Datasets:
OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC11638255
Sample acquisition was performed using BD FACSAria III (BD Biosciences, USA) and analyzed using FlowJo v10 (TreeStar, USA).
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PMC10291556
Changes in the mitochondrial membrane potential Δψm in HeLa cells.
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PMC9884169
Both ferroptosis and autophagy can be affected by the AMPK signaling pathway [15–17].
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PMC3164356
Although CHO-K1 is resistant to HSV-1 infection, the addition of mouse genes encoding HS3ST to CHO-K1 cells renders them susceptible to HSV-1 infection.
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PMC10900886
As observed previously, inoculation of imDCs in the absence of their autologous BLCL resulted in an average of 11% ± 2 VP1 cells at 6 hpi and the percentage remained stable at 24 hpi.
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PMC9429973
Methods: We report the case of a patient with CML, who developed severe bone marrow failure after treatment with Imatinib.
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PMC11541241
TORC1: DEPTOR, DEP domain containing mTOR interacting protein; KOG1, kontroller of growth 1; LST8, lethal with SEC.
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PMC4485786
Expression analysis was performed as previously described.
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PMC11612315
Two-way ANOVA followed by the Bonferroni multiple comparison test (*p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001, compared with the CFA group).
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PMC11599565
Although this HERV has lost its fusogenic properties, the immunosuppressive activity has been retained because the ISD is highly similar to the CKS-17 immunosuppressive peptide.
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PMC10748106
If one of the compounds has a leverage value higher than the h*, it will be considered an outlier, this is, out of the applicability domain of the model.
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PMC3734024
Taken together, these studies demonstrate that FasL B cells potentially play a role in the maintenance of peripheral tolerance and are elicited by diverse stimuli and inflammatory conditions.
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PMC9429973
However, it remains unclear how NPM1c expression in hematopoietic cells leads to its characteristic gene expression pattern.
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PMC11366496
Interestingly, our analysis of TCGA data also revealed a positive connection between RNF122 and JAK2, STAT3, and c‐Myc (Figure S4A).
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PMC6267596
Discovery of Ran signaling in DIAP cells suggests opportunities for targeting this pathway in combination with an AK inhibitor (e.g. alisertib) to prevent or disrupt polyploidy.
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PMC10237474
Both our CHO and HEK293-derived frozen stable pools maintain similar productivity after thawing and recovery.
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PMC11718031
This study investigates how different basal media and medium-feed combinations affect cell culture growth, metabolism, and mAb production of a CHO cell line engineered to produce Trastuzumab biosimilar.
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PMC11682525
Despite its tremendous promise, cell therapy faces formidable challenges, primarily centered around issues related to cell homing and post-transplantation survival.
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PMC10818573
Five pairs of primers were designed for the EBV genome (GenBank: V01555) using DNAMAN (version 8.0) primer design software (Table 1), with amplicon sizes of 265, 231, 134, 159, and 95 bp.
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PMC9635307
However, homophilic ligation of the N-domains of CEACAM1 with another N-domain of CEACAM1 is the predominant means of physiologic interaction .
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PMC8143558
By the end of 2020, over 81 million people had tested positive and over 1,7 million had died due to the pandemic .
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PMC11172027
The influence of NASeLM on the mitochondrial activity of MTS-SK cells is shown in Figure 5A, depicting that all concentrations used from 0 to 500 µg/mL after 24 h period showed did not exhibit enough influence to minimize it.
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PMC10165258
The effect of drugs applied simultaneously was tested on the viability of EwS spheroids, following the timeline shown in Figure 5B.
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PMC11267830
e Pattern diagram.
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PMC9429973
When using cyclophosphamide, vinorelbine and plerixafor, patients additionally prescribed G-SCF.
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PMC11352746
These systems are composed of a phase-contrast microscope with two to five color fluorescent channels and a digital camera.
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PMC11792090
Furthermore, SAP UCAR-T cells maintained process stability during scale-up production, indicating the potential for large-scale manufacturing.
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PMC10237474
Importantly, this is the first study to show that Expi293F GnTI stable pools generated via the PB transposon system have remarkable expression titers and purification yields for different classes of soluble secreted proteins such as His or Fc-tagged soluble secreted proteins, ECDs and protein complexes.
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PMC11335267
Thus, Pomc/Cart-dependent mechanisms regulating satiety are altered in Alx3-deficient mice.
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PMC9621239
Each symbol represents an individual experiment. (
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PMC9429973
Patients with age < 65 years old and lymphopenia, with obesity (IMC>30) and oncological diseases have severe evolution, these patients developed severe pneumonia (more than 30-40% of pulmonary field evaluated CT scan); Wald 9.34, p=0.002; 0 p<0.0001.
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PMC11513011
Taken together, as to relationship between EMT and apoptosis and FOXM1, EMT is one of mechanisms for avoiding apoptosis and FOXM1 is a target of DIB, that is, inhibition of FoxM1-mediated DNA repair by DIB suppressing breast cancer growth and metastasis.
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PMC11721096
To verify whether CHO@hTYR could specifically adsorb to the tyrosinase inhibitors, a mixture of tyrosinase-positive and tyrosinase-negative compounds was prepared to assess the specific adsorption capacity of recombinant cells.
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PMC11015054
The METTL5 expression in HCC and paracancerous tissues was analyzed using HCC immunohistochemical microarrays and bioinformatic retrieval methods to correlate METTL5 with clinicopathological features and survival prognosis.
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PMC10440586
The Rembrandt dataset was normalized by non-tumor samples and then served as the input matrices.
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PMC11779993
Bacteria in glycerol stock was streaked on TSA agar plate and then incubated overnight at 37°C.
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PMC9429973
Among the two largest SM-AHN subtypes, pts with SM-CMML (n = 72) had a lower ANC (p = 0.02) and tryptase levels (p = 0.04) than pts with MDS/MPN-U (n = 36).
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PMC11474209
produce MCs .
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PMC10565698
CircUSP10, composed of exons 5–11, is resistant to digestion by RNase R and has a stable closed-loop structure.
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PMC11420784
These data imply that PldA is required for UPEC to evade lysosome exocytosis both in vitro and ex vivo.
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PMC11585587
Western blot was used to analyze the expression level of apoptosis-related proteins in MM.1 S (C) and RPMI 8226 (G) cells.
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PMC9429973
To extend our data and to get a specific set of interaction partners involved in the transcriptional role of CDK6, we performed a nuclear fractionation prior to immunoprecipitation and mass spectrometry.
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PMC8873393
Scale bar = 50 μm.
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PMC11656048
The findings could provide a new idea for further improving the prognosis for patients with OS, and provide a theoretical basis and solid foundation for the clinical application of shikonin.
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PMC10123657
Total activity of aldehyde dehydrogenase (ALDH) was determined using 50 μg of cellular protein extract and measuring the production of NADH during aldehyde oxidation as previously reported .
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PMC11637820
This study was approved by the Institutional Ethics Committee of SRIHER (CSP/23/DEC/140/931).
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PMC11683240
Research has shown that PT is responsible for extended and severe inflammation in the airways, for example, in mouse models (9, 10).
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PMC11696576
Inhibition of cPLA2α would then have both epigenetic and metabolic consequences for this cell type (Fig. 7c).
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PMC8526701
TUNEL-positive cells were counted and plotted.
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PMC11766309
By integrating these therapeutic perspectives, we extend the translational relevance of YKT6 from a prognostic biomarker to a potential target for precision medicine in oncology.
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PMC9684669
To investigate the mechanism underlying this synergistic effect, we first examined two conventional terfenadine targets: the histamine H1 receptor (H1R) (37) and the human ether-a-go-go-related gene (hERG) channel (38).
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PMC11469524
α-IgM treatment in combination with Rapamycin (mTORC1) or SB203580 (p38) clustered and colocalized well with α-IgM+DMSO treatment.
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PMC11711127
Interestingly, inhibiting PKC-θ or disrupting the vimentin intermediate filament networks promotes Treg suppressive capacity (150).
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Rates of CCyR and MMR are shown in the Table.
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PMC7582629
Of note, Raman imaging can be used to study the uptake and the localization of silica-based diatomite nanoparticles (DNPs, size around 300–400 nm) conjugated with a non-targeting siRNA into cancer cell lines (H1355) for up to 72 h .
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PMC11592008
After treatment, the cells were trypsinized with 0.25% Trypsin–EDTA for 5 min, followed by centrifugation at 200× g for 5 min.
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PMC11711935
Additionally, the economic burden of treatment and the potential impact on professional and social lives further underline the importance of understanding and addressing these disorders.
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PMC10297204
Values of p < 0.05 were considered statistically significant.
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PMC10812665
The tubulin polymerization rate was determined by the change in absorbance at 340 nm over time .
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PMC11185260
In our previous effort to characterize scL nanocomplex encapsulating TP53 plasmid DNA (scL-p53) by cryogenic electron microscopy and atomic force microscopy, a virus-like structure of nanocomplex with ~100 nm in diameter was observed.26 Agarose gel motility shift assay of the same nanocomplex demonstrated that when prepared using the optimal ratio, >99.5% of the plasmid DNA used in the preparation of the nanocomplex was encapsulated.26 scL-SMARCB1 differs from scL-p53 nanocomplex only in the identity of the tumor suppressor cDNA present in the plasmid DNA component; the targeting single-chain monoclonal antibody and the cationic liposome are identical.
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Progression to acute myeloid leukemia (AML) was seen in 72 pts (49%), and the mOS from the time of AML diagnosis was 3.4 mo.
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PMC9275501
Hydrophobic nuclei are commonly used to encapsulate poorly water-soluble or hydrophobic drugs, which can improve the solubility and bioavailability of encapsulated drugs and avoid rapid degradation of drugs in vivo.
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PMC11696659
In this regard, it has been suggested that a combination of multiple techniques and biomarkers, perhaps aided with computational models based on machine learning, could be the best approach .
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PMC10840195
In our study, Sunitinib-resistant cell lines showed higher migration invasiveness, and detection of EMT-path-related proteins revealed that EMT transition to mesenchymal epithelium (MET) showed higher migration invasiveness.
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PMC5874706
Empty nanoparticles had no effect on cell viability.
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PMC3675084
We also observed the endogenous expression of survivin, a mitosis regulator and inhibitor of apoptosis protein, in OVCAR-3 and SKOV-3 cells (Figure 5A, B).
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PMC11682172
CORO1A mRNA expression levels of 204 primary breast cancers associated with different sites of metastasis: brain (n = 8); brain and other organs (n = 8); other metastatic organs (n = 169) and metastasis to the contralateral breast (n = 19).
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PMC4695073
As to age classifications, XPA level displayed more high value in prognostic prediction for younger (age≤50) patients than the older ones (age>50) (Figures 3A, 3B, 4A and 4B).
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PMC9429973
Our data show that future studies of the clinical significance and prognostic role of BAALC gene would be worth.
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PMC11569208
The HTS found 78 targets situated in the upper right quadrant with viral titer fold-change greater than 1.5 and P-value less than 0.05.
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RNF121 can also act as a broad regulator of NF-κB signalling.
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PMC11055510
Western blot analyzed the effect of miR-135a-3p interaction with IL1RAP on protein levels of IL1RAP, TAK1, and p-TAK1 in SKOV3 cells. *
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PMC9429973
Results: As of Feb 1, 2022, five patients (mean age [range], 26 [19-35] years old) have been treated with ARU-1801 gene therapy for SCD.
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PMC9596868
5Effect of quercetin and MST-312 on expression of DNA damage response proteins and telomerase activity. (
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PMC11344246
We hypothesise that the effect in organoid lines may be related to the dependency of these lines for Wnt supplementation to the media.
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PMC11697703
Briefly, corticospinal projection neurons were retrogradely labeled at P1 from the cerebral peduncle by injection of cholera toxin B subunit (CTB) from Vibrio cholerae with FITC conjugate (List Biological Laboratories, Campbell, CA) under ultrasound microscopic guidance.
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PMC9895440
Mean and SD are shown.
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PMC8557138
Employing these models, the authors demonstrated tumor cells derived IL-8 along with VEGF markedly upregulated the invasiveness of endothelial sprouts (DelNero et al. 2015).
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PMC10094712
Therefore, in our case, the optimal conditions for the synthesis of recombinant hSELENOM in bacterial cells of the Rosetta (DE3)pLysS strain (Novagen, USA) were achieved by inducing the lactose operon with 0.5 mM IPTG for 3 h at 25 °C.
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PMC9646302
We also conducted GST-pulldown assays to verify the direct interaction between LAPTM5 and RAC1 (Figure 5(g) and 5(h)).
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PMC7342409
GIST882-ir +im, 4.
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The unmodified ferra bis(dicarbollide) ion (2) also enhanced ROS production and apoptosis in cisplatin-treated A2780cis cells.
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PMC11470381
Both actin-GFP and Piezo1-mCherry channels have been shown for the detected ROI.
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PMC11180402
Moreover, ISO treatment induces autophagy and inhibits cell growth in UM-UC-3 cells through JNKs/JUN-dependent transcriptional induction of SESN2 .
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PMC10898159
These proteins function as “readers” that tether acetylated lysine residues to both histone and non-histone proteins such as TF, and control genes expression.
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PMC11023271
The Level of RIPK4 mRNA and GAPDH mRNA (as control) was measured by qPCR using the PowerTrack Sybrgreen master mix (Fisher Scientific #A46109) and human RIPK4- or GAPDH-specific primers.
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We first used dataset 1 (Table 1) to assess whether perfect TCR sequence matching raised the likelihood of T cell state matching.
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Numbers of genotyped clones with genotypes B, C and D were counted and compared between tumour and non-tumour tissues.
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PMC11511922
Correction to: Scientific Reports 10.1038/s41598-018-32861-w, published online 27 September 2018 This Article contains errors.
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PMC9503685
While the IC50 values of ceragenins were in the range of 11.37 ± 3.88 and 40.05 ± 2.65 mg/L, the IC50 values of AMPs were determined between 40.76 ± 5.35 and >200 mg/L. The poloxamer form of CSA-131 showed the lowest cytotoxicity among ceragenins (40.05 ± 2.65 mg/L).
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PMC10452486
Detailed investigations have been carried out by Kollnberger and his team of investigators on KIR and HLA-I variants in spondyloarthropathies and other diseases.
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PMC11746948
To select cDNA fragments of preferentially 370~420 bp in length, the library fragments were purified with AMPure XP system (Beckman Coulter, Beverly, USA).
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PMC9325715
The formation of the second layer was observed for the Fe concentrations between 600 and 1400 mg/L. Third layer formation begins at a Fe concentration of 1600 mg/L. It is noteworthy to mention, that classical isotherm models were developed for the description of surface sorption where the adsorbate in second adsorption layer is characterized by lower energy of adsorption.
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PMC11502327
In previous studies, we reviewed the independent predictive value of blood inflammatory complex markers for OC (24), and summarized and analyzed the specific mechanisms of natural polysaccharides against OC by intervening in inflammation and immune response, regulating tumor cell cycle, and affecting cell migration and invasion (25).
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PMC10582049
Representative images of histological subtypes identified in the experimental cohort (H&E staining, indolent n = 8, aggressive n = 7).
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YKT6 expression levels in normal tissues and cancers. (
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PMC11484188
The Scr group was transfected using Lipofectamine 2000 (Thermo Fisher Scientific, Inc.) with Luc-vector plasmid (500 ng/well) and was co-transfected with Luc-ATG7 3'UTR (50 ng/well) and Scr, whereas experimental group was transfected with Luc-vector plasmid (500 ng/well) and co-transfected with Luc-ATG7 3'UTR (50 ng/well) and miR-1343-3p mimic plasmid (500 ng/well; both Shanghai GenePharma Co., Ltd.).
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PMC11321678
After breaking the GEMs, the barcoded tagmented DNA was purified with SPRIselect Reagent Kit (Beckman Coulter, Pasadena, CA) and further amplified to enable sample indexing and enrichment of scATAC‐seq libraries.
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PMC11549062
Blots were visualized using the ECL chemiluminescent substrate reagent kit.
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PMC9429973
Overall, 9/36 pts (5 DCM, 3 MPCM, 1 mastocytoma) presented spontaneous complete regression of cutaneous lesions after a median time of 25 months (range: 17 months - 25 years).
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