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Selezione delle impostazioni ottimali del potenziale del tubo per l'imaging virtuale mono-energetico della TC a doppia energia dello iodio nell'addome.Per determinare le impostazioni appropriate del potenziale del tubo per l'acquisizione di dati a doppia sorgente e doppia energia su una gamma di dimensioni di fantocci e per determinare le energie fotoniche ottimali per l'imaging virtuale mono-energetico. Fantasmi d'acqua (larghezza 15-50 cm) contenenti un oggetto di prova di iodio sono stati scansionati su un scanner TC a doppia sorgente di terza generazione che utilizza tutte le coppie potenziali di tubi disponibili. Le immagini virtuali mono-energetiche a 40, 50, 60 e 70 keV sono state prodotte utilizzando Mono-energetic Plus. Per determinare i parametri operativi pratici per il sistema CT valutato, le esclusioni dei dati sono state effettuate in base all'accuratezza del numero CT dell'acqua, agli artefatti e all'utilizzo di un vincolo di rumore. Sono state misurate e confrontate le metriche di qualità dell'immagine. Sono state identificate le coppie di potenziali del tubo escluse; queste erano generalmente a basso potenziale del tubo per il raggio a bassa energia e il basso fotone energia io. Per le condizioni non escluse, il CNR più alto è stato ottenuto utilizzando l'impostazione 70/150Sn nei fantocci ≤35 cm a 40 keV. 70/150Sn ha fornito un CNR di iodio ottimale inferiore a 40 cm di larghezza laterale del fantoccio a 40 keV, mentre 90/150Sn ha consentito una qualità dell'immagine accettabile nei fantocci >40 cm di larghezza pari o superiore a 60 keV.
Risultati della risonanza magnetica dell'emangioendotelioma epitelioide epatico: enfasi sulla fase epatobiliare utilizzando Gd-EOB-DTPA.Esaminare le caratteristiche dell'emangioendotelioma epitelioide epatico ( HEH) sulla risonanza magnetica (MRI) utilizzando Gd-EOB-DTPA tra il gruppo core e non core sono stati calcolati per il centro e la periferia del tumore. Abbiamo anche esaminato la correlazione radiologica e patologica per i casi in cui è stata eseguita la resezione chirurgica. del centro ha mostrato un miglioramento lento a partire dalla fase di transizione, con conseguente divergenza tra i due grafici durante l'intero studio dinamico (p < 0.05). Patologicamente, il centro della lesione era costituito da una cellularità ridotta con stroma mixoialino e necrosi. considerato un nuovo segno diagnostico di HEH.
Doppio effetto del locus Ph1 del grano sulla sinapsi del cromosoma e sul crossover.Gli allopoliploidi devono possedere un meccanismo per facilitare la sinapsi e il crossover (CO) tra omologhi, in preferenza agli omeologi (cromosomi correlati), per garantire il successo della meiosi. Nel grano esaploide, il locus Ph1 ha un effetto importante sul controllo di questi processi. Lo studio di un mutante del grano privo di Ph1 offre l'opportunità di esplorare i meccanismi sottostanti. Recentemente, è è stato proposto che Ph1 stabilizza il grano durante la meiosi, sia promuovendo la sinapsi omologa durante la prima meiosi e impedendo ai siti MLH1 sugli omoeologi sinapsi di diventare CO più tardi nella meiosi. Qui, esploriamo questi due effetti e dimostriamo in primo luogo che se Ph1 è presente o meno, la sinapsi tra gli omeologi non avviene durante la fase del bouquet telomerico, con solo la sinapsi omologa che avviene durante questa fase. Inoltre, nel grano privo di Ph1, la sinapsi complessiva è de posato rispetto al bouquet telomerico, con più sinapsi che si verificano dopo la fase del bouquet, quando è possibile anche sinapsi omoeologa. In secondo luogo, dimostriamo che in assenza di Ph1, possiamo aumentare il numero di siti MLH1 che progrediscono a CO alterando le condizioni ambientali di crescita; mostriamo che livelli di nutrienti più elevati nel suolo o temperature più basse aumentano il livello di CO sia omologa che omoeologa. Queste osservazioni suggeriscono opportunità per migliorare lo sfruttamento del mutante del frumento Ph1 nei programmi di allevamento.
Ruolo della silodosina come terapia medica espulsiva nei calcoli ureterali: una meta-analisi di studi randomizzati controllati.L'obiettivo di questo studio è di indagare il efficacia della silodosina nella terapia espulsiva medica (MET) per i calcoli ureterali. Abbiamo condotto una revisione sistematica e una meta-analisi per determinare l'efficacia e la sicurezza della silodosina nella MET per i calcoli ureterali. Abbiamo cercato PubMed, Embase, Medline, Central (the Cochrane Library) , Numero 1,2013), Google Scholar dall'inizio a marzo 2015 per studi randomizzati e controllati (RCT), che confrontano silodosina con tamsulosina o controllo sul passaggio di calcoli ureterali. Otto RCT con un totale di 1145 pazienti con calcoli ureterali (300 pazienti nel controllo In questa meta-analisi sono stati inclusi 287 pazienti nel gruppo tamsulosina, 558 pazienti nel gruppo silodosina). Se confrontata con il controllo, la silodosina ha migliorato significativamente il tasso di espulsione dei calcoli ureterali distali (RR: 1,42; IC 95%, 1,21-1,67). ; P < 0.0001), mentre non vi era alcuna differenza significativa tra la silodosina e il controllo nella velocità di espulsione del prossimale (RR: 0,99; IC 95%, 0,69-1,43; P < 0,97) o medio (RR: 1,13; 95% CI, 0,60-2,16; P < 0,0001) calcoli ureterali. Non c'era alcuna differenza significativa tra silodosina e tamsulosina in termini di tempo di espulsione (WMD: -2,47; 95% CI, da -5,32 a 0,39; P = 0,09), uso di analgesici (WMD: -0,39; 95% CI, da -0,91 a 0,13; P = 0,14) e tasso di eiaculazione retrograda (RR: 1,85; 95% CI, 0,95-3,59; P = 0,07) in MET per calcoli ureterali distali. Tuttavia, la silodosina ha fornito un tasso di espulsione significativamente più alto (RR: 1,25; 95% CI, 1,13-1,37; P < 0,0001) rispetto alla tamsulosina per i calcoli ureterali distali. La silodosina ha migliorato significativamente il tasso di espulsione dei calcoli ureterali distali ed è risultata clinicamente superiore alla tamsulosina. La silodosina è risultata inefficace nella MET per i calcoli prossimali e medi dell'uretere. Sono necessari ulteriori studi RCT per confrontare l'efficacia della silodosina rispetto alla tamsulosina nella MET per i calcoli ureterali distali.
The Lung Cancer Surgical Study Group del Japan Clinical Oncology Group: attività passate, stato attuale e direzione futura.The Lung Cancer Surgical Study Group of il Japan Clinical Oncology Group è stato organizzato nel 1986. Inizialmente hanno partecipato 26 istituzioni collaborative. Nel primo periodo, il Lung Cancer Surgical Study Group si è concentrato su terapie a modalità combinate e ha condotto nove studi, tra cui JCOG9101: chemioterapia adiuvante per il cancro del polmone a piccole cellule resecato e JCOG9806: chemioradioterapia di induzione seguita da intervento chirurgico per tumore del solco superiore, che ha avuto un grande impatto sulle strategie di trattamento per alcuni tipi speciali di cancro del polmone. Dal 2000, il Lung Cancer Surgical Study Group ha definito l'adenocarcinoma radiologicamente non invasivo: JCOG0201 e ha studiato modalità adeguate di resezione chirurgica per carcinoma polmonare non a piccole cellule di piccole dimensioni: JCOG0802, JCOG0804 e JCOG1211. L'accumulazione di questi studi è ora completa e noi sono in attesa della maturazione dei dati di follow-up. Inoltre, sono stati condotti due studi adiuvanti: JCOG0707; uno studio di Fase III sulla chemioterapia adiuvante per il carcinoma polmonare non a piccole cellule di stadio I (T1 > 2 cm) resecato e JCOG1205; uno studio di Fase III sulla chemioterapia adiuvante per tumore neuroendocrino polmonare di alto grado completamente resecato. L'accantonamento di JCOG0707 è completo e si è in attesa della maturazione dei dati di follow-up. Attualmente, 44 istituzioni sono membri attivi del Lung Cancer Surgical Study Group. Oltre ai chirurghi toracici, al Lung Cancer Surgical Study Group partecipano anche medici oncologi, patologi e radioterapisti. Il Lung Cancer Surgical Study Group continua a condurre vari studi clinici nel tentativo di migliorare la sopravvivenza nei pazienti con cancro ai polmoni. In questa recensione, forniamo una panoramica degli ultimi 30 anni, nonché lo stato attuale e la direzione futura del Lung Cancer Surgical Study Group.
La carenza di Cks1 porta a difetti dell'apprendimento e della memoria a lungo termine e alla formazione dipendente da p27 di aggregati neuronali di cofilina.Nelle cellule mitotiche, la ciclina-dipendente La proteina subunità chinasi (CDK) CKS1 regola l'ingresso nella fase S mediando la degradazione dell'inibitore CDK p27. Sebbene i neuroni maturi manchino di CDK mitotici, abbiamo scoperto che CKS1 era attivamente espresso nei neuroni post-mitotici dell'ippocampo adulto. È interessante notare che il knockout di Cks1 (Cks1 -/-) i topi hanno mostrato una scarsa memoria a lungo termine e un ridotto mantenimento del potenziamento a lungo termine nei circuiti dell'ippocampo. Abbiamo inoltre dimostrato che è stato l'aumento del livello di p27 che ha attivato la cofilina sopprimendo la fosforilazione inibitoria mediata dalla chinasi RhoA della cofilina, con conseguente formazione di aggregati di cofilina nel C ks1-/- cellule neuronali. Coerentemente con i rapporti secondo cui la peptidil-prolil-isomerasi PIN1 compete con CKS1 per il legame di p27, abbiamo scoperto che l'inibizione di PIN1 diminuiva la formazione di aggregati di cofilina attraverso la diminuzione dei livelli di p27, attivando così RhoA e aumentando la fosforilazione della cofilina. I nostri risultati hanno rivelato che CKS1 è coinvolto nel normale sviluppo della sinapsi glutamatergica e nella maturazione della colonna vertebrale dendritica nell'ippocampo adulto attraverso la modulazione della stabilità di p27.
Il sequenziamento personalizzato del genoma accoppiato alla tecnologia iPSC identifica GTDC1 come un gene coinvolto nei disturbi dello sviluppo neurologico.I meccanismi cellulari e molecolari alla base delle condizioni dello sviluppo neurologico come lo spettro autistico sono stati studiati intensamente per decenni. La capacità di generare cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) specifiche del paziente offre ora una nuova strategia per modellare le malattie umane. Recenti studi hanno riportato la derivazione di iPSC da pazienti con disturbi neurologici. La sfida chiave rimane la dimostrazione di fenotipi correlati alla malattia e la capacità di modellare la malattia. Qui riportiamo un caso di studio con segni di disturbi dello sviluppo neurologico (NDDs) che ospitano riarrangiamenti cromosomici che sono stati sequenziati utilizzando il sequenziamento del DNA paired-end tag (DNA-PET) a inserto lungo Abbiamo identificato la rottura di un gene specifico, GTDC1 Derivando le iPSC da questo paziente e differenziandole in ne cellule progenitrici urali (NPC) e neuroni abbiamo sezionato il processo patologico a livello cellulare e osservato difetti sia nelle NPC che nelle cellule neuronali. Abbiamo anche dimostrato che l'interruzione dell'espressione di GTDC1 in NPC e neuroni umani wild type mostrava un fenotipo simile a quello delle iPSC dei pazienti. Infine, abbiamo utilizzato un modello di zebrafish per dimostrare un ruolo per GTDC1 nello sviluppo del sistema nervoso centrale. I nostri risultati evidenziano l'importanza di combinare le tecnologie di sequenziamento con la tecnologia iPSC per la modellazione di NDD che potrebbe essere applicata per la medicina personalizzata.
Una dimostrazione diretta delle differenze funzionali tra le suddivisioni del V5/MT umano.Due suddivisioni del V5/MT+ umano: uno situato posteriormente (MT/TO -1) e l'altro più anteriormente (MST/TO-2) sono stati identificati in partecipanti umani utilizzando la risonanza magnetica funzionale sulla base delle loro rappresentazioni del campo visivo omolaterale rispetto a quello controlaterale. Queste suddivisioni sono state quindi mirate per l'interruzione mediante l'applicazione di stimolazione magnetica transcranica ripetitiva (rTMS). La rTMS è stata erogata alle aree corticali mentre i partecipanti svolgevano compiti di discriminazione della direzione che coinvolgevano 3 diversi tipi di stimoli in movimento definiti dal movimento traslazionale, radiale o rotatorio di schemi di punti. Per il movimento traslatorio, le prestazioni erano significativamente ridotte rispetto alla linea di base quando rTMS è stato applicato sia a MT/TO-1 che a MST/TO-2 Per il movimento radiale, c'è stato un effetto differenziale tra MT/TO-1 e MST/TO-2, con solo interruzione di quest'ultima area che influenzano le prestazioni. L'rTMS non è riuscito a rivelare una dissociazione completa tra MT/TO-1 e MST/TO-2 in termini di contributo alla percezione del movimento rotatorio. Sulla base di questi risultati, MT/TO-1 e MST/TO-2 sembrano essere suddivisioni funzionalmente distinte di hV5/MT+. Mentre entrambe le aree sembrano essere implicate nell'elaborazione del movimento traslazionale, solo la regione anteriore (MST/TO-2) fornisce un contributo causale alla percezione del movimento radiale.
L'eliminazione dell'acquaporina-4 riduce l'aumento del glutammato extracellulare nella depressione a diffusione corticale in topi svegli.La depressione a diffusione corticale (CSD) è un fenomeno che sfida il meccanismi omeostatici da cui dipende in modo così critico la normale funzione cerebrale. L'analisi della sequenza di eventi nella CSD ha il potenziale di fornire nuove informazioni sui processi fisiologici alla base della normale funzione cerebrale, nonché sulla fisiopatologia delle condizioni neurologiche caratterizzate dalla disomeostasi ionica. Qui, abbiamo ha studiato la progressione sequenziale della CSD in topi svegli di tipo selvatico e in topi privi del recettore dell'acquaporina-4 (AQP4) o dell'inositolo 1,4,5-trifosfato di tipo 2 (IP3R2). una nuova combinazione - una risoluzione temporale e spaziale senza precedenti, mostriamo che la CSD porta a segnali di Ca2+ vivaci negli astrociti e che la durata di questi segnali di Ca2+ è ridotta in assenza di f AQP4 ma non in assenza di IP3R2. La diminuzione dei segnali Ca2+ astrocitici, AQP4-dipendenti, coincide nel tempo e nello spazio con una diminuzione della durata dell'overflow di glutammato extracellulare ma non con il picco iniziale del rilascio di glutammato, suggerendo che nella CSD, l'accumulo di glutammato extracellulare è esteso attraverso l'AQP4- rilascio di glutammato dipendente dagli astrociti. I dati attuali indicano un contributo gliale saliente alla CSD e identificano l'AQP4 come un nuovo obiettivo per la terapia.
Ruoli distinti per la corteccia cingolata anteriore e prefrontale dorsolaterale durante il conflitto tra regole astratte.Distinti modelli di attività all'interno della corteccia cingolata anteriore (ACC) e La corteccia prefrontale dorsolaterale (dlPFC) riportata negli studi di neuroimaging durante compiti che comportano conflitti tra risposte concorrenti è stata spesso citata come prova per i loro contributi chiave rispettivamente al monitoraggio del conflitto e all'adattamento comportamentale, tuttavia, le prove a sostegno dei pazienti neuropsicologici sono state scarse e contraddittorie. Abbiamo somministrato un analogo ben studiato del Wisconsin Card Sorting Test, progettato per suscitare il conflitto tra 2 regole astratte, a una coorte di 6 pazienti con danni all'ACC o al dlPFC. Neanche i pazienti che avevano subito danni più significativi all'ACC non sono stati compromessi su una misura di "costo del conflitto" né su misure di "adattamento comportamentale indotto dal conflitto". Al contrario, il danno a dlPFC non ha influenzato ct la misura del costo del conflitto ma ha abolito la capacità dei pazienti di adattare il proprio comportamento a seguito dell'esposizione al conflitto, rispetto ai controlli. Questo modello di risultati integra i risultati dei primati non umani con lesioni più circoscritte ad ACC o dlPFC sullo stesso compito e fornisce prove convergenti che l'ACC non è necessario per le prestazioni quando viene suscitato un conflitto tra 2 regole astratte, mentre dlPFC svolge un ruolo fondamentale nel comportamento adattamento.
Paura che si diffonde attraverso i sensi: gli eventi emotivi visivi alterano le risposte corticali al tatto, all'udito e alla vista.Attenzione e percezione sono potenziate per stimoli emotivamente significativi, promuovere una reattività e una sopravvivenza efficienti. Ma tale miglioramento si estende agli stimoli presentati simultaneamente attraverso diverse modalità sensoriali. Abbiamo utilizzato la risonanza magnetica funzionale negli esseri umani per esaminare gli effetti dei segnali emotivi visivi sugli input sensoriali concomitanti nelle modalità uditive, somatosensoriali e visive. Primo. , abbiamo identificato aree sensoriali sensibili a toni, tocchi o sfarfallii irrilevanti per il compito, presentati bilateralmente mentre i partecipanti si occupavano di un viso neutro o pauroso, quindi abbiamo misurato se queste risposte fossero modulate dal contenuto emotivo del viso. nelle cortecce primarie erano potenziate per gli stimoli uditivi e tattili quando questi apparivano con facce paurose, rispetto a quelle neutre, ma s le risposte della corteccia triata agli stimoli visivi sono state ridotte nell'emisfero sinistro, plausibilmente come conseguenza della competizione sensoriale. Infine, le analisi di congiunzione e connettività funzionale hanno identificato 2 reti distinte presumibilmente responsabili di questi processi di modulazione emozionale, che coinvolgono le cortecce cingolata, insulare e orbitofrontale per le aumentate risposte sensoriali e la corteccia prefrontale ventrolaterale per le diminuite risposte sensoriali. Questi risultati suggeriscono che l'emozione sintonizza l'eccitabilità dei sistemi sensoriali attraverso più modalità contemporaneamente, consentendo all'individuo di elaborare in modo adattivo gli input in arrivo in un ambiente potenzialmente minaccioso.
L'attenzione spaziale riduce lo scoppio nell'area corticale visiva dei macachi MST.L'attenzione visiva modula la frequenza di scarica dei neuroni in molte aree corticali dei primati. In V4, un area corticale nella via visiva ventrale, è stato anche dimostrato che l'attenzione spaziale riduce la tendenza dei neuroni a sparare picchi strettamente separati (burstiness). Un modello recente propone che un singolo meccanismo spieghi sia l'aumento della frequenza di scarica che la riduzione della burstness in V4. , ma questo non è stato testato empiricamente. Inoltre non è chiaro se la riduzione della burstness dovuta all'attenzione spaziale si trovi in altre aree visive e per altri tipi di attenzione. Abbiamo quindi registrato da singoli neuroni nell'area temporale superiore mediale (MST), una chiave area di elaborazione del movimento lungo il percorso visivo dorsale, di due scimmie rhesus mentre svolgono un compito che impegna sia l'attenzione spaziale che basata sulle caratteristiche Mostriamo che in MST, l'attenzione spaziale è associata a un chiaro reducti acceso in raffiche che è indipendente dal miglioramento simultaneo della cadenza di fuoco. Al contrario, l'attenzione basata sulle caratteristiche migliora la frequenza di fuoco ma non è associata a una significativa riduzione della raffica. Questi risultati stabiliscono la riduzione della burstiness come un effetto diffuso dell'attenzione spaziale. Suggeriscono anche che, contrariamente al modello proposto di recente, gli effetti dell'attenzione spaziale sulla raffica e sulla frequenza di fuoco emergono da meccanismi diversi.
Elicitori delle difese delle piante ospiti Sopprimono parzialmente le popolazioni di Cacopsylla pyricola (Hemiptera: Psyllidae) in condizioni di campo.Gli elicitori di difesa sono prodotti che attivano risposte di difesa acquisite in piante, rendendo così le piante meno suscettibili all'attacco di una vasta gamma di parassiti. Abbiamo dimostrato in precedenza in condizioni di laboratorio che le applicazioni fogliari degli stimolatori di difesa Actigard (acibenzolar-S-metil), Employ (proteina arpina) o ODC (chitosano) a peri in vaso (Pyrus communis L. ) ciascuno ha causato un aumento della mortalità delle ninfe Cacopsylla pyricola (Förster) (Hemiptera: Psyllidae) e alterato il comportamento di deposizione e ovodeposizione degli adulti In questo studio, abbiamo monitorato le popolazioni di C. pyricola su oltre un periodo di 3 anni su alberi cresciuti nei frutteti trattati con acqua (controllo non trattato), Actigard, Employ o ODC. Meno ninfe sono state osservate su alberi trattati con elicitors rispetto agli alberi non trattati sia nel 2014 che nel 2016. A simi Un modello ampio ma statisticamente non significativo è stato osservato nel 2015 quando è stato osservato quasi il 30% in meno di ninfe su alberi trattati con elicitori rispetto ai controlli non trattati. Le riduzioni osservate nel numero di psillidi da parte degli elicitori della difesa sono state modeste e non giustificano l'uso di questi prodotti da soli per la gestione di C. pyricola. Tuttavia, questi prodotti sono spesso utilizzati per la gestione del fuoco batterico e le nostre osservazioni secondo cui gli elicitori riducono anche le popolazioni di C. pyricola possono essere utili per approcci di gestione integrata dei parassiti a livello di sistema.
Sulle basi molecolari della divisione del lavoro in Solenopsis invicta (Hymenoptera: Formicidae) Lavoratori: Analisi RNA-seq.La formica del fuoco Solenopsis invicta Buren è un importante parassita invasivo. Tra i lavoratori di S. invicta i cambiamenti comportamentali dipendono dall'età in cui le formiche più giovani sono infermiere e le formiche più anziane raccoglitrici di formiche. Per identificare potenziali geni associati a questa divisione del lavoro, abbiamo confrontato l'espressione genica tra raccoglitrici e infermiere mediante sequenziamento ad alto rendimento In totale, abbiamo identificato 1.618 geni espressi in modo significativamente diverso tra infermieri e raccoglitori, di cui 542 erano sovraregolati nei raccoglitori e 1.076 erano sovraregolati negli infermieri. Molti percorsi relativi al metabolismo erano significativamente arricchiti, come l'accumulo di lipidi e la biosintesi degli acidi grassi, che potrebbero contribuiscono alla divisione del lavoro in S. invicta Diversi geni coinvolti nella metilazione del DNA, nella trascrizione e nelle risposte olfattive, nonché nella resistenza allo stress, sono stati espressi in modo differenziale sed tra infermieri e lavoratori raccoglitori. Infine, un confronto tra i dati di microarray precedentemente pubblicati e i nostri dati di RNA-seq in S. invicta mostra che 116 geni si sovrappongono e il termine GO myofibril assembly (GO: 0030239) è stato contemporaneamente arricchito in modo significativo. Questi risultati migliorano la conoscenza di geni e percorsi molecolari potenzialmente importanti associati alla divisione del lavoro dei lavoratori in S. invicta. Speriamo che il nostro set di dati fornisca. geni bersaglio candidati per interrompere l'organizzazione in S. invicta come strategia di controllo contro questo parassita invasivo.
Glicogeno fosforilasi e glicogeno sintasi: il clonaggio genico e l'analisi dell'espressione rivelano il loro ruolo nel metabolismo del trealosio nella cicala bruna, Nilaparvata lugens Stål (Hemiptera: Delphacidae).L'interferenza dell'RNA è stata utilizzata per studiare la funzione e la regolazione dei geni degli insetti\'. La glicogeno sintasi (GS) e la glicogeno fosforilasi (GP) sono due enzimi chiave nella conversione dei carboidrati\' negli insetti. Contenuto di glicogeno ed espressione genica di GP e GS in diversi I tessuti e gli stadi di sviluppo della cavalletta bruna Nilaparvata lugens Stål (Hemiptera: Delphacidae) sono stati analizzati nel presente studio, utilizzando la reazione a catena della polimerasi a trascrizione inversa quantitativa per determinare la loro risposta alle trealasi a doppio filamento (dsTRE), trealosio-6-fosfato sintasi (dsTPS) e iniezione di validamicina La più alta espressione di entrambi i geni è stata rilevata nel germoglio dell'ala, seguito dai tessuti delle gambe e della testa e sono stati mostrati diversi modelli di espressione ac superare le fasi di sviluppo analizzate. Il contenuto di glicogeno è diminuito significativamente di 48 e 72 ore dopo l'iniezione di dsTPS e 48 ore dopo l'iniezione di dsTRE. L'espressione di GP è aumentata di 48 ore dopo l'iniezione di dsTRE e dsTPS e diminuita significativamente di 72 ore dopo l'iniezione di dsTPS, dsTRE1-1 e dsTRE1-2. L'espressione di GS è diminuita significativamente di 48 h dopo l'iniezione di dsTPS2 e dsTRE2 e di 72 h dopo l'iniezione di dsTRE1-1 e dsTRE1-2. L'espressione di GP e GS e il contenuto di glicogeno sono diminuiti significativamente di 48 h dopo l'iniezione di validamicina. L'attività GP è diminuita significativamente 48 h dopo l'iniezione di validamicina, mentre le attività GS dei gruppi di iniezione dsTPS1 e dsTRE2 erano significativamente superiori a quelle della GFP a doppio filamento (dsGFP) 48 h dopo l'iniezione, rispettivamente. Pertanto, il glicogeno viene sintetizzato, rilasciato e degradato attraverso diversi tessuti degli insetti in base alla necessità di mantenere livelli stabili di trealosio.
Identificazione di quattro geni trasportatori di cassette leganti l'ATP in Cnaphalocrocis medinalis e la loro espressione in risposta al trattamento con insetticidi.La cassetta legante l'ATP (ABC) i trasportatori appartengono a una superfamiglia di geni coinvolti nel trasporto di molecole specifiche attraverso le membrane lipidiche, così come la resistenza agli insetticidi, presente in tutti gli organismi viventi. In questo studio, abbiamo combinato il database del trascrittoma Cnaphalocrocis medinals con un approccio bioinformatico per identificare quattro C. medinali ABCs (CmABCs), inclusi CmABCG1, CmABCG4, CmABCC2 e CmABCC3. L'analisi dell'espressione tissutale ha mostrato che questi geni avevano un modello di espressione tessuto-specifico. , CmABCC2 e CmABCC3 erano più alti nell'intestino medio, seguiti dall'espressione nel corpo grasso. L'analisi dell'espressione dello stadio di sviluppo ha mostrato che CmABCG1, CmABCG4, CmABCC2 e CmABCC3 sono stati espressi principalmente negli adulti. La trascrizione di CmABCG1, CmABCG4 e CmABCC2 è stata significativamente indotta dal clorpirifos. Nel loro insieme, i risultati del nostro studio hanno fornito informazioni utili per la comprensione del sistema di disintossicazione di C. medinalis.
Modelli Diel di attività per insetti impollinatori di due specie di palme da olio (Arecales: Arecaceae).L'impollinazione di due specie di palme da olio, Elaeis guineensis Jacquin ed Elaeis oleifera Cortés (Arecales: Arecaceae), dipende da un rapporto mutualistico con gli insetti, che utilizzano le infiorescenze maschili come luogo di cova, e visita le infiorescenze femminili attirate dall'odore emesso, che è simile a quello dei maschi. le infiorescenze di questi insetti sono fondamentali per l'adeguata impollinazione naturale della pianta ospite, la loro attività è scarsamente documentata. Nel presente studio, determiniamo l'attività diel di due punteruoli impollinatori specializzati (Coleoptera: Curculionidae) sulle infiorescenze dei rispettivi ospiti- palma: Elaeidobius kamerunicus Faust specializzato su E. guineensis, e Grasidius hybridus O\'Brien e Beserra specializzati su E. oleifera Il tempo medio di attività è stato studiato utilizzando l'intercettazione passiva tra ps. Quindi il modello e la durata sono stati affinati utilizzando l'intrappolamento per aspirazione all'interno del periodo attivo per ciascuna specie di insetto in corrispondenza delle infiorescenze maschili e femminili. Tutti gli esperimenti sono stati condotti in una piantagione di palma da olio ecuadoriana, situata vicino alla foresta amazzonica. El. kamerunicus e G. hybridus sono risultati essere gli impollinatori di E. guineensis ed E. oleifera, rispettivamente. Le due specie differivano nel loro modello di attività: E. kamerunicus era attivo al mattino e G. hybridus durante un breve periodo al tramonto. Per entrambe le specie di palma, le visite degli insetti sono state sincrone sia sulle infiorescenze maschili che su quelle femminili. La sincronicità è discussa come una strategia per mantenere la relazione mutualistica tra i partner. Questi risultati aumentano la nostra comprensione del sistema di impollinazione della palma da olio.
Analisi del trascrittoma e identificazione delle principali famiglie di geni di disintossicazione e obiettivi di insetticidi in Grapholita Molesta (Busck) (Lepidoptera: Tortricidae).La falena della frutta orientale, Grapholita molesta (Busck) (Lepidoptera: Tortricidae), è un importante parassita della maggior parte delle drupacee e delle pomacee e provoca gravi danni all'industria della frutta in tutto il mondo. Questo insetto è stato controllato principalmente attraverso l'applicazione di insetticidi; di conseguenza, G. molesta ha sviluppato una resistenza a molti diversi tipi di insetticidi. Per identificare i geni di disintossicazione, abbiamo, de novo, sequenziato il trascrittoma di G. molesta (Lepidoptera: Tortricidae) e prodotto 58.970 unigeni di cui 26.985 unigeni abbinati a proteine note. In totale, Sono state identificate 2.040 ripetizioni di sequenze semplici Il set completo di dati del trascrittoma ci ha permesso di identificare membri di importanti famiglie di geni correlati alla disintossicazione in G. molesta, tra cui 77 unigene s di putativi citocromo P450, 28 di glutatione S-transferasi, 46 di carbossilesterasi e 31 di bersagli insetticidi. Gli ortologhi di alcuni di questi unigeni hanno dimostrato di svolgere un ruolo fondamentale nella resistenza agli insetticidi in altre specie di insetti e questi unigeni probabilmente hanno funzioni simili in G. molesta.
L'effetto della distribuzione dei nidi sulla propagazione sostenibile di Osmia lignaria (Hymenoptera: Megachilidae) nei frutteti di ciliegie commerciali.L'ape blu del frutteto, Osmia lignaria (Say), è un'ape solitaria che è un eccellente impollinatore dei frutteti arborei. A causa dell'aumento annuale dei costi di affitto degli alveari, molti frutteti sono desiderosi di sviluppare strumenti e pratiche di gestione per supportare O. lignaria come impollinatore alternativo Stabilire l'impollinazione di O. lignaria come un'industria sostenibile richiede un'attenta considerazione della gestione delle api e dei frutteti. Qui, testiamo l'effetto della distribuzione dei nidi artificiali sulla propagazione all'interno dei frutteti di O. lignaria nei frutteti di ciliegie commerciali dello Utah. le distribuzioni sono state confrontate su tre appezzamenti accoppiati di 1,2 ettari. Una distribuzione, tradizionalmente impiegata dai consulenti di O. lignaria, includeva un contenitore situato in posizione centrale per l'annidamento di massa con \'satellite\' più piccoli e circostanti cassette nido ai margini del frutteto. L'altra distribuzione era composta da nidi più piccoli e più equamente distribuiti negli appezzamenti di 1,2 ettari. In quest'ultima distribuzione dei nidi è stata osservata una propagazione significativamente maggiore di O. lignaria, sebbene tutti i trattamenti abbiano determinato un ritorno delle api superiore al numero di api inizialmente rilasciate. Questi risultati forniscono supporto per l'uso di O. lignaria nei frutteti di ciliegie aspri e dimostrano come semplici modifiche alla configurazione e alla gestione delle api possano influenzare gli sforzi di propagazione.
PhagesDB: the actinobacteriophage database.The Actinobacteriophage Database (PhagesDB) è un sito Web completo, interattivo e supportato da un database che raccoglie e condivide informazioni relative a la scoperta, la caratterizzazione e la genomica dei virus che infettano gli ospiti Actinobatteri. Ad oggi, sono stati inseriti nel database più di 8000 batteriofagi, di cui oltre 1600 con genomi sequenziati. PhagesDB svolge un ruolo cruciale nell'organizzazione delle scoperte dei biologi fagici di tutto il mondo -inclusi gli studenti del programma SEA-PHAGES-ed è stato citato in oltre 50 articoli sottoposti a revisione paritaria. http://phagesdb. org/. gfh@pitt. edu.
Smoldyn: simulazione basata su particelle con modellazione basata su regole, interazione molecolare migliorata e un'interfaccia di libreria.Smoldyn è un simulatore biochimico spaziale e stocastico. Tratta ogni molecola di interesse come una singola particella nello spazio continuo, simulando la diffusione molecolare, le interazioni molecola-membrana e le reazioni chimiche, il tutto con una buona precisione. Questo articolo presenta diverse nuove funzionalità. Smoldyn ora supporta due tipi di modellazione basata su regole. Questi sono un metodo jolly, che è molto conveniente, e il pacchetto BioNetGen con estensioni per la simulazione spaziale, che è migliore per modelli complicati. Smoldyn include anche nuovi algoritmi per simulare la diffusione di molecole legate alla superficie e molecole con volume escluso. Entrambi sono esatti nel limite di brevi passi di tempo e ragionevolmente buono con passi più lunghi. Inoltre, Smoldyn supporta simulazioni di tracciamento di singole molecole. Infine, il codice sorgente di Smoldyn può essere acces sed tramite un'interfaccia di libreria del linguaggio C/C ++. Il software, la documentazione, il codice e gli esempi di Smoldyn sono disponibili su http://www. smoldyn. org. steven. s. andrews@gmail. com.
La duplicazione di aminoacidi nella struttura a spirale del collagene XVII altera la sua maturazione e trimerizzazione causando una lieve epidermolisi bollosa giunzionale.La funzione e la stabilità dei collageni dipendono dall'accurata formazione della tripla elica di tre catene polipeptidiche distinte. La rottura di questa struttura a tripla elica può causare disturbi del tessuto connettivo. Si pensa che la formazione della tripla elica dipenda da siti di oligomerizzazione a spirale a tre fili all'interno di domini non collagenosi. Tuttavia, si sa solo poco sulla rilevanza fisiologica di queste strutture a spirale. Il collagene transmembrana XVII, noto anche come antigene pemfigoide bolloso 180 kDa, fornisce stabilità meccanica attraverso l'ancoraggio delle cellule epiteliali alla membrana basale. Mutazioni nel gene del collagene XVII, COL17A1, causa epidermolisi bollosa giunzionale (JEB), caratterizzata da vesciche cutanee indotte da traumi cronici. Qui abbiamo sfruttato un nuovo evento naturale ing COL17A1, che porta a una duplicazione della lisina in-frame all'interno della struttura a spirale del dominio NC16A iuxtamembranoso del collagene XVII, che ha provocato un lieve fenotipo di JEB a causa della riduzione delle molecole di collagene XVII ancorate alla membrana. Questa mutazione provoca cambiamenti strutturali nella molecola mutante e interferisce con la sua maturazione. La struttura destabilizzata a spirale del collagene mutante XVII smaschera un sito di scissione della furina che si traduce in un eccessivo e non fisiologico spargimento di ectodomain durante la sua maturazione. Inoltre, diminuisce la sua stabilità a tripla elica a causa dell'oligomerizzazione difettosa del coiled-coil, che lo rende altamente suscettibile alla degradazione proteolitica. Come conseguenza della maturazione alterata e della ridotta stabilità dei trimeri di collagene XVII, il collagene XVII ridotto viene incorporato nella membrana cellulare, con conseguente compromissione dell'adesione dermo-epidermica. Presi insieme, utilizzando questo modello genetico, forniamo la prima prova che l'alterazione della struttura a spirale destabilizza l'oligomerizzazione e compromette lo spargimento fisiologico del collagene XVII in vivo.
Programmi di sviluppo nell'evoluzione della morfologia riproduttiva di Equisetum: un'ipotesi di modularità gerarchica.L'origine dell'Equisetum strobilus è stata a lungo dibattuta e la documentazione fossile ha giocato un ruolo importante in queste discussioni. Il paradigma alla base di questi dibattiti è stata la prospettiva del germoglio come alternanza nodo-internodo, con sporangiofori attaccati ai nodi. Tuttavia, i fossili storicamente esclusi da queste discussioni (es Cruciaetheca e Peltotheca) mostrano morfologie riproduttive che suggeriscono l'attaccamento di sporangiofori lungo gli internodi, sfidando le visioni tradizionali. Questo ha riacceso le discussioni sull'evoluzione dell'Equisetum strobilus, ma la mancanza di spiegazioni meccanicistiche ha portato le discussioni a uno stallo. Uno spostamento dell'attenzione dalla vista nodo-internodo a una prospettiva che enfatizza il fitomero come unità modulare del germoglio, libera il dibattito sui vincoli di omologia sulla natura della sp orangiophore e ispira un'ipotesi basata sul meccanismo per l'evoluzione dello strobilo. L'ipotesi, attingendo ai dati dell'anatomia dello sviluppo, dei meccanismi regolatori e dei reperti fossili, si basa su due principi: (1) il germoglio equisetale cresce per l'attività combinata del meristema apicale, che determina il modello fitomero, e dei meristemi intercalari responsabili dell'allungamento degli internodi ; e (2) l'attivazione dei programmi di crescita riproduttiva nel meristema intercalare produce spirali di sporangiofori lungo gli internodi. Espressione gerarchica dei moduli regolatori responsabili della (1) transizione alla crescita riproduttiva; (2) determinazione della crescita apicale; e (3) la differenziazione nodo-internodo all'interno dei fitomeri, può spiegare le morfologie riproduttive illustrate da Cruciaetheca (solo modulo 1), Peltotheca (moduli 1 e 2) ed Equisetum (tutti e tre i moduli). Questo modello ha implicazioni - verificabili da studi sulla documentazione fossile, sulla filogenesi e sullo sviluppo - per la direzionalità nell'evoluzione della morfologia riproduttiva (Cruciaetheca - Peltotheca - Equisetum) e per l'omologia dell'Equisetum stobilus. Inoltre, questo modello implica che lo sviluppo dello sporangioforo è indipendente dall'identità nodo-internodo, suggerendo che lo sporangioforo rappresenta l'espressione di un modulo di sviluppo ancestrale dell'eufillofita che precede l'evoluzione delle foglie.
Attraverso spesso e sottile: una necessità per riconciliare risultati contraddittori sulle traiettorie nello sviluppo corticale umano.Capire come procede normalmente lo sviluppo del cervello è una premessa di comprensione disturbi dello sviluppo neurologico. Ciò ha scatenato una vasta gamma di studi di risonanza magnetica (MRI). Sfortunatamente, sono in netto disaccordo su come matura la corteccia cerebrale. Mentre lo spessore corticale aumenta per i primi 8-9 anni di vita sono stati ripetutamente segnalati, altri trovare un assottigliamento corticale continuo dalla prima infanzia, almeno dall'età di 3 o 4. Esaminiamo queste incongruenze e discutiamo le possibili ragioni, incluso l'uso di diversi scanner, parametri di registrazione e strumenti di analisi e possibili effetti di variabili come il movimento della testa. Quando testati sullo stesso sottocampione, 2 metodi di stima dello spessore più diffusi (CIVET e FreeSurfer) hanno prodotto entrambi una diminuzione continua dello spessore da 3 anni. ure dello sviluppo corticale sono semplicemente le nostre migliori approssimazioni attuali, quindi il termine "spessore corticale apparente" può essere preferibile. Raccomandiamo strategie per raggiungere il consenso sul campo, tra cui neuroimaging multimodale per misurare i fenomeni utilizzando tecniche diverse, ad esempio l'uso del rapporto T1/T2 e la condivisione dei dati per consentire la replica attraverso i metodi di analisi. Poiché le origini dello sviluppo neurologico delle malattie a esordio precoce e tardivo sono sempre più riconosciute, è importante risolvere le incongruenze nelle traiettorie di maturazione del cervello.
node.dating: datazione degli antenati negli alberi filogenetici in R.Gli alberi filogenetici codificano le distanze evolutive tra specie o popolazioni. Con informazioni sufficienti, questi le distanze possono essere riscalate nel tempo per fornire stime delle date degli antenati più recenti della specie. Qui presentiamo il programma node. dating R, software di analisi del tempo di divergenza, che utilizza un metodo di massima verosimiglianza per stimare le date dei nodi interni di un albero filogenetico. node. dating è disponibile come parte del pacchetto R v3.30 ape v4.0 (cran. r-project. org). node. dating è disponibile anche nel repository GitHub: https:/ /github. com/brj1/node. dating , insieme a software e test supplementari. brj1@sfu. ca. I dati supplementari sono disponibili su Bioinformatics online.
L'impatto dell'assicurazione sanitaria sull'utilizzo dell'assistenza sanitaria materna: prove provenienti da Ghana, Indonesia e Ruanda.Mentre la ricerca ha valutato l'impatto dell'assicurazione sanitaria su utilizzo dell'assistenza sanitaria, pochi studi si sono concentrati sugli effetti dell'assicurazione sanitaria sull'uso dell'assistenza sanitaria materna. Analizzando i dati rappresentativi a livello nazionale del Demographic and Health Surveys (DHS), questo studio stima l'impatto dello stato di assicurazione sanitaria sull'uso della salute materna servizi in tre paesi con livelli relativamente elevati di copertura assicurativa sanitaria: Ghana, Indonesia e Ruanda. L'analisi utilizza la corrispondenza del punteggio di propensione per correggere i bias di selezione nell'adozione dell'assicurazione sanitaria e per valutare l'effetto dell'assicurazione sanitaria su quattro misurazioni dell'utilizzo dell'assistenza sanitaria materna : effettuare almeno una visita di assistenza prenatale; effettuare quattro o più visite di assistenza prenatale; iniziare le cure prenatali entro il primo trimestre e partorire in una struttura sanitaria. Sebbene i programmi di assicurazione sanitaria in questi tre paesi siano principalmente progettati per concentrarsi sui poveri, la copertura è stata fortemente sbilanciata verso i ricchi, specialmente in Ghana e Ruanda. L'Indonesia mostra una minore variazione nella copertura per stato patrimoniale. L'analisi ha rilevato effetti positivi significativi della copertura assicurativa sanitaria su almeno due delle quattro misure di utilizzo dell'assistenza sanitaria materna in ciascuno dei tre paesi. L'Indonesia si distingue per l'effetto più sistematico dell'assicurazione sanitaria in tutte e quattro le misure. L'impatto positivo dell'assicurazione sanitaria sembra più coerente sull'uso del parto in struttura rispetto all'uso dell'assistenza prenatale. L'analisi suggerisce che l'ampliamento dell'assicurazione sanitaria per includere premi sensibili al reddito o esenzioni per i poveri e compensi bassi o nulli può aumentare l'uso dell'assistenza sanitaria materna.
Analisi dell'incidenza dei benefici dell'assistenza sanitaria in Bangladesh - l'equità è importante per la copertura sanitaria universale.L'equità nell'accesso e nell'utilizzo dell'assistenza sanitaria è un obiettivo importante per qualsiasi sistema sanitario e un prerequisito essenziale per raggiungere la copertura sanitaria universale per qualsiasi paese. Questo studio ha studiato la misura in cui i benefici per la salute sono distribuiti tra i gruppi socioeconomici e come i diversi tipi di fornitori contribuiscono alla disuguaglianza nei benefici per la salute del Bangladesh. La distribuzione dei benefici per la salute tra i gruppi socioeconomici è stata stimata utilizzando indici di concentrazione. Sono stati analizzati i benefici per la salute di tre tipi di fornitori formali (fornitori pubblici, privati e ONG), separati in popolazioni rurali e urbane. La scomposizione degli indici di concentrazione in tipi di fornitori ha quantificato il contributo relativo dei fornitori a la distribuzione complessiva dei benefici tra i gruppi socioeconomici. Infine, la distribuzione dei benefici è stato confrontato con la distribuzione del fabbisogno di assistenza sanitaria (procurato da \'malattia e sintomi auto-riferiti\') tra i gruppi socioeconomici. Sono stati utilizzati i dati dell'ultima indagine sul reddito e la spesa delle famiglie, 2010 e WHO-CHOICE. È stata osservata una distribuzione complessiva pro-ricchi delle prestazioni sanitarie (CI = 0.229, t -value = 9.50). I benefici sanitari dei fornitori privati (CI = 0.237, t -value = 9.44) hanno ampiamente favorito i gruppi socioeconomici più ricchi. Poche prove di iniquità nei benefici sono state trovate nei fornitori pubblici (CI = 0.044, t -value = 2.98) e ONG (CI = 0.095, t -value = 0.54). I fornitori privati hanno contribuito per il 95,9% alla disuguaglianza complessiva. Il gruppo socioeconomico più povero con il 21,8% del fabbisogno di assistenza sanitaria ha ricevuto solo il 12,7% dei benefici, mentre il gruppo più ricco con il 18,0% del fabbisogno ha rappresentato il 32,8% dei benefici per la salute. I benefici sanitari complessivi in Bangladesh sono stati pro-ricchi, in particolare a causa dei benefici sanitari forniti da fornitori privati. È stato osservato che i fornitori pubblici contribuiscono in modo relativamente lieve alla disuguaglianza. Le persone più povere (più ricche) con il più grande (minimo) bisogno di assistenza sanitaria hanno effettivamente ricevuto benefici inferiori (più elevati). Quando si lavora per raggiungere la copertura sanitaria universale in Bangladesh, si dovrebbe prestare particolare attenzione a garantire che l'assistenza del settore privato sia più equa.
Alta frequenza del filogruppo B2 tra gli isolati fecali di Escherichia coli non clonalmente correlati da cinghiali, incluso il lignaggio ST131.I cinghiali sono mammiferi distribuiti in tutto il mondo la cui popolazione è in aumento in molte regioni, come la penisola iberica, determinando una maggiore esposizione per l'uomo. Sono considerati serbatoi di diversi agenti patogeni zoonotici e sono stati postulati come potenziali vettori di batteri resistenti agli antimicrobici (AMR). Questo studio mirava a determinare la prevalenza della resistenza antimicrobica e la distribuzione filogenetica di Escherichia coli dalle feci di cinghiale. La resistenza antimicrobica e il contenuto di integroni sono stati caratterizzati geneticamente e l'E. coli del filogruppo B2 è stato ulteriormente analizzato mediante tipizzazione molecolare e genotipizzazione della virulenza. La prevalenza di AMR E. coli è stata bassa , con solo il 7,5% degli isolati resistenti ad almeno un antimicrobico, principalmente ampicillina, tetraciclina e/o sulfonamide. è stato identificato un tasso elevato di filogruppo B2 (47,5%), la maggior parte dei quali mostrava modelli di elettroforesi a campo pulsato non correlati. I cloni ST131/B2 (sottolinea fimH 22), ST28/B2, ST1170/B2, ST681/B2 e ST625/B2, precedentemente descritti nelle infezioni extraintestinali nell'uomo, sono stati rilevati negli isolati B2 e portavano uno o più geni associati a patogeni extraintestinali E. coli (ExPEC). Questo studio ha dimostrato una bassa prevalenza di resistenza antimicrobica in E. coli da cinghiali, sebbene non siano esenti da batteri AMR, e una predominanza del filogruppo B2 geneticamente diverso, compresi gli isolati portatori di ExPEC che possono contribuire alla diffusione dei determinanti di virulenza tra diversi ecosistemi.
Misurazione standardizzata dei sintomi di individui con malattia di Lyme precoce nel tempo.Comprendere la letteratura sulla malattia di Lyme (LD) è difficile data la mancanza di una metodologia coerente e misurazione standardizzata dei sintomi e dell'impatto sul funzionamento. Questo studio prospettico incorpora misure ben convalidate per catturare il quadro dei sintomi di individui con LD precoce dal momento della diagnosi fino a 6 mesi dopo il trattamento. Centosette pazienti con LD precoce confermata e 26 controlli sani sono stati valutati utilizzando strumenti standardizzati per dolore, affaticamento, sintomi depressivi, impatto funzionale e funzionamento cognitivo. Prima del trattamento antibiotico, i pazienti manifestano notevoli sintomi di affaticamento e dolore statisticamente superiori ai controlli. Dopo il trattamento, non ci sono differenze di gruppo, suggerendo che i sintomi si risolvono e che non ci siano danni cognitivi residui a livello di analisi di gruppo. Tuttavia, utilizzando il sottogruppo ana lisi, alcuni individui manifestano sintomi persistenti che portano al declino funzionale e questi individui possono essere identificati immediatamente dopo il completamento del trattamento antibiotico standard utilizzando misure sintomatiche ben convalidate. Nel complesso, i risultati suggeriscono che i pazienti con LD precoci trattati idealmente si riprendono bene e sperimentano la risoluzione dei sintomi nel tempo, sebbene un piccolo sottogruppo continui a soffrire di sintomi che portano al declino funzionale. Gli autori discutono l'uso di strumenti standardizzati per l'identificazione di individui che giustificano un ulteriore follow-up clinico.
Correlazione tra la misura informatizzata Cogstate e WAIS-IV tra le madri di coorte di nascita.Ampi studi, con risorse limitate richiedono metodi di valutazione cognitiva economicamente vantaggiosi I test computerizzati offrono alternative praticabili ma sono necessari più dati sul loro funzionamento. Il nostro obiettivo era valutare la sovrapposizione tra una batteria di test neuropsicologici computerizzati e un test tradizionale di intelligenza generale (QI). Il funzionamento cognitivo è stato valutato in madri di coorte di nascita (n \ = 80) con due metodi ampiamente utilizzati: Cogstate, batteria di test computerizzata e WAIS-IV, un test del QI tradizionale. Sono state condotte analisi correlazionali. Abbiamo trovato correlazioni da deboli a moderate tra le misure, ad eccezione della comprensione verbale. Gli indici di le prestazioni complessive hanno mostrato correlazioni più coerenti rispetto ai sottotest. Le correlazioni complessive erano in accordo con studi precedenti. Cogstate è relativamente indipendente dalle capacità di comprensione verbale. Il ch cio del metodo di valutazione cognitiva dovrebbe essere fortemente guidato dalla domanda di ricerca. Sono necessari ulteriori studi per valutare l'applicabilità del Cogstate Composite Score nello screening cognitivo.
Prestazioni di valutazione cognitiva di Montreal tra afroamericani residenti in comunità.Riportare dati descrittivi e normativi per la valutazione cognitiva di Montreal (MoCA) in una popolazione- basato su un campione afroamericano. Il MoCA è stato somministrato a 1.419 partecipanti afroamericani (età media 49,89 anni, intervallo 18-75, 64% donne). Dopo aver escluso quelli con disturbi cognitivi soggettivi (n = 301), i dati normativi sono stati generati dall'istruzione e fasce di età sovrapposte (n = 1.118). Le correlazioni di Pearson e l'analisi della varianza sono state utilizzate per esaminare la relazione con le variabili demografiche ed è stata rivista la frequenza degli elementi mancanti. I punteggi totali MoCA (media 22,3, DS 3,9) erano inferiori a quelli pubblicati in precedenza dati normativi derivati da un'anziana popolazione canadese caucasica con l'80% che scende al di sotto del limite suggerito (<26) per la compromissione. Molti elementi del MoCA sono stati persi da gran parte del campione, incluso il disegno del cubo (72%), richiamo gratuito ritardato (66% <4/5 parole), ripetizione di frasi (63%) e elementi di astrazione (45%). Questo è il primo studio ad esaminare le prestazioni normative sul MoCA specifico per gli afroamericani residenti in comunità. I risultati suggeriscono che alcuni aspetti di questa misura e i punteggi di cutoff precedentemente stabiliti potrebbero non essere adatti per alcune popolazioni.
Un intervento per ridurre l'incidenza di dati non validi sulla valutazione neuropsicologica.Questo studio ha testato se i pazienti a cui era stata data una dispensa basata sulla teoria della deterrenza, immediatamente prima della valutazione, fornirebbe dati non validi meno frequentemente rispetto ai pazienti a cui è stata semplicemente consegnata una dispensa informativa. Tutti i pazienti ambulatoriali visitati per la valutazione clinica in una clinica di neuropsicologia VA hanno ricevuto in modo casuale una delle due dispense immediatamente prima della valutazione. L'"Intervento" L'opuscolo ha sottolineato l'importanza di impegnarsi più duramente, elencando esplicitamente le conseguenze di una risposta valida e non valida e ha chiesto ai pazienti di firmarlo e siglare. L'opuscolo "Controllo" ha fornito informazioni generali sulla valutazione neuropsicologica. esclusi dalle analisi se sono stati diagnosticati un disturbo neurocognitivo maggiore o non sono stati in grado di leggere la dispensa. Il Medical Symptom Validity Test (MSVT) era noi ed per determinare la validità delle prestazioni. I gruppi non differivano per età, istruzione o stato del contenzioso. Per l'intero campione (N = 251), non c'è stato alcun effetto della dispensa sul superamento o sul fallimento di MSVT. Tuttavia, tra i pazienti che richiedevano prestazioni di invalidità al momento della valutazione (n = 70), la dispensa di intervento era associata a una frequenza inferiore di fallimento della SMVT rispetto alla dispensa di controllo. Questo breve intervento a costo zero, basato sulla teoria, è stato associato a una minore frequenza di dati non validi tra i pazienti che richiedevano benefici per la disabilità al momento della valutazione clinica. Suggeriamo modifiche metodologiche che potrebbero produrre un intervento più potente che potrebbe essere efficace con ulteriori sottogruppi di pazienti.
Età e inibizione semantica misurate dal compito di Hayling: una meta-analisi.L'invecchiamento cognitivo è comunemente associato a una diminuzione del funzionamento esecutivo (EF) Una componente specifica dell'EF, l'inibizione semantica, è affrontata nel presente studio, che presenta una revisione meta-analitica della letteratura che ha valutato le prestazioni del test di Hayling Sentence Completion in gruppi di individui giovani e più anziani al fine di valutare la grandezza dell'effetto età. È stata eseguita una ricerca sistematica che coinvolge Web of Science, PsyINFO, PsychARTICLE e database MedLine e Google Scholar. Un totale di 11 studi sono stati inclusi in questa meta-analisi, per un totale di 887 partecipanti; 440 giovani e 447 anziani. Le dimensioni dell'effetto per le differenze di gruppo su quattro misure del test di Hayling, le risposte di latenza e i punteggi di errore nelle sezioni Automatica e Inibizione del test sono state calcolate utilizzando il pacchetto software Comprehensive Meta-Analysis età. I risultati hanno rivelato grandi effetti dell'età per le latenze di risposta sia nelle condizioni Automatiche (Hedges\' g = 0.81) che Inhibitory (Hedges\' g = 0.98), sebbene le ultime due dimensioni dell'effetto non differissero l'una dall'altra. Al contrario, l'analisi degli errori ha rivelato una differenza significativa tra il piccolo effetto osservato nella condizione Automatica (Hedges\' g = 0.13) rispetto all'effetto moderato osservato nella condizione Inhibition (Hedges\' g = 0,55). Questi risultati possono essere importanti per una migliore comprensione del funzionamento inibitorio negli individui anziani, anche se dovrebbero essere interpretati con cautela a causa del numero limitato di studi in letteratura fino ad oggi.
Lo sviluppo e la valutazione psicometrica di un punteggio indice supplementare del modulo di screening della batteria di valutazione neuropsicologica che è sensibile al trauma cranico.Questo studio esamina il validità del NAB Screening Module (modulo di screening della batteria di valutazione neuropsicologica, S-NAB) in una popolazione di pazienti ricoverati con trauma cranico acuto (TBI) e fornisce la valutazione psicometrica di un indice originale sensibile alla compromissione del TBI. come uno schermo TBI è stato esaminato utilizzando un disegno tra gruppi. Centoquattro pazienti con trauma cranico da lieve a grave sono stati reclutati da una coorte consecutiva di pazienti ricoverati in un centro di traumatologia maggiore del Regno Unito. Novantotto partecipanti di controllo sono stati selezionati da il campione normativo S-NAB. Tutti i pazienti con trauma cranico hanno completato l'S-NAB durante il loro ricovero. I partecipanti al controllo hanno ottenuto punteggi significativamente più alti rispetto ai partecipanti con trauma cranico allo screening totale indice (t = 3.626, p < 0.01), indice di attenzione (t = 7.882, p < 0.01) e indice esecutivo (t = 5.577, p < 0.01). È stato costruito un indice di compromissione TBI più breve di sei sottotest che discriminava accuratamente i pazienti con trauma cranico dai controlli normativi (t = 9.9, p < 0.01; Cohen\'s d = 1.54). L'indice TBI aveva un'eccellente precisione di classificazione (AUC = 0.83), superiore a quella degli indici S-NAB standard. L'indice TBI, l'indice di attenzione e l'indice di screening totale hanno dimostrato una compromissione crescente con l'aumento della gravità della lesione. L'indice S-NAB TBI è un indice di screening robusto e affidabile per l'uso con pazienti con trauma cranico acuto, che è sensibile agli effetti del trauma cranico acuto. Offre uno schermo cognitivo più breve rispetto all'S-NAB e dimostra una relazione dose-risposta con la gravità del trauma cranico.
Coerenza dei sintomi neurocognitivi auto-riferiti, dei sintomi del disturbo da stress post-traumatico e degli eventi concussivi dalla fine del primo impiego all'amministrazione sanitaria dei veterani Valutazione completa delle lesioni cerebrali traumatiche da parte di Operations Enduring Freedom /Iraqi Freedom/New Dawn Veterans.Questo studio ha esaminato la coerenza dei sintomi auto-riferiti e degli eventi concussivi nei veterani di combattimento che hanno riferito di aver sperimentato eventi concussivi. Centoquaranta, dispiegati singolarmente, Operazione Enduring Freedom, Operazione Iraqi Freedom e Operation New Dawn veterani di combattimento con Veteran Health Administration (VHA) Comprehensive Traumatic Brain Injury Evaluation (CTBIE) e nessun trauma cranico post-dispiegamento sono stati esaminati per valutare la coerenza di auto-riferito (a) trauma cranico correlato (TBI) sintomi, (b) sintomi correlati al disturbo da stress post-traumatico (PTSD) e (c) eventi concussivi correlati a trauma cranico da subito dopo l'implementazione al momento del VHA CTBIE. rosso alla loro auto-segnalazione di sintomi ed eventi traumatici al momento della loro valutazione sanitaria post-distribuzione, al momento della loro valutazione VHA completa, i soggetti hanno riportato una compromissione significativamente maggiore della concentrazione, del processo decisionale, della memoria, del mal di testa e del sonno. Inoltre, sebbene la metà dei soggetti abbia negato qualsiasi sintomo di disturbo post-traumatico da stress post-distribuzione, circa tre quarti hanno riferito di aver sperimentato tutti e quattro i sintomi di screening del disturbo post-traumatico da stress vicino al momento del VHA CTBIE. In quest'ultimo momento, i soggetti hanno anche riportato un numero significativamente maggiore di eventi concussivi correlati al trauma cranico, nonché più sequele post-traumatiche come la perdita di coscienza immediatamente successiva a questi eventi concussivi. Infine, sebbene l'84% riferisse un livello di disabilità così grave da rendere praticabili tutte le attività tranne le più semplici, la stragrande maggioranza ha riferito contemporaneamente di lavorare e/o frequentare il college. Questi risultati sollevano interrogativi sull'accuratezza dell'autovalutazione dei veterani di eventi traumatici sia vicini che lontani e sostengono l'inclusione di registrazioni contemporanee del Dipartimento della Difesa (DOD) nella valutazione dei veterani e nella pianificazione del trattamento.
Dati normativi per una batteria completa di test neuropsicologici utilizzati nella valutazione della commozione cerebrale correlata allo sport.L'uso di dati normativi è un segno distintivo della neuropsicologia processo di valutazione. Nel contesto della commozione cerebrale correlata allo sport, l'utilizzo di dati normativi è particolarmente essenziale quando i dati di base individualizzati non sono disponibili per il confronto. Lo scopo principale di questo studio era stabilire dati normativi per una batteria di test neuropsicologici completa utilizzata nella valutazione dello sport commozione cerebrale correlata Un obiettivo secondario era fornire dati normativi per le variabili demografiche pertinenti rilevanti per la valutazione degli atleti del college, tra cui sesso, precedenti lesioni alla testa (PHI) e storia di disturbo da deficit di attenzione e iperattività (ADHD) / disabilità dell'apprendimento (LD) I partecipanti includevano atleti universitari di sesso maschile e femminile (N = 794) che erano coinvolti in un programma di gestione delle commozioni cerebrali presso un'università della Divisione I della NCAA y tra il 2002 e il 2015. Agli atleti è stata somministrata una batteria di test neuropsicologici completa al basale progettata per valutare i seguenti domini cognitivi: apprendimento e memoria, attenzione e concentrazione, velocità di elaborazione e funzionamento esecutivo. La batteria di prova comprende principalmente misure di carta e matita. I dati normativi sono presentati per il campione complessivo di atleti. Vengono quindi fornite ulteriori sottonorme per popolazioni demografiche specificate (cioè sesso, PHI e storia di ADHD/LD). I risultati indicano che ci sono lievi differenze cognitive tra uomini e donne, così come tra quegli atleti con e senza una storia di ADHD/LD. Alla luce di questi risultati, vengono fornite norme aggiuntive per uomini e donne con e senza una storia di ADHD/LD. In assenza di test di riferimento, i dati normativi presentati qui possono essere utilizzati clinicamente per valutare il funzionamento cognitivo degli atleti dopo una commozione cerebrale.
Evidenziazione PDF automatizzata per supportare una più rapida cura della letteratura per il morbo di Parkinson\' e Alzheimer\'.Disturbi neurodegenerativi come Parkinson\' e Alzheimer\ 's sono malattie devastanti e costose, una fonte di grande onere globale. Al fine di fornire interventi di successo per i pazienti e ridurre i costi, è necessario comprendere sia le cause che i processi patologici. Il progetto ApiNATOMY mira a contribuire alla nostra comprensione dei disturbi neurodegenerativi da curando manualmente e estraendo i dati dal vasto corpus di letteratura accumulato su queste malattie. Poiché la cura è ad alta intensità di lavoro, abbiamo mirato ad accelerare il processo evidenziando automaticamente quelle parti del documento PDF di primaria importanza per il curatore. Utilizzando tecniche simili a quelli di sintesi, abbiamo sviluppato un algoritmo che si basa su caratteristiche linguistiche, semantiche e spaziali. Utilizzando questo algoritmo su un set di test manualmente cor Rettificata per l'imprecisione dello strumento, abbiamo ottenuto una misura macro F 1 di 0,51, che rappresenta un aumento del 132% rispetto al miglior modello di base di bag-of-words. È stata inoltre condotta una valutazione user based per valutare l'utilità della metodologia su 40 pubblicazioni inedite, che rivela che nell'85% dei casi tutte le frasi evidenziate sono rilevanti per il compito di curation e in circa il 65% dei casi, i punti salienti sono sufficienti per supportare l'attività di knowledge curation senza la necessità di consultare il testo completo. In conclusione, riteniamo che questi siano risultati promettenti per un passo nell'automazione del riconoscimento delle frasi rilevanti per la cura. Il perfezionamento del nostro approccio alle carte pre-digerite porterà a un'elaborazione più rapida e a una riduzione dei costi nel processo di cura. https://github. com/KHP-Informatics/NapEasy.
WikiGenomes: un'applicazione web aperta per il consumo da parte della comunità e la cura dei dati di annotazione genica in Wikidata.Con il progresso delle tecnologie di sequenziamento del genoma, nuovi genomi vengono sequenziate quotidianamente. Sebbene queste sequenze siano depositate in data warehouse pubblicamente disponibili, le loro annotazioni funzionali e genomiche (oltre ai geni che sono previsti automaticamente) risiedono principalmente nel testo delle pubblicazioni primarie. I curatori professionisti sono al lavoro per estrarre tali annotazioni dalla letteratura per gli organismi più studiati e depositandoli in database strutturati. Tuttavia, le risorse non esistono per finanziare la cura completa delle migliaia di organismi appena sequenziati in questo modo. Qui descriviamo WikiGenomes (wikigenomes. org), un'applicazione web che facilita il consumo e la cura dei dati genomici da parte dell'intera comunità scientifica. WikiGenomes si basa su Wikidata, un programma di conoscenza apertamente modificabile ph con l'obiettivo di aggregare la conoscenza pubblicata in un database libero e aperto. WikiGenomes consente al singolo ricercatore genomico di contribuire con la propria esperienza allo sforzo di curatela e integra la conoscenza in Wikidata, consentendone l'accesso a chiunque senza restrizioni. www. wikigenomes. org.
TMPL: un database di modelli di proteine transmembrana sperimentali e teorici posizionati nel doppio strato lipidico.Conoscere la posizione delle strutture proteiche all'interno della membrana è cruciale per ricerca fondamentale e applicata nel campo della biologia molecolare. Solo poche risorse web propongono file di coordinate di proteine transmembrana orientate, e queste escludono strutture previste, sebbene rappresentino la maggior parte dei modelli disponibili. In questo articolo, presentiamo TMPL (http: //www. dsimb. inserm. fr/TMPL/), un database di strutture proteiche transmembrana (α-elica e β-foglio) posizionate nel doppio strato lipidico È il primo database ad includere modelli teorici delle strutture proteiche transmembrana, rendendo è un grande repository con più di 11 000 voci. Il database TMPL contiene anche strutture proteiche risolte sperimentalmente, che sono disponibili come modelli atomistici o a grana grossa. Una caratteristica unica di TMPL è la possibilità di agli utenti di aggiornare il database caricando, attraverso un'interfaccia web intuitiva, le assegnazioni delle membrane che possono ottenere con il nostro recente web server OREMPRO.
Efficace classificazione dei documenti biomedici per identificare le pubblicazioni rilevanti per il Gene Expression Database (GXD) dei topi.Il Gene Expression Database (GXD) è un database online completo database all'interno della risorsa Mouse Genome Informatics, con l'obiettivo di fornire informazioni disponibili sull'espressione genica endogena durante lo sviluppo del topo. Le informazioni derivano principalmente da molte migliaia di pubblicazioni biomediche che i curatori del database devono esaminare e leggere. Dato il numero molto elevato di articoli biomedici pubblicati ciascuno anno, la classificazione automatica dei documenti svolge un ruolo importante nella ricerca biomedica. In particolare, è necessario un classificatore di documenti efficace ed efficiente per supportare il flusso di lavoro di annotazione GXD. Vi presentiamo qui uno schema di classificazione efficace ma relativamente semplice, che utilizza strumenti prontamente disponibili mentre impiega la selezione delle funzionalità , con l'obiettivo di assistere i curatori nell'identificazione delle pubblicazioni rilevanti per GXD estrarre le prestazioni del nostro metodo su un ampio set di dati curato manualmente, composto da oltre 25.000textPubMed, di cui circa la metà sono curati come rilevanti per GXD mentre l'altra metà come irrilevante per GXD. Oltre al testo dal titolo e dall'text, consideriamo anche le didascalie delle immagini, un'importante fonte di informazioni che integriamo nel nostro metodo. Applichiamo un classificatore basato su didascalie a un sottoinsieme di circa 3300 documenti, per i quali è disponibile il testo completo degli articoli curati. I risultati dimostrano che il nostro approccio proposto è robusto e affronta efficacemente la classificazione dei documenti GXD. Inoltre, l'utilizzo delle informazioni ottenute dalle didascalie delle immagini migliora nettamente le prestazioni, rispetto al solo titolo e all'text, affermando l'utilità delle didascalie delle immagini come fonte sostanziale di prove per determinare automaticamente la pertinenza delle pubblicazioni biomediche a una specifica area tematica. www. informatica. jax. org.
GrTEdb: il primo database web-based di elementi trasponibili in cotone (Gossypium raimondii).Anche se diversi genomi di specie diploidi e tetroploidi Gossypium sono stati sequenziati , manca il database degli elementi trasponibili (TE) basato sul Web. Per comprendere meglio i ruoli degli TE nelle dinamiche strutturali, funzionali ed evolutive del genoma del cotone, un database basato sul Web completo, specifico e di facile utilizzo, Gossypium raimondii Transposable Element Database (GrTEdb), è stato costruito un totale di 14 332 TE sono stati strutturalmente annotati e chiaramente classificati nel genoma di G. raimondii e questi elementi sono stati classificati in sette superfamiglie distinte in base all'ordine dei domini codificanti proteine, strutture e/o somiglianza di sequenza, inclusi 2929 elementi simili a Copia, 10 368 elementi simili a zingari, 299 L1, 12 mutatori, 435 PIF-Harbingers, 275 CACTA e 14 Helitron. Sono stati implementati strumenti hing, download e blast per aiutare gli utenti ad annotare in modo semplice ed efficace i TE oi frammenti di TE nelle sequenze genomiche di G. raimondii e di altre specie di Gossypium strettamente correlate. GrTEdb fornisce risorse e informazioni relative ai TE in G. raimondii e faciliterà le analisi di geni e genomi all'interno o tra le specie Gossypium, valutando l'impatto degli TE sui loro genomi ospiti e studiando la potenziale interazione tra TE e geni codificanti proteine in Gossypium specie. http://www. grtedb. org/.
ABCMdb reloaded: aggiornamenti sulle mutazioni nelle proteine della cassetta di legame dell'ATP.Le proteine ABC (ATP-Binding Cassette) con funzione alterata sono responsabili di numerose malattie umane Per facilitare la selezione delle posizioni e degli amminoacidi per gli studi di struttura/funzione ABC abbiamo generato un database, ABCMdb (Gyimesi et al. , ABCMdb: un database per l'analisi comparativa delle mutazioni proteiche nei trasportatori ABC, e un potenziale quadro per un applicazione generale. Hum Mutat 2012; 33:1547-1556. ), con strumenti interattivi. Il database è stato popolato con menzioni di mutazioni estratte da documenti full text, allineamenti e modelli strutturali. Nella nuova versione del database si è cercato di raccogliere l'effetto delle mutazioni da database tra cui ClinVar. A causa del basso numero di dati disponibili, anche nel caso delle proteine ABC che causano malattie ampiamente studiate, abbiamo incluso anche i possibili effetti delle mutazioni sulla base delle previsioni SNAP2 e PROVEAN. o aiutare l'interpretazione delle variazioni nelle regioni non codificanti, il database è stato integrato con le relative informazioni a livello di DNA. I nostri risultati sottolineano l'importanza delle previsioni in silico a causa delle scarse informazioni disponibili sulle varianti e suggeriscono che le mutazioni in posizioni analoghe nelle proteine ABC omologhe hanno un forte potere predittivo per gli effetti delle mutazioni. Il nostro ABCMdb migliorato fa avanzare la progettazione di studi sperimentali e meta-analisi al fine di comprendere le interazioni farmacologiche delle proteine ABC e gli effetti delle mutazioni sull'espressione funzionale. http://abcm2. hegelab. org.
Risorse software di base di Ensembl: archiviazione e accesso programmatico per la sequenza del DNA e l'annotazione del genoma.Le risorse software di Ensembl sono un'infrastruttura stabile per memorizzare, accedere e manipolare gli assemblaggi del genoma e le loro annotazioni funzionali. Il database Ensembl \'Core\' e l'Application Programming Interface (API) è stato il nostro primo importante pezzo di infrastruttura software e rimane al centro di tutte le nostre risorse genomiche. Dalla sua progettazione iniziale più di quindici anni fa, il numero di set di dati genomici, trascrittomici e proteomici disponibili al pubblico è cresciuto enormemente, accelerato dai continui progressi nella tecnologia di sequenziamento del DNA Inizialmente destinato a fornire annotazioni per il genoma umano di riferimento, abbiamo esteso il nostro quadro per supportare i genomi di tutte le specie così come modelli di assieme più ricchi. I collegamenti incrociati ad altre risorse informatiche facilitano la ricerca nel nostro database con una varietà di identi fiers come UniProt e RefSeq. La nostra struttura completa e robusta che memorizza una grande varietà di annotazioni genomiche in un'unica posizione funge da piattaforma per altri gruppi per generare e mantenere la propria annotazione su misura. Diamo il benvenuto al riutilizzo e ai contributi: i nostri database e le API sono disponibili pubblicamente, tutto il nostro codice sorgente è rilasciato con una licenza Apache v2.0 permissiva su http://github. com/Ensembl e abbiamo una mailing list attiva degli sviluppatori ( http: //www. ensembl. org/info/about/contact/index. html). http://www. ensembl. org.
La coerenza della letteratura dei database di sequenze bioinformatiche è efficace per valutare la qualità dei record.I database di sequenze bioinformatiche come Genbank o UniProt contengono centinaia di milioni di record di dati genomici dati. Questi record derivano da comunicazioni dirette da singoli laboratori, nonché da comunicazioni di massa da centri di sequenziamento su larga scala; la loro diversità e scala significa che soffrono di una serie di problemi di qualità dei dati tra cui errori, discrepanze, ridondanze, ambiguità, incompletezza e incongruenze con la letteratura pubblicata. In questo lavoro, si cerca di indagare e analizzare la qualità dei dati dei database di sequenze dal punto di vista di un curatore, che deve rilevare record anomali e sospetti. In particolare, si sottolinea il rilevamento di record inconsistenti rispetto alla letteratura Concentrandosi su GenBank, proponiamo una serie di 24 indicatori di qualità, che si basano sul trattamento di un record come aq uery nella letteratura pubblicata e quindi utilizzare i predittori di qualità delle query. Effettuiamo quindi un'analisi che mostri che gli indicatori di qualità proposti e la qualità delle registrazioni hanno un rapporto reciproco, in cui l'uno dipende dall'altro. Proponiamo di rappresentare la consistenza della letteratura record come vettore di questi indicatori di qualità. Riducendo la dimensionalità di questa rappresentazione ai fini della visualizzazione utilizzando l'analisi delle componenti principali, mostriamo che i record che sono stati segnalati come incoerenti con la letteratura cadono grosso modo nella stessa area e quindi condividono caratteristiche simili. Analizzando manualmente i record non precedentemente noti per essere errati che ricadono nella stessa area di quanto i record sappiano essere inconsistenti, mostriamo che un record su quattro è incoerente rispetto alla letteratura. Questa alta densità di registrazioni incoerenti apre la strada allo sviluppo di metodi automatici per il rilevamento di registrazioni errate. Concludiamo che l'incoerenza della letteratura è una strategia significativa per identificare i record sospetti. https://github. com/rbouadjenek/DQBioinformatics.
MiDAS 2.0: una tassonomia specifica dell'ecosistema e un database online per gli organismi dei sistemi di trattamento delle acque reflue ampliato per i gruppi di digestori anaerobici.Le acque reflue sono sempre più viste come una risorsa, con la tecnologia del digestore anaerobico che viene regolarmente implementata per la produzione di biogas. La caratterizzazione delle comunità microbiche coinvolte negli impianti di trattamento delle acque reflue e dei loro digestori anaerobici è considerata la chiave per il loro design e funzionamento ottimali. Il sequenziamento dell'amplicon del gene 16S rRNA consente il monitoraggio ad alto rendimento di questi sistemi. La guida sul campo MiDAS è una risorsa pubblica che fornisce protocolli di sequenziamento degli ampliconi e un database tassonomico specifico dell'ecosistema ottimizzato per l'uso con campioni di impianti di trattamento delle acque reflue. La tassonomia curata si sforza di fornire una classificazione a livello di genere per i filotipi abbondanti e il campo online guida collega questa identità alle informazioni pubblicate sulla loro ecologia, funzione e distribuzione n. Questo articolo descrive l'espansione delle risorse del database per coprire gli organismi dei sistemi di digestori anaerobici alimentati con fanghi primari e fanghi attivi in eccedenza. Il database aggiornato include le descrizioni degli abbondanti genus-level-taxa nelle acque reflue influenti, nei fanghi attivi e nei digestori anaerobici. Sono incluse anche informazioni sull'abbondanza per consentire la valutazione del ruolo dell'emigrazione nell'ecologia di ciascun filotipo. MiDAS è inteso come una risorsa collaborativa per la progressione della ricerca sull'ecologia del trattamento delle acque reflue, fornendo un archivio pubblico di conoscenza accessibile a tutti coloro che sono interessati a questi sistemi biotecnologicamente importanti. http://www. midasfieldguide. org.
AnnoSys-implementazione di un sistema di annotazione generico per dati basati su schemi utilizzando l'esempio dei dati di raccolta della biodiversità.Raccolta di ricerca biologica con miliardi di esemplari nel mondo -wide forniscono le informazioni di base più importanti per la ricerca sistematica sulla biodiversità. Sempre più record di dati campione diventano disponibili in erbari virtuali e portali di dati. La tradizionale procedura di annotazione (fisica) fallisce qui, così che un importante percorso di documentazione della ricerca e controllo della qualità dei dati è rotto. Per creare un sistema di annotazione online, abbiamo analizzato, modellato e adattato i flussi di lavoro di annotazione dei campioni tradizionali. Il sistema AnnoSys accede ai dati di raccolta da risorse Web convenzionali o dal servizio di accesso alla raccolta biologica (BioCASe) e accetta standard di dati basati su XML come ABCD o DarwinCore. Comprende un repository di dati di annotazione ricercabile, un'interfaccia utente e un sistema di messaggi basato su abbonamento tem. Descriviamo i componenti principali di AnnoSys e la sua interoperabilità attuale e prevista con i portali e le reti di dati sulla biodiversità. Vengono forniti dettagli sul modello architetturale sottostante, che implementa il modello W3C OpenAnnotation e consente l'adattamento di AnnoSys a diversi domini di problemi. Vengono discussi i vantaggi e gli svantaggi dei diversi approcci di annotazione digitale e feedback. Per il dominio della biodiversità, AnnoSys propone procedure di best practice per le annotazioni digitali di record complessi. https://annosys. bgbm. fu-berlin. de/AnnoSys/AnnoSys.
miRnalyze: uno strumento di collegamento al database interattivo per sbloccare la regolazione intuitiva dei microRNA delle vie di segnalazione cellulare.I vari processi fisiopatologici che si verificano nei sistemi viventi sono noti per essere orchestrata da delicate interazioni e dialoghi tra diversi geni e i loro regolatori. Tra i vari regolatori dei geni, c'è una classe di piccole molecole di RNA non codificanti note come microRNA. Anche se la relativa semplicità dei miRNA e la loro capacità di modulare i processi li rendono candidati terapeutici attraenti, la loro presenza in un gran numero rende difficile per i ricercatori sperimentali interpretare le complessità dei processi molecolari che regolano. La maggior parte degli strumenti bioinformatici esistenti non riescono ad affrontare queste sfide. Qui, presentiamo una nuova risorsa web \ 'miRnalyze\' che è stato specificamente progettato per identificare direttamente la presunta regolazione delle vie di segnalazione cellulare da parte dei miRNA. integra le previsioni del miRNA-target con i membri della cascata di segnalazione utilizzando lo strumento di previsione del miRNA TargetScanHuman 7.1 e il database del percorso KEGG, e fornisce così ai ricercatori approfondimenti sulla modulazione dei percorsi di trasduzione del segnale da parte dei miRNA. miRnalyze è in grado di identificare miRNA comuni che prendono di mira più di un gene nella stessa via di segnalazione, una caratteristica che aumenta ulteriormente la probabilità di modulare la via e le reazioni a valle quando si utilizzano modulatori di miRNA. Inoltre, miRnalyze può ordinare i miRNA in base ai tipi seed-match e al punteggio TargetScan Context ++ , fornendo così un elenco gerarchico dei miRNA più preziosi. Inoltre, al fine di fornire agli utenti informazioni complete su miRNA, geni e percorsi, miRnalyze si collega anche ai dati di espressione dei miRNA (miRmine) e dei geni (TiGER) e ai dati sull'abbondanza del proteoma (PaxDb). Per convalidare la capacità dello strumento, abbiamo documentato la correlazione della previsione di miRnalyze\'s con studi di conferma sperimentale. http://www. mirnalyze. in.
Vivere meglio attraverso le ontologie all'Immune Epitope Database.Il progetto Immune Epitope Database (IEDB) incorpora ontologie sviluppate in modo indipendente e vocabolari controllati nella sua cura e interfaccia di ricerca. Ciò semplifica le pratiche di curation, migliora l'esperienza di query dell'utente e facilita l'interoperabilità tra l'IEDB e altre risorse. Sebbene l'uso di ontologie sviluppate in modo indipendente sia stato a lungo raccomandato come best practice, continua ad esserci un numero significativo di progetti che si sviluppano i propri vocabolari, o che non sfruttano appieno il potere delle ontologie che stanno utilizzando. Descriviamo come utilizziamo le ontologie nello IEDB, fornendo un esempio concreto dei vantaggi delle ontologie nella pratica. www. iedb. org.
Strategie verso la cura digitale e semi-automatica in RegulonDB.Le informazioni biologiche generate sperimentalmente devono essere organizzate e strutturate per diventare conoscenza significativa. Tuttavia , la velocità con cui vengono pubblicate nuove informazioni rende la cura manuale sempre più incapace di far fronte all'ideazione di nuove strategie di cura che si avvalgono del data mining e dell'analisi del testo è, quindi, una strada promettente per aiutare i database delle scienze della vita a far fronte al diluvio di nuove informazioni In questo articolo, descriviamo l'integrazione delle tecnologie di estrazione del testo nella pipeline di cura del database RegulonDB e discutiamo come il processo può migliorare la produttività dei curatori. ad un insieme di entità di dominio potenzialmente rilevanti per il processo curativo. I documenti annotati vengono presentati al curatore, il quale, grazie ad un d interfaccia, può selezionare frasi contenenti tipi specifici di entità, limitando così la quantità di testo che deve essere ispezionata. Inoltre, è in corso di integrazione nel sistema un modulo in grado di calcolare la somiglianza semantica tra le frasi nell'intera raccolta di articoli da curare. Abbiamo testato il modulo utilizzando tre serie di articoli scientifici e sei esperti di dominio. Tutti questi miglioramenti ci stanno gradualmente consentendo di ottenere un processo di curatela ad alta produttività con la stessa qualità della curatela manuale.
Biocuration nel database di collegamento struttura-funzione: l'anatomia di una superfamiglia.Con quantità sempre crescenti di dati di sequenza disponibili sia nella letteratura primaria e archivi di sequenze, c'è un collo di bottiglia nell'annotare la funzione molecolare in una sequenza. Questo articolo descrive il processo di biocurazione e i metodi utilizzati nel database di collegamento struttura-funzione (SFLD) per aiutare ad affrontare alcune delle sfide. Discutiamo come la gerarchia all'interno del SFLD ci consente di dedurre proprietà funzionali dettagliate per superfamiglie di enzimi funzionalmente diverse in cui tutti i membri sono omologhi, conservano un aspetto della loro funzione chimica e hanno caratteristiche strutturali conservate associate che consentono la chimica. È inoltre presentata l'Ontologia struttura-funzione enzimatica (ESFO) , che è stato progettato per catturare le relazioni tra sequenza enzimatica, struttura e funzione che sono alla base dell'SFLD e viene utilizzato per guidare il processo di biocurazione s all'interno dell'SFLD. http://sfld. rbvi. ucsf. edu/.
Il database degli oligonucleotidi dell'HIV (HIVoligoDB).Il virus dell'immunodeficienza umana (HIV) è associato a una delle malattie infettive più diffuse, l'immunodeficienza acquisita sindrome (AIDS). Lo sviluppo di farmaci antiretrovirali e metodi per la rilevazione del virus richiede un'analisi completa della diversità genomica dell'HIV, in particolare nei siti di legame degli oligonucleotidi. Qui, descriviamo un versatile database online (HIVoligoDB) con oligonucleotidi selezionati per la diagnosi dell'HIV e del trattamento dell'AIDS. Attualmente, il database fornisce un'interfaccia per la visualizzazione, l'analisi e il download di 380 HIV-1 e 65 oligonucleotidi di HIV-2 annotati secondo genomi di riferimento curati. Il database consente anche la selezione del genoma dell'HIV più conservato regioni per lo sviluppo di saggi diagnostici molecolari e terapie candidate basate sulla sequenza. http://portugene. com/HIVoligoDB.
Il \'topo dritto\': definizione di assi anatomici in modelli di embrioni 3D.Un obiettivo primario del progetto eMouseAtlas è consentire la mappatura spaziale 3D di dati di espressione genica dell'intero embrione per catturare modelli 3D complessi per l'indicizzazione, la visualizzazione, il confronto incrociato e l'analisi. Per questo abbiamo sviluppato un quadro spazio-temporale basato su modelli 3D di embrioni in diverse fasi di sviluppo accoppiati con un'ontologia anatomica. introdurre un metodo per definire gli assi coordinati che corrispondono alle direzioni anatomiche o biologicamente rilevanti antero-posteriore (AP), dorso-ventrale (DV) e sinistra-destra (LR) che consentono query e analisi più sofisticate dei dati con rilevanza biologica associazioni e forniscono nuove visualizzazioni di dati che possono rivelare modelli altrimenti difficili da rilevare nello spazio di coordinate 3D standard. Queste coordinate anatomiche sono definite utilizzando il concetto di \'m dritto ous-embryo\' entro cui le coordinate anatomiche sono cartesiane. Il modello di embrione dritto è stato mappato tramite una complessa trasformazione non lineare sul modello di embrione standard. Esploriamo l'utilità di questo sistema di coordinate anatomiche nel chiarire la relazione spaziale dei modelli di espressione genica del fattore di crescita dei fibroblasti e del fattore di crescita dei fibroblasti mappati spazialmente e discutiamo l'importanza di questa tecnologia nel riassumere dati di immagini di embrioni di topo multimodali complessi dall'espressione genica e dall'anatomia studi. www. emouseatlas. org.
Informazioni sulle proteine curate nel database del genoma di Saccharomyces.A causa dei recenti progressi nella produzione di dati proteomici sperimentali, il database del genoma di Saccharomyces (SGD; www. yeastgenome. org ) ha ampliato le nostre attività di cura delle proteine per rendere disponibili ai nostri utenti nuovi tipi di dati. A causa del vasto interesse per le modifiche post-traduzionali (PTM) e della loro importanza per la funzione e la regolazione delle proteine, abbiamo recentemente iniziato a incorporare Informazioni PTM sulle singole pagine delle proteine. Qui presentiamo anche l'inclusione di nuovi dati sull'abbondanza e sull'emivita delle proteine ottenuti da studi sul proteoma ad alto rendimento. Questi nuovi tipi di dati sono stati inclusi con l'obiettivo di facilitare la ricerca sulla biologia cellulare. : www. yeastgenome. org.
Sito web di microsatelliti Boechera: un portale online per l'identificazione delle specie e la determinazione della parentela ibrida.Boechera (Brassicaceae) ha molte caratteristiche per consigliarlo come modello genere per la ricerca ecologica ed evolutiva, compresa la ricchezza di specie, la diversità ecologica, la trattabilità sperimentale e la stretta vicinanza filogenetica all'Arabidopsis. Tuttavia, gli sforzi per realizzare il pieno potenziale di questo sistema modello sono stati vanificati dalla frequente incapacità dei ricercatori di identificare i loro campioni e posizionare in un più ampio contesto evolutivo. Qui presentiamo il Boechera Microsatellite Website (BMW), un portale che archivia oltre 55.000 chiamate alleliche di microsatelliti da 4471 campioni (di cui 133 tipi nomenclaturali). Il portale include strumenti analitici che utilizzano dati da 15 loci microsatelliti come un sistema di codici a barre del DNA altamente efficace. La BMW facilita l'identificazione accurata dei campioni Boechera e l'indagine dell'evoluzione reticolata tra i ±83 taxa diploidi sessuali nel genere, aumentando così notevolmente il potenziale di Boechera come sistema modello. http://sites. biology. duke. edu/windhamlab/.
Database dei carotenoidi: strutture, impronte chimiche e distribuzione tra gli organismi.Promuovere la comprensione di come gli organismi sono correlati tramite i carotenoidi, evolutivamente o simbioticamente, o nelle catene alimentari attraverso le storie naturali, abbiamo creato il database dei carotenoidi, che fornisce informazioni chimiche su 1117 carotenoidi naturali con 683 organismi di origine. Per estrarre organismi strettamente correlati attraverso la biosintesi dei carotenoidi, offriamo un nuovo sistema di ricerca per similarità \'Cerca carotenoidi simili\' utilizzando la nostra impronta chimica originale \'Carotenoid DB Chemical Fingerprints\'. Queste impronte chimiche Carotenoid DB descrivono la sottostruttura chimica e i dettagli di modifica basati sui nomi semi-sistematici IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) dei carotenoidi. Le impronte digitali consentono inoltre (i) predizione più facile di sei funzioni biologiche dei carotenoidi: provitamina A, membrana stab ilizzanti, sostanze odorose, sostanze allelochimiche, attività antiproliferativa e attività MDR inversa contro le cellule tumorali, (ii) più facile classificazione delle strutture carotenoidi, (iii) ricerca parziale ed esatta della struttura e (iv) più facile estrazione di isomeri strutturali e stereoisomeri. Riteniamo che questo sia il primo tentativo di stabilire impronte digitali utilizzando i nomi semi-sistematici IUPAC. Per estrarre organismi con profilo ravvicinato, forniamo un nuovo strumento \'Cerca organismi con profilo simile\'. Le nostre statistiche attuali mostrano alcune informazioni sulla storia naturale: i carotenoidi sembrano essere stati diffusi in gran parte dai batteri, poiché producono carotenoidi C30, C40, C45 e C50, con la più ampia gamma di gruppi terminali, e condividono una piccola porzione di carotenoidi C40 con eucarioti. Gli Archaea condividono una porzione ancora più piccola con gli eucarioti. Gli eucarioti hanno poi sviluppato una notevole varietà di carotenoidi C40. Considerando i carotenoidi, gli eucarioti sembrano più strettamente correlati ai batteri che agli archaea a parte l'analisi del lignaggio dell'rRNA 16S. : http://carotenoiddb. jp.
Identificatori utilizzabili, stabili a lungo termine e compatibili con il web semantico per l'accesso agli oggetti di raccolta biologica.Con le attività di ricerca sulla biodiversità sempre più spostate sul web, la necessità di un sistema di identificatori persistenti e stabili per gli oggetti di raccolta fisica diventa sempre più pressante. Il consorzio delle strutture tassonomiche europee ha concordato un sistema comune di identificatori stabili basati su HTTP-URI che è ora distribuito alle sue organizzazioni membri. Il sistema segue Principi di Linked Open Data e implementazione di meccanismi di reindirizzamento a rappresentazioni di campioni leggibili dall'uomo e dalla macchina, facilitando l'integrazione perfetta nel Web semantico in crescita. per gli elementi di metadati RDF che facilitano l'accesso armonizzato alle informazioni sulla raccolta i n portali web. : http://cetaf. org/cetaf-stable-identifiers.
SilkPathDB: una risorsa completa per lo studio dei patogeni del baco da seta.I patogeni del baco da seta hanno fortemente ostacolato lo sviluppo dell'industria sericola e svolgono un ruolo importante nei lepidotteri ecologia, e alcuni dei quali vengono utilizzati come insetticidi biologici. I rapidi progressi negli studi sull'omica dei patogeni del baco da seta hanno prodotto una grande quantità di dati, che devono essere riuniti centralmente in modo coerente e sistematico. Ciò faciliterà il riutilizzo di Questi dati per ulteriori analisi Abbiamo raccolto dati genomici per 86 patogeni del baco da seta da 4 taxa (funghi, microsporidi, batteri e virus) e da 4 ospiti di lepidotteri e sviluppato il Silkworm Pathogen Database (SilkPathDB) ad accesso aperto per rendere prontamente queste informazioni L'implementazione di SilkPathDB prevede l'integrazione di Drupal e GBrowse come interfaccia grafica per un database relazionale Chado che ospita tutti i dataset coinvolti. sono stati assemblati e annotati per scopi comparativi e consentono la ricerca e l'analisi di sequenze omologhe, elementi trasponibili, posizioni subcellulari proteiche, comprese le proteine secrete, e l'ontologia genica. Riteniamo che SilkPathDB aiuterà i ricercatori nell'identificazione dei parassiti del baco da seta, nella comprensione dei meccanismi delle infezioni del baco da seta e nell'ecologia dello sviluppo dei parassiti del baco da seta (espressione genica) e dei loro ospiti. http://silkpathdb. swu. edu. cn.
PCPPI: un database completo per la previsione delle interazioni proteina-proteina del raccolto di Penicillium.Il Penicillium expansum, l'agente causale della muffa blu, è uno dei patogeni post-raccolta più diffusi, infettando un'ampia gamma di colture dopo il raccolto. In risposta, le colture hanno sviluppato vari sistemi di difesa per proteggersi da questo e da altri agenti patogeni. L'interazione tra penicillio e coltura è un processo multiforme e mediato da agenti patogeni e proteine derivate dall'ospite. L'identificazione e la caratterizzazione delle interazioni proteina-proteina (PPI) tra le specie sono fondamentali per chiarire i meccanismi molecolari alla base dei processi di infezione tra P. expansum e colture vegetali Qui abbiamo sviluppato PCPPI, la proteina Penicillium -Crop -Database delle interazioni proteiche, costruito sulla base delle interazioni ortologhe determinate sperimentalmente nei sistemi patogeno-pianta e delle interazioni dominio-dominio (DDI) disponibili in ciascun PPI. Finora, memorizza informazioni su 9911 proteine, 439 904 interazioni e sette specie ospiti, tra cui mela, kiwi, mais, pera, riso, fragola e pomodoro. Ulteriori analisi attraverso l'annotazione dell'ontologia genica (GO) hanno indicato che le proteine con più partner interagenti tendono a svolgere la funzione essenziale. Significativamente, le statistiche semantiche dei termini GO hanno anche fornito un forte supporto per l'accuratezza delle nostre interazioni previste in PCPPI. Riteniamo che tutti i set di dati PCPPI siano utili per facilitare lo studio delle interazioni patogeno-coltura e siano disponibili gratuitamente per la comunità di ricerca. : http://bdg. hfut. edu. cn/pcppi/index. html.
OCaPPI-Db: un database di sonde oligonucleotidiche per l'identificazione dei patogeni attraverso la cattura dell'ibridazione.La rilevazione e l'identificazione di batteri patogeni coinvolti in atti di bio- e l'agroterrorismo è essenziale per evitare la dispersione dei patogeni nell'ambiente e la propagazione all'interno della popolazione. I metodi molecolari convenzionali, come l'amplificazione PCR, i microarray di DNA o il sequenziamento del fucile a pompa, sono soggetti a varie limitazioni durante la valutazione dei campioni ambientali, che possono portare a risultati imprecisi. una strategia di cattura dell'ibridazione che utilizza un set di sonde oligonucleotidiche per mirare e arricchire i biomarcatori di interesse nei campioni ambientali. Qui, presentiamo Oligonucleotide Capture Probes for Pathogen Identification Database (OCaPPI-Db), un database di sonde di cattura online contenente un set di 1.685 oligonucleotidi sonde che consentono il rilevamento e l'identificazione di 30 agenti di biominaccia fino al livello di specie. Questo set di sonde può essere utilizzato nella sua interezza come strumento diagnostico completo o può essere limitato a una serie di sonde mirate a un agente patogeno specifico oa un fattore di virulenza in base alle esigenze dell'utente. : http://ocappidb. uca. works.
BELMiner: adattamento di un sistema di estrazione di relazioni basato su regole per estrarre dichiarazioni linguistiche di espressioni biologiche da frasi di prove della letteratura biomedica.Estrazione di relazioni significative con la semantica significato dalla letteratura biomedica è spesso un compito impegnativo. BioCreative V track4 challenge per la prima volta ha organizzato un compito condiviso completo per testare la robustezza degli algoritmi di estrazione del testo nell'estrazione di asserzioni semanticamente significative dalla dichiarazione di evidenza nel testo biomedico. , abbiamo testato la capacità di un parser semantico basato su regole di estrarre dichiarazioni Biological Expression Language (BEL) da frasi di prove estratte dalla letteratura biomedica come parte della sfida BioCreative V Track4. Il sistema ha ottenuto una migliore misura F complessiva del 21,29% in estraendo la dichiarazione BEL completa. Per l'estrazione della relazione, il sistema ha raggiunto una misura F del 65,13% sul set di dati di prova. Il nostro sistema ha ottenuto il migliore prestazione in cinque dei sei criteri adottati per la valutazione dagli organizzatori del compito. La mancanza di capacità di derivare inferenze semantiche, la limitazione negli insiemi di regole per mappare le estrazioni testuali alla funzione BEL sono stati alcuni dei motivi per le basse prestazioni nell'estrazione dell'istruzione BEL completa. Dopo l'attività condivisa abbiamo anche valutato l'impatto dei componenti NER differenziali sulla capacità di estrarre le istruzioni BEL sui set di dati di test oltre a fare una singola modifica nei set di regole che traducono le estrazioni di relazioni in un'istruzione BEL. C'è un netto miglioramento di oltre il 20% nelle prestazioni complessive della capacità del BELMiner di estrarre l'istruzione BEL sul set di test. Il sistema è disponibile come API REST all'indirizzo http://54.146.11.205:8484/BELXtractor/finder/. http://54.146.11.205:8484/BELXtractor/finder/.
Servizi di sensibilizzazione e formazione online presso il Saccharomyces Genome Database.Il Saccharomyces Genome Database (SGD; www. yeastgenome. org ), la genetica primaria e risorsa genomica per il lievito in erba S. cerevisiae , fornisce accesso pubblico gratuito a informazioni sapientemente curate sul genoma del lievito e sui suoi prodotti genetici. In qualità di hub centrale per la comunità di ricerca sui lieviti, SGD si impegna in una serie di sforzi di sensibilizzazione sociale per informare i nostri utenti sui nuovi sviluppi, promuovere la collaborazione, aumentare la consapevolezza pubblica dell'importanza del lievito per la ricerca biomedica e facilitare la scoperta scientifica. Qui descriviamo questi vari metodi di sensibilizzazione, dal networking alle conferenze scientifiche all'uso dei media online come post di blog e webinar, e includere le nostre prospettive sui vantaggi forniti dalle attività di sensibilizzazione per i database di organismi modello. http://www. yeastgenome. org.
VerSeDa: database del secretoma dei vertebrati.Sulla base degli strumenti attuali, la previsione del secretoma de novo (insieme completo di proteine secrete da un organismo) è un tempo consumando attività bioinformatiche che richiedono un'analisi multifattoriale al fine di ottenere previsioni affidabili in silico. Quindi, per accelerare questo processo e offrire ai ricercatori un archivio affidabile in cui è possibile ottenere informazioni sul secretoma per vertebrati e organismi modello, abbiamo sviluppato VerSeDa (Vertebrate Secretome Database) Questo database liberamente disponibile memorizza informazioni sulle proteine che si prevede vengano secrete attraverso i meccanismi classici e non classici, per l'ampia gamma di specie di vertebrati depositate nei siti NCBI, UCSC e ENSEMBL. Per quanto ne sappiamo, VerSeDa è l'unico stato database all'avanguardia progettato per archiviare i dati del secretoma da più genomi di vertebrati, risparmiando così un'importante quantità di tempo speso nella previsione delle caratteristiche proteiche che possono essere recuperato direttamente da questo repository. VerSeDa è disponibile gratuitamente su http://genomics. cicbiogune. es/VerSeDa/index. php.
Modelli di spostamento della mascella durante movimenti di arretramento paralleli e rotazionali: un'analisi agli elementi finiti.BACKGROUND Lo scopo di questa analisi era valutare i modelli di spostamento del mascellare inferiore in arretramenti paralleli e rotazionali utilizzando il metodo degli elementi finiti (FEM). MATERIALI E METODI È stato costruito un modello tridimensionale (3D) di elementi finiti di un emimascellare. Attraverso un'osteotomia convenzionale Le Fort I, 2 e 3 mm di posteriore sono stati simulati movimenti paralleli e rotazionali ed è stato valutato lo schema di spostamento della mascella in ciascun tipo di movimento. lo spostamento laterale era di 1,84 mm. Tutti gli spostamenti laterali nella regione anteriore sono risultati essere superiori a 1 mm. CONCLUSIONI I risultati di questo studio possono fornire informazioni su ho w la mascella tende a muoversi durante l'intervento di arretramento mascellare totale.
Agenesi della cistifellea: una rara causa embrionale di colica biliare ricorrente.BACKGROUND L'agenesia della cistifellea (GA) è un'anomalia anatomica estremamente rara con un'incidenza segnalata inferiore allo 0,5%. Di solito è asintomatico, ma può presentarsi con caratteristiche di colica biliare e colecistite. Presentiamo qui un caso di GA in un paziente con colica biliare ricorrente. CASE REPORT Una donna afroamericana di 24 anni si è presentata con episodi ricorrenti di dolore addominale del quadrante superiore destro. Durante il suo primo episodio, è stata riscontrata un aumento delle transaminasi e caratteristiche cliniche di colecistite, ma l'ecografia non ha visualizzato una colecisti ed è stata dimessa con una diagnosi di colica biliare. È tornata entro un settimana con peggioramento degli enzimi epatici, forte dolore e vomito. È stata eseguita una scansione con acido iminodiacetico epatobiliare (HIDA), che ancora una volta non ha mostrato la cistifellea. In caso di sospetto clinico di colecistite acuta, è stata sottoposta a sutura laparoscopica rgia. Intraoperatoriamente, la fossa della cistifellea era vuota ed è stata fatta una diagnosi di agenesia della cistifellea. Si è presentata una terza volta con disturbi simili ed è stata eseguita una colangiopancreatografia a risonanza magnetica (MRCP), che ha mostrato una normale anatomia del tratto biliare e una cistifellea assente. Fu fatta diagnosi di disfunzione dello sfintere di Oddi e fu dimessa con antispastici. CONCLUSIONI La diagnosi di GA è impegnativa. La rarità di questa entità combinata con le caratteristiche cliniche classiche della colecistite e la mancata visualizzazione della cistifellea nelle indagini di routine richiede un intervento chirurgico non necessario. La consapevolezza di questa condizione, insieme all'uso di migliori modalità di imaging come la MRCP preoperatoria, può aiutare i medici a gestire in modo appropriato questa condizione clinica non comune.
Il microRNA-181a regola il processo di apoptosi e autofagia nella malattia di Parkinson inibendo la segnalazione della proteina chinasi attivata da mitogeno p38 (MAPK)/c-Jun N-terminale chinasi (JNK) Pathways.BACKGROUND microRNA (miR)-181a è stato segnalato per essere sottoregolato nella malattia di Parkinson (PD), ma il meccanismo di regolazione del miR-181a sull'apoptosi neuronale e sull'autofagia è ancora poco compreso. Noi MATERIALI E METODI Cellule di neuroblastoma umano SK-N-SH sono state incubate con diverse concentrazioni di ione 1-metil-4-fenilpiridinio (MPP+) per indurre il modello di PD. è stata quindi analizzata l'espressione di miR-181a. Dopo la trasfezione con miR-181a mimic o scramble dopo il trattamento con MPP+, l'espressione di marcatori proteici autofagici (LC3II, LC3I e Beclin 1) e p38 mitogene-activated protein chinasi (MAPK)/c- Jun N-terminal chinasi (JNK) proteine di segnalazione (p-p38, p38, p-JNK, a nd JNK) e sono stati rilevati l'apoptosi cellulare. Inoltre, le cellule sono state trasfettate con inibitore miR-181a e coltivate in presenza o assenza dell'inibitore p38 SB203582 o dell'inibitore JNK SP600125 e l'apoptosi cellulare è stata testata nuovamente. RISULTATI L'espressione di miR-181a è stata gradualmente ridotta con l'aumento della concentrazione di MPP+ (P<0.05, P<0.01, o P<0.001). La sovraespressione di miR-181a ha ridotto significativamente il rapporto LC3II/LC3I, l'espressione di Beclin 1, l'apoptosi cellulare e l'espressione di p-p38 e p-JNK rispetto al gruppo di scramble MPP+ + miR-181a (tutti P<0.05). Inoltre, abbiamo osservato che SB203582 o SP600125 non hanno mostrato effetti sull'apoptosi cellulare, ma gli effetti dell'inibitore miR-181a sull'apoptosi cellulare sono stati invertiti dalla somministrazione di SB203582 o SP600125 rispetto al gruppo scramble (P<0.05). CONCLUSIONI I nostri risultati suggeriscono che miR-181a regola l'apoptosi e l'autofagia nel PD inibendo la via p38 MAPK/JNK.
Determinanti dell'età ossea avanzata nell'obesità infantile .L'obesità infantile è associata all'età ossea avanzata (BA). Studi precedenti suggeriscono che gli androgeni, gli estrogeni, la globulina legante gli ormoni sessuali e l'insulina sono responsabili di questo fenomeno, ma i risultati sono contraddittori e potrebbero essere distorti da fattori confondenti. Il nostro obiettivo è chiarire questa questione applicando un approccio multivariato. Abbiamo eseguito un'analisi di correlazione del punteggio di deviazione standard BA (SDS) con SDS specifiche per età e sesso per androgeni, estrogeni e con indicatori di secrezione di insulina derivati da test di tolleranza al glucosio orale, in un gruppo di bambini obesi È stata eseguita un'analisi multivariata per indagare quali parametri fossero predittivi indipendentemente di BA SDS. questa coorte (n = 101; età media 10,9 anni; media BA 11,8 anni; media BMI SDS 3,3), BMI SDS era significativamente correlata a BA SDS (r = 0,55, p < 0,001). coorte totale ( B = 0,27, p < 0,001), nonché nelle femmine (B = 0,34, p = 0,042), nei maschi (B = 0,31, p = 0,006) e nei bambini puberali (B = 0,32, p = 0,046), deidroepiandrosterone solfato (DHEAS) ha mostrato un'associazione positiva e indipendente con BA SDS. Non è stata trovata alcuna associazione con indicatori di secrezione di insulina. BMI SDS è altamente correlato a BA SDS nei bambini obesi. L'aumento del DHEAS ha un ruolo centrale nella BA avanzata nei bambini obesi. .
Modelli di metilazione dei geni SOX3, SOX9 e WNT4 nelle gonadi di cani con disturbo dello sviluppo sessuale XX (SRY-negativo).Ovotesticolare o testicolare Il disturbo dello sviluppo sessuale nei cani con cariotipo femminile e mancanza di SRY (XX DSD) è un'anomalia sessuale comune diagnosticata in numerose razze. Il background molecolare, tuttavia, rimane poco chiaro e i meccanismi epigenetici, inclusa la metilazione del DNA, non sono stati studiati. Lo scopo del nostro studio era l'analisi comparativa della metilazione delle isole CpG nei promotori dei geni candidati per XX DSD: SOX9, SOX3 e WNT4. Gli studi di metilazione sono stati condotti su DNA estratto da gonadi fissate in formalina/incluse in paraffina o congelate da 2 cani con ovotesticolare e 2 cani con XX DSD testicolare, nonché femmine di controllo (n = 4) e maschi (n = 2). Il DNA convertito con bisolfito è stato utilizzato per l'analisi della metilazione CpG mediante pirosequenziamento quantitativo. Le regioni promotrici di SOX9 e WNT4 hanno mostrato CpG simile metilazione n in ciascun gruppo, rispettivamente dallo 0 al 5,5% e dal 39 al 74%. Il promotore di SOX3 ha mostrato una metilazione significativamente più alta nei casi di XX DSD ovotesticolare e nei casi di XX DSD testicolare e nei maschi di controllo, suggerendo che la metilazione di SOX3 può svolgere un ruolo nella patogenesi del XX DSD canino.
L'interleuchina-4 induce la demetilazione sito-specifica CpG del promotore di Pendrin nelle cellule epiteliali bronchiali primarie umane.Il pendrin è sovraregolato nelle cellule epiteliali bronchiali dopo IL -4 stimolazione tramite il legame di STAT6 a un motivo GAS N4. La metilazione CpG basale del promotore di pendrina è cellula-specifica Abbiamo studiato se esiste una correlazione tra la sensibilità di IL-4 e lo stato di metilazione CpG del promotore di pendrina nella cellula epiteliale bronchiale umana Sono stati utilizzati la PCR in tempo reale e il pyrosequencing per quantificare rispettivamente i livelli di mRNA di pendrin e la metilazione del promotore di pendrin, con e senza stimolazione di IL-4, in cellule HBE primarie sane e malate, nonché in cellule NCI-H292. dopo la stimolazione con IL-4 era più robusto nelle cellule NCI-H292 che nelle cellule primarie. La quantità di gDNA metilato variava notevolmente tra i tipi di cellule. In particolare, il sito CpG 90 situato vicino al motivo N4 GAS era altamente metilato nel pr cellule immarie. Un sito CpG aggiuntivo (90bis), creato da un SNP, è stato trovato solo nelle cellule primarie. La stimolazione con IL-4 ha provocato una drammatica demetilazione dei siti CpG 90 e 90bis nelle cellule primarie. IL-4 induce la demetilazione di specifici siti CpG all'interno del promotore del pendrin. Queste alterazioni epigenetiche sono specifiche del tipo di cellula e possono in parte dettare la trascrizione dell'mRNA del pendrin.
Imaging in vivo del glicocalice endoteliale cerebrale nei topi.Il glicocalice endoteliale si riferisce allo strato proteoglicano o glicoproteico delle pareti dei vasi e ha funzioni fisiologiche critiche. Il glicocalice cerebrale può avere funzioni aggiuntive considerando la barriera emato-encefalica e altre caratteristiche. Tuttavia, la valutazione di esso è stata eseguita solo ex vivo, che include processi che presumibilmente danneggiano lo strato di glicocalice. Qui visualizziamo e caratterizziamo il glicocalice endoteliale cerebrale in vivo. Abbiamo visualizzato e quantificato il glicocalice endoteliale cerebrale in vivo sotto un microscopio a 2 fotoni etichettando il glicocalice e il lume del vaso con agglutinina di germe di grano, lectina e destrano, rispettivamente. L'intensità radiale è stata analizzata per misurare lo spessore del glicocalice endoteliale cerebrale in ciascun tipo di vaso Le arterie e i capillari cerebrali hanno un glicocalice endoteliale intatto, ma le vene e le venule no. lo strato del calice nelle arterie piali, nelle arterie penetranti e nei capillari era diverso; tuttavia, non era correlato con il diametro del vaso all'interno di ciascun tipo di vaso. Abbiamo caratterizzato la distribuzione del glicocalice endoteliale cerebrale in vivo. Rispetto ai risultati degli studi ex vivo, lo strato è più spesso, il che indica che lo strato può essere danneggiato nei sistemi ex vivo. Abbiamo anche osservato una distribuzione disomogenea del glicocalice endoteliale cerebrale che potrebbe riflettere l'eterogeneità funzionale del tipo di vaso.
Effetto benefico Akt2-dipendente della galanina sull'assorbimento del glucosio indotto dall'insulina negli adipociti di ratti diabetici.L'assorbimento del glucosio avviene tramite l'attivazione di un insulina- cascata di segnali, con conseguente traslocazione del trasportatore del glucosio 4 (GLUT4) alla membrana plasmatica di adipociti e miociti. Recenti ricerche hanno scoperto che la galanina potrebbe aumentare l'assorbimento del glucosio indotto dall'insulina. Questo studio mirava a esplorare se l'attivazione di Akt2 media gli effetti benefici di galanin sull'assorbimento del glucosio indotto dall'insulina negli adipociti di ratti diabetici. In questo esperimento, insulina, galanina e MK-2206, un inibitore di Akt, sono stati iniettati individualmente o in combinazione nei ratti diabetici una volta al giorno per dieci giorni. Quindi, l'assorbimento del glucosio e pAkt2 e le sue proteine a valle sono stati esaminati negli adipociti. La somministrazione di galanina ha aumentato significativamente l'assorbimento di 2-Deossi-D-[3H]glucosio indotto dall'insulina;Il contenuto di GLUT4 e della proteina 2 di membrana associata alla vescicola nella membrana plasmatica ni; e livelli di espressione di mRNA di pAkt2Thr308/Ser473 e Akt2 negli adipociti. Inoltre, le proteine a valle di Akt2 tra cui AS160 fosforilata sono state aumentate, ma i livelli della scatola forkhead fosforilata O1 e della glicogeno sintasi chinasi-3β sono stati ridotti. Il trattamento con MK-2206 può bloccare gli effetti benefici della galanina su questi eventi indotti dall'insulina. I risultati di questo studio suggeriscono che la fosforilazione di Akt2 media gli effetti benefici della galanina sull'assorbimento del glucosio indotto dall'insulina negli adipociti dei ratti diabetici.
La soppressione del MicroRNA-383 aumenta il potenziale terapeutico delle cellule staminali mesenchimali derivate dal midollo osseo umano nel trattamento delle lesioni del midollo spinale tramite GDNF.Trapianto di osso -cellule staminali mesenchimali derivate dal midollo (MSC) sono state utilizzate per trattare la lesione del midollo spinale (SCI) per migliorare la riparazione dei tessuti e la rigenerazione delle cellule neurali. Il fattore neurotrofico derivato dalla linea cellulare gliale (GDNF) è un fattore di crescita e sopravvivenza neurale identificato. Qui, abbiamo esaminato se la modifica dei livelli di GDNF nelle MSC possa aumentare ulteriormente il potenziale delle MSC nel promuovere la rigenerazione delle cellule neurali e successivamente l'esito terapeutico Abbiamo esaminato i livelli di mRNA e proteine di GDNF nelle MSC umane mediante RT-qPCR e Western blot, rispettivamente. sono state eseguite analisi per prevedere i microRNA (miRNA) che colpiscono GDNF nelle MSC. Il legame funzionale dei miRNA all'mRNA di GDNF è stato esaminato mediante un test reporter a doppia luciferasi. Le MSC sono state trasdotte con virus adeno-associato (AAV) c arrying null o antisenso per miR-383 (as-miR-383), che sono stati trapiantati in ratti nudi sottoposti a SCI. Sono stati valutati il tessuto intatto, il volume della cavità e il recupero dell'attività locomotoria. Le MSC esprimevano una proteina GDNF molto bassa, ma livelli sorprendentemente alti di mRNA GDNF. Le analisi bioinformatiche hanno mostrato che miR-383 ha inibito la traduzione proteica di GDNF, attraverso il legame al 3\'-UTR dell'mRNA di GDNF. Le MSC trasdotte con AAV-as-miR-383 hanno ulteriormente aumentato la percentuale di tessuto intatto, ridotto il volume della cavità e migliorato il recupero dell'attività locomotoria nei ratti nudi sottoposti a SCI, rispetto alle MSC. La soppressione di miR-383 può aumentare il potenziale terapeutico delle MSC derivate dal midollo osseo umano nel trattamento della SCI attraverso l'aumento dei livelli di proteina GDNF.
Ascite non maligna del liquido cerebrospinale in un paziente con tumore rabdoide teratoide atipico.Lo sviluppo di ascite sintomatica da uno shunt ventricoloperitoneale è raro nei bambini senza precedente patologia intra-addominale. Qui riportiamo un caso di ascite sintomatica in un bambino piccolo con uno shunt ventricoloperitoneale e tumore rabdoide teratoide atipico metastatico. Questo ragazzo di 15 mesi ha sviluppato ascite sintomatica mentre era sottoposto a chemioterapia per il suo tumore maligno al cervello. fino ad identificare l'eziologia di questa ascite ha prodotto un trasudato non maligno, sterile, refrattario a ripetute paracentesi. L'ascite si è infine risolta con la conversione dello shunt ventricoloperitoneale in uno shunt ventricoloatriale. Questo caso clinico evidenzia la necessità di essere sospettosi di non- ascite maligna del liquido cerebrospinale come causa di accumulo di liquido peritoneale anche nei bambini con tumore cerebrale primitivo maligno. sione dello shunt dal drenaggio peritoneale a quello atriale può alleviare rapidamente la morbilità associata a questa condizione.
Espressione di nuovi CD44st e MMP2 nei tessuti del NSCLC e loro significato clinico.L'espressione anormale di alcune molecole CD44 nei tessuti tumorali può indurre la degradazione del matrice extracellulare ed è strettamente associata a metastasi linfonodali ascellari, angiogenesi, progressione del cancro e resistenza ai farmaci Abbiamo misurato e confermato l'espressione di mRNA e proteine CD44st e MMP2 nei tessuti tumorali e nei tessuti normali adiacenti del polmone non a piccole cellule postoperatorie pazienti affetti da cancro (NSCLC) con adenocarcinoma (n = 72) o carcinoma a cellule squamose (n = 53) utilizzando la reazione a catena della polimerasi a trascrizione inversa quantitativa, il sequenziamento genico e l'analisi immunoistochimica. L'espressione di CD44st e MMP2 era strettamente associata alla classificazione istopatologica , metastasi linfonodali e stadio TNM dei tumori e la differenza era statisticamente significativa (p < 0,05). La sopravvivenza globale mediana (OS) per il gruppo ad alta espressione CD44st era di 30,52 mesi (intervallo di confidenza 95% (CI) 24,02-36,15); per il gruppo a bassa espressione era di 43,23 mesi (95% CI 31,81-52,02) (p = 0,020). L'OS mediana per il gruppo ad alta espressione di MMP-2 era di 30,53 mesi (95% CI 26,69-33,31); per il gruppo a bassa espressione era di 40,06 mesi (95% CI 33,55-46,45) (p = 0,022). I tassi di espressione di CD44st e MMP2 erano più alti nei carcinomi a cellule squamose che negli adenocarcinomi, erano strettamente associati alle metastasi linfonodali e allo stadio TNM e colpivano la prognosi dei pazienti.
Correlazione dell'espressione della caveolina-1 con la prognosi in pazienti con cancro gastrico dopo gastrectomia.La sovraregolazione dell'espressione della caveolina-1 (Cav-1) è correlata con grado istopatologico e prognosi infausta in diversi tumori umani. Tuttavia, nel cancro gastrico, la sua utilità clinica come utile marcatore molecolare prognostico rimane poco chiara. L'importanza prognostica dell'espressione di Cav-1 è stata analizzata retrospettivamente mediante immunoistochimica in 148 pazienti con cancro gastrico che avevano sottoposti a gastrectomia radicale L'espressione di Cav-1 è risultata positiva in 23 (15,5%) pazienti e negativa in 125 (84,5%). essere significativamente associata all'espressione di Cav 1. La sopravvivenza libera da malattia (DFS) mediana dei pazienti con espressione negativa di Cav-1 era significativamente migliore di quella dei pazienti con espressione positiva di Cav-1 (non raggiunta rispetto a 10. 2 mesi, p < 0,001). Inoltre, i pazienti con espressione di Cav-1 positiva avevano una sopravvivenza globale (OS) mediana peggiore rispetto ai pazienti con espressione di Cav-1 negativa (14,2 vs 40,3 mesi, p = 0,004). Nell'analisi multivariata, l'espressione di Cav-1 (positiva vs. negativa) era un fattore prognostico indipendente per DFS (p < 0,001, rapporto di rischio (HR) 2,58) e OS (p = 0,031, HR 1,87), così come la linfa metastasi linfonodali. I nostri risultati suggeriscono che l'espressione positiva di Cav-1 è associata a progressione e prognosi infausta nei pazienti con cancro gastrico dopo gastrectomia radicale. Prendere di mira Cav-1 sarebbe una potenziale opzione per il futuro trattamento del cancro gastrico.
Morte improvvisa nella malattia renale allo stadio terminale: confronto tra emodialisi e dialisi peritoneale.Questo studio mirava a valutare la morte totale e improvvisa (SD) in una coorte dei pazienti in dialisi, confrontando l'emodialisi (HD) con la dialisi peritoneale (PD). Questo è uno studio di coorte retrospettivo multicentrico. I decessi sono stati 626 su 1.823 nella MH e 62 su 249 nei pazienti con PD. I pazienti con MH avevano un numero maggiore di comorbidità ( p < 0,05). I pazienti con MP avevano un rischio di morte inferiore rispetto ai pazienti con MH (p < 0,001); tuttavia, il vantaggio è diminuito con il tempo (p < 0,001). I predittori di mortalità erano la frazione di eiezione ventricolare sinistra (LVEF) ≤35 %, età avanzata, cardiopatia ischemica, diabete mellito, precedente ictus e fibrillazione atriale (p < 0,03). Le DS erano 84:71 nella popolazione HD e 13 nella popolazione PD (12,1 e 22,8% di tutte le cause di morte, rispettivamente) È stato rilevato un rischio non significativo di SD tra i pazienti con PD rispetto ai pazienti con HD. I predittori di SD erano età avanzata, h ischemico malattia dell'orecchio e FEVS ≤35% (p < 0,05). I pazienti HD hanno mostrato una maggiore presenza di comorbidità e ridotta sopravvivenza rispetto ai pazienti PD; tuttavia, l'incidenza di SD non differisce nelle 2 popolazioni. Video Journal Club "Cappuccino con Claudio Ronco" su http://www. karger. com/. doi=464347.
La proteina 2 correlata a Dickkopf è epigeneticamente inattivata e sopprime la crescita del cancro colorettale e le metastasi tumorali antagonizzando la segnalazione Wnt/β-catenina.Attivazione aberrante del La via di segnalazione Wnt/β-catenina svolge un ruolo chiave nella patogenesi di tumori multipli, inclusi i tumori digestivi. Recenti studi hanno riportato che la proteina 2 correlata a Dickkopf (DKK2) è epigeneticamente inattivata in numerosi tipi di tumori e che i suoi prodotti genici mostrano tumori- proprietà soppressive. Tuttavia, le funzioni biologiche e i meccanismi molecolari sottostanti di DKK2 nel carcinoma del colon rimangono oscuri. Abbiamo esaminato l'espressione di DKK2 nelle linee cellulari del tumore del colon mediante RT-PCR e il suo stato di metilazione del promotore nelle linee cellulari del tumore del colon e nei tumori primari mediante metilazione -specific PCR (MSP). L'espressione ectopica di DKK2 è stata misurata mediante RT-PCR prima degli altri esperimenti. Per indagare la funzione di DKK2, abbiamo analizzato la formazione di colonie e la proliferazione cellulare razione, ha utilizzato analisi citometriche a flusso del ciclo cellulare e colorazione con fluorescenza di acridina/bromuro di etidio (AO/EB) per l'apoptosi ed ha esaminato la guarigione delle ferite, la migrazione transwell e la crescita del tumore in vivo. I Western blot sono stati utilizzati per esplorare i meccanismi di DKK2 nella transizione epitelio-mesenchimale e nella segnalazione canonica di Wnt/β-catenina. Mostriamo qui che la downregulation o il silenziamento di DKK2 era strettamente associato allo stato di ipermetilazione del suo promotore e che l'espressione di DKK2 poteva essere ripristinata mediante trattamento di demetilazione. La metilazione del promotore DKK2 è stata rilevata in quasi tutti i tumori e nei tessuti adiacenti al tumore, ma non nei normali tessuti del colon. L'espressione ectopica di DKK2 nelle linee cellulari del colon HCT116 e HT-29 ha inibito la formazione di colonie e la vitalità cellulare inducendo l'arresto e l'apoptosi del ciclo cellulare G0/G1 e la crescita di cellule HCT116 stabili infettate da DKK2 nei topi nudi è stata ridotta rispetto ai controlli. Inoltre, DKK2 ha limitato la migrazione cellulare attraverso l'inversione parziale della transizione epitelio-mesenchimale e anche mediante la sottoregolazione di diversi marcatori di cellule staminali. I nostri dati hanno inoltre mostrato che il ripristino dell'espressione di DKK2 ha provocato la downregulation della β-catenina attiva e dei suoi geni bersaglio a valle. DKK2 sembra essere un soppressore tumorale funzionale che regola la tumorigenesi del cancro del colon-retto antagonizzando la segnalazione Wnt/β-catenina.
Modifiche nell'espressione e nella funzione del recettore IP3 nel muscolo liscio aortico di topi aterosclerotici.Il perossinitrito è un vasodilatatore indipendente dall'endotelio che induce il rilassamento tramite l'iperpolarizzazione della membrana. L'attivazione dei recettori IP3 innesca l'apertura dei canali del potassio e l'iperpolarizzazione. In precedenza abbiamo scoperto che il rilassamento a perossinitrito è stato mantenuto durante lo sviluppo dell'aterosclerosi a causa di cambiamenti nell'espressione delle proteine regolatrici del calcio. In questo studio abbiamo studiato: (1) il meccanismo di rilassamento indotto da perossinitrito nell'aorta di topo, (2) l'effetto dell'aterosclerosi sul rilassamento a perossinitrito e altri vasodilatatori e (3) l'effetto dell'aterosclerosi sull'espressione e la funzione del recettore IP3. miografia e l'aterosclerosi è stata indotta da topi ApoE-/- che si nutrono di grasso L'espressione dei recettori IP3 è stata studiata mediante Western blotting e immunoistochimica. chimica. Il rilassamento a perossinitrito è stato attenuato dagli antagonisti IP3 2-APB e xestospongina C e anche dal bloccante del canale Kv 4-aminopiridina (4-AP). L'aterosclerosi ha attenuato la vasodilatazione al cromakalim e all'attivatore dell'AMPK A769662 ma non al perossinitrito. Il rilassamento è stato attenuato in misura maggiore da 2-APB nell'aorta aterosclerotica nonostante la ridotta espressione dei recettori IP3. 4-AP era meno efficace nei topi ApoE-/- nutriti con grassi per 4 mesi. Il rilassamento del perossinitrito comporta un rilascio di calcio indotto da IP3 e l'attivazione del canale KV. Questo meccanismo diventa meno importante con lo sviluppo dell'aterosclerosi e il rilassamento a perossinitrito può essere mantenuto da una maggiore estrusione di calcio.
Effetto dell'alimentazione sulla crescita staturale .Nei bambini, una crescita e uno sviluppo adeguati sono spesso considerati un indicatore surrogato di una buona salute. Un sistema complesso controlla l'inizio, la velocità e la cessazione della crescita, e fornisce quindi un meraviglioso esempio delle interazioni tra genetica, epigenetica e fattori ambientali (in particolare stress e nutrizione). La malnutrizione è considerata una delle principali cause di attenuazione della crescita nei bambini. Questa recensione riassume il nostro conoscenze attuali sui meccanismi che collegano nutrizione e crescita scheletrica, inclusi fattori sistemici, come insulina, ormone della crescita, fattore di crescita insulino-simile-1, fattore di crescita dei fibroblasti-21, ecc. , e meccanismi locali, inclusi mTOR, miRNA ed epigenetica Lo studio dei meccanismi molecolari che regolano la crescita scheletrica può portare alla definizione di migliori regimi nutrizionali e terapeutici per una crescita lineare più efficace nei bambini con malnutrizione e crescita anormale cravatte. .
Terrestrialità di Wild Sapajus cay (Illiger, 1815) come rivelata da trappole fotografiche.Anche se principalmente arboricola, la scimmia cappuccina (Sapajus cay) discende a al suolo per diversi motivi. Abbiamo utilizzato i record terrestri ottenuti da sondaggi con trappole fotografiche per indagare sulla stagionalità della terrestrità delle scimmie cappuccine, i motivi per scendere a terra e i periodi della giornata in cui la terrestrità era più pronunciata. Abbiamo condotto lo studio in il massiccio dell'Urucum, nel Pantanal brasiliano. Abbiamo ottenuto i dati da 2 sondaggi con fototrappole effettuati nelle stagioni secca e piovosa. I comportamenti terrestri sono stati classificati e i modelli di attività terrestre sono stati descritti utilizzando un approccio basato sulla densità del kernel. Abbiamo osservato un effetto stagionale sulla frequenza dei comportamenti terrestri delle scimmie cappuccine, che hanno utilizzato maggiormente il suolo durante la stagione secca. Abbiamo identificato 6 diversi tipi di comportamento terrestre, ma viaggiare (33,3%), foraggiamento (23,3%) e acqua potabile (23,3%) sono stati i più osservati. Tutti i record si sono verificati durante il giorno, con 2 picchi di attività terrestre. La terrestrialità stagionale era principalmente legata alle esigenze ecologiche durante i periodi di scarsità di cibo e acqua.
Lo stress cronico contribuisce alla disfunzione cognitiva e alle anomalie metaboliche dell'ippocampo nei topi APP/PS1.La risposta allo stress è determinata dal cervello e il cervello è un bersaglio sensibile per lo stress I nostri esperimenti precedenti hanno confermato che una volta che la risposta allo stress è oltre il limite tollerabile del cervello, in particolare quello dell'ippocampo, avrà effetti deleteri sulla struttura e sulla funzione dell'ippocampo; tuttavia, i meccanismi metabolici per questo non sono ben compreso Qui, abbiamo usato il labirinto dell'acqua di Morris, Elisa e la gascromatografia-tempo di volo/spettrometria di massa per osservare i cambiamenti nella cognizione, neuropatologia e metabolomica nell'ippocampo di topi APP/PS1 e topi wild-type (C57) causati da stress lieve imprevedibile cronico (CUMS), abbiamo anche esplorato ulteriormente la correlazione tra cognizione e metabolomica Abbiamo scoperto che 4 settimane di CUMS hanno aggravato il deterioramento cognitivo e aumentato la deposizione di amiloide-β nei topi APP/PS1, ma non ha influenzato i topi C57. In condizioni di non stress, rispetto ai topi C57, c'erano 8 diversi metaboliti nei topi APP/PS1. Tuttavia, in seguito a CUMS, sono stati modificati 3 diversi metaboliti rispetto ai topi C57 non trattati. Rispetto ai topi APP/PS1, c'erano 7 diversi metaboliti nei topi APP/PS1+CUMS. Tra queste alterazioni, acido 3-idrossibutirrico, valina, serina, beta-alanina e o-fosforiletanolammina, che sono coinvolte nel metabolismo degli sfingolipidi, nella sintesi e degradazione dei corpi chetonici e nel metabolismo degli amminoacidi. I risultati indicano che i topi APP/PS1 sono più vulnerabili allo stress rispetto ai topi C57 e i meccanismi metabolici del deterioramento cognitivo correlato allo stress nei topi APP/PS1 sono correlati a molteplici percorsi e reti, tra cui il metabolismo degli sfingolipidi, la sintesi e la degradazione dei corpi chetonici e metabolismo degli aminoacidi.
Predittori di metastasi linfonodali e prognosi in pazienti con cancro colorettale pT1 con cellule ad anello con sigillo e adenocarcinomi mucinosi.L'escissione locale del cancro colorettale precoce è limitato dalla presenza di metastasi linfonodali (LNM). I carcinomi a cellule ad anello con sigillo (SRC) e gli adenocarcinomi mucinosi (MAC) sono due sottotipi istologici relativamente rari. Tuttavia, poco si sa sui predittori di LNM e sulla prognosi per supportare la fattibilità di escissione locale in fase iniziale di SRC e MAC. Il database Surveillance Epidemiology and End Results è stato utilizzato per identificare tutti i pazienti con adenocarcinomi pT1, inclusi adenocarcinoma convenzionale (AC), MAC e SRC. È stata valutata la prevalenza di LNM e la lunga è stato calcolato il tasso di sopravvivenza a termine nei suddetti tre tipi di cancro del colon-retto. SRC rappresentava lo 0,3% e MAC rappresentava il 4,4% dell'intera coorte di adenocarcinomi del colon-retto. Rispetto ad AC, MRC e SRC erano più spesso localizzati d nel colon prossimale, ed ha mostrato un grado più alto. L'incidenza di LNM in AC, MAC e SRC era rispettivamente del 10,6%, 17,2% e 33,3% per i tumori del colon e del 14,8%, 25,9% e 46,2% per i tumori del retto. Nei pazienti con linfonodi asportati non meno di 12, l'incidenza di LNM in AC, MRC e SRC era rispettivamente del 12%, 21% e 44% per i tumori del colon e del 17%, 30% e 14% per i tumori del retto. Sebbene, i pazienti del colon MAC abbiano mostrato un tasso di sopravvivenza completamente peggiore rispetto all'AC, i pazienti del retto MAC hanno mostrato una prognosi simile all'AC. Abbiamo scoperto che nei pazienti con tumori rettali, l'SRC aveva una prognosi peggiore a 3 e 5 anni rispetto all'AC. Tuttavia, per i tumori del colon, la prognosi dell'SRC era simile a quella dell'AC. L'istologia non è risultata essere un fattore prognostico indipendente nell'analisi di sopravvivenza multivariata. MAC e SRC sono due sottotipi distinti di cancro del colon-retto che richiedono un'attenzione speciale nonostante la loro prevalenza relativamente rara. I pazienti con pT1 con SRC del retto e i pazienti con MAC del colon hanno una maggiore incidenza di LNM e, con questi esiti avversi, l'escissione locale non è raccomandata. Sebbene MAC del retto e SRC del colon abbiano un alto tasso di LNM, la prognosi di questi tipi è simile a quella dell'AC.
(-)-Epigallocatechin-3-Gallate inibisce l'infiammazione e l'apoptosi indotte dall'arsenico attraverso la soppressione dello stress ossidativo nei topi.Esposizione all'arsenico negli individui è stato scoperto essere associato a vari problemi di salute tra cui lesioni cutanee, cancro e disturbi cardiovascolari e immunologici. (-)-Epigallocatechina-3-gallato (EGCG), la principale e attiva catechina polifenolica presente nel tè verde, ha dimostrato potente attività antiossidante, anti-apoptotica e antinfiammatoria in vivo e in vitro. Pertanto, il presente studio è stato condotto per studiare gli effetti protettivi dell'EGCG contro l'infiammazione e l'immunotossicità indotte dall'arsenico nei topi. Siero IL-1β, IL-6 e Il TNF-α è stato determinato mediante ELISA, catalasi tissutale (CAT), malonildialdeide (MDA), superossido dismutasi (SOD), glutatione (GSH), ossido nitrico e caspasi 3 mediante kit commerciali, potenziale di membrana mitocondriale con Rh 123, ROS mitocondriale con 2 \',7\'-diclorofluo diacetato di resina (DCFH-DA), cellule apoptotiche e necrotiche e fenotipizzazione delle cellule T con analisi di citometria a flusso. I risultati hanno mostrato che il trattamento con l'arsenico ha aumentato significativamente i livelli di stress ossidativo (come indicato da catalasi, malonildialdeide, superossido dismutasi, glutatione e specie reattive dell'ossigeno), ha aumentato i livelli di citochine infiammatorie e ha promosso l'apoptosi. L'esposizione all'arsenico ha aumentato la frequenza relativa della sottopopolazione di cellule CD8+(Tc) (dal 2,8 al 18,9%) e ha ridotto la frequenza delle cellule CD4+(Th) (dal 5,2 al 2,7%). L'esposizione all'arsenico ha anche ridotto significativamente la frequenza delle cellule T(CD3) (dal 32,5% al 19,2%) e delle cellule B(CD19) (dal 55,1 al 32,5%). Tutti questi effetti indotti da NaAsO2 sono stati attenuati dall'EGCG. I presenti risultati in vitro indicano che l'EGCG attenua non solo l'immunosoppressione indotta da NaAsO2, ma anche l'infiammazione e l'apoptosi.
Studio di fattibilità dell'endoscopio flessibile tridimensionale nella dissezione endoscopica della sottomucosa: uno studio su animali ex vivo.Applicazione clinica di 3D (3D) La tecnologia per endoscopi flessibili non è stata segnalata Abbiamo sviluppato un endoscopio flessibile 3D e condotto uno studio di fattibilità della dissezione sottomucosa endoscopica (ESD) nello stomaco suino Quattro endoscopisti hanno utilizzato un endoscopio flessibile 3D per eseguire un totale di 8 procedure ESD su stomaci suini resecati Abbiamo valutato il tasso di resezione in blocco, il tasso di perforazione e i problemi meccanici che si verificano durante l'ESD. È stata utilizzata una scala analogica visiva (0, 2D superiore; 100, 3D superiore) per valutare la percezione della profondità, il senso di sicurezza della procedura, e l'affaticamento degli occhi della visualizzazione 3D. La resezione in blocco è stata ottenuta in tutti i casi e non ci sono stati casi di perforazione o problemi meccanici. La percezione della profondità e il senso di sicurezza sono stati valutati rispettivamente 85,5 ± 12,4 e 70,7 ± 9,7 (media ± DS). ceppo è stato valutato alto per la visualizzazione 3D (media ± DS, 12,6 ± 8,6). L'ESD utilizzando un endoscopio flessibile 3D era tecnicamente fattibile. Gli endoscopisti hanno riportato una buona percezione della profondità e un elevato senso di sicurezza durante l'utilizzo della visualizzazione 3D, ma hanno anche notato un forte affaticamento degli occhi.
Proprietà di superficie e risposta cellulare MC3T3-E1 di allotrapianti di osso corticale modificati con acido fosforico a bassa concentrazione.Questo studio sperimentale mirava a valutare l'effetto di acido fosforico a bassa concentrazione sulla struttura superficiale degli allotrapianti corticali. Le ossa corticali allogeniche sono state ottenute da femori e tibie di conigli bianchi della Nuova Zelanda. Le ossa sono state modificate mediante trattamento con varie concentrazioni di acido fosforico (10%, 20% o 30%) per 10, 30 o 60 minuti, quindi valutati con i seguenti metodi: 3-(4,5-Dimetil-2-tiazolil)-2,5-difenil-2H-tetrazolio bromuro (MTT) e saggio LIVE/DEAD, fosfatasi alcalina (ALP), test delle proprietà biomeccaniche, rilevamento dell'angolo di contatto, reazione a catena della polimerasi quantitativa in tempo reale (Q-PCR), western blotting e microscopia elettronica a scansione (SEM). Rispetto agli altri gruppi, il gruppo modificato con 10% H3PO4 per 10 minuti hanno avuto una citotossicità inferiore secondo MTT e LIVE/DEAD a saggi, maggiore idrofilia nel test di rilevamento dell'angolo di contatto e maggiore stabilità nel test delle proprietà biomeccaniche. Inoltre, è stata osservata una up-regulation dell'osteopontina (OPN) nelle ossa modificate con H3PO4 al 10% mediante Q-PCR e western blotting. Inoltre, il saggio ALP e il SEM hanno mostrato che la porosità superficiale e l'osteoinduttività erano aumentate nel gruppo modificato con H3PO4 al 10%. L'acido fosforico a bassa concentrazione può essere un potenziale metodo per la modifica della superficie degli allotrapianti corticali. Sono necessari ulteriori esperimenti su animali e studi su modelli di infezione animale per convalidare l'efficacia degli allotrapianti corticali modificati in superficie per riparare grandi difetti ossei segmentali.
La terapia con cellule mononucleari derivate dal midollo osseo accelera il recupero delle lesioni da ischemia-riperfusione renale modulando le molecole infiammatorie, antiossidanti e apoptotiche.Abbiamo studiato la capacità rigenerativa della somministrazione endovenosa di cellule mononucleate derivate dal midollo osseo (BMMCs) in un modello di ratto di danno bilaterale da ischemia/riperfusione renale (IR) e il coinvolgimento di antinfiammatori antinfiammatori e altri marcatori biologici in questo processo. I ratti sono stati sottoposti a 1 h renale bilaterale clampaggio del peduncolo. I BMMC sono stati iniettati iv 1 ora dopo la riperfusione e monitorati da 99mTc e GFP+ BMMCs. Ventiquattro ore dopo la riperfusione, sono state valutate la funzione renale e le alterazioni istologiche. L'espressione di mRNA (real time PCR) e proteine (ELISA e immuno-colorazione) di marcatori biologici sono stati analizzati. La funzione renale e la struttura sono migliorate dopo l'infusione di BMMCs nel gruppo IR (IR-C). BMMCs marcati sono stati trovati nei reni dopo la terapia. L'expre zione di marcatori infiammatori e biologici (TLR-2, TRL-4, RAGE, IL-17, HMGB-1, KIM-1) è stata ridotta e l'espressione di marcatori antinfiammatori e antiossidanti (IL-10, Nrf2 e HO -1) sono aumentati negli animali IR-C rispetto agli animali IR non trattati (IR-S). L'indice apoptotico è diminuito e l'indice di proliferazione è aumentato in IR-C rispetto a IR-S. I risultati contribuiscono alla nostra comprensione del ruolo di diversi attori biologici nel miglioramento renale morfofunzionale e nella citoprotezione in un modello di danno renale da riperfusione post-ischemica sottoposto a terapia cellulare.
La citochina pro-infiammatoria TNF-α attenua la differenziazione osteo-odontoblastica indotta da BMP9 delle cellule staminali della papilla apicale dentale (SCAP).Paodontite periapicale è una comune malattia orale causata dall'invasione batterica della polpa del dente, che di solito porta al rilascio locale di citochine pro-infiammatorie e lesioni osteolitiche Questo studio ha lo scopo di esaminare l'effetto del TNF-α sulla differenziazione osteogenica indotta da BMP9 dello stelo cellule della papilla apicale dentale (SCAP). È stato stabilito un modello di ratto di parodontite periapicale. È stata valutata l'espressione del TNF-α. I marcatori osteogeni e la formazione di osso ectopico negli iSCAP sono stati analizzati dopo il trattamento con BMP9 e TNF-α. La parodontite periapicale è stata stabilita con successo nel ratto immaturo denti permanenti con lesioni periapicali, in cui è stato dimostrato il rilascio di TNF-α durante la fase infiammatoria Attività della fosfatasi alcalina indotta da BMP9, espressione di osteocalcina e osteopontina e mineralizzazione della matrice zione in iSCAPs sono stati inibiti dal TNF-α in modo dose-dipendente, sebbene l'aumento di AdBMP9 abbia parzialmente superato l'inibizione del TNF-α. Inoltre, l'elevata concentrazione di TNF-α ha inibito efficacemente la formazione di osso ectopico indotta da BMP9 in vivo. Il TNF-α svolge un ruolo importante nel difetto osseo periapicale durante la fase infiammatoria e inibisce la differenziazione osteoblastica indotta da BMP9 degli iSCAP, che può essere parzialmente invertita da alti livelli di BMP9. Pertanto, BMP9 può essere ulteriormente esplorato come un potente fattore osteogenico per migliorare la differenziazione osteo/odontogena nella rigenerazione dei denti in condizioni di infiammazione cronica.
Sviluppo di un curriculum e di un programma di formazione sulla salute delle donne veterane per i residenti in medicina interna.I residenti in medicina interna devono sviluppare competenze come fornitori di cure primarie, ma un esiste un divario nel loro curriculum e formazione per quanto riguarda la salute riproduttiva delle donne. Con la crescente necessità di VA a causa del nuovo afflusso di donne veterane, pone problemi nel reclutamento di medici competenti formati in salute delle donne. Un lavoro intensivo di un mese per le donne È stato fornito un curriculum di salute riproduttiva con esperienza pratica per i residenti di Medicina Interna. Il curriculum è stato insegnato ai residenti che hanno ruotato presso la Women\'s Health Clinic per un mese. Sono stati somministrati esami pre-test e post-test. Aumento della conoscenza di residenti nel fornire valutazioni specifiche di genere e la gestione è stata valutata obiettivamente dai cambiamenti nei punteggi post-test. I dati sono stati analizzati per un miglioramento statisticamente significativo nei punteggi dei test scritti. Durante il periodo di valutazione, tal di 47 residenti in Medicina Interna si è alternato attraverso il Women\'s Health Center. Tutti i residenti hanno completato gli esami sia pre-test che post-test. Il tempo medio per completare il pre-test è stato di 20,5 ± 5,4 min e di 19,5 ± 4,8 min per il post-test. Non c'era correlazione tra il tempo per completare l'esame pre-test e l'esame post-test. Il punteggio totale è stato significativamente migliorato da 8,5 ± 1,6 a 13,2 ± 1,8 (p < 0,0001). Questo studio mostra come fornire ai medici in formazione informazioni sulla salute delle donne che consentano loro di fornire cure sicure e appropriate al genere nelle strutture di assistenza primaria. Questa pratica ridurrà la necessità di frequenti rinvii per cure specialistiche e quindi fornirà un risparmio sui costi per il paziente e l'assistenza sanitaria nel complesso.
L'effetto dei trattamenti fertilizzanti sulla gravità della peronospora del Fusarium e sulla biosintesi delle micotossine nella segale invernale.I funghi del genere Fusarium causano la peronospora del Fusarium (FHB), una malattia devastante che riduce la resa e la qualità del grano. Producono anche micotossine che possono rappresentare una seria minaccia per la salute umana e animale. Questo studio ha studiato gli effetti della fertilizzazione NPK, dell'applicazione fogliare di Cu, Zn e Mn, applicata separatamente e in combinazione, e dello stimolatore della crescita organica Nano-Gro® sulla presenza di FHB nella cultivar Dańkowskie Diament rye basata sull'analisi micologica dei chicchi e sulle concentrazioni di micotossine Fusarium nel grano. La gravità di FHB causata da sette specie del genere Fusarium è stato influenzato dalle condizioni meteorologiche nelle stagioni di crescita analizzate. La fertilizzazione applicata e lo stimolatore di crescita organico Nano-Gro® hanno esercitato vari effetti sullo sviluppo di FHB e sulla biosintesi di Fusarium micotossine (deossinivalenolo, nivalenolo, zearalenone e fumonisine) nel grano. La maggiore riduzione delle concentrazioni di deossinivalenolo e nivalenolo è stata osservata nel 2013 e i livelli di moniliformina erano inferiori nei campioni trattati rispetto ai campioni di controllo assoluto (non trattati) in entrambi gli anni dello studio. La gravità dell'FHB era positivamente correlata con le concentrazioni di zearalenone, deossinivalenolo, nivalenolo e moniliformina nei campioni di grano. È stato notato un maggiore accumulo di ergosterolo nella segale raccolta nel 2013 rispetto al 2012 e il trattamento con fertilizzanti ha portato a concentrazioni di ergosterolo più elevate rispetto al trattamento di controllo.
Attività antimicotiche e antiaflatossigene di cumarinil tiosemicarbazidi contro Aspergillus flavus NRRL 3251.Gli effetti antimicotici e antiaflatossigeni di due serie di cumarinil tiosemicarbazidi su Aspergillus flavus NRRL 3251 I funghi sono stati coltivati in terreno SI per 72 ore a 29 °C in presenza di 0, 0,1, 1 e 10 μg mL-1 di cumarinil tiosemicarbazidi: una serie con sostituzione in posizione 7 e un'altra con sostituzione in posizione 4 del nucleo cumarinico. La determinazione del peso secco del micelio è stata utilizzata per la stima dell'attività antimicotica, mentre il contenuto di aflatossina B1 nei terreni YES, determinato mediante la tecnica diluita e sparata LC-MS/MS, è stato utilizzato per la stima dell'effetto antiaflatossigeno. I saggi biochimici standard sono stati utilizzato per la determinazione dei marcatori dello stato ossidativo (TBARS, SOD, CAT e GPX) nel micelio di A. flavus NRRL 3251. I risultati mostrano che i tiosemicarbazidi 7-sostituiti-cumarinil possiedono una migliore azione antimicotica e anti attività aflatossigena rispetto a quelle 4-sostituite. Il composto sostituito più importante era il composto 3, N-(4-clorofenil)-2-(2-((4-metil-2-osso-2H-cromen-7-il)ossi)acetil)idrazina-1-carbotioammide , che ha completamente inibito la produzione di aflatossina alla concentrazione di 10 μg mL-1. La risposta allo stress ossidativo di A. flavus esposto ai composti selezionati indica la modulazione dello stress ossidativo come possibile causa dell'inibizione della produzione di aflatossine.
Relazione tra parametri ossei ecografici, funzione polmonare e indice di massa corporea nella popolazione studentesca sana.Bassa densità minerale ossea è stata segnalata in pazienti pediatrici e adulti pazienti con diverse malattie polmonari, ma sono disponibili dati limitati sull'associazione tra funzione polmonare e densità ossea in una popolazione giovane sana. Abbiamo esplorato i predittori di associazione tra massa ossea e funzione polmonare in studenti universitari sani del primo anno, concentrandosi sulla massa corporea indice (BMI). In questo studio trasversale abbiamo misurato la densità ossea con gli ultrasuoni e la funzione polmonare con la spirometria in 370 studenti universitari (271 ragazze e 99 ragazzi). Le informazioni sulle abitudini di vita, come l'attività fisica, il fumo e il consumo di alcol sono state ottenuto con un questionario. Tutta la funzione polmonare e i parametri ossei erano significativamente più alti nei ragazzi che nelle ragazze (P<0.001). Gli studenti sottopeso avevano una capacità vitale forzata significativamente inferiore (FVC%) (P=0.001 ragazze; P=0.012 ragazzi), mentre gli studenti in sovrappeso avevano una percentuale di FVC significativamente più alta rispetto agli studenti normopeso (P=0.024 ragazze; P=0.001 ragazzi). L'IMC era significativamente correlato con FVC% (P=0.001) e volume espiratorio forzato in 1 secondo (FEV1 %) in entrambi i sessi (P=0.001 ragazze; P=0.018 ragazzi) e con l'attenuazione degli ultrasuoni a banda larga (BUA) nei ragazzi. Non c'erano associazioni significative tra i parametri di funzionalità ossea e polmonare né nei ragazzi né nelle ragazze. Il determinante più importante della funzione polmonare e dei parametri ossei ecografici nella nostra popolazione di studio era l'indice di massa corporea, senza alcuna associazione diretta tra densità ossea e funzione polmonare.
Costi degli infortuni e delle malattie professionali in Croazia.Oltre a influenzare la qualità della vita, gli infortuni e le malattie professionali possono rappresentare un grande onere economico per un società. Ci sono molti studi che stimano i costi degli infortuni e delle malattie professionali nelle economie altamente sviluppate, ma le prove per altri paesi sono scarse. Questo studio mirava a stimare i costi finanziari degli infortuni e delle malattie professionali per il governo croato e i datori di lavoro nel 2015. I lavoratori sono stati esclusi per mancanza di dati. I costi sono stati stimati analizzando le fonti di dati disponibili sulla salute e sicurezza sul lavoro. I costi finanziari sono stati raggruppati in diverse categorie: spese mediche, perdite di produttività, pensioni di invalidità, risarcimento per menomazione fisica, spese amministrative e spese legali. A differenza di altri studi, sono stati indagati anche i costi del rispetto delle normative sulla sicurezza e salute sul lavoro. Nel 2015 i costi finanziari per em i lavoratori erano due volte più alti dei costi per il governo (604,6 milioni di HRK contro 297 milioni di HRK). I datori di lavoro hanno inoltre coperto circa 300 milioni di HRK di costi di conformità. Tenendo conto che i costi finanziari degli infortuni e delle malattie professionali sono significativi, anche senza includere i costi per i lavoratori, i responsabili politici dovrebbero impegnarsi ulteriormente nella loro prevenzione. Un prerequisito è la trasparenza nelle spese del Fondo di assicurazione sanitaria croato, nonché dati più dettagliati sui giorni di lavoro persi dalle industrie, le cause degli infortuni, ecc. Le organizzazioni responsabili della salute e sicurezza sul lavoro e i responsabili politici dovrebbero osservare le statistiche pertinenti in termini monetari pure.
Effetti neuroprotettivi dell'eugenolo contro la tossicità indotta dall'alluminio nel cervello di ratto.L'alluminio (Al) è un metallo neurotossico che contribuisce alla progressione di diverse malattie neurodegenerative Lo scopo del presente studio era di valutare l'effetto protettivo dell'integrazione alimentare di eugenolo contro il danno cerebrale indotto dall'alluminio (Al) nei ratti. I ratti Wistar maschi sono stati divisi in quattro gruppi: controlli normali, ratti alimentati con una dieta contenente 6.000 μg g- 1 eugenolo, ratti intossicati giornalmente con cloruro di alluminio (84 mg kg-1 peso corporeo) PO e alimentati con una dieta di base o una dieta contenente eugenolo La somministrazione orale giornaliera di Al per quattro settimane consecutive ai ratti ha ridotto significativamente lo stato antiossidante totale del cervello ( TAS) (11,42±0,31 μmol g-1 tessuto, p<0,001) con un successivo miglioramento significativo della perossidazione lipidica (MDA) (32,55±1,68 nmol g-1 tessuto, p<0,002). Inoltre, Al aumento dell'attività dell'acetilcolinesterasi cerebrale (AChE) (46,22±4,90 U mg-1 proteina, p<0,001), fattore di necrosi tumorale alfa (TNF-α) (118,72±11,32 pg mg-1 proteina, p<0,001) e caspasi 3 (Casp-3 ) (8,77±1,26 ng di proteina mg-1, p<0.001) livelli e, al contrario, ha soppresso significativamente il fattore neurotrofico derivato dal cervello (BDNF) (82,74±14,53 pg mg-1 di proteina, p<0.002) e serotonina (5-HT) (1,54±0,12 ng mg-1 tessuto, p<0,01) livelli. Inoltre, è stata osservata una diminuzione dell'immunocolorazione della proteina acida fibrillare gliale (GFAP) nello striato di ratti intossicati da Al, rispetto ai controlli non trattati. D'altra parte, la co-somministrazione di eugenolo alimentare con intossicazione da Al ha riportato a livelli normali il BDNF cerebrale (108,76±2,64 pg mg-proteina) e il 5-HT (2,13±0,27 ng mg-1) a livelli normali, una maggiore TAS cerebrale (13,43 ±0,24 μmol g-1 di tessuto, p<0,05), con una concomitante riduzione significativa dei livelli di TNF-α (69,98±4,74 pg mg-proteina) e Casp-3 (3,80±0,37 ng mg-proteina) ( p<0.001), così come l'attività AChE (24,50±3,25 U mg-1 di proteina, p<0.001) e l'aumento dell'immunoreattività del GFAP striatale, rispetto ai ratti trattati con Al. I risultati istologici dei tessuti cerebrali hanno verificato i dati biochimici. In conclusione, l'eugenolo ha un potenziale come agente neuroprotettivo grazie alle sue proprietà idrofobe, antiossidanti e anti-apoptotiche, nonché alla sua capacità neurotrofica contro la tossicità cerebrale indotta da Al nei ratti.
La supplementazione di zinco può migliorare le alterazioni indotte dal cadmio nel contenuto di bioelementi nei conigli?Lo studio è stato progettato per studiare l'influenza della supplementazione di zinco (Zn) sulle alterazioni indotte dal cadmio nello stato di zinco, rame (Cu) e magnesio (Mg) nei conigli A tal fine, sono state stimate le concentrazioni di cadmio (Cd), Zn, Cu e Mg nel sangue, fegato, reni, e ossa. I conigli sono stati divisi in un gruppo di controllo, un gruppo Cd-animali intossicati per via orale con Cd (10 mg kg-1 p. c. , come soluzione acquosa di Cd-cloruro), e un gruppo Cd+Zn-animali intossicati con lo stesso dose di Cd e co-trattato con Zn (20 mg kg-1 p. c. , come soluzione acquosa di Zn-solfato). Le soluzioni sono state somministrate per via orale, ogni giorno per 28 giorni. La mineralizzazione del campione è stata eseguita con acido nitrico concentrato (HNO3) e perclorico acido (HClO4) (4:1) e le concentrazioni di metalli sono state determinate mediante spettrofotometria ad assorbimento atomico (AAS). ved alcuni dei disturbi indotti da Cd nei livelli di bioelementi nei tessuti studiati. Gli effetti benefici di Zn sui livelli di Zn e Cu sono stati osservati nel sangue, così come sul livello renale di Cu. I valori calcolati per i rapporti Cu/Zn, Mg/Zn e Mg/Cu nel sangue suggeriscono che il co-trattamento con Zn riduce i cambiamenti indotti dal Cd nei rapporti dei bioelementi nel sangue.
Polimorfismi genetici degli enzimi CYP1A1, GSTM1 e GSTT1 e loro influenza sul rischio cardiovascolare e sul profilo lipidico nelle persone che vivono vicino a un impianto di gas naturale.Lo scopo di questo studio trasversale era vedere se i polimorfismi genetici degli enzimi CYP1A1, GSTM1 e GSTT1 sono associati a un rischio più elevato di malattia coronarica (CAD) e se influenzano il profilo lipidico in 252 soggetti che vivono vicino a un gas naturale Le concentrazioni sieriche a digiuno dei parametri biochimici sono state determinate con metodi standard I polimorfismi genetici del CYP 1A1 rs4646903, rs1048943, rs4986883 e rs1799814 sono stati genotipizzati con un frammento di restrizione a catena della polimerasi polimorfismo di lunghezza (PCR-RFPL), mentre le delezioni GSTM1 e GSTT1 sono state rilevate con PCR multiplex. Il rischio cardiovascolare è stato valutato con il punteggio di rischio Framingham e i soggetti sono stati divisi in due gruppi: >1 0% di rischio e ≤10% di rischio. I due gruppi non differivano nelle frequenze del genotipo. L'analisi MANCOVA, che includeva parametri lipidici, glucosio e BMI con sesso, età, ipertensione e abitudine al fumo come covariate, ha mostrato una differenza significativa tra i portatori di alleli GSTT10 e GSTT11 (p=0.001). UNIANCOVA con le stesse covariate ha mostrato che i livelli di colesterolo totale e trigliceridi erano significativamente più alti nei portatori di alleli GSTT11 rispetto ai portatori di GSTT10 (p<0.001 e p=0.006, rispettivamente). I nostri risultati suggeriscono che i polimorfismi CYP1A1, GSTM1 e GSTT1 non sono associati al rischio più elevato di CAD, ma che GSTT1 influisce sul profilo lipidico.
Ragionamento morale e suoi correlati nei candidati al lavoro.Lo scopo di questo studio era verificare l'applicabilità del Test di Ragionamento Morale (TMR) in la selezione dei candidati al lavoro e per vedere come correla con l'istruzione, l'intelligenza e i tratti della personalità "big five". Lo studio ha incluso 210 partecipanti (132 donne e 78 uomini) che si sono candidati per varie posizioni nel settore bancario. Il nostro i risultati hanno confermato l'applicabilità della TMR per il reclutamento perché hanno dimostrato che la TMR non permetteva ai candidati di falsificare le proprie risposte Inoltre, hanno confermato le opinioni di Kohlberg secondo cui l'intelligenza generale e l'istruzione sono le principali determinanti dello sviluppo morale (correlazione positiva), considerando che la tendenza alla risposta socialmente desiderabile ha mostrato una correlazione negativa.
L'impatto della concentrazione e del tempo di somministrazione sulle proprietà radiomodulanti dell'undecilprodigiosina in vitro.È stato riportato che il pigmento di undecilprodigiosina (UPP) mostra attività citotossica verso vari tipi di tumori. Tuttavia, la sua efficacia nel modificare la risposta cellulare alle radiazioni ionizzanti è ancora sconosciuta. In questo studio sono stati studiati gli effetti radiomodulatori dell'UPP. Gli effetti dell'UPP sono stati valutati in vitro trattando colture di sangue periferico umano con UPP e radiazioni ionizzanti utilizzando due regimi di trattamento, il trattamento pre-irradiazione UPP e il trattamento post-irradiazione UPP. L'attività dell'UPP è stata studiata valutando i suoi effetti sulla formazione di micronuclei indotti dalle radiazioni, sulla proliferazione cellulare e sull'induzione dell'apoptosi. UPP sono stati esaminati misurando l'attività della catalasi e il livello di malondialdeide, come misura dello stress ossidativo. I risultati hanno mostrato che l'effetto UPP s sulla risposta cellulare alle radiazioni ionizzanti dipendono dalla sua concentrazione e dai tempi della sua somministrazione. A bassa concentrazione, l'UPP ha mostrato effetti radioprotettivi nei linfociti umani irradiati mentre a concentrazioni più elevate ha agito come un radiosensibilizzatore migliorando la catastrofe mitotica o l'apoptosi a seconda del regime di trattamento. L'UPP ha modificato i processi redox nelle cellule, in particolare quando è stato impiegato prima dell'irradiazione. I nostri dati evidenziano l'importanza di ulteriori ricerche sul potenziale dell'UPP per sensibilizzare le cellule tumorali alla radioterapia inibendo i percorsi che portano alla resistenza al trattamento.
Protocolli di supporto alla nutrizione: miglioramento della somministrazione della nutrizione enterale.In terapia intensiva, la malnutrizione ha un impatto negativo e significativo sulla capacità di risposta del paziente al trattamento medico. È noto che la nutrizione enterale contrasta i cambiamenti metabolici associati a malattie critiche che aumentano il rischio di gravi complicanze e scarsi esiti clinici. L'erogazione inadeguata di supporto nutrizionale e la sottoalimentazione persistono nelle unità di terapia intensiva nonostante la disponibilità di linee guida e la ricerca attuale per migliore pratica. Recenti studi hanno dimostrato che i protocolli di supporto nutrizionale sono efficaci nel promuovere gli obiettivi nutrizionali in un'ampia varietà di pazienti in terapia intensiva. È essenziale trovare approcci che migliorino la somministrazione precoce della nutrizione enterale che soddisfi i requisiti e supporti risultati migliori. una posizione unica per assumere un ruolo attivo nella promozione dei migliori risultati nutrizionali per i propri pazienti utilizzando e valutare i protocolli di supporto nutrizionale.
Complicazioni dei dispositivi di accesso venoso periferico: strategie di prevenzione, rilevamento e recupero.La maggior parte dei pazienti ospedalizzati ha il posizionamento di un dispositivo di accesso venoso periferico, sia un catetere periferico corto o catetere centrale inserito periferico Rispetto ai cateteri venosi centrali non inseriti periferico, gli altri 2 tipi sono generalmente percepiti dagli operatori sanitari come più sicuri e meno complicati da gestire, e viene posta meno enfasi sulla prevenzione e sulla gestione L'esperienza degli infermieri nell'inserimento, gestione e rimozione di questi dispositivi può ridurre la probabilità di complicanze e un maggiore riconoscimento delle complicanze associate all'uso dei dispositivi è importante per garantire continui miglioramenti nella sicurezza, nella qualità e nell'efficienza dell'assistenza sanitaria Le complicanze associate ai cateteri periferici corti e ai cateteri centrali inseriti perifericamente includono ritenzione del laccio emostatico, tubi e ca collegamenti errati, flebiti, embolia gassosa, embolizzazione di frammenti del dispositivo e secrezione involontaria con un dispositivo di accesso venoso periferico trattenuto. L'integrazione delle strategie di prevenzione, rilevamento e recupero nella pratica infermieristica personale promuove la qualità e la sicurezza dell'assistenza sanitaria.
Monitoraggio domiciliare interstadio dopo la prima fase palliativa neonatale per la sindrome del cuore sinistro ipoplasico: strategie di educazione familiare.I bambini nati con la sindrome del cuore sinistro ipoplasico sono a livelli elevati rischio di grave morbilità, deficit di crescita e mortalità durante il periodo interstadio, che è il tempo dalla dimissione a casa dopo la palliazione della sindrome del cuore sinistro ipoplasico di primo stadio fino all'intervento chirurgico di secondo stadio. La fisiologia circolatoria del singolo ventricolo è complessa, fragile, e potenzialmente instabile. Iniziative multicentriche sono state implementate con successo per migliorare i risultati e ottimizzare la crescita e la sopravvivenza durante il periodo interstadio. Un obiettivo cruciale dell'assistenza è la formazione completa della famiglia nell'uso del monitoraggio domiciliare di saturazione di ossigeno, assunzione enterale, peso e il riconoscimento precoce di sintomi da "bandiera rossa" indicanti un potenziale scompenso cardiopolmonare o nutrizionale. unità di terapia intensiva del neonato con sindrome del cuore sinistro ipoplasico, gli infermieri forniscono assistenza critica e istruzione per preparare la famiglia all'assistenza domiciliare interstadio. Questo articolo presenta linee guida infermieristiche dettagliate per educare le famiglie all'assistenza domiciliare del loro bambino fragile dal punto di vista medico con circolazione a ventricolo singolo.
Accesso alla formazione continua per infermieri di terapia intensiva in contesti rurali o remoti.La cura dei malati critici non si verifica esclusivamente nei grandi centri medici o nelle aree urbane Gli infermieri che esercitano in contesti rurali o remoti esercitano la professione di infermieri generalisti, occupandosi di un'ampia gamma di pazienti, compresi quelli che necessitano di cure critiche. pratica attraverso la formazione continua in molte aree di contenuto. Inoltre, potrebbero non entrare in contatto con pazienti critici o situazioni emergenti così spesso come le loro controparti urbane, il che può rendere difficile rimanere a proprio agio con competenze più avanzate. Perché gli infermieri che lavorano in aree rurali o remote possono meno spesso l'assistenza ai pazienti critici, aumenta la necessità di rimanere vigili nel perseguimento della formazione continua; tuttavia, l'accesso alla formazione continua può essere problematico a causa del geo isolamento grafico, difficoltà a prendere tempo dal lavoro, risorse finanziarie limitate e percepita mancanza di argomenti applicabili. Con i progressi della tecnologia, gli infermieri di terapia intensiva che lavorano nelle aree rurali hanno più opzioni per la formazione continua, che è fondamentale per mantenere una forza lavoro infermieristica qualificata nelle strutture sanitarie rurali. Questo articolo affronta le sfide che gli infermieri di terapia intensiva che lavorano in aree remote o rurali devono affrontare nel perseguire la formazione continua e fornisce informazioni sulle opportunità educative disponibili.