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BioData-CellLine_annotated

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PMC11755519
The results of the cited study indicated a VEGF-C-independent mechanism for bladder cancer metastasis, in which exosomal LNMAT2 promotes lymphangiogenesis and metastasis through transcriptional regulation of PROX1 in HLECs.
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PMC10203589
FGF18 homologues are members of the FGF family with N-terminal signal peptides.
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PMC9250505
To determine the survival fraction (SF), ApoTox-Glo Triplex assays were used to evaluate live-cell protease activity (cell viability), and caspase 3/7 activity (apoptosis) of the colonies cultured in 3D Matrigel.
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PMC9429973
Despite of high-dose methotrexate (HD-MTX) has better pharmacodynamics in cerebrospinal fluid than endolumbar methotrexate given with endolumbar triplet injections (ETI), it couldn’t be prescribed in some cases due to old age and comorbidities.
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PMC11612794
Therefore, we propose that phosphorylation of the Dsn1 basic motif by Aurora B can facilitate the interactions via two interaction surfaces simultaneously for timely CENP-T-Mis12C interaction during mitosis (M phase; Figure 7).
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PMC11794847
The OCR was then automatically calculated by the analyzer, providing insights into various aspects of mitochondrial function, including basal respiration, ATP production, proton leak, and spare respiratory capacity.
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PMC11769522
In addition, the incubation of keratinocytes with IL-4 and IL-13 significantly reduced filaggrin gene expression .
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PMC11607764
PTBP1 stimulates the translation of p53 isoforms by binding to its internal ribosome entry site after DNA damage.
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PMC5833712
ERβ expression in ovarian cancer cells has been found to be significantly associated with longer disease-free survival and overall survival (OS).
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PMC11723947
These mediators inhibit effector T cell functions and can even contribute to infectious tolerance, a process whereby Treg convey immunosuppressive properties to conventional T cells.
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PMC11695623
All independent clinicopathologic prognostic factors were selected from Cox regression analysis.
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PMC9635307
These results imply that CEACAM1 in mature B cells may be associated with BCR signaling.
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PMC11761919
Notably, the level of Fiber2-specific sIgA in the Micro-E/Fiber2-PINs group was significantly higher than that in the Micro-E/Fiber2-inulin group at two weeks after third immunization (p < 0.01).
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PMC11723947
a Experimental model.
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PMC10588957
In HDACs, the sirtuin protein family (SIRT1-SIRT7) plays a unique and important role.
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PMC11718817
Signaling through PD-1 results in reduced T cell activity with effects on IL-2 secretion, T cell proliferation, and promotion of Tregs through metabolic reprogramming .
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PMC11706776
As previously described , SOCE was measured after Fura-2-AM loading of cells for 45 min at 37 °C.
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PMC8010066
P. aeruginosa establishes a biofilm within the lung of the susceptible patient coupled with the overproduction of the exopolysaccharide alginate (Ali Mirani et al. 2018; Tahmasebi et al. 2019).
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PMC11283030
Fig. 2ACLY expression was associated with poor prognosis of ccRCC.
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PMC11790599
Primary antibodies sources were as follows: Rabbit monoclonal to NRF2 (#ab62352), rabbit polyclonal to NQO1 (#ab34173) anti-bodies were purchased from Abcam.
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PMC11459296
Next, we aimed to determine whether the different myeloid and lymphoid CB-MNC subsets expanded in NSGS mice were functional.
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PMC9429973
Furthermore, bexmarilimab reduced PD-1 expression in NK- and CD8+CXCR3+ T cell populations of FAB M0-M2 AML and MDS-EB2.
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PMC9429973
Results: Data cut-off for preplanned interim analysis included 57 pts screened and 45 enrolled, 16 in phase 1 and 29 in phase 2.
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PMC11532793
Simulations were also generated with more samples and a higher level of biological variability, in order to emulate a large-scale observational RNA-seq study with human subjects.
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Image: Summary/Conclusion: COVID-19 infection led to a particularly dismal outcome in patients exposed to immunosuppressive agents and in those with chronic heart or pulmonary diseases, or diabetes.
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PMC11674891
After one week of acclimation, mice were randomly divided into two groups (WT vs. knockdown), and 1.0 × 10 A549-FLuc-WT and GRPR-knockdown cells suspended in 100 μL of phosphate-buffered saline (PBS) were injected intravenously via the tail vein.
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PMC8708099
no. P4333), and 0.1% of gentamicin (Sigma Aldrich, St. Louis, MO, USA, cat.
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PMC11607321
Never essential genes were discarded, i.e., genes that do not have an essentiality profile lower than 50% of the median log2 fold-change of essential genes in at least one cell line were removed.
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PMC10174970
The human PAAD cell lines are available at following cell line collections: American Type Culture Collection (ATCC; Manassas, VA, USA; http://www.atcc.org/); Leibniz Institute (DSMZ; Braunschweig, Germany; http://www.dsmz.de/); European Collection of Authenticated Cell Cultures (ECACC; Salisbury, UK; http://www.hpacultures.org.uk/collections/ecacc.jsp); Health Sciences Research Resources Bank (HSRRB; Tokyo, Japan; http://www.jhsf.or.jp/English/hsrrb.html); RIKEN of Japan (Tokyo, Japan; http://www.brc.riken.jp/lab/cell/english/); Interlab Cell Line Collection (ICLC; Genoa, Italy; http://www.iclc.it/Listanuova.html); Korean Cell Line Bank (KCLB; Seoul, Korea; http://cellbank.snu.ac.kr/english/index.php); China Infrastructure of Cell Line Resource (CICR; Beijing, China; http://www.cellresource.cn/).
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PMC7348793
The analysis of the mitochondrial genome sequences from other primates revealed that tandem repeats are absent from examined mtDNA control regions of humans and great apes, but appear in lower primates, where they are present in a homoplasmic state.
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PMC9429973
So far, seven patients have undergone autologous stem cell transplant.
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PMC10758402
in a solution of 0.5% BSA-PBS for a duration of 30 minutes at a temperature of 40°C.
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PMC9822769
Furthermore, cisplatin uptake was deeply reduced in A2780 cells in which the Ctr1 copper transporter gene was silenced.
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PMC9429973
Subgroup specific analysis within CEBPA revealed an improved outcome for CEBPA pts (n=46) (5-year OS: 52% vs 29%; P=.001, and 5-year EFS: 34% vs 18%; P=.018).
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PMC9100622
Boxplots are represented from min to max with median representation.
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PMC11754432
Membranes were incubated with either IRDye® 800CW Goat anti-Rabbit IgG Secondary Antibody or IRDye® 680RD Goat anti-Mouse IgG Secondary Antibody (LI-COR) for 1 h at room temperature.
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PMC10933092
Extracted RNA was prepared using the NEB Next Ultra II Directional RNA Library Prep Kit (NEB, United States).
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Interestingly, in vivo experiments demonstrated that phage therapy alone was effective enough to suppress S. aureus overgrowth, with no statistically significant additional benefit observed when S. epidermidis was combined with SaGU1.
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PMC11528603
Several renowned plant-derived compounds have been extensively prescribed (e.g. vincristine, paclitaxel, vinblastine, etc.)
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PMC8409415
P < .05, **P < .01; Kruskal‐Wallis H test was used to compare the groups).
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CHO/C5-hRFC: human RFC transfected cell line.
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Next, we evaluated the effect of aging on anti-tumor activity of OT-I TCR-T cells in vivo.
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Additionally, a 40% upregulation of ETV1 expression was observed in response to Dihydrotestosterone (DHT) treatment in LNCaP cells based on published RNA-seq data.
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PMC11593031
The comparative quantitative analysis outlined in both karyotypes and Table 1 demonstrates that the TR-beta cell line’s chromosomal instability is significantly more pronounced, reinforcing our findings that extended culture periods exacerbate chromosomal variations.
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PMC11063646
To know the andrographolide release pattern, in-vitro release data were fitted to different kinetic models like zero order, first order, and Higuchi and Korsmeyer-Peppas equations (Shah et al., 2021).
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PMC11742670
Due to the persistently excessive costs associated with developing new drugs, the practice of repurposing already approved and investigational drugs is increasingly appealing.
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PMC11515150
After coculture with CCRF-CEM cells overnight, 5D CAR-NK cells and 12 C CAR-NK cells exerted robust and specific tumor-killing activity relative to control NK cells, and stronger cytotoxicity and more IFN-γ release were observed in 12 C CAR-NK cells compared to those in 5D CAR-NK cells (Fig. 3d).
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PMC9429973
The gene panel includes 26 genes (ASXL1, CALR, CBL, CEBPA, DNMT3A, EZH2, FLT3, GATA2, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, MPL, MLL, NPM1, NRAS, PTPN11, RUNX1, SETBP1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1).
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PMC8701144
The TNKS protein displayed a uniform cytoplasmic localization in the E1B-55k siRNA-treated cells, although some of the TNKS protein co-localized with the remaining E1B-55k rod-like structures (Figure 3b).
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PMC11745823
Interestingly, we also found that RIT1 was inversely correlated with CD8 T cells by analysing the glioma TCGA database (Figure S6A).
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Scale bar, 1 µm.) (
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Membranes were developed using ECL Western Blotting Detection Reagents and analyzed using Alliance 1 D software (UVITEC, Cambridge, United Kingdom).
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= crude aqueous/alcoholic extract; MeOH/H2O ext.
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An ELONA assay was used to determine the KD of the A40s aptamer for recombinant EphA2 (KD = 0.76 ± 0.2641 nM).
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DMSO served as a negative control.
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Cox multivariate analysis showed that age ≥60 years (HR=2.272, 95%CI 1.110-4.651, P=0.025), IPI score 3-5 points(HR=3.562, 95%CI 1.794-7.074, P<0.001), ECOG-PS score 2-4 points (HR=2.675, 95%CI 1.162-6.153, P =0.021) and the number of cycles of chemotherapy<4 (HR=0.290, 95%CI 0.176-0.479, P<0.001) were independent risk factors for adverse prognosis of OS.
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PMC11474209
By regulating the restoration of damaged DNA and cell death in reaction to stress, the phosphoinositide 3-kinase-like kinase (PIKK) ataxia telangiectasia mutated (ATM) kinase is crucial for maintaining genome fidelity.
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PMC11772449
Therefore, we propose a hypothesis that pirfenidone may cooperate with Sora to kill liver cancer cells by inhibiting autophagy.
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PMC6803987
NMR spectra were analyzed on a Bruker DRX-500 MHz spectrometer (Bruker Optics, Ettlingen, Germany).
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C T-cell receptor (TCR)-based therapy.
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We have calculated the ratio between the IC50 of fibroblasts and the IC50 of HCT116, A2780, MDA-MB-231, or MCF-7 cell lines for complexes 1–4 that was named herein as the Selectivity index (SI).
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Nevertheless, HTN is considered an AE of BTKis as a class.
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The SOCS family of proteins plays a role in inhibiting this pathway .
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PMC8427838
However, the specific mechanisms by which TMIGD1 elicits these effects, particularly at the level of protein–protein interaction remain unknown.
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PMC9429973
C. Hasselbalch Riley, M. Hutchings, S.-S. Yoon, Y. Koh, S. Manier, T. Facon, S. J. Harrison, J. Er, F. Volzone, A. Pinto, C. Montes, E. M. Ocio, A. Alfonso-Pierola, P. Rodriguez Otero, F. Offner, A. Guidetti, P. Corradini, C. Titouan, C. Hulin, C. Touzeau, P. Moreau, R. Popat, S. Leong, R. Mazza, A.-M. E. Bröske, I. Dekhtiarenko, H.-J. Helms, S. Belli, T. Vardar, T. Fauti, J. Eckmann, T. Moore, M. Schneider, W. Jacob, M. Weisser, C. Carlo-Stella Rigshospitalet, Copenhagen, Denmark; Seoul National University College of Medicine, Seoul, South Korea; Lille University Hospital, Lille, France; Peter MacCallum Cancer Center and Royal Melbourne Hospital, and Sir Peter MacCallum Department of Oncology, University of Melbourne, Melbourne, Australia; Istituto Nazionale dei Tumori, Fondazione Pascale, IRCCS, Napoli, Italy; Hospital Universitario Marques de Valdecilla (IDIVAL), Universidad de Cantabria, Santander; Clinica Universidad de Navarra, Navarra, Spain; Universitair Ziekenhuis Gent, Gent, Belgium; Istituto Nazionale dei Tumori, Milano, Italy; CHU de Bordeaux, Bordeaux; CHU de Nantes, Nantes, France; University College London Hospitals NHS Foundation Trust, London, United Kingdom; Department of Biomedical Sciences, Humanitas University and Department of Oncology and Hematology, IRCCS Humanitas Research Hospital, Milano, Italy; Roche Pharma Research and Early Development, Roche Innovation Center Munich, Penzberg, Germany; Roche Pharma Research and Early Development, Roche Innovation Center Zurich, Zurich; Roche Pharma Research and Early Development, Roche Innovation Center Basel, Basel, Switzerland Background: Patients (pts) with relapsed/refractory multiple myeloma (RRMM) are in need of effective treatment options.
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PMC11019355
Understanding these mechanisms will shed light on gene expression evolution.
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Crystal packing of the molecule was attributed to the intermolecular (C–H⋯O) and three intramolecular (N–H/O, C–H/S) H-bonds (Fig. 7).
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PMC9429973
The dosage of serum EPO was low with an average of 1 mU/ML.
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Data were analyzed using the IDEAS software (MilliporeSigma) and FlowJo.
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The values are presented as the mean ± SEMs, and the data were evaluated via two-way ANOVA and subsequently compared with an unpaired two-tailed t test with Welch’s correction.
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The resulting RNA was quantified using the NanoDrop.
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PMC11763126
Further investigation into the mechanisms of action of CBDP1, as well as the roles of YTHDF2 and TRPM3 in ccRCC, holds promise for providing new insights and approaches for ccRCC treatment.
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PMC11777207
Since our data emphasized that binding affinity of antibodies to PD-L1 does not affect moDC migration to the extent that we predicted, we next asked whether the amino acids masked by the associated PD-L1 antibodies were different and may explain the differences in moDC migration.
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PMC9872547
These genes encode proteins that bind to P53 and Rb tumor suppressors, respectively, and suppress them.
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It should be noted that the combination of a drug with a specific nanocarrier can have a significant influence on the pharmacokinetic profile and pharmacological effect of the drug . “
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The results indicated that luciferase activity of HK2 was significantly enhanced following METTL1 overexpression; however, a marked decrease was observed upon ATF4 knockdown, even in the presence of METTL1 overexpression (Supplementary Fig. S7G), indicating that METTL1 could regulate the promoter of HK2 depending on ATF4.
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A549 cells were detached and counted as previously described.
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PMC9776316
Here, through an NHEJ pathway-focused gene RNAi screen, we found that the knockdown of XRCC4 significantly sensitized cisplatin treatment in the platinum-resistant ovarian cancer cell lines.
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PMC10852540
The basal proliferation rate of OVCAR3 cells showed statistically significant differences compared to HaCat cells.
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The functional experiments, including the CCK8, colony formation, EdU and transwell assays, revealed that knocking down RIT1 significantly reduced the proliferation, migration and invasion of glioma cells (Figure 3B–D and Figure S1G), implying that RIT1 is crucial in promoting these activities.
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PMC11754436
The Cox proportional hazards regression model was used to explore the univariate and multivariate hazard ratios and screen the OS prognostic factors.
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PMC11541241
In the D122 mutant, the expression levels of some genes associated with the TOR kinase pathway exhibited a significant change compared with that in the wild‐type isolate.
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PMC6364197
Thereby G0/G1 cells decrease and non-adhered cells actively divide, overpopulate and die, indicating that CTCPS are more suitable than TCPS and UPS for longer time culture (14,34).
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In Europe, the University Children’s Hospital Münster in Germany is working on GD2.CAR-VST, addressing challenges in CAR-VST expansion and co-stimulation requirements.
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PMC10530622
A recently identified player in the nephrolithiasis-metabolic disease-hyperoxaluria trio is the HIF-AhR axis .
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PMC11635519
MCP1-GFP peptide colocalized with CCR2-mCherry at the cell surface and distinct subcellular sites upon transient coexpression in HEK293T cells. (
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PMC11322866
Figure 1 The EZH2-specific methyltransferase inhibitor GSK126 induced cellular senescence in MM(A) SA-β-gal expression in GSK126-treated and control RPMI-8226 and OCI-MY5 cells.
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PMC11759543
Fig. 2Fig.
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PMC11171319
In fact, most people infected with oncoviruses will never develop cancer, meaning that other factors including the microbiome could favor transformation.
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PMC9143157
Moreover, time-dependency was also found for P-THP as well as free THP, in which the IC50, after 3 h of treatment, were 1.5–10 times higher than that after 72 h treatment (Figure 1).
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PMC9587298
To study if the highest reactivity to trap MGO by monoglycosylated anthocyanins, when compared to the diglycosylated anthocyanins, flavonoids, and cinnamic acids, is due to their lower reactivity in the reaction conditions used or if the results obtained are due to the competition for MGO, as monoglycosylated anthocyanins are in higher concentrations when compared to diglycosylated anthocyanins, flavonoids and cinnamic acids, the MGO trapping capacity of isolated compounds was studied by ESI-MS to evaluate their reactivity and the products formed by the reaction of MGO.Fig.
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PMC10452486
This is another salient finding to point out that Face-2 differs from Face-1 HCs in the glycosylation pattern.
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PMC7759933
During the time of cultivation, the spheroids were characterised by measuring the surface area, and viability of cells in spheroids.
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PMC11487720
Cells were cultured on coverslips overnight or 48 h. After the indicated experiments, cells were fixed with 3.7% paraformaldehyde for 20 min at room temperature and permeabilized with 0.5% Triton X-100 in 3.7% paraformaldehyde for another 10 min [15–18, 35].
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PMC10237474
As a result, even though Expi293F stable pools showed a 3-fold increase in titer compared to CHO-K1 stable, the difference in final purification yield was further increased to 10-fold which makes Expi293F stable pools the choice of expression host for protein 4 (S2G Fig, compare “Expression Titer” and “Purification Yield” panels).
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PMC6684588
This Fc sequence had been generated previously by PCR from a commercially available sequence and mutated from Asn to Lys at the 404 position (Kabat) for consistency with the most prevalent isotype allele.
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PMC9672323
Further investigations revealed that piroxicam-treated PBMCs augmented remarkably the LDH activity, and glycolysis index, when co-cultured with both U-87 MG and A-172 cell lines, but dexamethasone did not increase the LDH activity.
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PMC11519567
Fig. 1Compared with SS18, the physical properties of SS18-SSX condensate have also changed.
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PMC9622879
By solving this MILP problem, the optimization of the overall energy cost of the community and satisfaction of the thermal comfort at every home are achieved.
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PMC11634027
Plasmids containing ds-Exon12 with different motifs deletion were provided by WellGenetics.
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