PMCID
string | Sentences
string | ner
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|---|---|---|
PMC9429973
|
The Charlson Comorbidity Index score was 5 points, and median time from the first symptoms to hospital admission was 7 days.
|
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O"
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"."
]
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] |
PMC11687167
|
PCSK9 has received increased attention from cardiovascular specialists because of its specific mechanisms of action in lipid metabolism.
|
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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"mechanisms",
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"lipid",
"metabolism",
"."
]
}
] |
PMC11803918
|
Eight days after implantation, when the tumor volumes were around 50 mm, the mice were intravenously injected with an equivalent volume of PBS, γδ-T exosomes, Ce6-loaded liposomes, or hybrid exosomes every 3 days for up to 3 doses.
|
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
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"were",
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",",
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",",
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"every",
"3",
"days",
"for",
"up",
"to",
"3",
"doses",
"."
]
}
] |
PMC10994876
|
Viable cell density (VCD) was determined using trypan blue staining and viability was assessed using the MTS.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"and",
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"was",
"assessed",
"using",
"the",
"MTS",
"."
]
}
] |
PMC11345828
|
Conditions: (a) 45, [Pd(cinnamyl)Cl]2, Bu-BrettPhos, Cs2CO3, toluene. (
|
[
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"45",
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"[Pd(cinnamyl)Cl]2",
",",
"Bu-BrettPhos",
",",
"Cs2CO3",
",",
"toluene",
".",
"("
]
}
] |
PMC11310713
|
To verify one of the primary adverse effects of HRT, specifically the risk of developing breast cancer, we examined the morphology of the mammary gland through H&E stain.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"specifically",
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"breast",
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",",
"we",
"examined",
"the",
"morphology",
"of",
"the",
"mammary",
"gland",
"through",
"H&E",
"stain",
"."
]
}
] |
PMC9727330
|
These findings indicate the severe effect of NNDAsp treatment in the Caco-2 cells.
|
[
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"O",
"O",
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"treatment",
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"the",
"Caco-2",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC11650848
|
It was evident that DNA methylation at the DMR could be reduced significantly in multiple cell lines using these experiments.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"in",
"multiple",
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"using",
"these",
"experiments",
"."
]
}
] |
PMC11700340
|
During the logarithmic growth phase, the concentration of cancer cells steadily increased, and the toxicity of the medications being tested was assessed at various incubation durations .
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O"
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"the",
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",",
"and",
"the",
"toxicity",
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"the",
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"being",
"tested",
"was",
"assessed",
"at",
"various",
"incubation",
"durations",
"."
]
}
] |
PMC10170482
|
Cytoskeletal filaments are coupled to the nuclear envelope, mitochondria, and other organelles, resulting in the transmission of physical constraints to cellular structures.
|
[
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
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",",
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"in",
"the",
"transmission",
"of",
"physical",
"constraints",
"to",
"cellular",
"structures",
"."
]
}
] |
PMC9599726
|
We previously reported that the YAP inhibitor VP induced massive cell death in both GIST882 and GIST48 cells, but the type of cell death involved remained unknown .
|
[
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
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"O",
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"the",
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"cell",
"death",
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"unknown",
"."
]
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] |
PMC11535726
|
Kirschsteiniothelialongirostrata exhibits sporidesmium-like characteristics and shares similar features with other Kirschsteiniothelia species.
|
[
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"with",
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"Kirschsteiniothelia",
"species",
"."
]
}
] |
PMC11301242
|
Our analysis, integrated with clinical data, revealed that patients harboring ecDNA typically respond poorly to initial treatments, have a high propensity for relapse, and suffer from poor survival.
|
[
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"O",
"O",
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"O",
"O",
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",",
"and",
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"survival",
"."
]
}
] |
PMC7090062
|
Based on our findings, miR-30a, is an upstream regulator of autophagy in GIST cell lines.
|
[
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"O",
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"autophagy",
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"GIST",
"cell",
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"."
]
}
] |
PMC8873393
|
F Enlarged view of the genes with 24–28 introns shown in Fig. 4D.
|
[
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"Enlarged",
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"with",
"24–28",
"introns",
"shown",
"in",
"Fig.",
"4D",
"."
]
}
] |
PMC11612315
|
As changes in heat sensitivity are dependent on TRPV1 activity, we sought to determine whether intraplantar injection of 10 µg of GLP-1(7–36) modulates spontaneous pain behavior induced by the TRPV1 agonist CAP in mice.
|
[
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"mice",
"."
]
}
] |
PMC10933092
|
RNA sequencing (RNA-seq) data of BLCA 5637 control (sh-NC) and TRMT61A knockdown (sh-TRMT61A) 5637 cells using the Illumina HiSeq RNA-Seq platform were retrieved from the University of California Santa Cruz Xena Browser (https://xena.ucsc.edu/).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
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"O",
"O",
"O",
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"retrieved",
"from",
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"Cruz",
"Xena",
"Browser",
"(",
"https://xena.ucsc.edu/",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Instead the diagnosis is confirmed through criteria set by the National Institute of Health (NIH) and the International Chronic Ocular Graft-vs-Host-Disease Consensus Group (ICCGvHD), which place a heavy reliance on findings found on slit lamp examinations.
|
[
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"O",
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"findings",
"found",
"on",
"slit",
"lamp",
"examinations",
"."
]
}
] |
PMC11468365
|
It is observed that the MultiComb model has the lowest MSE for most cancer cell lines.
|
[
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"O",
"O",
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"lowest",
"MSE",
"for",
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"cancer",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC11721096
|
A. sparsifolia and C. arabica were purchased from a herbal market in Chengdu of Sichuan Province of the People’s Republic of China, and the voucher specimens (2021-02 for the former and 2021-03 for the latter) were deposited in the Herbarium of Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
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"Sichuan",
"Province",
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"’s",
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"(",
"2021",
"-",
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"03",
"for",
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")",
"were",
"deposited",
"in",
"the",
"Herbarium",
"of",
"Chengdu",
"Institute",
"of",
"Biology",
",",
"Chinese",
"Academy",
"of",
"Sciences",
"."
]
}
] |
PMC6102174
|
The known xanthone, 1-hydroxy-2,3,4,7-tetramethoxyxanthone (114) also showed activity inhibiting HBsAg and HbeAg secretions with IC50 values of 2.50 (SI > 2.2) and 3.61 (SI > 1.5) mM, respectively (Fig. 6).Fig.
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"known",
"xanthone",
",",
"1-hydroxy-2,3,4,7-tetramethoxyxanthone",
"(",
"114",
")",
"also",
"showed",
"activity",
"inhibiting",
"HBsAg",
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"HbeAg",
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"with",
"IC50",
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"2.50",
"(",
"SI",
">",
"2.2",
")",
"and",
"3.61",
"(",
"SI",
">",
"1.5",
")",
"mM",
",",
"respectively",
"(",
"Fig.",
"6).Fig",
"."
]
}
] |
PMC11727145
|
The Green’s medium composition used in this work was a slightly modified version from the one described by Rheinwald and Green (i.e., hereafter denominated as mGreen’s medium) and included DMEM and Ham’s F12 (Merck, Darmstadt, Germany) with a 3:1 proportion, 0.14 nM cholera toxin (Lubio Science, Zurich, Switzerland), 332.9 ng/mL hydrocortisone (Pfizer, New York, NY, USA), 8.3 ng/mL EGF (Merck, Darmstadt, Germany), 832.2 µM L-glutamine (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA), 0.12 U/mL insulin (Novo Nordisk Pharma, Bagsværd, Danemark), and 10% FBS (Merck, Darmstadt, Germany).
|
[
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"Green",
"’s",
"medium",
"composition",
"used",
"in",
"this",
"work",
"was",
"a",
"slightly",
"modified",
"version",
"from",
"the",
"one",
"described",
"by",
"Rheinwald",
"and",
"Green",
"(",
"i.e.",
",",
"hereafter",
"denominated",
"as",
"mGreen",
"’s",
"medium",
")",
"and",
"included",
"DMEM",
"and",
"Ham",
"’s",
"F12",
"(",
"Merck",
",",
"Darmstadt",
",",
"Germany",
")",
"with",
"a",
"3:1",
"proportion",
",",
"0.14",
"nM",
"cholera",
"toxin",
"(",
"Lubio",
"Science",
",",
"Zurich",
",",
"Switzerland",
")",
",",
"332.9",
"ng/mL",
"hydrocortisone",
"(",
"Pfizer",
",",
"New",
"York",
",",
"NY",
",",
"USA",
")",
",",
"8.3",
"ng/mL",
"EGF",
"(",
"Merck",
",",
"Darmstadt",
",",
"Germany",
")",
",",
"832.2",
"µM",
"L-glutamine",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
",",
"Waltham",
",",
"MA",
",",
"USA",
")",
",",
"0.12",
"U/mL",
"insulin",
"(",
"Novo",
"Nordisk",
"Pharma",
",",
"Bagsværd",
",",
"Danemark",
")",
",",
"and",
"10",
"%",
"FBS",
"(",
"Merck",
",",
"Darmstadt",
",",
"Germany",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Most patients were treated with venetoclax in combination with FLAG-IDA protocol (n=25, 86%).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Most",
"patients",
"were",
"treated",
"with",
"venetoclax",
"in",
"combination",
"with",
"FLAG-IDA",
"protocol",
"(",
"n=25",
",",
"86",
"%",
")",
"."
]
}
] |
PMC11490153
|
Table 2Identified ingredients in C. Citratus EO using GC-MS analysisNo.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Table",
"2Identified",
"ingredients",
"in",
"C.",
"Citratus",
"EO",
"using",
"GC-MS",
"analysisNo",
"."
]
}
] |
PMC11765879
|
We found that ZSC extract significantly reduces viability, alters the normal morphological phenotype of HER2-positive breast cancer cells, and inhibits cell migration as well as colony formation; this is accompanied by deregulating different apoptotic markers such as Bax/Bcl-2 and NF-κB in both cell lines.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"found",
"that",
"ZSC",
"extract",
"significantly",
"reduces",
"viability",
",",
"alters",
"the",
"normal",
"morphological",
"phenotype",
"of",
"HER2-positive",
"breast",
"cancer",
"cells",
",",
"and",
"inhibits",
"cell",
"migration",
"as",
"well",
"as",
"colony",
"formation",
";",
"this",
"is",
"accompanied",
"by",
"deregulating",
"different",
"apoptotic",
"markers",
"such",
"as",
"Bax/Bcl-2",
"and",
"NF-κB",
"in",
"both",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC11434983
|
The experiment was performed in triplicate.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"experiment",
"was",
"performed",
"in",
"triplicate",
"."
]
}
] |
PMC10914904
|
In this review, we summarized the biology of vtRNAs and focused on their interactions with the innate immune system.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"review",
",",
"we",
"summarized",
"the",
"biology",
"of",
"vtRNAs",
"and",
"focused",
"on",
"their",
"interactions",
"with",
"the",
"innate",
"immune",
"system",
"."
]
}
] |
PMC11283030
|
The above data suggested that the expression level of ACLY and p-ACLY might be predictive factors of ccRCC aggressiveness.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"above",
"data",
"suggested",
"that",
"the",
"expression",
"level",
"of",
"ACLY",
"and",
"p-ACLY",
"might",
"be",
"predictive",
"factors",
"of",
"ccRCC",
"aggressiveness",
"."
]
}
] |
PMC11766332
|
We computed the number of involved ASD-miRNAs identified for each glycosylation pathway and herein highlighted their molecular targets (glycogenes).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"computed",
"the",
"number",
"of",
"involved",
"ASD-miRNAs",
"identified",
"for",
"each",
"glycosylation",
"pathway",
"and",
"herein",
"highlighted",
"their",
"molecular",
"targets",
"(",
"glycogenes",
")",
"."
]
}
] |
PMC11650848
|
In this context, it is important to note that the DMR we show to be responsive to FA and haplotype in cord blood and blood from 11-year-olds also showed allele-specific methylation driven by haplotype in brain tissues in a previous study .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"this",
"context",
",",
"it",
"is",
"important",
"to",
"note",
"that",
"the",
"DMR",
"we",
"show",
"to",
"be",
"responsive",
"to",
"FA",
"and",
"haplotype",
"in",
"cord",
"blood",
"and",
"blood",
"from",
"11-year-olds",
"also",
"showed",
"allele-specific",
"methylation",
"driven",
"by",
"haplotype",
"in",
"brain",
"tissues",
"in",
"a",
"previous",
"study",
"."
]
}
] |
PMC11424574
|
These results indicate that uPA is involved in the MTA2-induced promotion of osteosarcoma metastasis.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"uPA",
"is",
"involved",
"in",
"the",
"MTA2-induced",
"promotion",
"of",
"osteosarcoma",
"metastasis",
"."
]
}
] |
PMC6642070
|
Cellular mRNA was extracted using the Dynabeads mRNA Direct Kit (Life Technologies) and cDNA was synthesized by the SuperScript III reverse transcriptase (Life Technologies) according to the manufacturer's instructions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Cellular",
"mRNA",
"was",
"extracted",
"using",
"the",
"Dynabeads",
"mRNA",
"Direct",
"Kit",
"(",
"Life",
"Technologies",
")",
"and",
"cDNA",
"was",
"synthesized",
"by",
"the",
"SuperScript",
"III",
"reverse",
"transcriptase",
"(",
"Life",
"Technologies",
")",
"according",
"to",
"the",
"manufacturer",
"'s",
"instructions",
"."
]
}
] |
PMC11777207
|
CD14 PBMCs were isolated using a magnetic cell sorting separation protocol using liquid chromatography columns, anti–phycoerythrin (PE) microbeads (Miltenyi Biotec), and PE-conjugated CD14 antibody (BioLegend, clone HCD14) according to the manufacturer’s instructions.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CD14",
"PBMCs",
"were",
"isolated",
"using",
"a",
"magnetic",
"cell",
"sorting",
"separation",
"protocol",
"using",
"liquid",
"chromatography",
"columns",
",",
"anti",
"–",
"phycoerythrin",
"(",
"PE",
")",
"microbeads",
"(",
"Miltenyi",
"Biotec",
")",
",",
"and",
"PE-conjugated",
"CD14",
"antibody",
"(",
"BioLegend",
",",
"clone",
"HCD14",
")",
"according",
"to",
"the",
"manufacturer",
"’s",
"instructions",
"."
]
}
] |
PMC11569208
|
Phosphoprotein phosphatases such as PP1 and PP2A have been shown to inactivate interferon response factors (IRF) to ultimately impede IFN responses in response to viral infection.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Phosphoprotein",
"phosphatases",
"such",
"as",
"PP1",
"and",
"PP2A",
"have",
"been",
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"to",
"inactivate",
"interferon",
"response",
"factors",
"(",
"IRF",
")",
"to",
"ultimately",
"impede",
"IFN",
"responses",
"in",
"response",
"to",
"viral",
"infection",
"."
]
}
] |
PMC7351993
|
In each arm, two sequential pulses out of eight pulses are picked up by an intensity modulator (IM) (NIR-MX-LN-10-P-P, Photline) and amplified by a bidirectional YDFA.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"each",
"arm",
",",
"two",
"sequential",
"pulses",
"out",
"of",
"eight",
"pulses",
"are",
"picked",
"up",
"by",
"an",
"intensity",
"modulator",
"(",
"IM",
")",
"(",
"NIR-MX-LN-10-P-P",
",",
"Photline",
")",
"and",
"amplified",
"by",
"a",
"bidirectional",
"YDFA",
"."
]
}
] |
PMC11422497
|
Gastrointestinal stromal tumors (GISTs) are a diverse group of tumors found throughout the gastrointestinal tract, varying in malignancy.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Gastrointestinal",
"stromal",
"tumors",
"(",
"GISTs",
")",
"are",
"a",
"diverse",
"group",
"of",
"tumors",
"found",
"throughout",
"the",
"gastrointestinal",
"tract",
",",
"varying",
"in",
"malignancy",
"."
]
}
] |
PMC11534377
|
The gap area was then measured using ImageJ software.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"gap",
"area",
"was",
"then",
"measured",
"using",
"ImageJ",
"software",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Aims: The aim of this study is to describe the epidemiological situation of adult Stem cell transplant patients in Mansoura, Egypt as basedon retrospective analysis of our electronic clinical records at hematology unit Oncology center mansoura university(OCMU) between November 2019 and February 2022 in our freshly established stem cell unit which started operating on November 2019.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Aims",
":",
"The",
"aim",
"of",
"this",
"study",
"is",
"to",
"describe",
"the",
"epidemiological",
"situation",
"of",
"adult",
"Stem",
"cell",
"transplant",
"patients",
"in",
"Mansoura",
",",
"Egypt",
"as",
"basedon",
"retrospective",
"analysis",
"of",
"our",
"electronic",
"clinical",
"records",
"at",
"hematology",
"unit",
"Oncology",
"center",
"mansoura",
"university(OCMU",
")",
"between",
"November",
"2019",
"and",
"February",
"2022",
"in",
"our",
"freshly",
"established",
"stem",
"cell",
"unit",
"which",
"started",
"operating",
"on",
"November",
"2019",
"."
]
}
] |
PMC11638255
|
Scale bar, 100 µm.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Scale",
"bar",
",",
"100",
"µm",
"."
]
}
] |
PMC11670407
|
e Lentivirus-transfected (shRNA-NC and shRNA-OTULIN) 143B cells were treated with CHX (100 μM) for 8 h and RSL3 (0.5 μM) for the indicated times.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"e",
"Lentivirus-transfected",
"(",
"shRNA-NC",
"and",
"shRNA-OTULIN",
")",
"143B",
"cells",
"were",
"treated",
"with",
"CHX",
"(",
"100",
"μM",
")",
"for",
"8",
"h",
"and",
"RSL3",
"(",
"0.5",
"μM",
")",
"for",
"the",
"indicated",
"times",
"."
]
}
] |
PMC11763764
|
Using antibodies against several known receptors of FGF1 and EGF1 in the western blot screening and co-immunoprecipitation (co-IP), we identified that the levels of EGFR and FGFR4 proteins were affected by SORL1.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Using",
"antibodies",
"against",
"several",
"known",
"receptors",
"of",
"FGF1",
"and",
"EGF1",
"in",
"the",
"western",
"blot",
"screening",
"and",
"co-immunoprecipitation",
"(",
"co-IP",
")",
",",
"we",
"identified",
"that",
"the",
"levels",
"of",
"EGFR",
"and",
"FGFR4",
"proteins",
"were",
"affected",
"by",
"SORL1",
"."
]
}
] |
PMC11757131
|
Anti-cyclin D1, anti-caspase 3, anti-P27, anti-CD36, and anti-ACC antibodies were purchased from Cell Signaling Technology (Beverly, MA).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Anti-cyclin",
"D1",
",",
"anti-caspase",
"3",
",",
"anti-P27",
",",
"anti-CD36",
",",
"and",
"anti-ACC",
"antibodies",
"were",
"purchased",
"from",
"Cell",
"Signaling",
"Technology",
"(",
"Beverly",
",",
"MA",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Results: All patients with chromothripsis showed a high genomic complexity (30/33 with CK by chromosome banding analysis and 3/33 classified as complex by CMA [range: 10-24 CNV, being at least three of them >5Mb (range: 3-6)].
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Results",
":",
"All",
"patients",
"with",
"chromothripsis",
"showed",
"a",
"high",
"genomic",
"complexity",
"(",
"30/33",
"with",
"CK",
"by",
"chromosome",
"banding",
"analysis",
"and",
"3/33",
"classified",
"as",
"complex",
"by",
"CMA",
"[",
"range",
":",
"10",
"-",
"24",
"CNV",
",",
"being",
"at",
"least",
"three",
"of",
"them",
">",
"5Mb",
"(",
"range",
":",
"3",
"-",
"6",
")",
"]",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Significantly reduced annualized bleeding rate[0(0,6) vs. 4(0,8),P<0.0001] and annualized joint bleeding rate[0(0,0.25) vs. 0(0,2),P<0.0001] was observed at study exit as well as the continuous trend of decreased bleeding rates.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Significantly",
"reduced",
"annualized",
"bleeding",
"rate[0(0,6",
")",
"vs.",
"4(0,8),P<0.0001",
"]",
"and",
"annualized",
"joint",
"bleeding",
"rate[0(0,0.25",
")",
"vs.",
"0(0,2),P<0.0001",
"]",
"was",
"observed",
"at",
"study",
"exit",
"as",
"well",
"as",
"the",
"continuous",
"trend",
"of",
"decreased",
"bleeding",
"rates",
"."
]
}
] |
PMC11635087
|
This process may be artificially recreated by producing listeriolysin O (LLO) from Listeria monocytogenes in chloroplasts to prevent digestion by phagosomes.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"process",
"may",
"be",
"artificially",
"recreated",
"by",
"producing",
"listeriolysin",
"O",
"(",
"LLO",
")",
"from",
"Listeria",
"monocytogenes",
"in",
"chloroplasts",
"to",
"prevent",
"digestion",
"by",
"phagosomes",
"."
]
}
] |
PMC10745221
|
A 1.3 mg/mL solution of GST-GAR, prepared as described in Lowe et.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"A",
"1.3",
"mg/mL",
"solution",
"of",
"GST-GAR",
",",
"prepared",
"as",
"described",
"in",
"Lowe",
"et",
"."
]
}
] |
PMC7154001
|
Some metabolites were identified as active or toxic metabolites.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Some",
"metabolites",
"were",
"identified",
"as",
"active",
"or",
"toxic",
"metabolites",
"."
]
}
] |
PMC11727638
|
This is likely due to increased 3D cell–cell interactions .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"is",
"likely",
"due",
"to",
"increased",
"3D",
"cell",
"–",
"cell",
"interactions",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
MDS presumed cases were also associated with monocytic alterations (n=5, 50%) with a frequent decrease in neutrophil precursors (n=4, 40%).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"MDS",
"presumed",
"cases",
"were",
"also",
"associated",
"with",
"monocytic",
"alterations",
"(",
"n=5",
",",
"50",
"%",
")",
"with",
"a",
"frequent",
"decrease",
"in",
"neutrophil",
"precursors",
"(",
"n=4",
",",
"40",
"%",
")",
"."
]
}
] |
PMC11637276
|
All the raw data associated with this figure are available in S1 Data.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"All",
"the",
"raw",
"data",
"associated",
"with",
"this",
"figure",
"are",
"available",
"in",
"S1",
"Data",
"."
]
}
] |
PMC11564322
|
The c-SRC inhibitor I alone decreased the PPARγ mRNA expression by 85.14%, compared to the control.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"c-SRC",
"inhibitor",
"I",
"alone",
"decreased",
"the",
"PPARγ",
"mRNA",
"expression",
"by",
"85.14",
"%",
",",
"compared",
"to",
"the",
"control",
"."
]
}
] |
PMC4485648
|
We found decreased pHi (Fig. 5A) and increased pHe (Fig. 5B) in SFN-treated hypoxic cells compared to non-treated hypoxic controls, suggesting that SFN interferes with the capacity of the pH regulating machinery of the parental A2780 cells as well as of both A2780/ADR and A2780/CP chemoresistant cell lines to maintain the proper acid-base balance in hypoxia.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"found",
"decreased",
"pHi",
"(",
"Fig.",
"5A",
")",
"and",
"increased",
"pHe",
"(",
"Fig.",
"5B",
")",
"in",
"SFN-treated",
"hypoxic",
"cells",
"compared",
"to",
"non-treated",
"hypoxic",
"controls",
",",
"suggesting",
"that",
"SFN",
"interferes",
"with",
"the",
"capacity",
"of",
"the",
"pH",
"regulating",
"machinery",
"of",
"the",
"parental",
"A2780",
"cells",
"as",
"well",
"as",
"of",
"both",
"A2780/ADR",
"and",
"A2780/CP",
"chemoresistant",
"cell",
"lines",
"to",
"maintain",
"the",
"proper",
"acid-base",
"balance",
"in",
"hypoxia",
"."
]
}
] |
PMC10882807
|
The clinical data of all patients were collected.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"clinical",
"data",
"of",
"all",
"patients",
"were",
"collected",
"."
]
}
] |
PMC11772449
|
is an online analysis tool that mainly analyzes transcriptome data and clinical data of 31 cancer types in the TCGA database.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"is",
"an",
"online",
"analysis",
"tool",
"that",
"mainly",
"analyzes",
"transcriptome",
"data",
"and",
"clinical",
"data",
"of",
"31",
"cancer",
"types",
"in",
"the",
"TCGA",
"database",
"."
]
}
] |
PMC10366908
|
Finally, the eluates were concentrated, and the elution buffer was replaced with PBS using Amicon Ultra (Merck KGaA, Darmstadt, Germany).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Finally",
",",
"the",
"eluates",
"were",
"concentrated",
",",
"and",
"the",
"elution",
"buffer",
"was",
"replaced",
"with",
"PBS",
"using",
"Amicon",
"Ultra",
"(",
"Merck",
"KGaA",
",",
"Darmstadt",
",",
"Germany",
")",
"."
]
}
] |
PMC11155445
|
It was found that the compound N,N-di-2,4-dimethoxybenzyl-N′-2-nitrobenzoylthiourea (88) showed good radical scavenging and antioxidant activity which is due to electron or hydrogen atoms donating ability of the title compounds toward free radicals (Fig. 29).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"It",
"was",
"found",
"that",
"the",
"compound",
"N",
",",
"N-di-2,4-dimethoxybenzyl-N′-2-nitrobenzoylthiourea",
"(",
"88",
")",
"showed",
"good",
"radical",
"scavenging",
"and",
"antioxidant",
"activity",
"which",
"is",
"due",
"to",
"electron",
"or",
"hydrogen",
"atoms",
"donating",
"ability",
"of",
"the",
"title",
"compounds",
"toward",
"free",
"radicals",
"(",
"Fig.",
"29",
")",
"."
]
}
] |
PMC11711663
|
This retrospective cohort study examines a group of HNSCC patients who took contrast-enhanced CT scans before treatment between 2003 and 2022.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"retrospective",
"cohort",
"study",
"examines",
"a",
"group",
"of",
"HNSCC",
"patients",
"who",
"took",
"contrast-enhanced",
"CT",
"scans",
"before",
"treatment",
"between",
"2003",
"and",
"2022",
"."
]
}
] |
PMC11507371
|
Such inclusion would allow a more profound understanding of the intricate mechanisms underlying CAP’s selectivity towards malignant cells.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Such",
"inclusion",
"would",
"allow",
"a",
"more",
"profound",
"understanding",
"of",
"the",
"intricate",
"mechanisms",
"underlying",
"CAP",
"’s",
"selectivity",
"towards",
"malignant",
"cells",
"."
]
}
] |
PMC9739791
|
Poly(phenylene ethynylene) (PPE) was chosen as a light-absorbing scaffold due to its high molar absorptivity and good photostability .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Poly(phenylene",
"ethynylene",
")",
"(",
"PPE",
")",
"was",
"chosen",
"as",
"a",
"light-absorbing",
"scaffold",
"due",
"to",
"its",
"high",
"molar",
"absorptivity",
"and",
"good",
"photostability",
"."
]
}
] |
PMC9096373
|
Henrietta Lacks (HeLa) cells, a cervical cancer cell line, were obtained from the Oncology Department of Affiliated Hospital of Southwest Medical University.
|
[
{
"tags": [
"B-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Henrietta",
"Lacks",
"(",
"HeLa",
")",
"cells",
",",
"a",
"cervical",
"cancer",
"cell",
"line",
",",
"were",
"obtained",
"from",
"the",
"Oncology",
"Department",
"of",
"Affiliated",
"Hospital",
"of",
"Southwest",
"Medical",
"University",
"."
]
}
] |
PMC11621493
|
The following plasmids were used for the transfection of COS7 cells: pcDNA4/HisMaxC (empty vector control); pcDNA4/HisMaxC-mPla2g4d; pcDNA3.1(+)/myc-HisB-hPLA2G4D; and pcDNA4/HisMaxC-mPla2g4d-S370A.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"following",
"plasmids",
"were",
"used",
"for",
"the",
"transfection",
"of",
"COS7",
"cells",
":",
"pcDNA4/HisMaxC",
"(",
"empty",
"vector",
"control",
")",
";",
"pcDNA4/HisMaxC-mPla2g4d",
";",
"pcDNA3.1(+)/myc-HisB-hPLA2G4D",
";",
"and",
"pcDNA4/HisMaxC-mPla2g4d-S370A",
"."
]
}
] |
PMC11638255
|
b Sankey diagram of Th-MYCN tumor cores depicting distribution of CD45-infiltrated low/high regions of interest, plotted against treatment group and duration.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"b",
"Sankey",
"diagram",
"of",
"Th-MYCN",
"tumor",
"cores",
"depicting",
"distribution",
"of",
"CD45-infiltrated",
"low/high",
"regions",
"of",
"interest",
",",
"plotted",
"against",
"treatment",
"group",
"and",
"duration",
"."
]
}
] |
PMC11706491
|
For example, the cdc2-M17 allele allows precise inactivation of CDK at the G1/S or G2/M transitions by adding bulky ATP analogs that inhibit kinase activity.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"For",
"example",
",",
"the",
"cdc2-M17",
"allele",
"allows",
"precise",
"inactivation",
"of",
"CDK",
"at",
"the",
"G1/S",
"or",
"G2/M",
"transitions",
"by",
"adding",
"bulky",
"ATP",
"analogs",
"that",
"inhibit",
"kinase",
"activity",
"."
]
}
] |
PMC6835762
|
Interest in the use of enzymes in polymer synthesis as a greener alternative to traditional chemical polymerization has been growing for a number of years .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Interest",
"in",
"the",
"use",
"of",
"enzymes",
"in",
"polymer",
"synthesis",
"as",
"a",
"greener",
"alternative",
"to",
"traditional",
"chemical",
"polymerization",
"has",
"been",
"growing",
"for",
"a",
"number",
"of",
"years",
"."
]
}
] |
PMC11012313
|
Additionally, while we have addressed the ability of LMP2A to function in the context of the entire virus (Figure 6), since LMP1 and LMP2A activate similar pathways (PI3K, NF-kB, STAT3) and have been shown to cooperate in promoting B cell lymphoma development , future studies should analyze if LMP1 and LMP2A enhance HIF-1α and ATP generation in an additive or synergistic manner.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Additionally",
",",
"while",
"we",
"have",
"addressed",
"the",
"ability",
"of",
"LMP2A",
"to",
"function",
"in",
"the",
"context",
"of",
"the",
"entire",
"virus",
"(",
"Figure",
"6",
")",
",",
"since",
"LMP1",
"and",
"LMP2A",
"activate",
"similar",
"pathways",
"(",
"PI3",
"K",
",",
"NF-kB",
",",
"STAT3",
")",
"and",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"cooperate",
"in",
"promoting",
"B",
"cell",
"lymphoma",
"development",
",",
"future",
"studies",
"should",
"analyze",
"if",
"LMP1",
"and",
"LMP2A",
"enhance",
"HIF-1α",
"and",
"ATP",
"generation",
"in",
"an",
"additive",
"or",
"synergistic",
"manner",
"."
]
}
] |
PMC10452486
|
Clustering and oligomerization of Face-2 is prevented by exogenous B2m, suggesting that B2m can downregulate the dimerization of Face-2.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Clustering",
"and",
"oligomerization",
"of",
"Face-2",
"is",
"prevented",
"by",
"exogenous",
"B2",
"m",
",",
"suggesting",
"that",
"B2",
"m",
"can",
"downregulate",
"the",
"dimerization",
"of",
"Face-2",
"."
]
}
] |
PMC11568601
|
Previous studies have shown that 4-PBA inhibits ER stress in osteosarcoma, while TUDCA has not been reported to date .
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Previous",
"studies",
"have",
"shown",
"that",
"4-PBA",
"inhibits",
"ER",
"stress",
"in",
"osteosarcoma",
",",
"while",
"TUDCA",
"has",
"not",
"been",
"reported",
"to",
"date",
"."
]
}
] |
PMC11779876
|
TCR libraries were quality checked on an Agilent Bioanalyzer and sequenced on an Illumina NovaSeq 6000 system (S4 flow cell) with 150 base pairs and paired-end configurations.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"TCR",
"libraries",
"were",
"quality",
"checked",
"on",
"an",
"Agilent",
"Bioanalyzer",
"and",
"sequenced",
"on",
"an",
"Illumina",
"NovaSeq",
"6000",
"system",
"(",
"S4",
"flow",
"cell",
")",
"with",
"150",
"base",
"pairs",
"and",
"paired-end",
"configurations",
"."
]
}
] |
PMC10778532
|
The three cell lines were maintained in cultures as described previously .
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"three",
"cell",
"lines",
"were",
"maintained",
"in",
"cultures",
"as",
"described",
"previously",
"."
]
}
] |
PMC11769522
|
As significantly increased concentrations were observed for IL-6 in response to treatment with the mixture of IFN-γ/TNF-α, for CXCL8 in response to treatment with TNF-α and IFN-γ/TNF-α, and for CCL2 in response to treatment with IFN-γ, TNF-α, and IFN-γ/TNF-α, dose-dependent effects on these cytokine stimulators were also investigated.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"significantly",
"increased",
"concentrations",
"were",
"observed",
"for",
"IL-6",
"in",
"response",
"to",
"treatment",
"with",
"the",
"mixture",
"of",
"IFN-γ/TNF-α",
",",
"for",
"CXCL8",
"in",
"response",
"to",
"treatment",
"with",
"TNF-α",
"and",
"IFN-γ/TNF-α",
",",
"and",
"for",
"CCL2",
"in",
"response",
"to",
"treatment",
"with",
"IFN-γ",
",",
"TNF-α",
",",
"and",
"IFN-γ/TNF-α",
",",
"dose-dependent",
"effects",
"on",
"these",
"cytokine",
"stimulators",
"were",
"also",
"investigated",
"."
]
}
] |
PMC10142392
|
In 2013, Y. Hyeok and et al. synthesized a series of novel amphiphilic copolymers, including hydrophilic PEG blocks and hydrophobic PCL blocks.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"2013",
",",
"Y.",
"Hyeok",
"and",
"et",
"al.",
"synthesized",
"a",
"series",
"of",
"novel",
"amphiphilic",
"copolymers",
",",
"including",
"hydrophilic",
"PEG",
"blocks",
"and",
"hydrophobic",
"PCL",
"blocks",
"."
]
}
] |
PMC9926039
|
P < 0.05 compared with the control Docking simulations are suitable tools in medicinal chemistry for exploring most possible ligand-target interactions with currently known three-dimensional structures.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"P",
"<",
"0.05",
"compared",
"with",
"the",
"control",
"Docking",
"simulations",
"are",
"suitable",
"tools",
"in",
"medicinal",
"chemistry",
"for",
"exploring",
"most",
"possible",
"ligand-target",
"interactions",
"with",
"currently",
"known",
"three-dimensional",
"structures",
"."
]
}
] |
PMC11470999
|
We first screened for proteins that might interact with CIP2A using the BioGRID database (https://thebiogrid.org/).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"first",
"screened",
"for",
"proteins",
"that",
"might",
"interact",
"with",
"CIP2A",
"using",
"the",
"BioGRID",
"database",
"(",
"https://thebiogrid.org/",
")",
"."
]
}
] |
PMC10547921
|
Radioisotope-labeled PDCs can also be used for treatment.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Radioisotope-labeled",
"PDCs",
"can",
"also",
"be",
"used",
"for",
"treatment",
"."
]
}
] |
PMC10723784
|
The cell cycle analysis of A2780 cells treated with CBG at 50 μM demonstrated the possible growth arrest at S phase, while in A2780/CP70 cells increased doses of CBG induced growth arrest in the S phase and G2/M phase.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"cell",
"cycle",
"analysis",
"of",
"A2780",
"cells",
"treated",
"with",
"CBG",
"at",
"50",
"μM",
"demonstrated",
"the",
"possible",
"growth",
"arrest",
"at",
"S",
"phase",
",",
"while",
"in",
"A2780/CP70",
"cells",
"increased",
"doses",
"of",
"CBG",
"induced",
"growth",
"arrest",
"in",
"the",
"S",
"phase",
"and",
"G2/M",
"phase",
"."
]
}
] |
PMC11317131
|
During twin PE, although each inserted 3′ single strand flap contains only part of the att site, there is enough overlapping sequence to form a double-stranded intermediate.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"During",
"twin",
"PE",
",",
"although",
"each",
"inserted",
"3′",
"single",
"strand",
"flap",
"contains",
"only",
"part",
"of",
"the",
"att",
"site",
",",
"there",
"is",
"enough",
"overlapping",
"sequence",
"to",
"form",
"a",
"double-stranded",
"intermediate",
"."
]
}
] |
PMC8345486
|
The IC50 values of compounds 15–23 ranged from 27 ± 3.6 μM (compound 23) to 66 ± 7.9 μM for sensitive A2780 cells (compound 19), and they were significantly higher than that of cisplatin IC50 (2.8 ± 0.21 μM, p < 0.00001), but comparable to carboplatin IC50 (51 ± 4.4 μM) (post-hoc Bonferroni comparisons).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"The",
"IC50",
"values",
"of",
"compounds",
"15–23",
"ranged",
"from",
"27",
"±",
"3.6",
"μM",
"(",
"compound",
"23",
")",
"to",
"66",
"±",
"7.9",
"μM",
"for",
"sensitive",
"A2780",
"cells",
"(",
"compound",
"19",
")",
",",
"and",
"they",
"were",
"significantly",
"higher",
"than",
"that",
"of",
"cisplatin",
"IC50",
"(",
"2.8",
"±",
"0.21",
"μM",
",",
"p",
"<",
"0.00001",
")",
",",
"but",
"comparable",
"to",
"carboplatin",
"IC50",
"(",
"51",
"±",
"4.4",
"μM",
")",
"(",
"post-hoc",
"Bonferroni",
"comparisons",
")",
"."
]
}
] |
PMC8973085
|
IR (KBr, v, cm): 3450–3263 (NH2), 3148 (NH), 2228 (CN), 1647 (C=O); H NMR (DMSO-d6): δ 2.66 (s, 3H, CH3), 3.68 (s, 3H, OCH3), 3.69 (s, 3H, OCH3), 6.88–7.48 (m, 9H, 7CH-Ar + NH2), 10.54 (bs, 1H, NH); C NMR (DMSO-d6) δ: 23.01, 55.46, 56.04, 105.30, 112.96, 114.57, 115.19, 115.64, 116.28, 116.53, 117.50, 121.18, 121.37, 123.50, 126.36, 130.32, 149.03, 150.71, 152.21, 156.85, 158.66, 161.82, 163.18, 177.57 MS m/z (%): 462 [M] (12), 423 (15), 352 (50), 118 (100).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"IR",
"(",
"KBr",
",",
"v",
",",
"cm",
"):",
"3450–3263",
"(",
"NH2",
")",
",",
"3148",
"(",
"NH",
")",
",",
"2228",
"(",
"CN",
")",
",",
"1647",
"(",
"C",
"=",
"O",
")",
";",
"H",
"NMR",
"(",
"DMSO-d6",
"):",
"δ",
"2.66",
"(",
"s",
",",
"3H",
",",
"CH3",
")",
",",
"3.68",
"(",
"s",
",",
"3H",
",",
"OCH3",
")",
",",
"3.69",
"(",
"s",
",",
"3H",
",",
"OCH3",
")",
",",
"6.88–7.48",
"(",
"m",
",",
"9H",
",",
"7CH-Ar",
"+",
"NH2",
")",
",",
"10.54",
"(",
"bs",
",",
"1H",
",",
"NH",
")",
";",
"C",
"NMR",
"(",
"DMSO-d6",
")",
"δ",
":",
"23.01",
",",
"55.46",
",",
"56.04",
",",
"105.30",
",",
"112.96",
",",
"114.57",
",",
"115.19",
",",
"115.64",
",",
"116.28",
",",
"116.53",
",",
"117.50",
",",
"121.18",
",",
"121.37",
",",
"123.50",
",",
"126.36",
",",
"130.32",
",",
"149.03",
",",
"150.71",
",",
"152.21",
",",
"156.85",
",",
"158.66",
",",
"161.82",
",",
"163.18",
",",
"177.57",
"MS",
"m/z",
"(",
"%",
"):",
"462",
"[",
"M",
"]",
"(",
"12",
")",
",",
"423",
"(",
"15",
")",
",",
"352",
"(",
"50",
")",
",",
"118",
"(",
"100",
")",
"."
]
}
] |
PMC10854447
|
Compounds 7a–o have no cytotoxic impact and are greater than 87% cell viability, as shown in Table 1.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Compounds",
"7a",
"–",
"o",
"have",
"no",
"cytotoxic",
"impact",
"and",
"are",
"greater",
"than",
"87",
"%",
"cell",
"viability",
",",
"as",
"shown",
"in",
"Table",
"1",
"."
]
}
] |
PMC10944868
|
Widely distributed, α-β tubulin heterodimers bind GTP, and β tubulin hydrolyzes GTP during microtubule polymerization.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Widely",
"distributed",
",",
"α-β",
"tubulin",
"heterodimers",
"bind",
"GTP",
",",
"and",
"β",
"tubulin",
"hydrolyzes",
"GTP",
"during",
"microtubule",
"polymerization",
"."
]
}
] |
PMC4839679
|
HEK293T cells were transfected with lentiviral constructs along with lentiviral packaging vectors pMD2.G and psPAX2.
|
[
{
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"B-CellLine",
"I-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"HEK293",
"T",
"cells",
"were",
"transfected",
"with",
"lentiviral",
"constructs",
"along",
"with",
"lentiviral",
"packaging",
"vectors",
"pMD2.G",
"and",
"psPAX2",
"."
]
}
] |
PMC11463018
|
C20H17N5O2, [M + H] m/z: 360.14550, found: 360.14505.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"C20H17N5O2",
",",
"[",
"M",
"+",
"H",
"]",
"m/z",
":",
"360.14550",
",",
"found",
":",
"360.14505",
"."
]
}
] |
PMC11300639
|
Specifically, we demonstrated that knockdown of RNF26 significantly decreased cell migration, proliferation and stemness in 786-O and A498 cells (Fig. 3c–g, Supplementary Fig. 2a).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Specifically",
",",
"we",
"demonstrated",
"that",
"knockdown",
"of",
"RNF26",
"significantly",
"decreased",
"cell",
"migration",
",",
"proliferation",
"and",
"stemness",
"in",
"786-O",
"and",
"A498",
"cells",
"(",
"Fig.",
"3c",
"–",
"g",
",",
"Supplementary",
"Fig.",
"2a",
")",
"."
]
}
] |
PMC10667689
|
After workup, 50 µL of HPLC-grade chloroform (Neutron Pharmacochemical Co, Iran) was added to each dried sample, and 1 µl was injected into the GC mass system (Agilent US94324233, USA) on a capillary column (HP-5; 30 m × 0.25 mm, 0.25 μm) in a splitless mode with the column temperature program: 100°C (H = 2) @ R 12°C to 210°C (H = 0) @ R 3°C to 250°C (H = 5) with a mass ionization voltage of 30 eV. The MSD ChemStation was used as the operating software.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"After",
"workup",
",",
"50",
"µL",
"of",
"HPLC-grade",
"chloroform",
"(",
"Neutron",
"Pharmacochemical",
"Co",
",",
"Iran",
")",
"was",
"added",
"to",
"each",
"dried",
"sample",
",",
"and",
"1",
"µl",
"was",
"injected",
"into",
"the",
"GC",
"mass",
"system",
"(",
"Agilent",
"US94324233",
",",
"USA",
")",
"on",
"a",
"capillary",
"column",
"(",
"HP-5",
";",
"30",
"m",
"×",
"0.25",
"mm",
",",
"0.25",
"μm",
")",
"in",
"a",
"splitless",
"mode",
"with",
"the",
"column",
"temperature",
"program",
":",
"100",
"°",
"C",
"(",
"H",
"=",
"2",
")",
"@",
"R",
"12",
"°",
"C",
"to",
"210",
"°",
"C",
"(",
"H",
"=",
"0",
")",
"@",
"R",
"3",
"°",
"C",
"to",
"250",
"°",
"C",
"(",
"H",
"=",
"5",
")",
"with",
"a",
"mass",
"ionization",
"voltage",
"of",
"30",
"eV.",
"The",
"MSD",
"ChemStation",
"was",
"used",
"as",
"the",
"operating",
"software",
"."
]
}
] |
PMC11721587
|
Then, 3 μl of nucleotide triphosphate mixture was added to the mixture and incubated at 30°C for 50 min.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Then",
",",
"3",
"μl",
"of",
"nucleotide",
"triphosphate",
"mixture",
"was",
"added",
"to",
"the",
"mixture",
"and",
"incubated",
"at",
"30",
"°",
"C",
"for",
"50",
"min",
"."
]
}
] |
PMC10170482
|
We determined the protein concentration using the Micro BCA Protein Assay Kit (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA).
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"determined",
"the",
"protein",
"concentration",
"using",
"the",
"Micro",
"BCA",
"Protein",
"Assay",
"Kit",
"(",
"Thermo",
"Fisher",
"Scientific",
",",
"Waltham",
",",
"MA",
",",
"USA",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Methods: De-identified patient-level electronic medical record data linked to claims data in the US from ConcertAI were utilized for this study.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Methods",
":",
"De-identified",
"patient-level",
"electronic",
"medical",
"record",
"data",
"linked",
"to",
"claims",
"data",
"in",
"the",
"US",
"from",
"ConcertAI",
"were",
"utilized",
"for",
"this",
"study",
"."
]
}
] |
PMC8735881
|
The cell proteins were separated by SDS-PAGE and transferred to a nitrocellulose membrane, which was then blocked with a 5% nonfat dry milk solution in TBS-Tween 20 at room temperature for 1 h. The membrane was incubated overnight at 4°C with a rabbit anti-gp120 polyclonal antibody (SinoBiological, Beijing, China), the human anti-gp41 monoclonal antibody 10E8, or a mouse anti-β actin antibody (Sigma).
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"were",
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"then",
"blocked",
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"a",
"5",
"%",
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"milk",
"solution",
"in",
"TBS-Tween",
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"at",
"room",
"temperature",
"for",
"1",
"h.",
"The",
"membrane",
"was",
"incubated",
"overnight",
"at",
"4",
"°",
"C",
"with",
"a",
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"anti-gp120",
"polyclonal",
"antibody",
"(",
"SinoBiological",
",",
"Beijing",
",",
"China",
")",
",",
"the",
"human",
"anti-gp41",
"monoclonal",
"antibody",
"10E8",
",",
"or",
"a",
"mouse",
"anti-β",
"actin",
"antibody",
"(",
"Sigma",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973
|
Best molecular response on previous TKIs (≤1% vs 1-10% vs ≥10%) was found to be independently significant factor due to multivariate analysis (p=0,0072, hazard ratio 7,6 (1,7-33)) Twenty two (44%) patients experienced adverse events (AEs) of any grade and 8 (16%) had AEs of grade 3-4 (Table 2), reported during treatment, regardless of the connection with the drug.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Best",
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"-",
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"%",
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"≥10",
"%",
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"to",
"be",
"independently",
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"factor",
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"to",
"multivariate",
"analysis",
"(",
"p=0,0072",
",",
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"7,6",
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"-",
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")",
")",
"Twenty",
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"%",
")",
"patients",
"experienced",
"adverse",
"events",
"(",
"AEs",
")",
"of",
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")",
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"AEs",
"of",
"grade",
"3",
"-",
"4",
"(",
"Table",
"2",
")",
",",
"reported",
"during",
"treatment",
",",
"regardless",
"of",
"the",
"connection",
"with",
"the",
"drug",
"."
]
}
] |
PMC10522430
|
Postharvest, cell enumeration, and subsequent dilution with complete culture medium occurred.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Postharvest",
",",
"cell",
"enumeration",
",",
"and",
"subsequent",
"dilution",
"with",
"complete",
"culture",
"medium",
"occurred",
"."
]
}
] |
PMC5415764
|
Over the course of two weeks, the size of the P+T/LPN exhibited greater variation than the conjugated P+T/LPN* in both PBS and 10% FBS buffer (Fig. 2B), which suggested that weaker interactions between drugs due to polymer-drug conjugation could improve particle stability.
|
[
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Over",
"the",
"course",
"of",
"two",
"weeks",
",",
"the",
"size",
"of",
"the",
"P+T/LPN",
"exhibited",
"greater",
"variation",
"than",
"the",
"conjugated",
"P+T/LPN",
"*",
"in",
"both",
"PBS",
"and",
"10",
"%",
"FBS",
"buffer",
"(",
"Fig.",
"2B",
")",
",",
"which",
"suggested",
"that",
"weaker",
"interactions",
"between",
"drugs",
"due",
"to",
"polymer-drug",
"conjugation",
"could",
"improve",
"particle",
"stability",
"."
]
}
] |
PMC11612626
|
Lysates from RPMI-8226 cells were incubated with the indicated proteasome substrates at concentrations of 15 μmol/L for up to 3 hours, and fluorescent intensity monitored was a direct measure of the activity of proteasomal subunit–specific catalytic activity.
|
[
{
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"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Lysates",
"from",
"RPMI-8226",
"cells",
"were",
"incubated",
"with",
"the",
"indicated",
"proteasome",
"substrates",
"at",
"concentrations",
"of",
"15",
"μmol/L",
"for",
"up",
"to",
"3",
"hours",
",",
"and",
"fluorescent",
"intensity",
"monitored",
"was",
"a",
"direct",
"measure",
"of",
"the",
"activity",
"of",
"proteasomal",
"subunit",
"–",
"specific",
"catalytic",
"activity",
"."
]
}
] |
PMC11291490
|
CD40L, classified as a type II transmembrane glycoprotein, belongs to the ligand member of the tumor necrosis factor (TNF) superfamily and plays a pivotal role in the development and regulation of adaptive immunity.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"CD40L",
",",
"classified",
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"a",
"type",
"II",
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"glycoprotein",
",",
"belongs",
"to",
"the",
"ligand",
"member",
"of",
"the",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"(",
"TNF",
")",
"superfamily",
"and",
"plays",
"a",
"pivotal",
"role",
"in",
"the",
"development",
"and",
"regulation",
"of",
"adaptive",
"immunity",
"."
]
}
] |
PMC11638288
|
During the onset of CD4 Th17-mediated neuroinflammation, T-bet-dependent NKp46 ILCs induce the expression of MMPs and chemokines, disrupting the blood–brain barrier and guiding 2D2 CD4 T cells from the meninges into the central nervous system parenchyma.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"During",
"the",
"onset",
"of",
"CD4",
"Th17-mediated",
"neuroinflammation",
",",
"T-bet-dependent",
"NKp46",
"ILCs",
"induce",
"the",
"expression",
"of",
"MMPs",
"and",
"chemokines",
",",
"disrupting",
"the",
"blood",
"–",
"brain",
"barrier",
"and",
"guiding",
"2D2",
"CD4",
"T",
"cells",
"from",
"the",
"meninges",
"into",
"the",
"central",
"nervous",
"system",
"parenchyma",
"."
]
}
] |
PMC11666785
|
To overcome these limitations, we propose a technique (corrSMLM) that recognizes and detects fortunate molecules (molecules with long blinking cycles) from the recorded data.
|
[
{
"tags": [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"To",
"overcome",
"these",
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PMC11694346
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Cytotoxicity assay indicated low toxicity of BT-DNBS at relevant concentrations, supporting its suitability for live-cell applications.
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PMC10606998
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The proton energy release peaks at the end of the proton track before the full deceleration.
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PMC11774747
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In the NCT00840853 reported by Cruz et al., efficacy of donor-derived CD19.CAR-VST in the treatment of B-cell malignancies that have relapsed post-allo-SCT (68).
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PMC11656657
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Tumor growth was evaluated by In vivo imaging system (IVIS) for five different orthotopically models (200′000 cell/mice) of five OS cell lines (143B, U-2OS, SAOS-2, MG-63, HOS) and one ERMS cell line (RD).
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PMC9429973
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The ORR at 6months were 71.2% and 57.1% respectively.
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Subsets and Splits
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