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|
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KP067444.1
|
Sapovirus GII
|
Liu,X., Yamamoto,D., Saito,M., Imagawa,T., Ablola,A., Tandoc,A.O. III, Segubre-Mercado,E., Lupisan,S.P., Okamoto,M., Furuse,Y., Oshitani,H., Tandoc,A., Oshitania,H.
|
Tohoku University Graduate School of Medicine, Department of Virology
|
Japan
|
2015-07-15
| null |
Sapporo virus
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,460
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Homo sapiens
|
feces
|
2012-09-29
| null | null |
Sapovirus GII strain PHL-TGO12-028, complete genome
|
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CAATTTTTGAGGAGATTGCTGAAATTGCCAAGAGGACGGCACAGTCAGAAGGGTTAGTGCTCACCAATGTGAACTACGACCAGGCTCTCGCCACCTACGAAGCGTGGTTTATAGGTGGTGCAGGCACCGGCCAGGATAGCCCCAGTGAAGAGACTACCAAATTAGTGTTTGAAATGGAGGGCAATGCTCGCCCCGAGGGGCAAAACCCCGAGCGCTCGAATGTGCCACTGGCTTCCCCACAGGACACCATTGGCCCAAGTGCTGCGCTCTTGCTCCCAACTCAAATTGAAACTCCAAACGCCACTGCACAGCGCGTGGAGCTGGCAGCTGCAACCGGAGCAATCACCAGCAATGTTCCTAGTTGCATTAGGGAGTGCTTTGCCAGCGTCACCACGCTCCCCTGGACCACTCGCCAAGCAGCCAACACGTTCTTGGGTGCAATCCATCTTGGTCCGAGGATCAATCCCTACACCGCGCACATGAGCGCCATGTTTGCAGGATGGGGAGGTAGTTTCCAGGTTCGTGTCACACTCTCTGGCTCAGGACTCTTTGCGGGACGTGCTGTCGTGGCTGTTTTACCACCAGGGGTCAACCCGGCAAATGTGCAAAATCCAGGGGTTTTTCCGCATGCGTTCATCGACGCGCGCACCGTGGATCCCATCCTGATCAACCTGCCAGACATTCGAGCAGTTGATTATCATCGGGTCGACGGTGACGAACCTACTGCCACCGTTGGCCTCTGGGTTGCACAACCACTCATCAACCCTTTTCAGACTGGCTCGATATCCACGTGTTGGCTGAGTTTTGAGACGCGCCCCGGTCCAGACTTTGATTTCTGTCTCCTCAAGGCACCCGAGCAGGAGATGGACAATGGCGTCTCCCCCGCAAATCTGCTTCCGCGGCGCCTTGGGCGATCTCGAGGCAACCGCCTTGGTGGTCGTATAACAGGTTTGGTGGTGGTGGCCGTGGCGGAACAAGTAAACCACCACTTTGCAGCCAACTCAACAACTCTTGGCTGGTCAACGCTCCCAATTGAACCAATCGCGGGAGCCGTGTCCTGGTACAAGTCCACTGCCTCCAACAGTGTCCGGGGGTTAATTGGGGCTGCAGGCAAGGGCATCATCTTCCCAAACATTGTCAACCACTGGACAGATGTAGCACTCTCTGCCAAAAACTCGGGCCAAACCAGTCTACCCGCCCCCAATGCTGACATGAGCGGCTACCCGGGGGCTTCCGGCCCCGTGGTGATGTTCCAGAACAATGGAGATGTCAATGAGAGCTCAGCTAACCATGGCATACTTACTGCAGCCAATCATGACTTTACCACATTGACACAGACTTTTGATGCTGCTGGCACGTGGATTTGGATGCCTTGGACTTCAACCCAACCTGATGGTACACAGAACAACAACGTGTACATCAATCCAATCTGGATCAATGGCAACTCTTCCCACCCCATACACGGCAAGTGCACAAACATGACCGGCACCAACTTTCAATTTGGTGGCACTGGTACCAACAATATCATGTTGTGGCAGGAACAGCACTTTACTTCGTGGCCAGGGGCAGCAGAGGTCTACTGTTCCCAGCTTGAGAGCACTGCAGAGATGTTTCAAAACAATATAGTCAACATTCCTGCTAATCAAATGGCAGTGTTCAATGTGGAGACTGCTGGGAACACATTCCAAATTGGCATCTTGCCAAATGGCTACTGTGTCACAAATGCTGCTGTTGGTACACACCAACTCCTTGACTTTGAAACTGCATTTAGGTTTGTTGGTCTTTTCCCCCAAAGTACAACACTTCAAGGGCCCAATGGGAACGCTGGTCGGGCCGTCAGATTTCTTGAATAATGTCTTGGTTCACAGGTGCAGCTCTTGCCGCTGGTTCTGTCGTAAACATGGCCGGCACCATTTCATCTATTGTGGCACAGCACAGGCAATTGGATCTAATGGCGCAAGCTAACAAAATTCAACAGGAGTGGGTGACAAAGCAGGAGGCATTGGCTCGACGGGGTCAAGATATTTCTCAGGATTTGGCCATCAATGGCACTGCCAAGCGGGTTGAGTCCCTCATTAATTCTGGATTCACCCCAGTAGATGCCCGCCGCCTTGCCGGTGGTACTGAAACCGTGCAGTATGGACTGCTGGACAGACCCATTCTGCACCGAGAGGTTCTCACAGGCATCTCTGAAACACACCACCTCCAGTCAATGCAAGGGGTTCTCAGTGCTTTCAAACAGGGGTCCAAGTATGGTGCTCCTCCGGCACCTGCTGGTTTCATCAATCCAAATTACCAATCTGCACCCCCCCGAGTGAATTTGGGTTTCCGACCCCCATCTACCAATGTGTAAATATTCTTTTAATTCTTTTCTGTCTTTTCTTTCTTCCATTCCGTGGTTCCTCACGCGTCCGGGTGGACAATTGCGATTAAGCGATCGCAGCCACGTCTCTCTTATGG
| 86,634
|
OK484998.1
|
Sapovirus GIII
|
Liu,X., Liu,Y., Yin,G.
|
Yunnan Agricultural university, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-11-05
| null |
Sapporo virus
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,341
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2020-06-08
| null | null |
Sapovirus GIII strain YNJD, complete genome
|
GTGATCGTGATGGCTAATTGCCGTCCGTTGCCTATTGGGCATTTGCCCAACAGGATTTTTGGCACCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGCGTGCACCAAAGGAGCTGCATTCAAATTAGAGTGGCTCCAAGATCCGGTGGTCATACGGCCCCCGGAGATTTTTGTTGCGCAAGGGGTGGTTGATGACTTCTTCCGCCCCAAGCGCGTTTTGCAGGGTGACCCACAACTCATTGCACAGGTTTTGCTGGGCGACGCCAACGGGCCACTCGTTGGTCCCGTGTCCATGCAGCAGCTAACATCACTGCTGCATGAGGTGTCGCAGGCCCTGAATGACCACAAGCACCCACTGGCTGGTAGATACACTAGAGCCTCACTGCAAAGGTATGCAGACACACTGTCCAATTACATACCCCTTGTTGACATCCTAACAGGACCTAAAGACCTCACTCCGCGTGATGTTCTCGAGCAACTCGCGGCAGGACGCGAATGGGAATGTGTGCCAGACAGTGCCCTAAAGAAGGTTTTCAGGGACATGTGGCAGCACATTTATGAGGGATGTGACAGTGTGTATATAAAGCTGCAAGATGTAAAACGCAAAATGCCACACATTGACACCACTGTGCTCAAGCAGTTTTTCATCACACTTACAGATACCATATCCATGGCAACAGCCTTGGACACCAAGACGTGGCTTGCACACATATTAGGTTGGCTCAAACCCACCTGCCTAGTGATGATCATGCAACAGCATGTCAACTCTCCCCAGGGGTGGGCTGCCACGCTAACTGCTCTAGCCGAGTTGTATTATGGTATCATGCCACTGACAGAGACGCTTGGCTCCATTGCCAGTTGGGTGACCGATAAGTTCGCTGATATGGCGACCAACACCTGGAGCAAGTTTAAGACCTGGTGGGACAGCCTATATACACCACAGGCTGGCAATGACCTTATCATATTGGGGGGTGTGGTTGGGCTGGTGTACTTCATGGTGTTTGGTGACGCGCCCACCCAAATGTTCACCAAAAAGTTGATGAAGGTGTGTGGTTTTATCACCTCCACAGTGGCTGCCATCAAAGCGGCCATGTGGATAGTGGATTACTTCAAACAGCGTGAACATGAGCATCAAGTTCGTGTCACGCTGGCCAGGTGGGCTGCATTGCAAGAGGTGATCAAACAGAACAGGTGTGCTGGCCTGTCAGAAGTGACCAAACTGAAAGAGTGCTGTGAAGTGTTGTTGAACGAGGTCACCGAGCTAATGTATAAACTCGGTGCCTCCCCTTTAGCAGGATTGATACGCAGCACCTCTGACGTCATACAAACTACCATCAATGACCTGGCCCAATTGATGGCTTATGACACCCAGCGCAAGCCACCTGCCATGATAGTGTTTGGTGGACCTCCAGGCATAGGTAAGACTAGGCTAGTGGAAGCTCTAGCAAGACAGTTGGGAGAAGTCAGTCATTTCACCATGACCGTTGACCACTATGACACCTACACTGGCAACACTGTTGCAATCTGGGATGAGTTTGACGTGGACTCAAAACAAGCCTTCATTGAGGCCACTATTGGTATTGTTAACTGTGCCCCTTACCCCTTGAACTGTGATCGGCCAGAGGCAAAGGGCAGGGTGTTTACCTCCCAGTACATCTTGGCTACCACCAATTGTCCAACCCCAGTCATGCCCGACCACCCAAGAGCCATGGCCTTTTGGCGCCGCATAACATTTATTGATGTGACAGCCCCAACAATTGAACAGTGGTTGGTGGACAACCCGGGCCGCAAGGCTCCTGCCTCCCTCTTCAAGGATGACTTTTCTCACCTGCAGTGTTCAGTGCGTGGTTACACCGCTTATGATGAAAAAGGCAACACACTGAGTGGTAAAGTGGCCAGGGCTAAGTATGTGTCAGTGAACAACCTTCTCGATTTGATCAAAGAGAAGTATAACAGTGAGGCCACTGACATCAAACACTTGTGGTTCACTGTCCCACAGGCCATACACAAACAAGCCCGTGATATCATACTGGGCTGGCTGCGGTTCCACTCTTACCCGAACACAGTGGCAGACAACATACCACTGTCCGAGGTCAGGGACCCCACGTGCTTTGGGTATGTGGTCATTTCTGACGTGGATCCGCCACGACATGTGAGTGACTACGTTGCCCACATTGAGGTGGAATCAGTACTACGCACTGACATTATGGACCTGTTAAGGGAAGGTGGTGGCGGCTTGTTTAGGGCCCTAAAGGTGAAGAGCGCCCCCCGCAACAGTGTTATCAACAAGGTCATGATGCAAGCACACCACACAACCTTGCAGGTGCTCACCAATCAGGAACCAAACCCGCCAAACTTGCCGCGTCCCAGGCGCTTGGTGTTTGTGGAGTCACCCATTGACATCATCAGCGCGTTGCGGCACCACGTCGGTTTTTGCACCATCCCCGGCATTGTCAAGATGGTCACATCTGGGGTGGGTCTGGGTGTCGAAAACCTTGGAAACTTCTTGCAATCCATCGCTGGCAATGTTCGGTTCCCCCTGCAATCTGAGTGTTCATTGCTCAGGACACCCGGTGGTGACGTCCTGTTTTACACCTCAGGACAGGCTGCCGTTTGGGCCACACCTGCGCGCTTCCCGATTGTTACCCCAGGTGAGGCGTCAGTTGGCAAGGATGTTTGTGCAGAGTCTTCCTGGTGGGATATTCTCAAAGCACTTTTCAGCACACTTGTGGTGGCATTCGGGCCAATAGCCACACTGGTGTTGACAGCACACAACCTGGCATATCTGAACGCCCGTGAAGGCACACTTAGTGAGGCAAAGGGGAAAAATAAACGTGGGCGTGGCGCACGCAAAGCCATTGCTCTCAGGGATGATGAGTATGACGAGTGGCAGGACATCATACGTGACTGGCGCAAAGAAATGACTGTCCAACAGTTCCTGGACCTCAAAGAGCGCGCCCTGTCCGGTGCCTCCGACCCCGACTCGCAGAGGTATAACGCCTGGCTTGAACTGCGTGCGAAGAGATTGAGTGCTGGGGCCTACCAGCACGCGGTTGTGGACATCATTGGAAAATCAGGCCACAGGCGTGAAGTGATTCGCACACAGATGATGCGAGCCCCTCGTGAACCAAAACCAGACACCTACGACAGTGAGGGGCGTGGTTATGTGGTGCCCATGACCGCTCAGGAAAAACATACAGGCTGGTCAGTGCATATTGGTAATGGCAGGTTGGTCACTTGCACACACGTGGCCAACATGTGTGATCGTGTGGGTGATGTTGAGTTCAAAATCACTGAAACAGACCGTGACACATGCATCATCACCGCCCCACTCGGTCACCTGCCCAGTGTTGCCCTTGGGGATGGACCACCAGCCTTGTACACTACTAATTTTCACCCCATCCGTGTGCTGGATGAGGGCAGTTGGGACACTACAACCACCCGCGTCACCGGCTGGCGTGTTGTCATTAACAACGGGACCACGACTGCCCCTGGTGATTGTGGCCAACCGTACTTGAATGCACGCCGGCAGCTTGTGGGGGTGCATGCGGCAACAAGCACATGCGGGGTGAAGAAACTCGTTTCCAGGGTGCAAACTAAAAGAGCATCAAAAGCCACATTTCCTTGGAAGGGTTTACCTGTCACCAACATGCCTGATGCTGGGGGTTTGCCCACTGGCACGCGGTACCACCGCTCCACTGCATGGCCCAAGCAGCTGCCAGAGGAAACGCACGCCCCCGCCCCTTATGGTGTGAATGATCCCCGGTACCCTTTCTCCCAACACCAAATGATTGCCAACAATCTCCAACCTTACACTGCAACACCAACAAACTTGGACAAAACCTTGCTGCAGCGTGCTGTGCGACACACCAAGGGCTATTTGGATCAGGTCATTGGCACTCACAGGTCACCAAACCTCACCTACGCTGCAGCAGTCCAGTCCATGGCTCATGACACAGCATGTGGACCAAACTTGCCAGGTAGGAAGAAGGACTACATGACAGATGAGGGTGAACCAATAGGACCCTTGAAAGACATGTTGGAGGAGGCATGGGACCTTGCTCACCGGGGGGTCCCGAGGCGGCATGAGTACAAACTGGCTTTAAAAGACGAGCTGCGACCCATTGCCAAGAACGAGCAGGGCAAGCGTCGTCTACTGTGGGGTTGTGACGCCGGTGTCTCAATGGTGGCCAATGCAGTCTTCAAGCCTGTGGCAGAAAGGTTGGCTGACACAGTGCCCATGCATCCCGTTGCGGTGGGCATCTGCATGGACAGCCCCCAGGTTGAGAAAATGAACCAGGCATTAACGGGCAGTGTGCTGTACTGCATGGATTACAGCAAATGGGACTCCACGCAAAACCCGGCAGTGACGAGCGCCAGTGTCGACATCTTGGCCTCTTATGCCGAGGATACACCCCTCACCTCAGCAGCTATAGCCACACTGTGTTCACCGGCCGTCGGCCGGCTTGACGACATTGGTTTGACAGTCACAACAGGACTCCCTTCTGGCATGCCGTTCACTAGTGTCATAAACTCTGTCAACCACATGATATACTTCGCCATGGCCGTGCTTGAAGCTTATGAGGAGTTCAGGGTGCCCTACATGGGAAACATTTTTGACAATGAGACTGTCTACACATATGGGGATGATTGTGTGTACGGCCTGACACCTGCAACAGCTTCCATCATGCCGGTGGTGGTCAAAAATCTGACCAGTTACGGGTTGGTTCCAACAGCTGCAGACAAATCTCAAACCATTGAGCCCACTGACACGCCAGTGTTCCTCAAGCGTACCTTTGCACAAACACCCTTTGGGCTGCGTGCACTGCTTGACGAAACAAGTCTAGCGCGGCAGTGCTACTGGGTTAAAGCTAACCGCACTAATGATCTCTTTGAACCAGCGGCCGTTGATGTGGAAATCAGGAAAAACCAATTGGAGGTCATGCTCGCATACGCCAGCCAACATCCAAGGGCAGTGTTTGACAAGCTTGCAAACATGGTTGA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| 22,366
|
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|
Sapovirus GIII
|
Liu,X., Liu,Y., Yin,G.
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Yunnan Agricultural university, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-11-05
| null |
Sapporo virus
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,341
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2020-06-08
| null | null |
Sapovirus GIII strain YNAN, complete genome
|
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OK485000.1
|
Sapovirus GIII
|
Liu,X., Liu,Y., Yin,G.
|
Yunnan Agricultural university, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-11-05
| null |
Sapporo virus
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,350
|
GenBank
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China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2020-06-08
| null | null |
Sapovirus GIII strain YNLH, complete genome
|
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Sapovirus GIII
|
Liu,X., Liu,Y., Bi,J., Yin,G.
|
Yunnan Agricultural University, Veterinary Medicine College
|
China
|
2021-12-28
| null |
Sapporo virus
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,341
|
GenBank
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China
|
China
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Sus scrofa
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feces
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2020-06-28
| null | null |
Sapovirus GIII strain YNJD2020, complete genome
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| 34,529
|
MW285641.1
|
Sapovirus GIII
|
Liu,X., Liu,Y., Bi,J., Yin,G.
|
Yunnan Agricultural University, Veterinary Medicine College
|
China
|
2021-12-28
| null |
Sapporo virus
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,341
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2020-07-24
| null | null |
Sapovirus GIII strain YNAN2020, complete genome
|
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Sapovirus GIII
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Liu,X., Liu,Y., Bi,J., Yin,G.
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Yunnan Agricultural University, Veterinary Medicine College
|
China
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2021-12-28
| null |
Sapporo virus
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Sapovirus
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Caliciviridae
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ssRNA(+)
| 7,350
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GenBank
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China
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China
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Sus scrofa
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feces
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2020-08-08
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Sapovirus GIII strain YNLH2020, complete genome
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| 34,531
|
KX688105.1
|
Sapovirus GIII
|
Li,J.
|
Shanghai Jiao Tong University
|
China
|
2018-08-31
|
1ah
|
Sapporo virus
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Sapovirus
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Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,319
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2010
| null | null |
Sapovirus GIII isolate 1ah, complete genome
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GATGGCTAACTGCCGTCCGTTGCCTATTGGGCATTTGCCCAACAGGATTTTTAGCACCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGCGTGCACTAGAGAAGCCATGTTCAAACTAGAGTGGCTTCAAGATCCGGTTGTTATTCAACCGCCGGATATTTATGTCGCACAAGGGGTGGTGGATGACTTCTTCCGCCCCAAGCGCGTTTTACAGGGTGATCCACAGCTCATTGCCCAGGTGCTGCTTGGTGATGCCAGTGGCCCGCTGGTTGGCCCCGTTTCCATGCAGCAACTGACATCATTACTGCATGAGGTCTCGCAGGCACTGAACGACCACAAACACCCTTTGGCTAATAGATACACCAGAGCTTCTTTGCAAAGATATGCAGACACATTGTCCAATTACATACCCCTAGTGGAGATACTCACTGGGCCAAAAGACCTCACTCCACGTGACGTGCTTGAGCAACTTGCAGCTGGGCGTGAGTGGGAGTGCGTCCCAGATAGTGCTCTCAAGAAGGTTTTCCGGGATATGTGGCAATACATTTGTGAGGGGTGTGACAGTGTGTACATCAAATTGCAAGACGTGAAGCGGAAAATACCCCACATCGACACTACAGTGTTGAAGCAGTTCTTCATTGCACTCACAGACACCATATCAATGGCAACAGCCCTGGATACCAAGACCTGGCTTGCACACATCCTGGGCTGGCTCAAACCCACCTGTTTGGTAATGATCATGCAGCAACACATCAACTCCCCCCAGGGATGGGCAGCCACTTTAACTGCTCTTGCCGAGCTGTACTACGGCATTATGCCGCTGACAGAGGCGCTCGGCTCTATTGCCGGTTGGGTCACCGACAAATTTGCCGATGTAACCACAAATACCTGGGGCAAGTTTAAGGCTTGGTGGGACAACCTTTACACACCACAGGCCGGTAATGACTTGATCATATTGGGGGGTGTTGTTGGGTTGGTGTACTTCATGGTGTTCGGTGACGCCCCAACTCAGATGTTCACCAAGAAGTTGATGAAGGTGTGTGGCTTCATCACTTCCACAGTGGCGGCAATCAAAGCCGCTATGTGGATAGTGGATTACTTCAAGCAGCGCGAGCATGAACACCAGGTCCGCGTCACCTTGGCGAGGTGGGCTGCACTCCAAGAGGTCATCAAGCAAAACAGGTGTGCTGGTCTCAGCGAGGTCACCAAACTGAAAGAGTGCTGTGAAGTTTTGTTGAATGAGGTCACTGAGCTGATGTACAAGCTGGGCGCCTCGCCCTTGGCAGGATTGATACGTAGCACTTCTGATGTCATACAAACCACTATCAACGACCTGGCGCAGTTAATGGCATATGACACCCAACGCAAGCCCCCGGCCATGATTGTATTTGGTGGGCCACCAGGCATAGGCAAAACCCGGCTGGTTGAAGCTTTGGCCAAACAACTTGGGGAGGTGAGCCACTTCACCATGACCGTCGACCACTACGACACTTACACAGGCAATGCAGTGGCAATCTGGGACGAGTTTGATGTAGATTCAAAGCAGGCTTTCATCGAAGCCACCATCGGAATCGTCAACTGTGCCCCCTACCCCTTAAATTGTGACCGGCCAGAGGCAAAGGGTAGAGTGTTCACGTCAAAATACGTGTTGGCCACCACCAACTGCCCCACACCAGTCATGCCCGACCACCCGAGAGCCATGGCGTTCTGGCGTCGTATAACTTTCATCGATGTCACCGCCCCAACAATCGAGCAGTGGTTGGTTGACAACCCCGGGCGCAAGGCACCGTCCAGCCTTTTTAAGGAGGACTTTTCTCACTTGCAGTGTTCTGTGCGCGGGTATACTGCCTACGATGAAAAGGGCAACACGCTCAACGGTAAGGTGGCTCGAGCCAAATATGTGTCAGTCAACAACCTGCTCGATCTGATCAAGGAGAAGTACAACAGTGAAGCCACTGACATCAAACACTTATGGTTCACCGTTCCACAGGGCATCCACAAGCAGGCTCGAGATATAATACTGGGTTGGCTGCGGTTCCACTCCTACCCCAACACCGTGGCTGACAACATACCGCTCTCAGAAGTCAGGGACCCCACTTGTTTTGGGTATGTGGTGATATCTGATGTGGACCCACCACGGCATGTGAGTGACCATGTGGCGCACATAGAAGTGGAGTCAATACTGCGCACTGACATCATGGACCTCCTGAGAGAGGGTGGCGGGGGTTTGTTCAGGGCGTTGAAGGTCAAGAGTGCCCCCCGGAACTGTGTGATCAGTAAGGTCATGATGCAAGCGCACCACACCACTTTGCAGGTGCTCACGAGTCAGGAGCCAAATCCACCAAACTTGCCCCGACCCAGGCGGCTGGTTTTTGTTGAGTCACCAATTGACATCATCAGCGCCTTGCGACACCACGTGGGTTTCTGCACCATCCCAGGCATAGTCAAGTTAATCACGTCTGGGGTTGGTTTGGGTGTGGAAAATTTGGGCAATTTCCTGCAATCCATCGCTGGCAATGTTAGGTTCCCTTTGCAGTCCGAGTGTTCGCTGCTCAGAACACCGAGTGGCGATGTGTTGTTTTACACTTCTGGGCAGGCTGCCGTGTGGGCAACACCCGCACGTTTTCCAATCGTCACTCCAGGAGAGGCGTCCGTTGGCAAGGATGTGTGCTCTGAGTCTTCCTGGTGGGATATCCTCAAGGCCTTGTTCAGCACACTAGTGGTGGCCTTTGGCCCCATAGCCACACTGGTCCTCACCGCACACAACTTGGCCTACCTGAACACCCGTGAAAACACCTTGAGCGAGGCCAAAGGGAAAAACAAGCGTGGCCGCGGTGCCCGCAAGGCCATCGCCCTCAGGGATGATGAGTATGACGAGTGGCAGGACATCATTCGTGACTGGCGTAAGGAGATGACTGTCCAGCAATTTCTGGACCTTAAGGAACGGGCTCTGTCTGGTGCTTCCGACCCTGACTCGCAACGATACAATGCTTGGCTTGAACTGCGTGCAAAGAGGTTGAGTGCTGGGGCTTACCAACACGCTGTTGTAGACATCATCGGAAAATCGGGTCACAGGCGCGAGGTGATCCGCACACAGATGATGCGTGCCCCCCGCGAGCCAAAAGCAGACACCTATGACAGTGAGGGGCGTGGTTACGTGGTACCCATGACTGCCCAGGAGAAACACACAGGCTGGGCGGTGCACGTTGGAAATGGCAGGCTGGTCACTTGCACACACGTGGCTAACATGTGCGACCGCGTGGCCGATGTGGAGTTCAAGATTGCTGAGACAGATCGTGACACGTGCATCATCACCGCCCCGCTCGGCCACCTGCCCAGTGTCGCCCTCGGAGATGGACCACCCGCCTTCTACACCACCAACTTCCACCCCATTCGCGTGCTGGATGAGGGTAGCTGGGACACCACATCCACCCGTGTCACCGGCTGGCGTGTCATTATCAACAACGGCACCACAACAGCTCCTGGTGATTGCGGCCAGCCATATTTGAACGCACGCCGGCAACTTGTTGGGGTGCACGCAGCAACAAGTACATGTGGGGTGAAGAAACTCGTGTCCAGAGTGCAAACCAAAAGGGCATTAAAAACCACATTCCCCTGGAAAGGTCTACCTGTCACTAACATGCCTGATGCTGGTGGCCTGCCGACTGGTACACGGTACCACCGCTCCATCGCATGGCCCAGGCAGTTGCCAGAAGAAACGCACGCCCCTGCTCCCTACGGAGTGAATGACCCCCGGTACCCCTTCTCCCAGCACCAGATGATTGCCAACAATTTACAGCCATACACCAAAACTCCAGTTGCACTAGACCAAACGCTGTTGCAACGTGCCGTTAAACACACAAAGGGCTACCTGGACCAGGTTATTGGAACACACAGGTCTCCAAACCTCACCTATGCAGCTGCAGTGGATTCAATGGCCCACGACACGGCATGTGGGCCTAACCTGCCTGGCCGCAAGAAAGATTACATGACAGATCAAGGGGAGCCCTTTGGGCCGCTCAAACAAATGTTGGAGGAAGCCTGGGACATGGCACATCGGGGTGTCCCCCGCAAGCACGAGTACAAACTCGCGCTCAAAGACGAACTCCGGCCCATAGAAAAGAATGACCAGGGCAAGAGGCGCCTCCTTTGGGGCTGTGATGCTGGGGTGTCATTGATAGCCAACTCTGTGTTCAAACCTGTGGCCGAGCGGCTGGTGGATACCGTACCCATGCACCCCGTGGCTGTTGGCATATGCATGGACAGCCCCCAAATCGAGCAAATGAACCAAGCCTTGACTGGTAGGGTACTATACTGCTTGGACTACAGCAAGTGGGACTCCACGCAAAACCCAGCCGTCACGTGTGCCAGTGTCGACATCTTGGCCTCCTACGCTGAGGATACACCACTCACCTCGGCAGCCATAGCCACACTGTGCTCACCAGCTGTCGGTCGGCTGGATGACATTGGCTTGACTGTCACCACAGGACTCCCCTCTGGCATGCCGTTCACAAGTGTCATAAATTCTATCAACCACATGATATATTTTGCCATGGCTGTGCTCGATGCCTATGAGGAGTTTAAGGTGCCCTATATGGGGAACATCTTTGACAATGAGACTGTCTACACCTATGGGGATGATTGTGTGTACGGCCTAACACCAGCCACAGCCTCAATTATGCCCGTAGTGGTTAAGAACCTGACCAGTTACGGATTGGTCCCAACTGCTGCAGACAAGTCCCAAAATATTGAGCCCACTGACACCCCTGTGTTTCTCAAACGCACCTTTTCTCAGACACCTTTTGGTTTACGGGCCCTGCTTGATGAGACAAGCTTGGCGCGGCAGTGCTACTGGGTCAAAGCTAACCGCACCACAGATCTTTTTGAGCCAGCTGCTGTTGATGTGGAGATCAGGAAGAACCAATTGGAGGTCATGCTCGCATATGCCAGCCAGCACCCAAGGGCCGTGTTTGACAAACTTGCAAACATGGTTGAGGTGACCG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| 68,905
|
KX688107.1
|
Sapovirus GIII
|
Li,J., Shen,Q., Zhang,W., Zhao,T., Li,Y., Jiang,J., Yu,X., Guo,Z., Cui,L., Hua,X.
|
Shanghai Jiao Tong University
|
China
|
2017-03-29
|
p2
|
Sapporo virus
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,387
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2015-10-16
| null | null |
Sapovirus GIII isolate p2, complete genome
|
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| 77,481
|
OR837774.1
|
Sapovirus sp.
|
George,U.E., Faleye,T.C., De Coninck,L., Agbaje,S.T., Ifeorah,I.M., Onoja,B.A., Oni,E.I., Olayinka,O.A., Ajileye,T.G., Oragwa,A.O., Akinleye,T.E., Popoola,B.O., Osasona,O.G., Olayinka,O.T., George,O.A., Ahmed,M.I., Komolafe,I.O., Adeniji,A.J., Matthijnssens,J., Adewumi,O.M.
|
Redeemer's University, African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases
|
Nigeria
|
2023-12-25
|
SaV/A14/AFP01/NGR/2020/S01
|
Sapovirus sp.
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,483
|
GenBank
| null |
Nigeria: Lagos State
|
Nigeria
|
Homo sapiens
|
feces
|
2020-01
| null | null |
Sapovirus sp. isolate SaV/A14/AFP01/NGR/2020/S01, complete genome
|
AGAGACAGGTGTTGGGTGTGTTTGGTTGGTTGGTATGGCTTCTAAGCCATTCTATCCAATTGATTTCAACCAGAAGGTTGAAATTGCAATCCTCTTCTCCGCCCACCTCAGGGTGAGTGGGAGGGAGGAAATTTTTGAGACAAAGCATGATATGTACGCTCATGTTTGCCAGGTGGTTGCCGGGGTGCGGCGCGAGATATTGCGTCGTGTCCCGGTACCCACGCCCTCTTTTGATGAAGAGGGGCTCCTCGATGCATTTGCATCTAAACCCCCTGTGGATATCAACCCTGACACCACATTTCGTGAGTTGTTCGGTGTTGACCCACACGAGCAATTCCCCTTGTCCATCACCGATTTGGCCAAATTGCAAGGTGAGCTTGTGGACGCAGCGCACAACCCAGGTCACATCCTGCGTCGTCACTACTCCACCGATTCGCTCACCAAACTAATCAACAAAATCACTAAATATATCCCCGTCCAAGCCACTTTAGCTGAGATGCAGGCACGAAGGGCCCATGAGAGGGAACGAGCTGACCTTTTCAAAGAATTACCTTTGGTCGACCCGGAGGTGACACAACAACAAAAGTCCTACTTTTATGCCATGTGGCGACAAGTGGTGAAGAAGGGCAAGGAATTTTTCATACCACTGGTGAAGTGTACATCGTGGAAGAAGAAGTTTTCAGAACCAGCAGAGATTGTGCGTCAACTTGTGGTGCACTTTTGTGAAGGCATGCGCACACAGTTCAGCACAAATGCCAATTATCTCAACCTGTCTCTCCTGGCCAAATTGCGGCCCACTGTCCTGACAATGATATTCCAGCAGCACAAGAACACCTACCGCGGATGGTTGGCCACCATCACCGCTCTTATCGAGGTCTATTCAAATTTGTTTCAGGACATGCGAGAAACCGCAGTGTCCGCGGTGTCTGCAGTCACACTCCTCTTTGAGTCGTTGAAACAATTCATTGAAGGGGTCATAGACCTGGTCAAAGGCACTTTTCAAGCGCAGGGTCCCACAAATTGTGGATGGGCTGCCATTGCCGCTGGTGTCATTTTAATTCTCCTCAAGGTATCTGGATGCCCTAATGTTATGGGCTACTGGCAGCGTCTGTTGAAGGCGTGTGCTGGTGTCACCACCATCGCTGCTGCTGCGAGGGCCTTCACCTGGGTCCGTGACATCATAGTGGAGGCTGAGAGAAAGGCTCGGCTAAAGAAATACATGGCACGCACGGCTGCCCTGTTGGAGCTTGCTGCATCACGGGATGTCACCGGAACGGAAGAGCTAAAGCGGCTACTTGAATGTTTCACTCAACTCATAGAAGAGGGTACAGAGTTAATCCAGGAATTTGGAACATCACCAATGGCAGGGCTTGCGCGCTCCTACGTTAGTGAGCTTGAGACTGCAGCCAATGGAATCAGGAGCACAATCCTTCTAGACACTCCCAGGAAGGTCCCAGTGGCAGTAATCTTGACTGGCCCCCCGGGTATAGGGAAAACACATCTTGCACAACACCTGGCCGCTGGCTTTGGCAAGACCTCAAATTTTTCCGTCACCCTAGACCACCATGATTCCTATACAGGCAATGAAGTAGCCATCTGGGATGAGTTTGACGTGGACGCTCAGGGTAAGTTTGTGGAAACAATGATCGGTGTGGTTAATACTGCACCGTATCCTTTAAATTGTGACAGGGTAGAAAACAAAGGCAAGGTGTTCACATCAAATTACATCATATGCACTAGTAACTACCCCACTTCTGTCCTGCCTGAGAACCCACGGGCCGGAGCTTTCTATCGTCGTGTCACAACGGTAGATGTGTCTTCCCCCATCATCGAAGAATGGAAGAAGAAAAACCCTGGGAAGAAACCCCCCCTAGATCTGTACAAGAAAGATTTCTCCCATTTGCGTCTCTCCGTGCGCCCATACCTCGGTTACAACCCGGAAGGGGACACCTTGGAGGGTGTGCGGGTGAAACCCATACTAACTAGTGTGGATGGCTTAACCAGAATCATGGAAACTAAGTTCAAAGAGCAAGGTAATGAGTTGCGCAACCTTTGGATCACATGCCCTCGCGATCTGGTTACACCTGCGACTTCCGGGTTGAAATCCTATATGGCTGCCAATCGTGCCTTAGCACAAGTCTTTGCAGAACCATCCTCCAATGAAATTGCAGAATCATGCACGTCCAGGGTTTTTGTGTCTGCCAACAACCCCCCCCCTTCTTTTGTGGGCAGACACGTCAAAGTCACAGCCATCAACCCTTGGGACGCGTCCCTCGCCAATTCAATGCTGTCAATGTTTGAGACCAACACCCACATACCAGCTGCCACACAGAGAGAAATCATGTATCGCGTATGGACACCTTTGATACATATGCAGACACGGGAGCCAAACACTCAGATGCTCCCTTATATCAACAGAGTCGTGCCAGTCTCTTCATCCTTTGATTTCGTTCGTGGGTTGCGCCACCACCTTGGCCTGTGTTCCATCAAGGGGATGTGGAAGGCGTACCAGGGGTGGCACAGCTCTGCAACTATTTTGGAATTTCTGTCCAAGCACATGGAAGACGTGACATTCCCTTCCAACCCAGAGTGCACCGTTTTCCGTGCTGCAGACGGTGATGTCATTTTCTATACATTTGGCTCATACGCTTGTTTCATCTCACCTGCACGAGTGCCATTCGTGGGGGATCCACCAAAAGCCGTCCACTCCAACATCACGCGGAACATGACGTGGATTGAAACGCTACGCCTGCTTGTTGAAACAATCACGGAGGGTCTGGCTCATTTTGGCCCATTGTTACTGATGGTTCACAACGTGGCATACTTAACAACCAGATCACAGCGTGACGAGGAGGCTAAAGGGAAGACCAAACATGGCAGAGGGGCCAGACATGCGCGACGTGGCGGGGTCAGCTTGTCAGACGACGAGTATGACGAGTGGCGTGATCTCGTGCGTGACTGGAGACAAGACATGACTGTCGGGGAGTTTGTTGAGTTACGAGAGCGCTACGCTCTAGGCATGGACTCAGAGGACGTTCAACGATATCGTGCATGGCTGCAACTTCGTGCGATGCGACTGGGTGCAGGTGCTTACCAGCATGCAACCATCATCGGGCGTGGGCGTGTCGAGGACACCATCATTCGCACACAGCCCATGCGAGCTCCACGCGCCCCCCGTTCCACGGGGTACGACGAGGAAGCCCCGACACCAATAGTCACTTTCACCAGCAACGGTGACCACGTCGGATATGGGTGTCATGTTGGCAACGGTGTGGTGGTGACGGTCACTCACGTGGCCGCTGCTGCGGATGCTGTTGATGGTGTGGAATTCACGGTTAGGAAAACTGAAGGTGAAACCACTTGGGTGAACACCCCTCTCAGCCAACTGCCACACTATCAGTTGGGTGACGGGACACCAGTCTACTATTCCACCCGACTGCACCCTGTCACCACAATTGCTGAAGGCACTTATGAGACCCCCAACATCACTGTCCACGGATTCCACTTGCGCATCATCAATGGGTACCCCACAAGACGTGGTGACTGCGGCACTCCATATTTTGACTCATGCCGCAGATTGGTTGGACTACATGCTGCCACCTCAACTAATGGAGAAACCAAATTGGCACAGAAAGTTAGTCGAGTCTCAAAAGTGGAAAATGCCTTTGCTTGGAAAGGTCTTCCTGTGTTGCGAGGCCCGGATTGTGGTGGTATGCCAACGGGAACAAGGTATCATCGGTCCCCGGCCTGGCCACAGCAACTCCCCAGTGAGACACATGCACCAGCGCCATTTGGTGCCGGAGATTCTCGATATAACTTCTCACAAGTGGAAATGTTGGTTTCGGGTCTAAAGCCCTATTCAGAACCAACCCCTGGGATTCCCCCTGCTTTGCTGCAGCGGGCTGCCACGCATACCCGCACATATCTGGAGTCAATCGTCGGCACACACCGGTCTCCCAATTTAACCTACAATGAGGCATGTGCCTTGCTGGACCGCAGTACATCTTGTGGCCCGTTCATTGCGGGTCAGAAAGGAGACTATTGGGATGAGGACCGTCAATGTTACACTGGGGTCCTGGCCGATCACCTTGCGAGAGCTTGGGATGCCGCCAGTCGTGGTGTTGCCCCGCAAAATGCTTACAAATTGGCTCTCAAAGATGAACTTCGCCCAATAGAGAAGAACCAGCAAGGCAAACGCCGGTTATTGTGGGGGTGTGACGCTGGTGCAACTTTGGTCGCGACAGCAGCTTTCAAGGGAATTGCCACACGCCTGCAAGCCGTTGCACCCATGACACCTGTTGGTGTTGGTATCAACATGGATAGCTACCAGGTAGAGGTGCTTAATGAATCCCTTAAGGGTGGGGTTGTGTACTGCTTAGATTACAGCAAGTGGGATTCCACACAACACCCGGCAGTGACGGCTGCGTCTCTGTCAATCCTTGAGCGACTGTCTGAGGCAACACCTATAACCACCTCGGCTGTTGAGTTGCTGTCATCACCCGCACGTGGCCATCTGAATGACATAGTATTTGTCACAAAGTCGGGGCTTCCCTCAGGCATGCCGTTCACCAGTGTTGTTAATTCGCTCAATCACATGACATACTTCGCAGCTGCAGTGTTGAAGGCTTACGAGCAGCACGGTGCGCCCTACACTGGTAATGTGTTCCAGGTTGAGACTGTCCACACTTATGGTGATGATTGTTTGTACTCTCTGTGTCCAGCAACCGCCTCCATCTTTGAGACTGTCTTGGCAAATCTTAGTGCCTTTGGTCTGCGACCCACAGCAGCTGACAAAACAGACAAAATAGCCCCCACCCATACACCAGTCTTCTTGAAGCGGACCCTCACCTGCACACCCAGGGGGATCCGTGGTTTGCTCGATATCACGTCAATTAAACGGCAGTTTTTCTGGATCAAAGCGAATCGCACCACAGACATAACATCCCCCCCTGCCTATGACAGGAAAGCTCGCAGTGTACAACTTGAAAATGCCCTTGCCT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| 10,009
|
OR837776.1
|
Sapovirus sp.
|
George,U.E., Faleye,T.C., De Coninck,L., Agbaje,S.T., Ifeorah,I.M., Onoja,B.A., Oni,E.I., Olayinka,O.A., Ajileye,T.G., Oragwa,A.O., Akinleye,T.E., Popoola,B.O., Osasona,O.G., Olayinka,O.T., George,O.A., Ahmed,M.I., Komolafe,I.O., Adeniji,A.J., Matthijnssens,J., Adewumi,O.M.
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Redeemer's University, African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases
|
Nigeria
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2023-12-25
|
SaV/A16/AFP15/NGR/2020/S015
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Sapovirus sp.
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Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,502
|
GenBank
| null |
Nigeria: FCT, Abuja
|
Nigeria
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Homo sapiens
|
feces
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2020-04
| null | null |
Sapovirus sp. isolate SaV/A16/AFP15/NGR/2020/S015, complete genome
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AGAGACAGGTGTTGGGTGTGTTTGGTTGGCATGGCTTCTAAGCCATTCTACCCAATTAAGTTCAACCCACGAGTTGAACATGCAGTCCTGTGTTCTGCCTACCTCAGGGTAGGTGGACGGGACTCAATCTTTGAAAACCACGAGGACATGTTAGCTCATGTTTCCCGTTTGGTTGAGCGGGCCTGGCAGCAACACCAGGCCCGCATTCCACGGCAGTTGGGGCTTGAATTTGAGGCTGAGGGGTTGTTGGACGCATTTTCATCCAAACCACCAGCCGACATTAATCCTGACACCACGTTTCGTGAACTCTTTGGCGTCGACCCACACGAACAATTCCCATTGTCCATAACAGATTTGGCACGACTTCAAGGTGAACTTGTAGATGCAGTGCGGAATCCGCATCACGCGCTGAGACGGCACTACTCTACCGATTCGATCACCGCCCTAATTACTAAGCTCACCAAAATTGTCCCAGTACAGGCCACATTGGAAGACATGCAAAGGCGCAGGGATTTTGAGAGGGAACGTGCCGAGGTGTTTCGGGAGTTGCCCCATTCAGATGAAGCCCCCCAACGAGACCCCAAAAGCTTCTTCTATGCCATGTGGAGACAAGTGATCAAACGAGGAAAAGGCTATTTCATTCCCTTAGTGAAGTGCACATCATGGAAGCGAAAATTCTCCGGAGCTGCTGAAGTGGTGCGACAGTGCTTGGTTGGATTTTGTGAGGGAATGCGAACTCAATTCTCTACAGATGTCAACTACATCCAGTTAGATTTGTTAGCACGCCTAAGACCAACAGTGTTGACCATGATCCTCCAACAGCATCGCAACACATTCAATGGTTGGCTTGCCACCATCACCGCCCTCATTGAAGTTTACTCAGGCTTGTTTCAAAACATGCGGGACACCGCAGTGTCTGTGGTGTCTTCCATAACACTTGTCTTTGACTCATTGCGGGCTTTTGTAGAGAAGGTCATCAACCTTGTGCGCACCACCTTCACTGCGCAGGGGCCCACAGATTTCGGATGGGCTGCCATCCTTGCTGGTACCATCTTAATTCTTATGAAAATCTCTGGCTGTCCACAAGCTTTGGGTTATTGGGGGAAAATCTTGAAAGTGTGCGGCAGCATCACATCAGTTACTGCAGCTGCACGTGCAGTCGCTTGGATTCGGGACACCATACGTGAGGCAGAGGGCCGCCGTCGGCTCAAACAGTTCATGGCGCGGTCATCAGCTCTCATTGAATTGGCCGCCTCGCGGGAGGTCACTGGTACAGACGACCTTAAGAAGCTGCTTGAGTGTTTTGTGCAATTGAGTGAGGAAGGTGCGGACTTGATCCAAGAGTTTGGAACCTCCCCCTTGGCTGGGCTGACTCGGTCGTATGTGTCAGAACTGGAAGCTGCTGCTAACACTGTTAGAACGACAATTCAACTTGACACACCAAGGAAAGTTCCTGTGGCTGTCATACTCACAGGCCCACCTGGCATTGGCAAAACACACCTTGCACAACACATTGGGGCAGGGTTCGGCAAATGCTCCACTTTCTCAGTGTGCACTGATCACCATGATAGTTACACTGGGAACAGGGTTGCCATATGGGATGAGTTTGATGTTGACACCCAGGGCCGGTACGTAGAAACCATGATTGGCATAATCAACAGTGCACCATATCCATTAAATTGTGACCGGGCCGAAAACAAAGGCAAGGTTTTCTCATCTGAGTATGTAATTTGCACCAGCAACTATCCAACCTCAGTCTTGCCTGACAACCCCCGTGCGGGTGCGTTTTACCGTCGTGTGCTAACTGTTGACGTAACCGCACCTGACATTGATGAATGGAAAAAGAAGAACCCCGGCAAAAAGCCTCCAGGTGACATGTTTAAGGCAGACTTTTCCCACTTGCGCCTTTTTGTTCGCCCATATCTTGGGTACAACGCCGATGGGGACACGCTAGAGGGTGTTCGGGTGCGGCCCCAACAGGTGACTGTGGATGGATTAGCCAAGATCATGGAGAGGCGTTTTGAGGAGCAAGGGGCAGATCAATTGCAGAACCTTTGGATTACGTGCCCCAAGGAGCTGGTCACCACCGCCACGGCTGGACTAAAGGCGTTCATGTCTGCAAACAGAGCACTTTGTCAGGTCATACAGGACCCATCCTCAAATGAGATAGCTGAAACTTGTGTGTCACGTGTTTTCGTCAGCAACCTCAGCCCCCCCCAGGGGTATCGTGGCCACAGGGTTAAGGTTTCCAGTGTGTGCCCAGAGGACGCTTCAATTGCCAATTCTATGCTCTCAATGTTTAACAGTGATTCCAGACTTTCTGCTGCGGTGCAGCGAGACATCATGTACCGTGTGTGGCGACCCCTAGTCCATCTTCAAGAACAAAGACCCAACACACAGGTCTTACCTTACATCAACCGGGTCGTTCCCGTCTCCTCCCCATTTGACTTCGTGCGGGGCCTACGTCACCACCTAGGTCTGTGCTCTATTCGAGGGATGTGGAGTGCCTACCGTGGGTGGTATGACTCAGCCACAATTATCGAGTTTGTTGCCAAGCATATGGCTGATGTCACGTTCCCAATGAACCCGGAGTGCACTGTTTTCCGAACCACCGATGGGGATGTGGTGTTCTACACTTATGGGTCATACGCCTGCTTGGCATCTCCCGCACGAGTGCCATTCGTAGGCGATCCACCAAAAGTTGTCCACTCAAATGTTACTAGGAACATGACCTGGGGGGAAACCCTACAGTTAGTTGCTGAGACCCTTATGGAGGTTATCACAAGATTCACCCCATTTCTTTTAACCCTGTACAATGTGACTTACCTCACCATGCGGGGGAGCCGTGAGGAAGAGGGCAAGGGCAAGAACAAACATGGCAGAGGTGCTCGTCATGGCAGACGTGGTGGTGTTAGCTTAAGTGATGATGAGTATGATGAGTGGAGAGATCTCATTCGTGACTGGCGTAAGGACATGTCAGTTAACGAGTTCCTCGACTTGAGAGAACGTTTTGCCGCTGGCATGGATGCAGAGGATGTCGAAAGATATCGAATGTGGCTCCAAATCCGCGCAATGCGTCTGAATGCTGGTGCTTACACACATGCCACCATCATAGGTAAGGGCAGGGTTGAGGACACCATCATCCGCACCCAGCCACTGAGGGCTCCAAGAAGACCAACCAACATTGAGTATGATGAAGAGGCTCCCACCCCAGTGGTTGAGTTCACATCGGATGGAGAGCATGTTGGTTATGGGTGCCATCTTGGCAATGGCGTTGTGTTGTCGGTGACACACGTTGTGTCGGCAGCCAACGAAGTTGAAGGGATGCCATTTAGTGTGAAAAAGACAGAAGGAGAGCTCACATGGGTGAACACAAATCTTGCTCGACTCCCCCACTACCAAATTGGCGACGGTAATCCAGTGTATTTTTCCCCCCGCCTCCATCCTGTCCTCACCCTTGCGGAGGGCACTTATGAGACCCCAAATATCACAGTAAATGGGTTTCACATTAGAATAACTAATGGGTATCCAACAAAGAAAGGGGACTGTGGGTTACCATATTTCAATGGTTGCCGCCAGCTGGTTGCACTACATGCTGCCACCGCCACCAACAGTGAGACCAAATTGGCTCAAAAGGTCACCCGTGTGTCAAAGGTTGAAAACGTCTTTGCGTGGAAAGGGCTGCCCGTTACGCGTGGCCCAGATTGTGGGGGGATGCCAACTGGCACACGATACCATCGGTCACCTGCGTGGCCCGATGAACAACCTGGGGAGACGCACGCACCTGCCCCGTTCGGGGCGGGCGATTCCCGCTACAGCTTCTCACAGGTCGAGATGCTGGTGAACGGGCTAAAGCCATATGCAGAGCCAACACCAGGGATCCCCCCTGCACTTTTGCAGCGTGCAGCCACACACACACGAGTGTACCTGGAGTCAATCATTGGTAACCACAAATCACCAAACTTGTCATTCTCTGAGGCTTGTGACCTCCTCGAACGATCCACTTCTTGTGGACCGTTTGTGGCAGGACAGAAAGGGGACTACTGGGATGAAAGCACCCATGCTTACACTGGACTACTGCGGGAGCACCTAGAGCGTACGTGGGACGCTGCATCACGAGGCGTTGCCCCACCAAACGCATACAAGCTTGCGCTCAAGGATGAGCTACGACCAACTGAGAAGAACGCCCAGGGCAAGCGACGTTTGCTATGGGGCTGTGATGCTGGGGCAACTCTAGTGGCAACTGCAGCGTTCAAGGGAGTGGCAGGGCGGCTTCAAAGTGTGTCACCAATGACACCCGTTGCAGTTGGGATAAATATGGATAGCTTTCAGGTCTCTGTGCTCAACGACTCACTCAAGGGTGGGGTCGTATACTGCTTGGACTACAGCAAGTGGGATTCCACTCAGCACCCTGCTGTCACTGCTTCATCGCTTGACATCCTTGCACGTTTCTCAGAAGCTACTCCCATAACCGCCTCTGCGGTTGAGTTGTTGACATCACCAGCAAAAGGTCACCTCAATGACATTGTGTTCACAACTCGGTCTGGACTACCATCAGGCATGCCCTTCACTAGCGTCGTTAACTCCCTGAACCACATGACATACTTTGCTGCTGCTGTCCTCAAGGCATATGAATCCCGAGGGGTACCATACACTGGCAATGTGTTCCAGCTCGAAACCGTACACACCTACGGGGACGACTGTGTCTACTCACTTTGCCCCGCAACGGCTTCCCTCTTTAGTGATGTGCTTTCCAATCTAGCCAGTTTTGGTCTCAAACCAACTGCCCCAGACAAAAGTGATTCCATAGCCCCCACACACACTCCTGTGTTTTTGAAGCGAACGCTCACAGCAACACCCAGGGGCATCAGGGCTCTGTTGGACATCACCTCAATCAAAAGGCAATTCTATTGGGTCAAGGCTAACCGCACAACTGACATCAACTCACCTGCTGTGTTCGACCGTGTGGCGCGTTGTACACAACTGGAAAACGCCTTGGC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| 10,010
|
OR837777.1
|
Sapovirus sp.
|
George,U.E., Faleye,T.C., De Coninck,L., Agbaje,S.T., Ifeorah,I.M., Onoja,B.A., Oni,E.I., Olayinka,O.A., Ajileye,T.G., Oragwa,A.O., Akinleye,T.E., Popoola,B.O., Osasona,O.G., Olayinka,O.T., George,O.A., Ahmed,M.I., Komolafe,I.O., Adeniji,A.J., Matthijnssens,J., Adewumi,O.M.
|
Redeemer's University, African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases
|
Nigeria
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2023-12-25
|
SaV/A18/AFP18/NGR/2020/S018
|
Sapovirus sp.
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,456
|
GenBank
| null |
Nigeria: Edo State
|
Nigeria
|
Homo sapiens
|
feces
|
2020-05
| null | null |
Sapovirus sp. isolate SaV/A18/AFP18/NGR/2020/S018, complete genome
|
TATAAGAGACAGGTGTTGGGTGTGTTTGGTTAGTATGGCTTCTAAGCCATTCTACCCTATTTCATTCAACCGCAAGGTTGAATATTCAGTGCTCAGATCGGCTCACCTCAGGGTGAGTGGTCGTGAGCAAATGTTTGAAACTATAGCAGAATTAGATAACTATGTAGAAACAGTGGTTGCTGGGCTGTGGCGTGACAATTTACGCCGCAGCCTGGAAGCGATCCCTACCTTCACTGAAGAGGGGCTGCTAGATTCTTTCTTGTCGAAACCACCCGTGGACATCAACCCAGACACGACGTTTCGTGAGTTATTTGGAGTTGACCCTCACGAACAGTTCCCCTTGTCCATTCATGATCTGGCCAAGTTACAAGGTGAGCTTGTGGAGGCGGCACGCAATCCTGGTCACATATTGCGGCGTCATTACTCCACCGATTCGCTCACCGCCCTAATTAATAAAATCACAAAATTTGTCCCCGTCCAAGCGACCTTACAAGAAATGCAGGCTCGACGTGCATTTGAGCGCGAACGAGCAGACCTTTTCAAGGAGCTGCCACATGTCGAGCCAGACGTTGGTCACCAGCAGAAGTCCTACTTCTATGCAATGTGGCGGCAGGTGGTTAAGAAGGGAAAAGAGTTCTTCATACCCCTTGTTAAGTGCACCTCATGGCGGAAAAAGTTCACTGAGCCTGCCGAAATCATACGACAAGTGTTGGTCCACTTTTGTGAGGGAATGCGTTCGCAATTTTCCACAAATGCGAACTACATCAATTTATCGCTCATCGCAAAGATGCGACCAACTGTTTTGACCATGATTTTCCAACAACACAAGAACACATACCGTGGCTGGCTGGCAACGGTCACCGCTCTGATTGAAGTGTACTCCAACTTGTTCCAGGACATGAGGGACACCGCGGTGTCCGCCGTGTCTGCGGTTACCCTCGTGTTTGAAACAATCAAGGATTTCATCAACAACGTCATTGACTTGGTTAAGTCCACCTTTCAAGCACAAGGCCCAACACCATGTGGGTGGGCGGCTATAGCCGCCGGTGCGTTACTTATCTTAATGAAGCTTTCAGGATGCTCTAACACAGCCAGCTACTGGCATAGGTTGCTTAAGGTGTGTGGTGGAGTCACCACTCTTGCTGCGGCGGCACGCGCTGTGGTCTGGGTTCGTGATATAATCATGGAAGCTGATGGCAAGTCCCGGCTTAAGAAGTACATGGCCCGGACTGCAGCCTTGCTAGAGCTTGCAGCCTCCAGAGATGTCAATGGCACCGATGAGCTAAAGCGGTTACTGGACTGCTTCACACAACTTATTGAGGAAGGTACAGAGCTGATTCAAGAGTTCGGAACATCACCACTCGCTGGCCTTGCCCGCTCGTATGTCAGTGAGCTGGAGTCGGCTGCTAATAGCATCAGGAGTACCATTTTGCTTGACACCCCACGCAAGACCCCTGTTGCCATCATCCTCACTGGCCCCCCAGGCATAGGCAAAACTAGGTTGGCACAACACCTCGCGGCTGGGTTTGGTAAGGTGTCAAATTTTTCCGTGACACTCGACCATCATGACTCGTACACTGGCAATGAGGTTGCCATCTGGGACGAGTTTGATGTTGACACACAAGGTAAATTTGTTGAGACCATGATTGGTATTGTCAACACGGCACCTTACCCACTCAATTGCGACCGGGTGGAGAACAAAGGGAAAGTGTTCACATCTGACTATGTCATCTGCACCAGCAACTACCCCACATCTGTCCTCCCGGAGAACCCGCGGGCCGGCGCCTTCTACCGTCGTGTGATCACGGTGGACGTCTCATCACCCTCAATAGACGACTGGAAGAAGAGGAACCCTGGAAAGAAACCCCCGTTGGACCTGTACAAGGGAGACTTTTCACACTTGCGCTTGTCAGTTAGACCGTTTCTTGGCTACAACCCTGAAGGAGACACATTAGACGGCGTGCGGGTTAAGCCCACAACTACCAGTGTTGATGGGTTGTCACGCTTAATGGAGACCAAGTTTAAGGAGCAAGGCAACGAGCAACGCAACATTTGGATCACCTGTCCGCGCGATCTGGTGGCCCCCGCCGCATCAGGCCTAAAATCCTACATGGCAGCCAATCGCGCGCTTGCCCAAGTGTTCCAGGAGCCCTCCTCCCAAGACATCGGGGAAGTGTGCACGTCTCGCGTGTACGTGTCATGCAATAACCCACCACCCACATTTGTTGGACGTGTTGTAAAAATCACAGCCATTAACCCATGGGACGCCTCGTTGGCCAATTCAATGCTCTCAATGTTTGAAACTTCCACACACATACCGGCATCAGTGCAGCGTGAGATTATGTACAGGGTCTGGGACCCGTTGGTCCACCTACAATCACGGGAGCCCAATACACAGATGTTACCTTACATTAATCGGGTGGTACCTGTCGCCTCGGCTTTTGACTTTATACGAGGCCTCCGACACCATCTCGGTTTGTGTTCGATCAAGGGGATGTGGCGCGCTTACCAAGGCTGGACAAGCTCAAGTTCGATCCTCGAGTTTTTGTCAAAACATATGGCTGATGTGAATTTCCCCCACAACCCTGAGTGCACCGTGTTCCGGGCCCCTGATGGGGATGTCATCTTCTACACTTTTGGGTCATACGCATGTTTTGTCTCCCCTGCTCGCGTGCCTTTTGTTGGTGATCCTCCGAAGAATGTTCACTCAAACATCACCCGCAACATGACATGGATCGAAACTTTACGCTTGCTTGCTGAGACAGTGACGGAGTGCCTAGCGCATTTCGGCCCGTTCTTGCTCATGTTGCACAATGTGTCTTACCTCACTGCGCGATCCAGCCGCGAAGAGGAAGCAAAAGGTAAAACAAAACACGGTCGCGGTGCCAAGCACTCGCGCAGGGGGGGGGTCAGCCTGTCTGATGATGAATATGATGAGTGGCGGGATCTAGTGCGTGACTGGCGCCAAGACATGACAGTTAGCGAGTTTGTCGAACTTCGAGAGAGGTTCGCGCTCGGCATGGACTCTGAGGATGTGCAGCGATACCGTGCCTGGCTTGAGCTGAGAGCAATGCGCATGGGAGCAGGGGCTTACCAACATGCCACAATCATCGGCAGGGGTGGTGTCCAAGACACGATAATACGCACCCAACCCATGCGCGCGCCACGAGCACCACGCCGTCAGGACTATGATGAAGAAGCACCCACTCCAATAGTTGCATTCACTTCTGGAGGTGAGCACATTGGTTACGGTTGCCACCTGGGCAATGGCGTGGTTGTGACAGTCACGCATGTTGCATCAGCCGCAGACCAAGTGGAAGGCCAGGAGTTCACTATTAGGAAAACTGAAGGGGAAACCACCTGGGTTAACACAGGTCTCGGCCACCTGCCCCATTATCAACTTGGGGATGGCGCCCCGGTCTACTACTCAGCCCGCCTCCACCCAGTGAGGACAATAGCAGAAGGCACATATGAAACACCTAATATCACAGTTCAGGGGTACCATCTCAGGATCCTCAACAATTACCCAACCAAGCGCGGGGATTGTGGGACACCATATTTCGACGCCTGTCGCAGACTGGTGGGTTTGCATGCCGCCACTTCCACCAACGGCGAGACAAAGCTCGCTCAACGCGTGACTAAGACATCTCGTGTTGAGAACGCTTTTGCGTGGAAGGGTCTGGCCGTCATACGTGGTCCTGATTGCGGGGGCATGCCCACTGGCACTCGCTACCACCGCTCCCCTGCCTGGCCTGAGACAATCGAGGGTGAGACCCACGCCCCTGCCCCGTTCGGGTCTGGTGACTCTCGGTACTCATTCTCTCAGGTGGAAATGCTCGTTAATGGACTCAAGCCTTACTCTGAACCCACACCAGGCATCCCACCTGCCTTGCTCCAAAGGGCGGCGACACACACACGCACCTACCTGGAAACTATAATTGGCACCCACAGATCACCTAATCTAACTTTTGGAGAAGCCTGCGCCTTGTTGGAGCGTACAACTTCTTGTGGACCTTTTGTGGCTGGCCAGAAAGGGGACTATTGGGATGAAGACAAACAGTGCTACACTGGTGTGCTGGCGGACCACCTTGCTAAGGCCTGGGATGCCGCCAATAGGGGTGTGGCTCCCCAGAATGCATACAAGCTGGCACTCAAGGATGAACTTCGACCCATTGACAAGAACGCGCAGGGCAAGCGCCGGTTGTTGTGGGGATGTGATGCTGGGGCCACGCTGGTCGCCACTGCAGCATTCAAAGGGGTGGCCACGCGGTTGCAAGCGGTTGCTCCTATGACACCAGTTGCGGTTGGCATCAATATGGACAGCTACCAAGTTGAAGTGCTTAATGAATCTCTCAAGGGAGGGGTTCTCTACTGTCTGGATTACAGTAAGTGGGATTCCACCCAGCACCCAGCGGTCACGGCCTCCTCATTGTCAATCCTAGAACGGCTGTCTGAGGCCACCCCAGTCACCACATCCGCAGTGGAGTTGCTATCATCCCCAGCACGAGGCCATTTGAACGACATAGTTTTTGTCACCAAGTCCGGACTCCCATCAGGTATGCCGTTCACCAGCGTCATCAATTCTCTCAACCACATGACATACTTTGCCGCAGCGGTGTTGCTGGCCTACGAGCAACACGGGGCCCCCTACACCGGGAATGTTTTCCAAGTTGAAACAGTGCACACCTATGGAGATGACTGTATGTATTCAGTCTGTCCTGCTACGGCCTCCATCTTCCACTCTGTTTTGGCCAACCTTACCGCATTTGGGCTGAAGCCTACCGCTGCAGATAAGAGTGAAAGCATTGCCCCCACCCACACGCCAGTGTTTCTCAAAAGAACCCTGACCTGCACACCTCGCGGCGTGCGGGGACTCTTGGACATAACCTCTATCAAAAGGCAATTCCTCTGGATCAAGGCCAACAGAACAACTGACATCAATTCTCCACCGGCATATGACCGAGAGGCACGCAGTGTTCAGCTCGAAAACGCTCTTGCCTATGCTTCACAGCACGGCCACAGTGTCTTTGAGGAGGTTGCCAAGCTGGCCCGTCACACGGCCCGAGCTGAGGGACTTGTGTTGACGAATGTCAACTACGACCAGGCTCTCGCCACCTACGAATCCTGGTTCATAGGCGGTACAGGCCTGGTGCCAGATGGCCCCAATGAAGAGACCACCAAATTAGTGTTTGAAATGGAGGGCAATGGCCTACCCCAGGCTGGACAACAGCAAGCTCTTGACGTGCCAGGAACAACTGGCCCGACTTCGTCGGCAGTGGTGGTGGCAAATCCTGACCAACCTTCTGCCCAGGCCCAACGTATGGAACTGGCTGTTGCAACCGGTGCCGTGTCATCAAATGTCCCGGATGCAGTGCGTCAATGCTTTGCACTCCTTCGCACATTTCCTTGGAACACTCGACAGGCCACAGGTACTTATCTTGGATCTGCTGCGCTGTCCCCAGCTCTCAACCCATACACCGCACATCTTTCGGCGATGTGGGCAGGGTGGGGTGGCAGCATGGAGGCGCGTGTCACCATTTCTGGTTCTGGCACCTTTGCTGGTAAAATTATTGTTGCCCTATTGCCCCCGGGGTTGGACCCAACGCGTGTGCGTGATCCTGGAGTTTTGCCCCACGCCCAGGTTGACGCTCGCGCTGTGGATCCTATCACATTTAATATCAATGATGTGAGGGCTGTGGACTACCACCGCACCGATGGCCAAGAGGCTACCAGCACCCTGGGTTTCTGGGTGTTGCAACCCCTCATCAATCCATTTAGCCACGATGCTTTGTCGACAGCATGGGTGTCGGTGGAAACTAGACCAGGACCTGACTTTGACTTCTGCCTCCTAAAACCCCCACAAATGGAGATGGAGAATGGTCTCTCTCCCAGCACACTCTTACCCAGACATCTTGGCCGTTCTCGCGGCAACAGGTGTGGGGGGTTCATAGTGGGTATGGCCGTAGTAGCCATGGCACACCAGGTCAACCACCATTTCTCCGCTGCAGCCACAACCTATGGGTGGTCCACACTTCCCCTCGGCCCGTGCGCCGCAAAGATCACTAGTTCTCTCCAAGGTGAAGCACCCACCTACACCGGGTTTGCAGATGTTAGTGGAGCGGGTGAGGGGCCAATAATACCTAACATCCCAAATCATTGGCCCGATTCTTGTGCTTCGTCTGTCATCGCAACTTGGGACAGCGCAGCCCACCGCCCAAACCTTGGTATTAGTGGATCAATAATGACCTTTGACAACCATGGGGATGCGGATGAAGCCCAAATAACCGGGGCTATGGCAGCAACGGTGGACCCATCCCCCAGTCATAGAACCCAGCTACAAGGTAGCTTCACAGCCAACACCATGCGCTTACTGCGCACGTCTGGTATTGAAAAGATTGGTGAGAACAACAAGAACGTGTATTTCATTCCAATCCTTCTTGATGGGGCCACTGGGTACATCAATGAAAAAGTTACAAACCTGGCTGACATCAACATTTCATATGGCCCTGTTGGTTCCAACAATGTCATCCTTTGGCGCGAGCGGGTCTTTTCCAGCCATCCTCGACCAGGCATCTTGTACAGCTCCCAGCTTGAATCCACTGCTTCTATCTTCCAAGATGGGCCGGTAAACATTCCCAACAACTACATGGCAGTTTTCAATGTCAGTGACACGGGTGCAGATTTCCAAATTGGTATTTGCCCTGACGGGTACATGCGCACGGGTTCCCCAGTTGGCACGGTTGTCGATCTAACACCCGAGTGCACTTTCACTTTTGTTGGCCTTTTCCCCTTCACTTCCCCTCTCAATGGGCCTCATGGGACTGGACGAGGCAGAAGTGTTTACCAATGAGTTGGTTGGTGGGAGCACTCCAGCTTGGCGGTGCGCTTGTTGACGCTGCTGGCAGCGTGTCCAACATGGTGTACCAGCACAAACAACTCGAACTCCTTAAACAACAAAACCAACTGTATTCAACCTGGATGGCCAAAAATGAACAGCTCCAACGTGACTCCATGGCACTGTCTGAAAAGTTGTCCACGGAGGGCCCTGCTCTCCGAGTCAAGGCTGCACTAGACGCGGGTTTTGACCCCGTCAGTGCCCGCCGTTTGGCCGGGTCAGGGGAGCGCCGGATTCAGGGGTACATAGACATGCCTATTATGACCCAGCAACATTCATCTGCACACTGGGTAAATGGAAATTTGAACAAAGTTAATTCGGCACTCACCACATTTCAACAAGGTACCCCTTTTGGCAAGCCCCAACCCCCCAAATTTCAAACAGGTGGGCCCAACATTGGGAACAACAGGCCAGCAGTCAACATCGGACACAACCCGGGCTCATCATCTGCCTAACCTATCCTCTTTTATTTCCTTTCTCTACTTTTCTTTTCTTTTCCGACTGGCACTCACGCGTTCGGGAGTATAATGCCAATTAAGCGATTGGCTCCAGTTTTTCTCT
| 10,011
|
OR837779.1
|
Sapovirus sp.
|
George,U.E., Faleye,T.C., De Coninck,L., Agbaje,S.T., Ifeorah,I.M., Onoja,B.A., Oni,E.I., Olayinka,O.A., Ajileye,T.G., Oragwa,A.O., Akinleye,T.E., Popoola,B.O., Osasona,O.G., Olayinka,O.T., George,O.A., Ahmed,M.I., Komolafe,I.O., Adeniji,A.J., Matthijnssens,J., Adewumi,O.M.
|
Redeemer's University, African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases
|
Nigeria
|
2023-12-25
|
SaV/A36/AFP33/NGR/2020/S033
|
Sapovirus sp.
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,494
|
GenBank
| null |
Nigeria: Edo State
|
Nigeria
|
Homo sapiens
|
feces
|
2020-08
| null | null |
Sapovirus sp. isolate SaV/A36/AFP33/NGR/2020/S033, complete genome
|
GTATAAGAGACAGGTGTTGGGTGTGTTTGGTTAGTATGGCTTCTAAGCCATTCTACCCTATTTCATTCAACCGCAAGGTTGAATATTCAGTGCTCAGATCGGCTCACCTCAGGGTGAGTGGTCGTGAGCAAATGTTTGAAACTATAGCAGAATTAGATAACCATGTAGAAACAGTGGTTGCTGGGCTGTGGCGTGACAATTTACGCCGCAGCCTGGAAGCGATCCCTACCTTCACTGAAGAGGGGCTGCTAGATTCTTTCTTGTCGAAACCACCCGTGGACATCAACCCAGACACGACGTTTCGTGAGTTATTTGGAGTTGACCCTCACGAACAGTTCCCCTTGTCCATTCATGATCTGGCCAAGTTACAAGGTGAGCTTGTGGAGGCGGCACGCAATCCTGGTCACATATTGCGGCGTCATTACTCCACCGATTCGCTCACCGCCCTAATTAATAAAATCACAAAATTTGTCCCCGTCCAAGCGACCTTACAAGAAATGCAGGCTCGACGTGCATTTGAGCGCGAACGAGCAGACCTTTTCAAGGAGCTGCCACATGTCGAGCCGGACGTTGGTCACCAGCAGAAGTCCTACTTTTATGCAATGTGGCGGCAGGTGGTTAAGAAGGGAAAAGAGTTCTTCATACCCCTTGTTAAGTGCACCTCATGGCGGAAAAAGTTCACTGAGCCTGCCGAAATCATACGACAAGTGTTGGTCCACTTTTGTGAGGGAATGCGTTCGCAATTTTCCACAAATGCGAACTACATCAATTTATCGCTCATCGCAAAGATGCGACCAACTGTTTTGACCATGATTTTCCAACAACACAAGAACACATACCGTGGCTGGCTGGCAACGGTCACCGCTCTGATTGAAGTGTACTCCAACTTGTTCCAGGACATGAGGGACACCGCGGTGTCCGCCGTGTCTGCGGTTACCCTCGTGTTTGAAACAATCAAGGATTTCATCAACAACGTCATTGACTTGGTTAAGTCCACCTTTCAAGCACAAGGCCCAACACCATGTGGGTGGGCGGCTATAGCCGCCGGTGCGTTACTTATCTTAATGAAGCTTTCAGGATGCTCTAACACAGCCAGCTACTGGCATAGGTTGCTTAAGGTGTGTGGTGGAGTCACCACTCTTGCTGCGGCGGCACGCGCTGTGGTCTGGGTTCGTGATATAATCATGGAAGCTGATGGCAAGTCCCGGCTTAAGAAGTACATGGCCCGGACTGCAGCCTTGCTAGAGCTTGCAGCCTCCAGAGATGTCAATGGTACCGATGAGCTAAAGCGGTTACTGGACTGCTTCACACAACTTATTGAGGAAGGTACAGAGCTGATTCAAGAGTTCGGAACATCACCACTCGCTGGCCTTGCCCGCTCGTATGTCAGTGAGCTGGAGTCGGCTGCTAATAGCATCAGGAGTACCATTTTGCTTGACACCCCACGCAAGACCCCTGTTGCCATCATCCTCACTGGCCCCCCAGGCATAGGCAAAACTAGGTTGGCACAACACCTCGCGGCTGGGTTTGGTAAGGTGTCAAATTTTTCTGTGACACTCGACCATCATGACTCGTACACTGGCAATGAGGTTGCCATCTGGGACGAGTTTGATGTTGACACGCAAGGTAAATTTGTTGAGACCATGATTGGTATTGTCAACACGGCACCTTACCCACTCAATTGCGACCGGGTGGAGAACAAAGGGAAAGTGTTCACATCTGACTATGTTATCTGCACCAGCAATTACCCCACATCTGTCCTCCCGGAGAACCCGCGGGCCGGCGCCTTCTACCGTCGTGTGATCACGGTGGACGTCTCATCACCCTCAATAGACGACTGGAAGAAGAGGAACCCTGGAAAGAAACCCCCGTTGGACCTGTACAAGGGAGACTTTTCACACTTGCGCTTGTCAGTTAGACCGTTTCTTGGCTACAACCCTGAAGGAGACACATTAGACGGCGTGCGGGTTAAGCCCACAACTACCAGTGTTGATGGGTTGTCACGCTTAATGGAGACCAAGTTTAAGGAGCAAGGCAACGAGCAACGCAACATTTGGATCACCTGTCCGCGCGATCTGGTGGCCCCCGCCGCATCAGGCCTAAAATCCTACATGGCAGCCAATCGCGCGCTTGCCCAAGTGTTTCAGGAGCCCTCCTCCCAAGACATCGGGGAAGTGTGCACGTCTCGCGTGTACGTGTCATGCAATAACCCACCACCCACATTTGTTGGACGTGTTGTAAAAATCACAGCCATTAACCCATGGGACGCCTCGTTGGCCAATTCAATGCTCTCAATGTTTGAAACTTCCACACACATACCGGCATCAGTGCAGCGTGAGATTATGTACAGGGTCTGGGACCCGTTGGTCCACCTACAATCACGGGAGCCCAATACACAGATGTTACCTTACATTAATCGGGTGGTACCTGTCGCCTCGGCTTTTGACTTTATACGAGGCCTCCGACACCACCTTGGTTTGTGTTCAATCAAGGGGATGTGGCGCGCTTACCAAGGCTGGACAAGCTCAAGTTCGATCCTCGAGTTTTTGTCAAAACATATGGCTGATGTGAATTTCCCCCACAACCCTGAGTGCACCGTGTTCCGGGCCCCTGATGGGGATGTCATCTTCTACACTTTTGGGTCATACGCATGTTTTGTCTCCCCTGCTCGCGTGCCTTTTGTTGGTGATCCTCCGAAGAATGTTCACTCAAACATCACCCGCAACATGACATGGGTCGAAACTTTACGCTTGCTTGCTGAGACAGTGACGGAGTGCCTAGCGCATTTCGGCCCGTTCTTGCTCATGTTGCACAATGTGTCTTACCTCACTGCGCGATCCAGCCGCGAAGAGGAAGCAAAAGGTAAAACAAAACACGGTCGCGGTGCCAAGCACTCGCGCAGGGGGGGGGTCAGCCTGTCTGATGATGAATATGATGAGTGGCGGGATCTAGTGCGTGACTGGCGCCAAGACATGACAGTTAGCGAGTTTGTCGAACTTCGAGAGAGGTTCGCGCTCGGCATGGACTCTGAGGATGTGCAGCGATACCGTGCCTGGCTTGAGCTGAGAGCAATGCGCTTGGGAGCAGGGGCTTACCAACATGCCACAATCATCGGCAGGGGTGGTGTCCAAGACACGATAATACGCACCCAACCCATGCGCGCGCCACGAGCACCACGCCGTCAGGACTATGATGAAGAAGCACCCACTCCAATAGTTGCATTCACTTCTGGAGGTGAGCACATTGGTTACGGTTGCCACCTGGGCAATGGCGTGGTTGTGACAGTCACGCATGTTGCATCAGCCGCAGACCAAGTGGAAGGCCAGGAGTTCACTATTAGGAAAACTGAAGGGGAAACCACCTGGGTTAACACAGGTCTCGGCCACCTGCCCCATTATCAACTTGGGGATGGCGCCCCGGTCTACTACTCAGCCCGCCTCCACCCAGTGAGGACAATAGCAGAAGGCACATATGAAACACCCAATATCACAGTTCAGGGGTACCATCTCAGGATCCTCAACAATTACCCAACCAAGCGCGGGGATTGTGGGACACCATATTTCGACGCCTGTCGCAGACTGGTGGGTTTGCATGCCGCCACTTCCACCAACGGCGAGACAAAGCTCGCTCAACGCGTGACTAAGACATCTCGTGTTGAGAACGCTTTTGCGTGGAAGGGTCTGGCCGTCATACGTGGTCCTGATTGCGGGGGCATGCCCACTGGCACTCGTTACCACCGCTCCCCTGCCTGGCCTGAGACAATCGAGGGTGAGACCCACGCCCCTGCCCCGTTCGGGTCTGGTGACTCTCGGTACTCATTCTCTCAGGTGGAAATGCTCGTTAATGGACTCAAGCCTTACTCTGAACCCACACCAGGCATCCCACCTGCCTTGCTCCAAAGGGCGGCGACACACACACGCACCTACCTGGAAACCATAATTGGCACCCACAGATCACCTAATCTAACTTTTGGAGAAGCCTGCGCCTTGTTGGAGCGTACAACTTCTTGTGGACCTTTTGTGGCTGGCCAGAAAGGGGACTATTGGGATGAAGACAAACAGTGTTACACTGGTGTGCTGGCGGACCACCTTGCTAAGGCCTGGGATGCCGCCAATAGGGGTGTGGCTCCCCAGAATGCATACAAGCTGGCACTCAAGGATGAACTTCGACCCATTGACAAGAACGCGCAGGGCAAGCGCCGGTTGTTGTGGGGATGTGATGCTGGGGCCACGCTGGTCGCCACTGCAGCATTCAAAGGGGTGGCCACGCGGTTGCAAGCGGTTGCTCCTATGACACCAGTTGCGGTTGGCATCAATATGGACAGCTACCAAGTTGAAGTGCTTAATGAATCTCTCAAGGGAGGGGTTCTCTACTGTCTGGATTACAGTAAGTGGGATTCCACCCAGCACCCAGCGGTCACGGCCTCCTCATTGTCAATCCTAGAACGGCTGTCTGAGGCCACCCCAGTCACCACATCCGCAGTGGAGTTGCTATCATCCCCAGCACGAGGCCATTTGAACGACATAGTTTTTGTCACCAAGTCCGGACTCCCATCAGGTATGCCGTTCACCAGCGTCATCAATTCTCTCAACCACATGACATACTTTGCCGCAGCGGTGTTGCTGGCCTACGAGCAACACGGGGCCCCCTACACCGGGAATGTTTTCCAAGTTGAAACAGTGCACACCTATGGAGATGACTGTATGTATTCAGTCTGTCCTGCTACGGCCTCCATCTTCCACTCTGTTTTGGCCAACCTTACCGCATTTGGGCTGAAGCCTACCGCTGCAGATAAGAGTGAAAGCATTGCCCCCACCCACACGCCAGTGTTTCTCAAAAGAACCCTGACCTGCACACCTCGCGGCGTGCGGGGACTCTTGGACATAACCTCTATCAAAAGGCAATTCCTCTGGATCAAGGCCAACAGAACAACTGACATCAATTCTCCACCGGCATATGACCGAGAGGCACGCAGTGTTCAGCTCGAAAACGCTCTTGCC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| 10,012
|
OR837780.1
|
Sapovirus sp.
|
George,U.E., Faleye,T.C., De Coninck,L., Agbaje,S.T., Ifeorah,I.M., Onoja,B.A., Oni,E.I., Olayinka,O.A., Ajileye,T.G., Oragwa,A.O., Akinleye,T.E., Popoola,B.O., Osasona,O.G., Olayinka,O.T., George,O.A., Ahmed,M.I., Komolafe,I.O., Adeniji,A.J., Matthijnssens,J., Adewumi,O.M.
|
Redeemer's University, African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases
|
Nigeria
|
2023-12-25
|
SaV/A143/AFP39/NGR/2020/S039
|
Sapovirus sp.
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,526
|
GenBank
| null |
Nigeria: FCT, Abuja
|
Nigeria
|
Homo sapiens
|
feces
|
2020-09
| null | null |
Sapovirus sp. isolate SaV/A143/AFP39/NGR/2020/S039, complete genome
|
TATAAGAGACAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGGTATGGCTTCTAAGCCATTCTATCCAATTGATTTCAACCAGAAGGTTGAAATTGCAATCCTCTTCTCCGCCCACCTCAGGGTGAGTGGGAGGGAGGAAATTTTTGAGACAAAGCATGATATGTACGCTCATGTTTGTCAGGTGGTTGCCGGGGTGCGGCGCGAGATACTGCGTCGTGTCCCGGTACCCACGCCCTCTTTTGATGAAGAGGGGCTCCTCGATGCATTTGCATCTAAACCCCCTGTGGATATTAACCCTGACACCACATTTCGTGAGTTGTTCGGTATTGACCCACACGAGCAATTCCCCTTGTCCATCACCGATTTGGCTAAATTGCAAGGTGAGCTTGTGGATGCAGCGCACAACCCAGGTCACATCCTGCGTCGTCACTACTCTACCGATTCGCTCACCAAACTAATCAATAAGGTCACTAAATATATCCCCGTCCAAGCCACCTTAGCTGAGATGCAGGCACGAAGGGCCCATGAGAGGGAACGAGCTGACCTTTTCAAAGAATTACCTTTGGTCGACCCGGAGGTGACACAACAACAAAAGTCCTACTTTTATGCCATGTGGCGACAAGTGGTGAAGAAGGGCAAGGAATTTTTCATACCACTGGTGAAGTGTACATCGTGGAAGAAGAAGTTTTCGGAACCAGCAGAGATTGTGCGTCAACTTGTGGTACACTTTTGTGAAGGCATGCGCACACAGTTCAGCACAAATGCTAATTATCTCAACCTGTCTCTCCTGGCCAAATTGCGGCCCACTGTCCTGACAATGATATTCCAGCAGCACAAGAACACCTACCGCGGGTGGTTGGCCACCATCACCGCTCTTATCGAGGTCTATTCAAATTTGTTTCAGGACATGCGAGAAACCGCAGTGTCTGCGGTGTCTGCAGTCACACTCCTCTTTGAGTCGTTGAAACAATTCATTGAAGGGGTCATAGACCTGGTCAAAGGCACTTTTCAAGCGCAGGGTCCCACAAACTGTGGATGGGCTGCCATTGCTGCTGGTGTCATTTTAATCCTCCTCAAGATATCTGGATGCCCCAATGTCATGGGCTACTGGCAGCGTCTGTTGAAAGTGTGTGCCGGTGTCACCACCATCGCTGCTGCTGCAAGGGCCTTCACCTGGGTCCGTGACATCATAGTGGAGGCTGAGAGAAAGGCCCGGCTAAAGAAATACATGGCACGCACGGCTGCCCTGTTGGAGCTTGCCGCGTCACGGGATGTCACTGGAACGGAGGAGCTAAAGCGGCTACTTGAATGTTTCACTCAACTCATAGAAGAGGGTACAGAGTTAATCCAGGAATTTGGAACGTCACCAATGGCAGGGCTTGCGCGTTCTTACGTTAGTGAGCTTGAGACTGCAGCCAATGGAATCAGGAGTACAATCCTTCTAGATACTCCCAGGAAGGTCCCAGTGGCGGTAATCTTGACTGGCCCCCCAGGTATAGGGAAAACACATCTTGCACAACACCTGGCCGCTGGCTTTGGCAAGACTTCAAATTTTTCCGTCACCCTGGATCACCATGATTCCTATACAGGTAATGAAGTGGCTATCTGGGATGAGTTTGACGTGGACGCTCAGGGTAAGTTTGTGGAAACAATGATCGGTGTGGTTAATACTGCACCATATCCTTTAAATTGTGACAGGGTGGAAAACAAAGGCAAGGTGTTCACTTCAAATTACATTATATGCACTAGCAACTACCCCACATCTGTCCTGCCTGAGAACCCACGGGCCGGAGCATTCTACCGTCGTGTCACAACGGTGGACGTGTCTTCCCCCATCATTGAAGAATGGAAGAAGAAAAACCCTGGGAAGAAACCCCCCTTAGATCTATACAAGAAAGATTTCTCCCATTTGCGTCTCTCCGTACGCCCATACCTCGGCTATAATCCGGAAGGAGACACCTTGGAGGGTGTGCGGGTGAAGCCCATACTAACTAGTGTGGATGGCTTAACTAGAATCATGGAAACTAAGTTCAAAGAGCAAGGTAACGAGTTGCGCAACCTTTGGATCACATGCCCTCGCGATTTGGTAACACCTGCGACTTCTGGGTTGAAATCCTATATGGCTGCCAATCGTGCCTTAGCACAGGTCTTTGCAGAACCATCTTCCAATGAAATTGCAGAATCATGCACGTCCAGGGTTTTTGTGTCTGCCAACAACCCCCCCCCTTCTTTTGTGGGCAGGCACGTCAAAGTCACAGCCATCAACCCTTGGGACGCGTCCCTTGCCAATTCAATGCTGTCAATGTTTGAGACCAACACCCACATACCAGCTGCCACACAGAGAGAAATCATGTATCGCGTGTGGACACCTTTGATACACATGCAGACACGGGAGCCAAACACCCAGATGCTCCCTTACATCAACAGAGTCGTGCCAGTCTCTTCATCCTTTGATTTCGTTCGTGGGTTGCGCCACCACCTTGGCCTGTGTTCCATCAAGGGGATGTGGAAGGCGTACCAGGGGTGGCACAGCTCTGCAACTATTTTGGAATTCCTATCCAAGCACATGGAAGACGTAACATTCCCTTCCAACCCAGAGTGCACCGTTTTCCGTGCTGCAGACGGTGATGTCATTTTCTACACATTTGGCTCATACGCTTGTTTCATCTCACCTGCACGAGTGCCATTCGTGGGGGATCCACCAAAAGCCGTCCACTCCAACATCACGCGGAACATGACGTGGATTGAAACGCTACGCCTGCTTGTTGAAACAATCACGGAGGGTCTGGCTCATTTTGGCCCATTGTTATTGATGGTTCACAACGTGGCATACTTAACAACCAGATCACAGCGTGATGAGGAGGCTAAAGGGAAGACCAAACATGGCAGAGGGGCCAGACATGCGCGACGTGGCGGGGTCAGCTTGTCAGACGACGAGTATGACGAGTGGCGTGATCTCGTGCGTGACTGGAGGCAAGACATGACTGTCGGGGAGTTCGTTGAGTTACGAGAGCGCTACGCTCTAGGCATGGACTCAGAGGATGTTCAACGGTATCGCGCATGGCTGCAACTTCGTGCGATGCGACTGGGTGCAGGTGCTTACCAGCATGCAACCATCATTGGGCGTGGGCGTGTCGAGGACACCATTATTCGCACACAGCCCATGCGAGCTCCACGCGCCCCCCGTTCCACGGGGTACGACGAGGAAGCCCCGACACCAATAGTCACTTTCACCAGCAACGGTGACCACGTCGGGTATGGGTGTCATGTTGGCAACGGTGTGGTGGTGACGGTCACTCACGTGGCCGCTGCTGCGGATGCCGTTGATGGTGTGGAATTCACGGTTAGGAAAACTGAAGGTGAAACCACTTGGGTGAACACCCCTCTCAGCCAACTGCCACACTACCAGTTGGGTGACGGGACACCAGTCTACTACTCCACCCGACTGCACCCTGTCACCACAATTGCCGAAGGCACTTATGAGACTCCCAACATCACTGTCCACGGATTCCACTTGCGCATCATCAATGGATACCCCACAAGACGTGGTGACTGCGGCACTCCATATTTTGACTCATGCCGTAGATTGGTTGGACTACATGCTGCCACCTCAACTAATGGAGAAACCAAACTGGCGCAGAAAGTTAGTCGAGTCTCAAAAGTGGAAAATGCCTTTGCTTGGAAAGGTCTTCCTGTGTTGCGAGGCCCGGATTGTGGTGGTATGCCAACGGGAACAAGGTATCATCGGTCCCCGGCCTGGCCACAGCAACTCCCCAATGAGACACATGCACCAGCACCATTTGGTGCCGGAGACTCTCGATACAACTTCTCACAAGTGGAAATGTTGGTTTCAGGTCTAAAGCCCTATTCAGAACCAACCCCTGGGATTCCCCCTGCTTTACTGCAACGGGCTGCCACGCATACTCGCACATATCTGGAGTCAATCGTCGGCACACACCGGTCTCCCAATTTAACCTACAATGAGGCATGTGCCTTGCTGGATCGCAGTACATCCTGTGGCCCGTTCATTGCGGGCCAGAAGGGAGACTATTGGGATGAGGACCGTCAGTGTTACACTGGGGTCCTGGCCGACCACCTTGCGAGAGCTTGGGATGCCGCCAGTCGTGGTGTTGCCCCGCAAAATGCTTATAAATTGGCTCTCAAGGATGAACTTCGCCCAATAGAGAAGAACCAGCAAGGCAAACGCCGGTTGTTGTGGGGGTGTGACGCTGGTGCAACTTTGGTCGCGACGGCAGCTTTCAAGGGAATTGCCACACGCCTGCAAGCCGTTGCACCCATGACACCTGTTGGTGTTGGTATCAACATGGACAGCTACCAGGTAGAGGTGCTTAATGAATCCCTTAAGGGTGGCGTTGTGTACTGTTTAGATTACAGCAAGTGGGATTCCACACAACACCCGGCAGTCACGGCTGCGTCTCTGTCAATTCTCGAGCGACTGTCTGAGGCAACACCAATAACCACCTCGGCTGTTGAGTTGCTGTCATCACCCGCACGTGGTCACCTGAATGACATTGTTTTTGTCACAAAGTCGGGGCTTCCCTCAGGCATGCCGTTCACCAGTGTTGTCAATTCGCTCAATCATATGACATACTTCGCAGCTGCAGTGCTGAAGGCTTACGAGCAGCACGGTGCGCCCTACACTGGTAATGTGTTCCAGGTTGAGACTGTCCACACTTACGGTGATGATTGTTTATACTCTCTGTGTCCAGCAACCGCCTCCATCTTTGAGACTGTCTTGGCAAATCTTAGTGCCTTTGGTCTGCGACCCACAGCAGCTGACAAAACAGACAAAATAGCCCCCACCCACACACCAGTCTTCTTGAAGCGGACCCTCACCTGCACACCCAGGGGGATCCGTGGTTTGCTCGACATCACGTCAATTAAACGGCAGTTTTTCTGGATCAAAGCGAATCGCACCACAGACATAACATCCCCCCCTGCCTACGATAGGAAAGCCCGCAGTGTGCAACTTGAAAATGCTCTTGCCTACGCCTCACAACATGGACATGCGGCATTTGAGGAAATTGCTGAAATCGCAAAGAAAACGGCACAGTCCGAAGGTTTGGTGCTCACAAATACAAATTATGACCAAGCTCTCGCCACCTATGAAGCGTGGTTCATAGGTGGTACAGGCTCTAGTCAAGATGATCCCAGTGAAGAGACCACCAAATTAGTGTTTGAAATGGAGGGCAATGCTCGCCCCGAGGGGCAAAACCCTGAGCGCACGAATGTGCCACTGGCCTCCCCTCAGGATACCATTGGTCCTAGTGCTGCGCTCTTGCTCCCAACTCAAATCGAAACTCCAAATGCCACCGCTCAGCGTGTTGAACTGGCGGCCGCAACAGGTGCAATCACCAGCAATGTTCCCAGTTGCATCCGGGAGTGCTTCGCCAGTGTCACCACGCTCCCCTGGACCACGCGTCAAGCGGCTAACACGTTCTTGGGTGCAATCCACCTTGGTCCGAGGATTAATCCTTACACCGCACATATGAGTGCCATGTTTGCAGGGTGGGGAGGTAGCTTCCAGGTCCGCGTCACGCTCTCTGGCTCTGGGCTCTTTGCAGGACGTGCCGTTGTTGCTGTCTTACCACCAGGGGTTAATCCGGCAAACGTGCAAAACCCGGGGGTTTTCCCCCACGCGTTCATAGACGCGCGCACCGTGGACCCCATCCTAATCAACCTACCAGATATTCGAGCAGTCGACTATCACCGAGTCGACGGTGATGAACCCACGGCCACTGTTGGTCTTTGGGTTGCACAACCACTCATCAACCCCTTTCAGACTGGCTCGATATCCACATGCTGGTTGAGTTTTGAGACACGCCCTGGCCCGGACTTTGATTTCTGTCTCCTCAAAGCACCTGAACAGGAGATGGACAATGGTGTCTCCCCTGCAAACCTGCTCCCTCGGCGCCTTGGACGGTCACGAGGCAACCGCCTCGGTGGACGTATAACAGGCTTGGTGGTGGTGGCTGTGGCAGAACAGGTGAACCACCACTTTGCAGCCAACTCAACAACGCTTGGCTGGTCAACGCTCCCAATTGAACCAATTGCAGGAGCTGTGTCCTGGTACAAGTCCACTGCCTCTAACAGCGTTCGGGGGCTGATTGGAGCTGCAGGTAAGGGTATCATCTTCCCAAACATTGTCAACCACTGGACAGATGTAGCACTCTCTGCCAAGAACTCAGGTCAAACAAACCTGCCTGCTCCCAATGCTGACATGAGTGGCTATCCAGGGGCTTCTGGCCCCGTGGTGATGTTCCAGAACAATGGTGATGTCAACGAGAGTTCAGCCAATCACGGCATACTCACTGCAGCCAACCACGACTTCACCACACTGACGCAGACTTTCGATGCTGCAGGCACGTGGATTTGGATGCCTTGGACTTCAACTCAACCTGATGGCACGCAGAACAACAACGTGTACATCAATCCAATTTGGATCAATGGCAACTCTTCTCACCCCATACACGGCAAGTGCACAAACATGGTCGGCACCAACTTCCAATTCGGTGGAACCGGTACCAACAATATCATGTTGTGGCAGGAGCAGCATTTCACTTCGTGGCCAGGGGCAGCGGAGGTCTACTGTTCCCAGCTCGAAAGCACTGCAGAGATGTTCCAAAACAATATAGTCAACATCCCTGCAAACCAAATGGCAGTCTTCAATGTGGAAACTGCTGGGAATACATTCCAAATTGGCATCCTACCAAATGGCTACTGTGTCACAAATGCTGCCGTTGGAACACATCAACTCCTTGACTTCGAGACTGCATTCAGATTTGTTGGTCTTTTCCCCCAAAGCACGACACTTCAAGGGCCCAATGGGAACGCTGGTCGGGCCGTTAGGTTCCTTGAATAATGTCTTGGTTTACAGGTGCAGCTCTTGCTGCCGGCTCTGTTGTGGACATGGCCGGCACCATTTCATCTATTGTGGCCCAACACAGGCAATTGGACCTAATGGCACAAGCCAATAAAATTCAACAGGAGTGGGTGACAAAGCAAGAGGCATTAGCTCGGCGGGGTCAAGATATCTCTCAGGATTTGGCCATCAATGGCACTGCCAAGCGGGTTGAGTCCCTCATTAACTCTGGATTCACCCCAGTTGATGCCCGTCGCCTTGCTGGGGGCACTGAGACCGTGCAGTATGGACTGCTGGACAGACCCATTTTGCACCGACAGGTCCTCACGGGCATCTCTGAGACTCACCACCTCCAGTCAATGCAAGGGGCTCTCAGTGCTTTTAAACAGGGGTCCAAGTATGGTGCCCCCCCGGCACCTGCTGGCTTCATCAACCCAAATTATCAATCTGCTCCCCCCCGGGTTAACTTGGGCTTTCGACCCCCATCTACCAATGTGTAAATATTCTTTAATTCTTCATCTATCCTTTCTTTCTTCCTTTCCGTGGTTCCTCACGCGTTCGGGTGGATAATTGCGATTAAGCGATCGCAGCCACGTTTCTTGCAAAGGGAAAAAAAAAAAAGAAAAAACCAAACACACCCAACACCTGTCTCTT
| 10,013
|
OR837781.1
|
Sapovirus sp.
|
George,U.E., Faleye,T.C., De Coninck,L., Agbaje,S.T., Ifeorah,I.M., Onoja,B.A., Oni,E.I., Olayinka,O.A., Ajileye,T.G., Oragwa,A.O., Akinleye,T.E., Popoola,B.O., Osasona,O.G., Olayinka,O.T., George,O.A., Ahmed,M.I., Komolafe,I.O., Adeniji,A.J., Matthijnssens,J., Adewumi,O.M.
|
Redeemer's University, African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases
|
Nigeria
|
2023-12-25
|
SaV/A143/AFP46/NGR/2020/S046
|
Sapovirus sp.
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,524
|
GenBank
| null |
Nigeria: Lagos State
|
Nigeria
|
Homo sapiens
|
feces
|
2020-11
| null | null |
Sapovirus sp. isolate SaV/A143/AFP46/NGR/2020/S046, complete genome
|
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| 10,014
|
MN187064.1
|
Sapovirus sp.
|
Liu,J., Ge,L., Huo,Y.
|
The Sixth People's Hospital of Zhengzhou, Center for Translational Medicine
|
China
|
2020-03-04
| null |
Sapovirus sp.
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,492
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
feces
|
2015-09-07
| null | null |
Sapovirus sp. strain 20150907, complete genome
|
GTGATTGGTTGGATGGCTTCCAAGCCATTCAAGCCAATAGTTCTCAATGTCACTTTCGAGTGGCAGGTCTTCAAGCGGTGCTACCTCAGGGTAGCGCCGCGTGAAGCATTTTGTGAGAACTTGAGTGAACTTCATCACTATTTTGCCAGGCGTGTGAACGCCTGGCTCAAGCATGCCACAAGGACCCTCCCAGACAAATACACGTTTGTCGAGGAGGGTCTCCTTGACATGTTTGGTACAAAGGCTCCTGACAGTGTTCAAGAAGGCACACTGTTCCGGGAGCTGTTCGGGGTTGACCAAACCGAGCAATTCCCGCTGTCCCTCGCAGACTTGGCCAAGTTGCAAGGAGAACTTGTTGACGCGACCCGTACCCCAGGACACGCATTGCGTCAAAAGTACACAATGGCCACTATACAGGACTTGATTGATAAGATTACCAAGGTTGTGCCAGTGCAGGCTACGCTCACTGAGATGCACGCGCGCAGGCAATTCGAGCGTGAACGAGCTGACCTGTTTCATGAACTCCCATTAGTGGATGAGGATGCTGGTTCGCAACCCAAAACTTACTTCTACACCATGTGGCGCCAAGTTGTGAAGAAGGGTAAAGCGTACTTCTGCCCTCTCGTCAAGACGAGTGCATGGCGCACCAAGATCAGTGCCATAACAGAACCCATCAAGGACTTCTTAATTGCGTTTTGCCAGGCAGTGCAACAAGAAATGGGCGTGAACCCGCAATATCTACAACTTGCCTGGCTACAGAAACTCAAACCCACCACATTAACCATCATTCTTCAACAACACAAGCACACCGTCTCAGGGTGGCTGGCCACTATGACAGCACTTGTAGAAGTGTATTCAAATCTGTTTGATGACTTACGCAAATCCTCAGTTGCCATCGTGTCAAGCATGGGAGCCTTCTGTGACATTTGTAAAGATTTTGTGTCACAGGTTGTAGAGCTGGTCAAAACGACATTCACTGCCCAGGGTCCGACAGACTTGGGGTGGGCAGCAGTGCTGGCAGGAGCTGCAATGATTTTGCTAAAAATGTCTGGGTGCCCCGGCGTCATTGGTATGTGGACAAAAGTACTTAAAATCTGTGGGGGCATCACCACTATCACAGCAGCAGCGCGTGGAGTGCGTTGGCTGAAGGATCTCTATGAGGAGGCTGAAGGACGTAGGCTGGCAAAAATGTACATGGCACGCGGTGCCGCCCTCATTGAACTTGCTGCTAGTCGTGAGGTTACAGGCATTGACGAGCTCAAGGGCCTCCTTGATTGTTTTACCATACTAATCGAGGAGGGCACTGAACTCATCCACAAGTTTGGCACTAGCCCACTGGCAGGTCTGGTACGCACATATGTGTCCGAACTAGAAACCCAGGCAAACAACATTAGATCCACCATTAAGCTTGATACTCCCAGACGGGTGCCCGTTGTCATTATCCTTACCGGGGCACCTGGCATCGGGAAAACTCGCTTAGCACAATATGTTGGCCAGCGATTTGGGAAAACCTCCAACTTCTCAGTAGCTGTGGACCACCATGATGGCTACACAGGGAACACTGTTTGCATATGGGATGAATTTGATGTTGATTCCAAGGGTGCGTTTGTGGAGACAATGATTGGGATCGCAAATACGGCACCCTTCCCGTTAAATTGTGACAGGGTTGAAAACAAAGGGCGTGTGTTCACGTCCGATTATGTCATTTGTACATCCAATTACCCTACATCCGTCATCCCAGACAACCCAAGAGCTGCGGCCTTTTACCGTAGGGTCTTAACTGTTGATGTCAGCGCACCAGATTTGGAGGAATGGAAAAAGAGGAACCCTGGTAAACGCCCTACTCCAGACTTATACCAAGATGATTTTTCCCATCTTAAATTGATGCTAAGACCATATTTGGGTTACAATCCAGACGGGGACACACTTGAAGGTCCCAGAGTTGCCCCAACCCAAATAAGTATAGCGGGACTGATAACCCTAATGGAAAGAAGGTTTAAGGAACAGGCTGGGCCCCTGCAGAACTTATGGTTACAAGTCCCAAAGTCACTTGTGGAGCAGTCCACAAATATGGTCAAAACATTCATGTACGCCAACCGCGCAGTGTGTGACGTGATACCTAATCCCGCCACCCGTGACATCACCGAAACTGCGTTGTCAAAAATCTTTGTGTGTGGCACCGCCCCATCACCTGAGTTCGTTGGCAAGCATATAGTCATCACTGGCATAGAGGTGGGTGATGCATCCATTGCCAACTCACTACTGTCCATGTTCACCACCACCACACGACTGTCTGCCGCGGCCCAGAGGGAGTACATGTACAGAGTGTGGAGTCCACTCATCCACATCCAAGATCGAAGTATAAACACTCAAAACCTCCCATACATCAATAGAGTGATCCCAGTGACATCCCACTGGGACTTTTTGAGGGGTCTGCGGCACCACCTTGGTTTCACATCTATTCCAGGCATGTGGAAGGCATTTCAAGGTTGGCGCACATCACAGGGCATAGTTGACTTTGTGGCACACCATATGGCAGATGTCACATTCCCAAGTAACCCAGAATGCACCATTTTTCGCACACCGGATGCAGATGTGGTCTTTTACACTTTTGGCTCATATGTATGTTTTGCCACCCCAGCACGGGTGCCGTATGTTGGCACACCACCCACTACCATCTACTCCAACACACCCCGATGCATGACTTGGGGTGAAACCATAGCACTGTTGTGTGAGGTGGTTGCCGAGTTTGTCCTTCATTTTGGTCCCGTGATTCTGTCTGCAGCCAATATTGCCTACCTTATGACCAGGGGGTCAAGGACTGAGGAGGCCAAGGGCAAAACCAAACATGGACGTGGCATGCGCCATGGCCACAGGGCCGGAGTGAGCCTCTCAGACGATGAGTATGATGAGTGGCGTGACTTGATGCGTGATTGGAGGCGTGACATGAGTGTCAATGACTTCCTGATGCTCAGAGAGAGGTCTGCGCTTGGGATGGATGATGAGGATGTGGCCAGGTACAGGGCATGGCTTGAGATCCGCGCCATGCGAATGGCAGGGGGTGCGTATACACATGCCACTATCATTGGGCGTGGTGGTGTGCGAGATGAGATCATACGCACGGCGCCACGCAGAGCCCCAACTCGGCCCCAACAACACTATGAGGAAGAGGCCCCAACAGCAATTGTGGAGTTCACGCAGGGCGGTGACCACATTGGATACGGGGTTCACATTGGCAATGGCAATGTGGTAACCGTCACCCACGTGGCATCAACGTCTGACGAGATCAATGGTAGTGCCTTTAAAATAACACGCACTGTTGGAGAGACAACGTGGGTGCAAGGGCCATTCTCACAATTACCACACATGCAAGTAGGTAGTGGCTCCCCGGTTTACTTCACCACACGGTTGCACCCAGTTTTCACAATATCAGAGGGAACATTTGAAACTCCAAACATCACCGTGAATGGGTTCCATGTCAGAATAATGAATGGTTACCCAACTAAGAAAGGTGACTGTGGGCTGCCCTACTTCAATTCTAACCGCCAGTTGGTGGCGTTGCATGCTGGCACGGACACACAAGGTGAAACAAAAGTGGCTCAACGTGTTGTCAAGGAGGTCACCACCCAAGATGAATTCCAATGGAAGGGTTTGCCAGTGGTCAAGTCTGGACTTGACGTTGGGGGCATGCCCACTGGGACTCGGTACCACAGGTCCCCTGCGTGGCCCGAAGAACAGCCTGGTGAGACACACGCCCCAGCACCTTTTGGTGCGGGAGACAAGAGGTACACATTTTCACAAACGGAAATGCTGGTGAATGGACTAAAACCCTATACGGAACCCACTGCTGGGATACCACCACAGCTCCTGTCTCGTGCGGTCACACATGTACGGTCGTACATAGAAACAATCATCGGCACACACCGGTCTCCTGTACTGACATACCATCAAGCATGTGAGCTGCTTGAACGGACCACTTCATGTGGTCCGTTCGTGCAGGGTCTCAAGGGCGACTACTGGGATGAAGAGCATCAGCAGTACACCGGTGTGCTGGCTAACCACCTTGAACAGGCGTGGGACAAGGCTAACAAAGGGATAGCACCAAGGAACGCCTATAAATTGGCACTTAAAGATGAGCTCAGGCCAATTGAGAAGAACAAAGCTGGCAAACGTAGGTTGTTGTGGGGCTGTGATGCTGCCACCACACTCATAGCCACCGCAGCCTTCAAGGCCGTGGCTACCAGGCTGCAGGTAGTGACGCCAATGACACCGGTTGCTGTTGGCATCAATATGGACTCTGTTCAGATGCAAGTAATGAATGACTCCTTAAAGGGAGGTGTCCTTTACTGCCTGGACTACTCCAAATGGGATTCCACACAAAATCCTGCAGTAACAGCAGCGTCACTAGCTATACTGGAGAGATTTGCTGAGCCCCACCCAATCGTGTCTTGTGCCATTGAGGCGCTTTCTTCCCCTGCAGAGGGTTACGTGAATGACATCAAGTTCGTGACACGCGGCGGTTTACCATCCGGGATGCCATTTACATCAGTTGTCAACTCCATCAACCATATGATATATGTAGCGGCAGCCATTCTGCAGGCGTACGAAAGCCACAGTGTCCCGTACACTGGAAATGTTTTCCAAGTGGAAACAGTCCACACGTATGGCGATGATTGCATGTACAGTGTGTGCCCTGCCACTGCATCAATTTTCCACACTGTGCTTGCCAACCTAACATCGTATGGACTCAAGCCCACTGCAGCAGACAAGAGTGAAGCAATCAAGCCAACCAACACGCCAGTGTTTTTGAAGAGGACATTCACACAAACCCCGCATGGAGTCCGAGCACTGCTAGACATCACTTCTATAACTAGACAGTTTTACTGGCTGAAGGCTAATAGGACATCAGACCCTTCTAGCCCACCTGCTTTCGATCGACAAGCACGCAGTGCGCAACTGGAGAACGCGCTAGCCTATGCTTCACAACATGGACCTGTTGT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| 53,672
|
MF944258.1
|
Sapovirus sp.
|
Liu,J.
|
The Sixth People's Hospital of Zhengzhou, Center for Translational Medicine
|
China
|
2018-04-17
| null |
Sapovirus sp.
|
Sapovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,484
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2015-10-18
| null | null |
Sapovirus sp. strain 20151018, complete genome
|
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| 71,119
|
ON812168.1
|
Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Sara tick phlebovirus
|
Phlebovirus
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Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,721
|
GenBank
| null |
China:Heilongjiang
|
China
|
Ixodes persulcatus
| null |
2019
|
SAMN28669420
|
PRJNA841744
|
MAG: Sara tick phlebovirus isolate TIGMIC_1, complete genome
|
CACAGAGGCGACCCCCTTATATCCGAAATCTGCAAGAATGTCCTTGAGTCGGCTAGACCAATTGTCTCAATACCTGGTGGAGCAGGTAAGGGACAGAGAGCCTGGCTTGATTGTCCCAGATCACGTCTTCACAGATCTGGGTACATGGCTGAAACCACCTAGTGTGCTAGTGGAACAGACTCAGAGTGGTGTCCTGAGTGTGAAGTTTCCAGGACTGGAGCAATGGAAAAGCGCATCTGAGGTCTCCATGTCCTCAATAATAGAGGAGACATGGCCACAGGAAAGGGCCTCACACCTGCGACATGACTACACTGCTGGGTTCTTTTGCAGATCTCTCGATACTCCATTGCGAAGTGTCTTCCAGATGTGCAGAGACGACAATGACAATCTGACTCCTGACAACATCATGACCGTTGGGAATGTCATCCTGGTGCATGAGTTTGCTACCACAAAAAGCACTCTCGAGACTAGCTCTCTAGATGCCTTCAAGTCCAAGATGCTCAGATACGCTCCGGCTTTGTCTTACAGAGCGCTGAAGGAAAACAAGGTGGTGGTGCTGACCATCACCGTGGTGTCACCAAAGACTGTACTGAGCAACCTTCCTCTGTCCACAGATGATGTCTATGAACTTTGTGTCAGGTTCTTGGTGGCCCGGGACATGGTGTGGCAATTAGAACAGCAAGGTGTGATTGTTTCTGATGAGGAAAAGGAGGACAATGAGAAGGCTGAAAAGGCTAGGATGACGATGTCGCAGATCAAGTTCAATTGGGAGTTTCAGAACAAGAACTTCCCAAATTGCAATGAGAGTGTCTATGAAGCCTCTAGATCGCAGCCTGACAAGAAGTATGTCATTGACCAGGTCCTTGCTGGGTTTCAGAACGCTGAAAAGAAGCTGAGAGAGGATCACTTTCTCAAGAAGGGCGAAAACCTAACCGAGGCTGACAGACTAGACTTGAACTTGGAGGAGTGTGCTAAAGCCATTAGCGACTACACAGAAAAGGTTGCCAAGGACAGAGAATTCAAGCCTGTTTGCACCATGAGCAGCATCATTCCCATCCCTTGGTGGGTTCCGAACCGAGGCACAGGTAGTAACAACATTTCTCAGTCACCAGCTACAGAGCCCAACTACATGCCCAGTCTAGGCACTTCTGATGAAACAACCTTCAGGCATTGGTCCAGTGCCTGGGAATTTGCCAAGCAGTTTCCAGAGAGGATGACTGAGGAGTCAGTGCAGGATGAGTTGTACGAGGCTATGAAAGCAGCCCCAGATGATCTTGACCTGACAGCTGAGCAAAAAGCAGAGATGGAGAGGCTGGAAAAGCTCATGGGGAACATCTCGAAGCCCTCTGAAGCCAAAGCCAGAAGTTGCTACAGGAGGGTGAACGTAAGGGTGTCTGCCAAAGATGAGAAGGAAGCAGCCAAGCGTGGTCTCAGAGGAAAGAAGTATGCTCAAGACAATGAAGTCCGAGCACACCATGAGCAGTCACAACTGCCTTTTAGTTTGGACAACTTTGTTGGAGACATTGAGGGCTTACTTGATAAGTCTCAAGAGATCTTCACAACTGTGTCTGGCACCAAGAACAGTTATGACAGAGACATGCTGCCTCACTTGGCTGAACAGGCTTATGCTCTACACAAGGACGGGGTTGGAGACCCATGGATAAAGTTGCTATCATCTTGGCTGAGCACTGACCTAGGGAAATGGTGCAGCTTCGTCTCAGATCTGGGCACAGAACTGGCCATCAGTATGAAGCAACACTGCAAGGGTAGTCAGATGATCCTCAAGAAACTGAGGCACTTTGACATTTATGTGCTCATAAGACCCACTTCAACCAAGTCAAGTGTGTTCTACTCCCTGATGACATTCCAAGTGAATCTGACTAATGACCCAGACCTGGTGGGGCCTGTGTTCAAGCAAGCCTTTAACAACGGCCAGATCTACTGGACAGAGTTCAACTCTGTAGACTCCAGCAAACTCACTAACATGGTGAAGTGCAGGTCGATCATGTACACCATGCTATCGTACTGGCTGGAATTTTACGGCTTGAAGTTCTGGGAAGTGAAACTGGCAGCTAAGTCCAGGGAGATGAATGAGGTGTGGAGAATGGTGACCATCTGTCTCATGATAATTCTAGACGACAAGACCAAGACAGAAGAGATCATCACAACAAGCAGGTACGTGTTCATGGAGGGCTTTGTGGCCCAACCTGCTCTGCCTAAGCCGCACAAGATGCTTGGTAAGCTCCCAGATGTGCTGAGGTCTAGGCTGCAAGTTTGGCTCATGCACAAGATGTTCGAGAGCATGACTATCATTGCTCGCCACCCCTTCTCCATGGCTTGGGAGGATGGTCGTCCCATTTGGTTCGGCCTTTTTAACATGTTCACGCAACAGAGCCTGAAGGAGCCTATGCAGCTGGTCTCCTGCTTCTACCTAGGTTATCTGAAGAACAAGGAGGAGAGTCCACAAGGAAACTCCTCATCCAAGCTGTATGAGAAAGTCATGGAGTATGAGTCTAGGAAACCAGGCACAAATCTCAACTTGGGCTGGGGAGATCCAGACTTGAGTGACATCAAGTTCCATGAGTTCTCTAGGAGCTTCTTGCTCTACTGCGCTGACTCTGCCATGAAGAAGTTGGAGACCATGTATGGACCCAAAGTGAAATCCCAGATGACTGATGACATTCTGTATGCCATTGGCAACTACGATCTCGAACAATTTGCTACACTGAAGGCATCAGCCACGTACGATCAGAGCATGTACGACTATGACCCAAAAAAGAAATATCACAGAGCTAAGGTTGTGGAGTTTGTGGTAAAGAACTCTCACAGAGCAACCCACATTCATGAGCTCTTGCAGGAGTGTTTGGAGGGGCTTGAGAAGAACACCTGCCTGCACATAGATCTGTTCAAGAAGGCTCAACATGGGGGAATCAGGGAGATCTATGTGCTTGGCCCAAGGGAGAGACTGGTTCAGCTCTGCCTAGAGCTAATAGCCAGGACAATCTGCAGGCGGTTCCCCTCAGAGACCATGATGAACCCTAAGAACAAGACAGACCTGCCACAGAGGCACAACAAGGATGCTAAGGGCAAATGTGGTCCTAAATTCATGACAACAGCCACCTCAGATGATGCTGCCAAATGGAATCAGGGCCATTATGTGAGCAAGTTTGCCATGCTACTCTGTAGATTCACTGATTCAGTGTTGCACCCTTTCATCATGAGGGCCTGTGCTCTGTTCACCCGCAAGATCATCAAGATCGATGACCAACTGCTGAAGATATTCGCAAAGTATGAGGAGAGGGTGTTCAGATCTGAACACATTGAGTTGATGCATGCAGCCTTCAGAGGAAGAGGGAATGAAAAGTATGGACATGTCGAACAGGGGAAGACCTTCCTGAAGACTGAGACAGGCATGCTGCAAGGGATCCTTCACTATGCCTCTAGCCTACTCCACACTGTGTACCAGGAGTTCATGCTGGACCTCATTGAAGCTAGGTTCAAACACAAGCATGCCATTCTGAGGAAGAAGAACACTAGCTTAAGGCCGCACGTGACTGTCATGCAGAGCTCTGACGACTCTTCTGTCATGATCTCCTTCCCAGTGTCGTCATCTATCCCGGAAGCCACTTCCCAGGGCATGGTTCTGGCCTGGATGTGCTTCCAGGTGAAGAAGGAGCTGGGGCTGCTGTTGGGTATCTACCCATCCGAAAAATGCACTTCCAACACCCCTTGGATTGTGGAGTTCAACTCAGAATTTTTCTTCATGAGTGACTTGATCAGGCCTCTTTTCCGTTGGGTGGCTGCAGCAAACGGTCTGAGTGAGCACGAGACCCTAGCAGGGAGACAGGAGGAGATGTCAAGCAACTTGACCAATGTTCTGGGTGGAGGGGGTACAACTAGTTTAACAGCAAATGTGCAGTTGGCTCAGATGATGCTCCATTACCAGATTCTTGGTGCATCCACATCTCTGGTGTTTGGACACTACTCGGTCATGCTGGAAGAGGTGCCAGATCCATCGTTGGGGTTCTTCCTTCTGGATCACCCATTTCTGGCTGGCCTCGGAGGATTCAAGTACAACCTGTACTTGGTAGTGAAGAAGACTAGGCTGGGCCTAAAGTACAAGAGGATCTTGAGAGGCCAAGATGATGCTGCCTCAGCTAGAGAAGAAAAGGGCCTTAGGGTTCGAACTCTGGAGACCACCAAGGCTGGATCCATTGTGGAATCCACCATCATCTCCATGTCAACCAGGAAGAAGTGGCTGGCTCTTATGGAGCGCATGGGTCTGCCAGAAACTTGGAAGGAGGACCTATTGGCTGACCAGAGGGTGCTGTATGAAAAGGCTCACACTCCGGAGCAGTTGAGGCTGAGACTGTCAGTGTTTGTCCACAGCCCTGGGGTGATCTCCTCCATAAGCTCCAGTGGAACAGTTGTGAGGCTGGTAGCGCTTGCGGCTTATGCTTTGAACAGGCCAGTGGTCCAGGACAGAACAGATTGGTACTGTGATGCAAACCTTCTGTTCAAGAAGCAATCGCTTCTTGTCACAACAGTTGAATCTCTGCGTGAGACCAAGGAGCTAGAAGAACCCATCACACTCAAGGATCTTCAGGCTCTGTTTCCTCAGAGAGAAGACTATGATGACCTCGAAAAGGTTGGTGAGAACTTCTCTGGAGTGACTGGCAGCTCAGTTCGACCTCACAGGCCACGGATCACCACCAGAGTGCAGGTGACAGGCTCAGCAGGGGGTGCTGCCCTGACTCTTCAAAACGTTGTCGAAGACAGATGGTATGGGCGCAAGAGGTACATGGTGGCTCCAAAGACCATGGAGCAATTGTGGGAAGCCGCAAAGCTAAGGATACCTTGGTTGGAGGACTCTGCTGAGCAGACCTTGTTGTCATCCCCCTTCACAGAGCCTGTGTCACTGAGAAACTTCATTGTTGGAGATCCCATCAAGAGCCGGAACGTTGCCATGTCTGGTGTGCCAGTAAAGAGGGGATCAGGCC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| 20,544
|
ON812251.1
|
Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-12-16
|
TIGMIC_2
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Sara tick phlebovirus
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Phlebovirus
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Phenuiviridae
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ssRNA(+/-)
| 6,707
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GenBank
| null |
China:Heilongjiang
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China
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Ixodes persulcatus
| null |
2019
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SAMN28704359
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PRJNA841744
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MAG: Sara tick phlebovirus isolate TIGMIC_2, complete genome
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| 20,615
|
ON812253.1
|
Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_3
|
Sara tick phlebovirus
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,716
|
GenBank
| null |
China:Heilongjiang
|
China
|
Ixodes persulcatus
| null |
2019
|
SAMN28704360
|
PRJNA841744
|
MAG: Sara tick phlebovirus isolate TIGMIC_3, complete genome
|
CGACCCCCTTATATCCGAAATCTGCAAGAATGTCCTTGAGTCGGCTAGACCAATTGTCTCAATACCTGGTGGAGCAGGTAAGGGACAGAGAGCCTGGCTTGATTGTCCCAGATCACGTCTTCACAGATCTGGGTACATGGCTGAAACCACCTAGTGTGCTAGTGGAACAGACTCAGAGTGGTGTCCTGAGTGTGAAGTTTCCAGGACTGGAGCAATGGAAAAGCGCATCTGAGGTCTCCATGTCCTCAATAATAGAGGAGACATGGCCACAGGAAAGGGCCTCACACCTGCGACATGATTACACTGCTGGTTTCTTTTGCAGATCTCTCGATACTCCATTGCGAAGTGTCTTCCAGATGTGCAGAGACGACAATGACAATCTGACTCCTGACAACATCATGACTGTTGGGAACGTCATCCTGGTGCATGAGTTTGCTACCACAAAAAGCACTCTCGAGACAAGCTCTCTAGATGCTTTCAAGTCCAAGATGCTCAGATATGCTCCGGCTTTGTCTTACAGAGCGCTGAAGGAAAACAAGGTGGTGGTGCTGACCATCACCGTGGTGTCACCAAAGACTGTACTGAGTAACCTTCCTCTGTCCACAGATGATGTCTATGAGCTTTGTGTCAGGTTCTTGGTGGCCCGGGACATGGTGTGGCAATTAGAACAGCAAGGTGTGATTGTTTCTGATGAGGAAAAGGAGGACAATGAGAAGGCTGAAAAGGCTAGGATGACGATGTCACAGATCAAGTTCAATTGGGAGTTTCAGAACAAGAACTTCCCAAATTGTAATGAGAGTGTCTATGAAGCCTCTAGATCGCAGCCTGACAAGAAGTATGTCATTGACCAGGTCCTTGCTGGGTTTCAGAACGCTGAAAAGAAGCTGAGAGAGGATCACTTTCTCAAGAAGGGCGAGAACCTAACCGAGGCTGACAGACTAGACTTGAACTTGGAGGAGTGTGCTAAAGCCATTAGCGACTACACAGAAAAGGTTGCCAAGGACAGAGAATTCAAGCCTGTTTGCACCATGAGCAGCATCATTCCCATCCCTTGGTGGGTTCCGAACCGAGGCACAGGTAGTAACAACATTTCCCAGTCACCAGCTACAGAGCCCAACTACATGCCCAGTCTAGGCACTTCTGATGAAACAACCTTCAGGCATTGGTCCAGTGCCTGGGAATTTGCCAAGCAGTTTCCAGAGAGGATGACTGAGGAGTCAGTGCAGGATGAGTTGTACGAGGCTATGAAAGCAGCCCCTGATGATCTTGACCTGACAGCTGAGCAGAAAGCAGAGATGGAGAGGCTGGAAAAGCTCATGGGGAACATCTCGAAGCCCTCTGAAGCCAAAGCCAGAAGTTGCTACAGAAGGGTGAACGTAAGGGTGTCTGCCAAAGATGAGAAGGAAGCAGCCAAGCGTGGTCTCAGAGGAAAGAAGTATGCTCAAGACAATGAAGTCCGAGCACACCATGAGCAGTCACAACTGCCTTTTAGTTTGGACAACTTTGTTGGAGACATTGAGGGCTTACTTGATAAGTCTCAAGAGATCTTCACAACTGTGTCTGGCACCAAGAACAGTTATGACAGAGACATGCTGCCTCACTTGGCTGAACAGGCTTATGCTCTACACAAGGACGGAGTTGGAGACCCGTGGATAAAGTTGCTATCATCTTGGCTGAGCACTGACCTAGGGAAATGGTGCAGCTTCGTCTCAGATCTGGGCACAGAACTGGCCATCAGTATGAAGCAACACTGCAAGGGCAGTCAGATGATCCTCAAGAAACTGAGGCACTTTGACATTTATGTGCTCATAAGACCCACTTCAACCAAGTCAAGTGTGTTCTACTCCCTGATGACATTCCAAGTGAATCTGACAAATGACCCAGACCTGGTGGGGCCTGTGTTCAAGCAAGCCTTTAACAACGGTCAGATCTACTGGACAGAGTTCAACTCTGTAGACTCCAGCAAACTTACTAACATGGTGAAGTGCAGGTCGATCATGTACACCATGCTATCGTACTGGCTGGAATTTTACGGCTTGAAGTTCTGGGAAGTGAAACTGGCAGCAAAGTCCAGGGAGATGAATGAGGTGTGGAGAATGGTGACCATCTGTCTCATGATAATCCTAGACGACAAGACCAAGACAGAAGAGATCATCACAACAAGCAGGTACGTGTTCATGGAGGGCTTTGTGGCCCAACCTGCTCTGCCTAAGCCGCACAAGATGCTTGGTAAGCTCCCAGATGTGCTGAGGTCTAGGCTGCAAGTTTGGCTCATGCACAAGATGTTCGAGAGCATGACTATCATTGCTCGCCACCCCTTCTCCATGGCTTGGGAGGATGGTCGTCCCATTTGGTTCGGCCTTTTTAACATGTTCACGCAACAGAGCCTGAAGGAGCCCATGCAGCTGGTCTCCTGCTTCTACCTAGGTTATCTGAAGAACAAGGAGGAGAGTCCACAGGGGAACTCCTCATCCAAACTGTATGAGAAAGTCATGGAGTATGAGTCTAGGAAACCAGGCACAAATCTCAACTTGGGCTGGGGAGATCCAGACTTGAGTGACATCAAGTTCCATGAGTTCTCTAGGAGCTTCTTGCTCTACTGTGCTGACTCTGCCATGAAGAAGCTGGAGACCATGTATGGACCCAAAGTGAAATCCCAGATGACTGATGACATCCTGTATGCCATTGGCAACTACGACCTCGAGCAATTTGCTACACTGAAAGCATCAGCCACATACGATCAGAGCATGTACGACTATGACCCAAAAAAGAAATATCACAGAGCTAAGGTTGTGGAGTTTGTGGTAAAGAACTCTCACAGAGCAACCCACATTCATGAGCTCTTGCAGGAGTGTTTGGAGGGGCTTGAGAAGAACACCTGCCTGCACATAGATCTGTTCAAGAAGGCACAACATGGGGGAATCAGGGAGATCTATGTACTTGGCCCAAGAGAGAGACTGGTTCAGCTCTGCCTAGAGCTAATAGCCAGGACTATCTGCAGGCGGTTCCCCTCAGAGACCATGATGAACCCTAAGAATAAGACAGACCTGCCACAGAGGCACAACAAGGATGCTAAGGGCAAATGTGGTCCTAAATTCATGACAACAGCCACCTCAGATGATGCTGCCAAATGGAACCAGGGCCATTATGTGAGCAAGTTTGCCATGCTACTCTGTAGATTCACTGATTCAGTGTTGCACCCTTTCATCATGAGGGCCTGTGCTCTGTTCACCCGCAAGATCATCAAGATCGATGACCAACTGCTGAAGATATTCGCAAAGTATGAGGAGAGGGTGTTCAGATCTGAACACATTGAGTTGATGCATGCAGCCTTCAGAGGAAGAGGGAATGAAAAATATGGGCATGTCGAACAGGGGAAGACCTTCCTGAAGACTGAGACAGGCATGTTGCAAGGGATCCTTCACTATGCCTCTAGCCTACTCCACACTGTGTATCAGGAGTTCATGCTGGACCTCATTGAAGCTAGGTTCAAACACAAACACGCCATTCTGAGGAAGAAGAACACTAGCTTAAAGCCGCACGTGACTGTCATGCAGAGCTCTGACGACTCTTCTGTCATGATCTCCTTCCCAGTGTCGTCATCCATCCCGGAAGCCACTTCCCAGGGTATGGTTCTGGCCTGGATGTGCTTCCAGGTGAAGAAGGAGCTGGGGCTGCTGTTGGGCATCTACCCATCCGAAAAATGCACTTCCAACACCCCTTGGATTGTGGAGTTCAACTCAGAATTTTTCTTCATGAGTGACTTGATCAGGCCTCTTTTCCGTTGGGTGGCTGCAGCAAACGGTCTGAGTGAGCACGAGACCCTAGCAGGGAGACAGGAGGAGATGTCAAGCAACTTGACCAATGTTCTGGGTGGAGGGGGCACTACTAGTTTAACAGCAAATGTGCAGTTGGCTCAGATGATGCTCCATTACCAGATTCTTGGTGCATCCACGTCTCTGGTGTTTGGACACTACTCGGTCATGCTGGAAGAGGTGCCAGATCCATCGTTGGGGTTCTTCCTTCTGGATCACCCATTTCTGGCTGGCCTCGGAGGATTCAAGTACAACCTGTACTTGGTAGTGAAGAAGACTAGGCTGGGCCTAAAGTACAAGAGGATCTTGAGAGGCCAAGATGATGCTGCCACAGCTAGAGAAGAAAAGGGCCTTAGGGTTCGAACTCTGGAAACTACCAAGGCTGGATCCATTGTGGAATCCACCATCATCTCCATGTCAACCAGGAAGAAGTGGCTGGCTCTTATGGAGCGCATGGGTCTGCCAGAAACTTGGAAGGAGGACCTATTGGCTGACCAGAGGGTGCTGTATGAAAAGGCTCACACTCCAGAGCAGTTGAGGCTGCGACTGTCAGTGTTTGTCCACAGCCCTGGGGTGATCTCCTCCATAAGCTCCAGTGGAACAGTTGTGAGGCTGGTAGCGCTTGCGGCTTATGCCTTGAACAGGCCAGTGGTTCAGGACAGAACAGATTGGTACTGTGATGCAAACCTTCTGTTCAAGAAGCAATCGCTTCTTGTCACAACAGTTGAATCTCTGCGTGAGACTAAGGAGCTAGAAGAACCCATCACTCTCAAGGATCTTCAGGCTCTGTTTCCTCAGAGAGAAGACTATGATGACCTCGAAAAGGTTGGTGAGAACTTCTCTGGAGTGACTGGCAGCTCAGTTCGACCTCACAGGCCACGGATCACCACCAGAGTGCAGGTGACAGGCTCAGCAGGGGGTGCTGCCCTGACTCTTCAAAACGTTGTCGAAGACAGATGGTATGGGCGCAAGAGGTACATGGTGGCTCCAAAGACCATGGAGCAATTGTGGGAAGCCGCAAAGCTAAGGATACCTTGGTTGGAGGACTCTGCTGAACAGACCTTGTTGTCATCCCCCTTCACAGAGCCTGTGTCACTGAGAAACTTCATTGTTGGAGACCCCATCAAGAGCCGGAACGTCGCCATGTCTGGTGTGCCAGTAAAGAGAGGATCAGGCCTGTCCAAC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| 20,617
|
ON812254.1
|
Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_4
|
Sara tick phlebovirus
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,712
|
GenBank
| null |
China:Heilongjiang
|
China
|
Ixodes persulcatus
| null |
2019
|
SAMN28669421
|
PRJNA841744
|
MAG: Sara tick phlebovirus isolate TIGMIC_4, complete genome
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ON812305.1
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Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_5
|
Sara tick phlebovirus
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
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|
GenBank
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China:Jilin
|
China
|
Ixodes persulcatus
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2019
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|
ON812307.1
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Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_7
|
Sara tick phlebovirus
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
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|
GenBank
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China:Jilin
|
China
|
Ixodes persulcatus
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2019
|
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|
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2022-12-16
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|
ON812310.1
|
Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_10
|
Sara tick phlebovirus
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
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|
GenBank
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China:Jilin
|
China
|
Ixodes persulcatus
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2019
|
SAMN28669476
|
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|
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|
ON812313.1
|
Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_12
|
Sara tick phlebovirus
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
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|
GenBank
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China:Jilin
|
China
|
Ixodes persulcatus
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2019
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|
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|
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
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China
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2022-12-16
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Phlebovirus
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2019
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|
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| 20,676
|
ON812316.1
|
Sara tick phlebovirus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_14
|
Sara tick phlebovirus
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,714
|
GenBank
| null |
China:Jilin
|
China
|
Ixodes persulcatus
| null |
2019
|
SAMN28704362
|
PRJNA841744
|
MAG: Sara tick phlebovirus isolate TIGMIC_14, complete genome
|
CAGAGGCGACCCCCTTATATCCGAAATCTGCAAGAATGTCCTTGAGTCGGCTAGACCAATTGTCTCAATACCTGGTGGAGCAGGTAAGGGACAGAGAGCCTGGCCTGATTGTCCCAGATCACGTCTTCACAGATCTGGGTACATGGCTGAAACCACCTAGTGTGCTAGTGGAACAGACTCAGAGTGGTGTCCTGAGTGTGAAGTTTCCAGGACTGGAGCAATGGAAAAGCGCATCTGAGGTCTCCATGTCCTCAATAATAGAGGAGACATGGCCACAGGAAAGGGCCTCACACCTGCGACATGATTACACTGCTGGTTTCTTTTGCAGATCTCTCGATACTCCATTGCGAAGTGTCTTCCAGATGTGCAGAGACGACAATGACAATCTGACTCCTGACAACATCATGACCGTTGGGAATGTCATCCTGGTGCATGAGTTTGCTACCACAAAAAGCACTCTCGAGACTAGCTCTCTAGATGCTTTCAAGTCCAAGATGCTCAGATATGCTCCGGCTTTGTCTTACAGAGCGCTGAAGGAAAACAAGGTGGTGGTGCTGACCATCACCGTGGTGTCACCAAAGACTGTACTGAGTAATCTTCCTCTGTCCACAGATGATGTCTATGAACTTTGTGTCAGATTCTTGGTGGCCCGGGACATGGTGTGGCAATTAGAACAGCAAGGTGTGATTGTTTCTGATGAGGAAAAGGAGGACAATGAGAAGGCTGAAAAGGCTAGGATGACGATGTCACAGATCAAGTTCAATTGGGAGTTTCAGAACAAGAACTTCCCAAATTGTAATGAGAGTGTCTATGAAGCCTCTAGATCGCAGCCTGACAAAAAGTATGTCATTGACCAGGTCCTAGCTGGGTTTCAGAACGCTGAAAAGAAGCTGAGAGAGGATCACTTTCTCAAGAAGGGCGAAAACCTAACCGAGGCTGACAGACTAGACTTGAACTTGGAGGAGTGTGCTAAAGCCATTAGCGACTACACAGAAAAGGCTGCCAAGGACAGAGAATTCAAGCCTGTTTGCACCATGAGCAGCATCATTCCCATCCCTTGGTGGGTTCCGAACCGAGGCACAGGTAGTAACAACATTTCCCAGTCTCCAGCTACAGAGCCCAACTACATGCCCAGTCTAGGCACTTCTGATGAAACAACCTTCAGGCATTGGTCCAGTGCCTGGGAATTTGCCAAGCAGTTTCCAGAGAGGATGACTGAGGAGTCAGTGCAGGATGAGTTGTACGAGGCTATGAAAGCAGCCCCTGATGATCTTGACCTGACAGCTGAGCAGAAAGCAGAGATGGAGAGGCTGGAAAAGCTCATGGGGAACATCTCGAAGCCCTCTGAAGCCAAAGCCAGAAGTTGCTACAGGAGGGTGAACGTAAGAGTGTCAGCCAAAGATGAGAAGGAAGCAGCTAAGCGTGGTCTCAGAGGAAAGAAGTATGCTCAAGACAATGAAGTCCGAGCACACCATGAGCAGTCACAACTGCCTTTTAGTTTGGACAACTTTGTTGGAGACATTGAGGGCTTACTTGATAAGTCTCAAGAGATCTTCACAACTGTGTCAGGCACCAAGAACAGTTATGACAGAGACATGCTGCCTCACTTGGCTGAACAGGCTTATGCTCTACACAAGGACGGAGTTGGAGACCCGTGGATAAAGTTGCTATCATCTTGGCTGAGCACTGACCTAGGGAAGTGGTGCAGCTTTGTCTCAGATCTGGGCACAGAACTGGCCATCAGTATGAAGCAACACTGCAAGGGCAGTCAGATGATCCTCAAGAAACTGAGGCACTTTGACATTTATGTGCTCATAAGACCCACTTCAACCAAGTCAAGTGTGTTCTACTCCCTGATGACATTCCAGGTGAATCTGACAAATGACCCAGACCTGGTGGGGCCTGTGTTCAAGCAAGCCTTCAACAACGGCCAGATCTACTGGACAGAGTTCAACTCTGTAGACTCCAGCAAACTCACTAACATGGTGAAGTGCAGGTCGATCATGTACACCATGCTATCGTACTGGCTGGAATTTTACGGCTTGAAGTTCTGGGAAGTGAAACTGGCAGCAAAGTCCAGGGAGATGAATGAGGTGTGGAGAATGGTGACCATCTGTCTCATGATAATTCTAGACGACAAGACCAAGACAGAAGAGATCATCACAACAAGCAGGTACGTGTTCATGGAGGGCTTTGTGGCCCAACCTGCTCTGCCTAAGCCGCACAAGATGCTTGGTAAGCTCCCAGATGTGCTGAGGTCTAGGCTGCAAGTTTGGCTCATGCACAAGATGTTCGAGAGCATGACTATCATTGCTCGCCACCCCTTCTCCATGGCTTGGGAGGATGGTCGTCCCATTTGGTTCGGCCTCTTTAACATGTTCACGCAACAGAGCCTGAAGGAGCCTATGCAGCTGGTCTCCTGCTTCTACCTAGGTTATCTGAAGAACAAGGAGGAGAGTCCACAGGGAAACTCCTCATCCAAACTGTATGAGAAAGTCATGGAGTATGAGTCTAGGAAACCAGGCACAAATCTCAACTTGGGCTGGGGAGATCCAGACTTGAGTGACATCAAGTTCCATGAGTTCTCTAGGAGCTTCTTACTCTACTGTGCTGACTCTGCCATGAAGAAGCTGGAGACCATGTATGGACCCAAAGTGAAATCCCAGATGACTGATGACATCCTGTATGCCATTGGCAACTACGACCTCGAGCAATTTGCTACACTGAAAGCATCAGCCACGTACGATCAGAGCATGTACGACTATGACCCAAAAAAGAAATATCACAGAGCTAAGGTTGTGGAGTTTGTGGTAAAGAACTCTCACAGAGCAACCCACATTCATGAGCTCTTGCAGGAGTGTTTGGAGGGGCTTGAGAAGAACACCTGCCTGCACATAGATCTGTTCAAGAAGGCACAACATGGGGGAATCAGGGAGATCTATGTGCTTGGCCCAAGGGAGAGACTGGTTCAGCTCTGCCTAGAGCTAATAGCCAGGACTATCTGCAGGCGGTTCCCCTCAGAGACCATGATGAACCCTAAGAACAAGACAGACCTGCCACAGAGGCACAACAAGGATGCTAAGGGCAAATGTGGTCCTAAATTCATGACAACAGCCACCTCAGATGATGCTGCCAAATGGAATCAGGGCCATTATGTGAGCAAGTTTGCCATGCTACTCTGTAGATTCACTGATTCAGTGTTGCACCCTTTCATCATGAGGGCCTGTGCTCTGTTCACCCGCAAGATCATCAAGATCGATGACCAACTGCTGAAGATATTCGCAAAGTATGAGGAGAGGGTGTTCAGATCTGAACACATTGAGTTGATGCATGCAGCCTTCAGAGGAAGAGGGAATGAAAAGTATGGACATGTCGAACAGGGGAAGACCTTCCTGAAGACTGAGACAGGCATGTTGCAAGGGATCCTTCACTATGCCTCTAGCCTACTCCACACTGTGTATCAGGAGTTCATGCTGGACCTCATTGAAGCTAGGTTCAAACACAAGCACGCCATTCTGAGGAAGAAGAACACTAGCTTAAAGCCGCACGTGACTGTCATGCAGAGCTCTGACGACTCTTCTGTCATGATCTCCTTCCCAGTGTCGTCATCTATCCCGGAAGCCACTTCCCAGGGCATGGTTCTGGCCTGGATGTGCTTCCAGGTAAAGAAGGAGCTGGGGCTGCTGTTGGGCATTTACCCATCCGAAAAATGCACTTCCAACACCCCTTGGATTGTGGAGTTCAACTCAGAATTTTTCTTCATGAGTGACTTGATCAGGCCTCTTTTCCGTTGGGTGGCTGCAGCAAACGGTCTGAGTGAGCACGAGACCCTAGCAGGGAGACAGGAGGAGATGTCAAGCAACTTGACCAATGTTCTGGGTGGAGGGGGCACAACTAGTTTAACAGCAAATGTGCAGTTGGCTCAGATGATGCTCCATTACCAGATTCTTGGTGCATCCACATCTCTGGTGTTTGGACACTACTCGGTCATGCTGGAAGAGGTGCCAGATCCATCGTTGGGGTTCTTCCTTCTGGATCACCCATTTCTGGCTGGACTCGGAGGATTCAAGTACAACCTGTACTTGGTAGTGAAGAAGACTAGGCTGGGCCTGAAGTACAAGAGGATCTTGAGAGGCCAAGATGATGCTGCCACAGCTAGAGAAGAAAAGGGCCTTAGGGTTCGAACTCTGGAGACTACCAAGGCTGGATCCATTGTGGAGTCCACCATCATCTCCATGTCAACCAGGAAGAAGTGGCTGGCTCTTATGGAGCGCATGGGTCTGCCAGAAACTTGGAAGGAGGACCTATTGGCTGACCAGAGGGTGCTGTATGAAAAGGCTCACACTCCGGAGCAGTTGAGGCTGAGACTGTCAGTGTTTGTCCACAGCCCTGGGGTGATCTCCTCCATAAGCTCCAGTGGAACAGTTGTGAGGCTGGTGGCGCTTGCGGCTTATGCCTTGAACAGGCCAGTGGTTCAGGACAGAACAGATTGGTACTGTGATGCAAACCTTCTGTTCAAGAAGCAATCGCTTCTTGTCACAACAGTTGAATCTCTGCGTGAGACTAAGGAGCTAGAAGAACCCATCACTCTCAAGGATCTTCAGGCTCTGTTTCCTCAGAGAGAAGACTATGATGACCTCGAAAAGGTTGGTGAGAACTTCTCTGGAGTGACTGGCAGCTCAGTTCGACCTCACAGGCCACGGATCACCACCAGAGTGCAGGTGACAGGCTCAGCAGGGGGTGCTGCCCTGACTCTTCAAAATGTTGTTGAAGACAGATGGTATGGGCGCAAGAGGTACATGGTGGCTCCAAAGACCATGGAGCAATTGTGGGAAGCCGCAAAGCTAAGGATACCTTGGTTGGAGGACTCTGCTGAGCAGACCTTGTTGTCATCCCCCTTCACAGAGCCTGTGTCTCTGAGAAACTTCATTGTTGGTGATCCCATCAAGAGCCGGAACGTTGCCATGTCTGGTGTGCCAGTAAAGAGAGGATCAGGCCTGTCCAACCTCTTCACCATGGTGGCCGAGAACTTTGCTCCTAATTTCAAACTAGGAGGCTCAACCGACACGGTTGCCAGATCTCGATCTGAGAAATTCCTCTGGATAAGGCATGCATTGGCCCTTGTGGCACATGGTCCCTTCAACCCTGGGGAGAAGATCAACATGGCAAAGGAGATTCTCCGGGAGAATCGAGACCTGAGTGTAGACCCAACCGCAGCAAGATCGCGAAGAAACTGTCTTGCAATCATGCAACACTTTGCGATCAACCAAGACAAAGGGAAGACGATCCAAATGATCACCGACCACAGGCTGGGAGCTCTGGGAAGTTATGTGCTCCGTCAAAAGTATGCTCGACCTGAGGATGTGTGCCCAGCTCTGGGACAGAAGCCTGGCTACTTTGACAGAGGAATATGGAGGGGAGTCTATGACAGAACCTTCATAGAAGTGCATCTCTACAGAGCCCTGCGAGACTCTACAGTCTCCATCACAGGGGTGATGGTGTCGTCTACAGATGACTTGAACAATGTCTTCAGGTTTCTCAAGGAGTGGGCGGCGGAGAACAACTGTGACAACGACCGGCACTACTGGATGGCCCCATCTGGTATGTGTGGTGAGCGGGTGACCCGCATGTTCAGGTTTTCCACATGTCCCATGGATAGCGGAGTTCCTGTCCACCTGGAGCCTCGACTGAAGATTGGTGTCAGCGCAGACGCTTATGATGAGATGATCCTCAGCCTCCGAAATGGCGTACTTCGGATAGAGGCACGAGATGCCAATGTTGCTGTGCCAGAGATTTGGACCACCCTGCTCAGTTACACGTGCAGAGAGAATGACATTGATGTGACTAGACAAGACATTCAAAGTCATTTGGTCTTGATTGGTCAGGTGGCGAACCCATTTGTCCTACCATGGTTGAATTGCAAGCCAGCAGACGACTACCTCTTTGATGACCTGGAGAAGGTCATATGTGAGAAGAGGGGCACTGCTCCTAACCCAAAGTGGTCCTGGGGAGCTAGGCCTGAAAAGATCCTAGACTGGAAGGTCTTTGCTGACAAAATCAGAGAGCTTTCTGAGCTGGAACTAAGAAGGAGAGGCATACTGACAATGGCCTCCATCTCTGGCACAGACATAGCTGTGGACCATGACGAACAACAATCTCCAGCTCAGCCTGCTGCACAGAGAGCCCGCCGGACCAGCCGGGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGGAGATGAGTTCATGACAATGGGCAATGAGGAGCTGCTCATGAAGGTGTTCAACACATTTGACGAAGAGATGCAAGAACCTGAGGCCAATGATCTCGATGATGATGACTTCAGACTGATTGTGGAAGAGATGGATTTCGACTTGGCTGCTCATCTTGAAGACATGGTGAAGAACTACTCAATGGTTGAGGCAGAGTCCGAGATCCGGTTTAGCCACCCTTTCATGTCTGGTGTCATTGACGAGTTTGTCAAGAACATGGGCGGGCCTAATGCTCTGAGCAAGATCCTGGTGACCAAGGAGTATCCGCCCAACATCTCTGAGCACCTCATAATACGCCTCAGGCTTCTTCTGAACTGGTGGGACAAGAGGCTTGTGAGGAGAACTCAAATGAGGTTGAGGAGTAGACCCTCTAGACCTGAACTGGATGCAGCTCTTGCAGCACTTTAAGTTTTGTCCCACTTGCTTGTAAACTAACTATTTTGGAGATTTGGGG
| 20,677
|
OP776338.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Apaa,T., Tarlinton,R., Staley,C., Withers,A., Chadwick,E., Hailer,F., Mckenzie,L., Lambin,X., Mathews,F., Harrison,S., Bremner-Harrision,S., Loose,M., Blanchard,A., Bennett,M.
|
University of Nottingham, School of Veterinary Medicine and Science
|
United Kingdom
|
2023-02-06
|
RhGB02
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,566
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Rhinolophus hipposideros
| null |
2021-06-24
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate RhGB02, complete genome
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| 18,721
|
OP776339.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Apaa,T., Tarlinton,R., Staley,C., Withers,A., Chadwick,E., Hailer,F., Mckenzie,L., Lambin,X., Mathews,F., Harrison,S., Bremner-Harrision,S., Loose,M., Blanchard,A., Bennett,M.
|
University of Nottingham, School of Veterinary Medicine and Science
|
United Kingdom
|
2023-02-06
|
RhGB05
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,600
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Rhinolophus hipposideros
| null |
2021-09-10
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate RhGB05, complete genome
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GCAAAGAGCTGAACATGATCATCATGCTTCCAGATGAAGACGTCGGTTTGGAAAAGGTGGAAAAAGCACTTACTTATGAGAAATTCATAGAATGGACAAAGCCAGACATGCTGGATGAAGAAGAGGTGGAAGTGTTCCTCCCTAGATTTAAGCTGGAGGAGAATTATGACATGAAGGATGTCCTTTGCTCTCTGGGCATGACCGATGCCTTTGAGGCGGGCAAGGCAGACTTTTCTGGGATGTCGTCGCGGAGAGACCTGTATCTGTCCAAGGCTGTGCACAAGTCCTTTGTGGAGATCAACGAGGAGGGCACGGAGGCCGCAGCCGCCACTGCCGCCGTCATGATGCTTCGATGTGCAAGGATCACGCCCAGGTTCTGTGCTGACCACCCCTTCCTTTTCTTTATCCAGCACAGCAAAACTAACAGTGTTCTGTTCTGTGGCCGATTCTCCTCACCGTAAAGAGATGGTCAGCACTGCACAGAGCTCTTCTCCTGTCCCCATCTGCCCCACTTTTCCTCTGACACTTCACAATGTGCCTACAAACCAAAGTGACCTTTGATAGCAATCCAAAAATAAAGGGGCTAATTTTGAAATCCCC
| 18,722
|
OP776340.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Apaa,T., Tarlinton,R., Staley,C., Withers,A., Chadwick,E., Hailer,F., Mckenzie,L., Lambin,X., Mathews,F., Harrison,S., Bremner-Harrision,S., Loose,M., Blanchard,A., Bennett,M.
|
University of Nottingham, School of Veterinary Medicine and Science
|
United Kingdom
|
2023-02-06
|
RhGB06
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,463
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Rhinolophus hipposideros
| null |
2021-08-30
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate RhGB06, complete genome
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| 18,723
|
LC663793.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Murakami,S., Horimoto,T.
|
Laboratory of Veterinary Microbiology; 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8657
|
Japan
|
2022-09-03
| null |
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,718
|
GenBank
| null |
Japan: Shizuoka
|
Japan
|
Rhinolophus cornutus
|
feces
|
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. Rc-kw8 RNA, complete genome
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| 25,846
|
OK287354.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Xia,X., Wang,B., Huang,B., Fan,Y., Huang,X., Qu,L., Hou,Y., Wang,R.
|
Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology
|
China
|
2022-08-20
|
BetaCoV_Yunnan_Rs_KMC6_2020
|
Sarbecovirus sp.
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,528
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
|
feces, abdominal cavity
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2020-10
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate BetaCoV_Yunnan_Rs_KMC6_2020, complete genome
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| 26,708
|
OK287355.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Xia,X., Wang,B., Huang,B., Fan,Y., Huang,X., Qu,L., Hou,Y., Wang,R.
|
Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology
|
China
|
2022-08-20
|
BetaCoV_Yunnan_Rp_JCC9_2020
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,694
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus blythi
|
feces, abdominal cavity
|
2020-03
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate BetaCoV_Yunnan_Rp_JCC9_2020, complete genome
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TTACCTACCCAAGAAAAGCCAACCACTCTCGATCTCTTGTAGATCTGTTCTCTAAACGAACTTTAAAATCTGTGTGGCTGTCACTCGGCTGCATGCTTAGTGCACTCACGCAGTATAATTAATAACTAATTACTGTCGTTGACAGGACACGAGTAACTCGTCTATCTTCTGCAGGTTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTTGCAGCCGATCATCAGCACATCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTCCCTGGTTTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTGCCTGTTTTACAGGTTCGCGACGTGCTTGTACGTGGCTTTGGAGACTCCGTGGAGGAGGCTTTATCAGAGGCACGTCAACATCTTAAAGATGGCACTTGTGGCTTAGTAGAAGTTGAAAAAGGCGTTTTGCCTCAACTTGAACAGCCCTATGTGTTCATCAAACGTTCTGATGCTCGAACTGCACCTCATGGCCATGTTATGGTAGAGCTGGTGGCAGAACTCGAAGGCATTCAGTACGGTCGTAGTGGTGAGACACTTGGTGTCCTTGTCCCTCATGTGGGCGAAACACCAGTGGCTTACCGCAAAGTTCTTCTTCGTAAGAACGGTAATAAAGGAGCTGGTGGCCATAGTTACGGCGCCGATCTAAAGTCATTTGACTTAGGTGACGAGCTTTCCACTGATCCTTATGAAGATTTTCAAGAAAATTGGAACACTAAACATGGCAGTGGTGTTACCCGTGAACTCATCCGTGAGCTCAATGGAGGAGCACACACTCGCTATGTCGATAACAACTTTTGTGGCCCTGATGGCTACCCTCTTGAGTGCATTAAAGATCTTCTAGCTCGTGCTGGTAAAGCTTCATGCACTTTGTCCGAACAACTGGACTTTATTGACACTAAGAGAGGTGTGTACTGCTGCCGTGAACACGAGCATGAAATTGCTTGGTACACGGAACGTTCTGAAAAGAGCTACGAATTGCAGACACCTTTTGAAATTAAACTGGCAAAGAAATTTGACACTTTTAATGGGGAATGTCCAAATTTTGTATTTCCTCTGAACTCCACAATCAAGACTATTCAACCAAGGGTTGAAAAGAAAAGGCTTGATGGTTTTATGGGTAGAATTCGATCTGTCTATCCAGTTGCTTCACCAAATGAATGCAACCAAATGTGCCTTTCAACTCTCATGAAGTGTGATCATTGTGGTGAAACTTCATGGCAGACAGGCGACTTTGTTAAAGCCACTTGTGAATTTTGTGGCACTGAAAATTTGACTAAAGAAGGTGCCACTACTTGTGGTTACCTACCCCAAAATGCTGTGGTCAAAATTTATTGTCCAGCATGTCACAATCCAGAAGTAGGACCTGAGCATAGTCTTGCTGAATACCATAATGAATCTGGCTTAAAAACCATTCTTCGTAAGGGTGGTCGCACTATTGCTTTTGGAGGCTGTGTGTTCTCTTATGTTGGTTGCCATAACAAGTGTGCTTACTGGGTTCCGCGTGCTAGTGCTAACATAGGTTGTAATCATACAGGTGTTGTAGGAGAAGGTTCCGAAGGTCTTAATGACAACCTTCTTGAGATACTTCAAAAAGACAAAGTCAACATCAACATTGTTGGTGACTTTAAACTCAATGAAGAGATTGCCATTATTTTGGCATCTTTTTCTGCTTCCACAAGTGCCTTTGTGGAAACTGTGAAAGGTTTGGATTATAAAGTATTCAAACAAATTGTTGAATCCTGTGGTAATTTTAAAGTTACAAAAGGAAAATTTAAGAAAGGTGCCTGGAATATTGGTGAACAGAAATCAATACTGAGTCCTCTTCATGCATTTGCATCAGAGGCTGCTCGTGTTGTGCGCTCCATTTTTTCTCGTACTCTTGAAACTGCTCAACACTCTGTGCATGTCCTACAACAGGCCGCTATAATAATCTTAGATGGGATTTCACAGTACTCACTGAGACTCATTGATGCTATGATGTTCACATCTGATTTGGTTACCAACAATCTAGTTGTGATGGCTTACATTACAGGTGGTGTTGTACAAATGACTTCACAGTGGCTAACAAACATCTTTGGCACTGTTTATGAAAAACTTAAACCGGTTCTTGACTGGCTTGAAGAGAAGTTCAAGGACGGTGTGGAGTTCCTTAAGGATGGTTGGGAAATTGTTAAATTTATCTCAACTTGTGCTTGTGAAATTGTCGGTGGACAAATTGTCACCTGTGTAAAGGAAATTAAGGAGAGTGTCCAAACATTCTTTAAGCTTGTAAACAAATTTTTGGCTTTATGTGCTGACTCCATTATTATTGGTGGAGCTAGACTTAAAGCCTTGAATTTAGGTGAAACATTTGTCACACACTCAAAAGGATTGTATAGAAAGTGTGTTAAATCCAGAGAAGCAACTGGCTTACTCATGCCTCTGAGAGCTCCAAAAGAAATTATTTTCTTAGAGGGAGAAACACTTCCTACAGAAGTGTTAACAGATGAAGTTGTTTTGAAAACTGGTGATTTACAACCATTAGAACAACCTACCAGTGAAGCTATTGAAGCTCCATTGATTGGTACACCAGTCTGTATTAACGGGCTCATGTTGCTCGAAATTAAAGACACAGAAAAGTACTGTGCCCTCTCACCTAATATGATGGTAACAAACAATACCTTCACACTTAAAGGTGGTGCACCAACAAAAGTCACTTTTGGTGATGATACTGTGATTGAAGTGCAAGGTTACAAGAGTGTGAATATCACTTTTGAACTTGATGAAAGGATTGATAAAGTACTTAATGAGAAGTGCTCTACCTATACAGTTGAACTTGGTACAGAAGTAAATGAGTTCGCTTGTGTTGTGGCAGATGCGGTCATAAAAACTTTGCAACCAGTATCTGAACTACTTACACCACTAGGCATTGACTTGGATGAGTGGAGTATGGCTACATACTACTTATTTGATGAGTCTGGTGAATTTAAATTGGCTTCACATATGTACTGTTCTTTCTACCCTCCAGATGAAGATGAGGAAGAAGGTGATTGTGAAGAAGAAGAGTTTGAACCACCAACTCAATATGAGTATGGTAATGAGAATGATTACCAAGGTAAATCTTTGGAATTTGGTGCCTCTTCTTCTTCTCTTCTACAACAAAAAGAACAAGAAGAAGATTGGTTAGAAGCTGATACTCAGGAAGAAATTGAGATTGCAGTTCAAGAAAATCAAACATCAAGTGTTGAAGTTCTATCTGTGTTACAGGTAGAATCAACACCGGTTGTTACTGAAACTAGTGAATTAAATAACTTCACAGGTTATCTAAAACTGACTGACAATGTCTTTATTAAAAATGCTGACATTGTAGAAGAAGCTAAAAAGGTAAAACCAACAATAGTTGTCAACGCAGCCAATGTTTACCTTAAACATGGAGGAGGTGTTGCGGGAGCTTTAAATAAGGCTACTAACAATGCCATGCAGGTTGAATCTGACGATTACATAGCCACTAATGGACCACTAAATGTGGGTGGTGGTTGTGTTTTGAGTGGACACAATCTTGCTAAAAACTGTCTTCATGTTGTTGGCCCAAATGTTAACAAAGGTGAAGATATTCAACTTCTTAAGAGTGCTTATGAAAATTTTAATCGGCATGATGCCTTACTTGCACCATTGTTATCAGCTGGTATTTTTGGTGCTGACCCTGTATATTCCTTAAAAGTTTGTGTAGATACTGTTCGCACAAATGTTTATCTAGCTGTCTTTGATAAAAATCTCTATGATAAACTTGTTTCAAGCTTTTTGGAAATGAAGAGTGAAAAGCAAGTTGAACAAAAGCTTGCTGAGATTTCTAAAGAGGAAATTAAGTCATTTATAACTGAAAGTAAACCTTCAGTTGAACAGAGACAACAAGATGATAAGAAAATCAAAGCTTGTGTTGAAGAAGTTACAACAACCTTGGAAGAAACTAAGTTTCTTACAGAAAACTTATTACTCTATATTGACATTAATGGCAATCTTCATCCAGATTCAGCTACTCTTGTTAAAGATATTGATGTCACTTTCCTAAAGAAGGATGCTCCTTATATGGTGGGTGATGTTATCCAAGAGGGTGTTTTAACTGCTGTGGTTATACCTACTAAAAAGGCTGGTGGCACAACTGAAATGTTAGCGAAAGCTTTGAAAAAAGTGCCAACAGGTAATTATATAACCACTTACCCAGGTCAGGGTTTAAATGGTTATACTGTGGAAGAGGCAAAGACAGTGCTTAAAAAGTGTAAAAGTGCCTTTTACATTCTACCATCTATTATCTCTAATGAGAAGCAAGAAATTCTTGGGACCGTTTCTTGGAATTTGCGAGAAATGCTTGCACATGCAGAAGAAACACGTAAATTAATGCCTGTTTGTATTGAAACTAAAGCTATAGTTTCAACTATACAGCGTAAATACAAGGGTATTAAAATACAAGAGGGTGTGGTTGATTATGGTGCTAGATTTTACTTTTACACCAGTAAAACAACTGTAGCATCACTTATCAACACACTTAATGATTTAAATGAGACTCTTGTTACAATGCCACTTGGCTATGTAACACATGGCTTAAATTTGGAAGAAGCTGCTCGGTATATGAGATCTCTCAAAGTGCCAGCTACAGTTTCTGTTTCTTCACCTGATGCTGTTACAGCGTATAATGGTTACCTTACTTCTTCTTCTAAAACACCTGAAGAACATTTTATTGAAACCATCTCACTTGCTGGTTCCTACAAGGATTGGTCTTATTCTGGACAATCTACACAATTAGGTATAGAATTTCTTAAGAGAGGTGATAAAAGTGTATATTACACTAGTAATCCTACCACATTCCACCTAGATGGTGAAGTTATCACCTTTGACAATCTTAAAACACTTCTCTCCCTGAGAGAAGTTAAGACTATTAAGGTGTTTACAACAGTAGACAACATTAACCTCCACACGCAAGTTGTGGACATGTCAATG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| 26,709
|
OK017792.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
GD2017F
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,537
|
GenBank
| 1
|
China: Guangdong
|
China
|
Rhinolophus affinis
| null |
2017-08
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate GD2017F, complete genome
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| 37,902
|
OK017793.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
YN2020A
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,310
|
GenBank
| 1
|
China: Yunnan
|
China
|
Rhinolophus affinis
| null |
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate YN2020A, complete genome
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Sarbecovirus sp.
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Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
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Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
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LN2020A
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Sarbecovirus sp.
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,167
|
GenBank
| 1
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China: Liaoning
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China
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Rhinolophus ferrumequinum
| null |
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate LN2020A, complete genome
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AACTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACTCGTCCTTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTCGCAGTCGATCATCAGCATACCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGTGTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTCTTCAGGTTAGTGACGTGTTAGTGCGTGGTTTCGGGGATACTGTGGAAGAAGCCCTAGCGGAAGCACGTGAACATCTTAAAAATGGCACTTGTGGCCTAGTAGAGCTGGAAAAAGGTGTCTTACGCCAGCTTGAAGAGCCCTATGTGTTCATTAAACGCTCTGAAGCCTTAAGCACCACTCATGGCCACAAGGTTATTGAATTGGTGGCTGAAATGAATGGCATTCAGTTCGGTCGTAGCGGTACAACACTGGGAGTTCTCGTGCCACATGTGGGCGAAACCCCAATCGCGTACCGCAATGTTCTTCTTCGTAAGAATGGTAATAAGGGAGCTGGTGGCCATAGCTACGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACGAGCTTAACACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAAAAATGGAACACTAAGCATGGCAGGGGTGCTCTCCGTGAACTCATTCGTGAGCTTAATGGAGGTGCAGTCACTCGCTATGTTGATAACAACTTCTGTGGCCCTGATGGGTATCCTCTTGACTGCATTAAAGATCTTCTCGCTCGTGCGGGTAAGTCGATGTGCACTCTTTCCGAACAACTCGATTTCATTGAATCGAAGCGTGGTGTCTATTGCTGCCGTGAACATGAGCATGAAATTGCTTGGTACACGGAGCGCTCAGACAAGAGTTATGAGCATCAGACACCATTCGAGGTTAAGAGTGCCAAAAAATTTGACACTTTTAAAGGGGAATGCCCGAAGTTCGTATTTCCTCTCAACTCCAAAGTCAAAGTCATTCAACCACGTGTTGAAAAGAAAAATACTGAAGGTTTCATGGGGCGTATACGCTCTGTGTACCAAGTTGCCACTCCAAATGAATGCAACGACATGCACTTGTCTGTCTTTATGAAGTGTAATCATTGTGATGAAGCCTCTTGGCAGACGTGTGACTTTCTCAAAGCCACTTGTGAATATTGTGGCACTGAAAATCCAGTTAGTGAAGGACCTACTACATGTGGGTATCTACCTACTAATGCTGTAGTAAAGATGCCCTGTCCTGCTTGTCAGAATAAAGAAGTGGGACCTGAGCATAGTGTTGCAGACTACCACAACCACTCAAATATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGACTAAATGTTTTGGAGGCTGTGTGTTTTCCTATGTTGGCTGCTATAACAAGCGTGCTTACTGGGTTCCTCGTGCTAGTGCCAATATAGGTTCAAACCATACTGGCATTACTGGTGACAATGTAGAAGTTCTTAATGAAGACCTCCTTGAGATACTGAATCGTGAACGTGTTAATATTAACATTGTTGGCGATTTTCAGTTGAATGAAGAGATTGCCATCATTTTAGCGTCTCTTTCTGCTTCTACGAGTGCTTTTGTTGACACTGTAAAGAGTCTTGATTATAAGTCTTTTAAAGCCATTGTTGAGTCTTGCGGAAACTACAAAGTTACCAAGGGCAAGCCTGTGAAAAGTGCTTGGAACATTGGACAACAAAAATCTATTCTGACACCACTGTGTGGATTTCCATCACAGGCTGCTGGTGTTATTAGATCTATTTTCTCTCGCACACTAGATGCAGCAAATAACTCTATCCCAGATTTACAAAGAGCAGCTGTCACCATCCTTGGTGGCATTTCCGAACAGTCACTGCGTCTTGTTGATGCAATGGTGTGTACATCAGATTTGATCACCAACAGTGTTGTCATCATGGCATATGTTACTGGTGGTCTTGTACAGCAAACAGTGCAATGGTTGTCTAATGTGTTAGGCACCACAGTTGACAAACTCAAACCTGTATTTACATGGCTTGAGACTAAGCTTAATGCAGGAATAGAGTTTCTCAAGGATGCTTGGGAAATTCTTAAATTCCTAGTTACAGGTGTGTTTGACATTGTTAAAGGTCAAATACGGGTGTTTTCCGACAACCTCAAAGAATGTGTAAAAACTTTTGTTGGTGTTGTCAACAAAGCGCTTGAAATGTGCATTGACCAAGTCACAATCGCAGGTACCAAGGTGAGATCACTCAACCTTGGAGAGGTTTTAATTGCGCAAAGCAAGGGCCTCTACCGTCGGTGTGTTCGTGGCAAGGAGCAGCTGCAACTACTTATGCCTTTGAAGGCACCTAAAGAAGTCACTTTCCTTGAAGGAGACTCACATGATACAGTATTAATCTCCGAAGAGGTTGTTCTTAAAAATGGTGAGCTTGAAGCACTCGAGACACCAGTTGACAGTTTCACTAATGGAGCTGTCGTAGGTACTCCAGTTTGTGTTAACGGCCTCATGCTCTTGGAGCTCAAAGATAAGGAACAGTATTGTGCTTTATCTCCAGGCTTATTAGCTACAAACAATGTTTTCCGTCTAAATGGAGGTGCACCGGTTAAAAGTGTAACCTTTGGAGAAAACACTGTTTTAGAAGTTCAAGGTTACAAGAATGTGAAAATCACATTTGAGCTTGATGAGCGTGTAGACAAAGTGCTTAATGAGAAGTGTTCTGTCTACACTGTTGAATCCGGTACAGAGGTTACTGAATTTGCATGCGTTGTTGCAGAAGCTATTGTAAAAACTTTGCAACCGGTTTCTGATCTTCTTACTAAGATGGGTATCGACCTTGACGAGTGGAGTGTAGCTACATTCTACTTGTTTGATGATGCTGGTGAAGAAAAACTTTCATCACGCATGTACTGTTCCTTCTACCCTCCTGATGAGGAAGAAGACTGCGAAGAGTATGAGGATGAGGAAGAAGTTCCTGATGAAACCTGTGAACATGAATACGGTACAGAGGATGACTATAAAGGTCTTCCTCTTGAGTTTGGTTCGTCAATAGAAATACAACAGGTTGCAGATGAAGAGGAAGACTGGCTTGATGATGCTGGTGAAGAAGAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACCAGTTAATCAGTTTACTGGTTACTTTAAACTTACTGACAATGTTGCCATTAAATGTGTTGACATCGTTAAGGAAGCGCAAAGTGCCAAACCGACGGTGATTGTTAATGCTGCTAACATCCACCTAAAACATGGTGGTGGTGTAGCTGGTGCACTCAACAAAGCAACCAATGGTGCCATGCAACAAGAGAGTGATGATTACATTAAACGAAATGGACCACTCACAGTAGGTGGTTCATGTTTGCTTTCTGGACACAATTTGGCTAAGAAGTGTATGCATGTTGTTGGCCCAAACCTAAATGCTGGTGAGGATGTCCAACTACTTAAAGCTGCATATGACAACTTTAATTCACAGAACGTATTACTTGCACCACTACTGTCAGCAGGCATATTTGGTGCTAAACCACTTCAGTCTTTAAAGATGTGTGTTGAAGTAGTTCGCACACAAGTTTACCTCGCAGTCAATGATAGGAGTCTTTATGATCAGGTTGTATTAGATTATCTGGACAGTTTGAAACCTAAAGTGGAGTTTCCCAAGAAGGAGGAGAATCCAAAATTGGAAGAGCCAAAAGCGAAACAGCCAGTCGAAAAACCTGTTGACGTCAAACCTAAAATTAAGGCTTGTGTCGAAGAGGTTACTACAACATTGGAAGAAACTAAACTTCTTACCCAAAACCTGCTTCTTTTTGCTGATATCAATGGTAAACCTTACCCGGATTCTCAGAATATGCTAAGAGGTGAGGACATGTCTTTTCTAGAAAAGAATGCACCATATGTAGTAGGTGATGTCATCACTAGTGGTGATATTACTTGTGTTATAATACCTGCTAAGAAGGCTGGTGGTACTACAGAAATGCTTGCAAAGGCATTAAAGAAAGTGCCAGTGTGTGAGTATATAACTACATATCCCGGACAAGGATGTGCTGGTTATACACTCGAAGAAGCAAAGACTGCGCTTAAGAGGTGCAAATCTGCATTCTATGTACTACCTTCAAAAACACCTAATGTAAAAGATGAAATCCTTGGAACGGTGTCCTGGAATTTAAGGGAAATGCTTGCTCATGCCGAAGAGACAAGAAAATTAATGCCTATTTGCATGGACATTAGAGCCATAATGGCTACAATCCAACGTAAGTATAAAGGTATTAGAATTCAAGAAGGAATCGTTGACTATGGTGTTCGGTTCTTTTTCTATACTAGCAAAGAGCCTGTAGCTTCTATTATTACAAAACTCAATTCTTTAAATGAACCACTTATCACAATGCCGATAGGTTATGTGACACATGGTTTTAACCTGGAAGAAGCTGCGCGTTGTATGCGCTCTCTTAAAGCTCCTGCTGTAGTTTCAGTGTCTTCACCAGACGCAGTTACTACATACAATGGATACCTCACATCATCTTCAAAGACACCTGAGGAACACTTCATAGAGACCATCTCCCTTGCGGGTACGTATAGAGACTGGTCTTACTCTGGACAACGTACAGAATTAGGTGTTGAATTTCTCAAGCGTGGAGATAAGATTGTCTACCATACTATTGAAAAACCCATCGAGTTCCATCTTGATGGTGAGGTTCTCCCACTTGACAAGCTCAAGAGTCTTTTGTCTCTTCGTGAAGTTAAGACTATTAAAGTGTTTACTACTGTAGACAATACAAACCTCCACACACAAGTTGTGGACATGTCTATGACATATGGACAGCATTTTGGTTCAACCTATTTGGACGGTGCTGATGTCACTAAGGTTAAGCCTCATGTTAATCATGAGGGTAAGACTTTCTTTGTACTACCTAGTGATGACACACTGCGTAGTGAAGCATTTGAATATTACCACACTCTCGACGAGAGTTTTCTCGGTAGATACATGTCTGCTTTGAATCACAC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Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
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Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
LN2020B
|
Sarbecovirus sp.
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,167
|
GenBank
| 1
|
China: Liaoning
|
China
|
Rhinolophus ferrumequinum
| null |
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate LN2020B, complete genome
|
AACTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACTCGTCCTTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTCGCAGTCGATCATCAGCATACCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGTGTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTCTTCAGGTTAGTGACGTGTTAGTGCGTGGTTTCGGGGATACTGTGGAAGAAGCCCTAGCGGAAGCACGTGAACATCTTAAAAATGGCACTTGTGGCCTAGTAGAGCTGGAAAAAGGTGTCTTACGCCAGCTTGAAGAGCCCTATGTGTTCATTAAACGCTCTGAAGCCTTAAGCACCACTCATGGCCACAAGGTTACTGAATTGGTGGCTGAAATGAATGGCATTCAGTTCGGTCGTAGCGGTACAACACTGGGAGTTCTCGTGCCACATGTGGGCGAAACCCCAATCGCGTACCGCAATGTTCTTCTTCGTAAGAATGGTAATAAGGGAGCTGGTGGCCATAGCTACGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACGAGCTTAACACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAAAAATGGAACACTAAGCATGGCAGGGGTGCTCTCCGTGAACTCATTCGTGAGCTTAATGGAGGTGCAGTCACTCGCTATGTTGATAATAACTTCTGTGGCCCTGATGGGTATCCTCTTGACTGCATTAAAGATCTTCTCGCTCGTGCGGGTAAGTCGATGTGCACTCTTTCCGAACAACTCGATTTCATTGAATCGAAGCGTGGTGTCTATTGCTGCCGTGAACATGAGCATGAAATTGCTTGGTACACTGAGCGCTCAGACAAGAGTTATGAGCACCAGACACCATTCGAGGTTAAGAGTGCCAAAAAATTTGACACTTTTAAAGGGGAATGCCCGAAGTTCGTATTTCCTCTCAACTCCAAAGTCAAAGTCATTCAACCACGTGTTGAAAAGAAAAATACTGAAGGTTTCATGGGGCGTATACGCTCTGTGTACCAAGTTGCCACTCCAAATGAATGCAACGACATGCACTTGTCTGTCTTTATGAAGTGTAATCATTGTGATGAAGCCTCTTGGCAGACGTGTGACTTTCTCAAAGCCACTTGTGAATATTGTGGCACTGAAAATCCAGTTAGTGAAGGACCTACTACATGTGGGTATCTACCTACTAATGCTGTAGTAAAGATGCCCTGTCCTGCTTGTCAGAATAAAGAAGTGGGACCTGAGCATAGTGTTGCAGACTACCACAACCACTCAAATATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGACTAAATGTTTTGGAGGCTGTGTGTTTTCCTATGTTGGCTGCTATAACAAGCGTGCTTACTGGGTTCCTCGTGCTAGTGCCAATATAGGTTCAAACCATACTGGCATTACTGGTGACAATGTAGAAGTTCTTAATGAAGACCTCCTTGAGATACTGAATCGTGAACGTGTTAATATTAACATTGTTGGCGATTTTCAGTTGAATGAAGAGATTGCCATCATTTTAGCGTCTCTTTCTGCTTCTACGAGTGCTTTTGTTGACACTGTAAAGAGTCTTGATTATAAGTCTTTTAAAGCCATTGTTGAGTCTTGCGGAAACTACAAAGTTACCAAGGGCAAGCCTGTGAAAAGTGCTTGGAACATTGGACAACAAAAATCTATTCTGACACCACTGTGTGGATTTCCATCACAGGCTGCTGGTGTTATTAGATCTATTTTCTCTCGCACACTAGATGCAGCAAATAACTCTATCCCAGATTTACAAAGAGCAGCTGTCACCATCCTTGGTGGCATTTCCGAACAGTCACTGCGTCTTGTTGATGCAATGGTGTGTACATCAGACTTGATCACCAACAGTGTTGTCATCATGGCATATGTTACTGGTGGTCTTGTACAGCAAACAGTGCAATGGTTGTCTAATGTGTTAGGCACCACAGTTGACAAACTCAAACCTGTATTTACATGGCTTGAGACTAAGCTTAATGCAGGAATAGAGTTTCTCAAGGATGCTTGGGAAATTCTTAAATTCCTAGTTACAGGTGTGTTTGACATTGTTAAAGGTCAAATACGGGTGTTTTCCGACAACCTCAAAGAATGTGTAAAAACTTTTGTTGGTGTTGTCAACAAAGCGCTTGAAATGTGCATTGACCAAGTCACAATCGCAGGTACCAAGGTGAGATCACTCAACCTTGGAGAGGTTTTAATTGCGCAAAGCAAGGGCCTCTACCGTCGGTGTGTTCGTGGCAAGGAGCAGCTGCAACTACTTATGCCTTTGAAGGCACCTAAAGAAGTCACTTTCCTTGAAGGAGACTCACATGATACAGTATTAATCTCCGAAGAGGTTGTTCTTAAAAATGGTGAGCTTGAAGCACTCGAGACACCAGTTGACAGTTTCACTAATGGAGCTGTCGTAGGTACTCCAGTTTGTGTTAACGGCCTCATGCTCTTGGAGCTCAAAGATAAGGAACAGTATTGTGCTTTATCTCCAGGCTTATTAGCTACAAACAATGTTTTCCGTCTAAATGGAGGTGCACCGGTTAAAAGTGTAACCTTTGGAGAAAACACTGTTTTAGAAGTTCAAGGTTACAAGAATGTGAAAATCACATTTGAGCTTGATGAGCGTGTAGACAAAGTGCTTAATGAGAAGTGTTCTGTCTACACTGTTGAATCCGGTACAGAGGTTACTGAATTTGCATGCGTTGTTGCAGAAGCTATTGTAAAAACTTTGCAACCGGTTTCTGATCTTCTTACTAAGATGGGTATCGACCTTGACGAGTGGAGTGTAGCTACATTCTACTTGTTTGATGATGCTGGTGAAGAAAAACTTTCATCACGCATGTACTGTTCCTTCTACCCTCCTGATGAGGAAGAAGACTGCGAAGAGTATGAGGATGAGGAAGAAGTTCCTGATGAAACCTGTGAACATGAATACGGTACAGAGGATGACTATAAAGGTCTTCCTCTTGAGTTTGGTTCGTCAATAGAAATACAACAGGTTGCAGATGAAGAGGAAGACTGGCTTGATGATGCTGGTGAAGAAGAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACCAGTTAATCAGTTTACTGGTTACTTTAAACTTACTGACAATGTTGCTATTAAATGTGTTGACATCGTTAAGGAAGCGCAAAGTGCCAAACCGACGGTGATTGTTAATGCTGCTAACATCCACCTAAAACATGGTGGTGGTGTAGCTGGTGCACTCAACAAAGCAACCAATGGTGCCATGCAACAAGAGAGTGATGATTACATTAAACGAAATGGACCACTCACAGTAGGTGGTTCATGTTTGCTTTCTGGACACAATTTGGCTAAGAAGTGTATGCATGTTGTTGGCCCAAACCTAAATGCTGGTGAGGATGTCCAACTACTTAAAGCTGCATATGACAACTTTAATTCACAGAACGTATTACTTGCACCACTACTGTCAGCGGGCATATTTGGTGCTAAACCACTTCAGTCTTTAAAGATGTGTGTTGAAGCAGTTCGCACACAAGTTTACCTCGCAGTCAATGATAGGAGTCTTTATGATCAGGTTGTATTAGATTATCTGGACAGTTTGAAACCTAAAGTGGAGTTTCCCAAGAAGGAGGAGAATCCAAAATTGGAAGAGCCAAAAGTGAAACAGCCAGTTGAAAAACCTGTTGACGTCAAACCTAAAATTAAGGCTTGTGTCGAAGAGGTTACTACAACATTGGAAGAAACTAAACTTCTTACCCAAAACCTGCTGCTTTTTGCTGATATCAATGGTAAACCTTACCCGGACTCTCAGAATATGCTAAGAGGTGAGGACATGTCTTTTCTAGAAAAGAATGCACCATATGTAGTAGGTGATGTCATCACTAGTGGTGATATTACTTGTGTTATAATACCTGCTAAGAAGGCTGGTGGTACTACAGAAATGCTTGCAAAGGCATTAAAGAAAGTGCCAGTGTGTGAGTATATAACTACATATCCCGGACAAGGATGTGCTGGTTATACACTCGAAGAAGCAAAGACTGCGCTTAAGAGGTGCAAATCTGCATTCTATGTACTACCTTCAAAAACACCTAATGTAAAAGATGAAATCCTTGGAACGGTGTCCTGGAATTTAAGGGAAATGCTTGCTCATGCCGAAGAGACAAGAAAATTAATGCCTATTTGCATGGACATTAGAGCCATAATGGCTACAATCCAACGTAAGTATAAAGGTATTAGAATTCAAGAAGGAATCGTTGACTATGGTGTTCGGTTCTTTTTCTATACTAGCAAAGAGCCTGTAGCTTCTATTATTACAAAACTCAATTCTTTAAATGAACCACTTATCACAATGCCGATAGGTTATGTGACACATGGTTTTAACCTGGAAGAAGCTGCGCGTTGTATGCGCTCTCTTAAAGCTCCTGCTGTAGTTTCAGTGTCTTCACCAGACGCAGTTACTACATACAATGGATACCTCACATCATCTTCAAAGACACCTGAGGAACACTTCATAGAGACCATCTCCCTTGCGGGTACGTATAGAGACTGGTCTTACTCTGGACAACGTACAGAATTAGGTGTTGAATTTCTCAAGCGTGGAGATAAGATTGTCTACCACACTATTGAAAAACCCATCGAGTTCCATCTTGATGGTGAGGTTCTCCCACTTGACAAGCTCAAGAGTCTTTTGTCTCTTCGTGAGGTTAAGACTATTAAAGTGTTTACTACTGTAGACAATACTAACCTCCACACACAAGTTGTGGACATGTCTATGACATATGGACAGCATTTTGGTTCAACCTATTTGGACGGTGCTGATGTCACTAAGGTTAAGCCTCATGTTAATCATGAGGGTAAGACTTTCTTTGTACTACCTAGTGATGACACACTGCGTAGTGAAGCATTTGAATATTACCACACTCTCGACGAGAGTTTTCTCGGTAGATACATGTCTGCTTTGAATCACAC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Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
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Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
LN2020C
|
Sarbecovirus sp.
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,588
|
GenBank
| 1
|
China: Liaoning
|
China
|
Rhinolophus ferrumequinum
| null |
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate LN2020C, complete genome
|
AACTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACTCGTCCTTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTCGCAGTCGATCATCAGCATACCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGTGTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTCTTCAGGTTAGTGACGTGTTAGTGCGTGGTTTCGGGGATACTGTGGAAGAAGCCCTAGCGGAAGCACGTGAACATCTTAAAAATGGCACTTGTGGCCTAGTAGAGCTGGAAAAAGGTGTCTTACGCCAGCTTGAAGAGCCCTATGTGTTCATTAAACGCTCTGAAGCCTTAAGCACCACTCATGGCCACAAGGTTATTGAATTGGTGGCTGAAATGAATGGCATTCAGTTCGGTCGTAGCGGTACAACACTGGGAGTTCTCGTGCCACATGTGGGCGAAACCCCAATCGCGTACCGCAATGTTCTTCTTCGTAAGAATGGTAATAAGGGAGCTGGTGGCCATAGCTACGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACGAGCTTAACACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAAAAATGGAACACTAAGCATGGCAGGGGTGCTCTCCGTGAACTCATTCGTGAGCTTAATGGAGGTGCAGTCACTCGCTATGTTGATAATAACTTCTGTGGCCCTGATGGGTATCCTCTTGACTGCATTAAAGATCTTCTCGCTCGTGCGGGTAAGTCGATGTGCACTCTTTCCGAACAACTCGATTTCATTGAATCGAAGCGTGGTGTCTATTGCTGCCGTGAACATGAGCATGAAATTGCTTGGTACACTGAGCGCTCAGACAAGAGTTATGAGCACCAGACACCATTCGAGGTTAAGAGTGCCAAAAAATTTGACACTTTTAAAGGGGAATGCCCGAAGTTCGTATTTCCTCTCAACTCCAAAGTCAAAGTCATTCAACCACGTGTTGAAAAGAAAAATACTGAAGGTTTCATGGGGCGTATACGCTCTGTGTACCAAGTTGCCACTCCAAATGAATGCAACGACATGCACTTGTCTGTCTTTATGAAGTGTAATCATTGTGATGAAGCCTCTTGGCAGACGTGTGACTTTCTCAAAGCCACTTGTGAATATTGTGGCACTGAAAATCCAGTTAGTGAAGGACCTACTACATGTGGGTATCTACCTACTAATGCTGTAGTAAAGATGCCCTGTCCTGCTTGTCAGAATAAAGAAGTGGGACCTGAGCATAGTGTTGCAGACTACCACAACCACTCAAATATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGACTAAATGTTTTGGAGGCTGTGTGTTTTCCTATGTTGGCTGCTATAACAAGCGTGCTTACTGGGTTCCTCGTGCTAGTGCCAATATAGGTTCAAACCATACTGGCATTACTGGTGACAATGTAGAAGTTCTTAATGAAGACCTCCTTGAGATACTGAATCGTGAACGTGTTAATATTAACATTGTTGGCGATTTTCAGTTGAATGAAGAGATTGCCATCATTTTAGCGTCTCTTTCTGCTTCTACGAGTGCTTTTGTTGACACTGTAAAGAGTCTTGATTATAAGTCTTTTAAAGCCATTGTTGAGTCTTGCGGAAACTACAAAGTTACCAAGGGCAAGCCTGTGAAAAGTGCTTGGAACATTGGACAACAAAAATCTATTCTGACACCACTGTGTGGATTTCCATCACAGGCTGCTGGTGTTATTAGATCTATTTTCTCTCGCACACTAGATGCAGCAAATAACTCTATCCCAGATTTACAAAGAGCAGCTGTCACCATCCTTGGTGGCATTTCCGAACAGTCACTGCGTCTTGTTGATGCAATGGTGTGTACATCAGACTTGATCACCAACAGTGTTGTCATCATGGCATATGTTACTGGTGGTCTTGTACAGCAAACAGTGCAATGGTTGTCTAATGTGTTAGGCACCACAGTTGACAAACTCAAACCTGTATTTACATGGCTTGAGACTAAGCTTAATGCAGGAATAGAGTTTCTCAAGGATGCTTGGGAAATTCTTAAATTCCTAGTTACAGGTGTGTTTGACATTGTTAAAGGTCAAATACGGGTGTTTTCCGACAACCTCAAAGAATGTGTAAAAACTTTTGTTGGTGTTGTCAACAAAGCGCTTGAAATGTGCATTGACCAAGTCACAATCGCAGGTACCAAGGTGAGATCACTCAACCTTGGAGAGGTTTTAATTGCGCAAAGCAAGGGCCTCTACCGTCGGTGTGTTCGTGGCAAGGAGCAGCTGCAACTACTTATGCCTTTGAAGGCACCTAAAGAAGTCACTTTCCTTGAAGGAGACTCACATGATACAGTATTAATCTCCGAAGAGGTTGTTCTTAAAAATGGTGAGCTTGAAGCACTCGAGACACCAGTTGACAGTTTCACTAATGGAGCTGTCGTAGGTACTCCAGTTTGTGTTAACGGCCTCATGCTCTTGGAGCTCAAAGATAAGGAACAGTATTGTGCTTTATCTCCAGGCTTATTAGCTACAAACAATGTTTTCCGTCTAAATGGAGGTGCACCGGTTAAAAGTGTAACCTTTGGAGAAAACACTGTTTTAGAAGTTCAAGGTTACAAGAATGTGAAAATCACATTTGAGCTTGATGAGCGTGTAGACAAAGTGCTTAATGAGAAGTGTTCTGTCTACACTGTTGAATCCGGTACAGAGGTTACTGAATTTGCATGCGTTGTTGCAGAAGCTATTGTAAAAACTTTGCAACCGGTTTCTGATCTTCTTACTAAGATGGGTATCGACCTTGACGAGTGGAGTGTAGCTACATTCTACTTGTTTGATGATGCTGGTGAAGAAAAACTTTCATCACGCATGTACTGTTCCTTCTACCCTCCTGATGAGGAAGAAGACTGCGAAGAGTATGAGGATGAGGAAGAAGTTCCTGATGAAACCTGTGAACATGAATACGGTACAGAGGATGACTATAAAGGTCTTCCTCTTGAGTTTGGTTCGTCAATAGAAATACAACAGGTTGCAGATGAAGAGGAAGACTGGCTTGATGATGCTGGTGAAGAAGAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACCAGTTAATCAGTTTACTGGTTACTTTAAACTTACTGACAATGTTGCCATTAAATGTGTTGACATCGTTAAGGAAGCGCAAAGTGCCAAACCGACGGTGATTGTTAATGCTGCTAACATCCACCTAAAACATGGTGGTGGTGTAGCTGGTGCACTCAACAAAGCAACCAATGGTGCCATGCAACAAGAGAGTGATGATTACATTAAACGAAATGGACCACTCACAGTAGGTGGTTCATGTTTGCTTTCTGGACACAATTTGGCTAAGAAGTGTATGCATGTTGTTGGCCCAAACCTAAATGCTGGTGAGGATGTCCAACTACTTAAAGCTGCATATGACAACTTTAATTCACAGAACGTATTACTTGCACCACTACTGTCAGCGGGCATATTTGGTGCTAAACCACTTCAGTCTTTAAAGATGTGTGTTGAAGTAGTTCGCACACAAGTTTACCTCGCAGTCAATGATAGGAGTCTTTATGATCAGGTTGTATTAGATTATCTGGACAGTTTGAAACCTAAAGTGGAGTTTCCCAAGAAGGAGGAGAATCCAAAATTGGAAGAGCCAAAAGTGAAACAGCCAGTTGAAAAACCTGTTGACGTCAAACCTAAAATTAAGGCTTGTGTCGAAGAGGTTACTACAACATTGGAAGAAACTAAACTTCTTACCCAAAACCTGCTGCTTTTTGCTGATATCAATGGTAAACCTTACCCGGACTCTCAGAATATGCTAAGAGGTGAGGACATGTCTTTTCTAGAAAAGAATGCACCATATGTAGTAGGTGATGTCATCACTAGTGGTGATATTACTTGTGTTATAATACCTGCTAAGAAGGCTGGTGGTACTACAGAAATGCTTGCAAAGGCATTAAAGAAAGTGCCAGTGTGTGAGTATATAACTACATATCCCGGACAAGGATGTGCTGGTTATACACTCGAAGAAGCAAAGACTGCGCTTAAGAGGTGCAAATCTGCATTCTATGTACTACCTTCAAAAACACCTAATGTAAAAGATGAAATCCTTGGAACGGTGTCCTGGAATTTAAGGGAAATGCTTGCTCATGCCGAAGAGACAAGAAAATTAATGCCTATTTGCATGGACATTAGAGCCATAATGGCTACAATCCAACGTAAGTATAAAGGTATTAGAATTCAAGAAGGAATCGTTGACTATGGTGTTCGGTTCTTTTTCTATACTAGCAAAGAGCCTGTAGCTTCTATTATTACAAAACTCAATTCTTTAAATGAACCACTTATCACAATGCCGATAGGTTATGTGACACATGGTTTTAACCTGGAAGAAGCTGCGCGTTGTATGCGCTCTCTTAAAGCTCCTGCTGTAGTTTCAGTGTCTTCACCAGACGCAGTTACTACATACAATGGATACCTCACATCATCTTCAAAGACACCTGAGGAACACTTCATAGAGACCATCTCCCTTGCGGGTACGTATAGAGACTGGTCTTACTCTGGACAACGTACAGAATTAGGTGTTGAATTTCTCAAGCGTGGAGATAAGATTGTCTACCACACTATTGAAAAACCCATCGAGTTCCATCTTGATGGTGAGGTTCTCCCACTTGACAAGCTCAAGAGTCTTTTGTCTCTTCGTGAGGTTAAGACTATTAAAGTGTTTACTACTGTAGACAATACTAACCTCCACACACAAGTTGTGGACATGTCTATGACATATGGACAGCATTTTGGTTCAACCTATTTGGACGGTGCTGATGTCACTAAGGTTAAGCCTCATGTTAATCATGAGGGTAAGACTTTCTTTGTACTACCTAGTGATGACACACTGCGTAGTGAAGCATTTGAATATTACCACACTCTCGACGAGAGTTTTCTCGGTAGATACATGTCTGCTTTGAATCACAC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| 37,906
|
OK017797.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
LN2020E
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,167
|
GenBank
| 1
|
China: Liaoning
|
China
|
Rhinolophus ferrumequinum
| null |
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate LN2020E, complete genome
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Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
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Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
LN2020F
|
Sarbecovirus sp.
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,167
|
GenBank
| 1
|
China: Liaoning
|
China
|
Rhinolophus ferrumequinum
| null |
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate LN2020F, complete genome
|
AACTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACTCGTCCTTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTCGCAGTCGATCATCAGCATACCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGTGTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTCTTCAGGTTAGTGACGTGTTAGTGCGTGGTTTCGGGGATACTGTGGAAGAAGCCCTAGCGGAAGCACGTGAACATCTTAAAAATGGCACTTGTGGCCTAGTAGAGCTGGAAAAAGGTGTCTTACGCCAGCTTGAAGAGCCCTATGTGTTCATTAAACGCTCTGAAGCCTTAAGCACCACTCATGGCCACAAGGTTATTGAATTGGTGGCTGAAATGAATGGCATTCAGTTCGGTCGTAGCGGTACAACACTGGGAGTTCTCGTGCCACATGTGGGCGAAACCCCAATCGCGTACCGCAATGTTCTTCTTCGTAAGAATGGTAATAAGGGAGCTGGTGGCCATAGCTACGGCATCGATCTAAAGTCTTATGATTTAGGTGACGAGCTTAACACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAAAAATGGAACACTAAGCATGGCAGGGGTGCTCTCCGTGAACTCATTCGTGAGCTTAATGGAGGTGCAGTCACTCGCTATGTTGATAATAACTTCTGTGGCCCTGATGGGTATCCTCTTGACTGCATTAAAGATCTTCTCGCTCGTGCGGGTAAGTCGATGTGCACTCTTTCCGAACAACTCGATTTCATTGAATCGAAGCGTGGTGTCTATTGCTGCCGTGAACATGAGCATGAAATTGCTTGGTACACTGAGCGCTCAGACAAGAGTTATGAGCACCAGACACCATTCGAGGTTAAGAGTGCCAAAAAATTTGACACTTTTAAAGGGGAATGCCCGAAGTTCGTATTTCCTCTCAACTCCAAAGTCAAAGTCATTCAACCACGTGTTGAAAAGAAAAATACTGAAGGTTTCATGGGGCGTATACGCTCTGTGTACCAAGTTGCCACTCCAAATGAATGCAACGACATGCACTTGTCTGTCTTTATGAAGTGTAATCATTGTGATGAAGCCTCTTGGCAGACGTGTGACTTTCTCAAAGCCACTTGTGAATATTGTGGCACTGAAAATCCAGTTAGTGAAGGACCTACTACATGTGGGTATCTACCTACTAATGCTGTAGTAAAGATGCCCTGTCCTGCTTGTCAGAATAAAGAAGTGGGACCTGAGCATAGTGTTGCAGACTACCACAACCACTCAAATATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGACTAAATGTTTTGGAGGCTGTGTGTTTTCCTATGTTGGCTGCTATAACAAGCGTGCTTACTGGGTTCCTCGTGCTAGTGCCAATATAGGTTCAAACCATACTGGCATTACTGGTGACAATGTAGAAGTTCTTAATGAAGACCTCCTTGAGATACTGAATCGTGAACGTGTTAATATTAACATTGTTGGCGATTTTCAGTTGAATGAAGAGATTGCCATCATTTTAGCGTCTCTTTCTGCTTCTACGAGTGCTTTTGTTGACACTGTAAAGAGTCTTGATTATAAGTCTTTTAAAGCCATTGTTGAGTCTTGCGGAAACTACAAAGTTACCAAGGGCAAGCCTGTGAAAAGTGCTTGGAACATTGGACAACAAAAATCTATTCTGACACCACTGTGTGGATTTCCATCACAGGCTGCTGGTGTTATTAGATCTATTTTCTCTCGCACACTAGATGCAGCAAATAACTCTATCCCAGATTTACAAAGAGCAGCTGTCACCATCCTTGGTGGCATTTCCGAACAGTCACTGCGTCTTGTTGATGCAATGGTGTGTACATCAGACTTGATCACCAACAGTGTTGTCATCATGGCATATGTTACTGGTGGTCTTGTACAGCAAACAGTGCAATGGTTGTCTAATGTGTTAGGCACCACAGTTGACAAACTCAAACCTGTATTTACATGGCTTGAGACTAAGCTTAATGCAGGAATAGAGTTTCTCAAGGATGCTTGGGAAATTCTTAAATTCCTAGTTACAGGTGTGTTTGACATTGTTAAAGGTCAAATACGGGTGTTTTCCGACAACCTCAAAGAATGTGTAAAAACTTTTGTTGGTGTTGTCAACAAAGCGCTTGAAATGTGCATTGACCAAGTCACAATCGCAGGTACCAAGGTGAGATCACTCAACCTTGGAGAGGTTTTAATTGCGCAAAGCAAGGGCCTCTACCGTCGGTGTGTTCGTGGCAAGGAGCAGCTGCAACTACTTATGCCTTTGAAGGCACCTAAAGAAGTCACTTTCCTTGAAGGAGACTCACATGATACAGTATTAATCTCCGAAGAGGTTGTTCTTAAAAATGGTGAGCTTGAAGCACTCGAGACACCAGTTGACAGTTTCACTAATGGAGCTGTCGTAGGTACTCCAGTTTGTGTTAACGGCCTCATGCTCTTGGAGCTCAAAGATAAGGAACAGTATTGTGCTTTATCTCCAGGCTTATTAGCTACAAACAATGTTTTCCGTCTAAATGGAGGTGCACCGGTTAAAAGTGTAACCTTTGGAGAAAACACTGTTTTAGAAGTTCAAGGTTACAAGAATGTGAAAATCACATTTGAGCTTGATGAGCGTGTAGACAAAGTGCTTAATGAGAAGTGTTCTGTCTACACTGTTGAATCCGGTACAGAGGTTACTGAATTTGCATGCGTTGTTGCAGAAGCTATTGTAAAAACTTTGCAACCGGTTTCTGATCTTCTTACTAAGATGGGTATCGACCTTGACGAGTGGAGTGTAGCTACATTCTACTTGTTTGATGATGCTGGTGAAGAAAAACTTTCATCACGCATGTACTGTTCCTTCTACCCTCCTGATGAGGAAGAAGACTGCGAAGAGTATGAGGATGAGGAAGAAGTTCCTGATGAAACCTGTGAACATGAATACGGTACAGAGGATGACTATAAAGGTCTTCCTCTTGAGTTTGGTTCGTCAATAGAAATACAACAGGTTGCAGATGAAGAGGAAGACTGGCTTGATGATGCTGGTGAAGAAGAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACCAGTTAATCAGTTTACTGGTTACTTTAAACTTACTGACAATGTTGCCATTAAATGTGTTGACATCGTTAAGGAAGCGCAAAGTGCCAAACCGACGGTGATTGTTAATGCTGCTAACATCCACCTAAAACATGGTGGTGGTGTAGCTGGTGCACTCAACAAAGCAACCAATGGTGCCATGCAACAAGAGAGTGATGATTACATTAAACGAAATGGACCACTCACAGTAGGTGGTTCATGTTTGCTTTCTGGACACAATTTGGCTAAGAAGTGTATGCATGTTGTTGGCCCAAACCTAAATGCTGGTGAGGATGTCCAACTACTTAAAGCTGCATATGACAACTTTAATTCACAGAACGTATTACTTGCACCACTACTGTCAGCGGGCATATTTGGTGCTAAACCACTTCAGTCTTTAAAGATGTGTGTTGAAGTAGTTCGCACACAAGTTTACCTCGCAGTCAATGATAGGAGTCTTTATGATCAGGTTGTATTAGATTATCTGGACAGTTTGAAACCTAAAGTGGAGTTTCCCAAGAAGGAGGAGAATCCAAAATTGGAAGAGCCAAAAGTGAAACAGCCAGTTGAAAAACCTGTTGACGTCAAACCTAAAATTAAGGCTTGTGTCGAAGAGGTTACTACAACATTGGAAGAAACTAAACTTCTTACCCAAAACCTGCTGCTTTTTGCTGATATCAATGGTAAACCTTACCCGGACTCTCAGAATATGCTAAGAGGTGAGGACATGTCTTTTCTAGAAAAGAATGCACCATATGTAGTAGGTGATGTCATCACTAGTGGTGATATTACTTGTGTTATAATACCTGCTAAGAAGGCTGGTGGTACTACAGAAATGCTTGCAAAGGCATTAAAGAAAGTGCCAGTGTGTGAGTATATAACTACATATCCCGGACAAGGATGTGCTGGTTATACACTCGAAGAAGCAAAGACTGCGCTTAAGAGGTGCAAATCTGCATTCTATGTACTACCTTCAAAAACACCTAATGTAAAAGATGAAATCCTTGGAACGGTGTCCTGGAATTTAAGGGAAATGCTTGCTCATGCCGAAGAGACAAGAAAATTAATGCCTATTTGCATGGACATTAGAGCCATAATGGCTACAATCCAACGTAAGTATAAAGGTATTAGAATTCAAGAAGGAATCGTTGACTATGGTGTTCGGTTCTTTTTCTATACTAGCAAAGAGCCTGTAGCTTCTATTATTACAAAACTCAATTCTTTAAATGAACCACTTATCACAATGCCGATAGGTTATGTGACACATGGTTTTAACCTGGAAGAAGCTGCGCGTTGTATGCGCTCTCTTAAAGCTCCTGCTGTAGTTTCAGTGTCTTCACCAGACGCAGTTACTACATACAATGGATACCTCACATCATCTTCAAAGACACCTGAGGAACACTTCATAGAGACCATCTCCCTTGCGGGTACGTATAGAGACTGGTCTTACTCTGGACAACGTACAGAATTAGGTGTTGAATTTCTCAAGCGTGGAGATAAGATTGTCTACCACACTATTGAAAAACCCATCGAGTTCCATCTTGATGGTGAGGTTCTCCCACTTGACAAGCTCAAGAGTCTTTTGTCTCTTCGTGAGGTTAAGACTATTAAAGTGTTTACTACTGTAGACAATACTAACCTCCACACACAAGTTGTGGACATGTCTATGACATATGGACAGCATTTTGGTTCAACCTATTTGGACGGTGCTGATGTCACTAAGGTTAAGCCTCATGTTAATCATGAGGGTAAGACTTTCTTTGTACTACCTAGTGATGACACACTGCGTAGTGAAGCATTTGAATATTACCACACTCTCGACGAGAGTTTTCTCGGTAGATACATGTCTGCTTTGAATCACAC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Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
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Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
LN2020G
|
Sarbecovirus sp.
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,168
|
GenBank
| 1
|
China: Liaoning
|
China
|
Rhinolophus ferrumequinum
| null |
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate LN2020G, complete genome
|
AACTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACTCGTCCTTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTCGCAGTCGATCATCAGCATACCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGTGTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTCTTCAGGTTAGTGACGTGTTAGTGCGTGGTTTCGGGGATACTGTGGAAGAAGCCCTAGCGGAAGCACGTGAACATCTTAAAAATGGCACTTGTGGCCTAGTAGAGCTGGAAAAAGGTGTCTTACGCCAGCTTGAAGAGCCCTATGTGTTCATTAAACGCTCTGAAGCCTTAAGCACCACTCATGGCCACAAGGTTATTGAATTGGTGGCTGAAATGAATGGCATTCAGTTCGGTCGTAGCGGTACAACACTGGGAGTTCTCGTGCCACATGTGGGCGAAACCCCAATCGCGTACCGCAATGTTCTTCTTCGTAAGAATGGTAATAAGGGAGCTGGTGGCCATAGCTACGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACGAGCTTAACACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAAAAATGGAACACTAAGCATGGCAGGGGTGCTCTCCGTGAACTCATTCGTGAGCTTAATGGAGGTGCAGTCACTCGCTATGTTGATAACAACTTCTGTGGCCCTGATGGGTATCCTCTTGACTGCATTAAAGATCTTCTCGCTCGTGCGGGTAAGTCGATGTGCACTCTTTCCGAACAACTCGATTTCATTGAATCGAAGCGTGGTGTCTATTGCTGCCGTGAACATGAGCATGAAATTGCTTGGTACACGGAGCGCTCAGACAAGAGTTATGAGCATCAGACACCATTCGAGGTTAAGAGTGCCAAAAAATTTGACACTTTTAAAGGGGAATGCCCGAAGTTCGTATTTCCTCTCAACTCCAAAGTCAAAGTCATTCAACCACGTGTTGAAAAGAAAAATACTGAAGGTTTCATGGGGCGTATACGCTCTGTGTACCAAGTTGCCACTCCAAATGAATGCAACGACATGCACTTGTCTGTCTTTATGAAGTGTAATCATTGTGATGAAGCCTCTTGGCAGACGTGTGACTTTCTCAAAGCCACTTGTGAATATTGTGGCACTGAAAATCCAGTTAGTGAAGGACCTACTACATGTGGGTATCTACCTACTAATGCTGTAGTAAAGATGCCCTGTCCTGCTTGTCAGAATAAAGAAGTGGGACCTGAGCATAGTGTTGCAGACTACCACAACCACTCAAATATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGACTAAATGTTTTGGAGGCTGTGTGTTTTCCTATGTTGGCTGCTATAACAAGCGTGCATACTGGGTTCCTCGTGCTAGTGCTAATATAGGTTCAAACCATACTGGCATTACTGGTGACAATGTAGAAGTTCTTAATGAAGACCTCCTTGAGATACTGAATCGTGAACGTGTTAATATTAACATTGTTGGCGATTTTCAGTTGAATGAAGAGATTGCCATCATTTTAGCGTCTCTTTCTGCTTCTACGAGTGCTTTTGTTGACACTGTAAAGAGTCTTGATTATAAGTCTTTTAAAGCCATTGTTGAGTCTTGCGGAAACTACAAAGTTACCAAGGGCAAGCCTGTGAAAAGTGCTTGGAACATTGGACAACAAAAATCTATTCTGACACCACTGTGTGGATTTCCATCACAGGCTGCTGGTGTTATTAGATCTATTTTCTCTCGCACACTAGATGCAGCAAATAACTCTATCCCAGATTTACAAAGAGCAGCTGTCACCATCCTTGGTGGCATTTCCGAACAGTCACTGCGTCTTGTTGATGCAATGGTGTGTACATCAGATTTGATCACCAACAGTGTTGTCATCATGGCATATGTTACTGGTGGTCTTGTACAGCAAACAGTGCAATGGTTGTCTAATGTGTTAGGCACCACAGTTGACAAACTCAAACCTGTATTTACATGGCTTGAGACTAAGCTTAATGCAGGAATAGAGTTTCTCAAGGATGCTTGGGAAATTCTTAAATTCCTAGTTACAGGTGTGTTTGACATTGTTAAAGGTCAAATACGGGTGTTTTCCGACAACCTCAAAGAATGTGTAAAAACTTTTGTTGGTGTTGTCAACAAAGCGCTTGAAATGTGCATTGACCAAGTCACAATCGCAGGTACCAAGGTGAGATCACTCAACCTTGGAGAGGTTTTAATTGCGCAAAGCAAGGGCCTCTACCGTCGGTGTGTTCGTGGCAAGGAGCAGCTGCAACTACTTATGCCTTTGAAGGCACCTAAAGAAGTCACTTTCCTTGAAGGAGACTCACATGATACAGTATTAATCTCCGAAGAGGTTGTTCTTAAAAATGGTGAGCTTGAAGCACTCGAGACACCAGTTGACAGTTTCACTAATGGAGCTGTCGTAGGTACTCCAGTTTGTGTTAACGGCCTCATGCTCTTGGAGCTCAAAGATAAGGAACAGTATTGTGCTTTATCTCCAGGCTTATTAGCTACAAACAATGTTTTCCGTCTAAATGGAGGTGCACCGGTTAAAAGTGTAACCTTTGGAGAAAACACTGTTTTAGAAGTTCAAGGTTACAAGAATGTGAAAATCACATTTGAGCTTGATGAGCGTGTAGACAAAGTGCTTAATGAGAAGTGTTCTGTCTACACTGTTGAATCCGGTACAGAGGTTACTGAATTTGCATGCGTTGTTGCAGAAGCTATTGTAAAAACTTTGCAACCGGTTTCTGATCTTCTTACTAAGATGGGTATCGACCTTGACGAGTGGAGTGTAGCTACATTCTACTTGTTTGATGATGCTGGTGAAGAAAAACTTTCATCACGCATGTACTGTTCCTTCTACCCTCCTGATGAGGAAGAAGACTGCGAAGAGTATGAGGATGAGGAAGAAGTTCCTGATGAAACCTGTGAACATGAATACGGTACAGAGGATGACTATAAAGGTCTTCCTCTTGAGTTTGGTTCGTCAATAGAAATACAACAGGTTGCAGATGAAGAGGAAGACTGGCTTGATGATGCTGGTGAAGAAGAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACCAGTTAATCAGTTTACTGGTTACTTTAAACTTACTGACAATGTTGCCATTAAATGTGTTGACATCGTTAAGGAAGCGCAAAGTGCCAAACCGACGGTGATTGTTAATGCTGCTAACATCCACCTAAAACATGGTGGTGGTGTAGCTGGTGCACTCAACAAAGCAACCAATGGTGCCATGCAACAAGAGAGTGATGATTACATTAAACGAAATGGACCACTCACAGTAGGTGGTTCATGTTTGCTTTCTGGACACAATTTGGCTAAGAAGTGTATGCATGTTGTTGGCCCAAACCTAAATGCTGGTGAGGATGTCCAACTACTTAAAGCTGCATATGACAACTTTAATTCACAGAACGTATTACTTGCACCACTACTGTCAGCAGGCATATTTGGTGCTAAACCACTTCAGTCTTTAAAGATGTGTGTTGAAGTAGTTCGCACACAAGTTTACCTCGCAGTCAATGATAGGAGTCTTTATGATCAGGTTGTATTAGATTATCTGGACAGTTTGAAACCTAAAGTGGAGTTTCCCAAGAAGGAGGAGAATCCAAAATTGGAAGAGCCAAAAGCGAAACAGCCAGTCGAAAAACCTGTTGACGTCAAACCTAAAATTAAGGCTTGTGTCGAAGAGGTTACTACAACATTGGAAGAAACTAAACTTCTTACCCAAAACCTGCTTCTTTTTGCTGATATCAATGGTAAACCTTACCCGGATTCTCAGAATATGCTAAGAGGTGAGGACATGTCTTTTCTAGAAAAGAATGCACCATATGTAGTAGGTGATGTCATCACTAGTGGTGATATTACTTGTGTTATAATACCTGCTAAGAAGGCTGGTGGTACTACAGAAATGCTTGCAAAGGCATTAAAGAAAGTGCCAGTGTGTGAGTATATAACTACATATCCCGGACAAGGATGTGCTGGTTATACACTCGAAGAAGCAAAGACTGCGCTTAAGAGGTGCAAATCTGCATTCTATGTACTACCTTCAAAAACACCTAATGTAAAAGATGAAATCCTTGGAACGGTGTCCTGGAATTTAAGGGAAATGCTTGCTCATGCCGAAGAGACAAGAAAATTAATGCCTATTTGCATGGACATTAGAGCCATAATGGCTACAATCCAACGTAAGTATAAAGGTATTAGAATTCAAGAAGGAATCGTTGACTATGGTGTTCGGTTCTTTTTCTATACTAGCAAAGAGCCTGTAGCTTCTATTATTACAAAACTCAATTCTTTAAATGAACCACTTATCACAATGCCGATAGGTTATGTGACACATGGTTTTAACCTGGAAGAAGCTGCGCGTTGTATGCGCTCTCTTAAAGCTCCTGCTGTAGTTTCAGTGTCTTCACCAGACGCAGTTACTACATACAATGGATACCTCACATCATCTTCAAAGACACCTGAGGAACACTTCATAGAGACCATCTCCCTTGCGGGTACGTATAGAGACTGGTCTTACTCTGGACAACGTACAGAATTAGGTGTTGAATTTCTCAAGCGTGGAGATAAGATTGTCTACCATACTATTGAAAAACCCATCGAGTTCCATCTTGATGGTGAGGTTCTCCCACTTGACAAGCTCAAGAGTCTTTTGTCTCTTCGTGAAGTTAAGACTATTAAAGTGTTTACTACTGTAGACAATACAAACCTCCACACACAAGTTGTGGACATGTCTATGACATATGGACAGCATTTTGGTTCAACCTATTTGGACGGTGCTGATGTCACTAAGGTTAAGCCTCATGTTAATCATGAGGGTAAGACTTTCTTTGTACTACCTAGTGATGACACACTGCGTAGTGAAGCATTTGAATATTACCACACTCTCGACGAGAGTTTTCTCGGTAGATACATGTCTGCTTTGAATCACAC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Sarbecovirus sp.
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Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
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Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
LN2020H
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Sarbecovirus sp.
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,167
|
GenBank
| 1
|
China: Liaoning
|
China
|
Rhinolophus ferrumequinum
| null |
2020-09
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate LN2020H, complete genome
|
AACTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACTCGTCCTTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTCGCAGTCGATCATCAGCATACCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGTGTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTCTTCAGGTTAGTGACGTGTTAGTGCGTGGTTTCGGGGATACTGTGGAAGAAGCCCTAGCGGAAGCACGTGAACATCTTAAAAATGGCACTTGTGGCCTAGTAGAGCTGGAAAAAGGTGTCTTACGCCAGCTTGAAGAGCCCTATGTGTTCATTAAACGCTCTGAAGCCTTAAGCACCACTCATGGCCACAAGGTTATTGAATTGGTGGCTGAAATGAATGGCATTCAGTTCGGTCGTAGCGGTACAACACTGGGAGTTCTCGTGCCACATGTGGGCGAAACCCCAATCGCGTACCGCAATGTTCTTCTTCGTAAGAATGGTAATAAGGGAGCTGGTGGCCATAGCTACGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACGAGCTTAACACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAAAAATGGAACACTAAGCATGGCAGGGGTGCTCTCCGTGAACTCATTCGTGAGCTTAATGGAGGTGCAGTCACTCGCTATGTTGATAACAACTTCTGTGGCCCTGATGGGTATCCTCTTGAATGCATTAAAGATCTTCTCGCTCGTGCGGGTAAGTCGATGTGCACTCTTTCCGAACAACTCGATTTCATTGAATCGAAGCGTGGTGTCTATTGCTGCCGTGAACATGAGCATGAAATTGCTTGGTACACTGAGCGCTCAGACAAGAGTTATGAGCATCAGACACCATTCGAGGTTAAGAGTGCCAAAAAATTTGACACTTTTAAAGGGGAATGCCCGAAGTTCGTATTTCCTCTCAACTCCAAAGTCAAAGTCATTCAACCACGTGTTGAAAAGAAAAATACTGAAGGTTTCATGGGGCGTATACGCTCTGTGTACCAAGTTGCCACTCCAAATGAATGCAACGACATGCACTTGTCTGTCTTTATGAAGTGTAATCATTGTGATGAAGCCTCTTGGCAGACGTGTGACTTTCTCAAAGCCACTTGTGAATATTGTGGCACTGAAAATCCAGTTAGTGAAGGACCTACTACATGTGGGTATCTACCTACTAATGCTGTAGTAAAGATGCCCTGTCCTGCTTGTCAGAATAAAGAAGTGGGACCTGAGCATAGTGTTGCAGACTACCACAACCACTCAAATATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGACTAAATGTTTTGGAGGCTGTGTGTTTTCCTATGTTGGCTGCTATAACAAGCGTGCATACTGGGTTCCTCGTGCTAGTGCCAATATAGGTTCAAACCATACTGGCATTACTGGTGACAATGTAGAAGTTCTTAATGAAGACCTCCTTGAGATACTGAATCGTGAACGTGTTAATATTAACATTGTTGGCGATTTTCAGTTGAATGAAGAGATTGCCATCATTTTAGCGTCTCTTTCTGCTTCTACGAGTGCTTTTGTTGACACTGTAAAGAGTCTTGATTATAAGTCTTTTAAAGCCATTGTTGAGTCTTGCGGAAACTACAAAGTTACCAAGGGCAAGCCTGTGAAAAGTGCTTGGAACATTGGACAACAAAAATCTATTCTGACACCACTGTGTGGATTTCCATCACAGGCTGCTGGTGTTATTAGATCTATTTTCTCTCGCACACTAGATGCAGCAAATAACTCTATCCCAGATTTACAAAGAGCAGCTGTCACCATCCTTGGTGGCATTTCCGAACAGTCACTGCGTCTTGTTGATGCAATGGTGTGTACATCAGACTTGATCACCAACAGTGTTGTCATCATGGCATATGTTACTGGTGGTCTTGTACAGCAAACAGTGCAATGGTTGTCTAATGTGTTAGGCACCACAGTTGACAAACTCAAACCTGTATTTACATGGCTTGAGACTAAGCTTAATGCAGGAATAGAGTTTCTCAAGGATGCTTGGGAAATTCTTAAATTCCTAGTTACAGGTGTGTTTGACATTGTTAAAGGTCAAATACGGGTGTTTTCCGACAACCTCAAAGAATGTGTAAAAACTTTTGTTGGTGTTGTCAACAAAGCGCTTGAAATGTGCATTGACCAAGTCACAATCGCAGGTACCAAGGTGAGATCACTCAACCTTGGAGAGGTTTTAATTGCGCAAAGCAAGGGCCTCTACCGTCGGTGTGTTCGTGGCAAGGAGCAGCTGCAACTACTTATGCCTTTGAAGGCACCTAAAGAAGTCACTTTCCTTGAAGGAGACTCACATGATACAGTATTAATCTCCGAAGAGGTCGTTCTTAAAAATGGTGAGCTTGAAGCACTCGAGACACCAGTTGACAGTTTCACTAATGGAGCTGTCGTAGGTACTCCAGTTTGTGTTAACGGCCTCATGCTCTTGGAGCTCAAAGATAAGGAACAGTATTGTGCTTTATCTCCAGGCTTATTAGCTACAAACAATGTTTTCCGTCTAAATGGAGGTGCACCGGTTAAAAGTGTAACCTTTGGAGAAAACACTGTTTTAGAAGTTCAAGGTTACAAGAATGTGAAAATCACATTTGAGCTTGATGAGCGTGTAGACAAAGTGCTTAATGAGAAGTGTTCTGTCTACACTGTTGAATCCGGTACAGAGGTTACTGAATTTGCATGCGTTGTTGCAGAAGCTATTGTAAAAACTTTGCAACCGGTTTCTGATCTTCTTACTAAGATGGGTATCGACCTTGACGAGTGGAGTGTAGCTACATTCTACTTGTTTGATGATGCTGGTGAAGAAAAACTTTCATCACGCATGTACTGTTCCTTCTACCCTCCTGATGAGGAAGAAGACTGCGAAGAGTATGAGGATGAGGAAGAAGTTCCTGATGAAACCTGTGAACATGAATACGGTACAGAGGATGACTATAAAGGTCTTCCTCTTGAGTTTGGTTCGTCAATAGAAATACAACAGGTTGCAGATGAAGAGGAAGACTGGCTTGATGATGCTGGTGAAGAAGAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACCAGTTAATCAGTTTACTGGTTACTTTAAACTTACTGACAATGTTGCCATTAAATGTGTTGACATCGTTAAGGAAGCGCAAAGTGCCAAACCGACGGTGATTGTTAATGCTGCTAACATCCACCTAAAACATGGTGGTGGTGTAGCTGGTGCACTCAACAAAGCAACCAATGGTGCCATGCAACAAGAGAGTGATGATTACATTAAACGAAATGGACCACTCACAGTAGGTGGTTCATGTTTGCTTTCTGGACACAATTTGGCTAAGAAGTGTATGCATGTTGTTGGCCCAAACCTAAATGCTGGTGAGGATGTCCAACTACTTAAAGCTGCATATGACAACTTTAATTCACAGAACGTATTACTTGCACCACTACTGTCAGCAGGCATATTTGGTGCTAAACCACTTCAGTCTTTAAAGATGTGTGTTGAAGTAGTTCGCACACAAGTTTACCTCGCAGTCAATGATAGGAGTCTTTATGATCAGGTTGTATTAGATTATCTGGACAGTTTGAAACCTAAAGTGGAGTTTCCCAAGAAGGAGGAGAATCCAAAATTGGAAGAGCCAAAAGTGAAACAGCCAGTTGAAAAACCTGTTGACGTCAAACCTAAAATTAAGGCTTGTGTCGAAGAGGTTACTACAACATTGGAAGAAACTAAACTTCTTACCCAAAACCTGCTTCTTTTTGCTGATATCAATGGTAAACCTTACCCGGACTCTCAGAATATGCTAAGAGGTGAGGACATGTCTTTTCTAGAAAAGAATGCACCATATGTAGTAGGTGATGTCATCACTAGTGGTGATATTACTTGTGTTATAATACCTGCTAAGAAGGCTGGTGGTACTACAGAAATGCTTGCAAAGGCATTAAAGAAAGTGCCAGTGTGTGAGTATATAACTACATATCCCGGACAAGGATGTGCTGGTTATACACTCGAAGAAGCAAAGACTGCGCTTAAGAGGTGCAAATCTGCATTCTATGTACTACCTTCAAAAACACCTAATGTAAAAGATGAAATCCTTGGAACGGTGTCCTGGAATTTAAGGGAAATGCTTGCTCATGCCGAAGAGACAAGAAAATTAATGCCTATTTGCATGGACATTAGAGCCATAATGGCTACAATCCAACGTAAGTATAAAGGTATTAGAATTCAAGAAGGAATCGTTGACTATGGTGTTCGGTTCTTTTTCTATACTAGCAAAGAGCCTGTAGCTTCTATTATTACAAAACTCAATTCTTTAAATGAACCACTTATCACAATGCCGATAGGTTATGTGACACATGGTTTTAACCTGGAAGAAGCTGCGCGTTGTATGCGCTCTCTTAAAGCTCCTGCTGTAGTTTCAGTGTCTTCACCAGACGCAGTTACTACATACAATGGATACCTCACATCATCTTCAAAGACACCTGAGGAACACTTCATAGAGACCATCTCCCTTGCGGGTACGTATAGAGACTGGTCTTACTCTGGACAACGTACAGAATTAGGTGTTGAATTTCTCAAGCGTGGAGATAAGATTGTCTACCACACTATTGAAAAACCCATCGAGTTCCATCTTGATGGTGAGGTTCTCCCACTTGACAAGCTCAAGAGTCTTTTGTCTCTTCGTGAGGTTAAGACTATTAAAGTGTTTACTACTGTAGACAATACTAACCTCCACACACAAGTTGTGGACATGTCTATGACATATGGACAGCATTTTGGTTCAACCTATTTGGACGGTGCTGATGTCACTAAGGTTAAGCCTCATGTTAATCATGAGGGTAAGACTTTCTTTGTACTACCTAGTGATGACACACTGCGTAGTGAAGCATTTGAATATTACCACACTCTCGACGAGAGTTTTCTCGGTAGATACATGTCTGCTTTGAATCACAC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Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
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Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
HB2020D
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Sarbecovirus sp.
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,552
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GenBank
| 1
|
China: Hubei
|
China
|
Rhinolophus
| null |
2020-07
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate HB2020D, complete genome
|
ATCTTTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACTCGTCCCTCTTCTGCAGACTGTTCACGGTTTCGCCCGTGTTGCAGTCGATCATCAGCATACCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGTGTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTGCCTGTTCTTCAGGTTAGAGACGTGCTAGTGCGTGGCTTCGGGGACTCTGTGGAAGAGGCCCTATCGGAGGCACGTGAACACCTTAAAAATGGCACTTGTGGCCTAGTAGAGCTGGAAAAAGGTGTGCTGCCGCAGCTTGAACAGCCCTATGTGTTCATTAAGCGATCTGATGCCCTAAGCACCGACCACGGCCACAAGGTTGTGGAATTGGTTGCAGAATTAGATGGCATTCAGTTCGGTCGTAGCGGTATAACATTGGGAGTTCTCGTGCCACATGTGGGCGAAACCCCAATTGCGTACCGCAATGTTCTTCTTCGTAAGAACGGTAATAAGGGAGCCGGTGGTCATAGCTATGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACGAGCTTGGCACTGATCCCATTGAAGATTATGAACAACACTGGAACACTAAGCATGGCAGTGGTGCCCTTCGTGAACTCACCCGTGAGCTCAATGGAGGTGTAGTCACTCGCTATGTTGATAACAACTTCTGTGGCCCAGATGGGTATCCTCTTGAATGCATTAAGGACCTTCTCGCCCGTGCGGGTAAGTCTATGTGCACTCTTTCTGAACAACTTGATTACATCGAGTCGAAGAGAGGCATCTACTGCTGCCGTGAACATGAACATGAAATTGTTTGGTTCACTGAGCGCTCTGAAAAGAGCTACGAGCACCAAACGCCCTTCGAGATTAAGAGTGCCAAGAAATTTGACACTTTTAAAGGGGAATGCCCAAAGTTCGTATTTCCTCTTAACTCAAAAGTCAAAGTCATTCAACCACGTGTTGAAAAGAAAAAGACTGAAGGTTTCATGGGGCGTATTCGCTCTGTGTACCCTGTTGCTACTCCTCAAGAGTGTAACGACATGCATTTGTCTACTTTGATGAAATGTAATCATTGCGATGAAGTTTCATGGCAGACGTGCGACTTTCTAAAAGCCACTTGTGAACAATGTGGCACTGAAAATTTAGTTTGTGAAGGACCCACTACATGTGGATACCTACCTACTAATGCTGTAGTAAAAATGCCCTGTCCCGCTTGCCAAGACCCGGAAGTAGGGCCAGAGCATAGTGTTGCTGATTACCACAATCATTCAAACATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGACTAAGTGTTTTGGAGGTTGTGTGTTTTCCTACGTTGGCTGCTATAACAAGCGAGCCTACTGGGTTCCTCGTGCTAGTGCTAGTATTGGTGCGAACCATACTGGCATTACTGGTGAAAATGTTGAGACTCTTAATGAGGATCTTCTGGAGATACTGAATCGCGAACGTGTTAACATTAACATTGTTGGTGATTTTCAGTTTAACGAGGAGATTGCCATTATTTTGGCATCTTTTTCAGCTTCTGCTAGCGCTTTCATCGAGACTGTAAAGGGTCTTGATTACAAGGCTTTTAAAACCATTGTTGAATCCTGCGGTAACTATAAAGTTACTAAAGGCAAGCCCATAATAGGAGCTTGGAACATTGGACAACAGAAATCGATTTTAACACCACTGTGCGGTTTCCCGTCACAGGCTGCTGGTGTTATTAGATCAATTTTCTCTCGCTCACTCAATGCAGCAAATCATTCGATTCCTGATCTTCAAAGAGCAGCTGTTACCATCCTGGATGGTATTTCTGAACAATCATTGCGTCTTGTTGACGCCATGGTTTACACTTCAGACCTGTTCACCAACAGTGTTGTCATTATGGCGTATGTGACTGGTGGTCTCGTACAACAAACGATGCAGTGGTTATCTAACATGTTAGGCACTGCTGTTGACAAGCTAAAACCTGTGTTTACATGGGTTGATGCCAAACTTGGTGCAGGAATTGAGTTTCTTAGGGAGGCCTGGGAAATTCTTAAATTCTTGGTTACAGGAGTGTTTGACATCGTTAAGGGTCAAATACAGGTGGCTACAGATAACATCAAGGAATGTGTAAAAACTTTTCTTGGTGTTGTTAATAAAGCACTTGAAATGTGCTTAGACCAGATCACGATTGCTGGTACTAAGTTGAGAACCCTCAACTTAGGTGAGGTCTTCATTGCGCAAAGCAGAGGACTCTACCGCCAGTGTATTCGTGGCAAAGAACAGCTGCAATTACTTATGCCTCTTAAGGCACCAAAAGAAGTCACCTTCCTTGAAGGAGATGCGCATGACACAGTACTAACCTCAGAAGAGGTTGTCCTTAAAAATGGTGAGCTCGAGGCATTGGAGACACCAATTGACAGTTTCACAAGTGGAGCTGTTGTTGGTACACCTGTTTGTATCAATGGCCTCATGCTCTTAGAGCTCGAGAATAAGGAACAGTATTGTGCCTTGTCCCCTGGCTTATTAGCAACAAACAATGTCTTTCGCCTAAAAGGAGGTGCGCCGGTTAAAGGTGTGACTTTTGGAGAGGACACTGTTTTAGAAGTTCAAGGCTACAAGAATGTGAAGATCACTTTTGAACTTGATGAGCGTGTAGATAAGGTGCTTAATGAGAAGTGCTCTGTCTATACTGTTGAGTCTGGTACGGAGGTTACTGAATTCGCGTGTGTTGTGGCGGAAGCTGTTGTAAAAACCTTACAACCAGTTTCTGATCTTCTTACCCCTATGGGTATTGACCTTGACGAGTGGAGTGTAGCTACATTTTACTTGTTCGATGACGCTGGTGAAGAAAAACTTTCATCACGCATGTATTGCTCCTTCTACCCCCCTGATGAGGAAGAAGATTGTGAAGAGTGTGAGGATGATGAAGAAATCTCAGAAGAAACCTGTGAACATGAATATGGCACAGAGGATGACTATAAAGGTCTTCCTCTTGAATTCGGTGCATCAACTGAAACACCACATGTTGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATTGGCTCGATGGTGCTACAGAAGCAGAACCTGAACCAGAACCTCTACCTGAAGAACCAGTCAACCAGTTCGTTGGTTATTTAAAGCTTACTGACAATGTCGCCATTAAGTGTGTTGACATCGTTAAGGAGGCACAAAGTGCTAAACCAACGGTGATTGTTAATGCTGCTAACATCCACTTGAAACATGGTGGTGGTGTAGCGGGTGCTCTAAATAAGGCCACTAATGGTGCTATGCAAAGTGAGAGTGATGAATACATTAGGCAAAATGGACCTCTTACAGTTGGAGGCTCATGTTTGCTTTCTGGACATAATCTTGCAGAGAAGTGTCTGCATGTTGTTGGACCAAACTTAAATGCCGGTGAGGATGTTCAACTCCTTAAAATGGCATATGAGAATTTCAATTCACAGGGTGTATTACTCGCACCTCTATTGTCAGCTGGCATATTTGGTGCTAAACCACTTCAGTCATTAAAAATGTGTGTTGAGATAGTTCGCACACAAGTTTATCTTGCAGTCAATGACAAGAGTCTTTATGATCAGATTATTCTAGATTATCTAGACAGTCTGAAACCTAAAGTGGAGTCCCCTAACAAGAGGGAAGAGCCAAAATTGGAGGAGCCTAAAGAGGTGCAGCCAGTTGTTGAGAAACCTGTTGATGTAAAACCTAAAATTAAGGCATGTATCGACGAGGTCACTACAACACTGGAGGAAACTAAGTTTCTTACCAACAAATTGCTTCTTTTTGCTGATATCAATGGTAAACTTTATCAAGATTCGCAGAATATGCTAAGAGGTGAAGACATGTCTTTCTTAGAAAAAGATGCACCATATATTGTTGGTGATGTCGTCACTAGTGGTGACATTACCTGTGTCATAATACCTGCTAAGAAGGCAGGTGGGACTACAGAAATGCTAGCAAGAGCATTAAAGAAAGTCCCAGTTGCTGAGTATATAACAACCTATCCTGGACAGGGATGTGCTGGTTATACACTTGAAGAAGCAAAGACTGCACTTAAAAAATGCAAATCTGCATTTTATGTTTTACCTTCAGAAACACCTAATGAAAAAGAAGAGGTTCTTGGCACAGTGTCATGGAATCTACGTGAAATGCTTGCTCATGCAGAGGAGACAAGAAAATTAATGCCTATTTGCCTGGATGTTAGAGCTATAATGACCACCATTCAGCGCAAGTACAAGGGTATTAAAGTTCAGGAAGGAATCGTGGATTATGGTGTCCGGTTCTTCTTCTACACTAGCAAGGAGCCTGTAGCTTCTATTATTACAAAGCTTAACGCTTTAAATCAGCCACTTGTTACTATGCCCATAGGTTATGTAACACATGGTCTTAATCTTGAAGAAGCTGCGCGTTGTATGCGCTCTCTCAAGGCACCTGCTGTAGTGTCAGTTTCTTCACCAGATGCTGTCACTGCATACAATGGTTACCTCACTTCATCTTCCAAGACACCTGAGGAGCATTTTGTGGAGACCATTTCTCTTGCGGGGTCGTATAGAGACTGGTCTTATTCAGGACAACGCACAGAGTTAGGTGTTGAATTTCTTAAGCGTGGGGATAAGATTGTCTACCACACCACAGAGAGCCCCGTCGAGTTTCATCTTGATGGTGAGGTTCTTCCACTTGATAAATTAAAGAGTCTTTTGTCTCTTCGCGAGGTTAAGACTATTAAGGTGTTTACAACCGTAGATAATACTAACCTCCACACGCATATTGTGGACATGTCTATGACTTATGGACAACAGTTCGGTCCTACTTATTTGGATGGTGCTGATGTCACTAAAATTAAGCCACATGTTAATCATGAAGGTAAGACATTTTTTGTACTACCTAGTGACGACACACTGCGTAGTGAAGCTTTTGAATACTACCATACTATCGATGAGAGTTTTCTTGGTAGATATATGTCAGCATT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| 37,911
|
OK017802.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
HB2020E
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,544
|
GenBank
| 1
|
China: Hubei
|
China
|
Rhinolophus
| null |
2020-07
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate HB2020E, complete genome
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| 37,912
|
OK017803.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
HN2021A
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,601
|
GenBank
| 1
|
China: Hunan
|
China
|
Rhinolophus pusillus
| null |
2021-02
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate HN2021A, complete genome
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GCCATAGTCATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACAAGCTGCTGCAGTTGTCTCAAGGGCTGCTGCTCTTGTGGATCTTGCTGTAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCTGTGCTCAAAGGAGTCAAATTACATTACACATAAACGAACTTATGGATTTGTTTATGAGAATTTTCACACTTGGAACTGTAACGCTCAAACAAGGTGAAATTAAGGATGCTACTCCTTCAGATTCTATTCGCGCTACTGCAACAATACCGATACAAGCCACACTCCCTTTCGGATGGCTTGTTGTTGGCGTTGCAATTCTTGCTGTTTTTCAAAGCGCTTCAAAAATAATTACACTCAAAAAGAGATGGCAGTTAGCCCTCTCTAAAGGTGTTCACTTTGTTTGCAACTTGCTTTTGCTGTTTCTAACAGTTTATTCACACCTACTGCTTGTTGCTGGTGGCTTAGAAGCCACTTTTCTTTTCCTTTATGCATTAGCTTATTGCTTGCAAACTGTGAATTTTGTGAGAATAATAATGCGATTCTGGTTGTGCTGGAAATGCCGTTCCAAGAATCCTTTACTTTATGATGCCAACTATTTTTTGTGCTGGCATACTAATTGTTATGACTATTGTATACCATACAATAGTGTAACTTCTTCAATCGTCATCACATGTGGTGACGGTACTACGAATCCCATTTCCGAGGATGACTACCAAATTGGTGGTTACACGGAAAAGTGGGAGTCTGGTGTTAAAGACTGTGTTGTATTACATAGTTATTTTACCTCAGACTATTACCAGCTGTACTCAACACAACTGAGCACAGACACTGGTGTTGAACATGTTACTTTCTTCATCTACAATAAAATTGTTGATGAACCTGAAGAACATGTCCAAATTCACACAATCGACGGTACATCCGGAGTTGTTAATCCAGCAATGGAACCAATTTATGATGAACCGACGACGACTACTAGCGTGCCTTTGTAAGCACAAGCTGATGAGTACGAACTTATGTACTCATTCGTTTCGGAAGAGACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGTACTTCTTTTTCTTGCTTTTGTGGTATTCTTGCTAGTCACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCGATTGTGTGCGTACTGCTGCAATATTGTTAACGTGAGTCTTGTAAAACCTTCTTTTTACGTTTACTCTCGTGTTAAAAATCTGAATTCTTCTAGAGTTCCTGATCTTCTGGTCTAAACGAACTAAATATTATATTAGTCTTTCTGTTTGGAACTTTAATTTTAGCCATGTCAGGTGACAACGGTACTATCACCGTTGAAGAGCTTAAAAAGCTCTTAGAACAATGGAACCTAGTAATAGGGTTCTTGTTTCTTACATGGATTTGTCTTTTACAATTTGCCTATGCCAATAGGAATAGGTTTTTGTATATAATTAAGTTAATTTTCCTCTGGCTGCTTTGGCCAGTAACTTTAGCTTGCTTTGTGCTTGCTGCTGTTTACAGAATAAATTGGATCACTGGTGGAATTGCCATTGCAATGGCCTGTCTTGTAGGCTTGATGTGGCTTAGCTACTTCATTGCTTCTTTCAGGCTGTTTGCTCGTACGCGTTCCATGTGGTCATTCAATCCAGAAACTAACATTCTTTTGAACGTGCCTCTCCATGGCACAATTCTGACCAGACCGCTTCTAGAGAGTGAACTCGTAATTGGAGCTGTGATCCTTCGTGGACATCTTCGTATTGCAGGACACCATCTAGGACGCTGTGACATCAAGGACCTGCCCAAAGAAATCACTGTAGCTACATCACGAACGCTTTCTTATTACAAATTGGGAGCTTCACAGCGTGTAGCAGGTGATTCAGGTTTTGCTGCGTACAGTCGCTACAGGATTGGAAACTATAAATTAAACACAGATCATTCCAGTAGCAGTGACAATATTGCTTTGCTTGTACAGTAAGTGACAACAGATGTTTCATCTCGTTGACTTTCAGGTTACTATAGCAGAGATATTATTAATTATTATGAGGACTTTTAAAATTTCCATTTGGAACCTTGATTATATCATAAATCTCATAATTAAAAATTTATCTAAGCCTCTAACTGAGAATAAATATTCTCAATTAGATGAAGAGCAACCAATGGAGATTGATTAAACGAACATGAAAATTATTTTCTTCTTGGTACTGATAACACTTGTTACTAGCGAGCTTTACCACTACCAAGAGTGTATTAGAGGTACAACTGTACTCTTAAAAGAACCTTGCTCTTCAGGAACATATGAAGGCAATTCACCATTTCATCCTCTAGCTGATAATAAATTCGCACTGACTTGCTTTAGCACTCAATTTGCTTTTGCTTGTCCTGACGGTGTTAAACACACCTATCAGTTACGTGCGAGATCAGTTTCACCCAAACTGTTCATCAGACAAGAGGAAGTTCAAGAACTTTACTCACCTGTTTTTCTTATTGTTGCGGCAATAGTGTTTATAATACTTTGCTTCACATTCAAGAGAAAAATAGAATGAGTGAACTTTCATTAATTGACTTCTATTTGTGCTTTTTAGCCTTTCTGCTATTCCTTGTTTTAATTATGCTCATTATCTTTTGGTTCTCATTAGAACTGCAAGATCATAATGAAACTTGCCACGCCTAAACGAACATGAAATTTCTTGTTTTCTTAGGAATTCTTACAACAGTAACTGCACTCCATCAGGAATGTAGCTTACAGTCATGTGCTCAACATCAACCCTATGTAGTTGATGATCCTTGTCCAATTCACTTCTACTCGCGATGGTACATCAGAGTAGGAGCTAGAAAATCAGCACCTTTGATTGAATTGTGTGTTGAAGAGGTAGGCTCTAAGTCACCTATTCAATACATTGACATTGGTAATTACACAGTTTCCTGTTCTCCTTTTACAATTAATTGCCAGGAACCTAAATTAGGTAGTCTCGTAGTACGCTGTTCGTATTATGAAGACTTTCTAGAGTATCATGACATTCGTGTTGTCTTAGATTTCATCTAAACGAACAAATTAAAATGTCTGACAATGGACCCCAAAACCAGCGTAGTGCACCCCGCATTACATTTGGTGGACCCTCAGATTCAAGTGACAATAACCAGAATGGAGAACGCAATGGTGCACGACCTAAACAACGTCGACCTCAAGGCTTACCCAATAATACTGCATCTTGGTTCACCGCTCTCACTCAACATGGCAAGGAAAACCTTACGTTCCCTCGAGGGCAAGGTGTTCCAATTAACACCAATAGCTCTAAAGATGACCAAATTGGCTACTACCGTAGAGCTACCAGACGAATCCGTGGTGGTGACGGTAAAATGAAAGAGCTCAGCCCCAGATGGTATTTTTACTATCTAGGAACTGGACCAGAAGCTGGACTTCCCTATGGTGCTAACAAAGAAGGCATCATATGGGTTGCAACTGAGGGAGCCTTAAACACACCGAAAGACCACATTGGCACCCGCAATCCTGCTAACAATGCTGCAATCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGGAGCAGAGGCGGCAGTCAAGCTTCTTCGCGCTCCTCATCACGTAGTCGCAATAATTCAAGAAACTCAACTCCAGGCAGCAGTAGGGGAACTTCTCCTGCTAGAATGGCTGGCAATGGTGGTGACACTGCTCTTGCTTTGCTGCTGCTTGATAGGTTGAACCAGCTTGAGAGCAAAGTATCTGGTAAAGGCCAACAACAACAGGGCCAAACTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCATCTAAAAAGCCTCGCCAAAAACGTACTGCTACAAAACAGTACAACGTCACCCAAGCATTTGGGAGACGTGGTCCAGAACAAACCCAAGGAAATTTCGGGGACCAAGAATTAATCAGACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCTCCAAGTGCCTCTGCATTCTTCGGAATGTCACGCATTGGCATGGAAGTCACACCTTCGGGAACATGGCTGACTTATCATGGAGCCATTAAATTGGATGACAAAGATCCACAATTCAAAGACAACGTCATACTGCTGAATAAGCACATTGACGCATACAAAACATTCCCACCAACAGAGCCTAAAAAGGACAAAAAGAAAAAGGCTGATGAAGTTCAGGCTTTACCGCAGAGACAGAAGAAGCAACAAACTGTGACTCTTCTTCCTGCTGCAGATTTGGATGAATTCTCCAAACAGTTGCAACAATCCATGAGTGATGCTGATTCAACCCAGGCTTAAACTCATGCGGACCACACAAGGCAGATGGGCTATATAAACGTTTTCGCTTTCCGTTTACGATATATAGTCTACTCTTGTGCAGAATGAATTCTCGTAACTACATAGCACAAGTAGATGTAGTTAACTTTAATTTCACATAGCAATCTTTAATCAATGTGTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGTGAATAATGCTAGGTAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCA
| 37,913
|
OK017804.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
HN2021B
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,592
|
GenBank
| 1
|
China: Hunan
|
China
|
Rhinolophus pusillus
| null |
2021-02
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate HN2021B, complete genome
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ATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACAAGCTGCTGCAGTTGTCTCAAGGGCTGCTGCTCTTGTGGATCTTGCTGTAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCTGTGCTCAAAGGAGTCAAATTACATTACACATAAACGAACTTATGGATTTGTTTATGAGAATTTTCACACTTGGAACTGTAACGCTCAAACAAGGTGAAATTAAGGATGCTACTCCTTCAGATTCTATTCGCGCTACTGCAACAATACCGATACAAGCCACACTCCCTTTCGGATGGCTTGTTGTTGGCGTTGCAATTCTTGCTGTTTTTCAAAGCGCTTCAAAAATAATTACACTCAAAAAGAGATGGCAGTTAGCCCTCTCTAAAGGTGTTCACTTTGTTTGCAACTTGCTTTTGCTGTTTCTAACAGTTTATTCACACCTACTGCTTGTTGCTGGTGGCTTAGAAGCCACTTTTCTTTTCCTTTATGCATTAGCTTATTGCTTGCAAACTGTGAATTTTGTGAGAATAATAATGCGATTCTGGTTGTGCTGGAAATGCCGTTCCAAGAATCCTTTACTTTATGATGCCAACTATTTTTTGTGCTGGCATACTAATTGTTATGACTATTGTATACCATACAATAGTGTAACTTCTTCAATCGTCATCACATGTGGTGACGGTACTACGAATCCCATTTCCGAGGATGACTACCAAATTGGTGGTTACACGGAAAAGTGGGAGTCTGGTGTTAAAGACTGTGTTGTATTACATAGTTATTTTACCTCAGACTATTACCAGCTGTACTCAACACAACTGAGCACAGACACTGGTGTTGAACATGTTACTTTCTTCATCTACAATAAAATTGTTGATGAACCTGAAGAACATGTCCAAATTCACACAATCGACGGTACATCCGGAGTTGTTAATCCAGCAATGGAACCAATTTATGATGAACCGACGACGACTACTAGCGTGCCTTTGTAAGCACAAGCTGATGAGTACGAACTTATGTACTCATTCGTTTCGGAAGAGACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGTACTTCTTTTTCTTGCTTTTGTGGTATTCTTGCTAGTCACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCGATTGTGTGCGTACTGCTGCAATATTGTTAACGTGAGTCTTGTAAAACCTTCTTTTTACGTTTACTCTCGTGTTAAAAATCTGAATTCTTCTAGAGTTCCTGATCTTCTGGTCTAAACGAACTAAATATTATATTAGTCTTTCTGTTTGGAACTTTAATTTTAGCCATGTCAGGTGACAACGGTACTATCACCGTTGAAGAGCTTAAAAAGCTCTTAGAACAATGGAACCTAGTAATAGGGTTCTTGTTTCTTACATGGATTTGTCTTTTACAATTTGCCTATGCCAATAGGAATAGGTTTTTGTATATAATTAAGTTAATTTTCCTCTGGCTGCTTTGGCCAGTAACTTTAGCTTGCTTTGTGCTTGCTGCTGTTTACAGAATAAATTGGATCACTGGTGGAATTGCCATTGCAATGGCCTGTCTTGTAGGCTTGATGTGGCTTAGCTACTTCATTGCTTCTTTCAGGCTGTTTGCTCGTACGCGTTCCATGTGGTCATTCAATCCAGAAACTAACATTCTTTTGAACGTGCCTCTCCATGGCACAATTCTGACCAGACCGCTTCTAGAGAGTGAACTCGTAATTGGAGCTGTGATCCTTCGTGGACATCTTCGTATTGCAGGACACCATCTAGGACGCTGTGACATCAAGGACCTGCCCAAAGAAATCACTGTAGCTACATCACGAACGCTTTCTTATTACAAATTGGGAGCTTCACAGCGTGTAGCAGGTGATTCAGGTTTTGCTGCGTACAGTCGCTACAGGATTGGAAACTATAAATTAAACACAGATCATTCCAGTAGCAGTGACAATATTGCTTTGCTTGTACAGTAAGTGACAACAGATGTTTCATCTCGTTGACTTTCAGGTTACTATAGCAGAGATATTATTAATTATTATGAGGACTTTTAAAATTTCCATTTGGAACCTTGATTATATCATAAATCTCATAATTAAAAATTTATCTAAGCCTCTAACTGAGAATAAATATTCTCAATTAGATGAAGAGCAACCAATGGAGATTGATTAAACGAACATGAAAATTATTTTCTTCTTGGTACTGATAACACTTGTTACTAGCGAGCTTTACCACTACCAAGAGTGTATTAGAGGTACAACTGTACTCTTAAAAGAACCTTGCTCTTCAGGAACATATGAAGGCAATTCACCATTTCATCCTCTAGCTGATAATAAATTCGCACTGACTTGCTTTAGCACTCAATTTGCTTTTGCTTGTCCTGACGGTGTTAAACACACCTATCAGTTACGTGCGAGATCAGTTTCACCCAAACTGTTCATCAGACAAGAGGAAGTTCAAGAACTTTACTCACCTGTTTTTCTTATTGTTGCGGCAATAGTGTTTATAATACTTTGCTTCACATTCAAGAGAAAAATAGAATGAGTGAACTTTCATTAATTGACTTCTATTTGTGCTTTTTAGCCTTTCTGCTATTCCTTGTTTTAATTATGCTCATTATCTTTTGGTTCTCATTAGAACTGCAAGATCATAATGAAACTTGCCACGCCTAAACGAACATGAAATTTCTTGTTTTCTTAGGAATTCTTACAACAGTAACTGCACTCCATCAGGAATGTAGCTTACAGTCATGTGCTCAACATCAACCCTATGTAGTTGATGATCCTTGTCCAATTCACTTCTACTCGCGATGGTACATCAGAGTAGGAGCTAGAAAATCAGCACCTTTGATTGAATTGTGTGTTGAAGAGGTAGGCTCTAAGTCACCTATTCAATACATTGACATTGGTAATTACACAGTTTCCTGTTCTCCTTTTACAATTAATTGCCAGGAACCTAAATTAGGTAGTCTCGTAGTACGCTGTTCGTATTATGAAGACTTTCTAGAGTATCATGACATTCGTGTTGTCTTAGATTTCATCTAAACGAACAAATTAAAATGTCTGACAATGGACCCCAAAACCAGCGTAGTGCACCCCGCATTACATTTGGTGGACCCTCAGATTCAAGTGACAATAACCAGAATGGAGAACGCAATGGTGCACGACCTAAACAACGTCGACCTCAAGGCTTACCCAATAATACTGCATCTTGGTTCACCGCTCTCACTCAACATGGCAAGGAAAACCTTACGTTCCCTCGAGGGCAAGGTGTTCCAATTAACACCAATAGCTCTAAAGATGACCAAATTGGCTACTACCGTAGAGCTACCAGACGAATCCGTGGTGGTGACGGTAAAATGAAAGAGCTCAGCCCCAGATGGTATTTTTACTATCTAGGAACTGGACCAGAAGCTGGACTTCCCTATGGTGCTAACAAAGAAGGCATCATATGGGTTGCAACTGAGGGAGCCTTAAACACACCGAAAGACCACATTGGCACCCGCAATCCTGCTAACAATGCTGCAATCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGGAGCAGAGGCGGCAGTCAAGCTTCTTCGCGCTCCTCATCACGTAGTCGCAATAATTCAAGAAACTCAACTCCAGGCAGCAGTAGGGGAACTTCTCCTGCTAGAATGGCTGGCAATGGTGGTGACACTGCTCTTGCTTTGCTGCTGCTTGATAGGTTGAACCAGCTTGAGAGCAAAGTATCTGGTAAAGGCCAACAACAACAGGGCCAAACTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCATCTAAAAAGCCTCGCCAAAAACGTACTGCTACAAAACAGTACAACGTCACCCAAGCATTTGGGAGACGTGGTCCAGAACAAACCCAAGGAAATTTCGGGGACCAAGAATTAATCAGACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCTCCAAGTGCCTCTGCATTCTTCGGAATGTCACGCATTGGCATGGAAGTCACACCTTCGGGAACATGGCTGACTTATCATGGAGCCATTAAATTGGATGACAAAGATCCACAATTCAAAGACAACGTCATACTGCTGAATAAGCACATTGACGCATACAAAACATTCCCACCAACAGAGCCTAAAAAGGACAAAAAGAAAAAGGCTGATGAAGTTCAGGCTTTACCGCAGAGACAGAAGAAGCAACAAACTGTGACTCTTCTTCCTGCTGCAGATTTGGATGAATTCTCCAAACAGTTGCAACAATCCATGAGTGATGCTGATTCAACCCAGGCTTAAACTCATGCGGACCACACAAGGCAGATGGGCTATATAAACGTTTTCGCTTTCCGTTTACGATATATAGTCTACTCTTGTGCAGAATGAATTCTCGTAACTACATAGCACAAGTAGATGTAGTTAACTTTAATTTCACATAGCAATCTTTAATCAATGTGTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGTGAATAATGCTAGGTAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCA
| 37,914
|
OK017805.1
|
Sarbecovirus sp.
|
Wu,Z., Han,Y., Wang,Y., Liu,B., Zhao,L., Zhang,J., Su,H., Zhao,W., Liu,L., Bai,S., Dong,J., Sun,L., Zhu,Y., Zhou,S., Song,Y., Sui,H., Yang,J., Wang,J., Zhang,S., Qian,Z., Jin,Q.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2021-09-22
|
HN2021G
|
Sarbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,571
|
GenBank
| 1
|
China: Hunan
|
China
|
Rhinolophus pusillus
| null |
2021-03
| null | null |
Sarbecovirus sp. isolate HN2021G, complete genome
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| 37,915
|
NC_003785.2
|
Satsuma dwarf virus
|
Iwanami,T., Kondo,Y., Karasev,A.V.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1999-04-06
|
S-58
|
Sadwavirus citri
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,794
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Satsuma dwarf virus RNA 1, complete sequence
|
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| 8,761
|
NC_003786.2
|
Satsuma dwarf virus
|
Iwanami,T., Kondo,Y., Karasev,A.V.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1999-04-06
|
S-58
|
Sadwavirus citri
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,344
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Satsuma dwarf virus RNA 2, complete sequence
|
TTGATTCAAGCGAAGTGGAAGCCCCACACAAAAATCATTCTGTTGTACTCTCTCTCTCTTTCACTGAGTCACATTTACTTTTGATGATGACTTCTTCTTCACTTTTTCTTTCGATGTTCGGGATAGCGCCCGTTCACCACTGATACTAGGGATAGCGCCCTAGTTTCGATTGCTGGGATAGCGCCCAGTTTCTTTTGTTAATATTTCGATATTTTCATTTTGTAATTTCGATTACTTTTCTTTTATATAAAAACCAAAAAGATTTTCCTATTTCTTTGATTTCTTTTTTGTTTATTTCTTTATGGAGATCTACGGATTCTCCCCCCTCTCCTTCCAGGACACCGAGTCCTGGAAGAACTCTGCTTTCGCAGCCTGCCGCGGCTGCAAGACCTACCCCATCGAGGAGGTAGGTACTGACGGATCCGTGAGGATCCGGGAGCTCCCGGTGGGGCTCGTACTAAAGGGCGTCATGGCCCAATATCGGTCCATTTTATGGACCCAATTTGTGGCGGATCCCGCCACTACCACCGTGGACCGGAAGTCCTTTGACTTCTGGCTCTTTTGCCGCCGTGCTGAGGCGGCCCAGGAACGAGCCTTTAGGGCTCGTCAGTCCAAGCGAGCCGCCAAGGCCGCTGCCCTCGATGCTGAGGGCTTAATTGATCGCTCCTACAAGGGGCGAACTTACAAGGTCTCTGTGCGGGGCCTTTCGTGGAAATCTGTGCGGGCTGCACAGAAGGCTGCCAGGAAGGCAGCCAAAAATTTTGGATTCACCATTTCGGAGAATCCCTTCTCGGCACTCCCATCTGAAGGGAGATCTGCCTTTTCTGCGGGTGAAACTCCCGCTCCTCCTGCCTGCGCGCTCCCCAATATTTGTTGGGCGGCTCGCAGGGCTTCCGCGAAGTCCGCCTCTCCTGCGGACGTAGAGAGTTTGCCCTTTTTGGGCTTACTCCCGGAGTCTCCCCGCCTCCGAAATGAGGGGTTGCTCTCTTTATTGAGAGCTAAGTTGGCCGACTTCAAGGCTGCGCGGGCACCGTTAGTGCCCATAGCTAAGAGGGTCGTCAAGACCCCTTCCGAAGACTCCATCTGGGAGTCTGTGGAGAAGAACGCCCCGATTGTCGGGTGCGTTATAAATGGTATGGTTGGGATTCCCAAAAACCCAATCATTCAGCGTCTTCTCCCTGAGCGCAAATATATTGCGCGCAAATGCGTCCGGGCTTTTGTTCCTCAAGTGATGTGTTCGTCAAGACACAAACATGACTTTGCCCAGTTGCGGAATCCTGATAAGTGGATTGTTTTCCCATCTGTGATTAGGATTTCCACTGTGGACGCTTACGCCACAGCCAGGCGCCTTGGGCTTATAAACGACTGCTCTTCGGCTCTCGAGCGAGTCAAGGCATTTTCCTCTCACCATCTAGACTTAGAGAAGGAAGTGTCTCGCCTCGAACGAGAAGCTTGCGCAGCCCCGCGGAAAACGATAGTGGCTAGGGTGTTCAAATTCTTCTTTGAAGAATATGCTCTAGCATACGATGAAGTCGTGGAAAGGCTTAGGGCTGCTAAAGAGGATAGGCGCAGGGAACATTTGGCTTTCCTGCGCAATATTAAGCGCCAGGCTCACGAGCTTGAATTGAAGGAACGCCAATCTTTTTTGGTGGCTATTGAAGAAGCTCGTATTAAGTCCCTTGAGCTCAAGGCTAAAATTGAAGAGGGTCCTCCCCCTCAAATTTTATATACCCCAGAGTGGCATGTTGTTCAGCGAGCAAAAGCTTATGCTGATGTTACAATGTCGCCCAGCGAAAGGGATATAGCGCATTTGGCTTATGAAAATAAGTACGTCAATGCTCGTGCGTATCCAAATACGGATGTCGCTGCGAAATTTAGAGCACGTTGTGATGCGCATTTTGAAAGGATTTTCGGATATGCTGTGCACCGAGGCACAAGAACCGAAACGTTGACTCAGGTTGCTGAGTCTCCTCCACCAATTATCACTGCGCCTGTTGGGCAAAGGGTTGGAGGAAATCCGCCAACAGAAACACCGGGAGCTGCTGCCGTGCGTGCTGCAATGCGACGTGCGGTTGAGCGCAATCGACCTGGGCCTGGAGAGTCATCGGCTATGCCAGCTCGGGAGCCCCTCTTGTCTCATAGAGGGCAATATTATGCACGCTCCCTTTCGGATAGATATAACAATATCTGCTCGCGCAACAATGCCTATGATTTAATGCGCGAGACTGACGTGCCCATTATGGAGTTTACGTTTGGGCAGCAGCAAGATATTGCTATTCCTCTATCCTCCCGATTCGGAAATCATCAATCTTTGCACGTTGGTGAACTGGAAATTGCCGTACAATCCTCGGTTTTGACCGGAGTTGATACGGCGATGGCTATAATGGTTTCCGACGCCTCCCATGATCGTCTTGAAGAGGGATTTTTAAGTCTAACTATTTTAAGATTGGGAGCCGGGTGGATGCGCCACACTATCCCCATAGGAATTACAGTTTTCCCAACTGACCCATTAGTCGATAGATTTCTGCGATTATCAGTTTTGACTGGTGGGTCACCTATGGCGGATGGTAGGCAAGTGGCCAGATTACACTATGGATTACTTGGCCAAGCCTATACAGGCGCTGGCGAGCAGCGATTAACGCAATATGCCACCAGAAGGATAAATGTGCGCCAAACGCACGTTACTCAGTTTCTGGAGGGCAACCATATCCATATTGCTCGCTCCGAGGATAGACAACAGCCACTCCCTCATATGAGTTTGGAGTTTAGGCCTCTATCCGGAAGCACCAGGTATGTTGCACGACCTGGAGGATATCAAGCTATTGAAAGTGGCAGGCAGAGTGTGGATATCACGCAAAATTTTATTCGCATGCCTACGCACTTAACGCGAAGTGCAACGGATCGGGAGGAAACTCCGGCACCCAACAATCCAAATGAGCAGAATGTTGGCAGAAGCGAGATCAACGCTGAAATCCCGACAAATTCTGCCGAGGAGGAGGAAAGGCGTCGGAGGACGCCGCATGGATCTGCTATTCATCGGGGTTATACAGAGTTCTCCGAACGTAACGAAAATCTCATTGAACATCTTTACGTTCCGTCTATGCATGGTCTATCTCTCAAGGAAGATATACATCTTTTCACTAAGAACCTGGAGATACCGAGTACTGCCGACTTCTGTAAGGAATTGGCAAGATACTCGGGTTTAACAGAGGCTATGAGTTATAGGGGTGCAAGCTACTATTCACGGCTCTTGTCCGGGGTTGCTATATTGCGTCCCCATTTCAAGTTTACTTTTAGACTTGTGACCCCTATCCTTGAATCCATACCCCTTTTTGTTGTCTGGGATGATTTGGGCCAATTAAACACTAAGGTCTCCTTATTATCTTCTGCTTTTCAGGTGATCGATTCCGATCATACGAGGGCAGCAGTGTATGAGGTTAGACCTTCTGGGCCAACTGATCTCCTTACCCCTTCGAAAGCCAACTATGGGGTTGGAGGAGATCTAGTTATCTTCTCAGGGGGTTATGGTTCCCTCTCCCTCTCCTCACCTTTGCGCCTCAAAATTGAAGCGTGTCTTCTTAAAGACACGAGTCTTGGATCTGGTGAGATTGCTCTACCCCAAGGTCCATCTTCTATGCTCTCATTTCATTATTTGAATGAGGTGGATCTTGGTGATGTGAATATGCACATATTTTTAGGTAGTTGTAAGTATAAATCCTCTTCTACCGTTGGTGGTAGAAAGTACATATCTGTGTGTCCAGCAGCGGGTCTTGTACATAAGGGTGGGAAAGCTGCTTATTTAGGTTTAGGAGCTTCCCTTTTTTCCTTATATAATTTTTGGAAGGGGAGCTATGTTCTCAAGGTTGACGTTCTGTCGAAGGGTAGTTGCGCTGGTGCGATATCAATTTACATTCCGCCACCAGGCTCAAGCGCTGATCACTACTCTCAATCGCAACTGGACACTCTTCCCAGGTATGAGTTGCCCTGGAGAGGTTCGGGATCCGCCAGATTCGAAGTCGAAAATTTTTCTTGGATTGGTTGGCATCTGACAAAACCGCAGCGATATATAACCAATGAGGACTGGTTTTCGCTGAATGCCGGTTTGTTGGTTGTTCTTAATCAACCACCTACAACTAGAACTGGCGGTTCTAGTGATATAAGAGTGATATTCCGAATTGTTAAATTTAAAAATCTCACTCTTAAAGAACGTTCAACAACCTGCGATATATTTGCAGGTATTAAAGACTCGGAGTATACAGATCCTTTAGTGGACGTGCTAGATGAAAACATCACGGCACCATCCGCTTCTTCATTGACGACGGTCCAAGATCCAGACCTTGGACTGGAAACTACTTCGAGCGCCCAGACTTCTGGACTGACCACCACGCGTAGTTTTGGAGCGTATTACGCTTATCTTCTTGGTGGCGAAAGTGCTGGAAATAGGTGGCACTCTTATGTGTTGCCTATTACTATGGGACACCACAGGGAGATGATAGGAGCATCTAAGACTGGATATTTAAATACTCAGCTTGATGAGACCATACGGATTCGCTATTCTTTGCGGAATCCGTTACATATTTTGTGCTCAGCTGGAGCGTATTATGCGGTTGACCTCCTATTTACTCTTGTTGTGGACGGTGATCATGGAGCCGAACGTGCCTACACTCAACTGGGTTTAATTCAAACGCCACTCATGGAATATTTTGATGGATATTCTGCGAGTAGAAATCTCTCTTCAGAAGGGGGGTATTCGAACCAATTGGGTGTGGGAAAATCTTACGTTCAGTTGATTGTCCCACGAAGGAACTACAGAGCTAGATCTATCACGACTAATACTGGTGCGCTCTTCTTTGAAACCATTGGATCGCTGACGGTTAAATTCGCTGTTAGCGCTAAGATCAAGGGAGTACATCTGTACGTTGAGCCTGTAGGACCTATCGATGTTGATGGGTATGGGCGGGGAGCGGACATATCTCTAACTAATGAGAATTTTGTCCTGA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| 8,762
|
MT344107.1
|
Satsuma dwarf virus
|
Yan,J., Zhang,S., Wu,J., Yang,F., Zhou,Y., Zhou,C., Cao,M.
|
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, National Center for Citrus Virus Exclusion
|
China
|
2020-12-16
|
EH1
|
Sadwavirus citri
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,726
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Citrus
| null |
2018
| null | null |
Satsuma dwarf virus isolate EH1 segment RNA1, complete sequence
|
AAATTTTCAATTTCACTCTCTCTCTCTTTTAAATTTTAAAAGATTTGAAATTCTGATTTCATGTCTATTCTTTCAGTTCACTTTATGATGTGTAGGATAGCGCCTACACTACGAAACTAGGGATAGCGCCCTAGCTCCGATACTGAGGATAGCGCCTCAGCTTGTTTTAAATTTGCACACATATTTCGATTTGTGTTTTATAATTTCGATTATTTTAATATCAAAAACCAAAAAGATTTTACCATTTCTTTCATTTCTTTTTGTTTTAATTCCTTATTTTAATGGAGATCTACGGATTCTCCCCACTCTCCTTCCAGGACACCGAGTCTTGGAAGAATTCTGCGTTCGCAGCCTGCCGAGGCTGCAGGACCTACCCCGTCGAGGAGGTAGGCGCTGATGGGTCCATTGTGACCCGTGAGGTCCCGGTGGGCCTCGTGCTGAAGGGCGTAATGGCCCAATATCGGTCCCTTTTGTGGACCCAATTTGTGGCGGATGCCGCCACCACTACCAGAGACCGGGAGTCTTTCGACTTCTGGCTTTTTTGCCGCCGTGCTGAGGCGGCACAGGAACGGGCCTTTTTGGCCCGGAAGACCAAGCGCGCCGCGAAGGCCGCCGCCCTCGATGCTGAGGGCATCATCGACCGCACCTATAAGGGGCGGTCCTACAAGGTCTCTACTAGAGGCTTTTCGTGGAAATCTGTGCGTGCAGCACAGAAGGCTGCCAAGAGAGCAGCCAAAAATTACGGGTTCTCCGTCTCGGTGAACCCTTTTTCTGCTCTCCCATCTGAAGGGAAAGCAGTCGCTGCAGGTGAAACTCCTGCTTCTAGTGTTGAGGTGGCTCCTCAATGCTACTGGGCTGCTCTTCGCAGCCTTAAAAGGGAGTTTTCCGAAACTCCTATTGAGGACCTCCCTTTTCTTGGGTTGGTCCAGCCCGTCCTGCCCCAGCGAAATGGGGATTTAGCGCGCAAGCTACGCGCTACTCTTAGGGCAGCGCAAGCTGCCCGCATTGCTGCTAGTTTCCCCTCCCAGCATGGGGATTCTAGACTTGAAAAGGCCACTTCTGTGGTCTTCACTCCAACCTTCCGTACCCCCGGATGCGAATTCAAGGGCGTCTTTATCAAGCCCAAAAACCCAATTATACAGGGTATGATGAGAAGGTATCTTATTCCTGGGAAGCCAACGTTTCAGAAATTAAACTATATCGCTCTTTCGGCTGGTCCTGAATGTGCACCTCCTATTGGAACCCCCCATCTAGATTTAGGGTTCCTGTCGAAGGTGTCGGATTTAGCGACATCACCAGGTGATAGTATGGACAAACTCATTGCTATCAAGTGTATTCTCCATCAAGAGTATGCATATGACGTCCATACCGATATGGGGGATGTTTTATTGTCCTTAAATTCCAAATTTATAGGAAGGGAAAATGAAGCATCCGAGCGAGGCTTTATTAGCGGAGCTCTGTATGGTGCTGGTGTATGTGTAGTCACCAGTGCCTGGAAATTTTTGGATAAAGCCTTACATGCTAGTCAAATAGGTGCTCAACTATCCAGTATATTGGAATATATCCAAGCTGGACTCGCGTGGCTAGCAAGTACGTATAGTATTATAGCTAACTTTTTTACACGTGCTAAAGATTATATTTTAGAATGTTTAGAGTTAGTCAAAAGTAAGCTCCCTTCCTACCTCTTCAATGAGGAAGTGGGGCGATACATGCTCTTGTTATTAGGAGTCTTTTTATGCTTGGGGCTTGTAAATAGTATTGTCTATACAGTTGCTCCAAAGTATGCTCTATCTTTTGGCACTGTGTGTAAATTAGCTTTGGGTGCCTTAGCTGTTGTAGGGTTAGGCGACATCACCGCCTATCTCTTTAATTCTTCGGGGACTAAATTACGAGCTTTTGTGAATATCATCTGCAATCTGTGCGGATGTAAGAACTTTTATAGTCCTTCTAGTGATGCAGAGGAAAGATCAGGTTTCTCTGTCTTGTCTTTAGTTGGAGCCATTGTTGGTCTCCAATCGCTACTTCCCGCTAATCTGTGTAAATTTTCATGGGACTGTGGCAAATGGGCGCAAACCTTTAAATCCGGGTTTGATTGTCATGAAAAATTTGCTTCCGTCTGTGAGCAGTTATCTGTCTGGTTACTTTCTAAAGTAGGGCTCTTTAAATCTAGTGAGAGCCAATCAATTCAGACGATACTGTTATCTTCGGGGGTAAATACCGCCAAATGGATGGAAGATGTAGCTCAGCTACATCTCGACGTGCACCAGTCAACGATATGCGTTCCTGATCTACTCGAACGTGCACGAAAACTTTTAGATACTGGGGACTCCTTAAGTAAACTTCTACAAAATTCTACTGTGTCCCTGAGTTTCTTGCTCCGCGAGCGTATTAAGCTAGCATATAAGAACTTGAGAGAGGATCATACACAACTGCAGTTGGCAGTTGATGTATCCACGAAAACCTCTTGTCCTTTCGTGCTTTTCTTTGCCGGAGATTCTGGGGTAGGCAAATCGACTGCAATGTCCAAATTTAGGGAAGATGTCCTAGACGATTTGGGCTACCCCAAGGTTGCAAGATTCTTCTCTCGAAATCCTGGAGAGAAGCATTGGGCAGGGTACTTGCGCCACACCGGTGTTATATATGACGATTTTGCGCAGGTGCCTCAGGCAGAAAATACGTACGATGAGTCGGAACTCATACGTATTGTCACTAATTCTATAGTCACTGTGCCTATGGCTATAGCTGAAGAGAAGGGGCGGACTTTCAGATCTAAATTTATCTTCGCATGTACTAATAGGTACTGCGAGAGTGAAGACGCCCCATTGGCCGATGTTATGGCCTTCCGACGACGGCGCCATTTATACATACATGTAAGTCGCAAGGCGGGCGTTGAACCAGGACCAACCGGAACGGATAACTTGTCGTTCTCTGAAATGGATAATAGACAATCTGATGGTGAACCCGCATATATACGTGTAAATGGCAAGAAGGAGTTGGTGAATCAGGATATGACTTATGCTCAATTGCGCCAACTCTATCTGGAAAGATACAGAGCTTTCGAGCTCTTGGAATCCCAACTCGAGGGTAGCGTTCCTCGAGCTGGAAAGCCGGACACCTCAAACTGTGATTCATGGTGGACCTTAATCGGCCATTCTCCCAACTTTGAGCCTGTCTGGTTCAACGGTACTCCCGTACGCGAGGAAGATCAACGAATTGATTTTTACAAAACTCGCTACGATATTTTAAGACTGCGCGCCATAATTGAAGAGATCGATTTCGCTGACATCGATTTCATTATCAAGAACTTCACATGTTGTGACAATGAAATTTTAAATGACGATCGTGAAGTTGAGGCAGTCGGCAAGAGACACTTGAATTCCATGTCAGAATTTACTCGAAAACTAGTGATTTCTTGCCTGAAAGAAAGAATTGCTGTCGAGGCGGAAAATTACACTATATTATCTAAATTCCGCTCGATGCTCACGATCCCAATTGATACTTGGAAAAAATCGCCTACTTGGTTTAAATGTGTTGCCCTTCTCCTGCTTATAGGAGGAGTCGGGTACACGTTGGTCAAGATCATAAATGGTATCATTGGGATCTTTAGAAGAGGACCAGCAGAAGCTGCACTTGCCCTGACCACTGGTGGACTTGCAGCTGTTCTGCGTGGAGATTCTCCTGATGACCCTCGTGAAGAACGAGATGATCCCGATAGGATTATAATTAAGGGTCGCGGGAAGGCTATTTGGGCAGGGGCCGAAATACCTGAAGCATTGGAAGCGCTTAGAAAGAGCCAAGTCGTACTGATGGGTCTCGCCAAATCTGGTGGACCTGCCTTATGCTCGGCACTCCCAATTTCTGCCCACTCCATCTTGTGTACCACTCACGAAATGGAGAATTTTGACCTGGATCAGAACATGAGCATCATACTGAACAATAGTGTTTATAGTTTTGTTCTAGTCCCAGGAGCCATCACATATAAGCGGTATAATGCACCCAATTTAGTTGATAAGGTGCATGAATTGGTGCGCGTCGACTTGCCCAAGAACCGAGGATTTTCACTGGACGTGCGCGCTCAATTCAGCGAGGACTTTTATGATAATGGTACCGCCATGAAATGCTGGGTGGTACCTAATAAAAACCCCGCTGTTAGCGACGTGATGCGCAAGGTCGACTGCGAGAAGAGCAATCAGATTATCGATATATTTGCTTCAGATCTCTCGCGGTCAAGTGGATGCGAGCCGGTTAGGCAAACTCAAAGGTTCATTTATGCCGATGGACCTGCTCGCAATGGACACTGCGGTCGCCTCCTATGTGCAAATTTGTCTGGTCACTGGCGCGTTATTGGTATGTGCGCTGGCGAAGGGAAGAATAGAGGAGGCGTTACTAAAGCTCTCTATGCAGATATTCCGCACGAATTCTTAGTCGAAGAAAAGGGTATTGCGGTGCATAGAGGGGCAGATATTGAGGATGCTCGCATCCTGGATCGTTTTGCTATAACGATCCAGGAGGATGTCCGTGAGCTCACTCCGATGACTAAATGTCTAGGAAGAGTTGCCGGGCAGAATTATCCTAGGGCTCTGAGGAAAACGTCTATAGTTCCTTCACAAATATTTGAACATCTCTGGAGGAAACCTGAGACTGAGCCCACTGTGCTTGGGAAATTGGATAAGCGAGCTCCATTTCCCTATGATCCATACACCACAATAAGTGACAAGTTTGTGGCGGAAGTTGGCCCTATAGATATCTCAGAGGGTTCTGATGCCTCTCTAACTTTGGCTAACATTGGATCATCTTGGAGGGCTGCTGGAGATATTCAATGTAGCACCGTCCTCTCTTGGGAGGTCGCAATTAATGGAAATCCAGCAATACCCTACTGTGAACGTTTGCCCATGTCCACCTCCGAAGGATATCCTGATTCTGTTAGCAGGAACTTTGGTGAGAAAGGGAAGAAGAGATTCTTCGAATTGGAAGGGGAGAACGTGAGAGTTCCCACTCCGGCTCTAATGAACGAATTGGAAGTTCTGGAAAGGGAACTACAAAAAGAAGAGGTCTGTTTAACGTGTATTAACACAGCATGTGCAAAGGATGAGAAGACAGCCTCGAAAAAGGTTAGGGTTGAACCTAAAACCCGAATTTTTGAAATTCTTCCGTTTCAAGTGAATATTATTATTCGAAGATATTTCATGTTCTGGATGCAGCTCCTGATGGCTGCACATGATCAGCTACCGAGCAAAGTGGGTTTGAATGTCTATTCTGAAAGCTGGGACATTCTGCTCGGGAGGCACACCCGTTTAGCTAACCATTTTACTGGTGACTATTCGGGTTTCGATACTTCAACCCCCAGAATCTTGGTCTATGCTATCATTGATAAGGTTAACGAATTGGCCAATGATTCTGAGATCAATCAACGCACTCGTCGAAACATAATCAGATTTGTTCTAAATCGTTATCTTATATCTGATGGTTATGTTTACGAGATTCATGGTGGTACACCCTCTGGCTTTGCGCCTACTGTAATGATAAATTCGATTGTCAACGAATTTTATTTGAAGTGGAGCTGGATGGGTATTATGAAAGAGGCAGGGTATGCAAAGGAAGCCTCGCTTTATGCTTTTCATGAAGCTACTGAGATTTCTCTTTATGGAGACGACAATTTTGTCTCAGTAGCTACTCCAGTAGCTTCCTTGTATAATCTTAAAACAATCTCTGAATTCCTGGGAAGGATAGGGGTGAAACTTGGTGATGGAGCCAAAACAGGAACAATAAAACCCTTTATCCCTCTCGAAGAGGTTGATTTTTTGAAGAGGCAGTTTGTCGCTGATGCCGGGTCTACGGCAATACTGTGTCCTCTTAAGAAAGTCTCTATTGAAGAGAGATTGTTTTATGTTAAAGGTGGACAAGATGAGTTGGCCGCATTAGAGTTAAATATGGCCACAGCTCTGTGTGAGGCCTTTTTCCATGGAAAGGAGTATTTTTGTTTTCTAGAGACAGAAATTCTCAAAGCTGTTAGGAAAAGTGGAATTAGTCTCACAAAGCCTCTTCCCACCATGGAATCAATAAGGGTGTGGTACCTTTCTCAGCGAACAAATACTAAGGTGCGCTCACCCTCCTACGAAGGACTTGGAACGATGTCTGGTATCCTAGCCGTTGGATTATCAGAGGCTAGAATCGTAGGTAATGTAACTTTCTATTCTGGAACTGAATTCCAAGGAAGAGTGGAAACTCACCTCAGGGTGATCCCTACTTATATTCCAGGGGGATGGAAAGTTGGAAAAGATAAACAAGTCTACATTTCTTTTGTGCGAGACGCCATCAAAATGGCTAACATTATTAAGAATGTAGATAATTTTGAGTGCGTTGTTGCTACTGATAAGGCAATGGCATATCTCATTGCAATTTGCGTGGCTTATAAGGAAAAGAGAATTTCCAGAATGGAAGTCAGATGTCACGTTCAGAATTTGAAGACAGCGGATGCGCTGTTGTGCAATGAGATTTGCAACAATCTGTAGAAATACAGAATCAGGTGATGCCCGCCGGACCTTAACGTGGGTTTTGTACAAAGTTTTCCGTTGTGTGTTTGCTTTGTTTTAGTTTGTTTGTTTTTCTTGAAATAAACTGGATTTCAATAGAGGGTTTCTTGAACTCTTCCCTCTTCCGATCCAAGAGTTTGGTGTGTTTTTCTTGATTTCTGCACCGGTTTCAATCAGTGAAAGTCTGATGGCC
| 45,148
|
MT344108.1
|
Satsuma dwarf virus
|
Yan,J., Zhang,S., Wu,J., Yang,F., Zhou,Y., Zhou,C., Cao,M.
|
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, National Center for Citrus Virus Exclusion
|
China
|
2020-12-16
|
EH1
|
Sadwavirus citri
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,362
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Citrus
| null |
2018
| null | null |
Satsuma dwarf virus isolate EH1 segment RNA2, complete sequence
|
AAATTTTCAATTTCACTCTTTCTCTCTTTTAAATTTTAAAAGATTTGAAATTCTGATTTCATGTCTATTCTTTCAGCTCACTTTATGATGTGTAGGATAGCGCCTACACTACGAAACTAGGGATAGCGCCCTAGCTCCGATACTGAGGATAGCGCCTCAGCTTGTTTTAAATTTGCACACATATTTCGATTTGTGTTTTGTAATTTCGATTATTTTAATTTTTAAAACCAAAAAGATTTTACTATTTCTCTTATTTCTTTTTTTGTTTTAATTTCTTATCTATATGGAGATTTACGGATTCTCCCCATTCTCCTTCCAGGACACCGAGTCCTGGAAGAATTCTGCGTTCGCAGCCTGCCGGGGCTGCAAGACCTACCCCGTCGAGGAGGTAGGTGCTGATGGGTCCATCGTGACCCGTGAGGTCCCGGTGGGCCTCGTGCTAAAGGGCGTAATGGCCCAATATCGGTCCCTTTTGTGGACCCAATTCGTGGCGGATGCCGCCACCACTACTAAAGACCGGGAGTCTTTTGACTTCTGGCTCTTTTGCCGCCGTGCTGAGGCGGCACAGGAACGGGCCTTTTTGGCTCGAAAGACCAAGCGCGCCAAGAAGGCCGCCGCCCTCGATGCTGAGGGTATCATCGATCGCACCTATAAGGGGCGGTCCTACAAGGTCTCTACTAGAGGCCTTTCATGGAAATCTGTGCGTGCTGCACAGAAGGCTGCCAAGAGAGCAGCCAAAAATTTTGGGTTTACCATCTCGGTGAACCCATTTTCTGCCCTCCCGTCTGAAGGGAAAGACTTTACTGCGGGTGAAACTCCCGCCAATACTGCGGCCTTGCCGCAAATCTGTTGGGCTGACCGCAAGGCGGCCATGAAGTCCACCTCTCCTGTGGACGTTGAGAGTTTGCCCTTTTTGGGTTTACTTCCGGAGTCCCCCCGCCTCCGTAATGAGGGACTACTCTCTTTGCTGAGAGCGAAGATCGCAGCTTTGGCTGCGAGCAGGGACAAATTAGTCCCCATATCTAAGAGGGTCGTTAAGACCCCAAAACAGGTCTCTGAGGTGGAGATCTCTGAGGAGGATGTACCCATTGTTGGGTGTATTATTAATGGAAAGGTTGGGGTTCCTAGGAACCCTATAATTAAACGCCTCCTCCCCACTAAGAAGCTGCTAAGAACCAGAGTTGTGGTTCCTTTTCAACCTAGGCTTCTTTGTTCGGCGCGCCATGTTCATGACATGGAACACTTAAAGGATGAAAATCGTTGGACTATTTATCCATCGATCATTAAAGTGTCGAGCAAAGCCGCTTATGCAACAGCGGCCCGTCTCAAACTTGTGCCCGACTTTGCCTCTGCGTTTGATAGAGTCCGTGCATTTTCCACTCACCTTCTAGATATAGAGGGGGAAGTGCAAAGACTCGAATCTCAACACCATCCGGCCCCGAGGAAAACTGTTGTGGCTAGGGTATTCAAATTCTTCTTTGAAGAATATGCCTTAGCTCATGATGAGGCTGAGAGTAGAGCACGCGCCCAACGTGAAGAAAGGCGCCGGGAACATCTGAGTTTCCTGTGCGGATTGCGACGCGCCGCTTCAGATCGGTTGAATCTGGAGCGAAGTCGGTTGAGAGAAGCTCTCCTTGTGGCACAACAACGAAGCGAGGAACTCAGGCGGAGTATGGAAGAAGGCCCAGTGCCTCAGATTTTATACAAGCCAGAGTGGCATGTTACTGAACGTGCGTGCGAACACGCCGCTAACTTGACTTCCGAGCACCCTTGTGAAAGGGAGATGCTTCAGCAAAGGTATCGGAGTAGTTATGCTAATACGATCTCCTGCCCAGATTCTTATGCGGCAAAGAGATATTTGAAGGCTACCGATGCCCATTTCGAGCGAATTTTCGGATATGCTGTGCATAGAGGCACAAGAACCGAAACTGTGACTCAGGTTGCTGAGTCTCCTCCACCAATTATAACTGCACCCGTGGGGCGAATGGTTGGAGGAAATCCACCCACAGAATCACCAGGAGCCGCTGCTGTTAGGGCGGCTATGCAACGAGCAGTAGAACGTAACAGACCTGGTCCTGGCGAATCTTCTGCAATGCCAGCTAGAGCTCCCTTACTCTCTCACAGAGGGCAATATTACGCTCGTTCTCTTTCAGATAGGTATAATAATATCTTTTCTCGCACCAACGCCTATAATCTTATGCGAGAGACTGATGTACCCATTATGGAATTTACATTTGGGCAACAACAGGATATTGCTATACCTCTATCTTCTAGATTTGGAAACCATCCATCCCTCCATATTGGTGAATTGGAAATCGCTGTTCAATCAGCAGTTTTATCTGGAGTGGATACAGCAATGGCTATCATGGTTTCAGACGCATCACATGACAGACTCGAGGAGGGATTCTTGAGTCTAACTATTCTGAGACTAGGAGCCGGGTGGATGCGCCATACTATACCAATTGGCATTACCGTTTTCCCAACGGATCCTCTCGTCGATCGTCTCTTAAGATTGTCTGTTTTGACCGGAGGATCTCCTATGGCAGATGGTAGACAAGTGGCTAGGCTCCATTATGGATTGCTTGGCCAAGCTTATACTGGCGCAGGTGAGCAAAGATTAACGCAGTATGCTACTCGAAGAATTAACGTGCGTCAGACGCACGTTACTCAGTTTCTCGAGGGCAACCATATACACATTGCTCGCTCTGAGGATAGACAGCAGCCGCTACCTCACATGAATTTGGAGTATCGGCCTCTATCTGGAAGCACTAGGTATGTGGCACGACCTGGTGGGTACCGAGCTGTTGAAGGCGGTAGGCAGAGTGTTGATATAACCCAGAACTTTATTGCGATGCCTACGCACTTAACGAGAAGTGCCACATCCCGGGAAATTGATATCCTGGGTCCCGCTAATCCAAATACCGCCACTGTTTCAAGTGGCGGAAGAACTACTACTACTCCCACTGGCGGTACTTTAGATGATAATAAGGAAATACCGGTGGGTGTGGAAATGGAAATGGAGGAGGAGGAAAGAAGGCGCCCACATGGGAGCGCCGTTCATCGTGGCTTCACAGAGTTCTCAGAGCGAAATGAGAATGTGATAGAGCATTTATATGTTCCATCCATGCACGGCTTATCCTTAAAAGAGGATATCCATCTGTTTACTGAGAATCTTGCCATACCATCCACGGCTGATTTCTGTAAAGAGTTGGCTCGTTATAATGTATTGGCAAAAGCCACCAGTTTTAGGAGTGCAAGCTATTATTCGCGCCTACTTTCCGGGGTGGCAATATTGCGCCCCCATTTTAAATTCATATTTAGGCTTGTTACTCCTATACTTGAATCCATACCGCTTCTCGTAGTCTGGGACGATTTATCTGAATTAACAACTAAAGTTTCCAGATTATCAGCCGCTTTTCAAGTTATCGATTCAGATCATACACGAGCGGCTGTTTATGAAGTGAGACCATCCGGACCAACGGACTTACTCACCCCTGCCAAAAGTAATTATGGTATGGGGGGAGATCTGGTTATCTTCTCCGGAGGGTATGGATCCTCCTCGCTAACCTCTGCCTTGCGACTTAAAATAGAAGCGAGTCTTCTGAAGGATTCGCAACTTGGATCAGGCGAGATTAGCATTCCTCAAGGTCCCTCCTCTATGCTATCATTTAGTTACTTGAATGAGATTGACCTTGGGGATATAGATTTACACTGTTTTCTAGGTAGTTGTAAATATAGTGGTACTTCGCCCGTTGGTGGGCGTAAATATATATCTGTGTGTCCGGCGGCCGGCCTTGTACATAATAAAGGTAAAGCTGCCTATCTAGGATTGACGGCTTCCCTTTTTTCCATGTATAATTTTTGGAAGGGAAGCTATATTCTCAAAGTGGATGTTCTCTCAAAGGGGAGTTGTGCAGGCGCAATTAGTATTTACGTCCCCCCTCCTGGAACCAGTGCTGACCACTATACCCAATCTCAGCTTGATACTCTCCCAAGATATGAATTACCCTGGAGAGGAACTGGGACTGCCAGGTTCGAAGTGGAAAACTTTTCCTGGGTTGGCTGGCACATAACTAAGCCCCAGAGGTACACCACCAATGAAGATTGGTTCTCATTAAACTCTGGATTGGTTGTTGTTCTCAACCAACCTCCTACCACTCGCACTGGAGGTTCTAGCGATATTAGAGTTATATTCAGAATCGTGAAGTTCAAAAACTTAACTCTAAAAGAACGATCCACGACCTGTGATATATTCACAGGTATTAAAGACTCGGAATACACTCATCCACTGGTGGATGTTCTCGACGAGAACATTTCGGCACCAGCATCTGTTTCTACTGATCCTGAAGGAGAAACAGGTACTTCATCGAGTGTTCAGACTGCTGCTCCTCTTATAAGCAAAAATTTTGGTGCATACTATGCTTATCTGCTTGGAGGCGCTAGCGCAGGGAAGAGGTGGCACAGCTATGTGCTGCCCATAACAATGGGGCATCACAGGAGTGAAATTGGGCGTACCAAGACTGGTTATCTCAACGAACAACTCGACGATACAGTCAGAATAAGGTATTCATTGCGGAACCCGCTACATATATTGTGTTCCGCCGGAGCTTATTACGCCACTGACCTTCTCTTCACTCTGGTGGTTGACGGTGATTTCACAGCTGAACGTGCCTATGCTCAGCTGGGCCTCATACAAACTCCTTTGATGGAGTACTATGAGGGCTATTCAACTGATAGAACTCTTACTTCTGAGGGGGGTTCCGTAAACCAGTTGGGCGTGGGCAAGTCATATATCCAACTACTTGTCCCGAGAAGGAATTATAGGGCTAGATCCGTTACGACGGACACCGCAGCCTTGTTTATAGAGACTATTGGCTCCCTCACAGTGCGCTTCACTGTTAGTGATAAAATAAAGGGAGTCCATCTTTTTGTTGAAGCTGCGGGCCCTATTGATGTGGATGGATATGGTCGCGGGGCAGATATCGGATTTACTGAGTCGTTTGTTCTGATGCCTGCTCTACGCACTGCCGCTTAATATAGCGGCGATTAGGTGATGCTCGCCGGACCTTAACGCGGGGCTTGCTTGTACATACTCATTCTTTTCCTTCTCTTTTTGTGTACTTTCTTTTCTTTGGTGGGAAAGGTGTGCACCCTTTCAGTTTTAGTATTCATGTGCACTGAATGCTGAAACTTTGCAAAGTTTTCCGTTGTGTGTTTACTTTGTTTTAGTTTGTTTGTTTTTCTTGAAATAAACTGGATTTCAATAGAGGGTTTCTTGAACTCTTCCCTCTTTCGATCCAAGAGTTTGGTGTGTTTTTCTTGATTTCTGCACCGGTTTCGATCAGTGAAAGTCTGATGGCCC
| 45,149
|
GU901210.1
|
Satsuma dwarf virus
|
Sun,X., Wu,G., Li,Y.
|
Southwest University, Lab of Plant Virology, College of Plant Protection
|
China
|
2010-04-14
|
FJ
|
Sadwavirus citri
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,349
|
GenBank
| null |
China: Chongqing, Fengjie
|
China
|
Citrus unshiu
| null |
2009-05-20
| null | null |
Satsuma dwarf virus isolate FJ segment RNA2, complete sequence
|
TTGATTCAAGCGAAGTGGAAGCCCCACACAAAAACCATCTTGTTGTACTCTCTCTCTCTCTCACTGAGTCACATTTACTTTTGATGATGACTTCTTCTTCACTTTTTCTTTCGATGTTCGGGATAGCGCCCGTTCACCACTGATACTAGGGATAGCGCCCTAGTTTCGATTGCTGGGATAGCGCCCAGTTTCTTTTGTTAATATTTCGATATTTTCATTTTGTAATTTCGATTACTTTTCTTTTATATTAAATTAAAACCAAAAAGATTTTCCCATTTCTTTGATTTCTTTTTTGTTTATTTCTTTATGGAGATCTACGGATTCTCCCCCTTCTCCTTCCAGGACACCGAGTCCTGGAAGAACTCTGCTTTCGCAGCCTGCCGCGGCTGCAAGACCTACCCCATCGAGGAGGTAGGTACTGACGGATCCGTGAGGATCCGGGAGCTCCCGGTGGGGCTCGTACTAAAGGGCGTCATGGCCCAATATCGGTCCATTTTATGGACCCAATTTGTGGCGGATCCCGCCACTACCACCGTGGACCGGAAGTCCTTTGACTTCTGGCTCTTTTGCCGCCGTGCTGAGGCGGCCCAGGAACGAGCCTTTAGGGCTCGCCAATCCAAGCGAGCCGCCAAGGCCGCTGCCCTCGATGCTGAGGGCTTAATTGATCGCTCCTACAAGGGGCGAACCTACAAGGTCTCTGTGCGGGGCCTTTCGTGGAAATCTGTGCGGGCTGCACAGAAGGCTGCCAGGAAGGCAGCCAAAAATTTTGGATTCACCATTTCGGAGAATCCCTTCTCGGCACTCCCATCTGAAGGGAGATCTGCCTTTTCTGCGGGTGAAACTCCCGCTCCTCCTGCCTGCGCGCTCCCCAATATTTGTTGGGCGGCTCGCAGGGCTTCCACGAAGTCCGCCTCTCCTGCGGACGTAGAGAGTTTGCCCTTTTTGGGCTTACTCCCGGAGTCTCCCCGCCTCCGAAATGAGGGGTTGCTCTCTTTATTGAGAGCCAAGTTGGCCGACTTCAAGGCTGCGCGGGCACCGCTAGTGCCCACAGCTAAGAGGGTCATCAAGACCCCTTCCGAAGACTCCATCTGGGAGTCTGTGGAGAAGAGCGCCCCGATTGTCGGGTGCGTTATAAATGGTATGGTTGGGATTCCCAAAAACCCAATCATTCAGCGTCTTCTCCCTGAGCGCAAATATATTGCGCGCAAATGCGTCCGGGCTTTTGTTCCTCAAGTGATGTGTTCGTCAAGACACAAACATGATTTTGCCCAGTTGCGGAATCCTGATAAGTGGATTATTTTCCCATCTGTGATTAGGATTTCCACTGTGGACGCTTACGCCACAGCCAGGCGCCTTGGGCTTATAAATGACTGTTCTTCGGCTCTCGAGCGAGTCAAGGCATTTTCCTCTCACCATCTAGACTTAGAGAAGGAAGTGTCTCGCCTCGAACGAGAAGTTCGCGCAGCCCCGCGGAAAACGATAGTAGCTAGGGTGTTCAAATCCTTCTTTGAAGAATATGCTCTAGCACACGATGAAATCGTGGAAAGGCTTAGGGCTGCTAAAGAGGATAGGCGCAGGGAACATTTGACTTTCCTGCGCAATATCAAGCGCCAGGCTCACGAGCTTGAATTGAAGGAACGCCAATCTTTTTTGGTGGCTATTGAAGAAGCTCGTATTAAGTCCCTTGAGCTCAAGGCTAAAATTGAAGAGGGTCCTCCCCCTCAAATTTTATATACCCCAGAGTGGCATGTTGTTCAGCGAGCAAAAGCTTATGCTGATGCTACAATGTCGCCCAGCGAAAGGGATATAGCGCATTTGGCTTATGAAAATAAGTACGTCAATGCTCGTGCGTATCCAAATACGGATGTCGCTGCGAGATTTAGAGCACGTTGTGATGCGCATTTTGAAAGGATTTTCGGATATGCTGTGCACCGAGGCACAAGAACCGAAACGTTGACTCAGGTTGCTGAGTCTCCTCCGCCAATTATCACTGCGCCTGTTGGGCAAAGGGTTGGAGGAAATCCGCCAACAGAAACACCGGGAGCTGCTGCCGTGCGTGCTGCAATGCGACGTGCGGTCGAGCGCAATCGACCTGGGCCTGGAGAGTCATCGGCTATGCCAGCTCGGGAGCCCCTCTTGTCTCATAGAGGGCAATATTATGCACGCTCCCTTTCGGATAGATATAACAATATCTTCTCGCGCAACAATGCCTATAATTTAATGCGCGAGACTGACGTGCCCATTATGGAGTTTACGTTTGGGCAGCAGCAAGATATTGCTATTCCTCTATCCTCCCGATTCGGAAATCATCAATCTTTACACGTTGGTGAACTGGAAATTGCCGTACAATCCTCGGTTTTGACCGGAGTTGATACGGCGATGGCTATAATGGTTTCCGACGCCTCCCATGATCGTCTTGAAGAGGGATTCTTAAGTCTCACTATTTTAAGATTGGGAGCCGGGTGGATGCGCCACACTATCCCCATAGGAATTACAGTTTTCCCAACTGACCCATTAGTCGATAGACTTTTGCGATTATCAGTTTTGACTGGTGGGTCACCTATGGCGGATGGTAGGCAAGTGGCCAGATTACATTATGGATTACTTGGCCAAGCCTATACAGGCGCTGGCGAGCAGCGATTAACGCTGTATGCCACCAGAAGGATAAATGTGCGTCAAACGCACGTTACTCAGTTTCTGGAGGGCAATCATATCCATATTGCTCGCTCCGAGGATAGACAACAGCCACTCCCTCATATGAGTTTGGAGTTTAGGCCTCTATCCGGAAGCACCAGGTATGTTGCACGACCTGGAGGATATCAAGCTATTGAAAGTGGCAGGCAGAGTGTGGATATCACGCGAAATTTTATTCGCATGCCTACGCACTTAACGCGAAGTGCAACGCATCGGGAGGAAACTCCCGCACCCGACAATCCAAATGAGCAGAATGTTGGCAGAAGCGAGATCAACGCTGAAATCCCGACAAATTCTGCCGAGGAGGAAGAAAGGCGTCGGAGGACGCCTCATGGATCTGCTATTCATCGGGGTTATACAGAGTTCTCCGAGCGGAACGAAAATCTTATTGAACATCTTTACGTTCCGTCTATGCATGGTCTATCTCTCAAGGAAGATATACATCTTTTCACTAAGAACCTTGAGATACCGAGTACTGCCGATTTCTGTAAGGAATTGGCAAGATACTCGGTTTTAACAGAGGCTATGAGTTATAGGGGTGCAAGTTACTATTCACGGCTCTTGTCCGGGGTTGCTATATTGCGTCCCCATTTTAAGTTTACTTTTAGACTTGTGACCCCTATCCTTGAATCCATACCCCTTTTTGTTGTCTGGGATGATTTGGGCCAATTAAACACTAAGGTCTCCTTATTATCTTCTGCTTTTCAGGTGATCGATTCCGATCATACGAGGGCAGCAGTGTATGAGGTTAGACCTTCTGGGCCAACTGATCTCCTTACCCCTTCGAAAGCCAACTATGGGGTTGGAGGAGATTTAGTTATCTTCTCAGGGGGTTATGGTTCCTCCTCCCTCTCCTCACCTTTGCGCCTCAAAATTGAAGCGTGTCTTCTTAAAGACACGCATCTTGGTTCTGGTGAGATTGCTCTACCCCAAGGTCCATCTTCCATGCTCTCATTTCATTATTTGAATGAGGTGGATCTTGGTGATGTGAATATGCACATATTTTTAGGTAGTTGTAAGTATAAATCCTCTTCTACCGTTGGTGGTAGAAAGTACATATCTGTGTGTCCAGCAGCGGGTCTTGTACATAAGGGTGGAAAAGCTGCTTATTTAGGTTTAGGAGCTTCCCTTTTTTCCCTATATAATTTTTGGAAGGGGAGCTATGTTCTCAAGGTTGACGTTCTGTCAAAGGGTAGTTGCGCTGGTGCGATATCAATTTACATTCCGCCACCAGGCTCAAGCGCTGATCACTACTCTCAACCGCAACTGGACACTCTTCCCAGGTATGAGTTGCCCTGGAGAGGTTCGGGATCCGCCAGATTCGAAGTCGAAAATTTTTCTTGGATTGGTTGGCATCTGACAAAACCGCAGCGATATATAACCAATGAAGACTGGTTTTCGCTGAATGCTGGTTTGTTGGTTGCTCTCAATCAACTACCTACAACTAGAACTGGCGGTTCTAGTGATATAAGAGTGATATTCCGAATTGTTAAATTTAAAAATCTCACTCTTAAAGAACGTTCAACAACCTGCGATATATTTGCAGGTATTAAAGACTCGGAGTATACAGATCCTCTAGTGGACGTGCTAGATGAAAACATCACGGCACCATCCGCTTCTTCATTGACGACGGTCCAAGATCCAGACCTTGGACTGGAAACTACTTCGAGCGCCCAGACTTCTGGACTGACCACCACGCGTAGTTTTGGAGCGTATTACGCTTATCTTCTTGGTGGCGAAAGTGCTGGAAATAGGTGGCACTCTTATGTGTTGCCTATTACTATGGGACACCACAGGGAGATGATAGGAGCATCTAAGACTGGGTATTTAAATACTCAGCTTGATGAGACCATACGGATTCGCTATTCTTTGCGGAATCCGTTACATATTTTGTGCTCAGCTGGAGCGTATTATGCGGTTGACCTCCTATTTACTCTTGTTGTGGACGGTGATCATGGAGCCGAACGTGCCTACACTCAACTGGGTTTAATTCAAACGCCACTCATGGAATATTTTGATGGATATTCTGCGAGTAGAAATCTCTCTTCAGAAGGGGGGTATTCGAACCAATTGGGTGTGGGAAAATCTTACGTTCAGTTGATTGTCCCACGAAGGAACTACAGAGCTAGATCTATCACGACTAATACTGGTGCGCTCTTCTTTGAAACCATTGGATCGCTGACGGTTAAATTCGCTGTTAGCGCTAAGATCAAGGGAGTACATCTGTACGTTGAGCCTGTAGGACCTATCGATGTTGATGGGTATGGGCGGGGAGCGGACATATCTCTAACTAATGAGAATTTTGTCCTGATGCCCTCGCTGCGTACAGCTGCTTAATTGCGGCATTTGGTGTTCCCAGTCGGACCTTTAACACTGGGGTTTGAGAACGGAAAGAAATTTTCTAGGGATTTCTTTCAATTTAAGTGATGCCCACCGGACTTTAACGTGGGGTTATGGCTTCTCTCTGCGGCCTGATGCAGAGTTGTACATTAATAACTAGTGTGTTTATTTTTGTGTGTTTGTTTTGTTTGTTTTGACATAAAATAAACTGAGTTTCAAAAAGGGTTTCTCGAGTTCTTCCCTTTCCGACTCAGGAGCTTGGCGTGTTTTTCTTGATTTCTGTCGCCGGTTTCAATCAGTGAAAGTCTGATGGCC
| 101,112
|
NC_003399.1
|
Scallion mosaic virus
|
Che,J., Zheng,H.Y., Chen,J.P., Adams,M.J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2002-02-06
| null |
Scallion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,324
|
RefSeq
| 1
|
China:Zhejiang: Hangzhou
|
China
|
Allium chinense
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Scallion mosaic virus, complete genome
|
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| 8,597
|
LC651456.1
|
Scallion mosaic virus
|
Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
|
Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
|
Japan
|
2022-03-30
|
WOTC465
|
Scallion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,300
|
GenBank
| 1
|
Japan: Tochigi
|
Japan
|
Allium macrostemon
|
plant leaf
|
2015
| null | null |
Scallion mosaic virus WOTC465 RNA, nearly complete genome
|
CACGAATTGAATGAATTGACAAAATTTGCGTTTCTTAACTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTATTCCACCACTCACGATGGCTGCGGTCACATTACACGCTCCGATAATCCAAACTAGTAATAATTATAAGAAGTTGACAGTTATCCAGTTCGGGGAGAACAAACCAATGTTGATCACTAGGATTAACACTGAGCAGATTAAAATTTCAAAAGCAAGTGATGTTGATCAGGTTATTGCTGGTCACTATAGACATCGCAGAGCAAAATCTGAGGCAAGCCAGAATAAAATTGGTGTAGACCAATTGGTTGGACTTGTTTGCGATATTATGAAAGTCAAAGATAATGGCGAAATACACCTAATTGATAAGAAGAAGGTCCAAAAACTTGACTTCAAAAGAAAACAAGGAACAGTTTATGCGCGTGCACAAGTAAAACACCTACAAGGACATAGACAACGCAGAGATTTTGAATCCAATCCAATGCTTGATGAATGGTTGGATATAATAATGCGTAAGACTGTAGGTAAGAAAACACACAAAACTAGTTCAATCGAGGCAGGTTGGAGTGGTTTCTTACTAAATGCATCAAGACTTATAGGGAGACAGAGCACACACAGAGGAAACACTTTTGTTGTTCGTGGAAAATGCGCAGACACATTGTTCGATGCACGAGTGCGAATGACGTATGATGCAATGTTAACCATTAGACAGTTTAGCGATGCAGGAGCGCGTTTCTGGCGTGGTTTCAATGATACATTTTTATCTTGTAGGGCAGACGATAGAGACCACACTTGCGCCACAAGTCTTGACGTATTGGAATGTGGACAAGTGGCAGCACTGCTTTGTCTAGCAATGTTCCCATGTGGAAAAATCACTTGTCAGCAATGCGTTCAAGACAACCTAAATCATGAGGGGCAAGCTAGTGACAAAAATGTACGCGAAAAGGTTGGTAAGATCAAAACTACCATACAGACCAATTATCCAGCATTCAGGCACGCGATACAGATGCTCGAACGTTATGAACAATCATTTCAGATAAATCCAAATTATGAAGGGTTTGCAGAAATACAAGGAATTTCTGAAGGAAGGAACAATTCTGCATTCTCACACGTGAATAGGCTTAATGCAATACTCATTAAAGGGTCGCAAGCGTCAAGTCTCGAGTTTAGTGAGGCCACAAAGAATTTATTGGAGATTGCACGGTATTTGCGGAATAGAACTGAAAACATAGAGAAAGGCTCTCTGAAACATTTTCGGAACAAAATATCCCAGAAATCTCATATCAACACAGCGTTATTGTGCGACAACCAGTTAGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCACGCAAAGCGATTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAGTAAACCCAGTAGATGGGTATGGCAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAATGGTGAAAGGAAGTTGGCGATAAATCGTTTAATAGTTCCCACCAACTTTGAAACGTTACGAGACCAGATGCAAGGTGAGACTATTGAACCACAGCCACTGACGAAGGCGTGCGTCAGTATGATGAATGGAGACTACGTTCATGCCTGTTGCTGTGTTACCACTGATGCAGGTAATCCAGTTCTATCTGATGTTCAGATGCCTACAAAACATCACCTGGTGATTGGCAATAGTGGCGATTCCAAGTATATAGATATGCCAAATACGGAGGGCCAGAAAATGTATATAGCTAAGAATGGGTACTGTTACATGAACATATTTTTAGCTATGTTAGTTAACGTCAATGAGACAGAAGCTAAAGCTTTCACGAAGATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTTGATGTGGCAACAGCATGCTACCTTTTAAAAGTCTTCTTTCCAGACGTCAACAACGCTGAGTTACCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTGCTCGACTCATATGGATCCTTATCAACAGGCTACCACATTCTAAAAGCAAATACAGTTGAGCAATTGATTAAATTCACACGGCATTCACTGGACTCTGAGATCAAACATTATGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCGCAGCCATGCACACAAGGGAAGAACTAATCGACCCACAGTTCCATCTCAAATTATTAATCAAAGGAATATACAATCCTCGAACATTAGAGAGAGCATTATTTTGGAATAGATATTTACCTTTGTACGCAATGCTGTCACCAGGGATTTTAATAGCATTTTACAATAGTGGTTCACTAGAATATTTAATGGATCGGTTCCTAAGTAAAGATAACGACTTTGTTGTGACATTAGTTGTCTTAAAATCACTTGCAAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGTGTAGCATCACAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAAGTCATCGAGGTTATGCAAGGAATCAAGCAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGTTGGTGGCTCTGGCTTCTAGGAGTGAATCAAATGCGGAACTAGATGAGGCTGGGTATAGTTTATTACGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTTTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATTACCTCATATTTGGTAAGCACTCGTAAGGGATTGAAACAATTGGCTTCCAAAGCACGTAACAAAGTGTCAAAAACGATGGGTGCAATTAGGGCGCAAGTTGTACGCGCAACATGCTCAACAATCAATTATTTTGTACCGGATATTGTGAAATTCATCAATGTTTTGGTGGTTATTGGACTCTTACTGACAATAGCAAGGGAAACTCAGAGCATGATTAATAATTTTGCAAACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACATGAAATGTGGCAGCTTAACTTTCATTTCAACTTACTTGAAAAACAGGACGGTAGGGCACCAACTTTTGAAGAATTTGACAAGCACTTAACGTTGGTGGCACCCCATCTTCGACACTTAATTCAGGACGAGGATAACGTTGAACACCAGTCGAAGAGACAGGAGCAGCAAGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTCTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACCAAGATTTTAAACAAAGTGCGAAATTTGGTCACAACAACTGAACCAACTGTATACCATCAAGCACTTGACGAGATTGAGGATGATCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGCTAGACCAAGATCAACAACCAACTCAATCACAGATGCAAGAGCCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCACATCAGTTAGAAAGAGGGCGCACAGTACCTCATTACCGAACAGAAGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCCATTGACATTGCTAACGGTAGCCATAGAGACATACTATTGATGGGTGGAGTGGGCTCTGGCAAATCGACAGGTCTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAGTGTACTGCTCATCGAGCCTACAAGGCCATTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTCTACATGAATACGACATTGAGGATGCGCGGATTGACAACATTTGGTTCTGCACCGGTTACAATTATGACAAGCGGCTTTGCTTTGAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTTTTTGATGAATTTCATGTGGACGATGCAAACGCAATGGCATTTAGATGTTTACTGATTGACAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCAACTCCACCTGGTAGAGAACCAGAGTTCGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAAGAATCATTATCTTTGCAAGAATTTGTACGCGCACAAGGAACAGGGGCGAAAGCTGATGTAATTCGCTATGGAGACAATATACTGGTTTACGTAGCAAGTTATAACGAGGTTGACATGCTTGGGGGCTTGTTATCGGAGCGTGGCTATAAGGTGACAAAAGTCGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGTGTTGAGATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAGAAGCATTTCATTGTGGCCACGAATATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCGGACTTTGGAACCAAAGTGGTTCCTACGCTAGATGTTGACAATAGAATGATGACATACAAGAAAATTCCTGTTAATTATGGAGAGCGTATACAACGTGTAGGACGGGTTGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCGCTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGTTGAGCGAAATTCCAAGCAGTATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGTTTCACATATGGATTGCCCGTAATACCGAACAACGTTACCACAAGTATCCTGGCAAACGCTACAGTTAGGCAAGCAAGAACAATGTCGCTCTTTGAGTTAAATCCATTCTATATGGCTAATTTAGTCCGCTACGATGGATCGATGCATCAATCATTACACAGTATTTTGAAGCGTTTTAAATTGCGTGACTCAGAAATCGTTCTAAATAAATTAGCCATTCCAAATAAAGGCCTACAATCTTGGTTGACAGCGAGTGAGTATTCACGGTTGGGGTCGAATGTTCCTGACAGACACGACATGCGTATACCCTTTATGTGCAAAGAAGTGCCAGAGAAACTACATGAGGAAGTGTGGGAAGCAATCCAGAAGTACAAGTGTGACGCTGGGTTCGGTAGGTTATCAAGTTCTAGCGCTTGCAAGATAGCATATACGTTGCAGACAGATGTTACTTCAATCCAAAGGACTGTGCGAATAATAGACACATTAATAGCAGAGGAGCGGCGGAAACAAGAATATTTCCGA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| 31,942
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LC651457.1
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Scallion mosaic virus
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Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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Japan
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2022-03-30
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WOA294
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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ssRNA(+)
| 9,298
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GenBank
| 1
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Japan: Aomori
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Japan
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Allium macrostemon
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plant leaf
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2014
| null | null |
Scallion mosaic virus WOA294 RNA, nearly complete genome
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CACGAATTGAATGAATTGACACAATTTGCGTTTATTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTACCTCACCATTCACAATGGCCATGGCCACACTACACGCACCAGTCATGCAAGCTAGTATTAATTACGAGAAATTAGCAGTAATTAAGTTTGGGGACAACAAACCAGTTTTAGTTACCAGAATTAACACTGGACAGATTAGAGTATCGGAAGCAAGCAAGGTGGATCAAGCCATTGTTGGACGTTACAGACACCGCAAAATGAAGTCTAATGTCAAGCAAGTCAGTTTTAGTGTGGAACAGTTAATCGGACTTGTATGTGACATCATGAAGGTCAAGGACGATGGCGAAATACACTTAATTGATAAGAAAGTCCAGAAATTTAATTTCATACAGAAGCACGGCATGACATATGCACGTGCGCAAGTGAAGCATTTACAAGGAAATAGACGGCGTAGGGATTTTGAATCCAGCCCAGCTCTCGACACATGGCTAGACATAATAATGCGCAAGACAGCAGGTAATAAACAACACAAAACTAGCAGAATCGAAGCAGGGTGGAGTGGTCTCTTACTAAATGCATCAAAACTTGTAGGTAAGCAAAGTACACACAGGGGTAATACCTTCATTGTTCGAGGGAAGTGTTCAGACACTTTGTTTGACGCACGAGTGCGAATGACATACGATGCAATGCTTAGCATAAGGCAGTTTAGCGACCCTGGATTGCGCTTTTGGCGTGGTTTTAATGACACGTTTCTGGCCCGCAGGGAGAGTGACAGAGACCACACATGCGCAACTAGCCTTGATGTACTGGAATGTGGAGAAGTTGCAGCATTACTTTGCTTGGCAATGTTCCCATGCGGGAAAATCACTTGTCATCAGTGCGTTCAGGATAACTTGAATCATGAGGGTCAAGCCAGTGACAAAAGATTACGAGAGAAGATCGTAAAGCTTAAAACTGTCATACAAACCAATCATCCGACGTTCAAGCACGCGATTCAAATGCTCGACCGTTACGAGCAATCACTACAAATCAACCCAAATTATGAAGGATTTGCAGAAATACAAGGAATCTCTGAGGGAAGGAACAACTCTGTGTTCCCACATGTTAACAAACTAAATGCAATCATCATAAAAGGGTCGCAAGCATCAAGCCATGAATTCGGCGAGGCTACGAAGAACTTATTGGAAATAGCACGATTTTTGCGAAATAGAACTGAGAACATAGAGAAAGGTTCTCTAAAACACTTCCGCAACAAAATATCCCAGAAATCCCACGTCAACACGGCCTTGCTATGTGACAATCAACTAGACAAAAATGGGAACTTTATCTGGGGTGAGAGAGGATATCATGCAAAGCGGTTTTTCAGCAATTACTTTGAGACAATAAACCCAGCTGATGGGTATAGTAAGTATATGAAACGACCGAACCCAAATGGTGGGAGAACGTTAGCAATAAATCGTCTTATCGTGCCTACTAATTTTGAAACACTACGAGACCAAATGCAAGGTGAAGCCATTGAAGTGCAACTGTTGACGAAAGCTTGTGTGAGCATGATGAATGGCGACTATGTTCACGCCTGTTGCTGTGTAACTAATGATGCAGGAGACCCCATATTATCTGATGTTCAAATGCCAACTAAACACCATTTGGTTATTGGTAATAGTGGAGATTCCAAGTATATAGATATGCCCAACTCGGAGGGTCAAAAGATGTACATAGCCAAGAATGGATATTGCTATATGAATATATTTTTAGCCATGTTGGTCAATGTAAATGAAACAGAAGCTAAAGCATTCACAAAGATGGTTCGAGACATAATAGTGGAAAGACTTGGACAGTGGCCTTCACTTCTCGATGTGGCAACAGCATGTTATCTTCTGAAAGTTTTCTTTCCGGACATCAACAATGCCGAATTACCAAGGATGCTAGTGGATCACACCACAAGGACAATTCATGTATTAGATTCATATGGGTCTCTGTCAACAGGCTATCATATTTTGAAAGCAAACACAGTCGAACAACTAATCAAATTCACAAGACACTCATTAGACTCTGAGATCAAGCACTACGCAGTGGGTGGGGACCCTCTAGAAGTCACACATGCGGAAGAAGAAGTGACTGATCCACAGTTTCACCTCAAGCTTCTGATCAAAGGAATATACAACCCTCGAGCATTAGAGAGAGCCTTATTATGGAATAGGTACCTACCTCTGTATGCAATGTTGTCGCCGGGAATTCTAATAGCGTTTTACAATAGTGGTTCGTTAGAATATTTGATGGACCGATTTTTAAGAAAGGACAATGATTTCGTTGTCACACTAGTCGTCCTGAATTCACTTGCGAGGAAAGTCTCATGTGCTAGGAGCGTTGCATCGCAAATTAGCATAATCGAGAGAGGGGCACCAGGTATGATCGAAGCCATGCAGGGAATCAAACAGAGGCACGCGCTTCCATATGACACAGCAATGAAGATGTTGGTCACTCTGGCCTCTAGAAGCGAGTCAAATGCAGAATTAGATGAGGCCGGGTATAGCTTGTTGCGAATGATTAGCGTGGAAGTAATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACGCGATGGTTGGTGCGAGCTAACACCGTGTGGAAAATTGTCCGCAATGTGGCGTTCGTCAAAATTCTCAATGCGTACACGAAGGGAATTAGTAGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATTACCTCATATTTGGCAAGTGCGCGCAAAGGGGCGACACAAGCAATTCTCAAAACACGTAATAAACTATCGAAAGCAGTGGGTGCAGTCAGAACGCAAGCTGTACGCATGACATGCACAACCATTAACTACTTTGTGCCGGATATTGTAAAGTTTGTGAATGTTTTAGTTGTCATTGGGCTCTTATTAACAATTGCAAAAGAAACCCAGAGCATGATTTCTAATTTTGCACACATGAGTAAGAACAAGCAAAAGTTGCAGGATGAGCATGAAATGTGGCAACTCAATTTTCACTTCACGCTACTCGAGAAGCAGGATGGACAAGCACCGACCTTTGAGGAATTTGACAAACACTTGAAATCAGTAGCACCACACCTTCGCCATTTGATTCAAGAAGAAGACAGTGTTAAACACCAGTCAAAGAGACACGAACAGCAAGAGTTGGAACGAATCATAGCGTTTATTGCACTAGTCCTGATGATGTTTGATGCTGAACGTAGTGACTGTGTGACTAAGATCTTGAACAAAGTGCGAAATTTAGTTACGACAACTGAGCCAACCGTGTACCACCAAGCACTCAATGAGATTGAGGATGATCTCAGCGAGAAAAATTTCACAATAGATTTTGAGCTGGATCAGGATGAGCAACCAACCCAATCACAAATGCAAGAAACAACTTTCGCAATGTGGTGGGCACACCAACTTACAAGAGGGCACACAGTACCTCACTACCGGACAGAAGGCCAGTTCATGGTGTTCACACGAGACACAGCACTTCAGGTTGCTCTCGACATCGCCAATGGTAGCCACAAGGATATATTGTTAATGGGTGGTGTGGGTTCAGGTAAGTCAACAGGCTTACCATTCAATTTATCCACAAAGGGGAGCGTTTTGCTTATAGAACCTACTAGACCGTTAGCCGAGAACGTGCACCGCCATCTGGCAAAGGAACCATTTTATATGAACACAACATTGAGGATGCGTGGGTTAACAACTTTTGGTTCTGCACCAGTCACAATTATGACTAGTGGCTTTGCTTTGAACTATTTCGCACATAACAGGGAGCGCTTAAGGGAGTATGACTACACACTATTCGATGAATTCCACGTCGATGATTCGAATGCAATGGCGTTCAGGTGCTTGTTGATTGACAACGCATATCACGGCAAGGTAGTTAAAATGTCAGCAACTCCACCTGGTAGAGAGCCTGAATTTACACCACAACACCCAGTGAAAGTGGAGATAGAGGAATCACTATCCTTACAAGAATTTGTGCGTGCACAAGGCACGGGGGCAAACGCCGACGTCATTCGACATGGGGATAATATATTAGTCTACGTTGCAAGTTACAATGAAGTTGATATGCTTGGAGGATTATTGTCAGAACATGGTTACAGAGTGACCAAAGTTGATGGACGCACAATGAAGGTTGGACGCGTCGAAATAACCACTTGTGGTACGCCAAACAAGAAGCACTTTATTGTGGCTACAAACATAATCGAGAATGGGGTCACGCTTGATATCGAAGTAGTTGTGGATTTTGGAACCAAGGTCGTACCTTCACTAGATAGCGACAATAGAATGATGGTGTATAAGAAAATTCCTATCAATTATGGTGAGCGAATACAACGACTTGGGCGAGTCGGACGACACAAGCAAGGGTATGCTCTGCGAATTGGCCATACTGAAAAGGGATTAAGCGAGATTCCAAGTAGTATAGCAACTGAAGCAGCGTTTAAGTGCTTCACATACGGATTGCCTGTAATACCGAACAATGTCACTACAAGCATTTTGGCGAATGTCACAGTGCGGCAAGCTAGAACAATGTCACTTTTTGAACTAAACCCTTTTTACATGGCAAATCTAGTGCGATACGATGGATCTATGCACCAGTCGCTACACAATATCTTGAAACGTTTCAAACTACGCGACTCGGAAATTATTCTAAATAAGCTGGCCATCCCGAACAAAGGTTTACAAACTTGGTTGACAGCAAGCGAGTATTCACGACTAGGATCAAACGTCCCAGATAGACGTGACATGCGCATACCTTTTATGTGCAAAGAAGTGCCTGAGAAGTTACATGAAGAGGTATGGGAAGCTATTCAAAAATACAAGTGTGATGCTGGTTTTGGTAAGCTATCAAGCTCTAGTGCTTGTAGAGTGGCATACACGTTGCAAACAGACATCACCTCAATTCAGAGAACAGTACGGATAATAGACACGCTAATAGCAGAGGAGCGTCGGAAACAGGAGTATTTCCGAACT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| 31,944
|
LC651459.1
|
Scallion mosaic virus
|
Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
|
Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
|
Japan
|
2022-03-30
|
WOAI218
|
Scallion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,298
|
GenBank
| 1
|
Japan: Aichi
|
Japan
|
Allium macrostemon
|
plant leaf
|
2014
| null | null |
Scallion mosaic virus WOAI218 RNA, nearly complete genome
|
CACGAATTGAATGAATTGACATAATTTGCGTTTATTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTATTCTACCATTCACAATGGCCACGACCACACTACACGCACCAGTTACGCAGGTTAGCACTGATCATAAGCAGTTAGCAATAATTAAGTTTGGCGACAACAAACCAGTTTTAGTTACCAGAATTAACACTGGACAGATTAGAGTATCAGGCGCAAGTAAGGTTGACCAGGCTATTGTCGGGCATTATAGGCACCACAAGATGGAGTCTGTTGTCAAGCAAAACAGTCTTGGTGTAGAGCAGCTAATTGGACTCGTATGTGACATCATGAAGACTAAAAATGATGGTGAATTACATTTAATTGACAAGAAAGTCCAAAAGCTTGATTTCGTAAAGAAGCACGGCATGACATATGCACGTGCGCAAGTGAAGCACTTACAAGGGAGCAGACAGCGTAGGGATTTCGAATCCAACCCAGCTCTCGACACATGGCTAGACATAATAATGCGCAAGACAGCAGGTAATAAACAACATAAAACTAGCAAGATCGAAGCGGGTTGGAGTGGTTACCTGTTAAATGCATCAAAACTTGTGGGGAAACAAAGTACACATAGAGGTAATACCTTTATTGTTCGAGGGAAGTGTTTAGACACTTTGTTTGACGCACGAGTGCGAATGACGTATGATGCAATGCTTAGTATAAGGCAGTTTAGCGACCCTGGAGTGCGCTTCTGGCGCGGTTTTAATGATACGTTCCTATCTCGTAGGGCAAGTGACAGAGACCACACGTGCGCAACTAGTCTTGACGTGTTGGAGTGTGGAGAAGTTGCAGCATTACTTTGCTTAGCAATGTTTCCATGTGGGAAAATCACTTGTCATCAGTGTGTTCAGGACAACTTAAACCATGAGGGGCAAGCCAGTGACAAGAAGTTGCGAGAGAAGATCGTAAAGCTTAAAACTATCATACAAACCAATCACCCGACATTTAAGCATGCGATTCAAATGCTCGACCGTTACGAACAATCACTACAAATTAACCCAAATTATGAAGGATTTGCAGAGATACAAGGAATCTCTGAGGGAAGAAACAACTCTGTGTTCCCGCATGTAAATAAATTGAATGCAATCATCGTAAAAGGATCGCAAGCATCAAGCCATGAATTTAGCGAAGCTACGAAGAACTTATTGGAGATAGCACGATTTCTGCGGAACAGGACTGAAAATATAGAGAAGGGTTCTCTAAAACACTTTCGCAACAAAATATCCCAGAAATCCCACGTCAACACGGCTTTGTTGTGTGACAACCAACTAGACAAAAATGGAAACTTTATCTGGGGTGAAAGAGGATATCATGCAAAGCGATTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAATAAACCCAGCTGACGGGTATGGCAAGTATATGCAACGCCCAAACCCAAATGGTGGGAGAACGTTAGCAATAAATCGCCTTATCGTGCCTACCAATTTCGAAACACTACGGGATCAAATGCAAGGTGAGGCCATTGAATTGCAACCATTAACGAAAGCTTGTGTAAGTTTGATGAACGGCGATTATGTCCACGCTTGTTGCTGCGTGACTAATGATGCAGGCGATCCTATATTGTCCGACGTCCAGATGCCAACCAAACACCACTTGGTTATTGGTAATAGCGGAGACTCCAAGTATATAGACATGCCCAATTCAGAGGGCCAGAAGATGTACATAGCCAAAAATGGATACTGTTACATGAACATATTTTTAGCCATGTTGGTTAATGTTAACGAAACGGAAGCCAAAGCATTCACAAAGATGGTTCGAGACATAATAGTGGAAAGACTTGGACAGTGGCCTTCACTTCTCGACGTAGCTACAGCGTGTTATCTCTTAAAGGTGTTCTTTCCAGACATCAACAATGCTGAGTTACCAAGGATGCTAGTGGACCATACTACAAAGACAATTCATGTGCTTGATTCATACGGATCTCTGTCAACAGGCTACCATATTTTGAAGGCTAACACAGTCGAACAATTGATCAAATTCACGAGACACTCATTGGACTCTGAGATCAAGCACTATTCAGTAGGTGGGGATCCTCTAGAAGCCACACATGCAGAAGAAGAAGTGACTGATCCACAATTTCATCTTAAGCTGCTAATCAAAGGAATATACAACCCTCGAGCACTAGAGAAAGCTCTATTATGGAATAGGTATTTACCTCTATATGCAATGCTGTCGCCGGGGATTCTAGTGGCATTCTATAATAGTGGCTCATTAGAATATTTGATGGACCAATTTTTACGAAAGGACAATGACTTCGTAGTCACACTAGTTGTATTGAATTCACTTGCGAGGAAGGTTTCATGCGCCAGGAGTGTTGCATCGCAGATTAGCATAATCGAGAAAGGAGCACCAGGTATGATTGAAGCCATGCAAGGAATTAAACAGAGGCATGCGCTTCCATATGACACAGCGATGAAGATGTTGGTCACCCTGGCCTCTAGAAGTGAATCAAACACAGAGTTAGATGCGGCCGGGTACAGCTTGTTGCGAATGATCAGTGTGGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACACGATGGTTGGTGCGAGCTAACACCGTGTGGAAAATTGTCCGCAATGTGGCGTTCGTCAAAATTCTCAATGCGTACACGAAAAGAATTGGTAGTGGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAATCGATTACATCATATTTGGCAAGTGCACGTAAAGGAGTGAAACAAGCAACTTTAAGGACACGCACCAAGTTGTTAGGAGCGATGAATTCAGTTAGGACACAAATTGTGCGTGCTACATGTTCAACTATTAATTATTTTGTGCCAGATATTGTAAAGTTCATTAACGTTTTAGTTGTGATTGGGCTTATACTAACAATTGCAAGAGAGACTCAGAGCATGATCGCTAACTTCGCACAGATGAGTAAGAGCAAGCAGAAACTGCAAGACGAGCACGAGATGTGGCAGTTAAATTTTCACTTTAATCTACTTGAAAAGCAAGACGGAAAAGCGCCAACTTTTGAGGAGTTCGACAAACATCTAAAGTCAGTGGCACCACACCTTCGCCACTTAATTCAGGAAGAAGATAGCGTTGAGCATCAGTCAAAAAGGCATGAGCAGCAAGAGCTGGAACGTATCATAGCATTTGTCGCTCTGGTCTTAATGATGTTTGATGCAGAGCGGAGCGATTGTGTAACCAAGATTCTAAACAAAGTACGGAATTTGGTCACGACAACCGAGCCAGCTGTGTACCACCAAGCACTCAACGAGATTGAAGACGATCTGAGTGAGAAGAATTTCACAATAGATTTCGAACTGGACCAAGACGACCAACCAACTCAATCACAAATGCAAGAAACCACTTTTGCAATGTGGTGGGCGCATCAACTTGTAAGAGGACACACAATACCTCACTATCGAACAGAGGGGCAGTTCATGGTATTCACACGAGACACAGCACTCCAGGTGGCGCTTGACATTGCTAATGGTAGCCACAAGGATATATTGTTAATGGGTGGAGTAGGTTCAGGTAAGTCAACAGGCTTGCCATTTAATTTATCTACCAAAGGCAGCGTGCTACTCGTTGAACCCACAAGGCCATTAGCTGAGAATGTGCATCGCCATTTGGCGAAAGAGCCATTCTATATGAGTACAACGTTGCGGATGCGTGGGTTAACAACTTTCGGATCTGCACCAGTTACCATTATGACTAGCGGGTTTGCTTTAAATTATTTCGCACACAATAGGGAGCGCCTGAGAGAGTATGACTACACACTTTTTGATGAGTTTCACGTGGATGATTCGAACGCAATGGCGTTTAGATGTTTGTTGATTGACAATGCATATCATGGCAAGGTAGTTAAGATGTCAGCGACCCCACCTGGTAGGGAACCAGAATACACACCACAACATCCAGTTAAAGTGGAAGTAGAGGAATCACTGTCATTACAAGAGTTTGTGCGTGCACAGGGCACAGGGGCTAATGCTGATGTTGTTCGACATGGAGACAACATATTAGTTTATGTGGCAAGTTACAACGAGGTTGACATGCTTAGTGGATTGCTTTCAGAGCGTGGTTACAAGGTGACTAAAGTCGATGGACGCACAATGAAGGTTGGACGTGTTGAAATAACAACCTGTGGTACACCAAATAAGAAACACTTCATCGTAGCCACAAACATAATCGAGAATGGAGTAACACTTGATATCGAAGTTGTTGTGGATTTCGGAACTAAAGTTGTGCCTTCGCTGGATAGTGACAATAGAATGATGGTGTATAAGAAAATTCCCATCAACTATGGCGAGCGGATACAACGACTCGGAAGAGTTGGACGGCACAAGCCAGGGTTTGCCTTACGAATTGGTCACACGGAAAAGGGACTAAGTGAGATTCCAAGTAGCATTGCAACTGAAGCAGCTTTTAAATGCTTTACGTATGGATTGTCCGTGATACCGAACAATGTCACCACAAGTATCTTGGCAAATGTCACAGTACGACAGGCTAGAACAATGTCTCTTTTCGAATTAAACCCTTTTTACATGGCCAATTTAGTGCGATATGATGGATCAATGCATCAATCACTTCACAGTTTATTGAAACGATTTAAATTGCGTGATTCTGAGATTGTCTTGAACAAATTAGCAATTCCAAACAAAGGTTTGCAAACTTGGCTAACAGCAAGTGAGTATTCACGATTAGGATCGAATGTTCCTGATAGACGCGACATGCGCATACCTTTCATGTGCAAAGAAGTACCAGAGAAACTACACGAAGAAGTGTGGGCAGCTATTCAACAGTATAAGTGTGATGCTGGGTTTGGTAAGTTATCAAGCTCCAGCGCTTGTAAAATAGCATACACACTACAAACAGATGTAACTTCCATTCAAAGGACGGTGCGGATAATAGACACATTGATAGCAGAGGAACGTCGAAAACAGGAATACTTTCGGACT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| 31,945
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LC651460.1
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Scallion mosaic virus
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Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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Japan
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2022-03-30
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WOC441
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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ssRNA(+)
| 9,298
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GenBank
| 1
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Japan: Chiba
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Japan
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Allium macrostemon
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plant leaf
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2015
| null | null |
Scallion mosaic virus WOC441 RNA, nearly complete genome
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CACGAATTGAATGAATTGACAAAATTTGCGTTTCTTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTATCCCACCACTCACGATGGCCGCAGTCACATTACACGCTCCGATAATCCAAACTAGCAATAGTTATAAGAAGTCAGCAGTTATCCAGTTCGGAGAGAACAAACCAATGTTGATCACTAGGATTAACACTGAGCAGATTAAGATTTCAAAAGCAAGTGATGTTGATCAGGTTATTGCTGATCACTATAGACATCGCATAGCAAAGTCTGAGGCAAACCAGAATAAAATTGGTGTAGACCAATTGGTTGGACTTGTTTGTGATATTATGAAAGTCAAAGATAATGGCGAAATACATTTAATTGATAAGAAGGTTCAAAAACTTGACTTCAAAAGGAAACAAGGAACAGTTTATGCGCGTGCACGAGTAAAACACCTACAAGGACATAGACAACGCAGAGATTTTGAATCCAATCCAATTCTCGATACATGGTTGGACATAATAATGCGCAAGACTGTAGGTAAGAAAACACACAAAACTAGTTCAATCGAGGCAGGTTGGAGTGGTTTCCTACTAAATGCATCAAGACTTATAGGGAAACAGAGCACACACAGAGGAAACACTTTTATTGTTCGTGGAAAATGCGCAGACACATTGTTCGACGCACGAGTGCGAATGACGTATGATGCAATGTTAAACATTAGACAGTTTAGCGATGCAGGAGCGCGTTTCTGGCGTGGCTTCAATGATACATTTTTATCTTGTAGAGCAGACGATAGAGACCACACTTGCGCCACAAGTCTTGACGTATTGGAATGTGGACAAGTGGCAGCACTACTTTGTCTAGCAATGTTCCCATGTGGGAAAATCACTTGTCAGCAATGCGTCCAAGACAACTTAAATCATGAGGGTCAAGCTAGTGACAAAAATGTACGCGAAAAGGTTGGTAAGATCAAAACTATCATACAGACCAGTTATCCAGCATTCAAGCACGCGATACAGATGCTCGAACGTTATGAACAATCATTTCAGATAAATCCAAATTATGAAGGGTTTGCGGAAATACAAGGAATTTCTGAAGGGAGGAACAATTCTGCATTCTCACACGTGAATAGACTTAACGCAATACTCATTAAAGGGTCGCAAGCGTCGAGTCTCGAATTTAGTGAGGCCACAAAGAATTTATTGGAGATTACACGGTATTTGCGGAATAGAACTGAAAACATAGAGAAAGGCTCTCTAAAACATTTTCGGAACAAAATATCCCAGAAATCTCATATCAACACAGCGTTATTGTGCGACAACCAGTTAGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCATGCAAAGCGATTTTTCAGCAATTACTTCGAGATAGTAAACCCAGCAGATGGGTATGGTAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAATGGTGAAAGGAAATTGGCGATAAATCGTTTGATAGTTCCCACCAATTTCGAAACGCTACGAGACCAGATGCAAGGTGAGACTATTGAACCACAGCCACTGACGAAGGCGTGCGTCAGCATGATGAATGGAGACTATGTTCATGCCTGTTGCTGTGTTACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTTTATCTGATGTTCAAATGCCTACAAAACATCACCTGGTGATTGGCAATAGTGGTGATTCCAAGTATATAGACATGCCAAACACGGAGGGCCAGAAAATGTATATAGCTAAGAATGGGTACTGTTACATGAACATATTTCTAGCTATGTTAGTTAATGTTAATGAGACAGAAGCTAAAGCTTTCACAAAGATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTCGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTTTGAAAGTCTTCTTTCCAGACGTCAACAACGCTGAGTTACCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTGCTCGACTCATATGGATCCTTATCAACAGGCTACCACATTCTAAAAGCAAACACAGTTGAGCAATTGATTAAATTCACACGGCATTCACTGGACTCTGAAATCAAACATTACGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCGAAGCCATGCACACAAGGGAAGAACTAATCGACCCACAGTTCCATCTCAAATTGTTAATCAAAGGAATATATAATCCTCGAACACTAGAGAGAGCACTATTCTGGAACAGATATTTACCTTTGTATGCAATGCTGTCTCCAGGAATTTTAATAGCATTTTACAATAGTGGCTCACTAGAATATTTAATGGATCGGTTTCTGAGAAAAGATAATGACTTTGTTGTGACATTAGTTGTTTTGAAATCACTTGCTAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGCGTGGCATCGCAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAGGTTATCGAGGTTATGCAAGGAATCAAACAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGTTGGTGACTTTGGCTTCTAGGAGTGAATCAAATGCGGAACTAGATGAGGCTGGATATAGTTTACTACGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCGGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTTTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATCACCTCATATTTGGTAAGCACTCGTAAGGGATTGAAACAATTGGCTTTCAAAGCACGCAACAAAGTGTCAAAAACGATGGGTGCAATTAGGGCGCAAGTTGTGCGCGCAACGTGTTCAACAATCAATTATTTTGTACCGGATATTGTGAAATTCATCAATGTTTTGGTTGTTATTGGACTCTTACTGACAATAGCAAAGGAAACTCAGAGCATGATTAATAATTTTGCAAACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACATGAAATGTGGCAGCTTAATTTTCATTTTAACCTACTTGAAAAACAGGACGGTAGGGCACCAACTTTTGAAGAATTTGACAAGCATTTAACGTCGGTAGCACCGCATCTTCGACACCTAATCCAGGACGAGGATAACGTTGCACACCAGTCGAAGAGACAGGAGCAGCAAGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTTTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACCAAGATTTTAAACAAAGTGCGGAATTTGGTCACAACAACTGAGTCAACTGTATATCATCAAGCGCTTGACGAGATTGAGGATGATCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGCTAGACCAAGATCAACAACCAACCCAATCACAGATGCAAGAGCCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCGCATCAGTTAGAAAGAGGGCGCACAATACCCCATTACCGAACAGAAGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCCATTGACATTGCTAACGGTAGTCATAGAGACATATTACTGATGGGCGGAGTGGGCTCTGGCAAATCGACAGGTCTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAGTGTACTGCTCATTGAGCCTACAAGGCCATTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAACCATTCTACATGAATACAACATTGAGGATGCGCGGATTGACAACATTTGGTTCTGCACCAGTTACAATTATGACAAGCGGCTTTGCTTTGAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTCTTTGATGAGTTTCATGTGGACGATGCAAATGCAATGGCATTTAGATGTTTATTGATTGACAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCGACTCCACCTGGTAGAGAGCCAGAGTTTGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTGGTGGTGGAGGAATCGTTATCTTTGCAAGAATTCGTACGCGCACAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGAGACAATATACTGGTTTACGTAGCAAGTTACAACGAGGTTGACATGCTTGGGGGCTTGTTATCAGAGCGCGGCTATAAGGTGACAAAAGTTGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGCGTTGAAATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAGAAGCATTTCATTGTGGCCACGAACATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCGGACTTTGGGACCAAAGTGGTGCCTACGCTAGACATTGACAATAGAATGATGACATACAAGAAAATTCCTGTTAATTATGGAGAGCGTATACAACGAGTGGGACGGGTCGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCATTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGCTGAGCGAAATTCCAAGCAGTATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGCTTCACATATGGATTGCCCGTAATACCGAACAACGTTACCACAAGTATCCTGGCAAATACTACAGTTAGGCAAGCAAGAACGATGTCGCTCTTTGAGTTAAACCCTTTCTATATGGCCAATTTAGTGCGATATGATGGTTCAATGCACCAGTCTCTACACAACATCCTGAAGCGTTTCAAGTTACGTGATTCAGAGGTTGTACTTAACAAACTAGCCATCCCAAACAAAGGTCTACAAACTTGGTTGACAGCGAGCGAGTATTCACGGTTAGGATCAAATGTTCCTGACAGGCATGACATGCGCATACCTTTCATGTGCAAAGAGGTGCCAGAGAAGCTACACGAAGAGGTGTGGGAAGCCATACAAAAATATAAATGTGACGCCGGTTTTGGTAGACTGTCAAGCTCCAGCGCTTGTAAAGTAGCATACACACTGCAAACAGACGTCACCTCGATTCAAAGGACGGTGCGAATAATAGATACGCTGATTGCAGAAGAGCGTCGAAAGCAAGAATATTTCCGAACT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2022-03-30
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Potyviridae
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| 31,947
|
LC651462.1
|
Scallion mosaic virus
|
Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
|
Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
|
Japan
|
2022-03-30
|
WOHR52
|
Scallion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,298
|
GenBank
| 1
|
Japan: Hiroshima
|
Japan
|
Allium macrostemon
|
plant leaf
|
2013
| null | null |
Scallion mosaic virus WOHR52 RNA, nearly complete genome
|
CACGAATTGAATGAATTGACAAAATTTGCGTTTCTTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTATCCCACCATTCACGATGGCCGCGGTCACACTACACGCTCCAATAATCCAAACTAGCAATAGTTACAAAAAGTTAGCAGTTATCCAGTTCGGAGAGAACAAACCAATGTTGATCACTAGGATTAACACTGGGCAGATTAAGATTTCAAAAGCAAGTGATGTTGATCAGGTTATTGCTGGTCACTATAGACATCGCATAGCAAAGTCTGAGGCAAGCCAGAATAAAATTGGTGTAGACCAATTGATTGGACTTGTTTGTGATATTATGAAAGTCAAAGATAATGGTGAAATACACTTAATTGATAAGAAGGCCCAAAAACTTGACTTCAAAAAGAAACAGGGAACAGTTTATGCGCGTGCACAAGTAAAACACCTACAAGGACATAGGCAACGCAGAGATTTTGAATCCAATCCAATTCTCGATACATGGTTGGACATAATAATGCGCAAGACTGTAGGTAAGAAAACACACAAAACTAGTTCAATCGAGGCAGGTTGGAGTGGCTTCCTACTAAATGCATCAAGACTTATAGGGAAGCAGAGCACACACAGAGGAAACACTTTTATTGTTCGTGGAAAATGCGCGGATACATTGTTCGATGCACGAGTGCGAATGACGTATGATGCAATGTTAAACATTAGACAGTTTAGCGATGCAGGAGCGCGTTTCTGGCGTGGCTTCAATGATACATTTTTATCTTGTAGAGCAGACGATAGAGACCACACTTGCGCCACAAGTCTTGACGTATTGGAATGTGGACAAGTGGCAGCACTGCTTTGTCTAGCAATGTTCCCATGTGGGAAAATCACTTGTCAACAATGCGTTCAAGACAACCTAAATCATGAGGGTCAAGCTAGTGACAAAAATGTACGCGAAAAGGTTGGTAAGATCAAAACTATCATACAGACCAGTTATCCAGCATTCAGACACGCGATACAGATGCTCGAACGTTATGAACAATCATTTCAGATAAATCCAAATTATGAAGGGTTTGCAGAAATACAAGGAATTTCTGAAGGGAGGAACAATTCTGCATTCTCACACGTGAATAGACTTAACGCAATACTTATTAAAGGGTCGCAAGCATCAAGTCTTGAATTTAGTGAGGCCACAAAGAATTTATTGGAGATTGCACGGTATTTGCGGAATAGAACTGAAAACATAGAGAAAGGCTCTCTAAAACATTTTCGGAACAAAATATCCCAGAAATCTCATATCAACACAGCGTTATTGTGCGACAACCAGTTAGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCATGCAAAGCGATTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAGTAAACCCAGCAGATGGATATGGTAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAATGGTGAAAGGAAGTTGGCGATAAATCGTTTGATAGTTCCCACCAACTTCGAAACGCTACGAGACCAGATGCAAGGTGAGACTATTGAACCACAGCCACTGACGAAGGCGTGCGTCAGCATGATGAATGGAGACTATGTTCATGCCTGTTGCTGTGTCACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTTTATCTGATGTTCAAATGCCTACAAAACATCACCTGGTGATTGGCAATAGTGGTGATTCCAAGTATATAGACATGCCAAACACGGAGGGCCAGAAAATGTATATAGCTAAGAATGGGTACTGTTACATGAACATATTTCTAGCTATGTTAGTTAATGTTAATGAGACAGAAGCTAAAGCTTTCACAAAGATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTCGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTTTGAAAGTCTTCTTTCCAGACGTCAACAACGCTGAGTTGCCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTGCTCGACTCATATGGATCCTTATCAACAGGCTACCACATTCTAAAAGCAAACACAGTTGAGCAATTGATCAAATTCACACGGCATTCACTGGACTCTGAAATCAAACATTACGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCGAAGCCATGCACACAAGAGAAGAACTAATCGACCCACAGTTCCATCTCAAATTGTTAATCAAAGGAATATACAATCCTCGAACATTAGAGAGAGCATTATTCTGGAATAGATATTTACCTCTGTATGCAATGCTGTCACCAGGAATTTTAATAGCATTTTACAATAGTGGTTCACTAGAATATTTAATGGATCGGTTTCTGAGAAAAGATAATGACTTTGTTGTGACATTGGTTGTTTTGAAATCACTTGCTAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGCGTAGCATCGCAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAAATCATCGAGGTTATGCAAGGAATCAAACAAAGACACGTACTTCCGTACGACACAGCGATGAAGATGTTGGTGACTCTGGCTTCTAGGAGTGAATCAAATGCGGAACTAGACGAGGCTGGATATAGTTTACTACGAATGATTAGCCTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTTTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATCACCTCATATTTGGTAAGCACTCGTAAGGGATTGAAACAATTGGCTTTCAAAGCACGCAACAAAGTGTCAAAAACGATGGGTGCAATTAGGGCGCAAGCTGTGCGTGCAACGTGTTCAACAATCAATTATTTTGTGCCGGATATTGTGAAATTCATCAATGTTTTGGTTGTTATTGGACTCTTACTGACGATAGCAAGGGAAACTCAGAGCATGATTAACAATTTTGCAAACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGACGAACATGAAATGTGGCAGCTTAATTTTCATTTCAACTTACTTGAAAAACAGGATGGTAGGGCACCAACTTTTGAAGAATTTGACAAGCATTTAACGTCGGTAGCACCGCATCTTCGACACCTAATCCAGGACGAGGATAACGTTGCACACCAATCGAAGAGACAGGAGCAGCAAGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTTTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACCAAGATTTTAAACAAAGTGCGGAATTTGGTCACAACAACTGAATCAACTGTATACCATCAAGCACTTGACGAGATTGAAGATGATCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGCTAGACCAAGATCAACAACCAACCCAATCACAGATGCAAGAGCCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCGCATCAGCTAGAAAGAGGGCGCACAGTACCCCATTACCGAACAGAAGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCCATTGACATTGCTAACGGTAGTCATAGAGACATATTATTGATGGGCGGAGTGGGCTCTGGCAAATCGACAGGTCTACCATTCAATCTATCTACAAGAGGCAGTGTACTGCTCATTGAGCCTACAAGGCCATTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTTTACATGAATACGACATTGAGGATGCGCGGATTGACAACATTTGGTTCTGCACCGGTTACAATTATGACAAGCGGCTTTGCTTTGAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGATTACACACTCTTTGATGAATTTCATGTGGACGATGCAAATGCAATGGCATTTAGATGTTTATTGATTGACAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCAACTCCACCTGGTAGAGAGCCAGAATTTGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAGGAATCGTTATCTTTGCAAGAATTCGTACGCGCACAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGGGACAATATACTGGTTTACGTAGCAAGTTACAACGAGGTTGACATGCTTGGGGGCTTGTTATCGGAGCGCGGCTATAAGGTGACAAAAGTCGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGCGTTGAAATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAGAAGCATTTCATTGTGGCCACGAATATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCGGACTTTGGGACCAAAGTGGTGCCTACGTTAGATATTGACAATAGAATGATGACATACAAGAAAATTCCTGTGAATTATGGGGAGCGTATACAACGAGTGGGACGGGTTGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCATTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGCTGAGCGAAATTCCAAGCAGTATAGCAACTGAAGCAGCATTCAAATGCTTCACATATGGATTGCCCGTAATACCGAACAACGTTACCACAAGTATCCTGGCAAATGCTACAGTTAGGCAAGCAAGAACGATGTCGCTCTTTGAGTTAAACCCTTTCTATATGGCCAATTTAGTGCGATATGATGGTTCAATGCACCAGTCTCTACACAACATCCTGAAGCGCTTCAAGTTACGTGATTCAGAGGTTGTACTTAACAAACTAGCCATCCCAAACAAAGGTCTACAAACTTGGTTGACAGCGAGCGAGTATTCACGGTTAGGATCAAATGTTCCTGACAGGCATGACATGCGCATACCTTTCATGTGCAAAGAGGTGCCAGAGAAGCTGCACGAAGAGGTGTGGGAAGCCATACAGAAATATAAATGTGACGCCGGTTTTGGTAGACTGTCAAGCTCCAGCGCTTGTAAAGTAGCATACACACTGCAAACAGATGTCACCTCGATTCAAAGGACGGTGCGAATAATAGATACGCTGATCGCAGAAGAGCGTCGAAAGCAAGAATATTTCCGGACT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| 31,948
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LC651463.1
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Scallion mosaic virus
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Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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Japan
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2022-03-30
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WOIW305
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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ssRNA(+)
| 9,298
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GenBank
| 1
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Japan: Iwate
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Japan
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Allium macrostemon
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plant leaf
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2014
| null | null |
Scallion mosaic virus WOIW305 RNA, nearly complete genome
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CACGAATTGAATGAATTGACATAATTTGCGTTTATTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTACCTCACCATTCACAATGGCCATGACCACACTACACGCACCAGTCATGCAATCTAGTATTAATTATGAGAAATTAGCAGTAATTAAGTTTGGGGACAACAAACCAGTTTTGGTAACCAGAATCAACACTGGACAGATTAGAATATCGGAGGCAAGCAAGGTGGATCAAGCCATTGTTGGACGTTACAGACACCACAAGATGAAGACTAATGTCAAGCAAGGCAGCTTTAGTGTGGACCAGTTAATCGGACTTGTATGTGACATCATGAAGGTTAAGGACGATGGCGAAATACACTTAATTGATAAGAAAGTCCAGAAATTCAATTTTATAAAGAAGCACGGCATGACATATGCACGCGCGCAAGTGAAGCACTTACAAGGAAATAGACGGCGCAGGGATTTTGAATCCAACCCAGCTCTTGACACATGGCTAGACATAATAATGCGCAAGACAGCAGGTAACAGACAACACAGAACTAGCAAAATCGAGGCAGGGTGGAGTGGCCTCTTACTAAATGCATCAAAACTTGTAGGTAAGCAAAGTACACACAGAGGTAATACCTTCATTGTTCGAGGGAAGTGTTCAGACACTTTGTTTGACGCACGAGTGCGAATGACATACGATGCAATGCTTAGCATAAGGCAGTTTAGCGACCCTGGATTGCGCTTTTGGCGTGGTTTTAATGACACGTTCCTAGCCCGCAGAGAGAGTGACAGAGACCACACATGCGCAACTAGCCTTGATGTACTGGAATGTGGAGAAGTTGCAGCATTACTTTGCCTGGCAATGTTCCCATGCGGGAAAATCACTTGTCACCAGTGTGTTCAGGATAACTTGAATCATGAGGGTCAAGCCAGTGACAAAAGATTACGAGAGAAGATCGTAAAGCTTAAAACTGTCATACAAACCAATCACCCGACGTTCAAGCATGCGATTCAGATGCTCGACCGCTACGAGCAATCACTACAAATCAACCCAAATTATGAAGGATTTGCAGAAATACAAGGAATCTCTGAGGGAAGGAACAACTCTGTGTTCCCACACGTTAACAAACTAAACGCAATCATCATAAAAGGGTCGCAAGCATCAAGCCATGAATTCGGCGAGGCTACGAAGAATTTATTGGAAATAGCACGATTTTTGCGAAATAGAACTGAGAACATAGAGAAAGGTTCTCTAAAACACTTCCGCAACAAAATATCCCAAAAATCCCACGTCAATACGGCCTTGCTGTGTGACAATCAACTAGACAAAAATGGGAACTTTATCTGGGGTGAGAGAGGATATCATGCAAAGCGGTTTTTCAGCAATTACTTTGAGACAATAAACCCAGCTGATGGGTATAGTAAGTATATGAAACGACCGAACCCAAATGGTGGGAGAATGTTAGCAATAAATCGTCTCATCGTGCCTACTAATTTTGAAACACTACGGGACCAAATGCAAGGTGAAGCCATTGAAGTGCAGCCGTTGACGAAAGCTTGTGTGAGCATGATGAATGGCGACTATGTTCACGCCTGTTGCTGTGTAACTAATGATGCAGGAGATCCTATATTATCTGATGTTCAAATGCCAACTAAACACCATTTGGTTATTGGTAATAGTGGAGACTCCAAGTATATAGACATGCCCAACTCAGAGGGTCAAAAGATGTACATAGCCAAGAATGGATATTGCTATATGAATATATTTTTAGCCATGTTGGTTAATGTTAATGAAACAGAAGCTAAAGCATTCACAAAGATGGTTCGAGACATAATAGTGGAAAGACTTGGACAGTGGCCTTCACTTCTCGATGTGGCAACAGCATGTTATCTTCTGAAAGTTTTCTTTCCGGACATCAACAATGCCGAATTACCAAGGATGCTAGTGGATCACACCACAAGGACAATTCATGTACTAGACTCATATGGGTCTCTGTCAACAGGTTATCATATTTTGAAAGCAAACACAGTCGAACAACTTATCAAATTCACAAGACACTCATTAGACTCTGAGATCAAACACTACGCAGTGGGTGGGGACCCTCTAGAAGTCACACACGCGGAAGAAGAAGTGACTGATCCACAGTTTCACCTCAAGCTTCTGATCAAAGGAATATACAACCCTCGAGCATTAGAGAGAGCCTTATTATGGAATAGGTACCTACCTCTGTATGCAATGTTGTCGCCGGGAATTCTAATAGCGTTTTACAATAGTGGCTCATTAGATTATTTGATGGACCGATTTTTAAGAAAGGATAATGATTTCGTTGTCACACTAGTCGTCCTGAATTCACTTGCGAGGAAAGTCTCATGCGCTAGGAGCGTTGCATCGCAAATTAGCATAATCGAGAGAGGGGCACCAGGTATGATTGAAGCCATGCAGGGAATCAAACAGAGGCACGCGCTTCCATATGACACAGCAATGAAGATGTTGGTCACTCTGGCCTCTAGAAGCGAGTCAAATGCAGAATTAGATGAGGCCGGGTATAGCTTGTTGCGAATGATTAGTGTGGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACGCGATGGTTGGTGCGAGCTAACACCGTGTGGAAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAAATTCTCAATGCGTACACGAAGGGAATTAGTAGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATTACCTCATATTTGGCAAGTGTGCGCAAAGGGGCGACACAAGCAATTTTCAAGGCACGTAATAAACTATCAAAAGCAGTGGGCGCAGTCAGAACGCAAGCTGTACGCATGACATGCACAACCATTAATTATTTTGTGCCGGATATTGTAAAGTTTGTGAATGTTTTAGTTGTCATTGGGCTCTTATTAACAATTGCAAAAGAAACCCAGAGCATGATTTCTAATTTTGCACACATGAGTAAGAACAAGCAAAAGTTGCAGGACGAGCATGAAATGTGGCAACTCAATTTTCACTTCACGCTACTTGAGAAGCAGGATGGACAAGCACCAACCTTTGAGGAATTTGACAAACACTTGAAATCAGTAGCACCACACCTTCGCCATTTGATTCAGGAAGAAGACAGTGTTGAACACCAGTCAAAGAGACATGAACAGCAAGAGTTGGAACGAATCATAGCGTTTATTGCACTAGTCCTGATGATGTTTGATGCTGAGCGTAGTGACTGTGTGACCAAGATCTTGAACAAAGTACGAAATTTAGTTACGACAACTGAGCCAGTCGTGTACCACCAAGCACTTAATGAGATTGAGGATGATCTCAGCGAGAAAAATTTCACAATAGATTTTGAGCTGGATCAGGATGAGCAACCAACCCAATCACAAATGCAGGAAACAACTTTCGCAATGTGGTGGGCACACCAACTTACAAGAGGGCACACAGTACCTCACTACCGGACAGAAGGCCAGTTCATGGTGTTCACACGAGACACAGCACTTCAGGTTGCTCTCGACATCGCCAATGGTAGCCACAAGGATATATTGTTAATGGGTGGTGTGGGTTCAGGTAAGTCAACAGGCTTACCATTCAATTTATCCACAAAGGGGAGCGTTTTGCTTATAGAACCTACTAGACCGTTAGCCGAGAACGTGCACCGCCATCTGGCAAAGGAACCATTTTATATGAACACAACATTAAGGATGCGTGGGCTAACAACTTTTGGTTCTGCACCAGTCACAATTATGACTAGTGGCTTTGCTTTGAACTATTTCGCACATAACAGGGAGCGCCTAAGGGAGTATGACTACACACTATTCGACGAGTTCCACGTCGATGATTCGAATGCAATGGCGTTCAGGTGCTTGTTGATTGACAACGCATATCACGGCAAGGTAGTTAAAATGTCAGCAACCCCACCTGGAAGAGAGCCTGAATTTACACCACAACACCCAGTGAAAGTGGAGATAGAGGAATCACTATCCTTACAAGAGTTTGTGCGTGCACAAGGCACGGGGGCAAACGCCGACGTCATTCGACATGGGGATAATATTTTGGTCTATGTTGCAAGTTATAATGAAGTTGACATGCTTGGAGGATTGTTGTCAGAACATGGTCACAGAGTGACTAAAGTCGATGGACGCACAATGAAGGTTGGACGCGTCGAAATAACCACTTGTGGTACGCCAAACAAGAAGCACTTTATTGTGGCCACAAACATAATCGAGAATGGGGTCACGCTTGATATCGAAGTAGTCGTAGATTTTGGGACCAAGGTCGTACCTTCACTAGATAGCGACAATAGAATAATGGTGTATAAGAAAATTCCCATCAATTATGGTGAGCGAATACAACGACTTGGGCGAGTCGGACGACACAAGCAAGGGTATGCTCTGCGAATTGGCCATACTGAAAAGGGATTAAGCGAGATTCCAAGTAGTATAGCAACTGAAGCAGCGTTTAAGTGCTTCACATACGGATTGCCTGTAATACCGAACAATGTCACTACAAGCATTCTGGCAAATGTCACAGTGCGGCAAGCTAGAACAATGTCACTTTTTGAACTAAATCCTTTCTACATGGCAAATCTAGTGCGATACGATGGATCTATGCACCAGTCGCTACACAATATCTTGAAACGTTTCAAATTACGCGACTCGGAAATTATTCTAAATAAGCTGGCCATCCCGAACAAAGGTTTACAAACTTGGTTGACAGCAAGCGAGTATTCACGACTAGGATCAAGCGTCCCAGATAGACGTGACATGCGCATACCTTTTATGTGCAAAGAAGTGCCTGAGAAGTTACATGAAGAGGTATGGGAAGCTATTCAAAAATACAAGTGTGATGCTGGTTTTGGTAAGCTATCAAGCTCTAGTGCTTGTAGAGTGGCATACACGTTGCAAACAGACATTACTTCAATTCAGAGAACAGTACGGATAATAGACACGCTAATAGCAGAGGAGCGTCGGAAACAGGAGTATTTCCGAACC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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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2022-03-30
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WOK140
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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GenBank
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Japan
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| 31,950
|
LC651465.1
|
Scallion mosaic virus
|
Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
|
Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
|
Japan
|
2022-03-30
|
WOKG131
|
Scallion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,298
|
GenBank
| 1
|
Japan: Kagoshima
|
Japan
|
Allium macrostemon
|
plant leaf
|
2013
| null | null |
Scallion mosaic virus WOKG131 RNA, nearly complete genome
|
TACGAATCGAATGAATTGACACAATTTGCGTTTATTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTAGCCCACCATTCACCATGGCTTTGGCCGTTCCACAAACAGTAGTTATGCGAACTAGTAGTAAGAGCGAGAAGCTATCAGTAATTCAATTTGGTACAAATAAACCAGTGTTAGTCACGAGAGTTAACGCTGGACAAATAAAAATCTCAAAAGCAAGTAAAATGGACCAAGCCATAGTTGGCCATTATAAGCACCGCAGTGCAAAATCTGGGGTGAGCCAGGAGAAGATCAGTGTGGACCAACTAGTAGGGCTTATATGTGACATAATGAAGGTTAAAGATAATGGAGAAATTCACTTAATCGATGGAAAAACTCAGAAACTTGATTTCATTAGGAAACGCAATGCAGTTTATGCTCGTGCCCATGTTAAGCATTTACAAGGTCACAGGCAACGTAGGGATTTTGAATCTAATTCGACTCTTGACAAATGGTTGGACATAATTATGCGTAGAACAGCAGGCAACAAACCACATAAAACCAGCGCCATAGAAGCAGGTTGGAGTGGCTTTCTCTTAAATGCTTCAAAGCTTGCAGGTAGACAGAGTACACATAGGGGTCATACCTTTATTGTTCGAGGCAAGTGCGCGGATACTTTGTTTGATGCACGAGTGCGAACAACTTATGATGCAATGCTACGTATGAGACAGTTTAGCGACCCAGGTGCACGATTCTGGCGTGGCTTCAATGACACATTTCTAGCACGTAGAGCGAGCGATAGAGATCACGTCTGTACCACTAACCTCAATGTAATGGAATGTGGGGAAGTAGCAGCGTTACTTTGTTTAGCCATGTTCCCGTGTGGAAAAATCACTTGTCACCAGTGTGTTCAAGATAACTTAGATCATGAAGGACAAGCTAGTGATAGAAGTCTACGTGAAAAGATTAGTGGAATCAAGACAATTATACAAACGAATCATCCAACATTCAAGCACGCAATACAAATGCTTGACCGGTATGAACAGTCATTTCAAATAAATCCGAATTATGAGGGTTTCGCAGAGATACAAGGAATTTCTGAAGGGAGGAATAATTCTGTGTTTCCACACATAAACAAACTCAATGCAATAATCATCAAGGGATCGCAAGCGTCGAGTCTAGAGTTTAGTGAAGCTACAAAGAATTTGTTGGAAATCACACGATTTCTACGAAACAGAACAGAGAACATAGAGAAAGGCTCTCTAAAACATTTTAGAAACAAGATATCTCAAAAATCTCACATCAACGCAGCCCTATTGTGCGACAACCAGTTAGACAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCATGCAAAGCGGTTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAGTAAACCCAGCAGATGGGTATGGCAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAATGGTGAAAGGAAGTTGGCGATAAGTCGTTTGATAGTTCCCACCAACTTCGAGACGCTACGAGACCAAATGCAAGGTGAGACTATTGAACCACAGCCACTGACGAAGGCGTGTGTAAGCATGATGAATGGAGATTACGTTCATGCCTGTTGCTGTGTTACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTCTATCCGACGTTCAAATGCCTACAAAACATCACCTGGTGATTGGCAATAGTGGTGACTCCAAGTATATAGACATGCCAAATACGGAGGGTCAGAAAATGTATATAGCTAAGAATGGGTACTGTTACATGAACATATTTCTAGCTATGTTAGTGAACGTTAATGAGACAGAGGCTAAAGCTTTCACGAAAATGGTCAGGGATATAGTGGTAGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTCGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTTTGAAAGTCTTCTTTCCAGATGTTAACAACGCTGAGTTACCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTGCTCGACTCATATGGATCCCTATCAACAGGCTACCACATTCTAAAAGCAAACACAGTTGAGCAACTGATTAAATTTACACGGCATTCACTGGACTCTGAGATCAAACATTACGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCGAAACTATGCACACAAGAGAAGAACTAATCGACCCACAGTTCCATCTCAAATTGTTAATCAAAGGAATATACAATCCTCGAACATTAGAGAGAACATTATTTTGGAATAGATATTTGCCTTTATATGCAATGCTGTCACCGGGAATTCTAATAGCATTCTACAATAGTGGTTCACTAGAATATTTAATGGATCGGTTCCTAAGAAAAGATAATGACTTTGTTGTAACATTAGTTGTTTTAAAATCACTTGCAAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGTGTGGCTTCGCAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAAGTCATTGAGGTTATTCAAGGGATCAAACAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGCTGGTGGCTCTGGCTTCTAGAAGTGAATCAAATGCGGAACTAGATGAGGCTGGATATAGCTTACTACGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTTCAGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTCTCAATACGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAATCGATCACCTCATATTTGGTAAGCACTCATAAGGGATTGAAACAATTGGCATTCAAAGCGCGCAGCAGAGTGTCAAAAACGATGGGTGCAATTAGAGCGCAAGTTGTACGCGCAACGTGTTCAACAGTCAATTATTTTGTACCGGATATTGTGAGATTCATCAATGTTTTGGTGGTTATTGGACTTTTACTGACAATAGCAAGGGAAACTCAGAGCATGATTAATAATTTTGCAAACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACATGAGATGTGGCAGCTTAATTTTCATTTCAATTTACTTGAAAAACAGGACGGTAGGGCACCAACTTTTGAAGAATTTGACAAGCATTTAATGTCGGTAGCACCGCATATTCGACACCTAATTCAGGACGAGGATAACGTTAAACACCAGTCGAAAAGACAAGAGCAGCAAGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTTTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGTGTAACCAAGATCTTAAACAAAGTGCGGAATTTGGTCACAACAACTGAAACAACTGTATACCATCAAGCGCTTGACGAGATTGAGGATGATCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGTTAGACCAAGATCAACAACCAACTCAATCACAGATGCAAGAGCCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCGCATCAGTTAGAAAGAGGGCGCACAGTACCCCATTATCGAACAGAAGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCCATTGACATTGCTAACGGTAGTCATAGAGACATACTATTGATGGGTGGAGTGGGTTCTGGCAAATCGACAGGTCTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAATGTACTGCTCATCGAGCCTACAAGGCCATTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTCTACATGAATACGACATTGAGGATGCGCGGATTGACCACATTTGGTTCCGCACCGGTTACAATTATGACAAGCGGCTTCGCTTTAAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTTTTTGATGAATTTCATGTGGACGATGCAAACGCAATGGCATTTAGATGTTTATTGATTGATAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCAACTCCACCCGGTAGAGAGCCAGAATTCGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAAGAATCATTGTCTTTGCAAGAATTCGTACGCGCACAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGAGACAATATACTGGTTTACGTAGCAAGTTATAACGAGGTTGACATGCTTGGGGGCTTGTTGTCGGAGCGTGGCTATAAGGTGACAAAAGTCGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGCGTTGAGATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAGAAACATTTCATTGTGGCCACGAATATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCGGACTTTGGGACTAAAGTGGTACCCACGCTTGATATTGACAATAGAATGATGACATATAAGAAAATCCCCGTCAACTATGGAGAGCGTATACAACGAGTGGGACGAGTTGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCATTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGCTGAGCGAAATTCCAAGCAGTATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGCTTCACATATGGATTGCCCGTAATACCGAATAACGTCACCACAAGCATCCTGGCAAATGCTACAGTTAGGCAAGCAAGAACGATGTCGCTCTTTGAGTTAAATCCATTCTATATGGCTAATCTAGTCCGCTACGATGGATCGATGCATCAATCATTACACAATATTCTGAAGCGTTTTAAATTGCGTGACTCAGAAATCGTTCTAAATAAATTAGCCATCCCAAATAAAGGTCTACAATCTTGGTTGACGGCGAGTGAGTATTCACGGTTGGGGTCGAACGTTCCTGACAGACACGACATGCGCATACCCTTTATGTGCAAAGAAGTGCCAGAGAAACTACATGAGGAGGTGTGGGAAGCAATTCAGAAGTACAAGTGCGATGCTGGGTTCGGTAGGTTATCAAGCTCTAGCGCTTGCAAAATAGCATATACGCTGCAGACAGACGTCACCTCAATCCAAAGGACTGTGCGGATAATAGACACATTAATAGCAGAGGAGCGACGGAAACAAGAATATTTTCGAACT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| 31,951
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LC651466.1
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Scallion mosaic virus
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Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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Japan
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2022-03-30
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WOKN375
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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ssRNA(+)
| 9,298
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GenBank
| 1
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Japan: Kanagawa
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Japan
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Allium macrostemon
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plant leaf
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2014
| null | null |
Scallion mosaic virus WOKN375 RNA, nearly complete genome
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TACGAATCGAATGAATTGACACAATTTGCGTTTATTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTAGCCCACCATTCACCATGGCTTTGGCCGTTCCACAAACAGTAGTTATGCGAACTAGTAGTAAGAGCGAGAAGCTATCAGTAATTCAGTTTGGTACAAATAAACCAGTGTTAGTCACGAGAGTTAACGCTGGACAAATAAAAATCTCAAAAGCAAGTAAAATGGACCAAGCCATAGTTGGCCATTATAAGCACCGCAGTGCAAAATCTGGGGTGAGCCAGGAGAAGATCAGTGTGGACCAACTAGTAGGACTTATATGTGATATAATGAAGGTCAAAGATAATGGAGAAATTCACTTAATTGATGGAAAAGCTCAGAAACTTGATTTCATTAGGAAACGCAATGCAGTTTATGCTCGTGCCCATGTTAAGCATTTACAAGGTCGCAGGCAACGTAGGGATCTTGAATCTAATCCGACTCTTGACAAATGGTTGGACATAATTATGCGTAGAACAGCAGGTAACAAACCACATAAGACCAGCGCCATAGAAGCAGGTTGGAGTGGTTTTCTTTTAAATGCTTCGAAGCTTGCAGGCAGACAGAGTACACATAGGGGTCATACCTTTATTGTTCGAGGCAAGTGCGCAGATACTTTGTTTGATGCACGAGTGCGAACAACTTATGATGCAATGCTACGTATGAGACAGTTTAGCGACCCAGGTGCACGATTCTGGCGTGGCTTCAATGACACATTCCTGGCACGTAGAGCGAGCGATAGAGACCACGTCTGTACCACTAACCTCGACGTAATGGCATGTGGGGAAGTAGCAGCGTTACTTTGTTTAGCCATGTTCCCGTGTGGAAAAATCACTTGTCACCAGTGTGTTCAAGATAACTTAAATCATGAAGGACAAGCTAGTGATAGAAGTCTACGTGAAAAGATTAGTGGAATCAAGACAATTATACAAACGAATCATCCAACATTCAAGCACGCAATACAAATGCTTGACCGGTATGAACAGTCATTTCAAATAAATCCGAATTATGAAGGTTTCGCAGAGATACAAGGAATTTCTGAAGGGAGGAATAATTCTGTGTTTCCACACATAAGCAAACTCAATGCAATAATCATCAAGGGATCGCAAGCGTCAAGCCTAGAGTTTAGTGAAGCCACAAAGAATTTGTTGGAAATCACACGATTTTTACGAAACAGAACAGAGAACATAGAGAAAGGCTCCCTAAAACATTTTAGAAACAAGATATCTCAAAAATCTCACATCAACGCAGCCCTATTGTGCGACAACCAGTTAGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCATGCAAAGCGATTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAGTAAACCCAGCAGATGGGTATGGCAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAACGGTGAAAGGAAGTTAGCAATAAGTCGTTTGATAGTTCCCACCAACTTTGAAACACTACGAGACCAGATGCAAGGTGAGACTATTGAACTACAGCCACTGACGAAGGCGTGTGTAAGCATGATGAATGGAGACTACGTTCATGCCTGTTGCTGTGTTACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTTTATCTGATGTTCAAATGCCTACAAAACATCACCTGGTGATTGGCAATAGTGGTGATTCCAAGTATATAGACATGCCGAATACGGAGGGTCAGAAAATGTATATAGCTAAGAATGGGTACTGTTACATGAACATATTTCTAGCTATGTTAGTGAACGTTAATGAGACAGAAGCTAAAGCTTTCACGAAAATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTCGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTTTGAAAGTCTTCTTTCCAGACGTCAACAACGCTGAGTTACCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTGCTCGACTCATATGGATCCCTATCAACAGGCTACCACATTCTAAAAGCAAACACAGTTGAGCAATTGATTAAATTTACACGGCATTCACTGGACTCTGAGATCAAACATTACGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCGAAACTATGCATACAAGAGAAGAACTAATCGACCCACAGTTCCATCTTAAATTGTTAATCAAAGGAATATACAATCCTCGAACATTAGAGAGAACATTATTTTGGAATAGATATTTGCCTTTGTATGCAATGCTGTCACCGGGAATTCTAATAGCATTTTACAATAGTGGTTCGTTAGAATATTTAATGGATCGGTTCCTAAGAAAAGATAATGACTTTGTTGTGACATTAGTTGTTTTAAAATCACTTGCAAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGCGTGGCATCGCAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAAGTCATCGAGGTTATACAAGGAATCAAACAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGCTGGTGACTCTGGCTTCTAGAAGTGAATCAAATGCGGAACTAGATGAGGCTGGGTATAGCTTACTACGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTCTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATCACCTCATATTTGGTAAGCACTCATAAGGGATTGAAACAATTGGCTTTCAAAGCGCGCAACAGAGTGTCAAAAACGGCGGGTGCAATTAGAGCGCAAGTTGTACGCGCAACGTGTTCAACAATCAATTATTTTGTACCGGATATTGTGAAATTCATCAATGTTTTGGTGGTTATTGGACTCTTATTGACAATAGCAAAGGAAACTCAGAGCATGATTAATAATTTTGCAAACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACACGAAATGTGGCAACTTAATTTTCATTTCAATTTACTTGAGAAACAGGACGGTAGGGCACCGACTTTTGAAGAATTTGACAAGCATTTAATGTCGGTAGCACCGCATCTTCGACATCTAATTCAGGACGAGGATAACGTTGAACACCAGTCGAAGAGACAAGAGCAGCAAGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTCTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACCAAGATCTTAAACAAAGTGCGAAATTTGGTCACAACAACTGAAACAACTGTATACCATCAAGCGCTTGACGAGATTGAGGATGATCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGTTAGACCAAGATCAACAGCCAACTCAATCACAGATGCAAGAACCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCGCATCAGTTAGAAAGAGGGCGCACAGTACCCCATTACCGAACAGAAGGTCATTTCATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCCATTGACATTGCTAACGGTAGTCATAGAGACATACTATTGATGGGTGGAGTGGGCTCTGGCAAATCGACAGGTCTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAATGTACTGCTTATCGAGCCTACAAGGCCATTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTCTACATGAATACGACATTGAGGATGCGCGGATTGACAACATTTGGTTCCGCACCGGTTACAATTATGACAAGCGGTTTCGCTTTAAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTTTTTGATGAATTTCATGTGGACGATGCAAACGCAATGGCATTTAGATGTTTATTGATTGATAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCAACTCCACCTGGTAGAGAGCCAGAATTCGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAAGAATCATTGTCTTTGCAAGAATTCGTACGCGCACAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGAGACAATATACTGGTTTACGTAGCAAGTTATAACGAGGTTGACATGCTTGGGGGCTTGTTGTCGGAGCGTGGCTATAAGGTGACAAAAGTCGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGCGTTGAGATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAGAAACATTTCATTGTGGCCACGAATATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCGGACTTTGGGACCAAAGTGGTGCCCACGCTTGATATTGACAATAGGATGATGACATATAAGAAAATTCCTGTCAATTATGGAGAGCGTATACAACGAGTGGGACGAGTTGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCATTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGCTGAGCGAAATTCCAAGCAGTATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGCTTCACATATGGATTGCCCGTAATACCGAACAACGTCACCACAAGCATCCTGGCAAATGCTACAGTTAGGCAAGCAAGAACGATGTCGCTCTTTGAATTAAATCCATTCTATATGGCCAATCTAGTCCGCTATGATGGATCGATGCATCAATCATTACACAATATTCTGAAGCGTTTTAAATTGCGTGACTCAGAAATCGTTCTAAATAAATTAGCCATCCCAAATAAAGGTCTACAATCTTGGTTGACAGCGAGTGAATATTCACGGTTGGGGTCGAACGTTCCTGACAGACACGACATGCGTATACCCTTTATGTGCAAAGAAGTGCCAGAGAAACTACATGAGGAAGTGTGGGAAGCAATTCAGAAGTACAAATGTGATGCTGGGTTCGGCAGGTTATCAAGCTCTAGCGCTTGTAAAATAGCATATACGTTGCAGACAGACGTCACCTCAATTCAAAGGACTGTGCGGATAATAGACACATTAATAGCAGAGGAGCGACGGAAGCAAGAGTATTTTCGAACT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| 31,952
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2022-03-30
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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| 1
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| 31,953
|
LC651468.1
|
Scallion mosaic virus
|
Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
|
Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
|
Japan
|
2022-03-30
|
WOKN613
|
Scallion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,298
|
GenBank
| 1
|
Japan: Kanagawa
|
Japan
|
Allium macrostemon
|
plant leaf
|
2015
| null | null |
Scallion mosaic virus WOKN613 RNA, nearly complete genome
|
CACGAATTGAATGAATTGACAAAATTTGCGTTTCTTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTACCCCACCACTCACGATGGCCGCGGTCACATTACACGCCCCGATAATCCAAACTAGCAATAATTATAAGAAGTTAGCAGTTATCCAGTTCGGAGAGAACAAACCAATGTTGATCACTAGGATTAACACTAAGCAAATTAAGATTGCAAAAGCAAGTGAAGTTGATCAGGTTACTGCTGATCACTATAGACATCGCATAGCAAAGTCTGAGGCAAGCCAGAATAAAATTGGAGTAGACCAATTGGTTGGACTTGTTTGCAATATTATGAAAGTCAAAGATAATGGCGAAATACACTTGATTGATAAGAAGGTCCAAAAACTTGACTTCAAAAGGAAACAAGGAACAATTTATGCGCGTGCACAAGTGAAACACCTACAAGGACATAGACAGCGCAGAGATTTTGAATCCAATTCAATTCTCGATACATGGCTGGACATAATAATGCGCAAGACTGTAGGTAAGAAAACACACAAAACTAGCTCAATCGAAGCAGGTTGGAGTGGTTTCCTACTAAGTGCATCAAGACTTATAGGGAGACAGAGCACACACAGAGGGAACACTTTTATTGTTCGTGGAAAATGCGCAGATACATTGTTCGATGCACGAGTGCGAATGACGTATGATGCAATGTTAAACATTAGACAGTTTAGCGATGCAGGAGCGCGTTTCTGGCGTGGCTTCAATGATACATTTTTATCTTGTAGAGCAGACGATAGAGACCACACTTGCGCCACAAGTCTTGACGTATTGGAATGTGGACAAGTGGCAGCACTGCTTTGTCTAGCAATGTTCCCATGTGGGAAAATCACTTGTCAGCAATGCGTTCAAGACAACCTAAATCATGAGGGTCAAGCTAGTGACAAAAATGTACGCGAAAAGGTTGGTAAGATCAAAACTATCATACAGACCAGTTATCCAGCATTCAGGCACGCGATACAGATGCTCGAACGTTATGAACAATCATTTCAGATAAATCCAAACTATGAAGGCTTTGCAGAAATACAAGGAATTTCTGAAGGGAGAAACAATTCTGCATTCTTACACGTGAATAGACTTAACGCAATACTCATTAAAGGGTCGCAAGCGTCAAGTCTCGAATTTAGTGAGGCCACAAAGAATTTATTGGAGGTTGCACGGTATTTGCGGAATAGAACTGAAAATATAGAGAAAGGCTCTCTAAAACATTTTCGGAATAAAATATCCCAGAAATCTCATATCAACACAGCGTTATTGTGCGACAACCAGTTAGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCATGCAAAGCGATTTTTCAGCAACTACTTCGAGACAGTAAACCCAGCAGATGGGTATGGCAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAATGGTGAAAGGAAGTTGGCGATAAATCGTTTGATAGTTCCCACCAACTTTGAAACGCTACGAGACCAAATGCAAGGTGAGGCTATTGAGCCACAGCCACTGACGAAGGCGTGCGTCAGCATGATGAATGGAGATTATGTTCATGCCTGTTGTTGTGTTACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTTTATCTGATGTTCAAATGCCTACAAAGCATCACCTAGTGATTGGCAATAGTGGTGATTCCAAGTACATAGACATGCCAAACACGGAGGGCCAGAAAATGTATATAGCTAAGAATGGGTACTGTTACATGAACATATTTTTAGCTATGTTAGTTAACGTTAATGAGGTAGAAGCCAAAGCTTTTACGAAGATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTCGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTCTGAAAGTCTTCTTTCCAGACGTCAACAACGCTGAGTTACCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTGCTCGACTCATACGGATCCTTATCAACAGGCTACCACATTCTAAAAGCAAACACAGTTGAGCAATTGATTAAGTTCACACGGCATTCACTGGACTCTGAAATTAAACATTACGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCAAAGCCATGCACACAAGAGAAGAACTAATCGATCCACAGTTCCATCTCAAATTGTTAATCAAAGGAATATACAATCCTCGAACATTAGAGAGAGCATTATTCTGGAATAGATATTTACCTTTGTATGCAATGCTGTCACCAGGAATTTTAATAGCATTTTACAATAGTGGTTCACTAGAATATTTAATGGATCGGTTTCTAAGGAAAGATAATGACTTTGTTGTGACATTAGTTGTTTTGAAATCACTTGCAAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGCGTAGCATCGCAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAAGTCATCGAGGTTATGCAAGGAATCAAACAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGTTGGTGACTCTGGCTTCTAGGAGTGAATCAAACGCGGAACTAGATGAGGCTGGATATAGCTTACTACGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACACGATGGATGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTTTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATCACCTCATATTTGGTAAGCACTCGTAAGGGATTGAAACAATTGGCTTTCAAAGCACGCAACAAAGTGTCAAAAACGATGGGTGCGATTAGGGCGCAAGTTGTACGCGCAACGTGTTCAACAATCAATTACTTTGTACCGGATATTGTGAAATTCATCAATGTTTTGGTGGTTATTGGACTCTTACTGACAATAGCAAGGGAAACTCAAAGCATGATTAATAATTTTGCAAACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACATGAAATGTGGCAGCTTAATTTTCATTTCAATCTACTTGAAAAACAGGACGGTAGGGCGCCAACCTTTGAAGAATTTGACAAGCATTTAACGTCGGTAGCACCGCATCTTCGACACCTAATCCAGGACGAGGATAACGTTGAACACCAGTCGAAGAGACAGGAGCAGCAGGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTTTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACCAAGATTTTAAACAAAGTGCGGAATTTGGTCACAACAACTGAATCAACTGTATACCATCAAGCGCTTGGAGAGATTGAGGATGATCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGCTAGACCAAGATCAACAACCAACCCAATCACAGATGCAAGAGCCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCACATCAGTTAGAAAGAGGGCGCACAATACCCCATTACCGAACAGAAGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCCATTGACATTGCTAACGGTAGTCATAGAGACATATTATTGATGGGCGGAGTGGGCTCTGGCAAATCGACAGGTCTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAGTGTACTGCTCATCGAGCCTACAAGGCCATTAGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTCTACATGAATACGACATTGAGGATGCGCGGATTGACAACATTTGGTTCTGCACCAGTTACAATTATGACAAGCGGCTTTGCTTTGAATTATTTTGCACACAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTTTTTGATGAATTTCATGTGGACGATGCAAATGCAATGGCATTTAGATGTTTATTGATTGACAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCAACTCCACCTGGTAGAGAGCCAGAATTTGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAGGAATCATTATCTTTGCAAGAATTCGTACGCGCACAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGAGACAATATACTGGTTTACGTAGCGAGTTACAACGAGGTTGACATGCTTGGGGGCTTGTTATCGGAGCGCGGCTATAAGGTGACAAAAGTCGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGCGTTGAAATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAGAAACATTTTATTGTGGCCACGAATATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTCGTTGCGGACTTTGGAACCAAAGTAGTGCCTACGCTAGATGTTGACAATAGAATGATGACATACAAGAAAATTCCTGTTAATTATGGAGAGCGTATACAACGAGTGGGACGGGTTGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCATTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGCTGAGCGAAATTCCAAGCAGTATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGCTTCACATATGGATTGCCCGTAATACCGAACAACGTTACCACAAGTATCCTGGCAAATGCTACAGTTAGGCAAGCAAGAACGATGTCGCTCTTTGAGTTAAATCCATTCTATATGGCTAATTTAGTCCGTTACGATGGATCGATGCATCAATCATTACATAATATTCTGAAGCGTTTTAAATTGCGCGATTCAGAAATCGTTCTAAATAAATTAGCCATCCCAAATAAAGGTCTACAATCTTGGTTGACAGCGAGTGAGTATTCACGGTTGGGGTCGAATGTTCCCGACAGACACGACATGCGTATACCCTTTATGTGCAAAGAAGTGCCAGAGAAACTACATGAGGAAGTGTGGGAAGCAATTCAGAAGTACAAGTGTGACGCTGGGTTCGGTAGGTTATCAAGCTCTAGCGCTTGCAAAATAGCATATACATTGCAGACAGATGTTACCTCAATCCAAAGGACTGTGCGGATAATAGACACATTAATAGCAGAGGAGCGGCGGAAACAAGAATATTTTCGAACT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| 31,954
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LC651469.1
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Scallion mosaic virus
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Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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Japan
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2022-03-30
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WOKW282
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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ssRNA(+)
| 9,298
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GenBank
| 1
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Japan: Kagawa
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Japan
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Allium macrostemon
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plant leaf
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2014
| null | null |
Scallion mosaic virus WOKW282 RNA, nearly complete genome
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CACGAATTGAATGAATTGACAAAATTTGCGTTTCTTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTATTCCACCACTCACGATGGCCGCGGTCACATTACACGCTCCGATAATCCAAACTAGTAATAATTATAAGAAGTTAGCAGTTATCCAGTTCGGGGAGAACAAACCAATGTTGATCACTAGGATTAACACTGAGCAGATTAAAATTTCAAAAGCAAGTGATGTTGATCAGGTTATTGCTGGTCACTATAGACATCGCAGAGCAAAATCTGAGACGAATCAGAATAAAATTGGTGTAGACCAGTTGGTTGGACTTGTTTGCGATATCATGAAAGTCAAAGATAATGGCGAAATACACCTAATTGATAAGAAGGTCCAAAAACTTGACTTCAAAAGAAAACAAGGAACAGTTTATGCGCGCGCACAAGTAAAACACCTACAAGGACATAGACAACGCAGAGATTTTGAATCCACTCCAATGCTTGACACATGGTTGGATATAATAATGCGTAAGACTGTAGGTAAGAGAACACACAAAACTAGTTCAATCGAGGCAGGTTGGAGTGGTTTCTTACTAAATGCATCAAGACTTATAGGGAGGCAGAGCACACACAGAGGAAACACCTTTGTTGTTCGTGGAAAATGCGCAGACACATTGTTCGATGCACGAGTGCGAATGACGTATGATGCAATGTTAACCATTAGACAGTTTAGCGATGCAGGAGCGCGTTTCTGGCGTGGCTTCAATGATACATTTTTATCTTGTAGGGCAGACGATAGAGACCACACTTGTGCCACAAGTCTTGACGTATTGGAATGTGGACAAGTGGCAGCACTGCTTTGTCTAGCAATGTTCCCATGTGGAAAAATCACTTGTCAGCAATGCGTTCAAGACAACCTAAATCATGAGGGGCAAGCTAGTGACAAAAATGTACGCGAAAAGGTTGGTAAGATCAAAACTATCATACAAACCAGTTATCCAGCATTCAGGCACGCGATACAGATGCTCGAACGTTATGAACAATCATTTCAGATAAATCCAAATTATGAAGGGTTTGCAGAAATACAAGGGATTTCTGAAGGAAGGAACAATTCTGCATTCTCACACGTGAATAGGCTTAATGCAATACTCATTAAAGGATCGCAAGCGTCAAGTCTTGAGTTTAGTGAGGCCACAAAGAATCTATTGGAGATTGCACGGTATTTGCGGAATAGAACTGAAAACATAGAGAAAGGCTCTCTGAAACATTTTCGGAACAAAATATCCCAGAAATCTCATATCAACACAGCGTTATTGTGCGACAACCAGCTAGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTACCACGCAAAGCGATTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAGTAAACCCAGCAGATGGGTATAGCAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAATGGTGAAAGGAAGTTGGCGATAAATCGTTTGATAGTTCCCACCAACTTCGAAACGTTACGAGATCAGATGCAAGGTGAGACTATCGAACTACAGCCACTGACGAAGGCGTGCGTTAGTATGATGAATGGAGACTACGTTCATGCCTGTTGCTGTGTTACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTCTATCTGATGTTCAAATGCCTACGAAACATCACCTGGTGATTGGCAATAGTGGCGATTCCAAGTATATAGACATGCCGAATACGGAGGGCCAGAAAATGTATATAGCCAAGAATGGGTTCTGTTACATGAACATATTTCTAGCCATGTTAGTTAACGTTAATGAGACAGAAGCTAAAGCTTTCACGAAGATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTTGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTTTGAAAGTCTTCTTTCCAGACGTCAACAACGCTGAGTTACCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTGCTCGACTCATATGGATCCTTATCAACAGGCTACCACATTCTAAAAGCAAACACAGTTGAGCAATTGATTAAATTCACACGGCACTCACTGGACTCTGAGATCAAACATTATGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCGCAGCCATGCACACAAGGGAAGAACTAATCGACCCACAGTTCCATCTCAAATTATTAATCAAAGGAATATACAATCCTCGAACATTAGAGAGAGCATTGTTTTGGAATAGATATTTACCCTTGTATGCTATGCTGTCACCAGGAATTTTAATAGCATTTTACAATAGTGGTTCACTAGAGTATTTAATGGATCGGTTCTTAAGTAAAGATAATGACTTTGTAGTGACATTAGTTGTTTTAAAATCACTTGCAAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGCGTAGCATCGCAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAAGTCATCGAGGTTATGCAAGGAATCAAACAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGTTGGTGACTCTGGCTTCTAGGAGTGAATCAAATGCGGAACTAGATGAGGCTGGGTATAGTTTACTACGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTTTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTAGTGGTAGAAGATACCACAGATTTGGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATCACCTCATATTTGGTAAGCACTCGTAAGGGATTGAAACAATTGGCTTCCAAAGCACGTAGCAAAGTGTCAAGAACGATGGGTGCGATTAGGGCGCAAGTTGTACGCGCAACGTGTTCAACAATCAATTATTTTGTACCGGATATTGTGAAATTCATCAATGTTTTGGTGGTTATTGGACTCTTACTGACAATAGCAAGGGAAACTCAGAGCATGATTAATAATTTTGCAAACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACATGAAATGTGGCAGCTTAATTTTCATTTCAACTTACTTGAAAAACAAGATGGTAGGGCACCAACTTTTGAAGAGTTTGACAAGCATTTATCGTCGGTAGCACCGCATCTTCGACACTTAATCCAGGACGAGGATAATGTTGAACACCAGTCGAAGAGACAGGAGCAGCAAGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTCTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACCAAGATTTTAAACAAAGTGCGGAATTTGGTCACAACAACTGAATCAACTGTATACCACCAAGCACTTAACGAAATTGAGGATGATCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTCGAGCTAGACCAAGATCAACAACCAATTCAATCGCAGATGCAAGAGCCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCACATCAGTTAGAAAGAGGGCGCACAGTACCCCATTACCGAACAGAAGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCCATTGACATTGCTAACGGTAGTCATAGAGACATATTATTGATGGGTGGAGTGGGCTCTGGCAAATCAACAGGTTTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAGTGTACTGCTCATCGAGCCTACAAGGCCATTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTTTACATGAATACGACATTGAGGATGCGCGGATTGACAACATTTGGTTCTGCACCGGTTACAATTATGACAAGCGGTTTTGCTTTGAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTTTTTGATGAATTTCATGTGAACGATGCAAATGCAATGGCATTTAGATGTTTACTGATTGACAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCAACTCCACCTGGTAGAGAGCCAGAATTCGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAAGAATCATTATCTTTGCAAGAATTTGTACGCGCACAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGAGACAATATACTGGTTTACGTAGCAAGTTATAACGAGGTTGACATGCTTGGGGGCTTGTTATCGGAGCGTGGCTATAGGGTGACAAAAGTCGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGTGTTGAGATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAAAAGCATTTCATTGTGGCTACAAACATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCAGACTTTGGGACCAAAGTGGTGCCTACGCTAGATGTTGACAATAGAATGATGACATACAAGAAAATTCCAGTCAATTATGGAGAGCGTATACAACGTGTGGGACGGGTTGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCGCTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGTTGAGCGAAATCCCAAGCAGTATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGTTTCACATATGGATTGCCCGTAATACCGAACAACGTTACCACAAGTATCTTGGCAAACGTTACAGTTAGGCAAGCAAGAACAATGTCGCTCTTTGAGTTAAACCCATTCTATATGGCTAATTTAGTCCGCTACGATGGATCGATGCATCAATCATTACACAGTATTCTGAAGCGTTTTAAATTGCGTGACTCAGAAATCGTTCTAAATAAATTAGCCATCCCGAATAAAGGTCTACAATCTTGGTTGACAGCGAGTGAGTATTCACGGTTGGGGTCGAATGTTCCTGACAGACACGACATGCGTATACCCTTTATGTGCAAAGAAGTACCAGAGAAGCTACATGAGGAAGTGTGGGAAGCAATTCAGAAGTACAAGTGTGACGCTGGGTTCGGTAAGTTATCAAGCTCTAGCGCTTGCAAAATAGCATATACGCTGCAGACGGATGTTACCTCAATCCAAAGGACCGTGCGAATAATAGACACATTAATAGCAGAGGAGCGGCGGAAACAAGAATACTTTCGAACT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| 31,955
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Scallion mosaic virus
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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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Japan
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2022-03-30
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WOM206
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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| 1
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| 31,956
|
LC651471.1
|
Scallion mosaic virus
|
Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
|
Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
|
Japan
|
2022-03-30
|
WOM210
|
Scallion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,298
|
GenBank
| 1
|
Japan: Miyazaki
|
Japan
|
Allium macrostemon
|
plant leaf
|
2014
| null | null |
Scallion mosaic virus WOM210 RNA, nearly complete genome
|
CACGAATTGAATGAATTGACAAAATTTGCGTTTCTTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTATTCCACCACTCACGATGGCCGCGGTCACATTACACGCTCCGATAATCCAAACTAGTAATAATTACAAGAAGTTAGCAGTTATCCAGTTCGGGGAGAACAAACCAATGTTGATCACTAGGATTAACACTGAGCAGATCAAAATTTCAAAAGCAAGTGATGTTGATCAGGTTATTGCTGGTCACTATAGACATCGCAGAGCAAAGTTTGAGGCAAGCCAGAATAAAATTGGTGTAGACCAATTGGTTGGACTTGTTTGCGATATAATGAAAGTTAAAGATAATGGCGAAATACACCTAATTGATAAGAAGGTCCAAAAACTTGACTTTAAAAGAAAACAAGGAACAGTTTATGCGCGTGCACAAGTAAAACACCTACAAGGACATAGACAACGCAGAGATTTTGAATCCAATCCAATGCTCGATACATGGTTGGATATAATAATGCGTAAGACTGTAGGTAAGAAAACACACAAAACTAGTTCAATCGAGGCAGGTTGGAGTGGTTTCTTACTAAATGCATCAAGACTTATAGGGAGACAGAGCACACACAGAGGAAATACTTTTGTTGTTCGTGGAAAATGCGCAGACACATTGTTCGATGCACGAGTGCGAATGACGTATGATGCAATGTTAACCATTAGACAGTTTAGCGATGCAGGAGCGCGTTTCTGGCGTGGCTTCAATGATACATTTTTATCTTGTAGGGCAGACGATAGAGACCACACTTGTGCCACAAGTCTTGACGTATTGGAATGTGGACAAGTGGCAGCACTGCTTTGTCTAGCAATGTTCCCATGTGGAAAAATCACTTGTCAGCAATGCGTTCAAGACAACCTAAATCATGAGGGGCAAGCTAGTGATAAAAATGTACGCGAAAAGGTTGGCAAGATCAAAACTATCATACAGACCAGTTATCCAGCATTCAGGCACGCAATACAGATGCTCGAACGTTATGAACAATCATTCCAGATAAATCCAAATTATGAAGGGTTTGCAGAAATACAAGGAATTTCTGAAGGAAGGAACAATTCTGCATTCTCACACGTGAATAGGCTTAATGCAATACTCATCAAAGGGTCGCAAGCGTCAAGTCTCGAGTTTAGTGAGGCCACAAAGAATTTATTGGAGATTGCACGGTATTTGCGGAATAGAACTGAAAACATAGAGAAAGGCTCTCTGAAACATTTTCGGAACAAAATATCCCAGAAATCTCATATCAACACAGCGTTATTATGCGACAACCAGTTGGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCACGCAAAGCGATTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAGTAAACCCAGCAGATGGGTATGGCAAGTACGCGAAACGACCAAATCCGAATGGTGAAAGGAAGTTGGCGATAAATCGTTTGATAGTTCCCACCAACTTCGAAACGTTACGAGACCAGATGCAAGGTGAGACTATTGAACCACAGCCACTGACGAAGGCGTGCGTCAGTATGATGAATGGAGACTACGTTCATGCCTGTTGCTGTGTTACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTCTATCTGATGTTCAAATGCCTACAAAACATCACCTGGTGATTGGCAATAGTGGCGATTCCAAGTATATAGACATGCCAAATACGGAGGGCCAGAAAATGTATATAGCTAAGAATGGGTACTGTTACATGAACATATTTCTAGCTATGTTAGTTAACGTCAATGAGACAGAAGCTAAAGCTTTCACGAAGATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAACGATTGGGACAATGGCCTTCATTACTTGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTTTGAAAGTCTTCTTTCCAGACGTCAACAATGCTGAATTACCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTGCTCGACTCATATGGATCCTTATCAACAGGCTACCACATTCTAAAAGCAAACACAGTTGAGCAATTGATTAAATTCACACGGCATTCACTGGATTCTGAGATCAAACATTATGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCGCAGCCATGCACACAAGGGAAGAACTAATCGACCCACAGTTCCATCTCAAATTGTTAATCAAAGGAATATACAACCCTCGAACATTAGAGAGAGCATTATTTTGGAATAGATATTTACCTTTGTATGCAATGCTGTCACCAGGAATTTTAATAGCATTTTACAATAGTGGTTCATTAGAATATTTAATGGATCGGTTCCTAAGTAAAGATAATGACTTCGTTGTGACATTAGTTGTCTTAAAATCACTTGCAAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGCGTAGCATCGCAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAAGTCATCGAGGTTATGCAAGGAATCAAACAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGTTGGTGGCTCTGGCTTCTAGGAGTGAATCAAATGCGGAACTAGATGAGGCTGGGTATAGTTTACTGCGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTTTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATTACCTCATATTTGGTAAGCACTCATAAGGGATTGAAACAATTGGCTTCCAAAGCACGAAACAAAGTGTCAAGAACGATGGGTGCAATTAGGGCGCAAGTTGTACGCGCAACGTGTTCAACAATCAATTATTTTGTACCAGATATTGTGAAATTCATCAATGTTTTGGTGGTTATTGGACTCTTACTGACAATAGCAAGGGAAACTCAGAGCATGATTAATAATTTTGCAAATATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACATGAAATGTGGCAGCTTAATTTTCATTTCAACTTACTTGAAAAACAGGACGGTAGGGCACCAACTTTTGAAGAATTTGACAAGCATTTAACGTCGGTTGCACCGCATCTTCGACACTTAATCCAGGACGAGGATAACGTTGAACATCAGTCGAAGAGACAGGAGCAGCAAGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTCTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACCAAGATTTTAAACAAAGTGCGGAACTTGGTCACAACAACTGAATCAACTGTATACCATCAAGCACTTGACGAGATTGAGGATGATCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGCTAGACCAAGATCAACAACCAACTCAATCACAGATGCAAGAGCCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCACATCAGTTAGAAAGAGGGCGCACAGTACCCCATTACCGAACAGAAGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGATACAGCACTTCAGGTTGCCATTGACATTGCTAACGGTAGTCATAGAGATATATTATTGATGGGTGGAGTGGGCTCTGGCAAATCGACAGGTCTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAGTGTACTGCTCATCGAGCCTACAAGGCCATTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTCTACATGAATACGACATTGAGGATGCGCGGATTGACAACATTTGGTTCTGCACCGGTTACAATTATGACAAGTGGCTTTGCTTTGAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTTTTTGATGAATTTCATGTGGACGATGCAAATGCAATGGCATTTAGATGTTTACTGATTGACAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCGACTCCACCTGGTAGAGAGCCAGAATTCGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAAGAATCATTATCTTTGCAAGAATTTGTACGCGCGCAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGAGACAATATACTGGTTTACGTAGCAAGTTACAACGAAGTTGACATGCTTGGGGGTTTGTTATCGGAGCGTGGCTATAAAGTGACAAAAGTCGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGTGTTGAGATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAGAAGCATTTCATTGTGGCCACGAATATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCAGACTTTGGGACCAAAGTGGTGCCTACGCTAGATGTTGACAATAGAATGATGACATACAAGAAAATTCCTGTTAACTATGGAGAGCGTATACAACGTGTGGGACGGGTTGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCACTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGTTGAGCGAAATTCCAAGCAGTATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGTTTTACATATGGATTGCCCGTAATACCGAACAACGTTACCACAAGTATCCTGGCAAACGCTACAGTTAGGCAAGCAAGAACAATGTCGCTCTTTGAGTTAAATCCATTCTATATGGCTAATTTAGTCCGCTACGATGGATCGATGCATCAATCATTACACAGTATTCTGAAGCGTTTTAAATTGCGCGACTCAGAAATCGTTTTAAATAAATTAGCCATCCCAAATAAAGGTCTACAATCTTGGTTGACAGCGAGTGAGTATTCACGGTTGGGGTCGAATGTTCCTGACAGACACGACATGCGTATACCCTTTATGTGCAAAGAAGTGCCAGAGAAACTACATGAAGAAGTGTGGGAAGCAATTCAGAAGTACAAGTGTGATGCTGGGTTCGGTAAGTTATCAAGCTCTAGCGCTTGCAAAATAGCATATACGTTGCAGACGGATGTAACCTCAATCCAAAGGACTGTGCGAATAATAGACACATTAATAGCAGAGGAGCGGCGGAAACAAGAATATTTTCGAACT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| 31,957
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LC651472.1
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Scallion mosaic virus
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Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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Japan
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2022-03-30
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WONS12
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Scallion mosaic virus
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Potyvirus
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Potyviridae
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ssRNA(+)
| 9,298
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GenBank
| 1
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Japan: Saga
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Japan
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Allium macrostemon
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plant leaf
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2012
| null | null |
Scallion mosaic virus WONS12 RNA, nearly complete genome
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CACGAATTGAATGAATTGACAAAATTTGCGTTTCTTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTATTCCACCACTCACGATGGCCGCGGTCACATTACACGCTCCGATAATCCAAACTAGTAATAATTATAAGAAGTTATCAGTTATCCAGTTCGGGAAGAACAAACCAATGTTGATCACTAGGATTAACACTAAGCAGATTAAAATTTCAAAAGCAAGTGATGTCGATCAGGTTGTTGCTGGTCACTATAGACATCGCAGAGCAAGGTCTGAGGCAAGCCAGAATAAAATTGGTGTAGACCAATTGGTTGGGCTTGTTTGCGATATTATGAAAGTCAAAGATAATGGCGAAATACACCTAATTGATAAGAAGGTCCAAAAACTTGACTTCAAAAGAAAACAAGGAACGGTTTATGCGCGTGCACAAGTAAAACATCTACAAGGGCATAGACAACGCAGAGATTTTGAATCCAATCAAATTCTCGATGCGTGGTTGGACATAATAATGCGCAAGACTGTAGGTAAGAAAACACACAAAACTAGTTCAATCGAGGCAGGTTGGAGTGGTTTCCTACTAAATGCATCAAGACTTATAGGGAGACAGAGCACACACAGAGGAAACACTTTTATTGTTCGTGGAAAATGCGCAGATACATTGTTCGATGCACGAGTGCGAATGACGTACGATGCAATGTTAAACATTAGACAGTTTAGCGATGCAGGGGCGCGTTTCTGGCGTGGCTTCAATGACACATTTTTATCTTATAGAGCAGACGATAGAGACCACACTTGCGCCACAAGTCTTGACGTATTGGAATGTGGACAAGTGGCAGCACTGCTTTGTCTAGCAATGTTCCCCTGTGGGAAAATCACTTGTCAGCAATGCGTTAAAGACAACCTAAATCATGAGGGTCAAGCTAGTGACAAAAATGTACGCGAAAAGGTTGGTAAGATCAAAACTATCATACAGACCAGTTATCCAGCATTCAGGCACGCGATACAGATGCTCGAACGTTATGAACAATCTTTTCAGATAAATCCAAATTATGAAGGGTTTGCAGAAATACAAGGAATTTCTGAAGGGAGGAACAACTCTGCATTCTCACACGTGAATAGGCTTAACGCAATACTCATCAAAGGATCGCAAGCGTCAAGTCTCGAGTTTAGTGAGGCCACAAAGAATTTATTGGAGATTGCACGGTATTTGCGGAATAGAACTGAAAACATAGAGAAAGGCTCTCTAAAACATTTTCGGAACAAAATATCCCAGAAATCTCATATTAACACAGCGTTATTGTGCGACAACCAGTTAGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCATGCAAAGCGATTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAGTAAACCCAGCAGATGGGTATGGCAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAATGGTGAAAGGAAGTTGGCGATAAATCGTTTGATAGTTCCCACCAACTTCGAGACGCTACGAGACCAAATGCAAGGTGAGACTATTGAACCACAGCCACTGACGAAGGCGTGCGTCAGCATGATGAATGGAGACTACGTTCATGCCTGTTGCTGTGTTACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTTTGTCTGATGTTCAAATGCCTACAAAACATCACTTGGTGATTGGCAATAGTGGTGATTCCAAGTATATAGACATGCCAAACACGGAGGGCCAGAAAATGTATATAGCTAAGAATGGGTACTGTTACATGAACATATTTCTAGCGATGTTGGTCAACGTCAATGAGACAGAAGCTAAAGCTTTCACGAAGATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTCGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTCTGAAAGTCTTCTTTCCAGATGTCAACAATGCTGAGTTGCCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGATTCACGTACTCGATTCATATGGATCCTTATCAACAGGCTACCATATTCTAAAAGCAAACACAGTCGAGCAATTGATTAAATTCACACGGCATTCACTGGAATCTGAGATCAAGCATTACGCAGTGGGTGGAGATCCTCTCGAAGCCATGCACACAAGGGAAGAACTAATCGACCCACAGTTCCATCTCAAATTGTTAATCAAAGGAATATATAATCCTCGAGCATTAGAGAGAGCATTATTTTGGAATAGATATTTACCTTTGTATGCAATGCTGTCACCAGGAATTTTAATAGCATTTTACAATAGTGGCTCACTAGAATATTTGATGGATCGGTTCCTAAGAAAAGATAATGACTTTGTCGTGACACTAGTTGTTTTGAAATCACTTGCAAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGCGTAGCGTCGCAAATTAGTATAATTGAGAGAGGTGCACCGGAAGTCATCGAGGTTGTGCAAGGGATCAAACAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGTTGGTGACTCTGGCTTCTAGGAGTGAATCAAATGCGGAACTAGATGAGGCTGGGTATAGCCTACTACGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAACTATCTGCAGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTTTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATTACCTCATATTTGGTAAGCACTCGTAAGGGATTGAAACAATTGGCTTTCAAAGCACGCAACAAAGTGTCAAAAACGATGGGTGCAATTAGGGCGCAAGTTATACGCGCAACGTGTTCAACAATCAATTATTTTGTACCGGATATTGTAAAGTTCATCAATGTTTTGGTGATTATTGGACTCTTACTGACAATAGCAAGGGAAACTCAGAGCATGATTCATAATTTTGCAAACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACATGAAATGTGGCAGCTTAATTTTCATTTCAACTTACTTGAAAAACAAGACGGTAGGGCACCAACTTTTGAAGAATTTGACAAGCATCTAACGTCGGTAGCACCGCATCTTCGACACCTAATCCAGGACGAGGAATACGTTGAACACCAATCGAAGAGACAAGAGCAGCAGGAGTTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTTTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACCAAGATTTTGAACAAAGTGCGGAATTTGGTCACAACAACTGAATCAACTGTATACCATCAAGCGCTTAACGAGATTGAGGATGATCTAAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGCTAGACCAAGATCAACAACCAACTCAATCACAGATGCAAGAACCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCGCATCAATTAGAAAGAGGGCGCACAGTACCCCATTACCGAACAGAAGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCTATTGACATTGCTAACGGTAGTCATAGAGACATATTATTGATGGGCGGAGTGGGCTCTGGCAAATCTACAGGTCTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAGTGTGCTACTCATCGAGCCTACGAGGCCATTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTCTACATGAACACGACATTGAGGATGCGCGGATTAACAACATTTGGTTCTGCACCGGTTACAATTATGACAAGCGGCTTTGCTTTGAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTTTTTGATGAATTTCACGTGGACGATGCAAATGCAATGGCATTTAGATGTTTATTGATTGACAACGCCTACCATGGCAAAGTTGTTAAGATGTCAGCAACTCCGCCTGGTAGGGAGCCAGAATTCGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAAGAATCATTGTCTTTGCAAGAATTCGTACGCGCACAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGAGACAATATACTGGTTTACGTGGCAAGTTATAACGAGGTTGACATGCTTGGGGGCTTGTTATCGGAGCGTGGCTATAAGGTGACAAAAGTCGATGGGCGTACAATGAAAGTCGGACGCGTCGAGATAACAACTTGTGGGACACCAAACAAGAAGCATTTCATTGTGGCCACGAATATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCGGACTTTGGGACTAAAGTGGTGCCTACGCTAGATGTTGACAATAGAATGATGACATATAAGAAAATTCCTGTCAATTATGGAGAGCGTATACAACGAGTGGGACGAGTTGGGAGGCACAAACCAGGGTTTGCATTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGCTGAGCGAAATTCCAAGCAGCATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGCTTCACATATGGATTGCCCGTGATACCGAACAACGTTACCACAAGTATCCTGGCAAATGCTACAGTTAGGCAAGCAAGAACGATGTCGCTCTTTGAGTTAAATCCATTCTATATGGCTAATTTAGTCCGCTATGATGGATCGATGCATCAATCATTACACAATATTCTGAAGCGTTTTAAATTGCGTGACTCAGAGATCGTTCTAAATAAATTAGCCATCCCAAATAAAGGTCTACAATCTTGGTTGACAGCGAGTGAGTATTCACGGTTGGGGTCGAATGTTCCTGACAGACACGATATGCGTATACCCTTTATGTGCAAAGAAGTGCCAGAGAAACTACATGAGGAAGTGTGGGAAGCAATCCAGAAGTACAAGTGTGATGCTGGGTTCGGTAGGTTATCAAGCTCTAGTGCTTGCAAAATAGCATATACGTTGCAGACAGATGTCACCTCAATCCAGAGGACTGTGCGGATAATAGACACATTAATAGCAGAGGAGCGGCGGAAACAAGAATATTTTCGAACT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Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
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2022-03-30
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Potyviridae
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| 31,959
|
LC651474.1
|
Scallion mosaic virus
|
Ohshima,K., Kawakubo,S., Muraoka,S., Gao,F., Ishimaru,K., Kayashima,T., Fukuda,S.
|
Faculty of Agriculture, Laboratory of Plant Virology; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
|
Japan
|
2022-03-30
|
WON224
|
Scallion mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,298
|
GenBank
| 1
|
Japan: Nagasaki
|
Japan
|
Allium macrostemon
|
plant leaf
|
2014
| null | null |
Scallion mosaic virus WON224 RNA, nearly complete genome
|
CACGAATTGAATGAATTGACAAAATTTGCGTTTCTTAGCTCAAATTCACTGCAATTAGCACTTTTCGTATCCCACCACTCACGATGGCCGCGGTCACATTACACGCTCCGATAATCCAAACTAGCAATAGTTATAAGAAGTTAGCAGTTATCCAGTTCGGAGAGAACAAACCAATGTTGATCACTAGGATTAACACTGAGCAGATTAAGATTTCAAAAGCAAGTGATGTTGATCAGGTTATTGCTGGTCACTATAGACATCGCATAGCAAAGTCTGAGGCAAGCCAGAATAAAATTGGTGTAGACCAATTGGTTGGACTTGTTTGTGATATTATGAAAGTCAAAGATAATGGCGAAATACACTTAATTGATAAGAAGGTCCAAAAACTTGACTTCAAAAGGAAACAAGGAACAGTTTATGCGCGTGCACAAGTAAAACACCTACAGGGACATAGACAACGCAGAGATTTTGAATCCAATCCATTTCTCGATACATGGTTGGACATAATAATGCGCAGGACTGTAGGTAAGAAAACACACAAAACTAGTTCAATTGAGGCAGGTTGGAGTGGTTTCCTACTAAATGCATCAAGACTTACAGGGAAACAGAGCACACACAGAGGAAACACTTTTATTGTCCGTGGAAAATGCGCAGATACATTGTTCGATGCACGAGTGCGAATGACGTATGATGCAATGTTAAACATTAGACAGTTTAGCGATGCAGGAGCGCGTTTTTGGCGTGGCTTCAATGATACATTTTTATCTTGTAGAGCAGACGATAGAGACCACACTTGCGCCACAAGTCTTGACGTATTGGAATGTGGACAAGTGGCAGCACTGCTTTGTCTAGCAATGTTCCCATGTGGGAAAATCACTTGTCAGCAATGCGTTCAAGACAACCTAAATCATGAGGGTCAAGCTAGTGACAAAAATGTACGCGAAAAGGTTGGTAAGATCAAAACAATCATACAGACCAGTTATCCAGCATTCAGGCACGCGATACAGATGCTCGAACGTTATGAACAATCATTTCAGATAAATCCAAATTATGAAGGGTTTGCAGAAATACAAGGAATTTCTGAAGGGAGGAACAATTCTGCATTCTTACACGTGAATAGACTTAACGCAATACTCATTAAAGGGTCGCAAGCTTCAAGTCTCGAATTTAGTGAGGCCACAAAGAATTTATTGGAGATTGCACGGTATTTGCGGAATAGAACTGAAAACATAGAGAAAGGCTCTCTGAAACACTTTCGGAACAAAATATCCCAGAAATCTCATATCAACACAGCGTTATTGTGCGACAACCAGTTAGATAAGAATGGAAATTTTGTTTGGGGTGAGAGAGGGTATCATGCAAAGCGGTTTTTCAGCAATTACTTCGAGACAGTAAACCCAGCAGATGGGTATGGTAAGTACGCAAAACGACCAAATCCAAATGGTGAAAGGAAGTTGGCGATAAATCGTTTGATAGTTCCCACCAACTTCGAAACGCTACGAGACCAGATGCAAGGTGAGACTATTGAACCACAGCCACTGACGAAGGCGTGTGTCAGCATGATGAATGGAGACTATGTTCATGCCTGTTGCTGTGTTACCACTGATGCAGGTGATCCAGTTTTATCTGATGTTCAAATGCCTACAAAACATCACCTGGTGATTGGCAATAGTGGTGATTCCAAGTATATAGACATGCCAAACACGGAGGGCCAGAAAATGTATATAGCTAAGAACGGGTACTGTTACATGAACATATTTCTAGCTATGTTAGTTAATGTTAATGAGACAGAAGCTAAAGCTTTCACAAAGATGGTCAGAGATATAGTGGTGGAGCGATTAGGACAATGGCCTTCACTCCTCGACGTGGCAACAGCATGCTACCTTTTGAAAGTCTTCTTTCCAGACGTTAACAATGCTGAGTTACCCAGAATGTTAGTGGATCACACGACAAAGACGGTTCACGTGCTCGACTCATATGGATCCTTATCAACAGGTTACCACATTCTAAAAGCAAACACAGTTGAGCAATTGATTAAATTCACACGGCATTCATTGGACTCTGAAATCAAACATTACGCAGTGGGTGGCGATCCTCTCGAAGCCATGCACACAAGAGAAGAACTAATCGACCCACAATTCCATCTCAAATTGTTAATCAAAGGAATATACAATCCTCGAACATTAGAGAGAGCATTATTCTGGAATAGATATTTACCTTTGTATGCAATGCTGTCACCAGGAATTTTAATAGCATTTTACAATAGTGGTTCATTAGAATATTTAATGGATCGGTTTCTGAGAAAAGATAATGACTTTGTTGTGACATTAGTTGTTTTGAAATCACTTGCTAGAAAAGTCTCATGTGCTAGAAGCGTAGCATCGCAAATTAGTATAATCGAGAGAGGTGCACCGGAAATCATCGAGGTTATGCAAGGAATCAAACAAAGACACGTACTTCCATACGACACAGCGATGAAGATGTTGGTGACTCTGGCTTCTAGGAGTGAATCAAATGCGGAACTAGATGAGGCTGGATATAGTTTACTACGAATGATTAGCTTCGAAGTGATGGAAAAAAATTATCTGCAGATCTTACACGATGGTTGGCGCGAGTTAACACCGTGTGGGAAATTGTCCGCAATGTGGCGCTCGTCAAGATTCTCAATGCGTACACAAAGAGAGTTGGTGGTAGAAGATACCACAGATTTAGGAGGCAGATACAGCGAGTCGATCACCTCATATTTGGTAAGCACTCGTAAGGGATTGAAACAATTGGCTTTCAAAGCACGCAACAAAGTGTCAAAAACGATGGGTGCAATTAGGGCGCAAGTTGTGCGCGCAACGTGTTCAACAATCAATTATTTTGTACCGGATATTGTGAAATTCATCAATGTTTTGGTTGTTATTGGACTCTTACTGACAATAGCAAGGGAAACCCAGAGTATGATCAATAATTTTGCAGACATGAAGAAGAGTAAACAGAAGTTACAGGATGAACATGAAATGTGGCAGCTTAATTTTCATTTCAACCTACTTGAAAAACAGGACGGTAGGGCACCAACTTTTGAAGAATTTGACAAGCATTTAACGTCGGTAGCACCGCATCTTCGACACCTAATCCAGGACGAGGATAACGTTGCACACCAGTCGAAGAGACAGGAGCAGCAAGAATTGGAGCGCATCATAGCCTTTATTGCATTAGTTTTAATGATGTTTGATGTAGAACGAAGTGACTGCGTAACAAAGATTTTAAACAAAGTGCGGAATTTGGTTACAACAACTGAATCGACTGTATACCATCAAGCGCTTGACGAGATTAAGGATGACCTGAGCGAGAAAAACTTCACAATTGATTTTGAGCTAGACCAAGATCAACAACCAACCCAATCACAGATGCAAGAACCAACGTTTGCTATGTGGTGGGCGCATCAGTTAGAAAGAGGGCGCACAGTACCCCATTACCGAACAGAGGGTCATTTTATGGTGTTCACGCGGGACACAGCACTTCAAGTTGCCATTGACATCGCTAACGGTAGTCATAGAGACATATTATTGATGGGCGGAGTAGGCTCTGGCAAATCGACAGGTCTACCATTCAATTTATCTACAAGAGGCAGTGTACTGCTCATTGAGCCTACAAGGCCGTTGGCTGAGAACGTTCACCGCCATTTGGCAAAGGAGCCATTCTACATGAATACGACATTGAGGATGCGCGGATTGACAACATTTGGTTCTGCACCAGTTACAATTATGACAAGCGGCTTTGCTTTGAATTATTTTGCACATAATAGAGAGCGACTTAGGGAGTATGAGTACACACTCTTTGATGAATTTCATGTGGACGATGCAAATGCTATGGCATTTAGATGTTTATTGATTGACAACGCTTACCATGGTAAAGTTGTTAAGATGTCAGCAACTCCACCTGGTAGAGAGCCAGAATTTGAGCCACAACATCCAGTGAAAGTAGTGGTGGAGGAATCGTTATCTTTGCAAGAATTCGTACGCGCACAAGGAACAGGAGCGAAAGCTGATGTAATTCGCCATGGAGACAATATACTGGTTTACGTAGCAAGTTACAACGAGGTTGACACGCTTGGGGGCTTGTTATCGGAGCGCGGCTATAAGGTGACAAAAGTCGATGGGCGCACAATGAAAGTTGGACGCGTTGAAATAACAACTTGTGGAACACCAAACAAGAAGCATTTCATTGTGGCCACGAATATAATTGAAAATGGGGTCACACTTGATATTGAAGTTGTTGCGGACTTTGGGACCAAAGTGGTGCCTACGCTAGATATTGACAATAGAATGATGACATACAAGAAAATTCCTGTTAATTATGGAGAGCGTATACAACGAGTGGGACGGGTTGGGAGACACAAACCAGGGTTTGCATTAAGAATTGGTCACACTGAAAAAGGGCTGAGCGAAATTCCGAGCAGTATAGCAACTGAAGCGGCATTCAAATGCTTCACATATGGATTGCCCGTAATACCGAACAACGTTACCACAAGTATCCTGGCAAATGCCACAGTTAGGCAAGCAAGAACGATGTCACTCTTTGAGTTAAACCCTTTCTATATGGCCAATTTAGTGCGATATGATGGTTCAATGCACCAGTCTCTACACAACATCCTGAAGCGCTTCAAGTTACGTGATTCAGAGGTTGTACTTAACAAACTAGCCATCCCAAACAAAGGTCTGCAAACTTGGTTGACAGCGAGCGAGTATTCACGGTTAGGATCAAATGTTCCTGACAGACATGACATGCGTATACCTTTCATGTGCAAAGAGGTGCCAGAGAAGCTGCACGAGGAGGTGTGGGAAGCCATACAAAAATATAAATGTGATGCCGGTTTTGGTAGACTGTCAAGCTCCAGCGCTTGTAAAGTAGCATACACACTGCAAACGGATGTCACCTCGATTCAAAGGACAGTGCGAATAATAGATACGCTGATTGCAGAAGAGCGTCGAAAGCAAGAATATTTCCGGACT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| 31,960
|
NC_043583.1
|
Schmallenberg virus
|
Hulst,M., Kortekaas,J., Hakze-van der Honing,R., Vastenhouw,S., Cornellissen,J., van Maanen,K., Bossers,A., Harders,F., Stockhofe,N., van der Poel,W.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
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2019-06-28
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F6
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
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Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,882
|
RefSeq
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
|
Bos taurus
| null |
2011
| null |
PRJNA485481
|
Schmallenberg virus isolate F6 segment L, complete sequence
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AGTAGTGTACCCCTAATTACAATCACTATGGAGACATACAAGATTAACATTTTTAGAGATAGGATCAACCAGTGTCGAAGTGCTGAAGAAGCCAAAGACATTGTTGCTGATCTTCTCATGGCTAGACATGACTACTTTGGTAGAGAGGTATGTTATTACCTGGATATCGAATTCCGGCAGGATGTTCCAGCTTACGACATACTTCTTGAATTTCTGCCAGCTGGCACTGCTTTCAACATTCGCAATTGTACACCAGACAATTTTATCATTCACAATGGCAAGCTTTATATCATTGACTATAAAGTATCAACTGATCATGCATATGGTCAAAAAACTTATGAAAAGTACACCCAGATCTTTGGAGACGCATTGTCAGAATTGCCGTTTGATTTTGAAGTTGTGATCATCCGTGCTGACCCTCTGCGAGATACTATCCATGTTAATTCAAATCAATTCTTGGAAATATTTGGGCCGCTCAACATAAACCTTGATTTTACTTGGTTCTTTAATTTGCGATCCCTGATATATGAGAAATATAAGGATGACGACAGATTCCTAGAAATTGTGAATCAAGGTGAATTTACGATGACTGGACCCTGGATTGATGAGGATACCCCGGAGCTCTATTCACACCCTGTCTTTTTGGAATTCTATGATTCTTTAGATGAGATGGCTAAACTGACATTCCATGAGTCTATGACATTTGATGCAACTCGCGGTGAGAAATGGAATCAAAATCTACAAAAGGTTATAAATAGATATGGCAATGATTATAACATTTTTGTGAAAGAGGCCGCTGCAGGAATCTTTAGATGTGAAGGGAACTACCCAAAACCAAATCATGATGAAATCACAATCGGTTGGAATCAAATGGTTCAAAGAGTGAGTACTGAGAGAAACCTGACTCAAGATGTCAGCAAGCAAAAACCATCTATTCATTTCATATGGGGTCAACCTGACGAAACATCAAATGCGACAACACCAAAACTAATCAAGATTGCAAAAGCACTCCAAAATATTTCTGGCGAGTCTACATATATAAGCGCATTCAGAGCATTGGGTATGCTTATGGACTTTTCTGAGAACACAGCTTTATATGAAGCACACACTAGCAAACTAAAAAGTATGGCAAGACAGACATCGAAAAGAATTGATACTAAACTGGAACCAATCAAAATAGGCACGGCGACAATTTATTGGGAACAGCAGTTTAAACTGGATACTGAAATAATGAATACAAAAGACAAATCACATTTGCTAAAAGATTTTCTTGGCATAGGGGGTCACGTGCAATTTTCAAAAAAGACCATTGACGATTTGGATACTGACAAACCTACTATATTAGATTTCAACAAAAAGGAAGTCATTGATTTTTGCAAATTCCAGTATGAAAATGTAAAGAAAATACTATCCGGAGATAATAATCTAGAGCGTATAGGATGTTATTTAGAAGAATATGGTGCAAATATTGCATCATGTTCAAAGGATACATGGGATCAGATTAACCAGATAGGGAAGTCAAATTACTGGGCTTGTATTAAAGATTTTTCAGTCTTGATGAAAAATATGTTGGCAGTTTCTCAATATAATAGGCACAATACTTTTCGTGTAGTGTGTTGTGCAAACAATAATCTGTTTGGGTTTGTAATGCCTTCTTCTGATATTAAAGCAAAGCGATCCACACTTGTTTACTTCTTAGCTGTGTTGCATTCTACTCCTCAGAATGTGATGCACCACGGTGCATTGCATGCGACATTTAAAACTGGTTCAAAATACCTTAGTATCTCTAAAGGAATGCGTTTAGATAAAGAACGATGTCAACGCATAGTTAGTTCACCGGGACTTTTTATGTTGACTACATTGATGTTTGCAGGAGACAATCCGACACTCAATTTGACTGATGTCATGAATTTTACATTCCACACTTCCCTGTCTATAACCAAAGCTATGCTGTCATTGACAGAACCATCAAGATATATGATAATGAATTCATTAGCCATATCCAGTCATGTTAGAGATTATATAGCAGAAAAATTTGGCCCTTATACAAAGACCAGCTTCTCTGTAGTAATGGCAAACTTGATTAAAAGGGGATGTTATATGGCATATAATCAAAGAGATAAAGTAGACATGAGGAATATCTGCCTAACAGATTATGAAATAACCCAAAAAGGTGTGAGAGATAACAGAGACCTATCATCAATCTGGTTTGAAGGCTATGTATCACTAAAAGAATATATTAACCAAATATATCTACCATTTTACTTCAATTCAAAAGGTTTGCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGATCTGGCTAAGACAATCTTAGATATAGAAAGGGACCAGAGATTAAATATCCCAGGAATATGGTCTACAACACCTAGAAAACAAACTGCAAATTTAAATATAACTATCTATGCAGTTGCAAAAAATCTAATAATGGACACTGCTAGACATAATTATATTAGATCACGGATAGAAAACACAAACAACTTAAATAGATCGATATGCACTATTTCTACATTCACCAGCTCTAAATCATGTATTAAAGTAGGCGACTTTGAGAAAGAAAAAAGCTCAGCAACAAAAAAGGCTGCAGATTGCATGTCAAAAGAGATAAAGAAGTATACAATTGCAAACCCAGAATTTGTTGATGAAGAGTTACTAAATGCAACTATAAGACATTCACGCTATGAAGACTTAAAAAAAGCAATCCCGAATTATATTGACATTATGTCAACTAAAGTATTTGATTCTCTGTACCAGAAAATAAAAAGGAAGGAGATAGATGATAAACCCACTGTGTATCATATACTCTCTGCTATGAAGAATCACACAGATTTTAAGTTTACATTCTTTAACAAAGGCCAAAAAACAGCAAAGGATAGGGAAATATTCGTAGGCGAATTTGAGGCAAAAATGTGCTTGTATTTAGTGGAGAGGATATCTAAAGAACGCTGTAAGTTGAATCCAGATGAGATGATTAGTGAACCAGGCGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAAGAGCTTGCAGAGTCTGAAATACGATTCACAGCAGCAACTATGAAACAGATCAAAGAACGCTATTTAGCAGAAATGGGAGAAGCAAGCCATATGATCGCATATAAACCACATTCTGTTAAGATTGAAATCAATGCAGACATGTCAAAATGGAGTGCCCAAGATGTTTTATTCAAATATTTCTGGTTGTTTGCATTAGATCCCGCACTTTATCTGCAAGAAAAAGAAAGGATATTGTACTTCCTATGCAATTATATGCAAAAAAAGCTAATTCTGCCTGATGAAATGCTCTGTAGCATCCTTGACCAACGTATCAAACATGAGGATGATATAATATATGAAATGACCAATGGCTTATCGCAAAATTGGGTCAATATTAAACGGAACTGGCTGCAGGGGAATCTCAATTACACAAGTAGCTACCTACATTCATGTTCTATGAATGTTTATAAGGATATTCTAAAGAGAGCAGCCACTTTACTAGAAGGGGAAGTTTTAGTCAATTCTATGGTTCATTCTGATGACAATCACACTTCAATAGTGATGATCCAAGATAAATTAGATGATGATATTGTTATTGAATTTTCTGCAAAACTATTTGAAAAAATATGTCTAACTTTTGGAAATCAAGCAAATATGAAGAAGACATATATAACAAATTTCATAAAGGAGTTCGTTTCACTTTTTAATATTTATGGTGAGCCATTTTCTGTTTATGGTCGCTTTATTTTGACATCTGTTGGCGATTGTGCTTTTCTTGGACCATATGAGGATGTTGCCAGTAGGTTGTCTGCAACGCAGACAGCAATTAAGCATGGAGCACCTCCATCACTTGCATGGACTGCTATTGCATTAACTCAGTGGATAACACATAGCACATATAACATGCTTCCAGGTCAAATCAATGATCCTACTTCATCTTTACCTAGTCATGATAGATTTGAGCTGCCTATAGAATTGTGTGGCTTAATAAATTCAGAATTACCCACTATAGCTATAGCAGGTTTGGAAGCAGATAATCTAAGTTATTTAGTTAGGTTATCAAAAAGAATGTCCCCTATACATCTTTGCCGTGAACCAATCCAGCATCAATATGAGAATATACATACATGGGATATAAGTAAACTGACACAATGTGATATTTTCAGACTTAAGCTTTTAAGATACATGACGTTAGACTCAACTATGTCATCTGATGATGGAATGGGCGAAACTAGTGAAATGAGATCTAGGTCTCTTCTGACACCAAGAAAATTCACTACTGCAAGTTCGTTATCTAGATTGCATTCATATGCTGATTATCAAAAAACAATACAAGACCAACAGAAAATTGAAGAATTATTTGAATATTTTATAGCCAACCCTCAACTATTGGTTACAAAAGGTGAGACTTGTGAAGAGTTCTGTATGTCTGTATTGTTCAGATACAACAGTCGTAAATTTAAAGAATCATTGTCTATTCAAAACCCAGCTCAGCTCTTCATAGAACAAGTATTGTTTGCAAATAAACCAATGATAGACTATACAAGTATTCATGATAGGTTGTTTGGTATACAAGATGACCCAAATATAAATGATGCTACATGTATTATTGGCAAGAAGACTTTTGTTGAAACATATCAGCAAATAAAAATTGATGTAGAAAAATTTACACTTGATGTAGAGGATATAAAGACGATATATAGCTTCTGTATAATGAACGACCCTATATTAGTTGCTTGTGCAAACAACTTGTTAATTTCAATACAGGGAGTGGAGATGCAACGATTGGGTATGACATGCTGTTATATGCCGGAGATTAAGAGCCTTAAAGTAATTTATCATAGTCCTGCTCTCGTATTACGTGCTTATGTAACAGATAACTATGAGCAAAAAGGGATGGAGCCAGATGAAATGCGGAGAGATATATATCATTTAGAAGAATTTATAGAGAAGACAAAATTGAGGACAAATATGCAAGGGAGAATTGCAAATAATGAAAT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| 3,458
|
KM047416.1
|
Schmallenberg virus
|
Hofmann,M.A., Mader,M., Fluckiger,F., Renzullo,S.
|
Institute of Virology and Immunology IVI, Development
|
Switzerland
|
2015-01-21
|
79.4
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,864
|
GenBank
| 1
|
Switzerland: Muehleberg, BE
|
Switzerland
|
Bos taurus
|
blood
|
2012-07-20
| null | null |
Schmallenberg virus isolate 79.4 segment L, complete sequence
|
CTAATTACAATCACTATGGAGACATACAAGATTAACATTTTTAGAGATAGGATCAACCAGTGTCGAAGTGCTGAAGAAGCCAAAGACATTGTTGCTGATCTTCTCATGGCTAGACATGACTACTTTGGTAGAGAGGTATGTTATTACCTGGATATCGAATTCCGGCAGGATGTTCCAGCTTACGACATACTTCTTGAATTTCTGCCAGCTGGCACTGCTTTCAACATTCGCAATTGTACACCAGACAATTTTATCATTCACAATGGCAAGCTTTATATCATTGACTATAAAGTATCAACTGATCATGCATATGGTCAAAAAACTTATGAAAAGTACACCCAGATCTTTGGAGACGCATTGTCAGAATTGCCGTTTGATTTTGAAGTTGTGATCATCCGTGCTGACCCTCTGCGAGATACTATCCATGTTAATTCAAATCAATTCTTGGAAATATTTGGGCCGCTCAACATAAACCTTGATTTTACTTGGTTCTTTAATTTGCGATCCCTGATATATGAGAAATATAAGGATGACGACAGATTCCTAGAAATTGTGAATCAAGGTGAATTTACGATGACTGGACCCTGGATTGATGAGGATACCCCGGAGCTCTATTCACACCCTGTCTTTTTGGAATTCTATGATTCTTTAGATGAGATGGCTAAACTGACATTCCATGAGTCTATGACATTTGATGCAACTCGCGGTGAGAAATGGAATCAAAATCTACAAAAGGTTATAAATAGATATGGCAATGATTATAACATTTTTGTGAAAGAGGCCGCTGCAGGAATCTTTAGATGTGAAGGGAACTACCCAAAACCAAATCATGATGAAATCACAATCGGTTGGAATCAAATGGTTCAAAGAGTGAGTACTGAGAGAAACCTGACTCAAGATGTCAGCAAGCAAAAACCATCTATTCATTTCATATGGGGTCAACCTGACGAAACATCAAATGCGACAACACCAAAACTAATCAAGATTGCAAAAGCACTCCAAAATATTTCTGGCGAGTCTACATATATAAGCGCATTCAGAGCATTGGGTATGCTTATGGACTTTTCTGAGAACACAGCTTTATATGAAGCACACACTAGCAAACTAAAAAGTATGGCAAGACAGACATCGAAAAGAATTGATACTAAACTGGAACCAATCAAAATAGGCACGGCGACAATTTATTGGGAACAGCAGTTTAAACTGGATACTGAAATAATGAATACAAAAGACAAATCACATTTGCTAAAAGATTTTCTTGGCATAGGGGGTCACGTGCAATTTTCAAAAAAGACCATTGACGATTTGGATACTGACAAACCTACTATATTAGATTTCAACAAAAAGGAAGTCATTGATTTTTGCAAATTCCAGTATGAAAATGTAAAGAAAATACTATCCGGAGATAATAATCTAGAGCGTATAGGATGTTATTTAGAAGAATATGGTGCAAATATTGCATCATGTTCAAAGGATACATGGGATCAGATTAACCAGATAGGGAAGTCAAATTACTGGGCTTGTATTAAAGATTTTTCAGTCTTGATGAAAAATATGTTGGCAGTTTCTCAATATAATAGGCACAATACTTTTCGTGTAGTGTGTTGTGCAAACAATAATCTGTTTGGGTTTGTAATGCCTTCTTCTGATATTAAAGCAAAGCGATCCACACTTGTTTACTTCTTAGCTGTGTTGCATTCTACTCCTCAGAATGTGATGCACCACGGAGCATTGCATGCGACATTTAAAACTGGTTCAAAATACCTTAGTATCTCTAAAGGAATGCGTTTAGATAAAGAACGATGTCAACGCATAGTTAGTTCACCGGGACTTTTTATGTTGACTACATTGATGTTTGCAGGAGACAATCCGACACTCAATTTGACTGATGTCATGAATTTTACATTCCACACTTCCCTGTCTATAACCAAAGCTATGCTGTCATTGACAGAACCATCAAGATATATGATAATGAATTCATTAGCCATATCCAGTCATGTTAGAGATTATATAGCAGAAAAATTTGGCCCTTATACAAAGACCAGCTTCTCTGTAGTAATGGCAAACTTGATTAAAAGGGGATGTTATATGGCATATAATCAAAGAGATAAAGTAGACATGAGGAATATCTGCCTAACAGATTATGAAATAACCCAAAAAGGTGTGAGAGATAACAGAGACCTATCATCAATCTGGTTTGAAGGCTATGTATCACTAAAAGAATATATTAACCAAATATATCTACCATTTTACTTCAATTCAAAAGGTTTGCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGATCTGGCTAAGACAATCTTAGATATAGAAAGGGACCAGAGATTAAATATCCCAGGAATATGGTCTACAACACCTAGAAAACAAACTGCAAATTTAAATATAACTATCTATGCAGTTGCAAAAAATCTAATAATGGACACTGCTAGACATAATTATATTAGATCACGGATAGAAAACACAAACAACTTAAATAGATCGATATGCACTATTTCTACATTCACCAGCTCTAAATCATGTATTAAAGTAGGCGACTTTGAGAAAGAAAAAAGCTCAGCAACAAAAAAGGCTGCAGATTGCATGTCAAAAGAGATAAAGAAGTATACAATTGCAAACCCAGAATTTGTTGATGAAGAGTTACTAAATGCAACTATAAGACATTCACGCTATGAAGACTTAAAAAAAGCAATCCCGAATTATATTGACATTATGTCAACTAAAGTATTTGATTCTCTGTACCAGAAAATAAAAAGGAAGGAGATAGATGATAAACCCACTGTGTATCATATACTCTCTGCTATGAAGAATCACACAGATTTTAAGTTTACATTCTTTAACAAAGGCCAAAAAACAGCAAAGGATAGGGAAATATTCGTAGGCGAATTTGAGGCAAAAATGTGCTTGTATTTAGTGGAGAGGATATCTAAAGAACGCTGTAAGTTGAATCCAGATGAGATGATTAGTGAACCAGGCGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAAGAGCTTGCAGAGTCTGAAATACGATTCACAGCAGCAACTATGAAACAGATCAAAGAACGCTATTTAGCAGAAATGGGAGAAGCAAGCCATATGATCGCATATAAACCACATTCTGTTAAGATTGAAATCAATGCAGACATGTCAAAATGGAGTGCCCAAGATGTTTTATTCAAATATTTCTGGTTGTTTGCATTAGATCCCGCACTTTATCTGCAAGAAAAAGAAAGGATATTGTACTTCCTATGCAATTATATGCAAAAAAAGCTAATTCTGCCTGATGAAATGCTCTGTAGCATCCTTGACCAACGTATCAAACATGAGGATGATATAATATATGAAATGACCAATGGCTTATCGCAAAATTGGGTCAATATTAAACGGAACTGGCTGCAGGGGAATCTCAATTACACAAGTAGCTACCTACATTCATGTTCTATGAATGTTTATAAGGATATTCTAAAGAGAGCAGCCACTTTACTAGAAGGGGAAGTTTTAGTCAATTCTATGGTTCATTCTGATGACAATCACACTTCAATAGTGATGATCCAAGATAAATTAGATGATGATATCGTTATTGAATTTTCTGCAAAACTATTTGAAAAAATATGTCTAACTTTTGGAAATCAAGCAAATATGAAGAAGACATATATAACAAATTTCATAAAGGAGTTCGTTTCACTTTTTAATATTTATGGTGAGCCATTTTCTGTTTATGGTCGCTTTATTTTGACATCTGTTGGCGATTGTGCTTTTCTTGGACCATATGAGGATGTTGCCAGTAGGTTGTCTGCAACGCAGACAGCAATTAAGCATGGAGCACCTCCATCACTTGCATGGACTGCTATTGCATTAACTCAGTGGATAACACATAGCACATATAACATGCTTCCAGGTCAAATCAATGATCCTACTTCATCTTTACCTAGTCATGATAGATTTGAGCTGCCTATAGAATTGTGTGGCTTAATAAATTCAGAATTACCCACTATAGCTATAGCAGGTTTGGAAGCAGATAATCTAAGTTATTTAGTTAGGTTATCAAAAAGAATGTCCCCTATACATCTTTGCCGTGAACCAATCCAGCATCAATATGAGAATATACATACATGGGATATAAGTAAACTGACACAATGTGATATTTTCAGACTTAAGCTTTTAAGATACATGACGTTAGACTCAACTATGTCATCTGATGATGGAATGGGCGAAACTAGTGAAATGAGATCTAGGTCTCTTCTGACACCAAGAAAATTCACTACTGCAAGTTCGTTATCTAGATTGCATTCATATGCTGATTATCAAAAAACAATACAAGACCAACAGAAAATTGAAGAATTATTTGAATATTTTATAGCCAACCCTCAACTATTGGTTACAAAAGGTGAGACTTGTGAAGAGTTCTGTATGTCTGTATTGTTCAGATACAACAGTCGTAAATTTAAAGAATCATTGTCTATTCAAAACCCAGCTCAGCTCTTCATAGAACAAGTATTGTTTGCAAATAAACCAATGATAGACTATACAAGTATTCATGATAGGTTGTTTGGTATACAAGATGACCCAAATATAAATGATGCTACATGTATTATTGGCAAGAAGACTTTTGTTGAAACATATCAGCAAATAAAAATTGATGTAGAAAAATTTACACTTGATGTAGAGGATATAAAGACGATATATAGCTTCTGTATAATGAACGACCCTATATTAGTTGCTTGTGCAAACAACTTGTTAATTTCAATACAGGGAGTGGAGATGCAACGATTGGGTATGACATGCTGTTATATGCCGGAGATTAAGAGCCTTAAAGTAATTTATCATAGTCCTGCTCTCGTATTACGTGCTTATGTAACAGATAACTATGAGCAAAAAGGGATGGAGCCAGATGAAATGCGGAGAGATATATATCATTTAGAAGAATTTATAGAGAAGACAAAATTGAGGACAAATATGCAAGGGAGAATTGCAAATAATGAAATTAAGTTAATGAA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| 88,094
|
KC355454.1
|
Schmallenberg virus
|
Hulst,M., Kortekaas,J., Hakze-van der Honing,R., Vastenhouw,S., Cornellissen,J., van Maanen,K., Bossers,A., Harders,F., Stockhofe,N., van der Poel,W.
|
Central Veterinary Institute of Wageningen UR (CVI), Virology Department
|
Netherlands
|
2013-09-01
|
HL1
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
|
Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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ssRNA(-)
| 6,882
|
GenBank
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
|
Ovis aries
|
brain
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2011
| null | null |
Schmallenberg virus isolate HL1 segment L, complete sequence
|
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| 93,299
|
KC355457.1
|
Schmallenberg virus
|
Hulst,M., Kortekaas,J., Hakze-van der Honing,R., Vastenhouw,S., Cornellissen,J., van Maanen,K., Bossers,A., Harders,F., Stockhofe,N., van der Poel,W.
|
Central Veterinary Institute of Wageningen UR (CVI), Virology Department
|
Netherlands
|
2013-09-01
|
F6
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,882
|
GenBank
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
|
Bos taurus
| null |
2011
| null | null |
Schmallenberg virus isolate F6 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACCCCTAATTACAATCACTATGGAGACATACAAGATTAACATTTTTAGAGATAGGATCAACCAGTGTCGAAGTGCTGAAGAAGCCAAAGACATTGTTGCTGATCTTCTCATGGCTAGACATGACTACTTTGGTAGAGAGGTATGTTATTACCTGGATATCGAATTCCGGCAGGATGTTCCAGCTTACGACATACTTCTTGAATTTCTGCCAGCTGGCACTGCTTTCAACATTCGCAATTGTACACCAGACAATTTTATCATTCACAATGGCAAGCTTTATATCATTGACTATAAAGTATCAACTGATCATGCATATGGTCAAAAAACTTATGAAAAGTACACCCAGATCTTTGGAGACGCATTGTCAGAATTGCCGTTTGATTTTGAAGTTGTGATCATCCGTGCTGACCCTCTGCGAGATACTATCCATGTTAATTCAAATCAATTCTTGGAAATATTTGGGCCGCTCAACATAAACCTTGATTTTACTTGGTTCTTTAATTTGCGATCCCTGATATATGAGAAATATAAGGATGACGACAGATTCCTAGAAATTGTGAATCAAGGTGAATTTACGATGACTGGACCCTGGATTGATGAGGATACCCCGGAGCTCTATTCACACCCTGTCTTTTTGGAATTCTATGATTCTTTAGATGAGATGGCTAAACTGACATTCCATGAGTCTATGACATTTGATGCAACTCGCGGTGAGAAATGGAATCAAAATCTACAAAAGGTTATAAATAGATATGGCAATGATTATAACATTTTTGTGAAAGAGGCCGCTGCAGGAATCTTTAGATGTGAAGGGAACTACCCAAAACCAAATCATGATGAAATCACAATCGGTTGGAATCAAATGGTTCAAAGAGTGAGTACTGAGAGAAACCTGACTCAAGATGTCAGCAAGCAAAAACCATCTATTCATTTCATATGGGGTCAACCTGACGAAACATCAAATGCGACAACACCAAAACTAATCAAGATTGCAAAAGCACTCCAAAATATTTCTGGCGAGTCTACATATATAAGCGCATTCAGAGCATTGGGTATGCTTATGGACTTTTCTGAGAACACAGCTTTATATGAAGCACACACTAGCAAACTAAAAAGTATGGCAAGACAGACATCGAAAAGAATTGATACTAAACTGGAACCAATCAAAATAGGCACGGCGACAATTTATTGGGAACAGCAGTTTAAACTGGATACTGAAATAATGAATACAAAAGACAAATCACATTTGCTAAAAGATTTTCTTGGCATAGGGGGTCACGTGCAATTTTCAAAAAAGACCATTGACGATTTGGATACTGACAAACCTACTATATTAGATTTCAACAAAAAGGAAGTCATTGATTTTTGCAAATTCCAGTATGAAAATGTAAAGAAAATACTATCCGGAGATAATAATCTAGAGCGTATAGGATGTTATTTAGAAGAATATGGTGCAAATATTGCATCATGTTCAAAGGATACATGGGATCAGATTAACCAGATAGGGAAGTCAAATTACTGGGCTTGTATTAAAGATTTTTCAGTCTTGATGAAAAATATGTTGGCAGTTTCTCAATATAATAGGCACAATACTTTTCGTGTAGTGTGTTGTGCAAACAATAATCTGTTTGGGTTTGTAATGCCTTCTTCTGATATTAAAGCAAAGCGATCCACACTTGTTTACTTCTTAGCTGTGTTGCATTCTACTCCTCAGAATGTGATGCACCACGGTGCATTGCATGCGACATTTAAAACTGGTTCAAAATACCTTAGTATCTCTAAAGGAATGCGTTTAGATAAAGAACGATGTCAACGCATAGTTAGTTCACCGGGACTTTTTATGTTGACTACATTGATGTTTGCAGGAGACAATCCGACACTCAATTTGACTGATGTCATGAATTTTACATTCCACACTTCCCTGTCTATAACCAAAGCTATGCTGTCATTGACAGAACCATCAAGATATATGATAATGAATTCATTAGCCATATCCAGTCATGTTAGAGATTATATAGCAGAAAAATTTGGCCCTTATACAAAGACCAGCTTCTCTGTAGTAATGGCAAACTTGATTAAAAGGGGATGTTATATGGCATATAATCAAAGAGATAAAGTAGACATGAGGAATATCTGCCTAACAGATTATGAAATAACCCAAAAAGGTGTGAGAGATAACAGAGACCTATCATCAATCTGGTTTGAAGGCTATGTATCACTAAAAGAATATATTAACCAAATATATCTACCATTTTACTTCAATTCAAAAGGTTTGCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGATCTGGCTAAGACAATCTTAGATATAGAAAGGGACCAGAGATTAAATATCCCAGGAATATGGTCTACAACACCTAGAAAACAAACTGCAAATTTAAATATAACTATCTATGCAGTTGCAAAAAATCTAATAATGGACACTGCTAGACATAATTATATTAGATCACGGATAGAAAACACAAACAACTTAAATAGATCGATATGCACTATTTCTACATTCACCAGCTCTAAATCATGTATTAAAGTAGGCGACTTTGAGAAAGAAAAAAGCTCAGCAACAAAAAAGGCTGCAGATTGCATGTCAAAAGAGATAAAGAAGTATACAATTGCAAACCCAGAATTTGTTGATGAAGAGTTACTAAATGCAACTATAAGACATTCACGCTATGAAGACTTAAAAAAAGCAATCCCGAATTATATTGACATTATGTCAACTAAAGTATTTGATTCTCTGTACCAGAAAATAAAAAGGAAGGAGATAGATGATAAACCCACTGTGTATCATATACTCTCTGCTATGAAGAATCACACAGATTTTAAGTTTACATTCTTTAACAAAGGCCAAAAAACAGCAAAGGATAGGGAAATATTCGTAGGCGAATTTGAGGCAAAAATGTGCTTGTATTTAGTGGAGAGGATATCTAAAGAACGCTGTAAGTTGAATCCAGATGAGATGATTAGTGAACCAGGCGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAAGAGCTTGCAGAGTCTGAAATACGATTCACAGCAGCAACTATGAAACAGATCAAAGAACGCTATTTAGCAGAAATGGGAGAAGCAAGCCATATGATCGCATATAAACCACATTCTGTTAAGATTGAAATCAATGCAGACATGTCAAAATGGAGTGCCCAAGATGTTTTATTCAAATATTTCTGGTTGTTTGCATTAGATCCCGCACTTTATCTGCAAGAAAAAGAAAGGATATTGTACTTCCTATGCAATTATATGCAAAAAAAGCTAATTCTGCCTGATGAAATGCTCTGTAGCATCCTTGACCAACGTATCAAACATGAGGATGATATAATATATGAAATGACCAATGGCTTATCGCAAAATTGGGTCAATATTAAACGGAACTGGCTGCAGGGGAATCTCAATTACACAAGTAGCTACCTACATTCATGTTCTATGAATGTTTATAAGGATATTCTAAAGAGAGCAGCCACTTTACTAGAAGGGGAAGTTTTAGTCAATTCTATGGTTCATTCTGATGACAATCACACTTCAATAGTGATGATCCAAGATAAATTAGATGATGATATTGTTATTGAATTTTCTGCAAAACTATTTGAAAAAATATGTCTAACTTTTGGAAATCAAGCAAATATGAAGAAGACATATATAACAAATTTCATAAAGGAGTTCGTTTCACTTTTTAATATTTATGGTGAGCCATTTTCTGTTTATGGTCGCTTTATTTTGACATCTGTTGGCGATTGTGCTTTTCTTGGACCATATGAGGATGTTGCCAGTAGGTTGTCTGCAACGCAGACAGCAATTAAGCATGGAGCACCTCCATCACTTGCATGGACTGCTATTGCATTAACTCAGTGGATAACACATAGCACATATAACATGCTTCCAGGTCAAATCAATGATCCTACTTCATCTTTACCTAGTCATGATAGATTTGAGCTGCCTATAGAATTGTGTGGCTTAATAAATTCAGAATTACCCACTATAGCTATAGCAGGTTTGGAAGCAGATAATCTAAGTTATTTAGTTAGGTTATCAAAAAGAATGTCCCCTATACATCTTTGCCGTGAACCAATCCAGCATCAATATGAGAATATACATACATGGGATATAAGTAAACTGACACAATGTGATATTTTCAGACTTAAGCTTTTAAGATACATGACGTTAGACTCAACTATGTCATCTGATGATGGAATGGGCGAAACTAGTGAAATGAGATCTAGGTCTCTTCTGACACCAAGAAAATTCACTACTGCAAGTTCGTTATCTAGATTGCATTCATATGCTGATTATCAAAAAACAATACAAGACCAACAGAAAATTGAAGAATTATTTGAATATTTTATAGCCAACCCTCAACTATTGGTTACAAAAGGTGAGACTTGTGAAGAGTTCTGTATGTCTGTATTGTTCAGATACAACAGTCGTAAATTTAAAGAATCATTGTCTATTCAAAACCCAGCTCAGCTCTTCATAGAACAAGTATTGTTTGCAAATAAACCAATGATAGACTATACAAGTATTCATGATAGGTTGTTTGGTATACAAGATGACCCAAATATAAATGATGCTACATGTATTATTGGCAAGAAGACTTTTGTTGAAACATATCAGCAAATAAAAATTGATGTAGAAAAATTTACACTTGATGTAGAGGATATAAAGACGATATATAGCTTCTGTATAATGAACGACCCTATATTAGTTGCTTGTGCAAACAACTTGTTAATTTCAATACAGGGAGTGGAGATGCAACGATTGGGTATGACATGCTGTTATATGCCGGAGATTAAGAGCCTTAAAGTAATTTATCATAGTCCTGCTCTCGTATTACGTGCTTATGTAACAGATAACTATGAGCAAAAAGGGATGGAGCCAGATGAAATGCGGAGAGATATATATCATTTAGAAGAATTTATAGAGAAGACAAAATTGAGGACAAATATGCAAGGGAGAATTGCAAATAATGAAAT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| 93,300
|
KC139362.1
|
Schmallenberg virus
|
Coupeau,D., Claine,F., Wiggers,L., Kirschvink,N., Muylkens,B.
|
University of Namur (FUNDP), Veterinary Integrated Research Unit (URVI)
|
Belgium
|
2013-02-03
|
Na1-CNS
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,882
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Ovis aries
| null |
2012-01
| null | null |
Schmallenberg virus strain Na1 isolate Na1-CNS RNA-dependent RNA polymerase gene, complete cds
|
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| 95,281
|
KC139363.1
|
Schmallenberg virus
|
Coupeau,D., Claine,F., Wiggers,L., Kirschvink,N., Muylkens,B.
|
University of Namur (FUNDP), Veterinary Integrated Research Unit (URVI)
|
Belgium
|
2013-02-03
|
Na1-BHK21-P2
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,882
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Ovis aries
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2012-01
| null | null |
Schmallenberg virus strain Na1 isolate Na1-BHK21-P2 RNA-dependent RNA polymerase gene, complete cds
|
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Coupeau,D., Claine,F., Wiggers,L., Kirschvink,N., Muylkens,B.
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University of Namur (FUNDP), Veterinary Integrated Research Unit (URVI)
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Belgium
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2013-02-03
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Orthobunyavirus schmallenbergense
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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| 1
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Belgium
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Belgium
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Ovis aries
| null |
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Schmallenberg virus strain Na1 isolate Na1-BHK21-P10 RNA-dependent RNA polymerase gene, complete cds
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| 95,283
|
KC139365.1
|
Schmallenberg virus
|
Coupeau,D., Claine,F., Wiggers,L., Kirschvink,N., Muylkens,B.
|
University of Namur (FUNDP), Veterinary Integrated Research Unit (URVI)
|
Belgium
|
2013-02-03
|
Na2-CNS
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,882
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Ovis aries
| null |
2012-01
| null | null |
Schmallenberg virus strain Na2 isolate Na2-CNS RNA-dependent RNA polymerase gene, complete cds
|
AGTAGTGTACCCCTAATTACAATCACTATGGAGACATACAAGATTAACATTTTTAGAGATAGGATCAACCAGTGTCGAAGTGCTGAAGAAGCCAAAGACATTGTTGCTGATCTTCTCATGGCTAGACATGACTACTTTGGTAGAGAGGTATGTTATTACCTGGATATCGAATTCCGGCAGGATGTTCCAGCTTACGACATACTTCTTGAATTTCTGCCAGCTGGCACTGCTTTCAACATTCGCAATTGTACACCAGACAATTTTATCATTCACAATGGCAAGCTTTATATCATTGACTATAAAGTATCAACTGATCATGTATATGGTCAAAAAACTTATGAAAAGTACACCCAGGTCTTTGGAGACGCATTGTCAGAATTGCCGTTTGATTTTGAAGTTGTGATCATCCGTGCTGACCCTCTGCGAGATACTATCCATGTTAATTCAAATCAATTCTTGGAAATATTTGGGCCGCTCAACATAAACCTTGATTTTACTTGGTTCTTTAATTTGCGATCCCTGATATATGAGAAATATAAGGATGACGACAGATTCCTAGAAATTGTGAATCAAGGTGAATTTACGATGACTGGACCCTGGATTGATGAGGATACCCCGGAGCTCTATTCACACCCTGTCTTTTTGGAATTCTATGATTCTTTAGATGAGATGGCTAAACTGACATTCCATGAGTCTATGACATTTGATGCAACTCGCGGTGAGAAATGGAATCAAAATCTACAAAAGGTTATAAATAGATATGGCAATGATTATAACATTTTTGTGAAAGAGGCCGCTGCAGGAATCTTTAGATGTGAAGGGAACTACCCAAAACCAAATCATGATGAAATCACAATCGGTTGGAATCAAATGGTTCAAAGAGTGAGTACTGAGAGAAACCTGACTCAAGATGTCAGCAAGCAAAAACCATCTATTCATTTCATATGGGGTCAACCTGACGAAGCATCAAATGCGACAACACCAAAACTAATCAAGATTGCAAAAGCACTCCAAAATATTTCTGGCGAGTCTACATATATAAGCGCATTCAGAGCATTGGGTATGCTTATGGACTTTTCTGAGAACACAGCTTTATATGAAGCACACACTAGCAAACTAAAAAGTATGGCAAGACAGACATCGAAAAGAATTGATACTAAACTGGAACCAATCAAAATAGGCACGGCGACAATTTATTGGGAACAGCAGTTTAAACTGGATACTGAAATAATGAATACAAAAGACAAATCACATTTGCTAAAAGATTTTCTTGGCATAGGGGGTCACGTGCAATTTTCAAAAAAGACCATTGACGATTTGGATACTGACAAACCTACCATATTAGATTTCAACAAAAAGGAAGTCATTGATTTTTGCAAATTCCAGTATGAAAATGTAAAGAAAATACTATCCGGAGATAATAATCTAGAGCGTATAGGATGTTATTTAGAAGAATATGGTGCAAATATTGCATCATGTTCAAAGGATACATGGGATCAGATTAACCAGATAGGGAAGTCAAATTACTGGGCTTGTATTAAAGATTTTTCAGTCTTGATGAAAAATATGTTGGCAGTTTCTCAATATAATAGGCACAATACTTTTCGTGTAGTGTGTTGTGCAAACAATAATCTGTTTGGGTTTGTAATGCCTTCTTCTGATATTAAAGCAAAGCGATCCACACTTGTTTACTTCTTAGCTGTGTTGCATTCTACTCCTCAGAATGTGATGCACCACGGTGCATTGCATGCGACATTTAAAACTGGTTCAAAATACCTTAGTATCTCTAAAGGAATGCGTTTAGATAAAGAACGATGTCAACGCATAGTTAGTTCACCGGGACTTTTTATGTTGACTACATTGATGTTTGCAGGAGACAATCCGACACTCAATTTGACTGATGTCATGAATTTTACATTCCACACTTCCCTGTCTATAACCAAAGCTATGCTGTCATTGACAGAACCATCAAGATATATGATAATGAATTCATTAGCCATATCCAGTCATGTTAGAGATTATATAGCAGAAAAATTTGGCCCTTATACAAAGACCAGCTTCTCTGTAGTAATGGCAAACTTGATTAAAAGGGGATGTTATATGGCATATAATCAAAGAGATAAAGTAGACATGAGGAATATCTGCCTAACAGATTATGAAATAACCCAAAAAGGTGTGAGAGATAACAGAGACCTATCATCAATCTGGTTTGAAGGCTATGTATCACTAAAAGAATATATTAACCAAATATATCTACCATTTTACTTCAATTCAAAAGGTTTGCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGATCTGGCTAAGACAATCTTAGATATAGAAAGGGACCAGAGATTAAATATCCCAGGAATATGGTCTACAACACCTAGAAAACAAACTGCAAATTTAAATATAACTATCTATGCAGTTGCAAAAAATCTAATAATGGACACTGCTAGACATAATTATATTAGATCACGGATAGAAAACACAAACAACTTAAATAGATCGATATGCACTATTTCTACATTCACCAGCTCTAAATCATGTATTAAAGTAGGCGACTTTGAGAAAGAAAAAAGCTCAGCAACAAAAAAGGCTGCAGATTGCATGTCAAAAGAGATAAAGAAGTATACAATTGCAAACCCAGAATTTGTTGATGAAGAGTTACTAAATGCAACTATAAGACATTCACGCTATGAAGACTTAAAAAAAGCAATCCCGAATTATATTGACATTATGTCAACTAAAGTATTTGATTCTCTGTACCAGAAAATAAAAAGGAAGGAGATAGATGATAAACCCACTGTGTATCATATACTCTCTGCTATGAAGAATCACACAGATTTTAAGTTTACATTCTTTAACAAAGGCCAAAAAACAGCAAAGGATAGGGAAATATTCGTAGGCGAATTTGAGGCAAAAATGTGCTTGTATTTAGTGGAGAGGATATCTAAAGAACGCTGTAAGTTGAATCCAGATGAGATGATTAGTGAACCAGGCGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAAGAGCTTGCAGAGTCTGAAATACGATTCACAGCAGCAACTATGAAACAGATCAAAGAACGCTATTTAGCAGAAATGGGAGAAGCAAGCCATATGATCGCATATAAACCACATTCTGTTAAGATTGAAATCAATGCAGACATGTCAAAATGGAGTGCCCAAGATGTTTTATTCAAATATTTCTGGTTGTTTGCATTAGATCCCGCACTTTATCTGCAAGAAAAAGAAAGGATATTGTACTTCCTATGCAATTATATGCAAAAAAAGCTAATTCTGCCTGATGAAATGCTCTGTAGCATCCTTGACCAACGTATCAAACATGAGGATGATATAATATATGAAATGACCAATGGCTTATCGCAAAATTGGGTCAATATTAAACGGAACTGGCTGCAGGGGAATCTCAATTACACAAGTAGCTACCTACATTCATGTTCTATGAATGTTTATAAGGATATTCTAAAGAGAGCAGCCACTTTACTACAAGGGGAAGTTTTAGTCAATTCTATGGTTCATTCTGATGACAATCACACTTCAATAGTGATGATCCAAGATAAATTAGATGATGATATTGTTATTGAATTTTCTGCAAAACTATTTGAAAAAATATGTCTAACTTTTGGAAATCAAGCAAATATGAAGAAGACATATATAACAAATTTCATAAAGGAGTTCGTTTCACTTTTTAACATTTATGGTGAGCCATTTTCTGTTTATGGTCGCTTTATTTTGACATCTGTTGGCGATTGTGCTTTTCTTGGACCATATGAGGATGTTGCCAGTAGGTTGTCTGCAACGCAGACAGCAATTAAGCATGGAGCACCTCCATCACTTGCATGGACTGCTATTGCATTAACTCAGTGGATAACACATAGCACATATAACATGCTTCCAGGTCAAATCAATGATCCTACTTCATCTTTACCTAGTCATGATAGATTTGAGCTGCCTATAGAATTGTGTGGCTTAATAAATTCAGAATTACCCACTATAGCTATAGCAGGTTTGGAAGCAGATAATCTAAGTTATTTAGTTAGGTTATCAAAAAGAATGTCCCCTATACATCTTTGCCGTGAACCAATCCAGCATCAATATGAGAATATACATACATGGGATATAAGTAAACTGACACAATGTGATATTTTCAGACTTAAGCTTTTAAGATACATGACGTTAGGCTCAACTATGTCATCTGATGATGGAATGGGCGAAACTAGTGAAATGAGATCTAGGTCTCTTCTGACACCAAGAAAATTCACTACTGCAAGTTCGTTATCTAGATTGCATTCATATGCTGATTATCAAAAAACAATACAAGACCAACAGAAAATTGAAGAATTATTTGAATATTTTATAGCCAACCCTCAACTATTGGTTACAAAAGGTGAGACTTGTGAAGAGTTCTGTATGTCTGTATTGTTCAGATACAACAGTCGTAAATTTAAAGAATCATTGTCTATTCAAAACCCAGCTCAGCTCTTCATAGAACAAGTATTGTTTGCAAATAAACCAATGATAGACTATACAAGTATTCATGATAGGTTGTTTGGTATACAAGATGACCCAAATATAAATGATGCTACATGTATTATTGGCAAGAAGACTTTTGTTGAAACATATCAGCAAATAAAAATTGATGTAGAAAAATTTACACTTGATCTAGAGGATATAAAGACGATATATAGCTTCTGTATAATGAACGACCCTATATTAGTTGCTTGTGCAAACAACTTGTTAATTTCAATACAGGGAGTGGAGATGCAACGATTGGGTATGACATGCTGTTATATGCCGGAGATTAAGAGCCTTAAAGTAATTTATCATAGTCCTGCTCTCGTATTACGTGCTTATGTAACAGATAACTATGAGCAAAAAGGGATGGAGCCAGATGAAATGCGGAGAGATATATATCATTTAGAAGAATTTATAGAGAAGACAAAATTGAGGACAAATATGCAAGGGAGAATTGCAAATAATGAAAT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| 95,284
|
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|
Schmallenberg virus
|
Coupeau,D., Claine,F., Wiggers,L., Kirschvink,N., Muylkens,B.
|
University of Namur (FUNDP), Veterinary Integrated Research Unit (URVI)
|
Belgium
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2013-02-03
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Na2-BHK21-P2
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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ssRNA(-)
| 6,882
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GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
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Ovis aries
| null |
2012-01
| null | null |
Schmallenberg virus strain Na2 isolate Na2-BHK21-P2 RNA-dependent RNA polymerase gene, complete cds
|
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| 95,285
|
KC139367.1
|
Schmallenberg virus
|
Coupeau,D., Claine,F., Wiggers,L., Kirschvink,N., Muylkens,B.
|
University of Namur (FUNDP), Veterinary Integrated Research Unit (URVI)
|
Belgium
|
2013-02-03
|
Na2-BHK21-P10
|
Orthobunyavirus schmallenbergense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,882
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Ovis aries
| null |
2012-01
| null | null |
Schmallenberg virus strain Na2 isolate Na2-BHK21-P10 RNA-dependent RNA polymerase gene, complete cds
|
AGTAGTGTACCCCTAATTACAATCACTATGGAGACATACAAGATTAACATTTTTAGAGATAGGATCAACCAGTGTCGAAGTGCTGAAGAAGCCAAAGACATTGTTGCTGATCTTCTCATGGCTAGACATGACTACTTTGGTAGAGAGGTATGTTATTACCTGGATATCGAATTCCGGCAGGATGTTCCAGCTTACGACATACTTCTTGAATTTCTGCCAGCTGGCACTGCTTTCAACATTCGCAATTGTACACCAGACAATTTTATCATTCACAATGGCAAGCTTTATATCATTGACTATAAAGTATCAACTGATCATGTATATGGTCAAAAAACTTATGAAAAGTACACCCAGGTCTTTGGAGACGCATTGTCAGAATTGCCGTTTGATTTTGAAGTTGTGATCATCCGTGCTGACCCTCTGCGAGATACTATCCATGTTAATTCAAATCAATTCTTGGAAATATTTGGGCCGCTCAACATAAACCTTGATTTTACTTGGTTCTTTAATTTGCGATCCCTGATATATGAGAAATATAAGGATGACGACAGATTCCTAGAAATTGTGAATCAAGGTGAATTTACGATGACTGGACCCTGGATTGATGAGGATACCCCGGAGCTCTATTCACACCCTGTCTTTTTGGAATTCTATGATTCTTTAGATGAGATGGCTAAACTGACATTCCATGAGTCTATGACATTTGATGCAACTCGCGGTGAGAAATGGAATCAAAATCTACAAAAGGTTATAAATAGATATGGCAATGATTATAACATTTTTGTGAAAGAGGCCGCTGCAGGAATCTTTAGATGTGAAGGGAACTACCCAAAACCAAATCATGATGAAATCACAATCGGTTGGAATCAAATGGTTCAAAGAGTGAGTACTGAGAGAAACCTGACTCAAGATGTCAGCAAGCAAAAACCATCTATTCATTTCATATGGGGTCAACCTGACGAAGCATCAAATGCGACAACACCAAAACTAATCAAGATTGCAAAAGCACTCCAAAATATTTCTGGCGAGTCTACATATATAAGCGCATTCAGAGCATTGGGTATGCTTATGGACTTTTCTGAGAACACAGCTTTATATGAAGCACACACTAGCAAACTAAAAAGTATGGCAAGACAGACATCGAAAAGAATTGATACTAAACTGGAACCAATCAAAATAGGCACGGCGACAATTTATTGGGAACAGCAGTTTAAACTGGATACTGAAATAATGAATACAAAAGACAAATCACATTTGCTAAAAGATTTTCTTGGCATAGGGGGTCACGTGCAATTTTCAAAAAAGACCATTGACGATTTGGATACTGACAAACCTACCATATTAGATTTCAACAAAAAGGAAGTCATTGATTTTTGCAAATTCCAGTATGAAAATGTAAAGAAAATACTATCCGGAGATAATAATCTAGAGCGTATAGGATGTTATTTAGAAGAATATGGTGCAAATATTGCATCATGTTCAAAGGATACATGGGATCAGATTAACCAGATAGGGAAGTCAAATTACTGGGCTTGTATTAAAGATTTTTCAGTCTTGATGAAAAATATGTTGGCAGTTTCTCAATATAATAGGCACAATACTTTTCGTGTAGTGTGTTGTGCAAACAATAATCTGTTTGGGTTTGTAATGCCTTCTTCTGATATTAAAGCAAAGCGATCCACACTTGTTTACTTCTTAGCTGTGTTGCATTCTACTCCTCAGAATGTGATGCACCACGGTGCATTGCATGCGACATTTAAAACTGGTTCAAAATACCTTAGTATCTCTAAAGGAATGCGTTTAGATAAAGAACGATGTCAACGCATAGTTAGTTCACCGGGACTTTTTATGTTGACTACATTGATGTTTGCAGGAGACAATCCGACACTCAATTTGACTGATGTCATGAATTTTACATTCCACACTTCCCTGTCTATAACCAAAGCTATGCTGTCATTGACAGAACCATCAAGATATATGATAATGAATTCATTAGCCATATCCAGTCATGTTAGAGATTATATAGCAGAAAAATTTGGCCCTTATACAAAGACCAGCTTCTCTGTAGTAATGGCAAACTTGATTAAAAGGGGATGTTATATGGCATATAATCAAAGAGATAAAGTAGACATGAGGAATATCTGCCTAACAGATTATGAAATAACCCAAAAAGGTGTGAGAGATAACAGAGACCTATCATCAATCTGGTTTGAAGGCTATGTATCACTAAAAGAATATATTAACCAAATATATCTACCATTTTACTTCAATTCAAAAGGTTTGCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGATCTGGCTAAGACAATCTTAGATATAGAAAGGGACCAGAGATTAAATATCCCAGGAATATGGTCTACAACACCTAGAAAACAAACTGCAAATTTAAATATAACTATCTATGCAGTTGCAAAAAATCTAATAATGGACACTGCTAGACATAATTATATTAGATCACGGATAGAAAACACAAACAACTTAAATAGATCGATATGCACTATTTCTACATTCACCAGCTCTAAATCATGTATTAAAGTAGGCGACTTTGAGAAAGAAAAAAGCTCAGCAACAAAAAAGGCTGCAGATTGCATGTCAAAAGAGATAAAGAAGTATACAATTGCAAACCCAGAATTTGTTGATGAAGAGTTACTAAATGCAACTATAAGACATTCACGCTATGAAGACTTAAAAAAAGCAATCCCGAATTATATTGACATTATGTCAACTAAAGTATTTGATTCTCTGTACCAGAAAATAAAAAGGAAGGAGATAGATGATAAACCCACTGTGTATCATATACTCTCTGCTATGAAGAATCACACAGATTTTAAGTTTACATTCTTTAACAAAGGCCAAAAAACAGCAAAGGATAGGGAAATATTCGTAGGCGAATTTGAGGCAAAAATGTGCTTGTATTTAGTGGAGAGGATATCTAAAGAACGCTGTAAGTTGAATCCAGATGAGATGATTAGTGAACCAGGCGATTCTAAATTGAAAAAATTAGAAGAGCTTGCAGAGTCTGAAATACGATTCACAGCAGCAACTATGAAACAGATCAAAGAACGCTATTTAGCAGAAATGGGAGAAGCAAGCCATATGATCGCATATAAACCACATTCTGTTAAGATTGAAATCAATGCAGACATGTCAAAATGGAGTGCCCAAGATGTTTTATTCAAATATTTCTGGTTGTTTGCATTAGATCCCGCACTTTATCTGCAAGAAAAAGAAAGGATATTGTACTTCCTATGCAATTATATGCAAAAAAAGCTAATTCTGCCTGATGAAATGCTCTGTAGCATCCTTGACCAACGTATCAAACATGAGGATGATATAATATATGAAATGACCAATGGCTTATCGCAAAATTGGGTCAATATTAAACGGAACTGGCTGCAGGGGAATCTCAATTACACAAGTAGCTACCTACATTCATGTTCTATGAATGTTTATAAGGATATTCTAAAGAGAGCAGCCACTTTACTACAAGGGGAAGTTTTAGTCAATTCTATGGTTCATTCTGATGACAATCACACTTCAATAGTGATGATCCAAGATAAATTAGATGATGATATTGTTATTGAATTTTCTGCAAAACTATTTGAAAAAATATGTCTAACTTTTGGAAATCAAGCAAATATGAAGAAGACATATATAACAAATTTCATAAAGGAGTTCGTTTCACTTTTTAACATTTATGGTGAGCCATTTTCTGTTTATGGTCGCTTTATTTTGACATCTGTTGGCGATTGTGCTTTTCTTGGACCATATGAGGATGTTGCCAGTAGGTTGTCTGCAACGCAGACAGCAATTAAGCATGGAGCACCTCCATCACTTGCATGGACTGCTATTGCATTAACTCAGTGGATAACACATAGCACATATAACATGCTTCCAGGTCAAATCAATGATCCTACTTCATCTTTACCTAGTCATGATAGATTTGAGCTGCCTATAGAATTGTGTGGCTTAATAAATTCAGAATTACCCACTATAGCTATAGCAGGTTTGGAAGCAGATAATCTAAGTTATTTAGTTAGGTTATCAAAAAGAATGTCCCCTATACATCTTTGCCGTGAACCAATCCAGCATCAATATGAGAATATACATACATGGGATATAAGTAAACTGACACAATGTGATATTTTCAGACTTAAGCTTTTAAGATACATGACGTTAGACTCAACTATGTCATCTGATGATGGAATGGGCGAAACTAGTGAAATGAGATCTAGGTCTCTTCTGACACCAAGAAAATTCACTACTGCAAGTTCGTTATCTAGATTGCATTCATATGCTGATTATCAAAAAACAATACAAGACCAACAGAAAATTGAAGAATTATTTGAATATTTTATAGCCAACCCTCAACTATTGGTTACAAAAGGTGAGACTTGTGAAGAGTTCTGTATGTCTGTATTGTTCAGATACAACAGTCGTAAATTTAAAGAATCATTGTCTATTCAAAACCCAGCTCAGCTCTTCATAGAACAAGTATTGTTTGCAAATAAACCAATGATAGACTATACAAGTATTCATGATAGGTTGTTTGGTATACAAGATGACCCAAATATAAATGATGCTACATGTATTATTGGCAAGAAGACTTTTGTTGAAACATATCAGCAAATAAAAATTGATGTAGAAAAATTTACACTTGATCTAGAGGATATAAAGACGATATATAGCTTCTGTATAATGAACGACCCTATATTAGTTGCTTGTGCAAACAACTTGTTAATTTCAATACAGGGAGTGGAGATGCAACGATTGGGTATGACATGCTGTTATATGCCGGAGATTAAGAGCCTTAAAGTAATTTATCATAGTCCTGCTCTCGTATTACGTGCTCATGTAACAGATAACTATGAGCAAAAAGGGATGGAGCCAGATGAAATGCGGAGAGATATATATCATTTAGAAGAATTTATAGAGAAGACAAAATTGAGGACAAATATGCAAGGGAGAATTGCAAATAATGAAAT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| 95,286
|
NC_076636.1
|
Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2
|
He,G., Zhou,Z., Wu,M., Zhang,J., Yang,L., Li,G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
| null |
Thetahypovirus sclerotiniae
|
Thetahypovirus
|
Hypoviridae
|
ssRNA(+)
| 15,249
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Botrytis cinerea
| null |
2013
| null |
PRJNA485481
|
Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2 strain SsHv2.HBstr-470, complete genome
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| 569
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NC_022896.1
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Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2
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Khalifa,M.E.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
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USA
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2013-11-26
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5472
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Thetahypovirus sclerotiniae
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Thetahypovirus
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Hypoviridae
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ssRNA(+)
| 14,581
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RefSeq
| null |
New Zealand
|
New Zealand
|
Sclerotinia sclerotiorum
| null |
1969-11-01
| null |
PRJNA485481
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Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2 isolate 5472, complete genome
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| 6,757
|
MH347276.1
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Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2
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He,G., Zhou,Z., Wu,M., Zhang,J., Yang,L., Li,G.
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Plant Protection, Huazhong Agricultural University
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China
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2019-02-11
| null |
Thetahypovirus sclerotiniae
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Thetahypovirus
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Hypoviridae
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ssRNA(+)
| 15,249
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Botrytis cinerea
| null |
2013
| null | null |
Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2 strain SsHv2.HBstr-470, complete genome
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| 65,401
|
KJ561218.1
|
Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2
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Hu,Z., Wu,S., Cheng,J., Fu,Y., Jiang,D., Xie,J.
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Huazhong Agricultural University, Plant Pathology, College of Plant Science and Technology
|
China
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2014-06-03
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SX247
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Thetahypovirus sclerotiniae
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Thetahypovirus
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Hypoviridae
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ssRNA(+)
| 15,239
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GenBank
| null |
China
|
China
|
Sclerotinia sclerotiorum
| null |
2010-05-01
| null | null |
Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2 isolate SX247, complete genome
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| 90,215
|
KF525367.1
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Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2
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Khalifa,M.E.
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The University of Auckland, School of Biological Sciences
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New Zealand
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2013-11-23
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5472
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Thetahypovirus sclerotiniae
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Thetahypovirus
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Hypoviridae
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ssRNA(+)
| 14,581
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GenBank
| null |
New Zealand
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New Zealand
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Sclerotinia sclerotiorum
| null |
1969-11-01
| null | null |
Sclerotinia sclerotiorum hypovirus 2 isolate 5472, complete genome
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| 92,479
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OL364850.1
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Seli virus
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Vucak,M., Nichols,J., Davison,A.J., Hughes,J., da Silva Filipe,A.
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University of Glasgow, Centre for Virus Research
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United Kingdom
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2022-01-18
| null |
Seli virus
| null | null |
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| 7,160
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GenBank
| null |
Sierra Leone: Gbenikoro
|
Sierra Leone
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Mus minutoides
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2019-08-31
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PRJNA780418
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Seli virus strain M.minutoides-wt/SLE/2019/Gbenikoro-00094 segment L, complete sequence
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Seli virus strain M.minutoides-wt/SLE/2019/Badala-00414 segment L, complete sequence
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| 33,675
|
NC_003215.1
|
Semliki Forest virus
|
Kaariainen,L., Takkinen,K., Keranen,S., Soderlund,H., Riedel,H., Lehrach,H., Garoff,H., Frischauf,A.M., Simons,K., Delius,H.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1987-03-09
| null |
Semliki Forest virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,442
|
RefSeq
| 5
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
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Semliki forest virus, complete genome
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ATGGCGGATGTGTGACATACACGACGCCAAAAGATTTTGTTCCAGCTCCTGCCACCTCGGCTACGCGAGAGATTAACCACCCACGATGGCCGCCAAAGTGCATGTTGATATTGAGGCTGACAGCCCATTCATCAAGTCTTTGCAGAAGGCATTTCCGTCGTTCGAGGTGGAGTCATTGCAGGTCACACCAAATGACCATGCAAATGCCAGAGCATTTTCGCACCTGGCTACCAAATTGATCGAGCAGGAGACTGACAAAGACACACTCATCTTGGATATCGGCAGTGCGCCTTCCAGGAGAATGATGTCTACGCACAAATACCACTGCGTATGCCCTATGCGCAGCGCAGAAGACCCCGAAAGGCTCGATAGCTACGCAAAGAAACTGGCAGCGGCCTCCGGGAAGGTGCTGGATAGAGAGATCGCAGGAAAAATCACCGACCTGCAGACCGTCATGGCTACGCCAGACGCTGAATCTCCTACCTTTTGCCTGCATACAGACGTCACGTGTCGTACGGCAGCCGAAGTGGCCGTATACCAGGACGTGTATGCTGTACATGCACCAACATCGCTGTACCATCAGGCGATGAAAGGTGTCAGAACGGCGTATTGGATTGGGTTTGACACCACCCCGTTTATGTTTGACGCGCTAGCAGGCGCGTATCCAACCTACGCCACAAACTGGGCCGACGAGCAGGTGTTACAGGCCAGGAACATAGGACTGTGTGCAGCATCCTTGACTGAGGGAAGACTCGGCAAACTGTCCATTCTCCGCAAGAAGCAATTGAAACCTTGCGACACAGTCATGTTCTCGGTAGGATCTACATTGTACACTGAGAGCAGAAAGCTACTGAGGAGCTGGCACTTACCCTCCGTATTCCACCTGAAAGGTAAACAATCCTTTACCTGTAGGTGCGATACCATCGTATCATGTGAAGGGTACGTAGTTAAGAAAATCACTATGTGCCCCGGCCTGTACGGTAAAACGGTAGGGTACGCCGTGACGTATCACGCGGAGGGATTCCTAGTGTGCAAGACCACAGACACTGTCAAAGGAGAAAGAGTCTCATTCCCTGTATGCACCTACGTCCCCTCAACCATCTGTGATCAAATGACTGGCATACTAGCGACCGACGTCACACCGGAGGACGCACAGAAGTTGTTAGTGGGATTGAATCAGAGGATAGTTGTGAACGGAAGAACACAGCGAAACACTAACACGATGAAGAACTATCTGCTTCCGATTGTGGCCGTCGCATTTAGCAAGTGGGCGAGGGAATACAAGGCAGACCTTGATGATGAAAAACCTCTGGGTGTCCGAGAGAGGTCACTTACTTGCTGCTGCTTGTGGGCATTTAAAACGAGGAAGATGCACACCATGTACAAGAAACCAGACACCCAGACAATAGTGAAGGTGCCTTCAGAGTTTAACTCGTTCGTCATCCCGAGCCTATGGTCTACAGGCCTCGCAATCCCAGTCAGATCACGCATTAAGATGCTTTTGGCCAAGAAGACCAAGCGAGAGTTAATACCTGTTCTCGACGCGTCGTCAGCCAGGGATGCTGAACAAGAGGAGAAGGAGAGGTTGGAGGCCGAGCTGACTAGAGAAGCCTTACCACCCCTCGTCCCCATCGCGCCGGCGGAGACGGGAGTCGTCGACGTCGACGTTGAAGAACTAGAGTATCACGCAGGTGCAGGGGTCGTGGAAACACCTCGCAGCGCGTTGAAAGTCACCGCACAGCCGAACGACGTACTACTAGGAAATTACGTAGTTCTGTCCCCGCAGACCGTGCTCAAGAGCTCCAAGTTGGCCCCCGTGCACCCTCTAGCAGAGCAGGTGAAAATAATAACACATAACGGGAGGGCCGGCGGTTACCAGGTCGACGGATATGACGGCAGGGTCCTACTACCATGTGGATCGGCCATTCCGGTCCCTGAGTTTCAAGCTTTGAGCGAGAGCGCCACTATGGTGTACAACGAAAGGGAGTTCGTCAACAGGAAACTATACCATATTGCCGTTCACGGACCGTCGCTGAACACCGACGAGGAGAACTACGAGAAAGTCAGAGCTGAAAGAACTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTAGATAAAAAATGCTGCGTCAAGAGAGAGGAAGCGTCGGGTTTGGTGTTGGTGGGAGAGCTAACCAACCCCCCGTTCCATGAATTCGCCTACGAAGGGCTGAAGATCAGGCCGTCGGCACCATATAAGACTACAGTAGTAGGAGTCTTTGGGGTTCCGGGATCAGGCAAGTCTGCTATTATTAAGAGCCTCGTGACCAAACACGATCTGGTCACCAGCGGCAAGAAGGAGAACTGCCAGGAAATAGTTAACGACGTGAAGAAGCACCGCGGGAAGGGGACAAGTAGGGAAAACAGTGACTCCATCCTGCTAAACGGGTGTCGTCGTGCCGTGGACATCCTATATGTGGACGAGGCTTTCGCTTGCCATTCCGGTACTCTGCTGGCCCTAATTGCTCTTGTTAAACCTCGGAGCAAAGTGGTGTTATGCGGAGACCCCAAGCAATGCGGATTCTTCAATATGATGCAGCTTAAGGTGAACTTCAACCACAACATCTGCACTGAAGTATGTCATAAAAGTATATCCAGACGTTGCACGCGTCCAGTCACGGCCATCGTGTCTACGTTGCACTACGGAGGCAAGATGCGCACGACCAACCCGTGCAACAAACCCATAATCATAGACACCACAGGACAGACCAAGCCCAAGCCAGGAGACATCGTGTTAACATGCTTCCGAGGCTGGGCAAAGCAGCTGCAGTTGGACTACCGTGGACACGAAGTCATGACAGCAGCAGCATCTCAGGGCCTCACCCGCAAAGGGGTATACGCCGTAAGGCAGAAGGTGAATGAAAATCCCTTGTATGCCCCTGCGTCGGAGCACGTGAATGTACTGCTGACGCGCACTGAGGATAGGCTGGTGTGGAAAACGCTGGCCGGCGATCCCTGGATTAAGGTCCTATCAAACATTCCACAGGGTAACTTTACGGCCACATTGGAAGAATGGCAAGAAGAACACGACAAAATAATGAAGGTGATTGAAGGACCGGCTGCGCCTGTGGACGCGTTCCAGAACAAAGCGAACGTGTGTTGGGCGAAAAGCCTGGTGCCTGTCCTGGACACTGCCGGAATCAGATTGACAGCAGAGGAGTGGAGCACCATAATTACAGCATTTAAGGAGGACAGAGCTTACTCTCCAGTGGTGGCCTTGAATGAAATTTGCACCAAGTACTATGGAGTTGACCTGGACAGTGGCCTGTTTTCTGCCCCGAAGGTGTCCCTGTATTACGAGAACAACCACTGGGATAACAGACCTGGTGGAAGGATGTATGGATTCAATGCCGCAACAGCTGCCAGGCTGGAAGCTAGACATACCTTCCTGAAGGGGCAGTGGCATACGGGCAAGCAGGCAGTTATCGCAGAAAGAAAAATCCAACCGCTTTCTGTGCTGGACAATGTAATTCCTATCAACCGCAGGCTGCCGCACGCCCTGGTGGCTGAGTACAAGACGGTTAAAGGCAGTAGGGTTGAGTGGCTGGTCAATAAAGTAAGAGGGTACCACGTCCTGCTGGTGAGTGAGTACAACCTGGCTTTGCCTCGACGCAGGGTCACTTGGTTGTCACCGCTGAATGTCACAGGCGCCGATAGGTGCTACGACCTAAGTTTAGGACTGCCGGCTGACGCCGGCAGGTTCGACTTGGTCTTTGTGAACATTCACACGGAATTCAGAATCCACCACTACCAGCAGTGTGTCGACCACGCCATGAAGCTGCAGATGCTTGGGGGAGATGCGCTACGACTGCTAAAACCCGGCGGCATCTTGATGAGAGCTTACGGATACGCCGATAAAATCAGCGAAGCCGTTGTTTCCTCCTTAAGCAGAAAGTTCTCGTCTGCAAGAGTGTTGCGCCCGGATTGTGTCACCAGCAATACAGAAGTGTTCTTGCTGTTCTCCAACTTTGACAACGGAAAGAGACCCTCTACGCTACACCAGATGAATACCAAGCTGAGTGCCGTGTATGCCGGAGAAGCCATGCACACGGCCGGGTGTGCACCATCCTACAGAGTTAAGAGAGCAGACATAGCCACGTGCACAGAAGCGGCTGTGGTTAACGCAGCTAACGCCCGTGGAACTGTAGGGGATGGCGTATGCAGGGCCGTGGCGAAGAAATGGCCGTCAGCCTTTAAGGGAGCAGCAACACCAGTGGGCACAATTAAAACAGTCATGTGCGGCTCGTACCCCGTCATCCACGCTGTAGCGCCTAATTTCTCTGCCACGACTGAAGCGGAAGGGGACCGCGAATTGGCCGCTGTCTACCGGGCAGTGGCCGCCGAAGTAAACAGACTGTCACTGAGCAGCGTAGCCATCCCGCTGCTGTCCACAGGAGTGTTCAGCGGCGGAAGAGATAGGCTGCAGCAATCCCTCAACCATCTATTCACAGCAATGGACGCCACGGACGCTGACGTGACCATCTACTGCAGAGACAAAAGTTGGGAGAAGAAAATCCAGGAAGCCATTGACATGAGGACGGCTGTGGAGTTGCTCAATGATGACGTGGAGCTGACCACAGACTTGGTGAGAGTGCACCCGGACAGCAGCCTGGTGGGTCGTAAGGGCTACAGTACCACTGACGGGTCGCTGTACTCGTACTTTGAAGGTACGAAATTCAACCAGGCTGCTATTGATATGGCAGAGATACTGACGTTGTGGCCCAGACTGCAGGAGGCAAACGAACGGATATGCCTATACGCGCTGGGCGAAACAATGGACAACATCGGATCCAAATGTCCGGTGAACGATTCCGATTCATCAACACCTCCCAGGACAGTGCCCTGCCTGTGCCGCTACGCAATGACAGCAGAACGGATCGCCCGCCTTAGGTCACACCAAGTTAAAAGCATGGTGGTTTGCTCATCTTTTCCCCTCCCGAAATACCATGTAGATGGGGTGCAGAAGGTAA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| 9,089
|
MH426977.1
|
Semliki Forest virus
|
Yadav,P.D.
|
National Institute of Virology, Maximum Containment Laboratory
|
India
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2020-06-30
| null |
Semliki Forest virus
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Alphavirus
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Togaviridae
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ssRNA(+)
| 11,445
|
GenBank
| null |
India
|
India
| null | null | null | null | null |
Semliki Forest virus strain NIV8913590, complete genome
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ATGGCGGATGTGTGACATACACGACGCCAAAAGATTTTGTTCCAGCTCCTGCCACCTCCGCTACGCGAGAGATTAACCACCCACGATGGCCGCCAAAGTGCATGTTGATATTGAGGCTGACAGCCCATTCATCAAGTCTTTGCAGAAGGCATTTCCGTCGTTCGAGGTGGAGTCATTGCAGGTCACACCAAATGACCATGCAAATGCCAGAGCATTTTCGCACCTGGCTACCAAATTGATCGAGCAGGAGACTGACAAAGACACACTCATCTTGGATATCGGCAGTGCGCCTTCCAGGAGAATGATGTCTACGCACAAATACCACTGCGTATGCCCTATGCGCAGCGCAGAAGACCCCGAAAGGCTCGTATGCTACGCAAAGAAACTGGCAGCGGCCTCCGGGAAGGTGCTGGATAGAGAGATCGCAGGGAAAATCACCGACCTGCAGACCGTCATGGCTACGCCAGACGCTGAATCTCCTACCTTTTGCCTGCATACAGACGTCACGTGTCGTACGGCAGCCGAAGTGGCCGTATACCAGGACGTGTATGCTGTACATGCACCAACATCGCTGTACCATCAGGCGATGAAAGGTGTCAGAACGGCGTATTGGATTGGGTTTGACACCACCCCGTTTATGTTTGACGCGCTAGCAGGCGCGTATCCAACCTACGCCACAAACTGGGCCGACGAGCAGGTGTTACAGGCCAGGAACATAGGACTGTGTGCAGCATCCTTGACTGAGGGAAGACTCGGCAAACTGTCCATTCTCCGCAAGAAGCAATTGAAACCTTGCGACACAGTCATGTTCTCGGTAGGATCTACATTGTACACTGAGAGCAGAAAGCTACTGAGGAGCTGGCACTTACCCTCCGTATTCCACCTGAAAGGTAAACAATCCTTTACCTGTAGGTGCGATACCATCGTATCATGTGAAGGGTACGTAGTTAAGAAAATCACTATGTGCCCCGGCCTGTACGGTAAAACGGTAGGGTACGCCGTGACGTATCACGCGGAGGGATTCCTAGTGTGCAAGACCACAGACACTGTCAAAGGAGAAAGAGTCTCATTCCCTGTATGCACCTACGTCCCCTCAACCATCTGTGATCAAATGACTGGCATACTAGCGACCGACGTCACACCGGAGGACGCACAGAAGTTGTTAGTGGGATTGAATCAGAGGATAGTTGTGAACGGAAGAACACAGCGAAACACTAACACGATGAAGAACTATCTGCTTCCGATTGTGGCCGTCGCATTTAGCAAGTGGGCGAGGGAATACAAGGCAGACCTTGATGATGAAAAACCTCTGGGTGTCCGAGAGAGGTCACTTACTTGCTGCTGCTTGTGGGCATTTAAAACGAAGAAGATGCACACCATGTACAAGAAACCAGACACCCAGACAATAGTGAAGGTGCCTTCAGAGTTTAACTCGTTCGTCATCCCGAGCCTATGGTCTACAGGCCTCGCAATCCCAGTCAGATCACGCATTAAGATGCTTTTGGCCAAGAAGACCAAGCGAGAGTTAATACCTGTTCTCGACGCGTCGTCAGCCAGGGATGCTGAACAAGAGGAGAAGGAGAGGTTGGAGGCCGAGCTGACTAGAGAAGCCTTACCACCCCTCGTCCCCATCGCGCCGGCGGAGACGGGAGTCGTCGACGTCGACGTTGAAGAACTAGAGTATCACGCAGGTGCAGGGGTCGTGGAAACACCTCGCAGCGCGTTGAAAGTCACCGCACAGCCGAACGACGTACTACTAGGAAATTACGTAGTTCTGTCCCCGCAGACCGTGCTCAAGAGCTCCAAGTTGGCCCCCGTGCACCCTCTAGCAGAGCAGGTGAAAATAATAACACATAACGGGAGGGCCGGCCGTTACCAGGTCGACGGATATGACGGCAGGGTCCTACTACCATGTGGATCGGCCATTCCGGTCCCTGAGTTTCAAGCTTTGAGCGAGAGCGCCACTATGGTGTACAACGAAAGGGAGTTCGTCAACAGGAAACTATACCATATTGCCGTTCACGGACCGTCGCTGAACACCGACGAGGAGAACTACGAGAAAGTCAGAGCTGAAAGAACTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTAGATAAAAAATGCTGCGTCAAGAGAGAGGAAGCGTCGGGTTTGGTGTTGGTGGGAGAGCTAACCAACCCCCCGTTCCATGAATTCGCCTACGAAGGGCTGAAGATCAGGCCGTCGGCACCATATAAGACTACAGTAGTAGGAGTCTTTGGGGTTCCGGGATCAGGCAAGTCTGCTATTATTAAGAGCCTCGTGACCAAACACGATCTGGTCACCAGCGGCAAGAAGGAGAACTGCCAGGAAATAGTCAACGACGTGAAGAAGCACCGCGGACTGGACATCCAGGCAAAAACAGTGGACTCCATCCTGCTAAACGGGTGTCGTCGTGCCGTGGACATCCTATATGTGGACGAGGCTTTCGCTTGCCATTCCGGTACTCTGCTGGCCCTAATTGCTCTTGTTAAACCTCGGAGCAAAGTGGTGTTATGCGGAGACCCCAAGCAATGCGGATTCTTCAATATGATGCAGCTTAAGGTGAACTTCAACCACAACATCTGCACTGAAGTATGTCATAAAAGTATATCCAGACGTTGCACGCGTCCAGTCACGGCCATCGTGTCTACGTTGCACTACGGAGGCAAGATGCGCACGACCAACCCGTGCAACAAACCCATAATCATAGACACCACAGGACAGACCAAGCCCAAGCCAGGAGACATCGTGTTAACATGCTTCCGAGGCTGGGTAAAGCAGCTGCAGTTGGACTACCGTGGACACGAAGTCATGACAGCAGCAGCATCTCAGGGCCTCACCCGCAAAGGGGTATACGCCGTAAGGCAGAAGGTGAATGAAAATCCCTTGTATGCCCCTGCGTCGGAGCACGTGAATGTACTGCTGACGCGCACTGAGGATAGGCTGGTGTGGAAAACGCTGGCCGGCGATCCCTGGATTAAGGTCCTATCAAACATTCCACAGGGTAACTTTACGGCCACATTGGAAGAATGGCAAGAAGAACACGACAAAATAATGAAGGTGATTGAAGGACCGGCTGCGCCTGTGGACGCGTTCCAGAACAAAGCGAACGTGTGTTGGGCGAAAAGCCTGGTGCCTGTCCTGGACACTGCCGGAATCAGATTGACAGCAGAGGAGTGGAGCACCATAATTACAGCATTTAAGGAGGACAGAGCTTACTCTCCAGAGGTGGCCTTGAATGAAATTTGCACCAAGTACTATGGAGTTGACCTGGACAGTGGCCTGTTTTCTGCCCCGAAGGTGTCCCTGTATTACGAGAACAACCACTGGGATAACAGACCTGGTGGAAGGATGTATGGATTCAATGCCGCAACAGCTGCCAGGCTGGAAGCTAGACATACCTTCCTGAAGGGGCAGTGGCATACGGGCAAGCAGGCAGTTATCGCAGAAAGAAAAATCCAACCGCTTTCTGTGCTGGACAATGTAATTCCTATCAACCGCAGGCTGCCGCACGCCCTGGTGGCTGAGTACAAGACGGTTAAAGGCAGTAGGGTTGAGTGGCTGGTCAATAAAGTAAGAGGGTACCACGTCCTGCTGGTGAGTGAGTACAACCTGGCTTTGCCTCGACGCAGGGTCACTTGGTTGTCACCGCTGAATGTCACAGGCGCCGATAGGTGCTACGACCTAAGTTTAGGACTGCCGGCTGACGCCGGCAGATTCGACTTGGTCTTTGTGAACATTCACACGGAATTCAGAATCCACCACTACCAGCAGTGTGTCGACCACGCCATGAAGCTGCAGATGCTTGGGGGAGATGCGCTACGACTGCTAAAACCCGGCGGCAGCCTCTTGATGAGAGCTTACGGATACGCCGATAAAATCAGCGAAGCCGTTGTTTCCTCCTTAAGCAGAAAGTTCTCGTCTGCAAGAGTGTTGCGCCCGGATTGTGTCACCAGCAATACAGAAGTGTTCTTGCTGTTCTCCAACTTTGACAACGGAAAGAGACCCTCTACGCTACACCAGATGAATACCAAGCTGAGTGCCGTGTATGCCGGAGAAGCCATGCACACGGCCGGGTGTGCACCATCCTACAGAGTTAAGAGAGCAGACATAGCCACGTGCACAGAAGCGGCTGTGGTTAACGCAGCTAACGCCCGTGGAACTGTAGGGGATGGCGTATGCAGGGCCGTGGCGAAGAAATGGCCGTCAGCCTTTAAGGGAGCAGCAACACCAGTGGGCACAATTAAAACAGTCATGTGCGGCTCGTACCCCGTCATCCACGCTGTAGGGCCTAATTTCTCTGCCACGACTGAAGCGGAAGGGGACCGCGAATTGGCCGCTGTCTACCGGGCAGTGGCCGCCGAAGTAAACAGACTGTCACTGAGCAGCGTAGCCATCCCGCTGCTGTCCACAGGAGTGTTCAGCGGCGGAAGAGATAGGCTGCAGCAATCCCTCAACCATCTATTCACAGCAATGGACGCCACGGACGCTGACGTGACCATCTACTGCAGAGACAAAAGTTGGGAGAAGAAAATCCAGGAAGCCATAGACATGAGGACGGCTGTGGAGTTGCTCAATGATGACGTGGAGCTGACCACAGACTTGGTGAGAGTGCACCCGGACAGCAGCCTGGTGGGTCGTAAGGGCTACAGTACCACTGACGGGTCGCTGTACTCGTACTTGGAAGGTACGAAATTCAACCAGGCTGCTATTGATATGGCAGAGATACTGACGTTGTGGCCCAGACTGCAAGAGGCAAACGAACAGATATGCCTATACGCGCTGGGCGAAACAATGGACAACATCAGATCCAAATGTCCGGTGGACGATTCCGATTCATCAACACCTCCCAGGACAGTGCCCTGCCTGTGCCGCTACGCAATGACAGCAGAACGGATCGCCCGCCTTAGGTCACACCAAGTTAAAAGCATGGTGGTTTGCTCATCTTTTCCCCTCCCGAAATACCATGTAGATGGGGTGCAGAAGG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AATACATAACCTGTGAGTACAAGACGGTCGTCCCGTCGCCGTACGTGAAGTGCTGCGGCGCCTCAGAGTGCTCCACTAAAGAGAAGCCTGACTACCAATGCAAGGTTTACACAGGCGTGTACCCGTTCATGTGGGGAGGGGCATATTGCTTCTGCGACTCAGAAAACACGCAACTCAGCGAGGCGTACGTCGATCGATCGGACGTATGCAGGCATGATCACGCATCTGCTTACAAAGCCCATACAGCATCGCTGAAGGCCAAAGTGAGGGTTATGTACGGCAACGTAAACCAGACTGTGGATGTTTACGTGAACGGAGACCATGCCGTCACGATAGGGGGTACTCAGTTCATATTCGGGCCGCTGTCATCGGCCTGGACCCCGTTCGACAACAAGATAGTCGTGTACAAAGACGAAGTGTTCAATCAGGACTTCCCGCCGTACGGATCTGGGCAACCAGGGCGCTTCGGCGACATCCAAAGCAGAACAGTGGAGAGTAACGACCTGTACGCGAACACGGCACTGAAGCTGGCACGCCCTTCACCCGGCACGGTCCATGTACCGTACACACAGACACCTTCAGGGTTCAAATATTGGCTAAAGGAAAAAGGGACAGCCCTAAATACGAAGGCTCCTTTTGGCTGCCAAATCAAAACGAACCCTGTCAGGGCCATGAACTGCGCCGTGGGAAACATCCCTGTCTCCATGAATTTGCCTGACAGCGCCTTTACCCGCATTGTCGAGGCGCCGACCATCACTGACCTGACTTGCACAGTGGCTACCTGTACGCACTCCTCGGATTTCGGCGGCGTCTTGACACTGACGTACAAGACCGACAAGAACGGGGACTGCTCTGTACACTCGCACTCTAACGTAGCTACTCTACAGGAGGCCACAGCAAAAGTGAAGACAGCAGGTAAGGTGACCTTACACTTCTCCACGGCAAGCGCATCACCTTCTTTTGTGGTGTCGCTATGCAGTGCTAAGGCCACCTGTTCAGCGTCGTGTGAGCCCCCGAAAGACCACATAGTCCCATATGCGGCTAGCCACAGTAACGTAGTGTTTCCAGACATGTCGGGCACCGCACTATCATGGGTGCAGAAAATCTCGGGTGGTCTGGGGGCCTTCGCAATCGGCGCTATCCTGGTGCTAGTTGTGGTCACTTGCATTGGGCTCCGCAGATAAGTTAGGGTAGGCAATGGCATTGATATAGCAAGAAAATTGAAAACAGAAAAAGTTAGGGTAAGCAATGGCATATAACCATAACTGTATAACTTATAACAAAGCGCAACAAGACCTGCGCAATTGGCCCCGTGGTCCGCCTCACGGAAACTCGGGGCAACTCATATTGACACATTAATTGGCAATAATTGGAAGCTTACATAAGCTTAATTCGACGAATAATTGGATTTTTATTTTATTTTGCAATTGGTTTTTAATATTTCC
| 48,746
|
MK280688.1
|
Semliki Forest virus
|
Ternovoi,V.A., Mikriukova,T.P., Protopopova,E.V., Mezhevalova,A.S., Konovalova,S.N., Shvalov,A.N., Loktev,V.B., Agafonov,A.P., Maksyutov,R.A.
|
State Research Center of Virology and Biotehnology 'Vector', Department of Molecular Virology
|
Russia
|
2019-06-04
|
Tanzania53
|
Semliki Forest virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,698
|
GenBank
| null |
Tanzania
|
Tanzania
|
Homo sapiens
| null |
1953
| null | null |
Semliki Forest virus isolate Tanzania53, complete genome
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ATGGCGGATGTGTGACATACACGACGCCAAAAGATTTTGTTCCAGCTCCTGCCACATCCGCCACGCGAGAGATTAACCACCCACGATGGCCGCCAAAGTGCATGTTGATATTGAGGCTGACAGCCCATTCATCAAGTCTTTGCAGAAGGCATTTCCGTCGTTCGAGGTGGAGTCATTGCAGGTCACACCAAATGACCATGCAAATGCCAGAGCATTTTCGCACCTGGCTACCAAATTGATCGAGCAGGAGACTGACAAAGACACACTCATCTTGGATATCGGCAGTGCGCCTTCCAGGAGAATGATGTCTACGCACAAATACCACTGCGTATGCCCTATGCGCAGCGCAGAAGACCCCGAAAGGCTCGTATGCTACGCAAAGAAACTGGCAGCGGCCTCCGGGAAGGTGCTGGATAGAGAGATCGCAGGGAAAATCACCGACCTGCAGACCGTCATGGCTACGCCAGACGCTGAATCTCCTACCTTTTGCCTGCATACAGACGTCACGTGTCGTACGGCAGCCGAAGTGGCCGTATACCAGGACGTGTATGCTGTACATGCACCAACATCGCTGTACCATCAGGCGATGAAAGGTGTCAGAACGGCGTATTGGATTGGGTTTGACACCACCCCGTTTATGTTTGACGCGCTAGCAGGCGCGTATCCAACCTACGCCACAAACTGGGCCGACGAGCAGGTGTTACAGGCCAGGAACATAGGACTGTGTGCAGCATCCTTGACTGAGGGAAGACTCGGCAAACTGTCCATTCTCCGCAAGAAGCAATTGAAACCTTGCGACACAGTCATGTTCTCGGTAGGATCTACATTGTACACTGAGAGCAGAAAGCTACTGAGGAGCTGGCACTTACCCTCCGTATTCCACCTGAAAGGTAAACAATCCTTTACCTGTAGGTGCGATACCATCGTATCATGTGAAGGGTACGTAGTTAAGAAAATCACTATGTGCCCCGGCCTGTACGGTAAAACGGTAGGGTACGCCGTGACGTATCACGCGGAGGGATTCCTAGTGTGCAAGACCACAGACACTGTCAAAGGAGAAAGAGTCTCATTCCCTGTATGCACCTACGTCCCCTCAACCATCTGTGATCAAATGACTGGCATACTAGCGACCGACGTCACACCGGAGGACGCACAGAAGTTGTTAGTGGGATTGAATCAGAGGATAGTTGTGAACGGAAGAACACAGCGAAACACTAACACGATGAAGAACTATCTGCTTCCGATTGTGGCCGTCGCATTTAGCAAGTGGGCGAGGGAATACAAGGCAGACCTTGATGATGAAAAACCTCTGGGTGTCCGAGAGAGGTCACTTACTTGCTGCTGCTTGTGGGCATTTAAAACGAAGAAGATGCACACCATGTACAAGAAACCAGACACCCAGACAATAGTGAAGGTGCCTTCAGAGTTTAACTCGTTCGTCATCCCGAGCCTATGGTCTACAGGCCTCGCAATCCCAGTCAGATCACGCATTGAGATGCTTTTGGCCAAGAAGACCAAGCGAGAGTTAATACCTGTTCTCGACGCGTCGTCAGCCAGGGATGCTGAACAAGAGGAGAAGGAGAGGTTGGAGGCCGAGCTGACTAGAGAAGCCTTACCACCCCTCGTCCCCATCGCGCCGGCGGAGACGGGAGTCGTCGACGTCGACGTTGAAGAACTAGAGTATCACGCAGGTGCAGGGGTCGTGGAAACACCTCGCAGCGCGTTGAAAGTCACCGCACAGCCGAACGACGTACTACTAGGAAATTACGTAGTTCTGTCCCCGCAGACCGTGCTCAAGAGCTCCAAGTTGGCCCCCGTGCACCCTCTAGCAGAGCAGGTGAAAATAATAACACATAACGGGAGGGCCGGCCGTTACCAGGTCGACGGATATGACGGCAGGGTCCTACTACCATGTGGATCGGCCATTCCGGTCCCTGAGTTTCAAGCTTTGAGCGAGAGCGCCACTATGGTGTACAACGAAAGGGAGTTCGTCAACAGGAAACTATACCATATTGCCGTTCACGGACCGTCGCTGAACACCGACGAGGAGAACTACGAGAAAGTCAGAGCTGAAAGAACTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTAGATAAAAAATGCTGCGTCAAGAGAGAGGAAGCGTCGGGTTTGGTGTTGGTGGGAGAGCTAACCAACCCCCCGTTCCATGAATTCGCCTACGAAGGGCTGAAGATCAGGCCGTCGGCACCATATAAGACTACAGTAGTAGGAGTCTTTGGGGTTCCGGGATCAGGCAAGTCTGCTATTATTAAGAGCCTCGTGACCAAACACGATCTGGTCACCAGCGGCAAGAAGGAGAACTGCCAGGAAATAGTCAACGACGTGAAGAAGCACCGCGGACTGGACATCCAGGCAAAAACAGTGGACTCCATCCTGCTAAACGGGTGTCGTCGTGCCGTGGACATCCTATATGTGGACGAGGCTTTCGCTTGCCATTCCGGTACTCTGCTGGCCCTAATTGCTCTTGTTAAACCTCGGAGCAAAGTGGTGTTATGCGGAGACCCCAAGCAATGCGGATTCTTCAATATGATGCAGCTTAAGGTGAACTTCAACCACAACATCTGCACTGAAGTATGTCATAAAAGTATATCCAGACGTTGCACGCGTCCAGTCACGGCCATCGTGTCTACGTTGCACTACGGAGGCAAGATGCGCACGACCAACCCGTGCAACAAACCCATAATCATAGACACCACAGGACAGACCAAGCCCAAGCCAGGAGACATCGTGTTAACATGCTTCCGAGGCTGGGTAAAGCAGCTGCAGTTGGACTACCGTGGACACGAAGTCATGACAGCAGCAGCATCTCAGGGCCTCACCCGCAAAGGGGTATACGCCGTAAGGCAGAAGGTGAATGAAAATCCCTTGTATGCCCCTGCGTCGGAGCACGTGAATGTACTGCTGACGCGCACTGAGGATAGGCTGGTGTGGAAAACGCTGGCCGGCGATCCCTGGATTAAGGTCCTATCAAACATTCCACAGGGTAACTTTACGGCCACATTGGAAGAATGGCAAGAAGAACACGACAAAATAATGAAGGTGATTGAAGGACCGGCTGCGCCTGTGGACGCGTTCCAGAACAAAGCGAACGTGTGTTGGGCGAAAAGCCTGGTGCCTGTCCTGGACACTGCCGGAATCAGATTGACAGCAGAGGAGTGGAGCACCATAATTACAGCATTTAAGGAGGACAGAGCTTACTCTCCAGAGGTGGCCTTGAATGAAATTTGCACCAAGTACTATGGAGTTGACCTGGACAGTGGCCTGTTTTCTGCCCCGAAGGTGTCCCTGTATTACGAGAACAACCACTGGGATAACAGACCTGGTGGAAGGATGTATGGATTCAATGCCGCAACAGCTGCCAGGCTGGAAGCTAGACATACCTTCCTGAAGGGGCAGTGGCATACGGGCAAGCAGGCAGTTATCGCAGAAAGAAAAATCCAACCGCTTTCTGTGCTGGACAATGTAATTCCTATCAACCGCAGGCTGCCGCACGCCCTGGTGGCTGAGTACAAGACGGTTAAAGGCAGTAGGGTTGAGTGGCTGGTCAATAAAGTAAGAGGGTACCACGTCCTGCTGGTGAGTGAGTACAACCTGGCTTTGCCTCGACGCAGGGTCACTTGGTTGTCACCGCTGAATGTCACAGGCGCCGATAGGTGCTACGACCTAAGTTTAGGACTGCCGGCTGACGCCGGCAGATTCGACTTGGTCTTTGTGAACATTCACACGGAATTCAGAATCCACCACTACCAGCAGTGTGTCGACCACGCCATGAAGCTGCAGATGCTTGGGGGAGATGCGCTACGACTGCTAAAACCCGGCGGCAGCCTCTTGATGAGAGCTTACGGATACGCCGATAAAATCAGCGAAGCCGTTGTTTCCTCCTTAAGCAGAAAGTTCTCGTCTGCAAGAGTGTTGCGCCCGGATTGTGTCACCAGCAATACAGAAGTGTTCTTGCTGTTCTCCAACTTTGACAACGGAAAGAGACCCTCTACGCTACACCAGATGAATACCAAGCTGAGTGCCGTGTATGCCGGAGAAGCCATGCACACGGCCGGGTGTGCACCATCCTACAGAGTTAAGAGAGCAGACATAGCCACGTGCACAGAAGCGGCTGTGGTTAACGCAGCTAACGCCCGTGGAACTGTAGGGGATGGCGTATGCAGGGCCGTGGCGAAGAAATGGCCGTCAGCCTTTAAGGGAGCAGCAACACCAGTGGGCACAATTAAAACAGTCATGTGCGGCTCGTACCCCGTCATCCACGCTGTAGGGCCTAATTTCTCTGCCACGACTGAAGCGGAAGGGGACCGCGAATTGGCCGCTGTCTACCGGGCAGTGGCCGCCGAAGTAAACAGACTGTCACTGAGCAGCGTAGCCATCCCGCTGCTGTCCACAGGAGTGTTCAGCGGCGGAAGAGATAGGCTGCAGCAATCCCTCAACCATCTATTCACAGCAATGGACGCCACGGACGCTGACGTGACCATCTACTGCAGAGACAAAAGTTGGGAGAAGAAAATCCAGGAAGCCATAGACATGAGGACGGCTGTGGAGTTGCTCAATGATGACGTGGAGCTGACCACAGACTTGGTGAGAGTGCACCCGGACAGCAGCCTGGTGGGTCGTAAGGGCTACAGTACCACTGACGGGTCGCTGTACTCGTACTTGGAAGGTACGAAATTCAACCAGGCTGCTATTGATATGGCAGAGATACTGACGTTGTGGCCCAGACTGCAAGAGGCAAACGAACAGATATGCCTATACGCGCTGGGCGAAACAATGGACAACATCAGATCCAAATGTCCGGTGGACGATTCCGATTCATCAACACCTCCCAGGACAGTGCCCTGCCTGTGCCGCTACGCAATGACAGCAGAACGGATCGCCCGCCTTAGGTCACACCAAGTTAAAAGCATGGTGGTTTGCTCATCTTTTCCCCTCCCGAAATACCATGTAGATGGGGTGCAGAAGG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| 62,333
|
MH880789.1
|
Semliki Forest virus
|
Hughes,H.R., Russell,B.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-borne Diseases
|
USA
|
2019-04-29
|
Me tri 5-71
|
Semliki Forest virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,820
|
GenBank
| null |
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
1971
| null | null |
Semliki Forest virus isolate Me tri 5-71, complete genome
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ATAGACACCACAGGACAGACCAAGCCCAAGCCAGGAGGCATCGTGTTAACATGCTTCCGAGGCTGGGTAAAGCAGCTGCAGTTGGACTACCGTGGACACGAAGTCATGACAGCAGCAGCATCATGGCGGATGTGTGACATACACGACGCCAAAAGATTTTGTTCCAGCTCCTGCCACCTCCGCTACGCGAGAGATTAACCACCCACGATGGCCGCCAAAGTGCATGTTGATATTGAGGCTGACAGCCCATTCATCAAGTCTTTGCAGAAGGCATTTCCGTCGTTCGAGGTGGAGTCATTGCAGGTCACACCAAATGACCATGCAAATGCCAGAGCATTTTCGCACCTGGCTACCAAATTGATCGAGCAGGAGACTGACAAAGACACACTCATCTTGGATATCGGCAGTGCGCCTTCCAGGAGAATGATGTCTACGCACAAATACCACTGCGTATGCCCTATGCGCAGCGCAGTAGACCCCGAAAGGCTCGTATGCTACGCAAAGAAACTGGCAGCGGCCTCCGGGAAGGTGCTGGATAGAGAGATCGCAGGGAAAATCACCGACCTGCAGACCGTCATGGCTACGCCAGACGCTGAATCTCCTACCTTTTGCCTGCATACAGACGTCACGTGTCGTACGGCAGCCGAAGTGGCCGTATACCAGGACGTGTATGCTGTACATGCACCAACATCGCTGTACCATCAGGCGATGAAAGGTGTCAGAACGGCGTATTGGATTGGGTTTGACACCACCCCGTTTATGTTTGACGCGCTAGCAGGCGCGTATCCAACCTACGCCACAAACTGGGCCGACGAGCAGGTGTTACAGGCCAGGAACATAGGACTGTGTGCAGCATCCTTGACTGAGGGAAGACTCGGCAAACTGTCCATTCTCCGCAAGAAGCAATTGAAACCTTGCGACACAGTCATGTTCTCGGTAGGATCTACATTGTACACTGAGAGCAGAAAGCTACTGAGGAGCTGGCACTTACCCTCCGTATTCCACCTGAAAGGTAAACAATCCTTTACCTGTAGGTGCGATACCATCGTATCATGTGAAGGGTACGTAGTTAAGAAAATCACTATGTGCCCCGGCCTGTACGGTAAAACGGTAGGGTACGCCGTGACGTATCACGCGGAGGGATTCCTAGTGTGCAAGACCACAGACACTGTCAAAGGAGAAAGAGTCTCATTCCCTGTATGCACCTACGTCCCCTCAACCATCTGTGATCAAATGACTGGCATACTAGCGACCGACGTCACACCGGAGGACGCACAGAAGTTGTTAGTGGGATTGAATCAGAGGATAGTTGTGAACGGAAGAACACAGCGAAACACTAACACGATGAAGAACTATCTGCTTCCGATTGTGGCCGTCGCATTTAGCAAGTGGGCGAGGGAATACAAGGCAGACCTTGATGATGAAAAACCTCTGGGTGTCCGAGAGAGGTCACTTACTTGCTGCTGCTTGTGGGCATTTAAAACGAAGAAGATGCACACCATGTACAAGAAACCAGACACCCAGACAATAGTGAAGGTGCCTTCAGAGTTTAACTCGTTCGTCATCCCGAGCCTATGGTCTACAGGCCTCGCAATCCCAGTCAGATCACGCATTGAGATGCTTTTGGCCAAGAAGACCAAGCGAGAGTTAATGCCTGTTCTCGACGCGTCGTCAGCCAGGGATGCTGAACAAGAGGAGAAGGAGAGGTTGGAGGCCGAGCTGACTAGAGAAGCCTTACCACCCCTCGTCCCCATCGCGCCGGCGGAGACGGGAGTCGTCGACGTCGACGTTGAAGAACTAGAGTATCACGCAGGTGCAGGGGTCGTGGAAACACCTCGCAGCGCGTTGAAAGTCACCGCACAGCCGAACGACGTACTACTAGGAAATTACGTAGTTCTGTCCCCGCAGACCGTGCTCAAGAGCTCCAAGTTGGCCCCCGTGCACCCTCTAGCAGAGCAGGTGAAAATAATAACACATAACGGGAGGGCCGGCCGTTACCAGGTCGACGGATATGACGGCAGGGTCCTACTACCATGTGGATCGGCCATTCCGGTCCCTGAGTTTCAAGCTTTGAGCGAGAGCGCCACTATGGTGTACAACGAAAGGGAGTTCGTCAACAGGAAACTATACCATATTGCCGTTCACGGACCGTCGTTGAACACCGACGAGGAGAACTACGAGAAAGTCAGAGCTGAAAGAACTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTAGATAAAAAATGCTGCGTCAAGAGAGAGGAAGCGTCGGGTTTGGTGTTGGTGGGAGAGCTAACCAACCCCCCGTTCCATGAATTCGCCTACGAAGGGCTGAAGATCAGGCCGTCGGCACCATATAAGACTACAGTAGTAGGAGTCTTTGGGGTTCCGGGATCAGGCAAGTCTGCTATTATTAAGAGCCTCGTGACCAAACACGATCTGGTCACCAGCGGCAAGAAGGAGAACTGCCAGGAAATAGTCAACGACGTGAAGAAGTACCGCGGACTGGACATCCAGGCAAAAACAGTGGACTCCATCCTGCTAAACGGGTGTCGTCGTGCCGTGGACATCCTATATGTGGACGAGGCTTTCGCTTGCCATTCCGGTACTCTGCTGGCCCTAATTGCTCTTGTTAAACCTCGGAGCAAAGTGGTGTTATGCGGAGACCCCAAGCAATGCGGATTCTTCAATATGATGCAGCTTAAGGTGAACTTCAACCACAACATCTGCACTGAAGTATGTCATAAAAGTATATCCAGACGTTGCACGCGTCCAGTCACGGCCATCGTGTCTACGTTGCACTACGGAGGCAAGATGCGCACGACCAACCCGTGCAACAAACCCATAATCATAGACACCACAGGACAGACCAAGCCCAAGCCAGGAGACATCGTGTTAACATGCTTCCGAGGCTGGGTAAAGCAGCTGCAGTTGGACTACCGTGGACACGAAGTCATGACAGCAGCAGCATCTCAGGGCCTCACCCGCAAAGGGGTATACGCCGTAAGGCAGAAGGTGAATGAAAATCCCTTGTATGCCCCTGCGTCGGAGCACGTGAATGTACTGCTGACGCGCACTGAGGATAGGCTGGTGTGGAAAACGCTGGCCGGCGATCCCTGGATTAAGGTCCTATCAAACATTCCACAGGGTAACTTTATGGCCACATTGGAAGAATGGCAAGAAGAACACGACAAAATAATGAAGGTGATTGAAGGACCGGCTGCGCCTGTGGACGCGTTCCAGAACAAAGCGAACGTGTGTTGGGCGAAAAGCCTGGTGCCTGTCCTGGACACTGCCGGAATCAGATTGACAGCAGAGGAGTGGAGCACCATAATTACAGCATTTAAGGAGGACAGAGCTTACTCTCCAGAGGTGGCCTTGAATGAAATTTGCACCAAGTACTATGGAGTTGACCTGGACAGTGGCCTGTTTTCTGCCCCGAAGGTGTCCCTGTATTACGAGAACAACCACTGGGATAACAGACCTGGTGGAAGGATGTATGGATTCAATGCCGCAACAGCTGCCAGGCTGGAAGCTAGACATACCTTCCTGAAGGGGCAGTGGCATACGGGCAAGCAGGCAGTTATCGCAGAAAGAAAAATCCAACCGCTTTCTGTGCTGGACAATGTAATTCCTATCAACCGCAGGCTGCCGCACGCCCTGGTGGCTGAGTACAAGACGGTTAAAGGCAGTAGGGTTGAGTGGCTGGTCAATAAAGTAAGAGGGTACCACGTTCTGCTGGTGAGTGAGTACAACCTGGCTTTGCCTCGACGCAGGGTCACTTGGTTGTCACCGCTGAATGTCACAGGCGCCGATAGGTGCTACGACCTAAGTTTAGGACTGCCGGCTGACGCCGGCAGATTCGACTTGGTCTTTGTGAACATTCACACGGAATTCAGAATCCACCACTACCAGCAGTGTGTCGACCACGCCATGAAGCTGCAGATGCTTGGGGGAGATGCGTTACGACTGCTAAAACCCGGCGGCAGCCTCTTGATGAGAGCTTACGGATACGCCGATAAAATCAGCGAAGCCGTTGTTTCCTCCTTAAGCAGAAAGTTCTCGTCTGCAAGAGTGTTGCGCCCGGATTGTGTCACCAGCAATACAGAAGTGTTCTTGCTGTTCTCCAACTTTGACAACGGAAAGAGACCCTCTACGCTACACCAGATGAATACCAAGCTGAGTGCCGTGTATGCCGGAGAAGCCATGCACACGGCCGGGTGTGCACCATCCTACAGAGTTAAGAGAGCAGACATAGCCACGTGCACAGAAGCGGCTGTGGTTAACGCAGCTAACGCCCGTGGAACTGTAGGGGATGGCGTATGCAGGGCCGTGGCGAAGAAATGGCCGTCAGCCTTTAAGGGAGCAGCAACACCAGTGGGCACAATTAAAACAGTCATGTGCGGCTCGTACCCCGTCATCCACGCTGTAGGGCCTAATTTCTCTGCCACGACTGAAGCGGAAGGGGACCGCGAATTGGCCGCTGTCTACCGGGCAGTGGCCGCCGAAGTAAACAGACTGTCACTGAGCAGCGTAGCCATCCCGCTGCTGTCCACAGGAGTGTTCAGCGGCGGAAGAGATAGGCTGCAGCAATCCCTCAACCATCTATTCACAGCAATGGACGCCACGGACGCTGACGTGACCATCTACTGCAGAGACAAAAGTTGGGAGAAGAAAATCCAGGAAGCCATAGACATGAGGACGGCTGTGGAGTTGCTCAATGATGACGTGGAGCTGACCACAGACTTGGTGAGAGTGCACCCGGACAGCAGCCTGGTGGGTCGTAAGGGCTACAGTACCACTGACGGGTCGCTGTACTCGTACTTGGAAGGTACGAAATTCAACCAGGCTGCTATTGATATGGCAGAGATACTGACGTTGTGGCCCAGACTGCAAGAGGCAAACGAACAGATATGCCTATACGCGCTGGGCGAAACAATGGACAACATCAGATCCAAATGTCCGGTGAACGATTCCGATTCATCATCACCTCCCAGGACAGTGCCCTG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GACAGTAATGCCGAACGTGGTGGGGTTCCCGTATAAGGCTCACATTGAAAGGCCAGGATATAGCCCCCTCACTTTGCAGATGCAGGTTGTTGAAACCAGCCTCGAACCAACCCTTAATTTGGAATACATAACCTGTGAGTACAAGACGGTCGTCCCGTCGCCGTACGTGAAGTGCTGCGGCGCCTCAGAGTGCTCCACTAAAGAGAAGCCTGACTACCAATGCAAGGTTTACACAGGCGTGTACCCGTTCATGTGGGGAGGGGCATATTGCTTCTGCGACTCAGAAAACACGCAACTCAGCGAGGCGTACGTCGATCGATCGGACGTATGCAGGCATGATCACGCATCTGCTTACAAAGCCCATACAGCATCGCTGAAGGCCAAAGTGAGGGTTATGTACGGCAACGTAAACCAGACTGTGGATGTTTACGTGAACGGAGACCATGCCGTCACGATAGGGGGTACTCAGTTCATATTCGGGCCGCTGTCATCGGCCTGGACCCCGTTCGACAACAAGATAGTCGTGTACAAAGACGAAGTGTTCAATCAGGACTTCCCGCCGTACGGATCTGGGCAACCAGGGCGCTTCGGCGACATCCAAAGCAGAACAGTGGAGAGTAACGACCTGTACGCGAACACGGCACTGAAGCTGGCACGCCCTTCACCCGGCACGGTCCATGTACCGTACACACAGACACCTTCAGGGTTCAAATATTGGCTAAAGGAAAAAGGGACAGCCCTAAATACGAAGGCTCCTTTTGGCTGCCAAATCAAAACGAACCCTGTCAGGGCCATGAACTGCGCCGTGGGAAACATCCCTGTCTCCATGAATTTGCCTGACAGCGCCTTTACCCGCATTGTCGAGGCGCCGACCATCACTGACCTGACTTGCACAGTGGCTACCTGTACGCACTCCTCGGATTTCGGCGGCGTCTTGACACTGACGTACAAGACCGACAAGAACGGGGACTGCTCTGTACACTCGCACTCTAACGTAGCTACTCTACAGGAGGCCACAGCAAAAGTGAAGACAGCACGTAAGGTGACCTTACACTTCTCCACGGCAAGCGCATCACCTTCTTTTGTGGTGTCGCTATGCAGTGCTAAGGCCACCTGTTCAGCGTCGTGTGAGCCCCCGAAAGACCACATAGTCCCATATGCGGCTAGCCACAGTAACGTAGTGTTTCCAGACATGTCGGGCACCGCACTATCATGGGTGCAGAAAATCTCGGGTGGTCTGGGGGCCTTCGCAATCGGCGCTATCCTGGTGCTAGTTGTGGTCACTTGCATTGGGCTCCGCAGATAATGAGTACCTCACCTTAGCATACAGGGTACTAAACTCATAGCTTAATTGACAGTATACCTCCATCATAATTAGCCAAGGGTACTGTAATTTTATCATAACTACTTGAACAGAAAACTGGAAAACAGAAAAAGTTAGGGTAGGCAATGTTAGTATATTATACCTCTATTATAATCACTTGAACGAAAACTGAAAAACAGAAAAAGTTAGGGTAAGCAATGGCATTAATATAGCAAGAAAACCGAAAATAGAAAAAGTTAGGGTAGGCAATGGCATTGATATAGCAAGAAAATTGAAAACAGAAAAAGTTAGGGTAAGCAATGGCATATAACCATAACTGTATAACTTATAACAAAGCGCAACAAGACCTGCGCAATTGGCCCCGTGGTCCGCCTCACGGAAACTCGGGGCAACTCATATTGACACATTAATTGGCAATAATTGGAAGCTTACATAAGCTTAATTCGACGAATAATTGGATTTTTATTTTATTTTGCAATTGGTTTTTAATATTTCC
| 63,013
|
KT009012.1
|
Semliki Forest virus
|
Ferguson,M.C., Saul,S., Fragkoudis,R., Weisheit,S., Cox,J., Patabendige,A., Sherwood,K., Watson,M., Merits,A., Fazakerley,J.K.
|
The Pirbright Institute
|
United Kingdom
|
2015-06-14
| null |
Semliki Forest virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,445
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Semliki Forest virus strain SFV6, complete genome
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