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BioData-CellLine_annotated

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PMC8753818
:> 0.05, **:> 0.01, ***:> 0.001, ****:> 0.0001) The effect of caspase-7 silencing on the constitutive expression of recombinant luciferase is shown in Fig. 3.
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PMC11089031
The AUC was 0.675 with p < 0.05 To investigate the role of ZNF692 in ccRCC, we analyzed expression profiles using the TCGA KIRC dataset of RNA-seq data for paired tumor and adjacent normal tissues.
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PMC11066331
Mycoplasma contamination was investigated on a routine basis using PCR.
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PMC10587429
In these human leukocytes, approximately 30%, 40%, 15% and 10% were hCD3 T, hCD20 B, hCD3 hCD56 NK and hCD3 hCD56 monocytes, respectively ( Figure 2E ).
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PMC6742971
We found that the presence of the low avidity T cell clone 93 did not hinder the cytotoxicity of the high avidity clone 211 when they were mixed together (Figure 1B).
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PMC10522430
Each well plate was allocated a total of 40 L of supernatant originating from HeLa cell cultures.
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PMC10719213
Representative data of independent experiments were cropped in Adobe Photoshop with only linear corrections to brightness applied.
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PMC10850553
The C5a–C5ar1 axis was then identified as the candidate.
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PMC10652261
At least 10 000 cells were analyzed per sample.
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PMC11738017
sBCMA, surface antigen density, effector-to-target ratio, and TCE dose collectively mediate primary refractoriness to anti-BCMA TCE.
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PMC11459296
For the most promising model, we extensively evaluated immune cell functionality in vitro and in vivo using sarcoma and leukemia xenografts.
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PMC7987994
Zn_SPS sample was prepared by cold pressing of pure Zn powder into a green compact and subsequent spark plasma sintering at 300 °C with details of the processing in.
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PMC8873393
In support of this concept, a number of recent papers have shown that RNA pathways (including RNA synthesis and processing) in turn affect the cellular response to DNA damage .
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PMC9429973
Children with aberrations of TCR loci had a significantly better prognosis - EFS (p=0.011) and OS (p=0.0074), all patients are living in the first complete remission.
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PMC9727330
The levels of released inflammatory cytokines, including interleukin-1 alpha (IL-1α) and IL-1 beta (IL-β), were monitored using an ELISA assay.
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PMC9429973
Moreover, we found an increase in global protein synthesis (Figure 2C-D).
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PMC11400680
Moreover, the improvement of U-Net using attention models was also found in some research.
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PMC3035438
For purification of chimeric IgG, cultures were transferred the preceding day into a medium containing 10% Ultra-Low IgG FBS (Invitrogen) instead of usual FBS and no chicken serum to reduce contamination with serum IgG. For the chimeric ch/hu-IgHG1 construct, we first amplified the full-length human IgHG1 constant region (about 3 kb comprising the exons CH1, H (hinge), CH2, CH3 and the downstream polyadenylation signal) and parts of the chicken IgHM constant region from human genomic DNA using the expand long range PCR system (Roche).
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PMC10669966
We identified 381 genes, many of which may have a role in tumorigenesis or cancer biology pathways and, therefore, may serve as therapeutic targets in LPSs.
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PMC4485786
Statistical significance was analyzed with one-tailed Student t-tests unless indicated otherwise, and the data met the assumptions of this test.
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PMC9429973
Patients with less than 5% of normal GPIIb/IIIa are classified as type I and 5–20% as type II.
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PMC11528603
The scale bars represent 50 µm.
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PMC10565698
Among these, the loss of E-cadherin expression has been recognized as the most prominent feature of EMT .
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PMC11679033
Intergroup relations regarding the distribution of M1 to M4 cells are displayed in Figure 7.
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PMC11194678
STAU1 overexpression impairs TFEB translocation and lysosome acidification. (
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PMC11317131
The phage gIII, which is essential for phage infectivity, is removed from the genome.
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PMC5415764
Then, the TET concentration was determined using a Waters e2695 HPLC equipped with a reverse phase C18 column (150 × 4.6 mm, 5 μm) at a maximum absorbance of 280 nm.
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PMC9352806
Effects of BMS treatment on the fat accumulation in daf-16 deficient mutant (A), hlh-30 deficient mutants (B) and hlh-30 interfered worms (C).
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PMC11629192
For these reasons, it is necessary to explore alternatives that provide a better balance of safety, efficacy, and ease of administration.
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PMC11297139
Therefore, we decided to test the oncogenic potential of ARID1A in Ewing’s sarcoma cell line using cell proliferation, invasion and migration assays.
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PMC10507284
Initially, we identified 852 differential expressed genes between the high‐ and low‐TROAP expression groups (Figure S3A), of which 641 were upregulated, and 211 were downregulated (Figure S3B).
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PMC11740907
After the cells were incubated, they were washed with PBS, allowed to dry naturally, and then fixed with 40% chilled trichloroacetic acid (TCA).
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PMC9966931
In all cases, they demonstrated potential as anticancer drugs, with toxicities varying between medium (LC50 ≈ 500 µg/mL) and high (LC50 ˂ 100 µg/mL).
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PMC10713411
C, D) The GO and KEGG enrichment analyses of these PCD-related DEGs. (
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PMC11670954
Sodium fluoride triggers the calcium-dependent RhoA/ROCK pathway, which compromises the integrity of the intestinal mucosa by disrupting the intracellular arrangement of ZO-1 and F-actin.
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PMC9429973
According to Covid-19 clinical course, the severe Covid-19 score had 35(43,2%)pts, and critical 19(23.5%)pts.
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PMC10891340
A and B) The control group and the infected group were treated with DMSO and CCCP respectively at 8 hpi (A) and 24 hpi (B).
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PMC11026382
The resulting model and inferred catalytic parameters now permit estimation of DHFR single mutant fitness in any TYMS background.
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PMC11409031
≤0.05, **≤0.01, ***≤0.001, ****≤0.0001.
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PMC11388384
We next labeled SHH-Halo with a cell impermeable fluorophore to detect extracellular SHH-Halo (20).
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PMC9454852
Thus, PLC-IP3 pathway inhibitors in the presence of BOLD-100 were utilized to repeat the Ca observations.
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PMC11792090
This approach effectively eliminates CD70-positive solid tumors while maintaining a favorable safety profile.
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PMC11697703
Cells were re-fixed in 4% PFA and washed thoroughly in ddH2O.
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PMC7961460
Moreover, another study of Gillingham et al. conducted in drosophila S2 cells and human COS cells confirmed that c10orf118 is a golgin, which interacts with Rab 2 family members through c10orf118 C-terminal domain .
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PMC11683240
Hsp90 (primary antibody from Santa Cruz Biotechnology) served as loading control, and the signal quantification was performed using the ImageJ software v.1.52.a (NIH).
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PMC11402217
∗∗∗∗p < 0.0001 vs. WT.(K) Comparison of cell cytotoxicity results of XD23 on WT-type 143B cells and Dkk1 overexpressing 143B cells.
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PMC11543885
The following day, co-transfect the cells with a 1:9 ratio (wt/wt) of pcDNA 5/FRT construct: pOG44 plasmid using Lipofectamine 3000 according to manufacturer’s instructions (https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/L3000001).
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PMC11216402
The following fibroblast and stomach RNA-seq profiles were downloaded from the ENCODE portal: HT1080 (ENCFF754UAP), bronchus fibroblast of lung (ENCFF716LRF), fibroblast skin of abdomen (ENCFF010QUB), fibroblast skin of scalp (ENCFF385POO), stomach 3-yr-old child (ENCFF299YCQ), stomach 37-yr-old adult (ENCFF683JSC), and stomach 34-yr-old adult (ENCFF547FBP).
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PMC11442172
Revising cancer cell culture conditions: comparing standard practices with physiologically relevant conditions for enhanced cancer metabolism modeling.
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Dividing this velocity by the kcat values for TYMS (as previously measured in our lab) yielded an estimate of intracellular TYMS concentration for each variant.
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PMC11413393
Further information on research design is available in the Nature Portfolio Reporting Summary linked to this article.
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PMC10808409
The absence of ferulic acid’s distinctive peaks in the spectra of the FA-Loaded TPGS mixed micelles (O2) indicated that the drug was entrapped within the hydrophobic micellar core due to its hydrophobic nature.
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PMC7602170
Via this pathway, increased expression levels of autophagy related genes may enhance metastatic spread in paranasal squamous cell carcinomas .
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PMC10976516
Intratumoral infection with VVΔTKΔN1L marked tumor regression with increased intratumoral CD4+ and CD8+T cells and neutrophil accumulation.
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PMC11411004
SDS-PAGE was utilized to separate the protein samples.
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SIRT1 can be modified by deacetylation to regulate p53 activity.
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5637 cells were stably transfected with SLC16A3-shRNA1 or NC-shRNA.
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PMC9429973
By reducing the intracellular labile iron pool, Vamifeport improved HSPC quality and survival, partially rescuing the stem cell pool size in MDS mice.
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PMC11782508
The results revealed that azurin from strain 105 is closely related to P. aeruginosa PAO1 azurin protein.
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PMC9596868
Total ATM and RAD50 gene expression was normalised to GAPDH.
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Several studies have shown that EWS::FLI1 is able to regulate the expression of various genes.
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Ineffective fixation for the SRB method and ineffective centrifugation for the MTT assay cause difficulties, resulting in loss of viable cells.
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All experiments above were repeated three times (n = 3).
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Establishment of transient transfection into the Jurkat cell line.
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A control experiment was performed to exclude differences in transfection efficiency between the samples causing varying levels of GFP expression.
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PMC11792090
The expressions of the CD70 CAR and CD47 were validated through flow cytometry analysis ( Figure 3B ).
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PMC10547921
Common ADC payloads include tubulin inhibitors and DNA damaging agents, with tubulin inhibitors accounting for more than half of the ADC drugs in clinical development.
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This study did not generate unique datasets/code.
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Besides, HOMER3 is the host gene of hsa_circ_0008135, a previous study suggested that Homer3 regulates NFATc1 function through its interaction with calcineurin to regulate RANKL-induced osteoclastogenesis and bone metabolism .
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PMC11695623
ROC curve analysis of DCUN1D5 diagnosis in LUAD. *
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59% (19/32) of patients completed ≥ 3cycles at the cut-off date (Table 1).
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PMC2944824
The cells were then washed and analyzed on a fluorescent plate reader.
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Briefly, LN‐229 and A‐172 cells were transfected following the protocols after their growth to 85% confluence in six‐well plates.
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ZDHHC20 was correlated with resistance to RSL3 (P = 0.139), ML162 (P = 0.135) and ML210 (P = 0.154) according to their Pearson correlation score. “
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PMC11395280
Mice treated with CCL198-83 survived substantially longer than mice that were not treated.
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PMC11680982
Remarkably, mouse experiments unambiguously revealed that the medium dose of neratinib not only retained its potential to enhance the efficacy of CDK4/6 inhibitor combined with endocrine therapy in HR/HER2-low breast cancer but also had good tolerability (P < 0.001).
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PMC7342409
The tumor size, growth rate, and survival time of nude mice were observed.
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PMC10858941
Cell lines were passaged for 20-25 passages.
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PMC9429973
A. Rawstron, N. Webster, A. Pitchford, S. Dalal, A. Bloor, R. de Tute, A. Hockaday, S. Jackson, D. Cairns, N. Greatorex, D. Allsup, T. Munir, P. Hillmen HMDS, Leeds Cancer Centre; Experimental Haematology, University of Leeds; Leeds Cancer Research UK Clinical Trials Unit, Leeds Institute of Clinical Trials Research, Leeds; Haematology, The Christie NHS Foundation Trust, Manchester; Haematology, Hull York Medical School, Hull; Haematology, Leeds Cancer Centre, Leeds, United Kingdom Background: Infectious complications are a major cause of morbidity and mortality in Chronic Lymphocytic Leukaemia (CLL).
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PMC7189327
However, few reports investigated the detailed molecular mechanisms of the biological roles of PTCH1 on BCC cell proliferation and growth.
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PMC9954564
Nonetheless, the mechanism by which this combination affects the autoimmune response development remains to be evaluated in further studies.
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PMC10158546
Area and fluorescence intensity within individual spheroids were analyzed with imagej.
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PMC11015054
Plate cloning assay showed that METTL5 knockdown inhibited cloning ability and proliferation of SMMC‐7721 and HepG2 cells (Figure 3C,D).
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PMC9429973
ECOG performance status score was 0-1 in 85% (53/62) patients.
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PMC11046454
Scale bars in the whole images and the enlarged view represent 20 and 10 μm, respectively. (
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PMC11448304
Cross reference of proteome (b) and 2-hydroxyisobutyrylome (c) with KEGG lung cancer related gene set (hsa05223).
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PMC9812014
This same alkaloid was again tested for its efficacy in the in vivo mice model for its effect on the IAV; HNJ managed to enhance the survival rate, prolong the mean survival time, and lower virus production in the lungs of mice on days 4 and 6 post-infection, as per the findings of this study, after the compound was orally delivered to the mice from 2 days prior inoculation to 6 days after infection.
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PMC9429973
Their transcriptome has been characterized by high-coverage RNA sequencing (RNA-seq) and their immunopeptidome by shotgun mass spectrometry (MS).
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PMC8414691
These results suggested that SRCAP interacts at midbody in telophase with essential cytokinesis regulators and with α-Tubulin, the main structural component of the midbody.
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PMC9164404
Compared with cisplatin, Abplatin more significantly disturbed the purine metabolism pathway (Additional file 1: Fig. S12).
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PMC3888431
Shortly after, Becker and coworkers deposited the first assembled transcriptome data from CHO cells in the NCBI database.
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PMC10882807
What’s more, we constructed the hsa_circ_0005397 overexpression vector pcDNA3.1- hsa_circ_005397 (pcDNA) and control vector (vector) into SK-Hep1.
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PMC11803918
Furthermore, we outline a method for efficiently loading hydrophobic drug molecules into γδ-T exosomes while preserving their functions through the membrane fusion process.
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PMC11528603
The caspase 3 activation and nuclear morphological changes for 48 hours in HL60 cells treated with (A) SA-EA (4.1 μg/ml) and (B) 0.05% DMSO (control).
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PMC11774747
In addition, these CAR-VST did not exhibit cytotoxicity against autologous healthy cells or “non infected” cells (82).
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PMC11476222
Building on this manual inspection, the next round of data processing was conducted using LipidSearch 4.2 Software (Thermo Fisher Scientific) for ganglioside identification and quantitation.
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PMC10877303
On the contrary, ‘BIOVIA Discovery Studio’ explored the non-binding interaction between these three drug candidates and the 3C-like protease (3CL).
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PMC11626627
The 786-O cells were transduced with the following constructs: (1) pLKO.1+pWPI, (2) sh-ERβ#2+pWPI, (3) oe-TWIST1+pWPI, (4) sh-ERβ+oe-TWIST1, or (5) sh-ERβ#2+sh-TWIST1#1 (5 groups, 5 mice per group).
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PMC11790971
Bar plots in (b, e) show the balanced accuracies (higher is better) of test cells from monoclonal wells, while (c, f) present the impurity scores (lower is better) calculated on test cells from all wells.
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