Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC6450504
siRNA targeting MDR1 (siMDR1): 5′- GGAAAAGAAACCAACUGUCdTdT-3′ (sense) and siRNA nontargeting (siSCR) duplex: 5′-AGUACUGCUUACGAUACGGdTdT-3′ (sense) were purchased from Dharmacon (CO, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "siRNA", "targeting", "MDR1", "(", "siMDR1", "):", "5′-", "GGAAAAGAAACCAACUGUCdTdT-3′", "(", "sense", ")", "and", "siRNA", "nontargeting", "(", "siSCR", ")", "duplex", ":", "5′-AGUACUGCUUACGAUACGGdTdT-3′", "(", "sense", ")", "were", "purchased", "from", "Dharmacon", "(", "CO", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC10999934
Gene set enrichment analysis (GSEA) was conducted with GSEA software, utilizing hallmark pathways gene sets obtained from the Molecular Signatures Database (http://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/index.jsp).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Gene", "set", "enrichment", "analysis", "(", "GSEA", ")", "was", "conducted", "with", "GSEA", "software", ",", "utilizing", "hallmark", "pathways", "gene", "sets", "obtained", "from", "the", "Molecular", "Signatures", "Database", "(", "http://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/index.jsp", ")", "." ] } ]
PMC11547917
Caco-2 cells were cultivated (1 × 10 cells/well) in six-well plates, where compounds were tested in two groups: -Group 1: cells were exposed to Trolox (2 mM) and ethanolic extract (AcE) (150 µM) for 24 h;-Group 2: cells were exposed to ethanol for 24 h; also, Caco-2 cells without compounds were used as absolute control.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Caco-2", "cells", "were", "cultivated", "(", "1", "×", "10", "cells/well", ")", "in", "six-well", "plates", ",", "where", "compounds", "were", "tested", "in", "two", "groups", ":", "-Group", "1", ":", "cells", "were", "exposed", "to", "Trolox", "(", "2", "mM", ")", "and", "ethanolic", "extract", "(", "AcE", ")", "(", "150", "µM", ")", "for", "24", "h;-Group", "2", ":", "cells", "were", "exposed", "to", "ethanol", "for", "24", "h", ";", "also", ",", "Caco-2", "cells", "without", "compounds", "were", "used", "as", "absolute", "control", "." ] } ]
PMC9250505
F IF analysis: representative images of fluorescent DNA damage markers γH2AX and RAD51 in CAOV2 cells were treated with NPB (N), Olaparib (O), or a combination (N + O) for 16 h are taken by confocal microscope.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "F", "IF", "analysis", ":", "representative", "images", "of", "fluorescent", "DNA", "damage", "markers", "γH2AX", "and", "RAD51", "in", "CAOV2", "cells", "were", "treated", "with", "NPB", "(", "N", ")", ",", "Olaparib", "(", "O", ")", ",", "or", "a", "combination", "(", "N", "+", "O", ")", "for", "16", "h", "are", "taken", "by", "confocal", "microscope", "." ] } ]
PMC11806818
Reprinted with permission from . (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Reprinted", "with", "permission", "from", ".", "(" ] } ]
PMC10125312
On the other hand, Hek293 had an IC50 of almost 15 nM, showing high resistance to AuNR-PEG.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "the", "other", "hand", ",", "Hek293", "had", "an", "IC50", "of", "almost", "15", "nM", ",", "showing", "high", "resistance", "to", "AuNR-PEG", "." ] } ]
PMC11683130
Schematic representation of the regulatory mechanism of Serpin protein in psoriasis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Schematic", "representation", "of", "the", "regulatory", "mechanism", "of", "Serpin", "protein", "in", "psoriasis", "." ] } ]
PMC10891340
Samples were reverse transcribed using the Hifair III 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (YEASEN, Shanghai, China).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Samples", "were", "reverse", "transcribed", "using", "the", "Hifair", "III", "1st", "Strand", "cDNA", "Synthesis", "SuperMix", "for", "qPCR", "(", "YEASEN", ",", "Shanghai", ",", "China", ")", "." ] } ]
PMC11696659
Discreet TAV that analyse the differences between the 1st and the 99th percentiles of the telomere lengths of a sample (P1-99), or the interquartile of the telomere lengths of a sample (p25-75) also showed significant differences in the cancer versus control cohorts (p < 0.0001 in both cases) (Fig. 3A and B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Discreet", "TAV", "that", "analyse", "the", "differences", "between", "the", "1st", "and", "the", "99th", "percentiles", "of", "the", "telomere", "lengths", "of", "a", "sample", "(", "P1", "-", "99", ")", ",", "or", "the", "interquartile", "of", "the", "telomere", "lengths", "of", "a", "sample", "(", "p25", "-", "75", ")", "also", "showed", "significant", "differences", "in", "the", "cancer", "versus", "control", "cohorts", "(", "p", "<", "0.0001", "in", "both", "cases", ")", "(", "Fig.", "3A", "and", "B", ")", "." ] } ]
PMC8348645
It is cultivated at a high altitude of 1500 m. It is usually grown in the frequently drought-stricken central and southern states of India .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "cultivated", "at", "a", "high", "altitude", "of", "1500", "m.", "It", "is", "usually", "grown", "in", "the", "frequently", "drought-stricken", "central", "and", "southern", "states", "of", "India", "." ] } ]
PMC11468365
As observed from Table 9, the MTDL model outperforms single-task learning.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "observed", "from", "Table", "9", ",", "the", "MTDL", "model", "outperforms", "single-task", "learning", "." ] } ]
PMC11791478
Tissue factor (TF) is overexpressed in various cancers and is typically associated with poor clinical outcomes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Tissue", "factor", "(", "TF", ")", "is", "overexpressed", "in", "various", "cancers", "and", "is", "typically", "associated", "with", "poor", "clinical", "outcomes", "." ] } ]
PMC11496491
GO enrichment analysis results show the top 20 terms that are most significant in terms of molecular function.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GO", "enrichment", "analysis", "results", "show", "the", "top", "20", "terms", "that", "are", "most", "significant", "in", "terms", "of", "molecular", "function", "." ] } ]
PMC9960565
Then, absorbance was measured at 550 nm using a Victor 1420 PerkinElmer microplate reader.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Then", ",", "absorbance", "was", "measured", "at", "550", "nm", "using", "a", "Victor", "1420", "PerkinElmer", "microplate", "reader", "." ] } ]
PMC11638288
Previous studies have indicated that NKp46 primarily promotes NK cell-mediated killing of tumor cells by interacting with its ligands such as ecto-CRT and heparan sulfate .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Previous", "studies", "have", "indicated", "that", "NKp46", "primarily", "promotes", "NK", "cell-mediated", "killing", "of", "tumor", "cells", "by", "interacting", "with", "its", "ligands", "such", "as", "ecto-CRT", "and", "heparan", "sulfate", "." ] } ]
PMC10538569
To determine the phenotype of iDCs, monocyte-derived iDCs were incubated with PE-conjugated anti-CD83, CD86, DC-SIGN, or HLA-DR, and FITC-conjugated anti-CD14 and APC-conjugated anti-CD3, CD11c antibodies (BD BioSciences) for 45 min on ice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "determine", "the", "phenotype", "of", "iDCs", ",", "monocyte-derived", "iDCs", "were", "incubated", "with", "PE-conjugated", "anti-CD83", ",", "CD86", ",", "DC-SIGN", ",", "or", "HLA-DR", ",", "and", "FITC-conjugated", "anti-CD14", "and", "APC-conjugated", "anti-CD3", ",", "CD11c", "antibodies", "(", "BD", "BioSciences", ")", "for", "45", "min", "on", "ice", "." ] } ]
PMC11725127
After centrifugation at 12,000 × g for 30 min, the supernatant was collected.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "centrifugation", "at", "12,000", "×", "g", "for", "30", "min", ",", "the", "supernatant", "was", "collected", "." ] } ]
PMC9429973
M. Mahbub, N. Chauhan Haematologiy, Royal Free Hospital, London, United Kingdom Background: Bone marrow aspirate and trephine biopsy (bone marrow biopsy) are an establised test to diagnose haematological disease.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "M.", "Mahbub", ",", "N.", "Chauhan", "Haematologiy", ",", "Royal", "Free", "Hospital", ",", "London", ",", "United", "Kingdom", "Background", ":", "Bone", "marrow", "aspirate", "and", "trephine", "biopsy", "(", "bone", "marrow", "biopsy", ")", "are", "an", "establised", "test", "to", "diagnose", "haematological", "disease", "." ] } ]
PMC9388315
Glucose intake for 5637 cells from media after 24 h treatment was significantly decreased in all used concentrations (P < 0.01) (Figure 6(a)).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Glucose", "intake", "for", "5637", "cells", "from", "media", "after", "24", "h", "treatment", "was", "significantly", "decreased", "in", "all", "used", "concentrations", "(", "P", "<", "0.01", ")", "(", "Figure", "6(a", ")", ")", "." ] } ]
PMC9621239
Three dimensional structures of wild-type HBx, mutant HBx and MYC are displayed respectively at the top of the panel.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Three", "dimensional", "structures", "of", "wild-type", "HBx", ",", "mutant", "HBx", "and", "MYC", "are", "displayed", "respectively", "at", "the", "top", "of", "the", "panel", "." ] } ]
PMC9884169
The morphological changes of cells with knockdown of MCT4 were determined by TEM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "morphological", "changes", "of", "cells", "with", "knockdown", "of", "MCT4", "were", "determined", "by", "TEM", "." ] } ]
PMC10882807
For example, circ_103809 targets miR-620 to suppress proliferation and invasion in HCC , and hsa_circ_104348 modulates the miR-187-3p/RTKN2 axis in hepatocellular carcinoma progression .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "example", ",", "circ_103809", "targets", "miR-620", "to", "suppress", "proliferation", "and", "invasion", "in", "HCC", ",", "and", "hsa_circ_104348", "modulates", "the", "miR-187", "-", "3p/RTKN2", "axis", "in", "hepatocellular", "carcinoma", "progression", "." ] } ]
PMC11451940
Complex 7 induced significant autophagy in A2780 cells; therefore, the most probable mechanism of its action relates to the induction of metabolic stress in A2780 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Complex", "7", "induced", "significant", "autophagy", "in", "A2780", "cells", ";", "therefore", ",", "the", "most", "probable", "mechanism", "of", "its", "action", "relates", "to", "the", "induction", "of", "metabolic", "stress", "in", "A2780", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
Grade 3-4 mucositis and enteropathy was reported in 2 patients (4.6%) and 6 (14%), respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Grade", "3", "-", "4", "mucositis", "and", "enteropathy", "was", "reported", "in", "2", "patients", "(", "4.6", "%", ")", "and", "6", "(", "14", "%", ")", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11391695
This value suggests that ACYP2, which was expressed at a low level, may possess diagnostic potential for hepatocellular carcinoma (Fig. 1E).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "value", "suggests", "that", "ACYP2", ",", "which", "was", "expressed", "at", "a", "low", "level", ",", "may", "possess", "diagnostic", "potential", "for", "hepatocellular", "carcinoma", "(", "Fig.", "1E", ")", "." ] } ]
PMC9429973
S. Dong Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, China, Beijing, China Background: Immune thrombocytopenia (ITP) is an autoimmune mediated hemorrhagic disease characterized by thrombocytopenia.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "S.", "Dong", "Beijing", "Children", "’s", "Hospital", ",", "Capital", "Medical", "University", ",", "National", "Center", "for", "Children", "’s", "Health", ",", "China", ",", "Beijing", ",", "China", "Background", ":", "Immune", "thrombocytopenia", "(", "ITP", ")", "is", "an", "autoimmune", "mediated", "hemorrhagic", "disease", "characterized", "by", "thrombocytopenia", "." ] } ]
PMC11787355
To evaluate the extent of PTPRZ1 association with gliomas, we first examined its expression at transcript and protein levels in human glioblastoma tissues.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "evaluate", "the", "extent", "of", "PTPRZ1", "association", "with", "gliomas", ",", "we", "first", "examined", "its", "expression", "at", "transcript", "and", "protein", "levels", "in", "human", "glioblastoma", "tissues", "." ] } ]
PMC11209164
Nevertheless, the potential of TPF as a potentiator of oncolytic virus and viral vector-based gene delivery more generally warrants further pre-clinical exploration.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nevertheless", ",", "the", "potential", "of", "TPF", "as", "a", "potentiator", "of", "oncolytic", "virus", "and", "viral", "vector-based", "gene", "delivery", "more", "generally", "warrants", "further", "pre-clinical", "exploration", "." ] } ]
PMC9429973
The MPN SAF or MPN 10 (Myeloproliferative Neoplasm Symptom Assessment Form) questionnaire is a validated tool for assessing the symptoms presented by patients with MPN, and their evolution during treatment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "MPN", "SAF", "or", "MPN", "10", "(", "Myeloproliferative", "Neoplasm", "Symptom", "Assessment", "Form", ")", "questionnaire", "is", "a", "validated", "tool", "for", "assessing", "the", "symptoms", "presented", "by", "patients", "with", "MPN", ",", "and", "their", "evolution", "during", "treatment", "." ] } ]
PMC11683130
Mutations in the SerpinB9 gene may contribute to the development of autoinflammatory diseases (121).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mutations", "in", "the", "SerpinB9", "gene", "may", "contribute", "to", "the", "development", "of", "autoinflammatory", "diseases", "(", "121", ")", "." ] } ]
PMC11306331
Statistical test: Mann–Whitney U test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Statistical", "test", ":", "Mann", "–", "Whitney", "U", "test", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: Our aim was to identify factors that may predict a lymphoma diagnosis at the time of CT, prior to diagnostic biopsy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "Our", "aim", "was", "to", "identify", "factors", "that", "may", "predict", "a", "lymphoma", "diagnosis", "at", "the", "time", "of", "CT", ",", "prior", "to", "diagnostic", "biopsy", "." ] } ]
PMC11300085
Chemerin is a newly described adipokine with significant effects on obesity, metabolic disorders, and immune trafficking.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chemerin", "is", "a", "newly", "described", "adipokine", "with", "significant", "effects", "on", "obesity", ",", "metabolic", "disorders", ",", "and", "immune", "trafficking", "." ] } ]
PMC4395774
Within the synapse, there is exocytosis of specialized granules that mediate cell cytotoxicity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Within", "the", "synapse", ",", "there", "is", "exocytosis", "of", "specialized", "granules", "that", "mediate", "cell", "cytotoxicity", "." ] } ]
PMC11698348
To assess the effects of loss of Elf5 on keratinocyte differentiation, we performed siRNA control and siElf5 knockdown in PMEKs for 48hrs, as described above, followed by calcium induced keratinocyte differentiation, as stated above, for additional 48-hours post transfection before cells were collected for further analyses.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "assess", "the", "effects", "of", "loss", "of", "Elf5", "on", "keratinocyte", "differentiation", ",", "we", "performed", "siRNA", "control", "and", "siElf5", "knockdown", "in", "PMEKs", "for", "48hrs", ",", "as", "described", "above", ",", "followed", "by", "calcium", "induced", "keratinocyte", "differentiation", ",", "as", "stated", "above", ",", "for", "additional", "48-hours", "post", "transfection", "before", "cells", "were", "collected", "for", "further", "analyses", "." ] } ]
PMC8735881
Consistently, CMI02 and CMI06 also rendered the modified 293FTTarget cells fully resistant to the fusion mediated by a panel of HIV-1 Envs that were resistant to GPI-10E8 (Figure 7(G)).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consistently", ",", "CMI02", "and", "CMI06", "also", "rendered", "the", "modified", "293FTTarget", "cells", "fully", "resistant", "to", "the", "fusion", "mediated", "by", "a", "panel", "of", "HIV-1", "Envs", "that", "were", "resistant", "to", "GPI-10E8", "(", "Figure", "7(G", ")", ")", "." ] } ]
PMC11727062
There is a clear need for further research into the potential of herbal monomers as both novel clinical therapies for melanoma and as components of combination treatments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "is", "a", "clear", "need", "for", "further", "research", "into", "the", "potential", "of", "herbal", "monomers", "as", "both", "novel", "clinical", "therapies", "for", "melanoma", "and", "as", "components", "of", "combination", "treatments", "." ] } ]
PMC11449273
We performed invasion assays only since in vitro cell invasion is a representative of the final stage of in vivo metastasis, following cell migration.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "performed", "invasion", "assays", "only", "since", "in", "vitro", "cell", "invasion", "is", "a", "representative", "of", "the", "final", "stage", "of", "in", "vivo", "metastasis", ",", "following", "cell", "migration", "." ] } ]
PMC9429973
Results: We found the following frequencies of mutant alleles in Hodgkin’s Lymphoma patients: GSTP1313G – 31.17%, GSTP1 341T – 9.7%, MDR1 1236T – 50.00%, MDR1 2677T – 48.70%, MDR13435 ТОНН – 58.44%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "We", "found", "the", "following", "frequencies", "of", "mutant", "alleles", "in", "Hodgkin", "’s", "Lymphoma", "patients", ":", "GSTP1313", "G", "–", "31.17", "%", ",", "GSTP1", "341", "T", "–", "9.7", "%", ",", "MDR1", "1236", "T", "–", "50.00", "%", ",", "MDR1", "2677", "T", "–", "48.70", "%", ",", "MDR13435", "ТОНН", "–", "58.44", "%", "." ] } ]
PMC11684269
ACC1 catalyzes the first rate-limiting step in the synthesis of palmitic acid.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ACC1", "catalyzes", "the", "first", "rate-limiting", "step", "in", "the", "synthesis", "of", "palmitic", "acid", "." ] } ]
PMC11502327
Compared with traditional drug delivery methods, functionalized nanoparticles can strongly inhibit endogenous miR-21 expression through endocytosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Compared", "with", "traditional", "drug", "delivery", "methods", ",", "functionalized", "nanoparticles", "can", "strongly", "inhibit", "endogenous", "miR-21", "expression", "through", "endocytosis", "." ] } ]
PMC11798926
For analysis, the amount of eluted interacting protein (in most cases, a myc-tagged SynDIG construct) was normalized to both the amount of eluted interacting protein (in most cases, an HA-tagged μ2 subunit) and to the amount of input interacting protein (in most cases, a myc-tagged SynDIG construct).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "analysis", ",", "the", "amount", "of", "eluted", "interacting", "protein", "(", "in", "most", "cases", ",", "a", "myc-tagged", "SynDIG", "construct", ")", "was", "normalized", "to", "both", "the", "amount", "of", "eluted", "interacting", "protein", "(", "in", "most", "cases", ",", "an", "HA-tagged", "μ2", "subunit", ")", "and", "to", "the", "amount", "of", "input", "interacting", "protein", "(", "in", "most", "cases", ",", "a", "myc-tagged", "SynDIG", "construct", ")", "." ] } ]
PMC11040965
Mann–Whitney U test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mann", "–", "Whitney", "U", "test", "." ] } ]
PMC11502066
A decrease in the migratory and invasive potential of these androgen-independent prostate cancer cells was achieved also using the flavanonol dihydromyricetin or ampelopsin (Figure 1) via downregulation of the CXCR4 protein expression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "decrease", "in", "the", "migratory", "and", "invasive", "potential", "of", "these", "androgen-independent", "prostate", "cancer", "cells", "was", "achieved", "also", "using", "the", "flavanonol", "dihydromyricetin", "or", "ampelopsin", "(", "Figure", "1", ")", "via", "downregulation", "of", "the", "CXCR4", "protein", "expression", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: The primary objective was to retrospectively examine the predictive accuracy of different survival models for estimating OS of CAR T cell therapies in LBCL using data cutoffs with different follow-up durations from the respective studies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "The", "primary", "objective", "was", "to", "retrospectively", "examine", "the", "predictive", "accuracy", "of", "different", "survival", "models", "for", "estimating", "OS", "of", "CAR", "T", "cell", "therapies", "in", "LBCL", "using", "data", "cutoffs", "with", "different", "follow-up", "durations", "from", "the", "respective", "studies", "." ] } ]
PMC9424261
Collectively, our findings suggesting that CA is a candidate component for the development of treatments against liver cancer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Collectively", ",", "our", "findings", "suggesting", "that", "CA", "is", "a", "candidate", "component", "for", "the", "development", "of", "treatments", "against", "liver", "cancer", "." ] } ]
PMC4659567
The reaction mixture was stirred at ambient temperature for 20 min (reactions with 5Braza and 5Faza), 2 h (reactions with aza, 3Iaza and 3Claza) or 3 h (reactions with 2Me4Claza, 3Cl5Braza and 3I5Braza), until the yellow (for 2, 4 and 5), or light (for 8) or dark (for 1, 3, 6 and 7) orange product was formed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "reaction", "mixture", "was", "stirred", "at", "ambient", "temperature", "for", "20", "min", "(", "reactions", "with", "5Braza", "and", "5Faza", ")", ",", "2", "h", "(", "reactions", "with", "aza", ",", "3Iaza", "and", "3Claza", ")", "or", "3", "h", "(", "reactions", "with", "2Me4Claza", ",", "3Cl5Braza", "and", "3I5Braza", ")", ",", "until", "the", "yellow", "(", "for", "2", ",", "4", "and", "5", ")", ",", "or", "light", "(", "for", "8)", "or", "dark", "(", "for", "1", ",", "3", ",", "6", "and", "7", ")", "orange", "product", "was", "formed", "." ] } ]
PMC4355729
The cells that migrated to the lower surface of each membrane were stained and counted under a light microscope in in five fields/well.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cells", "that", "migrated", "to", "the", "lower", "surface", "of", "each", "membrane", "were", "stained", "and", "counted", "under", "a", "light", "microscope", "in", "in", "five", "fields/well", "." ] } ]
PMC9429973
In addition, BrdU incorporation and cell cycle analysis was evaluated to assess cell proliferation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "BrdU", "incorporation", "and", "cell", "cycle", "analysis", "was", "evaluated", "to", "assess", "cell", "proliferation", "." ] } ]
PMC11694346
Traditional methods for biothiol detection often lack sensitivity, specificity, or compatibility with live-cell imaging.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Traditional", "methods", "for", "biothiol", "detection", "often", "lack", "sensitivity", ",", "specificity", ",", "or", "compatibility", "with", "live-cell", "imaging", "." ] } ]
PMC4816271
Stability of muK666 vs huK666 CARs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Stability", "of", "muK666", "vs", "huK666", "CARs", "." ] } ]
PMC11087766
Nuclear localization of the sfGFP-tagged protein was called if the highest intensity of GFP signal overlapped with the phage genome.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nuclear", "localization", "of", "the", "sfGFP-tagged", "protein", "was", "called", "if", "the", "highest", "intensity", "of", "GFP", "signal", "overlapped", "with", "the", "phage", "genome", "." ] } ]
PMC9429973
B. Andemariam, A. Inati, R. Colombatti, C. Minniti, C. Brown, M. Hottmann, S. Gray, C. Hoppe, M. Davis, P. Yue New England Sickle Cell Institute, University of Connecticut Health, Farmington, United States of America; Lebanese American University, Byblos and Beirut, Nini Hospital, Tripoli, Lebanon; Clinic of Pediatric Hematology Oncology, Department of Woman’s and Child’s Health, Azienda Ospedale – Università di Padova, Padua, Italy; Albert Einstein College of Medicine, Bronx; Aflac Cancer and Blood Disorder Center of Children’s Healthcare of Atlanta and Department of Pediatrics, Emory School of Medicine, Atlanta; Global Blood Therapeutics, South San Francisco, United States of America Background: Sickle cell disease (SCD) is a group of autosomal recessive red blood cell (RBC) disorders caused by a single point mutation in the β-globin gene, resulting in the production of hemoglobin S. Hemoglobin S polymerization within deoxygenated RBCs contributes to hemolysis, vaso-occlusion, and end-organ damage.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B.", "Andemariam", ",", "A.", "Inati", ",", "R.", "Colombatti", ",", "C.", "Minniti", ",", "C.", "Brown", ",", "M.", "Hottmann", ",", "S.", "Gray", ",", "C.", "Hoppe", ",", "M.", "Davis", ",", "P.", "Yue", "New", "England", "Sickle", "Cell", "Institute", ",", "University", "of", "Connecticut", "Health", ",", "Farmington", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Lebanese", "American", "University", ",", "Byblos", "and", "Beirut", ",", "Nini", "Hospital", ",", "Tripoli", ",", "Lebanon", ";", "Clinic", "of", "Pediatric", "Hematology", "Oncology", ",", "Department", "of", "Woman", "’s", "and", "Child", "’s", "Health", ",", "Azienda", "Ospedale", "–", "Università", "di", "Padova", ",", "Padua", ",", "Italy", ";", "Albert", "Einstein", "College", "of", "Medicine", ",", "Bronx", ";", "Aflac", "Cancer", "and", "Blood", "Disorder", "Center", "of", "Children", "’s", "Healthcare", "of", "Atlanta", "and", "Department", "of", "Pediatrics", ",", "Emory", "School", "of", "Medicine", ",", "Atlanta", ";", "Global", "Blood", "Therapeutics", ",", "South", "San", "Francisco", ",", "United", "States", "of", "America", "Background", ":", "Sickle", "cell", "disease", "(", "SCD", ")", "is", "a", "group", "of", "autosomal", "recessive", "red", "blood", "cell", "(", "RBC", ")", "disorders", "caused", "by", "a", "single", "point", "mutation", "in", "the", "β-globin", "gene", ",", "resulting", "in", "the", "production", "of", "hemoglobin", "S.", "Hemoglobin", "S", "polymerization", "within", "deoxygenated", "RBCs", "contributes", "to", "hemolysis", ",", "vaso-occlusion", ",", "and", "end-organ", "damage", "." ] } ]
PMC11261875
The authors declare the following financial interests/personal relationships which may be considered as potential competing interests: none
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "authors", "declare", "the", "following", "financial", "interests/personal", "relationships", "which", "may", "be", "considered", "as", "potential", "competing", "interests", ":", "none" ] } ]
PMC9429973
If the MFI had not decreased <2000U, two further cycles of single volume plasmapheresis and anti-CMV hyperimmune immunoglobulin 100mg/kg were given on D+1 and D+2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "If", "the", "MFI", "had", "not", "decreased", "<", "2000U", ",", "two", "further", "cycles", "of", "single", "volume", "plasmapheresis", "and", "anti-CMV", "hyperimmune", "immunoglobulin", "100mg/kg", "were", "given", "on", "D+1", "and", "D+2", "." ] } ]
PMC6892818
As positive controls for TRAF1 (a), TRAF2 (b) and TRAF3 (c) protein expression induction, in RCC cell immunoblotting experiments (top panels) lysates from HCT116 cells that were treated with control (‘C’) or treated with mCD40L (‘mL’) for 6 h were included, while for HRPT cell experiments (bottom panels) lysates from ACHN cells untreated or treated with mCD40L for 6 h were used.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "positive", "controls", "for", "TRAF1", "(", "a", ")", ",", "TRAF2", "(", "b", ")", "and", "TRAF3", "(", "c", ")", "protein", "expression", "induction", ",", "in", "RCC", "cell", "immunoblotting", "experiments", "(", "top", "panels", ")", "lysates", "from", "HCT116", "cells", "that", "were", "treated", "with", "control", "(", "‘", "C", "’", ")", "or", "treated", "with", "mCD40L", "(", "‘", "mL", "’", ")", "for", "6", "h", "were", "included", ",", "while", "for", "HRPT", "cell", "experiments", "(", "bottom", "panels", ")", "lysates", "from", "ACHN", "cells", "untreated", "or", "treated", "with", "mCD40L", "for", "6", "h", "were", "used", "." ] } ]
PMC11753949
To this aim, cultured DIV7 neurons were transduced with AAV2/9 viruses encoding EGFP-synaptopodin and cells showing high abundance of these fluorescent structures were selected for analysis by correlative light and electron microscopy (CLEM).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "this", "aim", ",", "cultured", "DIV7", "neurons", "were", "transduced", "with", "AAV2/9", "viruses", "encoding", "EGFP-synaptopodin", "and", "cells", "showing", "high", "abundance", "of", "these", "fluorescent", "structures", "were", "selected", "for", "analysis", "by", "correlative", "light", "and", "electron", "microscopy", "(", "CLEM", ")", "." ] } ]
PMC9874064
Tumor growth inhibition curves of nude mice bearing PDX tumors treated with different drugs, ∗∗∗p ​< ​0.001 (ordinary two-way ANOVA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Tumor", "growth", "inhibition", "curves", "of", "nude", "mice", "bearing", "PDX", "tumors", "treated", "with", "different", "drugs", ",", "∗∗∗p", "​", "<", "​0.001", "(", "ordinary", "two-way", "ANOVA", ")", "." ] } ]
PMC11596967
This dual nature of antioxidant and pro-oxidant activity becomes more pronounced under conditions of radiation exposure, disrupting the balance between protective and damaging effects.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "dual", "nature", "of", "antioxidant", "and", "pro-oxidant", "activity", "becomes", "more", "pronounced", "under", "conditions", "of", "radiation", "exposure", ",", "disrupting", "the", "balance", "between", "protective", "and", "damaging", "effects", "." ] } ]
PMC11186948
Cellular pellets were washed two times in PBS and centrifuged 5 min 2,500-3,000 rpm at 4 °C, resuspended in cold S300 buffer (50 mM HEPES pH 7.6, 300 mM NaCl, 0.1% NP40, 2 mM MgCl2, 10% glycerol) supplemented with protease inhibitors cocktail (P8340, Sigma-Aldrich) and nuclease (SC-202,391, Santa-Cruz Biotechnology) and left on ice for 1 h. Samples were centrifuged at maximum speed (13,000 rpm) for 10 min at 4 °C and the supernatant was quantified with Bradford assay (Bio-Rad) following the manufacturer’s instructions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cellular", "pellets", "were", "washed", "two", "times", "in", "PBS", "and", "centrifuged", "5", "min", "2,500", "-", "3,000", "rpm", "at", "4", "°", "C", ",", "resuspended", "in", "cold", "S300", "buffer", "(", "50", "mM", "HEPES", "pH", "7.6", ",", "300", "mM", "NaCl", ",", "0.1", "%", "NP40", ",", "2", "mM", "MgCl2", ",", "10", "%", "glycerol", ")", "supplemented", "with", "protease", "inhibitors", "cocktail", "(", "P8340", ",", "Sigma-Aldrich", ")", "and", "nuclease", "(", "SC-202,391", ",", "Santa-Cruz", "Biotechnology", ")", "and", "left", "on", "ice", "for", "1", "h.", "Samples", "were", "centrifuged", "at", "maximum", "speed", "(", "13,000", "rpm", ")", "for", "10", "min", "at", "4", "°", "C", "and", "the", "supernatant", "was", "quantified", "with", "Bradford", "assay", "(", "Bio-Rad", ")", "following", "the", "manufacturer", "’s", "instructions", "." ] } ]
PMC11798926
Data are represented as mean ± SEM; n = 11–15 cell per group, each group from 2 to 3 independent experiments; ns not significant; *p < 0.05; **p < 0.01; ***p < 0.001; ****p < 0.0001.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "represented", "as", "mean", "±", "SEM", ";", "n", "=", "11–15", "cell", "per", "group", ",", "each", "group", "from", "2", "to", "3", "independent", "experiments", ";", "ns", "not", "significant", ";", "*", "p", "<", "0.05", ";", "*", "*", "p", "<", "0.01", ";", "*", "*", "*", "p", "<", "0.001", ";", "*", "*", "*", "*", "p", "<", "0.0001", "." ] } ]
PMC11588008
Gently disperse the cell suspension, transfer it to 10 mL centrifuge tubes using a pipette, centrifuge at 1,000 rpm for 5 min, and discard the supernatant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Gently", "disperse", "the", "cell", "suspension", ",", "transfer", "it", "to", "10", "mL", "centrifuge", "tubes", "using", "a", "pipette", ",", "centrifuge", "at", "1,000", "rpm", "for", "5", "min", ",", "and", "discard", "the", "supernatant", "." ] } ]
PMC8143558
They also observed that the saponin fraction exhibited more activity against these fungal strains than bacterial strains that they included in their study.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "also", "observed", "that", "the", "saponin", "fraction", "exhibited", "more", "activity", "against", "these", "fungal", "strains", "than", "bacterial", "strains", "that", "they", "included", "in", "their", "study", "." ] } ]
PMC11753949
For CLEM, light microscopy was performed with an Andor DragonFly microscope with either a PlanApo 63X/1.4 NA oil immersion objective or a 20X air objective and equipped with a Zyla cMOS camera.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "CLEM", ",", "light", "microscopy", "was", "performed", "with", "an", "Andor", "DragonFly", "microscope", "with", "either", "a", "PlanApo", "63X/1.4", "NA", "oil", "immersion", "objective", "or", "a", "20X", "air", "objective", "and", "equipped", "with", "a", "Zyla", "cMOS", "camera", "." ] } ]
PMC11496728
The above data were from three independent experiments, when P < 0.05, the difference is statistically significant, compared with CHO-WT, *P < 0.05, **P < 0.01.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "above", "data", "were", "from", "three", "independent", "experiments", ",", "when", "P", "<", "0.05", ",", "the", "difference", "is", "statistically", "significant", ",", "compared", "with", "CHO-WT", ",", "*", "P", "<", "0.05", ",", "*", "*", "P", "<", "0.01", "." ] } ]
PMC11098378
After 30 min at 25°C, the reaction was quenched by the addition of 1 mM PMSF and the molecular weight of the core was determined by intact mass spectroscopic analysis (UTSW Proteomic Core), revealing a highly abundant peptide (T55-R287) corresponding to residues Thr-55-Arg287 (Ceg10) in Ceg10.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "30", "min", "at", "25", "°", "C", ",", "the", "reaction", "was", "quenched", "by", "the", "addition", "of", "1", "mM", "PMSF", "and", "the", "molecular", "weight", "of", "the", "core", "was", "determined", "by", "intact", "mass", "spectroscopic", "analysis", "(", "UTSW", "Proteomic", "Core", ")", ",", "revealing", "a", "highly", "abundant", "peptide", "(", "T55-R287", ")", "corresponding", "to", "residues", "Thr-55-Arg287", "(", "Ceg10", ")", "in", "Ceg10", "." ] } ]
PMC11551844
AuNPs-JDE showed the highest uptake followed by AuNPs-JDH, AuNPs-ansellone, AuNPs-control, AuNPs-JC-2 and AuNPs-contignasterol.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "AuNPs-JDE", "showed", "the", "highest", "uptake", "followed", "by", "AuNPs-JDH", ",", "AuNPs-ansellone", ",", "AuNPs-control", ",", "AuNPs-JC-2", "and", "AuNPs-contignasterol", "." ] } ]
PMC6948907
Acetylation of the histones is a posttranslational modification found in the all animal species.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Acetylation", "of", "the", "histones", "is", "a", "posttranslational", "modification", "found", "in", "the", "all", "animal", "species", "." ] } ]
PMC11665584
The eschar contained mostly dead or dying cells and was excluded from Xenium analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "eschar", "contained", "mostly", "dead", "or", "dying", "cells", "and", "was", "excluded", "from", "Xenium", "analysis", "." ] } ]
PMC11588008
Levels of GSH and GSSG in ovarian cancer cells in different treatment groups, ****P < 0.0001, **P < 0.01 vs blank group, P < 0.0001, P < 0.05 vs PM group, ▫▫▫▫P < 0.0001, ▫P < 0.05 vs PM + MSC group. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Levels", "of", "GSH", "and", "GSSG", "in", "ovarian", "cancer", "cells", "in", "different", "treatment", "groups", ",", "*", "*", "*", "*", "P", "<", "0.0001", ",", "*", "*", "P", "<", "0.01", "vs", "blank", "group", ",", "P", "<", "0.0001", ",", "P", "<", "0.05", "vs", "PM", "group", ",", "▫", "▫", "▫", "▫", "P", "<", "0.0001", ",", "▫", "P", "<", "0.05", "vs", "PM", "+", "MSC", "group", ".", "(" ] } ]
PMC11745823
Luciferase vectors, either wild‐type or mutant, were constructed based on HIF‐1α's potential binding site on the RIT1 promoter. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Luciferase", "vectors", ",", "either", "wild‐type", "or", "mutant", ",", "were", "constructed", "based", "on", "HIF‐1α", "'s", "potential", "binding", "site", "on", "the", "RIT1", "promoter", ".", "(" ] } ]
PMC9622879
Based on the functionalities of the RES and ESS, general mathematical formulas of the DERs and load for each home and the entire community are constructed and successfully transformed into an MILP problem that can be solved in a short time.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "the", "functionalities", "of", "the", "RES", "and", "ESS", ",", "general", "mathematical", "formulas", "of", "the", "DERs", "and", "load", "for", "each", "home", "and", "the", "entire", "community", "are", "constructed", "and", "successfully", "transformed", "into", "an", "MILP", "problem", "that", "can", "be", "solved", "in", "a", "short", "time", "." ] } ]
PMC7723249
In this study, we compared HAZV and CCHFV infection of human polarized epithelial cells to shed light on similarities and differences in virus-host cell interaction between these two viruses.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "we", "compared", "HAZV", "and", "CCHFV", "infection", "of", "human", "polarized", "epithelial", "cells", "to", "shed", "light", "on", "similarities", "and", "differences", "in", "virus-host", "cell", "interaction", "between", "these", "two", "viruses", "." ] } ]
PMC11737091
DBF4 mRNA expression was upregulated in ccRCC tissues (n = 541) compared with normal tissues (n = 72). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DBF4", "mRNA", "expression", "was", "upregulated", "in", "ccRCC", "tissues", "(", "n", "=", "541", ")", "compared", "with", "normal", "tissues", "(", "n", "=", "72", ")", ".", "(" ] } ]
PMC11380454
p <0.05 was considered statistically significant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.05", "was", "considered", "statistically", "significant", "." ] } ]
PMC11725127
GA treatment can reduce the cell viability of MM.1S and RPMI 8226 cell lines. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GA", "treatment", "can", "reduce", "the", "cell", "viability", "of", "MM.1S", "and", "RPMI", "8226", "cell", "lines", ".", "(" ] } ]
PMC7433824
Grade I‐III gliomas showed relatively high levels of PKM2 in RNA and protein levels, whereas GBMs were found to exert an almost 3‐ to 5‐fold increase in PKM2 levels.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Grade", "I‐III", "gliomas", "showed", "relatively", "high", "levels", "of", "PKM2", "in", "RNA", "and", "protein", "levels", ",", "whereas", "GBMs", "were", "found", "to", "exert", "an", "almost", "3‐", "to", "5‐fold", "increase", "in", "PKM2", "levels", "." ] } ]
PMC10965680
Only 1.28% of all the SNPs were found in exons, including 113,185 nonsynonymous and 101,604 synonymous SNPs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Only", "1.28", "%", "of", "all", "the", "SNPs", "were", "found", "in", "exons", ",", "including", "113,185", "nonsynonymous", "and", "101,604", "synonymous", "SNPs", "." ] } ]
PMC11489351
We selected MCF10A, an immortalized mammary epithelial cell line, for the initial RNA-seq experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "selected", "MCF10A", ",", "an", "immortalized", "mammary", "epithelial", "cell", "line", ",", "for", "the", "initial", "RNA-seq", "experiments", "." ] } ]
PMC11637276
The role of α2 integrin in pancreatic cancer remains controversial.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "role", "of", "α2", "integrin", "in", "pancreatic", "cancer", "remains", "controversial", "." ] } ]
PMC11680049
This localization of polyphenols and terpenoids, including in Sequoia, is generally determined by their physiological functions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "localization", "of", "polyphenols", "and", "terpenoids", ",", "including", "in", "Sequoia", ",", "is", "generally", "determined", "by", "their", "physiological", "functions", "." ] } ]
PMC11472569
The human ABC transporter family includes 48 members, classified into seven subfamilies (A to G) based on sequence homology, domain organization, and phylogenetic analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "human", "ABC", "transporter", "family", "includes", "48", "members", ",", "classified", "into", "seven", "subfamilies", "(", "A", "to", "G", ")", "based", "on", "sequence", "homology", ",", "domain", "organization", ",", "and", "phylogenetic", "analysis", "." ] } ]
PMC11366496
To further elucidate this issue, we conducted a series of related experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "elucidate", "this", "issue", ",", "we", "conducted", "a", "series", "of", "related", "experiments", "." ] } ]
PMC9429973
Prior cardiovascular (CV) risk factors were recorded: hypertension 8/56 14%, body mass index ≥25kg/m2 32/56 57%, hyperlipidemia (>220mg/dl) 13/56 23.2%, smokers 10/56 18% and diabetes mellitus 4/56 7%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Prior", "cardiovascular", "(", "CV", ")", "risk", "factors", "were", "recorded", ":", "hypertension", "8/56", "14", "%", ",", "body", "mass", "index", "≥25kg/m2", "32/56", "57", "%", ",", "hyperlipidemia", "(", ">", "220mg/dl", ")", "13/56", "23.2", "%", ",", "smokers", "10/56", "18", "%", "and", "diabetes", "mellitus", "4/56", "7", "%", "." ] } ]
PMC11720808
Similar results were observed in the colony-formation assay (Figure 1E), where SCU decreased the colony number.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similar", "results", "were", "observed", "in", "the", "colony-formation", "assay", "(", "Figure", "1E", ")", ",", "where", "SCU", "decreased", "the", "colony", "number", "." ] } ]
PMC8777939
For colony formation, A2780 and A2780-ADR cells were seeded into 6-well plates (1000 cells per well) and were incubated with various concentrations of etravirine (0–10 µM), paclitaxel (5 nM), and a combination of 10 µM etravirine and 5 nM paclitaxel.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "colony", "formation", ",", "A2780", "and", "A2780-ADR", "cells", "were", "seeded", "into", "6-well", "plates", "(", "1000", "cells", "per", "well", ")", "and", "were", "incubated", "with", "various", "concentrations", "of", "etravirine", "(", "0–10", "µM", ")", ",", "paclitaxel", "(", "5", "nM", ")", ",", "and", "a", "combination", "of", "10", "µM", "etravirine", "and", "5", "nM", "paclitaxel", "." ] } ]
PMC11697703
Imaging acquisition and neuron reconstruction were performed blinded to the experimental conditions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Imaging", "acquisition", "and", "neuron", "reconstruction", "were", "performed", "blinded", "to", "the", "experimental", "conditions", "." ] } ]
PMC11286266
Considering possible regulatory roles of N-glycosylation and disulphide bonds in ATF6α activation (Hong et al., 2004; Oka et al., 2019), three different versions of ATF6α_LD were used: (1) fully glycosylated ATF6α_LD (WT), (2) non-glycosylated ATF6α_LD (∆Gly), and (3) ATF6α_LD lacking its cysteines (∆C) (Figure 4A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Considering", "possible", "regulatory", "roles", "of", "N-glycosylation", "and", "disulphide", "bonds", "in", "ATF6α", "activation", "(", "Hong", "et", "al.", ",", "2004", ";", "Oka", "et", "al.", ",", "2019", ")", ",", "three", "different", "versions", "of", "ATF6α_LD", "were", "used", ":", "(", "1", ")", "fully", "glycosylated", "ATF6α_LD", "(", "WT", ")", ",", "(", "2", ")", "non-glycosylated", "ATF6α_LD", "(", "∆Gly", ")", ",", "and", "(", "3", ")", "ATF6α_LD", "lacking", "its", "cysteines", "(", "∆C", ")", "(", "Figure", "4A", ")", "." ] } ]
PMC8170755
Our results also revealed an inhibitory effect for VPA on the expression of MMP-2 and MMP-9 genes in the A459 cell.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "also", "revealed", "an", "inhibitory", "effect", "for", "VPA", "on", "the", "expression", "of", "MMP-2", "and", "MMP-9", "genes", "in", "the", "A459", "cell", "." ] } ]
PMC9429973
Multivariate analysis for PFS the results were advanced stage (HR 4.72 95%CI: 1.43-23.9, P=0.015), elevated LDH (HR 4.85 95%CI: 1.73-13.60, P=0.014) and ECOG-PS≥2 (HR 5.25 95%CI: 1.68-16.4, P=0.024).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Multivariate", "analysis", "for", "PFS", "the", "results", "were", "advanced", "stage", "(", "HR", "4.72", "95%CI", ":", "1.43", "-", "23.9", ",", "P=0.015", ")", ",", "elevated", "LDH", "(", "HR", "4.85", "95%CI", ":", "1.73", "-", "13.60", ",", "P=0.014", ")", "and", "ECOG-PS≥2", "(", "HR", "5.25", "95%CI", ":", "1.68", "-", "16.4", ",", "P=0.024", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: To correlate variant haemoglobin pattern with phenotypic presentation at diagnosis in SCD.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "To", "correlate", "variant", "haemoglobin", "pattern", "with", "phenotypic", "presentation", "at", "diagnosis", "in", "SCD", "." ] } ]
PMC10761571
In addition, it was found that gingerol could arrest the cell cycle and induce apoptosis through the activation of Caspase 3, 7, 8, and 9 .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "it", "was", "found", "that", "gingerol", "could", "arrest", "the", "cell", "cycle", "and", "induce", "apoptosis", "through", "the", "activation", "of", "Caspase", "3", ",", "7", ",", "8", ",", "and", "9", "." ] } ]
PMC10553757
Serum GH was measured at 36 weeks’ gestation and during postpartum days 1-4.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Serum", "GH", "was", "measured", "at", "36", "weeks", "’", "gestation", "and", "during", "postpartum", "days", "1", "-", "4", "." ] } ]
PMC11747467
ERBB2 has been reported to be highly enriched in bladder cancer and associated with poor clinical outcomes (32, 33), suggesting that it might be a promising therapeutic target.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ERBB2", "has", "been", "reported", "to", "be", "highly", "enriched", "in", "bladder", "cancer", "and", "associated", "with", "poor", "clinical", "outcomes", "(", "32", ",", "33", ")", ",", "suggesting", "that", "it", "might", "be", "a", "promising", "therapeutic", "target", "." ] } ]
PMC10213179
Red arrow highlights the node from protein SELEX presenting most inter-connections with aptamers from cell-internalization SELEX.(C) Isolation of the protein SELEX aptamer nodes and all directly connected nodes from both the protein and cell-internalization SELEX.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Red", "arrow", "highlights", "the", "node", "from", "protein", "SELEX", "presenting", "most", "inter-connections", "with", "aptamers", "from", "cell-internalization", "SELEX.(C", ")", "Isolation", "of", "the", "protein", "SELEX", "aptamer", "nodes", "and", "all", "directly", "connected", "nodes", "from", "both", "the", "protein", "and", "cell-internalization", "SELEX", "." ] } ]
PMC11521786
This could potentially explain how the direct recognition of the PAbs generated by vaccination, leading to receptor degradation, causes a cytotoxic effect on tumor cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "could", "potentially", "explain", "how", "the", "direct", "recognition", "of", "the", "PAbs", "generated", "by", "vaccination", ",", "leading", "to", "receptor", "degradation", ",", "causes", "a", "cytotoxic", "effect", "on", "tumor", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
No on-study deaths occurred.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No", "on-study", "deaths", "occurred", "." ] } ]
PMC11354225
Finally, chemoproteomic analyses identified numerous direct targets of EGCG within cellular compartments .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Finally", ",", "chemoproteomic", "analyses", "identified", "numerous", "direct", "targets", "of", "EGCG", "within", "cellular", "compartments", "." ] } ]
PMC10747160
We were keenly interested in how the M protein affected DC-SIGN-mediated trans-infectivity because, based on data from three other coronaviruses (SARS-CoV-1, Mouse Hepatitis virus, and Feline coronavirus), it is estimated that the SARS-CoV-2 particle expresses ~1100 M protein dimers on its surface .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "were", "keenly", "interested", "in", "how", "the", "M", "protein", "affected", "DC-SIGN-mediated", "trans-infectivity", "because", ",", "based", "on", "data", "from", "three", "other", "coronaviruses", "(", "SARS-CoV-1", ",", "Mouse", "Hepatitis", "virus", ",", "and", "Feline", "coronavirus", ")", ",", "it", "is", "estimated", "that", "the", "SARS-CoV-2", "particle", "expresses", "~1100", "M", "protein", "dimers", "on", "its", "surface", "." ] } ]
PMC3681794
B, Graphs show 2 where CT is the cross-threshold and represents the change in Glut-1 mRNA expression with time in 791T, HOS and U2OS cells in hypoxia relative to normoxia, where 1 would be equivalent expression in normoxia and hypoxia and greater than 1 represents an increase in hypoxia relative to normoxia.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", ",", "Graphs", "show", "2", "where", "CT", "is", "the", "cross-threshold", "and", "represents", "the", "change", "in", "Glut-1", "mRNA", "expression", "with", "time", "in", "791", "T", ",", "HOS", "and", "U2OS", "cells", "in", "hypoxia", "relative", "to", "normoxia", ",", "where", "1", "would", "be", "equivalent", "expression", "in", "normoxia", "and", "hypoxia", "and", "greater", "than", "1", "represents", "an", "increase", "in", "hypoxia", "relative", "to", "normoxia", "." ] } ]