Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11641630
In conclusion, both mycobacteria reduce migration, invasion, and anchorage-independent growth of BC cells, with their effectiveness varying by species and tumor differentiation grade.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "conclusion", ",", "both", "mycobacteria", "reduce", "migration", ",", "invasion", ",", "and", "anchorage-independent", "growth", "of", "BC", "cells", ",", "with", "their", "effectiveness", "varying", "by", "species", "and", "tumor", "differentiation", "grade", "." ] } ]
PMC11087766
One-step lysis curves of P. aeruginosa infected with wild-type or PicA T367P mutant PhiKZ.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One-step", "lysis", "curves", "of", "P.", "aeruginosa", "infected", "with", "wild-type", "or", "PicA", "T367P", "mutant", "PhiKZ", "." ] } ]
PMC11285179
Chromatin immunoprecipitation followed by quantitative PCR (ChIP-qPCR) was employed to validate the transcriptional regulatory ability and affinity of RXRα to specific sites at the ANGPT1 promoter.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chromatin", "immunoprecipitation", "followed", "by", "quantitative", "PCR", "(", "ChIP-qPCR", ")", "was", "employed", "to", "validate", "the", "transcriptional", "regulatory", "ability", "and", "affinity", "of", "RXRα", "to", "specific", "sites", "at", "the", "ANGPT1", "promoter", "." ] } ]
PMC11413393
Additionally, the majority of genes in this upregulated list (629/1005) did not map to any known GO biological process pathways and consist primarily of microRNAs (miRNAs), long non-coding RNAs (lncRNAs), pseudogenes and novel genes/transcripts. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "the", "majority", "of", "genes", "in", "this", "upregulated", "list", "(", "629/1005", ")", "did", "not", "map", "to", "any", "known", "GO", "biological", "process", "pathways", "and", "consist", "primarily", "of", "microRNAs", "(", "miRNAs", ")", ",", "long", "non-coding", "RNAs", "(", "lncRNAs", ")", ",", "pseudogenes", "and", "novel", "genes/transcripts", ".", "(" ] } ]
PMC8864075
Culture medium was refreshed and the cells were passaged when the confluency was 80%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Culture", "medium", "was", "refreshed", "and", "the", "cells", "were", "passaged", "when", "the", "confluency", "was", "80", "%", "." ] } ]
PMC9065483
After 24 h, mice were anesthetized and imaged using a live in vivo imaging system (Perkin Elmer).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "24", "h", ",", "mice", "were", "anesthetized", "and", "imaged", "using", "a", "live", "in", "vivo", "imaging", "system", "(", "Perkin", "Elmer", ")", "." ] } ]
PMC6182045
Cells were transfected with a modified pCDNA3.1 expression vector (22) encoding TZ97008 and the gene encoding resistance to Geneticin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "transfected", "with", "a", "modified", "pCDNA3.1", "expression", "vector", "(", "22", ")", "encoding", "TZ97008", "and", "the", "gene", "encoding", "resistance", "to", "Geneticin", "." ] } ]
PMC10222971
This bioassay is rapid, highly sensitive to a wide spectrum of activities, and is a powerful tool for detecting biologically active natural products.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "bioassay", "is", "rapid", ",", "highly", "sensitive", "to", "a", "wide", "spectrum", "of", "activities", ",", "and", "is", "a", "powerful", "tool", "for", "detecting", "biologically", "active", "natural", "products", "." ] } ]
PMC9429973
NF-kB target genes such as BIRC3, NFKB2, MHC II genes, and the T/NK cell-recruiting chemokines CXCL9, CXCL10, and CXCL11 were activated in target cells exposed to both birinapant and NK cells, compared to target cells exposed to NK cells alone (p value adj < 0.05).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "NF-kB", "target", "genes", "such", "as", "BIRC3", ",", "NFKB2", ",", "MHC", "II", "genes", ",", "and", "the", "T/NK", "cell-recruiting", "chemokines", "CXCL9", ",", "CXCL10", ",", "and", "CXCL11", "were", "activated", "in", "target", "cells", "exposed", "to", "both", "birinapant", "and", "NK", "cells", ",", "compared", "to", "target", "cells", "exposed", "to", "NK", "cells", "alone", "(", "p", "value", "adj", "<", "0.05", ")", "." ] } ]
PMC11638288
The binding of NK cell receptor NKp46 to its ligands plays a crucial role not only in viral and bacterial infections but also in the clearance of fungal infections within the body.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "binding", "of", "NK", "cell", "receptor", "NKp46", "to", "its", "ligands", "plays", "a", "crucial", "role", "not", "only", "in", "viral", "and", "bacterial", "infections", "but", "also", "in", "the", "clearance", "of", "fungal", "infections", "within", "the", "body", "." ] } ]
PMC9429973
Only variants with an allelic frequency (VAF) ≥ 2% and annotated as pathogenic or probably pathogenic were considered.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Only", "variants", "with", "an", "allelic", "frequency", "(", "VAF", ")", "≥", "2", "%", "and", "annotated", "as", "pathogenic", "or", "probably", "pathogenic", "were", "considered", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: We enrolled 53 patients affected by MPNs, naïve from any therapy, with the only exception of ASA (taken by 50% of patients).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "We", "enrolled", "53", "patients", "affected", "by", "MPNs", ",", "naïve", "from", "any", "therapy", ",", "with", "the", "only", "exception", "of", "ASA", "(", "taken", "by", "50", "%", "of", "patients", ")", "." ] } ]
PMC11775197
A well-established example exemplifies that the PPARγ agonist 15-d-PGJ2 and troglitazone block the IL-6 signaling pathway through the inactivation of STAT3, which induces attenuated proliferation and increased apoptosis in MM cells .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "well-established", "example", "exemplifies", "that", "the", "PPARγ", "agonist", "15-d-PGJ2", "and", "troglitazone", "block", "the", "IL-6", "signaling", "pathway", "through", "the", "inactivation", "of", "STAT3", ",", "which", "induces", "attenuated", "proliferation", "and", "increased", "apoptosis", "in", "MM", "cells", "." ] } ]
PMC11549062
Consistent changes in lysosome dynamics were also found, the confined proportion was increased to 25.0% and 23.3% compared with 20.6% in control, and directed particles were reduced to 15.6% and 19.3% compared with 22.6% in control (Figure 2A,B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consistent", "changes", "in", "lysosome", "dynamics", "were", "also", "found", ",", "the", "confined", "proportion", "was", "increased", "to", "25.0", "%", "and", "23.3", "%", "compared", "with", "20.6", "%", "in", "control", ",", "and", "directed", "particles", "were", "reduced", "to", "15.6", "%", "and", "19.3", "%", "compared", "with", "22.6", "%", "in", "control", "(", "Figure", "2A", ",", "B", ")", "." ] } ]
PMC6379402
In addition to the four cancer iCells that we used in the previous section, we create iCells for 16 other cancer tissues: carcinoid, cervical, endometrial, glioma, head and neck, liver, lymphoma, melanoma, ovarian, pancreatic, renal, skin, stomach, testis, thyroid, and urothelial cancer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "the", "four", "cancer", "iCells", "that", "we", "used", "in", "the", "previous", "section", ",", "we", "create", "iCells", "for", "16", "other", "cancer", "tissues", ":", "carcinoid", ",", "cervical", ",", "endometrial", ",", "glioma", ",", "head", "and", "neck", ",", "liver", ",", "lymphoma", ",", "melanoma", ",", "ovarian", ",", "pancreatic", ",", "renal", ",", "skin", ",", "stomach", ",", "testis", ",", "thyroid", ",", "and", "urothelial", "cancer", "." ] } ]
PMC11617590
Chemotherapy is thus crucial in the treatment of pancreatic cancer .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chemotherapy", "is", "thus", "crucial", "in", "the", "treatment", "of", "pancreatic", "cancer", "." ] } ]
PMC11551844
The synergistic action of sterols in AuNPs-JC-2 seemed to favour enhanced anti-cancer activity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "synergistic", "action", "of", "sterols", "in", "AuNPs-JC-2", "seemed", "to", "favour", "enhanced", "anti-cancer", "activity", "." ] } ]
PMC11261875
Tumor cells favor aerobic glycolysis, a phenomenon observed when sufficient oxygen is available.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Tumor", "cells", "favor", "aerobic", "glycolysis", ",", "a", "phenomenon", "observed", "when", "sufficient", "oxygen", "is", "available", "." ] } ]
PMC11222184
3A network represented by pathway from the KEGG database consisting of significantly enriched terms in SH-SY5Y cells treated with XL-888 (A) and Debio0932 (B) The significantly enriched terms in SH-SY5Y cells treated with XL-888 and Debio0932 from the KEGG human gene set library A network represented by pathway from the KEGG database consisting of significantly enriched terms in SH-SY5Y cells treated with XL-888 (A) and Debio0932 (B) The results revealed that SH-SY5Y cells exposed to XL-888 were closely associated with the signaling pathways of Pathways in cancer, Amyotrophic lateral sclerosis, Cell cycle, Prion disease, Apoptosis, MAPK signaling pathway, Pathways of neurodegeneration, Central carbon metabolism in cancer, p53 signaling pathway, and Epstein-Barr virus infection.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "3A", "network", "represented", "by", "pathway", "from", "the", "KEGG", "database", "consisting", "of", "significantly", "enriched", "terms", "in", "SH-SY5Y", "cells", "treated", "with", "XL-888", "(", "A", ")", "and", "Debio0932", "(", "B", ")", "The", "significantly", "enriched", "terms", "in", "SH-SY5Y", "cells", "treated", "with", "XL-888", "and", "Debio0932", "from", "the", "KEGG", "human", "gene", "set", "library", "A", "network", "represented", "by", "pathway", "from", "the", "KEGG", "database", "consisting", "of", "significantly", "enriched", "terms", "in", "SH-SY5Y", "cells", "treated", "with", "XL-888", "(", "A", ")", "and", "Debio0932", "(", "B", ")", "The", "results", "revealed", "that", "SH-SY5Y", "cells", "exposed", "to", "XL-888", "were", "closely", "associated", "with", "the", "signaling", "pathways", "of", "Pathways", "in", "cancer", ",", "Amyotrophic", "lateral", "sclerosis", ",", "Cell", "cycle", ",", "Prion", "disease", ",", "Apoptosis", ",", "MAPK", "signaling", "pathway", ",", "Pathways", "of", "neurodegeneration", ",", "Central", "carbon", "metabolism", "in", "cancer", ",", "p53", "signaling", "pathway", ",", "and", "Epstein-Barr", "virus", "infection", "." ] } ]
PMC11471157
Image showing spheroids of HaCaT cells and NIH/3T3 cells stained for the cytokeratin marker CK AE1/AE3.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", "showing", "spheroids", "of", "HaCaT", "cells", "and", "NIH/3T3", "cells", "stained", "for", "the", "cytokeratin", "marker", "CK", "AE1/AE3", "." ] } ]
PMC11618052
In that order, the most potent derivatives were 8f, 8g, 8h, 8j, and 8l, with GI50 values of 37, 22, 25, 29, and 33 nM. This means that 8g, 8h, and 8j were stronger than Erlotinib (GI50 = 33 nM).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "that", "order", ",", "the", "most", "potent", "derivatives", "were", "8f", ",", "8", "g", ",", "8h", ",", "8j", ",", "and", "8l", ",", "with", "GI50", "values", "of", "37", ",", "22", ",", "25", ",", "29", ",", "and", "33", "nM.", "This", "means", "that", "8", "g", ",", "8h", ",", "and", "8j", "were", "stronger", "than", "Erlotinib", "(", "GI50", "=", "33", "nM", ")", "." ] } ]
PMC11367146
The conventional drug discovery approach has some limitations due to the complex nature of diseases that involve interaction among various molecules and pathways.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "conventional", "drug", "discovery", "approach", "has", "some", "limitations", "due", "to", "the", "complex", "nature", "of", "diseases", "that", "involve", "interaction", "among", "various", "molecules", "and", "pathways", "." ] } ]
PMC10667689
Analyzing the expression of GLUT-1, HK-2, and PFKFB-3 showed that TIM-3 controls aerobic glycolysis by affecting the expression of these proteins.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Analyzing", "the", "expression", "of", "GLUT-1", ",", "HK-2", ",", "and", "PFKFB-3", "showed", "that", "TIM-3", "controls", "aerobic", "glycolysis", "by", "affecting", "the", "expression", "of", "these", "proteins", "." ] } ]
PMC4816271
Expression of exogenous HuK and MuK CAR constructs was monitored by flow cytometry using a Cy5-conjugated polyclonal goat anti-human Fc antibody (Jackson Immuno).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Expression", "of", "exogenous", "HuK", "and", "MuK", "CAR", "constructs", "was", "monitored", "by", "flow", "cytometry", "using", "a", "Cy5-conjugated", "polyclonal", "goat", "anti-human", "Fc", "antibody", "(", "Jackson", "Immuno", ")", "." ] } ]
PMC11283030
The top three immunoinhibitors [KDR (b), CD274/PD-L1 (c), PDCD1LG2/PD-L2 (d)] and PDCD1/PD-1 (e) correlation with ACLY expression in ccRCC patients. *
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "top", "three", "immunoinhibitors", "[", "KDR", "(", "b", ")", ",", "CD274/PD-L1", "(", "c", ")", ",", "PDCD1LG2/PD-L2", "(", "d", ")", "]", "and", "PDCD1/PD-1", "(", "e", ")", "correlation", "with", "ACLY", "expression", "in", "ccRCC", "patients", ".", "*" ] } ]
PMC11519788
Moreover, the CCR2 inhibitor RS 504393 29 significantly repressed the macrophage migration induced by SPOP knockdown (Figure 5J).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "the", "CCR2", "inhibitor", "RS", "504393", "29", "significantly", "repressed", "the", "macrophage", "migration", "induced", "by", "SPOP", "knockdown", "(", "Figure", "5J", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Patients were treated with 2 cycles of camrelizumab (CAM, 200 mg IV, q2w) followed by 2 cycles (28-day cycle) of CAM (IV, day 1 and day 15) combined with standard GEMOX (gemcitabine 1000 mg/m and oxaliplatin 100mg/m, IV, day 1 and day 15).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "were", "treated", "with", "2", "cycles", "of", "camrelizumab", "(", "CAM", ",", "200", "mg", "IV", ",", "q2w", ")", "followed", "by", "2", "cycles", "(", "28-day", "cycle", ")", "of", "CAM", "(", "IV", ",", "day", "1", "and", "day", "15", ")", "combined", "with", "standard", "GEMOX", "(", "gemcitabine", "1000", "mg/m", "and", "oxaliplatin", "100mg/m", ",", "IV", ",", "day", "1", "and", "day", "15", ")", "." ] } ]
PMC11122631
The LC-40D solvent delivery module, DGU-405 de-gassing unit, CBM-40 system controller, CTO-40S column oven, SPD-M40 photo diode array detector, and FRC-10A fraction collector made up the Shimadzu (Kyoto, Japan) HPLC apparatus.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "LC-40D", "solvent", "delivery", "module", ",", "DGU-405", "de-gassing", "unit", ",", "CBM-40", "system", "controller", ",", "CTO-40S", "column", "oven", ",", "SPD-M40", "photo", "diode", "array", "detector", ",", "and", "FRC-10A", "fraction", "collector", "made", "up", "the", "Shimadzu", "(", "Kyoto", ",", "Japan", ")", "HPLC", "apparatus", "." ] } ]
PMC9429973
Secondary objectives were to evaluate the CR/CRi after cycle 1 and 4, compare OS and RFS between both triplets, quality of life, medical resources, exploration of biomarkers, and immune recovery.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Secondary", "objectives", "were", "to", "evaluate", "the", "CR/CRi", "after", "cycle", "1", "and", "4", ",", "compare", "OS", "and", "RFS", "between", "both", "triplets", ",", "quality", "of", "life", ",", "medical", "resources", ",", "exploration", "of", "biomarkers", ",", "and", "immune", "recovery", "." ] } ]
PMC9429973
Results: We observed a striking erythroid/megakaryocytic differentiation bias after treatment in 16/45 patients, whereas the other patient group (n=29) showed predominant myeloid differentiation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "We", "observed", "a", "striking", "erythroid/megakaryocytic", "differentiation", "bias", "after", "treatment", "in", "16/45", "patients", ",", "whereas", "the", "other", "patient", "group", "(", "n=29", ")", "showed", "predominant", "myeloid", "differentiation", "." ] } ]
PMC11377827
B, C) Comparative bubble plots of HIF suppressor screen (B), or activator screen (C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", ",", "C", ")", "Comparative", "bubble", "plots", "of", "HIF", "suppressor", "screen", "(", "B", ")", ",", "or", "activator", "screen", "(", "C", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Among patients who died, the majority died from cause other than pLCH.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "patients", "who", "died", ",", "the", "majority", "died", "from", "cause", "other", "than", "pLCH", "." ] } ]
PMC5308810
Interestingly, we could barely detect CD44/CD24 and CD133/CD24 CSC populations in both A2780 and A2780/ADR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "we", "could", "barely", "detect", "CD44/CD24", "and", "CD133/CD24", "CSC", "populations", "in", "both", "A2780", "and", "A2780/ADR", "." ] } ]
PMC9429973
We studied clinical features of ET patients presented to our hospital according to their mutation status.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "studied", "clinical", "features", "of", "ET", "patients", "presented", "to", "our", "hospital", "according", "to", "their", "mutation", "status", "." ] } ]
PMC10887351
All these data supported the evidence of the antioxidant properties of β3-ARs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "these", "data", "supported", "the", "evidence", "of", "the", "antioxidant", "properties", "of", "β3-ARs", "." ] } ]
PMC6742971
The mice were purchased from The Jackson Laboratory (Bar Harbor, ME) and then bred in-house.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "mice", "were", "purchased", "from", "The", "Jackson", "Laboratory", "(", "Bar", "Harbor", ",", "ME", ")", "and", "then", "bred", "in-house", "." ] } ]
PMC7812570
Images were acquired with an Odyssey infrared imaging system (LI-COR Biosciences, Lincoln, NE, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Images", "were", "acquired", "with", "an", "Odyssey", "infrared", "imaging", "system", "(", "LI-COR", "Biosciences", ",", "Lincoln", ",", "NE", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The risk of thrombosis in MPNs was higher if HTN was also associated with other cardiovascular risk factors, i.e., dyslipidemia, diabetes or smoking.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "risk", "of", "thrombosis", "in", "MPNs", "was", "higher", "if", "HTN", "was", "also", "associated", "with", "other", "cardiovascular", "risk", "factors", ",", "i.e.", ",", "dyslipidemia", ",", "diabetes", "or", "smoking", "." ] } ]
PMC11718109
Quantifications of individual vesicle size from the VMAT2-synapsin and synaptophysin-synapsin vesicle clusters are shown in dot plot (E) and frequency histogram (F).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quantifications", "of", "individual", "vesicle", "size", "from", "the", "VMAT2-synapsin", "and", "synaptophysin-synapsin", "vesicle", "clusters", "are", "shown", "in", "dot", "plot", "(", "E", ")", "and", "frequency", "histogram", "(", "F", ")", "." ] } ]
PMC11139449
It uses a single-stranded DNA fragment as a donor template with homology to the target site and a matching PAM sequence.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "uses", "a", "single-stranded", "DNA", "fragment", "as", "a", "donor", "template", "with", "homology", "to", "the", "target", "site", "and", "a", "matching", "PAM", "sequence", "." ] } ]
PMC9429973
Nevertheless, whether expanded NK cells owned higher anti-HCMV function compared with primary NK cells in vitro and in vivo were still unknown.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nevertheless", ",", "whether", "expanded", "NK", "cells", "owned", "higher", "anti-HCMV", "function", "compared", "with", "primary", "NK", "cells", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "were", "still", "unknown", "." ] } ]
PMC10380508
An analysis of PAX2 and PAX8 expression levels in relation to the survival of RCC patients revealed high expression levels of both PAX2 (p < 0.001; Figure 5B) and PAX8 (p = 0.006; Figure 5C) in RCC which were associated with better overall patient survival.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "An", "analysis", "of", "PAX2", "and", "PAX8", "expression", "levels", "in", "relation", "to", "the", "survival", "of", "RCC", "patients", "revealed", "high", "expression", "levels", "of", "both", "PAX2", "(", "p", "<", "0.001", ";", "Figure", "5B", ")", "and", "PAX8", "(", "p", "=", "0.006", ";", "Figure", "5C", ")", "in", "RCC", "which", "were", "associated", "with", "better", "overall", "patient", "survival", "." ] } ]
PMC11361748
Cells were cultured in DMEM medium (Gibco #11995–065) supplemented with 10% FBS and 0.01% Penicillin-Streptomycin (Gibco #15140–122).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "cultured", "in", "DMEM", "medium", "(", "Gibco", "#", "11995–065", ")", "supplemented", "with", "10", "%", "FBS", "and", "0.01", "%", "Penicillin-Streptomycin", "(", "Gibco", "#", "15140–122", ")", "." ] } ]
PMC9429973
MFC MRD negativity probability was higher among patients receiving CPX-351 as induction therapy (MFC MRD negativity rate of 26/40, 65% and 25/55, 45% in CR patients who received CPX-351 or FLAI, respectively, p<0.05).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MFC", "MRD", "negativity", "probability", "was", "higher", "among", "patients", "receiving", "CPX-351", "as", "induction", "therapy", "(", "MFC", "MRD", "negativity", "rate", "of", "26/40", ",", "65", "%", "and", "25/55", ",", "45", "%", "in", "CR", "patients", "who", "received", "CPX-351", "or", "FLAI", ",", "respectively", ",", "p<0.05", ")", "." ] } ]
PMC9119314
Although the RTS,S malaria vaccine has now been approved for the prevention of P. falciparum malaria in children in regions where moderate-high transmission occurs, the current situation underlines the need for novel antimalarial drugs in order to achieve the Global technical strategy aim of reducing malaria incidence and deaths by 90% over the period 2016–2030 (WHO, 2016).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "the", "RTS", ",", "S", "malaria", "vaccine", "has", "now", "been", "approved", "for", "the", "prevention", "of", "P.", "falciparum", "malaria", "in", "children", "in", "regions", "where", "moderate-high", "transmission", "occurs", ",", "the", "current", "situation", "underlines", "the", "need", "for", "novel", "antimalarial", "drugs", "in", "order", "to", "achieve", "the", "Global", "technical", "strategy", "aim", "of", "reducing", "malaria", "incidence", "and", "deaths", "by", "90", "%", "over", "the", "period", "2016–2030", "(", "WHO", ",", "2016", ")", "." ] } ]
PMC11568601
The underlying mechanism might be associated with the activation of IRE1/CHOP pathway in ER stress.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "underlying", "mechanism", "might", "be", "associated", "with", "the", "activation", "of", "IRE1/CHOP", "pathway", "in", "ER", "stress", "." ] } ]
PMC10380508
Two controls were included: cells without siRNA transfection and cells transfected with the negative control siRNA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Two", "controls", "were", "included", ":", "cells", "without", "siRNA", "transfection", "and", "cells", "transfected", "with", "the", "negative", "control", "siRNA", "." ] } ]
PMC8973085
; IR (KBr, v, cm): 3271 (NH), 3141 (NH), 2220 (CN), 1667 (C=O), 1649 (C=O); H NMR (DMSO-d6): δ 2.36 (s, 3H, CH3), 2.39 (s, 3H, CH3), 2.65 (s, 3H, CH3), 4.20 (s, 2H, CH2), 6.09–7.45 (m, 12H, CH-Ar), 9.43 (bs, 1H, NH), 10.62 (bs, 1H, NH); C NMR (DMSO-d6): δ 20.90, 21.30, 21.50, 40.10, 105.20, 112.40, 113.50, 113.80, 115.70, 116.10, 122.40, 123.20, 127.40, 129.20, 129.90, 134.50, 135.30, 136.10, 150.20, 154.40, 155.10, 162.10, 163.40, 165.20, 168.80, 170.10; MS m/z (%): 524 [M] (90).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ ";", "IR", "(", "KBr", ",", "v", ",", "cm", "):", "3271", "(", "NH", ")", ",", "3141", "(", "NH", ")", ",", "2220", "(", "CN", ")", ",", "1667", "(", "C", "=", "O", ")", ",", "1649", "(", "C", "=", "O", ")", ";", "H", "NMR", "(", "DMSO-d6", "):", "δ", "2.36", "(", "s", ",", "3H", ",", "CH3", ")", ",", "2.39", "(", "s", ",", "3H", ",", "CH3", ")", ",", "2.65", "(", "s", ",", "3H", ",", "CH3", ")", ",", "4.20", "(", "s", ",", "2H", ",", "CH2", ")", ",", "6.09–7.45", "(", "m", ",", "12H", ",", "CH-Ar", ")", ",", "9.43", "(", "bs", ",", "1H", ",", "NH", ")", ",", "10.62", "(", "bs", ",", "1H", ",", "NH", ")", ";", "C", "NMR", "(", "DMSO-d6", "):", "δ", "20.90", ",", "21.30", ",", "21.50", ",", "40.10", ",", "105.20", ",", "112.40", ",", "113.50", ",", "113.80", ",", "115.70", ",", "116.10", ",", "122.40", ",", "123.20", ",", "127.40", ",", "129.20", ",", "129.90", ",", "134.50", ",", "135.30", ",", "136.10", ",", "150.20", ",", "154.40", ",", "155.10", ",", "162.10", ",", "163.40", ",", "165.20", ",", "168.80", ",", "170.10", ";", "MS", "m/z", "(", "%", "):", "524", "[", "M", "]", "(", "90", ")", "." ] } ]
PMC5716223
During the early stage of myoblast fusion, NGF transiently up-regulates NFκB activity and, directly or indirectly trough a NFκB-mediated mechanism, anticipates the myogenic progression by modulating αBcry and Hsp27 expression and promoting, at a late differentiation stage, myonuclear fusion and the accumulation and stabilization of the MyHC myofibrillar component.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "the", "early", "stage", "of", "myoblast", "fusion", ",", "NGF", "transiently", "up-regulates", "NFκB", "activity", "and", ",", "directly", "or", "indirectly", "trough", "a", "NFκB-mediated", "mechanism", ",", "anticipates", "the", "myogenic", "progression", "by", "modulating", "αBcry", "and", "Hsp27", "expression", "and", "promoting", ",", "at", "a", "late", "differentiation", "stage", ",", "myonuclear", "fusion", "and", "the", "accumulation", "and", "stabilization", "of", "the", "MyHC", "myofibrillar", "component", "." ] } ]
PMC10777969
Their reactivity arises from the presence of the nucleophilic center located in the ring, and the electrophilic center on the carbon atom of the C=N bond.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Their", "reactivity", "arises", "from", "the", "presence", "of", "the", "nucleophilic", "center", "located", "in", "the", "ring", ",", "and", "the", "electrophilic", "center", "on", "the", "carbon", "atom", "of", "the", "C", "=", "N", "bond", "." ] } ]
PMC11696576
GK420 suppressed their production but had no effect when excess-free AA was included (Fig. 3a) indicating AA metabolism was not affected by GK420.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GK420", "suppressed", "their", "production", "but", "had", "no", "effect", "when", "excess-free", "AA", "was", "included", "(", "Fig.", "3a", ")", "indicating", "AA", "metabolism", "was", "not", "affected", "by", "GK420", "." ] } ]
PMC9429973
Normally only expressed during embryonic development and only minimally, if at all, in adult normal tissues, ROR1 is overexpressed on malignant cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Normally", "only", "expressed", "during", "embryonic", "development", "and", "only", "minimally", ",", "if", "at", "all", ",", "in", "adult", "normal", "tissues", ",", "ROR1", "is", "overexpressed", "on", "malignant", "cells", "." ] } ]
PMC9622879
Thus, we determine the following constraint:12[12pt] $$ E_^(t) + E_^(t) + E_^(t) = E_(t), $$,RESload(t)+Ei,REScharge(t)+Ei,RESsell(t)=Ei,RES(t),where is the energy from the RES of home i that is used for the appliances of this home in time slot t, and is the energy from the RES of home i that is sold back to the community in time slot t. To maintain the energy balance in a smart home, the total energy demand should be equal to the total energy supply.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "we", "determine", "the", "following", "constraint:12[12pt", "]", "$", "$", "E_^(t", ")", "+", "E_^(t", ")", "+", "E_^(t", ")", "=", "E_(t", ")", ",", "$", "$", ",", "RESload(t)+Ei", ",", "REScharge(t)+Ei", ",", "RESsell(t)=Ei", ",", "RES(t),where", "is", "the", "energy", "from", "the", "RES", "of", "home", "i", "that", "is", "used", "for", "the", "appliances", "of", "this", "home", "in", "time", "slot", "t", ",", "and", "is", "the", "energy", "from", "the", "RES", "of", "home", "i", "that", "is", "sold", "back", "to", "the", "community", "in", "time", "slot", "t.", "To", "maintain", "the", "energy", "balance", "in", "a", "smart", "home", ",", "the", "total", "energy", "demand", "should", "be", "equal", "to", "the", "total", "energy", "supply", "." ] } ]
PMC8193813
The sensor system was designed and built by the EPA’s Office of Research and Development, and the UAS was owned and flown by the Dow Corporate Aviation Group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "sensor", "system", "was", "designed", "and", "built", "by", "the", "EPA", "’s", "Office", "of", "Research", "and", "Development", ",", "and", "the", "UAS", "was", "owned", "and", "flown", "by", "the", "Dow", "Corporate", "Aviation", "Group", "." ] } ]
PMC11684269
A large retrospective cohort study involving 523 T2D patients found a significant increase in CD8 T cell senescence (CD28, CD127, and CD57) with CKD progression (157).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "large", "retrospective", "cohort", "study", "involving", "523", "T2D", "patients", "found", "a", "significant", "increase", "in", "CD8", "T", "cell", "senescence", "(", "CD28", ",", "CD127", ",", "and", "CD57", ")", "with", "CKD", "progression", "(", "157", ")", "." ] } ]
PMC8609870
The results described above indicated that lncRNAs played a role in RSA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "described", "above", "indicated", "that", "lncRNAs", "played", "a", "role", "in", "RSA", "." ] } ]
PMC11459296
B-ALL samples, buffy coats (n=3) and CBs (n=3) were obtained from the collaborating hospitals and the Catalan Blood and Tissue Bank, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B-ALL", "samples", ",", "buffy", "coats", "(", "n=3", ")", "and", "CBs", "(", "n=3", ")", "were", "obtained", "from", "the", "collaborating", "hospitals", "and", "the", "Catalan", "Blood", "and", "Tissue", "Bank", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11470999
Data are expressed means ± standard deviation (SD).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "expressed", "means", "±", "standard", "deviation", "(", "SD", ")", "." ] } ]
PMC11763764
And each replicate included 3 technical replicates.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "And", "each", "replicate", "included", "3", "technical", "replicates", "." ] } ]
PMC11587606
Typical images of RHBDF1 (Left) and PKCζ (Right) immunofluorescence-staining of human breast cancer and para-cancerous tissues; scale bar 50 μm (number of patients n = 6). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Typical", "images", "of", "RHBDF1", "(", "Left", ")", "and", "PKCζ", "(", "Right", ")", "immunofluorescence-staining", "of", "human", "breast", "cancer", "and", "para-cancerous", "tissues", ";", "scale", "bar", "50", "μm", "(", "number", "of", "patients", "n", "=", "6", ")", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
7 pts required ibr dose-reduction due to toxicity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "7", "pts", "required", "ibr", "dose-reduction", "due", "to", "toxicity", "." ] } ]
PMC6450504
The devices were immersed in 13 mL of each acceptor media and maintained in an orbital shaker at 37 °C at 125 rpm for 48 h. Samples were withdrawn from the release media and replaced with fresh media at predetermined time points over 48 h. The amount of drug released in the acceptor compartment was analyzed by HPLC after dilution with the mobile phase.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "devices", "were", "immersed", "in", "13", "mL", "of", "each", "acceptor", "media", "and", "maintained", "in", "an", "orbital", "shaker", "at", "37", "°", "C", "at", "125", "rpm", "for", "48", "h.", "Samples", "were", "withdrawn", "from", "the", "release", "media", "and", "replaced", "with", "fresh", "media", "at", "predetermined", "time", "points", "over", "48", "h.", "The", "amount", "of", "drug", "released", "in", "the", "acceptor", "compartment", "was", "analyzed", "by", "HPLC", "after", "dilution", "with", "the", "mobile", "phase", "." ] } ]
PMC11180402
B Expression of indicated proteins in 5637 cells treated with ISO at various time points; GAPDH served as a normalization reference.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", "Expression", "of", "indicated", "proteins", "in", "5637", "cells", "treated", "with", "ISO", "at", "various", "time", "points", ";", "GAPDH", "served", "as", "a", "normalization", "reference", "." ] } ]
PMC11803149
Photos of tumors isolated from mice analyzed as in (B) on day 20.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Photos", "of", "tumors", "isolated", "from", "mice", "analyzed", "as", "in", "(", "B", ")", "on", "day", "20", "." ] } ]
PMC11547972
Background: Plant derived isolated compounds or extracts enjoy great popularity among cancer patients, although knowledge about their mode of action is unclear.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Background", ":", "Plant", "derived", "isolated", "compounds", "or", "extracts", "enjoy", "great", "popularity", "among", "cancer", "patients", ",", "although", "knowledge", "about", "their", "mode", "of", "action", "is", "unclear", "." ] } ]
PMC11742670
Table 6The predicted IC50 of the most potent drugs for the A-549 cell line.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "6The", "predicted", "IC50", "of", "the", "most", "potent", "drugs", "for", "the", "A-549", "cell", "line", "." ] } ]
PMC11473750
f ChIP-PCR assays assessing fold enrichment of MYCN protein binding at two sites within the RNF121 gene promoter: the MYCN protein binding summit (−136 bp [Promoter]) or the negative control region (−2285 bp [Control]) using an anti-IgG (control) or anti-MYCN antibody in total cell lysates from either SHEP-TET21N or SK-N-BE(2)-C neuroblastoma cells, both with basal high MYCN expression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "f", "ChIP-PCR", "assays", "assessing", "fold", "enrichment", "of", "MYCN", "protein", "binding", "at", "two", "sites", "within", "the", "RNF121", "gene", "promoter", ":", "the", "MYCN", "protein", "binding", "summit", "(", "−136", "bp", "[", "Promoter", "]", ")", "or", "the", "negative", "control", "region", "(", "−2285", "bp", "[", "Control", "]", ")", "using", "an", "anti-IgG", "(", "control", ")", "or", "anti-MYCN", "antibody", "in", "total", "cell", "lysates", "from", "either", "SHEP-TET21N", "or", "SK-N-BE(2)-C", "neuroblastoma", "cells", ",", "both", "with", "basal", "high", "MYCN", "expression", "." ] } ]
PMC11765988
Other hematologic malignancies documented in patients with a prior sarcoidosis diagnosis exceeding one year include myeloma, acute myelogenous leukemia, hairy cell leukemia, chronic myelogenous leukemia, Epstein-Barr virus-associated lymphoproliferative disease, lymphoproliferative disorders, myeloproliferative disorder, chronic lymphocytic leukemia, mycosis fungoides, and T-cell granular lymphocytic leukemia .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Other", "hematologic", "malignancies", "documented", "in", "patients", "with", "a", "prior", "sarcoidosis", "diagnosis", "exceeding", "one", "year", "include", "myeloma", ",", "acute", "myelogenous", "leukemia", ",", "hairy", "cell", "leukemia", ",", "chronic", "myelogenous", "leukemia", ",", "Epstein-Barr", "virus-associated", "lymphoproliferative", "disease", ",", "lymphoproliferative", "disorders", ",", "myeloproliferative", "disorder", ",", "chronic", "lymphocytic", "leukemia", ",", "mycosis", "fungoides", ",", "and", "T-cell", "granular", "lymphocytic", "leukemia", "." ] } ]
PMC11599565
Only few cells express the TFs Klf-4 and SOX2 (E & F), mainly detectable in the nested cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Only", "few", "cells", "express", "the", "TFs", "Klf-4", "and", "SOX2", "(", "E", "&", "F", ")", ",", "mainly", "detectable", "in", "the", "nested", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
Among them, CDK4, a high-risk gene highly expressed in cluster A (Fig. 1G), is closely associated with cell proliferation by regulating the cell cycle, which is consistent with the GSVA results.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "them", ",", "CDK4", ",", "a", "high-risk", "gene", "highly", "expressed", "in", "cluster", "A", "(", "Fig.", "1", "G", ")", ",", "is", "closely", "associated", "with", "cell", "proliferation", "by", "regulating", "the", "cell", "cycle", ",", "which", "is", "consistent", "with", "the", "GSVA", "results", "." ] } ]
PMC11791203
Fig. 5(A) Three dimensional docking interaction images of 1,2-benzenedicarboxylic acid, Cyclododecanol, 2,4-Ditert-Butylphenol and Sulfurous acid, hexyl octyl ester onto Bax. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "5(A", ")", "Three", "dimensional", "docking", "interaction", "images", "of", "1,2-benzenedicarboxylic", "acid", ",", "Cyclododecanol", ",", "2,4-Ditert-Butylphenol", "and", "Sulfurous", "acid", ",", "hexyl", "octyl", "ester", "onto", "Bax", ".", "(" ] } ]
PMC11621565
QRT-PCR for α-synuclein mRNA performed 48 h after treatment with bacterial compounds (curli CsgA 16 µg/ml, PSMα1 16 µg/ml, LPS 1 µg/ml, 32 µg/ml and 64 µg/ml, rhamnolipid 10 µg/ml, 40 µg/ml and 80 ug/ml) on dopaminergic-differentiated SH-SY5Y cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "QRT-PCR", "for", "α-synuclein", "mRNA", "performed", "48", "h", "after", "treatment", "with", "bacterial", "compounds", "(", "curli", "CsgA", "16", "µg/ml", ",", "PSMα1", "16", "µg/ml", ",", "LPS", "1", "µg/ml", ",", "32", "µg/ml", "and", "64", "µg/ml", ",", "rhamnolipid", "10", "µg/ml", ",", "40", "µg/ml", "and", "80", "ug/ml", ")", "on", "dopaminergic-differentiated", "SH-SY5Y", "cells", "." ] } ]
PMC11013014
°C]) were determined using samples in open capillary tubes and are reported without correction.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "°", "C", "]", ")", "were", "determined", "using", "samples", "in", "open", "capillary", "tubes", "and", "are", "reported", "without", "correction", "." ] } ]
PMC8903741
Each digested insert gene was ligated to NotI- and HindIII- digested pcDNA3.1(−), respectively, resulting in pcDNA3.1(−)::anti-hMMP9 HC and pcDNA3.1(−)::anti-hMMP9 LC, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "digested", "insert", "gene", "was", "ligated", "to", "NotI-", "and", "HindIII-", "digested", "pcDNA3.1(−", ")", ",", "respectively", ",", "resulting", "in", "pcDNA3.1(−)::anti-hMMP9", "HC", "and", "pcDNA3.1(−)::anti-hMMP9", "LC", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC8750422
Furthermore, we show that upregulation of GPR87 in lung adenocarcinoma promoted metastatic properties both in vitro and in vivo through the activation of the AKT-eNOS-NO signaling pathway (Figure 6).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "we", "show", "that", "upregulation", "of", "GPR87", "in", "lung", "adenocarcinoma", "promoted", "metastatic", "properties", "both", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "through", "the", "activation", "of", "the", "AKT-eNOS-NO", "signaling", "pathway", "(", "Figure", "6", ")", "." ] } ]
PMC11055510
Nuclear and cytoplasmic RNA from the OC cells was separated with NE-PER™ Kit (Thermo Fisher Scientific, Inc.) following the manufacturer’s instructions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nuclear", "and", "cytoplasmic", "RNA", "from", "the", "OC", "cells", "was", "separated", "with", "NE-PER", "™", "Kit", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ",", "Inc.", ")", "following", "the", "manufacturer", "’s", "instructions", "." ] } ]
PMC9429973
Significantly higher mortality was documented in pts who needed supplemental oxygen (58/81;71%) (CFR 43.1 vs.4.3%; p<0.001), and intensive care unit (ICU) admission (25/81-30.9%; 19/25 needed mechanical ventilation) (CFR 88% vs.7.1%;p<0.001).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Significantly", "higher", "mortality", "was", "documented", "in", "pts", "who", "needed", "supplemental", "oxygen", "(", "58/81;71", "%", ")", "(", "CFR", "43.1", "vs.4.3", "%", ";", "p<0.001", ")", ",", "and", "intensive", "care", "unit", "(", "ICU", ")", "admission", "(", "25/81", "-", "30.9", "%", ";", "19/25", "needed", "mechanical", "ventilation", ")", "(", "CFR", "88", "%", "vs.7.1%;p<0.001", ")", "." ] } ]
PMC11583010
Safety pharmacology endpoints [cardiovascular, central nervous system, renal, and respiration] were included.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Safety", "pharmacology", "endpoints", "[", "cardiovascular", ",", "central", "nervous", "system", ",", "renal", ",", "and", "respiration", "]", "were", "included", "." ] } ]
PMC11342785
Despite its small size, TPPP is proposed to nucleate and stabilize MTs at discrete structures called Golgi outposts to promote elongation, branching, and polarization of myelin sheaths in oligodendrocytes (29).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Despite", "its", "small", "size", ",", "TPPP", "is", "proposed", "to", "nucleate", "and", "stabilize", "MTs", "at", "discrete", "structures", "called", "Golgi", "outposts", "to", "promote", "elongation", ",", "branching", ",", "and", "polarization", "of", "myelin", "sheaths", "in", "oligodendrocytes", "(", "29", ")", "." ] } ]
PMC11721295
Mice were monitored by bioluminescence imaging (BLI); when BLI reached 1 × 10 p/s at approximately 14 days after implantation, we randomized mice into 2 treatment groups and initiated treatment with vehicle (10% [w/v] sulfobutylether-β-cyclodextrin) or 30 mg/kg MRTX1133 (Selleckchem, E1051) in vehicle twice a day for 2 days by i.p.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mice", "were", "monitored", "by", "bioluminescence", "imaging", "(", "BLI", ")", ";", "when", "BLI", "reached", "1", "×", "10", "p/s", "at", "approximately", "14", "days", "after", "implantation", ",", "we", "randomized", "mice", "into", "2", "treatment", "groups", "and", "initiated", "treatment", "with", "vehicle", "(", "10", "%", "[", "w/v", "]", "sulfobutylether-β-cyclodextrin", ")", "or", "30", "mg/kg", "MRTX1133", "(", "Selleckchem", ",", "E1051", ")", "in", "vehicle", "twice", "a", "day", "for", "2", "days", "by", "i.p", "." ] } ]
PMC9430052
In xenograft NOG mouse models, GC012F eliminated B cell lymphoma including DLBCL, MCL and Burkitt lymphoma cell lines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "xenograft", "NOG", "mouse", "models", ",", "GC012F", "eliminated", "B", "cell", "lymphoma", "including", "DLBCL", ",", "MCL", "and", "Burkitt", "lymphoma", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC9684669
Indeed, our work demonstrated the abnormal expression of CAMK2 family members, particularly CAMK2D, which is dramatically overexpressed in MDR cells, and terfenadine treatment inhibits the CAMK2D phosphorylation in a manner comparable to that of the CAMK2 inhibitor KN62.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Indeed", ",", "our", "work", "demonstrated", "the", "abnormal", "expression", "of", "CAMK2", "family", "members", ",", "particularly", "CAMK2D", ",", "which", "is", "dramatically", "overexpressed", "in", "MDR", "cells", ",", "and", "terfenadine", "treatment", "inhibits", "the", "CAMK2D", "phosphorylation", "in", "a", "manner", "comparable", "to", "that", "of", "the", "CAMK2", "inhibitor", "KN62", "." ] } ]
PMC11754784
Boxed region in the plots indicated the percentage of macrophage that phagocytized cancer cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Boxed", "region", "in", "the", "plots", "indicated", "the", "percentage", "of", "macrophage", "that", "phagocytized", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC11658074
CD151, a crucial transmembrane scaffold protein, interacts with integrins (ITGs), such as ITGα6β1, α6β4, α3β1, and α7β1 .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CD151", ",", "a", "crucial", "transmembrane", "scaffold", "protein", ",", "interacts", "with", "integrins", "(", "ITGs", ")", ",", "such", "as", "ITGα6β1", ",", "α6β4", ",", "α3β1", ",", "and", "α7β1", "." ] } ]
PMC11089031
After identified the studies, we explored the expression pattern of ZNF692 in different cell types exposed to ICB agents using the dataset from the study by Kevin Bi et al using “gene explore” tools and “ZNF692” as keyword.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "identified", "the", "studies", ",", "we", "explored", "the", "expression", "pattern", "of", "ZNF692", "in", "different", "cell", "types", "exposed", "to", "ICB", "agents", "using", "the", "dataset", "from", "the", "study", "by", "Kevin", "Bi", "et", "al", "using", "“", "gene", "explore", "”", "tools", "and", "“", "ZNF692", "”", "as", "keyword", "." ] } ]
PMC11300085
Chemerin plays its role mainly by activating CMKLR1 receptor that is highly expressed in OC cells .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chemerin", "plays", "its", "role", "mainly", "by", "activating", "CMKLR1", "receptor", "that", "is", "highly", "expressed", "in", "OC", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
Results: The life expectancy of HCL patients increased gradually across all ages between 1989-2019, irrespective of sex (Fig A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "The", "life", "expectancy", "of", "HCL", "patients", "increased", "gradually", "across", "all", "ages", "between", "1989", "-", "2019", ",", "irrespective", "of", "sex", "(", "Fig", "A", ")", "." ] } ]
PMC11599565
Fontana-Masson staining for the histological detection of melanin was performed using a validated kit purchased from ScyTek (Utah, USA), following their instructions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fontana-Masson", "staining", "for", "the", "histological", "detection", "of", "melanin", "was", "performed", "using", "a", "validated", "kit", "purchased", "from", "ScyTek", "(", "Utah", ",", "USA", ")", ",", "following", "their", "instructions", "." ] } ]
PMC9429973
Search and screening followed the methodology of Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) and Cochrane.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Search", "and", "screening", "followed", "the", "methodology", "of", "Preferred", "Reporting", "Items", "for", "Systematic", "Reviews", "and", "Meta-Analyses", "(", "PRISMA", ")", "and", "Cochrane", "." ] } ]
PMC10957991
TRPV4 expression is increased upon tension from cellular crowding as shown by the Western blots, performed from lysates done either from sparse or confluent MCF10A cultures.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "TRPV4", "expression", "is", "increased", "upon", "tension", "from", "cellular", "crowding", "as", "shown", "by", "the", "Western", "blots", ",", "performed", "from", "lysates", "done", "either", "from", "sparse", "or", "confluent", "MCF10A", "cultures", "." ] } ]
PMC11469524
For example, the somewhat disappointing response rates to drugs targeting the intracellular RAS/MAPK pathway could be explained by strong negative feedbacks .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "example", ",", "the", "somewhat", "disappointing", "response", "rates", "to", "drugs", "targeting", "the", "intracellular", "RAS/MAPK", "pathway", "could", "be", "explained", "by", "strong", "negative", "feedbacks", "." ] } ]
PMC10778532
This generates a pseudo-hypoxic state leading to a reprogramming and shaping of an unfavorable tumor microenvironment and contributing to ccRCC development.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "generates", "a", "pseudo-hypoxic", "state", "leading", "to", "a", "reprogramming", "and", "shaping", "of", "an", "unfavorable", "tumor", "microenvironment", "and", "contributing", "to", "ccRCC", "development", "." ] } ]
PMC3681794
Hypoxia is able to induce resistance to etoposide and vincristine in neuroblastoma cells and doxorubicin, vincristine and actinomycin-D in rhabdomyosarcoma and Ewing’s sarcoma cells. ,
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hypoxia", "is", "able", "to", "induce", "resistance", "to", "etoposide", "and", "vincristine", "in", "neuroblastoma", "cells", "and", "doxorubicin", ",", "vincristine", "and", "actinomycin-D", "in", "rhabdomyosarcoma", "and", "Ewing", "’s", "sarcoma", "cells", ".", "," ] } ]
PMC10847511
To the best of our knowledge, only one study in 2012 reported a correlation between the TAI score, one of the genomic scar scores for HRD, and sensitivity to cisplatin in 10 breast cancer cell lines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "the", "best", "of", "our", "knowledge", ",", "only", "one", "study", "in", "2012", "reported", "a", "correlation", "between", "the", "TAI", "score", ",", "one", "of", "the", "genomic", "scar", "scores", "for", "HRD", ",", "and", "sensitivity", "to", "cisplatin", "in", "10", "breast", "cancer", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC9429973
Results: There were no deaths in the group of patients with remission of ALL.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "There", "were", "no", "deaths", "in", "the", "group", "of", "patients", "with", "remission", "of", "ALL", "." ] } ]
PMC4360730
In addition, the assays performed by the ENCODE Consortium will continue to increase in diversity and complexity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "the", "assays", "performed", "by", "the", "ENCODE", "Consortium", "will", "continue", "to", "increase", "in", "diversity", "and", "complexity", "." ] } ]
PMC11222184
Lee et al. showed that 17-DMAG, an Hsp90 inhibitor, could suppress self-renewal of breast cancer stem cells by downregulating BMI1 expression .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lee", "et", "al.", "showed", "that", "17-DMAG", ",", "an", "Hsp90", "inhibitor", ",", "could", "suppress", "self-renewal", "of", "breast", "cancer", "stem", "cells", "by", "downregulating", "BMI1", "expression", "." ] } ]
PMC11621493
Data is presented as the relative ratio of products. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "is", "presented", "as", "the", "relative", "ratio", "of", "products", ".", "(" ] } ]
PMC10887351
Later, β3-AR antagonism reduced melanoma growth in vivo by increasing the NK and CD8 cell numbers as well as their cytotoxicity in the TME through the regulation of Treg and MDSC sub-populations .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Later", ",", "β3-AR", "antagonism", "reduced", "melanoma", "growth", "in", "vivo", "by", "increasing", "the", "NK", "and", "CD8", "cell", "numbers", "as", "well", "as", "their", "cytotoxicity", "in", "the", "TME", "through", "the", "regulation", "of", "Treg", "and", "MDSC", "sub-populations", "." ] } ]
PMC11799620
The percentage of inhibition was expressed as the following equation: The method mentioned by Mathew and Abraham (2006) is used to study the ability of OFAE to inhibit the hydroxyl radical.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "percentage", "of", "inhibition", "was", "expressed", "as", "the", "following", "equation", ":", "The", "method", "mentioned", "by", "Mathew", "and", "Abraham", "(", "2006", ")", "is", "used", "to", "study", "the", "ability", "of", "OFAE", "to", "inhibit", "the", "hydroxyl", "radical", "." ] } ]