OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

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PMC6461034	Redissolve peptides in 20 μl loading solvent for LC (4% acetonitrile, 0.5% TFA), pipetting 10 times up and down.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Redissolve", "peptides", "in", "20", "μl", "loading", "solvent", "for", "LC", "(", "4", "%", "acetonitrile", ",", "0.5", "%", "TFA", ")", ",", "pipetting", "10", "times", "up", "and", "down", "." ] } ]
PMC11806818	Advanced Recognition Mechanisms: Explore dual-aptamer or multi-aptamer systems to increase the specificity and sensitivity of sensors. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Advanced", "Recognition", "Mechanisms", ":", "Explore", "dual-aptamer", "or", "multi-aptamer", "systems", "to", "increase", "the", "specificity", "and", "sensitivity", "of", "sensors", ".", "(" ] } ]
PMC11699465	In addition, we also tested EGFR and HLA protein levels in TMEM199 knockout cells under a translation inhibition background.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "we", "also", "tested", "EGFR", "and", "HLA", "protein", "levels", "in", "TMEM199", "knockout", "cells", "under", "a", "translation", "inhibition", "background", "." ] } ]
PMC11001582	d, Eye size of flies normalized to the mean of the control eye size.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "d", ",", "Eye", "size", "of", "flies", "normalized", "to", "the", "mean", "of", "the", "control", "eye", "size", "." ] } ]
PMC6835428	It is unclear why the authors used A2780-ADR in combination with PTX and not adriamycin, for which these cells show resistance.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "unclear", "why", "the", "authors", "used", "A2780-ADR", "in", "combination", "with", "PTX", "and", "not", "adriamycin", ",", "for", "which", "these", "cells", "show", "resistance", "." ] } ]
PMC10547921	The trapping of GDP is believed to be a key mechanism by which auristatins exert their tubulin-interfering effect.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "trapping", "of", "GDP", "is", "believed", "to", "be", "a", "key", "mechanism", "by", "which", "auristatins", "exert", "their", "tubulin-interfering", "effect", "." ] } ]
PMC9429973	Aims: The aim of this study was to analyze the characteristics of CLL in younger patients treated with FCR.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "The", "aim", "of", "this", "study", "was", "to", "analyze", "the", "characteristics", "of", "CLL", "in", "younger", "patients", "treated", "with", "FCR", "." ] } ]
PMC9454852	Evaluating by cell surface ELISA the csGRP78 expression, after BOLD-100 treatment in a time period ranging from 1 to 48 h, we observed an increase at 1 h, reaching a peak after 3 h, and then a decrease (Figure 7C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Evaluating", "by", "cell", "surface", "ELISA", "the", "csGRP78", "expression", ",", "after", "BOLD-100", "treatment", "in", "a", "time", "period", "ranging", "from", "1", "to", "48", "h", ",", "we", "observed", "an", "increase", "at", "1", "h", ",", "reaching", "a", "peak", "after", "3", "h", ",", "and", "then", "a", "decrease", "(", "Figure", "7C", ")", "." ] } ]
PMC11783017	After treatment with Cis/Mn/NH@PGP, the apoptosis rate of 143B cells reached to 74.2 ± 1.6 %, which was significantly higher than the cells cultured with Cis/Mn@Lipo-IL11 (41.7 ± 0.3 %) and Mn@Lipo-IL11 (21.1 ± 0.2 %) (Fig. 3J and K).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "treatment", "with", "Cis/Mn/NH@PGP", ",", "the", "apoptosis", "rate", "of", "143B", "cells", "reached", "to", "74.2", "±", "1.6", "%", ",", "which", "was", "significantly", "higher", "than", "the", "cells", "cultured", "with", "Cis/Mn@Lipo-IL11", "(", "41.7", "±", "0.3", "%", ")", "and", "Mn@Lipo-IL11", "(", "21.1", "±", "0.2", "%", ")", "(", "Fig.", "3J", "and", "K", ")", "." ] } ]
PMC11013014	The crude residue was purified by silica gel column chromatography, using DCM/EtOAc, 3:1 (v/v) as eluent, to obtain the expected product 22 as a white solid with a yield of 51%.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "crude", "residue", "was", "purified", "by", "silica", "gel", "column", "chromatography", ",", "using", "DCM/EtOAc", ",", "3:1", "(", "v/v", ")", "as", "eluent", ",", "to", "obtain", "the", "expected", "product", "22", "as", "a", "white", "solid", "with", "a", "yield", "of", "51", "%", "." ] } ]
PMC11367146	Hook.	[ { "tags": [ "O", "O" ], "tokens": [ "Hook", "." ] } ]
PMC11345828	The reaction mixture was allowed to stir under an atmosphere of H2 at 40 °C until complete by LCMS.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "reaction", "mixture", "was", "allowed", "to", "stir", "under", "an", "atmosphere", "of", "H2", "at", "40", "°", "C", "until", "complete", "by", "LCMS", "." ] } ]
PMC5839394	The interaction of Ag with DNA was studied with EEM spectroscopy.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "interaction", "of", "Ag", "with", "DNA", "was", "studied", "with", "EEM", "spectroscopy", "." ] } ]
PMC11682224	Protein samples were separated by SDS-PAGE, transferred to PVDF membranes, and then subjected to antibody probing and chemiluminescent detection.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Protein", "samples", "were", "separated", "by", "SDS-PAGE", ",", "transferred", "to", "PVDF", "membranes", ",", "and", "then", "subjected", "to", "antibody", "probing", "and", "chemiluminescent", "detection", "." ] } ]
PMC11763111	The right diagram depicts the ratio of GFP-positive tumor cells lysed after 48 h of reaction in comparison to the control group, which comprised NK cells and tumor cells without CAR-T cells (n = 3).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "right", "diagram", "depicts", "the", "ratio", "of", "GFP-positive", "tumor", "cells", "lysed", "after", "48", "h", "of", "reaction", "in", "comparison", "to", "the", "control", "group", ",", "which", "comprised", "NK", "cells", "and", "tumor", "cells", "without", "CAR-T", "cells", "(", "n", "=", "3", ")", "." ] } ]
PMC10993311	Fetal growth was evaluated at T2 and T3 by a trained sonographer with a Siemens ACUSON X300TM ultrasound system, premium edition (Siemens, Mountain View, CA, USA), using abdominal curvilinear transducers (C5-2, C6-3, V7-3).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fetal", "growth", "was", "evaluated", "at", "T2", "and", "T3", "by", "a", "trained", "sonographer", "with", "a", "Siemens", "ACUSON", "X300TM", "ultrasound", "system", ",", "premium", "edition", "(", "Siemens", ",", "Mountain", "View", ",", "CA", ",", "USA", ")", ",", "using", "abdominal", "curvilinear", "transducers", "(", "C5", "-", "2", ",", "C6", "-", "3", ",", "V7", "-", "3", ")", "." ] } ]
PMC11657744	Fig. 1CEP89 deficiency delays ciliary disassembly in MEFs. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "1CEP89", "deficiency", "delays", "ciliary", "disassembly", "in", "MEFs", ".", "(" ] } ]
PMC9429973	Methods: This is an open-label phase 1b clinical trial (NCT04666649) of daily oral Ven in combination with biweekly out-patient IV PegC in 28-day cycles that will be administered to 4 cohorts (Table 1A) based on a standard 3 + 3 design.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "This", "is", "an", "open-label", "phase", "1b", "clinical", "trial", "(", "NCT04666649", ")", "of", "daily", "oral", "Ven", "in", "combination", "with", "biweekly", "out-patient", "IV", "PegC", "in", "28-day", "cycles", "that", "will", "be", "administered", "to", "4", "cohorts", "(", "Table", "1A", ")", "based", "on", "a", "standard", "3", "+", "3", "design", "." ] } ]
PMC8609870	Table 1 illustrated the DEGs and DELs (top 20), and Table 2 listed the top 15 DEMs.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "1", "illustrated", "the", "DEGs", "and", "DELs", "(", "top", "20", ")", ",", "and", "Table", "2", "listed", "the", "top", "15", "DEMs", "." ] } ]
PMC11738017	Summary of the determinants of anti-BCMA TCE therapeutic response.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary", "of", "the", "determinants", "of", "anti-BCMA", "TCE", "therapeutic", "response", "." ] } ]
PMC11794847	In post-HVEM knockdown, our data unveiled compelling changes in T cell behavior (Figure S2B).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "post-HVEM", "knockdown", ",", "our", "data", "unveiled", "compelling", "changes", "in", "T", "cell", "behavior", "(", "Figure", "S2B", ")", "." ] } ]
PMC9275501	MTT method and median effect method were used to determine the optimal synergistic drug loading ratio when the molar ratio of CDDP to CUR was 1:8.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MTT", "method", "and", "median", "effect", "method", "were", "used", "to", "determine", "the", "optimal", "synergistic", "drug", "loading", "ratio", "when", "the", "molar", "ratio", "of", "CDDP", "to", "CUR", "was", "1:8", "." ] } ]
PMC7823217	3D tumor constructs generated by 3D bioprinting approaches have expressed characteristics of in vivo tumor tissues, such as high growth rates of cancer cells, aggressive invasiveness, angiogenesis, metastasis, high resistance to anticancer drugs .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "3D", "tumor", "constructs", "generated", "by", "3D", "bioprinting", "approaches", "have", "expressed", "characteristics", "of", "in", "vivo", "tumor", "tissues", ",", "such", "as", "high", "growth", "rates", "of", "cancer", "cells", ",", "aggressive", "invasiveness", ",", "angiogenesis", ",", "metastasis", ",", "high", "resistance", "to", "anticancer", "drugs", "." ] } ]
PMC6267596	Some polyploid cells die during treatment, but the remaining cells are speculated to undergo reductive cell divisions(s) via multipolar mitosis, meiosis-like cell division or budding, similar to what is observed in megakaryocytes during platelet release .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Some", "polyploid", "cells", "die", "during", "treatment", ",", "but", "the", "remaining", "cells", "are", "speculated", "to", "undergo", "reductive", "cell", "divisions(s", ")", "via", "multipolar", "mitosis", ",", "meiosis-like", "cell", "division", "or", "budding", ",", "similar", "to", "what", "is", "observed", "in", "megakaryocytes", "during", "platelet", "release", "." ] } ]
PMC9429973	Results: NGS showed 3 genetic alterations: functional polymorphism on F5 gene associated with decreased FV levels; mutation in heterozygosity on VWF gene (autosomal dominant variant) characterized by increased affinity of VWF for platelet GPIBa, suggestive of von Willebrand Disease (VWD) type 2B; mutation in heterozygosity on NBEAL2 gene associated with macrothrombocytopenia.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "NGS", "showed", "3", "genetic", "alterations", ":", "functional", "polymorphism", "on", "F5", "gene", "associated", "with", "decreased", "FV", "levels", ";", "mutation", "in", "heterozygosity", "on", "VWF", "gene", "(", "autosomal", "dominant", "variant", ")", "characterized", "by", "increased", "affinity", "of", "VWF", "for", "platelet", "GPIBa", ",", "suggestive", "of", "von", "Willebrand", "Disease", "(", "VWD", ")", "type", "2B", ";", "mutation", "in", "heterozygosity", "on", "NBEAL2", "gene", "associated", "with", "macrothrombocytopenia", "." ] } ]
PMC11574271	Moreover, our findings indicate that miR-659-3p mimics indirectly affect the RON phosphorylation status in 5637 cells by downregulating RON expression, thereby diminishing the MSP-induced migratory and invasive activities (Fig. S3A, C, D).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "our", "findings", "indicate", "that", "miR-659", "-", "3p", "mimics", "indirectly", "affect", "the", "RON", "phosphorylation", "status", "in", "5637", "cells", "by", "downregulating", "RON", "expression", ",", "thereby", "diminishing", "the", "MSP-induced", "migratory", "and", "invasive", "activities", "(", "Fig.", "S3A", ",", "C", ",", "D", ")", "." ] } ]
PMC9429973	To characterize the effects of NPM1c degradation on the chromatin landscape and transcriptional output at genomic loci that are bound by NPM1c we used ChIPseq, PROseq and nascent RNAseq methods.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "characterize", "the", "effects", "of", "NPM1c", "degradation", "on", "the", "chromatin", "landscape", "and", "transcriptional", "output", "at", "genomic", "loci", "that", "are", "bound", "by", "NPM1c", "we", "used", "ChIPseq", ",", "PROseq", "and", "nascent", "RNAseq", "methods", "." ] } ]
PMC10578720	Expression of IL-10 and IL-1β in macrophages from mice livers.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Expression", "of", "IL-10", "and", "IL-1β", "in", "macrophages", "from", "mice", "livers", "." ] } ]
PMC11734514	IL-6 decreased over 24 hours (Figure 4C and D), while VEGF slightly decreased at 12 hours and increased again at 24 hours in A549 cells treated with C. aerizusa extract (Figure 4C and E).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IL-6", "decreased", "over", "24", "hours", "(", "Figure", "4C", "and", "D", ")", ",", "while", "VEGF", "slightly", "decreased", "at", "12", "hours", "and", "increased", "again", "at", "24", "hours", "in", "A549", "cells", "treated", "with", "C.", "aerizusa", "extract", "(", "Figure", "4C", "and", "E", ")", "." ] } ]
PMC11129910	The migration results obtained from the wound healing assay are consistent with the transwell migration assay results.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "migration", "results", "obtained", "from", "the", "wound", "healing", "assay", "are", "consistent", "with", "the", "transwell", "migration", "assay", "results", "." ] } ]
PMC11116779	For the reaction mixture, 100 ng of cDNA was used.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "the", "reaction", "mixture", ",", "100", "ng", "of", "cDNA", "was", "used", "." ] } ]
PMC10873328	First of all, as shown in Fig. 3a, the protein level of TGFBI was higher in 3AO than in normal human ovarian epithelial cell line IOSE80 and four other OC cell lines (A2780, Caov3, OVCAR3 and SKOV3).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "First", "of", "all", ",", "as", "shown", "in", "Fig.", "3a", ",", "the", "protein", "level", "of", "TGFBI", "was", "higher", "in", "3AO", "than", "in", "normal", "human", "ovarian", "epithelial", "cell", "line", "IOSE80", "and", "four", "other", "OC", "cell", "lines", "(", "A2780", ",", "Caov3", ",", "OVCAR3", "and", "SKOV3", ")", "." ] } ]
PMC11637284	Structure prediction confidence (n = 5) is displayed as the predicted lDDT (local Distance Difference Test) per aa.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Structure", "prediction", "confidence", "(", "n", "=", "5", ")", "is", "displayed", "as", "the", "predicted", "lDDT", "(", "local", "Distance", "Difference", "Test", ")", "per", "aa", "." ] } ]
PMC11679033	The absence of higher LDH release suggests that membrane integrity remained largely unaffected, indicating that the observed cytotoxic effects were not due to direct membrane disruption .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "absence", "of", "higher", "LDH", "release", "suggests", "that", "membrane", "integrity", "remained", "largely", "unaffected", ",", "indicating", "that", "the", "observed", "cytotoxic", "effects", "were", "not", "due", "to", "direct", "membrane", "disruption", "." ] } ]
PMC10055960	The thermogravimetric analysis (TGA) measurements were carried out on a Waters (Milford, MA, USA) TGA Q500 instrument, utilizing a heating rate of 10 °C min under a dry nitrogen flow of 60 mL min.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "thermogravimetric", "analysis", "(", "TGA", ")", "measurements", "were", "carried", "out", "on", "a", "Waters", "(", "Milford", ",", "MA", ",", "USA", ")", "TGA", "Q500", "instrument", ",", "utilizing", "a", "heating", "rate", "of", "10", "°", "C", "min", "under", "a", "dry", "nitrogen", "flow", "of", "60", "mL", "min", "." ] } ]
PMC4395774	Thus, the engraftment of relatively low levels of functional gene corrected T cells could lead to significant clinical benefit.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "the", "engraftment", "of", "relatively", "low", "levels", "of", "functional", "gene", "corrected", "T", "cells", "could", "lead", "to", "significant", "clinical", "benefit", "." ] } ]
PMC6114978	TSA stimulated an increase in expression of MST2 in 8 of 12 sarcoma cell lines (67%) (Figure 6B).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TSA", "stimulated", "an", "increase", "in", "expression", "of", "MST2", "in", "8", "of", "12", "sarcoma", "cell", "lines", "(", "67", "%", ")", "(", "Figure", "6B", ")", "." ] } ]
PMC11496728	Comparison of stable expression of SEAP in CHO-WT and CHO-KO cells. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Comparison", "of", "stable", "expression", "of", "SEAP", "in", "CHO-WT", "and", "CHO-KO", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC10706275	Although it has previously been discussed the topic of SSI of foreign genes into the CHO cells using CRISPR/Cas9, no pharmaceutical utilization was demonstrated .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "it", "has", "previously", "been", "discussed", "the", "topic", "of", "SSI", "of", "foreign", "genes", "into", "the", "CHO", "cells", "using", "CRISPR/Cas9", ",", "no", "pharmaceutical", "utilization", "was", "demonstrated", "." ] } ]
PMC11739504	qRT-PCR data showing a gradual increase in the level of Kat2b transcript during primary cilia formation. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "qRT-PCR", "data", "showing", "a", "gradual", "increase", "in", "the", "level", "of", "Kat2b", "transcript", "during", "primary", "cilia", "formation", ".", "(" ] } ]
PMC7723249	Human epithelial colorectal adenocarcinoma cells (Caco-2; kindly provided by Karl-Eric Magnusson, Linköping University) and Vero cells (ATCC) were grown in Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium (Thermofisher) supplemented with 1% Non-Essential Amino-Acid (Thermofisher), 10mM Hepes (Thermofisher) and 10% FBS at 37°C, 5%CO2.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Human", "epithelial", "colorectal", "adenocarcinoma", "cells", "(", "Caco-2", ";", "kindly", "provided", "by", "Karl-Eric", "Magnusson", ",", "Linköping", "University", ")", "and", "Vero", "cells", "(", "ATCC", ")", "were", "grown", "in", "Dulbecco", "’s", "Modified", "Eagle", "’s", "Medium", "(", "Thermofisher", ")", "supplemented", "with", "1", "%", "Non-Essential", "Amino-Acid", "(", "Thermofisher", ")", ",", "10mM", "Hepes", "(", "Thermofisher", ")", "and", "10", "%", "FBS", "at", "37", "°", "C", ",", "5%CO2", "." ] } ]
PMC10729469	Additionally, trends in Clec7A and Itgax expressions were recorded but without significant changes seen following TCRAβ-Treg treatments (Fig. 6C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "trends", "in", "Clec7A", "and", "Itgax", "expressions", "were", "recorded", "but", "without", "significant", "changes", "seen", "following", "TCRAβ-Treg", "treatments", "(", "Fig.", "6C", ")", "." ] } ]
PMC11792888	The Chinese hamster fibroblast cell line (CHO) is one of the most widely used to identify the toxicity of compounds .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Chinese", "hamster", "fibroblast", "cell", "line", "(", "CHO", ")", "is", "one", "of", "the", "most", "widely", "used", "to", "identify", "the", "toxicity", "of", "compounds", "." ] } ]
PMC7723249	HAZV and CCHFV infection experiment were performed in duplicate in two independent experiments.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HAZV", "and", "CCHFV", "infection", "experiment", "were", "performed", "in", "duplicate", "in", "two", "independent", "experiments", "." ] } ]
PMC5673955	Expression of hTERT in Jurkat and CD4 T cells after removal of RrA from cell growth media.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Expression", "of", "hTERT", "in", "Jurkat", "and", "CD4", "T", "cells", "after", "removal", "of", "RrA", "from", "cell", "growth", "media", "." ] } ]
PMC10850553	Statistical analysis was done by the Kruskal–Wallis test followed by the Steel test, 0 h as the control, in the left and by the Steel–Dwass test in the right panel. *	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Statistical", "analysis", "was", "done", "by", "the", "Kruskal", "–", "Wallis", "test", "followed", "by", "the", "Steel", "test", ",", "0", "h", "as", "the", "control", ",", "in", "the", "left", "and", "by", "the", "Steel", "–", "Dwass", "test", "in", "the", "right", "panel", ".", "*" ] } ]
PMC9429973	The number of publications by transfusion phenotype (TDT/NTDT) and thalassemia genotype (β-thal/α-thal) is shown in Table 1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "number", "of", "publications", "by", "transfusion", "phenotype", "(", "TDT/NTDT", ")", "and", "thalassemia", "genotype", "(", "β-thal/α-thal", ")", "is", "shown", "in", "Table", "1", "." ] } ]
PMC11509309	Fraction C-F32 (11.25 mg) was purified by semi-preparative reversed-phase HPLC (column: Phenomenex Kinetex EVO C18, 10 × 150 mm, 5 μm, H2O + 0.1% formic acid (FA)/CH3CN + 0.1% FA) to give purealidin Q (1.9 mg, 1) and aplysamine-2 (1.1 mg, 2).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fraction", "C-F32", "(", "11.25", "mg", ")", "was", "purified", "by", "semi-preparative", "reversed-phase", "HPLC", "(", "column", ":", "Phenomenex", "Kinetex", "EVO", "C18", ",", "10", "×", "150", "mm", ",", "5", "μm", ",", "H2O", "+", "0.1", "%", "formic", "acid", "(FA)/CH3CN", "+", "0.1", "%", "FA", ")", "to", "give", "purealidin", "Q", "(", "1.9", "mg", ",", "1", ")", "and", "aplysamine-2", "(", "1.1", "mg", ",", "2", ")", "." ] } ]
PMC11635087	To image membranes of CHO-K1 cells, Plasmem Bright Green (Dojindo) was added to the culture medium of CHO-K1 cells and incubated at 37℃ with 5% CO2 for 5 minutes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "image", "membranes", "of", "CHO-K1", "cells", ",", "Plasmem", "Bright", "Green", "(", "Dojindo", ")", "was", "added", "to", "the", "culture", "medium", "of", "CHO-K1", "cells", "and", "incubated", "at", "37", "℃", "with", "5", "%", "CO2", "for", "5", "minutes", "." ] } ]
PMC11629143	P‐TEFb is recruited by BRD4 and phosphorylates Pol II on serine 2, a modification that overcomes stalling and stimulates escape from the promoter and entry into the elongation phase of mRNA synthesis, leading to increased production of mRNA (Figure 5E).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P‐TEFb", "is", "recruited", "by", "BRD4", "and", "phosphorylates", "Pol", "II", "on", "serine", "2", ",", "a", "modification", "that", "overcomes", "stalling", "and", "stimulates", "escape", "from", "the", "promoter", "and", "entry", "into", "the", "elongation", "phase", "of", "mRNA", "synthesis", ",", "leading", "to", "increased", "production", "of", "mRNA", "(", "Figure", "5E", ")", "." ] } ]
PMC11621493	PLA2G4D acts as phospholipase with broad head group specificity. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PLA2G4D", "acts", "as", "phospholipase", "with", "broad", "head", "group", "specificity", ".", "(" ] } ]
PMC10719213	CD4+ and CD8+ T cells have significantly more mutations than CD19+ B cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CD4", "+", "and", "CD8", "+", "T", "cells", "have", "significantly", "more", "mutations", "than", "CD19", "+", "B", "cells", "." ] } ]
PMC11519077	After washing the cells with a PBS wash solution, the culture medium was replaced .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "washing", "the", "cells", "with", "a", "PBS", "wash", "solution", ",", "the", "culture", "medium", "was", "replaced", "." ] } ]
PMC10419319	By targeting the dysregulated glycolytic pathway, isoalantolactone offers a promising approach to overcoming drug resistance and enhancing the efficacy of cisplatin-based therapies.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "targeting", "the", "dysregulated", "glycolytic", "pathway", ",", "isoalantolactone", "offers", "a", "promising", "approach", "to", "overcoming", "drug", "resistance", "and", "enhancing", "the", "efficacy", "of", "cisplatin-based", "therapies", "." ] } ]
PMC11604768	pcDNA3.1_Signal-Flag-ADRB2 was generated by PCR amplifying the ADRB2 CDS from ADRB2-Tango (Addgene #66220) (introducing a stop codon) and inserting into pcDNA3.1(-)/myc-His A using Gibson assembly.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "pcDNA3.1_Signal-Flag-ADRB2", "was", "generated", "by", "PCR", "amplifying", "the", "ADRB2", "CDS", "from", "ADRB2-Tango", "(", "Addgene", "#", "66220", ")", "(", "introducing", "a", "stop", "codon", ")", "and", "inserting", "into", "pcDNA3.1(-)/myc-His", "A", "using", "Gibson", "assembly", "." ] } ]
PMC9429973	More favorable survival course associated with G-CHOP in comparison to G-B persisted in multivariate analysis (P=0,026, HR=15,12) after adjustment for age, sex, FLIPI grade and SARS-CoV-2 infection.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "More", "favorable", "survival", "course", "associated", "with", "G-CHOP", "in", "comparison", "to", "G-B", "persisted", "in", "multivariate", "analysis", "(", "P=0,026", ",", "HR=15,12", ")", "after", "adjustment", "for", "age", ",", "sex", ",", "FLIPI", "grade", "and", "SARS-CoV-2", "infection", "." ] } ]
PMC9429973	Results: A total of 21 pts were screened; 16 pts were enrolled and treated in phase I. Median age was 70 years (range, 23-80) and 11 (69%) were women.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "A", "total", "of", "21", "pts", "were", "screened", ";", "16", "pts", "were", "enrolled", "and", "treated", "in", "phase", "I.", "Median", "age", "was", "70", "years", "(", "range", ",", "23", "-", "80", ")", "and", "11", "(", "69", "%", ")", "were", "women", "." ] } ]
PMC5673955	A slight decrease of β‐Gal at day 50 was also observed due to cell death.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "slight", "decrease", "of", "β‐Gal", "at", "day", "50", "was", "also", "observed", "due", "to", "cell", "death", "." ] } ]
PMC11682172	Control = matched cancer cells without pre-treatment; + T = cancer cells after 5 days of co-culture with activated T lymphocytes, + CM = cancer cells after 5 days incubation with cell-free media conditioned by activated T lymphocytes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Control", "=", "matched", "cancer", "cells", "without", "pre-treatment", ";", "+", "T", "=", "cancer", "cells", "after", "5", "days", "of", "co-culture", "with", "activated", "T", "lymphocytes", ",", "+", "CM", "=", "cancer", "cells", "after", "5", "days", "incubation", "with", "cell-free", "media", "conditioned", "by", "activated", "T", "lymphocytes", "." ] } ]
PMC11543853	This provides evidence that endosomal rupture is a fundamental cellular process, which does not require enterovirus VP4 and VP1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "provides", "evidence", "that", "endosomal", "rupture", "is", "a", "fundamental", "cellular", "process", ",", "which", "does", "not", "require", "enterovirus", "VP4", "and", "VP1", "." ] } ]
PMC11194678	We further precluded the possibility that cytoplasmic STAU1 condensates recruited TFEB to inhibit its nuclear translocation (Fig. S4, B and C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "further", "precluded", "the", "possibility", "that", "cytoplasmic", "STAU1", "condensates", "recruited", "TFEB", "to", "inhibit", "its", "nuclear", "translocation", "(", "Fig.", "S4", ",", "B", "and", "C", ")", "." ] } ]
PMC10419319	Isoalantolactone effectively targeted key glycolytic enzymes (e.g., lactate dehydrogenase A, phosphofructokinase liver type, and hexokinase 2), reducing glucose consumption and lactate production in cisplatin-resistant OC cells (specifically A2780 and SNU-8).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Isoalantolactone", "effectively", "targeted", "key", "glycolytic", "enzymes", "(", "e.g.", ",", "lactate", "dehydrogenase", "A", ",", "phosphofructokinase", "liver", "type", ",", "and", "hexokinase", "2", ")", ",", "reducing", "glucose", "consumption", "and", "lactate", "production", "in", "cisplatin-resistant", "OC", "cells", "(", "specifically", "A2780", "and", "SNU-8", ")", "." ] } ]
PMC11443022	Our approach has effectively addressed ejaculatory disorder in 45,X/46,XY mosaic men, resulting in successful pregnancy.45,X/46,XY mosaicism is an uncommon chromosomal anomaly, affecting ~1 in 15 000 live births.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "approach", "has", "effectively", "addressed", "ejaculatory", "disorder", "in", "45,X/46,XY", "mosaic", "men", ",", "resulting", "in", "successful", "pregnancy.45,X/46,XY", "mosaicism", "is", "an", "uncommon", "chromosomal", "anomaly", ",", "affecting", "~1", "in", "15", "000", "live", "births", "." ] } ]
PMC6024716	Growth rate and viability are shown in Figure 2a, with all cell lines achieving confluency on day six, and exhibiting similar doubling times of approximately 24 h. The OAZ1 knockout cell lines showed similar viabilities to the parental cell line.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Growth", "rate", "and", "viability", "are", "shown", "in", "Figure", "2a", ",", "with", "all", "cell", "lines", "achieving", "confluency", "on", "day", "six", ",", "and", "exhibiting", "similar", "doubling", "times", "of", "approximately", "24", "h.", "The", "OAZ1", "knockout", "cell", "lines", "showed", "similar", "viabilities", "to", "the", "parental", "cell", "line", "." ] } ]
PMC9429973	Median of relapse timing was 12 months (2 to 83).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Median", "of", "relapse", "timing", "was", "12", "months", "(", "2", "to", "83", ")", "." ] } ]
PMC11252553	PBMCs were seeded at 10,000 cells per well in 96-well plates.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PBMCs", "were", "seeded", "at", "10,000", "cells", "per", "well", "in", "96-well", "plates", "." ] } ]
PMC10421378	Adhesion plays a crucial role in influencing the probiotic properties of bacterial cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Adhesion", "plays", "a", "crucial", "role", "in", "influencing", "the", "probiotic", "properties", "of", "bacterial", "cells", "." ] } ]
PMC9027909	Comparisons were carried out using the Student’s t-test.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Comparisons", "were", "carried", "out", "using", "the", "Student", "’s", "t-test", "." ] } ]
PMC11488203	Consequently, transmission of these properties to MSC-derived taxol-loaded EVs/exosomes already promote distinct anti-cancer issues alone disregard of the drug.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consequently", ",", "transmission", "of", "these", "properties", "to", "MSC-derived", "taxol-loaded", "EVs/exosomes", "already", "promote", "distinct", "anti-cancer", "issues", "alone", "disregard", "of", "the", "drug", "." ] } ]
PMC9429973	NFkB involves in cytokine regulations such as TNF-α & sIL-2R.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "NFkB", "involves", "in", "cytokine", "regulations", "such", "as", "TNF-α", "&", "sIL-2R", "." ] } ]
PMC10006224	We would like to emphasize, however, that the opposite response of STAG1 and STAG2 to NIPBL KD is similar in the three human cell lines tested here.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "would", "like", "to", "emphasize", ",", "however", ",", "that", "the", "opposite", "response", "of", "STAG1", "and", "STAG2", "to", "NIPBL", "KD", "is", "similar", "in", "the", "three", "human", "cell", "lines", "tested", "here", "." ] } ]
PMC11758416	Remove the cells from the incubator and centrifuge the plate at approximately 450 × g for 2 min at 4°C.b.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Remove", "the", "cells", "from", "the", "incubator", "and", "centrifuge", "the", "plate", "at", "approximately", "450", "×", "g", "for", "2", "min", "at", "4", "°", "C.b", "." ] } ]
PMC11687167	It has been reported that SREBP2 could upregulate PCSK9 expression , and PI3K/Akt was known to regulate SREBP expression .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "has", "been", "reported", "that", "SREBP2", "could", "upregulate", "PCSK9", "expression", ",", "and", "PI3K/Akt", "was", "known", "to", "regulate", "SREBP", "expression", "." ] } ]
PMC11805741	B Spectrophotometric scanning spectrum of the extracted pigment illustrating the maximum absorption at 470 nm Fig. 3LC/ESI-MS/MS spectra of the three eluted peaks (Peak 1, 3, and 5) of EGY7 carotenoids.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", "Spectrophotometric", "scanning", "spectrum", "of", "the", "extracted", "pigment", "illustrating", "the", "maximum", "absorption", "at", "470", "nm", "Fig.", "3LC/ESI-MS/MS", "spectra", "of", "the", "three", "eluted", "peaks", "(", "Peak", "1", ",", "3", ",", "and", "5", ")", "of", "EGY7", "carotenoids", "." ] } ]
PMC7136814	The coexpression and positive correlation of MYOD1, NOG, and BCL2 expression levels warrant further mechanistic investigations.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "coexpression", "and", "positive", "correlation", "of", "MYOD1", ",", "NOG", ",", "and", "BCL2", "expression", "levels", "warrant", "further", "mechanistic", "investigations", "." ] } ]
PMC8557138	This clearly demonstrated the significance of tissue architecture and polarity in moderating the angiogenic switch in the course of malignant transformation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "clearly", "demonstrated", "the", "significance", "of", "tissue", "architecture", "and", "polarity", "in", "moderating", "the", "angiogenic", "switch", "in", "the", "course", "of", "malignant", "transformation", "." ] } ]
PMC11538390	This study adds to the short list of common variants whose contribution to etiology of non-syndromic OFCs has been evaluated in molecular detail.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "study", "adds", "to", "the", "short", "list", "of", "common", "variants", "whose", "contribution", "to", "etiology", "of", "non-syndromic", "OFCs", "has", "been", "evaluated", "in", "molecular", "detail", "." ] } ]
PMC9429973	Grade ≥3 CRS occurred in 17% and 28% of patients with or without prior alloSCT, and Grade ≥3 neurologic events occurred in 26% and 25%, respectively.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Grade", "≥3", "CRS", "occurred", "in", "17", "%", "and", "28", "%", "of", "patients", "with", "or", "without", "prior", "alloSCT", ",", "and", "Grade", "≥3", "neurologic", "events", "occurred", "in", "26", "%", "and", "25", "%", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC9368503	In this study, we established a novel synovial sarcoma cell line, ICR-SS-1, which was derived from a PDX model from The Jackson Laboratory biorepository.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "we", "established", "a", "novel", "synovial", "sarcoma", "cell", "line", ",", "ICR-SS-1", ",", "which", "was", "derived", "from", "a", "PDX", "model", "from", "The", "Jackson", "Laboratory", "biorepository", "." ] } ]
PMC9429973	The authors found the GCV mutational signature in relapses and second neoplasias in transplantation recipients, raising the possibility of increased incidence of secondary cancers in patients (pts) receiving GCV treatment.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "authors", "found", "the", "GCV", "mutational", "signature", "in", "relapses", "and", "second", "neoplasias", "in", "transplantation", "recipients", ",", "raising", "the", "possibility", "of", "increased", "incidence", "of", "secondary", "cancers", "in", "patients", "(", "pts", ")", "receiving", "GCV", "treatment", "." ] } ]
PMC9250505	log10 scale) of NPB and mentioned PARP inhibitors for 6 days.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "log10", "scale", ")", "of", "NPB", "and", "mentioned", "PARP", "inhibitors", "for", "6", "days", "." ] } ]
PMC10887351	Moreover, data have shown the pro-tumoral role of β3-AR in NB and its involvement in tumor growth in a syngeneic murine model .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "data", "have", "shown", "the", "pro-tumoral", "role", "of", "β3-AR", "in", "NB", "and", "its", "involvement", "in", "tumor", "growth", "in", "a", "syngeneic", "murine", "model", "." ] } ]
PMC11394227	Therefore, the redox status of CHO-PAb cells and CHO-PAb-QS cells can be investigated by measuring the cells’ total glutathione (tGSH) and depending on the ratio of GSH to GSSG.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "the", "redox", "status", "of", "CHO-PAb", "cells", "and", "CHO-PAb-QS", "cells", "can", "be", "investigated", "by", "measuring", "the", "cells", "’", "total", "glutathione", "(", "tGSH", ")", "and", "depending", "on", "the", "ratio", "of", "GSH", "to", "GSSG", "." ] } ]
PMC9143157	The effect of P-THP has been confirmed by using various cell lines and solid tumor models, while its effect on gynecological malignancies have not been investigated.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "effect", "of", "P-THP", "has", "been", "confirmed", "by", "using", "various", "cell", "lines", "and", "solid", "tumor", "models", ",", "while", "its", "effect", "on", "gynecological", "malignancies", "have", "not", "been", "investigated", "." ] } ]
PMC4369959	Accumulated evidences revealed that changing lifestyle could prevent all these cancers.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Accumulated", "evidences", "revealed", "that", "changing", "lifestyle", "could", "prevent", "all", "these", "cancers", "." ] } ]
PMC9429973	Main objectives were rates of complete response, and incidence and severity of capillary leak syndrome (CLS).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Main", "objectives", "were", "rates", "of", "complete", "response", ",", "and", "incidence", "and", "severity", "of", "capillary", "leak", "syndrome", "(", "CLS", ")", "." ] } ]
PMC11721295	We used TCM for multiplex ELISA (Luminex analysis, see below) or conditioning fibroblasts.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "used", "TCM", "for", "multiplex", "ELISA", "(", "Luminex", "analysis", ",", "see", "below", ")", "or", "conditioning", "fibroblasts", "." ] } ]
PMC10522430	Dr. Ni'matuzzahroh conducted the identification based on a designated key book .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Dr.", "Ni'matuzzahroh", "conducted", "the", "identification", "based", "on", "a", "designated", "key", "book", "." ] } ]
PMC9429973	Methods: The CMML-specific prognostic scoring system (CPSS) has been validated in subjects receiving non-transplant therapy and was included in our study.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "The", "CMML-specific", "prognostic", "scoring", "system", "(", "CPSS", ")", "has", "been", "validated", "in", "subjects", "receiving", "non-transplant", "therapy", "and", "was", "included", "in", "our", "study", "." ] } ]
PMC11678448	The KEGG pathway analysis indicated that they were primarily engaged in cytokine–cytokine receptor interactions, interactions between viral proteins, cytokines, and cytokine receptors, the chemokine signaling pathway, and the IL-17 signaling pathway (Figure S3B).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "KEGG", "pathway", "analysis", "indicated", "that", "they", "were", "primarily", "engaged", "in", "cytokine", "–", "cytokine", "receptor", "interactions", ",", "interactions", "between", "viral", "proteins", ",", "cytokines", ",", "and", "cytokine", "receptors", ",", "the", "chemokine", "signaling", "pathway", ",", "and", "the", "IL-17", "signaling", "pathway", "(", "Figure", "S3B", ")", "." ] } ]
PMC6182045	The clade C consensus nucleic acid sequence was obtained Los Alamos National Laboratory 2010 HIV1 Env Reference Alignment and was translated using Geneious 10.2.3 (20).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "clade", "C", "consensus", "nucleic", "acid", "sequence", "was", "obtained", "Los", "Alamos", "National", "Laboratory", "2010", "HIV1", "Env", "Reference", "Alignment", "and", "was", "translated", "using", "Geneious", "10.2.3", "(", "20", ")", "." ] } ]
PMC11502327	In the process of synthesis of some nanoparticles, a lot of chemicals need to be consumed, especially by chemical synthesis methods such as vapor deposition and liquid phase reduction.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "process", "of", "synthesis", "of", "some", "nanoparticles", ",", "a", "lot", "of", "chemicals", "need", "to", "be", "consumed", ",", "especially", "by", "chemical", "synthesis", "methods", "such", "as", "vapor", "deposition", "and", "liquid", "phase", "reduction", "." ] } ]
PMC11731161	The graphic was created using Biorender USP7, also known as Ubiquitin-specific protease 7, is an enzyme that plays a crucial role in the regulation of protein degradation and cellular signaling by removing ubiquitin molecules from target proteins .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "graphic", "was", "created", "using", "Biorender", "USP7", ",", "also", "known", "as", "Ubiquitin-specific", "protease", "7", ",", "is", "an", "enzyme", "that", "plays", "a", "crucial", "role", "in", "the", "regulation", "of", "protein", "degradation", "and", "cellular", "signaling", "by", "removing", "ubiquitin", "molecules", "from", "target", "proteins", "." ] } ]
PMC9429973	While C1 displayed enrichment of RNA processing, downregulation of inflammatory pathways and aggressive clinical behavior, C2 showed increased inflammatory signaling and senescence with indolent clinical behavior.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "C1", "displayed", "enrichment", "of", "RNA", "processing", ",", "downregulation", "of", "inflammatory", "pathways", "and", "aggressive", "clinical", "behavior", ",", "C2", "showed", "increased", "inflammatory", "signaling", "and", "senescence", "with", "indolent", "clinical", "behavior", "." ] } ]
PMC11672142	Three-dose–response parameters were measured: 50% growth inhibition (GI50), total growth inhibition (TGI), and 50% cellular death (LC50).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Three-dose", "–", "response", "parameters", "were", "measured", ":", "50", "%", "growth", "inhibition", "(", "GI50", ")", ",", "total", "growth", "inhibition", "(", "TGI", ")", ",", "and", "50", "%", "cellular", "death", "(", "LC50", ")", "." ] } ]
PMC8633974	Nested PCR and agarose gel electrophoresis showed that in both U1 (Figure 9e) and JLat cells (Figure 9f) TatDE rLNP cleaved the 2.5kb section of HIV genome, and the expected 525bp amplicon was seen.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nested", "PCR", "and", "agarose", "gel", "electrophoresis", "showed", "that", "in", "both", "U1", "(", "Figure", "9e", ")", "and", "JLat", "cells", "(", "Figure", "9f", ")", "TatDE", "rLNP", "cleaved", "the", "2.5", "kb", "section", "of", "HIV", "genome", ",", "and", "the", "expected", "525bp", "amplicon", "was", "seen", "." ] } ]
PMC11381192	The CSI signature can function as a pragmatic tool for discerning common clinical features and directing individualised therapeutic strategies.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "CSI", "signature", "can", "function", "as", "a", "pragmatic", "tool", "for", "discerning", "common", "clinical", "features", "and", "directing", "individualised", "therapeutic", "strategies", "." ] } ]
PMC10713411	Treg cells affect the tumor immune microenvironment by modulating various immune cells such as macrophages, dendritic cells, T cells, NK cells and B cells .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Treg", "cells", "affect", "the", "tumor", "immune", "microenvironment", "by", "modulating", "various", "immune", "cells", "such", "as", "macrophages", ",", "dendritic", "cells", ",", "T", "cells", ",", "NK", "cells", "and", "B", "cells", "." ] } ]
PMC11772585	β-Tubulin was used for the normalization control.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "β-Tubulin", "was", "used", "for", "the", "normalization", "control", "." ] } ]
PMC9429973	Eleven patients had RCC, 5 MDS-EB and 2 t-MDS.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Eleven", "patients", "had", "RCC", ",", "5", "MDS-EB", "and", "2", "t-MDS", "." ] } ]

PMC6461034

Redissolve peptides in 20 μl loading solvent for LC (4% acetonitrile, 0.5% TFA), pipetting 10 times up and down.

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PMC11806818

Advanced Recognition Mechanisms: Explore dual-aptamer or multi-aptamer systems to increase the specificity and sensitivity of sensors. (

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PMC11699465

In addition, we also tested EGFR and HLA protein levels in TMEM199 knockout cells under a translation inhibition background.

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PMC11001582

d, Eye size of flies normalized to the mean of the control eye size.

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PMC6835428

It is unclear why the authors used A2780-ADR in combination with PTX and not adriamycin, for which these cells show resistance.

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PMC10547921

The trapping of GDP is believed to be a key mechanism by which auristatins exert their tubulin-interfering effect.

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PMC9429973

Aims: The aim of this study was to analyze the characteristics of CLL in younger patients treated with FCR.

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PMC9454852

Evaluating by cell surface ELISA the csGRP78 expression, after BOLD-100 treatment in a time period ranging from 1 to 48 h, we observed an increase at 1 h, reaching a peak after 3 h, and then a decrease (Figure 7C).

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PMC11783017

After treatment with Cis/Mn/NH@PGP, the apoptosis rate of 143B cells reached to 74.2 ± 1.6 %, which was significantly higher than the cells cultured with Cis/Mn@Lipo-IL11 (41.7 ± 0.3 %) and Mn@Lipo-IL11 (21.1 ± 0.2 %) (Fig. 3J and K).

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PMC11013014

The crude residue was purified by silica gel column chromatography, using DCM/EtOAc, 3:1 (v/v) as eluent, to obtain the expected product 22 as a white solid with a yield of 51%.

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PMC11367146

Hook.

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The reaction mixture was allowed to stir under an atmosphere of H2 at 40 °C until complete by LCMS.

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The interaction of Ag with DNA was studied with EEM spectroscopy.

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Protein samples were separated by SDS-PAGE, transferred to PVDF membranes, and then subjected to antibody probing and chemiluminescent detection.

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The right diagram depicts the ratio of GFP-positive tumor cells lysed after 48 h of reaction in comparison to the control group, which comprised NK cells and tumor cells without CAR-T cells (n = 3).

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PMC10993311

Fetal growth was evaluated at T2 and T3 by a trained sonographer with a Siemens ACUSON X300TM ultrasound system, premium edition (Siemens, Mountain View, CA, USA), using abdominal curvilinear transducers (C5-2, C6-3, V7-3).

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PMC11657744

Fig. 1CEP89 deficiency delays ciliary disassembly in MEFs. (

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PMC9429973

Methods: This is an open-label phase 1b clinical trial (NCT04666649) of daily oral Ven in combination with biweekly out-patient IV PegC in 28-day cycles that will be administered to 4 cohorts (Table 1A) based on a standard 3 + 3 design.

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PMC8609870

Table 1 illustrated the DEGs and DELs (top 20), and Table 2 listed the top 15 DEMs.

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Summary of the determinants of anti-BCMA TCE therapeutic response.

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In post-HVEM knockdown, our data unveiled compelling changes in T cell behavior (Figure S2B).

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PMC9275501

MTT method and median effect method were used to determine the optimal synergistic drug loading ratio when the molar ratio of CDDP to CUR was 1:8.

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PMC7823217

3D tumor constructs generated by 3D bioprinting approaches have expressed characteristics of in vivo tumor tissues, such as high growth rates of cancer cells, aggressive invasiveness, angiogenesis, metastasis, high resistance to anticancer drugs .

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PMC6267596

Some polyploid cells die during treatment, but the remaining cells are speculated to undergo reductive cell divisions(s) via multipolar mitosis, meiosis-like cell division or budding, similar to what is observed in megakaryocytes during platelet release .

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PMC9429973

Results: NGS showed 3 genetic alterations: functional polymorphism on F5 gene associated with decreased FV levels; mutation in heterozygosity on VWF gene (autosomal dominant variant) characterized by increased affinity of VWF for platelet GPIBa, suggestive of von Willebrand Disease (VWD) type 2B; mutation in heterozygosity on NBEAL2 gene associated with macrothrombocytopenia.

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PMC11574271

Moreover, our findings indicate that miR-659-3p mimics indirectly affect the RON phosphorylation status in 5637 cells by downregulating RON expression, thereby diminishing the MSP-induced migratory and invasive activities (Fig. S3A, C, D).

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PMC9429973

To characterize the effects of NPM1c degradation on the chromatin landscape and transcriptional output at genomic loci that are bound by NPM1c we used ChIPseq, PROseq and nascent RNAseq methods.

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PMC10578720

Expression of IL-10 and IL-1β in macrophages from mice livers.

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PMC11734514

IL-6 decreased over 24 hours (Figure 4C and D), while VEGF slightly decreased at 12 hours and increased again at 24 hours in A549 cells treated with C. aerizusa extract (Figure 4C and E).

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PMC11129910

The migration results obtained from the wound healing assay are consistent with the transwell migration assay results.

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PMC11116779

For the reaction mixture, 100 ng of cDNA was used.

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First of all, as shown in Fig. 3a, the protein level of TGFBI was higher in 3AO than in normal human ovarian epithelial cell line IOSE80 and four other OC cell lines (A2780, Caov3, OVCAR3 and SKOV3).

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PMC11637284

Structure prediction confidence (n = 5) is displayed as the predicted lDDT (local Distance Difference Test) per aa.

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The absence of higher LDH release suggests that membrane integrity remained largely unaffected, indicating that the observed cytotoxic effects were not due to direct membrane disruption .

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PMC10055960

The thermogravimetric analysis (TGA) measurements were carried out on a Waters (Milford, MA, USA) TGA Q500 instrument, utilizing a heating rate of 10 °C min under a dry nitrogen flow of 60 mL min.

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PMC4395774

Thus, the engraftment of relatively low levels of functional gene corrected T cells could lead to significant clinical benefit.

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TSA stimulated an increase in expression of MST2 in 8 of 12 sarcoma cell lines (67%) (Figure 6B).

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Comparison of stable expression of SEAP in CHO-WT and CHO-KO cells. (

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PMC10706275

Although it has previously been discussed the topic of SSI of foreign genes into the CHO cells using CRISPR/Cas9, no pharmaceutical utilization was demonstrated .

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PMC11739504

qRT-PCR data showing a gradual increase in the level of Kat2b transcript during primary cilia formation. (

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PMC7723249

Human epithelial colorectal adenocarcinoma cells (Caco-2; kindly provided by Karl-Eric Magnusson, Linköping University) and Vero cells (ATCC) were grown in Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium (Thermofisher) supplemented with 1% Non-Essential Amino-Acid (Thermofisher), 10mM Hepes (Thermofisher) and 10% FBS at 37°C, 5%CO2.

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PMC10729469

Additionally, trends in Clec7A and Itgax expressions were recorded but without significant changes seen following TCRAβ-Treg treatments (Fig. 6C).

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PMC11792888

The Chinese hamster fibroblast cell line (CHO) is one of the most widely used to identify the toxicity of compounds .

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PMC7723249

HAZV and CCHFV infection experiment were performed in duplicate in two independent experiments.

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PMC5673955

Expression of hTERT in Jurkat and CD4 T cells after removal of RrA from cell growth media.

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PMC10850553

Statistical analysis was done by the Kruskal–Wallis test followed by the Steel test, 0 h as the control, in the left and by the Steel–Dwass test in the right panel. *

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PMC9429973

The number of publications by transfusion phenotype (TDT/NTDT) and thalassemia genotype (β-thal/α-thal) is shown in Table 1.

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PMC11509309

Fraction C-F32 (11.25 mg) was purified by semi-preparative reversed-phase HPLC (column: Phenomenex Kinetex EVO C18, 10 × 150 mm, 5 μm, H2O + 0.1% formic acid (FA)/CH3CN + 0.1% FA) to give purealidin Q (1.9 mg, 1) and aplysamine-2 (1.1 mg, 2).

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PMC11635087

To image membranes of CHO-K1 cells, Plasmem Bright Green (Dojindo) was added to the culture medium of CHO-K1 cells and incubated at 37℃ with 5% CO2 for 5 minutes.

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PMC11629143

P‐TEFb is recruited by BRD4 and phosphorylates Pol II on serine 2, a modification that overcomes stalling and stimulates escape from the promoter and entry into the elongation phase of mRNA synthesis, leading to increased production of mRNA (Figure 5E).

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PMC11621493

PLA2G4D acts as phospholipase with broad head group specificity. (

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PMC10719213

CD4+ and CD8+ T cells have significantly more mutations than CD19+ B cells.

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PMC11519077

After washing the cells with a PBS wash solution, the culture medium was replaced .

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By targeting the dysregulated glycolytic pathway, isoalantolactone offers a promising approach to overcoming drug resistance and enhancing the efficacy of cisplatin-based therapies.

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pcDNA3.1_Signal-Flag-ADRB2 was generated by PCR amplifying the ADRB2 CDS from ADRB2-Tango (Addgene #66220) (introducing a stop codon) and inserting into pcDNA3.1(-)/myc-His A using Gibson assembly.

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PMC9429973

More favorable survival course associated with G-CHOP in comparison to G-B persisted in multivariate analysis (P=0,026, HR=15,12) after adjustment for age, sex, FLIPI grade and SARS-CoV-2 infection.

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PMC9429973

Results: A total of 21 pts were screened; 16 pts were enrolled and treated in phase I. Median age was 70 years (range, 23-80) and 11 (69%) were women.

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PMC5673955

A slight decrease of β‐Gal at day 50 was also observed due to cell death.

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PMC11682172

Control = matched cancer cells without pre-treatment; + T = cancer cells after 5 days of co-culture with activated T lymphocytes, + CM = cancer cells after 5 days incubation with cell-free media conditioned by activated T lymphocytes.

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PMC11543853

This provides evidence that endosomal rupture is a fundamental cellular process, which does not require enterovirus VP4 and VP1.

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PMC11194678

We further precluded the possibility that cytoplasmic STAU1 condensates recruited TFEB to inhibit its nuclear translocation (Fig. S4, B and C).

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PMC10419319

Isoalantolactone effectively targeted key glycolytic enzymes (e.g., lactate dehydrogenase A, phosphofructokinase liver type, and hexokinase 2), reducing glucose consumption and lactate production in cisplatin-resistant OC cells (specifically A2780 and SNU-8).

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PMC11443022

Our approach has effectively addressed ejaculatory disorder in 45,X/46,XY mosaic men, resulting in successful pregnancy.45,X/46,XY mosaicism is an uncommon chromosomal anomaly, affecting ~1 in 15 000 live births.

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PMC6024716

Growth rate and viability are shown in Figure 2a, with all cell lines achieving confluency on day six, and exhibiting similar doubling times of approximately 24 h. The OAZ1 knockout cell lines showed similar viabilities to the parental cell line.

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PMC9429973

Median of relapse timing was 12 months (2 to 83).

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PMC11252553

PBMCs were seeded at 10,000 cells per well in 96-well plates.

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PMC10421378

Adhesion plays a crucial role in influencing the probiotic properties of bacterial cells.

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Comparisons were carried out using the Student’s t-test.

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PMC11488203

Consequently, transmission of these properties to MSC-derived taxol-loaded EVs/exosomes already promote distinct anti-cancer issues alone disregard of the drug.

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PMC9429973

NFkB involves in cytokine regulations such as TNF-α & sIL-2R.

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PMC10006224

We would like to emphasize, however, that the opposite response of STAG1 and STAG2 to NIPBL KD is similar in the three human cell lines tested here.

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PMC11758416

Remove the cells from the incubator and centrifuge the plate at approximately 450 × g for 2 min at 4°C.b.

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PMC11687167

It has been reported that SREBP2 could upregulate PCSK9 expression , and PI3K/Akt was known to regulate SREBP expression .

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PMC11805741

B Spectrophotometric scanning spectrum of the extracted pigment illustrating the maximum absorption at 470 nm Fig. 3LC/ESI-MS/MS spectra of the three eluted peaks (Peak 1, 3, and 5) of EGY7 carotenoids.

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PMC7136814

The coexpression and positive correlation of MYOD1, NOG, and BCL2 expression levels warrant further mechanistic investigations.

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PMC8557138

This clearly demonstrated the significance of tissue architecture and polarity in moderating the angiogenic switch in the course of malignant transformation.

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PMC11538390

This study adds to the short list of common variants whose contribution to etiology of non-syndromic OFCs has been evaluated in molecular detail.

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PMC9429973

Grade ≥3 CRS occurred in 17% and 28% of patients with or without prior alloSCT, and Grade ≥3 neurologic events occurred in 26% and 25%, respectively.

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PMC9368503

In this study, we established a novel synovial sarcoma cell line, ICR-SS-1, which was derived from a PDX model from The Jackson Laboratory biorepository.

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PMC9429973

The authors found the GCV mutational signature in relapses and second neoplasias in transplantation recipients, raising the possibility of increased incidence of secondary cancers in patients (pts) receiving GCV treatment.

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PMC9250505

log10 scale) of NPB and mentioned PARP inhibitors for 6 days.

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PMC10887351

Moreover, data have shown the pro-tumoral role of β3-AR in NB and its involvement in tumor growth in a syngeneic murine model .

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PMC11394227

Therefore, the redox status of CHO-PAb cells and CHO-PAb-QS cells can be investigated by measuring the cells’ total glutathione (tGSH) and depending on the ratio of GSH to GSSG.

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PMC9143157

The effect of P-THP has been confirmed by using various cell lines and solid tumor models, while its effect on gynecological malignancies have not been investigated.

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PMC4369959

Accumulated evidences revealed that changing lifestyle could prevent all these cancers.

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PMC9429973

Main objectives were rates of complete response, and incidence and severity of capillary leak syndrome (CLS).

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PMC11721295

We used TCM for multiplex ELISA (Luminex analysis, see below) or conditioning fibroblasts.

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PMC10522430

Dr. Ni'matuzzahroh conducted the identification based on a designated key book .

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PMC9429973

Methods: The CMML-specific prognostic scoring system (CPSS) has been validated in subjects receiving non-transplant therapy and was included in our study.

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PMC11678448

The KEGG pathway analysis indicated that they were primarily engaged in cytokine–cytokine receptor interactions, interactions between viral proteins, cytokines, and cytokine receptors, the chemokine signaling pathway, and the IL-17 signaling pathway (Figure S3B).

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PMC6182045

The clade C consensus nucleic acid sequence was obtained Los Alamos National Laboratory 2010 HIV1 Env Reference Alignment and was translated using Geneious 10.2.3 (20).

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PMC11502327

In the process of synthesis of some nanoparticles, a lot of chemicals need to be consumed, especially by chemical synthesis methods such as vapor deposition and liquid phase reduction.

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PMC11731161

The graphic was created using Biorender USP7, also known as Ubiquitin-specific protease 7, is an enzyme that plays a crucial role in the regulation of protein degradation and cellular signaling by removing ubiquitin molecules from target proteins .

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PMC9429973

While C1 displayed enrichment of RNA processing, downregulation of inflammatory pathways and aggressive clinical behavior, C2 showed increased inflammatory signaling and senescence with indolent clinical behavior.

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PMC11672142

Three-dose–response parameters were measured: 50% growth inhibition (GI50), total growth inhibition (TGI), and 50% cellular death (LC50).

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PMC8633974

Nested PCR and agarose gel electrophoresis showed that in both U1 (Figure 9e) and JLat cells (Figure 9f) TatDE rLNP cleaved the 2.5kb section of HIV genome, and the expected 525bp amplicon was seen.

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PMC11381192

The CSI signature can function as a pragmatic tool for discerning common clinical features and directing individualised therapeutic strategies.

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PMC10713411

Treg cells affect the tumor immune microenvironment by modulating various immune cells such as macrophages, dendritic cells, T cells, NK cells and B cells .

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PMC11772585

β-Tubulin was used for the normalization control.

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PMC9429973

Eleven patients had RCC, 5 MDS-EB and 2 t-MDS.

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