text stringlengths 0 1.95k |
|---|
° |
Число |
переменных |
9 |
3 |
1 |
Коэффициент детерминации |
приведенный |
Псевдо-кри- |
терий AIC |
обычный |
Модель 1: Y ~ hg + t + h + O2 + Pmin + NO2 + pH + KG + IP |
1.68 |
0.835 |
-8.97 |
0.34 |
Псевдо-F-статистика |
Pr(>F) |
F |
0.51 |
0.343 |
Модель 2: Y ~ t + IP + Ss |
0.346 |
Модель 3: Y ~ t |
0.282 |
-12.9 |
-13.07 |
3.12 |
3.76 |
0.018 |
0.001 |
0.001 |
приведенный коэффициент детерминации |
Расчет моделей проводился с использованием двух функций: forward.sel(), |
максимизирующей |
adjR , и ordistep(), |
находящей минимум AIC. |
что все |
включенные переменные должны быть статистически значимыми, а все исключенные |
переменные – незначимыми в соответствии с пермутационным тестом, оценивающим |
частные F-статистики. На этом фоне модель 1 видится переопределенной, а модель 3 – |
незаслуженно урезанной, что явилось следствием некоторой математической условности |
подсчета критерия Акаике при RDA-анализе. Модель 2 представляется нам наиболее |
сбалансированной. |
При этом ставилось дополнительное условие, |
2 |
Дополнительную информацию для анализа моделей предоставляет дисперсионный |
анализ anova.cca, оценивающий по частным F-критериям статистическую значимость |
термов модели и осей канонических ординаций с использованием рандомизации. |
К разделу 6.3: |
# 1. Анализ главных координат - геоботанические описания в дельте р. Волга |
# Загрузка таблицы видов из предварительно подготовленного двоичного файла |
library(vegan) ; load(file="Fito_Full.RData"); Species <- Species[,-8] |
# Оценка коэффициентов корреляции Спирмена для различных метрик расстояния |
Env <- Fito_Full[,27:36] ; rankindex(scale(Env), Species, c("euc","man","bray","jac","kul")) |
spe.bray <- vegdist(Species) |
# PCoA по расстоянию Брея-Кертиса |
216 |
spe.b.pcoa <- cmdscale(spe.bray, k=(ncol(Species)), eig=TRUE) |
spe.b.wa <- wascores(spe.b.pcoa$points[,1:2], Species) |
# График взвешенных средних проекций видов |
ordiplot(scores(spe.b.pcoa)[,c(1,2)], type="n", ylim=c(-0.4,0.4)) |
abline(h=0, lty=3); abline(v=0, lty=3) |
ordipointlabel(spe.b.wa, display = "sp", font=4, pch=21, cex=0.7, bg="grey") |
# Формирование и вывод на биплот изоном факторов среды H и Sum_all |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.