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A variant on Chromosome 12 in gene SHMT2 (serine hydroxymethyltransferase 2) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Neurodevelopmental disorder with cardiomyopathy, spasticity, and brain abnormalities
GGCTCCAAACGCTGGGTAATCAGTGGAAAGGAAGCTCTTCTCCTACCTTAGTTCCTAGTCACAAACTCTGGGGTTCTCTTGGCTTTTCCATGCACGTGGATTGGGGCCTCAGGGAGCGGACGTGTAACTGGGGAATCCCCAAGACCCCTGGGCGCGCGTGGAGTTAACTGCGAGCCTGTCCTCATTCTGGCGATCAGACGCCCCAGGGCCTCGTGACCGCCCATTTCACGTGGCATTAGGGGAGAGGACAGCCCCGGATGCCCCGCGGACCCGGTGCTGGCAAATGAGCGGAGTTTTCGGCCTGGTCTCACAAGCTGAGCCTTTCCGGCCAGCTCTGAGCCCTGCAGATGATGCAACCGAGCTTCACTGCTTGCATCAGGCAGGGGTCCCGGCGGCAGTGAGGGCTGGAAGGAGGTGGAACGGGTAGGGGGCTAAGTAAGGGGAAAGGGTATTGGCTTACTCTCGGGCAGATCCCCACCCCCACCACTCCCACACAGCTCTTCCTCACGGACTGCTAAAGGTCTCCCCTCCCACCTGCATTGCTCTACAATCTGTGGCCTCAGCCCTTGCCAACTCTGCCTCTTCCCCCGCTGACTGGGGTATCAGTTTATGGTGCCCTGCAGGAAGACCCTCTTGTTCCTGTGGGTGGGAAGGTTCTGGAATCTCAGTTGCCCTCTCTGGAGTTGGGGAGACATAGGCTTTTGGAGGACAAGCTTTGCAGAGTGGTTCATGGAGTGAGGTGGTGGGAGATTTCTGAGGTGCGGTGCGGTGAATGGAGCAAATCAGAACCACCCCTTGGACGTTGATCTCAAGCTTGGCTCCAGAACTGGCTTTTGAAGGTGGAGGTGGGGGTAGTGAGAACTGAAACAGGCTGGCTGGACAACTGGCAGCTTGGTGTGGCCTTAGAAGCATGAGTGAGGGTGGCCGGGAGACGATTTGTCTGGACTGTTGTGATTTCACCCTGACTTTTCCTGCCTTCAGCCTCTGCAGAGATGTGGGCAGCTGGTCAGGATGGCCATTCGGGCTCAGCACAGCAACGCAGCCCAGACTCAGACTGGGGAAGCAAACAGGGGCTGGACAGGCCAGGAGAGCCTGTCGGACAGTGATCCTGAGATGTGGGAGTTGCTGCAGAGGGAGAAGGACAGGCAGTGTCGTGGCCTGGAGCTCATTGCCTCAGAGGTGGGACCTGGGGAGATGGGCAGGGGTTGGGCCACCATGGGTACAGGAAGTAACAAAGTTATCTTAACTGATATTTCTCCAAAACCCCCTTTCACACTCAGGACCTTTCTTTGGGCTTTATCTTCCTTTCTTATCTCCCTCAAGCAAAGGCAGTGCAAGTCCAGTTTATGGGGTTGGGACATTTAGGGAGCCTCCAGGGTCCCTACAGTTTCATCTGATCCCTTCCTTCCTTCCTCCTATGAGGAAGGAGGAGCCTAGAAGCACAAGTTTGAGTGGGTAGGTGGCATTGAGGGGCCACTGCTCATGGCAGATGGGTTTCTGAGAATGCTGCCTCTGGCTTTGCCCCAGGCCTGGTGCTGAGTGAATGGAGCTTTCTGCAGGGAGTACTCCCGCTTTCAGCTCTGGCTCTGGCAGGGAGGGACTGTGGGAGTCCAGGGGAAGGGGCTCAATACCTTCTGACATTGCCCCCCACCACCCCAGAACTTCTGCAGCCGAGCTGCGCTGGAGGCCCTGGGGTCCTGTCTGAACAACAAGTACTCGGAGGGTTATCCTGGCAAGAGGTGAGGGCTGGAGGGCAGTGTCAGGGATGGTGCTCCCAGTGGGGGAACCCACCTGTACCTTCCCAGTGTTCATTGAGGAGTGAACTTCCCAGTCCTTTGCTGATGGTTGAGAGTCCTTTCTCTGTGCCCTCATTACCCCTCTCCCACGGCAGATACTATGGGGGAGCAGAGGTGGTGGATGAAATTGAGCTGCTGTGCCAGCGCCGGGCCTTGGAAGCCTTTGACCTGGATCCTGCACAGTGGGGAGTCAATGTCCAGCCCTACTCCGGGTCCCCAGCCAACCTGGCCGTCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCAGTGAGTATGGATGGGCTGGCTGATGGTCTTGGCGGCAGGATTGGTGTGGGAAAGGAGTTATTTATTGAATACCTACTGTGGACCATACAGATGGAACAGGCCTTGCCCTGTCCTGCATGTCACAGTGGATGAGGAAGATAAGATCCCAGTTATAGTGCCTACCACAGAGTGGACAGAGCAGTGAGGCGGTGTGTCCTAGGACTGGTGTTCTGGGGACAGAGAACTGTGGAGTTGAAGGGAGTGGTTAAGTCCGGGGGTCCTTCCACCCAGGCCTTCTTACTTCCTCTCACTTCGCAGTCTCACCCACGGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCAACGTGAGTGCTCTAGGGTGTGGGGAGGGGCTCTTGGCCCTGGTGGTGGTCCTCCCCTGGAGAAGCTGAGGGCCTGGAGCGCCGGGCCGTCCTTAGGGTTAAGGAGGAGAGTGAGCTGCCCTGCTTCCTTCTCAGGGCTTTAGCTGTTTGTGTGTCTGTCCAGCCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTTGGTGGGGGGGGCTGGAGACTGGGCACCTCCCCAGGGGGTGGTGAGGAGGTGTGGGAGGAGGGCAGCCTTGGGCAGGCCTCTCCGGGCCCTCCCCAGGCTGAGGCCTTGCCTCTGTACCTGCCCAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGCTCCCTGAGGTCGGGCCTTGCCTTTCCCTGCCTTCAGGCCTATTCCTGGGGCACTGTTGGCCTGGACCTGAGAGGAATTCATTCCCACCTGCAGCCCTTAAGACTCCTGCCCAGTCTGTGAGAGTTCTCCTTCTCTTGCCCATGGTGGCCATGCCCTGGCAGGGGATTTGTGGATGGGATTGAGGGGCTGATTCCCTCTACCACTGGAATCCAGTGTACCAAGCCCACGTGAGCTGTGCCCTTGGGGCCCAGGTCCGCCAGCTTCCTCTGCCTTCTCTGTCCCTTGTCCTTCTTTTCAGCTTAGACTCTGACCATCCACCTCTCACACAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGTTGGGGATCCTGTCTTTGTAGGGTGTGGGGGGGCAATGGCCTGGAGGCTTAGACCCTGCACCTTGCTAACTGATGCTGGGGCTGATGGAAGGGAAATGCCAGGATGGAAGGAGTCAAGGCTGGGGTCACAGAGCTATGCTGAGGGTGCAGGGCCAGAGGGTAGTGCAGGGCTTGGGTCCAGGCCTAGGGTGACAGCTGCTACTGTCTCATCTCCAGGCCTGCACCCCCATGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCACTGGTATCAGGTAAGCCAGCAGGTGATGGGTGAGGGCCTCTGTAGCTTCAGGCAGAGGCCCAGGACTCACCACTCCCCATTTCTTACCCACCTTAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGTGAGACCTGGGG
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Task1_train_18001
Consider this mutation in SHMT2 (serine hydroxymethyltransferase 2) on Chromosome 12. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Neurodevelopmental disorder with cardiomyopathy, spasticity, and brain abnormalities
TGGCCGTCTACACAGCCCTTCTGCAACCTCACGACCGGATCATGGGGCTGGACCTGCCCGATGGGGGCCAGTGAGTATGGATGGGCTGGCTGATGGTCTTGGCGGCAGGATTGGTGTGGGAAAGGAGTTATTTATTGAATACCTACTGTGGACCATACAGATGGAACAGGCCTTGCCCTGTCCTGCATGTCACAGTGGATGAGGAAGATAAGATCCCAGTTATAGTGCCTACCACAGAGTGGACAGAGCAGTGAGGCGGTGTGTCCTAGGACTGGTGTTCTGGGGACAGAGAACTGTGGAGTTGAAGGGAGTGGTTAAGTCCGGGGGTCCTTCCACCCAGGCCTTCTTACTTCCTCTCACTTCGCAGTCTCACCCACGGCTACATGTCTGACGTCAAGCGGATATCAGCCACGTCCATCTTCTTCGAGTCTATGCCCTATAAGCTCAACGTGAGTGCTCTAGGGTGTGGGGAGGGGCTCTTGGCCCTGGTGGTGGTCCTCCCCTGGAGAAGCTGAGGGCCTGGAGCGCCGGGCCGTCCTTAGGGTTAAGGAGGAGAGTGAGCTGCCCTGCTTCCTTCTCAGGGCTTTAGCTGTTTGTGTGTCTGTCCAGCCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTTGGTGGGGGGGGCTGGAGACTGGGCACCTCCCCAGGGGGTGGTGAGGAGGTGTGGGAGGAGGGCAGCCTTGGGCAGGCCTCTCCGGGCCCTCCCCAGGCTGAGGCCTTGCCTCTGTACCTGCCCAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGCTCCCTGAGGTCGGGCCTTGCCTTTCCCTGCCTTCAGGCCTATTCCTGGGGCACTGTTGGCCTGGACCTGAGAGGAATTCATTCCCACCTGCAGCCCTTAAGACTCCTGCCCAGTCTGTGAGAGTTCTCCTTCTCTTGCCCATGGTGGCCATGCCCTGGCAGGGGATTTGTGGATGGGATTGAGGGGCTGATTCCCTCTACCACTGGAATCCAGTGTACCAAGCCCACGTGAGCTGTGCCCTTGGGGCCCAGGTCCGCCAGCTTCCTCTGCCTTCTCTGTCCCTTGTCCTTCTTTTCAGCTTAGACTCTGACCATCCACCTCTCACACAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGTTGGGGATCCTGTCTTTGTAGGGTGTGGGGGGGCAATGGCCTGGAGGCTTAGACCCTGCACCTTGCTAACTGATGCTGGGGCTGATGGAAGGGAAATGCCAGGATGGAAGGAGTCAAGGCTGGGGTCACAGAGCTATGCTGAGGGTGCAGGGCCAGAGGGTAGTGCAGGGCTTGGGTCCAGGCCTAGGGTGACAGCTGCTACTGTCTCATCTCCAGGCCTGCACCCCCATGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCACTGGTATCAGGTAAGCCAGCAGGTGATGGGTGAGGGCCTCTGTAGCTTCAGGCAGAGGCCCAGGACTCACCACTCCCCATTTCTTACCCACCTTAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGTGAGACCTGGGGTTTGAGGAGGGAAGGGGCTCCCATGCTGGATGACTGCCAGGTGACCTTGGGCTATGCTCATCCCTCCCCTTGTGCCTCGTTCCAGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTTGTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGGTGAGTGAGCAAGAAGGAGCCCCGGGCCAGCCAGTTCCCACTCACTGTCTGCTCCCTCCCCCAGCTGATCTCACTGCCTTCCCTAGAGCTCTGACCACTTGTTTCCTCACCCTCTCTCTCTAGCCAAGCTCCAGGATTTCAAATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCAGGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCATTGAAGGCACCTGGGAAATGAGGCCCACAGACTCAAAGTTACTCTCCTTCCCCCTACCTGGGCCAGTGAAATAGAAAGCCTTTCTATTTTTTGGTGCGGGAGGGAAGACCTCTCACTTAGGGCAAGAGCCAGGTATAGTCTCCCTTCCCAGAATTTGTAACTGAGAAGATCTTTTCTTTTTCCTTTTTTTGGTAACAAGACTTAGAAGGAGGGCCCAGGCACTTTCTGTTTGAACCCCTGTCATGATCACAGTGTCAGAGACGCGTCCTCTTTCTTGGGGAAGTTGAGGAGTGCCCTTCAGAGCCAGTAGCAGGCAGGGGTGGGTAGGCACCCTCCTTCCTGTTTTTATCTAATAAAATGCTAACCTGCCCTGAGTTTCCATTACTGTGGGTGGGGTTCCCCTGGGCCAAACAGTGATTTGTCTCCCTCAATGTGTACACCGCTCCGCTCCCACCACCGCTACCACAAGGACCCCCGGGGCTGCAGCCTCCTCTTTCTGTCTCTGATCAGAGCCGACACCAGACGTGATTAGCAGGCGCAGCAAATTCAATTTGTTAAATGAAATTGTATTTTGCCCACGGCTGCTTCTGTTTGATCCCTGGGGACAGAGGGGAGCAAGGGAGGGGAGTGGCAGGGGGAGGCCCAGGTGTGGGGCTGGAGGGGGTACTGGCGGCAGCGGGAGGCAGTAGGCTTGGGCAGGGGAGGAGTGCGCTGCGCCTCAGGAGGCAAAGGTGCCCCAGCCTGGGCAGGCCCTGGACCAGCCCAAGCTGAGCAGCGCCGCCCCTGGGCTGGCTCTCAGAGCCTGGGCTAACGTGGAGCCCGCCACGTCGCTTGGCACTCAGAGGCCCCTGCTTCTTGTTGGCTCACGTAGGCCACGCTCAACACGTAGCCTGTGCCACACCCTTCGAGGCCCGGGTAGGAGGGCAGAGGGGCTGGTCTGGGCTCTTGGTGGACCCCTGCTGGTGCTGCCTGCCTCCTCCTCCCCCACGTGGGACTCAAGCCAAGGGTCAGAGGCGCTTCCGCTGCTGGGAGCAAGGGAGGAGAGTAGGGGTGGAGCAGCCTCCCCTCTGCGTGGGAACCCGGCCTGTGTAAGCAGTAGCGGGACAGGGTGGCCGGAGTGATGCCTTGGGGCCTGCGGGGAGGAGTGGAAGAAGTGGATGGGCTGGCTGGCTGTGGCTTGCATGGCACTGGCAGCCCAGCCTGGCTTAGAAGTCTGGCCGGTCCTTCTTCAGCTTCTTATAGTCAGTGGAAACTGCAAGGAACTAAGAGGAGAGGGAAAGGGGGTTGCGCTGAGTACCCCAAGCCTCCCTTTGCTTCTAGTACGGGAGTTGTGGGTGCCAGGACCAGGAGATAAGAGGATGGGGGGCAACCCTAGAGCCATCGAGAGGTACCTTGTATTGGTCATTGGGGCTCAGGCGGTTCCAGGGCTCCGGGTTGTTCTTTCTGTCCCAGCTGTGGAGCAGGAGGGGGGAGGGTTAGGGTCTCCTCCCTGGGACCCAGAACTCTGTAACCCAATTTGACCCCCAAGCTCCACCCGGAGGCTCTGGCCCCACCCCAGTACCCCTGCCTCCTGCCCTGGGGG
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Task1_train_18002
A genetic alteration is present in SHMT2 (serine hydroxymethyltransferase 2) on Chromosome 12. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Neurodevelopmental disorder with cardiomyopathy, spasticity, and brain abnormalities
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Task1_train_18003
Consider a variant on Chromosome 12 in gene SHMT2 (serine hydroxymethyltransferase 2). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Neurodevelopmental disorder with cardiomyopathy, spasticity, and brain abnormalities
GTGAGTGCTCTAGGGTGTGGGGAGGGGCTCTTGGCCCTGGTGGTGGTCCTCCCCTGGAGAAGCTGAGGGCCTGGAGCGCCGGGCCGTCCTTAGGGTTAAGGAGGAGAGTGAGCTGCCCTGCTTCCTTCTCAGGGCTTTAGCTGTTTGTGTGTCTGTCCAGCCCAAAACTGGCCTCATTGACTACAACCAGCTGGCACTGACTGCTCGACTTTTCCGGCCACGGCTCATCATAGCTGGCACCAGCGCCTATGCTCGCCTCATTGACTACGCCCGCATGAGAGAGGTTGGTGGGGGGGGCTGGAGACTGGGCACCTCCCCAGGGGGTGGTGAGGAGGTGTGGGAGGAGGGCAGCCTTGGGCAGGCCTCTCCGGGCCCTCCCCAGGCTGAGGCCTTGCCTCTGTACCTGCCCAGGTGTGTGATGAAGTCAAAGCACACCTGCTGGCAGACATGGCCCACATCAGTGGCCTGGTGGCTGCCAAGGTGATTCCCTCGCCTTTCAAGCACGCGGACATCGTCACCACCACTACTCACAAGACTCTTCGAGGGGCCAGGTCAGGCTCCCTGAGGTCGGGCCTTGCCTTTCCCTGCCTTCAGGCCTATTCCTGGGGCACTGTTGGCCTGGACCTGAGAGGAATTCATTCCCACCTGCAGCCCTTAAGACTCCTGCCCAGTCTGTGAGAGTTCTCCTTCTCTTGCCCATGGTGGCCATGCCCTGGCAGGGGATTTGTGGATGGGATTGAGGGGCTGATTCCCTCTACCACTGGAATCCAGTGTACCAAGCCCACGTGAGCTGTGCCCTTGGGGCCCAGGTCCGCCAGCTTCCTCTGCCTTCTCTGTCCCTTGTCCTTCTTTTCAGCTTAGACTCTGACCATCCACCTCTCACACAGGTCAGGGCTCATCTTCTACCGGAAAGGGGTGAAGGCTGTGGACCCCAAGACTGGCCGGGAGATCCCTTACACATTTGAGGACCGAATCAACTTTGCCGTGTTCCCATCCCTGCAGGGGGGCCCCCACAATCATGCCATTGCTGCAGTAGCTGTGGCCCTAAAGCAGGTTGGGGATCCTGTCTTTGTAGGGTGTGGGGGGGCAATGGCCTGGAGGCTTAGACCCTGCACCTTGCTAACTGATGCTGGGGCTGATGGAAGGGAAATGCCAGGATGGAAGGAGTCAAGGCTGGGGTCACAGAGCTATGCTGAGGGTGCAGGGCCAGAGGGTAGTGCAGGGCTTGGGTCCAGGCCTAGGGTGACAGCTGCTACTGTCTCATCTCCAGGCCTGCACCCCCATGTTCCGGGAGTACTCCCTGCAGGTTCTGAAGAATGCTCGGGCCATGGCAGATGCCCTGCTAGAGCGAGGCTACTCACTGGTATCAGGTAAGCCAGCAGGTGATGGGTGAGGGCCTCTGTAGCTTCAGGCAGAGGCCCAGGACTCACCACTCCCCATTTCTTACCCACCTTAGGTGGTACTGACAACCACCTGGTGCTGGTGGACCTGCGGCCCAAGGGCCTGGATGGAGCTCGGGCTGAGCGGGTGCTAGAGCTTGTATCCATCACTGCCAACAAGAACACCTGTCCTGGAGACCGAAGTGCCATCACACCGGGCGGCCTGCGGCTTGGTGAGACCTGGGGTTTGAGGAGGGAAGGGGCTCCCATGCTGGATGACTGCCAGGTGACCTTGGGCTATGCTCATCCCTCCCCTTGTGCCTCGTTCCAGGGGCCCCAGCCTTAACTTCTCGACAGTTCCGTGAGGATGACTTCCGGAGAGTTGTGGACTTTATAGATGAAGGGGTCAACATTGGCTTAGAGGTGAAGAGCAAGACTGGTGAGTGAGCAAGAAGGAGCCCCGGGCCAGCCAGTTCCCACTCACTGTCTGCTCCCTCCCCCAGCTGATCTCACTGCCTTCCCTAGAGCTCTGACCACTTGTTTCCTCACCCTCTCTCTCTAGCCAAGCTCCAGGATTTCAAATCCTTCCTGCTTAAGGACTCAGAAACAAGTCAGCGTCTGGCCAACCTCAGGCAACGGGTGGAGCAGTTTGCCAGGGCCTTCCCCATGCCTGGTTTTGATGAGCATTGAAGGCACCTGGGAAATGAGGCCCACAGACTCAAAGTTACTCTCCTTCCCCCTACCTGGGCCAGTGAAATAGAAAGCCTTTCTATTTTTTGGTGCGGGAGGGAAGACCTCTCACTTAGGGCAAGAGCCAGGTATAGTCTCCCTTCCCAGAATTTGTAACTGAGAAGATCTTTTCTTTTTCCTTTTTTTGGTAACAAGACTTAGAAGGAGGGCCCAGGCACTTTCTGTTTGAACCCCTGTCATGATCACAGTGTCAGAGACGCGTCCTCTTTCTTGGGGAAGTTGAGGAGTGCCCTTCAGAGCCAGTAGCAGGCAGGGGTGGGTAGGCACCCTCCTTCCTGTTTTTATCTAATAAAATGCTAACCTGCCCTGAGTTTCCATTACTGTGGGTGGGGTTCCCCTGGGCCAAACAGTGATTTGTCTCCCTCAATGTGTACACCGCTCCGCTCCCACCACCGCTACCACAAGGACCCCCGGGGCTGCAGCCTCCTCTTTCTGTCTCTGATCAGAGCCGACACCAGACGTGATTAGCAGGCGCAGCAAATTCAATTTGTTAAATGAAATTGTATTTTGCCCACGGCTGCTTCTGTTTGATCCCTGGGGACAGAGGGGAGCAAGGGAGGGGAGTGGCAGGGGGAGGCCCAGGTGTGGGGCTGGAGGGGGTACTGGCGGCAGCGGGAGGCAGTAGGCTTGGGCAGGGGAGGAGTGCGCTGCGCCTCAGGAGGCAAAGGTGCCCCAGCCTGGGCAGGCCCTGGACCAGCCCAAGCTGAGCAGCGCCGCCCCTGGGCTGGCTCTCAGAGCCTGGGCTAACGTGGAGCCCGCCACGTCGCTTGGCACTCAGAGGCCCCTGCTTCTTGTTGGCTCACGTAGGCCACGCTCAACACGTAGCCTGTGCCACACCCTTCGAGGCCCGGGTAGGAGGGCAGAGGGGCTGGTCTGGGCTCTTGGTGGACCCCTGCTGGTGCTGCCTGCCTCCTCCTCCCCCACGTGGGACTCAAGCCAAGGGTCAGAGGCGCTTCCGCTGCTGGGAGCAAGGGAGGAGAGTAGGGGTGGAGCAGCCTCCCCTCTGCGTGGGAACCCGGCCTGTGTAAGCAGTAGCGGGACAGGGTGGCCGGAGTGATGCCTTGGGGCCTGCGGGGAGGAGTGGAAGAAGTGGATGGGCTGGCTGGCTGTGGCTTGCATGGCACTGGCAGCCCAGCCTGGCTTAGAAGTCTGGCCGGTCCTTCTTCAGCTTCTTATAGTCAGTGGAAACTGCAAGGAACTAAGAGGAGAGGGAAAGGGGGTTGCGCTGAGTACCCCAAGCCTCCCTTTGCTTCTAGTACGGGAGTTGTGGGTGCCAGGACCAGGAGATAAGAGGATGGGGGGCAACCCTAGAGCCATCGAGAGGTACCTTGTATTGGTCATTGGGGCTCAGGCGGTTCCAGGGCTCCGGGTTGTTCTTTCTGTCCCAGCTGTGGAGCAGGAGGGGGGAGGGTTAGGGTCTCCTCCCTGGGACCCAGAACTCTGTAACCCAATTTGACCCCCAAGCTCCACCCGGAGGCTCTGGCCCCACCCCAGTACCCCTGCCTCCTGCCCTGGGGGTCCCATTTCCCAGATACTGACAAAGGAACGGTCATATTAGCAGGTGCTGACAAGTGAGACAAGAAGCCTGTCACCATTGTCAGCATGGGGCTGCGTGACAAACTGACAACGGGGCCCAGGGACTCCCACTTGCTGCCTGCCACCCTAGGTTAACCCTAAGAGCAGAGTCGTGGGAATCAGACACAGATCCCAAGGGGCTGGGTTTCTGGTGATGTGCCGGGAATTATAAAGCCATGGGTGCGCCTTTCACTTCCGGACCCTCTCCGCGGCCGGGTGTGAAATCTCCGCCCCACACTGGTCCCCAATGCCACCCCCAGCAGCTCACCCGGCCACAACCCCAGTGCTCTGGTGAGGACTTAGAGGTACCCAAAAGCCCAAGCCCACCGCTGGCTGAGCGGCGTCGTCATGGCAACCCGGCCGGGAGAGGCGCGGGTTCCGCATTTCAGGGC
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Task1_train_18004
A genetic alteration is present in STAC3 (SH3 and cysteine rich domain 3) on Chromosome 12. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Bailey-Bloch congenital myopathy
TGTTCCTATTCCAGCTCAATCGCGATTAAAGGGGGGGGTCTTCTTTAATGACTCCGCCCCCACCCCCTCAGGCATCCGGGACCGTCAAGGGCAAAGGGAACAGAAAACTGAACCCGGTTCTGCAGAGTCTTCTTGTGTGCTTCCCTACCCCCATCACACCTCAGCCTTCTGGAAGGGGGGCGCGCCCGTCCCAGGCCTCCTCTTCCCCAGCCCAGCTGAGCCTCTGCCCTCCCCCCGCCAGCAGCAGATGGTGCCCGGGCTCCCGCTGCCAACCTTGCTAGGCGGTGCCAACCTCGGTCCTGGCAGACAACGGGCAGACGAGAAGAGGAGCTCCTGGCTGGCCAAGCCGACCCTCCCCCACCCGGCATCGAGCTCAAGACCCCCCCCACACACGCCTGCCCCACTCCAGCGACCACCCCAGCCTGCCTCTCACTGGGTCCGCTCTCAGGTCCCCAAACTCCTCGTCTCCTTCTGCTCCCTTCCCCACACCTTCCTGCTCCTCGCCACCTGCCGCCCTGACCAGGGCCGGCGTATTTGCATATTTGCATATGCAAATAATAACATTTGCATACGGTGCTCCGCAGGGGTGTCTCCGCGAGAGCCGGTTAGCTGTCTGCCCTCCGTTCTCACTCGGTACCTGTCGGAAAGGGTTAGGGCAGGGGCCGCGCGGGTGGGGTTAGGCCCCCGGCCTAGCTAGCTCGGTTCTCGGAGGACTTGAGGAAGTGTTGCCATGGAGACGGCACGCACCCCACCCCCTCCCAGGCCCAGGGTCTCGGGCTTGGTGTCTCTGGTTGTCTCCCCTTACCCACCCTCCACCCCCTCCCCATCCCTCGCTCTCCAACCGAGATCTTGCATCGCCCCCTGGCGGCCTAGCTCGGCGCCAAGCCAGATTCCGAAATGCAAGGGGCTGCCTGCGGCTAAATCGCCAAGAGCAAGGGGGGACTTACCCTACTACAAGATCCTGCTCCCAACCGCTGGGGCGCGGGGGCGGCGACTCCAGCCCTGCGCTCCCCTTTCTTTACTGACTACAGAGGCCTCACCTGGCGGGCGCACTTCCCACCTCCCGCCAACCTCAGCCCAGATGGGTCTCAGGTTACCCGATGGTAACGAGGCGGGACAGCTAGGGAGGATTCTCCACCCCTCCGCAGGCCCTCTCCTCAACCCCAGTTAAATAACAACTTTTCTAAGTTTTGTCAAAAGTTTAATAAATTCGCAACATTCGACAGTTCGCCCTCCCTCGCCCCCGCCCCCCGCCCCAGTCCCTGGCTCCTCCTAGTAGATACGCGTTTTTTTCCAGCTCTTGCAAGCGGGGCCTGAAAGGTTTCGGGTCCGGGCTGCTCTGGGCAGCAGGTATCCGAGGCCCCAGGCTGGGGAAGGGGGCGAGAACCAGTCCCTTCCCGGAAGCCCCGTCGCGCTCAGGCGGGCCTTCCTACCCCTCCTCTCCCAGCAGTCCCGTTGCTTTCGCCCCCCTCCCCAAACTCCACTGGGCCCGCCCAGAATGGGGTGTGGGTGTCTCCCGCTTGCAGGCGCCCGCACGCCTAAATTTCCTCTAGAAAGTCGGTGGGAAACAGCCCCACCTTGCGGCCGGTGTAGACCTTGACGTAGCCGCCCGCTTCGTCTCCTTTCTGCACCACGATCTAGAAGATTAAAGGATCAGAAGTAGGAGAGGAATCAAAGGAAAAGGTAGGAGAGGACAGCAGGGGAGCCGGGGTTTACAGGGGCTCACCCTAGTCTTATTAATGGTTAAGCTCTCCAAGGAGTGTGGTGGGCTAGGGAGCATTCAGGCCTGGGATTGGGTTGGGGCAACAGCCTACCTGGTCCTTCTTGAGAGTGATCTGCCCTATCTCGCGGTTCCCCACGAAGGATCTCGTCACGCGGTGCACACGTTCTCCAGCCCGGACCCGAATGATGAAGTTTGGAGGGAAAAATCCGACCTTCTCCCCGATTTTCCCCTAGGGAAGATAGTAGGGAGAGTCCATCTCTCAATGTCGGGTTCTGGACTCAACCCACACTCCACCCTAGCCCTAGCCATTTCTCTCACCCGCCACCATTCTTCATTGGAGTCATCAATGACTGTGATCTTCTCTCCTGGCCTGGGAGGGGAAGGGAGGGGCCTCACTCACATAGCAGGTCCCCTGCTGTGCCCCGGGTCCAGCATCAATAGGCTCCAAGCCCTGAGTCCCCCCTTTTCCTTTCCCTTGGGGGAACCCAGCTCTTTCCTCTTCACTCCGCAGTACCAGCCCCCTGCCCCAAGGCCTCTCACGGGAAATCCAGATCGTCCTTCTCCAGGGCTTTGAACCGATAGAGAGCCACAAAGTAATGAGACTGCTGGAAGCCAGGCTGCTTGTGCTGGGGGTGCAAGGGAATGATGAGTCTTAGGGCTCCTCTACCCCACACTGAGGGGCAGGATTCCAAGGCAGGGACATTCACCACACACTCTACACTCCAACTCTCTTCTAGGTCCCTGAACTGAGAGAAGTGTTTTGGTCGTGGGTGGGTGTGCAAGTTGATGGAGAGTGTGGGTCAGAAGTGATGGGAAGCCTAGGAGTTAAAGAGTGAGCTTCTGCCAGGGCCATGAGTAGTGGTGTCAGAGCTGGGTTGGGGAGAGAACTGGGTTCCTTGCAGGGAGGAAGGATTCTTACCTTGTCATCAGGTGTCTTCTTCTCAGCCTTCTTATCCCCTTCAGGGTTTCCTGGGATAGGAAACACCAACAAATTGTCTGTCTCCTGGAGGGCAATTCTTATTCTCTTACCCTTTTGTGGAAGGGCCTCGTCTATCCAAAGCTGGCCTGCCCTTTGCTCCTCCACCCTCTGTTCCACAGCTGAGCCTCTGATCCTACTCCATCTCTGGATGGAGGTGGGTAACACTCACCATCCTGGGGTTTGCCTTCCTCTGGTCTGGCCGACTCTGGCTCCTCCTCCATCATGGCTGCTACAGGCTGGAGGGGGCACCAGAGTTAGGGAGACGCTGTCTTGGGAACACATGCCCTGGCTGTCTATAATCAGGTCAGAGAACTATAGAATAATGGGATCTCAGAGATCTCAGAGTTGGAAGAGGCCTTGGAGGAAATATCTAGTTCAGCCATCTGCCTAATGCAGGAACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGGTCTCCCTCCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAGTGCCAGCTCCGCCTCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGATCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCACCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGACCCACTGTGCCCGGCCATGCAGGGACTTTCCCTAAAACATCCTATCAGGTGGGTCACCCACATTCTGCTTGAATGTAGCTAAATAACAGGGAATTCACTACCAGATTCCAGGTCCTTGACTATGCTGTCAGCCTTTAAAAATACTCCAGTGTGTAAGTAAAAAGTGAGCAGCATGGTCAGGCGCGGTGGCTTATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAATCTCCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATCGCTTGGACCCGGGAGGCAGAGTTTGCGGTGAGCCGAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGCAGCACAATTTTTATAATTCCCTTAAAAGAATATAACCCAAGAGTATGTTAGCCCTTCTGGAAGCAGCCATATCACATTGCTAGTGCCTTACAAGTCATTAATTCACTCCATAGAAATCCCTTATCTGTGTCCAACCTCCATATCAACAAGTTTGAGGCCAGATTTCTAGTTGTTTTTTGCAGTTGATTTTTTTGATCAGATATGTACATTTATCTTTTCTTTTCCCTTCCTTC
TGTTCCTATTCCAGCTCAATCGCGATTAAAGGGGGGGGTCTTCTTTAATGACTCCGCCCCCACCCCCTCAGGCATCCGGGACCGTCAAGGGCAAAGGGAACAGAAAACTGAACCCGGTTCTGCAGAGTCTTCTTGTGTGCTTCCCTACCCCCATCACACCTCAGCCTTCTGGAAGGGGGGCGCGCCCGTCCCAGGCCTCCTCTTCCCCAGCCCAGCTGAGCCTCTGCCCTCCCCCCGCCAGCAGCAGATGGTGCCCGGGCTCCCGCTGCCAACCTTGCTAGGCGGTGCCAACCTCGGTCCTGGCAGACAACGGGCAGACGAGAAGAGGAGCTCCTGGCTGGCCAAGCCGACCCTCCCCCACCCGGCATCGAGCTCAAGACCCCCCCCACACACGCCTGCCCCACTCCAGCGACCACCCCAGCCTGCCTCTCACTGGGTCCGCTCTCAGGTCCCCAAACTCCTCGTCTCCTTCTGCTCCCTTCCCCACACCTTCCTGCTCCTCGCCACCTGCCGCCCTGACCAGGGCCGGCGTATTTGCATATTTGCATATGCAAATAATAACATTTGCATACGGTGCTCCGCAGGGGTGTCTCCGCGAGAGCCGGTTAGCTGTCTGCCCTCCGTTCTCACTCGGTACCTGTCGGAAAGGGTTAGGGCAGGGGCCGCGCGGGTGGGGTTAGGCCCCCGGCCTAGCTAGCTCGGTTCTCGGAGGACTTGAGGAAGTGTTGCCATGGAGACGGCACGCACCCCACCCCCTCCCAGGCCCAGGGTCTCGGGCTTGGTGTCTCTGGTTGTCTCCCCTTACCCACCCTCCACCCCCTCCCCATCCCTCGCTCTCCAACCGAGATCTTGCATCGCCCCCTGGCGGCCTAGCTCGGCGCCAAGCCAGATTCCGAAATGCAAGGGGCTGCCTGCGGCTAAATCGCCAAGAGCAAGGGGGGACTTACCCTACTACAAGATCCTGCTCCCAACCGCTGGGGCGCGGGGGCGGCGACTCCAGCCCTGCGCTCCCCTTTCTTTACTGACTACAGAGGCCTCACCTGGCGGGCGCACTTCCCACCTCCCGCCAACCTCAGCCCAGATGGGTCTCAGGTTACCCGATGGTAACGAGGCGGGACAGCTAGGGAGGATTCTCCACCCCTCCGCAGGCCCTCTCCTCAACCCCAGTTAAATAACAACTTTTCTAAGTTTTGTCAAAAGTTTAATAAATTCGCAACATTCGACAGTTCGCCCTCCCTCGCCCCCGCCCCCCGCCCCAGTCCCTGGCTCCTCCTAGTAGATACGCGTTTTTTTCCAGCTCTTGCAAGCGGGGCCTGAAAGGTTTCGGGTCCGGGCTGCTCTGGGCAGCAGGTATCCGAGGCCCCAGGCTGGGGAAGGGGGCGAGAACCAGTCCCTTCCCGGAAGCCCCGTCGCGCTCAGGCGGGCCTTCCTACCCCTCCTCTCCCAGCAGTCCCGTTGCTTTCGCCCCCCTCCCCAAACTCCACTGGGCCCGCCCAGAATGGGGTGTGGGTGTCTCCCGCTTGCAGGCGCCCGCACGCCTAAATTTCCTCTAGAAAGTCGGTGGGAAACAGCCCCACCTTGCGGCCGGTGTAGACCTTGACGTAGCCGCCCGCTTCGTCTCCTTTCTGCACCACGATCTAGAAGATTAAAGGATCAGAAGTAGGAGAGGAATCAAAGGAAAAGGTAGGAGAGGACAGCAGGGGAGCCGGGGTTTACAGGGGCTCACCCTAGTCTTATTAATGGTTAAGCTCTCCAAGGAGTGTGGTGGGCTAGGGAGCATTCAGGCCTGGGATTGGGTTGGGGCAACAGCCTACCTGGTCCTTCTTGAGAGTGATCTGCCCTATCTCGCGGTTCCCCACGAAGGATCTCGTCACGCGGTGCACACGTTCTCCAGCCCGGACCCGAATGATGAAGTTTGGAGGGAAAAATCCGACCTTCTCCCCGATTTTCCCCTAGGGAAGATAGTAGGGAGAGTCCATCTCTCAATGTCGGGTTCTGGACTCAACCCACACTCCACCCTAGCCCTAGCCATTTCTCTCACCCGCCACGATTCTTCATTGGAGTCATCAATGACTGTGATCTTCTCTCCTGGCCTGGGAGGGGAAGGGAGGGGCCTCACTCACATAGCAGGTCCCCTGCTGTGCCCCGGGTCCAGCATCAATAGGCTCCAAGCCCTGAGTCCCCCCTTTTCCTTTCCCTTGGGGGAACCCAGCTCTTTCCTCTTCACTCCGCAGTACCAGCCCCCTGCCCCAAGGCCTCTCACGGGAAATCCAGATCGTCCTTCTCCAGGGCTTTGAACCGATAGAGAGCCACAAAGTAATGAGACTGCTGGAAGCCAGGCTGCTTGTGCTGGGGGTGCAAGGGAATGATGAGTCTTAGGGCTCCTCTACCCCACACTGAGGGGCAGGATTCCAAGGCAGGGACATTCACCACACACTCTACACTCCAACTCTCTTCTAGGTCCCTGAACTGAGAGAAGTGTTTTGGTCGTGGGTGGGTGTGCAAGTTGATGGAGAGTGTGGGTCAGAAGTGATGGGAAGCCTAGGAGTTAAAGAGTGAGCTTCTGCCAGGGCCATGAGTAGTGGTGTCAGAGCTGGGTTGGGGAGAGAACTGGGTTCCTTGCAGGGAGGAAGGATTCTTACCTTGTCATCAGGTGTCTTCTTCTCAGCCTTCTTATCCCCTTCAGGGTTTCCTGGGATAGGAAACACCAACAAATTGTCTGTCTCCTGGAGGGCAATTCTTATTCTCTTACCCTTTTGTGGAAGGGCCTCGTCTATCCAAAGCTGGCCTGCCCTTTGCTCCTCCACCCTCTGTTCCACAGCTGAGCCTCTGATCCTACTCCATCTCTGGATGGAGGTGGGTAACACTCACCATCCTGGGGTTTGCCTTCCTCTGGTCTGGCCGACTCTGGCTCCTCCTCCATCATGGCTGCTACAGGCTGGAGGGGGCACCAGAGTTAGGGAGACGCTGTCTTGGGAACACATGCCCTGGCTGTCTATAATCAGGTCAGAGAACTATAGAATAATGGGATCTCAGAGATCTCAGAGTTGGAAGAGGCCTTGGAGGAAATATCTAGTTCAGCCATCTGCCTAATGCAGGAACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGGTCTCCCTCCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCAGTGCCAGCTCCGCCTCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGATCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCACCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGACCCACTGTGCCCGGCCATGCAGGGACTTTCCCTAAAACATCCTATCAGGTGGGTCACCCACATTCTGCTTGAATGTAGCTAAATAACAGGGAATTCACTACCAGATTCCAGGTCCTTGACTATGCTGTCAGCCTTTAAAAATACTCCAGTGTGTAAGTAAAAAGTGAGCAGCATGGTCAGGCGCGGTGGCTTATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAATCTCCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATCGCTTGGACCCGGGAGGCAGAGTTTGCGGTGAGCCGAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGCAGCACAATTTTTATAATTCCCTTAAAAGAATATAACCCAAGAGTATGTTAGCCCTTCTGGAAGCAGCCATATCACATTGCTAGTGCCTTACAAGTCATTAATTCACTCCATAGAAATCCCTTATCTGTGTCCAACCTCCATATCAACAAGTTTGAGGCCAGATTTCTAGTTGTTTTTTGCAGTTGATTTTTTTGATCAGATATGTACATTTATCTTTTCTTTTCCCTTCCTTC
Task1_train_18005
The variant affects gene MARS1 (methionyl-tRNA synthetase 1), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2U
ATGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGTTGAGGCGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAGTCCTGTCAACATAGACTGCATCTCTACAAAAAAAATTTAAAAATTATCCAGGCACGGTGATGCCTGCCTGAAGTTCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGATGGAAGGATCATTTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATTACAGTGTGCTGTGTTGTGCCACTGCCCTCCTGCCTAGGTGACAGAGGGAGACCCTGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGGAGATAACCTTTCTCAGGCATGTATACAGGCAAATACATTTAAATGCATAAGTGGAGGAGGAGACAGTTGGCATTGAAGATCCTATGGGCAGACTAAGCTGTGTTGGGCTAGAGTGCTTGCCTTCCTTTGATCTCCTTTGACACTTTGCACCTCTTCATTACACTGATCCCAGTCAGCAGTTACATAATAGAATGTAATACCCTTGGGAGCAGAACCTAGGGCATATTTGCCTCTATACTTGCCACAGCAGTAAGCACACTCATTCTGAGAGATAAGTGACAGGGTAACACAAAAGGAGCACTACTCAATATGGTACAAAGTGGTTAGGGGGTTGGGATACAAAAAAGACTGTGTGGGAAGATGGCCATCAGTGAAGGAAGGTTTTCTTGGAGGAGGTGATTTCTAAGCTGGATTTCAGAGAAAGTTACGATATTCAGTTATGGAGAGAAAGGGTGATGGATGCACAAGAAATTAGTGAGATGCGTTTTATGGAAATAAGCTGTAAATGTTCTAGGAAGTAGTTGGGCCATCTATTGGGATATATAGCAGCAGCTGGGAAGAAGGGTTGAGGTTAATGTGAGGGAATCGGGGAGGCAGTGACTGTAGGCTAAGAATGGTTGGAAAGATGATAGGAGCCTTAGTGTAGTGTCAGTGCTAAAGAGGGGATGTTGATACAGGATGTGTACAGCTCAGATGTCAAGGATGATGAAACTTGAAAAGGAATACTGCATTGAGTGCCTTCAGACAGCAGGTTGAATGGCATGACCAGCAACGATCTAGAAAAGTGGGAAGGAGAGGGTGACGGTGAAGGCAAAACTGGTGCCTGCTGGTTTGAGTTAGGCCATGAGGAAGTGACAGACATGGGTTAGAGAGTCGGTACAAAAGGACTTGTTACGGGTCGTATCTAGGCTGGTGAGCTCTTTGGATTTCAGATAGTGGCTAGAGATTATAGTAACATAGCACCTGGAAAGAAGGGGAGAAGCCAGCGCTGGGAAAGTGTTCTTGGGAGTGGTGAGAGGGTAATGATTGGACAGAGCCTAGGGAGAGTTTGAGCCTGAGAATGAGGTAATAGAAAACAAGCAGTCATGACAGTAAAAGGGACAGAAATTGGTGTTGAACAAGGCTCCTTCATAGCAGTACAGGAGACTTCCTCACTGTGGCAGTGCCCTGTATTTGCATCTCTGGGGATCTTAGAGTGCCTCGGGAAGCTGTGGTCCTGTGGGTTTGTGTGCAGAAAGACTTCAAGTGTACATGAACACATGACAGTAGAACAAATCTGTGTCCGGGTGTTCTGTGCACTTTTCGTCCCTGTTGACCCTCACATCCCCCCATGCACTGTTCTCTTCCTCTTTCCTTACTAGGTTGCCTGTGGCTGGAGAAAGGAATGTGCTCATCACCAGTGCCCTCCCTTACGTCAACAATGTCCCCCACCTTGGGAACATCATTGGTTGTGTGCTCAGTGCCGATGTCTTTGCCAGGTGGAGCCAGCTGCTCGGGGAGAGACCTCCTAAGGGAAGGGCGGGTCCCAGGGGAATAGGATGCTTCAAGGGTGGGGCTGGGGAGATCCCAAGGACAAGGAAGCGCTGAAGCGGGGCCCCCTAGCGATCACCATATTCCCTTGCAGGTACTCTCGCCTCCGCCAGTGGAACACCCTCTATCTGTGTGGGACAGATGAGTATGGTACAGCAACAGAGACCAAGGCTCTGGAGGAGGGACTAACCCCCCAGGAGATCTGCGACAAGTACCACATCATCCATGCTGACATCTACCGCTGGTTTAACATTTCGTTTGATATTTTTGGTCGCACCACCACTCCACAGCAGACCAAGTAAGTTTCCTCTAATGAGGCAGAAATGGGGCTTGAAGGCTGAGACTGGGAACAGTGGGAGTATCTTGGAGACAGAAGGAACCCGGGTGGCTGTCTGGGCACTCCTAAACTTAGGATCTCAATATCACCCTGGGCAGTTATCCAGGCATTTTTGAGGGAAGATGGTGTGTGTAGAAGCCTGACCAGGAGCTGAAGGAGCAGCTGAGGGAGGGCAGAGACCAGACGCAGGCTGATGGGAAATATCTATCTTCCCTCTAGTGCCTCCCTTCCTCTCTGTGTCCTGAAGTCTAAGACACTTCTTCCCACTCCTGTATGCATTTATAACACATAAACTCATTCTTCCTCTGCCTAATACTCATCCTTATAAAAACTTTGCATAGCCGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGCTCACCGGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGGGCGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCATGCCATTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCTGGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACTATCCTGGCTAACCCAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAATTAACCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCAGAGCTTACAGTGAGCTGAGATAGTGCCACTGCACTTCAGACTTGGTGACGGAGTGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGAGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAATTAGCTGGACCTGGTGGTGGGCACCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCTGAGGCAGGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAACAAACAAAAAAACCCCCAAAACTTTACATAGTAGACAGGCCGCCAACTGATAGTGCTATGCAGTTTAGTTTAGCACTTGGACTGACTTAATTTTTAGGATATATTAAAGAACAGGCACAGTCCTATCCTATTGGAGATTTTTGTTAATGAAAAATACAAAACAGATAAATCTGTGTTCAACAAAAGTGAATTCTAAAGTGTTGAGGGGAAAGATTATGTGGGCAGTTGGGGAATATGTGTGATGGGTCTGAGCTCATCCAGTAAAACTCTCAAAAGATGAATAGATGCCCTTTTCCTTGAGGAGCCTTCTGCCTGATTTCTTTGTCACTGAGTTTGGGTCCCTGGTTGGAGTGGCAGGAGGAAGGGGTCCACCACGTCTTCTGACTGTCTCTTCCTGATCCCTGGCCCACCTCACCAGAATCACCCAGGACATTTTCCAGCAGTTGCTGAAACGAGGTTTTGTGCTGCAAGATACTGTGGAGCAACTGCGATGTGAGCACTGTGCTCGCTTCCTGGCTGACCGCTTCGTGGAGGGCGTGTGTCCCTTCTGTGGCTATGAGGAGGCTCGGGGTGACCAGTGTGACAAGTGTGGCAAGCTCATCAATGCTGTCGAGCTTAAGGTAAGAGGAGGGTCTCCATGGGAGCCCGGAAGGAGACAGTCCTTATTCTTAAGGGACGCCCTTCCTGTCCCATTTAGGATTTTTATTT
ATGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGTTGAGGCGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAGTCCTGTCAACATAGACTGCATCTCTACAAAAAAAATTTAAAAATTATCCAGGCACGGTGATGCCTGCCTGAAGTTCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGATGGAAGGATCATTTTGAGCCCAGGAGTTCAAGATTACAGTGTGCTGTGTTGTGCCACTGCCCTCCTGCCTAGGTGACAGAGGGAGACCCTGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGGAGATAACCTTTCTCAGGCATGTATACAGGCAAATACATTTAAATGCATAAGTGGAGGAGGAGACAGTTGGCATTGAAGATCCTATGGGCAGACTAAGCTGTGTTGGGCTAGAGTGCTTGCCTTCCTTTGATCTCCTTTGACACTTTGCACCTCTTCATTACACTGATCCCAGTCAGCAGTTACATAATAGAATGTAATACCCTTGGGAGCAGAACCTAGGGCATATTTGCCTCTATACTTGCCACAGCAGTAAGCACACTCATTCTGAGAGATAAGTGACAGGGTAACACAAAAGGAGCACTACTCAATATGGTACAAAGTGGTTAGGGGGTTGGGATACAAAAAAGACTGTGTGGGAAGATGGCCATCAGTGAAGGAAGGTTTTCTTGGAGGAGGTGATTTCTAAGCTGGATTTCAGAGAAAGTTACGATATTCAGTTATGGAGAGAAAGGGTGATGGATGCACAAGAAATTAGTGAGATGCGTTTTATGGAAATAAGCTGTAAATGTTCTAGGAAGTAGTTGGGCCATCTATTGGGATATATAGCAGCAGCTGGGAAGAAGGGTTGAGGTTAATGTGAGGGAATCGGGGAGGCAGTGACTGTAGGCTAAGAATGGTTGGAAAGATGATAGGAGCCTTAGTGTAGTGTCAGTGCTAAAGAGGGGATGTTGATACAGGATGTGTACAGCTCAGATGTCAAGGATGATGAAACTTGAAAAGGAATACTGCATTGAGTGCCTTCAGACAGCAGGTTGAATGGCATGACCAGCAACGATCTAGAAAAGTGGGAAGGAGAGGGTGACGGTGAAGGCAAAACTGGTGCCTGCTGGTTTGAGTTAGGCCATGAGGAAGTGACAGACATGGGTTAGAGAGTCGGTACAAAAGGACTTGTTACGGGTCGTATCTAGGCTGGTGAGCTCTTTGGATTTCAGATAGTGGCTAGAGATTATAGTAACATAGCACCTGGAAAGAAGGGGAGAAGCCAGCGCTGGGAAAGTGTTCTTGGGAGTGGTGAGAGGGTAATGATTGGACAGAGCCTAGGGAGAGTTTGAGCCTGAGAATGAGGTAATAGAAAACAAGCAGTCATGACAGTAAAAGGGACAGAAATTGGTGTTGAACAAGGCTCCTTCATAGCAGTACAGGAGACTTCCTCACTGTGGCAGTGCCCTGTATTTGCATCTCTGGGGATCTTAGAGTGCCTCGGGAAGCTGTGGTCCTGTGGGTTTGTGTGCAGAAAGACTTCAAGTGTACATGAACACATGACAGTAGAACAAATCTGTGTCCGGGTGTTCTGTGCACTTTTCGTCCCTGTTGACCCTCACATCCCCCCATGCACTGTTCTCTTCCTCTTTCCTTACTAGGTTGCCTGTGGCTGGAGAAAGGAATGTGCTCATCACCAGTGCCCTCCCTTACGTCAACAATGTCCCCCACCTTGGGAACATCATTGGTTGTGTGCTCAGTGCCGATGTCTTTGCCAGGTGGAGCCAGCTGCTCGGGGAGAGACCTCCTAAGGGAAGGGCGGGTCCCAGGGGAATAGGATGCTTCAAGGGTGGGGCTGGGGAGATCCCAAGGACAAGGAAGCGCTGAAGCGGGGCCCCCTAGCGATCACCATATTCCCTTGCAGGTACTCTCGCCTCCGCCAGTGGAACACCCTCTATCTGTGTGGGACAGATGAGTATGGTACAGCAACAGAGACCAAGGCTCTGGAGGAGGGACTAACCCCCCAGGAGATCTGCGACAAGTACCACATCATCCATGCTGACATCTGCCGCTGGTTTAACATTTCGTTTGATATTTTTGGTCGCACCACCACTCCACAGCAGACCAAGTAAGTTTCCTCTAATGAGGCAGAAATGGGGCTTGAAGGCTGAGACTGGGAACAGTGGGAGTATCTTGGAGACAGAAGGAACCCGGGTGGCTGTCTGGGCACTCCTAAACTTAGGATCTCAATATCACCCTGGGCAGTTATCCAGGCATTTTTGAGGGAAGATGGTGTGTGTAGAAGCCTGACCAGGAGCTGAAGGAGCAGCTGAGGGAGGGCAGAGACCAGACGCAGGCTGATGGGAAATATCTATCTTCCCTCTAGTGCCTCCCTTCCTCTCTGTGTCCTGAAGTCTAAGACACTTCTTCCCACTCCTGTATGCATTTATAACACATAAACTCATTCTTCCTCTGCCTAATACTCATCCTTATAAAAACTTTGCATAGCCGGGTGCAGTGGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGCTCACCGGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGGGCGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCATGCCATTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCTGGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACTATCCTGGCTAACCCAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAATTAACCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGCAGAGCTTACAGTGAGCTGAGATAGTGCCACTGCACTTCAGACTTGGTGACGGAGTGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGAGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAATTAGCTGGACCTGGTGGTGGGCACCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCTGAGGCAGGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAACAAACAAAAAAACCCCCAAAACTTTACATAGTAGACAGGCCGCCAACTGATAGTGCTATGCAGTTTAGTTTAGCACTTGGACTGACTTAATTTTTAGGATATATTAAAGAACAGGCACAGTCCTATCCTATTGGAGATTTTTGTTAATGAAAAATACAAAACAGATAAATCTGTGTTCAACAAAAGTGAATTCTAAAGTGTTGAGGGGAAAGATTATGTGGGCAGTTGGGGAATATGTGTGATGGGTCTGAGCTCATCCAGTAAAACTCTCAAAAGATGAATAGATGCCCTTTTCCTTGAGGAGCCTTCTGCCTGATTTCTTTGTCACTGAGTTTGGGTCCCTGGTTGGAGTGGCAGGAGGAAGGGGTCCACCACGTCTTCTGACTGTCTCTTCCTGATCCCTGGCCCACCTCACCAGAATCACCCAGGACATTTTCCAGCAGTTGCTGAAACGAGGTTTTGTGCTGCAAGATACTGTGGAGCAACTGCGATGTGAGCACTGTGCTCGCTTCCTGGCTGACCGCTTCGTGGAGGGCGTGTGTCCCTTCTGTGGCTATGAGGAGGCTCGGGGTGACCAGTGTGACAAGTGTGGCAAGCTCATCAATGCTGTCGAGCTTAAGGTAAGAGGAGGGTCTCCATGGGAGCCCGGAAGGAGACAGTCCTTATTCTTAAGGGACGCCCTTCCTGTCCCATTTAGGATTTTTATTT
Task1_train_18006
An alteration has been detected in MARS1 (methionyl-tRNA synthetase 1) on Chromosome 12. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Severe early-onset pulmonary alveolar proteinosis due to MARS deficiency
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Task1_train_18007
The variant affects gene MARS1 (methionyl-tRNA synthetase 1), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Spastic paraplegia 70, autosomal recessive
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Task1_train_18008
The gene MARS1 (methionyl-tRNA synthetase 1), on Chromosome 12, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2U
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Task1_train_18009
Given a variant located on Chromosome 12 and affecting MARS1 (methionyl-tRNA synthetase 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Severe early-onset pulmonary alveolar proteinosis due to MARS deficiency
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Task1_train_18010
Given a variant located on Chromosome 12 and affecting MARS1 (methionyl-tRNA synthetase 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Pulmonary alveolar proteinosis
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Task1_train_18011
The gene MARS1 (methionyl-tRNA synthetase 1) on Chromosome 12 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Severe early-onset pulmonary alveolar proteinosis due to MARS deficiency
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Task1_train_18012
This variant affects the gene MARS1 (methionyl-tRNA synthetase 1) found on Chromosome 12. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; not specified
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Task1_train_18013
This genomic variant is located on Chromosome 12, within the KIF5A (kinesin family member 5A) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
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Task1_train_18014
An alteration has been detected in KIF5A (kinesin family member 5A) on Chromosome 12. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; KIF5A-related disorder
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Task1_train_18015
Gene KIF5A (kinesin family member 5A) on Chromosome 12 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
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Task1_train_18016
Chromosome 12 houses a mutation in gene KIF5A (kinesin family member 5A). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Spastic paraplegia
CTAACACAATCTCACTGTGCGACACTCCTCTACCCCACAGACACAACTCCTGGCATCAGTACCTTTAGTTTCTCTTATTCTCCCACATTTCTTTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTATCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACACCAGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCTTAAAATGATGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCATTCTCCCACATTTCTGTTCATTAAGGGCATTGAAGAAAAGGGTGCCTTTCTCAGCTGCTGGAAGGAGGTTGTGGTATTTCTTTTCCCTCACATCCTGCCTGTTGACGTCTGATATCTTTTATTTTCATTCCAGGGGAAGCCATATGTTTTTGACCGTGTATTCCCCCCAAACACGACTCAAGAGCAAGTTTATCATGCATGTGCCATGCAGATTGTCAAAGGTAATAGATTTCTTTTTAGAATGTCTCTTCTCAGCACCCCATTTCCTACCCGACCTATCTCCACCAGTACTCTTTCTCTACTGTCTCTTCCAGATGTCCTTGCTGGCTACAATGGCACCATTTTTGCTTATGGACAGACATCCTCAGGGAAAACACATACCATGGAGGTGAGGGTTCTGGCTTTGGTGGTTGAGGGGCTAGGAGTGTTAATGGAAGATCAGGGAATCTCAGTGGGGGAAGGTCTAGGAATCAAGGATTGCCTGGTCCAGAGGCAGATAGATGAGTACAGAGGATGAACTGAAGGGCAATATTAGGGGAAGTTTAATGGAATCCCTCCAACCCACTGCAGTGGATCATCCTTTCCACTACTCCAGTCTTCTTTTGATCGGGAAAAGCAATGGAAGTCCAAAGGGCTACTCAATTATCTCCTTGCTCCTCTAAAAGGCAGACATGGTGGTGACCATCTCCTAACTTAGGATGTTCTTCTTATTGACTCTTGCCTTGGTGTTCACCTGCATACATCTGAGTTGTCTCATTCTCCCTGAGCCCCAGCTTCACTCTCAAATACCTTCACTCGCCAGGGAAAGCTGCACGACCCTCAGCTGATGGGAATCATTCCTCGAATTGCCCGAGACATCTTCAACCACATCTACTCCATGGATGAGAACCTTGAGTTCCACATCAAGGTGACCAGGGCACGACAGCTGGGCATTCAGATGGGGACTGGGAGGGGAAGATCTAAAATCTTCCCACTGAAGAGCCTGGGCTCCCCAACTTGACTCCCTTTCCGGTTACCAGAGTTCTTTGTCAAGATGTTCTCTTCTGTTCTTTTCCTCCCACCACCGTTTGAGCAGGTCACATTAGTATGGGATTCCTGAACTAGATTTAAGATAGGCCCTCTTTACTTCACACTCCTTCTTTCTTCTTAACCAGGTTTCTTACTTTGAAATTTACCTGGACAAAATTCGTGACCTTCTGGATGGTGAGTGTTTTGTCCCAGTGGATGAGGGTGTGTGAGGAGGGTGGAGAAAAGAAAGCTCACATTGCATTTGGAATTAGGTACCAATTGACAAGAGATGCAGAGGGCACACAGCACCCAAGTCTTTTGGCCCCGTTTACCAGAATTTCCAAAAACTGAGAAGGTCAGGAGATGAGCTTAGCAGCCAAGGACTACATATAAACAGTTCGAGAGGATCTGGGGCCGAGGAGCAGGAGCCCTGAGGAGGAGAAGGAGGAGGAACTGAGCCTTCAGCTCGTGCAGGGAGTTTAGGCTTCACAGGGAGAGTCTTCCTTTAGCACAGAGAAGAAAACCACCATCTGAGCTGACTGCAAGGTGCAGATGGGGGCGGTGGAAGTACTAGTCTTGCTTACCCTGCATTCTTTTGATTCAGTGACCAAGACAAATCTGTCCGTGCACGAGGACAAGAACCGGGTGCCATTTGTCAAGGTGAGAGTGGGTGTGGGGCACCTATGTGGGGCCAGTGTATTGAGAATGTTGGTGGGGGAGGAGCATAGGTCAGTGACCCTGAAGTTGGAGGGTGGATATCCTGGAGGAATGAGATGTGCCTAGGGGCCAGGGAGAGTCTAGGGGATCAGAAAAGATACTGTCTTGGCTGGGCATGGTGGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGCCGGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAATATAGTGAAACCCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAACTGGGCGTGGTGGCACATGCTTGTAATCCCAGCTATTTGGGACACTGAAGCAGGAGAATCTCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGAACCTGTCTTTAAAAAAAAAGAAGAAAAGAAAAGATACTGTCTTGAAAGGTCATTGGTCAGTGTGCATGCAATTTAATTTGCAAATCAAAGTTTACTGGAAGAAATGCCTGTAATCCCAACACTTTAGAAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATAGCAAGACCCGTCTCTCTTATTTAATCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGACCTAGGGTCACTGCAACCTCCCTGTCCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCGTCAGGCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTGATTTTAGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCTAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTATGCTGAGTCTCTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAATTTTTGTCAGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATTGCTTGAGCTCAAGAGTTTGAGGTTGCAGTGAGCCATGATAGTGCCACTGCACTCCAGCCTGTGTAGTAGAGAGACAGTGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTGGAGACAGATTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGCATATGGGATTATAGGTGCCTGCCACCAGGCCCACTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAGTGTGCTGGCATTACAGGCATAAGCCACTGCACCTGGCTGCGACAGTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCTCTCTTGTTGCCCAGGCTGGGGTACAGTGGCGCCCGATCTTGGCTTACTGCAACCTCAGCCTCCCGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCATGTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTGGAGATGGGATTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCACGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACATTGGCCTCCCAAACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGCCACTGTTTCAAAAAAGTAGTAAATACGTAAGATAAAAATAAATACAAAGCAGGGCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGACTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTTGACACT
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Task1_train_18017
Mutation context: Chromosome 12, Gene KIF5A (kinesin family member 5A). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
GTCATTGGTCAGTGTGCATGCAATTTAATTTGCAAATCAAAGTTTACTGGAAGAAATGCCTGTAATCCCAACACTTTAGAAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATAGCAAGACCCGTCTCTCTTATTTAATCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGACCTAGGGTCACTGCAACCTCCCTGTCCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCGTCAGGCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTGATTTTAGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCTAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTATGCTGAGTCTCTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAATTTTTGTCAGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATTGCTTGAGCTCAAGAGTTTGAGGTTGCAGTGAGCCATGATAGTGCCACTGCACTCCAGCCTGTGTAGTAGAGAGACAGTGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTGGAGACAGATTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGCATATGGGATTATAGGTGCCTGCCACCAGGCCCACTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAGTGTGCTGGCATTACAGGCATAAGCCACTGCACCTGGCTGCGACAGTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCTCTCTTGTTGCCCAGGCTGGGGTACAGTGGCGCCCGATCTTGGCTTACTGCAACCTCAGCCTCCCGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCATGTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTGGAGATGGGATTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCACGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACATTGGCCTCCCAAACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGCCACTGTTTCAAAAAAGTAGTAAATACGTAAGATAAAAATAAATACAAAGCAGGGCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGACTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTTGACACTGCACTCCAGCCTGGGCAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAGAAAATAATAATAATAAAAATAAATAAATAAATACAAACTTAAAAAACAAAGCTTATGGGTCACTGTCCATTTGTCCCCCACAGGGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGATGTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCAGTGAGTGAGGATACAAGGGGATCTCTCGAGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACAC
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Task1_train_18018
This sequence variant lies in KIF5A (kinesin family member 5A) on Chromosome 12. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
TCATTGGTCAGTGTGCATGCAATTTAATTTGCAAATCAAAGTTTACTGGAAGAAATGCCTGTAATCCCAACACTTTAGAAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATAGCAAGACCCGTCTCTCTTATTTAATCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGACCTAGGGTCACTGCAACCTCCCTGTCCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCGTCAGGCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTGATTTTAGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCTAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTATGCTGAGTCTCTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAATTTTTGTCAGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATTGCTTGAGCTCAAGAGTTTGAGGTTGCAGTGAGCCATGATAGTGCCACTGCACTCCAGCCTGTGTAGTAGAGAGACAGTGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTGGAGACAGATTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGCATATGGGATTATAGGTGCCTGCCACCAGGCCCACTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAGTGTGCTGGCATTACAGGCATAAGCCACTGCACCTGGCTGCGACAGTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCTCTCTTGTTGCCCAGGCTGGGGTACAGTGGCGCCCGATCTTGGCTTACTGCAACCTCAGCCTCCCGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCATGTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTGGAGATGGGATTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCACGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACATTGGCCTCCCAAACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGCCACTGTTTCAAAAAAGTAGTAAATACGTAAGATAAAAATAAATACAAAGCAGGGCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGACTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTTGACACTGCACTCCAGCCTGGGCAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAGAAAATAATAATAATAAAAATAAATAAATAAATACAAACTTAAAAAACAAAGCTTATGGGTCACTGTCCATTTGTCCCCCACAGGGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGATGTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCAGTGAGTGAGGATACAAGGGGATCTCTCGAGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACACT
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Task1_train_18019
This gene mutation involves KIF5A (kinesin family member 5A) on Chromosome 12. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
GGGAGGATCACTTGAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATAGCAAGACCCGTCTCTCTTATTTAATCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGACCTAGGGTCACTGCAACCTCCCTGTCCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCGTCAGGCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTGATTTTAGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCTAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACTATGCTGAGTCTCTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAATTTTTGTCAGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATTGCTTGAGCTCAAGAGTTTGAGGTTGCAGTGAGCCATGATAGTGCCACTGCACTCCAGCCTGTGTAGTAGAGAGACAGTGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTGGAGACAGATTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGCATATGGGATTATAGGTGCCTGCCACCAGGCCCACTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAGTGTGCTGGCATTACAGGCATAAGCCACTGCACCTGGCTGCGACAGTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCTCTCTTGTTGCCCAGGCTGGGGTACAGTGGCGCCCGATCTTGGCTTACTGCAACCTCAGCCTCCCGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCATGTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTGGAGATGGGATTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCACGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACATTGGCCTCCCAAACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGCCACTGTTTCAAAAAAGTAGTAAATACGTAAGATAAAAATAAATACAAAGCAGGGCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGACTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTTGACACTGCACTCCAGCCTGGGCAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAGAAAATAATAATAATAAAAATAAATAAATAAATACAAACTTAAAAAACAAAGCTTATGGGTCACTGTCCATTTGTCCCCCACAGGGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGATGTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCAGTGAGTGAGGATACAAGGGGATCTCTCGAGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTTGACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAAAGGCCCAGAAGGAGACGAT
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Task1_train_18020
Given a variant located on Chromosome 12 and affecting KIF5A (kinesin family member 5A), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_18021
Assess the clinical impact of this variant on gene KIF5A (kinesin family member 5A), found on Chromosome 12. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
TACTCTGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTTGACACTGCACTCCAGCCTGGGCAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAGAAAATAATAATAATAAAAATAAATAAATAAATACAAACTTAAAAAACAAAGCTTATGGGTCACTGTCCATTTGTCCCCCACAGGGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGATGTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCAGTGAGTGAGGATACAAGGGGATCTCTCGAGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTTGACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAAAGGCCCAGAAGGAGACGATTGCGAAGCTGGAGGCTGAGCTGAGCCGGTGGCGCAATGGTTAGAGAGGGATAGGTGGGAGTGAGGGGCAGTGGGAAGAGGAGGAGGATGTTTGGGAGCCAACTCTGTTTGGGTGGTGTTTCTGGCCAGGCCAATCTCCTAGAAGAGGGGCTGTGTTTCTGGACAGGTGCAGTAGAGCAGTCATGGGGGAAGGGAGGGGCCTGACTACCTACCTCCCATACTCCCAAAAGGTAGAGGGTCCACCTGGCAAGAGAGTTCAAGGGGCATGGTGAGTGAGAAGGAAGAACTCGTGGATGCAGCTTCTTCTTCTTCCATCTCTCACCTCGTCTTGCCCCTTTGCAGGAGAGAATGTGCCTGAGACAGAGCGCCTGGCTGGGGAGGAGGCAGCCCTGGGAGCCGAGCTCTGTGAGGAGACCCCTGTGAATGACAACTCATCCATCGTGGTGCGCATCGCGCCCGAGGAGCGGCAGAAATACGAGGAGGAGATCCGCCGTCTCTATAAGCAGCTTGACGACAAGGTGAGGGCGGCCAGGCAGGGCACTGAGGCACGCCAGGTGGGATGAGAGGTAGACGATCAAAGAAAATCGCTTATATTGCCTCTTTCTGGTTTTAAAAGGGATAAATGCTTATGCTTGAAATGTGGAAACATCAATATAAATGTATGTAAGAAAATTAAAATCATCCACTATTCAGAGATAACACTCAACATTTTGCTTTTCTCTGTGCATATACCATGCAATTGAGTTATACTGTATAAGTAATTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTGTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATTGTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGACCTCTGGCGATCCGCCCGCCTCGGCCCCCTGAAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTGTATATGTAATTATACATCTGATTTTTTTCATTCAGCATTATATTATGCACAATTTCCTACTTCATTAATAATTCTTCATAAAAGTATTTTTATTTTCATTTATTATTATTATTTTGCTTTGAGAGAAAGAGTCTTGCTTTGTTACTCGGGCTGAAGTGCAGTGGTGCAGTAATAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGGCTCGAGGGATCCCCCCCAACCTCAGCCTCTGAAAGAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGTTGGAGTCTCACTTTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAA
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Task1_train_18022
The gene KIF5A (kinesin family member 5A), on Chromosome 12, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
AATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTTGACACTGCACTCCAGCCTGGGCAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAGAAAATAATAATAATAAAAATAAATAAATAAATACAAACTTAAAAAACAAAGCTTATGGGTCACTGTCCATTTGTCCCCCACAGGGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGATGTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCAGTGAGTGAGGATACAAGGGGATCTCTCGAGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTTGACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAAAGGCCCAGAAGGAGACGATTGCGAAGCTGGAGGCTGAGCTGAGCCGGTGGCGCAATGGTTAGAGAGGGATAGGTGGGAGTGAGGGGCAGTGGGAAGAGGAGGAGGATGTTTGGGAGCCAACTCTGTTTGGGTGGTGTTTCTGGCCAGGCCAATCTCCTAGAAGAGGGGCTGTGTTTCTGGACAGGTGCAGTAGAGCAGTCATGGGGGAAGGGAGGGGCCTGACTACCTACCTCCCATACTCCCAAAAGGTAGAGGGTCCACCTGGCAAGAGAGTTCAAGGGGCATGGTGAGTGAGAAGGAAGAACTCGTGGATGCAGCTTCTTCTTCTTCCATCTCTCACCTCGTCTTGCCCCTTTGCAGGAGAGAATGTGCCTGAGACAGAGCGCCTGGCTGGGGAGGAGGCAGCCCTGGGAGCCGAGCTCTGTGAGGAGACCCCTGTGAATGACAACTCATCCATCGTGGTGCGCATCGCGCCCGAGGAGCGGCAGAAATACGAGGAGGAGATCCGCCGTCTCTATAAGCAGCTTGACGACAAGGTGAGGGCGGCCAGGCAGGGCACTGAGGCACGCCAGGTGGGATGAGAGGTAGACGATCAAAGAAAATCGCTTATATTGCCTCTTTCTGGTTTTAAAAGGGATAAATGCTTATGCTTGAAATGTGGAAACATCAATATAAATGTATGTAAGAAAATTAAAATCATCCACTATTCAGAGATAACACTCAACATTTTGCTTTTCTCTGTGCATATACCATGCAATTGAGTTATACTGTATAAGTAATTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTGTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATTGTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGACCTCTGGCGATCCGCCCGCCTCGGCCCCCTGAAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTGTATATGTAATTATACATCTGATTTTTTTCATTCAGCATTATATTATGCACAATTTCCTACTTCATTAATAATTCTTCATAAAAGTATTTTTATTTTCATTTATTATTATTATTTTGCTTTGAGAGAAAGAGTCTTGCTTTGTTACTCGGGCTGAAGTGCAGTGGTGCAGTAATAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGGCTCGAGGGATCCCCCCCAACCTCAGCCTCTGAAAGAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGTTGGAGTCTCACTTTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCGATCCTCC
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Task1_train_18023
This is a variant in KIF5A (kinesin family member 5A), located on Chromosome 12. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Spastic paraplegia
AATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTTGACACTGCACTCCAGCCTGGGCAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAGAAAATAATAATAATAAAAATAAATAAATAAATACAAACTTAAAAAACAAAGCTTATGGGTCACTGTCCATTTGTCCCCCACAGGGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGATGTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCAGTGAGTGAGGATACAAGGGGATCTCTCGAGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTTGACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAAAGGCCCAGAAGGAGACGATTGCGAAGCTGGAGGCTGAGCTGAGCCGGTGGCGCAATGGTTAGAGAGGGATAGGTGGGAGTGAGGGGCAGTGGGAAGAGGAGGAGGATGTTTGGGAGCCAACTCTGTTTGGGTGGTGTTTCTGGCCAGGCCAATCTCCTAGAAGAGGGGCTGTGTTTCTGGACAGGTGCAGTAGAGCAGTCATGGGGGAAGGGAGGGGCCTGACTACCTACCTCCCATACTCCCAAAAGGTAGAGGGTCCACCTGGCAAGAGAGTTCAAGGGGCATGGTGAGTGAGAAGGAAGAACTCGTGGATGCAGCTTCTTCTTCTTCCATCTCTCACCTCGTCTTGCCCCTTTGCAGGAGAGAATGTGCCTGAGACAGAGCGCCTGGCTGGGGAGGAGGCAGCCCTGGGAGCCGAGCTCTGTGAGGAGACCCCTGTGAATGACAACTCATCCATCGTGGTGCGCATCGCGCCCGAGGAGCGGCAGAAATACGAGGAGGAGATCCGCCGTCTCTATAAGCAGCTTGACGACAAGGTGAGGGCGGCCAGGCAGGGCACTGAGGCACGCCAGGTGGGATGAGAGGTAGACGATCAAAGAAAATCGCTTATATTGCCTCTTTCTGGTTTTAAAAGGGATAAATGCTTATGCTTGAAATGTGGAAACATCAATATAAATGTATGTAAGAAAATTAAAATCATCCACTATTCAGAGATAACACTCAACATTTTGCTTTTCTCTGTGCATATACCATGCAATTGAGTTATACTGTATAAGTAATTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTGTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATTGTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGACCTCTGGCGATCCGCCCGCCTCGGCCCCCTGAAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTGTATATGTAATTATACATCTGATTTTTTTCATTCAGCATTATATTATGCACAATTTCCTACTTCATTAATAATTCTTCATAAAAGTATTTTTATTTTCATTTATTATTATTATTTTGCTTTGAGAGAAAGAGTCTTGCTTTGTTACTCGGGCTGAAGTGCAGTGGTGCAGTAATAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGGCTCGAGGGATCCCCCCCAACCTCAGCCTCTGAAAGAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGTTGGAGTCTCACTTTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCGATCCTCC
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Task1_train_18024
Here is a genetic alteration in KIF5A (kinesin family member 5A) on Chromosome 12. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
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Task1_train_18025
Here’s a variant in KIF5A (kinesin family member 5A) located on Chromosome 12. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTTGACACTGCACTCCAGCCTGGGCAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAGAAAATAATAATAATAAAAATAAATAAATAAATACAAACTTAAAAAACAAAGCTTATGGGTCACTGTCCATTTGTCCCCCACAGGGTTGTACTGAACGCTTTGTGTCCAGCCCGGAGGAGATTCTGGATGTGATTGATGAAGGGAAATCAAATCGTCATGTGGCTGTCACCAGTGAGTGAGGATACAAGGGGATCTCTCGAGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTTGACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAAAGGCCCAGAAGGAGACGATTGCGAAGCTGGAGGCTGAGCTGAGCCGGTGGCGCAATGGTTAGAGAGGGATAGGTGGGAGTGAGGGGCAGTGGGAAGAGGAGGAGGATGTTTGGGAGCCAACTCTGTTTGGGTGGTGTTTCTGGCCAGGCCAATCTCCTAGAAGAGGGGCTGTGTTTCTGGACAGGTGCAGTAGAGCAGTCATGGGGGAAGGGAGGGGCCTGACTACCTACCTCCCATACTCCCAAAAGGTAGAGGGTCCACCTGGCAAGAGAGTTCAAGGGGCATGGTGAGTGAGAAGGAAGAACTCGTGGATGCAGCTTCTTCTTCTTCCATCTCTCACCTCGTCTTGCCCCTTTGCAGGAGAGAATGTGCCTGAGACAGAGCGCCTGGCTGGGGAGGAGGCAGCCCTGGGAGCCGAGCTCTGTGAGGAGACCCCTGTGAATGACAACTCATCCATCGTGGTGCGCATCGCGCCCGAGGAGCGGCAGAAATACGAGGAGGAGATCCGCCGTCTCTATAAGCAGCTTGACGACAAGGTGAGGGCGGCCAGGCAGGGCACTGAGGCACGCCAGGTGGGATGAGAGGTAGACGATCAAAGAAAATCGCTTATATTGCCTCTTTCTGGTTTTAAAAGGGATAAATGCTTATGCTTGAAATGTGGAAACATCAATATAAATGTATGTAAGAAAATTAAAATCATCCACTATTCAGAGATAACACTCAACATTTTGCTTTTCTCTGTGCATATACCATGCAATTGAGTTATACTGTATAAGTAATTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTGTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATTGTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGACCTCTGGCGATCCGCCCGCCTCGGCCCCCTGAAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTGTATATGTAATTATACATCTGATTTTTTTCATTCAGCATTATATTATGCACAATTTCCTACTTCATTAATAATTCTTCATAAAAGTATTTTTATTTTCATTTATTATTATTATTTTGCTTTGAGAGAAAGAGTCTTGCTTTGTTACTCGGGCTGAAGTGCAGTGGTGCAGTAATAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGGCTCGAGGGATCCCCCCCAACCTCAGCCTCTGAAAGAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGTTGGAGTCTCACTTTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCGATCCTCCCGCCTTGGCCTTTCAA
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Task1_train_18026
A mutation found in KIF5A (kinesin family member 5A) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 10
AGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGACAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTTGACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAAAGGCCCAGAAGGAGACGATTGCGAAGCTGGAGGCTGAGCTGAGCCGGTGGCGCAATGGTTAGAGAGGGATAGGTGGGAGTGAGGGGCAGTGGGAAGAGGAGGAGGATGTTTGGGAGCCAACTCTGTTTGGGTGGTGTTTCTGGCCAGGCCAATCTCCTAGAAGAGGGGCTGTGTTTCTGGACAGGTGCAGTAGAGCAGTCATGGGGGAAGGGAGGGGCCTGACTACCTACCTCCCATACTCCCAAAAGGTAGAGGGTCCACCTGGCAAGAGAGTTCAAGGGGCATGGTGAGTGAGAAGGAAGAACTCGTGGATGCAGCTTCTTCTTCTTCCATCTCTCACCTCGTCTTGCCCCTTTGCAGGAGAGAATGTGCCTGAGACAGAGCGCCTGGCTGGGGAGGAGGCAGCCCTGGGAGCCGAGCTCTGTGAGGAGACCCCTGTGAATGACAACTCATCCATCGTGGTGCGCATCGCGCCCGAGGAGCGGCAGAAATACGAGGAGGAGATCCGCCGTCTCTATAAGCAGCTTGACGACAAGGTGAGGGCGGCCAGGCAGGGCACTGAGGCACGCCAGGTGGGATGAGAGGTAGACGATCAAAGAAAATCGCTTATATTGCCTCTTTCTGGTTTTAAAAGGGATAAATGCTTATGCTTGAAATGTGGAAACATCAATATAAATGTATGTAAGAAAATTAAAATCATCCACTATTCAGAGATAACACTCAACATTTTGCTTTTCTCTGTGCATATACCATGCAATTGAGTTATACTGTATAAGTAATTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTGTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATTGTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGACCTCTGGCGATCCGCCCGCCTCGGCCCCCTGAAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTGTATATGTAATTATACATCTGATTTTTTTCATTCAGCATTATATTATGCACAATTTCCTACTTCATTAATAATTCTTCATAAAAGTATTTTTATTTTCATTTATTATTATTATTTTGCTTTGAGAGAAAGAGTCTTGCTTTGTTACTCGGGCTGAAGTGCAGTGGTGCAGTAATAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGGCTCGAGGGATCCCCCCCAACCTCAGCCTCTGAAAGAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGTTGGAGTCTCACTTTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCGATCCTCCCGCCTTGGCCTTTCAATGCGCTGGGATTAAAGGCATGCACCACCAGGCTAGCTAATATTTTAAATTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGCCTTGAACTCCTGGCTTCAACCGATCTTCCTGTAGGATATGGGGTTTCTAACTCAAAGCTTATACTATCTGGATTTTTATCAGGATCCTGCCTCTACCCCCAAACTTCTTACGTCTAAACTGGAAGGAGTAGCTTCCCTTCACCTGTCTTTCCCTGTTGCCTCCAACAGGATGATGAAATCAACCA
AGTCTGAGGATCCACTTGTGTTCTGTGTCCTCTGGGGTGGAGGGACTCAAAAGTGAGCAAGGAAACTGTACCCCCCAGAGGAGGAGGACCCCTTGTCTGTGGGACCCTGCTGCCTGGGAGATGTGGCAGCAGGGCTAGTCCTGGTGGGCACCTTCTCTCTGGGTGGGCGGGGCTGGGGTCAGTGGAAGCCGGGGGCTGAGGACCTCAGTTCTGCAGGGTGGTGCAGGTCCTGTTTCTCCCTTGCTCCTGCAGACATGAATGAACACAGCTCTCGGAGCCACAGCATCTTCCTCATCAACATCAAGCAGGAGAACATGGAAACGGAGCAGAAGCTCAGTGGGAAGCTGTATCTGGTGGACCTGGCAGGGAGTGAGAAGGTAGGGGGTCCTGTGGATATGGGGTGGGTGGAAGCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCGGGCTGGTTTGCAGTGGCACGATCTCTGTTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGTGATTCTCCTGCCTAAACCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCCTTGGCTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGCTCTCAGCTCACTGCAACCCCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCTCCCGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGACTCTTTTTTAACTAAAAAATGATTTGCATTGGGATATAATTCACATACCATAAAGTTCACCATTTTAAAGTGCAATTCAGTTGTTTGTAGTATGTTCCCAAGGTTGTGCAACCATTACGCTATCCAATTCTAGAGCACTGTCATCTTCTATTCACAGTCACTCTCCATTGTCCCCTAACCCCATCCCCTGTCAACTTCTAATCTACTTTCTGTCTCTATGGATTTGCCTATCCTGAACATTTCATATAAATGGAATCATATGGCTGGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGAGAAACCCCATCTCTACAAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGATAACCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGCGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATCATGTAATATGTGGCAGGGGTTAGGGGCAATGTGGTGTTTGACAAGACAGTTTAGGGGAACAGAGGAAGGGCCTTCCCCAATCCCAGCCAAGCATCTCTGTTACTCCATCTTCTTCCCTGTTCCTTCCTTCCTCCGTGGACTGAGCCCTGGAACGAGGTGGTGACAGCCCTCTCCATGTGCAGCTGCTCATACACACTCATCTCTTACTGCCCTGGTAGGTCAGCAAGACTGGAGCAGAGGGAGCCGTGCTGGACGAGGCAAAGAATATCAACAAGTCACTGTCAGCTCTGGGCAATGTGATCTCCGCACTGGCTGAGGGCACTGTGAGTGATCCTTAGGTCCCCTCACCCCTCAAGCCACACCCCATCTCCTCCCCCACCTGCTAATGCCACCATATGATCATGCCCCAATTCATGGGTTGTCTGATCCCGGGGTGGCACCACTATCCTTTCTGATTCCCTGTTGAATTTTATTTGTTTATTTCTGATTCCTGGTCTCCTTCCTCCCCCAGAAAAGCTATGTTCCATATCGTGACAGCAAAATGATAAGGATTCTCCAGGACTCTCTCGGGGGAAACTGCCGGACGACTATGTTCATCTGTTGCTCACCATCCAGTTATAATGATGCAGAGACCAAGTCCACCCTGATGTTTGGGCAGCGGTCAGTGGCAGGGTCCCCAGAGGGATCCCTGGTACCCAGCTTCCCATCCCAGCCTCTGCGGCTCTCTCTCCTCAGGGTCACCCAAGTCTCATGTTGCTCTCATTTCTTTGTTCCTCTTCTCCTCACCCAGGGCAAAGACCATTAAGAACACTGCCTCAGTAAATTTGGAGTTGACTGCTGAGCAGTGGAAGAAGAAATATGAGAAGGAGAAGGAGAAGACAAAGGCCCAGAAGGAGACGATTGCGAAGCTGGAGGCTGAGCTGAGCCGGTGGCGCAATGGTTAGAGAGGGATAGGTGGGAGTGAGGGGCAGTGGGAAGAGGAGGAGGATGTTTGGGAGCCAACTCTGTTTGGGTGGTGTTTCTGGCCAGGCCAATCTCCTAGAAGAGGGGCTGTGTTTCTGGACAGGTGCAGTAGAGCAGTCATGGGGGAAGGGAGGGGCCTGACTACCTACCTCCCATACTCCCAAAAGGTAGAGGGTCCACCTGGCAAGAGAGTTCAAGGGGCATGGTGAGTGAGAAGGAAGAACTCGTGGATGCAGCTTCTTCTTCTTCCATCTCTCACCTCGTCTTGCCCCTTTGCAGGAGAGAATGTGCCTGAGACAGAGCGCCTGGCTGGGGAGGAGGCAGCCCTGGGAGCCGAGCTCTGTGAGGAGACCCCTGTGAATGACAACTCATCCATCGTGGTGCGCATCGCGCCCGAGGAGCGGCAGAAATACGAGGAGGAGATCCGCCGTCTCTATAAGCAGCTTGACGACAAGGTGAGGGCGGCCAGGCAGGGCACTGAGGCACGCCAGGTGGGATGAGAGGTAGACGATCAAAGAAAATCGCTTATATTGCCTCTTTCTGGTTTTAAAAGGGATAAATGCTTATGCTTGAAATGTGGAAACATCAATATAAATGTATGTAAGAAAATTAAAATCATCCACTATTCAGAGATAACACTCAACATTTTGCTTTTCTCTGTGCATATACCATGCAATTGAGTTATACTGTATAAGTAATTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTGTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATTGTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCTCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGACCTCTGGCGATCCGCCCGCCTCGGCCCCCTGAAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTGTATATGTAATTATACATCTGATTTTTTTCATTCAGCATTATATTATGCACAATTTCCTACTTCATTAATAATTCTTCATAAAAGTATTTTTATTTTCATTTATTATTATTATTTTGCTTTGAGAGAAAGAGTCTTGCTTTGTTACTCGGGCTGAAGTGCAGTGGTGCAGTAATAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTGGGCTCGAGGGATCCCCCCCAACCTCAGCCTCTGAAAGAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAGTTGGAGTCTCACTTTGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCGATCCTCCCGCCTTGGCCTTTCAATGCGCTGGGATTAAAGGCATGCACCACCAGGCTAGCTAATATTTTAAATTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGCCTTGAACTCCTGGCTTCAACCGATCTTCCTGTAGGATATGGGGTTTCTAACTCAAAGCTTATACTATCTGGATTTTTATCAGGATCCTGCCTCTACCCCCAAACTTCTTACGTCTAAACTGGAAGGAGTAGCTTCCCTTCACCTGTCTTTCCCTGTTGCCTCCAACAGGATGATGAAATCAACCA
Task1_train_18027
The variant affects gene B4GALNT1 (beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Spastic paraplegia
AAGCCCCAGGGTGGGTGGGCTGCAGCCAAAGAAGGAAGGGAAGATTAGCCCCAGACATTTCTCTGATCCTTTGACCTCTTAGCTCCTCCAGGTCCCGGGGCTCTGCATCCTGAGCTATCCAACACCACTGTACTTTGGGACCCGTGGGCAGTTTCGCTGCAACCTGGAGTGGCACCTGGGGCTCGGAGAAGGAGAAAAGGTGAAGGAGCTTGGTTTAGGAGGGATGTGGATCCTCAGGGAGTGGGAGGCAGGTGGGTGTTCTGAGGGGGATCCTTGTGCTCAAGGGGTGCATGTTCATGCTGTGTTTCGGGAGTGGTGACTGCCCTTCTTTACTTATAGGAGACTTCAAAGCCAGATGGCCCAATGGTTGCAGGTGAGATGGGGTGACAAGAAGGAAGATTTGGGCATGTTGCATGGTGACACCTGGGTACTCCTGTCTTCTCCCATTCTAGTTGCTGAGCCTGTCAGGGTGGTGGTCCTAGACTTCAGTGGTGTCACCTTTGCAGATGCTGCTGGGGCCAGAGAAGTGGTGCAGGTGAGGGAGAGGGTAGGTTGAGGAGAAACCCCTTAGCATCTCACTCATACCCTCTGATCTGGGACTTAACCCCTTTGCCCCATCCCTGCAGCTGGCCAGCCGATGTCGAGATGCTAGGATCCGCCTCCTCCTGGCTCAGTGTAATGGTGAGATGTGTGGAGAAGAGCGGGGCCCAGTGCCTGGGCAATGACTGGACACCTGCGGTAGGGAAAAGGACCCGGTGTGGACTTAGGGTCTCAGAGTCTGACACCCTCCCCACATAGCCTTGGTGCAGGGGACACTGACCCGGGTAGGACTCCTGGACAGGGTGACTCCAGATCAGCTGTTTGTGAGTGTGCAGGATGCAGCTGCTTATGCCCTGGGGAGCCTGTTAAGGGGCAGTAGCACCAGGAGCGGGAGCCAGGAGGCACTGGGCTGCGGCAAGTGAGGCAGGGGTAAGTGGCTGGAGACCCAGGGAGAGGGGTTTGGGAAAGGGTCTGAGGAAGATCAAGAAGAAAAGGGTGGGGACGGAATGAATAGTAGATTGAAGACCAAATCAGGGAGCCCGGGCTGAGCTATGGGTGAGGAACTGAAGAACTCAGATCCCTAAGTAGGTGGGGTACCCCTGAGAGGACTGCCACATTTCATTAAGGAAGAGGGGTGCCTAATCTATTCCTGACATGTCTCCTCTCTTCTCCAGGAGCTCACTGACCCAAAGATTTGCACCGTGTGGGTCTGACCTCATCATGTGGAGTGCAGAGGGCCCTGATGACATGTGTGTGATGAGGACCATGACCCTTGAACCCCCTTACCTAACGTAACTAATAAAATGAAGCTGAGAGCTTTGGAATCCATGAAGTGAGTCTAGGTGTTTGCACAGGGACTCTGGTGCCCCTTCTTTTGTGCCCACAGCATTGCAGAGACACAACTAAGAATGGCTTTCACCAACCACCAGCCCTCACCCCAGCCCCAGAGCCACAAGTTCTCTCTGTGGGGGTGGGGCTGGAGCAGGTACACAGAGTACTGGATCTGAAGATGCAGATGAGGGGCACAGTCTTGGGATTATGTGTTGGGGAACTTCCCCACCCCCTCGGTCCCAAGATGAGAGGACAGTGTTTCCACCTTAGGTTCTTAGAGTCCCTCTGGGCTCTTTGGCACTTGGAAAGTGATCCCCCCATTTCCTGCCCCATGAGAATGGGCAGGGGGAGGACTTGGCACTGGCTGTGGGAGAGGTTATGGCTCCACCAGGCCTCTGGGCACTGGAAAAAGGAGGGGTGTCACCAGGACAACCCCTACTGGGCATCAGGTTCTGAAAAGGAAGAGTGAGGAACTAGAGGCTCAGGGACAGCCAGTAGAGTGCTCACAGGGTGGTGGGGTTTGTTGGAAATTCCTGGCAGGGACAAGGAGGCAGGCCCAGCCTGACAGTCAGAAATCCCCAGCGGGCCATCACTGGGAGGTCATGCACTGCAGCCGGTGTTTGAAGAAGAGCAGCCGGTGTTTGGCCATCTGGCTCTCGTCCAGTGATCCTGGGTAACGGTACCGGGCGTAAGTCTCTGCTCCGGCATCCCTTGATGTCCAAGGCAGCTTCAGTTTGGATGCATGATCCACCACGACGTCGGAGCAGGAGCCAACCCGAAGGGAACCAAGCCCATCCAAGAAGAATTCTGGGGGTGGAGGGGAGTACACAGTGAGGGATCCTGAGGGTGCAGAAGGCCGACTGGTAAGGGAGAACTCTCAAATTTAGGGTGTGGAAAGTGTGTGTGCAAAGGCTTGTTTCTAAGGACCCTGAGCATGTAAATCAACTCCCTGGGTCTCAGTCTTACTCTTGTGTAAATGGAGTCAATATACTTGTGCTTTGAAAATCGAAAAACCTACCCCTACTCCCAGAGGTTAAATAAACGCCAGATGGGTTGCACCGACTGTGGTCTGAACTAGGGGAAGCCCTGGGAGTAGAGCAGGGGTGGCGGGAACAGTGATGGGGAAGCTTATGGGGGCCCAGCGGCTGTGCTGGGAATGGAGATTCAACATGGCACATGTATACACATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAACAAAAAATATATATATTTATAAAAAAAAAAAAAGAGTATGCGGGGCTGGGAGAGGGTGGGAGCTGTCTCTCGCCCAGGTGCAGGTCTTGGTAAATCACTGCAGAACTGTTCTGGGGTTCCCGCTGGCGGCTGGGCGCGGGTGCAGCCTAGGAGGAGAGGCGCGTGACCGTGCGCCAGCTCCCCGTGGGGCTCCTGCCAGGGTCGACCGGGAGGGGGTGCCACTCACCCAGATGAGCCACGCGGCTGAGGCGGGGGTCGAAACCGACCTCGCGCACCTTGTCAGTCCGCGCCAGGAAGAAGTTAACCACGCCGTCGGTGACCACGCAGCCTGGGAAGCCGACGAGCTCGTGGTGGAAGCCGCGCCTTTGCCGGAGGCAGTTCCCGAGGCCTGGGGCGCCGGGCTCCACGCTCAGCAGCTGCCGATAAGTGGTGGCAAAGCCGGAGATCTCGCGCACCGCGCCCCCCACCTGCAGGGAGAGGGAGGTTGCCTCCAGGCGGGCCTGGGATAGGGGACCCGAAGGGGTCAAGGTCTGCGCTCCGGTGCCTTCGGGGGTACCCCTGCCCCATCCTCTTCCGCTTCACCCCTGCAGGACCCAGACAGTTCCCAGGCCCCACTTCGTGGTTCTCTCTTTGTCCTAGGGCTGGCCGTTCCTGGCCGCAGCGCCCCCGCTGTGGCCTTAGCCTGTTCAAGGCCCTTCTCCACCCCCACATCCTGCAGCCCCTGCCCTACCAGGTCCAGCGGCGTCCGCTCCAGCACGTCCACAAGCCTCTCCAGCCGCGTCCGCGCCGTGAAGACGAAGTCGTCGTCCACCCACAGCACGTACTTGGTGGTTACTTGAGACACGGCCAGGTTCCGGCCTGCGAACCAGCCCTGGCAGAAAGGTGTGTGTGGTTGGGGAGGCTGCAGAAATAGGACATGGCCCTCTGCCACCTTTCTTTCTCTCCCCCGACCCTTCTCAGCTTGTATTCTTCTCCAGACTTTTGAGTGCTTTCGAAAGGCCAGGAGCTAGGTAAAAGAAATGCAGATCCCCACAGAGGTTCCAAGTCAGTGGTCTTAGAATGCGTTTAATTTCCGTGTGCATTTATTTATTCATTCATCAGCTATTTTATTGAATGCCATTAGGCACTAAGCACCATTCTAAGAATTCAGAGAGAATTTCCTGCTCCCACGAAGCTTACATTCCAGGAATCCTCATGCTTAACAGGCACCCCATGATTCTGAGGCAGGTGGTCCTCGAATCACTACCCTGGAGGCTGCAGATTGAGGGCACACCCCCTGCGGGAGTCCTCTGGCCTGCCGTTCAGCCTGCTAGCTGCACACCTTGCCGAAGGGCATGAGATAGTGTTCCACGTAGGGGCCACTAACGCGCTCTGGCTTGTCGCTGTCGTCAGCGATGACCACGGTAACCGTTGGGTAGAAGCGGCGGATACTGGTGATGAGAGCCCGTAGCCGATCATAACGGAGGAAGGTCTTGGTGGCAATCGTGA
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Task1_train_18028
Here is a genetic alteration in B4GALNT1 (beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1) on Chromosome 12. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Spastic paraparesis
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This variant affects the gene B4GALNT1 (beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1) found on Chromosome 12. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 26
AGCCCCAGGGTGGGTGGGCTGCAGCCAAAGAAGGAAGGGAAGATTAGCCCCAGACATTTCTCTGATCCTTTGACCTCTTAGCTCCTCCAGGTCCCGGGGCTCTGCATCCTGAGCTATCCAACACCACTGTACTTTGGGACCCGTGGGCAGTTTCGCTGCAACCTGGAGTGGCACCTGGGGCTCGGAGAAGGAGAAAAGGTGAAGGAGCTTGGTTTAGGAGGGATGTGGATCCTCAGGGAGTGGGAGGCAGGTGGGTGTTCTGAGGGGGATCCTTGTGCTCAAGGGGTGCATGTTCATGCTGTGTTTCGGGAGTGGTGACTGCCCTTCTTTACTTATAGGAGACTTCAAAGCCAGATGGCCCAATGGTTGCAGGTGAGATGGGGTGACAAGAAGGAAGATTTGGGCATGTTGCATGGTGACACCTGGGTACTCCTGTCTTCTCCCATTCTAGTTGCTGAGCCTGTCAGGGTGGTGGTCCTAGACTTCAGTGGTGTCACCTTTGCAGATGCTGCTGGGGCCAGAGAAGTGGTGCAGGTGAGGGAGAGGGTAGGTTGAGGAGAAACCCCTTAGCATCTCACTCATACCCTCTGATCTGGGACTTAACCCCTTTGCCCCATCCCTGCAGCTGGCCAGCCGATGTCGAGATGCTAGGATCCGCCTCCTCCTGGCTCAGTGTAATGGTGAGATGTGTGGAGAAGAGCGGGGCCCAGTGCCTGGGCAATGACTGGACACCTGCGGTAGGGAAAAGGACCCGGTGTGGACTTAGGGTCTCAGAGTCTGACACCCTCCCCACATAGCCTTGGTGCAGGGGACACTGACCCGGGTAGGACTCCTGGACAGGGTGACTCCAGATCAGCTGTTTGTGAGTGTGCAGGATGCAGCTGCTTATGCCCTGGGGAGCCTGTTAAGGGGCAGTAGCACCAGGAGCGGGAGCCAGGAGGCACTGGGCTGCGGCAAGTGAGGCAGGGGTAAGTGGCTGGAGACCCAGGGAGAGGGGTTTGGGAAAGGGTCTGAGGAAGATCAAGAAGAAAAGGGTGGGGACGGAATGAATAGTAGATTGAAGACCAAATCAGGGAGCCCGGGCTGAGCTATGGGTGAGGAACTGAAGAACTCAGATCCCTAAGTAGGTGGGGTACCCCTGAGAGGACTGCCACATTTCATTAAGGAAGAGGGGTGCCTAATCTATTCCTGACATGTCTCCTCTCTTCTCCAGGAGCTCACTGACCCAAAGATTTGCACCGTGTGGGTCTGACCTCATCATGTGGAGTGCAGAGGGCCCTGATGACATGTGTGTGATGAGGACCATGACCCTTGAACCCCCTTACCTAACGTAACTAATAAAATGAAGCTGAGAGCTTTGGAATCCATGAAGTGAGTCTAGGTGTTTGCACAGGGACTCTGGTGCCCCTTCTTTTGTGCCCACAGCATTGCAGAGACACAACTAAGAATGGCTTTCACCAACCACCAGCCCTCACCCCAGCCCCAGAGCCACAAGTTCTCTCTGTGGGGGTGGGGCTGGAGCAGGTACACAGAGTACTGGATCTGAAGATGCAGATGAGGGGCACAGTCTTGGGATTATGTGTTGGGGAACTTCCCCACCCCCTCGGTCCCAAGATGAGAGGACAGTGTTTCCACCTTAGGTTCTTAGAGTCCCTCTGGGCTCTTTGGCACTTGGAAAGTGATCCCCCCATTTCCTGCCCCATGAGAATGGGCAGGGGGAGGACTTGGCACTGGCTGTGGGAGAGGTTATGGCTCCACCAGGCCTCTGGGCACTGGAAAAAGGAGGGGTGTCACCAGGACAACCCCTACTGGGCATCAGGTTCTGAAAAGGAAGAGTGAGGAACTAGAGGCTCAGGGACAGCCAGTAGAGTGCTCACAGGGTGGTGGGGTTTGTTGGAAATTCCTGGCAGGGACAAGGAGGCAGGCCCAGCCTGACAGTCAGAAATCCCCAGCGGGCCATCACTGGGAGGTCATGCACTGCAGCCGGTGTTTGAAGAAGAGCAGCCGGTGTTTGGCCATCTGGCTCTCGTCCAGTGATCCTGGGTAACGGTACCGGGCGTAAGTCTCTGCTCCGGCATCCCTTGATGTCCAAGGCAGCTTCAGTTTGGATGCATGATCCACCACGACGTCGGAGCAGGAGCCAACCCGAAGGGAACCAAGCCCATCCAAGAAGAATTCTGGGGGTGGAGGGGAGTACACAGTGAGGGATCCTGAGGGTGCAGAAGGCCGACTGGTAAGGGAGAACTCTCAAATTTAGGGTGTGGAAAGTGTGTGTGCAAAGGCTTGTTTCTAAGGACCCTGAGCATGTAAATCAACTCCCTGGGTCTCAGTCTTACTCTTGTGTAAATGGAGTCAATATACTTGTGCTTTGAAAATCGAAAAACCTACCCCTACTCCCAGAGGTTAAATAAACGCCAGATGGGTTGCACCGACTGTGGTCTGAACTAGGGGAAGCCCTGGGAGTAGAGCAGGGGTGGCGGGAACAGTGATGGGGAAGCTTATGGGGGCCCAGCGGCTGTGCTGGGAATGGAGATTCAACATGGCACATGTATACACATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAACAAAAAATATATATATTTATAAAAAAAAAAAAAGAGTATGCGGGGCTGGGAGAGGGTGGGAGCTGTCTCTCGCCCAGGTGCAGGTCTTGGTAAATCACTGCAGAACTGTTCTGGGGTTCCCGCTGGCGGCTGGGCGCGGGTGCAGCCTAGGAGGAGAGGCGCGTGACCGTGCGCCAGCTCCCCGTGGGGCTCCTGCCAGGGTCGACCGGGAGGGGGTGCCACTCACCCAGATGAGCCACGCGGCTGAGGCGGGGGTCGAAACCGACCTCGCGCACCTTGTCAGTCCGCGCCAGGAAGAAGTTAACCACGCCGTCGGTGACCACGCAGCCTGGGAAGCCGACGAGCTCGTGGTGGAAGCCGCGCCTTTGCCGGAGGCAGTTCCCGAGGCCTGGGGCGCCGGGCTCCACGCTCAGCAGCTGCCGATAAGTGGTGGCAAAGCCGGAGATCTCGCGCACCGCGCCCCCCACCTGCAGGGAGAGGGAGGTTGCCTCCAGGCGGGCCTGGGATAGGGGACCCGAAGGGGTCAAGGTCTGCGCTCCGGTGCCTTCGGGGGTACCCCTGCCCCATCCTCTTCCGCTTCACCCCTGCAGGACCCAGACAGTTCCCAGGCCCCACTTCGTGGTTCTCTCTTTGTCCTAGGGCTGGCCGTTCCTGGCCGCAGCGCCCCCGCTGTGGCCTTAGCCTGTTCAAGGCCCTTCTCCACCCCCACATCCTGCAGCCCCTGCCCTACCAGGTCCAGCGGCGTCCGCTCCAGCACGTCCACAAGCCTCTCCAGCCGCGTCCGCGCCGTGAAGACGAAGTCGTCGTCCACCCACAGCACGTACTTGGTGGTTACTTGAGACACGGCCAGGTTCCGGCCTGCGAACCAGCCCTGGCAGAAAGGTGTGTGTGGTTGGGGAGGCTGCAGAAATAGGACATGGCCCTCTGCCACCTTTCTTTCTCTCCCCCGACCCTTCTCAGCTTGTATTCTTCTCCAGACTTTTGAGTGCTTTCGAAAGGCCAGGAGCTAGGTAAAAGAAATGCAGATCCCCACAGAGGTTCCAAGTCAGTGGTCTTAGAATGCGTTTAATTTCCGTGTGCATTTATTTATTCATTCATCAGCTATTTTATTGAATGCCATTAGGCACTAAGCACCATTCTAAGAATTCAGAGAGAATTTCCTGCTCCCACGAAGCTTACATTCCAGGAATCCTCATGCTTAACAGGCACCCCATGATTCTGAGGCAGGTGGTCCTCGAATCACTACCCTGGAGGCTGCAGATTGAGGGCACACCCCCTGCGGGAGTCCTCTGGCCTGCCGTTCAGCCTGCTAGCTGCACACCTTGCCGAAGGGCATGAGATAGTGTTCCACGTAGGGGCCACTAACGCGCTCTGGCTTGTCGCTGTCGTCAGCGATGACCACGGTAACCGTTGGGTAGAAGCGGCGGATACTGGTGATGAGAGCCCGTAGCCGATCATAACGGAGGAAGGTCTTGGTGGCAATCGTGAC
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This genomic variant is located on Chromosome 12, within the B4GALNT1 (beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 26
GCTCTGCATCCTGAGCTATCCAACACCACTGTACTTTGGGACCCGTGGGCAGTTTCGCTGCAACCTGGAGTGGCACCTGGGGCTCGGAGAAGGAGAAAAGGTGAAGGAGCTTGGTTTAGGAGGGATGTGGATCCTCAGGGAGTGGGAGGCAGGTGGGTGTTCTGAGGGGGATCCTTGTGCTCAAGGGGTGCATGTTCATGCTGTGTTTCGGGAGTGGTGACTGCCCTTCTTTACTTATAGGAGACTTCAAAGCCAGATGGCCCAATGGTTGCAGGTGAGATGGGGTGACAAGAAGGAAGATTTGGGCATGTTGCATGGTGACACCTGGGTACTCCTGTCTTCTCCCATTCTAGTTGCTGAGCCTGTCAGGGTGGTGGTCCTAGACTTCAGTGGTGTCACCTTTGCAGATGCTGCTGGGGCCAGAGAAGTGGTGCAGGTGAGGGAGAGGGTAGGTTGAGGAGAAACCCCTTAGCATCTCACTCATACCCTCTGATCTGGGACTTAACCCCTTTGCCCCATCCCTGCAGCTGGCCAGCCGATGTCGAGATGCTAGGATCCGCCTCCTCCTGGCTCAGTGTAATGGTGAGATGTGTGGAGAAGAGCGGGGCCCAGTGCCTGGGCAATGACTGGACACCTGCGGTAGGGAAAAGGACCCGGTGTGGACTTAGGGTCTCAGAGTCTGACACCCTCCCCACATAGCCTTGGTGCAGGGGACACTGACCCGGGTAGGACTCCTGGACAGGGTGACTCCAGATCAGCTGTTTGTGAGTGTGCAGGATGCAGCTGCTTATGCCCTGGGGAGCCTGTTAAGGGGCAGTAGCACCAGGAGCGGGAGCCAGGAGGCACTGGGCTGCGGCAAGTGAGGCAGGGGTAAGTGGCTGGAGACCCAGGGAGAGGGGTTTGGGAAAGGGTCTGAGGAAGATCAAGAAGAAAAGGGTGGGGACGGAATGAATAGTAGATTGAAGACCAAATCAGGGAGCCCGGGCTGAGCTATGGGTGAGGAACTGAAGAACTCAGATCCCTAAGTAGGTGGGGTACCCCTGAGAGGACTGCCACATTTCATTAAGGAAGAGGGGTGCCTAATCTATTCCTGACATGTCTCCTCTCTTCTCCAGGAGCTCACTGACCCAAAGATTTGCACCGTGTGGGTCTGACCTCATCATGTGGAGTGCAGAGGGCCCTGATGACATGTGTGTGATGAGGACCATGACCCTTGAACCCCCTTACCTAACGTAACTAATAAAATGAAGCTGAGAGCTTTGGAATCCATGAAGTGAGTCTAGGTGTTTGCACAGGGACTCTGGTGCCCCTTCTTTTGTGCCCACAGCATTGCAGAGACACAACTAAGAATGGCTTTCACCAACCACCAGCCCTCACCCCAGCCCCAGAGCCACAAGTTCTCTCTGTGGGGGTGGGGCTGGAGCAGGTACACAGAGTACTGGATCTGAAGATGCAGATGAGGGGCACAGTCTTGGGATTATGTGTTGGGGAACTTCCCCACCCCCTCGGTCCCAAGATGAGAGGACAGTGTTTCCACCTTAGGTTCTTAGAGTCCCTCTGGGCTCTTTGGCACTTGGAAAGTGATCCCCCCATTTCCTGCCCCATGAGAATGGGCAGGGGGAGGACTTGGCACTGGCTGTGGGAGAGGTTATGGCTCCACCAGGCCTCTGGGCACTGGAAAAAGGAGGGGTGTCACCAGGACAACCCCTACTGGGCATCAGGTTCTGAAAAGGAAGAGTGAGGAACTAGAGGCTCAGGGACAGCCAGTAGAGTGCTCACAGGGTGGTGGGGTTTGTTGGAAATTCCTGGCAGGGACAAGGAGGCAGGCCCAGCCTGACAGTCAGAAATCCCCAGCGGGCCATCACTGGGAGGTCATGCACTGCAGCCGGTGTTTGAAGAAGAGCAGCCGGTGTTTGGCCATCTGGCTCTCGTCCAGTGATCCTGGGTAACGGTACCGGGCGTAAGTCTCTGCTCCGGCATCCCTTGATGTCCAAGGCAGCTTCAGTTTGGATGCATGATCCACCACGACGTCGGAGCAGGAGCCAACCCGAAGGGAACCAAGCCCATCCAAGAAGAATTCTGGGGGTGGAGGGGAGTACACAGTGAGGGATCCTGAGGGTGCAGAAGGCCGACTGGTAAGGGAGAACTCTCAAATTTAGGGTGTGGAAAGTGTGTGTGCAAAGGCTTGTTTCTAAGGACCCTGAGCATGTAAATCAACTCCCTGGGTCTCAGTCTTACTCTTGTGTAAATGGAGTCAATATACTTGTGCTTTGAAAATCGAAAAACCTACCCCTACTCCCAGAGGTTAAATAAACGCCAGATGGGTTGCACCGACTGTGGTCTGAACTAGGGGAAGCCCTGGGAGTAGAGCAGGGGTGGCGGGAACAGTGATGGGGAAGCTTATGGGGGCCCAGCGGCTGTGCTGGGAATGGAGATTCAACATGGCACATGTATACACATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAACAAAAAATATATATATTTATAAAAAAAAAAAAAGAGTATGCGGGGCTGGGAGAGGGTGGGAGCTGTCTCTCGCCCAGGTGCAGGTCTTGGTAAATCACTGCAGAACTGTTCTGGGGTTCCCGCTGGCGGCTGGGCGCGGGTGCAGCCTAGGAGGAGAGGCGCGTGACCGTGCGCCAGCTCCCCGTGGGGCTCCTGCCAGGGTCGACCGGGAGGGGGTGCCACTCACCCAGATGAGCCACGCGGCTGAGGCGGGGGTCGAAACCGACCTCGCGCACCTTGTCAGTCCGCGCCAGGAAGAAGTTAACCACGCCGTCGGTGACCACGCAGCCTGGGAAGCCGACGAGCTCGTGGTGGAAGCCGCGCCTTTGCCGGAGGCAGTTCCCGAGGCCTGGGGCGCCGGGCTCCACGCTCAGCAGCTGCCGATAAGTGGTGGCAAAGCCGGAGATCTCGCGCACCGCGCCCCCCACCTGCAGGGAGAGGGAGGTTGCCTCCAGGCGGGCCTGGGATAGGGGACCCGAAGGGGTCAAGGTCTGCGCTCCGGTGCCTTCGGGGGTACCCCTGCCCCATCCTCTTCCGCTTCACCCCTGCAGGACCCAGACAGTTCCCAGGCCCCACTTCGTGGTTCTCTCTTTGTCCTAGGGCTGGCCGTTCCTGGCCGCAGCGCCCCCGCTGTGGCCTTAGCCTGTTCAAGGCCCTTCTCCACCCCCACATCCTGCAGCCCCTGCCCTACCAGGTCCAGCGGCGTCCGCTCCAGCACGTCCACAAGCCTCTCCAGCCGCGTCCGCGCCGTGAAGACGAAGTCGTCGTCCACCCACAGCACGTACTTGGTGGTTACTTGAGACACGGCCAGGTTCCGGCCTGCGAACCAGCCCTGGCAGAAAGGTGTGTGTGGTTGGGGAGGCTGCAGAAATAGGACATGGCCCTCTGCCACCTTTCTTTCTCTCCCCCGACCCTTCTCAGCTTGTATTCTTCTCCAGACTTTTGAGTGCTTTCGAAAGGCCAGGAGCTAGGTAAAAGAAATGCAGATCCCCACAGAGGTTCCAAGTCAGTGGTCTTAGAATGCGTTTAATTTCCGTGTGCATTTATTTATTCATTCATCAGCTATTTTATTGAATGCCATTAGGCACTAAGCACCATTCTAAGAATTCAGAGAGAATTTCCTGCTCCCACGAAGCTTACATTCCAGGAATCCTCATGCTTAACAGGCACCCCATGATTCTGAGGCAGGTGGTCCTCGAATCACTACCCTGGAGGCTGCAGATTGAGGGCACACCCCCTGCGGGAGTCCTCTGGCCTGCCGTTCAGCCTGCTAGCTGCACACCTTGCCGAAGGGCATGAGATAGTGTTCCACGTAGGGGCCACTAACGCGCTCTGGCTTGTCGCTGTCGTCAGCGATGACCACGGTAACCGTTGGGTAGAAGCGGCGGATACTGGTGATGAGAGCCCGTAGCCGATCATAACGGAGGAAGGTCTTGGTGGCAATCGTGACTAGAGCGCTGATGTTGTACTGGGCTGAGATTGGGGGCACAGGGTTGGGTGCAGACAAGGAGGGTTGGGAGAGGGGAACAGGTAGATATCCCCTCCCAG
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Task1_train_18031
A mutation on Chromosome 12 affecting B4GALNT1 (beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 26
CAGGATGCAGCTGCTTATGCCCTGGGGAGCCTGTTAAGGGGCAGTAGCACCAGGAGCGGGAGCCAGGAGGCACTGGGCTGCGGCAAGTGAGGCAGGGGTAAGTGGCTGGAGACCCAGGGAGAGGGGTTTGGGAAAGGGTCTGAGGAAGATCAAGAAGAAAAGGGTGGGGACGGAATGAATAGTAGATTGAAGACCAAATCAGGGAGCCCGGGCTGAGCTATGGGTGAGGAACTGAAGAACTCAGATCCCTAAGTAGGTGGGGTACCCCTGAGAGGACTGCCACATTTCATTAAGGAAGAGGGGTGCCTAATCTATTCCTGACATGTCTCCTCTCTTCTCCAGGAGCTCACTGACCCAAAGATTTGCACCGTGTGGGTCTGACCTCATCATGTGGAGTGCAGAGGGCCCTGATGACATGTGTGTGATGAGGACCATGACCCTTGAACCCCCTTACCTAACGTAACTAATAAAATGAAGCTGAGAGCTTTGGAATCCATGAAGTGAGTCTAGGTGTTTGCACAGGGACTCTGGTGCCCCTTCTTTTGTGCCCACAGCATTGCAGAGACACAACTAAGAATGGCTTTCACCAACCACCAGCCCTCACCCCAGCCCCAGAGCCACAAGTTCTCTCTGTGGGGGTGGGGCTGGAGCAGGTACACAGAGTACTGGATCTGAAGATGCAGATGAGGGGCACAGTCTTGGGATTATGTGTTGGGGAACTTCCCCACCCCCTCGGTCCCAAGATGAGAGGACAGTGTTTCCACCTTAGGTTCTTAGAGTCCCTCTGGGCTCTTTGGCACTTGGAAAGTGATCCCCCCATTTCCTGCCCCATGAGAATGGGCAGGGGGAGGACTTGGCACTGGCTGTGGGAGAGGTTATGGCTCCACCAGGCCTCTGGGCACTGGAAAAAGGAGGGGTGTCACCAGGACAACCCCTACTGGGCATCAGGTTCTGAAAAGGAAGAGTGAGGAACTAGAGGCTCAGGGACAGCCAGTAGAGTGCTCACAGGGTGGTGGGGTTTGTTGGAAATTCCTGGCAGGGACAAGGAGGCAGGCCCAGCCTGACAGTCAGAAATCCCCAGCGGGCCATCACTGGGAGGTCATGCACTGCAGCCGGTGTTTGAAGAAGAGCAGCCGGTGTTTGGCCATCTGGCTCTCGTCCAGTGATCCTGGGTAACGGTACCGGGCGTAAGTCTCTGCTCCGGCATCCCTTGATGTCCAAGGCAGCTTCAGTTTGGATGCATGATCCACCACGACGTCGGAGCAGGAGCCAACCCGAAGGGAACCAAGCCCATCCAAGAAGAATTCTGGGGGTGGAGGGGAGTACACAGTGAGGGATCCTGAGGGTGCAGAAGGCCGACTGGTAAGGGAGAACTCTCAAATTTAGGGTGTGGAAAGTGTGTGTGCAAAGGCTTGTTTCTAAGGACCCTGAGCATGTAAATCAACTCCCTGGGTCTCAGTCTTACTCTTGTGTAAATGGAGTCAATATACTTGTGCTTTGAAAATCGAAAAACCTACCCCTACTCCCAGAGGTTAAATAAACGCCAGATGGGTTGCACCGACTGTGGTCTGAACTAGGGGAAGCCCTGGGAGTAGAGCAGGGGTGGCGGGAACAGTGATGGGGAAGCTTATGGGGGCCCAGCGGCTGTGCTGGGAATGGAGATTCAACATGGCACATGTATACACATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAACAAAAAATATATATATTTATAAAAAAAAAAAAAGAGTATGCGGGGCTGGGAGAGGGTGGGAGCTGTCTCTCGCCCAGGTGCAGGTCTTGGTAAATCACTGCAGAACTGTTCTGGGGTTCCCGCTGGCGGCTGGGCGCGGGTGCAGCCTAGGAGGAGAGGCGCGTGACCGTGCGCCAGCTCCCCGTGGGGCTCCTGCCAGGGTCGACCGGGAGGGGGTGCCACTCACCCAGATGAGCCACGCGGCTGAGGCGGGGGTCGAAACCGACCTCGCGCACCTTGTCAGTCCGCGCCAGGAAGAAGTTAACCACGCCGTCGGTGACCACGCAGCCTGGGAAGCCGACGAGCTCGTGGTGGAAGCCGCGCCTTTGCCGGAGGCAGTTCCCGAGGCCTGGGGCGCCGGGCTCCACGCTCAGCAGCTGCCGATAAGTGGTGGCAAAGCCGGAGATCTCGCGCACCGCGCCCCCCACCTGCAGGGAGAGGGAGGTTGCCTCCAGGCGGGCCTGGGATAGGGGACCCGAAGGGGTCAAGGTCTGCGCTCCGGTGCCTTCGGGGGTACCCCTGCCCCATCCTCTTCCGCTTCACCCCTGCAGGACCCAGACAGTTCCCAGGCCCCACTTCGTGGTTCTCTCTTTGTCCTAGGGCTGGCCGTTCCTGGCCGCAGCGCCCCCGCTGTGGCCTTAGCCTGTTCAAGGCCCTTCTCCACCCCCACATCCTGCAGCCCCTGCCCTACCAGGTCCAGCGGCGTCCGCTCCAGCACGTCCACAAGCCTCTCCAGCCGCGTCCGCGCCGTGAAGACGAAGTCGTCGTCCACCCACAGCACGTACTTGGTGGTTACTTGAGACACGGCCAGGTTCCGGCCTGCGAACCAGCCCTGGCAGAAAGGTGTGTGTGGTTGGGGAGGCTGCAGAAATAGGACATGGCCCTCTGCCACCTTTCTTTCTCTCCCCCGACCCTTCTCAGCTTGTATTCTTCTCCAGACTTTTGAGTGCTTTCGAAAGGCCAGGAGCTAGGTAAAAGAAATGCAGATCCCCACAGAGGTTCCAAGTCAGTGGTCTTAGAATGCGTTTAATTTCCGTGTGCATTTATTTATTCATTCATCAGCTATTTTATTGAATGCCATTAGGCACTAAGCACCATTCTAAGAATTCAGAGAGAATTTCCTGCTCCCACGAAGCTTACATTCCAGGAATCCTCATGCTTAACAGGCACCCCATGATTCTGAGGCAGGTGGTCCTCGAATCACTACCCTGGAGGCTGCAGATTGAGGGCACACCCCCTGCGGGAGTCCTCTGGCCTGCCGTTCAGCCTGCTAGCTGCACACCTTGCCGAAGGGCATGAGATAGTGTTCCACGTAGGGGCCACTAACGCGCTCTGGCTTGTCGCTGTCGTCAGCGATGACCACGGTAACCGTTGGGTAGAAGCGGCGGATACTGGTGATGAGAGCCCGTAGCCGATCATAACGGAGGAAGGTCTTGGTGGCAATCGTGACTAGAGCGCTGATGTTGTACTGGGCTGAGATTGGGGGCACAGGGTTGGGTGCAGACAAGGAGGGTTGGGAGAGGGGAACAGGTAGATATCCCCTCCCAGGACTGCCCTCTCCCAACTTGCTCCCCACCAAGGCTGGTTCTAATATGTCCCTGCCCCTACCAGCCTCACCTCCCTGGGGTAGAGACCCAGGTGGGTACAGCCGAGGGTTGGGCGGGTGTCTTATGCGGATAGTGAAAGCAGCCTCATGTCCCTCGGTGGAGAACCGGACTGGGAAGAAAGGACATGGCATTTGACCCTGAAGGGTGGGATAACATTCTGTTTTCAGCCAATCAATATTTAAGTGCCTACTCTGTGTCCCACCTTTCTAGGCCTTGGTGGACAAGAACAGAAGGTTCTTACCTTTATGGAACTTACATTCTAATGGGTAGGAGAAAAAACAACAAAGAAAATTTTAAGTAAAAGCTAATCTTTATTGAGCACTTACTATGTGCCAGACCCGTTAAAAAATTACCTTAAATATATGCACTCATTTTATCCCCATGATAGCCCTATTAAGTAGATTCCTACAACAGAAAAAAAAGCTGAGACACAGAAAAGTAACTTGCCACATTTACACAACTATTAAGCAACAAAACTGATAGCAACCTAGTCAGTCTGGTGCCAGGCTAAGTAAATTAAAAAATTCAGATACTGGTAAGTATTGAGTGGAAAATAAGACAAACAAGTAATGTGATAGTGAAGAGGAGGCATTTGAACTGAGATCTAAATGACAAGAAGAAGCCAGTCTGCAAAAATCTGGGGAAGAGCATTCCAGGCTGAGAAAATAGAAAGTGCAAAGGCCCTAAGGTGGAAGCAAACTTAGTGCAACAAAC
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Task1_train_18032
The following genetic variant occurs in CDK4 (cyclin dependent kinase 4) on Chromosome 12. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Familial melanoma
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Task1_train_18033
This genomic variant is located on Chromosome 12, within the CDK4 (cyclin dependent kinase 4) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Hereditary cancer-predisposing syndrome
ATAAAGGCCAACAATTCCAGCACTTTGGGATGCTGAGGTGAGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTTCTAGATCAGCCTGGGCAAGCAAGACCTTGTCTCTTTTTTTAAAAAAAAAGAAATGCCAGGTGCAGCGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGTCTGATGTGGGTGGATCATGAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCATTACTAAAAGTACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCGTGCACCTGTGGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGTCAAGAGAATTGCTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCGCACTACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCAAGACTCCATCTAAAAAAAAAAAAAGCCAGTCATGGTGGCGTGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCAAGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTTAGCCCAGGAGGTAGAGGCTACAGTGAGCTGTAATTGGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCTTATCTCAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAAGAGAATAAAGGGATATGAAGTTCCTAATTCCAGAACATTTCAGAGCTTTCTGCTATGGGCAAGTTAGTAGTACGCAAGTAAAAGAATGGGGCCAGATGCAGTAGCTTATGCTACTTTGGGAGGTAGGGGTGGGAGGATTGCTTGAGTGCAAGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAATATACTGAGACCCCATCTCTATAAAAATATTAACAAACTAGCCAAGCATGGAGGTGCGTGCCTGTAGTGTCAGCTAGTTGGGAAGCTGAGATGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTTGAAGCTGCAGTGAGCTGTGATCATGCCATTGCAATCCAGCCTGGGCAACACAGCAAGCCCTGGTCTCAAAAAAAAAGAATGGGCAAGGTATGGATGTGGTTTATGAACAAGCGATTTGGGGAATTCAAGGTAGTCCAGGGTATGTGGGTCCCATACTTTCGACGAAACATCTCTGCAAAGATACAGCCAACACTCCACATGTCCACAGGTGTTGCATATGTGGACTGCAGAAGAACTTCGGGAGCTCGGTACCAGAGTGTAACAACCTAAAGGGAATAGGAAGAATGGATGGGGACCCCATGGGTTACCATGAAACACAACTTGCTTGACTGAACACATGAAGCACATGACTTCTCAATTGCTACGGGCAATCACTCTCCTACTCCCAACCAGAACCCATTTTGGTACCATCTTTCTACTGACCACGGGTGTAAGTGCCATCTGGTAGCTGTAGATTCTGGCCAGGCCAAAGTCAGCCAGCTTGACTGTTCCACCACTTGTCACCAGAATGTTCTCTGGCTTCAGATCTCGGTGAACGATGCAATTGGCATGAAGGAAATCTAGGCCTCTTAGAAACTGGCGCATCAGATCCTAGTTTCAAAGGGGAGGTACAGATGCACTGGAAACTAGGCACCATACCTGAAATCCCAGAAGGTTCTACTACAAAGGTCCCAATCCACCTCTCAATGCCTACCAACCCCACTCACCTTGATCGTTTCGGCTGGCAAGCCTGGTGGGGGTGCCTTGTCCAGATATGTCCTTAGGTCCTGGTCTACATGCTCAAACACCAGGGTTACCTTGATCTCCCGGTCAGTTCGGGATGTGGCACAGACGTCCATCAGCCTGACCAGAGTAAATGCTCACTTTTCAATCCCCTTTAACCCAACATGGCCTCTCATTATTTCCTCAGGGTCCCCACTTCTCTACAGATCATCACACCCCACCTATAGGCTGTCTTTTCCCTTTACTCCCCACGCCCAACCCTCCACCACCTTCTCACCGGACAACATTGGGATGCTCAAAAGCCTCCAGTCGCCTCAGTAAAGCCACCTCACGAACTGTGCTGATGGGAAGGCCTCCTCCACCTCCTCCTCCATTGGGGACTCTCACACTCTTGAGGGCCACAAAGTGGCCACTGTGGGGATCACGGGCCTTGTACACTGTCCCATAGGCACCGACACCAATTTCAGCCACTGGCTCATATCGAGAGGTAGCCATTCTCAGATCAAGGGAGACCCTACAATCACAGACTCCTATCACCAAAAGTCGCTTACAGAGTTAGGATGGTATGAGCCTGCAGCAACAAAGGGACTCCCAAAAAAAAAGCGCAAAGAACACCACCAGCATCCCATCCCCCGCTCCCAGTCTTCCTTGGGGCCGGCCCCAGAGATAACACAATGACTCAATACCAACCCCTCCAGCCACGTGAGGCCCTGCAATAGAAAACGCTTTTTCCTTTGGGACAATCGCGCCCCGCACAAAGATCACACATGACACATGCCTTGCATCGAAGATCCTACACCTCAGTCCCTAAAATTATACTTTCCCATGACCACAAAGGCCCCACTTCCCGCCCTTGAGCGACCCTTCCATAACCAGCTCGCGAAACGAACGCGTGGAAAGCTGTGAGGGGGGCGGGCACTGGTTCTCATTCCTGGGAAGGGACTGCACTTACCTCACGCCAGCCCGGGGTGCTGTGGGGGCGGCCCGTTATCGGGGCCCCGGAGCCGGTTCCTACGGCCCCATACACCCGAGCTCGGTCCGGAGCAGCTGGACGCAGAGGGCCCGACCATAGACACAGGCCGCAAGCTAGAGAGGCCCCCTCACCCCCACCCTCACCATGTGACCAGCTGCCAAAGAGGCGCGCGGAAACTGGGAGGGCGGGGCGAACGCCGGACGTTCTGGGCACGTGACCGCCACCCATGCGCTGAGGGGCGGACAGGAGGTGCTTCGACTGGGAGGAGGGCGAAGAGTGTAAGGGGGCGGAGGGGCGATGGCAGCCACGTGATCTGTTGCTATCACACGTGACCGCTTGACATTGCTCTGAGGAGCAGAGGTGTGGCTACGCGGCGGGCACGTGACTGGCTGCCACAACCCCCGCTGCAGGGGGGGAGCGGTGAGGGGGACAAGAGAGGGTGGAGCCCGAGGCGGTGCCATGGCAACCTAGGCCACCCAGAGCCCAACTCCCGGCTGAAGGATTGTCTCACTACCGGTCTGAAGGCTGAACTCCAGTCTCACTACCGGTCTTTCAGCCTGTCTGCATTGGGGAGGGGGTGGGAGTTGGGGTACCAGAGGTGATGCTGTCACCTTTTCGCTCCACCATGAGAAAACATACTCTCATTTGTGTCATTGTTTCATTCATTAATTCTACAACATTTTACTGAGTGCTTGCTTCCAGTGTGTATGTGGGTTTTTATTTTGTTTTTGGTGTCTGTCACTGGCCCTTTAAAGTAGTGGTACGACTATCTATAAAGATGTAGCCAACAATGGGGTCTTCTACAATAGGGAGTAAACAATGCCCATTTGAGGGCAAAACTACGATTAAAGGATGACGGAAGGCAGATTAATACAGTAATCCAACAGGCTCAGTGACAAGGTAATCCTCTCACTTTTCCAACTTCCAAACCTCCCTGGGAGTGTTAATGCAAAGACCTGAGGCCATCTGGCAGAGAAGTTATTGATGAGCAGGAGACAGGAATACTTGACCTTTTAAGTTTTTTTTTTTTTTCCAGTAGGAAGGTTCTATGATTATGTGATATTTGTATGTGTGCATATATGCTTCTATGTATATATGTATGTATATGATATTATTTATCACATCATATATAAGACGGATACAGGATTGCACATGTGCAAGAAAGTTACCACCACACCCCCTGCACCCTCCAGACCACCACAATGAATGAAAATGACATGCCCCCTTCTGCAAACCTTGTGACTACTCATTTGGAGTTATTGTGCTTCCCTCTTTTTCCCTAGTGCCGCTTTCTTAGCACTTAGCACTGTCCAGAACACACTTGTTCCCAAATGGCCTCTGCCCAGACACCTAGGTAGACACAAGTAGATTTCTCCTACTTTGTTTTATTGGCTCCAAGGTCTTTATCTCCCAGCCCTTTGGGGGTATGGGAGTAAAGGAGGAAAGCGGTTAGTGTCTCATTTGTGAGAATTTGTCTAAAATCTAAAGCCATTTTATTA
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This variant impacts the gene CDK4 (cyclin dependent kinase 4) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Familial melanoma
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Task1_train_18035
This sequence change occurs on Chromosome 12, altering CDK4 (cyclin dependent kinase 4). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Hereditary cancer-predisposing syndrome
TAAAGGCCAACAATTCCAGCACTTTGGGATGCTGAGGTGAGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTTCTAGATCAGCCTGGGCAAGCAAGACCTTGTCTCTTTTTTTAAAAAAAAAGAAATGCCAGGTGCAGCGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGTCTGATGTGGGTGGATCATGAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCATTACTAAAAGTACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCGTGCACCTGTGGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGTCAAGAGAATTGCTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCGCACTACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCAAGACTCCATCTAAAAAAAAAAAAAGCCAGTCATGGTGGCGTGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCAAGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTTAGCCCAGGAGGTAGAGGCTACAGTGAGCTGTAATTGGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCTTATCTCAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAAGAGAATAAAGGGATATGAAGTTCCTAATTCCAGAACATTTCAGAGCTTTCTGCTATGGGCAAGTTAGTAGTACGCAAGTAAAAGAATGGGGCCAGATGCAGTAGCTTATGCTACTTTGGGAGGTAGGGGTGGGAGGATTGCTTGAGTGCAAGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAATATACTGAGACCCCATCTCTATAAAAATATTAACAAACTAGCCAAGCATGGAGGTGCGTGCCTGTAGTGTCAGCTAGTTGGGAAGCTGAGATGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTTGAAGCTGCAGTGAGCTGTGATCATGCCATTGCAATCCAGCCTGGGCAACACAGCAAGCCCTGGTCTCAAAAAAAAAGAATGGGCAAGGTATGGATGTGGTTTATGAACAAGCGATTTGGGGAATTCAAGGTAGTCCAGGGTATGTGGGTCCCATACTTTCGACGAAACATCTCTGCAAAGATACAGCCAACACTCCACATGTCCACAGGTGTTGCATATGTGGACTGCAGAAGAACTTCGGGAGCTCGGTACCAGAGTGTAACAACCTAAAGGGAATAGGAAGAATGGATGGGGACCCCATGGGTTACCATGAAACACAACTTGCTTGACTGAACACATGAAGCACATGACTTCTCAATTGCTACGGGCAATCACTCTCCTACTCCCAACCAGAACCCATTTTGGTACCATCTTTCTACTGACCACGGGTGTAAGTGCCATCTGGTAGCTGTAGATTCTGGCCAGGCCAAAGTCAGCCAGCTTGACTGTTCCACCACTTGTCACCAGAATGTTCTCTGGCTTCAGATCTCGGTGAACGATGCAATTGGCATGAAGGAAATCTAGGCCTCTTAGAAACTGGCGCATCAGATCCTAGTTTCAAAGGGGAGGTACAGATGCACTGGAAACTAGGCACCATACCTGAAATCCCAGAAGGTTCTACTACAAAGGTCCCAATCCACCTCTCAATGCCTACCAACCCCACTCACCTTGATCGTTTCGGCTGGCAAGCCTGGTGGGGGTGCCTTGTCCAGATATGTCCTTAGGTCCTGGTCTACATGCTCAAACACCAGGGTTACCTTGATCTCCCGGTCAGTTCGGGATGTGGCACAGACGTCCATCAGCCTGACCAGAGTAAATGCTCACTTTTCAATCCCCTTTAACCCAACATGGCCTCTCATTATTTCCTCAGGGTCCCCACTTCTCTACAGATCATCACACCCCACCTATAGGCTGTCTTTTCCCTTTACTCCCCACGCCCAACCCTCCACCACCTTCTCACCGGACAACATTGGGATGCTCAAAAGCCTCCAGTCGCCTCAGTAAAGCCACCTCACGAACTGTGCTGATGGGAAGGCCTCCTCCACCTCCTCCTCCATTGGGGACTCTCACACTCTTGAGGGCCACAAAGTGGCCACTGTGGGGATCACGGGCCTTGTACACTGTCCCATAGGCACCGACACCAATTTCAGCCACTGGCTCATATCGAGAGGTAGCCATTCTCAGATCAAGGGAGACCCTACAATCACAGACTCCTATCACCAAAAGTCGCTTACAGAGTTAGGATGGTATGAGCCTGCAGCAACAAAGGGACTCCCAAAAAAAAAGCGCAAAGAACACCACCAGCATCCCATCCCCCGCTCCCAGTCTTCCTTGGGGCCGGCCCCAGAGATAACACAATGACTCAATACCAACCCCTCCAGCCACGTGAGGCCCTGCAATAGAAAACGCTTTTTCCTTTGGGACAATCGCGCCCCGCACAAAGATCACACATGACACATGCCTTGCATCGAAGATCCTACACCTCAGTCCCTAAAATTATACTTTCCCATGACCACAAAGGCCCCACTTCCCGCCCTTGAGCGACCCTTCCATAACCAGCTCGCGAAACGAACGCGTGGAAAGCTGTGAGGGGGGCGGGCACTGGTTCTCATTCCTGGGAAGGGACTGCACTTACCTCACGCCAGCCCGGGGTGCTGTGGGGGCGGCCCGTTATCGGGGCCCCGGAGCCGGTTCCTACGGCCCCATACACCCGAGCTCGGTCCGGAGCAGCTGGACGCAGAGGGCCCGACCATAGACACAGGCCGCAAGCTAGAGAGGCCCCCTCACCCCCACCCTCACCATGTGACCAGCTGCCAAAGAGGCGCGCGGAAACTGGGAGGGCGGGGCGAACGCCGGACGTTCTGGGCACGTGACCGCCACCCATGCGCTGAGGGGCGGACAGGAGGTGCTTCGACTGGGAGGAGGGCGAAGAGTGTAAGGGGGCGGAGGGGCGATGGCAGCCACGTGATCTGTTGCTATCACACGTGACCGCTTGACATTGCTCTGAGGAGCAGAGGTGTGGCTACGCGGCGGGCACGTGACTGGCTGCCACAACCCCCGCTGCAGGGGGGGAGCGGTGAGGGGGACAAGAGAGGGTGGAGCCCGAGGCGGTGCCATGGCAACCTAGGCCACCCAGAGCCCAACTCCCGGCTGAAGGATTGTCTCACTACCGGTCTGAAGGCTGAACTCCAGTCTCACTACCGGTCTTTCAGCCTGTCTGCATTGGGGAGGGGGTGGGAGTTGGGGTACCAGAGGTGATGCTGTCACCTTTTCGCTCCACCATGAGAAAACATACTCTCATTTGTGTCATTGTTTCATTCATTAATTCTACAACATTTTACTGAGTGCTTGCTTCCAGTGTGTATGTGGGTTTTTATTTTGTTTTTGGTGTCTGTCACTGGCCCTTTAAAGTAGTGGTACGACTATCTATAAAGATGTAGCCAACAATGGGGTCTTCTACAATAGGGAGTAAACAATGCCCATTTGAGGGCAAAACTACGATTAAAGGATGACGGAAGGCAGATTAATACAGTAATCCAACAGGCTCAGTGACAAGGTAATCCTCTCACTTTTCCAACTTCCAAACCTCCCTGGGAGTGTTAATGCAAAGACCTGAGGCCATCTGGCAGAGAAGTTATTGATGAGCAGGAGACAGGAATACTTGACCTTTTAAGTTTTTTTTTTTTTTCCAGTAGGAAGGTTCTATGATTATGTGATATTTGTATGTGTGCATATATGCTTCTATGTATATATGTATGTATATGATATTATTTATCACATCATATATAAGACGGATACAGGATTGCACATGTGCAAGAAAGTTACCACCACACCCCCTGCACCCTCCAGACCACCACAATGAATGAAAATGACATGCCCCCTTCTGCAAACCTTGTGACTACTCATTTGGAGTTATTGTGCTTCCCTCTTTTTCCCTAGTGCCGCTTTCTTAGCACTTAGCACTGTCCAGAACACACTTGTTCCCAAATGGCCTCTGCCCAGACACCTAGGTAGACACAAGTAGATTTCTCCTACTTTGTTTTATTGGCTCCAAGGTCTTTATCTCCCAGCCCTTTGGGGGTATGGGAGTAAAGGAGGAAAGCGGTTAGTGTCTCATTTGTGAGAATTTGTCTAAAATCTAAAGCCATTTTATTAC
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Task1_train_18036
Given a variant located on Chromosome 12 and affecting CDK4 (cyclin dependent kinase 4), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Melanoma, cutaneous malignant, susceptibility to, 3
TAAAGGCCAACAATTCCAGCACTTTGGGATGCTGAGGTGAGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTTCTAGATCAGCCTGGGCAAGCAAGACCTTGTCTCTTTTTTTAAAAAAAAAGAAATGCCAGGTGCAGCGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGTCTGATGTGGGTGGATCATGAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCATTACTAAAAGTACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCGTGCACCTGTGGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGTCAAGAGAATTGCTTGAATCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCGCACTACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCAAGACTCCATCTAAAAAAAAAAAAAGCCAGTCATGGTGGCGTGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCAAGAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTTAGCCCAGGAGGTAGAGGCTACAGTGAGCTGTAATTGGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCTTATCTCAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAATAAAGAGAATAAAGGGATATGAAGTTCCTAATTCCAGAACATTTCAGAGCTTTCTGCTATGGGCAAGTTAGTAGTACGCAAGTAAAAGAATGGGGCCAGATGCAGTAGCTTATGCTACTTTGGGAGGTAGGGGTGGGAGGATTGCTTGAGTGCAAGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAATATACTGAGACCCCATCTCTATAAAAATATTAACAAACTAGCCAAGCATGGAGGTGCGTGCCTGTAGTGTCAGCTAGTTGGGAAGCTGAGATGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTTGAAGCTGCAGTGAGCTGTGATCATGCCATTGCAATCCAGCCTGGGCAACACAGCAAGCCCTGGTCTCAAAAAAAAAGAATGGGCAAGGTATGGATGTGGTTTATGAACAAGCGATTTGGGGAATTCAAGGTAGTCCAGGGTATGTGGGTCCCATACTTTCGACGAAACATCTCTGCAAAGATACAGCCAACACTCCACATGTCCACAGGTGTTGCATATGTGGACTGCAGAAGAACTTCGGGAGCTCGGTACCAGAGTGTAACAACCTAAAGGGAATAGGAAGAATGGATGGGGACCCCATGGGTTACCATGAAACACAACTTGCTTGACTGAACACATGAAGCACATGACTTCTCAATTGCTACGGGCAATCACTCTCCTACTCCCAACCAGAACCCATTTTGGTACCATCTTTCTACTGACCACGGGTGTAAGTGCCATCTGGTAGCTGTAGATTCTGGCCAGGCCAAAGTCAGCCAGCTTGACTGTTCCACCACTTGTCACCAGAATGTTCTCTGGCTTCAGATCTCGGTGAACGATGCAATTGGCATGAAGGAAATCTAGGCCTCTTAGAAACTGGCGCATCAGATCCTAGTTTCAAAGGGGAGGTACAGATGCACTGGAAACTAGGCACCATACCTGAAATCCCAGAAGGTTCTACTACAAAGGTCCCAATCCACCTCTCAATGCCTACCAACCCCACTCACCTTGATCGTTTCGGCTGGCAAGCCTGGTGGGGGTGCCTTGTCCAGATATGTCCTTAGGTCCTGGTCTACATGCTCAAACACCAGGGTTACCTTGATCTCCCGGTCAGTTCGGGATGTGGCACAGACGTCCATCAGCCTGACCAGAGTAAATGCTCACTTTTCAATCCCCTTTAACCCAACATGGCCTCTCATTATTTCCTCAGGGTCCCCACTTCTCTACAGATCATCACACCCCACCTATAGGCTGTCTTTTCCCTTTACTCCCCACGCCCAACCCTCCACCACCTTCTCACCGGACAACATTGGGATGCTCAAAAGCCTCCAGTCGCCTCAGTAAAGCCACCTCACGAACTGTGCTGATGGGAAGGCCTCCTCCACCTCCTCCTCCATTGGGGACTCTCACACTCTTGAGGGCCACAAAGTGGCCACTGTGGGGATCACGGGCCTTGTACACTGTCCCATAGGCACCGACACCAATTTCAGCCACTGGCTCATATCGAGAGGTAGCCATTCTCAGATCAAGGGAGACCCTACAATCACAGACTCCTATCACCAAAAGTCGCTTACAGAGTTAGGATGGTATGAGCCTGCAGCAACAAAGGGACTCCCAAAAAAAAAGCGCAAAGAACACCACCAGCATCCCATCCCCCGCTCCCAGTCTTCCTTGGGGCCGGCCCCAGAGATAACACAATGACTCAATACCAACCCCTCCAGCCACGTGAGGCCCTGCAATAGAAAACGCTTTTTCCTTTGGGACAATCGCGCCCCGCACAAAGATCACACATGACACATGCCTTGCATCGAAGATCCTACACCTCAGTCCCTAAAATTATACTTTCCCATGACCACAAAGGCCCCACTTCCCGCCCTTGAGCGACCCTTCCATAACCAGCTCGCGAAACGAACGCGTGGAAAGCTGTGAGGGGGGCGGGCACTGGTTCTCATTCCTGGGAAGGGACTGCACTTACCTCACGCCAGCCCGGGGTGCTGTGGGGGCGGCCCGTTATCGGGGCCCCGGAGCCGGTTCCTACGGCCCCATACACCCGAGCTCGGTCCGGAGCAGCTGGACGCAGAGGGCCCGACCATAGACACAGGCCGCAAGCTAGAGAGGCCCCCTCACCCCCACCCTCACCATGTGACCAGCTGCCAAAGAGGCGCGCGGAAACTGGGAGGGCGGGGCGAACGCCGGACGTTCTGGGCACGTGACCGCCACCCATGCGCTGAGGGGCGGACAGGAGGTGCTTCGACTGGGAGGAGGGCGAAGAGTGTAAGGGGGCGGAGGGGCGATGGCAGCCACGTGATCTGTTGCTATCACACGTGACCGCTTGACATTGCTCTGAGGAGCAGAGGTGTGGCTACGCGGCGGGCACGTGACTGGCTGCCACAACCCCCGCTGCAGGGGGGGAGCGGTGAGGGGGACAAGAGAGGGTGGAGCCCGAGGCGGTGCCATGGCAACCTAGGCCACCCAGAGCCCAACTCCCGGCTGAAGGATTGTCTCACTACCGGTCTGAAGGCTGAACTCCAGTCTCACTACCGGTCTTTCAGCCTGTCTGCATTGGGGAGGGGGTGGGAGTTGGGGTACCAGAGGTGATGCTGTCACCTTTTCGCTCCACCATGAGAAAACATACTCTCATTTGTGTCATTGTTTCATTCATTAATTCTACAACATTTTACTGAGTGCTTGCTTCCAGTGTGTATGTGGGTTTTTATTTTGTTTTTGGTGTCTGTCACTGGCCCTTTAAAGTAGTGGTACGACTATCTATAAAGATGTAGCCAACAATGGGGTCTTCTACAATAGGGAGTAAACAATGCCCATTTGAGGGCAAAACTACGATTAAAGGATGACGGAAGGCAGATTAATACAGTAATCCAACAGGCTCAGTGACAAGGTAATCCTCTCACTTTTCCAACTTCCAAACCTCCCTGGGAGTGTTAATGCAAAGACCTGAGGCCATCTGGCAGAGAAGTTATTGATGAGCAGGAGACAGGAATACTTGACCTTTTAAGTTTTTTTTTTTTTTCCAGTAGGAAGGTTCTATGATTATGTGATATTTGTATGTGTGCATATATGCTTCTATGTATATATGTATGTATATGATATTATTTATCACATCATATATAAGACGGATACAGGATTGCACATGTGCAAGAAAGTTACCACCACACCCCCTGCACCCTCCAGACCACCACAATGAATGAAAATGACATGCCCCCTTCTGCAAACCTTGTGACTACTCATTTGGAGTTATTGTGCTTCCCTCTTTTTCCCTAGTGCCGCTTTCTTAGCACTTAGCACTGTCCAGAACACACTTGTTCCCAAATGGCCTCTGCCCAGACACCTAGGTAGACACAAGTAGATTTCTCCTACTTTGTTTTATTGGCTCCAAGGTCTTTATCTCCCAGCCCTTTGGGGGTATGGGAGTAAAGGAGGAAAGCGGTTAGTGTCTCATTTGTGAGAATTTGTCTAAAATCTAAAGCCATTTTATTAC
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Task1_train_18037
Gene CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1) on Chromosome 12 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Vitamin D-dependent rickets, type 1A
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Task1_train_18038
This sequence change occurs on Chromosome 12, altering CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Multiple sclerosis, susceptibility to
GAACTGTGCAGTGTGCTGAGAGATTTATTTGGATGGAAGATGAGTTAATCTGTATACATCACAAGAGGAGAGCTGTGCCCAGCCTCTGGGGGGCCAGAGAATGCTGACTTAGGGAAACAGTCTCCCTCTGCCCACCGCCCTTATCCTGCCTCAGTGCCCCAGGGCTTCTGGCCACCCCCACACTCAGCTTTCATTCTGTCTGTCTGATTCCACTTCTCTGCTTGTATCCCTTCCTCTGAAGGAAATTATCTTGGAACAACTTTTCCAGAGAGGGCAAAGTGACCAATCTAGGACTTCCTTCAATCCTGGCAGTCCAAAAGCACTTTCCTTACCAGAGTCAGCAACCTCTGCCCATGTCTGCAAATCCCTAGCTCCGGGCCCATTTTACAGCTTAGCCCCTGCCGTTACTTTTCACCCCCCACCCCCTTAATCTCTTACAGGAAGCCAGACTAGACTTGGATGTTCCCACTACAGACAGAAACATGTCTGGGTTTGTGTTACAAACTACTCTTCCAGGCGTCCAGACCTCCCATTGTTATGGGGGTCACCCCCAGGACCTGAGAAACCAAGGTGGGAGATGGGAGGGTTAGAGTCTTGCCTCCAGGTCTTGTAGGAAGTGGGAATATGAGAGAAATAAGTCAAAATCAAGAATGGAATATTTGATTTATTCTAAAATTTGTGAATATTTAAAAATTTTCAATATAAAAAGCCAGAGGCCTGGGCAGGGACAGGCCCAAAGATGTCTCTGCCTGAGAACTAAGTGATGGGGCAAACCCACTTAATAGTGGCCAGAGAGCAAAGGAGAGTTATAAGAAACCGTAAACCAGGCTAGGGCAGATTCACCTTCCTAGGGGCAAGACAAAGAAGGAAGGGGGTAGACAGAGCCTACTAAGTAAGCTGCTTATCCCTTCTGCCACATGGTTCAGATTCAATCTAAGAATGTGTATGGTGACACCTAGTCAGAGACAGGCCCTGGCAGGGGACATAAAAAACAAATAAGGCTTCACCCTTCCTCTCAAAGAGCTTACATGCAAAGACGAAGGACCAACCAGGTACAGACCAGATGCACAGTTACTGAGCTTATGCTTTGATAAATGCTTAGCCAGCAGCATCAATGAACACTATGAAAGCCCAAAAAGAGAGGCAGTTGAATCTTTCCTCAGGCCATCCAGCATTATTAGTTAAAATCTGATTTCATCCTTGGGGGATGCATACATGATCAGAAGGGCCAAGCAAGCAGAGAGACCATGGTTTTCTCACCTGGCTTCCTGAGTCAGGCCAAGTGCATACTTCACACATTGGTCAGGGCCGCCTCACACTTCACTATGGTGGTTCTATCCAGTTTGGTCAGATAGGCATTAGGGGAAGATGTATACCTTGGTCTTGTGCCTACAAAAAATCTTATCCCTATGATGAATGAAAGGGTGATGATGACAGTCTCTTTCCATGGGACTATCTGTCCAAAAACTGTAGGTTGATGCTCCTTTCAGGTACCAGGACAGTCCGGGTCTTGGGTCTAACTGGGGCCGCACCTGGCTCAGGCTGCACCTCAAAATGTGTTAGGATCTGGAAAGGGAAGAAGGTGAGCATTACTATGAAAGATATCTATAATGGGGGGATTCATTGGTAATCCAATTGGTAAAGGGCATGCATTATTAGTGTTAGAATGGTCAATGATTGGGTGGCACCTGTGGCCAGTAGGGGACTTCTTGGTTAATAAGGGTGAGGGATTATGGTAGGGAAAAAATAGTTTGAATACCCTCACTTACACTCCAGGCCTATAATGGGCTTATCATATTTCAGAAGATTCATTCTACCAGGTCTTATATGATTTCCTATGCTTGTCAGGGGAAAGAGCTCACAACTTTAGAGGGTTAGGGTCTCTCCAGTCTGGGGAAGGTATAAAATCTAGAGCACTCACCTGGGCCAAAGCCATTTGCAATTCAAGCTCTGCCAGGCGTCTCCCCATACAGCTGCGCTTGCCAAAGCCAAAGGGAAGAGATGCAAATGGGTGGGGGGTGGGACCCTCCCCCAGCCAGCGAGCTGGACGAAAAGAATTTGGCTCTGGGAACTGGGCAGGGTCCCTTGAAGTGGCATAGTGACACAGAGTGACCAGCGTCTGGTGCAAAGGAAAACAAACTTGTCAGTTTGGGCTCAGAATAGGGCAGGCATGAAGAAGAGGATATTCAGACAGGGACAAAGGCAGGTCCTGGTGGGTGATGGGGAAGTTTTCTGGGGCTACTTTTGGAAGGATCTCCCCACTGTTCCATTACATCCTAGAAAGGCATATCCTAGAGAGGGGTCAAGGGGAGTGTTTGAAGGGCTTTTAGGAGAGTGTTTGAGAACAGGGTTGGGGCCCAAGATAGTGAGGAATGGCTCAGTAGAAAGGGTGCATAGGCTTTACTCACATTTTTGGGGATAATATAGTCACCCACATGAATGTCTTTGTCTGGGACACGAGAATTTCCAGGTACCACAGGGTACAGTCTAGGTTGCAAAGCACAAAATGGAGACAACAAGATGAGGCTAGGGGCTGCAGCCCCCTTCTCATTGTTTCCAACTTCCAAACCCTTTTTGGCCAGGAGTAGAGGGCCATTTTTCTCTGCTATCTCCCTGCTTCCATCCACTAGTTGCTTCCCCAGCCCTTCCTTGGCATTTCCTCTTGTTCCTCCTCTCCTTCCCCCTCACCTTAGCACTTCCTTGACCACCGCCTTCAGCAGGGGCAGCTGGGACAGAACAGTGGCTGAGGGGTAGGCACTGGAGCCAGGGCTCAGGGCAGCTGTGATCTCTGAGTGGAGTGCTGTCTGGACTTCGGGGTGCCGGGAGAGCTCATACAGAGCCCAAGAGAGCGTGTTGGACACCTGAAAAACATGTGAAAGCAAGAGAGGTGTTGGGTGTGAGAACCCAGCAGAGGGTGCAGATTATGGAAGAGTCTGGGGCTACAGGGTGCTAAGCCAAGCTGGTCTACGTGGCCATAATGGATCCCCTGCAACAGAAAAATGGAGCCGGAGTCTGCGGAGGCTAAGCCCTGGAACCGGCTCACAGCACGGAGGGAGAACCTCACCGTGTCCACTCCCGCCAATAGCAACTCTGTCACATTTCCCAGGATGGACTGGGCAGGCAACTCTTCCCGGAACAGGAAGTGGGTCAGGTGCGCCCCAGACTCCAGGTCCTTCTCGGGCTGTCCTCCGTTCCTCATGGCTGCCTCTGCCTCTCGCCGCTCCACGTGCCTCTGAGCTGCGTGGGTAGAAGGCACGTGAATACCTCGCTACCCCTGGACAGCTTTACATTCCCCCATTTCCACCTCGACCTGTGCCTTACCAAATGCAAACATCTGGTCCCAGTCTCGGCAGAGGCGGCCCCAGGGCCCAGGCACAAGGTGGCGCAGCCAGTGGGGCATCGCCATGGTCAACAGCGTGGACACAAACACCGAGCCCACAGCGCGGATGAAGGTCTCCGTGTCGGGTGGCACTTGAGCCTCCAGGCAGCCCAAGCGCGAGCCGAGCAGAACCGCGGCGATGCCTTGTCGGGAGGGGGCGCCGTCAGGGTTCCGGGAGGCTCTGGTAGGGCGCCCCCGACGCCTGCCCAGCTCTGTCCTGGGACTCACCTTCCAGTCCGAACTTGTAAAATTCCCCCGCCACGTCCCGAACCAGGGCGGGCGGCCCCGTGCCACGTCCCCGCTGGCGCCTCAGACGCCGCACAAGGTCGCAGACTACGTTGTTCAGGGTTCCGGCGTAGCGGGCGGCCGCTTGAGGCCGGAGGAGGAGCGGGGCCAGGAGACTGCGGAGCCTTTGCCATTCTTCGCCTTCCCTGCAGGGTTGAGGAGAGAGTGCGCATCGGGAAGGTGGGGACGGCTCGACGGGACTGGCTGCAGTGAAGGAGCGCGTTCGGCTGCGGTGGCCAGGAGAGGGATTGCGTCTGCCCCCTTGGGGTACGGAAACCTGCACCGGCCTGCGCCTGTCTTCCAGCCCCCTTCCTCTTTACTCATTTCCTGCCCTCAGGGGCCGGGGTTCCCGGGTAACTTGAGTCACAGAACCTTACATTCATTCCATCCAGATCCTTGTACCCTAGCCCAATTCCTCCGGTTCCCCCAGTT
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Task1_train_18039
A sequence alteration has been identified in CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Vitamin D-dependent rickets, type 1A
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Here is a genetic alteration in CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1) on Chromosome 12. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Vitamin D-dependent rickets, type 1A
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Task1_train_18041
A variant was discovered on Chromosome 12, affecting CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Vitamin D-dependent rickets, type 1A
CTGAGAACTAAGTGATGGGGCAAACCCACTTAATAGTGGCCAGAGAGCAAAGGAGAGTTATAAGAAACCGTAAACCAGGCTAGGGCAGATTCACCTTCCTAGGGGCAAGACAAAGAAGGAAGGGGGTAGACAGAGCCTACTAAGTAAGCTGCTTATCCCTTCTGCCACATGGTTCAGATTCAATCTAAGAATGTGTATGGTGACACCTAGTCAGAGACAGGCCCTGGCAGGGGACATAAAAAACAAATAAGGCTTCACCCTTCCTCTCAAAGAGCTTACATGCAAAGACGAAGGACCAACCAGGTACAGACCAGATGCACAGTTACTGAGCTTATGCTTTGATAAATGCTTAGCCAGCAGCATCAATGAACACTATGAAAGCCCAAAAAGAGAGGCAGTTGAATCTTTCCTCAGGCCATCCAGCATTATTAGTTAAAATCTGATTTCATCCTTGGGGGATGCATACATGATCAGAAGGGCCAAGCAAGCAGAGAGACCATGGTTTTCTCACCTGGCTTCCTGAGTCAGGCCAAGTGCATACTTCACACATTGGTCAGGGCCGCCTCACACTTCACTATGGTGGTTCTATCCAGTTTGGTCAGATAGGCATTAGGGGAAGATGTATACCTTGGTCTTGTGCCTACAAAAAATCTTATCCCTATGATGAATGAAAGGGTGATGATGACAGTCTCTTTCCATGGGACTATCTGTCCAAAAACTGTAGGTTGATGCTCCTTTCAGGTACCAGGACAGTCCGGGTCTTGGGTCTAACTGGGGCCGCACCTGGCTCAGGCTGCACCTCAAAATGTGTTAGGATCTGGAAAGGGAAGAAGGTGAGCATTACTATGAAAGATATCTATAATGGGGGGATTCATTGGTAATCCAATTGGTAAAGGGCATGCATTATTAGTGTTAGAATGGTCAATGATTGGGTGGCACCTGTGGCCAGTAGGGGACTTCTTGGTTAATAAGGGTGAGGGATTATGGTAGGGAAAAAATAGTTTGAATACCCTCACTTACACTCCAGGCCTATAATGGGCTTATCATATTTCAGAAGATTCATTCTACCAGGTCTTATATGATTTCCTATGCTTGTCAGGGGAAAGAGCTCACAACTTTAGAGGGTTAGGGTCTCTCCAGTCTGGGGAAGGTATAAAATCTAGAGCACTCACCTGGGCCAAAGCCATTTGCAATTCAAGCTCTGCCAGGCGTCTCCCCATACAGCTGCGCTTGCCAAAGCCAAAGGGAAGAGATGCAAATGGGTGGGGGGTGGGACCCTCCCCCAGCCAGCGAGCTGGACGAAAAGAATTTGGCTCTGGGAACTGGGCAGGGTCCCTTGAAGTGGCATAGTGACACAGAGTGACCAGCGTCTGGTGCAAAGGAAAACAAACTTGTCAGTTTGGGCTCAGAATAGGGCAGGCATGAAGAAGAGGATATTCAGACAGGGACAAAGGCAGGTCCTGGTGGGTGATGGGGAAGTTTTCTGGGGCTACTTTTGGAAGGATCTCCCCACTGTTCCATTACATCCTAGAAAGGCATATCCTAGAGAGGGGTCAAGGGGAGTGTTTGAAGGGCTTTTAGGAGAGTGTTTGAGAACAGGGTTGGGGCCCAAGATAGTGAGGAATGGCTCAGTAGAAAGGGTGCATAGGCTTTACTCACATTTTTGGGGATAATATAGTCACCCACATGAATGTCTTTGTCTGGGACACGAGAATTTCCAGGTACCACAGGGTACAGTCTAGGTTGCAAAGCACAAAATGGAGACAACAAGATGAGGCTAGGGGCTGCAGCCCCCTTCTCATTGTTTCCAACTTCCAAACCCTTTTTGGCCAGGAGTAGAGGGCCATTTTTCTCTGCTATCTCCCTGCTTCCATCCACTAGTTGCTTCCCCAGCCCTTCCTTGGCATTTCCTCTTGTTCCTCCTCTCCTTCCCCCTCACCTTAGCACTTCCTTGACCACCGCCTTCAGCAGGGGCAGCTGGGACAGAACAGTGGCTGAGGGGTAGGCACTGGAGCCAGGGCTCAGGGCAGCTGTGATCTCTGAGTGGAGTGCTGTCTGGACTTCGGGGTGCCGGGAGAGCTCATACAGAGCCCAAGAGAGCGTGTTGGACACCTGAAAAACATGTGAAAGCAAGAGAGGTGTTGGGTGTGAGAACCCAGCAGAGGGTGCAGATTATGGAAGAGTCTGGGGCTACAGGGTGCTAAGCCAAGCTGGTCTACGTGGCCATAATGGATCCCCTGCAACAGAAAAATGGAGCCGGAGTCTGCGGAGGCTAAGCCCTGGAACCGGCTCACAGCACGGAGGGAGAACCTCACCGTGTCCACTCCCGCCAATAGCAACTCTGTCACATTTCCCAGGATGGACTGGGCAGGCAACTCTTCCCGGAACAGGAAGTGGGTCAGGTGCGCCCCAGACTCCAGGTCCTTCTCGGGCTGTCCTCCGTTCCTCATGGCTGCCTCTGCCTCTCGCCGCTCCACGTGCCTCTGAGCTGCGTGGGTAGAAGGCACGTGAATACCTCGCTACCCCTGGACAGCTTTACATTCCCCCATTTCCACCTCGACCTGTGCCTTACCAAATGCAAACATCTGGTCCCAGTCTCGGCAGAGGCGGCCCCAGGGCCCAGGCACAAGGTGGCGCAGCCAGTGGGGCATCGCCATGGTCAACAGCGTGGACACAAACACCGAGCCCACAGCGCGGATGAAGGTCTCCGTGTCGGGTGGCACTTGAGCCTCCAGGCAGCCCAAGCGCGAGCCGAGCAGAACCGCGGCGATGCCTTGTCGGGAGGGGGCGCCGTCAGGGTTCCGGGAGGCTCTGGTAGGGCGCCCCCGACGCCTGCCCAGCTCTGTCCTGGGACTCACCTTCCAGTCCGAACTTGTAAAATTCCCCCGCCACGTCCCGAACCAGGGCGGGCGGCCCCGTGCCACGTCCCCGCTGGCGCCTCAGACGCCGCACAAGGTCGCAGACTACGTTGTTCAGGGTTCCGGCGTAGCGGGCGGCCGCTTGAGGCCGGAGGAGGAGCGGGGCCAGGAGACTGCGGAGCCTTTGCCATTCTTCGCCTTCCCTGCAGGGTTGAGGAGAGAGTGCGCATCGGGAAGGTGGGGACGGCTCGACGGGACTGGCTGCAGTGAAGGAGCGCGTTCGGCTGCGGTGGCCAGGAGAGGGATTGCGTCTGCCCCCTTGGGGTACGGAAACCTGCACCGGCCTGCGCCTGTCTTCCAGCCCCCTTCCTCTTTACTCATTTCCTGCCCTCAGGGGCCGGGGTTCCCGGGTAACTTGAGTCACAGAACCTTACATTCATTCCATCCAGATCCTTGTACCCTAGCCCAATTCCTCCGGTTCCCCCAGTTCCCAGGATTCGGGCCTCAAAGGATAAGGAGGTAGGCGGGGAGTGAGGTTGGGGCTCAACCTGAGTGTGGGTGAAGCAGACTGGGATGGGAACCCCAAGATGCCCAATGGTAGAGTGGGACAGCCGACCTCCCACCATGCCCCCAGATTGATAGTTTCGGGACCCGCAGCAGGAGAGGGCCGCTGCAGGGCGTCTGGGCTTCTGGGGGCAGAGAAGACTCACGCAGTGAGCAGTCCGCAAGCCCGCTGGCGGCAGCGGCGGTGCTCCGTCCAGGGCGAGAAGCTGCAGCGCTCGGGCCGGGGTCCCTCCTGTCGCAGCAGCTCCTCGACGAGTGCAGGGGCAGCCACGTACACGGTGCGCACTGTCCCAAAGCTGGCTAGCCACACCGGCCCGAAGTGCGCGGCGCCCTGCACCTGGGGGAGCGGACACAGCGGACACTTGGATACCTGGGCGGGGACTTTCAGCTTGACCTGTGCCCACGCCAAGGGCGTTGACTGGGCTTGGGAATAGGGAGCTTCTGCTCTTTCTCGGGTGCCCAACTAGTGTATGCCTTTGATACTGCAAACTCCTCCTCTCTCATTTCCCATCCCTAGAAAGTTTGAGTGTGATGGGCAAAACCGGAACTTTGTGCAAGGCAGACATTCAGGACCTCTCTGATCATCTCGGTCGAGGAGAAATCTCTAAAAGTTCCATGTCTGGACTGTCCATCTCAGGACGAGTCCTCAGTGAATGAAAAGGAACCCATGTAGC
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Task1_train_18042
An alteration has been detected in CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1) on Chromosome 12. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Vitamin D-dependent rickets, type 1A
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Task1_train_18043
This genomic variant is located on Chromosome 12, within the CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Vitamin D-dependent rickets, type 1A
AAAGAGCTTACATGCAAAGACGAAGGACCAACCAGGTACAGACCAGATGCACAGTTACTGAGCTTATGCTTTGATAAATGCTTAGCCAGCAGCATCAATGAACACTATGAAAGCCCAAAAAGAGAGGCAGTTGAATCTTTCCTCAGGCCATCCAGCATTATTAGTTAAAATCTGATTTCATCCTTGGGGGATGCATACATGATCAGAAGGGCCAAGCAAGCAGAGAGACCATGGTTTTCTCACCTGGCTTCCTGAGTCAGGCCAAGTGCATACTTCACACATTGGTCAGGGCCGCCTCACACTTCACTATGGTGGTTCTATCCAGTTTGGTCAGATAGGCATTAGGGGAAGATGTATACCTTGGTCTTGTGCCTACAAAAAATCTTATCCCTATGATGAATGAAAGGGTGATGATGACAGTCTCTTTCCATGGGACTATCTGTCCAAAAACTGTAGGTTGATGCTCCTTTCAGGTACCAGGACAGTCCGGGTCTTGGGTCTAACTGGGGCCGCACCTGGCTCAGGCTGCACCTCAAAATGTGTTAGGATCTGGAAAGGGAAGAAGGTGAGCATTACTATGAAAGATATCTATAATGGGGGGATTCATTGGTAATCCAATTGGTAAAGGGCATGCATTATTAGTGTTAGAATGGTCAATGATTGGGTGGCACCTGTGGCCAGTAGGGGACTTCTTGGTTAATAAGGGTGAGGGATTATGGTAGGGAAAAAATAGTTTGAATACCCTCACTTACACTCCAGGCCTATAATGGGCTTATCATATTTCAGAAGATTCATTCTACCAGGTCTTATATGATTTCCTATGCTTGTCAGGGGAAAGAGCTCACAACTTTAGAGGGTTAGGGTCTCTCCAGTCTGGGGAAGGTATAAAATCTAGAGCACTCACCTGGGCCAAAGCCATTTGCAATTCAAGCTCTGCCAGGCGTCTCCCCATACAGCTGCGCTTGCCAAAGCCAAAGGGAAGAGATGCAAATGGGTGGGGGGTGGGACCCTCCCCCAGCCAGCGAGCTGGACGAAAAGAATTTGGCTCTGGGAACTGGGCAGGGTCCCTTGAAGTGGCATAGTGACACAGAGTGACCAGCGTCTGGTGCAAAGGAAAACAAACTTGTCAGTTTGGGCTCAGAATAGGGCAGGCATGAAGAAGAGGATATTCAGACAGGGACAAAGGCAGGTCCTGGTGGGTGATGGGGAAGTTTTCTGGGGCTACTTTTGGAAGGATCTCCCCACTGTTCCATTACATCCTAGAAAGGCATATCCTAGAGAGGGGTCAAGGGGAGTGTTTGAAGGGCTTTTAGGAGAGTGTTTGAGAACAGGGTTGGGGCCCAAGATAGTGAGGAATGGCTCAGTAGAAAGGGTGCATAGGCTTTACTCACATTTTTGGGGATAATATAGTCACCCACATGAATGTCTTTGTCTGGGACACGAGAATTTCCAGGTACCACAGGGTACAGTCTAGGTTGCAAAGCACAAAATGGAGACAACAAGATGAGGCTAGGGGCTGCAGCCCCCTTCTCATTGTTTCCAACTTCCAAACCCTTTTTGGCCAGGAGTAGAGGGCCATTTTTCTCTGCTATCTCCCTGCTTCCATCCACTAGTTGCTTCCCCAGCCCTTCCTTGGCATTTCCTCTTGTTCCTCCTCTCCTTCCCCCTCACCTTAGCACTTCCTTGACCACCGCCTTCAGCAGGGGCAGCTGGGACAGAACAGTGGCTGAGGGGTAGGCACTGGAGCCAGGGCTCAGGGCAGCTGTGATCTCTGAGTGGAGTGCTGTCTGGACTTCGGGGTGCCGGGAGAGCTCATACAGAGCCCAAGAGAGCGTGTTGGACACCTGAAAAACATGTGAAAGCAAGAGAGGTGTTGGGTGTGAGAACCCAGCAGAGGGTGCAGATTATGGAAGAGTCTGGGGCTACAGGGTGCTAAGCCAAGCTGGTCTACGTGGCCATAATGGATCCCCTGCAACAGAAAAATGGAGCCGGAGTCTGCGGAGGCTAAGCCCTGGAACCGGCTCACAGCACGGAGGGAGAACCTCACCGTGTCCACTCCCGCCAATAGCAACTCTGTCACATTTCCCAGGATGGACTGGGCAGGCAACTCTTCCCGGAACAGGAAGTGGGTCAGGTGCGCCCCAGACTCCAGGTCCTTCTCGGGCTGTCCTCCGTTCCTCATGGCTGCCTCTGCCTCTCGCCGCTCCACGTGCCTCTGAGCTGCGTGGGTAGAAGGCACGTGAATACCTCGCTACCCCTGGACAGCTTTACATTCCCCCATTTCCACCTCGACCTGTGCCTTACCAAATGCAAACATCTGGTCCCAGTCTCGGCAGAGGCGGCCCCAGGGCCCAGGCACAAGGTGGCGCAGCCAGTGGGGCATCGCCATGGTCAACAGCGTGGACACAAACACCGAGCCCACAGCGCGGATGAAGGTCTCCGTGTCGGGTGGCACTTGAGCCTCCAGGCAGCCCAAGCGCGAGCCGAGCAGAACCGCGGCGATGCCTTGTCGGGAGGGGGCGCCGTCAGGGTTCCGGGAGGCTCTGGTAGGGCGCCCCCGACGCCTGCCCAGCTCTGTCCTGGGACTCACCTTCCAGTCCGAACTTGTAAAATTCCCCCGCCACGTCCCGAACCAGGGCGGGCGGCCCCGTGCCACGTCCCCGCTGGCGCCTCAGACGCCGCACAAGGTCGCAGACTACGTTGTTCAGGGTTCCGGCGTAGCGGGCGGCCGCTTGAGGCCGGAGGAGGAGCGGGGCCAGGAGACTGCGGAGCCTTTGCCATTCTTCGCCTTCCCTGCAGGGTTGAGGAGAGAGTGCGCATCGGGAAGGTGGGGACGGCTCGACGGGACTGGCTGCAGTGAAGGAGCGCGTTCGGCTGCGGTGGCCAGGAGAGGGATTGCGTCTGCCCCCTTGGGGTACGGAAACCTGCACCGGCCTGCGCCTGTCTTCCAGCCCCCTTCCTCTTTACTCATTTCCTGCCCTCAGGGGCCGGGGTTCCCGGGTAACTTGAGTCACAGAACCTTACATTCATTCCATCCAGATCCTTGTACCCTAGCCCAATTCCTCCGGTTCCCCCAGTTCCCAGGATTCGGGCCTCAAAGGATAAGGAGGTAGGCGGGGAGTGAGGTTGGGGCTCAACCTGAGTGTGGGTGAAGCAGACTGGGATGGGAACCCCAAGATGCCCAATGGTAGAGTGGGACAGCCGACCTCCCACCATGCCCCCAGATTGATAGTTTCGGGACCCGCAGCAGGAGAGGGCCGCTGCAGGGCGTCTGGGCTTCTGGGGGCAGAGAAGACTCACGCAGTGAGCAGTCCGCAAGCCCGCTGGCGGCAGCGGCGGTGCTCCGTCCAGGGCGAGAAGCTGCAGCGCTCGGGCCGGGGTCCCTCCTGTCGCAGCAGCTCCTCGACGAGTGCAGGGGCAGCCACGTACACGGTGCGCACTGTCCCAAAGCTGGCTAGCCACACCGGCCCGAAGTGCGCGGCGCCCTGCACCTGGGGGAGCGGACACAGCGGACACTTGGATACCTGGGCGGGGACTTTCAGCTTGACCTGTGCCCACGCCAAGGGCGTTGACTGGGCTTGGGAATAGGGAGCTTCTGCTCTTTCTCGGGTGCCCAACTAGTGTATGCCTTTGATACTGCAAACTCCTCCTCTCTCATTTCCCATCCCTAGAAAGTTTGAGTGTGATGGGCAAAACCGGAACTTTGTGCAAGGCAGACATTCAGGACCTCTCTGATCATCTCGGTCGAGGAGAAATCTCTAAAAGTTCCATGTCTGGACTGTCCATCTCAGGACGAGTCCTCAGTGAATGAAAAGGAACCCATGTAGCTTTAAGCCGCAAGCAGGCGGAGGGTACTGCCCACTCCGGCCTCCCCCTCCCGCGCACTTGTACTTTATCTGCAGGATCTCCACACCTCAGGACAGCGAGAAGGCGCTTTCGCAGCGCCCTCTGCTAAGAGTCGGGACGGGCTCTGCCCGAGTGTAGCCACACCGCCCCCAGCCTCAACTCGCCTTTTCCTTATTTCATGGGCATCCGTTCTCTCTGGCTGTCCCACATTTGCTCTGCACTAGTCAGTCCTTTCTGACGCTGTCAAAAC
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Task1_train_18044
A variant was discovered in gene CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1), Chromosome 12. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Vitamin D-dependent rickets, type 1A
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Task1_train_18045
An alteration has been detected in CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1) on Chromosome 12. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Vitamin D-dependent rickets, type 1A
AAGGCATATCCTAGAGAGGGGTCAAGGGGAGTGTTTGAAGGGCTTTTAGGAGAGTGTTTGAGAACAGGGTTGGGGCCCAAGATAGTGAGGAATGGCTCAGTAGAAAGGGTGCATAGGCTTTACTCACATTTTTGGGGATAATATAGTCACCCACATGAATGTCTTTGTCTGGGACACGAGAATTTCCAGGTACCACAGGGTACAGTCTAGGTTGCAAAGCACAAAATGGAGACAACAAGATGAGGCTAGGGGCTGCAGCCCCCTTCTCATTGTTTCCAACTTCCAAACCCTTTTTGGCCAGGAGTAGAGGGCCATTTTTCTCTGCTATCTCCCTGCTTCCATCCACTAGTTGCTTCCCCAGCCCTTCCTTGGCATTTCCTCTTGTTCCTCCTCTCCTTCCCCCTCACCTTAGCACTTCCTTGACCACCGCCTTCAGCAGGGGCAGCTGGGACAGAACAGTGGCTGAGGGGTAGGCACTGGAGCCAGGGCTCAGGGCAGCTGTGATCTCTGAGTGGAGTGCTGTCTGGACTTCGGGGTGCCGGGAGAGCTCATACAGAGCCCAAGAGAGCGTGTTGGACACCTGAAAAACATGTGAAAGCAAGAGAGGTGTTGGGTGTGAGAACCCAGCAGAGGGTGCAGATTATGGAAGAGTCTGGGGCTACAGGGTGCTAAGCCAAGCTGGTCTACGTGGCCATAATGGATCCCCTGCAACAGAAAAATGGAGCCGGAGTCTGCGGAGGCTAAGCCCTGGAACCGGCTCACAGCACGGAGGGAGAACCTCACCGTGTCCACTCCCGCCAATAGCAACTCTGTCACATTTCCCAGGATGGACTGGGCAGGCAACTCTTCCCGGAACAGGAAGTGGGTCAGGTGCGCCCCAGACTCCAGGTCCTTCTCGGGCTGTCCTCCGTTCCTCATGGCTGCCTCTGCCTCTCGCCGCTCCACGTGCCTCTGAGCTGCGTGGGTAGAAGGCACGTGAATACCTCGCTACCCCTGGACAGCTTTACATTCCCCCATTTCCACCTCGACCTGTGCCTTACCAAATGCAAACATCTGGTCCCAGTCTCGGCAGAGGCGGCCCCAGGGCCCAGGCACAAGGTGGCGCAGCCAGTGGGGCATCGCCATGGTCAACAGCGTGGACACAAACACCGAGCCCACAGCGCGGATGAAGGTCTCCGTGTCGGGTGGCACTTGAGCCTCCAGGCAGCCCAAGCGCGAGCCGAGCAGAACCGCGGCGATGCCTTGTCGGGAGGGGGCGCCGTCAGGGTTCCGGGAGGCTCTGGTAGGGCGCCCCCGACGCCTGCCCAGCTCTGTCCTGGGACTCACCTTCCAGTCCGAACTTGTAAAATTCCCCCGCCACGTCCCGAACCAGGGCGGGCGGCCCCGTGCCACGTCCCCGCTGGCGCCTCAGACGCCGCACAAGGTCGCAGACTACGTTGTTCAGGGTTCCGGCGTAGCGGGCGGCCGCTTGAGGCCGGAGGAGGAGCGGGGCCAGGAGACTGCGGAGCCTTTGCCATTCTTCGCCTTCCCTGCAGGGTTGAGGAGAGAGTGCGCATCGGGAAGGTGGGGACGGCTCGACGGGACTGGCTGCAGTGAAGGAGCGCGTTCGGCTGCGGTGGCCAGGAGAGGGATTGCGTCTGCCCCCTTGGGGTACGGAAACCTGCACCGGCCTGCGCCTGTCTTCCAGCCCCCTTCCTCTTTACTCATTTCCTGCCCTCAGGGGCCGGGGTTCCCGGGTAACTTGAGTCACAGAACCTTACATTCATTCCATCCAGATCCTTGTACCCTAGCCCAATTCCTCCGGTTCCCCCAGTTCCCAGGATTCGGGCCTCAAAGGATAAGGAGGTAGGCGGGGAGTGAGGTTGGGGCTCAACCTGAGTGTGGGTGAAGCAGACTGGGATGGGAACCCCAAGATGCCCAATGGTAGAGTGGGACAGCCGACCTCCCACCATGCCCCCAGATTGATAGTTTCGGGACCCGCAGCAGGAGAGGGCCGCTGCAGGGCGTCTGGGCTTCTGGGGGCAGAGAAGACTCACGCAGTGAGCAGTCCGCAAGCCCGCTGGCGGCAGCGGCGGTGCTCCGTCCAGGGCGAGAAGCTGCAGCGCTCGGGCCGGGGTCCCTCCTGTCGCAGCAGCTCCTCGACGAGTGCAGGGGCAGCCACGTACACGGTGCGCACTGTCCCAAAGCTGGCTAGCCACACCGGCCCGAAGTGCGCGGCGCCCTGCACCTGGGGGAGCGGACACAGCGGACACTTGGATACCTGGGCGGGGACTTTCAGCTTGACCTGTGCCCACGCCAAGGGCGTTGACTGGGCTTGGGAATAGGGAGCTTCTGCTCTTTCTCGGGTGCCCAACTAGTGTATGCCTTTGATACTGCAAACTCCTCCTCTCTCATTTCCCATCCCTAGAAAGTTTGAGTGTGATGGGCAAAACCGGAACTTTGTGCAAGGCAGACATTCAGGACCTCTCTGATCATCTCGGTCGAGGAGAAATCTCTAAAAGTTCCATGTCTGGACTGTCCATCTCAGGACGAGTCCTCAGTGAATGAAAAGGAACCCATGTAGCTTTAAGCCGCAAGCAGGCGGAGGGTACTGCCCACTCCGGCCTCCCCCTCCCGCGCACTTGTACTTTATCTGCAGGATCTCCACACCTCAGGACAGCGAGAAGGCGCTTTCGCAGCGCCCTCTGCTAAGAGTCGGGACGGGCTCTGCCCGAGTGTAGCCACACCGCCCCCAGCCTCAACTCGCCTTTTCCTTATTTCATGGGCATCCGTTCTCTCTGGCTGTCCCACATTTGCTCTGCACTAGTCAGTCCTTTCTGACGCTGTCAAAACCAGTTTCCCCAGCACTCTGTCTCGGGAAAGGCGTCCCTTCCTACCTGCAGCTCGTGTAGCCTCGACAGCCCCCCCTTGCAGAAAAGTTCGGCCAGAAAGCTGGGCGTAGAGGGGCCTGGGATGTCTGCCAAGCTCCGGCGTGCTGAGTGGTACTCTCGGTAGCCTAGGGAGGCGCCCAACTCGGGCGCCCAGCGGACGCGATGGAACACTCTGGAGGCGTACTTGAGGGTCTGGGTCATGGTCTGGTTCAGGGTGCTCGCGAAAGAAAGCGCTTCTCCTGAGCATCATATCTCAACCCCTATTTAACCTTTGGGTGAGGTGATGACGCCCCCTCTCCAAGCTCCTCAGCCAATCCCTCCTCCTGAGTGGTCTGTGCTGGGGATTAGCACCCAGGAACAGTAGGCGGGGCTGGGGCTGACTTCACAACTCCCTTGGGTCTCATGTTGCAATGACCCTCATGGGAGGGAGGGCCTAAGATTTTCCTCCTGGGAGAGTGCCTTTGTCTAGGAGCCTCAAAGTCTCATCCTAGGAAAGGCTATAAGGCTTTTTAGTAGGGACTAGGTGACCAAGCTACACTAGTCAGTCTCTGATATTCCCACTTCTACCAGTGAGCCCAGCCCCTTTAGGCCCATCCTCAGGAATTCCCCATCTTTCAGCTCCTCCAGGAAGGGAAGCAGGGGAGGCACAGCTGTAACTGTCCCCACATTCTTGGCTTAGTGGGTTGTATCTTCTCTGCATTATTTTCCTGCACTAGCCACACCTCCCCCTCCTCCTGTACCTAACATATACTGGGCAGATGGCAGGTGGGTTAATGGGCTAAAATGGCTCCTAGAACCTCCATCTTTCTTTCTTGAGGATAAGGGGGTCTCTTGGGTATACAAGCCCCCTCCTTCCAGACATGGGAATTTGGGGCTTGAGAAGCAGAAATGAAACTTTTTGTACATTAGTTAAGTTCAGAGATTGTCTGTGGGGTGTTAGAGGAGCTAAATGGATGTGGATGTTCTAATTCCCCAGCTGACTCGGTCTCCTCTGGGGGGCTTTCTGGTTAGCAGCTCCTTTCTACTTTTAGCCTCAGAATCCTGTGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCATGAGGCCAGGAGGTTGAGACAAGCTTGAGCAACATAGCAAGACTGTCTCTACAGAAGAAGTTTAAAAATTAGGCTGGGCACGGCAGCTCATGACTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTAAGGTGG
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Task1_train_18046
This variant impacts the gene CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; not provided
TTGGGGCCCAAGATAGTGAGGAATGGCTCAGTAGAAAGGGTGCATAGGCTTTACTCACATTTTTGGGGATAATATAGTCACCCACATGAATGTCTTTGTCTGGGACACGAGAATTTCCAGGTACCACAGGGTACAGTCTAGGTTGCAAAGCACAAAATGGAGACAACAAGATGAGGCTAGGGGCTGCAGCCCCCTTCTCATTGTTTCCAACTTCCAAACCCTTTTTGGCCAGGAGTAGAGGGCCATTTTTCTCTGCTATCTCCCTGCTTCCATCCACTAGTTGCTTCCCCAGCCCTTCCTTGGCATTTCCTCTTGTTCCTCCTCTCCTTCCCCCTCACCTTAGCACTTCCTTGACCACCGCCTTCAGCAGGGGCAGCTGGGACAGAACAGTGGCTGAGGGGTAGGCACTGGAGCCAGGGCTCAGGGCAGCTGTGATCTCTGAGTGGAGTGCTGTCTGGACTTCGGGGTGCCGGGAGAGCTCATACAGAGCCCAAGAGAGCGTGTTGGACACCTGAAAAACATGTGAAAGCAAGAGAGGTGTTGGGTGTGAGAACCCAGCAGAGGGTGCAGATTATGGAAGAGTCTGGGGCTACAGGGTGCTAAGCCAAGCTGGTCTACGTGGCCATAATGGATCCCCTGCAACAGAAAAATGGAGCCGGAGTCTGCGGAGGCTAAGCCCTGGAACCGGCTCACAGCACGGAGGGAGAACCTCACCGTGTCCACTCCCGCCAATAGCAACTCTGTCACATTTCCCAGGATGGACTGGGCAGGCAACTCTTCCCGGAACAGGAAGTGGGTCAGGTGCGCCCCAGACTCCAGGTCCTTCTCGGGCTGTCCTCCGTTCCTCATGGCTGCCTCTGCCTCTCGCCGCTCCACGTGCCTCTGAGCTGCGTGGGTAGAAGGCACGTGAATACCTCGCTACCCCTGGACAGCTTTACATTCCCCCATTTCCACCTCGACCTGTGCCTTACCAAATGCAAACATCTGGTCCCAGTCTCGGCAGAGGCGGCCCCAGGGCCCAGGCACAAGGTGGCGCAGCCAGTGGGGCATCGCCATGGTCAACAGCGTGGACACAAACACCGAGCCCACAGCGCGGATGAAGGTCTCCGTGTCGGGTGGCACTTGAGCCTCCAGGCAGCCCAAGCGCGAGCCGAGCAGAACCGCGGCGATGCCTTGTCGGGAGGGGGCGCCGTCAGGGTTCCGGGAGGCTCTGGTAGGGCGCCCCCGACGCCTGCCCAGCTCTGTCCTGGGACTCACCTTCCAGTCCGAACTTGTAAAATTCCCCCGCCACGTCCCGAACCAGGGCGGGCGGCCCCGTGCCACGTCCCCGCTGGCGCCTCAGACGCCGCACAAGGTCGCAGACTACGTTGTTCAGGGTTCCGGCGTAGCGGGCGGCCGCTTGAGGCCGGAGGAGGAGCGGGGCCAGGAGACTGCGGAGCCTTTGCCATTCTTCGCCTTCCCTGCAGGGTTGAGGAGAGAGTGCGCATCGGGAAGGTGGGGACGGCTCGACGGGACTGGCTGCAGTGAAGGAGCGCGTTCGGCTGCGGTGGCCAGGAGAGGGATTGCGTCTGCCCCCTTGGGGTACGGAAACCTGCACCGGCCTGCGCCTGTCTTCCAGCCCCCTTCCTCTTTACTCATTTCCTGCCCTCAGGGGCCGGGGTTCCCGGGTAACTTGAGTCACAGAACCTTACATTCATTCCATCCAGATCCTTGTACCCTAGCCCAATTCCTCCGGTTCCCCCAGTTCCCAGGATTCGGGCCTCAAAGGATAAGGAGGTAGGCGGGGAGTGAGGTTGGGGCTCAACCTGAGTGTGGGTGAAGCAGACTGGGATGGGAACCCCAAGATGCCCAATGGTAGAGTGGGACAGCCGACCTCCCACCATGCCCCCAGATTGATAGTTTCGGGACCCGCAGCAGGAGAGGGCCGCTGCAGGGCGTCTGGGCTTCTGGGGGCAGAGAAGACTCACGCAGTGAGCAGTCCGCAAGCCCGCTGGCGGCAGCGGCGGTGCTCCGTCCAGGGCGAGAAGCTGCAGCGCTCGGGCCGGGGTCCCTCCTGTCGCAGCAGCTCCTCGACGAGTGCAGGGGCAGCCACGTACACGGTGCGCACTGTCCCAAAGCTGGCTAGCCACACCGGCCCGAAGTGCGCGGCGCCCTGCACCTGGGGGAGCGGACACAGCGGACACTTGGATACCTGGGCGGGGACTTTCAGCTTGACCTGTGCCCACGCCAAGGGCGTTGACTGGGCTTGGGAATAGGGAGCTTCTGCTCTTTCTCGGGTGCCCAACTAGTGTATGCCTTTGATACTGCAAACTCCTCCTCTCTCATTTCCCATCCCTAGAAAGTTTGAGTGTGATGGGCAAAACCGGAACTTTGTGCAAGGCAGACATTCAGGACCTCTCTGATCATCTCGGTCGAGGAGAAATCTCTAAAAGTTCCATGTCTGGACTGTCCATCTCAGGACGAGTCCTCAGTGAATGAAAAGGAACCCATGTAGCTTTAAGCCGCAAGCAGGCGGAGGGTACTGCCCACTCCGGCCTCCCCCTCCCGCGCACTTGTACTTTATCTGCAGGATCTCCACACCTCAGGACAGCGAGAAGGCGCTTTCGCAGCGCCCTCTGCTAAGAGTCGGGACGGGCTCTGCCCGAGTGTAGCCACACCGCCCCCAGCCTCAACTCGCCTTTTCCTTATTTCATGGGCATCCGTTCTCTCTGGCTGTCCCACATTTGCTCTGCACTAGTCAGTCCTTTCTGACGCTGTCAAAACCAGTTTCCCCAGCACTCTGTCTCGGGAAAGGCGTCCCTTCCTACCTGCAGCTCGTGTAGCCTCGACAGCCCCCCCTTGCAGAAAAGTTCGGCCAGAAAGCTGGGCGTAGAGGGGCCTGGGATGTCTGCCAAGCTCCGGCGTGCTGAGTGGTACTCTCGGTAGCCTAGGGAGGCGCCCAACTCGGGCGCCCAGCGGACGCGATGGAACACTCTGGAGGCGTACTTGAGGGTCTGGGTCATGGTCTGGTTCAGGGTGCTCGCGAAAGAAAGCGCTTCTCCTGAGCATCATATCTCAACCCCTATTTAACCTTTGGGTGAGGTGATGACGCCCCCTCTCCAAGCTCCTCAGCCAATCCCTCCTCCTGAGTGGTCTGTGCTGGGGATTAGCACCCAGGAACAGTAGGCGGGGCTGGGGCTGACTTCACAACTCCCTTGGGTCTCATGTTGCAATGACCCTCATGGGAGGGAGGGCCTAAGATTTTCCTCCTGGGAGAGTGCCTTTGTCTAGGAGCCTCAAAGTCTCATCCTAGGAAAGGCTATAAGGCTTTTTAGTAGGGACTAGGTGACCAAGCTACACTAGTCAGTCTCTGATATTCCCACTTCTACCAGTGAGCCCAGCCCCTTTAGGCCCATCCTCAGGAATTCCCCATCTTTCAGCTCCTCCAGGAAGGGAAGCAGGGGAGGCACAGCTGTAACTGTCCCCACATTCTTGGCTTAGTGGGTTGTATCTTCTCTGCATTATTTTCCTGCACTAGCCACACCTCCCCCTCCTCCTGTACCTAACATATACTGGGCAGATGGCAGGTGGGTTAATGGGCTAAAATGGCTCCTAGAACCTCCATCTTTCTTTCTTGAGGATAAGGGGGTCTCTTGGGTATACAAGCCCCCTCCTTCCAGACATGGGAATTTGGGGCTTGAGAAGCAGAAATGAAACTTTTTGTACATTAGTTAAGTTCAGAGATTGTCTGTGGGGTGTTAGAGGAGCTAAATGGATGTGGATGTTCTAATTCCCCAGCTGACTCGGTCTCCTCTGGGGGGCTTTCTGGTTAGCAGCTCCTTTCTACTTTTAGCCTCAGAATCCTGTGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCATGAGGCCAGGAGGTTGAGACAAGCTTGAGCAACATAGCAAGACTGTCTCTACAGAAGAAGTTTAAAAATTAGGCTGGGCACGGCAGCTCATGACTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGCAGACTGCTTGAGCTCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGGAACTGTCTCTACAAAAAAT
TTGGGGCCCAAGATAGTGAGGAATGGCTCAGTAGAAAGGGTGCATAGGCTTTACTCACATTTTTGGGGATAATATAGTCACCCACATGAATGTCTTTGTCTGGGACACGAGAATTTCCAGGTACCACAGGGTACAGTCTAGGTTGCAAAGCACAAAATGGAGACAACAAGATGAGGCTAGGGGCTGCAGCCCCCTTCTCATTGTTTCCAACTTCCAAACCCTTTTTGGCCAGGAGTAGAGGGCCATTTTTCTCTGCTATCTCCCTGCTTCCATCCACTAGTTGCTTCCCCAGCCCTTCCTTGGCATTTCCTCTTGTTCCTCCTCTCCTTCCCCCTCACCTTAGCACTTCCTTGACCACCGCCTTCAGCAGGGGCAGCTGGGACAGAACAGTGGCTGAGGGGTAGGCACTGGAGCCAGGGCTCAGGGCAGCTGTGATCTCTGAGTGGAGTGCTGTCTGGACTTCGGGGTGCCGGGAGAGCTCATACAGAGCCCAAGAGAGCGTGTTGGACACCTGAAAAACATGTGAAAGCAAGAGAGGTGTTGGGTGTGAGAACCCAGCAGAGGGTGCAGATTATGGAAGAGTCTGGGGCTACAGGGTGCTAAGCCAAGCTGGTCTACGTGGCCATAATGGATCCCCTGCAACAGAAAAATGGAGCCGGAGTCTGCGGAGGCTAAGCCCTGGAACCGGCTCACAGCACGGAGGGAGAACCTCACCGTGTCCACTCCCGCCAATAGCAACTCTGTCACATTTCCCAGGATGGACTGGGCAGGCAACTCTTCCCGGAACAGGAAGTGGGTCAGGTGCGCCCCAGACTCCAGGTCCTTCTCGGGCTGTCCTCCGTTCCTCATGGCTGCCTCTGCCTCTCGCCGCTCCACGTGCCTCTGAGCTGCGTGGGTAGAAGGCACGTGAATACCTCGCTACCCCTGGACAGCTTTACATTCCCCCATTTCCACCTCGACCTGTGCCTTACCAAATGCAAACATCTGGTCCCAGTCTCGGCAGAGGCGGCCCCAGGGCCCAGGCACAAGGTGGCGCAGCCAGTGGGGCATCGCCATGGTCAACAGCGTGGACACAAACACCGAGCCCACAGCGCGGATGAAGGTCTCCGTGTCGGGTGGCACTTGAGCCTCCAGGCAGCCCAAGCGCGAGCCGAGCAGAACCGCGGCGATGCCTTGTCGGGAGGGGGCGCCGTCAGGGTTCCGGGAGGCTCTGGTAGGGCGCCCCCGACGCCTGCCCAGCTCTGTCCTGGGACTCACCTTCCAGTCCGAACTTGTAAAATTCCCCCGCCACGTCCCGAACCAGGGCGGGCGGCCCCGTGCCACGTCCCCGCTGGCGCCTCAGACGCCGCACAAGGTCGCAGACTACGTTGTTCAGGGTTCCGGCGTAGCGGGCGGCCGCTTGAGGCCGGAGGAGGAGCGGGGCCAGGAGACTGCGGAGCCTTTGCCATTCTTCGCCTTCCCTGCAGGGTTGAGGAGAGAGTGCGCATCGGGAAGGTGGGGACGGCTCGACGGGACTGGCTGCAGTGAAGGAGCGCGTTCGGCTGCGGTGGCCAGGAGAGGGATTGCGTCTGCCCCCTTGGGGTACGGAAACCTGCACCGGCCTGCGCCTGTCTTCCAGCCCCCTTCCTCTTTACTCATTTCCTGCCCTCAGGGGCCGGGGTTCCCGGGTAACTTGAGTCACAGAACCTTACATTCATTCCATCCAGATCCTTGTACCCTAGCCCAATTCCTCCGGTTCCCCCAGTTCCCAGGATTCGGGCCTCAAAGGATAAGGAGGTAGGCGGGGAGTGAGGTTGGGGCTCAACCTGAGTGTGGGTGAAGCAGACTGGGATGGGAACCCCAAGATGCCCAATGGTAGAGTGGGACAGCCGACCTCCCACCATGCCCCCAGATTGATAGTTTCGGGACCCGCAGCAGGAGAGGGCCGCTGCAGGGCGTCTGGGCTTCTGGGGGCAGAGAAGACTCACGCAGTGAGCAGTCCGCAAGCCCGCTGGCGGCAGCGGCGGTGCTCCGTCCAGGGCGAGAAGCTGCAGCGCTCGGGCCGGGGTTCCTCCTGTCGCAGCAGCTCCTCGACGAGTGCAGGGGCAGCCACGTACACGGTGCGCACTGTCCCAAAGCTGGCTAGCCACACCGGCCCGAAGTGCGCGGCGCCCTGCACCTGGGGGAGCGGACACAGCGGACACTTGGATACCTGGGCGGGGACTTTCAGCTTGACCTGTGCCCACGCCAAGGGCGTTGACTGGGCTTGGGAATAGGGAGCTTCTGCTCTTTCTCGGGTGCCCAACTAGTGTATGCCTTTGATACTGCAAACTCCTCCTCTCTCATTTCCCATCCCTAGAAAGTTTGAGTGTGATGGGCAAAACCGGAACTTTGTGCAAGGCAGACATTCAGGACCTCTCTGATCATCTCGGTCGAGGAGAAATCTCTAAAAGTTCCATGTCTGGACTGTCCATCTCAGGACGAGTCCTCAGTGAATGAAAAGGAACCCATGTAGCTTTAAGCCGCAAGCAGGCGGAGGGTACTGCCCACTCCGGCCTCCCCCTCCCGCGCACTTGTACTTTATCTGCAGGATCTCCACACCTCAGGACAGCGAGAAGGCGCTTTCGCAGCGCCCTCTGCTAAGAGTCGGGACGGGCTCTGCCCGAGTGTAGCCACACCGCCCCCAGCCTCAACTCGCCTTTTCCTTATTTCATGGGCATCCGTTCTCTCTGGCTGTCCCACATTTGCTCTGCACTAGTCAGTCCTTTCTGACGCTGTCAAAACCAGTTTCCCCAGCACTCTGTCTCGGGAAAGGCGTCCCTTCCTACCTGCAGCTCGTGTAGCCTCGACAGCCCCCCCTTGCAGAAAAGTTCGGCCAGAAAGCTGGGCGTAGAGGGGCCTGGGATGTCTGCCAAGCTCCGGCGTGCTGAGTGGTACTCTCGGTAGCCTAGGGAGGCGCCCAACTCGGGCGCCCAGCGGACGCGATGGAACACTCTGGAGGCGTACTTGAGGGTCTGGGTCATGGTCTGGTTCAGGGTGCTCGCGAAAGAAAGCGCTTCTCCTGAGCATCATATCTCAACCCCTATTTAACCTTTGGGTGAGGTGATGACGCCCCCTCTCCAAGCTCCTCAGCCAATCCCTCCTCCTGAGTGGTCTGTGCTGGGGATTAGCACCCAGGAACAGTAGGCGGGGCTGGGGCTGACTTCACAACTCCCTTGGGTCTCATGTTGCAATGACCCTCATGGGAGGGAGGGCCTAAGATTTTCCTCCTGGGAGAGTGCCTTTGTCTAGGAGCCTCAAAGTCTCATCCTAGGAAAGGCTATAAGGCTTTTTAGTAGGGACTAGGTGACCAAGCTACACTAGTCAGTCTCTGATATTCCCACTTCTACCAGTGAGCCCAGCCCCTTTAGGCCCATCCTCAGGAATTCCCCATCTTTCAGCTCCTCCAGGAAGGGAAGCAGGGGAGGCACAGCTGTAACTGTCCCCACATTCTTGGCTTAGTGGGTTGTATCTTCTCTGCATTATTTTCCTGCACTAGCCACACCTCCCCCTCCTCCTGTACCTAACATATACTGGGCAGATGGCAGGTGGGTTAATGGGCTAAAATGGCTCCTAGAACCTCCATCTTTCTTTCTTGAGGATAAGGGGGTCTCTTGGGTATACAAGCCCCCTCCTTCCAGACATGGGAATTTGGGGCTTGAGAAGCAGAAATGAAACTTTTTGTACATTAGTTAAGTTCAGAGATTGTCTGTGGGGTGTTAGAGGAGCTAAATGGATGTGGATGTTCTAATTCCCCAGCTGACTCGGTCTCCTCTGGGGGGCTTTCTGGTTAGCAGCTCCTTTCTACTTTTAGCCTCAGAATCCTGTGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCATGAGGCCAGGAGGTTGAGACAAGCTTGAGCAACATAGCAAGACTGTCTCTACAGAAGAAGTTTAAAAATTAGGCTGGGCACGGCAGCTCATGACTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGCAGACTGCTTGAGCTCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGGAACTGTCTCTACAAAAAAT
Task1_train_18047
Given a variant located on Chromosome 12 and affecting CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
AACAGGAAGTGGGTCAGGTGCGCCCCAGACTCCAGGTCCTTCTCGGGCTGTCCTCCGTTCCTCATGGCTGCCTCTGCCTCTCGCCGCTCCACGTGCCTCTGAGCTGCGTGGGTAGAAGGCACGTGAATACCTCGCTACCCCTGGACAGCTTTACATTCCCCCATTTCCACCTCGACCTGTGCCTTACCAAATGCAAACATCTGGTCCCAGTCTCGGCAGAGGCGGCCCCAGGGCCCAGGCACAAGGTGGCGCAGCCAGTGGGGCATCGCCATGGTCAACAGCGTGGACACAAACACCGAGCCCACAGCGCGGATGAAGGTCTCCGTGTCGGGTGGCACTTGAGCCTCCAGGCAGCCCAAGCGCGAGCCGAGCAGAACCGCGGCGATGCCTTGTCGGGAGGGGGCGCCGTCAGGGTTCCGGGAGGCTCTGGTAGGGCGCCCCCGACGCCTGCCCAGCTCTGTCCTGGGACTCACCTTCCAGTCCGAACTTGTAAAATTCCCCCGCCACGTCCCGAACCAGGGCGGGCGGCCCCGTGCCACGTCCCCGCTGGCGCCTCAGACGCCGCACAAGGTCGCAGACTACGTTGTTCAGGGTTCCGGCGTAGCGGGCGGCCGCTTGAGGCCGGAGGAGGAGCGGGGCCAGGAGACTGCGGAGCCTTTGCCATTCTTCGCCTTCCCTGCAGGGTTGAGGAGAGAGTGCGCATCGGGAAGGTGGGGACGGCTCGACGGGACTGGCTGCAGTGAAGGAGCGCGTTCGGCTGCGGTGGCCAGGAGAGGGATTGCGTCTGCCCCCTTGGGGTACGGAAACCTGCACCGGCCTGCGCCTGTCTTCCAGCCCCCTTCCTCTTTACTCATTTCCTGCCCTCAGGGGCCGGGGTTCCCGGGTAACTTGAGTCACAGAACCTTACATTCATTCCATCCAGATCCTTGTACCCTAGCCCAATTCCTCCGGTTCCCCCAGTTCCCAGGATTCGGGCCTCAAAGGATAAGGAGGTAGGCGGGGAGTGAGGTTGGGGCTCAACCTGAGTGTGGGTGAAGCAGACTGGGATGGGAACCCCAAGATGCCCAATGGTAGAGTGGGACAGCCGACCTCCCACCATGCCCCCAGATTGATAGTTTCGGGACCCGCAGCAGGAGAGGGCCGCTGCAGGGCGTCTGGGCTTCTGGGGGCAGAGAAGACTCACGCAGTGAGCAGTCCGCAAGCCCGCTGGCGGCAGCGGCGGTGCTCCGTCCAGGGCGAGAAGCTGCAGCGCTCGGGCCGGGGTCCCTCCTGTCGCAGCAGCTCCTCGACGAGTGCAGGGGCAGCCACGTACACGGTGCGCACTGTCCCAAAGCTGGCTAGCCACACCGGCCCGAAGTGCGCGGCGCCCTGCACCTGGGGGAGCGGACACAGCGGACACTTGGATACCTGGGCGGGGACTTTCAGCTTGACCTGTGCCCACGCCAAGGGCGTTGACTGGGCTTGGGAATAGGGAGCTTCTGCTCTTTCTCGGGTGCCCAACTAGTGTATGCCTTTGATACTGCAAACTCCTCCTCTCTCATTTCCCATCCCTAGAAAGTTTGAGTGTGATGGGCAAAACCGGAACTTTGTGCAAGGCAGACATTCAGGACCTCTCTGATCATCTCGGTCGAGGAGAAATCTCTAAAAGTTCCATGTCTGGACTGTCCATCTCAGGACGAGTCCTCAGTGAATGAAAAGGAACCCATGTAGCTTTAAGCCGCAAGCAGGCGGAGGGTACTGCCCACTCCGGCCTCCCCCTCCCGCGCACTTGTACTTTATCTGCAGGATCTCCACACCTCAGGACAGCGAGAAGGCGCTTTCGCAGCGCCCTCTGCTAAGAGTCGGGACGGGCTCTGCCCGAGTGTAGCCACACCGCCCCCAGCCTCAACTCGCCTTTTCCTTATTTCATGGGCATCCGTTCTCTCTGGCTGTCCCACATTTGCTCTGCACTAGTCAGTCCTTTCTGACGCTGTCAAAACCAGTTTCCCCAGCACTCTGTCTCGGGAAAGGCGTCCCTTCCTACCTGCAGCTCGTGTAGCCTCGACAGCCCCCCCTTGCAGAAAAGTTCGGCCAGAAAGCTGGGCGTAGAGGGGCCTGGGATGTCTGCCAAGCTCCGGCGTGCTGAGTGGTACTCTCGGTAGCCTAGGGAGGCGCCCAACTCGGGCGCCCAGCGGACGCGATGGAACACTCTGGAGGCGTACTTGAGGGTCTGGGTCATGGTCTGGTTCAGGGTGCTCGCGAAAGAAAGCGCTTCTCCTGAGCATCATATCTCAACCCCTATTTAACCTTTGGGTGAGGTGATGACGCCCCCTCTCCAAGCTCCTCAGCCAATCCCTCCTCCTGAGTGGTCTGTGCTGGGGATTAGCACCCAGGAACAGTAGGCGGGGCTGGGGCTGACTTCACAACTCCCTTGGGTCTCATGTTGCAATGACCCTCATGGGAGGGAGGGCCTAAGATTTTCCTCCTGGGAGAGTGCCTTTGTCTAGGAGCCTCAAAGTCTCATCCTAGGAAAGGCTATAAGGCTTTTTAGTAGGGACTAGGTGACCAAGCTACACTAGTCAGTCTCTGATATTCCCACTTCTACCAGTGAGCCCAGCCCCTTTAGGCCCATCCTCAGGAATTCCCCATCTTTCAGCTCCTCCAGGAAGGGAAGCAGGGGAGGCACAGCTGTAACTGTCCCCACATTCTTGGCTTAGTGGGTTGTATCTTCTCTGCATTATTTTCCTGCACTAGCCACACCTCCCCCTCCTCCTGTACCTAACATATACTGGGCAGATGGCAGGTGGGTTAATGGGCTAAAATGGCTCCTAGAACCTCCATCTTTCTTTCTTGAGGATAAGGGGGTCTCTTGGGTATACAAGCCCCCTCCTTCCAGACATGGGAATTTGGGGCTTGAGAAGCAGAAATGAAACTTTTTGTACATTAGTTAAGTTCAGAGATTGTCTGTGGGGTGTTAGAGGAGCTAAATGGATGTGGATGTTCTAATTCCCCAGCTGACTCGGTCTCCTCTGGGGGGCTTTCTGGTTAGCAGCTCCTTTCTACTTTTAGCCTCAGAATCCTGTGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGGCATGAGGCCAGGAGGTTGAGACAAGCTTGAGCAACATAGCAAGACTGTCTCTACAGAAGAAGTTTAAAAATTAGGCTGGGCACGGCAGCTCATGACTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGCAGACTGCTTGAGCTCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGGAACTGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGTATGCCTGTAGTGCCTTGAGAGGCTGAGGTGGATTACATGAGCCCGGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGTTATGATTGTACCACTGCACTCCAGCCTAGGCAACAGAGAGAGGGCCTGTCTCTAAAAAAAATTAAAATAAAAGAATCTCCCACAGTTTACCTCTCTGCTCCTTACTCCCTCATTCCCCACTGCAACTCTATCAGGCTCTGTGCCAGTCAGCTAGCTCTGAAGTTCTGGAATTGAAGGTCAATGTGAAAAAGGAGAGGGTCTCCACCCCCACACCTTCCCAAGGACTCTCCAGAGACAACACTTAGGGAACACAGATTCCCCAGGTCAAGTCTTACGCAGGGAGAGGACAGGAGGATGGTAGAAGGCATATGATACATACTCCACCCTTTCCTGAGAAATGGCAGAATAGGCATGTGTACACATATACATGTTATCCCAGGATCCACAAAGCAAACAGAAGTGGTAATTGAGCCTAGCAAGCAGTTTAGATGGACTACATTCCTCATTCCAGCTGAGGAGAGATCTCACAAGGAGAAAGGAGTGCTAAGGAAGAGCAAGACCCCACAGCCTTCCAAAGATCCCCTATGGTCCAAAGTCCTTTGACCATCTCAGTCAGCTGCTTTGTTTTCTGTTGGCAGTGGAGGGACAAGGTGAGAGGAGCCAGGGGTAGTCATGAACACCAGTGGGTTCTGCCCTGGGCAGCTCCCCACCTTCTTTAAGAGAGTACTGTGTCTCAGCTCCAGCAGTCTC
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Task1_train_18048
A change on Chromosome 12 affects gene TSFM (Ts translation elongation factor, mitochondrial). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_18049
Consider a variant on Chromosome 12 in gene TSFM (Ts translation elongation factor, mitochondrial). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Fatal mitochondrial disease due to combined oxidative phosphorylation defect type 3
GAGAGGAAATTGAAACTATCCGATGACATGGTGCTTTGAGCTGTGGACTTTTTCCGGATAGAAGGGATGATCAGGAGTTGTCTGTGTCAGTTATGGAGTATTCAGGATGGTGGGAAAAAGCACCTAATTGCTTTGGAGTCAGATCTGAGTTTTAATTCTAACTCTGCCTTGTGTTACTAGGTGGGTTACCTAAGTTCTCTAAGCCTAAGCTTATTGTAATAGTAGCTAGCATTTGAGTGCTATGTGCCAGATACTATAGTTAATGCTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGCTCACGCCATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGTGCCCGCCAGCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTATCGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCTAGTTAATGCTCCATATATATATATATATGTATATATATATATAAATTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTCGCTCGCTGTAACCTCTGCTGCCCAGGTTCAAGCAATTCCTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCACAACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGGCTGGCTGCTTTTACATATATTATTTATTTCTCCCCAAAACCCTGAAAGGTAGGTGGTGTCATCTCTATTTTAAAGGTGAGGAAACAAAGGCTTGATAAATTTAGTAAATGAGATTATGTCATTGAGTCACTTGCCCGAGGTCATATAGTCAGTAAATAGGCAGAACTGAGACCTGAGTCACACATACTTGTGTCACCACAACCTATACAACCTATGTTTGTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTGGAGAGAGTCTTGTTCCCAGGATGGACTGCAATGGTACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGATTAGTTGGGATTACAGGTGCACACCACCACGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTCATCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACTACACCCGGCCTGTTTTTAAGTACCAGAGTGCCTGGCACATAGTTGGTGCTTCATAAAGGTATTCTTCACTTCCCCCACTCCCGCTCTCCTGCCCCATACCCCTTTTCCTCTTTCTACAAAAACTGAAAATGGTATCTCTTCATCTTACTGCATATCCTATGTAAATGCAAAGGGACTGTCTTCCAAACTGGGCCTCTTCTGTGCATATTTTGGTACCATCACAGACATCACAATTTGTTGGTGTGTTGGTTTTTTGTTTTTGCTTTAATAGGAAAACTGGGAGAAAACATGATTCTTAAACGAGCTGCATGGGTGAAGGTGCCATCTGGGTTCTACGTTGGCTCTTATGTCCACGGAGCAATGCAGAGTCCCTCACTTCACAAGCTGGTGCTGGGGAAGTATGGGGCCCTGGTCATCTGTGAGACGTCTGAACAGAAAACAAACCTTGAAGACGTTGGCCGCCGCCTTGGGCAGCATGTGGTGGGCATGGCCCCCCTCTCTGTTGGCTCCCTGGACGATGAGCCTGGGGGAGAGGCAGAGACTAAGATGCTGTCCCAGCCGTATTTGCTGGATCCCTCCATTACCTTGGGGCAGTATGTGCAGCCTCAGGGGGTGTCGGTAGTAGACTTTGTGCGGTTTGAATGTGGAGAAGGTGAAGAGGCAGCAGAAACTGAATAGGTTCCAGAGACTTTTGGCCCAGGAGGAATATTTACTTTTAGCTCTGGACATCATTACAAAAAGGAATATTTCCCAAACCTCTTCAGACCGAGAATGCATGGGTAAAATTATTAAATAGTTGTATAATAAAAATAATTTTTTCCTTGTTTGCGTAATACTGGATTTAGCTTTTCTGTGCCTTTCAAAAACAACAGGTGGGCCTTATTGACGTGATAGTGTCGTGGAGAACAGGCATCAACAATACTGCTGCTCCCTTCAACATAGATTTATTATGGTATTTCTGAAATTTCTAACTTATATGTTCTGTCTTACACCTTTTATGACATAGAACTCTTTTGTTCTGTTTTTGCTTTGCGACACTGTGAACCGTGCTTCTGCCTCGGAACCTCCCTAGTTATATTACTTGTGCCACATGGATTTCTTTAGGATTATTGATTCAAACCTAGAGTTGTCTGGAAAATGTGGGTTCTCTTCTTTGTGATTGTCTGTAGTATGCTTTGAAGGTGCTCTGCAGTGGTAGACACACTGGTTCTGGCCTCATTTAATGAAATTAATAACACATGCCCCTATTTCTCTTTTGGATGATGTGTGGGTGGGTGGGTACTGAGGTTTCCTGGCCAGCTGTAAGGCAGATTTTGACATTCTTGTGCCAGAAACAGAAATTAGAGTAGTCCAGTTACCCAGAGAGCTCACTTAACATTGCCTCTTTACTTCCCCAGTACTGAAACATTTCTTCAAGTATAACATAAAATTACCGTAACAAGCAGACCCAGAATACTGAAAATAACTCCATTTGTTCATTATAGGTATCTTTATTTGAAAAGTGAAAAATGCTTTGACACATTACAGATCTGGGTATTTGGATTTTGCCTATGGAGTGCATATATGATTTCAATGATTTACAGGCTAAATAGATTTTAGAAATAATCATCTTAAAATTGAAAACAAAGGTAGGTCCTGGTATAATATTAAACATAAAGTTATTAAACATTTTAAGCATTGTTTTTTGGTTCTCTTTCTTTTGATTTCTCCAGATTTATGCAGTTTTAGTGCTTTCTGCTGAGGCTTTAGCTAGAGGGCCACAAAACCCAAAAACTATATGGTTAACATTTTAGGTATATAACAAGCAAGGAATGCAAGGATGAGAAAAAATGGAGAACATGCCGTGATTTGCAGACTCTATTATATCTAAATTAAGTAGCTGAATGTCAGGCAGAAATTGGTGGATAAATTATTTCCTGATATTGGCACTATCTGCTCTTTTCTGTGGCCTTGCAATAGGTATAGGCCTTCTTGCTTTAGAAAAGCCCCTTTTCTTTCTTCATTTGGAGCTGTTTCCAGCCAGGCAGAGCTGCAAATTGCCCTCTTGTGATGCCAAACACAGACACAAAGTCCTGTTCAGAGAGGTAATTCTAAGAGAGAAAACAAAGTTTCTAGTTAGAAGGAAGACATGACATCATTGCCAACAGAAGTTGAGGAAGTTGGAGCAAGAGGGAGTTCTAGGTGGATCCTTGAAGAGGGAAGTAGAATGAATTTCTCAGAAAGGCTGTTAAAGATTTAAATTATTCATTGGAGAGGTGTTCTTCAGGTCAGGGAGTCCCATTTTGGCCTGTGGCAGAAGCTTACTGGATTCACTGCTCTCACAGTGCCAGCAAGCGCCAGTTTCTTGCCAGAAGGCAATAAATGGGTTATGTATTAAGGATGAATTACAGACATCAAATTTTGGCAGAATGAAGAACTAAATTGAGCTATGGTTTTCCTTGTTTTCTGCCCGTAACTACCATTTTTACCCATAAATTTTCAAATGCATGATCGGGTGGATCTTATTGAGCATAAAATTCTTCTACACATTTACTTAATGATTTATTGAATATTTATATACAAGTAAAGATTATTAATATATGGGCTTTGCTTTCAAGAAAATTGTAGTCCAGATACTTGAGTTGACTAGATAAGACATTGTGGGAAATCCAGAGTCCAGAGTCTGTGCCTAAATCAACTTC
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Task1_train_18050
A variant has been detected on Chromosome 12 in AVIL (advillin). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Nephrotic syndrome, type 21
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Task1_train_18051
This variant affects the gene AVIL (advillin) found on Chromosome 12. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Steroid-resistant nephrotic syndrome
AGAGTCCACCAAATTCACATGGGAAGATTGACTTATCCAGCCTCCATCTGCATAGAAGTTTATGAGATTTCTGCTAGGTGTAAGCAGGGCTTTCAGTGAGTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCCATGGCGCGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGTCTACTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATGCTGCCACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTACAGTGGTACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCCCCTGGTTCAAGAGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTATGGGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATCAAACGCTTCATGAATTTGCATGCCATCCTTGCACAGGGACCATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAGTTTTAGTATATGTGCTGCCAAAGCAAGCACTCCAGCCTACTCTAGGTCCTTTGACCTTGCTGACAGGAGGAGGGGAGTGCAGGTCTGGGCTCCGAGGGGCTGGTCTGACCCGGGGCCCAGCCATCCTACCTTGCCATACCACAGGTAGTGCTCTGCCTGAGTTCGCAGCAGAAAGACATCATTGGAGTTTAGGGAGGAGGCAAAGGCTGGAACTTCCACTGCTTTGGTGTTAGATTTGTCATTTCCATGAATTTGGAAGAGTCTTACTGGAGGGTCAGGCTCGGCATTTCCCTTCCTGGAAGTCCCACCCTAGAGAGAAGAAAAGCAGAGTCCAGATCTAAGGAGCACCATGTGAGCAGAGTGCTAGAGGAGCTGTTGTGGGAAACGTGAATGTTATAGTATTATGTTTGCCCTTGAGGAGCTTCTAGACTCACTGGAAAGGGTCAGGGTAAGCTGGAGTTATGTCACCGATAACAACAACTTTCATCCTGAGAACTTTATCATATTCCAGGCTCTGTGACTGGTGCTTACCTACATCATTTCATTGATCCTCATTATAACTCTTATGAAGTAGATGTTATTATTCCATAGTACAGATGAGGAAACTGAGACTTGGAAACTTGACTAGTAAATGACAAGGCTAGGACTTGACCCCAGACTTGTGTGATATCAAGCATGTGCCATTACGCATTGCTTGGTAGTGCTTCAGCCAGGGCTTCATGGAAGAAGTGGGACTTGAATTTGAAAGAGCACATCTGAAGCAGGAGGGGTATGGTATGGTACACGTGAGGTCTAATGAAGAGACCCACCTGACTGGAGTGGAGGGTGCAGGTTAGGGAGCTGAGGGTGGTGCACCTGCATAGGTAATATGGGTCAGGTTATGAAAGACCTTGAACATAATTTAGATAGTGGTTCAGACTTGAAGCCCTAGGCAGTTGGGATTCACTTGACTGTCTTAGAGGGATTAACCCCCTTCTTCCTCTGTCTAATCCAAGCCTGACTCCCTACCCCACCCCTCCTCTGCTCTCCAATAGTCCTGTGCTGGTTTGTTAGTTTGGAACGTTCCAGCTCATGGTGTAATTTTATCAGAGCATCCTCACCTCAAAGATAACTAGCTTCCCTTTGAAGATGGCCATGAAGTGGCGTGGCTCCGTTCCCATCCTGACTCGAACCTGCACAGCAGCCCCATCAAACTGCCGATCCACCTCCACTGCCTGGTATGCTGAGGCTGCCAGCTCATCCTGTGAGGCGTGGCGGCCCTGCAATGGTGAGAGGCCATGAAGGACCCATGCTCCCCGCCCCAGCCCAGTGGCCAGAGGACACATCAGGATCCAAAGCTGAAGCCTGTGCCAGGCCTACCTGCCAGATGTACAAGATGTGATGTGGCTTCCCATTTACCTCGTATGTGTAGAGGACCAGATAACAGTCTCCCCCATAAAAGAAGCCATACCATTGATACTCCACAGGGACCAGCTCCAGGTTCTCAATTCTCCAGACCTGGGCATAGAAGGAGACACCGTTTTCCAGAGATGGGGGTGCTGAGAGGGGCTAGGCCACACTAAAGAGAGAATCCAGGTGGGAAAGGTGCTGACGTTTACTCCATGTTCCCTTTCTCCCTCTGGTTCTCTCCCAGTGCTGAGGACTCATCACATTTGCATGATTTGAATCGTGAGATGAACTGGGCCATCCTGTTCAGGAGCATCCCATCATGGCTCGGTCTTTGCAAGGCTGAGCAATGATTTGAATATATCTTCCAGGTGAGATATTGATAGCACATTTGAGGATGTGCCTTTCACTACCCTGAAAACTCTACAGACTCACAAGACTCTTAAAGAAGACTCCTGAGGTGCCGGAGGGGAAAGGGAAAGCAAAGCAGACACAGAATCACCTGCACCCCTGCCCCCAGCAGGACAGCCATGAAGGCCAGTGCTGTCTGCCCTGACATTTGAATCATTGGGCTTACCTCAACTTTTCCGTTGCCATCATCGACCATTCTTTCCTGGGCAGCTACCTCTGGCTTGGTGTGTAGCAGAGTCACATCAAATTTATCCTGGAAAACTTTAGCTGTGGAGAAAGGGTTGGGAAAAGCCGAGTGAGTAAGAAGCATCTGTGCCTGCTTTTCTAGAGTCTTAGCAATGAGAGGATGATCTGGGGGCAGTCTCACCAATTTTACCAATGCTGAACGTTTTCCCCAGGCCCATGGTCTGGTCCTTTACTGACCACTTCTGGAACAGCTGCTTGAACATGGCCGACTCAGCACCATCGTTGACGGTCTCCACATTGGTGCTGCTGGGGTAGCTCTTCATCTTGATGAAGCCCTGCAGAGCCACCCATTCCCAAAGGCAGGTCAGTGGTGGAATACACTGAGTTCTTTGCTTGTCTGGTAATTCACCTCTATGAAGCCACATGATATAAGCGTCTCCCCTCTGGGAGTCAGAGTCAAATTCTAACTCACTTTTGTCTAAGGACCAAGGTACCTGCCTAAAAAAAAAATGACTGAGTGGAACATTTTTGGATCTGTTTATTGGCTTGCGGTGATTATGGTTGTTAATTTTTAGGATGATTATGCTGTGTTCTTTCAGTACTTTTGTCCTTACTGACTTTGCATCACATTTGTTTGCTCATTTATTGCTTCTGGCTTGGTTCATCTGCATGGATCTGCACAAATATAAGCTCCTTGAGGACAGGGCCATTAACCTTGATATGTGATATCCCCTTCAATAATAACAGCCACCTTTTATTCAGCAGGTACTGTGTGCCAAGAACTGTTCTGAGTGCTTTTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTCGCTCTCACCTAGGCTGGAGTGCCGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTTTCCTATCTCAGTGCCCTGCCAGGTAGCCTGGACTACCGGCATGCGCCACCATGCCTGGATAATTTTTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGGCAGGCTGGTCTTGAACTCCTTACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCTGAGTGCTTTACAAATGATATTTAATCCTCACAATAACCCTAGGAGATGGGTATGACCCCCATGTTAGATATGGGGAAACTGAGGCCCACAGGTGTTAAGTATGTCTTCCCCAGAGCACACAGCTGGAAAAGACAAAACCTGGATTTGAATCCCAGTTTGTCTGCCTGACTTTGCAGTCCATGTACGTAAGCACAATGTTATATGCTCAAATACCTAGCATGGCTCTGTGGA
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Task1_train_18052
The variant affects gene AVIL (advillin), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Nephrotic syndrome, type 21
TCGGCTCACCGCAACCTCCGTCTACTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATGCTGCCACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTACAGTGGTACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCCCCTGGTTCAAGAGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTATGGGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATCAAACGCTTCATGAATTTGCATGCCATCCTTGCACAGGGACCATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAGTTTTAGTATATGTGCTGCCAAAGCAAGCACTCCAGCCTACTCTAGGTCCTTTGACCTTGCTGACAGGAGGAGGGGAGTGCAGGTCTGGGCTCCGAGGGGCTGGTCTGACCCGGGGCCCAGCCATCCTACCTTGCCATACCACAGGTAGTGCTCTGCCTGAGTTCGCAGCAGAAAGACATCATTGGAGTTTAGGGAGGAGGCAAAGGCTGGAACTTCCACTGCTTTGGTGTTAGATTTGTCATTTCCATGAATTTGGAAGAGTCTTACTGGAGGGTCAGGCTCGGCATTTCCCTTCCTGGAAGTCCCACCCTAGAGAGAAGAAAAGCAGAGTCCAGATCTAAGGAGCACCATGTGAGCAGAGTGCTAGAGGAGCTGTTGTGGGAAACGTGAATGTTATAGTATTATGTTTGCCCTTGAGGAGCTTCTAGACTCACTGGAAAGGGTCAGGGTAAGCTGGAGTTATGTCACCGATAACAACAACTTTCATCCTGAGAACTTTATCATATTCCAGGCTCTGTGACTGGTGCTTACCTACATCATTTCATTGATCCTCATTATAACTCTTATGAAGTAGATGTTATTATTCCATAGTACAGATGAGGAAACTGAGACTTGGAAACTTGACTAGTAAATGACAAGGCTAGGACTTGACCCCAGACTTGTGTGATATCAAGCATGTGCCATTACGCATTGCTTGGTAGTGCTTCAGCCAGGGCTTCATGGAAGAAGTGGGACTTGAATTTGAAAGAGCACATCTGAAGCAGGAGGGGTATGGTATGGTACACGTGAGGTCTAATGAAGAGACCCACCTGACTGGAGTGGAGGGTGCAGGTTAGGGAGCTGAGGGTGGTGCACCTGCATAGGTAATATGGGTCAGGTTATGAAAGACCTTGAACATAATTTAGATAGTGGTTCAGACTTGAAGCCCTAGGCAGTTGGGATTCACTTGACTGTCTTAGAGGGATTAACCCCCTTCTTCCTCTGTCTAATCCAAGCCTGACTCCCTACCCCACCCCTCCTCTGCTCTCCAATAGTCCTGTGCTGGTTTGTTAGTTTGGAACGTTCCAGCTCATGGTGTAATTTTATCAGAGCATCCTCACCTCAAAGATAACTAGCTTCCCTTTGAAGATGGCCATGAAGTGGCGTGGCTCCGTTCCCATCCTGACTCGAACCTGCACAGCAGCCCCATCAAACTGCCGATCCACCTCCACTGCCTGGTATGCTGAGGCTGCCAGCTCATCCTGTGAGGCGTGGCGGCCCTGCAATGGTGAGAGGCCATGAAGGACCCATGCTCCCCGCCCCAGCCCAGTGGCCAGAGGACACATCAGGATCCAAAGCTGAAGCCTGTGCCAGGCCTACCTGCCAGATGTACAAGATGTGATGTGGCTTCCCATTTACCTCGTATGTGTAGAGGACCAGATAACAGTCTCCCCCATAAAAGAAGCCATACCATTGATACTCCACAGGGACCAGCTCCAGGTTCTCAATTCTCCAGACCTGGGCATAGAAGGAGACACCGTTTTCCAGAGATGGGGGTGCTGAGAGGGGCTAGGCCACACTAAAGAGAGAATCCAGGTGGGAAAGGTGCTGACGTTTACTCCATGTTCCCTTTCTCCCTCTGGTTCTCTCCCAGTGCTGAGGACTCATCACATTTGCATGATTTGAATCGTGAGATGAACTGGGCCATCCTGTTCAGGAGCATCCCATCATGGCTCGGTCTTTGCAAGGCTGAGCAATGATTTGAATATATCTTCCAGGTGAGATATTGATAGCACATTTGAGGATGTGCCTTTCACTACCCTGAAAACTCTACAGACTCACAAGACTCTTAAAGAAGACTCCTGAGGTGCCGGAGGGGAAAGGGAAAGCAAAGCAGACACAGAATCACCTGCACCCCTGCCCCCAGCAGGACAGCCATGAAGGCCAGTGCTGTCTGCCCTGACATTTGAATCATTGGGCTTACCTCAACTTTTCCGTTGCCATCATCGACCATTCTTTCCTGGGCAGCTACCTCTGGCTTGGTGTGTAGCAGAGTCACATCAAATTTATCCTGGAAAACTTTAGCTGTGGAGAAAGGGTTGGGAAAAGCCGAGTGAGTAAGAAGCATCTGTGCCTGCTTTTCTAGAGTCTTAGCAATGAGAGGATGATCTGGGGGCAGTCTCACCAATTTTACCAATGCTGAACGTTTTCCCCAGGCCCATGGTCTGGTCCTTTACTGACCACTTCTGGAACAGCTGCTTGAACATGGCCGACTCAGCACCATCGTTGACGGTCTCCACATTGGTGCTGCTGGGGTAGCTCTTCATCTTGATGAAGCCCTGCAGAGCCACCCATTCCCAAAGGCAGGTCAGTGGTGGAATACACTGAGTTCTTTGCTTGTCTGGTAATTCACCTCTATGAAGCCACATGATATAAGCGTCTCCCCTCTGGGAGTCAGAGTCAAATTCTAACTCACTTTTGTCTAAGGACCAAGGTACCTGCCTAAAAAAAAAATGACTGAGTGGAACATTTTTGGATCTGTTTATTGGCTTGCGGTGATTATGGTTGTTAATTTTTAGGATGATTATGCTGTGTTCTTTCAGTACTTTTGTCCTTACTGACTTTGCATCACATTTGTTTGCTCATTTATTGCTTCTGGCTTGGTTCATCTGCATGGATCTGCACAAATATAAGCTCCTTGAGGACAGGGCCATTAACCTTGATATGTGATATCCCCTTCAATAATAACAGCCACCTTTTATTCAGCAGGTACTGTGTGCCAAGAACTGTTCTGAGTGCTTTTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTCGCTCTCACCTAGGCTGGAGTGCCGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTTTCCTATCTCAGTGCCCTGCCAGGTAGCCTGGACTACCGGCATGCGCCACCATGCCTGGATAATTTTTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGGCAGGCTGGTCTTGAACTCCTTACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCTGAGTGCTTTACAAATGATATTTAATCCTCACAATAACCCTAGGAGATGGGTATGACCCCCATGTTAGATATGGGGAAACTGAGGCCCACAGGTGTTAAGTATGTCTTCCCCAGAGCACACAGCTGGAAAAGACAAAACCTGGATTTGAATCCCAGTTTGTCTGCCTGACTTTGCAGTCCATGTACGTAAGCACAATGTTATATGCTCAAATACCTAGCATGGCTCTGTGGAGTGACACACCTGAAGTGCTCTTAGCAGAATTATTTGAACAGTATTGCACATCTGTAGCTCCTACCAGCGCTTTAGACATGGCTGCCTGTTTTTCAGCCTTTGTGGCTCCTTTTCCTTTCCACACGTAGATTTTGGTTCCACTTTGGTCCAGGATGTAGCAGTCC
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Task1_train_18053
Gene AVIL (advillin), found on Chromosome 12, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Steroid-resistant nephrotic syndrome
TCGGCTCACCGCAACCTCCGTCTACTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCATGCTGCCACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTACAGTGGTACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCCCCTGGTTCAAGAGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTATGGGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATTTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATCAAACGCTTCATGAATTTGCATGCCATCCTTGCACAGGGACCATGCTAATCTTCTCTGTATCATTCCAGTTTTAGTATATGTGCTGCCAAAGCAAGCACTCCAGCCTACTCTAGGTCCTTTGACCTTGCTGACAGGAGGAGGGGAGTGCAGGTCTGGGCTCCGAGGGGCTGGTCTGACCCGGGGCCCAGCCATCCTACCTTGCCATACCACAGGTAGTGCTCTGCCTGAGTTCGCAGCAGAAAGACATCATTGGAGTTTAGGGAGGAGGCAAAGGCTGGAACTTCCACTGCTTTGGTGTTAGATTTGTCATTTCCATGAATTTGGAAGAGTCTTACTGGAGGGTCAGGCTCGGCATTTCCCTTCCTGGAAGTCCCACCCTAGAGAGAAGAAAAGCAGAGTCCAGATCTAAGGAGCACCATGTGAGCAGAGTGCTAGAGGAGCTGTTGTGGGAAACGTGAATGTTATAGTATTATGTTTGCCCTTGAGGAGCTTCTAGACTCACTGGAAAGGGTCAGGGTAAGCTGGAGTTATGTCACCGATAACAACAACTTTCATCCTGAGAACTTTATCATATTCCAGGCTCTGTGACTGGTGCTTACCTACATCATTTCATTGATCCTCATTATAACTCTTATGAAGTAGATGTTATTATTCCATAGTACAGATGAGGAAACTGAGACTTGGAAACTTGACTAGTAAATGACAAGGCTAGGACTTGACCCCAGACTTGTGTGATATCAAGCATGTGCCATTACGCATTGCTTGGTAGTGCTTCAGCCAGGGCTTCATGGAAGAAGTGGGACTTGAATTTGAAAGAGCACATCTGAAGCAGGAGGGGTATGGTATGGTACACGTGAGGTCTAATGAAGAGACCCACCTGACTGGAGTGGAGGGTGCAGGTTAGGGAGCTGAGGGTGGTGCACCTGCATAGGTAATATGGGTCAGGTTATGAAAGACCTTGAACATAATTTAGATAGTGGTTCAGACTTGAAGCCCTAGGCAGTTGGGATTCACTTGACTGTCTTAGAGGGATTAACCCCCTTCTTCCTCTGTCTAATCCAAGCCTGACTCCCTACCCCACCCCTCCTCTGCTCTCCAATAGTCCTGTGCTGGTTTGTTAGTTTGGAACGTTCCAGCTCATGGTGTAATTTTATCAGAGCATCCTCACCTCAAAGATAACTAGCTTCCCTTTGAAGATGGCCATGAAGTGGCGTGGCTCCGTTCCCATCCTGACTCGAACCTGCACAGCAGCCCCATCAAACTGCCGATCCACCTCCACTGCCTGGTATGCTGAGGCTGCCAGCTCATCCTGTGAGGCGTGGCGGCCCTGCAATGGTGAGAGGCCATGAAGGACCCATGCTCCCCGCCCCAGCCCAGTGGCCAGAGGACACATCAGGATCCAAAGCTGAAGCCTGTGCCAGGCCTACCTGCCAGATGTACAAGATGTGATGTGGCTTCCCATTTACCTCGTATGTGTAGAGGACCAGATAACAGTCTCCCCCATAAAAGAAGCCATACCATTGATACTCCACAGGGACCAGCTCCAGGTTCTCAATTCTCCAGACCTGGGCATAGAAGGAGACACCGTTTTCCAGAGATGGGGGTGCTGAGAGGGGCTAGGCCACACTAAAGAGAGAATCCAGGTGGGAAAGGTGCTGACGTTTACTCCATGTTCCCTTTCTCCCTCTGGTTCTCTCCCAGTGCTGAGGACTCATCACATTTGCATGATTTGAATCGTGAGATGAACTGGGCCATCCTGTTCAGGAGCATCCCATCATGGCTCGGTCTTTGCAAGGCTGAGCAATGATTTGAATATATCTTCCAGGTGAGATATTGATAGCACATTTGAGGATGTGCCTTTCACTACCCTGAAAACTCTACAGACTCACAAGACTCTTAAAGAAGACTCCTGAGGTGCCGGAGGGGAAAGGGAAAGCAAAGCAGACACAGAATCACCTGCACCCCTGCCCCCAGCAGGACAGCCATGAAGGCCAGTGCTGTCTGCCCTGACATTTGAATCATTGGGCTTACCTCAACTTTTCCGTTGCCATCATCGACCATTCTTTCCTGGGCAGCTACCTCTGGCTTGGTGTGTAGCAGAGTCACATCAAATTTATCCTGGAAAACTTTAGCTGTGGAGAAAGGGTTGGGAAAAGCCGAGTGAGTAAGAAGCATCTGTGCCTGCTTTTCTAGAGTCTTAGCAATGAGAGGATGATCTGGGGGCAGTCTCACCAATTTTACCAATGCTGAACGTTTTCCCCAGGCCCATGGTCTGGTCCTTTACTGACCACTTCTGGAACAGCTGCTTGAACATGGCCGACTCAGCACCATCGTTGACGGTCTCCACATTGGTGCTGCTGGGGTAGCTCTTCATCTTGATGAAGCCCTGCAGAGCCACCCATTCCCAAAGGCAGGTCAGTGGTGGAATACACTGAGTTCTTTGCTTGTCTGGTAATTCACCTCTATGAAGCCACATGATATAAGCGTCTCCCCTCTGGGAGTCAGAGTCAAATTCTAACTCACTTTTGTCTAAGGACCAAGGTACCTGCCTAAAAAAAAAATGACTGAGTGGAACATTTTTGGATCTGTTTATTGGCTTGCGGTGATTATGGTTGTTAATTTTTAGGATGATTATGCTGTGTTCTTTCAGTACTTTTGTCCTTACTGACTTTGCATCACATTTGTTTGCTCATTTATTGCTTCTGGCTTGGTTCATCTGCATGGATCTGCACAAATATAAGCTCCTTGAGGACAGGGCCATTAACCTTGATATGTGATATCCCCTTCAATAATAACAGCCACCTTTTATTCAGCAGGTACTGTGTGCCAAGAACTGTTCTGAGTGCTTTTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTCGCTCTCACCTAGGCTGGAGTGCCGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTTTCCTATCTCAGTGCCCTGCCAGGTAGCCTGGACTACCGGCATGCGCCACCATGCCTGGATAATTTTTTTTGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGGCAGGCTGGTCTTGAACTCCTTACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCTGAGTGCTTTACAAATGATATTTAATCCTCACAATAACCCTAGGAGATGGGTATGACCCCCATGTTAGATATGGGGAAACTGAGGCCCACAGGTGTTAAGTATGTCTTCCCCAGAGCACACAGCTGGAAAAGACAAAACCTGGATTTGAATCCCAGTTTGTCTGCCTGACTTTGCAGTCCATGTACGTAAGCACAATGTTATATGCTCAAATACCTAGCATGGCTCTGTGGAGTGACACACCTGAAGTGCTCTTAGCAGAATTATTTGAACAGTATTGCACATCTGTAGCTCCTACCAGCGCTTTAGACATGGCTGCCTGTTTTTCAGCCTTTGTGGCTCCTTTTCCTTTCCACACGTAGATTTTGGTTCCACTTTGGTCCAGGATGTAGCAGTCC
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Task1_train_18054
A mutation in AVIL (advillin), located on Chromosome 12, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Nephrotic syndrome, type 21
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Task1_train_18055
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene DPY19L2 (dpy-19 like 2). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Spermatogenic failure 9
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Given this variant in gene DPY19L2 (dpy-19 like 2) on Chromosome 12, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Spermatogenic failure 9
TTCAAAAACAAAATTCTAAATGTTCATATTGTTTACTAATATTATCATAAAATACTCATTATGTACTTTGTAATCTTATATTTTTCAAACAAAAATTACTTTTGACTAAGACACAGAGTATAGCACATGCCCTCAATGATACAACCCTAAATGTTCTAATTAAGACATTTTATTCCATGAAACCCCTGACTGACCAGACTGATATCACTTCAAAAAATAAAAATAACCCACCTTCCTAGGAATTAAACTGGGAATGAATAGCAAGGGGTGATGAAGAATGGGCAGCTTCCATCACCTAATCTTTGAGAGAAGGCAAAGTGTAGAGCAAAGATATAGAAATCTGAATGAGGAGGAGGTTCCTAAATCCAAATTCAACCGCAGAATATACTTGTCAGGTTGGTAAGAAATCAGAAGTTAGCCTGCTCCATTCTCAAGGTTTGTGCCACCCCAGTACACTACTATTTACCACTCTTCAATTAGCTTTATCTGAGTGCCACAAATATTTGCATGGACGTGTGCAGTGTTCTGTGGTTAAAGAGATAAATATGGCATGGTCCCTGTTTCCAGTGGTACTTTTAAATACATATAATTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGGATGGTGGCGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAAGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCTAAATAAATAAATAAAAATTTGTGTATGTGTAGACGATTCATAAATTTACTGTTTTAAAAAATAAGGAAGACAAACAAATGACTTTTATATAAGGCAGAATCTCCCAGGGACTAGTAGGTGAAGAATGGGGTCCTCTGGGAGTTTGGAGGAGATAGTGATCATTATTTCATTCAGTGAGAGTTCTCATTAGTATTCTATCAAACTTATTTCTCTGATAAGGTTATTTATACTATTCTACCACTTATGGGGTTTTTTGTTCATTTCTCAGACCTCTTAAATATCTAAAATGCTTATAAATGTAATCCCTACAAAAAAAGTGTATCCAAAAAAAAAAGTTTGAAATGAAACTGGTTGTCCTGTTAGAAACATTGGTTGTTCAGAAATGCTTCATAAATATGTGAATATATATACTCCTTATCCATCTAACTCCGCATTTCCCAAATTCATTTGCACACAGAACACTTTTTTCATGGCACAGTTATCAAAACCACAGGTTAGAAAACAATGTCAGAGTACTTAAACTGTGAAGAGAAAATGTAATTGTTTCTCAAAAACTTTTGAATCTTGGCAAACTATATACAAACGCATACCTTTTGGTTTATTAAAACATAATGTAGTTATCTAAAACCTGTAGCCTACACTCTTAAATGGAGAGCAATTTTTACATAGCAATTTTGAATTATTTTCTTAACTCTATACTCAATTTACTTTTAAAATAACTAAAAAATGGTCTAAATTTGGTAATTACAACTTCATAGATTGAAGTGTATATATGTAATATATATATTTACATTTTTTTAGAGGGAGTCTTGCTCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATGACAGATGCACACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGAATTGAAGTATATTTTAAGAAACTTAAATTATAATTTATTTGCCTTCGTTTTATAAATCGAAGTTACCTGAGAATCAAAGTTAAAATACACATCTGAAGTACAAGGAAAGGATAGGAAAAACTTTCACGGAGAGGTGGTGTCCACATCACACGGGTGGCCTGAAATCAACAAAATGCCCACTTTACATCCTATTTACTACAACAAACATATTAAAAAACCAGGGGTGAGTTTGTTTTAGTAATTTTAATACTAGGCTCACTAGATCCCATTTCTGAGTGTCTGGCATAGCTTCTCAGTTTTTGAAGCTCTCTTAACTCATGAGGCCATTATGTAGACAGCAATTAACTACCATGTCCAGAAACCAGCAACAGATATATCAGACCGAGCAAAAGGAAACCCAAGGGACAAACAAGATTGTACGTATAAGAGTTGTGAAAATTCTGGAACTGACCAACTAGATCCACAGCCCAGCCCTGCAGTATGATCCTGGCATATGATCCTGGCATCCCAGGCTTTGGGATATATGCATGCCAAGACAAATAGCTAAACAAATGTCACCTAGGTCATTTGCAAGCACCAAGAGAGTTTCTACATAACAAGTAGGAATGAATATAAATACACACTTCGAATAGCTAGGATTGCCTCAGAATTTGTAAAATGTACCGTAAAAAAAGGTTAAGTATATATTTTAAAAACAACTAGAAGTATTTGGGAACTACAAATGTGATGCAAGTAATAAAGGTATTAAATTTTCATACGAACTTTAAAATTACTTCTAAGACATATGGGTCAGAGTATTGGAAAAATTTTCCATCAAAAATTCTGAAATTCTAGAAAGAATGTGAACTCTTATTACTTTGCAAGAGTCTTAAAAGTTATTGCTTCTCTTCCAAGATACCAAAATTGTAAATGTTGGAAGAGGAATTATGATACATATAAGAAAGTCAACTTATACCAACAGTTGTCTGGAACACTCAGAGAAAAGCCTTTGTCTTTATGTCAGCACATTGTTGAATGACAATGCATTTGTTTGCTTTAAAATAATATATATAAGGATTTTATGTATAATTTTTATGATTCCTTTATCTAATTGATTTTTAAAAATTAACCCAAGAGCAATGGATAAAAGTACTTCTACCCTGGCTTGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCCAGTATTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCTGAGCATGGTGGCACATGCCTGTAATGCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTTGAAAAAAAAAAAAAAGTACTTCTACCCTATGTAACCTGTGACATAACATATTAAATGTATTGCTCCCAAGAGCTAGTAGTCAGAATCTCTCTCTTTTTCAATGCCATATCCTCAGCATCTAGCAGAGCATGGACATGGTATGTACTCAATAATTTGTTGAATGAATCCATCATATTTGAAATAAGCTTCTATGAGCTCTTTTTTAGGTGGACTATGTTTCATTGGGCTGAATTAGTAAGTTAATGTCTATTTTGAATTGAGCATTTTGCATTACTGAACAGACAGCATGATGTAACAGAAAGAAGTGAGGGAGCAGGTGGCAGTGTCTTAACTGTGTCCCTGCTGTCAGGCCTGAGGCCTCTTTCATTGTTGTTAAGGGGAGTGCAATGTATACAAAGTTTCAGTTAGGCAAGATGAATAAGTTCTGGAGATCTGCTATACAACATTGTGTTAATACTATATTGTATACTTAAAAATCTGTTAAGAGGGCAGATCATATGTTACTTATTCTGACCACAATAAAAAGTTGAATATATATGTTATATATATATAATATATAAGTTTTTATAAAATATAACTATAATTTTATAATTTATAAAATATAAATTAATATATATGTGAGGTTTTAGAGGCAGACAGATATAGAATGGGAAATCCAGCTTCATCATGTAGTAAATGTGGAATGTGGATAAGTAACTTAACTTTCTCTAAATTTAAATTTCATAACTTGTATGGTGAGGCTACCACCACCC
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Task1_train_18057
A mutation on Chromosome 12 affecting DPY19L2 (dpy-19 like 2) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Spermatogenic failure 9
TCATATTGTTTACTAATATTATCATAAAATACTCATTATGTACTTTGTAATCTTATATTTTTCAAACAAAAATTACTTTTGACTAAGACACAGAGTATAGCACATGCCCTCAATGATACAACCCTAAATGTTCTAATTAAGACATTTTATTCCATGAAACCCCTGACTGACCAGACTGATATCACTTCAAAAAATAAAAATAACCCACCTTCCTAGGAATTAAACTGGGAATGAATAGCAAGGGGTGATGAAGAATGGGCAGCTTCCATCACCTAATCTTTGAGAGAAGGCAAAGTGTAGAGCAAAGATATAGAAATCTGAATGAGGAGGAGGTTCCTAAATCCAAATTCAACCGCAGAATATACTTGTCAGGTTGGTAAGAAATCAGAAGTTAGCCTGCTCCATTCTCAAGGTTTGTGCCACCCCAGTACACTACTATTTACCACTCTTCAATTAGCTTTATCTGAGTGCCACAAATATTTGCATGGACGTGTGCAGTGTTCTGTGGTTAAAGAGATAAATATGGCATGGTCCCTGTTTCCAGTGGTACTTTTAAATACATATAATTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGGATGGTGGCGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAAGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCTCATCTCTAAATAAATAAATAAAAATTTGTGTATGTGTAGACGATTCATAAATTTACTGTTTTAAAAAATAAGGAAGACAAACAAATGACTTTTATATAAGGCAGAATCTCCCAGGGACTAGTAGGTGAAGAATGGGGTCCTCTGGGAGTTTGGAGGAGATAGTGATCATTATTTCATTCAGTGAGAGTTCTCATTAGTATTCTATCAAACTTATTTCTCTGATAAGGTTATTTATACTATTCTACCACTTATGGGGTTTTTTGTTCATTTCTCAGACCTCTTAAATATCTAAAATGCTTATAAATGTAATCCCTACAAAAAAAGTGTATCCAAAAAAAAAAGTTTGAAATGAAACTGGTTGTCCTGTTAGAAACATTGGTTGTTCAGAAATGCTTCATAAATATGTGAATATATATACTCCTTATCCATCTAACTCCGCATTTCCCAAATTCATTTGCACACAGAACACTTTTTTCATGGCACAGTTATCAAAACCACAGGTTAGAAAACAATGTCAGAGTACTTAAACTGTGAAGAGAAAATGTAATTGTTTCTCAAAAACTTTTGAATCTTGGCAAACTATATACAAACGCATACCTTTTGGTTTATTAAAACATAATGTAGTTATCTAAAACCTGTAGCCTACACTCTTAAATGGAGAGCAATTTTTACATAGCAATTTTGAATTATTTTCTTAACTCTATACTCAATTTACTTTTAAAATAACTAAAAAATGGTCTAAATTTGGTAATTACAACTTCATAGATTGAAGTGTATATATGTAATATATATATTTACATTTTTTTAGAGGGAGTCTTGCTCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATGACAGATGCACACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGAATTGAAGTATATTTTAAGAAACTTAAATTATAATTTATTTGCCTTCGTTTTATAAATCGAAGTTACCTGAGAATCAAAGTTAAAATACACATCTGAAGTACAAGGAAAGGATAGGAAAAACTTTCACGGAGAGGTGGTGTCCACATCACACGGGTGGCCTGAAATCAACAAAATGCCCACTTTACATCCTATTTACTACAACAAACATATTAAAAAACCAGGGGTGAGTTTGTTTTAGTAATTTTAATACTAGGCTCACTAGATCCCATTTCTGAGTGTCTGGCATAGCTTCTCAGTTTTTGAAGCTCTCTTAACTCATGAGGCCATTATGTAGACAGCAATTAACTACCATGTCCAGAAACCAGCAACAGATATATCAGACCGAGCAAAAGGAAACCCAAGGGACAAACAAGATTGTACGTATAAGAGTTGTGAAAATTCTGGAACTGACCAACTAGATCCACAGCCCAGCCCTGCAGTATGATCCTGGCATATGATCCTGGCATCCCAGGCTTTGGGATATATGCATGCCAAGACAAATAGCTAAACAAATGTCACCTAGGTCATTTGCAAGCACCAAGAGAGTTTCTACATAACAAGTAGGAATGAATATAAATACACACTTCGAATAGCTAGGATTGCCTCAGAATTTGTAAAATGTACCGTAAAAAAAGGTTAAGTATATATTTTAAAAACAACTAGAAGTATTTGGGAACTACAAATGTGATGCAAGTAATAAAGGTATTAAATTTTCATACGAACTTTAAAATTACTTCTAAGACATATGGGTCAGAGTATTGGAAAAATTTTCCATCAAAAATTCTGAAATTCTAGAAAGAATGTGAACTCTTATTACTTTGCAAGAGTCTTAAAAGTTATTGCTTCTCTTCCAAGATACCAAAATTGTAAATGTTGGAAGAGGAATTATGATACATATAAGAAAGTCAACTTATACCAACAGTTGTCTGGAACACTCAGAGAAAAGCCTTTGTCTTTATGTCAGCACATTGTTGAATGACAATGCATTTGTTTGCTTTAAAATAATATATATAAGGATTTTATGTATAATTTTTATGATTCCTTTATCTAATTGATTTTTAAAAATTAACCCAAGAGCAATGGATAAAAGTACTTCTACCCTGGCTTGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCCAGTATTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCTGAGCATGGTGGCACATGCCTGTAATGCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGCAAGACTCTATCTTGAAAAAAAAAAAAAAGTACTTCTACCCTATGTAACCTGTGACATAACATATTAAATGTATTGCTCCCAAGAGCTAGTAGTCAGAATCTCTCTCTTTTTCAATGCCATATCCTCAGCATCTAGCAGAGCATGGACATGGTATGTACTCAATAATTTGTTGAATGAATCCATCATATTTGAAATAAGCTTCTATGAGCTCTTTTTTAGGTGGACTATGTTTCATTGGGCTGAATTAGTAAGTTAATGTCTATTTTGAATTGAGCATTTTGCATTACTGAACAGACAGCATGATGTAACAGAAAGAAGTGAGGGAGCAGGTGGCAGTGTCTTAACTGTGTCCCTGCTGTCAGGCCTGAGGCCTCTTTCATTGTTGTTAAGGGGAGTGCAATGTATACAAAGTTTCAGTTAGGCAAGATGAATAAGTTCTGGAGATCTGCTATACAACATTGTGTTAATACTATATTGTATACTTAAAAATCTGTTAAGAGGGCAGATCATATGTTACTTATTCTGACCACAATAAAAAGTTGAATATATATGTTATATATATATAATATATAAGTTTTTATAAAATATAACTATAATTTTATAATTTATAAAATATAAATTAATATATATGTGAGGTTTTAGAGGCAGACAGATATAGAATGGGAAATCCAGCTTCATCATGTAGTAAATGTGGAATGTGGATAAGTAACTTAACTTTCTCTAAATTTAAATTTCATAACTTGTATGGTGAGGCTACCACCACCCACAAAAAAAGTTTAGTGGGAATA
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Task1_train_18058
A variant found in Chromosome 12 affects RXYLT1 (ribitol xylosyltransferase 1). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; not provided
ACTATTCTCCCCTTTCCCTCCCTAATAATCCCAATTTTGAAACTCATGTCAGCAGACAAAACCATCCATCACCCTTACTCTCTGAAATCATGCACTTACCCTTGGGTTTCTCCCCCTACTTCTTCGAAGAGTTTAGCTCCTGGTACTCTCTAGCTCTGTCTGACACTACTCTGTTCTCAATTCTTAGTGACTGGCAAATCTACATAGATGGTCTTTCTGTCATTTTGGTCTTTGCAGTTCCTTCACCTCCCCTCCTCCAATAATCTGGGCTTCCACCTGACCTCAGCCATTCTCTCTCATGGTTATTTCCTAGACTTTGTCATTACACATACTGCACCTTCTGAACATGATCTCAAGTCCCAGCATCTCTTTCTACAACCACCATCATCTGTCATTCCAGCTCATTCCGTGTAATAATCTGACTCTGACAATTCAGCTGGCACTTAGAATCTATTGTTCCTACTACCCTTTTGTTGTCCTTCACTCCCCTTTCTTCATTTTATTCTTCACCTAACTTAAATTTCATTGTCAATCATAATTGCCTATACCTTCAGCTCCCTAATTCCCTAATCTGGCAAACCATAACTCTGGTTAAATCCAGCTCTCTGCCTACTCCATGCCTGCACCCATGCAACTACACATAATTGGAGAAAGGTGCTAATTGACCTTTATTTAAACACGTGACTTTGAACCTCAGGTGCCCAGCAGTCTTATATTTCCCTTGTCCATATATTCTCCCACTCTCCTAGAAGGCTGTTTTATACCTTCTTCTCTCCTACACTCTAACACCTCCGCCTTTCTTACTTTATGACCCTATTGCTTATTTCACTGAGAATAGTCAGGAGAAAGCATCTATCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTTATTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGACAGGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGTGTAGTTGGGATTACAGGTGCACGCCATCACGCCCGGCTAATTATTGTATTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCTTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCATGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCGCGTCTATCTTTCTTTACTGATCTTTCAGTTTCTACCCTTGCCCCTGTACAGTCCATTCTCAACACAATAGCCAGATTGATTCTGATGAAACCTACATCACGTCATGTCACCCCATGATCAAAAGCCTGCATGATAGAGTCCCGTGTGACCATTCAGACTTTATCTTCTGCGCCTGTTCCCTCAGTTACCCTACCTCAGCCACCCTGGCTTCCCCGCAGCTCCTTGAACATGCCAGGCACATGCTGTCTCATGGCCTTCACTCTTGCTTGCTCTTTTATCCCGCCAGATCTACGTGGCTTGCTCCTTCATCCCCAACTCTGTGCTCAGATGCTGCCGCAGTAAGACAGTCCCTCATCACTTATTTAAGATTGCAACCCTACCCCCTTAGAAACTCCTGCTCTACTTACTCCTTTGCTCTTTTCTCACAGTATTCTACCCCATCTAAATAATTTACTGACTTCACTTGGTCACTATCCATCTCCACCACTAGAACTAGAATATATGCTCCATGAGGGCAAGGTAGGGAAGAGAGGACCTAGCACTCCCAAAGTATCGGTTGAATTATTATTATCCATTCAGAAGTGTTACGGTGACTCCTAGATTTTATAAATGTACAACTGTAAAATGTTCCAATTCTTCAACATTTTTAAGAAATCTGTTTGGGCCAGGATTTTGGATATCTCTTATGCCTATCATCTCTATAAAGTTTCACCATTTCCTGAAACTGATTTTATTAAAAGATAAGGTATTTTTGTTCACAAACTATATACTTAGTAAAGTGAAAACTACAGTTGTTTTTCTGATTTTCTAGCTGGCAGCCTCAGGAAACAAATGAAAGTCTTAAGAATTACCAAGATGCCTTGCTTCAGAGTGATCTCACATTGTGCCCGGTCGGAGTAAACACAGAATGCTATCGAATCTATGAGGCTTGCTCCTATGGCTCCATTCCTGTGGTGGAAGACGTGATGACAGCTGGCAACTGTGGGAATACATCTGTGCACCACGGTGCTCCTCTGCAGTTACTCAAGTCCATGGGTGCTCCCTTTATCTTTATCAAGAACTGGAAGGAACTCCCTGCTGTTTTAGAAAAAGAGAAAACTATAATTTTACAAGAAAAAATTGAAAGAAGAAAAATGTTACTTCAGTGGTATCAGCACTTCAAGACAGAGCTTAAAATGAAATTTACTAATATTTTAGAAAGCTCATTTTTAATGAATAATAAAAGTTAATTATCTTTTTGAGCTAACATGTGATTTTTAAAATCATTTTGACTACTGGGTGTATAAATGTGTTTGTGTGTGTATGTATTTATAGATGTTCTTTAAGGTACCCTTGAAAACTCTACATTATGTATGCCACATAATGACATTTCAGTCAGTGGTAGACTACATATATGATAGTGGTCCCATAAGATTATAATGGAGCTGAAAAATTTCTATCGCCTAGTGATGTCATAGCCTAGTGATGACATATGTATTGCAATACATCACTCACGTGTTTGTGGTGATACTGGTGTAAACAAATCTATTGCACTGCCAGTCAAGTAAAAGTACAGCAATTATGTCCTGTACATAATATTTAATAATGACAATAAATGACTATGTTACTGGTTTATGTATTTACTATACTATACTTTTTACAATTTGTATTAGTTCTTGCATTGCTATGAATAAATGCCTGAGATTGAGTAATTTATAAAGAAGAGAGGTTTAATTGGCTCACAGTTCAACAGACTGTACGGGAAGCATGAAAACTTCAGGAAACTTAACAATCCTGGCAGAAAGCGAAGGGGAAGCAGACATGTCTTCACGTGGCCAGAGCAGAGGGAAAAGGGGGTGGGTGCTACACACTTTTAAACAACCAGATCTCACAAGCACTCACTACCAGGAAAGCAGCACCATAGGGGAAATCCACCTCCATGACCCAATCTCCTCCCACCAGGCCCTGCCTCCAACACTGGGGATTACAATTCAACATGAGGTTTGGGTGAGGCACAGATCCAAACCATATCATCATTATTTTCGAGTGTACTACTTGTACTTATTAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAACAGCCTCAGGCAGATCCTTCAGGAGGTATCCAGAAGAAGAAGGCATTGCTATCAGGAGATGGCAGCTCCATGCCTATTATTGCCCCTGAAGGCCTTGTGGTGGGGTGAGATGTGGAGGTGGAAGACAGTGATGTTAATGATTCTTACTCTGTCTAGGCTTAGGCTAATGCGGTTGTGTCTTCATTTTTAACAAAAAGTAAGAAAATAAAAGTAACAAATTTTTTAAATTTTTAAATAGACTAAAGTTTATAAAATAAGGATATAAAAAATATTTTTGTACAGCAGTATAATGTTTTCAGCAGTGTTATTATAAAATAATCAAAAGGTTTAAAAAGTTATAAAGTAAAAATTTACAGTAAGCTAACATTAATTTATTCGTCAAGAAAGAAAAATATTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTTGTTCTTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGCCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATAGCAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCTTAACCTCAGGTGATCCATCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGGTGGGATTACAGGTGTGAGCTATCGCACTCAGCCAGAAAAATATTTTTTTATAAATTTAGTGTAGGTTAAATATACAGGGTTTATAAAGTCTACAGTAGTTTACAGTAATGTCCTAGGTCTTCACATTCACTCACCACTCACTCATTCACTCAGAGCAACTTCCAGGCCTGCAAGCTCCATTCATAAAAGCTCTACAC
ACTATTCTCCCCTTTCCCTCCCTAATAATCCCAATTTTGAAACTCATGTCAGCAGACAAAACCATCCATCACCCTTACTCTCTGAAATCATGCACTTACCCTTGGGTTTCTCCCCCTACTTCTTCGAAGAGTTTAGCTCCTGGTACTCTCTAGCTCTGTCTGACACTACTCTGTTCTCAATTCTTAGTGACTGGCAAATCTACATAGATGGTCTTTCTGTCATTTTGGTCTTTGCAGTTCCTTCACCTCCCCTCCTCCAATAATCTGGGCTTCCACCTGACCTCAGCCATTCTCTCTCATGGTTATTTCCTAGACTTTGTCATTACACATACTGCACCTTCTGAACATGATCTCAAGTCCCAGCATCTCTTTCTACAACCACCATCATCTGTCATTCCAGCTCATTCCGTGTAATAATCTGACTCTGACAATTCAGCTGGCACTTAGAATCTATTGTTCCTACTACCCTTTTGTTGTCCTTCACTCCCCTTTCTTCATTTTATTCTTCACCTAACTTAAATTTCATTGTCAATCATAATTGCCTATACCTTCAGCTCCCTAATTCCCTAATCTGGCAAACCATAACTCTGGTTAAATCCAGCTCTCTGCCTACTCCATGCCTGCACCCATGCAACTACACATAATTGGAGAAAGGTGCTAATTGACCTTTATTTAAACACGTGACTTTGAACCTCAGGTGCCCAGCAGTCTTATATTTCCCTTGTCCATATATTCTCCCACTCTCCTAGAAGGCTGTTTTATACCTTCTTCTCTCCTACACTCTAACACCTCCGCCTTTCTTACTTTATGACCCTATTGCTTATTTCACTGAGAATAGTCAGGAGAAAGCATCTATCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTTATTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGACAGGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGTGTAGTTGGGATTACAGGTGCACGCCATCACGCCCGGCTAATTATTGTATTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCTTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCATGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCGCGTCTATCTTTCTTTACTGATCTTTCAGTTTCTACCCTTGCCCCTGTACAGTCCATTCTCAACACAATAGCCAGATTGATTCTGATGAAACCTACATCACGTCATGTCACCCCATGATCAAAAGCCTGCATGATAGAGTCCCGTGTGACCATTCAGACTTTATCTTCTGCGCCTGTTCCCTCAGTTACCCTACCTCAGCCACCCTGGCTTCCCCGCAGCTCCTTGAACATGCCAGGCACATGCTGTCTCATGGCCTTCACTCTTGCTTGCTCTTTTATCCCGCCAGATCTACGTGGCTTGCTCCTTCATCCCCAACTCTGTGCTCAGATGCTGCCGCAGTAAGACAGTCCCTCATCACTTATTTAAGATTGCAACCCTACCCCCTTAGAAACTCCTGCTCTACTTACTCCTTTGCTCTTTTCTCACAGTATTCTACCCCATCTAAATAATTTACTGACTTCACTTGGTCACTATCCATCTCCACCACTAGAACTAGAATATATGCTCCATGAGGGCAAGGTAGGGAAGAGAGGACCTAGCACTCCCAAAGTATCGGTTGAATTATTATTATCCATTCAGAAGTGTTACGGTGACTCCTAGATTTTATAAATGTACAACTGTAAAATGTTCCAATTCTTCAACATTTTTAAGAAATCTGTTTGGGCCAGGATTTTGGATATCTCTTATGCCTATCATCTCTATAAAGTTTCACCATTTCCTGAAACTGATTTTATTAAAAGATAAGGTATTTTTGTTCACAAACTATATACTTAGTAAAGTGAAAACTACAGTTGTTTTTCTGATTTTCTAGCTGGCAGCCTCAGGAAACAAATGAAAGTCTTAAGAATTACCAAGATGCCTTGCTTCAGAGTGATCTCACATTGTGCCCGGTCAGAGTAAACACAGAATGCTATCGAATCTATGAGGCTTGCTCCTATGGCTCCATTCCTGTGGTGGAAGACGTGATGACAGCTGGCAACTGTGGGAATACATCTGTGCACCACGGTGCTCCTCTGCAGTTACTCAAGTCCATGGGTGCTCCCTTTATCTTTATCAAGAACTGGAAGGAACTCCCTGCTGTTTTAGAAAAAGAGAAAACTATAATTTTACAAGAAAAAATTGAAAGAAGAAAAATGTTACTTCAGTGGTATCAGCACTTCAAGACAGAGCTTAAAATGAAATTTACTAATATTTTAGAAAGCTCATTTTTAATGAATAATAAAAGTTAATTATCTTTTTGAGCTAACATGTGATTTTTAAAATCATTTTGACTACTGGGTGTATAAATGTGTTTGTGTGTGTATGTATTTATAGATGTTCTTTAAGGTACCCTTGAAAACTCTACATTATGTATGCCACATAATGACATTTCAGTCAGTGGTAGACTACATATATGATAGTGGTCCCATAAGATTATAATGGAGCTGAAAAATTTCTATCGCCTAGTGATGTCATAGCCTAGTGATGACATATGTATTGCAATACATCACTCACGTGTTTGTGGTGATACTGGTGTAAACAAATCTATTGCACTGCCAGTCAAGTAAAAGTACAGCAATTATGTCCTGTACATAATATTTAATAATGACAATAAATGACTATGTTACTGGTTTATGTATTTACTATACTATACTTTTTACAATTTGTATTAGTTCTTGCATTGCTATGAATAAATGCCTGAGATTGAGTAATTTATAAAGAAGAGAGGTTTAATTGGCTCACAGTTCAACAGACTGTACGGGAAGCATGAAAACTTCAGGAAACTTAACAATCCTGGCAGAAAGCGAAGGGGAAGCAGACATGTCTTCACGTGGCCAGAGCAGAGGGAAAAGGGGGTGGGTGCTACACACTTTTAAACAACCAGATCTCACAAGCACTCACTACCAGGAAAGCAGCACCATAGGGGAAATCCACCTCCATGACCCAATCTCCTCCCACCAGGCCCTGCCTCCAACACTGGGGATTACAATTCAACATGAGGTTTGGGTGAGGCACAGATCCAAACCATATCATCATTATTTTCGAGTGTACTACTTGTACTTATTAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAACAGCCTCAGGCAGATCCTTCAGGAGGTATCCAGAAGAAGAAGGCATTGCTATCAGGAGATGGCAGCTCCATGCCTATTATTGCCCCTGAAGGCCTTGTGGTGGGGTGAGATGTGGAGGTGGAAGACAGTGATGTTAATGATTCTTACTCTGTCTAGGCTTAGGCTAATGCGGTTGTGTCTTCATTTTTAACAAAAAGTAAGAAAATAAAAGTAACAAATTTTTTAAATTTTTAAATAGACTAAAGTTTATAAAATAAGGATATAAAAAATATTTTTGTACAGCAGTATAATGTTTTCAGCAGTGTTATTATAAAATAATCAAAAGGTTTAAAAAGTTATAAAGTAAAAATTTACAGTAAGCTAACATTAATTTATTCGTCAAGAAAGAAAAATATTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTTGTTCTTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGCCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATAGCAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCTTAACCTCAGGTGATCCATCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGGTGGGATTACAGGTGTGAGCTATCGCACTCAGCCAGAAAAATATTTTTTTATAAATTTAGTGTAGGTTAAATATACAGGGTTTATAAAGTCTACAGTAGTTTACAGTAATGTCCTAGGTCTTCACATTCACTCACCACTCACTCATTCACTCAGAGCAACTTCCAGGCCTGCAAGCTCCATTCATAAAAGCTCTACAC
Task1_train_18059
This genomic variant is located on Chromosome 12, within the RXYLT1 (ribitol xylosyltransferase 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; not provided
ACTATTCTCCCCTTTCCCTCCCTAATAATCCCAATTTTGAAACTCATGTCAGCAGACAAAACCATCCATCACCCTTACTCTCTGAAATCATGCACTTACCCTTGGGTTTCTCCCCCTACTTCTTCGAAGAGTTTAGCTCCTGGTACTCTCTAGCTCTGTCTGACACTACTCTGTTCTCAATTCTTAGTGACTGGCAAATCTACATAGATGGTCTTTCTGTCATTTTGGTCTTTGCAGTTCCTTCACCTCCCCTCCTCCAATAATCTGGGCTTCCACCTGACCTCAGCCATTCTCTCTCATGGTTATTTCCTAGACTTTGTCATTACACATACTGCACCTTCTGAACATGATCTCAAGTCCCAGCATCTCTTTCTACAACCACCATCATCTGTCATTCCAGCTCATTCCGTGTAATAATCTGACTCTGACAATTCAGCTGGCACTTAGAATCTATTGTTCCTACTACCCTTTTGTTGTCCTTCACTCCCCTTTCTTCATTTTATTCTTCACCTAACTTAAATTTCATTGTCAATCATAATTGCCTATACCTTCAGCTCCCTAATTCCCTAATCTGGCAAACCATAACTCTGGTTAAATCCAGCTCTCTGCCTACTCCATGCCTGCACCCATGCAACTACACATAATTGGAGAAAGGTGCTAATTGACCTTTATTTAAACACGTGACTTTGAACCTCAGGTGCCCAGCAGTCTTATATTTCCCTTGTCCATATATTCTCCCACTCTCCTAGAAGGCTGTTTTATACCTTCTTCTCTCCTACACTCTAACACCTCCGCCTTTCTTACTTTATGACCCTATTGCTTATTTCACTGAGAATAGTCAGGAGAAAGCATCTATCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTTATTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGACAGGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGTGTAGTTGGGATTACAGGTGCACGCCATCACGCCCGGCTAATTATTGTATTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCTTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCATGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCGCGTCTATCTTTCTTTACTGATCTTTCAGTTTCTACCCTTGCCCCTGTACAGTCCATTCTCAACACAATAGCCAGATTGATTCTGATGAAACCTACATCACGTCATGTCACCCCATGATCAAAAGCCTGCATGATAGAGTCCCGTGTGACCATTCAGACTTTATCTTCTGCGCCTGTTCCCTCAGTTACCCTACCTCAGCCACCCTGGCTTCCCCGCAGCTCCTTGAACATGCCAGGCACATGCTGTCTCATGGCCTTCACTCTTGCTTGCTCTTTTATCCCGCCAGATCTACGTGGCTTGCTCCTTCATCCCCAACTCTGTGCTCAGATGCTGCCGCAGTAAGACAGTCCCTCATCACTTATTTAAGATTGCAACCCTACCCCCTTAGAAACTCCTGCTCTACTTACTCCTTTGCTCTTTTCTCACAGTATTCTACCCCATCTAAATAATTTACTGACTTCACTTGGTCACTATCCATCTCCACCACTAGAACTAGAATATATGCTCCATGAGGGCAAGGTAGGGAAGAGAGGACCTAGCACTCCCAAAGTATCGGTTGAATTATTATTATCCATTCAGAAGTGTTACGGTGACTCCTAGATTTTATAAATGTACAACTGTAAAATGTTCCAATTCTTCAACATTTTTAAGAAATCTGTTTGGGCCAGGATTTTGGATATCTCTTATGCCTATCATCTCTATAAAGTTTCACCATTTCCTGAAACTGATTTTATTAAAAGATAAGGTATTTTTGTTCACAAACTATATACTTAGTAAAGTGAAAACTACAGTTGTTTTTCTGATTTTCTAGCTGGCAGCCTCAGGAAACAAATGAAAGTCTTAAGAATTACCAAGATGCCTTGCTTCAGAGTGATCTCACATTGTGCCCGGTCGGAGTAAACACAGAATGCTATCGAATCTATGAGGCTTGCTCCTATGGCTCCATTCCTGTGGTGGAAGACGTGATGACAGCTGGCAACTGTGGGAATACATCTGTGCACCACGGTGCTCCTCTGCAGTTACTCAAGTCCATGGGTGCTCCCTTTATCTTTATCAAGAACTGGAAGGAACTCCCTGCTGTTTTAGAAAAAGAGAAAACTATAATTTTACAAGAAAAAATTGAAAGAAGAAAAATGTTACTTCAGTGGTATCAGCACTTCAAGACAGAGCTTAAAATGAAATTTACTAATATTTTAGAAAGCTCATTTTTAATGAATAATAAAAGTTAATTATCTTTTTGAGCTAACATGTGATTTTTAAAATCATTTTGACTACTGGGTGTATAAATGTGTTTGTGTGTGTATGTATTTATAGATGTTCTTTAAGGTACCCTTGAAAACTCTACATTATGTATGCCACATAATGACATTTCAGTCAGTGGTAGACTACATATATGATAGTGGTCCCATAAGATTATAATGGAGCTGAAAAATTTCTATCGCCTAGTGATGTCATAGCCTAGTGATGACATATGTATTGCAATACATCACTCACGTGTTTGTGGTGATACTGGTGTAAACAAATCTATTGCACTGCCAGTCAAGTAAAAGTACAGCAATTATGTCCTGTACATAATATTTAATAATGACAATAAATGACTATGTTACTGGTTTATGTATTTACTATACTATACTTTTTACAATTTGTATTAGTTCTTGCATTGCTATGAATAAATGCCTGAGATTGAGTAATTTATAAAGAAGAGAGGTTTAATTGGCTCACAGTTCAACAGACTGTACGGGAAGCATGAAAACTTCAGGAAACTTAACAATCCTGGCAGAAAGCGAAGGGGAAGCAGACATGTCTTCACGTGGCCAGAGCAGAGGGAAAAGGGGGTGGGTGCTACACACTTTTAAACAACCAGATCTCACAAGCACTCACTACCAGGAAAGCAGCACCATAGGGGAAATCCACCTCCATGACCCAATCTCCTCCCACCAGGCCCTGCCTCCAACACTGGGGATTACAATTCAACATGAGGTTTGGGTGAGGCACAGATCCAAACCATATCATCATTATTTTCGAGTGTACTACTTGTACTTATTAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAACAGCCTCAGGCAGATCCTTCAGGAGGTATCCAGAAGAAGAAGGCATTGCTATCAGGAGATGGCAGCTCCATGCCTATTATTGCCCCTGAAGGCCTTGTGGTGGGGTGAGATGTGGAGGTGGAAGACAGTGATGTTAATGATTCTTACTCTGTCTAGGCTTAGGCTAATGCGGTTGTGTCTTCATTTTTAACAAAAAGTAAGAAAATAAAAGTAACAAATTTTTTAAATTTTTAAATAGACTAAAGTTTATAAAATAAGGATATAAAAAATATTTTTGTACAGCAGTATAATGTTTTCAGCAGTGTTATTATAAAATAATCAAAAGGTTTAAAAAGTTATAAAGTAAAAATTTACAGTAAGCTAACATTAATTTATTCGTCAAGAAAGAAAAATATTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTTGTTCTTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGCCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATAGCAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCTTAACCTCAGGTGATCCATCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGGTGGGATTACAGGTGTGAGCTATCGCACTCAGCCAGAAAAATATTTTTTTATAAATTTAGTGTAGGTTAAATATACAGGGTTTATAAAGTCTACAGTAGTTTACAGTAATGTCCTAGGTCTTCACATTCACTCACCACTCACTCATTCACTCAGAGCAACTTCCAGGCCTGCAAGCTCCATTCATAAAAGCTCTACAC
ACTATTCTCCCCTTTCCCTCCCTAATAATCCCAATTTTGAAACTCATGTCAGCAGACAAAACCATCCATCACCCTTACTCTCTGAAATCATGCACTTACCCTTGGGTTTCTCCCCCTACTTCTTCGAAGAGTTTAGCTCCTGGTACTCTCTAGCTCTGTCTGACACTACTCTGTTCTCAATTCTTAGTGACTGGCAAATCTACATAGATGGTCTTTCTGTCATTTTGGTCTTTGCAGTTCCTTCACCTCCCCTCCTCCAATAATCTGGGCTTCCACCTGACCTCAGCCATTCTCTCTCATGGTTATTTCCTAGACTTTGTCATTACACATACTGCACCTTCTGAACATGATCTCAAGTCCCAGCATCTCTTTCTACAACCACCATCATCTGTCATTCCAGCTCATTCCGTGTAATAATCTGACTCTGACAATTCAGCTGGCACTTAGAATCTATTGTTCCTACTACCCTTTTGTTGTCCTTCACTCCCCTTTCTTCATTTTATTCTTCACCTAACTTAAATTTCATTGTCAATCATAATTGCCTATACCTTCAGCTCCCTAATTCCCTAATCTGGCAAACCATAACTCTGGTTAAATCCAGCTCTCTGCCTACTCCATGCCTGCACCCATGCAACTACACATAATTGGAGAAAGGTGCTAATTGACCTTTATTTAAACACGTGACTTTGAACCTCAGGTGCCCAGCAGTCTTATATTTCCCTTGTCCATATATTCTCCCACTCTCCTAGAAGGCTGTTTTATACCTTCTTCTCTCCTACACTCTAACACCTCCGCCTTTCTTACTTTATGACCCTATTGCTTATTTCACTGAGAATAGTCAGGAGAAAGCATCTATCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTTATTGCCCAGGCTGTAGTGCAGTGACAGGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGTGTAGTTGGGATTACAGGTGCACGCCATCACGCCCGGCTAATTATTGTATTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCTTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCATGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCGCGTCTATCTTTCTTTACTGATCTTTCAGTTTCTACCCTTGCCCCTGTACAGTCCATTCTCAACACAATAGCCAGATTGATTCTGATGAAACCTACATCACGTCATGTCACCCCATGATCAAAAGCCTGCATGATAGAGTCCCGTGTGACCATTCAGACTTTATCTTCTGCGCCTGTTCCCTCAGTTACCCTACCTCAGCCACCCTGGCTTCCCCGCAGCTCCTTGAACATGCCAGGCACATGCTGTCTCATGGCCTTCACTCTTGCTTGCTCTTTTATCCCGCCAGATCTACGTGGCTTGCTCCTTCATCCCCAACTCTGTGCTCAGATGCTGCCGCAGTAAGACAGTCCCTCATCACTTATTTAAGATTGCAACCCTACCCCCTTAGAAACTCCTGCTCTACTTACTCCTTTGCTCTTTTCTCACAGTATTCTACCCCATCTAAATAATTTACTGACTTCACTTGGTCACTATCCATCTCCACCACTAGAACTAGAATATATGCTCCATGAGGGCAAGGTAGGGAAGAGAGGACCTAGCACTCCCAAAGTATCGGTTGAATTATTATTATCCATTCAGAAGTGTTACGGTGACTCCTAGATTTTATAAATGTACAACTGTAAAATGTTCCAATTCTTCAACATTTTTAAGAAATCTGTTTGGGCCAGGATTTTGGATATCTCTTATGCCTATCATCTCTATAAAGTTTCACCATTTCCTGAAACTGATTTTATTAAAAGATAAGGTATTTTTGTTCACAAACTATATACTTAGTAAAGTGAAAACTACAGTTGTTTTTCTGATTTTCTAGCTGGCAGCCTCAGGAAACAAATGAAAGTCTTAAGAATTACCAAGATGCCTTGCTTCAGAGTGATCTCACATTGTGCCCGGTCCGAGTAAACACAGAATGCTATCGAATCTATGAGGCTTGCTCCTATGGCTCCATTCCTGTGGTGGAAGACGTGATGACAGCTGGCAACTGTGGGAATACATCTGTGCACCACGGTGCTCCTCTGCAGTTACTCAAGTCCATGGGTGCTCCCTTTATCTTTATCAAGAACTGGAAGGAACTCCCTGCTGTTTTAGAAAAAGAGAAAACTATAATTTTACAAGAAAAAATTGAAAGAAGAAAAATGTTACTTCAGTGGTATCAGCACTTCAAGACAGAGCTTAAAATGAAATTTACTAATATTTTAGAAAGCTCATTTTTAATGAATAATAAAAGTTAATTATCTTTTTGAGCTAACATGTGATTTTTAAAATCATTTTGACTACTGGGTGTATAAATGTGTTTGTGTGTGTATGTATTTATAGATGTTCTTTAAGGTACCCTTGAAAACTCTACATTATGTATGCCACATAATGACATTTCAGTCAGTGGTAGACTACATATATGATAGTGGTCCCATAAGATTATAATGGAGCTGAAAAATTTCTATCGCCTAGTGATGTCATAGCCTAGTGATGACATATGTATTGCAATACATCACTCACGTGTTTGTGGTGATACTGGTGTAAACAAATCTATTGCACTGCCAGTCAAGTAAAAGTACAGCAATTATGTCCTGTACATAATATTTAATAATGACAATAAATGACTATGTTACTGGTTTATGTATTTACTATACTATACTTTTTACAATTTGTATTAGTTCTTGCATTGCTATGAATAAATGCCTGAGATTGAGTAATTTATAAAGAAGAGAGGTTTAATTGGCTCACAGTTCAACAGACTGTACGGGAAGCATGAAAACTTCAGGAAACTTAACAATCCTGGCAGAAAGCGAAGGGGAAGCAGACATGTCTTCACGTGGCCAGAGCAGAGGGAAAAGGGGGTGGGTGCTACACACTTTTAAACAACCAGATCTCACAAGCACTCACTACCAGGAAAGCAGCACCATAGGGGAAATCCACCTCCATGACCCAATCTCCTCCCACCAGGCCCTGCCTCCAACACTGGGGATTACAATTCAACATGAGGTTTGGGTGAGGCACAGATCCAAACCATATCATCATTATTTTCGAGTGTACTACTTGTACTTATTAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAACAGCCTCAGGCAGATCCTTCAGGAGGTATCCAGAAGAAGAAGGCATTGCTATCAGGAGATGGCAGCTCCATGCCTATTATTGCCCCTGAAGGCCTTGTGGTGGGGTGAGATGTGGAGGTGGAAGACAGTGATGTTAATGATTCTTACTCTGTCTAGGCTTAGGCTAATGCGGTTGTGTCTTCATTTTTAACAAAAAGTAAGAAAATAAAAGTAACAAATTTTTTAAATTTTTAAATAGACTAAAGTTTATAAAATAAGGATATAAAAAATATTTTTGTACAGCAGTATAATGTTTTCAGCAGTGTTATTATAAAATAATCAAAAGGTTTAAAAAGTTATAAAGTAAAAATTTACAGTAAGCTAACATTAATTTATTCGTCAAGAAAGAAAAATATTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTTGTTCTTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGCCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATAGCAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAAAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCTTAACCTCAGGTGATCCATCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGGTGGGATTACAGGTGTGAGCTATCGCACTCAGCCAGAAAAATATTTTTTTATAAATTTAGTGTAGGTTAAATATACAGGGTTTATAAAGTCTACAGTAGTTTACAGTAATGTCCTAGGTCTTCACATTCACTCACCACTCACTCATTCACTCAGAGCAACTTCCAGGCCTGCAAGCTCCATTCATAAAAGCTCTACAC
Task1_train_18060
Assess the clinical impact of this variant on gene SRGAP1 (SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1), found on Chromosome 12. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Thyroid cancer, nonmedullary, 2
TTCTCATGCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGTGTGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATGTTCAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCATACTGGTCTTCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCTGTCTTGGCCTCCCAAAGTCCTGGGATTACAGGCATGAGCCAACGCGACCAGCCATCTTTTCTTTTTAGACTTGCTACCTGAAACGTGGGTAGCTGAGCAGAGTTAGTTGGTGGCCTTTGATCCCATTAGAGAGTTCTAAATTGTTGGCCCAGATCCTTGAATGAAATCTGATATTAAAATAACACCAAACTGAAGTCATAGGAGATTTGTAGTATAATATATACCCTCTCAATAATCAAGACATAGGAAAAATAAAATGAGTTTCAGTTGACTTCATTTTTTTACTCATGACTTTCCTTTCACTCTTGAGTGATTTGTAACCCACATCTTCACATATCAGGGACACAGCAAGACACAAAATCCTTAACTCCAATTTGGGATTTTAGAAGCTGTCAGAGCTTAGTAAATAGCAGCACTCTCTTAGATACTCCAGGGAAATTCAGTGAAAAATACTGCTAATGAATTTAAATTTCTCAAAGTTCAGGTACTGCTCTGATGCCATCTTCCCACACTATTTTATCTTCCATGAGTCTTCAGTCTATCATATTTGTTTGGCTTTTGTTGAGGCCTGACCCAATGACCTCATGTTTACAGATGGACTTGGGCCAGGACTAGGACCCTCTTTAAATTCTGCATTCTTGGTGCCCATTTGCCCAAGCACCACACAGGACACCGAGGGGTTGCAGAACTGATTAAGATATGGCCCTTATCCCTAACACTGATAGTCCAGTGAGAGGTACATTCACGGACCAGTGGATGTTGTTAATGTTGCAAACTGTAGATTAAGCTATGCTACACATTTTTTTTCCATTTTCTGTAGCTGACTACATAACTCAAAATGGGGGAAAAAAGGTCATTTGGATATATGATTTCCTTAAAATAACTTACAGCTTTTGTTGAAAATAATATTCAAATACTTCTCTATCAAACTCTCAGAATTAGCCTAGGGAAGGTTATTTCAAATGCTGTTTTTTACCAACTGGGTAGAAGAATGATACTCTCCACTTTTTTGTCTTCATTGAAAATAATAATAAATGCAGAGGTAAAAGTTGATGGACCTTGAGTGGACTTACCATTTTACTGCTTTGAAAGTGCTTTCTTGCCAGGCTCAGTGGCTTACATCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGACTGAGGCAGGCAGATTACCGAGTTTGAGACCAGTCTGGGCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAATATAAAAACTAGTTGAGCTTGGTTGCACGCCACCCTGTCTCTACAAAAAATATAAAAACTAGTTGGGTTTGGTTGCATGCCCCTGTAGTCTCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGGGTTCAAGGTTGCGGTGAGCTGTGAGCATGCCACCGCGCTGCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACCCTGTCTCCAAAAACAAAAAAGTGCTTTCTCAAAATTAAACTTGTTGTGAGTCACATTGTAACTTTGGGCAGAGGGAGTTAATTTCCCCTTTGGTTTCTAAGTTAGCTTTTTGGGAATCACACTGTAAAATGTCATGATCTAGTTCATCTTTAATGGTCCTTAGTTCTGCAACTCAACTTTTAAGCAAGCATGACGCTTCAACCTGCTTACTTTTTCTCTCTTTTTGGTAAAGTCTGTTTGGATGGCGGGGGAGCCGTTCACCCATGGTTGTCACTTGTTTGCTCTGTTTATCTTATGGGGACCATCTGTATACAATGTCTAGAGTTTACAAAGGGCCATTCCGTTAAAGATGTTTACTACAGAGGCTTGCTGTCTTTCTGTCGTGTTAGATACATTCCTCTATTTTCAGTTAGTGGACTTTTTAAGATGTAAATAATTTTAAAATATTCTTTTTTATTTTCTAATTACAGAGCAAAGAGATTGCATTCCAACTTCATGAGGATTTAATGAAGGTTCTTAATGAGCTTTATACGGTAAGGACATAATCTTTCTTCTTTTCTAGAATCCTTGGGTTAGAATTCTGGTTTGTAAAAACACTGCTCATTGTAGTATTCATTCCAAGCCAGAGTGACAATGGATCCTCATCTGCTTGAAATACAGGAACAAGGGATAGGTATACACAGCTACATTCCTTCGCCACTCCATTCCAATTTGGAGAAACTGTATTCAAATAAATTATCTATCTACCTATCTGTCTGTCTACGTACACATGTATATACACAATTAGCACACTTTAAGAAATTGAAGTATAGATGTCTCCATAAGATATGTTTTTAACTGGATTGTATGTGATCTCTACATATATTGAATTCGAGAATATTTTGTTTAAAATTGATGCCATTGTGGCCAGGCGTGGTGTAATTGCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATGTAAAAGGTAGCTGGGCATGGTGGGATGCGCCTGTAATCCCAGCTCTTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAATGTTGCCGTTATGGAACTTGAGCAATTTAGGTTGCGTTATTCTGGTACTTTCTTTTTTTCCCACATTTTAGTTCAATTAATTGTTTTGTTAATGACATATTAAAACTACTTTTGAAGGATATCTTTTTTTTTGCAATAATTTGCTTTTGTGACTTACATATTATTTAGGGTACTTCATGTAATCGTTAAAAATTAAATAAATTAAAACTACTTTATTAAAAATAACTAACACCTAATGATGTTGCAAGTTGGAATTAGTAATATACTTATGTAAGTATTTTTTCACACTTAATGATCATGTTATTAAATACAAATTTCTTTTGGGGGATATTTTATTTTAAGAGAATAAAATAACAACAAATGAGTAATATTAATTTATATTAATGAAAGATATTTGGATTTTTATTGTACAAGATTATTTTGTTTGTTGGTTTGTTTTTGAGGAGTCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTTGAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCAGCATGCCTGGCAAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTTTCAAGCTCCTGGCCTCATGTGATCCGCCCATCTCAGCCTCTCAAAGTGTTGGCATTACAGGCATGAGCCACCGAGCCTGGCCTGAATTGTTTTTTTATAGGCAAACTAAACCTGAAACTTGAAAGCACGTTTCTTGATTTACCAATTCCATTTGTTCCTAAAAAGGCACGTGTGTAAAATACAGTTTTGTAAATTAAATTTTTAATGCTCCTTTGATACTTACTAATTAAACTTGTAAATTAAACTTTTATAAAATGATTCTTTATAAAATGAACTTTCTAGTTTTTTACTATGTGTGTGATAAATCTATTTTTATAAAGCACATTTACTGCATCTGTGCATATAAATTGAATTGACAGTTTCTATGTGTTCCTCCTTCAGAAACTTTCCACTCTCCATGCAACCTACAAAAGCCTCAGGTTAAGAGATTATATCTATATACCAAATGCTTAATGAAACTGATTTTTATGTGATAAAGGCCAATTTCTAGCTCCTGCTTTATGTGATTTGTTAGCTTCTGATACCCTAAGGTATCAACCATTTCTAGAAGCCCAGTAATTTAAAAGTTAAATGACCTTTGTATACCTGAGACTTCCAAAGAGGAACAAGCAGAAATTCTGTGTCGTCTTCCATTGAACTCTTTTAAGATGAGGACATTGTGGCACTTTCCTTGAGGTTCCTTTGCTTAGACATTGTTTTACCTAGAAAT
TTCTCATGCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGTGTGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATGTTCAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCATACTGGTCTTCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCTGTCTTGGCCTCCCAAAGTCCTGGGATTACAGGCATGAGCCAACGCGACCAGCCATCTTTTCTTTTTAGACTTGCTACCTGAAACGTGGGTAGCTGAGCAGAGTTAGTTGGTGGCCTTTGATCCCATTAGAGAGTTCTAAATTGTTGGCCCAGATCCTTGAATGAAATCTGATATTAAAATAACACCAAACTGAAGTCATAGGAGATTTGTAGTATAATATATACCCTCTCAATAATCAAGACATAGGAAAAATAAAATGAGTTTCAGTTGACTTCATTTTTTTACTCATGACTTTCCTTTCACTCTTGAGTGATTTGTAACCCACATCTTCACATATCAGGGACACAGCAAGACACAAAATCCTTAACTCCAATTTGGGATTTTAGAAGCTGTCAGAGCTTAGTAAATAGCAGCACTCTCTTAGATACTCCAGGGAAATTCAGTGAAAAATACTGCTAATGAATTTAAATTTCTCAAAGTTCAGGTACTGCTCTGATGCCATCTTCCCACACTATTTTATCTTCCATGAGTCTTCAGTCTATCATATTTGTTTGGCTTTTGTTGAGGCCTGACCCAATGACCTCATGTTTACAGATGGACTTGGGCCAGGACTAGGACCCTCTTTAAATTCTGCATTCTTGGTGCCCATTTGCCCAAGCACCACACAGGACACCGAGGGGTTGCAGAACTGATTAAGATATGGCCCTTATCCCTAACACTGATAGTCCAGTGAGAGGTACATTCACGGACCAGTGGATGTTGTTAATGTTGCAAACTGTAGATTAAGCTATGCTACACATTTTTTTTCCATTTTCTGTAGCTGACTACATAACTCAAAATGGGGGAAAAAAGGTCATTTGGATATATGATTTCCTTAAAATAACTTACAGCTTTTGTTGAAAATAATATTCAAATACTTCTCTATCAAACTCTCAGAATTAGCCTAGGGAAGGTTATTTCAAATGCTGTTTTTTACCAACTGGGTAGAAGAATGATACTCTCCACTTTTTTGTCTTCATTGAAAATAATAATAAATGCAGAGGTAAAAGTTGATGGACCTTGAGTGGACTTACCATTTTACTGCTTTGAAAGTGCTTTCTTGCCAGGCTCAGTGGCTTACATCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGACTGAGGCAGGCAGATTACCGAGTTTGAGACCAGTCTGGGCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAATATAAAAACTAGTTGAGCTTGGTTGCACGCCACCCTGTCTCTACAAAAAATATAAAAACTAGTTGGGTTTGGTTGCATGCCCCTGTAGTCTCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGGGTTCAAGGTTGCGGTGAGCTGTGAGCATGCCACCGCGCTGCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACCCTGTCTCCAAAAACAAAAAAGTGCTTTCTCAAAATTAAACTTGTTGTGAGTCACATTGTAACTTTGGGCAGAGGGAGTTAATTTCCCCTTTGGTTTCTAAGTTAGCTTTTTGGGAATCACACTGTAAAATGTCATGATCTAGTTCATCTTTAATGGTCCTTAGTTCTGCAACTCAACTTTTAAGCAAGCATGACGCTTCAACCTGCTTACTTTTTCTCTCTTTTTGGTAAAGTCTGTTTGGATGGCGGGGGAGCCGTTCACCCATGGTTGTCACTTGTTTGCTCTGTTTATCTTATGGGGACCATCTGTATACAATGTCTAGAGTTTACAAAGGGCCATTCCGTTAAAGATGTTTACTACAGAGGCTTGCTGTCTTTCTGTCGTGTTAGATACATTCCTCTATTTTCAGTTAGTGGACTTTTTAAGATGTAAATAATTTTAAAATATTCTTTTTTATTTTCTAATTACAGAGCAAAGAGATTGCATTCCACCTTCATGAGGATTTAATGAAGGTTCTTAATGAGCTTTATACGGTAAGGACATAATCTTTCTTCTTTTCTAGAATCCTTGGGTTAGAATTCTGGTTTGTAAAAACACTGCTCATTGTAGTATTCATTCCAAGCCAGAGTGACAATGGATCCTCATCTGCTTGAAATACAGGAACAAGGGATAGGTATACACAGCTACATTCCTTCGCCACTCCATTCCAATTTGGAGAAACTGTATTCAAATAAATTATCTATCTACCTATCTGTCTGTCTACGTACACATGTATATACACAATTAGCACACTTTAAGAAATTGAAGTATAGATGTCTCCATAAGATATGTTTTTAACTGGATTGTATGTGATCTCTACATATATTGAATTCGAGAATATTTTGTTTAAAATTGATGCCATTGTGGCCAGGCGTGGTGTAATTGCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATGTAAAAGGTAGCTGGGCATGGTGGGATGCGCCTGTAATCCCAGCTCTTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAATGTTGCCGTTATGGAACTTGAGCAATTTAGGTTGCGTTATTCTGGTACTTTCTTTTTTTCCCACATTTTAGTTCAATTAATTGTTTTGTTAATGACATATTAAAACTACTTTTGAAGGATATCTTTTTTTTTGCAATAATTTGCTTTTGTGACTTACATATTATTTAGGGTACTTCATGTAATCGTTAAAAATTAAATAAATTAAAACTACTTTATTAAAAATAACTAACACCTAATGATGTTGCAAGTTGGAATTAGTAATATACTTATGTAAGTATTTTTTCACACTTAATGATCATGTTATTAAATACAAATTTCTTTTGGGGGATATTTTATTTTAAGAGAATAAAATAACAACAAATGAGTAATATTAATTTATATTAATGAAAGATATTTGGATTTTTATTGTACAAGATTATTTTGTTTGTTGGTTTGTTTTTGAGGAGTCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTTGAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCAGCATGCCTGGCAAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTTTCAAGCTCCTGGCCTCATGTGATCCGCCCATCTCAGCCTCTCAAAGTGTTGGCATTACAGGCATGAGCCACCGAGCCTGGCCTGAATTGTTTTTTTATAGGCAAACTAAACCTGAAACTTGAAAGCACGTTTCTTGATTTACCAATTCCATTTGTTCCTAAAAAGGCACGTGTGTAAAATACAGTTTTGTAAATTAAATTTTTAATGCTCCTTTGATACTTACTAATTAAACTTGTAAATTAAACTTTTATAAAATGATTCTTTATAAAATGAACTTTCTAGTTTTTTACTATGTGTGTGATAAATCTATTTTTATAAAGCACATTTACTGCATCTGTGCATATAAATTGAATTGACAGTTTCTATGTGTTCCTCCTTCAGAAACTTTCCACTCTCCATGCAACCTACAAAAGCCTCAGGTTAAGAGATTATATCTATATACCAAATGCTTAATGAAACTGATTTTTATGTGATAAAGGCCAATTTCTAGCTCCTGCTTTATGTGATTTGTTAGCTTCTGATACCCTAAGGTATCAACCATTTCTAGAAGCCCAGTAATTTAAAAGTTAAATGACCTTTGTATACCTGAGACTTCCAAAGAGGAACAAGCAGAAATTCTGTGTCGTCTTCCATTGAACTCTTTTAAGATGAGGACATTGTGGCACTTTCCTTGAGGTTCCTTTGCTTAGACATTGTTTTACCTAGAAAT
Task1_train_18061
A variant has been detected on Chromosome 12 in SRGAP1 (SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Thyroid cancer, nonmedullary, 2
TATGCCTAGAGCCTAGCATATTCCCTGGCACTTAATCCATGGCCAATTAGTGAGTTGAATTGAATCAAACTGAATTGATTGAACTTCACTGGAACAATATAGGGAAAGGACCTGGTTTTGTAACTTTAAAGTCACTTCTTTCCTCTTTAAGTGATTTATACTGCTTTTATGTACAAATTGAAAATGAACCTGTCAGTAATTGATTACTAATTTCCAGTATTATGCTTTTTTTCAAGTCATATTCTCTTAAAATGCAACATGAAAAAATACAAATGCAAATTAAAGATAATGAAGATTCAAGAATCTCAAAGCTGTTATATTCCTAGGAATACTAAATGAAATTCTATCTCCAATAAGCAGACTTTGGCAATCATTTATTATTTAAGAATTTTATTCTGGGGATAAGAGGGAAGGCATTCCTAGACTATTTTGGCAGATTCTAACCTGTTCTTCTCACTTCTAAAAGTTTATTCTTGATCTTCAATAAAAATATGCAAATTCAAAATATTGTAGTTAGTGTATTTGCAACCTACACAGATTTCAATAAATGATTGTATCAGTATCAGTATTGCACAAATAAAACTTGAATGCTATTTTTCATTCTTTTCTTTTGGTATTTGATTTTGCCTCTTTTATGTTTTAACAGCTTTATGGAGATACAATTCACATACTACACAGTTCACCCATTATAAATCTACAGCTGTCTTTCAGTATACTGAGAGTTGTATATCCATCACCACAATCAATTTTAGAATATTTTCATTATCCCACAAAGAAATCCTGCATCTCTCAGCCATCACCCCCAACTTCTTCCCTCTTCTTAGCCCTCATTAACCACAATCTACTTTTTGTCTCTATAGATTTATCTCTTCTGAACATTTCGTGTCAATAAAATCATATGTGGTCTTTTGTGACTTGCTTCTTTCACTTAGAATAATGTTTTCAAAGTTTCATCCATGTTATGGCATGTATCAGTTCTTCCTTCCTTTTTGTGGCTGAATAATATTTAATGATATGGCTATACCATATTTTATTTATTAGTTTGTAGACATTTAGATTGTTTTTACCTTTTAGCTATTATGCATAATACTGCTATAAACATTTGTGTGCACATTTTTAGGTGGAAATATGTTTTCATTTCTCTTATATATCTAGGAGCAGATTTGCTGAGTCATATGGTAACTCTATGTTTAACTTTTGAGAAACTACCAGATTGCTTTCCAAAGTGACTCTACCATTTTACATTCCCACCAGCAGTGTATGAGGGCTCCAATTTCTCCACATCCTCTCCAACACTTGCTATTGTCTGTCTTATTGATTGCAGCCATCCTAGTGGGTGTGAAGTGGTATCTCATTGTGGTTTTGACTTGCATTTCTCCGATTATCATTAGTATTTCCCAGTGATATTAAGCATCTCCTCATGTGCTTGTTGACCATTTGTATGTCGTCTTTGAAGACATGTCTATTCAGATTCATTGCCCATTTTAAAATTAGACTTTGTCTTTTTATTATTGAGTTGTAAGAGTTCTTTATATATTCTAGATATAAGTACCTAATAAGATACGTGATTTGCAAAAATATCTTCCCATTCTGTGGGTTCTCTTTTCACTCTCTTGATAGTGTCTATTTTTTTTTTTCTTTTTTTCACATGGAGTCTTGCTCTGTAGCCCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACTATCTTGGCTCACTGCAGCCTTCAACTCCCAGGTTCAGGCAATTCTTGTGGCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGACTATAGGTGCGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGGGTCTTCAATTTTGATGAATCTAATTTATTTTTTCATCTGTTGCTTGTACTTTTGATGTCATATCCAAGAAACCAGTGCCTAATCCAATGTCATGAAAGCTTACCCCCATGTTTCCTTCTGAGAGTTTTATAGCTGTAGGTCTCACATTTTTGTCTTTGATCAATTTTGCATTCATTTTTGTATGTGGTGTTCTTTTACTTTTTAAGTGCTGTGATCTTGGCTACCATGCAAGTCTGAACAGAGCCCTAAGAACATATCTGTCTGCGGAGTACAACCTTGAAACCTCCAGACATGAGGGCTTAGACATTATTGAGAATGCAGTTGATAATTTAGAGCCCAGGAGCGATAAGCAGAGATTCATGGAGATGTACCCTGCTGCGTTCTGTCCACCAATGAAGTTTGAGTTTCAGTCTCACATGGGTGATGAGGTCAGTAATTGATCATTTTTAAAATAATGAATTGTCTCTTCACTTATATTTCTCCTCACTTGCTATAATCTAACAGTTGTAATAATTCCCAGTTGTTTTCTCTCTCCTGTCCTTGCAGAGGCTCTTAATATAATGCTAAGATTAGTCGCTACCGCCTTTTAAAGCAAACGTCAAACACTCAAATACCCACAGAGGCCAAACAGATAAAAGGTGCAGATTTGCCTTGCACTAAGCTGTCCCAGAATAGAAAGTTTTTGTTCCACCTCAAGACATTTTAATTTAATGAAAATGAAGGCATTTTGCTGGTCTGATAGAATCTGTCTGATGGCTTCTGATAATCCTGATTTAAAGATTCTCATAAAGAAAAGTAATTGTATGTGGCAGGAAAATGGAAGAAGGAAAAAAAAGTACAAAACTTTTTTTAAAATTCAAGTTGGCTCCAAAGCTATAAAATGAGCCTTAGAAATTATGACTGTTTTAGATCCTTTATATAAATTCAGCTTTCTATGTTATTTTACCAAAAAAAATGCATTTAAACTGATTATGAGTTACAGTTGTTTATATTATTGTCTACAGACAGGAGAAAACAAAAAAAGCCAACTTAGGGAGCATGCTATATAGCACTTGTTGTCTCAGCTGTGCAAAACAAAACTCATAGATAAAAACTCAGTCTTAACTTATTATGGTGACAGTCTGTTTTTCCAAATGTAATTATAAGATCATGAAAAGATTTCTTTAATGCTATGTTTTTTTCTGAAACACCAAGTATTAAGACATGTAAAATATATACATGTTTTTATATATATTTTATATATATATACACATATAATGTACCTGCTGTATTTCTAATTGGATTTTATGTGTGTTTGATAGAAATGGTATTTAAGCCAAACACACATGGATTTTGACAAGCAAGATGAGTAGCTTATCCCATCTTTCCAAAACCAAATGGTTGCTGTTTTAATTTTTCAGCTGTGGATATGTTAAGCATGGCATGTTAACATATCACAGACAAATGACATCAGTTGTATTTTAATGGTTTAATTGTTTTAATAAAGTAAGTTGGTTGCCCTTTTTTTATGGCCAGTTCTGCTAAGGAGCAGTGGTAATCTCTCTAATGTTTTGGAAACTCTATAAAAGGAACCCCCATGAGCCAAGAGCATTTCTAAAACAAGGCAGATAAGAAGAAATTGTTTGTTTCTGGTGCAGTTTTAATAATGCTCTAATTTTGAACTTATCCATAATTGAGATCATGGCCAAATATCTTCTATCAAAACCTAAGATAAGTGACTTCTTGAAGTTCATGGTGAATCACGTGACTTGGCTGATATTGGTTAGGGAAGCCATATTTGAAAGATGCTAAAGTAGTCATTCACATTTTCTGAGTTTTTACTGTGTGCCAAGCACTGTTCTAAGTTCCTTGTGTACGTTGTCTCATTTCATTCCCACAGCAGCCCTGTGATATAAGAACTCTTATCCTCATTCTACAGATTAGGAAACTGAGGTTTTGTAACTTACCACAGTCACCTGGCTGGTAGGGGACAGAGCTGGCGTTCGAGTACAACTGACGGACTCGAGAGCTCAGACCCTAACCAGTAAGCCCTGCTGCCTTCTTTACTTATGTCCGTACAATCCACTTGAATCATCTTCTGCCTCTGCAAAAGAGTCATTAAGAATTCCACGAGTGAGATTTCAGCATCGGAGCTCCATCGCAGGAACCGCCCCATTCTTACCACAGTCCTTCCTGCAGCTGCCATCTTCCCAGTTGTAGCCAGGCCAAGCAGCTGCATTCTGCTATTGCAGCTTATGTAACAGCTCCATATTTACAAGTGAAGTTTTGATGTGCC
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Task1_train_18062
Chromosome 12 houses a mutation in gene TBK1 (TANK binding kinase 1). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Frontotemporal dementia and/or amyotrophic lateral sclerosis 4
CCAGGTTTTGCTAAGTGTACTATCCTGCCATGTTAAAATATCAAAGCCTAAGTCTTCATTGTTAGCATGGTTATTTGCCTATGATAACCCTATGCAGATAATATGGTTACTATTAACCATAATAATGGTTAAAGCACCTGGCTCCGGAAAAATAATCAGTGTTTGTTTTATGTAAACAAAAACACATTACACCCATGTGATTAAAAAAAACTACCCATGTGATAAAACTGCATATAAAGTTTTGGTCAATGATGGACCATATATACAACACTGGTTCCGTAAGATTATAATATCATATTTTTACTGTACCTTTTCTATGTTTAGACATGTTCAGATATACAAATACTGTTTCTAATTATGTTACAGCTGCCTGCAGTATTAAGTACAGTAGCATGCTGTACAGGTTCGTAGCCTAGGAGCAGTAGGCTAGCTACCCTATATAGCCTAGGTGTGTAGAAGGCTATACCATGTAGTTTTCTGTAAATATACTCTGTGATGTTCACACAATGATGCAGTTTTTAGAACTATTCCCATCATTAAGCAATGCATGACTGTACACATACATATACTTGCATGTAAAACTGGGGAAATTTGAGTAAGTTGGGTGTATCAATGTTAATAGCTGGTTGTGATGCTTTGCTATATGCAGGATGCCACCATTGGGGGAAGCTGGGAGAAGAATATATGGTGTCTCTCTTCATCATTTCTTAGAACTGCATGTGAATCTACAGTGATGTCAATGTTTTGTAAAAAGCTCACCCAGTGTGATTATCGTTAATAATAACTTAATTGTACATTTTAAAATAGCTAAAAAAATATAATTTGATTTTCTGTAACACAAAAGATAAATGCTTGACTGGATGGATACCCCATTCTCCATGGTGTGATTATTATGTATTGCATGTCTGTAACAAAACATCTCATGTACCTCATAAATATATTCATTTCCTATGTACACACAAAAATTAAAAACAAAAAATTTTCAAAAGGTGACACAGTGGAGGCTTGTAGAGCCAAATTACAATATTGCTGCTGAAACATTTCTTTTGATGTCATTGATCTATTCATGGGGAAGCTGTCTTTTCCCCCGAAGCATCATTTTGAAAATACCTAGTTTTATTAATGTATTTAACAAACATATAGTCACATAACAAGTGCTGTTCTTGGTTCTTTACATATTTAAGCCATTTAATCCTCACAACAATTCTGTGAAGTGGGTACTGTTATTATTTCCATTTTACTGATGAGGAAACAGTGCAGAGGAGTTAAGTCACTTACGGTTTTATAGGAAGTTAGTGGAAGAGCTGAGATTTGAACCCATGTATCTGATTCAAGTCAGTGCTCTAAACCGCTCTGCTATGTTGGTTCTCTATTTGAAAATATTAATAATCTTGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGTATCACTTGAGGCCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAGCATGGCGTAACCCTGTCTCTATTAAAAATACAAAAATCAGCTGGGTGTGGTGGTGCATGTTTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGCTGCAGTGAGTCAAGATCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAACAGAGCGAAACTCTGTCTCACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGGAAAGAAAATATTAAGAATCCTGTATATTACACAGGTATCCAAACATAAAAATACTTTAGAATTGCTTACTGTATGGACAGGTTATATGGAATGGAGTTTGTAGTATCCACATTAACAAAGCAAGTTTATATGGACTGGTTATGATATTAGGGATATGAATTAGAAATGGATGTTGTTGCACTCATTTAAAATATTTTGCCTCTCACTTTATCCCCAGTTATAGTGTCCTTTTGAATTTTTCTCACACAGTGCTACTATATTTCATGAACTGGTATATAAACAAACCAAAATTATTTCTTCAAATCAAGAACTTATCTACGAAGGGCGACGCTTAGTCTTAGAACCTGGAAGGCTGGCACAACATTTCCCTAAAACTACTGAGGAAAACCCTATATTTGTAGTAAGCCGGGAACCTCTGAATACCATAGGATTAATATATGAAAAAAGTAAGTTGGGATTTTTCTTGTCGTTCTTACTAGCCATTAGAAAAATACAGCCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCTCTACAAAAAAATAAAACAAAAATTAGTGGGGCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCCAGCTGCATGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTAAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGTGTGGGACCCTGTCTCAAAAACAAAAAAATCCACAAAGTCTGTCATTGTAGAAATGATTGTCATCCTTATAAAGCTGATGATAATATTAGTGTAGAGCTTTCATAAATATTAAAATTTTATAAATTACTATAGTTGAAAGAGAGTAATTGTAAAATTGAAAAAGCCTTGTAGACATGATTTGACTTCAAATATTTTGTTTCCTAAAACGATAAAATCGTTTGTCATACGTTTCACTGTAACTCTCTTTAAAAAGTGTTTTGCTAACACTCAAAATTACCTTTTATATCATAAATTTCAGCAAATATTTTTTGTGTGCAGTATGTATAGAACATTGTGCCAAGCTTTAGAGTCTAAGAAAAATTAGATCTGCATTTTTAGAATCTTTTAAATTACTCATTCTACTGGTAGAAAAAAAAATGGATCACCCAGAATTTTACAGTTCTATTTGAAGGTTGGGATTTGATGTAGATTTAAAGAGAAGCATTGGACTCATTGTGTTGGTGTATATTTAAGGAAAAAATGAAACTCCTTAGAAATATTTGAGGTAATTTGTTAGAGAATGAGCATTATTGTTTGAAGTGGTGTTTTTTTAATCACGAAAACTACATTACAGATTTTGCCACTAATGTTTAATTTAGACATTGTGTTTGCTCTATAAAGGATAAAGTGATTTTTTCAAAAAGTTTTCTTTCTCATTTTATTTTACTTCATATTTCAGTTTCCCTCCCTAAAGTACATCCACGTTATGATTTAGACGGGGATGCTAGCATGGCTAAGGTTAGTATTTAATTTAATTACTATGTAAACATCTGAATTTAATGTATCCTATCAATAGTGGAAGCAATAACATGTATTGTGTCTTCATGTATGTCTATATGACTTAGGAAATTATTCACTTAAATTGATACCCTTTCCAAGTGATTTTGTGGTCTTTCTTTTTTACTTTTTATCCTTTCTTGAATTCATTATATAAGAAAATTCTCTCCATTGAGATAGTGCATGTTTAGATAATGTTAAGGATAACATATTTATTATATTTATATCTATTTTTAACTCTTAGAAATTGGTGGTTTATTGTGTTTTTAATTAACCTGATAAAAATGTGTAAGCTTGAATAATTTTGTGTAAAAGTTTTTCTTACCCTATACCACAATTAGCACCAAATATTGACATTTTATTTCTTTATTAGGCAATAACAGGGGTTGTGTGTTATGCCTGCAGAATTGCCAGTACCTTACTGCTTTATCAGGAATTAATGCGAAAGGGGATACGATGGCTGATGTAAGTAATAGATTGAAATTTTGAAATTGATTTTCATGTAGACCTTGCCCCATCATTGATATTTTCTCTCTTCAAACTAGTTAGGTTAGGTGCTTGATTTTTATTATAATACATTTGTTTCACATTTAGTTTATAAAACATTTAGCAGCTCATTTTTCATGAGTCCTACAATGACCTTGTGAGACAGAACAAATAGTATCTGAATTTTAAAACTTACACCACGCTATAGGATGTGACGGCAAATGCATTTCTTTTCCTAGGACCTTGAGTAGTTGGTTGTCATTTAACTATGTTAGAAGTCTTTGGCTTGTTAGAATTCAGTACAATCTGTACTTTCTAGCATTTAAGTCCTCAAAGTCTTCCTTAATTTCCTACCATTTTCCCAAATGAAGTACACAGTCCTTTTTTAT
CCAGGTTTTGCTAAGTGTACTATCCTGCCATGTTAAAATATCAAAGCCTAAGTCTTCATTGTTAGCATGGTTATTTGCCTATGATAACCCTATGCAGATAATATGGTTACTATTAACCATAATAATGGTTAAAGCACCTGGCTCCGGAAAAATAATCAGTGTTTGTTTTATGTAAACAAAAACACATTACACCCATGTGATTAAAAAAAACTACCCATGTGATAAAACTGCATATAAAGTTTTGGTCAATGATGGACCATATATACAACACTGGTTCCGTAAGATTATAATATCATATTTTTACTGTACCTTTTCTATGTTTAGACATGTTCAGATATACAAATACTGTTTCTAATTATGTTACAGCTGCCTGCAGTATTAAGTACAGTAGCATGCTGTACAGGTTCGTAGCCTAGGAGCAGTAGGCTAGCTACCCTATATAGCCTAGGTGTGTAGAAGGCTATACCATGTAGTTTTCTGTAAATATACTCTGTGATGTTCACACAATGATGCAGTTTTTAGAACTATTCCCATCATTAAGCAATGCATGACTGTACACATACATATACTTGCATGTAAAACTGGGGAAATTTGAGTAAGTTGGGTGTATCAATGTTAATAGCTGGTTGTGATGCTTTGCTATATGCAGGATGCCACCATTGGGGGAAGCTGGGAGAAGAATATATGGTGTCTCTCTTCATCATTTCTTAGAACTGCATGTGAATCTACAGTGATGTCAATGTTTTGTAAAAAGCTCACCCAGTGTGATTATCGTTAATAATAACTTAATTGTACATTTTAAAATAGCTAAAAAAATATAATTTGATTTTCTGTAACACAAAAGATAAATGCTTGACTGGATGGATACCCCATTCTCCATGGTGTGATTATTATGTATTGCATGTCTGTAACAAAACATCTCATGTACCTCATAAATATATTCATTTCCTATGTACACACAAAAATTAAAAACAAAAAATTTTCAAAAGGTGACACAGTGGAGGCTTGTAGAGCCAAATTACAATATTGCTGCTGAAACATTTCTTTTGATGTCATTGATCTATTCATGGGGAAGCTGTCTTTTCCCCCGAAGCATCATTTTGAAAATACCTAGTTTTATTAATGTATTTAACAAACATATAGTCACATAACAAGTGCTGTTCTTGGTTCTTTACATATTTAAGCCATTTAATCCTCACAACAATTCTGTGAAGTGGGTACTGTTATTATTTCCATTTTACTGATGAGGAAACAGTGCAGAGGAGTTAAGTCACTTACGGTTTTATAGGAAGTTAGTGGAAGAGCTGAGATTTGAACCCATGTATCTGATTCAAGTCAGTGCTCTAAACCGCTCTGCTATGTTGGTTCTCTATTTGAAAATATTAATAATCTTGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGTATCACTTGAGGCCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAGCATGGCGTAACCCTGTCTCTATTAAAAATACAAAAATCAGCTGGGTGTGGTGGTGCATGTTTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCGGAGGCTGCAGTGAGTCAAGATCGTGCCACTGCACTCCATCCTGGGCAACAGAGCGAAACTCTGTCTCACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGGAAAGAAAATATTAAGAATCCTGTATATTACACAGGTATCCAAACATAAAAATACTTTAGAATTGCTTACTGTATGGACAGGTTATATGGAATGGAGTTTGTAGTATCCACATTAACAAAGCAAGTTTATATGGACTGGTTATGATATTAGGGATATGAATTAGAAATGGATGTTGTTGCACTCATTTAAAATATTTTGCCTCTCACTTTATCCCCAGTTATAGTGTCCTTTTGAATTTTTCTCACACAGTGCTACTATATTTCATGAACTGGTATATAAACAAACCAAAATTATTTCTTCAAATCAAGAACTTATCTACGAAGGGCAACGCTTAGTCTTAGAACCTGGAAGGCTGGCACAACATTTCCCTAAAACTACTGAGGAAAACCCTATATTTGTAGTAAGCCGGGAACCTCTGAATACCATAGGATTAATATATGAAAAAAGTAAGTTGGGATTTTTCTTGTCGTTCTTACTAGCCATTAGAAAAATACAGCCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCTCTACAAAAAAATAAAACAAAAATTAGTGGGGCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCCAGCTGCATGGGAGGCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAGCCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTAAGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGTGTGGGACCCTGTCTCAAAAACAAAAAAATCCACAAAGTCTGTCATTGTAGAAATGATTGTCATCCTTATAAAGCTGATGATAATATTAGTGTAGAGCTTTCATAAATATTAAAATTTTATAAATTACTATAGTTGAAAGAGAGTAATTGTAAAATTGAAAAAGCCTTGTAGACATGATTTGACTTCAAATATTTTGTTTCCTAAAACGATAAAATCGTTTGTCATACGTTTCACTGTAACTCTCTTTAAAAAGTGTTTTGCTAACACTCAAAATTACCTTTTATATCATAAATTTCAGCAAATATTTTTTGTGTGCAGTATGTATAGAACATTGTGCCAAGCTTTAGAGTCTAAGAAAAATTAGATCTGCATTTTTAGAATCTTTTAAATTACTCATTCTACTGGTAGAAAAAAAAATGGATCACCCAGAATTTTACAGTTCTATTTGAAGGTTGGGATTTGATGTAGATTTAAAGAGAAGCATTGGACTCATTGTGTTGGTGTATATTTAAGGAAAAAATGAAACTCCTTAGAAATATTTGAGGTAATTTGTTAGAGAATGAGCATTATTGTTTGAAGTGGTGTTTTTTTAATCACGAAAACTACATTACAGATTTTGCCACTAATGTTTAATTTAGACATTGTGTTTGCTCTATAAAGGATAAAGTGATTTTTTCAAAAAGTTTTCTTTCTCATTTTATTTTACTTCATATTTCAGTTTCCCTCCCTAAAGTACATCCACGTTATGATTTAGACGGGGATGCTAGCATGGCTAAGGTTAGTATTTAATTTAATTACTATGTAAACATCTGAATTTAATGTATCCTATCAATAGTGGAAGCAATAACATGTATTGTGTCTTCATGTATGTCTATATGACTTAGGAAATTATTCACTTAAATTGATACCCTTTCCAAGTGATTTTGTGGTCTTTCTTTTTTACTTTTTATCCTTTCTTGAATTCATTATATAAGAAAATTCTCTCCATTGAGATAGTGCATGTTTAGATAATGTTAAGGATAACATATTTATTATATTTATATCTATTTTTAACTCTTAGAAATTGGTGGTTTATTGTGTTTTTAATTAACCTGATAAAAATGTGTAAGCTTGAATAATTTTGTGTAAAAGTTTTTCTTACCCTATACCACAATTAGCACCAAATATTGACATTTTATTTCTTTATTAGGCAATAACAGGGGTTGTGTGTTATGCCTGCAGAATTGCCAGTACCTTACTGCTTTATCAGGAATTAATGCGAAAGGGGATACGATGGCTGATGTAAGTAATAGATTGAAATTTTGAAATTGATTTTCATGTAGACCTTGCCCCATCATTGATATTTTCTCTCTTCAAACTAGTTAGGTTAGGTGCTTGATTTTTATTATAATACATTTGTTTCACATTTAGTTTATAAAACATTTAGCAGCTCATTTTTCATGAGTCCTACAATGACCTTGTGAGACAGAACAAATAGTATCTGAATTTTAAAACTTACACCACGCTATAGGATGTGACGGCAAATGCATTTCTTTTCCTAGGACCTTGAGTAGTTGGTTGTCATTTAACTATGTTAGAAGTCTTTGGCTTGTTAGAATTCAGTACAATCTGTACTTTCTAGCATTTAAGTCCTCAAAGTCTTCCTTAATTTCCTACCATTTTCCCAAATGAAGTACACAGTCCTTTTTTAT
Task1_train_18063
A mutation found in TBK1 (TANK binding kinase 1) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Frontotemporal dementia and/or amyotrophic lateral sclerosis 4
AAAAACTATCCTTAAAATCAACCTTTTGAATACTTTAAATCAGGGTCATGAACACCAGAACCTCTAAAGGCCAGGCAGGTAACAGAAAGGAATGAGATTGGCCAGTGGGGACTCATCTACAGGGGAGAGCCACTACTCATATTCACCAAAGGTATTGCCCAATCTTCCCATTTCTCAAAAAAAGCTAGAAATACAGAATTTGTTAGAAATACCTTGATTTTTAAATGTTAACTGTTAATTGTTTTTTACATTGTTATTTACAGACCAAATAAAAGCATCTGTGGGCCATAAGTAACCAATGAGCCACAAATCTATGACATCTGCTTCAGACTCTTAGCCTTTTTGAAGCAATAATCTCAAAAGAAAATACATTGTGTATAATATTATGATTCTATATTAACAACAGTAATATATTTTCCTATTTCTAGGATTAGCTTATAATGAAGAACAAATCCACAAATTTGATAAGTAAGTATCCAGATTATGTTTAATAGTTATTTTTGGTGCTATTTTGGTTATCTTTATTAATATGATTCTTCTTAAAGTTGAAATTAATTACAATTTAAAAATACATTTTAATCTTGATTTTACAGGATTGTTACAATATGTAGACATTTTTGAGGTTCACACATCTGCTCCCTAATTGGGAAGTTACCATGATGGGAGAAGGAGGGGGGAGAAAGATTACCATTTCAGTCAGTCAGCTTCTGCCTCATATGCTCTGATTACAGAAGTACAGATAATACAGCACATAGGCAAGGGCAGACTTAACTACCGTCTTAATTTTAACCGCATTCAATAGGCATTTTTTTTACATCCATTTTGAACCTTCTCTTTATCTTCTTGCTGCTATAATGTCTATCTTAGAAACGTTTACTTTCTCCTGTAAATATTCTAAAGCCACAACAATCATTATAGGAAAGATACATTTCATATATTTGAAAATTTCTAAATATTGAAAGTAGAAACAGTGACATTGGTTTAAGCCTCTGATTATTTCTAAATTACAGGCAAAAACTGTATTACCATGCCACAAAAGCTATGACGCACTTTACAGATGAATGTGTTAAAAAGTATGAGGCATTTTTGAATAAGTCAGAAGAATGGATAAGGTGAGTAAACTTCTTTTGGAGTGATTAGTGGTTGACTGCACAATATAAATGTATATTTGAAGTAAGAATGCTTCACTAGACTGCATATCAATTGATTCTTTTTGGTTTTCAGAAAGATGCTTCATCTTAGGAAACAGTTATTATCGCTGACTAATCAGTGTTTTGATATTGAAGAAGAAGTATCAAAATATCAAGAATATACTAATGAGGTAGGTACAGCTGTCAAGGAAAAATTAAAATTCTTCTCAGTTTATAACTGATAGTGATTGACAAGGGAGAAATGGGATAGAATGTGCCTACATTCAGTTCCACCCACCAATTTTTAATATGTATTTTGAGCCAAGTTTTAAGAATGTAGATGTTTTACAACTAAAAACAGCTGATAAACCATCCTTTTATCAACTGTATGAAAAGTTTCTTTCTTAAAAGGGTGTTGATTTAAGTATTGTATCATCGATAGTTTTGAAATCAAAATTTAAAGTTTTTTTAAAGGACTTATTAAAAGCTGTAACACTTGATGTCAGATCTGTAGTAAGTACTTTTGTTCTGTGATTAATGTGGGGTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGATGTTTCAGTTACAAGAAACTCTGCCTCAGAAAATGTTTACAGCTTCCAGTGGAATCAAACATACCATGACCCCAATTTATCCAAGTTCTAACACATTAGTAGAAATGACTCTTGGGTAAGAAACTCATCATTTGGAAACTGTAGTGTTTCCATTTGCTTTCATTGCAGTTTGTGCTTTTGCTCTTACATTTTGAAATTTTTTATGTTTGTTGTAATACAATGTTTAATAAGGTTATCTATTGACCAGTTAAAAGAAAATAAAACATAAACATCATTCTAAAACATTTGCATACTGTTTTTGAGCAAAGGTGCTTGTTTATTTTATTAGTATGAAGAAATTAAAGGAAGAGATGGAAGGGGTGGTTAAAGAACTTGCTGAAAATAACCACATTTTAGAAAGGTGAGTAATGCAAAAATAATTACTGTGATTTTCTGTGCAATTGAGTTCATTCACATCTGTACTTATATCTTCCTGTATCAATAGATTCAGCAGTGGTAAAGGGTCATAAAGTCAGAACTCATGTTTTTCTCTCTATGATTGTGTATCTGTGATGCCTTTTAATGGTTGATTAGTTCCATTTTATAGAAGCACTGGTTAATCGAATTACTTATTTGAATCAGTTTGTAAAGATCAAACTCTATTTACATTATTTTTATAACTTAATTCATTGGAATCATAATTTTCAATTTGGTGAATCAGAGTTGCTTTTTAAGATACCAGCACTTTGGTGCTGAGTAGCTTACGGGGTCCTCTGCACACCTCCTTGCAGGTGAAAGCCACAGGTAAATGCAGTACTTTGAGGAGTTAGGTGTCTGCTTATTATCTGCAAAATCCTAATAGATAAGGCCAAAGAGATTTGAAAGCCTGCAGAGGCAATAAAGCAATTTTTGGATGGCAGTTTTCCTTATCCTGATTCCTCAGAGAAATTAAGTCATATTTGGCTCTGTAATAGAACCTTTTCTTTTTCAAGCCCTTAGGTTCTCCTCTATAGGTTCTCAAACGCTTGTAATGCTAATAAAAATATTTCACATTTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAAGCCAAGGCAGGCAGATTGCCTGAGCTCTGGAGTTCAAGACCAGCCTAGGCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCACGAGAATCACCTGAATCTGGGAGATGGAGGTTGCAGTCAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTTTCAAAAAAAAAAAAATGGATATGGAATTTTTGGGTCAGAGAGTATGTCAATTTCAATTTTTGTTGGGTTTTACTAATTTTATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCGAGACGGAGTTTCGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAATGGCGTGATCTCAGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTAGTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGCTGGGGTTTCACCATGTTGGCCATGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCAATTTTGTTCTTTAAAAGGGTGCATGTTATAGTCCTAAGCAGATAAAACCTATGCATTTGGCAACATTGAATGTATAACATCTTTTAAACATTCGCCAATTTGTTTAGTAAAAACCGAGATCTTATTTTAATTTATATTTCTGTGGTTTATAGTGATGTCAAACATCGTTTAATATGTTTGTTCAATTTTCATTTTTGGGGAGAGTTACTCGTTAACTTTAAAAAATATTTTCCTTGTTTATAGTAATTATCTAACTTTTATAGTATCCAGTTTACAGTTTCTTCAGAACTTTAGCTAAATCCTTTTAGGCTTAAAGATCACCAAGTAGAAGAGACTATAAAGATGTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTTTGTCGCCAGGCGGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAGCGTTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAACTGGGACTACAGGCACACGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCTGAGTGCTGAGACTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCCAAAGATGTGCTTTTAACTTTTATATTTAACTACTTATGC
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Task1_train_18064
Consider this mutation in LEMD3 (LEM domain containing 3) on Chromosome 12. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Cerebral arteriovenous malformation
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Task1_train_18065
This is a variant in NUP107 (nucleoporin 107), located on Chromosome 12. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Galloway-Mowat syndrome 7
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Consider this mutation in NUP107 (nucleoporin 107) on Chromosome 12. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Galloway-Mowat syndrome 7
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Task1_train_18067
The gene NUP107 (nucleoporin 107) on Chromosome 12 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Ovarian dysgenesis 6
GTACTAAGAATTAAACACTGATATAAGGCAGAAAAGTAAAGGAGGTACCAAATGAATTTAGAGAAAAAGTACTGGGCTAAAGCTTAAAGCTGGCTTCCCTGAGGAAAGAATTGAATTGAACTTTTAAAACTTAGTAGGATTTGCGTTGTTGAGAATGAAAAACAAGAGGAAGGAATTCCAGGTAGGATACATAGATTGGGAAACTCAAAGTAAGGTGGGTCTACCAGGTTGGAGTAGAATGCTTATAAAGGAAATAAAGTCAGTTCTGTTGTAACACGACATAGGTATTCAAAGTCATCACAATGTACAACATTGTGCAAAAACCCCACAGGACTTATAGGGAAATGGAGTTAAGAGAAAAATACTCAAAAACTTCATTAGTGATACATAAAATGATAAAAAGTTAATAAAAATGGTAGCACAGTTTTACATCTGTCAAACAGTTCAAAAAATACATAAATACTACAATAAATATGGCACTTTACCTTGAAAAAGGCCTAAAGTTTGCTTGTGGAATTGGATGTCAGGGTGGTAGAAGCTTTAGGGCACATGGCAGAAGTGTTTTTAAGAAGATCAGCATGGCAGTAGAAAAAATATACTTAAAATTAGATGGATAAAAGCCTGAAAAAGTAATTAGGAGCCTGTCAGAATTATTTGGACACTAAGTCATAAGGGTCTTTCCTAGGATAGTATTGATGATAATGGAAAGGAAGGAAGAGACACTGGTCAGGACCGGTGATTAGAAACAGAAGGCAGAGGTGGACTCAGTTATGCAGTAAGAGTCTCTGAAGTCTCTTGTTTGGATGATAAGAAAACTGGAAATACCATTAATAGAATCCCAAAAGTAAAATGGGGAATTAGTTAGTTCTATGTAGGAATTAAATGCAAACTAATGCATGCCTTGTTTTGATGTTGTACATAGGTCAGTATCAGAGAGTATCAGGTCAGTATCAGAATGTCAGGTATTGAGAAACATTCTAGGAGTAAATAACTATATAGATTGTATCTGGAATAAAATTTGATTTTAAATATTCAAAGCATCCACTAGAGTTGGATCTGCTTTCACCTGATATTTGGCATTTAAATGTTTTACTTTTTCCTCTAGATTTCAGCATTTATTATTTCATCACACTGAAGTTCTTCCTTGTTATTACCCCACTAGATCTTTCACTAAAGTTTAAAAACTATCAAGTGAATAGGTTCAGTCTAGAAGAGTTTGCAAGACTCCACATTATGAGGAAAATTGACATACTAAGAAAAACAATATTTCAAATTTGTTTATATTCATTGTGTTTTAGGAGCTTTTTAATAGATACGAGAGAGCAATTTATGCAGCTTTAAGTGGGAATCTTAAGCAGGTATGCAATCTGTTTTAATGTTTAAATTTTTTCTGTGGAGTAAAATTAAATAAAATATTCTAACAATTGTATATAACAAATATAAACTTAAGTTTGTATACTTAAGTATATACATACTTAAGTGTAGCAATGATAGAGATAATCATGAATCAGATAGTGACTTGTTCTGCTTAATTTGATGTATCCCATAACATGCATGGTATTTTAATGAATGAAATCAGATTTCAGTTTTTAACTAAGAATTGTAAATTTAACTCCAACACACATTTATTGATGACTTAAAATACTCATAGCTGTATGCAGAAATGTACCGGAAAGACACAGTGAGTCCTTGGGTTGTCTTACATACGCATGTTTTCTCACAACCCACTACTCCCTACATATTATAGCTATCTTTAGGGATACTATACTAATCAGTTGAAATGTCATATCAGCCTGGAAAACTGATGTTGTTGTTAACAGTATGAAAAAATCTGAACAGTTCAAACATCTTAGAAGATGTAGTTGGCGGAGGAAAGGTTATTTGGCATAATTTTTTTAAAATCTGCCGTGTTTTATATCATTATAAAGTGATTTTATAGTCTGTATCATTGGATGTAATTGCTTTTCCTTTCTTTTCTGTTGAATATGTCTATATGTTTCTGTTTTGTAATGGGGAAAAAGCTGCTTCCTGTCTGTGACACCTGGGAAGACACAGTTTGGGCCTACTTCCGGGTGATGGTGGACAGTCTGGTAGAACAGGAGATCCAGACATCAGTAGCAACTCTGGATGAAACTGAAGAACTCCCTAGAGAATATCTGGGAGCAAAGTGAGTTTGTTGGATTGTTTTGAGTCATGGTGATTTGTAGCATGCTCTTTGATGTTTCGTTTTACACCCCTTTTTCATATTATTAACATTATTCTTTTCCCGTTGTTTCTTTTGAAGCTGGACGTTAGAAAAGGTTTTTGAGGAACTTCAAGCTACTGACAAAAAGGTAAATGTTAATAGGAATATGTTAGGTATCTGGAATAGGAAACAGTGTTATTCTATTGTGCACTGTAGCTGAAAGGAAAAAGGTGGAACTTTCTCCCTTTTTCTCACCTATTAAAATAAGAATCATTCTTTGAAACGAAGAAACTTAATTACATAAATGATACATCATTTTTAGTTTTTTGTTTCGGATTAATTTCATCTAAGTATATGCACGTAAGCTATATTTATTCCTTTTTTAAAATTTAAAACACATTATGGAAAATTATTAAGACTTTATTTTCCTAGATCTTAAAATCTAATATTTTCTAAAAATTATATTCTTTTAAAAATGCTTAAACAACTGTAGTAATATTGTATGTACTTGTAACAATAAAATAATTTTAGAATGTATAAATAAAACCTTTATAGTAATTTCTACCCCTTTATGGTTATTCCCCTGAGATGATAAAACATACTGATATGTATCCTTCTATATTTCTCTCCATGATCTTACGAATATGTGTAAATAATGTAGATACTCCAATTTAGAATTTTGATTTTTGTGTTTTTCACATTTTACTACATATATTACTCTACAGCTTGATTTTTTTCATTTAATGATAATCTCCAAGTTAGTTTATTCATTTTCACTTAACCTTATTCTTTTTAATAAATACATAGTGTTCTTTAGAATAATGTATGATTTATTTTAATCATTCCCCTTTGGGTAGTATTTAGGTTATTTCTAGTGCTGTAATGAAGTTACATGTGTGTGTACTTAACTACTAGTCCTTCTGTTTCTTTGGGATAAGTTTCCTGAAAGCAGGGTTACCAGGTTAAGGAGTATAAATAAGTATATGCTTTATACATTGTATATACATACATACAGTGTTTCTGAATGAATTCTCTGAAGACATCAGGTTGTATACCTTAAAAATATATACAATAAAAATAAATAAAAAGGCCAGGTATGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTTGGGAGGCCAAGATGGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTAGACCAGCCTGGGCAGCATAGCAAAACTTCGTCTCTAAAAAAAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGTACCCACTTGTAGTCCCAGCTCCTCCAGAGGCTGAAGTGGGAGGATCGTGGCTTCAGTGAGCTGTGATTGTACTACTGCACTGGAGCCCAGGAGGTCGTGGCTTCAGTGAGCTGTCATTGCACTACTGCACCCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGGCCCTGTCTCAAAGAAAAAAGAAAAATTAAATAGGTAGGTAGGTAGGTAAAGAAACATTTTGAAATGGATGCTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCAACGTTGCACTCTAGCCTGAGCAACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAGAAAAAATTGAAATGGAAAAATAATTTATTACCTGGTTGTGGCAGTTAATTCATACTTCCACAAGTAATTTATTGAATTATACATTCTCACCAGCCTCAAATGTCACACTTTTTATGTTTTGCCAATCCATCAGAGTAGGTGGGAAATAGGAACTTGCTGTTCTACTCACATTTTCTTGTCTATTCATAAGGCTGAGCATGTTTCCTTATGTTTATTGACCATTTGTGAATTTTTTGTTCATATCTTTTAGCTATTTTTCTGTGGTGTTTTATATTTTTCTTATTATTATATAGGAGCACTTGATATAGT
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Task1_train_18068
A mutation found in NUP107 (nucleoporin 107) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Nephrotic syndrome, type 11
AAGCCAGTCTATCAGGTAGAAAGATCACCAAGACCTTTAACAGAGTGCCTTGGGCCCTGAAATAGTTACAGGTCACTGTAAAATTGGTAAACCAGTGATTTGACTCCTTTAGAAACCATTACAGAGAAGTCCGTAGGCATTCAAAATTGTGTATCTTTTTTCACAGCATCAAAAAAGCACGAAGCTGCAAAAGAAGTATTTGTGAAAATTCCTCAGGATTCTATAGCAGAAATCTATAATCAGTGCGAGGAACAAGGAATGGAAAGTCCACTTCCTGCTGAAGATGATAATGCTATCCGAGAACATTTGTGCATCAGAGCTTATTTGGTGAGACTGTAAAGAAAGCCACAGATGTGCCTACTTCATGATGATTTTTCGGATTCACTCTCAGAGTTTGAACTTTTTTCTAGAAGTAGTGTTGGTTCATCTTACCTCTCTTGTGACTATAGTGCTGACTCATCCACAAGGGGACTGACTTCATGACCTTATCTTCATTAGCATGATTCTCTAATCAATGCTAACCAACCAAGATCATCTCACATGGTAGATAGTGTCTATGATGTCTGGAAGTTATGTTTTCTTAAGATTTTGTGATGCATGTCTCAGCTTTAAATTTCTGCTTTTTTCAATAACTGAGAAAAAGCAAGATGCTCTAGGTTTGTTATGACTAAAATAGCAGCATACTCATTCAAAATTCATTCAAGGCTAGATGCGGTGACTCACGCCTATAATCCCAACACTTCGGGATGCCAAGGCAGAAGCATTGCTTGAGCCTGGGAGTTCAAGACTGGCCTGAGCAACACAGTGAGACCCCTGCATCTCTACAAAAAAATAAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCATGTACTTGTAGTCCCAGCTTCTTCAGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCATGAGCCCAGGGAGTTGAGGCTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCTTGTCTTTATTAGATCATGTACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGGTCCTGTCTCAAAAACAAAAAAAAAATTTTATTCAATAAATAATTATGTAATTACAGTGGGTTAGGTAGTAGGGCCAAATCTGTGGATAGCACCCTATCCTTGCCCTCTAAAAACTAATAGGCTAGTTAAGAAGACAAGTACACATGCATATGTTACAGAGCGATGAATGTCAAGATACATATACGATCAGGGTGCTCAGATTGGAGAATATGCCAGAAAACACAATATATATACCTTGTTTGTCACTTGACAAAACATTTATTCATGATATGAATTTTTGGAGGGAAAAAAATATATATTGAACAGTTTTATTTCTTGATGCTGCAAAATTATTTCTAAGAATCAAATGTTAAAAATGTTGGTGAAACGATAAAAGTGAAAACTTTTGTTATTTTATATTTTGGTTTTTTTATTTCACATTTTAGGAAGCCCATGAAACCTTTAATGAGTGGTTTAAGCATATGAATTCAGTTCCACAAAAACCTGCTTTGATACCTCAACCAACTTTTACTGAGAAAGTGGCTCATGAACACAAAGAAAAGAAATATGAAGTAAGTTAAATATGGATCTAGGATGTGCCTACTGCATCTTATAAATGTGTGTTGTATATTTAAAGAGATCGTTTCTTCAGCAACTATCTTTCGATCATAACAGGTAATCTCCCTGTTAATGTCCTGCTTTGGAAGATGCAATCTGTTTAGTTACTTTTCTGTAGGTAATTAACCAAACATGAAAAATGCCTTCAGGTGACATGAGCGTTCATTTACAAAGTTAACATTTTAGCGTTTTACTTAACTGCAGTCTGTTGATACTTATTTTTGTACTTGGCAGACTGAAACATCAACTCTTTAGAATGATGTTCTATATGTATGTTCCTGTCTGTATTTTCCAAATACATTATTTATTGGGTTTTATCCATTATATGTCTGCCTTGTGTTTGTTTTGCAGATGGATTTTGGTATTTGGAAAGGGCATTTGGATGCCCTAACTGCTGATGTGAAGGAGAAAATGTATAACGTCTTGTTGTTTGTTGATGGAGGGTGGATGGTGGATGTTAGAGAGGTAAGCTGTGTGCATTGTTTATAGCCAAAAACCAAAACACTCACCATGTTCTTTTTTAAAAATATTCTGTCTCTAAATGGGAGCATCTACAGATTTTACATAATTGTAGATATAGCTAAATCCCATGTTTTAAGCTAAACTGAAAATACTACCTAGGGAATGGGAATATTTGATTCTTGGATAAACTATTAGTTCACATTTACTATGTTCACAGAGGATACAAAAATCTAATTTTTAAAAAATTCTGGACCTAAAAATTTAATTATACATGTATGTCACTCCATTTACAGATATAAAGATAACTCGAGTAGTATCAGTAAGGCATAGCTAAGGTAGGGGCTCTCACCTCTGGGCTGTCCATTTTAATGACCTGGCAGACTTTTTAAAAACACTACAGGGTTCCACTCCCAGAGATTATGGTGTAATTGGTCTGAGGTAGGGCTGGGGTTTATTTTTGTTTTTTTAATCACTTGCAGTGCTTTAATATAATATATAGCCTGTGTTGAGAACCAGCTACAGAAGTATCAAGTGCCATAAGAAAGGCACAGGTTAAGTATTTTCTGAGTCCAGGAAAAGAAAAGATTGTTTTCACCTGAAAGGGAACTGGAACGTATGCTTGAAATGTATAGCATTTGACTGAATCTTGAACATACTGGTAGAATTTGGATGAGCTGAGATGGGAGAAAGGAAGGATACTGAGATAATAGTCATATAAGGGAAAGACATTGCAGCCTGACCCTGGTGCATGACAGAAACAGTGAGTAGCTTAGTTTATCCTCTGTAGACCTGAGGAGCTGTCTGAGAGCTGGAAATACTGGCTTCTTGGATATTTGATGTGTTATTTTGAACAAAGAAAACAGTAAGTGTTCTTGGTATCTTTCCTTTTGCCATTCTTCATACCCTCATCTATTTAGTACTTTTTCTTTAATTTTAGCTATTGCATTTTTTTTTTAGCCTGTCTTCTCTGACCAGAAGGAGGAAAAAGAATACAGGCAGGACAGCGAACTAAATTTGAGCCCCTATTTGCCACTATTACTGATGGAGTAATTATCTTAAATGTCTCCACTTTATTTTTTCTTTTTTTGTTTTAGAGACAAGGTCTTGCTCTATCACCCAGGCTGGAGGACAGTGGCTTCATCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTTCTGGGCTCAAGCAGTCCTTCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTAGGACAACAAGCACACACCACCATGCCTGGCTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGACACAGGATCTTGCTGTGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACTTCTAGCCTCAAGCTGTCCTCCCACCTTGGCCTCCTGAAGTGCTGCGATTACAGGCATGAGTCAATGTGTCGCCACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAAGAGTTTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTTGGCTCGCCTCCCAGATCCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGACCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCCAAGTCTCCACTTTTTATCCTAACGTTCGTAATAGAACTCCTTTGACTCGTTTTAAACCTTCCACAGGTTCCTCTGGCAAAACCTTTCTCATCTGATTCATGCTGATTCTCTTGAAGATAAAATTTTAATGTTGTAAAATGCTAATTAAGTGTCACTTAAATTTTGAAAAGACTTCAATGCTTTATTTATACATACATCTTTGCTATTCTAATTATTAATTAAGTAGATTAGGTAGTGAAAGCCACAAAATAGTCTTGGGATCTCATAAAATTAGAGTTGAGGCCAAGCGTGGTGGCTCACGCCTGTACTCCTAGCACTTTGAGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGGACAACA
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Task1_train_18069
Chromosome 12 houses a mutation in gene LYZ (lysozyme). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Amyloidosis, hereditary systemic 5
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Task1_train_18070
Assess the clinical impact of this variant on gene LYZ (lysozyme), found on Chromosome 12. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Amyloidosis, hereditary systemic 5
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Task1_train_18071
This mutation is located in gene LYZ (lysozyme) on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Amyloidosis, hereditary systemic 5
TGCCCCAATTCTTCCAGAGCCAGTACTTTAAACAATTCCATTTCATTATTTTCCTGTAGACTAATTCTTAGGACATCAGCATATCTCTCTTCAAGCATTAAAAAAATCTCTTTAGAGTCAGTGGATCAATAGACAGTTCCTGTTTTCCACACAACTGAAAGGGTGGAGCCCCCAAACCACAAGGGGAAGAAGGAAGTTAAAAGATGTTAAATACTGGGGCCAGCTCACCCTGGTCAGCCTAGCACTCTGACCTAGCAGTCAACATGAAGGCTCTCATTGTTCTGGGGCTTGTCCTCCTTTCTGTTACGGTCCAGGGCAAGGTCTTTGAAAGGTGTGAGTTGGCCAGAACTCTGAAAAGATTGGGAATGGATGGCTACAGGGGAATCAGCCTAGCAAACTGTAAGTCTACTCTCCATAATTCCAGAGAATTAGCTACGTATGGAACAGACACTAGGAGAGAAGGAAGAAGAAGAAGGGGCTTTGAGTGAATAGATGTTTTATTTCTTTGTGGGTTTGTATACTTACAATGGCTAAAAACATCAGTTTGGTTCTTTATAACCAGAGATACCCGATAAAGGAATACGGGCATGGCAGGGGAAAATTCCATTCTAAGTAAAACAGGACCTGTTGTACTGTTCTAGTGCTAGGAAGTTTGCTGGGTGCCTGAGATTCAATGGCACATGTAAGCTGACTGAAAGATACATTTGAGGACCTGGCAGAGCTCTCTCAAGTCCTTGGTATGTGACTCCAGTTATTTCCCATTTTGAACTTGGGCTCTGAGAGCCTAGAGTGATGCAGTATTTTTCTTGTCTTCAAGTCCCCTGCCGTGATGTGGGATTTTTATTTTTATTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTAAAGACAGTCTCACTGTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTTCTGGGCTCAAGTGATTCTCGTGCTTCAGCCTTCTGAGTAGCTGTGACTACAGGTGTGTACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTCAGTACAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAATGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGGTAGGATTACAGGTGTGAACCACTGCACCCAGCCGACATGGGATTTTTAACAGTGATGTTTTTAAAGAATATATTGAATTCCCTACACAAGAGCAGTAGGAACCTAGTTCCCTTCAGTCACTCTTTGTATAGGATCCCAGAAACTCAGCATGAAATGTTTTATTATTTTTATCTACTCTACTTGATTAACTATCTTTCATTTTCTCCCACACAATTCAAGATGTGCCATGAGGAAAAGTTATTTTATAGTTTAGTACATAGTTGTCGATGTAATAATCTCTGTAGTTTTCAGATTGAATTCAGACATTTCCCCTCAATAGCTATTTTTGAATGAATGAGTGAAGGGATGAAATCACGGAATAGTCTTGTTTTCAAGATTCTAACTTGATATCCAAATTCACCTTTAGATATTATAAGAAAATTTCTATCAGAAAATCCTTATGTTTTTCTGATTAAAAAAAGCATTTTTCCATCAGCCTATGTATCTGCTATGAATTTACAAAATCTACTCAACAGCTCTGTTGATTTTTCTGTTCTTGGCTGAATGTTGCCTGAGGGATGGGAGCACGGGAAGGGTAAAAGCAATGGAACAAACATGTATTTTAATATTTTAAAAGTATGTTATATTGTTCGTTGGTGTTACAAGATGATTTGCATTACAAAAGGATTCTCTTACAAGTCCCTTATCTTAACACTAAAGTGCTAAGATATTTTATAAGTAAATCTTTATACTTATAAAACAAATCAGTAAAATAGAAGTAGCTAAGTAGAACTGATTTTGCTATAGAGTATAAGTCACTTAGTGTTGCTGTTTATTACTAAAAATAAGTTCTTTTCAGGGATGTGTTTGGCCAAATGGGAGAGTGGTTACAACACACGAGCTACAAACTACAATGCTGGAGACAGAAGCACTGATTATGGGATATTTCAGATCAATAGCCGCTACTGGTGTAATGATGGCAAAACCCCAGGAGCAGTTAATGCCTGTCATTTATCCTGCAGTGGTAAGACAAGCTAATATTTGACCAATCTGGTTATACTTACAAGAATTGAGACTCAATACAAATGAAAAAGCCTTGAAAGGTTCATGAGGGACCTAGAAAAACTACATCTCAACTTCCAGAAAGTCATTATTATTTTCCTCATAATTCCCTGAGTAAGAAATTAAAGAAGTGGTATCATAAAAGGTTGATGTTTTTTAATATACAGAAGTTTCTGGAATGACCTATTAATTTACTGTCAATGGCCTTACTGATGCTTTGTCCAGAACAATGCCATTGCTCCTGCTTACTTTGGGGAGGTTTTGGGATAATTTAGTTGTATGGTCCTTTTTCAATTGTTTTACTTTTTTTTTTATGAAATGTTCTAAATGTATAGAAAATTAGAGACATTAGTATAATAAACAGCCATATGCCCATTATGCACTTTAAAAGTTGTTAACATTTTGCCATAGTTGCTTCTTCTATGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGAGAGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGTTTTATTTTGAGACAGGGTCTCCCTGTCCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACCATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAGTGATCATCCCACCACAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCATGCCTGGCAAATTTTTGAAATTTTTAGTACAGGCAAATTCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAGTTCAAGCAATCTTCCCACCTCAGCCTCCTTAAGTGCTGGAATTACAGGCGTTAGCCACTGTACCTGGCTACTGCTGAGAGACTTTTAAGTGAATTAGGAACATGATGATATTCCATTTCTAAATTCTTTAGTTTACATCTTCAAAAAATACAGTTCCTGTAGAATTATTATTGTAAATAACAAATTAACTTAAGGATTTATTTATTTGGAGTGAAACAAATATTTTACTGAACTCATAAAAATAGAAATACCATGTGGAATCCTCAGTGTCAAAAATATTGCAGAAATCTTGCAAAGTTGATATTATTAAATTGTTAAATATTAAAATTCCCAATAAAGAACATTAATCTTATTTCTAAAATCCAGTTAATTAAAAAAATTTATATTATATAATAATATTTGGTCATTAAATAAAAATTAGAAAATACAAATAAGAAAAATAACACCCATAATCTTACTACCCAGAGGTTTATAACCATGGGTAAATTCTGGTATATATTCTTCCAGAATGTATATCAATCATGTGTATGAATGTTAAATTATATCATACACATATAAACCCACATACAAACATGTAAATACTGTGTGCTTTTGCAAAAATTAAATTGTATTATACACACGGCTTTACAATTTGCTTCTTATCACACAAAATTATTTGCATGTCAGCAAATACAAATCGGTTTTTAATGATCTTTTGCTCCATTTTCCAGATGAGAAAAAAATACAAATCTGTATCATCATTTTAAAAGAATGACTAGAATTTTAATATATGAATATTCTATAATTTACTGATCCAATTGTTACTATTGAGCACTTAGGTTGTTTCCATTTTTCCCTCATAAATTGCTATGAATAGCTTTTTGTATACATCTTTGGGTGCATTTCTTATTTCTTTTGGATAAATTTTCAATAATAGAACTGCTGAGTAAAATATCACTAGGTGTTTTTTTACAGTGTCTAGTGCAAAGAAGACCTTTAATCATTTTGTTAATACTTCCAGAGCTTCCAATGACTTTGGTAAATGAAGAAAAAAATGCTTCATTTCATGCTGAATGGGAGAGAATGAAGAGAGTTTTCCCCAACAATTACACATATATGGACTCATAGAAAATAATATCTTACCATTCTTTCCACAGCCTAACAGAAAAAAGCTGGCTAAACCTAAATTTAAAATAAAATATCTATTAAAGTTTTTATTCCTTACCACCTGTCTTTCAGCTTTGCTGCAAGATAACATCGC
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Task1_train_18072
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene LYZ (lysozyme). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_18073
Mutation context: Chromosome 12, Gene LYZ (lysozyme). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
AGTACTTTAAACAATTCCATTTCATTATTTTCCTGTAGACTAATTCTTAGGACATCAGCATATCTCTCTTCAAGCATTAAAAAAATCTCTTTAGAGTCAGTGGATCAATAGACAGTTCCTGTTTTCCACACAACTGAAAGGGTGGAGCCCCCAAACCACAAGGGGAAGAAGGAAGTTAAAAGATGTTAAATACTGGGGCCAGCTCACCCTGGTCAGCCTAGCACTCTGACCTAGCAGTCAACATGAAGGCTCTCATTGTTCTGGGGCTTGTCCTCCTTTCTGTTACGGTCCAGGGCAAGGTCTTTGAAAGGTGTGAGTTGGCCAGAACTCTGAAAAGATTGGGAATGGATGGCTACAGGGGAATCAGCCTAGCAAACTGTAAGTCTACTCTCCATAATTCCAGAGAATTAGCTACGTATGGAACAGACACTAGGAGAGAAGGAAGAAGAAGAAGGGGCTTTGAGTGAATAGATGTTTTATTTCTTTGTGGGTTTGTATACTTACAATGGCTAAAAACATCAGTTTGGTTCTTTATAACCAGAGATACCCGATAAAGGAATACGGGCATGGCAGGGGAAAATTCCATTCTAAGTAAAACAGGACCTGTTGTACTGTTCTAGTGCTAGGAAGTTTGCTGGGTGCCTGAGATTCAATGGCACATGTAAGCTGACTGAAAGATACATTTGAGGACCTGGCAGAGCTCTCTCAAGTCCTTGGTATGTGACTCCAGTTATTTCCCATTTTGAACTTGGGCTCTGAGAGCCTAGAGTGATGCAGTATTTTTCTTGTCTTCAAGTCCCCTGCCGTGATGTGGGATTTTTATTTTTATTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTAAAGACAGTCTCACTGTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTTCTGGGCTCAAGTGATTCTCGTGCTTCAGCCTTCTGAGTAGCTGTGACTACAGGTGTGTACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTCAGTACAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAATGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGGTAGGATTACAGGTGTGAACCACTGCACCCAGCCGACATGGGATTTTTAACAGTGATGTTTTTAAAGAATATATTGAATTCCCTACACAAGAGCAGTAGGAACCTAGTTCCCTTCAGTCACTCTTTGTATAGGATCCCAGAAACTCAGCATGAAATGTTTTATTATTTTTATCTACTCTACTTGATTAACTATCTTTCATTTTCTCCCACACAATTCAAGATGTGCCATGAGGAAAAGTTATTTTATAGTTTAGTACATAGTTGTCGATGTAATAATCTCTGTAGTTTTCAGATTGAATTCAGACATTTCCCCTCAATAGCTATTTTTGAATGAATGAGTGAAGGGATGAAATCACGGAATAGTCTTGTTTTCAAGATTCTAACTTGATATCCAAATTCACCTTTAGATATTATAAGAAAATTTCTATCAGAAAATCCTTATGTTTTTCTGATTAAAAAAAGCATTTTTCCATCAGCCTATGTATCTGCTATGAATTTACAAAATCTACTCAACAGCTCTGTTGATTTTTCTGTTCTTGGCTGAATGTTGCCTGAGGGATGGGAGCACGGGAAGGGTAAAAGCAATGGAACAAACATGTATTTTAATATTTTAAAAGTATGTTATATTGTTCGTTGGTGTTACAAGATGATTTGCATTACAAAAGGATTCTCTTACAAGTCCCTTATCTTAACACTAAAGTGCTAAGATATTTTATAAGTAAATCTTTATACTTATAAAACAAATCAGTAAAATAGAAGTAGCTAAGTAGAACTGATTTTGCTATAGAGTATAAGTCACTTAGTGTTGCTGTTTATTACTAAAAATAAGTTCTTTTCAGGGATGTGTTTGGCCAAATGGGAGAGTGGTTACAACACACGAGCTACAAACTACAATGCTGGAGACAGAAGCACTGATTATGGGATATTTCAGATCAATAGCCGCTACTGGTGTAATGATGGCAAAACCCCAGGAGCAGTTAATGCCTGTCATTTATCCTGCAGTGGTAAGACAAGCTAATATTTGACCAATCTGGTTATACTTACAAGAATTGAGACTCAATACAAATGAAAAAGCCTTGAAAGGTTCATGAGGGACCTAGAAAAACTACATCTCAACTTCCAGAAAGTCATTATTATTTTCCTCATAATTCCCTGAGTAAGAAATTAAAGAAGTGGTATCATAAAAGGTTGATGTTTTTTAATATACAGAAGTTTCTGGAATGACCTATTAATTTACTGTCAATGGCCTTACTGATGCTTTGTCCAGAACAATGCCATTGCTCCTGCTTACTTTGGGGAGGTTTTGGGATAATTTAGTTGTATGGTCCTTTTTCAATTGTTTTACTTTTTTTTTTATGAAATGTTCTAAATGTATAGAAAATTAGAGACATTAGTATAATAAACAGCCATATGCCCATTATGCACTTTAAAAGTTGTTAACATTTTGCCATAGTTGCTTCTTCTATGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGAGAGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGTTTTATTTTGAGACAGGGTCTCCCTGTCCCCAGGCTGTAGTGCAGTGGCACCATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAGTGATCATCCCACCACAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCATGCCTGGCAAATTTTTGAAATTTTTAGTACAGGCAAATTCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAGTTCAAGCAATCTTCCCACCTCAGCCTCCTTAAGTGCTGGAATTACAGGCGTTAGCCACTGTACCTGGCTACTGCTGAGAGACTTTTAAGTGAATTAGGAACATGATGATATTCCATTTCTAAATTCTTTAGTTTACATCTTCAAAAAATACAGTTCCTGTAGAATTATTATTGTAAATAACAAATTAACTTAAGGATTTATTTATTTGGAGTGAAACAAATATTTTACTGAACTCATAAAAATAGAAATACCATGTGGAATCCTCAGTGTCAAAAATATTGCAGAAATCTTGCAAAGTTGATATTATTAAATTGTTAAATATTAAAATTCCCAATAAAGAACATTAATCTTATTTCTAAAATCCAGTTAATTAAAAAAATTTATATTATATAATAATATTTGGTCATTAAATAAAAATTAGAAAATACAAATAAGAAAAATAACACCCATAATCTTACTACCCAGAGGTTTATAACCATGGGTAAATTCTGGTATATATTCTTCCAGAATGTATATCAATCATGTGTATGAATGTTAAATTATATCATACACATATAAACCCACATACAAACATGTAAATACTGTGTGCTTTTGCAAAAATTAAATTGTATTATACACACGGCTTTACAATTTGCTTCTTATCACACAAAATTATTTGCATGTCAGCAAATACAAATCGGTTTTTAATGATCTTTTGCTCCATTTTCCAGATGAGAAAAAAATACAAATCTGTATCATCATTTTAAAAGAATGACTAGAATTTTAATATATGAATATTCTATAATTTACTGATCCAATTGTTACTATTGAGCACTTAGGTTGTTTCCATTTTTCCCTCATAAATTGCTATGAATAGCTTTTTGTATACATCTTTGGGTGCATTTCTTATTTCTTTTGGATAAATTTTCAATAATAGAACTGCTGAGTAAAATATCACTAGGTGTTTTTTTACAGTGTCTAGTGCAAAGAAGACCTTTAATCATTTTGTTAATACTTCCAGAGCTTCCAATGACTTTGGTAAATGAAGAAAAAAATGCTTCATTTCATGCTGAATGGGAGAGAATGAAGAGAGTTTTCCCCAACAATTACACATATATGGACTCATAGAAAATAATATCTTACCATTCTTTCCACAGCCTAACAGAAAAAAGCTGGCTAAACCTAAATTTAAAATAAAATATCTATTAAAGTTTTTATTCCTTACCACCTGTCTTTCAGCTTTGCTGCAAGATAACATCGCTGATGCTGTAGCTTGTGCAAA
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Task1_train_18074
A sequence alteration has been identified in KCNC2 (potassium voltage-gated channel subfamily C member 2) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy 103
TTGGATTTTATCTAATAGGAAACTGCCTTTCACACGACTAATATGAATTCAAAATAAATGTGAAAATGAAGAAGCATGTGGATTATTGTCTTACAATTTTTGACGTTATCTATTTACTCTGAATAGGAATATTTAAAAATGGAACCTATTTAAGAAAATATCTTAAGTAAACTTTGGCTTTGTGGTTTTTTAAGAGACATGCTTTTATTAATTTCTGAAAGCATTGTGTCCAAAACTCTTAATAAAAATTATTCCAAAGCACACAAACTCCGTTTCCAGGTAGTCAATTTTGAAGCGGCAAGATATTTTTGAGCATGCAGTGGAACAAGGCCAACTTCTCCAAATGTCCTTGAAATAAGTATCTGTTTACTTCTGTATCCTTGCCAAAGACTTTCACCATCCTATTGGCCTAGATACTAGCTTGTTATTTCAATGTTTACCTGGGATGATAGTGTGTCCTCTTTTCCCATGCCCTTCTTAAAGGCTCTGCATAGATACTTGAGAATAGTTTGATGAGAGCAGCAACACCAACTAAACTCTACCTTTCATAAATACATTCTTAACAGTTGTTAGATATATATTAGAAGAATTTGCATAGCAATCTACTAAATAAGCATAAGGACTGTGAATGAAACTTACAAACACTTACAAACTTCAGCTCCAGCCACATTGTTTTTTCCATTTACCTCATTAAAATTTCTAGAAGCTAAGGAGGGACCTATGAAAATGATGCCTCCTTTTTTGTTAGTTTGCTTTGTTAGTTGATGTTACTTCTAAATTATGCAAAATCATTCACATAAAATCATCATAAGTCATTTTTCTGTAAGAAAAAATGAAATGAAATTTATCTAAGTTATGGGGAATCAATAAACCCTACATTTTCCTAGTAGGGTAAAAGCTAATTAAATTGTTTAATCTGCAAAATATTTTACCTGTACCAGACAGTAGACAAGAGGTGACATCACTATTACTTTGGCAGCTGAATGTCAATTTCTAGTCGATCAACTCTACATTGTCTATAGCAATGGGGAGGAGCAGAGATTCAACTAATCTCAAGCAGTAAATCATTCAAAATTCAGTTCTGAGAGAGAGCAGAACCCAACACATTGTACCTAAAAAGGAATTCCACTGAGAAATTCAACTTTGCCATTGAGTGGCCAAAGCAGATCATCTATTCCCTGAAAAATGGTGGGTTAATTATATTACATGGCATGGACCCTCATCAAAGGGGTTATAATGAGATACCCTACTTAATTTAAGAACAATGAAAATTTAATCAATCCTCCAGGATATTACTAGGGAAGAGCTTTGTTATCAAAAAGGTTATCTTCCATATCACCTGTTTGGAGTTTAGGCCTTTGAAATGTAAGCATCCATTCTTCTTAAATAACTGCTTCTTGTGAATTAGGTTGAGATGCATGGCACCATGTGGCAGAGGTAAAACTGAGACAAACACACCAAGCCAAACGATATGGAGATCAACATTTTGAGGATGAAAGATGAAAAATGGCCAATATCATACCATCACATCGTGCAGGGAAACAAAGAAACATTGGCACAAAAGCAACAAACAGGCAAAAGAAAATATTGGCACCATCAGCAAAGGGCATTCCCACTAAAGCAGGAAAACTCTATAGACCAGCTATGCCATCTCCTACTTGGGGTTCAATTAGAAAATGCTACAGTCTAGCTATCTACAAGCCTGACACAAACACACATTTCGTGAAAGGGTTAGGGCTGAAAACTCATGAACATTTGCAGAAAATGAGAATGACTGCCTTCTGCCTAAGGAACATACTGGTCTATAAAGTATTTAATAACATGCATTTGAAGTCCTGCCTTACCTGATCTGTTATGTTCCAGAAGTCGATTGTCTTTGCCCAGACATGTGTCACTCTGTGTACTATTGCAGGCCATATTTAATTCTGTCTTGCAAAAAGTAGGTGAGCTTGCCTGAGGAGCAGGAGGGATGTGCTTCTTTCTTTTCCTTGGAAGTTTCTGCTTTGCCATTGCCAAGGAGTAGTACATTCCAAAATTATTGACAATGACAGGCACTGGCATGGCTATTGTCAGCACTCCAGCCAGAGCACACAGGGCTCCCACCAGCATGCCTGACCATGTTTGGGGGTACATATCCCCATAACCCAGGGTAGTCATGGTCACTACAGCCCACCAGAACCCAATGGGAATGTTTTTGAACTGTGTGTGCTCACTAGCTGAAGGGTCGTTAGGTTGAGCTCCCACTCTCTCGGCATAGTAGATCATGGTAGCAAATATCAAAACTCCTAGAGCCAGGAAAATTATCAGCAGCAAAAATTCATTAGTACTAGCTCGAAGAGTATGTCCAAGCACCCTCAGACCTACAAAATGGCGGGTGAGCTTGAAAATTCTCAGGATCCTCACAAACCTTACCACCCTGAGGAAGCCAAGCACATCTTTAGCAGCTTTGGATGACAGCCCACTGAGTCCCACCTCTAAGTAGAAAGGTAGGATGGCCACAAAGTCAATGATATTCAAGAGATTTTTGATGAATTCAAGTTTATTGGGTGAAAAAACAATACGGACTAAAAATTCAAAAGTAAACCACACCACACACACTCCTTCTACATACGTCAAGGCAGGATCCGTTTCAATTTCATACTGTAGAACAACACTTGTGCCATTGATGACTGGTTCTGTCTTGTTTTTAACAATATTGAAAGCTTCATGTGTTTCCAGGCAAAAAGTTGTAATTGAAACCAGGATGAAGAATAAAGAAGCAAAAGCAATAAACTGTAGAGGAAAAAGAAATAAAAAAACCCATAGTGATCTGAATCGTAATATATGTTGATTCTAATCTAAAAGCAACAATCCCTGTAAATAAAAAAGAATAACAGCATATTTAGAGGTTTCACTTGGATATGACCTAAGGAAAAGAAGATACATGTATGTAACATTAATTAGAGTGTACAGGTAATGTATTTCAGGTTCTGTTTTCAGCTTATAGATACAAAGGTTTGCTTTATGTTGGAATATAATTTATTGAGATTTTTTTGTGTAAGAAAATATAACCTGTAAAGAGAACATGAAAATCACTGTAAAGGAATTGCAAATGAAAACACACCAAAACAAAAGAGAAATTTAGATGACAGTTTATGATCCTAGAAATCTTTATGCATATGATCAAGTTTTAAACCTTTAAATTTAAGGTGCATGACACAGTGATAGAAATTTGGAAGCTACCCAAATTTAACTGTAGATTTGTATTCATATATAAAATGTTCTGGATATCGTATGGTAACAGCATGAAAAAAAATCTTTGCAATATGTGCTGCCATGTAAATTACATCAACTTCAGGTGGAGACTTGTCCAAAAGTGCAAATTTAGGGAGGAAGAATAAATAAGACTGAAAGGAGAAAAACCCAGTAAAGGAGCAATTTAAATGAAAATGTCTTCCTCTCTTGAAAATGGATCTCAAAGTGTTCGAGTAACATACTATAAAGCTGAAAGAGTTTTCTTAAATTCAATTCATTTCTTCAGCCAATAATATATGACTACACACACACACCTACCACCAACACAGAATAATAAAAAAAGCACTCATATAGTTCTTAGTAGTACCATATACTGTTGAAAGTAATTTACATCATTAACTCACATCAATCCTCATAACAGCACTACTCCTACTCCATTTTACAGTTCAGGGATATCAGGACAGAAAGTTTAAGCTACTTTTCCATGGTCATAAACTACAAAATGATAAGCCTGAGTCACTAACTTGACAAATTTAGCTGCAGATTCTGTTCCCCTCACTTACCAAACTCTCAAATGCAGAATACAAATGTGTTGAAAACCATTTATTTATGCTGGGATCACATACTTCTTAATATTAAAGATCTGAAAACTTGAAATCCAGCTGTTTGAATGAATGGCACTGTTATAGTCAGCAGTGCTAGAGATCACTAGTAATCTGTGATAACACTCAGGTTTAGCATGCTAAATGAACACCAATAGGTTCTTCCTTAAATGTCTAAACAAAAGAGTCATTCAGGAGAAGGAAGTTGTCAGTCAAGCGGAGGGAGGTTCTTACTTGAAAATAATAGAATGTATCCAAAA
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Task1_train_18075
Here is a genetic alteration in KCNC2 (potassium voltage-gated channel subfamily C member 2) on Chromosome 12. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy 103
ACGTTATCTATTTACTCTGAATAGGAATATTTAAAAATGGAACCTATTTAAGAAAATATCTTAAGTAAACTTTGGCTTTGTGGTTTTTTAAGAGACATGCTTTTATTAATTTCTGAAAGCATTGTGTCCAAAACTCTTAATAAAAATTATTCCAAAGCACACAAACTCCGTTTCCAGGTAGTCAATTTTGAAGCGGCAAGATATTTTTGAGCATGCAGTGGAACAAGGCCAACTTCTCCAAATGTCCTTGAAATAAGTATCTGTTTACTTCTGTATCCTTGCCAAAGACTTTCACCATCCTATTGGCCTAGATACTAGCTTGTTATTTCAATGTTTACCTGGGATGATAGTGTGTCCTCTTTTCCCATGCCCTTCTTAAAGGCTCTGCATAGATACTTGAGAATAGTTTGATGAGAGCAGCAACACCAACTAAACTCTACCTTTCATAAATACATTCTTAACAGTTGTTAGATATATATTAGAAGAATTTGCATAGCAATCTACTAAATAAGCATAAGGACTGTGAATGAAACTTACAAACACTTACAAACTTCAGCTCCAGCCACATTGTTTTTTCCATTTACCTCATTAAAATTTCTAGAAGCTAAGGAGGGACCTATGAAAATGATGCCTCCTTTTTTGTTAGTTTGCTTTGTTAGTTGATGTTACTTCTAAATTATGCAAAATCATTCACATAAAATCATCATAAGTCATTTTTCTGTAAGAAAAAATGAAATGAAATTTATCTAAGTTATGGGGAATCAATAAACCCTACATTTTCCTAGTAGGGTAAAAGCTAATTAAATTGTTTAATCTGCAAAATATTTTACCTGTACCAGACAGTAGACAAGAGGTGACATCACTATTACTTTGGCAGCTGAATGTCAATTTCTAGTCGATCAACTCTACATTGTCTATAGCAATGGGGAGGAGCAGAGATTCAACTAATCTCAAGCAGTAAATCATTCAAAATTCAGTTCTGAGAGAGAGCAGAACCCAACACATTGTACCTAAAAAGGAATTCCACTGAGAAATTCAACTTTGCCATTGAGTGGCCAAAGCAGATCATCTATTCCCTGAAAAATGGTGGGTTAATTATATTACATGGCATGGACCCTCATCAAAGGGGTTATAATGAGATACCCTACTTAATTTAAGAACAATGAAAATTTAATCAATCCTCCAGGATATTACTAGGGAAGAGCTTTGTTATCAAAAAGGTTATCTTCCATATCACCTGTTTGGAGTTTAGGCCTTTGAAATGTAAGCATCCATTCTTCTTAAATAACTGCTTCTTGTGAATTAGGTTGAGATGCATGGCACCATGTGGCAGAGGTAAAACTGAGACAAACACACCAAGCCAAACGATATGGAGATCAACATTTTGAGGATGAAAGATGAAAAATGGCCAATATCATACCATCACATCGTGCAGGGAAACAAAGAAACATTGGCACAAAAGCAACAAACAGGCAAAAGAAAATATTGGCACCATCAGCAAAGGGCATTCCCACTAAAGCAGGAAAACTCTATAGACCAGCTATGCCATCTCCTACTTGGGGTTCAATTAGAAAATGCTACAGTCTAGCTATCTACAAGCCTGACACAAACACACATTTCGTGAAAGGGTTAGGGCTGAAAACTCATGAACATTTGCAGAAAATGAGAATGACTGCCTTCTGCCTAAGGAACATACTGGTCTATAAAGTATTTAATAACATGCATTTGAAGTCCTGCCTTACCTGATCTGTTATGTTCCAGAAGTCGATTGTCTTTGCCCAGACATGTGTCACTCTGTGTACTATTGCAGGCCATATTTAATTCTGTCTTGCAAAAAGTAGGTGAGCTTGCCTGAGGAGCAGGAGGGATGTGCTTCTTTCTTTTCCTTGGAAGTTTCTGCTTTGCCATTGCCAAGGAGTAGTACATTCCAAAATTATTGACAATGACAGGCACTGGCATGGCTATTGTCAGCACTCCAGCCAGAGCACACAGGGCTCCCACCAGCATGCCTGACCATGTTTGGGGGTACATATCCCCATAACCCAGGGTAGTCATGGTCACTACAGCCCACCAGAACCCAATGGGAATGTTTTTGAACTGTGTGTGCTCACTAGCTGAAGGGTCGTTAGGTTGAGCTCCCACTCTCTCGGCATAGTAGATCATGGTAGCAAATATCAAAACTCCTAGAGCCAGGAAAATTATCAGCAGCAAAAATTCATTAGTACTAGCTCGAAGAGTATGTCCAAGCACCCTCAGACCTACAAAATGGCGGGTGAGCTTGAAAATTCTCAGGATCCTCACAAACCTTACCACCCTGAGGAAGCCAAGCACATCTTTAGCAGCTTTGGATGACAGCCCACTGAGTCCCACCTCTAAGTAGAAAGGTAGGATGGCCACAAAGTCAATGATATTCAAGAGATTTTTGATGAATTCAAGTTTATTGGGTGAAAAAACAATACGGACTAAAAATTCAAAAGTAAACCACACCACACACACTCCTTCTACATACGTCAAGGCAGGATCCGTTTCAATTTCATACTGTAGAACAACACTTGTGCCATTGATGACTGGTTCTGTCTTGTTTTTAACAATATTGAAAGCTTCATGTGTTTCCAGGCAAAAAGTTGTAATTGAAACCAGGATGAAGAATAAAGAAGCAAAAGCAATAAACTGTAGAGGAAAAAGAAATAAAAAAACCCATAGTGATCTGAATCGTAATATATGTTGATTCTAATCTAAAAGCAACAATCCCTGTAAATAAAAAAGAATAACAGCATATTTAGAGGTTTCACTTGGATATGACCTAAGGAAAAGAAGATACATGTATGTAACATTAATTAGAGTGTACAGGTAATGTATTTCAGGTTCTGTTTTCAGCTTATAGATACAAAGGTTTGCTTTATGTTGGAATATAATTTATTGAGATTTTTTTGTGTAAGAAAATATAACCTGTAAAGAGAACATGAAAATCACTGTAAAGGAATTGCAAATGAAAACACACCAAAACAAAAGAGAAATTTAGATGACAGTTTATGATCCTAGAAATCTTTATGCATATGATCAAGTTTTAAACCTTTAAATTTAAGGTGCATGACACAGTGATAGAAATTTGGAAGCTACCCAAATTTAACTGTAGATTTGTATTCATATATAAAATGTTCTGGATATCGTATGGTAACAGCATGAAAAAAAATCTTTGCAATATGTGCTGCCATGTAAATTACATCAACTTCAGGTGGAGACTTGTCCAAAAGTGCAAATTTAGGGAGGAAGAATAAATAAGACTGAAAGGAGAAAAACCCAGTAAAGGAGCAATTTAAATGAAAATGTCTTCCTCTCTTGAAAATGGATCTCAAAGTGTTCGAGTAACATACTATAAAGCTGAAAGAGTTTTCTTAAATTCAATTCATTTCTTCAGCCAATAATATATGACTACACACACACACCTACCACCAACACAGAATAATAAAAAAAGCACTCATATAGTTCTTAGTAGTACCATATACTGTTGAAAGTAATTTACATCATTAACTCACATCAATCCTCATAACAGCACTACTCCTACTCCATTTTACAGTTCAGGGATATCAGGACAGAAAGTTTAAGCTACTTTTCCATGGTCATAAACTACAAAATGATAAGCCTGAGTCACTAACTTGACAAATTTAGCTGCAGATTCTGTTCCCCTCACTTACCAAACTCTCAAATGCAGAATACAAATGTGTTGAAAACCATTTATTTATGCTGGGATCACATACTTCTTAATATTAAAGATCTGAAAACTTGAAATCCAGCTGTTTGAATGAATGGCACTGTTATAGTCAGCAGTGCTAGAGATCACTAGTAATCTGTGATAACACTCAGGTTTAGCATGCTAAATGAACACCAATAGGTTCTTCCTTAAATGTCTAAACAAAAGAGTCATTCAGGAGAAGGAAGTTGTCAGTCAAGCGGAGGGAGGTTCTTACTTGAAAATAATAGAATGTATCCAAAATCCAAAGTTGCCCCTAATATCTAGTCCTCAAGCATGCCATTGGGAAGAGCTGAGACAGTTCAAGAAGAGATTGAAACCACCTCCCTTTTTACCTGGTTGAGT
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Task1_train_18076
Given a variant located on Chromosome 12 and affecting KCNC2 (potassium voltage-gated channel subfamily C member 2), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy 103
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Task1_train_18077
A variant was discovered in gene KCNC2 (potassium voltage-gated channel subfamily C member 2), Chromosome 12. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy 103
GCAATGATAAAAGTTGAACACCTTCTTAAAGTTTTTGCTATGCAATCTGGCCTACAATAAGATGTATTATGTTATCATAAGGAAAAATAGTAAAACATTATGTCCTTTTGTAGCACATGATCTGGAAAAAAAGAATCACATGATGGGCCTGAAAACAAATTCAGATTATCTTTTTAGCCACCAAGTGGAAAGAGCTCCATAACACTCAGCTGGAATCCAAAAAACACAGATGCACAGATGTAATGGTCATGAGCCTGTGGTTTAATTTAAATGAATATGCACTTGCGGTTTTGTTTGGTTGGTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGAATGCCAACTCTGTTGTTGAATTTATGGCATGGCCTGAAAAAAAAAAAAAAAGATTTCCAAGTTGAAGCTACTAATTCTATGTTCAAATATGTGTATGCAGGCATGTTAGAATTTATGTATGCATTTAAATACCAAGTCTAAAGGAGTAGCAATGCTTTAAATTGTCTCTTTCATATTCTATTTCACACTGAAAACAAAACACGTCCACAGACTTCCAAAGTGTTATCAGTAGCACATCTTCTGACAAATTAGTAGATAGCTGCATAACGTCTCAGATGCAGACACTTCTGACATACAGAGGAAGAAAATAATGAAGATAGAGCCAAAGTAAAGTTGGGAGAATTCCCATTCTGCCCATGGGGTGTCTTTTCTGGGTGTCGGAAGCAAACCAGACACATGCAGTTGCAAAGATTTAACTGAATACAGTACTTTGTTCTCATATATAATTAAAAACCATTCACATACTGTATAATTTTTGGTTATTTATATGTCTTTATTTCCTTTCAACCAGAGAAATCATTATTGGTTACTTTTATAATCTCTTCATGAGATTTTGAAGAATTAATTGGGAATGTCAAGGATTAAAGTTGAGCTGTCATTTAAACTAGAACCCGAAAAAGAACACTGAGGCTGAAATCACAATATTAAAAGTAAAATAAAGTTTGCTCCAATCTAAATTACTCAGATTTAGAGAACTAGGATCACCAAAGTGGTTAATGTATGTTCAACCTGTAAGGATCAGAGATACAGCCCTAAGCAAAAGGGACGAGGCTCAAAATTCTGTGTGTAAGTGGGCTCTCTGGTCAACTCACGGAAACAATCCTAGTATTCGTCTCCCTTGGAAAGTGACAGGCCCAAACAACGTTCTGGAGATTCTCTTCACAACATAAACCTCCAGGCAAACCTTTCCTCCCTCCACCTCCCCAGACACATAGATACATTCCATTTCCCCTTCCTCTGTCCTCAGATTCAACCCCCAATTGGAGCCACGGCTCTGGGTGAGTCAGATGTGAAGGGGGCCTCACTGAAAATGTCAAATAGGGATGACCAGGAGGCCAGAAGAGAGATCTGAGCTAAAGGAAAAGTTAGAACAAAGGAGTGAGGGAGAAACTCGAGATGAATCCTCATACCCGTTTCAGGACAGGGTCCAAAGACGTGCACAGAAAAGTCGACATTGGCCCTCTAGGTCCCATCTGCTAAAGCAAATCTGTTTGAGTTGGGAGAAGAGGAGGAGGAGAAAGATGGGACTGGGTAGGGATGGTGGCCGGGGTCCCTGGGTTTACCCTGCAAAGGATGAGCCTCTAACTGTATCGCTAGGAAATCCCGGGTCTCTTCTACCCCCCATGCCTGAGGCCCTGGGGTGGAAAAGAACAGAAAGTTGGGGAGGGAGTTGGGAGAAGTTGAAGCAGCAGGGAAGGGGTCGATTCTGGCCTTACCCTGGCGGCTCTGGACGAGTAGGGGTCTTCGAAGAGGGCCCACATGCGGGGCTGCAGCCTCCTCCAGCGGCCAGATTTGCCGTCGGGGCCCCCGAGCCCCGCCGCGTCCTCGATGCCCAGCCTCTTGGCCGCCAGGTCCTCGTCGTCGCCGGGGTCGCCGCCAATGAGGTCGGGGGTCTCGAAGATGTCCAGCGCCTCCTCGGCGTCGCGGTGCTGCCGGTAGGTCATCCAGCAGCAGGGCTCCACGTCGGTCTCGTCGATGCCCCAGAAGGCCAGCTCCTCCTCGAAGAGCGGCCCGCACACGTCTGCGGGGCAGTGCAGCTTGCCGGTGCGGTAGTAATTGAGCACATAGGCGAAGACGCCCGGGTGCCGGTCGAAGAAGAACTCGCGGCCGCCACCGGGATGGTCGCTGGCCCTGCCGCCGCGGGAACTGCAGTTGCCCGCGCCGCCCTCGAAGCAGCCGCCTGGCCCGGGGGACAGCGGGGGCGCTCTCGGCGGCGGCGACAGTGGAGGCGGCGACGGCTGCAGCTTGTCGCCCGCCGTGGTCAAGCAGTCGCCTGGGGGCTCGGAGGAGGCAAGAAGGGCCAGGCGTGTTCCAGGCAGGGTCTTGAGGGTGCTGCGGTAGGTTTCGTGCCGGGTGCCCCCGACATTGAGGATCACCCTCTCGTTGTTCTCGATCTTGCCCATCTCTGTGACTCAGACATGACTAGGGGGAGGCAAACACAGCGCCGAGTTAAAGATCTTAGCCGTCAAAGACACACCATGACCCCCACCACCAACCCAGAGCGAGTCCAGGGATGCAGAGTTGGCAGACAGGCACGGGGCAAAGACCCTCCCCGGGAGGGGATCAGCGTCCAGCGCTGTCCCCGCCTCTTGCATCAAACCTTTCCCAGGTTTCCAGAGAACTACAGAGATAGCAGTCCTAGTCTTTCTTGACCTTTCATGACACCGTTTTCCCTGCCTCCCGCTTTCCTTTCTTTTGGCTCTGATCTCTTCACCTTCATCTTTTCACCTTCCACTCTTCCTCTTTTCTGTTCCCACTCAAGTCCAACCTGCTCCCAGCCCCTAACCCCCTCTCTGCCTCCCCAAACACACTCTCTCTCCCTCTAAACCTACTTTCTCCCCCTCCTTTGCCCCATTCTCTCCTCCTCCCCTGGTTGGCCTCTCATTCCCACTCTCCAAGACCCTCCTCTTTCTCCCCTTCCCCTAGCTTGGATGCAATTCTCTTAGGCAGGGAGTTTTCCTCAGGCAACTTGGCAGTGTTGGGTGAGAGCACACCCTCCCCCCACCCTGTGAAGAGCCCGGATTCCACACCCACCCTAGGTCAACCCCGGACCCCTCTCTACTCCCTAGCGCTCAGGGAGTGCCTTCTGAGCAACCTGTTCTAGGATCACCTCTACACCTGCTCACAGACCAAGCAAAAAGACAACACAGAAGTCAGAGAAAAAAAAAATCTCTGCTGTTGCTTTTCACCTAGGAGACCTCTGACTTATTTCCTCATTCGATTTCCTTTTCACGTTATTATTATTATTGTTGTTGATATTATTATTACTTGGGAAAGGAAACAACTAACTAAGATCCATCTTTAAGAATAGAAGTGATCAATGCATCCCACCCATCCCCCTTCCCAAGAAAAACAAATCCCTTAGTGGGTGGAGGGTGGGGGATTTGCTTTCTAGGAGGGGCGAGGCTCGGGGAAAAGCTGCTTGGAGGCACACCCCCTGGGTCCCTGAGCTGAAAGTCTCGCTGACAGTGTCCCTGTTTCCAGCCTCCCAGCCACCTCTCCCCAGGGCTTCATCTCTACATTCCTATTGCGGAAAGGCGGAGCGGGGGGATGCTGGCCTGCAGGGTCAACATGCCCTTTCCAGGAAATCGCCCCTTTCACCACCCCCGCCCCCATTTCCAGATACCTTAACGAGACCGAGAGAAAAGTGGTTCTGCTTTGGTTTCCGAGTGGACGAGGTTCTCTGGGCAGCGGGACTGAGTCTTGGCGCCCAGGTGAGCCGCCCTTCTCCGACGAGAAACTACTTGTTGGCGTTTTCCGGATTCAGGTGGTTGAGCCGCTTCCCTGGGCGCTGGGGTGGGGGAGAAAGCCCCCGCCGGCCGCCGGCCGCGCTCCCCGCCTTCATTCTGTGATCTGCGGATTTGCCAGTCGCCAACCTCCGCGCCCAGAGTCACCATCGCGCAGGGTTGGGCAAACCATGGAGCTCGGGGCGGGTCCAGCCGGCACTGCCCGACCCCTCCGGGAGCGGGCAGATCGGCTGGCCGTGAATGGAGTGGAGACTGGCCGCAGGTCAGGAGAGCTCACCACTTGAAGGTGAAGTCGCCCTG
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Task1_train_18078
A genetic alteration is present in KCNC2 (potassium voltage-gated channel subfamily C member 2) on Chromosome 12. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy 103
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Task1_train_18079
Mutation context: Chromosome 12, Gene BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
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Task1_train_18080
This mutation occurs in BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10) on Chromosome 12. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome 10
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Task1_train_18081
This variant affects the gene BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10) found on Chromosome 12. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
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Task1_train_18082
The gene BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10) on Chromosome 12 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Retinal dystrophy
CTATGCACCAGATACAAGAAAAACCAGTAAATACATGACATATCCTTACAAGCTCTTGGGGTCAGGAGAAAATCAAAGTATTAATTGCATATCCTTTCTAGTATTAACCTTTTACTACAGAAATGAAAGAGTTAACAATGCACAGTTATATTTCAGGTAACATATATTCAAAGGTATATCAAAGGTGAAAATCTATCCAAGTTTTCCAAATGAAGTGGCAGTAAACCAATGACCACATAAAAGTAAAAATTAATTTTATGCTTTTTGAAAAAAAATTTGAGCCTTTTACTCACTGCTAATTTAATTTTATGCTTTTTGAAAAAAATAATTTGAGCCTTTTACTCAGCTTTACAAAGTATGAGTAGGGAAAATTAATGCAAATAATGTATTCAATATTAAAAACAATTAGAATAAGCCCACCCAAATCAGAGATTAAATGATTCTATGAACTAAACATGTAACGATGAAGGAGGGCTGGAGTGAAAAAGATACAGGAGAGTAAAAAGGAGCTATAAAGAAAAACCCTCCCCTAAACACATAGGCTAACACAGAGCTGAGACACAGAGGCATAAAATAGGGAAAAAACAGACACACTTAGCCAAATCTTGGCTTCCCCTCTAGATTTGTTCCATAAAGTAATTTAATATTTGTATCTGGTCTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGG
CTATGCACCAGATACAAGAAAAACCAGTAAATACATGACATATCCTTACAAGCTCTTGGGGTCAGGAGAAAATCAAAGTATTAATTGCATATCCTTTCTAGTATTAACCTTTTACTACAGAAATGAAAGAGTTAACAATGCACAGTTATATTTCAGGTAACATATATTCAAAGGTATATCAAAGGTGAAAATCTATCCAAGTTTTCCAAATGAAGTGGCAGTAAACCAATGACCACATAAAAGTAAAAATTAATTTTATGCTTTTTGAAAAAAAATTTGAGCCTTTTACTCACTGCTAATTTAATTTTATGCTTTTTGAAAAAAATAATTTGAGCCTTTTACTCAGCTTTACAAAGTATGAGTAGGGAAAATTAATGCAAATAATGTATTCAATATTAAAAACAATTAGAATAAGCCCACCCAAATCAGAGATTAAATGATTCTATGAACTAAACATGTAACGATGAAGGAGGGCTGGAGTGAAAAAGATACAGGAGAGTAAAAAGGAGCTATAAAGAAAAACCCTCCCCTAAACACATAGGCTAACACAGAGCTGAGACACAGAGGCATAAAATAGGGAAAAAACAGACACACTTAGCCAAATCTTGGCTTCCCCTCTAGATTTGTTCCATAAAGTAATTTAATATTTGTATCTGGTCTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGCTATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGG
Task1_train_18083
This variant impacts the gene BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
CTATGCACCAGATACAAGAAAAACCAGTAAATACATGACATATCCTTACAAGCTCTTGGGGTCAGGAGAAAATCAAAGTATTAATTGCATATCCTTTCTAGTATTAACCTTTTACTACAGAAATGAAAGAGTTAACAATGCACAGTTATATTTCAGGTAACATATATTCAAAGGTATATCAAAGGTGAAAATCTATCCAAGTTTTCCAAATGAAGTGGCAGTAAACCAATGACCACATAAAAGTAAAAATTAATTTTATGCTTTTTGAAAAAAAATTTGAGCCTTTTACTCACTGCTAATTTAATTTTATGCTTTTTGAAAAAAATAATTTGAGCCTTTTACTCAGCTTTACAAAGTATGAGTAGGGAAAATTAATGCAAATAATGTATTCAATATTAAAAACAATTAGAATAAGCCCACCCAAATCAGAGATTAAATGATTCTATGAACTAAACATGTAACGATGAAGGAGGGCTGGAGTGAAAAAGATACAGGAGAGTAAAAAGGAGCTATAAAGAAAAACCCTCCCCTAAACACATAGGCTAACACAGAGCTGAGACACAGAGGCATAAAATAGGGAAAAAACAGACACACTTAGCCAAATCTTGGCTTCCCCTCTAGATTTGTTCCATAAAGTAATTTAATATTTGTATCTGGTCTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGG
CTATGCACCAGATACAAGAAAAACCAGTAAATACATGACATATCCTTACAAGCTCTTGGGGTCAGGAGAAAATCAAAGTATTAATTGCATATCCTTTCTAGTATTAACCTTTTACTACAGAAATGAAAGAGTTAACAATGCACAGTTATATTTCAGGTAACATATATTCAAAGGTATATCAAAGGTGAAAATCTATCCAAGTTTTCCAAATGAAGTGGCAGTAAACCAATGACCACATAAAAGTAAAAATTAATTTTATGCTTTTTGAAAAAAAATTTGAGCCTTTTACTCACTGCTAATTTAATTTTATGCTTTTTGAAAAAAATAATTTGAGCCTTTTACTCAGCTTTACAAAGTATGAGTAGGGAAAATTAATGCAAATAATGTATTCAATATTAAAAACAATTAGAATAAGCCCACCCAAATCAGAGATTAAATGATTCTATGAACTAAACATGTAACGATGAAGGAGGGCTGGAGTGAAAAAGATACAGGAGAGTAAAAAGGAGCTATAAAGAAAAACCCTCCCCTAAACACATAGGCTAACACAGAGCTGAGACACAGAGGCATAAAATAGGGAAAAAACAGACACACTTAGCCAAATCTTGGCTTCCCCTCTAGATTTGTTCCATAAAGTAATTTAATATTTGTATCTGGTCTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGCTATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGG
Task1_train_18084
With a mutation on Chromosome 12 in gene BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
AAGTATGAGTAGGGAAAATTAATGCAAATAATGTATTCAATATTAAAAACAATTAGAATAAGCCCACCCAAATCAGAGATTAAATGATTCTATGAACTAAACATGTAACGATGAAGGAGGGCTGGAGTGAAAAAGATACAGGAGAGTAAAAAGGAGCTATAAAGAAAAACCCTCCCCTAAACACATAGGCTAACACAGAGCTGAGACACAGAGGCATAAAATAGGGAAAAAACAGACACACTTAGCCAAATCTTGGCTTCCCCTCTAGATTTGTTCCATAAAGTAATTTAATATTTGTATCTGGTCTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATT
AAGTATGAGTAGGGAAAATTAATGCAAATAATGTATTCAATATTAAAAACAATTAGAATAAGCCCACCCAAATCAGAGATTAAATGATTCTATGAACTAAACATGTAACGATGAAGGAGGGCTGGAGTGAAAAAGATACAGGAGAGTAAAAAGGAGCTATAAAGAAAAACCCTCCCCTAAACACATAGGCTAACACAGAGCTGAGACACAGAGGCATAAAATAGGGAAAAAACAGACACACTTAGCCAAATCTTGGCTTCCCCTCTAGATTTGTTCCATAAAGTAATTTAATATTTGTATCTGGTCTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCGACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATT
Task1_train_18085
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Retinal dystrophy
CTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATTTTTTTTGTTTTTTAAGAGATGAAGTTTCACTCTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCATAGCTTACTGCAGCTCCGCATTCCTGAGCTCGTGATCCTCCTGTCTTAGCCTTCAAGTCGCTTTGTGCCTCACTACGCCTGGTTATTTTCTCTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTTGAATTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCAACTTGGCCTTCCAAAGTTTTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCTGGCCTAAAACACAGGCACTTGAGAGCAT
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Task1_train_18086
Located on Chromosome 12, this mutation impacts BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome 10
CTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATTTTTTTTGTTTTTTAAGAGATGAAGTTTCACTCTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCATAGCTTACTGCAGCTCCGCATTCCTGAGCTCGTGATCCTCCTGTCTTAGCCTTCAAGTCGCTTTGTGCCTCACTACGCCTGGTTATTTTCTCTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTTGAATTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCAACTTGGCCTTCCAAAGTTTTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCTGGCCTAAAACACAGGCACTTGAGAGCAT
CTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGCCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATTTTTTTTGTTTTTTAAGAGATGAAGTTTCACTCTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCATAGCTTACTGCAGCTCCGCATTCCTGAGCTCGTGATCCTCCTGTCTTAGCCTTCAAGTCGCTTTGTGCCTCACTACGCCTGGTTATTTTCTCTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTTGAATTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCAACTTGGCCTTCCAAAGTTTTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCTGGCCTAAAACACAGGCACTTGAGAGCAT
Task1_train_18087
This gene mutation involves BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10) on Chromosome 12. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
CTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATTTTTTTTGTTTTTTAAGAGATGAAGTTTCACTCTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCATAGCTTACTGCAGCTCCGCATTCCTGAGCTCGTGATCCTCCTGTCTTAGCCTTCAAGTCGCTTTGTGCCTCACTACGCCTGGTTATTTTCTCTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTTGAATTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCAACTTGGCCTTCCAAAGTTTTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCTGGCCTAAAACACAGGCACTTGAGAGCAT
CTGGTGACCTTAGTGTGCTTCTTCTAAAGACTTTTAAAGTTACGCTATTTTCCTAAGTAGACTGAACTGACTTTAGAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGCCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATTTTTTTTGTTTTTTAAGAGATGAAGTTTCACTCTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCATAGCTTACTGCAGCTCCGCATTCCTGAGCTCGTGATCCTCCTGTCTTAGCCTTCAAGTCGCTTTGTGCCTCACTACGCCTGGTTATTTTCTCTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTTGAATTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCAACTTGGCCTTCCAAAGTTTTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCTGGCCTAAAACACAGGCACTTGAGAGCAT
Task1_train_18088
Gene BBS10 (Bardet-Biedl syndrome 10) on Chromosome 12 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
GAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATCCTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATTTTTTTTGTTTTTTAAGAGATGAAGTTTCACTCTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCATAGCTTACTGCAGCTCCGCATTCCTGAGCTCGTGATCCTCCTGTCTTAGCCTTCAAGTCGCTTTGTGCCTCACTACGCCTGGTTATTTTCTCTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTTGAATTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCAACTTGGCCTTCCAAAGTTTTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCTGGCCTAAAACACAGGCACTTGAGAGCATGGGCTTTGGATTCAGACCTGGATTTGCTCTGTCATTTCCTTACCTGTGGCATTCACCAAGTAACCTCTTTGATCT
GAACCAGTGGTCACATGACTGCTTTACTTGGCTTGAGTTAGATGAAAAGTTTGGTTAATTAAAAACTTCTGATGTTATAGTTCATCTTCTGAATCTTGATTGTGAACTTTCTGAGGGTGTCTCTTAACAGTGATTACCATGTCAATGGTTAATATTTTTGTCAAACACTGAAGAACTGAAGTTAGTAGCTGGTATTTACCCATTACTGATTCCAAACCTGTCTGACTGCTTACCAAGGGTTGATTGGTTTGCAGTGCATGGACAGCTCTTATATATGTATGTGGAAAGCTGTACTTTCCTGTTTTAGATTTATAAAGGACTTTGGGAATGCCTAAAAGTGCATTAGCTATTATCATACTAACCATGGTTTCTTCTGATTGATGGCATTTTTTGGCATAATTGAGAAGATAGTAATGTAACAAGATCTCAAAATTACCACCTACTGGCAAAACACAACCAGCTGGCATAGATGAGGAAAGGTAACTCTGGGAAGTACCCATATTCGGTAACTTACAGCTCACTGGTAACATGCTTCCCTTTCTAGTAATATTTGTGACCTGTAAATTTTCGTAAGAAATTTCTATTCTATTTCCCCTTGTTGAATAAGCAGTGGAATTGTTCTTGAGTAATGGTTCATAATAATCAGTTAGCCTGTTTCTTTCCAAAGACAAACATGTCAGCGTTTCAACTGTTTGGAATGTATCTGTTGGTGTCAGTGTGGGGGTTGAATACGGAATATATGTTTCTAATTCTACATCTGGAATTACCAAATTAGAATGTACTTTTAAATATGTTTGAGTTTTTTCCAATGCATCTTTGTTCTCTGCAACTGTGTCCTGATAAGGCCTTTGTATTGAGCCATTACCAGGATCTGGTGCTTGATAACTTTCTCCACTGTTCTTATAAATAAAAAGACTTGAAGTGCCATTTTGGTCATTGGTTTGTGTCATGTAATTTAGATCAAGGTCTTTAAATAATTGCCGAAGCATTTTAAGTGCTCCATGTAAAGCATCCTCATGTTGTTCAATGAGACCATGCACTGGTCCACAAAGAACTATAGAGTGTGGTATAAATGCACATGTGCTTATCAAGCCTAGATGAACATATCTTTTGGATCTAAGGATAAGAGGTTTACAAAATTTCACCAAAGCAGTGTTAGGTATTTCACACTGCGAAAAGGCCTGTGGTGGTACAAATGGAGAAAGACCAATGATCCTCCGGATAAGAGAAACTTCTTCTGATGATAAACACTCAACCACTGATATGCCATTCACCCCTGCATAATAACTAACTAAATCTGGTTGTTTCACACTAGATATGAGCAATTTTACATTCTGACTATGTAGATGTTTCATTATTGCTTTTGTCTTTTCCATAATCCAAAATTGAGATGTCTGAAACTGTGCTTCTGAATTTAGAATAAACTCTGATCCAGAAGTGGAAAAAAGAGGCTGAATGGTTTCTGTTACTATCACCATTCGCATGTCACCATCTGCTGGGCGGTACACAGAAAAATCTTTCTGAAGCACAAGACCAGCTATGATCCTGGAATCTGAAACAGGAAGGCCAGTGACACCAACATTCAACTCTACAAAATGGTCATCCACTAACTCAAATACACCAATCCCACTTTTACAAGTCATACACTTGAAAAAGTAGTCACACATCAACTGTGAAATAAATTTATGATTATTTCTTCCCACTCTTCCACAAAAGTATGCTTCTAAGAGCAACTCTAAAGAGCTCCTACACAATGTTCTCTCTTTAGCAGACGAAAAGATAGACAAAAAGTGTCTACTTAGGTACTGGTCCATAATACCGTCTAATATTTGTGTCTGAAACGTTAGGAGAGCCTGGGAAATAAATTTCCACCGAGAACAATTTTTCCAATGCCTTCCATGGGTTTGAATGTTTTCACACATCAAAGGATCCTTTTCTCTGTCTGTGATTGCATGAAGTCCTCTAAGCAAATGGCAAAGAAAGATAATAAATGTTTTTGCACCATCTCCTGTTTTTTTGAGATGACTGGAAACACAGTCCACTATCATACTGTACAAAAAAGAAATAAAGCAACTCATTTTCAGAAGGCTGGCTTCCCACATCTTAAAACCATGTTTACACAGCCATAAGCATAAAATGAGAATATTGTTCCTTGGATACATCCTTAGTTTTTTCCTTTCTTGGAAAAAACTCTGCTCTATTCCAAGATTCCACCGTTGGGTGGAGTGGGGAGAAGTGGTCTTGAGAATTGGTAAGATTTGGGGTGCAGGAGTGTTCCCTTGGGCAGGGCTCTAATTCCGAGCATACAGCGGTTTCACCCGAGGTCAGTCTTTCTAAGTACGCATCGCCTCAGGATGGGACAAGAGCTCCACAGAGGCTGCCTGGGGTGCCCGGCTACGGGTTAGCGTGTGGGACGCGGGTACCTGGCTATGGGATGCTCTAAGTGTAGCGCCTCCAGGAGGCGGCCTCCATTCCGGCTGAGAAGCACCTCGCCAGTGGGCTTCGTACACAAAACTTGCCGTCCCTCGGGCCCCACGCAGCAGCTCACGATGGCTTCCAGCACCTCGGCCACCTGCAACGCCGCCTTCACAGACCCTGCAGCGGCCATAGAACTTAACATATCTGGGCCGCTTCCCCTTTTTGACCAGCTTGCAGAACACCCGGGCCGACCGAAAACAGGGGTGGGAACGGCCGGAAACGGAATAGGCGGGGAGAAAACCCGGAAGCCAGGAGTCGAAGCCGGGGTAGCACGGCTTCTTGGTTGGGCGAGAGGGCTGCCCTTCTGTCCGCCTGGTGGAAAAGCCCTGCAGCTTTGCCAGGTGGGGTGAGCTGGCCCGTTGTACGCGAAGGCAGAAAAAACAGACTAGGATTTCCAGCAGCTGTGCCTGGAGCGGCAACCCTAAGCCCCTCCCCGGCTCCCTAGGTGAATTCATCTCCCTCCAGTGGCGTCCGCTGCCCCCAAATCCCTTAGTCTCCCGAGAAACTTTCTTCCTAAGTCAACACGGTAGTGGGGCCTGCGTGAAGGAGAGGGCACCCCGGTTGGAACTCTGCTGGCTTTCATCCCCTGCCAGAAGCTGCTTTTTCCGGGGCAAAACCTCTGCCTTGGATTCACGCATGTTCCTGTCCACATTCCCCACGAGTTGCTCTCCTTACCATAACGGAAATAATTTGTAGATGCAGGACAGGTGAGGAGAGCCTGGCCACAGCCATGAATTGCAGGCTTTATGTCTGCTGCAGAGGCTTTACCACATTTCCTAGACTCAGGTATCACAATAAAACTCTAGACACCACAAATATATTAAGCAGAAATGATGCGAAGTCTCTATTTTTTGAGATGGACTCCCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTGACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGCTCAAGCGATTCCCGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACTGTGCCCCGCCAATATTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGATGTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCATGACCTGAATGATCCACCTGCCACGGCCTTTCAGAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCGCTGTGCAGATTTAAATCCATTAATCACGTCGGTGATCAACAGTATGCTTTAAAACACATGGCCAAGGATTATTGTATATAACCCAAAGACAGAAAATACTGTCTCTTATAACATTTTTTTTGTTTTTTAAGAGATGAAGTTTCACTCTGCCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCATAGCTTACTGCAGCTCCGCATTCCTGAGCTCGTGATCCTCCTGTCTTAGCCTTCAAGTCGCTTTGTGCCTCACTACGCCTGGTTATTTTCTCTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGATCTTGAATTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCAACTTGGCCTTCCAAAGTTTTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCTGGCCTAAAACACAGGCACTTGAGAGCATGGGCTTTGGATTCAGACCTGGATTTGCTCTGTCATTTCCTTACCTGTGGCATTCACCAAGTAACCTCTTTGATCT
Task1_train_18089
An alteration has been detected in SYT1 (synaptotagmin 1) on Chromosome 12. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Syndromic intellectual disability
TTTTTTAATTCCACAAAATAAATATAAAGCAAGGCATTGAGATGAAAACTCCCATTGAGCTACAATTCTATGCCTTTAAAATAAATATCCTTTTCAACTACAAACTGCAGAAAATGCAGGTATATTGAAAGTGAAGCACATTAAAAATAAGACACATGCTAGGTTTCTGGGGCAGCATTTCAGAGGCAATAGCGTTTTGTCAGGACAGACAGAAACTATGCCCAATATAGAATACATTAGACATGGAAATAATGAGCATTCCTTTGACTGTATCCCTCTTTCTCTGCTCCTTGAGTCACTTTGTTCTTTTTTTTTTCCTTTTTTTATAGGAGGCAACTTTTCTAGTCTTCACCTTTTTCTAGAAAAAAATAATTGAGTATTTCACATGCTAAAATAGGGTCTTAAGTTTGCCTTATCCTGAGGTTATAAGACAATCTGCCTGTCCTTCTGTCTTTCTCTATCCCTATGAAATGTATTATGAAAGAAGCAAAATATGCTAATTTCCAAATGCATGTGAGAATGTAAGCCCTTCTCCCCCAAATGTAGAAATAAACTACATATGCAGCTGGAAACATTAATCCAAAGGCTTCACAAGGATATTTTGTCTTGAATGCTACTAATCAATGCATTCCTAAGTGGAATAATCAAACTCTAAAAACTTCTGTTACCTTTGTGTGTCATGTCCCCCACCCCATTCATTACAATATGATTGCTTCCTGATAAATTTGCTTAGAACAAGCTCTAAGAATCAGTATAGCCCTCTTCTTTGTTCCAGAAACTATCCAGTGGATAGTTAATTCCTTTCACAATGGAATCACTCCAAGGGAAGATTGTCCGTTTTATTGACAATGTGTTGCATTTCACATTCTAAATTCCACTTGCAGAAGTGATTGTTTTCTCTGCTCTGAAGCTGTATATCAATGACATTTCTCATTTCATTAATATAATAAACCAGTCTCCAGCATATAAAGTCCACTAAAGGGCCCTAACTCAGCTGGTTCTTAATCTGGCCCTAGCTTTTATAATTACATTTTCTGCTACTTTCAACTCTGGCAATAAATGTTACATATTCCATTTATTTTAAACTCTTACCTTTACACTCAGCTGCTAGATTGAAACCATCACATATTCTGCTAAGTAAATTCATTACTTAGGAAGTAGAACTGAAATTTGCTTTTAAAAAGTATATATTTTATACCATAATGGTATAGGTTTGCTTTCATCAGTTCAATCATTCAGAAAAGGAAGTCATCAAATAAACTTTCAAAATCTGATGGAATCATTGAATAAATCCCGTGTAGCCTAAACTGATATTTCCATTTGATATCAATGCCAGATACATTGTAGTTACTCAGTAAATGTTTACTAAGAGAACGTATGGATGAGAAAAAAATATCTTTATTACTACTTTTTAACCATACTTTTCACTATACTATCATGTTTTATGCTCACAATCATATGATTAGTTGAAATTCTATATTAATTCTATATTAATTTTTTTGTAACATGCTGTCCCCCCACCCTTAAAATCAGATTATTGCACATGGTTGCCTTGGGAATTGTAATCAAATAGAGTGGGCTGAACACCAATGCCAGAACTTTCACTGATAAGACAACTGAAGCAAATGAATTTAGAGGTTAGCACAAGTTGACACAGACTCCATGGCATGGAGGTTCACAGCATAGGCTCTGAAAACCAAACAACTCATTCCTTAAACAACCTCAGACAGGTTATATAACTTCTCAGAGCTTCAAGCATCCTTACCTGTATAATGGCAATATTAATAGGATCTATTATGAGAAGTAACTGAGTTCATTCATGTAAAAGACTTAGTGCAAAGTATATAATAAAAATTAACGTTTGAGTATTAAGATTCAAGTCATTTTCATCCTCATCCTAGTGCTTGGAGATTGATTCTTCTATTTCCAATTCTTTAGCGCTCAAGGACGCTTTATAGTCGGGCCTTATCTCTAGAGCTAGATGATTCATATTCATTTCATGGCTTCTTTCAGAAAGTGCAGGTGGTGGTAACTGTTTTGGACTATGACAAGATTGGCAAGAACGATGCCATCGGCAAAGTCTTTGTGGGCTACAACAGCACCGGCGCGGAGCTGCGACACTGGTCAGACATGCTGGCCAACCCCAGGCGACCTATTGCCCAGTGGCACACCCTGCAGGTAGAGGAGGAAGTTGATGCCATGCTGGCCGTCAAGAAGTAAAGGAAAGAAGAAGCCTTTCTGCATTTGCCCATATAGTGCTCTTTAGCCAGTATCTGTAAATACCTCAGTAATATGGGTCCTTTCATTTTTCCAGCCATGCATTCCTAACACAATTCAGTGGTACTTGGAATCCTGTTTTAATTTGCACAAATTTAAATGTAGAGAGCCCCTAAGTCCTTCATCATACCACTGCCCTCCAAATCTACTCTTCTTTTAAGCAATATGATGTGTAGATAGAGCATGAATGAAATTATTTATTGTATCACACTGTTGTATATACCAGTATGCTAAAGATTTATTTCTAGTTTGTGTATTTGTATGTTGTAAGCGTTTCCTAATCTGTGTATATCTAGATGTTTTTAATAAGATGTTCTATTTTAAACTATGTAAATTGACTGAGATATAGGAGAGCTGATAATATATTATACGGTAAATATAGTATCGTCTGCATTCCAGCAAAAATATCAACTCGTAAGGCACTAGTACAGTTAAACTGACATCTTAAAGGACAACTTAAACCTGAGCTTTCTATTGAATCATTTGAGTACCAAGATAAACTTACACCACATACTTGGTGGGTGAATCCAATTTTGTAGAATTCCTACACAGGCAAAATAGCATGATCTGAGCAGCAGCATCCAGGCTGACCTCAAGGAAGCATAGCCACAAAACAGAATAGCACCTGTCTGTACATATTTACAAAGCTAAAATAATGGCTTCACTCTTATATTTGAGGAAGCAACTGAACAGGAGTCAATGATTTCATATTACTGCATATAGAATAACAACAAGGTGTTCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACATTTGTTTGGGGATGGGGGAGAAGAAGCTAAGGGGAGAAGTCAACATTTATGAAATATTGCCTGACTATTTAAAAAGAAAAAAGTAGCTCTCCATTATCACCTTTATACAAAATGTACATCCTGTGAATTCTGTTCCAGATTTCACACCTACAATAATTCCAAAAGGTTTGCACATTAGAGTTTGTAACAAAATATTTTATTATATAAAACCAGGTTAGAAGGAATGCAGGATATTTTTAACACAACAATCTGTGCTTATTACACAAAATTACTTTGTGGTAAACAGACAGTATTGTAATCCCATCAAAAGATGAAAGAAAAACAAAAACAAAAACCAACAACAATTAGCCATAGTTCTGAATGCACTTCAATTAAGCCAAAACAGACAGCTAGTGATCTTTTTATATGCTCTTTTTACTTAAGTTTTAATTTGTCCTTTAAAAAAAGGTGAAACAAACCAAGAACAAGTTCTAGAAAACTGAAGCAACCTCTTATGTATACTAGATGCTTGATTTAGGAGGAGTTTTTAAACGTTTTCAATGTTATTATGTAGTAAATGACACTATTATGAAGCTACTAGTCATTCCATAAGAGTCTTAAAGGACTGCTCTGTGTAACACTGTGACTGCCGTGTGTGCTTAGACCCGTAGTTTCCTCAGTGGATAGCACTCAATTTATTCCGTAGTGATATTGTAACAATACTGCCATTCCCTTCTACTGCACTGCCCAAGGTGTGTGTAGCACAAACAGTTCTCATTACAAAGGACCAATTCAGAACTGAAAAGCTATGCATAGGACAAGGAAGATACATAGAATGGGGTGGAACACAGCATTTTGTCAAGCACTGTGCAATATTCCATATTTTTCCCCACTATGGTAGACAACCATTTCGTGGAAGGGCAGCCTATTATCCCACACTGCATCTAGCCTTTTGTCCCATTCACTTCTGTGATCCATTTTAATTTCCAGGCCACAAGACAGTAGTGATGCTCTGAAATGAAAGTTTGTCTTCACAAATATCAAAACAAAATGGAGGAA
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Task1_train_18090
A variant affecting Chromosome 12, within the gene PTPRQ (protein tyrosine phosphatase receptor type Q), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 84A
ATGAGGTTAATGGGAATAATTTCCCCTAATTCTAGCTTCATATTGGTTTCAAGCCAACTCAAATAGAACTCAGATTATTATTATTATTACTCTATATAATTAATAATTGATAGAAAAGCATAATGAAATTCTGAAGTAAGTTGATTTTGAAAATGTAAAATACAATAATTACAACCAATTGCAGGGTATCCACTTGATATTAGGCACTAGACATTTATAAACATTCCAGAAATCTGCTTTTTGGTGAAAATGGTTGTATAATTGATTCAGTTTGCTATGTTTTTCATATCTAATGAAACTACATATTCCAAAATAGTTAAGGAAATAAGAAATTTATCCCAACTTGTTTGTATATTCACAACTATTGATTGAATTTTTTTCATACTTATTTGAAACGTTTCATCAATGCATGTATTAGCCCAGTTATCCTAAAGTAAAGTTGACTTGCCCCAACTCCAGTTTTTTATTTTAGGCAAAGTTCAGTTAAATACATTTATAAAAATCTTACACAAATAGATTTTATGCAGTGTATTATATATTTAATTTCATGTACCATGAAATTATATAAATGCAATTCTAAGTTTTATAACAAAGTTTTTTCCTTCCCAATCTTTCTCTTCCCCAGCTCCAGGAAAAGTGGTGAATCTCACAGTTGAGGCCTACAACGCTTCAGCAGTTAAGCTGATTTGGTATTTACCTCGGCAACCAAATGGCAAAATTACCAGCTTCAAGATTAGTGTCAAGCATGCCAGAAGTGGGATAGTAGTGAAAGATGTCTCAATCAGAGTAGAGGACATTTTGACTGGGAAATTGCCAGAATGCAATGTAAGTATCACAGAACACTTTCTATGTCTTGAAAAATCTTAGATAAATTTAATTTTCATATTTCTAGCATCTAGATACTATATTTTTACCAAAGTTTTATTAGTTATTTGATTACTTATGGTATCATGTTATACACAACGTTTTATTATTTGATTACTTAGGGTATCATGTAACACAATTGGCCTCATTCAGGTAGAATACAGGAATGGTTTGAGAATTCAAGAGTGAGGGATTAAAATCATTTAGGGAATTCTGAAAAGACTTCATCAAAGGAGTAGCATTTGTGATACACCATGGAGCAAGGACAGATAGAGATTTTGTGATGGTGGCATTCCCGGTGGAGGATACTTTATAAAGCCCTGAGGTGGAAAAGTGTAAGATATAATTGGAGAAAATATTTTACTTCCATATGACAGGAGGGAAGAGTACATGTAGGGTAATAGTTGAGGTTAAATTTGCAGAGGTAGACTGTCATTGTTGTGCATATCTTTGGTAAAGAATTTGTCGTTACTCTGGTCATTGATGATAAACCTCATAATAGTAATGCTTTATTATAGAATAAGCATCGTCATTTTAATTATATGATAAGCATAATAATGCTTTTCCTAAAATCATTTTGGTAATCTCTGTGTTACTATTAATGCAAACACAGTCAAACAGTTATTTTTGCTGTAAATACTTTATAAAAGTCTAAAAATCTTCTTTTTCAACTTATGATATAGTTCTAATACACGCACACACCTAACGTGTGAGCTAGTGGCATACTACTACTTTTTAGTACTTATGAGAAAAAAAAGTTCATTAACAGTAAGAAAGCAGCATTTGAACATACACAAGAGTAAAATTATTTCAGCTCTTTGGCTCTTGCACTGTTAACATGAAGCTTAAAAATTCTTACAGATGATTGTGCTGTAGTTTTACCTTTATTTTAAGCCACTTGAAATTCTATTCGTAAAGGTTAAGGTATAAGGAATACAATAAATATGTCCTCTTCTAAAACTGCAGACATAAATGGGTACAATTAAAATCTAGCAAATTTGTCTATAACTTTTGCATGTTATGTGTGTATGTATAGCATAAAAGAAAAAGAAATGAATTACATGTTCTTATTCTTATGTTCACCAAGAGATACAACATTATTTCTCTATTGATCTTATTTTATTTACTAGGAGAATAGTGAATCTTTTTTATGGAGTACAGCCAGCCCTTCTCCAACCCTTGGTAGAGTTACACCTCCATCGCGTACCACACATTCATCAAGCACGTTGACACAGAATGAGATCAGCTCTGTGTGGAAAGAGCCTATCAGTTTTGTAGTGACACACTTGAGACCTTATACAACATATCTTTTTGAAGTTTCAGCTGCTACAACTGAAGCAGGTTATATTGATAGTACGATTGTCAGAACACCAGAATCAGGTATGGTTCACTTTTTGTAGATAAAAAGATTTAAATGATTAGAGAATAATGTTTAATTTATGTAGATATTTAATTTTAATCTTCTTTACCTTTCAGTAACTTTTTTCCCCTAATAATATACCATAGGCATCCCATCAAGGGTTTCTTCGAATTTCTATACTCTTTTATATTATAGCACAAAATAAGTATTTGAAAGGAGAAAGATTTGCAAAAAACAATTCTTGAGCCACTGACCGTGATCCTCATATAGCTTTTATCATTTTATAATGTCAGCAATTTTTAGTAATCATCTTTGCCGTTCTAAATGATTTATAATCATTTACACCCTTCTCTCACTGTTATTGCCATCATCAAAAGCAGAAATACCTGCACTAGCAGAACGAGCATGTGATCAACATTTAGTTATCAGATACAAGCAGTAGCTAAAATATATACCTACTTATATCCCATTTGCACTGCAGTTTCCTCATCTGAAAAATAGAGACAGTAATAGTACCTTCCTTAGGGTGCCAGTGTTAAAATTAAATGAGAATAATTAGATATTATCATTACTACTGAATTTTATGAGAACATATTTTTGGTAAGGTATTCATATATTTAATTATGGTACTATATCAGTATTCATGTAAATACATGTATTTATGTATTTCATATATTTATAAAATTTAAGGGATATTGATATAGTCCCACATTACATAAGGTATTTATTATATATATAATATATATAGCTGACAGATATATCATAATATAGTATCAGGCATTAGGTTGTAATTGCTAATTTCTGAGGTATTGAAAATTATTGGTAGGGTAATTTCACTAAAGCATGTTTTTTCTGATAAAATAGCTGTTGGCTTCTATTATTTTTCATTTCATATAAGTTTGAAGTTTTTTTGTTCATTTAAATAACCATCTTTGAATTATACCATTTTCTTCTTACATACTCCTTACTTTTTATACAATAAAAAAATGATTTCGGGGGGAGCCAAGATGGCCGAATAGGAACAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCATGAGCGATGCAGAAGACGGGTGATTTCCGCATTTTCATCTAAGGTACCCGTTCGTCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGGATGCAGGTCAGTGCGTGCAGTGCGCCGTGAGAGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCACTTGGGGAGCACAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCTAGTCAAAGAAAGGGGTGACAGATGGCACCTGGAAAATCCAGTCACTCCCACCCGAATACTGCGCTTTTCCGACAGGCTTAAAAAACGGCACACCAGGAGATTATATCCTGCACATGGCTCAGGGGGTCCTACCCCCACGGAGTCTGCCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACTGCAAGGTGGCAGCGAGGCTGGGTGAGGGGCACCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCCTGGAAGCTCCAACTGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGGGGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAATGTCCCTGTCTGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACACAGCTGGAGATCTGAGAACGGGCAGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCGCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCACCCCCCAGTAGAGGCAGACTGACACCTCACAAGGCCGGGTACTCCTCTGAGACAAAACTTCCAGAGGAATGATCAGACAGCAGCATTTGCGGTTCACGAAAATCCACTGTTCTGCAGCCACCGCTGCTGGTACCCAGGCTAAC
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Task1_train_18091
A variant was discovered in gene MYF5 (myogenic factor 5), Chromosome 12. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Ophthalmoplegia, external, with rib and vertebral anomalies
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Task1_train_18092
A variant on Chromosome 12 in gene MYF5 (myogenic factor 5) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; External ophthalmoplegia
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Here is a mutation in MYF5 (myogenic factor 5) on Chromosome 12. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Abnormal rib morphology
GTTTTCAAGGTCTTCACTTTAGAGAGATCGCACCCTGAAAAGGTTGCTACTTCTCTGGCCCCTGAAGATGCTGGATCAATGAACCAGTGTTGCTTTAAGAAAATAATTCTGAAAAAAAAGTACAAAGTACCATTCACTGAAAGAAATAATAATAATAATAGGAAGGAAAACTCCCTCCTCCTCGCAATAACTTCGGAGCCACTATATTTATTGAACTGGGTTACCCTAGATTGAGTTGAGAACACTCCTGCTTCTTTCAACGGGGCCACAAGACCTAGTCCAAAACCCCAAGACTAATTGTGTAGACCTTAAGTAATTGCTTTTCCTAAATATAAACAGCACCTCCCCAACCCAAATAACCTGAAAGTGGATTAAGGTTGGAGGAGGATTGGTAAAAGCTGATTAATAGATTCATTCCCACTTAAATGACAACCCTCCCCTCTTGCCTTCTATCCATCGAAGTTCTAAAGACCCTGCTGTGATTGCTTTTCTGGAAGGCTTTTGTCACTGAAGTGTGTGAAGTTACTCCTGGTTTGAGGAGTTGGAAATTTTACACGAGTCAAGGATTGCAGTGGCGGCAGCTGGGACGCATCTGTAACGGTGTTAGTTTGCCTGAAAGCAGAAAATTAGCAACCCCAAAGCCCAGCTTGGCTGTTTAGTCTGTAGAAATGACAGGGCGGAGCAGAAAGAGAGGGAGAAAGGAGACTCACCCCTGGAAAGGGAGTTTGCCGTCGAAAACTGGGCTTCTTCTGTTGGAAATCTTAGAGACACTTTCAGTGCAGGTCTTTGGCCTGCTCAGGATCTAGGGAAGGCCTGGCACAAAGGAGAAGGTGCTCAACAAATACGTACAGAAGGGGAAAATGAAGGAAGCAAGAACGGGAGGAATGTTCCTGGTCACCTGGCCCTCCTGTGCCCCACCTCCTTTTAGATGAGCAGACATACAGGGAGAACTCAGAGCAAGCCCAGTCATGGGAAAAGGAACCTCCCTCCCTACTCTCAATAAGGTAGAGCCTAGAATAAATGACAATCTGAGCAAAACTTTACTCATCTGAAGCTATACAAAATAGATTTGGAAAGGCAAACCCTGTATTCACTCCAAGATTGAAAATGCCACTTCAAGTTTTTAGTAACCGTTATTCAATCCAATTGCTGGAAAAAGTTTTCGAGATAATTGAAGTTCATGAAAAAGAGAAACAAACACCCCCAAATCAGGTGATTCCTCACGCCCAGGATTGGGAGGGCAGGTCGGCTCTTGGTGCCAGCTGAAAGGGATTTCTATTTATTACCACTATTTTAAAATGTGTGTCCAATTGCAAAAAGTTGGACTGCCTTGGTCACTTTTGTGTGAAACACTCCTTAAGTGATCCCTTGTTTTAGCCTATCTAGAGAGTGCAAATGAGCAGGTTGGGGACCCACTGCCGCCCCAGCAGAAATACAGTAAAACCATTAGCGTCAAAAGGGGCAGTACACAGCAGATTGTCTGTAGAGGAAAGGCGGAGGTTTGTCCAGACAGCCCCCGCGGGGGTTGCGGTGGGATATGCTAATAGTGCCTGGCCACTGGGGCCGGCCTCCCTCCCGAAAGAATATATAAAGAACCCCAACCCCAGCTTGTCTACCCAGGCCAACAGGCGTCTGCCCTTGTTAATTACCGGAGCGACAGACTAGGGAGCTCCGCCCGGGATTTGCCCATCGGCGGAGGCGCCAGGCTCCCGTTTCTCCCCATCCCTCTCGCTGCCGTCCAGGTGCACCGCCTGCCTCTCAGCAGGATGGACGTGATGGATGGCTGCCAGTTCTCACCTTCTGAGTACTTCTACGACGGCTCCTGCATACCGTCCCCCGAGGGTGAATTTGGGGACGAGTTTGTGCCGCGAGTGGCTGCCTTCGGAGCGCACAAAGCAGAGCTGCAGGGCTCAGATGAGGACGAGCACGTGCGAGCGCCTACCGGCCACCACCAGGCTGGTCACTGCCTCATGTGGGCCTGCAAAGCCTGCAAGAGGAAGTCCACCACCATGGATCGGCGGAAGGCAGCCACTATGCGCGAGCGGAGGCGCCTGAAGAAGGTCAACCAGGCTTTCGAAACCCTCAAGAGGTGTACCACGACCAACCCCAACCAGAGGCTGCCCAAGGTGGAGATCCTCAGGAATGCCATCCGCTACATCGAGAGCCTGCAGGAGTTGCTGAGAGAGCAGGTGGAGAACTACTATAGCCTGCCGGGACAGAGCTGCTCGGAGCCCACCAGCCCCACCTCCAACTGCTCTGATGGCATGGTAAGCAATAGATCTGGTACCTGCTAGGCTACCCTAATCTTTTCTAAAGTCCTTACACCTCATTTAACCTGGTGTGGTGGGGAGAGTGGGGTGGAGGCAGATGCTGAGTTGCTTTAAAAGAAGAGAGGGGTCCACATTTAGAAAGACTCCCCAAACCGCTGCTGAACAAGATTTTAGTTTAACTTTCTAGCAGGTTCTAGGTGTACACTGTAATCGAGTGTTGACATGGAAGATGGGTGGCTGTGAATGATCACTCAGATGTTTTCTCCATTCCTGAATTTATTTTCAAAATATGCCATCTGTGGATCATGCCCTACGCTAATATCTAAAGGCACCGTTTCTAACTTAATGAGGAAATGGAAAGAAATACCCACACGGCCCCAGTTCCTGCTCCAATGAGGCCTGGCTGAAAGATGTTGATGCATTCTTTTTAGAGGGCGTTTGCTCCAAGGCTGCCAGGTTTTAATGTGTTTTTGCCCTGGGAAAGTGTTCTTTCCCTGAATTAGTGTGGCTTTCTTCTACTCCAATCCATTTTGCATGGTTAACCCAATGCACATTGCTGCTGAATTCCACCCCCTCTTCCCTTTGCTGCTGCTCTCCTCTTCTTCAAGCACAGAGATTGACCTCAGTGCCCTGGGAATTTGGAGAGGGCTAGCCCTTCCTAAATCAAGGCAGTGAAGGTGATTGACAGTGTTCGGTTACAGAGCTGGTGGGCAAGCACAGCCTCACCTTTGGTCAGAACATCTTTTGCCAAGACCTGAAAACAAACTTTGTTGTGTGTCTTGTATTATAGCCCGAATGTAACAGTCCTGTCTGGTCCAGAAAGAGCAGTACTTTTGACAGCATCTACTGTCCTGATGTATCAAATGGTAAGAATTGATAACTTCACAGGAGTTTAAAGACCAGTTCAACCTAACAATTCAGCCTATAAGATTCTGTTCTTGCTGATAGTATTGGGGAAGGGAGAATGGAAGTGATGGTTCTTATAGGGAGGCTTTGGTAAAGCAAAATAAACACATCTTCTGCTCCAAATCCCCCTAGCAGACACGCACGCACACATGCATACACACATGCACACACAATGTTGCTTGAAATATTATCAGGGGGCTTCCCCACTCCCCACGTCTACCCCTCAGGAATTGCCAGATATTTGTTGCAAATTTCTATGTTAGGCTTTCTGTGACCACCTGACCTCTGGGTGTCAGAGGAGCTGACCTACAATTTAAGGAGCAACATAAGCAAATCTGTCTATCTTGGGCTAATTATTTTTTAATGCTTTTCTCCTTGTATCCTTAGTATATGCCACAGATAAAAACTCCTTATCCAGCTTGGATTGCTTATCCAACATAGTGGACCGGATCACCTCCTCAGAGCAACCTGGGTTGCCTCTCCAGGATCTGGCTTCTCTCTCTCCAGTTGCCAGCACCGATTCACAGCCTGCAACTCCAGGGGCTTCTAGTTCCAGGCTTATCTATCATGTGCTATGAACTAATTTTCTGGTCTATATGACTTCTTCCAGGAGGGCCTAATACACAGGAAGAAGAAGGCTTCAAAAAGTCCCAAACCAAGACAACATGTACATAAAGATTTCTTTTCAGTTGTAAATTTGTAAAGATTACCTTGCCACTTTATAAGAAAGTGTATTTAACTAAAAAGTCATCATTGCAAATAATACTTTCTTCTTCTTTATTATTCTTTGCTTAGATATTAATACATAGTTCCAGTAATACTATTTCTGATAGGGGGCCATTGATTGAGGGTAGCTTGTTGCAATGCTTAACTTATATATACATATATATATATTATAAATATTGCTCATCAAAATGTCT
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Task1_train_18094
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene MYF5 (myogenic factor 5). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Scoliosis
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GTTTTCAAGGTCTTCACTTTAGAGAGATCGCACCCTGAAAAGGTTGCTACTTCTCTGGCCCCTGAAGATGCTGGATCAATGAACCAGTGTTGCTTTAAGAAAATAATTCTGAAAAAAAAGTACAAAGTACCATTCACTGAAAGAAATAATAATAATAATAGGAAGGAAAACTCCCTCCTCCTCGCAATAACTTCGGAGCCACTATATTTATTGAACTGGGTTACCCTAGATTGAGTTGAGAACACTCCTGCTTCTTTCAACGGGGCCACAAGACCTAGTCCAAAACCCCAAGACTAATTGTGTAGACCTTAAGTAATTGCTTTTCCTAAATATAAACAGCACCTCCCCAACCCAAATAACCTGAAAGTGGATTAAGGTTGGAGGAGGATTGGTAAAAGCTGATTAATAGATTCATTCCCACTTAAATGACAACCCTCCCCTCTTGCCTTCTATCCATCGAAGTTCTAAAGACCCTGCTGTGATTGCTTTTCTGGAAGGCTTTTGTCACTGAAGTGTGTGAAGTTACTCCTGGTTTGAGGAGTTGGAAATTTTACACGAGTCAAGGATTGCAGTGGCGGCAGCTGGGACGCATCTGTAACGGTGTTAGTTTGCCTGAAAGCAGAAAATTAGCAACCCCAAAGCCCAGCTTGGCTGTTTAGTCTGTAGAAATGACAGGGCGGAGCAGAAAGAGAGGGAGAAAGGAGACTCACCCCTGGAAAGGGAGTTTGCCGTCGAAAACTGGGCTTCTTCTGTTGGAAATCTTAGAGACACTTTCAGTGCAGGTCTTTGGCCTGCTCAGGATCTAGGGAAGGCCTGGCACAAAGGAGAAGGTGCTCAACAAATACGTACAGAAGGGGAAAATGAAGGAAGCAAGAACGGGAGGAATGTTCCTGGTCACCTGGCCCTCCTGTGCCCCACCTCCTTTTAGATGAGCAGACATACAGGGAGAACTCAGAGCAAGCCCAGTCATGGGAAAAGGAACCTCCCTCCCTACTCTCAATAAGGTAGAGCCTAGAATAAATGACAATCTGAGCAAAACTTTACTCATCTGAAGCTATACAAAATAGATTTGGAAAGGCAAACCCTGTATTCACTCCAAGATTGAAAATGCCACTTCAAGTTTTTAGTAACCGTTATTCAATCCAATTGCTGGAAAAAGTTTTCGAGATAATTGAAGTTCATGAAAAAGAGAAACAAACACCCCCAAATCAGGTGATTCCTCACGCCCAGGATTGGGAGGGCAGGTCGGCTCTTGGTGCCAGCTGAAAGGGATTTCTATTTATTACCACTATTTTAAAATGTGTGTCCAATTGCAAAAAGTTGGACTGCCTTGGTCACTTTTGTGTGAAACACTCCTTAAGTGATCCCTTGTTTTAGCCTATCTAGAGAGTGCAAATGAGCAGGTTGGGGACCCACTGCCGCCCCAGCAGAAATACAGTAAAACCATTAGCGTCAAAAGGGGCAGTACACAGCAGATTGTCTGTAGAGGAAAGGCGGAGGTTTGTCCAGACAGCCCCCGCGGGGGTTGCGGTGGGATATGCTAATAGTGCCTGGCCACTGGGGCCGGCCTCCCTCCCGAAAGAATATATAAAGAACCCCAACCCCAGCTTGTCTACCCAGGCCAACAGGCGTCTGCCCTTGTTAATTACCGGAGCGACAGACTAGGGAGCTCCGCCCGGGATTTGCCCATCGGCGGAGGCGCCAGGCTCCCGTTTCTCCCCATCCCTCTCGCTGCCGTCCAGGTGCACCGCCTGCCTCTCAGCAGGATGGACGTGATGGATGGCTGCCAGTTCTCACCTTCTGAGTACTTCTACGACGGCTCCTGCATACCGTCCCCCGAGGGTGAATTTGGGGACGAGTTTGTGCCGCGAGTGGCTGCCTTCGGAGCGCACAAAGCAGAGCTGCAGGGCTCAGATGAGGACGAGCACGTGCGAGCGCCTACCGGCCACCACCAGGCTGGTCACTGCCTCATGTGGGCCTGCAAAGCCTGCAAGAGGAAGTCCACCACCATGGATCGGCGGAAGGCAGCCACTATGCGCGAGCGGAGGTGCCTGAAGAAGGTCAACCAGGCTTTCGAAACCCTCAAGAGGTGTACCACGACCAACCCCAACCAGAGGCTGCCCAAGGTGGAGATCCTCAGGAATGCCATCCGCTACATCGAGAGCCTGCAGGAGTTGCTGAGAGAGCAGGTGGAGAACTACTATAGCCTGCCGGGACAGAGCTGCTCGGAGCCCACCAGCCCCACCTCCAACTGCTCTGATGGCATGGTAAGCAATAGATCTGGTACCTGCTAGGCTACCCTAATCTTTTCTAAAGTCCTTACACCTCATTTAACCTGGTGTGGTGGGGAGAGTGGGGTGGAGGCAGATGCTGAGTTGCTTTAAAAGAAGAGAGGGGTCCACATTTAGAAAGACTCCCCAAACCGCTGCTGAACAAGATTTTAGTTTAACTTTCTAGCAGGTTCTAGGTGTACACTGTAATCGAGTGTTGACATGGAAGATGGGTGGCTGTGAATGATCACTCAGATGTTTTCTCCATTCCTGAATTTATTTTCAAAATATGCCATCTGTGGATCATGCCCTACGCTAATATCTAAAGGCACCGTTTCTAACTTAATGAGGAAATGGAAAGAAATACCCACACGGCCCCAGTTCCTGCTCCAATGAGGCCTGGCTGAAAGATGTTGATGCATTCTTTTTAGAGGGCGTTTGCTCCAAGGCTGCCAGGTTTTAATGTGTTTTTGCCCTGGGAAAGTGTTCTTTCCCTGAATTAGTGTGGCTTTCTTCTACTCCAATCCATTTTGCATGGTTAACCCAATGCACATTGCTGCTGAATTCCACCCCCTCTTCCCTTTGCTGCTGCTCTCCTCTTCTTCAAGCACAGAGATTGACCTCAGTGCCCTGGGAATTTGGAGAGGGCTAGCCCTTCCTAAATCAAGGCAGTGAAGGTGATTGACAGTGTTCGGTTACAGAGCTGGTGGGCAAGCACAGCCTCACCTTTGGTCAGAACATCTTTTGCCAAGACCTGAAAACAAACTTTGTTGTGTGTCTTGTATTATAGCCCGAATGTAACAGTCCTGTCTGGTCCAGAAAGAGCAGTACTTTTGACAGCATCTACTGTCCTGATGTATCAAATGGTAAGAATTGATAACTTCACAGGAGTTTAAAGACCAGTTCAACCTAACAATTCAGCCTATAAGATTCTGTTCTTGCTGATAGTATTGGGGAAGGGAGAATGGAAGTGATGGTTCTTATAGGGAGGCTTTGGTAAAGCAAAATAAACACATCTTCTGCTCCAAATCCCCCTAGCAGACACGCACGCACACATGCATACACACATGCACACACAATGTTGCTTGAAATATTATCAGGGGGCTTCCCCACTCCCCACGTCTACCCCTCAGGAATTGCCAGATATTTGTTGCAAATTTCTATGTTAGGCTTTCTGTGACCACCTGACCTCTGGGTGTCAGAGGAGCTGACCTACAATTTAAGGAGCAACATAAGCAAATCTGTCTATCTTGGGCTAATTATTTTTTAATGCTTTTCTCCTTGTATCCTTAGTATATGCCACAGATAAAAACTCCTTATCCAGCTTGGATTGCTTATCCAACATAGTGGACCGGATCACCTCCTCAGAGCAACCTGGGTTGCCTCTCCAGGATCTGGCTTCTCTCTCTCCAGTTGCCAGCACCGATTCACAGCCTGCAACTCCAGGGGCTTCTAGTTCCAGGCTTATCTATCATGTGCTATGAACTAATTTTCTGGTCTATATGACTTCTTCCAGGAGGGCCTAATACACAGGAAGAAGAAGGCTTCAAAAAGTCCCAAACCAAGACAACATGTACATAAAGATTTCTTTTCAGTTGTAAATTTGTAAAGATTACCTTGCCACTTTATAAGAAAGTGTATTTAACTAAAAAGTCATCATTGCAAATAATACTTTCTTCTTCTTTATTATTCTTTGCTTAGATATTAATACATAGTTCCAGTAATACTATTTCTGATAGGGGGCCATTGATTGAGGGTAGCTTGTTGCAATGCTTAACTTATATATACATATATATATATTATAAATATTGCTCATCAAAATGTCT
Task1_train_18095
An alteration has been detected in CEP290 (centrosomal protein 290) on Chromosome 12. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Nephronophthisis
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Task1_train_18096
Assess the clinical impact of this variant on gene CEP290 (centrosomal protein 290), found on Chromosome 12. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Familial aplasia of the vermis
CAAAACAAACTTTTAAATAAATTTCAATAACAAAATTAATTCTTTTAAAAGAGTCCATCATGATTATAAGGTAACAAAAAGTATTATATGGCAGATCCATAAAATAGGAGTCTAGAAATATTTATTATTAAATGTTATATATTAAAAATAAACTGAATATATATATTTTATAGAATATAATTTAATTTTCTACAGTTTAATGAACAAATGGAATTCATTATTTAATACCATAATAAACTTTTTCCAAGGTGCTTACCAAATTTTGCTTGTTCTTCTCCAGCTTTTTCTACTTCTTCCAAAGCCAGCTCCACTTCTTGAGCTTTCATCTAAACATTAAAAAAAGGTTATTTCAATATGCCTTTATACTGGAATGTAAGCACTGAAAATAAAAATTCTGTTTTATTTGTTATGATCCTTAGTGCCAGCAATGGCTGGCACATGGAGACGTTCAGTAAATATTTGCTGAATAAATAGTTTTTGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTGCTTTTGAGATAGGGCCTCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCTGCCTCCTGGGCTCAAGCAATCTTCCCATCTCAGTCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCTTGGCGTGCCATCATGCTTGGTGTGCCATCATGCTCGGCAAATTTTTTCGTACAGGCAAGGACTCACTATATTATCCAGGCTAGTCTTGAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCAGGCAATTTTCTTACTTAAGACTACAATTTCTAGATTTTTAATAGCATGAAACATTTTTGATTCTCCTTTTTACCTCAAGTCCTCAAGTCTTATATCCAGTAATGCAACATCTCCCTTTGTAATGTCTTTCCACTACTTTTTTTCTGTTCCAATTGCTATTATTCTAATCCATAATTTCAGGTTTAAACTCCGCTATAATGTGATGTCTACAAAGCTCCAATTTCCTTCAGTTTGTCCTACATAATATACTCAGTTTTGCCTTCTTAAGGTGTATTTTTGTACCTATCAATTGTGTTTCGAAAACCTTTACTGCCTTCTCAATTGCTGATAGCATAAAATACACCTTTAAGGCCCTCAACAACCTATCTCAAAGTACTTACCCAAGATTTGTTTTCTCTACAGTCTGCTACAAACTTGCTGCACCTTGTTTCCTCAAATATAAAGAATAAACATATTTCCTGTTCTCAGTATTTATTTATGGTAACCAACAGCTCTAGAATTCCCTTACTATCTTACCACTGCATTGCCTTCCACTTATCTAACACTACTCCTCAGTATTGATCCTTTGTGAAGTCTTCTGACATCTCTTAAATCATTTCCCCTCTTAACAAATCCCTATAGCAGTCATTGTCTGCATTTGTCATTTGGACCTCAAGATATATTTCCTTATGTTACTTTTCAACATACTCATTCTATTTCCCCTACACACCCTTTTAGAAACTTTAAGTAGAAACTAGCAATGTTTTATACACTAAAATACTTAATTCACATTTAAATATATTGCATTTTTTAGTGGTGATGTAGATATTACCAGGTATTTTCACAAAGATTACCTTATATAAGAACAGATTTTTATAGTTCCACTAATAGCCAAACCTATAGTTAAAACCTACTACATACAAACCTTCATTAGTGACTGAGTAATTCTGAAAAGGTGTATCACATTTTCTTGCTTTTCACTTTTTAGCTCATTTACTTCCACCTAAGTAAACAGAAAAGCAACTGTTTTATATTTTATAACCTTCAAGCAAAATATAAGAACACTTCCAGATTGTGACAATTATAGTTGTCCCTGAAAAAAATAAATTCATATTTTATTAATAAATTAATCATAAGTTAATGTATATATCTATTATTATTGACCAATTAAGCACCTTGGATAAGGAAATCAATAAATTATCTGCCAGTTCTTCTTGACGGGGCAGGTCATCTGGGTCAACTTTCATTATTTCTTTCCAGTTTATATTAGGTGGCATCTTGAATTCTTTCACTGTGCTCCACCTCTGTAACAAAACAGGTGTATATTAGCATTTTCAAGGTACACAGTATTATTGGTTTTCTAGCACCTTACATTTTTTGCAGATTATTTCATTATAACTTTCTGATGTTAGCAAAACAGACAATTGGGCCACAAAATAGACAAGTGGGCAAAATAGCCTTGATCAAAAATAGCAGTCGGCACAAACTGTCAGAGTGTCCCGGCTAAATAAAATGTGACGGCTTCCTTGCTAACACTAATCTAAGTTAATACTTAAGATTTCTGGATCCCTTCCTCCACACCCCTACCCACAATGCGCGCGAACACCCTAATCCTGGCAAGCGCGAGGGTCTGTGGAAGGCCGACAATCATCCCTGATTTGGAGAAACAGAATTGGGGCTGAAAAAAAACGCAGAAATTAACATTTGGAATGAGTGAAGTTGTGCGGCGGAAACTGGAACCGAAGCAAGGCAGTATTAGGGACCCGAGGCTGGAAGGGCGGGGTAGCTATGCTGTGGCACACGGGCCCTCAGGCTAAAGAACCTGAGCGTGGAGTGACTCGCTAATCCTGCTTACAAGGATCCACCCACCTAGACCAAGCCTGGCAACCAGCGGAGGCCTCTCACTACCGCAACCACCAAGCTGGACCCGGCCGCGGGCCCTGACAGATCCCTATCGCGGTTCCACGCGGACTCTGGGTCCAGCCAAATGGTCCCGAGCAAGCCAAAGCGGCAGCGGCTGCTAGGCGACACCATCCCCAACTCCGCCAAGGCCAGAATAAGATCCCGGATGCCAGGAGAGCCTACAGTTCACGACCGTGGGTGATGCTTTACGTTTAGATTCTCCGCCGGAGTCCCAGAGCTCGGTGTTCAGGATGATGAGAAGGCGTGGAACGAGGACTTCAAATCCCAGAGTGCAGTTCTGCCTGAGGCTTCTGCATGCTGGGAACTGAAGTCCCTGAGAAGAGGAGGTAAGGCGCTCCCGGCATGCAACGCGTAAGACTGCGACGGTACCGGGGCGGCGGGGAAGGACCGAGAGGCGGGAGGAGCAGCGGCTCAGGCGCCTGCAAACTGGTGGCCTGAACGAGGTAGACCATGACTGTGGTTTCAGTGGCGTCACTCGCTGGGCTGCTCTTCCTGAGGTTTTCCTAAGCCATCCCCTGGCGGAACCGCCCCCAGGTGAGGTCGAGCTGTCGGTCAGCATATTGGGAGGAATTGAGGGGAGCAGTCCTGGGTTAGAGAAGCTTCTGCTATTGGGGCCGTAGGGCCTGGTCCCATTCTGAAAAAGTGGGAACACCCTGCCTTCTCTTCAGGCGTTTGCAAGCGGCGTCCAGGGTAGTGCCTTCTGTAAGAAGGAAAAAACAAAAAGTTTTAGCCTTGTTTAGTATCAGAATCTGTCTTGATAGTTAGAGTGAGAGCCGCGCAGCCGTGATCCTCGTTTGGGGGCGAGCGAAGAATTGACAAGAGGTCTCGGCATCCCGACCCCGCCCGCCTTACCTGTAGCACCATTCCTTTCGCGGATCGTGGGGCTTGATGGTTGTGGAGCTAGTATAAAGTCAAGGCTCTAGAGAGGAGAGGTTAGTACTTGTCCGGACCACTGCCGGGGGTGGAGAGAGAAGGGATCCAAGGACTCACCTGTACTATTGTTGCCACTTGCTTGGTTACCTAGGGTGCCCTTCCATGAAAGCGCCTTCTCTGGTGTTTACCACTCTTACTCGTGCAAGTTTTGCTCATCCTGCTCGTCTGCTCACAATCATGCTGGAGTATGATACATCTCTACCTAACTTTCCTAAGAAGCTGTAGACTTAAATCTAAATGACATTTCCAACTATCTGGACCAGTGCTTTGTCTTTTTTTTTTTTTAAACGCTGCTTTAAAAAAAAAATTACTGTACTTGACAGTAAATTTTCCTTTCGAAAATAAGTAATGAGTTTCTTTTTAAACCCCCAATTTGGGTAAAATAAGTAGCTCAGTACAAAATAAAAAGATACTGATTTTGTGAGATGAATTTTAAAGACATTAGTTA
CAAAACAAACTTTTAAATAAATTTCAATAACAAAATTAATTCTTTTAAAAGAGTCCATCATGATTATAAGGTAACAAAAAGTATTATATGGCAGATCCATAAAATAGGAGTCTAGAAATATTTATTATTAAATGTTATATATTAAAAATAAACTGAATATATATATTTTATAGAATATAATTTAATTTTCTACAGTTTAATGAACAAATGGAATTCATTATTTAATACCATAATAAACTTTTTCCAAGGTGCTTACCAAATTTTGCTTGTTCTTCTCCAGCTTTTTCTACTTCTTCCAAAGCCAGCTCCACTTCTTGAGCTTTCATCTAAACATTAAAAAAAGGTTATTTCAATATGCCTTTATACTGGAATGTAAGCACTGAAAATAAAAATTCTGTTTTATTTGTTATGATCCTTAGTGCCAGCAATGGCTGGCACATGGAGACGTTCAGTAAATATTTGCTGAATAAATAGTTTTTGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTGCTTTTGAGATAGGGCCTCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCTGCCTCCTGGGCTCAAGCAATCTTCCCATCTCAGTCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCTTGGCGTGCCATCATGCTTGGTGTGCCATCATGCTCGGCAAATTTTTTCGTACAGGCAAGGACTCACTATATTATCCAGGCTAGTCTTGAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCAGGCAATTTTCTTACTTAAGACTACAATTTCTAGATTTTTAATAGCATGAAACATTTTTGATTCTCCTTTTTACCTCAAGTCCTCAAGTCTTATATCCAGTAATGCAACATCTCCCTTTGTAATGTCTTTCCACTACTTTTTTTCTGTTCCAATTGCTATTATTCTAATCCATAATTTCAGGTTTAAACTCCGCTATAATGTGATGTCTACAAAGCTCCAATTTCCTTCAGTTTGTCCTACATAATATACTCAGTTTTGCCTTCTTAAGGTGTATTTTTGTACCTATCAATTGTGTTTCGAAAACCTTTACTGCCTTCTCAATTGCTGATAGCATAAAATACACCTTTAAGGCCCTCAACAACCTATCTCAAAGTACTTACCCAAGATTTGTTTTCTCTACAGTCTGCTACAAACTTGCTGCACCTTGTTTCCTCAAATATAAAGAATAAACATATTTCCTGTTCTCAGTATTTATTTATGGTAACCAACAGCTCTAGAATTCCCTTACTATCTTACCACTGCATTGCCTTCCACTTATCTAACACTACTCCTCAGTATTGATCCTTTGTGAAGTCTTCTGACATCTCTTAAATCATTTCCCCTCTTAACAAATCCCTATAGCAGTCATTGTCTGCATTTGTCATTTGGACCTCAAGATATATTTCCTTATGTTACTTTTCAACATACTCATTCTATTTCCCCTACACACCCTTTTAGAAACTTTAAGTAGAAACTAGCAATGTTTTATACACTAAAATACTTAATTCACATTTAAATATATTGCATTTTTTAGTGGTGATGTAGATATTACCAGGTATTTTCACAAAGATTACCTTATATAAGAACAGATTTTTATAGTTCCACTAATAGCCAAACCTATAGTTAAAACCTACTACATACAAACCTTCATTAGTGACTGAGTAATTCTGAAAAGGTGTATCACATTTTCTTGCTTTTCACTTTTTAGCTCATTTACTTCCACCTAAGTAAACAGAAAAGCAACTGTTTTATATTTTATAACCTTCAAGCAAAATATAAGAACACTTCCAGATTGTGACAATTATAGTTGTCCCTGAAAAAAATAAATTCATATTTTATTAATAAATTAATCATAAGTTAATGTATATATCTATTATTATTGACCAATTAAGCACCTTGGATAAGGAAATCAATAAATTATCTGCCAGTTCTTCTTGACGGGGCAGGTCATCTGGGTCAACTTTCATTATTTCTTTACAGTTTATATTAGGTGGCATCTTGAATTCTTTCACTGTGCTCCACCTCTGTAACAAAACAGGTGTATATTAGCATTTTCAAGGTACACAGTATTATTGGTTTTCTAGCACCTTACATTTTTTGCAGATTATTTCATTATAACTTTCTGATGTTAGCAAAACAGACAATTGGGCCACAAAATAGACAAGTGGGCAAAATAGCCTTGATCAAAAATAGCAGTCGGCACAAACTGTCAGAGTGTCCCGGCTAAATAAAATGTGACGGCTTCCTTGCTAACACTAATCTAAGTTAATACTTAAGATTTCTGGATCCCTTCCTCCACACCCCTACCCACAATGCGCGCGAACACCCTAATCCTGGCAAGCGCGAGGGTCTGTGGAAGGCCGACAATCATCCCTGATTTGGAGAAACAGAATTGGGGCTGAAAAAAAACGCAGAAATTAACATTTGGAATGAGTGAAGTTGTGCGGCGGAAACTGGAACCGAAGCAAGGCAGTATTAGGGACCCGAGGCTGGAAGGGCGGGGTAGCTATGCTGTGGCACACGGGCCCTCAGGCTAAAGAACCTGAGCGTGGAGTGACTCGCTAATCCTGCTTACAAGGATCCACCCACCTAGACCAAGCCTGGCAACCAGCGGAGGCCTCTCACTACCGCAACCACCAAGCTGGACCCGGCCGCGGGCCCTGACAGATCCCTATCGCGGTTCCACGCGGACTCTGGGTCCAGCCAAATGGTCCCGAGCAAGCCAAAGCGGCAGCGGCTGCTAGGCGACACCATCCCCAACTCCGCCAAGGCCAGAATAAGATCCCGGATGCCAGGAGAGCCTACAGTTCACGACCGTGGGTGATGCTTTACGTTTAGATTCTCCGCCGGAGTCCCAGAGCTCGGTGTTCAGGATGATGAGAAGGCGTGGAACGAGGACTTCAAATCCCAGAGTGCAGTTCTGCCTGAGGCTTCTGCATGCTGGGAACTGAAGTCCCTGAGAAGAGGAGGTAAGGCGCTCCCGGCATGCAACGCGTAAGACTGCGACGGTACCGGGGCGGCGGGGAAGGACCGAGAGGCGGGAGGAGCAGCGGCTCAGGCGCCTGCAAACTGGTGGCCTGAACGAGGTAGACCATGACTGTGGTTTCAGTGGCGTCACTCGCTGGGCTGCTCTTCCTGAGGTTTTCCTAAGCCATCCCCTGGCGGAACCGCCCCCAGGTGAGGTCGAGCTGTCGGTCAGCATATTGGGAGGAATTGAGGGGAGCAGTCCTGGGTTAGAGAAGCTTCTGCTATTGGGGCCGTAGGGCCTGGTCCCATTCTGAAAAAGTGGGAACACCCTGCCTTCTCTTCAGGCGTTTGCAAGCGGCGTCCAGGGTAGTGCCTTCTGTAAGAAGGAAAAAACAAAAAGTTTTAGCCTTGTTTAGTATCAGAATCTGTCTTGATAGTTAGAGTGAGAGCCGCGCAGCCGTGATCCTCGTTTGGGGGCGAGCGAAGAATTGACAAGAGGTCTCGGCATCCCGACCCCGCCCGCCTTACCTGTAGCACCATTCCTTTCGCGGATCGTGGGGCTTGATGGTTGTGGAGCTAGTATAAAGTCAAGGCTCTAGAGAGGAGAGGTTAGTACTTGTCCGGACCACTGCCGGGGGTGGAGAGAGAAGGGATCCAAGGACTCACCTGTACTATTGTTGCCACTTGCTTGGTTACCTAGGGTGCCCTTCCATGAAAGCGCCTTCTCTGGTGTTTACCACTCTTACTCGTGCAAGTTTTGCTCATCCTGCTCGTCTGCTCACAATCATGCTGGAGTATGATACATCTCTACCTAACTTTCCTAAGAAGCTGTAGACTTAAATCTAAATGACATTTCCAACTATCTGGACCAGTGCTTTGTCTTTTTTTTTTTTTAAACGCTGCTTTAAAAAAAAAATTACTGTACTTGACAGTAAATTTTCCTTTCGAAAATAAGTAATGAGTTTCTTTTTAAACCCCCAATTTGGGTAAAATAAGTAGCTCAGTACAAAATAAAAAGATACTGATTTTGTGAGATGAATTTTAAAGACATTAGTTA
Task1_train_18097
This variant affects the gene CEP290 (centrosomal protein 290) found on Chromosome 12. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Meckel-Gruber syndrome
CAAAACAAACTTTTAAATAAATTTCAATAACAAAATTAATTCTTTTAAAAGAGTCCATCATGATTATAAGGTAACAAAAAGTATTATATGGCAGATCCATAAAATAGGAGTCTAGAAATATTTATTATTAAATGTTATATATTAAAAATAAACTGAATATATATATTTTATAGAATATAATTTAATTTTCTACAGTTTAATGAACAAATGGAATTCATTATTTAATACCATAATAAACTTTTTCCAAGGTGCTTACCAAATTTTGCTTGTTCTTCTCCAGCTTTTTCTACTTCTTCCAAAGCCAGCTCCACTTCTTGAGCTTTCATCTAAACATTAAAAAAAGGTTATTTCAATATGCCTTTATACTGGAATGTAAGCACTGAAAATAAAAATTCTGTTTTATTTGTTATGATCCTTAGTGCCAGCAATGGCTGGCACATGGAGACGTTCAGTAAATATTTGCTGAATAAATAGTTTTTGGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTGCTTTTGAGATAGGGCCTCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCTGCCTCCTGGGCTCAAGCAATCTTCCCATCTCAGTCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCATGCCATCATGCTTGGCGTGCCATCATGCTTGGTGTGCCATCATGCTCGGCAAATTTTTTCGTACAGGCAAGGACTCACTATATTATCCAGGCTAGTCTTGAACTCCCAGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCAGGCAATTTTCTTACTTAAGACTACAATTTCTAGATTTTTAATAGCATGAAACATTTTTGATTCTCCTTTTTACCTCAAGTCCTCAAGTCTTATATCCAGTAATGCAACATCTCCCTTTGTAATGTCTTTCCACTACTTTTTTTCTGTTCCAATTGCTATTATTCTAATCCATAATTTCAGGTTTAAACTCCGCTATAATGTGATGTCTACAAAGCTCCAATTTCCTTCAGTTTGTCCTACATAATATACTCAGTTTTGCCTTCTTAAGGTGTATTTTTGTACCTATCAATTGTGTTTCGAAAACCTTTACTGCCTTCTCAATTGCTGATAGCATAAAATACACCTTTAAGGCCCTCAACAACCTATCTCAAAGTACTTACCCAAGATTTGTTTTCTCTACAGTCTGCTACAAACTTGCTGCACCTTGTTTCCTCAAATATAAAGAATAAACATATTTCCTGTTCTCAGTATTTATTTATGGTAACCAACAGCTCTAGAATTCCCTTACTATCTTACCACTGCATTGCCTTCCACTTATCTAACACTACTCCTCAGTATTGATCCTTTGTGAAGTCTTCTGACATCTCTTAAATCATTTCCCCTCTTAACAAATCCCTATAGCAGTCATTGTCTGCATTTGTCATTTGGACCTCAAGATATATTTCCTTATGTTACTTTTCAACATACTCATTCTATTTCCCCTACACACCCTTTTAGAAACTTTAAGTAGAAACTAGCAATGTTTTATACACTAAAATACTTAATTCACATTTAAATATATTGCATTTTTTAGTGGTGATGTAGATATTACCAGGTATTTTCACAAAGATTACCTTATATAAGAACAGATTTTTATAGTTCCACTAATAGCCAAACCTATAGTTAAAACCTACTACATACAAACCTTCATTAGTGACTGAGTAATTCTGAAAAGGTGTATCACATTTTCTTGCTTTTCACTTTTTAGCTCATTTACTTCCACCTAAGTAAACAGAAAAGCAACTGTTTTATATTTTATAACCTTCAAGCAAAATATAAGAACACTTCCAGATTGTGACAATTATAGTTGTCCCTGAAAAAAATAAATTCATATTTTATTAATAAATTAATCATAAGTTAATGTATATATCTATTATTATTGACCAATTAAGCACCTTGGATAAGGAAATCAATAAATTATCTGCCAGTTCTTCTTGACGGGGCAGGTCATCTGGGTCAACTTTCATTATTTCTTTCCAGTTTATATTAGGTGGCATCTTGAATTCTTTCACTGTGCTCCACCTCTGTAACAAAACAGGTGTATATTAGCATTTTCAAGGTACACAGTATTATTGGTTTTCTAGCACCTTACATTTTTTGCAGATTATTTCATTATAACTTTCTGATGTTAGCAAAACAGACAATTGGGCCACAAAATAGACAAGTGGGCAAAATAGCCTTGATCAAAAATAGCAGTCGGCACAAACTGTCAGAGTGTCCCGGCTAAATAAAATGTGACGGCTTCCTTGCTAACACTAATCTAAGTTAATACTTAAGATTTCTGGATCCCTTCCTCCACACCCCTACCCACAATGCGCGCGAACACCCTAATCCTGGCAAGCGCGAGGGTCTGTGGAAGGCCGACAATCATCCCTGATTTGGAGAAACAGAATTGGGGCTGAAAAAAAACGCAGAAATTAACATTTGGAATGAGTGAAGTTGTGCGGCGGAAACTGGAACCGAAGCAAGGCAGTATTAGGGACCCGAGGCTGGAAGGGCGGGGTAGCTATGCTGTGGCACACGGGCCCTCAGGCTAAAGAACCTGAGCGTGGAGTGACTCGCTAATCCTGCTTACAAGGATCCACCCACCTAGACCAAGCCTGGCAACCAGCGGAGGCCTCTCACTACCGCAACCACCAAGCTGGACCCGGCCGCGGGCCCTGACAGATCCCTATCGCGGTTCCACGCGGACTCTGGGTCCAGCCAAATGGTCCCGAGCAAGCCAAAGCGGCAGCGGCTGCTAGGCGACACCATCCCCAACTCCGCCAAGGCCAGAATAAGATCCCGGATGCCAGGAGAGCCTACAGTTCACGACCGTGGGTGATGCTTTACGTTTAGATTCTCCGCCGGAGTCCCAGAGCTCGGTGTTCAGGATGATGAGAAGGCGTGGAACGAGGACTTCAAATCCCAGAGTGCAGTTCTGCCTGAGGCTTCTGCATGCTGGGAACTGAAGTCCCTGAGAAGAGGAGGTAAGGCGCTCCCGGCATGCAACGCGTAAGACTGCGACGGTACCGGGGCGGCGGGGAAGGACCGAGAGGCGGGAGGAGCAGCGGCTCAGGCGCCTGCAAACTGGTGGCCTGAACGAGGTAGACCATGACTGTGGTTTCAGTGGCGTCACTCGCTGGGCTGCTCTTCCTGAGGTTTTCCTAAGCCATCCCCTGGCGGAACCGCCCCCAGGTGAGGTCGAGCTGTCGGTCAGCATATTGGGAGGAATTGAGGGGAGCAGTCCTGGGTTAGAGAAGCTTCTGCTATTGGGGCCGTAGGGCCTGGTCCCATTCTGAAAAAGTGGGAACACCCTGCCTTCTCTTCAGGCGTTTGCAAGCGGCGTCCAGGGTAGTGCCTTCTGTAAGAAGGAAAAAACAAAAAGTTTTAGCCTTGTTTAGTATCAGAATCTGTCTTGATAGTTAGAGTGAGAGCCGCGCAGCCGTGATCCTCGTTTGGGGGCGAGCGAAGAATTGACAAGAGGTCTCGGCATCCCGACCCCGCCCGCCTTACCTGTAGCACCATTCCTTTCGCGGATCGTGGGGCTTGATGGTTGTGGAGCTAGTATAAAGTCAAGGCTCTAGAGAGGAGAGGTTAGTACTTGTCCGGACCACTGCCGGGGGTGGAGAGAGAAGGGATCCAAGGACTCACCTGTACTATTGTTGCCACTTGCTTGGTTACCTAGGGTGCCCTTCCATGAAAGCGCCTTCTCTGGTGTTTACCACTCTTACTCGTGCAAGTTTTGCTCATCCTGCTCGTCTGCTCACAATCATGCTGGAGTATGATACATCTCTACCTAACTTTCCTAAGAAGCTGTAGACTTAAATCTAAATGACATTTCCAACTATCTGGACCAGTGCTTTGTCTTTTTTTTTTTTTAAACGCTGCTTTAAAAAAAAAATTACTGTACTTGACAGTAAATTTTCCTTTCGAAAATAAGTAATGAGTTTCTTTTTAAACCCCCAATTTGGGTAAAATAAGTAGCTCAGTACAAAATAAAAAGATACTGATTTTGTGAGATGAATTTTAAAGACATTAGTTA
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Task1_train_18098
A variant has been detected on Chromosome 12 in CEP290 (centrosomal protein 290). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Joubert syndrome 5
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This gene mutation involves CEP290 (centrosomal protein 290) on Chromosome 12. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Meckel-Gruber syndrome
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