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Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), found on Chromosome 12, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; RASopathy
GGGTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGT
GGGTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGGACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGT
Task1_train_18501
Mutation context: Chromosome 12, Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Noonan syndrome
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GGGTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGGACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGT
Task1_train_18502
The variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; PTPN11-related disorder
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Task1_train_18503
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_18504
A variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18505
Here is a mutation in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Male infertility with azoospermia or oligozoospermia due to single gene mutation
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Task1_train_18506
Given this context: Chromosome 12, gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
GGGTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGT
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Task1_train_18507
A variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; RASopathy
GTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTAT
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Task1_train_18508
A genomic change on Chromosome 12 affects PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18509
With a mutation on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
GTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTAT
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Task1_train_18510
This sequence change occurs on Chromosome 12, altering PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTAT
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Task1_train_18511
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
GTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTAT
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Task1_train_18512
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTAT
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Task1_train_18513
A variant found in Chromosome 12 affects PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Metachondromatosis
GTTCAAGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTAT
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Task1_train_18514
A variant found in Chromosome 12 affects PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18515
A mutation on Chromosome 12 affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome 3
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Task1_train_18516
A mutation found in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18517
A change on Chromosome 12 affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; RASopathy
AGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTA
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Task1_train_18518
Given this variant in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_18519
A change on Chromosome 12 affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; PTPN11-related disorder
AGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTA
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Task1_train_18520
A mutation in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), located on Chromosome 12, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18521
Here is a variant affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
AGTGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTA
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Task1_train_18522
A sequence alteration has been identified in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18523
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), found on Chromosome 12, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_18524
The following genetic variant occurs in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; PTPN11-related disorder
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Task1_train_18525
This genomic variant is located on Chromosome 12, within the PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTAATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
Task1_train_18526
The following genetic variant occurs in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Noonan syndrome
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
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Task1_train_18527
With a mutation on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Metachondromatosis
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
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Task1_train_18528
The variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_18529
Consider a variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
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Task1_train_18530
Chromosome 12 houses a mutation in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18531
With a mutation on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
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Task1_train_18532
This variant impacts the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18533
A genetic alteration is present in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
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Task1_train_18534
Here’s a variant in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Metachondromatosis
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Task1_train_18535
A mutation found in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18536
A variant has been detected on Chromosome 12 in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_18537
A variant has been detected on Chromosome 12 in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Noonan syndrome 3
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
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Task1_train_18538
This sequence change occurs on Chromosome 12, altering PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18539
A mutation found in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
TGATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGC
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Task1_train_18540
A mutation found in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18541
A sequence alteration has been identified in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18542
Consider a variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Short stature
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Task1_train_18543
This mutation occurs in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Abnormal cardiovascular system morphology
GATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCA
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Task1_train_18544
A mutation found in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18545
A variant found in Chromosome 12 affects PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_18546
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18547
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
GATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCA
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Task1_train_18548
With a mutation on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18549
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Metachondromatosis
GATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCA
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Task1_train_18550
Located on Chromosome 12, this mutation impacts PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCA
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Task1_train_18551
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Metachondromatosis
GATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCA
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Task1_train_18552
This variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Non-immune hydrops fetalis
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Task1_train_18553
This mutation occurs in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; RASopathy
GATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCA
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Task1_train_18554
This alteration in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18555
This alteration in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome
GATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCA
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Task1_train_18556
This mutation is located in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; RASopathy
GATTTTCATGACTCAGCCACCTAAGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCA
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Task1_train_18557
The variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), which is on Chromosome 12. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_18558
A variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18559
A mutation on Chromosome 12 affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; RASopathy
AGTAGTTGGGATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGG
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Task1_train_18560
A variant affecting Chromosome 12, within the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_18561
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18562
This genomic variant is located on Chromosome 12, within the PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18563
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
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Task1_train_18564
This sequence variant lies in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTTCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
Task1_train_18565
Given this context: Chromosome 12, gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
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Task1_train_18566
Chromosome 12 houses a mutation in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTTCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
Task1_train_18567
The following genetic variant occurs in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTTCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
Task1_train_18568
This is a variant in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), located on Chromosome 12. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Metachondromatosis
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
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Task1_train_18569
This mutation is located in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
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Task1_train_18570
An alteration has been detected in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; RASopathy
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
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Task1_train_18571
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) is located on Chromosome 12, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
GATTACAGCGCCTGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG
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Task1_train_18572
Here is a genetic alteration in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; RASopathy
TGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTT
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Task1_train_18573
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
TGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTT
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Task1_train_18574
This variant impacts the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
TGGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTT
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Task1_train_18575
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), on Chromosome 12, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; not provided
GGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTG
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Task1_train_18576
This variant affects the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) found on Chromosome 12. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_18577
Here is a genetic alteration in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
GGTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTG
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Task1_train_18578
Consider a variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Noonan syndrome
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GTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGACTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTGA
Task1_train_18579
This variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; RASopathy
GTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTGA
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Task1_train_18580
This variant lies on Chromosome 12 and affects the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18581
Given this variant in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
GTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTGA
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Task1_train_18582
Gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
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Task1_train_18583
This variant affects gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Metachondromatosis
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Task1_train_18584
Here is a mutation in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18585
A sequence alteration has been identified in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18586
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) is located on Chromosome 12, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_18587
A variant on Chromosome 12 in gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; RASopathy
GTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTGA
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Task1_train_18588
This sequence variant lies in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
GTGTACACTACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTGA
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Task1_train_18589
Consider this mutation in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; PTPN11-related disorder
TACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTGACCTCAGGT
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Task1_train_18590
Given this context: Chromosome 12, gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_18591
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Noonan syndrome
TACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTGACCTCAGGT
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Task1_train_18592
The gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) is located on Chromosome 12, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_18593
A variant affecting Chromosome 12, within the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Noonan syndrome 3
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Task1_train_18594
This sequence change occurs on Chromosome 12, altering PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Metachondromatosis
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Task1_train_18595
This alteration occurs within gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) located on Chromosome 12. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; LEOPARD syndrome 1
TACCACACCCAGCTAATTTGTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAATCTCCAACTCTTGGCCTCAAGGGATCTGCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCCCTATGTTTCTTTTTATAAAAATAAGCAAATTAATATTTTTATTACTATTTTCCTTTTATTTTTACACATCAAGTAGAACATTAAATATATTTCTCTGTAATTTTTTTCAGTTACCTAAATCTTTTAGTGATCTCTCTCATCTTTTTAATCAGCTGGATCGCATTCTATCATGTGAATATTTTATAACTTCTATATACTGTCACCAGCAGGTAGCGATTTAGTTGTGTCTAATATTTTAAAATGATATATAATGCCTCAATGAATATAGTAACCTTTTGCATATATTGTTTTGTGCTTTGGGATAACACTACCTCGTATTGGAAACTGTGTCATTACATGTGTCTTTAAAATTACATGTGTCTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTGAGTGGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGAGATCTCGGCCGACTGCAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGGTGAGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGGTCTGCTGACCTCAGGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCATCACTTTTTTTTTTTTCTTAATTGCTGCATAGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCAATACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGGGCGTCGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGACGTGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAATTGCTGCATAGTATTCCATTGTATGAGTAGTAACACAACAATTTTTATAATGCATAGTATTCCATTGTATGAATAGTAATGTAGCACTATTTGTTTATACATTTTTATGATTAAAAAACAAAATGTTTTTCTATTATGAATAAAGTGGCAATGAATATTTTTGTACAAGTGTTTTGGTAGCTATACAGTTATTGTCACTTAATATATGCAATTCGATAGGCCAGTCATTCAAAATAGAAGATATACAAGGTAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTTAGGAGTTTCAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTAGCTGAGCGTGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGATTTATAATGTATGTAAATCCACCGCGAAGGTTGCGGTGAACCGAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATATGCAAGGTAAAGATACTAATAAAGACCTTTGTGTTGAGTTGGTTGACATGTGGTTATTTCACCCATCGTATTTCTTATAGGGAATAGGTAAATTCGTTCCTTGGGTTTCTTTCAACACTTAGGTAAAATCCGACGTGGAAGATGAGATCTGATTTTACTGGTGTAACTCTTTATTTGTCCCCTTGCCTCCCTTTCCAATGGACTATTTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTCAGTAACATTTTAGTGACCACAAAGTCTGCTGCTCCCTTGTGCCCTGAGTGTCAGAAATGCATGACGGTCTGTGTATGACTCTCTGACTCCAAAGGCTTGTGACTGTTTTTTGAGCTGTAATCTTTAAAGAATTACTAAAGTGAGACTAATAGCATCAAATTATTTTCAGAGTACCTTTTTCCTGCAAAAGTTTTAATCAGTGTTACTTACACTCATCCTATAGGGGTTGCATACCATTCCTGCATATACTTGGTACGTGTATTAGTTTTAAGACTTATTGAACTTCAGCAGATAATCTTTGAGAGTTATTAGAGGAAAACAAATGATAATGGAGACACCAAAATAGCAGCAGTTTTCTATGGTGGCTCTCGACCAGTTATTCAGCAATGTCACCAACAGATGTCAGTTTAAGCTCAGAAGTGGAAAAGCAGAGAGCTCAGAGGGTCAGCTTTTTCATCAGTTCTTTTAATGTTATCACCACAATTATGTGAGAATGACCTTGCTTAGAGAAAATTATGTTATTTTCGAGATCTTTCCCCCTGTGTTGGAACTAGGCTGATGAAAGCATGGGCTTGACTTATTTATTGATTGTATTCGTTTTGTACATTCCCAATCTCCTCTCTGACTTGGTGCAAATTCAGGATCTCTTAGTTAGTTTGTATATTTTGTGTCTTCAGGTATGATTTTTTCAGCTTATACCTTTATGTCAGTGCTATTATGTGCTGATAATTTGTTTCTCTAGCTACCACCGTAGCTTCAGGCAAAAGGCTGTCAGCCAACTCTGTACAGTTTATTTCTAAATTTTACTGTTTTCAGTTGAGTATGGATGAAGAATAACTCAAAGTTTATTCTTTTGATGATGAGCCCTTAACACCACCTGCCATGATAGTACTTGCTTTCTGACCAAGATCCTGAGGGAAAAAGCCACTTTATTATTAGAACTATGTTAAGATGCTTCCCAAAAAACATGGAGCAGTATTGTCTCAAAGTCTGTCCTTGGATGGCTTTGGATGCCTACATCAGGACTGTCTGATGTGCTGGTTAAAATGCAGATTCCTGGGCCTCATTCAGACTTACATGTATTGATATTGCTGGTTGTGGAGCCTGGGAATTCATATTTTTAGCAAAATCCCTCATTTTTACTCCAAGTCTTATGTGCATTATACAGTTTGAGATGATCACCCAGGATATAGTCCAAAGACACTGGAGGCTGTTGAAGTATAGGTTGTATATATGGAAAAGGTTGGAATGTTTGAATTAATTTATAATGAAGATCCTTTTTAATTGAGTGTTCACATGCCAAGGCAAGGACAAACATTCAAAATGATTTTCTGTCTCTGTTACAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCAAGTGACGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGTAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGTCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGACCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTCTCTATTACAACTTTTTATTACAACTTCTTTATTTTGACTTTATTTTTACAAATTATTTATTTATTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCACACCCGGCCAATTTTGTATTTTTAGCAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCTTGACCTCAGGT
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Task1_train_18596
This is a variant in PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11), located on Chromosome 12. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Juvenile myelomonocytic leukemia
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Task1_train_18597
This variant impacts the gene PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18598
This gene mutation involves PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) on Chromosome 12. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Noonan syndrome 1
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Task1_train_18599
A mutation on Chromosome 12 affecting PTPN11 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; RASopathy
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