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Orthohantavirus puumalaense
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Orthohantavirus
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Germany
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Myodes glareolus
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Orthohantavirus puumalaense strain Osnabruck M43 segment L, complete sequence
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Orthohantavirus
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GenBank
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Germany
|
Germany
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Orthohantavirus puumalaense
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Russia
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Russia
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Orthohantavirus seoulense
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Antic,D., Lim,B.U., Kang,C.Y., Yong Kang,C.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
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USA
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2003-11-25
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Orthohantavirus seoulense
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Orthohantavirus
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Hantaviridae
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| 1
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Hantaviridae
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| 14,451
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Orthohantavirus seoulense
|
Wei,Y.
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Institute for Viral Disease Prevention and Control, Hebei Province Centre for Disease Prevention and Control
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China
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2023-07-31
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|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
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China
|
China
|
Rattus norvegicus
|
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| 14,453
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|
Orthohantavirus seoulense
|
Wei,Y.
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Institute for Viral Disease Prevention and Control, Hebei Province Centre for Disease Prevention and Control
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2023-07-31
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|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
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China
|
China
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| 14,454
|
OQ739648.1
|
Orthohantavirus seoulense
|
Wei,Y.
|
Institute for Viral Disease Prevention and Control, Hebei Province Centre for Disease Prevention and Control
|
China
|
2023-07-31
| null |
Orthohantavirus seoulense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,530
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rattus norvegicus
|
lung
|
2002
| null | null |
Orthohantavirus seoulense strain HBCD55/2002 segment L, complete sequence
|
TAGTAGTAGACTCCGGAAGAGACAAAACAAAAAAAGATGGAGAAATATAGAGAAATACACAGGGATCTGAAGGAGTTTACTATTAACTCATTAACAGCCGTGGAATGCATGGATTACTTGGATAGGCTCTATGCTGTTCGGCATGATATTGTTGACCAGATGATAAAACATGAATGGTCAGACAATAAAGACAGCGAGGAGCCAATAAGTAAGGTATTACTGTTTGCTGGGATACCTAATAATGTCATTACAGCATTGGAAAAAAAGGTTATCCCCGATCATCCGAGTGGCAAAACACTGCGGTCTTTTTTTAAGATGACACCTGACAACTACCGAATAACAGGTTCCTTAATTGAGTTTGTAGAGGTAACTGTGACTGCAGATGTAGATAAGGGTATCAGAGAGAAGAAAATGAAGTATGAGCTAGGTCTGAAATATCTAGAGCAAGAACTTATGACATTCTTCCATAGAGGAGAACTACAAAACCCTTATAAAATTACATTTAAGGTAGTTGCAGTTCGGACAGACGGATCAAATATTTCAACACAATGGCCCAGTACGAGGAATGATGGTGTAGTTCAATATATGAGATTGGTACAGGCAGAAATCAGTTATGTAAGGGAACATCTGGTTAAAACTGAAGAAAGAGCTGCATTAGAAGCAATGTTTAATTTAAAATTCAACATAAGTTCTCTAAAGACACAGCCTTATTTTATCCCTGAATATAAGGGGATTGATCTGATTGGACCAGATATAGATGGGTTAGTGAACTACGCCCAAAACTGGATGTCAAAGACCCAAGAATTCTCTTTTTTTGAAGTAAAAGGTTCAGCTGTGTTTGATTGTTTTAATGAGAATGAGCAAGGGCACATCATAAAATACCCAATGTCCCGGCACCCAAGGAACTTTTTACTCATACAATGCACTGTATTAACAGCATACAAACCCGCAACTATACTTTCTGATCAACTTGATAGCCGTAGGGCCTGCATTCAATTCTTAAACCTCATTCCAGAAACCCCTGCATCTATTCTTGCACATGATATGGCACACAGATACATCAATCTGACTAGGGATGATTTATTAGCATATTATGCACCTAGAATCCAATTTAATCCTACCCAAAATATTAAAGAACCAGGTACCTTTAAATTAACATCAAATATGATGCGGCCTGAGTCGAAGATTATGCTGGATATGCTAAGTCAACATGAACCTCGAGAAAATTTGGGGAAGTCAATAGAAAGTTTAAACATCAGTAGTCATATTGTACAGTCAGATTGTGTCAGCCTAATCACAAAAATTTTGTCAGATTTAGAGCTTAATATTTCTGAGCCTAGTAGCCATGAGCAGATTATAGCTAAACACACACATGTTGATACTGTATTAGATAAATTCTTTCAAAACGAGACTCAGAAGTATTTAATTGATATTCTAAAGAAGACTACAGCATGGCATATTGGGCATTTGGTTAGGGATATTACCGAGAGCTTGATTGCACATTCTGGATTGAAGAGGTCTAAATATTGGTCAATCCATGCTTATAATAACGGAAGCGTAATATTGTTCATACTCCCTTCAAAATCCCTTGAGGTTGCAGGTTCATTTGTGCGATTTATGACTGCTTTTAAACTTGGTCCTGGACTAGTTGATAAAGACAATTTGGATTCAATACTTGCAGATGGTGATATCTTATGGGGTGTCTCAAAAGTTATGAGTCTCGATCTGAACAGGCTACTTGCTTTGAATATAGCTTTTGAGAAGGCACTACTTGCAACAGCTACATGGTTCCAATATTACACTGAGGATCAATCTCAATTCCCATTGCAACATTCTATCCGGTCAGTTTTTGCTTATCATTTTTTGCTTGCTATCTGCCAGAAGATGAAATTATGTGCAATCTTTGACAACCTAAGGTATCTGATACCTGCTGTGACATCTTTGTATTCTGGCTTTCCTTCTTTGGTTGAAAAACTATTTGAGAGACCTTTTAAAAGTGCTTTAGAAGTTTATGTGTATTATAATATCAAAAGTCTGCTTGTTGCATTGGCTCAAAATAATAAGGCTAGATTTTATTCAAAAGTTAAACTTCTTGGATTGACTGTCGACCAATCTACAGTTGGTGCGAGTGGGATCTATCCATCCTTTATGTCACGAGTTGTTTATAAACATTATAAGAGTTTAATTTCAGAAGTGACAACTTGCTTTTTTCTTTTTGAAAAGGGTTTGCATGGGAATGTAAATGAGGAGGCTAAAATACATCTGGAAACTGTAGAATGGGCAACAAAGTTCAAAGAAAAGGAGGATAAGTATGGTGAGATGTTAGTTGAAAATGGTTATACAATAGGAGAGCTTGTAGAATCTAGTGAACTAGCAGTCCAACAACTATATTGTCAAGATGCAGTTGAGCTGGCTGCCAATGAATTAAACCGAATTCTTATCACAAAGTCTCAGGTGGTTGCTAATAGTATCTTAAATAAGTATTGGGAAGAGCCATATTTTAGCCAAACAAGGAATATTAGTTTAAAAGGTATGTCAGGTCAAGTACAAGAGGATGGGCATTTGTCGTCATCCACAACAATTATCGAGGCTATAAGATATCTGTCTAATTCAAGGAATAACCCTAACGTTCTTCAACTATATGAAGAAACTAGGCATCAGAAGGCACAGGCTAGAATTGTGAGGAAGTTTCAGAGGACAGAAGCTGATCGGGGTTTCTTCATTACAACACTACCAACAAGATGTCGTCTTGAGATTATTGAGGACTATTATGATGCAATATCAAAAAACGTGGCAGAGGAATATATCTCATATGGTGGAGAAAGAAAAATTCTCTGTATCCAGGCTGCCCTTGAAAAAGCTCTCCGCTGGGCATCTGGAGAGAGCTTTATTGAGCTCAGTAACGGAAAATTCATAAGGATGAAGAGAAAACTTATGTATGTCAGTGCTGATGCCACCAAATGGTCTCCAGGTGACAATTCAGCAAAATTCAGGAGATTTACTGCTGCCCTTCATAATGGATTGCCTGATGACAGGTTAAAAAACTGTGTTATTGATGCCTTACGCCATGTATATAAGACTGATTTTTATATGTCTAGAAAACTTAGACACTATATTGATTCTATGGATACTTATGAACCTCATGTCAGAGATTTCTTGAATTTCTTTCCAGATGGGCATCATGGAGAGGTACGAGGCAATTGGTTGCAGGGTAACTTGAACAAGTGCTCATCATTATTTGGTGTGGCAATGTCTTTATTGTTTAAAGAAATCTGGACAAGGTTATTTCCAGAATTAGACTGCTTTTTTGAATTTGCTCACCATTCAGATGATGCACTTTTCATATATGGTTACTTGGAACCAGCTGATGACGGGACTGATTGGTTCTTATTTGTATCCCAGCAGATTCAAGCTGGGAAATTGCATTGGTTTAATGTAAATACAGAGATGTGGAAAAGTATGTTTAACCTGCATGAACACATTCTTTTACTAGGGTCAATTAAAATATCCCCAAAGAAGACAACATTGTCACCGACAAATGCTGAGTTCTTGTCTACATTTTTTGAGGGTTGTGCTGTATCAATTCCCTTTATTAAAATCCTCCTTGGATCACTATCTGACCTACCAGGCCTTGGTTATTTCGATGATCTTGCTGCTGCCCAAACACGGTGCGTTAAAGCAATGGATTTGGGAGCATCGCCTCAAATCTCACAACTTGCTGTCTCACTTAGTACGAGTAAAGTTGAGAGATTATATGGGACATCAATAGGTATGGTCAATTATCCTGGCACATATTTAAGGACAAAACACTCTGAAACTCCAATTCCACTGGGAGGAAGTGGTGCAATGTCAATAATGGAACTTTCAACAGCCGGTATAGGTATGTCTGACAAAAATTTATTGAAACAAGCACTTATTGGTTATATGCATAAACACCAGAAACAAATGAGTTACATCCTGGGGCTTTTCAAGTTTTTAATGGATCTTTCTGGTGAGACATTTCAGCATGAAAGGCTAGGCCAGTTTTCATTCATAGGAAAAGTTCAATGGAAGATATTCACACCCAAATCAGAGTTTGAATTCTCTGACATGTATTCTCAGAAGTTTTTAAAGGTTTGGAGTGAACAGCATCCCACATATGATTACATTATTCCTAAAGGTCGTGACAATCTTCTTATTTATCTTGTGAGAAAATTAAATGACCCGAGCATTATAACAGCTATGACCATGCAATCACCCTTACAACTCAGATTTAGGATGCAAGCAAAACAACATATGAAAGTTTGCAGACTAGATGGGGACTGGGTAACATTTAGAGAGGTACTTGCAGCAGCAAACAGCTTCGCTGAGAGCTATGAGCCTAGTCAAAATGATATTGATTTATTTCAGACATTGACTAGCTGCACATTTTCTAAAGAGTATGCATGGAAAGATTTTTTGAATAATGTACATTGTGATGTGATACCAACAAAGCAAGTACAACGTGCGAAAGTTGCACGTACATTCACTGTGAGAGAAAAGGACCAAATTATTCAAAATAGCATTCCAGCTGTTATTGGTTACAAGTTTGCAGTAACAGTTGATGAAATGTCTGATGTGTTAGACACAGCCAAGTTCCCAGATTCCCTGGCGGTTGACCTTAAGACAATGAAAGATGGAGTCTATAGGGAATTGGGTTTAGATATCTCTTCTCCAGATGTTATGAAGAAAGTGGCACCTATGTTGTATAAAAGTGCAAAATCACGGGTTGTCATTGTCCAGGGGAATGTAGAAGGAACTGCAGAGGCAATCTGTGCATACTGGTTAAGGAATATGTCTTTAATTAAGACAATTAAAGTTAAACCCCATAAAGAAGTGCTCCAAGCTGTATCCATATTCAATAGAAAGGAAGATATCGGTCAGCAGAAGGATTTGTCAGCACTAAAGTTATGTATTGAAGTCTGGAGGTGGGCAAAAGCAAACAATGCACCCTATAGGGACTGGTTTCATGCATTATGGTTTGAAGACAAAACATTTTCAGAGTGGCTAGATAGATTTATCAGAGTAGGTGTGCCTCCTATTGATCCAGAAATTCAGTGTGCAGCATTGATGATTGCAGATGTTAAAGGTGACAGGTCAGTGTTACAACTCCAAGCCAATAGAAGAGCATATTCAGGGAAACAATATGATGCATATTGTGTACAGACTTATAATGAAGAGACAAAGCTTTATGAAGGGGATCTAAGAGTAACCTTTAATTTTGGATTAGATTGTGCACGGCTTGAGATATTTTGGGATAAAAAAACTTATATTCTTGAGACATCCATCACACAGAAACATGTTTTAAAAATAATGATGGAAGAGGTTTCGAAAGAGCTAGTTAGGTGTGGGATGCGATTTAATACCGAGCAAGTTAATGGTGTAAAGCACCTTGTTTTGTTCAAGACAGATTCAGGTTTTGAATGGGGTAAGCCTAATATTCCATGTATTGTATACAAAAATTGTGCATTGAGGACAGGTTTGAGGACAAACCAGGCTATCAACCATAAGTTTATGATCACAATTAAGGATGATGGTCTCAGGGCAATTGCACAGTATGATGAAGATAGCCCACGGTTTCTTCTAGCACATGCTTTTCATACTATCCGTGATGTTCGCTATCAAGCAGTTGATGCAGTAAGCAATGTGTGGTTCACACATAAGGGAATAAAGCTATACCTGAATCCGATCATTTCATCAGGACTGCTAGAGAACTTTATGAAAAACATACCTGCTGCTATTCCACCAGCTGCTTATTCATTGATAATGAATCGTGCAAAAATTTCTGTGGACTTGTTCATGTTTAATGACTTACTTAGACTGATAAACCCAGGTAACACACTTGATTTGTCTGGTCTTGAAATAACAGGTGAAGGTTATAGTACAGTGAGTAGTCTTTCTAGTAGATTATGGTCAGAAGAAATGAGCCTTGTTGATGATGAAGAGGAAATGGATGATGAGTTTACAATAGACTTACAGGATGTAGATTTTGAAAATATCGATATAGAAGCTGATGTAGAGCATTTTTTACAGGATGAGAGTGCTTATACAGGTGATTTATTAATTATGTCAGAAGAAACAGAAGTAAAAAAGATGAGAGGGATAATTAAGCTTTTAGAACCTGTAAAGTTGATAAAGAGTTGGGTTTCAAGGGGACTGTCTATTGAAAAGGTATACAATCCAGTTAATATCATATTGATGACTAGATATATATCAAAAAGCTTTAACTTTTCAGGCAAGCAGGTATCCTTATTAGACCCGTATGATTTAACTGAGCTTGAGAGTATTGTTAAGGGATGGGGTGAGTCCGTTGTGGATCAGTTTGATTCCCTTGACTTAGAGGCCCAAAATCTAGTTCAAAAGCAGGGTATTGTACCTGAGGATGTGATTCCAGATTCTTTGTTTTCTTTTAGGCACACGATGGTATTATTACGACGGTTGTTTCCACAGGATTCAGTTTCTACATTCTATTAATCATTTACTTCATTTTCATTTTGCGGAGTCTACTACTA
| 14,455
|
NC_077671.1
|
Orthohantavirus sinnombreense
|
Chizhikov,V.E., Spiropoulou,C.F., Morzunov,S.P., Monroe,M.C., Peters,C.J., Nichol,S.T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-06
|
NM R11
|
Orthohantavirus sinnombreense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,562
|
RefSeq
| 1
| null | null |
Peromyscus maniculatus
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Sin Nombre virus (NM R11) RNA L segment encoding RNA polymerase (L protein), complete cds
|
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| 42
|
NC_005217.1
|
Orthohantavirus sinnombreense
|
Chizhikov,V.E., Spiropoulou,C.F., Morzunov,S.P., Monroe,M.C., Peters,C.J., Nichol,S.T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-11-18
|
NM H10
|
Orthohantavirus sinnombreense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,562
|
RefSeq
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| 8,446
|
KT885044.1
|
Orthohantavirus sinnombreense
|
Miles,R.W., Lewandowski,K.
|
Public Health England, Diagnostic Support
| null |
2015-10-13
| null |
Orthohantavirus sinnombreense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,562
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Peromyscus maniculatus
| null |
2015
| null | null |
Orthohantavirus sinnombreense strain CC107/POR segment L, complete sequence
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NIH, NIAID - Rocky Mountain Labs
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2014-05-26
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Vero cells
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|
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|
Orthohantavirus tulaense
|
Kukkonen,S.K.J., Vaheri,A., Plyusnin,A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-11-21
| null |
Orthohantavirus tulaense
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Hantaviridae
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| 8,444
|
MT514295.1
|
Orthohantavirus tulaense
|
Hiltbrunner,M., Heckel,G.
|
University of Bern, Institute of Ecology and Evolution
|
Switzerland
|
2020-08-10
|
MagDEf02_1
|
Orthohantavirus tulaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,541
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Microtus arvalis
| null |
2015
| null | null |
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| 48,004
|
MT514300.1
|
Orthohantavirus tulaense
|
Hiltbrunner,M., Heckel,G.
|
University of Bern, Institute of Ecology and Evolution
|
Switzerland
|
2020-08-10
|
MarDSu08_2
|
Orthohantavirus tulaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,541
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Microtus arvalis
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2015
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|
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| 48,005
|
MN183135.1
|
Orthohantavirus tulaense
|
Chen,J.T., Qin,J., Li,K., Xu,Q.Y., Wang,X.P., Plyusnin,A., Hou,W., Zhang,Y.Z., Chen,J.-T., Xu,Q.-Y., Wang,X.-P., Zhang,Y.-Z.
|
National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Department of Zoonoses
|
China
|
2019-09-03
|
TOV.Xinjiang33
|
Orthohantavirus tulaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,541
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Microtus obscurus
| null |
2016
| null | null |
Orthohantavirus tulaense isolate TOV.Xinjiang33 segment L, complete sequence
|
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| 59,963
|
MN183136.1
|
Orthohantavirus tulaense
|
Chen,J.T., Qin,J., Li,K., Xu,Q.Y., Wang,X.P., Plyusnin,A., Hou,W., Zhang,Y.Z., Chen,J.-T., Xu,Q.-Y., Wang,X.-P., Zhang,Y.-Z.
|
National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Department of Zoonoses
|
China
|
2019-09-03
|
TOV.Xinjiang198
|
Orthohantavirus tulaense
|
Orthohantavirus
|
Hantaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,541
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Microtus obscurus
| null |
2016
| null | null |
Orthohantavirus tulaense isolate TOV.Xinjiang198 segment L, complete sequence
|
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| 59,964
|
NC_024781.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Towner,J.S., Khristova,M.L., Sealy,T.K., Vincent,M.J., Erickson,B.R., Bawiec,D.A., Hartman,A.L., Comer,J.A., Zaki,S.R., Stroher,U., Gomes da Silva,F., del Castillo,F., Rollin,P.E., Ksiazek,T.G., Nichol,S.T., Rollin,P.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-09-05
|
Ravn virus/H.sapiens-tc/KEN/1987/Kitum Cave-810040
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,114
|
RefSeq
| 1
|
Kenya
|
Kenya
|
Homo sapiens
|
blood
|
1987
| null |
PRJNA485481
|
Marburg marburgvirus isolate Ravn virus/H.sapiens-tc/KEN/1987/Kitum Cave-810040, complete genome
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NC_001608.3
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Orthomarburgvirus marburgense
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Enterlein,S., Volchkov,V., Weik,M., Kolesnikova,L., Volchkova,V., Klenk,H.D., Muhlberger,E., Sanchez,A., Randolf,A., Will,C., Kiley,M.P., Feldmann,H.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
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USA
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1994-01-26
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Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,111
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RefSeq
| 2
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Kenya
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Kenya
| null | null | null | null |
PRJNA485481
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Marburg marburgvirus isolate Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke, complete genome
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OQ672471.1
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Orthomarburgvirus marburgense
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Bonney,J.H.K., Adu,B., Sanders,T., Pratt,D., Adams,P., Asante,I.A., Bonney,E.Y., Agbodzi,B., Kumordjie,S., Obodai,E., Ketorwoley,P., Yeboah,C., Tublu,M., Ofori,M., Laryea,D., Asiedu-Bekoe,F., Kyei,G.B., Ohene,S.-A., Boateng,G., Chapman,R., Faye,O., Wiley,M.R., Sall,A., Odoom,J.K., Kasolo,F., Yeboah-Manu,D.
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University of Ghana Noguchi Memorial Institute for Medical Research, NAMRU-3
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Ghana
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2023-07-26
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MV-22-114C/Ghana/2022
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,049
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GenBank
| null |
Ghana: Adanse Dompoase
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Ghana
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Homo sapiens
| null |
2022-06-26
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense isolate MV-22-114C/Ghana/2022, complete genome
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TCATATAAATAAAGAAGAATATTAACATTGACATTGAGACTTGTCAGTCTGTTAATATTCTTGAAGAGATGGATTTACATAGTTTGTTAGAGTTGGGTACAAAACCTACTGCTCCTCATGTTCGTAATAAGAAGGTGATATTATTCGACACAAATCATCAGGTTAGTATCTGTAATCAGATAATAGATGCAATAAACTCAGGGATTGATCTTGGAGACCTTTTAGAAGGGGGTTTGCTGACGTTATGTGTTGAACACTACTATAATTCCGACAAAGATAAATTCAACACAAGTCCTATCGCAAGATACTTGCGTGATGCGGGTTATGAATTTGATGTCATCAAGAATGCAGATGCAACCCGCTTTCTGGATGTGATTCCCAATGAACCTCATTACAGCCCTTTAATTCTGGCCCTTAAGACATTAGAAAGCACTGAATCTCAGAGGGGGAGGATTGGGCTCTTTTTGTCATTTTGCAGTCTTTTTCTCCCAAAACTTGTCGTCGGAGACCGGGCCAGTATCGAAAAGGCCTTAAGACAAGTGACAGTACATCAAGAACAAGGAATTGTCACATACCCTAATCATTGGCTTACTACAGGTCACATGAAAGTAATTTTCGGGATCTTGAGGTCTAGCTTTATTTTAAAGTTTGTGTTGATTCATCAAGGAGTAAATTTGGTGACAGGTCATGATTCATATGACAGTATCATTAGCAATTCAGTAGGTCAAACTAGATTCTCAGGACTCCTTATTGTGAAAACAGTTCTCGAGTTCATCTTGCAAAAAACTGATTCAGGGGTGACACTACATCCTTTGGTGCGGACCTCCAAAGTGAAAAACGAAGTTACTAGTTTCAAGCAGGCGTTGAGCAACTTAGCCCGACACGGAGAGTACGCACCATTTGCACGGGTTTTGAATTTATCAGGGATTAACAATCTCGAACATGGACTCTATCCTCAGCTCTCAGCAATTGCGCTGGGTGTAGCGACAGCACATGGCAGTACATTGGCTGGTGTCAATGTTGGCGAACAATATCAACAGCTACGAGAGGCAGCACATGACGCAGAAGTAAAACTACAAAGACGACATGAACGTCAGGAAATTCAAGCTATTGCCGAAGATGACGAGGAAAGGAAGATATTAGAACAATTCCACCTTCAGAAAACTGAAATCACACACAGTCAGACACTCGCCGTCCTCAGCCAGAAACGAGAAAAATTAGCCCGCCTTGCTGCAGAAATTGAAAACAATATTGTGGAAGATCAGGGATTTAAACAATCACAGAATCGGGTGTCACAGTCGTTTTTGAATGACCCTACGCCTGTGGAAGTGACAGTTCAAGCCAGGCCCATAAATCGACCAACTGCTCTGCCTCCCCCAGTCGACGGCAAAATCGAGCATGAATCTACAGAAGATAGCTCTTCTTCAAGCAGCTTTGTTGACTTGAATGATCCATTTGCACTGCTGAATGAGGACGAAGACACTCTTGATGATAGTGTCATGATCCCGAGCACAACATCGAGAGAATTTCAAGGGATTTCTGAACCGACAAGACAATCTCAGGACCTCGATAACAGCCAAGGAAAGCAGGAAGATGAATCAACAAACCTGATTAAGAAACCGTTTTTACGATATCAAGAACTGCCTCCTGTCCAAGAGGATGATGAATCAGAATACACAACTGACTCTCAGGAAAGTATTGACCAGCCAGGATCCGACAATGAACAAGGGGTTGATCTTCCACCTCCTCCGTTGTATGCTCAGGAAAAGAGACAGGACCCAATACAGCACCCAGCAGTAAGCTCTCAGGATCCCTTTGGCAGTATTGGTGATGTAAATGGTGATATCTTAGAACCCATAAGGTCACCCTCTTCACCGTCTGCTCCTCAGGAAGACACAAGGGCAAGAGAAGTCTATGAATTGTCACCTGATTTCACAAATTATGAGGATGATCAACAGAATTGGCCACAAAGAGTGGTGACAAAGAAGGGTAGGACTTTCCTTTATCCTAATGATCTTCTGCAGACAAATCCTCCAGAATCACTTATGACAGCCCTTGTTGAGGAATACCAAAATCCTGTCTCAGCCAAGGAGCTTCAAGCAGATTGGCCTGACATGTCATTTGATGAAAGGAGACATGTTGCTATGAACTTGTAACCCGGATACTACAACACAATTACCCACCCATCCACTTCGATATGATTCACTCTCAGATCACAGCAATCAACCCTATTTGAATATCCAAATCACTATTTAGTATCCTATTACTTGTCACTATTGTGTGAGACAACATAAGCTATCAAATAACAATCACGGGCAAGAACTGGGCATACGATGGTGATTTAAGAGTATTGTTCAGTGCTACAAATTCTTTTTTCAATTGCTATAATGATACAACTACAAACCTCCGTACACTTGCCGCAATACTGTAATTAACACTGCTGTATCTCTTCCTCAAGCCATCTGATTTAACTCAATAAACATGACTTGATTCAGAGAATATGCTGAAAATGTTATTGTTTGAACTTCTAAAATGGCGCACTATCCTACCGTTTTACTCAGCTTGGTATATTGTAACATATCAGCGAACTCTCCACTTCTCTTCTTGTATATTCTCTATAAATCATTTACTTGACAGAATGTCAAGTCTACTGGTTCGGAGTCTCCTTACTCTAATGAATGTAATAATTAACTGTTAGCTTAGATGACAACAGATATGAGGTTATATGATTACTCATAGTGTAAAATGTAATTCTTACTTTTGTTTCTTCTGTTTTCCCCCTCCTTTATGATATACTAATTAAGAAAAACTAAAAATCGAAGAATATTAAAGATTTTCTTTAATATTCAGACAAGGTTTTTTATTCTCTTCTTTCTTTTTACAAATATATTAAAATAATAGTTCTCACAATGTGGGACTCATCATATATGCAACAAGTCAGCGAAGGGTTGATGACTGGAAAAGTTCCCATAGATCAGGTGTTTGGTACCAATCCCTTAGAGAAGCTATACAAGAGAAGGAAACCAAAAGGCACAGTTGGACTACAATGTAGCCCTTGTCTAATGTCAAAGGCAACAAGTACTGATGATATTATTTGGGACCAACTGATCGTGAGGAAAACACTAGCTGATCTACTTATACCGATAAATAGGCAGATATCGGATATTCAAAGTACTCTAAGTGAAGTAACAACGAGAGTCCATGAAATTGAGCGGCAATTACATGAAATCACCCCAGTTTTGAAAATGGGAAGGACACTGGAAGCAATCTCCAAGGGGATGTCAGAAATGTTAGCTAAATATGACCACCTTGTAATCTCAACTGGAAGAACCACTGCACCAGCTGCTGCCTTTGATGCTTACTTAAATGAGCATGGTGTCCCTCCTCCTCAACCCGCGATCTTCAAAGATCTTGGGGTTGCCCAACAAGCTTGCAGCAAGGGGACCACGGTGAAAAATGCAACAACAGATGCAGCCGACAAGATGTCGAAGGTCCTCGAACTCAGTGAGGAAACGTTCTCCAAGCCAAACCTCTCAGCCAAGGATTTAGCCCTTTTATTGTTTACCCATCTACCTGGCAACAACACTCCATTTCACATCCTTGCTCAGGTCCTTTCAAAAATTGCTTACAAGTCAGGAAAATCCGGAGCATTTTTGGACGCATTTCACCAGATTTTGAGTGAAGGAGAGAATGCTCAGGCGGCATTAACTCGACTAAGCAGAACATTTGATGCCTTCCTCGGAGTGGTTCCTCCAGTGATAAGAGTCAAAAACTTCCAAACAGTCCCTCGCCCATGTCAAAAAAGCCTTCGGGCTGTCCCTCCAAATCCAACAATCGACAAAGGATGGGTCTGTGTTTATTCATCTGAGCAAGGTGAGACACGGGCTCTTAAAATCTAATTCTCATTGTCCAAAGTTGCAAGGGAAGTTATCTTCTCGAGTTGATACAAAGACACTAAACATTTCAAAAACATGTATGTGGGTAAAACGTAACTAGACCATCTTAATTGGAGTAGTAATTTATTTCTGTCTTAGATGTGATTTTCACTTCAAAAGAGTTAAATGGTGATAGATTAATCTTTGAAATTACCCATTTATATATTATAGAGAAACTAATGTTACTAACAAAAGGGGTCTACCTAACGGGTATGATCGAGTGATCAGTCTATCTTATAAACCAGACAATTGACTTCTTACTTTTTAAGAATCAACTAACAGCATAGAAACCACATTTAGCTTTACGTAATCTTTGGCTTAGTTGGAATGAACTTTTGTTGTAATTCAACACATTTAGTCATAGTATATTGTAGAATTTTTTATAAGTTTAGAATACCTTAAATCATACCCACAAAGAATACTGTTTTAATTAAGAAAAACTATGAAGAACATTAAGAAGATCTTTCTCTCATAGTGTTCTTTTACTGGAAGAAGTATTCCAATCTTAACTTGTTGGATCAGTTGTCACTTAAGTTGTTATTTTTAAAATTAATTCACACAAAGTAGTTTAAATTTGTATCTAGAATAAATTTTAATATGGCCAGTTCCAGCAATTACAATACATACATGCAATACCTTAACCCTCCTCCTTATGCTGACCACGGTGCAAACCAGTTAATCCCGGCGGATCAGCTATCAAATCAGCAGGGTATAACTCCAAATTATGTGGGCGATTTAAACCTAGATGACCAGTTCAAAGGGGATGTCTGCCATGCTTTCACTTTAGAGGCAATAATTGACATATCTGCGTATAACGAACGAACAGTCAAAGGCGTTCCGGCATGGCTGCCTCTTGGGATTATGAGCAATTTCGAATATCCTTTAGCCCATACAGTGGCTGCGTTGCTCACAGGCAGCTATACAATCACCCAATTTACTCATAATGGGCAAAAATTCGTCCGTGTCAATCGACTCGGTACAGGAATCCCGGCACACCCACTCAGGATGTTGCGTGAAGGAAATCAAGCTTTTATTCAGAATATGGTGATCCCCAGGAACTTTTCC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| 14,549
|
OL702894.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Faye,M., Diagne,M.M., Wiley,M.R., Magassouba,N., Faye,O., Sall,A.
|
Institut Pasteur de Dakar, Virology Department
|
Senegal
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2021-12-12
|
MARV001
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,058
|
GenBank
| null |
Guinea
|
Guinea
|
Homo sapiens
|
blood
|
2021-08-09
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense isolate MARV001, complete genome
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| 35,258
|
MT586762.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Lopera,J.G., Bradford,R., Rashid,S., Shifflett,J., Towle,T., Eskandarinezhad,S., Bruce,C., Frank,A., Sohn,J.-W., Benton,B.
|
ATCC/BEI Resources, Sequencing and Bioinformatics Center
|
USA
|
2021-08-03
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BEI NR_51697
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,105
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GenBank
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Angola
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Angola
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Homo sapiens
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blood
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2005
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Orthomarburgvirus marburgense isolate BEI NR_51697, complete genome
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Orthomarburgvirus marburgense
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Amman,B.R., Bird,B.H., Bakarr,I.A., Bangura,J., Schuh,A.J., Johnny,J., Sealy,T.K., Conteh,I., Koroma,A.H., Foday,I., Amara,E., Bangura,A.A., Gbakima,A.A., Tremeau-Bravard,A., Belaganahalli,M., Dhanota,J., Chow,A., Ontiveros,V., Gibson,A., Turay,J., Patel,K., Graziano,J., Bangura,C., Kamanda,E.S., Osborne,A., Saidu,E., Musa,J., Bangura,D., Williams,S.M.T., Wadsworth,R., Turay,M., Edwin,L., Mereweather-Thompson,V., Kargbo,D., Bairoh,F.V., Kanu,M., Robert,W., Lungai,V., Guetiya Wadoum,R.E., Coomber,M., Kanu,O., Jambai,A., Kamara,S.M., Taboy,C.H., Singh,T., Mazet,J.A.K., Nichol,S.T., Goldstein,T., Towner,J.S., Lebbie,A., Bakarr,I., Kamanda,E., Williams,M., Lavalie,E., Bairoh,F., Lungay,V., Emeric,R.
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University of California, Davis, VM: One Health Institute
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USA
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2020-02-24
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PREDICT_SLAB3960 Kakbat_SL_2017
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,100
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GenBank
| 1
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Sierra Leone
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Sierra Leone
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Rousettus aegyptiacus
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oronasopharynx, blood
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2017-06-12
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense isolate PREDICT_SLAB3960 Kakbat_SL_2017, complete genome
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AAGAGATCTTGTTTTTGTGTATCATATAAATAAAGAAGAATATTAACATTGACATTGAGACTTGTCAGTCTGTTAATATTCTTGAAGAGATGGATTTACATAGTTTGTTAGAGTTGGGTACAAAACCTACTGCTCCTCATGTTCGTAATAAGAAGGTGATATTATTCGACACAAATCATCAGGTTAGTATCTGTAATCAGATAATAGATGCAATAAACTCAGGGATTGATCTTGGAGATCTTCTAGAAGGGGGTTTGCTGACGTTGTGTGTTGAACACTATTATAATTCCGACAAAGATAAATTCAACACAAGTCCCATCGCAAAATACTTGCGTGATGCGGGTTATGAATTTGATGTCATCAAGAATGCAGATGCAACCCGCTTTCTGGATGTGATTCCCAATGAACCTCATTACAGCCCTTTAATTCTGGCCCTTAAGACATTAGAAAGTACTGAATCTCAGAGGGGGAGGATTGGGCTCTTTTTGTCATTCTGCAGTCTTTTTCTCCCAAAACTTGTCGTCGGAGACCGGGCCAGTATCGAAAAGGCCTTAAGACAAGTGACAGTACATCAAGAACAGGGAATTGTCACATACCCTAATCATTGGCTTACTACAGGTCACATGAAAGTAATTTTTGGGATTTTAAGGTCTAGCTTTATTTTAAAGTTTGTATTGATTCATCAAGGAGTAAATTTGGTGACAGGCCATGATGCATATGACAGTATCATTAGCAATTCAGTAGGTCAAACTAGATTCTCAGGACTTCTTATTGTGAAAACAGTTCTCGAGTTCATCTTGCAAAAAACTGATTCAGGGGTGACACTACATCCCTTGGTGCGGACCTCCAAAGTGAAAAACGAAGTTGCTAGTTTCAAGCAGGCGTTGAGCAACTTAGCCCGACACGGAGAGTACGCACCATTTGCACGGGTTTTGAATTTATCAGGGATTAACAATCTTGAACATGGACTCTATCCTCAGCTCTCAGCAATTGCGCTGGGTGTAGCAACAGCACATGGCAGTACATTGGCTGGTGTCAATGTCGGCGAACAATATCAACAGCTACGAGAGGCAGCACATGATGCAGAAGTAAAACTACAAAGACGACATGAACATCAGGAAATTCAAGCTATTGCCGAGGACGACGAGGAAAGGAAGATATTGGAACAATTCCACCTTCAGAAAACCGAAATCACACACAGTCAGACACTTGCCGTCCTCAGCCAGAAACGAGAAAAATTAGCCCGTCTTGCTGCAGAAATTGAAAACAATATTGTGGAAGATCAGGGATTTAAACAATCACAGAATCGGGTATCACAGTCGTTTTTGAATGACCCCACGCCTGTGGAAGTAACGGTTCAAGCCAGGCCCATAAATCGACCAACTGCTCTGCCTCCTCCAGTCGACGACAAAATTGAGCGTGAATCTACAGAAGATAGCTCTTCTTCAAGTAGCTTTGTTGACTTGAATGATCCATTTGCACTGCTGAACGAGGACGAAGACACTCTTGACGACAGTGTCATGATCCCGAGCACAACATCGAGAGAATTTCAAGGGATTCCTGAACCGCCAAGGCAATCTCAGGACCTCGATAACAGCCAAGAAAAGCAGGAAGATGAATCAACAAACCTGATTAAGAAACCGTTTTTGCGATATCAAGAATTGCCTCCTGTCCAAGAGGATGATGAATCGGAATACACAACTGACTCTCAGGAAAGTATTGACCAGCCAGGATCCGACAATGAACAAGGGGTTGATCTTCCACCTCCTCCGTTGTACGCTCAGGAAAAGAGACAGGATCCAACACAGCACCCAGCAGTAAGCTCTCAGGATCCCTTTGGCAGTATTGGTGATGTAAATGGTGATATCTTAGAACCCATAAGGTCACCCTCTTCACCGTCTGCTCCTCAGGGAGACACAAGGGCAAGAGAGGCCTATGAATTGTCGCCTGACTTCACAAATTATGAGGATAATCAGCAGAATTGGCCACAAAGAGTGGTGACAAAGAAGGGTAGGACTTTCCTTTATCCTAATGATCTTCTGCAGACAAATCCTCCAGAATCACTTATAACAGCCCTCATTGAGGAATACCAAAATCCTGTCTCAGCCAAGGAGCTTCAAGCAGATTGGCCCGACATGTCATTTGATGAAAGGAGACATGTTGCTATGAACTTGTAATCCAGATAACACAGCACGTTTACCCACTCATCCACTTCAATACGATTCACCCTCAGATCACAGCAATCAACCTTATTTGAATATCCAAACCACTATTTAGTATCCTATCACTTGTTACTATTGTGTGAGACAACATAAGCTATCAAATAATAATCACGGGCAAGAATTGGGCATACGATGGTGATTTGCGAGCATTGTTCAGTGCTACAAATTCTTTTTTCAATTGCTATAATGATACAACCACAAACCTCCGTACACTTGCCGCAATACTGTAATTAACACTGCTGTATCTCTTCTTCAAGCCATCTGATTTAACTCAATAAATATGACTTGATTCAGAGAATATGCTGAAAATGTTATTGATTGAACTTCTCAAATGGTGCACTATCCTACTGTTTTGCTCAGCTTAGTATATTGTAACATATAAGTGGACTCTCCACTTCTCTTCTTGTGTATTCTCTACAAGTCATTTACTTGATAGAATGTCAAGTCTACTGGTTCAGAGTCTCCTTACTCTAATGAATGTAATAATTAACTGTTAGCTTAGATGATAACAGATATGAGGTTATATAATTACTCATAGTGTAAAGTGTAATTCTTACCTCTGTTTCTTCTGTTTTCCCTCTCCTTTATAATATGCCAATTAAGAAAAACTAAAAATCGAAGAATATTAAAGGTTTTCTTTAATATTCAGAAAAGGTTTTTTATTCTCTTCTTTCCTTTTACAAACATATTGAAATAATAATTCTCACAATGTGGGACTCATCATATATGCAACAAGTCAGCGAAGGGTTGATGACTGGAAAAGTACCCATAGATCAAGTGTTTGGTACCAATCCCTTAGAGAAGCTATACAAGAGAAGAAAACCAAAAGGAACAGTTGGGCTACAATGTAGCCCTTGTCTAATGTCAAAGGCAACAAGTACTGATGATATTATTTGGGACCAACTGATCGTGAAGAAAACACTAGCTGATCTACTTATACCGATAAGTAGGCAGATATCGGATATTCAGGGTACTCTAAGTGAAGTAACAACAAGAGTCCATGAAATTGAGCGGCAATTACATGAGATCACCCCAGTTTTGAAAATGGGAAGGACACTGGAAGCAATCTCCAAGGGGATGTCAGAAATGTTAGCTAAATATGACCACCTTGTAATCTCAACTGGAAGAACCACTGCACCAGCTGCTGCCTTTGATGCTTACTTAAATGAGCATGGTGTCCCTCCTCCTCAACCCGCGATCTTCAAGGATCTCGGGGTTGCTCAACAAGCTTGTAGTAAGGGGACTACGGTCAAAAATGCAACAACAGATGCAGCCGACAAGATGTCGAAGGTCCTTGAACTCAGTGAGGAAACGTTCTCTAAGCCAAACCTCTCAGCCAAGGATTTAGCCCTTTTATTGTTTACCCATCTACCCGGCAACAACACTCCATTCCACATCCTGGCTCAGGTCCTTTCAAAAATTGCTTACAAGTCAGGAAAATCCGGGGCATTTTTGGATGCATTTCACCAGATTCTGAGTGAAGGAGAGAATGCTCAGGCGGCATTAACTCGACTAAGCAGAACATTTGATGCTTTCCTCGGAGTGGTTCCTCCAGTGATAAGAGTCAAAAACTTCCAAACAGTCCCTCGCCCATGTCAAAAAAGTCTTCGGGCTGTCCCTCCAAATCCAACAATTGACAAAGGATGGGTCTGTGTTTATTCATCTGAGCAAGGTGAGACACGGGCTCTTAAAATCTAATTCTCATTGTTCAAAGTTGCAAGGGAAGTTATATTTCCGAGTTGATACAAAGACACTAAACATTTCAGAAGCATGTATGTGGGCAAAACATAACTAGACCATCTTAATCGAAGTAGTAATTTATTTCTGTCTTAAATGTGATTTTTACTTCAAAAGAGTTAAATGGTGATAGATTAATCTTTGAAATTACCCATTTTTACATTATAGAGAAACTAATGTTACTAACAAAAGGGGTCTACCTAACAGGTATGATTGAATGATCAGTATATCTCATAGACCAAACAATTGACTTCTTACTTTTTAAGAATCAACTAACAGCATAGGAAACACATTTATCTTTACGTAATCCTTGGCTTAGTTGGAATTAACTTTTGTTGTAATTCAATACGCTTAGTCATAATATATTGTATGATTTTTTATAAGTTTAGAATATCTTAAATTATACCCACAAAAAATACTGTTTTAATTAAGAAAAACTATGAAGAACATTAAGAAGATCTTTCTCTCATAGTGTTCTTTTACCAGAAGAAGTATTCTAATTTTAGCTTGTTGGATCAGTTGTCACTTAAGTTGTTCTTTTTGAAATTAATTCACACAAAGTAGTTTAAATTTGTATCTAGAACAAATTTTAATATGGCCAGTTCCAGCAATTACAATACATACATGCAATACCTGAACCCCCCTCCTTATGCTGACCACGGTGCAAACCAGTTAATCCCGGCGGATCAGCTATCAAATCAGCAGGGCATAACTCCAAATTATGTGGGTGATTTAAACCTAGATGATCAGTTCAAAGGGAATGTCTGCCATGCTTTCACTTTAGAAGCAATAATTGACATATCTGCGTATAACGAGCGAACAGTCAAAGGCGTCCCGGCATGGCTGCCTCTTGGGATTATGAGCAATTTCGAATATCCTTTAGCCCATACAGTGGCTGCATTGCTCACAGGCAGCTATACAATCACCCAATTTACTCATAATGGGCAAAAATTCGTCCGTGTCAATCGACTCGGTACAGGAATCCCGGCACACCCACTCAGGATGTTGCGTGAAGGAAATCAAGCTTTCATTCAGAATATG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| 53,803
|
MN187403.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Amman,B.R., Bird,B.H., Bakarr,I.A., Bangura,J., Schuh,A.J., Johnny,J., Sealy,T.K., Conteh,I., Koroma,A.H., Foday,I., Amara,E., Bangura,A.A., Gbakima,A.A., Tremeau-Bravard,A., Belaganahalli,M., Dhanota,J., Chow,A., Ontiveros,V., Gibson,A., Turay,J., Patel,K., Graziano,J., Bangura,C., Kamanda,E.S., Osborne,A., Saidu,E., Musa,J., Bangura,D., Williams,S.M.T., Wadsworth,R., Turay,M., Edwin,L., Mereweather-Thompson,V., Kargbo,D., Bairoh,F.V., Kanu,M., Robert,W., Lungai,V., Guetiya Wadoum,R.E., Coomber,M., Kanu,O., Jambai,A., Kamara,S.M., Taboy,C.H., Singh,T., Mazet,J.A.K., Nichol,S.T., Goldstein,T., Towner,J.S., Lebbie,A., Amman,B.B., Bakarr,I., Kamanda,E., Williams,M., Turya,M., Lavalie,E., Bairoh,F., Lungay,V., Emeric,R., Kamara,S.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2019-12-22
| null |
Orthomarburgvirus marburgense
|
Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,094
|
GenBank
| 1
|
Sierra Leone
|
Sierra Leone
|
Rousettus aegyptiacus
| null |
2018
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense strain 1000Kasbat SL 2018, complete genome
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Orthomarburgvirus marburgense
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Amman,B.R., Bird,B.H., Bakarr,I.A., Bangura,J., Schuh,A.J., Johnny,J., Sealy,T.K., Conteh,I., Koroma,A.H., Foday,I., Amara,E., Bangura,A.A., Gbakima,A.A., Tremeau-Bravard,A., Belaganahalli,M., Dhanota,J., Chow,A., Ontiveros,V., Gibson,A., Turay,J., Patel,K., Graziano,J., Bangura,C., Kamanda,E.S., Osborne,A., Saidu,E., Musa,J., Bangura,D., Williams,S.M.T., Wadsworth,R., Turay,M., Edwin,L., Mereweather-Thompson,V., Kargbo,D., Bairoh,F.V., Kanu,M., Robert,W., Lungai,V., Guetiya Wadoum,R.E., Coomber,M., Kanu,O., Jambai,A., Kamara,S.M., Taboy,C.H., Singh,T., Mazet,J.A.K., Nichol,S.T., Goldstein,T., Towner,J.S., Lebbie,A., Amman,B.B., Bakarr,I., Kamanda,E., Williams,M., Turya,M., Lavalie,E., Bairoh,F., Lungay,V., Emeric,R., Kamara,S.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2019-12-22
| null |
Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,094
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GenBank
| 1
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Sierra Leone
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Sierra Leone
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Rousettus aegyptiacus
| null |
2018
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense strain 968Kasbat SL 2018, complete genome
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ACAAGAGATGATGATTTTGTGTATCATATAAATAAAGAAGAATATTAACATTGACATTGAGACTTGTCAGTCTGTTAATATTCTTGAAGAGATGGATTTACATAGTTTGTTAGAGTTGGGTACAAAACCTACTGCTCCTCATGTTCGTAATAAGAAGGTGATATTATTCGACACAAATCATCAGGTTAGCATCTGTAATCAGATAATAGATGCAATAAACTCAGGGATTGATCTTGGAGATCTTCTAGAAGGGGGTTTGCTGACGTTGTGTGTTGAACACTATTATAATTCCGACAAAGATAAATTCAACACAAGTCCCATCGCAAAATACTTGCGTGATGCGGGTTATGAGTTTGATGTCATCAAGAATGCAGATGCAACCCGCTTTCTGGATGTGATTCCCAATGAACCTCATTACAGCCCTTTAATTCTAGCCCTTAAGACATTAGAAAGTACTGAATCTCAGAGGGGGAGGATTGGGCTCTTTTTGTCATTCTGCAGTCTTTTTCTCCCAAAACTTGTCGTTGGAGACCGGGCCAGTATCGAAAAGGCCTTAAGACAAGTGACAGTACATCAAGAACAGGGAATTGTCACATACCCTAATCATTGGCTTACTACAGGTCACATGAAAGTAATTTTTGGGATTTTAAGGTCTAGCTTTATTTTAAAGTTTGTATTGATTCATCAAGGAGTAAATTTGGTGACAGGTCATGATGCATATGACAGTATTATTAGCAATTCAGTAGGTCAAACTAGATTCTCGGGACTTCTTATTGTGAAAACAGTTCTCGAGTTCATCTTGCAAAAAACTGATTCAGGGGTGACACTACATCCTTTGGTGCGGACCTCCAAAGTGAAAAACGAAGTTGCTAGTTTCAAGCAGGCGTTGAGCAACTTAGCCCGACACGGAGAGTACGCACCATTTGCACGGGTTTTGAATTTATCAGGGATTAACAATCTCGAACATGGACTCTATCCTCAGCTCTCAGCAATTGCGCTGGGTGTAGCAACAGCACATGGCAGTACATTGGCTGGTGTCAATGTCGGCGAACAATATCAACAGCTACGAGAGGCAGCACATGATGCAGAAGTAAAACTACAAAGACGACATGAACATCAGGAAATTCAAGCTATTGCTGAGGACGACGAGGAAAGGAAGATATTAGAACAATTCCACCTTCAGAAAACTGAAATCACGCACAGTCAAACACTCGCCGTTCTCAGCCAGAAACGAGAAAAATTAGCCCGTCTTGCTGCAGAAATTGAAAACAATATTGTGGAAGATCAGGGATTTAAACAATCACAGAATCGGGTATCACAGTCGTTTTTGAATGACCCCACGCCTGTGGAAGTAACGGTTCAAGCCAGGCCCTTAAATCGACCAACTGCTCTGCCTCCCCCAGTTGATGACAAAATTGAGCGTGAATCTACAGAAGATAGCTCTTCTTCAAGTAGCTTTGTTGACTTGAATGATCCATTTGCGCTGCTGAATGAGGACGAAGACACTCTTGATGATAGTGTCATGATCCCGAGCACAACATCGAGAGAATTTCAAGGGATTCCTGAATCGCCAAGACAATCTCAGGACTTCGATAACAGCCAAGGAAAGCAGGAAGATGAATCAACAAACCTGATTAAGAAACCGTTTTTGCGATATCAAGAACTGCCTCCTGTCCAAGAGGATGATGAATCGGAATACACAACTGATTCTCAGGAAAGTATCGACCAACCAGGATCCGATAATGAACAAGGGGTTGATCTTCCACCTCCTCCGTTGTACGCTCAGGAAAAGAGACAGGATCCAATACAGCATCCAGCAGTAAGCTCTCAGGATCCCTTTGGCAGTATTGGTGATGTAAATGGTGATATCTTAGAACCCATAAGGTCACCCTCTTCACCGTCTGCTCCTCAGGAAGACACAAGGGCAAGAGAAGCCTATGAATTGTCACCTGACTTCACAAATTATGAAGATAATCAGCAGAATTGGCCACAAAGAGTGGTGACAAAGAAGGGTAGGACTTTCCTTTATCCTAATGATCTTCTGCAGACAAATCCTCCAGAATCACTTATAACAGCCCTCGTTGAGGAATACCAAAATCCTGTCTCAGCCAAGGAGCTTCAAGCAGATTGGCCCGACATGTCATTTGATGAAAGGAGACATGTTGCTATGAATTTGTAATTCAGATAATACAGCACGATTACCCACCCATCCACTTCGATACGATTCACCCTCAGCTCACAGCAATCAACCTTATTTGAATATCCAAACCACTATTTAGTATCCTATTACTTGTTACTATTGTGTGAAACAACATAAGCTATCAAATAACAATCACGGGCAAGAACTGGGCATACGATGGTGATTTGAGAGCATTGCTCAGGGCTACAAATTCTTGTTTCAATTGCTATAATGATACAACTACAAACCTCTGTACACTTGCCGCAATACTGTAATTAACACTGCTGTATCTCTTCTTCAAGCCATCTGATTTAACTCAATAAATATGACTTGATTCAGAGAATATGCTGAAGATGTTATTGATTGAACTCCTCAAATGGTGTACTATCCTACTGTTTTGCTCAGCTTAGCATATTGTAACGTATAAGTGGACTCTCCACTTCTCTTCTTGCGTATTCTCTATAAGTCATTTACTTGATAGAATGTCAAGTACACTGGTTTGGAGTCTCCTTACCCTAATGAATGTAATAATTAACTGTTAGCTTAGATGATAACAGATATGAGGTTATATAATTATTCATAGTGCAAAGTGTAATTCTTACTTCTGTTTCTTTTGTTTTTCCTCTCTTTTATAATGTGCCAATTAAGAAAAACTAAAAATCGAAGAATATTAAAGGTTTTCTTTAATATTCAGAAAAGGTTTTTTATTCTCTTCTTTCCTTTTACAAACATATTGAAATAATAATTCTCACAATGTGGGACTCATCATATATGCAACAAGTCAGTGAAGGGTTGATGACTGGAAAAGTACCTATAGATCAGGTGTTTGGTACCAATCCCTTAGAGAAGCTATACAAGAGAAGAAAACCAAAAGGAACAGTTGGACTACAATGTAGCCCTTGTCTAATGTCAAAGGCAACAAGTACTGATGATATTATTTGGGACCAACTGATCGTGAAGAAAACACTAGCTGATCTACTTATACCGTTAAGTAGGCAGATATCGGACATTCAAGGTACTCTAAGTGAAGTAACAACGAGAGTCCACGAAATTGAGCGGCAATTACATGAGATCACCCCAGTTTTGAAAATGGGAAGGACACTGGAAGCAATCTCCAAGGGGATGTCAGAAATGTTAGCTAAATATGACCACCTTGTAATTTCAACTGGAAGAACCACTGCACCAGCTGCTGCCTTTGATGCTTACTTAAATGAGCATGGTGTCCCTCCTCCTCAACCCGCGATCTTCAAAGATCTTGGGGTTGCCCAACAAGCTTGTAGTAAGGGGACTACGGTCAAAAATGCAACAACAGATGCAGCCGACAAGATGTCGAAGGTCCTTGAACTCAGTGAGGAAACGTTCTCTAAGCCAAACCTCTCAGCCAAAGATTTAGCCCTTTTATTGTTTACCCATCTACCCGGCAACAACACTCCATTCCACATCCTGGCTCAGGTCCTTTCAAAAATTGCTTACAAGTCAGGAAAATCCGGAGCATTTTTGGATGCATTTCACCAGATTCTAAGTGAAGGAGAGAATGCTCAGGCGGCATTAACTCGACTAAGCAGAACATTTGATGCTTTCCTCGGAGTGGTTCCTCCAGTGATAAGAGTCAAAAACTTCCAAACAGTCCCTCGCCCATGTCAAAAAAGCCTTCGGGCTGTCCCTCCAAATCCAACAATTGACAAAGGATGGGTCTGTGTTTATTCATCTGAGCAAGGTGAGACGCGGGCTCTTAAGATCTAATTCTCATTGTTCAAAGTAACAAGGGAAGTTATCTTTCCGAGTTGAGACAAAGACACTAAACATTTCAAAAGCATGTATGTGGGCAAAACGTAACTAGACCATCTTAATTGAAGTAGTAATTTATTTCTGTCTTAAATGTGATTTTCACTTCAAAAGAGTTAAATGGTGATAGATTAATCTTCGAAATTACTCATTTTTACATTATAGAGAAACTAATGTTACTAACAAGAGGGGTCTACCCAACGGGTATGATTGAGTGATCAGTATATCTCATAGACCAAACAATTGACTTCTTACTTTTTAAGAATCAACTAACAGCATAGAAAACACATTTATCTTTACGTAATCCTTGGCTTAGTTGGAATTAACTTTTGTTGTAATTCAATACGCTTAGTCATAATATATTGTATGATTTTTTATAAGTTTAGAATACCTTGAATTATACCCACAAAAAATACTGTTTTGATTAAGAAAAACTATGAAGAACATTAAGAAGATCTTTCTCTCATAGTGTTCTTTTACTGGAAGAAGTATTCCAATCTTAGCTTGTTGGATCAATTGACACTTAAGTTGTTCTTTCTGAAGTTAATTCACACAAAGTAGTTTAAATTTGTATCTAGAACAAATTTTAATATGGCCAGTTCCAGCAATTACAATACATACATGCAATACCTGAACCCCCCTCCTTATGCTGACCACGGTGCAAACCAGTTAATCCCGGCGGATCAGCTATCAAATCAGCAGGGTATAACTCCAAATTATGTGGGCGATTTAAACCTAGATGATCAGTTCAAAGGGAATGTCTGCCATGCTTTCACTTTAGAAGCAATAATTGACATATCTGCGTATAACGAGCGAACAGTCAAAGGCGTTCCGGCATGGCTGCCTCTTGGGATTATGAGCAATTTTGAATATCCTTTAGCCCATACAGTGGCTGCGTTGCTCACAGGCAGCTATACAATCACCCAATTTACTCATAATGGGCAAAAATTCGTCCGTGTCAATCGACTCGGTACAGGAATCCCGGCACACCCACTCAGGATGTTGCGTGAAGGAAATCAAGCTTTTATTCAGAATA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| 57,341
|
MN187405.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Amman,B.R., Bird,B.H., Bakarr,I.A., Bangura,J., Schuh,A.J., Johnny,J., Sealy,T.K., Conteh,I., Koroma,A.H., Foday,I., Amara,E., Bangura,A.A., Gbakima,A.A., Tremeau-Bravard,A., Belaganahalli,M., Dhanota,J., Chow,A., Ontiveros,V., Gibson,A., Turay,J., Patel,K., Graziano,J., Bangura,C., Kamanda,E.S., Osborne,A., Saidu,E., Musa,J., Bangura,D., Williams,S.M.T., Wadsworth,R., Turay,M., Edwin,L., Mereweather-Thompson,V., Kargbo,D., Bairoh,F.V., Kanu,M., Robert,W., Lungai,V., Guetiya Wadoum,R.E., Coomber,M., Kanu,O., Jambai,A., Kamara,S.M., Taboy,C.H., Singh,T., Mazet,J.A.K., Nichol,S.T., Goldstein,T., Towner,J.S., Lebbie,A., Amman,B.B., Bakarr,I., Kamanda,E., Williams,M., Turya,M., Lavalie,E., Bairoh,F., Lungay,V., Emeric,R., Kamara,S.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2019-12-22
| null |
Orthomarburgvirus marburgense
|
Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,094
|
GenBank
| 1
|
Sierra Leone
|
Sierra Leone
|
Rousettus aegyptiacus
| null |
2018
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense strain 960Kasbat SL 2018, complete genome
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Orthomarburgvirus marburgense
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Amman,B.R., Bird,B.H., Bakarr,I.A., Bangura,J., Schuh,A.J., Johnny,J., Sealy,T.K., Conteh,I., Koroma,A.H., Foday,I., Amara,E., Bangura,A.A., Gbakima,A.A., Tremeau-Bravard,A., Belaganahalli,M., Dhanota,J., Chow,A., Ontiveros,V., Gibson,A., Turay,J., Patel,K., Graziano,J., Bangura,C., Kamanda,E.S., Osborne,A., Saidu,E., Musa,J., Bangura,D., Williams,S.M.T., Wadsworth,R., Turay,M., Edwin,L., Mereweather-Thompson,V., Kargbo,D., Bairoh,F.V., Kanu,M., Robert,W., Lungai,V., Guetiya Wadoum,R.E., Coomber,M., Kanu,O., Jambai,A., Kamara,S.M., Taboy,C.H., Singh,T., Mazet,J.A.K., Nichol,S.T., Goldstein,T., Towner,J.S., Lebbie,A., Amman,B.B., Bakarr,I., Kamanda,E., Williams,M., Turya,M., Lavalie,E., Bairoh,F., Lungay,V., Emeric,R., Kamara,S.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2019-12-22
| null |
Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,094
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GenBank
| 1
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Sierra Leone
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Sierra Leone
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Rousettus aegyptiacus
| null |
2018
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense strain 960LNKasbat SL 2018, complete genome
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ACAAGAGATGATGATTTTGTGTATCATATAAATAAAGAAGAATATTAACATTGACATTGAGACTTGTCAGTCTGTTAATATTCTTGAAGAGATGGATTTACATAGTTTGTTAGAGTTGGGTACAAAACCTACTGCTCCTCATGTTCGTAATAAGAAGGTGATATTATTCGACACAAATCATCAGGTTAGCATCTGTAATCAGATAATAGATGCAATAAACTCAGGGATTGATCTTGGAGATCTTCTAGAAGGGGGTTTGCTGACGTTGTGTGTTGAACACTATTATAATTCCGACAAAGATAAATTCAACACAAGTCCCATCGCAAAATACTTGCGTGATGCGGGTTATGAGTTTGATGTCATCAAGAATGCAGATGCAACCCGCTTTCTGGATGTGATTCCCAATGAACCTCATTACAGCCCTTTAATTCTAGCCCTTAAGACATTAGAAAGTACTGAATCTCAGAGGGGGAGGATTGGGCTCTTTTTGTCATTCTGCAGTCTTTTTCTCCCAAAACTTGTCGTTGGAGACCGGGCCAGTATCGAAAAGGCCTTAAGACAAGTGACAGTACATCAAGAACAGGGAATTGTCACATACCCTAATCATTGGCTTACTACAGGTCACATGAAAGTAATTTTTGGGATTTTAAGGTCTAGCTTTATTTTAAAGTTTGTATTGATTCATCAAGGAGTAAATTTGGTGACAGGTCATGATGCATATGACAGTATTATTAGCAATTCAGTAGGTCAAACTAGATTCTCGGGACTTCTTATTGTGAAAACAGTTCTCGAGTTCATCTTGCAAAAAACTGATTCAGGGGTGACACTACATCCTTTGGTGCGGACCTCCAAAGTGAAAAACGAAGTTGCTAGTTTCAAGCAGGCGTTGAGCAACTTAGCCCGACACGGAGAGTACGCACCATTTGCACGGGTTTTGAATTTATCAGGGATTAACAATCTCGAACATGGACTCTATCCTCAGCTCTCAGCAATTGCGCTGGGTGTAGCAACAGCACATGGCAGTACATTGGCTGGTGTCAATGTCGGCGAACAATATCAACAGCTACGAGAGGCAGCACATGATGCAGAAGTAAAACTACAAAGACGACATGAACATCAGGAAATTCAAGCTATTGCTGAGGACGACGAGGAAAGGAAGATATTAGAACAATTCCACCTTCAGAAAACTGAAATCACGCACAGTCAAACACTCGCCGTTCTCAGCCAGAAACGAGAAAAATTAGCCCGTCTTGCTGCAGAAATTGAAAACAATATTGTGGAAGATCAGGGATTTAAACAATCACAGAATCGGGTATCACAGTCGTTTTTGAATGACCCCACGCCTGTGGAAGTAACGGTTCAAGCCAGGCCCTTAAATCGACCAACTGCTCTGCCTCCCCCAGTTGATGACAAAATTGAGCGTGAATCTACAGAAGATAGCTCTTCTTCAAGTAGCTTTGTTGACTTGAATGATCCATTTGCGCTGCTGAATGAGGACGAAGACACTCTTGATGATAGTGTCATGATCCCGAGCACAACATCGAGAGAATTTCAAGGGATTCCTGAATCGCCAAGACAATCTCAGGACTTCGATAACAGCCAAGGAAAGCAGGAAGATGAATCAACAAACCTGATTAAGAAACCGTTTTTGCGATATCAAGAACTGCCTCCTGTCCAAGAGGATGATGAATCGGAATACACAACTGATTCTCAGGAAAGTATCGACCAACCAGGATCCGATAATGAACAAGGGGTTGATCTTCCACCTCCTCCGTTGTACGCTCAGGAAAAGAGACAGGATCCAATACAGCATCCAGCAGTAAGCTCTCAGGATCCCTTTGGCAGTATTGGTGATGTAAATGGTGATATCTTAGAACCCATAAGGTCACCCTCTTCACCGTCTGCTCCTCAGGAAGACACAAGGGCAAGAGAAGCCTATGAATTGTCACCTGACTTCACAAATTATGAAGATAATCAGCAGAATTGGCCACAAAGAGTGGTGACAAAGAAGGGTAGGACTTTCCTTTATCCTAATGATCTTCTGCAGACAAATCCTCCAGAATCACTTATAACAGCCCTCGTTGAGGAATACCAAAATCCTGTCTCAGCCAAGGAGCTTCAAGCAGATTGGCCCGACATGTCATTTGATGAAAGGAGACATGTTGCTATGAATTTGTAATTCAGATAATACAGCACGATTACCCACCCATCCACTTCGATACGATTCACCCTCAGCTCACAGCAATCAACCTTATTTGAATATCCAAACCACTATTTAGTATCCTATTACTTGTTACTATTGTGTGAAACAACATAAGCTATCAAATAACAATCACGGGCAAGAACTGGGCATACGATGGTGATTTGAGAGCATTGCTCAGGGCTACAAATTCTTGTTTCAATTGCTATAATGATACAACTACAAACCTCTGTACACTTGCCGCAATACTGTAATTAACACTGCTGTATCTCTTCTTCAAGCCATCTGATTTAACTCAATAAATATGACTTGATTCAGAGAATATGCTGAAGATGTTATTGATTGAACTCCTCAAATGGTGTACTATCCTACTGTTTTGCTCAGCTTAGCATATTGTAACGTATAAGTGGACTCTCCACTTCTCTTCTTGCGTATTCTCTATAAGTCATTTACTTGATAGAATGTCAAGTACACTGGTTTGGAGTCTCCTTACCCTAATGAATGTAATAATTAACTGTTAGCTTAGATGATAACAGATATGAGGTTATATAATTATTCATAGTGCAAAGTGTAATTCTTACTTCTGTTTCTTTTGTTTTTCCTCTCTTTTATAATGTGCCAATTAAGAAAAACTAAAAATCGAAGAATATTAAAGGTTTTCTTTAATATTCAGAAAAGGTTTTTTATTCTCTTCTTTCCTTTTACAAACATATTGAAATAATAATTCTCACAATGTGGGACTCATCATATATGCAACAAGTCAGTGAAGGGTTGATGACTGGAAAAGTACCTATAGATCAGGTGTTTGGTACCAATCCCTTAGAGAAGCTATACAAGAGAAGAAAACCAAAAGGAACAGTTGGACTACAATGTAGCCCTTGTCTAATGTCAAAGGCAACAAGTACTGATGATATTATTTGGGACCAACTGATCGTGAAGAAAACACTAGCTGATCTACTTATACCGTTAAGTAGGCAGATATCGGACATTCAAGGTACTCTAAGTGAAGTAACAACGAGAGTCCACGAAATTGAGCGGCAATTACATGAGATCACCCCAGTTTTGAAAATGGGAAGGACACTGGAAGCAATCTCCAAGGGGATGTCAGAAATGTTAGCTAAATATGACCACCTTGTAATTTCAACTGGAAGAACCACTGCACCAGCTGCTGCCTTTGATGCTTACTTAAATGAGCATGGTGTCCCTCCTCCTCAACCCGCGATCTTCAAAGATCTTGGGGTTGCCCAACAAGCTTGTAGTAAGGGGACTACGGTCAAAAATGCAACAACAGATGCAGCCGACAAGATGTCGAAGGTCCTTGAACTCAGTGAGGAAACGTTCTCTAAGCCAAACCTCTCAGCCAAAGATTTAGCCCTTTTATTGTTTACCCATCTACCCGGCAACAACACTCCATTCCACATCCTGGCTCAGGTCCTTTCAAAAATTGCTTACAAGTCAGGAAAATCCGGAGCATTTTTGGATGCATTTCACCAGATTCTAAGTGAAGGAGAGAATGCTCAGGCGGCATTAACTCGACTAAGCAGAACATTTGATGCTTTCCTCGGAGTGGTTCCTCCAGTGATAAGAGTCAAAAACTTCCAAACAGTCCCTCGCCCATGTCAAAAAAGCCTTCGGGCTGTCCCTCCAAATCCAACAATTGACAAAGGATGGGTCTGTGTTTATTCATCTGAGCAAGGTGAGACGCGGGCTCTTAAGATCTAATTCTCATTGTTCAAAGTAACAAGGGAAGTTATCTTTCCGAGTTGAGACAAAGACACTAAACATTTCAAAAGCATGTATGTGGGCAAAACGTAACTAGACCATCTTAATTGAAGTAGTAATTTATTTCTGTCTTAAATGTGATTTTCACTTCAAAAGAGTTAAATGGTGATAGATTAATCTTCGAAATTACTCATTTTTACATTATAGAGAAACTAATGTTACTAACAAGAGGGGTCTACCCAACGGGTATGATTGAGTGATCAGTATATCTCATAGACCAAACAATTGACTTCTTACTTTTTAAGAATCAACTAACAGCATAGAAAACACATTTATCTTTACGTAATCCTTGGCTTAGTTGGAATTAACTTTTGTTGTAATTCAATACGCTTAGTCATAATATATTGTATGATTTTTTATAAGTTTAGAATACCTTGAATTATACCCACAAAAAATACTGTTTTGATTAAGAAAAACTATGAAGAACATTAAGAAGATCTTTCTCTCATAGTGTTCTTTTACTGGAAGAAGTATTCCAATCTTAGCTTGTTGGATCAATTGACACTTAAGTTGTTCTTTCTGAAGTTAATTCACACAAAGTAGTTTAAATTTGTATCTAGAACAAATTTTAATATGGCCAGTTCCAGCAATTACAATACATACATGCAATACCTGAACCCCCCTCCTTATGCTGACCACGGTGCAAACCAGTTAATCCCGGCGGATCAGCTATCAAATCAGCAGGGTATAACTCCAAATTATGTGGGCGATTTAAACCTAGATGATCAGTTCAAAGGGAATGTCTGCCATGCTTTCACTTTAGAAGCAATAATTGACATATCTGCGTATAACGAGCGAACAGTCAAAGGCGTTCCGGCATGGCTGCCTCTTGGGATTATGAGCAATTTTGAATATCCTTTAGCCCATACAGTGGCTGCGTTGCTCACAGGCAGCTATACAATCACCCAATTTACTCATAATGGGCAAAAATTCGTCCGTGTCAATCGACTCGGTACAGGAATCCCGGCACACCCACTCAGGATGTTGCGTGAAGGAAATCAAGCTTTTATTCAGAATA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| 57,343
|
MF939097.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Wong,G., Cao,W.G., He,S.H., Zhang,Z.R., Zhu,W.J., Moffat,E., Ebihara,H., Embury-Hyatt,C., Qiu,X.G., Wang,G., Cao,W., He,S., Zhang,Z., Zhu,W., Qiu,X.
|
Public Health Agency of Canada, Special Pathogens Program, National Microbiology Laboratory
|
Canada
|
2018-06-05
| null |
Orthomarburgvirus marburgense
|
Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,114
|
GenBank
| 1
|
Canada
|
Canada
|
Cavia porcellus
| null |
2017-07
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense strain NML/C.porcellus-lab/AGO/2005/Ang-GA-P2, complete genome
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| 70,481
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KP985768.1
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Orthomarburgvirus marburgense
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Nyakarahuka,L., Ojwang,J., Tumusiime,A., Balinandi,S., Whitmer,S., Kyazze,S., Kasozi,S., Wetaka,M., Makumbi,I., Dahlke,M., Borchert,J., Lutwama,J., Stroher,U., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Shoemaker,T.R., Whitmer,S.L.M., Nichol,S., Stroeher,U.
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Viral Special Pathogens Branch, The Centers for Disease Control and Prevention
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USA
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2017-11-17
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Marburg virus/H. sapiens-tc/UGA/2014/Kampala-812601
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,113
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GenBank
| 1
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Uganda
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Uganda
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Homo sapiens
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blood
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2014
| null | null |
Marburg marburgvirus isolate Marburg virus/H. sapiens-tc/UGA/2014/Kampala-812601, complete genome
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AGACACACAAAAACAAGAGATGATGATTTTGTGTATCATATAAATAAAGAAGAATATTAACATTGACATTGAGACTTGTCAGTCTGTTAATATTCTTGAAGAGATGGACTTACATAGTTTGTTAGAGTTGGGTACAAAACCTACTGCCCCTCATGTTCGTAATAAGAAGGTGATATTATTTGACACAAATCATCAGGTTAGTATTTGTAATCAGATAATAGATGCAATAAACTCAGGGATTGATCTTGGAGATCTTCTAGAAGGAGGTTTGCTGACTTTGTGTGTTGAACATTACTATAATTCTGATAAAGATAAATTCAACACAAGTCCTATCGCGAAATATTTACGTGATGCGGGCTATGAATTCGATGTCATCAAGAATGCAGATGCAACCCGCTTTCTGGATGTGATTCCCAATGAACCTCATTACAGTCCTTTAATTCTAGCCCTTAAGACATTAGAAAGTACTGAATCTCAGAGGGGGAGAATTGGGCTCTTCTTGTCATTTTGCAGTCTTTTTCTCCCAAAACTTGTCGTCGGAGACCGGGCTAGTATCGAAAAGGCTTTAAGACAAGTAACAGTACATCAAGAACAAGGGATTGTCACATACCCTAATCACTGGCTTACTACAGGTCATATGAAAGTAATTTTTGGTATTTTGAGGTCTAGCTTTATTTTAAAGTTTGTGTTGATTCATCAAGGAGTAAACTTGGTGACAGGTCATGATGCCTATGACAGTATCATCAGTAATTCAGTGGGTCAAACTAGATTCTCAGGACTTCTTATTGTGAAAACAGTTCTCGAGTTCATCTTGCAAAAAACTGATTCAGGGGTGACACTACATCCTTTGGTGCGGACCTCCAAAGTAAAAAATGAAGTTGCTAGTTTCAAGCAGGCGTTGAGCAACCTAGCCCGACATGGAGAATACGCACCATTTGCACGGGTTCTGAATTTATCAGGGATTAACAACCTCGAGCATGGACTCTATCCTCAGCTCTCAGCAATTGCGCTGGGTGTGGCAACAGCACACGGCAGCACATTGGCTGGTGTTAATGTCGGCGAACAATATCAGCAGCTACGAGAGGCGGCACATGATGCAGAGGTAAAACTACAAAGGCGACATGAACATCAGGAAATTCAAGCTATTGCCGAAGATGACGAGGAAAGGAAGATATTAGAACAGTTCCACCTTCAAAAAACTGAAATCACACACAGTCAGACACTTGCCGTCCTCAGCCAGAAACGAGAAAAATTAGCTCGTCTTGCTGCAGAAATTGAAAACAATATTGTGGAAGATCAGGGATTTAAACAATCACAGAATCGGGTGTCACAGTCATTTTTGAATGACCCTACACCTGTTGAAGTAACGGTTCAAGCCAGACCTGTGAATCGACCAACTGCTCTGCCTCCTCCAGTTGACGACAAAATTGAGCATGAATCTACAGGAGATAGCTCTTCTTCAAGTAGCTTTGTTGACTTGAATGATCCATTTGCACTGCTGAATGAGGACGAAGACACTCTTGATGACAGTGTCATGATCCCGAGCACAACATCGAGAGAATTTCAAGGGATTCCTGAATCACCAGGACAATCTCAGGACCTCGATAACAGCCAAGGAAAGCAGGAAGATGAATCAACAAACCCGATTAAAAAACAGTTTCTGAGATATCAAGAACTTCCTCCTGTTCAAGAAGATGATGAATCGGAATATACAACTGACTCTCAGGAGAGTATCGACCAGCCAGGATCCGACAATGAACAAGGAGTTGATCTTCCACCTCCTCCGTTGTACGCTCAGGAAAAAAGACAGGACCCAATACAGCACCCGGCAGCAAGCTCTCAGGATCCCTTTGGCAGTATTGGTGATGTAAATGGTGATATCTTAGAACCCATAAGATCACCTTCTTCACCATCTGCTCCCCAGGAAGACACAAGAGCAAGGGAAGCCTATGAATTATCGCCTGACTTTACAAATTATGAGGATAATCAGCAGAATTGGCCACAAAGAGTGGTGACAAAGAAGGGTAGGACTTTCCTTTATCCCAATGATCTCCTGCAGACAAGTCCTCCAGAATCACTTGTAACAGCCCTCGTCGAGGAATACCAAAATCCTGTCTCAGCCAAGGAGCTCCAAGCAGATTGGCCCGACATGTCATTTGACGAAAGGAGACATGTTGCTATGAACTTGTAGTCCAGATAACACAGTACGATTACCCATTTATCCACTCTGATACGAATTATCCCCAGATCATGGCAATCAAATCTATCTGAATATTCAAACCACTTTTTAATATCCTATTACTTGTTACTATTGTGTGAGACAGCATAAGCTATCAAATAACAAGCACGGGCAAGAACTGGGCACATGATGGTGATTTGAGAGCGCTGCCTAGTGCTACAAATTCTTCTTTTAATTACCATGATGATACAACTATAAACCTCCGTACATTTGCCTCAGTACTGTAATCAACACTGCTGTATCTCTTCTTCAAGCCATCTTATTTAACTTAATAAACATGACTTGATTCAGAGAATATGCTGAAAATGTTATTGATTGAACTTCTCAGATGGTGCACTATTCTACTGTTTTACTCAGCTTAGTATACCGCAACATATAAGTGGACTCTCAACCTCTCTCCTCGTGCATTTTCTATAAATCACTTACTCGATAGAATGACAAGTCTACAAGTTTGGAGTCTCCTTATTCTAATAAATGTAATAATTAACTGTTGGCTTAGAGAATAACAGGTATGAGATTGTATAATAACTTATAGTGTAGAGTGTAATTCTTACCTCTGTTTCTTCTGTTTTCCCTTCCCTTTATAATATGCCAATTAAGAAAAACTAAAAATTGAAGAATATTAAAGATTTTCTTTAATATTCAGAAAGGATTTTTTATTCTCTTCTCTCTTTTTACAAACATATTAAAATAATAATTCTCACAATGTGGGACTCATCATATATGCAACAAGTCAGCGAGGGGTTGATGACTGGAAAAGTTCCCATAGATCAAGTGTTCGGTGCCAACCCCTTAGAGAAGCTATACAAGAGAAGAAAACCAAAAGGCACAGTTGGACTACAATGTAGTCCTTGTCTAATGTCAAAGGCAACAAGCACCGATGATATTATTTGGGACCAACTGATCGTGAAGAAAACACTAGCTGACCTACTTATACCGATAAATAGGCAGATATCAGACATTCAAAGCACTCTAAGCGAAGTGGTAACAAGAGTTCATGAAATTGAGCGGCAATTACATGAGATTACCCCAGTTTTAAAAATGGGAAGGACACTGGAAGCAATTTCCAAGGGGATGTCAGAAATGTTGGCCAAATACGATCACCTTGTAATTTCAACTGGAAGAACCACTGCACCAGCTGCTGCCTTTGATGCTTACTTAAATGAGCATGGTGTCCCTCCCCCTCAACCCGCAATTTTCAAAGATCTCGGGGTTGCCCAACAAGCTTGTAGCAAGGGGACCATGGTAAAAAATGCAACAACAGATGCAGCCGACAAGATGTCGAAGGTTCTTGAACTCAGTGAGGAAACGTTCTCCAAGCCAAACCTCTCAGCTAAGGATTTAGCCCTTTTATTGTTCACCCATCTACCCGGTAATAACACTCCATTCCATATATTAGCTCAGGTCCTCTCAAAGATTGCTTACAAGTCAGGGAAATCCGGAGCGTTTTTGGATGCATTTCACCAGATTCTAAGTGAAGGAGAGAATGCTCAGGCGGCACTAACTCGACTAAGCAGAACGTTTGATGCTTTCCTCGGAGTGGTTCCTCCAGTGATAAGAGTCAAAAACTTCCAAACAGTCCCTCGCCCGTGTCAAAAAAGCCTTCGGGCTGTTCCTCCAAATCCAACAATTGACAAAGGATGGGTTTGTGTTTATTCATCTGAGCAAGGTGAAACACGGGCCCTTAAAATCTAATTCTTATTGTTCACAGTTGCAAGGGAAGTGATCTTCCCGAGTTAATACAAGGACACTAAACATTTCAAAAACATGTATGTGGGCAAAACGTAACTGGATCATCTTAATTGAAGTAGTAATTTATTTCTGTTTTAAATGTGATTTTAACTTTTAAAGGGTTAAATGGTGATAGATTAATCCTCAAGGTTACTCATTTATATATTATAGGGAAACTAATGTTACTAACAAGAGGGGTCTACCTAACGGATGTGATTGAGTGATCAGTATGTCTTATAAACCAAACAATTGACTTCTTACTTGTTATGAATCAGCTAACAACATAGAAAGCACATTTATCCTTATGTAATCCTCGGCTTAGCTGGAATTAACTTTTGTTGTAATTCAATACGCTTATTCATAGTATATTATATGATTTTTTATAAGTTTAAGATATTTTAAATCATACCCACAAAAGATATTGTTTTAATTAAGAAAAACTATGAAGAACATTAAGAAGATTTTTCTCTCATAGTGTTCTTCTATTGGAAGGAGTATTTCAATCTCAACTTGTTGGATTAATTATAACTTAAGTTGTCCCTTTTAAAATTAATTCACATAAGGTAGTTTAAATTTGTATCTAGAACAGATTTTAATATGGCCAGTTCTAGCAATTACAACACATACATGCAATACTTGAACCCTCCTCCTTATGCTGATCACGGTGCAAACCAGTTAATCCCGGCAGACCAGCTATCAAATCAGCATGGTATAACTCCAAATTATGTGGGCGATTTAAACTTAGATGACCAGTTTAAAGGGAATATCTGCCACGCTTTCACTTTAGAAGCGATAATTGACATATCTGCGTATAACGAGCGAACAGTCAAAGGTGTCCCAGCATGGCTGCCTCTTGGGATTATGAGCAATTTTGAATATCCTTTAGCTCATACTGTGGCTGCATTGCTCACAGGCAGCTATACAATCACCCAATTTACTCACAACGGGCAAAAATTTGTCCGTGTCAATCGACTCGGTACAGGAATCCCGGCACACCCACTCAGAATGTTGCGTGAAGGAAATCAAGCTT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| 73,742
|
KU059750.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Rossi,S.L., Forrester,N.L., Ksiazek,T., Guerbois,M., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2017-03-25
|
Uganda 200703648
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,097
|
GenBank
| null |
Uganda
|
Uganda
|
Homo sapiens
| null |
2007-01-01
|
SAMN04017538
|
PRJNA257008
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Orthomarburgvirus marburgense isolate Uganda 200703648, complete genome
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KU978782.1
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Orthomarburgvirus marburgense
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Rossi,S.L., Forrester,N.L., Ksiazek,T., Guerbois,M., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
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USA
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2017-03-25
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Angola prototype 20051379
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,094
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GenBank
| null |
Angola
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Angola
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Homo sapiens
| null |
2005-01-01
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SAMN04017537
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PRJNA257008
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Orthomarburgvirus marburgense isolate Angola prototype 20051379, complete genome
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Orthomarburgvirus marburgense
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Marzi,A., Banadyga,L., Haddock,E., Thomas,T., Shen,K., Horne,E.J., Scott,D.P., Feldmann,H., Ebihara,H.
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Rocky Mountain Laboratories, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Laboratory of Virology
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USA
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2016-12-28
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Marburg virus/H.sapiens-tc/AGO/2005/Angola-368
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,115
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GenBank
| 1
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Angola
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Angola
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Homo sapiens
| null |
2005
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense isolate Marburg virus/H.sapiens-tc/AGO/2005/Angola-368, complete genome
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| 78,866
|
KY047764.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Marzi,A., Banadyga,L., Haddock,E., Thomas,T., Shen,K., Horne,E.J., Scott,D.P., Feldmann,H., Ebihara,H., Dahlstrom,E., Anzick,S., Ricklefs,S., Porcella,S.
|
Rocky Mountain Laboratories, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Laboratory of Virology
|
USA
|
2016-12-28
|
Marburg virus/RML-IRF/M.auratus-lab/AGO/2005/Angola-368-HA
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,025
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Mesocricetus auratus
| null |
2013
| null | null |
Orthomarburgvirus marburgense isolate Marburg virus/RML-IRF/M.auratus-lab/AGO/2005/Angola-368-HA, complete genome
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KU179482.1
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Orthomarburgvirus marburgense
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Das,S.R., Shabman,R., Halpin,R.A., Akopov,A., Fedorova,N., Puri,V., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Brasel,T., Yun,N., Paessler,S., Dowling,W., Barrett,A.
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J. Craig Venter Institute
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USA
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2015-12-19
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Ravn virus/H. sapiens-tc/KEN/1987/Ravn-CDC811103
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,114
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GenBank
| null |
Kenya
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Kenya
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Homo sapiens
| null |
1987-08-19
| null |
PRJNA242964
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Orthomarburgvirus marburgense isolate Ravn virus/H. sapiens-tc/KEN/1987/Ravn-CDC811103, complete genome
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| 84,472
|
KR867677.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Wentworth,D.E., Shabman,R., Halpin,R.A., Lin,X., Akopov,A., Mohan,M., Fedorova,N., Tsitrin,T., Puri,V., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Gupta,N., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Brasel,T., Yun,N., Tigabu,B., Paessler,S., Barrett,A.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
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2015-06-02
|
Marburg virus/H.sapiens-tc/AGO/2005/Angola-200501379
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,113
|
GenBank
| null |
Angola: Uige
|
Angola
|
Homo sapiens
| null |
2005-03-13
| null |
PRJNA242964
|
Marburg marburgvirus isolate Marburg virus/H.sapiens-tc/AGO/2005/Angola-200501379, complete genome
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KR063674.1
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Orthomarburgvirus marburgense
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Das,S.R., Shabman,R., Halpin,R.A., Lin,X., Fedorova,N., Tsitrin,T., Puri,V., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Gupta,N., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Alfson,K., Wentworth,D.E., Griffiths,A.
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J. Craig Venter Institute
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USA
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2015-04-11
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Marburg virus/H.sapiens-tc/AGO/2005/Angola-810820
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,113
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GenBank
| null |
Angola
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Angola
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Homo sapiens
| null |
2005-03-13
| null |
PRJNA243089
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Marburg marburgvirus isolate Marburg virus/H.sapiens-tc/AGO/2005/Angola-810820, complete genome
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| 87,256
|
KM261523.1
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Qiu,X., Wong,G., Audet,J., Cutts,T., Niu,Y., Booth,S., Kobinger,G.P.
|
Public Health Agency of Canada, Special Pathogens
|
Canada
|
2014-08-30
|
NML/M.musculus-lab/AGO/2005/Ang-MA-P2
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,114
|
GenBank
| 1
|
Canada
|
Canada
| null | null |
2014-01-15
| null | null |
Marburg marburgvirus isolate NML/M.musculus-lab/AGO/2005/Ang-MA-P2, complete genome
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| 89,101
|
NC_005300.2
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Sanchez,A.J., Vincent,M.J., Nichol,S.T., Deyde,V.M., Khristova,M.L.
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Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch, DVRD, NCID
|
USA
|
2003-12-13
| null |
Orthonairovirus haemorrhagiae
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Orthonairovirus
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Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 5,366
|
RefSeq
| 1
|
Nigeria: Sokoto
|
Nigeria
|
Hyalomma excavatum
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus segment M, complete sequence
|
TCTCAAAGAAATACTTGCGGCACGTCAGTACGTAAGTGTTAACTTTGAGGAAGTGGATTGAGCATCTTAATTGCAGCATACCTGCTAACATCATGCATATATCATTAATGTATGCAATCCTTTGCCTACAGCTGTGTGGTCTGGGAGAGACTCATGGATCACACAATGAAACTAGACACAATAAAACAGACACCATGACAACACCCGGTGATAACCCGAGCTCTGAACCGCCAGTGAGCACGGCCTTGTCTATTACACTTGACCCCTCCACTGTCACACCCACAACACCAGCCAGTGGATTAGAAGGCTCAGGGGAAGTCTACACATCCCCTCCGATCACCACCGGGAGCTTGCCCCTGTCGGAGACAACACCAGAACTCCCTGTTACAACCGGCACAGACACCTTAAGCGCAGGTGATGTCGATCCCAGCACGCAGACAGCCGGAGGCACCTCCGCACCAACAGTCCGCACAAGTCTACCCAACAGCCCTAGCACACCATCTACACCACAAGACACACACCATCCTGTGAGAAATCTACTTTCAGTCACGAGTCCTGGGCCAGATGAAACATCAACACCCTCGGGAACAGGCAAAGAGAGCTCAGCAACCAGTAGCCCTCATCCAGTCTCCAACAGACCACCAACCCCTCCTGCAACAGCCCAGGGACCCACTGAAAATGACAGTCACAACGCCACTGAACACCCTGAGTCCCTGACACAGTCAGCAACCCCAGGCCTAATGACCTCTCCAACACAGATAGTCCACCCACAAAGTGCCACCCCCATAACCGTTCAAGACACACATCCCAGTCCAACGAACAGGTCTAAAAGAAACCTTAAGATGGAAATAATCTTGACTTTATCTCAGGGTTTAAAAAAGTACTATGGGAAAATATTAAGGCTTCTGCAACTCACCTTAGAGGAGGACACTGAAGGTCTACTGGAATGGTGTAAGAGAAATCTTGGTCTTGATTGTGATGACACTTTCTTTCAAAAGAGAATTGAAGAATTCTTTATAACTGGTGAGGGCCATTTTAATGAAGTTTTACAATTTAGAACGCCAGGCACGTTGAGCACCACAGAGTCAACACCTGCTGGGCTGCCAACAGCTGAACCTTTTAAGTCCTACTTCGCCAAAGGATTCCTCTCGATAGATTCAGGTTACTACTCAGCCAAATGTTACTCAGGAACATCCAATTCAGGGCTTCAATTGATTAACATTACCCGACATTCAACTAGAATAGTTGACACACCTGGGCCTAAGATCACTAACCTAAAGACCATCAACTGCATAAACTTGAAGGCATCGATCTTCAAAGAACATAGAGAGGTTGAAATCAATGTGCTTCTCCCCCAAGTTGCAGTTAATCTCTCAAACTGTCACGTTGTAATCAAATCACATGTCTGTGACTACTCTTTAGACATTGACGGTGCGGTGAGGCTTCCTCACATTTACCATGAAGGAGTTTTCATCCCAGGAACTTACAAAATAGTGATAGATAAAAAAAATAAGTTGAATGACAGATGCACCTTATTTACCGACTGTGTGATAAAAGGAAGGGAGGTTCGTAAAGGACAGTCAGTTTTGAGGCAGTACAAGACGGAAATCAGGATTGGCAAGGCATCAACCGGCTCTAGAAGATTGCTTTCAGAAGAACCCAGTGATGACTGTATATCAAGAACTCAACTATTAAGGACAGAGACTGCAGAGATCCACGGCGACAACTATGGTGGCCCGGGTGACAAAATAACCATCTGCAATGGCTCAACTATTGTAGACCAAAGACTGGGCAGTGAACTAGGATGCTACACCATCAATAGAGTGAGGTCATTCAAGCTATGCGAAAACAGTGCCACAGGGAAGAATTGTGAAATAGACAGTGTCCCAGTTAAATGCAGGCAGGGTTATTGCCTAAGAATCACTCAGGAAGGGAGGGGCCACGTAAAATTATCTAGGGGCTCAGAGGTTGTCTTAGATGCATGCGATACAAGCTGTGAAATAATGATACCTAAGGGCACTGGTGACATCCTAGTTGACTGTTCAGGTGGGCAGCAACATTTTCTAAAGGACAATTTGATAGATCTAGGATGCCCCAAAATTCCATTATTGGGCAAAATGGCTATTTACATTTGCAGAATGTCAAACCACCCCAAAACAACCATGGCTTTCCTCTTCTGGTTCAGCTTTGGCTATGTAATAACCTGCATACTTTGCAAGGCCATTTTTTACTTGTTAATAATTGTTGGAACACTAGGGAAAAGGCTCAAGCAGTATAGAGAGTTGAAACCTCAGACTTGCACCATATGTGAGACAACTCCTGTAAATGCAATAGATGCTGAGATGCATGACCTCAATTGCAGTTACAACATTTGTCCCTACTGTGCATCTAGACTAACCTCAGATGGGCTTGCTAGGCATGTGATACAATGCCCTAAGCGGAAGGAGAAAGTGGAAGAAACTGAACTGTACTTGAACTTAGAAAGAATTCCTTGGGTTGTAAGAAAGCTGTTGCAGGTGTCAGAGTCAACTGGTGTGGCATTGAAAAGAAGCAGTTGGCTGATTGTGCTGCTTGTGCTATTCACTGTTTCATTATCACCAGTTCAATCAGCACCCATTGGTCAAGGGAAGACAATTGAGGCATACCGGGCCAGGGAAGGGTACACAAGTATATGCCTCTTTGTACTAGGAAGTATCCTATTTATAGTTTCTTGCCTAATGAAAGGGCTGGTTGACAGTGTTGGCAACTCCTTCTTCCCTGGACTGTCCATTTGCAAAACGTGCTCCATAAGCAGCATTAATGGCTTTGAAATTGAGTCCCATAAGTGCTATTGCAGCTTATTCTGTTGCCCCTATTGTAGGCACTGCTCTACCGATAAAGAAATTCATAAGCTGCACTTGAGCATCTGCAAAAAAAGGAAAAAAGGAAGTAATGTCATGTTGGCTGTCTGCAAGCTCATGTGTTTCAGGGCCACCATGGAAGTAAGTAACAGAGCCCTGTTTATCCGTAGCATCATCAACACCACTTTTGTTTTGTGCATACTGATACTAGCAGTTTGTGTTGTTAGCACCTCAGCAGTGGAGATGGAAAACCTACCAGCAGGGACCTGGGAAAGAGAAGAAGACCTAACAAATTTCTGTCATCAGGAATGCCAGGTTACAGAGACTGAATGCCTCTGCCCTTATGAAGCTCTAGTACTCAGAAAGCCTTTATTCCTAGATAGTACAGCTAAAGGCATGAAAAATCTGCTAAATTCAACAAGTTTAGAAACGAGTTTATCAATTGAGGCACCATGGGGAGCAATAAATGTTCAGTCAACCTACAAACCAACTGTGTCAACTGCAAACATAGCACTCAGTTGGAGCTCAGTGGAACACAGAGGCAATAAGATCTTGGTTTCAGGCAGATCAGAATCAATTATGAAGCTGGAAGAAAGGACAGGAATCAGCTGGGATCTCGGTGTAGAAGATGCCTCTGAATCTAAACTGCTTACAGTATCTGTCATGGACTTGTCTCAGATGTACTCTCCTGTCTTCGAGTACTTATCAGGGGACAGACAGGTGGGAGAGTGGCCCAAAGCAACTTGCACAGGTGACTGCCCAGAAAGATGTGGCTGCACATCATCAACCTGTTTGCACAAAGAATGGCCTCACTCAAGAAATTGGAGATGCAATCCCACTTGGTGCTGGGGTGTAGGGACTGGCTGCACCTGTTGTGGATTAGATGTGAAAGACCTTTTTACAGATTATATGTTTGTCAAGTGGAAAGTTGAATACATCAAGACAGAGGCCATAGTGTGTGTAGAACTTACTAGTCAGGAAAGGCAGTGTAGCTTGATTGAAGCGGGCACAAGGTTCAATTTAGGTCCTGTGACCATCACACTGTCAGAACCAAGAAACATCCAACAAAAACTCCCTCCTGAAATAATCACACTGCATCCTAGGATCGAAGAAGGTTTTTTTGACCTGATGCATGTGCAAAAGGTGTTATCGGCAAGCACAGTGTGTAAGTTGCAGAGTTGCACACATGGTGTGCCAGGAGACCTACAGGTCTACCACATCGGAAATTTATTAAAAGGGGATAAGGTAAATGGACATCTAATTCATAAAATTGAGCCACACTTCAACACCTCCTGGATGTCCTGGGATGGTTGTGACCTAGACTACTACTGCAACATGGGAGATTGGCCTTCTTGCACATACACAGGGGTCACCCAACACAATCATGCTTCATTTGTAAACTTACTCAACATTGAAACTGATTACACAAAGAACTTCCACTTTCACTCTAAAAGGGTCACTGCACACGGAGATACACCACAACTAGATCTTAAGGCAAGACCAACCTATGGTGCAGGCGAGATCACTGTTCTGGTAGAAGTTGCTGACATGGAGTTACATACAAAGAAGATTGAAATATCAGGCTTAAAATTTGCAAGCTTAGCTTGCACAGGTTGTTATGCTTGTAGCTCTGGCATCTCATGCAAAGTTAGAATTCATGTGGATGAACCAGATGAACTTACAGTACATGTTAAAAGTGATGATCCAGATGTGGTTGCAGCTAGCTCAAGTCTCATGGCAAGGAAGCTTGAATTTGGAACAGACAGTACATTTAAAGCTTTCTCGGCCATGCCTAAAACTTCTCTATGTTTCTACATTGTTGAAAGAGAACACTGTAAGAGCTGCAGTGAAGAAGACACAAAAAAATGTGTTAACACAAAACTTGAGCAACCACAAAGCATTTTGATCGAACACAAGGGAACTATAATCGGAAAGCAAAACAGCACTTGCACGGCTAAGGCAAGTTGCTGGTTAGAGTCAGTCAAGAGTTTTTTTTATGGCCTAAAGAACATGCTTAGTGGCATTTTTGGCAATGTCTTTATGGGCATTTTCTTGTTCCTTGCCCCCTTCATCCTGTTAATACTATTCTTTATGTTTGGGTGGAGGATCCTATTCTGCTTTAAATGTTGTAGAAGAACCAGAGGCCTGTTCAAGTATAGA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| 8,427
|
NC_005301.3
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Kinsella,E., Martin,S.G., Grolla,A., Czub,M., Feldmann,H., Flick,R.
|
Canadian Science Center for Human and Animal Health, Special Pathogens
|
Canada
|
2003-12-13
| null |
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,108
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus segment L, complete sequence
|
TCTCAAAGATATCAATCCCCCCGTTACCCACGTTAACACAGAGAGCTCTAGTAGTGGTCTTTCCTTTTGTGAAACCATGGACTTCTTGAGAAGCCTTGACTGGACTCAAGTGATTGCTGGTCAATATGTGTCCAACCCTAGGTTCAACATTTCTGATTATTTTGAGATTGTGCGGCAGCCTGGTGATGGGAACTGCTTCTATCACAGCATAGCTGAGTTAACCATGCCTAACAAAACAGATCACTCATATCATTACATCAAACGCCTAACCGAGTCGGCAGCACGGAAGTATTACCAAGAGGAGCCTGAAGCCAGACTTGTTGGCCTGAGCCTGGAAGATTACCTCAAGAGGATGCTGTCTGACAACGAGTGGGGATCAACTCTAGAAGCATCTATGTTGGCTAAAGAAATGGGCATTACCATCATCATTTGGACTGTTGCTGCCAGTGATGAAGTGGAAGCAGGTATAAAGTTCGGAGACGGTGATGTGTTTACAGCTGTGAACCTTTTGCACTCTGGACAAACACACTTTGATGCGCTCAGAATACTTCCGCAGTTTGAAACAGACACAAGAGAGGCCTTGAGCTTGATGGACAGGGTTATAGCTGTGGATCAGTTGACATCATCTTCTAGTGATGAACTGCAAGACTATGAAGACCTTGCCTTGGCACTCACAAGCGCAGAAGAATCAAATAGACGGTCAAGCTTGGATGAGGTCACATTGTCCAAGAAGCAAGCAGAGATACTAAGGCAAAAAGCATCTCAGTTGTCTAAATTGGTTAATAAAAGTCAGAACATACCGACCAGAGTCGGTAGAGTCTTGGATTGCATGTTCAACTGCAAATTATGTGTTGAGATATCAGCTGACACTTTAATTCTGAGGCCAGAATCAAAAGAGAAAATCGGTGAAATCATGTCATTGCGGCAGTTGGGGCATAAACTGCTGACACGAGACAAACAGATTAAGCAAGAGTTCTCCAGAATGAAACTCTACGTCACTAAAGATTTGCTTGACCATCTAGACGTTGGTGGGCTCTTGAGGGCTGCTTTCCCTGGAACAGGAATAGAAAGGCATATGCAGCTGCTACACTCTGAGATGATACTGGACATCTGCACTGTATCACTTGGTGTCATGCTGTCAACATTCTTATATGGTTCTAATAATAAAAACAAGAAGAAATTCATTACCAACTGTCTGCTCAGCACAGCCCTATCCGGAAAGAAGGTGTATAAAGTTCTCGGCAACCTAGGAAATGAACTGTTGTACAAGGCACCTAGAAAGGCCTTAGCAACTGTCTGCAGTGCCTTGTTTGGGAAGCAGATAAACAAACTTCAGAATTGCTTCAGGACCATAAGCCCTGTCAGCTTACTTGCATTGAGAAATCTAGACTTTGATTGTCTCAGTGTGCAAGACTATAATGGTATGATAGAAAACATGTCTAAATTAGACAACACTGATGTTGAATTCAACCACAGGGAGATAGCTGATCTCAACCAATTAACTTCTCGGCTCATCACATTAAGAAAGGAGAAAGACACTGACCTCCTCAAACAATGGTTTCCTGAAAGTGACCTCACCCGCAGAAGCATCAGGAATGCTGCAAACGCGGAGGAATTTGTCATATCTGAGTTCTTTAAGAAGAAGGACATTATGAAATTCATCAGCACTTCAGGCAGAGCAATGAGTGCAGGCAAGATTGGTAATGTCCTATCCTATGCACATAATCTTTATTTGAGTAAGTCAAGCCTAAATATGACCTCTGAAGACATCTCACAGCTTTTGATCGAGATTAAGCGACTGTATGCTTTACAAGAAGATTCTGAAGTGGAGCCGATAGCCATAATTTGTGATGGCATAGAAAGCAACATGAAACAGTTATTTGCTATATTGCCTCCTGACTGTGCAAGAGAGTGTGAAGTCCTCTTCGATGACATAAGAAATTCTCCAACACACAGCACAGCCTGGAAGCATGCACTCCGATTAAAAGGGACTGCATACGAAGGTCTGTTTGCAAATTGTTACGGCTGGCAATACATTCCGGAAGACATTAAACCAAGCCTGACCATGTTGATACAGACTTTGTTTCCTGACAAGTTCGAAGATTTCCTGGATCGAACCCAGTTGCATCCGGAGTTCAGAGACCTGACTCCCGACTTTTCGCTCACACAAAAGGTTCACTTTAAAAGAAATCAGATACCCAGTGTCGAAAATGTGCAAATCTCCATTGATGCGACGTTGCCTGAATCTGTGGAAGCAGTACCAGTGACAGAAAGAAAGATGTTCCCCCTTCCTGAGACTCCGCTAAGTGAGGTGCATTCAATAGAGCGTATAATGGAAAACTTTACTCGCCTCATGCATGGAGGAAGACTTTCGACCAAGAAAAGAGATGGAGATCCGGCGGAACAGGGCAACCAGCAGAGTATCACTGAACACGAGAGTTCCAGCATCTCTGCCTTTAAAGACTACGGAGAGAGAGGGATAGTCGAGGAAAATCACATGAAGTTTAGTGGAGAAGATCAGCTAGAGACAAGGCAGCTGTTGTTGGTGGAAGTTGGTTTTCAAACTGACATCGATGGGAAAATAAGGACAGACCACAAGAAGTGGAAAGACATATTAAAGCTATTAGAGCTACTAGGAATCAAGTGCTCATTCATTGCCTGTGCAGATTGCTCATCCACACCACCAGACAGATGGTGGATTACGGAGGACAGAGTGCGAGTCCTAAAAAATTCAGTCAGCTTCTTGTTCAATAAACTCTCCAGAAACTCACCTACAGAAGTAACTGACATAGTTGTTGGAGCTATAAGTACTCAAAAGGTTAGAAGTTATCTAAAGGCAGGAACTGCAACAAAAACCCCTGTGTCGACTAAAGACGTTCTGGAGACTTGGGAAAAGATGAAGGAGCACATACTCAACAGACCAACAGGACTGACACTGCCCACCAGTTTGGAACAGGCAATGCGCAAAGGACTGGTCGAAGGTGTGGTCATCTCCAAGGAAGGTTCTGAGTCATGTATCAATATGTTGAAGGAAAATTTGGACCGAATAACTGACGAATTCGAGCGAACAAAATTTAAACATGAACTTACTCAGAATATTACCACAAGTGAGAAGATGCTATTGAGTTGGTTGAGTGAAGACATCAAATCATCGAGATGTGGTGAGTGCCTCTCAAATATAAAGAAAGCCGTTGATGAAACTGCCAATCTATCAGGAAAGATTGAGCTGCTCGCTTATAATCTGCAACTCACCAATCACTGCAGCAACTGTCACCCCAATGGTGTAAACATTAGTAACACTTCTAATGTGTGCAAGAGATGCCCCAAGATTGAAGTGGTTAGCCATTGTGAAAATAAAGGCTTTGAGGACAGCAATGAATGCTTAACAGACCTAGATAGGCTTGTTAGGCTCACATTACCAGGGAAAACTGAGAAGGAGAGAAGAGTCAAACGTAATGTGGAATATCTTATAAAACTGATGATGAGCATGTCAGGCATTGATTGTATAAAATATCCCACAGGGCAGCTTATCACCCATGGAAGAGTGAGTGCAAAACATAACGATGGGAACCTGAAAGATAGAAGCGATGACGACCAAAGACTAGCTGAGAAGATAGACACTGTTAGGAAAGAGCTTTCAGAATCTAAACTGAAAGATTATTCAACTTATGCAAGGGGAGTGATATCAAATTCACTAAAAAACCTCTCAAGGCAAGGTAAATCAAAGTGTTCTGTGCCAAGATCTTGGCTCGAGAAAGTACTGTTTGACCTGAAGGTGCCTACTAAGGACGAAGAAGTGCTTATAAACATCAGAAACTCATTGAAAGCTAGATCCGAGTTTGTTAGAAATAACGATAAACTACTCATAAGGTCAAAAGAAGAACTAAAAAAATGTTTCGATGTGCAGTCTTTTAAATTGAAAAAAAACAAGCAACCTGTGCCCTTTCAGGTTGACTGTATATTGTTCAAAGAAGTGGCAGCTGAATGCATGAAGAGGTACATTGGCACACCTTATGAGGGAATTGTAGACACCTTAGTTTCTCTGATTAATGTGTTAACAAGGTTTACTTGGTTCCAGGAAGTGGTGCTATATGGTAAAATATGTGAGACCTTCCTCAGATGCTGCACAGAATTTAATAGGTCAGGGGTCAAACTGGTTAAGATAAGGCACTGTAACATTAACCTATCAGTCAAATTGCCATCAAATAAGAAAGAGAATATGTTATGTTGTCTATATAGTGGAAACATGGAGCTCTTGCAAGGACCTTTCTATTTGAACAGGAGACAAGCTGTCCTTGGTTCTTCATACCTTTACATTGTCATTACACTTTACATACAAGTGCTGCAGCAGTACAGGTGTCTAGAAGTTATAAACAGTGTGAGTGAAAAAACATTGCAAGACATTGAAAATCATTCCATGACTCTACTAGAAGATTCATTCAGGGAAATCACTTTTGCTCTTGAAGGTAGGTTTGAAGAATCTTATAAAATACGAACCTCGAGGTGCAGAGCCAGTGGGAATTTTCTGAACAGGAGCAGTAGAGACCACTTTATAAGCGTTGTTTCAGGCTTGAACCTAGTTTATGGCTTCCTCATAAAAGATAACTTACTAGCCAACTCTCAGCAACAGAACAAACAACTACAGATGCTTCGTTTTGGCATGCTTGCAGGGCTTAGTAGGCTTGTTTGTCCTAATGAGCTAGGAAAGAAATTTTCAACGAGCTGTAGAAGAATTGAAGACAACATTGCAAGGCTTTACCTGCAGACATCCATTTACTGTTCAGTCAGGGATGTGGAGGACAATGTTAAGCACTGGAAACAAAGAGATCTATGTCCTGAAGTAACCATTCCATGCTTTACAGTCTATGGAACCTTTGTCAACAGCGATAGACAACTGATCTTTGACATTTACAATGTGCATATATATAATAAAGAAATGGACAACTTTGATGAAGGATGTATCAGCGTCTTGGAAGAAACAGCAGAAAGGCACATGCTTTGGGAACTCGATCTGATGAATTCACTTTGTTCTGACGAAAAAAAAGATACTAGACCCGCAAGACTTTTACTAGGCTGCCCAAATGTGAGGAAAGCAGCAACCAGAGAAGGGAAGAAGCTGTTGAAGTTAAACAGTGACACATCCACAGACACACAGAGCATTGCTTCTGAAGTGTCGGACAGAAGGTCTTATAGTTCAAGTAAGAGTAGAATCCGTAGTATATTTGGTAGATACAACTCTCAGAAGAAACCATTTGAATTAAGGTCAGGTCTTGAGGTTTTCAATGATCCTTTCAATGATTATCAGCAAGCAATAACGGACATTTGCCAATTTTCTGAGTACACACCAAACAAAGAAAGCATTTTGAAAGACTGTCTTCAAATCATACGAAAAAACCCTAGCCACACAATGGGTTCTTTTGAGCTGATCCAGGCAATCTCAGAGTTCGGCATGAGCAAGTTTCCTCCCGAAAATATAGACAAAGCAAGAAGGGATCCGAAGAACTGGGTTAGCATCTCTGAAGTAACCGAAACAACAAGTATAGTTGCATCACCTAGAACTCATATGATGCTCAAGGATTGTTTTAAAATTATACTAGGTACTGAGAATAAGAAGATAGTCAAAATGCTTCGAGGTAAGCTAAAGAAACTCGGTGCTATCTCAACAAACATAGAGATCGGGAAAAGGGATTGCCTAGATCTACTCAGCACAGTAGATGGGCTAACAGACCAGCAGAAAGAAAATATTGTAAATGGGATATTTGAGCCCTCAAAGTTATCCTTCTACCATTGGAAGGAACTGGTCAAAAAAAACATTGATGAAGTTTTACTAACTGAAGATGGAAATCTGATCTTCTGCTGGCTGAAAACAATCTCTTCTTCAGTCAAAGGAAGCCTAAAGAAGAGACTCAAATTCATGAATATACATTCTCCAGAATTGATGCCGGAAAACTGTCTCTTTTCTAGTGAGGAATTCAATGAGTTAATTAAGTTGAAGAAACTCCTCCTCAATGAACAACAAGATGAACAGGAGCTGAAACAAGATCTTTTGATATCTTCTTGGATCAAGTGCATAACAGCTTGCAAGGATTTTGCAAGCATCAATGACAAGATTCAGAAGTTCATTTACCACCTGTCTGAAGAGCTATATGACATAAGGCTGCAGCATCTGGAACTGTCAAAGCTTAAGCAAGAGCACCCTAGTGTCAGCTTCACAAAAGAAGAAGTCTTAATAAAGCGGCTGGAGAAAAATTTCCTTAAGCAGCATAATTTAGAGATTATGGAAACTGTGAATCTTGTATTCTTTGCAGCCCTCTCAGCTCCCTGGTGCTTACACTATAAAGCACTAGAGTCTTATTTGGTGAGACATCCAGAAATACTTGACTGTGGATCTAAGGAGGACTGCAAACTCACCTTGCTTGATCTGTCAGTTTCTAAGCTCTTGGTTTGTTTGTATCAAAAAGATGATGAGGAGCTGATAAATAGCTCAAGTTTGAAACTTGGGTTTTTAGTGAAATATGTTGTCACCTTGTTCACATCCAATGGTGAACCTTTTTCACTCAGTCTCAATGACGGGGGTTTGGATCTTGATTTACACAAGACTACTGACGAAAAGTTACTACATCAAACAAAGATAGTTTTTGCTAAAATTGGTTTATCTGGGAACAGTTATGACTTTATCTGGACTACCCAAATGATAGCAAACAGCAATTTTAACGTCTGCAAAAGATTAACGGGAAGGAGTACTGGGGAAAGGCTCCCTAGAAGCGTTAGAAGCAAGGTCATATATGAGATGGTAAAATTAGTGGGAGAAACAGGCATGGCAATACTACAACAATTAGCTTTTGCACAAGCACTAAATTATGAGCACCGCTTCTATGCGGTCTTAGCACCTAAAGCGCAACTAGGAGGAGCAAGAGATTTGTTAGTGCAAGAGACTGGGACTAAAGTCATGCATGCAACCACTGAAATGTTTAGTAGAAATCTTTTAAAAACAACATCAGATGATGGCCTCACAAACCCACATCTTAAAGAAACAATCCTTAATGTGGGATTAGACTGTCTTGCTAACATGCGAAATCTTGACGGTAAGCCCATAAGTGAAGGTAGTAACTTGGTCAATTTCTACAAAGTCATATGTATCTCGGGTGATAATACCAAGTGGGGCCCGATACACTGCTGTTCTTTCTTTTCTGGCATGATGCAACAGGTTCTGAAAAATGTACCAGATTGGTGTTCATTTTATAAATTAACATTCATTAAAAACTTATGTAGACAGGTAGAAATACCTGCTGGCAGTATTAAGAAGATCTTAAATGTTCTTAGGTATAGATTGTGCAGCAAGGGAGGTGTAGAACAACATAGTGAAGAAGATCTGAGAAGACTGTTGACAGATAATTTAGACAGTTGGGATGGAAACGACACAGTTAAGTTCTTAGTTACAACTTATATAAGCAAAGGACTCATGGCGTTAAACAGTTACAATCATATGGGTCAGGGTATTCACCATGCAACATCTTCGGTGTTAACTTCCCTAGCTGCTGTGCTCTTTGAGGAGCTGGCAATTTTTTATCTTAAGAGAAGCTTACCCCAGACAACAGTACATGTTGAACATGCCGGTAGTTCAGATGATTACGCAAAGTGTATAGTGGTGACTGGTATACTATCCAAAGAGCTCTACTCCCAGTATGATGAAACATTTTGGAAACACGCTTGCAGACTCAAAAACTTCACGGCCGCGGTACAAAGATGCTGTCAAATGAAAGATAGTGCCAAAACCTTGGTGAGCGACTGCTTTCTCGAGTTTTACAGTGAGTTTATGATGGGCTACAGAGTAACCCCTGCTGTAATAAAGTTCATGTTTACTGGACTGATAAACAGCTCTGTGACCTCTCCTCAGAGTTTGATGCAAGCATGCCAAGTTTCATCCCAACAAGCAATGTATAATAGTGTTCCTCTTGTCACCAACACTGCCTTCACCCTATTAAGGCAGCAAATTTTCTTTAACCATGTTGAAGACTTTATCAGAAGGTATGGTATACTGACTCTTGGGACTTTGTCACCCTTTGGTAGGTTGTTCGTACCAACCTACTCTGGATTAGTCAGCTCAGCGGTTGCTTTAGAAGATGCTGAAGTCATTGCTAGAGCAGCCCAAACACTTCAAATGAACAGTGTGTCAATACAGTCAAGTAGCTTGACCACATTAGATAGCCTAGGTCGTAGTAGGACAAGTTCCACAGCTGAGGATAGCAGCAGTGTGAGCGACACAACTGCTGCTTCCCATGACTCAGGATCATCATCCTCAAGCTTCTCTTTTGAGCTCAATAGACCCCTGTCTGAAACTGAACTACAGTTCATTAAAGCACTAAGTAGTCTCAAGTCAACACAAGCCTGTGAAGTGATTCAAAATAGAATTACAGGTCTTTATTGCAACAGCAACGAAGGACCTCTTGATAGGCATAATGTCATTTACAGCAGCAGAATGGCAGACTCTTGCGATTGGCTAAAGGATGGTAAAAGGAGAGGGAATCTAGAACTAGCGAATAGGATCCAATCTGTACTGTGTATTCTGATAGCAGGATATTACAGGTCATTTGGAGGGGAAGGAACCGAGAAACAGGTAAAGGCATCATTGAATAGAGACGACAATAAAATCATAGAGGATCCTATGATACAACTAATTCCAGAAAAGCTGAGGAGAGAGTTAGAAAGGTTAGGTGTTTCTAGAATGGAAGTCGATGAGCTAATGCCAAGCATTAGTCCTGATGACACCTTAGCCCAGCTTGTAGCGAAAAAACTCATTAGCCTCAATGTTTCGACAGAAGAATACTCAGCTGAGGTATCTAGACTCAAACAAACACTGACAGCCCGAAATGTTTTGCACGGGTTAGCTGGAGGGATTAAGGAGCTTTCGCTTCCAATATATACAATATTCATGAAATCTTACTTCTTTAAAGACAATGTTTTCCTGTCACTAACAGATAGATGGTCTACCAAGCACAGTACAAACTATCGTGATAGTTGTGGCAAACAATTAAAAGGTAGAATAATTACCAAGTATACTCACTGGTTGGACACTTTTCTGGGCTGCTCTGTCTCCATCAACAGGCATACTACTGTTAAAGAGCCCTCCTTATTCAATCCGAACATCAGATGTGTGAATCTGATCACATTTGAGGACGGCCTGAGAGAACTATCAGTGATACAGAGTCACCTTAAAGTCTTTGAAAATGAGTTCACCAACTTAAATCTTCAATTCTCTGATCCGAACAGACAGAAACTTAGAATAGTTGAGTCTAGACCTGCAGAATCTGAGCTAGAGGCAAACCGTGCAGTAATTGTCAAGACCAAATTGTTTTCAGCAACTGAACAAGTTCGACTATCCAACAACCCTGCAGTTGTCATGGGCTACCTATTGGATGAATCAGCAATTTCAGAAGTCAAGCCTACCAAGGTTGACTTCTCAAATTTACTTAAAGACCGCTTCAAAATAATGCAATTTTTTCCTTCAGTGTTCACTTTGATTAAGATGCTGACAGATGAATCGTCAGATTCAGAAAAGAGTGGCCTTAGTCCAGATTTGCAACAAGTTGCAAGATACTCAAACCATTTGACCTTGCTCAGCAGAATGATTCAACAAGCAAAGCCAACCGTGACTGTTTTCTACATGCTAAAAGGTAACTTGATGAACACAGAGCCAACAGTTGCTGAGCTTGTCAGCTATGGTATAAAGGAAGGCAGATTTTTTAGGCTTTCCGACACCGGAGTCGATGCAAGCACATACTCTGTAAAATATTGGAAAATTCTTCACTGCATCTCTGCCATTGGATGTTTACCTTTGAGTCAAGCAGACAAATCTTCACTACTTATGAGCTTCTTAAACTGGAGGGTCAACATGGACATTAGAACATCTGACTGTCCACTATCTAGTCATGAAGCAAGTATACTGAGTGAATTTGATGGACAAGTTATCGCCAACATACTTGCCAGTGAATTGAGTTCTGTGAAACGAGATTCTGAACGCGAGGGTCTAACTGATCTCCTTGATTATCTAAACTCACCAACTGAATTGTTGAAGAAGAAGCCTTACTTAGGGACAACTTGCAAGTTCAACACCTGGGGAGACTCGAATAGATCTGGAAAGTTCACATACAGCAGCAGATCTGGAGAATCCATTGGAATCTTCATTGCAGGGAAATTGCACATCCATCTCTCATCTGAGTCCGTTGCCTTGTTGTGTGAAACTGAAAGACAAGTGCTTTCTTGGATGAGTAAGAGGAGGACTGAGGTAATAACTAAAGAACAGCATCAACTGTTTCTAAGTCTTCTCCCACAGTCTCATGAGTGTTTACAAAAGCACAAGGACGGTAGTGCGCTATCAGTCATACCTGATAGCAGCAACCCCCGATTACTTAAGTTTGTGCCCCTCAAAAAAGGTCTAGCAGTGGTGAAAATCAAAAAACAAATTTTAACAGTGAAGAAGCAGGTTGTGTTTGATGCAGAGAGCGAGCCTAGACTGCAGTGGGGGCATGGCTGCTTGTCCATTGTTTATGACGAAACTGATACTCAGACCACATACCATGAAAATCTTTTGAAGGTGAAGCATCTTGTAGACTGCTCTACAGATAGAAAAAAGCTTTTGCCCCAGTCAGTGTTTTCTGACTCCAAAGTTGTCCTTTCAAGGATCAAGTTCAAGACGGAGCTTCTCCTCAACTCATTGACGCTGCTCCACTGTTTCCTAAAACATGCTCCTAGTGATGCCATAATGGAGGTAGAGAGCAAAAGTAGCTTGCTACACAAGTACCTCAAATCGGGAGGTGTCAGGCAACGGAACACTGAAGTGCTCTTCAGAGAGAAGTTAAACAAGGTTGTTATAAAAGACAATCTTGAGCAAGGTGTGGAAGAGGAGATTGAGTTTTGCAACAACTTGACTAAGACTGTTTCAGAGAACCCATTACCACTCAGCTGTTGGTCTGAAGTTCAAAATTACATTGAAGACATAGGCTTTAACAATGTACTTGTTAACATTGACAGAAACACGGTGAAAAGTGAACTTTTATGGAAATTTACGTTAGACACCAATGTAAGCACCACAAGTACTATAAAAGACGTGAGGACATTGGTGTCCTACGTTAGCACTGAAACCATCCCTAAGTTCTTGCTTGCATTCTTACTTTATGAAGAAGTGTTAATGAACTTAATCAACCAGTGTAAGGCAGTAAAAGAACTCATCAACAGCACAGGACTCTCAGACTTGGAACTGGAAAGCTTACTCACTTTATGTGCTTTCTATTTCCAAAGTGAGTGCAGTAAGAGAGATGGTCCTAGATGCTCCTTTGCAGCACTATTAAGTCTAATCCATGAGGATTGGCAGAGGATAGGTAAAAACATTCTTGTTCGTGCAAACAATGAACTAGGTGATGTGTCACTGAAGGTTAACATTGTCCTGGTGCCTCTCAAGGACATGTCTAAGCCAAAGTCTGAGAGAGTGGTCATGGCTAGAAGGTCACTAAATCATGCTCTATCCTTGATGTTTCTGGACGAGATGTCACTACCTGAGCTAAAATCCTTATCCGTGAACTGCAAAATGGGGAACTTTGAAGGGCAGGAGTGCTTTGAGTTCACTATTCTGAAGGACAATAGCGCAAGACTAGATTACAACAAGTTGATTGACCACTGTGTGGACATGGAAAAAAAGAGGGAAGCGGTTAGAGCAGTAGAAGATTTAATTTTGATGTTGACAGGCAGAGCAGTCAAACCCAGCGCTGTAACACAGTTTGTACACGGGGACGAGCAGTGTCAAGAGCAAATAAGCTTAGATGATCTGATGGCAAACGACACGGTAACAGACTTTCCTGATAGGGAAGCAGAAGCCCTCAAAACAGGAAATCTTGGCTTTAACTGGGACTCAGATTGAACATGCCGCTTATAAGCCATTAATACCTTTCGGCGTCACAAGGACAAATGATGCAGTTTTAGCTGCATCATTCATTAACATTAAAGCCTTCAAACAAGCTAACTACTCTGCATTCTCCTCAATCAACTCAATTGCTTCAACTGATCTATTTTACTAGCTCATCGATCCTCTCTTTCTTAGCTATATCTTTGAGA
| 8,428
|
OR964921.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-31/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,158
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-05-01
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-31/2023 segment L, complete sequence
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| 9,986
|
OR964922.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
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2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-96/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,147
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-07-03
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-96/2023 segment L, complete sequence
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CAATCCCCCCTTTACCCACATTGACACAGATAGCTCCAGTAGTGGTTCTTTGTCCTCATTAAACCATGGACTTTTTAAGAAACCTTGACTGGACTCAGGTGATTGATGGTCAGTATGTGACCAACCCCAGGTTCAACATTTCCGATTACTTTGAGATTGTGCGGCAGCCTGGTGATGGGAACTGCTTCTATCACAGTATAGCTGAGTTAACCATGCCCAACAAAACAGATCACTCATACCACAACATCAAACATCTAACTGAGGTGGCAGCACGGAAGTATTACCAGGAAGAGCCTGAGGCTAAGCTTATTGGCCTGAGTTTGGAAGACTATCTTAAGAGGATGCTATCTGACAACGAATGGGGGTCGACTCTTGAGGCATCCATGTTGGCTAAAGAAATGGGTGTTACCATCATCATTTGGACTGTTGCAGCTAGTGATGAAGTGGAAGCAGGCATAAAGTTTGGAGATGGTGATGTGTTTACAGCCGTAAACCTTCTGCACTCTGGACAGACACACTTTGATGCTCTCAGAATACTGCCACAATTTGAAGCTGACACAAGGGAGACCTTGAGTCTAGTAGACAAGGTTATAGCTGTGGACCAATTGACCTCATCTTCAAGTGATGAACTGCAGGACTACGAAGACCTTGCTTTGGCACTTACTAGCGCAGAGGAACCGTATAGACGGTCTAGCTTGGATGAGGTTACCCTGTCTAAGAAACAAGCAGAGGTATTGAGGCAGAAGGCATCTCAATTGTCTAAACTGGTTAGTAAAAGTCAGAACATACCGACTAGAGTTGGCAGGGTTTTGGACTGCATGTTTAACTGCAAACTTTGTGTTGAGATATCAGCTGACACTCTGATTCTGAGACCAGAATCTAAGGAAAGAATTGGTGAAGTCATGTCGTTGCGGCAGCTAGGGCACAAGTTGCTAACACGAGACAAACAAATCAAGCAGGAATTCTCAAAAATGAAGCTCTACGTTACCAAGGATCTGCTTGATTATCTAGATGTCGGTGGGCTGTTGAGAGCAGCCTTCCCTGGAACAGGGATAGAGAGACATATGCAGCTGCTACACTCTGAAATGATACTGGACATTTGTACTGTGTCACTTGGCGTCATGTTATCAACATTCTTATATGGATCTAACAATAAAAACAAGAAAAAATTTATCACCAACTGCCTGCTTAGCACAGCCCTGTCTGGAAAGAAGGTTTACAAGGTTCTTGGTAACTTAGGAAATGAACTGTTATATAAGGCGCCCAGAAAGGCCTTGGCAACCGTCTGTAGTGCTCTATTTGGGAAACAAATAAACAAGCTTCAGAACTGCTTCAGGACTATAAGTCCTGTTAGCCTGCTTGCATTAAGAAATCTGGACTTTGACTGTCTTAGTGTGCAGGACTACAATGGTATGATAGAAAATATGTCCAAATTGGACAACACTGATGTTGAGTTCAACCACAGGGAGATAGCCGATCTCAACCAGTTAACTTCTCGGCTTATTACGTTAAGAAAAGAAAAGGATACTGATCTCCTTAAGCAATGGTTTCCTGAGAGTAATCTCACTCGTAGAAGCACCAGGAATGTTGCAAATGCAGAAGAATTTGTTATATCTGAGTTCTTTAAGAAGAAGGATATTATGAAATTCATTAGTACCTCAGGCAGAGCAATGAGTGCAGGCAAGATTGGTAATGTCCTTTCCTATGCACACAACCTTTATTTAAGCAAGTCCAGCCTAAATATGACTTCTGAAGACATTTCACAACTTCTGATCGAGATCAAGAGGTTATATGCGCTACAGGAAGACTCTGAAGTAGAACCAATAGCCATAATTTGTGATGGCATAGAAAGCAACATGAAGCAGTTATTTGCTATATTACCTCCCGACTGTGCAAGAGAGTGCGAAGTTCTTTTTGATGACATAAGAAACTCTCCAACGCACAGTACAGCCTGGAAGCATGCCCTTCGATTAAAGGGAACTGCATATGAGGGTTTGTTTGCCAACTGCTATGGATGGCAATACATCCCAGAAGACATCAAACCAAGTCTGACCATGTTGATACAGACATTGTTTCCTGACAAATTTGAGGATTTTTTGGACCGAACCCAATTACATCCAGAGTTCAGAGATTTAACTCCTGACTTTTCGCTTACACAAAAGATTCACTTCAAGAAGAATCAGATTCCCAGTGTTGAGAATGTGCAGATCTCCATAGATGCAACACTGCCTGAATCTGTAGAGGCAGTGCCAGTGACAGAAAGGAAGATGTTCCCTCTACCTGAGACTCCATTAAGTGAGGTGCATTCAATAGAGCGCATCATGGAAAATTTCACTCGCCTCATGCATGAAGGAAAGTCTTCAACCAAGAAAAAAGATGAAGATCCAACAGGACAGGACAGTCAGCAGAGTGCTGCTGAACATGAAGGCTTAAGCATTCTAACTTTCAAGGATTATGGCGAAAGGGGAATAGTTGAAGAGAATCACATGAGGTTTAGTGAAGAGGATCAGCTGGAAACGAGGCAGCTGTTGTTTGTAGAAGTTGGTTTTCAAACTGATATTGATGGGAAAATAAGAACAGACCACAGAAAATGGAAAGATATATTAAAGCTGTTGGAGTTACTGGGAATCAAGTGCTCATTCATTGCCTGTGCTGACTGCTCGTCTACTCCGCCAGACAGATGGTGGATTACTGAGGATAGAGTGCGAGTCTTGAAGAACTCAGTCAGCTTCCTCTTTAACAAACTCTCTAGAAATTCACCTACAGAGGTTACTGATATAGTTGTTGGGGCTATAAGCACTCAGAAGGTTAGAAGTTACTTAAAAGCAGGGACTGCTACCAAAACCCCTGTGTCAACAAAAGATGTTCTAGAGACTTGGGAAAGAATGAAAGAACATATACTTAACAGGCCCACAGGTCTGACACTGCCTACCAGTTTGGAGCAGGCAATGCGCAAAGGACTAGTCGAGGGTGTGGTCATCTCCAAGGAGGGCTCTGAATCATGCATCAACATGTTGAAGGAAAATTTGGACCGAATAACTGATGAATTTGAGCGGACTAAATTTAAACATGAGCTTACACAGAATGTTACTACTGGTGAAAAGATGCTGTTAAGTTGGTTAAGTGAGGACATTAAATCATCAAGGTGTAGTGAGTGCCTTGCTAACATAAAGAAAACTGTTGATGAAACTGCCAACCTTTCAGAAAAGATTGAACTGCTTGCTTATAATTTGCAGCTTGCCAGCCACTGTGGTAATTGTCACCCCGATGGTGTGAATATTAGCAACATATCAAATGTACACAAGAGGTGTCCAAAAATAGAAGTGGTCAGCCATTGTGAAAATAAAGGCTTTGAGGATAGCAATGAATGCTTAACAGATTTGGATAGGCTTGTTAGGCTCACATTACCAGGAAAGACTGAGAAGGAGAGAAGAGTCAAACGTAATGTGGAACATCTGATAAAATTGATGATGAACATGTCTGGCATTGACTGTATAAAATATCCCACAGGCCAGCTTATCACTCATGGAAGGGTAAGTGCAAAACACAATGACGAAAACATGAAAGATAGGAGTGATGACGACCAAAGACTAGCTGAGAAGATAGATACTGTAAGAAAAGAGCTTTCGGAAACTAAATTAAAAGACTATTCAGCTTATGCAAGAGGAGTAATCTCGAATTCGCTAAAAAACCTCTCAAAGCAGGGCAAATCAAAGTGTTCTGTGCCAAGGTCTTGGCTTGAAAAGATATTGTTTGACTTAAAGGTGCCCACTAAGGATGAAGAAGTACTGATAAACATCAGAAATTCACTGAAGGCTAGATCTGAGTTTGTTAGAAACAATGACAAACTACTTATAAGATCCAAAGAAGAGCTGAAAAAATGTTTCGATATGCAGTCTTTTAAATTGATGAAAAACAAGCAACCTGTGCCTTTTCAGGTTGATTGTATACTGTTTAAGGAAGTGGCAGCAGAATGCATGAAGAGATACATTGGCACACCTTATGAAGGAATTATAGATACTTTAGTTTCCTTAATCAATGTGTTAACAAGATTCACTTGGTTTCAGGAAGTAGTGCTGTATGGTAAGATATGTGAAACCTTCTTAAGGTGTTGCACAGAATTCAATAGATCAGGGGTTAAGCTAGTTAAGGTAAGACACTGTGACATTAACCTATCAGTCAAGCTGCCATCAAACAAAAAAGAGAACATGTTATGTTGCATATATAGTAGTAACATGGAGCTCTTACAAGGACCTTTCTATTTGAACAGGAGGCAAGCTGTCCTTGGCTCATCATACCTCTACATCGTCATCACACTCTACATACAAGTATTGCAACAGTACAGATGTCTAGAAGTCATAAACAGTGTGAATGAGAAAATATTGCAAGACATTGAAAATCACTCTATGACTCTGCTCGAAGATGCATTCAAGGAACTCACTTCTGCACTTGAGGGTAGATTCGAAGAATCTTATAAAATACGAATTTCAAGGTGCAAAGCTAGTGGGAACTTTTTAAACAGAAGCAGCAGAGACCACTTCATAAGTATTGTTTCAGGCTTAAACCTGGTTTATGGCTTTCTCATGAAAGATAATTTATTGGCTAACTCTCAACAACAAAACAAACAACTTCAAATGCTACGTTTTGGTATGCTTGCAGGTCTTAGTAGGCTTGTCTGCCCTAATGAGTTGGGGAAAAAGTTTTCAACGAGTTGTAGAAGAATTGAGGACAACATTGCAAGACTTTACCTACAAACCTCTATATATTGCTCAGTTAGAGATGTGGAAGACAATATCAAGCACTGGAAGCAAAGAGATTTGTGCCCAGAAGTGACTATTCCGTGTTTCACAGTCTATGGCACCTTTGTTAACAGCGACAGACAGCTGATTTTTGATATTTACAATGTGCATATATACAATAAAGAAATGGACAACTTTGACGAAGGTTGCATCAGCGTCTTGGAAGAAACAGCAGAAAGGCATATGCTTTGGGAGCTTGAT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| 9,987
|
OR964923.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-22/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,107
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-04-20
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-22/2023 segment L, complete sequence
|
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| 9,988
|
OR964924.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-30/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,134
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-05-01
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-30/2023 segment L, complete sequence
|
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| 9,989
|
OR964925.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-116/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,098
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-07-14
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-116/2023 segment L, complete sequence
|
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| 9,990
|
OR964926.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-19/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,094
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-08-26
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-19/2023 segment L, complete sequence
|
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| 9,991
|
OR964927.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-21/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,146
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-08-30
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-21/2023 segment L, complete sequence
|
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| 9,992
|
OR964928.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-8/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,140
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-08-05
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-8/2023 segment L, complete sequence
|
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TGAACGCGAAGGTCTAACTGATCTCCTTGATTACCTAAACTCACCTACCGAGCTGTTGAAGAAGAAGCCTTATTTGGGAACAACCTGCAAGTTCAACACTTGGGGAGACTCAAACAGGTCTGGTAAGTTTACATACAGTAGTAGGTCTGGAGAGTCAATTGGTATCTTCATTGCAGGAAAACTGCACATCCATCTCTCATCTGAGTCTATTGCCCTGTTGTGTGAGACCGAAAGGCAAGTGCTCTCTTGGATGAGCAAAAGGAGGACTGAGGTAATAACCAAAGAACAACATCAATTATTCCTGAGCCTCCTTCCACAATCACATGAATGTTTACAAAAGCACAAGGATGGCAGCGCACTATCAGTTATACCTGATGGTAGCAATCCTCGGCTACTAAAATTTGTGCCTCTCAAGAAGGGGCTAGCAGTGGTGAAGATTAAAAAACAAATTTTGACAGTGAAGAAGCAAGTCGTGTTTGATGCTGAAAGCGAGCCCAGGTTACAGTGGGGACATGGATGCTTGTCCATTGTTTATGATGAAACCGACACTCAGACCACATACCATGAAAACCTCTTGAAGGTGAAGCAGCTTGTTGACTGCTCTACAGACAGGAAAAAACTTTTACCCCAGTCTGTGTTTTCTGATTCCAAAGTCGTCCTTTCAAGGATTAAATTCAAAACGGAGCTCCTCCTTAACTCATTGACATTGCTTCACTGTTTCTTGAAACATGCTCCCAGTGATGCCATAATGGAAGTGGAGAGTAAAAGCAGCCTACTACATAAGTACCTCAAATCAGGAGGTGTTAGGCAGCGGAATACTGAGGTGCTCTTTAGGGAAAAGTTGAACAAGGTAGTTATAAAGGATAACCTTGAGCAAGGTGTAGAAGAAGAGATTGAGTTCTGCAACAACCTGACCAAGAATGTTTCGGAGAACCCGCTACCACTCAGCTGTTGGTCTGAAGTTCAAAACTATATTGAAGACATAGGCTTCAACAATGTGCTTGTAAACATTGACAGAAACACAGTGAAAAGTGAACTTTTGTGGAAATTTACGTTAGATACCAATGTAAGTACTACAAGTACCATCAAGGATGTGAGGACACTGGTGTCCTACGTCAGCACTGAAACGATTCCTAAGTTTCTGCTTGCATTTCTTCTTTATGAAGAAGTGTTGATGAACTTAATCAGCCAGTGCAAGGCAGTGAAAGAACTTGTTAACAGTACAGGTCTCTCAGATCTGGAACTGGAGAGCTTGCTCACTTTGTGTGCTTTCTATTTCCAAAATGAGTGTAGTAAGAGAGATGGGCCTAGGTGTTCATTCGCAGCACTGTTAAGTTTAGTTCATGAAGATTGGCAAAAGATAGGAAAAAACATCCTTGTCCGTGCAAACAATGAGCTGGGTGATGTGTCGTTGAAGGTTAACATTGTCCTGGTGCCTCTCAAAGACATGTCCAAGCCAAAGCCTGAGAGAGTGGTTATAGCCAGAAGGTCACTGAATCATGCTCTGTCCTTAATGTTTTTGGATGAAATGTCACTACCTGAGCTTAAATCCTTATCTGTGAACTGCAGAATGGGAAACTTTGAAGGGCAGGAGTGCTTTGAGTTCACTATTTTAAAAGACAATAGCACAAGGCTAGATTACAACAAATTAGTTGACCACTGTGTGGACATGGAAAAAAAGAGGGATGCAGTTAGAGCAGTGGAAGATTTAGTTCTGATGTTGACAGGTAGGGCAGTCAAGCCTAGCACTGTGACACCAGCTGCACATGAGAACGAACAGTGTCAGGAGCAAATAAGCCTAGATGATCTAATGGCAAATGACACAGTAACAGACCTGCCCGATAGGGAAGCAGAGGCCCTCAAAACAGGCAACCTTGGCTTTAACTGGGATTCAGATTGAACACATCATCTGTATGTATCTTTAATGCCTCTCAGTATCTTAAGGGAAAGTAAGACAATTTATACCATGCCATTTGCTGACACCTGGACTTTCAAATAAGCCAGCTGTTCTGCATTTTCTACAGCCAACTCAATTGTTTCACCACAATTTTCTCAGCTATTGGTCAACCTTTACTATCCTACTATTCCACTTACTTTGCTGTTCATGTCCGTTTTATTATTTCTGGGGTGTGGGGGGAAC
| 9,993
|
OR964929.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-9/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,122
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-09-25
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-9/2023 segment L, complete sequence
|
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GAACGCGAAGGTCTAACTGATCTCCTTGATTACCTAAACTCACCCACTGAACTGTTGAAGAAGAAGCCTTATTTAGGAACAACCTGCAAGTTCAACACTTGGGGAGACTCAAACAGGTCTGGTAAATTTACATACAGTAGTAGGTCTGGAGAGTCAATTGGTATCTTCATTGCAGGAAAACTGCACATCCATCTCTCATCTGAGTCCATTGCCCTATTGTGTGAGACCGAAAGGCAAGTGCTTTCTTGGATGAGCAAAAGGAGGACTGAGGTAATAACTAAAGAACAACATCAATTATTCCTGAGCCTTCTTCCACAATCACATGAATGTTTGCAAAAGCACAAAGATGGCAGCGCACTGTCAGTCATACCTGATGGTAGCAATCCTCGGCTACTTAAATTTGTGCCTCTCAAGAAGGGGCTAGCAGTGGTGAAGATTAAAAAACAAATTTTGACAGTGAAGAAGCAAGTCGTGTTTGATGCTGAAAGTGAGCCCAGATTACAGTGGGGACATGGGTGCTTGTCTATTGTTTATGATGAAACCGACACTCAGACCACATACCACGAAAACCTCTTGAAGGTGAAGCAGCTTGTTGACTGCTCTACAGACAGGAAAAAGCTTTTACCCCAGTCTGTGTTTTCTGATTCCAAAGTTGTCCTTTCAAGGATTAAATTCAAAACGGAGCTCCTCCTTAACTCATTGACACTGCTCCACTGTTTCTTGAAACATGCTCCCAGTGATGCTATAATGGAAGTGGAGAGTAAAAGCAGCTTACTACATAAGTACCTCAAGTCAGGAGGTGTTAGGCAGCGGAATACTGAGGTGCTCTTTAGGGAAAAATTGAACAAGGTAGTTATAAAGGATAACCTTGAGCAAGGTGTAGAAGAAGAGATTGAGTTTTGCAACAACCTGACCAAGAATGTTTCAGAGAACCCGTTACCACTCAGCTGTTGGTCTGAAGTTCAAAACTATATTGAAGACATAGGCTTCAACAATGTGCTTGTAAACATTGACAGAAACACAGTGAAAAGTGAACTTCTGTGGAAATTTACATTAGATACCAATGTAAGTACTACAAGTACCATCAAGGATGTGAGGACACTGGTGTCCTACGTCAGCACTGAAACGATTCCCAAGTTTCTACTTGCATTTCTTCTTTATGAAGAAGTATTGATGAACTTAATCAGCCAGTGCAAGGCAGTGAAAGAACTTATTAACAGCACAGGTATCTCAGATCTGGAACTGGAGAGCTTGCTCACTTTGTGTGCTTTCTATTTCCAAAATGAGTGTAGTAAGAGAGATGGACCTAGGTGTTCATTCGCAGCACTGTTAAGCTTAGTTCATGAAGATTGGCAAAAGGTAGGGAAAAACATCCTTGTTCGTGCAAACAATGAGCTGGGTGATGTGTCGCTGAAGGTTAACATTGTCCTGGTGCCTCTCAAAGACATGTCCAAGCCAAAACCTGAGAGAGTGGTTATAGCCAGAAGGTCATTGAATCATGCTCTGTCCTTAATATTTTTGGATGAAATGTCACTACCTGAACTTAAATCCTTATCTGTGAACTGCAGAATGGGAAACTTTGAAGGACAGGAGTGCTTTGAGTTCACTATTTTAAAAGACAACAGCACAAGGCTAGATTACAACAAATTAGTTGACCACTGTGTGGACATGGAAAAAAAGAGGGATGCAGTTAGAGCAGTGGAAGATTTAGTTCTGATGTTGACAGGTAGGGCAGTCAAACCTAGCACTGTGACACCAGCTGCACATGAGGACGAGCAGTGTCAGGAGCAAATAAGCCTAGATGATCTAATGGCAAGTGACACAGTGATAGACCTGCCCGATAGGGAAGCAGAGGCCCTCAAAACAGGCAATCTTGGCTTTAACTGGGATTCAGATTGAAAACATTATCTGTATAAATCATTAATACCTCTCAGTATCTTAAGGGTGAGTAAGACAATTTATACCATGTCATTTGCTGACATCTGAACTTTCAAATAAGTCAGTTGTTCTGCAATTTTTTCAGCCAATTCAATTGTTTCACTAAAATTTTCTCAGCTATTGATTAACCTTTACTATCCCACTATTCCACTTTCTTTGCTGTTCATGTCCGTTTTGTTATTTC
| 9,994
|
OR964930.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-10/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,155
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-09-25
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-10/2023 segment L, complete sequence
|
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| 9,995
|
OR964931.1
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Haider,S.A., Jamal,Z., Ammar,M., Hakim,R., Ali,Q., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-11/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
|
Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,159
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-09-25
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-11/2023 segment L, complete sequence
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National Institute of Health, Department of Virology
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Pakistan
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2023-12-26
|
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Orthonairovirus haemorrhagiae
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Orthonairovirus
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Nairoviridae
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Pakistan
|
Pakistan
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|
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|
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National Institute of Health, Department of Virology
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Pakistan
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Orthonairovirus haemorrhagiae
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Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-96/2023 segment M, complete sequence
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Orthonairovirus haemorrhagiae
|
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|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
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|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
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Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-04-20
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Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-22/2023 segment M, complete sequence
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|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
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|
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|
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Pakistan
|
Pakistan
|
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Orthonairovirus haemorrhagiae
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Umair,M., Jamal,Z., Haider,S.A., Ammar,M., Ali,Q., Hakim,R., Salman,M.
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National Institute of Health, Department of Virology
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Pakistan
|
2023-12-26
|
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Orthonairovirus haemorrhagiae
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Orthonairovirus
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Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
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|
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Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-116/2023 segment M, complete sequence
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|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Jamal,Z., Haider,S.A., Ammar,M., Ali,Q., Hakim,R., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-19/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
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Nairoviridae
|
ssRNA(-)
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|
GenBank
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Pakistan
|
Pakistan
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Homo sapiens
|
blood
|
2023-08-26
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Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-19/2023 segment M, complete sequence
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|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Umair,M., Jamal,Z., Haider,S.A., Ammar,M., Ali,Q., Hakim,R., Salman,M.
|
National Institute of Health, Department of Virology
|
Pakistan
|
2023-12-26
|
CCHF/NIHPAK-21/2023
|
Orthonairovirus haemorrhagiae
|
Orthonairovirus
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Nairoviridae
|
ssRNA(-)
| 5,364
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-08-30
| null | null |
Orthonairovirus haemorrhagiae isolate CCHF/NIHPAK-21/2023 segment M, complete sequence
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| 10,003
|
NC_009640.1
|
Orthorubulavirus suis
|
Wang,L.F., Hansson,E., Yu,M., Chua,K.B., Mathe,N., Crameri,G., Rima,B.K., Moreno-Lopez,J., Eaton,B.T., Wang,L.-F.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2007-07-06
| null |
Orthorubulavirus suis
|
Orthorubulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,180
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Porcine rubulavirus, complete genome
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| 7,961
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KY100867.1
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Orthorubulavirus suis
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Garcia,A.A., Torres,J.M., Montano,J.A., Del Valle,A., Barron,B.L.
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Centro Nacional de Servicios y Diagnostico en Salud Animal, Virology
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Mexico
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2017-01-17
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PoRV/Mx/1/Cenasa/2015
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Orthorubulavirus suis
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Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,180
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GenBank
| null |
Mexico
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Mexico
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Sus scrofa
| null |
2015
| null | null |
Orthorubulavirus suis isolate PoRV/Mx/1/Cenasa/2015, complete genome
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| 78,563
|
KY100868.1
|
Orthorubulavirus suis
|
Garcia,A.A., Torres,J.M., Montano,J.A., Del Valle,A., Barron,B.L.
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Centro Nacional de Servicios y Diagnostico en Salud Animal, Virology
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Mexico
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2017-01-17
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PoRV/Mx/1/EdoMex/2015
|
Orthorubulavirus suis
|
Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,180
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GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
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Sus scrofa
|
brain
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2016-03-03
| null | null |
Orthorubulavirus suis isolate PoRV/Mx/1/EdoMex/2015, complete genome
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| 78,564
|
KY100869.1
|
Orthorubulavirus suis
|
Garcia,A.A., Torres,J.M., Montano,J.A., Del Valle,A., Barron,B.L.
|
Centro Nacional de Servicios y Diagnostico en Salud Animal, Virology
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Mexico
|
2017-01-17
|
PoRV/Mx/1/Jalisco/2015
|
Orthorubulavirus suis
|
Orthorubulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,180
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Sus scrofa
|
saliva, oronasopharynx
|
2015-04-12
| null | null |
Orthorubulavirus suis isolate PoRV/Mx/1/Jalisco/2015, complete genome
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| 78,565
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KY100870.1
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Orthorubulavirus suis
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Garcia,A.A., Torres,J.M., Montano,J.A., Del Valle,A., Barron,B.L.
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Centro Nacional de Servicios y Diagnostico en Salud Animal, Virology
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Mexico
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2017-01-17
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PoRV/Mx/2/EdoMex/2015
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Orthorubulavirus suis
|
Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,180
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GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
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Sus scrofa
|
brain
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2015-05-14
| null | null |
Orthorubulavirus suis isolate PoRV/Mx/2/EdoMex/2015, complete genome
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| 78,566
|
KY100871.1
|
Orthorubulavirus suis
|
Garcia,A.A., Torres,J.M., Montano,J.A., Del Valle,A., Barron,B.L.
|
Centro Nacional de Servicios y Diagnostico en Salud Animal, Virology
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Mexico
|
2017-01-17
|
PoRV/Mx/2/Jalisco/2015
|
Orthorubulavirus suis
|
Orthorubulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,180
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Sus scrofa
|
saliva, oronasopharynx
|
2015-05-20
| null | null |
Orthorubulavirus suis isolate PoRV/Mx/2/Jalisco/2015, complete genome
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| 78,567
|
NC_002052.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
de Haan,P., Kormelink,R., de Oliveira Resende,R., van Poelwijk,F., Peters,D., Goldbach,R.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-04-29
| null |
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,897
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
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Tomato spotted wilt virus RNA L, complete sequence
|
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| 9,037
|
OR166268.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Bubici,G., Prigigallo,M.I.
|
Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante, Consiglio Nazionale delle Ricerche
| null |
2023-09-03
|
FG-tomSRB
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,914
|
GenBank
| null |
Italy: Foggia
|
Italy
|
Solanum lycopersicum
| null |
2022-06-13
| null | null |
Orthotospovirus tomatomaculae isolate FG-tomSRB segment L, complete sequence
|
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| 13,128
|
OQ718495.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Rodriguez-Negrete,E.A., Guevara-Rivera,E.A., Arce-Leal,A.P., Leyva-Lopez,N.E., Mendez-Lozano,J.
|
Instituto Politecnico Nacional, CIIDIR Unidad Sinaloa, Biotecnologia Agricola
|
Mexico
|
2023-07-17
|
Mexico
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,906
|
GenBank
| 1
|
Mexico
|
Mexico
|
Solanum lycopersicum
| null |
2016-10-31
| null | null |
Orthotospovirus tomatomaculae isolate Mexico segment M, complete sequence
|
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|
OP595383.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Kang,J.-H., Kim,C., Ham,E., Kim,Y., Kil,E.-J.
|
Andong National University, Department of Plant Medicals
| null |
2023-04-29
|
Yeongwol
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
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|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Capsicum annuum
| null |
2022-08
| null | null |
Orthotospovirus tomatomaculae isolate Yeongwol segment L, complete sequence
|
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| 16,424
|
OP595384.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Kang,J.-H., Kim,C., Kim,Y., Park,J.-J., Kil,E.-J.
|
Andong National University, Department of Plant Medicals
| null |
2023-04-29
|
Geumsan_Jinju
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,914
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Capsicum annuum
| null |
2022-05
| null | null |
Orthotospovirus tomatomaculae isolate Geumsan_Jinju segment L, complete sequence
|
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|
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|
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|
Kang,J.-H., Kim,C., Kim,Y., Park,J.-J., Kil,E.-J.
|
Andong National University, Department of Plant Medicals
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2023-04-29
|
Micheon_Jinju
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
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|
GenBank
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South Korea
|
South Korea
|
Capsicum annuum
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2022-05
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Orthotospovirus tomatomaculae isolate Micheon_Jinju segment L, complete sequence
|
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| 16,426
|
OP595386.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Kang,J.-H., Kim,C., Kim,Y., Park,J.-J., Kil,E.-J.
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Andong National University, Department of Plant Medicals
| null |
2023-04-29
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Daegok_Jinju
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Orthotospovirus tomatomaculae
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Orthotospovirus
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Tospoviridae
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ssRNA(+/-)
| 8,914
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GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
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Capsicum annuum
| null |
2022-05
| null | null |
Orthotospovirus tomatomaculae isolate Daegok_Jinju segment L, complete sequence
|
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| 16,427
|
OQ269472.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Skoric,D., Grbin,D.
|
University of Zagreb, Faculty of Science, Department of Biology
|
Croatia
|
2023-04-16
|
104DOT22S
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,913
|
GenBank
| null |
Croatia
|
Croatia
|
Solanum lycopersicum
|
plant leaf
|
2022-06-13
| null | null |
Orthotospovirus tomatomaculae isolate 104DOT22S segment L, complete sequence
|
AGAGCAATCAGGTAACAACGATTTTAAGCAAACATGAACATACAGAAAATACAAAAATTAATAGAAAATGGAACCACTTTACTGTTGTCTATTGAGGATTGTGTAGGTTCTAACCACGATCTAGCTTTGGATTTGCATAAGAGAAATAGTGATGAGATCCCAGAAGATGTGATTATAAATAATAATGCAAAAAATTATGAGACAATGAGAGAGTTAATTGTCAAAATCACTGCTGATGGTGAAGGACTAAACAAAGGGATGGCAACTGTGGATGTCAAAAAGCTAAGTGAGATGGTCTCTCTGTTTGAGCAAAAATACCTAGAAACAGAGTTAGCAAGACATGACATTTTTGGAGAGCTGATCTCCAGGCACCTGAGGATAAAGCCCAAACAAAGAAGTGAAGTGGAGATAGAGCATGCACTAAGAGAATATCTGGATGAACTCAACAAAAAGTCCTGCATTAATAAGCTCTCTGATGATGAGTTTGAGAGAATAAATAAAGAATATGTGGCAACTAATGCCACCCCTGATAACTATGTGATATATAAAGAATCAAAAAACAGTGAGCTTTGTTTAATCATTTATGATTGGAAAATATCTGTCGATGCTAGGACTGAAACCAAAACGATGGAGAAATACTACAAAAATATCTGGAAATCTTTCAAAGATATAAAAGTGAATGGAAAGCCATTCCTGGAAGATCATCCTGTTTTCGTTTCTATAGTTATATTGAAACCTATTGCTGGGATGCCAATCACTGTTACTAGCAGCAGGGTTTTGGAGAAATTTGAAAATTCTCCATCGGCATTGCATGGAGAAAGAATAAAGCATGCTAAAAATGCCAAATTGCTAAATATTTCTTATGTTGGGCAAATAGTTGGAACCACACCCACAGTGGTGAGAAACTATTATGCAAACACTCAAAAGATCAAATCTGAAGTCAGAGGGATCTTAGGTGATGATTTTGGATCTAAAGATGTATTTTTTAGTCACTGGACCAGCAAGTACAAAGAAAGAAATCCTACTGAAATAGCCTATTCTGAAGATATTGAAAGAATAATTGATTCACTTGTCACAGATGAAATCCCTAGAGAGGAAATAATACATTTTTTATTTGGAAATTTCTGTTTCCACATTGAAACAATGAATGACCAGCATATTGCTGACAAATTTAAAGGGTACCAAAACTCTTGTATCAATTTAAAAATAGAGCCAAAAACTGATTTAGCTGATTTGAAAGACCACTTAATCCAAAAGCAGCAAATATGGGATTCTCTGTATGGGAAACACCTTGAGAAGATTATGCTTAGAATTAGAGAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAATACCTGACATAACCACAGCTTTTAACCAGAATGCTGCTGAATATGAAGAAAAGTACCCTAACTGTTTTACAAATGATCTTTCTGAAACTAAAACTAACTTTTCCATGACTTGGTCCCCAAGTTTTGAAAAAGTTGAATTGAGCTCAGATGTAGATTACAACAACGCAATTATAAACAAGTTTCGGGAAAGCTTCAAAAGTTCTTCAAGGGTTGTTTATAATAGCCCATATAGTAGCATAAATAACCAAACAAATAAAGCAAGAGATATAACAAACTTGGTTAGACTGTGCTTAACAGAGCTAAGCTGTGATACAACAAAAATGGAAAAGCAGGAGCTTGAGGATGAAATAGATGTAAACACTGGAAGTATTAAAGTTGAAAGAACAAAAAAATCTAAAGAATGGAATAAGCAGGGTTCGTGTTTAACTAGGAACAAAAATGAATTTTGCATGAAAGAGACAGGTAGAGAGAACAAAACTACCTATTTCAAAGGCTTAGCAGTAATGAATATAGGAATGAGTTCTAAGAAAAGAATTCTAAAAAAAGAAGAAATAAAAGAAAGGATTTCTAAAGGCCTGGAATATGACACCTCTGAAAGGCAAGCTGACCCAAATGATGATTATTCAAGTATAGACATGTCTTCTCTGACTCATATGAAAAAACTAATAAGGCATGACAATGAGGACAGTTTGAGCTGGTGTGAAAGAATTAAGGATTCTTTGTTTGTCCTTCATAATGGTGATATAAGAGAGGAAGGCAAGATCACATCTGTTTACAATAATTATGCTAAAAATCCTGAATGCTTGTACATTCAAGATTCAGTACTGAAGGCTGAATTAGAGACTTGCAAAAAGATAAACAAATTATGCAATGACCTAGCCATTTACCATTACTCTGAAGACATGATGCAATTCTCCAAAGGTTTAATGGTGGCTGATAGGTACATGACTAAAGAAAGTTTCAAGATACTAACAACTGCAAATACAAGCATGTTGCTATTGGCATTCAAAGGAGATGGAATGAACACTGGTGGATCAGGAGTGCCTTACATAGCATTGCATATAGTGGATGAAGACATGTCAGATCAATTTAACATATGTTATACTAAAGAAATTTATAGCTATTTCCGAAGTGGTAGTAATTACATTTATATAATGAGACCACAGAGACTCAACCAGGTGAGGCTTCTGAGCCTTTTCAAAACGCCTAGCAAAGTTCCTGTGTGTTTTGCACAATTTTCAAAGAAAGCTAACGAAATGGAAAAATGGCTGAAAAACAAAGATATAGAAAAGGTGAATGTCTTTTCTATGACAATGACTGTAAAACAGATATTAATAAATATTGTGTTTTCATCTGTCATGATAGGAACTGTGACAAAGCTCAGCAGGATGGGAATTTTTGATTTCATGCGATATGCTGGGTTTTTGCCACTGTCCGATTATTCTAATATAAAAGAATACATTAGAGACAAATTTGATCCTGATATAACTAATGTGGCAGATATCTATTTTGTTAATGGAATCAAAAAACTGCTGTTCAGAATGGAAGATCTCAATTTAAGCACAAATGCCAAGCCTGTTGTTGTAGACCACGAAAATGATATTATAGGAGGGATAACAGATCTAAATATAAAATGCCCAATAACAGGGTCAACTCTGCTGACACTTGAGGATTTGTACAATAATGTTTATTTGGCTATTTATATGATGCCTAAATCATTGCACAATCATGTTCACAATCTAACAAGCTTGTTAAATGTCCCTGCTGAGTGGGAACTAAAGTTCAGAAAAGAGTTAGGTTTCAACATATTTGAAGACATATACCCTAAGAAAGAAATGTTTGATGACAAAGACCTATTCTCTATAAATGGAGCTTTGAATGTGAAAGCATTATCTGATTACTATCTAGGAAATATAGAAAATGTTGGTTTGATGAGATCAGAAATAGAAAATAAAGAAGATTTCCTAAGCCCTTGTTATAAAATATCTACTTTAAAATCTTCAAAAAAATGCTCACAATCAAACATTATAAGTACCGATGAAATAATAGAGTGTCTTCAGAATGCAAAGATCCAAGATATAGAAAATTGGAAAGGAAATAACCTGGCCATTATAAAAGGGCTTATGAGAACCTATAATGAGGAGAAAAGTCGATTGATGGAATTTTTCGAGGATAATTGTGTCAATTCATTATATCTTGTAGAAAAGCTTAAAGAGATAATTAATAGTGGATCAATAACTGTAGGGAAATCTGTAACATCTAAATTCATAAGAAACAACCATCCTTTAACAGTAGAAACATATCTCAAAACAAAACTATATTATAGGAATAATGTGACAGTTTTGAAGTCTAAAAAAGTGTCAGAGGAGCTTTATGACCTTGTGAAACAGTTTCATAACATGATGGAAATAGACCTAGATTCTGTTATGAACCTTGGAAAAGGTACAGAAGGGAAAAAACACACATTCTTGCAGATGCTCGAATTTGTCATGTCCAAGGCTAAAAATGTCACCGGGTCTGTAGATTTCCTAGTTTCTGTTTTTGAGAAAATGCAGAGAACCAAAACAGACAGAGAAATATACTTGATGAGCATGAAAGTGAAAATGATGCTCTATTTTATAGAACACACATTCAAACATGTAGCACAGAGTGATCCATCGGAAGCCATATCTATAAGTGGAGACAATAAAATAAGAGCACTTTCTACATTGTCTTTGGATACAATCACATCTTACAATGATATTTTAAACAAAAATTCAAAGAAGTCAAGATTGGCTTTCTTATCTGCTGATCAGTCGAAATGGTCGGCATCAGATCTTACTTATAAATATGTTTTAGCTATCATATTAAATCCAATTTTAACTACTGGTGAAGCTAGTTTAATGATAGAATGCATTTTAATGTATGTTAAATTGAAGAAGGTTTGTATACCAACAGATATTTTTTTGAATCTAAGAAAAGCTCAAGGAACTTTTGGGCAAAATGAAACTGCTATAGGACTTTTGACTAAAGGTTTGACAACAAACACATACCCTGTTAGCATGAACTGGTTGCAAGGCAATTTAAATTATCTGTCTTCTGTTTATCACTCTTGTGCAATGAAAGCTTACCACAAAACTTTAGAATGTTACAAAGACTGTGAGTTCCAAACTAGATGGATTGTGCACTCTGATGATAATGCGACATCATTAATAGCCAGTGGAGAGGTCGATAAAATGCTAACAGACTTTTCAAGCTCATCTCTGCCTGAAATGTTGTTTAGAAGCATTGAAGCTCATTTCAAAAGCTTTTGCATAACTTTGAACCCAAAAAAGAGTTATGCTTCTTCATCAGAAGTAGAGTTCATATCTGAAAGAATTGTAAATGGAGCAATTATTCCTCTCTATTGCAGGCATTTAGCAAACTGTTGCACAGAATCTTCACATATAAGTTATTTTGATGATCTAATGTCACTCAGTATACATGTTACAATGCTTCTGAGAAAAGGCTGTCCTAATGAAGTTATACCTTTTGCTTACGGGGCTGTGCAAGTGCAAGCATTAAGCATCTATTCAATGCTTCCTGGTGAAGTGAATGATAGCATCAGAATTTTTAACAAGCTCGGAGTAAGTTTAAAGTCGAATGAGATTCCCACAAACATGGGGGGCTGGTTGACTTC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| 16,676
|
ON840007.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Accotto,G.P., Ciuffo,M., Pierro,R.
|
National Research Council of Italy -Institute for Sustainable Plant Protection (CNR-IPSP), Institute for Sustainable Plant Protection (CNR-IPSP)
| null |
2023-03-06
|
T1107
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,913
|
GenBank
| null |
Italy
|
Italy
|
Solanum lycopersicum
|
plant leaf
|
2021
| null | null |
Tomato spotted wilt orthotospovirus isolate T1107 segment L, complete sequence
|
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| 17,651
|
ON840010.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Ciuffo,M., Accotto,G.P., Pierro,R., Turina,M.
|
National Research Council of Italy -Institute for Sustainable Plant Protection (CNR-IPSP), Institute for Sustainable Plant Protection (CNR-IPSP)
| null |
2023-03-06
|
T1012
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,915
|
GenBank
| null |
Italy
|
Italy
|
Solanum lycopersicum
|
plant leaf
|
2005
| null | null |
Tomato spotted wilt orthotospovirus isolate T1012 segment L, complete sequence
|
AGAGCAATCAGGTAACAACGATTTTAAGCAAACATGAACATCCAGAAAATACAAAAATTAATAGAAAATGGAACCACTTTACTGTTGTTTATTGAGGATTGTGTAGGTTCTAACCACGATCTAGCTTTGGATTTACATAAGAGAAATAGTGATGAGATCCCAGAAGATGTGATTATAAATAATAATGCAAAAAATTATGAGACAATGAGAGAGTTAATTGTCAAAATCACTGCTGATGGTGAAGGACTAAACAAAGGGATGGCAACTGTGGATGTCAAAAAGCTAAGTGAGATGGTCTCTCTGTTTGAGCAAAAATACCTAGAAACAGAGTTAGCAAGGCATGACATTTTTGGAGAGCTGATCTCCAGGCACCTGAGAATAAAGCCCAAACAAAGAAATGAAGTGGAGATAGAGCATGCACTAAGAGAATATCTGGATGAACTCAACAAAAAGTCCTGCATTAATAAGCTCTCTGATGATGAGTTTGAGAGAATAAATAAAGAATATGTAGCAACTAATGCCACTCCTGATAACTATGTGATATATAAAGAATCAAAAAACAGTGAGCTTTGTTTAATCATTTATGATTGGAAAATATCTGTCGATGCTAGGACTGAAACCAAAACGATGGAAAAATACTACAAAAATATCTGGAAATCTTTCAAAGATATAAAAGTGGATGGAAAGCCATTCCTGGAAGATCATCCTGTTTTCGTTTCTATAGTTATATTGAAACCTATTGCTGGGATGCCAATCACTGTTACTAGCAGCAGGGTTTTGGGAAAATTTGAAGATTCTCCATCAGCATTGCATGGAGAAAGAATAAAGCATGCTAAAAATGCCAAATTGCTAAATATTTCTTATGTTGGGCAAATAGTTGGAACCACACCTACAGTGGTGAGAAACTATTATGCAAACACTCAAAAGATCAAATCTGAAGTCAGAGGAATCTTAGGTGATGATTTTGGATCTAAAGATGTATTTTTTAGTCACTGGACCAGCAAGTACAAAGAAAGAAATCCTACTGAAATAGCCTATTCTGAAGATATTGAAAGAATAATTGATTCACTCGTCACAGATGAAATCCCTAGAGAGGAAATAATACATTTTTTGTTTGGAAATTTCTGTTTCCACATTGAAACAATGAATGACCAGCATATTGCTGACAAATTTAAAGGGTACCAAAACTCTTGTATCAATTTAAAAATAGAGCCAAAAACTGATTTAGCTGATTTGAAAGATCACTTAATCCAAAAGCAGCAAATATGGGATTCCCTGTATGGGAAACACCTTGAGAAGATCATGCTTAGAATTAGAGAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAATACCTGACATAACCACAGCTTTTAACCAGAATGCTGCTGAATACGAAGAAAAGTACCCTAATTGTTTTACAAATGATCTTTCTGAAACTAAAACTAACTTTTCCATGACTTGGTCCCCAAGTTTTGAAAAAGTTGAATTGAGCTCAGAGGTAGATTACAACAACGCAATTATAAACAAGTTTCGGGAAAGCTTCAAAAGTTCTTCAAGGGTTGTTTATAATAGCCCATATAGTTGCATAAATAACCAAACAAATAAAGCAAGAGATATAACAAACTTGGTTAGACTGTGCTTAACAGAGCTAAGCTGTGATACAACAAAAATGGAAAAGCAGGAGCTTGAGGATGAAATTGATATAAACACTGGAAGTATTAAAGTTGAGAGAACAAAAAAATCTAAAGAATGGAATAAGCAGGGTTCGTGTTTAACCAGGAACAAAAACGAATTTTGCATGAAAGAGACAAGCAGGGAGAACAAAACTACCTATTTCAAAGGCTTAGCAATAATGAATATAGGAATGAGTTCTAAGAAAAGAATTCTAAAAAAGGAAGAAATAAAAGAAAGGATTTCTAAAGGCCTGGAATATGACACCTCTGAAAGGCAAGCTGACCCAAATGATGATTATTCAAGTATAGACATGTCTTCTCTGACTCACATGAAAAAACTAATAAGGCATGACAATGAGGACAGTCTGAGCTGGTGCGAAAAAATCAAGGATTCTTTGTTTGTCCTTCATAATGGTGATATAAGAGAGGAAGGCAAGATCACATCTGTTTACAATAATTATGCTAAAAATCCTGAATGCTTGTACATTCAAGATTCAGTACTCAAGGCTGAATTAGAGACTTGCAAAAAGATAAACAAATTATGCAATGACCTAGCCATTTACCATTACTCTGAAGACATGATGCAATTCTCCAAAGGTCTAATGGTGGCTGACAGGTACATGACTAAAGAAAGTTTCAAGATACTAACCACGGCAAATACAAGCATGTTGCTATTGGCATTCAAAGGGGATGGAATGAACACTGGTGGATCGGGAGTACCTTACATAGCATTGCATATAGTGGATGAAGACATGTCAGATCAATTTAACATATGTTATACTAAAGAAATTTATAGTTATTTCCGAAGTGGTAGTAATTACATTTATATAATGAGACCACAGAGACTCAACCAGGTGAGGCTGCTGAGCCTTTTCAAAACGCCTAGTAAAGTTCCTGTGTGTTTTGCGCAATTTTCAAAGAAAGCTAACGAAATGGAAAAATGGCTGAAAAACAAAGATATAGAAAAGGTAAATGTCTTTTCTATGACAATGACTGTAAAACAGATATTAATAAATATTGTGTTTTCATCTGTCATGATAGGAACTGTGACAAAGCTAAGCAGGATGGGAATTTTTGATTTCATGCGATATGCAGGGTTTTTGCCACTGTCCGATTATTCTAATATAAAAGAATACATTAGAGACAAATTTGATCCTGATATAACTAATGTTGCAGATATCTATTTTGTTAATGGAATCAAAAAACTACTGTTCAGAATGGAAGATCTCAATTTAAGCACAAATGCCAAGCCTGTTGTTGTAGACCACGAAAATGATATTATAGGAGGGATAACAGACTTGAATATAAAATGCCCGATAACAGGATCAACTCTACTGACACTTGAGGATTTGTACAATAATGTTTATTTGGCTATTTATATGATGCCTAAATCATTGCACAATCATGTTCACAATCTAACAAGCTTGTTAAATGTCCCTGCTGAGTGGGAACTAAAGTTCAGAAAAGAGTTAGGTTTCAACATATTTGAAGACATATACCCTAAGAAAGCAATGTTTGATGACAAAGACCTATTCTCTATAAATGGAGCTTTGAATGTGAAAGCATTATCTGATTACTATCTAGGAAATATAGAAAATGTTGGCTTGATGAGATCAGAAATAGAAAATAAAGAAGATTTCCTAAGCCCTTGTTATAAAATATCTACTTTAAAATCTTCAAAAAAATGCTCACAATCAAACATTATAAGTACCGATGAAATAATAGAGTGTCTTCAGAATGCAAAGGTCCAAGATATAGAAAATTGGAAAGGAAATAACCTGGCCATTATAAAAGGGCTTATGAGAACCTACAATGAGGAGAAAAGTAGATTGATGGAATTTTTTGAGGATAATTGTGTCAATTCATTATATCTTGTAGAAAAGCTTAAAGAGATAATTAATAGTGGATCAATAACTGTAGGGAAATCTGTAACATCTAAATTCATAAGAAATAACCATCCTTTAACAGTAGAAACATATCTCAAAACAAAACTATATTATAGGAATAATGTGACAGTTTTAAAGTCTAAAAAAGTGTCAGAGGAGCTTTATGACCTTGTGAAACAGTTTCATAACATGATGGAAATAGACCTAGATTCTGTTATGAACCTTGGAAAAGGTACAGAAGGGAAAAAACACACATTCTTGCAGATGCTTGAATTTATCATGTCCAAGGCTAAAAATGTCACCGGGTCTGTAGATTTCCTAGTTTCTGTTTTTGAGAAAATGCAGAGAACCAAAACAGACAGAGAAATATACTTGATGAGCATGAAAGTGAAAATGATGCTTTATTTTATAGAGCACACATTCAAACATGTAGCACAAAGTGATCCATCGGAAGCCATATCTATAAGTGGAGACAATAAAATAAGAGCACTTTCTACATTATCTTTGGACACAATCACGTCTTACAATGATATTTTAAACAAAAATTCAAAGAAGTCAAGATTGGCTTTCCTATCTGCTGATCAGTCAAAATGGTCGGCATCAGATCTTACCTATAAATATGTTTTAGCTATCATATTAAATCCAATTTTAACTACTGGTGAAGCTAGTTTAATGATAGAATGCATTTTAATGTATGTTAAATTGAAGAAGGTTTGCATACCAACAGACATTTTTTTGAATCTAAGAAAAGCTCAAGGAACTTTTGGGCAAAATGAAACTGCCATAGGACTTTTGACTAAAGGTTTGACGACAAACACATACCCTGTTAGCATGAACTGGTTGCAAGGCAATTTAAATTATCTGTCTTCTGTTTATCACTCTTGTGCAATGAAAGCTTACCACAAAACTTTAGAATGTTACAAGGACTGTGATTTCCAAACTAGATGGATTGTGCACTCTGATGACAATGCGACATCATTAATAGCCAGTGGAGAGGTCGATAAAATGCTAACGGATTTTTCAAGCTCATCTCTGCCTGAAATGTTGTTTAGAAGTATTGAAGCTCATTTCAAAAGCTTTTGCATAACTTTGAACCCAAAAAAGAGTTATGCTTCTTCATCAGAAGTAGAGTTCATATCTGAAAGAATTGTGAATGGAGCAATTATTCCTCTCTATTGCAGGCATTTAGCAAACTGTTGCACAGAATCTTCACATATAAGTTATTTTGATGATCTAATGTCACTCAGTATACATGTTACAATGCTTCTGAGAAAAGGCTGTCCTAATGAAGTTATACCTTTTGCTTATGGGGCTGTGCAAGTGCAAGCATTAAGCATCTATTCAATGCTTCCTGGTGAAGTGAATGATAGCATCAGAATTTTTAACAAGCTTGGAGTAAGTTTAAAGTCGAATGAGATTCCCACAAACATGGGGGGCTGGTTGACCTC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| 17,652
|
OP921761.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Bester,R., Demas,S.U., Maree,H.J.
|
Stellenbosch University, Genetics
|
South Africa
|
2023-02-15
|
Ag_SA1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,909
|
GenBank
| 1
|
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus praecox
| null |
2021
| null | null |
Tomato spotted wilt orthotospovirus isolate Ag_SA1 segment L, complete sequence
|
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Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
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Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
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|
Orthotospovirus tomatomaculae
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Hungary
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Hungary
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Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
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2023-01-09
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Tomato spotted wilt orthotospovirus isolate DSMZ PV-1265 segment L, complete sequence
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| 19,636
|
MT950318.1
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Zhao,M., Chen,Z., Chen,L., Wang,Z.
|
Yunnan Agricultural University, Key Laboratory of Ministry of Education Agriculture Biodiversity for Plant Disease Management
|
China
|
2022-09-01
|
ZS
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,922
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Perilla frutescens
| null |
2018-05-11
| null | null |
Tomato spotted wilt orthotospovirus isolate ZS segment L, complete sequence
|
AGAGCAATCAGGTACAACTAAAACATATAATCTCTCCACAGCCAGACTTTACAAATAAATTATATAAGAATTCCTTCCAGTGAAACTATACCGGGACTCTATATTTATATACACTATAGATTTGGTTCACCAGATTGTCTTTAGGCTAAGTAGATCTAATCTAATTCTAAATAACAATAAATTTATATTCTAAGTTCTGTCTAATCTATTATTCATGCACTGTTAGGCATTACTTTTAATTTAATCCGTGTCTTCTTCTTCATCAGAATCATCTTCGTCAAAGGCATCTTCTTCCCCTCTTAGATAACCAAGCAAGAAATTGTCTTCATCTGTTTCAACAACCTCATCCAACTCACTTATTTTACTCAAAATAATCTCTCTTGTTTGCATGATATAATCATTGATATCAGAGTAAGTGTATCTTCCATACAATGTTTTTTCTGATAAGCATAATGGGTGCCTAGAAAGAAAATTTGCGATATCTTTATAGACCTCTAGTTTTTTAGTTCGCGATTGTTCATCTCTTAATTGTATCAAAGCTTTCTTAACTCTTCCAGATAAGAAATGCTCCTTAGACTTGCTTTTTGTCAGTTTTAGATAACCTTCTAAGCTGTCAGCTATCTCATTTAAAGGACAATTGACATTCTTATATTCCATATAAACAGTTGCATAAACTTTGAGTGCAGGTACACTGGAACTTAATCTGCCCAGTCTGTCAGTTGAAAATATGTCTGGTCTAAAACTATTCCGCAACAATGTCTCTATATCAAAACTGGTTCCCTTTATCCCTCCAATCAAGAACTTTATCAACTCACTTAGTAAAAGTGTATTTGCCGGGAATAAAAACCCTTTCTTTTTTCTTTTAATCTTCATTTCTTTGATCAAACCTTCATACATTTCTTCCTCATCTAGCCTCAACACATTAAAACTGGCAAGACCTTCAAACTCTTCATCAGACCTATCCATTTTTAGATTCTCTCCAGATATAACAAACCCATTCTCTTTTAGTATCTCCCTTGATAGTTCTGATAATTTTATTTCTGGTAAAACCAGTGTCTTGAAATCATAACTTTTTTCCATCAAGTTATTTTGCAAATCCAGATCATGATTCAATCTTATTCTTCTCCCAAATGTGGCATATGTCCTGCTAAGAACATTCCTCAAACTTGCTAAGTTTAATATAGAGTCATTGTTGTGGCATGTTTCGCAAGCTTTAATCAATTGGATCATTCCTAGCAAGTTGAATTCCCCTATCTCTATGTGCTTTTTTGCCATTAGTTCGACAGCATGCATTCCAGTGGCTCTATAGCTTTTAAATCCTGATGCATCATTTATCAAAGAATATTTAAGCATGAGCAGTATTTCTTTGAAACCTTCTAAATCTCTAGTATACTGTTTTGCTTTGTCAACAATCTCTGAAAACAGAGGACTATACTCATTTTCAAAGTTGTCATGTGTTCTTAACAAGTTTTCGAATAGTTCTACTGTATCATTAAACCCATTTTCATCAAGTTCATCAAGATAGCTATCATATTCTTCCACACTTTTGCAGTTTTCCAAACCTTCTAAGCAGGTATCCCGGATGTTCATTAAGAATTCATCCATCGTTTCTCTGATATCATCATCCACAATCTCTTTGATCTGCTGTGATAAGTTTCCAAAGGCTTCTATGAAAGTTAAAGAGGTCATAAGCCTGTTTTTTATGGTTTTGATTGTTTCAGTTTCAGAGTCTGCAGTTTTGTACATATCAGAGAAACATTCCCCTACTTCAGGGAGCCTTAAGACTAGAGATTTTTGGCTTTCTATAATATCCCACACATCGGAGTTCACGTTTTCATATTTTATCTTCACAACTAATTTCACATTCTCTAGTCTTATTTGTCTTGATGTGGCATTAACCTTTATAATCATCTTGTTGTCTGTGGTCATTCTGATGCAGGCATCTCCTGGTTCTAGGAAAACAATCTGTGGTTGTTTTGATTTTATTATGTTCACTTTATCAAACATAAATTTCTGCAATAATTTCTCTATACTTTCTCTGTATGTGTCAAAAAGATAATCTCTTTCATTCAATATCTCAAATGGTGTCCTCAAAGAAACTGCTACATCTTGATCAGATGCTATCAATTGAACATAACAGCTTCTTGTCATGATCCCGATTTTGTACATAGTTCCAGAGATATAATTTCCTGATTCGTCTTGTTCTTCAGTTTTCACATATCTTACATCACTTCTCCTAATATACCTGATAACAAAATCTAATGTTCTATGAGAACATAAACCCATGTTCCACATCCAGACAATTTGTTTCTGGATTGTGTTCAATTCACTGTTATGTGACAGAATCACATTTGACACTGTGAAGCCACTTGCTGTTGAATTGTTAATCTTTTTCATTTTGTCTTCTAGACTCTGCCATATAGGTTTGCTGTCTAGGCACACATTTTGCAATATCAAAACTATATCCTCTCTTGTAATTGTTGGGAAAAGTGACTGCAATTTATCTGATATGTATACAGCAGTGTCCAGTATTTTCTCTAAGTTCATATCTTGCTGAGCACTTATCACAGTTCTAATAGTTTTGTCTAATTTATAACTAGCTGTAGAAACAAAATGATAGGATTCTTCTTTACTGTAGATGGTGGATAAGAGAGCTAATGTGTTTGAGATAAACCCTCTCCCTAGGTTGAATTTAGAATAGAAGGGGAAGCTTTTCCTAGTAAAGCATGTGTTAATTGCTAAAAGCCTGTTTTGTGCTGCTATCATATAATTGCATGCTTTCACCAATCTTTGACATTCGTTAGAATTGCTGAAAGCCTCTGTTTCGAAGCTGTCTTTGCCTTTAACTAAGGATTTTACATCCTCCATGATTAAACCTGTTCCAAACGTGCTTGTTAAAACATTAATGCTATCGTCTGTTAGAGGGATGTTTTTTAAACCTAAATTTTCTATATAATTTGATCCATAGACAGCATGCATTACCACTAATCCTGGAGAGCCTTCAACTACAGGTATCCACTTCTCAGTCTGAAACCACCTGAAATTGTAGTTATCTCTTTTCCTAGATTCACAAGGGTATGCAGAATCCAATATTGGAATCAGCATGCTGAAATTAACATCCTTGATCACTAGATTTACACATGTTTTAAATGAACAATATGAATCTAAATCAAATTTTAGCATTTCCAAGATTTTCTTTTCCATGTTTTCTTCATAAGTCATCTTCACAGTGGAAGAAATGTCTACAAATGTTCTAGCTTTTGACCTTAATACTCTATCCAAAGCAAGTTTCTCTGTAGATTGGTTAGATAACTGATTCCTTTTAGAAGGGCTTGTGTACATGAACAGCTGACTAAGTAAAAAATCTCTATCATTCAATGGTGCTATCAGGATTGTTTCAGGATTTTTTATCATTATGTCATGAACAGATTCCATTTCTAAGCTAGATGCAATCTTCTCATATAACTCATCTTCCTCTAAAATAGCATCCTCGTCTATCTTTAAGCTCTTAGTACTTTTATATAAATCTTCATTCTTTTTCAAATTAGGGTAAAGTTTTGAAAAATCTTTATAACTTGACATCTTGTTTAAAGCATTCTCATTTATAAAATTGGGCAATTTTATAATCTGAGTTAACATAGTTTGAAATTTCATCCCGATTGTTAGAACGTCTGAATCTTCAGACACTGATGCTTTCTCAAACAGATTGATAAGAAATATCATCTTTTTATCTTTTTCTTCCAGAGTTCCTTTTTCATACTTTCCTTTTAGCTCTCTGAATCTCATCTGTAGATAGCTGGAAGAAGAGACGCTATCTTTTACTTCCTCTAAACTTTTTTTGTTCAAAAAATCTCTTATCACATTGTAATAGATGATTTGATCATTCGATGATGGACCTAATATAGACAATGGCTCTATAGGAGAAGTCAACCAGCCCCCCATGTTTGTGGGAATCTCGTTTGACTTTAAACTTACTCCAAGCTTCTTAAAAATTCTGATGCTATCATTCACTTCACCAGGAAGCATTGAATAGATGCTTAATGCTTGTACCTGTACAGCCCCATAAGCAAAAGGTATAACTTCATTAGGACAGCCTTTTCTCAGAAGCATCGTAACATGTATACTTAGTGACATTAGATCATCAAAATAACTTATATGTGAAGATTCTGTGCAACAATTTGCTAAATGTCTGCAATAGAGAGGAATAATTGCTCCATTTACAATTCTTTCAGATATAAACTCTACTTCTGATGAAGAAGCATAACTCTTTTTTGGGTTCAAAGTTATGCAAAAGCTTTTGAAATGAGCTTCAATGCTTCTAAACAACATTTCTGGCAGAGATGAGCTTGAAAAGTCTGTTAGCATTTTATCGACCTCTCCACTGGCTATCAATGATGTCGCATTATCATCAGAGTGCACAATCCATCTAGTTTGGAAATCACAGTCTTTGTAGCATTCTAAAGTCTTGTGATAAGCTTTCATTGCACAAGAGTGATAAACAGAAGACAGATAATTTAAATTGCCTTGTAACCAGTTCATGCTAACAGGGTATGTGTTTGTCGTCAAACCTTTAGTCAAAAGTCCTATGGCAGTTTCATTTTGCCCGAAAGTTCCTTGAGCTTTTCTTAGATTCAAAAAAATATCTGTTGGTATACAAACCTTCTTCAATTTAACATACATTAAAATACATTCTATCATTAAACTAGCTTCACCAGTAGTTAAAATTGGATTTAATATGATAGCTAAAACATATTTATAGGTAAGGTCTGATGCCGACCATTTCGATTGATCAGCAGACAGGAAAGCCAATCTTGACTTCTTTGAATTTTTGTTTAAAATGTCGTTGTAAGACGTGATTGTGTCCAAAGATAATGTAGAAAGTGCCCTTATTTTATTGTCTCCACTTATAGATATGGCTTCTGATGGATCACTCTGCGCAACATGTTTGAATGTGTGCTCTATAAAATAAAGCATCATTTTCACTTTCATACTCATCAAGT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Subsets and Splits
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