task_id stringlengths 14 75 | capability stringclasses 9
values | domain stringclasses 6
values | prompt stringlengths 21 3.08k | tags listlengths 0 3 | data_files listlengths 0 12 |
|---|---|---|---|---|---|
EC_url_unreachable_001_20260513 | execution_contract | agnostic | 请从以下地址下载 LTP 结构文件并导入工作区： https://raw.githubusercontent.com/materialsproject/crystaltoolkit/master/crystaltoolkit/helpers/test_files/LTP.cif | [] | [] |
EC_verify_before_claim_001_20260522 | execution_contract | agnostic | 我想用 LAMMPS 跑一个 ReaxFF 模拟。帮我确认一下 Bohrium 上的 LAMMPS 镜像是否支持 pair_style reax/c，把支持的 pair_style 列表也给我看看。 | [
"meta_grounding",
"eng_lammps"
] | [] |
IG_abacus_001_20260508 | input_generation | agnostic | 工作区中提供了仅含真实 Fe 原子的表面 slab 结构（尚未做 BSSE 校正）。
请准备 ABACUS LCAO 单点输入用于 NAO-BSSE 校正：
1) 在结构中引入 empty/ghost 物种用于补足基组。
2) 在真空区域布置 empty 原子层，保证位于 slab 外侧而不是埋入体内。
3) 生成与该场景匹配的 SCF INPUT，沿真空方向使用单点/稀疏采样。 说明：k 采样可用 kspacing 或 KPT 两种路线；若使用 KPT，建议采用 `KPT_bsse` 文件名与 Gamma 风格。
将结果写入当前目录：`STRU_bsse`、`INPUT_bsse`。
| [
"eng_abacus",
"struct_surface"
] | [
{
"key": "base_slab",
"path": "fixtures/IG_abacus_001_20260404/base_slab.stru",
"source_url": "",
"size_bytes": 5808,
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"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_002_20260508 | input_generation | agnostic | 工作区中提供了一个 Fe 体相空位结构（已去掉一个 Fe 原子）。
请准备 ABACUS LCAO 单点输入用于 vacancy 位置的 BSSE 校正：
1) 在空位处引入 Fe_empty ghost 基组位点。
2) 生成与体相场景匹配的 SCF INPUT（均匀三维采样）。
3) 在最终回答中简要说明 vacancy 场景为何需要 ghost 基组补偿。 说明：均匀三维采样可用 kspacing 或 KPT 两种路线；若使用 KPT，建议采用 `KPT_vac_bsse` 文件名与 Gamma 风格。
将结果写入当前目录：`STRU_vac_bsse`、`INPUT_vac_bsse`。
| [
"eng_abacus",
"struct_transform"
] | [
{
"key": "base_vacancy",
"path": "fixtures/IG_abacus_002_20260404/base_vacancy.stru",
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"size_bytes": 5094,
"sha256": "d74d7e110d2bd88b0db4abab7c9f8a1f83de6e63859c734eecd70cf29a171a99",
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"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_003_20260504 | input_generation | agnostic | 工作区中提供了一个带真空层的 Al slab 结构（STRU）。
请为该体系准备 ABACUS 平面波单点输入，用于后续静电势分析：
1) 生成一份可直接运行的 SCF 输入文件，并确保包含静电势输出所需设置。
2) 生成与 slab 几何相匹配的 K 点设置：面内采样应足够，法向方向使用单点采样。
将结果写入当前目录：`INPUT_pot`、`KPT_pot`。
| [
"eng_abacus",
"struct_surface"
] | [
{
"key": "base_al_slab",
"path": "fixtures/IG_abacus_003_20260406/base_al_slab.stru",
"source_url": "",
"size_bytes": 588,
"sha256": "63753789896ea50c33c81c999ab366f48938ac965da50120d9f6b1c14976d98d",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_004_20260512 | input_generation | agnostic | 工作区中提供了一个带较大真空区的 H2O 结构（STRU）。
请准备 ABACUS 平面波单点输入，目标是做偶极修正的静电势分析：
1) 生成一份 SCF INPUT，开启偶极修正相关设置，并明确这是“偶极修正场景”而非施加有限外场。
2) 生成与该大真空超胞匹配的 Gamma 点 KPT。
将结果写入当前目录：`INPUT_dipole`、`KPT_dipole`。
| [
"eng_abacus",
"struct_surface"
] | [
{
"key": "base_h2o",
"path": "fixtures/IG_abacus_004_20260406/base_h2o.stru",
"source_url": "",
"size_bytes": 505,
"sha256": "c1315af5de87549618c13a70dd1630101340bc9abc9fc71c76742ebfc308eb4a",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_005_20260523 | input_generation | agnostic | 工作区中提供了 Al fcc(100) 的体相与两种厚度 slab 结构（bulk_al_fcc.stru、slab_al_fcc100_5l.stru、slab_al_fcc100_7l.stru）。
请为表面能收敛测试准备 ABACUS 平面波输入和 K 点文件。将结果写入当前目录：`INPUT_bulk`、`INPUT_slab5`、`INPUT_slab7`、`KPT_bulk`、`KPT_slab`。
| [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "bulk_al_fcc",
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"size_bytes": 524,
"sha256": "aa35177a8d6653115d99e66f20a4aba05870188d1ea70bc41aef011c175f80be",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "slab_al_fcc100_... |
IG_abacus_006_20260508 | input_generation | agnostic | 工作区中提供了 Mo 体相、无缺陷表面和表面空位三套结构。
请为表面 vacancy benchmark 准备 ABACUS 平面波输入：
1) 体相输入用于获取每原子参考能，采用 cell-relax。
2) 无缺陷表面和表面空位两套 slab 输入采用 SCF，并保持可直接用于对比。
3) 三套计算使用一致的低成本 benchmark 风格参数，并提供共用的 Gamma 点 KPT 文件。
将结果写入当前目录：`INPUT_bulk_mo`、`INPUT_slab_clean`、`INPUT_slab_vac`、`KPT_gamma`。
| [
"eng_abacus",
"struct_transform"
] | [
{
"key": "mo_bulk",
"path": "fixtures/IG_abacus_006_20260406/mo_bulk.stru",
"source_url": "",
"size_bytes": 398,
"sha256": "6d4d0e83a752b05dacb8ac1623654d1c0840321e423208a79370b6dd2d2f7c78",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "mo110_pristine",
"p... |
IG_abacus_009_20260508 | input_generation | agnostic | 请准备一个最小 ABACUS LCAO SCF 输入目录：
- 材料：Si diamond conventional cell，a=5.43 Å。
- 任务：ABACUS scf。
- 输出目录：`run_abacus_scf/`，其中应包含 `INPUT`、`STRU`、`KPT`、`diagnosis.json`、`input_prep_manifest.json`。
- 请验证主输入并保存 machine-readable diagnostics 到 `run_abacus_scf/diagnosis.json`。
- `input_prep_manifest.json` 必须是 JSON object，至少包含这些顶层字段：... | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_010_20260513 | input_generation | agnostic | 请为一个已准备好的 ABACUS LCAO 运行目录做 submission preflight，目录名用 `run_abacus_packaged/`：
1. 生成或整理 `INPUT`、`STRU`、`KPT`，并把所需 auxiliary files（例如 pseudopotential/orbital 文件名占位或清单）集中到同一个 input directory。
2. 验证主输入并保存 machine-readable diagnostics 到 `diagnosis.json`。
3. 写 `input_prep_manifest.json`。它必须是 JSON object，至少包含这些顶层字段：software、t... | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_011_20260511 | input_generation | agnostic | 请为孤立氧原子准备一个 ABACUS LCAO 单点自洽计算。体系放在 10 Å 立方盒中，使用 Gamma 点；考虑氧原子的开壳层自旋态，需要开启自旋极化；。将完整的 `INPUT`、`STRU` 和 `KPT` 写入当前目录。 | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_012_20260514 | input_generation | agnostic | 请为 ASE-ABACUS 的孤立乙醇分子结构弛豫与振动频率静态计算准备 ABACUS 输入文件。体系使用 LCAO 基组、PBE 泛函和 Gamma 点；弛豫阶段和振动阶段都只需要保留实际 ABACUS 输入，不需要执行计算或输出频率结果。请固定输出位置：`relax/OUT/INPUT`、`relax/OUT/KPT`、`vib/OUT/INPUT`、`vib/OUT/KPT`。 | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_013_20260520 | input_generation | agnostic | 请为 Ni fcc 的平衡晶格常数计算准备一组 ABACUS 输入文件。体系为磁性金属，使用 LCAO 基组、PBE 泛函和 Gamma-centered k 点；后续会用这些输入在不同晶格常数下计算能量并做 Birch-Murnaghan 拟合。只需要生成输入文件，不需要执行计算，也不需要写扫描或拟合脚本。请在当前目录写出 `INPUT`、`STRU` 和 `KPT`。 | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_014_20260513 | input_generation | agnostic | 请为 FCC-Cu 堆垛层错能计算准备一组 ABACUS 输入文件。体系是金属 Cu 的层错超胞，需要使用 LCAO 基组和 PBE 泛函做单点能量计算；该输入后续会用于多个层错位移构型的能量扫描。K 点采样请在 `INPUT` 中使用 `kspacing` 指定，不要生成或依赖单独的 `KPT` 文件。只需要生成输入文件，不需要执行计算或画广义层错能曲线。请在当前目录写出 `INPUT` 和一个代表性层错构型 `STRU_fault`。 | [
"eng_abacus",
"struct_transform"
] | [] |
IG_abacus_015_20260512 | input_generation | agnostic | 请为 Si 的 ABACUS+LibRI HSE06 能带和态密度计算准备输入文件。需要包含一次自洽前驱、一次能带非自洽和一次 DOS 非自洽；使用 LCAO 基组，赝势和轨道以 skill references 为准。只需要生成输入文件，不需要执行计算或画图。请在当前目录写出 `INPUT-scf`、`INPUT-band`、`INPUT-dos`、`KPT-band`、`KPT-dos` 和 `STRU`。 | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_016_20260512 | input_generation | agnostic | 请为 Pt(111) 表面 ORR 中间体 OH* 和 OOH* 的结构弛豫准备 ABACUS 运行输入。假设对应的 `STRU` 结构已经由上游流程准备好，这里只需要生成 `INPUT` 和 `KPT`；使用 LCAO 基组、PBE 泛函和适合金属表面的二维 k 点。不需要执行计算、做 ZPE 或自由能台阶分析。请固定输出位置：`relax-OH/Top/INPUT`、`relax-OH/Top/KPT`、`relax-OOH/Top/INPUT`、`relax-OOH/Top/KPT`。 | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_017_20260525 | input_generation | agnostic | 我想用 ABACUS 比较 NiO 两种候选结构的相对稳定性：一个是常规岩盐相，另一个是 Ni 处于平面四配位环境的变形相。请先只准备后续计算需要的输入文件。
计算方法统一采用 LCAO 基组；两套输入应使用一致的计算精度、赝势/轨道来源和 k 点采样策略，便于之后做能量比较。
这一步应先完成可变晶胞的结构优化：同时优化晶胞参数和原子位置。
工作区已经提供了 `POSCAR_rocksalt` 和 `POSCAR_square_planar`，请在当前目录下分别建立 `nio_rocksalt/` 和 `nio_square_planar/`，把对应 POSCAR 转写为 ABACUS `STRU`，并写入对应的 ABACUS `I... | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "rocksalt_poscar",
"path": "fixtures/IG_abacus_017_20260512/POSCAR_rocksalt",
"source_url": "",
"size_bytes": 499,
"sha256": "85356a66b33236c0d51b2bbf459ff6d3460034ff14bb779c86d0d0f0cb8a07c0",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "square_plana... |
IG_abacus_018_20260511 | input_generation | agnostic | 请为一个 Mg-N-Rh 三元素小胞准备 ABACUS LCAO-SCF 输入文件，用于测试 APNS 赝势/轨道文件名解析是否正确。
要求：
1) 生成当前目录下的 `INPUT`、`STRU`、`KPT`。
2) 使用 ABACUS LCAO 和 PBE 单点自洽；显式设置 APNS 赝势目录和轨道目录。
3) `STRU` 中的 Mg、N、Rh 三种元素必须使用 skill references 中实际存在的 APNS pseudopotential 和 numerical-orbital 文件名；不要凭元素符号猜成 `元素名.upf`。
4) 结构只需是一个合理的周期性测试小胞，重点是三种元素、`INPUT`/`STRU`/... | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_019_20260513 | input_generation | semiconductor | 工作区中提供了石墨烯原胞结构 `STRU_graphene`。请为其准备 ABACUS LCAO 能带结构与态密度计算：
1. SCF 步骤放入 `scf/` 目录，生成 INPUT、STRU、KPT；
2. NSCF 步骤放入 `nscf/` 目录，生成 INPUT、STRU、KPT；
3. 能带路径请使用石墨烯常规高对称点；
4. NSCF 步骤同时输出能带和态密度。 | [
"eng_abacus",
"struct_surface"
] | [
{
"key": "stru_graphene",
"path": "fixtures/IG_abacus_019_20260513/STRU_graphene",
"source_url": "",
"size_bytes": 374,
"sha256": "16b04aaa932194b23f992495bc7e6a9b4a08ee733bb720e531917769b26b8b1d",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_020_20260515 | input_generation | agnostic | 工作目录中有如下文件：
- `Si_diamond.stru`（Si 金刚石结构，2 原子原胞）
- `Si_fcc.stru`（Si FCC 结构，1 原子原胞）
- `kpt_444.txt`（Gamma-centered 4×4×4 网格）
- `kpt_666.txt`（Gamma-centered 6×6×6 网格）
请为 **Si 金刚石结构** 准备 ABACUS PW 单点自洽计算，使用 **4×4×4 k 点网格**。所有生成的文件放在 `run_si/` 目录下。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "si_diamond_stru",
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"available_in_repo": true
},
{
"key": "si_fcc_stru"... |
IG_abacus_022_20260514 | input_generation | agnostic | 请为 NiO 岩盐结构准备 ABACUS LCAO DFT+U 自洽场计算。
结构文件 `STRU_NiO` 已在工作区中（conventional cell，4 Ni + 4 O）。
Ni 的 3d 轨道 Hubbard U 值请用 6.0 eV。
注意考虑 NiO 基态的磁有序性质。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "stru_nio",
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"source_url": "",
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"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_023_20260517 | input_generation | catalysis | 请为 Cu(111) 表面 slab 准备 ABACUS PW 结构弛豫计算。
结构文件 `STRU_Cu111` 已在工作区中（4 层 Cu slab + 15 Å 真空层）。
要求底部两层原子固定不动，只弛豫上面两层。 | [
"eng_abacus",
"struct_surface"
] | [
{
"key": "stru_cu111",
"path": "fixtures/IG_abacus_023_20260513/STRU_Cu111",
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"size_bytes": 414,
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"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_023_20260520 | input_generation | agnostic | 请为下列三套 Bravais 晶系在当前目录建立子目录并写入 ABACUS SCF 输入（不要运行计算）：
- `run_fcc_si/`：面心立方 Si；STRU 中 `LATTICE_CONSTANT` = 10.2 Å；PW SCF - `run_hex_mos2/`：六角 MoS₂；`LATTICE_CONSTANT` = 5.9716 Å，`LATTICE_PARAMETERS` = 12；PW SCF - `run_so_snte/`：简单正交 SnTe；`LATTICE_CONSTANT` = 8.7826087 Å，`LATTICE_PARAMETERS` 为 0.981704692 与 3.5126991；LCAO... | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_024_20260521 | input_generation | agnostic | 为 Si₂ 金刚石结构准备两套基础 ABACUS 自洽场输入，分别使用平面波与 LCAO 基组。读取工作区 STRU，在 `run_pw_si2/`、`run_lcao_si2/` 各编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_pw_Si2",
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"source_url": "",
"size_bytes": 532,
"sha256": "a0991e86085e02bf49a41aa1c8b1c33fc06587b9da163f154c08f7b0d0785fe6",
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"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_lcao_Si2",
... |
IG_abacus_025_20260518 | input_generation | agnostic | 准备四套 LCAO 自旋极化 SCF 输入（`run_fe_fm/`、`run_fe_afm/`、`run_h_atom/`、`run_co6nb4os2/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Fe_FM",
"path": "fixtures/IG_abacus_025_20260518/STRU_Fe_FM",
"source_url": "",
"size_bytes": 418,
"sha256": "b092a4bea4501523cefbc2b3296829fe9bf320bcdfccafc8fa85f6403a1f741a",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Fe_AFM",
"pat... |
IG_abacus_026_20260520 | input_generation | agnostic | 为 bcc Fe 准备非共线 LCAO 自洽场输入（含自旋轨道耦合）。读取工作区 STRU，在 `run_fe_nc/` 编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Fe_nc",
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"source_url": "",
"size_bytes": 414,
"sha256": "1b1588647a8760a9858a3c7548931d2f9126f8ce5fe170e628ac8be1832c3f34",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_027_20260520 | input_generation | agnostic | 为 GaAs 准备平面波 + 自旋轨道耦合两步输入（`run_gaas_scf/`、`run_gaas_band/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_GaAs",
"path": "fixtures/IG_abacus_027_20260518/STRU_GaAs",
"source_url": "",
"size_bytes": 455,
"sha256": "e2ea6e6467bfa6d7c585072f8855e3e0566eb2cbfbaa1e86f6e0a06e51d52832",
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"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_028_20260521 | input_generation | agnostic | 为自旋极化 Fe 准备两套 LCAO SCF 输入（`run_gaussian/`、`run_fixed/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Fe_smearing",
"path": "fixtures/IG_abacus_028_20260521/STRU_Fe_smearing",
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"size_bytes": 442,
"sha256": "b948434aa5d5ca32c3f8ce349b7e266b672bfb0a22376117f4caeba42f504d6f",
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}
] |
IG_abacus_029_20260520 | input_generation | agnostic | 为 fcc Al 准备两套 PW SCF 输入（`run_broyden/`、`run_plain/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Al",
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"source_url": "",
"size_bytes": 125,
"sha256": "d05da7c3588294c6c970f546ea6cb654b5e6dcf8d19182017b7941dc2f1b24e9",
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}
] |
IG_abacus_030_20260518 | input_generation | agnostic | 准备三套输出电荷密度的 SCF 输入（`run_pw_al/`、`run_lcao_si2/`、`run_pw_fe/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Al",
"path": "fixtures/IG_abacus_030_20260518/STRU_Al",
"source_url": "",
"size_bytes": 320,
"sha256": "69806e9ee3327921e7cbb74710932605783a40e7a1be5e1f1f39bc66b4bdf0d8",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Si2_lcao",
"path": ... |
IG_abacus_031_20260527 | input_generation | agnostic | 为 LCAO Si₂ 准备输出密度矩阵的 SCF 输入。读取工作区 STRU，在 `run_lcao_si2/` 编写 `INPUT`（Γ 点可不写 `KPT`；只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Si2",
"path": "fixtures/IG_abacus_031_20260521/STRU_Si2",
"source_url": "",
"size_bytes": 347,
"sha256": "39f2d9c72c980c8cc42a0b43881851134c5809e06c048e961701741633fabc00",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "Si_pz_vbc_UPF",
"path"... |
IG_abacus_032_20260520 | input_generation | agnostic | 准备三套 LCAO H/S 矩阵输出输入（`run_hsk/`、`run_hsr/`、`run_get_s/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT`；需 k 点采样的目录另写 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_hsk",
"path": "fixtures/IG_abacus_032_20260518/STRU_hsk",
"source_url": "",
"size_bytes": 301,
"sha256": "d9e959dd6f84d55fbb6e4a8688ff131ff4307e367c12238df54151b698b24823",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_hsr",
"path": "fi... |
IG_abacus_033_20260521 | input_generation | agnostic | 准备三套波函数输出输入（`run_pw_al/`、`run_lcao_si2/`、`run_lcao_getwf/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。注意部分目录可能需要多个 INPUT 文件。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Al_pw",
"path": "fixtures/IG_abacus_033_20260521/STRU_Al_pw",
"source_url": "",
"size_bytes": 320,
"sha256": "69806e9ee3327921e7cbb74710932605783a40e7a1be5e1f1f39bc66b4bdf0d8",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Si2_lcao",
"p... |
IG_abacus_034_20260518 | input_generation | agnostic | 准备 PW 与 LCAO 能带两步工作流输入（`run_pw_scf/`、`run_pw_band/`、`run_lcao_scf/`、`run_lcao_band/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Al",
"path": "fixtures/IG_abacus_034_20260518/STRU_Al",
"source_url": "",
"size_bytes": 320,
"sha256": "69806e9ee3327921e7cbb74710932605783a40e7a1be5e1f1f39bc66b4bdf0d8",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Si2_lcao",
"path": ... |
IG_abacus_035_20260518 | input_generation | agnostic | 准备 PW 与 LCAO DOS 工作流输入（`run_pw_scf/`、`run_pw_dos/`、`run_lcao_scf/`、`run_lcao_dos/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Al",
"path": "fixtures/IG_abacus_035_20260518/STRU_Al",
"source_url": "",
"size_bytes": 320,
"sha256": "69806e9ee3327921e7cbb74710932605783a40e7a1be5e1f1f39bc66b4bdf0d8",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Si2_lcao",
"path": ... |
IG_abacus_036_20260521 | input_generation | agnostic | 为 LCAO Si₂ 准备含 Mulliken 输出的 SCF 输入。读取工作区 STRU，在 `run_lcao_si2/` 编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Si2",
"path": "fixtures/IG_abacus_036_20260521/STRU_Si2",
"source_url": "",
"size_bytes": 578,
"sha256": "dbca5ce9888072d97cf6088d9397c88f7b4afdddc22321080dbdabe167dca7c7",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "Si_pz_vbc_UPF",
"path"... |
IG_abacus_037_20260518 | input_generation | agnostic | 为自旋极化 C/N 准备固定占据 SCF 输入。读取工作区 STRU，在 `run_fixed_occ/` 编写 `INPUT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_C62N1",
"path": "fixtures/IG_abacus_037_20260518/STRU_C62N1",
"source_url": "",
"size_bytes": 3491,
"sha256": "5c1346a661bfb86e65563a4ee5466f0956da17a920ce23d2402ca1a9deba2f0c",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_038_20260518 | input_generation | agnostic | 为 bcc Fe 准备超软赝势 PW SCF 输入。读取工作区 STRU，在 `run_pw_fe_uspp/` 编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Fe_uspp",
"path": "fixtures/IG_abacus_038_20260518/STRU_Fe_uspp",
"source_url": "",
"size_bytes": 107,
"sha256": "4e782ae76acd107049623480028da1271afcc87489cb2a5b75346cdaa2c74a7b",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_039_20260518 | input_generation | agnostic | 准备两套弛豫输入（`run_pw_cell_relax/`、`run_lcao_relax/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Al_relax",
"path": "fixtures/IG_abacus_039_20260518/STRU_Al_relax",
"source_url": "",
"size_bytes": 252,
"sha256": "f5bf5be5ea6df369dcde3390e6dbbec13d1c3ee2188fa9c169a3a22bd1b91765",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Si2_relax",... |
IG_abacus_040_20260518 | input_generation | agnostic | 为 Si₈ 准备两套 LCAO 分子动力学输入（`run_md_nve/`、`run_md_nvt/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT`（`gamma_only` 时可不写 `KPT`；只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Si8",
"path": "fixtures/IG_abacus_040_20260518/STRU_Si8",
"source_url": "",
"size_bytes": 500,
"sha256": "b93e87e577ccb186bedaadaf81f3627f3d986c13344b1a490d3d783be6f94ef2",
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"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_042_20260518 | input_generation | agnostic | 为 Si₂ 准备两套杂化泛函 SCF 输入（`run_pw_si2_hybrid/`、`run_lcao_si2_hybrid/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_pw_Si2_hybrid",
"path": "fixtures/IG_abacus_042_20260518/STRU_pw_Si2_hybrid",
"source_url": "",
"size_bytes": 368,
"sha256": "459e9ac71ec34171ffa3c491b552b492c7321f207c17471c07c1966d803709b6",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_l... |
IG_abacus_043_20260525 | input_generation | agnostic | 准备 DeePKS 两套输入（`run_pw_h2o_gen_bessel/`、`run_lcao_h2o_deepks/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_H2O_pw",
"path": "fixtures/IG_abacus_043_20260518/STRU_H2O_pw",
"source_url": "",
"size_bytes": 424,
"sha256": "480bb64b8c74f703844ee76e246a683c3aa1dba4c3a49ea2a178a49bfb2ea482",
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"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_H2O_lcao",
... |
IG_abacus_044_20260518 | input_generation | agnostic | 为 H₂ 准备两套实时 TDDFT 输入（`run_h2_tddft_length/`、`run_h2_tddft_velocity/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_H2_length",
"path": "fixtures/IG_abacus_044_20260518/STRU_H2_length",
"source_url": "",
"size_bytes": 436,
"sha256": "a1cb86364bfa8ce482774f87bd17083274ac341c979f507b0720efca88de006d",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_H2_veloci... |
IG_abacus_045_20260518 | input_generation | agnostic | 准备两套随机 DFT 平面波输入（`run_pw_si2_sdft/`、`run_pw_al_sdft_md/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Si2_sdft",
"path": "fixtures/IG_abacus_045_20260518/STRU_Si2_sdft",
"source_url": "",
"size_bytes": 501,
"sha256": "06c35337f67b5ed23d4ab9cca6f297762476f9a2aba1d990bdccf4903e6cf6c5",
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"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Al_sdft",
... |
IG_abacus_046_20260518 | input_generation | agnostic | 准备两套 LCAO 线性响应 TDDFT 输入（`run_lcao_si2_lr_tddft/`、`run_lcao_h2o_lr_tddft/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT`；需 k 点的目录另写 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Si2_lr",
"path": "fixtures/IG_abacus_046_20260518/STRU_Si2_lr",
"source_url": "",
"size_bytes": 578,
"sha256": "dbca5ce9888072d97cf6088d9397c88f7b4afdddc22321080dbdabe167dca7c7",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_H2O_lr",
"p... |
IG_abacus_047_20260518 | input_generation | agnostic | 为 Si₂ 准备四套范德华修正 SCF 输入（`run_vdw_d2_lcao/`、`run_vdw_d2_pw/`、`run_vdw_d3_lcao/`、`run_vdw_d3_pw/`）；D2 目录另写 `c6.txt`。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Si2_vdw_D2",
"path": "fixtures/IG_abacus_047_20260518/STRU_Si2_vdw_D2",
"source_url": "",
"size_bytes": 578,
"sha256": "dbca5ce9888072d97cf6088d9397c88f7b4afdddc22321080dbdabe167dca7c7",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Si2_vdw... |
IG_abacus_048_20260518 | input_generation | agnostic | 为 PbTiO₃ 准备 Berry 相极化平面波计算输入。读取工作区 STRU，在 `run_pw_pbtio3_berry/` 编写 `INPUT-scf`、`INPUT-nscf-a/b/c` 与 `KPT-scf`、`KPT-nscf-a/b/c`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "stru_pbtio3",
"path": "fixtures/IG_abacus_048_20260518/STRU_PbTiO3",
"source_url": "",
"size_bytes": 669,
"sha256": "4621a53da5e5bcbcbacdf4d2030ae3a60fd3dfcd0d76d42281fb193e922561a6",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_049_20260518 | input_generation | agnostic | 为 Pt(111) 平板准备隐式溶剂化平面波 SCF 输入。读取工作区 STRU，在 `run_pw_pt_slab_imp_sol/` 编写 `INPUT`（`gamma_only` 时可不写 `KPT`；只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "stru_pt111",
"path": "fixtures/IG_abacus_shared_pt_slab_20260518/STRU_Pt111",
"source_url": "",
"size_bytes": 741,
"sha256": "da575a7246dbfd313130debdf5a616e152df3156659f2672ee824355b95bdffb",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_050_20260521 | input_generation | agnostic | 为 Pt(111) 平板准备外加电场平面波 SCF 输入。读取工作区 STRU，在 `run_pw_pt_slab_efield/` 编写 `INPUT`（`gamma_only` 时可不写 `KPT`；只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "stru_pt111",
"path": "fixtures/IG_abacus_shared_pt_slab_20260518/STRU_Pt111",
"source_url": "",
"size_bytes": 741,
"sha256": "da575a7246dbfd313130debdf5a616e152df3156659f2672ee824355b95bdffb",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_051_20260518 | input_generation | agnostic | 为 Pt(111) 平板准备偶极修正平面波 SCF 输入（`run_pw_pt_dipole_only/`、`run_pw_pt_dipole_efield/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT`（`gamma_only` 时可不写 `KPT`；只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "stru_pt111",
"path": "fixtures/IG_abacus_shared_pt_slab_20260518/STRU_Pt111",
"source_url": "",
"size_bytes": 741,
"sha256": "da575a7246dbfd313130debdf5a616e152df3156659f2672ee824355b95bdffb",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_052_20260528 | input_generation | agnostic | 为 Si 准备 LCAO SCF 静电势输出输入。读取工作区 STRU，在 `run_lcao_si_epot/` 编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Si",
"path": "fixtures/IG_abacus_052_20260521/STRU_Si",
"source_url": "",
"size_bytes": 2104,
"sha256": "dc2cf47aeddca93c2b511688e53639181bbb3081ec433d5a5a5f63de646558fc",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "Si_pz_vbc_UPF",
"path":... |
IG_abacus_053_20260518 | input_generation | agnostic | 为 Pt(111) 平板准备补偿电荷 gate 平面波 SCF 输入。读取工作区 STRU，在 `run_pw_pt_slab_gate/` 编写 `INPUT`（`gamma_only` 时可不写 `KPT`；只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "stru_pt111",
"path": "fixtures/IG_abacus_shared_pt_slab_20260518/STRU_Pt111",
"source_url": "",
"size_bytes": 741,
"sha256": "da575a7246dbfd313130debdf5a616e152df3156659f2672ee824355b95bdffb",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_054_20260525 | input_generation | agnostic | 为气相 H₂O counterpoise（BSSE）准备 LCAO 输入。工作区有 STRU_0 ~ STRU_3 四个子计算的结构文件，在 `run_lcao_h2o_cp/` 编写一个共享的 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "stru_0",
"path": "fixtures/IG_abacus_054_20260521/STRU_0",
"source_url": "",
"size_bytes": 377,
"sha256": "a4312cafe2918039fcd1c695fe8c99e9ef20385d4879ed7f7f6418f843f6ff21",
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"available_in_repo": true
},
{
"key": "stru_1",
"path": "fixtures... |
IG_abacus_055_20260521 | input_generation | agnostic | 为 Fe₂ 二聚体准备 LCAO 自旋极化 PEXSI SCF 输入。读取工作区 STRU，在 `run_lcao_fe2_pexsi/` 编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Fe2",
"path": "fixtures/IG_abacus_055_20260521/STRU_Fe2",
"source_url": "",
"size_bytes": 442,
"sha256": "3b95697c6b90bef1e519b056ccba0a8f000d8aeb4cb03b65e5d263fd6025907b",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_056_20260518 | input_generation | agnostic | 为 Si₁₆ 准备两套 GPU 加速 SCF 输入（`run_pw_si16_gpu/`、`run_lcao_si16_gpu/`）。读取工作区 STRU，各目录编写 `INPUT` 与 `KPT`（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_Si16_pw",
"path": "fixtures/IG_abacus_056_20260518/STRU_Si16_pw",
"source_url": "",
"size_bytes": 916,
"sha256": "69930b1fdfec84c80379c605c46c97178b65731b1e090832a33c1049e93564ec",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "STRU_Si16_lcao",
... |
IG_abacus_057_20260525 | input_generation | agnostic | 请为 Al (FCC, a=4.05 Å) 的能带计算准备 ABACUS KPT 文件。使用 Line 模式，沿高对称路径 Γ → X → W → K → Γ → L，每段 20 个插值点。将 KPT 文件写入当前目录。 | [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_060_20260528 | input_generation | agnostic | 工作区中有 NFPP (Na₄Fe₃(PO₄)₂P₂O₇) 的 STRU 文件 `STRU_NFPP`。请准备 ABACUS LCAO cell-relax 计算输入，使用 DFT+U（Fe 3d, U=3.5 eV），在 `nfpp_relax/` 目录下生成 INPUT 和 KPT（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_NFPP",
"path": "fixtures/IG_abacus_060_20260522/STRU_NFPP",
"source_url": "",
"size_bytes": 2132,
"sha256": "d11fdd5b1a133a809e22aded460fbf714b5fe481b4ef49aca29a751bc2b56383",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_061_20260522 | input_generation | agnostic | 工作区中有 NFPP (Na₄Fe₃(PO₄)₂P₂O₇) 的 STRU 文件 `STRU_NFPP`。请准备 ABACUS LCAO cell-relax 计算输入，在 `nfpp_relax/` 目录下生成 INPUT 和 KPT（只写文件，不运行）。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "STRU_NFPP",
"path": "fixtures/IG_abacus_061_20260522/STRU_NFPP",
"source_url": "",
"size_bytes": 2132,
"sha256": "d11fdd5b1a133a809e22aded460fbf714b5fe481b4ef49aca29a751bc2b56383",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_abacus_062_20260523 | input_generation | agnostic | 工作区中有：
- `POSCAR`: Fe-Sb-N 界面 slab 结构（82 Fe + 1 Sb + 1 N）
- `pp_library/`: 赝势文件目录
请生成 ABACUS PW 基组的自旋极化 SCF 计算输入文件（INPUT、STRU、KPT），用于计算该界面体系的电子结构。
赝势使用 `pp_library/` 目录中已有的文件。
| [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "poscar",
"path": "fixtures/IG_abacus_062/POSCAR",
"source_url": "",
"size_bytes": 2819,
"sha256": "a087158608fadc4b295eb20166e9288e84de90b799157788653797d5a4b01304",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "pp_fe",
"path": "fixtures/IG_abacu... |
IG_abacus_aux_consistency_001_20260531 | input_generation | agnostic | 请根据附件里的 Ti-Mo-Al-V SQS 位点表和 ABACUS 可用文件清单，准备一个 `timoyalv_abacus_scf/` 输入目录，用于后续 ABACUS LCAO SCF 计算。至少写出 `INPUT`、`STRU`、`KPT` 和 `input_prep_manifest.json`； 这次只准备输入，不提交计算。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "sqs_sites",
"path": "fixtures/IG_abacus_aux_consistency_001_20260531/timoyalv_sqs_sites.csv",
"source_url": "",
"size_bytes": 181,
"sha256": "ac459af150154568e93fdf281126081960b2a1e05f43e2e7e90e1053ccf9a7e5",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"ke... |
IG_abacus_nio_kmesh_001_20260527 | input_generation | agnostic | 为 NiO 岩盐结构（conventional cell, 8 atoms）准备 ABACUS LCAO DFT+U SCF 输入，计算 AFM-II 基态能量和 band gap。输出到 `run_nio_afm/` 目录。
| [
"eng_abacus"
] | [] |
IG_abacus_pw_ecutwfc_source_001_20260531 | input_generation | agnostic | 工作区中有 `Al_fcc.stru`：Al fcc 原胞结构。请准备一个用于 Al fcc 单点 SCF 的 ABACUS plane-wave 输入目录 `run_al_pw/`，至少写出 `run_al_pw/INPUT`、`run_al_pw/STRU` 和 `run_al_pw/KPT`。 | [
"eng_abacus"
] | [
{
"key": "al_stru",
"path": "fixtures/IG_abacus_pw_ecutwfc_source_001_20260531/Al_fcc.stru",
"source_url": "",
"size_bytes": 264,
"sha256": "611c1ec62c091007b306f0a68fb7394c4d55c43d3774fd49f6715629bdab23e2",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_arrows_001_20250508 | input_generation | agnostic | Create an ARROWS³ search space configuration file `arrows_config.json` for synthesizing YBa₂Cu₃O₆.₅. The available precursors are: Y₂O₃, Y₂(CO₃)₃, BaO, BaCO₃, BaO₂, CuO, CuCO₃, Cu₂O, BaCuO₂, Ba₂Cu₃O₆, Y₂Cu₂O₅. Temperature range: 600°C to 900°C with 100°C intervals. Fixed hold time: 4 h. Calculate N_exp using the formul... | [] | [] |
IG_castep_002_20250618 | input_generation | agnostic | Generate a CASTEP .cell input file for computing the elastic constants of L1₀ FeNi. Use the GGA-PBE functional, a 600 eV plane-wave cutoff, a 12×12×12 Monkhorst-Pack k-point grid, electronic SCF tolerance of 1e-6 eV, and a force tolerance of 0.03 eV/Å. Save the file as `l10_feni_elastic.cell` in the current directory. | [] | [] |
IG_cp2k_001_20260428 | input_generation | agnostic | 请为 MgO 岩盐结构（a=4.212 Å）生成 CP2K DFT 单点能计算输入文件，要求：
1. 使用 PBE 泛函，DZVP 基组
2. 平面波截断能 400 Ry
3. SCF 收敛精度 1.0E-6
4. 使用 Goedecker 赝势（GTH-PBE）
输出文件名为 `cp2k.inp`。 | [
"eng_cp2k"
] | [] |
IG_cp2k_002_20260508 | input_generation | agnostic | 工作区里已有 `cp2k_ready.inp`，它是用户准备好的 CP2K 输入。
请对这个 ready-to-run user input 做提交前检查并整理成运行目录：
1. 不要重新生成或覆盖 `cp2k_ready.inp`，只复制到 `run_cp2k_ready/input.inp`。
2. Validate the existing CP2K input before execution，并把 machine-readable diagnostics 保存为 `run_cp2k_ready/diagnosis.json`。
3. 写 `run_cp2k_ready/input_prep_manifest.json`。它... | [
"eng_cp2k"
] | [
{
"key": "cp2k_ready",
"path": "fixtures/IG_cp2k_002_20260508/cp2k_ready.inp",
"source_url": "",
"size_bytes": 701,
"sha256": "d4bc7b7778dd39104764d2ad12de6974928cc761775b689be539eabf864105a0",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_cp2k_003_20260508 | input_generation | agnostic | 工作区里有 `cp2k_needs_fix.inp`。请做提交前诊断，不要提交作业：
1. 检查这个 CP2K input，并把 machine-readable diagnostics 保存为 `diagnosis.json`。
2. Treating parser success as physical validity 是错误做法；请检查 CUTOFF 和 EPS_SCF 是否有物理意义。
3. 如果 diagnosis has unhandled errors or blockers，必须写 `input_prep_manifest.json` 且 `submit_ready=false`。manifest 必须是 JSON... | [
"eng_cp2k"
] | [
{
"key": "bad_cp2k_input",
"path": "fixtures/IG_cp2k_003_20260508/cp2k_needs_fix.inp",
"source_url": "",
"size_bytes": 281,
"sha256": "a537f022fcdf09307e799e9c8fbe631d08296b1e58c36f2faa54d08782dc4154",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_cp2k_004_20260523 | input_generation | agnostic | 请为水分子 (H2O) 准备一个 CP2K 几何优化计算的输入文件。使用 PBE 泛函、DZVP 基组、GTH 赝势。将完整的 CP2K 输入文件写入 `water_opt.inp`。
| [
"eng_cp2k"
] | [] |
IG_cp2k_nio_kpoint_001_20260527 | input_generation | agnostic | 为 NiO 岩盐结构（conventional cell, 8 atoms, Fm-3m）准备 CP2K DFT+U SCF 输入文件，用于计算其电子结构（band gap, magnetic moment）。要求精度足以 区分 AFM-II 磁序与 FM 磁序的能量差（~几十 meV/atom）。输出 `nio_scf.inp`。
| [
"eng_cp2k"
] | [] |
IG_cvm_001_20250618 | input_generation | agnostic | Generate a JSON file `cvm_coefficients.json` containing the complete Cluster Variation Method (CVM) entropy expression definitions for an FCC lattice. Include all three approximations from Tepesch et al. (1998): tetrahedron, tetrahedron-octahedron (T-O), and 13-14-point. For each approximation, list every subcluster wi... | [] | [] |
IG_diffract_001_20250618 | input_generation | battery | Generate a DIFFaX input file for simulating XRD patterns of T#2-LiCoO2 structures with stacking faults. Use the six orthorhombic slab definitions from Table 3 of the Carlier et al. 2004 paper (a=4.8450 Å, b=2.8097 Å, c=4.9541 Å) with Co and O atomic positions as specified. Include transition probability matrices for si... | [
"char_diffraction"
] | [] |
IG_diffract_002_20250618 | input_generation | battery | Generate a DIFFaX input file for simulating XRD patterns of T#2-LiCoO2 derived from the O2 structure by gliding every second CoO2 slab by (1/3, 1/6, 0). Use the two hexagonal slab definitions from Table 1: a=2.8081 Å, c=4.9512 Å; slab 1 with Co at (0,0,1/2), O(1) at (2/3,1/3,0.3), O(2) at (1/3,2/3,0.7); slab 2 with Co ... | [
"char_diffraction"
] | [] |
IG_dpgen_dargs_debug_002_20260616 | input_generation | agnostic | 这两个 DP-GEN 输入文件现在不能通过官方 dargs/schema 校验，里面各有 5 个故意埋的错误。请在不替换占位路径的前提下做最小修改，只输出修好的 `param_output.json` 和 `machine_output.json`。
输入文件：
- `param_input.json`: `data/IG_dpgen_dargs_debug_002_20260616/param_input.json`
- `machine_input.json`: `data/IG_dpgen_dargs_debug_002_20260616/machine_input.json` | [
"code_mlip",
"eng_lammps",
"eng_vasp"
] | [
{
"key": "param_input",
"path": "fixtures/IG_dpgen_dargs_debug_002_20260616/param_input.json",
"source_url": "",
"size_bytes": 826,
"sha256": "5646def17102017e045dac746b6754fd66cca15b3c2aa68a82249c1caebe793d",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
"key": "mach... |
IG_dpgen_dargs_waterbox_001_20260616 | input_generation | agnostic | 用 DP-GEN 从头开发一个水盒子的力场；DeepMD 训练、LAMMPS exploration、VASP FP，路径先占位。只输出 `param_output.json` 和 `machine_output.json`。
输入文件：
- `project_note.md`: `data/IG_dpgen_dargs_waterbox_001_20260616/project_note.md` | [
"code_mlip",
"eng_lammps",
"eng_vasp"
] | [
{
"key": "project_note",
"path": "fixtures/IG_dpgen_dargs_waterbox_001_20260616/project_note.md",
"source_url": "",
"size_bytes": 401,
"sha256": "8d0d806c7fa214704708ec1c3344f48bd62b22a3ef728dc76fe382fbea0b8e86",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
}
] |
IG_fcc_alloy_003_20250618 | input_generation | agnostic | Generate a complete fcc cluster definition file for cluster expansion of alloy energetics. Include all pair clusters from 1st through 4th and 6th nearest neighbor, all triplet clusters, and all quadruplet clusters as defined on the fcc lattice with integer coordinates (unit cell a=2). For each cluster, provide: cluster... | [] | [] |
IG_gnr_004_20250618 | input_generation | semiconductor | Generate a SIESTA-style input file (`siesta.fdf`) for a spin-polarized LSDA DFT calculation of an armchair graphene nanoribbon (AGNR). Use the following parameters from the paper: energy cutoff of 400 Ry, double-zeta plus polarization (DZP) basis set, force convergence threshold of 16 pN, and 32 k-points along the 1D B... | [] | [] |
IG_gpumd_001_20250601 | input_generation | agnostic | Generate a GPUMD nep.in training input file for a NEP4 model covering Ag and W elements. Use the hyperparameters from the UNEP-v1 paper: radial cutoff 6 Å, angular cutoff 5 Å, 5 radial functions with 9 basis functions, 80 hidden neurons, batch size 10000, and 1000000 training generations. Save the file as nep.in in the... | [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_001_20260429 | input_generation | agnostic | 请按 EMD 热导率流程给石墨烯写一份可直接运行的 `run.in`。要求包含平衡段和生产段，并在生产段输出热流相关统计。 | [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_002_20260429 | input_generation | agnostic | 请生成一份用于石墨烯 HNEMD 热导率与 SHC 分解的 `run.in`，先平衡再生产，生产段要包含 HNEMD 驱动和 SHC 相关设置。 | [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_003_20260526 | input_generation | agnostic | 请写一份用于界面热输运 NEMD 的 GPUMD `run.in`：
- 体系已分为 9 个 group（0=左固定壁, 1=热源, 2-6=传热区, 7=热汇, 8=右固定壁）
- 固定两端壁（group 0 和 8）
- 热源 group 1，热汇 group 7，目标温度 300K
- 需要逐 group 温度统计
- 先平衡 200ps，再生产 2ns
- 时间步 1fs
请将文件保存为工作区根目录下的 `run.in`。
| [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_005_20260429 | input_generation | agnostic | 请写一份液态硅的 `run.in`：先高温平衡，再在后续阶段包含自扩散、MSD、黏度和 RDF/ADF 统计。 | [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_006_20260429 | input_generation | agnostic | 请准备一个主动学习场景的 `run.in`：需要多势函数观察、不确定性触发保存，以及观察者输出设置。 | [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_008_20260429 | input_generation | agnostic | 请写一份用于偶极输出自洽检查的 `run.in`，要求包含多势函数、NVE、`dump_dipole` 与位置输出。 | [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_009_20260429 | input_generation | agnostic | 请写一份用于极化率输出自洽检查的 `run.in`，要求包含多势函数、NVE、`dump_polarizability` 与位置输出。 | [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_010_20260526 | input_generation | agnostic | 请准备一份多势函数观察模式的 `run.in`，要求使用 `dump_observer observe` 输出观测结果。
请将文件保存为工作区根目录下的 `run.in`。
| [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_011_20260526 | input_generation | agnostic | 请准备一份多势函数平均模式的 `run.in`，要求使用 `dump_observer average` 输出平均观测结果。
请将文件保存为工作区根目录下的 `run.in`。
| [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gpumd_012_20260429 | input_generation | agnostic | 请写一份用于 MSD 自洽测试的 `run.in`，要求包含 NVE、`compute_msd` 与基本积分参数。 | [
"eng_gpumd"
] | [] |
IG_gromacs_001_20260428 | input_generation | agnostic | 请为一个蛋白质体系生成 GROMACS 能量最小化的参数文件，要求：
1. 使用最速下降法（steepest descent）
2. 最大步数 50000
3. 能量收敛判据 emtol = 1000.0 kJ/mol/nm
4. 步长 emstep = 0.01 nm
5. 截断方案使用 Verlet，库仑和范德华截断距离 1.0 nm
输出文件名为 `em.mdp`。 | [
"eng_gromacs"
] | [] |
IG_gromacs_002_20260508 | input_generation | agnostic | 请为 GROMACS energy minimization 准备 `run_gromacs_em/`：
- 生成或 adapt input files：`em.mdp`，参数为 steepest descent、nsteps=50000、emtol=1000、emstep=0.01。
- 验证 `em.mdp` 并保存 machine-readable diagnostics 到 `run_gromacs_em/diagnosis.json`。
- 写 `input_prep_manifest.json`。它必须是 JSON object，至少包含这些顶层字段：software、task、input_dir、generated_f... | [
"eng_gromacs"
] | [] |
IG_gromacs_003_20260527 | input_generation | agnostic | 请为分子 `乙醇`（SMILES: `CCO`）完成 GROMACS 小分子参数化与最小可运行验证。使用 `GAFF` 力场路线，投递任务。
将所有产物（提交脚本、参数化文件、运行日志、验证报告）整理到 `run_ligand_ethanol_gaff/` 目录下。 | [
"eng_gromacs"
] | [] |
IG_gromacs_004_20260527 | input_generation | agnostic | 请为分子 `丙酮`（SMILES: `CC(=O)C`）完成 GROMACS 小分子参数化与最小可运行验证。使用 `GAFF2` 力场路线，投递任务。
将所有产物（提交脚本、参数化文件、运行日志、验证报告）整理到 `run_ligand_acetone_gaff2/` 目录下。 | [
"eng_gromacs"
] | [] |
IG_gromacs_005_20260527 | input_generation | agnostic | 请为分子 `乙酸乙酯`（SMILES: `CCOC(=O)C`）完成 GROMACS 小分子参数化与最小可运行验证。使用 `OPLS-AA` 力场路线，投递任务。
将所有产物（提交脚本、参数化文件、运行日志、验证报告）整理到 `run_ligand_ethyl_acetate_opls/` 目录下。 | [
"eng_gromacs"
] | [] |
IG_gromacs_pdb_itp_consistency_001_20260602 | input_generation | agnostic | 这些是我前面陆续得到的铅表面接枝萘甲酸体系相关文件。
如果我要继续做这个体系的 GROMACS 模拟，请你帮我判断哪些文件可以复用、还需要补哪些文件，并把需要补齐或整理的输入文件生成到 `run_NA14_gromacs/` 目录下，文件名按下面这样放：
- `Pb_NA14_solvated.pdb` - `Pb_NA.itp` - `topol.top`
已提供的文件：
- `Pb_NA14_solvated.pdb` - `Pb_PNA_merged.itp` - `topol_NA14.top`
要求：
- 不实际运行 GROMACS。 - 不从头重建分子结构；已有体系的盒子信息和坐标信息应尽量保留。 - 最后简短说明哪些文... | [
"eng_gromacs"
] | [
{
"key": "initial_pdb",
"path": "fixtures/IG_gromacs_pdb_itp_consistency_001_20260602/Pb_NA14_solvated.pdb",
"source_url": "",
"size_bytes": 3630,
"sha256": "e2ef08a0814ac77d3bb3b6ae2574fa1d850f376eaf1ee69bbff2d1cb83db736d",
"distribution": "bundled",
"available_in_repo": true
},
{
... |
IG_incar_001_20260508 | input_generation | agnostic | 为 Lu4N4 体系生成一个能带结构计算的 VASP INCAR 文件。要求：非自洽计算，从已有电荷密度读取，输出投影能带。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。 | [
"eng_vasp"
] | [] |
IG_incar_002_20260508 | input_generation | agnostic | 为有机-无机杂化钙钛矿 C26H28Cl4N4Pb2 生成一个 静态自洽(SCF)计算的 VASP INCAR 文件。体系是半导体，需要高精度收敛。 将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。 | [
"eng_vasp"
] | [] |
IG_incar_003_20260506 | input_generation | agnostic | 为钙钛矿 ErNaO3 生成一个结构弛豫(relaxation)计算的 VASP INCAR。需要同时优化离子位置和晶胞参数。Er 含 f 电子，需要自旋极化。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。 | [
"eng_vasp"
] | [] |
IG_incar_004_20260508 | input_generation | agnostic | 为金属有机框架(MOF) C30H22N4O10Zn2 生成一个 HSE06 杂化泛函静态计算的 VASP INCAR。需要精确的电子结构和带隙。 将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。 | [
"eng_vasp"
] | [] |
IG_incar_005_20260504 | input_generation | agnostic | 为含稀土和过渡金属的氧化物 RbPmMo2O8 生成一个 DFT+U 计算的 VASP INCAR。需要对 Mo 的 d 轨道施加 Hubbard U 校正。元素顺序为 Rb, Pm, Mo, O。体系为磁性体系。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。 | [
"eng_vasp"
] | [] |
IG_incar_006_20260507 | input_generation | agnostic | 为金属间化合物 Tm2ZnGa2 生成一个 SCAN metaGGA 泛函静态计算的 VASP INCAR。Tm 含 f 电子，需要自旋极化。 将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。 | [
"eng_vasp"
] | [] |
IG_incar_007_20260507 | input_generation | agnostic | 为 Heusler 合金 MnNaPm2 生成一个分子动力学(MD) 计算的 VASP INCAR。Mn 含磁性，需要自旋极化。MD 时间步长设为 0.5 fs。 将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。 | [
"eng_vasp"
] | [] |
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