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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC11798926
In an independent experiment, we confirmed that the SynDIG4 170–89 deletion mutant accumulates on the plasma membrane (Figure 2D).
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PMC11001582
Peptide eluates were then subjected to TMT labeling and high-pH fractionation for liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC–MS/MS); a total of 96 fractions were collected and pooled to 48 fractions, vacuum dried and stored at −80 °C until LC–MS/MS analysis.
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PMC10380508
The visualization of heatmaps and histograms was based on the “ggplot2” package .
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PMC9429973
In the ongoing phase 2 INCB 50465-201 trial (NCT02718300), add on parsaclisib has shown preliminary efficacy in patients with MF who experienced a suboptimal response to ruxolitinib.
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PMC9786247
Aiming at identifying markers for host adaptation and virulence of C. burnetii strains, we used the bovine mammary gland epithelial cell line PS as an in vitro infection model for the characterization of bacterial replication and host cell response after infection with 15 different C. burnetii isolates, which represented MLVA groups I to IV and were isolated from different hosts and organs, including three bovine milk isolates.
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PMC11545737
If caspase activity is blocked, RIP1 dissociates from complex IIa to form complex IIb with RIP3, which induces MLKL-dependent necroptosis .
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PMC11733919
Hydrodynamic diameters from DLS (by number) of MNP@PMAO, MNP@STV, MNP@CD26, and MNP@CD26@17D. (
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PMC9895440
R Studio (R version 4.2.1) was then used to calculate the average log2 fold change per gene and donor (average over the 5 guides per gene) and plot these values.
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PMC11604768
e Dual luciferase response curves in HEK293 cells in the presence or absence of 50 nM of the Gαq-specific inhibitor FR900359 (THRB-1, minCMV, rotation 8, spacer set 1; NFKB1, minCMV, rotation 8, spacer set 1).
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PMC9581083
Traditional Chinese medicine (TCM) philosophy categorizes COVID-19 as an “epidemic disease” caused by an epidemic evil with dampness and heat, termed Li-Qi in Chinese.
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PMC11607638
At the same concentration, SK1 was significantly less active to prolong feeding.
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PMC11730320
In addition, CD8+ T cells were reduced and demonstrated a loss of IL-7 receptor expression.
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PMC9429973
Most deaths were attributed to GvHD progression (n=10; 21%) followed by infection (n=6; 13%).
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PMC11126803
Even within the same tumor grade, patients with higher ESR2 expression had a worse prognosis for survival (Fig. S1B).
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PMC10523483
Usually, cytoplasmic NRF2 binds to Kelch-like ECH-associated protein-1 (KEAP1) and undergoes KEAP1-mediated degradation; upon oxidative stress, NRF2 disassociates from KEAP1, translocates to nucleus, and activates transcription through binding to the antioxidant response element (ARE) sequences within the promoters of detoxifying and antioxidant genes (13).
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PMC11767817
Both compounds similarly alter cell cycle progression in 5637 cells, mainly blocking the cell cycle in the G2/M phase and decreasing the percentage of cells in the G0/G1 phase.
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PMC11678368
The SI values for trans-[PtCl2(5ClL)2] are as follows: 0.95 (A2780), 1.01 (A2780cis), 0.78 (HT-29), and 1.04 (MDA-MB-231).
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PMC11171319
This conceptualizes that development is a bidirectional process and that somatic cells can gradually dedifferentiate into primitive stages of the developmental hierarchy, where HCMV, in our model, could be a dedifferentiation vector.
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PMC11629461
UVA (380 nm, 0.1, 0.3, 3.5, 6, 12 mW/cm, 1.5 min) was found to trigger dose dependently calcium transients in the NOX5‐CHO‐K1 cell, but the high dose of 3.5 mW/cm showed no effect in the parental cell CHO‐K1 or empty vector‐transfected pcDNA3.1‐CHO‐K1 cells (Figure 1), or in HEK293 cells (data not shown).
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PMC9429973
We hypothesized that PRL, by signaling specifically through the pro-proliferative, anti-apoptotic LF/IFPRLR drives the three stages of B cell malignancy development, namely, initiation (Stage 1), establishment (Stage 2), and sustenance (Stage 3).
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PMC11683240
As a positive control for cell death, 20% DMSO was added.
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PMC10048572
It is known that hematological malignancies, similarly to solid tumors, are characterized by tumor heterogeneity .
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PMC11731161
Furthermore, we assessed the differential sensitivity of these cell lines in response to two additional SINE compounds, specifically ELT and VER.
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PMC10123657
Such leakage could be another source of contamination.
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PMC11679326
FLAG reduced viability in human non-small-cell lung carcinoma A549 and H1299 cells, hepatocellular carcinoma Hep3B cells, and colorectal adenocarcinoma SW480 cells .
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PMC11785489
TCRβ-null Jurkat (J.RT3-T3.5, male) and HEK-293T (CRL-3216, female) cell lines were obtained from the American Type Culture Collection (ATCC).
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PMC8345486
Synthesis of 8--1N-1,2,3-triazol-4-yl}-2′-deoxyadenosine (18), 8--1N-1,2,3-triazol-4-yl}-2′-deoxyadenosine (19) and 8--1N-1,2,3-triazol-4-yl}-2′-deoxyadenosine (20).
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PMC11063646
FTIR spectroscopy was conducted for andrographolide, excipients (flaxseed oil, xanthan gum), physical mixture, and formulated emulgels.
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PMC11267830
a Representative images of DCAF15 or DCAF15 cells treated with vehicle or with 1 μm or 5 μm indisulam.
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PMC10887351
β3-AR has three intra- and extracellular loops, but it lacks the phosphorylation sites for both PKA and β-ARK kinases.
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PMC11731161
Due to the increased ubiquitination of XPO1 induced by SEL, we speculate that there may be either an increased interaction of a specific E3 ligase with XPO1 or a decreased interaction of a particular deubiquitinating enzyme with XPO1.
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PMC11594074
The percentages of the CCRF-CEM cell population in the S-phase decreased from 35.1% to 32.6%, 28%, and 21.9%, respectively.
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PMC9352806
The constitution was then centrifuged at 13000 rpm for 15 min at 4 °C, and 75 μL of supernatant was transferred to a fresh glass vial for LC/MS analysis.
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PMC8708099
Lügering et al. showed that the addition of IL-4 and -13, but not IL-10, caused a significant decrease in IL-8 secretion .
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PMC11593084
ADCs are one of the growing modalities for solid tumor therapy.
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PMC11632064
Although PKA appears to be a candidate target for melanoma treatment, no selective inhibitor of this kinase is currently available.
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PMC11739484
Moreover, our miRNA-mRNA network analysis identified up-regulated miR-22-3p as a potential regulator of MMP7, MMP11, and MMP14 expression, implicating post-transcriptional regulation in MMP-mediated processes in SKCM.
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PMC9878278
Primer sequences used for qRT-PCR.
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PMC11437637
Because epidemiological studies indicate that in China, EC risk is highest in patients aged 55-<60 years , we used 55 years as the cutoff for age grouping.
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PMC11033180
The examination of the enteric neuron network in the gut of Sema5A mice in future studies would enhance the physiological robustness of our findings.
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PMC11707832
These findings indicate a distinctive pattern of MAN2B1 expression across various immune cell types, possibly highlighting its varied role within the immune system.
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PMC11300639
Since TSC1 is a negative regulator of the mTOR signaling pathway , we wondered whether RNF26 promotes the degradation of TSC1 in ccRCC.
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PMC11731161
G NCI-H929 cells were treated with DMSO or 500 nM SEL for 4 h, then cell lysates were prepared for Co-IP assays, 1ug of the anti-bait protein antibody was added to each group, representative immunoblotting images and the quantitative analysis results demonstrated that SEL impaired the interaction between USP7 and XPO1.
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PMC11700165
While inspection of the BTK-SYK sequence also revealed potential additional translation initiation codons, we were unable to see shorter isoforms following the expression of the constructs in all tested cell types.
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PMC11533140
The in vitro inhibition assays of all final compounds against PI3K were performed by Shanghai ChemPartner Co., Ltd. (China).
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PMC9429973
Results: In this study, 63 (90%) patients confirmed the pathogenic microorganisms based on NGS test.
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PMC8751435
Significant difference from the control (p < .05), **Very significant difference from control (p < .01) As Figure 4a,c shows, protein levels of GSDME, P2X7R, NLRP3, IL‐1β, cleaved‐caspase‐3, caspase‐1, and cleaved‐PARP were significantly upregulated by CME in concentration‐dependent manner.
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The released BIM accelerates the apoptosis as an apoptotic activator.
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K is equivalent to 0.94, whereas, λ is equivalent to 1.54178.
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PMC11720808
Poly-T oligo-attached magnetic beads were used to purify mRNA from total RNA.
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We have found previously that UVA irradiation activates the multi‐subunit NOX2 (gp91) in rodent mast cells (rat peritoneal mast cells, mouse bone marrow‐derived mast cells, and rat mast cell line RBL‐2H3), to trigger persistent calcium oscillations and IL6/LTC4 release, via the O2 ‐receptor tyrosine kinase–phospholipase Cγ–IP3–IP3 receptors (IP3R)–Ca signaling pathway. ,
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A limitation of serine integrase technology is that the att site must first be inserted at the target sequence.
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Values represent the mean of the total amount of grams per day taken by each mouse during a four-day period (n = 13 per group).
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Conversely, the rate of ACYP2 was significantly increased.
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The frequency of herpesvirus DNA detection in at least one biological material was HSV1-2 – 20%, CMV – 13%, EBV – 20%, HHV6 – 47%, respectively.
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PMC11552389
A375 and A875 cell lines were transfected with Lipofectamine 3000 (Invitrogen, CA, USA) based on provided directions.
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The obtained results revealed significant in vitro antiproliferative effects for the complexes with the bphen ligand (for 1 and 5) against A2780 and A2780R, and with the mphen ligand (for 2) in A2780, with sub-micromolar IC50 values.
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The cell cycle assay was performed in HR/HER2-low breast cancer cells administered the triple combination of 125 nM neratinib, CDK4/6 inhibitor (100 nM, palbociclib), and endocrine therapy (100 nM, ET, fulvestrant).
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The bone medium is made up of DMEM High Glucose with 2 mM sodium phosphate, 100 nM dexamethasone, 50 mg/L ascorbate, 10 mM beta-glycerol phosphate, and 1% Pen/Strep.
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PMC11412721
Total RNA was extracted from the spleen of 4–6-week--old asymptomatic mice using nucleospin RNA II (Macherey-Nagel).
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PMC10125312
For the MTT assays, cells without AuNR-PEG and not irradiated were used as a viability control (CTL).
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Furthermore, CIP2A regulates the cell cycle and mitosis by interacting with proteins such as Plk1, E2F1, Akt, and DAPK1. ,
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Additionally, selenoprotein impairment is a hallmark of MeHg toxicity.
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Since there was also no observable change in HIV-1 replication in MT-4 cells by either compound treatment, we omitted to profile the respective miRNA expression herein (Figure 2c and Figure S2a,d).
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PMC11726848
The non-irradiated cells retained typical morphology as they were attached to the substrate, flattened, and formed intercellular contacts.
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PMC11518702
In IgM-stimulated Raji cells, HGAL-KO decreased calcium flux, while GRB2-KO enhanced calcium flux (8).
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PMC11422497
Cell counting kit-8 (CCK8) and (B) RT-qPCR and (C) Western-blot assay showed the effects of circ_SMA4/miR-494-3p/KIT axis on cell proliferation and KIT mRNA and protein expression in GISTs. (
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PMC11488203
After termination of the ELISA reactions by the addition of stopping solution, the absorbance of each well was measured with the Fluoroscan Ascent Fl (ThermoFisher Scientific) using a 450‐nm wavelength filter.
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PMC11665584
These ligand-receptor pairs have been reported to moderate inflammation within the context of cancer, inflammatory conditions, and wound healing (45–47).
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PMC6901583
a BRD4 expression was examined in normal and GIST tissues by Western blotting.
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PMC11507371
Overall, it becomes apparent that cellular responses to CAP are divergent between tumourigenic A431 and non-malignant HaCaT cells.
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PMC6222726
Although different Bursera species are used for different health issues, they are traditionally attributed medicinal properties including providing relief from pain, inflammation, rheumatism, and can help treat illnesses such as colds, skin tumors, polyps, and venereal diseases .
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PMC8759873
We included 200 μl of chloroform, mix well by inversion, centrifuge at 14000 rpm, 4°C for 15 min.
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PMC5415764
The purified PLGA-SS-PTX was obtained by freeze-drying and was kept at 4 °C for use.
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PMC10243817
The diagnosis of allergic rhinitis was based on the concordance between atopic status and typical allergic symptoms.
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PMC11527437
All four TCRs did not recognize wild-type KRAS, but interestingly, the three HLA-A*11:01–restricted TCRs recognized the KRAS G12C peptide, albeit at 10-to-100-fold lower potency compared with the KRAS G12V peptide.
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PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: CNS relapse was rare in younger DLBCL treated with this intensified strategy.
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PMC11413393
e Cell line growth curves of RCC243 cells engineered to overexpress PRMT1 isoforms in the presence of 2.5 μM, 5 μM and 10 μM MS023.
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PMC11731161
qPCR standard protocol was 95 °C for 5 min, followed by 45 cycles of 95 °C for 10 s and 60 °C for 30 s. Expression fold change was calculated with 2.
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PMC9429973
Two deaths occurred during the study, one during KRd treatment (pneumonia, bacterial, n=1 [2.2%]) and one during IRd treatment (pneumonia, n=1 [2.2%]), which was related to IRd.
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PMC11680562
These identified peaks closely match the characteristic pattern of a monoclinic crystal structure (JCPDS: 45–0937).
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PMC11721277
The transformations of substituents in the pyrrole ring A of the chlorin macrocycle were accompanied by significant changes in the spectral properties of the chlorin molecule.
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PMC7334607
Cellular activity is measured by enzymatic conversion of alamarBlue, normalized to background florescence.
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Aza treatment resulted in significant demethylation of the genome including the DMR region of interest.
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KK-47 and T-24 cells were seeded at 1.0 × 10⁶ cells/well (n = 3) and 5637 cells were seeded on 1.5 × 10 cells/well (n = 3) on 6-well plates.
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This confirmed the creation of a highly crystalline, single-phase Fe3O4nanostructure (JCPDS Card No. 88–0315).
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PMC7229095
In the case of ClonePix2 assessment, transfected cells were cultured for 12–16 days at 37 °C in a 5% CO2 incubator in semi-solid media prepared by mixing concentrated basal media (2× concentrate for CDM1, 1.5× concentrate for CDM2 and CDM3) with CloneMatrix reagent (Molecular Devices, San Jose, CA, USA).
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PMC11470999
After treating B16 and A375 cells with 5 µM PF for different time, mRNA levels of CIP2A were analyzed by RT‐qPCR. (
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PMC4355729
Therefore, in consistence with previous studies, our study suggests that the PI3K-AKT and WNT/CTNNB1 pathways converge on GSK3β in renal cancer cells29.
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PMC11377827
OTUD5 (also known as DUBA) has been implicated in multiple cell pathways, including mTOR regulation (Cho et al, 2021), and OTUD5 depletion only had a marginal change in HIFGFP reporter levels in 21% oxygen (Fig. EV1B).
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PMC11659734
For BPE, no clear differences were observed between oxidative damage and direct DNA strand breaks.
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PMC10996034
Gene expression levels were calculated for both the A2780 and the A2780/Taxol cell lines in the present study using RSEM (version 1.2.8) to screen DEGs1 with |log2(Fold Change)|≥1 and FDR≤0.001.
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PMC9429973
Methods: IGH clonal rearrangements detection was performed by Sanger sequencing on bone marrow or peripheral blood samples collected for minimal residual disease purposes in FIL MCL0208 trial (NCT02354313).
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PMC10899471
A proposed model elucidating the mechanism of miR-939-3p-induced sarcoma proliferation and poor prognosis through suppressing BATF2 via directly binding to its 3’ UTR.
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PMC11763111
To minimize bias, mice were randomly assigned to receive different CAR-T/PCDH-T cells after tumor implantation.
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PMC9429973
Patient characteristics such as age at diagnosis, sex, year of diagnosis, race, and SES as determined by rural/urban census tract residence (RUCA), and neighborhood (as represented by the Yost Index, a composite measure of 7 variables assessing different aspects of the SES of a census tract) were collected and analyzed.
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PMC2118063
Immunohistochemical studies of LN from WT (+/+) and IRF8-deficient (−/−) mice.
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PMC11335267
However, although the Magel2-deficient phenotype is also associated with hypothalamic Pomc neuron dysfunction , it is unlikely that both phenotypes are directly related since we did not detect altered hypothalamic expression of Magel2 in Alx3-deficient mice.
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PMC11546117
The hMECs showed an epithelial morphology and the expression of epithelial markers and tight junctions.
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PMC11794568
This included inhibition of the relative mitochondrial content, mitochondrial DNA copy number, ATP production, respiratory capacity, and expression levels of oxidative phosphorylation-related proteins in melanoma cells.
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