Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11766309
Furthermore, on the basis of multiple databases, including data retrieved from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and the Genotype-Tissue Expression (GTEx) database, an in-depth bioinformatics analysis was performed to determine the functional significance of YKT6 in various cancers; we utilized expression data from the TCGA and GTEx databases, gene copy number alteration data from the cBioPortal database, and gene mutation data for the high and low YKT6 expression groups from the UCSC Xena database.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "on", "the", "basis", "of", "multiple", "databases", ",", "including", "data", "retrieved", "from", "The", "Cancer", "Genome", "Atlas", "(", "TCGA", ")", "and", "the", "Genotype-Tissue", "Expression", "(", "GTEx", ")", "database", ",", "an", "in-depth", "bioinformatics", "analysis", "was", "performed", "to", "determine", "the", "functional", "significance", "of", "YKT6", "in", "various", "cancers", ";", "we", "utilized", "expression", "data", "from", "the", "TCGA", "and", "GTEx", "databases", ",", "gene", "copy", "number", "alteration", "data", "from", "the", "cBioPortal", "database", ",", "and", "gene", "mutation", "data", "for", "the", "high", "and", "low", "YKT6", "expression", "groups", "from", "the", "UCSC", "Xena", "database", "." ] } ]
PMC11093197
Quantitative analysis of sphere number (sphere size >25,000 μm, N = 3). *
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quantitative", "analysis", "of", "sphere", "number", "(", "sphere", "size", ">", "25,000", "μm", ",", "N", "=", "3", ")", ".", "*" ] } ]
PMC11687167
In addition to its role in infectious sepsis and atherosclerosis, PCSK9 is involved in other noninfectious conditions, such as autoimmune diseases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "its", "role", "in", "infectious", "sepsis", "and", "atherosclerosis", ",", "PCSK9", "is", "involved", "in", "other", "noninfectious", "conditions", ",", "such", "as", "autoimmune", "diseases", "." ] } ]
PMC10968586
Neither OLE nor HT exhibited a cytotoxic effect on pancreatic ductal adenocarcinoma cell lines BxPC-3 and CFPAC-1 for doses up to 300 μM, but both were able to decrease cell viability of pancreatic ductal adenocarcinoma cell line MIA PaCa-2 (IC50 = 150.1 μM for OLE and 75.1 for HT) after 72 h incubation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Neither", "OLE", "nor", "HT", "exhibited", "a", "cytotoxic", "effect", "on", "pancreatic", "ductal", "adenocarcinoma", "cell", "lines", "BxPC-3", "and", "CFPAC-1", "for", "doses", "up", "to", "300", "μM", ",", "but", "both", "were", "able", "to", "decrease", "cell", "viability", "of", "pancreatic", "ductal", "adenocarcinoma", "cell", "line", "MIA", "PaCa-2", "(", "IC50", "=", "150.1", "μM", "for", "OLE", "and", "75.1", "for", "HT", ")", "after", "72", "h", "incubation", "." ] } ]
PMC10823017
From the dose-response curve, a 30% reduction of cell viability was observed at a concentration of 10.0 µM in 786-0 (P<0.01) and Caki-1 (P<0.01) cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "From", "the", "dose-response", "curve", ",", "a", "30", "%", "reduction", "of", "cell", "viability", "was", "observed", "at", "a", "concentration", "of", "10.0", "µM", "in", "786", "-", "0", "(", "P<0.01", ")", "and", "Caki-1", "(", "P<0.01", ")", "cells", "." ] } ]
PMC10452486
These studies suggest that clustering of cell surface HLA molecules may have facilitated dimerization of B2m-free HCs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "studies", "suggest", "that", "clustering", "of", "cell", "surface", "HLA", "molecules", "may", "have", "facilitated", "dimerization", "of", "B2m-free", "HCs", "." ] } ]
PMC11267830
For the shRNA xenograft study, J.gamma1-expressing luciferase cells were transduced with shRNA lentiviral particles targeting RBM39.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "the", "shRNA", "xenograft", "study", ",", "J.gamma1-expressing", "luciferase", "cells", "were", "transduced", "with", "shRNA", "lentiviral", "particles", "targeting", "RBM39", "." ] } ]
PMC11697065
Sew Peak-Chew: Methodology.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Sew", "Peak-Chew", ":", "Methodology", "." ] } ]
PMC6835428
Chitosan is a linear polysaccharide with a carbohydrate backbone with two types of repeating residues, 2-amino-2-deoxy-glucose (glucosamine) and 2-N-acetyl-2-deoxy-glucose (N-glucosamine), linked by a (1-4)-β-glycosidic linkage.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chitosan", "is", "a", "linear", "polysaccharide", "with", "a", "carbohydrate", "backbone", "with", "two", "types", "of", "repeating", "residues", ",", "2-amino-2-deoxy-glucose", "(", "glucosamine", ")", "and", "2-N-acetyl-2-deoxy-glucose", "(", "N-glucosamine", ")", ",", "linked", "by", "a", "(1", "-", "4)-β-glycosidic", "linkage", "." ] } ]
PMC10652261
C NMR (75 MHz, DMSO-d6) δ (ppm): 43.24 (CH2), 44.38 (CH3), 46.35 (2CH2), 53.09 (2CH2), 62.50 (CH), 99.82 (CH), 100.18 (CH), 104.79 (d, J = 21.00 Hz, CH), 109.22 (CH), 116.69 (2CH), 125.62 (d, J = 19.50 Hz, CH), 127.09 (2CH), 127.93 (CH), 130.89 (d, J = 11.25 Hz, CH), 133.45 (C), 134.94 (C), 145.99 (C), 146.42 (d, J = 11.25 Hz, C), 149.64 (C), 163.36 (d, J = 238.5 Hz, C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "NMR", "(", "75", "MHz", ",", "DMSO-d6", ")", "δ", "(", "ppm", "):", "43.24", "(", "CH2", ")", ",", "44.38", "(", "CH3", ")", ",", "46.35", "(", "2CH2", ")", ",", "53.09", "(", "2CH2", ")", ",", "62.50", "(", "CH", ")", ",", "99.82", "(", "CH", ")", ",", "100.18", "(", "CH", ")", ",", "104.79", "(", "d", ",", "J", "=", "21.00", "Hz", ",", "CH", ")", ",", "109.22", "(", "CH", ")", ",", "116.69", "(", "2CH", ")", ",", "125.62", "(", "d", ",", "J", "=", "19.50", "Hz", ",", "CH", ")", ",", "127.09", "(", "2CH", ")", ",", "127.93", "(", "CH", ")", ",", "130.89", "(", "d", ",", "J", "=", "11.25", "Hz", ",", "CH", ")", ",", "133.45", "(", "C", ")", ",", "134.94", "(", "C", ")", ",", "145.99", "(", "C", ")", ",", "146.42", "(", "d", ",", "J", "=", "11.25", "Hz", ",", "C", ")", ",", "149.64", "(", "C", ")", ",", "163.36", "(", "d", ",", "J", "=", "238.5", "Hz", ",", "C", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Moreover, the phosphorylation of SYK recombinant protein is increased in vitro in the presence of a HSP110 recombinant protein, suggesting that HSP110 acts as a molecular chaperone for optimal activation of SYK through phosphorylation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "the", "phosphorylation", "of", "SYK", "recombinant", "protein", "is", "increased", "in", "vitro", "in", "the", "presence", "of", "a", "HSP110", "recombinant", "protein", ",", "suggesting", "that", "HSP110", "acts", "as", "a", "molecular", "chaperone", "for", "optimal", "activation", "of", "SYK", "through", "phosphorylation", "." ] } ]
PMC11055323
To complement the bases at the sticky end and label biotin at the DNA end, add 50 μl of the mixture (37.5 μl 0.4 mM biotin-14-dATP, 1.5 μl of 10mMdCTP, 1.5 μl of 10 mM dGTP, 1.5μlof 10 mM dTTP, and 8 μl of 5U/μl DNA polymerase I, large (Klenow) fragment(NEB M0210)) and incubating at 37 °C for 4 h. After that, ligation is performed by adding 120 μl of 10XNEB T4 DNA ligase buffer (NEB, B0202L), 100 μl of 10% Triton X-100, 637.8 μl of water, 1.2 μl of 10%BSA (Sigma-Aldrich SRE0098) and 5 μl of 400 U/μl T4 DNA ligase (NEB, M0202L) and incubating for 6 h at room temperature.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "complement", "the", "bases", "at", "the", "sticky", "end", "and", "label", "biotin", "at", "the", "DNA", "end", ",", "add", "50", "μl", "of", "the", "mixture", "(", "37.5", "μl", "0.4", "mM", "biotin-14-dATP", ",", "1.5", "μl", "of", "10mMdCTP", ",", "1.5", "μl", "of", "10", "mM", "dGTP", ",", "1.5μlof", "10", "mM", "dTTP", ",", "and", "8", "μl", "of", "5U/μl", "DNA", "polymerase", "I", ",", "large", "(", "Klenow", ")", "fragment(NEB", "M0210", ")", ")", "and", "incubating", "at", "37", "°", "C", "for", "4", "h.", "After", "that", ",", "ligation", "is", "performed", "by", "adding", "120", "μl", "of", "10XNEB", "T4", "DNA", "ligase", "buffer", "(", "NEB", ",", "B0202L", ")", ",", "100", "μl", "of", "10", "%", "Triton", "X-100", ",", "637.8", "μl", "of", "water", ",", "1.2", "μl", "of", "10%BSA", "(", "Sigma-Aldrich", "SRE0098", ")", "and", "5", "μl", "of", "400", "U/μl", "T4", "DNA", "ligase", "(", "NEB", ",", "M0202L", ")", "and", "incubating", "for", "6", "h", "at", "room", "temperature", "." ] } ]
PMC11594806
In cancerous and inflamed tissues, extracellular ADO primarily exerts an immunosuppressive effect through overstimulation of Gs protein-coupled A2A receptors (A2ARs) on immune cells .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "cancerous", "and", "inflamed", "tissues", ",", "extracellular", "ADO", "primarily", "exerts", "an", "immunosuppressive", "effect", "through", "overstimulation", "of", "Gs", "protein-coupled", "A2A", "receptors", "(", "A2ARs", ")", "on", "immune", "cells", "." ] } ]
PMC10887351
In detail, the group observed that metastatic patients with low β3-ARs levels in circulating CD99+ cells had a complete remission in the two years of the study, while metastatic ones, with higher β3-ARs in CD99+ cells, had relapsed within the study, indicating thus a possible role of β3-ARs in the ES progression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "detail", ",", "the", "group", "observed", "that", "metastatic", "patients", "with", "low", "β3-ARs", "levels", "in", "circulating", "CD99", "+", "cells", "had", "a", "complete", "remission", "in", "the", "two", "years", "of", "the", "study", ",", "while", "metastatic", "ones", ",", "with", "higher", "β3-ARs", "in", "CD99", "+", "cells", ",", "had", "relapsed", "within", "the", "study", ",", "indicating", "thus", "a", "possible", "role", "of", "β3-ARs", "in", "the", "ES", "progression", "." ] } ]
PMC11224020
Data were analyzed by ordinary one-way ANOVA; ****P < 0.0001.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "were", "analyzed", "by", "ordinary", "one-way", "ANOVA", ";", "*", "*", "*", "*", "P", "<", "0.0001", "." ] } ]
PMC11476222
Various flow rates were tested using a ZIC-HILIC column to optimize the separation of gangliosides and their isomers.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Various", "flow", "rates", "were", "tested", "using", "a", "ZIC-HILIC", "column", "to", "optimize", "the", "separation", "of", "gangliosides", "and", "their", "isomers", "." ] } ]
PMC9429973
At 12 months of FU, 91% (n=42) were RBC transfusion-free.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "12", "months", "of", "FU", ",", "91", "%", "(", "n=42", ")", "were", "RBC", "transfusion-free", "." ] } ]
PMC11180402
LncRNAs were once thought to be “junk RNAs”, but an increasing number of studies have reported that they play important molecular and functional roles in various human cancers .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "LncRNAs", "were", "once", "thought", "to", "be", "“", "junk", "RNAs", "”", ",", "but", "an", "increasing", "number", "of", "studies", "have", "reported", "that", "they", "play", "important", "molecular", "and", "functional", "roles", "in", "various", "human", "cancers", "." ] } ]
PMC11724582
In addition, further validation of the relationship between CAFs and osimertinib resistance in vivo is needed to confirm our findings.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "further", "validation", "of", "the", "relationship", "between", "CAFs", "and", "osimertinib", "resistance", "in", "vivo", "is", "needed", "to", "confirm", "our", "findings", "." ] } ]
PMC10890055
To date, the biological response of newly prepared Zn alloys has been performed on cell cultures of various origins (reviewed, e.g., in ), mainly on L929 and on osteoblast-like cell lines MG-63 and MC3T3-E1 .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "To", "date", ",", "the", "biological", "response", "of", "newly", "prepared", "Zn", "alloys", "has", "been", "performed", "on", "cell", "cultures", "of", "various", "origins", "(", "reviewed", ",", "e.g.", ",", "in", ")", ",", "mainly", "on", "L929", "and", "on", "osteoblast-like", "cell", "lines", "MG-63", "and", "MC3T3-E1", "." ] } ]
PMC11802929
We also show the agreement between SCT expression and NetMHCpan prediction.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "also", "show", "the", "agreement", "between", "SCT", "expression", "and", "NetMHCpan", "prediction", "." ] } ]
PMC11482552
Similarly, a study carried out by Hong et al. used CCR5 copy numbers to calculate HIV-1 DNA copies per 1 million cells .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similarly", ",", "a", "study", "carried", "out", "by", "Hong", "et", "al.", "used", "CCR5", "copy", "numbers", "to", "calculate", "HIV-1", "DNA", "copies", "per", "1", "million", "cells", "." ] } ]
PMC11139449
Upon confirming integration, the clones that exhibited successful integration were selected for sequencing and other downstream experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Upon", "confirming", "integration", ",", "the", "clones", "that", "exhibited", "successful", "integration", "were", "selected", "for", "sequencing", "and", "other", "downstream", "experiments", "." ] } ]
PMC7612475
Total, nuclear, and cytoplasmic RNA preparations, RNA sequencing (RNA-seq), and downstream data analysis, including differential splicing analysis using dSpliceType was carried out as described previously (16).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Total", ",", "nuclear", ",", "and", "cytoplasmic", "RNA", "preparations", ",", "RNA", "sequencing", "(", "RNA-seq", ")", ",", "and", "downstream", "data", "analysis", ",", "including", "differential", "splicing", "analysis", "using", "dSpliceType", "was", "carried", "out", "as", "described", "previously", "(", "16", ")", "." ] } ]
PMC11806106
Further, the microscope was combined with a pressurized perfusion system, allowing the fast change of solutions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", ",", "the", "microscope", "was", "combined", "with", "a", "pressurized", "perfusion", "system", ",", "allowing", "the", "fast", "change", "of", "solutions", "." ] } ]
PMC11711935
Fibroblasts secrete both cytokines that promote pigmentation, including stem cell factor (SCF) and keratinocyte growth factor (KGF), and small amounts of those that inhibit pigmentation, such as Dickkopf1 (DKK1) and transforming growth factor (TGF)‐β.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fibroblasts", "secrete", "both", "cytokines", "that", "promote", "pigmentation", ",", "including", "stem", "cell", "factor", "(", "SCF", ")", "and", "keratinocyte", "growth", "factor", "(", "KGF", ")", ",", "and", "small", "amounts", "of", "those", "that", "inhibit", "pigmentation", ",", "such", "as", "Dickkopf1", "(", "DKK1", ")", "and", "transforming", "growth", "factor", "(TGF)‐β", "." ] } ]
PMC9429973
In POLLUX, ≥CR rates were higher with D-Rd vs Rd in the early relapse (53% vs 12%; P <0.0001) and late relapse (62% vs 38%; P = 0.0012) subgroups.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "POLLUX", ",", "≥CR", "rates", "were", "higher", "with", "D-Rd", "vs", "Rd", "in", "the", "early", "relapse", "(", "53", "%", "vs", "12", "%", ";", "P", "<", "0.0001", ")", "and", "late", "relapse", "(", "62", "%", "vs", "38", "%", ";", "P", "=", "0.0012", ")", "subgroups", "." ] } ]
PMC10158546
Cells were washed 6× for 5 min in PBST, incubated with 300 mM DAPI for 1 h at room temperature, rinsed 3× in PBS and then coverslips were mounted using Prolong Glass with NucBlue.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "washed", "6", "×", "for", "5", "min", "in", "PBST", ",", "incubated", "with", "300", "mM", "DAPI", "for", "1", "h", "at", "room", "temperature", ",", "rinsed", "3", "×", "in", "PBS", "and", "then", "coverslips", "were", "mounted", "using", "Prolong", "Glass", "with", "NucBlue", "." ] } ]
PMC11244823
A gD1_83, B gD1_160, C gD1_180, D gD1_402.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "gD1_83", ",", "B", "gD1_160", ",", "C", "gD1_180", ",", "D", "gD1_402", "." ] } ]
PMC11544122
a–c SNX9 recruitment to CXCR4 was examined by BRET in cells transfected with HA-CXCR4-YFP and SNX9-RlucII.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "a", "–", "c", "SNX9", "recruitment", "to", "CXCR4", "was", "examined", "by", "BRET", "in", "cells", "transfected", "with", "HA-CXCR4-YFP", "and", "SNX9-RlucII", "." ] } ]
PMC5673955
These results should facilitate further investigations of RrA as a potent anti‐telomerase therapeutic protein.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "should", "facilitate", "further", "investigations", "of", "RrA", "as", "a", "potent", "anti‐telomerase", "therapeutic", "protein", "." ] } ]
PMC9622879
In this section, because our proposed method is day-ahead scheduling, we focus on reviewing existing day-ahead scheduling methods for a LEC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "section", ",", "because", "our", "proposed", "method", "is", "day-ahead", "scheduling", ",", "we", "focus", "on", "reviewing", "existing", "day-ahead", "scheduling", "methods", "for", "a", "LEC", "." ] } ]
PMC10788478
Additionally, LGR6 expression positively correlated with the Ki‐67 labeling index in lung adenocarcinomas (Figure 3a).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "LGR6", "expression", "positively", "correlated", "with", "the", "Ki‐67", "labeling", "index", "in", "lung", "adenocarcinomas", "(", "Figure", "3a", ")", "." ] } ]
PMC11737091
The constructed vectors were verified via PCR and direct DNA sequencing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "constructed", "vectors", "were", "verified", "via", "PCR", "and", "direct", "DNA", "sequencing", "." ] } ]
PMC11768281
As the front-lines during Plasmodium immune evasion, CD4+ and CD8+ T-cells are targeted to amplify their magnitude, with potential targets encompassing a wide range of subsets and non-T-cell components that aid defense.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "the", "front-lines", "during", "Plasmodium", "immune", "evasion", ",", "CD4", "+", "and", "CD8", "+", "T-cells", "are", "targeted", "to", "amplify", "their", "magnitude", ",", "with", "potential", "targets", "encompassing", "a", "wide", "range", "of", "subsets", "and", "non-T-cell", "components", "that", "aid", "defense", "." ] } ]
PMC11591052
The relative real-time PCR data showed that 20E significantly up-regulated the expression of all the genes studied in both cell lines (Figure 3).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "relative", "real-time", "PCR", "data", "showed", "that", "20E", "significantly", "up-regulated", "the", "expression", "of", "all", "the", "genes", "studied", "in", "both", "cell", "lines", "(", "Figure", "3", ")", "." ] } ]
PMC11082662
The human ovarian carcinoma cell lines used in our study included the following: Caov-3 cells [cat.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "human", "ovarian", "carcinoma", "cell", "lines", "used", "in", "our", "study", "included", "the", "following", ":", "Caov-3", "cells", "[", "cat", "." ] } ]
PMC11704135
There are several examples of the pyrimidine nucleus in nature, including uric acid, nucleic acids, alkaloids from tea, coffee chocolate, and nucleotides.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "are", "several", "examples", "of", "the", "pyrimidine", "nucleus", "in", "nature", ",", "including", "uric", "acid", ",", "nucleic", "acids", ",", "alkaloids", "from", "tea", ",", "coffee", "chocolate", ",", "and", "nucleotides", "." ] } ]
PMC7757104
E-cadherin expression levels were non-significantly upregulated in ACRP cells following OPNc silencing compared with those in the control cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "E-cadherin", "expression", "levels", "were", "non-significantly", "upregulated", "in", "ACRP", "cells", "following", "OPNc", "silencing", "compared", "with", "those", "in", "the", "control", "cells", "." ] } ]
PMC11694346
DNBS serves as a commonly used fluorescence quenching moiety and reaction site for biotiols.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DNBS", "serves", "as", "a", "commonly", "used", "fluorescence", "quenching", "moiety", "and", "reaction", "site", "for", "biotiols", "." ] } ]
PMC2777936
Human embryonal carcinoma cells were stably infected with a lentiviral construct carrying a canonical Wnt responsive reporter to assess Wnt signalling activity following induced differentiation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Human", "embryonal", "carcinoma", "cells", "were", "stably", "infected", "with", "a", "lentiviral", "construct", "carrying", "a", "canonical", "Wnt", "responsive", "reporter", "to", "assess", "Wnt", "signalling", "activity", "following", "induced", "differentiation", "." ] } ]
PMC8992508
In 2016, Kraege et al. investigated a series of 22 heterodimeric derivatives characterized by the presence of a quinazoline ring linked to a chalcone scaffold for their ability to inhibit BCRP, using the pheophorbide A assay on the MDCK II BCRP cell line [Figure 5].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "2016", ",", "Kraege", "et", "al.", "investigated", "a", "series", "of", "22", "heterodimeric", "derivatives", "characterized", "by", "the", "presence", "of", "a", "quinazoline", "ring", "linked", "to", "a", "chalcone", "scaffold", "for", "their", "ability", "to", "inhibit", "BCRP", ",", "using", "the", "pheophorbide", "A", "assay", "on", "the", "MDCK", "II", "BCRP", "cell", "line", "[", "Figure", "5", "]", "." ] } ]
PMC10213179
Cells (150,000) in 150 μL serum-free medium were then plated into the upper side of a 24-well Transwell Permeable Support (Cultek, Madrid, Spain).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "(", "150,000", ")", "in", "150", "μL", "serum-free", "medium", "were", "then", "plated", "into", "the", "upper", "side", "of", "a", "24-well", "Transwell", "Permeable", "Support", "(", "Cultek", ",", "Madrid", ",", "Spain", ")", "." ] } ]
PMC7841189
Experiments were performed in triplicate. *
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Experiments", "were", "performed", "in", "triplicate", ".", "*" ] } ]
PMC9429973
In addition, there was paucity of peer-reviewed publications on life expectancy and prevalence from European countries with assumed high prevalence.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "there", "was", "paucity", "of", "peer-reviewed", "publications", "on", "life", "expectancy", "and", "prevalence", "from", "European", "countries", "with", "assumed", "high", "prevalence", "." ] } ]
PMC11638255
TGF-β serum and TME data are presented as mean ± SEM, n = 7 (both groups) biological replicates, two independent experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TGF-β", "serum", "and", "TME", "data", "are", "presented", "as", "mean", "±", "SEM", ",", "n", "=", "7", "(", "both", "groups", ")", "biological", "replicates", ",", "two", "independent", "experiments", "." ] } ]
PMC8143558
Table 2 shows saponin-rich plants that are being traditionally utilized, as compared to a larger number of saponin-rich plants, as shown by Table 1, that are not being used for their soapy characteristics.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "2", "shows", "saponin-rich", "plants", "that", "are", "being", "traditionally", "utilized", ",", "as", "compared", "to", "a", "larger", "number", "of", "saponin-rich", "plants", ",", "as", "shown", "by", "Table", "1", ",", "that", "are", "not", "being", "used", "for", "their", "soapy", "characteristics", "." ] } ]
PMC11013014
M.p.
[ { "tags": [ "O", "O" ], "tokens": [ "M.p", "." ] } ]
PMC9429973
The proportion of patients with inpatient (IP) visits was highest in the post-relapse phase, with 77.4% having ≥1 visit.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "proportion", "of", "patients", "with", "inpatient", "(", "IP", ")", "visits", "was", "highest", "in", "the", "post-relapse", "phase", ",", "with", "77.4", "%", "having", "≥1", "visit", "." ] } ]
PMC9429973
The treatment was well-tolerated, and most toxicities were grade 1-2 and consistent with the known toxicities of the two agents.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "treatment", "was", "well-tolerated", ",", "and", "most", "toxicities", "were", "grade", "1", "-", "2", "and", "consistent", "with", "the", "known", "toxicities", "of", "the", "two", "agents", "." ] } ]
PMC9429973
Summary/Conclusion: In conclusion, we identified HSP110 as a regulator of BCR signaling through SYK chaperoning in DLBCL.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary/Conclusion", ":", "In", "conclusion", ",", "we", "identified", "HSP110", "as", "a", "regulator", "of", "BCR", "signaling", "through", "SYK", "chaperoning", "in", "DLBCL", "." ] } ]
PMC11347429
The genotyping analysis (see below) showed that the samples were primarily Caucasian (153) followed by African-American (people of African ancestry in the US, 41), Mexican-American-Indian (4), Asian (2), and admixed (2) ( Table 2 ).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "genotyping", "analysis", "(", "see", "below", ")", "showed", "that", "the", "samples", "were", "primarily", "Caucasian", "(", "153", ")", "followed", "by", "African-American", "(", "people", "of", "African", "ancestry", "in", "the", "US", ",", "41", ")", ",", "Mexican-American-Indian", "(", "4", ")", ",", "Asian", "(", "2", ")", ",", "and", "admixed", "(", "2", ")", "(", "Table", "2", ")", "." ] } ]
PMC11786156
Thus, further studies with larger sample sizes are required to validate adhesion-independent cell proliferation and prognosis of CD54+CD11a- cases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "further", "studies", "with", "larger", "sample", "sizes", "are", "required", "to", "validate", "adhesion-independent", "cell", "proliferation", "and", "prognosis", "of", "CD54+CD11a-", "cases", "." ] } ]
PMC10858941
Cells to be exposed to hypoxia were shifted to Whitley H35 Hypoxystation on the day after plating plates and kept under a humid atmosphere for 48 h at 1% O2, while parallel normoxic cultures remained in the usual tissue culture incubator.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "to", "be", "exposed", "to", "hypoxia", "were", "shifted", "to", "Whitley", "H35", "Hypoxystation", "on", "the", "day", "after", "plating", "plates", "and", "kept", "under", "a", "humid", "atmosphere", "for", "48", "h", "at", "1", "%", "O2", ",", "while", "parallel", "normoxic", "cultures", "remained", "in", "the", "usual", "tissue", "culture", "incubator", "." ] } ]
PMC9429973
Results: The median age of 244 patients included in the study was 58 old years (range: 29-81).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "The", "median", "age", "of", "244", "patients", "included", "in", "the", "study", "was", "58", "old", "years", "(", "range", ":", "29", "-", "81", ")", "." ] } ]
PMC11604768
The experiments were not randomized.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "experiments", "were", "not", "randomized", "." ] } ]
PMC9429973
Mechanistically, combinatorial treatment of subasumstat and CFZ enhanced genotoxic and proteotoxic stress and apoptosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mechanistically", ",", "combinatorial", "treatment", "of", "subasumstat", "and", "CFZ", "enhanced", "genotoxic", "and", "proteotoxic", "stress", "and", "apoptosis", "." ] } ]
PMC9429973
Several desensitisation approaches have been developed based on strategies used for solid organ transplantation, yet there exists no consensus in their application to haplo HCT for paediatric haemoglobinopathies where there is a particularly high risk of graft failure [de la Fuente, BBMT 2019, de la Fuente, ASH 2020].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Several", "desensitisation", "approaches", "have", "been", "developed", "based", "on", "strategies", "used", "for", "solid", "organ", "transplantation", ",", "yet", "there", "exists", "no", "consensus", "in", "their", "application", "to", "haplo", "HCT", "for", "paediatric", "haemoglobinopathies", "where", "there", "is", "a", "particularly", "high", "risk", "of", "graft", "failure", "[", "de", "la", "Fuente", ",", "BBMT", "2019", ",", "de", "la", "Fuente", ",", "ASH", "2020", "]", "." ] } ]
PMC9429973
This resulted in a trend towards higher Z-scores in patients than controls (p=0.0597).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "resulted", "in", "a", "trend", "towards", "higher", "Z-scores", "in", "patients", "than", "controls", "(", "p=0.0597", ")", "." ] } ]
PMC11496491
To investigate mRNA Expression profile and associated signaling pathways in the treatment of diabetic foot ulcer healing by tibial cortex transverse distraction.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "mRNA", "Expression", "profile", "and", "associated", "signaling", "pathways", "in", "the", "treatment", "of", "diabetic", "foot", "ulcer", "healing", "by", "tibial", "cortex", "transverse", "distraction", "." ] } ]
PMC11720808
Quantification of 143B cell proliferation shown in (A). (
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Quantification", "of", "143B", "cell", "proliferation", "shown", "in", "(", "A", ")", ".", "(" ] } ]
PMC11519788
These findings implied a complex crosstalk between UBC cells and infiltrated macrophages.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "implied", "a", "complex", "crosstalk", "between", "UBC", "cells", "and", "infiltrated", "macrophages", "." ] } ]
PMC9429973
Severe AEs occurred in 17% (3/18) of treatment-naive pts and 19% (5/26) of switched pts.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Severe", "AEs", "occurred", "in", "17", "%", "(", "3/18", ")", "of", "treatment-naive", "pts", "and", "19", "%", "(", "5/26", ")", "of", "switched", "pts", "." ] } ]
PMC9429973
IgHV MS was assessed in parallel by Sanger sequencing or the commercial NGS assay IdentiClone® Assay (Invivoscribe) as reference.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IgHV", "MS", "was", "assessed", "in", "parallel", "by", "Sanger", "sequencing", "or", "the", "commercial", "NGS", "assay", "IdentiClone", "®", "Assay", "(", "Invivoscribe", ")", "as", "reference", "." ] } ]
PMC11144200
Our ELISPOT data elucidated that the IFN-γ secreting spot forming within the DC/tumor fusion+ LPS-RGD-Nb36-DOX categories were elevated compared with those within the other control group after being challenged with Hep3B and A-427 cells (Fig. 3A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "ELISPOT", "data", "elucidated", "that", "the", "IFN-γ", "secreting", "spot", "forming", "within", "the", "DC/tumor", "fusion+", "LPS-RGD-Nb36-DOX", "categories", "were", "elevated", "compared", "with", "those", "within", "the", "other", "control", "group", "after", "being", "challenged", "with", "Hep3B", "and", "A-427", "cells", "(", "Fig.", "3A", ")", "." ] } ]
PMC11400680
Analysis of cell structures and physiological functions is indispensable for diagnosing diseases and their progressions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Analysis", "of", "cell", "structures", "and", "physiological", "functions", "is", "indispensable", "for", "diagnosing", "diseases", "and", "their", "progressions", "." ] } ]
PMC11609529
RT-PCR was also performed to amplify sequences spanning from YAP1 exon 3–5 to MAML2 exon 2 using the following forward primers: YAP1-exon 3-F (5′-GACAACAACATGGCAGGACC-3′), YAP1-exon 4-F (5′-TCCTGATGGATGGGAACAAGC-3′), and YAP1-exon 5-F (5′ACCAGAGAATCAGTCAGAGTGC-3′), along with the reverse primer MAML2-exon 2-R (5′-TTGCTGTTGGCAGGAGATAG-3′).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RT-PCR", "was", "also", "performed", "to", "amplify", "sequences", "spanning", "from", "YAP1", "exon", "3–5", "to", "MAML2", "exon", "2", "using", "the", "following", "forward", "primers", ":", "YAP1-exon", "3-F", "(", "5′-GACAACAACATGGCAGGACC-3′", ")", ",", "YAP1-exon", "4-F", "(", "5′-TCCTGATGGATGGGAACAAGC-3′", ")", ",", "and", "YAP1-exon", "5-F", "(", "5′ACCAGAGAATCAGTCAGAGTGC-3′", ")", ",", "along", "with", "the", "reverse", "primer", "MAML2-exon", "2-R", "(", "5′-TTGCTGTTGGCAGGAGATAG-3′", ")", "." ] } ]
PMC11467964
Construction and validation of a nomogram. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Construction", "and", "validation", "of", "a", "nomogram", ".", "(" ] } ]
PMC11612794
This prompted us to examine the phenotype of double mutant cells expressing CENP-T and Dsn1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "prompted", "us", "to", "examine", "the", "phenotype", "of", "double", "mutant", "cells", "expressing", "CENP-T", "and", "Dsn1", "." ] } ]
PMC11380454
Chemotherapeutic treatments have been shown to increase PD-L1 expression 46, 47, which enhances tumor cell evasion from host immunosurveillance.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chemotherapeutic", "treatments", "have", "been", "shown", "to", "increase", "PD-L1", "expression", "46", ",", "47", ",", "which", "enhances", "tumor", "cell", "evasion", "from", "host", "immunosurveillance", "." ] } ]
PMC10669966
While the precise downstream signaling pathways remain unclear, the formed complex stabilizes SLFN12 and its RNase activity, resulting in protein synthesis inhibition .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "the", "precise", "downstream", "signaling", "pathways", "remain", "unclear", ",", "the", "formed", "complex", "stabilizes", "SLFN12", "and", "its", "RNase", "activity", ",", "resulting", "in", "protein", "synthesis", "inhibition", "." ] } ]
PMC10808409
Cell cycle analysis of Caco-2 (untreated) and treated with O2 & FA: (A) Histogram showing percentage of cell population in each phase of cell cycle analysis. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "cycle", "analysis", "of", "Caco-2", "(", "untreated", ")", "and", "treated", "with", "O2", "&", "FA", ":", "(", "A", ")", "Histogram", "showing", "percentage", "of", "cell", "population", "in", "each", "phase", "of", "cell", "cycle", "analysis", ".", "(" ] } ]
PMC11536589
MRTX1133 was administered daily, while PKF-118-310 was given every three days (Wei et al. 2010).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MRTX1133", "was", "administered", "daily", ",", "while", "PKF-118", "-", "310", "was", "given", "every", "three", "days", "(", "Wei", "et", "al.", "2010", ")", "." ] } ]
PMC11541241
Appressorial morphogenesis requires activated cAMP/PKA signalling (downstream of cPKA) and inactivated TOR signalling (TORoff), and TORoff arrested mitosis in the G2 phase, which induced autophagy (Marroquin‐Guzman et al., 2017; Marroquin‐Guzman & Wilson, 2015).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Appressorial", "morphogenesis", "requires", "activated", "cAMP/PKA", "signalling", "(", "downstream", "of", "cPKA", ")", "and", "inactivated", "TOR", "signalling", "(", "TORoff", ")", ",", "and", "TORoff", "arrested", "mitosis", "in", "the", "G2", "phase", ",", "which", "induced", "autophagy", "(", "Marroquin‐Guzman", "et", "al.", ",", "2017", ";", "Marroquin‐Guzman", "&", "Wilson", ",", "2015", ")", "." ] } ]
PMC8584666
In this study, although the expression of GPI-80 mRNA was detectable in several tumor cell lines, the levels of GPI-80 protein were significantly lower than that in neutrophils.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "although", "the", "expression", "of", "GPI-80", "mRNA", "was", "detectable", "in", "several", "tumor", "cell", "lines", ",", "the", "levels", "of", "GPI-80", "protein", "were", "significantly", "lower", "than", "that", "in", "neutrophils", "." ] } ]
PMC11781181
First, we revealed that most of the exosomes had been internalized by keratinocyte (Fig. S4A) to investigate further whether keratinocyte internalize plasma-derived exosome to promote ferroptosis in SJS/TEN.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "First", ",", "we", "revealed", "that", "most", "of", "the", "exosomes", "had", "been", "internalized", "by", "keratinocyte", "(", "Fig.", "S4A", ")", "to", "investigate", "further", "whether", "keratinocyte", "internalize", "plasma-derived", "exosome", "to", "promote", "ferroptosis", "in", "SJS/TEN", "." ] } ]
PMC3888431
Thereby, all transcripts with minor differences to the reference genome were removed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thereby", ",", "all", "transcripts", "with", "minor", "differences", "to", "the", "reference", "genome", "were", "removed", "." ] } ]
PMC5941560
They proposed that this mutation “may play a role in the genesis or in the tumorigenic progression of leukemic T cells” .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "proposed", "that", "this", "mutation", "“", "may", "play", "a", "role", "in", "the", "genesis", "or", "in", "the", "tumorigenic", "progression", "of", "leukemic", "T", "cells", "”", "." ] } ]
PMC10253553
Collectively, these data show RICTOR and mTOR in complex 2 maintain the phosphorylation of NDRG1 (Thr346) in ccRCC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Collectively", ",", "these", "data", "show", "RICTOR", "and", "mTOR", "in", "complex", "2", "maintain", "the", "phosphorylation", "of", "NDRG1", "(", "Thr346", ")", "in", "ccRCC", "." ] } ]
PMC6642070
Antibody against β-actin was obtained from Sigma.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Antibody", "against", "β-actin", "was", "obtained", "from", "Sigma", "." ] } ]
PMC3164356
We constructed CHO-K1 genome sequencing libraries with insert sizes of 200 bp, 350 bp, 500 bp, 800 bp, 2 kb, 5 kb, 10 kb and 20 kb to generate a total sequence of 343.64 Gb (Supplementary Table 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "constructed", "CHO-K1", "genome", "sequencing", "libraries", "with", "insert", "sizes", "of", "200", "bp", ",", "350", "bp", ",", "500", "bp", ",", "800", "bp", ",", "2", "kb", ",", "5", "kb", ",", "10", "kb", "and", "20", "kb", "to", "generate", "a", "total", "sequence", "of", "343.64", "Gb", "(", "Supplementary", "Table", "1", ")", "." ] } ]
PMC11655498
In NPC cells, EBV lytic infection induces ATM activation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "NPC", "cells", ",", "EBV", "lytic", "infection", "induces", "ATM", "activation", "." ] } ]
PMC11593713
Human coronavirus 229E (HCoV-229E), SARS-CoV-2, SARS-CoV, Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), HCoV-OC43, HCoV-NL63, and HKU-1 are the seven human coronaviruses (HCoVs) that have been found to date.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Human", "coronavirus", "229E", "(", "HCoV-229E", ")", ",", "SARS-CoV-2", ",", "SARS-CoV", ",", "Middle", "East", "respiratory", "syndrome", "coronavirus", "(", "MERS-CoV", ")", ",", "HCoV-OC43", ",", "HCoV-NL63", ",", "and", "HKU-1", "are", "the", "seven", "human", "coronaviruses", "(", "HCoVs", ")", "that", "have", "been", "found", "to", "date", "." ] } ]
PMC9429973
We monitored the AML associated immunophenotype in PDXs finding it was similar to that of the original AML.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "monitored", "the", "AML", "associated", "immunophenotype", "in", "PDXs", "finding", "it", "was", "similar", "to", "that", "of", "the", "original", "AML", "." ] } ]
PMC11335267
p < 0.05, **p < 0.01 and ***p < 0.001; two-way ANOVA followed by Bonferroni transformation (A, B and E) or Student’s t test (C and D) Altered food intake and gene expression in the arcuate nucleus of Alx3-deficient mice (A) Expression of orexigenic and anorexigenic genes in the arcuate nucleus of wild type (WT) or Alx3-deficient (KO) mice fed ad libitum or after an overnight fasting (n = 8 per genotype). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.05", ",", "*", "*", "p", "<", "0.01", "and", "*", "*", "*", "p", "<", "0.001", ";", "two-way", "ANOVA", "followed", "by", "Bonferroni", "transformation", "(", "A", ",", "B", "and", "E", ")", "or", "Student", "’s", "t", "test", "(", "C", "and", "D", ")", "Altered", "food", "intake", "and", "gene", "expression", "in", "the", "arcuate", "nucleus", "of", "Alx3-deficient", "mice", "(", "A", ")", "Expression", "of", "orexigenic", "and", "anorexigenic", "genes", "in", "the", "arcuate", "nucleus", "of", "wild", "type", "(", "WT", ")", "or", "Alx3-deficient", "(", "KO", ")", "mice", "fed", "ad", "libitum", "or", "after", "an", "overnight", "fasting", "(", "n", "=", "8", "per", "genotype", ")", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
There is evidence that eltrombopag can improve response rates in patients with R/R SAA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "is", "evidence", "that", "eltrombopag", "can", "improve", "response", "rates", "in", "patients", "with", "R/R", "SAA", "." ] } ]
PMC11777207
This study serves as a rational for why specifically targeting PD-L1:CD80 cis interactions may work and further pursuing these costimulatory and coinhibitory molecules in the development of new interventions could lead to progress in the repurposing of current immune checkpoint therapies across a range of immunologic diseases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "study", "serves", "as", "a", "rational", "for", "why", "specifically", "targeting", "PD-L1:CD80", "cis", "interactions", "may", "work", "and", "further", "pursuing", "these", "costimulatory", "and", "coinhibitory", "molecules", "in", "the", "development", "of", "new", "interventions", "could", "lead", "to", "progress", "in", "the", "repurposing", "of", "current", "immune", "checkpoint", "therapies", "across", "a", "range", "of", "immunologic", "diseases", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: EMN23, a retrospective, multicenter study, investigated the demographic and clinical characteristics, the treatment pathways, and the HCRU of adult pts with AL amyloidosis who initiated treatment in 2004–2018 from 13 sites across 10 European countries.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "EMN23", ",", "a", "retrospective", ",", "multicenter", "study", ",", "investigated", "the", "demographic", "and", "clinical", "characteristics", ",", "the", "treatment", "pathways", ",", "and", "the", "HCRU", "of", "adult", "pts", "with", "AL", "amyloidosis", "who", "initiated", "treatment", "in", "2004–2018", "from", "13", "sites", "across", "10", "European", "countries", "." ] } ]
PMC11185260
We further investigated whether the scL-SMARCB1 nanocomplex could successfully restore the exogenous SMARCB1 expression in these cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "further", "investigated", "whether", "the", "scL-SMARCB1", "nanocomplex", "could", "successfully", "restore", "the", "exogenous", "SMARCB1", "expression", "in", "these", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
D. Venney, Y. Atlasi, A. Mohd-Sarip, K. Mills Haematology; Queens University Belfast, Belfast, United Kingdom Background: Acute Myeloid Leukaemias (AMLs) are an array of blood cell disorders arising from alterations within myeloid precursors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D.", "Venney", ",", "Y.", "Atlasi", ",", "A.", "Mohd-Sarip", ",", "K.", "Mills", "Haematology", ";", "Queens", "University", "Belfast", ",", "Belfast", ",", "United", "Kingdom", "Background", ":", "Acute", "Myeloid", "Leukaemias", "(", "AMLs", ")", "are", "an", "array", "of", "blood", "cell", "disorders", "arising", "from", "alterations", "within", "myeloid", "precursors", "." ] } ]
PMC9429973
All-grade adverse events (AEs) occurred in 92/105 (88%) pts (grade ≥3 AEs: 33/105 [31%]).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All-grade", "adverse", "events", "(", "AEs", ")", "occurred", "in", "92/105", "(", "88", "%", ")", "pts", "(", "grade", "≥3", "AEs", ":", "33/105", "[", "31", "%", "]", ")", "." ] } ]
PMC11783017
For the analysis of macrophages, the single cell suspension was stained with PE-anti-F4/80, FITC-anti-CD86 and APC-anti-CD206 antibodies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "the", "analysis", "of", "macrophages", ",", "the", "single", "cell", "suspension", "was", "stained", "with", "PE-anti-F4/80", ",", "FITC-anti-CD86", "and", "APC-anti-CD206", "antibodies", "." ] } ]
PMC10419319
Isoalantolactone–cisplatin treatment resulted in increased phosphorylation of JNK, whereas the total form of JNK remained unchanged in both A2780 and SNU-8 cells (Figure 4A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Isoalantolactone", "–", "cisplatin", "treatment", "resulted", "in", "increased", "phosphorylation", "of", "JNK", ",", "whereas", "the", "total", "form", "of", "JNK", "remained", "unchanged", "in", "both", "A2780", "and", "SNU-8", "cells", "(", "Figure", "4A", ")", "." ] } ]
PMC8481254
We predicted that CDK19 expression in HCC tissues was upregulated relative to that in normal liver tissues (Supplementary Fig. 5A) through the TCGA online visualization website, and high expression of CDK19 was associated with poor prognosis (Supplementary Fig. 5B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "predicted", "that", "CDK19", "expression", "in", "HCC", "tissues", "was", "upregulated", "relative", "to", "that", "in", "normal", "liver", "tissues", "(", "Supplementary", "Fig.", "5A", ")", "through", "the", "TCGA", "online", "visualization", "website", ",", "and", "high", "expression", "of", "CDK19", "was", "associated", "with", "poor", "prognosis", "(", "Supplementary", "Fig.", "5B", ")", "." ] } ]
PMC9429973
E. Meyer, A. Pavlova, A. Gandhi, R. Hoeg, C. Oliai, R. Mehta, S. Srour, J. McGuirk, E. Waller, N. Fernhoff, M. S. Killian, J. Mcclellan, A. Putnam, B. Shaw, M. Abedi, R. Negrin BLOOD AND MARROW TRANSPLANTATION AND CELLULAR THERAPY, Stanford Hospital and Clinics, Stanford, CA; Department of Medicine, Division of Hematology/Medical Oncology, Oregon Health and Science University, Portland, OR; Department of Medicine, Division of Bone Marrow Trasnplant, University of California, Davis, Comprehensive Cancer Center, Davis, CA; Department of Medicine, Blood and Bone Marrow Transplant Program, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA; Department of Stem Cell Transplantation and Cellular Therapy, Division of Cancer Medicine, MD Anderson Cancer Center, Houston, TX; Department of Hematologic Malignancies and Cellular Therapeutics, University of Kansas Medical Center, Kansas City, KS; Bone Marrow and Stem Cell Transplant Center, Winship Cancer Institute of Emory University, Atlanta, CA; Orca Bio, Menlo Park, CA; Department of Medicine, Division of Hematology and Oncology, BMT Program, Medical College of Wisconsin, Wilwaukee, WI; Department of Medicine, Division of Bone Marrow Transplant, University of California, Davis Medical Center, Davis, CA; Department of Blood and Marrow Transplantation and Cellular Therapy, Stanford Hospital and Clinics, Stanford, CA, United States of America Background: Rates of graft versus host disease (GVHD) and non-relapse mortality (NRM) following myeloablative allogeneic hematopoietic stem cell transplant (MA-alloHSCT) remain unacceptably high.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "E.", "Meyer", ",", "A.", "Pavlova", ",", "A.", "Gandhi", ",", "R.", "Hoeg", ",", "C.", "Oliai", ",", "R.", "Mehta", ",", "S.", "Srour", ",", "J.", "McGuirk", ",", "E.", "Waller", ",", "N.", "Fernhoff", ",", "M.", "S.", "Killian", ",", "J.", "Mcclellan", ",", "A.", "Putnam", ",", "B.", "Shaw", ",", "M.", "Abedi", ",", "R.", "Negrin", "BLOOD", "AND", "MARROW", "TRANSPLANTATION", "AND", "CELLULAR", "THERAPY", ",", "Stanford", "Hospital", "and", "Clinics", ",", "Stanford", ",", "CA", ";", "Department", "of", "Medicine", ",", "Division", "of", "Hematology/Medical", "Oncology", ",", "Oregon", "Health", "and", "Science", "University", ",", "Portland", ",", "OR", ";", "Department", "of", "Medicine", ",", "Division", "of", "Bone", "Marrow", "Trasnplant", ",", "University", "of", "California", ",", "Davis", ",", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "Davis", ",", "CA", ";", "Department", "of", "Medicine", ",", "Blood", "and", "Bone", "Marrow", "Transplant", "Program", ",", "University", "of", "California", ",", "Los", "Angeles", ",", "Los", "Angeles", ",", "CA", ";", "Department", "of", "Stem", "Cell", "Transplantation", "and", "Cellular", "Therapy", ",", "Division", "of", "Cancer", "Medicine", ",", "MD", "Anderson", "Cancer", "Center", ",", "Houston", ",", "TX", ";", "Department", "of", "Hematologic", "Malignancies", "and", "Cellular", "Therapeutics", ",", "University", "of", "Kansas", "Medical", "Center", ",", "Kansas", "City", ",", "KS", ";", "Bone", "Marrow", "and", "Stem", "Cell", "Transplant", "Center", ",", "Winship", "Cancer", "Institute", "of", "Emory", "University", ",", "Atlanta", ",", "CA", ";", "Orca", "Bio", ",", "Menlo", "Park", ",", "CA", ";", "Department", "of", "Medicine", ",", "Division", "of", "Hematology", "and", "Oncology", ",", "BMT", "Program", ",", "Medical", "College", "of", "Wisconsin", ",", "Wilwaukee", ",", "WI", ";", "Department", "of", "Medicine", ",", "Division", "of", "Bone", "Marrow", "Transplant", ",", "University", "of", "California", ",", "Davis", "Medical", "Center", ",", "Davis", ",", "CA", ";", "Department", "of", "Blood", "and", "Marrow", "Transplantation", "and", "Cellular", "Therapy", ",", "Stanford", "Hospital", "and", "Clinics", ",", "Stanford", ",", "CA", ",", "United", "States", "of", "America", "Background", ":", "Rates", "of", "graft", "versus", "host", "disease", "(", "GVHD", ")", "and", "non-relapse", "mortality", "(", "NRM", ")", "following", "myeloablative", "allogeneic", "hematopoietic", "stem", "cell", "transplant", "(", "MA-alloHSCT", ")", "remain", "unacceptably", "high", "." ] } ]
PMC11476106
Cluster density was also calculated after classifying clusters by cell count following the established criteria (Table 1, Section 2).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cluster", "density", "was", "also", "calculated", "after", "classifying", "clusters", "by", "cell", "count", "following", "the", "established", "criteria", "(", "Table", "1", ",", "Section", "2", ")", "." ] } ]
PMC10723784
There are data that suggested that the levels of AEA, PEA, and OEA (oleoylethanolamide, which is a bioactive endogenous ethanolamide fatty acid which is very similar in structure to the endocannabinoid ligands) increased in the follicular fluids in patients diagnosed with ovarian cancer and those with ovarian cysts.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "are", "data", "that", "suggested", "that", "the", "levels", "of", "AEA", ",", "PEA", ",", "and", "OEA", "(", "oleoylethanolamide", ",", "which", "is", "a", "bioactive", "endogenous", "ethanolamide", "fatty", "acid", "which", "is", "very", "similar", "in", "structure", "to", "the", "endocannabinoid", "ligands", ")", "increased", "in", "the", "follicular", "fluids", "in", "patients", "diagnosed", "with", "ovarian", "cancer", "and", "those", "with", "ovarian", "cysts", "." ] } ]
PMC9504875
The cell lysates were immunoprecipitated with anti-FLAG pAb, followed by immunoblot.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "lysates", "were", "immunoprecipitated", "with", "anti-FLAG", "pAb", ",", "followed", "by", "immunoblot", "." ] } ]
PMC11769516
mycotoxins are, apart from AFs, the most common and harmful mycotoxins.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "mycotoxins", "are", ",", "apart", "from", "AFs", ",", "the", "most", "common", "and", "harmful", "mycotoxins", "." ] } ]
PMC11806613
The indicated TNBC cell lines (4T1, MDA-MB-231, and BT549) and the triple-positive BC cell line BT474 were treated with OST-01 in a dose-dependent manner for 24 h. Left: Lipid peroxide levels were measured using a lipid peroxidation assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "indicated", "TNBC", "cell", "lines", "(", "4T1", ",", "MDA-MB-231", ",", "and", "BT549", ")", "and", "the", "triple-positive", "BC", "cell", "line", "BT474", "were", "treated", "with", "OST-01", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "for", "24", "h.", "Left", ":", "Lipid", "peroxide", "levels", "were", "measured", "using", "a", "lipid", "peroxidation", "assay", "." ] } ]