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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
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PMC11737091
Gene sets with |NES| > 1, NOM p < 0.05, and FDR q < 0.25 were considered significantly enriched.
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PMC11095939
Data are presented as means ± SEM; n = 6; ****p<0.0001 by two-way ANOVA. (
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PMC8623816
Based on previously reported phenotypes of fungal strains infected with various mycoviruses, we presumed that strain D122 may be infected by one or more mycoviruses .
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PMC3995603
C: Histological features of the back and ears.
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PMC9429973
In vitro, the effect of IL-35 on CD34+ progenitor cells (MK-ITP+IL-35 group) was measured.
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PMC11286266
Contour plots, as in ‘A’, representing the screen designed to identify ATF6α repressors by successive rounds of enrichments.
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PMC9429973
While the median time to AML progression in both isolated del(5q) and del(5q) combined with one aberration had not been reached at the end of the observation period, the median time to AML progression for patients with del(5q) as part of a complex karyotype was 31 months in the entire cohort and 14 months in the low-intensity treatment group.
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PMC11023271
Keratinocyte proliferation is a vital process for skin development, wound healing, and skin tumor formation .
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PMC11706491
Traditionally, assessing the timing of cell duplication in single-celled organisms has relied on monitoring the optical density of a culture over a restricted timeframe.
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PMC11513571
rSP, (B) Poly I:C, and (C) RSV were used as stimulants for A549 cells and the collection of supernatants were performed at different timepoints (hours). (
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PMC8701144
The following siRNA sequences were used (all from Merck): Control siRNA: endoribonuclease-prepared siRNA pool (esiRNA) that that target multiple locations in the EGFP mRNA sequence (Merck; EHUEGFP), E1B-55k siRNA (I): (GGA GCG AAG AAA CCC AUC UGA UU) and E1B-55k siRNA (II): (GGC CAG AUU GCA AGU ACA AGA UU).
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PMC11679892
However, recent studies also focus on the potential anticancer effects of P. sidoides and show that this plant may affect various biological pathways associated with cancer .
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PMC11748363
The content of the Erlenmeyer flask was transferred to the flask with the phenylacetic acid and three drops of N,N‐dimethylformamide (DMF) were added (mixture 1).
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PMC9325715
The molecular docking analysis within MIB showed as many as 32 potential binding sites for Fe interaction with bLTF (Table S. 1.).
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PMC11295144
NL2 has been viewed as a chief synaptic adhesion mediator based on its well-characterized interactions with the presynaptic proteins Neurexins (Sudhof, 2008), although many other adhesion proteins have also been shown to facilitate the initiation of synaptic contacts (Connor and Siddiqui, 2023).
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PMC9739791
Inside the cell, the equatorial chloride or carboxylate ligands are exchanged for water and the aquated Pt(II) complex binds to the N7 position of purine bases, forming crosslinks with DNA, mainly 1,2- and 1,3-intrastrand crosslinks .
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PMC11638255
Significantly enriched GO terms associated with biological processes and molecular functions were identified using a two-tailed Fisher’s exact test.
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PMC6835428
Notch1, Claudin3 (CLDN3), Nin one binding protein (NOB1p), and Cyclooxigenase-2 (COX-2) (reviewed in ), represent other suitable targets related to OC growth and migration.
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PMC11748363
Presented title compounds were prepared by three different methods; either by direct reaction between amine (2‐aminopyridine, 5‐chloropyridin‐2‐amine, and 6‐chloropyridin‐2‐amine) and corresponding phenylacetyl chloride or by activation of substituted phenylacetic acid (coupling with CDI or reaction of acid with oxalyl chloride) and further reaction with corresponding amine.
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PMC9164404
Cisplatin, the alkylating agent of platinum(II) (Pt(II)), is the most common antitumor drug in clinic.
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PMC10253973
It is associated with an inappropriate lifestyle and a negative environmental effect on people’s health.
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PMC9429973
The mean (standard error; SE) change in LDH ranged from –338.0 (87.3; mean [SE] baseline LDH = 581.0 [94.9] U/L; n = 11) to –3,101.0 (569.9; mean [SE] baseline LDH = 3,552.0 [584.6] U/L; n = 12) U/L. Amongst studies that had non-zero baseline values, the reduction in transfusion dependence following eculizumab treatment ranged from 15.0% (baseline proportion, 23.0%; n = 231) to 80.0% (baseline proportion, 100.0%; n = 5).
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PMC11683240
After the incubation, the cells were lysed and Gαi, which had not been ADP-ribosylated during the intoxication with PT, was ADP-ribosylated and biotin-labeled via the incubation with PTS1 and biotin-labeled NAD.
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PMC10507284
Statistical tests: Student's t‐test. (
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Patients’ mean age was 46 years (range 28-75), 41% of them were male and 59% were female.
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PMC8728081
EDAX results of Kajjali at different regions showed that concentration of small size mercury particles was higher than that of large particles (Fig. 1c).
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PMC9429973
Heart iron, ventricular dysfunction, and ventricular dilatation were significant univariate prognosticators.
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PMC11551844
It displayed anti-allergic, anti-asthma and anti-thrombolytic activities and may be used for the prevention of inflammatory or allergic reactions or the treatment of cardiovascular or haemodynamic disorders.
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PMC11632064
Sequential measurement steps were: (1) baseline (no injection), (2) oligomycin 3 μM (#ab141829; Abcam Inc.), (3) FCCP 0.5 μM (#15218; Cayman Chemical), (4) rotenone 1 μM (#ab143145; Abcam Inc.) and antimycin A 1 μM (#ab141904; Abcam Inc.), and (5) monensin 20 μM (#M5273; MilliporeSigma).
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PMC11721587
Data are means ± SD from two independent experiments. ***
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PMC10253553
Genetic alterations in at least one gene that can be linked to potential changes in mTOR signaling occur in approximately 20% of ccRCC cases .
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PMC11052306
Even dendrimer 2-G3-[Au10-Cu20-NN10-PEG8][AuCl4]10, having only 10 [AuCl2][AuCl4] complexes, had exactly the same properties.
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PMC11496728
CHO cells have several advantages over other cell types, such as their ability to grow stably in a chemically defined and serum-free medium (SFM), relative safety against replication of human pathogenic viruses, and the ability to express recombinant proteins with human-like post-translational modifications.
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PMC11629461
These data suggest that UVA irradiation, likely via type II photodynamic action (i.e., via O2), activated NOX5 to trigger persistent calcium oscillations.
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PMC11476004
Xun et al. also used peripheral blood lymphocytes to diagnose squamous cell carcinoma of the larynx, regarding them as reliable biomarkers.
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PMC8481254
Because CDK8 is a homologous twin kinase of CDK19, the expression of CDK8 was also detected in subsequent experiments.
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PMC9111184
In addition to the permeability assays, studies on alteration of the biochemical properties of Caco-2 ​cells under the effect of ezetimibe and hydroxycinnamic acid derivatives was evaluated using FTIR accompanied with multivariate analysis by PCA.
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PMC11787381
Mice injected with Aβ1-42 and treated with the formulated bambuterol (300 µg/kg/d) showed better cognitive performance and remained longer in the target ring area, indicating an improvement in memory.
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PMC6182045
Both the PGT121 and 10-1074 bNAbs bind glycans (based at N332 or N334) at the stem of the V3 domain and derive from the same inferred IgVH germ-line genes (7, 31).
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PMC11320084
Specific metastasis‐related molecules can provide reference for clinical prediction of efficacy, evaluation of prognosis, and search for the best treatment plan.
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PMC9429973
The interaction of of MSC and cancer cells was mimicked in coculture experiment with or without bortezomib.
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PMC8389560
It is well known that the main mechanism for the entry of nanodrugs and therapeutic genes into the cell is endocytosis which determines the targeted delivery of nanoparticles .
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PMC3203927
RNeasy mini kit was obtained from Qiagen (Valencia, CA).
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PMC9985266
However, whether IL-27 participates in inflammatory reactions, oxidative stress or other possible mechanisms is unknown and is worthy of further exploration in future experiments.
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PMC9429973
Falciparum malaria-related anemia accounted for 32%, commonly in SM (55%) compared to UM (9%) giving highly statistically significant differences in TNF-α levels between falciparum malaria-related anemia and falciparum malaria without anemia (P value 0.000).
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PMC9895440
While Teff express higher levels of these activation genes, other genes of the Tex-term signature, including PDCD1, CD27, TOX, FUT8, LYST, and PDE7B, were more expressed in the Tex condition (Supplementary Fig. 2e, Supplementary Data 2).
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PMC10545062
Animals deemed fluid responsive undergo fluid boluses until either a max number of boluses are administered, at which point NE is increased, or normotension is achieved.
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PMC11740907
The distinct wells were subjected to different quantities of both P5W30 and P5W30-BW-SLNs.
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PMC11765678
For the CellTiterGlO assay, 2500–3000 cells/well were seeded in opaque white, 96-well plates and allowed to attach overnight.
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PMC11095939
Representative immunohistochemistry (IHC) images of liver tissues stained for Mecp2 or Ki67 at the indicated time points after PHx.
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27 patients (30%) required chemotherapy during COVID-19.
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PMC10033453
∗∗p < 0.005, ∗∗∗p < 0.0005, ∗∗∗∗p < 0.00005.
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PMC11754094
In contrast, the HR and HDR pathways are error free; thus, genome editing that uses single-stranded oligodeoxynucleotides (ssODN) or double-stranded donor plasmids flanking homology arms has higher fidelity by leveraging these repair pathways.
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PMC9429973
BM were obtained at diagnosis, after 1 and 2 induction, and 3, 9, 12 and 15 months after consolidation of chemotherapy.
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PMC11240571
p-values were determined using the ANOVA method, which compares mean values among three or more groups.
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PMC9429973
In the survival analysis of TC, ELTS score successfully dissected 3 risk groups both for PFS and OS (p=0.013 and p<0.001, respectively) (Figure 2A-B).
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PMC8481254
Next, we treated two liver cancer cell lines with increasing concentrations of d-glucose, and CCK-8 assays (Fig. 1D) and soft agar colony-formation assays (Fig. 1E) indicated that the cell proliferation activities were elevated by increasing the concentrations of glucose.
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PMC10582049
Proportions of regulatory T cells, T helper cells, and neutrophils (scRNAseq data) in LUAD patient samples with predicted indolent (n = 6) and aggressive (n = 7) tumor behavior (*—p < 0.05). (
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PMC11789597
LP‐1 was purchased from Cellcook (Guangzhou China) and cultured in IMDM (Biological Industries) supplemented with 20% FBS (TransGen Biotech), 2mM L‐glutamine (Biological Industries), and 100 U mL penicillin/streptomycin (Biological Industries).
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PMC11766332
Moreover, we evaluated whether targets of ASD-miRNAs in the glycosylation pathways were enriched for ASD risk genes reported in the Simons Foundation Autism Research Initiative and AutDB database (http://autism.mindspec.org/autdb/HG_Home.do (accessed on 21 June 2024)) including genes reported by GWAS studies, common variant association, genetic syndromes, and copy number variation .
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PMC10530622
In addition, the blockage of IL-1β prevented CaOx-induced kidney injury .
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PMC9429973
Results: There were an estimated 190 hospitalizations with a diagnosis of VOD, with 50% of the patients being covered by Medicaid.
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PMC11429241
The traditional models lack the proper architectural, mechanical, and biochemical cues that make up the natural tumor microenvironment .
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We performed the procedure along the rigid schedule (Figure 1A).
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PMC11752767
M2 macrophages, Tregs, myeloid-derived suppressor cells (MDSCs), and other cells are key components of the suppressive tumor microenvironment (TME).
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PMC9429973
Functional T cell analysis showed enrichment of effector memory T cells and low numbers of naïve T cells which frequently showed exhausted or senescent phenotype.
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PMC11742431
TCGA database analysis of Survivin gene expression levels in various stages of bladder cancer. (
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PMC11337594
Melanoma, one of the most lethal forms of skin cancer, has the potential to develop in any area where melanocytes are present.
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PMC11472569
These findings underscore the critical role of EV-mediated TME reshaping in the development of MDR.
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PMC11739670
CD8αβ and CD8αα bound to MR1 with very similar affinities, with KD’s of the interaction around 250 µM (Figure 1, Figure S2, Table S1).
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PMC8903741
We then cultured the cells for seven days and selected six leading clones (#3, #6, #10, #13, #14, and #18) from the 24 clones that revealed high growth circumstances.
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PMC11045125
293 FT cells (ATCC) were maintained in DMEM media (Gibco) with 1mM sodium pyruvate (Gibco), 1X non-essential amino acids (Gibco), 10% FBS, 500 μg per ml of G418, and 1% pen/strep.
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PMC10440586
Thus, CD99 may be related to glioma recurrence.
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Aims: This study was designed to address this data gap by evaluating the characteristics and clinical outcomes about patients with CLL/SLL after treatment with both cBTKi and BCL2i.
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PMC9429973
Results: Fifty seven CLL pt treated with VEN from 13 sites were included, with a median age of 58 years (38-80) at diagnosis; 35% were female.
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PMC9512971
Exploratory efficacy endpoints were the SARS-CoV-2 viral load (measured at the central laboratory), presence of lung lesions on chest imaging, time to resolution of clinical symptoms, proportion of patients in whom the clinical symptoms resolved, and antibody responses (IgM and IgG; measured at the central laboratory).
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PMC3164356
The version described in this paper is the first version, AFTD01000000.
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PMC11794847
Given its influence on T cell functionality, HVEM holds potential significance in shaping immune therapy outcomes, making it a focal point for investigations into novel immunotherapeutic strategies.
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PMC11754432
Although oxylipin production was not investigated in this context, increased levels of ALA, EPA and DHA were detected following ALA supplementation, all of which are known substrates for ALOX15B .
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PMC11740573
Asterisk indicates the statistical differences: * P < 0.05 Average MIC value of Kanamycin alone and in association with calcitriol against strains of (EC) E. coli, (EF) E. faecalisand (GBS) S. agalactiae.
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PMC11468365
These drug and cell line features are then concatenated and processed through an attention mechanism, which outputs two optimized feature representations for the target tasks.
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PMC11719944
Further research is required to better understand how excess or deficiency of PRL affects metabolic changes and to look into the possibility of using PRL as a therapeutic target.
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Moreover, upregulation of XRCC4 is observed in a panel of platinum-resistant cell lines relative to the parental cell lines, as well as in ovarian cancer patients with poor progression-free survival.
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PMC11719944
CD8+ cells have the ability to release antimicrobial and cytolytic molecules, such as granulysin and perforin, during infectious and autoimmune processes, contributing to the maintenance of inflammation .
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PMC11682172
HPRT1 and HMBS were used as reference genes.
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PMC10203589
For example, FGF18 expression was significantly elevated in MPM, and FGFR 1 inhibition inhibited MPM progression and increased MPM sensitivity to cisplatin and radiation (176–178); FGF18 significantly reduced the resistance of cervical cancer patients to cisplatin (162).
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PMC11549062
In parallel, we established the knockdown and overexpression of PDGFR and PTP1B in VSMCs.
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Aims: Investigate safety and efficacy of CTX130 in pts with R/R TCL.
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1FT-IR analysis of Fe3O4@Glu-Gingerol NPs.
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Thus, none of the stimulants induced IgG production or had the same effect on antibody production as in the unstimulated cells.
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PMC11673902
They explored changes in blood cell deformability in disease models, laying the groundwork for clinical applications of the technique.
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PMC10955424
A total of 11 malignant ascites out of 13 samples tested, derived from different ovarian cancer patients (Table 1), were active in conferring chemoresistance with variable potency as monitored by the reduction of cPARP levels in A2780cisR cells treated with RJY13 prodrug (Fig. 1B and E).
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PMC9429973
Results showed a significant increase both in the FV- and LV- CAR T cells, compared to untransduced cells (mean 890.2 and 3,141pg/ml and 1,553 and 2,225pg/ml for FV- and LV- CAR T cells, in ratios 5:1 and 10:1, respectively).
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PMC11683240
PBS was aspirated as a control.
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PMC11786600
Effect of different portable electrospun dressings on proliferation and viability of NIH/3T3 cells. (
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PMC10812665
Rot and MPP are well-known mitochondrial toxicants (c-I inhibitors).
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PMC11632064
Cells were treated for 72 h with DMSO 0.1% or RSK inhibitors at 3 μM. (D) CXCL8 transcript levels in human melanoma cell lines treated for 72 h with DMSO 0.1% or RSK inhibitors at 3 μM. (E) CXCL8 transcript levels in human melanoma cell lines treated with escalating doses of RSK inhibitors for 72 h. (F) CXCL8 transcript levels in human melanoma cell lines treated with RSK inhibitors for 6, 24 and 48 h. (G, H) CXCL8 transcript levels in MeWo and A-375 cells in response to escalating doses of additional RSK inhibitors.
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PMC8345486
In the SKOV-3 cells, p53 expression, enhanced by compound 23, was visibly lower than that in the cisplatin-sensitive cell lines, that is, A2780 and OVCAR-3 (Figure 8A).
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PMC11718109
Scale bars, 10 μm; inset: 2.5 μm.
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PMC11055510
Firstly, the results of RT-qPCR experiments showed that si-IL1RAP transfection was successful, and the inhibitor could promote the expression of IL-1RAP (Fig. 8A).
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