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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC9429973
CK-AML has remained poorly characterized at the molecular level, with mainstream techniques struggling to unravel the complexity of the structural variants (SVs) and link them to phenotypic characteristics.
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PMC11188874
Cells were treated with SG-UBD253 at the indicated concentrations for 24 hours, washed, stained with a conjugated antibody to pan-HLA ABC and quantitated by flow cytometry.
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PMC11743975
Images at 90 min show some red fluorescence still colocalized with green fluorescence (Figure 3A).
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PMC9429973
This highlights the potential of tec as a highly effective treatment option for patients with TCE RRMM who have been exposed to ≥3 LOT.
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PMC10237474
no. 1383501, Thermo Fisher Scientific) supplemented with 0.1% of Kolliphor P188 (cat.
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PMC11291697
RNA-seq analysis identified 206 differentially expressed genes in the proband’s LCL, of whom 74 upregulated and 132 downregulated, including GTDC1 (Fig. 1B, Supplementary Tables S2 and S3).
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PMC5916734
Electrophoresis was performed under nonreducing conditions; molecular weights are given in kDa; colloidal Coomassie staining.
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PMC11297139
In addition, self-association upon mutation, including in-frame insertion or deletion within the YEATS domain, led to increased ENL occupancy at target genomic loci along with the recruitment of elongation factors, resulting in abnormal target gene expression and consequent developmental defects.
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PMC11742290
Table 2 summarizes the studies that have investigated the role of LGR5 in chemotherapy resistance in different cancers including breast, cervical, colorectal, gastric, hepatocellular and ovarian cancer.
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PMC8526701
Unlike the cBAF and pBAF complexes, the ncBAF complex has not been reported to have repeated mutations in cancer .
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PMC11476106
HGs were FFPE after 2 and 3 weeks of culture, then cut into 3 µm sections.
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PMC11781181
We also demonstrated that circulating exosomal miR-375-3p was positively correlated with intracellular Fe and MDA levels but negatively correlated with CoQ10 level in SJS/TEN patients (Fig. S17).
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PMC11612315
We also determined whether exendin 20–29 modulates proton-induced TRPV1 activation via patch-clamp recordings and calcium imaging.
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PMC11269792
Bioinformatics website to predict the potential targets of CDV3 and miR-6838-5p, (B and C) Dual luciferase reporter assay and RIP assay to detect the targeting relationship between CDV3 and miR-6838-5p, (D and E) CDV3 expression in tissues and cells, (F) Effect of miR-6838-5p on CDV3 expression; data are expressed as mean ± SD (n = 3). *
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PMC11786767
Since the lipid-containing nuclear components also display amphiphilic characteristics, it is also plausible that Ki-67 and the lipid-containing components may function redundantly, at least partially, thereby explaining several interesting observations.
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PMC10589262
The Golgi complex is a specialized organelle for protein processing and trafficking .
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PMC11753435
The ipTM score was extracted from the postrun output files and plotted via Matplotlib.
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PMC9596868
We found increased expression of γ-H2AX in A2780 and OVCAR3 cells, while no γ-H2AX upregulation was observed in OSEs (Fig. 5B–C).
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PMC11204465
In the presence of ZnCO3, the free phenolic compound C-6 was reacted with chlorinated unsaturated cyclopentanone C-7 to effectively construct the D, E-bicyclic compound.
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PMC9784246
Its molecular mechanism was suggested to be the induction of apoptosis through the inhibition of DNA topoisomerase I and II activity .
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PMC11552389
Furthermore, investigating the potential crosstalk between FOXN3 and other transcriptional regulators known to modulate drug resistance may unveil synergistic or antagonistic interactions that could be leveraged for therapeutic benefit.
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The median age of the patients was 48 (23-67), and 16 patients (66%) were female.
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PMC6600592
67.7–68.5 °C.
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Therefore, USP43 shows specificity towards the HIF-1α isoform.
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When duplicates were discriminated using FSC‐H and FSC‐A plots.
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Aims: To investigate the effectiveness of our new-proposed PK-guided, trough level escalating dosing regimen.
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NOD-Prkdc-Il2rg/Rj (NXG) mice were purchased from Janvier labs.
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These proteins could serve as important focal points for understanding the disease mechanisms.
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PMC11026382
The point mutants were created in a plasmid encoding both DHFR and TYMS (see Methods for details), and the plasmids were transformed into an E. coli selection strain lacking the endogenous DHFR and TYMS genes (ER2566 ΔfolA ΔthyA).
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Productive deployment of staff and efficient use of time.
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After 5 days of growth in 6-well plates, the GNA assay was repeated.
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Antibodies against dopachrome tautomerase/DCT (#HPA010743) and tyrosinase/TYR (#05-647) were purchased from MilliporeSigma.
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We found that the medial and distal phospho-site clusters are required for desensitization of CXCR5 signaling, while none of the phospho-site clusters are required for agonist-stimulated internalization.
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PMC9960565
Human blood was collected from healthy donors in EDTA (anticoagulant) containing tubes.
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In 2006, freshly immunomagnetically-isolated AdV-VST from allo-SCT donor leukapheresis without any prior expansion, successfully control in 4 out of 5 evaluable patients with AdV infection-related complications (59).
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PMC10421378
Simulated gastrointestinal conditions have been shown to increase the adhesion of Lactobacillus paracasei to Caco-2 cells.
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Furthermore, Y2O3NPs were imaged using transmission electron microscopy (TEM) to reveal the morphology and average particle size of the suspended Y2O3NPs particles.
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We overexpressed CCL28 in LLC cells, which was validated by ELISA.
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PMC11790599
The lysosomal system is integral to the macropinocytotic process, as the eventual fusion of macropinosomes with lysosomes allows the release of amino acids and molecules to support cell growth (Palm, 2019).
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PMC11144382
To investigate the effects of these identified putative NFI binding sites on promoter activity, luciferase reporter constructs under the transcriptional control of either the wild-type or mutant CRABP2 (Figure 4B) or VCAM1 (Figure 4B’) promoters, consisting of wild-type (WT) or mutated (MUT) NFI binding sites, respectively, were transfected into COS-7 cells.
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PMC11637820
S. aureus, which is the most prevalent pathogen in DFU and leads to abscesses, osteomyelitis, and gangrene , showed a robust inactivation of >70% in our study.
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PMC10761218
It has been determined that the methanolic extract derived from the leaf exhibited the highest level of activity followed by stem in inhibiting the viability of HepG2 cells, surpassing the methanolic extracts obtained from the root.
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PMC9429973
Exposure of CD9- AML cell lines (n=8) or samples (n=9) to panobinostat significantly elevated CD9 mRNA and protein expression (3.1-32.2-fold, P<0.05), and restored activating histone acetylation marks (4.1-41.6-fold, P<0.05).
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PMC11657695
6KCNA2/Kv1.2 is involved in the regulation of the Hippo signaling pathway.
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PMC11521786
The HER1-ECD and HER2-ECD were generated at the Immunology and Immunotherapy Direction of the Center of Molecular Immunology (CIM, Cuba), along with the four subdomains (I, II, III, and IV) included in HER3-ECD and the irrelevant control PDL1 fused to His-tag.
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PMC9429973
Many molecular mechanisms and functionally relevant biological programs seem to be of importance in the pathogenesis of the disease, with emphasis on the antigenic drive within a specific microenvironment along with the apoptotic pathways failure that may have eventually a role in the survival of CLL cells.
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PMC11706776
Taken together, these results show that (i) KCNN1 is overexpressed in biopsies from ES patients and in ES cells, and that (ii) KCNN1 expression is associated with patient survival at 5 years after diagnosis.
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PMC11533140
Mass spectra (MSs) were taken in the ESI mode using the Agilent 1100 LC-MS system (Agilent, Palo Alto, CA, United States).
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The FDR was obtained by correcting the p-value of gene differences.
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The results from the BLAST calculations are used in the mapping step to search databases for Ontologies belonging to the BLAST hits.
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Forty-eight to seventy-two hours after the induction of DSBs, cells were analyzed by flow cytometry FACSCalibur (BD Biosciences).
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There is accumulating evidence that the combination of immunosuppressive drugs and TPO analogues (TPOa) may improve ITP responses.
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These findings suggest that the observed larger HD for NP_BSA+ (around 102 nm) is unlikely to be caused by multilayer formation of BSA+; instead, it is more likely attributed to inherent limitations of the DLS technique,.e.g.,
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which allows selective depletion of transgenic T cells with the therapeutic monoclonal antibody rituximab in the event of unmanageable toxicity.
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Moreover, fusing RhoBAST with AP3 did not substantially affect the light‐up property of the RhoBAST : SpyRho complex, shown by high fluorescence turn‐on values with all tested constructs (Table S1).
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The evaluation of parasitemia and the parasite morphology was performed using a microscopic evaluation of thin blood smears that were first fixed with methanol (Merck) and then stained with Giemsa (Sigma).
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This ambiguity of the signal derivation remains the main limitation of the study.
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After 15 minutes of incubation in the dark, cells were analyzed on a cytofluorimeter by fluorescence activated cell sorting analysis (CyAn™ ADP Analyzer - Beckman Coulter; CA, USA) using Summit 4.3 software.
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Protein‐binding aptamers were utilized in STED microscopy using covalently fluorophore‐labeled aptamers or in DNA‐PAINT by conjugating the aptamer to an oligonucleotide docking strand.[ , ]
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Primers were synthesized by Beijing Liuhe Huada Gene Technology Co. (Supplementary Table S1).
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All data are mean ± SEM.
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The integrity and quantity of isolated RNA were checked by the Nanodrop One instrument (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA).
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2.
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Statistical values are expressed as the average ± SEM.
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DNA was extracted using Quick Extract DNA extraction solution (Epicenter Catalog no. QE09050).
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A and B) Cell migratory ability was assessed by wound healing. (
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Aims: To perform a comparative analysis between patients with AML secondary to MDS and dn-AML-MDS.
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Fig. 4Kinetic analysis-directed optimization of computing efficiency of DNP.a Identifying the rate-determining step in microenvironment-confined DNA computation by simulating the accelerated reaction rate in different computing layers.
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PMC10728200
STUB1 and GPX4 expression lentiviruses were purchased from Genechem (Genechem, Shanghai, China).
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Next, we determined whether a gene-specific increase in PD-L1 methylation could result in a decrease in expression.
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The cell death mechanism of the dual chelator is assessed in the context of intracellular labile Fe binding and was found to induce both apoptosis and ferroptosis.
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Microfluidics-based methods that can rapidly sort cells have been adapted only for mammalian cells.
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In MM, CXCL7 has been identified as the predominant activator of MMP13.
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Docking results showed that N or O atoms in ON fragment and O atom in C=O groups in the oxime derivatives interacted with ammonic acid residues by hydrogen bond, and their docking affinity partly coincided with their anti-HBV activities in vitro.
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PMC11650848
The primary SNP in this investigation (rs365052) showed a perfect LD R score of 1.0 with a SNP in close proximity (rs2747431).
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PMC11694625
Conventional UV/Vis spectra of 3a–3d were shown in Fig. S17.† The UV/Vis spectra are similar and the structural difference of 3a–3d has little effect on positions of absorption peaks.
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PMC11747949
RS504393 has shown promising activity when used in combination with immune check blockade in solid tumor preclinical studies (Tu et al. 2020).
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PMC11194678
Furthermore, as STAU1 regulates the destiny of hundreds of target mRNAs, if it has therapeutic potential, a more specific strategy to manipulate STAU1 function relevant to neurodegenerative processes is urgently needed.
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PMC9220170
After 24 h from the moment of transduction, the nutrient medium was changed.
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PMC9429973
The 5-year FFP was 89% vs 84% for patients with strict protocol adherence or not (p=0.37); OS was not also different.
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PMC9429973
Results: Our large-scale single-cell morphological characterization of Multiple Myeloma samples reveals three reoccurring cell community modes, which we call PhenoGroups (PGs).
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PMC11574029
B GSEA analysis showing significant enrichment of the PI3K/AKT pathway in RNA sequencing data.
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Aims: To 1) confirm BCL-2 sensitization by single-agent Ibr and 2) monitor changes in the cellular immune profile of patients (pts) treated with I+V in CAPTIVATE (NCT02910583), a multicenter phase 2 study evaluating 1L I+V treatment (tx) in CLL and SLL.
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PMC11794568
In this study, we aimed to determine whether CRIP1 is involved in melanoma and to investigate the relationship between CRIP1 and TFAM-mediated mitochondrial biogenesis.
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PMC9429973
Both present an unfavorable impact on survival (median OS of 6 months; p-value<0.001/HR 1.8 (CI 0.63-5.2).
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PMC8041314
The relative statistical distribution was calculated, which represented the percentage of occurrence of the corresponding partial structure within the respective class (0–7).
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PMC11555465
The initial observations revealed that the T. gondii tachyzoite culture supernatant had an effect on the proliferation, migration, invasion and apoptosis of 5637 cells.
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PMC7334607
Eighteen samples from the A673 cell line were RNA sequenced, visualized in the left panel of Figure 4.
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Yield = 90, yellow solid, m. p.: 172–174 °C, IR (KBr) cm 3456, 3042, 2346, 1948, 1750, 1356, 1185, 997, 864, 732, δH (600 MHz, DMSO-d6) 13.93 (1H, s), 8.13 (2H, d, J = 8.1 Hz), 8.02 (2H, d, J = 8.1 Hz), 7.68 (1H, s), 7.45–7.39 (3H, m), 7.38–7.33 (2H, m), 7.32–7.27 (1H, m), 7.17 (1H, t, J = 7.6 Hz), 7.10 (1H, d, J = 7.9 Hz), 5.03 (2H, s); C NMR (151 MHz, DMSO) δ 161.65, 143.37, 136.30, 136.05, 132.40, 129.24, 129.21, 129.19, 128.16, 127.92, 126.66, 125.10, 123.99, 123.30, 121.48, 119.64, 111.10, 43.10.
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PMC11745823
Of the sh‐RNAs evaluated, sh‐RIT1#2 had the greatest knockdown efficacy and will consequently be employed in future research.
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PMC7433824
A‐type lamins maintain the telomere length, and their loss results in telomere shortening.
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This underscores the need for novel regimens capable of inducing deeper remissions via eradicating measurable residual disease (MRD).
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PMC3888431
The same analysis was performed on the reference-based and the final data set, but here only the predicted coding sequences were translated to the protein sequence and aligned.
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Cancer cells can use autophagy as a survival mechanism against viral infection, degrading viral components before the virus can replicate effectively .
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PMC11301242
Box plots indicate the gene expression levels in lymphoma samples without ecDNA amplification (n=6), with asterisks denoting outliers.
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PMC10213179
A ponceau of the membrane was performed for loading control (right image).
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How the anti-AML capacity of γδ T cells is suppressed in vivo is unknown.
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The error bars indicate the standard deviations.
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Raw traces depicting individual voltage responses to a series of 500 ms current pulses ranging from −50 pA to +20 pA in 10 pA steps, and to +30 pA above the rheobase (red trace).
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PMC10890055
The undiluted extracts of the alloys were toxic to both tested cell lines and almost completely inhibited the metabolic activity of both cell lines (relative metabolic activity was 7% or less; data not shown).
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