTGTTAAAGATAGGTTTATTGAACTTGACCAGGAAGCCCAGCGGAAGGTCACTGAAGAGAGAGTGCTACCAGAAGATGTACTTCCAGACTCCCTCTTTTCATTTAGACATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTATTTCCCAGGGACTCAGCCTCTTCCTTTTATTAACAGATTATACTTCTTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 32,698
|
MZ014472.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Yashina,L.N., Tregubchak,T.V., Malyshev,B.S., Smetannikova,N.A., Grishchenko,I.V., Dol'sky,A.A., Shvalov,A.N., Zaykovskaya,A.V., Kazantsev,A.V., Chekashov,V.N., Krasovskaya,T.Y.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology 'Vector', Genomic Research
|
Russia
|
2022-03-04
|
Saratov-MG125/Russia/2019
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
GenBank
| null |
Russia: Saratov
|
Russia
|
Myodes glareolus
|
lung
|
2019-05
| null | null |
Puumala orthohantavirus isolate Saratov-MG125/Russia/2019 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAGTTTACTACAAATGGAGAAATACAGAGAGATCCACGAGAGAGTGAAGGAGGCAGTCCCAGGGGAAACGTCCGCAGTAGAGTGTTTAGACTTATTAGATCGGCTGTATGCAGTTAGGCATGATGTTGTAGATCAGATGATAAAGCATGATTGGTCTGACAATAAAGATAAAGAACAACCAATTGGTCTGGTCTTATTAATGGCTGGTGTCCCAAATGATGTGATACAAAGCATGGAGAAAAGAATTATCCCAGGGAGTCCAAGTGGCCAAATTCTTAGATCATTTTTTAAGATGACACCTGATAATTATAAAATAACAGGAAATCTAATAGAGTTTATTGAGGTAACAGTGACTGCTGATGTGGCAAGAGGTGTTAGAGAAAAAATATTAAAATACCAAGGAGGTTTAGAGTTTATTGAGCAACAACTACAGGTAGAAGCACAAAAAGGTAATTGTCAATCTGGCTTTAGGATAAAGTTTGATGTGGTGGCTATAAGAACAGATGGATCAAATATTTCAACACAATGGCCCAGCAGGAGGAATGAAGGTGTTGTACAGGCAATGAGGTTAATACAGGCAGACATTAATTTCGTTAGAGAACATTTGATAAAAAATGACGAGAGAGGTGCACTTGAAGCAATGTTTAATTTAAAATTTCATGTCACTGGCCCTAAAGTGCGAACATTTGATATTCCGAATTACAGGCCTCAGCAATTATGTCAACCTGTATTAGAAAATCTGGTAGATTATTGTAAGAATTGGCTCGGAACTGATCATGCTTTTGCATTTAAAGAAGTAACTGGGCAACGTGTCTTTAATGTGTTTAGAGATGAAGAAGAACTACATGCATCTAAGTATGGACACTCAAGAAAGCCTAGAAATTTTCTTTTATGTCAAATAAGCCTTCAAGCACCATATCTACCATCAACCATAGCCTCTGATCAATATGATACAAGGTTAGCTTGCAGTGAAATTCTGAAAAATTATCCTGAGACACCTTTACAACTTTTAGCCAGGGATATGGCTTACAAATACATTACACTAGATAATGAGGATATTATCAATTATTATAATCCGAGAGTTTACTTTAAACCCACACAAAATATCAAAGAACCAGGGACTTTTAAGTTAAATTTGTCTAGTATGGATCCTAAGTCGAAGGCATTGATTGATATAATCTCAAAGGATTCAAAGAAAGGGGTTTTTGGTGAATTAATAGATAGTATTGATGTAGCAAGTCAGGTTCAGCAGAATGAATGTGCAAAAACTATTGAAAAAATCCTTTCTGATCTTGAAGTTAATATAGGTGATTCTACTGCTGGATTAGAACAACCAAAAAGAACTACCGGAGTGGATGATATCTTAAGGAAGTTTTATGACAATGAACTTGTTAAGTACTTAATCTCAGTTATACGGAAAACAACTGCCTGGCATTTAGGACATCTATTACGTGATATTACTGAATCTCTTATTGCACATGCAGGGCTTAAAAGATCTAAATATTGGTCTACTCATGGCTATGCCTATGGTAGTGTCCTGTTGTGTATCCTGCCATCTAAATCACTTGAAGTTGCAGGCTCATTCATTAGATTTTTTACTATATTCAAGGAGGGACTAGGCCTTATTGATGTAGATAATCTTGATTCTAAAGTAGAGATTGATGGTGTTTCATGGTGTTTCAGCAAAATTATTAGCCTGGATTTAAATCGATTATTAGCATTGAATATTGCATTTGAAAAGTCCCTTCTTGCTACAGCTACATGGTTTCAATATTATACAGAGGATCAAGGGCATTTCCCTCTCCAACATGCATTACGATCTGTCTTTGCATTCCATTTCCTTCTTTCCACATCTCAAAAGATGAAACTATGTGCCATATTTGATAATCTACGGTACCTTATTCCAGCAGTTACATCAACATATTCTGGCTTTGAGCCATTAATTAGGAAGTTCTTTGAACGACCCTTCAAAAGTGCATTGGAGGTATACTTGTATAATATTATAAAGACACTATTAGTTAGCTTAGCTCAAAATAATAAAATAAGATTTTATTCAAGAGTTAGACTTTTGGGGCTAACTGTTGATCAATCAACAATTGGGGCAAGTGGAGTTTATCCATCATTAATGTCACGGGTCGTGTATAAGCATTATCGTAGTTTAATTTCAGAAGCAACAACTTGTTTCTTTTTATTTGAGAAAGGACTACATGGTAATCTCACAGAAGAAGCTAAAATTCACCTTGAGACAGTTGAATGGGCCAGAAAATTTAGAGAAAAAGAAAGAGAGTTAGGTAGTTATATAATGGAAGAAGGTTATCATATACAAGATGTCTTAAACAATCAGGTAGTTGTTGAACAGCAACTCTTTTGCCAAGAAGTTGTCGAATTAGCTGCCCAAGAATTAAATACTTACTTGCATGCAAAGTCTCAAGTAATGGCAAGTAATATAATGAATAAACATTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACCAGGAATATCAGTCTTAAGGGGATGTCAGGAGCATTACAAGAAGATGGTCATCTGGCTGCAAGTGTTACTCTCATTGAGGCAATTCGGTTTTTAAATCATTCACAAAATAACCCTACAGTATTAGAACTTTATGAACAGACAAAAAAACAAAGGGCACAAGCAAGAATTGTTAGGAAATACCAAAGGACTGAAGCTGATAGAGGTTTCTTCATAACCACATTATCAACTAGAGTAAGGTTAGAAATTATTGAAGATTATTATGATGCTATAGCTAGGGTTGTTCCAGAAGAATATATATCCTATGGAGGTGAAAGAAAGATACTGAACATTCAACAGGCTTTAGAGAAGGCATTGAGGTGGGCTTCTGGAGAAAGTGAAATCCAGTCCTCGTTGGGTCACTCCATAAAATTGAAAAGAAAGCTGATGTATGTAAGTGCGGATGCAACTAAATGGTCACCAGGTGATAATTCAGCAAAGTTTAGAAGATTTACTCAATCCTTATATGATGGTTTACGTGATGACAAGCTAAAAAATTGTGTAGTTGATGCTCTAAGAAATATTTATGAAACTGACTTTTTTATATCCAGAAAACTGCATAGGTATATTGATAATATGGGTGAATTGTCTGATGAAGTACTAGATTTCTTATCTTTTTTTCCTAATAAAGTGTCTGCTTCAATAAAAGGCAACTGGCTGCAAGGTAATTTAAACAAATGTTCTTCATTATTTGGGGCGGCGGTATCATTATTGTTTAAACGTGTGTGGGCCAAATTATATCCAGAGTTAGAGTGTTTTTTTGAGTTTGCTCATCACTCTGATGATGCTTTATTCATTTATGGTTATTTAGAACCAGTAGATGATGGAACAGAATGGTTTCAGTACGTGACTCAACAAATACAGGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTGTGAATCAAGAAATGTGGAAAAGCATGTTTAATCTCCATGAGCATATTTTATTAATGGGTTCTATAAAAATATCACCTAAAAAGACAACAGTATCTCCTACAAATGCGGAGTTTTTATCTACATTCTTTGAGGGTTGTGCAGTCTCTATCCCCTTTATAAAGATTTTATTAGGTTCACTCTCTGATCTGCCTGGCTTGGGTTATTTCGATGATCTTGCTGCAGCTCAAAGTAGGTGTGTTAAGGCATTAGATATGGGTGCATGCCCTCAGCTTGCACAACTAGGAATAGTATTATGTACGAGTAAGGTTGAAAGATTATATGGTACTGCTCCTGGTATGGTCAATAATCCTACTGCATACTTAAAGGTGGACAGAAGTCTGATTCCTATACCGTTAGGTGGTGATGGTTCTATGTCAATCATGGAACTAGCCACAGCAGGTATAGGGATGGCAGACAAAAATATATTAAAAAATGCATTCATAACTTACAAACATGCAAAAAAAGATAATGATAGATATGTGTTAGGATTGTTTAAATTCTTAATGTCATTGTCAGATGATATATTCCAGCATGATCGCTTGGGGGAATTTAGTTTTGTAGGTAAAGTTCAGTGGAAAGTTTTCACCCCTAAAAGTGAGTTTGAATTTTATGACCAATATTCAAGAAAATATCTTGAGCTGTGGAGTGAACAACATCCTGTCTATGATTATATTATACCAAGAGGTAGGGATAACCTATTAGTATACTTGGTAAGGAAGTTAAATGACCCTAGTATAGTTACTGCAATGACAATGCAATCACCACTTCAATTGAGGTTTCGGATGCAGGCAAAGCAACATATGAAAGTATGTAAGTTAGGTGGTGAATGGGTGACATTTAGGGAAGTTCTTGCCGCTGCAGATGCATTTGCATCAGAGTACCGACCAACATCACAGGATATGGAGCTCTTTCAAACACTTGTTAATTGTACATTTTCTAAAGAATATGCCTGGAGGGACTTCTTAAATGAAGTACAATGTGATGTTTTAACAACAAGACAAATTCATAGACCAAAAGTTGCCCGTACTTTTACAGTTAAAGAAAGAGATCAAACAATACAAAATCCTATTACGGCTGTGATTGGCTACAAGTATGCTAGTAAAGTAGATGAAATAAGTGATGTATTAGATAGTGCTATTCATCCAGACTCATTGTCTACCGACTTGCAGCTTATGAGGGAAGGTGTCTACAGAGAATTAGGTCTTGATATCAGCCAACCGAATGTATTGAAGAAAGTTGCACCATTGTTGTATAAGTCTGGAAAGTCGAGGATTGTAATTGTGCAAGGAAATGTAGAGGGTACAGCTGAATCAATTTGTAGTTATTGGTTGAAGACTATGTCTCTTGTTAAGACTATTAAAGTAAAACCAAAAAAGGAGGTCCTAAAAGCTGTATCTCTTTATGGAAAAAAAGAAAAAGCTGGTGATTTAACACATTTAGCTGCAATGAGATTATGCATTGAAGTTTGGAGATGGTGCAAAGCTAATGAGCAAGATTCTGTATCTTGGTTAAAGTATCTAATGTTTGAAAACAAAACATTGGAACAATGGATAGATTCATTTTGTTCCAGAGGAGTTTTACCTGTGGATCCTGAGATCCAATGTTTAGGCCTTCTTGTATATGATCTTAAGGGACAAAAGGGTTTATTGCAAGTACAAGCTAACAGGAGAGCATATTCAGGGAAGCAGTATGATGCCTATTGTGTGCAAACTTATAATGAAGAGACAAAACTTTATGAAGGAGATTTGAGGGTAACATTTAATTTTGGTATAGACTGTGCAAGACTAGAAATCTTTTGGGACAAAAAAGAGTATATTTTGGAAACATCCATAACCCAACGAAATGTATTAAAGATTCTCATGGAAGAAGTAACTAAAGAATTACTACRTTGTGGTATGAGATTTAAGACAGAGCAAGTCAACTCCTCACGTAGTGTAGTATTGTTTAAAACAGAAAGTGGTTTTGAATGGGGTAAACCCAATGTACCATGTATTGTTTATAGAAATTGCACCCTTAGGACAGGATTGAGAGTACGACAGCCTACAAACAAAGCATTTTCAATTACTATTCAGGCTAATGGATTTAGGGCTATGGCCCAGCTTGATGAAGAAAATCCTAGATTCTTACTCGCCCATGCATATCATAATTTAAAAGATGTTAGGTATCAGGCACTACAAGCAGTCGGAAATGTGTGGTTTAAGATGACTCAACATAAACTGTTTATAAATCCGATAATATCTGCTGGGCTGCTTGAGAATTTTATGAAAGGTTTGCCTGCAGCAATTCCTCCAGCAGCTTACTCTCTAATTATGAACAAGGCAAAAATATCTGTTGATTTATTCATGTTTAATGAACTGTTAGCTTTAATTAACCCACAGAATGTTTTAAACTTAGATGGAATAGAAGAAACATCAGAAGGTTTTACAACAGTTAGCACAATTTCTAGTACACAATGGTCAGAAGAGGTAAGTTTAACAATGGATGATAGTGATGATGATGAGAATGCTTCACAGCTTGATTACACTATTGACCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGATCTAAAAGAGGATATCGAGCATTTTTTACAGGATGAATCAGCATATACTGGAGATCTCTTAATTCAAACTGAGGAAACTGAAATAAGAAAGCTGAGAGGTATGATCAAAATTCTTGAGCCTGTAAAGCTTATTAAAAGTTGGGTTTCCAAAGGTTTATCCATAGACAAGATATATAACCCTGTTAATATTGTTCTCATGACTCGATACATGTCCAAGCATTACAATTTCCATACAAAGCAGTTATCTCTTATGGATCCGTATGATTTAACAGAGTTCGAAAGTATTGTTAAAGGTTGGGGAGAGTGTGTTAAAGATAGGTTTATTGAACTTGACCAGGAAGCCCAGCGGAAGGTCACTGAAGAGAGAGTGCTACCAGAAGATGTACTTCCAGACTCCCTCTTTTCATTTAGACATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTATTTCCCAGGGACTCAGCCTCTTCTTTTTATTAACAGATTATACTTCTTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 32,699
|
MZ014473.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Yashina,L.N., Tregubchak,T.V., Malyshev,B.S., Smetannikova,N.A., Grishchenko,I.V., Dol'sky,A.A., Shvalov,A.N., Zaykovskaya,A.V., Kazantsev,A.V., Chekashov,V.N., Krasovskaya,T.Y.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology 'Vector', Genomic Research
|
Russia
|
2022-03-04
|
Saratov-MG131/Russia/2019
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
GenBank
| null |
Russia: Saratov
|
Russia
|
Myodes glareolus
|
lung
|
2019-05
| null | null |
Puumala orthohantavirus isolate Saratov-MG131/Russia/2019 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAATTTACTACAAATGGAGAAATACAGAGAGATCCACGAGAGAGTGAAGGAGGCAGTCCCAGGGGAAACGTCTGCAGTAGAGTGTTTAGACTTATTAGATCGGCTGTATGCAGTTAGGCATGATGTTGTAGATCAGATGATAAAGCATGATTGGTCTGACAATAAAGATAAAGAACAACCAATTGGTCTGGTCTTATTAATGGCTGGTGTCCCAAATGATGTGATACAAAGCATGGAGAAAAGAATTATTCCAGGGAGTCCAAGTGGCCAAATTCTTAGATCATTTTTCAAGATGACACCTGATAATTATAAAATAACAGGAAATCTAATAGAGTTTATTGAGGTAACAGTGACTGCTGATGTGGCAAGAGGTGTTAGAGAAAAAATATTAAAATACCAAGGAGGTTTAGAGTTTATTGAGCAACAACTACAGGTAGAAGCACAAAAAGGTAATTGTCAATCTGGCTTTAGGATAAAGTTTGACGTGGTGGCTATAAGAACAGACGGATCAAATATTTCAACACAATGGCCCAGCAGGAGGAATGAAGGTGTTGTACAGGCAATGAGGTTAATACAGGCAGACATTAATTTTGTTAGAGAACATTTGATAAAAAATGACGAGAGAGGTGCACTTGAAGCAATGTTTAATTTAAAATTTCATGTCACTGGCCCTAAAGTGCGAACATTTGACATTCCGAATTACAGGCCTCAGCAATTATGTCAACCTGTATTAGAAAATCTGGTAGATTATTGTAAGAATTGGCTCGGAACTGATCATGCTTTTGCATTTAAAGAAGTAACTGGGCAACGTGTCTTTAATGTGTTTAGAGATGAAGAAGAACTACATGCATCTAAGTATGGACACTCAAGAAAGCCTAGAAATTTTCTTTTGTGTCAAATAAGCCTTCAAGCACCATATCTACCATCAACCATAGCCTCTGATCAATATGATACAAGGTTAGCTTGCAGTGAAATTCTGAAAAATTATCCTGAGACACCTTTACAACTTTTAGCCAGGGATATGGCTTACAAATACATTACACTAGATAATGAGGATATTATCAATTATTATAATCCGAGAGTTTACTTTAAACCCACACAAAATATCAAAGAACCAGGGACTTTTAAGTTAAATTTGTCTAGTATGGATCCTAAGTCAAAGGCGTTGATTGATATAATCTCAAAGGACTCAAAGAAAGGGGTTTTTGGTGAATTAATTGATAGTATTGATGTAGCAAGTCAGGTTCAGCAGAATGAATGTGCAAAAACTATTGAAAAAATCCTTTCTGATCTTGAAGTTAATATAGGTGATTCTACTGCTGGATTAGAACAACCAAAAAGAACTACCGGAGTGGATGATATCTTAAGGAAGTTTTATGACAATGAACTTGTTAAGTACTTAATCTCAGTTATACGGAAAACAACTGCCTGGCATTTAGGACATCTATTACGTGATATTACTGAATCTCTTATTGCACATGCAGGGCTTAAAAGATCTAAATATTGGTCTGCTCATGGCTATGCCTATGGTAGTGTCCTGTTGTGTATCCTGCCGTCTAAATCACTTGAAGTTGCAGGCTCATTCATTAGATTTTTTACTATATTCAAGGAGGGACTAGGCCTTATTGATGTAGATAATCTTGACTCTAAAGTAGAGATTGATGGTGTTTCATGGTGTTTCAGCAAAATTATTAGCCTGGATTTAAATCGATTATTAGCATTGAATATTGCATTTGAAAAGTCCCTTCTTGCTACAGCCACATGGTTTCAATATTACACAGAGGATCAAGGGCATTTCCCTCTCCAGCATGCACTACGATCTGTCTTTGCATTCCATTTCCTTCTTTCCACATCTCAAAAGATGAAACTATGTGCCATATTTGATAATCTACGGTACCTTATTCCAGCAGTTACATCAACATATTCTGGCTTTGAGCCATTAATTAGGAAGTTCTTTGAACGACCCTTCAAAAGTGCATTGGAGGTATACTTGTATAATATTATAAAGACACTATTAGTTAGCTTAGCTCAAAATAATAAAATAAGATTTTATTCAAGAGTTAGACTTTTGGGGCTAACTGTTGATCAATCAACAATTGGGGCAAGTGGAGTTTATCCATCATTAATGTCACGGGTCGTGTATAAGCATTATCGTAGTTTAATTTCAGAAGCAACAACTTGTTTCTTTCTATTTGAGAAAGGACTGCATGGTAATCTCACAGAAGAAGCTAAAATTCACCTTGAGACAGTTGAATGGGCCAGAAAATTTAGAGAAAAAGAAAGAGAGTTAGGTAGTTATATAATGGAAGAAGGTTATCATATACAAGATGTCTTAAACAATCAGGTAGTTGTTGAACAGCAACTCTTTTGCCAAGAAGTTGTCGAATTAGCTGCCCAAGAATTAAATACTTACTTGCATGCAAAGTCTCAAGTAATGGCAAGTAATATAATGAATAAACATTGGGATAAACCATACTTTAGTCAAACCAGGAATATCAGTCTTAAGGGGATGTCAGGAGCATTACAAGAAGATGGTCATCTGGCTGCAAGTGTTACTCTCATTGAGGCAATTCGTTTTTTAAATCATTCACAAAATAACCCTACAGTATTAGAACTTTATGAACAGACAAAAAAACAAAGGGCACAAGCAAGAATTGTTAGGAAATACCAAAGGACTGAAGCTGATAGAGGTTTCTTCATAACCACATTACCAACTAGAGTAAGGTTAGAAATTATTGAAGATTATTATGATGCTATAGCTAGGGTTGTTCCAGAAGAATATATATCTTATGGAGGTGAAAGAAAGATACTGAATATTCAACAGGCTTTAGAGAAGGCATTGAGGTGGGCTTCCGGAGAAAGTGAAATCCAGTCCTCGTTGGGTCACTCCATAAAATTGAAAAGAAAGCTGATGTATGTAAGTGCAGATGCAACTAAATGGTCACCAGGTGATAATTCAGCAAAGTTTAGAAGATTTACTCAATCCTTATATGATGGTTTACGTGATGACAAGCTAAAAAATTGTGTAGTTGATGCTCTAAGAAATATTTATGAAACTGACTTTTTTATATCCAGAAAACTGCATAGGTATATTGATAATATGGGTGAATTGTCTGATGAAGTACTAGATTTCTTATCTTTTTTTCCTAATAAAGTGTCTGCTTCAATAAAAGGCAACTGGCTGCAAGGTAATTTAAACAAATGTTCTTCATTATTTGGGGCAGCAGTATCATTATTGTTTAAACGTGTGTGGGCCAAATTATATCCAGAGTTAGAGTGTTTTTTTGAGTTTGCTCATCACTCTGATGATGCTTTATTCATTTATGGTTATTTAGAACCAGTAGATGATGGAACAGAATGGTTTCAGTATGTGACTCAACAAATACAGGCAGGAAACTTTCATTGGCATGCTGTAAATCAAGAAATGTGGAAAAGCATGTTTAATCTCCATGAGCATATTTTATTAATGGGTTCTATAAAAATATCACCTAAAAAGACAACAGTATCTCCTACAAATGCGGAGTTTTTATCTACATTTTTTGAGGGTTGTGCAGTCTCTATCCCCTTTATAAAGATTTTATTAGGTTCACTCTCTGATCTGCCTGGCTTGGGTTATTTCGATGATCTTGCTGCAGCTCAAAGTAGGTGTGTTAAAGCATTAGATATGGGTGCATGCCCTCAGCTTGCACAACTAGGAATAGTATTATGTACGAGTAAGGTTGAAAGATTATATGGTACTGCTCCTGGTATGGTCAATAATCCTACTGCATACTTAAAGGTGGACAGAAGTCTGATTCCTATACCGTTAGGTGGTGATGGTTCTATGTCAATCATGGAACTTGCCACAGCAGGTATAGGGATGGCAGACAAAAATATATTAAAAAATGCATTCATAACTTACAAACATGCAAAAAAAGATAATGATAGATATGTGTTAGGATTGTTTAAATTCTTAATGTCATTGTCAGATGATATATTCCAGCATGATCGCTTGGGGGAATTTAGTTTTGTGGGTAAAGTTCAGTGGAAAGTTTTCACCCCTAAAAGTGAGTTTGAATTTTATGACCAATATTCAAGAAAATATCTTGAGCTTTGGAGTGAACAACATCCTGTCTATGATTATATTATACCAAGAGGTAGGGATAACCTATTAGTATACTTGGTAAGGAAATTAAATGATCCTAGTATAGTTACTGCAATGACAATGCAATCACCACTTCAATTGAGGTTTCGGATGCAGGCAAAGCAACATATGAAAGTATGTAAGTTAGGTGGTGAATGGGTGACATTTAGGGAAGTTCTTGCTGCTGCGGATGCATTTGCATCAGAGTACCGACCAACATCACAGGATATGGAGCTCTTTCAAACACTTGTTAATTGTACATTTTCTAAAGAATATGCCTGGAGGGATTTCTTAAATGAAGTGCAATGTGATGTTTTAACAACAAGACAAATTCATAGACCAAAAGTTGCCCGTACTTTTACAGTTAAAGAAAGAGATCAAACAATACAAAATCCTATTACGGCTGTGATTGGCTACAAGTATGCTAGTAAAGTAGATGAAATAAGTGATGTATTAGATAGTGCTATTCACCCAGACTCATTGTCTACCGACTTGCAGCTTATGAGGGAAGGTGTCTACAGAGAATTAGGTCTTGATATCAGCCAACCGAATGTATTGAAGAAAGTTGCACCATTGTTGTATAAGTCTGGAAAGTCGAGGATTGTAATTGTGCAAGGAAATGTAGAGGGTACAGCTGAATCAATTTGTAGTTATTGGTTGAAGACTATGTCTCTTGTTAAGACTATTAAAGTAAAACCAAAAAAGGAGGTCTTAAAAGCTGTATCTCTTTATGGAAAAAAAGAAAAAGCTGGTGATTTAACACATTTAGCTGCAATGAGATTATGCATTGAAGTTTGGAGATGGTGCAAAGCTAATGAGCAAGATTCTGTATCTTGGTTAAAGTATCTAATGTTTGAAAACAAAACATTGGAACAATGGATAGATTCATTTTGTTCAAGAGGAGTTTTACCTGTGGATCCCGAGATCCAGTGTTTAGGTCTTCTTGTATATGATCTTAAGGGACAAAAGGGTTTATTGCAAATACAAGCTAACAGGAGAGCATATTCAGGGAAGCAGTATGATGCCTATTGTGTGCAAACTTATAATGAAGAGACAAAACTTTATGAAGGAGATTTGAGGGTAACATTTAATTTTGGTATAGACTGTGCAAGATTAGAAATCTTTTGGGACAAAAAAGAGTATATTTTGGAAACATCCATAACCCAACGAAATGTATTAAAGATTCTCATGGAAGAAGTAACTAAAGAATTACTACRTTGTGGTATGAGATTTAAGACAGAGCAAGTCAACTCCTCACGTAGTGTAGTATTGTTTAAAACAGAAAGTGGTTTTGAATGGGGTAAACCCAATGTACCATGTATTGTTTATAGAAATTGCACCCTTAGGACAGGATTGAGAGTACGACAGCCTACAAACAAAGCATTTTCAATTACTATTCAGGCTAATGGATTTAGGGCTATGGCCCAGCTTGATGAAGAAAATCCTAGATTTTTACTTGCCCATGCATACCATAATCTAAAGGATGTTAGGTATCAGGCACTACAAGCAGTCGGAAATGTGTGGTTTAAGATGACTCAACATAAACTGTTTATAAATCCGATAATATCTGCTGGGCTGCTGGAGAATTTTATGAAAGGTTTGCCTGCAGCAATTCCTCCAGCAGCTTACTCTCTAATTATGAACAAGGCAAAAATATCTGTTGATTTATTCATGTTTAATGAACTGTTAGCTTTAATTAACCCACAGAATGTTTTAAACTTAGATGGAATAGAAGAAACATCAGAAGGTTTTACAACAGTTAGCACAATCTCTAGTACACAATGGTCAGAAGAGGTAAGTTTAACAATGGATGATAGTGATGATGATGATAATGCTTCACAGCTTGATTACACTATTGACCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGATCTAAAAGAGGATATCGAGCATTTTTTACAGGATGAATCAGCATATACTGGAGATCTCTTAATTCAAACTGAGGAAACTGAAATAAGAAAGCTGAGAGGTATGATCAAAATTCTTGAGCCTGTAAAGCTTATTAAAAGTTGGGTTTCCAAAGGTTTATCCATAGACAAGATATATAACCCTGTTAATATTGTTCTCATGACTCGATACATGTCCAAGCATTACAATTTTCATACAAAACAGTTATCTCTTATGGATCCATATGATTTAACAGAGTTCGAAAGTATTGTTAAAGGTTGGGGAGAGTGTGTTAAAGATAGGTTTATTGAACTTGACCAGGAAGCCCAGCGGAAGGTCACTGAAGAGAGAGTACTACCAGAAGATGTACTTCCAGACTCCCTCTTTTCATTTAGACATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTATTTCCCAGGGACTCAGCCTCTTCCTTTTATTAACAGATTATACTTCTTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 32,700
|
MN832779.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Kunec,D., Groenke,N., Trimpert,J., Binder,F., Osterrieder,N., Ulrich,R.G.
|
Institute of Virology, FU Berlin
|
Germany
|
2020-09-30
| null |
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,525
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
| null | null | null | null | null |
Orthohantavirus puumalaense strain Vranica segment L, complete sequence
|
CCGAGATAGAGAAGTTTACTACAAATGGAGAAATACAGAGATATTCATGAGAGGGTCAAGGAGGCAATCCCAGGGGGAACATCAGCAGTAGAATGTTTAGATCTATTAGATCGATTGTATGCAGTCAGACATGATGTTGTAGATCAAATGATAAAGCATGATTGGTCTGACAATAAAGATAAGGAACAACCTATTGGTCTCGTATTATTAATGGCAGGGGTGCCAAATGATGTGATACAGAGGATGGAGAAACGTATTATTCCAGGGAGTCCTAGTGGGCAAATACTTAGATCATTCTTCAAAATGACCCCAGATAATTATAAGATAACAGGGAATCTTATCGAGTTTATTGAGGTGACTGTAACAGCTGATGTGGCAAGAGGAGTTAGGGAAAAGATATTAAAATATCAAGGGGGACTAGAGTTCATTGAGCAACTTCTCCAGGTAGAGGCACAAAAGGGCAATTGTCAACCTGGTTTTAAAATAAAATTTGATGTAATTGCAATAAGGACAGATGGATCAAATATCTCTACGCAATGGCCCAGTAGGAGGAATGAAGGTGTTGTACAGGCAATGCGATTAATACAAGCTGACATTAATTTTGTGAGAGAACATCTGGTAAAAAATGAAGAGCGGGGAGCCCTTGAAGCAATGTTTAATTTGAAATTTCATGTTACAGGTCCTAAGGTACGAACATTTGATATTCCCAATTACAGACCTCAACCATTATGTCAGCCATTATTAGAGAACTTAGTAGACTACTGTAAGAATTGGCTTGAGACTGAGCATGCATTTGCTTTTAAAGAGGTAACTGGGCAGCGTGTTTTTAATGTTTTTAAAGAAGAGGAAGAATTACATGCATCTAAATATGGACATTCCAGAAAACCTAGAAATTTTTTATTATGTCAAATCAGCTTGCAAGCACCATATTTGCCTTCAACCATTGCTTCAGATCAGTATGATACTCGGTTAGCATGTAATGAAGTATTAAAAAATTACCCCGAGACACCATTACAACTTTTAGCTAGAGATATGGCTTATAAGTATGTAACATTAGATCATGATGATATTATTAATTATTATAATCCAAGAGTTTATTTTAAGCCAACACAGAGTGTTAAGGAGCCAGGAACTTTCAAGTTAAATCTGTCAAATATGGATGCAAAGTCAAAGGCATTGATTGATTTAATTTCAAAGGATTCAAAGAAAGGTGTGTTTGGTGAGTTAATTGATAGCATAGATATAGCAAGTCAGGTTCAGCAGAATGAATGTGCCAAGACTGTTGAGAAGATCTTATCTGACTTAGAGGTGAATCTGGGTGAATCTAATGTGGGTTTAGACCAACCAAAAAGAACAACAGGTGTGGATGATATCTTAAGAAAATTTTATGATAATGAACTTATAAAATATTTAATTTCTGTTATCAGAAAAACAACTGCCTGGCATTTGGGCCATTTATTACGTGATATAACAGAATCTTTGATAGCACATGCAGGGTTAAAGAGATCAAAATACTGGTCAGCTCATGGGTATGCTTATGGCAGTGTGCTTTTGTGCATTTTACCATCCAAATCACTAGAAGTCTCTGGGTCATTTATCAGGTTCTTCACAGTATTTAAAGAAGGGTTAGGTCTAATTGATTCTGAAAATCTTGACTCTAAAGTTGAAATTGACGGGGTTACCTGGTGTTTTAGTAAAATTATTAGTTTGGATTTAAATAGATTGCTGGCATTGAATATTGCGTTTGAAAAATCTCTCCTTGCAACAGCAACTTGGTTTCAATATTATGCTGAAGATCAAGGGCACTTTCCTCTTCAACATGCTTTGAGATCTGTCTTTGCATTCCATTTTCTTTTATCAACGTCCCAAAAAATGAAGCTATGTGCAATTTTCGATAACTTGAGGTATCTGATACCAGCTGTAACATCGACATATTCAGGCTTTGAACCATTAATAAGAAAATTCTTTGAAAGACCTTTTAAAAGTGCACTTGAAGTCTATTTATATAATATTATTAAAACATTGCTTGTGAGCTTAGCTCAAAATAATAAGATAAGGTTTTATTCTAAGGTTAGATTGTTAGGTTTAACAGTAGATCAATCAACAATCGGGGCAAGTGGGGTTTACCCTTCTCTAATGTCAAGAGTTATATACAAACATTATCGAAGCTTGATCTCAGAAGCAACTACTTGTTTTTTTCTGTTTGAAAAGGGCTTACATGGCAATCTCACAGAAGAGGCTAAAATCCATCTTGAAACTGTCGAGTGGGCAAGGAATTTCCGCGAAAAAGAAAGGAGACTAGGTAGTTATATTATGGAAGAAGGATATCATATCCAAGATGTGTTAAACAATCAAGTTGTTGTAGAGCAACAGCTATTTTGTCAAGAAGTTGTAGAATTAGCTGCCCAAGAATTAAATACTTACTTGCATGCAAAGTCCCAGGTCATGGCTAGTAATATAATGAACAAACACTGGGATAAACCATATTTCAGTCAAACCCGGAATATTAGTTTAAAGGGAATGTCAGGTGCTCTACAAGAAGATGGTCATCTTGCCGCAAGTGTTACGCTTATAGAGGCTATAAGATATTTAAATCATTCACAAAACAATCCAACTGTGTTGGAATTATACGAACAAACGAAAAAACAGAGGGCTCAAGCTAGGATTGTACGAAAGTATCAAAGAACTGAGGCTGATCGAGGCTTCTTTATCACCACATTACCTACTAGGGTGAGGCTTGAGATTATAGAGGACTATTATGATGCTATAGCAAAGGTGGTACCTGAAGAATATATCTCTTATGGAGGTGAAAGAAAAATTTTGAATATCCAACAGGCTCTTGAGAAGGCATTGAGGTGGGCTTCAGGTGAAAGTGAAATACAATCAACACTAGGTCATTCTATAAAATTGAAAAGAAAGTTGATGTACGTTAGTGCTGATGCTACAAAATGGTCACCTGGTGATAATTCAGCAAAATTTCGGCGCTTCACGCAGTCATTGTATGATGGGCTACGTGATGATAAATTAAAAAACTGTGTAGTTGATGCATTAAGGAATATATACGAGACAGATTTCTTTATATCTAGGAAGTTACATAGATATATTGATAACATGGGTGAACTATCTGAAGAGGTATTAGATTTCTTATCATTTTTCCCAAATAAGATATCTGCTTCAATTAAGGGAAACTGGTTACAGGGTAATTTGAACAAATGTTCATCTTTATTTGGGGCTGCGATATCACTGTTGTTTAAGCGTGTCTGGGGCAAACTGTATCCAGAGTTGGAGTGCTTTTTTGAGTTTGCTCATCATTCTGATGATGCATTGTTTATTTATGGTTATTTAGAACCAGTAGATGATGGCACAGAGTGGTTTCAATATGTAACACAACAAATACAAGCAGGCAACTTGCACTGGCATGCTGTAAATCAGGAAATGTGGAAAAGCATGTTTAATCTACATGAACATATCCTATTAATGGGATCAATAAAGATTTCACCAAAGAAAACTACTGTGTCTCCCACAAATGCCGAGTTTTTATCCACATTCTTTGAAGGTTGTGCAGTTTCCATACCCTTTATAAAAATACTGTTGGGTTCACTATCAGATTTGCCCGGGTTAGGTTACTTTGATGATCTTGCTGCAGCTCAAAGTAGATGCGTGAAAGCTTTAGATATGGGTGCATGCCCACAGCTTGCACAATTGGGAATAGTTTTATGTACAAGTAAGGTTGAAAGACTATATGGTACAGCTCCTGGAATGGTAAATAATCCCACTGCATATCTCAAAGTAGATAGAAATTTAATACCTATTCCCTTAGGTGGTGATGGCTCTATGTCAATCATGGAGTTAGCCACTGCAGGTATTGGTATGGCTGATAAAAATATATTGAAGAATGCATTTATTACATATAAACATGCACGGAAAGATAATGACAGATATATCTTAGGCCTATTTAAGTTTCTGATGTCATTATCTGATGATATCTTTCAACATGACCGCTTGGGGGAATTCAGTTTTGTGGGAAAAGTCCAGTGGAAAGTTTTCACGCCTAAGAGTGAGTTTGAATTTTATGATCAGTACTCAAGAAAGTATTTAGAACTTTGGAGTGAACAACACCCAGTTTATGATTATATTATTCCAAGGGGTAGAGACAATTTACTAGTTTATTTAGTCAGGAAATTGAATGACCCTAGTATAGTCACTGCAATGACAATGCAATCACCTTTACAGTTAAGATTTAGAATGCAAGCTAAACAACATATGAAGGTATGCAAATTAGAAGGTGAGTGGGTTACTTTTAGGGAAGTATTGGCTGCAGCAGATGCATTTGCATCTGAATATAAACCAACTACACAAGACATGGATCTTTTTCAAACACTTGTGAACTGCACATTTTCCAAAGAATATGCATGGAGAGATTTTTTAAATGAGGTTCAGTGTGATGTCCTTACAACTAGACAAATTCATAGGCCTAAGATAGCTCGAACATTTACTGTGAAAGAAAGAGATCAAACAATACAGAACCCTATCACTGCTGTCATAGGTTATAAGTACGCAAGTAAAGTAGATGAAATCAGTGATGTTTTGGATAGTGCTATGCATCCAGATTCTTTATCAACAGATTTACAGCTTATGAGAGAAGGTGTTTATAGGGAATTAGGCTTAGATATTAGTCAACCAAATGTATTAAAAAAAGTAGCACCACTTCTATACAAGTCTGGTAAGTCACGTATTGTTATTGTTCAAGGCAATGTAGAAGGGACTGCTGAATCTATCTGTAGTTATTGGCTTAAAACTATGTCCCTTGTAAAGACCATAAAAGTTAAACCCAAAAAGGAAGTCCTGAAGGCTGTGTCTTTATATGGTAAAAAGGAAAAGGCTGGAGATCTAACACATTTAGCTGCAATGAGGTTATGCATAGAGGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATGAACAGGATTCTGTGGCATGGTTAAAATGTTTAATGTTTGAAAATAAAACCCTGGAACAATGGATCGATTCTTTTTGTTCTAGAGGAGTATTGCCTGTTGACCCAGAAATCCAGTGTTTAGGGTTATTGGTATATGATCTTAAAGGCCAGAAGGGTCTATTGCAGATACAAGCTAATAGAAGAGCTTATTCAGGTAAACAATATGATGCTTATTGTGTTCAGACTTATAATGAAGAAACAAAACTTTATGAGGGAGATTTAAGGGTGACTTTCAACTTTGGTATAGATTGTGCACGTCTAGAAATCTTTTGGGAAAAAAGAGAATATATACTAGAGACTTCTGTGACTCAACGTAATGTACTAAGAATTCTTATGGAAGAAGTGACCAAAGAGTTATTACGGTGTGGAATGAGATTCAAAACAGAGCAGGTTAATTCTTCAAGAAGTGTTGTTTTGTTCAAAACAGAAAGTGGGTTTGAATGGGGTAAACCTAATATACCCTGTATTGTGTATAAAAACTGTGCTCTTAGGACAGGCCTGAGAGTCAGACAACCAACAAATAAGGCATTCTCGATTACAATCCAAGCAAATGGATTCAGAGCCATGGCACAACTTGATGAAGAAAATCCAAGGTTTCTTCTTGCGCATGCATATCACAATTTAAAGGACGTAAGGTATCAAACTTTACAGGCTGTTGGGAACATATGGTTTAAAATGACTCAACATAAGTTATTTATAAATCCCATTATCTCTGCTGGTCTTCTGGAGAATTTTATGAAAGGCTTACCAGCAGCTATCCCACCTGCAGCATATTCGCTGATTATGAATAAGGCCAAAATTTCTGTAGATCTATTTATGTTCAATGAGTTGTTAGCCCTGATAAACCCACAAAATGTTTTAAACCTTGATGGTATTGAAGAAACATCTGAAGGGTTTACAACTGTTAGTACAATTTCAAGTACTCAATGGTCAGAAGAGGTGAGTTTAACAATGGATGATAGTGATGAAGATGATGATGCATCCCAACTAGATTATACAATTGATCTTGACGATATAGACTTTGAGACAATTGATCTTAAAGAAGATATTGAGCATTTCTTACAAGATGAGTCTGCTTATACAGGAGATCTGTTAATTCAAACTGAAGAAACTGAGATAAGGAAGTTAAGGGGAATGGTAAAGATTTTAGAGCCTGTCAAATTGATAAAGAGCTGGGTGTCTAAAGGCCTTTCAATAGACAAGATATATAATCCTGTAAACATTATTCTTATGACTCGATATATGTCTAAACATTTTAATTTTCATGCAAAACAGTTATCACTTATGGACCCGTATGACTTAACTGAATTTGAGAGTATTGTCAAGGGGTGGGGTGAATGCGTTAAGGATAGATTTATTGAGCTTGACCAGGAAGCACAGCGAAAAGTATCTGAAGAGATGGTACTGCCTGAAGATGTACTACCTGATTCTCTCTTTTCATTTAGGCATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTGTTTCCTAGGGACTCAGCCTCTTCATTTTATTGACAGACTGTACCTTCTTTTGCTCTTTTCTCG
| 46,831
|
MN832782.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Kunec,D., Groenke,N., Trimpert,J., Binder,F., Osterrieder,N., Ulrich,R.G.
|
Institute of Virology, FU Berlin
|
Germany
|
2020-09-30
| null |
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
| null | null | null | null | null |
Orthohantavirus puumalaense strain Sotkamo segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAATTTACTACAAATGGAGAAATACAGAGATATTCATGAGAGAGTCAAGGAGGCAGTCCCAGGGGAAACATCAGCAGTAGAATGTTTAGATTTATTGGATAGATTGTATGCAGTGAGGCATGATGTTGTAGACCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATAGAGAACAGCCTATAGGCCTTGTCTTACTAATGGCAGGTGTTCCAAATGATGTAATTCAGAGTATGGAGAAAAGAGTCATCCCAGGAAGTCCCAGTGGTCAGATCCTTAGATCATTTTTTAAAATGACACCTGACAATTATAAAATAACAGGGAACCTTATAGAGTTCATTGAGGTCACAGTGACAGCTGATGTGGCAAGGGGAGTTAGAGAGAAGATATTAAAGTATCAAGGGGGTTTAGAATTTATTGAACAATTGTTACAGATAGAAGCTCAGAAAGGTAATTGTCAATCTGGTTTTAAGATAAAGTTTGATGTGGTAGCAGTTAGGACTGATGGTTCAAACATATCAACACAGTGGCCTAGTAGAAGGAATGAAGGCGTTGTTCAAGCAATGAGATTAATACAAGCAGACATTAATTTTGTCAGAGAACACCTGATAAAGAATGATGAGAGAGGAGCACTTGAGGCAATGTTTAATCTAAAATTTCATGTAACAGGTCCTAAGGTTCGTACATTTGATATTCCGAATTATAGACCTCAGCCATTATGCCAACCTATATTAGAAAATCTAGTAGATTATTGTAAAAATTGGCTTGGAACAGATCATGCATTTGCATTTAAGGAAGTGACTGGTCAACGTGTTTTCAATGTCTTTAGGGAGGAGGAAGAAATACATGCATCCAAATATGGACACTCTAGAAAGCCTAGGAATTTTCTTTTATGTCAAATTAGCTTGCAGTCACCATATTTACCATCAACAATTGCATCTGATCAGTATGATACACGATTAGCTTGTAGTGAAATTTTAAAAAACTATCCTGAGACACCATTACAGCTATTGGCTAGAGATATGGCCTATAAATACATCACATTAGATCATGATGACATTATCAATTATTATAATCCAAGGGTTTACTTTAAGCCAACACAGAATATTAAAGAACCAGGTACCTTCAAATTGAATCTATCTAACATGGATCCAAAATCAAAAGCATTAATTGATGTCATATCAAAGGATTCAAAAAAAGGAGTGTTCGGTGAGTTGATTGATAGTGTTGATGTAGCAAGTCAAGTACAGCATAATGAATGCTCAAAAACTATTGAGAAAATTTTGTCAGATTTAGAAGTTAATCTAGGTGATGTGGCAAATGGATTAGATCAACCTAAGAAAACAACTGGTGTGGATGATATTTTAAGAAAATTTTATGATAATGAGCTTGTTAAGTACTTGATATCTGTTATACGGAAAACAACAGCCTGGCATCTAGGACATTTATTACGAGATATTACTGAGTCCTTAATTGCACATGCAGGGCTTAAAAGATCTAAATACTGGTCTGCTCACGGTTATGCATGTGGTAGTGTCTTATTATGCATATTACCATCTAAATCACTTGAAGTTGCTGGATCATTTATAAGGTTCTTTACTGTATTTAAGGAAGGTCTAGGTTTAATTGATACAGATAATCTTGACTCTAAAGCAGAAATTGATGGCGTTTCATGGTGCTTTAGTAAGATAATTAGTTTAGATTTAAATAGATTACTGGCCTTGAATATTGCATTTGAAAAATCCCTTCTTGCCACAGCAACATGGTTTCAGTATTATACTGAAGATCAAGGACATTTTCCTCTTCAACATGCACTTCGGTCCGTATTTGCATTCCATTTCCTTCTTTCTGTATCCCAGAAGATGAAATTGTGCGCAATCTTTGATAATCTCCGATATTTGATTCCAGCTGTCACATCTACCTACTCTGGCTTTGAACCTTTAATCAGAAAATTCTTTGAGCGGCCTTTTAAAAGTGCACTTGAAGTCTACTTATATGGTATTATAAAAGTATTACTAGTGAGCTTGGCTCAGAATAACAAAATAAGGTTTTATTCCAGGGTTAGACTTTTAGGGTTAACTGTTGACCAATCAACGATTGGAGCAAGCGGAGTGTATCCCTCTCTTATGTCAAGGGTTGTTTATAAGCATTATCGCAGTTTAATATCAGAGGCAACTACTTGTTTCTTTCTTTTTGAGAAGGGATTGCATGGCAATCTTACAGAAGAAGCTAAAATCCACCTAGAAACAGTTGAATGGGCTAGAAAATTTAGAGAGAAAGAAAGAGAATTGGGGAGTTATATAATGGAAGAAGGTTATCATATACAAGATGTTCTAAATAACCAAGTAGCTGTTGAACAGCAACTTTTTTGTCAAGAAGTTGTCGAACTAGCTGCTCAAGAACTAAACACTTACTTACATGCCAAATCCCAAGTCATGGCAAGCAACATTATGAACAAACACTGGGATAAACCTTATTTTAGCCAAACCAGAAATATAAGTCTTAAAGGTATGTCAGGTGCATTACAGGAAGATGGTCATTTAGCAGCAAGTGTGACATTAATTGAAGCAATTCGGTTCTTAAACCATTCACAAAATAATCCTACAGTACTTGAACTTTATGAGCAAACAAAAAAACAAAGGGCACAAGCAAGAATTGTTAGGAAATATCAAAGAACTGAGGCTGATAGAGGTTTTTTTATTACCACACTACCTACTAGAGTAAGATTAGAAATTATAGAAGATTATTATGATGCTATTGCCAAAGTTGTCCCAGAGGAATACATATCATATGGGGGTGAAAGGAAAATACTTAATATTCAGCAAGCCCTTGAAAAGGCACTTCGATGGGCCTCAGGTGAAAGTGAAATACAGTCTTCACTAGGTCATTCCATAAAATTGAAAAGAAAATTAATGTATGTTAGTGCAGATGCAACTAAGTGGTCACCTGGTGATAACTCTGCTAAATTTAGACGATTTACTCAATCTTTATATGATGGACTACGTGATGATAAATTAAAAAATTGTGTAGTTGATGCCTTAAGAAACATATATGAGACTGACTTTTTTATATCTAGAAAATTACACAGATATATTGATAATATGGGTGAATTATCTGATGAAGTGTTAGATTTCTTGTCATTTTTTCCGAATAAAGTATCTGCATCTATTAAAGGCAATTGGTTGCAAGGCAATCTAAACAAGTGTTCTTCATTATTTGGGGCAGCAATATCATTATTGTTTAAACGTGTGTGGGCTAAATTGTACCCAGAGTTAGAATGTTTTTTTGAATTTGCCCATCATTCTGATGATGCTTTATTTATTTATGGTTATCTGGAGCCTATAGATGATGGTACTGAGTGGTTTCAATATGTGACCCAACAAATTCAAGCAGGCAACTTTCATTGGCATGCTGTGAATCAGGAGATGTGGAAAAGTATGTTTAACCTCCATGAACACATTTTATTGATGGGTTCAATAAAGATTTCACCTAAAAAGACAACAGTATCACCTACAAATGCTGAATTCTTGTCTACATTTTTTGAAGGCTGTGCAGTCTCTATTCCCTTTATAAAAATCCTTTTAGGTTCTCTATCAGATTTACCTGGTTTAGGTTACTTTGATGATCTTGCAGCTGCTCAAAGCAGATGTGTCAAAGCACTAGATATGGGTGCATGTCCACAGCTTGCACAGTTAGGAATAGTGCTATGTACAAGTAAAGTTGAAAGGTTATATGGCACTGCCCCGGGTATGGTAAATAACCCTACTGCATACTTAAAAGTGGATAGAAACTTAATACCTATTCCTTTAGGTGGTGATGGTTCTATGTCAATCATGGAGTTAGCAACAGCTGGGATAGGAATGGCAGATAAGAACATCTTAAAAAATGCATTTATAACTTATAAGCATGCTAAGAAGGATAACGATAGATACGTTCTGGGTTTATTTAAGTTTTTAATGTCACTATCTGATGATATTTTTCAACATGATCGTTTAGGAGAGTTCAGCTTTGTTGGGAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACCCCTAAAAGTGAGTTTGAATTTTATGATCAATATTCTAGAAAATATCTAGAGCTTTGGAGTGAACAGCACCCAGTTTATGACTATATCATACCAAGAGGTAGAGATAACCTTTTAGTGTACCTGGTAAGAAAATTGAATGATCCCAGCATAGTTACTGCAATGACAATGCAATCACCATTGCAATTAAGGTTCAGAATGCAGGCGAAACAGCATATGAAGGTATGTAAACTAGGTGGTGAATGGGTGACATTTAGAGAGGTTCTTGCTGCTGCAGATGCATTTGCGTCTGAATATCGGCCTACATTACAAGATATGGAGCTATTTCAAACATTAGTTAATTGTACATTTTCTAAAGAATACGCATGGAGAGACTTTTTAAATGAAGTACAGTGTGATGTACTAATAACAAGACAAATCCATAGACCAAAAGTTGCTCGTACATTCACAGTGAAAGAACGGGATCAAACAATTCAGAATCCTATTACAGCTGTAATAGGTTATAAATATGCAAGTAAAGTAGATGAGATAAGTGATGTATTGGATAGTGCCTTACATCCAGACTCCTTATCCACTGATTTGCAACTCATGAGAGAAGGTGTATATAGAGAATTGGGACTTGACATTAGTCAACCAAATGTTTTAAAGAAAGTTGCACCTCTATTATATAAATCAGGGAAATCTAGGATAGTGATAGTGCAAGGAAATGTTGAGGGTACAGCTGAGTCAATCTGTAGTTATTGGCTGAAAACTATGTCTCTTGTTAAAACTATTAAAGTGAAGCCTAAAAAGGAGGTATTAAAGGCTGTATCACTTTATGGTAAGAAAGAGAAGGTGGGTGATCTGACACATTTAGCTGCAATGAGACTATGTATCGAGGTTTGGAGATGGTGTAAAGCAAATGAACAAGATTCAGTAACATGGTTGAAATACTTGGTGTTTGAGAATAAAACACTAGAGCAGTGGGTAGACTTATTTTGTTCAAGAGGGGTATTGCCTATTGACCCAGAAATTCAGTGTTTAGGTCTTCTGGTATATGATCTTAAAGGGCAAAAGGGTTTATTGCAAATACAAGCCAATAGACGAGCATATTCAGGAAAGCAATATGATGCATATTGTGTGCAAACTTACAATGAGGAAACAAAACTTTATGAAGGAGATTTAAGGGTAACTTTTAATTTTGGTATAGACTGTGCACGTCTTGAAATTTTTTGGGATAAAAAAGAGTATATTTTAGAAACATCTATAACTCAACGGAATGTTTTGAAAATCTTGATGGAAGAAGTAACTAAAGAGTTGTTGCACTGCGGTATGAGATTTAAAACAGAACAAGTTAATTCATCAAGAAGTGTTGTGTTGTTTAAGACAGAGAGTGGCTTTGAGTGGGGTAAGCCTAATGTGCCCTGTATAGTTTATAGGAATTGTACTCTCCGAACAGGCCTTAGGGTAAGACACCCGACAAATAAAGCATTCTCAATTACAATTCAGGCTAATGGCTTTAGGGCTATGGCACAGCTTGATGAAGAAAATCCTAGATTTCTTCTTGCACATGCTTATCATAATTTAAAGGATGTGAGATATCAGGCATTACAGGCAGTAGGAAATGTGTGGTTTAAAATGACACAGCATAAGTTGTTTATAAACCCGATCATATCAGCTGGATTACTAGAAAATTTTATGAAAGGGTTGCCTGCAGCAATTCCCCCAGCAGCTTATTCTCTTATTATGAATAAAGCAAAAATTTCTGTTGATTTATTTATGTTTAATGAACTATTAGCTTTGATAAATCCACAAAATGTTTTGAACTTGGATGGGATTGAGGAGACATCTGAAGGTTTTACAACAGTGAGCACAATCTCTAGCACACAGTGGTCAGAAGAAGTAAGTTTGACACTAGATGATAGTGATGATGATGATGATGCTTCAAACCTAGATTATACTATTGACCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGATCTAAAGGAGGATATTGAGCATTTTTTACAAGATGAATCTGCTTATACTGGAGATCTGTTAATTCAGACTGAGGAAACAGAAGTAAGAAAGTTGAGGGGTATGATAAAAATTCTTGAGCCTGTAAAGCTGATAAAAAGTTGGGTTTCTAAAGGTTTGTCTATTGATAAAATATACAATCCTGTAAATATTATCCTAATGACTCGGTATATGTCTAAACATTATAATTTCCAGGCAAAGCAGTTATCTCTAATGGATCCATATGATCTGACTGAATTTGAGAGTGTTGTTAAAGGCTGGGGAGAGTGTGTCAAGGATCGATTTATTGAACTTGATCAAGAAGCTCAACGAAAAGTTGCTGAAGAGAGAGTACTGCCTGAGGATGTACTCCCAGACTCCCTCTTTTCATTTAGACATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTGTTCCCTAGGGATTCAGCCTCTTCTTTTTATTAACAGATTATACTTCTTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 46,832
|
MT514291.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Hiltbrunner,M., Heckel,G.
|
University of Bern, Institute of Ecology and Evolution
|
Switzerland
|
2020-08-10
|
MglDCr02
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Myodes glareolus
| null |
2012
| null | null |
Orthohantavirus puumalaense isolate MglDCr02 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAGTTTACTACAAATGGAAAAATACAGAGAGATTCATGAGAGGGTTAAGGAAGCAGTCCCAGGGGAGACATCAGCAGTAGAGTGTTTGGACTTATTAGATAGATTGTATGCAGTAAGACATGATGTTGTGGACCAGATGATAAAACATGATTGGTCTGACAATAAAGATAGAGAGCAACCAATTGGTCTTGTCCTTTTAATGGCAGGAGTCCCAAATGATGTAATTCAAGGTATGGAGAAGAGAATAATTCCAGGCAGCCCCAGTGGTCAAATACTGAGATCATTTTTTAAAATGACCCCTGATAATTATAAAATAACAGGGAATTTGATTGAGTTCATCGAGGTTACAGTGACTGCTGATGTAGCAAGAGGTGTTAGAGAAAAAATTCTAAAGTATCAAGGGGGTCTAGAATTCATAGAGCAACTCCTCCATGTAGAAGCCCAGAAAGGTAATTGTCAGTCTGGTTTTAAGATAAAATTTGATGTAGTTGCCATTAGAACAGATGGTTCAAATATATCTACACAGTGGCCTAGTAGGAGGAATGAAGGGGTTGTCCAGGCAATGAGATTGATACAGGCTGATATAAATTTCGTGAGGGAGCACCTGATTAGGAATGAAGAACGAGGAGCTCTTGAGGCAATGTTTAATCTGAAATTCCATGTAACTGGTCCAAAAGTGAGGACGTTTGATATCCCAAACTATAGACCACAACCATTATGTCAACCAACATTAGAAAGTTTAGTAGATTATTGCAAGAATTGGCTTGAGACAGATCATGCATTTGCATTCAAAGAAGTAACTGGACAGAGGGTATTTAATGTATTTAGAGAAGAAGAAGAATTACATGCATTAAAGTATGGGCATTCAAGAAAACCAAGGAATTTTCTTCTTTGTCAAATTAGTTTACAATCACCATATTTACCATCAACAATTGCTTCAGATCAATATGACACACGTTTAGTTTGTAGTGAAATATTGAAAAACTACCCTGAAACACCAGTACAGCTCCTTGCAAGGGATATGGCTTATAAATACATTACATTAGATCATGACGATATAGTAAATTATTATAATCCCCGAGTGTATTTCAAACCAACACAGAATATAAAAGAGCCAGGAACTTTTAAATTAAATTTATCAAACATGGATCCAAAATCAAAAGCATTGATTGACATAATTTCAAAGGATTCAAAAAAAGGTGTATTTGGAGAATTAATTGATAGTATTGATGTGGCTAGTCAAGTGCAACAAAATGAATGTGCCAAAATAATTGAGAAAATTTTATCAGATCTAGAAGTCAATTTAGGTGAATCTACATCAGGATTAGATCAGCCAAAGAGAACAACAGGTGTAGATGATATTCTTAGGAAATTTTATGATAATGAACTTGTTAAATATTTAATTTCTGTGATAAGAAAGACTACTGCCTGGCATTTAGGACATTTATTGCGCGATATTACAGAATCATTGATTGCACATGCAGGGTTAAGGAGATCTAAATACTGGTCAGCTCATGGATATGCCTGTGGTAATGTACTATTGTGTATTTTACCTTCAAAGTCACTTGAAGTTGCAGGTTCTTTTATTAGGTTTTTTACTGTTTTTAAAGAGGGCTTAGGACTTATTGATCCTGATAATTTGGATTCAAAAATAGAAATTGATGGGGTTTCATGGTGCTTTAGTAAGGTTATCAGCTTGGATCTAAATCGGCTATTAGCATTAAATATAGCATTTGAGAAGTCCCTTCTTGCAACAGCTACATGGTTTCAATACTACACTGAGGATCAAGGACATTTTCCTCTTCAGCATGCATTGCGTTCTGTATTTGCCTTTCATTTTTTACTTGCTACTTCCCAAAAAATGAAACTCTGTGCAATCTTTGACAATTTGAGATATCTGATACCAGCCGTTACATCAACATACTCAGGCTTTGAACCTCTAATACGGAAATTTTTTGAAAGACCCTTTAAGAGTGCTCTTGAAGTTTATTTATATAGTATCATTAAAACACTGCTTGTGAGCTTAGCTCAAAATAATAAAATTAGATTTTATTCAAGGGTCCGACTTTTAGGACTCACAGTTGATCAATCTACAATAGGAGCAAGTGGTGTTTACCCCTCATTAATGTCAAGAGTGATTTATAAGCACTATCGAAGCTTAATTTCTGAAGCAACCACCTGTTTTTTTCTCTTTGAAAAAGGTTTGCACGGTAATCTAACAGAAGAAGCTAAAATTCACCTTGAGACTGTTGAGTGGGCCAGAAAATTTCAGGAAAAAGAAAGTAAGTTTGGGAGTTTTGTGATGGAAGAGGGTTATCATATACAAGATGTATTGAACAATCAAGTACCTGTTGAGCAACAGCTCTTTTGTCAGGAAGTTGTAGAATTGGCTGCTCAAGAACTAAATACATATTTACATGCCAAATCTCAGGTAATGGCAAGTAATATTATGAACAAATACTGGGATAAACCTTATTTTAGTCAAACTAGGAATATCAGTTTAAAGGGAATGTCAGGTGCATTGCAGGAAGACGGTCACTTAGCAGCAAGTGTGACATTAATTGAGGCAATTCGCTTTTTGAACCATTCACAAAATAATCCTACAGTTCTTGAACTATATGAACAAACTAAAAAACAGAAGGCTCAAGCCAGGATAGTCCGGAAATATCAGAGAACTGAGGCTGATCGAGGTTTTTTTATTACTACATTGCCAACTAGAGTGAGGTTAGAGATTATAGAAGATTATTATGATGCTATAGCCAAAGTTGTGCCAGAAGAATATATATCTTATGGAGGAGAAAGGAAGATATTAAATATTCAGCAGGCTCTTGAAAAAGCACTTAGATGGGCATCAGGTGAAAGTGAAATACAATCATCATTGGGTCATAGTATAAAGTTAAAAAGGAAATTGATGTATGTAAGTGCAGATGCAACAAAGTGGTCACCTGGTGATAATTCAGCGAAATTCAAAAGATTTACCCAGTCATTGTATGATGGATTGCGTGATGAAAAATTAAAAAACTGTGTTGTTGATGCATTAAGAAATATATATGAAACTGATTTTTTTATTTCTAGAAAATTACATAGATATATTGATAATATGGGTGAGTTATCTGATGAAGTCTTAGACTTCTTATCATTTTTCCCTAACAAAGTTTCAGCATCTATTAAAGGTAATTGGCTACAAGGCAATTTAAATAAGTGTTCTTCATTATTTGGAGCTGCAGTATCATTGCTGTTTAAACGTGTTTGGGCTAAATTATATCCAGAACTGGAATGCTTCTTTGAATTTGCTCATCATTCAGATGATGCTCTATTTATATATGGTTACTTAGAACCAGTTGATGATGGTACAGAATGGTTTCAGTATGTAACTCAACAAATTCAAGCAGGCAATTTGCATTGGCATGCTGTGAACCAAGAGATGTGGAAAAGTATGTTCAATCTACATGAGCACATTTTATTGATGGGTTCTATAAAAATATCACCAAAAAAGACAACTGTGTCACCAACTAATGCTGAATTTTTGTCAACATTTTTTGAAGGCTGTGCAGTGTCTATTCCATTCATTAAAATTTTATTGGGATCATTGTCAGACTTACCTGGTTTAGGTTATTTTGATGATCTAGCTGCTGCACAGAGCCGATGTGTAAAAGCATTAGACATGGGTGCATGCCCTCAACTCGCACAATTAGGAATAGTATTATGCACAAGTAAGGTAGAGAGATTATATGGCACAGCTCCTGGGATGGTGAACAACCCTACTGCTTATTTAAAGGTGGATAGGAATTTAATACCTATACCTCTAGGTGGTGATGGTTCTATGTCAATTATGGAGCTTGCAACAGCTGGAATAGGAATGGCTGATAAAAATATATTAAAAAATGCTTATATCACTTACAAACATGCAAAAAGAGACAATGATAGATACATTTTAGGATTATTTAAATTTTTAATGTCTTTATCAGATGATCTCTTTCAGCATGATCGTCTAGGGGAGTTTAGTTTTGTTGGAAAAGTGCAATGGAAAGTGTTTACACCTAAGAGTGAATTTGAATTTTATGATCAATATTCAAGGAAATATTTAGAGATATGGAGTGAACAGCATCCTGTATATGATTACATTATTCCACGAAGTAGAGACAATCTTTTAGTATACTTAGTACGGAAATTAAATGATCCTAGTATAGTAACAGCGATGACAATGCAATCACCACTTCAATTGAGGTTTAGAATGCAAGCAAAACAGCACATGAAAGTGTGTAAACTAGATGGTGATTGGGTAACTTTTAGAGAAGTATTAGCAGCTGCTGATGCATTTGCATCTGATTATAAGCCCAGTCCACAAGATATGGAACTTTTTCAAACACTAGTCAATTGTACATTTTCAAAAGAGTATGCCTGGAGAGATTTCTTAAATGAAGTACAATGTGATGTGCTAACAACAAGACAAATACATAGACCTAAAATAGCACGTACTTTCACAGTTAAAGAAAAGGATCAAACCATACAGAACCCAATTACAGCAGTTATAGGTTACAAATATGCTAGTAAAGTGGATGAAATCAGTGATGTTCTAGATAGTGCCATACACCCTGATTCTTTGTCTACAGATTTGCAGCTCATGAGGGAAGGTGTATACAGAGAATTAGGACTTGATATTAGCCAACCAAATGTATTAAAGAAAGTTGCCCCTCTATTGTATAAGTCAGGAAAATCAAGGATTGTGATTGTGCAAGGAAATATAGAGGGGACAGCTGAATCAATCTGCAGTTATTGGTTAAAGACTATGTCACTCGTTAAAACTATAAAGGTAAAGCCCAAAAAGGAAGTACTAAAGGCAGTTTCTTTATATGGTAAGAAGGAGAAGGCAGGTGATCTGACACATCTAGCAGCAATGAGGTTGTGCATTGAGGTTTGGAGGTGGTGCAAAGCAAATGAACAAGATTCAGTTACATGGTTAAAGTATTTAATGTTTGAAAACAAAACTTTAGAACAATGGATTGACTCCTTTTGCTCTAGAGGTGTTTTACCAGTTGATCCTGAAATACAATGTTTAGGCCTTTTAATTTACGACCTTAAAGGACAGAAAGGCCTGTTGCAGATACAGGCAAATCGGAGAGCTTACTCAGGTAAGCAGTATGATGCTTATTGTGTACAAACATACAATGAGGAAACCAGGTTATATGAGGGAGATTTGAGAGTTACTTTTAATTTTGGTATTGATTGTGCAAGATTGGAGATTTTCTGGGAAAAGAAAGAATACATTTTAGAGACATCTGTGACTCAACGAAATGTATTGAAGATTTTAATGGAGGAGGTAACAAAAGAATTGTTAAGATGTGGTATGAGATTCAAAACAGAGCAAGTTAACTCTTCTCGTAGTGTTGTTTTATTCAAAACAGAAAGTGGGTTTGAATGGGGGAAGCCTAATATACCTTGTATTGTTTATAGAAACTGTACACTCAGAACAGGTCTGAGAGTGCGGCATCCGACAAATAAGGCATTCTCTATTACTATTCAGGCTAATGGGTTTAGGGCTATGGCACAATTAGATGAAGAAAATCCACGATTTCTTCTAGCTCATGCATATCATAACTTGAAGGATGTGAGGTATCAAGCTCTACAGGCTGTAGGAAATGTCTGGTTCAAGATGACACAGCATAAGTTATTTATCAATCCAATTATATCTGCTGGATTATTAGAAAACTTTATGAAAGGTCTACCTGCAGCAATCCCACCTGCAGCATATTCACTTATTATGAATAAAGCTAAGATATCTGTTGATTTATTCATGTTTAATGAGTTGTTGGCATTAATCAATCCGCAAAATGTGTTGAATTTGGATGGTATTGAGGAGACATCTGAGGGTTACACAACAGTAAGTACAATTTCTAGCTCACAGTGGTCTGAAGAAGTCAGTCTGACTATGGATGATAGTGATGATGATGAAAACAGTTCTCAGTTAGACTACACAATTGATCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGATCTTAAAGAGGATATTGAACACTTTTTACAGGATGAGTCAGCTTATACTGGAGATCTATTAATTCAAACTGAAGAAACAGAGATTAAGAAATTAAGAGGTATGATCAAAATCTTAGAACCTGTTAAGTTGATAAAGAGTTGGGTTTCAAAAGGTCTGTCAATAGATAAAATATACAATCCTGTTAATATTATACTCATGACCAGATATATGTCTAAACACTTCAATTTCCATGCAAAACAGTTGTCATTGATGGACCCATATGATCTCACTGAATTTGAGAGTATTGTTAAAGGCTGGGGAGAGTGTGTTAAAGATCGATTTATAGAATTGGATCAAGAGGCACAAAGAAAAGTTTCTGAAGAGAGAGTTTTACCTGAAGATGTATTACCGGATTCTCTCTTTTCTTTTAGGCATGCTGATATCCTATTAAAGAGGTTATTTCCTAGGGACTCAGCCTCCTCATTTTATTAACAGATTGTACTTTCTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 47,996
|
MT514292.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Hiltbrunner,M., Heckel,G.
|
University of Bern, Institute of Ecology and Evolution
|
Switzerland
|
2020-08-10
|
MglDKe04
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Myodes glareolus
| null |
2012
| null | null |
Orthohantavirus puumalaense isolate MglDKe04 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAATTTACTAAAAATGGAAAAATATAGAGAGATCCATGAGAGGGTCAAGGAAGCAGTCCCAGGGGAGACATCAGCAGTAGAATGTCTGGACTTATTGGATAGATTATATGCAGTAAGGCATGATGTTGTTGATCAGATGATAAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATAAAGAACAACCCATAGGCCTTGTTCTCTTAATGGCTGGAATTCCTAATGATGTGATTCAGGGTATGGAAAAGAGAATAATCCCAGGGAGTCCTAGCGGTCAAATATTAAGATCATTCTTTAAGATGACTCCTGATAATTTCAAGATAACAGGGAATCTCATTGAGTTTATTGAAGTTACAGTAACTGCTGATGTGGCAAGAGGTGTGAGGGAAAAAGTTCTAAAGTATCAAGGGGGTTTGGAGTTTATAGAGCATCTTCTTCATGTAGAAGCCCAGAAAGGTAATTGTCAACCTGGTTTTAGGATAAAATTTGATGTAGTTGCTGTTAGAACAGATGGTTCAAATATATCGACACAATGGCCTAGCAGAAGAAATGAGGGTGTTGTTCAAGCCATGAGGCTAATACAGGCTGATATAAACTTTGTGAGAGAGCATTTAATTAGAAATGAAGAAAGAGGAGCTCTTGAGGCAATGTTCAATCTAAAATTTCATGTTACTGGTCCAAAAGTGAGGACATTTGACATCCCAAATTATAGGCCACAGCCTTTATGCCAGCCTACATTAGAAAGTCTGGTAGATTATTGTAAAAATTGGCTTGAAACAGATCATGCTTTTGCATTTAAGGAAGTAACAGGACAACGTGTCTTCAATGTGTTTAGAGAGGAGGAAGAATTACATGCACAGAAATATGGCCATTCAAGGAAACCAAGAAATTTTCTGTTATGTCAAATTAGCCTCCAGGCACCATATTTACCATCTACAATTGCTTCTGATCAATATGATACACGATTAGCATGCGGTGAAGTACTAAAAAATTATCCAGAGACCCCAGTACAGCTTTTAGCAAGAGATATAGCTTATAAGTATATCACATTAGACCATGATGACATAATCAATTATTATAATCCCCGGGTCTATTTTAAGCCAACACAAAGTATTAAGGAGCCAGGAACTTTCAAGCTAAATTTATCTAACATGGATCCTAAATCTAAGGCATTGATTGATTTAATTTCAAAGGATTCTAAAAAAGGTGTTTTTGGCGAGTTAATAGATAGTATTGATGTTGCAAGCCAAGTGCAGCAGAATGAGTGTGCTAAAATTATAGAGAAAATCTTATCAGACTTAGAAGTCAATCTAGGTGAAACCACATCAGGTTTAGATCAACCAAAAAGAACAACTGGAGTAGATGATATTCTAAGAAAATTCTATGATAATGAGCTTGTTAAGTACCTAATATCTATAATAAGAAAAACTACTGCCTGGCATTTAGGACATTTATTACGTGATATTACAGAATCATTGATTGCACATGCTGGTCTAAGGAGATCCAAGTATTGGTCAGCTCATGGTTACGCTTGTGGTAATGTTTTGTTATGTATACTACCATCTAAGTCACTTGAGGTAGCTGGATCGTTCATTAGGTTCTTCACTGTATTTAAAGAGGGTTTAGGATTAATTGATCCTGACAATTTAGACTCTAAAGTAGAAATCGATGGGGTATCTTGGTGCTTTAGTAAAATCATTAGTTTAGACTTAAACCGGTTATTAGCACTAAATATTGCATTTGAAAAGTCACTTCTTGCCACAGCTACATGGTTTCAATATTATACTGAAGATCAAGGACATTTCCCTCTTCAACATGCACTACGATCTGTATTTGCTTTTCATTTTTTGCTTTCAACTTCACAAAAAATGAAATTGTGTGCAATCTTTGATAACTTGAGGTACTTGATACCAGCAGTAACATCAACATATTCAGGTTTTGAGCCTTTAATAAGAAAGTTTTTTGAAAGACCCTTTAAGAGTGCTCTTGAAATTTATTTATATAGTATAATAAAGACATTACTTGTAAGCTTAGCTCAAAACAATAAGATTAGATTTTATTCTAAGGTTCGACTCTTAGGACTTACAGTAGACCAATCCACGATAGGAGCAAGTGGTGTGTATCCTTCATTGATGTCGAGAGTAATTTATAAGCATTACAGGAGTTTGATTTCAGAGGCAACAACTTGTTTTTTTCTTTTTGAAAAGGGGTTACATGGTAACCTTACAGAAGAGGCTAAGATTCATCTTGAGACTGTTGAATGGGCTAGGAAATTTCAGGAGAAAGAAAGTCTGTTAGGGAGTCATATAATGGAAGAAGGTTATCACATTCAGGATGTATTGCACAATCAAGTGGTGGTTGAACAGCAACTTTTTTGTCAGGAAGTTGTAGAACTGGCTGCTCAGGAGCTTAACACATATTTACATGCCAAGTCCCAAGTTATGGCAAGTAATATCATGAATAAACACTGGGATAAACCCTATTTCAGCCAGACCAGAAATATTAGCTTAAAAGGGATGTCAGGTGCACTGCAAGAAGATGGTCATCTAGCTGCAAGTGTTACATTGATCGAAGCGATTCGGTTTCTGAACCATTCACAAAATAACCCAACAGTTTTGGAGTTATACGAACAGACTAAAAAACAGAAAGCTCAAGCTAGGATTGTAAGGAAATACCAGAGGACTGAAGCTGATCGGGGCTTTTTTATCACCACCTTACCAACTAGGGTAAGACTTGAAATTATTGAAGATTATTATGATGCTATAGCTAAAGTTGTACCTGAGGAATATATATCATATGGAGGTGAGAGAAAGATATTAAATATCCAACAAGCTCTTGAAAAGGCACTTAGATGGGCATCAGGTGAGAGTGAGATACAGTCATCACTAGGTCATAATATTAAGTTAAAAAGGAAATTAATGTATGTAAGTGCAGATGCTACGAAGTGGTCACCTGGTGATAATTCAGCTAAATTTAAAAGATTTACACAATCATTATATGATGGTTTACGTGATGAAAAATTAAAGAATTGTGTTGTCGACGCCTTAAGAAACATTTATGAAACTGATTTTTTTATATCTAGAAAATTGCATAGATATATTGACAATATGGGTGAACTATCTGCTGAAGTTATGGATTTTTTATCATTTTTTCCTAATAAAGTATCTGCCTCTATTAAAGGTAATTGGTTACAAGGTAACTTGAACAAATGCTCTTCATTATTTGGGGCTGCAATATCATTACTATTCAAACGTGTGTGGTCCAGACTGTACCCCGAATTAGAATGTTTTTTTGAATTTGCCCACCATTCTGATGATGCATTATTCATATATGGCTATTTAGAACCAGTTGATGACGGCACTGAATGGTTCCAATATGTAACTCAGCAGATTCAAGCTGGGAACTTACATTGGCACGCTGTAAATCAAGAGATGTGGAAAAGTATGTTTAATTTGCATGAACACATCTTATTAATGGGTTCTATAAAGATATCACCAAAGAAGACAACCGTATCACCCACTAATGCTGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGATGTGCAGTTTCTATACCTTTTATTAAAATTTTGCTGGGTTCTTTATCAGATCTCCCTGGTCTAGGATATTTTGATGATCTGGCGGCAGCACAGAGCCGGTGTGTGAAAGCATTGGACATGGGTGCATGCCCTCAGCTTGCACAGTTAGGGATAGTATTGTGTACAAGTAAGGTGGAAAGATTATATGGGACAGCCCCTGGGATGGTAAATAATCCTACTGCATACTTAAAAGTAGACAGGAGCTTGATACCTATACCTTTGGGTGGTGATGGTTCAATGTCAATAATGGAACTTGCAACTGCTGGGATAGGGATGGCTGATAAAAATATATTAAAAAATGCTTATATAACCTACAAACATGCCAAGAAGGATAATGATAGATATATCTTAGGTCTATTTAAGTTTTTAATGTCTTTATCTGATGATATCTTTCAACATGATCGTTTAGGAGAGTTTAGTTTTGTTGGAAAAGTGCAGTGGAAAGTGTTTACACCTAAAAGCGAATTTGAGTTTTATGATCAATATTCTAGGAAATACCTAGAGATATGGAGTGAACAACATCCAGTATATGACTATATTATCCCTAGAGGTAGGGATAACCTTTTAGTGTATTTAGTCCGGAAGCTAAATGATCCTAGTATTGTAACTGCAATGACAATGCAATCACCATTACAATTGAGGTTTAGAATGCAAGCAAAACAGCATATGAAAGTATGTAAATTAGATGGGGACTGGGTAACTTTCAGGGAAGTATTAGCTGCTGCAGACGCATTTGCTTCTAATTATAAACCTAGTCTTCAAGATATGGAACTTTTTCAAACATTAGTTAATTGCACATTTTCAAAAGAGTATGCCTGGAGAGATTTCTTGAATGAAGTACAGTGTGATGTTTTGACAACGAGACAGATCCATAGGCCTAAAATAGCACGTACTTTCACAGTCAAGGAAAGGGATCAGACAATACAGAACCCAATCACAGCAGTTATAGGTTATAAGTATGCAAGTAAAGTAGATGAAATCAGTGATGTTCTAGACAGTGCTATACATCCTGATTCACTGTCCACAGATTTACAACTTATGAGAGAGGGTGTTTATAGAGAATTGGGATTGGATATTGGTCAACCAAATGTATTAAAGAAAGTTGCTCCCCTCTTATATAAATCAGGGAAATCAAGAATTGTTATTGTACAAGGAAATGTTGAGGGGACAGCAGAATCCATTTGCAGTTACTGGCTAAAGAGCATGTCTCTTGTCAAGACCATTAAAGTAAAACCGAAAAAGGAAGTACTAAAGGCAGTTTCCTTATATGGTAAAAAGGAAAAAGCTGGAGATTTAACACATCTTGCTGCAATGAGATTATGCATTGAGGTATGGAGATGGTGTAAAGCAAATGAACAAGATTCAATCACATGGTTAAAGTATTTAATGTTTGAGAATAAAACCTTGGAGCAGTGGATTGATTCTTTCTGCTCAAGAGGGGTATTACCTGTTGACCCTGAAATTCAGTGTCTAGGCCTCTTGGTTTATGATCTAAAAGGACAGAAGGGTCTATTACAAATACAGGCTAATAGAAGAGCTTACTCAGGCAAACAATATGATGCCTATTGTGTACAGACATATAATGAGGAAACAAAGCTTTATGAAGGGGATTTGAGGGTAACATTTAATTTTGGTATTGATTGTGCCAGGCTAGAAATTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATTTTGGAGACATCAATCACTCAACGGAATGTATTAAAAATATTAATGGAAGAAGTTACAAAAGAACTATTAAGGTGTGGTATGAGATTCAAGACAGAACAGGTTAATTCCTCCCGAAGTGTAGTTTTATTCAAAACAGAAAGCGGTTTTGAGTGGGGAAAGCCAAATATCCCATGTATTGTATATCGGAATTGTACACTTAGAACAGGTCTTAGGGTAAGACACCCAACAAATAAGGCATTTTCTATTACCATACAAGCTAATGGTTTTAGGGCAATGGCACAGCTTGATGAAGAGAATCCAAGATTTCTCCTGGCTCATGCATATCATAGTTTGAAGGATGTAAGGTATCAAGCACTACAGGCAGTAGGAAATGTGTGGTTTAAAATGACACAGCATAAGTTATTCATAAACCCAATTATTTCTGCTGGTTTATTAGAAAATTTTATGAAGGGTTTACCTGCAGCAATTCCACCTGCAGCATATTCACTTATTATGAATAAAGCAAAAATATCTGTTGATTTGTTTATGTTTAATGAGTTATTAGCATTGATAAATCCACAAAATGTATTAAATTTAGATGGTATTGAGGAGACATCTGAAGGTTACACAACAGTAAGTACAATTTCTAGCACACAGTGGTCTGAAGAAGTAAGTTTGATGCTAGATGACAGTGATGATGATGAAGACAACTCACAATTAGATTATACAATTGATCTTGATGATATAGACTTTGAAACAATTGATCTTAAAGAAGACATTGAACATTTTTTACAGGATGAATCTGCTTACACTGGGGATTTATTAATCCAAACAGAAGAGACTGAGATAAAAAAATTGCGAGGGATGGTAAAGATCCTAGAGCCTGTTAAGTTGATAAAAAGTTGGGTTTCAAAAGGGTTATCAATAGATAAAATATATAATCCTGTAAATATCATCCTCATGACCCGTTATATGTCTAAACACTTTAACTTTCATGCAAAACAGTTATCCTTAATGGATCCTTATGATCTTACTGAGTTTGAGAGTATTGTCAAAGGTTGGGGTGAGTGTGTTAAGGATAGATTCATCGAATTGGATCAAGAAGCACAGAGGAAAGTCTCAGAGGAGAGGGTTCTCCCTGAAGATGTATTGCCTGATTCCCTATTTTCATTTAGACATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTATTTCCTAGGGATTCAGCATCTTCGTTTTATTAACAGATTAGACTTTCTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 47,997
|
MT514293.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Hiltbrunner,M., Heckel,G.
|
University of Bern, Institute of Ecology and Evolution
|
Switzerland
|
2020-08-10
|
MglDKe05
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Myodes glareolus
| null |
2012
| null | null |
Orthohantavirus puumalaense isolate MglDKe05 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAATTTACTAAAAATGGAAAAATATAGAGAGATCCATGAGAGGGTCAAGGAAGCAGTCCCAGGGGAGACATCAGCAGTAGAATGTCTGGACTTATTGGATAGATTATATGCAGTAAGGCATGATGTTGTTGATCAGATGATAAAGCATGACTGGTCTGATAATAAGGATAAAGAACAACCCATAGGCCTTGTTCTCTTAATGGCTGGAATTCCTAATGATGTGATTCAGGGTATGGAAAAGAGAATAATCCCAGGGAGTCCTAGCGGTCAAATATTAAGATCATTCTTTAAGATGACTCCTGATAATTTCAAGATAACAGGGAATCTCATTGAGTTTATTGAAGTTACAGTAACTGCTGATGTGGCAAGAGGTGTGAGGGAAAAAGTTCTAAAGTATCAAGGGGGTTTGGAGTTTATAGAGCATCTTCTTCATGTAGAAGCCCAGAAAGGTAATTGTCAACCTGGTTTTAGGATAAAATTTGATGTAGTTGCTGTTAGAACAGATGGTTCAAATATATCGACACAATGGCCTAGCAGAAGAAATGAGGGTGTTGTTCAAGCCATGAGGCTAATACAGGCTGATATAAACTTTGTGAGAGAGCATCTAATTAGAAATGAAGAAAGAGGAGCTCTTGAGGCAATGTTCAATCTAAAATTTCATGTTACTGGTCCAAAAGTGAGGACATTTGACATCCCAAATTATAGGCCACAGCCTTTATGCCAGCCTACATTAGAAAGTCTGGTAGATTATTGTAAAAATTGGCTTGAAACAGATCATGCTTTTGCATTTAAGGAAGTAACAGGACAACGTGTCTTCAATGTGTTTAGAGAGGAGGAAGAATTACATGCACAGAAATATGGCCATTCAAGGAAACCAAGAAATTTTCTGTTATGTCAAATTAGCCTCCAGGCACCATATTTACCATCTACAATTGCTTCTGATCAATATGATACACGATTAGCATGCGGTGAAGTACTAAAAAATTATCCAGAGACCCCAGTACAGCTTTTAGCAAGAGATATAGCTTATAAGTATATCACATTAGACCATGATGACATAATCAATTATTATAATCCCCGGGTCTATTTTAAGCCAACACAAAGTATTAAGGAGCCAGGAACTTTCAAGCTAAATTTATCTAACATGGATCCTAAATCTAAGGCATTGATTGATTTAATTTCAAAGGATTCTAAAAAAGGTGTTTTTGGCGAGTTAATAGATAGTATTGATGTTGCAAGCCAAGTGCAGCAGAATGAGTGTGCTAAAATTATAGAGAAAATCTTATCAGACTTAGAAGTCAATCTAGGTGAAACCACATCAGGTTTAGATCAACCAAAAAGAACAACTGGAGTAGATGATATTCTAAGAAAATTCTATGATAATGAGCTTGTTAAGTACCTAATATCTATAATAAGAAAAACTACTGCCTGGCATTTAGGACATTTATTACGTGATATTACAGAATCATTGATTGCACATGCTGGTCTAAGGAGATCCAAGTATTGGTCAGCTCATGGTTACGCTTGTGGTAATGTTTTGTTATGTATACTACCATCTAAGTCACTTGAGGTAGCTGGATCGTTCATTAGGTTCTTCACTGTATTTAAAGAGGGTTTAGGATTAATTGATCCTGACAATTTAGACTCTAAAGTAGAAATCGATGGGGTATCTTGGTGCTTTAGTAAAATCATTAGTTTAGACTTAAACCGGTTATTAGCACTAAATATTGCATTTGAAAAGTCACTTCTTGCCACAGCTACATGGTTTCAATATTATACTGAAGATCAAGGACATTTCCCTCTTCAACATGCACTACGATCTGTATTTGCTTTTCATTTTTTGCTTTCAACTTCACAAAAAATGAAATTGTGTGCAATCTTTGATAACTTGAGGTACTTGATACCAGCAGTAACATCAACATATTCAGGTTTTGAGCCTTTAATAAGAAAGTTTTTTGAAAGACCCTTTAAGAGTGCTCTTGAAATTTATTTATATAGTATAATAAAGACATTACTTGTAAGCTTAGCTCAAAACAATAAGATTAGATTTTATTCTAAGGTTCGACTCTTAGGACTTACAGTAGACCAATCCACGATAGGAGCAAGTGGTGTGTATCCTTCATTGATGTCGAGAGTAATTTATAAGCATTACAGGAGTTTGATTTCAGAGGCAACAACTTGTTTTTTTCTTTTTGAAAAGGGGTTACATGGTAACCTTACAGAAGAGGCTAAGATTCATCTTGAGACTGTTGAATGGGCTAGGAAATTTCAGGAGAAAGAAAGTCTGTTAGGGAGTCATATAATGGAAGAAGGTTATCACATTCAGGATGTATTGCACAATCAAGTGGTGGTTGAACAGCAACTTTTTTGTCAGGAAGTTGTAGAACTGGCTGCTCAGGAGCTTAACACATATTTACATGCCAAGTCCCAAGTTATGGCAAGTAATATCATGAATAAACACTGGGATAAACCCTATTTCAGCCAGACCAGAAATATTAGCTTAAAAGGGATGTCAGGTGCACTGCAAGAAGATGGTCATCTAGCTGCAAGTGTTACATTGATCGAAGCGATTCGGTTTCTGAACCATTCACAAAATAACCCAACAGTTTTGGAGTTATACGAACAGACTAAAAAACAGAAAGCTCAAGCTAGGATTGTAAGGAAATACCAGAGGACTGAAGCTGATCGGGGCTTTTTTATCACCACCTTACCAACTAGGGTAAGACTTGAAATTATTGAAGATTATTATGATGCTATAGCTAAAGTTGTACCTGAGGAATATATATCATATGGAGGTGAGAGAAAGATATTAAATATCCAACAAGCTCTTGAAAAGGCACTTAGATGGGCATCAGGTGAGAGTGAGATACAGTCATCACTAGGTCATAATATTAAGTTAAAAAGGAAATTAATGTATGTAAGTGCAGATGCTACGAAGTGGTCACCTGGTGATAATTCAGCTAAATTTAAAAGATTTACACAATCATTATATGATGGTTTACGTGATGAAAAATTAAAGAATTGTGTTGTCGACGCCTTAAGAAACATTTATGAAACTGATTTTTTTATATCTAGAAAATTGCATAGATATATTGACAATATGGGTGAACTATCTGCTGAAGTTATGGATTTTTTATCATTTTTTCCTAATAAAGTATCTGCCTCTATTAAAGGTAATTGGTTACAAGGTAACTTGAACAAATGCTCTTCATTATTTGGGGCTGCAATATCATTACTATTCAAACGTGTGTGGTCCAGACTGTACCCCGAATTAGAATGTTTTTTTGAATTTGCCCACCATTCTGATGATGCATTATTCATATATGGCTATTTAGAACCAGTTGATGACGGCACTGAATGGTTCCAATATGTAACTCAGCAGATTCAAGCTGGGAACTTACATTGGCACGCTGTAAATCAAGAGATGTGGAAAAGTATGTTTAATTTGCATGAACACATCTTATTAATGGGTTCTATAAAGATATCACCAAAGAAGACAACCGTATCACCCACTAATGCTGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGATGTGCAGTTTCTATACCTTTTATTAAAATTTTGCTGGGTTCTTTATCAGATCTCCCTGGTCTAGGATATTTTGATGATCTGGCGGCAGCACAGAGCCGGTGTGTGAAAGCATTGGACATGGGTGCATGCCCTCAGCTTGCACAGTTAGGGATAGTATTGTGTACAAGTAAGGTGGAAAGATTATATGGGACAGCCCCTGGGATGGTAAATAATCCTACTGCATACTTAAAAGTAGACAGGAGCTTGATACCTATACCTTTGGGTGGTGATGGTTCAATGTCAATAATGGAACTTGCAACTGCTGGGATAGGGATGGCTGATAAAAATATATTAAAAAATGCTTATATAACCTACAAACATGCCAAGAAGGATAATGATAGATATATCTTAGGTCTATTTAAGTTTTTAATGTCTTTATCTGATGATATCTTTCAACATGATCGTTTAGGAGAGTTTAGTTTTGTTGGAAAAGTGCAGTGGAAAGTGTTTACACCTAAAAGCGAATTTGAGTTTTATGATCAATATTCTAGGAAATACCTAGAGATATGGAGTGAACAACATCCAGTATATGACTATATTATCCCTAGAGGTAGGGATAACCTTTTAGTGTATTTAGTCCGGAAGCTAAATGATCCTAGTATTGTAACTGCAATGACAATGCAATCACCATTACAATTGAGGTTTAGAATGCAAGCAAAACAGCATATGAAAGTATGTAAATTAGATGGGGACTGGGTAACTTTCAGGGAAGTATTAGCTGCTGCAGACGCATTTGCTTCTAATTATAAACCTAGTCTTCAAGATATGGAACTTTTTCAAACATTAGTTAATTGCACATTTTCAAAAGAGTATGCCTGGAGAGATTTCTTGAATGAAGTACAGTGTGATGTTTTGACAACGAGACAGATCCATAGGCCTAAAATAGCACGTACTTTCACAGTCAAGGAAAGGGATCAGACAATACAGAACCCAATCACAGCAGTTATAGGTTATAAGTATGCAAGTAAAGTAGATGAAATCAGTGATGTTCTAGACAGTGCTATACATCCTGATTCACTGTCCACAGATTTACAACTTATGAGAGAGGGTGTTTATAGAGAATTGGGATTGGATATTGGTCAACCAAATGTATTAAAGAAAGTTGCTCCCCTCTTATATAAATCAGGGAAATCAAGAATTGTTATTGTACAAGGAAATGTTGAGGGGACAGCAGAATCCATTTGCAGTTACTGGCTAAAGAGCATGTCTCTTGTCAAGACCATTAAAGTAAAACCGAAAAAGGAAGTACTAAAGGCAGTTTCCTTATATGGTAAAAAGGAAAAAGCTGGAGATTTAACACATCTTGCTGCAATGAGATTATGCATTGAGGTATGGAGATGGTGTAAAGCAAATGAACAAGATTCAATCACATGGTTAAAGTATTTAATGTTTGAGAATAAAACCTTGGAGCAGTGGATTGATTCTTTCTGCTCAAGAGGGGTATTACCTGTTGACCCTGAAATTCAGTGTCTAGGCCTCTTGGTTTATGATCTAAAAGGACAGAAGGGTCTATTACAAATACAGGCTAATAGAAGAGCTTACTCAGGCAAACAATATGATGCCTATTGTGTACAGACATATAATGAGGAAACAAAGCTTTATGAAGGGGATTTGAGGGTAACATTTAATTTTGGTATTGATTGTGCCAGGCTAGAAATTTTTTGGGATAAAAGAGAATATATTTTGGAGACATCAATCACTCAACGGAATGTATTAAAAATATTAATGGAAGAAGTTACAAAAGAACTATTAAGGTGTGGTATGAGATTCAAGACAGAACAGGTTAATTCCTCCCGAAGTGTAGTTTTATTCAAAACAGAAAGCGGTTTTGAGTGGGGAAAGCCAAATATCCCATGTATTGTATATCGGAATTGTACACTTAGAACAGGTCTTAGGGTAAGACACCCAACAAATAAGGCATTTTCTATTACCATACAAGCTAATGGTTTTAGGGCAATGGCACAGCTTGATGAAGAGAATCCAAGATTTCTCCTGGCTCATGCATATCATAGTTTGAAGGATGTAAGGTATCAAGCACTACAGGCAGTAGGAAATGTGTGGTTTAAAATGACACAGCATAAGTTATTCATAAACCCAATTATTTCTGCTGGTTTATTAGAAAATTTTATGAAGGGTTTACCTGCAGCAATTCCACCTGCAGCATATTCACTTATTATGAATAAAGCAAAAATATCTGTTGATTTGTTTATGTTTAATGAGTTATTAGCATTGATAAATCCACAAAATGTATTAAATTTAGATGGTATTGAGGAGACATCTGAAGGTTACACAACAGTAAGTACAATTTCTAGCACACAGTGGTCTGAAGAAGTAAGTTTGATGCTAGATGACAGTGATGATGATGAAGACAACTCACAATTAGATTATACAATTGATCTTGATGATATAGACTTTGAAACAATTGATCTTAAAGAAGACATTGAACATTTTTTACAGGATGAATCTGCTTACACTGGGGATTTATTAATCCAAACAGAAGAGACTGAGATAAAAAAATTGCGAGGGATGGTAAAGATCCTAGAGCCTGTTAAGTTGATAAAAAGTTGGGTTTCAAAAGGGTTATCAATAGATAAAATATATAATCCTGTAAATATCATCCTCATGACCCGTTATATGTCTAAACACTTTAACTTTCATGCAAAACAGTTATCCTTAATGGATCCTTATGATCTTACTGAGTTTGAGAGTATTGTCAAAGGTTGGGGTGAGTGTGTTAAGGATAGATTCATCGAATTGGATCAAGAAGCACAGAGGAAAGTCTCAGAGGAGAGGGTTCTCCCTGAAGATGTATTGCCTGATTCCCTATTTTCATTTAGACATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTATTTCCTAGGGATTCAGCATCTTCGTTTTATTAACAGATTAGACTTTCTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 47,998
|
MT514294.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Hiltbrunner,M., Heckel,G.
|
University of Bern, Institute of Ecology and Evolution
|
Switzerland
|
2020-08-10
|
MglLTU01
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,550
|
GenBank
| 1
|
Lithuania
|
Lithuania
|
Myodes glareolus
| null |
2015
| null | null |
Orthohantavirus puumalaense isolate MglLTU01 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAGTTTACTACAAATGGAGAAATACAGAGAGATCCATGAGAGAGTAAAGGAGGCAGTTCCAGGGGAAACATCAGCAGTAGAATGTCTGGACTTATTGGATCGATTGTATGCAGTTCGACATGATGTTGTTGACCAAATGATAAAGCATGATTGGTCTGATAATAAAGATAAGGAACAACCAATAGGCCTTGTTCTGTTAATGGCAGGTGTTCCAAATGATGTGATACAGAGTATGGAAAAAAGAATCATCCCTGGGAGTCCTAGTGGTCAAATCCTTAGATCTTTCTTCAAAATGACACCGGATAATTACAAGATAACAGGTAATCTTATTGAATTCATTGAAGTAACAGTGACTGCTGATGTGGCAAGAGGTGTGAGAGAAAAGATATTAAAATATCAAGGAGGACTAGAATTCATTGAACAGCTCTTACAGATAGAAGCCCAAAAAGGTAATTGCCAATCTGGATTTAAAATAAAATTTGATGTAGTAGCTGTTCGAACTGATGGATCAAATATTTCAACCCAGTGGCCTAGCAGGAGGAATGAAGGGGTTGTCCAGGCAATGAGATTGATACAAGCTGATATTAACTTTGTCAGAGAGCATTTGATAAAAAATGATGAAAGAGGGGCACTTGAAGCAATGTTCAATCTGAAATTCCATGTGACAGGACCTAAAGTACGTACTTTTGATATCCCAAATTATAGGCCTCAACCTTTATGTCAACCAGTATTAGAAAGCCTAGTTGATTATTGTAAGAACTGGCTTGGAACAGATCATGCATTTGCTTTTAAGGAGGTTACAGGACATCGTGTGTTTAATGTATTTAGAGAAGAGGAAGAAATACATGCATCCAAATATGGGCATTCAAGGAAGCCTAGAAATTTTTTATTGTGCCAGATAGGTTTACAAGCACCGTATTTACCATCAACAATTGCATCTGATCAGTATGACACACGATTAGCTTGTAGTGAGGTCTTAAAGAATTATCCTGAAACACCACTGCAACTTTTAGCTAGAGACATGGCCTATAAGTATATCACATTAGATCATGATGATATTATCAATTATTATAATCCCAGAGTTTACTTCAAGCCGACACAAAATATTAAAGAACCAGGCACTTTTAAATTAAATTTATCCAATATGGACCCAAAATCAAAGGCATTAATTGATGTTATTTCAAAAGACTCAAAAAAAGGTATATTTGGTGAATTAATTGATAGCATCGATGTAGCAAGTCAGGTACAACAAAATGAGTGTGCCAAGACTATTGAGAAAATATTGTCGGATTTGGAAGTAAACCTGGGCGATTCTACATCTGGCTTAGACCAACCTAAAAGGACAACAGGTGTAGATGACATATTAAGAAAGTTTTATGATAATGAGCTTGTCAAATACTTGATTTCTGTTATACGGAAAACAACTGCCTGGCACTTAGGACACTTGTTACGTGACATCACTGAATCTTTAATTGCACATGCAGGACTCAAGAGATCTAAATATTGGTCTGCGCATGGATATGCATGTGGTAGTGTCCTATTATGTATTCTACCTTCTAAGTCACTTGAAGTTGCAGGCTCATTTATTAGGTTTTTCACTGTGTTTAAGGAGGGTTTGGGTCTTATAGATGTTGATAATCTTGATTCTAAAGCAGAAATTGATGGTGTCTCTTGGTGTTTCAGTAAGATAATTAGTTTAGACCTGAATAGGCTATTAGCATTAAATATATCATTTGAAAAATCTCTACTAGCTACAGCCACATGGTTCCAATATTATACAGAGGACCAGGGACATTTTCCCCTTCAACATGCACTAAGGTCAGTCTTTGCATTTCATTTTTTATTGTCAACATCCCAAAAAATGAAATTATGTGCAATCTTTGACAACTTGCGTTACCTGATCCCAGCAGTAACGTCTACCTATTCTGGGTTTGAACCATTAATTAGAAAATTCTTTGAACGGCCTTTTAAGAGTGCACTTGAAGTCTATCTGTATAATATAATAAAAACATTATTGGTAAGCTTAGCACAAAATAATAAAATAAGATTTTATTCCCGTGTTAGGCTTTTGGGTTTGACTGTAGATCAATCAACAATTGGGGCAAGTGGAGTTTATCCCTCATTGATGTCAAGGGTTGTTTACAAGCATTATCGTAGTTTAATCTCTGAAGCCACAACTTGCTTTTTTCTTTTTGAAAAGGGACTACATGGTAATTTAACAGAGGAAGCTAAAATACACCTTGAAACGGTTGAATGGGCTCGAAAATTCAGAGAAAAGGAAAGAGAATTTGGTAGTTATATAATGGAAGAGGGCTATCATATACAAGATGTGTTAAGCAATCTAGTGACTGTTGAACAACAGCTTTTCTGTCAAGAAGTTGTCGAGTTAGCTGCACAAGAACTAAATACATATTTGCATGCAAAGTCCCAGGTTATGGCAAGTAATATCATGAATAAACATTGGGATAAACCTTATTTTAGTCAAACTAGAAATATAAGTCTTAAAGGCATGTCAGGTGCATTACAAGAAGATGGCCATTTGGCAGCAAGTGTCACATTGATTGAAGCTATCCGTTTTTTAAACCATTCACAAAATAACCCTACAGTGCTAGAACTTTATGAGCAAACAAAGAAACAAAGGGCACAAGCAAGAATTGTGAGAAAATATCAAAGGACTGAAGCAGATCGAGGATTCTTTATTACTACATTGCCAACCAGAGTGAGATTAGAGATTATTGAAGACTATTATGATGCCATAGCTAAAGTTGTTCCTGAAGAATATATTTCATACGGAGGTGAAAGAAAAATCCTAAATATCCAACAAGCACTTGAAAAGGCGCTTCGGTGGGCATCAGGTGAAAGTGAAATACAATCTTCTTTAGGTCATTCTATAAAGTTAAAGAGAAAACTTATGTATGTAAGTGCAGATGCAACCAAATGGTCGCCTGGTGATAATTCAGCTAAGTTTCGACGATTTACTCAATCACTATATGATGGATTACGCGACGATAAGTTAAAAAATTGTGTAGTTGATGCTTTAAGGAACATATACGAGACTGATTTTTTTATATCTAGAAAACTACATAGGTATATAGACAATATGGGTGAATTATCTGATGAGGTCTTAGATTTTTTATCATTTTTCCCTAATAAAGTATCTGCTTCTATTAAAGGTAATTGGTTACAAGGTAATTTAAATAAATGCTCTTCATTGTTCGGGGCAGCAATTTCATTATTATTTAAACGTGTATGGGCTAAATTATACCCTGAATTAGAGTGTTTCTTTGAGTTTGCCCATCATTCTGATGATGCTTTGTTCATTTATGGTTATTTAGAACCTGTTGATGATGGGACAGAATGGTTTCAATATGTTACCCAGCAAATACAAGCAGGTAACTTTCACTGGCATGCTGTGAACCAAGAAATGTGGAAAAGTATGTTCAACCTTCATGAGCACATTTTGCTAATGGGTTCAATCAAAATATCACCTAAGAAAACAACAGTATCCCCTACAAATGCAGAATTTTTATCAACATTTTTTGAAGGTTGTGCAGTGTCTATTCCATTTATTAAAATCCTTTTAGGGTCATTGTCAGATCTACCAGGTCTTGGTTATTTTGATGACCTTGCTGCAGCCCAGAGTAGATGTGTTAAAGCACTTGACATGGGTGCATGCCCTCAGCTTGCACAGTTAGGGATAGTATTGTGCACAAGTAAAGTTGAAAGGTTGTATGGTACTGCCCCAGGCATGGTGAATAATCCTACTGCTTATCTAAAAGTTGATAGAAACTTAATCCCTATTCCTTTAGGGGGTGATGGATCTATGTCAATTATGGAGCTTGCAACTGCAGGGATTGGGATGGCAGATAAAAATATACTTAAAAATGCCTTTATAACCTATAAGCATGCAAAGAAAGATAATGATAGATATATTCTAGGATTGTTTAAGTTCTTAATGTCATTATCAGATGATATATTTCAACATGATCGTCTGGGAGAATTCAGCTTTGTGGGTAAAGTACAGTGGAAAGTTTTTACACCAAAAAGTGAATTTGAATTTTATGACCAATACTCTAGGAAATATTTAGAGCTATGGAGTGAACAGCATCCAGTATATGACTATATTATACCAAGGGGTAGGGACAATCTTTTGGTATACTTGGTGAGAAAATTGAATGATCCTAGTATAGTCACAGCAATGACAATGCAGTCACCACTCCAGTTAAGATTTAGGATGCAGGCAAAGCAACATATGAAAGTGTGTAAGTTAGGTGGTGAATGGGTAACATTTAGGGAGGTACTTGCAGCTGCAGATGCATTTGCTTCCGAATATAGACCTACTCTACAAGATATGGAACTCTTTCAGACACTAGTGAATTGCACATTTTCCAAAGAATATGCTTGGAGGGATTTTTTGAATGAAGTACAATGTGATGTACTCACGACAAGACAGATTCATAGGCCAAAAGTAGCAAGAACATTTACAGTTAAAGAAAGGGATCAAACAATACAAAATCCCATTACAGCAGTAATTGGTTATAAGTATGCAAGTAAAGTGGATGAAATTAGTGATGTTCTTGACAGTGCTATACATCCTGATTCTTTGTCTACTGATTTACAATTAATGAGAGAAGGCGTATACAGGGAATTAGGACTTGATATCAGTCAGCCAAATGTACTGAAGAGAGTTGCACCCTTATTATATAAATCTGGGAAATCAAGGATTGTAATTGTACAAGGTAACATTGAAGGAACAGCAGAATCAATTTGTAGTTATTGGTTAAAGACTATGTCCCTTGTGAAAACTATAAAGGTAAAACCAAAGAAGGAGGTATTGAAAGCTGTATCTCTTTATGGCAAAAAGGAGAAGGCTGGGGATTTAACACACTTAGCTGCTATGAGATTATGCATTGAGGTTTGGAGATGGTGTAAGGCAAATGAGCAGGATGCAGTTGTGTGGTTAAAATACTTGATGTTTGAAAACAAAACTTTAGAGCAATGGATAGATTTGTTTTGTTCACGGGGTGTATTGCCTGTTGATCCTGAAATTCAATGTTTGGGCCTTCTGGTATATGATCTTAAAGGGCAAAAAGGCCTTTTACAGATACAAGCTAATAGAAGAGCCTATTCTGGAAAACAATATGATGCATATTGTGTACAAACTTATAATGAGGAGTCTAAACTTTATGAGGGAGATTTGAGGGTTACATTCAATTTTGGTATAGACTGTGCAAGGTTAGAGATATTTTGGGATAAAAAAGAATATATATTAGAGACTTCTATTACTCAGCGTAATGTTTTAAAGATCCTAATGGAAGAAGTGACCAAAGAATTATTGCGATGTGGTATGAGATTCAAGACAGAACAAGTTAATTCATCAAGGAGTGTAGTACTCTTTAAGACAGAGAGTGGATTTGAATGGGGGAAACCTAACATTCCATGTATTGTTTATAGAAACTGTACCCTTCGTACGGGCCTTAGAGTGCGGCAACCAACGAATAAGGCATTCTCAATTACCATTCAGGCCAATGGTTTTAGAGCTATGGCACAACTTGATGAAGAAAATCCAAGATTTCTTCTTGCTCATGCATATCATAATCTGAAAGATGTAAGGTACCAAGCTTTGCAGGCAGTAGGAAATGTTTGGTTTAAAATGACACAACACAAGTTGTTTATAAACCCAATAATATCTGCTGGTTTATTAGAGAATTTTATGAAGGGATTACCTGCGGCAATCCCTCCAGCAGCTTATTCCCTCATCATGAATAAGGCGAAAATTTCTGTTGATCTATTTATGTTTAATGAGTTGTTGGCCCTGATAAACCCTCAAAATGTTTTGAACCTTGACGGGATCGAGGAAACATCTGAGGGCTATACTACAGTTAGCACCATATCAAGCACACAGTGGTCAGAGGAGGTTAGTCTGACAATGGATGATAGTGATGATGATGATAATGCATCCCAGTTAGATTATACTATTGATCTTGATGATATAGATTTTGAGACAATTGATCTTAAAGAGGATATTGAGCATTTCTTACAGGATGAATCAGCTTATACTGGAGATCTGTTAATCCAGACTGAAGAGACTGAAATTAGAAAGTTAAGGGGTATGATAAAGATCCTTGAGCCTGTAAAATTGATAAAAAGCTGGGTTTCTAAAGGGTTGTCTATAGATAAGATATATAACCCTGTCAATATCATTCTTATGACTCGCTATATGTCTAAACACTATAATTTCCATGCAAAGCAACTCTCGTTAATGGATCCTTATGATCTTACTGAATTTGAAAGCATTGTTAAAGGATGGGGTGAATGTGTTAAAGATCGATTTATTGAGCTTGATCAAGAAGCCCAGAGAAAAGTTAGTGAGGAAAGAGTACTACCAGAAGATGTGCTCCCAGATTCTCTTTTTTCATTTAGGCATGCTGATATCTTATTAAAGAGATTATTTCCTAGGGATTCAGCCTCATCCTTTTATTAACAGATGGTACTTCTTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 47,999
|
MT024592.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Strandin,T., Smura,T., Ahola,P., Aaltonen,K., Sironen,T., Hepojoki,J., Eckerle,I., Ulrich,R.G., Vapalahti,O., Kipar,A., Forbes,K.M.
|
University of Helsinki, Department of Virology
|
Finland
|
2020-05-06
| null |
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,515
|
GenBank
| 1
|
Finland
|
Finland
|
Myodes glareolus
|
lung
|
2017
| null | null |
Orthohantavirus puumalaense strain Suo/lung segment L, complete sequence
|
AGAGAAATTTACCACAAATGGAAAAATATAGAGAGATTCATGAGAGAGTCAAGGAGGCAGTTCCAGGGGAAACATCAGCAGTGGAGTGTTTAGATTTATTGGATAGATTATATGCAGTAAGACATGACGTTGTGGACCAGATGATAAAGCATGACTGGTCTGATAATAAAGATAGAGAACAGCCAATAGGTCTTGTCTTATTGATGGCAGGTGTTCCAAATGATGTGATTCAGGGCATGGAAAAGAGAGTTATCCCAGGAAGTCCTAGTGGCCAGATCCTTCGATCATTTTTCAAAATGACACCTGACAATTATAAAATAACAGGGAATCTTATTGAATTCATTGAGGTTACAGTGACAGCTGATGTAGCAAGAGGGGTTAGAGAAAAGATGTTAAAATATCAAGGGGGTTTAGAGTTTATCGAGCAGCTGTTACAAATAGAAGCGCAAAAAGGTAATTGCCAATCTGGTTTTAAGATAAAGTTCGATGTGGTTGCAATTAGAACTGATGGCTCAAATATATCAACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGAAGGTGTTGTTCAAGCAATGAGATTAATACAAGCAGATATCAATTTTGTCAGAGAACACTTAATAAAGAATGATGAGAGAGGAGCACTTGAGGCAATGTTTAATTTAAAATTTCATGTGACAGGTCCTAAGGTTCGTACATTTGATATTCCAAATTATAGGCCTCAACCATTATGTCAACCTGTGTTAGAGAATCTTGTAGATTATTGTAAAAATTGGCTTGGGACAGATCATGCATTTGCATTTAAGGAAGTAACTGGTCAGCGTGTCTTTAATGTTTTTAGGGAGGAGGAAGAAATACATGCATCTAAATATGGACATTCTAGGAAGCCTAGAAATTTCCTTCTGTGCCAGATTAGTTTACAATCACCATATCTACCATCAACAATTGCATCTGATCAGTATGATACACGGTTAGCCTGCAGTGAAGTTTTGAAGAATTATCCTGAGACACCACTACAGCTATTAGCCAGAGATATGGCCTATAAATATATCACATTAGACCATGATGATATTATTAATTATTATAATCCAAGAGTTTACTTTAAGCCGACACAGAATATTAAAGAACCAGGTACCTTTAAACTGAATCTGTCCAACATGGATCCAAAATCAAAGGCACTAATTGATGTTATATCAAAGGATTCAAAAAAAGGAGTGTTTGGTGAATTAATTGACAGTGTTGATGTAGCCAGTCAAGTGCAGCATAATGAATGTTCAAAAACTATTGAAAAAATTCTGTCAGATTTGGAGGTTAACTTAGGTGATGCTACAAATGGATTGGATCAGCCTAAGAAAACAACTGGAGTGGATGATATTCTAAGAAAGTTCTATGATAATGAGCTTGTTAAGTACCTAATTTCTGTTATACGGAAGACAACTGCCTGGCATCTAGGACACTTATTACGGGATATTACTGAATCCTTAATTGCACATGCAGGGCTTAAAAGATCTAAATACTGGTCTGCTCACGGTTATGCATGTGGCAGTGTTTTATTATGTATACTACCTTCTAAGTCACTCGAAGTTGCCGGGTCATTTATTAGGTTTTTCACTGTTTTTAAGGAAGGTTTAGGTCTGATTGACACAGACAATCTCGATTCTAAGGCAGAAATTGATGGTGTTTCATGGTGCTTTAGTAAGATAATTAGTCTAGATTTGAATAGATTACTGGCCTTGAATATTGCATTTGAAAAATCCCTCCTTGCCACAGCAACGTGGTTTCAATATTATACTGAAGATCAAGGGCACTTTCCCCTTCAGCATGCACTTCGGTCTGTATTTGCATTTCATTTTCTTTTGTCAGTATCTCAGAAGATGAAGTTATGTGCAATATTTGATAATCTCCGGTACTTGATTCCAGCTGTCACATCTACCTATTCTGGCTTTGAACCTTTAATTAGAAAGTTCTTTGAGCGACCCTTCAAAAGTGCACTTGAGGTATACCTATACGGTATTATAAAAGTATTATTAGTAAGCTTAGCCCAAAATAACAAGATAAGATTTTATTCCAGGGTTAGACTCTTAGGGTTAACTGTTGATCAATCAACAATTGGAGCAAGTGGAGTATACCCCTCTCTCATGTCAAGGGTTGTTTATAAGCATTATCGCAGTTTAATCTCAGAGGCAACTACTTGCTTTTTCCTTTTTGAAAAGGGGCTACATGGTAATCTCACAGAAGAAGCTAAAATCCATCTTGAAACAGTTGAGTGGGCTAGAAAATTTAGAGAAAAAGAAAGAGAATTAGGTAGCTATATAATGGAAGAAGGTTATCACATACAAGATGTTTTAAGTAATCACGTAGCTGTTGAACAGCAGCTCTTTTGTCAAGAAGTTGTTGAATTAGCTGCTCAAGAACTTAACACATATTTGCATGCCAAATCTCAAGTTATGGCGAGTAACATCATGAACAAGCACTGGGATAAGCCATATTTTAGCCAGACTAGGAATATTAGTCTTAAGGGTATGTCAGGTGCATTACAAGAAGATGGTCATTTAGCTGCAAGTGTGACATTAATCGAAGCAATTCGGTTTTTAAATCATTCACAAAATAACCCTACAGTATTAGAGCTTTATGAACAAACAAAAAAGCAAAGGGCACAAGCAAGAATTGTTAGGAAATACCAGAGAACTGAGGCTGATAGAGGTTTTTTTATTACCACACTACCAACCAGAGTAAGATTAGAAATTATAGAAGATTATTATGATGCTATCGCTAAAGTTGTTCCAGAGGAATACATATCATATGGGGGTGAAAGGAAAATACTTAATATTCAGCAAGCCCTTGAAAAGGCACTTCGGTGGGCCTCAGGTGAAAGTGAAATACAATCTTCACTAGGTCATTCTATAAAATTAAAACGGAAATTAATGTATGTTAGTGCAGATGCAACTAAATGGTCACCTGGCGATAACTCTGCTAAATTCAGACGATTTACTCAATCTTTATATGATGGACTTCGTGATGATAAATTAAAAAATTGTGTAGTTGATGCTTTAAGAAATATATATGAAACTGACTTTTTCATATCTAGGAAATTACATAGGTATATTGACAATATGGGTGAATTGTCTGATGAAGTATTAGATTTTCTATCATTCTTTCCAAATAAAGTATCTGCATCTATTAAAGGCAATTGGCTGCAAGGCAATTTAAATAAGTGTTCCTCATTATTTGGGGCGGCAATATCACTATTATTTAAACGTGTGTGGGCCAAGTTATACCCAGAATTAGAATGTTTCTTTGAATTTGCTCATCATTCTGATGATGCTTTATTCATTTACGGTTATTTGGAGCCAGTAGATGATGGTACCGAATGGTTCCAGTATGTGACCCAACAGATTCAAGCAGGCAATTTTCACTGGCATGCTGTGAATCAGGAAATGTGGAAGAGTATGTTTAACCTTCATGAACATATCTTATTGATGGGTTCAATAAAAATATCACCTAAAAAGACAACAGTATCACCCACAAATGCTGAATTCCTGTCTACATTTTTTGAGGGCTGTGCAGTATCTATCCCTTTTATAAAAATTCTTTTAGGGTCTTTATCGGATTTACCTGGTCTAGGTTATTTTGATGACCTTGCAGCTGCACAGAGCAGATGTGTCAAAGCACTAGATATGGGTGCATGCCCCCAGCTTGCACAATTAGGGATAGTGCTGTGTACAAGTAAAGTTGAAAGACTATATGGCACTGCCCCAGGTATGGTAAATAACCCTACTGCATATTTAAAAGTAGATAGGAATTTAATACCTATACCGTTAGGCGGTGATGGGTCTATGTCAATTATGGAATTGGCAACAGCTGGGATAGGAATGGCAGATAAGAACATATTAAAAAATGCCTTTATAACTTATAAGCATGCCAAGAAGGATAATGATAGATATGTTTTGGGCTTATTTAAATTTCTAATGTCATTATCCGATGATATTTTTCAACATGATCGTTTAGGAGAATTTAGCTTTGTTGGAAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACCCCTAAAAGTGAGTTTGAATTTTATGATCAATATTCTAGAAAATATCTAGAGCTTTGGAGTGAGCAGCACCCAGTTTATGACTATATCATACCAAGAGGTAGAGATAATCTATTAGTGTACTTGGTAAGAAAGTTGAATGATCCTAGTATAGTTACTGCAATGACCATGCAATCACCATTACAATTAAGGTTTAGGATGCAGGCTAAACAGCATATGAAAGTATGCAAGCTAGATGGTGAGTGGGTGACATTTAGAGAGGTTCTTGCTGCTGCAGATGCATTTGCATCTGAATATCGGCCAACATTACAGGATATGGATTTATTCCAGACATTGGTCAATTGTACATTTTCTAAAGAATATGCATGGAGAGACTTTTTAAATGAAGTACAATGTGATGTATTAACAACAAGACAAATTCACAGGCCGAAAGTTGCTCGTACATTCACAGTTAAAGAACGAGATCAAACAATTCAGAATCCTATCACTGCTGTAATAGGCTACAAATATGCAAGTAAAGTAGATGAGATAAGTGATGTATTAGATAGTGCTATACACCCAGACTCTCTATCGACTGATTTGCAGCTCATGAGAGAAGGCGTGTATAGAGAGCTGGGACTTGATATTAGTCAGCCAAATGTTTTAAAGAAAGTTGCACCTTTGCTATATAAATCAGGGAAATCAAGGATAGTAATAGTGCAAGGAAATGTTGAGGGTACAGCTGAGTCAATTTGTAGTTACTGGTTAAAAACTATGTCTCTTGTAAAGACTATTAAAGTAAAGCCAAAAAAGGAGGTATTGAAGGCTGTATCACTTTATGGCAAGAAAGAAAAAGTAGGTGATCTGACACATTTAGCTGCAATGAGACTATGTATTGAGGTCTGGAGATGGTGTAAAGCAAATGAACAAGATTCAGTAACATGGCTGAAATACTTGATATTTGAGAATAAGACACTAGAGCAGTGGGTAGACTTGTTTTGTTCAAGAGGAGTATTACCTGTTGATCCAGAAATTCAATGCCTAGGTCTTTTGGTATATGATCTTAAAGGTCAAAAGGGTTTATTGCAGATACAAGCCAATAGACGAGCATATTCAGGAAAGCAATATGATGCATACTGTGTGCAAACTTATAATGAGGAAACAAAACTCTATGAGGGAGATTTGAGAGTGACTTTTAACTTTGGTATAGATTGTGCACGTCTTGAAATTTTTTGGGATAAAAGAGAGTATATCTTAGAAACATCTATAACTCAGCGAAATGTCTTGAAAATTTTGATGGAAGAAGTAACTAAAGAGTTATTACGCTGTGGTATGAGATTTAAAACAGAACAAGTTAATTCATCAAGAAGTGTCGTACTGTTTAAAACAGAGAGTGGTTTTGAATGGGGTAAGCCCAATGTGCCCTGTATAGTATATAGAAATTGCACTCTTCGAACAGGCCTTAGAGTAAGACATCCAACAAATAAAGCATTTTCAATTACAATTCAAGCTAATGGCTTTAGGGCCATGGCCCAGTTAGATGAAGAAAATCCCAGATTTCTTCTTGCACATGCATATCACAACTTAAAGGATGTGAGGTATCAGGCACTACAGGCGGTAGGAAATGTATGGTTTAAAATGACACAACATAAGTTATTTATAAATCCAATCATATCAGCTGGACTATTAGAAAACTTTATGAAAGGATTACCAGCAGCAATTCCCCCAGCAGCTTATTCCCTTATTATGAATAAAGCAAAAATCTCTGTTGATCTATTTATGTTTAATGAACTGCTGGCCCTGATAAACCCGCAAAATGTTTTAAACTTGGATGGTATTGAGGAAACGTCTGAAGGTTTCACAACAGTAAGCACAATTTCTAGCACACAGTGGTCAGAAGAGGTAAGTTTAACACTAGATGACAGTGATGATGATGATGATGCTTCTAATTTAGATTATACTATCGATCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGACTTAAAAGAAGATATTGAGCATTTTCTACAAGATGAATCTGCTTATACTGGAGATTTATTGATTCAAACTGAAGAAACCGAAATAAGGAAGTTAAGGGGCATGATCAAAATTCTGGAGCCCGTAAAGTTGATAAAAAGCTGGGTTTCTAAAGGTTTATCTATTGACAAAATATACAACCCTGTAAATATCATCCTGATGACCCGGTATATGTCAAAACATTATAATTTCCAAGCAAAGCAGTTATCTCTAATGGATCCATATGATTTAACTGAGTTTGAGAGTGTTGTTAAAGGCTGGGGGGAGTGTGTCAAGGACCGATTTATTGAACTTGATCAAGAAGCTCAACGGAAAGTTACTGAAGAGAGAGTATTGCCCGAGGATGTACTCCCAGACTCTCTTTTTTCATTTAGGCATGCTGATATCTTGTTAAAGAGATTGTTCCCTAGGGATTCAGCCTCTTCTTTTTATTAACAGATTGTACTTCTTATTGCTCTTTTC
| 50,621
|
MT024595.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Strandin,T., Smura,T., Ahola,P., Aaltonen,K., Sironen,T., Hepojoki,J., Eckerle,I., Ulrich,R.G., Vapalahti,O., Kipar,A., Forbes,K.M.
|
University of Helsinki, Department of Virology
|
Finland
|
2020-05-06
| null |
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,515
|
GenBank
| 1
|
Finland
|
Finland
|
Myodes glareolus
| null |
2017
| null | null |
Orthohantavirus puumalaense strain Suo/renal segment L, complete sequence
|
AGAGAAATTTACCACAAATGGAAAAATATAGAGAGATTCATGAGAGGGTCAAGGAGGCAGTTCCAGGGGAAACATCAGCAGTGGAGTGTTTAGATTTATTGGATAGATTATATGCAGTAAGACATGACGTTGTGGACCAGATGATAAAGCATGACTGGTCTGATAATAAAGATAGAGAACAGCCAATAGGTCTTGTCTTATTGATGGCAGGTGTTCCAAATGATGTGATTCAGGGCATGGAAAAGAGAGTTATCCCAGGAAGTCCTAGTGGCCAGATCCTTCGATCATTTTTCAAAATGACACCTGACAATTATAAAATAACAGGGAATCTTATTGAATTCATTGAGGTTACAGTGACAGCTGATGTAGCAAGAGGGGTTAGAGAAAAGATATTAAAATATCAAGGGGGTTTAGAGTTTATCGAGCAGCTGTTACAAATAGAAGCGCAAAAAGGTAATTGCCAATCTGGTTTTAAGATAAAGTTCGATGTGGTTGCAATTAGAACTGATGGCTCAAATATATCAACACAATGGCCTAGTAGAAGAAATGAAGGTGTTGTTCAAGCAATGAGATTAATACAAGCAGATATCAATTTTGTCAGAGAACACTTAATAAAGAATGATGAGAGAGGAGCACTTGAGGCAATGTTTAATTTAAAATTTCATGTGACAGGTCCTAAGGTTCGTACATTTGATATTCCAAATTATAGGCCTCAACCATTATGTCAACCTGTGTTAGAGAATCTTGTAGATTATTGTAAAAATTGGCTTGGGACAGATCATGCATTTGCATTTAAGGAAGTAACTGGTCAGCGTGTCTTTAATGTTTTTAGGGAGGAGGAAGAAATACATGCATCTAAATATGGACATTCTAGGAAGCCTAGAAATTTCCTTCTGTGCCAGATTAGTTTACAATCACCATATCTACCATCAACAATTGCATCTGATCAGTATGATACACGGTTAGCCTGCAGTGAAGTTTTGAAGAATTATCCTGAGACACCACTACAGCTATTAGCCAGAGATATGGCCTATAAATATATCACATTAGACCATGATGATATTATTAATTATTATAATCCAAGAGTTTACTTTAAGCCGACACAGAATATTAAAGAACCAGGTACCTTTAAACTGAATCTGTCCAACATGGATCCAAAATCAAAGGCACTAATTGATGTTATATCAAAGGATTCAAAAAAAGGAGTGTTTGGTGAATTAATTGACAGTGTTGATGTAGCCAGTCAAGTGCAGCATAATGAATGTTCAAAAACTATTGAAAAAATTCTGTCAGATTTGGAGGTTAACTTAGGTGATGCTACAAATGGATTGGATCAGCCTAAGAAAACAACTGGAGTGGATGATATTCTAAGAAAGTTCTATGATAATGAGCTTGTTAAGTACCTAATTTCTGTTATACGGAAGACAACTGCCTGGCATCTAGGACACTTATTACGGGATATTACTGAATCCTTAATTGCACATGCAGGGCTTAAAAGATCTAAATACTGGTCTGCTCACGGTTATGCATGTGGCAGTGTTTTATTATGTATACTACCTTCTAAGTCACTCGAAGTTGCCGGGTCATTTATTAGGTTTTTCACTGTTTTTAAGGAAGGTTTAGGTCTGATTGACACAGACAATCTCGATTCTAAGGCAGAAATTGATGGTGTTTCATGGTGCTTTAGTAAGATAATTAGTCTAGATTTGAATAGATTACTGGCCTTGAATATTGCATTTGAAAAATCCCTCCTTGCCACAGCAACGTGGTTTCAATATTATACTGAAGATCAAGGGCACTTTCCCCTTCAGCATGCACTTCGGTCTGTATTTGCATTTCATTTTCTTTTGTCAGTATCTCAGAAGATGAAGTTATGTGCAATATTTGATAATCTCCGGTACTTGATTCCAGCTGTCACATCTACCTATTCTGGCTTTGAACCTTTAATTAGAAAGTTCTTTGAGCGACCCTTCAAAAGTGCACTTGAGGTATACCTATACGGTATTATAAAAGTATTATTAGTAAGCTTAGCCCAAAATAACAAGATAAGATTTTATTCCAGGGTTAGACTCTTAGGGTTAACTGTTGATCAATCAACAATTGGAGCAAGTGGAGTATACCCCTCTCTCATGTCAAGGGTTGTTTATAAGCATTATCGCAGTTTAATCTCAGAGGCAACTACTTGCTTTTTCCTTTTTGAAAAGGGGCTACATGGTAATCTCACAGAAGAAGCTAAAATCCATCTTGAAACAGTTGAGTGGGCTAGAAAATTTAGAGAAAAAGAAAGAGAATTAGGTAGCTATATAATGGAAGAAGGTTATCACATACAAGATGTTTTAAGTAATCACGTAGCTGTTGAACAGCAGCTCTTTTGTCAAGAAGTTGTTGAATTAGCTGCTCAAGAACTTAACACATATTTGCATGCCAAATCTCAAGTTATGGCGAGTAACATCATGAACAAGCACTGGGATAAGCCATATTTTAGCCAGACTAGGAATATTAGTCTTAAGGGTATGTCAGGTGCATTACAAGAAGATGGTCATTTAGCTGCAAGTGTGACATTAATCGAAGCAATTCGGTTTTTAAATCATTCACAAAATAACCCTACAGTATTAGAGCTTTATGAACAAACAAAAAAGCAAAGGGCACAAGCAAGAATTGTTAGGAAATACCAGAGAACTGAGGCTGATAGAGGTTTTTTTATTACCACACTACCAACCAGAGTAAGATTAGAAATTATAGAAGATTATTATGATGCTATCGCTAAAGTTGTTCCAGAGGAATACATATCATATGGGGGTGAAAGGAAAATACTTAATATTCAGCAAGCCCTTGAAAAGGCACTTCGGTGGGCCTCAGGTGAAAGTGAAATACAATCTTCACTAGGTCATTCTATAAAATTAAAACGGAAATTAATGTATGTTAGTGCAGATGCAACTAAATGGTCACCTGGCGATAACTCTGCTAAATTCAGACGATTTACTCAATCTTTATATGATGGACTTCGTGATGATAAATTAAAAAATTGTGTAGTTGATGCTTTAAGAAATATATATGAAACTGACTTTTTCATATCTAGGAAATTACATAGGTATATTGACAATATGGGTGAATTGTCTGATGAAGTATTAGATTTTCTATCATTCTTTCCAAATAAAGTATCTGCATCTATTAAAGGCAATTGGCTGCAAGGCAATTTAAATAAGTGTTCCTCATTATTTGGGGCGGCAATATCACTATTATTTAAACGTGTGTGGGCCAAGTTATACCCAGAATTAGAATGTTTCTTTGAATTTGCTCATCATTCTGATGATGCTTTATTCATTTACGGTTATTTGGAGCCAGTAGATGATGGTACCGAATGGTTCCAGTATGTGACCCAACAGATTCAAGCAGGCAATTTTCACTGGCATGCTGTGAATCAGGAAATGTGGAAGAGTATGTTTAACCTTCATGAACATATCTTATTGATGGGTTCAATAAAAATATCACCTAAAAAGACAACAGTATCACCCACAAATGCTGAATTCCTGTCTACATTTTTTGAGGGCTGTGCAGTATCTATCCCTTTTATAAAAATTCTTTTAGGGTCTTTATCGGATTTACCTGGTCTAGGTTATTTTGATGACCTTGCAGCTGCACAGAGCAGATGTGTCAAAGCACTAGATATGGGTGCATGCCCCCAGCTTGCACAATTAGGGATAGTGCTGTGTACAAGTAAAGTTGAAAGACTATATGGCACTGCCCCAGGTATGGTAAATAACCCTACTGCATATTTAAAAGTAGATAGGAATTTAATACCTATACCGTTAGGCGGTGATGGGTCTATGTCAATTATGGAATTGGCAACAGCTGGGATAGGAATGGCAGATAAGAACATATTAAAAAATGCCTTTATAACTTATAAGCATGCCAAGAAGGATAATGATAGATATGTTTTGGGCTTATTTAAATTTCTAATGTCATTATCCGATGATATTTTTCAACATGATCGTTTAGGAGAATTTAGCTTTGTTGGAAAAGTTCAATGGAAAGTGTTTACCCCTAAAAGTGAGTTTGAATTTTATGATCAATATTCTAGAAAATATCTAGAGCTTTGGAGTGAGCAGCACCCAGTTTATGACTATATCATACCAAGAGGTAGAGATAATCTATTAGTGTACTTGGTAAGAAAGTTGAATGATCCTAGTATAGTTACTGCAATGACCATGCAATCACCATTACAATTAAGGTTTAGGATGCAGGCTAAACAGCATATGAAAGTATGCAAGCTAGATGGTGAGTGGGTGACATTTAGAGAGGTTCTTGCTGCTGCAGATGCATTTGCATCTGAATATCGGCCAACATTACAGGATATGGATTTATTCCAGACATTGGTCAATTGTACATTTTCTAAAGAATATGCATGGAGAGACTTTTTAAATGAAGTACAATGTGATGTATTAACAACAAGACAAATTCACAGGCCGAAAGTTGCTCGTACATTCACAGTTAAAGAACGAGATCAAACAATTCAGAATCCTATCACTGCTGTAATAGGCTACAAATATGCAAGTAAAGTAGATGAGATAAGTGATGTATTAGATAGTGCTATACACCCAGACTCTCTATCGACTGATTTGCAGCTCATGAGAGAAGGCGTGTATAGAGAGCTGGGACTTGATATTAGTCAGCCAAATGTTTTAAAGAAAGTTGCACCTTTGCTATATAAATCAGGGAAATCAAGGATAGTAATAGTGCAAGGAAATGTTGAGGGTACAGCTGAGTCAATTTGTAGTTACTGGTTAAAAACTATGTCTCTTGTAAAGACTATTAAAGTAAAGCCAAAAAAGGAGGTATTGAAGGCTGTATCACTTTATGGCAAGAAAGAAAAAGTAGGTGATCTGACACATTTAGCTGCAATGAGACTATGTATTGAGGTCTGGAGATGGTGTAAAGCAAATGAACAAGATTCAGTAACATGGCTGAAATACTTGATATTTGAGAATAAGACACTAGAGCAGTGGGTAGACTTGTTTTGTTCAAGAGGAGTATTACCTGTTGATCCAGAAATTCAATGCCTAGGTCTTTTGGTATATGATCTTAAAGGTCAAAAGGGTTTATTGCAGATACAAGCCAATAGACGAGCATATTCAGGAAAGCAATATGATGCATACTGTGTGCAAACTTATAATGAGGAAACAAAACTCTATGAGGGAGATTTGAGAGTGACTTTTAACTTTGGTATAGATTGTGCACGTCTTGAAATTTTTTGGGATAAAAGAGAGTATATCTTAGAAACATCTATAACTCAGCGAAATGTCTTGAAAATTTTGATGGAAGAAGTAACTAAAGAGTTATTACGCTGTGGTATGAGATTTAAAACAGAACAAGTTAATTCATCAAGAAGTGTCGTACTGTTTAAAACAGAGAGTGGTTTTGAATGGGGTAAGCCCAATGTGCCCTGTATAGTATATAGAAATTGCACTCTTCGAACAGGCCTTAGAGTAAGACATCCAACAAATAAAGCATTTTCAATTACAATTCAAGCTAATGGCTTTAGGGCCATGGCCCAGTTAGATGAAGAAAATCCCAGATTTCTTCTTGCACATGCATATCACAACTTAAAGGATGTGAGGTATCAGGCACTACAGGCGGTAGGAAATGTATGGTTTAAAATGACACAACATAAGTTATTTATGAATCCAATCATATCAGCTGGACTATTAGAAAACTTTATGAAAGGATTACCAGCAGCAATTCCCCCAGCAGCTTATTCCCTTATTATGAATAAAGCAAAAATCTCTGTTGATCTATTTATGTTTAATGAACTGCTGGCCCTGATAAACCCGCAAAATGTTTTAAACTTGGATGGTATTGAGGAAACGTCTGAAGGTTTCACAACAGTAAGCACAATTTCTAGCACACAGTGGTCAGAAGAGGTAAGTTTAACACTAGATGACAGTGATGATGATGATGATGCTTCTAATTTAGATTATACTATCGATCTTGATGATATAGATTTTGAAACAATTGACTTAAAAGAAGATATTGAGCATTTTCTACAAGATGAATCTGCTTATACTGGAGATTTATTGATTCAAACTGAAGAAACCGAAATAAGGAAGTTAAGGGGCATGATCAAAATTCTGGAGCCCGTAAAGTTGATAAAAAGCTGGGTTTCTAAAGGTTTATCTATTGACAAAATATACAACCCTGTAAATATCATCCTGATGACCCGGTATATGTCAAAACATTATAATTTCCAAGCAAAGCAGTTATCTCTAATGGATCCATATGATTTAACTGAGTTTGAGAGTGTTGTTAAAGGCTGGGGGGAGTGTGTCAAGGACCGATTTATTGAACTTGATCAAGAAGCTCAACGGAAAGTTACTGAAGAGAGAGTATTGCCCGAGGATGTACTCCCAGACTCTCTTTTTTCATTTAGGCATGCTGATATCTTGTTAAAGAGATTGTTCCCTAGGGATTCAGCCTCTTCTTTTTATTAACAGATTGTACTTCTTATTGCTCTTTTC
| 50,622
|
MN639737.1
|
Orthohantavirus puumalaense
|
Binder,F., Reiche,S., Roman-Sosa,G., Saathoff,M., Ryll,R., Trimpert,J., Kunec,D., Hoper,D., Ulrich,R.G.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Diseases
| null |
2020-04-30
| null |
Orthohantavirus puumalaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,551
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Myodes glareolus
| null | null | null | null |
Orthohantavirus puumalaense strain Osnabruck V29 segment L, complete sequence
|
ATAGTAGTAGACTCCGAGATAGAGAAGTTTACTACAAATGGAAAAATACAGAGAGATCCATGAGAGGGTTAAGGAAGCAGTCCCAGGAGAGACATCAGCAGTTGAGTGTTTAGACTTATTAGATAGATTATATGCAGTAAGGCATGATGTTGTTGACCAGATGATAAAACATGACTGGTCTGACAATAAAGATAGAGAACAGCCTATAGGTTTAGTTCTTTTAATGGCTGGGGTACCAAATGATGTGATCCAAGGAATGGAGAAAAGAATAATTCCAGGGAGCCCTAGCGGTCAAATACTAAGATCATTTTTCAAAATGACTCCCGATAATTACAAAATAACAGGAAGTCTGATAGAGTTTATTGAGGTGACAGTTACTGCTGATATAGCAAGAGGTGTTAGGGAAAAGGTTTTGAAATATCAAGGAGGGTTAGAGTTCATTGAGCAACTTTTGCATATAGAAGCCCAGAAGGGAAATTGCCAGCCTGGTTTTAAAATAAAGTTTGATGTAGTTGCCATAAGGACAGATGGTTCAAATATCTCCACACAGTGGCCTAGTAGAAGAAATGAAGGTGTTGTTCAGGCGATGAGGTTAATTCAAGCTGATATAAATTTTGTAAGGGAACACTTAATTCGAAATGAAGAGAGAGGAGCACTTGAAGCAATGTTTAATTTAAAATTTCATGTGACTGGTCCAAAAGTAAGGACATTTGATATTCCTAATTATAGGCCTCAACCACTGTGTCAACCAGCATTAGAAAGCTTGGTGGATTACTGTAAAAATTGGCTTGAGACAGATCATGCATTCGCATTTAAAGAAGTAACAGGACAGCGTGTATTTAATGTGTTTAGAGAAGAAGAAGAATTACATGCATCAAGGTATGGTCATTCAAGAAAACCAAGGAATTTTTTATTATGTCAAATTAGCTTACAAGCACCATATTTACCGTCTACTATTGCCTCTGATCAATATGATACACGTTCAGTTTGTAATGAAATATTAAAGAATTATCCGGAAACACCAGTACAGCTCTTAGCAAGAGACATGGCCTATAAATATATTACATTAGATCACGATGATATAATAAACTACTACAATCCACGTGTTTATTTTAAACCGACACAAAATATAAAAGAACCAGGGACATTCAAACTTAACTTGTCAAATATGGATCCAAAATCAAAGGCATTAATTGATTTAATTTCAAAAGATTCTAAAAAAGGTGTGTTTGGTGAGTTAATTGATAGTATTGATGTAGCAAGTCAAGTTCAGCAAAATGAATGTGCTAAGGTTGTTGAAAAAATCCTATCAGATTTGGAAGTCAACTTGGGTGATTCCACCTCAGGCCTAGATCAGCCAAAAAGAACAACTGGAGTAGATGATATCTTGAGAAAATTTTATGATAACGAACTTGTTAAATATCTAATTTCAGTGATAAGGAAAACTACTGCATGGCATTTAGGACATCTATTACGTGATATTACGGAGTCTTTAATTGCACATGCAGGATTACGAAGATCTAAATATTGGTCAGCCCATGGTTATGCCTGTGGTAATATACTGTTATGTATTTTACCATCCAAATCACTTGAGGTGGCAGGGTCTTATATTAGATTTTTTACTGTGTTTAAAGAAGGTTTAGGGCTTATTGATCCTGATAATTTAGATTCAAAAGTAGAGATAGATGGGGTTTCTTGGTGTTTTAGTAAAATTATCAGTTTAGATTTAAATAGGTTATTAGCATTGAATATTGCATTTGAAAAATCATTACTTGCAACAGCTACGTGGTTTCAGTACTATACTGAGGATCAAGGACATTTTCCTCTCCAACATGCATTAAGGTCTGTATTTGCATTTCATTTCCTGCTTTCAACTTCCCAGAAGATGAAGCTATGTGCAATTTTTGACAACCTGAGGTATTTAATACCAGCAGTGACATCTACATATTCAGGTTTTGAGCCTTTAATAAGAAAATTCTTTGAAAGACCTTTCAAGAGTGCTCTTGAAATATATTTATACAGTATTATCAAAACATTGCTTGTAAGTTTAGCACAAAATAATAAAATTAGATTTTACTCTAAAGTTAGGCTACTAGGGCTAACAGTTGATCAATCTACAATAGGAGCAAGTGGTGTTTACCCTTCATTGATGTCAAGAGTAATTTATAAGCATTATCGGAGTTTAATATCTGAGGCAACTACTTGTTTCTTCCTTTTTGAGAAAGGCTTACATGGCAACCTTACAGAAGAAGCTAAAATTCATTTAGAGACTGTTGAATGGGCTCGAAAATTTCAGGAGAAAGAGAGGAAATTAGGAAGTTATGTAATGGAAGAAGGTTATCACATACAGGATGTATTGAACAATCATATAATTGTTGAGCAGCAACTATTTTGTCAGGAAGTTGTGGAACTTGCTGCTCAAGAATTGAATACATACCTACATGCCAAATCTCAAGTTATGGCAAGTAATATAATGAATAAGCATTGGGATAAACCATATTTTAGTCAAACCAGGAATATTAGTTTAAAAGGGATGTCAGGTGCACTGCAAGAAGATGGTCATTTGGCTGCAAGTGTGACATTGATTGAAGCAATTCGATTTTTAAATCACTCACAAAATAACCCGACAGTTTTAGAATTATATGAACTAACAAAGAAACAAAAAGCTCAAGCAAGGATTGTGCGAAAATATCAAAGAACAGAGGCTGACCGAGGATTTTTTATTACTACCCTACCCACTCGAGTGAGATTAGAGATCATAGAAGATTATTACGATGCTATAGCCAAAGTTGTTCCTGAAGAGTACATATCTTATGGAGGAGAAAGGAAAATATTGAATATCCAACAAGCTCTTGAAAAGGCACTTCGGTGGGCATCAGGTGAAAGTGAGATACAATCATCATTAGGGCATAGTATTAAGTTAAAGAGGAAATTAATGTATGTAAGTGCAGATGCAACGAAGTGGTCACCTGGCGATAATTCTGCAAAGTTCAAAAGATTTACACAATCCTTATATGATGGTTTACGCGATGAGAAGTTGAAGAACTGTGTTGTTGATGCCTTAAGAAATATATATGAGACTGATTTTTTTATATCTAGAAAATTACATAGATATATTGACAATATGGGCGAATTATCGGATGAAGTTCTAGATTTTTTATCATTTTTTCCCAATAAAGTGTCTGCATCTATTAAGGGCAATTGGTTGCAGGGCAATTTAAATAAATGTTCTTCACTTTTCGGGGCAGCAATATCATTATTATTTAAACGTGTGTGGGCAAAATTGTATCCAGAATTAGAATGTTTCTTTGAATTTGCTCATCATTCTGATGATGCATTATTCATATATGGTTATTTAGAACCTGTGGATGATGGTACAGAATGGTTTCAGTATGTGACCCAACAGATCCAAGCAGGTAATTTGCATTGGCATGCAGTTAATCAAGAAATGTGGAAAAGCATGTTTAATCTGCATGAACACATCTTGTTAATGGGCTCTATAAAAATATCACCGAAGAAAACAACTGTATCACCTACTAATGCTGAATTCTTATCAACATTTTTTGAAGGTTGTGCTGTATCTATCCCATTTATCAAAATTTTATTAGGTTCATTATCAGATTTACCCGGTTTAGGTTATTTTGATGATTTGGCTGCAGCACAGAGTCGATGTGTAAAGGCACTAGATATGGGTGCATGTCCTCAACTTGCACAATTAGGAATAGTATTGTGCACAAGCAAAGTGGAGAGATTGTATGGAACAGCTCCTGGAATGGTAAATAATCCTACTGCTTACCTAAAAGTAGATAGAAATTTAGTACCTATACCACTAGGTGGTGATGGTTCTATGTCAATAATGGAACTTGCTACAGCCGGAATTGGGATGGCTGATAAGAATATATTAAAAAATGCCTATATTACCTATAAACATGCAAAAAAAGATAATGATAGATATATTTTAGGTTTATTCAAATTTTTGATGTCATTATCTGATGATATTTTCCAGCATGACCGGCTAGGAGAATTTAGCTTTGTTGGGAAAGTACAATGGAAGGTGTTTACTCCTAAAAGTGAGTTTGAATTTTATGATCAATATTCGAGGAAATACCTAGAAATTTGGAGTGAACAACATCCAGTTTATGATTATATTATCCCTAGGGGTAGGGATAATCTTTTGGTATATTTGGTTCGAAAGCTAAATGACCCTAGCATCGTTACTGCAATGACAATGCAGTCACCTCTTCAACTAAGATTTAGAATGCAAGCAAAACAACATATGAAAGTATGCAAGTTAGATGGTGATTGGGTAACTTTTAGAGAAGTCCTAGCAGCAGCTGACTCATTTGCATCTACTTATAAACCTAGTACTCAAGATATGGAGCTTTTTCAAACACTAGTAAATTGTACATTTTCGAAAGAGTATGCCTGGAGAGACTTTCTAAATGAAGTACAATGTGATGTTTTAACAACAAGACAGATCCATAGACCTAAGGTAGCACGGACTTTCACAGTCAAGGAGAGGGATCAAACTATACAAAATCCTATTACAGCAGTCATAGGATATAAATATGCAAGCAAGGTAGATGAAATTAGTGATGTATTAGATAGTGCAATACATCCTGATTCTTTATCTACAGATTTACAGCTTATGAGAGAAGGTGTGTATAGAGAATTAGGACTTGATATAAGTCAGCCAAATGTCTTAAAGAAAGTTGCACCATTGCTTTATAAGTCAGGAAAGTCAAGGATTGTTATTGTACAAGGGAATATTGAGGGAACTGCAGAGTCTATCTGTAGTTACTGGCTTAAGACAATGTCTCTTGTTAAGACCATAAAAGTAAAACCAAAAAAGGAGGTATTAAAAGCAGTTTCATTATATGGTAAAAAAGAGAAGGCTGGTGATTTAACACATTTAGCTGCAATGAGATTATGTATTGAGGTGTGGAGATGGTGTAAAGCAAATGAACAAGACTCAGCCACATGGTTAAAGTATTTAATGTTTGAAAATAAGACTTTGGAACAGTGGATTGACTCTTTTTGCTCAAGGGGTGTTTTACCTGTCGATCCGGAAATTCAGTGCTTGGGCCTGTTAATCTATGATTTGAAAAAACAGAAAGGATTACTACAAATACAAGCAAATCGAAGGGCATATTCAGGTAAGCAGTATGATGCTTATTGTGTGCAAACATACAATGAAGAAACAAAGCTTTATGAAGGAGATCTCCGGGTAACATTTAATTTTGGTATTGATTGTGCAAGGTTAGAGATCTTTTGGGATAAAAAGGAATATATCCTGGAGACATCAATTACTCAGAGAAATGTATTAAAAATTTTAATGGAAGAAGTAACAAAAGAATTATTACGCTGTGGTATGAGATTCAAAACAGAACAAGTTAGCTCTTCTCGAAGTGTAGTGTTGTTCAAAACAGAGAGCGGATTTGAATGGGGTAAACCAAATATCCCATGCATTGTCTATAGGAATTGTACACTGAGAACAGGATTAAGAGTACGCCATCCTACAAATAAGGCATTCTCTATTACTATACAGGCTAATGGTTTCAGAGCCATGGCACAGTTAGATGAAGAAAATCCTAGATTCCTGCTAGCCCATGCATATCATAATTTAAAGGATGTGAGGTATCAAGCATTACAAGCTGTTGGGAATATATGGTTTAAAATGACACAACATAAACTATTTATTAATCCAATTATTTCAGCTGGGTTATTGGAGAATTTCATGAAGGGACTACCAGCAGCAATCCCACCTGCTGCATATTCATTAATTATGAATAAAGCAAAGATTTCTGTTGACTTATTCATGTTTAATGAGTTATTGGCATTAATTAACCCAAAGAATGTGTTAAATCTAGATGGTATTGAAGAAACTTCTGAAGGTTATACGACAGTTAGTACAATTTCTAGTACACAATGGTCTGAAGAAGTAAGTTTAACTATGGATGATAGTGATGATGACGAGAATAGTTCACAAATGGATTACACAATTGACCTTGATGATATAGACTTTGAAACAATTGATCTCAAAGAAGATATTGAGCATTTTCTACAGGATGAATCTGCTTATACTGGAGATCTCTTGATCCAGACTGAGGAGACTGAGATAAAAAAATTGAGAGGTATGGTCAAAATTTTAGAACCTGTAAAATTAATAAAGAGCTGGGTTTCAAAAGGTCTATCAATAGACAAGATATACAACCCTGTTAATATTATTCTTATGACTCGGTACATGTCAAAACACTTTAATTTCCATGCAAAGCAGTTGTCATTAATGGATCCGTATGATCTTACTGAATTTGAGAGTATTGTGAAAGGCTGGGGTGAGTGTGTTAAATATCGATTTATTGAATTAGATCAGGAAGCACAGAGAAAAGTTTCTGAGGAGAGAGTTCTCCCAGAAGATGTACTGCCAGATTCCTTATTTTCATTCAGACATGCTGATATCTTGTTAAAGCGATTATTCCCAAGGGATTCAGCCTCTTCATTTTATTAACAGATTATATTTTCTATTGCTCTTTTCTCGGAGCATACTACTA
| 50,827
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.