PMCID
string | Sentences
string | ner
list |
|---|---|---|
PMC11618052
|
LC-MS (m/z) for: C21H19N5O2S (exact mass = 405.13); calculated [M + H]: 406.13; found [M + H]: 406.10.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"LC-MS",
"(",
"m/z",
")",
"for",
":",
"C21H19N5O2S",
"(",
"exact",
"mass",
"=",
"405.13",
")",
";",
"calculated",
"[",
"M",
"+",
"H",
"]",
":",
"406.13",
";",
"found",
"[",
"M",
"+",
"H",
"]",
":",
"406.10",
"."
]
}
] |
PMC11656380
|
Cells (5 × 10 cells/well) were seeded in a 4-well glass bottom dish.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"(",
"5",
"×",
"10",
"cells/well",
")",
"were",
"seeded",
"in",
"a",
"4-well",
"glass",
"bottom",
"dish",
"."
]
}
] |
PMC7841067
|
However, its expression pattern and function in human thyroid cancer remain obscure.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"its",
"expression",
"pattern",
"and",
"function",
"in",
"human",
"thyroid",
"cancer",
"remain",
"obscure",
"."
]
}
] |
PMC10079526
|
SUMOs can be conjugated and removed from target proteins in a dynamic manner.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"SUMOs",
"can",
"be",
"conjugated",
"and",
"removed",
"from",
"target",
"proteins",
"in",
"a",
"dynamic",
"manner",
"."
]
}
] |
PMC10421378
|
To evaluate the viability of probiotic cells, the most commonly used method is pour plate counts.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"evaluate",
"the",
"viability",
"of",
"probiotic",
"cells",
",",
"the",
"most",
"commonly",
"used",
"method",
"is",
"pour",
"plate",
"counts",
"."
]
}
] |
PMC11607638
|
SKR mRNA level after SK and SKR gene knockdown. ****
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"SKR",
"mRNA",
"level",
"after",
"SK",
"and",
"SKR",
"gene",
"knockdown",
".",
"*",
"*",
"*",
"*"
]
}
] |
PMC11451940
|
Moreover, complexes 1, 2 and 5 also showed significant effects in the MCF-7, PC-3, A549 and HOS cells, with IC50 ≈ 1–6 μM. All these complexes are also considerably more active than the free HLap ligand and the reference drug cisplatin.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"complexes",
"1",
",",
"2",
"and",
"5",
"also",
"showed",
"significant",
"effects",
"in",
"the",
"MCF-7",
",",
"PC-3",
",",
"A549",
"and",
"HOS",
"cells",
",",
"with",
"IC50",
"≈",
"1–6",
"μM.",
"All",
"these",
"complexes",
"are",
"also",
"considerably",
"more",
"active",
"than",
"the",
"free",
"HLap",
"ligand",
"and",
"the",
"reference",
"drug",
"cisplatin",
"."
]
}
] |
PMC5261804
|
Top PPIs included JAK1-AKT, JAK1-PIK3R1, SRC-AKT1, and PIK3R1-AKT1 (FDR(BH) = 2.13e-4)).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Top",
"PPIs",
"included",
"JAK1-AKT",
",",
"JAK1-PIK3R1",
",",
"SRC-AKT1",
",",
"and",
"PIK3R1-AKT1",
"(",
"FDR(BH",
")",
"=",
"2.13e-4",
")",
")",
"."
]
}
] |
PMC10587429
|
Immunofluorescent staining of tumor tissues from huNSG-SGM3 and NSG-SGM3 mice.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Immunofluorescent",
"staining",
"of",
"tumor",
"tissues",
"from",
"huNSG-SGM3",
"and",
"NSG-SGM3",
"mice",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
36(54%) pts were > 60 yrs at diagnosis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"36(54",
"%",
")",
"pts",
"were",
">",
"60",
"yrs",
"at",
"diagnosis",
"."
]
}
] |
PMC11742047
|
From then, 304 and 160 lipids were putatively annotated in the positive and negative ionization ESI modes, respectively.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"From",
"then",
",",
"304",
"and",
"160",
"lipids",
"were",
"putatively",
"annotated",
"in",
"the",
"positive",
"and",
"negative",
"ionization",
"ESI",
"modes",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC7759933
|
In addition to metabolic activity, we noticed an important change in cell proliferation at day 7 with a slight increase in cell death, which turned out to be significant after 10 days of cultivation.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
"to",
"metabolic",
"activity",
",",
"we",
"noticed",
"an",
"important",
"change",
"in",
"cell",
"proliferation",
"at",
"day",
"7",
"with",
"a",
"slight",
"increase",
"in",
"cell",
"death",
",",
"which",
"turned",
"out",
"to",
"be",
"significant",
"after",
"10",
"days",
"of",
"cultivation",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Despite their proven efficacy in the control of intravascular hemolysis (IVH), up to 72% of patients experience persistent hemolysis leading to suboptimal hemoglobin (Hb) levels and 36% require transfusions despite ECU treatment which results in a significant impact on the quality of life (QoL), including persistent fatigue.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Despite",
"their",
"proven",
"efficacy",
"in",
"the",
"control",
"of",
"intravascular",
"hemolysis",
"(",
"IVH",
")",
",",
"up",
"to",
"72",
"%",
"of",
"patients",
"experience",
"persistent",
"hemolysis",
"leading",
"to",
"suboptimal",
"hemoglobin",
"(",
"Hb",
")",
"levels",
"and",
"36",
"%",
"require",
"transfusions",
"despite",
"ECU",
"treatment",
"which",
"results",
"in",
"a",
"significant",
"impact",
"on",
"the",
"quality",
"of",
"life",
"(",
"QoL",
")",
",",
"including",
"persistent",
"fatigue",
"."
]
}
] |
PMC11770746
|
Once the fiber bends, the force applied is the maximum, making the repetitions reproducible.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Once",
"the",
"fiber",
"bends",
",",
"the",
"force",
"applied",
"is",
"the",
"maximum",
",",
"making",
"the",
"repetitions",
"reproducible",
"."
]
}
] |
PMC11792888
|
Our findings support a model in which scorpion venom causes caspase-independent apoptotic cell death, likely due to a p53-resistant phenotype and mitochondrial-dependent.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"findings",
"support",
"a",
"model",
"in",
"which",
"scorpion",
"venom",
"causes",
"caspase-independent",
"apoptotic",
"cell",
"death",
",",
"likely",
"due",
"to",
"a",
"p53-resistant",
"phenotype",
"and",
"mitochondrial-dependent",
"."
]
}
] |
PMC11666785
|
A video comparing SMLM and corrSMLM is shown in Supplementary Video 2, and reconstructed images for varying blinking times are shown in Supplementary Note 2.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"video",
"comparing",
"SMLM",
"and",
"corrSMLM",
"is",
"shown",
"in",
"Supplementary",
"Video",
"2",
",",
"and",
"reconstructed",
"images",
"for",
"varying",
"blinking",
"times",
"are",
"shown",
"in",
"Supplementary",
"Note",
"2",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
A. R. Mato, J. M. Pagel, C. C. Coombs, N. N. Shah, N. Lamanna, T. Munir, E. Lech-Maranda, T. A. Eyre, J. A. Woyach, W. G. Wierda, C. Y. Cheah, J. B. Cohen, L. E. Roeker, M. R. Patel, B. Fakhri, M. A. Barve, C. Tam, D. Lewis, J. N. Gerson, A. J. Alencar, C. Ujjani, I. Flinn, S. Sundaram, S. Ma, D. Jagadeesh, J. Rhodes, J. Taylor, O. Abdel-Wahab, P. Ghia, S. J. Schuster, D. Wang, B. Nair, E. Zhu, D. E. Tsai, M. S. Davids, J. R. Brown, W. Jurczak Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York; Loxo Oncology at Lilly, Stamford; University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill; Medical College of Wisconsin, Milwaukee; Herbert Irving Comprehensive Cancer Center, Columbia University, New York, United States of America; Haematology, St. James’s University Hospital, Leeds, United Kingdom; Institute of Hematology and Transfusion Medicine, Warsaw, Poland; Oxford University Hospitals NHS Foundation Trust, Churchill Cancer Center, Oxford, United Kingdom; The Ohio State University Comprehensive Cancer Center, Columbus; MD Anderson Cancer Center, Houston, United States of America; Linear Clinical Research and Sir Charles Gairdner Hospital, Perth, Australia; Winship Cancer Institute, Emory University, Atlanta; Florida Cancer Specialists/Sarah Cannon Research Institute, Sarasota; University of California San Francisco, San Francisco; Mary Crowley Cancer Research, Dallas, United States of America; Peter MacCallum Cancer Center, Royal Melbourne Hospital, and University of Melbourne, Melbourne, Australia; Plymouth Hospitals NHS Trust - Derriford Hospital, Plymouth, United Kingdom; Lymphoma Program, Abramson Cancer Center, University of Pennsylvania, Philadelphia; University of Miami Miller School of Medicine, Miami; Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle; Sarah Cannon Research Institute, Nashville; Hematology and Medical Oncology, Tisch Cancer Institute, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York; Robert H. Lurie Comprehensive Cancer Center of Northwestern University, Chicago; Cleveland Clinic, Cleveland; Northwell Health Cancer Institute, Donald and Barbara Zucker School of Medicine at Hofstra/Northwell Health, New Hyde Park, United States of America; Università Vita-Salute San Raffaele and IRCCS Ospedale San Raffaele, Milan, Italy; Dana-Farber Cancer Institute and Harvard Medical School, Boston, United States of America; Maria Sklodowska-Curie National Research Institute of Oncology, Krakow, Poland Background: Covalent BTK inhibitors (BTKi) have transformed the management of chronic lymphocytic leukemia/small lymphocytic lymphoma (CLL/SLL), but many patients (pts) will require additional treatment.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A.",
"R.",
"Mato",
",",
"J.",
"M.",
"Pagel",
",",
"C.",
"C.",
"Coombs",
",",
"N.",
"N.",
"Shah",
",",
"N.",
"Lamanna",
",",
"T.",
"Munir",
",",
"E.",
"Lech-Maranda",
",",
"T.",
"A.",
"Eyre",
",",
"J.",
"A.",
"Woyach",
",",
"W.",
"G.",
"Wierda",
",",
"C.",
"Y.",
"Cheah",
",",
"J.",
"B.",
"Cohen",
",",
"L.",
"E.",
"Roeker",
",",
"M.",
"R.",
"Patel",
",",
"B.",
"Fakhri",
",",
"M.",
"A.",
"Barve",
",",
"C.",
"Tam",
",",
"D.",
"Lewis",
",",
"J.",
"N.",
"Gerson",
",",
"A.",
"J.",
"Alencar",
",",
"C.",
"Ujjani",
",",
"I.",
"Flinn",
",",
"S.",
"Sundaram",
",",
"S.",
"Ma",
",",
"D.",
"Jagadeesh",
",",
"J.",
"Rhodes",
",",
"J.",
"Taylor",
",",
"O.",
"Abdel-Wahab",
",",
"P.",
"Ghia",
",",
"S.",
"J.",
"Schuster",
",",
"D.",
"Wang",
",",
"B.",
"Nair",
",",
"E.",
"Zhu",
",",
"D.",
"E.",
"Tsai",
",",
"M.",
"S.",
"Davids",
",",
"J.",
"R.",
"Brown",
",",
"W.",
"Jurczak",
"Memorial",
"Sloan",
"Kettering",
"Cancer",
"Center",
",",
"New",
"York",
";",
"Loxo",
"Oncology",
"at",
"Lilly",
",",
"Stamford",
";",
"University",
"of",
"North",
"Carolina",
"at",
"Chapel",
"Hill",
",",
"Chapel",
"Hill",
";",
"Medical",
"College",
"of",
"Wisconsin",
",",
"Milwaukee",
";",
"Herbert",
"Irving",
"Comprehensive",
"Cancer",
"Center",
",",
"Columbia",
"University",
",",
"New",
"York",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
";",
"Haematology",
",",
"St.",
"James",
"’s",
"University",
"Hospital",
",",
"Leeds",
",",
"United",
"Kingdom",
";",
"Institute",
"of",
"Hematology",
"and",
"Transfusion",
"Medicine",
",",
"Warsaw",
",",
"Poland",
";",
"Oxford",
"University",
"Hospitals",
"NHS",
"Foundation",
"Trust",
",",
"Churchill",
"Cancer",
"Center",
",",
"Oxford",
",",
"United",
"Kingdom",
";",
"The",
"Ohio",
"State",
"University",
"Comprehensive",
"Cancer",
"Center",
",",
"Columbus",
";",
"MD",
"Anderson",
"Cancer",
"Center",
",",
"Houston",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
";",
"Linear",
"Clinical",
"Research",
"and",
"Sir",
"Charles",
"Gairdner",
"Hospital",
",",
"Perth",
",",
"Australia",
";",
"Winship",
"Cancer",
"Institute",
",",
"Emory",
"University",
",",
"Atlanta",
";",
"Florida",
"Cancer",
"Specialists/Sarah",
"Cannon",
"Research",
"Institute",
",",
"Sarasota",
";",
"University",
"of",
"California",
"San",
"Francisco",
",",
"San",
"Francisco",
";",
"Mary",
"Crowley",
"Cancer",
"Research",
",",
"Dallas",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
";",
"Peter",
"MacCallum",
"Cancer",
"Center",
",",
"Royal",
"Melbourne",
"Hospital",
",",
"and",
"University",
"of",
"Melbourne",
",",
"Melbourne",
",",
"Australia",
";",
"Plymouth",
"Hospitals",
"NHS",
"Trust",
"-",
"Derriford",
"Hospital",
",",
"Plymouth",
",",
"United",
"Kingdom",
";",
"Lymphoma",
"Program",
",",
"Abramson",
"Cancer",
"Center",
",",
"University",
"of",
"Pennsylvania",
",",
"Philadelphia",
";",
"University",
"of",
"Miami",
"Miller",
"School",
"of",
"Medicine",
",",
"Miami",
";",
"Fred",
"Hutchinson",
"Cancer",
"Research",
"Center",
",",
"Seattle",
";",
"Sarah",
"Cannon",
"Research",
"Institute",
",",
"Nashville",
";",
"Hematology",
"and",
"Medical",
"Oncology",
",",
"Tisch",
"Cancer",
"Institute",
",",
"Icahn",
"School",
"of",
"Medicine",
"at",
"Mount",
"Sinai",
",",
"New",
"York",
";",
"Robert",
"H.",
"Lurie",
"Comprehensive",
"Cancer",
"Center",
"of",
"Northwestern",
"University",
",",
"Chicago",
";",
"Cleveland",
"Clinic",
",",
"Cleveland",
";",
"Northwell",
"Health",
"Cancer",
"Institute",
",",
"Donald",
"and",
"Barbara",
"Zucker",
"School",
"of",
"Medicine",
"at",
"Hofstra/Northwell",
"Health",
",",
"New",
"Hyde",
"Park",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
";",
"Università",
"Vita-Salute",
"San",
"Raffaele",
"and",
"IRCCS",
"Ospedale",
"San",
"Raffaele",
",",
"Milan",
",",
"Italy",
";",
"Dana-Farber",
"Cancer",
"Institute",
"and",
"Harvard",
"Medical",
"School",
",",
"Boston",
",",
"United",
"States",
"of",
"America",
";",
"Maria",
"Sklodowska-Curie",
"National",
"Research",
"Institute",
"of",
"Oncology",
",",
"Krakow",
",",
"Poland",
"Background",
":",
"Covalent",
"BTK",
"inhibitors",
"(",
"BTKi",
")",
"have",
"transformed",
"the",
"management",
"of",
"chronic",
"lymphocytic",
"leukemia/small",
"lymphocytic",
"lymphoma",
"(",
"CLL/SLL",
")",
",",
"but",
"many",
"patients",
"(",
"pts",
")",
"will",
"require",
"additional",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC9918897
|
Atypical mitoses and some giant-cell figures were also observed.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Atypical",
"mitoses",
"and",
"some",
"giant-cell",
"figures",
"were",
"also",
"observed",
"."
]
}
] |
PMC11021472
|
Efficient fractionation was validated by WB and RT-qPCR (Supplemental Fig. 2 and 3).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Efficient",
"fractionation",
"was",
"validated",
"by",
"WB",
"and",
"RT-qPCR",
"(",
"Supplemental",
"Fig.",
"2",
"and",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC10874773
|
Possible biosynthetic pathways of seco-prezizaane-type sesquiterpenes.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Possible",
"biosynthetic",
"pathways",
"of",
"seco-prezizaane-type",
"sesquiterpenes",
"."
]
}
] |
PMC6133382
|
Thus, the development of a precision-engineered CHO cell line resulting from CRISPR/Cas9 gene editing is a desirable alternative for HIV vaccine manufacturing.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Thus",
",",
"the",
"development",
"of",
"a",
"precision-engineered",
"CHO",
"cell",
"line",
"resulting",
"from",
"CRISPR/Cas9",
"gene",
"editing",
"is",
"a",
"desirable",
"alternative",
"for",
"HIV",
"vaccine",
"manufacturing",
"."
]
}
] |
PMC11756514
|
Each symbol represents the mean + sd of MBL four, SP-D three, and HSA, two independent experiments, respectively.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Each",
"symbol",
"represents",
"the",
"mean",
"+",
"sd",
"of",
"MBL",
"four",
",",
"SP-D",
"three",
",",
"and",
"HSA",
",",
"two",
"independent",
"experiments",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC10938336
|
Similarly, monocarbonyl curcumin exhibited a noteworthy binding affinity of −6.73 kcal/mol with PARP1, forming hydrogen bond interactions with Lys B126, Lys B3, and Ser B121 residues.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Similarly",
",",
"monocarbonyl",
"curcumin",
"exhibited",
"a",
"noteworthy",
"binding",
"affinity",
"of",
"−6.73",
"kcal/mol",
"with",
"PARP1",
",",
"forming",
"hydrogen",
"bond",
"interactions",
"with",
"Lys",
"B126",
",",
"Lys",
"B3",
",",
"and",
"Ser",
"B121",
"residues",
"."
]
}
] |
PMC11247842
|
Fifty-two significant SNPs for SCS were associated with trans-eQTL (FDR < 0.05) from eight different tissues or cells (adipose, macrophages, muscle, intramuscular muscle, ovary, liver, milk, uterus) for 61 genes from 23 chromosomes.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Fifty-two",
"significant",
"SNPs",
"for",
"SCS",
"were",
"associated",
"with",
"trans-eQTL",
"(",
"FDR",
"<",
"0.05",
")",
"from",
"eight",
"different",
"tissues",
"or",
"cells",
"(",
"adipose",
",",
"macrophages",
",",
"muscle",
",",
"intramuscular",
"muscle",
",",
"ovary",
",",
"liver",
",",
"milk",
",",
"uterus",
")",
"for",
"61",
"genes",
"from",
"23",
"chromosomes",
"."
]
}
] |
PMC11634027
|
Top three panels show blots on total cell lysates expressing the indicated proteins, using the antibodies indicated on the right.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Top",
"three",
"panels",
"show",
"blots",
"on",
"total",
"cell",
"lysates",
"expressing",
"the",
"indicated",
"proteins",
",",
"using",
"the",
"antibodies",
"indicated",
"on",
"the",
"right",
"."
]
}
] |
PMC7812570
|
After washing three times with TBS-Tween 20, the membrane was incubated with IRDye 680LT goat anti-rabbit IgG, IRDye 800CW goat anti-human IgG, or IRDye 680RD goat anti-mouse IgG for 2 h at room temperature.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"washing",
"three",
"times",
"with",
"TBS-Tween",
"20",
",",
"the",
"membrane",
"was",
"incubated",
"with",
"IRDye",
"680LT",
"goat",
"anti-rabbit",
"IgG",
",",
"IRDye",
"800CW",
"goat",
"anti-human",
"IgG",
",",
"or",
"IRDye",
"680RD",
"goat",
"anti-mouse",
"IgG",
"for",
"2",
"h",
"at",
"room",
"temperature",
"."
]
}
] |
PMC11271278
|
HAPI analysis not only defines genes that are highly interactive with enhancers but also determines the location of their enhancers.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"HAPI",
"analysis",
"not",
"only",
"defines",
"genes",
"that",
"are",
"highly",
"interactive",
"with",
"enhancers",
"but",
"also",
"determines",
"the",
"location",
"of",
"their",
"enhancers",
"."
]
}
] |
PMC11599565
|
The triad of phenotype, transcriptome and protein expression in mesoderm-derived ovarian carcinoma cells undergoes a neuronal-like differentiation upon cisplatin exposure.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"triad",
"of",
"phenotype",
",",
"transcriptome",
"and",
"protein",
"expression",
"in",
"mesoderm-derived",
"ovarian",
"carcinoma",
"cells",
"undergoes",
"a",
"neuronal-like",
"differentiation",
"upon",
"cisplatin",
"exposure",
"."
]
}
] |
PMC9351137
|
Yokoyama highlighted the moonlighting function of a number of chromatin-binding proteins as mitotic microtubules regulators .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Yokoyama",
"highlighted",
"the",
"moonlighting",
"function",
"of",
"a",
"number",
"of",
"chromatin-binding",
"proteins",
"as",
"mitotic",
"microtubules",
"regulators",
"."
]
}
] |
PMC11742047
|
The role of CL in the framework of activation of the apoptotic process is double.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"role",
"of",
"CL",
"in",
"the",
"framework",
"of",
"activation",
"of",
"the",
"apoptotic",
"process",
"is",
"double",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Grade ≥3 TEAEs of special interest included hypertension (8%), infection (8%), atrial fibrillation or flutter (2%), neutropenia (2%), and second primary malignancy (2%).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Grade",
"≥3",
"TEAEs",
"of",
"special",
"interest",
"included",
"hypertension",
"(",
"8",
"%",
")",
",",
"infection",
"(",
"8",
"%",
")",
",",
"atrial",
"fibrillation",
"or",
"flutter",
"(",
"2",
"%",
")",
",",
"neutropenia",
"(",
"2",
"%",
")",
",",
"and",
"second",
"primary",
"malignancy",
"(",
"2",
"%",
")",
"."
]
}
] |
PMC11594074
|
DNA methylation is the transfer of a methyl group from S-adenosyl-L-methionine (SAM) to the carbon atom on position 5 of a cytosine residue in a CpG dinucleotide, forming 5-methylcytosine .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"DNA",
"methylation",
"is",
"the",
"transfer",
"of",
"a",
"methyl",
"group",
"from",
"S-adenosyl-L-methionine",
"(",
"SAM",
")",
"to",
"the",
"carbon",
"atom",
"on",
"position",
"5",
"of",
"a",
"cytosine",
"residue",
"in",
"a",
"CpG",
"dinucleotide",
",",
"forming",
"5-methylcytosine",
"."
]
}
] |
PMC11352746
|
Primary neuronal cultures are derived directly from neural tissues in the brain and spinal cord.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Primary",
"neuronal",
"cultures",
"are",
"derived",
"directly",
"from",
"neural",
"tissues",
"in",
"the",
"brain",
"and",
"spinal",
"cord",
"."
]
}
] |
PMC11420784
|
To confirm that PldA suppresses the activation of autophagy, 5637 cells and BALB/c mice were pretreated with 3-MA, and the amount of LC3-II in 5637 cells and mouse bladders infected with WT, ΔpldA, or ΔpldA+ was assayed.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"confirm",
"that",
"PldA",
"suppresses",
"the",
"activation",
"of",
"autophagy",
",",
"5637",
"cells",
"and",
"BALB/c",
"mice",
"were",
"pretreated",
"with",
"3-MA",
",",
"and",
"the",
"amount",
"of",
"LC3-II",
"in",
"5637",
"cells",
"and",
"mouse",
"bladders",
"infected",
"with",
"WT",
",",
"ΔpldA",
",",
"or",
"ΔpldA+",
"was",
"assayed",
"."
]
}
] |
PMC11637276
|
Indeed, down-regulation of MAP3K1 significantly reduced invasion of MDA-MB-231 cells in 3D culture systems (Fig 6B and 6C).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Indeed",
",",
"down-regulation",
"of",
"MAP3K1",
"significantly",
"reduced",
"invasion",
"of",
"MDA-MB-231",
"cells",
"in",
"3D",
"culture",
"systems",
"(",
"Fig",
"6B",
"and",
"6C",
")",
"."
]
}
] |
PMC11777207
|
The crystallized structures in complex with PD-L1 and the binding kinetics of these antibodies have been well described.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"crystallized",
"structures",
"in",
"complex",
"with",
"PD-L1",
"and",
"the",
"binding",
"kinetics",
"of",
"these",
"antibodies",
"have",
"been",
"well",
"described",
"."
]
}
] |
PMC10178190
|
The activity of many of the soluble factors that were enriched in the active CM, such as IL-6, is mediated by the Janus kinases/signal transducer and activator of the transcription JAK/STAT pathway .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"activity",
"of",
"many",
"of",
"the",
"soluble",
"factors",
"that",
"were",
"enriched",
"in",
"the",
"active",
"CM",
",",
"such",
"as",
"IL-6",
",",
"is",
"mediated",
"by",
"the",
"Janus",
"kinases/signal",
"transducer",
"and",
"activator",
"of",
"the",
"transcription",
"JAK/STAT",
"pathway",
"."
]
}
] |
PMC10040136
|
Immunofluorescence assay for CD73 and CD90 in paired comparative clinical samples (A).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Immunofluorescence",
"assay",
"for",
"CD73",
"and",
"CD90",
"in",
"paired",
"comparative",
"clinical",
"samples",
"(",
"A",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Most of these substitutions could be assigned to an antigenic site or receptor binding site.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Most",
"of",
"these",
"substitutions",
"could",
"be",
"assigned",
"to",
"an",
"antigenic",
"site",
"or",
"receptor",
"binding",
"site",
"."
]
}
] |
PMC11742864
|
It was found that the energy and protein intakes of the ONS-EPA group were considerably greater than the control (p < 0.001).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"was",
"found",
"that",
"the",
"energy",
"and",
"protein",
"intakes",
"of",
"the",
"ONS-EPA",
"group",
"were",
"considerably",
"greater",
"than",
"the",
"control",
"(",
"p",
"<",
"0.001",
")",
"."
]
}
] |
PMC11514418
|
Nevertheless, this study was limited by a small sample size and a retrospective analysis approach, which may introduce some subjectivity in case selection, thus requiring further validation in the future.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Nevertheless",
",",
"this",
"study",
"was",
"limited",
"by",
"a",
"small",
"sample",
"size",
"and",
"a",
"retrospective",
"analysis",
"approach",
",",
"which",
"may",
"introduce",
"some",
"subjectivity",
"in",
"case",
"selection",
",",
"thus",
"requiring",
"further",
"validation",
"in",
"the",
"future",
"."
]
}
] |
PMC10940855
|
I, Mean percentages of Annexin V cells within RPMI-8226 multiple myeloma cells treated with sh-EFNB2 or sh-Control and exposed to bortezomib (Bor), dexamethasone (Dex), or lenalidomide (Len) for 24 hours.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"I",
",",
"Mean",
"percentages",
"of",
"Annexin",
"V",
"cells",
"within",
"RPMI-8226",
"multiple",
"myeloma",
"cells",
"treated",
"with",
"sh-EFNB2",
"or",
"sh-Control",
"and",
"exposed",
"to",
"bortezomib",
"(",
"Bor",
")",
",",
"dexamethasone",
"(",
"Dex",
")",
",",
"or",
"lenalidomide",
"(",
"Len",
")",
"for",
"24",
"hours",
"."
]
}
] |
PMC4270159
|
Each experiment has three cohorts.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Each",
"experiment",
"has",
"three",
"cohorts",
"."
]
}
] |
PMC10854447
|
H NMR (400 MHz, δ ppm DMSO-d6): 8.80 (s, 1H, triazole-CH), 7.93–7.88 (m, 4H, Ar–H), 7.64 (two d, J = 8.4, 2.1 Hz, 1H, Ar–H), 7.48 (t, J = 8.4 Hz, 2H, Ar–H), 7.37 (t, J = 7.4 Hz, 1H, Ar–H), 6.32 (s, 2H, N–CH2).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"H",
"NMR",
"(",
"400",
"MHz",
",",
"δ",
"ppm",
"DMSO-d6",
"):",
"8.80",
"(",
"s",
",",
"1H",
",",
"triazole-CH",
")",
",",
"7.93–7.88",
"(",
"m",
",",
"4H",
",",
"Ar",
"–",
"H",
")",
",",
"7.64",
"(",
"two",
"d",
",",
"J",
"=",
"8.4",
",",
"2.1",
"Hz",
",",
"1H",
",",
"Ar",
"–",
"H",
")",
",",
"7.48",
"(",
"t",
",",
"J",
"=",
"8.4",
"Hz",
",",
"2H",
",",
"Ar",
"–",
"H",
")",
",",
"7.37",
"(",
"t",
",",
"J",
"=",
"7.4",
"Hz",
",",
"1H",
",",
"Ar",
"–",
"H",
")",
",",
"6.32",
"(",
"s",
",",
"2H",
",",
"N",
"–",
"CH2",
")",
"."
]
}
] |
PMC11539788
|
Then, the supernatants were removed, and the cells were washed with PBS and cultured in serum-free media for 36 h. The wound areas of each group were observed and photographed under an inverted microscope (Olympus, Japan).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Then",
",",
"the",
"supernatants",
"were",
"removed",
",",
"and",
"the",
"cells",
"were",
"washed",
"with",
"PBS",
"and",
"cultured",
"in",
"serum-free",
"media",
"for",
"36",
"h.",
"The",
"wound",
"areas",
"of",
"each",
"group",
"were",
"observed",
"and",
"photographed",
"under",
"an",
"inverted",
"microscope",
"(",
"Olympus",
",",
"Japan",
")",
"."
]
}
] |
PMC7342409
|
Imatinib-r group vs. CK group, *p<0.05, **p<0.01; each drug administration group vs. Imatinib-r group, #p<0.05, ##p<0.01; Imatinib+CQ group vs. Imatinib group, and p<0.05, and p<0.01. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Imatinib-r",
"group",
"vs.",
"CK",
"group",
",",
"*",
"p<0.05",
",",
"*",
"*",
"p<0.01",
";",
"each",
"drug",
"administration",
"group",
"vs.",
"Imatinib-r",
"group",
",",
"#",
"p<0.05",
",",
"#",
"#",
"p<0.01",
";",
"Imatinib+CQ",
"group",
"vs.",
"Imatinib",
"group",
",",
"and",
"p<0.05",
",",
"and",
"p<0.01",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973
|
MMB may address a critical unmet need, particularly in MF pts with anemia.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MMB",
"may",
"address",
"a",
"critical",
"unmet",
"need",
",",
"particularly",
"in",
"MF",
"pts",
"with",
"anemia",
"."
]
}
] |
PMC11767817
|
The protein levels were measured after 8 h of incubation.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"protein",
"levels",
"were",
"measured",
"after",
"8",
"h",
"of",
"incubation",
"."
]
}
] |
PMC11756514
|
In contrast, TarS is preferentially expressed over TarM under stress-inducing conditions (66).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"contrast",
",",
"TarS",
"is",
"preferentially",
"expressed",
"over",
"TarM",
"under",
"stress-inducing",
"conditions",
"(",
"66",
")",
"."
]
}
] |
PMC7229095
|
The media application to clone screening was also tested in more up-to-date ClonePix2 technology.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"media",
"application",
"to",
"clone",
"screening",
"was",
"also",
"tested",
"in",
"more",
"up-to-date",
"ClonePix2",
"technology",
"."
]
}
] |
PMC9878278
|
GraphPad Prism 5.0 (GraphPad software, San Diego, CA, United States) was used to conduct all statistical analyses.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"GraphPad",
"Prism",
"5.0",
"(",
"GraphPad",
"software",
",",
"San",
"Diego",
",",
"CA",
",",
"United",
"States",
")",
"was",
"used",
"to",
"conduct",
"all",
"statistical",
"analyses",
"."
]
}
] |
PMC9917080
|
exposure to SeNPs (Figure 9D,H).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"exposure",
"to",
"SeNPs",
"(",
"Figure",
"9D",
",",
"H",
")",
"."
]
}
] |
PMC11678448
|
The KEGG pathway annotation results indicate that the important pathways for DEG enrichment include lysosomal function and glutathione metabolism (Figure S2B).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"KEGG",
"pathway",
"annotation",
"results",
"indicate",
"that",
"the",
"important",
"pathways",
"for",
"DEG",
"enrichment",
"include",
"lysosomal",
"function",
"and",
"glutathione",
"metabolism",
"(",
"Figure",
"S2B",
")",
"."
]
}
] |
PMC10713411
|
A 9-gene signature was finally determined.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"9-gene",
"signature",
"was",
"finally",
"determined",
"."
]
}
] |
PMC11224206
|
This opinion paper illustrates the lack of reliable quantitative data on these markers and identifies a major research agenda which needs to be addressed with urgency in view of laboratory conditions in which embryos are maintained as well as climate change–derived heat stress which has a negative effect on numerous clinical markers of early human embryo development.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"opinion",
"paper",
"illustrates",
"the",
"lack",
"of",
"reliable",
"quantitative",
"data",
"on",
"these",
"markers",
"and",
"identifies",
"a",
"major",
"research",
"agenda",
"which",
"needs",
"to",
"be",
"addressed",
"with",
"urgency",
"in",
"view",
"of",
"laboratory",
"conditions",
"in",
"which",
"embryos",
"are",
"maintained",
"as",
"well",
"as",
"climate",
"change",
"–",
"derived",
"heat",
"stress",
"which",
"has",
"a",
"negative",
"effect",
"on",
"numerous",
"clinical",
"markers",
"of",
"early",
"human",
"embryo",
"development",
"."
]
}
] |
PMC10809689
|
Our results showed that TIM-3/Gal-9 interaction increased GLS transcript and protein levels in both HL-60 and THP-1 cell lines.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"results",
"showed",
"that",
"TIM-3/Gal-9",
"interaction",
"increased",
"GLS",
"transcript",
"and",
"protein",
"levels",
"in",
"both",
"HL-60",
"and",
"THP-1",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC10759659
|
These findings were consistent with the bioinformatic analysis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"findings",
"were",
"consistent",
"with",
"the",
"bioinformatic",
"analysis",
"."
]
}
] |
PMC11126803
|
Together, the data from Figure 2, A–E suggest that LncRNA-SERB has a relatively high expression in tumor cells, and this factor plays an important role in promoting VM formation, collagen I based 3D VM formation, and invasion.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Together",
",",
"the",
"data",
"from",
"Figure",
"2",
",",
"A",
"–",
"E",
"suggest",
"that",
"LncRNA-SERB",
"has",
"a",
"relatively",
"high",
"expression",
"in",
"tumor",
"cells",
",",
"and",
"this",
"factor",
"plays",
"an",
"important",
"role",
"in",
"promoting",
"VM",
"formation",
",",
"collagen",
"I",
"based",
"3D",
"VM",
"formation",
",",
"and",
"invasion",
"."
]
}
] |
PMC11697703
|
Details of imaging quantification methodologies are described in method details.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Details",
"of",
"imaging",
"quantification",
"methodologies",
"are",
"described",
"in",
"method",
"details",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Sorted BT Mk showed the downregulation of niche factors, as Pf4, Cxcl12, TnC, relevant for HSC maintenance and reduced expression of extracellular matrix molecules, contributing to the impaired HSC-niche crosstalk.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Sorted",
"BT",
"Mk",
"showed",
"the",
"downregulation",
"of",
"niche",
"factors",
",",
"as",
"Pf4",
",",
"Cxcl12",
",",
"TnC",
",",
"relevant",
"for",
"HSC",
"maintenance",
"and",
"reduced",
"expression",
"of",
"extracellular",
"matrix",
"molecules",
",",
"contributing",
"to",
"the",
"impaired",
"HSC-niche",
"crosstalk",
"."
]
}
] |
PMC6024716
|
From the three transduced pools, eight single-cell derived clones were isolated using limiting dilutions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"From",
"the",
"three",
"transduced",
"pools",
",",
"eight",
"single-cell",
"derived",
"clones",
"were",
"isolated",
"using",
"limiting",
"dilutions",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Aims: We aimed to validate the epigenetic characteristics of EZH2 expression and H3K27 methylation status using immunohistochemistry staining.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aims",
":",
"We",
"aimed",
"to",
"validate",
"the",
"epigenetic",
"characteristics",
"of",
"EZH2",
"expression",
"and",
"H3K27",
"methylation",
"status",
"using",
"immunohistochemistry",
"staining",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Our findings support further research regarding the role of Rac1 and its pharmacological inhibition in AML.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"findings",
"support",
"further",
"research",
"regarding",
"the",
"role",
"of",
"Rac1",
"and",
"its",
"pharmacological",
"inhibition",
"in",
"AML",
"."
]
}
] |
PMC11711663
|
Human Papillomaviruses 16 and 18 (HPV16 and HPV18) account for around 85% of HPV-associated HNSCC.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Human",
"Papillomaviruses",
"16",
"and",
"18",
"(",
"HPV16",
"and",
"HPV18",
")",
"account",
"for",
"around",
"85",
"%",
"of",
"HPV-associated",
"HNSCC",
"."
]
}
] |
PMC9100622
|
We show that the statin-induced increased ROS level is a direct consequence of the altered MVA pathway, as it can be fully rescued by mevalonate acid or by GGpp.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"show",
"that",
"the",
"statin-induced",
"increased",
"ROS",
"level",
"is",
"a",
"direct",
"consequence",
"of",
"the",
"altered",
"MVA",
"pathway",
",",
"as",
"it",
"can",
"be",
"fully",
"rescued",
"by",
"mevalonate",
"acid",
"or",
"by",
"GGpp",
"."
]
}
] |
PMC11791432
|
Among them, A total of 970 patients had completed records of survival time and survival status.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Among",
"them",
",",
"A",
"total",
"of",
"970",
"patients",
"had",
"completed",
"records",
"of",
"survival",
"time",
"and",
"survival",
"status",
"."
]
}
] |
PMC11496728
|
The optimized vectors were transfected into CHO-S cells, and the transient expression of eGFP was observed under fluorescence microscopy for 48 h, and the cell pellet was collected, and the MFI value of eGFP was detected by flow cytometry.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"optimized",
"vectors",
"were",
"transfected",
"into",
"CHO-S",
"cells",
",",
"and",
"the",
"transient",
"expression",
"of",
"eGFP",
"was",
"observed",
"under",
"fluorescence",
"microscopy",
"for",
"48",
"h",
",",
"and",
"the",
"cell",
"pellet",
"was",
"collected",
",",
"and",
"the",
"MFI",
"value",
"of",
"eGFP",
"was",
"detected",
"by",
"flow",
"cytometry",
"."
]
}
] |
PMC6835428
|
A problem liked to GEMMs is represented by the frequent infertility of GEMM animals.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"problem",
"liked",
"to",
"GEMMs",
"is",
"represented",
"by",
"the",
"frequent",
"infertility",
"of",
"GEMM",
"animals",
"."
]
}
] |
PMC11531735
|
Tumor-free survival of multiple-treatment groups were analyzed by Kaplan-Meier analysis using the log-rank test with the Bonferroni correction.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Tumor-free",
"survival",
"of",
"multiple-treatment",
"groups",
"were",
"analyzed",
"by",
"Kaplan-Meier",
"analysis",
"using",
"the",
"log-rank",
"test",
"with",
"the",
"Bonferroni",
"correction",
"."
]
}
] |
PMC10631132
|
Subsequently, the 96-well plate was centrifuged for 3 min at 100 × g and half medium changes were performed after one and two days.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Subsequently",
",",
"the",
"96-well",
"plate",
"was",
"centrifuged",
"for",
"3",
"min",
"at",
"100",
"×",
"g",
"and",
"half",
"medium",
"changes",
"were",
"performed",
"after",
"one",
"and",
"two",
"days",
"."
]
}
] |
PMC10154881
|
It is known that MV induces strong cellular immunity. , ,
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"is",
"known",
"that",
"MV",
"induces",
"strong",
"cellular",
"immunity",
".",
",",
","
]
}
] |
PMC5308810
|
CXCR4 also displayed higher expressions of cancer stem cell markers.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CXCR4",
"also",
"displayed",
"higher",
"expressions",
"of",
"cancer",
"stem",
"cell",
"markers",
"."
]
}
] |
PMC11794847
|
However, the detailed mechanism why HVEM could bind to FOXA2 needed to be explored further.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"the",
"detailed",
"mechanism",
"why",
"HVEM",
"could",
"bind",
"to",
"FOXA2",
"needed",
"to",
"be",
"explored",
"further",
"."
]
}
] |
PMC10243817
|
The cells were washed, resuspended, and stained with fixable viability stain 700 (BD Biosciences) to exclude dead cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cells",
"were",
"washed",
",",
"resuspended",
",",
"and",
"stained",
"with",
"fixable",
"viability",
"stain",
"700",
"(",
"BD",
"Biosciences",
")",
"to",
"exclude",
"dead",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11095939
|
As a result, there were 2658 Mecp2 direct target genes, in which 537 were PHx-activated and 2121 were PHx-repressed genes (Figure 6A).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"a",
"result",
",",
"there",
"were",
"2658",
"Mecp2",
"direct",
"target",
"genes",
",",
"in",
"which",
"537",
"were",
"PHx-activated",
"and",
"2121",
"were",
"PHx-repressed",
"genes",
"(",
"Figure",
"6A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11594074
|
It can be seen in Figure 10 that Ki-67 is a nuclear protein that decreases in a dose-dependent manner after 24 h of incubation with compound 4.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"can",
"be",
"seen",
"in",
"Figure",
"10",
"that",
"Ki-67",
"is",
"a",
"nuclear",
"protein",
"that",
"decreases",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"after",
"24",
"h",
"of",
"incubation",
"with",
"compound",
"4",
"."
]
}
] |
PMC11747949
|
Multiple variables analysis for VEGFR, CD44, CCL2, CAIX expression in hypoxia comparing transwell coculture phenotype when cells are treated with vehicle versus CCR2 antagonist. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Multiple",
"variables",
"analysis",
"for",
"VEGFR",
",",
"CD44",
",",
"CCL2",
",",
"CAIX",
"expression",
"in",
"hypoxia",
"comparing",
"transwell",
"coculture",
"phenotype",
"when",
"cells",
"are",
"treated",
"with",
"vehicle",
"versus",
"CCR2",
"antagonist",
".",
"("
]
}
] |
PMC11680982
|
HER2 knockdown efficiency was examined at both the RNA and protein levels (P < 0.001) (Fig. 3A,B).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"HER2",
"knockdown",
"efficiency",
"was",
"examined",
"at",
"both",
"the",
"RNA",
"and",
"protein",
"levels",
"(",
"P",
"<",
"0.001",
")",
"(",
"Fig.",
"3A",
",",
"B",
")",
"."
]
}
] |
PMC11547972
|
The tumor cells were treated with amygdalin alone, with SFN alone or with both amygdalin and SFN.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"tumor",
"cells",
"were",
"treated",
"with",
"amygdalin",
"alone",
",",
"with",
"SFN",
"alone",
"or",
"with",
"both",
"amygdalin",
"and",
"SFN",
"."
]
}
] |
PMC11306331
|
MBP recruitment with blue light resulted in droplet dissolution in all cases.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MBP",
"recruitment",
"with",
"blue",
"light",
"resulted",
"in",
"droplet",
"dissolution",
"in",
"all",
"cases",
"."
]
}
] |
PMC7917457
|
All phases of the cloning were confirmed with PCR, restriction digestion analysis, and sequencing.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"phases",
"of",
"the",
"cloning",
"were",
"confirmed",
"with",
"PCR",
",",
"restriction",
"digestion",
"analysis",
",",
"and",
"sequencing",
"."
]
}
] |
PMC11727907
|
As shown in Figure 6, treatment with IGF-1, but not with IGF-1 + Klotho, reduces the malondialdehyde (MDA) accumulation (Figure 7A), a marker of lipid peroxidation, after 4 h from the treatment, suggesting that the reduction in MDA is consequent to the OxPhos reduction.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"shown",
"in",
"Figure",
"6",
",",
"treatment",
"with",
"IGF-1",
",",
"but",
"not",
"with",
"IGF-1",
"+",
"Klotho",
",",
"reduces",
"the",
"malondialdehyde",
"(",
"MDA",
")",
"accumulation",
"(",
"Figure",
"7A",
")",
",",
"a",
"marker",
"of",
"lipid",
"peroxidation",
",",
"after",
"4",
"h",
"from",
"the",
"treatment",
",",
"suggesting",
"that",
"the",
"reduction",
"in",
"MDA",
"is",
"consequent",
"to",
"the",
"OxPhos",
"reduction",
"."
]
}
] |
PMC11321678
|
Notably, we found that TF regulators were active only in Group 3 and Group 4 subgroups, which may explain their cellular origin and poor prognosis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Notably",
",",
"we",
"found",
"that",
"TF",
"regulators",
"were",
"active",
"only",
"in",
"Group",
"3",
"and",
"Group",
"4",
"subgroups",
",",
"which",
"may",
"explain",
"their",
"cellular",
"origin",
"and",
"poor",
"prognosis",
"."
]
}
] |
PMC11742047
|
It has been demonstrated that Cer stimulates caspase 3-5-7-8 and 9 activities, leading to apoptosis in many cells and tissues.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"has",
"been",
"demonstrated",
"that",
"Cer",
"stimulates",
"caspase",
"3",
"-",
"5",
"-",
"7",
"-",
"8",
"and",
"9",
"activities",
",",
"leading",
"to",
"apoptosis",
"in",
"many",
"cells",
"and",
"tissues",
"."
]
}
] |
PMC11127909
|
All animal experiments were approved by the Sun Yat-sen University Laboratory Animal Care and Use Committee (Guangzhou, China).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"animal",
"experiments",
"were",
"approved",
"by",
"the",
"Sun",
"Yat-sen",
"University",
"Laboratory",
"Animal",
"Care",
"and",
"Use",
"Committee",
"(",
"Guangzhou",
",",
"China",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Results: Of 7484 patients in the Flatiron database with newly diagnosed AML, 1188 met the selection criteria and 436 were propensity score-matched resulting in 218 per treatment group.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"Of",
"7484",
"patients",
"in",
"the",
"Flatiron",
"database",
"with",
"newly",
"diagnosed",
"AML",
",",
"1188",
"met",
"the",
"selection",
"criteria",
"and",
"436",
"were",
"propensity",
"score-matched",
"resulting",
"in",
"218",
"per",
"treatment",
"group",
"."
]
}
] |
PMC9509578
|
Hence, inhibition of CYP enzymes could also constitute an alternative therapy to overcome MDR .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Hence",
",",
"inhibition",
"of",
"CYP",
"enzymes",
"could",
"also",
"constitute",
"an",
"alternative",
"therapy",
"to",
"overcome",
"MDR",
"."
]
}
] |
PMC11720107
|
These findings support our hypothesis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"findings",
"support",
"our",
"hypothesis",
"."
]
}
] |
PMC7229095
|
CDM1 yielded the most pickable number of clones achieving productivity above ~ 10 mg/L in 96-well plates.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CDM1",
"yielded",
"the",
"most",
"pickable",
"number",
"of",
"clones",
"achieving",
"productivity",
"above",
"~",
"10",
"mg/L",
"in",
"96-well",
"plates",
"."
]
}
] |
PMC9777812
|
Therefore, the purpose of the present study was to validate the regulatory roles of bta-miR-106b in cell proliferation, cell cycle, and protein and fat synthesis by targeting the CDKN1A gene in BMECs.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"the",
"purpose",
"of",
"the",
"present",
"study",
"was",
"to",
"validate",
"the",
"regulatory",
"roles",
"of",
"bta-miR-106b",
"in",
"cell",
"proliferation",
",",
"cell",
"cycle",
",",
"and",
"protein",
"and",
"fat",
"synthesis",
"by",
"targeting",
"the",
"CDKN1A",
"gene",
"in",
"BMECs",
"."
]
}
] |
PMC11533140
|
The antiproliferative activities of 17e and 17p on MRC-5 and HL-7702 were weaker than those of BKM-120 and also weaker than the inhibitory activities on A2780, which preliminarily indicated that 17e and 17p had weak toxicity toward normal cell lines MRC-5 and HL-7702, and 17p was selected as a candidate for further research.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"antiproliferative",
"activities",
"of",
"17e",
"and",
"17p",
"on",
"MRC-5",
"and",
"HL-7702",
"were",
"weaker",
"than",
"those",
"of",
"BKM-120",
"and",
"also",
"weaker",
"than",
"the",
"inhibitory",
"activities",
"on",
"A2780",
",",
"which",
"preliminarily",
"indicated",
"that",
"17e",
"and",
"17p",
"had",
"weak",
"toxicity",
"toward",
"normal",
"cell",
"lines",
"MRC-5",
"and",
"HL-7702",
",",
"and",
"17p",
"was",
"selected",
"as",
"a",
"candidate",
"for",
"further",
"research",
"."
]
}
] |
PMC10093184
|
After a short adhesion phase (5–10 min) to avoid floating of the tumor pieces in the cultivation medium, DMEM high-glucose medium supplemented with 10% fetal calf serum (FCS), 1% antibiotic–antimycotic solution (all from Sigma-Aldrich), and 1% L-glutamine (Biowest, Riverside, MO, USA) was added.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"a",
"short",
"adhesion",
"phase",
"(",
"5–10",
"min",
")",
"to",
"avoid",
"floating",
"of",
"the",
"tumor",
"pieces",
"in",
"the",
"cultivation",
"medium",
",",
"DMEM",
"high-glucose",
"medium",
"supplemented",
"with",
"10",
"%",
"fetal",
"calf",
"serum",
"(",
"FCS",
")",
",",
"1",
"%",
"antibiotic",
"–",
"antimycotic",
"solution",
"(",
"all",
"from",
"Sigma-Aldrich",
")",
",",
"and",
"1",
"%",
"L-glutamine",
"(",
"Biowest",
",",
"Riverside",
",",
"MO",
",",
"USA",
")",
"was",
"added",
"."
]
}
] |
PMC11711127
|
In this context, maturation accompanies upregulation of MHC, co-stimulatory receptors, cytokines, and extracellular vesicles that can overcome T cell resistance to activation (101).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"context",
",",
"maturation",
"accompanies",
"upregulation",
"of",
"MHC",
",",
"co-stimulatory",
"receptors",
",",
"cytokines",
",",
"and",
"extracellular",
"vesicles",
"that",
"can",
"overcome",
"T",
"cell",
"resistance",
"to",
"activation",
"(",
"101",
")",
"."
]
}
] |
PMC11098378
|
Second, while some IEPs simply bind/sequester host factors to inhibit their function, others can alter post-translation modifications to modify stability or function .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Second",
",",
"while",
"some",
"IEPs",
"simply",
"bind/sequester",
"host",
"factors",
"to",
"inhibit",
"their",
"function",
",",
"others",
"can",
"alter",
"post-translation",
"modifications",
"to",
"modify",
"stability",
"or",
"function",
"."
]
}
] |
PMC8316344
|
Meanwhile, the imbalance of intracellular iron homeostasis is also a major cause for carcinogenesis .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Meanwhile",
",",
"the",
"imbalance",
"of",
"intracellular",
"iron",
"homeostasis",
"is",
"also",
"a",
"major",
"cause",
"for",
"carcinogenesis",
"."
]
}
] |
PMC11711345
|
For that, the canonical SMILES (simplified molecular-input line-entry system) of those compounds was obtained from the PubChem database (pubchem.ncbi.nlm.nih.gov).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"that",
",",
"the",
"canonical",
"SMILES",
"(",
"simplified",
"molecular-input",
"line-entry",
"system",
")",
"of",
"those",
"compounds",
"was",
"obtained",
"from",
"the",
"PubChem",
"database",
"(",
"pubchem.ncbi.nlm.nih.gov",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Image: Summary/Conclusion: Gordon et al. reported 2 CLL cases one with ITP and other with Evans syndrome successfully treated with venetoclax.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Image",
":",
"Summary/Conclusion",
":",
"Gordon",
"et",
"al.",
"reported",
"2",
"CLL",
"cases",
"one",
"with",
"ITP",
"and",
"other",
"with",
"Evans",
"syndrome",
"successfully",
"treated",
"with",
"venetoclax",
"."
]
}
] |
PMC5839394
|
The cells were detached from the flasks with trypsin and suspended in 0.5 ml of TE buffer (100 mM Tris-HCl, 100 mM EDTA pH 8).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cells",
"were",
"detached",
"from",
"the",
"flasks",
"with",
"trypsin",
"and",
"suspended",
"in",
"0.5",
"ml",
"of",
"TE",
"buffer",
"(",
"100",
"mM",
"Tris-HCl",
",",
"100",
"mM",
"EDTA",
"pH",
"8)",
"."
]
}
] |
PMC11687663
|
With a molecular weight of 564.15 Da, a CaCO2 permeability score of -6.37, and a TPSA of 250.97, Schaftoside (B7) exceeds the preferred limits for several key drug-likeliness parameters.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"With",
"a",
"molecular",
"weight",
"of",
"564.15",
"Da",
",",
"a",
"CaCO2",
"permeability",
"score",
"of",
"-6.37",
",",
"and",
"a",
"TPSA",
"of",
"250.97",
",",
"Schaftoside",
"(",
"B7",
")",
"exceeds",
"the",
"preferred",
"limits",
"for",
"several",
"key",
"drug-likeliness",
"parameters",
"."
]
}
] |
PMC9428827
|
We focused on the balance of CD8/Tregs because of the well-known function of IL-2 stimulating these populations.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"focused",
"on",
"the",
"balance",
"of",
"CD8/Tregs",
"because",
"of",
"the",
"well-known",
"function",
"of",
"IL-2",
"stimulating",
"these",
"populations",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.