PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC9895440 | Bottom row: example images of CD28-EGFP (n = 6) or TCRz-EGFP (n = 5) fusion proteins, or anti-CD45 (n = 6) and SNX9 in Teff. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Bottom",
"row",
":",
"example",
"images",
"of",
"CD28-EGFP",
"(",
"n",
"=",
"6",
")",
"or",
"TCRz-EGFP",
"(",
"n",
"=",
"5",
")",
"fusion",
"proteins",
",",
"or",
"anti-CD45",
"(",
"n",
"=",
"6",
")",
"and",
"SNX9",
"in",
"Teff",
"."
]
}
] |
PMC7887261 | It should be noted however that our study still has limited power to detect association for ultra-rare variants and those candidates (16/25) that could not be assessed in the validation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"should",
"be",
"noted",
"however",
"that",
"our",
"study",
"still",
"has",
"limited",
"power",
"to",
"detect",
"association",
"for",
"ultra-rare",
"variants",
"and",
"those",
"candidates",
"(",
"16/25",
")",
"that",
"could",
"not",
"be",
"assessed",
"in",
"the",
"validation",
"."
]
}
] |
PMC11247842 | 2Results for meta-analyses using MR-MEGA approach . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"2Results",
"for",
"meta-analyses",
"using",
"MR-MEGA",
"approach",
"."
]
}
] |
PMC11739484 | Kaplan–Meier survival curves were constructed for survival analysis, with hazard ratios (HR) and 95% confidence intervals (CI) computed using Cox proportional hazards models. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Kaplan",
"–",
"Meier",
"survival",
"curves",
"were",
"constructed",
"for",
"survival",
"analysis",
",",
"with",
"hazard",
"ratios",
"(",
"HR",
")",
"and",
"95",
"%",
"confidence",
"intervals",
"(",
"CI",
")",
"computed",
"using",
"Cox",
"proportional",
"hazards",
"models",
"."
]
}
] |
PMC11794568 | This dual role makes mitochondrial biogenesis an important direction in cancer research with potential therapeutic value. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"dual",
"role",
"makes",
"mitochondrial",
"biogenesis",
"an",
"important",
"direction",
"in",
"cancer",
"research",
"with",
"potential",
"therapeutic",
"value",
"."
]
}
] |
PMC11144200 | Doxorubicin’s antitumor effectiveness may be constrained with ineffective tumor penetration, systemic adverse effects, as well as drug resistance. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Doxorubicin",
"’s",
"antitumor",
"effectiveness",
"may",
"be",
"constrained",
"with",
"ineffective",
"tumor",
"penetration",
",",
"systemic",
"adverse",
"effects",
",",
"as",
"well",
"as",
"drug",
"resistance",
"."
]
}
] |
PMC11731161 | E and F Representative immunoblotting images of Co-IP assays reveal that endogenous USP7 interacts with XPO1 in NCI-H929 and MM.1S cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"E",
"and",
"F",
"Representative",
"immunoblotting",
"images",
"of",
"Co-IP",
"assays",
"reveal",
"that",
"endogenous",
"USP7",
"interacts",
"with",
"XPO1",
"in",
"NCI-H929",
"and",
"MM.1S",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Exploratory endpoints included natural killer (NK) cell, T-cell, and B-cell count in peripheral blood. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Exploratory",
"endpoints",
"included",
"natural",
"killer",
"(",
"NK",
")",
"cell",
",",
"T-cell",
",",
"and",
"B-cell",
"count",
"in",
"peripheral",
"blood",
"."
]
}
] |
PMC11764090 | An increase in extreme weather will amplify the impact of cold stress on agricultural production. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"An",
"increase",
"in",
"extreme",
"weather",
"will",
"amplify",
"the",
"impact",
"of",
"cold",
"stress",
"on",
"agricultural",
"production",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Image: Summary/Conclusion: Iron chelation was required in 13% of patients with CHAs, mostly among CDAs and enzyme defects, independently from transfusion requirements. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Image",
":",
"Summary/Conclusion",
":",
"Iron",
"chelation",
"was",
"required",
"in",
"13",
"%",
"of",
"patients",
"with",
"CHAs",
",",
"mostly",
"among",
"CDAs",
"and",
"enzyme",
"defects",
",",
"independently",
"from",
"transfusion",
"requirements",
"."
]
}
] |
PMC11536589 | We analyzed the active β-catenin levels between the MRTX1133-resistant PDAC cells and parental PDAC cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"analyzed",
"the",
"active",
"β-catenin",
"levels",
"between",
"the",
"MRTX1133-resistant",
"PDAC",
"cells",
"and",
"parental",
"PDAC",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC10944868 | It is interesting to note that all compounds show excellent BBB parameters. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"is",
"interesting",
"to",
"note",
"that",
"all",
"compounds",
"show",
"excellent",
"BBB",
"parameters",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Studies suggest that polymorphisms in the FAS gene may affect cancer risk. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Studies",
"suggest",
"that",
"polymorphisms",
"in",
"the",
"FAS",
"gene",
"may",
"affect",
"cancer",
"risk",
"."
]
}
] |
PMC11319300 | To determine chromatin state and sequence conservation of the MYEOV-3′-putative enhancer, we obtained ChIP-seq data for the five major regulatory histone marks including H3K4me1, H3K4me3, H3K27ac, H3K27me3, and H3K36me3, combined with ATAC-seq in lymphoblastoid cell lines of five primate species (human, chimpanzee, gorilla, orangutan and macaque) (García-Pérez et al., 2021); see details in Supplementary Table S1. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"determine",
"chromatin",
"state",
"and",
"sequence",
"conservation",
"of",
"the",
"MYEOV-3′-putative",
"enhancer",
",",
"we",
"obtained",
"ChIP-seq",
"data",
"for",
"the",
"five",
"major",
"regulatory",
"histone",
"marks",
"including",
"H3K4me1",
",",
"H3K4me3",
",",
"H3K27ac",
",",
"H3K27me3",
",",
"and",
"H3K36me3",
",",
"combined",
"with",
"ATAC-seq",
"in",
"lymphoblastoid",
"cell",
"lines",
"of",
"five",
"primate",
"species",
"(",
"human",
",",
"chimpanzee",
",",
"gorilla",
",",
"orangutan",
"and",
"macaque",
")",
"(",
"García-Pérez",
"et",
"al.",
",",
"2021",
")",
";",
"see",
"details",
"in",
"Supplementary",
"Table",
"S1",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | She presented with prolonged PT and aPTT measurements, which corrected after incubation with normal plasma. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"She",
"presented",
"with",
"prolonged",
"PT",
"and",
"aPTT",
"measurements",
",",
"which",
"corrected",
"after",
"incubation",
"with",
"normal",
"plasma",
"."
]
}
] |
PMC9592219 | The mRNA expression and clinical data were obtained from the Cancer Genome Atlas (TCGA) liver cancer dataset (https://www.proteinatlas.org/). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"mRNA",
"expression",
"and",
"clinical",
"data",
"were",
"obtained",
"from",
"the",
"Cancer",
"Genome",
"Atlas",
"(",
"TCGA",
")",
"liver",
"cancer",
"dataset",
"(",
"https://www.proteinatlas.org/",
")",
"."
]
}
] |
PMC10551595 | Moreover, GinA mediated increased mRNA expression levels of Caspases9, 3, and 8 in CCRF‐CEM cells (Figure 5A). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Moreover",
",",
"GinA",
"mediated",
"increased",
"mRNA",
"expression",
"levels",
"of",
"Caspases9",
",",
"3",
",",
"and",
"8",
"in",
"CCRF‐CEM",
"cells",
"(",
"Figure",
"5A",
")",
"."
]
}
] |
PMC8592717 | Post-treatment of PAL in the mouse model of PD showed that it improved the behavioral deficits and protected against dopaminergic neuronal loss . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Post-treatment",
"of",
"PAL",
"in",
"the",
"mouse",
"model",
"of",
"PD",
"showed",
"that",
"it",
"improved",
"the",
"behavioral",
"deficits",
"and",
"protected",
"against",
"dopaminergic",
"neuronal",
"loss",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | No grade 3-4 infusion reactions were observed in any case. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"No",
"grade",
"3",
"-",
"4",
"infusion",
"reactions",
"were",
"observed",
"in",
"any",
"case",
"."
]
}
] |
PMC7841067 | The results of the Western blot analysis indicated that the protein expression of AKAP4 was significantly decreased in ACT-1 cells transfected with sh-AKAP4 (Fig. 2A). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"results",
"of",
"the",
"Western",
"blot",
"analysis",
"indicated",
"that",
"the",
"protein",
"expression",
"of",
"AKAP4",
"was",
"significantly",
"decreased",
"in",
"ACT-1",
"cells",
"transfected",
"with",
"sh-AKAP4",
"(",
"Fig.",
"2A",
")",
"."
]
}
] |
PMC11742290 | Overcoming chemoresistance in cancers with high LGR5 expression likely requires targeting both LGR5 + and LGR5- cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Overcoming",
"chemoresistance",
"in",
"cancers",
"with",
"high",
"LGR5",
"expression",
"likely",
"requires",
"targeting",
"both",
"LGR5",
"+",
"and",
"LGR5-",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11791432 | ANXA1 exhibits elevated expression levels in various types of tumors, such as pancreatic cancer , breast cancer , and renal clear cell carcinoma . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ANXA1",
"exhibits",
"elevated",
"expression",
"levels",
"in",
"various",
"types",
"of",
"tumors",
",",
"such",
"as",
"pancreatic",
"cancer",
",",
"breast",
"cancer",
",",
"and",
"renal",
"clear",
"cell",
"carcinoma",
"."
]
}
] |
PMC11407042 | CRITICAL: Cells must undergo 2–3 times passages before conducting infection experiments. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CRITICAL",
":",
"Cells",
"must",
"undergo",
"2–3",
"times",
"passages",
"before",
"conducting",
"infection",
"experiments",
"."
]
}
] |
PMC2118063 | qPCR analyses of gene transcripts in comparisons of NFS-202 cells with an inactive siRNA (closed bar) or with active siRNA #2 and #5 (open and shaded bars, respectively). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"qPCR",
"analyses",
"of",
"gene",
"transcripts",
"in",
"comparisons",
"of",
"NFS-202",
"cells",
"with",
"an",
"inactive",
"siRNA",
"(",
"closed",
"bar",
")",
"or",
"with",
"active",
"siRNA",
"#",
"2",
"and",
"#",
"5",
"(",
"open",
"and",
"shaded",
"bars",
",",
"respectively",
")",
"."
]
}
] |
PMC11486946 | Furthermore, EGFR was internalized in the cells treated with the five compounds without EGF, as shown in timelapse TIRF images (Fig. 4d and Supplementary movie 3) and by quantification (Fig. 4e). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"EGFR",
"was",
"internalized",
"in",
"the",
"cells",
"treated",
"with",
"the",
"five",
"compounds",
"without",
"EGF",
",",
"as",
"shown",
"in",
"timelapse",
"TIRF",
"images",
"(",
"Fig.",
"4d",
"and",
"Supplementary",
"movie",
"3",
")",
"and",
"by",
"quantification",
"(",
"Fig.",
"4e",
")",
"."
]
}
] |
PMC8382973 | We targeted the V3–V4 hypervariable region of the bacterial 16S rRNA gene. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"targeted",
"the",
"V3–V4",
"hypervariable",
"region",
"of",
"the",
"bacterial",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Inter-individual variation in fetal hemoglobin (HbF) expression is a known and potentially heritable modifier of SCD severity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Inter-individual",
"variation",
"in",
"fetal",
"hemoglobin",
"(",
"HbF",
")",
"expression",
"is",
"a",
"known",
"and",
"potentially",
"heritable",
"modifier",
"of",
"SCD",
"severity",
"."
]
}
] |
PMC11731161 | MM cell lines were cultured in RPMI-1640 medium (Hyclone, USA) containing 10% fetal bovine serum (Bovogen, Australia) and supplemented with 1% penicillin/streptomycin and 1% L-glutamine. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MM",
"cell",
"lines",
"were",
"cultured",
"in",
"RPMI-1640",
"medium",
"(",
"Hyclone",
",",
"USA",
")",
"containing",
"10",
"%",
"fetal",
"bovine",
"serum",
"(",
"Bovogen",
",",
"Australia",
")",
"and",
"supplemented",
"with",
"1",
"%",
"penicillin/streptomycin",
"and",
"1",
"%",
"L-glutamine",
"."
]
}
] |
PMC11768927 | This showed the potential synergy of combining VSV with IKK-β inhibitors for cancer treatment to overcome antiviral resistance. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"showed",
"the",
"potential",
"synergy",
"of",
"combining",
"VSV",
"with",
"IKK-β",
"inhibitors",
"for",
"cancer",
"treatment",
"to",
"overcome",
"antiviral",
"resistance",
"."
]
}
] |
PMC11574029 | To elucidate the expression of Notch family receptors (NOTCH1-NOTCH4) in BLCA, we analyzed BLCA cohorts from the GEO (GSE13507 and GSE37815). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"elucidate",
"the",
"expression",
"of",
"Notch",
"family",
"receptors",
"(",
"NOTCH1-NOTCH4",
")",
"in",
"BLCA",
",",
"we",
"analyzed",
"BLCA",
"cohorts",
"from",
"the",
"GEO",
"(",
"GSE13507",
"and",
"GSE37815",
")",
"."
]
}
] |
PMC9412887 | Secondly, biodegradable amphiphilic polymer and C16-CisPt-Suc (a Pt (IV) prodrug) were mixed to form Pt-nanoparticles (Pt-NPs). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Secondly",
",",
"biodegradable",
"amphiphilic",
"polymer",
"and",
"C16-CisPt-Suc",
"(",
"a",
"Pt",
"(",
"IV",
")",
"prodrug",
")",
"were",
"mixed",
"to",
"form",
"Pt-nanoparticles",
"(",
"Pt-NPs",
")",
"."
]
}
] |
PMC11513011 | In general, Ras mutant cancer cells are highly resistant to most chemotherapy, but our study showed that Ras mutations may confer sensitivity to DIB, thus meeting a large unmet needs . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"general",
",",
"Ras",
"mutant",
"cancer",
"cells",
"are",
"highly",
"resistant",
"to",
"most",
"chemotherapy",
",",
"but",
"our",
"study",
"showed",
"that",
"Ras",
"mutations",
"may",
"confer",
"sensitivity",
"to",
"DIB",
",",
"thus",
"meeting",
"a",
"large",
"unmet",
"needs",
"."
]
}
] |
PMC11021472 | To overexpress circZDHHC11, a PLC5-circ vector-based construct containing the full-length circZDHHC11 was purchased from Geneseed (Guangzhou, China). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"overexpress",
"circZDHHC11",
",",
"a",
"PLC5-circ",
"vector-based",
"construct",
"containing",
"the",
"full-length",
"circZDHHC11",
"was",
"purchased",
"from",
"Geneseed",
"(",
"Guangzhou",
",",
"China",
")",
"."
]
}
] |
PMC11656048 | A, B) The MG63 and 143B cells were co-treated with shikonin and Fer-1 after 24 h, and the cell viabilities were examined by CCK-8 assay. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
",",
"B",
")",
"The",
"MG63",
"and",
"143B",
"cells",
"were",
"co-treated",
"with",
"shikonin",
"and",
"Fer-1",
"after",
"24",
"h",
",",
"and",
"the",
"cell",
"viabilities",
"were",
"examined",
"by",
"CCK-8",
"assay",
".",
"("
]
}
] |
PMC11754094 | Whether these nCas9-based genome editing systems also generate large deletions is not clearly established. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Whether",
"these",
"nCas9-based",
"genome",
"editing",
"systems",
"also",
"generate",
"large",
"deletions",
"is",
"not",
"clearly",
"established",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | P. J. Walter, A. Schilhabel, P. Cramer, J. von Tresckow, S. Kohlscheen, K. Fischer, B. Eichhorst, S. Böttcher, M. Brüggemann, M. Kneba, M. Hallek, M. Ritgen Laboratory for Specialized Hematological Diagnostics, Medical Department II, University Hospital Schleswig-Holstein, Kiel; Department I of Internal Medicine, Center for Integrated Oncology Aachen Bonn Cologne Duesseldorf, German CLL Study Group, University Hospital Cologne, Cologne; Department of Hematology and Stem Cell Transplantation, West German Cancer Center, University Hospital Essen, University of Duisburg-Essen, Essen; Medical Department III Hematology, Oncology, Palliative Care, Center for Inner Medicine, University Hospital Rostock, Rostock, Germany Background: CD20 expression is still a controversial issue regarding its prognostic value for therapy outcome. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"P.",
"J.",
"Walter",
",",
"A.",
"Schilhabel",
",",
"P.",
"Cramer",
",",
"J.",
"von",
"Tresckow",
",",
"S.",
"Kohlscheen",
",",
"K.",
"Fischer",
",",
"B.",
"Eichhorst",
",",
"S.",
"Böttcher",
",",
"M.",
"Brüggemann",
",",
"M.",
"Kneba",
",",
"M.",
"Hallek",
",",
"M.",
"Ritgen",
"Laboratory",
"for",
"Specialized",
"Hematological",
"Diagnostics",
",",
"Medical",
"Department",
"II",
",",
"University",
"Hospital",
"Schleswig-Holstein",
",",
"Kiel",
";",
"Department",
"I",
"of",
"Internal",
"Medicine",
",",
"Center",
"for",
"Integrated",
"Oncology",
"Aachen",
"Bonn",
"Cologne",
"Duesseldorf",
",",
"German",
"CLL",
"Study",
"Group",
",",
"University",
"Hospital",
"Cologne",
",",
"Cologne",
";",
"Department",
"of",
"Hematology",
"and",
"Stem",
"Cell",
"Transplantation",
",",
"West",
"German",
"Cancer",
"Center",
",",
"University",
"Hospital",
"Essen",
",",
"University",
"of",
"Duisburg-Essen",
",",
"Essen",
";",
"Medical",
"Department",
"III",
"Hematology",
",",
"Oncology",
",",
"Palliative",
"Care",
",",
"Center",
"for",
"Inner",
"Medicine",
",",
"University",
"Hospital",
"Rostock",
",",
"Rostock",
",",
"Germany",
"Background",
":",
"CD20",
"expression",
"is",
"still",
"a",
"controversial",
"issue",
"regarding",
"its",
"prognostic",
"value",
"for",
"therapy",
"outcome",
"."
]
}
] |
PMC9786247 | Cells were cultured with advanced DMEM/Ham’s F12 nutrient mix [1:1] (Gibco, Life Technologies, Darmstadt, Germany) supplemented with Insulin-like growth factor (10 ng/mL; Peprotech, Hamburg, Germany), Fibroblast growth factor (5 ng/mL; Peprotech), Epidermal growth factor (5 ng/mL; Sigma-Aldrich, Taufkirchen, Germany), Hydrocortisone (1 µg/mL, Sigma-Aldrich), HEPES buffer 20 mM (Fisher Scientific, Schwerte, Germany) and L-Glutamine (2 mM, Life Technologies; . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"were",
"cultured",
"with",
"advanced",
"DMEM/Ham",
"’s",
"F12",
"nutrient",
"mix",
"[",
"1:1",
"]",
"(",
"Gibco",
",",
"Life",
"Technologies",
",",
"Darmstadt",
",",
"Germany",
")",
"supplemented",
"with",
"Insulin-like",
"growth",
"factor",
"(",
"10",
"ng/mL",
";",
"Peprotech",
",",
"Hamburg",
",",
"Germany",
")",
",",
"Fibroblast",
"growth",
"factor",
"(",
"5",
"ng/mL",
";",
"Peprotech",
")",
",",
"Epidermal",
"growth",
"factor",
"(",
"5",
"ng/mL",
";",
"Sigma-Aldrich",
",",
"Taufkirchen",
",",
"Germany",
")",
",",
"Hydrocortisone",
"(",
"1",
"µg/mL",
",",
"Sigma-Aldrich",
")",
",",
"HEPES",
"buffer",
"20",
"mM",
"(",
"Fisher",
"Scientific",
",",
"Schwerte",
",",
"Germany",
")",
"and",
"L-Glutamine",
"(",
"2",
"mM",
",",
"Life",
"Technologies",
";",
"."
]
}
] |
PMC8041314 | In total 1505 potential candidates resulted, from which 87 were manually selected by experience-driven decisions depending on availability and price, from which 41 were ordered from ENAMINE and 23 were delivered within the purity requirement of 95%. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"total",
"1505",
"potential",
"candidates",
"resulted",
",",
"from",
"which",
"87",
"were",
"manually",
"selected",
"by",
"experience-driven",
"decisions",
"depending",
"on",
"availability",
"and",
"price",
",",
"from",
"which",
"41",
"were",
"ordered",
"from",
"ENAMINE",
"and",
"23",
"were",
"delivered",
"within",
"the",
"purity",
"requirement",
"of",
"95",
"%",
"."
]
}
] |
PMC2196094 | To determine whether cathepsin G is expressed also by rat MCs, a cDNA fragment containing the entire coding region of mouse neutrophil cathepsin G was used as probe in a Northern blot analysis of mRNA from ear and peritoneal MCs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"determine",
"whether",
"cathepsin",
"G",
"is",
"expressed",
"also",
"by",
"rat",
"MCs",
",",
"a",
"cDNA",
"fragment",
"containing",
"the",
"entire",
"coding",
"region",
"of",
"mouse",
"neutrophil",
"cathepsin",
"G",
"was",
"used",
"as",
"probe",
"in",
"a",
"Northern",
"blot",
"analysis",
"of",
"mRNA",
"from",
"ear",
"and",
"peritoneal",
"MCs",
"."
]
}
] |
PMC11291490 | For instance, genes such as IRF3 and CD20 are notably absent in avian species. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"instance",
",",
"genes",
"such",
"as",
"IRF3",
"and",
"CD20",
"are",
"notably",
"absent",
"in",
"avian",
"species",
"."
]
}
] |
PMC11746942 | Finally, the sections were dehydrated, cleared in xylene, and mounted. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Finally",
",",
"the",
"sections",
"were",
"dehydrated",
",",
"cleared",
"in",
"xylene",
",",
"and",
"mounted",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Prior treatment with ruxolitinib was reported in 83% (74/89); 46% had also received at least 1 additional treatment. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Prior",
"treatment",
"with",
"ruxolitinib",
"was",
"reported",
"in",
"83",
"%",
"(",
"74/89",
")",
";",
"46",
"%",
"had",
"also",
"received",
"at",
"least",
"1",
"additional",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Sub-trials may not start at the same time and may be added by a substantial amendment to the master. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Sub-trials",
"may",
"not",
"start",
"at",
"the",
"same",
"time",
"and",
"may",
"be",
"added",
"by",
"a",
"substantial",
"amendment",
"to",
"the",
"master",
"."
]
}
] |
PMC11731614 | Additionally, two differentially expressed microRNAs suggested altered keratinocyte-to-neuron communication (Fig. 4F-G). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additionally",
",",
"two",
"differentially",
"expressed",
"microRNAs",
"suggested",
"altered",
"keratinocyte-to-neuron",
"communication",
"(",
"Fig.",
"4F-G",
")",
"."
]
}
] |
PMC11240448 | A third basal BC group consists of only one cell line, HCC2157, whose primary, immediate oncogenic driver is STAT3. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"third",
"basal",
"BC",
"group",
"consists",
"of",
"only",
"one",
"cell",
"line",
",",
"HCC2157",
",",
"whose",
"primary",
",",
"immediate",
"oncogenic",
"driver",
"is",
"STAT3",
"."
]
}
] |
PMC11519077 | After 48 h, gene expression levels were analyzed using real-time PCR, and the data were statistically evaluated using T-tests, U-Mann–Whitney, and Tukey's post hoc analyses. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"48",
"h",
",",
"gene",
"expression",
"levels",
"were",
"analyzed",
"using",
"real-time",
"PCR",
",",
"and",
"the",
"data",
"were",
"statistically",
"evaluated",
"using",
"T-tests",
",",
"U-Mann",
"–",
"Whitney",
",",
"and",
"Tukey",
"'s",
"post",
"hoc",
"analyses",
"."
]
}
] |
PMC7987994 | The ISO standard describes so-called exaggerated conditions. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"ISO",
"standard",
"describes",
"so-called",
"exaggerated",
"conditions",
"."
]
}
] |
PMC11594588 | Platelets are activated during the adhesive events of primary homeostasis and initiation of the blood-clotting cascades. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Platelets",
"are",
"activated",
"during",
"the",
"adhesive",
"events",
"of",
"primary",
"homeostasis",
"and",
"initiation",
"of",
"the",
"blood-clotting",
"cascades",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | We also estimated the penetrance of pathogenic DDX41 germline variants for the development of MNs. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"also",
"estimated",
"the",
"penetrance",
"of",
"pathogenic",
"DDX41",
"germline",
"variants",
"for",
"the",
"development",
"of",
"MNs",
"."
]
}
] |
PMC11791264 | E, HEK293T cells were co-transfected with HA-tagged ETD7, empty vector pCMV3-N-HA (HA), FLAG-tagged Ub, and MYC-tagged LC3B WT or K51M mutant in the presence of 10 μM MG132 for 10 h. The ubiquitination of LC3B was determined by anti-MYC immunoprecipitation followed by Western blot with anti-FLAG antibody. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"E",
",",
"HEK293",
"T",
"cells",
"were",
"co-transfected",
"with",
"HA-tagged",
"ETD7",
",",
"empty",
"vector",
"pCMV3-N-HA",
"(",
"HA",
")",
",",
"FLAG-tagged",
"Ub",
",",
"and",
"MYC-tagged",
"LC3B",
"WT",
"or",
"K51",
"M",
"mutant",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"10",
"μM",
"MG132",
"for",
"10",
"h.",
"The",
"ubiquitination",
"of",
"LC3B",
"was",
"determined",
"by",
"anti-MYC",
"immunoprecipitation",
"followed",
"by",
"Western",
"blot",
"with",
"anti-FLAG",
"antibody",
"."
]
}
] |
PMC10631132 | Both cell lines retained a certain degree of ALP expression following mesodermal differentiation using either using the EB differentiation (Fig. 2C,D,I,J) or MB differentiation protocol (Fig. 2E,F,K,L). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Both",
"cell",
"lines",
"retained",
"a",
"certain",
"degree",
"of",
"ALP",
"expression",
"following",
"mesodermal",
"differentiation",
"using",
"either",
"using",
"the",
"EB",
"differentiation",
"(",
"Fig.",
"2C",
",",
"D",
",",
"I",
",",
"J",
")",
"or",
"MB",
"differentiation",
"protocol",
"(",
"Fig.",
"2E",
",",
"F",
",",
"K",
",",
"L",
")",
"."
]
}
] |
PMC11661040 | The siRNA sequences were as follows: siCGREF1-1: 5’-ACUCUGAAGUGCAGCAUCAGCTT-3’; siCGREF1-2: 5’-GAGCUGCUGUCCAUGUUGACATT-3’; siCGREF1-3: 5’-GGGAAACACUGGAGUCUAAGATT-3’; siNC: 5’-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT − 3’. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"siRNA",
"sequences",
"were",
"as",
"follows",
":",
"siCGREF1",
"-",
"1",
":",
"5’-ACUCUGAAGUGCAGCAUCAGCTT-3",
"’",
";",
"siCGREF1",
"-",
"2",
":",
"5’-GAGCUGCUGUCCAUGUUGACATT-3",
"’",
";",
"siCGREF1",
"-",
"3",
":",
"5’-GGGAAACACUGGAGUCUAAGATT-3",
"’",
";",
"siNC",
":",
"5’-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT",
"−",
"3",
"’",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Pts were stratified by refractory status, prior therapy, prior transplant, cytogenetic risk and response (responder [≥PR] or non-responder [<PR]), and samples from each category were grouped for analysis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Pts",
"were",
"stratified",
"by",
"refractory",
"status",
",",
"prior",
"therapy",
",",
"prior",
"transplant",
",",
"cytogenetic",
"risk",
"and",
"response",
"(",
"responder",
"[",
"≥PR",
"]",
"or",
"non-responder",
"[",
"<",
"PR",
"]",
")",
",",
"and",
"samples",
"from",
"each",
"category",
"were",
"grouped",
"for",
"analysis",
"."
]
}
] |
PMC11451829 | Subconjunctival injection of fibroblasts (NIH3T3) combined with extracellular matrix can induce different grades of pterygium-like lesions throughout the follow-up period in a rabbit model. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Subconjunctival",
"injection",
"of",
"fibroblasts",
"(",
"NIH3T3",
")",
"combined",
"with",
"extracellular",
"matrix",
"can",
"induce",
"different",
"grades",
"of",
"pterygium-like",
"lesions",
"throughout",
"the",
"follow-up",
"period",
"in",
"a",
"rabbit",
"model",
"."
]
}
] |
PMC11678130 | As presented in Figure 8, the treatment of CAM with the QUE (10 µM) + 5-FU (10 µM) combination produced a reduction in the total vessel area and the number of vascular branching points compared to the control, suggesting the in ovo antiangiogenic effect of this treatment. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"presented",
"in",
"Figure",
"8",
",",
"the",
"treatment",
"of",
"CAM",
"with",
"the",
"QUE",
"(",
"10",
"µM",
")",
"+",
"5-FU",
"(",
"10",
"µM",
")",
"combination",
"produced",
"a",
"reduction",
"in",
"the",
"total",
"vessel",
"area",
"and",
"the",
"number",
"of",
"vascular",
"branching",
"points",
"compared",
"to",
"the",
"control",
",",
"suggesting",
"the",
"in",
"ovo",
"antiangiogenic",
"effect",
"of",
"this",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC11023271 | Mutations in RIPK4 were found in SCC samples, which were mostly missense mutations or targeting the functional kinase domain [12–14]. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Mutations",
"in",
"RIPK4",
"were",
"found",
"in",
"SCC",
"samples",
",",
"which",
"were",
"mostly",
"missense",
"mutations",
"or",
"targeting",
"the",
"functional",
"kinase",
"domain",
"[",
"12–14",
"]",
"."
]
}
] |
PMC8358176 | on 24-well flat-bottom plates (Nunc, Roskilde, Denmark) and exposed to the preparation of carboxylated SWCNT or MWCNT (dispersed in PBS; 100 µg. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"on",
"24-well",
"flat-bottom",
"plates",
"(",
"Nunc",
",",
"Roskilde",
",",
"Denmark",
")",
"and",
"exposed",
"to",
"the",
"preparation",
"of",
"carboxylated",
"SWCNT",
"or",
"MWCNT",
"(",
"dispersed",
"in",
"PBS",
";",
"100",
"µg",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Increase in plasma CC-99282 and degradation of Ikaros/Aiolos in peripheral T cells occurred in a dose-dependent manner, and maximum degradation (>90%) occurred by day 4 of treatment at doses ≥0.4 mg. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Increase",
"in",
"plasma",
"CC-99282",
"and",
"degradation",
"of",
"Ikaros/Aiolos",
"in",
"peripheral",
"T",
"cells",
"occurred",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
",",
"and",
"maximum",
"degradation",
"(",
">",
"90",
"%",
")",
"occurred",
"by",
"day",
"4",
"of",
"treatment",
"at",
"doses",
"≥0.4",
"mg",
"."
]
}
] |
PMC11468365 | The drug features extracted from a molecular graph are non-Euclidean features, although not translation-invariant. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"drug",
"features",
"extracted",
"from",
"a",
"molecular",
"graph",
"are",
"non-Euclidean",
"features",
",",
"although",
"not",
"translation-invariant",
"."
]
}
] |
PMC11525028 | Data are presented as the mean ± SD; ns, not significant; ∗p < 0.05, ∗∗p < 0.01, ∗∗∗p < 0.001, and ∗∗∗∗p < 0.0001, by Student’s t test (G), by one-way ANOVA with Dunnett’s multiple comparisons test (E, F, L, Q, and U), with Tukey’s multiple comparisons test (J, M, and O), and two-way ANOVA with Dunnett’s multiple comparisons test (P). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Data",
"are",
"presented",
"as",
"the",
"mean",
"±",
"SD",
";",
"ns",
",",
"not",
"significant",
";",
"∗p",
"<",
"0.05",
",",
"∗∗p",
"<",
"0.01",
",",
"∗∗∗p",
"<",
"0.001",
",",
"and",
"∗∗∗∗p",
"<",
"0.0001",
",",
"by",
"Student",
"’s",
"t",
"test",
"(",
"G",
")",
",",
"by",
"one-way",
"ANOVA",
"with",
"Dunnett",
"’s",
"multiple",
"comparisons",
"test",
"(",
"E",
",",
"F",
",",
"L",
",",
"Q",
",",
"and",
"U",
")",
",",
"with",
"Tukey",
"’s",
"multiple",
"comparisons",
"test",
"(",
"J",
",",
"M",
",",
"and",
"O",
")",
",",
"and",
"two-way",
"ANOVA",
"with",
"Dunnett",
"’s",
"multiple",
"comparisons",
"test",
"(",
"P",
")",
"."
]
}
] |
PMC11761919 | Levels of in IL-1β, IL-6, IL-8, and TNF-α in serum. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Levels",
"of",
"in",
"IL-1β",
",",
"IL-6",
",",
"IL-8",
",",
"and",
"TNF-α",
"in",
"serum",
".",
"("
]
}
] |
PMC6222726 | Their flowers are small, yellow, and densely hairy. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Their",
"flowers",
"are",
"small",
",",
"yellow",
",",
"and",
"densely",
"hairy",
"."
]
}
] |
PMC8875242 | The concentrations of grazoprevir tested in our assays could plausibly occur in the small intestine during therapy, so their effects on the intestinal absorption of ABCB1 substrates in humans warrant evaluation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"concentrations",
"of",
"grazoprevir",
"tested",
"in",
"our",
"assays",
"could",
"plausibly",
"occur",
"in",
"the",
"small",
"intestine",
"during",
"therapy",
",",
"so",
"their",
"effects",
"on",
"the",
"intestinal",
"absorption",
"of",
"ABCB1",
"substrates",
"in",
"humans",
"warrant",
"evaluation",
"."
]
}
] |
PMC11770130 | NTS has been recognized as an important peptide in the regulation of metabolic homeostasis for decades, though most studies on the functions and underlying mechanism of NTS were performed in the CNS or intestine. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"NTS",
"has",
"been",
"recognized",
"as",
"an",
"important",
"peptide",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"metabolic",
"homeostasis",
"for",
"decades",
",",
"though",
"most",
"studies",
"on",
"the",
"functions",
"and",
"underlying",
"mechanism",
"of",
"NTS",
"were",
"performed",
"in",
"the",
"CNS",
"or",
"intestine",
"."
]
}
] |
PMC11590005 | Perhaps these data justify the higher rates of prejudice related to gender and low income among the university stu-dents who participated in our study. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Perhaps",
"these",
"data",
"justify",
"the",
"higher",
"rates",
"of",
"prejudice",
"related",
"to",
"gender",
"and",
"low",
"income",
"among",
"the",
"university",
"stu-dents",
"who",
"participated",
"in",
"our",
"study",
"."
]
}
] |
PMC11626627 | Expression differences of TWIST1 in cancer and adjacent tissues in TCGA-KIRC. ( | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Expression",
"differences",
"of",
"TWIST1",
"in",
"cancer",
"and",
"adjacent",
"tissues",
"in",
"TCGA-KIRC",
".",
"("
]
}
] |
PMC11055510 | Cells were digested using 0.25 % trypsin and resuspended by centrifugation to obtain a single-cell suspension; 2 × 10 cells/well were inoculated in a 6-well plate. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"were",
"digested",
"using",
"0.25",
"%",
"trypsin",
"and",
"resuspended",
"by",
"centrifugation",
"to",
"obtain",
"a",
"single-cell",
"suspension",
";",
"2",
"×",
"10",
"cells/well",
"were",
"inoculated",
"in",
"a",
"6-well",
"plate",
"."
]
}
] |
PMC11519567 | We further show that H2AK119ub mediates SS18-SSX condensation through an acidic region (AR) of C-SSX (Fig. 3A), which was reported to interact with H2AK119ub . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"further",
"show",
"that",
"H2AK119ub",
"mediates",
"SS18-SSX",
"condensation",
"through",
"an",
"acidic",
"region",
"(",
"AR",
")",
"of",
"C-SSX",
"(",
"Fig.",
"3A",
")",
",",
"which",
"was",
"reported",
"to",
"interact",
"with",
"H2AK119ub",
"."
]
}
] |
PMC9412887 | However, there is still a long way to go when currently studied nanomedicines can be used in clinic. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"there",
"is",
"still",
"a",
"long",
"way",
"to",
"go",
"when",
"currently",
"studied",
"nanomedicines",
"can",
"be",
"used",
"in",
"clinic",
"."
]
}
] |
PMC11650848 | The diagonal line of squares in the middle is the Functional OR Genomic Element Database (FORGEdb) scores which are out of 10 and is used to predict if genetic variants are likely to be regulatory elements. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"diagonal",
"line",
"of",
"squares",
"in",
"the",
"middle",
"is",
"the",
"Functional",
"OR",
"Genomic",
"Element",
"Database",
"(",
"FORGEdb",
")",
"scores",
"which",
"are",
"out",
"of",
"10",
"and",
"is",
"used",
"to",
"predict",
"if",
"genetic",
"variants",
"are",
"likely",
"to",
"be",
"regulatory",
"elements",
"."
]
}
] |
PMC10898159 | MiRNA-218 can inhibit JAK-STAT pathway and P55PIK can promote PI3K-AKT pathway. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MiRNA-218",
"can",
"inhibit",
"JAK-STAT",
"pathway",
"and",
"P55PIK",
"can",
"promote",
"PI3K-AKT",
"pathway",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | In this study, we investigated the efficacy and safety of the combination of EPAG and CysA in LR-MDS in a non-randomized phase II investigator-initiated trial (IIT). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"investigated",
"the",
"efficacy",
"and",
"safety",
"of",
"the",
"combination",
"of",
"EPAG",
"and",
"CysA",
"in",
"LR-MDS",
"in",
"a",
"non-randomized",
"phase",
"II",
"investigator-initiated",
"trial",
"(",
"IIT",
")",
"."
]
}
] |
PMC11670954 | Numerous studies have employed LPS to establish cellular or animal models of intestinal mucosal barrier damage . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Numerous",
"studies",
"have",
"employed",
"LPS",
"to",
"establish",
"cellular",
"or",
"animal",
"models",
"of",
"intestinal",
"mucosal",
"barrier",
"damage",
"."
]
}
] |
PMC11724582 | Fig. 5CAFs downregulated the expression of YAP/TAZ in H1975 cells, and YAP1 was associated with poor prognosis in lung cancer patients. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Fig.",
"5CAFs",
"downregulated",
"the",
"expression",
"of",
"YAP/TAZ",
"in",
"H1975",
"cells",
",",
"and",
"YAP1",
"was",
"associated",
"with",
"poor",
"prognosis",
"in",
"lung",
"cancer",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC11429241 | The scaffolds were characterized with SEM, followed by biological evaluation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"scaffolds",
"were",
"characterized",
"with",
"SEM",
",",
"followed",
"by",
"biological",
"evaluation",
"."
]
}
] |
PMC3681794 | Highly significant resistance to etoposide, cisplatin and doxorubicin in hypoxia was seen in all 3 osteosarcoma cell lines, consistent with previous data showing hypoxia-induced resistance to cisplatin, doxorubicin and etoposide in a range of different tumour types. –, , , , , , , , , , , , , , | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Highly",
"significant",
"resistance",
"to",
"etoposide",
",",
"cisplatin",
"and",
"doxorubicin",
"in",
"hypoxia",
"was",
"seen",
"in",
"all",
"3",
"osteosarcoma",
"cell",
"lines",
",",
"consistent",
"with",
"previous",
"data",
"showing",
"hypoxia-induced",
"resistance",
"to",
"cisplatin",
",",
"doxorubicin",
"and",
"etoposide",
"in",
"a",
"range",
"of",
"different",
"tumour",
"types",
".",
"–",
",",
",",
",",
",",
",",
",",
",",
",",
",",
",",
",",
",",
",",
","
]
}
] |
PMC9429973 | LenM was most common, >75% (n=28).Other maintenance therapies included bortezomib n=4, daratumumab (dara)n=3 and lenalidomide + bortezomib (RV) combination n=4. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"LenM",
"was",
"most",
"common",
",",
">",
"75",
"%",
"(n=28).Other",
"maintenance",
"therapies",
"included",
"bortezomib",
"n=4",
",",
"daratumumab",
"(dara)n=3",
"and",
"lenalidomide",
"+",
"bortezomib",
"(",
"RV",
")",
"combination",
"n=4",
"."
]
}
] |
PMC11640476 | This approach focused on critical experimental parameters and data quality assessment to support result robustness and reliability while characterizing and understanding the confidence limits of the test. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"approach",
"focused",
"on",
"critical",
"experimental",
"parameters",
"and",
"data",
"quality",
"assessment",
"to",
"support",
"result",
"robustness",
"and",
"reliability",
"while",
"characterizing",
"and",
"understanding",
"the",
"confidence",
"limits",
"of",
"the",
"test",
"."
]
}
] |
PMC9516401 | Approximately 90% of all patients are known type 2 diabetes mellitus (T2DM) cases, and about 4.6 million people lost their lives due to T2DM in 2011 (Hussain and Ali, 2016 ▶). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Approximately",
"90",
"%",
"of",
"all",
"patients",
"are",
"known",
"type",
"2",
"diabetes",
"mellitus",
"(",
"T2DM",
")",
"cases",
",",
"and",
"about",
"4.6",
"million",
"people",
"lost",
"their",
"lives",
"due",
"to",
"T2DM",
"in",
"2011",
"(",
"Hussain",
"and",
"Ali",
",",
"2016",
"▶",
")",
"."
]
}
] |
PMC11718274 | The mitochondrial membrane potential integrity, ROS generation level, the expression of apoptotic and mitochondrial and oxidative stress markers were also assessed. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"mitochondrial",
"membrane",
"potential",
"integrity",
",",
"ROS",
"generation",
"level",
",",
"the",
"expression",
"of",
"apoptotic",
"and",
"mitochondrial",
"and",
"oxidative",
"stress",
"markers",
"were",
"also",
"assessed",
"."
]
}
] |
PMC11718109 | F The corresponding line-scan analysis from the inset in (E) (dotted white line) is shown for both VMAT2-GFP and VGAT-FLAG. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"F",
"The",
"corresponding",
"line-scan",
"analysis",
"from",
"the",
"inset",
"in",
"(",
"E",
")",
"(",
"dotted",
"white",
"line",
")",
"is",
"shown",
"for",
"both",
"VMAT2-GFP",
"and",
"VGAT-FLAG",
"."
]
}
] |
PMC5716223 | Immunoblot analysis of phosphorylated and total JNK in L6C5 cells at different times (15, 30 and 60 min) since NGF (20 ng/ml) supplementation. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Immunoblot",
"analysis",
"of",
"phosphorylated",
"and",
"total",
"JNK",
"in",
"L6C5",
"cells",
"at",
"different",
"times",
"(",
"15",
",",
"30",
"and",
"60",
"min",
")",
"since",
"NGF",
"(",
"20",
"ng/ml",
")",
"supplementation",
"."
]
}
] |
PMC11357960 | In anti-PD-1 immunotherapy, treatment with the PD-1 blockade interrupted the inhibitory effect mediated by PD-1/PD-L1 axis and restored activity of lymphocytes, which are the main effector cells with an anti-tumor function (19). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"anti-PD-1",
"immunotherapy",
",",
"treatment",
"with",
"the",
"PD-1",
"blockade",
"interrupted",
"the",
"inhibitory",
"effect",
"mediated",
"by",
"PD-1/PD-L1",
"axis",
"and",
"restored",
"activity",
"of",
"lymphocytes",
",",
"which",
"are",
"the",
"main",
"effector",
"cells",
"with",
"an",
"anti-tumor",
"function",
"(",
"19",
")",
"."
]
}
] |
PMC11574271 | As shown in Fig. 3G, overexpression of RON in J82-oeRON cells resulted in visible cell morphological changes. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"shown",
"in",
"Fig.",
"3",
"G",
",",
"overexpression",
"of",
"RON",
"in",
"J82-oeRON",
"cells",
"resulted",
"in",
"visible",
"cell",
"morphological",
"changes",
"."
]
}
] |
PMC11656048 | After being cultured overnight, cells were treated with different concentrations of shikonin (0, 0.25, 0.5, 1, 2, 4, 6, 8 and 10 uM) for 24 or 48 h. The optimal experimental dose and treatment time of the drug were determined based on concentration and time effects of subsequent cell experiments, with 3 wells per group. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"being",
"cultured",
"overnight",
",",
"cells",
"were",
"treated",
"with",
"different",
"concentrations",
"of",
"shikonin",
"(",
"0",
",",
"0.25",
",",
"0.5",
",",
"1",
",",
"2",
",",
"4",
",",
"6",
",",
"8",
"and",
"10",
"uM",
")",
"for",
"24",
"or",
"48",
"h.",
"The",
"optimal",
"experimental",
"dose",
"and",
"treatment",
"time",
"of",
"the",
"drug",
"were",
"determined",
"based",
"on",
"concentration",
"and",
"time",
"effects",
"of",
"subsequent",
"cell",
"experiments",
",",
"with",
"3",
"wells",
"per",
"group",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | MTVspleen was an adverse factor for OS (p=0.0103; HR: 1.36; 95% CI: 1.08-1.72) and PFS (p=0.0019; HR: 1.40; 95% CI: 1.13-1.72) in multivariate analysis. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MTVspleen",
"was",
"an",
"adverse",
"factor",
"for",
"OS",
"(",
"p=0.0103",
";",
"HR",
":",
"1.36",
";",
"95",
"%",
"CI",
":",
"1.08",
"-",
"1.72",
")",
"and",
"PFS",
"(",
"p=0.0019",
";",
"HR",
":",
"1.40",
";",
"95",
"%",
"CI",
":",
"1.13",
"-",
"1.72",
")",
"in",
"multivariate",
"analysis",
"."
]
}
] |
PMC11320834 | Both drugs were dissolved in DMSO at a final solvent concentration of 0.25% (v/v), which did not affect cell viability. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Both",
"drugs",
"were",
"dissolved",
"in",
"DMSO",
"at",
"a",
"final",
"solvent",
"concentration",
"of",
"0.25",
"%",
"(",
"v/v",
")",
",",
"which",
"did",
"not",
"affect",
"cell",
"viability",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | All episodes of infections were reported in the first 45 of myeloma diagnosis(Median 6 days; Range 0–45). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"episodes",
"of",
"infections",
"were",
"reported",
"in",
"the",
"first",
"45",
"of",
"myeloma",
"diagnosis(Median",
"6",
"days",
";",
"Range",
"0–45",
")",
"."
]
}
] |
PMC11721277 | Currently, we are developing new water-soluble derivatives of chlorin with Tc chelators, which have increased hydrophilicity. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Currently",
",",
"we",
"are",
"developing",
"new",
"water-soluble",
"derivatives",
"of",
"chlorin",
"with",
"Tc",
"chelators",
",",
"which",
"have",
"increased",
"hydrophilicity",
"."
]
}
] |
PMC9221284 | In each case, significant bands with apparent molecular weights of 67 kDa (c-Myc1), 64 kDa (c-Myc2); 55 kDa (c-MycS), 45 kDa (c-MycS1), and 43 kDa (c-MycS2) were obtained. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"each",
"case",
",",
"significant",
"bands",
"with",
"apparent",
"molecular",
"weights",
"of",
"67",
"kDa",
"(",
"c-Myc1",
")",
",",
"64",
"kDa",
"(",
"c-Myc2",
")",
";",
"55",
"kDa",
"(",
"c-MycS",
")",
",",
"45",
"kDa",
"(",
"c-MycS1",
")",
",",
"and",
"43",
"kDa",
"(",
"c-MycS2",
")",
"were",
"obtained",
"."
]
}
] |
PMC11012012 | The molecular cascade connecting SLAMF1/CD150 to the activation of autophagy relies on the accumulation of ROS, the activation of the MAP kinases, and the phosphorylation of BCL2. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"molecular",
"cascade",
"connecting",
"SLAMF1/CD150",
"to",
"the",
"activation",
"of",
"autophagy",
"relies",
"on",
"the",
"accumulation",
"of",
"ROS",
",",
"the",
"activation",
"of",
"the",
"MAP",
"kinases",
",",
"and",
"the",
"phosphorylation",
"of",
"BCL2",
"."
]
}
] |
PMC11674441 | Table 3 shows the list of neoantigens selected. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Table",
"3",
"shows",
"the",
"list",
"of",
"neoantigens",
"selected",
"."
]
}
] |
PMC11774747 | The engineering process does not promote the expansion of a single clone; rather, it adds a new receptor to an already diverse set of T cells. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"engineering",
"process",
"does",
"not",
"promote",
"the",
"expansion",
"of",
"a",
"single",
"clone",
";",
"rather",
",",
"it",
"adds",
"a",
"new",
"receptor",
"to",
"an",
"already",
"diverse",
"set",
"of",
"T",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC4685341 | It is strongly dependent on the glycan pattern of the Fc N-glycan: low core-fucose levels (= high non-fucose levels) typically result in an increased ADCC. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"is",
"strongly",
"dependent",
"on",
"the",
"glycan",
"pattern",
"of",
"the",
"Fc",
"N-glycan",
":",
"low",
"core-fucose",
"levels",
"(=",
"high",
"non-fucose",
"levels",
")",
"typically",
"result",
"in",
"an",
"increased",
"ADCC",
"."
]
}
] |
PMC11489275 | Variables covered in the study include age, gender, smoke, mechanic hand, heliotrope rash, Gottron's sign/papules, shawl sign, periungual erythema, Raynaud phenomenon, skin ulcers, muscle weakness, arthritis/arthralgia, RP-ILD, V sign, anti-nuclear antibody (ANA), rheumatoid factor (RF), Ro52, fever, lymphocyte class, lymphocyte count, duration, albumin(ALB), alanine aminotransferase(ALT), aspartate aminotransferase(AST), creatine kinase (CK), Lactate dehydrogenase (LDH), C-reactive protein (CRP), erythrocyte sedimentation rate (ESR), neutrophil to lymphocyte ratio (NLR), and white blood cell (WBC). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Variables",
"covered",
"in",
"the",
"study",
"include",
"age",
",",
"gender",
",",
"smoke",
",",
"mechanic",
"hand",
",",
"heliotrope",
"rash",
",",
"Gottron",
"'s",
"sign/papules",
",",
"shawl",
"sign",
",",
"periungual",
"erythema",
",",
"Raynaud",
"phenomenon",
",",
"skin",
"ulcers",
",",
"muscle",
"weakness",
",",
"arthritis/arthralgia",
",",
"RP-ILD",
",",
"V",
"sign",
",",
"anti-nuclear",
"antibody",
"(",
"ANA",
")",
",",
"rheumatoid",
"factor",
"(",
"RF",
")",
",",
"Ro52",
",",
"fever",
",",
"lymphocyte",
"class",
",",
"lymphocyte",
"count",
",",
"duration",
",",
"albumin(ALB",
")",
",",
"alanine",
"aminotransferase(ALT",
")",
",",
"aspartate",
"aminotransferase(AST",
")",
",",
"creatine",
"kinase",
"(",
"CK",
")",
",",
"Lactate",
"dehydrogenase",
"(",
"LDH",
")",
",",
"C-reactive",
"protein",
"(",
"CRP",
")",
",",
"erythrocyte",
"sedimentation",
"rate",
"(",
"ESR",
")",
",",
"neutrophil",
"to",
"lymphocyte",
"ratio",
"(",
"NLR",
")",
",",
"and",
"white",
"blood",
"cell",
"(",
"WBC",
")",
"."
]
}
] |
PMC11772585 | G The protein levels of ATF4 in HSC-1 and A431 cells with or without shMETTL1 were detected by western blot (n = 3). | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"G",
"The",
"protein",
"levels",
"of",
"ATF4",
"in",
"HSC-1",
"and",
"A431",
"cells",
"with",
"or",
"without",
"shMETTL1",
"were",
"detected",
"by",
"western",
"blot",
"(",
"n",
"=",
"3",
")",
"."
]
}
] |
PMC11394227 | Most results have demonstrated extended cell culture times and titer increases in products ranging from 35% to 500% . | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Most",
"results",
"have",
"demonstrated",
"extended",
"cell",
"culture",
"times",
"and",
"titer",
"increases",
"in",
"products",
"ranging",
"from",
"35",
"%",
"to",
"500",
"%",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Aims: This SLR evaluated differences in the clinical manifestations of VOD/SOS post-HCT in adults compared to children. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aims",
":",
"This",
"SLR",
"evaluated",
"differences",
"in",
"the",
"clinical",
"manifestations",
"of",
"VOD/SOS",
"post-HCT",
"in",
"adults",
"compared",
"to",
"children",
"."
]
}
] |
PMC11367146 | Table 2Sl no.CompoundsMW (g/mol)ML OGPHBA<10HBD<5Rotational bond<10TPSAWLOGPLipinski violationAbbott Bioavailability(in Å)1β-Sitosterol414.716.7311620.238.0210.552Daucosterol576.853.9664999.385.8510.553Heptacosane380.738.860024010.7810.5541-Octacosanol410.767.07112620.2310.1410.555Tessalatin270.281.8742158.922.6100.556Gigantol274.312.2642558.922.900.557Gallic acid170.12−0.1654197.990.500.568Gamma-Sitosterol414.716.7311620.238.0210.559Stigmasterol412.696.6211520.237.810.5510Dihydroconiferyl dihydro-p-coumarate330.372.6152975.993.2200.5511Methyl Linoleate294.474.7201526.35.9710.5512Syringaldehyde182.170.2441355.761.2200.5513Vanillin152.150.5131246.531.2100.55 Drug likeness screening of Vanda tessellata constituent. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Table",
"2Sl",
"no.",
"CompoundsMW",
"(g/mol)ML",
"OGPHBA<10HBD<5Rotational",
"bond<10TPSAWLOGPLipinski",
"violationAbbott",
"Bioavailability(in",
"Å)1β-Sitosterol414.716.7311620.238.0210.552Daucosterol576.853.9664999.385.8510.553Heptacosane380.738.860024010.7810.5541-Octacosanol410.767.07112620.2310.1410.555Tessalatin270.281.8742158.922.6100.556Gigantol274.312.2642558.922.900.557Gallic",
"acid170.12−0.1654197.990.500.568Gamma-Sitosterol414.716.7311620.238.0210.559Stigmasterol412.696.6211520.237.810.5510Dihydroconiferyl",
"dihydro-p-coumarate330.372.6152975.993.2200.5511Methyl",
"Linoleate294.474.7201526.35.9710.5512Syringaldehyde182.170.2441355.761.2200.5513Vanillin152.150.5131246.531.2100.55",
"Drug",
"likeness",
"screening",
"of",
"Vanda",
"tessellata",
"constituent",
"."
]
}
] |
PMC11659921 | Furthermore, inhibiting HMGCR reduces the stemness and metastasis of hepatocellular carcinoma through Hedgehog signaling. | [
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"inhibiting",
"HMGCR",
"reduces",
"the",
"stemness",
"and",
"metastasis",
"of",
"hepatocellular",
"carcinoma",
"through",
"Hedgehog",
"signaling",
"."
]
}
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.