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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC9100622
Briefly, the A673, TC71, and POE cell lines were seeded at 1 × 10 cells per well, except for the POE cell line (2 × 10), in 6-well plates, treated with Atorvastatin and stained with 5 µM Cell Rox Dep Red probes or 2 µM Bodipy C11 for 30 min at 37 °C, 5% CO2.
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PMC10728200
Cells were treated with RSL3 and IM at various doses, and the half-maximal inhibitory concentration assay (IC50) was calculated using nonlinear regression analysis in GraphPad Prism 8.0.2.
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PMC11742047
Workflow for lipid annotation.
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PMC9429973
However, critically ill hemato-oncological (HO) patients still have a high risk of mortality, and stigma of poor prognosis may affect triage to ICU admission and clinical decisions.
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PMC11055323
The blue and black dotted lines indicate the intrinsic chromatin domains.
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PMC3931643
Targeting mTOR with asTORi represents a potential new approach.
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PMC9429973
Results: The results of the CD269, CD319 and sSLAMF7, sBCMA protein concentrations in the serum of NDMM patients are presents in Table 1.
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PMC4695073
In previous studies, we found that eukaryotic translation initiation factor 3a (eIF3a) confer to cispaltin sensitivity via downregulating the synthesis of nucleotide excision repair (NER) proteins, such as xeroderma pigmentosum complementation group A (XPA) and C (XPC), in NPC cell lines .
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PMC9841531
A three-dimensional grid box (x = 67.52 Å; y = 62.25 Å; z = 66.43 Å) was adjusted, and the exhaustiveness parameter was set to 8.
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PMC11684297
The experiment was done in triplicate.
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PMC9046263
The highly proliferative A172 cell line demonstrated a marked overexpression of one specific HERV: HML-6 at chromosome 19q13.43b.
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PMC11718031
The results hereby suggest that these amino acids are beneficial for improving mAb production by the cell line used here.
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PMC11413393
When comparing these two data sets, we note a total of 165 genes that are significantly down regulated (FDR ≤ 0.01, log2(FC) < 0) across both experimental conditions (Fig. 4b).
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PMC10197932
Finally, as expected, UT lymphocytes incubated with Dynabeads show a physiological increase of ROS with respect to the control (UT).
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PMC10362265
Fig. 4a shows the SASA of the amino acids at the 74th positions and the small surface region, wherein C74 is located, for five of the complexes.
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PMC11731614
To study keratinocyte-derived extracellular vesicles (KDEVs), we fractionated cell-conditioned medium (CCM) from cultured adult mouse primary keratinocytes (Moehring, 2018, Sadler et al., 2020) using a qEV 35-nm size-exclusion chromatography column (Böing, 2014) (Fig. 1A).
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PMC10850553
Some cells were pre-treated with the selective C5AR1 inhibitor, W54011 (300 nM, 30 min) prior to the treatment with recombinant C5a.
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PMC11718109
A Fluorescence images of iPSC-derived DA neurons (day 30) stained for DAPI to label nuclei (blue) and immunolabeled with antibodies directed against βIII-tubulin (green) and TH (magenta).
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PMC11360263
further research is needed to improve their efficacy, safety, and accessibility, particularly for populations at high risk of HCMV-associated cancers .
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PMC11760643
Of note, the use of antibodies and complement for ex vivo cell depletion to mitigate GVHD risk in donor stem cell transplantation has been previously used to reduce GVHD severity .
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PMC11286266
Cells were analysed in basal conditions (UT) or upon endoplasmic reticulum (ER) induction with Tg (0.5 µM, 5 hr).
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PMC10079526
Dashed lines represent cut off at a foldchange of two (log2 = 1) and p-value of 0.05 (-log10 = 1.3) (n = 4).
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PMC6771295
In Mero-14 cells, SIRT5 silencing increased SIRT1 levels in the untreated and resveratrol treated cells and SIRT3 protein levels in resveratrol treated cells (Figures 4Bi,ii, compare bars 1 to 5 and 4 to 8, respectively).
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PMC11700247
To investigate how RT affects CART-19 therapy, we injected 2 × 10 A20 tumor cells in both sides of the mice as previously and, 19 days later, treated one of the tumors with RT, followed by lymphodepletion with cyclophosphamide and IV injection of 1 × 10 CART-19 cells (Figure 2A; supplemental Figure 2A).
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PMC11637276
MDA-MB-231 cells overexpressing PPP2R1A were a gift from Professor Alexis Gautreau (École Polytechnique, Paris, France).
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PMC11224020
However, how shape sensing affects immune cell function is mostly unknown.
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PMC8735881
In addition to their high antiviral efficacy, we are still intrigued to understand the mechanism of action of the CMI constructs.
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PMC11538390
Genomic coordinates are shown according to the human genome build GRCh38/hg38.
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Caspase-9, known as an initiator caspase, plays a pivotal role in activating executor caspases, such as caspase-3 [43–45].
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PMC11519583
d Representative images of MPs at 3 days after transfection with the respective siRNAs, followed by staining with SPiDER-βGal (magenta) and DAPI (cyan).
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PMC11637284
It is possible that they modulate the efficiency of mitochondrial protein import, and that in the cell lines in which the charged amino acids were mutated an import phenotype would be masked because the ectopically expressed mutant TAC60 subunits were overexpressed.
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PMC8097906
a–g Cell viability measurement via MTS-assay of RH-30 cells after treatment with two plant extracts (VSM and LW) and five plant-derived compounds (Geni, Seco, Mata, Daid and Jaspl.)
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PMC11769516
Of particular importance is the widespread contamination of food and feed with Fusarium mycotoxins, which contribute to disorders of the nervous system.
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PMC11764090
Brassinosteroid (BR) receptor brassinazole-resistant 1 (BZR1) regulates CBF1 and CBF2 gene expression , enhancing cold resistance without affecting growth (Figure 2).
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PMC11752740
For MRP1, the reduction was even more significant, with combination treatment resulting in a decrease of around 98% in SK-BR3 cells.
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PMC11783017
ns: no significance, ∗P < 0.05, ∗∗P < 0.01, ∗∗∗P < 0.001, compared with Control group.
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PMC11271278
To support this finding, we utilized TCGA ATAC-seq data to estimate potential regulatory activity of translocated enhancers we identified in several breast, prostate, and colon cancer cell lines.
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PMC11792766
No. 15140122), for all cell lines.
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PMC11519788
These results supported the notion that SPOP inhibited macrophage-mediated UBC cell proliferation and stemness by negatively regulating STAT3 activation.
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PMC11413393
FANCM loss also plays a role in R-loop resolution, thus contributing to the phenotype at multiple levels.
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PMC11730320
In contrast, Vδ1+ thymocytes are generated from mid-gestation onward and represent the dominant γδ thymocyte population throughout late fetal, post-natal and adult life, although only a minor constituent of the peripheral blood γδ T cell population following birth.
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PMC11661024
Apoptosis, the programmed cell death, is initiated by extrinsic and intrinsic pathways.
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The flow rate was 0.6 mL/min.
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PMC11638255
Ccr7 is involved in neutrophil migration to lymph nodes where their accumulation has been implicated in solid tumor progression and metastases.
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PMC11802929
e Top: Binary TCR-Groups (HPhobic-Low and HPhobic-High) are defined based on the median value of hydrophobic residue percentages for all SARS-CoV-2 cells.
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We also identified a decrease in the number of ADH1B + CAFs in stage II LUADs compared to stage I LUADs (Supplementary Fig. S3C).
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RNA-in situ hybridization confirms presence of HML-6 provirus RNA in the nucleus (DAPI) and cytoplasm of glioblastoma cells.
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Dosed at 0.25 mg/kg.
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The number of experiments and p-values are indicated in the figure legends.
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PMC9429973
The most common immune-related AE assessed by sponsor was hypothyroidism (n = 13, 16%).
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However, previous data in our study drew an opposite conclusion compared to other research using A549 cells.
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Inhibitory rate of PTX combined with LFU on A-204 cells in vitro.
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The release process is influenced by several factors, including polymer erosion, expansion, relaxation, and drug dissolution or dispersion within the polymer matrix.67 The surface characteristics of P5W30-BW-SLNs were assessed using transmission electron microscopy (TEM).
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These results suggest that the incorporation of the chlorine atom into the ligand of the platinum complex significantly enhances its cytotoxic effectiveness in breast cancer models.
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DigitalMLPA libraries were sequenced on an NGS platform.
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This effect, in turn, has a tumor-suppressive effect on cancer cells .
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Demographics and genotyping data were obtained from the Eurocord database.
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PMC9429973
All pts responded to V1 and V2, uMRD in PB was achieved at the end of V1 in 12/13 pts (92%) and thus far with V2 in 9/13 pts (69%).
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PMC9780037
If successfully tested, these approaches should extend the room temperature shelf life of cyt c therapeutic delivery systems, making them more available to patients in clinical facilities with limited refrigeration conditions.
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PMC11394227
The cell viability rate was 31.9% on the 10th day, and the experiment was terminated when the cell viability dropped below 10% on the 12th day.
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PMC7723249
Then, the well were washed 3 times with PBS and cultured during 24 hours in fresh complete culture medium (200μl apically and 600μl basolaterally).
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PMC11621493
Statistical comparison was performed with multiple unpaired two-tailed Student’s t test, followed by Bonferroni posthoc analysis.
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PMC11774112
However, the intensity increased dramatically when the polymer concentration was increased to that of CMC, indicating that pyrene was present in the hydrophobic environment of the formed polymeric micelles (Figure 2C).
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PMC11267036
Then, the body weights of mice, tumor weights, and volumes were monitored, followed by functional assays.
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Two of the cancer gene products in the proximity proteome are known to physically interact with the N-CoR complex (SMARCE1 and SPEN)—suggesting these may all operate through a similar mechanism.
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Samples obtained were kept at −80 °C before use.
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PMC10093184
We further provide gene expression analysis of selected genes encoding for cellular immune checkpoints (CD270, CD274, CD276), proteins with kinase activity (MET, ERBB2), and genes linked to metastatic potential (MMP-2, MMP-9), as well as selected long non-coding RNA (MALAT1) and microRNAs affecting cell migration and invasion (miR-9, miR-34a, miR93).
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PMC10452486
In a unique experiment, Demaria et al. selectively removed any B2m-free HCs (Face-2) on the cell surface of PMA-activated T cells with brief treatment of cold trypsin.
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PMC11787651
As the instrumentation in MS evolves and improves, it is important to systematically evaluate histone PTM analysis on any new platform and identify ways to maintain or improve existing analytical methods.
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PMC9429973
In addition, AITL patient-derived organoid model was established to study the regulatory role of YY1 and its inhibitors in relapsed and refractory AITL.
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PMC6468656
Lentiviruses were produced via co-transfection of 293T cells with an shRNA-expressing plasmid, an envelope plasmid (pMD.G) and a packaging plasmid (pCMV-dR8.91) using calcium phosphate (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA).
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PMC11271800
It is well established that inflammation plays a significant role in the development of tumors and is regarded as one of the defining characteristics of cancer.
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PMC11394112
Furthermore, despite the previous survey of GCB DLBCL cell lines demonstrating this subtype displays little to no IL6R expression, we show the VAL GCB DLBCL cells express a high abundance of both IL6R subunits.
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PMC11686380
In conclusion, we identified a GAP43 variant in a neurodevelopmental disease patient and demonstrated that GAP43 plays essential roles in brain development.
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PMC9429973
Due to the higher infectious risk, caused by immune dysregulation typical of CLL, it is important to evaluate the timing of vaccination and maintain safety measures at any time.
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PMC9429973
The effectiveness of chemotherapy was evaluated after 4-6 cycles of chemotherapy in accordance with clinical guidelines.
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PMC11472569
Recent studies have revealed a novel mechanism responsible for MDR, in which EVs directly transport various proteins, including ABC transporters and proteins related to tumor survival and DNA repair, to recipient cells [Table 1].
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PMC11750165
In neighboring cells of neural ectoderm, Ngn1 as a proneural gene is repressed by a Hairy Enhancer-of-split-related protein (Kim et al., 1997; Takke et al., 1999).
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Representative MRI images (right panel).
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In a reaction vessel, the ester (e.g., 37, 49, 61) was dissolved in THF/MeOH/H2O (5:1:1, 0.2 M).
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The position of this band is consistent with the molecular weight of CIP2A protein.
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Compared with the ARID1A normal function groups, the ARID1A deficient group exhibited a higher TMB level (Fig. 3a).
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PMC9635307
Cell proliferation of the transfectants were analyzed by addition of [H]-thymidine (1.0μCi/well, PerkinElmer, Waltham, MA) for 6 h, as previously described .
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PMC11769516
of T-2 toxin and sacrificed after 1, 3 and 7 days.
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Hoechst 33342 (Invitrogen, OR, USA, Cat# H3570) was added prior to flow cytometry to exclude dead cells.
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During 12 months of romiplostim treatment dramatic meaningful QoL improvement by all SF-36 scales (GEE, p<0.001) and by FACT-Th6 score (GEE, 11.4 at baseline vs 17.1 at 12 months, p<0.001) was demonstrated.
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PMC6627640
The Z-score values for each gene across the parental and resistant lines were determined and hierarchal clustering was performed using a correlation metric for similarity and average linkage clustering.
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The overall response rate (ORR) at 3months was 63.6% and 30.3% respectively.
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We found that sex, Ph (+), and HSCT after CAR-T infusion is not associated with the long-term survival of patients.
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We observed that 0.5µM ACY-1215 gave the best result in terms of HDAC6 inhibition, leading to an increased acetylated α-tubulin without affecting histone H3 acetylation level.
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PMC11429241
After disinfection, the scaffolds were detached and placed in the wells of a 96-well plate, which was prepared following protocol , and submerged in the cell-culturing media supplemented with 10% FBS and 1% PS for 1 h. The cells were seeded at density of 7000–14,000 cells per well in 200 μL ofsupplemented culture medium.
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PMC11684269
In this review, we highlight T cell metabolism as a potential therapeutic target for kidney disease and review recent advancements in T cell immunometabolism and the renal microenvironment in the disease context.
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PMC8875242
Its polyspecificity is due to the presence of a large and flexible binding pocket containing several distinct transport-competent sites for rhodamine123 (RHD123), Hoechst 33342, digoxin, and prazosin .
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PMC11754784
The fluorescent intensity distributions of the target and nontarget cells treated by DNP1 and DNP3 were calculated by ImageJ, respectively, further confirming the strong fluorescent intensity of target CEM cells and very weak fluorescent intensity of nontarget cell mixtures (Supplementary Fig. 27).
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PMC10203589
In addition, the effect of FGF18 is also reflected in the correlation with radiotherapy, chemotherapy and other drugs on cancer prognosis ( Table 2 ).
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Autophagy is a significant antimicrobial response that inhibits Salmonella growth .
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PMC11683240
Subsequently, cells were treated with α1AT or water (solvent control) and intoxicated in FCS-free medium with PT for the uptake analysis for 4 h at 37 °C or for the binding analysis for 40 min at 4 °C.
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PMC8414691
WCE, whole cell extract.
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The most frequently reported risk factor was history of cardiovascular disease (36% CML, 33% Ph+ALL).
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PMC11021472
ST486, DG75, CA46 and BL41 cells were transfected with lentivirus carrying shRNAs targeting circZDHHC11 or control vectors (NT1: black, NT2: grey, sh1: light red, sh2: dark red).
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