Datasets:
OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
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PMC10582049
Representative images of CHP staining showing deposition of collagen in the tumor tissue isolated from patients with indolent and aggressive LUADs.
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PMC9429973
Our analysis showed that VEN-O ranked the first for ORR (SUCRA value 100%, probably the best 100%).
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PMC9429973
Mean PPPM all-cause costs were $18,552 and $2,837 in the on- and off-treatment phases, respectively.
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PMC9429973
Maintenance therapy with (Thal) post-ASCT with no impact on PFS (33 vs 32 mo, HR 1.24, p=0.47).
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PMC8708099
Increasing knowledge of the pathophysiology of immune-mediated diseases has led to the development of targeted therapies that can selectively interfere with the crucial mediators of the inflammatory process .
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PMC9429973
One pt discontinued blinatumomab due to persistent grade 2 tremor.
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PMC10582049
Also, we found a positive correlation between the gene expression of ADH1B CAF markers in early-stage LUADs and better survival.
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PMC11792740
Abnormal TCR signaling is a fundamental barrier to effective T-cell responses within the TME.
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PMC10729469
To isolate immune cells from brain, brain tissues were homogenized in Hanks’ balanced salt solution (HBSS) and passed through a 70 μm cell strainer.
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PMC6442998
Left panel: YAP-ir (in green) in GIST882 with DAPI nuclear counterstaining.
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PMC11422497
The cumulative evidence supports KIT as a functional target gene for miR-494-3p and further substantiates the oncogenic role of KIT in GISTs.
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PMC11622247
A control experiment used probe CEM14 (Fig. 6B) to target the TCR mRNA expressed by CCRF CEM cells.
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PMC9429973
D. Duarte, S. Duarte, C. Sol dos Reis, P. Silva Coelho, L. Leite, R. Branca, S. Roncon, C. Pinho Vaz, A. Campos Bone Marrow Transplantation Service, Instituto Português de Oncologia (IPO)-Porto; Instituto de Investigação e Inovação em Saúde (i3S), Universidade do Porto; Celular Therapy Service, Instituto Português de Oncologia (IPO)-Porto, Porto, Portugal Background: Hematopoietic stem cell (HSC) transplantation (HSCT) is used in the treatment of hematologic malignancies, bone marrow failure and immunodeficiencies and is often associated with cytomegalovirus (CMV) reactivation/infection.
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PMC11247842
On BTA20, we included two intronic variants for MAP3K1, both affecting the ncRNA LOC104975241.
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PMC9429973
PRLR expression was silenced using the CRISPR-Cas9 technology.
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PMC9429973
Median age was 72 y (range 20, 78 y), with 8 pts >70 y. Histologies included aggressive B-NHL (9), transformed follicular lymphoma (2), and mantle cell lymphoma (1).
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PMC9681981
The RT-qPCR results were analyzed in SAS ver.
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The culture was incubated at 30 C and 200 rpm.
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PMC10443665
Their cytotoxic effect has been expected, due to their polysaccharide structures, as findings by Shu et al. showed that polysaccharides from S. chinensis suppressed in vivo proliferation of H22 cells without toxic effects on tumor-bearing mice (31).
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PMC8270637
H9 cell, a normal human T lymphocyte line, can be activated into effector T cells that kill tumor cells using a CD3/CD28 antibody.
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PMC10170482
It has been shown that cancer cells’ detachment from the extracellular matrix elevates ROS levels.
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PMC11574271
Moreover, treatment of J82-oeRON cells with RON-specific inhibitor BMS-777607 significantly inhibited RON phosphorylation levels (Fig. 1G), This effect was also associated with diminished cell migration and invasive activity (Fig. 1J, K).
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PMC11224020
ER Flipper-TR probe from Spirochrome (SC021) was added 30 minutes before the start of the experiment.
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PMC5833712
The mechanism for this effect is unclear but may be a result of a stabilized ERβ protein when acetylated.
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PMC11435360
The BBN GEM group had 20% no invasion, 60% LP invasion, and 20% MP invasion, whereas the BBN PAG + GEM group had 100% no invasion (Figure 3D).
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PMC11724582
In addition, H1975 cells themselves do not secrete a small amount of TGF-β1, which supports the use of TGF-β1 as a CAF inducer in this study.
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PMC11591794
However, a decrease in cell viability was observed parallel to the increase in GA dose.
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PMC11591038
Therefore, whether enhancing HIF-1 activity may have positive impacts on AD by augmenting brain circulation or enhancing angiogenesis requires further investigation.
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PMC9424261
F Densitometric analysis of HERPUD1 protein expression in Bel-7402 and Bel-7404 cells normalized to housekeeping protein GAPDH.
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PMC9429973
One week after the second dose of the vaccine, the percentage of patients that tested positive for IgG against the RBD antigen was significantly inferior to that of HCP (71% vs 96%, P<.001).
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PMC4485786
The immunoscope was determined as published previously.
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PMC11435360
It is important to note that PAG inhibits many other pyridoxal 5′-phosphate-dependent enzymes, creating the potential for off-target effects of PAG administration.
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PMC9429973
The safety profile of IRd was similar and consistent to that previously reported.
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PMC9672323
7 × 10 PBMCs were stimulated by anti-CD3 (0.157 μg/mL, Biolegend, clone OKT3, cat.
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Statistical analyses: Tukey HSD post hoc one-way (B,C) or two-way (E,F) ANOVA.
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Time-to-event analyses utilized the Kaplan-Meier method.
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PMC9429973
N. Elenga, M. Etienne-Julan, G. Loko, R. AlOkka, A. Adel, M. Yassin pediatric, CHU Cayenne, Cayenne, French Guiana; CHU Guadeloupe, Point a pitre; CHU de Fort de France, Fort de France, France; pharmacy; Hematology, National Centre for Cancer Care and Research - Hamad Medical Corporation, doha, Qatar Background: Oxidative stress is one of the key contributors to the pathophysiology of sickle cell disease (SCD) and related complications including acute pain (vaso-occlusive crisis or VOC), tissue ischaemia, stroke, and acute chest syndrome (ACS).
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PMC11422497
KIT identified as a functional target gene for miR-494-3p in GISTs. (
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Nevertheless, our work revealed a role for OTULIN in regulating GPX4 protein stability and confirmed that the antiapoptotic effects associated with OTULIN and GPX4 are closely related to cisplatin resistance.
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PMC11549612
Statistical significance was set at p<0.05, p<0.01, and p<0.001.
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PMC11678841
The cell line was maintained by subculturing it twice a week at a temperature of 37 °C and 5% CO2.
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PMC9856122
In 2021, approximately 6 lakh deaths occurred due to HIV-related causes, and approx.
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PMC9429973
J. Strouse, U. Obdodo, H. Stapleton, D. Thompson Hematology, Duke University, Durham; Medical School, Lincoln Memorial University Debusk School of Osteopathic Medicine, Harrogate; Environmental Science and Policy, Duke Nicholas School of the Environment, Durham, United States of America Background: Sickle cell disease is a severe hemoglobinopathy that affects approximately 40,000 children in the United States and over 300,000 infants worldwide each year, mostly in Africa and India.
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PMC8913139
Next, a luciferase reporter assay showed that the miR-448 mimics reduced Wt-ROCK1 luciferase activity (P < 0.01, Figure 3(b)).
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PMC9429973
The pooled median OS was 16.7 months in 3 RCTs (N=161), 16.5 months in a single prospective study (N=34), and 14.4 months in 5 retrospective studies (N=1472).
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PMC10932641
The abnormal levels of lncRNA in the blood of cancer patients are closely associated with the presence of tumors, and the high stability and relative abundance of circulating lncRNA may make it a more reliable cancer biomarker.
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PMC9019892
Although several second‐ and third‐generation KIT kinase inhibitors have been developed that could overcome some of the KIT mutations conferring resistance, the low clinical responses and narrow safety window have limited their broad application.
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PMC10854447
Protein tyrosine kinases are important in signal transduction pathways that govern cellular processes such as proliferation, differentiation, migration, and angiogenesis.
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PMC11499381
Cells were imaged in a Phenix high-content imager, using a 63x lens in confocal mode.
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The SNX9-RlucII plasmid was made using NEBuilder HiFi DNA assembly with an RlucII backbone fragment amplified by PCR from CXCR4-RlucII (a gift from Nikolaus Heveker (Hôpital Sainte-Justine)) and PCR amplified fragment of the His-SNX9-pET15b plasmid.
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Workflow of HEK293S GnTI and Expi293F GnTI stable pool generation via the PB transposon system. (
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Nafamostat expressed eight interactions with 3CL having one Electrostatic Bond at GLU294 position, four Conventional Hydrogen Bonds at PRO135, GLY112, ASN206, VAL246 positions, one Pi-Sigma Bond at VAL205 position, one Pi-Alkyl Bond PRO111 position, and one Unfavorable Bond at LYS201 position (Table 3, Fig. 6).Table 1Non-bond interactions between the top three compounds (selected based on docking scores) and the MERS-CoV 3CL protein.
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PMC11297139
As a result, more researchers are striving to locate and create safe drugs targeting transcriptional cofactors that are linked indirectly to DNA and move around the genome.
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There is no significant difference in the impact of vitality.
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Finally, mathematical modeling is gaining interest as a way to better understand the biological phenomena in siRNA effects and delivery.
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Firstly, thermoresponsive poly (di (ethylene glycol) methyl ether methacrylate-co-oligo (ethylene glycol) methyl ether methacrylate) (PMEO2MA-OEGMA) polymer was anchored to gold nanocages to PMEO2MA-OEGMA-modified gold nanocages, where PMEO2MA-OEGMA served as a temperature-sensitive gate guard at a lower critical solution temperature of ca.
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PMC11785489
Given the central role of the TCR in T cell activation and differentiation, we and others have identified differences in TCR sequences (e.g., hydrophobicity, V gene selection) using bulk sequencing of flow-sorted T cell populations.
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PMC11291697
Data analysis was performed with the Agilent Cytogenomics v.5.2.0.20 software.
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For downstream analysis, readouts for both fractions of CM of each sample were combined and duplicates were removed in Microsoft Excel.
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PMC11406030
A single band of 153 kDa was detected when hybridized with a LMTK3-specific antibody or with LMTK3BP #1 (Figure 4C).Figure 4Binding affinity of LMTK3BP(A) A colorimetric biotin assay was performed with increasing concentrations (3.6, 4.5, 5.4, 6.2, and 18 μg) of N-terminal biotin-labeled LMTK3 peptide #1 and 50 μg of protein isolated from A2780 cells.
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The clinical characteristics and mortality of these patients were summarized.
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PMC11366496
Cell growth curves were assessed employing the CCK‐8 assay in several treatment cohorts. (
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The findings of this study will assist clinicians in diagnosing and better managing severe malaria cases.
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PMC11763111
For cytokine assays, 1 × 10 sorted CAR-T cells were co-cultured with 1 × 10 CCRF-CEM-Luc-GFP cells in 24-well plates, in 1 ml of medium, for 24 h. Supernatants were collected and analyzed for human cytokines and chemokines using the LEGENDplex Human Panel (BioLegend, 741189).
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PMC8750422
There is a need to explore novel oncogenic mechanisms to overcome these therapeutic limitations.
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PMC9429973
Apurinic/apyrimidinic endonuclease/redox factor 1 (APEX1) is a multifunctional protein that is essential for Base Excision Repair (BER), but also for gene transcription regulation, mainly involving the APEX1 redox signaling activity (Ref-1).
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PMC10366908
These results suggested that EMab-300 specifically recognizes mEGFR, and it is also useful for detecting endogenous mEGFR using flow cytometry.
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PMC6901583
a The phosphorylation of p65 was analyzed in the indicated cells by Western blotting.
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The individual treatments and their combination are safe for healthy skin cell lines at low concentrations, ranging from 5 µM to 20 µM for TQ and 2.5 µM to 25 µM for CU.
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PMC11377827
The association of USP43 with HIF-1α was also observed in other cell lines (A549 and MCF7 cells) (Fig. EV3D,E).
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PMC11323699
Interestingly, these associations appear T-cell specific since no correlation exists when considering CD68 and CD163 before or after NACT, for either the CD47 or the CD47 subset (Suppl.
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PMC7961460
The expression of c10orf118 was verified in breast cancer patient specimens and was found to be associated with the presence of estrogen receptor that characterizes a good patient survival.
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The means ± SDs are provided (n = 5). **
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Interestingly, vitamin A and its metabolites have been used as a differentiation modulator of malignant cells for cancer treatment.
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Images are the removed tumors in the mice that were killed on day 19.
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PMC9878278
The effect of siMDA5 on phosphorylated IRF3 (p-IRF3) protein expression was determined in both mock-and ZIKV-infected SC at 48 hpi by Western blotting. (
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PMC11222184
The fact that BMI1, ETS2, IGFBP7, MAP2K3, SOD1 expressions are downregulated in SH-SY5Y cells after XL-888 treatment supports the cytotoxic effect of XL-888 against these cells.
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Group comparisons in B, C, and E were performed using two-tailed paired t-tests, with statistical significance indicated by asterisks (***p < 0.001, **p < 0.01, *p < 0.05, NS.
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In total, the cell line was screened three times, generating triplicate SF datasets.
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JAK2-positive and -negative groups were compared using Student’s t-tests or χ tests, as appropriate.
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PMC11806106
Single-cell FRET measurements were further corrected for background fluorescence, bleed-through of CFP into YFP channel, and false excitation of YFP using Microsoft Excel.
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Still images from a time-lapse video (Movie S2) of progerin-SMCs showing the formation of nuclear bleb on an existing bleb after a NM rupture. (
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PMC11411004
Based on the cell count, RIPA lysate was administered, and the samples were promptly relocated to a consistently chilled freezer for storage.
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In the hypothalamus, we confirmed the presence of Alx3 protein by western blot (Fig. 6C).
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Data are shown as mean ± SEM. ***
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7‐AAD negatives cells were used for the analysis.
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Cross‐validation for tuning parameter selection in the LASSO regression model. (
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In addition, long-term or acute bleeding has been related to thrombotic and ischemic phenomena.
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The initiation of mammalian cell culture as the fundamental method for biopharmaceutical manufacturing in the industry was triggered by the approval of the human tissue plasminogen activator (Genentech, USA) by the FDA in 1986, which was the first therapeutic protein obtained from recombinant mammalian cells (Kim et al. 2012; Lee et al. 2015).
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PMC11701801
The mice were randomized into two groups when the tumors were palpable (about 14–21 days after implantation).
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orally in the neurosurgical context).
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Notably, they regulate oncogenes or oncogene-like proteins, thus serving a key role in biological processes such as cell proliferation, autophagy, apoptosis and differentiation (4).
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The toxic side effects of chemotherapy are important factors affecting its efficacy and compliance.
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Matrix metalloproteinases (MMPs) play a crucial role in the destruction of articular cartilage [, ].
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PMC11737091
In ccRCC, the top five immunoinhibitors that are most strongly correlated with DBF4 are KDR, LAG3, IL10, BTLA, and TIGIT, whereas the top five immunostimulators that are most strongly correlated with DBF4 are IL6R, CD80, MIC8, TNFSF4, and IL6 (Fig. 4D).
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PMC10237474
no. 15338–100, Gibco).
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Cell Domes with cells incubated for 10 days or high-density Cell Domes with cells incubated for 3 days were incubated for 72 h in the medium containing 10, 100, and 1000 nM doxorubicin (DOX; Fujifilm Wako Chemical).
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PMC11687167
MAPK signaling inhibitors such as U0126 and SB203580 can prevent lung, breast, and melanoma tumor cell- and Treg cell-mediated T-cell senescence, thereby enhancing antitumor immunity and the efficacy of immunotherapy in vivo .
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PMC10530622
The bacteria or their metabolites interfere with transporter activity and expression, reinforcing the role of the microbiota in oxalate availability .
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A little lower cytotoxicity against the A549 cell line was reported for nano-GO particles stabilized with PLA-PEG copolymers .
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