Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11766350
rAAV viral genome titers were determined for supernatant and cell pellet samples by qPCR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "rAAV", "viral", "genome", "titers", "were", "determined", "for", "supernatant", "and", "cell", "pellet", "samples", "by", "qPCR", "." ] } ]
PMC11790971
Training was halted if the validation score did not improve for 50 consecutive epochs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Training", "was", "halted", "if", "the", "validation", "score", "did", "not", "improve", "for", "50", "consecutive", "epochs", "." ] } ]
PMC9429973
DIS3 mutations along with del(13q) have been recently described by us as associated with a strong negative effect on clinical outcome.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DIS3", "mutations", "along", "with", "del(13q", ")", "have", "been", "recently", "described", "by", "us", "as", "associated", "with", "a", "strong", "negative", "effect", "on", "clinical", "outcome", "." ] } ]
PMC9429973
CADENZA, https://BPDCNtrial.com, NCT03386513 A. Navickas, J. González, M. M. Rivas, M. Clavijo, N. Carnelutto, M. E. Funes, M. J. Mela Osorio, R. Mariano, M. L. Rapan, M. Moirano, I. Rey, S. Cranco, J. E. Giunta, R. Ramirez, M. B. Castro, A. Enrico, A. Gimenez Conca, C. Belli Hematologia, Hospital el Cruce, Florencio Varela; Hematología, Hospital Durand, CABA; Hematología, Hospital Austral, Pilar; Hematología, Hospital Aleman; Hematología, Hospital de Clinicas, CABA; Hematologia, Sanatorio Britanico, Rosario; Hematologia, Fundaleu, CABA; Hematologia, Hospital San Martin, Parana, Entre Rios; Hematologia, Sanatorio Sagrado Corazon, CABA; Hematologia, Hospital San Martin, La Plata, Buenos Aires; Hematologia, Hospital Ramos Mejia, Buenos Aires; Hematologia, Instituto Alexander Fleming, CABA; Hematologia, Instituto Privado de Hematología y Hemoterapia, Parana, Entre Rios; Hematologia, Instituto Conciencia, Neuquen; Hematologia, Hospital Privado, Cordoba; Hematologia, Hospital Italiano, La Plata, Buenos Aires; Hematologia, Hospital Italiano Buenos Aires, CABA; Hematologia, Academia Nacional de Medicina, Buenos Aires, Argentina Background: Midostaurin has been approved by EMA and FDA in combination with intensive chemotherapy (CMT) for FLT3 positive AML based on improved survival.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CADENZA", ",", "https://BPDCNtrial.com", ",", "NCT03386513", "A.", "Navickas", ",", "J.", "González", ",", "M.", "M.", "Rivas", ",", "M.", "Clavijo", ",", "N.", "Carnelutto", ",", "M.", "E.", "Funes", ",", "M.", "J.", "Mela", "Osorio", ",", "R.", "Mariano", ",", "M.", "L.", "Rapan", ",", "M.", "Moirano", ",", "I.", "Rey", ",", "S.", "Cranco", ",", "J.", "E.", "Giunta", ",", "R.", "Ramirez", ",", "M.", "B.", "Castro", ",", "A.", "Enrico", ",", "A.", "Gimenez", "Conca", ",", "C.", "Belli", "Hematologia", ",", "Hospital", "el", "Cruce", ",", "Florencio", "Varela", ";", "Hematología", ",", "Hospital", "Durand", ",", "CABA", ";", "Hematología", ",", "Hospital", "Austral", ",", "Pilar", ";", "Hematología", ",", "Hospital", "Aleman", ";", "Hematología", ",", "Hospital", "de", "Clinicas", ",", "CABA", ";", "Hematologia", ",", "Sanatorio", "Britanico", ",", "Rosario", ";", "Hematologia", ",", "Fundaleu", ",", "CABA", ";", "Hematologia", ",", "Hospital", "San", "Martin", ",", "Parana", ",", "Entre", "Rios", ";", "Hematologia", ",", "Sanatorio", "Sagrado", "Corazon", ",", "CABA", ";", "Hematologia", ",", "Hospital", "San", "Martin", ",", "La", "Plata", ",", "Buenos", "Aires", ";", "Hematologia", ",", "Hospital", "Ramos", "Mejia", ",", "Buenos", "Aires", ";", "Hematologia", ",", "Instituto", "Alexander", "Fleming", ",", "CABA", ";", "Hematologia", ",", "Instituto", "Privado", "de", "Hematología", "y", "Hemoterapia", ",", "Parana", ",", "Entre", "Rios", ";", "Hematologia", ",", "Instituto", "Conciencia", ",", "Neuquen", ";", "Hematologia", ",", "Hospital", "Privado", ",", "Cordoba", ";", "Hematologia", ",", "Hospital", "Italiano", ",", "La", "Plata", ",", "Buenos", "Aires", ";", "Hematologia", ",", "Hospital", "Italiano", "Buenos", "Aires", ",", "CABA", ";", "Hematologia", ",", "Academia", "Nacional", "de", "Medicina", ",", "Buenos", "Aires", ",", "Argentina", "Background", ":", "Midostaurin", "has", "been", "approved", "by", "EMA", "and", "FDA", "in", "combination", "with", "intensive", "chemotherapy", "(", "CMT", ")", "for", "FLT3", "positive", "AML", "based", "on", "improved", "survival", "." ] } ]
PMC11655536
D The survival analysis of patients with high and low expression level of NHE1 in TCGA datasets.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", "The", "survival", "analysis", "of", "patients", "with", "high", "and", "low", "expression", "level", "of", "NHE1", "in", "TCGA", "datasets", "." ] } ]
PMC11518994
C PAX5 variant allele analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "PAX5", "variant", "allele", "analysis", "." ] } ]
PMC11796104
Exclusion criteria included: (1) history of antiresorptive or pro-osteogenic drug use, except for calcium and vitamin D supplementation; (2) malignancies, bone metastases, endocrine disorders, and other bone metabolism diseases; (3) severe liver or kidney conditions, prolonged bed rest, organ transplantation, and specific medical histories; (4) abnormal biochemical parameters; and (5) lack of informed consent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Exclusion", "criteria", "included", ":", "(", "1", ")", "history", "of", "antiresorptive", "or", "pro-osteogenic", "drug", "use", ",", "except", "for", "calcium", "and", "vitamin", "D", "supplementation", ";", "(", "2", ")", "malignancies", ",", "bone", "metastases", ",", "endocrine", "disorders", ",", "and", "other", "bone", "metabolism", "diseases", ";", "(", "3", ")", "severe", "liver", "or", "kidney", "conditions", ",", "prolonged", "bed", "rest", ",", "organ", "transplantation", ",", "and", "specific", "medical", "histories", ";", "(", "4", ")", "abnormal", "biochemical", "parameters", ";", "and", "(", "5", ")", "lack", "of", "informed", "consent", "." ] } ]
PMC3734024
In all analyses, propidium iodide was used to exclude dead cells and doublets were excluded by gating based on forward scatter height and area channels.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "all", "analyses", ",", "propidium", "iodide", "was", "used", "to", "exclude", "dead", "cells", "and", "doublets", "were", "excluded", "by", "gating", "based", "on", "forward", "scatter", "height", "and", "area", "channels", "." ] } ]
PMC11512230
Compared to normal cells, AltMV SPV adsorbed more effectively on patient-derived sarcoma cells, whereas TMV SP were more effective on the established sarcoma cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Compared", "to", "normal", "cells", ",", "AltMV", "SPV", "adsorbed", "more", "effectively", "on", "patient-derived", "sarcoma", "cells", ",", "whereas", "TMV", "SP", "were", "more", "effective", "on", "the", "established", "sarcoma", "cells", "." ] } ]
PMC10606998
In addition, partial damage to the organic shell of SPIONs, aggravated by radiation, is possible, opening access to the magnetite core.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "partial", "damage", "to", "the", "organic", "shell", "of", "SPIONs", ",", "aggravated", "by", "radiation", ",", "is", "possible", ",", "opening", "access", "to", "the", "magnetite", "core", "." ] } ]
PMC10849234
The genetic tractability of this model, as demonstrated by stable RAB27A knockdown using CRISPRi further demonstrates its utility for loss-of-function experiments to probe questions about the regulation and impacts of human neutrophil degranulation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "genetic", "tractability", "of", "this", "model", ",", "as", "demonstrated", "by", "stable", "RAB27A", "knockdown", "using", "CRISPRi", "further", "demonstrates", "its", "utility", "for", "loss-of-function", "experiments", "to", "probe", "questions", "about", "the", "regulation", "and", "impacts", "of", "human", "neutrophil", "degranulation", "." ] } ]
PMC6642070
Taken together, these results imply that increased lactate levels are associated with SAMS, especially mild myalgia.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Taken", "together", ",", "these", "results", "imply", "that", "increased", "lactate", "levels", "are", "associated", "with", "SAMS", ",", "especially", "mild", "myalgia", "." ] } ]
PMC11792766
No. 1117140001), Triton X‐100 (Merck, Cat.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No.", "1117140001", ")", ",", "Triton", "X‐100", "(", "Merck", ",", "Cat", "." ] } ]
PMC11394730
Compared with untreated cells, emodin-induced cell cycle arrest at the S and G2/M phases and decreased cell viability in a dose/time-dependent manner.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Compared", "with", "untreated", "cells", ",", "emodin-induced", "cell", "cycle", "arrest", "at", "the", "S", "and", "G2/M", "phases", "and", "decreased", "cell", "viability", "in", "a", "dose/time-dependent", "manner", "." ] } ]
PMC11354225
Nevertheless, the addition of epigallocatechin gallate (EGCG) to MAL-PDT improves cytotoxicity .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nevertheless", ",", "the", "addition", "of", "epigallocatechin", "gallate", "(", "EGCG", ")", "to", "MAL-PDT", "improves", "cytotoxicity", "." ] } ]
PMC11194678
We inserted the MTOR-5′UTR to the upstream of Luciferase (referred to as MTOR-5′UTR-LUC) and cotransfected this construct with EGFP-tagged STAU1, STAU1 5KE, or control EGFP vector in COS7 cells (Fig. 3 F and Fig. S2 G).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "inserted", "the", "MTOR-5′UTR", "to", "the", "upstream", "of", "Luciferase", "(", "referred", "to", "as", "MTOR-5′UTR-LUC", ")", "and", "cotransfected", "this", "construct", "with", "EGFP-tagged", "STAU1", ",", "STAU1", "5KE", ",", "or", "control", "EGFP", "vector", "in", "COS7", "cells", "(", "Fig.", "3", "F", "and", "Fig.", "S2", "G", ")", "." ] } ]
PMC8992508
Chromones are a class of natural compounds, characterized by the presence of 1,4-benzopyrane structure.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chromones", "are", "a", "class", "of", "natural", "compounds", ",", "characterized", "by", "the", "presence", "of", "1,4-benzopyrane", "structure", "." ] } ]
PMC11116779
According to previous in vitro studies on A549 cells (21, 23, 24), we investigated the effects of PS-NPs (800 nm) exposure on this cell line at a concentration of 10–500 μg/mL, ranging from PS-MP concentrations experienced by residents of urban areas to those probably reflecting high-level exposure for workers at industrial manufacturing sites (24).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "According", "to", "previous", "in", "vitro", "studies", "on", "A549", "cells", "(", "21", ",", "23", ",", "24", ")", ",", "we", "investigated", "the", "effects", "of", "PS-NPs", "(", "800", "nm", ")", "exposure", "on", "this", "cell", "line", "at", "a", "concentration", "of", "10–500", "μg/mL", ",", "ranging", "from", "PS-MP", "concentrations", "experienced", "by", "residents", "of", "urban", "areas", "to", "those", "probably", "reflecting", "high-level", "exposure", "for", "workers", "at", "industrial", "manufacturing", "sites", "(", "24", ")", "." ] } ]
PMC11047729
In the study performed by S. Mukherjee et al. on acute myeloblastic leukemia, the HL-60 cell line inhibition of telomerase was observed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "study", "performed", "by", "S.", "Mukherjee", "et", "al.", "on", "acute", "myeloblastic", "leukemia", ",", "the", "HL-60", "cell", "line", "inhibition", "of", "telomerase", "was", "observed", "." ] } ]
PMC11591794
HeLa and HaCat cells were treated with concentrations of 10–1000 nM DOX and 10–1000 µM GA.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HeLa", "and", "HaCat", "cells", "were", "treated", "with", "concentrations", "of", "10–1000", "nM", "DOX", "and", "10–1000", "µM", "GA", "." ] } ]
PMC9429973
The cardiac response rate was 18.5% at 3 months and 23.5% at 6 months.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cardiac", "response", "rate", "was", "18.5", "%", "at", "3", "months", "and", "23.5", "%", "at", "6", "months", "." ] } ]
PMC11407042
•The lead contact will share all data reported in this study upon request.•This study does not report the original code.•Any additional information required to reanalyze the data reported in this study is available from the lead contact upon request.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "•The", "lead", "contact", "will", "share", "all", "data", "reported", "in", "this", "study", "upon", "request.•This", "study", "does", "not", "report", "the", "original", "code.•Any", "additional", "information", "required", "to", "reanalyze", "the", "data", "reported", "in", "this", "study", "is", "available", "from", "the", "lead", "contact", "upon", "request", "." ] } ]
PMC10891340
The stability of MFN2 was enhanced after virus infection, but degradation of MFN2 still occurred after CCCP treatment (Figures 7A and 7B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "stability", "of", "MFN2", "was", "enhanced", "after", "virus", "infection", ",", "but", "degradation", "of", "MFN2", "still", "occurred", "after", "CCCP", "treatment", "(", "Figures", "7A", "and", "7B", ")", "." ] } ]
PMC11666785
IML-SPIM has enabled super-resolution imaging at large field-of-view (FOV).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IML-SPIM", "has", "enabled", "super-resolution", "imaging", "at", "large", "field-of-view", "(", "FOV", ")", "." ] } ]
PMC10547921
Radioisotopes are also commonly used as payloads for PDCs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Radioisotopes", "are", "also", "commonly", "used", "as", "payloads", "for", "PDCs", "." ] } ]
PMC11750161
All other reagents were purchased from Sigma-Aldrich (St. Louis, MO, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "other", "reagents", "were", "purchased", "from", "Sigma-Aldrich", "(", "St.", "Louis", ",", "MO", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The cumulative incidence of CRS (all grades) was 35.3% (95%CI 30.6-40.1) at 3 days and 82.7% (95%CI 78.5-86.1) at 12 days.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cumulative", "incidence", "of", "CRS", "(", "all", "grades", ")", "was", "35.3", "%", "(", "95%CI", "30.6", "-", "40.1", ")", "at", "3", "days", "and", "82.7", "%", "(", "95%CI", "78.5", "-", "86.1", ")", "at", "12", "days", "." ] } ]
PMC10047551
After 14 days of antibiotic selection, DNA was extracted.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "14", "days", "of", "antibiotic", "selection", ",", "DNA", "was", "extracted", "." ] } ]
PMC11481779
The first one was TAD calling.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "first", "one", "was", "TAD", "calling", "." ] } ]
PMC11740508
We found that DNA damage accumulates in BRCA mutated cells over time (Fig. 2B–G), thus we are most likely impacting PARPi + DNMTi complex activity at replication forks, where DNMT and PARP are in natural proximity and functionally required .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "DNA", "damage", "accumulates", "in", "BRCA", "mutated", "cells", "over", "time", "(", "Fig.", "2B", "–", "G", ")", ",", "thus", "we", "are", "most", "likely", "impacting", "PARPi", "+", "DNMTi", "complex", "activity", "at", "replication", "forks", ",", "where", "DNMT", "and", "PARP", "are", "in", "natural", "proximity", "and", "functionally", "required", "." ] } ]
PMC11621565
In 2003, Heiko Braak et al. published a study on autopsies that challenged this initial view and proposed a pathological staging.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "2003", ",", "Heiko", "Braak", "et", "al.", "published", "a", "study", "on", "autopsies", "that", "challenged", "this", "initial", "view", "and", "proposed", "a", "pathological", "staging", "." ] } ]
PMC10933092
The red line represents mA sites in short hairpin (sh)-TRMT61A 5637 cells and the blue line represents mA sites in sh-NC 5637 cells. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "red", "line", "represents", "mA", "sites", "in", "short", "hairpin", "(sh)-TRMT61A", "5637", "cells", "and", "the", "blue", "line", "represents", "mA", "sites", "in", "sh-NC", "5637", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC10170482
Quantitative analysis of mitochondrial morphologies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quantitative", "analysis", "of", "mitochondrial", "morphologies", "." ] } ]
PMC9822769
These data indicate that OCTs are possible carrier proteins for the uptake of 2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "data", "indicate", "that", "OCTs", "are", "possible", "carrier", "proteins", "for", "the", "uptake", "of", "2", "." ] } ]
PMC11706491
synCut3 plasmid was kindly given by Paul Nurse .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "synCut3", "plasmid", "was", "kindly", "given", "by", "Paul", "Nurse", "." ] } ]
PMC11738017
A-C) The TCE cytotoxicity assay dose-response curve.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A-C", ")", "The", "TCE", "cytotoxicity", "assay", "dose-response", "curve", "." ] } ]
PMC11306019
D,E) Total cell counts on the 11th and 14th day, with statistical analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", ",", "E", ")", "Total", "cell", "counts", "on", "the", "11th", "and", "14th", "day", ",", "with", "statistical", "analysis", "." ] } ]
PMC11535726
Colonies circular, flat, dense, radial sulcate, edge entire, pearl-gray on the surface, dark brown on the reverse and becoming grey-white along the margin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Colonies", "circular", ",", "flat", ",", "dense", ",", "radial", "sulcate", ",", "edge", "entire", ",", "pearl-gray", "on", "the", "surface", ",", "dark", "brown", "on", "the", "reverse", "and", "becoming", "grey-white", "along", "the", "margin", "." ] } ]
PMC11564405
Correlation analyses revealed that RILPL2 expression demonstrated a significant positive correlation with CD4 + T cell infiltration in NSCLC (R = 0.294, P < 0.001), LUAD subgroup (R = 0.256, P = 0.038), and LUSC subgroup (R = 0.333, P = 0.004) respectively; RILPL2 expression exhibited a significant positive correlation with CD8 + T cell infiltration in NSCLC (R = 0.263, P = 0.002), LUAD subgroup (R = 0.280, P = 0.023), and LUSC subgroup (R = 0.250, P = 0.031) respectively (Tables 2, 3, 4, 5, Supplementary Tables 1, 2).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Correlation", "analyses", "revealed", "that", "RILPL2", "expression", "demonstrated", "a", "significant", "positive", "correlation", "with", "CD4", "+", "T", "cell", "infiltration", "in", "NSCLC", "(", "R", "=", "0.294", ",", "P", "<", "0.001", ")", ",", "LUAD", "subgroup", "(", "R", "=", "0.256", ",", "P", "=", "0.038", ")", ",", "and", "LUSC", "subgroup", "(", "R", "=", "0.333", ",", "P", "=", "0.004", ")", "respectively", ";", "RILPL2", "expression", "exhibited", "a", "significant", "positive", "correlation", "with", "CD8", "+", "T", "cell", "infiltration", "in", "NSCLC", "(", "R", "=", "0.263", ",", "P", "=", "0.002", ")", ",", "LUAD", "subgroup", "(", "R", "=", "0.280", ",", "P", "=", "0.023", ")", ",", "and", "LUSC", "subgroup", "(", "R", "=", "0.250", ",", "P", "=", "0.031", ")", "respectively", "(", "Tables", "2", ",", "3", ",", "4", ",", "5", ",", "Supplementary", "Tables", "1", ",", "2", ")", "." ] } ]
PMC11297139
The phase separation of ARID1A in Ewing’s sarcoma is indispensable for its engagement with EWS/FLI1, which provides access to EWS/FLI1-linked enhancers and in turn induces chromatin remodeling.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "phase", "separation", "of", "ARID1A", "in", "Ewing", "’s", "sarcoma", "is", "indispensable", "for", "its", "engagement", "with", "EWS/FLI1", ",", "which", "provides", "access", "to", "EWS/FLI1-linked", "enhancers", "and", "in", "turn", "induces", "chromatin", "remodeling", "." ] } ]
PMC11474209
70 % of global freshwater blooms are estimated to be toxic.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "70", "%", "of", "global", "freshwater", "blooms", "are", "estimated", "to", "be", "toxic", "." ] } ]
PMC11656048
In general, Nrf2, as a transcription factor, which binds to its negative regulatory protein Keap1 and is ubiquitinated and degraded by the ubiquitin-proteasome system (Shuhua et al., 2022).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "general", ",", "Nrf2", ",", "as", "a", "transcription", "factor", ",", "which", "binds", "to", "its", "negative", "regulatory", "protein", "Keap1", "and", "is", "ubiquitinated", "and", "degraded", "by", "the", "ubiquitin-proteasome", "system", "(", "Shuhua", "et", "al.", ",", "2022", ")", "." ] } ]
PMC9412887
The obtained aPD-1/CDDP@NPs MNs could be sufficiently dissolved in water within 5 min and penetrated thoroughly into mouse skin within 20 min.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "obtained", "aPD-1/CDDP@NPs", "MNs", "could", "be", "sufficiently", "dissolved", "in", "water", "within", "5", "min", "and", "penetrated", "thoroughly", "into", "mouse", "skin", "within", "20", "min", "." ] } ]
PMC8524093
In the first, CHIKV is maintained in a sylvatic transmission cycle between forest dwelling Aedes mosquitoes and non-human primates resulting in sporadic human cases and small outbreaks (Diallo et al., 1999; Petersen et al., 2010).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "first", ",", "CHIKV", "is", "maintained", "in", "a", "sylvatic", "transmission", "cycle", "between", "forest", "dwelling", "Aedes", "mosquitoes", "and", "non-human", "primates", "resulting", "in", "sporadic", "human", "cases", "and", "small", "outbreaks", "(", "Diallo", "et", "al.", ",", "1999", ";", "Petersen", "et", "al.", ",", "2010", ")", "." ] } ]
PMC11473750
When we compared TH-MYCN and non-transgenic littermate tissues for RNF121 expression level in post-natal sympathetic ganglia and tumour tissues from 1 to 6 weeks of age, we found RNF121 was significantly upregulated during early tumorigenesis at 2 weeks of age and the difference further increased by 6 weeks of age, at the point of palpable tumour formation (Fig. 3a).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "we", "compared", "TH-MYCN", "and", "non-transgenic", "littermate", "tissues", "for", "RNF121", "expression", "level", "in", "post-natal", "sympathetic", "ganglia", "and", "tumour", "tissues", "from", "1", "to", "6", "weeks", "of", "age", ",", "we", "found", "RNF121", "was", "significantly", "upregulated", "during", "early", "tumorigenesis", "at", "2", "weeks", "of", "age", "and", "the", "difference", "further", "increased", "by", "6", "weeks", "of", "age", ",", "at", "the", "point", "of", "palpable", "tumour", "formation", "(", "Fig.", "3a", ")", "." ] } ]
PMC9429973
ROTEM and PFR expression confirm the existence of dynamic states of hypercoagulability in MPNs and could be used to assess the efficacy of prophylaxis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ROTEM", "and", "PFR", "expression", "confirm", "the", "existence", "of", "dynamic", "states", "of", "hypercoagulability", "in", "MPNs", "and", "could", "be", "used", "to", "assess", "the", "efficacy", "of", "prophylaxis", "." ] } ]
PMC10669128
The few preclinical models of leiomyosarcoma and the lack of fidelity of the established LMS cell lines to their mesenchymal neoplasm of origin limit the translational understanding of the disease.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "few", "preclinical", "models", "of", "leiomyosarcoma", "and", "the", "lack", "of", "fidelity", "of", "the", "established", "LMS", "cell", "lines", "to", "their", "mesenchymal", "neoplasm", "of", "origin", "limit", "the", "translational", "understanding", "of", "the", "disease", "." ] } ]
PMC10297204
The RFS at the last observation of eight weeks was 34%, 80%, and 80% in the control, 30E, and 99.5E groups, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "RFS", "at", "the", "last", "observation", "of", "eight", "weeks", "was", "34", "%", ",", "80", "%", ",", "and", "80", "%", "in", "the", "control", ",", "30E", ",", "and", "99.5E", "groups", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11532793
The latest QL pipeline with adjusted deviances for small counts from edgeR v4 bypasses the estimation of transcript-specific NB-dispersions and DTE can be assessed via quasi-F-tests (14).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "latest", "QL", "pipeline", "with", "adjusted", "deviances", "for", "small", "counts", "from", "edgeR", "v4", "bypasses", "the", "estimation", "of", "transcript-specific", "NB-dispersions", "and", "DTE", "can", "be", "assessed", "via", "quasi-F-tests", "(", "14", ")", "." ] } ]
PMC11767725
However, systemic metabolic factors offer additional therapeutic targets.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "systemic", "metabolic", "factors", "offer", "additional", "therapeutic", "targets", "." ] } ]
PMC11754291
All analyses and graphs were performed using R (version 4.4.1), utilizing the packages tidyverse (version 2.0.0), car (version 3.1.2), afex (version 1.3.1), emmeans (version 1.10.3), ggplot2 (version 3.5.1), and dplyr (version 1.1.4).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "analyses", "and", "graphs", "were", "performed", "using", "R", "(", "version", "4.4.1", ")", ",", "utilizing", "the", "packages", "tidyverse", "(", "version", "2.0.0", ")", ",", "car", "(", "version", "3.1.2", ")", ",", "afex", "(", "version", "1.3.1", ")", ",", "emmeans", "(", "version", "1.10.3", ")", ",", "ggplot2", "(", "version", "3.5.1", ")", ",", "and", "dplyr", "(", "version", "1.1.4", ")", "." ] } ]
PMC11087055
Live-imaging performed at 4 x objective lends on a spinning disk confocal microscope for 10 hr.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Live-imaging", "performed", "at", "4", "x", "objective", "lends", "on", "a", "spinning", "disk", "confocal", "microscope", "for", "10", "hr", "." ] } ]
PMC10870498
The KIF23-succ level was decreased in ATC cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "KIF23-succ", "level", "was", "decreased", "in", "ATC", "cells", "." ] } ]
PMC9784246
To investigate the anti-L. major effects of C. macrocarpa total extract and its derived fractions, the promastigotes and axenic amastigotes of L. major were separately cultured in the presence and absence of different concentrations (100, 50, 25, 12.5, 6.25, and 3.12 μg/mL).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "the", "anti-L.", "major", "effects", "of", "C.", "macrocarpa", "total", "extract", "and", "its", "derived", "fractions", ",", "the", "promastigotes", "and", "axenic", "amastigotes", "of", "L.", "major", "were", "separately", "cultured", "in", "the", "presence", "and", "absence", "of", "different", "concentrations", "(", "100", ",", "50", ",", "25", ",", "12.5", ",", "6.25", ",", "and", "3.12", "μg/mL", ")", "." ] } ]
PMC11699465
TIPs are generated by co-IP/MS assay.(B) Immunofluorescence assay to show nuclear localization in human osteosarcoma cell 143B, colorectal carcinoma cell line HCT116 as well as ovarian cancer cell line Caov-3, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TIPs", "are", "generated", "by", "co-IP/MS", "assay.(B", ")", "Immunofluorescence", "assay", "to", "show", "nuclear", "localization", "in", "human", "osteosarcoma", "cell", "143B", ",", "colorectal", "carcinoma", "cell", "line", "HCT116", "as", "well", "as", "ovarian", "cancer", "cell", "line", "Caov-3", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC9847912
Absorbance was measured at 570 nm using a Victor Multilabel Plate Reader (PerkinElmer Inc., Akron, OH).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Absorbance", "was", "measured", "at", "570", "nm", "using", "a", "Victor", "Multilabel", "Plate", "Reader", "(", "PerkinElmer", "Inc.", ",", "Akron", ",", "OH", ")", "." ] } ]
PMC11377827
Samples were centrifuged at 1700 × g for 4 min at 4 °C, separating the soluble nucleoplasm from the insoluble chromatin fraction.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Samples", "were", "centrifuged", "at", "1700", "×", "g", "for", "4", "min", "at", "4", "°", "C", ",", "separating", "the", "soluble", "nucleoplasm", "from", "the", "insoluble", "chromatin", "fraction", "." ] } ]
PMC8526701
C BRD9 mRNA level in GISTs and adjacent nontumor tissues was examined by real-time PCR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "BRD9", "mRNA", "level", "in", "GISTs", "and", "adjacent", "nontumor", "tissues", "was", "examined", "by", "real-time", "PCR", "." ] } ]
PMC11590005
Denial of prejudice’ captures the idea that racism no longer exists in Brazil but could be used by black people as means to obtain social benefits. ‘
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Denial", "of", "prejudice", "’", "captures", "the", "idea", "that", "racism", "no", "longer", "exists", "in", "Brazil", "but", "could", "be", "used", "by", "black", "people", "as", "means", "to", "obtain", "social", "benefits", ".", "‘" ] } ]
PMC9429973
The kinetics of sBCMA change from baseline to C2D1 EOI corresponded with response to cevostamab, with greater reductions increasing the probability of best response.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "kinetics", "of", "sBCMA", "change", "from", "baseline", "to", "C2D1", "EOI", "corresponded", "with", "response", "to", "cevostamab", ",", "with", "greater", "reductions", "increasing", "the", "probability", "of", "best", "response", "." ] } ]
PMC7812570
After two washes with PBS, the cells were fixed with 4% formaldehyde in PBS containing 1% BSA for 15 min and blocked with blocking buffer (5% goat serum in PBS containing 1% BSA) for 1 h. Then, the cells were sequentially stained with a mouse anti-His tag antibody, Alexa Fluor 488-conjugated goat anti-mouse IgG antibody, and Alexa Fluor 555-conjugated CtxB (Invitrogen Life Technologies).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "two", "washes", "with", "PBS", ",", "the", "cells", "were", "fixed", "with", "4", "%", "formaldehyde", "in", "PBS", "containing", "1", "%", "BSA", "for", "15", "min", "and", "blocked", "with", "blocking", "buffer", "(", "5", "%", "goat", "serum", "in", "PBS", "containing", "1", "%", "BSA", ")", "for", "1", "h.", "Then", ",", "the", "cells", "were", "sequentially", "stained", "with", "a", "mouse", "anti-His", "tag", "antibody", ",", "Alexa", "Fluor", "488-conjugated", "goat", "anti-mouse", "IgG", "antibody", ",", "and", "Alexa", "Fluor", "555-conjugated", "CtxB", "(", "Invitrogen", "Life", "Technologies", ")", "." ] } ]
PMC11768281
The data extraction process emphasized identifying T-cell targets, immune response stages, mechanisms of action, study design, and experimental outcomes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "data", "extraction", "process", "emphasized", "identifying", "T-cell", "targets", ",", "immune", "response", "stages", ",", "mechanisms", "of", "action", ",", "study", "design", ",", "and", "experimental", "outcomes", "." ] } ]
PMC11583010
The 15A7.5 mAb is specific for human nectin-4 (Fig. 1B) and does not cross-react with human nectin-1, -2 and -3 that are all expressed by parental MDA-MB-231 cells [Fig. 1B (Inlay)].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "15A7.5", "mAb", "is", "specific", "for", "human", "nectin-4", "(", "Fig.", "1B", ")", "and", "does", "not", "cross-react", "with", "human", "nectin-1", ",", "-2", "and", "-3", "that", "are", "all", "expressed", "by", "parental", "MDA-MB-231", "cells", "[", "Fig.", "1B", "(", "Inlay", ")", "]", "." ] } ]
PMC11802929
PG2-specific cells were enriched with EM and CM phenotypes, and PG3-specific cells were mainly cytotoxic (Fig. 4d bottom).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PG2-specific", "cells", "were", "enriched", "with", "EM", "and", "CM", "phenotypes", ",", "and", "PG3-specific", "cells", "were", "mainly", "cytotoxic", "(", "Fig.", "4d", "bottom", ")", "." ] } ]
PMC11705862
Zoomed-in images of microglias in the yellow squares are shown to the right in (C and D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Zoomed-in", "images", "of", "microglias", "in", "the", "yellow", "squares", "are", "shown", "to", "the", "right", "in", "(", "C", "and", "D", ")", "." ] } ]
PMC11673902
This method determines the viscoelasticity of erythrocytes, granulocytes, and peripheral blood mononuclear cells in a single measurement and enables differentiation of B and CD4+ T lymphocytes by measuring mechanical properties .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "method", "determines", "the", "viscoelasticity", "of", "erythrocytes", ",", "granulocytes", ",", "and", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "in", "a", "single", "measurement", "and", "enables", "differentiation", "of", "B", "and", "CD4", "+", "T", "lymphocytes", "by", "measuring", "mechanical", "properties", "." ] } ]
PMC9429973
IL-2, IL-6 and IFN-γ levels were higher in patients than controls.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IL-2", ",", "IL-6", "and", "IFN-γ", "levels", "were", "higher", "in", "patients", "than", "controls", "." ] } ]
PMC9739791
The complex was also found to be stable both at high (pH = 9) and low (pH = 3) pH values.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "complex", "was", "also", "found", "to", "be", "stable", "both", "at", "high", "(", "pH", "=", "9", ")", "and", "low", "(", "pH", "=", "3", ")", "pH", "values", "." ] } ]
PMC10698968
We performed an in vitro phenotypic characterization through multiple biological assays, firstly to verify the neoplastic nature of the MF-R 3 cell line and secondly to investigate the validity of MF-R 3 2D and 3D cultures as preclinical models to recapitulate the morphologic and phenotypic characteristics of the original tumour, increasing the spectrum of available tools to be used in different experimental settings.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "performed", "an", "in", "vitro", "phenotypic", "characterization", "through", "multiple", "biological", "assays", ",", "firstly", "to", "verify", "the", "neoplastic", "nature", "of", "the", "MF-R", "3", "cell", "line", "and", "secondly", "to", "investigate", "the", "validity", "of", "MF-R", "3", "2D", "and", "3D", "cultures", "as", "preclinical", "models", "to", "recapitulate", "the", "morphologic", "and", "phenotypic", "characteristics", "of", "the", "original", "tumour", ",", "increasing", "the", "spectrum", "of", "available", "tools", "to", "be", "used", "in", "different", "experimental", "settings", "." ] } ]
PMC6450504
Following treatments, the spheroids were washed with PBS and fixed in 4% paraformaldehyde overnight at 4 °C.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "treatments", ",", "the", "spheroids", "were", "washed", "with", "PBS", "and", "fixed", "in", "4", "%", "paraformaldehyde", "overnight", "at", "4", "°", "C", "." ] } ]
PMC11770130
The cohort of children was described in the previous study, and the study has been approved by the ethics committee of Peking University Third Hospital (ethnic approval number 2021-283-06).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cohort", "of", "children", "was", "described", "in", "the", "previous", "study", ",", "and", "the", "study", "has", "been", "approved", "by", "the", "ethics", "committee", "of", "Peking", "University", "Third", "Hospital", "(", "ethnic", "approval", "number", "2021", "-", "283", "-", "06", ")", "." ] } ]
PMC3995603
The plasma histamine levels in the control group (39.85 ± 5.44 ng/mL) were elevated compared to the normal group (28.56 ± 2.56 ng/mL).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "plasma", "histamine", "levels", "in", "the", "control", "group", "(", "39.85", "±", "5.44", "ng/mL", ")", "were", "elevated", "compared", "to", "the", "normal", "group", "(", "28.56", "±", "2.56", "ng/mL", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The rituximab was given weekly in the first MBVP cycle, fortnightly in the second (in total 6 rituximab administrations).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "rituximab", "was", "given", "weekly", "in", "the", "first", "MBVP", "cycle", ",", "fortnightly", "in", "the", "second", "(", "in", "total", "6", "rituximab", "administrations", ")", "." ] } ]
PMC11489351
G, representative immunoblot for Notch1 and loading control (β-tubulin; β-Tub) using lysates from control MCF10A cells or MCF10A cells treated for 24 h with an inhibitor of the sodium bicarbonate transporter (S0859) to lower pHi or incubated under 15% CO2 atmospheric conditions to raise pHi (see Methods and Fig. S4 for details).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "G", ",", "representative", "immunoblot", "for", "Notch1", "and", "loading", "control", "(", "β-tubulin", ";", "β-Tub", ")", "using", "lysates", "from", "control", "MCF10A", "cells", "or", "MCF10A", "cells", "treated", "for", "24", "h", "with", "an", "inhibitor", "of", "the", "sodium", "bicarbonate", "transporter", "(", "S0859", ")", "to", "lower", "pHi", "or", "incubated", "under", "15", "%", "CO2", "atmospheric", "conditions", "to", "raise", "pHi", "(", "see", "Methods", "and", "Fig.", "S4", "for", "details", ")", "." ] } ]
PMC11423992
10687–010, Gibco).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "10687–010", ",", "Gibco", ")", "." ] } ]
PMC10158546
The following TaqMan gene expression assays were used: ACTB (Hs03023943_g1), GFAP (Hs00909233_m1), TUBB3 (Hs00801390_s1), PRNP (Hs01920617_s1) and PRNP_CDS (Hs04937277_s1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "following", "TaqMan", "gene", "expression", "assays", "were", "used", ":", "ACTB", "(", "Hs03023943_g1", ")", ",", "GFAP", "(", "Hs00909233_m1", ")", ",", "TUBB3", "(", "Hs00801390_s1", ")", ",", "PRNP", "(", "Hs01920617_s1", ")", "and", "PRNP_CDS", "(", "Hs04937277_s1", ")", "." ] } ]
PMC8557138
Morphological and functional heterogeneity along the vascular tree has been well documented (Gerritsen 1987; Castro et al. 2018).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Morphological", "and", "functional", "heterogeneity", "along", "the", "vascular", "tree", "has", "been", "well", "documented", "(", "Gerritsen", "1987", ";", "Castro", "et", "al.", "2018", ")", "." ] } ]
PMC11740399
To study the tissue distribution of the SRT3025 and OXA after 3025@ML + OXA administration, the subcutaneous tumor model was constructed in 5 nude mice in each group as previously described.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "study", "the", "tissue", "distribution", "of", "the", "SRT3025", "and", "OXA", "after", "3025@ML", "+", "OXA", "administration", ",", "the", "subcutaneous", "tumor", "model", "was", "constructed", "in", "5", "nude", "mice", "in", "each", "group", "as", "previously", "described", "." ] } ]
PMC11678841
Common antifungal treatments primarily focus on alleviating symptoms and eradicating the pathogen but often fail to restore the inflammatory homeostasis of mucosal tissues, leading to recurrent infections.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Common", "antifungal", "treatments", "primarily", "focus", "on", "alleviating", "symptoms", "and", "eradicating", "the", "pathogen", "but", "often", "fail", "to", "restore", "the", "inflammatory", "homeostasis", "of", "mucosal", "tissues", ",", "leading", "to", "recurrent", "infections", "." ] } ]
PMC11591052
Additionally, 20E has been utilized in multiple clinical trials by the French company “BioPhytis” to treat Dushen’s myodystrophy, Alzheimer’s disease, sarcopenia, and the severe distress syndrome that developed following the COVID-19 outbreak (https://www.biophytis.com/ (accessed on 22 March 2024)) .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "20E", "has", "been", "utilized", "in", "multiple", "clinical", "trials", "by", "the", "French", "company", "“", "BioPhytis", "”", "to", "treat", "Dushen", "’s", "myodystrophy", ",", "Alzheimer", "’s", "disease", ",", "sarcopenia", ",", "and", "the", "severe", "distress", "syndrome", "that", "developed", "following", "the", "COVID-19", "outbreak", "(", "https://www.biophytis.com/", "(", "accessed", "on", "22", "March", "2024", ")", ")", "." ] } ]
PMC11291490
Statistical significance was assessed using an unpaired Student’s t-test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Statistical", "significance", "was", "assessed", "using", "an", "unpaired", "Student", "’s", "t-test", "." ] } ]
PMC11754784
Data are represented as mean ± s.d. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "represented", "as", "mean", "±", "s.d", ".", "(" ] } ]
PMC11549612
Methylation analysis via the OncoDB database.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methylation", "analysis", "via", "the", "OncoDB", "database", "." ] } ]
PMC11271278
Seed regions for AmpliconArchitect were identified using the default settings of the prepareAA script.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Seed", "regions", "for", "AmpliconArchitect", "were", "identified", "using", "the", "default", "settings", "of", "the", "prepareAA", "script", "." ] } ]
PMC9429973
The incidence of vaccine-related anaphylaxis has been reported to be 5 times higher for mRNA vaccines than others.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "incidence", "of", "vaccine-related", "anaphylaxis", "has", "been", "reported", "to", "be", "5", "times", "higher", "for", "mRNA", "vaccines", "than", "others", "." ] } ]
PMC7823217
B. (a) The bioprinted model of hepatocellular carcinoma (3DP-HepG2) directly after printing (b) Proliferation rates of cells in 3DP-HepG2 and in its 2D counterpart (2D-HepG2) at different time points. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B.", "(", "a", ")", "The", "bioprinted", "model", "of", "hepatocellular", "carcinoma", "(", "3DP-HepG2", ")", "directly", "after", "printing", "(", "b", ")", "Proliferation", "rates", "of", "cells", "in", "3DP-HepG2", "and", "in", "its", "2D", "counterpart", "(", "2D-HepG2", ")", "at", "different", "time", "points", ".", "(" ] } ]
PMC8481254
We have previously reported that high glucose (HG)-linked increases in the O-GlcNAcylation of target proteins plays significant roles in the development of liver cancer [11–13], HG is able to induce O-GlcNAcylation and expression and Yes-associated protein (YAP) can be modified by O-GlcNAcylation to increase its stability.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "have", "previously", "reported", "that", "high", "glucose", "(HG)-linked", "increases", "in", "the", "O-GlcNAcylation", "of", "target", "proteins", "plays", "significant", "roles", "in", "the", "development", "of", "liver", "cancer", "[", "11–13", "]", ",", "HG", "is", "able", "to", "induce", "O-GlcNAcylation", "and", "expression", "and", "Yes-associated", "protein", "(", "YAP", ")", "can", "be", "modified", "by", "O-GlcNAcylation", "to", "increase", "its", "stability", "." ] } ]
PMC11634794
Clear cell Renal Cell Carcinoma (ccRCC), accounting for approximately 75% of all cases, represents the predominant pathological type within RCC and serves as the primary cause of RCC-associated deaths (2).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Clear", "cell", "Renal", "Cell", "Carcinoma", "(", "ccRCC", ")", ",", "accounting", "for", "approximately", "75", "%", "of", "all", "cases", ",", "represents", "the", "predominant", "pathological", "type", "within", "RCC", "and", "serves", "as", "the", "primary", "cause", "of", "RCC-associated", "deaths", "(", "2", ")", "." ] } ]
PMC11675244
Other agents, such as salinomycin, an antibiotic potassium ionophore, have been shown to selectively kill breast cancer stem cells by blocking Wnt/β-catenin signaling and inducing degradation of the Wnt co-receptor LRP6 .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Other", "agents", ",", "such", "as", "salinomycin", ",", "an", "antibiotic", "potassium", "ionophore", ",", "have", "been", "shown", "to", "selectively", "kill", "breast", "cancer", "stem", "cells", "by", "blocking", "Wnt/β-catenin", "signaling", "and", "inducing", "degradation", "of", "the", "Wnt", "co-receptor", "LRP6", "." ] } ]
PMC11026382
Taken together, our data demonstrates at single-residue resolution how epistasis mediated through a biochemical interaction reshapes a mutational landscape.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Taken", "together", ",", "our", "data", "demonstrates", "at", "single-residue", "resolution", "how", "epistasis", "mediated", "through", "a", "biochemical", "interaction", "reshapes", "a", "mutational", "landscape", "." ] } ]
PMC10706275
CRISPR-Cas9 technology, known for its convenience, precision, and efficiency, has seen rapid development .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CRISPR-Cas9", "technology", ",", "known", "for", "its", "convenience", ",", "precision", ",", "and", "efficiency", ",", "has", "seen", "rapid", "development", "." ] } ]
PMC11696576
The activities of human recombinant cPLA2α, GVIA iPLA2 and GV sPLA2 were measured using a modified Dole radioactivity-based group-specific mixed micelle assay described previously for measuring the activity of GK470/AVX235.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "activities", "of", "human", "recombinant", "cPLA2α", ",", "GVIA", "iPLA2", "and", "GV", "sPLA2", "were", "measured", "using", "a", "modified", "Dole", "radioactivity-based", "group-specific", "mixed", "micelle", "assay", "described", "previously", "for", "measuring", "the", "activity", "of", "GK470/AVX235", "." ] } ]
PMC11394730
Furthermore, in contrast to the vehicle-treated group, emodin administration dramatically increased the cleaved caspase-3, -9, and PARP expression levels.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "in", "contrast", "to", "the", "vehicle-treated", "group", ",", "emodin", "administration", "dramatically", "increased", "the", "cleaved", "caspase-3", ",", "-9", ",", "and", "PARP", "expression", "levels", "." ] } ]
PMC11730320
During the conversion step, demultiplexing of samples was performed and QC metrics were computed to assess the sequencing quality.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "the", "conversion", "step", ",", "demultiplexing", "of", "samples", "was", "performed", "and", "QC", "metrics", "were", "computed", "to", "assess", "the", "sequencing", "quality", "." ] } ]
PMC9592219
Weiler et al. found that activating YAP can induce CIN.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Weiler", "et", "al.", "found", "that", "activating", "YAP", "can", "induce", "CIN", "." ] } ]
PMC7602170
However, the upstream activators and downstream regulators of the mTORC2 pathway are poorly understood, unlike mTORC1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "upstream", "activators", "and", "downstream", "regulators", "of", "the", "mTORC2", "pathway", "are", "poorly", "understood", ",", "unlike", "mTORC1", "." ] } ]
PMC9429973
Among HMR mutations, ASXL1 was mutated in 88 (23%) pts, SRSF2 in 35 (9%), EZH2 in 32 (8%), U2AF1 in 15 (5%), and IDH1/2 in 11 (3%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "HMR", "mutations", ",", "ASXL1", "was", "mutated", "in", "88", "(", "23", "%", ")", "pts", ",", "SRSF2", "in", "35", "(", "9", "%", ")", ",", "EZH2", "in", "32", "(", "8", "%", ")", ",", "U2AF1", "in", "15", "(", "5", "%", ")", ",", "and", "IDH1/2", "in", "11", "(", "3", "%", ")", "." ] } ]
PMC11673128
We hypothesized that the combination of TKIs and anti-CD47 mAb could restore antitumor immunity by enhancing phagocytosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "hypothesized", "that", "the", "combination", "of", "TKIs", "and", "anti-CD47", "mAb", "could", "restore", "antitumor", "immunity", "by", "enhancing", "phagocytosis", "." ] } ]
PMC9672323
The effect of drugs on the cell cycle phase of T cells in PBMCs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "effect", "of", "drugs", "on", "the", "cell", "cycle", "phase", "of", "T", "cells", "in", "PBMCs", "." ] } ]
PMC11106977
Furthermore, OGT deficiency inhibited the O-GlcNAcylation of NF-κB p65 and NFATc1, preventing their transfer to the nucleus and reducing downstream transcriptional activities that control osteoclast differentiation .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "OGT", "deficiency", "inhibited", "the", "O-GlcNAcylation", "of", "NF-κB", "p65", "and", "NFATc1", ",", "preventing", "their", "transfer", "to", "the", "nucleus", "and", "reducing", "downstream", "transcriptional", "activities", "that", "control", "osteoclast", "differentiation", "." ] } ]