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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC5574817
The data presented in this article are related to the research article entitled “The effects of deoxyelephantopin on the cardiac delayed rectifier potassium channel current (IKr) and human ether-a-go-go-related gene (hERG) expression” (Y.F. Teah, M.A. Abduraman, A. Amanah, M.I. Adenan, S.F. Sulaiman, M.L. Tan) , which the possible hERG blocking properties of deoxyelephantopin were investigated.
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PMC9250505
Thus, NPB synergizes with PARPi in EOC cells to promote DNA damage and impair DNA repair after PARPi treatment.
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PMC7153288
Curves show the 48 h of treatment of the A549 cells with the PY medium (the upper curve) and with the PY medium inoculated with Streptomyces sp. SS1-1 (the lower curve).
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PMC10996034
Total protein concentration was quantified with the BCA Protein Concentration Assay Kit (Beyotime Institute of Biotechnology) according to the manufacturer's instructions.
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PMC9243326
Venn diagram of lncRNAs identified by the CNCI and CPC methods. (
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PMC10968586
As regards a possible anti-estrogenic action, 10 μM OLE had no effect on estrogen receptor α (ERα) basal activation, and 10–75 μM OLE had irrelevant activity on E2-induced ERα activation and E2-modulated ERα expression, but reduced E2-induced ERK1/2 phosphorylation .
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PMC11725127
That is, USP2 first forms an initial encounter complex with GA, USP2:GA, then irreversibly forms a covalently linked complex USP2-GA.
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PMC10891340
Mitochondrial autophagy, as a type of marcoautophagy, could sequesters dysfunctional mitochondria by forming double-membrane autophagosomes, which are transported to lysosomes for degradation (Nakatogawa et al., 2009).
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PMC11532793
As in our earlier study, the edgeR divided-count strategy is compared with Swish and sleuth.
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PMC9429973
Duration of 2L Tx and OS were analyzed using the Kaplan Meier method.
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PMC11680982
E–H) In cell cycle assay, western blot, and apoptosis assay, knockdown of HER2 promoted G1 phase arrest and reduced Cyclin D1, CDK4 and EGFR expression.
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PMC11224020
Treatment of DCs with CK666, which inhibits ARP2/3 activity, led to the disappearance of this actin structure (Fig. 3a, Supplementary Video 4 and Extended Data Fig. 3a), suggesting that ARP2/3 activity is needed for its formation.
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PMC11172027
The cell proliferation was estimated with the CASY Cell Counter (Hoffmann-La Roche Ltd., Basel, Switzerland).
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PMC11487720
When L929S cells are exposed to UV, downregulation of caspase 3 occurs.
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PMC11767793
Such an optical interference could be circumvented if assays with an absorbance readout at the gold optical transparence range (λ > 650 nm) or based on luminescence (e.g., ATP) were utilized as alternatives to MTS.
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PMC10547921
Phenyl piperazine substitution at R3 and substitution of R1 and R2 to F and H, respectively, resulted in a slightly improved analog 110 that was effective against C-Kit and HER2-expressing cell lines at nmol/L concentration.
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PMC9841531
The maximal inhibition (Imax) of compounds 24 and 30 reached 66.8 and 61.1%, respectively, with IC50 values of 0.983 and 1.51 μM, respectively.
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PMC11672142
Mass spectra were obtained using a Waters Xevo G-25 QTof in positive ion mode, analyzer resolution mode, capillary (kV): 3.0000, sampling cone: 40.0000, source temperature (°C): 100, source offset: 60, desolvation temperature (°C): 350, cone gas flow (L/Hr): 10.0, and desolvation gas flow (L/Hr): 600.0.
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PMC10587429
For orthotopic injection, lay the anesthetized animal on its side on the surgical bed, right tibia on the top.
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PMC11781181
FTH1 plays an important role in the maintenance of the cellular iron balance in ferroptosis.
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PMC9429973
Methods: Presented here are results from the TRAPeze study in The Netherlands.
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PMC11380454
To our knowledge, this is the first report showing the regulation of PD-L1 by the VLA-4 integrin.
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Renal impairement existed in 18pts (34%).
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PMC10818573
When customizing the lateral flow strips, AuNPs with larger particle sizes were selected as labeling materials to improve sensitivity.
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PMC10040136
When the cells reach 60–70% confluence, they are ready for trilineage differentiation.
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PMC11806818
This work could provide a low-cost and stable diagnostic solution for people living in remote or isolated areas, especially in developing countries with limited medical facilities.
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These results prompted further testing with an in vivo, patient-derived xenograft.
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PMC9776316
No.: A1978/AC-15) and FLAG (Cat.
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Migration distance of the cells was quantified by distance of gap using wound healing analysis package provided by JuLI Stage software.
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PMC11754784
c Real-time fluorescent kinetics of cage-Nb after adding c-sgc8c.
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Utilizing the comet test allowed for the confirmation of the existence of DNA damage.
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PMC9429973
Methods: Globally, there were 11,878 respondents to the LC 2020 GPS, comprised of 9,179 patients and 2,699 caregivers.
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PMC11488203
Further analysis of the common miRs expressed in MSC control and taxol exosomes was performed for differential expression of up- and down-regulation as displayed in a volcano blot (B).
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PMC11585565
Gene expression was normalized with that of ATCB1 and shown as the relative gene expression.
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PMC11345828
Anhydrous EtOH (80 mL) was added followed by K2CO3 (6.8 g, 49 mmol).
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To evaluate the efficiency of gene knockdown, RT-qPCR for the BOLA genes was carried out under the previously outlined conditions, and Western blot analysis was carried out.
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PMC9841531
A-549, MCF-7, MDA-MB-231, NIH/3T3, and MDCK II BCRP cells were cultured in DMEM cell culture media (Genetix Biotech Asia, New Delhi, India, and Biowest, Nuaillé, France) supplemented with 10% fetal bovine serum (FBS; Genetix Biotech Asia, New Delhi, India, and Biowest, Nuaillé, France).
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PMC10812665
Elution was performed using buffers with increasing pH (pH 2.9→pH 12), ion strength (buffer concentration 0.12–0.45 M) and using a temperature gradient.
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PMC9429973
IncuCyte imaging based cytolytic assays demonstrated strong killing activity against Raji targets.
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PMC11738017
To explore the mechanisms responsible for driving primary refractoriness and resistance to anti-BCMA TCE or CAR T therapy apart from antigen escape, we interrogated serial WGS data collected before and after therapy in 9 patients who either had primary refractory MM (n = 8) or who progressed without antigen escape (n = 1; supplemental Table 1).
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PMC11727000
In duplicate experiments, cells were pulsed with biotin and biotinylated proteins were isolated under denaturing conditions and the proteins were identified by mass spectrometry.
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PMC10656496
On day 16, spheroids were treated with opposite drug (from trametinib to panobinostat and vice versa) for 96 h, then with CA1 for 72 h, and then the process was repeated until the experiment was terminated. (
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PMC11756514
The library includes transposon-mutants of tarS (NE0942) and tarM (NE0611), referred to as JE2ΔtarS and JE2ΔtarM. To generate a JE2ΔtarMS mutant, allelic exchange was performed as described in Bose et al. (39) to exchange the Em resistance cassette to Kan in JE2ΔtarS. To create the JE2ΔtarMS mutant, the ΔtarM mutation was transduced to JE2ΔtarS using φ80α with selection for Em resistance.
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PMC6222635
For DWDOP1, signals in theC-NMR spectrum were located at δ102.48, 100.12, 78.45, 76.51, 75.00, 73.84, 72.76, 71.40, 69.92, 60.47, 23.04, and 20.52.
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PMC9429973
Results: Interestingly, BR-HMCLs demonstrated significant resistance to Btz compared to their parental counterparts (CTR-HMCLs) (mean IC50: BR-HMCLs =5nM vs CTR-HMCL=2.3nM, p<0.05).
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PMC11750696
Furthermore, the study indicated that compounds triggering ER stress can intensify Th17 effector functions (54).
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PMC10747160
The 96-well plate was then retrieved from the humidified incubator, and the media were gently pipetted out of wells.
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PMC9031474
For example, approved chemotherapeutics—such as paclitaxel, vinblastine, or belotecan—are natural products or contain natural product pharmacophores.
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PMC10873328
The area under the curve of prognosis model based on the risk score in training cohort. (
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Within the ctDNA cohort, 8/14 (57%) mutations detected in tumour samples were present in ctDNA at study entry.
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PMC3019555
miRNAs were isolated from total cell lysates or Ago2-bound fractions using the mirVana miRNA Isolation kit (Ambion).
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PMC11541409
Tumor heterogeneity presents another hurdle for TKI therapy.
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PMC11411131
Therefore, while SBP2 expression is practical for low-level Sec incorporation, it is insufficient for high-level Sec incorporation.
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PMC11714165
Quantification analysis further confirmed that the DN‐F group showed significantly lower TRAP‐positive area compared to the other groups (Figure 6G).
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PMC11011837
Furthermore, these cell lines share similar behaviors in specific metabolic pathways, such as purine metabolism and glutathione metabolism.
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PMC11464982
The absence of viable cells of the production strain in the food enzyme was demonstrated ■■■■■ No colonies were produced.
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PMC10674574
Caco-2 cells were isolated from colon tissue derived from a 72-year-old in the 1970s .
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PMC11592837
In this regard, our kinetic data also provide evidence that mt-cfDNA quantification can be an effective approach to biomonitor modulators of DOX related cardiotoxicity.
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PMC11144382
This suggests that dysfunctional NFIX proteins in MSS may directly increase CRABP2 expression through a reduced ability to suppress CRABP2 promoter activity which in turn results in the activation of the RA pathway, which may then indirectly misregulate VCAM1 expression in a tissue-specific manner, and contribute to the pathology observed in MSS (Figure 5).
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Patients with genetic predisposition for hemochromatosis have a higher chance of developing hyper-ferritinemia, with a potential to promote significant organ dysfunction.
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PMC9429973
Secondary objectives include assessment of PK, activity, and immunogenicity, and identification of biomarkers associated with response and resistance.
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PMC11106977
Macrophages in the immune system can be divided into two types: classically activated macrophages (M1) and alternatively activated macrophages (M2), which perform pro-inflammatory and anti-inflammatory functions, respectively .
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PMC5261804
Intuitively, the significance of each node propagates to its neighbors.
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PMC11792090
The quantity of CAR-T cells in the mouse blood was measured three days later. (
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PMC11264242
While the molecular mass of naïve SSX2 gene product is about 22 kDa, the SS18-SSX2 fusion produces a higher-molecular-weight protein of 75 kDa.
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PMC7022782
JEOL JEM-1200 EX II microscope (JEOL ltd, Tokyo, Japan) operating at 100 kV (tungsten filament gun) and equipped with the TEM CCD camera Olympus Mega View III (Olympus Corp., Tokio, Japan) was used to obtain images at different magnifications (12,000× to 100,000×).
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PMC6312945
The expression of HbsAg in MHCC97-L pSUPER.neo-miR-101 group was significantly different from that in MHCC97-L pSUPER.neo-345 group (P<0.05) (Fig. 4).
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PMC11726848
At the dose of 4 Gy, the number of cells in the G2/M phase has increased by 25–50% of the total number of living cells, and at doses of 8 and 16 Gy, it reached almost 100%.
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PMC11095939
IgG served as a negative control.
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PMC11752767
NK cells can synergize with many other immune cells against cancer cells, as shown in Fig. 2.
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PMC9221284
Finally, we did not identify a specific transcript that could produce the new c-MycS1 isoform suggested in Western blot.
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PMC11026382
A central factor behind DHFR and TYMS biochemical coupling is that loss-of-function mutations in TYMS help to preserve reduced folate pools, allowing THF to shuttle one-carbon units in downstream biochemical processes like purine biosynthesis even when DHFR activity is low.
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PMC11139449
PCR amplification was performed on the CASP8AP2 gene using a 20 μL reaction mixture.
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E and F) The proportion of apoptotic cells in A498 cell line was assessed by flow cytometry.
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PMC10565698
These results, as well as the in vitro findings, suggest that circUSP10 inhibits tumor growth via EMT in vivo.
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PMC10154097
Online bioinformatics tool circBank predicted miR-218-5p as a potential target of circSOX4 with binding sites (Figure 3(b)).
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PMC11409031
The ROC analysis demonstrates that the model holds significant clinical utility.
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PMC11055323
To this end, we took advantage of the well-known N12(Sall4)-NuRD interaction module and fuse it or its variants to SS18-SSX (SS) and show that N12, not its variant N12(R3A) nor N12(K5A), can pull endogenous HDAC1 into the condensates (Fig. 3a, b), presumably as part of NuRD complex .
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PMC10847511
This included 10 assays for platinum agent (Carboplatin 2, Cisplatin 4, Oxaliplatin 4) and 14 assays for PARP inhibitors (Olaparib 6, Talazoparib 3, Veriparib 2, Niraparib 2, Rucaparib 1).
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PMC11711063
Tumor sizes were monitored using calipers twice a week.
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PMC11387401
About 20 ng cDNA was used as input in a 10 µL quantitative real-time PCR (LightCycler 480 II, Roche Applied Science, Belgium).
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PMC11798926
The transmembrane protein Synapse Differentiation Induced Gene 4 (SynDIG4), also known as Proline-rich transmembrane protein 1 (PRRT1), is an AMPA-type glutamate receptor (AMPAR) auxiliary factor that is necessary for maintaining extra-synaptic pools of GluA1.
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PMC9429973
AID is also implicated in another IgH rearrangement, the Locus Suicide Recombination (LSR).
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This group of disorders is sometimes associated with abnormal phenotypes.
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In addition, bioinformatics analyses suggested that RILPL2 expression demonstrated a noteworthy positive correlation with various chemokines; high RILPL2 expression indicated a higher anticancer immune score.
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PMC8348645
For compounds showing ‹50% inhibition, the IC50 value was not calculated.
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The double-blind period comprises an 8-week dose-titration period and a 12-week fixed-dose period.
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Periderm cells could be isolated from murine embryonic palate shelves using fluorescence-activated cell sorting (FACS) and the Krt17-GFP transgenic mouse line (McGowan and Coulombe, 1998).
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O-GlcNAcylation may affect the progression of RA by targeting proteins or regulating signaling pathways.
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PMC11790971
An inverted epi-detection setup was used with a 25× water immersion objective lens with 1.05 NA (XLPLN25XWMP2, Olympus).
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PMC11739504
Microtubules are subjected to diverse post-translational modifications (PTMs), including acetylation, polyglutamylation, detyrosination/tyrosination, polyglycylation, and phosphorylation.
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PMC11345828
The title compound (30 mg, 39% yield) was prepared following General Procedure F using compound 48 (70 mg, 0.089 mmol, 1.0 equiv) and (tetrahydro-2H-pyran-4-yl)methyl 4-methylbenzenesulfonate (75 mg, 0.27 mmol, 3.0 equiv) followed by saponification using General Procedure G. LCMS Method 2: RT = 1.378 min, MS (ESI): mass calcd for C46H49Cl2N5O7, 853.3, m/z found 853.8 (M + H).
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PMC11521786
Due to its minimal kinase activity, HER3 was largely underrated as a target for antitumor therapies.
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PMC6379402
The two normalized distributions are statistically significantly different if their Mann–Whitney U-test p value is less than or equal to 5%.
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PMC10870498
A Genes positively and negatively related to KIF23 were obtained using the Linkedomics database; B The 80 genes positively related to the expression of KIF23.
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Eligible pts had measurable disease at enrollment, ECOG 0-1, and r/r DLBCL after ≥2 lines of prior tx.
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PMC11612315
For rectal temperature recording, the rectal temperature was measured with a digital thermometer (Therma‐1; ETI, West Sussex, UK) by inserting a corn oil-soaked flexible bead probe into the rectum after the intraperitoneal administration of 200 μL of vehicle, exendin 9–39 (50 µg/kg), or BCTC 5 mg/kg in wild-type mice (n = 6).
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Source data are provided as a Source Data file.
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PMC11357960
B-E) The expression of CD69 and Annexin V were analyzed on CD45CD3CD4 T cells (B), CD45CD3CD8 T cells (C), CD45CD3CD56 NK cells (D) and CD45CD3CD19 B cells (E).
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PMC8735881
HEK293T cells (refers to as effector cells) were seeded in a 96-well plate at 1.5 × 10 cells per well, incubated at 37°C with 5% CO2 overnight, and the cells were then cotransfected with a DSP1-7-expressing plasmid and an Env-expressing plasmid and incubated at 37°C for 24 h. Transgene- or mock-transduced 293FTTarget cells were resuspended in prewarmed culture medium and mixed with EnduRen live cell substrate (Promega), and then incubated at 37°C for 30 min.
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