Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC11590870
In particular, leucine reduces Fe, and has a long aliphatic side chain that interacts with the acyl chains of fatty acids .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "particular", ",", "leucine", "reduces", "Fe", ",", "and", "has", "a", "long", "aliphatic", "side", "chain", "that", "interacts", "with", "the", "acyl", "chains", "of", "fatty", "acids", "." ] } ]
PMC10530622
This heterogeneity among studies was considered a major issue in a meta-analysis published in 2020 and a reason not to declare a substantial causal relationship between urinary stones and CVD.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "heterogeneity", "among", "studies", "was", "considered", "a", "major", "issue", "in", "a", "meta-analysis", "published", "in", "2020", "and", "a", "reason", "not", "to", "declare", "a", "substantial", "causal", "relationship", "between", "urinary", "stones", "and", "CVD", "." ] } ]
PMC9504875
Nonstructural protein 2 (NS2) of human orthopneumovirus (belonging to the Pneumoviridae family; formerly named human respiratory syncytial virus) binds to RIG-I to prevent association with MAVS .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nonstructural", "protein", "2", "(", "NS2", ")", "of", "human", "orthopneumovirus", "(", "belonging", "to", "the", "Pneumoviridae", "family", ";", "formerly", "named", "human", "respiratory", "syncytial", "virus", ")", "binds", "to", "RIG-I", "to", "prevent", "association", "with", "MAVS", "." ] } ]
PMC8735881
In brief, 1×10 RHPA.c/2635-infected CEMss-CCR5 cells (donor cells) were mixed with 5×10 vector-transduced CEMss-CCR5 cells (target cells), and seeded into a 12-well plate for coculturing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "brief", ",", "1", "×", "10", "RHPA.c/2635-infected", "CEMss-CCR5", "cells", "(", "donor", "cells", ")", "were", "mixed", "with", "5", "×", "10", "vector-transduced", "CEMss-CCR5", "cells", "(", "target", "cells", ")", ",", "and", "seeded", "into", "a", "12-well", "plate", "for", "coculturing", "." ] } ]
PMC10421378
Figure 2 shows the recorded thermal properties of the samples, where it can be seen that the glass transition was recorded in a similar range as when using DSC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "2", "shows", "the", "recorded", "thermal", "properties", "of", "the", "samples", ",", "where", "it", "can", "be", "seen", "that", "the", "glass", "transition", "was", "recorded", "in", "a", "similar", "range", "as", "when", "using", "DSC", "." ] } ]
PMC11240448
The absolute value of each DPD score is defined as the signed distance function from a cell data point to the separating hyperplane.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "absolute", "value", "of", "each", "DPD", "score", "is", "defined", "as", "the", "signed", "distance", "function", "from", "a", "cell", "data", "point", "to", "the", "separating", "hyperplane", "." ] } ]
PMC11564322
, PPARγ (dilution 1:2000, cat.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ ",", "PPARγ", "(", "dilution", "1:2000", ",", "cat", "." ] } ]
PMC8658661
Other altered pathways in HB are signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) and signaling pathways PI3K/Akt, ERK, and p38 .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Other", "altered", "pathways", "in", "HB", "are", "signal", "transducer", "and", "activator", "of", "transcription", "3", "(", "STAT3", ")", "and", "signaling", "pathways", "PI3K/Akt", ",", "ERK", ",", "and", "p38", "." ] } ]
PMC9429973
Of the 105 samples sent for sequencing, 38 (36%) were from bone marrow, 37 (35%) peripheral blood, 7 (7%) skin, 5 (5%) lymph node, and 18 (17%) other.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "the", "105", "samples", "sent", "for", "sequencing", ",", "38", "(", "36", "%", ")", "were", "from", "bone", "marrow", ",", "37", "(", "35", "%", ")", "peripheral", "blood", ",", "7", "(", "7", "%", ")", "skin", ",", "5", "(", "5", "%", ")", "lymph", "node", ",", "and", "18", "(", "17", "%", ")", "other", "." ] } ]
PMC11286266
Bar graphs display the quantification of the fold-change of BiP::sfGFP (top) and XBP1s::mCherry signals (bottom) in more than three independent experiments indicated by mean ± standard error of the mean (SEM).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bar", "graphs", "display", "the", "quantification", "of", "the", "fold-change", "of", "BiP::sfGFP", "(", "top", ")", "and", "XBP1s::mCherry", "signals", "(", "bottom", ")", "in", "more", "than", "three", "independent", "experiments", "indicated", "by", "mean", "±", "standard", "error", "of", "the", "mean", "(", "SEM", ")", "." ] } ]
PMC11769516
However, further studies are needed to confirm the antioxidant properties of honey and to clarify its potential effect in the treatment of Fusarium mycotoxin poisoning .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "further", "studies", "are", "needed", "to", "confirm", "the", "antioxidant", "properties", "of", "honey", "and", "to", "clarify", "its", "potential", "effect", "in", "the", "treatment", "of", "Fusarium", "mycotoxin", "poisoning", "." ] } ]
PMC11707577
Confocal microscopy images of cells stained with Mitotracker and incubated with M13EGFR(TNP) (A–D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Confocal", "microscopy", "images", "of", "cells", "stained", "with", "Mitotracker", "and", "incubated", "with", "M13EGFR(TNP", ")", "(", "A", "–", "D", ")", "." ] } ]
PMC5363531
This suggests that the loss of LKB1, reducing AMPK activation, makes cells more sensitive to dasatinib which, in turn, induces cellular stress and downregulates both p70S6K and Akt phosphorylation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "suggests", "that", "the", "loss", "of", "LKB1", ",", "reducing", "AMPK", "activation", ",", "makes", "cells", "more", "sensitive", "to", "dasatinib", "which", ",", "in", "turn", ",", "induces", "cellular", "stress", "and", "downregulates", "both", "p70S6", "K", "and", "Akt", "phosphorylation", "." ] } ]
PMC11344246
Dose response curves for two organoid lines treated with RO-3306, Apcin and DCZ0415.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Dose", "response", "curves", "for", "two", "organoid", "lines", "treated", "with", "RO-3306", ",", "Apcin", "and", "DCZ0415", "." ] } ]
PMC9429973
Patient-reported outcomes will include general and lymphoma-specific measures of health-related quality of life assessed by the EORTC Quality of Life Questionnaire-Core 30 and Functional Assessment of Cancer Therapy – Lymphoma, and work productivity by the Work Productivity and Activity Impairment Questionnaire.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patient-reported", "outcomes", "will", "include", "general", "and", "lymphoma-specific", "measures", "of", "health-related", "quality", "of", "life", "assessed", "by", "the", "EORTC", "Quality", "of", "Life", "Questionnaire-Core", "30", "and", "Functional", "Assessment", "of", "Cancer", "Therapy", "–", "Lymphoma", ",", "and", "work", "productivity", "by", "the", "Work", "Productivity", "and", "Activity", "Impairment", "Questionnaire", "." ] } ]
PMC7868205
It is a key cell line that revolutionised cancer research by accounting for more than sixteen thousand scientific publications related to oncology.21 MTT assay, which is a widely applied or standard method to elucidate the cytotoxic potential of agents at the preclinical level, was used to determine the dose related to cell death.22 In pharmacology, half-maximal inhibitory concentration (IC50) is a determinant of how potent an antagonistic drug is.23 AgNPs are well known for their cytotoxicity on cancer cells, with a special mention to HeLa cells.24,25 Therefore, MTT assay was used in this study to determine the IC50 value which is a measure of the efficacy of the tested material.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "a", "key", "cell", "line", "that", "revolutionised", "cancer", "research", "by", "accounting", "for", "more", "than", "sixteen", "thousand", "scientific", "publications", "related", "to", "oncology.21", "MTT", "assay", ",", "which", "is", "a", "widely", "applied", "or", "standard", "method", "to", "elucidate", "the", "cytotoxic", "potential", "of", "agents", "at", "the", "preclinical", "level", ",", "was", "used", "to", "determine", "the", "dose", "related", "to", "cell", "death.22", "In", "pharmacology", ",", "half-maximal", "inhibitory", "concentration", "(", "IC50", ")", "is", "a", "determinant", "of", "how", "potent", "an", "antagonistic", "drug", "is.23", "AgNPs", "are", "well", "known", "for", "their", "cytotoxicity", "on", "cancer", "cells", ",", "with", "a", "special", "mention", "to", "HeLa", "cells.24,25", "Therefore", ",", "MTT", "assay", "was", "used", "in", "this", "study", "to", "determine", "the", "IC50", "value", "which", "is", "a", "measure", "of", "the", "efficacy", "of", "the", "tested", "material", "." ] } ]
PMC11247842
When de-regressed proofs, estimated breeding values, or DYD were used as phenotypes, weighted analysis based on accuracy was performed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "de-regressed", "proofs", ",", "estimated", "breeding", "values", ",", "or", "DYD", "were", "used", "as", "phenotypes", ",", "weighted", "analysis", "based", "on", "accuracy", "was", "performed", "." ] } ]
PMC9429973
Further patients deceased or being in remission and potentially therapy-related complications were considered.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", "patients", "deceased", "or", "being", "in", "remission", "and", "potentially", "therapy-related", "complications", "were", "considered", "." ] } ]
PMC11693599
Cancer stem cells (CSCs), a subpopulation of cells with acquired drug resistance, contribute to the recurrence and poor prognosis of ovarian cancer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cancer", "stem", "cells", "(", "CSCs", ")", ",", "a", "subpopulation", "of", "cells", "with", "acquired", "drug", "resistance", ",", "contribute", "to", "the", "recurrence", "and", "poor", "prognosis", "of", "ovarian", "cancer", "." ] } ]
PMC11467964
Correlations between risk score and immune cell types. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Correlations", "between", "risk", "score", "and", "immune", "cell", "types", ".", "(" ] } ]
PMC9926039
They are expressed on immune, endothelial, and various types of cancer cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "are", "expressed", "on", "immune", ",", "endothelial", ",", "and", "various", "types", "of", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC9672323
Figure 7The effect of drugs on the LDH activity of T cells in PBMCs alone or in co-culture condition.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "7The", "effect", "of", "drugs", "on", "the", "LDH", "activity", "of", "T", "cells", "in", "PBMCs", "alone", "or", "in", "co-culture", "condition", "." ] } ]
PMC10040136
Upon treating GIST cells with Wortmannin, an inhibitor of the PI3K-AKT signaling pathway, both the conditioned medium and recombinant TGF-β2 protein were unable to activate the PI3K-AKT signaling pathway in GIST cells (Fig. 5E, F).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Upon", "treating", "GIST", "cells", "with", "Wortmannin", ",", "an", "inhibitor", "of", "the", "PI3K-AKT", "signaling", "pathway", ",", "both", "the", "conditioned", "medium", "and", "recombinant", "TGF-β2", "protein", "were", "unable", "to", "activate", "the", "PI3K-AKT", "signaling", "pathway", "in", "GIST", "cells", "(", "Fig.", "5E", ",", "F", ")", "." ] } ]
PMC9351137
In particular, BAF53a, CFDP1, GAS41, and YL1 were found at the spindle in both metaphase and/or anaphase; Tip60 localized at the centrosomes and also showed a kinetochore accumulation, as previously reported .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "particular", ",", "BAF53a", ",", "CFDP1", ",", "GAS41", ",", "and", "YL1", "were", "found", "at", "the", "spindle", "in", "both", "metaphase", "and/or", "anaphase", ";", "Tip60", "localized", "at", "the", "centrosomes", "and", "also", "showed", "a", "kinetochore", "accumulation", ",", "as", "previously", "reported", "." ] } ]
PMC11435360
To investigate the effect of CSE-mediated H2S production on BC cell viability and bladder tumor progression, we inhibited CSE activity using the inhibitor PAG.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "the", "effect", "of", "CSE-mediated", "H2S", "production", "on", "BC", "cell", "viability", "and", "bladder", "tumor", "progression", ",", "we", "inhibited", "CSE", "activity", "using", "the", "inhibitor", "PAG", "." ] } ]
PMC9429973
AEs were grading according to Common Terminology Criteria (CTCAE) version 5.0.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "AEs", "were", "grading", "according", "to", "Common", "Terminology", "Criteria", "(", "CTCAE", ")", "version", "5.0", "." ] } ]
PMC11767725
This activates MAPK and NF-κB pathways, triggering the production of cytokines, chemokines, and adhesion molecules that perpetuate inflammation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "activates", "MAPK", "and", "NF-κB", "pathways", ",", "triggering", "the", "production", "of", "cytokines", ",", "chemokines", ",", "and", "adhesion", "molecules", "that", "perpetuate", "inflammation", "." ] } ]
PMC11786767
Scale bars represent (C) whole cells: 2 μm; segment: 5 μm; (E) 5 μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bars", "represent", "(", "C", ")", "whole", "cells", ":", "2", "μm", ";", "segment", ":", "5", "μm", ";", "(", "E", ")", "5", "μm", "." ] } ]
PMC8316344
5βTrCP-mediated ubiquitination of TFRC is essential for TRIB2 to decline labile iron.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "5βTrCP-mediated", "ubiquitination", "of", "TFRC", "is", "essential", "for", "TRIB2", "to", "decline", "labile", "iron", "." ] } ]
PMC11644761
Differentiated SK-N-BE cells were treated with 4 μM forskolin (Abcam, Cambridge, UK, Cat.
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Differentiated", "SK-N-BE", "cells", "were", "treated", "with", "4", "μM", "forskolin", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "UK", ",", "Cat", "." ] } ]
PMC9429973
At 9 months CR in 81/136 (59.6%) for I+V and 11/138 (8%) for I (p<0.0001).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "9", "months", "CR", "in", "81/136", "(", "59.6", "%", ")", "for", "I+V", "and", "11/138", "(", "8", "%", ")", "for", "I", "(", "p<0.0001", ")", "." ] } ]
PMC9503685
The study showed that high concentrations of LL-37 (2.5 g/L) are required for biofilm eradication.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "study", "showed", "that", "high", "concentrations", "of", "LL-37", "(", "2.5", "g/L", ")", "are", "required", "for", "biofilm", "eradication", "." ] } ]
PMC11411004
b Distribution of apoptosis two days after the addition of I-4 and c cell cycle distribution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "b", "Distribution", "of", "apoptosis", "two", "days", "after", "the", "addition", "of", "I-4", "and", "c", "cell", "cycle", "distribution", "." ] } ]
PMC9429973
As it can be shown, the AI algorithm demonstrated similar performance to that of a hematologist.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "it", "can", "be", "shown", ",", "the", "AI", "algorithm", "demonstrated", "similar", "performance", "to", "that", "of", "a", "hematologist", "." ] } ]
PMC11286266
For the construction of the WT LD repair template (WT; UK3054), a minigene block that contains exons 10–17 of cgATF6α (785 bp; GenScript) was digested with AgeI and AflII and ligated into AgeI/ AflII-digested pUC57 plasmid.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "the", "construction", "of", "the", "WT", "LD", "repair", "template", "(", "WT", ";", "UK3054", ")", ",", "a", "minigene", "block", "that", "contains", "exons", "10–17", "of", "cgATF6α", "(", "785", "bp", ";", "GenScript", ")", "was", "digested", "with", "AgeI", "and", "AflII", "and", "ligated", "into", "AgeI/", "AflII-digested", "pUC57", "plasmid", "." ] } ]
PMC11648299
DD affects all ethnicities; our investigation was conducted in Sweden where most citizens have skin types ranging from 1 to 3.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DD", "affects", "all", "ethnicities", ";", "our", "investigation", "was", "conducted", "in", "Sweden", "where", "most", "citizens", "have", "skin", "types", "ranging", "from", "1", "to", "3", "." ] } ]
PMC11679326
Traditionally, unique glycocode readers, carbohydrate-binding proteins, have been used to identify differentially expressed carbohydrate determinants associated with the tumor cell surface.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Traditionally", ",", "unique", "glycocode", "readers", ",", "carbohydrate-binding", "proteins", ",", "have", "been", "used", "to", "identify", "differentially", "expressed", "carbohydrate", "determinants", "associated", "with", "the", "tumor", "cell", "surface", "." ] } ]
PMC11612794
Schematic representation of chicken Dsn1 (349 aa).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Schematic", "representation", "of", "chicken", "Dsn1", "(", "349", "aa", ")", "." ] } ]
PMC11656657
Five-day co-cultures were performed in 6 to 16 independent experiments, in which GFP + OS (A, bottom panel), ERMS (B, bottom panel) and ARMS (C, bottom panel), Ewing (D, bottom panel) cell lines were co-cultured with NT T or CAR.GD2 T-cells at the effector-target (E: T) ratio of 1:1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Five-day", "co-cultures", "were", "performed", "in", "6", "to", "16", "independent", "experiments", ",", "in", "which", "GFP", "+", "OS", "(", "A", ",", "bottom", "panel", ")", ",", "ERMS", "(", "B", ",", "bottom", "panel", ")", "and", "ARMS", "(", "C", ",", "bottom", "panel", ")", ",", "Ewing", "(", "D", ",", "bottom", "panel", ")", "cell", "lines", "were", "co-cultured", "with", "NT", "T", "or", "CAR.GD2", "T-cells", "at", "the", "effector-target", "(", "E", ":", "T", ")", "ratio", "of", "1:1", "." ] } ]
PMC11640555
Therefore, the effect of CX-4945 on the NF-κB pathway was evaluated on U-87 cell lysates by Western blot analysis (Figure 2A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "the", "effect", "of", "CX-4945", "on", "the", "NF-κB", "pathway", "was", "evaluated", "on", "U-87", "cell", "lysates", "by", "Western", "blot", "analysis", "(", "Figure", "2A", ")", "." ] } ]
PMC4369959
Thus authors highlight the importance of consuming whole foods over active constituents.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", "authors", "highlight", "the", "importance", "of", "consuming", "whole", "foods", "over", "active", "constituents", "." ] } ]
PMC11412721
Interestingly, Trp53 Eμ-myc males, which develop lymphomas less rapidly, exhibited the lowest number of immature B cells (Figure 3A), suggesting a direct correlation between the level of immature B cell expansion and the speed of lymphomagenesis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "Trp53", "Eμ-myc", "males", ",", "which", "develop", "lymphomas", "less", "rapidly", ",", "exhibited", "the", "lowest", "number", "of", "immature", "B", "cells", "(", "Figure", "3A", ")", ",", "suggesting", "a", "direct", "correlation", "between", "the", "level", "of", "immature", "B", "cell", "expansion", "and", "the", "speed", "of", "lymphomagenesis", "." ] } ]
PMC6222635
The results of this study have shown that the skeleton of the polysaccharides from wild-grown and greenhouse-grown Dendrobium officinale was the same and consisted of (1→4)-linked mannose and (1→4)-linked glucose.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "of", "this", "study", "have", "shown", "that", "the", "skeleton", "of", "the", "polysaccharides", "from", "wild-grown", "and", "greenhouse-grown", "Dendrobium", "officinale", "was", "the", "same", "and", "consisted", "of", "(1→4)-linked", "mannose", "and", "(1→4)-linked", "glucose", "." ] } ]
PMC10040136
All experiments were repeated at least thrice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "experiments", "were", "repeated", "at", "least", "thrice", "." ] } ]
PMC8357004
Asterisks (*) indicate significant differences between the treated and untreated groups The relative expression level of p16INK4a, p14ARF, p15INK4b genes in the Caco-2 cell line treated with TSA (2.5 μm) versus untreated control groups (24 and 48 h).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Asterisks", "(", "*", ")", "indicate", "significant", "differences", "between", "the", "treated", "and", "untreated", "groups", "The", "relative", "expression", "level", "of", "p16INK4a", ",", "p14ARF", ",", "p15INK4b", "genes", "in", "the", "Caco-2", "cell", "line", "treated", "with", "TSA", "(", "2.5", "μm", ")", "versus", "untreated", "control", "groups", "(", "24", "and", "48", "h", ")", "." ] } ]
PMC11544122
Bars represent the mean ± SD from multiple independent experiments as described above for each receptor.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bars", "represent", "the", "mean", "±", "SD", "from", "multiple", "independent", "experiments", "as", "described", "above", "for", "each", "receptor", "." ] } ]
PMC11098378
The supernatant was transferred to a new tube before adding 25 μg of the GST-IpaH4-3xFlag-ub construct and incubating for 1 h at 4°C with rotation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "supernatant", "was", "transferred", "to", "a", "new", "tube", "before", "adding", "25", "μg", "of", "the", "GST-IpaH4", "-", "3xFlag-ub", "construct", "and", "incubating", "for", "1", "h", "at", "4", "°", "C", "with", "rotation", "." ] } ]
PMC9429973
Demographics, risk stratification, treatment received, adverse events & survival was collected & analysis performed on Microsoft excel v16.57 & SPSS Statistics v28.0.1.1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Demographics", ",", "risk", "stratification", ",", "treatment", "received", ",", "adverse", "events", "&", "survival", "was", "collected", "&", "analysis", "performed", "on", "Microsoft", "excel", "v16.57", "&", "SPSS", "Statistics", "v28.0.1.1", "." ] } ]
PMC11387401
NC assay comparison p values were all 0.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "NC", "assay", "comparison", "p", "values", "were", "all", "0", "." ] } ]
PMC5311252
In summary, the analysis across multiple cancer types strongly supports the results of the LUAD analysis, indicating that oncomotif-miRNAs are in fact an integrated part of the oncogenic signaling network that drives cancer cell proliferation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "summary", ",", "the", "analysis", "across", "multiple", "cancer", "types", "strongly", "supports", "the", "results", "of", "the", "LUAD", "analysis", ",", "indicating", "that", "oncomotif-miRNAs", "are", "in", "fact", "an", "integrated", "part", "of", "the", "oncogenic", "signaling", "network", "that", "drives", "cancer", "cell", "proliferation", "." ] } ]
PMC11409031
Through the analysis of these data, future studies may uncover additional biomarkers, prognostic factors, and potential therapeutic targets to advance precision medicine for OV .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Through", "the", "analysis", "of", "these", "data", ",", "future", "studies", "may", "uncover", "additional", "biomarkers", ",", "prognostic", "factors", ",", "and", "potential", "therapeutic", "targets", "to", "advance", "precision", "medicine", "for", "OV", "." ] } ]
PMC11486946
Trajectories outside the cell region determined by the AI-aided cell search algorithm were removed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Trajectories", "outside", "the", "cell", "region", "determined", "by", "the", "AI-aided", "cell", "search", "algorithm", "were", "removed", "." ] } ]
PMC11066331
Heat map with hierarchical clustering analysis (Ward metric) of the 75 m/z signals (C).Fig.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Heat", "map", "with", "hierarchical", "clustering", "analysis", "(", "Ward", "metric", ")", "of", "the", "75", "m/z", "signals", "(C).Fig", "." ] } ]
PMC11045125
B. Immunoblot analysis was performed to compare expression of various different GC B cell proteins as indicated in stable tumor-derived cell lines (N1, N3, N4) versus the P493-6 cell line (with Myc expression turned on).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B.", "Immunoblot", "analysis", "was", "performed", "to", "compare", "expression", "of", "various", "different", "GC", "B", "cell", "proteins", "as", "indicated", "in", "stable", "tumor-derived", "cell", "lines", "(", "N1", ",", "N3", ",", "N4", ")", "versus", "the", "P493", "-", "6", "cell", "line", "(", "with", "Myc", "expression", "turned", "on", ")", "." ] } ]
PMC6487404
The intestine was carefully everted on a glass rod (3.0 mm diameter), filled with 2 mL of Krebs buffer, and divided into sacs approximately 4.5 cm in length with silk suture.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intestine", "was", "carefully", "everted", "on", "a", "glass", "rod", "(", "3.0", "mm", "diameter", ")", ",", "filled", "with", "2", "mL", "of", "Krebs", "buffer", ",", "and", "divided", "into", "sacs", "approximately", "4.5", "cm", "in", "length", "with", "silk", "suture", "." ] } ]
PMC11474209
Cyanobacteria are characterized by gene sequences that code for producing toxic metabolites; various genera of cyanobacteria release these toxins.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cyanobacteria", "are", "characterized", "by", "gene", "sequences", "that", "code", "for", "producing", "toxic", "metabolites", ";", "various", "genera", "of", "cyanobacteria", "release", "these", "toxins", "." ] } ]
PMC9429973
Transient margination of CD4 and CD8 T cells was strongest in pts with CR.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transient", "margination", "of", "CD4", "and", "CD8", "T", "cells", "was", "strongest", "in", "pts", "with", "CR", "." ] } ]
PMC9780037
Here, I discuss these research lines and how their timely conjunction can advance cancer therapy and prognosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "I", "discuss", "these", "research", "lines", "and", "how", "their", "timely", "conjunction", "can", "advance", "cancer", "therapy", "and", "prognosis", "." ] } ]
PMC11632064
Fold change in cell count during the exponential growth phase of MeWo and A-375 cells. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fold", "change", "in", "cell", "count", "during", "the", "exponential", "growth", "phase", "of", "MeWo", "and", "A-375", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC10502403
The Roman numerals (I, II, and III) at the top of each sample name indicate that the T cells were derived from the same healthy donor and induced on the same day. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Roman", "numerals", "(", "I", ",", "II", ",", "and", "III", ")", "at", "the", "top", "of", "each", "sample", "name", "indicate", "that", "the", "T", "cells", "were", "derived", "from", "the", "same", "healthy", "donor", "and", "induced", "on", "the", "same", "day", ".", "(" ] } ]
PMC11697703
For miRNA expression analysis after Fezf2 and Fezf2 shRNA expression in N2A cells and neurons, miRNAs were isolated using miRVana isolation kit (Ambion), cDNA was prepared using Agilent mRNA 1st-strand synthesis kit (Agilent, Cat.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "miRNA", "expression", "analysis", "after", "Fezf2", "and", "Fezf2", "shRNA", "expression", "in", "N2A", "cells", "and", "neurons", ",", "miRNAs", "were", "isolated", "using", "miRVana", "isolation", "kit", "(", "Ambion", ")", ",", "cDNA", "was", "prepared", "using", "Agilent", "mRNA", "1st-strand", "synthesis", "kit", "(", "Agilent", ",", "Cat", "." ] } ]
PMC11676169
A comparable interaction was observed in the T-ALL cell line CCRF-CEM (Figure 2G).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "comparable", "interaction", "was", "observed", "in", "the", "T-ALL", "cell", "line", "CCRF-CEM", "(", "Figure", "2", "G", ")", "." ] } ]
PMC11380454
Moreover, AS101 and SAS may increase, at least in part, chemosensitivity through inhibition of the VLA-4/IL-10/PD-L1 pathway.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "AS101", "and", "SAS", "may", "increase", ",", "at", "least", "in", "part", ",", "chemosensitivity", "through", "inhibition", "of", "the", "VLA-4/IL-10/PD-L1", "pathway", "." ] } ]
PMC11412721
However, aberrant RNA splicing is a common feature of cancer cells (Graubert et al., 2012; Martin et al., 2013; Pajares et al., 2007; Sette and Paronetto, 2022) and to which extent alternative splicing generates functionally relevant proteins is controversial (Abascal et al., 2015; Bardot and Toledo, 2015; Blencowe, 2017; Tress et al., 2017a; Tress et al., 2017b; Ule and Blencowe, 2019; Weatheritt et al., 2016).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "aberrant", "RNA", "splicing", "is", "a", "common", "feature", "of", "cancer", "cells", "(", "Graubert", "et", "al.", ",", "2012", ";", "Martin", "et", "al.", ",", "2013", ";", "Pajares", "et", "al.", ",", "2007", ";", "Sette", "and", "Paronetto", ",", "2022", ")", "and", "to", "which", "extent", "alternative", "splicing", "generates", "functionally", "relevant", "proteins", "is", "controversial", "(", "Abascal", "et", "al.", ",", "2015", ";", "Bardot", "and", "Toledo", ",", "2015", ";", "Blencowe", ",", "2017", ";", "Tress", "et", "al.", ",", "2017a", ";", "Tress", "et", "al.", ",", "2017b", ";", "Ule", "and", "Blencowe", ",", "2019", ";", "Weatheritt", "et", "al.", ",", "2016", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Laboratory parameters (hemoglobin (Hb) levels, hematocrit, WBC counts, reticulocyte counts, and LDH levels) were measured at baseline and follow-up time points.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Laboratory", "parameters", "(", "hemoglobin", "(", "Hb", ")", "levels", ",", "hematocrit", ",", "WBC", "counts", ",", "reticulocyte", "counts", ",", "and", "LDH", "levels", ")", "were", "measured", "at", "baseline", "and", "follow-up", "time", "points", "." ] } ]
PMC6835428
Current chemotherapy is based on the use of the combined systemic administration of cisplatin–paclitaxel (PTX) .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Current", "chemotherapy", "is", "based", "on", "the", "use", "of", "the", "combined", "systemic", "administration", "of", "cisplatin", "–", "paclitaxel", "(", "PTX", ")", "." ] } ]
PMC11300639
e–k 786-O and A498 cells were infected with indicated shRNAs for 72 h. Then, these cells were treated with or without Everolimus and subjected to western blotting, transwell, CCK-8, tube formation, and nude mouse xenografts assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "e", "–", "k", "786-O", "and", "A498", "cells", "were", "infected", "with", "indicated", "shRNAs", "for", "72", "h.", "Then", ",", "these", "cells", "were", "treated", "with", "or", "without", "Everolimus", "and", "subjected", "to", "western", "blotting", ",", "transwell", ",", "CCK-8", ",", "tube", "formation", ",", "and", "nude", "mouse", "xenografts", "assay", "." ] } ]
PMC9847912
To our knowledge, GSK232 has not been tested against HIV-2, and there are limited data regarding the susceptibility of HIV-2 to other HIV-1 maturation inhibitors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "our", "knowledge", ",", "GSK232", "has", "not", "been", "tested", "against", "HIV-2", ",", "and", "there", "are", "limited", "data", "regarding", "the", "susceptibility", "of", "HIV-2", "to", "other", "HIV-1", "maturation", "inhibitors", "." ] } ]
PMC11547972
The present study investigated whether the combination of two herbal drugs, the cyanogenic diglucoside amygdalin and the isothiocyanate sulforaphane (SFN), influences growth and proliferation of renal cell carcinoma (RCC) cell lines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "present", "study", "investigated", "whether", "the", "combination", "of", "two", "herbal", "drugs", ",", "the", "cyanogenic", "diglucoside", "amygdalin", "and", "the", "isothiocyanate", "sulforaphane", "(", "SFN", ")", ",", "influences", "growth", "and", "proliferation", "of", "renal", "cell", "carcinoma", "(", "RCC", ")", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC11267830
For cell proliferation, each group (2000 cells/well) was assessed using a CCK-8 assay (APExBIO, K1018) on days 2, 4, 6, and 8, and the absorbance was measured at 450 nm with a Bio-Rad microplate absorbance reader (Bio-Rad).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "cell", "proliferation", ",", "each", "group", "(", "2000", "cells/well", ")", "was", "assessed", "using", "a", "CCK-8", "assay", "(", "APExBIO", ",", "K1018", ")", "on", "days", "2", ",", "4", ",", "6", ",", "and", "8", ",", "and", "the", "absorbance", "was", "measured", "at", "450", "nm", "with", "a", "Bio-Rad", "microplate", "absorbance", "reader", "(", "Bio-Rad", ")", "." ] } ]
PMC11451940
ESI mass spectra (m/z, corresponding species (theor.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ESI", "mass", "spectra", "(", "m/z", ",", "corresponding", "species", "(", "theor", "." ] } ]
PMC11714165
NBD‐T could also partially inhibit osteoclast formation to some extent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "NBD‐T", "could", "also", "partially", "inhibit", "osteoclast", "formation", "to", "some", "extent", "." ] } ]
PMC11629461
To verify whether photodynamic action is involved in UVA activation of NOX5, photodynamic action with photosensitizer SALPC, with a ФΔ of 0.38, , was used.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "verify", "whether", "photodynamic", "action", "is", "involved", "in", "UVA", "activation", "of", "NOX5", ",", "photodynamic", "action", "with", "photosensitizer", "SALPC", ",", "with", "a", "ФΔ", "of", "0.38", ",", ",", "was", "used", "." ] } ]
PMC9429973
R. Garcia-Sanz, C. Martínez, F. De la Cruz, A. P. González, A. Rodríguez, B. Sánchez-González, E. Domingo-Domenech, M. Moreno, J. López, J. L. Piñana, M. Bastos, M. Canales, A. Gutiérrez, M. J. Rodríguez-Salazar, A. Navarro, A. Sureda hematology, Hospital Universitario, Salamanca; hematology, Hospital Clinic, Barcelona; hematology, Hospital Virgen del Rocío, Sevilla; hematology, Hospital Universitario Central de Asturias, Oviedo; hematology, Hospital 12 de Octubre, Madrid; hematology, Hospital del Mar; hematology, Hospital Duran i Reynals, Barcelona; hematology, Hospital Germans Trias i Pujol, Badalona; hematology, Hospital Ramón y Cajal, Madrid; hematology, Hospital Clínico, Valencia; hematology, Hospital Gregorio Marañón; hematology, Hospital La Paz, Madrid; hematology, Hospital Son Espases, Palma de Mallorca; hematology, Hospital Universitario de Canarias, Tenerife, Spain Background: For Refractory/Relapsed Hodgkin Lymphoma (RRHL) patients, the combination of BRentuximab vedotin, Etoposide, Solumedrol, High dose Ara-C and Platinum (BRESHAP) as induction therapy prior to high-dose therapy and Autologous Stem Cell Transplantation (APBSCT) induces an overall (OR) and complete remission (CR) rate of 93% and 71% of patients with an initial 75% Time to Tumor Progression at three years (Garcia-Sanz et al, Ann Oncol 2019).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "R.", "Garcia-Sanz", ",", "C.", "Martínez", ",", "F.", "De", "la", "Cruz", ",", "A.", "P.", "González", ",", "A.", "Rodríguez", ",", "B.", "Sánchez-González", ",", "E.", "Domingo-Domenech", ",", "M.", "Moreno", ",", "J.", "López", ",", "J.", "L.", "Piñana", ",", "M.", "Bastos", ",", "M.", "Canales", ",", "A.", "Gutiérrez", ",", "M.", "J.", "Rodríguez-Salazar", ",", "A.", "Navarro", ",", "A.", "Sureda", "hematology", ",", "Hospital", "Universitario", ",", "Salamanca", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Clinic", ",", "Barcelona", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Virgen", "del", "Rocío", ",", "Sevilla", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Universitario", "Central", "de", "Asturias", ",", "Oviedo", ";", "hematology", ",", "Hospital", "12", "de", "Octubre", ",", "Madrid", ";", "hematology", ",", "Hospital", "del", "Mar", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Duran", "i", "Reynals", ",", "Barcelona", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Germans", "Trias", "i", "Pujol", ",", "Badalona", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Ramón", "y", "Cajal", ",", "Madrid", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Clínico", ",", "Valencia", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Gregorio", "Marañón", ";", "hematology", ",", "Hospital", "La", "Paz", ",", "Madrid", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Son", "Espases", ",", "Palma", "de", "Mallorca", ";", "hematology", ",", "Hospital", "Universitario", "de", "Canarias", ",", "Tenerife", ",", "Spain", "Background", ":", "For", "Refractory/Relapsed", "Hodgkin", "Lymphoma", "(", "RRHL", ")", "patients", ",", "the", "combination", "of", "BRentuximab", "vedotin", ",", "Etoposide", ",", "Solumedrol", ",", "High", "dose", "Ara-C", "and", "Platinum", "(", "BRESHAP", ")", "as", "induction", "therapy", "prior", "to", "high-dose", "therapy", "and", "Autologous", "Stem", "Cell", "Transplantation", "(", "APBSCT", ")", "induces", "an", "overall", "(", "OR", ")", "and", "complete", "remission", "(", "CR", ")", "rate", "of", "93", "%", "and", "71", "%", "of", "patients", "with", "an", "initial", "75", "%", "Time", "to", "Tumor", "Progression", "at", "three", "years", "(", "Garcia-Sanz", "et", "al", ",", "Ann", "Oncol", "2019", ")", "." ] } ]
PMC11342785
However, upon nocodazole wash-out, MT filaments rapidly emerged from many TPPP droplet-hubs in an aster-like structure (Fig. 4F and Video S6).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "upon", "nocodazole", "wash-out", ",", "MT", "filaments", "rapidly", "emerged", "from", "many", "TPPP", "droplet-hubs", "in", "an", "aster-like", "structure", "(", "Fig.", "4F", "and", "Video", "S6", ")", "." ] } ]
PMC6617630
Interestingly, unlike MYC expression, the expression of BCL2 was completely insensitive to I-BET, JQ1, and OTX-015 treatment (Fig. 3a, b).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "unlike", "MYC", "expression", ",", "the", "expression", "of", "BCL2", "was", "completely", "insensitive", "to", "I-BET", ",", "JQ1", ",", "and", "OTX-015", "treatment", "(", "Fig.", "3a", ",", "b", ")", "." ] } ]
PMC11413393
Following three days of treatment with 5 µM MS023, each cell line was analyzed in duplicate relative to controls and a differential gene expression analysis (DGEA) was performed on the aggregate of both cell line replicates to look for common differentially expressed genes (Fig. 4a).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "three", "days", "of", "treatment", "with", "5", "µM", "MS023", ",", "each", "cell", "line", "was", "analyzed", "in", "duplicate", "relative", "to", "controls", "and", "a", "differential", "gene", "expression", "analysis", "(", "DGEA", ")", "was", "performed", "on", "the", "aggregate", "of", "both", "cell", "line", "replicates", "to", "look", "for", "common", "differentially", "expressed", "genes", "(", "Fig.", "4a", ")", "." ] } ]
PMC11047729
Additionally, it should be mentioned that apart from the benefits, there may also be several limitations associated with the use of natural substances, such as the following:Their ambiguous effect on chemoprevention;The lack of data indicating the optimal and toxic doses;The lack of data regarding their potential side effects;The lack of data evaluating their pharmacodynamic properties.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "it", "should", "be", "mentioned", "that", "apart", "from", "the", "benefits", ",", "there", "may", "also", "be", "several", "limitations", "associated", "with", "the", "use", "of", "natural", "substances", ",", "such", "as", "the", "following", ":", "Their", "ambiguous", "effect", "on", "chemoprevention;The", "lack", "of", "data", "indicating", "the", "optimal", "and", "toxic", "doses;The", "lack", "of", "data", "regarding", "their", "potential", "side", "effects;The", "lack", "of", "data", "evaluating", "their", "pharmacodynamic", "properties", "." ] } ]
PMC11720107
Moreover, Isbilen and Volkan reported that at the highest extract concentration, LDH release significantly decreased to levels comparable with the control .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "Isbilen", "and", "Volkan", "reported", "that", "at", "the", "highest", "extract", "concentration", ",", "LDH", "release", "significantly", "decreased", "to", "levels", "comparable", "with", "the", "control", "." ] } ]
PMC11686380
Arrows indicate transfected neurons.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Arrows", "indicate", "transfected", "neurons", "." ] } ]
PMC11599565
Of note, patients suffering from different types of cancer, develop an antibody-mediated immune response triggered by the PNMA1 antigen, a 37-kDa protein restricted to neurons, testis cells and cancer cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "note", ",", "patients", "suffering", "from", "different", "types", "of", "cancer", ",", "develop", "an", "antibody-mediated", "immune", "response", "triggered", "by", "the", "PNMA1", "antigen", ",", "a", "37-kDa", "protein", "restricted", "to", "neurons", ",", "testis", "cells", "and", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
This mode of IR has the potential to be more tolerated by BT patients than oral chelators.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "mode", "of", "IR", "has", "the", "potential", "to", "be", "more", "tolerated", "by", "BT", "patients", "than", "oral", "chelators", "." ] } ]
PMC11676674
Conversely, the positive controls (MMC) displayed significantly increased MN frequencies (p < 0.05) compared to NC cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Conversely", ",", "the", "positive", "controls", "(", "MMC", ")", "displayed", "significantly", "increased", "MN", "frequencies", "(", "p", "<", "0.05", ")", "compared", "to", "NC", "cells", "." ] } ]
PMC10812665
There is evidence that this pathway was indeed activated by Ber, as α-KG was decreased and 2-OH-glut was augmented.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "is", "evidence", "that", "this", "pathway", "was", "indeed", "activated", "by", "Ber", ",", "as", "α-KG", "was", "decreased", "and", "2-OH-glut", "was", "augmented", "." ] } ]
PMC6627640
Similarly, a significantly decreased expression of PRC1 complex genes BMI1, PCGF6, PCGF1, RYBP, CBX6, SCMH1, and L3MBTL1 was noted in seven to 10 of the lines as compared with parental cell lines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similarly", ",", "a", "significantly", "decreased", "expression", "of", "PRC1", "complex", "genes", "BMI1", ",", "PCGF6", ",", "PCGF1", ",", "RYBP", ",", "CBX6", ",", "SCMH1", ",", "and", "L3MBTL1", "was", "noted", "in", "seven", "to", "10", "of", "the", "lines", "as", "compared", "with", "parental", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC9812014
The most common subtype of HCoV, HCoV-OC43, is responsible for over 30% of respiratory infections and can cause re-infection for the rest of one’s life .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "most", "common", "subtype", "of", "HCoV", ",", "HCoV-OC43", ",", "is", "responsible", "for", "over", "30", "%", "of", "respiratory", "infections", "and", "can", "cause", "re-infection", "for", "the", "rest", "of", "one", "’s", "life", "." ] } ]
PMC11769516
α-ZEL, which is about three times more estrogenic than ZEA, is the main metabolite formed in pigs and humans.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "α-ZEL", ",", "which", "is", "about", "three", "times", "more", "estrogenic", "than", "ZEA", ",", "is", "the", "main", "metabolite", "formed", "in", "pigs", "and", "humans", "." ] } ]
PMC11509224
Another nine spongian diterpene derivatives, ceylonins A–F (160–165, Figure 14) and ceylonins G–I (166–168, Figure 15) , were also isolated from the Spongia ceylonensis sponge.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Another", "nine", "spongian", "diterpene", "derivatives", ",", "ceylonins", "A", "–", "F", "(", "160–165", ",", "Figure", "14", ")", "and", "ceylonins", "G", "–", "I", "(", "166–168", ",", "Figure", "15", ")", ",", "were", "also", "isolated", "from", "the", "Spongia", "ceylonensis", "sponge", "." ] } ]
PMC9261184
If a venting event occurred, a procedure was in place to ensure that the measurement team would receive advance notice from the ship crew and monitor the vent in two ways:The forward mast vent flowmeter records the vented volume flowrateThe event would be recorded by the measurement team using a portable optical gas imaging (OGI) camera.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "If", "a", "venting", "event", "occurred", ",", "a", "procedure", "was", "in", "place", "to", "ensure", "that", "the", "measurement", "team", "would", "receive", "advance", "notice", "from", "the", "ship", "crew", "and", "monitor", "the", "vent", "in", "two", "ways", ":", "The", "forward", "mast", "vent", "flowmeter", "records", "the", "vented", "volume", "flowrateThe", "event", "would", "be", "recorded", "by", "the", "measurement", "team", "using", "a", "portable", "optical", "gas", "imaging", "(", "OGI", ")", "camera", "." ] } ]
PMC11201245
At this point, it is important to realize that the retrospective compilation of the tested OC patients does not correspond to the natural prevalence but was artificially concentrated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "this", "point", ",", "it", "is", "important", "to", "realize", "that", "the", "retrospective", "compilation", "of", "the", "tested", "OC", "patients", "does", "not", "correspond", "to", "the", "natural", "prevalence", "but", "was", "artificially", "concentrated", "." ] } ]
PMC11653533
Therefore, there is a growing recognition that natural plant-derived compounds are a valuable and robust source of new, safe, and effective secondary bioactive metabolites with therapeutic promise (Zaman et al., 2023, Islam et al., 2022).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "there", "is", "a", "growing", "recognition", "that", "natural", "plant-derived", "compounds", "are", "a", "valuable", "and", "robust", "source", "of", "new", ",", "safe", ",", "and", "effective", "secondary", "bioactive", "metabolites", "with", "therapeutic", "promise", "(", "Zaman", "et", "al.", ",", "2023", ",", "Islam", "et", "al.", ",", "2022", ")", "." ] } ]
PMC11779605
Sample names are labeled along the y-axis and associated score on the x-axis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Sample", "names", "are", "labeled", "along", "the", "y-axis", "and", "associated", "score", "on", "the", "x-axis", "." ] } ]
PMC10898159
It physiologically regulates cell stability and differentiation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "physiologically", "regulates", "cell", "stability", "and", "differentiation", "." ] } ]
PMC11684297
The IA aggregation can be visualized if we can deploy AFM and check the z-height of the treated and untreated IA samples .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "IA", "aggregation", "can", "be", "visualized", "if", "we", "can", "deploy", "AFM", "and", "check", "the", "z-height", "of", "the", "treated", "and", "untreated", "IA", "samples", "." ] } ]
PMC11754784
f Flow cytometry analysis-based fluorescence intensity statistics of four different cancer cells treated with cage-Nb, DNP1, and DNP3 in TAMRA channel and FAM channel.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "f", "Flow", "cytometry", "analysis-based", "fluorescence", "intensity", "statistics", "of", "four", "different", "cancer", "cells", "treated", "with", "cage-Nb", ",", "DNP1", ",", "and", "DNP3", "in", "TAMRA", "channel", "and", "FAM", "channel", "." ] } ]
PMC11224020
Cells were further cultured for 48 h. The following SMARTpool siRNAs were used: ON-TARGETplus Pla2g4a siRNA (Dharmacon, L-009886-00-0010) and ON-TARGETplus Non-Targeting Control Pool (Dharmacon, D-001810-10-20).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "further", "cultured", "for", "48", "h.", "The", "following", "SMARTpool", "siRNAs", "were", "used", ":", "ON-TARGETplus", "Pla2g4a", "siRNA", "(", "Dharmacon", ",", "L-009886", "-", "00", "-", "0010", ")", "and", "ON-TARGETplus", "Non-Targeting", "Control", "Pool", "(", "Dharmacon", ",", "D-001810", "-", "10", "-", "20", ")", "." ] } ]
PMC11240571
It was successfully shown that sarcoma cells can release functional exosomal PD-L1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "was", "successfully", "shown", "that", "sarcoma", "cells", "can", "release", "functional", "exosomal", "PD-L1", "." ] } ]
PMC11001582
Following curation, spike-sorted data were analyzed using custom-written MATLAB scripts and subjected to an additional quality control where only units in which less than 1% of associated spikes violated the physiological refractory period of 2 ms were included for further analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Following", "curation", ",", "spike-sorted", "data", "were", "analyzed", "using", "custom-written", "MATLAB", "scripts", "and", "subjected", "to", "an", "additional", "quality", "control", "where", "only", "units", "in", "which", "less", "than", "1", "%", "of", "associated", "spikes", "violated", "the", "physiological", "refractory", "period", "of", "2", "ms", "were", "included", "for", "further", "analysis", "." ] } ]
PMC9429973
WES did not reveal any pathogenic variants in genes associated with immune dysregulation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "WES", "did", "not", "reveal", "any", "pathogenic", "variants", "in", "genes", "associated", "with", "immune", "dysregulation", "." ] } ]
PMC11711066
After 24 h, the cells are stimulated with estrogen (10 nM), AS‐IV (1 μM), and MPP (5 μM).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "24", "h", ",", "the", "cells", "are", "stimulated", "with", "estrogen", "(", "10", "nM", ")", ",", "AS‐IV", "(", "1", "μM", ")", ",", "and", "MPP", "(", "5", "μM", ")", "." ] } ]