PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC11434983 | The new complex maintains the ability to target EGFR, since the inhibitory activity remains similar after the replacement of Br atoms with PPh3. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"new",
"complex",
"maintains",
"the",
"ability",
"to",
"target",
"EGFR",
",",
"since",
"the",
"inhibitory",
"activity",
"remains",
"similar",
"after",
"the",
"replacement",
"of",
"Br",
"atoms",
"with",
"PPh3",
"."
]
}
] |
PMC11711347 | The estrogen receptor-α protein (PDB ID 1A52) was obtained from the Protein Data Bank database and imported into Molegro Virtual Docker version 5 . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"estrogen",
"receptor-α",
"protein",
"(",
"PDB",
"ID",
"1A52",
")",
"was",
"obtained",
"from",
"the",
"Protein",
"Data",
"Bank",
"database",
"and",
"imported",
"into",
"Molegro",
"Virtual",
"Docker",
"version",
"5",
"."
]
}
] |
PMC3019555 | Exponentially growing cells were plated on 12-mm glass coverslips (Thermo Fisher Scientific) into 24-well plates and treated with the indicated drugs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Exponentially",
"growing",
"cells",
"were",
"plated",
"on",
"12-mm",
"glass",
"coverslips",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
")",
"into",
"24-well",
"plates",
"and",
"treated",
"with",
"the",
"indicated",
"drugs",
"."
]
}
] |
PMC11297139 | For quantification, multiple sets of FRAP experiments were performed on independent GFP-ARID1A condensates. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"quantification",
",",
"multiple",
"sets",
"of",
"FRAP",
"experiments",
"were",
"performed",
"on",
"independent",
"GFP-ARID1A",
"condensates",
"."
]
}
] |
PMC10761571 | Characterization of the synthesized nanoparticles suggests that gingerol was properly conjugated with Fe3O4 NPs after functionalization with glucose. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Characterization",
"of",
"the",
"synthesized",
"nanoparticles",
"suggests",
"that",
"gingerol",
"was",
"properly",
"conjugated",
"with",
"Fe3O4",
"NPs",
"after",
"functionalization",
"with",
"glucose",
"."
]
}
] |
PMC11591038 | Downstream of HIF-1, a number of target genes involved in antioxidation with HREs in their promoters have been reported. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Downstream",
"of",
"HIF-1",
",",
"a",
"number",
"of",
"target",
"genes",
"involved",
"in",
"antioxidation",
"with",
"HREs",
"in",
"their",
"promoters",
"have",
"been",
"reported",
"."
]
}
] |
PMC9895440 | The next day (7 days total), the degranulation capacity and production of cytokines of the cells was measured as above. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"next",
"day",
"(",
"7",
"days",
"total",
")",
",",
"the",
"degranulation",
"capacity",
"and",
"production",
"of",
"cytokines",
"of",
"the",
"cells",
"was",
"measured",
"as",
"above",
"."
]
}
] |
PMC11643361 | Essential metals such as zinc, copper, and iron play pivotal roles in numerous biological processes within the human body . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Essential",
"metals",
"such",
"as",
"zinc",
",",
"copper",
",",
"and",
"iron",
"play",
"pivotal",
"roles",
"in",
"numerous",
"biological",
"processes",
"within",
"the",
"human",
"body",
"."
]
}
] |
PMC11095939 | The cutoff of distance of peak-to-gene is 25 kb. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cutoff",
"of",
"distance",
"of",
"peak-to-gene",
"is",
"25",
"kb",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973 | The primary objective of part 1 is to determine the recommended phase 2 dose of oral LOXO-338 in patients who were previously treated for CLL/SLL and other B-cell NHL, administered alone or in combination with pirtobrutinib. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"primary",
"objective",
"of",
"part",
"1",
"is",
"to",
"determine",
"the",
"recommended",
"phase",
"2",
"dose",
"of",
"oral",
"LOXO-338",
"in",
"patients",
"who",
"were",
"previously",
"treated",
"for",
"CLL/SLL",
"and",
"other",
"B-cell",
"NHL",
",",
"administered",
"alone",
"or",
"in",
"combination",
"with",
"pirtobrutinib",
"."
]
}
] |
PMC11529598 | Collectively, these findings indicated that miR-3154 promotes glioblastoma proliferation and metastasis via targeting TP53INP1, elucidating pathogenetic mechanism of glioblastoma. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Collectively",
",",
"these",
"findings",
"indicated",
"that",
"miR-3154",
"promotes",
"glioblastoma",
"proliferation",
"and",
"metastasis",
"via",
"targeting",
"TP53INP1",
",",
"elucidating",
"pathogenetic",
"mechanism",
"of",
"glioblastoma",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Further studies with case-control cohort are necessary to better understand the possible prognostic impact and mutual influence between MPN and MGUS. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Further",
"studies",
"with",
"case-control",
"cohort",
"are",
"necessary",
"to",
"better",
"understand",
"the",
"possible",
"prognostic",
"impact",
"and",
"mutual",
"influence",
"between",
"MPN",
"and",
"MGUS",
"."
]
}
] |
PMC10667689 | While AML cells are known to produce Gal-9 (though in few amounts in vitro) to sharpen the effect of TIM-3, we designed Gal-9 groups in which, after exchanging the medium of cells that were exposed to 50 ng/mL PMA for 24 h, 100 ng/mL Recombinant Human Gal-9 (Escherichia coli expressed, carrier-free) (BioLegend, USA) was added to the medium. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"While",
"AML",
"cells",
"are",
"known",
"to",
"produce",
"Gal-9",
"(",
"though",
"in",
"few",
"amounts",
"in",
"vitro",
")",
"to",
"sharpen",
"the",
"effect",
"of",
"TIM-3",
",",
"we",
"designed",
"Gal-9",
"groups",
"in",
"which",
",",
"after",
"exchanging",
"the",
"medium",
"of",
"cells",
"that",
"were",
"exposed",
"to",
"50",
"ng/mL",
"PMA",
"for",
"24",
"h",
",",
"100",
"ng/mL",
"Recombinant",
"Human",
"Gal-9",
"(",
"Escherichia",
"coli",
"expressed",
",",
"carrier-free",
")",
"(",
"BioLegend",
",",
"USA",
")",
"was",
"added",
"to",
"the",
"medium",
"."
]
}
] |
PMC11768927 | One key observation is that cellular sensitivity to VSV-mediated oncolysis varies depending on tumor type, suggesting that cell-type-specific responses play a critical role. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"One",
"key",
"observation",
"is",
"that",
"cellular",
"sensitivity",
"to",
"VSV-mediated",
"oncolysis",
"varies",
"depending",
"on",
"tumor",
"type",
",",
"suggesting",
"that",
"cell-type-specific",
"responses",
"play",
"a",
"critical",
"role",
"."
]
}
] |
PMC10213179 | These aptamers would be capable of targeting the hEphA2 receptor expressed by cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"aptamers",
"would",
"be",
"capable",
"of",
"targeting",
"the",
"hEphA2",
"receptor",
"expressed",
"by",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11656657 | Our analysis of fresh tumor biopsies from a cohort of 64 sarcoma patients showed that GD2 was expressed in a substantial proportion of these samples, particularly in OS, ARMS, and DSRCT. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"analysis",
"of",
"fresh",
"tumor",
"biopsies",
"from",
"a",
"cohort",
"of",
"64",
"sarcoma",
"patients",
"showed",
"that",
"GD2",
"was",
"expressed",
"in",
"a",
"substantial",
"proportion",
"of",
"these",
"samples",
",",
"particularly",
"in",
"OS",
",",
"ARMS",
",",
"and",
"DSRCT",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | In CD5 positive cohort, 52% of pts were men and median age at diagnosis was 63 years. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"CD5",
"positive",
"cohort",
",",
"52",
"%",
"of",
"pts",
"were",
"men",
"and",
"median",
"age",
"at",
"diagnosis",
"was",
"63",
"years",
"."
]
}
] |
PMC9960565 | The compounds with the highest SI values were the monodentate G0.5(COOPt(NH3)2Cl)8 (SI value < 6) and G2.5(COOPt(NH3)2Cl)32 (SI value = 10) metallodendrimers and the bidentate G2.5COO(Pt(NH3)2)16 (SI value = 3) and G3.5COO(Pt(NH3)2)32 (SI value = 20) metallodendrimers. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"compounds",
"with",
"the",
"highest",
"SI",
"values",
"were",
"the",
"monodentate",
"G0.5(COOPt(NH3)2Cl)8",
"(",
"SI",
"value",
"<",
"6",
")",
"and",
"G2.5(COOPt(NH3)2Cl)32",
"(",
"SI",
"value",
"=",
"10",
")",
"metallodendrimers",
"and",
"the",
"bidentate",
"G2.5COO(Pt(NH3)2)16",
"(",
"SI",
"value",
"=",
"3",
")",
"and",
"G3.5COO(Pt(NH3)2)32",
"(",
"SI",
"value",
"=",
"20",
")",
"metallodendrimers",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Grade 3 or higher adverse events directly attributable to therapy were mainly myelosuppression-related and included neutropenic infections in 3 (11%) and elevation of liver enzymes in 1 (4%) pt. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Grade",
"3",
"or",
"higher",
"adverse",
"events",
"directly",
"attributable",
"to",
"therapy",
"were",
"mainly",
"myelosuppression-related",
"and",
"included",
"neutropenic",
"infections",
"in",
"3",
"(",
"11",
"%",
")",
"and",
"elevation",
"of",
"liver",
"enzymes",
"in",
"1",
"(",
"4",
"%",
")",
"pt",
"."
]
}
] |
PMC7757104 | These results suggested that OPNc may not only modulates drug sensitivity, but also promote cell viability. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"results",
"suggested",
"that",
"OPNc",
"may",
"not",
"only",
"modulates",
"drug",
"sensitivity",
",",
"but",
"also",
"promote",
"cell",
"viability",
"."
]
}
] |
PMC11748618 | Hypermethylated promoter regions have traditionally been associated with transcriptional repression while hypomethylated regions are associated with increased transcriptional activity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Hypermethylated",
"promoter",
"regions",
"have",
"traditionally",
"been",
"associated",
"with",
"transcriptional",
"repression",
"while",
"hypomethylated",
"regions",
"are",
"associated",
"with",
"increased",
"transcriptional",
"activity",
"."
]
}
] |
PMC11040965 | B Densitometric analysis of the experiment shown in (A). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"B",
"Densitometric",
"analysis",
"of",
"the",
"experiment",
"shown",
"in",
"(",
"A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11098378 | To do this, we adapted and expanded a previously described effector library for expression in insect cells . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"do",
"this",
",",
"we",
"adapted",
"and",
"expanded",
"a",
"previously",
"described",
"effector",
"library",
"for",
"expression",
"in",
"insect",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11463018 | Each incubated mixture contained 0.8 mg/mL human liver microsome, 50 μL magnesium chloride, 60 μL potassium phosphate buffer (pH 7.4) and 0.5 μM tested compound in a total volume of 200 μL. After prewarming at 37 °C for 5 min, 50 μL NADPH was added to initiate the reaction. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Each",
"incubated",
"mixture",
"contained",
"0.8",
"mg/mL",
"human",
"liver",
"microsome",
",",
"50",
"μL",
"magnesium",
"chloride",
",",
"60",
"μL",
"potassium",
"phosphate",
"buffer",
"(",
"pH",
"7.4",
")",
"and",
"0.5",
"μM",
"tested",
"compound",
"in",
"a",
"total",
"volume",
"of",
"200",
"μL.",
"After",
"prewarming",
"at",
"37",
"°",
"C",
"for",
"5",
"min",
",",
"50",
"μL",
"NADPH",
"was",
"added",
"to",
"initiate",
"the",
"reaction",
"."
]
}
] |
PMC11674891 | This tumor model was reviewed and approved by the Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) of the National Cancer Center Research Institute (NCCRI), an AAALAC International-accredited facility that follows Institute of Laboratory Resources (ILAR) guidelines. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"tumor",
"model",
"was",
"reviewed",
"and",
"approved",
"by",
"the",
"Institutional",
"Animal",
"Care",
"and",
"Use",
"Committee",
"(",
"IACUC",
")",
"of",
"the",
"National",
"Cancer",
"Center",
"Research",
"Institute",
"(",
"NCCRI",
")",
",",
"an",
"AAALAC",
"International-accredited",
"facility",
"that",
"follows",
"Institute",
"of",
"Laboratory",
"Resources",
"(",
"ILAR",
")",
"guidelines",
"."
]
}
] |
PMC11507371 | Similarly, previous studies did not register noteworthy alterations in Keap1 translocation within HaCaT cells after cultivation in PAM (60 s) equivalent to a hydrogen peroxide concentration of ~32 μM . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Similarly",
",",
"previous",
"studies",
"did",
"not",
"register",
"noteworthy",
"alterations",
"in",
"Keap1",
"translocation",
"within",
"HaCaT",
"cells",
"after",
"cultivation",
"in",
"PAM",
"(",
"60",
"s",
")",
"equivalent",
"to",
"a",
"hydrogen",
"peroxide",
"concentration",
"of",
"~32",
"μM",
"."
]
}
] |
PMC11599565 | Western blots, Immunocytochemistry and FACS analysis were performed using standard protocols as previously described. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Western",
"blots",
",",
"Immunocytochemistry",
"and",
"FACS",
"analysis",
"were",
"performed",
"using",
"standard",
"protocols",
"as",
"previously",
"described",
"."
]
}
] |
PMC11499381 | Incorporation of both V1–154 and V155–238 did not alter the potency of αCGRP at either receptor; however, there was a trend towards a small reduction in the Emax of αCGRP at the AMY1 receptor in Cos7 cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Incorporation",
"of",
"both",
"V1–154",
"and",
"V155–238",
"did",
"not",
"alter",
"the",
"potency",
"of",
"αCGRP",
"at",
"either",
"receptor",
";",
"however",
",",
"there",
"was",
"a",
"trend",
"towards",
"a",
"small",
"reduction",
"in",
"the",
"Emax",
"of",
"αCGRP",
"at",
"the",
"AMY1",
"receptor",
"in",
"Cos7",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11394730 | Throughout history, many civilizations have used garlic in cooking, but its most widespread application has been in Mediterranean cuisine, specifically in the Middle East and Asia. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Throughout",
"history",
",",
"many",
"civilizations",
"have",
"used",
"garlic",
"in",
"cooking",
",",
"but",
"its",
"most",
"widespread",
"application",
"has",
"been",
"in",
"Mediterranean",
"cuisine",
",",
"specifically",
"in",
"the",
"Middle",
"East",
"and",
"Asia",
"."
]
}
] |
PMC11610461 | KC is also considered a metabolic disease, and the array of genes mutated in KC occurrence is involved in regulating various metabolic events such as glycolysis, tri-carboxylic acid (TCA) cycle, oxidative phosphorylation, and fatty acid metabolism (Chakraborty et al., 2021; Wettersten, 2020; Weiss, 2018). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"KC",
"is",
"also",
"considered",
"a",
"metabolic",
"disease",
",",
"and",
"the",
"array",
"of",
"genes",
"mutated",
"in",
"KC",
"occurrence",
"is",
"involved",
"in",
"regulating",
"various",
"metabolic",
"events",
"such",
"as",
"glycolysis",
",",
"tri-carboxylic",
"acid",
"(",
"TCA",
")",
"cycle",
",",
"oxidative",
"phosphorylation",
",",
"and",
"fatty",
"acid",
"metabolism",
"(",
"Chakraborty",
"et",
"al.",
",",
"2021",
";",
"Wettersten",
",",
"2020",
";",
"Weiss",
",",
"2018",
")",
"."
]
}
] |
PMC10747160 | After performing this quality control check, we then sought to test the antiviral capabilities of both the WT-Grft and Q-Grft proteins on pseudoviral infectivity assays. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"performing",
"this",
"quality",
"control",
"check",
",",
"we",
"then",
"sought",
"to",
"test",
"the",
"antiviral",
"capabilities",
"of",
"both",
"the",
"WT-Grft",
"and",
"Q-Grft",
"proteins",
"on",
"pseudoviral",
"infectivity",
"assays",
"."
]
}
] |
PMC11489351 | From these RNA-Seq data, we generated volcano plots of transcripts at low pHi (Fig. 2A) and high pHi (Fig. 2B), where the gray dots indicate transcripts with significant upregulation (log2FC > 0.5) or downregulation (log2FC < −0.5) compared to control (with false discovery rate [FDR] < 0.05). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"From",
"these",
"RNA-Seq",
"data",
",",
"we",
"generated",
"volcano",
"plots",
"of",
"transcripts",
"at",
"low",
"pHi",
"(",
"Fig.",
"2A",
")",
"and",
"high",
"pHi",
"(",
"Fig.",
"2B",
")",
",",
"where",
"the",
"gray",
"dots",
"indicate",
"transcripts",
"with",
"significant",
"upregulation",
"(",
"log2FC",
">",
"0.5",
")",
"or",
"downregulation",
"(",
"log2FC",
"<",
"−0.5",
")",
"compared",
"to",
"control",
"(",
"with",
"false",
"discovery",
"rate",
"[",
"FDR",
"]",
"<",
"0.05",
")",
"."
]
}
] |
PMC11711871 | This resulted in a truncated DNA-binding domain of the GR, which, upon dexamethasone induction, was no longer able to delocalize from the cytoplasm to the nucleus, as shown in transfected COS cells (Figure S2A, B). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"resulted",
"in",
"a",
"truncated",
"DNA-binding",
"domain",
"of",
"the",
"GR",
",",
"which",
",",
"upon",
"dexamethasone",
"induction",
",",
"was",
"no",
"longer",
"able",
"to",
"delocalize",
"from",
"the",
"cytoplasm",
"to",
"the",
"nucleus",
",",
"as",
"shown",
"in",
"transfected",
"COS",
"cells",
"(",
"Figure",
"S2A",
",",
"B",
")",
"."
]
}
] |
PMC11267830 | Subsequently, Western blot analysis revealed the loss of EZH2 and THOC1 signals in the J.gamma1 and Jurkat cell lines after 48 h of drug treatment (Fig. 6i). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Subsequently",
",",
"Western",
"blot",
"analysis",
"revealed",
"the",
"loss",
"of",
"EZH2",
"and",
"THOC1",
"signals",
"in",
"the",
"J.gamma1",
"and",
"Jurkat",
"cell",
"lines",
"after",
"48",
"h",
"of",
"drug",
"treatment",
"(",
"Fig.",
"6i",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | After 2 cycles of therapy, 2/28 patients achieved CR (7.1%), 25/28 PR (89.3%) and 1/28 not evaluated. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"2",
"cycles",
"of",
"therapy",
",",
"2/28",
"patients",
"achieved",
"CR",
"(",
"7.1",
"%",
")",
",",
"25/28",
"PR",
"(",
"89.3",
"%",
")",
"and",
"1/28",
"not",
"evaluated",
"."
]
}
] |
PMC11306331 | n = 20 cells analyzed from one representative experiment of 3 biological replicates. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"n",
"=",
"20",
"cells",
"analyzed",
"from",
"one",
"representative",
"experiment",
"of",
"3",
"biological",
"replicates",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | There is currently no approved treatment for wAIHA; patients with severely symptomatic anemia are typically managed with corticosteroids and rituximab, both of which are associated with potential relapse and adverse events. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"There",
"is",
"currently",
"no",
"approved",
"treatment",
"for",
"wAIHA",
";",
"patients",
"with",
"severely",
"symptomatic",
"anemia",
"are",
"typically",
"managed",
"with",
"corticosteroids",
"and",
"rituximab",
",",
"both",
"of",
"which",
"are",
"associated",
"with",
"potential",
"relapse",
"and",
"adverse",
"events",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Each trial tested one of the three FDA approved anti-CD19 CAR-T products: Axicabtagene Ciloleucel (Axi-cel, “ZUMA-7”), Tisagenlecleucel (Tisa-cel, “BELINDA”) and Lisocabtagene Maraleucel (Liso-cel, “TRANSFORM”). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Each",
"trial",
"tested",
"one",
"of",
"the",
"three",
"FDA",
"approved",
"anti-CD19",
"CAR-T",
"products",
":",
"Axicabtagene",
"Ciloleucel",
"(",
"Axi-cel",
",",
"“",
"ZUMA-7",
"”",
")",
",",
"Tisagenlecleucel",
"(",
"Tisa-cel",
",",
"“",
"BELINDA",
"”",
")",
"and",
"Lisocabtagene",
"Maraleucel",
"(",
"Liso-cel",
",",
"“",
"TRANSFORM",
"”",
")",
"."
]
}
] |
PMC10850553 | Total RNA sequencing was performed on a NextSeq500 (Illumina). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Total",
"RNA",
"sequencing",
"was",
"performed",
"on",
"a",
"NextSeq500",
"(",
"Illumina",
")",
"."
]
}
] |
PMC11359735 | The deuterated myo-inositol-TMS6 derivative elutes slightly earlier than the non-deutero equivalent. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"deuterated",
"myo-inositol-TMS6",
"derivative",
"elutes",
"slightly",
"earlier",
"than",
"the",
"non-deutero",
"equivalent",
"."
]
}
] |
PMC11746942 | Consistent with the outcome induced by IL-6, S1PR3 antagonist TY significantly suppressed IMQ-induced hyperproliferation and STAT3 activation (Fig. S3A). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Consistent",
"with",
"the",
"outcome",
"induced",
"by",
"IL-6",
",",
"S1PR3",
"antagonist",
"TY",
"significantly",
"suppressed",
"IMQ-induced",
"hyperproliferation",
"and",
"STAT3",
"activation",
"(",
"Fig.",
"S3A",
")",
"."
]
}
] |
PMC10470467 | Different infiltrating abundances of 28 immune cell types between high/low-risk group (p < 0.05; p < 0.01; p < 0.001; ****p < 0.0001); (B) Different expression level of 8 immune checkpoints between subgroups; (C) Kaplan–Meier analysis of patients in the IMvigor210 cohort between high- and low-risk groups, and (D) the proportion of response to anti-PD-L1 immunotherapy between high- and low-risk groups (CR: complete response; PR: partial response; SD: stable disease; PD: progressive disease). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Different",
"infiltrating",
"abundances",
"of",
"28",
"immune",
"cell",
"types",
"between",
"high/low-risk",
"group",
"(",
"p",
"<",
"0.05",
";",
"p",
"<",
"0.01",
";",
"p",
"<",
"0.001",
";",
"*",
"*",
"*",
"*",
"p",
"<",
"0.0001",
")",
";",
"(",
"B",
")",
"Different",
"expression",
"level",
"of",
"8",
"immune",
"checkpoints",
"between",
"subgroups",
";",
"(",
"C",
")",
"Kaplan",
"–",
"Meier",
"analysis",
"of",
"patients",
"in",
"the",
"IMvigor210",
"cohort",
"between",
"high-",
"and",
"low-risk",
"groups",
",",
"and",
"(",
"D",
")",
"the",
"proportion",
"of",
"response",
"to",
"anti-PD-L1",
"immunotherapy",
"between",
"high-",
"and",
"low-risk",
"groups",
"(",
"CR",
":",
"complete",
"response",
";",
"PR",
":",
"partial",
"response",
";",
"SD",
":",
"stable",
"disease",
";",
"PD",
":",
"progressive",
"disease",
")",
"."
]
}
] |
PMC10291556 | The cell’s ability to migrate into the open area was expressed as a percentage of control. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cell",
"’s",
"ability",
"to",
"migrate",
"into",
"the",
"open",
"area",
"was",
"expressed",
"as",
"a",
"percentage",
"of",
"control",
"."
]
}
] |
PMC11755624 | Other studies showed that this lncRNA can alter T cell differentiation, with evidence supporting its inhibiting and enhancing role in the process of Th17 differentiation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Other",
"studies",
"showed",
"that",
"this",
"lncRNA",
"can",
"alter",
"T",
"cell",
"differentiation",
",",
"with",
"evidence",
"supporting",
"its",
"inhibiting",
"and",
"enhancing",
"role",
"in",
"the",
"process",
"of",
"Th17",
"differentiation",
"."
]
}
] |
PMC10823017 | Multiple attempts have been made to pharmacologically modulate the PI3K/Akt pathway to tackle ccRCC, and these have been published in previous studies (11, 12). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Multiple",
"attempts",
"have",
"been",
"made",
"to",
"pharmacologically",
"modulate",
"the",
"PI3K/Akt",
"pathway",
"to",
"tackle",
"ccRCC",
",",
"and",
"these",
"have",
"been",
"published",
"in",
"previous",
"studies",
"(",
"11",
",",
"12",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The positive benefit-risk profile of mitapivat has been demonstrated in two recently completed phase 3 studies in adults with PK deficiency who are not regularly transfused (ACTIVATE, NCT03548220) or regularly transfused (ACTIVATE-T, NCT03559699). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"positive",
"benefit-risk",
"profile",
"of",
"mitapivat",
"has",
"been",
"demonstrated",
"in",
"two",
"recently",
"completed",
"phase",
"3",
"studies",
"in",
"adults",
"with",
"PK",
"deficiency",
"who",
"are",
"not",
"regularly",
"transfused",
"(",
"ACTIVATE",
",",
"NCT03548220",
")",
"or",
"regularly",
"transfused",
"(",
"ACTIVATE-T",
",",
"NCT03559699",
")",
"."
]
}
] |
PMC11765879 | A soft agar colony formation assay was performed to observe the formation of colonies in soft agar, which reflects tumor formation in vivo. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"soft",
"agar",
"colony",
"formation",
"assay",
"was",
"performed",
"to",
"observe",
"the",
"formation",
"of",
"colonies",
"in",
"soft",
"agar",
",",
"which",
"reflects",
"tumor",
"formation",
"in",
"vivo",
"."
]
}
] |
PMC9014716 | Human hepatoma HepG2 and Bel-7404 cells and human embryonic kidney (HEK)-293T cells were purchased from Jiangsu KeyGEN BioTECH Co., Ltd. (Nanjing, China) and maintained in Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM; HyClone Laboratories, Inc., South Logan, UT, USA) supplemented with 10% fetal bovine serum, 100 U/ml of penicillin, and 0.1 mg/ml of streptomycin under an atmosphere of 5% CO2/95% air at 37°C. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Human",
"hepatoma",
"HepG2",
"and",
"Bel-7404",
"cells",
"and",
"human",
"embryonic",
"kidney",
"(HEK)-293",
"T",
"cells",
"were",
"purchased",
"from",
"Jiangsu",
"KeyGEN",
"BioTECH",
"Co.",
",",
"Ltd.",
"(",
"Nanjing",
",",
"China",
")",
"and",
"maintained",
"in",
"Dulbecco",
"’s",
"modified",
"Eagle",
"’s",
"medium",
"(",
"DMEM",
";",
"HyClone",
"Laboratories",
",",
"Inc.",
",",
"South",
"Logan",
",",
"UT",
",",
"USA",
")",
"supplemented",
"with",
"10",
"%",
"fetal",
"bovine",
"serum",
",",
"100",
"U/ml",
"of",
"penicillin",
",",
"and",
"0.1",
"mg/ml",
"of",
"streptomycin",
"under",
"an",
"atmosphere",
"of",
"5",
"%",
"CO2/95",
"%",
"air",
"at",
"37",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC9848491 | However, neoadjuvant therapy for UCEC remains complex and controversial (4). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"neoadjuvant",
"therapy",
"for",
"UCEC",
"remains",
"complex",
"and",
"controversial",
"(",
"4",
")",
"."
]
}
] |
PMC11659921 | Alterations in cell viability following inhibition of TNFSF11 expression in the A2780 cell line. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Alterations",
"in",
"cell",
"viability",
"following",
"inhibition",
"of",
"TNFSF11",
"expression",
"in",
"the",
"A2780",
"cell",
"line",
".",
"("
]
}
] |
PMC11733919 | In this regard, a plethora of senescence-associated cell surface markers that could be potentially targeted have been already proposed. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"regard",
",",
"a",
"plethora",
"of",
"senescence-associated",
"cell",
"surface",
"markers",
"that",
"could",
"be",
"potentially",
"targeted",
"have",
"been",
"already",
"proposed",
"."
]
}
] |
PMC11612794 | Scale bar, 10 μm.(E) Quantification data of GFP-Dsn1 signals at kinetochores in mitotic cells shown in (D). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Scale",
"bar",
",",
"10",
"μm.(E",
")",
"Quantification",
"data",
"of",
"GFP-Dsn1",
"signals",
"at",
"kinetochores",
"in",
"mitotic",
"cells",
"shown",
"in",
"(",
"D",
")",
"."
]
}
] |
PMC8956657 | This was attributed to ORF4b binding preferentially (via its NLS sequences) to the host nuclear import protein IMPα3 (also known as KPNA4), which is responsible for the nuclear translocation of NF-κB. Consistent with this hypothesis, wild-type ORF4b, but not ORF4b NLS mutants, outcompete p65 for IMPα3 binding in immunoprecipitation assays. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"was",
"attributed",
"to",
"ORF4b",
"binding",
"preferentially",
"(",
"via",
"its",
"NLS",
"sequences",
")",
"to",
"the",
"host",
"nuclear",
"import",
"protein",
"IMPα3",
"(",
"also",
"known",
"as",
"KPNA4",
")",
",",
"which",
"is",
"responsible",
"for",
"the",
"nuclear",
"translocation",
"of",
"NF-κB.",
"Consistent",
"with",
"this",
"hypothesis",
",",
"wild-type",
"ORF4b",
",",
"but",
"not",
"ORF4b",
"NLS",
"mutants",
",",
"outcompete",
"p65",
"for",
"IMPα3",
"binding",
"in",
"immunoprecipitation",
"assays",
"."
]
}
] |
PMC10213199 | had the most significant results. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"had",
"the",
"most",
"significant",
"results",
"."
]
}
] |
PMC11060216 | Some limitations in our study include that only one cell line was used, and the function of S100A6 in the differentiation behavior of stem cells was not explored. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Some",
"limitations",
"in",
"our",
"study",
"include",
"that",
"only",
"one",
"cell",
"line",
"was",
"used",
",",
"and",
"the",
"function",
"of",
"S100A6",
"in",
"the",
"differentiation",
"behavior",
"of",
"stem",
"cells",
"was",
"not",
"explored",
"."
]
}
] |
PMC11297139 | The representative images supported by the relevant statistics have been chosen upon three independent preparations with similar outcomes. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"representative",
"images",
"supported",
"by",
"the",
"relevant",
"statistics",
"have",
"been",
"chosen",
"upon",
"three",
"independent",
"preparations",
"with",
"similar",
"outcomes",
"."
]
}
] |
PMC11589157 | To date, genome data is available only for a female individual of this species, which was initially sequenced on the Sanger platform in 2014 and subsequently updated through the integration of PacBio reads. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"date",
",",
"genome",
"data",
"is",
"available",
"only",
"for",
"a",
"female",
"individual",
"of",
"this",
"species",
",",
"which",
"was",
"initially",
"sequenced",
"on",
"the",
"Sanger",
"platform",
"in",
"2014",
"and",
"subsequently",
"updated",
"through",
"the",
"integration",
"of",
"PacBio",
"reads",
"."
]
}
] |
PMC10582049 | This indicates CAF diversity even at early stages of LUAD progression. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"indicates",
"CAF",
"diversity",
"even",
"at",
"early",
"stages",
"of",
"LUAD",
"progression",
"."
]
}
] |
PMC11655536 | A Edu detected cell proliferation after treated with HA for 48 h at 10 μM of RPMI-8226 (upper) and U266 (lower). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"Edu",
"detected",
"cell",
"proliferation",
"after",
"treated",
"with",
"HA",
"for",
"48",
"h",
"at",
"10",
"μM",
"of",
"RPMI-8226",
"(",
"upper",
")",
"and",
"U266",
"(",
"lower",
")",
"."
]
}
] |
PMC11521786 | However, to confirm our hypothesis, future studies should address the comparison of the antitumor effects of HER3-specific PAbs with HER3-specific monoclonal antibodies (even with a mixture of them). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"to",
"confirm",
"our",
"hypothesis",
",",
"future",
"studies",
"should",
"address",
"the",
"comparison",
"of",
"the",
"antitumor",
"effects",
"of",
"HER3-specific",
"PAbs",
"with",
"HER3-specific",
"monoclonal",
"antibodies",
"(",
"even",
"with",
"a",
"mixture",
"of",
"them",
")",
"."
]
}
] |
PMC11721277 | The reaction time was reduced from 2 h to 30–40 min. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"reaction",
"time",
"was",
"reduced",
"from",
"2",
"h",
"to",
"30–40",
"min",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Our data provide the rationale for epeleuton as a potential novel therapeutic option for clinical management of patients with SCD. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Our",
"data",
"provide",
"the",
"rationale",
"for",
"epeleuton",
"as",
"a",
"potential",
"novel",
"therapeutic",
"option",
"for",
"clinical",
"management",
"of",
"patients",
"with",
"SCD",
"."
]
}
] |
PMC8740518 | Accordingly, we assume that cellular uptake of citrate increased during tumor growth. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Accordingly",
",",
"we",
"assume",
"that",
"cellular",
"uptake",
"of",
"citrate",
"increased",
"during",
"tumor",
"growth",
"."
]
}
] |
PMC11635087 | In addition, many mitochondria surrounded the subcellular vesicle containing chloroplasts. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"addition",
",",
"many",
"mitochondria",
"surrounded",
"the",
"subcellular",
"vesicle",
"containing",
"chloroplasts",
"."
]
}
] |
PMC11389534 | This complex is anchored on the cytosolic side of the ER. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"complex",
"is",
"anchored",
"on",
"the",
"cytosolic",
"side",
"of",
"the",
"ER",
"."
]
}
] |
PMC10154881 | Experimental design for OVA peptide‐pulsed DC assay. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Experimental",
"design",
"for",
"OVA",
"peptide‐pulsed",
"DC",
"assay",
"."
]
}
] |
PMC11746948 | All animal experiments were approved by the Animal Research Ethics Committee of Shenzhen Bay Laboratory (Approved Protocol ID: AEYCQ202101), and all relevant ethical regulations were followed. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"animal",
"experiments",
"were",
"approved",
"by",
"the",
"Animal",
"Research",
"Ethics",
"Committee",
"of",
"Shenzhen",
"Bay",
"Laboratory",
"(",
"Approved",
"Protocol",
"ID",
":",
"AEYCQ202101",
")",
",",
"and",
"all",
"relevant",
"ethical",
"regulations",
"were",
"followed",
"."
]
}
] |
PMC11248911 | The pyrazoline derivatives 1–4 were synthesized by the cycloaddition reaction of the starting benzylidene acetone with hydrazine derivatives thus, heterocyclization of benzylidene acetone with hydrazine hydrate in glacial acetic acid afforded the corresponding N-acetylpyrazoline 1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"pyrazoline",
"derivatives",
"1–4",
"were",
"synthesized",
"by",
"the",
"cycloaddition",
"reaction",
"of",
"the",
"starting",
"benzylidene",
"acetone",
"with",
"hydrazine",
"derivatives",
"thus",
",",
"heterocyclization",
"of",
"benzylidene",
"acetone",
"with",
"hydrazine",
"hydrate",
"in",
"glacial",
"acetic",
"acid",
"afforded",
"the",
"corresponding",
"N-acetylpyrazoline",
"1",
"."
]
}
] |
PMC11560255 | After being incubated overnight (37°C, 5% CO2), they were treated with IC50, 2IC50, and 4IC50 of PMBE for 24 hours. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"being",
"incubated",
"overnight",
"(",
"37",
"°",
"C",
",",
"5",
"%",
"CO2",
")",
",",
"they",
"were",
"treated",
"with",
"IC50",
",",
"2IC50",
",",
"and",
"4IC50",
"of",
"PMBE",
"for",
"24",
"hours",
"."
]
}
] |
PMC11764090 | Therefore, further screening of various cold-related genes and the interaction mechanism between them is the key to exploring the mechanism of signal transduction and regulation in the future. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"further",
"screening",
"of",
"various",
"cold-related",
"genes",
"and",
"the",
"interaction",
"mechanism",
"between",
"them",
"is",
"the",
"key",
"to",
"exploring",
"the",
"mechanism",
"of",
"signal",
"transduction",
"and",
"regulation",
"in",
"the",
"future",
"."
]
}
] |
PMC11656048 | Therefore, it is urgent to explore new therapeutic targets and to develop effective anti-OS drugs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"it",
"is",
"urgent",
"to",
"explore",
"new",
"therapeutic",
"targets",
"and",
"to",
"develop",
"effective",
"anti-OS",
"drugs",
"."
]
}
] |
PMC11286266 | To restore cellular homeostasis, adaptive pathways, collectively known as the unfolded protein response (UPR), are activated. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"restore",
"cellular",
"homeostasis",
",",
"adaptive",
"pathways",
",",
"collectively",
"known",
"as",
"the",
"unfolded",
"protein",
"response",
"(",
"UPR",
")",
",",
"are",
"activated",
"."
]
}
] |
PMC11742670 | These two approaches usually utilize public databases for drugs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"two",
"approaches",
"usually",
"utilize",
"public",
"databases",
"for",
"drugs",
"."
]
}
] |
PMC11513011 | Panel B. In KK-47 and T24, DIB decreased the expression of FoxM1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Panel",
"B.",
"In",
"KK-47",
"and",
"T24",
",",
"DIB",
"decreased",
"the",
"expression",
"of",
"FoxM1",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | HUTS21 staining was: i) impaired by depletion of plasma from whole blood samples, and reconstituted by specific plasma components (sVCAM-1, FN); ii) impaired by pre-incubation with anti-CD49d HP1/2 blocking mAbs before addition of plasma, sVCAM-1 and FN. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"HUTS21",
"staining",
"was",
":",
"i",
")",
"impaired",
"by",
"depletion",
"of",
"plasma",
"from",
"whole",
"blood",
"samples",
",",
"and",
"reconstituted",
"by",
"specific",
"plasma",
"components",
"(",
"sVCAM-1",
",",
"FN",
")",
";",
"ii",
")",
"impaired",
"by",
"pre-incubation",
"with",
"anti-CD49d",
"HP1/2",
"blocking",
"mAbs",
"before",
"addition",
"of",
"plasma",
",",
"sVCAM-1",
"and",
"FN",
"."
]
}
] |
PMC11015054 | Hepatocellular carcinoma overexpresses the N6‐methyltransferase METTL5 which correlates with malignant cell behavior and poor prognosis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Hepatocellular",
"carcinoma",
"overexpresses",
"the",
"N6‐methyltransferase",
"METTL5",
"which",
"correlates",
"with",
"malignant",
"cell",
"behavior",
"and",
"poor",
"prognosis",
"."
]
}
] |
PMC11632064 | Volcano plot of the inflammatory response gene set (Hallmarks, MSigDB) from RNA-seq analyses performed on MeWo cells treated with BI-D1870 for 72 h compared to DMSO. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Volcano",
"plot",
"of",
"the",
"inflammatory",
"response",
"gene",
"set",
"(",
"Hallmarks",
",",
"MSigDB",
")",
"from",
"RNA-seq",
"analyses",
"performed",
"on",
"MeWo",
"cells",
"treated",
"with",
"BI-D1870",
"for",
"72",
"h",
"compared",
"to",
"DMSO",
"."
]
}
] |
PMC11267830 | Using rMATS, a method for quantitatively analyzing differential splicing events, to assess cluster splicing phenomena between peripheral CD3+ T cells and T-ALL cells, it was observed that exon skipping events are markedly more prevalent in T-ALL cells than in normal T cells . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Using",
"rMATS",
",",
"a",
"method",
"for",
"quantitatively",
"analyzing",
"differential",
"splicing",
"events",
",",
"to",
"assess",
"cluster",
"splicing",
"phenomena",
"between",
"peripheral",
"CD3",
"+",
"T",
"cells",
"and",
"T-ALL",
"cells",
",",
"it",
"was",
"observed",
"that",
"exon",
"skipping",
"events",
"are",
"markedly",
"more",
"prevalent",
"in",
"T-ALL",
"cells",
"than",
"in",
"normal",
"T",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9545474 | H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 5.73 (1H, d, J H‐H=14.1 Hz, H11), 5.63 (2H, d, J H‐H=6.3 Hz, H3), 5.53 (2H, m, H4), 5.33 (1H, d, J H‐H=15.4 Hz, H10), 4.92 (1H, d, J H‐H=14.0 Hz, H11), 4.56 (1H, d, J H‐H=14.0 Hz, H10), 4.25 (1H, m, H11), 4.01 (1H, d, J H‐H=15.1 Hz, H10), 3.96 (1H, d, J H‐H=14.1 Hz, H11), 3.66 (2H, m, H10), 3.40 (1H, d, J H‐H=15.3, H10), 2.76 (1H, sept, J H‐H=6.88 Hz, H6), 2.27 (3H, s, H1), 2.11 (6H, 2 s, H13), 1.23 (6H, dd, J H‐H=6.9, 1.7 Hz, H7) ppm. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"H",
"NMR",
"(",
"400",
"MHz",
",",
"CDCl3",
"):",
"δ",
"5.73",
"(",
"1H",
",",
"d",
",",
"J",
"H‐H=14.1",
"Hz",
",",
"H11",
")",
",",
"5.63",
"(",
"2H",
",",
"d",
",",
"J",
"H‐H=6.3",
"Hz",
",",
"H3",
")",
",",
"5.53",
"(",
"2H",
",",
"m",
",",
"H4",
")",
",",
"5.33",
"(",
"1H",
",",
"d",
",",
"J",
"H‐H=15.4",
"Hz",
",",
"H10",
")",
",",
"4.92",
"(",
"1H",
",",
"d",
",",
"J",
"H‐H=14.0",
"Hz",
",",
"H11",
")",
",",
"4.56",
"(",
"1H",
",",
"d",
",",
"J",
"H‐H=14.0",
"Hz",
",",
"H10",
")",
",",
"4.25",
"(",
"1H",
",",
"m",
",",
"H11",
")",
",",
"4.01",
"(",
"1H",
",",
"d",
",",
"J",
"H‐H=15.1",
"Hz",
",",
"H10",
")",
",",
"3.96",
"(",
"1H",
",",
"d",
",",
"J",
"H‐H=14.1",
"Hz",
",",
"H11",
")",
",",
"3.66",
"(",
"2H",
",",
"m",
",",
"H10",
")",
",",
"3.40",
"(",
"1H",
",",
"d",
",",
"J",
"H‐H=15.3",
",",
"H10",
")",
",",
"2.76",
"(",
"1H",
",",
"sept",
",",
"J",
"H‐H=6.88",
"Hz",
",",
"H6",
")",
",",
"2.27",
"(",
"3H",
",",
"s",
",",
"H1",
")",
",",
"2.11",
"(",
"6H",
",",
"2",
"s",
",",
"H13",
")",
",",
"1.23",
"(",
"6H",
",",
"dd",
",",
"J",
"H‐H=6.9",
",",
"1.7",
"Hz",
",",
"H7",
")",
"ppm",
"."
]
}
] |
PMC9813422 | In order to accomplish this, viruses have developed various strategies to replicate their genomes and attach them to host chromosomes. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"order",
"to",
"accomplish",
"this",
",",
"viruses",
"have",
"developed",
"various",
"strategies",
"to",
"replicate",
"their",
"genomes",
"and",
"attach",
"them",
"to",
"host",
"chromosomes",
"."
]
}
] |
PMC11597291 | The size and ζ-potential of the nCGO-PEG particles tended to increase with incubation time in RPMI 1640 cells culture medium; however, no aggregation or sedimentation was observed. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"size",
"and",
"ζ-potential",
"of",
"the",
"nCGO-PEG",
"particles",
"tended",
"to",
"increase",
"with",
"incubation",
"time",
"in",
"RPMI",
"1640",
"cells",
"culture",
"medium",
";",
"however",
",",
"no",
"aggregation",
"or",
"sedimentation",
"was",
"observed",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Results: Forty-two pts received acala (median age 69 y [range 42–84]; median 2 prior systemic regimens [range 1–4]). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"Forty-two",
"pts",
"received",
"acala",
"(",
"median",
"age",
"69",
"y",
"[",
"range",
"42–84",
"]",
";",
"median",
"2",
"prior",
"systemic",
"regimens",
"[",
"range",
"1–4",
"]",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | We also identified up to 11 referral labs participating in MM trials which significantly adds to a trial operation complexity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"also",
"identified",
"up",
"to",
"11",
"referral",
"labs",
"participating",
"in",
"MM",
"trials",
"which",
"significantly",
"adds",
"to",
"a",
"trial",
"operation",
"complexity",
"."
]
}
] |
PMC11615828 | Nocodazole treatment only reduced 35.8 ± 1.9% and 48.2 ± 2.1% of LAMP1‐ and TGN38‐labeled vesicle motility, respectively (Figure S10b,c,e,f and Video S10, Supporting Information). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Nocodazole",
"treatment",
"only",
"reduced",
"35.8",
"±",
"1.9",
"%",
"and",
"48.2",
"±",
"2.1",
"%",
"of",
"LAMP1‐",
"and",
"TGN38‐labeled",
"vesicle",
"motility",
",",
"respectively",
"(",
"Figure",
"S10b",
",",
"c",
",",
"e",
",",
"f",
"and",
"Video",
"S10",
",",
"Supporting",
"Information",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Image: Summary/Conclusion: Various clinical features are differently associated with palpable spleen size in PMF and SMF patients. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Image",
":",
"Summary/Conclusion",
":",
"Various",
"clinical",
"features",
"are",
"differently",
"associated",
"with",
"palpable",
"spleen",
"size",
"in",
"PMF",
"and",
"SMF",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC7917457 | The insertion of transgenes or coating VALO-D102 with 6K-NY-ESO-1(91−110) and 9K-MAGE-A3(161−180) did not have any adverse effects on the oncolytic potential in any of the cell lines tested, and the efficacy of VALO-D102 and PeptiCRAd-1 was found to be identical to the parental unarmed Ad5/3-D24 virus (Figures 3A−3E).Figure 3Oncolytic potency of VALO-D102 is identical to the parental strain and is not affected by coating the virus with tumor antigens(A–E) Oncolytic potency of VALO-D102 and PeptiCRAd-1, a cancer vaccine platform consisting of VALO-D102 coated with two modified tumor antigens, was compared to the Ad5/3-D24 parental strain in a (A) human A375 melanoma cell line, (B) human SK-MEL-2 melanoma cell line, (C) human A549 lung carcinoma cell line, (D) human SW982 synovial sarcoma cell line, and (E) human HCC70 triple-negative breast cancer cell line. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"insertion",
"of",
"transgenes",
"or",
"coating",
"VALO-D102",
"with",
"6K-NY-ESO-1(91−110",
")",
"and",
"9K-MAGE-A3(161−180",
")",
"did",
"not",
"have",
"any",
"adverse",
"effects",
"on",
"the",
"oncolytic",
"potential",
"in",
"any",
"of",
"the",
"cell",
"lines",
"tested",
",",
"and",
"the",
"efficacy",
"of",
"VALO-D102",
"and",
"PeptiCRAd-1",
"was",
"found",
"to",
"be",
"identical",
"to",
"the",
"parental",
"unarmed",
"Ad5/3-D24",
"virus",
"(",
"Figures",
"3A−3E).Figure",
"3Oncolytic",
"potency",
"of",
"VALO-D102",
"is",
"identical",
"to",
"the",
"parental",
"strain",
"and",
"is",
"not",
"affected",
"by",
"coating",
"the",
"virus",
"with",
"tumor",
"antigens(A",
"–",
"E",
")",
"Oncolytic",
"potency",
"of",
"VALO-D102",
"and",
"PeptiCRAd-1",
",",
"a",
"cancer",
"vaccine",
"platform",
"consisting",
"of",
"VALO-D102",
"coated",
"with",
"two",
"modified",
"tumor",
"antigens",
",",
"was",
"compared",
"to",
"the",
"Ad5/3-D24",
"parental",
"strain",
"in",
"a",
"(",
"A",
")",
"human",
"A375",
"melanoma",
"cell",
"line",
",",
"(",
"B",
")",
"human",
"SK-MEL-2",
"melanoma",
"cell",
"line",
",",
"(",
"C",
")",
"human",
"A549",
"lung",
"carcinoma",
"cell",
"line",
",",
"(",
"D",
")",
"human",
"SW982",
"synovial",
"sarcoma",
"cell",
"line",
",",
"and",
"(",
"E",
")",
"human",
"HCC70",
"triple-negative",
"breast",
"cancer",
"cell",
"line",
".",
"("
]
}
] |
PMC11599565 | Bar graphs represent densitometric analyses of western blots performed to measure protein expression following drug exposure. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Bar",
"graphs",
"represent",
"densitometric",
"analyses",
"of",
"western",
"blots",
"performed",
"to",
"measure",
"protein",
"expression",
"following",
"drug",
"exposure",
"."
]
}
] |
PMC8777939 | These cells were permeabilized with PBS containing 0.25% Triton X-100 for 10 min and blocked with 1% bovine serum albumin (BSA) (Roche, Germany), 22.52 mg/mL glycine, and 0.1% Tween 20 in PBS at room temperature. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"cells",
"were",
"permeabilized",
"with",
"PBS",
"containing",
"0.25",
"%",
"Triton",
"X-100",
"for",
"10",
"min",
"and",
"blocked",
"with",
"1",
"%",
"bovine",
"serum",
"albumin",
"(",
"BSA",
")",
"(",
"Roche",
",",
"Germany",
")",
",",
"22.52",
"mg/mL",
"glycine",
",",
"and",
"0.1",
"%",
"Tween",
"20",
"in",
"PBS",
"at",
"room",
"temperature",
"."
]
}
] |
PMC11593713 | The analysis of the results showed that the viral infection significantly affected TOS, TAC, and OSI values and GPx and GR activities (Figure 2, Table S2). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"analysis",
"of",
"the",
"results",
"showed",
"that",
"the",
"viral",
"infection",
"significantly",
"affected",
"TOS",
",",
"TAC",
",",
"and",
"OSI",
"values",
"and",
"GPx",
"and",
"GR",
"activities",
"(",
"Figure",
"2",
",",
"Table",
"S2",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Grade 1 CRS was reported in 6/19 and Grade 2 CRS in 3/19. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Grade",
"1",
"CRS",
"was",
"reported",
"in",
"6/19",
"and",
"Grade",
"2",
"CRS",
"in",
"3/19",
"."
]
}
] |
PMC11566417 | Briefly, a licensed veterinarian collected 40 mL of blood from the coccygeal vein of each of three female, lactating, Holstein-Frisian cows into evacuated tubes containing ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Briefly",
",",
"a",
"licensed",
"veterinarian",
"collected",
"40",
"mL",
"of",
"blood",
"from",
"the",
"coccygeal",
"vein",
"of",
"each",
"of",
"three",
"female",
",",
"lactating",
",",
"Holstein-Frisian",
"cows",
"into",
"evacuated",
"tubes",
"containing",
"ethylenediaminetetraacetic",
"acid",
"(",
"EDTA",
")",
"."
]
}
] |
PMC11805741 | This suggested that at least one of the treatments has a different effect on gene expression compared to the others. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"suggested",
"that",
"at",
"least",
"one",
"of",
"the",
"treatments",
"has",
"a",
"different",
"effect",
"on",
"gene",
"expression",
"compared",
"to",
"the",
"others",
"."
]
}
] |
PMC11700247 | Figure 4A). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Figure",
"4A",
")",
"."
]
}
] |
PMC7294030 | Aurisin A significantly inhibited cell migration into the wounded area in a dose- and time-dependent manner in all experimental dose. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aurisin",
"A",
"significantly",
"inhibited",
"cell",
"migration",
"into",
"the",
"wounded",
"area",
"in",
"a",
"dose-",
"and",
"time-dependent",
"manner",
"in",
"all",
"experimental",
"dose",
"."
]
}
] |
PMC11739696 | DNA damage is a key consequence of oxidative stress, where excessive ROS can induce various DNA lesions, including single-strand DNA breaks and more severe double-strand DNA breaks. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"DNA",
"damage",
"is",
"a",
"key",
"consequence",
"of",
"oxidative",
"stress",
",",
"where",
"excessive",
"ROS",
"can",
"induce",
"various",
"DNA",
"lesions",
",",
"including",
"single-strand",
"DNA",
"breaks",
"and",
"more",
"severe",
"double-strand",
"DNA",
"breaks",
"."
]
}
] |
PMC11763111 | We propose that primed PBMCs are capable of recognizing antigens on CAR-T cells, but the combined modifications of reducing CD38, CD3, HLA-I, and HLA-II expression, along with LLT1 overexpression, collectively minimize alloreactivity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"propose",
"that",
"primed",
"PBMCs",
"are",
"capable",
"of",
"recognizing",
"antigens",
"on",
"CAR-T",
"cells",
",",
"but",
"the",
"combined",
"modifications",
"of",
"reducing",
"CD38",
",",
"CD3",
",",
"HLA-I",
",",
"and",
"HLA-II",
"expression",
",",
"along",
"with",
"LLT1",
"overexpression",
",",
"collectively",
"minimize",
"alloreactivity",
"."
]
}
] |
PMC7802142 | Data are expressed as mean ± SEM. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Data",
"are",
"expressed",
"as",
"mean",
"±",
"SEM",
"."
]
}
] |
PMC11612315 | Two-tailed unpaired t test (**p < 0.01, compared with each control CAP). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Two-tailed",
"unpaired",
"t",
"test",
"(",
"*",
"*",
"p",
"<",
"0.01",
",",
"compared",
"with",
"each",
"control",
"CAP",
")",
"."
]
}
] |
PMC11747467 | All of the bladder cancer cells were cultivated in an incubator with a humidified atmosphere containing 5% CO2 at 37°C. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"of",
"the",
"bladder",
"cancer",
"cells",
"were",
"cultivated",
"in",
"an",
"incubator",
"with",
"a",
"humidified",
"atmosphere",
"containing",
"5",
"%",
"CO2",
"at",
"37",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | The median length of stay in ICU was 5 days (range 2-11). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"median",
"length",
"of",
"stay",
"in",
"ICU",
"was",
"5",
"days",
"(",
"range",
"2",
"-",
"11",
")",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.