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BioData-CellLine_annotated

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PMC11519788
The band signals were semi-quantified using ImageJ software, with the 0-h timepoint as the reference.
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PMC9429973
Results: Before ARI0002h infusion, MP could be identified in 33 (100%) pts by EXENT QIP-MS.
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PMC7039683
KRT18 is expressed in many epithelia other than periderm, including trophectoderm (Foshay and Gallicano, 2009), embryonic surface ectoderm (McGowan and Coulombe, 1998; Tadeu and Horsley, 2013), oral epithelia (whether basal or superficial layer not reported) (Gong et al., 2005), embryonic cornea (Gong et al., 2005), gonad (Appert et al., 1998), bladder (Erman et al., 2006), choroid plexus (Diez-Roux et al., 2011) and others.
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PMC11765988
Immunosuppressive treatment prescribed in sarcoidosis patients, particularly corticosteroids and biological agents, may increase the susceptibility to lymphoproliferative malignancies.
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PMC2614415
Aurora-A staining of TMA core of benign ovarian tissue (20×). (
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PMC11127909
E The degree of mPTP opening in 143B-V, 143B-EFHD1, 143BR-shV and 143BR-shEFHD1 cells treated with/without cisplatin, N = 3.
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PMC11672142
The partition coefficients for Trp, Def, and DefNEtTrp were 0.255, 0.427, and 0.433, respectively.
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PMC9429973
On ROC analysis, the ‘HT10 score’ (addition of 10 points to the patient-specific CAR-HEMATOTOX in case procalcitonin ≥1.4 µg/l on event day) exhibited superior discrimination for severe infections (AUC 0.92, p<0.0001, sens.
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PMC10040136
It has been demonstrated that the mTOR inhibitor rapamycin can activate the TGF-β receptor via a mechanism independent of TGF-β, while maintaining its inhibitory effect on mTOR, ultimately leading to the suppression of tumor cell proliferation .
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PMC11711871
The results are presented in mUnits/mg.
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PMC11257203
Indo, Indomethacin; Cur, curcumin.
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Methods: Patients (≥ 18 years) with clinically stable PNH (lactate dehydrogenase [LDH] levels ≤ 1.5 × upper limit of normal [246 U/L]) and ≥ 3 months prior eculizumab treatment were enrolled in the study, which consisted of a screening period (day -1 to day -30), a 10-week randomized treatment period and an extension period of up to 172 weeks.
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PMC11462673
Murine model experiments have reported that LDB1 plays a critical role in LMO2-driven thymic cell self-propagation, thymic cell radiosensitivity tolerance, and the transformation of pre-leukemic thymic cells into overt T-ALL .
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PMC11413393
MS023 was administered 3 days sequentially at 80 mg/kg intraperitoneally, with 4 days off for a period of three weeks or until vehicle control reached humane endpoint.
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PMC11795610
The mouse primary keratinocytes were seeded into 6-well plates.
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PMC10877303
The drug-likeness properties of the three selected compounds were evaluated using ADMET calculations (Table 4).
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PMC11489275
This study also found that ALB, LDH, CRP, ESR, NLR, and WBC were significantly higher in patients who died within 1 month, suggesting that MDA5-positive DM-ILD patients had higher levels of inflammation and the increase of inflammatory factors may be related to the short-term prognosis of patients .
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PMC9429973
CAR-NKAE cells perform robust cytotoxicity towards MOLM-13 AML cell line after 24h of coculture at an effector:target ratio of 1:1, exerting a quasi-total lysis of AML cells (Fig.2A).
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PMC10605143
Total RNA was isolated using the Direct-zol RNA MiniPrep Kit (Zymo Research, Irvine, CA, USA) and digested with DNase I (Worthington Biochemical Corporation, Lakewood, NJ, USA).
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PMC10747139
This study evidenced the biosafety, the NA activity, and the lack of Ru(II) bioaccumulation in major organs.
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PMC11718274
Regression and correlation analysis was also conducted to estimate the effect of different concentrations of Y2O3-NPs on genomic DNA integrity and genes’ expression in A-431 cancer cells.
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PMC6133382
Permethylated N-glycans were dissolved in methanol (20 μl), and small aliquot (approximately 1 μl) was spotted on to a MALDI plate (Opti-TOF-384 well insert, Applied Biosystems, Foster City, CA, US) and crystallized with DHB matrix (20 mg/mL in 50% methanol/water, Sigma Aldrich).
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PMC11615743
By normalizing with the fluorescence intensity of the cells incubated with DH1‐v1 and DH2‐v1, CEM cells displayed more significant fluorescence enhancement, with a signal gain of ≈130, compared with the control cell lines exhibiting low fluorescence enhancement, with a signal gain of ≈20, resulting in a positive‐to‐negative ratio of 6.6 (Figure S8, Supporting Information).
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PMC11694066
Inhibitor stock solutions were prepared in DMSO and stored in aliquots at −80°C.
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PMC11453018
In proliferative ES cells, the EWS::FLI1/P300 complex induces LMNB1 by binding to its enhancer motif containing 14 GGAA repeats.
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PMC11025866
The libraries underwent 75 bp paired-end reads using an Illumina HiSeq 2500 according to Illumina protocols, generating an average of 35 million paired-end reads per library.
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PMC11506827
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL), a key member of the tumor necrosis factor (TNF) superfamily, selectively induces apoptosis in cancer cells by binding to death receptors 4 and 5 (DR4/5) , triggering intracellular signaling and leading to programmed cell death .
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PMC6102174
The structures of the new compounds were elucidated as dihydrodehydrodiconiferyl alcohol 9-O-β-d-(3″-O-acetyl)-xylopyranoside (151) and threo-4,9,9′-trihydroxy-3,3′-dimethoxy-8-O-4′-neolignan 7-O-α-rhamnopyranoside (152) and henrylactones A–E (153–157) by extensive spectroscopic analyses and X-ray diffraction experiment.
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PMC9812014
Michellamines D and F exhibited significant cytoprotection against HIV with EC50 dosages of 3 μM and 2 μM against the HIV-RF strain respectively .
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Almost all of the upregulated pathways in PLPS were involved in DNA replication and cell proliferation.
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A summary of their activity profiles is provided in Table 1.
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NeuGcGM3 ganglioside-positive section (red).
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The dead cells (Q1) detected by PI staining may have resulted from damaging cell dissociation for flow cytometric analysis, as the HepG2 cells tend to form aggregates.
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Effect of 3-HIB supplementation on the fatty acid composition of cells.
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Cells (5x10/56 μL) were seeded on the upper compartment and then incubated at 37°C for 24 h. Cells on the upper surface of the filter were then removed using a cotton swab, leaving those attached to the lower surface stained with Diff-Quik reagents (Thermo Scientific, Waltham, MA).
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PMC11765243
Class I PI3Ks phosphorylate the 3-OH group of the inositol ring in phosphoinositides (PI(4,5)P2) with the inositol phosphorylated in the 4-OH and 5-OH groups producing PI(3,4,5)P3 (PIP3)).
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However, little is known about what affects the Ki-67 index of tumor cells of DLBCL.
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For instance, MMP-mediated cleavage of chemokines or cytokines could alter the immune cell composition within the tumor, creating an immunosuppressive microenvironment conducive to tumor progression.
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Moreover, Bacteroidota was relatively more abundant in oral samples from patients with stage Binet A in comparison to stage Binet C (p=0.008).
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For visualization of plaques, a 0.5% Crystal Violet solution were added to the wells.
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The results and observations reported above reveal that synaptopodin can bind and bundle actin and also link actin to the ER.
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In contrast, progressive disease was observed in more than 60% patients without FGFR alterations even after pemigatinib treatment, and had the worst prognosis compared to other rearrangement types of FGFR.
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After JAK2/STAT3 inhibition, we observed a decrease in c-MYC protein expression in sarcoma cells treated with LFU and PTX combination in vitro.
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On the basis of the RNA-seq data, a decreased expression of PRC2 complex genes RBBP4, RBBP7, PHF2, and YY1 was noted in seven to 10 of the lines as compared with their parental control lines.
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When sound waves are reflected, refracted, scattered, and other effects occur on the surface of an object, there is an exchange of momentum and energy with the object.
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Quantile normalization of the collected contacts was performed among the samples to normalize depth differences.
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In the assays against APN, VEGFR2 and MMP9 and the wound healing assay, compound 8 exhibited promising in vitro anti-APN, anti-angiogenesis, anti-metastasis, and anti-invasion activities.
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The enzymatically active 226-aa protease has a molecular mass of 24,987 and no N-linked glycosylation sites.
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However, CAR-T cell therapy for T cell-derived malignancies is challenging because of the lack of specific malignant T antigens, which may lead to CAR-T cell fratricide, normal T cell aplasia, and malignant T cell contamination during manufacturing and treatment .
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Corticosteroids (e.g., Prednisone): These remain the first line of treatment in patients with sarcoidosis .
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PMC11588085
Upper panels represent results without ABC transporter inhibitor Reserpine, and Bottom panels represent results from cells treated with 15 µM of Reserpine (negative control).
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PMC11637276
We therefore hypothesised that α2β1 integrin may activate MAPK11 and regulate ECM internalisation.
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This reaction fully activates the tyrosine kinase domain of the receptor intracellular domain, and the activated tyrosine kinase initiates a cascade activation reaction. “
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The mitochondrial permeability transition pore is a channel that is composed of voltage-dependent anion channels that span the mitochondrial outer membrane.
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PMC9509578
Cell surface markers such as CD133 and CD44 have exclusively been associated with the CSC phenotypic characteristics in different cancer types .
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Data are shown as mean ± SEM.
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qRT‒PCR analysis of RNF19A and ILK mRNA levels in tumour samples from the LV-Control and LV-RNF19A groups. (
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The Cy5 signal is white and DAPI is blue.
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Each sample was diluted to 6 mg/ml in 0.1 % RapiGest buffer.
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Another interesting aspect of the three-dimensional calixarene platform is its ability to encapsulate donors to a definitive binding pocket, making it more appealing than other ubiquitous ligands such as salens or porphyrins.
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PMC11544771
Briefly, cells, plated in 100 mm dishes (5 × 10 cells per dish), were cultured under a standard culture condition.
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These observations raised the possibility of redundant roles of FURIN and S1P in activating ATF6α by cleaving its LD.
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For the expansion of γ9δ2 T cells, PBMCs (2×10 cells/mL) were stimulated with recombinant human Interleukin-2 (IL-2, 25 ng/mL; Prospec) and Zoledronate (1 μM; Sigma) for 14 days in RPMI-1640 medium containing 10% heat-inactivated fetal bovine serum (FBS), penicillin (100 IU/mL), and streptomycin (100 μg/mL) at 37°C in a humidified incubator with 5% CO2.
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Subsequently, 70% ice‐cold ethanol was gradually added to the suspended cells to minimise aggregation, followed by fixation at −20°C for 3 h. After fixation, the cells were centrifuged to eliminate the ethanol and subsequently rinsed with PBS to eradicate any remaining ethanol.
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PMC9587298
Also observed are the successive losses of one MGO residue (m/z 251) and two MGO residues (m/z 179).
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PMC11342785
Figure 3Synthetic clustering of native TPPP fragments triggers microtubule binding, but not bundling, in cells.
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PMC8481254
Indeed, overexpression of CDK19 led to a significant upregulation in YAP expression, whereas CDK19 knockout had the opposite effect (Fig. 5C).
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PMC7757104
As samples from patients with ovarian cancer exhibit high levels of OPNc (30), and the results of the present study demonstrated that CDDP-resistant cells present upregulated levels of OPNc, we hypothesized that targeting OPNc in ovarian cancer cells with high levels of OPNc may be a promising new therapeutic approach to overcome resistance to CPPD.
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PMC11706491
The Fucci-G1 probe, which marks cells in the G1 phase, relies on the degradation of the Cdt1 protein.
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PMC10969097
While there is clinical evidence on this specific subject, research conducted on various types of mushrooms and their extracts reveals encouraging outcomes in reversing chemoresistance, enhancing the sensitivity of cancer cells to chemotherapy and restraining the growth of cancer cells.
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PMC9822769
Such signals indicate the formation of aquated Pt(II) species (see Supplementary Material) .
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Instead, SARS-CoV-1 and 2 inhibit nuclear import of innate immune signaling proteins using ORF6.
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PMC10808409
This gives the conclusion that the ideal micelles’ particle size should be between 10 and 100 nm.
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PMC9429973
However, patients treated with anti-CD20 monoclonal antibodies have shown lower seroconversion rates after receiving mRNA SARS-CoV-2 vaccines.
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PMC9504875
To determine the region of N protein important for binding with TRIM25, two deletion mutants of N protein (N ∆C and N ∆N) were prepared and subjected to immunoprecipitation with TRIM25 (Figure 3A).
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PMC9621239
However, Malmström et al. included patients who received the antiviral treatment of interferon (IFN) or lamivudine (LMV).
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PMC11026382
We transformed these libraries into the E. coli selection strain (ER2566 ΔfolA ΔthyA).
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PMC10747160
Its numerous spike mutations and widespread transmission (despite its modest immune evasion capabilities) serve as a reminder that it is still necessary to develop new boosters in preparation for future COVID-19 variants .
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PMC11547972
All experiments were carried out three to six times.
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PMC8973085
calcd for C24H19FN4O3S: C, 62.33; H, 4.14; N, 12.11.
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PMC10538569
HIV-1 Gag p24 in the culture supernatants collected at days 3, 6, 9, 12, and 15 post co-culture of CD4 with unmodified CD8 (solid line) or GPI-scFv X5 CD8 (dotted line) infected with HIV-1 NL4-3.
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PMC9429973
Ultimately, we aim to determine whether we can preferentially target these ‘stem-like’ cells for therapeutic benefit.
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PMC9429973
Hyperactive SUMOylation (SUMO) signalling is involved in both cancer pathogenesis and cancer progression.
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PMC6948907
On the other hand, the aberrant methylation of tumor suppressor genes leading to the cancers (Costello et al., 2000).
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PMC6617630
Cells were lysed with RIPA buffer for 30 min on ice and lysates cleared by centrifugation, and Western blotting was performed as described earlier .
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PMC11334037
OE-IGF2 increased drug sensitivity in GIST882 and GIST-T1 cells, but after treatment with 2-DG, transfection with OE-IGF2 no longer changed drug sensitivity in GIST cells (Figure 5E, P < 0.001).
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PMC7185206
In our TCGA analysis, patients with melanomas demonstrating low PD-L1 protein-to-mRNA ratios trended toward worse outcomes than patients whose tumors featured high PD-L1 protein-to-mRNA ratios (Figure 3(a)).10.1080/2162402X.2020.1744980-F0003Figure 3.Primary melanoma ADAM10 and ADAM17 staining correlates negatively with PD-L1 staining. (
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PMC11777207
Similarly, KikRed cDC2s (CD11bXCR1) migrated in comparable levels between αPD-1– and isotype-treated mice (Fig. 3, L, O, and P).
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PMC10212663
The whole procedure of this work was presented in Figure 9.
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PMC3765139
A panel of melanoma cell lines representative of tumors at diverse differentiation stages was selected.
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PMC2614416
With protein probability set at ≤ 1e-002, the 77831 original hits (i.e. using the default filter settings) returned by Bioworks 3.2 on the HepG2 proteome are reduced to 1795 validated, unique proteins (Additional File 1).
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Secondary endpoints included overall response rate (ORR), adverse events (AE), serious adverse events (SAE) and OS.
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PMC9429973
Within 60days post-HSCT, the most common grade 3 to 5 adverse events for the NAC and control groups were infections (19/80 [24%] vs. 10/40 [25%]) and gastrointestinal adverse events (16/80 [20%] vs. 7/40 [18%]).
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PMC11786600
PED4 contains PVB, PF-127, and kaempferol.
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PMC5916734
Similar amplification of cDNA from the 3B12-86 cell line using primers homologous to the beginning and end regions of the FIX ORF also revealed only a product of the target size (Fig. 4B), thus indicating that there are neither long deletions/insertions in the FIX ORF sequence nor mutations that alter splicing of FIX mRNA.
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PMC11604768
RNA and plasmid DNA libraries were sequenced using a 50 cycle SP flow cell on a NovaSeq 6000 (Illumina) using custom sequencing primers (Supplementary Data 4).
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PMC8996378
It was tested for MDR reversal activity using the Rh123 accumulation assay in KBv200 cell lines.
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PMC10748106
Quantitative structure activity relationships (QSAR) in cancer are a powerful tool that considers strict statistical parameters to generate an equation or an algorithm that describes the relationship between the biological activity and one or more properties of the compounds .
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PMC8009078
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PMC9429973
Secondary wAIHA were associated with reduced response to corticosteroids and increased need for second-line therapy.
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