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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC11785489
This time-related confound would require systematic shifts in V(D)J recombination with human age.
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PMC10878518
Many bone and soft-tissue sarcomas showed high CAR mRNA expression, which varied in malignant tumors with the same histology .
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PMC10079526
Dots represent the numbers of DNMT1 foci/cell.
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PMC2118063
BCL6 also arrests further development by acting in concert with PAX5 (BSAP) to repress genes involved in plasmacytic differentiation (2).
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PMC11635519
Despite the binding mode differences, we noticed that PepA’s N-terminal His mimics several interactions of GLP-1’s N-terminal His with the GLP-1R binding site (Figure 7B,C).
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PMC10362265
Human tetramer has intermolecular disulfide contacts that are formed between IL18 and IL18BP, resulting in a grid-like organization of dimers (Fig. 5) ; unlike the YLDV tetramer, which is formed by a disulfide attachment between C132s of the YLDV decoys leading to a side-by-side spatial arrangement of the dimers .
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PMC11714165
The left tibial medullary cavities were injected with 143B‐luciferase cells to construct an osteosarcoma model.
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PMC10006224
When we segregated G1 and G2 cells, we observed that the difference between the salt resistant fraction and the total chromatin-bound protein was reduced in G2 for both STAG1 and STAG2, consistent with the stabilization resulting from cohesion establishment (Fig. 2c).
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PMC9429973
Cells at day 9 and 14 of the differentiation process show a high percentage of multinucleation with more than 2 nuclei, nuclear deformities and mitotic problems.
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PMC11224020
Right, box plot showing the minimum to maximum range of CCR7 intensity (N = 3; n = 87 cells in 3 µm (control), n = 99 cells in 3 µm (PGE2), n = 87 cells in 3 µm (PGE2 + BI605906)).
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PMC11607638
The effect of SK has been studied before in D. melanogaster, L. migratoria, G. bimaculatus, P. americana (L.), and other insect species. , , ,
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PMC9412887
In vivo biodistribution experiments showed that DOX accumulation in tumor site of tumor-bearing mice treated with DOX@ pPGNCs and NIR irradiation was highest (Figure 3e), confirming that NIR irradiation-triggered photothermal effects of gold nanocages could further strengthen DOX accumulation.
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PMC8751435
However, it is still not exclusive that apoptosis may be stimulated in pyroptotic cell at the same time, and more exploration is needed to make a more specific conclusion.
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PMC9672323
Afterward, cells were centrifuged for 10 min at 800 × g and fixed using 70% pre-cooled ethanol.
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PMC10578720
Following HBV exposure, SIRT3-overexpressing macrophages led to significantly increased proportions of CD86 cells and decreased CD206 cells compared to cells infected with vectors (Supplemental Figure S4D, http://links.lww.com/HC9/A586).
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PMC9429973
The median duration of the titration period was 5.0 weeks, and 77.0% of patients reached the recommended dose of 400mg at the time of analysis.
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PMC9918897
The analysis was performed by using high-performance liquid chromatography (HPLC).
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PMC11216402
Therefore, COL1A1 and FGF5 are dysregulated in both the Mes-like GC cell lines and stomach cancer tissue, consistent with the increased chromatin accessibility of newly identified flanking distal peaks, which are likely acting as enhancers.
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PMC11391695
Furthermore, ACYP2 inhibition induced cell apoptosis and substantially enhanced cell proliferation, colony formation, migration and invasion in HCC cells.
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PMC9429973
Summary/Conclusion: flow cytometry should be used as an important tool in the screening and typing of GT patients.
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PMC11252553
Non-irradiated & untreated (A), untreated with irradiation (B, E & H), Taurine-treated with irradiation (C, F & I), & cysteine-treated with irradiation (D, G & J).
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PMC11357960
These results suggested that although inhibition of SUMOylation levels could improve the activation status of T and NK lymphocytes, extreme decline in SUMOylation levels would lead to the increased death rates of lymphocytes.
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PMC9429973
Our work suggested that epigenetic therapies can be safe and effective for patients with PTCL, particularly those with T-cell lymphomas with a follicular helper (TFH) phenotype (Marchi E et al. Br.
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PMC11078693
This step is performed following the manufacturer’s instructions: https://biotium.com/wp-content/uploads/2016/12/PI-AnnexinV.pdf.
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PMC11704834
In the present study, it was identified that TLE1 reduces gefitinib-induced growth inhibition and apoptosis in LUAD A549 cells in part via downregulation of E-cadherin, and TLE1 expression is upregulated in the experimentally generated gefitinib-resistant A549 (A549GR) cell line to promote EMT and gefitinib insensitivity.
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PMC9429973
The average age of patients at the time of transplantation was 42 years, of which 11 patients with only TP53 deficiency (26.1%), 25 patients with TP53 single mutation (59.5%), and 6 patients with TP53 multiple hits (14.2%).
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PMC11609529
The GSEA preranked method was performed using the Molecular Signatures Database (MSigDB v.7.1).
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PMC10873328
Recently, attentions have been focused on the identification of novel signatures in cancer early diagnosis, molecular typing, medical decision-making and prognosis prediction with the application of comprehensive bioinformatics.
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PMC11594074
After incubation, each well was washed four times with 150 µL of 1× wash buffer.
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PMC11377827
H3K4me3: control vs. USP43 sgRNA ****P < 0.0001, control vs. 14-3-3 siRNA ****P < 0.0001, control vs. USP43 sgRNA + 14-3-3 siRNA ****P < 0.0001.
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PMC11705862
Non-targeting negative control siRNA (Ambion, #4390843) was used as a negative control.
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PMC9370419
A two-sides p-value of <0.05 is considered statistically significant.
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PMC11755624
Furthermore, the knockdown of the CALML3-AS1 and SNHG9 molecules reduced activation markers of dendritic cells, drivers of psoriasis progression .
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PMC8992508
Most compounds showed low inhibition of P-gp and no activity against MRP1, but some derivatives displayed a good activity also against P-gp, in some cases even higher than against BCRP.
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PMC7039683
Figure 4—figure supplement 1.Detailed description of enhancer activity pattern of Tg(IRF6-9.7:gfp) and Tg(ZNF750-37:gfp).(A–K) Lateral views of (A–C, G–I) bright field or (B’, C’, D, E, H’, I’, J, K) epifluorescence images of (A–F) Tg(IRF6-9.7:gfp) or (G–K) Tg(ZNF750-37:eGFP) transgenic zebrafish embryos at the indicated stage.
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PMC10938336
During the 24 h treatment, no notable necrosis was found.
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PMC11742864
Further studies revealed that ONS-EPA significantly downregulates CRP and TNF-α, neutrophil/lymphocyte ratio and platelet/lymphocyte radio, as well as pro-inflammatory status, indicating that intake of EPA significantly benefited the patients with NSCLC to absorb energy and proteins and to improve the body composition, which prevented cachexia development.
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PMC11388384
The lack of clarity regarding how HH spreads makes it even more puzzling how the signaling range of HH can be tuned in diverse tissues.
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PMC11711871
Interestingly, GR rats exhibited increased heart weight following a HSD, which might indicate a hypertensive state and the result of volume overload as observed in humans .
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PMC11670407
To explore the effect of OTULIN expression on the survival of patients with tumors, we extracted data from the TCGA database on OTULIN associated with sarcoma (data on osteosarcoma were not used because there is more abundant data on sarcoma than osteosarcoma) and found that high OTULIN expression significantly reduced the survival of patients with sarcoma (Fig. 1a).
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PMC11765678
The selective iNOS inhibitor, 1400W, reduced both uptake and cytotoxicity of Adriamycin in P-gp-expressing NCI/ADR-RES cells only.
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PMC11095939
Together, our findings identify a critical negative regulatory role for Mecp2 in quiescence exit and tissue regeneration, partially through targeting several NRs.
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PMC11785489
To calculate Pnull, we summed the probabilities of randomly drawing two observations with the same cluster assignment for each of the nine transcriptional clusters (A1–A9, Figure 1A).
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PMC11291697
This approach allowed to refine the deletion between chromosomal positions (hg38) chr2:144,119,297 (Proximal 1 probe) and chr2:144,194,675 (Distal 3 probe).
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PMC11670407
Currently, the combination of surgical resection and neoadjuvant chemotherapy (cisplatin, doxorubicin, and methotrexate) has increased the 5-year overall survival (OS) rate from less than 20% to greater than 60% .
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PMC11476106
Ewing sarcoma (ES) is the second most frequent bone or soft-tissue cancer in children, adolescents, and young adults .
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PMC11348300
The PpIX production in these diverse tissues leads to excessive background signal if using conventional, steady-state fluorescence imaging.
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PMC9429973
In univariate analysis gal-3 expression was not a statistically significant prognostic factor for OS and EFS in the whole group of patients (p=0.16 for EFS and p=0.19 for OS).
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PMC9429973
Responses were observed in PTCL (75% ORR at DL≥3) and CTCL (67% ORR at DL≥3) and across disease compartments.
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PMC11786704
Mechanism of action: PC capsules reduce ROS, inhibit inflammation via the p38 MAPK pathway, prevent apoptosis, and then promote tissue repair.
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PMC9592219
In this study, Schrödinger (LSA, USA) was used to simulate and dock the screened drugs.
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Image: Summary/Conclusion: Discordant expression of proteins-products of oncogenes NSD2, cyclin D1 and c-Maf in tumor cells in bone marrow and bone plasmacytoma could be evidence of different tumor clones activation in PCM.
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PMC11569208
Supernatant was analyzed for VSV∆51 viral titer 24 hpi by viral plaque assay (n = 3, mean ± SD; ****P < 0.0001 by two-way ANOVA). (
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PMC9429973
MRD by CTCs and MFC-BM were also negative.
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TORC1 regulates ribosome biogenesis through directly phosphorylating the split Zn‐finger transcription factor SFP1.
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PMC9587298
These fragments can undergo further fragmentation, as denoted in Table S2.
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PMC11351758
Confocal fluorescence images and image stacks in our lab were collected using a Zeiss LSM 510 META NLO mounted on an Axiovert 200 M inverted microscope (Carl Zeiss Microimaging, Inc., Thornwood, NY, USA).
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PMC10882807
Comparison of the cell cycle distribution of has_circ0005397-knockdown HCCLM3 cells. (
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While the overall number of cells that stained positive for Aurora-A were higher in the carcinomas due to increased epithelial content, the intensity of the staining was equivalent with benign ovarian epithelial cells (Fig. 1D–G).
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PMC9429973
Key inclusion criteria included: 1) CML in chronic phase at original diagnosis, 2) total duration of IM therapy of minimum 3 years, 3) total duration of MR or deeper response over 2 years.
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The herpes virus entry mediator (HVEM) is a co-stimulatory molecule with a novel downstream signaling pathway.
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Figure 6Effect of α-Taxilin knockdown on TLR’s expression. (
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Protein concentrations were quantified using the Lowry method, and 50 μg of protein from each sample was subjected to SDS-PAGE electrophoresis on 10% polyacrylamide gels.
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The absorbance at 405 nm was then detected by the microplate reader (Thermo Fisher Scientific).
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Furthermore, to our knowledge, Ceg10 is the first structurally characterized S-nitrosylated Legionella effector.
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PMC11628904
Isotonic medium was prepared by supplementing control E3 medium with NaCl (Sigma‐Aldrich) to a final solute concentration of 270 mOsm.
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PMC11739504
Thus, the subcellular localization of Kat2b during primary cilia biogenesis was examined to verify whether Kat2b is associated with primary cilia as a transcriptional coactivator in the nucleus or in other cellular locations.
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PMC8010066
Comparing to the control group, the colony counts of PA-2, PA-3, and PAO1 decreased significantly during the co-culture with SA-1 (P-value In contrast to other strains, the colony count of PA-4 strain after co-culture indicated a slight reduction.
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PMC9596868
No. 9284T) and mouse monoclonal anti GAPDH (6C5) from Santa Cruz Biotechnology, USA (Cat no. SC- 32233).
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PMC11791264
ns: not significant (p > 0.05), ∗p < 0.05, ∗∗∗p < 0.001, ∗∗∗∗p < 0.0001 (Two-way ANOVA followed by Tukey’s multiple comparison).
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PMC11638288
Gili and coworkers showed that the binding of NKp46/NCR1 to its ligands also plays a critical role in clearing certain lymphoma cells in vivo.
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PMC9429973
These findings will need to be confirmed in larger studies and their biological basis will need to be further investigated.
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PMC9429973
Malignant cells have an increased demand for key cellular components and a reliance on de novo synthesis pathways.
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PMC10419319
The 25 common gene targets are shown in Figure 6A.
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PMC9503685
In this case, the CSA in the micelles has direct access to the bacteria.
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PMC11300639
Data are presented as the mean ± SEM of three replicates. ***,
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PMC11638255
To visualize GSEA results, the same approach for the GeoMX DSP data was employed as above.
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PMC11798926
Cells were then incubated for 20 min with primary antibodies [either Mouse α-myc IgG2a (Cell Signaling Technology Cat# 2276, RRID:AB_331783, 1:1,000), Rat α-HA (Roche Cat# 11867423001, RRID:AB_390918, 1:200), or Ms. α-Flag (Sigma-Aldrich Cat# F3165, RRID: AB_259529; 1:500)], followed by three BSA-PBS washes and incubation with appropriate secondary antibodies.
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PMC10890307
This normalization allowed us to compare different types of cells and growth conditions, thus providing a better understanding of cancer cell metabolism.
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PMC10589262
Body weight and tumor volume were measured three times a week after drug treatment.
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PMC11770130
Though the results of ICV injection indicated that NTS could regulate food intake via direct interactions with the CNS, it did not rule out the possibility that NTS could also regulate food intake via interacting with peripheral tissues in physiological conditions.
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PMC9429973
Among the efficacy-evaluable pts, the ORR was 100% (27/27), with 93% (25/27) achieving a complete metabolic response (CMR) and 7% (2/27) achieving a partial metabolic response.
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PMC7582629
The increased amount of lipid droplets correlates with the increased aggressiveness of cancer.
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PDGFR is internalized into early endosomes, traffics via mobile endosomes, and is delivered to multivesicular bodies (MVBs) /lysosomes or recycled back to the plasma membrane.
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PMC11742670
However, their review focused on Human-Computer Interaction (HCI) research with an emphasis on explainability.
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PMC11470381
These settings ensure precise segmentation of cells across all time frames.
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PMC8540611
Since the FAM-label is located on the siRNA sense strand not involved in RNA interference, this method should not affect the overall gene silencing process.
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PMC9429973
Methods: We enrolled participants with sickle cell disease between 5 and 18 years of age in a prospective study of environmental exposures.
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PMC11377827
However, the involvement of USP43, a poorly characterised DUB, in the HIF response was unknown, and we confirmed that USP43 depletion prevented full activation of the HIFGFP reporter in 1% oxygen (Figs. 1D,E and EV1A).Figure 1Mutagenesis screens identify USP43 as a regulator of the HIF response.(A) Schematic of the pooled DUB sgRNA library screen.
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PMC11650848
Lastly, we identified a relationship between the methylation quantitative trait locus (mQTL) and cognitive development in early life (for a graphical abstract see Additional File 1: Fig. S1).
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PMC9841531
Yellow solid; yield: 82%, melting point: 193–195 °C: FTIR (cm): 3255.87 (NH), 2219.58 (CN), 1670.16 (C=O), 1594.87 (C=O), 1517.83 (C=C); H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.36 (s, 1H), 8.62 (s, 1H), 8.54 (s, 1H), 8.00–7.94 (m, 1H), 7.59–7.52 (m, 1H), 7.50–7.43 (m, 2H), 7.36–7.21 (m, 2H), 6.91–6.78 (m, 2H), 5.27 (s, 2H), 3.80 (s, 3H), 3.68 (s, 3H); MS calculated.
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PMC9429973
During the first year of DARA use, 90.5%, 83.2%, 72.6% and 63.5% of the patients continued DARA at 3, 6, 9, and 12 months, respectively.
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PMC11781181
no. ab285269) (both from Abcam) assay kits, respectively, according to the manufacturer's instructions.
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PMC11352877
Hypoxia is a frequent concomitant of pathological diseases, which leads to the activation of hypoxia-induced factors.
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PMC11442172
Frequently, these standard media include a largely undefined serum component (e.g., fetal bovine serum (FBS)) in conjunction with one of the several defined basal media (e.g., Minimal Essential Medium (MEM), Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM), and RPMI 1640).
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PMC5916734
The clonal 3B12 cells were sequentially transfected with the linearized plasmids p1.2-Zeo-VKORC and p1.2-Hygro-Fur.
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PMC11087055
White asterisks, the polonaise movements at the induced axis which are opposite direction to the authentic axis. (
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PMC11763111
Fig. 6LLT1 overexpression renders resistance to allogenic PBMCs.
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PMC10808409
Stability studies showed no significant differences after storage for three months at 4 ºC, which validated the stability of the formulation.
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PMC9429973
HRQoL was a secondary endpoint assessed using two validated questionnaires: the European Organisation of Research and Treatment of Cancer Core Quality of Life Questionnaire (EORTC QLQ-C30) and the EuroQol 5-dimension 5-level questionnaire (EQ-5D-5L).
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