extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "A", "joint", "model", ",", "adjusted", "for", "monitoring", "strategy", "(", "fixed", "-", "dose", "versus", "concentration", "-", "controlled", ")", "and", "recipient", "age", ",", "was", "developed", ";", "it", "combined", "a", "mixed", "-", "effects", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "MPA", "AUC", "thresholds", "were", "determined", "using", "time", "-", "dependent", "receiver", "-", "operating", "characteristics", "(", "ROC", ")", "curves", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Data", "from", "490", "adult", "renal", "-", "transplant", "recipients", ",", "representative", "of", "the", "general", "population", "of", "adult", "renal", "-", "transplant", "patients", "(", "i", ".", "e", ".", "including", "patients", "considered", "at", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "A", "significant", "association", "was", "found", "between", "the", "longitudinal", "exposure", "to", "MPA", "(", "MPA", "AUCs", "=", "f", "(", "t", ")", ")", "and", "AR", "(", "p", "=", "0", ".", "0081", ")", ",", "and", "validated", "by", "bootstr...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "significant", "positive", "correlation", "was", "observed", "between", "time", "post", "-", "transplantation", "and", "ROC", "thresholds", "which", "increased", "in", "average", "from", "35mgh", "/", "L", "in", "the", "first", "days", "to", "41mgh", "/",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "a", "new", "modeling", "approach", "which", "recognizes", "the", "repeated", "measures", "in", "a", "same", "patient", ",", "this", "study", "supports", "the", "association", "between", "MPA", "exposure", "and", "AR", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "-", "year", "supplementation", "with", "a", "grape", "extract", "containing", "resveratrol", "modulates", "inflammatory", "-", "related", "microRNAs", "and", "cytokines", "expression", "in", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "of", "type", "2", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Numerous", "studies", "have", "shown", "that", "resveratrol", "(", "RES", ")", "exerts", "anti", "-", "inflammatory", "effects", "but", "human", "trials", "evidencing", "these", "effects", "in", "vivo", "are", "limited", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "the", "molecular", "mechanisms", "triggered", "in", "humans", "following", "the", "oral", "intake", "of", "RES", "are", "not", "yet", "understood", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "the", "purpose", "of", "this", "study", "was", "to", "investigate", "the", "molecular", "changes", "in", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "PBMCs", ")", "associated", "to", "the", "one", "-", "year", "daily", "intake", "o...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O",...
[ "We", "used", "microarrays", "and", "RT", "-", "PCR", "to", "analyze", "expression", "changes", "in", "genes", "and", "microRNAs", "(", "miRs", ")", "involved", "in", "the", "inflammatory", "response", "modulated", "by", "the", "consumption", "of", "GE", "-"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "We", "also", "examined", "the", "changes", "in", "several", "serobiochemical", "variables", ",", "inflammatory", "and", "fibrinolytic", "markers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "showed", "that", "supplementation", "with", "GE", "or", "GE", "-", "RES", "did", "not", "affect", "body", "weight", ",", "blood", "pressure", ",", "glucose", ",", "HbA1c", "or", "lipids", ",", "beyond", "the", "values", "regulated", "by"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "did", "not", "find", "either", "any", "significant", "change", "on", "serum", "inflammatory", "markers", "except", "for", "a", "significant", "reduction", "of", "ALP", "and", "IL", "-", "6", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "expression", "of", "the", "pro", "-", "inflammatory", "cytokines", "CCL3", ",", "IL", "-", "1", "beta", "and", "TNF", "-", "alpha", "was", "significantly", "reduced", "and", "that", "of", "the", "transcriptional", "repressor", "LRRFIP", "-", "1", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Also", ",", "a", "group", "of", "miRs", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "the", "inflammatory", "response", ":", "miR", "-", "21", ",", "miR", "-", "181b", ",", "miR", "-", "663", ",", "miR", "-", "30c2", ",", "miR", "-", "155", "and",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Our", "results", "provide", "preliminary", "evidence", "that", "long", "-", "term", "supplementation", "with", "a", "grape", "extract", "containing", "RES", "downregulates", "the", "expression", "of", "key", "pro", "-", "inflammatory", "cytokines", "with", "the",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "Systems", "analysis", "of", "genetic", "variation", "in", "MPTP", "neurotoxicity", "in", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "analyzed", "genetic", "variation", "in", "severity", "of", "neuronal", "damage", "using", "the", "known", "dopaminergic", "neurotoxicant", ",", "MPTP", ",", "as", "a", "prototypical", "chemical", "denervation", "agent", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Male", "mice", "from", "ten", "members", "of", "the", "BXD", "family", "of", "recombinant", "inbred", "strains", "received", "12", ".", "5mg", "/", "kg", "MPTP", "s", ".", "c", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "(", "vs", ".", "saline", ")", "and", "48h", "later", "brains", "were", "taken", "for", "multiple", "related", "biochemical", "analyses", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Striatal", "dopamine", "(", "DA", ")", "and", "its", "metabolites", ",", "DOPAC", "and", "HVA", ",", "and", "serotonin", "and", "its", "metabolite", ",", "5", "-", "HIAAA", ",", "were", "analyzed", "by", "HPLC", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DA", "turnover", "was", "assessed", "using", "DOPAC", "/", "DA", "and", "HVA", "/", "DA", "ratios", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Striatal", "tyrosine", "hydroxylase", "(", "TH", ")", ",", "glial", "fibrilary", "acidic", "protein", "(", "GFAP", ")", ",", "and", "iron", "content", "in", "ventral", "midbrain", "were", "quantified", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "dopamine", "measures", ",", "as", "well", "as", "TH", "and", "GFAP", ",", "demonstrated", "wide", ",", "genotype", "-", "dependent", "differences", "in", "response", "to", "MPTP", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Serotonin", "was", "largely", "unaffected", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Principal", "components", "analysis", "(", "PC", ")", "on", "difference", "values", ",", "saline", "minus", "MPTP", ",", "for", "DA", ",", "DOPAC", ",", "HVA", ",", "and", "TH", ",", "yielded", "a", "dominant", "principal", "component", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "PC", "trait", "residuals", "for", "each", "genotype", "were", "compared", "against", "complementary", "expression", "data", "for", "striatum", "of", "the", "same", "strains", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Three", "transcripts", "representing", "Mtap2", ",", "Lancl", "1", ",", "and", "Kansl1l", "were", "highly", "correlated", "with", "the", "PC", ",", "as", "was", "the", "difference", "score", ",", "MPTP", "minus", "saline", "for", "GFAP", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "systems", "approach", "to", "the", "study", "of", "environmental", "neurotoxicants", "holds", "promise", "to", "define", "individual", "genetic", "differences", "that", "contribute", "to", "variability", "in", "susceptibility", "to", "risk", "factors", "for...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Design", ",", "synthesis", "and", "cytotoxicity", "of", "cell", "death", "mechanism", "of", "rotundic", "acid", "derivatives", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "investigation", ",", "16", "new", "rotundic", "acid", "(", "RA", ")", "derivatives", "modified", "at", "the", "C", "-", "3", ",", "C", "-", "23", "and", "C", "-", "28", "positions", "were", "synthesized", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "cytotoxicities", "of", "the", "derivatives", "were", "evaluated", "against", "HeLa", ",", "A375", ",", "HepG2", ",", "SPC", "-", "A1", "and", "NCI", "-", "H446", "human", "tumor", "cell", "lines", "by", "MTT", "assay", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Among", "these", "derivatives", ",", "compounds", "4", "-", "7", "exhibited", "stronger", "cell", "growth", "inhibitory", "than", "RA", "and", "compound", "4", "was", "found", "to", "be", "the", "best", "inhibition", "activity", "on", "five", "human", "tumo...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "apoptosis", "mechanism", "of", "compound", "4", "in", "HeLa", "cells", "was", "investigated", "by", "western", "blot", "analysis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "indicated", "that", "compound", "4", "could", "induce", "apoptosis", "through", "increasing", "protein", "expression", "of", "cleaved", "caspase", "-", "3", "and", "Bax", ",", "and", "decreasing", "protein", "expression", "of", "Bcl", "-", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "summary", ",", "the", "present", "work", "suggests", "that", "compound", "4", "might", "serve", "as", "an", "effective", "chemotherapeutic", "candidate", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Inhibition", "of", "PDGFR", "alpha", "by", "MEDI", "-", "575", "Reduces", "Tumor", "Growth", "and", "Stromal", "Fibroblast", "Content", "in", "a", "Model", "of", "Non", "-", "Small", "Cell", "Lung", "Cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "receptor", "alpha", "(", "PDGFR", "alpha", ")", "is", "a", "receptor", "tyrosine", "kinase", "that", "promotes", "cell", "survival", "and", "is", "expressed", "in", "both", "the", "tumor", "and", "the", "strom...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "developed", "a", "fully", "human", "monoclonal", "antibody", ",", "MEDI", "-", "575", ",", "that", "selectively", "binds", "to", "human", "PDGFR", "alpha", "with", "high", "affinity", ",", "with", "no", "observable", "affinity", "for", "murine...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "more", "fully", "characterize", "the", "role", "of", "PDGFR", "alpha", "in", "the", "regulation", "of", "tumor", "stroma", ",", "we", "evaluated", "the", "in", "vivo", "antitumor", "effects", "of", "MEDI", "-", "575", "in", "tumor", "-", "bearing", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "We", "utilized", "the", "Calu", "-", "6", "non", "-", "small", "cell", "lung", "cancer", "model", ",", "because", "it", "lacks", "an", "in", "vitro", "proliferative", "response", "to", "PDGFR", "alpha", "activation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Antitumor", "activity", "was", "observed", "when", "the", "study", "was", "performed", "in", "mice", "expressing", "the", "human", "receptor", ",", "but", "no", "activity", "was", "observed", "in", "the", "mice", "expressing", "the", "murine", "receptor", "."...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Immunohistological", "analysis", "of", "tumors", "from", "mice", "expressing", "human", "PDGFR", "alpha", "showed", "a", "highly", "significant", "reduction", "in", "stromal", "fibroblast", "content", "and", "only", "minor", "changes", "in", "tumor", "proliferative...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Additional", "in", "vitro", "studies", "indicated", "that", "exposure", "of", "primary", "cancer", "-", "associated", "fibroblasts", "to", "MEDI", "-", "575", "can", "directly", "affect", "proliferation", "and", "key", "signaling", "pathways", "in", "these", "c...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "highlight", "the", "potential", "for", "observing", "antitumor", "activity", "with", "MEDI", "-", "575", "through", "modulation", "of", "the", "stromal", "component", "of", "tumors", "and", "confirm", "that", "the", "PDGFR", "alpha", "pathwa...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Supramolecular", "H", "-", "bonded", "porous", "networks", "at", "surfaces", ":", "exploiting", "primary", "and", "secondary", "interactions", "in", "a", "bi", "-", "component", "melamine", "-", "xanthine", "system", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "control", "over", "the", "formation", "of", "a", "bi", "-", "component", "porous", "network", "was", "attained", "by", "the", "self", "-", "assembly", "at", "a", "solid", "-", "liquid", "interface", "by", "exploiting", "both", "primary", "and", "se...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMIC...
[ "Porphyromonas", "gingivalis", "virulence", "factor", "gingipain", "RgpB", "shows", "a", "unique", "zymogenic", "mechanism", "for", "cysteine", "peptidases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Zymogenicity", "is", "a", "regulatory", "mechanism", "which", "prevents", "inadequate", "catalytic", "activity", "in", "the", "wrong", "context", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "plays", "a", "central", "role", "in", "maintaining", "microbial", "virulence", "factors", "in", "an", "inactive", "form", "inside", "the", "pathogen", "until", "secretion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Among", "these", "virulence", "factors", "is", "the", "cysteine", "peptidase", "gingipain", "B", "(", "RgpB", ")", ",", "which", "is", "the", "major", "virulence", "factor", "secreted", "by", "the", "periodontopathogen", "Porphyromonas", "gingivalis", "that", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "structure", "of", "the", "complex", "between", "soluble", "mature", "RgpB", ",", "consisting", "of", "a", "catalytic", "domain", "and", "an", "immunoglobulin", "-", "superfamily", "domain", ",", "and", "its", "205", "-", "residue", "N", "-", "termina...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL",...
[ "It", "attaches", "laterally", "to", "the", "catalytic", "domain", "through", "a", "large", "concave", "surface", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "main", "determinant", "for", "latency", "is", "a", "surface", "inhibitory", "loop", ",", "which", "approaches", "the", "active", "-", "site", "cleft", "of", "the", "enzyme", "on", "its", "non", "-", "primed", "side", "in", "a", "substrate", "-", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "inserts", "an", "arginine", "(", "R126", ")", "into", "the", "S1", "pocket", ",", "thus", "matching", "the", "substrate", "specificity", "of", "the", "enzyme", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Downstream", "of", "R126", ",", "the", "polypeptide", "leaves", "the", "cleft", ",", "thereby", "preventing", "cleavage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "the", "carbonyl", "group", "of", "R126", "establishes", "a", "very", "strong", "hydrogen", "bond", "with", "the", "co", "-", "catalytic", "histidine", ",", "H440", ",", "pulling", "it", "away", "from", "the", "catalytic", "cysteine", ",", ...	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "The", "present", "results", "provide", "the", "structural", "determinants", "of", "zymogenic", "inhibition", "of", "RgpB", "by", "way", "of", "a", "novel", "inhibitory", "mechanism", "for", "peptidases", "in", "general", "and", "open", "the", "field", "for", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Disruption", "of", "Ttll5", "/", "Stamp", "gene", "(", "Tubulin", "tyrosine", "ligase", "-", "like", "protein", "5", "/", "SRC", "-", "1", "and", "TIF2", "associated", "modulatory", "protein", "gene", ")", "in", "male", "mice", "causes", "sperm", "malform...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Tubulin", "tyrosine", "ligase", "-", "like", "family", "member", "5", "(", "TTLL5", "/", "STAMP", ")", "has", "multiple", "activities", "in", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "TTLL5", "is", "one", "of", "13", "TTLLs", ",", "has", "polyglutamylation", "activity", ",", "augments", "the", "activity", "of", "p160", "coactivators", "(", "SRC", "-", "1", "and", "TIF2", ")", "in", "glucocorticoid", "receptor", "-", "regulated", "gene", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "To", "examine", "TTLL5", "/", "STAMP", "functions", "in", "whole", "animals", ",", "mice", "were", "prepared", "with", "an", "internal", "deletion", "that", "eliminated", "several", "activities", "of", "the", "Stamp", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "mutation", "causes", "both", "reduced", "levels", "of", "STAMP", "mRNA", "and", "C", "-", "terminal", "truncation", "of", "STAMP", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Homozygous", "targeted", "mutant", "(", "Stamptm", "/", "tm", ")", "mice", "appear", "normal", "except", "for", "marked", "decreases", "in", "male", "fertility", "associated", "with", "defects", "in", "progressive", "sperm", "motility", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Abnormal", "axonemal", "structures", "with", "loss", "of", "tubulin", "doublets", "occur", "in", "most", "Stamptm", "/", "tm", "sperm", "tails", "in", "conjunction", "with", "substantial", "reduction", "in", "alpha", "-", "tubulin", "polyglutamylation", ",", "w...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "axonemes", "in", "other", "structures", "appear", "unaffected", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "is", "no", "obvious", "change", "in", "the", "organs", "for", "sperm", "development", "of", "wt", "vs", ".", "Stamptm", "/", "tm", "males", "despite", "the", "levels", "of", "wt", "STAMP", "mRNA", "in", "testes", "being", "20", "-", "fold", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "defect", "in", "male", "fertility", "is", "unrelated", "to", "other", "Ttll", "genes", "or", "24", "genes", "previously", "identified", "as", "important", "for", "sperm", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "STAMP", "appears", "to", "participate", "in", "a", "unique", ",", "tissue", "-", "selective", "TTLL", "-", "mediated", "pathway", "for", "alpha", "-", "tubulin", "polyglutamylation", "that", "is", "required", "for", "sperm", "maturation", "and", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Impaired", "in", "vivo", "binding", "of", "MeCP2", "to", "chromatin", "in", "the", "absence", "of", "its", "DNA", "methyl", "-", "binding", "domain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MeCP2", "is", "a", "methyl", "-", "CpG", "-", "binding", "protein", "that", "is", "a", "main", "component", "of", "brain", "chromatin", "in", "vertebrates", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "vitro", "studies", "have", "determined", "that", "in", "addition", "to", "its", "specific", "methyl", "-", "CpG", "-", "binding", "domain", "(", "MBD", ")", "MeCP2", "also", "has", "several", "chromatin", "association", "domains", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "specific", "interactions", "of", "MeCP2", "with", "methylated", "or", "non", "-", "methylated", "chromatin", "regions", "and", "the", "structural", "characteristics", "of", "the", "resulting", "DNA", "associations", "in", "vivo", "remain", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "analysed", "the", "role", "of", "the", "MBD", "in", "MeCP2", "-", "chromatin", "associations", "in", "vivo", "using", "an", "MeCP2", "mutant", "Rett", "syndrome", "mouse", "model", "(", "Mecp2", "(", "tm", ")", "(", "1", ")", "(", ".", ")", "(...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Our", "results", "show", "that", "in", "mutant", "mice", ",", "the", "truncated", "form", "of", "MeCP2", "(", "Delta", "MeCP2", ")", "is", "expressed", "in", "different", "regions", "of", "the", "brain", "and", "liver", ",", "albeit", "at", "50", "%", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", "to", "the", "punctate", "nuclear", "distribution", "characteristic", "of", "wt", "MeCP2", ",", "Delta", "MeCP2", "exhibits", "both", "diffuse", "nuclear", "localization", "and", "a", "substantial", "retention", "in", "the", "cytoplasm", ",", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "mutant", "brain", "tissue", ",", "neuronal", "nuclei", "are", "smaller", ",", "and", "Delta", "MeCP2", "chromatin", "is", "digested", "faster", "by", "nucleases", ",", "producing", "a", "characteristic", "nuclease", "-", "resistant", "dinucleosome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "a", "fraction", "of", "Delta", "MeCP2", "is", "found", "associated", "with", "nucleosomes", ",", "its", "interaction", "with", "chromatin", "is", "transient", "and", "weak", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "our", "results", "unequivocally", "demonstrate", "that", "in", "vivo", "the", "MBD", "of", "MeCP2", "together", "with", "its", "adjacent", "region", "in", "the", "N", "-", "terminal", "domain", "are", "critical", "for", "the", "proper", "intera...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "E2f2", "induces", "cone", "photoreceptor", "apoptosis", "independent", "of", "E2f1", "and", "E2f3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "'", "activating", "'", "E2fs", "(", "E2f1", "-", "3", ")", "are", "transcription", "factors", "that", "potently", "induce", "quiescent", "cells", "to", "divide", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Work", "on", "cultured", "fibroblasts", "suggested", "they", "were", "essential", "for", "division", ",", "but", "in", "vivo", "analysis", "in", "the", "developing", "retina", "and", "other", "tissues", "disproved", "this", "notion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "retina", ",", "therefore", ",", "is", "an", "ideal", "location", "to", "assess", "other", "in", "vivo", "adenovirus", "E2", "promoter", "binding", "factor", "(", "E2f", ")", "functions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "thought", "that", "E2f1", "directly", "induces", "apoptosis", ",", "whereas", "other", "activating", "E2fs", "only", "induce", "death", "indirectly", "by", "upregulating", "E2f1", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Indeed", ",", "mouse", "retinoblastoma", "(", "Rb", ")", "-", "null", "retinal", "neuron", "death", "requires", "E2f1", ",", "but", "not", "E2f2", "or", "E2f3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "we", "report", "an", "entirely", "distinct", "mechanism", "in", "dying", "cone", "photoreceptors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "neurons", "survive", "Rb", "loss", ",", "but", "undergo", "apoptosis", "in", "the", "cancer", "-", "prone", "retina", "lacking", "both", "Rb", "and", "its", "relative", "p107", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "while", "E2f1", "killed", "Rb", "/", "p107", "null", "rod", ",", "bipolar", "and", "ganglion", "neurons", ",", "E2f2", "was", "required", "and", "sufficient", "for", "cone", "death", ",", "independent", "of", "E2f1", "and", "E2f3", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "whereas", "E2f1", "-", "dependent", "apoptosis", "was", "p53", "and", "p73", "-", "independent", ",", "E2f2", "caused", "p53", "-", "dependent", "cone", "death", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "in", "vivo", "analysis", "of", "cone", "photoreceptors", "provides", "unequivocal", "proof", "that", "E2f", "-", "induces", "apoptosis", "independent", "of", "E2f1", ",", "and", "reveals", "distinct", "E2f1", "-", "and", "E2f2", "-", "activated", "deat...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Glucose", "and", "memory", ":", "The", "influence", "of", "drink", ",", "expectancy", ",", "and", "beliefs", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RATIONALE", ":", "An", "increasing", "number", "of", "studies", "suggest", "that", "glucose", "can", "enhance", "aspects", "of", "memory", "and", "the", "central", "methodology", "is", "the", "use", "of", "the", "glucose", "-", "placebo", "design", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "critical", "issue", "therefore", "is", "separating", "the", "pharmacological", "effects", "of", "glucose", "from", "the", "expectancies", "created", "by", "consuming", "a", "drink", "that", "might", "contain", "glucose", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "OBJECTIVE", ":", "A", "modified", "balanced", "placebo", "design", "examined", "the", "role", "that", "expectancy", "and", "belief", "about", "the", "drink", "consumed", "has", "on", "the", "pharmacological", "changes", "observed", "following", "glucose", "consum...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "METHOD", ":", "Ninety", "-", "three", "participants", ",", "allocated", "according", "to", "a", "drink", "(", "glucose", ",", "placebo", ")", "x", "message", "(", "told", "glucose", ",", "told", "nothing", ",", "told", "placebo", ")", "unrelated", "design...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ "Each", "task", "has", "some", "evidence", "for", "hippocampus", "involvement", ",", "and", "variations", "in", "task", "difficulty", "were", "used", "to", "assess", "the", "idea", "that", "glucose", "effects", "are", "sensitive", "to", "task", "difficulty", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RESULTS", ":", "While", "the", "messages", "biased", "drink", "judgements", "in", "the", "expected", "direction", ",", "judgements", "of", "drink", "content", "were", "at", "chance", "and", "glucose", "only", "enhanced", "delayed", "free", "recall", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "subtle", "effects", "of", "the", "messages", "did", "not", "modify", "the", "glucose", "enhancement", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "However", ",", "believing", "glucose", "had", "been", "consumed", "showed", "an", "independent", "improvement", "in", "delayed", "free", "recall", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "joint", "model", ",", "adjusted", "for", "monitoring", "strategy", "(", "fixed", "-", "dose", "versus", "concentration", "-", "controlled", ")", "and", "recipient", "age", ",", "was", "developed", ";", "it", "combined", "a", "mixed", "-", "effects", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "MPA", "AUC", "thresholds", "were", "determined", "using", "time", "-", "dependent", "receiver", "-", "operating", "characteristics", "(", "ROC", ")", "curves", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Data", "from", "490", "adult", "renal", "-", "transplant", "recipients", ",", "representative", "of", "the", "general", "population", "of", "adult", "renal", "-", "transplant", "patients", "(", "i", ".", "e", ".", "including", "patients", "considered", "at", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "A", "significant", "association", "was", "found", "between", "the", "longitudinal", "exposure", "to", "MPA", "(", "MPA", "AUCs", "=", "f", "(", "t", ")", ")", "and", "AR", "(", "p", "=", "0", ".", "0081", ")", ",", "and", "validated", "by", "bootstr...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "significant", "positive", "correlation", "was", "observed", "between", "time", "post", "-", "transplantation", "and", "ROC", "thresholds", "which", "increased", "in", "average", "from", "35mgh", "/", "L", "in", "the", "first", "days", "to", "41mgh", "/",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "a", "new", "modeling", "approach", "which", "recognizes", "the", "repeated", "measures", "in", "a", "same", "patient", ",", "this", "study", "supports", "the", "association", "between", "MPA", "exposure", "and", "AR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "-", "year", "supplementation", "with", "a", "grape", "extract", "containing", "resveratrol", "modulates", "inflammatory", "-", "related", "microRNAs", "and", "cytokines", "expression", "in", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "of", "type", "2", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Numerous", "studies", "have", "shown", "that", "resveratrol", "(", "RES", ")", "exerts", "anti", "-", "inflammatory", "effects", "but", "human", "trials", "evidencing", "these", "effects", "in", "vivo", "are", "limited", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "the", "molecular", "mechanisms", "triggered", "in", "humans", "following", "the", "oral", "intake", "of", "RES", "are", "not", "yet", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "the", "purpose", "of", "this", "study", "was", "to", "investigate", "the", "molecular", "changes", "in", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "PBMCs", ")", "associated", "to", "the", "one", "-", "year", "daily", "intake", "o...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O",...

[ "We", "used", "microarrays", "and", "RT", "-", "PCR", "to", "analyze", "expression", "changes", "in", "genes", "and", "microRNAs", "(", "miRs", ")", "involved", "in", "the", "inflammatory", "response", "modulated", "by", "the", "consumption", "of", "GE", "-"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "We", "also", "examined", "the", "changes", "in", "several", "serobiochemical", "variables", ",", "inflammatory", "and", "fibrinolytic", "markers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "showed", "that", "supplementation", "with", "GE", "or", "GE", "-", "RES", "did", "not", "affect", "body", "weight", ",", "blood", "pressure", ",", "glucose", ",", "HbA1c", "or", "lipids", ",", "beyond", "the", "values", "regulated", "by"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "did", "not", "find", "either", "any", "significant", "change", "on", "serum", "inflammatory", "markers", "except", "for", "a", "significant", "reduction", "of", "ALP", "and", "IL", "-", "6", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "expression", "of", "the", "pro", "-", "inflammatory", "cytokines", "CCL3", ",", "IL", "-", "1", "beta", "and", "TNF", "-", "alpha", "was", "significantly", "reduced", "and", "that", "of", "the", "transcriptional", "repressor", "LRRFIP", "-", "1", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Also", ",", "a", "group", "of", "miRs", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "the", "inflammatory", "response", ":", "miR", "-", "21", ",", "miR", "-", "181b", ",", "miR", "-", "663", ",", "miR", "-", "30c2", ",", "miR", "-", "155", "and",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Our", "results", "provide", "preliminary", "evidence", "that", "long", "-", "term", "supplementation", "with", "a", "grape", "extract", "containing", "RES", "downregulates", "the", "expression", "of", "key", "pro", "-", "inflammatory", "cytokines", "with", "the",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "Systems", "analysis", "of", "genetic", "variation", "in", "MPTP", "neurotoxicity", "in", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "analyzed", "genetic", "variation", "in", "severity", "of", "neuronal", "damage", "using", "the", "known", "dopaminergic", "neurotoxicant", ",", "MPTP", ",", "as", "a", "prototypical", "chemical", "denervation", "agent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Male", "mice", "from", "ten", "members", "of", "the", "BXD", "family", "of", "recombinant", "inbred", "strains", "received", "12", ".", "5mg", "/", "kg", "MPTP", "s", ".", "c", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "(", "vs", ".", "saline", ")", "and", "48h", "later", "brains", "were", "taken", "for", "multiple", "related", "biochemical", "analyses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Striatal", "dopamine", "(", "DA", ")", "and", "its", "metabolites", ",", "DOPAC", "and", "HVA", ",", "and", "serotonin", "and", "its", "metabolite", ",", "5", "-", "HIAAA", ",", "were", "analyzed", "by", "HPLC", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DA", "turnover", "was", "assessed", "using", "DOPAC", "/", "DA", "and", "HVA", "/", "DA", "ratios", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Striatal", "tyrosine", "hydroxylase", "(", "TH", ")", ",", "glial", "fibrilary", "acidic", "protein", "(", "GFAP", ")", ",", "and", "iron", "content", "in", "ventral", "midbrain", "were", "quantified", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "dopamine", "measures", ",", "as", "well", "as", "TH", "and", "GFAP", ",", "demonstrated", "wide", ",", "genotype", "-", "dependent", "differences", "in", "response", "to", "MPTP", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Serotonin", "was", "largely", "unaffected", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Principal", "components", "analysis", "(", "PC", ")", "on", "difference", "values", ",", "saline", "minus", "MPTP", ",", "for", "DA", ",", "DOPAC", ",", "HVA", ",", "and", "TH", ",", "yielded", "a", "dominant", "principal", "component", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "PC", "trait", "residuals", "for", "each", "genotype", "were", "compared", "against", "complementary", "expression", "data", "for", "striatum", "of", "the", "same", "strains", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Three", "transcripts", "representing", "Mtap2", ",", "Lancl", "1", ",", "and", "Kansl1l", "were", "highly", "correlated", "with", "the", "PC", ",", "as", "was", "the", "difference", "score", ",", "MPTP", "minus", "saline", "for", "GFAP", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "systems", "approach", "to", "the", "study", "of", "environmental", "neurotoxicants", "holds", "promise", "to", "define", "individual", "genetic", "differences", "that", "contribute", "to", "variability", "in", "susceptibility", "to", "risk", "factors", "for...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Design", ",", "synthesis", "and", "cytotoxicity", "of", "cell", "death", "mechanism", "of", "rotundic", "acid", "derivatives", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "investigation", ",", "16", "new", "rotundic", "acid", "(", "RA", ")", "derivatives", "modified", "at", "the", "C", "-", "3", ",", "C", "-", "23", "and", "C", "-", "28", "positions", "were", "synthesized", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "cytotoxicities", "of", "the", "derivatives", "were", "evaluated", "against", "HeLa", ",", "A375", ",", "HepG2", ",", "SPC", "-", "A1", "and", "NCI", "-", "H446", "human", "tumor", "cell", "lines", "by", "MTT", "assay", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Among", "these", "derivatives", ",", "compounds", "4", "-", "7", "exhibited", "stronger", "cell", "growth", "inhibitory", "than", "RA", "and", "compound", "4", "was", "found", "to", "be", "the", "best", "inhibition", "activity", "on", "five", "human", "tumo...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "apoptosis", "mechanism", "of", "compound", "4", "in", "HeLa", "cells", "was", "investigated", "by", "western", "blot", "analysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "indicated", "that", "compound", "4", "could", "induce", "apoptosis", "through", "increasing", "protein", "expression", "of", "cleaved", "caspase", "-", "3", "and", "Bax", ",", "and", "decreasing", "protein", "expression", "of", "Bcl", "-", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "summary", ",", "the", "present", "work", "suggests", "that", "compound", "4", "might", "serve", "as", "an", "effective", "chemotherapeutic", "candidate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Inhibition", "of", "PDGFR", "alpha", "by", "MEDI", "-", "575", "Reduces", "Tumor", "Growth", "and", "Stromal", "Fibroblast", "Content", "in", "a", "Model", "of", "Non", "-", "Small", "Cell", "Lung", "Cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "receptor", "alpha", "(", "PDGFR", "alpha", ")", "is", "a", "receptor", "tyrosine", "kinase", "that", "promotes", "cell", "survival", "and", "is", "expressed", "in", "both", "the", "tumor", "and", "the", "strom...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "developed", "a", "fully", "human", "monoclonal", "antibody", ",", "MEDI", "-", "575", ",", "that", "selectively", "binds", "to", "human", "PDGFR", "alpha", "with", "high", "affinity", ",", "with", "no", "observable", "affinity", "for", "murine...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "more", "fully", "characterize", "the", "role", "of", "PDGFR", "alpha", "in", "the", "regulation", "of", "tumor", "stroma", ",", "we", "evaluated", "the", "in", "vivo", "antitumor", "effects", "of", "MEDI", "-", "575", "in", "tumor", "-", "bearing", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "We", "utilized", "the", "Calu", "-", "6", "non", "-", "small", "cell", "lung", "cancer", "model", ",", "because", "it", "lacks", "an", "in", "vitro", "proliferative", "response", "to", "PDGFR", "alpha", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Antitumor", "activity", "was", "observed", "when", "the", "study", "was", "performed", "in", "mice", "expressing", "the", "human", "receptor", ",", "but", "no", "activity", "was", "observed", "in", "the", "mice", "expressing", "the", "murine", "receptor", "."...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immunohistological", "analysis", "of", "tumors", "from", "mice", "expressing", "human", "PDGFR", "alpha", "showed", "a", "highly", "significant", "reduction", "in", "stromal", "fibroblast", "content", "and", "only", "minor", "changes", "in", "tumor", "proliferative...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Additional", "in", "vitro", "studies", "indicated", "that", "exposure", "of", "primary", "cancer", "-", "associated", "fibroblasts", "to", "MEDI", "-", "575", "can", "directly", "affect", "proliferation", "and", "key", "signaling", "pathways", "in", "these", "c...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "highlight", "the", "potential", "for", "observing", "antitumor", "activity", "with", "MEDI", "-", "575", "through", "modulation", "of", "the", "stromal", "component", "of", "tumors", "and", "confirm", "that", "the", "PDGFR", "alpha", "pathwa...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Supramolecular", "H", "-", "bonded", "porous", "networks", "at", "surfaces", ":", "exploiting", "primary", "and", "secondary", "interactions", "in", "a", "bi", "-", "component", "melamine", "-", "xanthine", "system", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "The", "control", "over", "the", "formation", "of", "a", "bi", "-", "component", "porous", "network", "was", "attained", "by", "the", "self", "-", "assembly", "at", "a", "solid", "-", "liquid", "interface", "by", "exploiting", "both", "primary", "and", "se...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMIC...

[ "Porphyromonas", "gingivalis", "virulence", "factor", "gingipain", "RgpB", "shows", "a", "unique", "zymogenic", "mechanism", "for", "cysteine", "peptidases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Zymogenicity", "is", "a", "regulatory", "mechanism", "which", "prevents", "inadequate", "catalytic", "activity", "in", "the", "wrong", "context", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "plays", "a", "central", "role", "in", "maintaining", "microbial", "virulence", "factors", "in", "an", "inactive", "form", "inside", "the", "pathogen", "until", "secretion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Among", "these", "virulence", "factors", "is", "the", "cysteine", "peptidase", "gingipain", "B", "(", "RgpB", ")", ",", "which", "is", "the", "major", "virulence", "factor", "secreted", "by", "the", "periodontopathogen", "Porphyromonas", "gingivalis", "that", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "structure", "of", "the", "complex", "between", "soluble", "mature", "RgpB", ",", "consisting", "of", "a", "catalytic", "domain", "and", "an", "immunoglobulin", "-", "superfamily", "domain", ",", "and", "its", "205", "-", "residue", "N", "-", "termina...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL",...

[ "It", "attaches", "laterally", "to", "the", "catalytic", "domain", "through", "a", "large", "concave", "surface", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "main", "determinant", "for", "latency", "is", "a", "surface", "inhibitory", "loop", ",", "which", "approaches", "the", "active", "-", "site", "cleft", "of", "the", "enzyme", "on", "its", "non", "-", "primed", "side", "in", "a", "substrate", "-", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "inserts", "an", "arginine", "(", "R126", ")", "into", "the", "S1", "pocket", ",", "thus", "matching", "the", "substrate", "specificity", "of", "the", "enzyme", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Downstream", "of", "R126", ",", "the", "polypeptide", "leaves", "the", "cleft", ",", "thereby", "preventing", "cleavage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "the", "carbonyl", "group", "of", "R126", "establishes", "a", "very", "strong", "hydrogen", "bond", "with", "the", "co", "-", "catalytic", "histidine", ",", "H440", ",", "pulling", "it", "away", "from", "the", "catalytic", "cysteine", ",", ...

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "The", "present", "results", "provide", "the", "structural", "determinants", "of", "zymogenic", "inhibition", "of", "RgpB", "by", "way", "of", "a", "novel", "inhibitory", "mechanism", "for", "peptidases", "in", "general", "and", "open", "the", "field", "for", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Disruption", "of", "Ttll5", "/", "Stamp", "gene", "(", "Tubulin", "tyrosine", "ligase", "-", "like", "protein", "5", "/", "SRC", "-", "1", "and", "TIF2", "associated", "modulatory", "protein", "gene", ")", "in", "male", "mice", "causes", "sperm", "malform...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Tubulin", "tyrosine", "ligase", "-", "like", "family", "member", "5", "(", "TTLL5", "/", "STAMP", ")", "has", "multiple", "activities", "in", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "TTLL5", "is", "one", "of", "13", "TTLLs", ",", "has", "polyglutamylation", "activity", ",", "augments", "the", "activity", "of", "p160", "coactivators", "(", "SRC", "-", "1", "and", "TIF2", ")", "in", "glucocorticoid", "receptor", "-", "regulated", "gene", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "To", "examine", "TTLL5", "/", "STAMP", "functions", "in", "whole", "animals", ",", "mice", "were", "prepared", "with", "an", "internal", "deletion", "that", "eliminated", "several", "activities", "of", "the", "Stamp", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "mutation", "causes", "both", "reduced", "levels", "of", "STAMP", "mRNA", "and", "C", "-", "terminal", "truncation", "of", "STAMP", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Homozygous", "targeted", "mutant", "(", "Stamptm", "/", "tm", ")", "mice", "appear", "normal", "except", "for", "marked", "decreases", "in", "male", "fertility", "associated", "with", "defects", "in", "progressive", "sperm", "motility", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Abnormal", "axonemal", "structures", "with", "loss", "of", "tubulin", "doublets", "occur", "in", "most", "Stamptm", "/", "tm", "sperm", "tails", "in", "conjunction", "with", "substantial", "reduction", "in", "alpha", "-", "tubulin", "polyglutamylation", ",", "w...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "axonemes", "in", "other", "structures", "appear", "unaffected", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "is", "no", "obvious", "change", "in", "the", "organs", "for", "sperm", "development", "of", "wt", "vs", ".", "Stamptm", "/", "tm", "males", "despite", "the", "levels", "of", "wt", "STAMP", "mRNA", "in", "testes", "being", "20", "-", "fold", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "defect", "in", "male", "fertility", "is", "unrelated", "to", "other", "Ttll", "genes", "or", "24", "genes", "previously", "identified", "as", "important", "for", "sperm", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "STAMP", "appears", "to", "participate", "in", "a", "unique", ",", "tissue", "-", "selective", "TTLL", "-", "mediated", "pathway", "for", "alpha", "-", "tubulin", "polyglutamylation", "that", "is", "required", "for", "sperm", "maturation", "and", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Impaired", "in", "vivo", "binding", "of", "MeCP2", "to", "chromatin", "in", "the", "absence", "of", "its", "DNA", "methyl", "-", "binding", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MeCP2", "is", "a", "methyl", "-", "CpG", "-", "binding", "protein", "that", "is", "a", "main", "component", "of", "brain", "chromatin", "in", "vertebrates", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vitro", "studies", "have", "determined", "that", "in", "addition", "to", "its", "specific", "methyl", "-", "CpG", "-", "binding", "domain", "(", "MBD", ")", "MeCP2", "also", "has", "several", "chromatin", "association", "domains", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "specific", "interactions", "of", "MeCP2", "with", "methylated", "or", "non", "-", "methylated", "chromatin", "regions", "and", "the", "structural", "characteristics", "of", "the", "resulting", "DNA", "associations", "in", "vivo", "remain", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "analysed", "the", "role", "of", "the", "MBD", "in", "MeCP2", "-", "chromatin", "associations", "in", "vivo", "using", "an", "MeCP2", "mutant", "Rett", "syndrome", "mouse", "model", "(", "Mecp2", "(", "tm", ")", "(", "1", ")", "(", ".", ")", "(...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Our", "results", "show", "that", "in", "mutant", "mice", ",", "the", "truncated", "form", "of", "MeCP2", "(", "Delta", "MeCP2", ")", "is", "expressed", "in", "different", "regions", "of", "the", "brain", "and", "liver", ",", "albeit", "at", "50", "%", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "the", "punctate", "nuclear", "distribution", "characteristic", "of", "wt", "MeCP2", ",", "Delta", "MeCP2", "exhibits", "both", "diffuse", "nuclear", "localization", "and", "a", "substantial", "retention", "in", "the", "cytoplasm", ",", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "mutant", "brain", "tissue", ",", "neuronal", "nuclei", "are", "smaller", ",", "and", "Delta", "MeCP2", "chromatin", "is", "digested", "faster", "by", "nucleases", ",", "producing", "a", "characteristic", "nuclease", "-", "resistant", "dinucleosome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "a", "fraction", "of", "Delta", "MeCP2", "is", "found", "associated", "with", "nucleosomes", ",", "its", "interaction", "with", "chromatin", "is", "transient", "and", "weak", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "our", "results", "unequivocally", "demonstrate", "that", "in", "vivo", "the", "MBD", "of", "MeCP2", "together", "with", "its", "adjacent", "region", "in", "the", "N", "-", "terminal", "domain", "are", "critical", "for", "the", "proper", "intera...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "E2f2", "induces", "cone", "photoreceptor", "apoptosis", "independent", "of", "E2f1", "and", "E2f3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "'", "activating", "'", "E2fs", "(", "E2f1", "-", "3", ")", "are", "transcription", "factors", "that", "potently", "induce", "quiescent", "cells", "to", "divide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Work", "on", "cultured", "fibroblasts", "suggested", "they", "were", "essential", "for", "division", ",", "but", "in", "vivo", "analysis", "in", "the", "developing", "retina", "and", "other", "tissues", "disproved", "this", "notion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "retina", ",", "therefore", ",", "is", "an", "ideal", "location", "to", "assess", "other", "in", "vivo", "adenovirus", "E2", "promoter", "binding", "factor", "(", "E2f", ")", "functions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "thought", "that", "E2f1", "directly", "induces", "apoptosis", ",", "whereas", "other", "activating", "E2fs", "only", "induce", "death", "indirectly", "by", "upregulating", "E2f1", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Indeed", ",", "mouse", "retinoblastoma", "(", "Rb", ")", "-", "null", "retinal", "neuron", "death", "requires", "E2f1", ",", "but", "not", "E2f2", "or", "E2f3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "we", "report", "an", "entirely", "distinct", "mechanism", "in", "dying", "cone", "photoreceptors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "neurons", "survive", "Rb", "loss", ",", "but", "undergo", "apoptosis", "in", "the", "cancer", "-", "prone", "retina", "lacking", "both", "Rb", "and", "its", "relative", "p107", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "while", "E2f1", "killed", "Rb", "/", "p107", "null", "rod", ",", "bipolar", "and", "ganglion", "neurons", ",", "E2f2", "was", "required", "and", "sufficient", "for", "cone", "death", ",", "independent", "of", "E2f1", "and", "E2f3", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "whereas", "E2f1", "-", "dependent", "apoptosis", "was", "p53", "and", "p73", "-", "independent", ",", "E2f2", "caused", "p53", "-", "dependent", "cone", "death", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "in", "vivo", "analysis", "of", "cone", "photoreceptors", "provides", "unequivocal", "proof", "that", "E2f", "-", "induces", "apoptosis", "independent", "of", "E2f1", ",", "and", "reveals", "distinct", "E2f1", "-", "and", "E2f2", "-", "activated", "deat...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Glucose", "and", "memory", ":", "The", "influence", "of", "drink", ",", "expectancy", ",", "and", "beliefs", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RATIONALE", ":", "An", "increasing", "number", "of", "studies", "suggest", "that", "glucose", "can", "enhance", "aspects", "of", "memory", "and", "the", "central", "methodology", "is", "the", "use", "of", "the", "glucose", "-", "placebo", "design", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "critical", "issue", "therefore", "is", "separating", "the", "pharmacological", "effects", "of", "glucose", "from", "the", "expectancies", "created", "by", "consuming", "a", "drink", "that", "might", "contain", "glucose", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "OBJECTIVE", ":", "A", "modified", "balanced", "placebo", "design", "examined", "the", "role", "that", "expectancy", "and", "belief", "about", "the", "drink", "consumed", "has", "on", "the", "pharmacological", "changes", "observed", "following", "glucose", "consum...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "METHOD", ":", "Ninety", "-", "three", "participants", ",", "allocated", "according", "to", "a", "drink", "(", "glucose", ",", "placebo", ")", "x", "message", "(", "told", "glucose", ",", "told", "nothing", ",", "told", "placebo", ")", "unrelated", "design...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ "Each", "task", "has", "some", "evidence", "for", "hippocampus", "involvement", ",", "and", "variations", "in", "task", "difficulty", "were", "used", "to", "assess", "the", "idea", "that", "glucose", "effects", "are", "sensitive", "to", "task", "difficulty", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RESULTS", ":", "While", "the", "messages", "biased", "drink", "judgements", "in", "the", "expected", "direction", ",", "judgements", "of", "drink", "content", "were", "at", "chance", "and", "glucose", "only", "enhanced", "delayed", "free", "recall", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "subtle", "effects", "of", "the", "messages", "did", "not", "modify", "the", "glucose", "enhancement", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "However", ",", "believing", "glucose", "had", "been", "consumed", "showed", "an", "independent", "improvement", "in", "delayed", "free", "recall", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]