Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC10728200
It was found that STUB1 overexpression led to an increase GPX4 degradation and prolonged the half-life of GPX4 protein in GIST-T1 cells (Fig. 4D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "was", "found", "that", "STUB1", "overexpression", "led", "to", "an", "increase", "GPX4", "degradation", "and", "prolonged", "the", "half-life", "of", "GPX4", "protein", "in", "GIST-T1", "cells", "(", "Fig.", "4D", ")", "." ] } ]
PMC10890055
Figure 2 shows the metabolic activity (resazurin assay) of hFOB 1.19 cells after their one-day exposure to ZnCl2 solutions preceded by 14-day incubation at different temperatures.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "2", "shows", "the", "metabolic", "activity", "(", "resazurin", "assay", ")", "of", "hFOB", "1.19", "cells", "after", "their", "one-day", "exposure", "to", "ZnCl2", "solutions", "preceded", "by", "14-day", "incubation", "at", "different", "temperatures", "." ] } ]
PMC11672142
DefNEtTrp was able to inhibit 50% cell growth (proliferation) of all cell lines at an average GI50 concentration of 1.2 μM. It showed the highest antiproliferative sensitivity to leukemia with a GI50 of 0.29 μM and the least sensitivity to renal cancer with a GI50 of 4.97 μM. Interestingly, the broad-spectrum antiproliferative behavior exhibited by DefNEtTrp is superior to the activity of triapine according to the information available in the NCI-60 database (Table S3; compound S759096).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DefNEtTrp", "was", "able", "to", "inhibit", "50", "%", "cell", "growth", "(", "proliferation", ")", "of", "all", "cell", "lines", "at", "an", "average", "GI50", "concentration", "of", "1.2", "μM.", "It", "showed", "the", "highest", "antiproliferative", "sensitivity", "to", "leukemia", "with", "a", "GI50", "of", "0.29", "μM", "and", "the", "least", "sensitivity", "to", "renal", "cancer", "with", "a", "GI50", "of", "4.97", "μM.", "Interestingly", ",", "the", "broad-spectrum", "antiproliferative", "behavior", "exhibited", "by", "DefNEtTrp", "is", "superior", "to", "the", "activity", "of", "triapine", "according", "to", "the", "information", "available", "in", "the", "NCI-60", "database", "(", "Table", "S3", ";", "compound", "S759096", ")", "." ] } ]
PMC11244823
After migration, one half of each gel was transferred to nitrocellulose 0.45 μm for 2 h at 200 mA. The membrane was incubated with mouse anti-V5 tag antibody (ab27671, Abcam) followed by incubation with secondary goat anti-mouse-IRdye 800CW (Li-COR) and imaged at Li-COR Odyssey M Imaging System.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "migration", ",", "one", "half", "of", "each", "gel", "was", "transferred", "to", "nitrocellulose", "0.45", "μm", "for", "2", "h", "at", "200", "mA.", "The", "membrane", "was", "incubated", "with", "mouse", "anti-V5", "tag", "antibody", "(", "ab27671", ",", "Abcam", ")", "followed", "by", "incubation", "with", "secondary", "goat", "anti-mouse-IRdye", "800CW", "(", "Li-COR", ")", "and", "imaged", "at", "Li-COR", "Odyssey", "M", "Imaging", "System", "." ] } ]
PMC11607321
This transformed data is then used in an ordinary least squares (OLS), whose calculated weights are a correlative metric between two proteins.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "transformed", "data", "is", "then", "used", "in", "an", "ordinary", "least", "squares", "(", "OLS", ")", ",", "whose", "calculated", "weights", "are", "a", "correlative", "metric", "between", "two", "proteins", "." ] } ]
PMC11478724
This suppression is due to the down-regulation of STAT3 expression, which in turn reduces the activity of downstream anti-apoptosis molecules like Bcl2 and increases the activity of downstream apoptosis molecules like CASP8, CASP9, CASP3, and BAX.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "suppression", "is", "due", "to", "the", "down-regulation", "of", "STAT3", "expression", ",", "which", "in", "turn", "reduces", "the", "activity", "of", "downstream", "anti-apoptosis", "molecules", "like", "Bcl2", "and", "increases", "the", "activity", "of", "downstream", "apoptosis", "molecules", "like", "CASP8", ",", "CASP9", ",", "CASP3", ",", "and", "BAX", "." ] } ]
PMC11155445
Mentioned acyl thiourea was also found effective in rats and reduced the mortality rate from 100% to 20% as well as provided physical relief from severe symptoms.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mentioned", "acyl", "thiourea", "was", "also", "found", "effective", "in", "rats", "and", "reduced", "the", "mortality", "rate", "from", "100", "%", "to", "20", "%", "as", "well", "as", "provided", "physical", "relief", "from", "severe", "symptoms", "." ] } ]
PMC11588008
The final diluted concentration of PD98059 was 2, 5, 10, 20, 50, 100, and 200 µM. The drug intervention time was 4 days and 7 days.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "final", "diluted", "concentration", "of", "PD98059", "was", "2", ",", "5", ",", "10", ",", "20", ",", "50", ",", "100", ",", "and", "200", "µM.", "The", "drug", "intervention", "time", "was", "4", "days", "and", "7", "days", "." ] } ]
PMC11206251
The HepG2 cell directory number was TCHu 72, and they were purchased from the cell bank of the Chinese Academy of Sciences.
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "HepG2", "cell", "directory", "number", "was", "TCHu", "72", ",", "and", "they", "were", "purchased", "from", "the", "cell", "bank", "of", "the", "Chinese", "Academy", "of", "Sciences", "." ] } ]
PMC9812014
The PI-3 virus virion contains negative-sense ssRNA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "PI-3", "virus", "virion", "contains", "negative-sense", "ssRNA", "." ] } ]
PMC11271278
For the CUTLL1 cell line that is not included in the CCLE copy number dataset, we used Neoloop to infer the copy number profile using HiChIP reads.
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "the", "CUTLL1", "cell", "line", "that", "is", "not", "included", "in", "the", "CCLE", "copy", "number", "dataset", ",", "we", "used", "Neoloop", "to", "infer", "the", "copy", "number", "profile", "using", "HiChIP", "reads", "." ] } ]
PMC9429973
Results: Baseline characteristics are in Table 1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "Baseline", "characteristics", "are", "in", "Table", "1", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: We used bone marrow (BM) CD19CD138 sorted cells and matched BM plasma from 32 pts (7 IgM MGUS, 25 WM) and 5 healthy controls to perform whole exome sequencing, RNA-seq, proteomic and metabolomic analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "We", "used", "bone", "marrow", "(", "BM", ")", "CD19CD138", "sorted", "cells", "and", "matched", "BM", "plasma", "from", "32", "pts", "(", "7", "IgM", "MGUS", ",", "25", "WM", ")", "and", "5", "healthy", "controls", "to", "perform", "whole", "exome", "sequencing", ",", "RNA-seq", ",", "proteomic", "and", "metabolomic", "analysis", "." ] } ]
PMC11531744
ROC curve of the risk score in predicting 1-, 2-, and 3-years OS. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ROC", "curve", "of", "the", "risk", "score", "in", "predicting", "1-", ",", "2-", ",", "and", "3-years", "OS", ".", "(" ] } ]
PMC11650848
The same trained researcher performed each assessment on all children and was blinded prior to assessment of the child’s FASSTT study intervention group (placebo or FA-supplemented).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "same", "trained", "researcher", "performed", "each", "assessment", "on", "all", "children", "and", "was", "blinded", "prior", "to", "assessment", "of", "the", "child", "’s", "FASSTT", "study", "intervention", "group", "(", "placebo", "or", "FA-supplemented", ")", "." ] } ]
PMC10198699
A revised version of the SA MTA that retained the original framework but eliminated this and other problematic issues in the original SA MTA was developed by a group of law academics and is freely available online.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "revised", "version", "of", "the", "SA", "MTA", "that", "retained", "the", "original", "framework", "but", "eliminated", "this", "and", "other", "problematic", "issues", "in", "the", "original", "SA", "MTA", "was", "developed", "by", "a", "group", "of", "law", "academics", "and", "is", "freely", "available", "online", "." ] } ]
PMC10988555
In this regard, the anticancer properties of ruthenium, osmium, rhodium, copper, gold, iridium, and titanium metal complexes have been explored.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "regard", ",", "the", "anticancer", "properties", "of", "ruthenium", ",", "osmium", ",", "rhodium", ",", "copper", ",", "gold", ",", "iridium", ",", "and", "titanium", "metal", "complexes", "have", "been", "explored", "." ] } ]
PMC5311252
No. MSY0000724), 10 nM AllStar neg.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No.", "MSY0000724", ")", ",", "10", "nM", "AllStar", "neg", "." ] } ]
PMC10818573
Although some viral infections result in morphological changes, such as cytopathic effects detectable by microscopy, other viral infections are associated with no visible changes in cellular appearance or alterations that occur slowly and are not easily observed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "some", "viral", "infections", "result", "in", "morphological", "changes", ",", "such", "as", "cytopathic", "effects", "detectable", "by", "microscopy", ",", "other", "viral", "infections", "are", "associated", "with", "no", "visible", "changes", "in", "cellular", "appearance", "or", "alterations", "that", "occur", "slowly", "and", "are", "not", "easily", "observed", "." ] } ]
PMC11745823
Overall, these findings indicate that RIT1 facilitates tumour progression by activating PI3K/AKT/c‐Myc signalling.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Overall", ",", "these", "findings", "indicate", "that", "RIT1", "facilitates", "tumour", "progression", "by", "activating", "PI3K/AKT/c‐Myc", "signalling", "." ] } ]
PMC10079526
G Cluster 3 represents proteins involved in SUMOylation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "G", "Cluster", "3", "represents", "proteins", "involved", "in", "SUMOylation", "." ] } ]
PMC9429973
Of the 48 pts, 45 were evaluable (BCR::ABL1 >0.1% at baseline) for major molecular response (MMR); 3 were excluded for BCR::ABL1 atypical transcripts.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "the", "48", "pts", ",", "45", "were", "evaluable", "(", "BCR::ABL1", ">", "0.1", "%", "at", "baseline", ")", "for", "major", "molecular", "response", "(", "MMR", ")", ";", "3", "were", "excluded", "for", "BCR::ABL1", "atypical", "transcripts", "." ] } ]
PMC9429973
Our data suggest that eltrombopag might improve hematologic cell counts in patients with PGF, especially in those patients who remained on treatment at week 24, however further research is warranted to extend its applicability for larger cohorts R. Wong, M. Al-Adhami, J. Savage, R. Horneff, M. Yeh, T. Dumagay, D. Gomez-Almaguer Sir Y.K. Pao Centre for Cancer & Department of Medicine and Therapeutics, Prince of Wales Hospital, The Chinese University of Hong Kong, Sha Tin, Hong Kong; Apellis Pharmaceuticals, Inc., Waltham, United States of America; Swedish Orphan Biovitrum AB, Stockholm, Sweden; Apellis Pharmaceuticals, Waltham, Waltham, United States of America; Department of Cellular Therapeutics, Makati Medical Centre, Makati, Philippines; Hematology Service, Hospital Universitario “Dr José Eleuterio González”, Universidad Autónoma de Nuevo León, Monterrey, Mexico Background: Paroxysmal nocturnal hemoglobinuria (PNH) is a rare and life-threatening disease characterized by complement-mediated hemolysis and thrombosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "data", "suggest", "that", "eltrombopag", "might", "improve", "hematologic", "cell", "counts", "in", "patients", "with", "PGF", ",", "especially", "in", "those", "patients", "who", "remained", "on", "treatment", "at", "week", "24", ",", "however", "further", "research", "is", "warranted", "to", "extend", "its", "applicability", "for", "larger", "cohorts", "R.", "Wong", ",", "M.", "Al-Adhami", ",", "J.", "Savage", ",", "R.", "Horneff", ",", "M.", "Yeh", ",", "T.", "Dumagay", ",", "D.", "Gomez-Almaguer", "Sir", "Y.K.", "Pao", "Centre", "for", "Cancer", "&", "Department", "of", "Medicine", "and", "Therapeutics", ",", "Prince", "of", "Wales", "Hospital", ",", "The", "Chinese", "University", "of", "Hong", "Kong", ",", "Sha", "Tin", ",", "Hong", "Kong", ";", "Apellis", "Pharmaceuticals", ",", "Inc.", ",", "Waltham", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Swedish", "Orphan", "Biovitrum", "AB", ",", "Stockholm", ",", "Sweden", ";", "Apellis", "Pharmaceuticals", ",", "Waltham", ",", "Waltham", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Department", "of", "Cellular", "Therapeutics", ",", "Makati", "Medical", "Centre", ",", "Makati", ",", "Philippines", ";", "Hematology", "Service", ",", "Hospital", "Universitario", "“", "Dr", "José", "Eleuterio", "González", "”", ",", "Universidad", "Autónoma", "de", "Nuevo", "León", ",", "Monterrey", ",", "Mexico", "Background", ":", "Paroxysmal", "nocturnal", "hemoglobinuria", "(", "PNH", ")", "is", "a", "rare", "and", "life-threatening", "disease", "characterized", "by", "complement-mediated", "hemolysis", "and", "thrombosis", "." ] } ]
PMC10589262
Therefore, breakthroughs beyond KIT, such as identification of novel druggable targets and tumorigenic mechanisms, are needed for GIST treatment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "breakthroughs", "beyond", "KIT", ",", "such", "as", "identification", "of", "novel", "druggable", "targets", "and", "tumorigenic", "mechanisms", ",", "are", "needed", "for", "GIST", "treatment", "." ] } ]
PMC11796104
Furthermore, hsa-circ-9130, novel_circ_0014940 and hsa-circ-0054894 were significantly increased while hsa-circ-2484 and novel_circ_0033084 were decreased in the OP group compared to the control group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "hsa-circ-9130", ",", "novel_circ_0014940", "and", "hsa-circ-0054894", "were", "significantly", "increased", "while", "hsa-circ-2484", "and", "novel_circ_0033084", "were", "decreased", "in", "the", "OP", "group", "compared", "to", "the", "control", "group", "." ] } ]
PMC9429973
It is a dynamic cohort with the inclusion of approximately 900 patients each year: 2765 patients included at the end of 2019 of which 561 were aged 80 and over (20.3%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "a", "dynamic", "cohort", "with", "the", "inclusion", "of", "approximately", "900", "patients", "each", "year", ":", "2765", "patients", "included", "at", "the", "end", "of", "2019", "of", "which", "561", "were", "aged", "80", "and", "over", "(", "20.3", "%", ")", "." ] } ]
PMC8427838
As such, we sought to determine which of the two domains of moesin was involved in interacting with TMIGD1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "such", ",", "we", "sought", "to", "determine", "which", "of", "the", "two", "domains", "of", "moesin", "was", "involved", "in", "interacting", "with", "TMIGD1", "." ] } ]
PMC9429973
So we conducted a single-arm, phase II trial for newly diagnosed B-cell PVRL to evaluate the efficacy and safety of ZR (zanubrutinib plus rituximab) regimen with intravitreal MTX.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "So", "we", "conducted", "a", "single-arm", ",", "phase", "II", "trial", "for", "newly", "diagnosed", "B-cell", "PVRL", "to", "evaluate", "the", "efficacy", "and", "safety", "of", "ZR", "(", "zanubrutinib", "plus", "rituximab", ")", "regimen", "with", "intravitreal", "MTX", "." ] } ]
PMC9848491
IC50 of MK.2206 in high and low risk groups. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IC50", "of", "MK.2206", "in", "high", "and", "low", "risk", "groups", ".", "(" ] } ]
PMC7917457
Unfortunately, the use of immune checkpoint inhibitor (ICI) antibodies can create durable responses in only a small minority of cancer patients, the response rate being 10%–25% in a majority of cancers.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unfortunately", ",", "the", "use", "of", "immune", "checkpoint", "inhibitor", "(", "ICI", ")", "antibodies", "can", "create", "durable", "responses", "in", "only", "a", "small", "minority", "of", "cancer", "patients", ",", "the", "response", "rate", "being", "10%–25", "%", "in", "a", "majority", "of", "cancers", "." ] } ]
PMC11711127
Progenitor exhausted T cells progressively lose proliferative and re-activation potential, to become a terminally differentiated exhausted population (TCF).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Progenitor", "exhausted", "T", "cells", "progressively", "lose", "proliferative", "and", "re-activation", "potential", ",", "to", "become", "a", "terminally", "differentiated", "exhausted", "population", "(", "TCF", ")", "." ] } ]
PMC9429973
116 (79%) were diagnosed on histopathologic evaluation while the remainder were diagnosed without microscopic confirmation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "116", "(", "79", "%", ")", "were", "diagnosed", "on", "histopathologic", "evaluation", "while", "the", "remainder", "were", "diagnosed", "without", "microscopic", "confirmation", "." ] } ]
PMC11594641
Knockdown of Rab27A or Rab27B reduced tumor growth and metastasis in murine models of melanoma .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Knockdown", "of", "Rab27A", "or", "Rab27B", "reduced", "tumor", "growth", "and", "metastasis", "in", "murine", "models", "of", "melanoma", "." ] } ]
PMC9848491
GSEA showed that cell cycle, fc gamma r mediated phagocytosis, Nod like receptor signaling pathway, pathways in cancer, oocyte meiosis, progesterone mediated oocyte maturation, ubiquitin mediated proteolysis, Notch signaling pathway, JAK-STAT signaling pathway, erbb signaling pathway were mainly enriched in the high-risk group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GSEA", "showed", "that", "cell", "cycle", ",", "fc", "gamma", "r", "mediated", "phagocytosis", ",", "Nod", "like", "receptor", "signaling", "pathway", ",", "pathways", "in", "cancer", ",", "oocyte", "meiosis", ",", "progesterone", "mediated", "oocyte", "maturation", ",", "ubiquitin", "mediated", "proteolysis", ",", "Notch", "signaling", "pathway", ",", "JAK-STAT", "signaling", "pathway", ",", "erbb", "signaling", "pathway", "were", "mainly", "enriched", "in", "the", "high-risk", "group", "." ] } ]
PMC11075223
It might reduce the expression of pro-inflammatory cytokines by inhibiting microglia activation to play an antidepressant role .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "might", "reduce", "the", "expression", "of", "pro-inflammatory", "cytokines", "by", "inhibiting", "microglia", "activation", "to", "play", "an", "antidepressant", "role", "." ] } ]
PMC10957991
Bar 20 um. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bar", "20", "um", ".", "(" ] } ]
PMC10907726
Thus, in this study, we investigated whether autophagy was correlated to the inhibitory effects of DATS on OS cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "in", "this", "study", ",", "we", "investigated", "whether", "autophagy", "was", "correlated", "to", "the", "inhibitory", "effects", "of", "DATS", "on", "OS", "cells", "." ] } ]
PMC11546117
Doubling time was calculated as previously described , aliquots of 5 × 10 cells were cryopreserved in 1 mL of freezing medium (90% FBS and 10% DMSO).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Doubling", "time", "was", "calculated", "as", "previously", "described", ",", "aliquots", "of", "5", "×", "10", "cells", "were", "cryopreserved", "in", "1", "mL", "of", "freezing", "medium", "(", "90", "%", "FBS", "and", "10", "%", "DMSO", ")", "." ] } ]
PMC11024707
However, there was no statistical significance in the multinomial logistic regression analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "there", "was", "no", "statistical", "significance", "in", "the", "multinomial", "logistic", "regression", "analysis", "." ] } ]
PMC9429973
Presenting symptoms included fever in 4 (12%), neurologic deficit (weakness, fatigue, and altered mental status) in 14 (41%) and anasarca in 6 (18%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Presenting", "symptoms", "included", "fever", "in", "4", "(", "12", "%", ")", ",", "neurologic", "deficit", "(", "weakness", ",", "fatigue", ",", "and", "altered", "mental", "status", ")", "in", "14", "(", "41", "%", ")", "and", "anasarca", "in", "6", "(", "18", "%", ")", "." ] } ]
PMC11791264
Here, we revealed that the lysine residue in the LC3B protein is methylated by the lysine methyltransferase SETD7.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "we", "revealed", "that", "the", "lysine", "residue", "in", "the", "LC3B", "protein", "is", "methylated", "by", "the", "lysine", "methyltransferase", "SETD7", "." ] } ]
PMC8343815
Our findings indicated that both AuNPs and AuNRs substantially improved the radiosensitivity of HeLa cells; however, the radiosensitization of AuNRs was remarkably higher than that of AuNPs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "findings", "indicated", "that", "both", "AuNPs", "and", "AuNRs", "substantially", "improved", "the", "radiosensitivity", "of", "HeLa", "cells", ";", "however", ",", "the", "radiosensitization", "of", "AuNRs", "was", "remarkably", "higher", "than", "that", "of", "AuNPs", "." ] } ]
PMC11615828
Rab5‐labeled early endosomes are required for retrograde transport.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Rab5‐labeled", "early", "endosomes", "are", "required", "for", "retrograde", "transport", "." ] } ]
PMC10213179
Once the tumor volume exceeds 800 mm (∼15–20 days after inoculation) the gastrocnemius muscles are surgically resected, and the occurrence of lung metastasis is observed by in vivo luciferin reading of the whole mice or ex vivo luciferin detection of the lung.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Once", "the", "tumor", "volume", "exceeds", "800", "mm", "(", "∼15–20", "days", "after", "inoculation", ")", "the", "gastrocnemius", "muscles", "are", "surgically", "resected", ",", "and", "the", "occurrence", "of", "lung", "metastasis", "is", "observed", "by", "in", "vivo", "luciferin", "reading", "of", "the", "whole", "mice", "or", "ex", "vivo", "luciferin", "detection", "of", "the", "lung", "." ] } ]
PMC10565698
A. Nucleocytoplasmic isolation assay of circUSP10 in HCCLM3 and BEL-7407 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "Nucleocytoplasmic", "isolation", "assay", "of", "circUSP10", "in", "HCCLM3", "and", "BEL-7407", "cells", "." ] } ]
PMC8658661
Thus, the expression of enzymes of the UGT family—UGT1A1, UGT1A4, UGT1A6, UGT2B7, UGT2B15, and GSTM1, which play a key role in the metabolism of a wide range of anticancer agents—was observed either at very low levels in the HepG2 cell line or was not detected at all in comparison with hepatocytes .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "the", "expression", "of", "enzymes", "of", "the", "UGT", "family", "—", "UGT1A1", ",", "UGT1A4", ",", "UGT1A6", ",", "UGT2B7", ",", "UGT2B15", ",", "and", "GSTM1", ",", "which", "play", "a", "key", "role", "in", "the", "metabolism", "of", "a", "wide", "range", "of", "anticancer", "agents", "—", "was", "observed", "either", "at", "very", "low", "levels", "in", "the", "HepG2", "cell", "line", "or", "was", "not", "detected", "at", "all", "in", "comparison", "with", "hepatocytes", "." ] } ]
PMC11632064
Although MeWo cells have an IC50 similar to that of A-375 cells (25.4 nM), they show a survival plateau at 30–50% of maximal viability at higher doses of BI 6727, as seen with PrestoBlue HS and crystal violet assays (Fig 4B–D).
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "MeWo", "cells", "have", "an", "IC50", "similar", "to", "that", "of", "A-375", "cells", "(", "25.4", "nM", ")", ",", "they", "show", "a", "survival", "plateau", "at", "30–50", "%", "of", "maximal", "viability", "at", "higher", "doses", "of", "BI", "6727", ",", "as", "seen", "with", "PrestoBlue", "HS", "and", "crystal", "violet", "assays", "(", "Fig", "4B", "–", "D", ")", "." ] } ]
PMC11348300
As shown in Fig. 4B, the skin serves as the principal emitter of PpIX fluorescence, with intensities averaging twice as high as those observed in tumors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "shown", "in", "Fig.", "4B", ",", "the", "skin", "serves", "as", "the", "principal", "emitter", "of", "PpIX", "fluorescence", ",", "with", "intensities", "averaging", "twice", "as", "high", "as", "those", "observed", "in", "tumors", "." ] } ]
PMC9429973
D. A. Sallman, M. M. Al Malki, A. S. Asch, E. S. Wang, J. G. Jurcic, T. J. Bradley, I. W. Flinn, D. A. Pollyea, S. N. Kambhampati, T. N. Tanaka, J. F. Zeidner, G. Garcia-Manero, D. Jeyakumar, L. Gu, A. Tan, M. Chao, C. O’Hear, I. Lal, P. Vyas, N. Daver Moffitt Cancer Center, Tampa; City of Hope National Medical Center, Duarte; Stephenson Cancer Center, Oklahoma University Health, Oklahoma City; Roswell Park Comprehensive Cancer Center, Buffalo; Columbia University Medical Center, New York; Sylvester Comprehensive Cancer Center, University of Miami Miller School of Medicine, Miami; Tennessee Oncology, Nashville; University of Colorado School of Medicine, Denver; Sarah Cannon Research Institute, Kansas City; University of California San Diego Moores Cancer Center, San Diego; Lineberger Comprehensive Cancer Center, University of North Carolina, Chapel Hill; The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston; University of California Irvine, Orange; Gilead Sciences, Inc., Foster City, United States of America; Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, Oxford, United Kingdom Background: Magrolimab is a monoclonal antibody that blocks CD47, a “don’t eat me” signal overexpressed on cancer cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D.", "A.", "Sallman", ",", "M.", "M.", "Al", "Malki", ",", "A.", "S.", "Asch", ",", "E.", "S.", "Wang", ",", "J.", "G.", "Jurcic", ",", "T.", "J.", "Bradley", ",", "I.", "W.", "Flinn", ",", "D.", "A.", "Pollyea", ",", "S.", "N.", "Kambhampati", ",", "T.", "N.", "Tanaka", ",", "J.", "F.", "Zeidner", ",", "G.", "Garcia-Manero", ",", "D.", "Jeyakumar", ",", "L.", "Gu", ",", "A.", "Tan", ",", "M.", "Chao", ",", "C.", "O’Hear", ",", "I.", "Lal", ",", "P.", "Vyas", ",", "N.", "Daver", "Moffitt", "Cancer", "Center", ",", "Tampa", ";", "City", "of", "Hope", "National", "Medical", "Center", ",", "Duarte", ";", "Stephenson", "Cancer", "Center", ",", "Oklahoma", "University", "Health", ",", "Oklahoma", "City", ";", "Roswell", "Park", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "Buffalo", ";", "Columbia", "University", "Medical", "Center", ",", "New", "York", ";", "Sylvester", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "University", "of", "Miami", "Miller", "School", "of", "Medicine", ",", "Miami", ";", "Tennessee", "Oncology", ",", "Nashville", ";", "University", "of", "Colorado", "School", "of", "Medicine", ",", "Denver", ";", "Sarah", "Cannon", "Research", "Institute", ",", "Kansas", "City", ";", "University", "of", "California", "San", "Diego", "Moores", "Cancer", "Center", ",", "San", "Diego", ";", "Lineberger", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "University", "of", "North", "Carolina", ",", "Chapel", "Hill", ";", "The", "University", "of", "Texas", "MD", "Anderson", "Cancer", "Center", ",", "Houston", ";", "University", "of", "California", "Irvine", ",", "Orange", ";", "Gilead", "Sciences", ",", "Inc.", ",", "Foster", "City", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Weatherall", "Institute", "of", "Molecular", "Medicine", ",", "University", "of", "Oxford", ",", "Oxford", ",", "United", "Kingdom", "Background", ":", "Magrolimab", "is", "a", "monoclonal", "antibody", "that", "blocks", "CD47", ",", "a", "“", "do", "n’t", "eat", "me", "”", "signal", "overexpressed", "on", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC10957991
TRPV4 ion channel is one of the mechanosensors, prominently expressed in the basal stem cells and impacting cellular processes via physical changes in the microenvironment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TRPV4", "ion", "channel", "is", "one", "of", "the", "mechanosensors", ",", "prominently", "expressed", "in", "the", "basal", "stem", "cells", "and", "impacting", "cellular", "processes", "via", "physical", "changes", "in", "the", "microenvironment", "." ] } ]
PMC11489351
We sought to biochemically validate pH-dependent changes in Notch1 protein abundance and downstream pathway activation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "sought", "to", "biochemically", "validate", "pH-dependent", "changes", "in", "Notch1", "protein", "abundance", "and", "downstream", "pathway", "activation", "." ] } ]
PMC11725127
Overexpression of KRAS (Fig. 6D) could partially abrogate the USP2 knockout-induced cell growth inhibition (Fig. 6E and F).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Overexpression", "of", "KRAS", "(", "Fig.", "6D", ")", "could", "partially", "abrogate", "the", "USP2", "knockout-induced", "cell", "growth", "inhibition", "(", "Fig.", "6E", "and", "F", ")", "." ] } ]
PMC11763126
D IF assay showing colocalization of CBDP1 and YTHDF2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", "IF", "assay", "showing", "colocalization", "of", "CBDP1", "and", "YTHDF2", "." ] } ]
PMC11411004
The combination of HDAC and LSD1 small-molecule inhibitors has shown significant synergistic antitumor effects in a variety of malignancies, including rhabdomyosarcoma (Haydn et al. 2017), glioblastoma, and acute myeloid leukemia (Bulut et al. 2022).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "combination", "of", "HDAC", "and", "LSD1", "small-molecule", "inhibitors", "has", "shown", "significant", "synergistic", "antitumor", "effects", "in", "a", "variety", "of", "malignancies", ",", "including", "rhabdomyosarcoma", "(", "Haydn", "et", "al.", "2017", ")", ",", "glioblastoma", ",", "and", "acute", "myeloid", "leukemia", "(", "Bulut", "et", "al.", "2022", ")", "." ] } ]
PMC11640419
However, this survival is associated with an increased risk of genomic instability and cancer predisposition.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "this", "survival", "is", "associated", "with", "an", "increased", "risk", "of", "genomic", "instability", "and", "cancer", "predisposition", "." ] } ]
PMC6379402
Table 1Validation of the iCell rewired genesGene, breast cancerLiterature supportPatient survival curve diff.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "1Validation", "of", "the", "iCell", "rewired", "genesGene", ",", "breast", "cancerLiterature", "supportPatient", "survival", "curve", "diff", "." ] } ]
PMC11775197
In a mouse model, the PPARα inhibitor GW6471 inhibited this metastatic effect .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "a", "mouse", "model", ",", "the", "PPARα", "inhibitor", "GW6471", "inhibited", "this", "metastatic", "effect", "." ] } ]
PMC11218145
In a previous drug screening, we identified thonzonium bromide (TB) as one of the most active compounds against MPM cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "a", "previous", "drug", "screening", ",", "we", "identified", "thonzonium", "bromide", "(", "TB", ")", "as", "one", "of", "the", "most", "active", "compounds", "against", "MPM", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
We also verified that ROS low cells have a lower mitochondrial mass by MitoTracker and TOMM20 staining (mitochondria to nucleus ratio 1.18 vs 1.35 for ROS high, p=0.0005), suggesting that mitochondrial mass and functions might be involved in quiescent cells properties.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "also", "verified", "that", "ROS", "low", "cells", "have", "a", "lower", "mitochondrial", "mass", "by", "MitoTracker", "and", "TOMM20", "staining", "(", "mitochondria", "to", "nucleus", "ratio", "1.18", "vs", "1.35", "for", "ROS", "high", ",", "p=0.0005", ")", ",", "suggesting", "that", "mitochondrial", "mass", "and", "functions", "might", "be", "involved", "in", "quiescent", "cells", "properties", "." ] } ]
PMC7338939
To determine DAPT effectiveness, the killing factor for all nine mice, shown in Table 3, was calculated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "determine", "DAPT", "effectiveness", ",", "the", "killing", "factor", "for", "all", "nine", "mice", ",", "shown", "in", "Table", "3", ",", "was", "calculated", "." ] } ]
PMC2196094
The processed proteolytically active RMCP-5 is a basic protein with a net charge of +14.1 (Arg + Lys = 29; Asp + Glu = 16). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "processed", "proteolytically", "active", "RMCP-5", "is", "a", "basic", "protein", "with", "a", "net", "charge", "of", "+", "14.1", "(", "Arg", "+", "Lys", "=", "29", ";", "Asp", "+", "Glu", "=", "16", ")", ".", "(" ] } ]
PMC11687663
All the parameters are in favour towards the Quercetin (B12) to choose as best anti-cancer agent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "the", "parameters", "are", "in", "favour", "towards", "the", "Quercetin", "(", "B12", ")", "to", "choose", "as", "best", "anti-cancer", "agent", "." ] } ]
PMC2193049
Expression of a minigene product in transfected cells has been difficult to assess by means other than functional assays.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Expression", "of", "a", "minigene", "product", "in", "transfected", "cells", "has", "been", "difficult", "to", "assess", "by", "means", "other", "than", "functional", "assays", "." ] } ]
PMC11026382
First, in the TYMS R166Q context, there are very few deleterious mutations.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "First", ",", "in", "the", "TYMS", "R166Q", "context", ",", "there", "are", "very", "few", "deleterious", "mutations", "." ] } ]
PMC8592717
PAL—a natural, water-soluble phenolic aldehyde (Figure 1)—is also a naturally occurring compound resulting from phenolic acids' degradation .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PAL", "—", "a", "natural", ",", "water-soluble", "phenolic", "aldehyde", "(", "Figure", "1)—is", "also", "a", "naturally", "occurring", "compound", "resulting", "from", "phenolic", "acids", "'", "degradation", "." ] } ]
PMC11310713
Sp increases with thinner trabecular bone, generating greater cavities in the bone.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Sp", "increases", "with", "thinner", "trabecular", "bone", ",", "generating", "greater", "cavities", "in", "the", "bone", "." ] } ]
PMC9429973
Overall, patients received ruxolitinib for a median of 11.1 months with median dose intensity of 28.7 mg/day.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Overall", ",", "patients", "received", "ruxolitinib", "for", "a", "median", "of", "11.1", "months", "with", "median", "dose", "intensity", "of", "28.7", "mg/day", "." ] } ]
PMC10996034
DEGs were screened from common genes with |log2(Fold Change)|≥1 and Padj<0.01.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DEGs", "were", "screened", "from", "common", "genes", "with", "|log2(Fold", "Change)|≥1", "and", "Padj<0.01", "." ] } ]
PMC11004721
All the authors agree with the publication of this corrigendum, and are grateful to the Editor of Oncology Reports for allowing them the opportunity to publish this.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "the", "authors", "agree", "with", "the", "publication", "of", "this", "corrigendum", ",", "and", "are", "grateful", "to", "the", "Editor", "of", "Oncology", "Reports", "for", "allowing", "them", "the", "opportunity", "to", "publish", "this", "." ] } ]
PMC11539788
The IHC analysis was conducted as previously described .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "IHC", "analysis", "was", "conducted", "as", "previously", "described", "." ] } ]
PMC11546117
The hMEC in vitro model showed higher bidirectional apparent permeability for propranolol compared to atenolol, confirming the ability to distinguish between passive paracellular and transcellular transport routes (Figure 5, Table 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "hMEC", "in", "vitro", "model", "showed", "higher", "bidirectional", "apparent", "permeability", "for", "propranolol", "compared", "to", "atenolol", ",", "confirming", "the", "ability", "to", "distinguish", "between", "passive", "paracellular", "and", "transcellular", "transport", "routes", "(", "Figure", "5", ",", "Table", "1", ")", "." ] } ]
PMC11806106
Several attempts to create a MOR-based sensor have been made, for example, based on the well-established so-called dLight sensors for the dopamine D1 receptor.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Several", "attempts", "to", "create", "a", "MOR-based", "sensor", "have", "been", "made", ",", "for", "example", ",", "based", "on", "the", "well-established", "so-called", "dLight", "sensors", "for", "the", "dopamine", "D1", "receptor", "." ] } ]
PMC11306331
Quantification of illumination at the sample using a light meter (ThorLabs PM200) revealed 450 nm intensities of ~200 mW/cm (standard illumination) and 30 mW/cm (low intensity).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quantification", "of", "illumination", "at", "the", "sample", "using", "a", "light", "meter", "(", "ThorLabs", "PM200", ")", "revealed", "450", "nm", "intensities", "of", "~200", "mW/cm", "(", "standard", "illumination", ")", "and", "30", "mW/cm", "(", "low", "intensity", ")", "." ] } ]
PMC11711127
However, these intrinsic processes are calibrated to work with APCs and Tregs, that set levels for signals 1–4.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "these", "intrinsic", "processes", "are", "calibrated", "to", "work", "with", "APCs", "and", "Tregs", ",", "that", "set", "levels", "for", "signals", "1–4", "." ] } ]
PMC9727330
Interestingly, NNDAsp showed competitive inhibition of ASNS protein expression, in almost 3% of stained cancer cells, compared to 18% and 35% of untreated cells and cells pre-treated with Asp, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "NNDAsp", "showed", "competitive", "inhibition", "of", "ASNS", "protein", "expression", ",", "in", "almost", "3", "%", "of", "stained", "cancer", "cells", ",", "compared", "to", "18", "%", "and", "35", "%", "of", "untreated", "cells", "and", "cells", "pre-treated", "with", "Asp", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC10243817
These studies demonstrated that TGF-β2/TGF-βR3 signaling primarily regulated biological processes such as ECM production and organization in nasal epithelial cells, and expression of COL1A1, COL4A1, COL4A2, and COL5A1 was a prominent effect.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "studies", "demonstrated", "that", "TGF-β2/TGF-βR3", "signaling", "primarily", "regulated", "biological", "processes", "such", "as", "ECM", "production", "and", "organization", "in", "nasal", "epithelial", "cells", ",", "and", "expression", "of", "COL1A1", ",", "COL4A1", ",", "COL4A2", ",", "and", "COL5A1", "was", "a", "prominent", "effect", "." ] } ]
PMC11190062
FlowJo version 10 (TreeStar, Ashland, OR, USA) was used to gate BrdU positive cell fractions of live cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FlowJo", "version", "10", "(", "TreeStar", ",", "Ashland", ",", "OR", ",", "USA", ")", "was", "used", "to", "gate", "BrdU", "positive", "cell", "fractions", "of", "live", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
The cumulative incidence of EBV and BK-virus associated hemorrhagic cystitis between the three groups were no statistically significant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cumulative", "incidence", "of", "EBV", "and", "BK-virus", "associated", "hemorrhagic", "cystitis", "between", "the", "three", "groups", "were", "no", "statistically", "significant", "." ] } ]
PMC11371747
Cells were stained with the SRB protein dye (0.4% (w/v) in 1% acetic acid.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "stained", "with", "the", "SRB", "protein", "dye", "(", "0.4", "%", "(", "w/v", ")", "in", "1", "%", "acetic", "acid", "." ] } ]
PMC11696576
In line with this, a separate study showed that ASB14780 reduced AA levels and inhibited the growth of triple-negative breast cancer xenografts, dependent on the oncogenic activity of PI3KCA and restricted dietary AA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "line", "with", "this", ",", "a", "separate", "study", "showed", "that", "ASB14780", "reduced", "AA", "levels", "and", "inhibited", "the", "growth", "of", "triple-negative", "breast", "cancer", "xenografts", ",", "dependent", "on", "the", "oncogenic", "activity", "of", "PI3KCA", "and", "restricted", "dietary", "AA", "." ] } ]
PMC11025866
All RT-qPCR reactions were carried out on at least three biological replicates.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "RT-qPCR", "reactions", "were", "carried", "out", "on", "at", "least", "three", "biological", "replicates", "." ] } ]
PMC11420784
UPEC utilizes outer membrane phospholipase PldA to disrupt fusiform vesicle membrane , escaping into BEC cytosol to evade toll-like receptor 4 (TLR4)-mediated exocytosis .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "UPEC", "utilizes", "outer", "membrane", "phospholipase", "PldA", "to", "disrupt", "fusiform", "vesicle", "membrane", ",", "escaping", "into", "BEC", "cytosol", "to", "evade", "toll-like", "receptor", "4", "(TLR4)-mediated", "exocytosis", "." ] } ]
PMC11064533
Post-translational modification, protein turnover, and chaperons were upregulated in clumps, but the expression varied in E. coli K-12 but was the opposite in the cases of symptomatic bacteriuria E. coli and ocular E. coli (45–48).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Post-translational", "modification", ",", "protein", "turnover", ",", "and", "chaperons", "were", "upregulated", "in", "clumps", ",", "but", "the", "expression", "varied", "in", "E.", "coli", "K-12", "but", "was", "the", "opposite", "in", "the", "cases", "of", "symptomatic", "bacteriuria", "E.", "coli", "and", "ocular", "E.", "coli", "(", "45–48", ")", "." ] } ]
PMC4659567
Since the used mixture of solvents was similar to that one used for in vitro cytotoxicity testing (0.1% DMF in RPMI-1640 medium), it can be anticipated that similar processes proceeded within the performed biological testing, altogether resulting in inactivity of the studied complexes against the used human cancer cell line.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "the", "used", "mixture", "of", "solvents", "was", "similar", "to", "that", "one", "used", "for", "in", "vitro", "cytotoxicity", "testing", "(", "0.1", "%", "DMF", "in", "RPMI-1640", "medium", ")", ",", "it", "can", "be", "anticipated", "that", "similar", "processes", "proceeded", "within", "the", "performed", "biological", "testing", ",", "altogether", "resulting", "in", "inactivity", "of", "the", "studied", "complexes", "against", "the", "used", "human", "cancer", "cell", "line", "." ] } ]
PMC11659921
Transcriptional data and clinical information for 376 OV cases and 180 normal tissues were obtained from The Cancer Genome Atlas (TCGA, https://portal.gdc.cancer.gov/).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transcriptional", "data", "and", "clinical", "information", "for", "376", "OV", "cases", "and", "180", "normal", "tissues", "were", "obtained", "from", "The", "Cancer", "Genome", "Atlas", "(", "TCGA", ",", "https://portal.gdc.cancer.gov/", ")", "." ] } ]
PMC11317131
This is expected to reduce the amount of epegRNA available for PE as well as reduce the number of donor plasmids available for integrase insertion.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "is", "expected", "to", "reduce", "the", "amount", "of", "epegRNA", "available", "for", "PE", "as", "well", "as", "reduce", "the", "number", "of", "donor", "plasmids", "available", "for", "integrase", "insertion", "." ] } ]
PMC11607321
Confidence intervals of 95% are displayed for the regression lines in panels d, e, and f. Box-and-whisker plots show 1.5× interquartile ranges, centers indicate medians in panels e and f. a Distribution of proteomics cancer cell lines correlation with an independent dataset (CCLE) grouped by whether the cancer cell line had proteomic data for the model training (orange, n = 291) versus cell lines without any proteomics prior (light blue, n = 78).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Confidence", "intervals", "of", "95", "%", "are", "displayed", "for", "the", "regression", "lines", "in", "panels", "d", ",", "e", ",", "and", "f.", "Box-and-whisker", "plots", "show", "1.5", "×", "interquartile", "ranges", ",", "centers", "indicate", "medians", "in", "panels", "e", "and", "f.", "a", "Distribution", "of", "proteomics", "cancer", "cell", "lines", "correlation", "with", "an", "independent", "dataset", "(", "CCLE", ")", "grouped", "by", "whether", "the", "cancer", "cell", "line", "had", "proteomic", "data", "for", "the", "model", "training", "(", "orange", ",", "n", "=", "291", ")", "versus", "cell", "lines", "without", "any", "proteomics", "prior", "(", "light", "blue", ",", "n", "=", "78", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Results: Seventeen patients with a median age of 57.5 years (46-72) were treated with CPX-351: 13 with newly diagnosed AML (11 MRC-AML and 2 t-AML) and 4 patients who relapsed after a previous HSCT and who acquired novel cytogenetic abnormalities (2 complex karyotypes, CK).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "Seventeen", "patients", "with", "a", "median", "age", "of", "57.5", "years", "(", "46", "-", "72", ")", "were", "treated", "with", "CPX-351", ":", "13", "with", "newly", "diagnosed", "AML", "(", "11", "MRC-AML", "and", "2", "t-AML", ")", "and", "4", "patients", "who", "relapsed", "after", "a", "previous", "HSCT", "and", "who", "acquired", "novel", "cytogenetic", "abnormalities", "(", "2", "complex", "karyotypes", ",", "CK", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Secondary endpoints include dose-limiting toxicities (part 2 only), objective response rate, duration of response, progression-free survival, overall survival, minimal residual disease negativity rate, safety, and pharmacokinetics.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Secondary", "endpoints", "include", "dose-limiting", "toxicities", "(", "part", "2", "only", ")", ",", "objective", "response", "rate", ",", "duration", "of", "response", ",", "progression-free", "survival", ",", "overall", "survival", ",", "minimal", "residual", "disease", "negativity", "rate", ",", "safety", ",", "and", "pharmacokinetics", "." ] } ]
PMC11407042
A549 cells and P. aeruginosa co-culture medium Note: Do not add antibiotics to the co-culture medium.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A549", "cells", "and", "P.", "aeruginosa", "co-culture", "medium", "Note", ":", "Do", "not", "add", "antibiotics", "to", "the", "co-culture", "medium", "." ] } ]
PMC9429973
We further found that NPM1c acts in collaboration with the MLL1 complex and define the mechanism by which MLL1-Menin small molecule inhibitors produce clinical responses in patients with NPM1-mutated AML.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "further", "found", "that", "NPM1c", "acts", "in", "collaboration", "with", "the", "MLL1", "complex", "and", "define", "the", "mechanism", "by", "which", "MLL1-Menin", "small", "molecule", "inhibitors", "produce", "clinical", "responses", "in", "patients", "with", "NPM1-mutated", "AML", "." ] } ]
PMC10631132
All cells were counterstained for 15 min with 4′,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) (R&D Systems, Minneapolis, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "cells", "were", "counterstained", "for", "15", "min", "with", "4′,6-diamidino-2-phenylindole", "(", "DAPI", ")", "(", "R&D", "Systems", ",", "Minneapolis", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11055443
The apoptosis rate of Caco-2 cells treated with secretome and V. cholerae was also % 33.22 ± 2.86 which showed a significant decrease of 12.36% in comparison with Caco-2 cells treated with V. cholerae alone (P <0.0001).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "apoptosis", "rate", "of", "Caco-2", "cells", "treated", "with", "secretome", "and", "V.", "cholerae", "was", "also", "%", "33.22", "±", "2.86", "which", "showed", "a", "significant", "decrease", "of", "12.36", "%", "in", "comparison", "with", "Caco-2", "cells", "treated", "with", "V.", "cholerae", "alone", "(", "P", "<", "0.0001", ")", "." ] } ]
PMC11013014
M.p.
[ { "tags": [ "O", "O" ], "tokens": [ "M.p", "." ] } ]
PMC7229095
Cell-specific productivity (Qp) is calculated based on the growth rate (μ) and the volumetric productivity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell-specific", "productivity", "(", "Qp", ")", "is", "calculated", "based", "on", "the", "growth", "rate", "(", "μ", ")", "and", "the", "volumetric", "productivity", "." ] } ]
PMC11085211
GISTs are rare mesenchymal neoplasms caused by a gain of function mutation in KIT or PDGFRα, two tyrosine kinase receptors (TKRs).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GISTs", "are", "rare", "mesenchymal", "neoplasms", "caused", "by", "a", "gain", "of", "function", "mutation", "in", "KIT", "or", "PDGFRα", ",", "two", "tyrosine", "kinase", "receptors", "(", "TKRs", ")", "." ] } ]
PMC9429973
At the DCO, the median duration of response (DoR) was not reached, and the longest DoR was > 14 months.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "the", "DCO", ",", "the", "median", "duration", "of", "response", "(", "DoR", ")", "was", "not", "reached", ",", "and", "the", "longest", "DoR", "was", ">", "14", "months", "." ] } ]
PMC11718109
D Quantification of the overlapping signal punctas between synapsin/VMAT2, synapsin/VGLUT2 and VGLUT2/VMAT2 represented as mean ± SD, pooled from two independent experiments (n ≥ 5 cells per experiment).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", "Quantification", "of", "the", "overlapping", "signal", "punctas", "between", "synapsin/VMAT2", ",", "synapsin/VGLUT2", "and", "VGLUT2/VMAT2", "represented", "as", "mean", "±", "SD", ",", "pooled", "from", "two", "independent", "experiments", "(", "n", "≥", "5", "cells", "per", "experiment", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Compared with the control group, paeoniflorin could significantly improve cell viability and mitophagy level in BIPN cell model, and improved the damage to mitochondria. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Compared", "with", "the", "control", "group", ",", "paeoniflorin", "could", "significantly", "improve", "cell", "viability", "and", "mitophagy", "level", "in", "BIPN", "cell", "model", ",", "and", "improved", "the", "damage", "to", "mitochondria", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
Pts who received R-ICE might have been intended to proceed to HDCT/HSCT but did not due to lack of response to R-ICE.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pts", "who", "received", "R-ICE", "might", "have", "been", "intended", "to", "proceed", "to", "HDCT/HSCT", "but", "did", "not", "due", "to", "lack", "of", "response", "to", "R-ICE", "." ] } ]