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Task1_train_18700
This variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Noonan syndrome
GGGTGTGGTGGAAATAGGCCTGACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGT
GGGTGTGGTGGAAATAGGCCTGACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTTCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGT
Task1_train_18701
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
GGGTGTGGTGGAAATAGGCCTGACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGT
GGGTGTGGTGGAAATAGGCCTGACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTTCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGT
Task1_train_18702
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18703
Here is a variant affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Noonan syndrome with multiple lentigines
GACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACA
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Task1_train_18704
This mutation is located in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Metachondromatosis
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Task1_train_18705
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
GACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACA
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Task1_train_18706
A genetic alteration is present in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Metachondromatosis
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Task1_train_18707
An alteration has been detected in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
GACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACA
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Task1_train_18708
The variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18709
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACA
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Task1_train_18710
Here’s a variant in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; RASopathy
GACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACA
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Task1_train_18711
A sequence alteration has been identified in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
GACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACA
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Task1_train_18712
Chromosome 12 houses a mutation in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18713
The variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_18714
This alteration occurs within gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Cafe-au-lait spot
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Task1_train_18715
Given this context: Chromosome 12, gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Specific learning disability
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Task1_train_18716
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), on Chromosome 12, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Abnormal facial shape
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Task1_train_18717
Here is a variant affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Scoliosis
ACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAG
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Task1_train_18718
The following genetic variant occurs in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Intellectual disability, mild
ACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAG
ACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCTGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAG
Task1_train_18719
This is a variant in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), located on Chromosome 12. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Noonan syndrome
ACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAG
ACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCTGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAG
Task1_train_18720
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Noonan syndrome with multiple lentigines
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Task1_train_18721
This gene mutation involves PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; RASopathy
ACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAG
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Task1_train_18722
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18723
Located on Chromosome 12, this mutation impacts PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
ACTCTTGAGGATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAG
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Task1_train_18724
This alteration occurs within gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_18725
A genetic alteration is present in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Noonan syndrome
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
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Task1_train_18726
A mutation on Chromosome 12 affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_18727
This variant impacts the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
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Task1_train_18728
The variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Metachondromatosis
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Task1_train_18729
A variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18730
A mutation found in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18731
A variant has been detected on Chromosome 12 in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
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Task1_train_18732
A variant affecting Chromosome 12, within the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Epicanthus
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Task1_train_18733
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Depressed nasal ridge
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
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Task1_train_18734
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Abnormal pinna morphology
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Task1_train_18735
Located on Chromosome 12, this mutation impacts PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Wide nasal bridge
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
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Task1_train_18736
The following genetic variant occurs in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Short stature
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAAGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
Task1_train_18737
A change on Chromosome 12 affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Abnormal cardiovascular system morphology
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAAGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
Task1_train_18738
Given this context: Chromosome 12, gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Microcephaly
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAAGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
Task1_train_18739
With a mutation on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; RASopathy
GATCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAA
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Task1_train_18740
This sequence change occurs on Chromosome 12, altering PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; RASopathy
TCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGG
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Task1_train_18741
Mutation context: Chromosome 12, Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
TCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGG
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Task1_train_18742
A variant found in Chromosome 12 affects PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18743
The variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18744
A mutation in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), located on Chromosome 12, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18745
This alteration in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Metachondromatosis
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Task1_train_18746
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), on Chromosome 12, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_18747
Here is a variant affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Noonan syndrome
TCCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGG
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Task1_train_18748
This variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_18749
A genetic alteration is present in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18750
This gene mutation involves PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18751
This gene mutation involves PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome
CCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGA
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Task1_train_18752
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), on Chromosome 12, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; RASopathy
CCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGA
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Task1_train_18753
This mutation is located in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
CCCTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGA
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Task1_train_18754
This variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_18755
The variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18756
A variant was discovered in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), Chromosome 12. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAAGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
Task1_train_18757
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; RASopathy
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18758
Given this context: Chromosome 12, gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Metachondromatosis
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18759
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18760
This sequence change occurs on Chromosome 12, altering PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18761
A variant has been detected on Chromosome 12 in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18762
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18763
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Metachondromatosis
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Task1_train_18764
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18765
This genomic variant is located on Chromosome 12, within the PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18766
This alteration in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_18767
This variant impacts the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Neurodevelopmental disorder
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18768
A variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18769
This is a variant in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), located on Chromosome 12. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Metachondromatosis
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18770
This genomic variant is located on Chromosome 12, within the PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18771
This mutation is located in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18772
This sequence variant lies in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18773
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18774
This variant affects the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) found on Chromosome 12. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCACGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
Task1_train_18775
This sequence variant lies in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; RASopathy
CTTAAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAG
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Task1_train_18776
A sequence alteration has been identified in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_18777
A genetic alteration is present in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Noonan syndrome
AAGTCATTTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAGAAT
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Task1_train_18778
A genomic change on Chromosome 12 affects PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Noonan syndrome with multiple lentigines
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Task1_train_18779
This variant impacts the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; RASopathy
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This variant impacts the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18781
Consider a variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
TTTTGCTTGGTTCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAGAATATAAAAT
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Task1_train_18782
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) is located on Chromosome 12, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; PTPN11-related disorder
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Task1_train_18783
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), found on Chromosome 12, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_18784
A sequence alteration has been identified in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18785
Here is a mutation in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome
TCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAGAATATAAAATCAGATGTGGGA
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Task1_train_18786
A sequence alteration has been identified in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Noonan syndrome with multiple lentigines
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Task1_train_18787
A change on Chromosome 12 affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; See cases
TCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAGAATATAAAATCAGATGTGGGA
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Task1_train_18788
This variant impacts the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_18789
Mutation context: Chromosome 12, Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; PTPN11-related disorder
TCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAGAATATAAAATCAGATGTGGGA
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Task1_train_18790
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_18791
Given a variant located on Chromosome 12 and affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Noonan syndrome 3
TCTCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAGAATATAAAATCAGATGTGGGA
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Task1_train_18792
This gene mutation involves PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome with multiple lentigines
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Task1_train_18793
A change on Chromosome 12 affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; RASopathy
TCTTTTTCCTTCTTTTCTTCTACTCTTCTATGATTCATCTCTTTGATTGTGATTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGAGACAGAGTCTTGTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATCTGACACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAATAGAGACAAGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCTTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGTCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCTACCATGCCCGGCCCATTCTGTTCTCTTCTACCATAAATATATTTCTCCCCTAACACTATATTTGTTTGCTTCACAAGATTCCAGCTGCTTTTCCACCAAGGCCTTTGATGGAAGCTGTGCTGTGACCTCTGTAATGAGTCTGTGGGCTGCTGATTCTCCAGTTTGGGCTTCATGATTATACTGGGGAATATTGGGTTTCCTAAATCTCATTCATTTCTTGGGCAAGTAGATATATGTGAAAGTGTTTATTTGTCCAGTTGTTAAAGAAGCTACCATTTATTGAGCCAGCCTCTGAGCACAATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTTTAAAATTATTTACTTCTTCTATTTCAATAACTTTATTATTATTATTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATTGAGCGATCTTAGCTCACTGCAACCTCTGCTTTCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACTGGTACGTGACAACATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTGCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGGCCCCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTATAGGTGAGAGCCACTGCGCCCGGCCCTCTTTCAGTAATTTTGATGTATTTTTTTGTATATGATTCCTGTTTCATTCTGTCCAACCAGCACTCTGTATGGTATGTGCTGTTGTCCCCATTTCACAGATGCAGAAATTAAGGGTCAGAGAGGTTAAGGGACTTACCTCAGGCACGTTGTACTGGAGAAGCTGAACTCCAAGAGCAGGTTTGGGCTGACTCCAAAGCCCTATGCTTTTTGCCAACATATTTTCAAACATAAATAGACAATTTTATAAATAGCTCCAAAGAGTAGACATTGTTTCTGTTGATATTAATGGCTTGGTTTTGAGTCTGAAACCCCCATGAATGATTCTGTTGTCCCTGCTTTTTGTCCTTCTGCCCGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGGGTCATCTGGTGGGCAAGAAGCGACAGTTTCTGTTTTTAGTTTATGGAAGGAAAGTGCTCACGAAAACAGTCTGGGGAAGAGAGGTTGAATGGGAAAATTCTTTCACAAAAATCTGGGCTGAAGACTTCAGTGTGTCTGCCTGAGAACAGAAGTGACACTATTTGAGCTTTTGGCATAAAATGAAGTCTAGGAGCTGCAGAACCCACTGCCATGGCCTTTTGTTGCATACACAGTGGTGGTCTCTATCCAGCCACCTGACCTTGTTTACAGTATGGGGTGATTTGTTGGCAAGTGAGGGAATCCTGACTTCTGCCACTTCGTTATTTATGTAGTCTTCTGGGATCATTGGTATTGGTCAGAAGTTCAACACTGTAGCCATTGCAACATGCTCAGTTAAAACAGCAAAGACTAAATTAGCATTGTCTCTGAGTCCACTAAAAGTTGTGCATTAAACAACTTCATCCTGGCTCTGCAGTTTCTCTTTATTCTTCATGATGTTTCCTTCGTAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGGTACCAGCCTGAGGGCTGGCATGCGGATTCTCATTCTCTTGCTAGGCCTCTTGGATACGCTCTCCTTTTGAGCAGGAGGACAGGCTCTGATAGACAACTGTTTGATTTCGGAATGGGAAACAAACTCCCAACTAAAAGGGCCTCTGGAAACTGTCAATTATTCTCCACTTCTCAGCTCTGATTTTTCACTGCAGAGGAGCTTAGGGAAGGGCACCATCCTATCAGCCTGGCCTGCCAGATTGAAGAACTGCCATGCAGAAAGGTTCTGATGTTCTCAGGCTCATGTGGCAAGCGTAAAACTCAAAGCCTTGAAGTTTCTAGCCTGTTCCAGCCTTGATCCAGGCCATGTTTATCCTGATTCCATCCTTTAAAACGAATGCCTCACTCTTAATAGCGCACGGCAGTTTGAACCACTAATTTGGTCGAGTTGGAAACAGTGAAATTTCAATTTTAATAAGCTGTGCATAATGAAGAGGAATGTGGAATTGGAGCCTTTCCATCTGAAGCTATTCATAACAGGCACAAAGCTGAGTTAATTAGGAATATGCTGAGATGAAGGAAATGAGGAGAGCTGCTCTTTTGGGGGCTGTGCTTCTCTCCCCAACCCCTCAACCCCATTGCCATGCTGCAGATGGGGTGGTGTCTAAACATCAGTGGCGAGTGCCTGCATTACTCTGCTCGTTGCCTTCCAGAGAACTCAGCTTCTCCAAATGCTGAGCTCTTTTCAGAATGGGACCTGCCACCAGTATTTGAAAGATTTCTAGCCTAGCAGAACAGCAGCCACGTTATCAAAGTTTGGTTGGCCAAAGGAAGGTACTTGCTAATTAGTTTAGTAGGTTTTCAGTCCGCACAGACATACGGGATTGTTTTATTGTACATAGACATCTTCAGAAACAGTGTATGTATAGAAATGTAAGGTCAAAATTTGAACCTCAGTGCTTTAAATCTGAATTTGTATTAACTGATATGAAATATTTAGACGGTTACTTTATTTTATATCTGTCTTCCATTATACTTAATTTGGCTCAAGAATAGTTAGGCAAAAAGTTGCCCAAAGAGAAGGATCTCCTAGTAAATACAAAGAGAATGTAACATAGTTGCTACAAGTTGGAGCATGTTCAGGGATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAGAGGTCTCTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAATCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCGCCACCACACCTAGCTAATTTTCGCATTTTTTGTAGTGTCACAGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTAGGCTCAAGCAGTGCTTCTGCCTCAGCCTCTCTGAGTAGTTAGGACTACAAATTTGTGGCTCCATGCCCGGCTAATTTTTTTATCTTTATTTTGTAGAGACAAGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAACAACCCTCCCACTTTGGGTTTCCAAAGTGCTGGGATTACAAGTGTGAGCCACTGAGCCCAGTGACCTCTGGGTTTTAAAAATGTGTAGGCTTCAATTATTTATTTTAAAAAATGAAATCCTGCAATATATAGTTTTCTGCGTTGTGTGGTTTGAATCAATCTGGGAACTGGCTTGCTGGCTGATTGTGGTAAAGTAAGAAGTACTTAATTTAGTAGAAAGTTTAAATGGCAGACATAACATTAAACCCAGCTGATTTATAAATGAAGCAAAAGAACAAAACTCATTCAGGATAATTGGTTATTCTAAAATACAGTCATTTCTAAAATTATGAAGTGTTCAGGACCTTTGGGAGTGAAAGAATTTGCTAAAGAAGGATCAGTGAAAAAAAGGAATGATGGGTGAAGAGCTGTGGAGAAGGAAGAGAAGAAACAGCACAAGGAAGGAAGAATATAAAATCAGATGTGGGAAT
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Task1_train_18794
A sequence alteration has been identified in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18795
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; PTPN11-related disorder
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Task1_train_18796
This mutation is located in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; not specified
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Task1_train_18797
A variant was discovered on Chromosome 12, affecting RPH3A (rabphilin 3A). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
ATGGAAGATGTTTCACACACCGTCCTAGGTGTGCTGCTCTGTTCTGACCCACAGGGCCAGGAGAAAGGCCAGAGGTCTTGGGGAAGTTGTAGGTAGATCACCCTCTTCACAACAACCAGTGTAGTGGAGAGCATGCCACATTTAAGAGATGGAAGACTTGGAGTTGAGCCCTTGTTTTTCCATTCTCTAGCTGTGTACTATTGGACCAGTCCTTAAGATTTTGGATATTCCCCTTTCTCCATCCAAACTCCACTTTCTTCATGGGTAAACTGAAGCCCTTTCTACTGAGTTTTCAGGGTGGATGGGCTGAATAAATATGAATTGTGCAGGGCTCTGTAGTAATAATAAAAGTGTGCTGGCTATTGTGTCAGTGTGCTTTGGATGAGGAGGAAAGATAAAAATGGGCACTCATGAAGGTAAGAGCAACAGCGCTTGGCTGCCACATCTTCAATCCCTGTCTCTCCTCCCCAAGGTGTGGAAGCGTTCTGGAGCGTGGTTCTTCAAAGGCTTCCCCAAACAGGTCCTCCCACAGCCTATGCCTATAAAGAAGACCAAGCCCCAGCAGCCTGTCAGTGAGCCTGCTGCCCCTGAACAGCCTGCTCCTGAGCCCAAGCACCCTGCCCGGGCTCCAGCTCGAGGTAGGACAAAACAGGTGCTTCTTTCAGGACCAAGGACAGATCTTAGCCAACTGGTCTACCTGAGGGATGGCCTGACATCATGTCTGTGTTTCCACCCAGTTGTTGCATGGTCAGCTTCTGCACTTGGGTCTAGGACTCCTATATCTCCTTCAGAGTTCACCATAAATCGTTACCAAGAGGGTAGCACAGGGAACTCTCCAGCAATGCCAAGCCGCCCAGAGGCTTCATTGTCATCCCTGGTGGCATATCTAGTGTACAAGAGGTGGAAATTAAAATTAGGAACTGAGAGAGACTTTCACCACCAAGATCACACTGGAGCCTGGGAGAATACTCGGCTTGCTGAGAAGGCCTTCCTGGACCCTGTTATTTCTCCTACTATCCATAAGCAAGTCTGATTTGGACTAATTAAAAGTGAAAGATGAATAGAAGGAAATCAGTAAAAGAAAATTACTGCTACTAAATTGCTACTATTGACATTATCACTATTATCCAAGTATTATGATTAATTATTAAAATGATTAAGAGGGAGAAGCAAAACAGTAAAAATTTTAAAAAGCAACCATAGTAAAAATACATTTTAGTTGGACTAGACCACTAGGACTGACCAGATAAAGCCCTTGCAATAATTTCAATTGATGCTAAGTGATAAAATCTGGACTAAATGACAATTCCAGATTGAGTGCAGGCGGTACTTCTGAAAGGAAGGGTACAGCGTTTTTCATAAGATAACTTATCAAGGCACTTAGCACAATGCCTGCCACCTAAGAGGCATTCAACAAATGTTTTCTTCCTGACAAGGCAAGAGCAATTTCTACTCCTTGCAGAGAATCACCAAATTGCCAACATATATTGCATCCCTGAGGAGTCCCCAGTTTTCACCACTAAAATACTCCTTCTTCCTAGTTCTTCTAGGCTGAGAAGGCTGTATAGCATAATTGTTCTTTATAAAGCCTGTGTATGCTCATATGTGTTTGTGCATGCAAAAAAAAATGTGAAATTGTAAACAGGAGCTAGATCAAAGAGGAGGTTGGGAGAAAGACTTTTAATTTTTAAAACATATTCTTAGGCAATAGTCAATGAACCCCTTTGTAGGCTTCTTAAGTACCGGTTTTCCAGACACCAGAAAACCAGTACTCCTCATAATTTGTGTTTTCTTTCTCCAGGTGACAGTGAAGATAGGAGGGGCCCGGGTCAGAAGACAGGTGGGTTCTGCTGACTCTGTTTTGTCATTTGAGACACGAATTCACCTAATTCCCTCGATGCCCTTTCTCTACTCAATTCATGCTCTTCTTTCCAGGCCCTGACCCAGCCTCTGCTCCCGGGCGAGGAAACTATGGGCCTCCCGTGCGCAGGGCCTCCGAGGCACGAATGAGCTCATCTAGCCGAGATTCAGAGAGCTGGGACCACAGTGGGGGTGCTGGAGACTCCAGCCGGAGCCCAGCAGGTGAGCAAGATGGGCAAATCCAGAGACAGTTCTCTGGATAGGGAGACTCAAAAAGAATGAGGGGAACTGTGTTTTTATTCATTTACTTAGGCAGCATTTATTGAGTCCTACTGTGTGCCGTGTTCTATTCCAGATACTGGTTTTAGTCTATGGTAGAGGAAAGACAGGATTCAGAAACAATTCTGGCTCTAGACATCCATAATTTTGGTTAGATCCTTTTCTTGCTGTAATACCATATGTCAGAAAGCATGATTTTTTTTCTCCCCGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTGGGGGAAAAATGCCCCTAGGCTTCGAACAAAGTAAGGATGCTTCACTCTCAAAGATCTCTCCAAGTCTCCCCTTGGCAATGGCCTCTGCTGTCTGGGCATATGGCATAGGTCAGCATGGCCAGGATGTCACTGACATGTGCTCGTATTGGGTACCTCACATTTCTGGCCTCACTCTTGGTGGGTTTATTTGGTAAGAGTGCCCATTGGTAGGGGTCATGGAGCACAGGACTTTGAAGGAAATGTCTACCATATTGGAACATCTTTGTTCCATGGCCCCTTGTCTGAGACCTCAAAGCGGCTTCATTTCTTTTGCAGGAAGGGGCTGTGTCTGGGTCTAAGTCAGATTGGCTGAATATTTATGTCCCACATACATCTGGCCTTCTCTTCCTGAATTGTGTGTTTGTAGCTTAGCACTTCACTTCCTCTTATTGGCAACAGAGCTGGGCACGTACCTTGTGCTTCATAATCTGCCCAGACCTCCCCCCGACAATGAACCTATGGTTCAGATGAACAGAGAAAGAGGAACTTCCAGATCCTCAACATCAGGAAGTATTTATAGAGTGTTTACTATGTGCCAAATGCCGTCTCAAGTTCTTTTACATACATTATCTCATTTAATGTTTGCCACAACTCCAAAATCCACGTATGAGACTTCTGTTATTCGCATTTTACAGAATGGAGAAACTGAGCCTCAGAGAGGCGATGCTACTTGCCTTAGGTCACACAACTGATAATTGGTTAGAATGAGAATTAATTCCCTGTGTGTCCAATCTCAAAGCCTGTACTTTTTCTTTTCTCTTCCAGAGGTAAAGTTTCTTTTGACAATGCCTTTTAAAATTATTTTTTAATTGTTGTAAAATATATATAACATAAAATCTACCATTTTAACCATTTTCATGTGTACAATTCAGTGGTGTAAAGTACATTCACACGGTTACACAACCATGCCACTATCCATCTGCAGAACTTTTTTGTCATTACAAACTGAAACTTTGTATCCATTAAATAATTCCACACTCCTCTCTGCCCAGCCCCTGGTAACCACTCTTTTTGATTCTGTATCTGTGGTTTTGACTACTCTAGGTACTGCGTATCAGTAGAATAATACAGAATTTGTCCTTTCATGACTGGCTTATTCCACCTAGCATAATGTCTTCAAGGTTCACCCGTGTTGTAGCATGTGTCAGAATTTCTTTCCTTTTTAACCCATTATGCTGGAGGTTGCAATATTTTTGTGTGAAAAACCAGACCTTGACGGTGACTTTGAGCAGTAGGATATAAATAACTCCTACAAGCTTAGCATTCCAATAATGGAACACTGGGCATAAATTAAGAATACACAATATTCTATTGTGTATTTATATAGTGTATATATATATACACACACATAATATAGTGTACATATATATACAATAGAATATATAGAAACAGTATATATAATATAAAATATACAATATACAGTATACGTTATATATTATATACATATAGTGTATATACACACAGTGCATATACTATATATAGTGGTGTATATGTATATACATGTATATATACATATATATAGTGGTGTGTGTGTATATATATATTATATATACTACATTCTGTTTATCCATTCACCCATCAGTGGGAGTTTGGTTTATTTCAACCTTTTAGCTGTTGTAAATGATGTCATTGTGCGCCTGACATACAAATATCTGTTGCACTCTGTTCTTTTGAGTATAT
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Task1_train_18798
This variant affects the gene OAS1 (2'-5'-oligoadenylate synthetase 1) found on Chromosome 12. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Pulmonary alveolar proteinosis with hypogammaglobulinemia
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Task1_train_18799
A genomic change on Chromosome 12 affects OAS1 (2'-5'-oligoadenylate synthetase 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Pulmonary alveolar proteinosis with hypogammaglobulinemia
GAAAATACCACAGACAACTGTGAAAGGATTTCATCAACAACAAAAAAAAGATAAAGAAGGAAACACAAAATCTGTTAAATAAGATTTATGTTGGCTGGAGGTTAAAATGCATTTCCAGAGCAGAGTTCAGAGAAAGGCTGGGCTGCTTGTTGCTGGCTAAAGGACAAAGGGTAAGTTTCAGGAAGCAGAAGAGTGAGCAGATGAAATTCAGCACTGGGATCAGGGGAGTGTCTGATTTGCAAAAGGAAAGTGCAAAGACAGCTCCTCCCTTCTGAGGAAACGAAACCAACAGCAGTCCAAGCTCAGTCAGCAGAAGAGATAAAAGCAAACAGGTCTGGGAGGCAGTTCTGTTGCCACTCTCTCTCCTGTCAATGATGGATCTCAGAAATACCCCAGCCAAATCTCTGGACAAGTTCATTGAAGACTATCTCTTGCCAGACACGTGTTTCCGCATGCAAATCAACCATGCCATTGACATCATCTGTGGGTTCCTGAAGGAAAGGTGCTTCCGAGGTAGCTCCTACCCTGTGTGTGTGTCCAAGGTGGTAAAGGTGAGTCCAGGCCTGCCTGGCCAGGGGAGGGGTGGCTGAATGTGCAAGAGTTGAGATTGAGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCAAAAACCTAGAACCCAGGGTGCAAATGTGAGTACAGAGAGCTGAGATCTTCTGGGATGGTGGTTTCTTATTTATCCACACAGCATGTTAAAATAGATTCTGGGGTGAAATCCTACATCCCTATTATTAACAAGTGACCCTCCCCCCTACTTCCCGCTGAAGTTTATGAACCACTGTCCTGGGCGATGCCCATTTCAGAAATAGGGAACTGAATCCCAGCTCTGGTAAACAGTTTGCTAATTCGTGGCCAGGCTAGGGGCTCACCATTTCTGCAGTGAAGAATCATATGTTTTGAAAGCAAATAGCACCTGCTGGCTGCAAGACCTTGAGCAAGTCACTTAACTACTCTGTGTTCCAATTTCCTCAGCCATAATCCCCAATACTGTTGCAGTCTTGCCAGTGCACCTTAATGTAGCAGCTTCTCACTGAATTAGTACCCAAGGTTCTTTGTCCTGCATCCAAGAAAATTAAGGAACATGGACACAAACGTGAGCTTGGAGCAAAAGTTCAGTAAGCAAAAGAAGAAAGCTGTCTCCACTGTGGAGAGGGAAGTCTGAGTGGATTGCCAGATTGCAGCTGAATGCAAAAAACTTTTATAAGAAACCACTCTCCTCCCTGTAACTGTTTGAGAAACTTTTTATCAGTAAAGCTGTGCAACTTCCCTTACCTTATGCAGCTGTGGGTATATCTCTAGGCAAGCATAAAGCGCTGCTTCTCTTGTATGTATAACTGTGGATTTGTTTTAGGTAAGTCCCACTCCCTGCGCCAGTTTCAGGCAGGCCGCTCCTCCAGGGCCCAGCCTTGACCATTTACCTAACTGATTTTTCCTCTACTTTCCCTCAATACCTCATAGGGCCGTGTAGATTAAGTAAAATAGTAAGTGTGAACCACCCAGCATAAGCTAGTCCTGGGCATCGTAAAGGACAATGGGAAAAGAACACAGATCCTGGAAGAAGGCCCCCAGGTTTGAATTGTATTTGCCACCTACTAGCTGGGTGATGGGGCTGATATATTATCTCACTGAGCATCCATTTTCCCATCTGTAAAATGGGAACTAATGATAATGGCATCCAAATCATAGCATCATTGTGAGCATTATAGGAGTTTAAGACATGCAATGCCTTCAGAACAGTGGCTAGTGCTCCATAATGTTAGTGATTGCTCCTGTCATTTTATTTAGGGAGGTTTGCCTCACTAAGCATCAATTATTATTTTTGTCGTCTTTTTCAGGGTGGCTCCTCAGGCAAGGGCACCACCCTCAGAGGCCGATCTGACGCTGACCTGGTTGTCTTCCTCAGTCCTCTCACCACTTTTCAGGATCAGTTAAATCGCCGGGGAGAGTTCATCCAGGAAATTAGGAGACAGCTGGAAGCCTGTCAAAGAGAGAGAGCATTTTCCGTGAAGTTTGAGGTCCAGGCTCCACGCTGGGGCAACCCCCGTGCGCTCAGCTTCGTACTGAGTTCGCTCCAGCTCGGGGAGGGGGTGGAGTTCGATGTGCTGCCTGCCTTTGATGCCCTGGGTGAGAGCTCCCAGCTTCTTTTTCTCCCTCTTCCCATTTCTGAGCAGAAATCTCCCACAGTTTGAGAGCTTTTTGCCCCAACAGGGCATCTCTCTAAAGCAGGGTGGGAGGAGATCTTAGGATCTGTCCCGGGGCAAGAATGAATACGGTCATGATCTATCACAGGAGAGACATTAAACAGCAAATTGGCATAATGTGGGGACAAAGACATTTCTTACAGAACATCTGCAAGGCTTACTGGTTCTGTTTAAGGCAAAATGTGTGAATTTTATCTTTCTAAAATCAGGCAGCAAAGATGTGGCTTAAAGTTCATGTTACTCTCATCTTTGTCCCAACATGAGATCTCATCAAACGTATGCAGCACGTTGGGAGATAGATATTTATAATTTGCAGGAACATTTGGACAGGAAGTGTAACCTCTCAGAGGCTCCCTTGCCACATCAGGAGAATTGGTAAAACCACACTACCTGTATCATATCATTATTTTAAGTGATAAATGATCATCTACATTCAGCTCTGATGAGTAATAGGTGTTCAAAAATAGGAACTTCCAGCCAAGTGTGGTGGCTCATGCTTGTAATTCCAACACTTTTGGAGGCTGAGGCAGGAGGGTCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAGCAAAGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATTTTAAAACATTAGCCAAGTGTGGTGGTACATGCCTGTGGTCGCAGTTATTCAGGACGCTGAGACTGAACGATCACATGAGGCCAGCCAAGGATTCGAGGTGTCAGTGAGCCACGAATGTACCACTGCACTCCATCCTAGGCACAGAGCAAGAGCAAGACCCTGTCTCAATCAATCAGTCAATCAGTCAAAACTATGAATTTCCCAGCTGTATATGAAGGCACCTCAAAACACCACAGTGAACTCACAGAGGGACACGGAATAGTTTAGATTTTAATTTTTTGAGGGAAATGCGATGACATCTGTCACACACCGCACAAACGGCTACTATTAAACTGAACTTACTGATTAGTGGCTACTAATTAATAGTTGGTCATTAAGCAGTAATTAGTGATTAATTATCAAGTAATTAGGACTTAATTAAAGGAACTGTCACAGTTTCCTTTAGTCCTAGGGCAGCCATGAAAAAAAAAATGCTGACTCTCCAAAGACACCAGGGTATGAGAAAGTTTTGGATTCTCTCCTTTGTGCCATCTCCTGTGTTGGGGGCTGAAGTACAATGGTTGTAAAAGACAAGAGGGAGAAGGCTGGTCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGTGGGGGGATCACTTGAAGTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCTCACATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGTGTGCCTGTAATCACAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGATGGAGGTTGCAATGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCGAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAATATAAGGAGTGATTAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAACTAAGTAGGGTGAAACAATAGATAGCCATGGGGGTTAGGGAGCTTTTTTAGACAGGGTCGTGAGGGAGGGTCCCTGAGCCTGAGTGGCGAGAAGGAGTGAGCCTTGGGGAGATCTGGAGGTTCTGGGAAGAGGAATGGCAAGTGCAGAGGCCCTGAAGCAGCAATGACCATGGCACATTTGAGGAAGAGAGAAAAAGTCAGAGAAGTAGAAAGTGGGCAAAGGAAGCAAGACAGGAGGTGAGGTGGGAGAGGTTCCAGAGACCAGATCACACCAGACATCATTGGCCACCATAAGATCTTTGGGTTTTAAAATTCCAGATGTTATGGGATGCAGGAAGC
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