PMCID
string | Sentences
string | ner
list |
|---|---|---|
PMC9874064
|
The results showed that the number of cell colonies formed by cells treated with cisplatin was significantly higher than those formed in cells treated with NP-Pt-USP1i (Fig. 3E and F).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"results",
"showed",
"that",
"the",
"number",
"of",
"cell",
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"formed",
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"with",
"cisplatin",
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"significantly",
"higher",
"than",
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"formed",
"in",
"cells",
"treated",
"with",
"NP-Pt-USP1i",
"(",
"Fig.",
"3E",
"and",
"F",
")",
"."
]
}
] |
PMC11700523
|
Various mechanisms have been proposed for kidney injury associated with excessive MR activation, including podocyte damage and fibrosis of the interstitium, and kidney injury can be suppressed by MR antagonists .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Various",
"mechanisms",
"have",
"been",
"proposed",
"for",
"kidney",
"injury",
"associated",
"with",
"excessive",
"MR",
"activation",
",",
"including",
"podocyte",
"damage",
"and",
"fibrosis",
"of",
"the",
"interstitium",
",",
"and",
"kidney",
"injury",
"can",
"be",
"suppressed",
"by",
"MR",
"antagonists",
"."
]
}
] |
PMC11610461
|
Among them, the positive correlation based on hallmark gene sets is relatively weak, which may be due to the differences in the scope of gene sets, because hallmark gene sets focus on core components, while KEGG and WikiPathways gene sets cover a broader network.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Among",
"them",
",",
"the",
"positive",
"correlation",
"based",
"on",
"hallmark",
"gene",
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"is",
"relatively",
"weak",
",",
"which",
"may",
"be",
"due",
"to",
"the",
"differences",
"in",
"the",
"scope",
"of",
"gene",
"sets",
",",
"because",
"hallmark",
"gene",
"sets",
"focus",
"on",
"core",
"components",
",",
"while",
"KEGG",
"and",
"WikiPathways",
"gene",
"sets",
"cover",
"a",
"broader",
"network",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Main outcome measures: Cox proportional hazard model was used to generate the Hazard Ratios (HRs) with 95% confidence interval (CI) for all-cause mortality comparing frail vs. prefrail vs. fit patients.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Main",
"outcome",
"measures",
":",
"Cox",
"proportional",
"hazard",
"model",
"was",
"used",
"to",
"generate",
"the",
"Hazard",
"Ratios",
"(",
"HRs",
")",
"with",
"95",
"%",
"confidence",
"interval",
"(",
"CI",
")",
"for",
"all-cause",
"mortality",
"comparing",
"frail",
"vs.",
"prefrail",
"vs.",
"fit",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC11680982
|
The outcomes clearly demonstrated that the triple combination exerted significantly enhanced inhibitory effects on proliferation and colony formation in HR/HER2-low breast cancer cells, surpassing the efficacy of CDK4/6 inhibitor combined with endocrine therapy alone (CI < 0.5, P < 0.01) (Fig. 4A,B).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"outcomes",
"clearly",
"demonstrated",
"that",
"the",
"triple",
"combination",
"exerted",
"significantly",
"enhanced",
"inhibitory",
"effects",
"on",
"proliferation",
"and",
"colony",
"formation",
"in",
"HR/HER2-low",
"breast",
"cancer",
"cells",
",",
"surpassing",
"the",
"efficacy",
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"CDK4/6",
"inhibitor",
"combined",
"with",
"endocrine",
"therapy",
"alone",
"(",
"CI",
"<",
"0.5",
",",
"P",
"<",
"0.01",
")",
"(",
"Fig.",
"4A",
",",
"B",
")",
"."
]
}
] |
PMC6627640
|
A quality control of reads generated from RNA sequencing was performed using FASTQC.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"quality",
"control",
"of",
"reads",
"generated",
"from",
"RNA",
"sequencing",
"was",
"performed",
"using",
"FASTQC",
"."
]
}
] |
PMC11750161
|
We reported that the C-terminal phosphorylation sites play a pivotal role in the signal transduction of equine FSHR (Seong et al., 2020) and equine LH/CGR (Byambaragchaa et al., 2022b).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"reported",
"that",
"the",
"C-terminal",
"phosphorylation",
"sites",
"play",
"a",
"pivotal",
"role",
"in",
"the",
"signal",
"transduction",
"of",
"equine",
"FSHR",
"(",
"Seong",
"et",
"al.",
",",
"2020",
")",
"and",
"equine",
"LH/CGR",
"(",
"Byambaragchaa",
"et",
"al.",
",",
"2022b",
")",
"."
]
}
] |
PMC7570809
|
Then, cells were seeded onto vitronectin.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Then",
",",
"cells",
"were",
"seeded",
"onto",
"vitronectin",
"."
]
}
] |
PMC11344246
|
Error bars show the standard error of the mean of the biological replicates (n = 2 except for RMUG-S which is n = 3).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Error",
"bars",
"show",
"the",
"standard",
"error",
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"the",
"mean",
"of",
"the",
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"replicates",
"(",
"n",
"=",
"2",
"except",
"for",
"RMUG-S",
"which",
"is",
"n",
"=",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC10808409
|
Also, the CMC of Pluronic F127, P123, and TPGS were measured and were found to be 0.0025%, 0.0025%, and 0.025%, respectively.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Also",
",",
"the",
"CMC",
"of",
"Pluronic",
"F127",
",",
"P123",
",",
"and",
"TPGS",
"were",
"measured",
"and",
"were",
"found",
"to",
"be",
"0.0025",
"%",
",",
"0.0025",
"%",
",",
"and",
"0.025",
"%",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC8753818
|
To this end, it has been reported that the proteolytic activity of caspases affects the cell cycle proteins as their substrates .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"this",
"end",
",",
"it",
"has",
"been",
"reported",
"that",
"the",
"proteolytic",
"activity",
"of",
"caspases",
"affects",
"the",
"cell",
"cycle",
"proteins",
"as",
"their",
"substrates",
"."
]
}
] |
PMC11607638
|
Penicillin/streptomycin solution (SV30010) was from Hyclone™ (Shanghai, China).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Penicillin/streptomycin",
"solution",
"(",
"SV30010",
")",
"was",
"from",
"Hyclone",
"™",
"(",
"Shanghai",
",",
"China",
")",
"."
]
}
] |
PMC11705630
|
Further studies with double knockdown of IRF9 and STAT2 revealed that ISGF3 mediates the effect of GLDC on cell proliferation.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
"studies",
"with",
"double",
"knockdown",
"of",
"IRF9",
"and",
"STAT2",
"revealed",
"that",
"ISGF3",
"mediates",
"the",
"effect",
"of",
"GLDC",
"on",
"cell",
"proliferation",
"."
]
}
] |
PMC10975211
|
These have gained attention for a variety of reasons.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"have",
"gained",
"attention",
"for",
"a",
"variety",
"of",
"reasons",
"."
]
}
] |
PMC11787381
|
Donepezil (DPZ) served as a positive control (blue).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Donepezil",
"(",
"DPZ",
")",
"served",
"as",
"a",
"positive",
"control",
"(",
"blue",
")",
"."
]
}
] |
PMC11240571
|
This inhibitory effect was inactivated by the anti-PD-L1 antibody.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"inhibitory",
"effect",
"was",
"inactivated",
"by",
"the",
"anti-PD-L1",
"antibody",
"."
]
}
] |
PMC11696576
|
For experiments, 5 × 10 cells were seeded in 0.5 mL in 24 well plates with RPMI medium supplemented with 5% FBS, 0.3 mg/mL glutamine, and 0.1 mg/mL gentamicin.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"experiments",
",",
"5",
"×",
"10",
"cells",
"were",
"seeded",
"in",
"0.5",
"mL",
"in",
"24",
"well",
"plates",
"with",
"RPMI",
"medium",
"supplemented",
"with",
"5",
"%",
"FBS",
",",
"0.3",
"mg/mL",
"glutamine",
",",
"and",
"0.1",
"mg/mL",
"gentamicin",
"."
]
}
] |
PMC11279397
|
This study utilized bioinformatics analysis methods for the first time to identify target genes associated with perilla from multiple databases.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"study",
"utilized",
"bioinformatics",
"analysis",
"methods",
"for",
"the",
"first",
"time",
"to",
"identify",
"target",
"genes",
"associated",
"with",
"perilla",
"from",
"multiple",
"databases",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Prior TKI exposure did not affect OS but was associated with better event-free survival (HR 0.15 95% CI 0.03-0.71, p=0.016).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Prior",
"TKI",
"exposure",
"did",
"not",
"affect",
"OS",
"but",
"was",
"associated",
"with",
"better",
"event-free",
"survival",
"(",
"HR",
"0.15",
"95",
"%",
"CI",
"0.03",
"-",
"0.71",
",",
"p=0.016",
")",
"."
]
}
] |
PMC11697065
|
Variation in gene copy number, transcript level and protein abundances were observed across all clones (Supplementary Figure 7A-C).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Variation",
"in",
"gene",
"copy",
"number",
",",
"transcript",
"level",
"and",
"protein",
"abundances",
"were",
"observed",
"across",
"all",
"clones",
"(",
"Supplementary",
"Figure",
"7A-C",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Gene editing strategies permit alteration of CTLA4 while retaining the endogenous gene control machinery.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Gene",
"editing",
"strategies",
"permit",
"alteration",
"of",
"CTLA4",
"while",
"retaining",
"the",
"endogenous",
"gene",
"control",
"machinery",
"."
]
}
] |
PMC7802142
|
n ≥ 5; *P < 0.05, **P < 0.01 versus the PBS groups by One-way ANOVA.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"n",
"≥",
"5",
";",
"*",
"P",
"<",
"0.05",
",",
"*",
"*",
"P",
"<",
"0.01",
"versus",
"the",
"PBS",
"groups",
"by",
"One-way",
"ANOVA",
"."
]
}
] |
PMC6948907
|
We have previously shown that GE (25μM, IC50) inhibits the growth of hepatocellular carcinoma PLC/PRF5 cells significantly with a time and dosedependent manner (Dastjerdi et al., 20154).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"have",
"previously",
"shown",
"that",
"GE",
"(",
"25μM",
",",
"IC50",
")",
"inhibits",
"the",
"growth",
"of",
"hepatocellular",
"carcinoma",
"PLC/PRF5",
"cells",
"significantly",
"with",
"a",
"time",
"and",
"dosedependent",
"manner",
"(",
"Dastjerdi",
"et",
"al.",
",",
"20154",
")",
"."
]
}
] |
PMC10890055
|
hFOB 1.19 cells were seeded in 48-well plates in DMEM/Ham’s F-12 medium without phenol red, with 10% FBS and with or without the selection reagent, G418.
|
[
{
"tags": [
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"hFOB",
"1.19",
"cells",
"were",
"seeded",
"in",
"48-well",
"plates",
"in",
"DMEM/Ham",
"’s",
"F-12",
"medium",
"without",
"phenol",
"red",
",",
"with",
"10",
"%",
"FBS",
"and",
"with",
"or",
"without",
"the",
"selection",
"reagent",
",",
"G418",
"."
]
}
] |
PMC8708099
|
no. ab211091) according to the manufacturer’s protocol.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"no.",
"ab211091",
")",
"according",
"to",
"the",
"manufacturer",
"’s",
"protocol",
"."
]
}
] |
PMC11248911
|
Calcd.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Calcd",
"."
]
}
] |
PMC10706275
|
One limitation of this study pertains to the productivity data, which was obtained from shake flask cell cultures rather than from bioreactors.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"One",
"limitation",
"of",
"this",
"study",
"pertains",
"to",
"the",
"productivity",
"data",
",",
"which",
"was",
"obtained",
"from",
"shake",
"flask",
"cell",
"cultures",
"rather",
"than",
"from",
"bioreactors",
"."
]
}
] |
PMC11786767
|
E: Quantification of chromosome area and microtubule organization patterns.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"E",
":",
"Quantification",
"of",
"chromosome",
"area",
"and",
"microtubule",
"organization",
"patterns",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
These results support the potential to use these criteria as primary surrogate endpoints.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"results",
"support",
"the",
"potential",
"to",
"use",
"these",
"criteria",
"as",
"primary",
"surrogate",
"endpoints",
"."
]
}
] |
PMC9479186
|
This work was supported by the Medical and public health projects in Zhejiang Province (2022499342, FH); the Medical and public health projects in Zhejiang Province (2022505268, YZ); Diagnosis And Therapy Center of Upper Gastrointestinal Tumor (JBZX-202006, XC).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"work",
"was",
"supported",
"by",
"the",
"Medical",
"and",
"public",
"health",
"projects",
"in",
"Zhejiang",
"Province",
"(",
"2022499342",
",",
"FH",
")",
";",
"the",
"Medical",
"and",
"public",
"health",
"projects",
"in",
"Zhejiang",
"Province",
"(",
"2022505268",
",",
"YZ",
")",
";",
"Diagnosis",
"And",
"Therapy",
"Center",
"of",
"Upper",
"Gastrointestinal",
"Tumor",
"(",
"JBZX-202006",
",",
"XC",
")",
"."
]
}
] |
PMC10932641
|
The protein was separated with sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis and then transferred to a polyvinylidene fluoride (PVDF) membrane.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"protein",
"was",
"separated",
"with",
"sodium",
"dodecyl",
"sulfate-polyacrylamide",
"gel",
"electrophoresis",
"and",
"then",
"transferred",
"to",
"a",
"polyvinylidene",
"fluoride",
"(",
"PVDF",
")",
"membrane",
"."
]
}
] |
PMC6102174
|
Swerilactone A showed anti-HBV property against HBsAg secretion with an IC50 value of 3.66 mM, and against HBeAg secretion with an IC50 value of 3.58 mM. However, swerilactone B exhibited no activity at the highest tested concentration of 4.64 mM. Swerilactones C and D (25, 26) with a 6/6/6/6/6 pentacyclic ring system are another type of secoiridoid dimers with C20 skeleton, and their structures were determined by X-ray crystallographic analyses.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Swerilactone",
"A",
"showed",
"anti-HBV",
"property",
"against",
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"secretion",
"with",
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"IC50",
"value",
"of",
"3.66",
"mM",
",",
"and",
"against",
"HBeAg",
"secretion",
"with",
"an",
"IC50",
"value",
"of",
"3.58",
"mM.",
"However",
",",
"swerilactone",
"B",
"exhibited",
"no",
"activity",
"at",
"the",
"highest",
"tested",
"concentration",
"of",
"4.64",
"mM.",
"Swerilactones",
"C",
"and",
"D",
"(",
"25",
",",
"26",
")",
"with",
"a",
"6/6/6/6/6",
"pentacyclic",
"ring",
"system",
"are",
"another",
"type",
"of",
"secoiridoid",
"dimers",
"with",
"C20",
"skeleton",
",",
"and",
"their",
"structures",
"were",
"determined",
"by",
"X-ray",
"crystallographic",
"analyses",
"."
]
}
] |
PMC11672142
|
The cells that were presupplemented with Fe(III) exhibited a significant 115-fold increase in viability relative to the nonsupplemented group (Figure S20).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cells",
"that",
"were",
"presupplemented",
"with",
"Fe(III",
")",
"exhibited",
"a",
"significant",
"115-fold",
"increase",
"in",
"viability",
"relative",
"to",
"the",
"nonsupplemented",
"group",
"(",
"Figure",
"S20",
")",
"."
]
}
] |
PMC4395774
|
After 12 weeks, mice were sacrificed, and blood, bone marrow, thymus and spleen were removed for each mouse for analysis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"12",
"weeks",
",",
"mice",
"were",
"sacrificed",
",",
"and",
"blood",
",",
"bone",
"marrow",
",",
"thymus",
"and",
"spleen",
"were",
"removed",
"for",
"each",
"mouse",
"for",
"analysis",
"."
]
}
] |
PMC11363012
|
Key parameters of the cell-picking process, such as the aspiration/dispensing speed and volume, were optimized to obtain a 95% success transfer rate with minimal cross-contamination.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Key",
"parameters",
"of",
"the",
"cell-picking",
"process",
",",
"such",
"as",
"the",
"aspiration/dispensing",
"speed",
"and",
"volume",
",",
"were",
"optimized",
"to",
"obtain",
"a",
"95",
"%",
"success",
"transfer",
"rate",
"with",
"minimal",
"cross-contamination",
"."
]
}
] |
PMC11792888
|
AIF signal was normalized to β-Actin.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"AIF",
"signal",
"was",
"normalized",
"to",
"β-Actin",
"."
]
}
] |
PMC10582049
|
The package contains the core survival analysis routines, including Kaplan–Meier and Aalen–Johansen (multi-state) curves, and Cox models.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"package",
"contains",
"the",
"core",
"survival",
"analysis",
"routines",
",",
"including",
"Kaplan",
"–",
"Meier",
"and",
"Aalen",
"–",
"Johansen",
"(",
"multi-state",
")",
"curves",
",",
"and",
"Cox",
"models",
"."
]
}
] |
PMC9370419
|
The HiBiT peptide was attached to the N-terminal of HBx and could be measured by chemical fluorescence by binding to the LgBiT. The HiBiT tag is short and does not affect the HBx function; therefore, with the help of a sleeping-beauty transposon system, such a cell line establishment was deemed to be safe and fast.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"HiBiT",
"peptide",
"was",
"attached",
"to",
"the",
"N-terminal",
"of",
"HBx",
"and",
"could",
"be",
"measured",
"by",
"chemical",
"fluorescence",
"by",
"binding",
"to",
"the",
"LgBiT.",
"The",
"HiBiT",
"tag",
"is",
"short",
"and",
"does",
"not",
"affect",
"the",
"HBx",
"function",
";",
"therefore",
",",
"with",
"the",
"help",
"of",
"a",
"sleeping-beauty",
"transposon",
"system",
",",
"such",
"a",
"cell",
"line",
"establishment",
"was",
"deemed",
"to",
"be",
"safe",
"and",
"fast",
"."
]
}
] |
PMC11656657
|
For CM4, freshly isolated PBMC (4 × 10/cm) were co-cultured for 72 h with semiconfluent 143B, 143B G-CSF or U-2OS cell line in Medium.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"CM4",
",",
"freshly",
"isolated",
"PBMC",
"(",
"4",
"×",
"10/cm",
")",
"were",
"co-cultured",
"for",
"72",
"h",
"with",
"semiconfluent",
"143B",
",",
"143B",
"G-CSF",
"or",
"U-2OS",
"cell",
"line",
"in",
"Medium",
"."
]
}
] |
PMC10506676
|
Data analysis All experiments were performed in duplicate.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Data",
"analysis",
"All",
"experiments",
"were",
"performed",
"in",
"duplicate",
"."
]
}
] |
PMC4839679
|
Additionally we observed the increased representation of CE16:0, CE20:5, CE20:4 and decreased representation of CE20:1 in comparing the lipid profile of Caki2+PBRM1 with that of Caki2+Vector, which was consistent with the comparison of normal kidney tissue and renal cell carcinoma obtained from nephrectomies from six patients reported earlier .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additionally",
"we",
"observed",
"the",
"increased",
"representation",
"of",
"CE16:0",
",",
"CE20:5",
",",
"CE20:4",
"and",
"decreased",
"representation",
"of",
"CE20:1",
"in",
"comparing",
"the",
"lipid",
"profile",
"of",
"Caki2+PBRM1",
"with",
"that",
"of",
"Caki2+Vector",
",",
"which",
"was",
"consistent",
"with",
"the",
"comparison",
"of",
"normal",
"kidney",
"tissue",
"and",
"renal",
"cell",
"carcinoma",
"obtained",
"from",
"nephrectomies",
"from",
"six",
"patients",
"reported",
"earlier",
"."
]
}
] |
PMC9878278
|
Densitometry analysis was performed using ImageJ and the p-IRF3/β-actin ratio in infected cells relative to the siCtrl mock was calculated.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Densitometry",
"analysis",
"was",
"performed",
"using",
"ImageJ",
"and",
"the",
"p-IRF3/β-actin",
"ratio",
"in",
"infected",
"cells",
"relative",
"to",
"the",
"siCtrl",
"mock",
"was",
"calculated",
"."
]
}
] |
PMC11742864
|
Payungsak Tantipaiboonwong et al. found that PSO and rosemary acid decreased NF-κB expression induced by TNF-α in lung cancer cells and mouse models, leading to reduced expression of IL-1β, IL-6, IL-8, TNF-α, and COX-2.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Payungsak",
"Tantipaiboonwong",
"et",
"al.",
"found",
"that",
"PSO",
"and",
"rosemary",
"acid",
"decreased",
"NF-κB",
"expression",
"induced",
"by",
"TNF-α",
"in",
"lung",
"cancer",
"cells",
"and",
"mouse",
"models",
",",
"leading",
"to",
"reduced",
"expression",
"of",
"IL-1β",
",",
"IL-6",
",",
"IL-8",
",",
"TNF-α",
",",
"and",
"COX-2",
"."
]
}
] |
PMC10154881
|
Activation of NK cells and T cells in TDLNs at 3 dpi and 9 dpi were analyzed by flow cytometry.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Activation",
"of",
"NK",
"cells",
"and",
"T",
"cells",
"in",
"TDLNs",
"at",
"3",
"dpi",
"and",
"9",
"dpi",
"were",
"analyzed",
"by",
"flow",
"cytometry",
"."
]
}
] |
PMC6268318
|
The methanol, dichloromethane and acetate extracts of C. erythrophyllum showed bioactivity in a yeast-based microtiter assay for DNA-damaging agents (Table 1).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"methanol",
",",
"dichloromethane",
"and",
"acetate",
"extracts",
"of",
"C.",
"erythrophyllum",
"showed",
"bioactivity",
"in",
"a",
"yeast-based",
"microtiter",
"assay",
"for",
"DNA-damaging",
"agents",
"(",
"Table",
"1",
")",
"."
]
}
] |
PMC9479186
|
We suppose NDUFC1 could be a target for therapy for HCC.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"suppose",
"NDUFC1",
"could",
"be",
"a",
"target",
"for",
"therapy",
"for",
"HCC",
"."
]
}
] |
PMC11803918
|
The results showed that human γδ-T exosomes could induce tumor cell apoptosis dose-dependently (Figures 4A).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"results",
"showed",
"that",
"human",
"γδ-T",
"exosomes",
"could",
"induce",
"tumor",
"cell",
"apoptosis",
"dose-dependently",
"(",
"Figures",
"4A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11476666
|
In addition, extending the treatment duration beyond 24 h could provide complementary information regarding the longer term effects of the stilbenes on these cancer traits.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"extending",
"the",
"treatment",
"duration",
"beyond",
"24",
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"could",
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"complementary",
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"regarding",
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"term",
"effects",
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"the",
"stilbenes",
"on",
"these",
"cancer",
"traits",
"."
]
}
] |
PMC4355729
|
The mRNA expression of PIK3R1 was significantly decreased in 786 and A-704 mutated cells compared with 786-O and A-704 WT cells (Fig. 2b).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"mRNA",
"expression",
"of",
"PIK3R1",
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"decreased",
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"786",
"and",
"A-704",
"mutated",
"cells",
"compared",
"with",
"786-O",
"and",
"A-704",
"WT",
"cells",
"(",
"Fig.",
"2b",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
U. Keller, G. Heynen, F. Baumgartner, M. Heider, U. Patra, J. Braune, P. Mertins, S. Müller, F. Bassermann, J. Krönke, M. Wirth Hematology, Oncology and Cancer Immunology, Charite - Universitätsmedizin Berlin, Berlin; Medicine III, Technische Universität München, Munich; Biochemistry II, Goethe Universität Frankfurt, Frankfurt; Proteomics Core, Max-Delbrück Center for Molecular Medicine, Berlin, Germany Background: Multiple myeloma (MM) is a genetically and clinically heterogeneous neoplastic plasma cell disorder.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"U.",
"Keller",
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"F.",
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"M.",
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",",
"U.",
"Patra",
",",
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",",
"P.",
"Mertins",
",",
"S.",
"Müller",
",",
"F.",
"Bassermann",
",",
"J.",
"Krönke",
",",
"M.",
"Wirth",
"Hematology",
",",
"Oncology",
"and",
"Cancer",
"Immunology",
",",
"Charite",
"-",
"Universitätsmedizin",
"Berlin",
",",
"Berlin",
";",
"Medicine",
"III",
",",
"Technische",
"Universität",
"München",
",",
"Munich",
";",
"Biochemistry",
"II",
",",
"Goethe",
"Universität",
"Frankfurt",
",",
"Frankfurt",
";",
"Proteomics",
"Core",
",",
"Max-Delbrück",
"Center",
"for",
"Molecular",
"Medicine",
",",
"Berlin",
",",
"Germany",
"Background",
":",
"Multiple",
"myeloma",
"(",
"MM",
")",
"is",
"a",
"genetically",
"and",
"clinically",
"heterogeneous",
"neoplastic",
"plasma",
"cell",
"disorder",
"."
]
}
] |
PMC11476106
|
Subjective observation revealed that at 2 weeks of culture, in approximately 95% of clusters of the A673 cell line grown in HGs without and with added VN, the cells displayed large nuclei with varying hematoxylin intensity and evident cytoplasm (medium to high eosinophilic), with reduced intercellular spaces (Figure 3A,B).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Subjective",
"observation",
"revealed",
"that",
"at",
"2",
"weeks",
"of",
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",",
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"approximately",
"95",
"%",
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"clusters",
"of",
"the",
"A673",
"cell",
"line",
"grown",
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"HGs",
"without",
"and",
"with",
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"VN",
",",
"the",
"cells",
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"large",
"nuclei",
"with",
"varying",
"hematoxylin",
"intensity",
"and",
"evident",
"cytoplasm",
"(",
"medium",
"to",
"high",
"eosinophilic",
")",
",",
"with",
"reduced",
"intercellular",
"spaces",
"(",
"Figure",
"3A",
",",
"B",
")",
"."
]
}
] |
PMC11768927
|
They attributed this constitutive activation to the expression of CHD1 and MAP3k7, two tumor-suppressor genes, which when silenced, allowed for permissive VSV-M51R infection and efficient production of viral progeny.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"They",
"attributed",
"this",
"constitutive",
"activation",
"to",
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"expression",
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",",
"two",
"tumor-suppressor",
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",",
"which",
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"silenced",
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"allowed",
"for",
"permissive",
"VSV-M51R",
"infection",
"and",
"efficient",
"production",
"of",
"viral",
"progeny",
"."
]
}
] |
PMC11248911
|
for C12H15N3S (233.33): C, 61.77; H, 6.48; N, 18.01; S, 13.74.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"C12H15N3S",
"(",
"233.33",
"):",
"C",
",",
"61.77",
";",
"H",
",",
"6.48",
";",
"N",
",",
"18.01",
";",
"S",
",",
"13.74",
"."
]
}
] |
PMC11694066
|
The median response of replicates was normalized per median marginal value (i.e., response in the absence of treatment).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"median",
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"of",
"replicates",
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"normalized",
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"median",
"marginal",
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"i.e.",
",",
"response",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"treatment",
")",
"."
]
}
] |
PMC10969097
|
Another significant limitation of this study is that although all the included studies described the combined use of mushroom extracts with chemotherapeutic agents as synergistic or potentiating, none of them carried out a comprehensive analysis of inhibitory concentrations.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Another",
"significant",
"limitation",
"of",
"this",
"study",
"is",
"that",
"although",
"all",
"the",
"included",
"studies",
"described",
"the",
"combined",
"use",
"of",
"mushroom",
"extracts",
"with",
"chemotherapeutic",
"agents",
"as",
"synergistic",
"or",
"potentiating",
",",
"none",
"of",
"them",
"carried",
"out",
"a",
"comprehensive",
"analysis",
"of",
"inhibitory",
"concentrations",
"."
]
}
] |
PMC11400680
|
In cellular structure segmentations proposed by (24), the use of box prompts was found while in (25) mask prompts were used.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"cellular",
"structure",
"segmentations",
"proposed",
"by",
"(",
"24",
")",
",",
"the",
"use",
"of",
"box",
"prompts",
"was",
"found",
"while",
"in",
"(",
"25",
")",
"mask",
"prompts",
"were",
"used",
"."
]
}
] |
PMC11361748
|
The cDNA obtained was subjected to qRT-PCR using the itaq Universal SYBR green kit (Bio-Rad, #1725122) and the CFX 96 Real-Time System (Bio-Rad).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"cDNA",
"obtained",
"was",
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"using",
"the",
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"Universal",
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"green",
"kit",
"(",
"Bio-Rad",
",",
"#",
"1725122",
")",
"and",
"the",
"CFX",
"96",
"Real-Time",
"System",
"(",
"Bio-Rad",
")",
"."
]
}
] |
PMC6442998
|
We previously identified phosphodiesterase 3A (PDE3A) as a potential therapeutic target expressed in most GIST.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"tokens": [
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"phosphodiesterase",
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")",
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"potential",
"therapeutic",
"target",
"expressed",
"in",
"most",
"GIST",
"."
]
}
] |
PMC11012313
|
In this study, the mTOR-dependent increases in HIF-1α were dependent on increases in HIF-1α RNA levels and required the activity of the transcription factor STAT3 .
|
[
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"O",
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"tokens": [
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"this",
"study",
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"the",
"mTOR-dependent",
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"HIF-1α",
"were",
"dependent",
"on",
"increases",
"in",
"HIF-1α",
"RNA",
"levels",
"and",
"required",
"the",
"activity",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"STAT3",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The study-safety profile was consistent with previous BTK inhibitor clinical trial data.
|
[
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"O",
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"O",
"O"
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"tokens": [
"The",
"study-safety",
"profile",
"was",
"consistent",
"with",
"previous",
"BTK",
"inhibitor",
"clinical",
"trial",
"data",
"."
]
}
] |
PMC11295144
|
Two functionally distinct GABAAR subtypes, the synaptic type α2β2γ2-GABAARs versus extrasynaptic type α4β3δ-GABAARs were expressed in HEK293 cells alone or together with NL2 and co-cultured with striatal GABAergic medium spiny neurons to enable innervation of HEK293 cells by GABAergic axons.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Two",
"functionally",
"distinct",
"GABAAR",
"subtypes",
",",
"the",
"synaptic",
"type",
"α2β2γ2-GABAARs",
"versus",
"extrasynaptic",
"type",
"α4β3δ-GABAARs",
"were",
"expressed",
"in",
"HEK293",
"cells",
"alone",
"or",
"together",
"with",
"NL2",
"and",
"co-cultured",
"with",
"striatal",
"GABAergic",
"medium",
"spiny",
"neurons",
"to",
"enable",
"innervation",
"of",
"HEK293",
"cells",
"by",
"GABAergic",
"axons",
"."
]
}
] |
PMC10820104
|
The Structure solution was conducted using SHELXT 2014/4 .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"Structure",
"solution",
"was",
"conducted",
"using",
"SHELXT",
"2014/4",
"."
]
}
] |
PMC10812665
|
For the transcriptomics experiment and ATP analysis, cells differentiated for 48 h (day 2, d2) were re-seeded into 96-well plates at a density of 200,000 cells/cm in DM.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"the",
"transcriptomics",
"experiment",
"and",
"ATP",
"analysis",
",",
"cells",
"differentiated",
"for",
"48",
"h",
"(",
"day",
"2",
",",
"d2",
")",
"were",
"re-seeded",
"into",
"96-well",
"plates",
"at",
"a",
"density",
"of",
"200,000",
"cells/cm",
"in",
"DM",
"."
]
}
] |
PMC9780037
|
Nevertheless, they prove the possibility of designing and building a vast array of highly sensitive cyt c detection systems.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Nevertheless",
",",
"they",
"prove",
"the",
"possibility",
"of",
"designing",
"and",
"building",
"a",
"vast",
"array",
"of",
"highly",
"sensitive",
"cyt",
"c",
"detection",
"systems",
"."
]
}
] |
PMC11673128
|
Nevertheless, resistance to lorlatinib also developed, partly caused by off-target mechanisms, i.e., by processes bypassing ALK dependency .
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Nevertheless",
",",
"resistance",
"to",
"lorlatinib",
"also",
"developed",
",",
"partly",
"caused",
"by",
"off-target",
"mechanisms",
",",
"i.e.",
",",
"by",
"processes",
"bypassing",
"ALK",
"dependency",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Patients with more than one bleeding manifestation were shown with lower BDNF levels (serum BDNF ng/ml mean ± SD in >1 vs. ≤ 1 positive bleeding history; 7.66 ± 3.21 vs. 10.98 ± 4.0 p=0.03), albeit similar platelets numbers (171 ± 97.56 vs. 183 ± 57.85, p=N.S).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Patients",
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"than",
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"bleeding",
"manifestation",
"were",
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"(",
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">",
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"vs.",
"≤",
"1",
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"bleeding",
"history",
";",
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"±",
"3.21",
"vs.",
"10.98",
"±",
"4.0",
"p=0.03",
")",
",",
"albeit",
"similar",
"platelets",
"numbers",
"(",
"171",
"±",
"97.56",
"vs.",
"183",
"±",
"57.85",
",",
"p",
"=",
"N.S",
")",
"."
]
}
] |
PMC11138140
|
A major advantage of the Holomonitor M4 is that it utilizes a low-power 635 nm laser, which minimizes phototoxicity, making the instrument ideal for long-duration live-cell imaging .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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",",
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",",
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"the",
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"live-cell",
"imaging",
"."
]
}
] |
PMC11291490
|
Scale bars, 40 μm.
|
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"Scale",
"bars",
",",
"40",
"μm",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
K. Rejeski, O. Albanyan, G. Iacoboni, V. Bücklein, V. Blumenberg, O. Penack, W. Bethge, S. Völkl, A. Perez, C. Carpio, C. Schmidt, N. Müller, K. Reid, R. Faramand, M. Davila, L. Bullinger, F. Locke, M. von Bergwelt-Baildon, A. Mackensen, P. Barba, M. Jain, M. Subklewe Department of Medicine III - Hematology/Oncology, LMU University Hospital; Laboratory for Translational Cancer Immunology, LMU Gene Center, Munich; German Cancer Consortium (DKTK), Munich Site, and German Cancer Research Center, Heidelberg, Germany; Department of Blood and Marrow Transplant and Cellular Immunotherapy, Moffitt Cancer Center, Tampa, United States of America; Department of Hematology, University Hospital Vall d’Hebron, Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona; Department of Medicine, Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Spain; Department of Hematology, Oncology and Tumorimmunology, Charité Universitätsmedizin Berlin, Berlin; Department of Hematology, Oncology, Immunology and Rheumatology, University Hospital Tübingen, Tübingen; Department of Internal Medicine 5, Hematology and Oncology, University of Erlangen-Nuremberg, Erlangen, Germany; Blood & Marrow Transplant Program, Miami Cancer Institute, Miami, United States of America Background: Real-world evidence has underlined the role of hematological toxicity and infections in driving the toxicity burden of CD19 CAR-T. We have recently developed a classification system for post-CAR-T hematotoxicity, identifying three unique phenotypes of neutrophil recovery (Rejeski et al Blood 2021).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"K.",
"Rejeski",
",",
"O.",
"Albanyan",
",",
"G.",
"Iacoboni",
",",
"V.",
"Bücklein",
",",
"V.",
"Blumenberg",
",",
"O.",
"Penack",
",",
"W.",
"Bethge",
",",
"S.",
"Völkl",
",",
"A.",
"Perez",
",",
"C.",
"Carpio",
",",
"C.",
"Schmidt",
",",
"N.",
"Müller",
",",
"K.",
"Reid",
",",
"R.",
"Faramand",
",",
"M.",
"Davila",
",",
"L.",
"Bullinger",
",",
"F.",
"Locke",
",",
"M.",
"von",
"Bergwelt-Baildon",
",",
"A.",
"Mackensen",
",",
"P.",
"Barba",
",",
"M.",
"Jain",
",",
"M.",
"Subklewe",
"Department",
"of",
"Medicine",
"III",
"-",
"Hematology/Oncology",
",",
"LMU",
"University",
"Hospital",
";",
"Laboratory",
"for",
"Translational",
"Cancer",
"Immunology",
",",
"LMU",
"Gene",
"Center",
",",
"Munich",
";",
"German",
"Cancer",
"Consortium",
"(",
"DKTK",
")",
",",
"Munich",
"Site",
",",
"and",
"German",
"Cancer",
"Research",
"Center",
",",
"Heidelberg",
",",
"Germany",
";",
"Department",
"of",
"Blood",
"and",
"Marrow",
"Transplant",
"and",
"Cellular",
"Immunotherapy",
",",
"Moffitt",
"Cancer",
"Center",
",",
"Tampa",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"University",
"Hospital",
"Vall",
"d’Hebron",
",",
"Vall",
"d’Hebron",
"Institute",
"of",
"Oncology",
"(",
"VHIO",
")",
",",
"Barcelona",
";",
"Department",
"of",
"Medicine",
",",
"Universitat",
"Autònoma",
"de",
"Barcelona",
",",
"Bellaterra",
",",
"Spain",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Oncology",
"and",
"Tumorimmunology",
",",
"Charité",
"Universitätsmedizin",
"Berlin",
",",
"Berlin",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Oncology",
",",
"Immunology",
"and",
"Rheumatology",
",",
"University",
"Hospital",
"Tübingen",
",",
"Tübingen",
";",
"Department",
"of",
"Internal",
"Medicine",
"5",
",",
"Hematology",
"and",
"Oncology",
",",
"University",
"of",
"Erlangen-Nuremberg",
",",
"Erlangen",
",",
"Germany",
";",
"Blood",
"&",
"Marrow",
"Transplant",
"Program",
",",
"Miami",
"Cancer",
"Institute",
",",
"Miami",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
"Background",
":",
"Real-world",
"evidence",
"has",
"underlined",
"the",
"role",
"of",
"hematological",
"toxicity",
"and",
"infections",
"in",
"driving",
"the",
"toxicity",
"burden",
"of",
"CD19",
"CAR-T.",
"We",
"have",
"recently",
"developed",
"a",
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"system",
"for",
"post-CAR-T",
"hematotoxicity",
",",
"identifying",
"three",
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"recovery",
"(",
"Rejeski",
"et",
"al",
"Blood",
"2021",
")",
"."
]
}
] |
PMC11769522
|
Therefore, the effects of IL-4 and IL-13 supplementation on other cytokines or epidermal barrier formation by canine keratinocytes need to be elucidated.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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",",
"the",
"effects",
"of",
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"and",
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"supplementation",
"on",
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"or",
"epidermal",
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"canine",
"keratinocytes",
"need",
"to",
"be",
"elucidated",
"."
]
}
] |
PMC10809689
|
Thus, the more glutamine is used by the cell, the more NH4 + will be released.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Thus",
",",
"the",
"more",
"glutamine",
"is",
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"by",
"the",
"cell",
",",
"the",
"more",
"NH4",
"+",
"will",
"be",
"released",
"."
]
}
] |
PMC8996378
|
Among all these compounds, compound 30 was the most active inhibitor in ABCB1-overexpressing human K562/R7 leukemic cells, which was almost two-fold more efficient (183 ± 17% at 5 µM) than cyclosporin A, which was taken here as reference (100%) (Corea et al., 2003).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Among",
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"almost",
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"183",
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"%",
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")",
"than",
"cyclosporin",
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",",
"which",
"was",
"taken",
"here",
"as",
"reference",
"(",
"100",
"%",
")",
"(",
"Corea",
"et",
"al.",
",",
"2003",
")",
"."
]
}
] |
PMC9878278
|
The data suggest that the two TGF-β superfamily members TGF-β1 and Activin A do not respond to ZIKV infection of SC and do not play a role in modulating ZIKV replication and antiviral immunity.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
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"that",
"the",
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"not",
"respond",
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"of",
"SC",
"and",
"do",
"not",
"play",
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"in",
"modulating",
"ZIKV",
"replication",
"and",
"antiviral",
"immunity",
"."
]
}
] |
PMC11449273
|
Nuclear NPM localization/levels have been associated with decreased tumorigenic properties in vitro–specifically decreased growth of mutant p53-expressing cells .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Nuclear",
"NPM",
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"have",
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"with",
"decreased",
"tumorigenic",
"properties",
"in",
"vitro",
"–",
"specifically",
"decreased",
"growth",
"of",
"mutant",
"p53-expressing",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11519567
|
However, it remains unclear whether there are differences in biological functions and physical properties between the condensates formed by SS18 and SS18-SSX.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"it",
"remains",
"unclear",
"whether",
"there",
"are",
"differences",
"in",
"biological",
"functions",
"and",
"physical",
"properties",
"between",
"the",
"condensates",
"formed",
"by",
"SS18",
"and",
"SS18-SSX",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Previous studies indicated a substantial role of the BH3 family in PI resistance and in response to PI.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Previous",
"studies",
"indicated",
"a",
"substantial",
"role",
"of",
"the",
"BH3",
"family",
"in",
"PI",
"resistance",
"and",
"in",
"response",
"to",
"PI",
"."
]
}
] |
PMC11618052
|
LC-MS (m/z) for: C19H16ClN5OS (exact mass = 397.08); calculated [M + H]: 398.08; found [M + H]: 398.00.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"LC-MS",
"(",
"m/z",
")",
"for",
":",
"C19H16ClN5OS",
"(",
"exact",
"mass",
"=",
"397.08",
")",
";",
"calculated",
"[",
"M",
"+",
"H",
"]",
":",
"398.08",
";",
"found",
"[",
"M",
"+",
"H",
"]",
":",
"398.00",
"."
]
}
] |
PMC11739670
|
CD8 is displayed as an orange cartoon and HLA is displayed as a green cartoon.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CD8",
"is",
"displayed",
"as",
"an",
"orange",
"cartoon",
"and",
"HLA",
"is",
"displayed",
"as",
"a",
"green",
"cartoon",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
We validated this finding with western blots and could also show that cPCMDT1-KD led to an increase in the phosphorylation of the ATM, ATR, CHK1, DNA-PK and RPA32 proteins.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"validated",
"this",
"finding",
"with",
"western",
"blots",
"and",
"could",
"also",
"show",
"that",
"cPCMDT1-KD",
"led",
"to",
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"the",
"phosphorylation",
"of",
"the",
"ATM",
",",
"ATR",
",",
"CHK1",
",",
"DNA-PK",
"and",
"RPA32",
"proteins",
"."
]
}
] |
PMC11700165
|
The TEL-SYK and Δ-TEL-SYK were kind gifts of Dr. Akihiro Abe, Nagoya University School of Medicine, Japan.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"TEL-SYK",
"and",
"Δ-TEL-SYK",
"were",
"kind",
"gifts",
"of",
"Dr.",
"Akihiro",
"Abe",
",",
"Nagoya",
"University",
"School",
"of",
"Medicine",
",",
"Japan",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The intravascular coagulation may disseminate and cause a variety of severe and potentially fatal clinical manifestations including major bleedings and thromboembolic events.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"intravascular",
"coagulation",
"may",
"disseminate",
"and",
"cause",
"a",
"variety",
"of",
"severe",
"and",
"potentially",
"fatal",
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"manifestations",
"including",
"major",
"bleedings",
"and",
"thromboembolic",
"events",
"."
]
}
] |
PMC9504875
|
hPIV-2 V protein has been reported to bind to MDA5 and LGP2 .
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"V",
"protein",
"has",
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"to",
"bind",
"to",
"MDA5",
"and",
"LGP2",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Our pilot results on childhood T-ALL patient samples (n=7) revealed potential targets for minimal residual disease monitoring.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"pilot",
"results",
"on",
"childhood",
"T-ALL",
"patient",
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"(",
"n=7",
")",
"revealed",
"potential",
"targets",
"for",
"minimal",
"residual",
"disease",
"monitoring",
"."
]
}
] |
PMC11674891
|
GRPR knockdown significantly inhibited lung cancer cell invasion (Figure 2e), while no changes were observed in cell proliferation following GRPR depletion (Figure 2f).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O"
],
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",",
"while",
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"were",
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"following",
"GRPR",
"depletion",
"(",
"Figure",
"2f",
")",
"."
]
}
] |
PMC11750161
|
In inactivating mutants (eel LH/CGR-D417N and Y558F), the cyclic adenosine monophosphate (cAMP) response did not result in completely impaired signal transduction.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"cAMP",
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"not",
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"in",
"completely",
"impaired",
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"transduction",
"."
]
}
] |
PMC10919056
|
When gap junctions are blocked, humoral and CD8+ T-cell immune responses are inhibited or even eliminated (38).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"or",
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"eliminated",
"(",
"38",
")",
"."
]
}
] |
PMC3813807
|
The firefly luciferase activity of the cells that were transfected with miRNA mimics was represented as the percentage activity relative to that of the cells that were transfected with negative control miRNA mimics.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"activity",
"relative",
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"that",
"of",
"the",
"cells",
"that",
"were",
"transfected",
"with",
"negative",
"control",
"miRNA",
"mimics",
"."
]
}
] |
PMC11534035
|
High expression of PAI1 has been linked to poorer prognosis and patient outcomes (17).
|
[
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
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"been",
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"prognosis",
"and",
"patient",
"outcomes",
"(",
"17",
")",
"."
]
}
] |
PMC11271278
|
We first developed an analysis method, Highly Active Promoter Interactions (HAPI), that utilizes H3K27ac HiChIP data to quantify all enhancer interactions of each gene’s promoter in the genome, including intra- and inter-chromosomal interactions.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"first",
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"an",
"analysis",
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",",
"that",
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"of",
"each",
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"promoter",
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"the",
"genome",
",",
"including",
"intra-",
"and",
"inter-chromosomal",
"interactions",
"."
]
}
] |
PMC8389560
|
Real-time qPCRs were performed in a 25 µL reaction mixture containing SYBR Green I PCR Master Mix (Evrogene, Russia) and 300 nM of the appropriate primers (Table 1).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"reaction",
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"containing",
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",",
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")",
"and",
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"the",
"appropriate",
"primers",
"(",
"Table",
"1",
")",
"."
]
}
] |
PMC10808409
|
Model terms with p < 0.05 were considered statistically significant.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"Model",
"terms",
"with",
"p",
"<",
"0.05",
"were",
"considered",
"statistically",
"significant",
"."
]
}
] |
PMC11640115
|
Differences in the ORR between groups were analyzed using the Chi-square test.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"between",
"groups",
"were",
"analyzed",
"using",
"the",
"Chi-square",
"test",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Non-ABL1 mutations were found in 22/66 patients (33%), with 5 (8%) of pts with at least 2 mutations.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
],
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"%",
")",
"of",
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"."
]
}
] |
PMC11684821
|
A recent prepublication claimed that MR1 allomorphs drive the specificity of MR1-restricted TCRs and asserted that the MC.7.G5 TCR only responded to targets expressing MR1*04 (29).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"tokens": [
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"MC.7.G5",
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"expressing",
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"*",
"04",
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")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
By the CCO, 423 deaths occurred.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"."
]
}
] |
PMC9429973
|
In age subgroups, the estimated HR for OS for DEC vs IC was 1.34 (99% CI: 0.79-2.28) for pts aged 60-64, 1.14 (99% CI: 0.77-1.69) for pts aged 65-69, and 0.84 (99% CI: 0.55-1.26) for pts aged ≥70 yrs (p-value for trend: 0.058).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"pts",
"aged",
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"-",
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"(",
"99",
"%",
"CI",
":",
"0.77",
"-",
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")",
"for",
"pts",
"aged",
"65",
"-",
"69",
",",
"and",
"0.84",
"(",
"99",
"%",
"CI",
":",
"0.55",
"-",
"1.26",
")",
"for",
"pts",
"aged",
"≥70",
"yrs",
"(",
"p-value",
"for",
"trend",
":",
"0.058",
")",
"."
]
}
] |
PMC11676169
|
We have recently reported that BCAT1 was overexpressed in a subgroup of T-cell acute lymphoblastic (T-ALL) samples, especially those with NOTCH1 activating mutations.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"have",
"recently",
"reported",
"that",
"BCAT1",
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"T-cell",
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")",
"samples",
",",
"especially",
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"with",
"NOTCH1",
"activating",
"mutations",
"."
]
}
] |
PMC9841531
|
In addition, 8 demonstrated electrostatic π–cation as well as hydrophobic π–alkyl interaction with Lys38 in close proximity to Tyr34 and Leu66.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"8",
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"electrostatic",
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"cation",
"as",
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"π",
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"close",
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"Tyr34",
"and",
"Leu66",
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]
}
] |
PMC11476004
|
Cancer is diagnosed most often in dogs eight years old and older and is the cause of their deaths .
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"is",
"the",
"cause",
"of",
"their",
"deaths",
"."
]
}
] |
PMC10142392
|
Nanoparticles are submicron-sized structures that allow for the controlled release of drugs within the body, thus offering protection against non-specific interactions and enzymatic degradation.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"controlled",
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"of",
"drugs",
"within",
"the",
"body",
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"thus",
"offering",
"protection",
"against",
"non-specific",
"interactions",
"and",
"enzymatic",
"degradation",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.