PMCID
string | Sentences
string | ner
list |
|---|---|---|
PMC11740207
|
By comprehensively and/or VSLSLCs understanding the epigenetic mechanisms regulating VSELSC functions, researchers can develop novel epigenetic therapies to reverse or inhibit malignant transformation.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"By",
"comprehensively",
"and/or",
"VSLSLCs",
"understanding",
"the",
"epigenetic",
"mechanisms",
"regulating",
"VSELSC",
"functions",
",",
"researchers",
"can",
"develop",
"novel",
"epigenetic",
"therapies",
"to",
"reverse",
"or",
"inhibit",
"malignant",
"transformation",
"."
]
}
] |
PMC11371627
|
Biopsy of the right gastrocnemius muscle showed severe atrophy of skeletal muscle without signs of inflammation, rimmed vacuoles or ragged red fibres.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Biopsy",
"of",
"the",
"right",
"gastrocnemius",
"muscle",
"showed",
"severe",
"atrophy",
"of",
"skeletal",
"muscle",
"without",
"signs",
"of",
"inflammation",
",",
"rimmed",
"vacuoles",
"or",
"ragged",
"red",
"fibres",
"."
]
}
] |
PMC11473750
|
The 11q13.4-ter region is emphasised by a thin black bar underline.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"11q13.4-ter",
"region",
"is",
"emphasised",
"by",
"a",
"thin",
"black",
"bar",
"underline",
"."
]
}
] |
PMC11577421
|
Individually, each analysis method may not conclusively determine how the glycocalyx affects NP uptake, as potential interference with other cellular processes could confound data interpretation.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Individually",
",",
"each",
"analysis",
"method",
"may",
"not",
"conclusively",
"determine",
"how",
"the",
"glycocalyx",
"affects",
"NP",
"uptake",
",",
"as",
"potential",
"interference",
"with",
"other",
"cellular",
"processes",
"could",
"confound",
"data",
"interpretation",
"."
]
}
] |
PMC11543853
|
Enteroviruses, one of the largest groups of non-enveloped viruses, cause diseases ranging from the common cold to life-threatening encephalitis.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Enteroviruses",
",",
"one",
"of",
"the",
"largest",
"groups",
"of",
"non-enveloped",
"viruses",
",",
"cause",
"diseases",
"ranging",
"from",
"the",
"common",
"cold",
"to",
"life-threatening",
"encephalitis",
"."
]
}
] |
PMC11747949
|
Animals were fed with an irradiated breeding/maintenance diet for transgenic mice (Altromin, #1414) and water ad libitum.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Animals",
"were",
"fed",
"with",
"an",
"irradiated",
"breeding/maintenance",
"diet",
"for",
"transgenic",
"mice",
"(",
"Altromin",
",",
"#",
"1414",
")",
"and",
"water",
"ad",
"libitum",
"."
]
}
] |
PMC9436459
|
0.2 μg/mL (5-FU)A27808.5 μg/mL 0.7 μg/mL (5-FU)Bel-7402n.a.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"0.2",
"μg/mL",
"(5-FU)A27808.5",
"μg/mL",
"0.7",
"μg/mL",
"(5-FU)Bel-7402n.a",
"."
]
}
] |
PMC8557138
|
For example, Wartenberg et al. cultured human embryonic stem cell line H1 with tumor spheroids of human prostate cancer cell line DU-145 to demonstrate infiltration of CD31 cells into the tumor spheroids suggesting the use of these confrontational cultures to evaluate anti-angiogenic drugs and to study expression patterns due to cellular interactions (Wartenberg et al. 2006).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"example",
",",
"Wartenberg",
"et",
"al.",
"cultured",
"human",
"embryonic",
"stem",
"cell",
"line",
"H1",
"with",
"tumor",
"spheroids",
"of",
"human",
"prostate",
"cancer",
"cell",
"line",
"DU-145",
"to",
"demonstrate",
"infiltration",
"of",
"CD31",
"cells",
"into",
"the",
"tumor",
"spheroids",
"suggesting",
"the",
"use",
"of",
"these",
"confrontational",
"cultures",
"to",
"evaluate",
"anti-angiogenic",
"drugs",
"and",
"to",
"study",
"expression",
"patterns",
"due",
"to",
"cellular",
"interactions",
"(",
"Wartenberg",
"et",
"al.",
"2006",
")",
"."
]
}
] |
PMC11736898
|
For experiments involving inhibitors, either ketoconazole (Sigma Aldrich), VID400 (Thermo Fisher Scientific) or vehicle (negative controls) were added at the same time as vitamin D. Proliferation of normal and keloid keratinocytes was measured using an MTT (3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide) assay as detailed elsewhere .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"experiments",
"involving",
"inhibitors",
",",
"either",
"ketoconazole",
"(",
"Sigma",
"Aldrich",
")",
",",
"VID400",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
")",
"or",
"vehicle",
"(",
"negative",
"controls",
")",
"were",
"added",
"at",
"the",
"same",
"time",
"as",
"vitamin",
"D.",
"Proliferation",
"of",
"normal",
"and",
"keloid",
"keratinocytes",
"was",
"measured",
"using",
"an",
"MTT",
"(",
"3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium",
"bromide",
")",
"assay",
"as",
"detailed",
"elsewhere",
"."
]
}
] |
PMC7987994
|
There are attempts to bring in vitro testing of degradable metallic biomaterials closer to physiological conditions.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"There",
"are",
"attempts",
"to",
"bring",
"in",
"vitro",
"testing",
"of",
"degradable",
"metallic",
"biomaterials",
"closer",
"to",
"physiological",
"conditions",
"."
]
}
] |
PMC6627640
|
On the basis of the Western and RT-PCR analysis, BMI1 levels were consistently decreased in resistant cells as compared with parental cells, and EZH2 was repressed in a smaller subset of cells (Figure 3B,C).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"On",
"the",
"basis",
"of",
"the",
"Western",
"and",
"RT-PCR",
"analysis",
",",
"BMI1",
"levels",
"were",
"consistently",
"decreased",
"in",
"resistant",
"cells",
"as",
"compared",
"with",
"parental",
"cells",
",",
"and",
"EZH2",
"was",
"repressed",
"in",
"a",
"smaller",
"subset",
"of",
"cells",
"(",
"Figure",
"3B",
",",
"C",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
During hematopoietic stem cell transplantation, it is expected to strengthen monitoring of the pathogenic microorganisms, so as to provide effective prevention to control infection with the pathogenic microorganisms, thus improving the patients’ survival rate.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"During",
"hematopoietic",
"stem",
"cell",
"transplantation",
",",
"it",
"is",
"expected",
"to",
"strengthen",
"monitoring",
"of",
"the",
"pathogenic",
"microorganisms",
",",
"so",
"as",
"to",
"provide",
"effective",
"prevention",
"to",
"control",
"infection",
"with",
"the",
"pathogenic",
"microorganisms",
",",
"thus",
"improving",
"the",
"patients",
"’",
"survival",
"rate",
"."
]
}
] |
PMC11742231
|
Recent graph-based models, while promising, frequently neglect the critical role of atomic interactions and fail to integrate drug fingerprints with SMILES for comprehensive molecular graph construction.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Recent",
"graph-based",
"models",
",",
"while",
"promising",
",",
"frequently",
"neglect",
"the",
"critical",
"role",
"of",
"atomic",
"interactions",
"and",
"fail",
"to",
"integrate",
"drug",
"fingerprints",
"with",
"SMILES",
"for",
"comprehensive",
"molecular",
"graph",
"construction",
"."
]
}
] |
PMC11730305
|
TGA analysis of Co3O4@Glu-Ellagic acid; suggests good thermal stability of the.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"TGA",
"analysis",
"of",
"Co3O4@Glu-Ellagic",
"acid",
";",
"suggests",
"good",
"thermal",
"stability",
"of",
"the",
"."
]
}
] |
PMC7961460
|
Nevertheless, the induction of HAS2 was obtained via stimulation with a peptide bearing the first 211 amino acids, a region found in the full size but not in the 50-kDa fragment.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Nevertheless",
",",
"the",
"induction",
"of",
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"was",
"obtained",
"via",
"stimulation",
"with",
"a",
"peptide",
"bearing",
"the",
"first",
"211",
"amino",
"acids",
",",
"a",
"region",
"found",
"in",
"the",
"full",
"size",
"but",
"not",
"in",
"the",
"50-kDa",
"fragment",
"."
]
}
] |
PMC11464982
|
Based on these results, duplicate cultures of the cells were exposed to and scored for chromosomal aberrations at concentrations of 2030, 3384 and 5640 U/mL (corresponding to 3635, 6060 and 10,100 μg TOS/mL), in the short‐term treatments, with and without S9‐mix, and at 1218, 2030, 3384 and 5640 U/mL (corresponding to 2181, 3635, 6060 and 10,100 μg TOS/mL) in the long‐term treatment without S9‐mix.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Based",
"on",
"these",
"results",
",",
"duplicate",
"cultures",
"of",
"the",
"cells",
"were",
"exposed",
"to",
"and",
"scored",
"for",
"chromosomal",
"aberrations",
"at",
"concentrations",
"of",
"2030",
",",
"3384",
"and",
"5640",
"U/mL",
"(",
"corresponding",
"to",
"3635",
",",
"6060",
"and",
"10,100",
"μg",
"TOS/mL",
")",
",",
"in",
"the",
"short‐term",
"treatments",
",",
"with",
"and",
"without",
"S9‐mix",
",",
"and",
"at",
"1218",
",",
"2030",
",",
"3384",
"and",
"5640",
"U/mL",
"(",
"corresponding",
"to",
"2181",
",",
"3635",
",",
"6060",
"and",
"10,100",
"μg",
"TOS/mL",
")",
"in",
"the",
"long‐term",
"treatment",
"without",
"S9‐mix",
"."
]
}
] |
PMC11795610
|
The epidermis was then mechanically separated from the dermis.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"epidermis",
"was",
"then",
"mechanically",
"separated",
"from",
"the",
"dermis",
"."
]
}
] |
PMC10607604
|
Furthermore, the localization of the tight junction marker, ZO-1 , showed a clear localization along cell junctions in parental KURAMOCHI cells and a more diffuse and punctate localization in KO or KD clones for PTPN13 (Figure 4).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"the",
"localization",
"of",
"the",
"tight",
"junction",
"marker",
",",
"ZO-1",
",",
"showed",
"a",
"clear",
"localization",
"along",
"cell",
"junctions",
"in",
"parental",
"KURAMOCHI",
"cells",
"and",
"a",
"more",
"diffuse",
"and",
"punctate",
"localization",
"in",
"KO",
"or",
"KD",
"clones",
"for",
"PTPN13",
"(",
"Figure",
"4",
")",
"."
]
}
] |
PMC9352806
|
As expected, the lipidomic analysis predicted that autophagy was involved in the effects of BMS, characterized by the regulation of daf-16/hlh-30 mediated lipophagy.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"expected",
",",
"the",
"lipidomic",
"analysis",
"predicted",
"that",
"autophagy",
"was",
"involved",
"in",
"the",
"effects",
"of",
"BMS",
",",
"characterized",
"by",
"the",
"regulation",
"of",
"daf-16/hlh-30",
"mediated",
"lipophagy",
"."
]
}
] |
PMC11438317
|
Transient transfection of HEK293 cells was carried out using the calcium phosphate precipitation method .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Transient",
"transfection",
"of",
"HEK293",
"cells",
"was",
"carried",
"out",
"using",
"the",
"calcium",
"phosphate",
"precipitation",
"method",
"."
]
}
] |
PMC11449273
|
Inserts were fixed, stained, and imaged under an inverted microscope at 20x magnification.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Inserts",
"were",
"fixed",
",",
"stained",
",",
"and",
"imaged",
"under",
"an",
"inverted",
"microscope",
"at",
"20x",
"magnification",
"."
]
}
] |
PMC11334037
|
A: Western blot measured the transfection efficiency of OE-insulin-like growth factor 2 (IGF2) or sh-IGF2 in gastrointestinal stromal tumors (GIST) 882 and GIST-T1 cells; B: ELISA of IGF2 expression in OE-IGF2 or sh-IGF2 transfected GIST882 and GIST-T1 cells; C: Cell counting kit-8 assay assessed cell viability in GIST882 and GIST-T1 cells; D: Transwell assay evaluated the migration of OE-IGF2- or sh-IGF2-transfected cells (scar bar = 50 μm); E: Transwell assays of the invasiveness of OE-IGF2 or sh-IGF2 transfected cells. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
":",
"Western",
"blot",
"measured",
"the",
"transfection",
"efficiency",
"of",
"OE-insulin-like",
"growth",
"factor",
"2",
"(",
"IGF2",
")",
"or",
"sh-IGF2",
"in",
"gastrointestinal",
"stromal",
"tumors",
"(",
"GIST",
")",
"882",
"and",
"GIST-T1",
"cells",
";",
"B",
":",
"ELISA",
"of",
"IGF2",
"expression",
"in",
"OE-IGF2",
"or",
"sh-IGF2",
"transfected",
"GIST882",
"and",
"GIST-T1",
"cells",
";",
"C",
":",
"Cell",
"counting",
"kit-8",
"assay",
"assessed",
"cell",
"viability",
"in",
"GIST882",
"and",
"GIST-T1",
"cells",
";",
"D",
":",
"Transwell",
"assay",
"evaluated",
"the",
"migration",
"of",
"OE-IGF2-",
"or",
"sh-IGF2-transfected",
"cells",
"(",
"scar",
"bar",
"=",
"50",
"μm",
")",
";",
"E",
":",
"Transwell",
"assays",
"of",
"the",
"invasiveness",
"of",
"OE-IGF2",
"or",
"sh-IGF2",
"transfected",
"cells",
".",
"("
]
}
] |
PMC8414691
|
SRCAP (SNF2-related CBP activator protein) is the causative gene of FHS [6–8].
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"SRCAP",
"(",
"SNF2-related",
"CBP",
"activator",
"protein",
")",
"is",
"the",
"causative",
"gene",
"of",
"FHS",
"[",
"6–8",
"]",
"."
]
}
] |
PMC11539788
|
First, the driving factor that results in decreased RNF19A expression in BCa should be further investigated.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"First",
",",
"the",
"driving",
"factor",
"that",
"results",
"in",
"decreased",
"RNF19A",
"expression",
"in",
"BCa",
"should",
"be",
"further",
"investigated",
"."
]
}
] |
PMC11604768
|
b Heatmap of selected promoter responses to agonism across GPCR experiment groups.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"b",
"Heatmap",
"of",
"selected",
"promoter",
"responses",
"to",
"agonism",
"across",
"GPCR",
"experiment",
"groups",
"."
]
}
] |
PMC10523483
|
Therefore, we deduce that H1.2 sequestrated nuclear NRF2 via protein–protein interaction (Fig. 5 A–C).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Therefore",
",",
"we",
"deduce",
"that",
"H1.2",
"sequestrated",
"nuclear",
"NRF2",
"via",
"protein",
"–",
"protein",
"interaction",
"(",
"Fig.",
"5",
"A",
"–",
"C",
")",
"."
]
}
] |
PMC11055323
|
d The expression of SS18-EGFP and SS18-SSX-EGFP were confirmed by western blotting.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"d",
"The",
"expression",
"of",
"SS18-EGFP",
"and",
"SS18-SSX-EGFP",
"were",
"confirmed",
"by",
"western",
"blotting",
"."
]
}
] |
PMC11687663
|
The LogP value is obtained by taking the logarithm of this ratio.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"LogP",
"value",
"is",
"obtained",
"by",
"taking",
"the",
"logarithm",
"of",
"this",
"ratio",
"."
]
}
] |
PMC11361748
|
A single TPA treatment results in a neutrophil influx in the dermis that peaks at 12 h and resolves within 24 h. A subsequent TPA treatment or a UVB challenge, when applied 24 h but not 48 h later, accelerates, amplifies, and prolongs neutrophil infiltration.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"single",
"TPA",
"treatment",
"results",
"in",
"a",
"neutrophil",
"influx",
"in",
"the",
"dermis",
"that",
"peaks",
"at",
"12",
"h",
"and",
"resolves",
"within",
"24",
"h.",
"A",
"subsequent",
"TPA",
"treatment",
"or",
"a",
"UVB",
"challenge",
",",
"when",
"applied",
"24",
"h",
"but",
"not",
"48",
"h",
"later",
",",
"accelerates",
",",
"amplifies",
",",
"and",
"prolongs",
"neutrophil",
"infiltration",
"."
]
}
] |
PMC10965315
|
The Abcam company provided the dichloro‐dihydro‐fluorescein diacetate (DCFDA)/H2DCFDA‐cellular reactive oxygen species (ROS) detection assay kit (#ab113851, United Kingdom).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"Abcam",
"company",
"provided",
"the",
"dichloro‐dihydro‐fluorescein",
"diacetate",
"(DCFDA)/H2DCFDA‐cellular",
"reactive",
"oxygen",
"species",
"(",
"ROS",
")",
"detection",
"assay",
"kit",
"(",
"#",
"ab113851",
",",
"United",
"Kingdom",
")",
"."
]
}
] |
PMC11633763
|
The glycolysis precise molecular process underlying USP22 involvement in osteosarcoma remains unclear despite the fact that the protein's significance in osteosarcoma has been partially revealed more research is necessary to determine this.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"glycolysis",
"precise",
"molecular",
"process",
"underlying",
"USP22",
"involvement",
"in",
"osteosarcoma",
"remains",
"unclear",
"despite",
"the",
"fact",
"that",
"the",
"protein",
"'s",
"significance",
"in",
"osteosarcoma",
"has",
"been",
"partially",
"revealed",
"more",
"research",
"is",
"necessary",
"to",
"determine",
"this",
"."
]
}
] |
PMC9516447
|
The 78-kDa glucose regulated protein (GRP78), also referred to as HSPA5/BiP, is a multifunctional protein that can impact a wide range of human diseases, including cancer, via diverse mechanisms .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"78-kDa",
"glucose",
"regulated",
"protein",
"(",
"GRP78",
")",
",",
"also",
"referred",
"to",
"as",
"HSPA5/BiP",
",",
"is",
"a",
"multifunctional",
"protein",
"that",
"can",
"impact",
"a",
"wide",
"range",
"of",
"human",
"diseases",
",",
"including",
"cancer",
",",
"via",
"diverse",
"mechanisms",
"."
]
}
] |
PMC10335954
|
Several studies have discussed the candidacy of TRIP13 in the carcinogenesis of other neoplasms (Banerjee et al. 2014; Larkin et al. 2012; Sheng et al. 2018), and Lu and colleagues (Lu et al. 2019a, b) observed the elevation of TRIP13 expression in gastric adenocarcinoma.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Several",
"studies",
"have",
"discussed",
"the",
"candidacy",
"of",
"TRIP13",
"in",
"the",
"carcinogenesis",
"of",
"other",
"neoplasms",
"(",
"Banerjee",
"et",
"al.",
"2014",
";",
"Larkin",
"et",
"al.",
"2012",
";",
"Sheng",
"et",
"al.",
"2018",
")",
",",
"and",
"Lu",
"and",
"colleagues",
"(",
"Lu",
"et",
"al.",
"2019a",
",",
"b",
")",
"observed",
"the",
"elevation",
"of",
"TRIP13",
"expression",
"in",
"gastric",
"adenocarcinoma",
"."
]
}
] |
PMC11725127
|
The sections were then quenched with 0.3% hydrogen peroxide in methanol for 30 min to block endogenous peroxidase activity and washed in TBS (pH 7.2).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"sections",
"were",
"then",
"quenched",
"with",
"0.3",
"%",
"hydrogen",
"peroxide",
"in",
"methanol",
"for",
"30",
"min",
"to",
"block",
"endogenous",
"peroxidase",
"activity",
"and",
"washed",
"in",
"TBS",
"(",
"pH",
"7.2",
")",
"."
]
}
] |
PMC6627640
|
For each parental line, resistant clones were derived from independently treated batches of cells as described in Material and Methods.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"each",
"parental",
"line",
",",
"resistant",
"clones",
"were",
"derived",
"from",
"independently",
"treated",
"batches",
"of",
"cells",
"as",
"described",
"in",
"Material",
"and",
"Methods",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
.
|
[
{
"tags": [
"O"
],
"tokens": [
"."
]
}
] |
PMC11721295
|
Twelve hours after the last treatment, mice were sacrificed and lungs flushed with 1× PBS and fixed, paraffin embedded, sectioned, and stained as described below (see Histology, immunofluorescence, and quantification).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Twelve",
"hours",
"after",
"the",
"last",
"treatment",
",",
"mice",
"were",
"sacrificed",
"and",
"lungs",
"flushed",
"with",
"1",
"×",
"PBS",
"and",
"fixed",
",",
"paraffin",
"embedded",
",",
"sectioned",
",",
"and",
"stained",
"as",
"described",
"below",
"(",
"see",
"Histology",
",",
"immunofluorescence",
",",
"and",
"quantification",
")",
"."
]
}
] |
PMC11349530
|
IL-33 expression correlates with increased immunosuppressive macrophages, monocytes, and microglia in human glioma specimens and mouse models (66).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"IL-33",
"expression",
"correlates",
"with",
"increased",
"immunosuppressive",
"macrophages",
",",
"monocytes",
",",
"and",
"microglia",
"in",
"human",
"glioma",
"specimens",
"and",
"mouse",
"models",
"(",
"66",
")",
"."
]
}
] |
PMC6684588
|
Data are means ± SEM. (
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Data",
"are",
"means",
"±",
"SEM",
".",
"("
]
}
] |
PMC11599565
|
Interestingly, within the regular ovarian surface epithelium (OSE), we identified cells exhibiting neuronal features, which are prominently observed in ovarian carcinoma cells, as reported in this study.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Interestingly",
",",
"within",
"the",
"regular",
"ovarian",
"surface",
"epithelium",
"(",
"OSE",
")",
",",
"we",
"identified",
"cells",
"exhibiting",
"neuronal",
"features",
",",
"which",
"are",
"prominently",
"observed",
"in",
"ovarian",
"carcinoma",
"cells",
",",
"as",
"reported",
"in",
"this",
"study",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
F. Charles Cano, A. Kloos, T. Fangmann, N. Kattre, R. Schottmann, K. Döhner, A. Ganser, M. Heuser Department of Hematology, Hemostasis, Oncology and Stem Cell Transplantation, Medizinische Hochschule Hannover, Hannover; Department of Internal Medicine III, University Hospital of Ulm, Ulm, Germany Background: Acute myeloid leukaemia (AML) with the translocation DEK-NUP214 (t(6;9)(p23;q34)) is a rare subtype present in 1% of adult and 2% of paediatric patients and is recognized by the world health organization (WHO) as a unique subgroup of AML.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"F.",
"Charles",
"Cano",
",",
"A.",
"Kloos",
",",
"T.",
"Fangmann",
",",
"N.",
"Kattre",
",",
"R.",
"Schottmann",
",",
"K.",
"Döhner",
",",
"A.",
"Ganser",
",",
"M.",
"Heuser",
"Department",
"of",
"Hematology",
",",
"Hemostasis",
",",
"Oncology",
"and",
"Stem",
"Cell",
"Transplantation",
",",
"Medizinische",
"Hochschule",
"Hannover",
",",
"Hannover",
";",
"Department",
"of",
"Internal",
"Medicine",
"III",
",",
"University",
"Hospital",
"of",
"Ulm",
",",
"Ulm",
",",
"Germany",
"Background",
":",
"Acute",
"myeloid",
"leukaemia",
"(",
"AML",
")",
"with",
"the",
"translocation",
"DEK-NUP214",
"(",
"t(6;9)(p23;q34",
")",
")",
"is",
"a",
"rare",
"subtype",
"present",
"in",
"1",
"%",
"of",
"adult",
"and",
"2",
"%",
"of",
"paediatric",
"patients",
"and",
"is",
"recognized",
"by",
"the",
"world",
"health",
"organization",
"(",
"WHO",
")",
"as",
"a",
"unique",
"subgroup",
"of",
"AML",
"."
]
}
] |
PMC10142392
|
Star compositions have potential advantages over linear block copolymers in terms of physical properties, stability, biodegradability, and functionalization.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Star",
"compositions",
"have",
"potential",
"advantages",
"over",
"linear",
"block",
"copolymers",
"in",
"terms",
"of",
"physical",
"properties",
",",
"stability",
",",
"biodegradability",
",",
"and",
"functionalization",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Lymphocytes subsets analysis revealed a deficiency of B memory, Tregs and an increased of HLADR+ T cells in all patients.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Lymphocytes",
"subsets",
"analysis",
"revealed",
"a",
"deficiency",
"of",
"B",
"memory",
",",
"Tregs",
"and",
"an",
"increased",
"of",
"HLADR+",
"T",
"cells",
"in",
"all",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC11787355
|
Specific OD is ODPTPRZ1-ODFlu.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Specific",
"OD",
"is",
"ODPTPRZ1-ODFlu",
"."
]
}
] |
PMC7570809
|
Consequently, to improve the survival rate, novel and effective therapeutic strategies are needed.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Consequently",
",",
"to",
"improve",
"the",
"survival",
"rate",
",",
"novel",
"and",
"effective",
"therapeutic",
"strategies",
"are",
"needed",
"."
]
}
] |
PMC8996378
|
These results indicated that these compounds had the reversal effect of MDR independent from ABCB1 by targeting other cellular pathways that are responsible for MDR (Reis et al., 2014).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"results",
"indicated",
"that",
"these",
"compounds",
"had",
"the",
"reversal",
"effect",
"of",
"MDR",
"independent",
"from",
"ABCB1",
"by",
"targeting",
"other",
"cellular",
"pathways",
"that",
"are",
"responsible",
"for",
"MDR",
"(",
"Reis",
"et",
"al.",
",",
"2014",
")",
"."
]
}
] |
PMC11597291
|
An increase in the MW of PEG caused a decrease in the size of the particles (Table 2), presumably due to the more effective steric stabilization of the conjugates by the high MW PEG molecules.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"An",
"increase",
"in",
"the",
"MW",
"of",
"PEG",
"caused",
"a",
"decrease",
"in",
"the",
"size",
"of",
"the",
"particles",
"(",
"Table",
"2",
")",
",",
"presumably",
"due",
"to",
"the",
"more",
"effective",
"steric",
"stabilization",
"of",
"the",
"conjugates",
"by",
"the",
"high",
"MW",
"PEG",
"molecules",
"."
]
}
] |
PMC6803987
|
The cytotoxicity of esculetin for HL-7702 cells was determined by the trypan blue assay .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cytotoxicity",
"of",
"esculetin",
"for",
"HL-7702",
"cells",
"was",
"determined",
"by",
"the",
"trypan",
"blue",
"assay",
"."
]
}
] |
PMC11661024
|
Finally, the molecular identification technique based on 16srRNA gene sequencing revealed that CH and KH isolates belonged to Lactobacillus fermentum with nearly 99% homology.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Finally",
",",
"the",
"molecular",
"identification",
"technique",
"based",
"on",
"16srRNA",
"gene",
"sequencing",
"revealed",
"that",
"CH",
"and",
"KH",
"isolates",
"belonged",
"to",
"Lactobacillus",
"fermentum",
"with",
"nearly",
"99",
"%",
"homology",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
HIT pretest probability was calculated using the 4Ts score by 2 independent hematologist.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"HIT",
"pretest",
"probability",
"was",
"calculated",
"using",
"the",
"4Ts",
"score",
"by",
"2",
"independent",
"hematologist",
"."
]
}
] |
PMC8382973
|
The names of the repository/repositories and accession number(s) can be found below: NCBI SRA; PRJNA726948.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"names",
"of",
"the",
"repository/repositories",
"and",
"accession",
"number(s",
")",
"can",
"be",
"found",
"below",
":",
"NCBI",
"SRA",
";",
"PRJNA726948",
"."
]
}
] |
PMC11454015
|
Importantly, analysis of mammary glands two-month post-MIND injections showed engraftment of human cells positive for cytokeratin-5 and lamin a/c.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Importantly",
",",
"analysis",
"of",
"mammary",
"glands",
"two-month",
"post-MIND",
"injections",
"showed",
"engraftment",
"of",
"human",
"cells",
"positive",
"for",
"cytokeratin-5",
"and",
"lamin",
"a/c",
"."
]
}
] |
PMC11740207
|
Furthermore, the outer membrane of ABs can display specific CD surface markers, although this is not consistent across all ABs (Kerr et al., 1972; Lecoeur et al., 1997; Coleman et al., 2001; Zhang et al., 2018; Aoki et al., 2020; Dou et al., 2020; Serrano-Heras et al., 2020).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"the",
"outer",
"membrane",
"of",
"ABs",
"can",
"display",
"specific",
"CD",
"surface",
"markers",
",",
"although",
"this",
"is",
"not",
"consistent",
"across",
"all",
"ABs",
"(",
"Kerr",
"et",
"al.",
",",
"1972",
";",
"Lecoeur",
"et",
"al.",
",",
"1997",
";",
"Coleman",
"et",
"al.",
",",
"2001",
";",
"Zhang",
"et",
"al.",
",",
"2018",
";",
"Aoki",
"et",
"al.",
",",
"2020",
";",
"Dou",
"et",
"al.",
",",
"2020",
";",
"Serrano-Heras",
"et",
"al.",
",",
"2020",
")",
"."
]
}
] |
PMC11679033
|
Slides were analyzed at 1000× magnification using a light microscope (Leitz, Oberkochen, Germany).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Slides",
"were",
"analyzed",
"at",
"1000",
"×",
"magnification",
"using",
"a",
"light",
"microscope",
"(",
"Leitz",
",",
"Oberkochen",
",",
"Germany",
")",
"."
]
}
] |
PMC6461034
|
Prior proteome‐wide Phomics and NetworKIN analyses are based on a UniProt human reference proteome FASTA file derived from release 2014_01 filtered for “no fragments”, and containing 21849 TrEMBL entries and 39703 Swiss‐Prot entries.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Prior",
"proteome‐wide",
"Phomics",
"and",
"NetworKIN",
"analyses",
"are",
"based",
"on",
"a",
"UniProt",
"human",
"reference",
"proteome",
"FASTA",
"file",
"derived",
"from",
"release",
"2014_01",
"filtered",
"for",
"“",
"no",
"fragments",
"”",
",",
"and",
"containing",
"21849",
"TrEMBL",
"entries",
"and",
"39703",
"Swiss‐Prot",
"entries",
"."
]
}
] |
PMC11742431
|
Different time points were selected for the experiment, where 0 h was the control.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Different",
"time",
"points",
"were",
"selected",
"for",
"the",
"experiment",
",",
"where",
"0",
"h",
"was",
"the",
"control",
"."
]
}
] |
PMC11670407
|
Subsequently, it was incubated with secondary antibody for 1 h at room temperature.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Subsequently",
",",
"it",
"was",
"incubated",
"with",
"secondary",
"antibody",
"for",
"1",
"h",
"at",
"room",
"temperature",
"."
]
}
] |
PMC11401358
|
Briefly, to investigate the ROS scavenging ability of different biomaterials, mouse embryonic fibroblasts NIH 3T3 cells were seeded into 6-well plates pretreated with 0.1 % gelatin overnight at a density of 5 × 10 cells per well.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Briefly",
",",
"to",
"investigate",
"the",
"ROS",
"scavenging",
"ability",
"of",
"different",
"biomaterials",
",",
"mouse",
"embryonic",
"fibroblasts",
"NIH",
"3T3",
"cells",
"were",
"seeded",
"into",
"6-well",
"plates",
"pretreated",
"with",
"0.1",
"%",
"gelatin",
"overnight",
"at",
"a",
"density",
"of",
"5",
"×",
"10",
"cells",
"per",
"well",
"."
]
}
] |
PMC8345486
|
A2780cis cells were seeded into 6-well plates at a density of 3.5 × 10 cells and cultured for 24 h before treatment (37 °C and 5% CO2).
|
[
{
"tags": [
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A2780cis",
"cells",
"were",
"seeded",
"into",
"6-well",
"plates",
"at",
"a",
"density",
"of",
"3.5",
"×",
"10",
"cells",
"and",
"cultured",
"for",
"24",
"h",
"before",
"treatment",
"(",
"37",
"°",
"C",
"and",
"5",
"%",
"CO2",
")",
"."
]
}
] |
PMC6835428
|
However, as chemical modifications can impair siRNA effectiveness, their employment should be carefully considered.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"However",
",",
"as",
"chemical",
"modifications",
"can",
"impair",
"siRNA",
"effectiveness",
",",
"their",
"employment",
"should",
"be",
"carefully",
"considered",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
44% patiets presented unmutated IgHv, 7% del17p, 13% del11q.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"44",
"%",
"patiets",
"presented",
"unmutated",
"IgHv",
",",
"7",
"%",
"del17p",
",",
"13",
"%",
"del11q",
"."
]
}
] |
PMC11078693
|
We immunostained the RPMI 8226 cells with TUBB4A antibodies at a final concentration of 10 μg /mL from 1:30 dilution of a 300 μg /mL stock concentration obtained following the probe conjugation with Biotium CF568 Mix-n-Stain kit according to the manufacturer’s instructions: https://biotium.com/wp-content/uploads/2017/10/PI-Mix-n-Stain-Antibody-Labeling-Kits.pdf.c.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"immunostained",
"the",
"RPMI",
"8226",
"cells",
"with",
"TUBB4A",
"antibodies",
"at",
"a",
"final",
"concentration",
"of",
"10",
"μg",
"/mL",
"from",
"1:30",
"dilution",
"of",
"a",
"300",
"μg",
"/mL",
"stock",
"concentration",
"obtained",
"following",
"the",
"probe",
"conjugation",
"with",
"Biotium",
"CF568",
"Mix-n-Stain",
"kit",
"according",
"to",
"the",
"manufacturer",
"’s",
"instructions",
":",
"https://biotium.com/wp-content/uploads/2017/10/PI-Mix-n-Stain-Antibody-Labeling-Kits.pdf.c",
"."
]
}
] |
PMC11760643
|
p < 0.001; p < 0.0001; no significant difference (ns).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"p",
"<",
"0.001",
";",
"p",
"<",
"0.0001",
";",
"no",
"significant",
"difference",
"(",
"ns",
")",
"."
]
}
] |
PMC11240052
|
Error bars represent the mean of three separate determinations ± standard deviation (SD). *
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Error",
"bars",
"represent",
"the",
"mean",
"of",
"three",
"separate",
"determinations",
"±",
"standard",
"deviation",
"(",
"SD",
")",
".",
"*"
]
}
] |
PMC10158546
|
ReN cells were differentiated as thin-3D cultures and lysate collected at weekly timepoints post-differentiation was western blotted for PrP (via 3F4 mAb), TUBB3 and GFAP.
|
[
{
"tags": [
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"ReN",
"cells",
"were",
"differentiated",
"as",
"thin-3D",
"cultures",
"and",
"lysate",
"collected",
"at",
"weekly",
"timepoints",
"post-differentiation",
"was",
"western",
"blotted",
"for",
"PrP",
"(",
"via",
"3F4",
"mAb",
")",
",",
"TUBB3",
"and",
"GFAP",
"."
]
}
] |
PMC7612475
|
Arrows, SCEs.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Arrows",
",",
"SCEs",
"."
]
}
] |
PMC11483468
|
The total volume was 50 µL, containing the reaction buffer, cell lysate, dNTPs, Taq enzyme and Ts primers (5'-AATCCGTCGAGCAGAGTT-3'), at 25 ℃ extension for 30 min.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"total",
"volume",
"was",
"50",
"µL",
",",
"containing",
"the",
"reaction",
"buffer",
",",
"cell",
"lysate",
",",
"dNTPs",
",",
"Taq",
"enzyme",
"and",
"Ts",
"primers",
"(",
"5'-AATCCGTCGAGCAGAGTT-3",
"'",
")",
",",
"at",
"25",
"℃",
"extension",
"for",
"30",
"min",
"."
]
}
] |
PMC11413393
|
GO annotations for DNA repair (GO:0006281), DNA duplex unwinding (GO:0032508) and nuclear DNA replication (GO:0033260) were detected at overrepresentation levels greater than 4-fold (Fig. 4c).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"GO",
"annotations",
"for",
"DNA",
"repair",
"(",
"GO:0006281",
")",
",",
"DNA",
"duplex",
"unwinding",
"(",
"GO:0032508",
")",
"and",
"nuclear",
"DNA",
"replication",
"(",
"GO:0033260",
")",
"were",
"detected",
"at",
"overrepresentation",
"levels",
"greater",
"than",
"4-fold",
"(",
"Fig.",
"4c",
")",
"."
]
}
] |
PMC11627133
|
Furthermore, all designed bifunctional AP3‐RhoBAST constructs exhibited a high binding affinity to GFP, with K D values of 75±15 nM (F30), 56±6 nM (Loop), 84±7 nM (Linker) (Figure 1C, Figure S1F, G, Table S1).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Furthermore",
",",
"all",
"designed",
"bifunctional",
"AP3‐RhoBAST",
"constructs",
"exhibited",
"a",
"high",
"binding",
"affinity",
"to",
"GFP",
",",
"with",
"K",
"D",
"values",
"of",
"75±15",
"nM",
"(",
"F30",
")",
",",
"56±6",
"nM",
"(",
"Loop",
")",
",",
"84±7",
"nM",
"(",
"Linker",
")",
"(",
"Figure",
"1C",
",",
"Figure",
"S1F",
",",
"G",
",",
"Table",
"S1",
")",
"."
]
}
] |
PMC9275501
|
PTX + TET/iRGD LPNs had the highest cytotoxicity to A2780/PTX cells, especially promoting ROS production, enhancing apoptosis, and cell cycle arrest.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"PTX",
"+",
"TET/iRGD",
"LPNs",
"had",
"the",
"highest",
"cytotoxicity",
"to",
"A2780/PTX",
"cells",
",",
"especially",
"promoting",
"ROS",
"production",
",",
"enhancing",
"apoptosis",
",",
"and",
"cell",
"cycle",
"arrest",
"."
]
}
] |
PMC11783017
|
Changes in shear viscosity with increasing shear rate of 3%PAMB/1.5%PEG-SG hydrogels. (
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Changes",
"in",
"shear",
"viscosity",
"with",
"increasing",
"shear",
"rate",
"of",
"3%PAMB/1.5%PEG-SG",
"hydrogels",
".",
"("
]
}
] |
PMC11075223
|
The components of 271–273 are furofurans with methoxy and D-allose substitutions on the benzene ring.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"components",
"of",
"271–273",
"are",
"furofurans",
"with",
"methoxy",
"and",
"D-allose",
"substitutions",
"on",
"the",
"benzene",
"ring",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Combining Belamaf (B) with carfilzomib and dexamethasone (Kd) is potentially synergistic through direct myeloma-cell kill and immune response against myeloma.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Combining",
"Belamaf",
"(",
"B",
")",
"with",
"carfilzomib",
"and",
"dexamethasone",
"(",
"Kd",
")",
"is",
"potentially",
"synergistic",
"through",
"direct",
"myeloma-cell",
"kill",
"and",
"immune",
"response",
"against",
"myeloma",
"."
]
}
] |
PMC11487720
|
E HCT116 cells were added 1 μL of DAF for probing Ca ion (green) and DAPI (blue) and PI (red) for staining nuclei, followed by exposure to UV (960 mJ/cm) and cold shock at 4 °C for 10 min, and then time-lapse microscopy at 22 °C Calcium influx and NO production during UV/cold shock-mediated nuclear bubbling.
|
[
{
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"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"E",
"HCT116",
"cells",
"were",
"added",
"1",
"μL",
"of",
"DAF",
"for",
"probing",
"Ca",
"ion",
"(",
"green",
")",
"and",
"DAPI",
"(",
"blue",
")",
"and",
"PI",
"(",
"red",
")",
"for",
"staining",
"nuclei",
",",
"followed",
"by",
"exposure",
"to",
"UV",
"(",
"960",
"mJ/cm",
")",
"and",
"cold",
"shock",
"at",
"4",
"°",
"C",
"for",
"10",
"min",
",",
"and",
"then",
"time-lapse",
"microscopy",
"at",
"22",
"°",
"C",
"Calcium",
"influx",
"and",
"NO",
"production",
"during",
"UV/cold",
"shock-mediated",
"nuclear",
"bubbling",
"."
]
}
] |
PMC11487720
|
At low temperatures (22 °C and below), WWOX preferentially dissociates itself from interacting with TRAF2 in the nucleus.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"At",
"low",
"temperatures",
"(",
"22",
"°",
"C",
"and",
"below",
")",
",",
"WWOX",
"preferentially",
"dissociates",
"itself",
"from",
"interacting",
"with",
"TRAF2",
"in",
"the",
"nucleus",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Efficacy assessments included overall response rate (ORR), rate of complete response or better (≥CR), rate of very good partial response or better (≥VGPR), progression-free survival (PFS), time to next treatment (TTNT), and overall survival (OS) were assessed.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Efficacy",
"assessments",
"included",
"overall",
"response",
"rate",
"(",
"ORR",
")",
",",
"rate",
"of",
"complete",
"response",
"or",
"better",
"(",
"≥CR",
")",
",",
"rate",
"of",
"very",
"good",
"partial",
"response",
"or",
"better",
"(",
"≥VGPR",
")",
",",
"progression-free",
"survival",
"(",
"PFS",
")",
",",
"time",
"to",
"next",
"treatment",
"(",
"TTNT",
")",
",",
"and",
"overall",
"survival",
"(",
"OS",
")",
"were",
"assessed",
"."
]
}
] |
PMC11792090
|
To evaluate the specificity of SAP UCAR-T cells, mock T cells, mock CAR-T cells, and SAP UCAR-T cells were co-cultured with CD70-positive 786-0 cells, as well as CD70-negative CASKI and BXPC3 cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"evaluate",
"the",
"specificity",
"of",
"SAP",
"UCAR-T",
"cells",
",",
"mock",
"T",
"cells",
",",
"mock",
"CAR-T",
"cells",
",",
"and",
"SAP",
"UCAR-T",
"cells",
"were",
"co-cultured",
"with",
"CD70-positive",
"786",
"-",
"0",
"cells",
",",
"as",
"well",
"as",
"CD70-negative",
"CASKI",
"and",
"BXPC3",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9895440
|
Then cells were permeabilized using self-made Perm-Wash buffer (PBS with 0.1% Triton-X100 and 0.1% BSA) for 10 min at RT.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Then",
"cells",
"were",
"permeabilized",
"using",
"self-made",
"Perm-Wash",
"buffer",
"(",
"PBS",
"with",
"0.1",
"%",
"Triton-X100",
"and",
"0.1",
"%",
"BSA",
")",
"for",
"10",
"min",
"at",
"RT",
"."
]
}
] |
PMC10421378
|
The effect of technological parameters (temperature) on cell mortality was also determined using DSC analysis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"effect",
"of",
"technological",
"parameters",
"(",
"temperature",
")",
"on",
"cell",
"mortality",
"was",
"also",
"determined",
"using",
"DSC",
"analysis",
"."
]
}
] |
PMC11657744
|
Cells were transfected with siRNAs targeting Cep89 or Fbf1, serum-starved for ciliogenesis, and then treated with serum-containing media to disassemble the cilia for 8–12 h. Fixed cells were stained with antibodies against acetylated α-tubulin (Ac-tub, green), γ-tubulin (γ-tub, red), and DAPI (blue).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cells",
"were",
"transfected",
"with",
"siRNAs",
"targeting",
"Cep89",
"or",
"Fbf1",
",",
"serum-starved",
"for",
"ciliogenesis",
",",
"and",
"then",
"treated",
"with",
"serum-containing",
"media",
"to",
"disassemble",
"the",
"cilia",
"for",
"8–12",
"h.",
"Fixed",
"cells",
"were",
"stained",
"with",
"antibodies",
"against",
"acetylated",
"α-tubulin",
"(",
"Ac-tub",
",",
"green",
")",
",",
"γ-tubulin",
"(",
"γ-tub",
",",
"red",
")",
",",
"and",
"DAPI",
"(",
"blue",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
In patients with recorded baseline and post-treatment indirect bilirubin levels (n=80) and reticulocyte percentages (n=178), the mean (SD) minimum observed post-treatment value for indirect bilirubin decreased from baseline by 1.1 (1.9) mg/dL, from 3.1 (2.0) mg/dL to 1.9 (1.9) mg/dL, and reticulocyte percentage decreased from baseline by 3.8% (5.8%), from 11.6 % (6.8%) to 7.7% (5.1%).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"patients",
"with",
"recorded",
"baseline",
"and",
"post-treatment",
"indirect",
"bilirubin",
"levels",
"(",
"n=80",
")",
"and",
"reticulocyte",
"percentages",
"(",
"n=178",
")",
",",
"the",
"mean",
"(",
"SD",
")",
"minimum",
"observed",
"post-treatment",
"value",
"for",
"indirect",
"bilirubin",
"decreased",
"from",
"baseline",
"by",
"1.1",
"(",
"1.9",
")",
"mg/dL",
",",
"from",
"3.1",
"(",
"2.0",
")",
"mg/dL",
"to",
"1.9",
"(",
"1.9",
")",
"mg/dL",
",",
"and",
"reticulocyte",
"percentage",
"decreased",
"from",
"baseline",
"by",
"3.8",
"%",
"(",
"5.8",
"%",
")",
",",
"from",
"11.6",
"%",
"(",
"6.8",
"%",
")",
"to",
"7.7",
"%",
"(",
"5.1",
"%",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Definitions Response was defined as BCR-ABL1 transcript levels according to the International Scale (IS) ≤10%, ≤1% and ≤0.1% at 3, 6 and 12 months after initiating TKI-therapy.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Definitions",
"Response",
"was",
"defined",
"as",
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"transcript",
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"according",
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"the",
"International",
"Scale",
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"IS",
")",
"≤10",
"%",
",",
"≤1",
"%",
"and",
"≤0.1",
"%",
"at",
"3",
",",
"6",
"and",
"12",
"months",
"after",
"initiating",
"TKI-therapy",
"."
]
}
] |
PMC6892818
|
The co-cultures involved a defined number of effector cells (10,000/well) and three different densities of HRPT cells (6000, 8000 and 10,000/well).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
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"co-cultures",
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"defined",
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"three",
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"of",
"HRPT",
"cells",
"(",
"6000",
",",
"8000",
"and",
"10,000/well",
")",
"."
]
}
] |
PMC9960565
|
The silver chloride precipitate was removed through centrifugation at 20,124× g for 1.5 h at 20 °C.
|
[
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"chloride",
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"1.5",
"h",
"at",
"20",
"°",
"C",
"."
]
}
] |
PMC9954564
|
Furthermore, multivariate analysis using different MDR-based methods was performed to identify possible gene–gene interactions affecting the disease risk.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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",",
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"analysis",
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"different",
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"to",
"identify",
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"–",
"gene",
"interactions",
"affecting",
"the",
"disease",
"risk",
"."
]
}
] |
PMC11754291
|
This figure illustrates the ELISA protocol used to evaluate α-MSH levels in cell media from primary human keratinocytes cultured in 12-well plates.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"figure",
"illustrates",
"the",
"ELISA",
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"human",
"keratinocytes",
"cultured",
"in",
"12-well",
"plates",
"."
]
}
] |
PMC11453378
|
This may further implicate 11bHSD1L as a relevant gene in cancer cell growth, particularly considering its increased expression in many tumour cell lines.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"may",
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"cancer",
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",",
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"its",
"increased",
"expression",
"in",
"many",
"tumour",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC11473843
|
We propose ERK5 inhibition as a potential co-targeting strategy to counteract FAK inhibitor resistance in lung cancer patients with KRAS mutations.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
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"propose",
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"co-targeting",
"strategy",
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"in",
"lung",
"cancer",
"patients",
"with",
"KRAS",
"mutations",
"."
]
}
] |
PMC6600592
|
Significant interactions with protein residue in docking were compound 4A-3 and 4D-3 for −22.8858 kcal/mol and −21.2040 kcal/mol, respectively.
|
[
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"kcal/mol",
"and",
"−21.2040",
"kcal/mol",
",",
"respectively",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Our algorithm could provide a potential simply, non-inferior and rapid detection ability of lymphoma with bone marrow involvement to replace invasive bone marrow biopsy for patients who are ineligible for invasive procedure.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"marrow",
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"are",
"ineligible",
"for",
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"."
]
}
] |
PMC9479186
|
Statistical significance was indicated by p < 0.05.
|
[
{
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"O",
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"O",
"O",
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"significance",
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"indicated",
"by",
"p",
"<",
"0.05",
"."
]
}
] |
PMC11429241
|
no. K1642), as described in the accompanying protocol.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"no.",
"K1642",
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",",
"as",
"described",
"in",
"the",
"accompanying",
"protocol",
"."
]
}
] |
PMC10812665
|
It has since been used in a large European test battery , in a DNT screen of the U.S. National Toxicology Program (NTP) and as part of the European Food Safety Agency (EFSA) test battery .
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"has",
"since",
"been",
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"European",
"test",
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",",
"in",
"a",
"DNT",
"screen",
"of",
"the",
"U.S.",
"National",
"Toxicology",
"Program",
"(",
"NTP",
")",
"and",
"as",
"part",
"of",
"the",
"European",
"Food",
"Safety",
"Agency",
"(",
"EFSA",
")",
"test",
"battery",
"."
]
}
] |
PMC11587606
|
It is noticeable that, due to the often considerably large differences within the GTEx groups, statistically significant analysis of gene expression data may not be readily achieved for a target gene.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"the",
"GTEx",
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"achieved",
"for",
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"target",
"gene",
"."
]
}
] |
PMC11248911
|
Calcd.
|
[
{
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"O",
"O"
],
"tokens": [
"Calcd",
"."
]
}
] |
PMC11789597
|
BM mononuclear cells (BMMCs) were isolated from BM samples using Lymphoprep (Stemcell Technologies, Inc., Vancouver, BC, Canada).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"BM",
"mononuclear",
"cells",
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"BMMCs",
")",
"were",
"isolated",
"from",
"BM",
"samples",
"using",
"Lymphoprep",
"(",
"Stemcell",
"Technologies",
",",
"Inc.",
",",
"Vancouver",
",",
"BC",
",",
"Canada",
")",
"."
]
}
] |
PMC11806613
|
Scale bar, 10 μm.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Scale",
"bar",
",",
"10",
"μm",
"."
]
}
] |
PMC11536589
|
In our study, we revealed that the genes associated with the Wnt/β-catenin signaling pathway exhibited increased expression in both MRTX1133-treated and MRTX1133-resistant PDAC cells.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"our",
"study",
",",
"we",
"revealed",
"that",
"the",
"genes",
"associated",
"with",
"the",
"Wnt/β-catenin",
"signaling",
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"expression",
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"both",
"MRTX1133-treated",
"and",
"MRTX1133-resistant",
"PDAC",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC10595704
|
The study helps define the harmful effects of exposure to airborne polystyrene nanoplastics on human health at the respiratory system level.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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],
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"nanoplastics",
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"human",
"health",
"at",
"the",
"respiratory",
"system",
"level",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
The combination of tolinapant and decitabine synergistically reduced viability of some human T-cell lymphoma cell lines.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"and",
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"human",
"T-cell",
"lymphoma",
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"."
]
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] |
Subsets and Splits
No community queries yet
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