PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC10114490 | For this purpose, HDF were infected with the lentivirus vector pLV-hTERT-IRES-hygro. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"this",
"purpose",
",",
"HDF",
"were",
"infected",
"with",
"the",
"lentivirus",
"vector",
"pLV-hTERT-IRES-hygro",
"."
]
}
] |
PMC6901583 | The regulation of the NF-κB pathway by BRD4 has been shown in previous work. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"regulation",
"of",
"the",
"NF-κB",
"pathway",
"by",
"BRD4",
"has",
"been",
"shown",
"in",
"previous",
"work",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | 90% of patients were in stage C. Heterosexual transmission was the main mode of contamination (100%). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"90",
"%",
"of",
"patients",
"were",
"in",
"stage",
"C.",
"Heterosexual",
"transmission",
"was",
"the",
"main",
"mode",
"of",
"contamination",
"(",
"100",
"%",
")",
"."
]
}
] |
PMC11655498 | In the context of gene function studies, CRISPRa-mediated transcriptional activation overcomes the limitations of cDNA overexpression. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"the",
"context",
"of",
"gene",
"function",
"studies",
",",
"CRISPRa-mediated",
"transcriptional",
"activation",
"overcomes",
"the",
"limitations",
"of",
"cDNA",
"overexpression",
"."
]
}
] |
PMC10237474 | no. 11003495, Cytiva) pre-equilibrated with TBS (20 mM Tris, 150 mM NaCl, pH 7.5) was used for capture. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"no.",
"11003495",
",",
"Cytiva",
")",
"pre-equilibrated",
"with",
"TBS",
"(",
"20",
"mM",
"Tris",
",",
"150",
"mM",
"NaCl",
",",
"pH",
"7.5",
")",
"was",
"used",
"for",
"capture",
"."
]
}
] |
PMC11411131 | The full-length TrxR1 signal (αHA) decreased in a MeHg-dependent manner. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"full-length",
"TrxR1",
"signal",
"(",
"αHA",
")",
"decreased",
"in",
"a",
"MeHg-dependent",
"manner",
".",
"("
]
}
] |
PMC9370419 | HBx also inhibits the recruitment of other host inhibitory factors, including PRMT5, APOBEC3B, and LINC01431 . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"HBx",
"also",
"inhibits",
"the",
"recruitment",
"of",
"other",
"host",
"inhibitory",
"factors",
",",
"including",
"PRMT5",
",",
"APOBEC3B",
",",
"and",
"LINC01431",
"."
]
}
] |
PMC11322866 | The regulation of senescence in haematopoietic stem cells is associated with their therapeutic efficacy. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"regulation",
"of",
"senescence",
"in",
"haematopoietic",
"stem",
"cells",
"is",
"associated",
"with",
"their",
"therapeutic",
"efficacy",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | A diagnosis of Acute Myeloid Leukemia (AML), high-risk Myelodysplastic Syndrome and Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) was present in 85% (82/96), 1% (1/96) and 14 (14/96) patients, respectively. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"diagnosis",
"of",
"Acute",
"Myeloid",
"Leukemia",
"(",
"AML",
")",
",",
"high-risk",
"Myelodysplastic",
"Syndrome",
"and",
"Acute",
"Lymphoblastic",
"Leukemia",
"(",
"ALL",
")",
"was",
"present",
"in",
"85",
"%",
"(",
"82/96",
")",
",",
"1",
"%",
"(",
"1/96",
")",
"and",
"14",
"(",
"14/96",
")",
"patients",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC2777936 | Substantial repression of FZD5 mRNA was confirmed for all five constructs with most efficient repression detected with constructs FZD5-2, FZD5-4, and FZD5-5 (Figure 5a). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Substantial",
"repression",
"of",
"FZD5",
"mRNA",
"was",
"confirmed",
"for",
"all",
"five",
"constructs",
"with",
"most",
"efficient",
"repression",
"detected",
"with",
"constructs",
"FZD5",
"-",
"2",
",",
"FZD5",
"-",
"4",
",",
"and",
"FZD5",
"-",
"5",
"(",
"Figure",
"5a",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | 56 cases developed aGVHD, with a cumulative incidence of 52.8%. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"56",
"cases",
"developed",
"aGVHD",
",",
"with",
"a",
"cumulative",
"incidence",
"of",
"52.8",
"%",
"."
]
}
] |
PMC11575040 | Jin et al. reported that engineered colorectal cancer (CRC) exosomes loaded with functional miR-1270 (Exo-miR-1270) strongly inhibited the proliferation and migration of CRC cells and promoted their apoptosis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Jin",
"et",
"al.",
"reported",
"that",
"engineered",
"colorectal",
"cancer",
"(",
"CRC",
")",
"exosomes",
"loaded",
"with",
"functional",
"miR-1270",
"(",
"Exo-miR-1270",
")",
"strongly",
"inhibited",
"the",
"proliferation",
"and",
"migration",
"of",
"CRC",
"cells",
"and",
"promoted",
"their",
"apoptosis",
"."
]
}
] |
PMC11257988 | Unlike lung cancers with mutated EGFR and ALK expressions, KRAS has long been considered a challenging therapeutic target, even regarded as “undruggable”. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Unlike",
"lung",
"cancers",
"with",
"mutated",
"EGFR",
"and",
"ALK",
"expressions",
",",
"KRAS",
"has",
"long",
"been",
"considered",
"a",
"challenging",
"therapeutic",
"target",
",",
"even",
"regarded",
"as",
"“",
"undruggable",
"”",
"."
]
}
] |
PMC11761919 | seral LDH. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"seral",
"LDH",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973 | A very rare cause involves variants in bisphosphoglyerate mutase (BPGM), which regulates the red blood cell concentration of 2,3-bisphosphoglycerate (2,3-BPG), an important modifier of Hb-oxygen affinity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"very",
"rare",
"cause",
"involves",
"variants",
"in",
"bisphosphoglyerate",
"mutase",
"(",
"BPGM",
")",
",",
"which",
"regulates",
"the",
"red",
"blood",
"cell",
"concentration",
"of",
"2,3-bisphosphoglycerate",
"(",
"2,3-BPG",
")",
",",
"an",
"important",
"modifier",
"of",
"Hb-oxygen",
"affinity",
"."
]
}
] |
PMC7709199 | Assembled from a common pentasaccharide core, mammalian N-glycosylation is complex and the ensuing glycan trees display a wide variety of branches of varying sugar composition. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Assembled",
"from",
"a",
"common",
"pentasaccharide",
"core",
",",
"mammalian",
"N-glycosylation",
"is",
"complex",
"and",
"the",
"ensuing",
"glycan",
"trees",
"display",
"a",
"wide",
"variety",
"of",
"branches",
"of",
"varying",
"sugar",
"composition",
"."
]
}
] |
PMC11730000 | Reactive oxygen species (ROS) levels were determined microscopically using the dihydroethidium staining method. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Reactive",
"oxygen",
"species",
"(",
"ROS",
")",
"levels",
"were",
"determined",
"microscopically",
"using",
"the",
"dihydroethidium",
"staining",
"method",
"."
]
}
] |
PMC5925824 | An alignment position is marked with (*) if both mu-PD-L1 and ca-PD-L1 substitutions differ from the hu-PD-L1 sequence. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"An",
"alignment",
"position",
"is",
"marked",
"with",
"(",
"*",
")",
"if",
"both",
"mu-PD-L1",
"and",
"ca-PD-L1",
"substitutions",
"differ",
"from",
"the",
"hu-PD-L1",
"sequence",
"."
]
}
] |
PMC8009078 | One of the hydroxyl groups of phenyl ring linkage with chromone ring was formed one HB with Lys449 a distance of 2.03 Å. The Prime-MMGBSA binding energy of A4 was analyzed with their corresponding dock conformation at receptor binding sites. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"One",
"of",
"the",
"hydroxyl",
"groups",
"of",
"phenyl",
"ring",
"linkage",
"with",
"chromone",
"ring",
"was",
"formed",
"one",
"HB",
"with",
"Lys449",
"a",
"distance",
"of",
"2.03",
"Å.",
"The",
"Prime-MMGBSA",
"binding",
"energy",
"of",
"A4",
"was",
"analyzed",
"with",
"their",
"corresponding",
"dock",
"conformation",
"at",
"receptor",
"binding",
"sites",
"."
]
}
] |
PMC7348793 | The enzymes were inactivated by incubating the reaction mix for 15 min at 80 °C, and the resulting product was used without further purification as a template in sequencing reactions containing 1 mL of the template, 0.5 mL of BigDye v3.1 mastermix (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA), 1.75 mL of 5x BigDye dilution buffer (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA), 2 mL of 2 pMol/mL of the corresponding sequencing primer (Supplementary Table S1) and 4.75 μL of water. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"enzymes",
"were",
"inactivated",
"by",
"incubating",
"the",
"reaction",
"mix",
"for",
"15",
"min",
"at",
"80",
"°",
"C",
",",
"and",
"the",
"resulting",
"product",
"was",
"used",
"without",
"further",
"purification",
"as",
"a",
"template",
"in",
"sequencing",
"reactions",
"containing",
"1",
"mL",
"of",
"the",
"template",
",",
"0.5",
"mL",
"of",
"BigDye",
"v3.1",
"mastermix",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
",",
"Waltham",
",",
"MA",
",",
"USA",
")",
",",
"1.75",
"mL",
"of",
"5x",
"BigDye",
"dilution",
"buffer",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
",",
"Waltham",
",",
"MA",
",",
"USA",
")",
",",
"2",
"mL",
"of",
"2",
"pMol/mL",
"of",
"the",
"corresponding",
"sequencing",
"primer",
"(",
"Supplementary",
"Table",
"S1",
")",
"and",
"4.75",
"μL",
"of",
"water",
"."
]
}
] |
PMC11635519 | The resulting 244 bp product was purified by electrophoresis in 2% agarose followed by gel extraction. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"resulting",
"244",
"bp",
"product",
"was",
"purified",
"by",
"electrophoresis",
"in",
"2",
"%",
"agarose",
"followed",
"by",
"gel",
"extraction",
"."
]
}
] |
PMC11012313 | Stable retention of the vector DNA or vector + LMP2A DNA in BJAB or Ramos cell lines was maintained by growth in cRPMI + 2 μg/mL gentamycin + 400 μg/mL hygromycin (BJAB) or only 400 μg/mL of hygromycin (Ramos) as described previously . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Stable",
"retention",
"of",
"the",
"vector",
"DNA",
"or",
"vector",
"+",
"LMP2A",
"DNA",
"in",
"BJAB",
"or",
"Ramos",
"cell",
"lines",
"was",
"maintained",
"by",
"growth",
"in",
"cRPMI",
"+",
"2",
"μg/mL",
"gentamycin",
"+",
"400",
"μg/mL",
"hygromycin",
"(",
"BJAB",
")",
"or",
"only",
"400",
"μg/mL",
"of",
"hygromycin",
"(",
"Ramos",
")",
"as",
"described",
"previously",
"."
]
}
] |
PMC11291490 | Briefly, the collected tissues were sectioned at a thickness of 4 μm using a Leica RM2128 microtome (Germany). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Briefly",
",",
"the",
"collected",
"tissues",
"were",
"sectioned",
"at",
"a",
"thickness",
"of",
"4",
"μm",
"using",
"a",
"Leica",
"RM2128",
"microtome",
"(",
"Germany",
")",
"."
]
}
] |
PMC11597167 | BACE1 activity is, therefore, implicated in the pathogenesis of AD, and inhibition of BACE1 is considered a potential therapeutic strategy for the treatment of the disease. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"BACE1",
"activity",
"is",
",",
"therefore",
",",
"implicated",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"AD",
",",
"and",
"inhibition",
"of",
"BACE1",
"is",
"considered",
"a",
"potential",
"therapeutic",
"strategy",
"for",
"the",
"treatment",
"of",
"the",
"disease",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Pts were included if they had received ≥3 prior lines of therapy (LOT) or were refractory to a PI and an IMiD (double-refractory); received a PI, an IMiD, and anti-CD38 monoclonal antibody and had documented progressive disease during/after their last LOT. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Pts",
"were",
"included",
"if",
"they",
"had",
"received",
"≥3",
"prior",
"lines",
"of",
"therapy",
"(",
"LOT",
")",
"or",
"were",
"refractory",
"to",
"a",
"PI",
"and",
"an",
"IMiD",
"(",
"double-refractory",
")",
";",
"received",
"a",
"PI",
",",
"an",
"IMiD",
",",
"and",
"anti-CD38",
"monoclonal",
"antibody",
"and",
"had",
"documented",
"progressive",
"disease",
"during/after",
"their",
"last",
"LOT",
"."
]
}
] |
PMC11621493 | The TALON beads were removed from the lysate by centrifugation at 300 g for 3 min and transferred to a gravity column. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"TALON",
"beads",
"were",
"removed",
"from",
"the",
"lysate",
"by",
"centrifugation",
"at",
"300",
"g",
"for",
"3",
"min",
"and",
"transferred",
"to",
"a",
"gravity",
"column",
"."
]
}
] |
PMC11718809 | GO enrichment analysis showed that the host genes were enriched in a total of 2142 terms: 1615 under biological processes (BP), 257 under cellular components (CC), and 270 under molecular functions (MF) (q-value < 0.05). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"GO",
"enrichment",
"analysis",
"showed",
"that",
"the",
"host",
"genes",
"were",
"enriched",
"in",
"a",
"total",
"of",
"2142",
"terms",
":",
"1615",
"under",
"biological",
"processes",
"(",
"BP",
")",
",",
"257",
"under",
"cellular",
"components",
"(",
"CC",
")",
",",
"and",
"270",
"under",
"molecular",
"functions",
"(",
"MF",
")",
"(",
"q-value",
"<",
"0.05",
")",
"."
]
}
] |
PMC11632064 | Threshold values for fold change > 1.2-fold and false-discovery rate (FDR)-adjusted P-values < 0.1 were used to select differentially expressed transcripts (DETs) between groups treated with RSK inhibitors (BI-D1870, LJH685) versus control (DMSO). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Threshold",
"values",
"for",
"fold",
"change",
">",
"1.2-fold",
"and",
"false-discovery",
"rate",
"(FDR)-adjusted",
"P-values",
"<",
"0.1",
"were",
"used",
"to",
"select",
"differentially",
"expressed",
"transcripts",
"(",
"DETs",
")",
"between",
"groups",
"treated",
"with",
"RSK",
"inhibitors",
"(",
"BI-D1870",
",",
"LJH685",
")",
"versus",
"control",
"(",
"DMSO",
")",
"."
]
}
] |
PMC9436459 | Among these 21 species, M. alba, M. mongolica, and M. macroura were the top three species rich in different MDAAs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Among",
"these",
"21",
"species",
",",
"M.",
"alba",
",",
"M.",
"mongolica",
",",
"and",
"M.",
"macroura",
"were",
"the",
"top",
"three",
"species",
"rich",
"in",
"different",
"MDAAs",
"."
]
}
] |
PMC10999934 | Correlation analysis between FBXO2 and PEG10. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Correlation",
"analysis",
"between",
"FBXO2",
"and",
"PEG10",
"."
]
}
] |
PMC10706275 | Conversely, the K1-EGFP-15 only exhibited 1200-bp bands without a knock-in. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Conversely",
",",
"the",
"K1-EGFP-15",
"only",
"exhibited",
"1200-bp",
"bands",
"without",
"a",
"knock-in",
"."
]
}
] |
PMC11760643 | Collection and utilisation of human blood were done in accordance with approval by the University of Wollongong Human Ethics Committee (HE 12/290). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Collection",
"and",
"utilisation",
"of",
"human",
"blood",
"were",
"done",
"in",
"accordance",
"with",
"approval",
"by",
"the",
"University",
"of",
"Wollongong",
"Human",
"Ethics",
"Committee",
"(",
"HE",
"12/290",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Methods: EP eligibility criteria includes adults with pathologically confirmed PTCL, defined per WHO criteria, after ≥ 2 cycles of 1 prior standard regimen, and a CD4 lymphocyte count of ≥ 50/mm. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"EP",
"eligibility",
"criteria",
"includes",
"adults",
"with",
"pathologically",
"confirmed",
"PTCL",
",",
"defined",
"per",
"WHO",
"criteria",
",",
"after",
"≥",
"2",
"cycles",
"of",
"1",
"prior",
"standard",
"regimen",
",",
"and",
"a",
"CD4",
"lymphocyte",
"count",
"of",
"≥",
"50/mm",
"."
]
}
] |
PMC6267596 | c & d) BIOCARTA pathway analysis shows associated signaling pathway and proteins. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"c",
"&",
"d",
")",
"BIOCARTA",
"pathway",
"analysis",
"shows",
"associated",
"signaling",
"pathway",
"and",
"proteins",
"."
]
}
] |
PMC11604768 | Orange and gray projection lines indicate the positive and negative directions of the treatment projection, respectively. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Orange",
"and",
"gray",
"projection",
"lines",
"indicate",
"the",
"positive",
"and",
"negative",
"directions",
"of",
"the",
"treatment",
"projection",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC10094992 | ALDH1A subfamily is composed by the three different isoforms: ALDH1A1, ALDH1A2 and ALDH1A3. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ALDH1A",
"subfamily",
"is",
"composed",
"by",
"the",
"three",
"different",
"isoforms",
":",
"ALDH1A1",
",",
"ALDH1A2",
"and",
"ALDH1A3",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | M. Lübbert, P. Wijermans, M. Kicinski, S. Chantepie, W. van der Velden, R. Noppeney, L. Griskevicius, A. Neubauer, M. Crysandt, R. Vrhovac, M. Luppi, S. Fuhrmann, E. Audisio, A. Candoni, O. Legrand, R. Foà, G. Gaidano, D. van Lammeren-Venema, E. F. Posthuma, M. Hoogendoorn, A. Giraut, M. Stevens-Kroef, J. H. Jansen, E. Ammatuna, J.-P. Vilque, R. Wäsch, H. Becker, N. Blijlevens, U. Dührsen, F. Baron, S. Suciu, S. Amadori, A. Venditti, G. Huls Department of Hematology, Oncology and Stem Cell Transplantation, Faculty of Medicine, University Medical Center Freiburg, University of Freiburg, Freiburg, Germany; Department of Hematology, Haga Teaching Hospital, The Hague, Netherlands; EORTC Headquarters, Brussels, Belgium; Institut d’Hématologie de Basse Normandie, Centre Hospitalo-Universitaire de Caen, Caen, France; Department of Hematology, Radboud University Medical Centre, Nijmegen, Netherlands; Klinik für Hämatologie, Universitätsklinikum Essen, Essen, Germany; Department of Hematology, Oncology and Transfusion Medicine Center, Vilnius University Hospital Santaros Klinikos, Vilnius University, Vilnius, Lithuania; Department of Internal Medicine, Hematology, Oncology and Immunology, Philipps University Marburg and University Hospital Gießen and Marburg, Campus Marburg, Marburg; Department of Hematology, Oncology, Hemostaseology and Stem Cell Transplantation, Medical Faculty, Center for Integrated Oncology Aachen Bonn Cologne Duesseldorf (CIO ABCD), Aachen, Germany; Department of Haematology, University Hospital Centre Zagreb, Zagreb, Croatia; Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche Materno-Infantili e dell’Adulto, University of Modena and Reggio Emilia, Azienda Ospedaliera Universitaria, Modena, Italy; Department of Hematology and Oncology, HELIOS Hospital Berlin-Buch, Berlin, Germany; SC Ematologia Città della Salute e della Scienza Torino, Torino; Clinica Ematologica Azienda Sanitaria Universitaria Integrata di Udine, Udine, Italy; Service d’Hématologie Clinique et de Thérapie cellulaire, Hôpital Saint Antoine, APHP, Paris, France; Ematologia, Dipartimento di Medicina Traslazionale e di Precisione, “Sapienza” Università di Roma, Rome; Division of Hematology, Department of Translational Medicine, Università del Piemonte Orientale and Azienda Ospedaliero-Universitaria Maggiore della Carità, Novara, Italy; Department of Internal Medicine, Reinier de Graaf Hospital, Delft; Department of Hematology, Medical Center Leeuwarden, Leeuwarden; Radboud University Medical Center, Nijmegen, Netherlands; Dept laboratory Medicine, Lab Hematology, Radboud University Medical Center, Nijmegen; University Medical Center Groningen, Groningen, Netherlands; University of Liège, Liège, Belgium; Department of Biomedicine and Prevention, University of Rome Tor Vergata, Rome, Italy Background: Older, fit AML patients (pts) treated with induction chemotherapy (IC) have poor long-term survival unless HSCT is performed. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"M.",
"Lübbert",
",",
"P.",
"Wijermans",
",",
"M.",
"Kicinski",
",",
"S.",
"Chantepie",
",",
"W.",
"van",
"der",
"Velden",
",",
"R.",
"Noppeney",
",",
"L.",
"Griskevicius",
",",
"A.",
"Neubauer",
",",
"M.",
"Crysandt",
",",
"R.",
"Vrhovac",
",",
"M.",
"Luppi",
",",
"S.",
"Fuhrmann",
",",
"E.",
"Audisio",
",",
"A.",
"Candoni",
",",
"O.",
"Legrand",
",",
"R.",
"Foà",
",",
"G.",
"Gaidano",
",",
"D.",
"van",
"Lammeren-Venema",
",",
"E.",
"F.",
"Posthuma",
",",
"M.",
"Hoogendoorn",
",",
"A.",
"Giraut",
",",
"M.",
"Stevens-Kroef",
",",
"J.",
"H.",
"Jansen",
",",
"E.",
"Ammatuna",
",",
"J.-P.",
"Vilque",
",",
"R.",
"Wäsch",
",",
"H.",
"Becker",
",",
"N.",
"Blijlevens",
",",
"U.",
"Dührsen",
",",
"F.",
"Baron",
",",
"S.",
"Suciu",
",",
"S.",
"Amadori",
",",
"A.",
"Venditti",
",",
"G.",
"Huls",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Oncology",
"and",
"Stem",
"Cell",
"Transplantation",
",",
"Faculty",
"of",
"Medicine",
",",
"University",
"Medical",
"Center",
"Freiburg",
",",
"University",
"of",
"Freiburg",
",",
"Freiburg",
",",
"Germany",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Haga",
"Teaching",
"Hospital",
",",
"The",
"Hague",
",",
"Netherlands",
";",
"EORTC",
"Headquarters",
",",
"Brussels",
",",
"Belgium",
";",
"Institut",
"d’Hématologie",
"de",
"Basse",
"Normandie",
",",
"Centre",
"Hospitalo-Universitaire",
"de",
"Caen",
",",
"Caen",
",",
"France",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Radboud",
"University",
"Medical",
"Centre",
",",
"Nijmegen",
",",
"Netherlands",
";",
"Klinik",
"für",
"Hämatologie",
",",
"Universitätsklinikum",
"Essen",
",",
"Essen",
",",
"Germany",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Oncology",
"and",
"Transfusion",
"Medicine",
"Center",
",",
"Vilnius",
"University",
"Hospital",
"Santaros",
"Klinikos",
",",
"Vilnius",
"University",
",",
"Vilnius",
",",
"Lithuania",
";",
"Department",
"of",
"Internal",
"Medicine",
",",
"Hematology",
",",
"Oncology",
"and",
"Immunology",
",",
"Philipps",
"University",
"Marburg",
"and",
"University",
"Hospital",
"Gießen",
"and",
"Marburg",
",",
"Campus",
"Marburg",
",",
"Marburg",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Oncology",
",",
"Hemostaseology",
"and",
"Stem",
"Cell",
"Transplantation",
",",
"Medical",
"Faculty",
",",
"Center",
"for",
"Integrated",
"Oncology",
"Aachen",
"Bonn",
"Cologne",
"Duesseldorf",
"(",
"CIO",
"ABCD",
")",
",",
"Aachen",
",",
"Germany",
";",
"Department",
"of",
"Haematology",
",",
"University",
"Hospital",
"Centre",
"Zagreb",
",",
"Zagreb",
",",
"Croatia",
";",
"Dipartimento",
"di",
"Scienze",
"Mediche",
"e",
"Chirurgiche",
"Materno-Infantili",
"e",
"dell’Adulto",
",",
"University",
"of",
"Modena",
"and",
"Reggio",
"Emilia",
",",
"Azienda",
"Ospedaliera",
"Universitaria",
",",
"Modena",
",",
"Italy",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
",",
"HELIOS",
"Hospital",
"Berlin-Buch",
",",
"Berlin",
",",
"Germany",
";",
"SC",
"Ematologia",
"Città",
"della",
"Salute",
"e",
"della",
"Scienza",
"Torino",
",",
"Torino",
";",
"Clinica",
"Ematologica",
"Azienda",
"Sanitaria",
"Universitaria",
"Integrata",
"di",
"Udine",
",",
"Udine",
",",
"Italy",
";",
"Service",
"d’Hématologie",
"Clinique",
"et",
"de",
"Thérapie",
"cellulaire",
",",
"Hôpital",
"Saint",
"Antoine",
",",
"APHP",
",",
"Paris",
",",
"France",
";",
"Ematologia",
",",
"Dipartimento",
"di",
"Medicina",
"Traslazionale",
"e",
"di",
"Precisione",
",",
"“",
"Sapienza",
"”",
"Università",
"di",
"Roma",
",",
"Rome",
";",
"Division",
"of",
"Hematology",
",",
"Department",
"of",
"Translational",
"Medicine",
",",
"Università",
"del",
"Piemonte",
"Orientale",
"and",
"Azienda",
"Ospedaliero-Universitaria",
"Maggiore",
"della",
"Carità",
",",
"Novara",
",",
"Italy",
";",
"Department",
"of",
"Internal",
"Medicine",
",",
"Reinier",
"de",
"Graaf",
"Hospital",
",",
"Delft",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Medical",
"Center",
"Leeuwarden",
",",
"Leeuwarden",
";",
"Radboud",
"University",
"Medical",
"Center",
",",
"Nijmegen",
",",
"Netherlands",
";",
"Dept",
"laboratory",
"Medicine",
",",
"Lab",
"Hematology",
",",
"Radboud",
"University",
"Medical",
"Center",
",",
"Nijmegen",
";",
"University",
"Medical",
"Center",
"Groningen",
",",
"Groningen",
",",
"Netherlands",
";",
"University",
"of",
"Liège",
",",
"Liège",
",",
"Belgium",
";",
"Department",
"of",
"Biomedicine",
"and",
"Prevention",
",",
"University",
"of",
"Rome",
"Tor",
"Vergata",
",",
"Rome",
",",
"Italy",
"Background",
":",
"Older",
",",
"fit",
"AML",
"patients",
"(",
"pts",
")",
"treated",
"with",
"induction",
"chemotherapy",
"(",
"IC",
")",
"have",
"poor",
"long-term",
"survival",
"unless",
"HSCT",
"is",
"performed",
"."
]
}
] |
PMC7185206 | The mechanism of soluble PD-L1 production and its effects are unknown. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"mechanism",
"of",
"soluble",
"PD-L1",
"production",
"and",
"its",
"effects",
"are",
"unknown",
"."
]
}
] |
PMC11746948 | We compared gene expression levels between the control group and the 2-BP-treated group. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"compared",
"gene",
"expression",
"levels",
"between",
"the",
"control",
"group",
"and",
"the",
"2-BP-treated",
"group",
"."
]
}
] |
PMC9596868 | We also investigated the combination of MST-312 with quercetin in OSE cells and noted no significant effect in cell viability at the concentrations used (Fig. 2G and H).Fig. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"also",
"investigated",
"the",
"combination",
"of",
"MST-312",
"with",
"quercetin",
"in",
"OSE",
"cells",
"and",
"noted",
"no",
"significant",
"effect",
"in",
"cell",
"viability",
"at",
"the",
"concentrations",
"used",
"(",
"Fig.",
"2",
"G",
"and",
"H).Fig",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | MSC from MM patients were more resistant to bortezomib treatment and more effective in supporting cancer cells viability during incubation with the drug as compare with HD MSC. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MSC",
"from",
"MM",
"patients",
"were",
"more",
"resistant",
"to",
"bortezomib",
"treatment",
"and",
"more",
"effective",
"in",
"supporting",
"cancer",
"cells",
"viability",
"during",
"incubation",
"with",
"the",
"drug",
"as",
"compare",
"with",
"HD",
"MSC",
"."
]
}
] |
PMC11521786 | Of note, PAbs titers against this human variant (HER3-ECD) were higher (an order of magnitude) if compared with the titers achieved by immunization against the murine variant (see Figure 1B ), probably because the HER3-ECD is a nonself-antigen in mice. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Of",
"note",
",",
"PAbs",
"titers",
"against",
"this",
"human",
"variant",
"(",
"HER3-ECD",
")",
"were",
"higher",
"(",
"an",
"order",
"of",
"magnitude",
")",
"if",
"compared",
"with",
"the",
"titers",
"achieved",
"by",
"immunization",
"against",
"the",
"murine",
"variant",
"(",
"see",
"Figure",
"1B",
")",
",",
"probably",
"because",
"the",
"HER3-ECD",
"is",
"a",
"nonself-antigen",
"in",
"mice",
"."
]
}
] |
PMC7887261 | b Increased DNA damage (γH2AX) levels in five out of the six genes knockdowns (mean ± SEM, n = 2~4), MLNR, CHEK2, POMC, ATM, and MME, compared with non-targeting (NT) siRNA control. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"b",
"Increased",
"DNA",
"damage",
"(",
"γH2AX",
")",
"levels",
"in",
"five",
"out",
"of",
"the",
"six",
"genes",
"knockdowns",
"(",
"mean",
"±",
"SEM",
",",
"n",
"=",
"2~4",
")",
",",
"MLNR",
",",
"CHEK2",
",",
"POMC",
",",
"ATM",
",",
"and",
"MME",
",",
"compared",
"with",
"non-targeting",
"(",
"NT",
")",
"siRNA",
"control",
"."
]
}
] |
PMC11739504 | The tagged vector was replaced with GFP to avoid overlap with the fluorescence wavelength that identifies the IFT52 and proceeded with the following experiment. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"tagged",
"vector",
"was",
"replaced",
"with",
"GFP",
"to",
"avoid",
"overlap",
"with",
"the",
"fluorescence",
"wavelength",
"that",
"identifies",
"the",
"IFT52",
"and",
"proceeded",
"with",
"the",
"following",
"experiment",
"."
]
}
] |
PMC6901583 | Recent research has shown the targeting of CCL2 in solid tumors with carlumab (a monoclonal antibody) in many phase I and II clinical trials. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Recent",
"research",
"has",
"shown",
"the",
"targeting",
"of",
"CCL2",
"in",
"solid",
"tumors",
"with",
"carlumab",
"(",
"a",
"monoclonal",
"antibody",
")",
"in",
"many",
"phase",
"I",
"and",
"II",
"clinical",
"trials",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | 108 (55.4%) patients had an IgG subtype. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"108",
"(",
"55.4",
"%",
")",
"patients",
"had",
"an",
"IgG",
"subtype",
"."
]
}
] |
PMC11754784 | Macrophages were stained by CFSE (green) and CEM were labeled with Far-red (red). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Macrophages",
"were",
"stained",
"by",
"CFSE",
"(",
"green",
")",
"and",
"CEM",
"were",
"labeled",
"with",
"Far-red",
"(",
"red",
")",
"."
]
}
] |
PMC11267830 | In summary, our findings underscore the indispensable role of DCAF15 in the mechanism of action of aromatic sulfonamide drugs in T-ALL and its crucial contribution to subsequent downstream consequences. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"summary",
",",
"our",
"findings",
"underscore",
"the",
"indispensable",
"role",
"of",
"DCAF15",
"in",
"the",
"mechanism",
"of",
"action",
"of",
"aromatic",
"sulfonamide",
"drugs",
"in",
"T-ALL",
"and",
"its",
"crucial",
"contribution",
"to",
"subsequent",
"downstream",
"consequences",
"."
]
}
] |
PMC4839679 | The coverslips were thoroughly rinsed with PBS containing 0.1% Tween 20, mounted on glass slides with Prolong Gold antifade containing DAPI (ThermoFisher Scientific, Waltham, MA) and imaged by Evos FL fluorescence microscope (ThermoFisher Scientific, Waltham, MA) as well as LSM 710 confocal microscope (Carl Zeiss Microscopy, LLC, Thornwood, NY). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"coverslips",
"were",
"thoroughly",
"rinsed",
"with",
"PBS",
"containing",
"0.1",
"%",
"Tween",
"20",
",",
"mounted",
"on",
"glass",
"slides",
"with",
"Prolong",
"Gold",
"antifade",
"containing",
"DAPI",
"(",
"ThermoFisher",
"Scientific",
",",
"Waltham",
",",
"MA",
")",
"and",
"imaged",
"by",
"Evos",
"FL",
"fluorescence",
"microscope",
"(",
"ThermoFisher",
"Scientific",
",",
"Waltham",
",",
"MA",
")",
"as",
"well",
"as",
"LSM",
"710",
"confocal",
"microscope",
"(",
"Carl",
"Zeiss",
"Microscopy",
",",
"LLC",
",",
"Thornwood",
",",
"NY",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Additionally, for further functional studies, we generated a homozygotic ELANE p.Cys55Arg mutant, that might serve as a unique model of the genotype-phenotype gradient of elastase activity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additionally",
",",
"for",
"further",
"functional",
"studies",
",",
"we",
"generated",
"a",
"homozygotic",
"ELANE",
"p.",
"Cys55Arg",
"mutant",
",",
"that",
"might",
"serve",
"as",
"a",
"unique",
"model",
"of",
"the",
"genotype-phenotype",
"gradient",
"of",
"elastase",
"activity",
"."
]
}
] |
PMC10968586 | In vitro results for OLE are conflicting. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"vitro",
"results",
"for",
"OLE",
"are",
"conflicting",
"."
]
}
] |
PMC11757230 | Given these findings, we also investigated the effect of cADSCs on the growth of a canine lymphoma cell line in vivo. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Given",
"these",
"findings",
",",
"we",
"also",
"investigated",
"the",
"effect",
"of",
"cADSCs",
"on",
"the",
"growth",
"of",
"a",
"canine",
"lymphoma",
"cell",
"line",
"in",
"vivo",
"."
]
}
] |
PMC11190538 | The DPPH (1–diphenyl–2–picrylhydrazyl) scavenging activity of C-PC was measured by the method of Lee et al. . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"DPPH",
"(",
"1–diphenyl–2–picrylhydrazyl",
")",
"scavenging",
"activity",
"of",
"C-PC",
"was",
"measured",
"by",
"the",
"method",
"of",
"Lee",
"et",
"al.",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Moreover, while 11 ACS events were reported the year before starting L-gln, only 2 ACS events occrred after 12 months of initiation of L-gln. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"while",
"11",
"ACS",
"events",
"were",
"reported",
"the",
"year",
"before",
"starting",
"L-gln",
",",
"only",
"2",
"ACS",
"events",
"occrred",
"after",
"12",
"months",
"of",
"initiation",
"of",
"L-gln",
"."
]
}
] |
PMC10530622 | siRNA is produced from double-stranded RNA (dsRNA) and is cleaved by an enzyme called ribonuclease III. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"siRNA",
"is",
"produced",
"from",
"double-stranded",
"RNA",
"(",
"dsRNA",
")",
"and",
"is",
"cleaved",
"by",
"an",
"enzyme",
"called",
"ribonuclease",
"III",
"."
]
}
] |
PMC7723249 | To date, HAZV which together with the recently discovered Tofla virus , belong to the same serogroup as CCHFV is used as a surrogate for CCHFV infections both in vitro and in vivo. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"date",
",",
"HAZV",
"which",
"together",
"with",
"the",
"recently",
"discovered",
"Tofla",
"virus",
",",
"belong",
"to",
"the",
"same",
"serogroup",
"as",
"CCHFV",
"is",
"used",
"as",
"a",
"surrogate",
"for",
"CCHFV",
"infections",
"both",
"in",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"."
]
}
] |
PMC11731161 | The cell viability analysis showed that the combination treatment was more effective in inhibiting cell proliferation than either agent administered alone (Fig. 6E). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cell",
"viability",
"analysis",
"showed",
"that",
"the",
"combination",
"treatment",
"was",
"more",
"effective",
"in",
"inhibiting",
"cell",
"proliferation",
"than",
"either",
"agent",
"administered",
"alone",
"(",
"Fig.",
"6E",
")",
"."
]
}
] |
PMC11539788 | In addition, RNF19A expression was negatively correlated with the expression of multiple genes related to mTOR signalling. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"RNF19A",
"expression",
"was",
"negatively",
"correlated",
"with",
"the",
"expression",
"of",
"multiple",
"genes",
"related",
"to",
"mTOR",
"signalling",
"."
]
}
] |
PMC2193049 | Lactacystin has been shown to irreversibly block the trypsin-like and chymotrypsin-like activities, reversibly inhibit the PGPH activity, and moderately block the BrAAP activity of the proteasome (28, 29). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Lactacystin",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"irreversibly",
"block",
"the",
"trypsin-like",
"and",
"chymotrypsin-like",
"activities",
",",
"reversibly",
"inhibit",
"the",
"PGPH",
"activity",
",",
"and",
"moderately",
"block",
"the",
"BrAAP",
"activity",
"of",
"the",
"proteasome",
"(",
"28",
",",
"29",
")",
"."
]
}
] |
PMC11711663 | Logσ=3 3D Firstorder RootMeanSquared Logσ=0.1-3D glszm SmallAreaLowGrayLevelEmphasis Exponential gldm LargeDependenceHighGrayLevelEmphasis 95% CI is calculated by exp(coef ± 1.96×se). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Logσ=3",
"3D",
"Firstorder",
"RootMeanSquared",
"Logσ=0.1",
"-",
"3D",
"glszm",
"SmallAreaLowGrayLevelEmphasis",
"Exponential",
"gldm",
"LargeDependenceHighGrayLevelEmphasis",
"95",
"%",
"CI",
"is",
"calculated",
"by",
"exp(coef",
"±",
"1.96",
"×",
"se",
")",
"."
]
}
] |
PMC11541241 | Among the conventional approaches to manipulating plant disease, host plant genetic resistance through genetic modification technologies appears to be the more durable and faster strategy (Kuo & Falk, 2020). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Among",
"the",
"conventional",
"approaches",
"to",
"manipulating",
"plant",
"disease",
",",
"host",
"plant",
"genetic",
"resistance",
"through",
"genetic",
"modification",
"technologies",
"appears",
"to",
"be",
"the",
"more",
"durable",
"and",
"faster",
"strategy",
"(",
"Kuo",
"&",
"Falk",
",",
"2020",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | First, 79 smears, obtained from 18 patients, were examined with the FFM platform vs the CellaVision DM1200 system. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"First",
",",
"79",
"smears",
",",
"obtained",
"from",
"18",
"patients",
",",
"were",
"examined",
"with",
"the",
"FFM",
"platform",
"vs",
"the",
"CellaVision",
"DM1200",
"system",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | However, patients with cyclin D1-positive DLBCL had shorter PFS and OS than cyclin D1-negative patients (P<0.05). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"patients",
"with",
"cyclin",
"D1-positive",
"DLBCL",
"had",
"shorter",
"PFS",
"and",
"OS",
"than",
"cyclin",
"D1-negative",
"patients",
"(",
"P<0.05",
")",
"."
]
}
] |
PMC11753435 | To further evaluate the overall performance of PepPrCLIP-generated IPs compared with RFDiffusion-generated IPs, we performed an unpaired Welch’s t test on the two groups of peptides. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"further",
"evaluate",
"the",
"overall",
"performance",
"of",
"PepPrCLIP-generated",
"IPs",
"compared",
"with",
"RFDiffusion-generated",
"IPs",
",",
"we",
"performed",
"an",
"unpaired",
"Welch",
"’s",
"t",
"test",
"on",
"the",
"two",
"groups",
"of",
"peptides",
"."
]
}
] |
PMC11531744 | According to the expression profile of IRGs, we employed a consensus clustering algorithm to categorize the TCGA OC patients into de novo groups. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"According",
"to",
"the",
"expression",
"profile",
"of",
"IRGs",
",",
"we",
"employed",
"a",
"consensus",
"clustering",
"algorithm",
"to",
"categorize",
"the",
"TCGA",
"OC",
"patients",
"into",
"de",
"novo",
"groups",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Systems biology approaches can enhance our understanding of NFκB and the roles of specific subunits in DLBCL. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Systems",
"biology",
"approaches",
"can",
"enhance",
"our",
"understanding",
"of",
"NFκB",
"and",
"the",
"roles",
"of",
"specific",
"subunits",
"in",
"DLBCL",
"."
]
}
] |
PMC11204465 | Compounds 31 and 32 have broad-spectrum antitumour activity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Compounds",
"31",
"and",
"32",
"have",
"broad-spectrum",
"antitumour",
"activity",
"."
]
}
] |
PMC11592837 | Since the discovery that ionizing radiation can trigger a rapid phosphorylation of H2A histone variant H2AX at serine 138 by Ataxia-telangiectasia mutated (ATM) kinase, the phosphorylated form was named gamma-H2AX . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Since",
"the",
"discovery",
"that",
"ionizing",
"radiation",
"can",
"trigger",
"a",
"rapid",
"phosphorylation",
"of",
"H2A",
"histone",
"variant",
"H2AX",
"at",
"serine",
"138",
"by",
"Ataxia-telangiectasia",
"mutated",
"(",
"ATM",
")",
"kinase",
",",
"the",
"phosphorylated",
"form",
"was",
"named",
"gamma-H2AX",
"."
]
}
] |
PMC11049548 | Multivariate statistics were applied to spectral buckets. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Multivariate",
"statistics",
"were",
"applied",
"to",
"spectral",
"buckets",
"."
]
}
] |
PMC11521786 | After blocking, membranes were incubated overnight with primary antibodies: anti-HER3 (AF234, R&D Systems, USA), anti-HER2 (AF1129, R&D Systems), anti-HER1 (AF231, R&D Systems), or ß-actin (MAB8929, R&D Systems). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"blocking",
",",
"membranes",
"were",
"incubated",
"overnight",
"with",
"primary",
"antibodies",
":",
"anti-HER3",
"(",
"AF234",
",",
"R&D",
"Systems",
",",
"USA",
")",
",",
"anti-HER2",
"(",
"AF1129",
",",
"R&D",
"Systems",
")",
",",
"anti-HER1",
"(",
"AF231",
",",
"R&D",
"Systems",
")",
",",
"or",
"ß-actin",
"(",
"MAB8929",
",",
"R&D",
"Systems",
")",
"."
]
}
] |
PMC11224020 | b, Expression of CCR7–GFP in Pla2g4a-knockdown (si-cPLA2) and control (si-Ctrl) DCs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"b",
",",
"Expression",
"of",
"CCR7–GFP",
"in",
"Pla2g4a-knockdown",
"(",
"si-cPLA2",
")",
"and",
"control",
"(",
"si-Ctrl",
")",
"DCs",
"."
]
}
] |
PMC10858941 | Microfluidic devices were used following the protocol previously described . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Microfluidic",
"devices",
"were",
"used",
"following",
"the",
"protocol",
"previously",
"described",
"."
]
}
] |
PMC11740907 | Measurement of melting points and crystallization temperatures, enthalpy and entropy changes carried out by using DSC. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Measurement",
"of",
"melting",
"points",
"and",
"crystallization",
"temperatures",
",",
"enthalpy",
"and",
"entropy",
"changes",
"carried",
"out",
"by",
"using",
"DSC",
"."
]
}
] |
PMC4355729 | We then applied the CRISPR/Cas9 technology21 to screen 786-O cells and A-704 cells with haploid deletion mutation of PIK3R1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"then",
"applied",
"the",
"CRISPR/Cas9",
"technology21",
"to",
"screen",
"786-O",
"cells",
"and",
"A-704",
"cells",
"with",
"haploid",
"deletion",
"mutation",
"of",
"PIK3R1",
"."
]
}
] |
PMC11697703 | Averages were compared for triplicates of each condition. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Averages",
"were",
"compared",
"for",
"triplicates",
"of",
"each",
"condition",
"."
]
}
] |
PMC11748335 | Cells were then centrifuged at 9,400 × g for 5 min at 4 °C and the supernatant was discarded. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"were",
"then",
"centrifuged",
"at",
"9,400",
"×",
"g",
"for",
"5",
"min",
"at",
"4",
"°",
"C",
"and",
"the",
"supernatant",
"was",
"discarded",
"."
]
}
] |
PMC9966931 | At the highest concentration assayed, MGI was potent, but this effect nearly disappeared when hybrids were tested at 0.125%. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"At",
"the",
"highest",
"concentration",
"assayed",
",",
"MGI",
"was",
"potent",
",",
"but",
"this",
"effect",
"nearly",
"disappeared",
"when",
"hybrids",
"were",
"tested",
"at",
"0.125",
"%",
"."
]
}
] |
PMC11806106 | D, E Averaged FRET-based measurement of HEK293 cells stably expressing the NOP conformation sensor measured in a 96-well plate format at a plate reader (schematic image of a 96-well plate created with BioRender, licence INC-12457). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"D",
",",
"E",
"Averaged",
"FRET-based",
"measurement",
"of",
"HEK293",
"cells",
"stably",
"expressing",
"the",
"NOP",
"conformation",
"sensor",
"measured",
"in",
"a",
"96-well",
"plate",
"format",
"at",
"a",
"plate",
"reader",
"(",
"schematic",
"image",
"of",
"a",
"96-well",
"plate",
"created",
"with",
"BioRender",
",",
"licence",
"INC-12457",
")",
"."
]
}
] |
PMC9014716 | Western blot analysis showed that PS-T could down-regulate P-gp expression in human HepG2 or Bel-7404 cells with miR-224-5p inhibitor, respectively. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Western",
"blot",
"analysis",
"showed",
"that",
"PS-T",
"could",
"down-regulate",
"P-gp",
"expression",
"in",
"human",
"HepG2",
"or",
"Bel-7404",
"cells",
"with",
"miR-224",
"-",
"5p",
"inhibitor",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC6901583 | Conditioned media were collected for ELISA assays to assess VEGFA secretion. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Conditioned",
"media",
"were",
"collected",
"for",
"ELISA",
"assays",
"to",
"assess",
"VEGFA",
"secretion",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Follow-up duration was estimated using reverse Kaplan-Meier method. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Follow-up",
"duration",
"was",
"estimated",
"using",
"reverse",
"Kaplan-Meier",
"method",
"."
]
}
] |
PMC11547972 | This in vitro study shows that combining SFN with amygdalin exerts a synergistic suppression of tumor cell growth and permits a distinct reduction in amygdalin dosage. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"in",
"vitro",
"study",
"shows",
"that",
"combining",
"SFN",
"with",
"amygdalin",
"exerts",
"a",
"synergistic",
"suppression",
"of",
"tumor",
"cell",
"growth",
"and",
"permits",
"a",
"distinct",
"reduction",
"in",
"amygdalin",
"dosage",
"."
]
}
] |
PMC10454535 | BTZ had IC50 values over 1000 times lower than the RES derivatives at all time points (Table 1). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"BTZ",
"had",
"IC50",
"values",
"over",
"1000",
"times",
"lower",
"than",
"the",
"RES",
"derivatives",
"at",
"all",
"time",
"points",
"(",
"Table",
"1",
")",
"."
]
}
] |
PMC7961460 | Second, in ER negative patients the expression of c10orf118 is highly variable compared to the ones expressing ER. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Second",
",",
"in",
"ER",
"negative",
"patients",
"the",
"expression",
"of",
"c10orf118",
"is",
"highly",
"variable",
"compared",
"to",
"the",
"ones",
"expressing",
"ER",
"."
]
}
] |
PMC7887261 | The cell line was authenticated by ATCC STR analysis and routinely check to be mycoplasma-free. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cell",
"line",
"was",
"authenticated",
"by",
"ATCC",
"STR",
"analysis",
"and",
"routinely",
"check",
"to",
"be",
"mycoplasma-free",
"."
]
}
] |
PMC10652261 | no. 550914, San Jose). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"no.",
"550914",
",",
"San",
"Jose",
")",
"."
]
}
] |
PMC11661040 | Results from three experiments are summarized in a histogram format. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
"from",
"three",
"experiments",
"are",
"summarized",
"in",
"a",
"histogram",
"format",
".",
"("
]
}
] |
PMC5363531 | The following controls were used to set up compensation and quadrants: unstained cells, cells stained with Annexin V-FITC alone (no PI), cells stained with PI alone (no Annexin V-FITC). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"following",
"controls",
"were",
"used",
"to",
"set",
"up",
"compensation",
"and",
"quadrants",
":",
"unstained",
"cells",
",",
"cells",
"stained",
"with",
"Annexin",
"V-FITC",
"alone",
"(",
"no",
"PI",
")",
",",
"cells",
"stained",
"with",
"PI",
"alone",
"(",
"no",
"Annexin",
"V-FITC",
")",
"."
]
}
] |
PMC9065483 | Four hours later, cells were infected with VSVΔ51-GFP (MOI 0.1). ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Four",
"hours",
"later",
",",
"cells",
"were",
"infected",
"with",
"VSVΔ51-GFP",
"(",
"MOI",
"0.1",
")",
".",
"("
]
}
] |
PMC10606998 | The main objective of this work was to determine the potential of dextran-coated iron oxide nanoparticles to increase the radiosensitivity of malignant glioma cells when exposed to various kinds of ionizing radiation, namely, X-rays, gamma radiation, and proton irradiation at the Bragg peak. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"main",
"objective",
"of",
"this",
"work",
"was",
"to",
"determine",
"the",
"potential",
"of",
"dextran-coated",
"iron",
"oxide",
"nanoparticles",
"to",
"increase",
"the",
"radiosensitivity",
"of",
"malignant",
"glioma",
"cells",
"when",
"exposed",
"to",
"various",
"kinds",
"of",
"ionizing",
"radiation",
",",
"namely",
",",
"X-rays",
",",
"gamma",
"radiation",
",",
"and",
"proton",
"irradiation",
"at",
"the",
"Bragg",
"peak",
"."
]
}
] |
PMC11633763 | Compared with that in adjacent tissues, HK2 protein (Figure 4E,F,J) and mRNA (Figure 4H) expression was significantly higher in osteosarcoma tissue, which was confirmed by immunohistochemical staining (Figure 4G). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Compared",
"with",
"that",
"in",
"adjacent",
"tissues",
",",
"HK2",
"protein",
"(",
"Figure",
"4E",
",",
"F",
",",
"J",
")",
"and",
"mRNA",
"(",
"Figure",
"4H",
")",
"expression",
"was",
"significantly",
"higher",
"in",
"osteosarcoma",
"tissue",
",",
"which",
"was",
"confirmed",
"by",
"immunohistochemical",
"staining",
"(",
"Figure",
"4",
"G",
")",
"."
]
}
] |
PMC8922418 | However, in the future, gene therapy could be a powerful strategy for HIV-1/AIDS treatment if we can overcome all limitations and ensure on-target efficiency and safety. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"in",
"the",
"future",
",",
"gene",
"therapy",
"could",
"be",
"a",
"powerful",
"strategy",
"for",
"HIV-1/AIDS",
"treatment",
"if",
"we",
"can",
"overcome",
"all",
"limitations",
"and",
"ensure",
"on-target",
"efficiency",
"and",
"safety",
"."
]
}
] |
PMC11590870 | Also, some cancer cells have acquired resistance to some of these drugs and existing treatments, not being effective enough to reduce the high mortality rate associated with cancer . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Also",
",",
"some",
"cancer",
"cells",
"have",
"acquired",
"resistance",
"to",
"some",
"of",
"these",
"drugs",
"and",
"existing",
"treatments",
",",
"not",
"being",
"effective",
"enough",
"to",
"reduce",
"the",
"high",
"mortality",
"rate",
"associated",
"with",
"cancer",
"."
]
}
] |
PMC11661024 | However, the possible impacts of postbiotics on cervical cancer have not been reported yet. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"the",
"possible",
"impacts",
"of",
"postbiotics",
"on",
"cervical",
"cancer",
"have",
"not",
"been",
"reported",
"yet",
"."
]
}
] |
PMC10142392 | Asymmetric AB3 multi-arm polymers are easy to construct, providing a versatile structure for delivering various lipophilic drugs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Asymmetric",
"AB3",
"multi-arm",
"polymers",
"are",
"easy",
"to",
"construct",
",",
"providing",
"a",
"versatile",
"structure",
"for",
"delivering",
"various",
"lipophilic",
"drugs",
"."
]
}
] |
PMC5811757 | This cell line was cultured in RPMI 1640 medium (Sigma-Aldrich, Germany) supplemented with 10% FBS (Gibco, UK), 100 µg/ml streptomycin and 100 U/ml penicillin (Sigma-Aldrich, Germany) and was incubated in a 5% CO2 atmosphere at 37°C. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"cell",
"line",
"was",
"cultured",
"in",
"RPMI",
"1640",
"medium",
"(",
"Sigma-Aldrich",
",",
"Germany",
")",
"supplemented",
"with",
"10",
"%",
"FBS",
"(",
"Gibco",
",",
"UK",
")",
",",
"100",
"µg/ml",
"streptomycin",
"and",
"100",
"U/ml",
"penicillin",
"(",
"Sigma-Aldrich",
",",
"Germany",
")",
"and",
"was",
"incubated",
"in",
"a",
"5",
"%",
"CO2",
"atmosphere",
"at",
"37",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC11352311 | In A498, cell viability decreased to 70.38 ± 3.36% after treatment with 100 μM esculin and to 38.98 ± 4.35% at 200 μM (Figure 3B). | [
{
"tags": [
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"A498",
",",
"cell",
"viability",
"decreased",
"to",
"70.38",
"±",
"3.36",
"%",
"after",
"treatment",
"with",
"100",
"μM",
"esculin",
"and",
"to",
"38.98",
"±",
"4.35",
"%",
"at",
"200",
"μM",
"(",
"Figure",
"3B",
")",
"."
]
}
] |
PMC4270159 | Treatment of the cells with the secondary kinase inhibitor alone. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Treatment",
"of",
"the",
"cells",
"with",
"the",
"secondary",
"kinase",
"inhibitor",
"alone",
"."
]
}
] |
PMC11519788 | Recently VEZF1 exhibited overexpression in breast and liver cancers, suggesting a potential role in promoting cancer progression 37-39. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Recently",
"VEZF1",
"exhibited",
"overexpression",
"in",
"breast",
"and",
"liver",
"cancers",
",",
"suggesting",
"a",
"potential",
"role",
"in",
"promoting",
"cancer",
"progression",
"37",
"-",
"39",
"."
]
}
] |
PMC8973085 | Found: C, 65.28; H, 4.79; N, 9.80. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Found",
":",
"C",
",",
"65.28",
";",
"H",
",",
"4.79",
";",
"N",
",",
"9.80",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.