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test · 604 rows

task_id stringlengths 14 75	capability stringclasses 9 values	domain stringclasses 6 values	prompt stringlengths 21 3.08k	tags listlengths 0 3	data_files listlengths 0 12
IG_incar_008_20260506	input_generation	agnostic	为钙钛矿 BaZrO3 生成一个弹性常数计算的 VASP INCAR。使用有限差分法计算弹性张量，位移幅度 0.015 A。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_009_20260506	input_generation	agnostic	为有机金属氧化物 C8H12HfO4 生成一个 DFPT(密度泛函微扰理论) 介电常数计算的 VASP INCAR。需要计算介电张量和 Born 有效电荷。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_010_20260528	input_generation	agnostic	为含重元素 Pb 的卤化物 Br6H6Pb2S2 生成一个自旋轨道耦合(SOC)计算的 VASP INCAR。Pb 的 SOC 效应显著，需要高精度设置。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_011_20260506	input_generation	agnostic	为三元金属间化合物 CdOs3Pt 生成一个高精度态密度(DOS)计算的 VASP INCAR。体系为磁性金属，需要投影态密度(PDOS)。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_012_20260528	input_generation	agnostic	为普鲁士蓝类似物 C24Fe8N24Na4 生成一个 NEB(nudged elastic band)+HSE06 过渡态搜索的 VASP INCAR。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_013_20260506	input_generation	agnostic	为三元碳化物表面 (Ta,V)2C (C33O2Ta16V16) 生成一个表面弛豫计算的 VASP INCAR。表面计算需要固定晶胞形状，体系为金属。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp", "struct_surface" ]	[]
IG_incar_014_20260523	input_generation	agnostic	为氢钝化的 SiO2 slab 模型 H16O24Si12 生成一个静态计算的 VASP INCAR。体系是绝缘体 slab，需要固定晶胞形状。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp", "struct_surface" ]	[]
IG_incar_015_20260508	input_generation	agnostic	为 BiSI 中 I 替位 S 缺陷体系生成一个 HSE06+SOC 缺陷计算的 VASP INCAR。含重元素 Bi 需要自旋轨道耦合，缺陷计算需要固定晶胞形状，使用 HSE06 获取准确缺陷能级。需要离子弛豫。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_016_20260507	input_generation	agnostic	为稀土硒化物 DySe 生成一个 GW 计算前驱步骤的 SCF VASP INCAR。Dy 含 f 电子(MAGMOM~7)，需要保存高质量波函数供后续 GW 使用。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_017_20260506	input_generation	agnostic	为简单金属 Al (FCC) 生成一个高精度结构优化的 VASP INCAR，作为后续光学计算的前驱步骤。需要高精度设置和完全优化晶胞参数。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_018_20260508	input_generation	agnostic	为双钙钛矿 Ca4TaOs 生成一个磁性自洽(SCF)计算的 VASP INCAR。体系含 5d 过渡金属(Ta, Os)，需要自旋极化和适当的初始磁矩。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_019_20260508	input_generation	agnostic	为硼酸铯 B12Cs4O20 生成一个非磁性绝缘体的静态 SCF 计算 VASP INCAR。体系为非磁性，宽带隙绝缘体。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_incar_020_20260507	input_generation	agnostic	为三元硒化物 Na3AlSe 生成一个磁性金属体系的静态 SCF 计算 VASP INCAR。体系为磁性金属，需要投影态密度。将完整的 INCAR 写入当前目录下的 `INCAR` 文件。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_lammps_001_20250618	input_generation	agnostic	Generate a LAMMPS input script for a two-phase coexistence MD simulation to predict the melting temperature of Ni at standard pressure. Retrieve the FCC Ni conventional unit cell (Materials Project mp-134) from the structure database and use it to build a 14x14x28 supercell. Initialize the lower half as liquid (heated ...	[ "eng_lammps" ]	[]
IG_lammps_001_20260428	input_generation	agnostic	请为一个 FCC 铜体系生成 LAMMPS 分子动力学输入文件，要求： 1. 使用 EAM 势（Cu_u3.eam），晶格常数 3.615 Å 2. 3×3×3 超胞 3. NPT 系综，温度 300 K，压力 0 bar 4. 运行 10000 步，时间步长 1 fs 5. 每 100 步输出热力学信息输出文件名为 `in.lammps`。	[ "eng_lammps" ]	[]
IG_lammps_004_20250618	input_generation	agnostic	Generate a LAMMPS input script for a two-phase coexistence MD simulation of Ni at 10 GPa external pressure. Retrieve the FCC Ni conventional unit cell from the structure database and use it to build a 14x14x28 supercell. Set up NPH ensemble with external pressure of 10 GPa, 1 fs timestep, and 120 ps production run. Sav...	[ "eng_lammps" ]	[]
IG_lammps_deepmd_typemap_001_20260607	input_generation	agnostic	为含能材料 EAP（乙二胺高氯酸盐，化学式 C₂H₁₂N₂Cl₂O₈，包含 H/C/N/O/Cl 五种元素）写一个 LAMMPS DeePMD 分子动力学输入脚本。模型文件为 `model.pb`（全周期表 118元素type_map）。体系232原子，2500K NVT模拟100ps，时间步0.1fs。输出 `in.lammps`。	[ "eng_lammps", "code_mlip" ]	[]
IG_lammps_eap_deepmd_preflight_001_20260602	input_generation	agnostic	工作区中有 `eap_model_notes.txt`，记录了 EAP（乙二胺高氯酸盐）232 原子 DeePMD 高温 MD 的体系和模型信息。请生成 LAMMPS 输入文件，不需要真实运行。要求： - 2500 K NVT，100 ps，时间步 0.1 fs； - DeePMD 模型文件是 `iter23_0.pb`； - data 文件的原子类型顺序是 H C N O Cl； - 输出 `in.eap_deepmd` 和 `run.sh`。	[ "eng_lammps", "code_mlip" ]	[ { "key": "eap_model_notes", "path": "fixtures/IG_lammps_eap_deepmd_preflight_001_20260602/eap_model_notes.txt", "source_url": "", "size_bytes": 279, "sha256": "8b2a348f0587526d6a22b365a703c59f89f0cbb0025dcbaded1ea429db80b574", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
IG_lammps_gaff_001_20260518v2	input_generation	agnostic	工作区中有一个 20 重复单元的聚乙烯链结构 `polyethylene.xyz`。请使用 GAFF 力场为该体系准备 LAMMPS 结构优化输入，输出 `in.lammps` 和 `data.lammps`。	[ "eng_lammps" ]	[ { "key": "pe_xyz", "path": "fixtures/IG_lammps_gaff_001/polyethylene.xyz", "source_url": "", "size_bytes": 6635, "sha256": "9f38bb171f6b881608860bc87705da277b655e644aa9452ffb25f5af530c04b9", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
IG_lammps_sgcmc_001_20260523	input_generation	agnostic	请生成一个 LAMMPS 输入脚本，使用 `fix sgcmc` 研究 BCC Fe-10at%Cu 合金在 800K 下的短程有序(SRO)。要求：4x4x4 BCC 超胞（128原子），EAM 势，每100 MD 步尝试一次 MC swap，运行 50000 步。输出到 `in.sgcmc`。	[ "eng_lammps" ]	[]
IG_lammps_tensile_bond_001_20260525	input_generation	agnostic	生成 LAMMPS 输入文件，对 FCC Cu 单晶进行 z 方向单轴拉伸模拟，并追踪拉伸过程中键长和键角的演化。要求： - EAM 势 - 300K NVT 平衡后施加应变 - 输出键长分布和键角分布随应变的变化数据 - 输出为 `in.tensile_cu`	[ "eng_lammps" ]	[]
IG_matgl_001_20250624	input_generation	agnostic	Generate a complete M3GNet model configuration JSON file named `m3gnet_form_energy_config.json` for training a formation energy (eV/atom) property prediction model on bulk crystals. Use the hyperparameters from the MatGL paper (Table S4) for the Matbench formation energy model. The configuration must be valid JSON with...	[ "code_mlip" ]	[]
IG_matgl_002_20250624	input_generation	agnostic	Generate a complete CHGNet model configuration JSON file named `chgnet_mlip_config.json` for training a universal machine learning interatomic potential (MLIP) on crystal structures. Use the hyperparameters from the MatGL paper (Table S7). The configuration must be valid JSON with the `@class`, `@module`, `@model_versi...	[ "code_mlip" ]	[]
IG_nep_001_20260428	input_generation	agnostic	目录里有一份 NEP 训练数据 `train.xyz`。请先看数据，再给出可直接训练的 `nep.in`。要求： - `type` 与数据中的元素一致； - 参数不要照抄模板，要和这份数据规模匹配； - 不要写超出 NEP 合法范围的值。同时写一份简短说明，说明你怎么定的关键参数。输出到当前目录：`nep.in`、`nep_input_note.md`。	[ "eng_gpumd" ]	[ { "key": "train_xyz", "path": "fixtures/IG_nep_001_20260428/train.xyz", "source_url": "", "size_bytes": 557, "sha256": "622628a00b8268ec047f61071d276c26f0a6a2366293b568faf64b81c622eed4", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true }, { "key": "test_xyz", "path": "fix...
IG_nernst_002_20260108	input_generation	battery	Implement the Nernst equation to compute the effective electrochemical redox potential of the H₅IO₆/HIO₃ redox couple (E° = 1.626 V) as a function of pH, following the methodology described in Wang et al. (2024) for the LiIn(IO₃)₄ aqueous synthesis system. The half-reaction is H₅IO₆ + H⁺ + 2e⁻ → HIO₃ + 3H₂O. Write a Py...	[ "char_electrochem" ]	[]
IG_orca_001_20260522	input_generation	agnostic	工作区中有 `molecules.csv`，包含 5 个小分子的 SMILES。请用 ORCA 量化计算估算这些分子的 Hansen 溶解度参数（δD, δP, δH），生成可直接提交的输入文件。要求使用 B3LYP/def2-TZVP 级别。	[ "eng_orca" ]	[ { "key": "molecules_csv", "path": "fixtures/IG_orca_001/molecules.csv", "source_url": "", "size_bytes": 138, "sha256": "4ebe045696d83cc05d38bdd011f94ed9078250d2e696eb733ddda073a4ed8bee", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
IG_orca_002_20260522	input_generation	agnostic	请为乙醇分子生成 ORCA 输入文件，计算其红外光谱（振动频率 + IR 强度）。要求使用 B3LYP/def2-TZVP 级别。输出为 `ethanol_ir.inp`。	[ "eng_orca" ]	[]
IG_orca_003_20260525	input_generation	agnostic	请为苯甲醛(benzaldehyde)生成 ORCA 输入文件，完成以下两步计算： 1. 几何优化（B3LYP/def2-SVP） 2. 基于优化构型的 TD-DFT 计算（PBE0/def2-SV(P)，10 个激发态）输出两个输入文件 `opt.inp` 和 `tddft.inp`，以及一个 `run.sh` 脚本按顺序执行。	[ "eng_orca" ]	[]
IG_pourbaix_formula_003_20260108	input_generation	battery	Implement the Pourbaix potential formula from Wang et al. (2024) as a Python function. The Pourbaix potential (equation 3 in the paper) is: Φ̄ = (1/N_M) × [(G − N_O·μ_H₂O) − RT·ln(10)·(2N_O − N_H)·pH − (2N_O − N_H + Q)·E] where N_M, N_O, N_H are the number of metal, oxygen, and hydrogen atoms; Q is the charge; G is the...	[ "char_electrochem" ]	[]
IG_pymatgen_001_20260118	input_generation	agnostic	Generate a Pt(111) surface slab structure using pymatgen. Start from bulk platinum (FCC), create a slab with the (111) Miller index, add a 10 Å vacuum layer, and ensure the slab has symmetric (identical) top and bottom terminations. Save the resulting structure to pt_111_slab.cif in the current working directory.	[ "struct_surface" ]	[]
IG_pymatgen_002_20260118	input_generation	agnostic	Generate a Si(111) surface slab from bulk silicon using pymatgen. Use the primitive bulk unit cell, create a slab with the (111) Miller index oriented to expose the non-polar termination (no dangling Si atoms), and add a 10 Å vacuum layer. Save the structure to si_111_slab.cif in the current working directory.	[ "struct_surface" ]	[]
IG_pyscf_001_20260608	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为水分子（H 0 0 0; H 0 0 0.96; O 居中，可用合理坐标或直接用 `O 0 0 0; H 0 0 0.96; H 0.93 0 -0.24`）写一个单点 DFT 计算脚本 `run_pyscf.py`，使用 wB97X-D 泛函、def2-TZVP 基组，打印总能量。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_002_20260609	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为甲烷分子 CH4 写一个单点能量计算脚本 `run_pyscf.py`，使用 r2SCAN 泛函（meta-GGA）和 def2-SVP 基组，打印总能量。分子坐标可自行给出合理值。只需写出脚本本身，无需提交或运行。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_003_20260609	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为乙烯分子 C2H4 写一个单点 DFT 脚本 `run_pyscf.py`，使用 M06-2X 泛函、cc-pVDZ 基组，打印总能量。坐标可自行给出合理值。只需写出脚本本身，无需提交或运行。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_004_20260609	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为苯分子 C6H6 写一个单点能量脚本 `run_pyscf.py`。方法上请选用一个带经验色散校正的范围分离杂化泛函（range-separated hybrid + dispersion），基组用 def2-SVP。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_005_20260608	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为甲醇分子 CH3OH 写一个单点 DFT 脚本 `run_pyscf.py`，使用 wB97X-D3 泛函、def2-TZVP 基组，打印总能量。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_006_20260608	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为甲基自由基 CH3（doublet，单重态以外的开壳层体系）写一个单点 DFT 脚本 `run_pyscf.py`，使用 PBE 泛函、def2-SVP 基组。注意正确设置自旋。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_007_20260608	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为水分子写一个几何优化脚本 `run_pyscf.py`，在 PBE/def2-SVP 级别下用 geomeTRIC 优化器优化结构，并打印优化后的总能量。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_008_20260608	input_generation	agnostic	请用 PySCF 准备一个苯分子单点 B3LYP/def2-SVP 计算：写出 `run_pyscf.py`，并把可直接执行的 Bohrium 提交命令（含正确的镜像和 cmd）写入 `submit_cmd.txt`。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_009_20260609	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为甲醛分子 CH2O 写一个脚本 `run_pyscf.py`，在 B3LYP/def2-SVP 级别做单点计算，并输出 HOMO-LUMO gap 和偶极矩。只需写出脚本本身，无需提交或运行。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_pyscf_010_20260608	input_generation	agnostic	请用 PySCF 为 N2 分子写一个 CCSD(T) 单点能量脚本 `run_pyscf.py`，使用 cc-pVDZ 基组，打印 CCSD(T) 总能量。	[ "eng_pyscf" ]	[]
IG_qe_001_20250618	input_generation	agnostic	Generate a Quantum ESPRESSO pw.x SCF input file for diamond (primitive cell) using the parameters from Mounet & Marzari (2005): GGA-PBE functional, 40 Ry wavefunction cutoff, appropriate charge-density cutoff ratio, and an 8x8x8 Monkhorst-Pack k-mesh. Save the input as diamond_scf.in in the current directory.	[ "eng_qe" ]	[]
IG_qe_001_20260109	input_generation	agnostic	Generate a Quantum ESPRESSO pw.x input file (si_relax.in) for geometry relaxation of silicon (diamond-cubic, Materials Project mp-149), which you first retrieve from the structure database. Use PBE functional and precise-level convergence settings. Relax atomic positions only, keeping the cell shape and volume fixed.	[]	[]
IG_qe_002_20250618	input_generation	agnostic	Generate a Quantum ESPRESSO ph.x input file for a DFPT phonon calculation of diamond on an 8x8x8 q-point grid. Apply the acoustic sum rule. Use consistent parameters with the SCF run: GGA-PBE, 40 Ry wavefunction cutoff, 8x8x8 k-mesh. Save the input as diamond_phonon.in in the current directory.	[ "eng_qe" ]	[]
IG_siesta_001_20250618	input_generation	agnostic	Generate a SIESTA .fdf input file for a spin-polarized DFT geometry optimization of antiferromagnetic NiO. Retrieve the FCC NiO primitive cell (Fm-3m) from the structure database and use it to build the AFM-II supercell with propagation vector Q=(0.5,0.5,0.5). Apply GGA-PBE, 400 Ry mesh cutoff, 13x13x13 k-point grid, d...	[]	[]
IG_vasp_001_20250618	input_generation	semiconductor	Retrieve the bulk silicon structure (diamond cubic) from the structure database, then generate two VASP INCAR files: INCAR_relax for PBE structural relaxation and INCAR_hse for one-shot HSE06 band gap calculation. Follow the AMP² computational settings described in Kim et al. (Scientific Data, 2020): PBE functional for...	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_001_20260109	input_generation	agnostic	Generate VASP input files (INCAR, POSCAR, KPOINTS) for geometry relaxation of GeTe (trigonal R-3m, Materials Project mp-1189580), which you first retrieve from the structure database. Optimize atomic positions and cell shape while keeping the cell volume fixed. Use PBE functional and precise-level settings. No spin pol...	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_001_20260121	input_generation	agnostic	Generate a VASP INCAR file for structural optimization of bulk pyrite FeS2 (cubic Pa-3), which you first retrieve from the structure database. Use the PBE functional with DFT+U correction (U=2.0 eV on Fe-3d). Save the INCAR to the working directory.	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_001_20260508	input_generation	alloy	Generate a VASP INCAR file for a two-stage geometry optimization of a 128-atom BCC solid solution alloy. Use GGA-PBE functional, 350 eV plane-wave cutoff, 2×2×2 k-point mesh, Methfessel-Paxton smearing with 0.2 eV broadening. The first stage uses PREC=Low and the second stage uses PREC=Normal. Set convergence criteria ...	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_001_20260618	input_generation	agnostic	Generate a VASP INCAR file for a spin-polarized GGA+U calculation of NiO. Use Dudarev's simplified U-J approach (LDAUTYPE=2) with U=6.4 eV on Ni 3d orbitals, a 550 eV plane-wave cutoff, PAW pseudopotentials, and settings appropriate for full structural relaxation (ionic and cell degrees of freedom). Include reasonable ...	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_001_20260625	input_generation	agnostic	Generate a VASP INCAR file for PBEsol geometry optimization of the primitive CsPbI₃ perovskite structure, which you first retrieve from the structure database (e.g. Materials Project). The INCAR must use the PBEsol functional, a 500 eV plane-wave cutoff, Γ-centered k-point sampling, and convergence criteria of 1e-5 eV ...	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_002_20260121	input_generation	agnostic	Generate a VASP INCAR file for structural optimization of bulk anatase TiO2 (tetragonal I41/amd), which you first retrieve from the structure database. Use the PBE functional with DFT+U correction (U=7.3 eV on Ti-3d). Save the INCAR to the working directory.	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_003_20250601	input_generation	agnostic	Generate a VASP INCAR file for DFT single-point energy and force calculations using the settings from the UNEP-v1 training data generation: PBE functional, 600 eV plane-wave energy cutoff, PREC=Accurate, Gaussian smearing with SIGMA=0.02 eV, electronic convergence threshold EDIFF=1E-6, blocked Davidson algorithm (ALGO=...	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_003_20260618	input_generation	agnostic	Generate a VASP INCAR file for a spin-polarized GGA+U calculation of MnO (rock-salt, AFM). Use Dudarev's simplified U-J approach (LDAUTYPE=2) with U=4.0 eV on Mn 3d orbitals, a 550 eV plane-wave cutoff, PAW pseudopotentials, and settings appropriate for full structural relaxation. Include reasonable convergence criteri...	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_005_20250618	input_generation	agnostic	Generate VASP input files (INCAR, POSCAR, KPOINTS) for a SCAN meta-GGA calculation of an isolated O2 dimer in a 15×15×15 Å³ cubic box. Use the parameters from Zhang et al. (npj Comput. Mater. 2018): plane-wave cutoff 520 eV, PAW potentials, gamma-point only k-mesh (appropriate for a large molecular box), convergence to...	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_dftu_001_20260522	input_generation	agnostic	工作区中有 NiO.vasp（氧化镍 POSCAR）。请生成静态计算 INCAR 文件 `INCAR`。PBE 泛函，ENCUT=550 eV。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_fenc_orr_restart_001_20260602	input_generation	agnostic	工作区中有 `fenc_restart_bundle.json`，记录了 FeN4/graphene ORR 中间体已有计算目录、上一版公共 INCAR 和可用的 CONTCAR 情况。请据此生成下一轮“稳定重跑”会用到的 VASP 输入文件，不需要真实提交计算。请输出 `INCAR_restart`，并写一个 `restart_inputs/check_before_submit.sh`，用于在提交前检查 POTCAR、CONTCAR/OSZICAR 和 VASP 启动命令等基本条件。	[ "eng_vasp" ]	[ { "key": "restart_bundle", "path": "fixtures/IG_vasp_fenc_orr_restart_001_20260602/fenc_restart_bundle.json", "source_url": "", "size_bytes": 1661, "sha256": "863e5b819a06f1c5bb1f05a5c165c947f922a8de2f71f320f03f0472b3c33749", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
IG_vasp_he_potcar_gate_001_20260602	input_generation	agnostic	我想用 VASP 做 Ni 中辐照缺陷的电子结构计算：完美 Ni、一个 He4V4 氦泡模型、一个 V6 空洞模型。工作区中有 `potcar_inventory.json`，请根据这个 POTCAR 清单，在 `vasp_inputs/` 下为能准备的体系生成输入模板。请把需要用户后续确认或补齐的信息统一写在 `vasp_inputs/README.md`。不需要真实提交计算。	[ "eng_vasp" ]	[ { "key": "potcar_inventory", "path": "fixtures/IG_vasp_he_potcar_gate_001_20260602/potcar_inventory.json", "source_url": "", "size_bytes": 791, "sha256": "694d1addc913bca0cbd77a84f5bf713169b9420e631a0965223b92702f8afcb7", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
IG_vasp_mag_001_20260508	input_generation	agnostic	工作区中有 Fe_bcc.vasp（体心立方铁，2个原子）。请生成适合该体系的 SCF 计算 INCAR 文件 `INCAR_mag`。注意：Fe 是典型的铁磁性金属，请确保计算设置正确反映其磁性。 ENCUT = 520 eV，电子步收敛精度 1E-6 eV，PBE 泛函。	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_metagga_001_20260508	input_generation	agnostic	工作区中有 TiO2_rutile.vasp（金红石结构 TiO2，6 个原子）。生成 r2SCAN 泛函结构优化的 INCAR 文件 `INCAR_r2scan`，要求： - r2SCAN meta-GGA 泛函 - 结构优化（离子+晶胞） - ENCUT = 600 eV - 力收敛标准 0.01 eV/A	[ "eng_vasp" ]	[]
IG_vasp_qha_pbesol_workflow_001_20260602	input_generation	agnostic	工作区中有 `qha_systems.json`，列出了 4 个晶体结构的原子数、元素和 QHA 体积点。请在 `qha_inputs/` 下生成 VASP + PBEsol 做 QHA 会用到的输入模板和命令脚本，不需要真实提交计算。需要至少包含： - `qha_inputs/dfpt/INCAR` - `qha_inputs/finite_displacement/INCAR` - `qha_inputs/phonopy_commands.sh`	[ "eng_vasp" ]	[ { "key": "qha_systems", "path": "fixtures/IG_vasp_qha_pbesol_plan_001_20260602/qha_systems.json", "source_url": "", "size_bytes": 1170, "sha256": "0e26774a8887b37d71a387c5a2c62caab84332be27b4ed78a334e0837026a42a", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
PIG_abacus_007_20260527	input_generation	agnostic	请为 Si 的 ABACUS LCAO-SCF 试算准备当前目录下的 `INPUT`、`STRU`、`KPT`，并把 Bohrium 提交配置写入 `submit_job.json`。	[ "eng_abacus" ]	[]
PIG_abacus_008_20260527	input_generation	agnostic	请为 Si 的 ABACUS PW-SCF 试算准备当前目录下的 `INPUT`、`STRU`、`KPT`，并把 Bohrium 提交配置写入 `submit_job.json`。	[ "eng_abacus" ]	[]
PIG_abacus_bader_001_20260528	input_generation	agnostic	工作区中有 Al₂O₃ 的 CIF 文件 `Al2O3.cif`（刚玉结构，R-3c，10原子）。请用 ABACUS 对其做 SCF 计算并输出电荷密度，我后续要做 Bader 电荷分析看 Al-O 之间的电荷转移。帮我把输入文件放在 `abacus_bader/` 目录下并提交运行。	[ "eng_abacus" ]	[ { "key": "cif_file", "path": "fixtures/PIG_abacus_bader_001/Al2O3.cif", "source_url": "", "size_bytes": 1163, "sha256": "44cb17809379c935dbfccf09437dd57ca770236c563e05455d1e5578930a74dd", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
PIG_abacus_convert_001_20260513	input_generation	agnostic	工作区中有一个 Pd(111) slab 的 CIF 文件 `Pd111_slab.cif`（16 个 Pd 原子，4 层）。请将其转换为 ABACUS LCAO 格式并准备好 SCF 计算输入，我要直接提交跑。	[ "eng_abacus", "struct_surface" ]	[ { "key": "cif_file", "path": "fixtures/IG_abacus_convert_001_20260513/Pd111_slab.cif", "source_url": "", "size_bytes": 902, "sha256": "cd35d54ef41bb186b31253848cc340b61fc50b96591db437dde69d62cb7a58eb", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
PIG_cp2k_tm_001_20260524	input_generation	agnostic	工作区中有 Fe₂O₃（hematite，R-3c）的 CIF 文件 `Fe2O3.cif`（10原子原胞）。请用 CP2K 对其做 PBE+U (U_eff=4.0 eV on Fe 3d) 的 SCF 单点能计算。使用 DZVP-MOLOPT-SR-GTH 基组、截断能 600 Ry、k 点 Gamma only。帮我准备好输入并跑一下。	[ "eng_cp2k" ]	[ { "key": "cif_file", "path": "fixtures/PIG_cp2k_tm_001/Fe2O3.cif", "source_url": "", "size_bytes": 1163, "sha256": "daf4402fd138600af8ecb18ac04fdc23622e99a717945a1d597b3fb756024b1f", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
PWO_abacus_phonon_001_20260524	workflow_orchestration	agnostic	工作区中有 Si 金刚石结构的 CIF 文件 `Si.cif`（2 原子原胞）。请用 ABACUS 计算 Si 的声子色散曲线（有限位移法），沿 G-X-K-G 路径绘制，并报告 Gamma 点光学支频率（THz）。	[ "eng_abacus" ]	[ { "key": "si_cif", "path": "fixtures/PWO_abacus_phonon_001/Si.cif", "source_url": "", "size_bytes": 748, "sha256": "be8d0398dfe90f55754782edc7c1ae41b28b1518535d2c961257ddb66241d0ce", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
PWO_dpa_finetune_001_20260603	workflow_orchestration	agnostic	工作区 `data/` 下是我的一份 DeePMD 格式训练数据集。帮我用 DPA3 预训练模型在这份数据上微调大约 3000 步，跑完把训练和测试（验证）的 loss 告诉我。	[ "code_mlip" ]	[ { "key": "train_type_map", "path": "fixtures/PWO_dpa_finetune_001/data/data_0/type_map.raw", "source_url": "", "size_bytes": 4, "sha256": "2af2202bdb95741681b308b05c1dae7837141fe32b10d14db2a4c0ea9103e55b", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true }, { "key": "train_ty...
PWO_dpa_head_case_001_20260524	workflow_orchestration	agnostic	请使用 DPA-3.2-5M 模型对 MgO 做结构优化，输出提交配置 `opt_submit.json`。	[ "code_mlip" ]	[]
PWO_dpa_head_organic_001_20260521	workflow_orchestration	agnostic	请使用 DPA 模型对咖啡因分子做构型优化，输出为 `caffeine_optimized.cif`。	[ "code_mlip" ]	[]
PWO_elec_009_20260521	workflow_orchestration	agnostic	对 Al₂O₃ 准备 ABACUS Bader 电荷分析所需文件和 Bohrium 提交配置（文件名 `al2o3_bader_submit.json`）。本题只检验输入文件与提交 JSON，不要投递或执行计算。	[ "eng_abacus" ]	[]
PWO_gpumd_phonon_001_20260526	workflow_orchestration	agnostic	使用 GPUMD 计算 Si 金刚石结构的声子色散关系。要求： - 使用 NEP 势函数（Si 体系，从 GPUMD 官方 examples 或已有资源获取） - 提交到 Bohrium 运行 - 报告 Gamma 点光学支频率 - 结果写入工作区根目录 `phonon_result.json`：`{"gamma_optical_THz": ..., "method": "gpumd"}`	[ "eng_gpumd" ]	[]
PWO_orca_tddft_001_20260525	workflow_orchestration	agnostic	请用 ORCA 计算萘 (naphthalene, C₁₀H₈) 的第一激发态吸收波长。先做几何优化（B3LYP/def2-SVP），然后在优化结构上做 TD-DFT（PBE0/def2-SVP，5 个根）。报告 S₁ 的激发能 (eV) 和振子强度。	[ "eng_orca" ]	[]
PWO_qe_bands_001_20260526	workflow_orchestration	agnostic	使用 Quantum ESPRESSO 计算 Si 的能带结构（金刚石结构，a=5.43 Å）。沿 Γ-X-L-Γ 高对称路径计算能带，报告带隙类型和带隙值。	[ "eng_qe" ]	[]
PWO_qe_scf_001_20260524	workflow_orchestration	agnostic	请帮我对 MgO 岩盐结构做一次 Quantum ESPRESSO pw.x 的 SCF 单点能计算。结构参数：Fm-3m, a=4.21 Å, Mg 在 (0,0,0), O 在 (0.5,0.5,0.5)。使用 PBE 泛函、ecutwfc=60 Ry、4×4×4 k 点网格。帮我跑一下看看总能是多少。	[ "eng_qe" ]	[]
PWO_vasp_submit_001_20260521	workflow_orchestration	agnostic	帮我用 VASP 计算一个 O₂ 分子的平衡键长和结合能，用 PBE 泛函。	[ "eng_vasp" ]	[ { "key": "potcar_O", "path": "fixtures/PWO_vasp_submit_001/POT/PAW_PBE/O/POTCAR", "source_url": "", "size_bytes": 220113, "sha256": "593e090199bb912785fa070a88f396478de48a4e1c2239de14d9e81b9e668c40", "distribution": "restricted", "available_in_repo": false, "restriction_kind": "licen...
PWO_vasp_submit_002_20260528	workflow_orchestration	agnostic	工作区中提供了 Si 金刚石结构 `POSCAR_Si` 和对应的 `POTCAR_Si`。请准备 VASP 自洽场计算输入，放入 `si_scf/` 目录（含 POTCAR），并输出提交配置 `submit.json`。	[ "eng_vasp" ]	[ { "key": "poscar_si", "path": "fixtures/PIG_vasp_001_20260513/POSCAR_Si", "source_url": "", "size_bytes": 100, "sha256": "50ef4d1c61414e15775ba85c728622acf7489ba8463bb72d89ac5f951ecbd809", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true }, { "key": "potcar_si", "path": "...
PXRD_pawley_303K_001_20260502_v1	scientific_analysis	agnostic	文件 `pxrd_303K.xy` 是一个有机-无机杂化硝普盐在 303 K（30 °C）下采集的粉末 X 射线衍射（PXRD）数据（Cu Kα1, λ = 1.5406 Å, 2θ 范围 5°–50°, 步长 ~0.02°, 两列格式: 2θ 强度）。该化合物为单斜晶系，空间群 P 21（No. 4）。文献参考晶胞：a ≈ 10.83 Å, b ≈ 9.62 Å, c ≈ 10.13 Å, beta ≈ 108.75°, V ≈ 1000 Å³。精修策略建议： - 建议使用 14°–50° 2θ 区间以避开低角伪影 - 基线 / 背景函数使用低阶（0–1 阶）以避免过拟合 - 若多次精修收敛到不同盆地，选择 wR 最低且体积与...	[ "char_diffraction" ]	[ { "key": "pxrd_data", "path": "fixtures/PXRD_pawley_303K_001_20260502_v1/pxrd_303K.xy", "source_url": "", "size_bytes": 54498, "sha256": "f9be7a7941b9f3efe0862561bc201b494459db31765255459321b78ae398c58f", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
PXRD_thermal_expansion_001_20260508	scientific_analysis	agnostic	文件 `_td-pxrd_test.txt` 包含一个化合物在 8 个温度下的变温粉末 X 射线衍射（PXRD）数据，温度标签对应关系为：30°C→303K、50°C→323K、70°C→343K、90°C→363K、110°C→383K、120°C→393K、130°C→403K、140°C→413K。该化合物为单斜晶系，空间群提示为 P 21（No. 4），波长为 Cu Kα1，λ = 1.5406 Å。数据特征与精修策略： - 数据为实测变温实验数据，扣除背景前的动态范围约 10×–30×；2θ 范围 5°–50°，建议精修使用 14°–50° 区间以避开低角伪影。 - 推荐将数据按相拆分（RTP 4 点、HTP 4 点）分...	[ "char_diffraction" ]	[ { "key": "vt_pxrd_data", "path": "fixtures/PXRD_thermal_expansion_001_20260506/_td-pxrd_test.txt", "source_url": "https://matmaster-test.oss-cn-zhangjiakou.aliyuncs.com/matmaster_evo/eval_data/PXRD_thermal_expansion_001_20260427_v3/1777279719__td-pxrd_test.txt", "size_bytes": 435960, "sha256": "...
RT_cof_3d_001_20260629	structure_retrieval	polymer	从 COF 数据库检索 3D 类型、dia 拓扑的 COF 结构。请完成以下交付： 1) `3d_dia_cof.json`：包含 `query_type`, `query_topology`, `candidate_count`, `results` （每个含 name, topology, type, formula, density, void_fraction）； 2) `3d_dia_report.md`：说明 3D COF 与 2D COF 在结构上的核心区别、dia 拓扑的连接规则（四面体节点+线性连接体），以及检索到的结构是否符合预期； 3) 导出第一个候选结构为 `COF_3D_dia.cif`。	[ "meta_database" ]	[]
RT_cof_comparison_001_20260629	structure_retrieval	polymer	分别检索 hcb 拓扑和 sql 拓扑的 COF 各 3 个，对比两种拓扑在孔径(PLD/LCD)和比表面积上的差异。请完成以下交付： 1) `topology_comparison.json`：包含 `hcb_results`（3个）和 `sql_results`（3个），每个含 name, topology, pld, lcd, surface_area_m2g； 2) `topology_comparison_report.md`：对比分析两组数据的孔径和比表面积分布差异，解释为什么不同拓扑会导致不同的孔道几何。	[ "meta_database" ]	[]
RT_cof_elements_001_20260629	structure_retrieval	polymer	检索同时含有硼(B)和氮(N)元素的 COF 结构，返回最多 5 个候选。请完成以下交付： 1) `bn_cof_candidates.json`：包含 `query_elements`, `candidate_count`, `results`（每个含 name, formula, elements, topology, surface_area）； 2) `bn_cof_report.md`：分析这些 COF 的共同特征（连接化学类型、典型拓扑、孔径范围），解释为什么 B+N 组合在 COF 中常见（硼酸酯键、硼嗪键等）。	[ "meta_database" ]	[]
RT_cof_name_001_20260629	structure_retrieval	polymer	检索 COF-LZU1 的晶体结构，并报告其基本结构信息。请完成以下交付： 1) `COF_LZU1.cif`：导出结构文件； 2) `cof_lzu1_info.json`：包含 `name`, `topology`, `elements`, `formula`, `space_group`, `pld`, `lcd`, `surface_area`, `type`(2D/3D), `database_source`； 3) 在报告中确认这是否确实是亚胺键连接的 hcb 拓扑 COF。	[ "meta_database" ]	[]
RT_cof_pore_size_001_20260629	structure_retrieval	polymer	检索孔限径(PLD)大于 20 埃的 COF 结构，按孔径从大到小排列，返回前 5 个。请完成以下交付： 1) `large_pore_cof.json`：包含 `filter_criterion`, `results`（每个含 name, pld, lcd, topology, surface_area, type）； 2) `large_pore_cof_report.md`：分析大孔 COF 的结构特征（什么样的拓扑/连接体长度容易产生大孔）； 3) 导出孔径最大的结构为 `largest_pore_cof.cif`。	[ "meta_database" ]	[]
RT_cof_surface_area_001_20260629	structure_retrieval	polymer	帮我筛选比表面积大于 2000 m²/g 的 COF 材料，我想找适合甲烷储存的高孔隙率结构。请完成以下交付： 1) `high_sa_cof.json`：包含 `filter_criterion`, `application`, `results`（每个含 name, surface_area_m2g, void_fraction, pld, lcd, topology）； 2) `gas_storage_screening.md`：从检索结果中推荐 2-3 个最适合甲烷储存的候选，说明推荐理由（孔径匹配甲烷动力学直径~3.8Å、高空隙率、合适拓扑）。	[ "meta_database" ]	[]
RT_cof_topology_001_20260629	structure_retrieval	polymer	帮我从 COF 数据库中检索 sql 拓扑、含三嗪(triazine)节点的 COF 结构。请完成以下交付： 1) `cof_retrieval_report.md`：说明检索条件、使用了哪个数据库、返回了多少候选、各候选的关键属性（拓扑、元素、孔径等）； 2) `cof_candidates.json`：至少包含 `query_topology`, `database_source`, `candidate_count`, `results`（每个结果含 name, topology, elements, pld, lcd）； 3) 将筛选出的第一个结构导出为 `COF_sql_triazine.cif`。	[ "meta_database" ]	[]
SA_abacus_ads_001_20260519	scientific_analysis	agnostic	工作区中有 ABACUS SCF 计算结果文件 `abacus_results.json`，包含 Pt(111) clean slab、CO 分子、以及 CO 吸附在 Pt(111) 上的三个体系的总能量。请计算 CO 的吸附能 E_ads = E(CO+slab) - E(slab) - E(CO)，输出到 `adsorption_energy.json`，格式为 `{"E_ads": ...}`。	[ "eng_abacus" ]	[ { "key": "abacus_results", "path": "fixtures/SA_abacus_ads_001/abacus_results.json", "source_url": "", "size_bytes": 609, "sha256": "ab02855210715c1362b9fe4620924770a2ddcfec6f448ece9b65ebd42adeff5e", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
SA_abacus_wf_001_20260514	scientific_analysis	agnostic	工作区中有一个已完成的 ABACUS slab 计算结果： - `mock_running_scf.log`：SCF 收敛日志（含费米能级） - `mock_ElecStaticPot_z_avg.dat`：沿 z 方向平均的静电势（两列：z 分数坐标 + 势能值）请从这些数据中提取功函数（work function），写入 `work_function.json`，格式为 `{"work_function_eV": <数值>, "V_vacuum_eV": <数值>, "E_fermi_eV": <数值>}`。	[ "eng_abacus" ]	[ { "key": "scf_log", "path": "fixtures/SA_abacus_wf_001_20260514/mock_running_scf.log", "source_url": "", "size_bytes": 824, "sha256": "1318f839340374eabb0813062105e370670cbddba94d8af356685f1cc3075f2e", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true }, { "key": "pot_data", ...
SA_ads_site_001_20260521	scientific_analysis	agnostic	工作区中有一个弛豫后的 H/Zn(0001) 吸附结构 `H_on_Zn0001_relaxed.xyz`（2x2 超胞，4 层 slab + 1 个 H 原子）。请分析该 H 原子处于什么吸附位点，并给出判断依据。输出 `site_analysis.json`，格式：`{"actual_site": "...", "coordination": ..., "distances_to_nearest_Zn_A": [...], "reasoning": "..."}`	[ "struct_surface" ]	[ { "key": "relaxed_structure", "path": "fixtures/SA_ads_site_001/H_on_Zn0001_relaxed.xyz", "source_url": "https://bohrium-agent-test.oss-cn-zhangjiakou.aliyuncs.com/evomaster/evaluation/sa_ads_site_001/H_on_Zn0001_relaxed.xyz", "size_bytes": 876, "sha256": "03f1ee3d151d563e8863cb2888611d951a9d1ce...
SA_agnostic_001_20250618	scientific_analysis	agnostic	Calculate the Debye temperature Θ_D (in K) of Ni₃Al using the Moruzzi-Janak-Schwarz approximation. The bulk modulus is B = 180 GPa, the average atomic volume is Ω = 11.14 Å³/atom, and the average atomic mass is M̄ = 45.24 amu. Write your answer to a file named debye_temperature.txt in the working directory, with the nu...	[]	[]
SA_agnostic_001_20260625	scientific_analysis	semiconductor	Calculate the decomposition enthalpy (ΔH_decomp) in meV/atom for CsGe₀.₅Sn₀.₅Br₃. Use the formula ΔH_decomp = E(CsGe₀.₅Sn₀.₅Br₃) - E(CsBr) - 0.5E(GeBr₂) - 0.5E(SnBr₂). Fetch total energies per atom from Materials Project for CsBr (mp-1066996), GeBr₂ (use OQMD or estimate), SnBr₂ (mp-23215), and construct the perovski...	[ "meta_database" ]	[]
SA_agnostic_002_20250618	scientific_analysis	agnostic	Calculate the nearest-neighbor effective cluster interaction V_1nn (in meV/atom) for the Pd-V alloy system at T = 1000 K using the bond proportion model. The spring constants are: k_PdPd = 3.2 eV/Å², k_VV = 2.8 eV/Å², and k_PdV = 3.5 eV/Å². The system is fcc (d = 3). Write your answer to a file named v1nn_meV.txt in th...	[]	[]
SA_agnostic_002_20260625	scientific_analysis	semiconductor	Calculate the mixing entropy ΔS_mix (in meV/atom/K) and the free-energy-corrected decomposition enthalpy ΔH_decomp - TΔS_mix (in meV/atom) at T = 298 K for a B-site alloyed perovskite with composition CsGe₀.₂₅Hg₀.₂₅Pb₀.₂₅Sn₀.₂₅Br₃. Use the ideal solid solution model: ΔS_mix = -k_B Σ x_i ln(x_i), where k_B = 8.617333262...	[]	[]
SA_agnostic_003_20250618	scientific_analysis	agnostic	Calculate the volumetric thermal expansion ΔV/N (in Å³/atom) at T = 1000 K for an fcc alloy using the quasiharmonic approximation. The bulk modulus is B = 150 GPa and the average Grüneisen parameter is γ̄ = 2.0. Write your answer to a file named thermal_expansion.txt in the working directory, with the numeric value on ...	[]	[]
SA_agnostic_003_20260625	scientific_analysis	agnostic	Calculate Bartel's tolerance factor τ for CsGe₀.₅₆₂₅Sn₀.₄₃₇₅Br₃. Use Shannon ionic radii (6-coordination, in Å): Cs⁺ = 1.81, Ge²⁺ = 0.73, Sn²⁺ = 1.18, Br⁻ = 1.96. n_A = 1 (Cs oxidation state). r_B is the composition-weighted average. Use the formula: τ = r_X/r_B - n_A*(n_A - (r_A/r_B)/ln(r_A/r_B)). Write the result to ...	[]	[]
SA_agnostic_005_20250618	scientific_analysis	agnostic	The purely configurational order-disorder transition temperature of Ni3Al (L1₂ → fcc disordered) is T_config = 1350 K. The configurational entropy change upon disordering at 50:50 composition is ΔS_config = 0.693 k_B/atom. The vibrational entropy change upon disordering is ΔS_vib = 0.05 k_B/atom. Compute the corrected ...	[]	[]
SA_barrier_001_20250115	scientific_analysis	battery	From the paper 'Factors that affect Li mobility in layered lithium transition metal oxides' by Kang and Ceder, extract the activation barrier data for Li migration in LiCoO₂ as a function of Li slab distance (Figure 2). Create a CSV file named licoo2_barrier_vs_slab.csv with columns: slab_distance_angstrom and activati...	[ "analysis_data", "meta_grounding" ]	[]
SA_bat_formation_001_20260521	scientific_analysis	battery	工作区中有 ABACUS 计算结果文件 `abacus_energies.json`，包含 LiCoO2 体相、Li 金属、Co 金属和 O2 分子的总能量。请计算 LiCoO2 的生成能（每 formula unit），输出到 `formation_energy.json`，格式为 `{"E_f_per_fu": ...}`。	[ "eng_abacus" ]	[ { "key": "energies", "path": "fixtures/SA_formation_energy_001/abacus_energies.json", "source_url": "", "size_bytes": 713, "sha256": "e9cdbd270796124f8394c02c341dfcb57d73feaccef73439fcfef7f6898d7616", "distribution": "bundled", "available_in_repo": true } ]
SA_bat_oxpot_001_20260519	scientific_analysis	battery	请计算 FEC（氟代碳酸乙烯酯，SMILES: C1OC(=O)OC1F）的电化学氧化电位 vs Li/Li+，输出到 `fec_oxidation.json`，格式为 `{"E_ox_vs_Li": ...}`。	[]	[]
SA_battery_003_20250618	scientific_analysis	battery	Calculate the theoretical Mn2+/Mn4+ double redox capacity (in mAh/g) of the cathode material Li2Mn2/3Nb1/3O2F. The Mn2+/Mn4+ couple involves 2 electrons per Mn ion. Use atomic masses: Li=6.94, Mn=54.94, Nb=92.91, O=16.00, F=19.00 g/mol. Save your calculation steps and result to a file named capacity_calculation.txt.	[ "char_electrochem" ]	[]

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