Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11422150
We focused on the flow cytometry of immune cells in the bone marrow.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "focused", "on", "the", "flow", "cytometry", "of", "immune", "cells", "in", "the", "bone", "marrow", "." ] } ]
PMC11743414
Therefore, there is an urgent need to identify reliable prognostic biomarkers to improve the clinical treatment and management of AML.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "there", "is", "an", "urgent", "need", "to", "identify", "reliable", "prognostic", "biomarkers", "to", "improve", "the", "clinical", "treatment", "and", "management", "of", "AML", "." ] } ]
PMC11767817
Thus, this work focused on necrotic and apoptotic cell death pathways.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "this", "work", "focused", "on", "necrotic", "and", "apoptotic", "cell", "death", "pathways", "." ] } ]
PMC11783017
Nanocomposite hydrogels possess a three-dimensional structure that can achieve various anti-tumor properties by incorporating multifunctional nanomaterials.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nanocomposite", "hydrogels", "possess", "a", "three-dimensional", "structure", "that", "can", "achieve", "various", "anti-tumor", "properties", "by", "incorporating", "multifunctional", "nanomaterials", "." ] } ]
PMC11739670
In particular, the roles of MHCI residues D227 and Q226 in forming the main contact interface between classical MHCI and CD8 were closely mimicked by MR1 residues E224 and Q223 (Figure 2D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "particular", ",", "the", "roles", "of", "MHCI", "residues", "D227", "and", "Q226", "in", "forming", "the", "main", "contact", "interface", "between", "classical", "MHCI", "and", "CD8", "were", "closely", "mimicked", "by", "MR1", "residues", "E224", "and", "Q223", "(", "Figure", "2D", ")", "." ] } ]
PMC10998613
Our findings highlight the need to apply similar studies to heteromeric structures to fully resolve the atomic-scale structure and dynamics of GPCRs in different heteromultimeric states and the functional consequences of heteromerization.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "findings", "highlight", "the", "need", "to", "apply", "similar", "studies", "to", "heteromeric", "structures", "to", "fully", "resolve", "the", "atomic-scale", "structure", "and", "dynamics", "of", "GPCRs", "in", "different", "heteromultimeric", "states", "and", "the", "functional", "consequences", "of", "heteromerization", "." ] } ]
PMC11015054
METTL5: Forward: 5'-AAGGAACTAGAGAGAGTCGCC TG-3'.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "METTL5", ":", "Forward", ":", "5'-AAGGAACTAGAGAGAGTCGCC", "TG-3", "'", "." ] } ]
PMC11655536
These results collectively suggest that HA behaved as a NHE1 inhibitor rather than a P2X7 antagonist in our study.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "collectively", "suggest", "that", "HA", "behaved", "as", "a", "NHE1", "inhibitor", "rather", "than", "a", "P2X7", "antagonist", "in", "our", "study", "." ] } ]
PMC8873393
B Quantification of clonogenic assay shown in Fig. 1A.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", "Quantification", "of", "clonogenic", "assay", "shown", "in", "Fig.", "1A", "." ] } ]
PMC9479186
P < 0.01.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P", "<", "0.01", "." ] } ]
PMC11471157
During hydrolysis, asparagine and glutamine are converted to aspartic acid and glutamic acid, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "hydrolysis", ",", "asparagine", "and", "glutamine", "are", "converted", "to", "aspartic", "acid", "and", "glutamic", "acid", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11055323
Scale bars, 5 μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bars", ",", "5", "μm", "." ] } ]
PMC11566417
Briefly, cells were cultured in their corresponding antibiotic-free culture medium for at least 2 subcultures at a concentration of 1 × 10 per T75 flask.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "cells", "were", "cultured", "in", "their", "corresponding", "antibiotic-free", "culture", "medium", "for", "at", "least", "2", "subcultures", "at", "a", "concentration", "of", "1", "×", "10", "per", "T75", "flask", "." ] } ]
PMC11116779
Selected concentrations of PS-NPs (10, 100, and 500 μg/mL) were added to A549 cells (500,000/well).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Selected", "concentrations", "of", "PS-NPs", "(", "10", ",", "100", ",", "and", "500", "μg/mL", ")", "were", "added", "to", "A549", "cells", "(", "500,000/well", ")", "." ] } ]
PMC11591030
As shown in Figure 4, under non-stress conditions, compared with the control group, 250 µg/mL AOP increased the gene expression of IKKβ in the PBLs, while 150 µg/mL AOP increased the gene expression of IkBα in the PBLs (p < 0.05).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "shown", "in", "Figure", "4", ",", "under", "non-stress", "conditions", ",", "compared", "with", "the", "control", "group", ",", "250", "µg/mL", "AOP", "increased", "the", "gene", "expression", "of", "IKKβ", "in", "the", "PBLs", ",", "while", "150", "µg/mL", "AOP", "increased", "the", "gene", "expression", "of", "IkBα", "in", "the", "PBLs", "(", "p", "<", "0.05", ")", "." ] } ]
PMC11301242
Left: co-amplification in chromosome 1 of THP-1 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Left", ":", "co-amplification", "in", "chromosome", "1", "of", "THP-1", "cells", "." ] } ]
PMC10734950
We sought to determine if F8 can inhibit phosphorylation in the MAPK, JAK, STAT, and ERK pathways since thiophenes have been previously shown to inhibit the phosphorylation of essential biological pathways Our results indicate that JAK 1 and JAK 2 were hypophosphorylated after F8 treatment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "sought", "to", "determine", "if", "F8", "can", "inhibit", "phosphorylation", "in", "the", "MAPK", ",", "JAK", ",", "STAT", ",", "and", "ERK", "pathways", "since", "thiophenes", "have", "been", "previously", "shown", "to", "inhibit", "the", "phosphorylation", "of", "essential", "biological", "pathways", "Our", "results", "indicate", "that", "JAK", "1", "and", "JAK", "2", "were", "hypophosphorylated", "after", "F8", "treatment", "." ] } ]
PMC7136814
Intracellular staining was performed on fixed and permeabilized RMS and RT cell suspensions with Transcription Factor Buffer Set (BD Biosciences, Jose, CA) prior to staining with fluorochrome-conjugated anti-human antibodies following manufacturer's protocol with minor modifications.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Intracellular", "staining", "was", "performed", "on", "fixed", "and", "permeabilized", "RMS", "and", "RT", "cell", "suspensions", "with", "Transcription", "Factor", "Buffer", "Set", "(", "BD", "Biosciences", ",", "Jose", ",", "CA", ")", "prior", "to", "staining", "with", "fluorochrome-conjugated", "anti-human", "antibodies", "following", "manufacturer", "'s", "protocol", "with", "minor", "modifications", "." ] } ]
PMC9388315
In addition to its use in cooking, it has been used as a gastrointestinal pain reliever in some diseases .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "its", "use", "in", "cooking", ",", "it", "has", "been", "used", "as", "a", "gastrointestinal", "pain", "reliever", "in", "some", "diseases", "." ] } ]
PMC11697189
The line connecting HSPs represents the interaction between them, and the thickness represents the correlation strength between HSPs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "line", "connecting", "HSPs", "represents", "the", "interaction", "between", "them", ",", "and", "the", "thickness", "represents", "the", "correlation", "strength", "between", "HSPs", "." ] } ]
PMC6364197
The effect of different concentrations of collagen type I on the cell seeding and cell proliferation was improved compared to UPS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "effect", "of", "different", "concentrations", "of", "collagen", "type", "I", "on", "the", "cell", "seeding", "and", "cell", "proliferation", "was", "improved", "compared", "to", "UPS", "." ] } ]
PMC8913139
Furthermore, overexpression of ROCK1 abolished the antitumor effect of miR-448 in GBM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "overexpression", "of", "ROCK1", "abolished", "the", "antitumor", "effect", "of", "miR-448", "in", "GBM", "." ] } ]
PMC11323699
The Pearson correlation coefficient (r) is indicated on each panel.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Pearson", "correlation", "coefficient", "(", "r", ")", "is", "indicated", "on", "each", "panel", "." ] } ]
PMC11650848
B Methylation response of the DMR/promoter region to various demethylation techniques in different cell lines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", "Methylation", "response", "of", "the", "DMR/promoter", "region", "to", "various", "demethylation", "techniques", "in", "different", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC9444294
A Tissue microarrays: 36 out of 37 synovial sarcoma samples showed positive nuclear staining for SS18-SSX.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "Tissue", "microarrays", ":", "36", "out", "of", "37", "synovial", "sarcoma", "samples", "showed", "positive", "nuclear", "staining", "for", "SS18-SSX", "." ] } ]
PMC9813422
The proximity of DNA fragments can be detected by PCR with a set of primers in 3C or by the NGS technology in Hi-C (Fig. 2) (46, 47).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "proximity", "of", "DNA", "fragments", "can", "be", "detected", "by", "PCR", "with", "a", "set", "of", "primers", "in", "3C", "or", "by", "the", "NGS", "technology", "in", "Hi-C", "(", "Fig.", "2", ")", "(", "46", ",", "47", ")", "." ] } ]
PMC11802855
To eliminate nonspecific binding, the beads underwent three washes with IP buffer and one wash with distilled water.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "eliminate", "nonspecific", "binding", ",", "the", "beads", "underwent", "three", "washes", "with", "IP", "buffer", "and", "one", "wash", "with", "distilled", "water", "." ] } ]
PMC11790971
Additionally, cell line B has distinct clusters that show clear separation from other cell lines in those passages.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "cell", "line", "B", "has", "distinct", "clusters", "that", "show", "clear", "separation", "from", "other", "cell", "lines", "in", "those", "passages", "." ] } ]
PMC11126803
The lentiviral supernatants were then filtered with 0.45 μm filters and used to infect RCC cells for 48 h. We placed Matrigel Matrix (BD Biosciences) at 4 °C overnight in advance, and evenly added 50 μl to each well of a 96-well plate for incubation at 37 °C for 2 h. Subsequently, 100 μl of cells were resuspended in serum-free DMEM and loaded onto the surface of Matrigel at 3 × 10 cells/well.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "lentiviral", "supernatants", "were", "then", "filtered", "with", "0.45", "μm", "filters", "and", "used", "to", "infect", "RCC", "cells", "for", "48", "h.", "We", "placed", "Matrigel", "Matrix", "(", "BD", "Biosciences", ")", "at", "4", "°", "C", "overnight", "in", "advance", ",", "and", "evenly", "added", "50", "μl", "to", "each", "well", "of", "a", "96-well", "plate", "for", "incubation", "at", "37", "°", "C", "for", "2", "h.", "Subsequently", ",", "100", "μl", "of", "cells", "were", "resuspended", "in", "serum-free", "DMEM", "and", "loaded", "onto", "the", "surface", "of", "Matrigel", "at", "3", "×", "10", "cells/well", "." ] } ]
PMC9429973
Future trials need to consider the high risk of CAR-T cell exhaustion upon cont.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Future", "trials", "need", "to", "consider", "the", "high", "risk", "of", "CAR-T", "cell", "exhaustion", "upon", "cont", "." ] } ]
PMC10728200
Ubiquitin primarily regulates target proteins through covalent binding with substrate lysines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ubiquitin", "primarily", "regulates", "target", "proteins", "through", "covalent", "binding", "with", "substrate", "lysines", "." ] } ]
PMC6600253
Consistently, our previous study also showed that PT effectively induced senescence in lung cancer cells at a concentration of 50 μM .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consistently", ",", "our", "previous", "study", "also", "showed", "that", "PT", "effectively", "induced", "senescence", "in", "lung", "cancer", "cells", "at", "a", "concentration", "of", "50", "μM", "." ] } ]
PMC11726183
The MTT [3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide] assay was used to determine the reduction in cancer cell viability induced by cytotoxic agents.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "MTT", "[", "3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium", "bromide", "]", "assay", "was", "used", "to", "determine", "the", "reduction", "in", "cancer", "cell", "viability", "induced", "by", "cytotoxic", "agents", "." ] } ]
PMC9872547
This finding has been demonstrated in previous studies for other cancer cells (6, 8, 31, 32) and may happen because nano-curcumin has higher cellular uptake and biostability than curcumin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "finding", "has", "been", "demonstrated", "in", "previous", "studies", "for", "other", "cancer", "cells", "(", "6", ",", "8", ",", "31", ",", "32", ")", "and", "may", "happen", "because", "nano-curcumin", "has", "higher", "cellular", "uptake", "and", "biostability", "than", "curcumin", "." ] } ]
PMC11541409
Reversible binding of imatinib to catalytic center permits leaky entry of ATP and activation of KIT.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Reversible", "binding", "of", "imatinib", "to", "catalytic", "center", "permits", "leaky", "entry", "of", "ATP", "and", "activation", "of", "KIT", "." ] } ]
PMC9429973
Patients will be randomized 1:1 to receive six 21-day (D) cycles of either R-CHOP + tafasitamab (12 mg/kg intravenously, D 1, 8, and 15) + LEN (25 mg orally, D1–10) or R-CHOP plus tafasitamab + LEN placebos.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "will", "be", "randomized", "1:1", "to", "receive", "six", "21-day", "(", "D", ")", "cycles", "of", "either", "R-CHOP", "+", "tafasitamab", "(", "12", "mg/kg", "intravenously", ",", "D", "1", ",", "8", ",", "and", "15", ")", "+", "LEN", "(", "25", "mg", "orally", ",", "D1–10", ")", "or", "R-CHOP", "plus", "tafasitamab", "+", "LEN", "placebos", "." ] } ]
PMC11597291
Pegylation increased the hydrodynamic size and ζ-potential of nCGO particles (Table 2).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pegylation", "increased", "the", "hydrodynamic", "size", "and", "ζ-potential", "of", "nCGO", "particles", "(", "Table", "2", ")", "." ] } ]
PMC11604015
Hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) is a potential therapy for relapsed/refractory (R/R) T cell-derived malignancies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hematopoietic", "stem", "cell", "transplantation", "(", "HSCT", ")", "is", "a", "potential", "therapy", "for", "relapsed/refractory", "(", "R/R", ")", "T", "cell-derived", "malignancies", "." ] } ]
PMC10123657
Activation of the interleukin-7 pathway leads to increased survival of leukemic cells ; it is likely that certain mouse proteins contributed to activate this pathway in human cells (Figure 3A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Activation", "of", "the", "interleukin-7", "pathway", "leads", "to", "increased", "survival", "of", "leukemic", "cells", ";", "it", "is", "likely", "that", "certain", "mouse", "proteins", "contributed", "to", "activate", "this", "pathway", "in", "human", "cells", "(", "Figure", "3A", ")", "." ] } ]
PMC11640247
These results suggest that the RAC3-R66W variant delays axonal elongation in cortical neurons but does not prevent it.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "suggest", "that", "the", "RAC3-R66W", "variant", "delays", "axonal", "elongation", "in", "cortical", "neurons", "but", "does", "not", "prevent", "it", "." ] } ]
PMC11194678
D and E) Representative WB images of HTT Q72 in U251 cells coexpressing mCherry-HTTexon1 Q72 and control GFP-vector, EGFP-STAU1 WT, or 5KE mutant. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", "and", "E", ")", "Representative", "WB", "images", "of", "HTT", "Q72", "in", "U251", "cells", "coexpressing", "mCherry-HTTexon1", "Q72", "and", "control", "GFP-vector", ",", "EGFP-STAU1", "WT", ",", "or", "5KE", "mutant", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
All 22 response-evaluable patients treated with ATRA and arsenic trioxide induction had a CR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "22", "response-evaluable", "patients", "treated", "with", "ATRA", "and", "arsenic", "trioxide", "induction", "had", "a", "CR", "." ] } ]
PMC11753435
In addition to these performance metrics, it is important to highlight the significant difference in inference runtime between the two approaches.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", "to", "these", "performance", "metrics", ",", "it", "is", "important", "to", "highlight", "the", "significant", "difference", "in", "inference", "runtime", "between", "the", "two", "approaches", "." ] } ]
PMC7802142
Entry into anagen phase was more induced in mice treated with ReN-NVs, as evidenced by positive immunofluorescence staining for β-catenin (Fig. 5e).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Entry", "into", "anagen", "phase", "was", "more", "induced", "in", "mice", "treated", "with", "ReN-NVs", ",", "as", "evidenced", "by", "positive", "immunofluorescence", "staining", "for", "β-catenin", "(", "Fig.", "5e", ")", "." ] } ]
PMC11046454
The effective synthesis of the AptPTK7-tethered, FITC-labeled TDN (termed as TDN-AptPTK7) was first verified (Figure S29), without compromising the binding specificity of AptPTK7 to PTK7 CEM cells (Figure S30).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "effective", "synthesis", "of", "the", "AptPTK7-tethered", ",", "FITC-labeled", "TDN", "(", "termed", "as", "TDN-AptPTK7", ")", "was", "first", "verified", "(", "Figure", "S29", ")", ",", "without", "compromising", "the", "binding", "specificity", "of", "AptPTK7", "to", "PTK7", "CEM", "cells", "(", "Figure", "S30", ")", "." ] } ]
PMC11766350
These would suppress transgene expression in the HEK293 cells but not form any part of the AAV produced.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "would", "suppress", "transgene", "expression", "in", "the", "HEK293", "cells", "but", "not", "form", "any", "part", "of", "the", "AAV", "produced", "." ] } ]
PMC11723947
Isolated PBMC were frozen in heat-inactivated FCS (Gibco FBS, ThermoFisher) containing 10% tissue culture-grade DMSO (Sigma).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Isolated", "PBMC", "were", "frozen", "in", "heat-inactivated", "FCS", "(", "Gibco", "FBS", ",", "ThermoFisher", ")", "containing", "10", "%", "tissue", "culture-grade", "DMSO", "(", "Sigma", ")", "." ] } ]
PMC11634794
In multivariate survival analysis, LAMP1 emerged as an independent prognostic marker for overall survival(OS)(P<0.05).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "multivariate", "survival", "analysis", ",", "LAMP1", "emerged", "as", "an", "independent", "prognostic", "marker", "for", "overall", "survival(OS)(P<0.05", ")", "." ] } ]
PMC9429973
T. Rückert, G. Andrieux, M. Boerries, N. M. Woessner, S. Minguet, S. Doetsch, K. Aumann, M Schiff, L. M. Braun, E. Haring, B. A. Siranosian, A. S. Bhatt, P. Nordkild, J. Wehkamp, B. A. H. Jensen, J. Duyster, R. Zeiser, N. Köhler Department of Medicine I; Institute of Medical Bioinformatics and Systems Medicine, Medical Center – University of Freiburg, Faculty of Medicine, University of Freiburg; German Cancer Consortium (DKTK) and German Cancer Research Center (DKFZ), Partner Site Freiburg; Faculty of Biology; Signalling Research Centres BIOSS and CIBSS; Spemann Graduate School of Biology and Medicine (SGBM), University of Freiburg; Institute for Immunodeficiency, Center for Chronic Immunodeficiency (CCI); Institute of Surgical Pathology, Medical Center – University of Freiburg, Faculty of Medicine, University of Freiburg, Freiburg, Germany; Department of Genetics; Department of Medicine (Hematology, Blood and Marrow Transplantation), Stanford University, Stanford, United States of America; Defensin Therapeutics, Copenhagen, Denmark; Department of Internal Medicine I, University Hospital Tübingen, Tübingen, Germany; Department of Biomedical Sciences, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark; CIBSS – Centre for Integrative Biological Signalling Studies, University of Freiburg, Freiburg, Germany Background: Allogeneic hematopoietic cell transplantation (allo-HCT) is a curative therapy option for patients with hematological malignancies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "T.", "Rückert", ",", "G.", "Andrieux", ",", "M.", "Boerries", ",", "N.", "M.", "Woessner", ",", "S.", "Minguet", ",", "S.", "Doetsch", ",", "K.", "Aumann", ",", "M", "Schiff", ",", "L.", "M.", "Braun", ",", "E.", "Haring", ",", "B.", "A.", "Siranosian", ",", "A.", "S.", "Bhatt", ",", "P.", "Nordkild", ",", "J.", "Wehkamp", ",", "B.", "A.", "H.", "Jensen", ",", "J.", "Duyster", ",", "R.", "Zeiser", ",", "N.", "Köhler", "Department", "of", "Medicine", "I", ";", "Institute", "of", "Medical", "Bioinformatics", "and", "Systems", "Medicine", ",", "Medical", "Center", "–", "University", "of", "Freiburg", ",", "Faculty", "of", "Medicine", ",", "University", "of", "Freiburg", ";", "German", "Cancer", "Consortium", "(", "DKTK", ")", "and", "German", "Cancer", "Research", "Center", "(", "DKFZ", ")", ",", "Partner", "Site", "Freiburg", ";", "Faculty", "of", "Biology", ";", "Signalling", "Research", "Centres", "BIOSS", "and", "CIBSS", ";", "Spemann", "Graduate", "School", "of", "Biology", "and", "Medicine", "(", "SGBM", ")", ",", "University", "of", "Freiburg", ";", "Institute", "for", "Immunodeficiency", ",", "Center", "for", "Chronic", "Immunodeficiency", "(", "CCI", ")", ";", "Institute", "of", "Surgical", "Pathology", ",", "Medical", "Center", "–", "University", "of", "Freiburg", ",", "Faculty", "of", "Medicine", ",", "University", "of", "Freiburg", ",", "Freiburg", ",", "Germany", ";", "Department", "of", "Genetics", ";", "Department", "of", "Medicine", "(", "Hematology", ",", "Blood", "and", "Marrow", "Transplantation", ")", ",", "Stanford", "University", ",", "Stanford", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Defensin", "Therapeutics", ",", "Copenhagen", ",", "Denmark", ";", "Department", "of", "Internal", "Medicine", "I", ",", "University", "Hospital", "Tübingen", ",", "Tübingen", ",", "Germany", ";", "Department", "of", "Biomedical", "Sciences", ",", "Faculty", "of", "Health", "and", "Medical", "Sciences", ",", "University", "of", "Copenhagen", ",", "Copenhagen", ",", "Denmark", ";", "CIBSS", "–", "Centre", "for", "Integrative", "Biological", "Signalling", "Studies", ",", "University", "of", "Freiburg", ",", "Freiburg", ",", "Germany", "Background", ":", "Allogeneic", "hematopoietic", "cell", "transplantation", "(", "allo-HCT", ")", "is", "a", "curative", "therapy", "option", "for", "patients", "with", "hematological", "malignancies", "." ] } ]
PMC10914904
Notably, this mechanism is distinct from the canonical micro (mi)RNA pathway, and it operates independently of Drosha.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Notably", ",", "this", "mechanism", "is", "distinct", "from", "the", "canonical", "micro", "(mi)RNA", "pathway", ",", "and", "it", "operates", "independently", "of", "Drosha", "." ] } ]
PMC11678368
However, the complexes did not fully dissolve.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "complexes", "did", "not", "fully", "dissolve", "." ] } ]
PMC8609870
At present, some researchers have obtained some results about recurrent abortion through transcriptome sequencing .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "present", ",", "some", "researchers", "have", "obtained", "some", "results", "about", "recurrent", "abortion", "through", "transcriptome", "sequencing", "." ] } ]
PMC11468365
Then, a network is designed to simultaneously predict the synergy and sensitivity score. “
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Then", ",", "a", "network", "is", "designed", "to", "simultaneously", "predict", "the", "synergy", "and", "sensitivity", "score", ".", "“" ] } ]
PMC9436459
Next, the visible-light-mediated regioselective Schenck ene reaction of S82 using Ru(bpy)3Cl2·6H2O and MeOH gave an excellent ratio for the tertiary alcohol S84, a better substrate for dehydration, which smoothly provided the diene S85 under SOCl2/DBU in 75% yield.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Next", ",", "the", "visible-light-mediated", "regioselective", "Schenck", "ene", "reaction", "of", "S82", "using", "Ru(bpy)3Cl2·6H2O", "and", "MeOH", "gave", "an", "excellent", "ratio", "for", "the", "tertiary", "alcohol", "S84", ",", "a", "better", "substrate", "for", "dehydration", ",", "which", "smoothly", "provided", "the", "diene", "S85", "under", "SOCl2/DBU", "in", "75", "%", "yield", "." ] } ]
PMC9429973
Then, we analyzed data from more than 7500 patients diagnosed with CML from research networks: EMEA and the US; covering more than 16 million subjects.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Then", ",", "we", "analyzed", "data", "from", "more", "than", "7500", "patients", "diagnosed", "with", "CML", "from", "research", "networks", ":", "EMEA", "and", "the", "US", ";", "covering", "more", "than", "16", "million", "subjects", "." ] } ]
PMC11470999
To further investigate PF's inhibitory activity on melanoma, we included six other melanoma cell lines (B16, A875, HT144, C32, WM115, A2058).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "investigate", "PF", "'s", "inhibitory", "activity", "on", "melanoma", ",", "we", "included", "six", "other", "melanoma", "cell", "lines", "(", "B16", ",", "A875", ",", "HT144", ",", "C32", ",", "WM115", ",", "A2058", ")", "." ] } ]
PMC11634794
Our results demonstrated that cells with LAMP1 overexpression exhibited slower or nearly negligible rates of proliferation compared to the control group, indicating an inhibitory effect of LAMP1 overexpression on cellular proliferation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "demonstrated", "that", "cells", "with", "LAMP1", "overexpression", "exhibited", "slower", "or", "nearly", "negligible", "rates", "of", "proliferation", "compared", "to", "the", "control", "group", ",", "indicating", "an", "inhibitory", "effect", "of", "LAMP1", "overexpression", "on", "cellular", "proliferation", "." ] } ]
PMC10218459
Chemotherapy is the gold standard of treatment for several cancers, and most of them are routinely treated with combination chemotherapy, which has shown better outcomes than monotherapy even in incurable cancers .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chemotherapy", "is", "the", "gold", "standard", "of", "treatment", "for", "several", "cancers", ",", "and", "most", "of", "them", "are", "routinely", "treated", "with", "combination", "chemotherapy", ",", "which", "has", "shown", "better", "outcomes", "than", "monotherapy", "even", "in", "incurable", "cancers", "." ] } ]
PMC10142392
Scientific research has further evolved towards designing new non-linear architectures of copolymers , including star , comb , brush , and hyperbranched structures such as dendrimers .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scientific", "research", "has", "further", "evolved", "towards", "designing", "new", "non-linear", "architectures", "of", "copolymers", ",", "including", "star", ",", "comb", ",", "brush", ",", "and", "hyperbranched", "structures", "such", "as", "dendrimers", "." ] } ]
PMC11726183
Yield = 93, light yellow solid, m. p.: 146–148 °C, IR (KBr) cm 3482, 3164, 2764, 2372, 1665, 1464, 1210, 783, 664, δH (600 MHz, DMSO-d6) 13.54 (1H, s), 8.41 (1H, s), 8.20 (1H, d, J = 8.3 Hz), 8.12–8.04 (1H, m), 7.95 (1H, s), 7.73–7.59 (4H, m), 7.45–7.36 (3H, m), 7.33 (2H, t, J = 7.5 Hz), 7.30–7.23 (1H, m), 7.17 (1H, s), 7.07 (1H, d, J = 7.9 Hz), 4.98 (2H, s); C NMR (151 MHz, DMSO) δ 161.46, 143.21, 136.06, 133.83, 132.17, 131.24, 130.35, 129.21, 129.18, 129.13, 129.07, 128.12, 127.94, 127.93, 127.91, 127.25, 126.88, 125.56, 125.39, 123.89, 119.76, 111.00, 43.02.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Yield", "=", "93", ",", "light", "yellow", "solid", ",", "m.", "p.", ":", "146–148", "°", "C", ",", "IR", "(", "KBr", ")", "cm", "3482", ",", "3164", ",", "2764", ",", "2372", ",", "1665", ",", "1464", ",", "1210", ",", "783", ",", "664", ",", "δH", "(", "600", "MHz", ",", "DMSO-d6", ")", "13.54", "(", "1H", ",", "s", ")", ",", "8.41", "(", "1H", ",", "s", ")", ",", "8.20", "(", "1H", ",", "d", ",", "J", "=", "8.3", "Hz", ")", ",", "8.12–8.04", "(", "1H", ",", "m", ")", ",", "7.95", "(", "1H", ",", "s", ")", ",", "7.73–7.59", "(", "4H", ",", "m", ")", ",", "7.45–7.36", "(", "3H", ",", "m", ")", ",", "7.33", "(", "2H", ",", "t", ",", "J", "=", "7.5", "Hz", ")", ",", "7.30–7.23", "(", "1H", ",", "m", ")", ",", "7.17", "(", "1H", ",", "s", ")", ",", "7.07", "(", "1H", ",", "d", ",", "J", "=", "7.9", "Hz", ")", ",", "4.98", "(", "2H", ",", "s", ")", ";", "C", "NMR", "(", "151", "MHz", ",", "DMSO", ")", "δ", "161.46", ",", "143.21", ",", "136.06", ",", "133.83", ",", "132.17", ",", "131.24", ",", "130.35", ",", "129.21", ",", "129.18", ",", "129.13", ",", "129.07", ",", "128.12", ",", "127.94", ",", "127.93", ",", "127.91", ",", "127.25", ",", "126.88", ",", "125.56", ",", "125.39", ",", "123.89", ",", "119.76", ",", "111.00", ",", "43.02", "." ] } ]
PMC10747139
The in vitro assays were carried out on cancerous cell lines, specifically B16 (mouse melanoma), HepG2 (human hepatocellular carcinoma), and A549 (human lung) cells, as well as normal LO2 (human normal embryonic liver) cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "in", "vitro", "assays", "were", "carried", "out", "on", "cancerous", "cell", "lines", ",", "specifically", "B16", "(", "mouse", "melanoma", ")", ",", "HepG2", "(", "human", "hepatocellular", "carcinoma", ")", ",", "and", "A549", "(", "human", "lung", ")", "cells", ",", "as", "well", "as", "normal", "LO2", "(", "human", "normal", "embryonic", "liver", ")", "cells", "." ] } ]
PMC11731161
Subsequently, we evaluated cytotoxic effects of SEL in these cells under different conditions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Subsequently", ",", "we", "evaluated", "cytotoxic", "effects", "of", "SEL", "in", "these", "cells", "under", "different", "conditions", "." ] } ]
PMC10362265
6Tetramer structure of hIL18 (pink) and IL18BP (blue) complex is shown, highlighting two symmetric ionic interactions between E103 and R113.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "6Tetramer", "structure", "of", "hIL18", "(", "pink", ")", "and", "IL18BP", "(", "blue", ")", "complex", "is", "shown", ",", "highlighting", "two", "symmetric", "ionic", "interactions", "between", "E103", "and", "R113", "." ] } ]
PMC9429973
L. Gore, M. Loh, C.-H. Pui, Y. Matloub, M. J. Hanley, J. Du, M. Hennessy, M. Granier, A. Biondi, L. Silverman University of Colorado Cancer Center and Children’s Hospital, Aurora, CO; University of Washington, Seattle, WA; St. Jude Children’s Research Hospital, Memphis, TN; Takeda Development Center Americas, Inc., Lexington, MA, United States of America; Incyte Biosciences Intl Sarl, Morges, Switzerland; Clinica Pediatrica Universita Milano-Bicocca, Monza, Italy; Dana Farber/Boston’s Children’s Hospital, Boston, MA, United States of America Background: Philadelphia chromosome–positive (Ph+) acute lymphoblastic leukemia (ALL) is associated with improved outcomes when tyrosine kinase inhibitors (TKIs) are added to chemotherapy; current 5-year event-free survival (EFS) and overall survival (OS) for newly diagnosed patients (pts) are 60% and 86%, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "L.", "Gore", ",", "M.", "Loh", ",", "C.-H.", "Pui", ",", "Y.", "Matloub", ",", "M.", "J.", "Hanley", ",", "J.", "Du", ",", "M.", "Hennessy", ",", "M.", "Granier", ",", "A.", "Biondi", ",", "L.", "Silverman", "University", "of", "Colorado", "Cancer", "Center", "and", "Children", "’s", "Hospital", ",", "Aurora", ",", "CO", ";", "University", "of", "Washington", ",", "Seattle", ",", "WA", ";", "St.", "Jude", "Children", "’s", "Research", "Hospital", ",", "Memphis", ",", "TN", ";", "Takeda", "Development", "Center", "Americas", ",", "Inc.", ",", "Lexington", ",", "MA", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Incyte", "Biosciences", "Intl", "Sarl", ",", "Morges", ",", "Switzerland", ";", "Clinica", "Pediatrica", "Universita", "Milano-Bicocca", ",", "Monza", ",", "Italy", ";", "Dana", "Farber/Boston", "’s", "Children", "’s", "Hospital", ",", "Boston", ",", "MA", ",", "United", "States", "of", "America", "Background", ":", "Philadelphia", "chromosome", "–", "positive", "(", "Ph+", ")", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "(", "ALL", ")", "is", "associated", "with", "improved", "outcomes", "when", "tyrosine", "kinase", "inhibitors", "(", "TKIs", ")", "are", "added", "to", "chemotherapy", ";", "current", "5-year", "event-free", "survival", "(", "EFS", ")", "and", "overall", "survival", "(", "OS", ")", "for", "newly", "diagnosed", "patients", "(", "pts", ")", "are", "60", "%", "and", "86", "%", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11707577
The intracellular ROS production after PDT treatment was inferred by using ROS‐Glo™ H2O2 Assay (Promega) following the manufacturer's instructions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intracellular", "ROS", "production", "after", "PDT", "treatment", "was", "inferred", "by", "using", "ROS‐Glo", "™", "H2O2", "Assay", "(", "Promega", ")", "following", "the", "manufacturer", "'s", "instructions", "." ] } ]
PMC11730311
Data is presented as a mean ± SEM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "is", "presented", "as", "a", "mean", "±", "SEM", "." ] } ]
PMC11216402
Our findings suggest that activation of this small set of TFs driving the Mes-like GC regulatory program plays an important role in cancer progression, and highlight new biology and potential therapeutic opportunities in GC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "findings", "suggest", "that", "activation", "of", "this", "small", "set", "of", "TFs", "driving", "the", "Mes-like", "GC", "regulatory", "program", "plays", "an", "important", "role", "in", "cancer", "progression", ",", "and", "highlight", "new", "biology", "and", "potential", "therapeutic", "opportunities", "in", "GC", "." ] } ]
PMC11753541
The authors are aware that this modification may not work in all scenarios as India is a vast country with diverse climatic zones, so actual room temperature may vary significantly depending on the region and the time of the year.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "authors", "are", "aware", "that", "this", "modification", "may", "not", "work", "in", "all", "scenarios", "as", "India", "is", "a", "vast", "country", "with", "diverse", "climatic", "zones", ",", "so", "actual", "room", "temperature", "may", "vary", "significantly", "depending", "on", "the", "region", "and", "the", "time", "of", "the", "year", "." ] } ]
PMC11697065
6Identification of Protein Hits Associated with High and Low qP A: Venn diagrams derived from D0 and D6 proteomics data detailing significant up and down regulated proteins in high secreting clones that are shared by 4 cell lines: mAb1, MonoAb1, MonoAb2 and BisAb1 as well as the number of proteins specific to each cell line.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "6Identification", "of", "Protein", "Hits", "Associated", "with", "High", "and", "Low", "qP", "A", ":", "Venn", "diagrams", "derived", "from", "D0", "and", "D6", "proteomics", "data", "detailing", "significant", "up", "and", "down", "regulated", "proteins", "in", "high", "secreting", "clones", "that", "are", "shared", "by", "4", "cell", "lines", ":", "mAb1", ",", "MonoAb1", ",", "MonoAb2", "and", "BisAb1", "as", "well", "as", "the", "number", "of", "proteins", "specific", "to", "each", "cell", "line", "." ] } ]
PMC7917457
To further evaluate the mechanism of the tumor growth control, complete responders from each group were rechallenged with 2× the original dose of the same tumor cells into the contralateral flank.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "evaluate", "the", "mechanism", "of", "the", "tumor", "growth", "control", ",", "complete", "responders", "from", "each", "group", "were", "rechallenged", "with", "2", "×", "the", "original", "dose", "of", "the", "same", "tumor", "cells", "into", "the", "contralateral", "flank", "." ] } ]
PMC8073654
There have been reports on the pharmacokinetic studies of (E)-4-(3′,4′-dimethoxyphenyl)but-3-en-1-ol (2), which has anti-inflammatory action .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "have", "been", "reports", "on", "the", "pharmacokinetic", "studies", "of", "(E)-4-(3′,4′-dimethoxyphenyl)but-3-en-1-ol", "(", "2", ")", ",", "which", "has", "anti-inflammatory", "action", "." ] } ]
PMC10222971
An in vitro cytotoxicity study on HeLa cells was used as a preliminary bioassay for screening of natural products with potential anticancer activity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "An", "in", "vitro", "cytotoxicity", "study", "on", "HeLa", "cells", "was", "used", "as", "a", "preliminary", "bioassay", "for", "screening", "of", "natural", "products", "with", "potential", "anticancer", "activity", "." ] } ]
PMC11394112
The human IL6 presence in the mouse facilitates the engraftment of malignant cells, although no engraftment rate was reported .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "human", "IL6", "presence", "in", "the", "mouse", "facilitates", "the", "engraftment", "of", "malignant", "cells", ",", "although", "no", "engraftment", "rate", "was", "reported", "." ] } ]
PMC11680049
An inhibitory effect against F. oxisporum was observed with the addition of 200 mg/L of the extract to the nutrient medium, with the effect strengthening as the concentration increased to 350 mg/L and higher.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "An", "inhibitory", "effect", "against", "F.", "oxisporum", "was", "observed", "with", "the", "addition", "of", "200", "mg/L", "of", "the", "extract", "to", "the", "nutrient", "medium", ",", "with", "the", "effect", "strengthening", "as", "the", "concentration", "increased", "to", "350", "mg/L", "and", "higher", "." ] } ]
PMC11742864
A remarkable increase of apoptotic cells along with the percentage of G1-phase cells was found in A549 cells treated with DHA, indicating that DHA induces NSCLC cell apoptosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "remarkable", "increase", "of", "apoptotic", "cells", "along", "with", "the", "percentage", "of", "G1-phase", "cells", "was", "found", "in", "A549", "cells", "treated", "with", "DHA", ",", "indicating", "that", "DHA", "induces", "NSCLC", "cell", "apoptosis", "." ] } ]
PMC9910796
Input extracts and immunoprecipitated samples were analyzed in 12% polyacrylamide SDS-PAGE followed by western blot with anti-V5 and anti-Flag mAbs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Input", "extracts", "and", "immunoprecipitated", "samples", "were", "analyzed", "in", "12", "%", "polyacrylamide", "SDS-PAGE", "followed", "by", "western", "blot", "with", "anti-V5", "and", "anti-Flag", "mAbs", "." ] } ]
PMC8524093
This event was observed during the outbreaks occurred in La Reunion, Italy, Thailand, and Puerto Rico.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "event", "was", "observed", "during", "the", "outbreaks", "occurred", "in", "La", "Reunion", ",", "Italy", ",", "Thailand", ",", "and", "Puerto", "Rico", "." ] } ]
PMC7709199
The heterogeneity in N-glycosylation (NG) has been a longstanding issue in structural biology (Chang et al., 2007 ▸) and is commonly addressed at three different time points during protein expression and purification. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "heterogeneity", "in", "N-glycosylation", "(", "NG", ")", "has", "been", "a", "longstanding", "issue", "in", "structural", "biology", "(", "Chang", "et", "al.", ",", "2007", "▸", ")", "and", "is", "commonly", "addressed", "at", "three", "different", "time", "points", "during", "protein", "expression", "and", "purification", ".", "(" ] } ]
PMC11806818
The number of h-JHNzymes at this time can reflect the number of CEM cells by inhibiting the overall catalytic activity of H2O2 oxidation of 4-mercaptophenylboronic acid (4-MPB) and output by the proportional SERS strategy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "number", "of", "h-JHNzymes", "at", "this", "time", "can", "reflect", "the", "number", "of", "CEM", "cells", "by", "inhibiting", "the", "overall", "catalytic", "activity", "of", "H2O2", "oxidation", "of", "4-mercaptophenylboronic", "acid", "(", "4-MPB", ")", "and", "output", "by", "the", "proportional", "SERS", "strategy", "." ] } ]
PMC5417661
The HCT116 cells that have an intact mitotic checkpoint18 and normal p53 response19 exhibited onefold longer M phase arrest upon the compound treatments when compared to the HCT8 cells (Figure 1B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "HCT116", "cells", "that", "have", "an", "intact", "mitotic", "checkpoint18", "and", "normal", "p53", "response19", "exhibited", "onefold", "longer", "M", "phase", "arrest", "upon", "the", "compound", "treatments", "when", "compared", "to", "the", "HCT8", "cells", "(", "Figure", "1B", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The majority of costs (77%, $4.0 million) were attributable to the care associated with acute complications, which includes VOCs, acute chest syndrome and stroke.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "majority", "of", "costs", "(", "77", "%", ",", "$", "4.0", "million", ")", "were", "attributable", "to", "the", "care", "associated", "with", "acute", "complications", ",", "which", "includes", "VOCs", ",", "acute", "chest", "syndrome", "and", "stroke", "." ] } ]
PMC11723947
The post-translational modifications may be induced downstream of the signaling pathways activated by environmental signals, providing a link between the cytoplasmic and nuclear events that regulate gene expression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "post-translational", "modifications", "may", "be", "induced", "downstream", "of", "the", "signaling", "pathways", "activated", "by", "environmental", "signals", ",", "providing", "a", "link", "between", "the", "cytoplasmic", "and", "nuclear", "events", "that", "regulate", "gene", "expression", "." ] } ]
PMC6684588
GDF11, which is structurally similar to myostatin, can also inhibit muscle regeneration or induce muscle atrophy under certain conditions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GDF11", ",", "which", "is", "structurally", "similar", "to", "myostatin", ",", "can", "also", "inhibit", "muscle", "regeneration", "or", "induce", "muscle", "atrophy", "under", "certain", "conditions", "." ] } ]
PMC11762280
C57BL/6NGpt mice (wild type, WT) and Zbp1 (Zbp1 KO) mice were purchased from GemPharmatech (Nanjing, Jiangsu, China).
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C57BL/6NGpt", "mice", "(", "wild", "type", ",", "WT", ")", "and", "Zbp1", "(", "Zbp1", "KO", ")", "mice", "were", "purchased", "from", "GemPharmatech", "(", "Nanjing", ",", "Jiangsu", ",", "China", ")", "." ] } ]
PMC9545714
In summary, the studies presented in this publication, reveal a unique effect of GTE on skin at the dermal and epidermal levels.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "summary", ",", "the", "studies", "presented", "in", "this", "publication", ",", "reveal", "a", "unique", "effect", "of", "GTE", "on", "skin", "at", "the", "dermal", "and", "epidermal", "levels", "." ] } ]
PMC11706776
Our results appear to correspond to the positions observed by Fuest and colleagues, concerning the binding of EWS::FLI1 to an alternative enhancer in the second intron of the KCNN1 A transcript .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "appear", "to", "correspond", "to", "the", "positions", "observed", "by", "Fuest", "and", "colleagues", ",", "concerning", "the", "binding", "of", "EWS::FLI1", "to", "an", "alternative", "enhancer", "in", "the", "second", "intron", "of", "the", "KCNN1", "A", "transcript", "." ] } ]
PMC11387401
Moreover, although combinational antiretroviral therapy (cART) can control an HIV-1 infection, it cannot eliminate the virus, as HIV-1 can initiate and maintain a latent state that causes viral rebound upon treatment cessation (Siliciano and Greene 2011).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "although", "combinational", "antiretroviral", "therapy", "(", "cART", ")", "can", "control", "an", "HIV-1", "infection", ",", "it", "can", "not", "eliminate", "the", "virus", ",", "as", "HIV-1", "can", "initiate", "and", "maintain", "a", "latent", "state", "that", "causes", "viral", "rebound", "upon", "treatment", "cessation", "(", "Siliciano", "and", "Greene", "2011", ")", "." ] } ]
PMC9429973
However, PFS2 tends to be longer and OS was superior in patients treated with ITd followed by maintenance with ixazomib versus placebo.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "PFS2", "tends", "to", "be", "longer", "and", "OS", "was", "superior", "in", "patients", "treated", "with", "ITd", "followed", "by", "maintenance", "with", "ixazomib", "versus", "placebo", "." ] } ]
PMC11805741
W: Cell dry weight calculated in grams.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "W", ":", "Cell", "dry", "weight", "calculated", "in", "grams", "." ] } ]
PMC11506670
Furthermore, in relation to the results of in vitro experiments, it is intriguing to speculate whether an altered or increased nucleotide exchange could explain the functional consequences observed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "in", "relation", "to", "the", "results", "of", "in", "vitro", "experiments", ",", "it", "is", "intriguing", "to", "speculate", "whether", "an", "altered", "or", "increased", "nucleotide", "exchange", "could", "explain", "the", "functional", "consequences", "observed", "." ] } ]
PMC9318744
To test the utility of the ACE2plusC3 model in antiviral drug screening, we used these cells to compare the antiviral efficacy of nine previously identified or potential antiviral drug candidates against SARS-CoV-2 infection.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "test", "the", "utility", "of", "the", "ACE2plusC3", "model", "in", "antiviral", "drug", "screening", ",", "we", "used", "these", "cells", "to", "compare", "the", "antiviral", "efficacy", "of", "nine", "previously", "identified", "or", "potential", "antiviral", "drug", "candidates", "against", "SARS-CoV-2", "infection", "." ] } ]
PMC9428827
Mutein was able to increase CD8MP/Treg ratio in both settings, validating the hypothesis that it is enough to eliminate the interaction of the IL-2 molecule with the receptor alpha chain to achieve a preferential expansion of IL-2Rβγc-expressing cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mutein", "was", "able", "to", "increase", "CD8MP/Treg", "ratio", "in", "both", "settings", ",", "validating", "the", "hypothesis", "that", "it", "is", "enough", "to", "eliminate", "the", "interaction", "of", "the", "IL-2", "molecule", "with", "the", "receptor", "alpha", "chain", "to", "achieve", "a", "preferential", "expansion", "of", "IL-2Rβγc-expressing", "cells", "." ] } ]
PMC11261875
The imaging diagnosis using F-FDG PET/CT is based on glucose metabolism in vivo .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "imaging", "diagnosis", "using", "F-FDG", "PET/CT", "is", "based", "on", "glucose", "metabolism", "in", "vivo", "." ] } ]
PMC10965315
A sterile 100‐μL pipette tip was then used to make a scratch in the cell monolayer, and after that, PBS was used to rinse away any debris or floating cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "sterile", "100‐μL", "pipette", "tip", "was", "then", "used", "to", "make", "a", "scratch", "in", "the", "cell", "monolayer", ",", "and", "after", "that", ",", "PBS", "was", "used", "to", "rinse", "away", "any", "debris", "or", "floating", "cells", "." ] } ]
PMC10606998
Iron ions can be released into the cytosol and participate in the formation of a hydroxyl radical or catalyze this reaction directly on the surface of a nanoparticle when its organic shell is destroyed .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Iron", "ions", "can", "be", "released", "into", "the", "cytosol", "and", "participate", "in", "the", "formation", "of", "a", "hydroxyl", "radical", "or", "catalyze", "this", "reaction", "directly", "on", "the", "surface", "of", "a", "nanoparticle", "when", "its", "organic", "shell", "is", "destroyed", "." ] } ]
PMC11737091
Knockdown of DBF4 significantly reduced the proliferation of 786-O and A498 cells. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Knockdown", "of", "DBF4", "significantly", "reduced", "the", "proliferation", "of", "786-O", "and", "A498", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC11186948
Interestingly, our reported patient was clinically diagnosed with RSTS, a chromatinopathy which known causative genes encode for enzymes antagonizing HDACs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "our", "reported", "patient", "was", "clinically", "diagnosed", "with", "RSTS", ",", "a", "chromatinopathy", "which", "known", "causative", "genes", "encode", "for", "enzymes", "antagonizing", "HDACs", "." ] } ]
PMC10988808
Therefore, understanding the molecular mechanisms driving ccRCC progression is paramount in developing new and more effective therapeutic strategies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "understanding", "the", "molecular", "mechanisms", "driving", "ccRCC", "progression", "is", "paramount", "in", "developing", "new", "and", "more", "effective", "therapeutic", "strategies", "." ] } ]
PMC9429973
Median number of prior therapies was 2 (range, 1-6) and 10 (25%) pts were refractory to last therapy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Median", "number", "of", "prior", "therapies", "was", "2", "(", "range", ",", "1", "-", "6", ")", "and", "10", "(", "25", "%", ")", "pts", "were", "refractory", "to", "last", "therapy", "." ] } ]
PMC10671321
Indeed, enzymatic activity was recovered in COS cell medium after transfections.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Indeed", ",", "enzymatic", "activity", "was", "recovered", "in", "COS", "cell", "medium", "after", "transfections", "." ] } ]