PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC8336407 | 80< 0.001t200 + E2.050.20 ± 0.60< 0.001t200 + E2.565.6 ± 0.60< 0.001t200 + E1.542.5 ± 1.94< 0.001E1.531 ± 3.33< 0.001t200 + E2.050.20 ± 0.600.190The experiment was repeated five times and the average is reported with standard error for each group. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"80",
"<",
"0.001t200",
"+",
"E2.050.20",
"±",
"0.60",
"<",
"0.001t200",
"+",
"E2.565.6",
"±",
"0.60",
"<",
"0.001t200",
"+",
"E1.542.5",
"±",
"1.94",
"<",
"0.001E1.531",
"±",
"3.33",
"<",
"0.001t200",
"+",
"E2.050.20",
"±",
"0.600.190The",
"experiment",
"was",
"repeated",
"five",
"times",
"and",
"the",
"average",
"is",
"reported",
"with",
"standard",
"error",
"for",
"each",
"group",
"."
]
}
] |
PMC11574029 | Fig. 4SPP1 activates the PI3K-AKT pathway to promote BLCA cell proliferation, migration, and invasion. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Fig.",
"4SPP1",
"activates",
"the",
"PI3K-AKT",
"pathway",
"to",
"promote",
"BLCA",
"cell",
"proliferation",
",",
"migration",
",",
"and",
"invasion",
"."
]
}
] |
PMC11394112 | The mice with no detectable signal by the fourth week post-injection were scored as ‘ungrafted’. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"mice",
"with",
"no",
"detectable",
"signal",
"by",
"the",
"fourth",
"week",
"post-injection",
"were",
"scored",
"as",
"‘",
"ungrafted",
"’",
"."
]
}
] |
PMC11714165 | Schematic illustration of the co‐assembly of NBD‐F and D‐NBD‐F at a molar ratio of 3:1 to form DN‐F. B) TEM image and DLS characterization of the formed DN‐F nanoparticles. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Schematic",
"illustration",
"of",
"the",
"co‐assembly",
"of",
"NBD‐F",
"and",
"D‐NBD‐F",
"at",
"a",
"molar",
"ratio",
"of",
"3:1",
"to",
"form",
"DN‐F.",
"B",
")",
"TEM",
"image",
"and",
"DLS",
"characterization",
"of",
"the",
"formed",
"DN‐F",
"nanoparticles",
"."
]
}
] |
PMC11792888 | The A549 cell line is a wild-type p53 cell line that lacks the CDKN2A locus , which contains the ARF gene responsible for P14 expression. | [
{
"tags": [
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"A549",
"cell",
"line",
"is",
"a",
"wild-type",
"p53",
"cell",
"line",
"that",
"lacks",
"the",
"CDKN2A",
"locus",
",",
"which",
"contains",
"the",
"ARF",
"gene",
"responsible",
"for",
"P14",
"expression",
"."
]
}
] |
PMC6222726 | It is used to treat the flu. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"is",
"used",
"to",
"treat",
"the",
"flu",
"."
]
}
] |
PMC11627398 | It has been shown that immune dysregulation is prevalent among patients with septic shock . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"has",
"been",
"shown",
"that",
"immune",
"dysregulation",
"is",
"prevalent",
"among",
"patients",
"with",
"septic",
"shock",
"."
]
}
] |
PMC11317131 | Mutations A369P and E434G are located together proximal to the coiled-coiled motif which has been implicated in the regulation of interactions between monomers of the tetrameric interface during synapsis. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Mutations",
"A369P",
"and",
"E434",
"G",
"are",
"located",
"together",
"proximal",
"to",
"the",
"coiled-coiled",
"motif",
"which",
"has",
"been",
"implicated",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"interactions",
"between",
"monomers",
"of",
"the",
"tetrameric",
"interface",
"during",
"synapsis",
".",
"("
]
}
] |
PMC11295144 | GABAAR and NL2 co-expression induces the adhesion of active GABAergic terminals. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"GABAAR",
"and",
"NL2",
"co-expression",
"induces",
"the",
"adhesion",
"of",
"active",
"GABAergic",
"terminals",
"."
]
}
] |
PMC11703896 | All the receptor-ligand binding was visualized in the Discovery Studio software (V 21.0.20298) (Table 1). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"the",
"receptor-ligand",
"binding",
"was",
"visualized",
"in",
"the",
"Discovery",
"Studio",
"software",
"(",
"V",
"21.0.20298",
")",
"(",
"Table",
"1",
")",
"."
]
}
] |
PMC7136814 | MYOD1 and NOG might not be actively involved in the process, but could be indicators of, or associated with, other more fundamental mechanisms. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MYOD1",
"and",
"NOG",
"might",
"not",
"be",
"actively",
"involved",
"in",
"the",
"process",
",",
"but",
"could",
"be",
"indicators",
"of",
",",
"or",
"associated",
"with",
",",
"other",
"more",
"fundamental",
"mechanisms",
"."
]
}
] |
PMC11747949 | Pixel density signal of each spot, representing one analyte, was quantified. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Pixel",
"density",
"signal",
"of",
"each",
"spot",
",",
"representing",
"one",
"analyte",
",",
"was",
"quantified",
"."
]
}
] |
PMC11257988 | Hofmann et al. reported the discovery of a highly efficient, selective, and orally bioavailable small molecule SOS1 inhibitor BI-3406, which binds to the catalytic domain of SOS1, thereby preventing its interaction with KRAS. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Hofmann",
"et",
"al.",
"reported",
"the",
"discovery",
"of",
"a",
"highly",
"efficient",
",",
"selective",
",",
"and",
"orally",
"bioavailable",
"small",
"molecule",
"SOS1",
"inhibitor",
"BI-3406",
",",
"which",
"binds",
"to",
"the",
"catalytic",
"domain",
"of",
"SOS1",
",",
"thereby",
"preventing",
"its",
"interaction",
"with",
"KRAS",
"."
]
}
] |
PMC10671321 | Recently, we showed that ColQ binds to LRP4 . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Recently",
",",
"we",
"showed",
"that",
"ColQ",
"binds",
"to",
"LRP4",
"."
]
}
] |
PMC10933092 | Additionally, a methylation-driven lncRNA-based signature with potential clinical applications for predicting the prognosis of BLCA was identified. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additionally",
",",
"a",
"methylation-driven",
"lncRNA-based",
"signature",
"with",
"potential",
"clinical",
"applications",
"for",
"predicting",
"the",
"prognosis",
"of",
"BLCA",
"was",
"identified",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Eventually, after a median follow-up of 7 years (range 1-30 years), 5 patients (15.2%) originated a second hematological malignancy and 2 patients (6.1%) evolved in secondary myelofibrosis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Eventually",
",",
"after",
"a",
"median",
"follow-up",
"of",
"7",
"years",
"(",
"range",
"1",
"-",
"30",
"years",
")",
",",
"5",
"patients",
"(",
"15.2",
"%",
")",
"originated",
"a",
"second",
"hematological",
"malignancy",
"and",
"2",
"patients",
"(",
"6.1",
"%",
")",
"evolved",
"in",
"secondary",
"myelofibrosis",
"."
]
}
] |
PMC9812014 | SIP-1 reduced viral propagation by more than 98 percent at 10 μM at 8 and 12 days post-infection. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"SIP-1",
"reduced",
"viral",
"propagation",
"by",
"more",
"than",
"98",
"percent",
"at",
"10",
"μM",
"at",
"8",
"and",
"12",
"days",
"post-infection",
"."
]
}
] |
PMC11723947 | The extracellular mediators and signaling events that regulate the crosstalk between these CD4 T cell subsets have been extensively characterized. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"extracellular",
"mediators",
"and",
"signaling",
"events",
"that",
"regulate",
"the",
"crosstalk",
"between",
"these",
"CD4",
"T",
"cell",
"subsets",
"have",
"been",
"extensively",
"characterized",
"."
]
}
] |
PMC11442172 | These increased catabolic reactions likely occur to compensate for the impaired mitochondrial activity that could not be corrected by increasing the glycolytic flux (31). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"increased",
"catabolic",
"reactions",
"likely",
"occur",
"to",
"compensate",
"for",
"the",
"impaired",
"mitochondrial",
"activity",
"that",
"could",
"not",
"be",
"corrected",
"by",
"increasing",
"the",
"glycolytic",
"flux",
"(",
"31",
")",
"."
]
}
] |
PMC10006224 | Arrow points to a 1.3 Mb-long loop that disappears in NIPBL KD but is maintained (even increased) in STAG2 KD cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Arrow",
"points",
"to",
"a",
"1.3",
"Mb-long",
"loop",
"that",
"disappears",
"in",
"NIPBL",
"KD",
"but",
"is",
"maintained",
"(",
"even",
"increased",
")",
"in",
"STAG2",
"KD",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11361748 | The data reported here point to K17 as a positive regulator of both the membrane association and activity of this kinase. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"data",
"reported",
"here",
"point",
"to",
"K17",
"as",
"a",
"positive",
"regulator",
"of",
"both",
"the",
"membrane",
"association",
"and",
"activity",
"of",
"this",
"kinase",
"."
]
}
] |
PMC11055323 | Mice were euthanized according to institutional guidelines when tumor volumes equaled to 15% of body weights or if mice became moribund, with tumor being extracted and divided for IHC. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Mice",
"were",
"euthanized",
"according",
"to",
"institutional",
"guidelines",
"when",
"tumor",
"volumes",
"equaled",
"to",
"15",
"%",
"of",
"body",
"weights",
"or",
"if",
"mice",
"became",
"moribund",
",",
"with",
"tumor",
"being",
"extracted",
"and",
"divided",
"for",
"IHC",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Results: The median CAR-T cells infused were 1.06×10/kg (range,0.08-24×10/kg). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"The",
"median",
"CAR-T",
"cells",
"infused",
"were",
"1.06",
"×",
"10/kg",
"(",
"range,0.08",
"-",
"24",
"×",
"10/kg",
")",
"."
]
}
] |
PMC11343332 | The results demonstrated a significant reduction in the mRNA expression of both VEGF and FGF, indicating the potential of pycnogenol to interfere with key pathways involved in angiogenesis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"results",
"demonstrated",
"a",
"significant",
"reduction",
"in",
"the",
"mRNA",
"expression",
"of",
"both",
"VEGF",
"and",
"FGF",
",",
"indicating",
"the",
"potential",
"of",
"pycnogenol",
"to",
"interfere",
"with",
"key",
"pathways",
"involved",
"in",
"angiogenesis",
"."
]
}
] |
PMC11371747 | Relative affinities of RFC for LV-stereosiomers were assessed by [H]-l-LV influx competition with unlabeled compounds and the antifolates MTX and PLX as reference. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Relative",
"affinities",
"of",
"RFC",
"for",
"LV-stereosiomers",
"were",
"assessed",
"by",
"[H]-l-LV",
"influx",
"competition",
"with",
"unlabeled",
"compounds",
"and",
"the",
"antifolates",
"MTX",
"and",
"PLX",
"as",
"reference",
"."
]
}
] |
PMC11767725 | This state profoundly affects the skin microbiota by altering the biochemical, structural, and immune landscape of the epidermis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"state",
"profoundly",
"affects",
"the",
"skin",
"microbiota",
"by",
"altering",
"the",
"biochemical",
",",
"structural",
",",
"and",
"immune",
"landscape",
"of",
"the",
"epidermis",
"."
]
}
] |
PMC11092382 | Lu et al. studied the developmental toxicity and neurotoxicity of sophocarpine in zebrafish embryos/larvae and reported that sophocarpine had neurotoxic effects with ED50 and LD50 values of 87.1 and 166 mg/L, respectively. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Lu",
"et",
"al.",
"studied",
"the",
"developmental",
"toxicity",
"and",
"neurotoxicity",
"of",
"sophocarpine",
"in",
"zebrafish",
"embryos/larvae",
"and",
"reported",
"that",
"sophocarpine",
"had",
"neurotoxic",
"effects",
"with",
"ED50",
"and",
"LD50",
"values",
"of",
"87.1",
"and",
"166",
"mg/L",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC11143482 | Moreover, this procedure is performed to ensure the efficacy and safety of new medications. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"this",
"procedure",
"is",
"performed",
"to",
"ensure",
"the",
"efficacy",
"and",
"safety",
"of",
"new",
"medications",
"."
]
}
] |
PMC11792888 | In contrast, the analysis of AIF expression levels revealed a dose-dependent increase in the AIF-cleaved form (see Figures 5 C and 5H, p < 0.05), while the total level of AIF protein remained unchanged (not shown). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"contrast",
",",
"the",
"analysis",
"of",
"AIF",
"expression",
"levels",
"revealed",
"a",
"dose-dependent",
"increase",
"in",
"the",
"AIF-cleaved",
"form",
"(",
"see",
"Figures",
"5",
"C",
"and",
"5H",
",",
"p",
"<",
"0.05",
")",
",",
"while",
"the",
"total",
"level",
"of",
"AIF",
"protein",
"remained",
"unchanged",
"(",
"not",
"shown",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Mean data from the various scales of SF-36 indicated significantly worse outcomes in physical health (66.2 [SD 16.8] NTDT vs 77.1 [SD 18.1] TDT; P=0.008), mental health (47.4 [SD 8.4] NTDT vs 51.6 [SD 7.2] TDT; P=0.009), and general health domains (41.9 [SD 8.2] NTDT vs 46.3 [SD 10.0] TDT; P=0.018). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Mean",
"data",
"from",
"the",
"various",
"scales",
"of",
"SF-36",
"indicated",
"significantly",
"worse",
"outcomes",
"in",
"physical",
"health",
"(",
"66.2",
"[",
"SD",
"16.8",
"]",
"NTDT",
"vs",
"77.1",
"[",
"SD",
"18.1",
"]",
"TDT",
";",
"P=0.008",
")",
",",
"mental",
"health",
"(",
"47.4",
"[",
"SD",
"8.4",
"]",
"NTDT",
"vs",
"51.6",
"[",
"SD",
"7.2",
"]",
"TDT",
";",
"P=0.009",
")",
",",
"and",
"general",
"health",
"domains",
"(",
"41.9",
"[",
"SD",
"8.2",
"]",
"NTDT",
"vs",
"46.3",
"[",
"SD",
"10.0",
"]",
"TDT",
";",
"P=0.018",
")",
"."
]
}
] |
PMC11482552 | The reliability of negative results in HPV screening is critical for patient health, as it can influence clinical decisions. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"reliability",
"of",
"negative",
"results",
"in",
"HPV",
"screening",
"is",
"critical",
"for",
"patient",
"health",
",",
"as",
"it",
"can",
"influence",
"clinical",
"decisions",
"."
]
}
] |
PMC6222635 | From the HSQC signals, we found the (71.46, 5.43) signal, which should be attributed to C2 of 2-acetoxy-(1→4)-linked mannose. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"From",
"the",
"HSQC",
"signals",
",",
"we",
"found",
"the",
"(",
"71.46",
",",
"5.43",
")",
"signal",
",",
"which",
"should",
"be",
"attributed",
"to",
"C2",
"of",
"2-acetoxy-(1→4)-linked",
"mannose",
"."
]
}
] |
PMC11087055 | Despite the technical limitations, the suppression level of the Wnt/PCP pathway through the ΔDEP-misexpression was sufficient to lead to the PS deformation (Figure 1 and Figure 1—figure supplement 1). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Despite",
"the",
"technical",
"limitations",
",",
"the",
"suppression",
"level",
"of",
"the",
"Wnt/PCP",
"pathway",
"through",
"the",
"ΔDEP-misexpression",
"was",
"sufficient",
"to",
"lead",
"to",
"the",
"PS",
"deformation",
"(",
"Figure",
"1",
"and",
"Figure",
"1—figure",
"supplement",
"1",
")",
"."
]
}
] |
PMC11718809 | First, the quality of the raw data was assessed using C++ (v20) and R (v4.3.2). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"First",
",",
"the",
"quality",
"of",
"the",
"raw",
"data",
"was",
"assessed",
"using",
"C++",
"(",
"v20",
")",
"and",
"R",
"(",
"v4.3.2",
")",
"."
]
}
] |
PMC11787381 | Images were acquired with a confocal microscope LSM 900 with Zen software at 20x magnification (Zeiss) using the same acquisition parameters (automatic acquisition). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Images",
"were",
"acquired",
"with",
"a",
"confocal",
"microscope",
"LSM",
"900",
"with",
"Zen",
"software",
"at",
"20x",
"magnification",
"(",
"Zeiss",
")",
"using",
"the",
"same",
"acquisition",
"parameters",
"(",
"automatic",
"acquisition",
")",
"."
]
}
] |
PMC11767725 | Liraglutide, administered at 3 mg for three months in a prospective case series, resulted in a reduction in BMI from 39.3 ± 6.2 to 35.6 ± 5.8 (p = 0.002), waist circumference from 121.3 ± 19.2 cm to 110.6 ± 18.1 cm (p = 0.01), and C-reactive protein (CRP) levels from 4.5 ± 2.2 mg/L to 3.0 ± 2.1 mg/L (p = 0.04). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Liraglutide",
",",
"administered",
"at",
"3",
"mg",
"for",
"three",
"months",
"in",
"a",
"prospective",
"case",
"series",
",",
"resulted",
"in",
"a",
"reduction",
"in",
"BMI",
"from",
"39.3",
"±",
"6.2",
"to",
"35.6",
"±",
"5.8",
"(",
"p",
"=",
"0.002",
")",
",",
"waist",
"circumference",
"from",
"121.3",
"±",
"19.2",
"cm",
"to",
"110.6",
"±",
"18.1",
"cm",
"(",
"p",
"=",
"0.01",
")",
",",
"and",
"C-reactive",
"protein",
"(",
"CRP",
")",
"levels",
"from",
"4.5",
"±",
"2.2",
"mg/L",
"to",
"3.0",
"±",
"2.1",
"mg/L",
"(",
"p",
"=",
"0.04",
")",
"."
]
}
] |
PMC9111184 | Caco-2, Human colorectal adenocarcinoma epithelial cell lines (ECACC 86010202) were cultured in DMEM supplemented with 10% FBS and 2 mM L-glutamine at 37 °C in an atmosphere with 5% CO2 by seeding approx. | [
{
"tags": [
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Caco-2",
",",
"Human",
"colorectal",
"adenocarcinoma",
"epithelial",
"cell",
"lines",
"(",
"ECACC",
"86010202",
")",
"were",
"cultured",
"in",
"DMEM",
"supplemented",
"with",
"10",
"%",
"FBS",
"and",
"2",
"mM",
"L-glutamine",
"at",
"37",
"",
"°",
"C",
"in",
"an",
"atmosphere",
"with",
"5",
"%",
"CO2",
"by",
"seeding",
"approx",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Additionally, treatment refractoriness has been demonstrated to resolve by the administration of complement-targeted therapeutics in a subset of patients. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additionally",
",",
"treatment",
"refractoriness",
"has",
"been",
"demonstrated",
"to",
"resolve",
"by",
"the",
"administration",
"of",
"complement-targeted",
"therapeutics",
"in",
"a",
"subset",
"of",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC10758402 | In addition, fluorescent microscopy confirmed increased HSV.n212-GFP transgene expression in murine CT26.wt, CT2A glioma,S180 sarcoma and human 786-0 cells as shown in ( Supplementary Figures S1A, B ). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"fluorescent",
"microscopy",
"confirmed",
"increased",
"HSV.n212-GFP",
"transgene",
"expression",
"in",
"murine",
"CT26.wt",
",",
"CT2A",
"glioma",
",",
"S180",
"sarcoma",
"and",
"human",
"786",
"-",
"0",
"cells",
"as",
"shown",
"in",
"(",
"Supplementary",
"Figures",
"S1A",
",",
"B",
")",
"."
]
}
] |
PMC11718031 | Osmolality level is a good indicator of nutrient consumption and for basal media Ex-Cell CD CHO fusion, Ex-Cell CD-CHO, and Ex-Cell CHO 5 that were tested, the osmolality was relatively high throughout the cultivation (around 300–340 mOsmol/kg). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Osmolality",
"level",
"is",
"a",
"good",
"indicator",
"of",
"nutrient",
"consumption",
"and",
"for",
"basal",
"media",
"Ex-Cell",
"CD",
"CHO",
"fusion",
",",
"Ex-Cell",
"CD-CHO",
",",
"and",
"Ex-Cell",
"CHO",
"5",
"that",
"were",
"tested",
",",
"the",
"osmolality",
"was",
"relatively",
"high",
"throughout",
"the",
"cultivation",
"(",
"around",
"300–340",
"mOsmol/kg",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | M. Elbogdady, S. Shamaa, M. Nasr, M. Elzaafarany, T. Elkhodary, M. Abd Elhamid, E. Azmy, M. Awad, H. Ghazy, M. Elbayomy, M. Taalab, S. Saber, Z. Emarah, M. Denwar, A. Elsergany Hematology; Medical Oncology, Oncology center Mansoura university - Mansoura university - Egypt, Mansoura, Egypt Background: Stem cell transplanrt is an integral part of the treatment of hematologic disorders and especially malignant ones. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"M.",
"Elbogdady",
",",
"S.",
"Shamaa",
",",
"M.",
"Nasr",
",",
"M.",
"Elzaafarany",
",",
"T.",
"Elkhodary",
",",
"M.",
"Abd",
"Elhamid",
",",
"E.",
"Azmy",
",",
"M.",
"Awad",
",",
"H.",
"Ghazy",
",",
"M.",
"Elbayomy",
",",
"M.",
"Taalab",
",",
"S.",
"Saber",
",",
"Z.",
"Emarah",
",",
"M.",
"Denwar",
",",
"A.",
"Elsergany",
"Hematology",
";",
"Medical",
"Oncology",
",",
"Oncology",
"center",
"Mansoura",
"university",
"-",
"Mansoura",
"university",
"-",
"Egypt",
",",
"Mansoura",
",",
"Egypt",
"Background",
":",
"Stem",
"cell",
"transplanrt",
"is",
"an",
"integral",
"part",
"of",
"the",
"treatment",
"of",
"hematologic",
"disorders",
"and",
"especially",
"malignant",
"ones",
"."
]
}
] |
PMC11638288 | Furthermore, Ankita et al. investigated the binding sites of NKp46 with vimentin, and the 2.2-Å crystal structure of NKp46 revealed two potential ligand-binding sites. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"Ankita",
"et",
"al.",
"investigated",
"the",
"binding",
"sites",
"of",
"NKp46",
"with",
"vimentin",
",",
"and",
"the",
"2.2-Å",
"crystal",
"structure",
"of",
"NKp46",
"revealed",
"two",
"potential",
"ligand-binding",
"sites",
"."
]
}
] |
PMC11653552 | Intriguingly, YAP expression does not influence MM development, aligning with studies that emphasize the independent roles of YAP and TAZ, as for example in lung cancer where TAZ was found to regulate principally genes involved in the remodeling of the extracellular matrix and therefore preside over processes of cell invasion and migration (Fig. 1B) . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Intriguingly",
",",
"YAP",
"expression",
"does",
"not",
"influence",
"MM",
"development",
",",
"aligning",
"with",
"studies",
"that",
"emphasize",
"the",
"independent",
"roles",
"of",
"YAP",
"and",
"TAZ",
",",
"as",
"for",
"example",
"in",
"lung",
"cancer",
"where",
"TAZ",
"was",
"found",
"to",
"regulate",
"principally",
"genes",
"involved",
"in",
"the",
"remodeling",
"of",
"the",
"extracellular",
"matrix",
"and",
"therefore",
"preside",
"over",
"processes",
"of",
"cell",
"invasion",
"and",
"migration",
"(",
"Fig.",
"1B",
")",
"."
]
}
] |
PMC9436459 | In view of small specific optical rotation values of 70 and 71, they might be racemic mixtures with different ratio of (8"R) and (8"S)-enantiomers. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"view",
"of",
"small",
"specific",
"optical",
"rotation",
"values",
"of",
"70",
"and",
"71",
",",
"they",
"might",
"be",
"racemic",
"mixtures",
"with",
"different",
"ratio",
"of",
"(",
"8\"R",
")",
"and",
"(8\"S)-enantiomers",
"."
]
}
] |
PMC11473750 | The 11q13.4-ter region is emphasised by a thin black bar underline. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"11q13.4-ter",
"region",
"is",
"emphasised",
"by",
"a",
"thin",
"black",
"bar",
"underline",
"."
]
}
] |
PMC11471157 | In the absence of DFP, the large spheroids observed with DFP were not present on Day 7. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"the",
"absence",
"of",
"DFP",
",",
"the",
"large",
"spheroids",
"observed",
"with",
"DFP",
"were",
"not",
"present",
"on",
"Day",
"7",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The median OS was not reached, while 6-month and 12-month OS rates were 97.6% (95% CI: 90.6-99.4) and 91.4% (95% CI: 82.7-95.8), respectively. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"median",
"OS",
"was",
"not",
"reached",
",",
"while",
"6-month",
"and",
"12-month",
"OS",
"rates",
"were",
"97.6",
"%",
"(",
"95",
"%",
"CI",
":",
"90.6",
"-",
"99.4",
")",
"and",
"91.4",
"%",
"(",
"95",
"%",
"CI",
":",
"82.7",
"-",
"95.8",
")",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | B. Mautner, B. Brewer, J. Mort, E. Pierce, F. Ghamsari, S. Dibenedetto, E. Morse, L. Wells, A. Morris, C. Allen, I. Patel, D. D’Souza, C. Jackson, M. Perciavalle, B. Yelvington, R. Miller, K. Abernathy, K. Walsh, H. Wolfe, S. Locke, D. Reed, V. Duong, B. Dholaria, T. LeBlanc, R. Shallis, M. Keng, B. Horton, F. El Chaer Hematology and Oncology; Public Health Sciences, Division of Translational Research and Applied Statistics, University of Virginia, Charlottesville; Hematology and Oncology, Yale University, New Haven; Hematology and Oncology, University of Maryland Medical Center, Baltimore; Hematology and Oncology, Wake Forest Baptist Medical Comprehensive Cancer Center, Winston-Salem; Hematology and Oncology, Vanderbilt University Medical Center, Nashville; Hematology and Oncology, Duke Cancer Institute, Durham, United States of America Background: The prognosis of younger adult patients with acute lymphoblastic leukemia (ALL) has improved with the adoption of pediatric-inspired chemotherapy regimens. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"B.",
"Mautner",
",",
"B.",
"Brewer",
",",
"J.",
"Mort",
",",
"E.",
"Pierce",
",",
"F.",
"Ghamsari",
",",
"S.",
"Dibenedetto",
",",
"E.",
"Morse",
",",
"L.",
"Wells",
",",
"A.",
"Morris",
",",
"C.",
"Allen",
",",
"I.",
"Patel",
",",
"D.",
"D’Souza",
",",
"C.",
"Jackson",
",",
"M.",
"Perciavalle",
",",
"B.",
"Yelvington",
",",
"R.",
"Miller",
",",
"K.",
"Abernathy",
",",
"K.",
"Walsh",
",",
"H.",
"Wolfe",
",",
"S.",
"Locke",
",",
"D.",
"Reed",
",",
"V.",
"Duong",
",",
"B.",
"Dholaria",
",",
"T.",
"LeBlanc",
",",
"R.",
"Shallis",
",",
"M.",
"Keng",
",",
"B.",
"Horton",
",",
"F.",
"El",
"Chaer",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
";",
"Public",
"Health",
"Sciences",
",",
"Division",
"of",
"Translational",
"Research",
"and",
"Applied",
"Statistics",
",",
"University",
"of",
"Virginia",
",",
"Charlottesville",
";",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
",",
"Yale",
"University",
",",
"New",
"Haven",
";",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
",",
"University",
"of",
"Maryland",
"Medical",
"Center",
",",
"Baltimore",
";",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
",",
"Wake",
"Forest",
"Baptist",
"Medical",
"Comprehensive",
"Cancer",
"Center",
",",
"Winston-Salem",
";",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
",",
"Vanderbilt",
"University",
"Medical",
"Center",
",",
"Nashville",
";",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
",",
"Duke",
"Cancer",
"Institute",
",",
"Durham",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
"Background",
":",
"The",
"prognosis",
"of",
"younger",
"adult",
"patients",
"with",
"acute",
"lymphoblastic",
"leukemia",
"(",
"ALL",
")",
"has",
"improved",
"with",
"the",
"adoption",
"of",
"pediatric-inspired",
"chemotherapy",
"regimens",
"."
]
}
] |
PMC11795610 | Myricetin, GSK1016790A and HC-067047 did not increase apoptosis in keratinocyte cells compared with the High Ca group (Figure S5). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Myricetin",
",",
"GSK1016790A",
"and",
"HC-067047",
"did",
"not",
"increase",
"apoptosis",
"in",
"keratinocyte",
"cells",
"compared",
"with",
"the",
"High",
"Ca",
"group",
"(",
"Figure",
"S5",
")",
"."
]
}
] |
PMC9844987 | However, genes are associated with highly different effect sizes, with ubiquitously expressed or essential genes frequently being less affected (Battle et al., 2017). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"genes",
"are",
"associated",
"with",
"highly",
"different",
"effect",
"sizes",
",",
"with",
"ubiquitously",
"expressed",
"or",
"essential",
"genes",
"frequently",
"being",
"less",
"affected",
"(",
"Battle",
"et",
"al.",
",",
"2017",
")",
"."
]
}
] |
PMC11731614 | For each fraction, the chromatographic run was for 2 h in total with the following profile: 0–8% for 6, 8% for 64, 24% for 20, 36% for 10, 55% for 10, 95% for 10 and again 95% for 6 We used Orbitrap HCD-MS2 method for these experiments. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"each",
"fraction",
",",
"the",
"chromatographic",
"run",
"was",
"for",
"2",
"h",
"in",
"total",
"with",
"the",
"following",
"profile",
":",
"0–8",
"%",
"for",
"6",
",",
"8",
"%",
"for",
"64",
",",
"24",
"%",
"for",
"20",
",",
"36",
"%",
"for",
"10",
",",
"55",
"%",
"for",
"10",
",",
"95",
"%",
"for",
"10",
"and",
"again",
"95",
"%",
"for",
"6",
"We",
"used",
"Orbitrap",
"HCD-MS2",
"method",
"for",
"these",
"experiments",
"."
]
}
] |
PMC10854447 | In general, cyclisation of amidoximes 6a–o to 1,2,4-oxadiazole derivatives 7a–o increased the activity of the newly synthesised compounds. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"general",
",",
"cyclisation",
"of",
"amidoximes",
"6a",
"–",
"o",
"to",
"1,2,4-oxadiazole",
"derivatives",
"7a",
"–",
"o",
"increased",
"the",
"activity",
"of",
"the",
"newly",
"synthesised",
"compounds",
"."
]
}
] |
PMC5941560 | PTEN mutations in Jurkat were first described by Sakai et al. in 1998. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"PTEN",
"mutations",
"in",
"Jurkat",
"were",
"first",
"described",
"by",
"Sakai",
"et",
"al.",
"in",
"1998",
"."
]
}
] |
PMC11711127 | Recent studies show that HLA-DR-bound citrullinated peptides are not necessarily arthritis-initiating neo-Ags; rather, they appear to induce varying degrees of immune tolerance, which may prevent the development of RA in the majority of individuals (188). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Recent",
"studies",
"show",
"that",
"HLA-DR-bound",
"citrullinated",
"peptides",
"are",
"not",
"necessarily",
"arthritis-initiating",
"neo-Ags",
";",
"rather",
",",
"they",
"appear",
"to",
"induce",
"varying",
"degrees",
"of",
"immune",
"tolerance",
",",
"which",
"may",
"prevent",
"the",
"development",
"of",
"RA",
"in",
"the",
"majority",
"of",
"individuals",
"(",
"188",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The expression of GR and CPT-1 were also decreased at both the mRNA and protein levels in those with poor response to glucocorticoids. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"expression",
"of",
"GR",
"and",
"CPT-1",
"were",
"also",
"decreased",
"at",
"both",
"the",
"mRNA",
"and",
"protein",
"levels",
"in",
"those",
"with",
"poor",
"response",
"to",
"glucocorticoids",
"."
]
}
] |
PMC11055510 | Since miRNA can bind to the 3′ UTR of mRNA and inhibit the transcriptional activity and translation level of mRNA (Wang & Liu, 2021; Zhang et al., 2019), when miR-135a-3p was adsorbed by circMAN1A2, we detected its downstream effect on the transcription and translation of target mRNA that affects the OC process. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Since",
"miRNA",
"can",
"bind",
"to",
"the",
"3′",
"UTR",
"of",
"mRNA",
"and",
"inhibit",
"the",
"transcriptional",
"activity",
"and",
"translation",
"level",
"of",
"mRNA",
"(",
"Wang",
"&",
"Liu",
",",
"2021",
";",
"Zhang",
"et",
"al.",
",",
"2019",
")",
",",
"when",
"miR-135a-3p",
"was",
"adsorbed",
"by",
"circMAN1A2",
",",
"we",
"detected",
"its",
"downstream",
"effect",
"on",
"the",
"transcription",
"and",
"translation",
"of",
"target",
"mRNA",
"that",
"affects",
"the",
"OC",
"process",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Results: The study is currently open and enrolling pts and will include ≈70 study sites in ≈16 countries. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"The",
"study",
"is",
"currently",
"open",
"and",
"enrolling",
"pts",
"and",
"will",
"include",
"≈70",
"study",
"sites",
"in",
"≈16",
"countries",
"."
]
}
] |
PMC11750696 | Moreover, the heightened expression of GADD34, a consequence of the PERK/eIF2α/ATF4 signaling route, is linked to the excessive production of pro-inflammatory cytokines in the context of RA (73). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"the",
"heightened",
"expression",
"of",
"GADD34",
",",
"a",
"consequence",
"of",
"the",
"PERK/eIF2α/ATF4",
"signaling",
"route",
",",
"is",
"linked",
"to",
"the",
"excessive",
"production",
"of",
"pro-inflammatory",
"cytokines",
"in",
"the",
"context",
"of",
"RA",
"(",
"73",
")",
"."
]
}
] |
PMC11188874 | H, Shown are gene accession numbers for the top 20 peptides most upregulated by either tubastatin-A or ACY-738. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"H",
",",
"Shown",
"are",
"gene",
"accession",
"numbers",
"for",
"the",
"top",
"20",
"peptides",
"most",
"upregulated",
"by",
"either",
"tubastatin-A",
"or",
"ACY-738",
"."
]
}
] |
PMC8956657 | ORF4b nuclear localization has been attributed to two short clusters of basic residues (nuclear localization signal sites NLS1 and NLS2) in the ORF4b N-terminal domain, while the C-terminus harbors a PDE domain (Fig. 1A). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ORF4b",
"nuclear",
"localization",
"has",
"been",
"attributed",
"to",
"two",
"short",
"clusters",
"of",
"basic",
"residues",
"(",
"nuclear",
"localization",
"signal",
"sites",
"NLS1",
"and",
"NLS2",
")",
"in",
"the",
"ORF4b",
"N-terminal",
"domain",
",",
"while",
"the",
"C-terminus",
"harbors",
"a",
"PDE",
"domain",
"(",
"Fig.",
"1A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11706491 | A Laplacian of Gaussian (LoG) particle detector was used on red channel and particle diameter was set at 2.2 μm or 3.0 μm depending on nuclei size. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"Laplacian",
"of",
"Gaussian",
"(",
"LoG",
")",
"particle",
"detector",
"was",
"used",
"on",
"red",
"channel",
"and",
"particle",
"diameter",
"was",
"set",
"at",
"2.2",
"μm",
"or",
"3.0",
"μm",
"depending",
"on",
"nuclei",
"size",
"."
]
}
] |
PMC9143157 | Doxil has been approved for ovarian cancer as a promising therapeutic with a high therapeutic potential; however, clinical results could not indicate a sufficient anticancer activity to replace the existing cytotoxic agents such as TC , which is considered to be mostly due to the low release rate of its active pharmaceutical ingredients (API) . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Doxil",
"has",
"been",
"approved",
"for",
"ovarian",
"cancer",
"as",
"a",
"promising",
"therapeutic",
"with",
"a",
"high",
"therapeutic",
"potential",
";",
"however",
",",
"clinical",
"results",
"could",
"not",
"indicate",
"a",
"sufficient",
"anticancer",
"activity",
"to",
"replace",
"the",
"existing",
"cytotoxic",
"agents",
"such",
"as",
"TC",
",",
"which",
"is",
"considered",
"to",
"be",
"mostly",
"due",
"to",
"the",
"low",
"release",
"rate",
"of",
"its",
"active",
"pharmaceutical",
"ingredients",
"(",
"API",
")",
"."
]
}
] |
PMC9786247 | Differences between genotypes were only marginal, although strains of MLVA genotype II replicated significantly better than genotype I strains. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Differences",
"between",
"genotypes",
"were",
"only",
"marginal",
",",
"although",
"strains",
"of",
"MLVA",
"genotype",
"II",
"replicated",
"significantly",
"better",
"than",
"genotype",
"I",
"strains",
"."
]
}
] |
PMC7081114 | Self-renewal capacity of BEL-7404 cells detected using colony-forming assays after transfection with short hairpin RNA shCtrl or shKIF21B. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Self-renewal",
"capacity",
"of",
"BEL-7404",
"cells",
"detected",
"using",
"colony-forming",
"assays",
"after",
"transfection",
"with",
"short",
"hairpin",
"RNA",
"shCtrl",
"or",
"shKIF21B",
"."
]
}
] |
PMC11190062 | p-value) >2 were annotated. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"p-value",
")",
">",
"2",
"were",
"annotated",
"."
]
}
] |
PMC11240571 | Following radiotherapy, tumor cells upregulated PD-L1, and human-derived exosomal PD-L1 were detected in the bloodstream. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Following",
"radiotherapy",
",",
"tumor",
"cells",
"upregulated",
"PD-L1",
",",
"and",
"human-derived",
"exosomal",
"PD-L1",
"were",
"detected",
"in",
"the",
"bloodstream",
".",
"("
]
}
] |
PMC11705862 | All images and quantifications were captured/ performed blindly. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"images",
"and",
"quantifications",
"were",
"captured/",
"performed",
"blindly",
"."
]
}
] |
PMC6379402 | The idea is to choose the value of k such that the obtained clusters are the most stable (for which and are maximum). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"idea",
"is",
"to",
"choose",
"the",
"value",
"of",
"k",
"such",
"that",
"the",
"obtained",
"clusters",
"are",
"the",
"most",
"stable",
"(",
"for",
"which",
"and",
"are",
"maximum",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | O. Markovic, A. Divac, Z. Cvetkovic, D. Stanisavljevic, K. Markovic, I. Bukurecki, T. Bibic, N. Stanisavljevic, J. Bila, M. Zdravkovic University of Belgrade, Medical Faculty; Department of Hematology, CHC Bezanijska kosa; Department of Hematology, CHC Zemun; Institut of Statistics, University of Belgrade, Medical Faculty; Department of Hematology, CHC Zvezdara; Clinic of Hematology, Clinical Center of Serbia; Department of Cardiology, CHC Bezanijska kosa, Belgrade, Serbia Background: Patients with lymphopproliferative diseases (LPD) and covid-19 have poor outcome as consequence of inadequate humoral and cellular immunity due to the hematological disease itself but also due to the administered chemotherapy which further increases the risk of complications and mortality. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"O.",
"Markovic",
",",
"A.",
"Divac",
",",
"Z.",
"Cvetkovic",
",",
"D.",
"Stanisavljevic",
",",
"K.",
"Markovic",
",",
"I.",
"Bukurecki",
",",
"T.",
"Bibic",
",",
"N.",
"Stanisavljevic",
",",
"J.",
"Bila",
",",
"M.",
"Zdravkovic",
"University",
"of",
"Belgrade",
",",
"Medical",
"Faculty",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"CHC",
"Bezanijska",
"kosa",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"CHC",
"Zemun",
";",
"Institut",
"of",
"Statistics",
",",
"University",
"of",
"Belgrade",
",",
"Medical",
"Faculty",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"CHC",
"Zvezdara",
";",
"Clinic",
"of",
"Hematology",
",",
"Clinical",
"Center",
"of",
"Serbia",
";",
"Department",
"of",
"Cardiology",
",",
"CHC",
"Bezanijska",
"kosa",
",",
"Belgrade",
",",
"Serbia",
"Background",
":",
"Patients",
"with",
"lymphopproliferative",
"diseases",
"(",
"LPD",
")",
"and",
"covid-19",
"have",
"poor",
"outcome",
"as",
"consequence",
"of",
"inadequate",
"humoral",
"and",
"cellular",
"immunity",
"due",
"to",
"the",
"hematological",
"disease",
"itself",
"but",
"also",
"due",
"to",
"the",
"administered",
"chemotherapy",
"which",
"further",
"increases",
"the",
"risk",
"of",
"complications",
"and",
"mortality",
"."
]
}
] |
PMC11593031 | A banding cytogenetic study by Sawyer and Tuchman in 1989 revealed that 35 years ago, the cell line was only near triploid . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"banding",
"cytogenetic",
"study",
"by",
"Sawyer",
"and",
"Tuchman",
"in",
"1989",
"revealed",
"that",
"35",
"years",
"ago",
",",
"the",
"cell",
"line",
"was",
"only",
"near",
"triploid",
"."
]
}
] |
PMC7504302 | Pathological angiogenesis is a key mechanism in cancer cell proliferation, invasion, and metastasis, and is thus a hallmark of cancer . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Pathological",
"angiogenesis",
"is",
"a",
"key",
"mechanism",
"in",
"cancer",
"cell",
"proliferation",
",",
"invasion",
",",
"and",
"metastasis",
",",
"and",
"is",
"thus",
"a",
"hallmark",
"of",
"cancer",
"."
]
}
] |
PMC11637276 | Extracted CDMs were subsequently washed twice with PBS and residual DNA was digested with 10 μg/ml DNase I in PBS at 5% CO2, 37°C for 1 h; for 384-well plates, DNase incubation was overnight. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Extracted",
"CDMs",
"were",
"subsequently",
"washed",
"twice",
"with",
"PBS",
"and",
"residual",
"DNA",
"was",
"digested",
"with",
"10",
"μg/ml",
"DNase",
"I",
"in",
"PBS",
"at",
"5",
"%",
"CO2",
",",
"37",
"°",
"C",
"for",
"1",
"h",
";",
"for",
"384-well",
"plates",
",",
"DNase",
"incubation",
"was",
"overnight",
"."
]
}
] |
PMC11708541 | 4-AP is a selective voltage blocker channel used for multiple sclerosis patients. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"4-AP",
"is",
"a",
"selective",
"voltage",
"blocker",
"channel",
"used",
"for",
"multiple",
"sclerosis",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC2193049 | The length of the COOH-terminal extension did not influence the recognition of the transfected cells, as cells expressing MAGE-3271–279 with a COOH-terminal extension of 15 amino acids did not lead to a recognition of the cells, either (data not shown). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"length",
"of",
"the",
"COOH-terminal",
"extension",
"did",
"not",
"influence",
"the",
"recognition",
"of",
"the",
"transfected",
"cells",
",",
"as",
"cells",
"expressing",
"MAGE-3271–279",
"with",
"a",
"COOH-terminal",
"extension",
"of",
"15",
"amino",
"acids",
"did",
"not",
"lead",
"to",
"a",
"recognition",
"of",
"the",
"cells",
",",
"either",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
]
}
] |
PMC11765988 | Sarcoidosis-Lymphoma Syndrome (SLS) refers to the increased risk of developing lymphoma in people with sarcoidosis, a connection first recognized in 1986 by Brincker. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Sarcoidosis-Lymphoma",
"Syndrome",
"(",
"SLS",
")",
"refers",
"to",
"the",
"increased",
"risk",
"of",
"developing",
"lymphoma",
"in",
"people",
"with",
"sarcoidosis",
",",
"a",
"connection",
"first",
"recognized",
"in",
"1986",
"by",
"Brincker",
"."
]
}
] |
PMC9428827 | In the models for primary tumor growth studied (CT26, MB16, TC1, and 4T1), mutein was able to delay tumor growth ( Figure 2A ). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"the",
"models",
"for",
"primary",
"tumor",
"growth",
"studied",
"(",
"CT26",
",",
"MB16",
",",
"TC1",
",",
"and",
"4T1",
")",
",",
"mutein",
"was",
"able",
"to",
"delay",
"tumor",
"growth",
"(",
"Figure",
"2A",
")",
"."
]
}
] |
PMC10523483 | Endogenous Co-IP results in A549 cells under basal condition or after 24-h 200 μM tBHP treatment. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Endogenous",
"Co-IP",
"results",
"in",
"A549",
"cells",
"under",
"basal",
"condition",
"or",
"after",
"24-h",
"200",
"μM",
"tBHP",
"treatment",
".",
"("
]
}
] |
PMC11711345 | In silico evaluation of cytotoxicity in human cancer cell lines The cytotoxicity of the compounds on human cancerous and non-malignant cell lines and possible mechanisms of action were evaluated in silico through the CLC-Pred 2.0 (Cell Line Cytotoxicity Predictor, way2drug.com/cell-line) webserver . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"silico",
"evaluation",
"of",
"cytotoxicity",
"in",
"human",
"cancer",
"cell",
"lines",
"The",
"cytotoxicity",
"of",
"the",
"compounds",
"on",
"human",
"cancerous",
"and",
"non-malignant",
"cell",
"lines",
"and",
"possible",
"mechanisms",
"of",
"action",
"were",
"evaluated",
"in",
"silico",
"through",
"the",
"CLC-Pred",
"2.0",
"(",
"Cell",
"Line",
"Cytotoxicity",
"Predictor",
",",
"way2drug.com/cell-line",
")",
"webserver",
"."
]
}
] |
PMC11506670 | All novel mutant setups, as well as cells expressing the canonical Q61K mutant, displayed a shrunken cytoplasm with a punctate actin staining characteristic of cytoskeletal disassembly. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"novel",
"mutant",
"setups",
",",
"as",
"well",
"as",
"cells",
"expressing",
"the",
"canonical",
"Q61",
"K",
"mutant",
",",
"displayed",
"a",
"shrunken",
"cytoplasm",
"with",
"a",
"punctate",
"actin",
"staining",
"characteristic",
"of",
"cytoskeletal",
"disassembly",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Corresponding values for bilirubin were -28.5 (18.9) versus -25.6 (11.9) µmol/L, and for LDH were -183.8 (267.8) versus -58.9 (178.2) U/L. Mean (SD) change in FACIT-Fatigue score was similar in both subgroups (9.9 [13.0] and 9.8 [11.4], respectively). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Corresponding",
"values",
"for",
"bilirubin",
"were",
"-28.5",
"(",
"18.9",
")",
"versus",
"-25.6",
"(",
"11.9",
")",
"µmol/L",
",",
"and",
"for",
"LDH",
"were",
"-183.8",
"(",
"267.8",
")",
"versus",
"-58.9",
"(",
"178.2",
")",
"U/L.",
"Mean",
"(",
"SD",
")",
"change",
"in",
"FACIT-Fatigue",
"score",
"was",
"similar",
"in",
"both",
"subgroups",
"(",
"9.9",
"[",
"13.0",
"]",
"and",
"9.8",
"[",
"11.4",
"]",
",",
"respectively",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Patients with a CCI score of 0 points at diagnosis showed a median OS of 8.7 years compared to 3.8 years and 2.6 years for patients with a score of 1 point and ≥2 points, respectively (p <0.001). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Patients",
"with",
"a",
"CCI",
"score",
"of",
"0",
"points",
"at",
"diagnosis",
"showed",
"a",
"median",
"OS",
"of",
"8.7",
"years",
"compared",
"to",
"3.8",
"years",
"and",
"2.6",
"years",
"for",
"patients",
"with",
"a",
"score",
"of",
"1",
"point",
"and",
"≥2",
"points",
",",
"respectively",
"(",
"p",
"<",
"0.001",
")",
"."
]
}
] |
PMC9817179 | PA-JF646 was activated and excited under variable powers by 405 nm and 640 nm laser lines, respectively, while JFX549 was excited by a 561 nm laser line. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"PA-JF646",
"was",
"activated",
"and",
"excited",
"under",
"variable",
"powers",
"by",
"405",
"nm",
"and",
"640",
"nm",
"laser",
"lines",
",",
"respectively",
",",
"while",
"JFX549",
"was",
"excited",
"by",
"a",
"561",
"nm",
"laser",
"line",
"."
]
}
] |
PMC10507284 | The migration capability of SW982 cells in NC and TROAP‐siRNA groups was determined by wound healing assay. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"migration",
"capability",
"of",
"SW982",
"cells",
"in",
"NC",
"and",
"TROAP‐siRNA",
"groups",
"was",
"determined",
"by",
"wound",
"healing",
"assay",
"."
]
}
] |
PMC7823217 | Recent studies showed that the presence of CTCs, capable of disseminating cancer cells to distant locations are the major contributors to the development of metastatic cancer . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Recent",
"studies",
"showed",
"that",
"the",
"presence",
"of",
"CTCs",
",",
"capable",
"of",
"disseminating",
"cancer",
"cells",
"to",
"distant",
"locations",
"are",
"the",
"major",
"contributors",
"to",
"the",
"development",
"of",
"metastatic",
"cancer",
"."
]
}
] |
PMC11569208 | Indeed, our VSV∆51-shACP2 demonstrates improved viral infectivity and oncolysis through its predicted mechanism of action of IFN-1 repression (Fig. 4). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Indeed",
",",
"our",
"VSV∆51-shACP2",
"demonstrates",
"improved",
"viral",
"infectivity",
"and",
"oncolysis",
"through",
"its",
"predicted",
"mechanism",
"of",
"action",
"of",
"IFN-1",
"repression",
"(",
"Fig.",
"4",
")",
"."
]
}
] |
PMC10577955 | Q1: shows necrotic cells, Q2: shows later period apoptotic cells, Q3: shows normal cells, Q4: shows early apoptotic cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Q1",
":",
"shows",
"necrotic",
"cells",
",",
"Q2",
":",
"shows",
"later",
"period",
"apoptotic",
"cells",
",",
"Q3",
":",
"shows",
"normal",
"cells",
",",
"Q4",
":",
"shows",
"early",
"apoptotic",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11590005 | B-MRS scores for the domain ‘affirmation of differences’ (representation of those who believe that whites and non-whites are truly different) were higher among male dental students (PR=1.138; CI 95%: 1.019–1.271) and those from low-income families (PR=1.306; CI 95%: 1.089–1.565). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"B-MRS",
"scores",
"for",
"the",
"domain",
"‘",
"affirmation",
"of",
"differences",
"’",
"(",
"representation",
"of",
"those",
"who",
"believe",
"that",
"whites",
"and",
"non-whites",
"are",
"truly",
"different",
")",
"were",
"higher",
"among",
"male",
"dental",
"students",
"(",
"PR=1.138",
";",
"CI",
"95",
"%",
":",
"1.019–1.271",
")",
"and",
"those",
"from",
"low-income",
"families",
"(",
"PR=1.306",
";",
"CI",
"95",
"%",
":",
"1.089–1.565",
")",
"."
]
}
] |
PMC11775197 | NcRNAs modulate cancer by regulating gene expression and complex biological processes . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"NcRNAs",
"modulate",
"cancer",
"by",
"regulating",
"gene",
"expression",
"and",
"complex",
"biological",
"processes",
"."
]
}
] |
PMC11055323 | c Representative image of immunofluorescence for H3K27ac and H2AK119ub in the BJ fibroblasts with lentiviral expression of SS18-SSX1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"c",
"Representative",
"image",
"of",
"immunofluorescence",
"for",
"H3K27ac",
"and",
"H2AK119ub",
"in",
"the",
"BJ",
"fibroblasts",
"with",
"lentiviral",
"expression",
"of",
"SS18-SSX1",
"."
]
}
] |
PMC11699178 | GEM, a chemotherapy agent, has demonstrated good sensitivity in treating ovarian cancer, making it a commonly used drug in clinical practice . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"GEM",
",",
"a",
"chemotherapy",
"agent",
",",
"has",
"demonstrated",
"good",
"sensitivity",
"in",
"treating",
"ovarian",
"cancer",
",",
"making",
"it",
"a",
"commonly",
"used",
"drug",
"in",
"clinical",
"practice",
"."
]
}
] |
PMC11599565 | Panel C: It is possible to discriminate in regular ovarian tissues two different cell populations: one cell type lonely express KRT80, whereas the other cell type dually express KRT80 and ChgA (A-D). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Panel",
"C",
":",
"It",
"is",
"possible",
"to",
"discriminate",
"in",
"regular",
"ovarian",
"tissues",
"two",
"different",
"cell",
"populations",
":",
"one",
"cell",
"type",
"lonely",
"express",
"KRT80",
",",
"whereas",
"the",
"other",
"cell",
"type",
"dually",
"express",
"KRT80",
"and",
"ChgA",
"(",
"A-D",
")",
"."
]
}
] |
PMC11190062 | Glycolysis was determined using the following formula: (maximum rate measurement before oligomycin injection) − (last rate measurement before glucose injection). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Glycolysis",
"was",
"determined",
"using",
"the",
"following",
"formula",
":",
"(",
"maximum",
"rate",
"measurement",
"before",
"oligomycin",
"injection",
")",
"−",
"(",
"last",
"rate",
"measurement",
"before",
"glucose",
"injection",
")",
"."
]
}
] |
PMC10969097 | For example, many groups have reported that mushrooms minimise side effects such as nausea, bone marrow suppression and anaemia . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"example",
",",
"many",
"groups",
"have",
"reported",
"that",
"mushrooms",
"minimise",
"side",
"effects",
"such",
"as",
"nausea",
",",
"bone",
"marrow",
"suppression",
"and",
"anaemia",
"."
]
}
] |
PMC11670954 | Second, our study focused solely on one signaling pathway, highlighting the need to broaden our experiments to encompass additional mechanisms. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Second",
",",
"our",
"study",
"focused",
"solely",
"on",
"one",
"signaling",
"pathway",
",",
"highlighting",
"the",
"need",
"to",
"broaden",
"our",
"experiments",
"to",
"encompass",
"additional",
"mechanisms",
"."
]
}
] |
PMC6133382 | Samples were then examined under a light microscope (Zeiss Axioskop 2, Zeiss, Jena, Germany) with 495-nm wavelength excitation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Samples",
"were",
"then",
"examined",
"under",
"a",
"light",
"microscope",
"(",
"Zeiss",
"Axioskop",
"2",
",",
"Zeiss",
",",
"Jena",
",",
"Germany",
")",
"with",
"495-nm",
"wavelength",
"excitation",
"."
]
}
] |
PMC3681794 | Further work is needed to identify a targetable pathway on which hypoxia-induced drug resistance in osteosarcoma is dependent. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
"work",
"is",
"needed",
"to",
"identify",
"a",
"targetable",
"pathway",
"on",
"which",
"hypoxia-induced",
"drug",
"resistance",
"in",
"osteosarcoma",
"is",
"dependent",
"."
]
}
] |
PMC11783017 | Previous studies have found that the small molecule drug NHWD-870 inhibits OS growth by regulating MYC levels. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Previous",
"studies",
"have",
"found",
"that",
"the",
"small",
"molecule",
"drug",
"NHWD-870",
"inhibits",
"OS",
"growth",
"by",
"regulating",
"MYC",
"levels",
"."
]
}
] |
PMC11672881 | The A375 human melanoma cell lines, primary human dermal fibroblast adult (HDFa) cell lines, and HaCaT human keratinocytes cell lines were purchased from the ATCC, VA, USA, and AddexBio, San Diego, CA, USA. | [
{
"tags": [
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"A375",
"human",
"melanoma",
"cell",
"lines",
",",
"primary",
"human",
"dermal",
"fibroblast",
"adult",
"(",
"HDFa",
")",
"cell",
"lines",
",",
"and",
"HaCaT",
"human",
"keratinocytes",
"cell",
"lines",
"were",
"purchased",
"from",
"the",
"ATCC",
",",
"VA",
",",
"USA",
",",
"and",
"AddexBio",
",",
"San",
"Diego",
",",
"CA",
",",
"USA",
"."
]
}
] |
PMC11740207 | ABs can also express integrins or other adhesion molecules that aid in phagocytic interactions. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ABs",
"can",
"also",
"express",
"integrins",
"or",
"other",
"adhesion",
"molecules",
"that",
"aid",
"in",
"phagocytic",
"interactions",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Methods: We retrospectively collected data from all adult patients with a MYC-R aBCL diagnosed in our center between 2010-2021. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"We",
"retrospectively",
"collected",
"data",
"from",
"all",
"adult",
"patients",
"with",
"a",
"MYC-R",
"aBCL",
"diagnosed",
"in",
"our",
"center",
"between",
"2010",
"-",
"2021",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.