Datasets:
OTAR3088
/
Variants_IOB_format

Dataset card Data Studio Files
xet
 Community
1
words
listlengths
4
199
labels
listlengths
4
199
__index_level_0__
int64
32
4.26k
[ "The", "slightly", "better", "growth", "of", "the", "β5", "-", "T1A", "-", "K81R", "mutant", "allowed", "us", "to", "solve", "the", "crystal", "structure", "of", "a", "yeast", "proteasome", "(", "yCP", ")", "with", "the", "β5", "-", "T1A", "mutation", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
3,904
[ "Next", ",", "we", "examined", "the", "position", "of", "the", "β5", "propeptide", "in", "the", "β5", "-", "T1A", "-", "K81R", "mutant", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O" ]
3,911
[ "As", "the", "K81R", "mutation", "is", "located", "far", "from", "the", "active", "site", "(", "Thr1Cα", "–", "Arg81Cα", ":", "24", "Å", "),", "any", "influence", "on", "propeptide", "conformation", "can", "be", "excluded", "." ]
[ "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,914
[ "As", "expected", "from", "β5", "-", "T1A", "mutants", ",", "the", "yeasts", "show", "severe", "growth", "phenotypes", ",", "with", "minor", "variations", "(", "Supplementary", "Fig", ".", "4a", "and", "Table", "1", ")." ]
[ "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,920
[ "We", "determined", "crystal", "structures", "of", "the", "β5", "-", "H", "(-", "2", ")", "L", "-", "T1A", ",", "β5", "-", "H", "(-", "2", ")", "T", "-", "T1A", "and", "the", "β5", "-", "H", "(-", "2", ")", "A", "-", "T1A", "-", "K81R", "mu...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "...
3,921
[ "For", "the", "β5", "-", "H", "(-", "2", ")", "A", "-", "T1A", "-", "K81R", "variant", ",", "only", "the", "residues", "Gly", "(-", "1", ")", "and", "Ala", "(-", "2", ")", "could", "be", "visualized", ",", "indicating", "that", "Ala", "(-", "2", ...
[ "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
3,922
[ "As", "proven", "by", "the", "β2", "-", "T1A", "crystal", "structures", ",", "Thr", "(-", "2", ")", "hydrogen", "bonds", "to", "Gly", "(-", "1", ")", "O", ".", "Although", "this", "interaction", "was", "not", "observed", "for", "the", "β5", "-", "H",...
[ "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutan...
3,927
[ "This", "discrepancy", "in", "growth", "was", "traced", "to", "an", "additional", "point", "mutation", "L", "(-", "49", ")", "S", "in", "the", "β5", "-", "propeptide", "of", "the", "β5", "-", "K33A", "mutant", "(", "see", "also", "Supplementary", "Note",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,935
[ "Additional", "proof", "for", "the", "key", "function", "of", "Lys33", "was", "obtained", "from", "the", "β5", "-", "K33A", "mutant", ",", "with", "the", "propeptide", "expressed", "separately", "from", "the", "main", "subunit", "(", "pp", "trans", ")." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,937
[ "Consistent", "with", "this", ",", "the", "crystal", "structure", "of", "the", "β5", "-", "K33A", "pp", "trans", "mutant", "in", "complex", "with", "carfilzomib", "only", "showed", "partial", "occupancy", "of", "the", "ligand", "at", "the", "β5", "active", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,939
[ "Since", "no", "acetylation", "of", "the", "Thr1", "N", "terminus", "was", "observed", "for", "the", "β5", "-", "K33A", "pp", "trans", "apo", "crystal", "structure", ",", "the", "reduced", "reactivity", "towards", "substrates", "and", "inhibitors", "indicates"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,940
[ "Furthermore", ",", "the", "crystal", "structure", "of", "the", "β5", "-", "K33A", "pp", "trans", "mutant", "without", "inhibitor", "revealed", "that", "Thr1Oγ", "strongly", "coordinates", "a", "well", "-", "defined", "water", "molecule", "(∼", "2", "Å", ";"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,941
[ "Notably", ",", "only", "with", "the", "additional", "point", "mutation", "L", "(-", "49", ")", "S", "present", "in", "the", "β5", "propeptide", "could", "we", "purify", "a", "small", "amount", "of", "the", "β5", "-", "D17N", "mutant", "yCP", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O" ]
3,946
[ "Even", "though", "the", "β5", "-", "D17N", "pp", "trans", "yCP", "crystal", "structure", "appeared", "identical", "to", "the", "WT", "yCP", "(", "Supplementary", "Fig", ".", "7b", "),", "the", "co", "-", "crystal", "structure", "with", "the", "α", "′,",...
[ "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
3,948
[ "Autolysis", "and", "residual", "catalytic", "activity", "of", "the", "β5", "-", "D17N", "mutants", "may", "originate", "from", "the", "carbonyl", "group", "of", "Asn17", ",", "which", "albeit", "to", "a", "lower", "degree", "still", "can", "polarize", "Lys3...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,949
[ "In", "agreement", ",", "an", "E17A", "mutant", "in", "the", "proteasomal", "β", "-", "subunit", "of", "the", "archaeon", "Thermoplasma", "acidophilum", "prevents", "autolysis", "and", "catalysis", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,950
[ "X", "-", "ray", "data", "on", "the", "β5", "-", "D166N", "mutant", "indicate", "that", "the", "β5", "propeptide", "is", "hydrolysed", ",", "but", "due", "to", "reorientation", "of", "Ser129OH", ",", "the", "interaction", "with", "Asn166Oδ", "is", "disrupt...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,954
[ "Soaking", "the", "β5", "-", "D166N", "crystals", "with", "carfilzomib", "and", "MG132", "resulted", "in", "covalent", "modification", "of", "Thr1", "at", "high", "occupancy", "(", "Supplementary", "Fig", ".", "8c", ")." ]
[ "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,955
[ "His", "(-", "2", ")", "occupies", "the", "S2", "pocket", "like", "observed", "for", "the", "β5", "-", "T1A", "-", "K81R", "mutant", ",", "but", "in", "contrast", "to", "the", "latter", ",", "the", "propeptide", "in", "the", "T1C", "mutant", "adopts", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
3,961
[ "On", "the", "basis", "of", "the", "phenotype", "of", "the", "T1C", "mutant", "and", "the", "propeptide", "remnant", "identified", "in", "its", "active", "site", ",", "we", "suppose", "that", "autolysis", "is", "retarded", "and", "may", "not", "have", "bee...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,962
[ "Despite", "propeptide", "hydrolysis", ",", "the", "β5", "-", "T1C", "active", "site", "is", "catalytically", "inactive", "(", "Fig", ".", "4b", "and", "Supplementary", "Fig", ".", "9a", ")." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,963
[ "Notably", ",", "the", "2FO", "–", "FC", "electron", "-", "density", "map", "of", "the", "T1C", "mutant", "also", "indicates", "that", "Lys33NH2", "is", "disordered", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,966
[ "To", "investigate", "the", "reason", "for", "this", "singularity", ",", "we", "analysed", "a", "β5", "-", "T1S", "mutant", ",", "which", "is", "viable", "but", "suffers", "from", "growth", "defects", "(", "Fig", ".", "4a", "and", "Table", "1", ")." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,969
[ "Crystal", "structure", "analysis", "of", "the", "β5", "-", "T1S", "mutant", "confirmed", "precursor", "processing", "(", "Fig", ".", "4g", "),", "and", "ligand", "-", "complex", "structures", "with", "bortezomib", "and", "carfilzomib", "unambiguously", "corrobo...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,971
[ "Here", "we", "have", "described", "the", "atomic", "structures", "of", "various", "β5", "-", "T1A", "mutants", ",", "which", "allowed", "for", "the", "first", "time", "visualization", "of", "the", "residual", "β5", "propeptide", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,984
[ "The", "mutation", "D166N", "lowers", "the", "pKa", "of", "Thr1N", ",", "which", "is", "thus", "more", "likely", "to", "exist", "in", "the", "uncharged", "deprotonated", "state", "(", "Thr1NH2", ")." ]
[ "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
3,996
[ "To", "investigate", "why", "the", "CP", "specifically", "employs", "threonine", "as", "its", "active", "-", "site", "residue", ",", "we", "used", "a", "β5", "-", "T1S", "mutant", "of", "the", "yCP", "and", "characterized", "it", "biochemically", "and", "s...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,001
[ "Activity", "assays", "with", "the", "β5", "-", "T1S", "mutant", "revealed", "reduced", "turnover", "of", "Suc", "-", "LLVY", "-", "AMC", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,002
[ "We", "also", "observed", "slightly", "lower", "affinity", "of", "the", "β5", "-", "T1S", "mutant", "yCP", "for", "the", "Food", "and", "Drug", "Administration", "-", "approved", "proteasome", "inhibitors", "bortezomib", "and", "carfilzomib", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,003
[ "(", "a", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "β1", "-", "T1A", "propeptide", "and", "the", "matured", "WT", "β1", "active", "-", "site", "Thr1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,008
[ "Only", "the", "residues", "(-", "5", ")", "to", "(-", "1", ")", "of", "the", "β1", "-", "T1A", "propeptide", "are", "displayed", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O" ]
4,009
[ "(", "b", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "β1", "-", "T1A", "propeptide", "and", "the", "β2", "-", "T1A", "propeptide", "highlights", "subtle", "differences", "in", "their", "conformations", ",", "but", "illustrates", "that", "Ala1", "and", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,010
[ "(", "c", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "β1", "-", "T1A", ",", "the", "β2", "-", "T1A", "and", "the", "β5", "-", "T1A", "-", "K81R", "propeptide", "remnants", "depict", "their", "differences", "in", "conformation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,012
[ "(", "a", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "β1", "-", "T1A", "propeptide", "and", "the", "β5", "-", "H", "(-", "2", ")", "L", "-", "T1A", "mutant", "propeptide", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O" ]
4,016
[ "(", "c", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "β2", "-", "T1A", "propeptide", "and", "the", "β5", "-", "H", "(-", "2", ")", "T", "-", "T1A", "mutant", "propeptide", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O" ]
4,018
[ "(", "c", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "WT", "β5", "and", "the", "β5", "-", "K33A", "pp", "trans", "mutant", "active", "site", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,023
[ "Notably", ",", "His", "(-", "2", ")", "does", "not", "occupy", "the", "S1", "pocket", "formed", "by", "Met45", ",", "similar", "to", "what", "was", "observed", "for", "the", "β5", "-", "T1A", "-", "K81R", "mutant", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O" ]
4,032
[ "(", "d", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "β5", "-", "T1A", "-", "K81R", "and", "the", "β5", "-", "T1C", "mutant", "subunits", "onto", "the", "WT", "β5", "subunit", ".", "(", "e", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "β5", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutan...
4,033
[ "(", "f", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "WT", "β5", "and", "β5", "-", "T1C", "mutant", "active", "sites", "illustrates", "the", "different", "orientations", "of", "the", "hydroxyl", "group", "of", "Thr1", "and", "the", "thiol", "side", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,035
[ "(", "g", ")", "Structural", "superposition", "of", "the", "WT", "β5", "and", "β5", "-", "T1S", "mutant", "active", "sites", "reveals", "different", "orientations", "of", "the", "hydroxyl", "groups", "of", "Thr1", "and", "Ser1", ",", "respectively", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,036
[ "Inhibition", "of", "WT", "and", "mutant", "β5", "-", "T1S", "proteasomes", "by", "bortezomib", "and", "carfilzomib", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,039
[ "Structures", "of", "the", "β5", "-", "T1S", "mutant", "in", "complex", "with", "both", "ligands", "(", "green", ")", "prove", "the", "reactivity", "of", "Ser1", "(", "right", "panel", ")." ]
[ "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,044
[ "MS", "analyses", "under", "non", "-", "denaturing", "conditions", "clearly", "showed", "that", "the", "Cys129Ser", "(", "C129S", ")", "mutant", "is", "dimerized", "in", "the", "presence", "of", "haem", ",", "indicating", "that", "the", "haem", "-", "mediate...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
4,149
[ "Similarly", ",", "the", "C129S", "mutant", "of", "PGRMC1", "converted", "from", "monomer", "to", "dimer", "by", "binding", "to", "haem", "(", "Fig", ".", "2b", ")." ]
[ "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,155
[ "Analysis", "by", "gel", "filtration", "chromatography", "revealed", "that", "the", "relative", "molecular", "sizes", "of", "the", "wild", "-", "type", "and", "the", "C129S", "mutant", "of", "PGRMC1", "are", "increased", "by", "adding", "haem", "to", "apo", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
4,169
[ "Furthermore", ",", "the", "Tyr113Phe", "(", "Y113F", ")", "mutant", "of", "PGRMC1", "was", "not", "responsive", "to", "haem", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,172
[ "As", "shown", "in", "Fig", ".", "4a", ",", "the", "cytosolic", "domain", "of", "wild", "-", "type", "PGRMC1", ",", "but", "not", "the", "Y113F", "mutant", ",", "interacted", "with", "purified", "EGFR", "in", "a", "haem", "-", "dependent", "manner", "....
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,180
[ "The", "C129S", "mutant", "of", "PGRMC1", "also", "interacted", "with", "endogenous", "PGRMC1", "and", "EGFR", "(", "Supplementary", "Fig", ".", "16", ")." ]
[ "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,184
[ "Whereas", "FLAG", "-", "tagged", "wild", "-", "type", "PGRMC1", "interacted", "with", "endogenous", "PGRMC1", "and", "EGFR", ",", "the", "Y113F", "mutant", "did", "not", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O" ]
4,185
[ "EGF", "-", "induced", "phosphorylations", "of", "EGFR", "and", "its", "downstream", "targets", "AKT", "and", "ERK", "were", "decreased", "by", "PGRMC1", "knockdown", "(", "PGRMC1", "-", "KD", ")", "(", "Fig", ".", "4f", ")." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,189
[ "To", "further", "investigate", "the", "role", "of", "the", "dimerized", "form", "of", "PGRMC1", "in", "cancer", "proliferation", ",", "we", "performed", "PGRMC1", "knockdown", "-", "rescue", "experiments", "using", "FLAG", "-", "tagged", "wild", "-", "type", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
4,192
[ "Ten", "days", "after", "intra", "-", "splenic", "implantation", "of", "HCT116", "cells", "that", "were", "genetically", "tagged", "with", "a", "fluorescent", "protein", "Venus", ",", "the", "group", "implanted", "with", "PGRMC1", "-", "KD", "cells", "showed",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
4,194
[ "PGRMC1", "-", "KD", "significantly", "suppressed", "the", "conversion", "of", "doxorubicin", "to", "doxorubicinol", "(", "Fig", ".", "6d", ")", "and", "increased", "sensitivity", "to", "doxorubicin", "(", "Fig", ".", "6e", ")." ]
[ "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,199
[ "This", "effect", "was", "reversed", "by", "co", "-", "expression", "of", "the", "wild", "-", "type", "PGRMC1", "but", "not", "of", "the", "Y113F", "mutant", ",", "suggesting", "that", "PGRMC1", "enhances", "doxorubicin", "resistance", "of", "cancer", "cells...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,200
[ "(", "a", ")", "Mass", "spectrometric", "analyses", "of", "the", "wild", "-", "type", "(", "wt", ")", "PGRMC1", "or", "the", "C129S", "mutant", "in", "the", "presence", "or", "absence", "of", "haem", "under", "non", "-", "denaturing", "condition", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,224
[ "(", "c", ")", "Gel", "-", "filtration", "chromatography", "analyses", "of", "PGRMC1", "(", "a", ".", "a", ".", "44", "–", "195", ")", "wild", "-", "type", "(", "wt", ")", "and", "the", "Y113F", "or", "C129S", "mutant", "in", "the", "presence", "or...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
4,235
[ "(", "c", ")", "FLAG", "-", "PGRMC1", "wt", "or", "Y113F", "(", "full", "length", ")", "was", "over", "-", "expressed", "in", "HCT116", "cells", "and", "immunoprecipitated", "with", "anti", "-", "FLAG", "antibody", "-", "conjugated", "beads", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,239
[ "(", "c", ")", "Spheroid", "formation", "in", "control", "and", "PGRMC1", "-", "KD", "HCT116", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O" ]
4,246
[ "Scale", "bar", ":", "0", ".", "1", "mm", ".", "(", "d", ")", "Tumour", "-", "bearing", "livers", "of", "NOG", "mice", "at", "10", "days", "after", "intrasplenic", "injection", "of", "HCT116", "(", "control", ")", "or", "PGRMC1", "-", "KD", "cells", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O" ]
4,247
[ "Doxorubicin", "was", "incubated", "with", "HCT116", "cells", "expressing", "control", "shRNA", "or", "shPGRMC1", "(", "PGRMC1", "-", "KD", "),", "and", "the", "doxorubicinol", "/", "doxorubicin", "ratios", "in", "cell", "pellets", "were", "determined", "using",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,250
[ "of", "four", "separate", "experiments", ".", "**", "P", "<", "0", ".", "01", "versus", "control", "using", "unpaired", "Student", "'", "s", "t", "-", "test", ".", "(", "e", ")", "Indicated", "amounts", "of", "doxorubicin", "were", "added", "to", "HCT1...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "I-mutant", "I-mutant", "O", "...
4,251
[ "Apo", "form", "Haem", "-", "bound", "form", "Mass", "(", "Da", ")", "Mass", "(", "Da", ")", "aPGRMC1", "wt", "(", "a", ".", "a", ".", "44", "–", "195", ")", "ESI", "-", "MS", "—", "17", ",", "844", ".", "14", "—", "36", ",", "920", ".", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
4,256
[ "The", "protein", "sizes", "of", "the", "wt", "and", "C129S", "PGRMC1", "cytosolic", "domains", "(", "a", ".", "a", ".", "44", "–", "195", ")", "in", "the", "presence", "or", "absence", "of", "haem", "were", "estimated", "by", "ESI", "-", "MS", ",", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mutant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4,257