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Orthotospovirus tomatomaculae
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Qiu,Y., Tong,J., Ji,Y., Ma,J., Zhang,H., Wen,C., Zhang,Y., Xu,X.
|
Vegetable Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences
|
China
|
2022-07-24
|
water dropwort
|
Orthotospovirus tomatomaculae
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Orthotospovirus
|
Tospoviridae
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|
China
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2021-04-12
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Tomato spotted wilt orthotospovirus isolate water dropwort segment L, complete sequence
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|
Orthotospovirus tomatomaculae
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|
Andong National University, Department of Plant Medicals
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2022-05-29
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|
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|
South Korea
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Orthotospovirus tomatomaculae
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Andong National University, Department of Plant Medicals
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2022-05-29
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Orthotospovirus tomatomaculae
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South Korea
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South Korea
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|
Andong National University, Department of Plant Medicals
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2022-05-29
|
Songcheong
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
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|
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South Korea
|
South Korea
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|
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|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Kang,J.-H., Kwak,M.-H., Kil,E.-J.
|
Andong National University, Department of Plant Medicals
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2022-05-29
|
Goesan
|
Orthotospovirus tomatomaculae
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
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|
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South Korea
|
South Korea
|
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2021-06
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Tomato spotted wilt orthotospovirus isolate Goesan segment L, complete sequence
|
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| 30,507
|
NC_007015.1
|
Ovine enzootic nasal tumor virus
|
Cousens,C., Minguijon,E., Dalziel,R.G., Ortin,A., Garcia,M., Park,J., Gonzalez,L., Sharp,J.M., de las Heras,M., Cousens,C.A.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-05-25
|
sheep TNO28
|
Ovine enzootic nasal tumor virus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,434
|
RefSeq
| 1
| null | null |
Ovis aries
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Ovine enzootic nasal tumour virus, complete genome
|
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| 8,218
|
KC189895.1
|
Ovine enzootic nasal tumor virus
|
Walsh,S.R., Linnerth-Petrik,N.M., Yu,D.L., Foster,R.A., Menzies,P.I., Diaz-Mendez,A., Chalmers,H.J., Wootton,S.K.
|
University of Guelph, Pathobiology
|
Canada
|
2013-08-12
|
ENTV-1OVC
|
Ovine enzootic nasal tumor virus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,436
|
GenBank
| 1
|
Canada
|
Canada
|
Ovis aries
| null |
2011-05-11
| null | null |
Ovine enzootic nasal tumor virus isolate ENTV-1OVC, complete genome
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University of Guelph, Pathobiology
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Ovine enzootic nasal tumor virus
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University of Guelph, Pathobiology
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Canada
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Ovine enzootic nasal tumor virus
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Ovine enzootic nasal tumor virus
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|
University of Guelph, Pathobiology
|
Canada
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|
ENTV-1NA3
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Ovine enzootic nasal tumor virus
|
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Retroviridae
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Canada
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Canada
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University of Guelph, Department of Pathobiology
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Ovine enzootic nasal tumor virus isolate ENTV-1NA4, complete genome
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University of Guelph, Department of Pathobiology
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Canada
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Ovine enzootic nasal tumor virus
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University of Guelph, Department of Pathobiology
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Ovine enzootic nasal tumor virus
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Ovine enzootic nasal tumor virus isolate ENTV-1NA7, complete genome
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| 101,325
|
NC_077220.1
|
Ovine picornavirus
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
| null |
Ovine picornavirus
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,557
|
RefSeq
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null | null |
SAMEA5337357
|
PRJNA485481
|
Ovine picornavirus genome assembly, complete genome: monopartite
|
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| 839
|
LR216006.1
|
Ovine picornavirus
| null |
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2019-03-25
| null |
Ovine picornavirus
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,557
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null | null |
SAMEA5337357
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PRJEB28719
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Ovine picornavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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Ovine picornavirus
| null |
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2019-03-25
| null |
Ovine picornavirus
| null |
Picornaviridae
|
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|
GenBank
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United Kingdom
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null | null |
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|
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Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
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2019-03-25
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Ovine picornavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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| 64,569
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Ovine picornavirus
| null |
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2019-03-25
| null |
Ovine picornavirus
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Picornaviridae
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|
GenBank
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United Kingdom
|
United Kingdom
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Ovine picornavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
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2019-03-25
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United Kingdom
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United Kingdom
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Ovis aries
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Ovine picornavirus genome assembly, complete genome: monopartite
|
AAAATGGAGTGCATATAGCATGGTTCCCATGCTGTATGCTACCCCATTTTCTTCCCTCCCCCTCCAACTACCTTTTCCCCCTCTATTGTAACTTAGAAGCTAATACACATAGCCCAATAGGGGCACCACACCCAGTGGTGTATAGGGCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCTTTGCCGTTAACCCCCACAGTACTACGCGACTGTTAGTAGGTAACGTAACTAGTGAAGGTTGATCCGGAGGTAAACCCCAACCTCCAGAAACGTGAGATGAGGGTTCAGTAACCCCCTATGGTAACATAGACTGATCCCTGCGCTGGCTCACGGGCTTCGTGCACTGAATCTAGGTAAAGTTACTGAAGCCACGAGTGTGCTACTGTGGTTTCCTCCAGCGCCTTGAATGCGGCTAACCCTAACCCCGGAGCACATGCATATAATCCAATATGTAGTGTGTCGTAATGAGTAATTCTGGGACGGGACCGACTACTTTAGGTTGCTGTGTTTCCTTTATTTTTATATATCAATTTATGGTGACAAGTTACAAGATGGCAGTTTTGAGTGTTTGCTGTGCTCCCTGCTTTGAGATTTTCCCCATTACCAATAGAAAGATTAAGTGTCACATCAGGTATTATGTTAAAACCGTGTCAGGAACTGCTTCTTTGGTTTACACACATTATGTTCCCTTTTCAAACAACATAAGAGTAAAGAGGAAATGTAATACAGGTGTTTCTCAGTCAAGACAGTCTTCAGGAAATCGAACAGAAAATTTGAGTGCTGATAATGGAGCCCAGATTACAACTGTCAATTATTATGGTGCATATTATGCTGGTGCAAAAGGTGAAGCAAGTCTGCAAATGGACCCTGAGAAATTTACTAAACCTATAGTAGAGTTGGCTAATGGCCCCGCCCTCAAGTCACCTAGCATAGAAGAATGTGGGTATTCAGACAGAATAATACAGCTAACAGCAGGCAATTCTACTATAACAACTCAGGAAGCAGCCAAAGCTATTGTTGCTTATGGTGAGTGGCCAGCTGACCAACAGTATAATAAAGGGCAGGCTGTTGACAAAATGACTAAACCAGGACCCAGTGTTGAAAGGTTCTATACTTTAGAATCATTCCAGTGGACATCAAATTTTAAAGGCAGAGCATACAGACTTCCAGGGTGTTTAACAGACATTGGAATGTTCGGACAGAATTGCCAGTATCACTACCTGCTAAATACAGGATATGCTATACATGTACAGGTTAATGCAACAAAGTTTCATGCAGGAATGCTTTATGTAGGTGTTATCCCAGAATGCCAGGTATCAGCTGAACCACAGGACATTATGGAATTGCAGGATGAACCCTTCTTTGCACAGTATCCCCTACATCAATTGCCTATTTTCCCTCACCAATTTATTAATTTAAGGACAAACAATTCAGCTACAATAATTGTGCCCTATATTAATTGTAATCCAAGTGATTCACCTCTAGCACATAATAACCTAACGCTGGTGATAGCCCAGGTGACATCATTAAGTTATGGCACAGGAGCCGCATCCTATGTGCCTATTACTGTTACAATTGGGCCATTAAACACATCTTTTTCAGGCATCCGTAATGCGGTTTTTGCCCAGGGTGTGCCAACCTTTTCTGTACCTGGCTCAGGCCAATTTGTTACTACCTTAAAGAATGATGGCTATCCAGTTATACCATTTTTTGAACAGGTTAAAGATGTCCATATCCCTGGTAGAGTGAGAAATTTGATGGAAGTTTGTGCAATTGATACATTTTGTGCTGCAGGTGAGGCATCCCAACCCTATTTCAATTTAAATGTTGGAGATTATAATGAAAATCCTATTAAGACATGGGATATGTCCCTGTTGTCAACATTGTTTAGTACAACATATCTTGGTAGATGTGCTAAGTTCTTTTCTCAGTATAGAGGATCAATTAAAATTACATTTACAATGTGTGGTACTGCACTAACTACAGGAAAATTATTACTTGCATATACACCACCAGGAGGAGATGCACCAGCAAAAAGATCAGATGCTATGTTAGGTACACACATGATATGGGATATAGGATTACAATCTTCTGTTACATTTATTATCCCGTACATTTCTGCCACACAGTACAGGTTTGCCAATGTATCTAATAATGTATTATCTTATTGTGGATATATAACTGTTTTTATGCAAACTGCCATAGTAACACCCCCTTCAACAGGAACAATAGTGCCCATCACAGTGATGGCATCTGCCTGTGATGATATGGAATTCAGATTGGCAACAGATAATGCTTATTATCAAGGAATAAATGATGACTTGACAGCATTGATAGAAAACAAAATTCAAACAGTACTTCAGAGTGTCAATGCTCCAGCTTCTTCTTCAAATTCTTTACCTTCCACACTTGCAATACAAGAGGGTGATGCTGTCGCACTGACAGCAACGGAGACTGGTGCATCATCATCTACCCAACCAGGTCAAGTCATGGAAACAAGGAAGATCCCATTGACTTTTAGCAAGTTAGAGACTAGTATTGAATCTTTCCTATCTAGGTATTCTCTCTTTTTCCAGGGTGAAATTAATACAAATTCTGCAGGAAATGGTTATGTTAGGGTACCATTGTGGGTCAATCAGAATGAGTCTACCCAGTTGGCTGTTAGAACAAAGTATAGAATGTTTACTTATCTTAAAATGCATTTTGATGTGGTTATAATAATAACATTAAAGGAAGGTGCACGGGCACAAAATCTGATTGTTACATCTACACAACCATATACTTTCCAAGCCATATTTTGTCCTGCTGGAGCACCAACACCCAGTAGATGGGATTCCCCTGAGTGGGTCGTACCAACAACTCCAAGCTGTTACTTCAAAACCACAGACCCACCTGCCTCAATGAGATTGCCTTTCATGAGCCCCTCTTTTGCTTACCCCATTTTTTATGATGGTTACTCAAATTTTGAGACAGAGACAAACCAGTATGGATTGTTTCCAGGCAATAATATAGGGGATATATTTATTAAGTGTTTAACCAAACACAATGTGACTGATTCTGTTGCTGGAAAATTTGATGTGAAATGCTTTGCCAGACCATTGGATATACAGGCGTGGTGCCCAAGACCCATTGTTACCCTGAAAGAAACAGTAAATGTTACAGCATCCAGAGGAAGGATTGAGGCTGTGTCCCACGAAACAGGCCACACCATTACACCACGAGTTGGTGATATGGGTGTTGATGTCAGGGTTCAGACTGGACCTAAGAAGAGCAGGGCGCGGCCACATATTAGGAATAATCCACCACCTTTTCACAAGAAGTATCCTGTCTTTAGACATGCACATGACCCAGATGTTTCTTTCCATGGGATACCAATAACAAAAGATATTATAGCTATTCCTTATCATTTAAGTTTTGATGCATTGTATATGGATGATGTTTATTGTGATTATCAAGTTTATTATTCATCATTGAATTATGATATAGTGTTAATCAAGTGTAAACATGATTATGAACCAGTACGCCTAATACCCCCTTCTGGTTATATGTGGTCCTCTTGTTATACAGGTTTGTTTTCTAAAACATATAGATTCACTAAGTATAAGGATCTCCCCATGTGTATATTTAATGAAAATGCTTACGTTGAAGAGCACACCCAGTATGGTATGGTTGAGTGCAACATACCCATACCTTCGGGCTGGTGTGGATCCCCTTTGTACAATTCTAGTGGAGTAATAGGCATGGCCACTGGAACAGATGATGAATGGTCAACTTTTACAGTTCTTCTTGAAGTGCCAGCTGTTGTTGGTCTTGTGACAGTGGAAGAACAAGGTATCACAGATATGACAGCCCAACTCTTCTCCACCCTTGGTTCAGCTTTTGGAAAATCTGCAGTTGAAAGTGCTGCTGCAGCGTTTAAAGAAAATGTTGATACAAGTGCCTATACTAATGAGACTATTAAAAGTGTTATAAACCTGCTAGTTAAAGCTATAACTGTTACAGTTATGATTGCTAAGTCAGAAGATAAAATAGCCACAGCTGTGGGTCTAGGTGTGCTACTAGGTACAGATTTGTTAGTAGGCTCCCCTTTTGATTGGCTGCGCAAGAAAGTATCAAACCTGCTAAATATAAAGGTTGCACAAGAGCAAGGCTTTGTGGATTGGCTCAAGGATTTTAATGTTGTCTGTTCATCCATGAAGTGGATTGATTGGATAGGGGAAAAGATAATGTCCTTCATAGATTGGATTAAATCCTTACTTGAGAAAGACCCAGAAAAAGAGCAATTTTTACAGGATGTTAAGCTATTACCAGACCTGTTAGCCAAATTTGATAAGATGGTTAGAAATCCCTATCGGATATCAAATTTAGAAAAAGAGAAATTGTGTGATTCTGTTATTAATTTGAAAATGAGAGCAGATAGGTATGGTGTTATTAGAAATTTTGCTACACAACAGTTAATGGATAAATATAATAAAGCAGTTTCAATGAAAGCTAGCATGAATAGGAAGAGATTTGAACCTATAGCAGTGTTGATTCATGGAAGCCCAGGCTCAGGTAAGAGTTTAACTACTATAGCAATAGGAAAAGTTTTGTCTAAATATTTGGGTGCTGAAGAACCCTATTCATTACCACCAGACCCTAAATATTTTGATGGCTATGAACAACAACCAGTAGTCATTATGGATGATGTAGCACAGAACCCAGATGGAGAAGACTTGAAACTCTTTTGCCAAATGGTTTCCACTACAACTTTTCATGTACCTATGGCTGACTTGCCTGATAAGGGCAAGACTTTTATTTCAGATTTTGTTTTAGCTTCTACTAATTGTGCTGGTGATTTGACTCCCCCTACTGTTAGAGAACCCTTAGCTATTAAGAGAAGATTTTTTCTTGATTTAGACATTGAGGTTAAGGATGAATATAAAATTAATGGTAGATTGGATGCCTCAAAGGCTTTGCAATCAGATGGTAAAAAATGTGCAAACTTTAAGAATTCGTGCCCCTTATTTA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| 64,571
|
NC_078374.1
|
Palo verde broom virus
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-06
|
P4
|
Emaravirus parkinsoniae
|
Emaravirus
|
Fimoviridae
|
ssRNA(-)
| 7,022
|
RefSeq
| null |
USA: Tucson, AZ
|
USA
| null | null |
2016
| null |
PRJNA485481
|
Palo verde broom virus isolate P4 segment RNA1, complete sequence
|
GTGATCTCCCAATATCAACCTGCTCTAGTATTCAAAGTATAATCAAAAGTGGTGAGTTTACTATAGAAGTATTATGCAAGGAACTTATTATATTAATTAATTTAAACCATGCTATATATCAAATTCAACTTCATCATCAACTATATAATAATACTTCAATAACATATATATAAAGATGACACAGAACTCCTGATATGTTATATCATCCTTACTTGAACAGAGCTCAAATAAATATGAATAAGGCTCAATTTCATACTGGAATTTATTATGTAGCTCCTCATGATATTCTAAATCTATTATTAATTGACTATTTAATTTATCTCTAATTGTTTTTAAATCACTAACCTTTCCTTTATCAGTATTGTACAAATTAGAGTCAATAGATAGACATTTAGCAATTTTTTTTAGGAATGGTGCTATTGAAGTTTCATCATCATCCATATACACTATGTTGTACAACTTTGAAATATTCTCTTTACTGAAATTGGTATACTTAACATTACTATTATTAAACATTGACTGTATTGTTGTATGACTTATATGTGTATATTCACTGGCTAAATAGGATCTGTCATATTTACATATATTTGTCATTAATATTATGTCATCATAATGATCCAATCCTCTGAGTTCTGTTATATAGTCAAAAAGCTTAGGTATCTCTATGATGTTCCTGTTCTTTATTATGAATTCTAATTTAACACTATTATACCTTTCGTTCCTCAGTGTTAGAATAAAACCATGGTCTTCCTGTGGTGATGCAACATCTATTGATGTATATGTGTATACTTTTATATTACACAATCTTCTATTTTCAGGGTCATACCTCATTGTTACATTTAGACCTTTTATATATACAGTCCAGTCAGTTTCTATATCCCTGGAATGTTGGACATTGTGTAAAATATTCTTATAATCCATTCTGAACTTTGAGATTAACCTTTCTACAATATGATTCAGATTTGTTATCCTTATATTGGTTAAATTAGGTTTGTAAAGCCTCATATTTACATGGTATTTATCCCCAAGATAATGCACTTTTACATTTAAAAAGACTCCTGATATGTGGTAATTAACCTCACTGAAATTTACACCAGAGTCTGTTGGTACGACCCAATGATTCATGGTGTAATTTGTATTCATCAAAGATTTAACTGCCATGTGGTCTGTTGCAAAGTTACACCTTTTGAGGAACAATGTTTTGTGTATATCATTAATTTTAAGAGAAGCATCCTGGAGGATTCTAAACACTGGCTGACCAGATATGACACCATGCTGAGATATATCATTCCACACTTCATCTGTGACCTTAGACCTAATATATGACAGATAATGCATGTCATCATTATACCTTTTATTTACATTGGCACTATAAACCTGATCATTGACTGATATATGTATTTTATGGCTCACCTTGTAGTTTATTATAAAACCTTCATGTTTATACATACCCAATCTGTTTAGTAAGTAATCATTTAAATCCCTTGATGACTTAGTTCCTATAAAAAGTTTACTTGTGACCCTATCTCTCAACATGAACGAATTCAATGTCATTAAAAAACTTCTAGGTGTTGTGTAATCAATGTTTGAACCATTAATGAAGTCATTATAATATTTCACCTGTAAAGCTTGAAATCTACATTTAATCCTATAAACTCTATTACTATAATCACCAAATTCCTGATTTTTTATAAGGAAATCTTCATAATTTTTAACAAATTTATACTTTGCATTTATATAGGTTTTAAAGTCATCATCTATATCTTCAGGATATTCATACATCTTCAAATTGATCTTCTCCAACTGCATTTCAGCCATACCTATCAATGTATCTGTTTTTTGGTCAATTTTATCCACATCAATGGATTTATTCTCAACAACAATATCCCTTATTATGGTTGTTATTGAATATCTACCATACTCAGGCTGATAGATACTCTTAGGTATAACAATCCTGAAATCAGCCCTATCTCGTGAAATTGAATAAACTTCCTCCTTGCAGTGATATAAATGCAGTGCAGCTGATGTTTGTTGGTCTGTGAACAGACTTAGTTGTAGATAATTAAGCAATTTTTCAGGTGTCATTATGTATTTTTTTGTCTCAAGCTTCAGTTTTTCATATATCTCAGAAATGGTCATGAGATTATAATCATCACTGAGATTGTACCTGTATATTTTTGCGTTACTTGTTATAATTCTTCTTGCATAGTCATACTGAGGCCTACTGAATATGAGTGAATTAATGAATTTTTTGTTGTTATAATTTGAAAGCAGGCGATCTCTTATCTCTGTATGATCTCTAGGATTTGCTATACACCACATAGGGTTCAATGCATCCAATTTTCTAAATTCATCCTCATTCTCTTTAAATTTATTATATGTATATGTATTCTTAGGCTTAACATTTTTAACTGTTGGTATTACGCTTAATAAATTTTGCTTCATTGTATCCTTCTCATAGAGTGTGTATGGGTCCTCTTGATCCTTTAGCAAATAATCTTCGAATGTTGTCATAAGACACATCTTTATGTAATTTTTAAATGGTTCGCAGTCTTCGACTTCTAAGTACCTGGTAATCAATTCCAATGTAAATATCTCTGAAAATGGCAGTGTGGATTTTTTATCTACAAATATGTTCATCTTTTCTATTATCCTATTCAATACTTTCAGTGGATCACCAGCATTATATGGTATTAAACCAGCAAAATCTATAGGTATTTTATATCTAGGTAATACTGATATTGGCATATCACTACAATAACTATCAATACCTAAGATAACATTATATGGGGACTTCTTAGATGATGCATTTAAGTTGTAAGTTGCTAGGACTAAATGATTTATTAAGCTAACAGTCACTTTTATTAATGTCATAGGAGCAGCATGCATAAAAGCATTATTTATATAACCTGAGAATGAAGCAAGGTCATCCACAGGTGAATCATAAGTGACATCTGAACTAATAGGTAAAAGGTCCGATAAATAGAAATAGAAAAGCTCATTACCTATTATTAGTGTTGATAGAAATTCCTTGTAAAAATTTGAGATATATGTCTTCTTTCTGTTTACAACTATACAGTGTTTTAGTGTTGACCACTGTATTAATGTGTATAAGAATGTGCCTATGAATTTATCTGACACATATGAATTACTATCTCTCATTATTAAAAAGTCATAACAACTGTCATCTGAATGGCAAAGGAAGTCCATGTAATTGTTCATACTATATTTTGAATTAAGGCACTCAAGCATTATTGACATTAAGTTTGCACAACAGCAGTGTACAAATGACGATGTTGCATTTAAATTACCTTGTAACCAATTAGAAGTAACTACTTGGTAATTCCTTGAATAATTTGCAGTCAAATCCTCATACCTTGTTATTTTTACATCATCAGATTGGAACCGTAAGATGTTATACAATGCGTTATCTGTTAGAACTATAAACTTTTTATAATACTTAGTTATCAAATATATATAAAACCACTTTTCTTCAGGTGTGAGAAATATATTTGTTGATATTGGTATTATGAATTTAGGTAGAACATCTCTTGCAGACCACTTTGAAGCATCACAAGAAACAGACAATATATCCGTTTTCCATTGGTTTTTCTTGTTATAATGTTTTCTTTTCTTTAACATATCTATCCTTTGGTCATACATCTTCTTGTGTTTCTTTTCACCAGCTATTGATATAGCCTCTTGAGGGACCATTTTATTTATTGTTTTAAATAATGTTTCAACTGGGTAGAGGCATAATCGACATGTTAAGTTACCAGTGTATATTTCTCTATCATTGAAAGATCTCTGATCCTTATAAAATATTTTTATAATAATGTCATTAGATTCCATATAGTTAGAATCATAAAAATCTCTTAATGTTTTACAACCTGTCCTGTCACATTCCTCAATAACACAGTCAAAAACTTTTGCAGAGTGTTGTTTAATTATATCAAGGTTTACAGGCTGTATGAATTCCTTTTTGAAGTCTTTAAAAACAATAAACTTATAACCATTAATTGTTTTAATAGCTACATCAGGTAATTTCTGTATTTTAGTGTAGGCCTCAAAATCATCACCATATAATTTAACTTTAGATTTACTATTCTCAAAGTTTCTATGGTTAATAGATAATATGGCTTTATTGAGTTCATAAACGAATTCATTTTCATTTGTTATTGCTGAATTCTTTATGTATGATTCTAAGGTGCGTAAATCTTTCACCTCATTTAGGTTATTTATATTCAATTGATCCGACCCTTGTGTCACCATTGATTTTGTGGAAGAAAATTGTGATTTCGTCAGTATAGATTCATCAAGAGCCAGATCCTGTTTTATATTGGTTCTTATTGTGTCACTCTGAGACCTCAAAGAAGAGTATGTCAGGAGTGTTGATAACCTCATGGCATTATAATCTATACCCTTAGATGTATTGTTTCTACCTTGTAGTATTGTACCTTCATTATCTTTCAGAAAGTCCTCATATTCTCTTTCAAACTGAACTGGAGTGTGGTATAATTTTAATAGCTCTTGTGGTGATCCATGCAGGCCTTTGTTACCTAAATAAAACAATAAATAACTTTCCTGTAAGATTTCTTTAGGGTTGTACACTTTGATCTTTGATATAGGCATAATCAGTTGATTTATTGAATTAAACCCTGTATCTATGATTTCATTTTGATCATTTATTTTTGTAGTCTTTAGACTTCTTAATATGATGGATCTCTGAGAAGGTGATTCTTCAATAGCTGTGAATATCCTATTCATTATATATATATGTGAAAATGTTGTTGGTCTACACTCTAACTTGTCCTTAATGAGTTCATCTGGGTTTGAAAATGTTGAGTAACATACCATCATTATATTTTTGAAGTTCTCTGTTATTGACAATGAGCTTAAAGTTACCATATTTGACATGAGCATTGCAAGCATCCTTGTGTCAAATTTTATTTTTGATGTTAAATTGTTGTAATATGTAATTAACTGTGTATATTTACAAAATGCATTTGACAACAGTTTCATTCTAGATAGATCCATTGATATAACTTTTGATATAATTATTCTATACGGACCTGACTCTACCATTGAATGTGCAATCCCTAATTTTTTATTAAGGTTGAATATATCCTTGCAGTTTTGATCTCTCATGAGTATTGACAGTGTTAAGTACCTGATGGGTGAGCCTTTCATAGGATCAGAATTAGGTAGCATGAGACATATTGTACAAGGATCTATTGTTTGAATCAGTCTAAATTTAGAATTTTTAACTGTTTCCAGAGCTATAAGGTTTTTTACCATAGAATGCTGGACATATAGGTAATCAATCATTTTGCCATCCTGTTCTGATACCTTCAGATTATACTCTATATCCGATTGCAAATGTGAATTAGGGTTTAAATCTCTTGAATAAGATTTATTATTGTATGAAATGTTATATACTGATTCAAACATCTCCTCAACTTTTTTTATATCACTAGACTTATCCTTGTAAGATAAACATTTAAGTTTATTATCATTCCTATTTCTGTCAAAACCACAGATTGATTCTTTTATGCTTCTTGCTCTATCAGTTGTGATACTAAATGCATTGTTGTGATATATGTTTATATCACACATTTCACCATAAAACAATGATCCTTTTTTATTCTTTTCTCTCTCCTCTTTCTCCTTATTTGGGCTTATGAGCATTTCGAGTGCATCATCCTTAAAAAGATCTTTAGCTAATCTCATTACACCAGTTGTGTATGAATCTCCACCATGCTCTTTAATTTTCGAGAACACACTAGAATAGAAATTCTTTCTAGACTGTTTGCCAATTTCAAAGCCTGGTATAAATGGGTAATAAATTGAAGGTCTATACTTTGATGTGAATGTGTATGTTTTCTTCGCTATCTGGTCTTGCAAGGTGGCAAGGTCTTCAATGTGTAATGCAGTTTGTGTGTAAAGACCCTCCTCTCTGTTTTTCATAAAATTCATGTTAAACTCATCAATACTATCATTACAAAATAATATACAATCATCCCTAATGTGATCGAGTCTTTCTTCAGTGTAATTTTTGTTAGTTATAAGAGATAAATGATCAATATCAACTTCAATATCTCTCCATTTATTACCAAAGAGTGATTTAATTATAGATGAGTTTTCATTATCTTCAAATCTACCTTTGAAACCAGTTATAAAGTCATCGTCTGTATCTATGGTGTTGTGAAACTCATTAAAATAAACAGACTCTGGTAGTTGGCAGTATTTTTGCCTCAACTCTGAGCAGATTGCTATAAAGTCATTAATTGTTTCAATGAGCACATTCTCCTGCATGGAATCAGTATCTATCACTATATCACCAATCTGTGTAAAACCAGCAGTATTATAATTTATGACCACAACAAGGTCGTCACCAACAAACCTCTTGTACTTCTCATAAAACAAAACTAGATCTGTCTTCACAGTCACTTTAACTTCAATGATTATATTCCTCTTCTCTGCTTCATCACAAAATAATATATCAGGTGTAGACTTTGTTGGTATGTCTTGATAGTAATCAGACAGTTTGAAATCTTGGGCTATAAACCTATACTTCTGCATCAGAGAGGACTTAATAACCTCAATCATCATGTCATGCCTAGCCATTTCAAGTAATTGTATTATTATAAAGACAATGTCAAGATAATACTTGTTGACCGGTTTGTGCAGGATCCTCTGTGCTATAGGGTACAACTTTGTTGCAACTAACATATCACCTTCAAATCTCTCCCTATAAACCCTCTCAGGTGTTGGCTTATGGCTGAGCATAGTCAATCTTGACCTCCCTCTACCTATGAGTGATAAGAACTCATCAAGTAGAGAATTGTAATCATCATCTATGTCCCTGTTTCTTATTTTTTCAAGATAATCACTTATATAAGCATTTTTAGCCTTCCTCTCAGAATCCTTAGAATTGATTTTCATCTTCTTGGTAGACATCCTGCTATCTTACCAGCTTTCTATAAAATGTTTTGAACACTATTTGTTGTTGTTATTGGGAG
| 133
|
MF766024.1
|
Palo verde broom virus
|
Ilyas,M., Avelar,U., Schuch,U.K., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2018-05-12
|
P3
|
Emaravirus parkinsoniae
|
Emaravirus
|
Fimoviridae
|
ssRNA(-)
| 7,015
|
GenBank
| null |
USA: Tucson, AZ
|
USA
| null | null |
2015
| null | null |
Palo verde broom virus isolate P3 segment RNA1, complete sequence
|
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| 70,785
|
MF766025.1
|
Palo verde broom virus
|
Ilyas,M., Avelar,U., Schuch,U.K., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2018-05-12
|
P4
|
Emaravirus parkinsoniae
|
Emaravirus
|
Fimoviridae
|
ssRNA(-)
| 7,022
|
GenBank
| null |
USA: Tucson, AZ
|
USA
| null | null |
2016
| null | null |
Palo verde broom virus isolate P4 segment RNA1, complete sequence
|
GTGATCTCCCAATATCAACCTGCTCTAGTATTCAAAGTATAATCAAAAGTGGTGAGTTTACTATAGAAGTATTATGCAAGGAACTTATTATATTAATTAATTTAAACCATGCTATATATCAAATTCAACTTCATCATCAACTATATAATAATACTTCAATAACATATATATAAAGATGACACAGAACTCCTGATATGTTATATCATCCTTACTTGAACAGAGCTCAAATAAATATGAATAAGGCTCAATTTCATACTGGAATTTATTATGTAGCTCCTCATGATATTCTAAATCTATTATTAATTGACTATTTAATTTATCTCTAATTGTTTTTAAATCACTAACCTTTCCTTTATCAGTATTGTACAAATTAGAGTCAATAGATAGACATTTAGCAATTTTTTTTAGGAATGGTGCTATTGAAGTTTCATCATCATCCATATACACTATGTTGTACAACTTTGAAATATTCTCTTTACTGAAATTGGTATACTTAACATTACTATTATTAAACATTGACTGTATTGTTGTATGACTTATATGTGTATATTCACTGGCTAAATAGGATCTGTCATATTTACATATATTTGTCATTAATATTATGTCATCATAATGATCCAATCCTCTGAGTTCTGTTATATAGTCAAAAAGCTTAGGTATCTCTATGATGTTCCTGTTCTTTATTATGAATTCTAATTTAACACTATTATACCTTTCGTTCCTCAGTGTTAGAATAAAACCATGGTCTTCCTGTGGTGATGCAACATCTATTGATGTATATGTGTATACTTTTATATTACACAATCTTCTATTTTCAGGGTCATACCTCATTGTTACATTTAGACCTTTTATATATACAGTCCAGTCAGTTTCTATATCCCTGGAATGTTGGACATTGTGTAAAATATTCTTATAATCCATTCTGAACTTTGAGATTAACCTTTCTACAATATGATTCAGATTTGTTATCCTTATATTGGTTAAATTAGGTTTGTAAAGCCTCATATTTACATGGTATTTATCCCCAAGATAATGCACTTTTACATTTAAAAAGACTCCTGATATGTGGTAATTAACCTCACTGAAATTTACACCAGAGTCTGTTGGTACGACCCAATGATTCATGGTGTAATTTGTATTCATCAAAGATTTAACTGCCATGTGGTCTGTTGCAAAGTTACACCTTTTGAGGAACAATGTTTTGTGTATATCATTAATTTTAAGAGAAGCATCCTGGAGGATTCTAAACACTGGCTGACCAGATATGACACCATGCTGAGATATATCATTCCACACTTCATCTGTGACCTTAGACCTAATATATGACAGATAATGCATGTCATCATTATACCTTTTATTTACATTGGCACTATAAACCTGATCATTGACTGATATATGTATTTTATGGCTCACCTTGTAGTTTATTATAAAACCTTCATGTTTATACATACCCAATCTGTTTAGTAAGTAATCATTTAAATCCCTTGATGACTTAGTTCCTATAAAAAGTTTACTTGTGACCCTATCTCTCAACATGAACGAATTCAATGTCATTAAAAAACTTCTAGGTGTTGTGTAATCAATGTTTGAACCATTAATGAAGTCATTATAATATTTCACCTGTAAAGCTTGAAATCTACATTTAATCCTATAAACTCTATTACTATAATCACCAAATTCCTGATTTTTTATAAGGAAATCTTCATAATTTTTAACAAATTTATACTTTGCATTTATATAGGTTTTAAAGTCATCATCTATATCTTCAGGATATTCATACATCTTCAAATTGATCTTCTCCAACTGCATTTCAGCCATACCTATCAATGTATCTGTTTTTTGGTCAATTTTATCCACATCAATGGATTTATTCTCAACAACAATATCCCTTATTATGGTTGTTATTGAATATCTACCATACTCAGGCTGATAGATACTCTTAGGTATAACAATCCTGAAATCAGCCCTATCTCGTGAAATTGAATAAACTTCCTCCTTGCAGTGATATAAATGCAGTGCAGCTGATGTTTGTTGGTCTGTGAACAGACTTAGTTGTAGATAATTAAGCAATTTTTCAGGTGTCATTATGTATTTTTTTGTCTCAAGCTTCAGTTTTTCATATATCTCAGAAATGGTCATGAGATTATAATCATCACTGAGATTGTACCTGTATATTTTTGCGTTACTTGTTATAATTCTTCTTGCATAGTCATACTGAGGCCTACTGAATATGAGTGAATTAATGAATTTTTTGTTGTTATAATTTGAAAGCAGGCGATCTCTTATCTCTGTATGATCTCTAGGATTTGCTATACACCACATAGGGTTCAATGCATCCAATTTTCTAAATTCATCCTCATTCTCTTTAAATTTATTATATGTATATGTATTCTTAGGCTTAACATTTTTAACTGTTGGTATTACGCTTAATAAATTTTGCTTCATTGTATCCTTCTCATAGAGTGTGTATGGGTCCTCTTGATCCTTTAGCAAATAATCTTCGAATGTTGTCATAAGACACATCTTTATGTAATTTTTAAATGGTTCGCAGTCTTCGACTTCTAAGTACCTGGTAATCAATTCCAATGTAAATATCTCTGAAAATGGCAGTGTGGATTTTTTATCTACAAATATGTTCATCTTTTCTATTATCCTATTCAATACTTTCAGTGGATCACCAGCATTATATGGTATTAAACCAGCAAAATCTATAGGTATTTTATATCTAGGTAATACTGATATTGGCATATCACTACAATAACTATCAATACCTAAGATAACATTATATGGGGACTTCTTAGATGATGCATTTAAGTTGTAAGTTGCTAGGACTAAATGATTTATTAAGCTAACAGTCACTTTTATTAATGTCATAGGAGCAGCATGCATAAAAGCATTATTTATATAACCTGAGAATGAAGCAAGGTCATCCACAGGTGAATCATAAGTGACATCTGAACTAATAGGTAAAAGGTCCGATAAATAGAAATAGAAAAGCTCATTACCTATTATTAGTGTTGATAGAAATTCCTTGTAAAAATTTGAGATATATGTCTTCTTTCTGTTTACAACTATACAGTGTTTTAGTGTTGACCACTGTATTAATGTGTATAAGAATGTGCCTATGAATTTATCTGACACATATGAATTACTATCTCTCATTATTAAAAAGTCATAACAACTGTCATCTGAATGGCAAAGGAAGTCCATGTAATTGTTCATACTATATTTTGAATTAAGGCACTCAAGCATTATTGACATTAAGTTTGCACAACAGCAGTGTACAAATGACGATGTTGCATTTAAATTACCTTGTAACCAATTAGAAGTAACTACTTGGTAATTCCTTGAATAATTTGCAGTCAAATCCTCATACCTTGTTATTTTTACATCATCAGATTGGAACCGTAAGATGTTATACAATGCGTTATCTGTTAGAACTATAAACTTTTTATAATACTTAGTTATCAAATATATATAAAACCACTTTTCTTCAGGTGTGAGAAATATATTTGTTGATATTGGTATTATGAATTTAGGTAGAACATCTCTTGCAGACCACTTTGAAGCATCACAAGAAACAGACAATATATCCGTTTTCCATTGGTTTTTCTTGTTATAATGTTTTCTTTTCTTTAACATATCTATCCTTTGGTCATACATCTTCTTGTGTTTCTTTTCACCAGCTATTGATATAGCCTCTTGAGGGACCATTTTATTTATTGTTTTAAATAATGTTTCAACTGGGTAGAGGCATAATCGACATGTTAAGTTACCAGTGTATATTTCTCTATCATTGAAAGATCTCTGATCCTTATAAAATATTTTTATAATAATGTCATTAGATTCCATATAGTTAGAATCATAAAAATCTCTTAATGTTTTACAACCTGTCCTGTCACATTCCTCAATAACACAGTCAAAAACTTTTGCAGAGTGTTGTTTAATTATATCAAGGTTTACAGGCTGTATGAATTCCTTTTTGAAGTCTTTAAAAACAATAAACTTATAACCATTAATTGTTTTAATAGCTACATCAGGTAATTTCTGTATTTTAGTGTAGGCCTCAAAATCATCACCATATAATTTAACTTTAGATTTACTATTCTCAAAGTTTCTATGGTTAATAGATAATATGGCTTTATTGAGTTCATAAACGAATTCATTTTCATTTGTTATTGCTGAATTCTTTATGTATGATTCTAAGGTGCGTAAATCTTTCACCTCATTTAGGTTATTTATATTCAATTGATCCGACCCTTGTGTCACCATTGATTTTGTGGAAGAAAATTGTGATTTCGTCAGTATAGATTCATCAAGAGCCAGATCCTGTTTTATATTGGTTCTTATTGTGTCACTCTGAGACCTCAAAGAAGAGTATGTCAGGAGTGTTGATAACCTCATGGCATTATAATCTATACCCTTAGATGTATTGTTTCTACCTTGTAGTATTGTACCTTCATTATCTTTCAGAAAGTCCTCATATTCTCTTTCAAACTGAACTGGAGTGTGGTATAATTTTAATAGCTCTTGTGGTGATCCATGCAGGCCTTTGTTACCTAAATAAAACAATAAATAACTTTCCTGTAAGATTTCTTTAGGGTTGTACACTTTGATCTTTGATATAGGCATAATCAGTTGATTTATTGAATTAAACCCTGTATCTATGATTTCATTTTGATCATTTATTTTTGTAGTCTTTAGACTTCTTAATATGATGGATCTCTGAGAAGGTGATTCTTCAATAGCTGTGAATATCCTATTCATTATATATATATGTGAAAATGTTGTTGGTCTACACTCTAACTTGTCCTTAATGAGTTCATCTGGGTTTGAAAATGTTGAGTAACATACCATCATTATATTTTTGAAGTTCTCTGTTATTGACAATGAGCTTAAAGTTACCATATTTGACATGAGCATTGCAAGCATCCTTGTGTCAAATTTTATTTTTGATGTTAAATTGTTGTAATATGTAATTAACTGTGTATATTTACAAA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| 70,786
|
MF766026.1
|
Palo verde broom virus
|
Ilyas,M., Avelar,U., Schuch,U.K., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2018-05-12
|
P5
|
Emaravirus parkinsoniae
|
Emaravirus
|
Fimoviridae
|
ssRNA(-)
| 7,015
|
GenBank
| null |
USA: Tucson, AZ
|
USA
| null | null |
2015
| null | null |
Palo verde broom virus isolate P5 segment RNA1, complete sequence
|
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| 70,787
|
MF766027.1
|
Palo verde broom virus
|
Ilyas,M., Avelar,U., Schuch,U.K., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2018-05-12
|
P8
|
Emaravirus parkinsoniae
|
Emaravirus
|
Fimoviridae
|
ssRNA(-)
| 7,018
|
GenBank
| null |
USA: Tucson, AZ
|
USA
| null | null |
2016
| null | null |
Palo verde broom virus isolate P8 segment RNA1, complete sequence
|
CTCCCAATATCAACCTGCTCTAGTATTCAAAGTATAATCAAAAGTGGTGAGTTTACTATAGAAGTATTATGCAAGGAACTTATTATATTAATTAATTTAAACCATGCTATATATCAAATTCAACTTCATCATCAACTATATAATAATACTTCAATAACATATATATAAAGATGACACAGAACTCCTGATATGTTATATCATCCTTACTTGAACAGAGCTCAAATAAATATGAATAAGGCTCAATTTCATACTGGAATTTATTATGTAGCTCCTCATGATATTCTAAATCTATTATTAATTGACTATTTAATTTATCTCTAATTGTTTTTAAATCACTAACCTTTCCTTTATCAGTATTGTACAAATTAGAGTCAATAGATAGACATTTAGCAATTTTTTTTAGGAATGGTGCTATTGAAGTTTCATCATCATCCATATACACTATGTTGTACAACTTTGAAATATTCTCTTTACTGAAATTGGTATACTTAACATTACTATTATTAAACATTGACTGTATTGTTGTATGACTTATATGTGTATATTCACTGGCTAAATAGGATCTGTCATATTTACATATATTTGTCATTAATATTATGTCATCATAATGATCCAATCCTCTGAGTTCTGTTATATAGTCAAAAAGCTTAGGTATCTCTATGATGTTCCTGTTCTTTATTATGAATTCTAATTTAACACTATTATACCTTTCGTTCCTCAGTGTTAGAATAAAACCATGGTCTTCCTGTGGTGATGCAACATCTATTGATGTATATGTGTATACTTTTATATTACACAATCTTCTATTTTCAGGGTCATACCTCATTGTTACATTTAGACCTTTTATATATACAGTCCAGTCAGTTTCTATATCCCTGGAATGTTGGACATTGTGTAAAATATTCTTATAATCCATTCTGAACTTTGAGATTAACCTTTCTACAATATGATTCAGATTTGTTATCCTTATATTGGTTAAATTAGGTTTGTAAAGCCTCATATTTACATGGTATTTATCCCCAAGATAATGCACTTTTACATTTAAAAAGACTCCTGATATGTGGTAATTAACCTCACTGAAATTTACACCAGAGTCTGTTGGTACGACCCAATGATTCATGGTGTAATTTGTATTCATCAAAGATTTAACTGCCATGTGGTCTGTTGCAAAGTTACACCTTTTGAGGAACAATGTTTTGTGTATATCATTAATTTTAAGAGAAGCATCCTGGAGGATTCTAAACACTGGCTGACCAGATATGACACCATGCTGAGATATATCATTCCACACTTCATCTGTGACCTTAGACCTAATATATGACAGATAATGCATGTCATCATTATACCTTTTATTTACATTGGCACTATAAACCTGATCATTGACTGATATATGTATTTTATGGCTCACCTTGTAGTTTATTATAAAACCTTCATGTTTATACATACCCAATCTGTTTAGTAAGTAATCATTTAAATCCCTTGATGACTTAGTTCCTATAAAAAGTTTACTTGTGACCCTATCTCTCAACATGAACGAATTCAATGTCATTAAAAAACTTCTAGGTGTTGTGTAATCAATGTTTGAACCATTAATGAAGTCATTATAATATTTCACCTGTAAAGCTTGAAATCTACATTTAATCCTATAAACTCTATTACTATAATCACCAAATTCCTGATTTTTTATAAGGAAATCTTCATAATTTTTAACAAATTTATACTTTGCATTTATATAGGTTTTAAAGTCATCATCTATATCTTCAGGATATTCATACATCTTCAAATTGATCTTCTCCAACTGCATTTCAGCCATACCTATCAATGTATCTGTTTTTTGGTCAATTTTATCCACATCAATGGATTTATTCTCAACAACAATATCCCTTATTATGGTTGTTATTGAATATCTACCATACTCAGGCTGATAGATACTCTTAGGTATAACAATCCTGAAATCAGCCCTATCTCGTGAAATTGAATAAACTTCCTCCTTGCAGTGATATAAATGCAGTGCAGCTGATGTTTGTTGGTCTGTGAACAGACTTAGTTGTAGATAATTAAGCAATTTTTCAGGTGTCATTATGTATTTTTTTGTCTCAAGCTTCAGTTTTTCATATATCTCAGAAATGGTCATGAGATTATAATCATCACTGAGATTGTACCTGTATATTTTTGCGTTACTTGTTATAATTCTTCTTGCATAGTCATACTGAGGCCTACTGAATATGAGTGAATTAATGAATTTTTTGTTGTTATAATTTGAAAGCAGGCGATCTCTTATCTCTGTATGATCTCTAGGATTTGCTATACACCACATAGGGTTCAATGCATCCAATTTTCTAAATTCATCCTCATTCTCTTTAAATTTATTATATGTATATGTATTCTTAGGCTTAACATTTTTAACTGTTGGTATTACGCTTAATAAATTTTGCTTCATTGTATCCTTCTCATAGAGTGTGTATGGGTCCTCTTGATCCTTTAGCAAATAATCTTCGAATGTTGTCATAAGACACATCTTTATGTAATTTTTAAATGGTTCGCAGTCTTCGACTTCTAAGTACCTGGTAATCAATTCCAATGTAAATATCTCTGAAAATGGCAGTGTGGATTTTTTATCTACAAATATGTTCATCTTTTCTATTATCCTATTCAATACTTTCAGTGGATCACCAGCATTATATGGTATTAAACCAGCAAAATCTATAGGTATTTTATATCTAGGTAATACTGATATTGGCATATCACTACAATAACTATCAATACCTAAGATAACATTATATGGGGACTTCTTAGATGATGCATTTAAGTTGTAAGTTGCTAGGACTAAATGATTTATTAAGCTAACAGTCACTTTTATTAATGTCATAGGAGCAGCATGCATAAAAGCATTATTTATATAACCTGAGAATGAAGCAAGGTCATCCACAGGTGAATCATAAGTGACATCTGAACTAATAGGTAAAAGGTCCGATAAATAGAAATAGAAAAGCTCATTACCTATTATTAGTGTTGATAGAAATTCCTTGTAAAAATTTGAGATATATGTCTTCTTTCTGTTTACAACTATACAGTGTTTTAGTGTTGACCACTGTATTAATGTGTATAAGAATGTGCCTATGAATTTATCTGACACATATGAATTACTATCTCTCATTATTAAAAAGTCATAACAACTGTCATCTGAATGGCAAAGGAAGTCCATGTAATTGTTCATACTATATTTTGAATTAAGGCACTCAAGCATTATTGACATTAAGTTTGCACAACAGCAGTGTACAAATGACGATGTTGCATTTAAATTACCTTGTAACCAATTAGAAGTAACTACTTGGTAATTCCTTGAATAATTTGCAGTCAAATCCTCATACCTTGTTATTTTTACATCATCAGATTGGAACCGTAAGATGTTATACAATGCGTTATCTGTTAGAACTATAAACTTTTTATAATACTTAGTTATCAAATATATATAAAACCACTTTTCTTCAGGTGTGAGAAATATATTTGTTGATATTGGTATTATGAATTTAGGTAGAACATCTCTTGCAGACCACTTTGAAGCATCACAAGAAACAGACAATATATCCGTTTTCCATTGGTTTTTCTTGTTATAATGTTTTCTTTTCTTTAACATATCTATCCTTTGGTCATACATCTTCTTGTGTTTCTTTTCACCAGCTATTGATATAGCCTCTTGAGGGACCATTTTATTTATTGTTTTAAATAATGTTTCAACTGGGTAGAGGCATAATCGACATGTTAAGTTACCAGTGTATATTTCTCTATCATTGAAAGATCTCTGATCCTTATAAAATATTTTTATAATAATGTCATTAGATTCCATATAGTTAGAATCATAAAAATCTCTTAATGTTTTACAACCTGTCCTGTCACATTCCTCAATAACACAGTCAAAAACTTTTGCAGAGTGTTGTTTAATTATATCAAGGTTTACAGGCTGTATGAATTCCTTTTTGAAGTCTTTAAAAACAATAAACTTATAACCATTAATTGTTTTAATAGCTACATCAGGTAATTTCTGTATTTTAGTGTAGGCCTCAAAATCATCACCATATAATTTAACTTTAGATTTACTATTCTCAAAGTTTCTATGGTTAATAGATAATATGGCTTTATTGAGTTCATAAACGAATTCATTTTCATTTGTTATTGCTGAATTCTTTATGTATGATTCTAAGGTGCGTAAATCTTTCACCTCATTTAGGTTATTTATATTCAATTGATCCGACCCTTGTGTCACCATTGATTTTGTGGAAGAAAATTGTGATTTCGTCAGTATAGATTCATCAAGAGCCAGATCCTGTTTTATATTGGTTCTTATTGTGTCACTCTGAGACCTCAAAGAAGAGTATGTCAGGAGTGTTGATAACCTCATGGCATTATAATCTATACCCTTAGATGTATTGTTTCTACCTTGTAGTATTGTACCTTCATTATCTTTCAGAAAGTCCTCATATTCTCTTTCAAACTGAACTGGAGTGTGGTATAATTTTAATAGCTCTTGTGGTGATCCATGCAGGCCTTTGTTACCTAAATAAAACAATAAATAACTTTCCTGTAAGATTTCTTTAGGGTTGTACACTTTGATCTTTGATATAGGCATAATCAGCTGATTTATTGAATTAAACCCTGTATCTATGATTTCATTTTGATCATTTATTTTTGTAGTCTTTAGACTTCTTAATATGATGGATCTCTGAGAAGGTGATTCTTCAATAGCTGTGAATATCCTATTCATTATATATATATGTGAAAATGTTGTTGGTCTACACTCTAACTTGTCCTTAATGAGTTCATCTGGGTTTGAAAATGTTGAGTAACATACCATCATTATATTTTTGAAGTTCTCTGTTATTGACAATGAGCTTAAAGTTACCATATTTGACATGAGCATTGCAAGCATCCTTGTGTCAAATTTTATTTTTGATGTTAAATTGTTGTAATATGTAATTAACTGTGTATATTTACAAAATGCA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| 70,788
|
MF766028.1
|
Palo verde broom virus
|
Ilyas,M., Avelar,U., Schuch,U.K., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2018-05-12
|
P9
|
Emaravirus parkinsoniae
|
Emaravirus
|
Fimoviridae
|
ssRNA(-)
| 7,025
|
GenBank
| null |
USA: Tucson, AZ
|
USA
| null | null |
2016
| null | null |
Palo verde broom virus isolate P9 segment RNA1, complete sequence
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| 70,789
|
OP288969.1
|
Pangolin coronavirus
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Gong,W., Mi,S., Jiang,J., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-30
|
HKU4/GX-2020
|
Pangolin coronavirus
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,358
|
GenBank
| null |
China: Guangxi
|
China
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Manis javanica
| null |
2020
| null | null |
Pangolin coronavirus isolate HKU4/GX-2020, complete genome
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| 13,162
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MW532698.1
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Pangolin coronavirus
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Lu,S., Fan,H., Liu,Y., Wang,L., Liu,W., Liu,C., An,X., Liu,Z., Zhu,S., Chen,Z., Tong,Y., Song,L.
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Beijing University of Chemical Technology, College of Life Science and Technology
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China
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2022-02-01
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GX_P2V
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Pangolin coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,729
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GenBank
| null | null | null |
Pholidota
| null | null | null | null |
Pangolin coronavirus isolate GX_P2V, complete genome
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| 33,170
|
MT121216.1
|
Pangolin coronavirus
|
Liu,P., Jiang,J.Z., Wan,X.F., Hua,Y., Li,L., Zhou,J., Wang,X., Hou,F., Chen,J., Zou,J.
|
Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Animals Endemic Disease
|
China
|
2020-05-18
|
MP789
|
Pangolin coronavirus
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,521
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Manis javanica
|
lung
|
2019-03-29
| null | null |
Pangolin coronavirus isolate MP789, complete genome
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| 50,441
|
MT040333.1
|
Pangolin coronavirus
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Cao,W., Jia,N., Zhang,Y., Tong,Y., Jiang,J., Jiang,B., Li,J., Yuan,T., Li,W., Qiang,X., Qin,S., Pei,G.
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2020-04-01
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PCoV_GX-P4L
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Pangolin coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,805
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GenBank
| null |
China
|
China
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Manis javanica
| null |
2017
| null | null |
Pangolin coronavirus isolate PCoV_GX-P4L, complete genome
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| 53,029
|
MT040334.1
|
Pangolin coronavirus
|
Cao,W., Jia,N., Zhang,Y., Tong,Y., Jiang,J., Jiang,B., Li,J., Yuan,T., Li,W., Qiang,X., Qin,S., Pei,G.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2020-04-01
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PCoV_GX-P1E
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Pangolin coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,801
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Manis javanica
| null |
2017
| null | null |
Pangolin coronavirus isolate PCoV_GX-P1E, complete genome
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| 53,030
|
MT040335.1
|
Pangolin coronavirus
|
Cao,W., Jia,N., Zhang,Y., Tong,Y., Jiang,J., Jiang,B., Li,J., Yuan,T., Li,W., Qiang,X., Qin,S., Pei,G.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2020-04-01
|
PCoV_GX-P5L
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Pangolin coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,806
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Manis javanica
| null |
2017
| null | null |
Pangolin coronavirus isolate PCoV_GX-P5L, complete genome
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| 53,031
|
MT040336.1
|
Pangolin coronavirus
|
Cao,W., Jia,N., Zhang,Y., Tong,Y., Jiang,J., Jiang,B., Li,J., Yuan,T., Li,W., Qiang,X., Qin,S., Pei,G.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2020-04-01
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PCoV_GX-P5E
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Pangolin coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,802
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Manis javanica
| null |
2017
| null | null |
Pangolin coronavirus isolate PCoV_GX-P5E, complete genome
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| 53,032
|
MT072864.1
|
Pangolin coronavirus
|
Cao,W., Jia,N., Zhang,Y., Tong,Y., Jiang,J., Jiang,B., Li,J., Yuan,T., Li,W., Qiang,X., Qin,S., Pei,G.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2020-04-01
|
PCoV_GX-P2V
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Pangolin coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,795
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin coronavirus isolate PCoV_GX-P2V, complete genome
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| 53,033
|
ON024072.1
|
Pangolin hunnivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME1
|
Pangolin hunnivirus
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,146
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin hunnivirus strain PHV/BIME1/P031T/pangolin/2018, complete genome
|
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| 30,176
|
ON024073.1
|
Pangolin hunnivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME1
|
Pangolin hunnivirus
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,144
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin hunnivirus strain PHV/BIME1/P032T/pangolin/2018, complete genome
|
CTCTTTTCCCCCTTTCCTTTTTTCCCTTTGTAACTTTTCTTGTAATTTTACAATAATTTCCCCAATGTGCTTAAGGAGACCACCACTTAGTGACCTCTGAAAGACATTTGGTGTCAGTTTTGAATTTTCTCACCTTCAGGTTAAGGCGCAACTTGGCTTAAGACGCTTGTAATACAGCATTGTTGATGACCTTCTTACTTGGAGTCAAACACAGACTTTTCTTGTTTCTACTTCCTCTGGCGCTCGCCAGGGGTTGCGGAGTTGCCTCTCCCGTCGTTTCTTGGAGTGCGCCACCAGCATCTTGCTGGAACTATGGGCACAAGAGGCGCCAGAGCCAATACCTTGGATGTCTGATGCTGCTGTGTATGTACACTGGAATAAGCATGATCGGAGAAATCCGTTCCAATTGTCTGCGGAACAACAGTGGGTGACCACTGCCTCAGAGGCCGAAAGCCACGGGGTTCACAGCCCCCTTTTGGAATTGCTTGCATGTTGTGCTTAGAGTAGGTGTGCTTACCAGTACTGTTGGACATTTGATGCACGCTCTGGTTGCAGGGCTAAGGATGCCCATAAGGTACCCGCACGTAACCTTTAGAGAGTGTGGATCTGATATGGGGAATGGTATTGCTTTACAATGACCATTTTAAAAAACGTCTATGCCCTGCGAAAGCCGGGGGATCCGGCTTTTCTTTTTTTTTTATACAAGATTTTATGGTTAAAATAATTTGTGTTCAGATTGGTTCAATAATTGTTGTTTACTATCCAAGTGAGTACAATACATCCAGTCATGGGTTCAGGCGGAAGTAAGCAAGAATCAGGAAACACCAATAACACCGGTAATCATGGTGTCATAAATTATAACTTTTACAATCAACAGTGGCAGAATTCTGTGGATTTGGAAGGTGCCCTGCAGCATACTGAGACTTCCTACGGTGGTACAGGTGGTGGTGGCTCCCAACATAATAAAGACAGTAATTTACTGTCTACAGGAATACAAGCCGCCGCGAACATTCTACCTCTGTTGGCTGACAGTGTTGTAGAAGACTTTGAGAATTCTGACAGAATTTCTAAGACTCAGGCAGGTGCTACCACTTTAATATCTCAGCACCAAGTGGGGCGTATGCTCTACACTGGTAAACATGATAACTGCTCACCTTCTAGTGCTGCTGACCAGCCTACCACTGCTGGCCCCTCCATCGATCGCTTCATAACGATGCCGATTGGTGAATGGTCCACCTCTATTTCTGTCTATGGTGGCTGGGCAGCTCCTCTTCCTTGGGTTCCCTTGACACAACAAACTCCATTTGCTGCTTTGGCACGCCGCCACTTTTTGCTTAATTGTGGGTGGCACGTGCAGGTTCAGGTCAATAGCACCCGGTTTCACGGTGGTGCTTTGGGGTGCTTTTTAGTACCTCAGTTTGTTTATACCAACCAATCTAGCTTGCATCTGACCCCTATTACTCCCGAGGACCACCCGCAGTTTTCAAATCAGCAGCTTTTTCTGTTTCCTCACCAGATAATAAATCCCCGGACGAATTCTTCAGCAGAAATAATAGTTCCTTATGCCAATAACACCCCCAGCTGTGACCCAACGCAACAAGCTCCATGGACTTTGTTAATAGTAGTTTTGTCACCTCTGTCTTATGCCTCTGGAGCCACAACTTCACTCACCGTGTACGCGTCTTTCCGTCCCCTTGAGGCTGAATTTCATGGCATAAGACAGTCTAATTCTGACTTCCAGGGTCTTCCTAAGGTTCGGAATGAGAGTGCCTCCTACACTTTTTGTTCTTCACAGCCTAATGCTACTGAACCTGATTATGGAGCTATTACCCGTTCTTCTCCACGATTTTTACCCGCCCAAGTTACTGATCTTTTGCAAATTTCTTCTATACCTACTCTTGTTTCTGAGAGAGCTGTTTTGTTTACACAAACGGCCGCAGACAAGCCCTTAATGACAATGAATGTTTCTTTGACTGCAACAGATTTACTAAATACTTCCTTAGAAAGTGTGTCCCGAGGTTTTGCCCAATACAGGGGCAGTATAGCTATGAAAATGCTTTTTACAGGTAATCAAATGCAAAATACCCGGTTTGTGGCTGCTTATACCCCTCCTGGAGCTGATCCCCCTGCTAATCGACAACAGGCTTTAGAAGGTTTGTATACTGTCTTTGATACTGGTCTTAATTCTTCAGCAGAATTTGTTATACCTTTCATTTCTACCACAGATTACAGATACTGCAATGCAGTGACTGGAATAGAGGTTGGGTCTGCCGGATACTTTACGTTGTGGCAGATGACTAACCTAGCTGTTCCACCTGGCTCACCTGCTACTGCAGAACTTCTAGTTTTTGCCTCCTCGGGTCAGGACTTTGAGTGGCGTGCTGTGACTTCACCTTACCTTGCTTTTCAAGGCGAGTCCACTCAAGTTATGCCTGGTGAAACTGGGCAGACTTCTGAGCCGACTGCTGCCAATTCTAATGCTGTGGTTGTTCCTATACCATATAATTCTTCTAGGCTTTCCAACAGTAGTCTTAGGTTTTGGTTTGATAGGTATTTTCTTATAGATGCAATTCCTGTTCATCAAAAGACTAGTGCTACAGACTTGTTCCTGCTTCAATGGCCAAACATTTTGTGGCGACTGCCAGAGGTTCTTGGTATGTTGCACTGCACTTATGTTAGATTTGAATTAGAAATAGCTTTTAGACCTTGGAACAAGGACTCTTTGGACATGGAAATGGTTTATTGGCCACCTGGCTCTTTCATACCAACAGGTACCTCAACCTGGCATACAACTACCACCGGCCGTCGTTTACGACACACCGGGCCTTTGCCCCGCTGGGTATGGAACACCACTGTAACTCCCACCTTTACTGCTAGGATACCTTTTTGCTGTCCTGCTTCAGTGCTGACACAGACCTATACTGGATGGAGTAATACTTCACATGCCTCAGGTACGTTTGGCACTGCTCCTGGTCTCAATACACTTGGTGCTTTGACATTTGCCTCCTCTCAATTTTCCACTACTACCACTACTACAACTGAATTTTATATTTATGCTAGGTTTGCTGACATTCAGGGTTGGTGTCCCCGGCCAGGTGCCTATCTGGCTCCTCCCACTTCTCACGGAGGTGCTACCAACTATTCTTTGCTGGCCCTTGCCGGTGATGTTGAAACAAACCCAGGCCCTTCTCTTTCTAAGATTGCTCGCAAATTGGATCCTGATATTGATGCTTTATTTAAAAAATTTGAGGAAATGAGAGAAAGCTTCAAGAAAATTTCTGATTTTGCTACCTGGGCAAAAATTTTTGAGGACGCCGATAAAACTGCTTGGATGAAAAGGATTGGGAAGTTTTTATGTTATGCCATAATACTTTCCCGTGCAAAATCTGATCCTTTACTGGCTGCTGCTGTCGGCTTTCTTCTGTCTCAAAATTGGCTTGCTACCCTGTGTGAAAAATTTGTGAAACATTTGAAGGCTCATGCAAAGACTCCCCCCCCCCCTTTTCCACAGTTGGATGATGATCCTGATGAAGGAACCTCTGGTGACACTGCCAAGTCCACTGTTCCTGAACAGGTTTTGGCAGCTGCCCAGGCTGAATTTGCTAGGCGGCATCCAAATCCCTTTGAAGAAGAGGATTTAAAACCTTTTGAGAAATTTAAAGCTTTCTTTAAAATACCCAAGCTACAGGGCTCTACTCTTTCAAATTTGAATCAACTGTTAGTTTTGTGCCGTAATGCCCAATGGTTAGGCGGCCAGTTACAAAAATTGCTTGACTGGTTGGGTTTATGGCGCAAACAGGAAGAAGAAGTTTCTGAAGAGCATTTTAAAGAGTTGATGAAGGAGTATCCTCAGAAATTGAATGATTTTGAAACCTACCGCAACTCTCCCAAACATCCAAAGTGGAAAGAATGTCAGGAATGGTTTGAGAAGATGAGAAAGATTGTTGCCTTGCATGACCCCAAATTGACACATCTTTTCCCCATCATGGTCAGCCCCCCTCCAGACAAAGCCCGCACTGAACCCCTACTGTTAGTGCTGCGTGGCAAGCCTGGTCAGGGAAAATCAATTGCTGCTGCTGCCTTAGCCCAAATGTTTGCCTATTCCTTATCTGGTAAACCTGAATATTATTCTTATAATGCTAGTACAAATTATTTTGATGGTTATTGTCAACAGCCTGTGGTGTTGATTGATGATTTAGGCCAAGATCCAGCTGGTACTGATTTTTCTGTATTTTGTCAGATGATTTCAACCACTCCTTTTATTCCAAATATGGCTTCTTTGAATGATAAAGGCATTAAATTTACCAGTGATATTATAATAGTGACTACTAATTTATCTGAGTTTAGACCTGTAACAATAAGTGATCCAGCTGCCCTTGCCAGGCGCATTAATTTTGATTATACCGTGTCTGCTGGGCCTTCCTTTGTTACCCGACGCGGCACCCTTGATTTTGAAAAAGCCCTACAGCCCACCGGGTCTGCTGCTCCCTTTCCTTTTTGTAAAGTTGATATTAATTTATTTTCAAGTGCCTGTTTGAAGTTTAGGGATGTTGATCTTAAATGTGAGTGTAGTTTGTTAGATGTTTATTCTAGGATGATTAATGCCCATAAACAGAGAACTGATGTTTTGTCCAAATTTGTAGATATTTTTAAATTTGAAGGACCCGGCCATGATCCCCGTGTTTACAAACCTTTACCCAAACCCCGGTCTTCTGAAGTCCGACGGTGGTGTGATTTGGCTGTGAATACTAAGTTTGGTGATGATGAAGTATTGTGCTTTTTGAGGAAGCATTGTGATTCTGATTTGCTGAATTCTTATGTTGCAAGGTTTTATGGTGGTAGCCCCGACCCTTTGAAGAGAGGTCCTTCATTTATGGATGTTATAGGTGTGATTACCCAATGTTTAGCTCTTTTTATAATGGTTTTAAGCTTAGGTGTGGTTGTTTGGCAGCTTTGTCACATGGAAGGCGCCTATGGTGGTCCTGTCAAGAGAGAAAAGA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| 30,177
|
ON024074.1
|
Pangolin hunnivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-06-16
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BIME2
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Pangolin hunnivirus
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Hunnivirus
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Picornaviridae
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ssRNA(+)
| 7,231
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin hunnivirus strain PHV/BIME2/P035T/pangolin/2018, complete genome
|
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| 30,178
|
ON024075.1
|
Pangolin hunnivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME2
|
Pangolin hunnivirus
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,231
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin hunnivirus strain PHV/BIME2/P044T/pangolin/2018, complete genome
|
CCCCCTCCCCCCTCTCCCCCCTTCCTTTTTACATTTTTTTCCATCATGTAATATGTGAATTCACCCTGAAAGTGTTTGAAGGGACCACCACTTAGTGACCCCCGATAAGCTTCAGTGCAAGTTAAGAGTTTTCTTACCTTCAAGATATGGTGCAACTTGGCTTAAGACGCTTGTAATACAGCATCGTTGCTAAAACCAGCTTTCTTGGAGTCAAACCCAGTTTTCAAATTTTCCACTCTCTCTGGCTCTCGCCAGAGGGAACGGAGTTTCCTCTCCCGTTACTTCTTAAGAGTGGACTACCACCATCTTGGTGGAGCTATAGCCACAAGAGGAGCCAAAACCAATACCTTGGTGTGTTGATTTATTGGGCGAGTTTGTTGAGCGCAATCTGGTCGGTTTAACCGTGCTGCTAGTCTGTGGAGTTATAGCAGGTAACTGCTACCTCAGAGGCCAAAAGCCACGGGGTTGACAGCCCCCTAGTAGTATTCTTTGATGCCAGGCTGCTAGTATGCATTCTCAATCAATAGCTTGACTATCTGATGCATGTTTTGGTGGCAGGGTGAAGGATGCCCATCAGGTACTCGCACGTAACCTTTAGAGAGTGTGAATCTGAGATGGGGAACAACGTCACTATATGACCGTTGTTTTAAAAAACGTCTAAGCCCCGCAACAACCAGGGGGACCTGGTTTTCTTTTTTTTTTAAATTGTTGTTTATGGTGAAAATTATTTCTGTTAAAATTGGCTCTATTGTTATAGTTTACTATCCAAGTGAATATAAGAAGATTGTTAGTCATGGGTTCTGGTGGAAGTAAACAAGAGTCTGGTAACACTAACAACACCGGTAACCATGGTGTGATTAATTACAACTTTTACAATCAGCAATGGCAAAATTCAGTGGATTTGGAAGGTGCTTTACAGTCTACAGAGACCAGTTATGGTGGAGCTGGTGGTGGCGGATCTCAGCATCACAAGGAAAGTAACCTGTTAAGTACTGGGATACAAGCTGCCGCAAACATTCTTCCACTTTTGGCTGACAGTGTCACTGAAGACTTTGAGAATTCAGATCGGGTCTCTAAAACCCAAGCCGGCGCTACCACCCTTGTGTCACAACATCAAGCCGGCCGCATGCTCTACACTGGTAAGCACGACAACTGTCCACCCTCTAGTGCTGCTGATGAACCCACTACTGCTGGCCCTTCAGTTGACCGTTTCATCACCATGCAAATTGGTGAATGGACCACTTCAATTAATGTTTACGGTGGCTGGGCTGCCCCGCTTCCTTGGGTGCCTTTAACTCAACAAACACCCTTTGCTGCCTTAGCACGTAGACATTTTCTCCTCAACTGTGGGTGGCATGTTCAGGTTCAAGTGAACAGTACCCGGTTTCATGGTGGAGCTTTGGGTTGTTTTTTGGTGCCACAGTTTGTGTATAACAATCAATCCAGTCTACGTCTGACACCCATCACACCAGATGATCACCCACTTTTTTCTAATCAGCAGCTTTTTCTTTACCCCCATCAGATAATAAATCCTCGTACCAATTCTTCAGCTGAAATTGTGGTTCCTTATGCCAACAATACTCCTAGCTGTGATCCAACCCAACAAGCGCCTTGGACCTTACTTATTGTGGTGCTTTCACCTCTTTCATATTCTGCAGGCGCTACAACCTCTTTGACAGTTTATGCTTCTTTCCGCCCTGTTGAAGCTGAGTTTCATGGTATCAGGCAGTCTAATTCAGAATTTCAGGGTCTACCCAAGGTTCGCAACGAGAGTGCTTCTTACACTTTTTGTTCCTCACAACCTAATGCAACAGAACCTGACTACGGAGCAATAACCCGCTCTTCACCAAGATTTTTGCCTGCACAGGTGATTGACTTATTGCAAATTTCTTCAATACCTACATTGGTGTCTGAACGAGCTGTACTTTTTACACAAACTGCTGCTGACAAGGCATTGATGACAATGAATGTTTCTTTAACAGCTACTGATCTCCTCAACACTTCACTGGAGAGTGTGTCAAGAGGGTTTGCCCAATATCGAGGCAGCATATGTATGAAGATGATGTTCACTGGTAATCAGATGCAGAACACCCGTTTTGCAGCCGCCTACACTCCTCCTGGTGCTGACCCTCCTGCCAACCGCCAACAAGCACTTGAAGGGCTTTATACTGTTTTTGACACTGGTTTGAATTCTTCTGCTGAATTTGTTATACCTTTTATTTCCACAACTGATTACAGGTACTGCAATGCCGTAGCAGGCATTGAAGTTGGCTCTGCCGGCTTCTTTACTATTTGGCAGATGACAAATTTGGCAGTCCCCCCTGGCTCGCCCCCCACTGCTGAGCTTCTTGTTTTTGCTTCTTCTGGCCGTGATTTTGAATGGCGTGCTGTCAGCTCTCCTTTTTTAGCTTTTCAGGGTGAGTCTACCCAAATAAGCCCTGGTGAGACTGGACAGGTGACAGAGCCTACTGCTGCAAATTCCAATGCTGAAATAGTTCCCATTCCTTATGCTCCATCTAGGCTTTCAAATAGTTCTTTGAGGTTTTGGTTTGATAGGTACTTTCTGCTGGACGCTATTCCTGTTCATCAAAAGACTAATGCTACTGATCTTTTTCTTCTTAGGTGGCCGGACATTTTATGGCGCCTGCCAGAAGTTTTGGGAATGCTGCATTGCACCTATGTTAGGTTTGAACTTGAGCTGGCCTTCCGGCCATGGAACAAGGATGACCTGGACATGGAGATGGTGTACTGGCCTCCTGGGTCGTACATACCAACTGGCAATTCCACTTGGCATACCACAACAACTGGTCGTCGCCTTAGACATACTGGTCCATTGCCTAGGTGGGTGTGGAACACACGTGTTACCCCCACCTTTACTGCTAGGATTCCTTTTTGTTGTCCAGCATCTGTTCTTACACAGACTTACACAGGCTGGAGCAATACTTCACATGCTTCAGGAACTTTTGGAACTGCTCCTGGTCTAAATACTCTTGGTGCTCTGACTATGGCTTCTAGTCAATTTTCTACCACTACAACTACCACTACAGAATTTTATATATATGCTAGATTTGCTGACATCCAGGGCTGGTGTCCTCGACCTGGAGCTTACTTAGCACCTCCTACCCCTGCACACCGTGGAGCAACAAATTATTCTCTCTTGCAACTCGCCGGGGATGTTGAGCAAAACCCCGGCCCTTCCTTGTCAAAGATTGCCCGGAAGCTTGATCCAGACATTGATGCTCTTTTTAAAAAATTTGAAGAAATGAGAGATAGCTTTAAGAAAATAACTGATTATGCTCAATGGGCCCAGATTTTTGAACAGGCTGATAAGGTTAAGTGGATGAAAAGAATTGGAAAATTTTTGTGCTATGCTATTATACTTTCTAGGGCAAGATCTGATCCCTTATTGGCTGCTGCTTTGGGCTTTTTGTTATCACAGGATTGGCTGTCTGCACTTTGTATGAAATTTATTAAGCATTTAAAACAGTATGCCAAAACTGAACCCCCTCCCTTGCCGCATGCTGATGATGATCCTGCCGAAGGCACCTCAGAACAGACTGGCAAGGACACTGTACCTGAAGAGGTCTTGGCTGCTGCTCAAGCTGAATTTGCCAAAAGACACCCCAATCCCTTTGAGGAAGATGAATTGAAACCCTTTGAAAAATTTAAGCAATTTTTTAAAATACCCAAATTACAAGGATCTACTTTGACTAATTTGAATCAACTGCTTGTCCTATGCCGCAATGCTCAATGGCTTGGTGGACAGTTACAGAAATTGCTTGATTGGCTGGGTTTGTGGCGCAAGCAGGAAGAAGAAGTTTCTGAGGAGCATTTTAAAGATTTGATGAAACAGTATCCAGAGAAAATTACTGATTTTGAAATGTACCGCAATTCCCCAAAGCATCCTAAGTGGAAAGAATGCCAGGAGTGGTTTGAGAAAATGCGGAAAATTGTTGCACTGCATGACCCTAAATTGACCCATCTCTTTCCTGTAATGGTTACTGCCCCACCTGACAAGGCCAGAACAGAACCTTTGCTAGTTGTGCTACGAGGAAAGCCTGGTCAGGGAAAATCTGTTGCTGCTGCTGCTTTAGCACAAATGTTTGCCTATACTTTGTCTGGGAAACCTGATTATTATTCTTATAATGCAAGTACCAATTATTTTGATGGTTATAGTCAGCAACCTGTGGTTTTAATAGATGATTTAGGTCAGGACCCAGCAGGAACAGATTTTTCAGTTTTTTGCCAGATGATTTCAACAACTCCTTTTATACCCAATATGGCTTCTTTAAATGATAAGGGTATTAAATTTACTAGTGATATTATAATAGTTACCACCAATCTTTCTGAATTTAGACCTGTTACAATTAGTGACCCTGGAGCTTTGCAAAGACGCATAAATTATGATTACACTGTGTCAGCGGGGCCTGCTTTTCTTACCCGTCGTGGCACATTAGATTTTGAGAAAGCTTTGCAACCCACTGGAGCTGCTGCCCCTTTTTCTTTTTGTAAAAATGATATACATTTGTTTTCAAGTGCTTGTCTTAAATTTAAGGATGCTGACTTAAAGTGTGAATGTAGTTTAATGGATGTTTATTCTAGAGTTATTAATTCCCATAAGCAGAGGACCGATATTTTGTCTAAGTTTATTGAAGTTTTTAAATTTGAAGGTCCTGGACATGATCCCAGAGTTTATAAGCCCCTTCCCAAACCCCGTGCATCTGAGGTGAGAAAATGGTGTGACATGGCCATTAATACACATTTTGGTGATGATGAAGTTTTGTGTTTTTTAAGAAAACATTGTGATTCAGATTTGCTTAATTCTTATGTAGCTAGGTTTTATGGTGGTGGCCCTGACCCCCTTAAAAGAGGTCCTTCATTTATGGATGTGATTGGAGTGATTACCCAGTGTTTGGCTTTGTTTATCATGGTTCTTAGTCTGGGTGTGGTTGTGTGGCAACTTTGTCATATGGAAGGAGCCTATGGCGGGCCAGTTAAAA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| 30,179
|
ON024076.1
|
Pangolin hunnivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-06-16
|
BIME4
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Pangolin hunnivirus
|
Hunnivirus
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Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,050
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin hunnivirus strain PHV/BIME4/P022T/pangolin/2018, complete genome
|
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| 30,180
|
ON024077.1
|
Pangolin hunnivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME5
|
Pangolin hunnivirus
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,093
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin hunnivirus strain PHV/BIME5/P031T/pangolin/2018, complete genome
|
GGGACCACCACTATGTGACCCCTTGCCAAATGTCACTGGAGTTAAGCTTTCTTAACCTTCACTTCAAGGTGGAGTTTCTGGTTGAAGACGCTTGTAATAAAACCGGAGCTTTGATCTTCTGTCGTGGAGTCAAACACAGTATCCTCATTTTCTACAGTCCTTGGCGCTTGCCAGGGACGCGGAGTTCTCCACCCGTCCTTCTTTGGGAGCATACCACACACACCTTGTGTGAGCTATGGGTGCATGGAGAGCCACAACCTCTATTGTGGCAGTTTCTAGTGTAGTTTTACAATCTTGAAACGTGTCTCATCGGTTTTTGCCGTGCTACTTGTCTGTGGAAGCAATGTGGGTGACCACATCCTCAGAGGCCAAAAGCCACGGGGTTGACAGCCCCCAAGTAGTATTCTTTGATGTGAGATGCTTAGTATGGATTTGTATTCTATGCTAGAGGACTGTTGTGACATGTTGTGGCGGTAGGGTGAAGGATGTCCAGCAGGTACCCGCAGGTAACCTTTAGAGACTGTGGATCTGAGCTGGAGACTGGGCGTGCTTTACACGGCCCAGTTTAAAAAACGTCTAAGCCCTGCAAACGCCTGGGGGACCAGGCTTTCCATTTTTATTACATGATTGTTTTATGGTTGAGATAATTGCAGTCCAGATTGGTAACATTGTGATTGTTTACAAACCAAGTTTATACAAAACAACATTGCACAATGGGTTCAGGTGGAAGTAAACAGGAATCTGGCAATACCAACAACACTGGAAACCATGGAGTTATTAACTACAATTTTTACAACCAACAATGGCAAAATTCCGTTGATCTGGAAGGTGCTTTGCAGCAGAATGAAACATCCTACGGTGGCACTGGTGGCGGTGGTTCGCAACACAACAAAGATTCCAACTTGCTTACCACTGGCATACAGGCTGCCGCCGGCATACTACCCCTTTTGGCAGACAGTGTAACGGAAGATTTTGAGAATTCTGATAGGATTTCCAAGACTCAGGCTGGTGCTACAACACTCATTTCACAACATCAAGTTGGGAGAATGCTCTATGCAGGTAAGCATCCAAACATCTCTCCTTCAAGTGCTGCTGATCAACCCACAACCGCTGGCCCGTCAATTGACCGTTTCATCACACTTCCCCTTGGTGAATGGACCACTTCCATTGGAGTGTATGGCGGATGGGCCGCCCCACTTCCGTGGGTTCCTTTGACGCAACAAACTCCTTTTGCTGCTTTGGCCCGTCGTCATTTTCTTTTGAACTGTGGATGGCATGTTCAGGTGCAAGTCAACAGCACCCGCTTCCATGGCGGGGCTCTTGGTGTTTTCATGGTGCCTCAGTTTGTGTATACAAACCAGTCATCCCTGCACTTGACTCCTATAACGCCTGAGGATCATCCATTGTTTTCAAACCAGCAGCTGTTTCTGTACCCCCATCAAATTTTGAATCCACGTACTAATTCTTCTGCAGAGGTGATAGTGCCCTATGCCAACAATACTCCCAGCTGTGATCCCACACAGCAAGCTCCATGGACTTTGTTGGTAGTGGTGCTCTCACCCCTTTCCTACTCGGCTGGTGCCACCACTTCACTGACTGTATATGCTTCTTTCAGGCCAATAGATGCTGAGTTTCATGGTATACGTCAATCTAACAGTGATTTTCAAGGGCTTCCAAAAGTGCGAAATGAAAGCGCTTCATACACTTTTTGTTCAACCCAACCTAATTCAACTGAACCAGATTATGGGGCCATAACTAGATCGAGCCCTCGATTTTTACCGGCCCAGGTTACTGATCTTTTGCAGATTTCTTCCATCCCTACTCTTGTGTCTGAGAGAGCTGTGCTCTTTACTCAGACTGCTGCTGACAAGCCCCTGATGACAATGAATGTTTCCCTGACTGCCACTGATCTGTTGAATACTTCCCTCGAGAGCGTGTCCCGTGGGTTTGCTCAGTATCGTGGTAGCATTTGCATGAAGATGATTTTTACTGGCAACCAAATGCAGAACACCCGTTACGTTGCTGCTTACACCCCCCCTGGAGCTGATCCGCCTGTTAATAGACAACAGGCCATGGAAGGTTTGTATACAATTTTTGACACTGGATTAAATTCTGCTTCCAAATTTGTCATTCCCTTCATTTCAACCACTGATTACCGTTACTGCAATGCAGTCTCTGGCATTGAAGTTGGATCTGCTGGCTACTTTACCATCTGGCAGCTTACAAATTTGGCAGTTCCTCCGGGTTCCCCTGCTACTGCAGAGCTCTTGGTGTTTGCTTCTTCAGGTGAAGATTTTGAGTGGAGAGCAGTTTCCTCCCCATATTTGGCTTTTCAGGGTGAGGACACCCAAGTAGCTCCTGGTGAGACTGGACAGTTGGTGGAAGCCACTGCCGCAAACTCTAATGCTGAGGTTGTTCCTATACCCTATTCCCAAGCTCGCTTGTCTAATAGTAGTCTTAGATTTTGGTTTGATCGCTACTTTCTTCTTGATGCTATTCCCATTCATCAGAAAACCAATGCTACTGACCTATTTCTTCTTAAATGGCCTGACATTTTGTGGCGCCTGCCAGAAGTGTTGGGCATGTTCCATTGCACTTACGTGCGCTTTGAGTTAGAGCTTGCTTTGAGGCCCTGGAATAAAGATGATTTGGACATGGAGATGATTTACTGGCCACCTGGCTCTTACATACCAACTGGAAATTCAACTTGGCACACCACCACCACCGGTCGCAGGCTCAGACACACTGGTCCGTTGCCACGCTGGGTGTGGAATACTACTACCACTCCTACTTTTACTGCCCGCATTCCTTTTTGTTGTGCTGCTTCTGTGCTAACCCAAACATACACTGGTTGGTCAAATACCTCGCATGCTTCAGGTACTTTTGGGACAGCTCCTGGCCTGAATACTCTTGGGGCCTTGACGATTGCCAGTAGTCAATTTTCCACTACAACTACTACCACCACAGAATTTTATGTGTTTGCCCGCTTTGCTGATGTCCAGGGATGGTGCCCTCGTCCAGGACAGTACTTAACCCCCCCCACCCCTGCTCATCGTGGTGCCACCAACTATTCTTTGCTGCAACTGGCTGGTGATGTTGAAACAAACCCCGGGCCTTCTCTTTCTAAAATTGCCCGCAGACTGGACCCAGACATTGACCAGCTTTTTAAAAAATTTGAATCTATGCAGGAAAGCTTTAAGAAAGTGGTTGATTATGCTAATTGGGCAAAAATATTTGAAGATGCTGATAAGGAAAAATGGATGAAAAGGATTGGAAAGTTTCTCTGCTATGCTGTGATTTTATCTCGTGCTAAAGGTGATCCTTTACTTTCTGCTGCTTTGGGCTACCTGCTTGCCCAGAACTGGCTGCATTCTCTGTGCGGCAAATTTGTGAAGCATCTGAGGCAGTATGCCCGGACCTCCCCTCCTCCTTTTCCTGATTTGGATGAAGACCCTGACGAAGGCACGTCGTCTGCAACAGGGAAAGATCAAGCCAGAGCTGAACAAATCCTTGCTGCAGCTCAAGAGGAATATGCCCGCCGCCATCCTAACCCTTTTGATGAAGTGGACATGAGCCCGTTAGAAAAATTTAAAAATTTTTTCAAAATTCCCAAGATGCAAGGATCCACCCTTACAAATTTGAATCAATTGCTTGTGCTGTGTCGCAATGCCCAATGGCTTGGAGGGCAGCTTCAAAAGCTTTTGGATTGGTTGGGCTTGTGGAAAAAACAGGAAGAAGAGGTTTCAGAAGAGCATTTTAAAGAGCTTATGAAACAATATCCAGCAAAATTGACTGAATTTGAGACATACCGGAATGCCCCAAAACATCCTAAATGGAAAGAGTGCAAAGAATGGTTTGACAAAATGCGTCAATTGGTTGTGCTTCATGATCCCAAATTAACACACCTTTTTCCCCTAATGGTTGAGCCAGCTCCTGAGAAGGCACGCACTGAGCCGATATTGCTTGTGCTGCGTGGAAAGCCAGGCCAAGGCAAATCTGTTGCAGCAGCAGCTTTGGCTCAGATGTGTGCTTATACACTTTCTGGTAAGCCTGATTATTATTCTTATAATGCTTCTACAAATTATTTTGATGGCTATAATCAGCAACCTGTAGTTTTGATTGATGACTTGGGGCAAGACCCTGCTGGAACTGATTTTTCTGTTTTTTGTCAAATGATTTCTACCACCCCTTTTATACCAAACATGGCTTCATTGAATGATAAAGGTATTAAGTTTACAAGTGATGTTATTATAGTTACCACCAATTTGTCTGAATTTAGGCCTGTTACCATAAGTGATCCTGGTGCCTTACAACGGCGCATCAATTTTGATTACGTTGTTACTGCTGGCACTTCTTTTTTGACAAAGAAAGGCACCTTGGATTTGGATAAAGCTTTGCAACCCACTGGTGCTGCCTGTCCTTTTCCTTTTTGTAAATCTGATGTTAACATGTTTTCTAGTGCTTGTCTCAAATTTAGGGATGTGGATGCTAAGTGTGAGTGTAGCTTGGTAGATGTTTATTCCCGTGTGGTTAATATGCATAAGACCAAGACTGACATTTTGGGCAAATTTGTTGGTATTTTTAAATTTGAAGGACCTGGACATGATCCACGCATGATTAAACCGTTGCCCAAGCCCAGAGGTGCTGAGGTAAGGAAATGGTGTGATTTGGCAGTTAATACTACCCTGCATGATGATGAAGTGCTGTCCTTTCTCCGCAAACATTTTGATTCAGATATTTTAAATTCCTATGTGGCAAGATTTTATGGTGGTGGACCTGACCCCTTGAAAACTGGACCTAGCTTTATGGATGTTATAGGTGTTTTGACGCAGTGTTTGGCTCTTTTTATCATGGTGCTTAGCCTTGGAGTGGTGGTCTGGCAGTTGTGTCACATGGAAGGAGCCTACGGCGGTCCTGTAAAGCGTGACCGTAAGGTTAATGCGCTCAAGCTGGTTGACATCGCTGGTTTGCAAGGACCCCTGAATCTTGACATGGAAAAG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| 30,181
|
ON024078.1
|
Pangolin hunnivirus
|
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-06-16
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BIME5
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Pangolin hunnivirus
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Hunnivirus
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Picornaviridae
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ssRNA(+)
| 7,092
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin hunnivirus strain PHV/BIME5/P032T/pangolin/2018, complete genome
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| 30,182
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OP288966.1
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Pangolin pestivirus
|
Gong,W., Mi,S., Jiang,J., Tu,C.
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Jilin University, College of Veterinary Medicine
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China
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2023-08-30
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PPeV-GX-2020
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Pangolin pestivirus
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Pestivirus
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Flaviviridae
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ssRNA(+)
| 12,024
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GenBank
| null |
China: Guangxi
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China
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Manis javanica
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oronasopharynx
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2020
| null | null |
Pangolin pestivirus isolate PPeV-GX-2020, complete genome
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GTATGAAGATAAATCAAAGAGGTCAGAGCGGTCACCCGCAGCAGCCTGCTTCATACACATTGGCAGTACCCAAAAGCTAGGTGAATTGGAAGTTGCCAAACAAACAGCACTAAGAGCGAAGGGCGAAAGAATGCTAGCCATGCATCGAGTAGCACGAGCTCTGAAGATGTGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGGAAGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCTTACCTTAATGCAACTGGGGGTCGGTTGCATGAATCCATTAGGGATATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTAGCACATAGCACATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGAGTAGGGACCACACCACCAATGGGTGCTGAAGAGCCAGTCTATGACAGGAATCTGCAGCCACTTTTTGGGGTAAAGCATGGTGATCTACACCCTCAATCCACGCTGGTCTTACCACACGCCAGGGGGAGACGAACGAGGCGTGTGAGACTGAAAGACATACCAAGGAAGGGAGACTGTGAAAGAAGTAACGGAGAAGTCTCAGGGGTGTACGTCAAACCAGGGCCGATATGGTACAGCGATTATGAAGGCCCTGTCTATCATAGAATTCCATTGGAGCTCTGTGCCAAATCAACACCATGCGAAGTAAAAAAATTAGTAGGTAGGATGGAAGGTAGCGACGGGAAGTTGTACCACGTATTTACTTGTCCTGATGGGTGTCTGTTCTTTTCAAGGGCAAACCATGAAGCCACCACCTATTTTATGGTAAATAATGCATTAGACGCCCCACTCTGGCTACAATCATGTAGTGACAACAAGCCAAGTGACGACAAAATCAAGAAAGGCAAGATTTCCCATAAACCTAAAGAAACAGAAAAAGATGTCAAAAAGAAAGCACCTGACGCAACCATTGTGGTAGAAGGGGTTAAATACCAAGTCACAAAGAAAGGTAAAGTACGTGGGAAGACTACCGATGGACTATACCACAACAAAAATAAGCCCCCAGAATCCAGAAAGAAGCTAGAAAAGGCATTGCTAGCTTGGGCAATAATGTGTTGCATTCTTATAGACCTAGTACAAGCTGACAATATAACACAATGGAATTTGTGGGACAACAGCTCAACTGAAGACATACATCTGGCAATGTTCAGGAGGAATATTAACCGAAGTTTACACGGAATTTGGCCCAAAAATATTTGTAAAGGAACCCCAACGTACCTATCAAAAGATTATGAACTAAGGACAATTGAAGGTATGATGGATTCTAGCAGTAGTACAAACTACACATGTTGCAAACTGCAAAGGCATGAGTGGAATAAACATGGGTGGTGTAATTGGTTCAACATAGATCCATGGCTGAGAGCAATGAACCAAACGCAATACAATTTAACAAGTAAAGCCTATAGAATGGAATGTGCAGTCACTTGTAGGTATGACAATGAAACGGACTTAAATATAGTGCTACAAGCCAGAGACAGCCCTACAATGTTAACAGGCTGCAAGAAAGGAAAGAATTACTCCTTTTCTGGTGAAATTAGATCCAAGCCCTGCAGTCAACACCTAGAAATAGAGGATTTGATGCTTGCTGACCATTCTTGCCATTTAGAAGACAGTGTCATGGAAACTATGGTTGATGAGGTTACAGAACTAGTTGAAAAGACAAGGAAGAAAGCTAGTAGGAGCCTTAGTTGGGCTGAAGGAAAAATAAGAAGCTTAAGGCTAAGGTTATTTGGGGCAGAGGCGTCACCATACTGTAATATAACAAGAGTGGTTGGAAACATAGTTTACACCAGAAATTGCACTCCAGCGTGTTTACCACCAACAACTGTTGTTGTAGGACCTGGGGCTTTTGACTTACTTGGGGGTGACAGTGATGGAAAGACAATATACATCCCAACAGGTGTCGAAAATGATATCATAATGATAACAATCATAGCCATGTCTGAATTCCTACCTGAGACTGCAAGTGTTGCCTACACAATTTTTCATTATTTGAACCTAAAAACCTCTCACCCGTTAATTGAAGACTCCTGTGACAAAAACAAGCTAAACTTGACCATCAACAGGCCTGTCCATACAGTAGTGCCAAAACAATTTTATTTTTTAGGTAAGTGGTCTTGTATAAAACCCAGTTGGTGGCCGTATTGGAGTACCACTGAGGAACTTATCTTTGATTTGGAAAACGTTATAGGACTTATGATTAGGTTAGTAAAACAAGCTATGACAATCCTTAACGACCTCAGTGCCGTATCATTTATTGCAGCTATTATCAAATTGGTACAAGGGAAGCCTATACATGCCATCATATGGCTACTGCTGCTTACCGGAGTCCATGGCCAATACTTGAAAAATAACAAACTCAGATGTAAAGATCAATTTAAGTATGCCCTGGCTAATGGAGTAGAAATTGGTCTGCTAGGGGCAAGCAAATTGACAACAATGTGGGAAGATCTAGAGCTGGATGATGGACAGGTAAAAGCTAAATGCACACACGGACGATGGGAAATAACGGTTAAATGCAAATTGGCAAGGGACACCTGGTTGGCAGAAAAGCATGAAAGAGCCCTACCTACATCTGTCAAATTCATAAGTATCCATAAAAGATCAAAAGTAACCACACGGACCATAGAAGAACCAATGGGCGTGTGTGACTGTGATAGTACCCCAGTGGAAAATGCAAATTACAAGGCTATTCACATAGCATCTTCTGCTTTTTATTTGGAATGCCCATATAAATGGATTGGAAATATAACCTGCAAAACCAAACAACCACAATTATGGCATACAGAAACTATAGAAACAATAATATATAACAGCCAAAACTTTGAAGACAAAAGGTGTAAGAGAACCAAAACTATAAACAACAAAGAATTTATCTGTGAATATGGGGGAAACAATTCATGTGTAGCAGGGCAACAGGTGAGGTACAAAGAAGAATACAAATTAGAAAGTTGTGATTGGTGTGGTTACACATTTGGAAACAGCACAGACTTACCAACTTGGCCCATAGGGCAATGTAAAGTTGAGGAATACATAGGGAGAGTAGCAGCTGAAAACAGAAGTTGCACAATAAATGGTGTGGAAATAACCAAAAATGGAGAAGTGGAGTGCATAATTGGGACAACAAAAGTAAAAACGACACAGAAGACTAACGAATTACTAGCAATGCCATGTCAACCAATCAAAACTGGTTCCGATACATCATATTCCAATGGGAGGCAAACATGCACCTACAACTTCTCTAAAGTGTTACCAAACAAATACTATAATATAATAGATGAGTTCTGGCAGCAATACATAGTTAAAGACGGGTACCAGTACTGGTTTGACTTATCGGCCATGGACCATCGAAGGAACATGGTCGCGGAATTTATAGTGATCATTGTTGTTGCACTCTTAGGGGGGAGAGTAACGCTTTGGTTATTGGTAGCCTACCACCTCTTTGACGTAACCCAAGCATATGTGCCAGCACAAAATTCACCAGGAGAATTTTTTATGTACAGCAGTATATTAATAGATGCAGACCTTGAAGTAATAGCTCACTTCCTCCTATTACTAGCTTTACTATTTGACGCAAATTGTAGAAATATATTTCTGTCTGTGTTCTTTATACTGACATCATCAGCCAAAACAACTATCATCTTTTTAATTCTCTGCTTGATAGGTGGTGTGAAGGCTGAGGCATCAGAAGCTCACTGGCAGTACATTGAGTACACCTACCTAATCATCTTAACTGCAATTAGTGTAATTGTGATGACTAAAAGAAGGAATTTTAGTTTCTTCACAGTGACTACAACGGTCATTCTATTCCGCTTTACTGTAACAGTGCCCACTGAAGCTAACTACTTAATAATATACATTCTCTTTGTACTGTTTTACATGTTAATGGCAATATACTACAACGGCAAGTGTAGAAAGCTGATACTGCTGTTACTAAGTTTTGCTTTTTTGTACGGTGTTCTGGGAATCGCAAACCATTTGAACAGCCTTAAAACTACCACCATTAATTTGCTAGTAGTTAATTGGCCAAGAGCAGGGGTTCTACTGAGCATATACCTTTCATTGACAACTTGGTCAGCCACATCAGGGGTAGACATCTCGGGATACCTGCTTGCAGTGGTTGCAGTGGTAATGGCCATTGTTTCAACCTTTTTGGATCTGGTTGTATTATGGACTATAATACCATGGTATAATGTAACCAAGCTATATTACATAAAGAACAAAGTTAACAAAGTGAGAAAAGATTGGCAAATGGAGGAAGCCACCTATGGGACTCTCCTGGACACTAGTGAAGGGGTACACCAGATTGCAACACCAGACATCAAGGCCATAGACCCCTTAATTTGGATTGTGCTTAAATCTATGTTATTGGCTGCACTAACAACAATCTGGAAACCAATAATTCTTGGATATTGTATATTGGAAATGCTATACTGGCTTCACTTAAAATTAATCAATGAACTAGCAGGGTTTACCAACATACTGTCAAGGATTGTGGCCTCACTAATAGAAGTTAGTTGGAAAGGCTTGGGGGATGAAGTCGGAACTCTATACAAGACCTATCTTCTAAGCTGTAGAGTCAAGCAGCTAGTTGTCAAACACAAAGTTAACAACCCTGAAGTAAAAAAGTGGTTTAAAAGAGAAGAAATATTTGGGATGCCAAAGATATACATGGTTACAGCCATAAGAAATTTGACCAAAGACAATGCTATCCTTTGCTCAGTGTGTGAAAATAATAATTTAAGAAGAATATGCCCCAAGTGTGGAAGTAGAGGCACTCAAATTAAATGCGGGATGACCCTAGCCGCCTTTGAAGAGAGGTTTTATTCAAAGATTTTCATAACAGATAACACCCAAGAAGACTTAAGGATTGAAGGGCCTGGAAAGATGGTTAGATACGCAGATAAAGG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| 13,159
|
OQ476762.1
|
Pangolin pestivirus
|
Wang,H., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-04-11
|
GD/P21-2/2019
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,540
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Manis javanica
| null |
2019
| null | null |
Pangolin pestivirus isolate GD/P21-2/2019, complete genome
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| 16,773
|
OP868576.1
|
Pangolin pestivirus
|
Liang,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, COLLEGE OF VETERINARY MEDICINE SCAU
| null |
2023-03-31
|
GD/P42/2019
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,470
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2019
| null | null |
Pangolin pestivirus isolate GD/P42/2019, complete genome
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TCATACACATTGGGCATTCCAAACTGATCTATAGGTAGATTGGATATGTACCAAAGAAAACAGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAAGATGTTAGCCATACACTGAGTAGCACTAGCCCTGATAATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGAAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGTAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAAGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCATCCTTAGTGCAGCCGGGGGTTGGTTGCATGAATCCAATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGCATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGACCATAGCACATGAATTTTGAAATCTTTTTTAGAGTAGGGACCACACCTCCTAGAGGGGCCAAAGAACCTGTTTATGACAGGAACCTACAGCCTCTTTTTGGAGTTAAACACAGTCAATTACACCCTAAGTCCACTCTAATTTTGCCACATGCTAGGGGAAAGAGAACCCAGCAAGTAAAATTGGTGGACTTACCAAGAAAAGGAGACTGTGAACGGACAGGGGGGGAGGTATCAGGCATTTTCGTTAAACCTGGGCCAATATGGTACAGTGATTACGAAGGACCAGTTTATCACCGGATACCTCTCGAACTCTGCGCTAAATCAACACCTTGCAATGTCAAAAAATTGATTGGGAGAATGGAAGGCAGCGACACCAAATTATACCATGTGTACACCTGCCCAGATGGCTGCTTATTTTTTGTCAGAGCAAATCAAAGTAAAACTACCTATTTCATGGTAAACAACGCCCTAGATGCACCGCTCTGGGTGCAATCCTGCAGTGACGACAAGCCAAAAAACGACAAAATGGTTAAGGGAAAAATTGCACATAAACCAAAAGAAACTGAAAAAGACATAAAGAAGAAAGCACCTGACGCAACCATTGTGGTAGAAGGGGTTAAGTACCAAATAACAAAGAAAGGGAAAGTAAGGAGCAAAAAGACAGAGGATGGACTGTACCACAACAAGAATAAACCACCAGAATCCAGAAAGAAGTTAGAAAAAGCATTGCTGGCTTGGGCAATTCTATGCTGTCTATTGGTCATACCTACCCACGCTGACAACATCACACAGTGGAATCTGTGGGATAATGGAACAATTGACGATATCCATTTAGCAATGTACAACAGAGGCATAAACAGGAGTCTGCATGGTATCTGGCCAAAAACAATTTGTAAAGGGACTCCGATGTATTTGGCAAAAGATTATGAGCTTAAGCTTATAGAAGGTATGATGGATTCCAGCAGCCATACCAATTACACCTGCTGCAAACTGCAAAGACATGAATGGAATAAACATGGCTGGTGCAACTGGTTTAATATAGACCCATGGATAAAAGCAATGAATGAAACCCAATCCAACTTGTCTAAAGGTACATATAAAATGGAATGCGCGGTCACCTGTAGATATGACAACAATTCTGACCTTAATATAGTCTTGCAAGCTAGGGACAGTCCAACAATGTTAACCGGATGTAAGAAAGGAAAAAATTACTCCTTTTCAGGAGTTGTGAGAAATAAACCCTGTTCTGAAGAACTGGCTATTGAAGACTTAATGCTAGCAGACCATTCATGTCACCTAGGGGACAGCATAATGGAAGCAGTGGTGGATGAAACAACAGAACTGATTGAGAAAGCTAGGAAGAAGGCAAGTAGAAGCCTGAGCTGGGCTGAAAACAAACTGAGAAATCTTAGGCTGAAACTATTTGGGGCCGAGGCGTCACCCTACTGCAACATTTCTAAAATAATTGGTAACGTAGTATACACAAAAAACTGCACCCCAGCCTGTCTCCCATCGACGGCCACCATTATCGGCCCCGGAGCTTTTGATTTGCTCGGAGGGAGCGGGAATGAAAAAAAAATATACATACCAACTGGAATTAAAAATGAGATAGTAATGTTAACAATTATAGCGGCATCTGAATTTCTACCCGAGACATCCAGTGTAGCTTACATTATCTTCCACTATTTCAATGTCAAAACCACCCACCCATTGGTTACCGACAATTGTGACAAAAACCAATTGAATTTGACTATAACCAGGCCTACTTCAGATGTAGTGCCCAAACAATTTTACTTTTTAGGTGCATGGTCTTGCATAAAACCAGACTGGTGGCCGTATTGGAGCACGGCAGAGGAAATCTTGTTTGATGTGGAAGCAGTTGTTGGGATAGTAATAAGGTTGGTGAGAGAGGTAACAAGAATTTATGAAGATTTGACGGCAGTTGCTTTTATAGCAGGAACAATAAAACTTATACAAGGTAAGCCCATTCACGCAATAATATGGGTGTTGTTACTCTCTGGGGTCAACGCCTATTCATGGGACAAATATTCAAAAATTAGCTGCAAAGACCAGTTTAAGTACGCCCTTGCCTCAGGAGTAGGTATGGACCTGTTAGGGCCTACCCAGTTAACAACACAATGGGAAGATTACAATCTGGATGACGGACAAGTATTAGCTAAATGTAATGATGGGAGGTGGACAATAACAGTTAAATGCAAGCTAGCAAGAGATACATGGCTGGTCGAAAAACATGAAAGGGCCCTTCCTACAAGCGTTAAATTCATCAGCATCCACAACAGAACTAAAACAAGAGAGAGAAACATAGAAACACCCATGGGTGTGTGTGATTGTGATGCAAGACCACAAGAAAACTCCAATTTTAATGCTATAGCCACGGCAGGGGCAGCCTTCCACCTGACATGCCCTTACCACTGGATTGGCAACATAACTTGCTTAACCCGACAACCGGACTTGTGGAAGACTGAAATTGTGGAGACCATAATATACAATAGCCAAAACTACAATGACCCAACGTGTAAAAGAACAAAAACAATTAATGACAAAGAATTCGAATGCAAATTCGGAGGCAACAGTAGCTGCGTGCCAGGACAACAAATTAAATACACACAGCAACTTTTTCTACGAGAATGCCACTGGTGTGGATACAATTTTCAAGAAGCAACAGACTTACCACAATGGCCTATTGGACAATGTAAGGTTGAACAATATCCTGGGTCAGTAGCAGCCAATGAAACCAACTGTACGATAAATGGGGTTCAAATAACTAAAGATGGTAATGTAGAATGTTTAATTGGTAAAATAAAAGTTAAAACACGTCAGGTAACAAATGATTTACTAGCTATGCCCTGCCAGCCGATAAAAACAGGCTCTGATACAAAATACACAAGTGGGAGGCAGACTTGTACATTTAATTACTCACAAGTGCTGCCCAACAAATACTATAACATAATAGATCAGTTTTGGCAACAATTTATAGTCAAGGATGGTTACCAGTATTGGTTTGACCTGGAAGCCGGTGACCACAGAAGGAGTATTTTATCAGAATATATAGTAATAGTAGTTGTTGCACTGCTAGGTGGCAAGATTTCCTTGTGGATTCTGATAGCTTTTCACTTGTTAGACCTGTCCCAAGCTTACATTCCAGGCAGCAATTCACCAGGGGAATTCTTTATGTATAGTTCTATAGTTGTTGAAGCCAATCTGGAGACCATAGCCCACTTCCTCTTGCTGCTAGCTTTGCTATATGACAACACCTGTAGGAACTTATTTCTATCTGTATACTTTGTACTAACCTCTTCAGCCAAGACTACTATCATTTTTATAATCCTTTGCCTAATTGGTTTTGCCAGGGCTGACAGTGGGGTAAGCGGATGGCCAAATTTTGAGAGTGCTTACCTCACTATGTTAGTAATTATAAGCATATTAGTGATTGCAAAAAAAAGAAACTTCTGCTTCTTTACTATCACAGTAACAGTAGTTCTATTTAGACTAGCAGTAGTGTTGCCTACACAAGCCAGCTATATAATAGTGTATATTCTCTTTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATATATTACTTTGGGAGATTTAGGAAGCTACTTTTGCTGGTGATGAGTTTCGCATTCTTATATGGACTGATAGGAATTTTAAATGCCTTAAACAGCTCAAGAATAGTCTTTGTTAACACTGTGATTGTAAATTGGCCAAGGATAGGCATTTTGATGAGTGCATACTTAGCCTTAACAACGTGGACCATAACTTCAGGGATAGATATTACAGGGTACATATTGGGAGCAGCAGCCGTGGTATTGACTATAATTTCCACAGTTATAGATATAACCATATTGTGGACTATAATACCATGGTATAACATAACCAAATTATACTACATCAAAAATGAGGTGAGTAAGACCAAGAAGGATTGGAAAACAAATGAAGCCTATGATGAATTGCTGAATACCAAAGAAGGGGTACACCAGATAGCAACCCCGAGCATCAAGGCTGTTGATCCTTTAGTTTGGATCATCATGAAATCAATATTATTAGCAGCCCTGACTACCATATGGAAACCTGTGATCTTGGGATATTGCATCATAGAAATGGCTTACTGGCTACATAAAAAACTAATTTATGAATTGGCTGGAATGACAAATATGTTATCAAGAATAATGGCTGCGCTGATAGAAATTAGCTGGAGTGGGCTTGGAGAAGATGCAAGGATTTTGTATAAGACATACCTTTTAAGCACTGAAATAAAAAGATTAGTTATTAAACACAAAGTGAACAACCCAGGAGTCAAAAGATGGTTTGGGGCAGAGGAAATATTTGGAATGCCAAAAATATACATGGTCACTCATATAAAAAATTTAACCAAGGATAAGGCTATACTTTGTTCTGTTTGCGAAAACAACAATAGCAGCCGGAGGTGTCCCAAATGCGGTTGCAAAGGGACACCAATCAAATGTGGCATGACCTTGTCAGAATTTGAAGAAAGATTTTATACTAAAATTTTTATAACCGAATATAATCAAAATGATCATAGGGTGGAAGGACCAGGCAAAATTGTTAGATATATGGACAATGGACTGCTATACCTGAGAAATTTACCAATACTGGCAACTAAAC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| 16,984
|
ON843279.1
|
Pangolin pestivirus
|
Shi,Y., Li,L., Zhou,J., Hua,Y., Zeng,Z., Yuan,Z., Chen,J.
|
Institute of Zoology, Guangdong Academy of Sciences, Animals endemic disease
|
China
|
2022-07-25
|
lymph
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,333
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2019-08
| null | null |
Pangolin pestivirus isolate lymph, complete genome
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ATGTGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGGAAGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCTTACCTTAATGCAACTGTGGGTCGGTTGCATGAATCCATTAGGGATATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTAGCACATAGTATATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGGGTAGGGACTACACCACCAATGGGTGCTGAGGAACCAGTCTATGACAGGAATCTGCAGCCACTTTTTGGGGTAAAGCATGGTGATTTACACCCCCAATCCACACTGGTCTTACCACACGCCAGGGGGAGACGAACTAAGCGTGTGAGACTGAAAGACATACCAAGGAAGGGAGACTGTGAAAGAAGTAATGGTGAAGTCTCAGGGGTATACGTCAAACCAGGACCAGTATGGTACAGCGACTATGAAGGGCCTGTCTACCACAGAATTCCACTAGAACTCTGTGCCAAGTCGACACCATGTGAAGTTAAAAAATTAGTAGGTAGGATGGAAGGCAGTGACAATAAGTTGTATCACGTATTCACTTGTCCTGATGGGTGCTTGTTCTTCTCAAGGGCAAACCATGAAGCCACCACCTACTTCATGGTAAACAATGCGTTAGACGCCCCACTCTGGCTACAATCATGTAGCGACAACAAGCCAAGCGACGACAAAATCAAAAAAGGCAAAGTTTCCCACAAACCCAAAGAGACTGAAAAAGATGTCAAAAAGAAGGCACCTGACGCAACAATTGTGGTAGAAGGGGTTAAATACCAAGTTACGAAGAAAGGTAAGGTACGTGGGAAGACTACTGATGGATTATACCACAACAAAAATAAGCCCCCAGAATCCAGAAAGAAGTTAGAAAAGGCACTATTAGCATGGGCAATAATATGTTGCATTGTTATAGACCTAGCACAAGCTGACAATATAACACAATGGAATCTGTGGGACAACAGCTCGATTGAAGACATACACCTGGCAATGTTTAGGAGGAACATTAGCCGGAGTCTACACGGAATCTGGCCAAAAAGAATTTGTAAAGGAACCCCAACCTACCTATCAAAAGATTATGAACTAAGAACGATTGAAGGTATGATGGATTCTAGCAGTAGTACAAACTACACATGCTGCAAATTGCAAAGACACGAGTGGAACAAACATGGGTGGTGTAATTGGCTCAACATAGATCCATGGTTGAGAGTAATGAACCAAACGCAACACAACTTAACAAACAATACTTATAGGATGGAATGTGCAGTTACCTGTAGGTATGACAATGAAACGGACTTGAACATAGTGTTACAAGCCCGAGATAGCCCTACAATGTTAACAGGCTGCAAAAAAGGAAAAAATTACTCCTTTTCTGGTGAAATCAGATCTAAGCCTTGCAGTCAAGATCTGGCAATAGAGGATTTGATGCTGGCCGACCATTCATGCCATTTGGAAGACAGTGTCATAGAAACTATGGTTGATGAGGTTACAGAACTAGTTGAAAAGACAAGGAAGAAAGCTAGTAGGAGCCTTAGTTGGGCTGAAGGCAAAATAAGAAGCCTAAGGCTAAGGTTGTTTGGGGCTGAGGCATCACCATACTGTAATATAACAAAAGTGATTGGAAATATAGTTTACACCAAAAATTGTACTCCAGCATGCCTACCACCAACAGCTGTTGTTATAGGACCTGGGGCTTTTGACTTACTTGGGGGTGATAGCAATGGAAAAACGATATACATCCCAACAGGTGTCACAAATGATGTTATAATGATAACAATCATAGCTATGTCTGAATTCCTACCTGAGACTGCAAGTGTTGCTTATACAATCTTCCATTATTTGAATATAAAAACCTCTCACCCGTTAATTGAAGACTCCTGTGATAAAACCAAACTAAACCTGACCATCAATAGACCTGTTCATACAGTGGTGCCAAAACAATTCTATTTTTTAGGTAAGTGGTCTTGTATAAAACCCAGTTGGTGGCCATATTGGAGCGCCACTGAGGAACTCATCTTTGATTTGGAAAATGTTATAGGACTTATGGTTAGGTTAGTAAAACAAGTTACAACAATTCTTAACGACCTTAGTGCTGTAGCATTTATTGCAGCAATTATCAAATTGATACAAGGGAAGCCTATACATGCCATCATATGGCTGCTGTTGCTTACCGGAGTCCAAGGCCAATACCTGAATGACAACAAACTTAAATGTAGAGACCAATTTAAGTATGCCCTGGCTAATGGAGTAGACATTGGCCTACTGGGCGCAAAAAATTTGACAACAATGTGGCAAGATTATAAATTGGATGATGGACAAGTAAAAGCTGAATGCATTCACAGACGATGGGAAATAACGGTCAAATGCAAATTAGCAAGGGACACTTGGTTGGCAGAAAAGCATGAACGTGCCCTACCTACGTCTGTCAAATTCTTTAGTATTCACAACAGATCAAAAGAAACCACACGGACCATAGAAAGACCAATGGGCGTGTGCGACTGTGGTAGTACCCCATCTGAAAATGCAAACTACAATGCTATGAGGACAGCATCTTCTGCTTTCTATCTGGAATGCCCATATGAGTGGATTGGAAATATAACCTGCAAAACCAAGCAACCACAATTATGGCATACAGAAATTATAGAGACAATAACATACAACAGCCAAAACTTTGAAGACAAAGGGTGTAAAAGAACTAAAACTCTAGATGACAAAGAATTTGACTGTAAATACGGGGGAAATAACTCATGTGTGGTAGGCCAGCAGGTAAGTTACAAGAAAGAATACCAATTAGAAAGTTGTGATTGGTGTGGTTATACGTTTAGGGATAGCACAGACTTACCAACCTGGCCCATAGGACATTGTAAAGTTAAAGAATTCATAGGGAAAGTGGTAGCTGGAAATACAAGTTGCATAATAAATGGTGTAGAAATAACCAAAAATGGGGAAGTGGAGTGCGAAATTGGAACGACAAAAGTGAAAACAACACAGAAGACTAATGACCTACTAGCAATGCCATGCAAACCAATCAAGACTGGCTCAGATACATCATATTCCAATGGGAGGCAAACATGTACCTTTAATTACTCTAAAGTGTTACCAAACAAATATTACAACATCATAGATGAGTTCTGGCAGCAGTACATAGTTAAGGACGGATACCAGTACTGGTTTGACTTATCTGCTATGGACCATCGAAGGAGTGTGGTTGCTGAATTTATAGTAATTGTTGTTGTTGCGCTCTTAGGGGGGAGGGTAACACTTTGGTTGTTGGTAGCCTACCATCTTCTTGATATGACCCAAGCATACATACCAGGACAAAATTCACCAGGAGAATTTTTTATGTACAGTAGTATATTAATAGATGCAGATCTTGAGGTAATATCTCACTTTCTCCTTTTACTAGCTCTACTATTTGACACAAACTGTAGAAATATATTTCTGTCTGTGTTCTTTATACTGACATCATCAGCCAAAACAACTGTCATCTTTTTAATCCTCTGCTTGGTAGGTTGTGTGAAGGCCGAGGCATCAGAAGCTCACTGGCAGTACATTGAGTACACCTACCTGATCATCTTAACAGTAGTTAGCATAATTGTGATGGCCAAAAGAAGGAACTTTAGTTTCTTCACAGTAACCCTAACAGTCACTCTGTTCCGTTTTTCTGCAACAGTACCAGCTGAAGCCAATTACTTAATAATATACATCCTCTTTGTATTGTTTTACATGCTAATGGCAATATATTATGATGGCAAGTGCAGAAAACCTATACTGCTGTTACTAAGCTTTGCATTCTTGTATGGTGCTCTGGGGATTATAAACTATTTGAACAGCTTCAAAGCCACCACTATAAACTTGTTAGTAGTAAACTGGCCAAGAGTAGGGGTTCTACTAAGCATATACCTTTCAATAACAACTTGGTCAGCCACATCGGGGGTAGATATCTCGGGATACCTGCTTGCAGTGGCTGCAGTAATAATGACCATTATTTCCATCTTTTTAGACCTAGTTGTGATATGGGCCATAATACCATGGTACAATGTAACCAAGCTATATTACATCAAGAACAAAGTTAACAGAGCAAGAAAAGATTGGCAAATGGAGGAAGCCACCTATGGGACTCTTTTGGACACGAGCGAAGGGGTACACCAGATTGCAACGCCTGATATCAAGGCCATAGACCCTTTAATTTGGATTGTACTTAAATCTATACTATTGGCTGCACTAACAACAATCTGGAAACCAATAATTCTTGGATATTGTATATTGGAGATGCTATACTGGCTTCACTTAAAATTAATCAATGAACTAGCAGGATTCACCAACATACTGTCAAGGATTGTAGCCTCACTAATAGAAGTCAGTTGGAAAGGCTTAGGGGATGAAGTCGGAACTCTATATAAAACCTATCTTCTAAGCTGCAAAGTCAAACAGCTAGTTGTCAAACATAAAGTTAACAACCCTGAAATAAAAAAGTGGTTTAGAGGAGAAGAAATATTTGGGATGCCAAAAATATACATGGTTACAGCTGTAAGAAATTTGACCAAAGACAATGCTATCCTTTGTTCAGTATGTGAAAATAATAATTTGAGAAGAATGTGCCCAAAGTGTGGGAGTAGAGGCACCCAAATTAAATGTGGAATGACCCTGGCAGCCTTTGAAGAGAGGTTCTATTCAAAGATTTTTATAACAGATAACAACCAGGAAGACTTAAGGATTGAAGGACCTGGGAAAGTGGTTAGATATGCAGACAAAGGGTTGTTGTACCTCAGGAACTTACCAATATTAGCCACAAAACAGAAGCTGCTAATAGTTGGAAACCTTGGGAATGAAATAGCTGACTTAGAACATCTAGGGTGGACTCTGAGAGGCCCCGCAGTATGCAAAAAAATAACACAAGCAACTAAATGTCAGGCCAGCATC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| 27,665
|
ON024090.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME1
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,469
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME1/P019T/pangolin/2018, complete genome
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TCATACACATTGGATATATACCAAATTAAAGTTCAGGTGAATTGGGTATACCAAACAACAGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGACGTTAGCCATACGCTGAGTAGCACTAACCCTGATCATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCTATCCTTAATGCAATCGGGGGTCGGTTGCATGAATCCAATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATTGGCGCCAATGGGGAAAGGCTCTATAAACTGGCGTGGACCATAGCATATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGGGTAGGGATTACACCTCCAAGGGGGGCCAAGGAACCTATCTACGATAGGAACCTGCAACCACTTTTTGGAGTGAAGCACAGTCAACTACACCCCAAGTCCACATTAACTTTACCACACCAGAGAGGAAAGAAAACTCAGGAGGTGAAGTTGATGGACTTGCCGAGAAAAGGAGACTGTGAACTAACCAAAGGAGAGGTATCAGGTATCTTTGTCAAACCTGGACCTATATGGTACAGTGACTACGAAGGCCCCGTTTACCATCGAATACCTCTGGAACTCTGCGCTCAATCGACACCATGTAGCGTAAAAAAATTAATTGGGAGAATGGAAGGTAGCGATACGAAATTATATCATGTATACACATGCCCAGATGGTTGTTTGTTTTTCACTAGAGCCAACCGAAGTAGAGTGACCTACTTTATGGTAAACAATGCTTTGGACGCACCACTCTGGGTGCAATCATGTAGTGACGACAAGCCCAAAAATGATAAGATGGTTAAAGGTAAGATTGCACATAAACCAAAAGAAAATGAAAAGGACATAAAAAAGAAGGCACCTGACGCAACTATTGTAGTGGAAGGGGTCAAATACCAAATAACTAAAAAAGGAAAGGTAAGGAGTAAGAAAACAGAGGACGGATTGTATCATAACAAAAACAAACCACCAGAATCTAGAAAGAAATTAGAAAAGGCATTACTGGCTTGGGCAATACTGTGCTGTCTCTTAATAGTGCCAACACAAAGTGATAACATCACACAATGGAATTTATGGGACAATGGGTCGATCGATGACATCCATTTAGCCATGTTCAATAGAGGAATAAACAGAAGTTTGCATGGGATTTGGCCAAAAAGAATTTGCAAGGGGACGCCACCATACTTAGCCAAAGATTATGAACTGAAGCTCATAGAAGGAATGATGGATTCTAGTAGCTACACAAACTACACATGCTGCAAATTGCAAAGACACGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTTCAACATAGACCCATGGATAAGAGAGATGAACGAAACCCAGCACAATTTAACCTCGGGTGACTATAAAATGGAGTGTGCAGTTACTTGCAGGTATGACAATAATTCAGATCTAAACATAGTTTTACAAGCCAGAGACAGTCCAACAATGCTAACAGGATGTAAGAAAGGAAAAAATTACTCCTTCTCAGGGGAAATAAGAAACAAGCCCTGCTCTGAAGAATTAGGTATTGAAGACCTAATGTTAGCCGACCATTCATGCCACTTAGAGGACAGCATAATGGAAACTGTAGTTGATGAGACAACGGAATTAATTGAAAAGGCTAGGAAGAAAGCAAGTAGAAGCCTAAGCTGGGCTGAAAACAAGTTAAGGAATCTTAGATTAAAACTGTTTGGAGCAGAAGCATCACCTTACTGCAATATTTCTAAAATAATTGGCAACATAGTCTACACAAAAAATTGTACTCCAGCCTGTCTCCCTTCAACAGCTACCATCATTGGACCTGGAGCTTTTGATTTGCTTGGAGGGAGTGGTGACAGTAGAAAAATATACATACCCACAGGAATAGGGAATGAAGTAGTAATGTTAACAATTATAGCGGCATCGGAATTTTTGCCTGAAGCATCCAGCTTAGCCTATGTCATCTTCCATTACTACAACGTTAAGACCACCCACCCATTGGTCGGAGTAGAATGTGATAAAAGTCAGCTAAACTTAACCATAAACAAACCTGTCTCAAGTGTAGTCCCTAAACAATTTTACTTTCTAGGAGCCTGGTCCTGTATAAAACCAGACTGGTGGCCATACTGGAGCACAGCAGAGGAAGTCCTGTTTGACCTAGAAGCACTTGTTGGAATTGCGGTAAGGGTAGTACGGGAAATTGCAAGGATTTACGAAGACTTAACAGCAGTTGCCTTTATAGCAGGGGTAATAAAACTCTTACAGGGCAAACCCATACATGCAGTGGTGTGGGTGTTACTACTCTCAGGGGTCAAGGCCCATTCACGGACACCAATCAAGTGCAGACAAGAATTCAGATACGCCCTTGCCACAGGGGTAGACATTGGGCTATTGGGAGCAACTCAATTAACTACACACTGGGAAAACCATGCATTGGATGATGGGCAAGTAAAGGCTAGGTGCAATAATAACATATGGACAATTACTGTCACATGTAAATTAGTAAGAGACACATGGCTAGCTGAAAAACATGAAAGGGCCTTGCCAACTAGTGTCAAGTTCATTAGTATACACAACAAAACAAAAGCAATGCCAACAAGAAACATAAAAAGACCCGAGGGCGTCTGTGACTGCAACGCAACACCTAAAGAAAATTCTAACTTTCGAGCCCTAGTCACTGCGGGTCCAGCCTTTTACTTGCAATGCCCTTATGGTTGGGTGGGTAATATCACTTGCCATACACAACAACCACAACTATGGAAAACCGAAATTATAGAGACCATAACGTATTACAGCAAAGATTATAATGACCCAACCTGTAAAAGGACAAAAATACATGAAGGAAAAGAGTACACGTGCAAATATGGTGGCAATGGAAGCTGTGTACTCGGACAACAGATTAAATATACACAAAATCTTCAACTAGAGAAATGCACCTGGTGCGGCTATGAATTTCAAGAAGCCACAGATTTGCCGCAATGGCCTGTCGGACAGTGTAAGGTCAAACAATATGAAGGACTAGTAATGGCAAACAACTTCAATTGTACAATAAACGGAGTAAAAATAGATAAGAGTGGTCAGGTGACATGCTTAATTGGGAAAACACAAGTTAAAACCACCCAGGTAACAGAAGAGTTGCTGGCTATGCCCTGCCAACCTATAAAGGTAGGTTCAGACACAAAATATGCAAGTGGGAGACAAACATGTACGTTCAATTACTCCGAGGTATTACCCAAAAAGTATTACAACATAGTAGACAATTTTTGGCAACAATACATAGTCAAGGATGGCTACCAATACTGGTTTGACCTGGAGGCTGGCGATCATAGAAGGAGCATCTTAGCAGAGTTCATAGTAATTGTGGTTGTGGCACTATTAGGTGGCAGAGTTACACTGTGGATTCTGGTAGCTTACCATTTGTTAGACTTATCTCAAGCTTACATTCCAAACAGCAACTCACCAGGGGAATTTTTCATGTATAGCTCAGTAATTGTTGAGGCAAATTTGGAAACAATATCACATTTCCTTCTGCTATTAGCTTTACTGTACAACACTGACTGCAGGAACCTATTTTTATCCATATACTTTATACTAACTTCCTCAATCAAGACTACCATTATTTTCATAATCCTTTGTCTAGTTGGCCTCGTAAAGGCCGACAGTGGGGAGAGTGAGTGGAGAAATTTTGAAAATGTCTACCTTGTCATGTTAATAACCATTAGTATATTAGTAATTGCAAAGAAAAGAAACTTCTGTTTTTTTACCGTTACAATAACCGTGGTCTTATTCAGGATGGCAGTAACTTTACCTGCACAATCTAGTTACATAGTAGCATACATCTTTTTTATTTTATTCTACATGTTAATGTCCATATACTACTTTGGAAGATTTAGAAAATTACTCTTATTAGTGATGAGCTTTGCATTTTTATATGGCCTAATAGGAGCTTTGAACACCTTAAACAACTCAAGAAGCTTTTTGTTAGATATTGTGGTTGTAAATTGGCCTAGAGTAGGAGTTTTAATGAGCCTGTACCTGGCACTAACAACATGGTCAATAACTTCAGGAGTAGATATTGCGGGATACCTACTGGGGGCAGCCGCCGTAATAATGACTATGCTTTCCATGATCATAGACATAACTATATTGTGGACTGTGATACCATGGTACAACATTACTAAATTGTACTACATCAAAAAGGAGGTGAATAAGACCAAGAAAGATTGGAAAACAAATGAAACTTATGATGAGTTGCTAAGTACCAAAGAGGGGGTTCACCAAATAGCAACCCCAAGTATTAAAGCCATTGATCCTCTTGTCTGGATTACCATGAAATCAATATTACTAGCTGCATTAACCTCCATATGGAAACCAGTAATCCTAGGGTATTGTATAATTGAAATGATCTACTGGCTCCACAAAAAACTAATTTATGAGTTGGCTGGGTTAACAAACACTTTATCAAGAATAATGGCTTCACTAATAGAAATTAGTTGGAGTGGCTTGGGGGAAGAAGTTGGGATGCTGTATAAGACATACCTCCTAAGCACTGAAATTAGAAAGCTGATTATCAAACACAAAGTAAACAACCCCGGGGTTAAAAAATGGTTCGGGGCTGAGGAAATATTTGGAATGCCAAAAATATATATGGTTACCAGCATAAGAAACCTATCTAAAGACAAGGCTATACTTTGCTCCGTTTGCGAGAACAACAGTAGCAGCCGAAGATGCCCAAAATGTGGTTGCAAGGGGACACCAATCAAATGCGGCATGACCCTGTCAGAATTTGAGGAAAGATTTTACACAAAAATATTTATAACTGAACACAACCAAAATGATCATAGAGTAGAGGGACCAGGCAAGATTGTTAGGTATACAGACAATGGGTTACTTTACTTAAGGAATTTGCCAATACTAGCAACTAAACAAAAGATG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| 30,188
|
ON024091.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME1
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,132
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME1/P143T/pangolin/2018, complete genome
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CTTCATACACATTGGATATGCCAAATTAAAGTTCAGGTAAATTGGACATACCAAACAACAGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGATGTTAGCCATACACCGAGTAGCACTAACCCTGATCATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGAAGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCATGCCCAGGCTTTCCTTAATGCAATCGGGGGTCGGTTGCATGAATCCAATAGGGAGATCTACACAGCCTGATAGGGTATTGGCGCCAATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGACCATAGCACATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGAGTAGGGATTACACCTCCAAGGGGGGCTAAGGAACCTATCTATGATAGGAACCTGCAACCACTTTTTGGAGTGAAGCACAGTCAACTACACCCGAAGTCCACATTAGTTTTGCCGCATGAAAGAGGCAAGAAAACCCAGCAGGTAAGATTGGTGGACTTGCCAAGAAAAGGAGACTGTGAACTTACCAAAGGAGAGGTGTCGGGCATCTTTGTCAAACCTGGACCGATATGGTACAGTGATTACGAAGGTCCTGTATACCATCGAATACCTCTAGAACTCTGCGCTCAATCGACACCTTGTAGCGTGAAAAAATTAATTGGAAGAATGGAAGGTAGTGACACCAAATTATATCATGTATACACATGCCCAGATGGTTGTCTGTTTTTCACTAGGGCAAACAGAAGCAAAACGACCTACTTCATGGTAAACAATGCTTTGGACGCACCACTCTGGGTACAATCTTGTAGTGATGACAAACCAAAAAATGATAAGATGGTTAAAGGTAAGATTGCACATAAACCAAAGGAACATGAAAAGGATATAAAGAAGAAGGCACCTGACGCGACCATTGTAGTAGAAGGGGTCAAGTACCAAATAACTAAAAAAGGAAAAGTAAAGAGTAAAAAGACAGAAGATGGACTGTATCACAACAAGAACAAACCACCAGAATCTAGAAAGAAATTAGAAAAGGCATTACTGGCTTGGGCGGTACTGTGCTCCCTTTTAATAGTACCCGTGCAAAGTGACAACATCACACAGTGGAATCTATGGGACAATGGGACGATTGATGACATCCATTTAGCTATGTTCAATAGGGGGATAAATAGGAGTCTGCACGGGATTTGGCCAAAAAGAATTTGCAAGGGAACGCCTTTATACTTGGCAAAAGACTATGAATTGAGGCTTATAAACGGAATGATGGACTCTAGCAGCTACACAAATTACACATGCTGCAAACTGCAAAGACACGAGTGGAATAAACACGGATGGTGTAACTGGTTTAACATAGACCCATGGATAAAAGAGATGAACGAAACCCAGCACAATTTGACCCAGGGCCAATATAGAATGGAGTGTGCAGTTACTTGCAGGTACGACAATAATTCAGATCTAAATATAGTCCTACAAGCTAGGGACAGCCCAACAATGTTGACAGGATGCAAGAAGGGAAAAAATTATTCCTTCTCAGGGGAAATAAGAAATAAGCCCTGTTCTGAAGAGTTAGGCATTGAAGACCTAATGCTAGCTGACCATTCATGTCACCTAGAGGACAGCATAATGGAAGCAGTAGTCGACGAGACAACAGAACTGATTGAAAAAGCTAGGAAGAAAGCAAGTAGAAGTCTAAGTTGGGCTGAAAACAAATTAAGAAATCTTAGATTGAAACTATTCGGAGCGGAAGCATCACCCTACTGCAATATTTCTAAAATAATTGGCAATATAGTTTATACAAAAAATTGCACTCCAGCCTGTCTACCTTCAACAGCTACCATAATCGGGCCTGGGGCTTTTGACCTGCTTGGAGGGAGTGGCAACAATAAAAAGATATACATACCCACAGGAGTAGGAAGTGAGGTAGTAATGTTAACAATTATAGCGGCATCAGAATTTTTGCCCGAAACATCTAGTTTAGCTTACGTCATTTTCCATTATTACAATATCAAGACTACCCATCCACTAATTGAGGTGGAATGTAACAAAAATCAGCTAAATTTGACCATAAACAAACCTGTCTCAGATGTAGTCCCTAAACAATTTTATTTTTTGGGAGCCTGGTCCTGCATAAAACCAAACTGGTGGCCATACTGGAGTACAGCAGAAGAAGTCCTGTTTGACATAGAAGCAATTGCTGGAATTGCTGTAAGGTTGATACAGGAAACTGTAAGGATTTATGAAGACTTAACAGCAGTTGCTTTTATAGCGGGGATAATAAAACTTGTACAAGGCAAACCCATACATGCAATAATGTGGGTGTTACTACTCTCAGGGGTCAAGGCCCGAGCACAGTCATCAATCATGTGCAGAGAAGAATTTAAATACGCCCTTGCCTCAGGGGTGGACATTGGGCTATTGGGGGCAACTCAATTGACTACACAGTGGGAAGACCATAGACTGGATGATGGGCAAGTAATGGCTAATTGTAACAACCGCCGATGGACAATTACCGTCAAATGCAAATTAGCTAGAGATACATGGCTAGCTGAAAAACATACAAGGGCCTCGGCGACTAGCGTCAAGTTTATTAGCATCCACAACAGAACAAAGGTGACAACAAGAAACATAAAAGAACCCCAGGGTGTGTGTGATTGCGGAGCAACACCTAAAGAAAATTCCAATTTTAGGGCAATAGTCATCGCAGGATCAGCCTTTTATTTAACATGCCCTTATGGTTGGGAGGGTAACGTGACTTGCCTTACTACACAACCACAACTATGGCATACTGAAATTGTGGAGACTATAAAATATAACAGCAAGGATTACAATGACCCAACCTGTAAGAGGACAAAAACACATAATGATGGAAAAGAGTACACATGCCAATATGGAGGTAACAGCAGCTGTGTACCAGGACAGCAGATTAAATATACACAAAATCTTCAATTAGAGAAATGCACCTGGTGTGATTACGAATTTCAAGAGGCCACAGACTTGCCACAATGGCCTATTGGACAATGCAAGGTCAAACAATATAATGGCTTAATAATGGCAAACAACTCCAATTGTACAATAAACGGAGTTTTAATAACCAAAAAAGGTGATGTGGAATGCTTAATCGGAAAAATACGAGTCAAAACTACCCAAAAAACAAACGAACTACTGGCTATGCCCTGCCAACCTATAAAGGTAGGTTCAGACACAAAATATGCAAGTGGGAGGCAAACATGTACATTTAACTACTCCCAGGTATTACCCAACAAGTATTATAACATAATTGACAACTTTTGGCAACAATTCATAGTCAAGGATGGTTACCAATACTGGTTTGATTTGGAAGCTGGTGACCACAGAAGGAGCATCCTGGCAGAATACATAGTGATTGTAGTTGTGGCATTATTAGGTGGCAGAATTACACTGTGGATTTTGGTAGCCTACCATTTGTTAGACTTATCTCAAGCTTATATTCCAGGCAGCAATTCACCGGGGGAGTTTTTCATGTATAGCTCAGTGATTGTTGAAGCAAATTTGGAAACAATATCTCATTTTCTTCTGTTACTAGCTTTGTTGTATAATGCCAACTGTAGAAACCTATTTTTATCTATATATTTTATACTAACTTCTTCAATCAAGACCACTACTATTTTCATAATCCTCTGCTTAGTTGGCTTCGTAAAGGCTGATGGTGGGGGGAGTGGGTGGCAGAACCTCGAAAACATTTACCTTGTTATGTTAATAACTATCAGTATATTAGTAATTGCAAAGAAAAGAAATTTCTGTTTCTTCACTGTCACAATAACTGTAGTTTTATTTAGGATGGCAGTGACTTTACCCGCACAATCTAATTACATGGTAGCATACATCCTTTTTATTTTATTCTATATGTTAATGTCCATATACTACTTCGGAAGATTTAGAAAATTGCTTTTGTTAGTAATGAGCTTTGCATTTCTATATGGCCTAATAGGAGCTTTGAACACCCTAAATAATTCAAGAAATGATTTTTTAAACATTGTGGTTGTAAATTGGCCTAGAGTAGGGATTTTAATGAGCTTATACTTGGCACTAACAACTTGGTCAATAACTTCAGGAGTAGATATTGCAGGGTACCTAATGGGGGCAGCTGCCGTGATACTGACTATGGTTTCCATGGTTATAGACATAACCATATTATGGACTGTGATACCGTGGTACAACATCACCAAATTATACTACATCAAAAAAGAGGTAAATAGGGCCAAGAGAGATTGGAAAGTGAATGAGGCTTATGATGAGCTGCTAAATACTAAAGAGGGAGTTCACCAAATAGCAACCCCGAGTATTAAAGCCATTGATCCTCTTGTCTGGATCACCATGAAATCAATACTACTAGCGGCATTGACATCCATATGGAAGCCAGTAATCTTAGGATACTGCATAATTGAAATGGTCTACTGGCTCCATAAAAAATTAATTTACGAACTGGCTGGGATGACAAACACTTTATCAAGAATAGTAGCTGCATTAATAGAAATCAGTTGGAGTGGCTTAGGGGAAGAAGCTGGAACACTGTACAAGACATACCTCCTGAGTACCGAAATAAGGAAACTGATTATCAAACACAAAGTAAACAACCCTGGAGTTAAAAAATGGTTTAGAGCCGAGGAAATATTTGGAATGCCAAAAATATATATGGTCACCAATATAAGAAACCTAACTAAAGACAAAGCTATACTTTGCTCCGTCTGCGAGAATAACAGCAATAGCCGGAGATGCCCAAAATGTGGTTGTATGGGAACACCAATTAAATGTGGCATGACCCTGTCAGAATTCGAGGAAAGATTCTACACAAAAATATTTATAACTGAACACAACGAAAATGACCATAGGGTAGAAGGGCCAGGCAAGATTGTTAGATACGCAGACAACGGGCTACTTTACCTAAGGAATTTGCCAATACTAGCAACTAAGCAAAAGATGC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| 30,189
|
ON024092.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME1
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,080
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME1/P186T/pangolin/2018, complete genome
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TCATACATATTGGACATACTAAATTAAAATTCAGGTGAATTGAACATACCAAATAATAGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGACGTTAGCCATACGCTGAGTAGCACTAACCCTGATCATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGTAACCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCATCCTTAATGCAATCGGGGGCCGGTTGCATGAATCCACTAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGACCGTAGCACATGAATTTTGAACTCTTTTTTAGGGTAGGGAATACACCACCAAGAGGGGCCAAGGAACCTATCTATGATAGGTACTTGCAACCACTCTTCGGGGTAAAACACAGTTCATTACATCCCAAGTCTACATTGGTTCTGCCGCATGAAAGAGGAAAGAAAACCCAGCAGGTGAAATTGGTAGACTTGCCAAGAAAAGGGGACTGTGAATTAACCAAAGGGGAGGTATCAGGCATCTTCGTCAAACCTGGGCCAATATGGTACAGTGATTACGAAGGCCCCGTTTACCATCGAATACCTTTAGAACTCTGTGCTCAATCAACACCATGCAGAGTAAAAAAATTAATTGGAAGGATGGAAGGTAGTGACACCAAATTATACCATGTATACACGTGCCCAGATGGTTGTCTGTTCTTTACTAGGGCAAATTCAAGCAGAGCGACCTACTTCATGGTGAATAATGCTTTAGATGCGCCACTTTGGGTGCAATCTTGTAGTGATGACAAACCAAAAAATGACAAGATGGTTAAGGGTAAGATTGCACATAAACCAAAGGAAACTGAAAAGGATATAAAGAAAAAGGCACCTGACGCAACCATTGTAGTGGAAGGAGTGAAATACCAAATAACTAAAAAAGGAAAAGTAAGGAACAAGAAAACGGAGGACGGACTATATCATAACAGAAACAAACCACCAGAATCTAGAAAAAAATTAGAAAAGGCACTACTAGCTTGGGCAATATTATGCTGCCTCTTGATAGTGCCTGTGCAAGCTGACAATATCACACAATGGAATTTATGGGACAATGGGACGATTGATGACATCCATCTAGCCATGTTCAATAGAGGGATAAATAGAAGTCTGCATGGGATCTGGCCGAAAAGAATTTGCAAAGGGGCACCACAATACTTGGCAAAAGATTATGAATTAAAACTCATAGAAGGAATGATGGATTCTAGTAGTTTTACAAATTATACATGTTGCAAATTGCAAAGACATGAGTGGAACAAACATGGATGGTGCAATTGGTTCAACATAGACCCATGGATAAGGGAGATGAATCAAACCCAACACAATTTGACCAATGGAAGTTATAAAATGGAGTGTGCAGTTACTTGTAGATACGACAACAACTCAGACTTAAATATAGTCCTACAAGCCAGGGACAGTCCAACCATGCTAACTGGGTGTAAAAGAGGAAAGAACTACTCCTTCTCCGGGGAAATAAGAAGCAGGCCCTGTTCTGCAGAATTAGGCATTGAAGATCTAATGTTGGCTGACCATTCATGTCACCTGGAAGACAGTATAGTGGAAGCTGTAGTCGACGAGACAACAGAATTGATTGAAAAAGCTAGGAAGAAAGCAAGTAGAAGTCTAAGTTGGGCTGAAAATAAACTGAGAAATCTTAGATTAAAACTATTTGGGGCAGAAGCATCACCTTACTGCAACATTTCCAGAATAATTGGCAATATAGTTTATACAAAAAATTGTACCCCAGCCTGCCTCCCTTCAACAGCTACTATTATTGGACCCGGAGCTTTTGACTTGCTCGGAGGGGATGGCAGCTCAAAACAAATATACATACCTACAGGAATTGGAAATGAAATAGTGATGTTGACGATTATAGCAGCATCAGAATTCTTGCCTGAAACAGCCAGCGTGGCTTATGTCATTTTTCATTACTACAATATGAAAACCACCCACCCATTAGTCGGTGAGGATTGTGACAAAAACCAGCTAAATTTGACCATAAGCAGACCTGTCTCAGATGTTGTCCCCAGACAATTTTACTTTCTAGGAGCATGGTCCTGTATAAAACCGAACTGGTGGCCATACTGGAGCACAGCAGAAGAGGTTTTGTTTGACCTAGAAGCACTCGTTGGAATTGGTGTGAGATTAATACAGGAAATTATGAGGATCTATGAAGACTTAACAGCAGTTGCTTTTATAGCAGGTGTAATAAAGCTCTTACAAGGCAAGCCTATACATGCAATAATTTGGGTGTTATTACTATCAGGAGTCAGGGCCCATTCATGGAAATCAATCAGTTGCAGAGACCAGTTCAAGTATGCCCTAGCCACAGGGGTGGATATTGGGCTATTGGGAGCAACTCAGTTAACTACCCATTGGGAAGACTACAAACTAAATGATGGACAGGTGAGTGCCAACTGCGTAAATGGTAGATGGGTAATCACAGTTAAATGTAAGTTAGCAAGGGATACATGGCTAGCAGAAAAACATGAGAGAGCTTTACCGACTAGTGTCAAGTTCATCAGCATACACAACAGAACTAAAATGACAATAAGAAACATAGAAAAACCCCAAGGTGTATGTGACTGTGACTCAACACCTGTAGAAAATTCCAATTTTAAGGCCATAGTTACTGCAGGAGCAGCCTTCTACTTGGCATGCCCTTATGGTTGGGTAGGCAATGTTAGCTGCAAAACCCGGCAACCACAACTATGGAAAACTGAAATTGTGGAGACTATAATGTACAATAGCCAAAATTACAATGACCCAACCTGTAAGAGAACAAAAACAGTTCGTGGAAAAGAGCACACGTGCAGATATGGAGGTAACTCAAGCTGTGTATTAGGTCAACAGGTTGGATATACAAAAAATTTTCAAATAGAAAAATGCACCTGGTGTGACTATGAATTTCTAGAAGCTACAGATTTGCCACAATGGCCAATTGGACAGTGCAAGGTCAAACAATACGAAGGGTTAGTGATAGCAAGCAACACCAACTGTACAATAAACGGAGTATTAATAACTAAAAATGGTGATGTAGAATGTTTAATAGGGAAAACGCAAATCAAAACTACAAAAAAAACAGACGACCTATTGGCAATGCCCTGTCAACCTATAAAAACAGGTTCAGACACAAAATACGCAAATGGGAGACAAACGTGTACATTCAACTACTCCAAGGTACTACCAAACAAGTATTATAACATTGTAGACAATTTTTGGCAGCAATTTATAGTCAAGGATGGCTACCAATACTGGTTTGATCTGGAAGCTGGTGACCACAGAAGGAGCATTTTAGCAGAATATATAGTAATTGTGGTTGTGGCACTATTAGGCGGCAAGGTTACATTGTGGATCCTAGTAGCTTATCACCTATTAGATTTATCACAAGCTTACATTCCAGGCAGCAACTCGCCAGGAGAATTCTTTATGTATAGTTCAGTGATTGTTGAAGCAAACTTGGAAACTATATCTCACTTCCTTCTGTTATTAGCTTTACTGTATAACACTGACTGCAAGAACTTATTTTTATCTATATATTTTATACTAACTTCTTCAATCAAGACTACCATTATTTTCATGATCCTCTGCCTAGTTGGCTTTGCAAGGGCTGATGGTGATGAGAGTGGGTGGCCAAACTTTGAGAATGCCTACCTTGTCATATTAATAATTATCAGTATATTGGTAATAGCAAAGAAAAGAAATTTCTGTTTTTTCACCGTCACAATAACAGTAATTTTATTTAGAATGGCAGTTACTTTACCTACACAACCTAGCAATATAGTAATATATATCCTTTTTGTTCTATTTTACATGTTAATGTCCATATACTACTTTGGAAGATTTAGAAAATTGGTTCTATTAGTAATGAGCTTTGCATTTCTGTATGGTCTAATAGGAGCTTTAAACACCTTAAACAATTCAAGAAACACTTTTTTAAGCGTTGTGGTAGTAAACTGGCCTAGGGTAGGAATTTTAATGAGCCTATATCTAGCTTTAACAACATGGTCAATAACTTCAGGAGTAGATATTGCCGGGTATCTACTGGGGGCAGCAGCAGTGATACTAACTATGATTTCCATGGTTATAGACATAACTATACTATGGACAGTGATACCGTGGTACAATATCACTAAATTATACTACATCAAAAAAGAGGTGGATAAGACCAAGAAAGATTGGAAGACAAACGAGGCTTATGATGAGTTGCTAAATACCAAAGAGGGAGTTCACCAGATAGCAACTCCGAGTATCAAGGCCATTGATCCTCTTGTCTGGATCACCATGAAATCAATACTACTAGCAGCACTGACCTCCATATGGAAACCAGTAATCTTAGGATATTGTATAGTAGAAATGGTTTACTGGCTCCACAAAAAACTAATTTATGAGCTAGCTGGGATGACAAACACCTTATCAAGAATAGTAGCTGCACTAATAGAAATTAGTTGGGGTGGCTTAGGGGACGAGACTGGGACACTATATAAAACGTACCTCCTAAGTACTGAGATAAAAAAACTGGTCATTAAACATAAAGTCAACAACCCTGGAATTAAAAAGTGGTTTGGGGCTGAGGAAATATTTGGAATGCCGAAGATATACATGGTCACCAATATAAGAAATTTAACCAAAGACAAAGCTATTCTTTGCTCCGTCTGTGAGAATAACAGTGACAGCCGGAGATGTCCCAAATGTGGCTGCATGGGAACACCAATCAAGTGCGGCATGACCCTGTCGGAATTTGAGGAAAGATTTTACACAAAGATCTTCATAACTGAACACAACCAAAATGACCATAGGATGGAGGGACCAGGCAAGGTTGTTAGGTACGCGAATAACGGACTACTGTATCTAAGGAACTTGCCGATACTAGCAACCAAGCAGAAGATGTTAATA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| 30,190
|
ON024093.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME1
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,243
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME1/P202T/pangolin/2018, complete genome
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TCATACATATTGGTTATACCAAATTAAAGTTTAGGTAAATTGGATATACCAAACAATAGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGACGTTAGCCATACGCCAAGTAGCACTAACCCTGATCATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGAGGCCGTAGCAGTGAGAACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCATCCTTAATGCAATCGGGGGTCGGTTGCATGAATCCACTAGGGAGATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGATCATAGCACATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGGGTAGGGAATACACCGCCAAGGGGGGCTAAGGAACCTATTTATGATAGGAACCTGCAGCCGCTCTTTGGGGTGAAGCACAGTCCGTTACATCCAAAGTCCACATTGACACTGCCACATGAAAGAGGGAAGAAAACTCGGCAGGTGAAATTGGCGGACTTGCCAAGAAAAGGAGACTGTGAATTAACCAAAGGGGAGGTGTCGGGCATCTTCGTCAAACCTGGACCAACATGGTATAGTGACTACGAAGGCCCTGTTTACCATCGAATACCTCTAGAACTCTGCGCTCAATCAACACCATGTAGCGTAAAAAAACTAATTGGAAGAATGGAAGGTAGTGACACCAAATTATACCACGTGTACACATGCCCAGACGGGTGCCTGTTTTTTACTAGGGCAAATGCAAGCAGAGCAACCTACTTTATGGTGAACAATGCCTTGGACGCACCACTCTGGGTACAATCCTGCAGTGATGACAAACCTAAAACTGACAAGATGGTCAAAGGCAAGATTACACATAAACCAAAGGAAACTGAAAAAGATGTAAAGAAGAAGGCCCCCGACGCAACTATTGTAGTGGAAGGGGTAAAATATCAGATAACAAAAAAAGGAAAAGTAAGGAGCAAGAAAACAGAGGATGGATTGTATCATAACAAAAACAAACCACCAGAATCCAGAAAGAAACTAGAAAAAGCGTTGCTGGCTTGGGCAATATTGTGTTGCTTACTATTAGTGCCCGTGCAAACTGACAATGTCACACAATGGAATCTATGGGACAATGGGACAATTGATGATATCCACTTAGCTATGTTTAATAGAGGGGTAAACAGAAGTCTGCATGGAATTTGGCCAAAGAGAATTTGCAAGGGGACACCACAATACTTAGCAAAAGATTATGAGTTGAAACTTATAGAAGGAATGATGGATTCCAGCAGCTACACTAACTACACTTGTTGCAAATTGCAAAGACACGAATGGAACAAACATGGATGGTGCAACTGGTTCAGCATAGACCCATGGATAAGAGAAATGAATGAAACTCAACACAACTTGACCAATGGCAATTATAAGATGGAGTGTGCAGTCACTTGTAGGTATGATAACAATTCGGACCTAAACATAGTGTTGCAGGCCAGGGACAGTCCCACAATGTTAACCGGGTGTAAGAAGGGAAAGAATTATTCCTTCTCCGGGGAAATAAGAAGCAAGCCCTGTTCCACAGAATTAGGTATTGAGGACTTAATGTTAGCTGATCATTCATGCCACTTGGAAGACGGCATAATGGAAGCTGTAGTTGATGAAACAACAGAATTAATTGAAAAGGCCAGGAAGAAAGCAAGTAGAAGTCTAAGTTGGGCTGAAAACAAACTGAGAAACCTTAGATTAAGACTATTTGGAGCAGAAGCATCACCTTACTGCAATATATCCAAGATACTTGGCAATATAGTTTATACAAAAAATTGTACTCCAGCCTGTCTACCTTCAACAGCCACTATCATTGGACCTGGAGCTTTTGACTTGCTTGGAGGGGATGGCAACTCAAAACAAATATACATACCCACAGGAGTTGGAAGTGAAATAGTGATGCTGACAATTATAGCAGCATCCGAATTTTTGCCCGAGACAGCCAGTGTGGCCTATGTCATTTTCCATTACTACAACATCAAGACCACCCACCCATTAATTAGTGAGGAATGTGATAAAAGCAAATTAAACTTGACCATAAATAGACCTGTCTCAGATGTTGTTCCTAAACAATTTTACTTTTTAGGAGCATGGTCCTGTATAAAACCAAACTGGTGGCCATATTGGAGCACAGCAGAAGAGGTTTTGTTTGACTTGGAGGCAATTGTTGGAATTGGCATAAGACTAGTACAGGAGATTATAAGGATCTATGAAGACCTAACAGCAGTTGCTTTTATAGCAGGGGTAATAAAACTCTTACAAGGCAAACCTATACATGCAATAATATGGGTATTGCTACTTTCTGGAGTCAAGGCTCATTCGCAGACAATCCTTTGCAAAAACCAGTTCAAGTACGCCCTTGCCTCAGGGGTAGATGTAGGGCTACTGGGAGCAACCCAATTAACTACCCAATGGAGAGACACAACCCTAGATGATGGACAGGTAATGGCCCAATGCAGCGGAGGCAAGTGGACAATTACAGTTAAATGCAAGTTAGCAAGAGATACATGGCTGGCAGAAAAACATGAAAGGGCCTTACCCACCAGTGTTAAATTCATTAGCATCCACAACAGAACAAAAACAAAAAAAGTGATAAGAAACATAGAAACACCTCAAGGTGTTTGTGATTGCAATGCAACACCTAAAGAAAATTCTAATTTTAGAGCCCTGGTCGCAGCAGGAGCAGCCTTTTATTTAAATTGCCCTTATGGTTGGATTGGCAATGTGACCTGCATCACCCAACAACCAGAACTATGGAAGACTGAAATTGTAGAAACTATAGTGTATGATAGCAAAAATTACAATGATTTAACATGTAATAGGACAAAAACACATAATGATGGAAAAGAATACAAATGCAAATATGGGGGTAACCTAAGTTGTGTGCTAGGACAGCAGATTGAATACACACAAAATCTTCAACTAGAAAGATGTACCTGGTGCGGCTATAACTTTGAAGAGGCCACAGGCTTGCCACAATGGCCCGTTGGACAGTGCAAGGTTAAACAATATAAAGGGTTAATAATGGCAAACAACACCAATTGTACAATAAATGGAGTACTAATAGGTGAAGGTGGCAGTGTAGAATGTCTAATTGGGAAAGTGAAAATTAAAACAACTCAAAAAACAAGTGAATTGTTAGCCATGCCTTGTCAACCTATAAAAGTGGGATCAGACACGAAATATGCGAATGGGAGACAAACATGTACATATAACTACTCCCAAGTGCTACCCAACAAATATTATAACATAATAGACAATTTCTGGCAACAATATATAGTCAAGGATGGGTACCAATATTGGTTTGACCTAGAAGCTGGTGACCATAGAAGAAGCATCTTAGCAGAATATATAGTAATTGTGATTGTAGCACTATTAGGTGGTAAGGTCACACTGTGGATCCTAGTAGCTTACCATCTGTTAGATTTATCACAAGCTTACATTCCAGGAAGCAATTCGCCAGGGGAATTTTTTATGTATAGCTCAGTGATTATTGAAGCAAATTTAGAAACCATATCTCATTTTCTCCTGCTATTAGCTCTGTTATACAATACTGACAGTAGGAACTTGTTTTTATCAATATTTTTTATACTAACTTCCTCAATCAGGACTACAGTTATTTTCATAATCCTTTGTTTAGTTGGCTTTGTAAAGGCTGATGGTGAAGAGAGTGGGTGGCCAAACTTTGAAAATGTTTACCTTGTTATGTTAATAATAATCAGCATATTAGTAATTGCAAAGAAAAGGAATTTCTGTTTTTTTACCGTTACAATAACAGTAGTATTATTTAGAATGGCAGTAACTTTACCTGCCCAATCTAGTTATATAGTAGTGTATATCCTTTTTATTTTATTCTACATGCTAATGTCTATATACTACTTTGGAAGGTTTAGAAAATTACTTCTGTTAGTGATGAGCTTTGCTTTTTTATATGGCCTAATAGGGGCTTTAAACACCCTAAACAATTCAAGGGATGCCTTTTTAAACATTGTGACTGTAAACTGGCCCAGAGTAGGGATTTTAATGAGCTTATATTTAGTTCTAACAACATGGTCGGTAACTTCAGGAGTAGATATTACCGGGTACCTACTAGGGGCAGTGGCCATAATATTGACTATGATTTCCATGGTTATCGACATAACTATATTATGGACTGTGATACCATGGTATAATATTACTAAATTATACTACATTAAAAAAGAGGTGAATAAGACTAGGAAAGACTGGAAGACAAGTGAAGCCTACGACGAGTTGCTAAATACCAAAGAAGGAGTCCACCAAATAGCAACCCCAAGCATTAAGGCTATCGATCCTCTTGTCTGGATCACCATGAAATCAATATTACTAGCAGCACTGACCTCCATATGGAAACCAGTAATCTTAGGATACTGTATAGTAGAAATGGTTTACTGGCTTCACAAAAAATTAATTTATGAACTGGCTGGGATGACAAATGCCTTATCAAGGATAGTAGCTGCACTAATAGAAATTAGCTGGAGTGGCTTGGGGGAAGAGGCAGGGATACTATATAAGACATATCTCCTAAGCACTGAAATAAGAAAATTGGTCATCAAACACAAAGTAAATAACCCCGGAATCAAAAAGTGGTTTGGGGCTGAGGAAATATTTGGAATGCCAAAAATATACATGGTCACCAATATAAAAAATCTAACTAAAGACAAAGCTATACTTTGCTCCGTCTGTGAGAATAACAACAATAGCCGGAGATGCCCCAAATGTGGTTGCATGGGAACACCAATCAAATGTGGCATGACCCTATCAGAATTTGAGGAAAGATTCTACACAAAAATATTTATAACTGAACACAACCAAAACGACCATAGAGTGGAGGGACCAGGTAAGATTGTTAGGTACGCGGACAATGGACTACTGTACCTAAGGAATTTGCCGATACTAGCAACTAAACAGAAAATG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| 30,191
|
ON024094.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME1
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,440
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME1/P218T/pangolin/2018, complete genome
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TCATACATATTGGTTATACCAAATTAAAGTTCAGGTGAATTGGATGTACCAAACAATAGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGACGTTAGCCATACGCCGAGTAGCACTAACCCTGATCATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGAGGCCGTAGCAGTGAGAACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCATCCTTAATGCAATCGGGGGTCGGTTGCATGAATCCACTAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGAACATAGCACATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGGGTAGGGAATACACCGCCAAGAGGGGCCAAGGAACCTATTTATGATAGGAACCTGCAGCCACTCTTCGGGGTAAAGCACAGTCCATTACATCCCAAGTCCACATTGGTATTGCCACATGAGAGAGGGAAGAAAACTCGGCAAGTGAAATTGGTGGACTTACCAAGAAAAGGAGACTGTGAATTAACCAAAGGAGAGGTGTCAGGCATTTTCGTTAAACCTGGGCCGACATGGTATAGTGACTACGAAGGTCCTGTTTACCACAGAATACCTCTAGAACTCTGCGCCCAATCAACACCATGTAGCGTAAAAAAACTAATTGGAAGAATGGAAGGCAGTGACACCAAATTATACCACGTGTACACATGCCCAGATGGTTGTCTGTTTTTCACTAGGGCAAATGCAAGCAAAGCAACCTACTTTATGGTGAACAATGCTTTGGACGCACCACTCTGGGTGCAATCCTGCAGTGATGATAAACCTAAAACTGACAAGATGGTCAAAGGCAAGATTACACACAAACCAAAGGAAACTGAAAAAGATGTAAAGAAGAAGGCTCCAGACGCAACTATTGTAGTGGAAGGGGTAAAATATCAGATAACAAAAAAAGGAAAAGTAAAGAGCAAGAAAACAGAGGATGGATTGTACCATAACAAAAATAAACCGCCAGAATCTAGAAAGAAATTAGAAAAAGCGCTGCTAGCTTGGGCAATATTGTGTTGCCTTTTGATAGTGCCCGTGCAAACTGATAATGTCACACAATGGAATCTATGGGACAATGGTACAATTGATGATATCCATTTAGCTATGTTTAATAGAGGGATAAATAGAAGTCTGCATGGAATTTGGCCAAAGAGAATTTGCAAGGGGACACCACAATACTTAGCAAAAGATTATGAATTGAAACTTATAGAAGGAATGATGGATTCCAGTAGTTACACGAACTACACGTGTTGTAAGTTGCAAAGACACGAGTGGAACAAACATGGATGGTGTAACTGGTTCAACATAGACCCATGGATAAGAGAAATGAATCAAACTCAACACAATTTAACCAATGGCAATTATAGGATGGAATGTGCAGTAACTTGTAGGTATGATAACAATTCAGACCTAAACATAGTGCTGCAGGCCAGGGACAGTCCTACAATGTTAACCGGGTGCAAGAAGGGAAAGAATTATTCCTTCTCTGGGGAAATAAGAAGCAAGCCCTGTTCCATACAATTGGGCATTGAAGACTTAATGTTAGCTGATCATTCATGTCACCTGGAAGACGGCATAATGGAAGCTGTAGTTGATGAGGCAACAGAATTAATTGAAAAGGCTAGGAAGAAAGCAAGTAGAAGTCTAAGTTGGGCCGAAAACAAACTGAGAAATCTTAGATTAAGATTATTTGGAGCAGAAGCGTCACCCTACTGCAACATATCCAAGATAATTGGCAATATAGTTTATACTAAAAATTGTACTCCAGCCTGTCTCCCTTCAACAGCCACTATCATTGGACCTGGAGCTTTTGACTTGCTTGGAGGGGATGGCAACTCAAAACAAATATACATACCTACAGGAGTTGGAAGTGAAATAGTGATGCTAACAATTATAGCAGCATCTGAATTTTTGCCCGAAACAGCCAGTGTAGCTTATGTCATTTTCCATTATTACAATATCAAGACTACCCACCCATTAGTTAGTGAGGAATGTGATAAAAGTAAATTAAACTTGACCATAAACAGACCTGTCTCAGACGTTGTTCCTAAGCAATTTTACTTTTTAGGAGCATGGTCTTGCATAAAACCAAATTGGTGGCCATACTGGAGCACAGCAGAAGAGGTTTTGTTTGACTTAGAGGCAATTGTTGGAATTAGTATAAGACTAGTACAGGAGATTATAAGGATCTATGAAGACCTAACAGCAGTTGCCTTTATAGCAGGGGTAATAAAACTCTTACAAGGCAAACCTATACATGCAGTAATATGGGTATTGTTACTTTCTGGAGTTAAGGCCCACTCACGGACAATCCTTTGCAAAGACCAGTTTAAGTACGCCCTTGCCACAGGGGTAGATATTGGGCTATTGGGAGCAACCCAATTGACTACCCAATGGGAAGACAGAAAGCTAGATGATGGACAAGTAATGGCTGTATGCAGAGAGAACAAGTGGACAATCACAGCCAAGTGCAAGTTAGCAAGAGATACATGGCTGGCAGAAAAACATGAAAGGGCCTTACCCACCAGCGTTAAATTCATTAGCATCCACAACAAAACAAAAGAAAGAAAGGTGATAAGAAACATAGAAACACCCCAAGGTGTATGTGATTGTGGTGCAACACCTAAAGAGAATTCCAATTTCAAAGCCATGGTCATCGCAGGATCAGCCTTTTATTTGACTTGCCCTTACGGTTGGATAGGCAATGTGACCTGCATCACTAAACAACCACAACTATGGAAGACTGAAATCATAGAAACTATAGTGTATAATAGCCAAAATTACAACGATTTAACATGCAAGAGGACAAAAACACATAATGAAAAAGAATACGCATGCAAATATGGGGGTAACTCAAGTTGTGTGCTAGGACAGCAAATTGAATTTACACAAAATCTTCAACTAGAAAAATGCACCTGGTGTGACTATGATTTTAAAGAGGCCACAGGCCTACCACACTGGCCCATTGGACAATGCAAAGTTAAACAATATGAAGGGTTAATAATGGCAAACAACACCAATTGTACAATAAACGGGGTACTAATAAGTAAAGATGGCAACGTGGAATGTTTAATTGGGGAAACACAAATTAAAACAACCCAAAAAACAGAAGAACTGTTAGCCATGCCCTGTCAGCCTATAAAAGTGGGATCAGACACAAAATATGCAAATGGGAGACAAACATGCACATACAACTACTCCCAGGTGCTACCCAACAAATATTATAATATAATAGACAATTTCTGGCAACAATTTATAGTCAAGGATGGGTACCAATATTGGTTTGACCTGGAAGCTGGTGACCATAGAAGAAGCATCTTAGCAGAATATATAGTGATTGTGGTCGTAGCACTTTTAGGTGGTAAGGTCACACTGTGGATCCTAGTAGCTTACCATCTGTTGGATTTATCACAAGCTTACATTCCAGGAAGCAATTCGCCAGGGGAATTTTTCATGTATAGTTCAATTATTGTTGAAGCAAATTTGGAAACCATATCCCATTTTCTTCTACTATTAGCTCTGTTGTACAATACTGACAGTAGGAATTTATTTCTATCTATATTTTTTATATTGACTTCCTCAATCAGGACCACAATTATTTTCATAATCCTCTGTTTAGTAGGCTTTGTAAGGGCTGATAGTGAAAAGAGCCAGTGGCCAAACTTTGAAAATGTTTACCTTGTTATATTAATAATCCTCAGCATATTAGTAATTGCAAAGAAAAGGAATTTCTGCTTTTTTACCGTCACAATAACAGTAGTATTGTTTAGAATGGCAGTAACTTTACCCGCCCAATCTAGTTATATAGTAGTGTATATTCTCTTTATTCTATTCTACATGTTAATGTCCATATACTACTTTGGAAGATTTAGAAAATTACTTTTATTAGTGATGAGTTTTGCATTTTTATATGGCCTAATAGGGGCTCTAAACACCCTAAACAATTCAAGGGATGCCTTTTTAAACATTGTGATTGTAAACTGGCCCAGAGTAGGGATCCTAATGAGCTTATATCTGACTCTAACAACATGGTCAGTAACTTCAGGAGTAGACATTACTGGGTACTTGCTAGGGGCAGTAGCCATAATATTGACTATGATTTCCATGGTTATTGACATAACTATATTATGGACTGTGATACCGTGGTATAATATTACCAAATTGTACTACATTAAAAAAGAGGTGGATAAGACTAAGAAGGACTGGAAGGCAAATGAAGCCTATGACGAGTTGCTAAATACTAAAGAAGGAGTCCACCAAATAGCAACCCCAAGTATTAAGGCCATCGATCCTCTTGTCTGGATCACCATGAAATCTATACTACTGGCAGCACTGACCTCCATATGGAAACCAGTAATCTTAGGATACTGTATAGTAGAAATGGTTTACTGGCTTCACAAAAAATTAATTTACGAATTGGCTGGGATGACAAACGCTTTATCAAGAATAATGGCTGCATTAATAGAAATTAGTTGGAGTGGCTTAGGGGAAGAGGCCGGGACGCTATATAAGACATATCTCCTAAGTACTGAAATAAGAAAACTGGTTATCAAACACAAAGTAAACAACCCCGGAATCAAAAAGTGGTTTGGGGCTGAAGAAATATTTGGAATGCCAAAAATATACATGGTCACCAATATAAAAAATTTAACTAAAGACAAAGCTATACTTTGCTCCGTCTGTGAGAATAACAACAATAGTCGGAGATGCCCCAAATGTGGTTGTATGGGAACACCAATTAAATGTGGCATGACCCTATCAGAATTTGAGGAAAGATTTTATACAAAAATCTTTATAACTGAACACAACCAAAACGATCATAGAGTGGAGGGACCAGGCAAGATAGTTAGGTACGCAGACAATGGACTACTGTATCTAAGAAATTTGCCAATACTAGCAACTAAGCAGAAAATGTTA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| 30,192
|
ON024095.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME1
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,342
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME1/P229T/pangolin/2018, complete genome
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TCATACACATTGGATATGCCAAATTAGAATTTAGGTGAATCGGATATACCAAACAACTGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGAAGTTAGCCATACTCTGAGTAGCACTAACCCTGATCATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCTATCCTTAATGCAATCGGGGGTCGGTTGCATGAATCCAATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATTGGCGCCAATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGATCATAGCACATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGGGTAGGGATTACACCTCCAAAGGGGGCTAAGGAACCTATTTACGATAGGAACCTGCAACCACTTTTTGGAGTGAAGCACAGTCAACTACACCCCAAGTCCACATTGACTTTACCACACGAAAGAGGAAAAAAAACTCAGGAGGTGAAATTGGTGGACTTGCCAAGAAAAGGAGACTGTGAACTAACCAAGGGTGAGGTGTCAGGTATCTTCGTCAAACCTGGACCTATATGGTACAGTGACTACGAAGGCCCCGTTTACCATCGAATACCTCTAGAACTCTGCGCTCAGTCGACACCATGTAGCGTAAAAAAATTAATTGGAAGAATGGAAGGTAGTGACACAAAATTATATCATGTGTATACATGTCCAGATGGTTGTTTGTTTTTCACTAGGGCCAACCGAAGCAGAGAGACCTACTTTATGGTAAACAATGCTTTGGACGCACCACTCTGGGTGCAATCATGTAGTGACGACAAACCAAAGAATGACAAGATGGTTAAAGGTAAGATTGCACATAAACCAAAAGAAAATGAAAAGGATATAAAGAAGAAGGCACCTGACGCAACGATTGTAGTGGAAGGGGTCAAATACCAAATAACTAAGAAAGGAAAGGTAAGGAGTAAGAAAACAGAGGACGGATTGTACCACAACAAGAATAAACCACCAGAATCTAGAAAGAAATTAGAAAAAGCATTATTGGCTTGGGCAATACTGTGCTGCCTCTTAATTTTTCCTGTACAAAGTGACAACATCACACAATGGAATTTATGGGACAATGGGACAGTCGATGACATCCATTTGGCTATGTTTAATAGGAGGGTAAACAGAAGTCTGCATGGGATTTGGCCAAAAAGAATTTGCAAGGGGACGCCACCATACTTAGCAAAAGATTATGAATTGAAGCTCATAGAAGGAATGATGGATTCTAGTAGCTACACAAACTACACATGCTGCAAATTGCAAAGACATGAATGGAACAAACATGGATGGTGTAACTGGTTCAACATAGACCCATGGATAAGAGAGATGAATGAAACCCAAAGAAATTTAACCTCGGGTACATATAAAATGGAGTGTGCAGTTACTTGTAGGTACGACAACAATTCAGATCTAAACATAGTATTACAAGCCAGGGACAGTCCAACAATGTTAACAGGATGCAAGAGGGGAAAGAATTACTCCTTCTCGGGGGAGATTAGAAACAAGCCCTGCTCTCAAGAATTAGGCATTGAAGATCTAATGCTAGCTGATCATTCATGTCACTTGGAGGACAGTATAATGGAAGCTGTAGTTGATGAGGCAACGGAGTTGATTGAAAAGGCTAGGAAGAAAGCAAGTAGAAGCCTAAGTTGGGCTGAAAACAAGTTGAGGAATCTTAGATTGAAACTATTCGGAGCAGAAGCGTCACCCTACTGCAATATTTCTAAAGTAATTGGCAACATAGTTTACACAAAAAATTGCACTCCAGCCTGTCTCCCTTCAACAGCTACCATCATCGGACCCGGAGCTTTTGATTTGCTTGGAGGGAGTGGTGACAGTAGGAAAATATACATACCCTCGGGAATAGAAAATGAAGTAATAATGTTAACAATTATAGCGGCATCAGAATTTTTGCCTGAAACATCCAGTTTAGCTTATGTCATCTTCCATTACTACAACATTAAGACCACCCATCCATTAGTTGGAGTGGAATGTGATAAAAATCAGTTAAATTTAACCATAAACAAACCTGTCTCAACTGTAGTCCCTAAACAATTTTACTTTTTAGGAGCTTGGTCCTGTATAAAACCAGACTGGTGGCCATACTGGAGTGAAGCAGAAGAAGTCCTGTTTGACCTAGAAGCACTTGTTGGAATTGCTGTAAGATTAGTGAGGGAAATCGCAAGGATTTATGAAGACTTAACAGCAGTTGCCTTTATAGCAGGGATAATAAAACTTCTACAAGGCAAGCCCATACATGCAGTGGTGTGGGTATTACTACTCTCAGGGGTCAAGGCCCATTCATTGACATCAATCAGATGCAGGGACGAATTTAAATACGCCCTTGCCACAGGGGTTGACATTGGGCTATTGGGAGCAACTCAATTAACTACACATTGGGAAGACTATAAATTGGATGATGGACAAGTAAAGGCTGTGTGTGTTAACGGCACGTGGACAATTACCATCACATGTAAATTGGTAAGAGACACATGGCTAGCCGAAAAACATGAAAGGGCCTTGCCAACTAGTGTTAAGTTCATTAGTATACACAACAAAACAAAAGGGATGACAATAAGAAACATAGAAAAACCCTTAGGCGTGTGTGATTGCAACGCAACACCTAAAGAAAACTCTAATTTTAGGGCCCTTGTCATTGCGGGTCCAGCCTTTTATTTGGCATGCCCTTATGGTTGGGTGGGTAACATCACTTGCCTTACCCAACAACCACAACTATGGAAAACTGAAATTATAGAGACTATAATGTATAACAGCAAAGATTATAAAGACCCAACTTGTAAGAGGACAAAAACACATGAAGGAAAAGAGCACACGTGCAAATATGGAGGTAACACAAGCTGTGTATTAGGACAACAGATTGAATACACACGAAATCTTCAACTAGAGAAATGCATCTGGTGTGGCTATGAATTCCAAGAAGCTACAGATTTACCACAATGGCCTATCGGACAGTGTAAGGTCAAACAATATCTAGGATTGATAATAGCAAACAACCCCAATTGTACAATAAACGGAGTGAAAATAGATAAAAGTGGTGAGGTGGAATGTTTAATTGGGAAAACACAAGTTAAAACTGCCCAAATAACAAGTGAATTACTAGCTATGCCCTGCCAGCCTATAAAGGTGGGTTCAGACACAAAATATACAAGTGGGAGACAAACATGCACGTTTAATTACTCCAAGGTACTACCCAACAAGTATTATAACATAATAGATAATTTTTGGCAACAATTCATAGTCAAGGATGGCTACCAATACTGGTTTGATCTGGAGGCTGGCGACCATAGAAGGAGCATCTTAGCAGAATACATAGTAATTGTGGTTGTGGCACTGTTAGGTGGCAAAGTTACACTGTGGATTTTGGTAGCCTACCATTTGTTAGACCTATCCCAAGCTTACATTCCAAGCAGCAACTCACCAGGAGAATTTTTTATGTACAGCTCAGTAATTATTGAAGCAAATTTGGAAACAATATCGCATTTCCTTCTGCTATTAGCTTTACTGTACAACAGTGATTGCAGGAACCTATTTTTATCTATATACTTTATGCTGACCTCATCAATCAAAACTACCACTATTTTCATAATCCTTTGTCTAGTTGGCTCCGTGAGGGCTGATAGTGAGGAGAGTGGGTGGTGGAATTTTGAAAATGTTTACCTTGTTATATTAATAACTATTAGTGTATTGGTAATTGCAAAGAAAAGAAACTTCTGTTTTTTTACCGTTACAATAACCGTAGTCTTATTTAGGATGGCAGTGATTTTACCCGCACAATCTAGTTACATAGTGGCATACATCCTTTTTATTTTATTCTACATGTTAATGTCTATATACTACTTCGGAAGATTTAGAAAATTACTTTTATTAGTGATGAGCTTTGCATTTCTATATGGCCTAATAGGAGCTTTAAACACCCTGAACAATTCAAGGAATTTTTTTTTAAATACCGTGGTTGTAAATTGGCCTAGAGTAGGGGTTTTAATGAGCTTGTACCTAGCACTAACAACATGGTCAATAACTTCAGGAGTAGATATTGCGGGACACCTACTGGGAGCAGCTGCCGTAATACTGACTATGGTTTCCATGGTTATAGACATAACTATATTATGGACCGTGATACCATGGTACAACATCACTAAATTGTATTACATAAAAAAAGAGGTAAATAAGATCAAGAAAGATTGGAAAACAAATGAGGCTTATGATGAATTGCTAAGTACCAAAGAGGGAGTCCACCAAATAGCAACCCCAAGCATTAAGGCCATTGACCCTCTTGTCTGGATTACCATGAAATCAATATTACTAGCCGCATTAACCTCCATATGGAAACCAGTAATCTTAGGGTATTGCATAATTGAAATGGTCTACTGGCTCCACAAAAAACTAATTTATGAATTGGCTGGGTTAACAAACACATTATCAAGAATAGTGGCTTCACTAATAGAAGTTAGTTGGAGTGGCTTAGGGGAAGAAGTTGGGGTGCTATACAAGACATACCTTCTAAGCACCGAAGTAAAAAAACTGATTATCAAACACAAAGTGAACAACCCCGGAGTTAAAAGGTGGTTCGGGGCTGAGGAAATATTTGGAATGCCAAAAATATATATGGTTACAAGCATAAGAAACCTAACTAAAGATAAAGCCATACTTTGCTCCGTTTGCGAGAACAACAATAGCAGCAGGAAATGTCCAAAATGTGGTTGTAAGGGGACACCAATCAAATGTGGCATGACCCTGTCAGAATTTGAGGAAAGATTTTACACAAAAATATTTATAACCGAACATAACCAAAATGATCATAGAGTGGAAGGACCAGGCAAGATCGTTAGGTATACAGACAATGGGTTACTTTACTTGAGGAATTTGCCAATACTAGCAACTAAGCAAAAGATGCT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| 30,193
|
ON024096.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME2
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,468
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME2/P022T/pangolin/2018, complete genome
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TCATACACATTGGATATTCCAAACTGACCTTAGGTAAATTGGACGTATACCAAAGAAAACAGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAAGATGTTAGCCATACACTGAGTAGCACTAGCCCTGATAATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGAAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAAGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCATCCTTAATGCAGCCGGGGGTTGGTTGCATGAATCCAATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGCATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGACCATAGCACATGAATTTTGAAATTTTCTTTAGAGTAGGGACCACACCTCCAAGAGGAGCCAAGGAGCCTGTTTATGACAGGAATCTGCAGCCTCTCTTCGGAGTCAAACACAGTCAATTACACCCCAAGTCTACACTAACATTGCCACATGCGAGGGGAAAGAGAACCCAGAGAGTGAAGCTAGTAGACTTGCCAAGAAAAGGAGACTGTGAGCGAACGGGGGGGGAAGTATCAGGCATCTTCGTCAAGCCTGGACCAACGTGGTACAGTGATTACGAAGGGCCAGTCTACCATCGGATACCTCTCGAACTCTGCGCAAAATCAACACCTTGTAACATTAAAAAATTGATTGGGAGAATGGAAGGCAGTGACACCAAATTGTACCATGTGTACACCTGCCCAGATGGCTGCTTATTTTTTGTCAGAGCAAATTCAAGCAAAACAACCTACTTTATGGTAAACAATGCTCTAGATGCACCACTGTGGGTACAATCCTGTAGTGATGACAAGCCAAAGAACGACAAAATGGTTAAGGGAAAAATTGCACACAAACCAAAAGAAAATGAAAAAGACATAAAGAAGAAAGCACCTGACGCAACGATAGTAGTGGAAGGGGTTAAGTACCAGATAACAAAGAAAGGCAAGGTAAGAAGCAAGAAGACAGAGGATGGACTATACCACAATAAGAATAAACCACCAGAATCCAGAAAGAAATTAGAAAAGGCATTGCTGGCTTGGGCAATACTATGCTGTCTGTTGGTGATACCCACCCATGCCGACAACATCACACAATGGAATCTATGGGATAATGGAACAATTGATGACATCCATTTAGCTATGTACAACAGAGGTATAAATAGAAGTTTGCACGGTATTTGGCCAAAAACGATCTGCAAAGGGGCACCCATGTATTTGGCAAAAGATTATGAACTCAAGCTTATAGAAGGCATGATGGACTCCAGCAGCCACACCAATTACACCTGTTGCAAACTACAAAGACATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGTAACTGGTTCAACATAGACCCATGGATAAAGGCAATGAACGAAACTCAACACAATTTGACTACCGGCTCCTACAAAATGGAATGTGCGGTCACCTGTAGATATGACAACGATTCTGACCTAAACATAGTCTTGCAGGCTAGGGACAGTCCAACGATGTTAACTGGATGTAAGAGGGGAAAAAACTACTCCTTTTCAGGAGTTGTAAGGAACAAGCCTTGTTCTGAAGAACTAGCTATTGAAGACTTGATGTTGGCAGACCATTCATGTCATTTGGGAAACAGCATAATAGAAGCAGTGGTAGATGAAACAACAGAATTGGTTGAGAAAGCTAGGAAGAAGGCCAGTAGAAGTTTAAGCTGGGCTGAGAACAAATTGAGAAACCTTAGGTTGAAACTATTTGGGGCTGAAGCGTCACCTTACTGCAACATCTCTAAGGTAATTGGTAACGTAGTATACACAAATAACTGTACCCCAGCCTGCCTCCCATCGACAGCCACCATCATTGGCCCCGGAGCTTTTGATCTGCTTGGGGGGAGTGGAAAAGACAAGAAAATATATATACCAACTGGAATTAAAAATGAAATAATAATGTTAACAATTATAGCGGCGTCTGAATTTTTTCCTGAGACGTCCAGTGTAGCCTATGTCATCTTCCACTATTTCAATATCAAAACCACCCACCCACTAATTACCCAAGATTGTGACAAAAACCAATTGAATTTGACCATAACCAGGCCAGTTTCAGATGTGGTCCCCAAACAATTTTACTTTTTAGGTGCATGGTCTTGCATAAAACCAGACTGGTGGCCGTACTGGAGTGCAGCAGAGGAAATCCTGTTTGACTTGGAGGCAATTGTTGGGGTAGCAGTAAGATTGGTGAGAGAGATGACAAGGATTTATGAAGATCTAACAGCAGTTGCTTTTATAGCGGGGGCAATAAAACTCATACAAGGCAAACCCATCCACGCGATAATATGGGTATTGTTACTTTCTGGGGTCAATGCCTATTCATGGGACAAATACTCAAAAATTAGCTGCAAGGACCAATTTAAATACGCCCTTGCCTCAGGGGTAGATGTAGGCCTGCTGGGACCTACCCAGTTAACAACACAGTGGGAAGACTACGCTCTGAATGACGGACAAGTAATGGCCAAATGCAACGATGGTAGGTGGACAATAACAGTTAAATGCAAGTTAGCAAGGAACACGTGGCTAGTTGAAAAACACGAAAGGGCTCTCCCGACAAGCGTCAAATTTATTAGCGTCCACAACAGAACAAAAGAAACAAAAAGAGAAATAGAAAAACCCATGGGCGTATGTGATTGTGACGCAGTACCTGATGAAAACGCCAACTTCAAAGCCATGCACAAAACAAAGTCGGCCTTCTATCTAGAATGTCCTTACCACTGGATCGGCAACATAACTTGCCGAACCCAGCAACCACAATTGTGGAAAACTGAAATCGTGGAGACTATAATATACAATAGCCAAAACTACAACGACCCAACATGTAAAAGGACAACAACAGTCAATGGAAAAGAATATGAATGCGGATTAGGAGGCAACAACACTTGTGTGTCGGGGCAGCAAGTTAAATACACACAGCAACTTTCCTTAAGAAAATGCCAATGGTGTGGATATGAATTTGAAGAAGCAACAGACTTACCACAATGGCCTATTGGACAATGTATAGTTGAGCAATATATTGGATTAGTAGCTGCCAATGAAACCAATTGCACAATAAATGGGGTTCAAATAACAGAAAGTGGCTCAGTAGAATGTTTAATCGGAAAAACGAAAGTTAAAACAACTCAGAAGACAACAGAGTTACTAGCTATGCCCTGCCAGCCGATAAAAACAGGCTCTGACACAAAATATGCCAGTGGGAGACAGACTTGCACATTTAACTACTCACAAGTGCTACCCAACAAATATTACAACACAGTGGATGAGTTCTGGCAACAATTTATAGTCAAGAATGGTTACCAATACTGGTTTGACCTGAAAGCCGGAGACCATAGAAGGAGCATTCTATCAGAATACATAGTAATAGTAGTTGTGGCACTACTAGGTGGCAAGCTTTCCCTGTGGATTCTGATAGCATTCCACTTATTAGACCTGTCCCAAGCTTACATCCCAGGCAGTAATTCACCAGGAGAATTCTTTATGTATAGCTCCGTGGTTGTTGAAGCAGATCTGGAGACCATAGCTCATTTTCTCTTACTGCTAGCGTTGCTATACGACAACGCTTGTAGGAACTTGTTTTTATCTGTTTTCTTTATGTTGACCTCTTCATTCAAGACCACCATTATTTTCATAATCCTTTGCCTAGTTGGTACTGCCAGGGCTGACGATGGGGGAAGCAGATGGCCAGATTTAGAAAGAATTTATCTCATCATGTTAATAATCATAAGTATACTAGTAATTACAAAAAAGAAAAACTTTAGCTTCTTCACTATCACTGCAACAGTGGTCCTATTTAGATTAGCAGTGGTATTACCAACACAATCTAGTTATATGATAGTATATATTTTCTTTGTCTTGTTTTATGTACTAATGTCTATATACTACTTTGGAAGATTCAGAAAGCTGCTATTACTGGTAATGAGTTTTGCATTTCTATATGGACTGATAGGAACTTTAAATGCCTTAAACAGCTCAAAAACAGCTCTCATCAATACTATAGTTGTAAATTGGCCAAGAGTAGGCATTTTAATGAGTGCGTATTTAGCCTTAACAACGTGGACTATAACTTCAGGAGTGGACATTACAGGGTATATATTGGGGGCAGCAGCTATAATATTAACCATGATTTCTACAGCTATAGATATAACTGTTTTATGGACCATAATACCATGGTACAATATAACTAAATTATACTATATCAAGAATGTGGTAAGAAAGACTAAGAAAGACTGGAAGACAAATGAAGTCTATGATAAATTGTTGAACACTAGAGAGGGAGTGCACCAAATAGCAACCCCAAGCATCAAGGCCATTGATCCTCTAGTCTGGATCACCATGAAATCAATACTATTAGCTGCCTTGACTTCCATATGGAAACCTGTGATTTTGGGATATTGTATCATAGAAATGGTTTATTGGCTACACAAAAAACTAATTTATGAATTAGCTGGAATGACGAACACATTATCAAGAATAATAGCTGCACTGATAGAAATTAGCTGGAGTGGGTTGGGAGAAGATACAAGCACACTGTACAAGACATACCTTCTAAGCACCGAAATAAAAAAATTGGTCATTAAACACAAAGTAAACAACCCAGGAGTCAAGAGATGGTTTAGGGCTGAAGAAATATTCGGAATGCCAAAAATATACATGGTTACCCATATAAAAAACTTAACCAAGGATAAAGCCATACTTTGTTCCGTCTGCGAAAATAACAACAGTAACCGGAGGTGCCCCAAATGCGGTTGCAAAGGAACACCAATTAAATGCGGCATGACCTTGTCAGAATTTGAAGAGAGATTTTATACAAAAATTTTTATAACTGATCACAACCAAAACGACCACAGGGTAGAAGGACCAGGCAAAATAGTGAGATATATAGATAATGGGCTGCTATACCTGAGGAACTTACCAATATTGGCAACCAAACA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| 30,194
|
ON024097.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME3
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,482
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME3/P019T/pangolin/2018, complete genome
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TCATACACATTGGGCGTACCAAACGTTGTTAGGTTAATTGGGCAAACAAACAATTGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGATGTTAGCCATACACCAAGTAGCACTAGCCCTGATTATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGCAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGTAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCAGCCTTAGTGCAACCGGGGGTTGGTTGCATGAATCCGATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGAACATAGCACATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGAGTAGGGAATACACCACCAGGAGGGGCTCAGGAACCCGTTTATGACAGGAACCTGCAGCCACTTTTCGGGGTAAAACACAGCCAACTGCACCCTAAGTCCACACTGATTTTGCCACACGTAAGGGGGAAGAAAACTCAGCAAGTGAAATTAGTGGACTTACCAAGGAAGGGGGACTGTGAGAGAACTGGAGGGGAGGTGTCGGGTATTTTTGTCAAGCCTGGACCAACATGGTATAGTGACTATGAAGGCCCAGTTTACCATCGTATACCTCTTGAGCTGTGTGCCAAATCAACACCATGTAGCATCAAGAAACTGATTGGGAGAATGGAAGGTAGCGACACTAAACTGTATCACGTGTATACTTGCCCAGACGGCTGCTTATTTTTCACCAGAGCAAACTTAAGCAAGACAACTTACTTCATGGTAAACAACGCCTTAGATGCGCCACTATGGGTGCAGTCTTGCAGTGATGATAAGCCAAAGAACGACAAAATGGTTAAAGGCAAGATTGCACACAAGCCAAAGGAGAATGAAAAGGACATAAAGAAAAAAGCACCAGACGCAACAATTGTGGTTGAAGGAGTGAAATACCAAGTAACGAAGAAGGGGAAAGTTAAAAGTAAGAAAACTGAAGATGGATTATATCACAACAAAAATAAACCACTAGAGTCTAGAAAAAAATTAGAGAAAGCTCTATTAGCTTGGGCAATATTATGTTGCCTGCTAGTAGTACCTGTGCATTCTAACAACATTACACAGTGGAATTTGTGGGACAATGGGACAATTGACGACATTCATCTAGCCATGTTTAACAGAGGCATAAATAGAAGTTTGCATGGAATTTGGCCAAAAAATATTTGTAAGGGGACACCGGTATATTTGGCAAAAGATTATGAGTTGAAACTTATAGAAGGAATGATGGATTCAAGCAGTTATACAAATTACACCTGTTGCAAATTGCAAAGACATGAATGGAACAAACATGGATGGTGTAACTGGTTCAGCATAGACCCATGGTTACACGAAATGAACCAAACTCAACACAACTTGACTGCAGGGATATACAGGATGGAGTGTGCAGTTGTTTGTAGATATGACAACAATTCTGACTTAAACATAGTTCTACAAGCCAGGGATAGTCCGACAATGCTGACTGGATGTAAGAAGGGAAAAAATTACTCCTTCTCAGGAGAGATAAGAAACAAGCCATGTTCTGAGGAGTTGGCCATTGAAGACCTAATGCTGGCAGATCACTCATGTCACTTGGAGGACAGCATAATGGAAGCTGTAGTCGATGAAACGACAGAATTAATCGAAAAAGCTAGGAAGAAAGCGAGTAGAAGCTTGAGCTGGGCAGAAAACAAACTAAGAAATGTTAGGCTCAAATTATTCGGAGCAGAAGCATCGCCCTACTGCAATATTTCCAGAGTGGTTGGCAATATAGTGTATACAAGCAATTGCACCCCAGCCTGTCTTCCATCGACAGCTACCATTATTGGCCCTGGAGCATTTGATTTACTCGGGGGGAGTGGAAAGGAGAAGAAAATATACATACCTACTGGAATAAAGAATGAGATGATAATGCTAACAATTATAGCGGCATCTGAGTTTTTACCTGAGACATCCAGTGTGGCTTACATCATCTTCCATTATTTCAATGTTAAAACTACACACCCATTAATTACTGAAAACTGTGACAAAAATAAGCTAAACTTAACCATAGACAAACCAGTATCAGAAGTGGTCCCCAAACAATTCTACTTTTTAGGTGCCTGGTCCTGTATAAAACCAAATTGGTGGCCCTACTGGAGCACAACTGAAGAGATTTTATTTGACCTGGAAGCAATTGCCGGAATCGCAGTAAGACTGATACAGGAAATTTTGAGAATTTATGAAGACTTAACGGCAGTTGCTTTCATAGCAGGGGTCATAAAGCTTATACAAGGCAAACCCATACATGCAGTGATATGGGTACTGTTGCTTTCAGGTGTCAAGGCTAATTCATGGGACAAATTTTCAAAAATCCAATGCAGGGATGAGTTTAAATATGCTCTTGCCTATGGGGTGGACGTAGGACCACTTGGTGCAACTCAATTGACAACACAATGGGAAGACTACAATCTAGATGATGGACAAGTATTTGCCAAATGTAATGGCGGTAGGTGGACCATCACAGTCAAATGTAAGCTAGCAAGAAACACATGGCTAGCCGAAAAGCATGAACGGGCCTTACCTACTTCTGTTAAGTTTATCAGTGTCCACAACAGAAGCGCCACCACAACAAGAAATATAAAAGAACCTATGGGCGTGTGTGGCTGTGACGCAGAACCCAAAGAGAATGCCAACTTCCGAGCTATGGTCCGTGCAGGAGCTACCTTTTACTTACAATGCCCCTACGGGTGGCGAGGAAACATAACCTGCATTACCAAACAACCACAATTGTGGCACACAGAAATAGTGGAAACTTTGATCTATGATAGTAAAAATTACAATGACCCCACATGCAAAAGGACAAAAACACATGAAGGCAAAGAGTACACATGCAAACTTGGAGGCAACACCAGTTGCCAAATGGAGCAACAAGTCAAATATACAAGGAACCTTTCTCTAGAGAGTTGCAACTGGTGTGGATATGAGTTTTCAGAAGAGACTGACCTACCTCATTGGCCGATTGGACAGTGCAAGGTTAAACAATACCAAGGATTAGTAGATGCAACAAATACTAGTTGCATCATAAATGGGGTACAAATAGCCAAGGGAGGTAGTGTCCGATGCTTAATTGGTAAAATACAAATTGAGACTAAACAAATAACAGATGAATTGTTGGCAATGCCCTGTCAACCATTAAAAACAGGGTCCGACACAAAGTATTCAAATGGGAGGCAAACTTGCACGTACAATTATTCTGCAGTACTCAAAAATAAATATTACAACATTATAGACAATTTTTGGCAACAGTATATAGTTAAGGATGGCTACCAGTACTGGTTCGACCTAGAAGCTGGTGATCATAGAAGGAGCATTTTAGCAGAATACATAGTAATTGTTGTTGTTGCATTGCTAGGGGGCAAGATTTCTCTATGGATCTTGATAGCTTACCATTTATTGGATTTATCACAAGCTTACATTCCAAACAACAACTCACCAGGGGAATTCTTTATGTTTAGCACCATAATAATTGAAGCAAATTTGGAAGTTATATCCCATTTCTTACTGCTGTTGGCCCTGCTCTACAATTATAATTGTAGAAATTTGTTTTTATCTATATATTTTGTGTTAACCTCATCAATCAAAACCACCATTATATTTATAATTCTTTGTTTAATTGGCTACGCGAAAGCTGATGGAGGGGAAAGTGGATGGCCAGACTTGGAAAACATATATCTTTGTATACTGGTGGCTATAAGCATATTGGTGATTGCAAAGAAAAGAAATTTCTGCTTCTTAACTGTAACAGTAACAGTAGTTTTATTTAGATTAGCAGTAACATTACCTGCGCAATCCAGCTATATAATAGTATACATTGTTTTTGTTCTATTCTATATACTAATGTCAATATATTATTTTGGAAGATATAGGAAATTGATTTTATTAATTATGAGCTTTGCATTTCTATATGGTTTAATAGGAATACTAAACACTATAAATAGTTCAAGAGCTACCTTCTTGAACGCTGTGGTCATAAATTGGCCAAGAGTAGGGATTTTCATGAGTTTATACCTAGCCTTAACAACATGGACTGTAACTTCTGGAGTGGACATCACCGGGTACATGTTTGGGGCAGCAGCCATGATACTGACCATGGTTTCCACCGTTGTAGATATAACAGTATTGTGGACAGTAATACCATGGTACAACATCACCAAATTATATTACATCAAAAAGCAGGTAAATAAAACTAGGGAGGATTGGAAATCAGAAGATGCTTACGAGGAGTTACTGAATACTAGGGAAGGAGTACACCAGATAGCCACCCCAAGTATCAGGGCCATCGACCCACTCGTCTGGATCACTATGAAATCAATACTACTGGCAGCACTAACTTCCATATGGAAACCAGTGATCCTAGGGTATTGTGTTATAGAGATGGCTTACTGGCTCCACAAAAAACTAATCTATGAGTTGGCAGGAATGACAAACACGTTATCAAGAATAATGGCTGCAATGATAGAAATTAGTTGGAGTGGACTAGGAAGTGAAGCTGGAAACTTGTATAAGACCTACCTCCTAAGCACTGAAATAAAAAGACTGGTGATTAAACATAAAGTTAATAACCCAGGAATAAGGAAATGGTTCGGAGCCGAAGAAATATTTGGAATGCCGAAAATATATATGGTTACTCACATAAATAATCTGACCAAAGATAAGGCTATACTTTGTTCTGTCTGCGAAAACAATGACAGTAATCGGAAGTGTCCAAAATGCGGCTCCAAAGGAACTCCGATCAAGTGTGGCATGACCCTGTCAGAATTTGAGGAGAGATTTTATACAAAAATTTTTATAACTGAACACAGCCAAAGTGATCATAGATTAGAGGGCCCTGGCAAGATAGTTAGGTATGCAGACAATGGGCTATTGTACCTGAGAAATCTGCCAATATTGGCGTCTAAACAGAAGAT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| 30,195
|
ON024098.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME3
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,102
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME3/P115T/pangolin/2018, complete genome
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CTTCATACACATTGGGCGTACCAAACGTTGTTAGGTTAATTGGGCAAACAAACAATTGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGATGTTAGCCATACACCAAGTAGCACTAGCCCTGATTATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGCAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGTAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCAGCCTTAGTGCAACCGGGGGTTGGTTGCATGAATCCGATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGAACATAGCACATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGAGTAGGGAATACACCACCAGGAGGGGCTCAGGAACCCGTTTATGACAGGAACCTGCAGCCACTTTTCGGGGTAAAACACAGCCAACTGCACCCTAAGTCCACACTGATTTTGCCACACGTAAGGGGGAAGAAAACTCAGCAAGTGAAATTAGTGGACTTACCAAGGAAGGGGGACTGTGAGAGAACTGGAGGGGAGGTGTCGGGTATTTTTGTCAAACCTGGACCAACATGGTATAGTGACTATGAAGGCCCAGTTTACCATCGTATACCTCTTGAGCTGTGTGCCAAATCAACACCATGTAGCATCAAGAAACTGATTGGGAGAATGGAAGGTAGCGACACTAAACTGTATCACGTGTATACTTGCCCAGACGGCTGCTTATTTTTCACCAGAGCAAACTTAAGCAAGACAACTTACTTCATGGTAAACAACGCCTTAGATGCGCCACTATGGGTGCAGTCTTGCAGTGATGATAAGCCAAAGAACGACAAAATGGTTAAAGGCAAGATTGCACACAAGCCAAAGGAGAATGAAAAGGACATAAAGAAAAAAGCACCAGACGCAACAATTGTGGTTGAAGGAGTGAAATACCAAGTAACGAAGAAGGGGAAAGTTAAAAGTAAGAAAACTGAAGATGGATTATATCACAACAAAAATAAACCACTAGAGTCTAGAAAAAAATTAGAGAAAGCTCTATTAGCTTGGGCAATATTATGTTGCCTGCTAGTAGTACCTGTGCATTCTAACAACATTACACAGTGGAATTTGTGGGACAATGGGACAATTGACGACATTCATCTAGCCATGTTTAACAGAGGCATAAATAGAAGTTTGCATGGAATTTGGCCAAAAAATATTTGTAAGGGGACACCGGGATATTTGGCAAAAGATTATGAGTTGAAACTTATAGAAGGAATGATGGATTCAAGCAGTTATACAAATTACACCTGTTGCAAATTGCAAAGACATGAATGGAACAAACATGGATGGTGTAACTGGTTCAACATAGACCCATGGTTACACGAAATGAACCAAACTCAACACAACTTGACTGCAGGGATATACAGGATGGAGTGTGCAGTTGTTTGTAGATATGACAACAATTCTGACTTAAACATAGTTCTACAAGCCAGGGATAGTCCGACAATGCTGACTGGATGTAAGAAGGGAAAAAATTACTCCTTCTCAGGAGAGATAAGAAACAAGCCATGTTCTGAGGAGTTGGCCATTGAAGACCTAATGCTGGCAGATCACTCATGTCACTTGGAGGACAGCATAATGGAAGCTGTAGTCGATGAAACGACAGAATTAATCGAAAAAGCTAGGAAGAAAGCGAGTAGAAGCTTGAGCTGGGCAGAAAACAAACTAAGAAATGTTAGGCTCAAATTATTCGGAGCAGAAGCATCGCCCTACTGCAATATTTCCAGAGTGGTTGGCAATATAGTGTATACAAGCAATTGCACCCCAGCCTGTCTTCCATCGACAGCTACCATTATTGGCCCTGGAGCATTTGATTTACTCGGGGGGAGTGGAAAGGAGAAGAAAATATACATACCTACTGGAATAAAGAATGAGATGATAATGCTAACAATTATAGCGGCATCTGAGTTTTTACCTGAGACATCCAGTGTGGCTTACATCATCTTCCATTATTTCAATGTTAAAACTACACACCCATTAATTACTGAAAACTGTGACAAAAATAAGCTAAACTTAACCATAGACAAACCAGTATCAGAAGTGGTCCCCAAACAATTCTACTTTTTAGGTGCCTGGTCCTGTATAAAACCAAATTGGTGGCCCTACTGGAGCACAACTGAAGAGATTTTATTTGACCTGGAAGCAATTGCCGGAATCGCAGTAAGACTGATACAGGAAATTTTGAGAATTTATGAAGACTTAACGGCAGTTGCTTTCATAGCAGGGGTCATAAAGCTTATACAAGGCAAACCCATACATGCAGTGATATGGGTACTGTTGCTTTCAGGTGTCAAGGCTAATTCATGGGACAAATTTTCAAAAATCCAATGCAGGGATGAGTTTAAATATGCTCTTGCCTATGGGGTGGACGTAGGACCACTTGGTGCAACTCAATTGACAACACAATGGGAAGACTACAATCTAGATGATGGACAAGTATTTGCCAAATGTAATGGCGGTAGGTGGACCATCACAGTCAAATGTAAGCTAGCAAGAAACACATGGCTAGCCGAAAAGCATGAACGGGCCTTACCTACTTCTGTTAAGTTTATCAGTGTCCACAACAGAAGCGCCACCACAACAAGAAATATAAAAGAACCTATGGGCGTGTGTGGCTGTGACGCAGAACCCAAAGAGAATGCCAACTTCCGAGCTATGGTCCGTGCAGGAGCTACCTTTTACTTACAATGCCCCTACGGGTGGCGAGGAAACATAACCTGCATTACCAAACAACCACAATTGTGGCACACAGAAATAGTGGAAACTTTGATCTATGATAGTAAAAATTACAATGACCCCACATGCAAAAGGACAAAAACACATGAAGGCAAAGAGTACACATGCAAACTTGGAGGCAACACCAGTTGCCAAATGGAGCAACAAGTCAAATATACAAGGAACCTTTCTCTAGAGAGTTGCAACTGGTGTGGATATGAGTTTTCAGAAGAGACTGACCTACCTCATTGGCCGATTGGACAGTGCAAGGTTAAACAATACCAAGGATTAGTAGATGCAACAAATACTAGTTGCATCATAAATGGGGTACAAATAGCCAAGGGAGGTAGTGTCCGATGCTTAATTGGTAAAATACAAATTGAGACTAAACAAATAACAGATGAATTGTTGGCAATGCCCTGTCAACCATTAAAAACAGGGTCCGACACAAAGTATTCAAATGGGAGGCAAACTTGCACGTACAATTATTCTGCAGTACTCAAAAATAAATATTACAACATTATAGACAATTTTTGGCAACAGTATATAGTTAAGGATGGCTACCAGTACTGGTTCGACCTAGAAGCTGGTGATCATAGAAGGAGCATTTTAGCAGAATACATAGTAATTGTTGTTGTTGCATTGCTAGGGGGCAAGATTTCTCTATGGATCTTGATAGCTTACCATTTATTGGATTTATCACAAGCTTACATTCCAAACAACAACTCACCAGGGGAATTCTTTATGTTTAGCACCATAATAATTGAAGCAAATTTGGAAGTTATATCCCATTTCTTACTGCTGTTGGCCCTGCTCTACAATTATAATTGTAGAAATTTGTTTTTATCTATATATTTTGTGCTAACCTCATCAATCAAAACCACCATTATATTTATAATTCTTTGTTTAATTGGCTACGCGAAAGCTGATGGAGGGGAAAGTGGATGGCCAGACTTGGAAAACATATATCTTTGTATACTGGTGGCTATAAGCATATTGGTGATTGCAAAGAAAAGAAATTTCTGCTTCTTAACTGTAACAGTAACAGTAGTTTTATTTAGATTAGCAGTAACATTACCTGCGCAATCCAGCTATATAATAGTATACATTGTTTTTGTTCTATTCTATATACTAATGTCAATATATTATTTTGGAAGATATAGGAAATTGATTTTATTAATTATGAGCTTTGCATTTCTATATGGTTTAATAGGAATACTAAACACTATAAATAGTTCAAGAGCTACCTTCTTGAACGCTGTGGTCATAAATTGGCCAAGAGTAGGGATTTTCATGAGTTTATACCTAGCCTTAACAACATGGACTGTAACTTCTGGAGTGGACATCACCGGGTACATGTTTGGGGCAGCAGCCATGATACTGACCATGGTTTCCACCGTTGTAGATATAACAGTATTGTGGACAGTAATACCATGGTACAACATCACCAAATTATATTACATCAAAAAGCAGGTAAATAAAACTAGGGAGGATTGGAAATCAGAAGATGCTTACGAGGAGTTACTGAATACTAGGGAAGGAGTACACCAGATAGCCACCCCAAGTATCAGGGCCATCGACCCACTCGTCTGGATCACTATGAAATCAATACTACTGGCAGCACTAACTTCCATATGGAAACCAGTGATCCTAGGGTATTGTGTTATAGAGATGGCTTACTGGCTCCACAAAAAACTAATCTATGAGTTGGCAGGAATGACAAACACGTTATCAAGAATAATGGCTGCAATGATAGAAATTAGTTGGAGTGGACTAGGAAGTGAAGCTGGAAACTTGTATAAGACCTACCTCCTAAGCACTGAAATAAAAAGACTGGTGATTAAACATAAAGTTAATAACCCAGGAATAAGGAAATGGTTCGGAGCCGAAGAAATATTTGGAATGCCGAAAATATATATGGTTACTCACATAAATAATCTGACCAAAGATAAGGCTATACTTTGTTCTGTCTGCGAAAACAATGACAGTAATCGGAAGTGTCCAAAATGCGGCTCCAAAGGAACTCCGATCAAGTGTGGCATGACCCTGTCAGAATTTGAGGAGAGATTTTATACAAAAATTTTTATAACTGAACACAGCCAAAGTGATCATAGATTAGAGGGCCCTGGCAAGATAGTTAGGTATGCAGACAATGGGCTATTGTACCTGAGAAATCTGCCAATATTGGCGTCTAAACAGAAG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| 30,196
|
ON024099.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME4
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,504
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME4/P035T/pangolin/2018, complete genome
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TCATACACCATTGAGCATGCCAAATTGAAATTTAGGTAAATTGGAAATATCAAATAACTGCATTAGGGGTGAAGGGCGAAAGGCTGTTAGCCATACACCGAGTAGCACTAACCCCAGTGATATGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTTCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGATATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCACCCTTAGTGCAATCGGGGGTCGGTTGCATGAATCCGATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGACCATAGCACATGAATTTTGAAATTTTCTTTAGGGTAGGGAATACACCACCAAGGGGGGCGCTAGAACCTGTCTATGACAGGAACTTGCAGCCACTGTTTGGGGTGAAACACAGTGAACTACATCCGAAGTCCACATTGACTTTACCACACAAAAGGGGGTTAAAAACCCAACAAGTGAGACTGATGGACTTACCTAAGAAAGGCGATTGTGAGCGGACCCAGGGGGAGGTGTCAGGTATCTTTGTAAAGCCTGGACCGACGTGGTATAGTGACTACGAGGGTCCGGTCTACCATAGAATACCTCTTGAGCTCTGCGCCAAATCAACACCATGTCAAATTAAGAAACTGGTTGGAAGAATGGAAGGTAGTGACACTAAGCTATACCATGTGTACACTTGCCCAGATGGGTGCCTATTCTTCACAAGAGCAAACCCAAGTAAAACAACCTACTTTATGGTAAACAACGCCTTAGACGCACCACTTTGGGTACAATCTTGCAGTGATGATAAACCAAAAAATGATAAGATGGTTAAAGGAAAGATAACTCACAAACCAAAGGAAAACGAAAAGGACATAAAAAAGAAAGCACCTGATGCCACTATAGTAGTGGAAGGAGTGAAGTACCAAATCACTAAGAAAGGGAAAGTAAGGAGCAAAAAGACTGAAGATGGACTATACCACAACAAGAACAAGCCACCGGAATCAAGAAAAAAATTGGAAAAAGCTCTACTTGCCTGGGCGGTACTGTGTTGTCTATTAATTGTGCCCATACACGCTGATAATATCACACAGTGGAACCTATGGGACAATAGCACAATTGACGACATACATTTGGCTATGTTTAACCGAGGTATAAACAGAAGTCTGCATGGGATTTGGCCAAAAAAAACTTGTAAAGGAACACCAGTATACTTGGCAAAAGATTATGAACTGAAGCTCATAGACGGGATGATGGACTCAAGTAGTCACACAAATTATACCTGTTGTAAGCTGCAAAGACACGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGCTCAACATAGATCCATGGATACATGAAATGAACCAAACACAATACAACTTAACCCAAGGCACCTACAGAATGGAGTGTGCAGTCACTTGCAGGTACGACAACAACTCCGACTTAAACATTGTGCTACAAGCCAGGGACAGTCCAACAATGCTGACTGGATGCAAAAAAGGAAAAAATTACTCCTTTTCAGGGGAGATTAGGAATAAACCTTGTTCACAAGAGTTAGGTATTGAAGACTTAATGCTGGCAGACCACTCATGCCATCTGGAAGATAGTATGCTGGAAACTATAGTAGATGAGACAACAGAGTTGGTGGAAAAAGCTAGAAAGAAAGCTAGTAGAACCCTAAGTTGGGCTGAAAACAAGTTGAGAAATCTTAGGTTGAAACTGTTTGGAGCAGAAGCATCACCCTACTGTAACGTTAGTAAGGTAATCGGAAATGTGGTCTACACATCCAACTGTACTCCAGCCTGTCTCCCAGCAACGGCAACCATCATCGGCCCAGGGAGTTTCGACCTGCTAGGGGGGGGAGGAAATACCTACAAGATATATATACCAACAGGAATAAAAAATGAGATAATAATGATAACAATCATAGCAGCATCTGAATTCTTCCCAGAGGTGTCTAGTGTAGCTTATGTCATCTTTCATTATTTGAATATCAAGACCTCCCATCCACTAATCGAAAACGACTGTGATAAGAACCAATTGAACCTAACCATAAATAAACCAGTTTCAGAGGTGGTCCCGAAACAATTTTATTTTTTAGGAGCATGGTCCTGCATAAAACCAAGCTGGTGGCCATATTGGAGCGAGGCAGAAGAGGTCCTTTTTGACTTGGAAGCGACTATTGGGATCGCTGTAAGACTGGTGCAGGAGGCAGCAAGAATCTACGAGGACTTATCGGCAGTAGCCTTCATAGCAGGGGTGATAAAACTCATACAAGGTAAGCCCATACATGCACTAATATGGGTTCTACTACTCTCTGGTGTCAAGGCACACTCATGGGACAAATATTCGAAAATCAGCTGCAAGGACGGATTCAAATATGCTCTTGCTAAGGGGACAACAATTGAATTACTGGGACCTACAAACTTGACAACACAATGGGAGGATTATGAATTGGATGATGGACAAGTAGTTGCAAAATGCTCCAATGGCAGATGGACTGTTACACCAAAATGCAAGTTGGCGAGAAACACTTGGCTGGCCGAAAAGCATGAGAGAGCTTTGCCAACCAGTGTTAAATTTATCAGTGTTCACAATAGAACCAAGTCCACAACAAGGAGTGTGACAAAACCATATGGGCTTTGCGATTGTAATGCAACACCCATGGAAAATGCCAACTTCCATGCTATGGAGAAAGCAGGTAGTGCTTTTCATTTAGTTTGCCCTTATGGTTGGATAGGAAATGTAACCTGCTTCACCACCCAAAAACAATTGTGGCACTCTGAAATCATTGAGACCATAATGTACAACAGTCAAAATTACAATGACCCGACATGTAGAAGGACAAACACATCAAAAGGTGTAGAATTTAATTGTAAGCAAGGGGGGAACACATCCTGCATACTAGGAGAGCAAATTAAATATTCACAGGATCTCACTCTCAAAAAGTGCAATTGGTGTGGCTATGAGTTTGAGGAGGCGACAGACTTACCAAAGTGGCCAATTGGTCAATGTAGTGTTAAACAGTATGAAGGGTTGGTGGCTGCGAACGACACTAATTGTACCATAAATGGGGTATTGATAACTAAAACAGGTAAGGTGGAGTGCTTAATTGGAAAAGTAAAAATTAGAACTGAACAACAAACAACCGAACTCCTAGCTATGCCCTGCAAGCCAATTAGAATCGGTTCTGATACAAAATACACAACTGGGAGGCAGACATGCACTTTCAACTACTCTCAAGTACTACCTAACAAATATTACGACATCATTGATAACTTCTGGCAACAGTTTATAGTTAAGGATGGATACCAGTACTGGTTCGACCTAGAGGCTGGTGACCACAGGAGGAGTATCTTGGCAGAATACATAGTAATTGTAGTGGTAGCATTACTGGGAGGGAGAATTTCCCTATGGATGTTAGTAGCTTATCACCTGCTACAGCTAACAGAGGCTTACATCCCAGGGAACAACTCACCAGGAGAATTTTTTATGTACAGCTCCATAATCGTAGAAGCTAATTTAGAAGTCTTATCTCATTTTCTTTTGCTATTGGCTCTATTATATAACACTAATTGTAAAAATTTTTTTCTATCAATATACTTCATTCTGACTTCTTCATCAAAAAATACCATTATTTTTATAATCCTCTGCCTAATTGGTTGCGTCAAAGCTGACAACAAGGAAAATACATGGCCAGATTTTGAAAACATTTATCTTATCATTCTAATAATCATAAGTGTGCTAGTAATTGCAAAGAAAAGAAACTTTAGCTTTTTTACAATCACGGTGACCGTGATACTCTTTAGACTGGCAGTAACACTACCTGCACAATCTAGTTATATAGTAGTATACATCATTTTTGTTGCATTTTATATGCTAATGTCTATATACTATTTTGGAAGATTGAGGAAACCACTTTTATTAATAATGAGCTTTGCATTTCTATATGGCTTAATAGGCGCACTCAACTCTTTAGGAAACTTAAAGGGGGCTGTTTTCAATATTGTGATAGTAAATTGGCCAAGAGTAGGAATCCTAGTGAGCTCATATTTGGCCTTGACCACATGGACCATAACTTCAGGGATAGATATTACAGGATATCTACTTGGGGCTGCAGCAGTGGCGCTGACCATATTCTCCACAGTTATTGATATAACGATACTGTGGACTATAATACCATGGTACAACATCACTAAATTATACTACATAAAGAAGAGGTTAAATAGGATTCATGAAGACTGGAAAGTAAATGAAGCCTATGAGGAATTGCTAAATACCAAAGAGGGAGTGCATCAAATAGCAACCCCAAGTATTAAGGCTGTTGACCCCTTAATCTGGGTAATTATGAAGTCAATACTGCTAGCAGCGTTGACCTCCATTTGGAAACCAATAATTTTGGGGTACTGTATAGTGGAGATGACCTACTGGCTTCACAAAAAATTGATTTATGAATTGGCTGGGATGACCAACATGTTATCTAGAATTATGGCTGCAATAGTCGAAATCAGTTGGAGTGGACTGGGCAGCCAGGCAGGGACTTTGTACAAGACATACCTGTTAAGCTCTGAAATAAAGAAACTAATCATCAAACATAAGGTAAATAATCCGGGGGTCCAAAAATGGTTCGGAGCGGAGGAAATATTCGGGATGCCAAAAATATATATGGTCACTAGCATAAAAAACCTGACAAAGGACAAAGCTATACTCTGTTCTGTTTGTGAGAACAATAACAGCAAGAGGAAGTGCCCCAAGTGTGGATTTAAAGGAACACCAATCAAATGTGGCATGACCCTATCAGAATTCGAAGAGAGGTTTTATTCCAAAATCTTCATAACTGACTATAGTCAGGATGACCATAGAGTAGAGGGGCCAGGGAAGATAGTCAGGTATACAAACAATGGTCTACTCTACCTTAGGAATTTACCAATACTAGCAACTAAGCAAA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CTTTTGCCGGTCAAAAAGCAAAAAATACATCCATATGAGGCCTATATTGCCTTACTTCACATGGTCAGGAGTATGGAGGTAAGGAAAATGGATGGGCCAGTCATGGAAAACCATAATATGTGGATCCTGAAGAAAATACGAAAGCCATCTAAACTTGGTTTAAAAAATTTAGTAGTACCAGGGGCATTGGATTGCCCAGTTGAAAGAAACCAAAAAAAATATAACATATACAATTCAAGGATAGGCGGGGTCATGCAATCGGCCGGCATTGACCTCAATAAGTTGCCCGTAGTAAGATCTCAGGTAGATTCTAAAAGTTTCCATGAATCAATAAGAGACAAGATAGACAAGAAACCAAACCAACAAAATCCTAATTTACATGATGAATTAATCAAAGTTTTTGAAGCATGCAAGGTTAAAGAATTACAGGGAAAATTAGATGAAGTGGATTGGGAGACCCTTGAAGTAGGGCTAAATAGGAAAGGTGCCCCTGGCTTTCTTGAGAAGGAAAACATAGGTGAGCTAGTTAGTTCGGCAGCGGGGAAGAAAAAAGTTGAAAATGTGATATCAAAACTAGCATTGGGAAAACACATTGAGTATTATGAAACCGCAATCCCAAAAAACGAAAAGAGAGCAGTAACAGAAGACTGGATTGAGGGAGATTATATAGAAGAAAAGAAACCCAGAGTGATACAATATCCAGAAGCCAAAACAAGACTAGCCATAACCAAGGTAATGTACAATTGGGTAAAACAGAAGCCTATATTAATACCAGGATATGAAGGAAAAACACCTATATTTAATATCTTCAATAAAGTGCATAGGGAATGGAAGCTATTTAAGGATCCTGTGGCTGTCAGCTTTGATACGAAAGCCTGGGACACCCAAGTCACCCCAAAAGATCTACTGTTAATAGCAAAGATACAAAAATACTATTTCAAGAAGAAATGGCACAGATTTGTAGACACAGTAACACAACACATGTTAGAGGTTCCAGTAATAACTGAAGATGGCCAAGTTTACTTAAGGGTGGGGCAAAGAGGTAGTGGCCAACCTGATACAAGTGCAGGCAATAGCATGTTAAACGTGCTAACAATGATATATTGCTTCTGCATAGCCAATAACATACCATATTCAGCTTTCTCAAGAATAGCTAAAATACATGTGTGTGGTGATGATGGATTCTTGATAACTGAAAGAGCACTTGGAGAGAAGTTCGCTAAAGAAGGTCCTCAACTCTTGTACGAAGCAGGGAAACCACAAAAATTGTTGGAAGAGGCTGGAATGAAATTGGCATACAAATTTGAAGACATAGAATTCTGCTCCCATACACCTATCCAAGTGCGATGGGTTAGTGGGGCAACATCCTATGCTGCTGGAAGAGAAACATCCACCATCTTAGCCAAAATGTCAACTAGGCTAGATTCAATGGGAGAGCGAGGCTCAGAAGAATATGAAAAATCAGTGGCATTTAGCTTCCTCTTACTTTATTTCTGGAACCCAATAATAAGAAGGGTGTGCTTGAGAGTGTTGGGAGAGACGGGGGATAAATACTCCAGGGTTACCACATTCTATTGTAGGGGGGATCCAATAGGCGCTTTCTATACAATATACAATTACAGATTAGATGAACTTGACAGAGCTGATTTCAGGAAACTATCACAGTTGAATTTGAGTATGAGCATTCTACACATCTGGAAAAAGAACACCTCACAAAGATTGTTAAGGGACTGCATATTAGCAGGAAGTAGTGGAGGGAACAGAATAGAGAATGCAGACAGACTTGTAAGTAAGAGAACAGGACAAAAATACATACCAGGAGAAGGCTACGTGATGCAAGGTAGGCATTATGAGGAATTGGAGCTTAAAACCAATTTTAAACCCATAACAACATTAGGTCTTGAAAGGTACGTTCCAGGACCTATCAAAACCTTTATCCTTAAGAGATTTAAAGTGTTGACACTGTTATTCTAGAAAAGCAGCATTCTACAGCATCAGGCTACCCCAGTGGTCTAAAACCACTGAACACTGACTGACGCCAGTTGCCGGGGGAGTCGACAACAGCAGACAAAGCCACACAGGTGGCCCATATCTGAAGGGGAATGGCTGTTACCCCCTTCTGAATTACCAGCTTACTTATAATGAATAAGCTGAGCTACCCCAGTGGTAAAACCACTGAATACTGACTGACGCCAGTTGCTTGGGGAGTCAACCATAATAAGCTAGAGCTACACAGGTGGCTCACATCTGAGGAGGAATGGCTGTTACCCTCTTCTGAATTATCAGCCTATTTACATCAGATAAGCTAGGCTACCCCAGTGGCAAGACCACTGAATACTGACTGACGCCAGTTGCCTGGGGAGTCAACCATAATAAGCTAGAGCTACACAGGTGGCTCACATCTGAGGAGGAATGGCTGTTACCCTCTTCTGAATTATCAGCCTATTTATATCAGCACTTTAGCTGAGCAGGGTATCAAGGGTACACTCCCAGGGGAGTTGACC
| 30,197
|
ON024100.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME5
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,147
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME5/P131T/pangolin/2018, complete genome
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CTTCATACACTTTGGGCATATCCAAAACCATTTAGGTGGATTGGAAACACTAAATTAACTGCACTAGGGGCGAAGGGCGAAAGAATGTTAGCCATACTTCAAGTAGCACTAGCCCTTATGATGTGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCTACCTTAATGCAATCGGGGGTCGGTTGCATGAATCCAATAGGGATATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTAGACCATAGCACATGAACTTTGAACTTTTCTTTAGGGTAGGGATCACACCACCAAGAGGGGCTAAGGAACCTGTCTATGACAAGTATCTGCAGCCTATCTTTGGCGTGAAGCACAGTGAACTACATCCCAAGTCAACACTGTCTTTGCCACACAAGAGAGGGGGTAAGACTCGGCAGGTAAAGTTAGTGGACTTGCCCCGGAAAGGGGACTGTGAACGCACCAATGGAGAGGTTACAGGCATCTATGTCAAACCAGGACCAACCTGGTATAGTGACTACGAAGGCCCCGTCTACCATCGAATTCCTCTCGAGCTCTGTGCAAAATCAACACCTTGTCTTGTAAAAAAATTAATCGGCAGAATGGAAGGTAGTGACACTAAGTTATACCATGTGTACACATGTCCAGACGGCTGCTTATTTTTTACGAGAGCAAATTCAAAAAGAACTACCTATTTCATGGTGAACAACGCACTAGATGCACCACTTTGGGTACAATCTTGTAGCGACGATAAACCAAAAAACGACAAAATGGTAAAGGGGAAAATTGCACATAAACCAAAAGAGACTGAAAAAGATGTAAAAAAGAAAGCCCCTGACGCTACTATAGTAGTAGAAGGAGTTAAATACCAAGTCACCAAGAAAGGTAAGGTAAGGAGTAAAAAAACTGAAGATGGATTATACCACAACAAAAATAAGCCACCAGAATCTAGAAAGAAGCTAGAGAAGGCATTATTAGCATGGGCAATATTATGTTGCTTGCTAATTATGCCCGTCGGCACTGACAATATAACACAATGGAACCTATGGGACAATGGTTCAACCGATGACATTCACCTGGCCATGTACATGAGGGGCGTAAATAGGAGCTTACACGGGATTTGGCCCAAAAGGATATGTAAAGGGACGCCAACATACCTTTCAAAAGACTATGAGTTAAAGCTGATACAAGGTATGATGGACTCAAGTAGTCACACAAATTACACCTGTTGTAAACTGCAAAGACACGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAATTGGATCAACATAGACCCATGGCTGAAAGAGATGAACCAAACTCAACACAACTTAACCCAAGGTAGCTACAAGATGGAGTGTGCCGTAACATGCAGATATGACAACAACTCAGATTTAAATATAGTTCTACAGGCCAGAGATAGCCCAACAATGTTAACTGGGTGTAAGAAAGGGAAAAATTATTCGTTCTCAGGAGAAGTTAGAGACAAACCATGCTCTCAGGAAGTGGGTGTAGAAGACCTAATGTTGGCAGACCACTCGTGCCATATAGAGGATGGAATAATAGAGTCCATAGTGGACGAGACAACAGAGCTTGTTGAAAAAGCTAGGAAGAAGGCAAGTAGAAGCCTTAGTTGGGCTGAGAACAAATTGAGGAATTTGAGGTTGAAGCTGTTTGGAGCTGAGGCATCACCATACTGTAATATTTCCAAAATAATTGGTAACATAGTTTATACAAAAAATTGCACCCCGGCTTGTTTACCTGCTACAGCAACCATCATTGGCCCAGGGGCTTTTGATTTAATTGGAAGCAGTGGGAATAACAAAAAGATATATATACCAACAGGCCTTCAAAATGAACTAATAATGTTGACTATCATAGCAGCATCTGAGTTCCTGCCAGAAACATCGAGTGTGATATATATTGTTTTTCACTACTTAAACATCAAAACTTCTCACCCACTGATTGAAGGAAACTGCGATAAGACCAAACTAAATTTAACTATCAGTAAGCCAGTTTCAGAAGTGGTCCCAAAACAGTTCTACTTCTTAGGTGCATGGTCTTGCATAAAACCAAGCTGGTGGCCTTACTGGAGCGAAACAGAAGAAATTCTTTTTGACCTAGAGGCCTTAATTGGAATTGTGGTGAGACTACTGCAGGAAGCAACAAGAATCTATGAAGATTTAACAGCAGTTGCCTTCATAGCTGGAGTGATAAAAATCATACAAGGAAAACCTATACACGCAGTAATATGGGTCTTACTTCTTTCTGGGGTGAAGGCTGACTCATGGGATAAATTTTCAAAAATTAGCTGTAAGGATCAATTCAAATATGCTTTGGCCAAAGGAACCCACATAAGTCTACTAGGGGCAAGCAATTTGACAACACACTGGGAAGATTATATCTTAGATGATGGGCAGGTGATGGCCAAATGTAATGATGGCCGATGGACAATCACAGTAAAGTGTAAATTAGCAAGGGACACATGGTTGGCTGAAAAACATGAACGCGCACTACCAACTAGTGTCAAATTTATATCAATACACAATAGAACAAAAGACACAATTAGAACCATAACGTCACCTAGAGCTATCTGTGATTGTGGTGCAAAACCTAGGGAGAATTCCAATTTTAAAGCCATGAAAGTGGTAAGTACTGCTTTCCACCTTATCTGTCCATACGGATGGAAGGGAAATATAACCTGCCACACTACACAGCTTAAGTTGTGGCACACAGAAATTGTAGAGACCCTGAAATATGATAGTACAGGCTATCAAGACCATACGTGTGCACGCACAAAAACAGAAGAAAACAAAGAATATGTGTGTACTCACGGGGGCAATGAAAGCTGTGTAATGGGAAACCAGATAAATTACACACAAGACCTTAGTCTGGAGAATTGCAAGTGGTGCGGCTACACGTTCACAGAAGCAAAGGACCTGCCAAAATGGCCTATTGGAGACTGTAAAGTGAGACAGTACCAGGGGTTAGTGTTCGCAAGCAACACCAGCTGCACAATAAACGGAGTTGAAGTAAAAGTGGGAGGCGACGTAGAATGTATGATTGGAGATGTAAAAGTTTCAACTAAACAAATAACAACAGACTTACTTGCTATGCCCTGCCAACCGATAAGAACAGGCTCCGACACAAAGTACACAAGTGGGAGACAAACATGCTCATTTAACTACTCTAAAGTCCAACCAAACAAATATTACAACATCATTGATAAATTTTGGCAACAGTACATAACCAAAGATGGATACCAATACTGGTTTGACTTGGAAGCCGGTGACCATAGAAGGAGTCTGGTAGCTGAATATATAGTGATTGTGGTTGTAGCCTTGCTAGGTGGAAAAATTTCCTTATGGATCCTTGTAATTTATCATTTGTTTGAATTGTCACAAGCTTATATTCCAACACAGAATTCACCAGCTGAATTCTTTATGTACAGTTCAGTTTTTGTAGAAGCTAACCTGGAAGTCATATCTCATTTTCTCTTGCTCCTGGCATTGCTGTACAATACCGACAGCAGGAACATGTTTCTATCAATATTCTTCATATTGACCTCTTCAGCTAAAACAACCATCATCTTTATAATCCTTTGCGTGATTGGCTGTGCAAAGGCCGATGATGGAAGCGAAAAGTGGTACAATATAGAAAATTTCTACTTAGTTATGCTAATAATAATAAGTGTAATGGTGATAGCAAAGAAGAGAAATTTTAGTTTTTTTACCGTCTCTATCACTGTACTACTATTTAGACTGGCCGTAACCATCCCCACGCAGCTTAGTTACATAATGGTCTACATTCTCTTTGTTCTATTCTATATGCTAACATCTATATACTACTTTGGAAGATTAAGAAAGTTACTTTTAGTCTTAATGAGTTTTGCTTTTGTTTATGGTTTACTTGGGCTACTTAACTGTTTAAGTGACCTACAGGGGCCCGCTTTCAGCATAATAACAGTAAACTGGCCAAGGACAGGGTTACTTGTGAGCATATATCTGGCATTGACCACTTGGACGGTAGTATCAGGTATTGATGTTACTGGGCATGCCCTTGGGGCTGCAGCAGTAGTGTTAACACTGCTTTCTTCAATTATAGACATAACTGTACTATGGACTATAATACCTTGGTATAACATTACAAAATTGTATTATATAAGAGGGAAAGTAGACAAAATCAAAGAAGACTGGAGAACAAATGAGGCCTATGAAGAAATGTTAAACACTAGAGAAGGAGTACATCAGATAGCAACTCCAAGTATTAAGGCAATAGACCCCCTTGTTTGGGTTGTCATGAAATCAATAATTTTGGCATCATTGACCACGATTTGGAAACCGGTAATTATAGGATTTTGCCTTGTAGAGATGCTCTATTGGCTCCATGTAAAGTTGGTTCACGAACTAGCAGGACTGACAAATCTTCTTTCAAGAGTTGTAGCATCCTTAATAGAAATCAGTTGGGGTGGATTAGGTGGAGAGATTGGTGTATTATACAAAACATACCTACTAAGTTCCAATATTAAAAAATTAATTATCAAGCACAAAGTAAACAATCCCGGAGTCCGCAAGTGGTTCGGTGAAGAGGAGATTTTTGGGATGCCAAAAATATACATGGTTACCAGTATAAGAAACTTGACTAAGGACAAGGCTATACTCTGCTCCATATGTGAGAACAATAGCGGCAACAGGACATGTCCAAAATGTGGGAGTAAAGGAACACCTATTAAATGTGGGATGACTTTATCAGAATTTGAAGAGAAATTCTACACAAAGATCTTTATAACTGAGTATAACCAAAATGACTATAGAGTTGAGGGACCAGGTAAGGTAGTCAGATATGTAGATAAAGGGCTACTTTACTTAAGAAATTTACCCATTTTAGCCACCAAACAA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| 30,198
|
ON024101.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME5
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,485
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME5/P141T/pangolin/2018, complete genome
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CTTCATACACTTTGGGCATATCCAAAACCATTTAGGTGGATTGGAAACACTAAATTAACTGCACTAGGGGCGAAGGGCGAAAGAATGTTAGCCATACTTCAAGTAGCACTAGCCCTTATGATGTGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGCAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCTACCTTAATGCAATCGGGGGTCGGTTGCATGAATCCAATAGGGATATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTAGACCATAGCACATGAACTTTGAACTTTTCTTTAGGGTAGGGATCACACCACCAAGAGGGGCTAAGGAACCTGTCTATGACAAGTATCTGCAGCCTATCTTTGGCGTGAAGCACAGTGAACTACATCCCAAGTCAACACTGTCTTTGCCACACAAGAGAGGGGGTAAGACTCGGCAGGTAAAGTTAGTGGACTTGCCCCGGAAAGGGGACTGTGAACGCACCAATGGAGAGGTTACAGGCATCTATGTCAAACCAGGACCAACCTGGTATAGTGACTACGAAGGCCCCGTCTACCATCGAATTCCTCTCGAGCTCTGTGCAAAATCAACACCTTGTCTTGTAAAAAAATTAATCGGCAGAATGGAAGGTAGTGACACTAAGTTATACCATGTGTACACATGTCCAGACGGCTGCTTATTTTTTACGAGAGCAAATTCAAAAAGAACTACCTATTTCATGGTGAACAACGCACTAGATGCACCACTTTGGGTACAATCTTGTAGCGACGATAAACCAAAAAACGACAAAATGGTAAAGGGGAAAATTGCACATAAACCAAAAGAGACTGAAAAAGATGTAAAAAAGAAAGCCCCTGACGCTACTATAGTAGTAGAAGGAGTTAAATACCAAGTCACCAAGAAAGGTAAGGTAAGGAGTAAAAAAACTGAAGATGGATTATACCACAACAAAAATAAGCCACCAGAATCTAGAAAGAAGCTAGAGAAGGCATTATTAGCATGGGCAATATTATGTTGCTTGCTAATTATGCCCGTCGGCACTGACAATATAACACAATGGAACCTATGGGACAATGGTTCAACCGATGACATTCACCTGGCCATGTACATGAGGGGCGTAAATAGGAGCTTACACGGGATTTGGCCCAAAAGGATATGTAAAGGGACGCCAACATACCTTTCAAAAGACTATGAGTTAAAGCTGATACAAGGTATGATGGACTCAAGTAGTCACACAAATTACACCTGTTGTAAACTGCAAAGACACGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAATTGGATCAACATAGACCCATGGCTGAAAGAGATGAACCAAACTCAACACAACTTAACCCAAGGTAGCTACAAGATGGAGTGTGCCGTAACATGCAGATATGACAACAACTCAGATTTAAATATAGTTCTACAGGCCAGAGATAGCCCAACAATGTTAACTGGGTGTAAGAAAGGGAAAAATTATTCGTTCTCAGGAGAAGTTAGAGACAAACCATGCTCTCAGGAAGTGGGTGTAGAAGACCTAATGTTGGCAGACCACTCGTGCCATATAGAGGATGGAATAATAGAGTCCATAGTGGACGAGACAACAGAGCTTGTTGAAAAAGCTAGGAAGAAGGCAAGTAGAAGCCTTAGTTGGGCTGAGAACAAATTGAGGAATTTGAGGTTGAAGCTGTTTGGAGCTGAGGCATCACCATACTGTAATATTTCCAAAATAATTGGTAACATAGTTTATACAAAAAATTGCACCCCGGCTTGTTTACCTGCTACAGCAACCATCATTGGCCCAGGGGCTTTTGATTTAATTGGAAGCAGTGGGAATAACAAAAAGATATATATACCAACAGGCCTTCAAAATGAACTAATAATGTTGACTATCATAGCAGCATCTGAGTTCCTGCCAGAAACATCGAGTGTGATATATATTGTTTTTCACTACTTAAACATCAAAACTTCTCACCCACTGATTGAAGGAAACTGCGATAAGACCAAACTAAATTTAACTATCAGTAAGCCAGTTTCAGAAGTGGTCCCAAAACAGTTCTACTTCTTAGGTGCATGGTCTTGCATAAAACCAAGCTGGTGGCCTTACTGGAGCGAAACAGAAGAAATTCTTTTTGACCTAGAGGCCTTAATTGGAATTGTGGTGAGACTACTGCAGGAAGCAACAAGAATCTATGAAGATTTAACAGCAGTTGCCTTCATAGCTGGAGTGATAAAAATCATACAAGGAAAACCTATACACGCAGTAATATGGGTCTTACTTCTTTCTGGGGTGAAGGCTGACTCATGGGATAAATTTTCAAAAATTAGCTGTAAGGATCAATTCAAATATGCTTTGGCCAAAGGAACCCACATAAGTCTACTAGGGGCAAGCAATTTGACAACACACTGGGAAGATTATAACTTAGATGATGGGCAGGTGATGGCCAAATGTAATGATGGCCGATGGACAATCACAGTAAAGTGTAAATTAGCAAGGGACACATGGTTGGCTGAAAAACATGAACGCGCACTACCAACTAGTGTCAAATTTATATCAATACACAATAGAACAAAAGACACAATTAGAACCATAACGTCACCTAGAGCTATCTGTGATTGTGGTGCAAAACCTAGGGAGAATTCCAATTTTAAAGCCATGAAAGTGGTAAGTACTGCTTTCCACCTTATCTGTCCATACGGATGGAAGGGAAATATAACCTGCCACACTACACAGCCTAAGTTGTGGCACACAGAAATTGTAGAGACCCTGAAATATGATAGTACAGGCTATCAAGACCATACGTGTGTACGCACAAAAACAGAAAAAAACAAAGAATATGTGTGTACTCACGGGGGCAATGAAAGCTGTGTAATGGGAAACCAGATAAATTACACACAAGACCTTAGTCTGGAGAATTGCAAGTGGTGCGGCTACACGTTCACAGAAGCAAAGGACCTGCCAAAATGGCCTATTGGAGACTGTAAAGTGAGACAGTACCAGGGGTTAGTGTTCGCAAGCAACACCAGCTGCACAATAAACGGAGTTGAAGTAAAAGTGGGAGGCGACGTAGAATGTATGATTGGAGATGTAAAAGTTTCAACTAAACAAATAACAACAGACTTACTTGCTATGCCCTGCCAACCGATAAGAACAGGCTCCGACACAAAGTACACAAGTGGGAGACAAACATGCTCATTTAACTACTCTAAAGTCCAACCAAACAAATATTACAACATCATTGATAAATTTTGGCAACAGTACATAACCAAAGATGGATACCAATACTGGTTTGACTTGGAAGCCGGTGACCATAGAAGGAGTCTGGTAGCTGAATATATAGTGATTGTGGTTGTAGCCTTGCTAGGTGGAAAAATTTCCTTATGGATCCTTGTAATTTATCATTTGTTTGAATTGTCACAAGCTTATATTCCAACACAGAATTCACCAGCTGAATTCTTTATGTACAGTTCAGTTTTTGTAGAAGCTAACCTGGAAGTCATATCTCATTTTCTCTTGCTCCTGGCATTGCTGTACAATACCGACAGCAGGAACATGTTTCTATCAATATTCTTCATATTGACCTCTTCAGCTAAAACAACCATCATCTTTATAATCCTTTGCGTGATTGGCTGTGCAAAGGCCGATGATGGAAGCGAAAAGTGGTACAATATAGAAAATTTCTACTTAGTTATGCTAATAATAATAAGTGTAATGGTGATAGCAAAGAAGAGAAATTTTAGTTTTTTTACCGTCTCTATCACTGTACTACTATTTAGACTGGCCGTAACCATCCCCACGCAGCTTAGTTACATAATGGTCTACATTCTCTTTGTTCTATTCTATATGCTAACATCTATATACTACTTTGGAAGATTAAGAAAGTTACTTTTAGTCTTAATGAGTTTTGCTTTTGTTTATGGTTTACTTGGGCTACTTAACTGTTTAAGTGACCTACAGGGGCCCGCTTTCAGCATAATAACAGTAAACTGGCCAAGGACAGGGTTACTTGTGAGCATATATCTGGCATTGACCACTTGGACGGTAGTATCAGGTATTGATGTTACTGGGCATGCCCTTGGGGCTGCAGCAGTAGTGTTAACACTGCTTTCTTCAATTATAGACATAACTGTACTATGGACTATAATACCTTGGTATAACATTACAAAATTGTATTATATAAGAGGGAAAGTAGACAAAATCAAAGAAGACTGGAGAACAAATGAGGCCTATGAAGAAATGTTAAACACTAGAGAAGGAGTACATCAGATAGCAACTCCAAGTATTAAGGCAATAGACCCCCTTGTTTGGGTTGTCATGAAATCAATAATTTTGGCATCATTGACCACGATTTGGAAACCGGTAATTATAGGATTTTGCCTTGTAGAGATGCTCTATTGGCTCCATGTAAAGTTGGTTCACGAACTAGCAGGACTGACAAATCTTCTTTCAAGAGTTGTAGCATCCTTAATAGAAATCAGTTGGGGTGGATTAGGTGGAGAGATTGGTGTATTATACAAAACATACCTACTAAGTTCCAATATTAAAAAATTAATTATCAAGCACAAAGTAAACAATCCCGGAGTCCGCAAGTGGTTCGGTGAAGAGGAGATTTTTGGGATGCCAAAAATATACATGGTTACCAGTATAAGAAACTTGACTAAGGACAAGGCTATACTCTGCTCCATATGTGAGAACAATAGCGGCAACAGGACATGTCCAAAATGTGGGAGTAAAGGAACACCTATTAAATGTGGGATGACTTTATCAGAATTTGAAGAGAAATTCTACACAAAGATCTTTATAACTGAGTATAACCAAAATGACTATAGAGTTGAGGGACCAGGTAAGGTAGTCAGATATGTAGATAAAGGGCTACTTTACTTAAGAAATTTACCCATTTTAGCCACCAAACAA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| 30,199
|
ON024102.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME6
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,367
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME6/P141T/pangolin/2018, complete genome
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CCGCTTCATACACATTGGACAATTCAAATTACTGTTTAGGTTAATTGGCAGCATCCAAAGAAACAGCACTAGGGGTGGAGGGCGAAAGAATGTTAACCATACTTCAAGTAGCACAAGCCCCAATGATGTGCGAGAGCCCAAACCTGAGTAGATGAGGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGTAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCTACCTTAGTGCAACCGGGGGTTGGTTGCATGAACCCAATAGGGGTATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGCTCATATAATATGAATTTTGAACTTTTCTTTAGAGTAGGGAATGTACCTCCAAGAGGGGCCGTAGAACCTATCTATGATAGAAATCTACATCCACTTTTTGGGGTGGCACATGAGGAATTACATCCTAGATCGACATTGGTTCTACCACACGCAAGAGGAAGGAAGACTAAGGTGGTCAAGCTAGTAGACCTGCCTAGAAAAGGAGACTGTGATAGAACTGGTGGAGATGTATCTGGTATTTACGTGAAACCAGGGCCAATATGGTATAGTGACTATGAAGGTCCTGTCTATCACCGTATACCTCTAGAACTCTGTGCCAAATCAAGACCTTGTTCAATAAAAAAATTAGTTGGCCGGATGGAAGGTAGTGATAGTAAGTTATATCATGTCTATACCTGTCCGGATGGATGCATTTTCTTCACAAGAGCAAAGAGGAACAATGAAACAACTTACTTTATGGTGAATAACGCGTTAGATGCACCACTATGGGTACAATCTTGCAGTGATGATAAGCCAAAGAACGATAAAATGACCAGAGGAAAAGTAGTACACAAACCTAAAGAAACTGAGAAGGATGTGAAGAAGAAGGCGCCCGATGCAACAATAGTTGTAGAAGGGGTAAAATACCAGGTCACAAAGAAAGGAAAAGTGAGGAGCAAAAAGACTGAAGATGGACTTTACCATAATAAAAATAAGCCACAAGAATCCAGGAAGAAATTGGAAAAAGCACTATTGGCATGGGCTATTTTGTGTTGTTTAATAGTACCGGTTAAAACAGATAACATAACACAATGGAATTTGTGGGATAACAATTCAATTGATAACATTCATTTAGCCATGTATGTAAGGGGGGTGAACAGAAGTTTGCATGGAATCTGGCCAAAGAGGATCTGTAAAGGACCACCAGGGTATCTAGCCAAAGATTACGAGTTAAAGCTAATAGAAGGGATGATGGACTCAAGTAGTTATACAAATTACACTTGCTGTAAGCTACAAAGACATGAATGGAATAAACATGGGTGGTGTAATTGGTTCAACATAGACCCATGGCTGAAGGAGATGAACCAGACCCAATACAATTTGACTCTAGGTAGCTACAAAATGGAATGTGCCGTAACATGTAGGTATGACAATGATTCTGACTTAAATATAGTCCTACAGGCCAGGGACAGCCCAACAATGTTAACTGGTTGTAAGAGAGGAAAAAACTACTCCTTTTCAGGGGTAATTAGAAATAAGCCGTGCTCTAGTGAGCTTGGCATTGAAGACTTGATGCTGGCAGACCACTCTTGCCATATGGGAGACAGTATGGTTGAAACTTTAGTAGATGAGGCCACTGAAGTTGTTGAAAAAGCTAGAAAGAAAGCAAGTAGAACCCTAAGCTGGGCAGAGACAAAAATAAGAAATCTTAGGCTGAAACTATTTGGGGCGGAAGCATCACCATACTGCAACATTAGTAAAGTATTAGGTAATATAGTATACACAAACAACTGCACCCCAGCCTGTTTACCGGCGACAGCAACCATAATTGGACCTGGAAGTTTTGACTTACTTGGAGGCAGTGACAGCAAGAAGATATTTATACCAACTGGTGTCCAAAATGAGATTATTGTGCTAACAATTATAGCTGTATCTGATTTCTTACCTGAAACTTCCAGTGTAGCCTATGTAATCTTTCACTACCTCAATATTAAATTGTCCCACCCATTGATTGGTGAAAATTGTGATAAAAACCAACTAAATTTAACCATCAATAGACCTGTCTCTGAAGTTGTCCCCAAACAGTTCTATTTCTTAGGTGCATGGTCTTGTATTAAACCCGATTGGTGGCCATACTGGAGTGAAGCAGAGGAAATTATCTTTGACTTGGAAGCTATCATTGGGATCATGGTGAGGATAATCAAAGAAGCAGCAAGAATCTATGAAGATGTAACTGCAATTGCCTTTCTAGCTGGGATAATAAAACTCATACAGGGCAAACCGATACATGCTTTAATTTGGGTTTTATTACTTTCTGGGGTTAAAGCTCAAGATTGGGACAAATTTACCAAAATTAGTTGTAAAGATCAATTTAAATATGCATTAGCAAAGGGGACACATATAGGACTACTAGGGGCTTCAAATTTGACAACACAATGGGATGATTACAACTTAGATGATGGACAAGTTAAAGCAAAATGTGAAAATGGTAGATGGCAAATTACTGTTGTATGTAAATTAGCTAGAGACACCTGGTTGGCAGAAAAACATGAACAAGCTTTATATACTTCAGTAAAATTTATCAGCATCCATAATAGAACCAAAAACACAGTTAGGAAAATAGAAGAACCACGTGGGGTTTGCAATTGCGCAGCAGAACCCCGAGAGAACTCAAATTTTAAAGCTATGGAAAAAGCAGAACATGCTTTTCATCTGATTTGCCCATATGGATGGGAAGGAAACATAACATGCCATACCACCCAGCCCCAATTATGGCACACAGAAGTTGTTGAAACCTTGTTGTATGACAGTAAGAGTTATGATGACCCGACATGTAGCAGAACAATTACATCCCAAGACATAGAATATCATTGTAAAAAAGGAGGAAACTCATCTTGTGTGCAAGGGCAACAAGTTGAGTACTCACCTAGCTTCAATTTGGAGTATTGTCTGTGGTGTGGGTACAACTTTAGTAAGGAAGAGGGGTTGCCAAAGTGGCCTATTGGACAGTGCAAGGTAAAGCAATATAGAGGAAAAGTGGAATCAGACTTTGCAAACTGTACAATTAATGGAGTAACCATAACAATACAAGGAGAAGTGGAATGTACAATTGGAGCAGTTAGAGTTAAGACCAAACAAGAAAATAATCAATTGTTATCTATGCCATGTTCACCAATAAAAACCGGCTCAGATACAAAATACACAAGTGGAAGGCAAACTTGTACCTATAATTACTCTAAAGTACTACCCAACAAGTACTACAACATTGTAGATAACTTTTGGCAACAATATATAATTAAAGATGGTTATCAATACTGGTTTGACCTAGAGGCAGGGGACCACAGGAGAAGTATAGTGGCTGAATACATCGTAATTGTGGTAGTGGCACTGTTGGGTGGTAGGGTAACTCTTTGGATTCTTGTAGCATATCACCTATTTGAATATTCACAAGCTTACATCCCAGGGCATAACTCCCCAGGGGAGTTTTTTATGTATAGCTCTATGATTGTAGAATCAAATTTAGAAACCATTTCCCACTTCCTCTTATTATTGGCTTTGTTATATAATTTTAGCAGTAGGAATTTTTTCTTATCTATATACTTTGTGCTAACCTCCTCAGCTAAAACTACCATTATTTTCATAATTCTTTGCCTTATTGGCGGCGTAAGGGCAGACGGGCATAACAACTGGTTACCAAACATAGAGAATATTTATCTAGTGACTTTAATAATGATTAGTATAGCTGTTATTGCAAAGAGAAGGAATTTCAGTTTTTTAACTGTTACCATAACCGTTTTCTTTTTCAGGTTAGCGGTAACACTCCCTATACAATCTAGCTACATATTAATTTACGTTCTCTTTGTCTGCTTTTATATACTCATGGCAATATACTATTTTGGTAAATTTAGGAAGCTTATTCTACTATTGATGAGTTTTGCTTTCTTATGTGGATTAATTGGTCTGCTCAATTGCCTTAACAACTCAAAAGATGCTTTAATGAATATTATAGTCATCAATTGGCCCAGGTTGGGGTTATTGGTCAGCGTATACCTCTCTCTAACAACTTGGGCCGTAACTACAGGCTTGGACGTCACAGGGTACATTTTAGGGATAGCTGCAACAGTGCTCGCAGCACTCTCTATGTCCATGGATTTAGTAATACTATGGGCTGTAATACCCTGGTACAACACAACTAAACTGTACTACATAAAAAGAAAAGTGGATAAAGTCAAAAAAGACTGGAAAGTAGAGGGGGGAGTCTTTGAGGAACTAATTAGCACAAGAGAAGGAGTACATCATATTGCTACACCAAGCATCAAGGCAATTGACCCCCTCGTTTGGATTGTGATGAAATCAATACTACTAGCATCACTGACGTCCATCTGGAAACCTGTGATCCTTGGATATTGTATAGTGGAAATGCTTTATTGGCTTCATATTAAACTAATCCATGAGCTGGCTGGGATGACAAACTTTTTATCTAGAATAATGGCTTCCATAATAGAAATTAGCTGGGGAGGGTTAGGTAGTGAAGTAGGAATGTTGTACAAAACATACCTGCTAAGCACAGAGATAAAAAAACTGGTTATAAAGCATAAAGTTAACAACCCAGGAATACGCAAGTGGTTTGGAGAAGAAGAAATATTTGGAATGCCTAAGGTGTACATGGTCACAGCTATTAAAAATTTAACCAAAAGCAAAGCTATATTGTGTTCCATTTGTGAAAATAGTAGCAACAACAGAATTTGCCCAAAGTGTGGCAACAAGGGGACACCAATTAAATGTGGAATGACTCTTTCAGAATTTGAAGAAAGATTTTACACAAAGATTTTCATAACGGACCACAGTCAAAAGGACCATAGAGTCGAAGGCCCAGGCAAGATAGTTAGATATCTAGACAATGGACTGCTGTATCTAAGAAATCTACCAATATTGGCAACTA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| 30,200
|
ON024103.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME6
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,082
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME6/P226T/pangolin/2018, complete genome
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CTTCATACACATTGGACATATCAAATTGTTGATTAGGTTGATTGGCAATACGTTAAAGAAACAGCACTAGGGGTGGAGGGCGAAAGAATGTTAACCATACTTCAAGTAGCACAAGCCCTAATGATGTGCGAGAGCCTAAACCTGAGTAGATGAGGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGTAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCGTGCCCAGGCCTACCTTAGTGCAACCGGGGGTTGGTTGCATGAATCCAATAGGGATATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGCTCATATAATATGAATTTTGAAACTTTTTTTAGAGTAGGGAATATACCCCCAAGAGGGGCTGTGGAACCTGTCTACGATAGGTATCTACGTCCACTTTTTGGGGTGGCACATGAAGAGTTACACCCTAAATCCACATTGGTTTTACCACACATAAGAGGAAAGAAAACTCAGGAGGTTAAGCTAGTAGATCTACCTAGAAAAGGAGACTGTGATAGAACCAATGGGGATGTTTCTGGTATTTACGTGAAGCCGGGGCCAACATGGTACAGCGACTATGAGGGCCCTGTCTATCACCGCATACCTCTAGAATTGTGTGCCAAATCAACACCTTGTACAACAAAAAAACTAGTTGGCCGGATGGAAGGCAGTGACAGTAAGTTATATCATGTCTATACCTGTCCAGATGGATGTATCTTCTTCACAAGAGCAAAGAGAAGTAACAAAATAACTTATTTCATGGTAAACAATGCTTTAGATGCACCATTATGGGTACAATCTTGTAGTGATGACAAGCCTAAGAATGACAAAATAACTAAAGGGAAGGTAATACATAAGCCCAAAGAAACTGAGAAGGATGTGAAGAAGAAGGCACCCGATGCGACTATAGTGGTGGAAGGAGTCAAATATCAGGTTACAAAGAAAGGAAAAGTAAAAAGTAAAAAGACTGAAGATGGACTCTACCACAACAAAAACAAACCACATGAATCCAGAAAAAAATTGGAAAAAGCGCTGCTGGCATGGGCTATTCTGTGTTGCCTGTTAATTGTGCCAGTACAAACAGACAACATAACACAGTGGAACTTATGGGACAATAATTCAATTGATGATATTCACTCAGCAATGTATGCAAGGGGGATAAATAGAAGCTTGCATGGAATCTGGCCAAAAAGAATCTGCAAAGGACCACCAGGATATCTAGCCAAAGACTATGAGCTGAAGCTCATAGAAGGGATGATGGACTCGAGTAGTTACACGAATTACACTTGCTGTAAATTACAGAGGCATGAATGGAATAAACACGGGTGGTGTAATTGGTTTAACATAGACCCTTGGTTGAAAGAAATGAACCAAACCCAACATAATCTTACTCTAGGCAATTACAAAATGGAATGTGCTGTAACATGTAGGTACGACAACAACTCTGACTTAAATGTAGTCTTACAGGCCAGGGATAGTCCAACAATGCTAACTGGTTGTAGGAAAGGGAAAAACTACTCCTTTTCAGGGGAAATCAGAAATAAGCCATGTTCTACCGAGCTTGGTATTGAAGATTTAATGCTGGCAGACCACTCATGCCATATGGGAGACAGCGTGGTTGAAACCCTGGTAGATGAGGCCACTGAGGTTGTTGAGAAGGCTAGGAAGAGGGCAAGTAGAACCCTAAGTTGGGCGGAGACAAAGATAAGAAATCTTAGACTGAAACTATTTGGGGCGGAAGCGACACCATACTGTAATATTACTAGAATATTAGGCAATATAGTGTATACAAGAAACTGTACTCCAGCCTGCTTACCAGCCACTGCTACAATAATTGGTCCTGGAAGTTTTGACTTACTCGGAGGCAGTAGCAGCAAACAGATATTCATACCAACTGGTGTGCAAAATGAGATCATTATGCTGACAATTATAGCTGCATCTGATTTCCTGCCTGAAACTTCCAGTGTAGCTTATGTAATCTTTCATTACCTCAATATTAAATTGACCCACCCATTGATTGGTGAAAATTGCGACAAGAACCAACTAAACCTGACTATCAATAGACCTGTCTCTGAAGTAGTCCCCAAACAATTCTATTTTCTGGGTGCTTGGTCTTGCATCAAACCTGATTGGTGGCCATATTGGAGTGAAGCCGAAGAAATCATGTTCGACCTGGAAGCCATTATTGGGATCATAGTGAGACTAGTTAGAGAAGCAGCACGAATTTACGAAGATCTAACTGCAGTTGCTTTTTTAGCTGGAATAATAAAACTCATACAGGGCAAGCCTATACATGCTTTAATATGGGTTTTACTACTCTCTGGAGTTAATGGCCAAGATTGGGACAAGTACTCTAAAATCAGCTGCAAGGATGAATTCAAGTATGCTCTAGCAAAGGGGACACATATTGGATTACTAGGAGCTTCAAATTTGACAACACAATGGGAAGATTATAACCTAGATGATGGGCAAGTCAAAGCAAAATGTGAAAACGGTAGATGGCAAATCACAGTTGTATGCAGATTAGCAAGAGACACCTGGTTGGCAGAAAAACATGAGCGGGCTTTATCTACTTCAGTAAAATTCATTAGTATTCATAATAGAACCAAAAACACAGTTAGGGAAATAGAAAGACCACAAGGAGTTTGTGATTGCGGAGCAACACCCAAGGAAAATTCAAATTTTAAAGCTATTGCAATAGCAGGCCAAGCTTTCCACCTTATTTGCCCATATAAATGGAGAGGTAACATAACATGCCACACCCGGCAACCCCAATTATGGCATACAGAGGTTGTTGAGACCTTAGTGTACAATAGTGCAAATTATGATGACCCAACATGTAATAGAACAATTACAAACGGAAGCAAAGAATTTCACTGCGCTAAAGGGGGGAACACATCTTGTATACAAGGTCAACAAGTTAAGTATTCATCTAATTTCAACTTGGAGTTTTGTTTATGGTGTGGGTACGAATTCAAAGAGAAGGATGGTTTACCAACATGGCCTATAGGAGAATGTAAAGTGAAGCAATACACAGGGAAGGTAGAATCAAATTTTCTAAACTGTACAATTAATGGAGTAAACATAACAGAAGAAGGGGATGTAGAGTGTATGATTGGAACCGTTAAAATTAAAACCAAACAAACAGACAACCAGCTATTATCTAGGCCATGTTCCCCAATAAAAACTGGTTCAGACACAAAATACACAAGTGGAAGGCAAACATGCACCTTTAACTACTCTAAAGTATTACCCAATAAGTACTATGACATCATAGACAATTTCTGGCAACAGTATATAGTTAAAGATGGCTATCAGTACTGGTTTGATCTAGAGGCAGGGGACCACAGGAGGAGTATACTGGCTGAATACATTGTAATTGTGGTGGTGGCATTGTTGGGAGGTAGAATAACCCTTTGGATTCTTGTAGCATACCACTTGTTTGAATTTTCACAAGCATATATTCCTGGGCAAAACTCTCCAGGGGAGTTTTTTATGTTTAGCTCTATAATTGTAGAATCAAATTTAGAAATCATTTCCCATTTCCTCTTGCTGCTAGCCCTGTTATACAATACTGATAGTAGGAATCTTTTCCTATCTATATACTTCATATTAACTTCCTCAGCTAAAACCACTATTATTTTTATAATCCTTTGTCTCATTAGTGGTGTAAAAGCAGATGGACAAGGTGACTGGTTGCCAAATATGGAGCATATATACCTAGCCATTTTAATAATGATTAGTATAGCTGTTATTGCAAAGAGAAGGAATTTTAGCTTTTTAACTGTAACCATAACTGTTTTCTTCTTTAGACTAGCGGTGACGCTGCCCGTACAATCTAGCTATATATTAATCTATGTTTTCTTTTTCTGTTCTTACGTACTTATGGCAATATATTATTTTGGTAGATTTAGGAAGCCTTGTTTACTATTAATGAGTTTTGCTTTCTTATATGGATTGATTGGTCTGCTTAACTGCCTTAACAACTCAAAAAGCGCTTTAATGAACATTGTAGTTGTCAATTGGCCTAGGTTAGGATTATTGGTCAGCCTATATCTCTCCCTAACAACTTGGGCTGTAACCACAGGCTTGGATATTACTGGGTACATCTTAGGGATGATTGCAACAGTGTTTGCAGCACTCTCCATGTCCTTAGATTTAACAATACTATGGACTGTGATACCTTGGTACAATACAACCAAGCTGTATTATATAAAAAGAAGAGTAGAAAAGGTTAAAAAAGACTGGGAAGTAGGAGGGACAGTTTTCGAGGAATTAATTAACACAGGAGAGGGAGTACATCACATTGCAACACCAAGCATTAAGGCAATCGACCCCCTTGTTTGGGTTGTGATGAAATCAATATTACTGGCTTCACTAACTTCCATTTGGAAACCTGTGATTCTTGGGTACTGTATGGTGGAAATGCTTTATTGGCTTCATGTTAAATTAATCCATGAACTAGCTGGGATGACAAATGTTTTATCTAGAGTGATGGCTTCTATAATAGAAATTAGCTGGTGTGGGCTAGGCAATGAAGTAGGAATATTGTATAAAACTTACCTATTAAGTACAGAAATAAAAAGACTGGTAATTAAACATAAAGTTAACAACCCAGGAATACGTAAATGGTTTAAAGAAGAAGAAATATTTGGGATGCCAAAGGTATACATGGTTACGGCTATTAAAAATTTAACCAAAAGCAAAGCCATACTATGCTCCGTCTGTGAAAACAGTAGTAGCAACAGAGTATGCCCAAAATGTGGTAGCAAAGGAACACCAATTAAATGCGGAATGACCCTTTCTGAGTTTGAAGAAAGATTTTATACAAAGATTTTTATAACAGACCATGGCCAAAACGATCACAGAGTTGAAGGTCCTGGTAAGATAGTCAGATATTTGGACAATGGACTGCTGTATCTAAGAAATCTACCAATATTGGCAACT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| 30,201
|
ON024104.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME7
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,510
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME7/P022T/pangolin/2018, complete genome
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CCGCTTCATACACATTGGGCATTGTTACAAATTTGTATAGGTGAATTGGCCAATGGAAAATTAACTGCACTAGGGGCAAAGGGCGAAAGAGAGTTAGCCATACCTTGAGTAGCACGAGCCTCGGTGATGTGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGTAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCATGCCCAGGCCTACCTTAGTGCAACCGGGGGTTGGTTGCATGAATCCAATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGATCATAGCACATGAATTTTGAAATTTTTTTTAGAGTAGGGAATGTACAGCCAAGAGGGGCCAAGGAACCTGTCTATGACAGAAATCTTCAGCCACTCTTCGGCACTAAGCACGAAGAGCTACACCCCCAGTCCACATTAGTACTACCACATGTAAGGGGGAGAAAGACTCAACAGGTTAAATTGGTAGACTTACCAACAAAAGGGGATTGTGAGAGAACTAACGGTGAAGTTTCCGGCATATATGTCAAGCCAGGACCAATTTGGTACAGCGACTACGAAGGCCCTGTCTACCATCGAATACCTTTAGAACTTTGTGCTAAGTCAACACCTTGTTCAGTTAAAAAATTAGTTGGCCGGATGGAGGGCAGTGACACTAAACTATATCATGTGTACACATGCCCAGATGGCTGCATATTTTTTACAAAAGCAAGTAAAAACAAAACTACCTATTTTATGGTAAACAATGCACTGGACGCTCCACTTTGGGTACAATCCTGCAGTGACACAAAACCAAAGAATGACAAAATGGTGAAAGGGAAGATTACACATAAGCCAAAGGAAGTTGAGAAGGATACAAAAAAGAAAGCACCCGACGCAACTATTGTAGTAGAAGGTGTCAAATACCAGGTCACAAAGAAAGGGAAAGTAAAGAGCAAGAAAACTGAGGATGGATTATACCATAATAAGAATAAACCACCAGAGTCTAGAAAAAAATTAGAAAAAGCACTACTAGCTTGGGCCATACTATGTAGTTTACTAATCATACCAGTACAATCTGACAATGTAACACAGTGGAACTTGTGGGACAATAACTCAATTGATGATATCCATCTGGCAATGTTTAAAAGAGGTGTAAACAGAAGCCTACATGGTATCTGGCCAAAAAGAATTTGCAAGGGAGTGCCCGGGCACCTAGCAAAAGATTATGAATTGAAACTTATAGATGGGATGATGGATTCAAGTGGTTATACAAACTACACTTGTTGTAAGCTGCAAAGACATGAATGGAACAAACATGGCTGGTGCAATTGGTTCAACATAGACCCATGGTTGAAAGAAATGAATCAAACACAACACAATCTAACCCAAGGGCAATACAAAATGGAGTGTGCTGTAACTTGCAGATATGACAACAAAACTGATTTAAACATAGTACTGCAAGCTCGAGACAGCCCTACCATGTTGACCGGCTGCAAAAAAGGAAAGAATTACTCCTTTTCAGGCGAAATCAGAAACAAACCTTGTTCTGCAGAATTAGGCATTGAAGATTTAATGTTGTCAGATCACACATGTCATTTGGAAGACGGTATAATAGAAGCCATAGTTGATGATGCAACAGAATTAGTTGAAAAAGCTAGAAAGAAAGCAAGCCGGAGTCTCAGTTGGGCTGAAAACAAATTGAGAAACATTAGGCTGAAATTATTTGGGGCAGAGGCTTCACCATATTGCAACATCAGCAAAGTAATTGGAAACATAGTTTACACAAGTAATTGCACACCGGCCTGCCTACCCTCAACTGCCACCATCATCGGCCCTGGAGCTTTTGACTTACTTGGGGGCAGTGGAGGGAGACAAATATATATACCAACAGGAGTCCAAAATGAAATGATAATACTAACCATTATAGCAGCATCTGACTACCTGCCTGAAACTGCTAGCGTTGCCTATGTGATTTTCCACTACCTCAATATAAAGCTTTCCCACCCACTGATTGAGGATAATTGTGATAAAAACCAACTAAATTTAACAATTAACAAAGTGGTTTCAGAAGTGGTTCCCAAGCAATTTTACTTTCTGGGGGCGTGGTCTTGCATTAAACCAAGCTGGTGGCCGTATTGGAGTGAAGCAGAAGAAATTTTATTTGACTTAGAAGCTATGATTGGTATTCTAGTAAGATTATTAAAAGAAGCCACTAGGATTTATGAAGATTTGACTGCAGTAGCATTTATAGCTGGGGTAATAAAACTCATACAAGGTAAACCTGTACATGCCTTGATATGGCTCTTGATTCTCTCTGGGGTCAATGCTCAAGACTGGGACAAATTCAGTAAAATTAAATGCAAGGACCAGTTCAAGTATGCCCTAGCTAAAGGGAAACATATTGGGTTATTAGGAGCCTCTAATCTAACTACACAATGGGAAGATCACTCACTGGATGATGGGCAAGTAGCTGCTATATGTGAAAATGGTAGGTGGGTAGTAACAGTAAAGTGTAAATTGGCAAGGGACACATGGCTAGCTGAGAAACATGAAAGAGCTTTACCTACCTCCGTCAAATTCATCAGCATCCACAATAAGACCAAAGACAACAACAGGGTCATCAGCAAACCACTTGGTGTATGTGACTGTAATGCTTCGCCAAAAGAGAATGCCAATTTTAATGCTATAACAATAGTTGGGTCAGCATTCCATTTAACTTGCCCGTATGGCTGGAAAGGGAACATAACTTGTCACACCCGACAACCACAGTTATGGCACACAGAAATTGTCGAGACCTTATTTTATGACAGCCAAGACTATCACGACCCTTCATGTCTAAAAACGAAAACGATAACAGGTAAAGAACACGAGTGTATCCTTGGTGGTAACACTAGCTGTGTAGCCGGACAACAAATAAGCTACACATCCAATTTTAATTTGGAACAATGTAACTGGTGTGGGTACACTTTCACCAACAGCACAAGTGACCTACCTAAGTGGCCAATTGGGCAATGCAAAGTTAGTCAATTTCAAGGGCTGGTGGCAGCCAATAATATAAATTGCACAATAAATGGGGTTGAGATAACAACAGAAGGAACAGTAGAATGCATGATTGGGACAATCAAGGTCAAGACTAGACAAGTAACAGGCCAGTTGCTGGCTATGCCTTGCCAACCAATTCGACACGGTTCCGACACAAAATATGCAAGTGGAAGACAAACATGCACATTCAACTACTCTGCAGTACTACCGAAGAAATATTACAAAATTATAGACAATTTCTGGCAGCAATATATAGTTAAAGATGGCTACCAGTACTGGTTTGATCTAGAAGCTGGTGACCACAGGAGAAGTATACTAGCTGAGTACATTGTGATTGTGATTGTGGCACTTTTGGGAGGCAAGGTTACATTATGGATACTCGTGGCCTACCACTTATTTGACTTCTCACAGGCATACATACCAGGACAAAATTCCCCAGGAGAATTTTTTATGTACAGCACTATGATTATAGAAGCAAATTTAGAAGTTGTTTCTCATTTTTTACTATTGCTAGCATTACTGTATAATAGCAATAGTAGAAACCTTTTTCTGTCTATATACTTCCTACTTACCTCCTCAGCTAAAACAGCTGTTATTTTTATAATTCTTTGTTTGATTGGTAGTGTTAAAGGTGAAGATCTCATGGATGAATGGTTAGATATGGAAAATATTTACCTAACCACACTAGTAGTGGTTAGCATAGTAATCATAGCAAAGAAAAGGAATTTCTGTTTTCTTACTGTAACAGCTACTGTGCTTTTGTTCAGGACTGCTGTGATTTTGCCTACGCAATACAGTTATATAGTAGTTTACGCTATCTTTGTTCTTTTTTATATGTTAATGTCTATTTACTACTTTGGGAAATTTAGGAAGATAATCTTGCTATTCATGAGCTTTGCTTTCCTATATGGTTTGATTGGCTTACTTAATGCTTTAAGCAGTTTTAAGGGGGTTGCCATAAACATAATAGTGGTGAGTTGGCCTAGGCTAGGACTATTAGTAAGTTTGTACCTCTCAGCAACAACTTGGACTTTAACAACAGGTGTGGACGTTGCAGGATATATTTTAGGTGTAATAGCAGTTATTCTTACAATAATTTCCATGTCACTGGATGTAACTGTATTATGGACTGTGATTCCATGGTATAATACAACTAAATTATATTATATAAAAAGAAAGGTCAATAAAGTTAGAGAAGATTGGAAAGTGAAAGGAGGGGTTTATGAAACATTATTGAACACAGAAGAGGGGGTACATCAAATAGCAACTCCAAGTATCAAAGCAATTGACCCCCTTGTTTGGATTGCTATGAAATCCATAATATTGGCAGCAATAACTTCAATTTGGAAACCGGTGATTTTGGCATACTGTATTGTAGAGATGACCTATTGGCTTCACATCAAGTTAATTAAAGAACTAGCAGGTATGACAAATACACTGTCTAGAATTGTAGCCTCAATAATAGAGATTAGTTGGAGCGGACTAGGGAATGAAGTCAGCACACTATACAAAACATATATCTTAAGCACTGAACTTAAAAAATTGATTATTAAACACAAAGTAAACAACCCAGGAGTCCGTAGATGGTTTAAGGATGAAGAAATATTTGGAATGCCAAAAATTTACATGGTTACGACCATCAAAAATTTAACCAAAGATAAAGCCATACTATGCTCTGTTTGCGAAAATAGTGATAGTAAAAGGATATGTCCAAAGTGTGGTAGTAAAGGAACACCAATTAAATGTGGGATGACTCTTTCAGAATTTGAAGAAAAATTTTATACCAAAATTTTCATATCAGACTACAACCAGAGCGACCACAGAGTTGAAGGACCCGGAAAAATAGTTAGATACTTAGATAATGGGCTTTTATATCTAAGAAATCTACCAATACTAGCA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| 30,202
|
ON024105.1
|
Pangolin pestivirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
|
BIME7
|
Pangolin pestivirus
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,457
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin pestivirus strain PPeV/BIME7/P023T/pangolin/2018, complete genome
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CCGCTTCATACACATTGGGCATTGTTACAAATTTGTATAGGTGAATTGGCCAATGGAAAATTAACTGCACTAGGGGCAAAGGGCGAAAGAGAGTTAGCCATACCTTGAGTAGCACGAGCCTCGGTGATGTGCGAGAGCCCCAACCTGAGTAGATGAGGGAGGCCGTAGCAGTGAGTACACTGTAGCCAACAAGGTTCCTACTGGTAAGGATCACCCACTAGGTATGACCTGTAGTTGGGGGCATGCCCAGGCCTACCTTAGTGCAACCGGGGGTTGGTTGCATGAATCCAATAGGGAAATCTACACAGCCTGATAGGGTATCGGCGCCGATGGGGAAAGGCTCTATAAAATGGCGTGGATCATAGCACATGAATTTTGAAATTTTTTTTAGAGTAGGGAATGTACAGCCAAGAGGGGCCAAGGAACCTGTCTATGACAGAAATCTTCAGCCACTCTTCGGCACTAAGCACGAAGAGCTACACCCCCAGTCCACATTAGTACTACCACATGTAAGGGGGAGAAAGACTCAACAGGTTAAATTGGTAGACTTACCAACAAAAGGGGATTGTGAGAGAACTAACGGTGAAGTTTCCGGCATATATGTCAAGCCAGGACCAATTTGGTACAGCGACTACGAAGGCCCTGTCTACCATCGAATACCTTTAGAACTTTGTGCTAAGTCAACACCTTGTTCAGTTAAAAAATTAGTTGGCCGGATGGAGGGCAGTGACACTAAACTATATCATGTGTACACATGCCCAGATGGCTGCATATTTTTTACAAAAGCAAGTAAAAACAAAACTACCTATTTTATGGTAAACAATGCACTGGACGCTCCACTTTGGGTACAATCCTGCAGTGACACAAAACCAAAGAATGACAAAATGGTGAAAGGGAAGATTACACATAAGCCAAAGGAAGTTGAGAAGGATACAAAAAAGAAAGCACCCGACGCAACTATTGTAGTAGAAGGTGTCAAATACCAGGTCACAAAGAAAGGGAAAGTAAAGAGCAAGAAAACTGAGGATGGATTATACCATAATAAGAATAAACCACCAGAGTCTAGAAAAAAATTAGAAAAAGCACTACTAGCTTGGGCCATACTATGTAGTTTACTAATCATACCAGTACAATCTGACAATGTAACACAGTGGAACTTGTGGGACAATAACTCAATTGATGATATCCATCTGGCAATGTTTAAAAGAGGTGTAAACAGAAGCCTACATGGTATCTGGCCAAAAAGAATTTGCAAGGGAGTGCCCGGGCACCTAGCAAAAGATTATGAATTGAAACTTATAGATGGGATGATGGATTCAAGTGGTTATACAAACTACACTTGTTGTAAGCTGCAAAGACATGAATGGAACAAACATGGCTGGTGCAATTGGTTCAACATAGACCCATGGTTGAAAGAAATGAATCAAACACAACACAATCTAACCCAAGGGCAATACAAAATGGAGTGTGCTGTAACTTGCAGATATGACAACAAAACTGATTTAAACATAGTACTGCAAGCTCGAGACAGCCCTACCATGTTGACCGGCTGCAAAAAAGGAAAGAATTACTCCTTTTCAGGCGAAATCAGAAACAAACCTTGTTCTGCAGAATTAGGCATTGAAGATTTAATGTTGTCAGATCACACATGTCATTTGGAAGACGGTATAATAGAAGCCATAGTTGATGATGCAACAGAATTAGTTGAAAAAGCTAGAAAGAAAGCAAGCCGGAGTCTCAGTTGGGCTGAAAACAAATTGAGAAACATTAGGCTGAAATTATTTGGGGCAGAGGCTTCACCATATTGCAACATCAGCAAAGTAATTGGAAACATAGTTTACACAAGTAATTGCACACCGGCCTGCCTACCCTCAACTGCCACCATCATCGGCCCTGGAGCTTTTGACTTACTTGGGGGCAGTGGAGGGAGACAAATATATATACCAACAGGAGTCCAAAATGAAATGATAATACTAACCATTATAGCAGCATCTGACTACCTGCCTGAAACTGCTAGCGTTGCCTATGTGATTTTCCACTACCTCAATATAAAGCTTTCCCACCCACTGATTGAGGATAATTGTGATAAAAACCAACTAAATTTAACAATTAACAAAGTGGTTTCAGAAGTGGTTCCCAAGCAATTTTACTTTCTGGGGGCGTGGTCTTGCATTAAACCAAGCTGGTGGCCGTATTGGAGTGAAGCAGAAGAAATTTTATTTGACTTAGAAGCTATGATTGGTATTCTAGTAAGATTATTAAAAGAAGCCACTAGGATTTATGAAGATTTGACTGCAGTAGCATTTATAGCTGGGGTAATAAAACTCATACAAGGTAAACCTGTACATGCCTTGATATGGCTCTTGATTCTTTCTGGGGTCAATGCTCAAGACTGGGACAAATTCAGTAAAATTAAATGCAAGGACCAGTTCAAGTATGCCCTAGCTAAAGGGAAACATATTGGGTTATTAGGAGCCTCTAATCTAACTACACAATGGGAAGATCACTCACTGGATGATGGGCAAGTAGCTGCTATATGTGAAAATGGTAGGTGGGTAGTAACAGTAAAGTGTAAATTGGCAAGGGACACATGGCTAGCTGAGAAACATGAAAGAGCTTTACCTACCTCCGTCAAATTCATCAGCATCCACAATAAGACCAAAGACAACAACAGGGTCATCAGCAAACCACTTGGTGTATGTGACTGTAATGCTTCGCCAAAAGAGAATGCCAATTTTAATGCTATAACAATAGTTGGGTCAGCATTCCATTTAACTTGCCCGTATGGCTGGAAAGGGAACATAACTTGTCACACCCGACAACCACAGTTATGGCACACAGAAATTGTCGAGACCTTATTTTATGACAGCCAAGACTATCACGACCCTTCATGTCTAAAAACGAAAACGATAACAGGTAAAGAACACGAGTGTATCCTTGGTGGTAACACTAGCTGTGTAGCCGGACAACAAATAAGCTACACATCCAATTTTAATTTGGAACAATGTAACTGGTGTGGGTACACTTTCACCAACAGCACAAGTGACCTACCTAAGTGGCCAATTGGGCAATGCAAAGTTAGTCAATTTCAAGGGCTGGTGGCAGCCAATAATATAAATTGCACAATAAATGGGGTTGAGATAACAACAGAAGGAACAGTAGAATGCATGATTGGGACAATCAAGGTCAAGACTAGACAAGTAACAGGCCAGTTGCTGGCTATGCCTTGCCAACCAATTCGACACGGTTCCGACACAAAATATGCAAGTGGAAGACAAACATGCACATTCAACTACTCTGCAGTACTACCGAAGAAATATTACAAAATTATAGACAATTTCTGGCAGCAATATATAGTTAAAGATGGCTACCAGTACTGGTTTGATCTAGAAGCTGGTGACCACAGGAGAAGTATACTAGCTGAGTACATTGTGATTGTGATTGTGGCACTTTTGGGAGGCAAGGTTACATTATGGATACTCGTGGCCTACCACTTATTTGACTTCTCACAGGCATACATACCAGGACAAAATTCCCCAGGAGAATTTTTTATGTACAGCACTATGATTATAGAAGCAAATTTAGAAGTTGTTTCTCATTTTTTACTATTGCTAGCATTACTGTATAATAGCAATAGTAGAAACCTTTTTCTGTCTATATACTTCCTACTTACCTCCTCAGCTAAAACAGCTGTTATTTTTATAATTCTTTGTCTGATTGGTAGTGTTAAAGGTGAAGATCTCATGGATGAATGGTTAGATATGGAAAATATTTACCTAACCACACTAGTAGTGGTTAGCATAGTAATCATAGCAAAGAAAAGGAATTTCTGTTTTCTTACTGTAACAGCTACTGTGCTTTTGTTCAGGACTGCTGTGATTTTGCCTACGCAATACAGTTATATAGTAGTTTACGCTATCTTTGTTCTTTTTTATATGTTAATGTCTATTTACTACTTTGGGAAATTTAGGAAGATAATCTTGCTATTCATGAGCTTTGCTTTCCTATATGGTTTGATTGGCTTACTTAATGCTTTAAGCAGTTTTAAGGGGGTTGCCATAAACATAATAGTGGTGAGTTGGCCTAGGCTAGGACTATTAGTAAGTTTGTACCTCTCAGCAACAACTTGGACTTTAACAACAGGTGTGGACGTTGCAGGATATATTTTAGGTGTAATAGCAGTTATTCTTACAATAATTTCCATGTCACTGGATGTAACTGTATTATGGACTGTGATTCCATGGTATAATACAACTAAATTATATTATATAAAAAGAAAGGTCAATAAAGTTAGAGAAGATTGGAAAGTGAAAGGAGGGGTTTATGAAACATTATTGAACACAGAAGAGGGGGTACATCAAATAGCAACTCCAAGTATCAAAGCAATTGACCCCCTTGTTTGGATTGCTATGAAATCCATAATATTGGCAGCAATAACTTCAATTTGGAAACCGGTGATTTTGGCATACTGTATTGTAGAGATGACCTATTGGCTTCACATCAAGTTAATTAAAGAACTAGCAGGTATGACAAATACACTGTCTAGAATTGTAGCCTCAATAATAGAGATTAGTTGGAGCGGACTAGGGAATGAAGTCAGCACACTATACAAAACATATATCTTAAGCACTGAACTTAAAAAATTGATTATTAAACACAAAGTAAACAACCCAGGAGTCCGTAGATGGTTTAAGGATGAAGAAATATTTGGAATGCCAAAAATTTACATGGTTACGACCATCAAAAATTTAACCAAAGATAAAGCCATACTATGCTCTGTTTGCGAAAATAGTGATAGTAAAAGGATATGTCCAAAGTGTGGTAGTAAAGGAACACCAATTAAATGTGGGATGACTCTTTCAGAATTTGAAGAAAAATTTTATACCAAAATTTTCATATCAGACTACAACCAGAGCGACCACAGAGTTGAAGGACCCGGAAAAATAGTTAGATACTTAGATAATGGGCTTTTATATCTAAGAAATCTACCAATACTAGCA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| 30,203
|
ON024118.1
|
Pangolin protoparvovirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
| null |
Pangolin protoparvovirus
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,024
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin protoparvovirus strain PPrV/P170T/pangolin/2018, complete genome
|
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GTCTACTGATGTTGTGCATCTCCC
| 30,214
|
ON024119.1
|
Pangolin protoparvovirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
| null |
Pangolin protoparvovirus
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,058
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin protoparvovirus strain PPrV/P179T/pangolin/2018, complete genome
|
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-06-16
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Parvoviridae
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|
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China
|
China
|
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Pangolin protoparvovirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-06-16
| null |
Pangolin protoparvovirus
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
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|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
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|
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Pangolin protoparvovirus
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
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China
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2022-06-16
| null |
Pangolin protoparvovirus
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Protoparvovirus
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Parvoviridae
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GenBank
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China
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China
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Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin protoparvovirus strain PPrV/P215T/pangolin/2018, complete genome
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|
ON024126.1
|
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|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
| null |
Pangolin protoparvovirus
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
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| 5,070
|
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China
|
China
|
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| null |
2018
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|
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|
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|
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|
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|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
| null |
Pangolin protoparvovirus
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
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|
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| null |
China
|
China
|
Pholidota
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|
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TTAATCAACCAG
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|
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-06-16
| null |
Pangolin protoparvovirus
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Protoparvovirus
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Parvoviridae
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ssDNA(+/-)
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GenBank
| null |
China
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China
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Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin protoparvovirus strain PPrV/P229T/pangolin/2018, complete genome
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CTTGGTCAGTTGGTTCTAAAGAATGATAGGCGGTTTGTGTGTTTAAACTTGGGCGGGAAAAGGTGGCGGGCTAATTGTGGGCGTGGTTAAAGGTATAAAAGACAAACCATAGACCGTTACTGACATTCGCTTCTTGTCTTTGACAGAGAGAACCTCTCTTACTTTGACTAACCATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTGAAGAGACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGTTTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGAGCTAACATCTTTAATTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCAGAAGTTGATAGCCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAGAACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAAAACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGTAAACTTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACATAAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTGTCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAGTATCAAGACAGACAAATTGTCAGTACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGCGGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAGACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGAAATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAACTAACTAACTTTGATCTTGCAAATTCTAGAACATGTCAAATTTTTAGGATGCATGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCATGTGTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAGCCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTGAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAATTTAATTTGGATTGAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAACAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAATTGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAGAATTGGATGCGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGTTAGTATGTAAACTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTGGTTAAACATGGTTTTGTATCAACCATGGCTAACTATACACATCATTGGGGAAAAGTGCCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTACAAAGACTTAAAGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGACGTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACGATCAAACCAACTTGGCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCAACGTGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACGATTGGAAGAAGACTTTCGAGACGACTTGGATTAAGGTACGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTGAGGTGGGGGGAGGGGAAGAATTTAATGACTTAACTAAGTATGTGTTTTTTTATAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACCAACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCTGGTAAAAACCCATACTTATATTTCTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTTTAGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAACCAACTAAAAGAAGTAGACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAAGCCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAATCTTGCACCAATGAGTGATGGAGCAGTTCAACCAGACGGTGGTCAGCCTGCTGTCAGAAATGAAAGAGCTACAGGATCTGGGAACGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTCAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTACATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACCCATGCACAAATTGTAACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAACACACACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTTTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAATACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCAAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATATCCAGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAAATGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAGCAGGAATTAACTATACTAATATATTTAATACTTATAGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCGCCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAGAATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAATTCAACAAATGAGTATTAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGAAAATTGTATATGAAAAATCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATACTAACATACTTACTATGTTTTTATGTTTATTACATGTTATTTTAAGATTAATTAAATTACAGCATAGAAATATTGTACTTGTATTTGATATAGGATTTAGAAGGTTTGTTATATGGTATACAATAACTGTAAGAAATAGAAGAACATTTAGATCATAGTTAGTAGTTTGTTTTATAAAATGTATTGTAAACCATTAATGTATGTTGTTATGGTGTGGGTGGTTGGTTGGTTTGCCCTTAGAATATGTTAAGGACCAAAAAAATCAATAAAAGACATTTAAAACTAAATGGCCTCGTATACTGTCTATAAGGTGAACTAACCTTACCATTAGTATCAATCTGTCTTTAAGGGGGGGGTGGATGGGAGATGCACAACATCAGTAGACTGACTGGCCTGGTTGGTTGCTCTGCTTAATCAACCAGACCGCGTAGCGGTCTGGTTGATTAAGCGCAACCAACCAGGCCAGTCAGTCTACTGATGTTGTGCATCTCCCACCCACTCCCCCCTTAAAGACAGATTGATACTAATGGTAAGGTTAGTTCACCTTATAGACAGTATACGAGGCCATTTAG
| 30,221
|
ON024134.1
|
Pangolin protoparvovirus
|
Cao,W.-C., Hu,Y.-L., Jiang,J.-F., Shi,W., Shi,M., Que,T.-C., Cui,X.-M., Ye,R.-Z., Xia,L.-Y., Hou,X., Zheng,J.-J., Jia,N., Xie,X.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-06-16
| null |
Pangolin protoparvovirus
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,086
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Pholidota
| null |
2018
| null | null |
Pangolin protoparvovirus strain PPrV/P108T/pangolin/2018, complete genome
|
CGCCCACAATTAGCCCGCCACCTTTTCCCGCCCAAGTTTAAACACACAAACCGCCTATCATTCTTTAGAACCAACTGACCAAGGAGCGTACGTATGACGTGTGACTGCCGTAGGCAGCGCGCGCAGCGCGCGTCATCACGTCATACGTACGTGAACTTGGTCAGTTGGTTCTAAAGAATGATAGGCGGTTTGTGTGTTTAAACTTGGGCGGGAAAAGGTGGCGGGCTAATTGTGGGCGTGGTTAAAGGTATAAAAGACAAACCATAGACCGTTACTGACATTCGCTTCTTGTCTTTGACAGAGTGAACCTCTCTTACTTTGACTAACCATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTGAAGAGACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGTTTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGAGCTAACATCTTTAATTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCAGAAGTTGATAGCCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAGAACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAAAACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGTAAACTTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACATAAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTGTCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAGTATCAAGACAGACAAATTGTCAGTACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGCGGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAGACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGAAATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAACTAACTAACTTTGATCTTGCAAATTCTAGAACATGTCAAATTTTTAGGATGCATGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCATGTGTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAGCCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTGAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAATTTAATTTGGATTGAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAACAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAATTGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAGAATTGGATGCGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGTTAGTATGTAAACTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTGGTTAAACATGGTTTTGTATCAACCATGGCTAACTATACACATCATTGGGGAAAAGTGCCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTACAAAGACTTAAAGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGACGTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACGATCAAACCAACTTGGCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCAACGTGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACGATTGGAAGAAGACTTTCGAGACGACTTGGATTAAGGTACGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTGAGGTGGGGGGAGGGGAAGAATTTAATGACTTAACTAAGTATGTGTTTTTTTATAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACCAACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCTGGTAAAAACCCATACTTATATTTCTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTTTAGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAACCAACTAAAAGAAGTAGACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAAGCCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAATCTTGCACCAATGAGTGATGGAGCAGTTCAACCAGACGGTGGTCAGCCTGCTGTCAGAAATGAAAGAGCTACAGGATCTGGGAACGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTCAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTACATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACCCATGCACAAATTGTAACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAACACACACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTTTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAATACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCAAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATATCCAGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAAATGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAGCAGGAATTAACTATACTAATATATTTAATACTTATAGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCGCCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAGAATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAATTCAACAAATGAGTATTAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGAAAATTGTATATGAAAAATCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATACTAACATACTTACTATGTTTTTATGTTTATTACATGTTATTTTAAGATTAATTAAATTACAGCATAGAAATATTGTACTTGTATTTGATATAGGATTTAGAAGGTTTGTTATATGGTATACAATAACTGTAAGAAATAGAAGAACATTTAGATCATAGTTAGTAGTTTGTTTTATAAAATGTATTGTAAACCATTAATGTATGTTGTTATGGTGTGGGTGGTTGGTTGGTTTGCCCTTAGAATATGTTAAGGACCAAAAAAATCAATAAAAGACATTTAAAACTAAATGGCCTCGTATACTGTCTATAAGGTGAACTAACCTTACCATTAGTATCAATCTGTCTTTAAGGGGGGGGTGGGTGGGAGATGCACAACATCAGTAGACTGACTGGCCTGGTTGGTTGCTCTGCTTAATCAACCAGACCGCTACGCGGTCTGGTTGATTAAGCGCAACCAACCAGGCCAGTCAGTCTACTGATGTTGTGCATCTCCC
| 30,222
|
NC_005028.1
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Maoka,T., Hataya,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-07-10
| null |
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,155
|
RefSeq
| null | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Papaya leaf-distortion mosaic potyvirus, complete genome
|
AAAAAATATAAAAACTCAACAAAACTTATGCAAAACAATTTCAATACACACACTTAACTTTCATATTGTGCAATTCAAATCTTTGCATTAATTCAACATTTCCAGCTTTTAAAACGAATAACACACACAGACAACATGTCGATTGTTATTGGTGATTTTTCCATCCCACTCATCTGCAGAACTGAGCAGATTGAATGTGTTCGTCTTGTTCCTGGAACAAGAGTTGAAGAAGTGAAGACCATTAAAAAGGTCTTAAAAACACACTACCAAGAAATAACTCTTGGTTGTACTGATAGATGCGCGGGCCTGAGCGCATACACAAAAACCTCCCTTAAGAGAGCAATTAAGGAAAAGGATTTAACTGCATCTGGCAGTTGTTTCCACTGTGGCCTTAGAGCACAAATCGGAGAGGGTAGAAAAAGGGTAGAATTAGCACCCATTTCAGTCATGGAGGATGTTGAAACTGTGGAACAAGTACTTGTTCCATGTATGGTAGAAGAGAAGTATTATAAGGAAGTTTCGAATTTCCAGAAGGCTACGCTCATCGACAAACCAAAGCTAACTATAGCCCCAGTTTTAATGGCACAACCTGCCCAAGTGCCAAGGCCCGCTGTTTTTAATGAAATACGAAAAGTTCATGAGGAGATGAAGTCCCAAACCTCTGAAAACAAGGTCTTAGAAGAGGAAACTCAATGCGCCAGTGATGCAGCGCTTCACCACTTAGACGACGTTCATGCGTGTAGAGCTCGAGCACAGGTAGGCATTGAACGCATACTAGCCAGACATGCAAGGCATAGAATCGAGGCTAGACAGCAAGTTGAAGAGGAGCAATCGGAAGCATTAGCAGCGTTCGAATCCTTCTTCAATCAAACTCACAGAGAAGACAGATATGAAGGGAAAGTCTTAACCATTCGAAATGGGATCACAGGCTGGTTTGAACCAAATAGGAATGATATTAAGAACGCAGCTAGGCGGAGGAAGAGAGCTAACAAGAAAATCCCGTTTGTTGCACGTGAAAATGACGTCGCGCGGATAGAAACTCATGAACCTAACGTCAAAGAGGAGACAAAAGATGTGGAGGAAGCAACTGACACATACACATTTAAGAAGCAGCGCAATGATAAAAAGAGAGTGCTGAAAGAAAATGTGTCTCTTAGTATGGCGCGCATTAATGAACTTGTCCGATGTGTTACAAAATTATGCCGAAAAGATTCAAAGGAGCTTGAGTTTATCGGCAAGAGAGGAAGTCTTCGAGTTCAATGTACTAAAAATTGTGGTTCACGAGTGATACTAAGACACTTGCGTGGAGAACTTAGAAGAAAAGATTGTTATTGGGATCGTATCATTGAGAATTTCTTTGAAATTGCAGCTGCAAAGCTTCAGAATAAGAATCTCAATAACAATGAATCTGTGAGGAGAGGGCACAGTGGACATATCATTCAATATGATAAGTTTAGAGGTTTGAGTGGACGGCATTTCGGAAGTTACATCATTGTTAGGGGTAGCATGGATGGCAGAATTATTGACGCTCGTTCAAAGATCACACACAGCGTTATGATCAACATGACCCACTACAGTGATGCAGGTTTGAGTTTTTGGAAAGGTTTTGATCGTCAATTTATTGACATTCGAGATAGACCTAAGAACGCTCATGAGTGCAAGGCCACTATAAACGTTGAGGAGTGTGGCGAAATGGCAGCCATTGTAAACCAACTCCTATTTCCAATGTGGAAAATAACATGCACTCAATGTGGAGAACTGCTTGAAATGTTGTCACAAGAAGAGGAACTTGAATCTTTCAGGCGTAAAAGGAGCCAATTGGCAAGTAAATTATCCAGTCTTCATATCAAATTTCCTTACGTGGATCATTTTCTTAATCGATATGAGAATAGTCTGAATCGGATGAACACAAACTTCGATGCGCACAAACAAATTGCACAAATTATTGGCAGTCGCAAAGAGATTCCTTTTTCAAATTTAGAGCATCTGAATGAATTGCTAATTAAGTCGGATAAACTTGTTAGCGAGGATTTCTATGAAATGTCTCAATGCCTTTTAGAGCTAACACGCTGGCATAAAAACAGGAGCGATTCATTCAAGAAGGGAGAGATTCACCATTTCCGAAATAAGATGTCAGGTAAAGCACAATTTAATTTTGCATTGATGTGTGACAACCAACTTGACAAAAATGGTAACTTCGTGTGGGGTGAAAGAGGTTATCATGCGAAGAGGTTTTTCTTAAACTTCTTTGAGAAAGTTGATTCAACTGACGGTTATAAGAAACACATAATGCGAGTCAACCCAAATGGCACAAGACAAACAGCTATAGGAAAACTGATTTTATCGACGGATCCATCTACGCTACGACAACAAATGAAAGGTAGCCCAATCACAAGAGTTCCAGTTGGTAAATATTGTACAAGCAAAAGAGATGGTTGTTACGTCTATCCAGCATGCTGTGTTACAATGGAAGATGGTACGCCATTGTTTTCTGATATCAAGATGCCAACTAAGAATCATCTAGTCATTGGAAATTCAGGAGATCCAAAGTATGTGGATGTACCAAGCAGCTCAAGTGACATGATTGTGGCTAAGGAAGGTTATTGTTATCTCAACATTTTCTTGGCAATGTTGCTGAATGTGAATGAGAGTGAATCAAAATCATTCACAAAGAAGGTTAGAGATATAATTGTACCGCGTCTCGGTCAATGGCCAAGCTTAATCGATGTTGCAACTGAATGTTACTTCCTATCAGCCTTCCACCCTGAAACGAAAAATGCTGAGTTGCCCCGAATTCTAGTGGATCATACATCAAAATGTATGCATGTGATCGATTCATATGGCTCGCTAGACACGCAATTTCATGTTCTGAAGGCAAATACTGTAAGTCAGCTAATTAAATTCGCCGATAATGACTTGGATTCGGAGCTGAAACATTATTTAGTAGGTGGAGACCTCCATAGCAAGCAAGCTCCTCAGTGTTCCATAAAATTACTCTGTAAATGTATATATAGGCCTAAATTGATGAGGCAATGCATTGAGGAAGAGCCTTTTTTGTTGATTTTAGCGTGTATCTCACCAGGTGTTTTATTAGCTTTATATAATAGTCAGCATTTAGAATTAGCTTTAAAGTACTGGATGAGCAAGCAACAGTCTGTCGCTGCTTTATTTGCAATGATCCATGGACTAGCTGCAAAAGTAACAGTTGCTCAAACATTGAATGAGCAGAGACTAATACTTGAACGCGGGGCGCGCAATTTGATTTCGGTCATGGAAACCATACACATGACAAGCCATTCATACCAACCCGCGCTTCTTCAACTACAGGTCATGGCAAATCGTAGAGACATGAATTCCACTCTTGATCTCGCCGGATTCAGCATATTACAATCTGAAGATAGTATGTATTGGATGGAAAAAAGTTATCTCATGGAATTAGAGGATTCGTGGAACGACTTAAAGTGGTTGGAAAAATTACAAGAAATGTGGCGATTATCAAAGTACTCAATATCTGGGATAAGTCAACTTTCAATGAAAGGCGCTACCGATTTAGGCGGTCGATATTCAGTATCTGCAAAGCAGTTTATAACATCAGTGATGAAACCTGTCAAGAAATCTTGTGTAAAAGCAAGAGATACTTGTAAGGAAGTAATCATCAATACAACATCCTGGACATTTCGGGCAACATTTTCTTTGTGTAGGTGGTGCTTGCCTGATTGTTTGAAGTTTATAAACATGCTTATAGTTATAAGTTTGATTCTCAGCATTTGGCATTCAGCTAATTCTATATCGTTCGACTATGCACAAATGAAGAGAGAAAAGCAGGTGAATATCGAGAAAGTTCTGATGAATAATTTAGTGGCCCTTCATAAGGAGCAGATAAAGATCAATCCAGACCTGACAAAGGAAGAATTTAAGGAGTACATTGCAAGAAGTAGACCTGAGCTGATTGCATTAGTTAATAAAGAATTGCAAGAAGAAGTTGATCATCAAGCTAAGCGCAAAGGTGAACAAAACTTGGAGAAAATTATAGCATTTGTTGCCTTAGTTATGATGATTTTTGACTCAGAGAAAAGTGATTGTGTATATAAGACACTGAACAAATTGCGAAATCTCGTTGCCACATGTGATGAACCTGTCGCACATCAAAGCTTGGACGACATTCAAGACATCTTGACTGACAAAGAAACAACCATTGATTTCGACTTAGATTGTGAGGGGAGCAAAGTTACAGAGTTCAAGGAGATGAACTTTGCCGCATGGTGGGAAAAACAACTACAATGTGATAGAGTGGTACCCCATTATAGAACCACTGGGAAATTTATTGAATTCACTCGTGAAAGCTGTGTTAGTGTGAGTAACACAATATCTCATGCCCCTGAGAAAGAATGGATAGTCCGTGGTGGTGTTGGATCAGGAAAATCTACTGGTCTACCATTCGCGTTATCTAGTAAAGGCGCAGTTCTTATGCTCGAACCAACAAGACCATTGGCAGAGAATGTCTCACGACAGTTGAGACAACATCCCTTTTATGCAAACCCCACATTGAGAATGCGAGGAATGTCATCTTTTGGATCTAGTAATATATGTATAATGACTAGTGGATTTGCTTTCAATTACTTTGCAAATAATCCTCTAAAATTAAGTGATTTTGAATTTGTGATAATAGATGAGTGTCACGTCCTAGATAGCAACGCTATGGCATTCGTGTGTCTTCTCAAAGAACACAACTATGATGGCAAACTATTGAAAGTGTCAGCCACACCACAGGGCCGTGAATGTGAATTCCACACACAGCATCCAGTTTCCATTCATATAGAGGAACAACTTAGTTTCCAAGCTTTTTGTGAAGCTCAAGGAACTGGGTCTGCACGAGATGTAATCAATAAGGGAGACAACATTTTAGTGTATGTTGCTAGTTACAATGAGGTTGATCAGCTCTCAAAAATGCTCGGAGATAAAGGCTATTTAGTGACTAAAGTCGATGGGCGTACCATGAA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TTCTAGCACGCGTTAGTGAGGTTTTACCTCCTATTATCTATGTGTCAGTGAGGGTAGCCCTCGTGTGATCTCTTAGAAAGTATTGTCCCAAGCTGCAGTGGCTGGTTGTTCATAGCATGAGTGGCTCATGGACCTTCAGCCTAAGCAAGGAGGGA
| 8,478
|
OK570265.1
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Mo,C., Wu,Z., Guo,Y., Zhang,S., Li,P., Li,H.
|
South China Agricultural University, College of Plant Protection
|
China
|
2022-09-04
|
GD
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,153
|
GenBank
| null |
China: Guangzhou, Guangdong
|
China
|
Carica papaya
| null |
2017-02-20
| null | null |
Papaya leaf distortion mosaic virus isolate GD, complete genome
|
AAAAATATAAAAACTCAACAAAACTTATGCAAAACTATTTCAATACATACACTAAACTTCTGAATTGTGCAATTCAAATCTTTGCATCAACTCAATATTTTCAGCTTTTGAAACAAACAACGCTTACAGACAACATGTCGATCGTTATTGGTGATTTTTCTATTCCACTCACCTACAGAACTGAGCAGGTTGAATGTGTTCGTCTTGTTCCTGGAACAAGAGTTGAAGAAGTGAAGACCATTAAAAAGGTCTTAAAAACACACTACCAAGAAGTAACTCTTGGTTGTACTGATAGATGCGCGGGCCTGAGCGCATACACAAAAACCTCCCTTAAGAGAGCAATTAAGGAAAAGGATTTAACTGCATCTGGCAGCTGTATCTACTGTGGGCTTAGGGCACAAATTGGAGAGGGTAGGAAAAGGGTAGAATTAGTACCCATTTCAGTCATGGAGGATGTTGAAATTGTGGAACAAGTACTTGTTCCATGTATGGTAGAGGAGAAATATTATAAGGAAGTTTCGAATTTCCATAAGGCTACGCTCATCGACAGACCAAAGCTAACTATAGCCCCAGTTTTAATGGCACGACCTGCCCAAGTGCCGAAACCTGCTGTTTTTAATGGAGTACGAAAAGTTCATGAGGAGATGGAGTCCCAAACCTCTGAAAACAAGGTCTTAGAAGAGGAAATTCAATGCGTTGGTGATGCAGCGCTTCGCCACTTAGATGAAGTTTATGAGCGTAGAAAACGAGCGCAGGTAGGCATTGACCGCATACACGCCAGACATGCAAGGCATAGAACTGAGGCTAGACAGCAGGTTAACGAGGAGCAATCGGAAGCACTAGCAGCGTTCGAATCCTTCTTTAATCAAACTCACAGAGAGGATAAATATGAAGGGAAAATCTTAACCATTCGAAATGGGATCACAGGCTGGTTTGAACCAAATAGGCGTGATATTAAGAACGCAGCTAGGCGAAGAAAGAGAGCCAGCAAGAAAGCCTTGTCTGTTGCACGTGAAAATGACGTCATGCGGATTGAAACTCAAAAACCTAACATCAAAGAGGGAATAAAAGATGTGGAGGAAGTAACTGACACGTCTATATTTAAGAAGCAGCACAATAAGAAAAAGAGAGTGCTGAGAGAAAATGTGCCTCTTGGAATGGTGCGCATTAATGAACTCGTCCGATGTGTTACAAAATTATGCCGAAAAGACTCAAAGGAGCTTGAGTTTATCGGCAAGAGAGGAAGTCTTAAAGTTCAATGTACTAAAAATTGTGGTTCACGAGTGATATTAAGACACTTGCGTGGGGAACTTAGAAGAAAAGATTGTTATTGGGATCGTGTCATTGAGAATTTCTTCGAAATTGCAGCTGCAAAGCTCCGGAATAAGAATCTCAATAACAATGAATCTGTGAGGAGAGGGCACAGTGGACATATCATTCAATACGATAAGTTCAAAGGTTTAAGCGGACGGCATTTTGGAAGCTACATCATTGTTAGGGGTGATATGGATGGCAGAATCATTGACGCTCGTTCAAAGATCACACACAACGTTATGATCAATATGACCCACTACAGTGATGCAGGTTTAAGTTTTTGGAAAGGTTTCGACCGTCAATTTATTGACACTCGAGAAAAACCTAAGAACGCCCACGAGTGCAAAGCCACTATAAATGTTGAGGAGTGTGGCGAAATGGCAGCCATTGTAAACCAACTCCTATTTCCAATGTGGAAAATAACATGCACTCAATGTGGAGAACTGCTTGAAATGTTGTCGCAAGAGGAGGAACTTGAGTCTTTCAGGCGCAAAAGGAATCAATTGGCAAGTAAATTGTCCAGTCTTCATATCAAATTTCCTTATGTGGATCATTTTCTTAATCGATATGAAAATAGTCTGGACCGGATGAACACAAACTTCGATGCGCATAAACAAATTGCACAAATTAATGGCGGTCGCAAAGAGATTCCTTTTTCAAATTTAGAGCGTCTGAATGAATTGCTAATTAAGTCGGATAAGCTTGTTAGCAAGGATTTCTATGAAATGTCTCAATGCCTTTTAGAGCTAACACGCTGGCATAAAAACAGGAGCGATTCATTCAAGAAGGGAGAGATTCATCATTTCCGAAATAAGATGTCAGGCAAAGCACAATTTAATTTTGCATTGATGTGTGACAACCAGCTTGACAAAAATGGTAACTTCGTGTGGGGTGAAAGAGGTTATCATGCGAAGAGGTTTTTCTCAAACTTCTTTGAGAAAGTTGATTCAACTGACGGTTATAAGAAACACATAACGCGAGTCAACCCAAATGGCACACGACAAACAGCTATAGGAAAACTGATTTTATCGACGGATCCATCTACACTGCGACAACAGATGAAAGGCAACCCAGTCACAAGAGTTCCAGTTGGCAAATATTGTACAAGTAAAAGAGATAATTGTTACGTCTATCCAGCATGCTGTGTTACTATGGAAGATGGTACGCCATTGTTTTCAGATATCAAGATGCCAACTAAGAATCATCTAGTCATTGGGAATTCAGGAGATCCAAAGTATGTGGATGTACCGAGCAACTCAAGTGACATGATTGTAGCCAAGGAAGGTTATTGTTATCTCAACATTTTCTTGGCAATGTTGCTGAATGTGAATGAAAGTGAATCAAAATCATTCACAAAGAAGGTTAGAGATATAATTGTGCCGCGTCTCGGTCAGTGGCCAAGCTTAATTGATGTTGCAACCGAATGTTACTTCCTATCAGCCTTTCACCCTGAAACGAAAAATGCTGAGCTACCTCGAATCCTGGTGGATCATACGTCAAAATGTATGCATGTGATCGATTCATATGGTTCGCTAGATACTCAATTTCATGTTCTAAAGGCAAATACTGTAAGTCAGCTCATTAAATTCGCAGATGATGACTTGGATTCGGAGATGAAACATTATTTAGTAGGTGGAGACCTCCATAGTAAGCAAGTGCCTCAGTGTTCCATAAAATTACTTTGTAGATGTATATATAGGCCTAAATTGATGAGGCAATGCATTGAGGAAGAACCTTTTTTATTAATTTTAGCGTGTATCTCACCAGGCGTCTTATTAGCTTTATATAATAGTCAACATTTAGAATTAGCTTTAAAGTACTGGATGAGTAAGCAACAATCTGTCGCTGCTTTATTTGCAATGATCCATGGATTAGCCGCAAAAGTGACAGTTGCTCAAACATTGAATGAGCAGAGGTTAATACTTGAGCACGGAGCGCGCAATTTGATTTCAGTCATGGAAGCCATACACATGACAAACCATTCATACCAACCCGCGCTTCTTCAACTACAGGTCATGGCAAATCGTAGAGACATGAATTCCGCTCTTGATCTCGCTGGATTCAGCATATTACAATCTGAAGATAGTATGTATTGGATGGAAAAAAGCTATCTCATGGAATTAGAGGATTCGTGGAACGACTTAAAGTGGTTGGAAAAATTACGAGAAATGTGGCGATTGTCAAAGTACTCAATATCTGGGATAAGTCAACTTTCAATGAAAGGCGCTACCGATTTAGGCGGTCGATATTCAGTATCTGCAAAGCAGTTTATGACATCAGTGATGAAACCTGTCAAGAAATCTTGTGTAAAAGCAAGAGATACTTGTAAGGAAGTAATCATCAATACAACATCTTGGACATTTCGGGCAACATTCTCTTTGTGTAAGTGGTGCTTGCCTGATTGTTTGAAGTTTATAAACATGCTTATAGTTATAAGTTTGATTCTCAGCATTTGGCATTCAGCTAATTCCATATCATTCGATTATGCACAAATGAAGAGAGAAAAGCAGGTAAATGTCGAGAAAATTCTGATGAATAATTTAGTGGCCCTTTATAAGGAACAGATAAAGATTAATCCAGATCTGACAAAGGAAGAATTTAAGGAATACATTGCAAGAAGTAGACCTGAGCTGATCACATTAGTTAACAAGGAATTGCAAGAAGAAGTTGATCACCAAGCTAAGCGGAAAGGTGAACAAAATTTGGAGAAAATTATAGCATTTGTCGCTTTAGTTATGATGATCTTTGACTCGGAGAAAAGTGATTGCGTATATAAGACACTGAACAAATTGCGAAATCTCGTAGCCACATGTGATGAACCTGTCGCACATCAAAGCTTGGACGACATTCAAGACATTTTGACTGACAAAGAAACAACCATTGATTTCGACTTAGATTGTGAGGGGAGCAAAGTTACAGAGTTCAAGGAGATGAACTTTGCCGCATGGTGGGAAAAACAACTACAATATGATAGAGTGGTACCCCATTACAGGACAACTGGGAAATTTATTGAATTCACTCGTGAAAGCTGTGCTAGCGTGAGTAACACAATATCTCATGCCCCTGAGAAAGAATGGATAGTCCGTGGTGGTGTCGGATCAGGAAAATCTACTGGTCTACCATTTGCGTTATCTAGTAAAGGTGCAGTTCTTATGCTCGAACCAACGAGACCATTGGCAGAGAATGTCTCACGACAGTTGAGACAACATCCCTTCTATGCAAACCCCACATTGAGAATGCGAGGAATGTCAACTTTTGGATCCAGTAATATATGTATAATGACTAGTGGATTTGCCTTCAATTATTTTGCAAATAACCCTTTAAAATTAAGTGATTTTGAATTTGTGATAATAGATGAGTGTCACGTCCTAGATAGTAACGCTATGGCATTTGTGTGTCTTCTCAAAGAGCACAACTACGATGGCAAATTATTGAAAGTGTCAGCCACACCACAGGGTCGTGAATGTGAATTCCACACACAGCATCCGGTTTCCATTCATATAGAGGAACAACTTAGTTTCCAAGCTTTTTGCGAAGCTCAAGGAACTGAGTCTGCACGAGATGTAATCAATAAGGGGGATAACATTTTAGTGTATGTCGCAAGTTACAATGAGGTTGATCAGCTCTCAAAAATGCTCGGAGACAAAGGCTATTTAGTAACTAAAGTCGATGGGCGCACCATGAAA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| 25,827
|
MG197985.2
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Peng,B., Gu,Q.
|
Chinese Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou Fruit Research Institute
|
China
|
2017-12-20
|
XX7
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,152
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Cucurbita moschata
| null |
2017-07-27
| null | null |
Papaya leaf distortion mosaic virus isolate XX7, complete genome
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| 72,976
|
KT633944.1
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Liu,F., Shen,W.T., Tuo,D.C., Yan,P., Zhou,P.
|
Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology
|
China
|
2016-02-06
|
PLDMV-LM
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,153
|
GenBank
| null |
China: Hainan, Lingshui
|
China
|
Carica papaya
| null |
2015-05-01
| null | null |
Papaya leaf distortion mosaic virus isolate PLDMV-LM, complete genome
|
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| 83,863
|
JX974555.1
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Shen,W., Tuo,D., Yan,P., Li,X., Zhou,P., Tuo,D.C., Shen,W.T.
|
Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Papaya Biotechnology Laboratory
|
China
|
2013-01-20
|
HaiNan-DF
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,153
|
GenBank
| 1
|
China: Hainan, Dongfang
|
China
|
Carica papaya
| null |
2012-08-08
| null | null |
Papaya leaf distortion mosaic virus isolate HaiNan-DF, complete genome
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| 95,340
|
JX416282.1
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Wu,P.-H., Hung,T.-H., Chang,L.-S.
|
National Taiwan University, Plant Pathology and Microbiology
|
Taiwan
|
2012-10-03
|
Taiwan-CZ
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,154
|
GenBank
| null |
Taiwan: Pingtong
|
Taiwan
|
Carica papaya
|
plant leaf
| null | null | null |
Papaya leaf distortion mosaic virus isolate Taiwan-CZ, complete genome
|
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| 96,156
|
EU233272.1
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Yang,H.-Y., Chang,L.-S., Lee,Y.-H., Liu,T.-C., Hung,T.-H.
|
National Taiwan University, Plant Pathology and Microbiology
|
Taiwan
|
2007-11-07
|
Taiwan-KS
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,153
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
| null | null | null | null | null |
Papaya leaf distortion mosaic virus isolate Taiwan-KS, complete genome
|
AAAAATATAAAAACTCAACAAAACTTATGCAAAACAATTTCAACACACACGCTAAACTTTCAGATTGCGCAATTCAAATCTTTGCATTAAATCACTATTTTCGGTTTTTGAAGCAAACAACGCACATAGATAACATGTCGATTGTTATTGGTGATTTTTCTGTCCCACTCACCTGCAGAACTGAGCAGGTTGAACGTGTTCGCCTTGTTCCTGGAACAAGAGTTGAAGAAGTGAAGACCATTAAAAAGGTCCTAAAAACACACTACCAAGAAGTAACTCTTGGTTGTACTAATAGATGCGCGGGCCTGAGCGCATACACAAAAACCTCCCTTAAGAGAGCAATTAAGGAAAAGGATTTAACTGCATCTGGCAGCTGTTTTCACTGTGGGCTTAGAGCTCAAATTGGAGAGGGTAGGAAAAGGGTAGAATTAGTACCCATTTCAATCATGGAGGATGTTGAGACTGTGGAACAAGTACTTGTTCCATGTATGGTAGAAGAGAAGTATTATCAGGAAATTCAGAATTTCCAGAAGGCTACGCTCATCAACAGACCAAAGCTAACTGTAGCCCCAGTTTTAATGGCACAACCTGCTCAAGTGCCGAAGCCCGCTGTTTTTAATGGAATACAAAAAGTTCATGAAGAGATGAAGTCCCACAACTCTGAAGACAAGGTCTTAGAAGAGGAAACTCAATGCGCTGGTGATGTAGCGCTTCGCCACTTAAATGAAGTTTCTGTGCGTAGAGAACGAGCGCAGGCAGGCATTGAACGCATACTAGCCAGACATGCAAGGCATAAAATTGAGGCTACACAGCAAGTTGAAGAGGAGCAATCGGAAGCATTAGCAGCGTTCGAGTCCTTCTTCAATCAAACTCACAGAGAGGATAAATATGAAGGGAGAATCTTAACCATTCGAAATGGGATCACGGGCTGGTTTGAACCAAATAAGCGTGATATCAAGAACGCAGCTAGACGGAGGAAGAGAGCCAACAAGAAAGCCCTGTTTGCTGCGCGTGAAAATGATGTCACGCGGATTGAAACTCATGAACCTAATGTCAAAGAGGAGACAAAAGACGTGGAAGAAGCAACTGACACGCACACATTTAAGAAGCAGCACAATGAAAGAAGGAGAGTGCTGAAAGAAAATGTGCCTCTCGGCATGGTGCGCATTAATGAACTTGTCCGATGTGTTGCAAAATTATGCCGAAAAGACTCAAAGGAGCTTGAGTTTATCGGCAAGAGAGGAAGTCTTCGAATTCAATGCACTAAAAATTGTAGTCCACGAGTGATACTAAGACACTTGCGTGGTAAACTCAGGAGAAAAGATTGCTACTGGGATCGTGTCATTGAGAATTTCTTCGAAATTGCAGCTGCAAAACTTCAGAATAAGAATCTCAATAACAATGAATCTGTGAGGAGAGGGCATAGTGGACATATCATTCAATATGATAAGTTTAAAGGTTTGAGTGGACGACATTTTGGAAGTTACATCATTGTTAGGGGTGACATGGATGGCAGAATTATTGACGCTCGTTCAAAGATTACACACAATGTTATGATTAATATGACCCACTACAGTGATGCAGGTTCGAGTTTTTGGAAAGGTTTCGACCGTCAATTTATTGCCACTCGAGATAGACCTAAGAACGCTCATGAGTGCAAGGCTACTATAAACGTTGAGGAGTGTGGTGAAATGGCAGCCATTATAAACCAACTCCTATTTCCAATGTGGAAAATAACATGCACTCAGTGTGGAGAACTGCTTGAAATGTTGTCACAAGAAGAGGAACTTGAATCTTTCAGGCGTAAAAGGAACCAATTGGCAAGTAAATTATCCAGTCTCCATAACAAATTTCCTTACGTGGATCATTTTCTTAATCGATATGAGAATAGTCTGGATCAGATGAACACAAACTTCGATGCGCACAAACAAATTGCACAAATCATTGGCGGTCGCAAAGAAATTCCTTTTTCAAATTTAGGGCGTCTGAATGAATTGCTAATTAAATCGGATAAACTTGTTAGCGAGGATTTCTATGAAATGTCTCAATGCCTTTTAGAGCTAACACGCTGGCACAAAAACAGGAGCGATTCATTCAAGAAGGGAGAGGTTCACCATTTCCGAAATAAGATATCAGGTAAGGCACAATTTAATTTTTCATTGATGTGTGACAACCAACTTGACAAAAATGGCAACTTCGTGTGGGGTGAAAGAGGTTATCACGCGAAGAGGTTTTTCTCAAATTTTTTTGAGAAAGTTGATTCGACTGATGGTTATAAGAAACACATAATGCGAGTCAACCCAAATGGTACAAGACAGACAGCTATAGGAAAACTGATTTTATCGACAGATCCATCGACGCTGCGACAACAGATGAAAGGTAACCCAATCACAAGAGTTCCAGTTGGCAAACACTGTACAAGTAAAAGAGATGATTGTTACGTCTATCCAGCGTGCTGTGTAACAATGGAAGATGGTACGCCATTATTTTCTGATATCAAGATGCCGACTAAGAATCATCTAGTCATTGGGAATTCAGGAGATCCAAAGTATGTGGATGTACCGAGCAGCTCAAGTGACATGATTGTGGCTAAGGAAGGTTATTGTTATCTCAACATTTTCTTGGCAATGTTGCTGAATGTGAATGAGAGTGAATCAAAATCATTCACAAAGAAGGTTAGAGATATAATCGTGCCGCGTCTTGGTCAGTGGCCAAGCTTAATTGATGTTGCAACTGAATGTTACTTCCTATCAGCCTTCCACCCTGAAACGAAAAATGCTGAGCTACCTCGAATTCTAGTGGATCATACGTCAAAATGTATGCATGTGATCGATTCATATGGTTCGCTAGACACCCAATTTCATGTTCTTAAGGCAAACACTGTAAGTCAGCTAATTAAATTTGCCGATGATGACTTGGATTCGGAGATGAAACATTATTTAGTAGGTGGAGACCTCCATAGCAAGCAAGTTCCTCAGTGTTCCATAAAATTACTTTGTAGATGTATATATAGACCTAAATTGATGAGGCAATGTATTGAGGAAGAACCTTTTTTATTAATTTTAGCGTGTATCTCACCAGGTGTCTTATTAGCTTTATATAATAGTCAGCATTTAGAATTAGCTTTAAAGTACTGGATGGGTAAGCAACAATCTGTCGCTGCTTTATTTGCAATGATTCACGGATTAGCCGCAAAAGTAACAGTTGCTCGAACATTGAATGAGCAAAGATTAATACTTGAGCACGGAGCGCGCAATTTGATTTCGGTCATGGAAGCCATACATATGACAAGCCATTCATACCAACCCGCGCTTCTTCAACTACAGGTCATGGCAAATCGTAGAGACATGAATTCCACTCTTGATCTTGCCGGATTCAGCATATTACAATCTGAAGATGGTATGTATTGGATGGAAAAAAGCTATCTCATGGAATTAGAGGATTCATGGAACGACTTAAAGTGGTTGGAAAAATTACAAGAAATGTGGCGATTGTCAAAGTACTCAATATCTGGGATAAGTCAACTTTCAATGAAAGGCGCTACCGATTTAGGCGGTCGATATTCAGTATCTGCAAAGCAGTTTATAACATCAGTGACGAAACCTGTCAAGAGATCTTGTGTAAAAGCAAGAGATACTTGTAAGGAGGTAATCATCAATACAACATCCTGGACATTTCGGGCAACATTCTCTTTGTGTAAGTGGTGCTTGCCTGATTGTTTGAAGTTTATAAACATGCTTATAGTTATAAGTTTGATTCTCAGCATTTGGCATTCAGCTAATTCTATATCATTCGATTATGCACAAATGAAGAGAGAAAAGCAGGCGAACATCGAGAAAATTTTGATGAATAATCTAGTGGCCCTTCATAAGGAACAGATAAAGATTAATCCAGACCTGACAAAGGAAGAATTTAAGGAGTACATTGCAAGGAATAGACCTGAGCTGATTGCATTAGTTGATAAAGAATTGCAAGAAGGAGTTGGTCACCAAGCTAAGCGCAAAAGTGAACAAAATTTGGAGAAAATAATAGCATTTGTTGCCTTAGTTATGATGATTTTTGACTCGGAGAAAAGTGATTGCGTATACAAGACACTGAACAAATTGCGAAATCTCGTTGCCACATGTGATGAACCTGTTGCACATCAAAGCTTGGATGACATTCAAGACATTTTGACTGACAAAGAAACAACCATTGATTTCGACTTAGATTGTGAGGGGAGCAAAGTTACAGAGTTCAAGGAGATGAACTTTGCCGCATGGTGGGAAAAACAACTACAATATGATAGAGTGGTACCTCATTACAGAACCACTGGGAAATTTATCGAATTCACTCGTGAAAGCTGTGCTAGTGTGAGTAACACAATATCTCACGCCCCTGAAAAAGAATGGATAGTCCGTGGTGGTGTCGGATCAGGAAAATCTACCGGTCTACCATTCGCATTATCTAGCAAAGGCGCAGTTCTCATGCTCGAACCAACAAGACCATTGGCAGAGAATGTCTCACGACAGTTGAAACAACATCCCTTCTATGCAAACCCCACATTGAGAATGCGAGGAATGTCAGCTTTTGGATCAAGTAATATATGTATAATGACTAGTGGATTTGCTTTCAATTACTTTGCAAATAACCCTTTAAAATTAAGTGATTTTGAATTTGTGATAATAGATGAGTGTCACGTCCTAGATAGCAACGCTATGGCATTCGTGTGTCTTCTCAAAGAGCACAATTATGATGGCAAATTATTGAAAGTGTCAGCCACACCACAGGGCCGTGAATGTGAATTCCACACACAGCACCCAGTTTCTATTCATATAGAGGAACAACTTAGTTTCCAAGCTTTTTGTGAAGCTCAAGGAACTGGGTCTGCACGAGATGTAATCAATAAGGGTGATAACATTTTAGTGTATGTTGCTAGTTACAATGAGGTTGATCAGCTTTCAAAAATGCTCGGAGATAAAGGCTATTTAGTGACTAAAGTTGACGGGCGCACCATGAAA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| 106,609
|
AB088221.1
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Maoka,T., Kashiwazaki,S., Tsuda,S., Usugi,T., Hibino,H., Hataya,T.
|
Plant Virology Lab.; Hitsujigaoka 1, Toyohira, Sapporo 0628555
|
Japan
|
2003-07-24
|
J56P
|
Papaya leaf distortion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,153
|
GenBank
| 2
|
Japan: Okinawa, Ishigaki
|
Japan
|
Carica papaya
| null | null | null | null |
Papaya leaf distortion mosaic virus genomic RNA, complete genome, strain: P
|
AAAAATATAAAAACTCAACAAAACTTATGCAAAACAATTTCAATACACACACTTAACTTTCATATTGTGCAATTCAAATCTTTGCATTAATTCAACATTTCCAGCTTTTAAAACGAATAACACACACAGACAACATGTCGATTGTTATTGGTGATTTTTCCATCCCACTCATCTGCAGAACTGAGCAGATTGAATGTGTTCGTCTTGTTCCTGGAACAAGAGTTGAAGAAGTGAAGACCATTAAAAAGGTCTTAAAAACACACTACCAAGAAATAACTCTTGGTTGTACTGATAGATGCGCGGGCCTGAGCGCATACACAAAAACCTCCCTTAAGAGAGCAATTAAGGAAAAGGATTTAACTGCATCTGGCAGTTGTTTCCACTGTGGCCTTAGAGCACAAATCGGAGAGGGTAGAAAAAGGGTAGAATTAGCACCCATTTCAGTCATGGAGGATGTTGAAACTGTGGAACAAGTACTTGTTCCATGTATGGTAGAAGAGAAGTATTATAAGGAAGTTTCGAATTTCCAGAAGGCTACGCTCATCGACAAACCAAAGCTAACTATAGCCCCAGTTTTAATGGCACAACCTGCCCAAGTGCCAAGGCCCGCTGTTTTTAATGAAATACGAAAAGTTCATGAGGAGATGAAGTCCCAAACCTCTGAAAACAAGGTCTTAGAAGAGGAAACTCAATGCGCCAGTGATGCAGCGCTTCACCACTTAGACGACGTTCATGCGTGTAGAGCTCGAGCACAGGTAGGCATTGAACGCATACTAGCCAGACATGCAAGGCATAGAATCGAGGCTAGACAGCAAGTTGAAGAGGAGCAATCGGAAGCATTAGCAGCGTTCGAATCCTTCTTCAATCAAACTCACAGAGAAGACAGATATGAAGGGAAAGTCTTAACCATTCGAAATGGGATCACAGGCTGGTTTGAACCAAATAGGAATGATATTAAGAACGCAGCTAGGCGGAGGAAGAGAGCTAACAAGAAAATCCCGTTTGTTGCACGTGAAAATGACGTCGCGCGGATAGAAACTCATGAACCTAACGTCAAAGAGGAGACAAAAGATGTGGAGGAAGCAACTGACACATACACATTTAAGAAGCAGCGCAATGATAAAAAGAGAGTGCTGAAAGAAAATGTGTCTCTTAGTATGGCGCGCATTAATGAACTTGTCCGATGTGTTACAAAATTATGCCGAAAAGATTCAAAGGAGCTTGAGTTTATCGGCAAGAGAGGAAGTCTTCGAGTTCAATGTACTAAAAATTGTGGTTCACGAGTGATACTAAGACACTTGCGTGGAGAACTTAGAAGAAAAGATTGTTATTGGGATCGTATCATTGAGAATTTCTTTGAAATTGCAGCTGCAAAGCTTCAGAATAAGAATCTCAATAACAATGAATCTGTGAGGAGAGGGCACAGTGGACATATCATTCAATATGATAAGTTTAGAGGTTTGAGTGGACGGCATTTCGGAAGTTACATCATTGTTAGGGGTAGCATGGATGGCAGAATTATTGACGCTCGTTCAAAGATCACACACAGCGTTATGATCAACATGACCCACTACAGTGATGCAGGTTTGAGTTTTTGGAAAGGTTTTGATCGTCAATTTATTGACATTCGAGATAGACCTAAGAACGCTCATGAGTGCAAGGCCACTATAAACGTTGAGGAGTGTGGCGAAATGGCAGCCATTGTAAACCAACTCCTATTTCCAATGTGGAAAATAACATGCACTCAATGTGGAGAACTGCTTGAAATGTTGTCACAAGAAGAGGAACTTGAATCTTTCAGGCGTAAAAGGAGCCAATTGGCAAGTAAATTATCCAGTCTTCATATCAAATTTCCTTACGTGGATCATTTTCTTAATCGATATGAGAATAGTCTGAATCGGATGAACACAAACTTCGATGCGCACAAACAAATTGCACAAATTATTGGCAGTCGCAAAGAGATTCCTTTTTCAAATTTAGAGCATCTGAATGAATTGCTAATTAAGTCGGATAAACTTGTTAGCGAGGATTTCTATGAAATGTCTCAATGCCTTTTAGAGCTAACACGCTGGCATAAAAACAGGAGCGATTCATTCAAGAAGGGAGAGATTCACCATTTCCGAAATAAGATGTCAGGTAAAGCACAATTTAATTTTGCATTGATGTGTGACAACCAACTTGACAAAAATGGTAACTTCGTGTGGGGTGAAAGAGGTTATCATGCGAAGAGGTTTTTCTTAAACTTCTTTGAGAAAGTTGATTCAACTGACGGTTATAAGAAACACATAATGCGAGTCAACCCAAATGGCACAAGACAAACAGCTATAGGAAAACTGATTTTATCGACGGATCCATCTACGCTACGACAACAAATGAAAGGTAGCCCAATCACAAGAGTTCCAGTTGGTAAATATTGTACAAGCAAAAGAGATGGTTGTTACGTCTATCCAGCATGCTGTGTTACAATGGAAGATGGTACGCCATTGTTTTCTGATATCAAGATGCCAACTAAGAATCATCTAGTCATTGGAAATTCAGGAGATCCAAAGTATGTGGATGTACCAAGCAGCTCAAGTGACATGATTGTGGCTAAGGAAGGTTATTGTTATCTCAACATTTTCTTGGCAATGTTGCTGAATGTGAATGAGAGTGAATCAAAATCATTCACAAAGAAGGTTAGAGATATAATTGTACCGCGTCTCGGTCAATGGCCAAGCTTAATCGATGTTGCAACTGAATGTTACTTCCTATCAGCCTTCCACCCTGAAACGAAAAATGCTGAGTTGCCCCGAATTCTAGTGGATCATACATCAAAATGTATGCATGTGATCGATTCATATGGCTCGCTAGACACGCAATTTCATGTTCTGAAGGCAAATACTGTAAGTCAGCTAATTAAATTCGCCGATAATGACTTGGATTCGGAGCTGAAACATTATTTAGTAGGTGGAGACCTCCATAGCAAGCAAGCTCCTCAGTGTTCCATAAAATTACTCTGTAAATGTATATATAGGCCTAAATTGATGAGGCAATGCATTGAGGAAGAGCCTTTTTTGTTGATTTTAGCGTGTATCTCACCAGGTGTTTTATTAGCTTTATATAATAGTCAGCATTTAGAATTAGCTTTAAAGTACTGGATGAGCAAGCAACAGTCTGTCGCTGCTTTATTTGCAATGATCCATGGACTAGCTGCAAAAGTAACAGTTGCTCAAACATTGAATGAGCAGAGACTAATACTTGAACGCGGGGCGCGCAATTTGATTTCGGTCATGGAAACCATACACATGACAAGCCATTCATACCAACCCGCGCTTCTTCAACTACAGGTCATGGCAAATCGTAGAGACATGAATTCCACTCTTGATCTCGCCGGATTCAGCATATTACAATCTGAAGATAGTATGTATTGGATGGAAAAAAGTTATCTCATGGAATTAGAGGATTCGTGGAACGACTTAAAGTGGTTGGAAAAATTACAAGAAATGTGGCGATTATCAAAGTACTCAATATCTGGGATAAGTCAACTTTCAATGAAAGGCGCTACCGATTTAGGCGGTCGATATTCAGTATCTGCAAAGCAGTTTATAACATCAGTGATGAAACCTGTCAAGAAATCTTGTGTAAAAGCAAGAGATACTTGTAAGGAAGTAATCATCAATACAACATCCTGGACATTTCGGGCAACATTTTCTTTGTGTAGGTGGTGCTTGCCTGATTGTTTGAAGTTTATAAACATGCTTATAGTTATAAGTTTGATTCTCAGCATTTGGCATTCAGCTAATTCTATATCGTTCGACTATGCACAAATGAAGAGAGAAAAGCAGGTGAATATCGAGAAAGTTCTGATGAATAATTTAGTGGCCCTTCATAAGGAGCAGATAAAGATCAATCCAGACCTGACAAAGGAAGAATTTAAGGAGTACATTGCAAGAAGTAGACCTGAGCTGATTGCATTAGTTAATAAAGAATTGCAAGAAGAAGTTGATCATCAAGCTAAGCGCAAAGGTGAACAAAACTTGGAGAAAATTATAGCATTTGTTGCCTTAGTTATGATGATTTTTGACTCAGAGAAAAGTGATTGTGTATATAAGACACTGAACAAATTGCGAAATCTCGTTGCCACATGTGATGAACCTGTCGCACATCAAAGCTTGGACGACATTCAAGACATCTTGACTGACAAAGAAACAACCATTGATTTCGACTTAGATTGTGAGGGGAGCAAAGTTACAGAGTTCAAGGAGATGAACTTTGCCGCATGGTGGGAAAAACAACTACAATGTGATAGAGTGGTACCCCATTATAGAACCACTGGGAAATTTATTGAATTCACTCGTGAAAGCTGTGTTAGTGTGAGTAACACAATATCTCATGCCCCTGAGAAAGAATGGATAGTCCGTGGTGGTGTTGGATCAGGAAAATCTACTGGTCTACCATTCGCGTTATCTAGTAAAGGCGCAGTTCTTATGCTCGAACCAACAAGACCATTGGCAGAGAATGTCTCACGACAGTTGAGACAACATCCCTTTTATGCAAACCCCACATTGAGAATGCGAGGAATGTCATCTTTTGGATCTAGTAATATATGTATAATGACTAGTGGATTTGCTTTCAATTACTTTGCAAATAATCCTCTAAAATTAAGTGATTTTGAATTTGTGATAATAGATGAGTGTCACGTCCTAGATAGCAACGCTATGGCATTCGTGTGTCTTCTCAAAGAACACAACTATGATGGCAAACTATTGAAAGTGTCAGCCACACCACAGGGCCGTGAATGTGAATTCCACACACAGCATCCAGTTTCCATTCATATAGAGGAACAACTTAGTTTCCAAGCTTTTTGTGAAGCTCAAGGAACTGGGTCTGCACGAGATGTAATCAATAAGGGAGACAACATTTTAGTGTATGTTGCTAGTTACAATGAGGTTGATCAGCTCTCAAAAATGCTCGGAGATAAAGGCTATTTAGTGACTAAAGTCGATGGGCGTACCATGAAA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Papaya mosaic virus
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|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-04-29
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Papaya mosaic virus
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| 9,034
|
MN203139.1
|
Papaya mosaic virus
|
Alcala-Briseno,R.I.I., Casarrubias-Castillo,K., Lopez-Ley,D., Garrett,K.A., Silva-Rosales,L.
|
Centro de Investigacion y Estudios Avanzados del IPN, Genetic Engineering
|
Mexico
|
2020-01-04
|
PapMV.PC-VA
|
Papaya mosaic virus
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,623
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Carica papaya
| null |
2014-09-24
| null | null |
Papaya mosaic virus isolate PapMV.PC-VA, complete genome
|
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Alcala-Briseno,R.I.I., Casarrubias-Castillo,K., Lopez-Ley,D., Garrett,K.A., Silva-Rosales,L.
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Centro de Investigacion y Estudios Avanzados del IPN, Genetic Engineering
|
Mexico
|
2020-01-04
|
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Papaya mosaic virus
|
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Alphaflexiviridae
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|
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Mexico
|
Mexico
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|
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|
Centro de Investigacion y Estudios Avanzados del IPN, Genetic Engineering
|
Mexico
|
2020-01-04
|
PapMV.CD-W
|
Papaya mosaic virus
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
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| 6,563
|
GenBank
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Mexico
|
Mexico
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2014-09-23
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|
Papaya mosaic virus
|
Chen,W.Y.
|
Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences
|
China
|
2012-10-28
|
PMV-HN
|
Papaya mosaic virus
|
Potexvirus
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Alphaflexiviridae
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ssRNA(+)
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|
GenBank
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China
|
China
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Carica papaya
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|
2007-01-01
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|
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Papaya mosaic virus
|
Potexvirus
|
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|
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|
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|
NC_001785.1
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Papaya ringspot virus
|
Wang,C., Bau,H., Yeh,S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1992-12-03
| null |
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
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|
RefSeq
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| 9,058
|
OQ335837.1
|
Papaya ringspot virus
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute Dsmz - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2023-06-21
|
DSMZ PV-0401
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,326
|
GenBank
| null |
Italy: Campania
|
Italy
|
Cucurbita pepo
| null | null | null | null |
Papaya ringspot virus isolate DSMZ PV-0401, complete genome
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| 15,044
|
OL677454.1
|
Papaya ringspot virus
|
Udavatha,P., Mesta,R.K., Basavarajappa,M.P., Venkataravanappa,V., Devappa,V., Narasimha Reddy,L.R.C., Shankarappa,K.S., Premchand,U.
|
University of Horticultural Sciences, Bagalkot, Department of Plant Pathology
|
India
|
2023-01-23
|
Bagalkote
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,341
|
GenBank
| null |
India: Karnataka,Bagalkot
|
India
|
Carica papaya
|
plant leaf
|
2021-03
| null | null |
Papaya ringspot virus isolate Bagalkote, complete sequence
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AAATAAAACATCTCAACACAACACAATTCGAAGCAACCAAACAAATTTAAGCACTTTCTACTTACAAATCTCATTATCTGAAATCATGTCTTCGTTATATCAATTGCAACCAATTGCACTGAAAGACCGTCTGTTAGGTCATAAGGAAGGAAGCGGAGGGATCGAGCATAAGCTCGAGAGAAAGGGAGATAGAGGAAATACTCGCCATGTTGGTGAGTTTGTTATAAGTGAAGGAGCTAAAATCCTTCAGCTTATTCAAATTGGCGATGCTGAAATTGGAAGGACCTTCCTGGGAGGTGATCGGCGAGTCCGCGCCGATGTTTTTGAAATCGTTAAGAAGACGATGGTTGGCTGCCTGGGCTACAACTTTGAAAGTGAATTATGGTTTTGCCATTCATGCGATAAGACTTCTGACAAGTATTTTAAGAAATGTGACTGCGGAGATAAGTATTACTACTCCGAGAGGAATTTGATGAAAACGCTACAAGATTTGATGTATCAATTTGACATGACCCCATCTGAAATCGACGCAGTTGGATATGATTATCTAGCTGACGCGGTTGATTTTGCTGAACGATCTGTCAAGGAACCTCAAGTCGTGAAATCTGTGGAGCCTGAGGTGTCGAAACTTGTGAAATCTGATGAAGGAACCCTGGCGACGCCTAAGCCTGGATCACCATTAATCACCACGAAACAGGAAGATGCTTGGACAATACAAATTGGAGAAATCTCTGTTCCAATTGTTGTCATCAAGGAAACACTGGTGGTTAAGGGAATCACAAGCAATTTTGATTCTATTGGTTTTCAGCGTAGAAATGAAATTGGTAGGCCAGTAGAAAACGAAGTTCCTCAAGAAAAATTGAAAGAAGCAGTGCACCTAGCACTTGAAGTTGGTAATGAAATTGCGGAAAAGAAACCTGTAATCAAGGGAACACCGGCTGGGAGCGCTAGCCCTGAGTTTCAGGAAGAAATTCGAAAGCATAAGGAGCATGCTAAGATTGCAGCAATTCAAGTTCAAAAGGAAAAAGAAAAGCACCAAGAGATATTCTCTGCTCTGGAGTCAAAGCTGAACTTAAAGGCTAGGAGGAAAAATCAAACTGTATTCTGTGACAAAAGAGGCACACTTAGATGGAGGACCCGACAAGGTCATAAGAAGAATAAACTGATACAACAAGTGAGTGACCACATCGTTACTCAAATCCAATGTGATTTTGGTTGTAAGGCTCGGTACTTTGAACCCCACCTTCCTGGTATTAAGCGGGCTACATCTAAGAAGGTCCACAAATCATGTAAGCAATTGAGGATTGTTGGTAACAACAAGATAAATTATGTCATGAAAAATCTGTGTGACATAATTATCGAAAGAAGCATTCCTGTGGAGCTCATCACAAAGCGATGCAAGAGGAGGATTTTTCAGAAGAAAGGTAGAAGCTACGTACAGTTGAGGCACATGGACGGTGTTCGTGTACAACGAGATGTAAGCAGCTCGCCCGATATGGAGCGGCTGTTTACACAATTCTGCAAATTTTTGGTTGGACACAAACCGGAGAAATCTGCAAACCTGACGTTCGGTTCCAGTGGTCTGATTTTCAAACCAAAGTTTGCTGACAATGTGGGGCGGTACTTTGGTGACTATTTTATTGTCCGAGGACGTCTTGGAGGTAGGCTGTTTGATGGAAGATCAAAATTGGCAAGGTCAATCTATGCTAAGATGGAACAATACAATGACGTGGCTGAAAAATTTTGGCTCGGTTTCAATAGGGCTTTTCTGCGGCACAGAAAACCAACGGACCACACTTGCACGTCTGACATGGACGTTACAATGTGTGGGGAAGTTGCGGCTCTCGCAACAATAATCCTGTTTCCGTGTCATAAGATAACTTGCAATACTTGCATGAGCAAAGTAAAGGAAAGAGTTATTGACGAATTCGGGGAGGAATTGAATTGTGAACTTGAACGCTTGCGTGAAACTCTTTCGTCATATGGAGGATCATTCGGGCATGTCTCAACATTGCTTGATCAACTGAACAAAGTTTTGAATGCGCGGAACATGAACGATGAAGCTTTTAAGGAAATTGCTAAGAAAATTGATGCAAAGAAAGAGAGTCCTTGGACTCACATGACAGCTATTAACAACACGCTCATCAAAGGTTCGCTAGCAACTGGCTATGAATTTGAAAGAGCGTCTGATAATCTTCGAGAGATTGTGAGATGGCATCTCAAAAGGACAGAGTCAATAAAAGCTGGCAGTGTTGAAAGTTTCAGAAATAAGCGTTCTGGAAAGGCCCACTTCAACCCAGCTCTTACATGTGATAATCAATTGGATAGGAATGGCAATTTCTTATGGGGTGAGAGGCAATACCACGCTAAAAGATTCTTAGCCAACTATTTTGAAAAGATTGATCACAGTAAGGGTTATGAGCACTACAGTCAACGCCAAAATCCAAATGGTGTCAGGAAAATAGCCATTGGCAATTTGATATTTTCAACAAATTTGGAAAGATTTCGGCAGCAAATGGTTGAACATCACATCGATCAAGGACCAATTACTCGCGAATGCATTGCATTACGCAATAACAATTATGTTCATGTATGTAGCTGCGTGACTTTAGATGATGGAACCCCAGCAATAAGTGAGTTGAAGACTCCTACCAAGAACCACATAGTTCTTGGTAACTCTGGTGATCCTAAGTACGTTGACTTGCCGACTCTTGAGTCTGATTCAATGTACATAGCCAAGAAAGGTTACTGCTACATGAACATCTTTTTAGCGATGCTCATAAACATACCTGAGAATGAGGCAAAGGACTTTACAAAGAGGGTTCGTGACCTTGTGGGTTCAAAACTTGGAGAATGGCCAACGATGTTAGATGTCGCAACATGCGCAAACCAGTTGATAATTTTCCATCCTGATGCAGCCAATGCAGAATTGCCGCGAATTTTAGTGGATCACCGACAGAAAACAATGCATGTCATTGACTCTTTTGGGTCTGTGGATTCTGGGTATCATATATTAAAGGCAAACACAGTTAATCAGCTGATCCAATTTGCTAGGGAACCACTTGATAGTGAAATGAAGCACTACATTGTTGGTGGAGAATTCGACCCAACTACTAGTTGCTTGCACCAGCTGATTCGTGTCATTTATAAGCCTCATGAACTTCGAAATTTGCTCAGGAATGAACCGTATTTAATAGTGATTGCATTGATGTCACCAAGTGTGCTTCTTACCTTGTTCAATAGTGGCGCAATTGAGCACGCGTTGAACTACTGGATCAAAAGAGACCAAGACGTCCTCAAGGTTATTGTTTTAGTGGAGCAATTGTGCAGGAAGGTGACACTTGCTAGAACAATTCTGGAACAATTTAATGAAATTCGTCAAAATGCGAGAGAAATACATGAACTGATGGATCGAAACAATAAGCCTTGGATCTCATATGATCGCTCATTAGAACTATTGAGCGTCTATGCGAACTCACATTTGACAGATGAAGGTCTGCTCAAGCAAGGATTTTCAACATTGGATCCTAGATTACGTGAGGCTGTAGAAAAAACCTACGCCGCTCTTTTGCAGGAAGAATGGCGTGCTTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGGTACTTTGCATTCAAGTCACAACCATCTTTTTCCGAATATTTAAAGCCAAAAGGGCGCGCAGATTTGAAGATTGTATACGACTTCTCACCGAAGTATTGTGTACACGAGGTCGGAAAGGCATTGCTACAGCCGATTAAAGCTGGAGCTGGAATTGCATCGCGAATCATCAGTGATTGTGGAGCATTCATTCGTAGGAATGCCGCAAGAGGCTGTGCTTACATTTTTAAGGATCTTTTTCAGTTTGTGCATGTAGTACTAGTTTTAAGCATTCTATTACAAATTTTTAGGAGTGTGCAAGGAATTGCTACAGAGCATATACAATTGAAGCAGGCGAGGGCAGAAGTGGAAAAACAGAAGGATTTTGATCGACTTGAGGCTCTATACGCTGAGTTGTGCGTTAAGAGCGGTGAGCAACCGACTGCTGAAGAGTTTCTTGATTTTGTAACAGAGCGTGAACCAAGACTTAAGAGTCAAGCTTACAATTTGATTTACATACCAGTGATTCATCAAGCAAAATCGGACAATGAGAAGAAGCTCGAGCAAGTCATTGCATTCATTACACTAATTTTAATGATGATTGACGTGGACAAGAGTGACTGTGTTTACAGGATTCTGAATAAGTTTAAAGGCGTGATGAAATCTTGCGACGCAAATGTATATCATCAGTCTTTAGATGACATTCGGGATTTTTATGAAGACAAGCAACTGACAATTGACTTCGATATCACTGGAGAAAATCAGATCAATCGAGGACCTATAGACGTCACGTTTGAGAAATGGTGGGATAATCAACTGTCTAACAACAACACAATTGGCCATTATCGAATTGGGGGAACGTTTGTTGAGTTTTCAAGGAATAACGCAGCTACTGTGGCTAGTGAGATAGCTCACAGTCCTGAACGTGAGTTTCTAGTACGCGGGGCTGTTGGTAGTGGTAAATCAACGAACCTTCCGTTCTTGCTTAGCAAGCATGGCAGCGTGTTGTTAATAGAACCCACTAGACCTCTTTGTGAGAACGTTTGTAAGCAACTACGCGGTGATCCATTCCATTGTAATCCAACCATTCGCATGCGAGGATTAACGGCTTTTGGTTCTACCACATTAACAATAATGACAAGCGGATTCGCTTTACTTTATTATGCTCCCAACATTCAACAATTGAGGCTTTTTGATTTCATAATTTTTGGAGAATTTCCAGTCATAGATAGCCAAGCCATGGCTTTTTTTTGTTTGGAGGAAGGGAACGCTATCGAAAAGAAGATTCTTAAAGGTTCTGCCACGCCCCCTGGGCGTGAGTTTGAGTTTTCAACCCAATTCCCAACAAAGATTGTAACTGAGCAATCCATAAGCTTCAAACAGTTGGTTGATAACTTCGGTACTG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| 19,202
|
OP947576.1
|
Papaya ringspot virus
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2023-01-09
|
DSMZ PV-0244
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,326
|
GenBank
| null |
Italy
|
Italy
| null | null | null | null | null |
Papaya ringspot virus isolate DSMZ PV-0244, complete genome
|
AAATAAAACATCTCAACACAACACAATCAAAAGCACTTCAACAAATATCAACTTATCTCACTTTCAATTATCATAGCAAGCGACAATGTCTTCTTTGTATACTTTGCAACCAGCAGCCCAGCGTGACAGAAGGTTAGAGAATAAGAAAGGTTCTGGCTGGATCGAGCACAAACTCGAAAGAAAAGGGGATAGAGGAAACACTCACTATTGTAGTGAGTTTGACATTAGCAAGGGTGCTAAAATTTTGCAATTAATGCAGATTGGTAACACTGAAGTTGGAAGGACCTTCCTGGAAGGTAACAGATTCGTTCGTGCGAGCATATTTGAGATCGTCCGGAAAACCATGGTTGGTCGTCTGGGATATGATTTCGAGAGTGAACTATGGTTCTGTCACAGCTGCAACGAAACTTCTGAAAAATACTTCAAGAAATGTAACTGTGGGGAAAAATATTACTATTCTGAAAGAAACCTGATGCAAACAATGCGCGATCTGATGTATCAGTTTGACATGACACCATCAGAGATCAACTCCGTTGATTTTGACTATCTCGCTGATGCAGTGGATTATGCCGAACGGTCAGTCAAGAAATCTCAAGCTCCGGAACCTGTGGAACTTCCAATGGTGGAACCGATTGTGGTCGGTGAGGAAGGTATTCCAATAGTTTCTGAACCAGAAGTTGTGCCTGTAACCACCAAAGTTGAAGAAGCATGGACGATTCAGATTGGGGAAATTCCTGTCCCACTTGTCGTCATCAAGGAAACGCCAATTACCAGTGGTTTGAATGGAACTCTGAAATCAACTGGCTTTTCACTTGAAGCTGAAATTACACAATTGGTGGAGAAGAAAGTCCTTCAGGAAGAGGTGAAAGAAGCAGTGCACCTGGCACTCGAAGTTGGTAATGAGATTGCTGAGAAGAAGCCTGAACTCAAGCTAATGCCACACTGGAGTGCTAGCTTCGAGTTGCACAAGAAAATTCGTAGGCATAAGGAGCATGCTAAGATTGCATCAATTCAAGTTCAGAAGGAAAGAGAAAAAGACCAAAAGATATTCTCAGCTCTGGAATTAAGGCTTAACTTAAAATCCAGGAGAAGAAATCAAGCTGTGGTCCGTGACAAAAGAGGCACACTTAAATGGAAGACCCGACAAGATCACAAGAAGGGTAAACTAATGCAACAAGTGAGTGATTCTGTTGTCACTCAAATTTATTGCGATTTTGGTTATAAACCTCAATATTCTGAACCTCACCTTCCTGGCATCAAGCGGTCTACATCTAAGAGGATCTGCAAACCGCGCAAGCAATCGAGAATTGTTGGAAATAACAAGATAAATTATGTCATGAAAAATCTGTGTGACATAATTATCGAAAGAGGCATTCCTGTGGAGCTTGTTACGAAGCGATGCAAGAGAAGAATTCTTCAGAAGGAGGGTAGAAGCCATGTGCAGTTGAGACACATGAATGGCATTCGTGCACGACAAGATGTGAGCAGTTCGCCCGATATGGAGCAGTTATTTACGCAATTTTGCAAATTCTTAGTTGGACACAAACCACTTAAATCCGAAAATCTGACATTCGGTTCTAGTGGTTTGATTTTCAAGCCGAAGTTTGGCGACAACGTGGGGCGACACTTTGGTGACTATTTCGTTGTTCGAGGACGTCTTGGAGGTAAATTATTTGATGGTAGATCAAAACTAGCGAGATCGATTTATGCCAAGATGGAGCAATACAATGACGTGGCGGAAAAATTCTGGCTCGGTTTTAATAGGGCTTTTCTACGGCATAGAAAACCAACGGACCACACTTGCACGTCCGACATGGACGTTACAATGTGTGGGGAGGTAGCAGCTCTTGCAACTATAATCCTGTTTCCGTGCCACAAGATAACTTGCAACACTTGCATGAGCAAAGTAAAGGGAAGAGTTATCGACGAAGTCGGCGAGGACTTAAATTGTGAGCTTGAACGTTTACGTGAAACTCTTTCAGCATATGGAGGGTCATTCGGACATGTCTCAACATTACTTGATCAATTAAACAGAGTTTTAAATGCACGGAACATGAACGATGGAGCTTTTAAAGAGATTGCGAAGAAGATTGATGAAAAGAAAGAGAGTCCTTGGACTCACATGACAGCCATCAATAACACGCTCATCAAAGGTTCGCTAGCAACTGGCTACGAATTCGAGAGAGCATCTGATAGCCTCCGAGAGATCGTGAGATGGCACCTCAAAAGGACAGAATCAATAAAAGCTGGCAGCGTTGAAAGTTTTAGAAATAAGCGTTCTGGAAAAGCTCACTTCAACCCAGCTCTCACGTGTGATAACCAGTTGGACAAGAATGGTAATTTCTTATGGGGTGAAAGGCAATACCACGCCAAAAGATTCTTTGCCAATTATTTTGAGAAGATTGATCATAGTAAGGGTTATGAGTACTATAGTCAACGCCAAAACCCAAATGGTATCAGGAAAATCGCCATTGGCAATTTAGTATTTTCAACAAATTTGGAGAGATTTCGGCAGCAAATGGTCGAACACCACATCGATCAAGGACCGATTACTCGTGAGTGCATTGCATTGCGCAATAACAATTATGTTCATGTGTGTAGCTGCGTAACTTTAGATGATGGAACTCCAGCAACTAGTGAGTTGAAAACTCCTACCAAGAATCACATAGTTCTTGGTAATTCTGGTGATCCTAAGTACGTTGACCTGCCGACTCTTGAGTCTGATTCGATGTACATAGCCAAGAAGGGTTATTGCTACATGAACATCTTTTTAGCAATGCTCATAAACATACCTGAAAATGAGGCGAAGGACTTCACAAAAAGAGTTCGTGATCTTGTAGGTTCAAAACTTGGAGAGTGGCCAACAATGCTAGATGTCGCAACATGCGCAAATCAGCTGATTATTTTCCATCCTGATGCAGCCAACGCAGAATTGCCGCGAATTCTAGTGGACCACCGGCAGAAAACAATGCATGTCATTGACTCTTTCGGGTCCGTGGATTCTGGATATCATATATTGAAGGCAAATACAGTCAATCAGCTGATCCAATTCGCTAGAGAACCACTCGATAGTGAAATGAAGCACTACATTGTCGGCGGAGAGTTTGACCCGACTACTAACTGCTTGCATCAGTTGATTCGTGTCATCTATAAGCCTCATGAACTCCGGAACCTGCTCAGGAATGAACCGTATCTGATCGTGATTGCATTGATGTCACCAAGTGTACTTTTAACTTTGTTCAATAGTGGTGCGATTGAACACGCATTGAATTATTGGATCAAAAAAGATCAAGATGTTGTTGAGGTCATTGTTCTAGTGGAGCAATTATGCAGGAAAGTGACACTTGCTAGAACAATCCTGGAGCAGTTTAATGAGATTCGTCAAAATGCGAGAGATTTACATGAGCTAATGGATCGAAACAATAAGCCTTGGATTTCATATGATCGCTCATTGGAACTATTGAGTGTGTATGCGAATTCGCAGTTGACGGATGAAGGTCTACTCAAACAAGGATTTTCAACATTAGATCCTAGGTTGCGTGAAGCTGTGGAAAAAACCTACGCCACTCTTTTGCAGGAAGAATGGCGTGCGTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGGTACTTTGCGTTCAAATCACAACCGTCTTTTTCCGAGTATTTAAAGCCAAAAGGGCGCGCAGATTTGAAAATTGTATACGACTTCTCACCGAAGTATTGTGTACACGAGGTCGGAAAGGCGTTTCTACAGCCAGTCAAAGCCGGGGCTAAATTCGCATCGCGAGTCATTAATGGTTGCGGAACTTTCATTCGGAAGAGTGCCGCAAAAGGCTGTGCTTACATTTTCAAGGATCTTTTCCAGTTTGTACATGTAGTGTTGGTTTTAAGCATTTTATTACAGATCTTTAGGAGTGCGCAAGGAATTGCCACAGAGCATATACAATTGAAGCAGGCGAAGGCAGAAGTAGAGAGACAGAAGGATTTTGATCGTCTGGAAGCTCTATACGCTGAAATGTGCGTTAAGAGTGGCGAACAACCAACTGCTGAAGAATTTCTTGATTTTGTAATGGAGCGTGAGCCAAGGCTTAAGGATCAAGCTTACAATTTAATACACATACCAGTGATTCATCAAGCAAAATCGAGCAATGAGAAAAAGCTCGAACAAGTCATTGCATTCATTACATTAATTTTAATGATGATCGACGTGGACAAGAGTGATTGTGTTTATAGAATCTTGAATAAGTTTAAAGGCGTGATAAATTCTTGCAACACAAATGTTTATCACCAATCTTTAGATGACATTCGGGATTTCTATGAAGACAAGCAGTTGACTATTGACTTTGACATCACTGGAGAAAATCAGATCAATCGAGGACCTATAGACGTTACGTTTGAGAAATGGTGGGATAACCAATTGTCCAACAACAACACAATTGGCCACTATCGAATTGGGGGAACGTTTGTTGAATTTTCACGAGGTAATGCAGCCACTGTGGCTAGTGAGATAGCTCATAGTCCTGAGCGTGAGTTTCTTGTTCGCGGAGCCGTTGGTAGTGGTAAATCAACGAATCTTCCTTTCTTGCTTAGTAAGCATGGTAGCGTGTTGTTAATAGAGCCCACCAGACCTCTTTGTGAGAACGTCTGTAAGCAATTACGTGGTGAACCATTCCATTGTAACCCAACTATTCGCATGCGTGGATTAACGGCTTTTGGTTCTACCAACATCACAATAATGACAAGCGGGTTTGCTTTGCATTATTATGCTCACAATATTCAGCAATTGAAGCTCTTTGATTTCATAATCTTTGATGAATGTCATGTCATAGATAGCCAAGCCATGGCCTTCTATTGTCTGATGGAGGGGAACGCTATTGAGAAAAAGATTCTTAAAGTTTCTGCTACGCCACCTGGGCGTGAAGTTGAGTTCTCGACACAATTCCCAACAAAGATTGTGACGGAACAATCCATAAGCTTTAAACAGTTGGTTGACAACTTCGGTA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| 19,651
|
OP947578.1
|
Papaya ringspot virus
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2023-01-09
|
DSMZ PV-0402
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,326
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Citrullus lanatus
| null | null | null | null |
Papaya ringspot virus isolate DSMZ PV-0402, complete genome
|
AAATAAAACATCTCAATACAACACAATCAAAAGCACTTCAACAAATATCAACTTATCTCACTTTCAATTATCATAGCAAGCGACAATGTCTTCTTTGTATACTTTGCAACCAGCAGCCCAGCGTGACAGAAGGTTAGAGAATAAGAAAGGTTCTGGCTGGATCGAGCACAAACTCGAAAGAAAAGGGGATAGAGGAAACACTCACTATTGTAGTGAGTTTGACATTAGCAAGGGTGCTAAAATTTTGCAATTAATGCAGATTGGTAACACTGAAGTTGGAAGGACCTTCCTGGAAGGTAACAGATTCGTTCGTGCGAGCATATTTGAGATCGTCCGGAAAACCATGGTTGGTCGTCTGGGATATGATTTCGAGAGTGAACTATGGTTCTGTCACAGCTGCAACGAAACTTCTGAAAAATACTTCAAGAAATGTAACTGTGGGGAAAAATATTACTATTCTGAAAGAAACCTGATGCAAACAATGCACGATCTGATGTATCAGTTTGACATGACACCATCAGAGATCAACTCCGTTGATTTTGACTATCTCGCTGATGCAGTGGATTATGCCGAACGGTCAGTCAAGAAATCTCAAGCTCCGGAACCTGTGGAACTTCCAATGGTGGAACCGATTGTGGTCGGTGAGGAAGGTATTCCAATAGTTTCTGAACCAGAAGTTGTGCCTGTAACCACCAAAGTTGAAGAAGCATGGACGATTCAGATTGGGGAAATTCCTGTCCCACTTGTCGTCATCAAGGAAACGCCAATTACCAGTGGTTTGAATGGAACTCTGAAATCAACTGGCTTTTCACTTGAAGCTGAAATTACACAATTGGTGGAGAAGAAAGTCCTTCAGGAAGAGGTGAAAGAAGCAGTGCACCTGGCACTCGAAGTTGGTAATGAGATTGCTGAGAAGAAGCCTGAACTCAAGCTAATGCCACACTGGAGTGCTAGCTTCGAGTTGCACAAGAAAATTCGTAGGCATAAGGAGCATGCTAAGATTGCATCAATTCAAGTTCAGAAGGAAAGAGAAAAAGACCAAAAGATATTCTCAGCTCTGGAATTAAGGCTTAACTTAAAATCCAGGAGAAGAAATCAAGCTGTGGTCCGTGACAAAAGAGGCACACTTAAATGGAAGACCCGACAAGATCACAAGAAGGGTAAACTAATGCAACAAGTGAGTGATTCTGTTGTCACTCAAATTTATTGCGATTTTGGTTATAAACCTCAATATTCTGAACCTCACCTTCCTGGCATCAAGCGGTCTACATCTAAGAGGATCTGCAAACCGCGCAAGCAATCGAGAATTGTTGGAAATAACAAGATAAATTATGTCATGAAAAATCTGTGTGACATAATTATCGAAAGAGGCATTCCTGTGGAGCTTGTTACGAAGCGATGCAAGAGAAGAATTCTTCAGAAGGAGGGTAGAAGCCATGTGCAGTTGAGACACATGAATGGCATTCGTGCACGACAAGATGTGAGCAGTTCGCCCGATATGGAGCAGTTATTTACGCAATTTTGCAAATTCTTAGTTGGACACAAACCACTTAAATCCGAAAATCTGACATTCGGTTCTAGTGGTTTGATTTTCAAGCCGAAGTTTGGCGACAACGTGGGGCGACACTTTGGTGACTATTTCGTTGTTCGAGGACGTCTTGGAGGTAAATTATTTGATGGTAGATCAAAACTAGCGAGATCGATTTATGCCAAGATGGAGCAATACAATGACGTGGCGGAAAAATTCTGGCTCGGTTTTAATAGGGCTTTTCTACGGCATAGAAAACCAACGGACCACACTTGCACGTCCGACATGGACGTTACAATGTGTGGGGAGGTAGCAGCTCTTGCAACTATAATCCTGTTTCCGTGCCACAAGATAACTTGCAACACTTGCATGAGCAAAGTAAAGGGAAGAGTTATCGACGAAGTCGGCGAGGACTTAAATTGTGAGCTTGAACGTTTACGTGAAACTCTTTCAGCATATGGAGGGTCATTCGGACATGTCTCAACATTACTTGATCAATTAAACAGAGTTTTAAATGCACGGAACATGAACGATGGAGCTTTTAAAGAGATTGCGAAGAAGATTGATGAAAAGAAAGAGAGTCCTTGGACTCACATGACAGCCATCAATAACACGCTCATCAAAGGTTCGCTAGCAACTGGCTACGAATTCGAGAGAGCATCTGATAGCCTCCGAGAGATCGTGAGATGGCACCTCAAAAGGACAGAATCAATAAAAGCTGGCAGCGTTGAAAGTTTTAGAAATAAGCGTTCTGGAAAAGCTCACTTCAACCCAGCTCTCACGTGTGATAACCAGTTGGACAAGAATGGTAATTTCTTATGGGGTGAAAGGCAATACCACGCCAAAAGATTCTTTGCCAATTATTTTGAGAAGATTGATCATAGTAAGGGTTATGAGTACTATAGTCAACGCCAAAACCCAAATGGTATCAGGAAAATCGCCATTGGCAATTTAGTATTTTCAACAAATTTGGAGAGATTTCGGCAGCAAATGGTCGAACACCACATCGATCAAGGACCAATTACTCGTGAGTGCATTGCATTGCGCAATAACAATTATGTTCATGTGTGTAGCTGCGTAACTTTAGATGATGGAACTCCAGCAACTAGTGAGTTGAAAACTCCTACCAAGAATCACATAGTTCTTGGTAATTCTGGTGATCCTAAGTACGTTGACCTGCCGACTCTTGAGTCTGATTCGATGTACATAGCCAAGAAGGGTTATTGCTACATGAACATCTTTTTAGCAATGCTCATAAACATACCTGAAAATGAGGCGAAGGACTTCACAAAAAGAGTTCGTGATCTTGTAGGTTCAAAACTTGGAGAGTGGCCAACGATGCTAGATGTCGCAACATGCGCAAATCAGCTGATTATTTTCCATCCTGATGCAGCCAACGCAGAATTGCCGCGAATTCTAGTGGACCACCGGCAGAAAACAATGCATGTCATTGACTCTTTCGGGTCCGTGGATTCTGGATATCATATATTGAAGGCAAATACAGTCAATCAGCTGATCCAATTCGCTAGAGAACCACTCGATAGTGAAATGAAGCACTACATTGTCGGCGGAGAGTTTGACCCGACTACTAACTGCTTGCATCAGTTGATTCGTGTCATCTATAAGCCTCATGAACTCCGGAACCTGCTCAGGAATGAACCGTATCTGATCGTGATTGCATTGATGTCACCAAGTGTACTTTTAACTTTGTTCAATAGTGGTGCGATTGAACACGCATTGAATTATTGGATCAAAAGAGATCAAGATGTTGTTGAGGTCATTGTTCTAGTGGAGCAATTATGCAGGAAAGTGACACTTGCTAGAACAATCCTGGAGCAGTTTAATGAGATTCGTCAAAATGCGAGAGATTTACATGAGCTAATGGATCGAAACAATAAGCCTTGGATTTCATATGATCGCTCATTGGAACTATTGAGTGTGTATGCGAATTCGCAGTTGACGGATGAAGGTCTACTCAAACAAGGATTTTCAACATTAGATCCTAGGTTGCGTGAAGCTGTGGAAAAAACCTACGCCACTCTTTTGCAGGAAGAATGGCGTGCGTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGGTACTTTGCGTTCAAATCACAACCGTCTTTTTCCGAGTATTTAAAGCCAAAAGGGCGCGCAGATTTGAAAATTGTATACGACTTCTCACCGAAGTATTGTGTACACGAGGTCGGAAAGGCGTTTCTACAGCCAGTCAAAGCCGGGGCTAAATTCGCATCGCGAATCATTAATGGTTGCGGAACTTTCATTCGGAAGAGTGCCGCAAAAGGCTGTGCTTACATTTTCAAGGATCTTTTCCAGTTTGTACATGTAGTGTTGGTTTTAAGCATTTTATTACAGATCTTTAGGAGTGCGCAAGGAATTGCCACAGAGCATATACAATTGAAGCAGGCGAAGGCAGAAGTAGAGAGACAGAAGGATTTTGATCGTCTGGAAGCTCTATACGCTGAAATGTGCGTTAAGAGTGGCGAACAACCAACTGCTGAAGAATTTCTTGATTTTGTAATGGAGCGTGAGCCAAGGCTTAAGGATCAAGCTTACAATTTAATACACATACCAGTGATTCATCAAGCAAAATCGAGCAATGAGAAAAAGCTCGAACAAGTCATTGCATTCATTACATTAATTTTAATGATGATCGACGTGGACAAGAGTGATTGTGTTTATAGAATCTTGAATAAGTTTAAAGGCGTGATAAATTCTTGCAACACAAATGTTTATCACCAATCTTTAGATGACATTCGGGATTTCTATGAAGACAAGCAGTTGACTATTGACTTTGACATCACTGGAGAAAATCAGATCAATCGAGGACCTATAGACGTTACGTTTGAGAAATGGTGGGATAACCAATTGTCCAACAACAACACAATTGGCCACTATCGAATTGGGGGAACGTTTGTTGAATTTTCACGAGGTAATGCAGCCACTGTGGCTAGTGAGATAGCTCATAGTCCTGAGCGTGAGTTTCTTGTTCGCGGAGCCGTTGGTAGTGGTAAATCAACGAATCTTCCTTTCTTGCTTAGTAAGCATGGTAGCGTGTTGTTAATAGAGCCCACCAGACCTCTTTGTGAGAACGTCTGTAAGCAATTACGTGGTGAACCATTCCATTGTAACCCAACTATTCGCATGCGTGGATTAACGGCTTTTGGTTCTACCAACATCACAATAATGACAAGCGGGTTTGCTTTGCATTATTATGCTCACAATATTCAGCAATTGAAGCTCTTTGATTTCATAATCTTTGATGAATGTCATGTTATAGATAGCCAAGCCATGGCCTTCTATTGTCTGATGGAGGGGAACGCTATTGAGAAAAAGATTCTTAAAGTTTCTGCTACGCCACCTGGGCGTGAAGTTGAGTTCTCGACACAATTCCCAACAAAGATTGTGACGGAACAATCCATAAGCTTTAAACAGTTGGTTGACAACTTCGGTA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| 19,653
|
OK633883.1
|
Papaya ringspot virus
|
Tran,T.T.Y.
|
National Chung Hsing University, Plant Pathology
| null |
2022-11-02
|
PRSV ST2
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,323
|
GenBank
| null |
Viet Nam: Soc Trang
|
Viet Nam
|
Carica papaya
| null |
2015
| null | null |
Papaya ringspot virus isolate PRSV ST2, complete genome
|
AAATAAAACATCTCAACACAACACAAATCAGAGCATTCGAACACACTCAAGCAAATCTTGTTCTCAAATCCTACAATTTGCAATCATGTCTGCATTGTACCAATTGCAACCTATAGCACTTAAAGATCGTCTCTTGTCCCGCGAGAGAGGGAAGGGCTGGATCGAGCTCAAGCTCGAGAGAAAAGGAGAAGCGGGAAATACTCATTATACTGGCGAGTTTGTGATTAGCGAGGGAGCAAAGATTTTGCAACTCGTTCAAATCGGAAATGCTGAAGTTGGCAGAGCCTTCCTGGAAGGCAATAGGAGAACTCGAGCTGATATCTTCGAAATTGTTAAGAAAACGATGATCGGCCTCTTAGGGTACGACTTCGAATGTGAGCAATGGTACTGCCACTCTTGCGACAACACATCTGCAAAGTACTTCAAGACATGTAACTGTGGTGAGAAGTACTACTACTCAGAGAGAAATTTAATCAAGTCAATGCACGATTTGATGTATCAATTCGATATGACAGCTTCTGAAATTGAACAAGTCGGGTATGATTACTTGGCTGAAGCAGTGGATTTTGCTGAACAATCTGTGGCAAAGTCGAAGGTTCTAACATCTGTGGAATCCGAATTGGTGGAGACCATGGTGGCTAGTGAGGAAAGTTTTCTGGCGGTTCATGAACCAAAAATTGTACCCGTAACACCAAAGGTTGAAGAAGCATGGACAATACAGATTGGGGAAATTTCTGTCCCACTTGTTGTCAGAACGGAAACGTCAATTATCAGCAATGTGAATGGAACTCTAAATTCGACTGGATTATCGCTCAAAGCCGGAACTGCAAAGCCGACTAAAAATGCAGTTTCTCAAGACGAGGTGAAAGAGGCAGTGCATTTGGCGCTTGAAGTCGGAAATGAAATTGCTGAAAAGAAACCTGAACTTAAACTAACACCATATTGGAGTGATAGTTTTGAGTTACAGAAAAGAGTTCGTAAGCACAAGGAACATGCTAAACTTGAAGCAATCCGAGTTCAAAAAGAGAAGGAAAGGGACCGGAAAATATTTGTTGCCCTAGAAACAAAATTGAATTTAAGAGCTAGGAGGCAGGGGCAAGTTATTATCTGCGATAAGAGAGGTACTTTGAAGTGGAAGAAGCGTCAACAACGTAAGAAAAACAAAGTGATTACACAAGTGATTGAATCTGTTGTTACTACAATTCACAGTAATCTTGAGTGCAAAACTTTAAATCTTGATGACACAATTCCTGGAATCAAATGCGCAACTTCTAAGAAAATGCGGGAAAAGAAAAAGAATCTCAAAATAGTTGGCAGCAATAAGGTCAATTATGTCATGAAAAGTCTGTGTGACATAATAATCGATCGGAACATTCCTATCGAGATAGTCACGAAGCGATGCAAAAGAAAGATTTTCCGTAAAGACGGAAAAAATTATGTGCAATTAAGGCACATGGTTGGCATTAATGCACCGCGCGATGCAAGTAGTTCACCAGAAATGGAGAAGTTGTTCACGCGCCTTTGTAGATTTTTGATCAGGAGGCAGTCGGTTAAAGCTGCATGTCTGACACACGGATCAAGTGGTCTCATCTTTAAACCGAAGTTCGCTGACAGAATAGGTCGATATTTTGGTGAATACTTTATCACGCGTGGGCGCTATGAAGGAAAATTATTTGATGGAAGATCAAAGCTGGCTAGATCGGTTCGCATGAATATGGAGCAATACAACGATGTTGCTGAAAAATTTTGGCTTGGTTTTAACAGGGCTTTCTTGCGGCACAGGAAACCAACAGATCATGTGTGTACATCTGATATGGATGTTACAATGTGCGGTGAAGTGGCGGCTCTAGTAACCATAATCTTATTTCCGTGTCATAAGATAACTTGTAATACTTGCATGAACAAAGTTAAAGGAAGAGTTATTGACGAAGTCGGCGAGGATTTGAATTGTGAGCTTGAACGTCTACGTGAAACTCTCTCGTCATATGGAGGTTCATTCGGTCATGTTTCAACGTTGCTCGACCAATTAAATAGAATCTTGAATGCACGTAACATGAACGATGGAGCTTTCAAAGAGATCGCAAAGAAGATTGATGAAAAGAAAGAAAGTCCTTGGACTCACATGACAACCATCAATAACACGCTTATCAAAGGTTCGGTGGCAACTCGCTATGAATTTGAAAGAGCATCCGACAGTCTGCGTGAAGTTGTGAGATGGCATCTCAAAAGAACAGAGTCAATAAAAGCTGGCAGTGTTGAGAGCTTTAGGAACAAACGTTCTGGAAAAGCTCACTTCAACTTAGCTCTCATGTGTGATAATCAATTGGATAGGAATGGCAATTTCTTGTGGGGTGAGAGACAGTATCACGCCAAAAGATTCTTTGCTAACTATTTTGAGAAAATTGATCACAGTAAGGGCTATGAGCATTATAGCCAACGCCAAAACCCAAATGGGATTCGAAAGATTGCCATTGGTAATTTGATATTCTCCACAAATTTGGATAGGTTTCGGCAGCAAATGGTTGAACATCACATTGACCAGGGACCAATCACTCGTGAGTGTATTGCACTGCGCAATAACAATTACGTTCATGTATGTAGTTGCGTGACTTTAGATGACGGGACTCCAGCAACGAGCGAATTGAAGACTCCCACCAAGAATCACATTGTTCTTGGTAATTCTGGTGACCCCAAATATGTTGACTTGCCAACTCTCGAATCGGATTCAATGTACATAGCAAAAAGAGGCTATTGCTACATGAACATTTTCCTAGCAATGCTCATAAACATACCTGAGAATGAGGCAAAGGATTTTACGAAGAGGGTTCGTGATCTTGTGGGTTCGAAACTTGGAGAGTGGCCAACAATGTTAGATGTCGCGACATGTGCTAATCAATTGATCATTTTTCATCCCGATGCAGCCAATGCAGAATTACCGCGGATCTTGGTTGATCACCGACAGAAGACAATGCATGTCATTGATTCATTTGGATCTGTTGATTCTGGATATCACATATTGAAGGCAAACACGGTAAATCAATTAATTCAGTTTGCCAGAGAGCCACTTGATAGTGAAATGAAGCACTACATCGTTGGTGGAGAATTTGATCCAACCACTAGTTGCTTGCATCAGCTAATACGCGTCATTTACAAGCCTCATGAACTCCGCAATTTGCTCAGAAACGAACCATATCTAATAGTAATTGCTTTGATGTCACCAAGCGTGCTTTTAACTCTATTTAATAGTGGTGCAATTGAGCATGCATTGAACTATTGGATTAAAAGGGACCAGGATGTTGTAGAGGTTATTGTTTTGGTTGAGCAATTGTGTCACAAAGTGACACTTGCTAGAACAATTTTGGAGCAATTCAATGAAATTCGCCAGAATGCAAGGGACATACATGAGCTAATGGATCGCAACAACAAACCTTGGATTTCATATGATCGATCATTAGAATTATTGAGTGTCTACGCGAATTCGCAATTGACGGATGAAGGCCTGCTTAAGCAAGGATTTTCAACACTGGATCCTCGATTGCGTGAAGCTGTTGAAAAAACCTACGCCGCTCTTTTGCAGGAAGAGTGGCGTGCCTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGGTACTTTGCATTCAAATCACAACCATCTTTTTCCGAGTATTTAAAGCCAAAAGGGTGCGCAGATTTGAAAATTGTGTACGACTTCTCACCGAAGTACTGTGCACACGAGGTCGGAAAGGCATTATTGCAGCCAATCAGAGCAGGAGCTGAAATCACATCGCGTTTCATAAACGGTTGTGGGACGTTTATTCGGAAGAGTGCTGCAAAAGGTTGTGCTTATATTTTTAAGGATCTTTTCCAATTCGTTCACGTAATACTAGTGTTAAGCATTTTACTGCAGATATTTAGGAGTGTACAAGGAATTGCCACAGAGCACATACAATTGAAGCAAGCGAAGGCGGAGGTGGAAAAACAGAAAGATTTCGATCGGTTGGAAGCTTTGTACGCTGAACTATGTGTCAAGAGTGGTGAACAACCGACGGCTGAAGAATTCATTGATTTTGTGATGGAGCGTGAACCAAGGCTTAAGGATCAAGTTTACAACTTAATTCATTTACCAGTAATCCATCAAGCAAAATCAGACAATGAAAAGAAACTCGAACAAGTCATTGCTTTTATAACATTAATTTTAATGATGATTGACGTGGACAAGAGTGACTGTGTTTACAGGATCTTGAACAAATTTAAAGGCGTGATAAAATCGTGCGACACAAGTGTTTATCATCAGTCTTTAGATGACATTCGAGACTTCTATGAAGACAAGCAATTGACCATTGATTTTGACATCACTGGTGAAAGTCAGATCAATCGTGGGCCTATAGATGTCACATTTGAGAAATGGTGGGATAATCAACTGTCCAACAACAACACAATTGGCCATTACCGAATTGGAGGAATGTTCGTTGAATTCTCACGAAGCAACGCGGCTACTGTGGCTAGCGAAATAGCTCATAGTCCTGAACGCGAATTCTTAATTCGCGGAGCTGTTGGTAGTGGTAAGTCAACGAATCTTCCGTTCTTGCTTAGCAAGCATGGTAGTGTATTACTAATAGAGCCCACCAGACCCCTGTGTGAGAATGTTTGCAAGCAATTGCGCGGTGAGCCGTTTTATTGTAATCCAACCATTCGCATGCGTGGATTAACGGCTTTTGGTTCAACCAACATCACTATTATGACGAGCGGGTTTGCTTTACATTATTATGCTCATAACATCCAACAATTAAGGCTTTTTGATTTCATAATCTTTGATGAATGTCATGTCATAGACAGCCAGGCAATGGCCTTTTATTGTTTGATGGAGGGTAATGCAATTGATAAGAAAATTCTTAAAGTTTCTGCCACGCCACCTGGGCGTGAAGTTGAGTTTTCAACGCAATTCCCAATAAAAATTGTCACTGAGCAGTCCATAAGCTTTAAACAGTTAGTCGACAATTTTGGAA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| 22,411
|
OK465456.1
|
Papaya ringspot virus
|
Liu,L., Peng,B., Gu,Q.
|
Zhengzhou Fruit Science Institute of Chinese Academy of Agricultural Science, Watermelon and Melon Disease and Insect Control Research Group
| null |
2022-09-26
|
HaNHK10
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,332
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Cucurbitaceae
| null |
2017-03-26
| null | null |
Papaya ringspot virus isolate HaNHK10, complete genome
|
AAATAAAACATCTCAACACAACACAATTCAAAGCAATCAAATACACTCAAGCAAACTTTATTTTCGAACCTTTCGATTCGTAATCATGTCTTCATTGTACCAATTGCAACCGATAGCACTGAAAGACCGTCTCTTGTCTCACAAGAGAGGGAAAGGCTGGATCGAGCACAAGCTCGAACGGAAGGGTGATAAAGGCAACACTCGTTATGTTGGCGAGTTCGTGGTTAGTGAAGGAGCTAAAATACTGCAGCTCATTCAAATTGGAAATGCCGAAGTTGGCAGAGCCTTCCTGGAAGGCGACAGGAGAACTCAAGCTGATATTTTTGAAATAGTAAAGAAAACAATGGTCGGCCGCCTGGGTTATGACTTCGAATGTGAGCTATGGTGTTGTCATTCTTGTGACAAAACATCAGCAAAATACTTCAAGAAATGTGACTGCGGCGAAACGTACTATTACTCAGAGAGAAATCTGATCAAATCAATGCACAATCTGATGTATCAGTTTGATATGACAGCCTCTGAGATTAAACAAGTAGGATTCGACTACTTGGCTGACGCCGTGGATTTTGCTGAACAATCTGTTATGAAATCCGAAATTCCGATATCTGCGGAACCCGAGCTTGTGGAGCCCATTGTGATTAGTAAGGAAAGTCTTCTGGCGGCTTCTGGACCAGAAGTTGTGCCTGTAACTGCAAAAGTTGAAGAGGCGTGGACGATTCAAATTGGGGAAATTCCTGTCCCACTTGTCGTCATCAAGGAAACACCAGTTATCAGCGGTTTGAACGGAACTCTGAATTCCACTGGTTTTCAACTTGAAGCTGAGATTACAAAACCAATCGAAGACATAGTCCCTCAAGATGAGGTGAAGGAAGCAGTGCACTTGGCACTTGAAGTTGGCAATGAAATTGCTGAGAAGAAACCTGAGTTCAAACTAGCACCATACTGGAGTGCTAGTCTTGAATTGCACAAGAGAGTTCGTAAGCATAAGGAGCATGTTAAGGTCGAAGCAATCCGAATTCAGAAAGAGAAGGAAAGGGAACTGAAGATATTTGCTGCTTTAGAAGCAAAGCTGAACTTACGAAATAGGAGGCAAGGACAAGTGATTGTTTGCAATAAGAGAGGGACTTTAGTGTGGAAAAAGCGGCAACAACGCAAGAAAAACAAAGTGATTGCGCAAATGAGTGACTCTGTCGTCACGAAAATTCATAGTAATTTTGAGTGCGAGATTCGAGATCTCGACGTGGCAACGCCTGGTGTCAAATGCGCTACTTCAAAGAAAATGCAGAAGAAGCAAAAGCAATCCAAGTTAGTTGGCAGCAACAAGATTAATTACGTCATGAAAAATCTGTGTGATGTAATTGTCGACAGGAACATCCCTGTCGAATTGATCACGAAGCGCTGCAGAAGAAAAATTTTCCGTAAAGCTGGGAATAATTATGTGCAATTAAGGCACATGAATGGCAACAACGCACCACGGGATGTGAGAAGCTCACCAGAAATGGAGAAGTTATTCACGCGCCTCTGCAAATTCTTGATCAGGAAAAATTCAATTGAAGCTGCACGATTAACACACGGTTCAAGTGGTCTTATCTTCAAACCGAAATTCGCTGACAAAATAGGTCGATATTTTGGTGAATATTTTATCACGCGTGGACGCTATGAAGGAAAATTATTTGATGGAAGATCAAAGCTGTCTAAACCGATTCGCATGAAAATGGAGCAATATAATGACGTTGCTGAAAAATTCTGGCTTGGTTTTAACAGGGCCTTCTTGCGTCACAGGAAGCCAACGGATCATGTGTGCACATCTGACATGGATGTCACAATGTGCGGCGAAGTAGCGGCTCTAGCAACCATAATCTTGTTTCCGTGTCATAAGATAACTTGCAACACTTGCATGAACAAGGTGAAAGGGAGAGTCATTGACGAAGTTGGTGAGGACTTGAACTGTGAGCTCGAACGTCTACGTGAAACTCTTTCGTCATATGGAGGCTCATTTGGTCACGTTTCAACATTACTTGATCAACTGAACAGAGTTTTGAATGCACGCAACATGAACGACGGAGCTTTTAAAGAGATAGCGAAGAAGATTGATGAAAAGAAAGAGAGTCCTTGGACGCACATGACAGCCATCAATAATACGCTTATCAAAGGTTCATTAGCAACTGGCTATGAATTTGAAAGAGCATCTGACAGTCTGCGAGAAATCGTGAGATGGCACCTCAAAAGAACAGAATCAATAAAAGCTGGCAGTGTTGAGAGCTTCAGAAACAAACGTTCTGGAAAAGCTCATTTCAACCCAGCTCTTACGTGTGACAATCAATTGGACAGAAATGGCAATTTCTTATGGGGTGAAAGACAGTATCACGCTAAAAGGTTCTTCGCTAACTACTTTGAAAAGATTGATCACAGCAAGGGTTATGAGTACTACAGTCAACGCCAAAACCCAAATGGCATTCGAAAGATCGCCATTGGTAATCTGATATTCTCTACAAACTTGGAGAGGTTTCGGCAGCAAATGGTTGAACATCATATTGACCAAGGGCCAATCACTCGTGAGTGTATCGCACTGCGCAATAACAATTACGTTCATGTATGTAGCTGCGTGACTTTAGATGATGGAACTCCAGCAACGAGTGAGTTGAAGACTCCCACCAAGAACCACATCGTTCTTGGTAATTCTGGTGATCCTAAGTACGTTGATTTGCCGACTCTTGAGTCTGATTCAATGTACATAGCTAAGAAGGGCTACTGTTACATGAACATTTTCCTTGCGATGCTCATAAACATACCTGAGAATGAGGCAAAGGACTTTACGAAAAGAGTTCGTGATCTTGTTGGTTCGAAATTGGGAGAGTGGCCAACGATGCTAGATGTTGCGACATGTGCCAATCAATTGATCATTTTCCATCCTGATGCAGCTAATGCGGAATTGCCACGAATCCTAGTGGATCATCGACAGAAAACAATGCACGTCATTGATTCATTTGGATCTGTAGACTCTGGATATCATATATTAAAAGCGAACACTGTTAATCAGTTAATTCAATTTGCCAGGGAGCCGCTTGATAGTGAAATGAAGCACTACATTGTTGGCGGAGAATTTGATCCAACCACTAGTTGCTTGCATCAATTGATTCGCGTCATTTACAAGCCCCATGAACTCCGCAATTTACTCAGAAATGAACCATATCTAATAGTGGTTGCACTGATGTCGCCAAGTGTGCTTTTAACTCTATTCAATAGTGGTGCAATTGAACATGCATTGAACTATTGGATCAAAAGGGACCAAGATGTCGTCGAGGTTATTGTTTTAGTTGAGCAATTATGTCGCAAGGTGACGCTTGCTAGAACAATAATGGAGCAGTTTAACGAAATTCGCCAAAACGCAAGAGATATACACGAGCTAATGGATCGAAATAATAAACCTTGGATTTCATATGATCGATCACTAGAGCTATTAAGTGTGTACGCGAATTCGCAACTGACGGATGAAGGCCTTCTCAAACAAGGATTCTCAACACTGGATCCGAGATTGCGCGAAGCTGTCGAAAAAACCTACGCCGCTCTCTTGCAGGAAGAATGGCGTGCATTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGGTACTTTGCATTCAAATCACAACCATCTTTTTCAGAGTATTTAAAGCCAAAAGGGCGCGCAGATTTGAAAATTGTGTACGACTTCTCACCGAAGTACTGTGTACACGAGGTCGGAAAGGCATTACTACAGCCAATCAAAGCTGGAGCTGAAGTTACATCGCGCCTCATAAACGGTTGTGGCACGTTCATTCGGAAAAGTGCCGCGAAAGGTTGTGCTTATATTTTCAAGGACCTTTTTCAGTTTGTTCACGTAGTGTTGGTGTTAAGCATTTTACTGCAAATATTTAGGAGTGCGCAAGGGATTGCCACAGAGCATATACAATTAAAGCAAGCGAAGGCGGAGATGGAAAAGCAGAAAGATTTCGACCGACTGGAAGCTTTATACGCGGAACTGTGCGTTAAAAGCGGTGAGCAGCCGACGGCTGAAGAATTCCTTGATTTCGTGATGGAGCGTGAACCAAGGCTCAAGGATCAAGTTTATAACTTAATCCACATACCAGTGATTCACCAGGCGAAATCGGACAACGAGAAGAAGCTCGAACAAGTCATTGCATTTATAACATTAATTTTAATGATGATCGACGTGGACAAAAGTGACTGTGTTTATAGGATCTTGAACAAATTTAAAGGCGTGATAAACTCGTGCAACGCAAATGTTTATCATCAGTCTTTGGATGACATTCGGGACTTCTATGAAGATAAGCAATTGACGATTGACTTTGACATCACTGGCGAAAACCAAATCAATCGAGGACCTATAGATGTCACGTTCGAGAAATGGTGGGATAATCAGCTGTCCAACAACAACACAATTGGCCATTATAGAATTGGAGGAACGTTCGTTGAATTCTCAAGAAGCAACGCAGCTACTGTAGCTAGTGAAATAGCTCATAGCCCTGAACGCGAATTCCTAGTTCGCGGAGCTGTTGGTAGTGGCAAGTCAACGAATCTTCCGTTCTTACTTAGTAAACATGGTAACGTGTTGTTAATAGAACCCACTAGGCCCCTCTGCGAAAATGTCTGCAAGCAACTGCGCGGTGAGCCGTTTCATTGCAATCCGACCATTCGTATGCGTGGATTAACGGCATTTGGTTCGACTAACATCACAATCATGACGAGTGGATTTGCTTTACATTACTATGCACACAACCTTCAACAATTGAGACTCTTTGATTTCATAATTTTTGATGAATGTCATGTCATAGACAGCCAGGCAATGGCCTTTTACTGTTTGATGGAAGGCAACGCAATTGAAAAGAAGGTTCTTAAGGTTTCTGCCACGCCACCTGGGCGCGAAGTTGAATTCTCAACGCAATTCCCAACAAAAATTGTTACTGAGCAGTCCATAAGCTTTAAGCAGTTAGTCGACAACTTCGGAA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| 24,223
|
OK570264.1
|
Papaya ringspot virus
|
Mo,C., Wu,Z., Guo,Y., Zhang,S., Li,P., Li,H.
|
South China Agricultural University, College of Plant Protection
|
China
|
2022-09-04
|
GD
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,326
|
GenBank
| null |
China: Jiangmen, Guangdong
|
China
|
Carica papaya
| null |
2017-03-02
| null | null |
Papaya ringspot virus isolate GD, complete genome
|
AAAATAAAACATCTCAACACAACACAAATTAAAGCATTCAAACACATTCAAGCATCTTTTACTTTCAAATCTCTCAATTTGCAATCATGTCTTCATTATACCAATTGCAGCCGATAGCATTGAAAGACCGTCTTTTGTCTCACAAAAGAGGGAAGGGCTGGATCGAGCATAAGCTCGAAAGGAAAGGAGAAGCAGGAAACACTCGTCATGTTGGCGAGTTTGTGATTAGTGAAGGAGCAAAAATTTTGCAACTTGTCCAAATCGGGAACGCTGAAATTGGCAGGGCCTTTCTGGAAGGTGATAGGAGAACTCGAGCTGATATTTTTGACATTGTCAAGAAAACCATGGTCGGTCTCTTAGGATACGATTTTGAGTGTGAGCTATGGTGCTGTCATTCTTGTGACAGAACATCTGCAAAGTACTTCAAGAAGTGTGACTGCGGTGAAAAGTACTATTACTCAGAGAGGAATTTAATTAAGTCAATGCATGACTTAATGTATCAATTCGACATGACAGCCTCTGAAATTGAACAAGTTGGGTATGATTATTTGGCTGAAGCTGTAGACTTTGCTGAGCAATCTGTAACAAAATCAAAGGTTCTGGCAACTGTGGAACCTGAGTTCGTGGAAACTGTCACAGTTAGCGAGGGAGATTCTCTAGTGACTTCTGAGCCAGAGGTTGAACTTATAACTACCAAAGTTGAAGAAGCCTGGACAATACAAATTGGGCAAATTCCTGTTCCATTGGTTGTCATAAAGGAAACGCCAATTGTCAGTGGCATGAATGGGACTCTTAACTCAACTGGTTTCTCACTCGATGCTGAGATTTCAAAGCCGGCAAAGAGTGCAGTTTCGAAGGATGAAGTAAAGGAAGCAGTGAATTTGGCACTTGAAGTTGGCAATGAGATTGCTGAGCGGAAACCTGAGCTCAAACTCACGCCATACTGGAGTGCTAGTCTTGAGTTACACAAAAGAATTCGCAAGCACAAAGAACATTCCAAAATCGAAGCAATTCGAGTTCGAAAAGAGAAGGAGATAAACAAGAATATATTTGCCGCTTTAGAAGCAAAGTTGAACTTGAGAGCTAGGAGGAAGGGGCAAGTTATTGCATGTGACGAGAGGGGCACTTTGAAATGGAAGAAGCGTCAACAACGTAAGAAAAGCAAAGTGCTTTCGCAAGTGAGTGACACTGTCGTCACAACAATTCACAGTAATTTTGCATGTAGAACTTTAGATCTTAATGCCGCAATTCCCGGTATTAAACGCGCAACATCAAAGAGGATGTGGAAAAAACAGAAGCAATCTAAGATAACTGGCAGCAATAAGATCAACTATGTCATGAAAAATCTGTGTGACATAATTGTTGACAGGGACATTCCCATTGAATTAATCACGAAGCGCTGCAGAAGAAAGATTTTCCGTAAAAACGGGAAAAATTACGTGCAATTAAGACACATGACTGGCACTAATGCACCAAAGGATGTAAGTAGTTCACCAGAAATGGAGAAATTATTTACACGCCTTTGCAAGTTCCTGATCAGGAAGCAGTCGGTTAAAGCCGCGCGCTTAACGCATGGCTCAAGTGGTCTCATCTTCAAACCGAAATTCGCTGACAGAATAGGTCGATATTTTGGTGAATATTTCATCACGCGCGGACGCTATGAAGGAAAGTTGTTTGATGGAAGATCAAGGCTGGCTAGATCGATTCGTATGCATATGGAGCAATACAATGATGTCGCTGAGAAATTCTGGCTCGGCTTCAACAGGGCTTTCTTGCGACACAGGAAGCCAACGGATCATGTGTGCACATCTGACATGGATGTTACAATGTGCGGTGAAGTGGCGGCTCTGGCAACCATAATCTTGTTTCCGTGTCATAAGATAACTTGCAACACTTGCATGAATAGAGTAAAGGGAAGAGTTATTGACGAAGTCGGCGAGGATTTAAATTGTGAACTTGAACGTTTACGTGAAACTCTTTCGTCATATGGAGGTTCATTTGGTCATGTTTCAACATTACTTGATCAATTGAACAGGGTTTTGAATGCACGTAACTTGAACGATGGAGCTTTCAAAGAGATTGCAAAGAAGATTGATGAAAGAAAAGAAAGTCCTTGGACTCACATGGCAGCCATTAATAACACGCTTATTAAAGGTTCACTAGCAACTGGTTATGAGTTCGAAAGGGCATCCGATAGTTTGCGGGAAGTTGTGAGATGGCATCTCAAAAGGACAGAGTCGATAAAAGCTGGCAGTGTTGAGAGCTTCAGAAACAAACGTTCTGGAAAAGCTCATTTCAACTTAGCTCTCACGTGTGACAATCAATTGGACAGAAATGGAAATTTCTTATGGGGTGAGAGACAATATCACGCCAAAAGATTCTTTGCTAATTACTTTGAGAAGATTGATCACAGTAAGGGCTATGAGCATTATAGTCAACGCCAAAACCCAAATGGCATTCGAAAGATCGCAATCGGTAACCTAATATTCTCTACAAATTTAGAGAGGTTTCGGCAGCAATTGGTTGAACATCATATTGATCAGGGACCAATCACCCGTGAGTGTATCGCTCTGCGCAACAACAATTACGTTCATGTATGTAGCTGTGTGACCTTAGATGATGGAAGTCCAGCAACGAGTGAATTGAAAACACCCACCAAGAATCACATTGTTCTTGGTAATTCTGGAGATCCTAAATATGTTGACTTGCCAACTCTTGAGTCGGATTCAATGTATATAGCAAAGAGAGGTTATTGTTACATGAACATTTTCCTGGCAATGCTCATAAACATACCTGAGAATGAAGCGAAGGACTTTACGAAGAGGGTTCGCGATCTTGTGGGCTCAAAACTTGGAGAGTGGCCAACGATGTTAGACGTTGCGACATGTGCCAATCAATTGATTATTTTTCATCCCGATGCAGCCAATGCGGAATTGCCGCGAATCTTAGTGGATCACCGACAGAAGACAATGCATGTCATCGATTCATTTGGATCGGTAGATTCTGGGTACCATATATTGAAGGCTAACACAGTGAATCAGCTAATTCAATTTGCTAGAGAGCCACTCGATAGTGAAATGAAGCACTACATTGTTGGTGGAGAATTCGACCCAACTACTAGTTGCTTGCATCAGCTAATACGTGTCATTTACAAGCCTCATGAACTCCGCAATTTGCTCAGAAACGAACCATATCTAATAGTGATTGCACTGATGTCACCAAGCGTACTCTTAACTCTATTTAATAGTGGTGCAATTGAACATGCATTGAATTATTGGATCAAACGAGATCAAGATGTTGTTGAGGTTATTGTTTTAGTAGAGCAATTGTGTCGCAAGGTGACGCTTGCTAGAACAATCCTGGAGCAGTTTAATGAAATTCGCCAGAACGCAAGAGACATACATGAGTTAATGGATCGAAATAATAAACCTTGGATTTCATATGATCGATCATTGGAGTTATTGAGTGTGTACGCGAATTCGCAGTTGACGGATGAAGGTCTGCTCAAGCAAGGATTTTCAACACTGGATCCTCGATTGCGTGAAGCTGTTGAAAAAACCTACGCCGCTCTCTTGCAGGAAGAGTGGCGTGCTTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGGTACTTTGCCTTCAAATCACAACCATCTTTTTCCGAGTATTTAAAGCCAAAAGGGCGCGCAGATTTAAAAATTGTGTACGACTTCTCACCGAAGTACTGTGTACACGAGGTCGGAAAGGCATTGTTACAGCCAGTCAAAGCTGGAGCTGAAATCGCGTCACGTGTTATAAACGGTTGTGGAACGTTCATTCGGAAGAGTGCCGCAAGAGGCTGTGCTTACATTTTTAAGGATCTTTTTCAGTTCGTTCATGTAGTGTTAGTGTTAAGCATTTTATTACAAATATTTAGGAGCGTACAAGGAATTGCTAAAGAGCACATACAATTAAAGCAAGCAAAAGCAGAAGCAGAAAAGCAGAAAGATTTTGATCGGTTGGAAGCCTTATACGCTGAGTTGTGCATTAAGGGTGGTGAGCAACCAACGGCTGAAGAATTTCTCGATTTTGTGATAGAGCGTGAACCAAGGCTTAAAGATCAGGTTTACAACTTGATTTACATACCAGTAATTCATCAAGCAAAATCGGACAATGAAAAGAAACTCGAACAAATCATTGCATTTATAACATTAATTTTGATGATGATTGACGTGGATAAGAGTGACTGTGTTTATAGGGTCTTGAACAAATTTAAAGGCGTGATAAAATCTTGCGATACAAGTGTTTATCATCAGTCTTTGGATGATATTCGGGACTTCTATGAAGATAAGCAATTGACTATTGACTTTGACATCACTGGTGAAAATCAAATTAATCGTGGACCTATAGATGTCACGTTCGAGAAGTGGTGGGACAATCAACTGTCCAATAACAACACAATTGGTCATTACCGAATTGGAGGAACATTCGTTGAATTCTCACGAAGTAACGCAGCTACTGTGGCTAGTGAAATAGCTCATAGTCCTGAACGCGAATTCCTAGTTCGCGGAGCCGTTGGTAGTGGTAAATCAACGAATCTTCCGTTCTTGCTTAGCAAGCATGGCAATGTGTTGTTAATAGAGCCCACCAGGCCCCTTTGCGAAAATGTTTGCAAGCAACTACGCGGTGATCCGTTTCATTGCAATCCAACCATCCGCATGCGTGGATTAACGGCTTTTGGTTCGACCAATATCACAATCATGACGAGTGGATTTGCCTTGCATTATTACGCTCATAACATTCAACAATTAAGGCTCTTCGATTTCATAATCTTTGATGAATGTCATGTCATAGATAGCCAAGCAATGGCCTTTTATTGTCTGATGGAGGGTAATGCGATTGAAAAGAAAATTCTCAAAGTTTCTGCAACACCACCTGGGCGTGAGGTTGAATTCTCAACGCAATTTCCAACAAAAATTGTCACTGAGCAGTCCATAAGCTTCAAGCAGTTGGTCGATAATTTCGGT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| 25,826
|
MT090406.1
|
Papaya ringspot virus
|
Naseem,S.
|
Comsats University, Department of Biosciences
|
Pakistan
|
2021-12-12
|
PK
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,320
|
GenBank
| null |
Pakistan
|
Pakistan
|
Carica papaya
| null |
2015-12
| null | null |
Papaya ringspot virus isolate PK, complete genome
|
AAATAAAACATCTCAACACAACACAATCGAAAACAATCAAACAAATTTCAACTTTGTTCACTATCGAATCTTACAACAAGCAATCATGTCTTCTCTGTACACGCTACGACCTGCTGCTCAATACGATAGGAGACTAGAAACAAAGAAAGGTTCCAGCTGGATCGAGCGTAAACTCGAATGGAAAGGTGAAAGAGGGAACACTCACTATTGTAGTGAGTTTGACATAAGCAAGGGTGCCAAGATTCTGCAATTGATTCAGATCGGCAATGCTGAAGTTGGAAGAACTTTTCTGGAAGGTAACAAGTTTGTTCGTGCCAACATCTTTGAAATCGTCAGAAAGACGATGGTTGGCCACCTGGGGTATGATTTTGAGTGCGAGCTATGGTTCTGTCACACTTGCGACAGAACATCTGCGAAGTACTTTAAGAAATGTGAGTGTGGTGAGAATTATTACTATTCTGAAAGAAATCTAATGAAAACATTGAATAATCTCACATATCAATTCGACCTTACGCCATCCGAGATTGATGCAATCGATCTCGACTACTTAGCTGAAGCTGTCGATTACGCTGAACAAAGCGTGAAAAAGACGGCAATGGTTGAAGATGCACCCAATCCTGTACAAGAAGTAGTGAGCAACAAAGTGTCCACTGTAGTTGATCCAATTATACCAAATGCGGTGCCAGCCACGAATAAAGTGGAGCAAGCGTGGACAATACAGATTGGCGATATCACTGTGCCACTCGTAGCAATTGAAGAGACGCCAGTCGTCAGTGGAATCATTGGTTCATTGAAATCAACCGGTTTCTCGGTTGAGGAAGCAACTGAAAAGCTAGTGGAAACTGAAATTCCACAGTCCAAAATTGAGGAAGCAGTGCATCTGGCACTAGAAGTCGGAAACGAGATTGCTGAGAAAAGACCTGACTTGAAATTAATACCATACTGGAGTGCTAGTTTGGAGATGCGCAAAAGAATCAGGAAACACATTAACGATGCTCGCGAAATGACTAGGTTGGTCAAAGAGCGACAGGATAAAGACAAGCAAATCTTTGATTCTCTAGAGAGACAGCTCAATCTGAAAGCCAGAAGGAAGGAACAGGTCATCGTCTGTGATCAAAGAGGAACTCTAAAGTGGAAAAAGCGACAGCAACGCAAAATGAGCAGGAAAGTCTTGCAAGGATGTGATTCTGTTATCACAAAAATTCACGGTATCTCTGAATATGAGCTTCAGCATACCGATTTTTCCACTCCTGGCATTAAATGCGCAACATCGAGGAAAGTCCAAAGGAAAAAGAAGGGAAGTCAGTCCAAGATAATTGGTAGCAGAAAAATCAATTATGTCATGAGAAATATGTGTGATGTAATCATAGAAAAGAATATCCCTGTTGAATTAATAACAAAGCGATGCAAGAGAAGAATCTTCCGTAAAGCCGGTAGAAACTATGTGCAACTGAGACACATGGATGGTATCAATGCTAAACGAGATGTGAGAAGTTCACCAGAAATGGAGAAGCTATTCACGCAGTTTTGCAGGTTTCTGATTAGGAAGCAAACAGTTAAAGCAAAAATGTTGGCACATGGTTCAAGTGGCCTAATTTTTAAGCCAAAGTTTGGTGATAAAATAGGTCGATATTTCGGTGATTACTTCATCGTTCGTGGACGCTATGAAGGGAAACTGTTTGATGGGAGATCCAAGTTATCAAATCCAGTGCGATTCAAGATGGAGCAGTATAGTGATGTGGCCGAGAAATTTTGGCTCGGTTTTAACAGGGCCTTCTTGCGGCATAGGAAGCCAACGGATCATGTATGTACATCCGACATGGATGTTACAATGTGTGGTGAAGTAGCTGCCTTAGCAACGATAATCCTGTTTCCGTGTCACAAGATAACTTGTAACACTTGCATGAACCGGGTAAAGGAAAGAGTCATTGATGAAGTCGGTGAAGATCTAAATTGTGAACTTGGACGTTTACGTGAAACTCTTTCGTCGTACGGAGGCTCATTCGGGCATGTCTCAGCGTTACTTGATCAATTGAACAGAGTTTTGAATGCACGCAACACGAATGATGGAGCTTTTAAGGAAATAGCAAAGAAAATCGATGATAAGAAAGAAAGCCCCTGGACCCACATGACAGCCATCAATAATACGCTCATTAAAGGTTCGTTAGCAACTGGCTACGAATTTGAAAGAGCGTCTGATAATCTTCGAGAGATTGTGAGATGGCATCTCAAAAGAACGGAATCAATAAAGGCTGGCAGTGTTGAGAGCTTTAGAAATAAACGGTCTGGAAAAGCTCATTTTAATCTAGCTCTTACATGTGATAACCAATTGGACAGGAATGGTAACTTCGTGTGGGGTGAGAGACAATATCATGCCAAAAGATTCTTTGCTAACTATTTTGAGAAAATTGATCACAGTAAGGGTTATGAGTACTACAGTCAGCGCCAAAATCCAAATGGTGTCAGGAAAATTGCAATTGGAAACTTGATATTCTCAACAAATTTGGAGAGGTTTCGACAGCAAATGGTTGAACATCACATTGATCAAGGACCAATCACCCGTGAGTGTATCGCATTGCGCAATAACAATTACGTTCATGTGTGTAGTTGCGTTACCTTGGATGATGGAACTCCAGCAACAAGTGAGTTGAAGACTCCAACCAAGAATCACATTGTTCTTGGTAATTCTGGTGATCCTAAGTATGTTGACTTACCGACTCTTGAGTCTGAATCAATGTACATAGCTAAGAAAGGATACTGCTACATGAACATCTTTTTGGCGATGCTCATAAACATACCTGAGAATGAGGCGAAGGATTTTACGAAGAGAGTTCGTGATCTTGTGGGTTCAAAACTTGGAGAATGGCCAACGATGTTAGATGCTGCCACATGCGCCAATCAGTTGGTTATTTTTCATCCTGACGCAGCTAATGCGGAATTGCCAAGAATTCTGGTGGATCACCGACAGAAGACAATGCATGTCATTGATTCGTTCGGATCAGTGGATTCTGGATACCACATATTAAAAGCAAACACAGTCAATCAGCTGATTCAATTTGCCAGAGAACCACTTGACAGTGAGATGAAACACTATATAGTTGGCGGAGAATTTGATCCAACGACTAGTTGCTTGCACCAGTTGATTCGTGTCATTTACAAGCCTTATGAACTCCGAGATTTGCTCAGAAATGAACCGCATTTAATTGTGATTGCATTGATGTCACCAAGCGTGCTTTTAACTCTGTTCAATAGCGGTGCAATTGAACATGCGTTGAATTATTGGATCAAAAGGGATCAAGATGTTGTTGAAGTTATAGTCTTGGTGGAGCAATTGTGCAGGAAAGTAACGCTTGCTAGGACAATCATGGAGCAATTCAACGAAATTCGTCAAAATGCAAGAGACATACATGAGCTGATGGATCAAAATAGTAAACCTTGGATTTCATATGATCGTTCATTAGAGTTATTGAGTGTGTATGCAAATTCACATTTAACAGATGAAGGCCTACTCAAGCAAGGATTTTCTACACTGGACCCTAGACTACGTGAAGCTGTTGAAAAAACCTACGCCGCTCTTTTGCAGGAAGAGTGGCGTGCTTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCATTTAAGATACTTTGCGTTCAAATCACAATCACCTTTTTCCGAGTATTTAAAGCCAAAAGGGCGCGCAGATTTAAAAATTGTGTACGACTTCTCACCGAAGTACTGTGCACACGAGGTCGGAAAGGCGCTGCTACAGCCAATCAGAGCTGGAGCTGAAATAACATCGCAAATTGTTAGTGGCTGCGGAACATTCATTCGGAAAAGCGCTGCAAAAGGTTGTGCTTACATTTTCAAGGATCTTTTTCAGTTCGTGCACGTAGTTTTAGTTTTAAGTATTCTACTGCAAATATTTAGGAGCGTGCAAGGAATCGCCATGGAGCATATACAATTAAAGCAAGCAAAGGCAGAAATGGAAAGACAGAAAGATTTTGATCAGTTAGAAGCTCTATACACCGAACTGTGTGTCAAGAGCGGTGAACAGCCAACAGCAGACGAATTTCTTGATTTCGTGACAGAACGTGAACCAAGGCTCAAGAATCAAGTCTGCAACTTGATTCACATACCAGTGATACACCAAGCAAAATCTGACAATGAAAAGAAACTTGAGCAAGTAATCGCATTCATCACATTAATTTTGATGATGATTGACGTGGATAAGAGTGATTGTGTGTATAGGGTCTTGAACAAGTTTAAGGGTGTGATAAAGTCTTGTGATACAAGTGTTTATCACCAATCTTTAGATGACATTCAAGACTTCTATGAAGACAAACAATTGACGATTGATTTTGATATCACTGGAGAAAATCAAATTAATCGTGGTCCCATAGACGTCACGTTCGAGAAATGGTGGGATAACCAACTGTCCAACAACAACACGATTGGCCATTATCGAATTGGCGGAATGTTCATTGAATTCTCACGAAGCAATGCAGCTACTGTGGCTAGTGAAATAGCTCACAGTTCTGAACGTGAGTTCTTAGTCCGTGGAGCTGTTGGTAGTGGCAAGTCAACAAACCTTCCGTTTCTGCTTAGCAAACATGGCAGTGTGTTGTTAATAGAACCTACTCGACCCCTTTGCGAGAACGTTTGTAAGCAATTACGCGGTGAACCGTTCCATTGTAATCCAACCATTCGCATGCGTGGGCTAACGGCTTTTGGTTCTACTAACATCACGATCATGACAAGTGGATTTGCCTTGCATTACTATGCTCACAACATCCAACAATTGAGACTCTTTGATTTCATAATCTTTGATGAATGTCACGTTATAGACAGCCAAGCCATGGCTTTCTATTGTTTAATGGAAGGAAATGCAATTGAAAAGAAGATCCTTAAAGTTTCTGCCACGCCACCTGGGCGTGAAGTTGAGTTTTCAACACAGTTCCCAACGAAGATTGTGACTGAGCAATCTATCAGTTTTAAACAGCTGGTAGACAATT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| 35,254
|
MT747167.1
|
Papaya ringspot virus
|
Medina-Salguero,A.X., Cornejo-Franco,J.F., Grinstead,S., Mowery,J., Mollov,D., Quito-Avila,D.F., Medina,A.
|
Escuela Superior Politecnica del Litoral, Centro de Investigaciones Biotecnologicas del Ecuador
|
Ecuador
|
2021-06-14
|
Mild_Los_Rios
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,320
|
GenBank
| 1
|
Ecuador
|
Ecuador
|
Carica papaya
| null |
2018-03-27
| null | null |
Papaya ringspot virus strain PRSV-mild, complete genome
|
AAATAAAACATCTCAACACAACATAATCAAAAGCACTTTAACAAACATCAACTCATTTCATTTTCAACTATCATAGCAAGCAACAATGTCTTCTTTGTATACTCTGCGACCAGTAGCTCAGCGCGATAGGAGGTTAGAGAGCAGTAAAGGTTCTGGCTGGCTCGAGCACAAACTCGAAAGGAAAGGGGATAGAGGAAACACTCACTATTGTAGTGAGTTTGACATTAGCGAGGGCGCCAAAATTCTGCAATTGGTGCAAATTGGTAACACTGAAGTTGGAAGAACCTTTCTGGAAGGTAACAGATTTGTCCGTGCGAACATATTTGAGATCATCCGGAAAACCATGGTTGGTCGTCTGGGGTACGATTTCGAGAGTGAATTATGGTTTTGTCACAACTGCAATGAAACTTCTGAAAAATACTTTAAGAAATGTGATTGTGGGGAAAAATATTACTATTCTGAAAGAAACTTGATGACAACAATGCAAAACCTGATGTATCAGTTTGATATGACACCATCGGAGATCAACTCCGTCGATTTCAATTATCTTGCTGATGCAGTTGATTACGCTGAACAATCAGTCGAGAGATCTCAAGTTCCGGACTCTGTGGAACTTGTAATGATGGAACCAATTGAGGCTAGTGAGGAAGGTATTCCAATGGTTTTTGAACCGGAGGTTGTGCCTATAACCGCTAAAGTTGAAGAAGCATGGACGATATTGATTGGGGAAATTCCTGTCCCACTTGTCGTCATTGAGGAAACGCCAATTATCAGTGGCGCGAATGGAACTCTGGGCTCAACTGGTTTCTCACTTGAAGCTGACACCACAAAATTGATGGAGAAGGAAGTCCTCCAGGAAAAGTTGAAAGAAGCAGTGCATCTGGCACTCGAAGTTGGTAACGAGATTGCTGAGAAGAAGCCCGAATTCAAGCTGATACCATATTGGAGTGCTAGTCTCGAATTGCATAAGAGAATTCGTAAGCATAAGGAGCATGCTAAGATTGCAGCAATTCAAGTTCAGAAGGAAAGAGAAAAAGAACAAAAGGCATTCTCAGCTCTGGAGTTAAGGCTTAACTTAAAATCCAGGAGAAGAAATCAAACTATAGTCTGTGACAAAAGAGGCACACTTAAATGGAAAACCCGGCAATGTTATAAGAGGAGTAGACTAATGCAACAAGTAAATGATTCAGTTGTCACTCAAATTCACTGTGGTCTTGTTCATGAAACTCAATATACTGAACCGCACCTTCCTGGCATTAAGCGAGCTACATCTAAGAAGGCCTGCAAACCGCGCAGGCAATCGAAAATTGTTGGCAATAACAAGATAAATTATGTCATGAAAAATCTGTGTGACACAATTATCGAAAGAAGCATTCCTGTGGAGCTTATTACGAAGCGATGCAAGAGAAATATTCTTCAAAAGGAAGGTAGAAGCTATGTGCAGTTGAGGCACATGAATGGCATTCGTGCACAAAAAGATGTGAGCAGCTCGCCTGGTATGGAGCAGTTATTTACACAATTTTGCAAATTTCTTGTTGGACATAAATCACTCAAATCCGGAAATCTGACGTTCGGTTCTAGTGGTCTGATTTTCAAGCCAAAGTTTGCCGACAATGTGGGGCGATACTTTGGTGACTATTTCATTGTCCGAGGACGCCTTGGAGGTAGGCTATTTGACGGTAGATCAAAACTAGCGAGATCGGTCTATGCCAAGATGGAGCAATACAATGATGTGGCTGAGAAATTCTGGCTCGGTTTTAATAGAGCTTTTCTACGGCATAGGAAACCGACGGATCACACTTGCACATCTGACATGGATGTTACACAGTGTGGGGAGGTAGCAGCTCTTGTGACTATAATCCTGTTTCCGTGCCACAAAATAACTTGCAACACTTGCATGAGTAAAGCAAAGGGAAGAGTTATTGACGAAGTCGGTGAGGATTTGAATTGTGAGCTTGAACGTTTACGTGGAACTCTTTCATCATATGGAGGGTCATTCGGGCATGTCTCAATATTACTTGATCAACTAAACAGAGTCTTGAATGCGCGGAACATGAACGATGGAGCTTTTAAAGAAATTGCGAAGAAGATTGATGCAAAGAAAGAGAGGCCTTGGACTCACATGACGGCTATCAACAACACGCTCGTTAAAGGTTCGCTAGCAACTGGCTACGAGTTTGAAAGAGCGTCTGATAGTCTCCTAGAGATCGTGAGATGGCATCTCAAAAGGACAGAATCGATAAAAGCTGGCAGCATTGAAAGTTTTAGAAATAGGCGTTCTGGAAAAGCTCACTTCAACCCAGCTCTTACGTGTGATAATCAGTTGGACAGGAATGGTAATTTCTTATGGGGAGAAAGACAATACCATGCTAAACGATTCTTTGCCAACTATTTTGAGAAAATTGATCATAGTAAGGGTTATGAATACTATAGTCAACGCCAAAACCCGAATGGTGTCAGGAAAATTGCCATTGGCAATTTAGTATTTTCAACAAATTTGGAGAGATTTCGGCAGCAAATGGTTGAACATCACATTGACCAAGGACCAATTACTCGTGAGTGCATCGCATTACGCAATAACAATTATGTTCATGTATGTAGTTGCGTAACCTTAGATGATGGAACTCCAGCAACAAGCGAGTTGAAGACTCCTACCAAGAATCACATCGTTCTTGGTAATTCTGGTGACCCTAAATATGTTGACTTGCCGACTCTTGAGTCTGATTCGATGTACATAGCCAAAAAAGGTTATTGCTACATGAACATTTTTCTAGCGATGTTAATAAACATACCTGAGAATGAGGCGAAGGATTTTACAAAGAGAGTTCGTGACCTTGTGGGTTCAAAACTTGGAGAGTGGCCAACGATGTTAGATGTTGCAACATGCGCAAACCAGCTAATAATCTTTCATCCTGACGCAGCCAATGCAGAATTGCCGCGAATTTTAGTGGACCACCGACAGAAAACAATGCATGTCATTGACTCTTTTGGTTCCGTGGATTCTGGATATCATATATTGAAGGCAAACACAGTTAACCAGTTGATTCAATTCGCTAGGGAACCACTTGATAGTGAAATGAAGCATTACATCGTCGGTGGAGAATTTGACCCAACTACTAACTGCTTGCATCAGTTGATTCGTGTTATTTACAAGCCTCATGAACTCCGGAACTTGCTCAGAAATGAACCGTACCTAATTGTGATTGCATTGATGTCACCAAGCGTGCTTTTAACTTTGTTCAATAGTGGTGCGATTGAGCACGCGTTGAATTATTGGATTAAGAGAGATCAAGATGTTGTTGAGGTCATAGTTTTAGTGGAGCAATTGTGTAGGAAAGTGACGCTTGCTAGAACAATACTGGAGCAGTTTAATGAGATTCGTCAAAATGCGAGAGATATACATGAGTTAATGGATCGAAACAATAAGCCTTGGGTTTCATATGATCGCTCATTGGAACTATTGAGTGTGTATGCGAACTCGCAGTTGACAGATGAAGGTCTACTCAAGCAAGGATTTTCAACATTAGATCCTAGGTTGCGTGAAGCTGTGGAAAAAACCTACGCCACTCTATTGCAGGAAGAATGGCGTGCGTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGGTACTTTGCATTCAAATCACAACCGTCTTTTTCCGAGTATTTAAAGCCAAAAGGGCACGCAGATTTGAAAATTGTATACGACTTCTCACCGAAGTATTGTGTACACGAGGTCGGAAAGGCGCTACTACGACCAGTCAAGGTCGGAGCTGAAATCACATCGCGGATCATTAATGGTTGCGGAACTTTCATTCGGAAGAGTGCCGCGAGAGGCTGTGCTTACATTTTCAAGGACCTTTTCCAGTTCGTACATGTAGTACTAGTTTTAAGCATCTTATTACAGATTTTTAGGAGTGCGCAAGGAATTGTCACAGAGCATATACAATTAAAGCAGGTGAAAGTAGAAGTGGAGAAACAGAAAGATTTTGATCGTCTGGAGGCTCTATACGCTGAATTGTGCGTAAAGAGCGGTGAGCAACCGACTGCTGAAGAATTTCTTGATTTTGTAGTGGAGCGTGAACCAAGGCTTAAAGACCAAGCTTACAGTTTAATTCACATACCAGTGATTCATCAAGCAAAATCGGACAATGAGAAAAAACTCGAGCAAGTTATTGCATTCATTACATTAATTTTAATGATGATCGACGTGGACAAAAGTGATTGTGTTTATAGAATCTTGAATAAGTTTAAAGGTGTGATGAAATCTTGTAACACAGATGTTTACCACCAGTCTTTAGATGACATTCGGGATTTTTATGAAGACAAGCAGTTGACTATTGATTTTGATATTACTGGAGAAAATCAAATCAATCGAGGACCTATAGACGTCACGTTCGAGAAATGGTGGGATAACCAATTATCCAACAACAACACGATCGGTCATTATCGAATTGGAGGAATGTTTGTTGAATTTTCACGGAGTAATGCAGCCACTGTGGCTTGTGAGATAGCTCATAGTCCTGAGCGTGAGTTTCTGGTTCGCGGAGCTGTTGGCAGCGGTAAATCAACGAATCTTCCTTTCTTGCTTAGTAAGCATGGCAGCGTATTGTTAATAGAGCCTACCAGACCTCTTTGTGAGAACGTTTGTAAGCAGCTACGTGGTGCACCATTCCATTGTAATCCAACAATTCGCATGCGTGGATTGACGGCTTTCGGTTCTACCAACATCACAATAATGACAAGCGGATTCGCTTTACATTATTATGCTCACAACATTCAACAATTAAGACTCTTTGATTTCATAATTTTTGATGAATGTCATGTCATAGATAGCCAAGCCATGGCCTTCTATTGTCTGATGGAAGGGAACGCTATTGAAAAGAAGATCCTTAAAGTTTCTGCTACGCCACCTGGGCGTGAGGTTGAGTTTTCAACACAATTCCCAACAAAGATTGTAACTGAACAATCCATAAGCTTCAAACAATTGGTTGACAACTTTGGTA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| 41,547
|
MW030522.1
|
Papaya ringspot virus
|
Maheshwari,Y., Selvaraj,V., Hallan,V.
|
CSIR - Institute of Himalayan Bioresource Technology, Plant Virus Laboratory
|
India
|
2021-06-08
|
Palampur
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,317
|
GenBank
| null |
India: Palampur, Himachal Pradesh
|
India
|
Carica papaya
|
plant leaf
|
2018-11
| null | null |
Papaya ringspot virus isolate Palampur, complete genome
|
AAATAAAACATCTCAAAAAACACAATTAAAAACAATCAAACAAACTTCAAATTTATTCACTATCGAATCTCACAACAAGCGATCATGTCTCTCTTGTACACATTACGACCTGCTGCTCAACACGATAGGAGGTTGGAAACAATTAAGGGTTCTGGCTGGATCGAGCACAAGCTTGAACGAAAAGGTGATAGAGGCAACACTCACTACTGTAGTGAGTTTAACATAAGTAAGGGTGCTAAAATTCTGCAACTAATTCAAATTGGCACTGCTGAAGTTGGAAGAACTTTTCTGGAAGGTAGTAAGTTTGTCCGTGCCAACATTTTTGAAATCGTCAGAAAGACGATGGTTGGGCGTCTGGGGTATGACTTCGAGTGCGAGCTATGGTTTTGTCATACGTGTGACAGAACATCTGAAAAGTACTTCAAGAAATGCGCATGTGGTGAAAATTATTATTATTCTGAAAGAAATCTAATGACAACATTGAATGACCTCACGTATCAATTCGACCTGACGCCATCCGAAATTGATTCAATCGGTTTCGACTACTTAGTTGAAGCTGTTGATTACGCCGAACAAAGTGCGAAAAGACGGCAAGTTGAGGAACCCACTCCTGTACAAGAAGCGGCAGTTGACAAAGTAAACACTGTGGTTGAACCAATTGTAACAAACTTGGCTCCAGTCGCGGATAGGGTGAAGCAAGCATGGACAATACAAATTGGCGATATTACTGTGCCACTTGTGGCAATTAAGGAAACACCAGTTGCTAGTGGAGTCATTGGCTCCTTAGAATCAACCGGGTTCTTTGTTGAAGCAACGACTGAAAAGACGTTAGAAGTTGAAATTCCACAGTCCAAAATTGAAGAAGCAGTGCATTTGGCACTAGAGATTGGAAACGAAATTGCTATTAAGAAACCTGAGTTGAAGTTAACACCATACTGGAGTGCTAGTTTGGAGATGCGCAAAAGAATCAGGAAATGCATCAATGACGCTCGCGAAATGACTAGGTTGGTCAAAGAACGGCAGAACAAAGATAAGCAAATTTTTGACTCCTTAGAGAGACAACTTAATCTGAAAGCCAGAAGGAAAAACCAAGTTATCATTTGTGATCAAAGAGGAACTCTGAAATGGAAGAAGCGACAGCAGCGTAAAGCGAGCAGGAAGGTCTTACAAGGGAGCGATTTTGTCGTCACAAAAATCCATGGTGTTTTTGACTTCAAACCTCGGTGTATCGATTTTGGCACTCTTGGTATCAAGTGTGCGACATCGAGGAAGGCTTTAAGGAAAGAGAAAGGAAAACAGTCCAAGATAATTGGTAACAACAAAATTAATTATGTCATGAAACATCTGTGTGACATAATCATAGAAAAGGACCTCCCTGTTGAATTAATTACAAAGCGATGTAAGAGGAAAATCTTCCGCAAAGCCGGTAAGAATTATGTGCAACTAAGGCACATGGATGGTATCAATGCTAAACGGGATGTAAGAAGTTCACCAGGAATGGAGAAGTTATTCACGCAATTTTGCAAGTTCCTAATTAGGAAGCAAACAGTTAAAGCAAAGACGCTGACGCATGGTTCAAGTGGCCTAATTTTCAAGCCAAAATTTGGTGATAAAATAGGTCGATATTTTGGTGATTACTTCATCATTCGTGGACGATATGAAGGGAAACTTTTTGATGGGAGATCGAAGTTATCAAATCCAGTGCGATTCAAGATGGAGCATTATAGTGAAGTAGCCGAGAAATTTTGGCTCGGCTTCAACAGGGCCTTCTTGCAACATAGGAAGCCAACAGATCACGTGTGTACATCTGACATAGATGTCACAATGTGCGGTGAAGTAGCTGCTTTAGCAACCATAATTCTGTTTCCATGTCATAAGATAACTTGCAACACTTGTATGAATCGAGTAAAAGGGAGAGTTATTGACGAGGTCGGTGAAGATCTAAATTGTGAGCTTGAGCGTTTGCGTGAAACTCTTTCATCATATGGAGGATCATTCGGGCATGTTTCAACATTGCTTGATCAATTGAATAAAGTTTTGAATGCACGTAACACGAATGATGGAGCTTTTAAGGAAATAGCAAAGAAAATCGATGACAAGAAAGAAAGTCCTTGGACCCACATGACAGCCATCAATAATACGCTTATCAAAGGTTCGTTAGCAACTGGCTACGAATTTGGGAAAGCATCTGATAATCTTCGAGAAATTGTGAGATGGCATCTCAAAAGGACGGAATCAATAAAGGCTGGCAGTGTTGAAAGTTTTAGGAATAGACGATCTGGAAAAGCCCACTTCAATCTCGCTCTCACGTGCGACAACCAGTTGGATAGAAATGGTAATTTCTTGTGGGGTGAGAGACAATATCACGCTAAAAGATTCTTTGCTAATTATTTTGAGAAGATTGATCACAGTAAGGGATACGAACACTATAGTCAACGCCAAAATCCAAACGGCACCAGGAGAATTGCTATTGGAAACTTGATATTTTCAACAAACTTGGAGAGATTCCGGCAGCAAATGGTTGAACACCACATTGATCAAGGACCAATTACCCGTGAGTGTATTGCATTGCGCAATAACAACTATGTTCATGTTTGTAGTTGTGTAACCTTAGATGATGGAACTCCAGCAACAAGTGAATTAAAGACTCCAACCAAGAATCACATTGTTCTTGGTAATTCTGGTGATCCTAAGTATGTCGATTTACCGACTCTTGAGTCTGATTCGATGTACATAGCTAAGAAAGGTTACTGCTACATGAACATCTTTCTGGCGATGCTCATAAACATACCTGAGAATGAGGCGAAGGATTTCACGAAGAGAGTTCGTGATCTTGTGGGTTCAAAACTCGGGGAGTGGCCAACGATGTTAGATGTTGCAACATGCGCCAACCAGTTAACCATTTTTCATCCTGATGCAGCTAATGCGGAATTGCCAAGAATTCTAGTGGATCACCGACAGAAGACAATGCATGTCATTGATTCGTTCGGATCAGTGGATTCTGGATACCACATATTGAAAGCAAACACAGTTAATCAACTGATTCAATATGCCAGAGAACCACTTGATAGTGAAATGAAACACTATATTGTTGGCGGAGAATTTGATCCAACTACTAGCTGCTTGCACCAATTGATTCGTGTCATTTACAAGCCTCATGAACTCCGAAATTTGCTCAGAAACGAACCATACTTGATTGTGATTGCATTGATGTCACCAAGTGTGCTTCTAACTCTGTTCAATAGCGGTGCAATCGAACACGCATTGAATTATTGGATTAAAAGAGATCAAGATGTTGTTGAAGTTATAGTCTTGGTAGAGCAATTGTGCAGGAAGGTGACGCTCGCTAGAACTATCATGGAGCAATTTAATGAAATTCGTCAGAATGCAAGAGACATACATGAACTAATGGATCGAAATAGTAAACCTTGGATTTCATATGATCGTTCATTGGAACTATTGAGTGTGTACGCAAATTCACAGTTGACGGATGAAGGTCTACTCAAGCAAGGGTTTTCTACACTGGATCCTAGACTGCGCGAAGCTGTTGAAAAAACCTACGCCGCTCTTTTGCAGGAAGAGTGGCGTGCTTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGATACTTTGCGTTCAAATCACAATCGTCTTTTTCCGAATATTTAAAGCCAAAAGGGCGCGCAGATTTAAAAATTGTGTACGACTTCTCACCGAAGTATTGTGCACACGAGGTCGGAAGGGCGCTGCTACAGCCAATTAGAGTTGGAGCTGAAATAACATCGCGACTTGTCAATGGCTGCGGAACGTTCATTCGGAAAAGCGCTGCAAGAGGTTGTGCTTACATCTTCAAGGATCTTTTCCAGTTCGTACACGTAGTGTTGGTTTTGAGCATTTTACTGCAAATATTTAGGAGCGCGCAAGGAATCGCCATGGAGCATTTACAATTGAAGCAAGCGAAGGCAGAAGTGGAGAGACAGAGGGATTTTGATCGGTTAGAAGCTCTATATACTGAACTGTGTGTTAAGAGCGGTGAACAACCGACAGCAGATGAATTTCTTGATTTTGTGATGGGACGTGAACCAAGGCTCAAGGATCAAGCCTACAGCTTGATTCACATACCAGTGATACATCAAGCAAAATCTGACAATGAAAGGAAACTTGAACAAGTCATCGCATTTGTAACATTAATTTTGATGATGATTGATGTGGATAAGAGTGATTGTGTTTATAGGATCTTAAATAAATTTAAGGGCGTGATAATTTCTTGCAACTCAAGTGTTTATCATCAGTCCTTAGATGACATCCAGGACTTCTATGAAGACAAGCAATTGACTATTGATTTTGACATCACTGGAGAAAATCAAATTAATCGTGGGCCTATAGATGTCACGTTCGAGAAATGGTGGGATAACCAACTGTCCAACAACAATACGATTGGCCATTATCGAATTGGGGGAGCGTTTATTGAATTCTCAAGAAGCAATGCAGCTACTGTGGCTAGTGAAATAGCCCACAGTCCTGAACGCGAGTTCTTAGTTCGCGGAGCCGTTGGTAGTGGCAAATCAACAAACCTTCCGTTTCTGCTTAGTAAGCATGGCAGCGTATTGCTTATAGAGCCTACTCGACCCCTTTGCGAGAACGTTTGTAAGCAACTACGTGGTGAACCGTTCCATTGTAATCCAACCATTCGCATGCGTGGACTAACGGCTTTTGGTTCTACCAACATCACAATCATGACAAGTGGATTTGCTTTACATTACTACGCTCACAACATTCAACAATTGAGGCTCTTTGACTTCATAATTTTTGATGAATGTCACGTTATAGATAGCCAAGCCATGGCTTTCTATTGTTTAATGGAAGGAAACGCGATTGAAAAGAAGATTCTTAAAGTTTCCGCCACGCCACCTGGGCGTGAAGTTGAGTTCTCAACACAGTTTCCAATAAAAATTGTGACTGAACAATCCATCAGTTTCAAACAGTTGGTAGATAATTTCGGCAC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| 41,626
|
MT470188.1
|
Papaya ringspot virus
|
Tran,T.T.Y., Chen,C.H., Wang,C.H., Yeh,S.D.
|
National Chung Hsing University, Plant Pathology
| null |
2021-03-17
|
PRSV strain P / mutant HA 5-1
|
Papaya ringspot virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,326
|
GenBank
| null |
USA: Hawaii
|
USA
|
Carica papaya
| null |
1984
| null | null |
Papaya ringspot virus isolate PRSV strain P / mutant HA 5-1, complete genome
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AAATAAAACATCTCAACACAACATAATCAAAAGTACTTCAACAAACATCAATTTATCTCATTTTCAATTGTCATAACAAGCAACAATGTCTTCTTTGTACACTCTTCGAGCAGCAGCTCAGTACGATAGGAGGTTGGAAAGCAAGAAAGGTTCTGGTTGGGTCGAGCACAAACTCGAAAGGAAAGGTGAGAGAGGAAACACTCACTATTGTAGTGAGTTTGACATTAGTAAGGGTGCCAAAATCCTGCAATTGGTGCAGATTGGTAACACTGAAGTTGGAAGGACCTTCCTGGAAGGTAACAGATTTGTTCGTGCGAATATATTTGAGATTATCCGGAAAACCATGGTTGGTCGTCTGGGATATGATTTCGAAAGTGAACTATGGGTCTGTTGCAACTGTGACAAAACTTCTGAAAAATACTTCAAGAAATGTGACTGTGGGGAAACATATTATTATTCTGAAAGAAACCTGATGAGGACAATGAATGACCTGATGTATCAGTTTGACATGACACCATCAGAGATCAATTCTGTCGATCTCGAATATCTTGCTAATGCGGTGGACTATGCTGAACAGTTAGTCAAGAGATCTCGAGTTCCGGAACCTGTGGGACTTGCAATGATGGAACCAATTGTGGCTAGTGGGGAAGGTATTCTAATGGTTTCTGAACCAGAAGTTATGCCCGTAACTACCAAAGTTGAAGAAGCATGGACAATACAGATTGGGGAAATTCCTGTCCCACTTGTCGTCATCAAGGAAACGCCAGTTATCAGTGGTGTGGATGGAACTCTGAACTCAACTGGTTTCTCACTTGAAGCTGATATTACAAAACTGGTGGAAAAGGAAATCCTTCAGGAAGAGGTGAAAGAAGCAGTGCACCTGGCACTCGAAGTTGGTAACGAGATTGCTGAGAAGAAGCCTGAATTCAAGCTAATACCATATTGGAGTGCTAGCCTTGAGTTGCACAAGAGAATTCGTAAGCATAAGGAGCATGCTAAGATTGCAGCAAGTCAAGTTCAGAAGGAAAGAGAAAAAGACCAAAAGGTATTCTCAGCTCTGGAGTTAAGGCTTAACTTAAAATCCAGGAGAAGAAATCAAGCTGTAGTTTGTGACAAAAGAGGCACACTTAAATGGAAGACCCAAAGAGGTCACAAGAAGAGTAAATTAATGCAACAAGCAAGTGATTTTGTTGTCACTCAAATTCATTGTGATTTTGGTTGCAAAACTCAATATTCTGAACCTCACATCCCTGGCATTAAGCAATCTACATCTAAGAAGATCTGCAAACCGCGCAAGCATTCGAGAATTGTCGGTAATAGCAAGATAAATTATATCATGAAAAATCTTTGTGACACAATTATTGAAAGAGGCATTCCTGTGGAGCTTGTTACGAAGCGATGCAAGAGAAGAATTCTTCAGAAAGAGGGTAGAAGCTATGTGCAGTTGAGGCACATGAATGGCATTCGTGCACGACAAGATGTGAGCAGTTCGCCCGATATGGAGCTGTTATTTACGCAATTTTGCCAATTCCTGGTTGGACATAAACCACTCAAATCCAAAAATCTGACGTTCGGTTCTAGTGGTCTGATTTTCAAGCCGAAGTTTGCCGACAACGTGGGGCGATATTTTGGCGACTATTTCGTTGTTCGAGGACGTCTTGGAGGTAAGTTATTTGATGGTAGATCAAAACTAGCAAGATCGGTCTATGCCAAAATGGATCAATACAATGACGTGGCTGAAAAATTCTGGCTTGGTTTTAATAGGGCTTTTCTGCGGCATAGAAAACCAACAGACCACACTTGCACGTCTGACATGGACGTTACAATGTGTGGGGAGGTAGCAGCTCTTGCAACTATAATCCTGTTTCCGTGCCACAAGATAACTTGCAACACTTGCATGAGCAAAGTAAAGGGAAGAGTAATTGACGAAGTTGGTGAGGATTTGAATTGTGAGCTTGAACGTTTACGTGAAACTCTTTCAGCATATGGAGGGTCATTCGGACATGTCTCAACATTACTTGATCAATTAAACAGAGTTTTGAATGCGCGGAACATGAACGATGGAGCTTTTAAAGAGATTGCGAAGAAGATTGATGAAAAGAAAGAGAGTCCTTGGACTCACATGACAACCATCAACAACACGCTCATCAAAGGTTCGTTAGCAACTGGCTACGAATTTGAGAGAGCATCTAATAGTCTCCGAGAGATCGTTAGATGGCACCTCAAAAGGACAGAATCAATAAAAGCTGGCAGCGTTGAAAGTTTTAGAAATAAGCGTTCTGGGAAAGCTCACTTCAACCCAGCTCTTACGTGTGATAATCAGTTGGATAAGAATGGTAATCTCTTATGGGGTGAAAGGCAGTACCACGCTAAAAGATTCTTTGCCAACTATTTTGAGAAGATTGATCATAGTAAGGGTTATGAGTACTATAGTCAACGCCAAAACCCAAATGGTATCAGGAAAATTGCCATTGGTAATTTGGTATTTTCAACAAATTTGGAGAGATTTCGGCAGCAAATGGTTGAACACCATATTGATCAAGGACCAATTACTCGTGAGTGCATTGCATTGCGTAATAACAATTACGTCCATGTATGTAGCTGCGTAACTTTAGATGATGGAACTCCAGCGACAAGTGAGTTGAAAACTCCTACCAAGAATCACATCGTTCTTGGTAATTCTGGTGATCCTAAGTACGTTGACCTGCCAACTCTTGAGTCTGATTCGATGTACATAGCTAAAAAGGGTTATTGCTACATGAACATTTTTTTAGCTATGCTCATCAACATACCTGAAAATGAGGCGAAGGACTTCACAAAAAGGGTTCGTGACCTTGTGGGTTCAAAACTTGGAGAGTGGCCAACGATGCTAGATGTCGCAACATGCGCAAATCAGCTGGTAATTTTTCATCCTAACGCAGCCAACGCAGAATTACCGCGAATTCTAGTGGATCACCGACAGAAAACAATGCATGTCATCGATTCTTTTGGGTCCGTGGATTCTGGATATCATATATTGAAGGCAAATACAGTCAATCAGCTGATCCAATTCGCTAGGGACCCACTCGATAGTGAAATGAAGCACTACATTGTCGGCGGAGAGTTTGACCCGACTACTAACTGCTTGCATCAGTTGATTCGTGTCATCTATAAGCCTCATGAACTCCGGAGCCTGCTCAGGAATGAACCGTACCTGGTTGTGATTGCATTGATGTCACCAAGTGTACTTTTGACTTTGTTCAATAGTGGTGCGATTGAGCACGCGTTGAGTTATTGGATCAAAAGAGATCAAGATGTTGTTGAGGTCATTGTTTTAGTGGAGCAATTATGCAGGAAAGTGACGCTTGCTAGAACAATCCTGGAGCAGTTTAATGAGATTCGTCAAAATGCGAGAGATTTACATGAGCTAATGGATCGAAACAACAAGCCTTGGATTTCATATGATCGCTCATTAGAACTATTGAGTGTGTATGCGAATTCGCAGTTGACGGATGAAGGTCTACTCAAGCAAGGATTTTCAACATTAGATCCTAGGTTGCGTGAAGCTGTGGAAAAAACCTACGCCACTCTTTTGCAGGAAGAATGGCGTGCGTTAAGTTTGTTTCAAAAGTTGCACTTAAGGTACTTTGCGTTCAAATCACAACCGTCTTTTTCCGAGTATTTAAAGCCAAAAGGGCGCGCAGATTTAAAAATTGTGTACGACTTCTCACCGAAGTATTGTGTACACGAGGTCGGAAAGGCGTTCCTACTGCCAGTCAAGGCTGGGGCTAAAATCGCATCGCGAATCATTAATGGTTGCGGAGCTTTCATTCGGAAGAGTGCCGCAAAAGGCTGTGCTTACATTTTCAAGGATCTTTTCCAATTTGTACATGTGGTGTTAGTTTTAAGCATTTTATTACAAATCTTTAGGAGTGTGCAAGGAATTGCCACAGAGCATATACAATTGAAGCAGGCGAAGGCAGAAGTGGAAAGACAGAAGGATTTTGATTGTCTGGAGGCTCTATACGCTGAATTGTGCGTTAAGAGCGGTGAGCAACCAACTGCTGAAGAATTTCTTGATTTTGTGATGGAGCGTGAGCCAAGGCTTAAGGATCAAGCTTACAATTTAATATACATACCAGTGATTCATCAAGCAAAATCAGACAATGAGAAAAAGCTCGAGCAAGTCATTGCATTCATCACATTAATTCTAATGATGATCGACGTAGATAAGAGTGATTGCGTTTATAGAATCTTAAACAAGTTTAAAGGCGTGATAAATTCTAGCAACACAAATGTTTATCACCAGTCTTTAGATGACATTCGGGATTTCTATGAAGACAAGCAGTTGACTATTGACTTTGATATTACTGGAGAAAATCAGATCAATCGAGGACCTATAGACGTTACGTTTGAGAAATGGTGGGATAATCAATTGTCCAACAACAATACAATTGGCCATTATCGAATCGGGGGAACGTTTGTTGAGTTTTCACGGGTTAATGCAGCCACTGTGGCTAGTGAGATAGCTCATAGTCCTGAGCGTGAGTTTCTTGTTCGTGGAGCTGTTGGTAGTGGTAAATCAACGAACCTTCCTTTCTTGCTTAGTAAGCATGGTAGTGTGTTGTTAATAGAGCCCACCAGACCTCTTTGTGAGAACGTTTGTAAGCAATTACGTGGTGAACCATTCCATTGTAATCCAACTATTCGCATGCGCGGATTAACGGCTTTTGGTTCTACCAACATCACAATAATGACAAGCGGATTCGCTTTACATTATTACGCTCACAATATTCAACAATTGAGGCTCTTTGATTTCATAATCTTTGATGAATGTCATGTCATAGATAGTCAAGCCATGGCCTTCTATTGTCTGATGGAGGGGAACGCTATTGAGAAGAAGATCCTTAAAGTTTCTGCTACGCCACCTGGGCGTGAGGTTGAGTTTTCAACACAATTCCCAACAAAGATTGTAACGGAACAATCCATAAGCTTTAAGCAGTTGGTTGACAACTTTGGTA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